1VX6_B
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[ FASTA input ]
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[ reference std structure ]
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((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....))))))))))))))..
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[ reference ext structure ]
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([[[[[[[....[[[[[[[[[.)](((((((...([...).].))))..))...)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).)))))))))]]]]]]]... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
(((((..(((..((((((((....(..((((............))))..).....)))))))..)(((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))).)))))..
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1VX6_B
(ext)
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GACUCGUUCAUACUACAGUGGAUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCACUGUAAGGCUUGGCUAGUACUGAGGUGGGAGACCGCUCGGGAACACCAGGUGAUGAGUCAG |
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[ predicted structure ] |
(((((.((((..(((((((((...(..(((((((......)))))))..)..)..)))))))..)((((((....((((((.((((..))))))))))...)))))))))))))))..
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2LBS_A
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GGGAUACCAUGUUCAAGUGAACGUGGUAUCUC |
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((((((((((((((....))))))))))))))
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[ reference ext structure ]
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((((((((((((((....))))))))))))))
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2LBS_A
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[ FASTA input ]
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((((((((((((((....))))))))))))))
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2LC8_A
(ext)
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2LC8_A
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GGUCAGGGUCAGGAGCCCCCCCCUGAACCCAGGAUAACCCUCAAAGUCGGGGGGCA |
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.(((.((((((((.[[[[[[[)))).))))..))).............]]]]]]].
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[ reference ext structure ]
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.((((((((((((({{{{{.[)))).))))).))).............])}}}}}. ( )
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..((.(((((((((......)))))).)))..))..(((((........)))))..
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2LDL_A
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2LDL_A
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GGAUCCAUUCGAUUAGUGAACGGAUCC |
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(ext)
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2LDT_A
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2LHP_A
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2LHP_A
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(ext)
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2LI4_A
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GGACCGAUAAGGUAGAAAUGCCUUAUCGGUCC |
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2LJJ_A
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2LK3_A
(ext)
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2LKR_A
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2LKR_A
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2LQZ_A
(ext)
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2LU0_A
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2LU0_A
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2LUN_A
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2LV0_A
(ext)
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2LV0_A
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2LWK_A
(ext)
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2M12_A
(ext)
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2M58_A
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2M58_A
(ext)
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2M5U_A
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2M8K_A
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2M8K_A
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|
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2MF0_G
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[ FASTA input ]
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2MF0_G
(ext)
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2MHI_A
(ext)
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[ FASTA input ]
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2MHI_A
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[ FASTA input ]
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GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC |
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(ext)
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2MI0_B
(ext)
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2MI0_A
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[ FASTA input ]
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GAGCAGCAUCGUCGGCUGCUCA |
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2MI0_B
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[ FASTA input ]
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GCGGCAGUUGACUACUGUCGC |
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2MIY_A
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[ FASTA input ]
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2MIY_A
(ext)
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[ FASTA input ]
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(ext)
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[ FASTA input ]
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2MQT_A
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[ FASTA input ]
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2MS1_B
|
[ FASTA input ]
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(ext)
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[ FASTA input ]
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2MXL_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU |
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|
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2N0R_A
(ext)
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[ FASTA input ]
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2N0R_A
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[ FASTA input ]
|
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2N1Q_A
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[ FASTA input ]
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2N1Q_A
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|
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2N2O_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU |
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2N2O_A
|
[ FASTA input ]
|
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|
2N2P_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU |
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|
[ FASTA input ]
|
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU |
[ reference std structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
....((((((...))))))....
|
[ predicted structure ] |
((.(((((((...))))))))).
|
2N4L_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).)))))))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((.((.(.(((((.....)))))).))))))))))))))))
|
2N4L_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((.(((..((((.....)))))))).)))))))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((.((((.((((((...))))))))))))))))))))))))
|
2N6Q_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU |
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|
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
|
[ reference ext structure ]
|
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>> ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((((((........))))))))
|
2N6Q_A
|
[ FASTA input ]
|
AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU |
[ reference std structure ]
|
((((..[{{{{.{{{))))....}}}]}}}}
|
[ reference ext structure ]
|
((((.[{<<<<..<<))))....>>]}>>>> ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((.(((........))).))))
|
2N7M_X
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((................(((....))).(((......)))(((((........))))).))))).)))))))))))
|
2N7M_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((.((((...(.(((...(.................)..))).)...((((((......))))))..)))).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((..(((((.(.(.....(((....)))..).))))))...(((((((....))))))).))))).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.((((((..(...........)((((..)))).(((......)))(((((.(....).))))))))))).)))))))))))
|
2N8V_X
|
[ FASTA input ]
|
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]]. ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((((((..)))).))))(((..((((((((....................)))))))))))
|
2N8V_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..((((((.[[[.[).)))))...(((((((......))))))).))))..........].]]].
