CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - Pknots
1VX6_B
[ FASTA input ]
GACUCGUUCAUACUACAGUGGAUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCACUGUAAGGCUUGGCUAGUACUGAGGUGGGAGACCGCUCGGGAACACCAGGUGAUGAGUCAG
[ reference std structure ]
((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....))))))))))))))..
[ reference ext structure ]
([[[[[[[....[[[[[[[[[.)](((((((...([...).].))))..))...)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).)))))))))]]]]]]]...
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((...(((.((((.(.............).((((....))))((((((((........))))))))...)))).(((((....))))).((.....)).)))))))))))..
2K5Z_A
[ FASTA input ]
GGUCUACAUUGCUGUUGUCGUGUGUGACC
[ reference std structure ]
(((((((((.((....)).))))).))))
[ reference ext structure ]
(((((((((.((....)).))))).))))
[ predicted structure ]
(((((((((..........))))).))))
2K63_A
[ FASTA input ]
GGAGUAUGUAUUGGCACUGAGCAUACUCC
[ reference std structure ]
(((((((((...........)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((.........))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...........)))))))))
2K66_A
[ FASTA input ]
GGAGUAUGUGAAAGCAUACUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
2KD8_A
[ FASTA input ]
GGAUGGUUGGGGUUAGCCAUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
2KDQ_B
[ FASTA input ]
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC
[ reference std structure ]
((((((...((((......))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((([..(]((......)).)))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((...((((......))))))))))
2KE6_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((((((((.(....).))))))).))).))).)))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
2KEZ_A
[ FASTA input ]
GGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACC
[ reference std structure ]
(((((.(((.....)))..)))))
[ reference ext structure ]
((((((((((...)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.....)))..)))))
2KFC_A
[ FASTA input ]
GGAGAGGUUCUAGUUAUACCCUCUAUAAAAAACUAA
[ reference std structure ]
..(((((...[[[......)))))........]].]
[ reference ext structure ]
..({a((.(.<<(.....)))(})..A)...).>.>
( )
( )
( )
( )
()
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((.(((..[[[[[..)))))))......]]]]].
2KGP_A
[ FASTA input ]
GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC
[ reference std structure ]
(((.((((((......)))))))))
[ reference ext structure ]
(((.((((((......)))))))))
[ predicted structure ]
....(((((((....)))))))...
2KMJ_A
[ FASTA input ]
GGCCAGAUUGAGCUUCGGCUCUCUGGUC
[ reference std structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((....)))))))))))
2KPV_A
[ FASTA input ]
GGAGGUAGUAGGUCGAAAGACCGUUCUACACUCC
[ reference std structure ]
((((((((.(((((....)))).).)))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((.(((((....)))).).)))).))))
[ predicted structure ]
((((((((..((((....))))...)))).))))
2KRL_A
[ FASTA input ]
GGACGGUGGCAGCACUGUCUAGCUGCGGGCAUUAGACUGGAAAACUAGUGCUCUUUGGGUAACCACUAAAAUCCCGAAAGGGUGGGCUGUGGUGACCCUCCG
[ reference std structure ]
.((((.((....)).)))).......((((((((.....[[....))))))))......(.(((((.....(...........)....))))).)...]]..
[ reference ext structure ]
.(((((.((..))).))))......([[)((((((..<.<{(}.)))))).]].....(.((((((.....((.((.).).).)....)))))))...)>.>
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((((.[[[[[))))))..]]]]](((((((((.........)))))))))...((((.(((((......(((....)))......))))).))))....
2KU0_A
[ FASTA input ]
GGAGGAACUACUGUCUUCCUUCGGGUCGUGCAGCCUCC
[ reference std structure ]
(((((.....(((((..((....))..).)))))))))
[ reference ext structure ]
((((((..).((((((((((..)))))).)))))))))
[ predicted structure ]
((((((.......))))))...((((......))))..
2KUR_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUUAUUAAAUUAAUUCUUAAUAACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
2KUU_A
[ FASTA input ]
GGCUUGAUUGUAUGUGUAAAUUAAUUCUUACACACUACAAAUUAAGCC
[ reference std structure ]
(((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((((((((((....))))))))).))).))).)))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
2KUV_A
[ FASTA input ]
GGCUCGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUCGAGCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
2KUW_A
[ FASTA input ]
GGGGUUGGUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAUCAGCUCC
[ reference std structure ]
(((((((((((.(((((((........)))))))..)).)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((.(....).))))))).))).)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
2KX8_A
[ FASTA input ]
GGGAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUUCCC
[ reference std structure ]
((((((.((((((((((.....)))))..)))))..))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((.....)))))..))))).)))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((.((((((((((.....)))))..)))))..))))))
2KXM_A
[ FASTA input ]
GGCUGCUUGUCCUUUAAUGGUCCAGUC
[ reference std structure ]
(((((...(.((......)).))))))
[ reference ext structure ]
(((((...(((((....))))))))))
[ predicted structure ]
(((.....)))((.....)).......
2KZL_A
[ FASTA input ]
GGGAGUAAAGAUUGAGACAAGUAGGACUUCGGUCCGAAUACACUCAUGAACUCCC
[ reference std structure ]
.(((((......((((.......((((....)))).......))))...))))).
[ reference ext structure ]
((((((...((.((((...(.((((((....)))))))....)))).))))))))
[ predicted structure ]
((((((....(((......))).((((....))))((......))....))))))
2L1F_A
[ FASTA input ]
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGG
[ reference std structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....)))))))
[ reference ext structure ]
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))...(((((((....)))))))
( )
[ predicted structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))...(((((((....)))))))
2L1F_B
[ FASTA input ]
GGCGGACCCGUGGUGGAACAGACGUGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAGGG
[ reference std structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
[ reference ext structure ]
.((((.()((.(((((((((....)))))....)))))).))))..((((((((....))))))))
( )
[ predicted structure ]
.((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))
2L2K_A
[ FASTA input ]
GGUAAGGUGGGUGGAAUCCUUCGGGAUCCCACCUACCCUGCC
[ reference std structure ]
((((.(((((((((.((((....)))).))))))))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((.(((((..))))).))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((.(((((((((.((((....)))).))))))))).))))
2L3C_B
[ FASTA input ]
GGUAGUAUAACAAUAUCCGUGUUGUUAUAGUACC
[ reference std structure ]
((((.((((((((((....)))))))))).))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((..))))))))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((.(((((((((......))))))))).))))
2L3E_A
[ FASTA input ]
GGCUUUUGCUCCCCGUGCUUCGGCACGGAAAAGCC
[ reference std structure ]
(((((((......(((((....))))).)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((......((((((..)))))).)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.....((((((....)))))))))))))
2L3J_B
[ FASTA input ]
GGCAUUAAGGUGGGUGGAAUAGUAUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUAUAGUAUCCCACCUACCCUGAUGCC
[ reference std structure ]
(((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.....))))))))))).))).))))))))).)))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(((((((((.(((.(((((((((((.....))))))))))).))).))))))))).)))))))
2L5Z_A
[ FASTA input ]
GAGCUGCAGCACGAAAGUGACGGCUC
[ reference std structure ]
((((((...(((....))).))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.)((((..)))).))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((...(((....))).))))))
2L94_A
[ FASTA input ]
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC
[ reference std structure ]
((((((((.((((((((((....))))))))))....))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....))))))))))))...)))))))
