1VX6_B
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1VX6_B
(ext)
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2KD8_A
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(ext)
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2KE6_A
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(ext)
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2KMJ_A
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2KPV_A
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2KRL_A
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2KRL_A
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2KUR_A
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2KUV_A
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2KX8_A
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2KZL_A
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2L3C_B
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2L3J_B
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2L3J_B
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2L5Z_A
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2L94_A
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2LA5_A
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2LC8_A
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2LDL_A
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[ reference std structure ]
|
((...((.......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..))))........))....))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((.....((((((((.((((.((((...))))..)))).......((((((((.((((..))))).))))))).......)))..)))))......)))..)))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((..(((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).))....((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))...)).
|
2LKR_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC |
[ reference std structure ]
|
((...((.......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..))))........))....))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((.....((((((((.((((.((((...))))..)))).......((((((((.((((..))))).))))))).......)))..)))))......)))..)))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((..(((.....(((((.((.((((.(((.....)))..)))).))....((((((((((((....))))))))))))((....))....)))))......)))...)).
|
2LQZ_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACUUCCAUUGCUUCGGCAAAAGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.....(((....)))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((...)(((((..)))))..)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((....))))))))))
|
2LQZ_A
|
[ FASTA input ]
|
GGACUUCCAUUGCUUCGGCAAAAGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.....(((....)))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((...)(((((..)))))..)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((....))))))))))
|
2LU0_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAGCUUCGGCUGAGAGCUAAGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..((((............(((((....)))))))))...)))))
|
2LU0_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAGCUUCGGCUGAGAGCUAAGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..((((............(((((....)))))))))...)))))
|
2LUN_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGUGAUGCUUCGGCAUAUCAGCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(...(((....)))...).))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(.(((((....))))).).))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((....))))))))))))
|
2LUN_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGUGAUGCUUCGGCAUAUCAGCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(...(((....)))...).))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(.(((((....))))).).))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(..((((....))))..).))))
|
2LV0_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAUGUUGAAAAAUUAGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((..........)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(......).)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((........))))))))
|
2LV0_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAUGUUGAAAAAUUAGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((..........)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(......).)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((........))))))))
|
2LWK_A
|
[ FASTA input ]
|
GAGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.(..(((....))).).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((((.(((....)))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((.(.((((....))))).)))))))
|
2LWK_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.(..(((....))).).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((((.(((....)))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((.((((....)))))))))))))
|
2M12_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGUAUUGGAAAUGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((...........))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...........))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((...........))))))
|
2M12_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGUAUUGGAAAUGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((...........))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...........))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((...........))))))
|
2M58_A
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAAAGGGCUUCGGCCACUCAAACUACAGAGACGCCAGUCACUCAGAUAUCCUGGU |
[ reference std structure ]
|
...((...(((....)))..))........(((...[[[[...))).......]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
((.((((.((((..)))))))).)).....(((...[[[[...))).......]]]].
|
[ predicted structure ] |
..............(((..(((........)))..)))....................
|
2M58_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAAAGGGCUUCGGCCACUCAAACUACAGAGACGCCAGUCACUCAGAUAUCCUGGU |
[ reference std structure ]
|
...((...(((....)))..))........(((...[[[[...))).......]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
((.((((.((((..)))))))).)).....(((...[[[[...))).......]]]].
|
[ predicted structure ] |
..............(((..(((........)))..)))(...............)...
|
2M5U_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUUCUGGUGAAUCUGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
2M5U_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUUCUGGUGAAUCUGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
2M8K_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((......[[[[[[[[[[[[))))).....].].]]]]]]]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcddddd......d))))).....D.].}>ABCDDDDD. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........(((((((((((.((((....))))...)))))))))))
|
2M8K_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((......[[[[[[[[[[[[))))).....].].]]]]]]]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcddddd......d))))).....D.].}>ABCDDDDD. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((((((((((((((((....))))..))))))))))))
|
2MF0_G
|
[ FASTA input ]
|
UGUCGACGGAUAGACACAGCCAUCAAGGACGAUGGUCAGGACAUCGCAGGAAGCGAUUCAUCAGGACGAUGA |
[ reference std structure ]
|
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..(((.......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..((((.....)))).
|
[ predicted structure ] |
((((........))))..((((((......))))))......(((((.....)))))(((((.....)))))
|
2MF0_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGUCGACGGAUAGACACAGCCAUCAAGGACGAUGGUCAGGACAUCGCAGGAAGCGAUUCAUCAGGACGAUGA |
[ reference std structure ]
|
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..(((.......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..((((.....)))).
|
[ predicted structure ] |
.(((........)))...((((((......))))))......(((((.....))))).((((.....)))).
|
2MHI_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((...((.((((...))))))..(...((.....)).)).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..(((.((((...))))))).(..(((.....))))).)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((.....)))))).))..((((.....))))...))))))
|
2MHI_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((...((.((((...))))))..(...((.....)).)).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..(((.((((...))))))).(..(((.....))))).)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((((.((((...))))))))).((((.....))))..)))))))
|
2MI0_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAGCAUCGUCGGCUGCUCA |
[ reference std structure ]
|
((((((.........)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.........)))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.......))))))).
|
2MI0_B
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCAGUUGACUACUGUCGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.......)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.......)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((.....))))))))
|
2MI0_A
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAGCAUCGUCGGCUGCUCA |
[ reference std structure ]
|
((((((.........)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.........)))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.......))))))).
|
2MI0_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCAGUUGACUACUGUCGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.......)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.......)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((.....))))))))
|
2MIY_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.....[[[[[[.)))))))).........(((......)))..]]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[{..<<<<...)))))))).........(((......)))..]}>>>>.. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..........))))))))).........((((....))))..........
|
2MIY_A
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.....[[[[[[.)))))))).........(((......)))..]]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[{..<<<<...)))))))).........(((......)))..]}>>>>.. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((............)))))))).........((((....))))..........
|
2MQT_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAGGGUCUCCUCUGAGUGAUUGACUACCCGUCAGCGGGGGUCUUUCAUUUGGGGGCUCGUGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.((((((((.....((((..((((.((((....))))))))..))))..)))))))).)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.((((((((.....((((((((((.(((((..)))))))))))))))..)))))))).))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.((((((((...((((((..((((.((((....))))))))..)))))))))))))).)))))
|
2MQT_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAGGGUCUCCUCUGAGUGAUUGACUACCCGUCAGCGGGGGUCUUUCAUUUGGGGGCUCGUGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((.((((((((.....((((..((((.((((....))))))))..))))..)))))))).)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.((((((((.....((((((((((.(((((..)))))))))))))))..)))))))).))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((...((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))))))))
|
2MS1_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGUUGGUCUAGGGGUAUGAUUCUCGCUUAGGGUGCGAGAGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGACGAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((....((...........))((((((.......)))))).....((((.......))))...)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((....((((.[.....))))((((((.......))))))...]((((((...)..)))))..))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.......(((.....(((((((.......))))))).)))((((.......))))))))))))
|
2MS1_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGUUGGUCUAGGGGUAUGAUUCUCGCUUAGGGUGCGAGAGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGACGAGCC |
[ reference std structure ]
|
(((((....((...........))((((((.......)))))).....((((.......))))...)))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((....((((.[.....))))((((((.......))))))...]((((((...)..)))))..))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.......(((.....(((((((.......))))))).)))((((.......))))))))))))
|
2MXL_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU |
[ reference std structure ]
|
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((.(((((((.(..).)).))))).))))))) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
|
2MXL_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU |
[ reference std structure ]
|
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((.(((((((.(..).)).))))).))))))) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((......)).)))))))))))))
|
2N0R_A
|
[ FASTA input ]
|
CUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUG |
[ reference std structure ]
|
(...((((....))))......)
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((....))))...))))
|
[ predicted structure ] |
....((((....)))).......
|
2N0R_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUG |
[ reference std structure ]
|
(...((((....))))......)
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((....))))...))))
|
[ predicted structure ] |
....((((....)))).......
|
2N1Q_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((...((((..(((((((....)))))))...(((..(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))..)))....)))).......(((..(((((....)))))..)))...))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....((((((((((....)))))))))).))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((........((((((((....)))))))).....((.((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).))..(((((....)))))..........(((((....))))).....)).))))))))))).
|
2N1Q_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((...((((..(((((((....)))))))...(((..(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))..)))....)))).......(((..(((((....)))))..)))...))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....((((((((((....)))))))))).))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.........(((((((....))))))).....(((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).....(((((....)))))..........(((((....)))))...)))))))))))))))).
|
2N2O_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU |
[ reference std structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ predicted structure ] |
...(((((((...)))))))...
|
2N2O_A
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU |
[ reference std structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ predicted structure ] |
....((((((...))))))....
|
2N2P_A
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU |
[ reference std structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ predicted structure ] |
...(((((((...)))))))...
|
2N2P_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU |
[ reference std structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ predicted structure ] |
...(((((((...)))))))...
|
2N4L_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).)))))))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((..((((.....)))))))))))))))))))))))
|
2N4L_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).)))))))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((..(((..((((.....)))))))..))))))))))))))
|
2N6Q_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU |
[ reference std structure ]
|
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
|
[ reference ext structure ]
|
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>> ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.........)))))............
|
2N6Q_A
|
[ FASTA input ]
|
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU |
[ reference std structure ]
|
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
|
[ reference ext structure ]
|
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>> ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.........)))))............
|
2N7M_X
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((..(((((.(((.....(((....)))..))))))))..((((((((....))))))))))))).)))))))))))
|
2N7M_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((..(((((.(((.....(((....)))..))))))))..((((((((....)))))))))))))))))))))))))
|
2N8V_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]]. ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.((((((((....)).)))))).((((((((......)))))))))))))...............
|
2N8V_X
|
[ FASTA input ]
|
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]]. ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.((((((((....)).)))))).((((((((......)))))))))))))...............
|
2RPT_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(((....))).))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((....))).))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(((....))).))))
|
2RPT_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(((....))).))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((....))).))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(((....))).))))
|
2RRC_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCACCACGGCGAGGUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((.(....).).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..)))).))))). ()
|
[ predicted structure ] |
(((((...........))))).
|
2RRC_A
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCACCACGGCGAGGUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((.(....).).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..)))).))))). ()
|
[ predicted structure ] |
(((((...........))))).
|
2WRQ_Y
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUGAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..)))..... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
2WRQ_Y
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUGAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..)))..... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
2WW9_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUG |
[ reference std structure ]
|
.((((............).....(.((....(((....)))..........))..)...))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((({([<(.(.)..].}..)>((((((...(((..).))).......)..)).)).).)))) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
....((((......)))).............................................
|
2WW9_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGG |
[ reference std structure ]
|
((((((...((.....)).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((...(.....)).)))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))).)))))))
|
2WW9_D
|
[ FASTA input ]
|
AGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUG |
[ reference std structure ]
|
.((((............).....(.((....(((....)))..........))..)...))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((({([<(.(.)..].}..)>((((((...(((..).))).......)..)).)).).)))) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
....((((......)))).............................................
|
2WW9_F
|
[ FASTA input ]
|
CCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGG |
[ reference std structure ]
|
((((((...((.....)).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((...(.....)).)))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))).)))))))
|
2WW9_E
|
[ FASTA input ]
|
UGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUAC |
[ reference std structure ]
|
......(..((((....))))............)
|
[ reference ext structure ]
|
[(..])(.((((((..))))))({(..}.))..) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..................................
|
2WW9_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUAC |
[ reference std structure ]
|
......(..((((....))))............)
|
[ reference ext structure ]
|
[(..])(.((((((..))))))({(..}.))..) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..................................
|
2WWQ_V
|
[ FASTA input ]
|
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((.(.......).))).....((.((.......)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)(.......]]].((((.((....).).))))]..)((.(((...)..)).))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.((...)).)))).(((.(.......).))).....(((((.......))))))))))))....
|
2WWQ_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((.(.......).))).....((.((.......)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)(.......]]].((((.((....).).))))]..)((.(((...)..)).))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.((...)).)))).(((.(.......).))).....(((((.......))))))))))))....
|
2XKV_B
|
[ FASTA input ]
|
CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC |
[ reference std structure ]
|
.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
|
[ reference ext structure ]
|
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)...... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))))))
|
2XKV_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC |
[ reference std structure ]
|
.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
|
[ reference ext structure ]
|
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)...... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
....(((((((((((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..))))).).)))))))
|
2XQD_Y
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAACACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA |
[ reference std structure ]
|
((.((((..((((........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))).))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)(......])}.(((((((.....))))))})..)(((((.......)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...............(((((((((.......))))).))))(((((.......))))))))))))....
|
2XQD_Y
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAACACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA |
[ reference std structure ]
|
((.((((..((((........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))).))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)(......])}.(((((((.....))))))})..)(((((.......)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...............(((((((((.......))))).))))(((((.......))))))))))))....
|
2XXA_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...)))))))).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((..)))))...))))).))).))).))))))).)).))))))...)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.......................................(((((((((((((.((..(((((....))))).....)).))))))))))))))))))
|
2XXA_G
|
[ FASTA input ]
|
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...)))))))).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((..)))))...))))).))).))).))))))).)).))))))...)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.......................................(((((((((((((.((..(((((....))))).....)).))))))))))))))))))
|
2Y8W_B
|
[ FASTA input ]
|
UCCCCACGCGUGUGGGGAUG |
[ reference std structure ]
|
.((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((....))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((....)))))))..
|
2Y8W_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCCCACGCGUGUGGGGAUG |
[ reference std structure ]
|
.((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((....))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((....)))))))..
|
2Y9C_V
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGACGACUGAAAAGUCGGCAUUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUAUGGGUAACCUAAGGAGACUGG |
[ reference std structure ]
|
((..((.(((((....))))).))..).)..........(((((((..((....))...)))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((((..))))))))).)).)..........((((((((.(((..))))..))))))).. ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
|
2Y9C_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGACGACUGAAAAGUCGGCAUUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUAUGGGUAACCUAAGGAGACUGG |
[ reference std structure ]
|
((..((.(((((....))))).))..).)..........(((((((..((....))...)))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((((..))))))))).)).)..........((((((((.(((..))))..))))))).. ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((....))))).))).))).........((((((((.((((...)))).)))))))).
|
2YIE_Z
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG |
[ reference std structure ]
|
......(((((.......))))).....(((......)))................
|
[ reference ext structure ]
|
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
|
[ predicted structure ] |
......(((((.......)))))..........((((((..........)))))).
|
2YIE_Z
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG |
[ reference std structure ]
|
......(((((.......))))).....(((......)))................
|
[ reference ext structure ]
|
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
|
[ predicted structure ] |
......(((((.......)))))..........((((((..........)))))).
|
2YIE_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU |
[ reference std structure ]
|
.............(((.......))).....((((......))))........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........ ( )
|
[ predicted structure ] |
......(((....(((.......)))..)))((((......))))........
|
2YIE_X
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU |
[ reference std structure ]
|
.............(((.......))).....((((......))))........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........ ( )
|
[ predicted structure ] |
......(((....(((.......)))..)))((((......))))........
|
2ZZM_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAGGGGUCGCCAAGCCUGGCCAAAGGCGCUGGGCCUAGGACCCAGUCCCGUAGGGGUUCCAGGGUUCAAAUCCCUGCCCCUGC |
[ reference std structure ]
|
......(..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))......((.......))...)......