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.(((((((.[[[[[).)))))).((((((((......))))))))))))).........]]]]]. ( )
|
[ predicted structure ] |
.......((((((((..)))).))))(((..((((((((.(................).)))))))))))
|
2YIE_Z
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG |
[ reference std structure ]
|
......(((((.......))))).....(((......)))................
|
[ reference ext structure ]
|
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
|
[ predicted structure ] |
..(..)((((((.....))))))(..(((......)))..)......(((..))).
|
2YIE_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU |
[ reference std structure ]
|
.............(((.......))).....((((......))))........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........ ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((((((((........)).)))))..))((((((........)))))).
|
2YIE_X
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGGGCAGGGUGAAAUUCCCGACCGGUGGUAUAGUCCACGAAUCCAU |
[ reference std structure ]
|
.............(((.......))).....((((......))))........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.(.((((...)..))))..).(((((..)..))))........ ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((((((.............)))))..))((((............)))).
|
2YIE_Z
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAGAGUCUGGAUGAGAGAAGAUUCG |
[ reference std structure ]
|
......(((((.......))))).....(((......)))................
|
[ reference ext structure ]
|
....(.((((((...)..)))))..).(((((..)..))))...............
|
[ predicted structure ] |
......((((((.....))))))...(((......))).........(((..))).
|
3AMU_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((........))..((((((((((..(...)))))))))))((((((...)..))))))))))))....
|
3AMU_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((........))..((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
|
3J0L_2
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG |
[ reference std structure ]
|
(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((.((..(((..............)))..)))))))))))...........((.....((.((((.....)).)).))...))..(((((.(((..))))))))
|
3J0L_h
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA |
[ reference std structure ]
|
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).)) ( )
|
[ predicted structure ] |
(.((((.(..(.(((((.((..((((((((......(((((..)))))....(((((...))))(..)...((((..)))).).))))))))..)).)))))))).)).))
|
3J0L_7
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU |
[ reference std structure ]
|
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........ ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((........))))).)))..((........))..........
|
3J0L_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAU |
[ reference std structure ]
|
(.(.(.((((.(...((.......))...).))))...)).)........
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((((.(.(((((.....)))))..)))))..)))))........ ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((........))))).)))..((........)).(......).
|
3J0L_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU |
[ reference std structure ]
|
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..)) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(.(((((((.((.((.((((.(......))))))))).))))))).)..
|
3J0L_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACG |
[ reference std structure ]
|
(((..((((((.(...((.....((((....)))).....)).)))))..))))).((((.........))).)....................(((((.......))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((([.(.((((.(...((....((((((..))))))....)).)))))..]))))(((((.(....)..))).))..........(...().).(((((.......))))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((.((..(((((((......)))))))..)))))))))))...(......)(((.(..((.(((((...))).)).))).)))..(((((.(((..))))))))
|
3J0L_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCGUGAGACAGGUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))).)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))).)))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))).)))).
|
3J0L_a
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA |
[ reference std structure ]
|
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.((..(..).(((..)))(((..)))..))))..))))....
|
3J0L_a
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGCAAGUCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUA |
[ reference std structure ]
|
.((((....[.[.[[[.....[[..))]].......]]]]])).....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[.())(.(.((((...(((..]])))...)..)))))].).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.((..(..).(((..)))(((..)))..))))..))))....
|
3J0L_g
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG |
[ reference std structure ]
|
.................((........))..
|
[ reference ext structure ]
|
......(.........[[[......).]].]
|
[ predicted structure ] |
..((((((((.(.......))).).)).)))
|
3J0L_8
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCGUGAGACAGGUUA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))).)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))).)))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((....))).)))).
|
3J0L_h
|
[ FASTA input ]
|
CACCGCCCGUCGCUUGUAGUAACGAAUGGUCUGGUGAACCUUCUGGACUGCGACAGCAAUGUUGCGGAAAAAUAAGUAAACCCUACCAUUUGGAACAACAAGAAGUCGUAA |
[ reference std structure ]
|
.......((.(.(((((.....((((((((..(((..((.(..(...((((((((....))))))))...)..).))..)))..)))))))).....)))))..).))...