2LA5_A
[ FASTA input ]
GCUGCGGUGUGGAAGGAGUGGCUGGGUUGCGCAGCG
[ reference std structure ]
(((((.((....................))))))).
[ reference ext structure ]
((((((<<).[(..{a.(.}A..]))..>>))))).
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((.......................)))))).
2LBS_A
[ FASTA input ]
GGGAUACCAUGUUCAAGUGAACGUGGUAUCUC
[ reference std structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
2LC8_A
[ FASTA input ]
GGUCAGGGUCAGGAGCCCCCCCCUGAACCCAGGAUAACCCUCAAAGUCGGGGGGCA
[ reference std structure ]
.(((.((((((((.[[[[[[[)))).))))..))).............]]]]]]].
[ reference ext structure ]
.((((((((((((({{{{{.[)))).))))).))).............])}}}}}.
( )
[ predicted structure ]
.....((((((((.[[[[[[[)))).))))(((.....))).......]]]]]]].
2LDL_A
[ FASTA input ]
GGAUCCAUUCGAUUAGUGAACGGAUCC
[ reference std structure ]
((((((.(((.......))).))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((.......))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((.((((.....)))).))))))
2LDT_A
[ FASTA input ]
GGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCCCC
[ reference std structure ]
(((((((..((((....))))...)))))))
[ reference ext structure ]
((((((.(.(((((..))))).).).)))))
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((....))))...)))))))
2LHP_A
[ FASTA input ]
GGGUGAAAUGGAGGACUUCGGUCCUCAAAUUUCACCC
[ reference std structure ]
(((((((((.((((((....))))))..)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((.(((((((..)))))))..)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.((((((....))))))..)))))))))
2LI4_A
[ FASTA input ]
GGACCGAUAAGGUAGAAAUGCCUUAUCGGUCC
[ reference std structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((..)))))))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
2LJJ_A
[ FASTA input ]
GGCCUCAGCACUACCCCAGUGUAGGUC
[ reference std structure ]
((((...(.((.......)).).))))
[ reference ext structure ]
((((...((((.......)))).))))
[ predicted structure ]
(((((..(((((.....))))))))))
2LK3_A
[ FASTA input ]
GGCUUAGAUCAGAAAUGAUCAGCC
[ reference std structure ]
((((..(((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
((((..((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((..(((((....)))))))))
2LKR_A
[ FASTA input ]
GGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
[ reference std structure ]
((...((.......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..))))........))....))
[ reference ext structure ]
((((.(((.....((((((((.((((.((((...))))..)))).......((((((((.((((..))))).))))))).......)))..)))))......)))..))))
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.(((..[[[[[..(((((.((((.....)))).((((..((((....))))((((((((((((....))))))))))))((....)))))))))))..)))....]]]]].
2LQZ_A
[ FASTA input ]
GGACUUCCAUUGCUUCGGCAAAAGUCC
[ reference std structure ]
(((((.....(((....)))..)))))
[ reference ext structure ]
(((((...)(((((..)))))..))))
( )
[ predicted structure ]
((((((...((((....))))))))))
2LU0_A
[ FASTA input ]
GGAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAGCUUCGGCUGAGAGCUAAGUUCC
[ reference std structure ]
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
[ reference ext structure ]
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
[ predicted structure ]
(((((..((((.((....))...(((((....)))))))))...)))))
2LUN_A
[ FASTA input ]
GGGCAGUGAUGCUUCGGCAUAUCAGCCC
[ reference std structure ]
((((.(...(((....)))...).))))
[ reference ext structure ]
((((.(.(((((....))))).).))))
[ predicted structure ]
((((..((((((....)))..)))))))
2LV0_A
[ FASTA input ]
GGGCUAAUGUUGAAAAAUUAGCCC
[ reference std structure ]
(((((((..........)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.(......).)))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
2LWK_A
[ FASTA input ]
GAGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU
[ reference std structure ]
.(((((((.(..(((....))).).)))))))
[ reference ext structure ]
.((((((((((.(((....)))))))))))))
[ predicted structure ]
...........((((....))))((....)).
2M12_A
[ FASTA input ]
GGGUGUAUUGGAAAUGAGCACCC
[ reference std structure ]
((((((...........))))))
[ reference ext structure ]
((((((...........))))))
[ predicted structure ]
((((((...........))))))
2M58_A
[ FASTA input ]
GAAGAAAGGGCUUCGGCCACUCAAACUACAGAGACGCCAGUCACUCAGAUAUCCUGGU
[ reference std structure ]
...((...(((....)))..))........(((...[[[[...))).......]]]].
[ reference ext structure ]
((.((((.((((..)))))))).)).....(((...[[[[...))).......]]]].
[ predicted structure ]
........(((....))).(((........)))..(((((.............)))))
2M5U_A
[ FASTA input ]
GGCAGAUUCUGGUGAAUCUGCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
2M8K_A
[ FASTA input ]
GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA
[ reference std structure ]
(((((......[[[[[[[[[[[[))))).....].].]]]]]]]]]].
[ reference ext structure ]
((((([{<abcddddd......d))))).....D.].}>ABCDDDDD.
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
..........((((((((((((((((....)))).).)))))))))))
2MF0_G
[ FASTA input ]
UGUCGACGGAUAGACACAGCCAUCAAGGACGAUGGUCAGGACAUCGCAGGAAGCGAUUCAUCAGGACGAUGA
[ reference std structure ]
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..(((.......))).
[ reference ext structure ]
((((........))))..((((((......)))))).......((((.....))))..((((.....)))).
[ predicted structure ]
((((........))))..((((((......))))))......(((((.....)))))(((((.....)))))
2MHI_A
[ FASTA input ]
GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC
[ reference std structure ]
((((((((...((.((((...))))))..(...((.....)).)).)))))))
[ reference ext structure ]
((((((((..(((.((((...))))))).(..(((.....))))).)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.(((.....)))))))).((((.....))))..)))))))
2MI0_A
[ FASTA input ]
GAGCAGCAUCGUCGGCUGCUCA
[ reference std structure ]
((((((.........)))))).
[ reference ext structure ]
((((((.........)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.......))))))).
2MI0_B
[ FASTA input ]
GCGGCAGUUGACUACUGUCGC
[ reference std structure ]
(((((((.......)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
((((((((.....))))))))
2MIY_A
[ FASTA input ]
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA
[ reference std structure ]
((((((((.....[[[[[[.)))))))).........(((......)))..]]]]]]..
[ reference ext structure ]
((((((((.[{..<<<<...)))))))).........(((......)))..]}>>>>..
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((............)))))))).........((((....))))(....)....
2MQT_A
[ FASTA input ]
GGGCGAGGGUCUCCUCUGAGUGAUUGACUACCCGUCAGCGGGGGUCUUUCAUUUGGGGGCUCGUGCCC
[ reference std structure ]
(((((.((((((((.....((((..((((.((((....))))))))..))))..)))))))).)))))
[ reference ext structure ]
(((((.((((((((.....((((((((((.(((((..)))))))))))))))..)))))))).)))))
( )
[ predicted structure ]
(((((.((((((((...((((((..((((.((((....))))))))..)))))))))))))).)))))