|
[ reference ext structure ]
|
.(.(((((.[[[[){...<(.}a(]]]](((((((.....)))))))((((..))))A)...((((>).)..)))..))).).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((((.......)))))))....)))..............(...(((((.......))))))))))))
|
2ZZM_B
|
[ FASTA input ]
|
GCAGGGGUCGCCAAGCCUGGCCAAAGGCGCUGGGCCUAGGACCCAGUCCCGUAGGGGUUCCAGGGUUCAAAUCCCUGCCCCUGC |
[ reference std structure ]
|
......(..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))......((.......))...)......
|
[ reference ext structure ]
|
.(.(((((.[[[[){...<(.}a(]]]](((((((.....)))))))((((..))))A)...((((>).)..)))..))).).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((((.......)))))))....)))..............(...(((((.......))))))))))))
|
2ZZN_D
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGUAGUCUAGGGGCUAGGCAGCGGACUGCAGAUCCGCCUUACGUGGGUUCAAAUCCCACCCCCGGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([....(..]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)<.{(..]]]].((((((.....))))))....>((((((}).)..))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
|
2ZZN_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGUAGUCUAGGGGCUAGGCAGCGGACUGCAGAUCCGCCUUACGUGGGUUCAAAUCCCACCCCCGGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([....(..]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)<.{(..]]]].((((((.....))))))....>((((((}).)..))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((...)))))).((((((....).))))).....(((((.......))))))))))))
|
3A2K_C
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......))))))))))))....
|
3A2K_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((..(.((((((((((.....)))).)))))).).))).(((((.......))))))))))))....
|
3A3A_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUGAUCCUCAGUGGUCUGGGGUGCAGGCUUCAAACCUGUAGCUGUCUAGCGACAGAGUGGUUCAAUUCCACCUUUCGGGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.))))))))))))) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
|
3A3A_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUGAUCCUCAGUGGUCUGGGGUGCAGGCUUCAAACCUGUAGCUGUCUAGCGACAGAGUGGUUCAAUUCCACCUUUCGGGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.))))))))))))) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
|
3ADB_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCCGCCACCGGGGUGGUCCCCGGGCCGGACUUCAGAUCCGGCGCGCCCCGAGUGGGGCGCGGGGUUCAAUUCCCCGCGGCGGCCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((((..((((([..(.])))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((..)....)))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((([[()))))))(((((((.....)))))))(((((((....)))))))(((((]..)].))))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..((((((....))))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((.......)))))))))))))....
|
3ADB_C
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCCGCCACCGGGGUGGUCCCCGGGCCGGACUUCAGAUCCGGCGCGCCCCGAGUGGGGCGCGGGGUUCAAUUCCCCGCGGCGGCCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((((..((((([..(.])))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((..)....)))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((([[()))))))(((((((.....)))))))(((((((....)))))))(((((]..)].))))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..((((((....))))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((.......)))))))))))))....
|
3AKZ_H
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGGGAGGUCGUCUAACGGUAGGACGGCGGACUCUGGAUCCGCUGGUGGAGGUUCGAGUCCUCCCCUCCCAGCCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)(.....]]]].((((((.....))))))...)((((((...)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.......)))))).((((((....((((....)))).....))))))...)))))))....
|
3AKZ_H
|
[ FASTA input ]
|
UGGGAGGUCGUCUAACGGUAGGACGGCGGACUCUGGAUCCGCUGGUGGAGGUUCGAGUCCUCCCCUCCCAGCCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)(.....]]]].((((((.....))))))...)((((((...)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.......)))))).((((((....((((....)))).....))))))...)))))))....
|
3AM1_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGGGGUACCGGGCUUGGUAGCCCGGGGCUUCGGCCGAGGGCGAGAGCCCUCGGGGUUCGAUUCCCCCCCUGCGCCGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))((((((....))))))((((.......)))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..((((((([[())))))))(((....)))(((((((..)))))))(((((]..)].))))))))))))).. ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(((((((....)))))))((..((((((((((((....))))))))...))))..))..)))))))))..
|
3AM1_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGGGGUACCGGGCUUGGUAGCCCGGGGCUUCGGCCGAGGGCGAGAGCCCUCGGGGUUCGAUUCCCCCCCUGCGCCGC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))((((((....))))))((((.......)))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..((((((([[())))))))(((....)))(((((((..)))))))(((((]..)].))))))))))))).. ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(((((((....)))))))((..((((((((((((....))))))))...))))..))..)))))))))..
|
3AMU_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
|
3AMU_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((................((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
|
3GX2_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCG |
[ reference std structure ]
|
((((((((......(((...(((...[[)))......))).(((..(((....))).)))...(]]..(((((....)))))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<<.))...).)))))(})..((((..))))...).).(>>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(((...(((.....)))......))).(((.((((....)))))))........(((((....)))))...)))))))).
|
3GX2_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCG |
[ reference std structure ]
|
((((((((......(((...(((...[[)))......))).(((..(((....))).)))...(]]..(((((....)))))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<<.))...).)))))(})..((((..))))...).).(>>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(((...(((.....)))......))).(((.((((....)))))))........(((((....)))))...)))))))).
|
3IAB_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACUCAGUAAUAUGCUUUGGAAACGAAGCUUACAAAAUGGAGUCC |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((((....))))))..........))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(..).(((((((..)))))))..........))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.((..((.((((((....)))))).))....)).))))))
|
3IAB_R
|
[ FASTA input ]
|
GGACUCAGUAAUAUGCUUUGGAAACGAAGCUUACAAAAUGGAGUCC |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((((....))))))..........))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(..).(((((((..)))))))..........))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.((..((.((((((....)))))).))....)).))))))
|
3ID5_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGCCCUCUGAGCGUUCGCGCUGUGAUGA |
[ reference std structure ]
|
..........(...(((....)))......).
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((....)))...)))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((.......))))))............
|
3ID5_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGCCCUCUGAGCGUUCGCGCUGUGAUGA |
[ reference std structure ]
|
..........(...(((....)))......).
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((....)))...)))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((.......))))))............
|
3IVN_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC |
[ reference std structure ]
|
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
|
3IVN_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC |
[ reference std structure ]
|
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...((((((.........))))))........(((((.........)))))..))))))))
|
3IWN_A
|
[ FASTA input ]
|
CACGCACAGGGCAAACCAUUCGAAAGAGUGGGACGCAAAGCCUCCGGCCUAAACGGCAUUGCACUCCGCCGUAGGUAGCGGGGUUACCGAUGG |
[ reference std structure ]
|
((((......([...((((((....))))))..(])...(((.((((((((..((((..........))))))))).)))))))...)).)).
|
[ reference ext structure ]
|
((((......({...(((((((..)))))))..(}).(.(((.([[(((((..((((..........)))))))))))]].))))..)).)). ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((...((((((....))))))...))...(((.(((((((..(((((..........)))))))))..)))))).........
|
3IWN_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CACGCACAGGGCAAACCAUUCGAAAGAGUGGGACGCAAAGCCUCCGGCCUAAACGGCAUUGCACUCCGCCGUAGGUAGCGGGGUUACCGAUGG |
[ reference std structure ]
|
((((......([...((((((....))))))..(])...(((.((((((((..((((..........))))))))).)))))))...)).)).
|
[ reference ext structure ]
|
((((......({...(((((((..)))))))..(}).(.(((.([[(((((..((((..........)))))))))))]].))))..)).)). ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((...((((((....))))))...))...(((.(((((((..(((((..........)))))))))..)))))).........
|
3IYQ_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAAACGGUCUCGACGGGGGUCGCCGAGGGCGUGGCUGCGCGCCGAGGUGCGGGUGGCCUCGUAAAAACCCGCAACGGCAUAACUGCCAACACCAACUACGCUCUCGCGGCUUAAUGACCGCGACCUCGCCCGGUAGCCCUGCCGGGGGCUCACCGGAAGCGGGGACACAAACCCGGCUAGCCCGGGGCCACGCCCUCUAACCCCGGGCGAAGCUUGAAGGGGGCUCGCUCCUGGCCGCCCGUCCGCGGGCCAAGCCAGGAGGACACGCGAAACGCGGACUACGCGCGUAGAGGCCCGCCGUAGGGACCUUCGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCACCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((....................(((........(((.((((..(((((((...<<<<.<....))).....>.>>>>...............................((.((..........)).)).........(..((....aaa...))...)....................AAA....((.(((.....[.....[...))).))..........].....]....((.......(.....{{{..)........).).............}}}......)))).....))))))).......))).......(..((.......))..)....)))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((.()....(...........(((..()....((<(((((..(((((((((.{{{{.{)..)))).....}.}}}}............................(..(((((((.....).))))))..(..(.(((b(((.e...ee...))..B)))(.))..)....)...)..EEE...(.a.(((.....d.dd.d....)))(A)....)..().D..DDD.....(((.(((.((..[[[[[[[.))...))))).)............]]]]]]]...)))).....))))>)).).....))).......c.ccc....)..CCC.C...)))).... () ( ) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((((((.(((((((((...((((((((((((.(((((((.(.(((((((............)))))))..((((....))))................((((((........))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..))))))........)))))..))..).))))))))))))...((((.(((...)))....)))).....((((((((.(((((....)))))...))))))))..........(((((.......)))))...))))).)))).)))))).......(((((.......))))))))))))....
|
3IYQ_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAAACGGUCUCGACGGGGGUCGCCGAGGGCGUGGCUGCGCGCCGAGGUGCGGGUGGCCUCGUAAAAACCCGCAACGGCAUAACUGCCAACACCAACUACGCUCUCGCGGCUUAAUGACCGCGACCUCGCCCGGUAGCCCUGCCGGGGGCUCACCGGAAGCGGGGACACAAACCCGGCUAGCCCGGGGCCACGCCCUCUAACCCCGGGCGAAGCUUGAAGGGGGCUCGCUCCUGGCCGCCCGUCCGCGGGCCAAGCCAGGAGGACACGCGAAACGCGGACUACGCGCGUAGAGGCCCGCCGUAGGGACCUUCGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCACCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((....................(((........(((.((((..(((((((...<<<<.<....))).....>.>>>>...............................((.((..........)).)).........(..((....aaa...))...)....................AAA....((.(((.....[.....[...))).))..........].....]....((.......(.....{{{..)........).).............}}}......)))).....))))))).......))).......(..((.......))..)....)))....
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3IZ4_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUUGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACCAUCAUCAUCAUCACAUGAGGAUCACCCAUGUAACGAUGAUGAUGCCUCUCUCCCUAGCCUCCGCUCUUAGGACGGGGAUCAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAAGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUUAAUCAGGCUAGUUUGUUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGCUGGCAAGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGACGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.............((..((((.......((..(((((((((.((((...aaaa..))))......AAAA.................................((((((((.(.(((.(.((....))).))).).)))))))).(.(((((.((((..(((...[[[[.)))..)))).....)))))..).........]]]]......(....(((..{{{{{.)))....)..............}}}}}..((((((((...(((.<<<.<<<)))...)))))))).........>>>.>>>...))))))...)))..))......))))..))...(((((.......))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((...(.......................(((..(((....)))..)))(((((..............)))))........((((....)))).........((((((((((.(.(((((.((....))))))).).))))))))))(((((((((((.(..(((.......))))))))....)))))))..................((((...((((((....))))))...)))).....((((.((((....((((((((((.(((........))).))))))))))...........)))).)))).............................)..(((((.......))))))))))))...
|
3IZ4_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUUGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACCAUCAUCAUCAUCACAUGAGGAUCACCCAUGUAACGAUGAUGAUGCCUCUCUCCCUAGCCUCCGCUCUUAGGACGGGGAUCAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAAGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUUAAUCAGGCUAGUUUGUUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGCUGGCAAGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGACGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.............((..((((.......((..(((((((((.((((...aaaa..))))......AAAA.................................((((((((.(.(((.(.((....))).))).).)))))))).(.(((((.((((..(((...[[[[.)))..)))).....)))))..).........]]]]......(....(((..{{{{{.)))....)..............}}}}}..((((((((...(((.<<<.<<<)))...)))))))).........>>>.>>>...))))))...)))..))......))))..))...(((((.......))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3IZF_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((((......((.(((...(....)...)))...)).....))))))).(((((.......((((((((....)))))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((.(((...[(...].).)))...)))...)))))))).((((((((.()((((((((((..)))))))))).)))))))).))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((..(((((.(((((......))..))).)))))...))))))))((((((....((.((((((((....))))))))...))))))))))))))))).
|
3IZF_C
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((((......((.(((...(....)...)))...)).....))))))).(((((.......((((((((....)))))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((.(((...[(...].).)))...)))...)))))))).((((((((.()((((((((((..)))))))))).)))))))).))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((..(((((.(((((......))..))).)))))...))))))))((((((....((.((((((((....))))))))...))))))))))))))))).
|
3J0L_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU |
[ reference std structure ]
|
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........ ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.......))))).................................
|
3J0L_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG |
[ reference std structure ]
|
(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))........)))........((((((.(....)))))))
|
3J0L_7
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU |
[ reference std structure ]
|
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........ ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.......))))).................................
|
3J0L_g
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG |
[ reference std structure ]
|
.................((........))..
|
[ reference ext structure ]
|
......(.........[[[......).]].]
|
[ predicted structure ] |
...............................
|
3J0L_a
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA |
[ reference std structure ]
|
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.............(((.((....)))))........))))....
|
3J0L_a
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA |
[ reference std structure ]
|
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.............(((.((....)))))........))))....
|
3J0L_h
|
[ FASTA input ]
|
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA |
[ reference std structure ]
|
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).)) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..(.(((.....((((((((....))))))))......))))..)))..))))))))..)).)))))..).))...
|
3J0L_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCGUGAGACAGGUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))).)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))).)))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))).)))).
|
3J0L_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU |
[ reference std structure ]
|
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..)) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((((..(((((((.....)))))))))))...........
|
3J0L_2
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG |
[ reference std structure ]
|
(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((.(((((.((........)).)))))....)))))))))....(((((((((.......))))))........)))........((((((.(....)))))))
|
3J0L_h
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA |
[ reference std structure ]
|
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).)) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((.(.(((((.((..((((((((..(((..(.(((.....((((((((....))))))))......))))..)))..))))))))..)).)))))..).))...
|
3J0L_8
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCGUGAGACAGGUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))).)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))).)))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))).)))).
|
3J0L_g
|
[ FASTA input ]
|
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG |
[ reference std structure ]
|
.................((........))..
|
[ reference ext structure ]
|
......(.........[[[......).]].]
|
[ predicted structure ] |
...............................
|
3J0L_1
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU |
[ reference std structure ]
|
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..)) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((((..(((((((.....)))))))))))...........
|
3J16_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((<<.[)({.{...])>>((((((.(..)..))))))..)((((((}..)}.)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.................(((((((.....)))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
3J16_L
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((<<.[)({.{...])>>((((((.(..)..))))))..)((((((}..)}.)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.................(((((((.....)))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
3J20_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((.........)))(((((((.......))))).))..(((((.......))))))))))))....
|
3J20_0
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.....((((((.(((((((((((.......))))))))))))))))).........))))))))....