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((.(((((((....(((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))))).).)).)) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((......(((((.((..((((((((........(((..))).......((((...))))....................))))))))..)).)))))..).))...
|
3J0L_1
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACU |
[ reference std structure ]
|
....((..(.(((.(.(.(.(((.....))).).))))).)..)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((((.(((.(.(.(((((.....))))).))))).))))))..)) ( )
|
[ predicted structure ] |
...(((.(...((.((.((((.........))))))))...).)))....
|
3J0L_g
|
[ FASTA input ]
|
GAACCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGG |
[ reference std structure ]
|
.................((........))..
|
[ reference ext structure ]
|
......(.........[[[......).]].]
|
[ predicted structure ] |
..(((((.((..........))...)).)))
|
3J16_L
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((<<.[)({.{...])>>((((((.(..)..))))))..)((((((}..)}.)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((........((((((...))...((..)).....))))...((((((.....)))))))))))))....
|
3J16_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((((....))((((((...))...((..)).....))))...((((((.....)))))))))))))....
|
3J20_0
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(....(((((.(((.(((((((.......))))))).)))))))).......)..))))))))....
|
3J20_0
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((.(((((((((((.......))))))))))))))))))).)..)).))))))))....
|
3J20_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((......(((((((((((.((((..)))).)))))))))))..(((((.((..))))))))))))))....
|
3J20_2
|
[ FASTA input ]
|
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGGCGUCCCUUCUGGGACGCCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGCCUGGGGUACUGGAAGGUCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGUAAGGCCCGCCCGAGGAUGCGGCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGCCUCUGGCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGUGGCCACUAUUAUUGGGCCUAAAGCGGCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUCGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCCGGGGUAGGGGUGAAAUCCUAUAAUCCCGGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGCGCGGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGGUGCCGUAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGGCUGAAGGUCUUGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGGUAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCCUCCCGCUCGGGAGGAGGCACUCUGGGGGGACUGCCGGCGAUAAGCCGGAGGAAGGGGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAAUGGGACCCGACCUCGAAAGGGGAAGGGAAUCCCCUAAACCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUGAAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGUGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUCCACCCGAGCGGAGUCCGGGUGAGGCCUGAUCUCCUUCGGGAGGUCAGGUCGAGCCCGGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
...(((...<.<<<...))).(((((((((....((((.(((......((.(((..(((..(..((((((((....))))))))..))))......(((.......(((((.(...(...(((((((.((((......((.((....)).)).......))))...(((((((((.(((....))))))))))))....((..(((....))))).)))))))..).).))))).(((....(((...((((((.........)))))).)))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))..).....(.(((....((((....))))..)))).))..))))...((((.(((...))).))))....(((((((.......)))))))......(((((((.....[[[[[.....[...)).].......]]]]])))))..)))))))))..........(((((...a..((....(((..((((((.(((((((((.....((((((((.....))))))))....)))))))..))))))))...(((((((.....((((((.(...((((((((...((........))......))))))))...).......((....))..))))))....))).)))..))))....)).....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{..(((((((((.((((.....)))).)))))))))...{{..))}}.....}}}}}}A))).(((......((((....))))....)))...>>>.>(((((.(((((((..((.((((((..(((((((.((......((........))..........(((((((...((((.(......(((.((((.....)))).)))...)..))))...(..(((...((((((((....((((((.((....))....(((......)))...)))))).....((((.((((((..........((((((....))))))........)))))).....(((((.....)))))........)))).....))).)))...)).))).)....)))))))...))..))))))).(...((((((......(((..((..((((....))))..))....)))......))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..)))))).....((((((.........)))))).......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((...(..(.(((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..))))))))))).)..)...))))..).))...)..)..(.(.(((((....))))).).)}...........