2MS1_B
[ FASTA input ]
GGCUCGUUGGUCUAGGGGUAUGAUUCUCGCUUAGGGUGCGAGAGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGACGAGCC
[ reference std structure ]
(((((....((...........))((((((.......)))))).....((((.......))))...)))))
[ reference ext structure ]
(((((....((((.[.....))))((((((.......))))))...]((((((...)..)))))..)))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((((.........)).(((((((((.......)))))).)))(((((.......))))))))))))
2MXL_A
[ FASTA input ]
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU
[ reference std structure ]
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
[ reference ext structure ]
..(((((((.(((((((.(..).)).))))).)))))))
()
( )
[ predicted structure ]
..(((((((..((((((......)).))))..)))))))
2N0R_A
[ FASTA input ]
CUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUG
[ reference std structure ]
(...((((....))))......)
[ reference ext structure ]
((((((((....))))...))))
[ predicted structure ]
....((((....)))).......
2N1Q_A
[ FASTA input ]
GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC
[ reference std structure ]
(((((((((((...((((..(((((((....)))))))...(((..(((.(((....((((.(((((((....)))))))...))))..))).)))..)))....)))).......(((..(((((....)))))..)))...))))))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....((((((((((....)))))))))).))))))))))))).
[ predicted structure ]
((((((((((..((....))(((((((....)))))))....((((((..(((....((((.(((((((....)))))))...))))..)))((((((....))).)))(((.....))).(((((....)))))...)))))))))))))))).
2N2O_A
[ FASTA input ]
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU
[ reference std structure ]
....((((((...))))))....
[ reference ext structure ]
....((((((...))))))....
[ predicted structure ]
.........((((....))))..
2N2P_A
[ FASTA input ]
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU
[ reference std structure ]
....((((((...))))))....
[ reference ext structure ]
....((((((...))))))....
[ predicted structure ]
...((((((.....))))))...
2N4L_A
[ FASTA input ]
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC
[ reference std structure ]
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((((((((((.....((((((.....))))))...))))))))))))))
2N6Q_A
[ FASTA input ]
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU
[ reference std structure ]
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
[ reference ext structure ]
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>>
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((.........)))))((......))..
2N7M_X
[ FASTA input ]
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU
[ reference std structure ]
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((.(((((((((((((....))).(((....))).....)))))))((((((((....))))))))...))))))))))))))
2N8V_X
[ FASTA input ]
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG
[ reference std structure ]
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
[ reference ext structure ]
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]].
( )
[ predicted structure ]
(((((.((((((((....)).)))))).((((((((......)))))))))))))...............
2RP0_A
[ FASTA input ]
UCCGGUCGACUCCGGAGAAACAAAGUC
[ reference std structure ]
(((((..[.[.)))))........].]
[ reference ext structure ]
((([{<a(....])))......}>A.)
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((..[[[[))))).......]]]]
2RPT_A
[ FASTA input ]
GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC
[ reference std structure ]
((((.(((....))).))))
[ reference ext structure ]
((((.(((....))).))))
[ predicted structure ]
((((.(((....))).))))
2RRC_A
[ FASTA input ]
GGACCCACCACGGCGAGGUCCA
[ reference std structure ]
((((((.(....).).))))).
[ reference ext structure ]
(((((((((..)))).))))).
()
[ predicted structure ]
((((((........).))))).
2WRQ_Y
[ FASTA input ]
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUGAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
[ reference std structure ]
.((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
[ reference ext structure ]
.((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..))).....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
2WW9_F
[ FASTA input ]
CCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGG
[ reference std structure ]
((((((...((.....)).))))))
[ reference ext structure ]
(((((((...(.....)).))))))
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((((....))).)))))))
2WW9_E
[ FASTA input ]
UGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUAC
[ reference std structure ]
......(..((((....))))............)
[ reference ext structure ]
[(..])(.((((((..))))))({(..}.))..)
( )
( )
[ predicted structure ]
.........((((....)))).(((......)))
2WW9_D
[ FASTA input ]
AGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUG
[ reference std structure ]
.((((............).....(.((....(((....)))..........))..)...))).
[ reference ext structure ]
(((({([<(.(.)..].}..)>((((((...(((..).))).......)..)).)).).))))
( )
( )
( )
( )
()
( )
()
[ predicted structure ]
....((((......)))).((((..[[[.(((((....)))))))))...]]](((....)))
2WWQ_V
[ FASTA input ]
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((.........)))).(((.(.......).))).....((.((.......)).)))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)(.......]]].((((.((....).).))))]..)((.(((...)..)).)))))))))....
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((...((((.........)))).((.....)).))))))..(((((((((.......)))(....))))))).
2XKV_B
[ FASTA input ]
CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC
[ reference std structure ]
.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
[ reference ext structure ]
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)......
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
....((((((((((((((((((((((((((((((((......)))((....)))))).((....)))))).))))))))..))))).).)))))))
2XQD_Y
[ FASTA input ]
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAACACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
[ reference std structure ]
((.((((..((((........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))).))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{.[)(......])}.(((((((.....))))))})..)(((((.......))))))))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
2XXA_G
[ FASTA input ]
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGC
[ reference std structure ]
(.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...)))))))).)
[ reference ext structure ]
((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((..)))))...))))).))).))).))))))).)).))))))...))))))))))
( )
[ predicted structure ]
((((((((((...((.(((..((((.(((((((......)(((((((....))).(((.((.....)).)))))))))))))))))))))).))))))))))
2Y8W_B
[ FASTA input ]
UCCCCACGCGUGUGGGGAUG
[ reference std structure ]
.((((((....))))))...
[ reference ext structure ]
.((((((....))))))...
[ predicted structure ]
(((((((....)))))))..
2Y9C_V
[ FASTA input ]
GCCGUGACGACUGAAAAGUCGGCAUUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUAUGGGUAACCUAAGGAGACUGG
[ reference std structure ]
((..((.(((((....))))).))..).)..........(((((((..((....))...)))))))..
[ reference ext structure ]
(((.(((((((((..))))))))).)).)..........((((((((.(((..))))..)))))))..
( )
[ predicted structure ]
.......(((((....)))))((....)).........((((((((.(((.....))).)))))))).
2YIE_X
[ FASTA input ]
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU
[ reference std structure ]
.............(((.......))).....((((......))))........
[ reference ext structure ]
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........
( )
[ predicted structure ]
.....((((((...........))))))...((((......))))........
2YIE_Z
[ FASTA input ]
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG
[ reference std structure ]
......(((((.......))))).....(((......)))................
[ reference ext structure ]
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
[ predicted structure ]
.((((..(((((...........))))))))).((((((..........)))))).
2ZY6_A
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCGAGUCCGGGCACC
[ reference std structure ]
(((((((..(.(...........))...)))))))...
[ reference ext structure ]
((((((((((.(......).....))).)))))))...
( )
[ predicted structure ]
(((((((.......(((((....))))))))))))...
2ZZM_B
[ FASTA input ]
GCAGGGGUCGCCAAGCCUGGCCAAAGGCGCUGGGCCUAGGACCCAGUCCCGUAGGGGUUCCAGGGUUCAAAUCCCUGCCCCUGC
[ reference std structure ]
......(..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))......((.......))...)......
[ reference ext structure ]
.(.(((((.[[[[){...<(.}a(]]]](((((((.....)))))))((((..))))A)...((((>).)..)))..))).).)