|
3J20_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGGCGUCCCUUCUGGGACGCCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGCCUGGGGUACUGGAAGGUCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGUAAGGCCCGCCCGAGGAUGCGGCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGCCUCUGGCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGUGGCCACUAUUAUUGGGCCUAAAGCGGCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUCGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCCGGGGUAGGGGUGAAAUCCUAUAAUCCCGGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGCGCGGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGGUGCCGUAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGGCUGAAGGUCUUGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGGUAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCCUCCCGCUCGGGAGGAGGCACUCUGGGGGGACUGCCGGCGAUAAGCCGGAGGAAGGGGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAAUGGGACCCGACCUCGAAAGGGGAAGGGAAUCCCCUAAACCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUGAAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGUGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUCCACCCGAGCGGAGUCCGGGUGAGGCCUGAUCUCCUUCGGGAGGUCAGGUCGAGCCCGGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
...(((...<.<<<...))).(((((((((....((((.(((......((.(((..(((..(..((((((((....))))))))..))))......(((.......(((((.(...(...(((((((.((((......((.((....)).)).......))))...(((((((((.(((....))))))))))))....((..(((....))))).)))))))..).).))))).(((....(((...((((((.........)))))).)))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))..).....(.(((....((((....))))..)))).))..))))...((((.(((...))).))))....(((((((.......)))))))......(((((((.....[[[[[.....[...)).].......]]]]])))))..)))))))))..........(((((...a..((....(((..((((((.(((((((((.....((((((((.....))))))))....)))))))..))))))))...(((((((.....((((((.(...((((((((...((........))......))))))))...).......((....))..))))))....))).)))..))))....)).....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{..(((((((((.((((.....)))).)))))))))...{{..))}}.....}}}}}}A))).(((......((((....))))....)))...>>>.>(((((.(((((((..((.((((((..(((((((.((......((........))..........(((((((...((((.(......(((.((((.....)))).)))...)..))))...(..(((...((((((((....((((((.((....))....(((......)))...)))))).....((((.((((((..........((((((....))))))........)))))).....(((((.....)))))........)))).....))).)))...)).))).)....)))))))...))..))))))).(...((((((......(((..((..((((....))))..))....)))......))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..)))))).....((((((.........)))))).......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((...(..(.(((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..))))))))))).)..)...))))..).))...)..)..(.(.(((((....))))).).)}...........
|
[ reference ext structure ]
|
N/A
|
[ predicted structure ] |
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|
3J20_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))))))....
|
3J20_0
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.....((((((.(((.(((((((.......))))))).))))))))).........))))))))....
|
3J20_2
|
[ FASTA input ]
|
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGGCGUCCCUUCUGGGACGCCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGCCUGGGGUACUGGAAGGUCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGUAAGGCCCGCCCGAGGAUGCGGCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGCCUCUGGCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGUGGCCACUAUUAUUGGGCCUAAAGCGGCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUCGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCCGGGGUAGGGGUGAAAUCCUAUAAUCCCGGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGCGCGGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGGUGCCGUAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGGCUGAAGGUCUUGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGGUAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCCUCCCGCUCGGGAGGAGGCACUCUGGGGGGACUGCCGGCGAUAAGCCGGAGGAAGGGGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAAUGGGACCCGACCUCGAAAGGGGAAGGGAAUCCCCUAAACCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUGAAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGUGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUCCACCCGAGCGGAGUCCGGGUGAGGCCUGAUCUCCUUCGGGAGGUCAGGUCGAGCCCGGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
...(((...<.<<<...))).(((((((((....((((.(((......((.(((..(((..(..((((((((....))))))))..))))......(((.......(((((.(...(...(((((((.((((......((.((....)).)).......))))...(((((((((.(((....))))))))))))....((..(((....))))).)))))))..).).))))).(((....(((...((((((.........)))))).)))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))..).....(.(((....((((....))))..)))).))..))))...((((.(((...))).))))....(((((((.......)))))))......(((((((.....[[[[[.....[...)).].......]]]]])))))..)))))))))..........(((((...a..((....(((..((((((.(((((((((.....((((((((.....))))))))....)))))))..))))))))...(((((((.....((((((.(...((((((((...((........))......))))))))...).......((....))..))))))....))).)))..))))....)).....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{..(((((((((.((((.....)))).)))))))))...{{..))}}.....}}}}}}A))).(((......((((....))))....)))...>>>.>(((((.(((((((..((.((((((..(((((((.((......((........))..........(((((((...((((.(......(((.((((.....)))).)))...)..))))...(..(((...((((((((....((((((.((....))....(((......)))...)))))).....((((.((((((..........((((((....))))))........)))))).....(((((.....)))))........)))).....))).)))...)).))).)....)))))))...))..))))))).(...((((((......(((..((..((((....))))..))....)))......))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..)))))).....((((((.........)))))).......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((...(..(.(((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..))))))))))).)..)...))))..).))...)..)..(.(.(((((....))))).).)}...........
|
[ reference ext structure ]
|
N/A
|
[ predicted structure ] |
..((((((.......))))))((((((((((..(((......(((.((((......(((..((.((((((((....)))))))).)))))....)))).)))....(((((((((((...(((((((.((((((((.((((((....)))))).).)))))))...(((((((((.(((....)))))))))))).....((.(((....))))).)))))))..((((((((.(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).((((((((....))))...))))....(((((.((.......)))))))((((((...((((((.....))))....((((((...(((((....))))).))))))....))....((((((((...)))))))).((((((((((.......))))))))))..)))))).................)))))))))))..)))))))).))).))))))))))..........(((((...(((((((((...(((((((((.(((((((((((..((((((((.....)))))))).)))))))))))..)))))))))..((((((.....((((((((((.(((((((((((..((......)))...)))))))))).)))(((.........))).)))))))....).)))))................((((((((...(...((((.........))))...))))))))).....((..(((((((.(((((((((((((((...)))))))))))))))...((....))....)))))))..)).......))))))))).)))))...............(((((((((((((.(((.(((((.(.((((((((..............................(((((((((.(((((((((...(((...)))....)))))))))..)))(((.......)))((.(((((((((((.((((((.((.........((((......))))..................(((((((.((((....((((((....)))))).))))..)))))))..((.(((((.....))))).))..)).)))))))))))).)))))....))........))))))......)))))))).)...(((((((.....(((((((..((((....))))..)))..)))).....)))))))((((((.....(((((((........)))))))...))))))..))))).))).(((((((.......)))))))............)))))))........)))))....)((((.(((..(((((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..)))))))))))))..))).)))).................(((((((....)))))))..............
|
3J2C_O
|
[ FASTA input ]
|
UGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCA |
[ reference std structure ]
|
........(.(..((...((((.(((..((((((((((((.....(((((..(((..((....)).))).)))))....))))))))))))..))).))))....))...)..)...((((((((....)))))))).......
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
...............(..((((.(((..((((((((((((.(..((((((.((((..((....)).))))))))))..)))))))))))))..))).))))).............((((((((((....)))))))))).....
|
3J2C_M
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((((....))))..........((((...((((........)))).))))..(((((.((((.....((......(((((((....))))))).........))......)))))))))........((((....))))(((..............(((......)))....)))............(((((((.......(((.....)))......)))))))..((((((((.....))))))))........((((((.....)))))).(((((((.......)))))))..............((((((((.....(((.......(((....))).........))).....))))))))...(((((..(((((((........))))))).....)))))..........(((((((.........)))))))..............))..
|
3J2C_M
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(.((...(..((((...((((((..(.......((........))...........((((.(..(....((.(((..(.(((((....))))).)....(....)...))).).).).((.(((....((.((.......(((((((......))...(((......)))...)))))........((.((((..(...((..((.......))))....)..))))..(....(.(.....).).......)..)).........).).)...)..)))))....).)))).....)...)))))).(...(.(((((.....(((..((...((......))...))....))).....))))).)......(....((((.((........)).))))....)..)...)))).....(((((((.........)))))))......).....)).)..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((((....))))...((((((((((((..((((........)))))))))..(((((.((((.....(.......(((((((....)))))))..........)......))))))))).........(((....)))(((((.............(((......)))...)))))...........(((((((.......(((.....)))......)))))))..((.(((((.....))))).))........((((((.....)))))).(((((((.......)))))))...)))))))...(((((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....)))))..........(((((((.........)))))))..............))..
|
3J2C_O
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCA |
[ reference std structure ]
|
........(.(..((...((((.(((..((((((((((((.....(((((..(((..((....)).))).)))))....))))))))))))..))).))))....))...)..)...((((((((....)))))))).......
|
[ reference ext structure ]
|
..(.....).((((((((.((((((((((((((((((((((((.(.((((.((((..(((..))).))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))).)))(..).((((((((((..)))))))))).(...) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...............(..((((((((((((((((((((((.(.(((((((.((((..((...))..))))))))))).)))))))))))))))))))))))).............((((((((((....)))))))))).....
|
3J2L_3
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)...... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((((((((((.((((((((((((.....))))))))))))...))))))))))..((((((((((.((((((((.....))))))))))))))))))..))))))).........
|
3J2L_3
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)...... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((.(((((((.((..((((..((.....))..))))..))...))))))).))(.((((((((...((((((((.....))))))))..)))))))).)))))))).........
|
3J3D_C
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.)))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((.((....)))))(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
3J3D_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.)))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((((((((......)))))))))...............(((((.......))))))))))))....
|
3J3E_7
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((......((((((......(((((..((....))..))))).......))))))(((((((((((...............)))))).........))))).)))))))))..
|
3J3E_8
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.............((.....((((((....))))))((....((((((....))))..))..(((((((..(....)..))))))).))..........................))......
|
3J3E_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..............(.........((....))((((((....(((((........)))))..(((((((..........))))))).))))))......................).......
|
3J3E_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((......((((((......((((((.((....)).)))))).......))))))(((((((((((...............))))))).........)))).)))))))))..
|
3J3F_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((................(((.(.((((((((....(((((....)))))....((((((((..(....)..)))))))))))))))).)..)))........(((((((((((.....)))))))))..))....))))).))))...
|
3J3F_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.((...((((.(((((((((((((((.................))))))))))))))).)))).....))))).......((((((.....)))))))))))))))...
|
3J3F_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))...
|
3J3F_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..(...............((((((((((((....(((((....)))))....((((((((..........)))))))))))))))).........))))...((((((((((.....)))))))))..))....))))))))))...
|
3J3V_B
|
[ FASTA input ]
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCAAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.(.....((((((((.......(((...............)))........)))))).)).((.......((.(((((...))))).)).......))...).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[.(.[)[[[[[[[[[.)]((((((..[.([....).].)]))..)))...]]]]]].]]..((((.(((((((((((...)))))))))).)))))]..].]]]]].).(.) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((...((((((((...((..((((((.......)))..)))..))....)))))).)).(((((....)))(((((....))))).........)).))))))))))....
|
3J3V_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCAAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.(.....((((((((.......(((...............)))........)))))).)).((.......((.(((((...))))).)).......))...).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[.(.[)[[[[[[[[[.)]((((((..[.([....).].)]))..)))...]]]]]].]]..((((.(((((((((((...)))))))))).)))))]..].]]]]].).(.) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((...((((((((...((((((((((.......))..))))))))....)))))).))....(......)((((((....))))))...........))))))))))....
|
3J45_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU |
[ reference std structure ]
|
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........)))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...)))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
....(((...............((((((....((((.......)))).....)))))))))
|
3J45_4
|
[ FASTA input ]
|
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU |
[ reference std structure ]
|
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........)))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...)))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
....(((((..((((..(((((((((((.((....))..))))))..))))))))))))))
|
3J46_1
|
[ FASTA input ]
|
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU |
[ reference std structure ]
|
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
|
[ reference ext structure ]
|
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
........................(((((((..(((.......)))......)))))))....
|
3J46_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU |
[ reference std structure ]
|
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
|
[ reference ext structure ]
|
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
........................(((((((..(((.......)))......)))))))....
|
3J46_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAA |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((((((((((((.((...........((((((((((...((((((((....))))))))))))))))))..........)..).))))))))))))))))...
|
3J46_p
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
3J46_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA |
[ reference std structure ]
|
.......((((((...((.....)).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(.(((((((...(.....)).)))))).).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
......((((((((..((.....))))))))))...
|
3J46_4
|
[ FASTA input ]
|
CUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAA |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((.((((.(.(...(......((..((((((...((((((((....))))))))))))))..))........)..).).)))).)))))))))))...
|
3J46_p
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((((...)))))))......((((.......)))).)))))))....
|
3J46_2
|
[ FASTA input ]
|
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA |
[ reference std structure ]
|
.......((((((...((.....)).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(.(((((((...(.....)).)))))).).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
......((((((((..((.....))))))))))...
|
3J5B_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))(((((((....)))))))....)))))))....
|
3J5B_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))..((((.......))))((((((((....))))))))...)))))))....
|
3J5N_W
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.........))))...(((.......)))((((((...........)))))).)))))))....
|
3J5N_W
|
[ FASTA input ]
|
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))((((...........))))...)))))))....
|
3J6V_A
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUCUUAAUAAACUUACACAUGCAAGCAUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAGGUUAUUAAAACUAAGAGGAGCUGGCAUCAAGCACACACCCUGUAGCUCACGACGCCUUGCUUAACCACACCCCACGGGAAACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGCACCAUACCAAAUAGGGUUAAAUUCUAACUAAGCUGUAAAAAGCCAUGAUUAAAAUAAAAAUAAAUGACGAAAGUGACCCUACAAUAGCCGACGCACUAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUACAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAAAAAAAGUAAGCGUAAUUAUGAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUCUCUACACCAAGAGAAUCAAGCACGAAAGUUAUUAUGAAACCAAUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAGAUUCAGUGCAUCUAACCCUAUUUAAACGCACUAGCUACAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
[ reference std structure ]
|
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ] |
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|
3J6V_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUCUUAAUAAACUUACACAUGCAAGCAUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAGGUUAUUAAAACUAAGAGGAGCUGGCAUCAAGCACACACCCUGUAGCUCACGACGCCUUGCUUAACCACACCCCACGGGAAACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGCACCAUACCAAAUAGGGUUAAAUUCUAACUAAGCUGUAAAAAGCCAUGAUUAAAAUAAAAAUAAAUGACGAAAGUGACCCUACAAUAGCCGACGCACUAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUACAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAAAAAAAGUAAGCGUAAUUAUGAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUCUCUACACCAAGAGAAUCAAGCACGAAAGUUAUUAUGAAACCAAUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAGAUUCAGUGCAUCUAACCCUAUUUAAACGCACUAGCUACAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
[ reference std structure ]
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|
[ reference ext structure ]
|
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[ predicted structure ] |
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|
3J7A_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA |
[ reference std structure ]
|
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
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[ reference ext structure ]
|
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).)).... ( ) ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).((((.........))))((((((......))).)))...))))))).
|
3J7A_7
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA |
[ reference std structure ]
|
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).)).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.(((....)))))))(((.........)))(((((((......))).))))..))))))).
|
3JB9_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).).................... ()
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
|
3JB9_N
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA |
[ reference std structure ]
|
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
|
[ reference ext structure ]
|
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
|
[ predicted structure ] |
(((((((................................))))))).((......(((.....)))........))..............