|
[ reference ext structure ]
|
N/A
|
[ predicted structure ] |
...........((((.((...(.((((((((((((((((((.(((..(((.(((..(((..((((((((((((..)))))))))))))))(((((((((((...((..((((((((....(((((((((((((((..((((((....))))))...)))))))...(((((((((.(((....))))))))))))....(((..((....)))))))))))))..(((((..((((((((..(((..(((((((((...)..)))))))))))....)))))).)).)))))......))).)))..))..))....))))).).)..)))).(((((....)))).).))))).........(((((...)).)))........).))))))))))))..((((((((...))))))))((((((((((.........)))).)))).))..........(((((((((((((((((((.(((..........))))).))))))))))).................))))))))).(((((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))...)))))))))..)))))))))).)...((((......)))).((..(((((((((((.(((......))).))).))))))))..))..)))))))...)).(((((.......))))).(........)......((((((((...((...((((..((..)).))))...))))))))))...))))...(((..((((((((((((((((...)))))).((......((.(((...........)))))(.((..)))(((..((((....))))...)))....))...(((((((((.......((((((((((.((....((((.(((...)))(......)..))))...(((((((....((((...(.((((((........))))))).....(((.((....))..))).((((((((((((.((((((.(......)...((((......))))..))))))....(((((..((((((.((((....(((((((..))))))).))))..))))))..(((.(((((.....)))))))).....))))).)))))).))))))..))))......)))))))...(((((((.((((....(((((((.....((((.((..((((....))))..))...)))).....))))))).(((..(....(((((((........)))))))....)))).......))))...)))))))....................)).)).))))))))......)).))))))).(((((((..(((((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..)))))))))))))..)))))))..................(((((((....)))))))))))).))))))))
|
3J20_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((......((((((((....((......))....))))))))..(((((.......))))))))))))....
|
3J20_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGGCGUCCCUUCUGGGACGCCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGCCUGGGGUACUGGAAGGUCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGUAAGGCCCGCCCGAGGAUGCGGCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGCCUCUGGCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGUGGCCACUAUUAUUGGGCCUAAAGCGGCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUCGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCCGGGGUAGGGGUGAAAUCCUAUAAUCCCGGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGCGCGGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGGUGCCGUAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGGCUGAAGGUCUUGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGGUAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCCUCCCGCUCGGGAGGAGGCACUCUGGGGGGACUGCCGGCGAUAAGCCGGAGGAAGGGGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAAUGGGACCCGACCUCGAAAGGGGAAGGGAAUCCCCUAAACCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUGAAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGUGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUCCACCCGAGCGGAGUCCGGGUGAGGCCUGAUCUCCUUCGGGAGGUCAGGUCGAGCCCGGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCCU |
[ reference std structure ]
|
...(((...<.<<<...))).(((((((((....((((.(((......((.(((..(((..(..((((((((....))))))))..))))......(((.......(((((.(...(...(((((((.((((......((.((....)).)).......))))...(((((((((.(((....))))))))))))....((..(((....))))).)))))))..).).))))).(((....(((...((((((.........)))))).)))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))..).....(.(((....((((....))))..)))).))..))))...((((.(((...))).))))....(((((((.......)))))))......(((((((.....[[[[[.....[...)).].......]]]]])))))..)))))))))..........(((((...a..((....(((..((((((.(((((((((.....((((((((.....))))))))....)))))))..))))))))...(((((((.....((((((.(...((((((((...((........))......))))))))...).......((....))..))))))....))).)))..))))....)).....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{..(((((((((.((((.....)))).)))))))))...{{..))}}.....}}}}}}A))).(((......((((....))))....)))...>>>.>(((((.(((((((..((.((((((..(((((((.((......((........))..........(((((((...((((.(......(((.((((.....)))).)))...)..))))...(..(((...((((((((....((((((.((....))....(((......)))...)))))).....((((.((((((..........((((((....))))))........)))))).....(((((.....)))))........)))).....))).)))...)).))).)....)))))))...))..))))))).(...((((((......(((..((..((((....))))..))....)))......))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..)))))).....((((((.........)))))).......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((...(..(.(((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..))))))))))).)..)...))))..).))...)..)..(.(.(((((....))))).).)}...........