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((....))))...((((.....)))).((((((..........))))))(((((.......))))))))))))
2ZZN_D
[ FASTA input ]
GCCGGGGUAGUCUAGGGGCUAGGCAGCGGACUGCAGAUCCGCCUUACGUGGGUUCAAAUCCCACCCCCGGC
[ reference std structure ]
(((((((..((([....(..]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)<.{(..]]]].((((((.....))))))....>((((((}).)..))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..(((((.....))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))
3A2K_C
[ FASTA input ]
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>)))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((..(((....((((((((((.....)))).))))))...))).(((((.......))))))))))))....
3A3A_A
[ FASTA input ]
GCCCGGAUGAUCCUCAGUGGUCUGGGGUGCAGGCUUCAAACCUGUAGCUGUCUAGCGACAGAGUGGUUCAAUUCCACCUUUCGGGC
[ reference std structure ]
(((((((.(..((((([..(.])))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((..)....))))).)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((..(((((({[{.))))))(((((((..)...))))))((((((....))))))(((((]}.)}.)))))))))))))
()
[ predicted structure ]
(((((((....((((((....))))))((((((.......)))))).(((((....))))).((((.......))))..)))))))
3ADB_C
[ FASTA input ]
GGCCGCCGCCACCGGGGUGGUCCCCGGGCCGGACUUCAGAUCCGGCGCGCCCCGAGUGGGGCGCGGGGUUCAAUUCCCCGCGGCGGCCGCCA
[ reference std structure ]
(((((((((..((((([..(.])))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((..)....)))))))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((..(((((([[()))))))(((((((.....)))))))(((((((....)))))))(((((]..)].)))))))))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((((..((((((....))))))((((((.......))))))(((((((....)))))))((((.......)))))))))))))....
3AKZ_H
[ FASTA input ]
UGGGAGGUCGUCUAACGGUAGGACGGCGGACUCUGGAUCCGCUGGUGGAGGUUCGAGUCCUCCCCUCCCAGCCA
[ reference std structure ]
.((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)(.....]]]].((((((.....))))))...)((((((...)..))))))))))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
3AM1_B
[ FASTA input ]
GGCGCGGGGUACCGGGCUUGGUAGCCCGGGGCUUCGGCCGAGGGCGAGAGCCCUCGGGGUUCGAUUCCCCCCCUGCGCCGC
[ reference std structure ]
(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))((((((....))))))((((.......)))))))))))))..
[ reference ext structure ]
(((((((((..((((((([[())))))))(((....)))(((((((..)))))))(((((]..)].)))))))))))))..
( )
[ predicted structure ]
(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))((((((....))))))((((.......)))))))))))))..
3AMU_B
[ FASTA input ]
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA
[ reference std structure ]
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..))))))))))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((..........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
3DW4_A
[ FASTA input ]
UGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUG
[ reference std structure ]
.(((((.....(....)....))))).
[ reference ext structure ]
.(((((..()(((..)))...))))).
( )
[ predicted structure ]
.(((((...............))))).
3G4S_9
[ FASTA input ]
UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCAGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCACC
[ reference std structure ]
...((((((....((((.(........(.((((...(.....)...))))...)......).)).))....(..(......(((((.((....))))))).....)..)....))))))...
[ reference ext structure ]
..([[[[[[.[..[[[[[[..[..)].((((((...({{...)}}.))).)....))...]]]].]]](((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))).]]]]]]...
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( )
( )
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( )
[ predicted structure ]
...(((((((((....)))(((((...((((((((...((((((((.(....)....((......))))))..)))))))).((((.((....))))))))))))))).....))))))...
3GCA_A
[ FASTA input ]
CUGGGUCGCAGUAACCCCAGUUAACAAAACAAG
[ reference std structure ]
(((((...[.[....))))).........]..]
[ reference ext structure ]
((((<((({{)....>)))).......)..)}}
( )
()
( )
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( )
( )
( )
[ predicted structure ]
.((((..........))))(((.....)))...
3GX2_A
[ FASTA input ]
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCG
[ reference std structure ]
((((((((......(((...(((...[[)))......))).(((..(((....))).)))...(]]..(((((....)))))..))))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((..({(.((((.((((.<<<<.))...).)))))(})..((((..))))...).).(>>>>((((((..))))))..))))))))).
( )
( )
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( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((..(.....)..(((((.(((((((........)))..((((....)))))))).))))).(((((....)))))...)))))))).
3HAY_E
[ FASTA input ]
GGCUGCCUGGGUCCGCCUUGAGUGCCCGGGUGAGAAGCAUGAUCCCGGGUAAUUAUGGCGGACCCACA
[ reference std structure ]
........(((((((.(.......((((((.............)))))).......).)))))))...
[ reference ext structure ]
........(((((((((.......(((((((((.......))))))))).......)))))))))...
[ predicted structure ]
.......((((((((((.....((((((((((.....))....)))))))).....))))))))))..
3HJW_D
[ FASTA input ]
GGGCCACGGAAACCGCGCGCGGUGAUCAAUGAGCCGCGUUCGCUCCCGUGGCCCACAA
[ reference std structure ]
(((((((((.......(((((((.........)))))))......)))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((.......(((((((((.....)))))))))......)))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((....(((((((((.........)))))))..))).)))))))))....
3IAB_R
[ FASTA input ]
GGACUCAGUAAUAUGCUUUGGAAACGAAGCUUACAAAAUGGAGUCC
[ reference std structure ]
((((((........((((((....))))))..........))))))
[ reference ext structure ]
((((((...(..).(((((((..)))))))..........))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((...((((((....))))))))))......))))))
3ID5_D
[ FASTA input ]
GGGGCGCCCUCUGAGCGUUCGCGCUGUGAUGA
[ reference std structure ]
..........(...(((....)))......).
[ reference ext structure ]
..........(((((((....)))...)))).
( )
( )
[ predicted structure ]
..(((((.............))))).......
3IVN_B
[ FASTA input ]
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC
[ reference std structure ]
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).)))))))))
( )
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[ predicted structure ]
((((((((...((((((.........))))))((....))(((((.........)))))..))))))))
3IWN_A
[ FASTA input ]
CACGCACAGGGCAAACCAUUCGAAAGAGUGGGACGCAAAGCCUCCGGCCUAAACGGCAUUGCACUCCGCCGUAGGUAGCGGGGUUACCGAUGG
[ reference std structure ]
((((......([...((((((....))))))..(])...(((.((((((((..((((..........))))))))).)))))))...)).)).
[ reference ext structure ]
((((......({...(((((((..)))))))..(}).(.(((.([[(((((..((((..........)))))))))))]].))))..)).)).
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
...((.....))...((((((....))))))...((((......[[(((.....))).))))(((((((........)))))))...]]....
3IZF_C
[ FASTA input ]
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
[ reference std structure ]
(((((((((....(((((((......((.(((...(....)...)))...)).....))))))).(((((.......((((((((....)))))))).....))))).))))))))).
[ reference ext structure ]
(((((((((....((((((((....(((.(((...[(...].).)))...)))...)))))))).((((((((.()((((((((((..)))))))))).)))))))).))))))))).
( )
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( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((....((((((((..(((((.(((((......))..))).)))))...))))))))((((((.......((((((((....)))))))).....))))))))))))))).