|
3JB9_C
|
[ FASTA input ]
|
CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).).................... ()
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
|
3JB9_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA |
[ reference std structure ]
|
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
|
[ reference ext structure ]
|
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
|
[ predicted structure ] |
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|
3JYV_7
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((([.....(..]))).((((.........)))).....(((((..)....))))))))))).....
|
[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ] |
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|
3JYV_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
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|
.((((((..((([.....(..]))).((((.........)))).....(((((..)....))))))))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((aa.{)(<.[<..})A.(((((((.....)))))))A..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
(((((((...((..........))..(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
3JYX_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUAGGUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................(.(((........))).......(..........................)......)................(((((((....))))))).......................
|
[ reference ext structure ]
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.(..)..............................().<((((({(([.....[.).}..)..(.(((.((..]].......))......))).)...))))>)...(....)...((((((((..))))))))....................... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
3JYX_3
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGUAGAGCCGACAGUAGUGUAGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
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|
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|
[ reference ext structure ]
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((((((((.....([.....((..)(((.......{(...})......)))...)....(.])((.......(((.((..(...)..)).))).......))).)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
3JYX_5
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUUGACCUCAAACAGGUAGGAGUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAAUAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGAUUGCCUUAGUAACGGCGAGUGAAGCGGCAAAAGCUCAAAUUUGAAAUCUGGUACCUUCGGUGCCCGAGUUGUAAUUUGGAGAGGGCAACUUUGGGGCCGUUCCUUGUCUAUGUCCUUGGAACAGGACGUCAUAGGGGGUGAGAAUCCCGUGUGCGAGGAGUGCGGUUCUUUGUAAAGUGCCUUCGAAGAGUCGAGUUGUUUGGGAAUGCAGCUCUAAGUGGGUGGAAAUUCAUCUAAAGCUAAAUAUUGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACAGUGAUGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUACGUGAAAUUGUUGAAAGGGAAGGGCAUUUGAUCACAUGGUGUUUUGUGCCCUCUGCUCCUUGUGGGUAGGGGAAUCUCGCAUUUCACUGGGCCAGCAUCAGUUUUGGUGGCAGGAUAAACCCAUAGGAAUGUAGCUUGCCUCGGUAAGUAUUAUAGCCUGUGGGAAUACUGCCAGCUGGGACUGAGUGAAAUGACGUAAGUCAAGGAUGCUGGCAUAAUGGUUAUAUGCCGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAACGUCUAUGCGAGUGUUUGGGUAAACCAUACGCGUAAUGAAAGUGAGCGUAGGUUGGGGCCUCGCAAGAGGUGCACAAUCGACCGAUCCUGAUGUCUUCGGAUGGAUUUGAGUAAGAGCAUAGCUGUUGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAAUAGGGUGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGUAGCGGUUUGACGUGCAAAUCGAUCGUCGAAUUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCACGAAGCUCGUUUUAUGAGGUAAGCAAUGAUUAGAGGUCGGGGUCGAAAGACCUUGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAUGUAAGAAGUCCUUGUUACUUAAUUGAACGUGGACAUUUGAAUGAGAGCUUUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGAACGUAGAGUUAAGGUGCCGGAAUACACGCUCAUCAACAAAAGGUGUUAGUUCAUCUAGACAGCCGGACGGUGGCCAUGGAAGUCGGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCGGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCCAAGCGUGUUACCUAUACUCUACCGUCAGGGUGCCCUGACGAGUAGGCAGGCGUGGAGGUCGUGACGAAGCCUGACCGUAAGGUCGGGUCGAACGGCCUCUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGGGGGAAAGGUUCCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGAUGGGGAAGCUCCGUUUCAAAGGCCUGAUUUUAUGCAGGCCACCAUCGAAGGGAAUCCGGUUAAGAUUCCGGAACCUGGUGGUUCUUCACGGUAACGUAACUGAAUGUGGAGACGUCGCGAGCCCUGGGAGGAGUUAUCUUUUCUUCUUAACAGCUUAUCACCCGAAUUGGUUUAUCCGGAAUGGGGUCUUAUGGCUGGAAGAGGCCAGCACCUUUGCUGGCUCCGGUGCGCUUGACGGCCGUGAAAAUCCACAGGAAGGAAUAGUUUUCAUGCCAGGUCGUACUGAUAACCGCAGCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUAGUUGAUAGAAUAAUGUGAUAAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUAAGUUAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCUGACUGUCUAAUUAAAACAUAGCAUUGCGAUGGUCAAAAGUGAUGUUGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGAAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCCAGUGAAAUACCACUACCUUUAUGUUUCUUUACUUAUUCAAUGAAGCGGAGCUGGAAUUAAUUUUCCACAUCCUUGUGUAUAGGGUCCCAUUCGGGGCUGAUCCGGGUUGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCCAUCUGUUAAACGAUAACGCAGAUGUCCUAAGGGGGGCUCAUGGAGAACAGAAAUCUCCAGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCCCCCUUGAUUUUGAUUUUCGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGCCUCGAAUUUGAGGCUAGAGGUGCCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUGUUACCGCAAUAGUAAUUGAACUUAGUACGAGAGGAACAGUUCAUUCGGAUAAUUGGUUUUUGCGGCUGUCUGAUCAGGCAUUGCCGCGAAGCUACAUCCGCUGGAUUAUGGCUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUAGAACGCGGUGAUUUCUUUGCUCCACACAAUAUGUACCUUUUGUAUAAUGGCGUCCUUGUGGCGUCUACCUUUUGUAUAAUGCUAGCAACGGUGCACUUGGCGGAAAGGCCUUGGGUGCUUGCUGGCGUGAAAUUGAACUAUUUUGCGUGGGGAAAAUCAUUUGUAUACGACUUAGAUGUACAAGGGGUAUUGUAAGCAGUAGAGUAGCCUUGUUGUUACGAUCUGCUGAGAUUACCUUUUGUCUGAUUUGU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
N/A
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[ predicted structure ] |
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3JYX_5
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[ FASTA input ]
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3JYX_3
(ext)
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3JYX_4
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3KIY_A
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[ reference std structure ]
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|
[ reference ext structure ]
|
N/A
|
[ predicted structure ] |
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|
3KTW_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUC |
[ reference std structure ]
|
.(((....((..((((.((((((....)))))).))))...))......((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))
|
[ reference ext structure ]
|
.((..((.(((<((((.((((([..{(]))))).))))(>))).)....(((((.(...((.(..(((....})))).)..))))))))))..).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..(.((((.....)))).).(((.(((..........))).)))..))))))
|
3KTW_C
|
[ FASTA input ]
|
AGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUC |
[ reference std structure ]
|
.(((....((..((((.((((((....)))))).))))...))......((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))
|
[ reference ext structure ]
|
.((..((.(((<((((.((((([..{(]))))).))))(>))).)....(((((.(...((.(..(((....})))).)..))))))))))..).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..(.((((.....)))).).(((.(((..........))).)))..))))))
|
3LA5_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((([..((((((......{{.))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]..]]]))))))..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
|
3LA5_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((([..((((((......{{.))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]..]]]))))))..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
|
3NDB_M
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGAC |
[ reference std structure ]
|
.(((.(..(((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))).....).))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.((((((((((.((((((((((([.((((((((({.(}))))))))).(])))))...((((((((....((((..((((...))))).).)))))))))))))))))))).)))))))....)))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(..(((.....(((....))).....)))).)))))).))))))..))))))))...)))))))
|
3NDB_M
|
[ FASTA input ]
|
GUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGAC |
[ reference std structure ]
|
.(((.(..(((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))).....).))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.((((((((((.((((((((((([.((((((((({.(}))))))))).(])))))...((((((((....((((..((((...))))).).)))))))))))))))))))).)))))))....)))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(..(((.....(((....))).....)))).)))))).))))))..))))))))...)))))))
|
3NKB_B
|
[ FASTA input ]
|
GGUCCGCAGCCUCCUCGCGGCGCAAGCUGGGCAACAUUCCGAAAGGUAAUGGCGAAUGCGGACC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.[[....))).......]]....((((((....)).)))).....))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((({{..).))).......}..[}(.((((((..))).)))])....)))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((......((((....))))......(((((....)).))))))...))))))))
|
3NKB_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUCCGCAGCCUCCUCGCGGCGCAAGCUGGGCAACAUUCCGAAAGGUAAUGGCGAAUGCGGACC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.[[....))).......]]....((((((....)).)))).....))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((({{..).))).......}..[}(.((((((..))).)))])....)))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((......((((....))))......(((((....)).))))))...))))))))
|
3NMU_E
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUUGAAGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC |
[ reference std structure ]
|
............(...((....))......)...
|
[ reference ext structure ]
|
............((((((....))...))))...
|
[ predicted structure ] |
.........((((...((....))......))))
|
3NMU_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUUGAAGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC |
[ reference std structure ]
|
............(...((....))......)...
|
[ reference ext structure ]
|
............((((((....))...))))...
|
[ predicted structure ] |
.........((((...((....))......))))
|
3NPB_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUAUCAAGAGAAGCAGAGGGACUGGCCCGACGAAGCUUCAGCAACCGGUGUAAUGGCGAAAGCCAUGACCAAGGUGCUAAAUCCAGCAAGCUCGAACAGCUUGGAAGAUAAGAAC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((...(((.[[[[)))......))))).((..(((((...((((......)))).)))..)).))....(]]]]((.((.......)).))..))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((((.()(((.[[[[)))......))))).)).()(((((..((((((..))))))))))..)........(]]]]((.((.......)).))..)))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....(((((.(.(((.....)))..)...)))))(((.(((((..(.(((((....))))).)))..))))))....(...((((((.....)))))))..)))))))))
|
3NPB_A
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUAUCAAGAGAAGCAGAGGGACUGGCCCGACGAAGCUUCAGCAACCGGUGUAAUGGCGAAAGCCAUGACCAAGGUGCUAAAUCCAGCAAGCUCGAACAGCUUGGAAGAUAAGAAC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((...(((.[[[[)))......))))).((..(((((...((((......)))).)))..)).))....(]]]]((.((.......)).))..))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((((.()(((.[[[[)))......))))).)).()(((((..((((((..))))))))))..)........(]]]]((.((.......)).))..)))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....(((((.(.(((.....)))..)...)))))(((.(((((..(.(((((....))))).)))..))))))....(...((((((.....)))))))..)))))))))
|
3O58_3
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((([..(.....]))....((..((.........)............))...).).)))....(((...))).((((((((....))))))))......................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{((((([((.<<....<).]..)>((.(.(.........>.>..........))...))..))))}))(((...)))(((((((((....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.............................((...............(........)))....((((((((.....................................))))))))(((((((((....))))))))).....................
|
3O58_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.......................))....)))))).)).(((((.......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....({((........[...(.]..)....)}.).))))))).)).(((((......(((((((.((....)))))))))....))))).))))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((....(...((..............))....).....)))))).))((((((....((.(((((.(((....))))))))...))))))))))))))))).
|
3O58_3
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((([..(.....]))....((..((.........)............))...).).)))....(((...))).((((((((....))))))))......................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{((((([((.<<....<).]..)>((.(.(.........>.>..........))...))..))))}))(((...)))(((((((((....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.............................((...............(........)))....((((((((.....................................))))))))(((((((((....))))))))).....................
|
3O58_2
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.......................))....)))))).)).(((((.......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....({((........[...(.]..)....)}.).))))))).)).(((((......(((((((.((....)))))))))....))))).))))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((....(...((..............))....).....)))))).))((((((....((.(((((.(((....))))))))...))))))))))))))))).
|
3OVB_D
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((.(((((((.......))))))).))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((((((.......))))))).))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))))))))))....
|
3OVB_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((.(((((((.......))))))).))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((.(((((((.......))))))).))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))))))))))....
|
3OVS_D
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((((.......))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((...)..))))))))))))...
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))))))))))...
|
3OVS_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((((.......))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((...)..))))))))))))...
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))))))))))...
|
3P22_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGUUUUUCCUUCGAAAGAAGGUUUUUAUCCCAGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.....(((((....))))).......)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.....((((((..)))))).......)))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((.(...(((((....))))).....).)))))).
|
3P22_G
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGUUUUUCCUUCGAAAGAAGGUUUUUAUCCCAGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.....(((((....))))).......)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.....((((((..)))))).......)))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((.(...(((((....))))).....).)))))).
|
3PDR_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGAUGCUUGUCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((((.[[[..[[[..[[[[[[[[......[[[[[[(((((....((((....))))....))))).....[[[[[[[[[......)]]]]]]]]]..].]]]]].((........))....]]]]]]]].]]]...]]]..))....))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.<<<<<<<<<.<<<<<<<<<a(.A.<<<<<<[[[[[[...[[[[..)(]]]]...]]]]]].{...{{{{{{{{b.{...))B}}}}}}}}}.>.>>>>>(((........)))).>>>>>>>>>>>>>>.>>>>..].().}))))))). ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...(..(((((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).((((....))))....)))))))).))).....))..)...)))))))).
|
3PDR_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGAUGCUUGUCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((((.[[[..[[[..[[[[[[[[......[[[[[[(((((....((((....))))....))))).....[[[[[[[[[......)]]]]]]]]]..].]]]]].((........))....]]]]]]]].]]]...]]]..))....))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.<<<<<<<<<.<<<<<<<<<a(.A.<<<<<<[[[[[[...[[[[..)(]]]]...]]]]]].{...{{{{{{{{b.{...))B}}}}}}}}}.>.>>>>>(((........)))).>>>>>>>>>>>>>>.>>>>..].().}))))))). ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...(..(((((..((((((((......(((((.(((((....((((....))))....)))))....((((((((((.......))))))))))...))))).((((....))))....)))))))).))).....))..)...)))))))).
|
3R4F_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC |
[ reference std structure ]
|
((((.((((((((.......((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))...((((((....))))))))))
|
3R4F_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC |
[ reference std structure ]
|
((((.((((((((.......((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))...((((((....))))))))))
|
3R9X_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((.(......).)))))))...........
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(.(...)).)))))))........... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))...........
|
3R9X_C
|
[ FASTA input ]
|
CAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((.(......).)))))))...........