|
[ reference ext structure ]
|
N/A
|
[ predicted structure ] |
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|
3J2C_O
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCA |
[ reference std structure ]
|
........(.(..((...((((.(((..((((((((((((.....(((((..(((..((....)).))).)))))....))))))))))))..))).))))....))...)..)...((((((((....)))))))).......
|
[ reference ext structure ]
|
..(.....).((((((((.((((((((((((((((((((((((.(.((((.((((..(((..))).))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))).)))(..).((((((((((..)))))))))).(...) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((((((((((((........)))..((..))(((((((((.((((.((((..))))))))))))))(((...))).))))))))..)))))..)).))).)).(..((((((((((..))))))))))..)...
|
3J2C_M
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(.((...(..((((...((((((..(.......((........))...........((((.(..(....((.(((..(.(((((....))))).)....(....)...))).).).).((.(((....((.((.......(((((((......))...(((......)))...)))))........((.((((..(...((..((.......))))....)..))))..(....(.(.....).).......)..)).........).).)...)..)))))....).)))).....)...)))))).(...(.(((((.....(((..((...((......))...))....))).....))))).)......(....((((.((........)).))))....)..)...)))).....(((((((.........)))))))......).....)).)..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3J2C_O
|
[ FASTA input ]
|
UGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCA |
[ reference std structure ]
|
........(.(..((...((((.(((..((((((((((((.....(((((..(((..((....)).))).)))))....))))))))))))..))).))))....))...)..)...((((((((....)))))))).......
|
[ reference ext structure ]
|
..(.....).((((((((.((((((((((((((((((((((((.(.((((.((((..(((..))).))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)))).)))(..).((((((((((..)))))))))).(...) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
3J2C_M
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(.((...(..((((...((((((..(.......((........))...........((((.(..(....((.(((..(.(((((....))))).)....(....)...))).).).).((.(((....((.((.......(((((((......))...(((......)))...)))))........((.((((..(...((..((.......))))....)..))))..(....(.(.....).).......)..)).........).).)...)..)))))....).)))).....)...)))))).(...(.(((((.....(((..((...((......))...))....))).....))))).)......(....((((.((........)).))))....)..)...)))).....(((((((.........)))))))......).....)).)..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3J2L_3
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)...... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.((((((((((..((((((.......))..))))..)).).)))))))).))).((((((.(.(((((((.(((..)))))))))).))))))).)..)))))).........
|
3J2L_3
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)...... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.....(..(((((((.((..((((((.......))..))))..))...)))))))..)...((((((.(..((((((.((....))))))))..)))))))....)))))).........
|
3J3D_C
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.)))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
3J3D_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.)))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((..(..)).)))((((((.(....)))))))....(((((((..)).))))))))))))....
|
3J3E_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.....((.((((((..(((..((((((..)))))).)))..))....((((((((((((((((.(((((........)))))))))).).).))))))))))))).))...(((..(..))))
|
3J3E_7
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....(.((((((......(((((((......))..))))).......))))))(.(((((((((....(......)...)))))))))).......)...)))))))))..
|
3J3E_8
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.....((.((((....(((..((((((..)))))).)))........(((((.((((.(((((.((((..........)))))))))...).))).))))))))).))...(((..(..))))
|
3J3E_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(..(.(((((((...(.(((((((......))..))))))....).))))))(.(((((((((.(..(......)..))))))))))).(..)..)..))))))))))..
|
3J3F_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(.(((((.(((........((((((......))))..))(((((((((((((...).)))))))))))).))).))))))..(((((.(((..))))))))))))))))...
|
3J3F_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.......((..(((..((((......)))).)))..)).((((((((.((((((((((((((((..(......))))))))))))))).)).(...)(((((..)))))((((((((...))))))))))).).))))...)).))))...
|
3J3F_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(...(((.(((........((((((......))))..))..(((((.((((......)))).)))))...))).)))..)..(((((.((....)))))))))))))))...
|
3J3F_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.............(((..((((......)))).))).....((((((((.(((((..(((((((((..........)))))))))..))).))......(((((..)))))((((((((...))))))))))).).))))......))))...