3J0L_8
[ FASTA input ]
GACCGUCGUGAGACAGGUUA
[ reference std structure ]
(((((((....))).)))).
[ reference ext structure ]
((((((((..)))).)))).
[ predicted structure ]
(((((((....))).)))).
3J0L_a
[ FASTA input ]
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA
[ reference std structure ]
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
[ reference ext structure ]
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].)....
( )
[ predicted structure ]
((((((((........)))).((....))((.....))..))))....
3J0L_1
[ FASTA input ]
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU
[ reference std structure ]
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
[ reference ext structure ]
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..))
( )
[ predicted structure ]
..........((((..(((((((.....)))))))))))...........
3J0L_g
[ FASTA input ]
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG
[ reference std structure ]
.................((........))..
[ reference ext structure ]
......(.........[[[......).]].]
[ predicted structure ]
...........((.....))(((.....)))
3J0L_7
[ FASTA input ]
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU
[ reference std structure ]
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
[ reference ext structure ]
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((.[[[[[[)))))((.....))...]]]]]]..((((....)))).
3J0L_h
[ FASTA input ]
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA
[ reference std structure ]
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
[ reference ext structure ]
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).))
( )
[ predicted structure ]
(((((.......[[[[[.[[..[[[[[[[[.)))))..((....)).((((((((....)))))))).......((......))]]]]]]]]..]].]]]]].........
3J0L_2
[ FASTA input ]
GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG
[ reference std structure ]
(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
[ reference ext structure ]
((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))).
( )
( )
[ predicted structure ]
((((.(((((((.........))((((....))))....)))))))))....(((((((((.......))))))...[[[[[)))...]]]]]((((((.......))))))
3J16_L
[ FASTA input ]
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((((<<.[)({.{...])>>((((((.(..)..))))))..)((((((}..)}.))))))))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((.........))))...(((((((.....)))).)))((.(((((.......))))))).))))....
3J20_0
[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..))))))))))))....
( )
( )
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[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
3J20_1
[ FASTA input ]
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA
[ reference std structure ]
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
3J2L_3
[ FASTA input ]
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC
[ reference std structure ]
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
[ reference ext structure ]
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)......
( )
( )
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( )
( )
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( )
[ predicted structure ]
(((((((....(((((((((.....)))(((.((.....))))).((........)))))).))..((((((((...((((((.((....))))))))..))))))))..))))))).........
3J3D_C
[ FASTA input ]
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA
[ reference std structure ]
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.))))))))))))....
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((.((....))))))))((((...........))))(((((.......))))))))))))....
3J3E_8
[ FASTA input ]
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG
[ reference std structure ]
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
[ reference ext structure ]
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))...........
( )
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( )
()
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( )
[ predicted structure ]
.......((((((.....)))..)))((((((((((((..((.((((........)))))).(((((((..........))))))).))))))).......((((.....)).)))))))...
3J3E_7
[ FASTA input ]
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU
[ reference std structure ]
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
[ reference ext structure ]
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].)..
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((......((((((......(((((((......))..))))).......))))))(((((((((((...............)))))).((....))))))).)))))))))..
3J3F_8
[ FASTA input ]
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU
[ reference std structure ]
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
[ reference ext structure ]
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....))))))))).....................
()
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
........((((((.....))(((((....))(((((((.....(((((....)))))...(((((((((..........))))))))))))))))....))).(((....)))((((((((.....)))))))).((((........)))))))).
3J3F_7
[ FASTA input ]
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
[ reference std structure ]
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
[ reference ext structure ]
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))...
( )
( )
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((.((.(((..(.....).((((((((((....))...(....)((....))))))))))..(((....))))))))((....))((((((.....)))))))))))))))...
3J3V_B
[ FASTA input ]
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCAAG
[ reference std structure ]
((((((.(.....((((((((.......(((...............)))........)))))).)).((.......((.(((((...))))).)).......))...).))))))....
[ reference ext structure ]
(([[[[[[.(.[)[[[[[[[[[.)]((((((..[.([....).].)]))..)))...]]]]]].]]..((((.(((((((((((...)))))))))).)))))]..].]]]]].).(.)
( )
( )
( )
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( )
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( )
( )
( )
( )
( )
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( )
[ predicted structure ]
((((((((((...(((((((((.......)((((.......))))((....))....)))))).)).(((((....)))))((.....))(((((....))))).))))))))))....
3J45_4
[ FASTA input ]
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU
[ reference std structure ]
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))
( )
[ reference ext structure ]
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...))))))))
( )
[ predicted structure ]
(((((((....)))..)))).(((((((.((....))((.........))..)))))))..
3J46_2
[ FASTA input ]
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA
[ reference std structure ]
.......((((((...((.....)).))))))....
[ reference ext structure ]
.....(.(((((((...(.....)).)))))).)..
( )
( )
[ predicted structure ]
......((((((((...........))))))))...
3J46_p
[ FASTA input ]
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
[ reference std structure ]
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).)))))))....
3J46_4
[ FASTA input ]
CUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAA
[ reference std structure ]
..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
[ reference ext structure ]
..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))...
( )
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( )
( )
( )
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( )
[ predicted structure ]
..(((((((((((((((.....)))).(((((((..((((((...((((((((....))))))))))))))............)))))...))..)))))))))))...
3J46_1
[ FASTA input ]
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU
[ reference std structure ]
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
[ reference ext structure ]
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..)
( )
( )
()
( )
[ predicted structure ]
..((.....))...((......))((((((((((((.......))).))...)))))))....
3J5B_1
[ FASTA input ]
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
[ reference std structure ]
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))(((.(((((.....)))))))).(((((.......))))))))))))....
3J5N_W
[ FASTA input ]
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.........)))).(((((.......)))))(((((........))..))).))))))))....
3J7A_7
[ FASTA input ]
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA
[ reference std structure ]
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
[ reference ext structure ]
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((((((((.........)))).((((.........))))((((((......))).))))).))))))).
3JB9_N
[ FASTA input ]
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA
[ reference std structure ]
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
[ reference ext structure ]
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
[ predicted structure ]
((((....)))).((((((((..........))).))))).......(((((...(((.....)))[[[.)).)))..]]](....)...
3JB9_C
[ FASTA input ]
CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU
[ reference std structure ]
(((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
()
[ predicted structure ]
.((((((((((.[[[[[[[[[[[[......((((((((...........))))))))((........)).)))))...)))))....]]]]]]]]]]]]......
3JYV_7
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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3JYX_3
[ FASTA input ]
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGUAGAGCCGACAGUAGUGUAGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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3JYX_4
[ FASTA input ]
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUAGGUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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3KTW_C
[ FASTA input ]
AGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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3LA5_A
[ FASTA input ]
GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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3NDB_M
[ FASTA input ]
GUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGAC
[ reference std structure ]
.(((.(..(((((((((.(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))))).))))))).....).))).
[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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3NKB_B
[ FASTA input ]
GGUCCGCAGCCUCCUCGCGGCGCAAGCUGGGCAACAUUCCGAAAGGUAAUGGCGAAUGCGGACC
[ reference std structure ]
(((((((((((.[[....))).......]]....((((((....)).)))).....))))))))
[ reference ext structure ]
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( )
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[ predicted structure ]
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3NMU_E
[ FASTA input ]
GCCGUUGAAGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC
[ reference std structure ]
............(...((....))......)...