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(.(...)).)))))))........... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))...........
|
3RKF_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))
|
3RKF_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))))))
|
3SD1_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.((.((((((((((.....((.(((((((...........)))))))))...(((....))).)))))))))))).....)))).
|
3SD1_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.((.((((((((((.....((.(((((((...........)))))))))...(((....))).)))))))))))).....)))).
|
3SIU_F
|
[ FASTA input ]
|
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.....))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(((((..).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((......(.....)...))))))
|
3SIU_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.....))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(((((..).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((......(.....)...))))))
|
3SN2_B
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((......)))))))))))
|
3SN2_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((......)))))))))))
|
3TRZ_Z
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((.......)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.......)))))(.).
|
[ predicted structure ] |
((((((.....))))))....
|
3TRZ_Z
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((.......)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.......)))))(.).
|
[ predicted structure ] |
((((((.....))))))....
|
3TS0_U
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.....)))))))....
|
3TS0_U
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.....)))))))....
|
3TS2_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((..........)))))....
|
3TS2_V
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((..........)))))....
|
3U4M_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(<.[[){{{{{{{{{{...{{{{{{{{{{....)]}}}}}}}}}}}}}}........>]}}}}}})))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(.........(((..((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).)..........)))))..))))
|
3U4M_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(<.[[){{{{{{{{{{...{{{{{{{{{{....)]}}}}}}}}}}}}}}........>]}}}}}})))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(.........(((((((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).)..........)))))))))))
|
3UZL_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA |
[ reference std structure ]
|
((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(((..(<[<..().)))(((((((.....)))))))(((...)))..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
3UZL_B
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA |
[ reference std structure ]
|
((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(((..(<[<..().)))(((((((.....)))))))(((...)))..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
3VJR_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUAAGCGGUUCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
3VJR_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUAAGCGGUUCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
3W1K_J
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUAGAUAGGCGCUGGUGUGCCUCCUAGACUUCAAAUCUACGGUCUCGCUAUUUAAGCGAGAGGUGGGUUCGAUUCCCACAUACUCCCG |
[ reference std structure ]
|
(((((((....(((((..[.))))).((((((.......)))).))(((((((.....))))))).{{{{{..]....}}}}}.))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((...((((([[{.))))).(((((((.....))))).))((((((((...)))))))).<<<<<<]}.>].>>>>>)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...((((((....))))))((((((.......)))).))(((((((.....))))))).(((((.......))))).))))))).
|
3W1K_J
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUAGAUAGGCGCUGGUGUGCCUCCUAGACUUCAAAUCUACGGUCUCGCUAUUUAAGCGAGAGGUGGGUUCGAUUCCCACAUACUCCCG |
[ reference std structure ]
|
(((((((....(((((..[.))))).((((((.......)))).))(((((((.....))))))).{{{{{..]....}}}}}.))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((...((((([[{.))))).(((((((.....))))).))((((((((...)))))))).<<<<<<]}.>].>>>>>)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...((((((....))))))........((.(((((((.((((((((.....))))))))))))))).))........))))))).
|
3W3S_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC |
[ reference std structure ]
|
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.....((((....))))..((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((.......)))))))))))))...
|
3W3S_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC |
[ reference std structure ]
|
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...(.((((....)))).)((((((.......))))).)(((((((((....))))))))).(((((.......)))))))))))))...
|
3WC1_P
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((........(((((((...........))))))).......(((((.......))))))))))))..
|
3WC1_P
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((.((((((((((.((.....)).))))))).))).))(((((.......))))))))))))..
|
3WQY_C
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.......((((((((((((.((((((((...)))))))).))..))))...)))))))))))))....
|
3WQY_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.......(((((((((((((((((((((...))))))))))))..)))...)))))))))))))....
|
3ZEX_C
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...............................................................................................................((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..)))................
|
3ZEX_G
|
[ FASTA input ]
|
GUGAGAUUGUGAAGGGAUCUCGCAGGCAUCGUGAGGGAAGUAUGGGGUAGUACGAGAGGAACUCCCAUGCCGUGCCUCUGGUUUCUGGAGUUUGUCGAAGGGCAAGUGCUCCGACGCUAUCGCACGGUGGUUCUCGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAACCAGUCCCAAGACCGGGUGCCCG |
[ reference std structure ]
|
...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
...((((((....).)))))....(((((((..(((((.(.(((((.((.((((..)))))).)))))).((((((...((((...((((((((((....)))))..))))).).))))..))))).((((((.(((((()((.))..)..)))))).)))).))))).....))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.......)))))))).((((((....((((.((((((((..((.(....)..)))))))))).......(((((((((((.....((((..((((....)))))))).((((......))))......................))))))))))))))).......))))))..
|
3ZEX_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGGAAAUGCGAAACACUUGCCAGGUGACCCAUCCAUCCUCCCACGGUGAGCUUUCUUUUCACCAUAAUCCACAUCUCCGGCCUUGCUGGGGCUUGGGCCUCUCGACUUCUCGCGUUACUCGGAGCGGGGGCUCAAGAUUGAAAAAUGCAGCUCACCCUACGUACUGUCCUUUGUUGUGAGUUCGGCGCAUUAAAGCAAAAACCUGGGGUG |
[ reference std structure ]
|
((....))........((....(.(...((...(((........((((((.......)))))....((...((.............))(..((((........(((.......)))........))))...)....)).......((..((.........))..)).).......))).....)).........))..))..........
|
[ reference ext structure ]
|
(((..)))......((((.((.(.((((((...((((.(((.((((((((.......)))))(..((((..((.............))(((((((((.((...(((.[..(.])))..).)).)))))).))...))))....)(((.(((().....()))).)))))).)))))))....)))......)))))))))).)....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...................((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((.(.(((.............)))))))))))))))..))))))....))))))))............((((((((((.......)))))))))).....))))))....
|
3ZEX_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAACUGCAGACCGUACUCAUCACCGCAUCAGGUCCCCAAGCAUCGAAUGCUCUGGUAACAUAGAGAAAGGUACACUCAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUGCGUAAGUUCGCAAGAAGCAUUGGCUCUGAGGGCAAAGUGGGGGUCCACAGGAGGGCCAGUGUCCUUUGAAGGCUACCCUCCCGAGCCGUAUCUACUAACCUCCUUCUGGUGUGUUGUUUUUACGUCUCACUCCCGCGCAGGUGUUUUCGCUUCCUUUUUUUGGUUGCGCACCUACAAAUUGCCAACUCAGAACUGCUUACGGCGGGGAAUCCAACUGUAUAAUUAAAACAUAGGUUUGUGAUGCAUCCAAGUGGUGUAUGUCGCAAACUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAACGUGAGAGAUUCACCGACGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCUUCCAAUUAGAGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUCCCUCUGUCCCGAGUUACUAUCUAGCGAAACGACAGUCAAGGGAACGGACUUGAAGGGCUAAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGUUUGACUCCAGUCUGGCUCUGUGCGGCGACUUUGGAGGUGUAGUAUAGGUGGAAGCGCAAGCUCAAAUGAAAUACCACCACUCGGAACGUUGCUUCACUUAUCGAAUGAAGAGACCAAUGGUUGUUUUGCGCAGUCUUCGGGCUGUGCGCCGUCUAGGCUGGGCAUAAUUGUGGUGUUUCUUUCACCGCCACGGGAGGGGUGUUGGUUUUUUAUCCUCCUCUCCGUUUCUCCUUUUCUCUCUUUCUCCCUUUUUUUGGGCGUUUGAGGGUUGGUGACCCGUGGGCGCCCACGCGUGCGGAACUACUGCGCCAACGGGGUGGGAACUUUUCGUUUCUUCUCCGGAGUCUUGUUUCGAGACAUCUGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCAUAUCUGUUACACGACAACGCAGGUGUCCUAAGGCGAGCUCAGUGGGAACAGAAAUCUCACGUGGAACACAAGCGUAAAUGCUUGCUUGAUUAACGAUUUCCAGUACGAAUCGAGACUGCGAAAGCAAGGCCAGCGAUCCUUUGCGAAGAACAGGAAAUAUGAACAAAUCAUACCAGAGGUGUCAGAAUAAUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAACCUAGCGCCGCAGAAGACGCUAAGGGUUGGAUUGUUCACCCACUGACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUGGUUUUACCCUACUUGGCUGGAGAUUGCGAGUAAAAGAUUAUCCGCGCAAAGCGGAGGCAGUCCGUUUUUUUCUGGGUCUGCCGUUCGGUGGCAUGUGCUUGGCGCUGCCAUCUC |
[ reference std structure ]
|
.........................((......))......((((.....)))).........((((....((((..(((.((..(....(.......(((((....(....).....)))))((.(((((((((...((((((........((((....(((.((((..)))).)))))))..(((.((((...(.((.................)).)..)))).)))..))))))...((((....(((..((.......))..)))))).).......)))..)))))).))(.).......((((((((....((.........))...(..((((....((((.....))))......))))..)...(((.(((...((.((.....((....(((.......)))....))..)).)..).)))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))).....).))))))).)..))).))).)))).)))).........(..[[[[[......).]]]]]....(((((..(((.(........(((..((((...(((((.(((((((...((..(((.((.((.((........(...aaaa..((....))..........).AAAA...))).)..)).)))..))....((((.....((......(...((...((((((((....))))))))...).))..((.((((........((((.......))))..((((((..((......((.....))..)).((.((...((((.....(.(((...............))).)...))))...)).))))))))...))))....))...................((((.((((((.....)))))).)))).....))...))))........)))))))..)))))..(((.......)).)((((((...........))))))((.{...{{{{{{{.(.((((((.......))))))...).{{)(..((}}....}}}}}}}....(....(((<....(..>)))...)..((......)).}))..)......((((...............(((.......)))..)))).....)).....)))..).)))........(..(.(.((((((...((.......))...))))))...))...).......((((..((((((...((((((.(......).))))..))..(((.(.....).))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).)))).....)..))).)))))........................(((((.....)))))(((((((((........)))).)))))....((((((..((((...)))).))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
....(((((((((((..........................((((.....))))...............................................(((......)))......................................(((((((....)))))..............))..................................................(((((((.((((.....((..((.......))..)).).................(((((.........(((((.(((((.....................(((((((((((((((.....)))))..))))))))))))))))))))......)))))...................)))...)))))))........((((((.......)))))).............((((..((((((.......)))))).))))................(((((((((((......................)))))...))))))...........((((.(((((((........))))))).))))....((((((((((.........................................................................((.(((((.........))))).))..............((((((((....)))))))).....)))))))))).........((((.......))))...(((.((((((.................))))))))).............................((((((((((((((((...))))))))))))))))......(.........)......((((((((((((.....))))))))))))..((((((...))))))..................................((((((((((((((.......................(((((((((.......))))))........(((((......))))).........(((((.........)))))...............((((((((((((((........................................................))))))))))))))......................((((((((.............)))))))).......(((((((((((((......)))))))..)))))).............)))..........................))))))))))))))..........................................(((((.....)))))...................))))))))))).(((((((.((((...)))))))))))..
|
3ZEX_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((....(..((((((......)))..)))..).....)))))).))((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).
|
3ZEX_H
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UUUUGUCCCUCUCCAAACGAGAGUACAUGCAUGGGCUGGCAUGAGCGGCACGCUCCACGACCGUGGGGCUCGAGGGGCACUUUACGUCCCGAGGCGCUGAACCUUGAUGCUUGGAAUUUCAUGCUCAGGGACUUU |
[ reference std structure ]
|
.....(....(.......)......(.....(..(...(......(((...(((((((....))))))).......(...(...........)...)......))).....)......)...)....).).....
|
[ reference ext structure ]
|
...(((...[(](....))...(..(..((((.((...(.(...((((..((((((((....)))))))).(...((((.(...........).))))...).))))..).)......))..)))).)))).).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((((((((.......).....(((((........)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((................))))))))..)))))...
|
3ZEX_H
|
[ FASTA input ]
|
UUUUGUCCCUCUCCAAACGAGAGUACAUGCAUGGGCUGGCAUGAGCGGCACGCUCCACGACCGUGGGGCUCGAGGGGCACUUUACGUCCCGAGGCGCUGAACCUUGAUGCUUGGAAUUUCAUGCUCAGGGACUUU |
[ reference std structure ]
|
.....(....(.......)......(.....(..(...(......(((...(((((((....))))))).......(...(...........)...)......))).....)......)...)....).).....
|
[ reference ext structure ]
|
...(((...[(](....))...(..(..((((.((...(.(...((((..((((((((....)))))))).(...((((.(...........).))))...).))))..).)......))..)))).)))).).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((((((.....)).....(((((........)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((..(((..((((................)))).)))..)))))...
|
3ZEX_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGAAUCGCCACUUCUCUUAUCUGGGUGCUCUGCCCGCCCUUGUCGGCGCCCAGUACCUUCAUUUUCACAAGAU |
[ reference std structure ]
|
..................................((((......)))).........................
|
[ reference ext structure ]
|
..................(..(.........[(((((((.().))))))].)..).)................ ( )
|
[ predicted structure ] |
....................(((((((((...............)))))))))....................
|
3ZEX_B
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAACUGCAGACCGUACUCAUCACCGCAUCAGGUCCCCAAGCAUCGAAUGCUCUGGUAACAUAGAGAAAGGUACACUCAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUGCGUAAGUUCGCAAGAAGCAUUGGCUCUGAGGGCAAAGUGGGGGUCCACAGGAGGGCCAGUGUCCUUUGAAGGCUACCCUCCCGAGCCGUAUCUACUAACCUCCUUCUGGUGUGUUGUUUUUACGUCUCACUCCCGCGCAGGUGUUUUCGCUUCCUUUUUUUGGUUGCGCACCUACAAAUUGCCAACUCAGAACUGCUUACGGCGGGGAAUCCAACUGUAUAAUUAAAACAUAGGUUUGUGAUGCAUCCAAGUGGUGUAUGUCGCAAACUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAACGUGAGAGAUUCACCGACGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCUUCCAAUUAGAGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUCCCUCUGUCCCGAGUUACUAUCUAGCGAAACGACAGUCAAGGGAACGGACUUGAAGGGCUAAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGUUUGACUCCAGUCUGGCUCUGUGCGGCGACUUUGGAGGUGUAGUAUAGGUGGAAGCGCAAGCUCAAAUGAAAUACCACCACUCGGAACGUUGCUUCACUUAUCGAAUGAAGAGACCAAUGGUUGUUUUGCGCAGUCUUCGGGCUGUGCGCCGUCUAGGCUGGGCAUAAUUGUGGUGUUUCUUUCACCGCCACGGGAGGGGUGUUGGUUUUUUAUCCUCCUCUCCGUUUCUCCUUUUCUCUCUUUCUCCCUUUUUUUGGGCGUUUGAGGGUUGGUGACCCGUGGGCGCCCACGCGUGCGGAACUACUGCGCCAACGGGGUGGGAACUUUUCGUUUCUUCUCCGGAGUCUUGUUUCGAGACAUCUGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCAUAUCUGUUACACGACAACGCAGGUGUCCUAAGGCGAGCUCAGUGGGAACAGAAAUCUCACGUGGAACACAAGCGUAAAUGCUUGCUUGAUUAACGAUUUCCAGUACGAAUCGAGACUGCGAAAGCAAGGCCAGCGAUCCUUUGCGAAGAACAGGAAAUAUGAACAAAUCAUACCAGAGGUGUCAGAAUAAUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAACCUAGCGCCGCAGAAGACGCUAAGGGUUGGAUUGUUCACCCACUGACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUGGUUUUACCCUACUUGGCUGGAGAUUGCGAGUAAAAGAUUAUCCGCGCAAAGCGGAGGCAGUCCGUUUUUUUCUGGGUCUGCCGUUCGGUGGCAUGUGCUUGGCGCUGCCAUCUC |
[ reference std structure ]
|
.........................((......))......((((.....)))).........((((....((((..(((.((..(....(.......(((((....(....).....)))))((.(((((((((...((((((........((((....(((.((((..)))).)))))))..(((.((((...(.((.................)).)..)))).)))..))))))...((((....(((..((.......))..)))))).).......)))..)))))).))(.).......((((((((....((.........))...(..((((....((((.....))))......))))..)...(((.(((...((.((.....((....(((.......)))....))..)).)..).)))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))).....).))))))).)..))).))).)))).)))).........(..[[[[[......).]]]]]....(((((..(((.(........(((..((((...(((((.(((((((...((..(((.((.((.((........(...aaaa..((....))..........).AAAA...))).)..)).)))..))....((((.....((......(...((...((((((((....))))))))...).))..((.((((........((((.......))))..((((((..((......((.....))..)).((.((...((((.....(.(((...............))).)...))))...)).))))))))...))))....))...................((((.((((((.....)))))).)))).....))...))))........)))))))..)))))..(((.......)).)((((((...........))))))((.{...{{{{{{{.(.((((((.......))))))...).{{)(..((}}....}}}}}}}....(....(((<....(..>)))...)..((......)).}))..)......((((...............(((.......)))..)))).....)).....)))..).)))........(..(.(.((((((...((.......))...))))))...))...).......((((..((((((...((((((.(......).))))..))..(((.(.....).))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).)))).....)..))).)))))........................(((((.....)))))(((((((((........)))).)))))....((((((..((((...)))).))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
....(((..................(((((...........((((.....))))...........(((((((........................((((((((......).............((((.......................(((((((....))))))..............).)))).))))))).............................(((.....(((((((.((((.....((..((.......))..))...................(((((.........(((((.(((((.....(...........)...((((((((((((((.(....)))))..))))))))))))))))))))......)))))..................))))...))))))).....)))((((((.......)))))).............((((..((((((.......)))))).))))................(((((((((((....((((.....)))).....)))))...))))))((((((.((.(((((.(((((((........))))))).)))))...)).))))))......................................(((....))).....((((((((((..........(((.(((((.........))))).))).............((((((((....))))))))......................))))))))))...........(.(((((((.................))))))))...............)))))))........((((((((((.((((.....)))).))))))))))....)))))..............(((((.((((((.....)))))).)))))..((((((...)))))).....(((((.......)))))............(((((((.((((((..........................((((((.......))))))........((((((....)))))).........(((((.........)))))...............((((((..(((((..................(((.......)))...........................)))))..))))))....................((((....))))........................(.(((((((((((.(......).)))))..))))))).........................................)))))).)))))))..........................................(((((.....)))))(((((.((...........)).)))))))).(((((((.((((...)))))))))))..
