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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
Alterna
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
CMfinder(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((.......)))).))))).....(((((.(((((....((((....))))....)))))....(((((.((((.......)))).)))))...)))))........................................... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((..(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).........)))))))).)))...)))..))....))))))). |
|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....................((((((((......(((((.(((((....................)))))....((((((((((.......))))))))))...)))))...(....))))))))).......................... |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....(((..(((..((((((((.(....(((((..((((....((((....))))....))))......(((((((((.......)))))))))....))))).......).)))))))).)))...)))........))))))). |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(.((((((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))).(...((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).))).....)).)))).)))))))). |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(...(((..(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....))))).....((((..(((.......)))..))))....))))).(())....)))))))).)))...)))...)............ |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((..(((..(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....(((((.((((.......)))).)))))...))))).(())....)))))))).)))...)))..)))........... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((..(((..((((((((......(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).....)))))))).)))...))).......)))))))). |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((..(((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).)))...)))..))))....))))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((..(((..((((((((..(((.(((((((((((.....(((....))).....)))).....((((((((((.......))))))))))....)))).))).))).)))))))).)))...))........)))))))). |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((((((..((((.((((((((.(....((((((.((((...(((((....)))).)..)))).....((((((((((.......))))))))))..)))))).(())...)))))))))))))...))))))))....))))... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((..(((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))).....((((((((((.......))))))))))....)))).))).))).)))))))).)))...)).)......)))))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((........((((.((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).........))))))))......)))).......)))))))). |
|
Multilign(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((..(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).........)))))))).)))...)))..))))....))))). |
|
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................(((.(.(((((........(((((.((((.....((((....)))).....)))).....((((..(((.......)))..))))....))))).(())......)))))).)))...................... |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
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[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Pknots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((..(((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).)))...)).)))....)))))))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RDfolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((........((((.((((((((.........(((((.......((((....)))).............((((((((((.......))))))))))...))))).........))))))))......)))).......)))))))). |
|
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((.......(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).........)))))))).)))........)))).......... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((..(((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).)))...)).)))....)))))))). |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.......((((((((.((((..(((((((((((..))).(((((......)))))........(((((.............)))))...).))))).))..)))))))))))).((..)))).))).))..))))))). |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((...(((.((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).))))))))......)))...))...)))))))). |
|
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((..(((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).........)))))))).)))...)))..))))....))))). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..(((..(((..((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).)))...)))..))))....))))). |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((......)))..((((((.....))).....(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).(((....)))...((((..............))))..))).. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((......)))..((((((.....))).....(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).(((....)))...((((..............))))..))).. |