[ reference ext structure ]
............((((((....))...))))...
[ predicted structure ]
.........((((((.((....))))....))))
3NPB_A
[ FASTA input ]
GUUCUUAUCAAGAGAAGCAGAGGGACUGGCCCGACGAAGCUUCAGCAACCGGUGUAAUGGCGAAAGCCAUGACCAAGGUGCUAAAUCCAGCAAGCUCGAACAGCUUGGAAGAUAAGAAC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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3O58_3
[ FASTA input ]
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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3O58_2
[ FASTA input ]
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
[ reference std structure ]
(((((((((....((((((((.....((.......................))....)))))).)).(((((.......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).
[ reference ext structure ]
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( )
[ predicted structure ]
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3OVB_D
[ FASTA input ]
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACCA
[ reference std structure ]
((((.(((((((.......))))))).))))....
[ reference ext structure ]
((((.(((((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))....
3OVS_D
[ FASTA input ]
GGAAGUAGAUGGUUCAAGUCCAUUUACUUCCACC
[ reference std structure ]
((((((((((((.......))))))))))))...
[ reference ext structure ]
(((((((((((((...)..))))))))))))...
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))...
3P22_G
[ FASTA input ]
GCUGGGUUUUUCCUUCGAAAGAAGGUUUUUAUCCCAGUC
[ reference std structure ]
((((((.....(((((....))))).......)))))).
[ reference ext structure ]
((((((.....((((((..)))))).......)))))).
[ predicted structure ]
((((((.....(((((....))))).......)))))).
3PDR_A
[ FASTA input ]
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGAUGCUUGUCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA
[ reference std structure ]
((((((((((.[[[..[[[..[[[[[[[[......[[[[[[(((((....((((....))))....))))).....[[[[[[[[[......)]]]]]]]]]..].]]]]].((........))....]]]]]]]].]]]...]]]..))....))))))).
[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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3R4F_A
[ FASTA input ]
GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC
[ reference std structure ]
((((.((((((((.......((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
((((.(((((((((....).((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
3R9X_C
[ FASTA input ]
CAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCU
[ reference std structure ]
(((((((.(......).)))))))...........
[ reference ext structure ]
(((((((.(.(...)).)))))))...........
( )
[ predicted structure ]
.(((((((((....)))))))))(((.....))).
3RKF_A
[ FASTA input ]
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC
[ reference std structure ]
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..)))))))
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[ predicted structure ]
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3SD1_A
[ FASTA input ]
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA
[ reference std structure ]
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
[ reference ext structure ]
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))).
( )
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( )
[ predicted structure ]
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3SIU_F
[ FASTA input ]
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG
[ reference std structure ]
((((((.....((.....))..))))))
[ reference ext structure ]
((((((...(((((..).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((................))))))
3SN2_B
[ FASTA input ]
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC
[ reference std structure ]
((((((.((((((...).)))))))))))
[ reference ext structure ]
((((((.((((((...).)))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((......)))))))))))
3TRZ_Z
[ FASTA input ]
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG
[ reference std structure ]
(((((.......)))))....
[ reference ext structure ]
(((((.......)))))(.).
[ predicted structure ]
((((((.....))))))....
3TS0_U
[ FASTA input ]
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG
[ reference std structure ]
((((((.......))))))....
[ reference ext structure ]
((((((.......))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.....)))))))....
3TS2_V
[ FASTA input ]
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG
[ reference std structure ]
(((((..........)))))....
[ reference ext structure ]
(((((..........)))))....
[ predicted structure ]
(((((..........)))))....
3U4M_B
[ FASTA input ]
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC
[ reference std structure ]
((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
[ reference ext structure ]
(((((((..(<.[[){{{{{{{{{{...{{{{{{{{{{....)]}}}}}}}}}}}}}}........>]}}}}}}))))))
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[ predicted structure ]
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3UZL_B
[ FASTA input ]
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
[ reference std structure ]
((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
[ reference ext structure ]
(((((((..(((..(<[<..().)))(((((((.....)))))))(((...)))..)((((((]>.)>.))))))))))))....
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[ predicted structure ]
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3VJR_D
[ FASTA input ]
GGGGGCUAAGCGGUUCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA
[ reference std structure ]
.((((((((((((.......))))))))))))....
[ reference ext structure ]
.(((((((((((((...)..))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((((((((.......))))))))))))....
3W1K_J
[ FASTA input ]
GGGAGUAGAUAGGCGCUGGUGUGCCUCCUAGACUUCAAAUCUACGGUCUCGCUAUUUAAGCGAGAGGUGGGUUCGAUUCCCACAUACUCCCG
[ reference std structure ]
(((((((....(((((..[.))))).((((((.......)))).))(((((((.....))))))).{{{{{..]....}}}}}.))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((...((((([[{.))))).(((((((.....))))).))((((((((...)))))))).<<<<<<]}.>].>>>>>)))))))).
( )
[ predicted structure ]
(((((((...((((((....))))))((((((.......)))).))(((((((.....))))))).(((((.......))))).))))))).
3W3S_B
[ FASTA input ]
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC
[ reference std structure ]
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
[ reference ext structure ]
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))...
( )
( )
[ predicted structure ]
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3WC1_P
[ FASTA input ]
GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC
[ reference std structure ]
.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
[ reference ext structure ]
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((((....(((((((...........)))))))))))...(((((.......))))))))))))..
3WQY_C
[ FASTA input ]
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
3ZEX_D
[ FASTA input ]
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU
[ reference std structure ]
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
[ reference ext structure ]
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))).
( )
( )
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( )
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[ predicted structure ]
(((((((((((....))((.....)).....(((((((((((((.....)))).((((((.....)).(((((.....)))))(((....))))))))))...))))))))))))))).
3ZEX_C
[ FASTA input ]
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG
[ reference std structure ]
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
..((((.((((..(((((..((((((((..........)))).((........))((((((((((((.((.......))))))))).)))))))))..((((....))))[[[[[[.[[[[[[[.((((....))))))))).)))))))).....]]]]]]]]]]]]]
3ZEX_F
[ FASTA input ]
CGAAUCGCCACUUCUCUUAUCUGGGUGCUCUGCCCGCCCUUGUCGGCGCCCAGUACCUUCAUUUUCACAAGAU
[ reference std structure ]
..................................((((......)))).........................
[ reference ext structure ]
..................(..(.........[(((((((.().))))))].)..).)................
( )
[ predicted structure ]
.(((.......)))......(((((((((...............)))))))))....................
3ZEX_H
[ FASTA input ]
UUUUGUCCCUCUCCAAACGAGAGUACAUGCAUGGGCUGGCAUGAGCGGCACGCUCCACGACCGUGGGGCUCGAGGGGCACUUUACGUCCCGAGGCGCUGAACCUUGAUGCUUGGAAUUUCAUGCUCAGGGACUUU
[ reference std structure ]
.....(....(.......)......(.....(..(...(......(((...(((((((....))))))).......(...(...........)...)......))).....)......)...)....).).....
[ reference ext structure ]
...(((...[(](....))...(..(..((((.((...(.(...((((..((((((((....)))))))).(...((((.(...........).))))...).))))..).)......))..)))).)))).)..
( )
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
....(((((((((.....))))....((((........))))((((((((.(((((((....)))))))....(((((.......)))))((((.......))))..))))(((....))).)))).)))))...