|
3ZEX_F
|
[ FASTA input ]
|
CGAAUCGCCACUUCUCUUAUCUGGGUGCUCUGCCCGCCCUUGUCGGCGCCCAGUACCUUCAUUUUCACAAGAU |
[ reference std structure ]
|
..................................((((......)))).........................
|
[ reference ext structure ]
|
..................(..(.........[(((((((.().))))))].)..).)................ ( )
|
[ predicted structure ] |
....................(((((((((...............)))))))))....................
|
3ZEX_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUGAGAUUGUGAAGGGAUCUCGCAGGCAUCGUGAGGGAAGUAUGGGGUAGUACGAGAGGAACUCCCAUGCCGUGCCUCUGGUUUCUGGAGUUUGUCGAAGGGCAAGUGCUCCGACGCUAUCGCACGGUGGUUCUCGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAACCAGUCCCAAGACCGGGUGCCCG |
[ reference std structure ]
|
...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
...((((((....).)))))....(((((((..(((((.(.(((((.((.((((..)))))).)))))).((((((...((((...((((((((((....)))))..))))).).))))..))))).((((((.(((((()((.))..)..)))))).)))).))))).....))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.......)))))))).((((((....((((.((((((((...............)))))))).......(((((((((((............(((.......((((.((((((....))))))..))))......)))......))))))))))))))).......))))))..
|
3ZEX_E
|
[ FASTA input ]
|
UGGAAAUGCGAAACACUUGCCAGGUGACCCAUCCAUCCUCCCACGGUGAGCUUUCUUUUCACCAUAAUCCACAUCUCCGGCCUUGCUGGGGCUUGGGCCUCUCGACUUCUCGCGUUACUCGGAGCGGGGGCUCAAGAUUGAAAAAUGCAGCUCACCCUACGUACUGUCCUUUGUUGUGAGUUCGGCGCAUUAAAGCAAAAACCUGGGGUG |
[ reference std structure ]
|
((....))........((....(.(...((...(((........((((((.......)))))....((...((.............))(..((((........(((.......)))........))))...)....)).......((..((.........))..)).).......))).....)).........))..))..........
|
[ reference ext structure ]
|
(((..)))......((((.((.(.((((((...((((.(((.((((((((.......)))))(..((((..((.............))(((((((((.((...(((.[..(.])))..).)).)))))).))...))))....)(((.(((().....()))).)))))).)))))))....)))......)))))))))).)....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...................((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((.(.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))............((((..((((.......))))..)))).....))))))....
|
3ZEX_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...............................................................................................................((((((((((((.(((((....))))).)))))))))..)))................
|
3ZEX_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..........(((......))).............))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).
|
3ZND_W
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...)))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.(((((.(((.....)))..)))))))))))))(((((.......))))))))))))....
|
3ZND_W
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...)))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.(((((.(((.....)))..)))))))))))))(((((.......))))))))))))....
|
4A1C_2
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
............((((...............))))................(((...((((((.(((...))).))))))....)))...............((((.((((((.((((((((......))))))))))))))))))........
|
4A1C_3
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((............))))..)))...)))))))..((((((......((.((((((....)))))))).....)))))))))))))))..
|
4A1C_3
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((............))))..)))...)))))))..((((((......((.((((((....)))))))).....)))))))))))))))..
|
4A1C_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
............((((...............))))................(((...((((((.(((...))).))))))....)))...............((((.((((((.((((((((......))))))))))))))))))........
|
4A4U_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
4A4U_A
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
4AOB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(((((((.......))))....)))..(((.((((....)))))))..(((((....))))).........)))))))).
|
4AOB_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(((..(.........)......)))..(((.((((....)))))))..(((((....))))).........)))))))).
|
4ATO_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA |
[ reference std structure ]
|
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(((...[[[[[)))....]]]]]..... ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
............((..((....)).))......
|
4ATO_G
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA |
[ reference std structure ]
|
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(((...[[[[[)))....]]]]]..... ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
...........((((.((....)))))).....
|
4BW0_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA |
[ reference std structure ]
|
(((...(((....)))......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)))))...))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((...(((....)))......))).
|
4BW0_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA |
[ reference std structure ]
|
(((...(((....)))......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)))))...))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((...(((....)))......))).
|
4BY9_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((........................((((....))))........................))))))
|
4BY9_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((........((.....((.......((((....))))........)).....)).......))))))
|
4BYQ_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG |
[ reference std structure ]
|
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((.........(((((((((((.....((((((((....))))))))..)))))))..........)))))))))))))
|
4BYQ_N
|
[ FASTA input ]
|
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG |
[ reference std structure ]
|
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((.(.........((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).))..........))))).)))))))
|
4C4Q_N
|
[ FASTA input ]
|
GACUAGCCGUAGUGGCGAGCUCCCUGGGUGGUCUAAGUCCUGAGUACAGGACAGUCGUCAGUAGUUCGACGUGAGCACUAGCCCACCUCGAGAUGCUACGUGGACGAGGGCAUGCCCAAGACACACCUUAACCCUGGCGGGGGUCGCUAGGGUGAAAUCACAUUAUGUGAUGGGGGUACGACCUGAUAGGGUGCUGCAGAGGCCCACUAGCAGGCUAGUAUAAAAAUCUCUGC |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((..((((((((.(((.((....)).))).))))...))))....)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).)).(((....))).((..[[[[.))))))))...))))))).........]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((((((..))))))).))))...)))))...)))))(((....))).))))).))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).))(((((..)))))((..[[[[[))))))))...)))))))........]]]]]. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((..(((.(((((((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((.((....)).))).))))...)))))...)))))(((....))).)))).)))))(.(((((((((.....))))))))).).((((((...))))))................)))).)))........)))))).).)))))))..............
|
4C4Q_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUAGCCGUAGUGGCGAGCUCCCUGGGUGGUCUAAGUCCUGAGUACAGGACAGUCGUCAGUAGUUCGACGUGAGCACUAGCCCACCUCGAGAUGCUACGUGGACGAGGGCAUGCCCAAGACACACCUUAACCCUGGCGGGGGUCGCUAGGGUGAAAUCACAUUAUGUGAUGGGGGUACGACCUGAUAGGGUGCUGCAGAGGCCCACUAGCAGGCUAGUAUAAAAAUCUCUGC |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((..((((((((.(((.((....)).))).))))...))))....)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).)).(((....))).((..[[[[.))))))))...))))))).........]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((((((..))))))).))))...)))))...)))))(((....))).))))).))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).))(((((..)))))((..[[[[[))))))))...)))))))........]]]]]. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((..((((((((((((((((...((((((....))))))..(((((.((((((((((((((((....))))))))))))...))))...)))))(((....))).............((((((((((...))))))))))...((((((...))))))........))))))))))))))))........)))))).).)))))))..............
|
4C4W_H
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC |
[ reference std structure ]
|
(((...(((((..........)))))......)))
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((..........))))))...).))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((......)))).....((((....))))..
|
4C4W_H
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC |
[ reference std structure ]
|
(((...(((((..........)))))......)))
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((..........))))))...).))) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(..........)....................
|
4C7O_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((((....)))))).))))).).))))))))
|
4C7O_E
|
[ FASTA input ]
|
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((....)))).)).))))).).))))))))
|
4CXG_1
|
[ FASTA input ]
|
CGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAA |
[ reference std structure ]
|
.(..((.(..(.((.((..(.(.(.((((.(((..(.((..(.....(...((((((((.(.........).)))))))).....).....)..)).)..))).)))).).))..)).)).)...).))...).. ( )
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.(..(.((.(((((.(.(.((((.(((..(.((((((((..(...((((((((.(.........).)))))))).....)..)))))))).)..))).)))).).)))))).)).)().).)).))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
|
4CXG_a
|
[ FASTA input ]
|
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG |
[ reference std structure ]
|
.(.((....)).)...........................(.....).
|
[ reference ext structure ]
|
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
|
[ predicted structure ] |
................................................
|
4CXG_Y
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(..(((.((((((((((((((......))))).)))))))))..))).).))))))))....
|
4CXG_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAA |
[ reference std structure ]
|
.(..((.(..(.((.((..(.(.(.((((.(((..(.((..(.....(...((((((((.(.........).)))))))).....).....)..)).)..))).)))).).))..)).)).)...).))...).. ( )
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.(..(.((.(((((.(.(.((((.(((..(.((((((((..(...((((((((.(.........).)))))))).....)..)))))))).)..))).)))).).)))))).)).)().).)).))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..........(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).............
|
4CXG_Y
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((......(...(((((((((.(((((((......))))).)).))))))..))).).))))))))....
|
4CXG_a
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG |
[ reference std structure ]
|
.(.((....)).)...........................(.....).
|
[ reference ext structure ]
|
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
|
[ predicted structure ] |
................................................
|
4CXG_2
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG |
[ reference std structure ]
|
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.((((((((..(((.......)))..))))))..))))).).... () ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((.......)))))...(..((((....))))....)........
|
4CXG_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG |
[ reference std structure ]
|
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.((((((((..(((.......)))..))))))..))))).).... () ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((......))))..........((((....)))).............
|
4ENB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
......((((((........(.(((((....))))).)..)))))).....
|
4ENB_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
......((((((..........(((((....)))))....)))))).....
|
4ENC_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((((........(.(((((....))))).)..)))))).....
|
4ENC_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((((........(.(((((....))))).)..)))))).....
|
4FNJ_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG |
[ reference std structure ]
|
(.((.(((..((((((....))))).)))).)).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((.((((()((((((..))))))).))).)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((......(((((((.......)))))))))..
|
4FNJ_A
|
[ FASTA input ]
|
CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG |
[ reference std structure ]
|
(.((.(((..((((((....))))).)))).)).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((.((((()((((((..))))))).))).)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((.(((...(((((....)))))..))).))..
|
4FRG_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...{(.}.((((...<(.(((([(..]..)))))(>(((((..)))))(((((.).).)))))..))))).)))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((...........((((.......))))...((((....)))).(((.......))).))))....)))))).
|
4FRG_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...{(.}.((((...<(.(((([(..]..)))))(>(((((..)))))(((((.).).)))))..))))).)))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((....(((..(((((((....(((((......))))).....))).))))..)))..))))....)))))).
|
4FRN_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((...{(.}(((((....(.(((([(..]..)))))(.(.<.<<<<).aaaa(.).).)AAAA..))))))))))).......(((>>>>...>))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.......(((((....(.((((.......)))).......)......(((.......)))....)))))))))))......(((........))).
|
4FRN_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((...{(.}(((((....(.(((([(..]..)))))(.(.<.<<<<).aaaa(.).).)AAAA..))))))))))).......(((>>>>...>))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.......(((((.........((((((.......................))))))........))))))))))).....................
|
4HXH_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA |
[ reference std structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ predicted structure ] |
.....((((((....)))))).....
|
4HXH_A
|
[ FASTA input ]
|
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA |
[ reference std structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ predicted structure ] |
.....((((((....)))))).....
|
4JF2_A
|
[ FASTA input ]
|
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))))))).(((((((((.((...<<<...)))))))))....(.(((((..)))))).))>>>.. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))))))).((((((((..............))))))))......((((....)))).........
|
4JF2_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))))))).(((((((((.((...<<<...)))))))))....(.(((((..)))))).))>>>.. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))))))).((((((((..............))))))))......((((....)))).........
|
4JRC_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))). ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..(((((........((((((...........))))))))))))))))).
|
4JRC_A
|
[ FASTA input ]
|
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))). ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((..((((..((..((((....))))....)).)))..)))).))))).
|
4K27_U
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC |
[ reference std structure ]
|
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|
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|
((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
|
[ predicted structure ] |
((((..((..((..(((((...((((....))))..)))))..))..))..))))
|
4K27_U
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC |
[ reference std structure ]
|
((((..((..((..(((((...((((....))))..)))))..))..))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((.(((....)))))))))))))))))))))))))
|
4KR2_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG |
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|
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
|
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|
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|
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|
4KR2_C
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG |
[ reference std structure ]
|
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
|
[ reference ext structure ]
|
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|
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(((((.................(((((((.......))))))).((((((.......)))))))))))
|
4KR3_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))). ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.[[[[){<<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B>.BBBBB)))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.......)........(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
|
4KR3_C
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))). ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.[[[[){<<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B>.BBBBB)))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.................(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
|
4KR7_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.......((((....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.......((((....))))))))))))....
|
4KR7_X
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.......((((....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.......(((((....))))))))))))....
|
4KZE_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).))))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..((((.............(((((((.....)))))))........((......))))))...))))))))))
|
4KZE_R
|
[ FASTA input ]
|
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).))))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..(((..............(((((((.....))))))).......((((....)))))))...))))))))))
|
4L81_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
(((((..(((((((..)))))[)).()(((((.{{{{..))).))....]..((((((..)))))))))))((((((..))))))......}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
.........((((....))))((((.((((((.......)))).))))))..(((((....)))))......((((....))))............
|
4L81_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU |
[ reference std structure ]
|
(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[..))).))).)))..(((((....)))))))))).((((....)))).......]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..(((((((..)))))[)).()(((((.{{{{..))).))....]..((((((..)))))))))))((((((..))))))......}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((....((((....))))(((.(((((((.......))).)))))))..(((((....)))))))))).((((....))))............
|
4LCK_F
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUGAGAAGAAGAGUAUUAAGGAUUUACUAUGAUUAGCGACUCUAGGAUAGUGAAAGCUAGAGGAUAGUAACCUUAAGAAGGCACUUCGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.........(..(.(...(.((.(......(..[[[[[...........).]]]]].).)).).).)..).........))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(.((.....(.(((..(((..((.(((((....([([{{{{{{....).]..)]}}}}}}))))).)))))..))))......)).))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.....((((....((.((((((..(((((((..(((((....((.....)).....)))))...)))))))))))))....)).))))..))))))
|
4LCK_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUGAGAAGAAGAGUAUUAAGGAUUUACUAUGAUUAGCGACUCUAGGAUAGUGAAAGCUAGAGGAUAGUAACCUUAAGAAGGCACUUCGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.........(..(.(...(.((.(......(..[[[[[...........).]]]]].).)).).).)..).........))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(.((.....(.(((..(((..((.(((((....([([{{{{{{....).]..)]}}}}}}))))).)))))..))))......)).))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.....((((.......((((((..(((((((.........((((((...........)))))).))))))))))))).......))))..))))))
|
4M4O_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((.(((((.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).))))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((..(...)((((.(.(.[..)]..).))))))))))))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.......((((..............)))))))))))))))))))
|
4M4O_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC |
[ reference std structure ]
|
((((((.(((((.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).))))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((..(...)((((.(.(.[..)]..).))))))))))))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((.((..((.(.((.((.....)).)).).))..)).))))).))))))
|
4M6D_D
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((...(..)((((.(.(.[..)]..).)))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((.........(((((.(..........).)))))..)))
|
4M6D_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC |
[ reference std structure ]
|
.(((..(.......((...(.(.[..)]..)...)))..))).