|
3J3V_B
|
[ FASTA input ]
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCAAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.(.....((((((((.......(((...............)))........)))))).)).((.......((.(((((...))))).)).......))...).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[.(.[)[[[[[[[[[.)]((((((..[.([....).].)]))..)))...]]]]]].]]..((((.(((((((((((...)))))))))).)))))]..].]]]]].).(.) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((.....((((((.(.((..((((.............))))..))...))))))).(((((..........(((((...)))))..........)).))))))))).))).
|
3J3V_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCAAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.(.....((((((((.......(((...............)))........)))))).)).((.......((.(((((...))))).)).......))...).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[.(.[)[[[[[[[[[.)]((((((..[.([....).].)]))..)))...]]]]]].]]..((((.(((((((((((...)))))))))).)))))]..].]]]]].).(.) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((.....((((((.((((..(((((((.......)))))))..)).).))))))).(((((((((..(...(((((...)))))...)..)))))).))))))))).))).
|
3J45_4
|
[ FASTA input ]
|
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU |
[ reference std structure ]
|
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........)))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...)))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
....(((....)))........(((((..(..((((.......))))..)...)))))...
|
3J45_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGU |
[ reference std structure ]
|
....(((((..(((........(((((..((....))...)))))........)))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
....(((((..(((...(((((((((((((((..))))).))))))))))...)))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
....((((..))))...(..).(((((((((.((((.((..))))))).))).)))))...
|
3J46_1
|
[ FASTA input ]
|
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU |
[ reference std structure ]
|
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
|
[ reference ext structure ]
|
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((..((.(((...))).))))))..............((.(((........))).)).
|
3J46_4
|
[ FASTA input ]
|
CUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAA |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((.(..(((........)))..)(((((.....((..)).(((((((....)))))))...................)))))(..........)))))))...
|
3J46_p
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).((((((((((..))).)))))))(((((...)..)))).)))))))....
|
3J46_p
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).((((((((((..))).)))))))((((.......)))).)))))))....
|
3J46_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUU |
[ reference std structure ]
|
....((((.[..[[[.))).....{{{{{{...{{{]]]..].}}}.......}}}}}}...)
|
[ reference ext structure ]
|
....(((([{..{{.{)))...}<<<<<<<<<<<<<]}}..}.>>>>....>>>>>>>>>..) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
.(.((((..((.(((...))).))))))...((......)).((.(((........))).)))
|
3J46_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAA |
[ reference std structure ]
|
..(((((((((((.(.((.(...........(((...........(((.(((......))).)))..................)))..).)).).)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((.((((((.(.([.{.).<.<<<.(.(...).((((.(((.....).)).))))....).......).]}>>>>..)))))).)))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((.((((((........))))))((((((..((((..)).(((((((....)))))))...(((..)))...))..))))))(..........)))))))...
|
3J46_2
|
[ FASTA input ]
|
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA |
[ reference std structure ]
|
.......((((((...((.....)).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(.(((((((...(.....)).)))))).).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.......(((((((..........)).)))))....
|
3J46_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGA |
[ reference std structure ]
|
.......((((((...((.....)).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(.(((((((...(.....)).)))))).).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(....(((((((..........)).)))))...)
|
3J5B_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))..((((((.......))))))..((((((...)..))))))))))))....
|
3J5B_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))..((((((.......))))))..(((((.......))))))))))))....
|
3J5N_W
|
[ FASTA input ]
|
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.........)))).(((((.......)))))(((((........))..))))))))))))....
|
3J5N_W
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((.......))))).(((((.......)))))(((((........))..))))))))))))....