3ZEX_G
[ FASTA input ]
GUGAGAUUGUGAAGGGAUCUCGCAGGCAUCGUGAGGGAAGUAUGGGGUAGUACGAGAGGAACUCCCAUGCCGUGCCUCUGGUUUCUGGAGUUUGUCGAAGGGCAAGUGCUCCGACGCUAUCGCACGGUGGUUCUCGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAACCAGUCCCAAGACCGGGUGCCCG
[ reference std structure ]
...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
[ reference ext structure ]
...((((((....).)))))....(((((((..(((((.(.(((((.((.((((..)))))).)))))).((((((...((((...((((((((((....)))))..))))).).))))..))))).((((((.(((((()((.))..)..)))))).)))).))))).....)))))))..
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[ predicted structure ]
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3ZND_W
[ FASTA input ]
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA
[ reference std structure ]
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
[ reference ext structure ]
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...))))....
( )
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((((((.(((((.(((.....)))..)))))))))))))(((((.......))))))))))))....
4A1C_2
[ FASTA input ]
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA
[ reference std structure ]
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
[ reference ext structure ]
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........)))))....................
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[ predicted structure ]
......((((((((((.((((......)))))))).....)))))).((((......))))....(((((....))))).(((((....)(((.........)))((....)).((((((((......))))))))))))..(((.....))).
4A1C_3
[ FASTA input ]
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU
[ reference std structure ]
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
[ reference ext structure ]
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).)))))))))..
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[ predicted structure ]
((((((((((.((((((((((....))))....((((((((.....))))(.....)(((....)))))))))))))...((((((....))))))(((....))).).)))))))))..
4A4U_A
[ FASTA input ]
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC
[ reference std structure ]
(((((((((....)))))))))
[ reference ext structure ]
(((((((((....)))))))))
[ predicted structure ]
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4AOB_A
[ FASTA input ]
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA
[ reference std structure ]
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
[ reference ext structure ]
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))).
( )
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( )
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( )
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[ predicted structure ]
...((((((((...[[[((......)).))))))))..]]]((((.(((....)))))))..(((((....))))).((((....)))).....
4ATO_G
[ FASTA input ]
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA
[ reference std structure ]
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
[ reference ext structure ]
.....(((...[[[[[)))....]]]]].....
( )
()
[ predicted structure ]
....(((((......)))))((((....)))).
4BW0_A
[ FASTA input ]
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA
[ reference std structure ]
(((...(((....)))......))).
[ reference ext structure ]
((((((((((..)))))...))))).
( )
[ predicted structure ]
.(((..(((....)))......))).
4BY9_A
[ FASTA input ]
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC
[ reference std structure ]
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
[ reference ext structure ]
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............))))))))))
( )
[ predicted structure ]
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4BYQ_N
[ FASTA input ]
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG
[ reference std structure ]
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
[ reference ext structure ]
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..)))))))
( )
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( )
[ predicted structure ]
.((((.(((....)))..((((....)))))))).((((((((....))))))))....(((((((((......))))..)))))..
4C4W_H
[ FASTA input ]
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC
[ reference std structure ]
(((...(((((..........)))))......)))
[ reference ext structure ]
(((.(((((((..........))))))...).)))
( )
[ predicted structure ]
..((((......)))).....((((....))))..
4C7O_E
[ FASTA input ]
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA
[ reference std structure ]
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
[ reference ext structure ]
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((....)))).)).))))).).))))))))
4CXG_a
[ FASTA input ]
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG
[ reference std structure ]
.(.((....)).)...........................(.....).
[ reference ext structure ]
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
[ predicted structure ]
.............((.((.[[.)))).......]]....((.....))
4CXG_Y
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
[ reference std structure ]
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
((((((((.((((........))))...(((((((......))))).))((((.......))))))))))))....
4CXG_1
[ FASTA input ]
CGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAA
[ reference std structure ]
.(..((.(..(.((.((..(.(.(.((((.(((..(.((..(.....(...((((((((.(.........).)))))))).....).....)..)).)..))).)))).).))..)).)).)...).))...)..
( )
[ reference ext structure ]
.(((((.(..(.((.(((((.(.(.((((.(((..(.((((((((..(...((((((((.(.........).)))))))).....)..)))))))).)..))).)))).).)))))).)).)().).)).)))..
( )
( )
[ predicted structure ]
.(((..(((((((((((....)).))))..))))))))(((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...[[[(((((....))))).))).))))........]]].......
4CXG_2
[ FASTA input ]
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG
[ reference std structure ]
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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4ENB_A
[ FASTA input ]
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG
[ reference std structure ]
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
[ reference ext structure ]
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>)....
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((((..[[[[[[))))((....(((((....)))))))..]]]]]].....
4ENC_A
[ FASTA input ]
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG
[ reference std structure ]
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
[ reference ext structure ]
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>)....
( )
[ predicted structure ]
(((((..[[[[[[))))).....(((((....)))))....]]]]]].....
4FNJ_A
[ FASTA input ]
CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
((((.((((()((((((..))))))).))).))))
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[ predicted structure ]
.....(((..(((((((.......)))))))))).
4FRG_B
[ FASTA input ]
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA
[ reference std structure ]
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
[ reference ext structure ]
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4FRN_A
[ FASTA input ]
GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA
[ reference std structure ]
.(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))).
[ reference ext structure ]
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4HXH_A
[ FASTA input ]
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA
[ reference std structure ]
.....((((((....)))))).....
[ reference ext structure ]
.....((((((....)))))).....
[ predicted structure ]
.....((((((....)))))).....
4JF2_A
[ FASTA input ]
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA
[ reference std structure ]
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
[ reference ext structure ]
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4JRC_A
[ FASTA input ]
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC
[ reference std structure ]
(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
[ reference ext structure ]
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( )
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4K27_U
[ FASTA input ]
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
[ predicted structure ]
((....))......(((((...((((....))))..)))))..((((....))))
4KR2_C
[ FASTA input ]
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG
[ reference std structure ]
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
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4KR3_C
[ FASTA input ]
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC
[ reference std structure ]
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))).
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4KR7_X
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA
[ reference std structure ]
((((((((.......((((....))))))))))))....
[ reference ext structure ]
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.......(((((....))))))))))))....
4KZE_R
[ FASTA input ]
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC
[ reference std structure ]
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
[ reference ext structure ]
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4L81_A
[ FASTA input ]
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU
[ reference std structure ]
(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[..))).))).)))..(((((....)))))))))).((((....)))).......]]]].
[ reference ext structure ]
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4LCK_F
[ FASTA input ]
GGGUGCGAUGAGAAGAAGAGUAUUAAGGAUUUACUAUGAUUAGCGACUCUAGGAUAGUGAAAGCUAGAGGAUAGUAACCUUAAGAAGGCACUUCGAGCACCC
[ reference std structure ]
((((((.....((.........(..(.(...(.((.(......(..[[[[[...........).]]]]].).)).).).)..).........))..))))))
[ reference ext structure ]
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4M4O_B
[ FASTA input ]
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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( )
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[ FASTA input ]
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC
[ reference std structure ]
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
[ reference ext structure ]
.((((((...(..)((((.(.(.[..)]..).))))))))))
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.(((.((....))(((((..............)))))..)))