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.(..(...)((...(.(.[..)]..)...))).)))). ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(.......(((((..............)))))).))))
|
4M6D_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((...(..)((((.(.(.[..)]..).)))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.............(((((..............))))).....
|
4M6D_F
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
..(.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).)..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.........(((((.(..........).)))))..)))
|
4M6D_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
..(.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).)..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
............(((((.(..........).))))).....
|
4M6D_L
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC |
[ reference std structure ]
|
.(((..(.......((...(.(.[..)]..)...)))..))).
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.(..(...)((...(.(.[..)]..)...))).)))). ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.((.......((((.(..........).)))))).))))
|
4MGN_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB))))))... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
|
4MGN_B
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB)))))).. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
|
4MGN_D
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB))))))... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
|
4MGN_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB)))))).. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
|
4MGN_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAUCAAUAGUAGUUAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUAAUGAAACGGCAGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((.........(((((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).)))))))..........))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((.....(.(((((((((...(((((....([([{{{{{{....).]..)]}}}}}}))))).)))))))))).......))). ( )
|
[ predicted structure ] |
............((((((((..(((((........((((((...........)))))))))))))))))))..............
|
4MGN_C
|
[ FASTA input ]
|
GAAUCAAUAGUAGUUAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUAAUGAAACGGCAGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((.........(((((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).)))))))..........))).
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
............(((((((.(((..((((..((..((((....))))....)).)))..)))).)))))))..............
|
4OOG_D
|
[ FASTA input ]
|
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
4OOG_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
4OQU_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
(((((..((((((....))))[))..((((((.{{{{{.))).)))...]..(((((....))))))))))((((((..))))))......}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((....((((....))))(((.(((((((.......))).)))))))..(((((....)))))......((((....))))......)))))..
|
4OQU_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA |
[ reference std structure ]
|
(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))..(((((....)))))))))).((((....)))).......]]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..((((((....))))[))..((((((.{{{{{.))).)))...]..(((((....))))))))))((((((..))))))......}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((....((((....))))((((.((((((.......)))).))))))..(((((....)))))......((((....))))......)))))..
|
4P5J_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..[...)))))(((((((.......)))))))...{{{{..]....}}}}(((...{{{{{{))).).}}}}}}..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((([[()..)))))(((((((.......)))))))...{{{{{]..}].}}}}(((..{{{{{{{))).).}}}}}}.} () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((......)))))(((((((.......)))))))...((((.......)))).(((((....)))))...........
|
4P5J_A
|
[ FASTA input ]
|
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..[...)))))(((((((.......)))))))...{{{{..]....}}}}(((...{{{{{{))).).}}}}}}..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((([[()..)))))(((((((.......)))))))...{{{{{]..}].}}}}(((..{{{{{{{))).).}}}}}}.} () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((((......)))))(((((((.......)))))))...((((.......)))).(((((....)))))...........
|
4P8Z_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC |
[ reference std structure ]
|
(((((..(((((..(((((((((...[[[.)))))))))..{{{{.{{{.{{{{......{{{{{...{{{{..{{{...]]]}}}.......}}}}((....)).....<<<<<...}}}}}.(((.....)))}}}}.}}}....>>>>>.((((....))))....}}}}...)))))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((..(((((((((...[.[.))))))))).{<<<<<<<<<<<<<(..<)<<<<<<.<.<<<<a.aaa...]].AAA...>.A..>>>aa...>AA....aaaaaa.()>>>>>>a.(.....)>A>>>>>>>>>.}.AAAAA.(((((..)))))..A.>>>>...)))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((.......................(.......................)...............(((((................................))))).((((....))))..))))))).))))))..)))))
|
4P8Z_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC |
[ reference std structure ]
|
(((((..(((((..(((((((((...[[[.)))))))))..{{{{.{{{.{{{{......{{{{{...{{{{..{{{...]]]}}}.......}}}}((....)).....<<<<<...}}}}}.(((.....)))}}}}.}}}....>>>>>.((((....))))....}}}}...)))))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((..(((((((((...[.[.))))))))).{<<<<<<<<<<<<<(..<)<<<<<<.<.<<<<a.aaa...]].AAA...>.A..>>>aa...>AA....aaaaaa.()>>>>>>a.(.....)>A>>>>>>>>>.}.AAAAA.(((((..)))))..A.>>>>...)))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((......................(((.....................)))......(((.....((((...........((.....))..............))))...))).........))))))).)))))))))))))
|
4PDB_I
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((...(((((....)))..)).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.([)((((..))))...])))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(..((((....))))..).)))))))))
|
4PDB_I
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((...(((((....)))..)).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.([)((((..))))...])))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
|
4PJO_4
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........)))))).................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......))))))).................
|
[ predicted structure ] |
..........((((((.(.....).)))))).................
|
4PJO_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........))))))................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......)))))))................
|
[ predicted structure ] |
.....(((..((((((.(.....).)))))).........)))....
|
4PJO_2
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........))))))................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......)))))))................
|
[ predicted structure ] |
..........((((((.(.....).))))))................
|
4PJO_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........)))))).................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......))))))).................
|
[ predicted structure ] |
......(...((((((.........))))))..........)......
|
4PKD_V
|
[ FASTA input ]
|
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
|
4PKD_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
|
4PLX_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA |
[ reference std structure ]
|
(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...............((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
|
4PLX_A
|
[ FASTA input ]
|
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA |
[ reference std structure ]
|
(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...............((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
|
4QJD_D
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
............((((.(....).))))..................
|
4QJD_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
.............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.............((((........))))..................
|
4QJD_B
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
.............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.............((((.(....).))))..................
|
4QJD_F
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
............((((.(....).))))..................
|
4QJD_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
............((((........))))..................
|
4QJD_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
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|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
............((((........))))..................
|
4QJH_F
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QJH_B
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........ ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QJH_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
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|
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|
[ reference ext structure ]
|
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........ ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QJH_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
.........(((.[[[....))).............]]]........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QJH_D
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
........(((..[[......))).............]]........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QJH_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
........(((..[[......))).............]]........
|
[ reference ext structure ]
|
........(((((()[[)..))))...........]]........() ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((........)))).......................
|
4QK8_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUGCCGAAUCCGAAAGGUACGGAGGAACCGCUUUUUGGGGUUAAUCUGCAGUGAAGCUGCAGUAGGGAUACCUUCUGUCCCGCACCCGACAGCUAACUCCGGAGGCAAUAAAGGAAGGA |
[ reference std structure ]
|
..((((....((....))..(((((....(.....(.[((((....((((((.....))))))..(((((.{{{{{{)))))..)))).)].)....)))))..)))).....}}}}}}.
|
[ reference ext structure ]
|
..((((((.((((..))))[.(((((..((.....(.[((((.(.(((((((.....)))))))[)((((.{{{{{{)))).].)))).)].))..))))))]))))).....}}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((......((((((.............))))))((((((...(((((((...)))))))..((((((.....)))))).............))))))...))))))..........
|
4QK8_A
|
[ FASTA input ]
|
GUUGCCGAAUCCGAAAGGUACGGAGGAACCGCUUUUUGGGGUUAAUCUGCAGUGAAGCUGCAGUAGGGAUACCUUCUGUCCCGCACCCGACAGCUAACUCCGGAGGCAAUAAAGGAAGGA |
[ reference std structure ]
|
..((((....((....))..(((((....(.....(.[((((....((((((.....))))))..(((((.{{{{{{)))))..)))).)].)....)))))..)))).....}}}}}}.
|
[ reference ext structure ]
|
..((((((.((((..))))[.(((((..((.....(.[((((.(.(((((((.....)))))))[)((((.{{{{{{)))).].)))).)].))..))))))]))))).....}}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
4R4P_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......))).)))(((..(((.(((..((((......))))..)))...)))))).....)))))))))..))...)))).)
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))((((((([[[[.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))[[[).(((((((..((((......))))..)))..))))]]]....]]]]))))))..))..))))).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.....((((...(((((....).))))..))))..((((((.(((.......(((((((....((((......(((((((.....))))))))))))))))...))(((..((..((((((((((....))))))))))..))..))).....)))))))))..)).))))))))
|
4R4P_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......))).)))(((..(((.(((..((((......))))..)))...)))))).....)))))))))..))...)))).)
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))((((((([[[[.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))[[[).(((((((..((((......))))..)))..))))]]]....]]]]))))))..))..))))).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((..(((...((((.......))))..))).......((...........((((((.....((......(((((((((.....))))))))))).))))...))(((..((.(((((((((((....))))))))))).))..)))........))))))))...))))))))
|
4RMO_P
|
[ FASTA input ]
|
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG |
[ reference std structure ]
|
......(((((...[[[[[..))))).........]]]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]... ( )
|
[ predicted structure ] |
..........((((((..................))))))....
|
4RMO_P
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG |
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|
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|
[ reference ext structure ]
|
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]... ( )
|
[ predicted structure ] |
..........(((((((................)))))))....
|
4TUW_C
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ predicted structure ] |
.......((((((....))))))....
|
4TUW_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
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|
4TUX_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
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|
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|
4TUX_D
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ predicted structure ] |
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|
4TVX_L
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
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|
4TVX_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG |
[ reference std structure ]
|
..............................................(((((....)))))
|
[ reference ext structure ]
|
..............................................((((((..))))))
|
[ predicted structure ] |
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|
4TZY_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
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[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[..[[)))))))).....).{{{{{{]]...]]}}}}}}..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
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|
4TZY_X
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
|
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|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
|
4U7U_X
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG |
[ reference std structure ]
|
.............................................((((((....))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.............................................(((((((..)))))))
|
[ predicted structure ] |
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|
4U7U_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG |
[ reference std structure ]
|
.............................................((((((....))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.............................................(((((((..)))))))
|
[ predicted structure ] |
...((((((........))))))......................((((((....))))))
|
4UE4_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUUUAAGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((((((.......[[..))))...{{{{{...]]......}}}}}))......((((((...((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((.(((..(((((((.((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..))))...)).))))))....)))))))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))...)))))).))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((..([[)[[[)))))(.){{{{{.].]].]]...}}}}})))))(..(((((((((((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((({)(..(((((((.((((((((..(((((((((((....(((((.(((((....)))).))))))..))))).).)))))...)).))))))....)))))))).})))).)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.(((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).))))).))(((....((((((...(((((((.((((((..(((.(..(((((((.((((((......((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))))...)))))))...))).))))))))))..).))))))))))))))))...))))))....))))
|
4UE4_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUUUAAGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((((((.......[[..))))...{{{{{...]]......}}}}}))......((((((...((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((.(((..(((((((.((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..))))...)).))))))....)))))))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))...)))))).))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((..([[)[[[)))))(.){{{{{.].]].]]...}}}}})))))(..(((((((((((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((({)(..(((((((.((((((((..(((((((((((....(((((.(((((....)))).))))))..))))).).)))))...)).))))))....)))))))).})))).)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).)))))))))((....((((((((((((((((.(((((((..((....((((((((((((((......((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))))...)))))))...))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))....))..
|
4UE5_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCU |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..[...)))))))....{{{{.....]..}}}}))).(((((.((....(((((...((.((((.....((((..((((((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((.(((.(..((.(..((((((....))))))..).))..).))......(.(((((.....((((....(((....)))....))))...))))))).))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))..)))).)))).)).....)))))...)).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.[{).)))))))....<<<<.....]}.>>>>))).((((((((.(.)(((((..((..((((...(<)(((.(((((((.(((((......(((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((..<a)))))))))).)).))))......b.bbbbbb....bbbbbbbbbb....>ABBBBBBBBBB..BBBBBBB)))))))))).)))))))...)))))))...)))))))))))).))).>)))).).)....)))))...)))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((((......))))))))...((((........))))....(((((.((.((((((((((.(((((((....(((((((((((((.((((((((((.(.((((....))))..).)))))).((((((((((((((((((....))))))))))))))))))................(((((....))))).......((((((......(((((((((....))).))))))....))))))...))))))))))))))))))))))))..)).)))))))).))))))).
|
4UE5_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCU |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..[...)))))))....{{{{.....]..}}}}))).(((((.((....(((((...((.((((.....((((..((((((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((.(((.(..((.(..((((((....))))))..).))..).))......(.(((((.....((((....(((....)))....))))...))))))).))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))..)))).)))).)).....)))))...)).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.[{).)))))))....<<<<.....]}.>>>>))).((((((((.(.)(((((..((..((((...(<)(((.(((((((.(((((......(((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((..<a)))))))))).)).))))......b.bbbbbb....bbbbbbbbbb....>ABBBBBBBBBB..BBBBBBB)))))))))).)))))))...)))))))...)))))))))))).))).>)))).).)....)))))...)))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((((......)))))))).......((((........))))(((((.((.(..(((((((.((.((((....(((((.(((((((.((((((((((.(.((((....))))..).)))))).((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).................((((....))))........((((((......(((((((((....))).))))))....))))))...))))))))))).))))))))).))..)).)))))..).))))))).
|
4UN5_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG |
[ reference std structure ]
|
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
|
[ predicted structure ] |
............................((((....))))((((........................)))).........
|
4UN5_A
|
[ FASTA input ]
|
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG |
[ reference std structure ]
|
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
|
[ predicted structure ] |
............................((((....)))).........................................
|
4UYJ_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGUAAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4UYJ_R
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGUAAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((.[.{{{{{.)))))....<<<<<}]..}}}}....>>>>>)))))).((((((((((.((((((((..))))))))).)))))))))..)))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
4UYK_R
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGAAGCCGCCUCUGUAAGGAGGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4UYK_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGAAGCCGCCUCUGUAAGGAGGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4W24_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
............................................(((.[[....[)))...]...{{{......]].............}}}.............((....))(.....((.......)).....)....................