4M6D_L
[ FASTA input ]
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC
[ reference std structure ]
.(((..(.......((...(.(.[..)]..)...)))..))).
[ reference ext structure ]
.((((.(..(...)((...(.(.[..)]..)...))).)))).
( )
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( )
[ predicted structure ]
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4M6D_F
[ FASTA input ]
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).)
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4MGN_C
[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4MGN_D
[ FASTA input ]
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4MGN_B
[ FASTA input ]
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4OOG_D
[ FASTA input ]
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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4OQU_A
[ FASTA input ]
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4P5J_A
[ FASTA input ]
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4P8Z_A
[ FASTA input ]
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC
[ reference std structure ]
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4PDB_I
[ FASTA input ]
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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4PJO_2
[ FASTA input ]
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG
[ reference std structure ]
..........((((((.........))))))................
[ reference ext structure ]
..........(((((((.......)))))))................
[ predicted structure ]
....(((((.[[[[[[)))))....]]]]]]................
4PJO_4
[ FASTA input ]
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG
[ reference std structure ]
..........((((((.........)))))).................
[ reference ext structure ]
..........(((((((.......))))))).................
[ predicted structure ]
....(((((.......)))))..(((((((((.....)))))).))).
4PKD_V
[ FASTA input ]
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU
[ reference std structure ]
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
[ reference ext structure ]
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
[ predicted structure ]
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4PLX_A
[ FASTA input ]
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA
[ reference std structure ]
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((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF
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[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
............((((.[[[....))))...........]]]....
[ reference ext structure ]
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
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.....(((.......)))....((((.............))))...
4QJD_D
[ FASTA input ]
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA
[ reference std structure ]
............((((.[[[....))))...........]]]....
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............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
[ predicted structure ]
.....(((.......)))....((((.............))))...
4QJD_B
[ FASTA input ]
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA
[ reference std structure ]
.............((((.[[[....))))...........]]]....
[ reference ext structure ]
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
[ predicted structure ]
......(((.......)))....((((.............))))...
4QJH_D
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
........(((..[[......))).............]]........
[ reference ext structure ]
........(((((()[[)..))))...........]]........()
( )
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[ predicted structure ]
........((((........)))).......((.((......)))).
4QJH_B
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
.........(((..[[....))).............]].........
[ reference ext structure ]
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........
( )
( )
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[ predicted structure ]
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4QJH_F
[ FASTA input ]
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG
[ reference std structure ]
.........(((.[[[....))).............]]]........
[ reference ext structure ]
........((((([[[[)[.)))).(.)]......]]]]........
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4QK8_A
[ FASTA input ]
GUUGCCGAAUCCGAAAGGUACGGAGGAACCGCUUUUUGGGGUUAAUCUGCAGUGAAGCUGCAGUAGGGAUACCUUCUGUCCCGCACCCGACAGCUAACUCCGGAGGCAAUAAAGGAAGGA
[ reference std structure ]
..((((....((....))..(((((....(.....(.[((((....((((((.....))))))..(((((.{{{{{{)))))..)))).)].)....)))))..)))).....}}}}}}.
[ reference ext structure ]
..((((((.((((..))))[.(((((..((.....(.[((((.(.(((((((.....)))))))[)((((.{{{{{{)))).].)))).)].))..))))))]))))).....}}}}}}.
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4R4P_A
[ FASTA input ]
GCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC
[ reference std structure ]
(.((((..((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......))).)))(((..(((.(((..((((......))))..)))...)))))).....)))))))))..))...)))).)
[ reference ext structure ]
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4RMO_P
[ FASTA input ]
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG
[ reference std structure ]
......(((((...[[[[[..))))).........]]]]]....
[ reference ext structure ]
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]...
( )
[ predicted structure ]
..........(((((((((((.....))))...)))))))....
4TUW_C
[ FASTA input ]
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC
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[ reference ext structure ]
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[ FASTA input ]
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC
[ reference std structure ]
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4TVX_L
[ FASTA input ]
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
..............................................((((((..))))))
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[ FASTA input ]
GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC
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[ reference ext structure ]
(((((((((((.(((((((.[[..[[)))))))).....).{{{{{{]]...]]}}}}}}..)))))))))
( )
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[ FASTA input ]
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG
[ reference std structure ]
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4UN5_A
[ FASTA input ]
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
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4UYJ_R
[ FASTA input ]
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGUAAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU
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.(((((((((((((((.[.{{{{{.)))))....<<<<<}]..}}}}....>>>>>)))))).((((((((((.((((((((..))))))))).)))))))))..))))
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[ predicted structure ]
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4UYK_R
[ FASTA input ]
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGAAGCCGCCUCUGUAAGGAGGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU
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4W24_8
[ FASTA input ]
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
....................................(..(.(.(.((.[[....[))).{.]...{{{{{{{..]]..}.......}}}}}}...}....))..)((....))(((...((((.)..)))...)))....................
()
( )
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[ predicted structure ]
........((((((.....))(((((....))(((((((.....(((((....)))))...(((((((((..........))))))))))))))))....))).(((....)))((((((((.....)))))))).((((........))))))))
4W24_7
[ FASTA input ]
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU
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(((((...(...)(((.((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))..))((((((..(()(((((((.(((..)))))))))).)..))))))...).))))..
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[ predicted structure ]
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4W28_6
[ FASTA input ]
UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
[ reference std structure ]
.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).)....
( )
[ reference ext structure ]
.(.((((....(.([{(.{).).).(((((.........)))))...]<.<<<<.}.>}.>>.>.>))))).....
( )
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4WFL_A
[ FASTA input ]
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.){{{{{]...]]]]...}}}}})))))(..((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))
( )
( )
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4WJ4_B
[ FASTA input ]
UCCGCGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAUGACUGUUAAUCAUUGGGUCCCUGGUUCGAGUCCAGGUCGCGGAGCCA
[ reference std structure ]
(((((((..((((.....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
[ reference ext structure ]
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
( )
( )
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))....((((...........))))(((((.......))))))))))))....
4X4P_B
[ FASTA input ]
GGCCGCGGCAGGUUCGAGUCCUGCCGCGAUCGCCAC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
((((((((((((.......)))))))))...)))..
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4XW7_A
[ FASTA input ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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4Y1J_A
[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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4Y1M_B
[ FASTA input ]
GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC
[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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4ZNP_A
[ FASTA input ]
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[ predicted structure ]
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5A17_A
[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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5AXW_B
[ FASTA input ]
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU
[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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5CCB_N
[ FASTA input ]
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA
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5D3G_E
[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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5DDR_A
[ FASTA input ]
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG
[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
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5F9F_D
[ FASTA input ]
GAAUAUAAUAGUGAUAUUAUAUUC
[ reference std structure ]
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
5F9R_A
[ FASTA input ]
GCGCAUAAAGAUGAGACGCGUUUUAGAGCUAUGCUGUUUUGAAAAAAACAGCAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCUU
[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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5GAP_U
[ FASTA input ]
UUCUUGCCUUUUACCAGAAC
[ reference std structure ]
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[ predicted structure ]
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5HLF_E
[ FASTA input ]
UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG
[ reference std structure ]
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ reference ext structure ]
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
[ predicted structure ]
..((((((((((((((.....))))))))))))))
N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.
std - standard base pair definition
ext - extended base pair definition
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