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4W24_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))..
|
4W24_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((((((((((.((...((((.(((((((((((((((.................))))))))))))))).)))).....))))).......((((((.....)))))))))))))))..
|
4W24_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
............................................(((.[[....[)))...]...{{{......]].............}}}.............((....))(.....((.......)).....)....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(..(.(.(.((.[[....[))).{.]...{{{{{{{..]]..}.......}}}}}}...}....))..)((....))(((...((((.)..)))...))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..(...............((((((((((((....(((((....)))))....((((((((..........)))))))))))))))).........))))...((((((((((.....)))))))))..))....))))))))))..
|
4W28_6
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).).... ( )
|
[ reference ext structure ]
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.(.((((....(.([{(.{).).).(((((.........)))))...]<.<<<<.}.>}.>>.>.>)))))..... ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((((......((((...(((((((((((((...))))))).))))))...)))).........)))))))...
|
4W28_6
|
[ FASTA input ]
|
UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).).... ( )
|
[ reference ext structure ]
|
.(.((((....(.([{(.{).).).(((((.........)))))...]<.<<<<.}.>}.>>.>.>)))))..... ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((....((((....((((((((((...))))))).)))))))...(((....))))))))))))...
|
4WFL_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
[ reference std structure ]
|
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|
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|
(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.){{{{{]...]]]]...}}}}})))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.(((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))))
|
4WFL_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
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|
(((((((...((((((....[[[[[..))))...{{{{{...]]]]]...}}}}}))......((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
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[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.){{{{{]...]]]]...}}}}})))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).)))))))))((....(((((((((((((((....)))))))))))))))....))..
|
4WJ4_B
|
[ FASTA input ]
|
UCCGCGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAUGACUGUUAAUCAUUGGGUCCCUGGUUCGAGUCCAGGUCGCGGAGCCA |
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|
(((((((..((((.....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
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|
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|
4WJ4_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCGCGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAUGACUGUUAAUCAUUGGGUCCCUGGUUCGAGUCCAGGUCGCGGAGCCA |
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|
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|
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|
4X4P_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCGGCAGGUUCGAGUCCUGCCGCGAUCGCCAC |
[ reference std structure ]
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((((((((((((.......)))))))))...)))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((.......)))))))))...)))..
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((((((((((((.......)))))))))...)))..
|
4X4P_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCGGCAGGUUCGAGUCCUGCCGCGAUCGCCAC |
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|
((((((((((((.......)))))))))...)))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((.......)))))))))...)))..
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((((((((((((.......)))))))))...)))..
|
4XW7_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA |
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|
(((((((..((........(((((....))))).))..)))))))(((((.........)))))
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4XW7_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA |
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|
(((((((..((........(((((....))))).))..)))))))(((((.........)))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((......[[[[[[...)]]]]]])))))))))))(((((.........)))))
|
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|
4Y1J_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAAGGGGAGUAGCGUCGGGAAACCGAAACAAAGUCGUCUAUUCGUGAGGAAACUCACCGGCUUUGUUGACAUACGAAAGUAUGUUUAGCAAGACCUUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((......((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..))....)))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((()[[[[(((((..)))))[[[[[[[[.()......(((((....))))).)]]]]]]]]((((((((..))))))))].]]].))))))).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((((......((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..........)))))
|
4Y1J_A
|
[ FASTA input ]
|
AAAGGGGAGUAGCGUCGGGAAACCGAAACAAAGUCGUCUAUUCGUGAGGAAACUCACCGGCUUUGUUGACAUACGAAAGUAUGUUUAGCAAGACCUUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((......((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..))....)))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((()[[[[(((((..)))))[[[[[[[[.()......(((((....))))).)]]]]]]]]((((((((..))))))))].]]].))))))).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))))))
|
4Y1M_B
|
[ FASTA input ]
|
GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC |
[ reference std structure ]
|
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.[[[[[.(((((((..)))))))[[[[[[[[.(.......(((((..)))))))]]]]]]]](((((((((..)))))))))]]]]]))))).))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
|
4Y1M_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC |
[ reference std structure ]
|
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.[[[[[.(((((((..)))))))[[[[[[[[.(.......(((((..)))))))]]]]]]]](((((((((..)))))))))]]]]]))))).))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((((.(((((...))))).)))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
|
4ZNP_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACAGGACUGGCGGAUUAGUGGGAAACCACGUGGACUGUAUCCGAAAAAAAGCCGACCGCCUGGGCAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((((..(.[[[[[....((((....))))..)..))))))))........{{{..]]]]]..}}}...
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((([{{{....{{{{...)}}}}.))))))))))))).......<<<.]}}}....>>>... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((..(...(......((((....)))))..).))))))))........(((.........)))...
|
4ZNP_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACAGGACUGGCGGAUUAGUGGGAAACCACGUGGACUGUAUCCGAAAAAAAGCCGACCGCCUGGGCAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((((..(.[[[[[....((((....))))..)..))))))))........{{{..]]]]]..}}}...
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((([{{{....{{{{...)}}}}.))))))))))))).......<<<.]}}}....>>>... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((............((((....))))....)))))))))........(((.........)))...
|
5A17_A
|
[ FASTA input ]
|
GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..(.....)..)).))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((.....))))).))))))))
|
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((((((((...((.......))..))))))))
|
5A17_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..(.....)..)).))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((.....))))).))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((....(.......)...))))))))
|
5AJ3_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..[[[[[..)))))(((((((((..((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((...(((((...)))))...))).)).(((....((..((((......))).)))......)))..(.....)))).(((....))).....)))))).......(..((...(((((....)))).))).).)).))))))...(.((((((.....[[[.....[[.)))]].......]]]..))).)..))))))))).....((((......((((...((..............(((((((......((((((.((........))..))))))......).....(.((....)))))))))......))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{{......)..}}}}}}}.))).(((........((....))......)))...]]]]](((((.(((((.(...((..(((((..((((((((((.....((........))..........(((((((..(......).((.(((...((((((.(....((..(((((....))).......))..))......((.....))......).).)))...)).)))))....)))))))..)).)))))))).(...((((.....))))..(.....)..(....(((((((......)))))))....)..)..))))).....(((((((.........)))))))......))...).)))))))).))..(.(..((.(...(((.((..((((((.(((((...((((.....))))..)))))...).)))))..)).)))....).))...)..)..(((((((((....)))))))))}.......
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.[[[[[)[)))))((((((((((.[[[[[[((.((([[[{{{{.(((....))).(..){)(...({(((((.((((((((.)))))))).))).)).((((<<(((..(((((...).))).)))...))>))))}((...))).}.(((....)))(.)..}}}]]]))(..)<<}((((...(((((..))))).))))>>)))]]]]]]...((((((((().<<<<<(..)<<<.)))>>>......>>>>>)))))..))))))))).....(((((...<.(<<<<.<<<......<......<<<<<<<(((...(((((((.((.(....).))..)))))))...))).....<.<<<.)>>>>>>>>>>>...>.>>>>.>>>..(..((((((...((.((((((.........)))))).))))))))..)...a...aaaaaaa.....))..AAAAAAA>))).aaaaa.aa>(.((....)).)AAAAAAA.].]]]]](((((.(((((.(...((..(((((((((((((aaaa...aaaa......).AA....b......bbbbbbb.(......).bb.bbb(.bc)((((((..(.((.((((((....))).......))).))......((.....))....).))).)))BA..C.BBBBB..B.BBBBBBA..AA.AA.))))))(((.((((.....))))).((..).).)((..(((((((((...).))))))))..))..).))))))cc()ccccccccc..B....CCCCCCCCC.CC..)))....)))))))).))..(.(((((.(..(((((((((((((((((((((...((((.....))))..))))).).).))))))))))))))...).)).)))c.)C.(((((((((....)))))))))A....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((((((((((....((((((((...........................................(((((((((.(((((...)))))....))))..))))).......(((......)))..............................................................................................................................................)))))))).........................................(((........((((((.(((......)))..))))))........................))).....................))))))))).))))).(...........).......................(((((((.........)))))))..........................................((((((((((((...............((((.........(((........))).....(((((((((((........................................................................................................)))))))))))....)))).....................(((.((........(((((((......)))))))....)).)))..........(((((((.........)))))))...........))))))........)))))).......(((((((((((((..(((((..................))))).....)))))))))))))................((((((((((....)))))))))).......
|
5AJ3_A
|
[ FASTA input ]
|
ACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..[[[[[..)))))(((((((((..((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((...(((((...)))))...))).)).(((....((..((((......))).)))......)))..(.....)))).(((....))).....)))))).......(..((...(((((....)))).))).).)).))))))...(.((((((.....[[[.....[[.)))]].......]]]..))).)..))))))))).....((((......((((...((..............(((((((......((((((.((........))..))))))......).....(.((....)))))))))......))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{{......)..}}}}}}}.))).(((........((....))......)))...]]]]](((((.(((((.(...((..(((((..((((((((((.....((........))..........(((((((..(......).((.(((...((((((.(....((..(((((....))).......))..))......((.....))......).).)))...)).)))))....)))))))..)).)))))))).(...((((.....))))..(.....)..(....(((((((......)))))))....)..)..))))).....(((((((.........)))))))......))...).)))))))).))..(.(..((.(...(((.((..((((((.(((((...((((.....))))..)))))...).)))))..)).)))....).))...)..)..(((((((((....)))))))))}.......
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.[[[[[)[)))))((((((((((.[[[[[[((.((([[[{{{{.(((....))).(..){)(...({(((((.((((((((.)))))))).))).)).((((<<(((..(((((...).))).)))...))>))))}((...))).}.(((....)))(.)..}}}]]]))(..)<<}((((...(((((..))))).))))>>)))]]]]]]...((((((((().<<<<<(..)<<<.)))>>>......>>>>>)))))..))))))))).....(((((...<.(<<<<.<<<......<......<<<<<<<(((...(((((((.((.(....).))..)))))))...))).....<.<<<.)>>>>>>>>>>>...>.>>>>.>>>..(..((((((...((.((((((.........)))))).))))))))..)...a...aaaaaaa.....))..AAAAAAA>))).aaaaa.aa>(.((....)).)AAAAAAA.].]]]]](((((.(((((.(...((..(((((((((((((aaaa...aaaa......).AA....b......bbbbbbb.(......).bb.bbb(.bc)((((((..(.((.((((((....))).......))).))......((.....))....).))).)))BA..C.BBBBB..B.BBBBBBA..AA.AA.))))))(((.((((.....))))).((..).).)((..(((((((((...).))))))))..))..).))))))cc()ccccccccc..B....CCCCCCCCC.CC..)))....)))))))).))..(.(((((.(..(((((((((((((((((((((...((((.....))))..))))).).).))))))))))))))...).)).)))c.)C.(((((((((....)))))))))A....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((((((((((....((((.....((((((.......(((.(((..((.(((.(.....((((........((...(((((...)))))...))((((((((....(((..(((......))).)))......))).))))).....)))).....)))).)).))))))......)))))).....(((....)))..............((((.......(((.((((...((((.((....)))).))...)))).)))...)))))))).......................................(((((((..(((.((((((.(((......)))..)))))).))).....)...(((....)))))))))...................))))))))).)))))(((.........)))......................(((((((.........))))))).....(((.....)))..........................((((((((((((..(((.......)))(((((..(((...(((........))))))..(((.(((((((....................(........................................................................)..........))))))).)))...)))))....................((((.((........(((((((......)))))))....)).)))).........(((((((.........)))))))...........))))))........)))))).......(((.((..(((((..(((((....((.......))...))))).....)))))..)).)))................((((((((((....)))))))))).......
|
5AXW_B
|
[ FASTA input ]
|
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU |
[ reference std structure ]
|
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).))))....
|
[ predicted structure ] |
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
5AXW_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU |
[ reference std structure ]
|
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).))))....
|
[ predicted structure ] |
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
5CCB_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((([{{.{).......}]}}((((((((...))))))))....(((((.......)))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
|
5CCB_N
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((([{{.{).......}]}}((((((((...))))))))....(((((.......)))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((..((((........))))....((((((.......))))))(((((.......))))))))))))....
|
5D3G_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5D3G_E
|
[ FASTA input ]
|
ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5DDR_A
|
[ FASTA input ]
|
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((....)))))..[.....((((((..........))))))....)))))].
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[(((((((..)))))))){.(()(((((((..........))))))).).]]].)}. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((((....)))))........((((((..........))))))....)))))..
|
5DDR_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((....)))))..[.....((((((..........))))))....)))))].
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[(((((((..)))))))){.(()(((((((..........))))))).).]]].)}. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((((....)))))........((((((..........))))))....)))))..
|
5DI4_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA |
[ reference std structure ]
|
...............(....).(((((......)))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.....(....)[[[[[[[)..].]]]]]].........
|
[ predicted structure ] |
((((......))))........(((((......)))))..........
|
5DI4_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA |
[ reference std structure ]
|
...............(....).(((((......)))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.....(....)[[[[[[[)..].]]]]]].........
|
[ predicted structure ] |
((((......))))........(((((......)))))..........
|
5F9F_D
|
[ FASTA input ]
|
GAAUAUAAUAGUGAUAUUAUAUUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
5F9F_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAUAUAAUAGUGAUAUUAUAUUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
5F9R_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGCAUAAAGAUGAGACGCGUUUUAGAGCUAUGCUGUUUUGAAAAAAACAGCAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCUU |
[ reference std structure ]
|
...................((((((..((((((((.(..(....)..).))))))))....))))))..(((..).)).......(.((....)).).((.(((...))).))..
|
[ reference ext structure ]
|
...................((((((..((((((((.((.(....).)).))))))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).((((((.())))))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..............(((..(((((((.(((((((((((((....)))))))))))))...))))))).......))).........(((....))).(((((((...))))))).
|
5F9R_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGCAUAAAGAUGAGACGCGUUUUAGAGCUAUGCUGUUUUGAAAAAAACAGCAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCUU |
[ reference std structure ]
|
...................((((((..((((((((.(..(....)..).))))))))....))))))..(((..).)).......(.((....)).).((.(((...))).))..
|
[ reference ext structure ]
|
...................((((((..((((((((.((.(....).)).))))))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).((((((.())))))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...................(((((((.(((((((((((((....)))))))))))))...)))))))..............................(((((((...))))))).
|
5GAP_U
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UUCUUGCCUUUUACCAGAAC |
[ reference std structure ]
|
.(((...........)))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.........))))).
|
[ predicted structure ] |
....................
|
5GAP_U
|
[ FASTA input ]
|
UUCUUGCCUUUUACCAGAAC |
[ reference std structure ]
|
.(((...........)))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.........))))).
|
[ predicted structure ] |
....................
|
5HLF_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5HLF_E
|
[ FASTA input ]
|
UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|