|
3J6V_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUCUUAAUAAACUUACACAUGCAAGCAUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAGGUUAUUAAAACUAAGAGGAGCUGGCAUCAAGCACACACCCUGUAGCUCACGACGCCUUGCUUAACCACACCCCACGGGAAACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGCACCAUACCAAAUAGGGUUAAAUUCUAACUAAGCUGUAAAAAGCCAUGAUUAAAAUAAAAAUAAAUGACGAAAGUGACCCUACAAUAGCCGACGCACUAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUACAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAAAAAAAGUAAGCGUAAUUAUGAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUCUCUACACCAAGAGAAUCAAGCACGAAAGUUAUUAUGAAACCAAUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAGAUUCAGUGCAUCUAACCCUAUUUAAACGCACUAGCUACAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
[ reference std structure ]
|
...((((..[[[[[..)))).(((((((.(..((((((((....(((.((...(......)........(.....((......((((.....)))).......)).(((....((...(.......)..))......))).........).....(.....)......))))).......(..(....((.((....)).).).).).)).))))))...((((((((.....[[......[..))).]........]]..)))))..).))))))).....(((........(((....(......(......((((((...(..(((.....(........)......)))..)...))........(....)...))))....)..)....)))......((((.....(....(((.........)))....)..))))...........(((((..............))))).))).(((........(......)......)))...]]]]](((((.(.(((((...((..(((((..(((.((..((.....((........))...........((.(((..............(((...(((.((......((...((((....))).......)...)).....(((.....))).......).).)...)).)))......))).))...))...)).))).(...((((......))))...............(((.(........).)))........)..))))).......(((((.(.....).)))))........))...))))).)))).))..(.(..(......((((....((..(.(..((((.(.(((......))).).))))..).)..))....)))).......)...)..)....(..((((....))))..)..........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((......))..((((((..((((((((((((.((((((.((((((..))))))(((((.(((....)))))).)).(((..))))))))))))))))))))))))))...(((((((((.(((((((..((..))((((((((((((.(.((.(.(((...........)))).).)).))))).(..(((((..)))))).((((.(((...)))))))((.((((.............))))))((((......((((((((((.(((((((.((.(((...))).))..))))).).)...........).)))))).)))(...(((((((((...(((.(((..((((.......)))))))(((..((((((((((...)))..))).))))..))(((((...((.(.((((.(((..))))))).).)))))))..)......(.(((((((.(.......)))))))).)....(..)...)))...)))))))).)....)(((((((((.(.((((((....((((.....))))((((((((...((..((((((.(((.(((((((...(((.(((((....................(((((.((((.....(((((((((..))))).)).).)(((..(((((...)))))..))).((((.(........))))))))))))))))))).))).((.(((((((..(....))))))).)))....).))))))(((((........).))))..))).))))))..))(((((((.(......)))))))).))))))))(..))))))))))))).))))))))...((((.(((..(((..(..((((.((((........)).))))))..))))..)))))))((((..))))...))))))..)..)))))).).)))))))))....)..
|
3J6V_A
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUCUUAAUAAACUUACACAUGCAAGCAUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAGGUUAUUAAAACUAAGAGGAGCUGGCAUCAAGCACACACCCUGUAGCUCACGACGCCUUGCUUAACCACACCCCACGGGAAACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGCACCAUACCAAAUAGGGUUAAAUUCUAACUAAGCUGUAAAAAGCCAUGAUUAAAAUAAAAAUAAAUGACGAAAGUGACCCUACAAUAGCCGACGCACUAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUACAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAAAAAAAGUAAGCGUAAUUAUGAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUCUCUACACCAAGAGAAUCAAGCACGAAAGUUAUUAUGAAACCAAUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAGAUUCAGUGCAUCUAACCCUAUUUAAACGCACUAGCUACAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
[ reference std structure ]
|
...((((..[[[[[..)))).(((((((.(..((((((((....(((.((...(......)........(.....((......((((.....)))).......)).(((....((...(.......)..))......))).........).....(.....)......))))).......(..(....((.((....)).).).).).)).))))))...((((((((.....[[......[..))).]........]]..)))))..).))))))).....(((........(((....(......(......((((((...(..(((.....(........)......)))..)...))........(....)...))))....)..)....)))......((((.....(....(((.........)))....)..))))...........(((((..............))))).))).(((........(......)......)))...]]]]](((((.(.(((((...((..(((((..(((.((..((.....((........))...........((.(((..............(((...(((.((......((...((((....))).......)...)).....(((.....))).......).).)...)).)))......))).))...))...)).))).(...((((......))))...............(((.(........).)))........)..))))).......(((((.(.....).)))))........))...))))).)))).))..(.(..(......((((....((..(.(..((((.(.(((......))).).))))..).)..))....)))).......)...)..)....(..((((....))))..)..........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((......))...(((((..((((.(((((...((((((.(((.((..)).)))(((((.(((....)))))).)).(((..)))))))))..))))).)))))))))...(((((((((..((((((..((..))((((((((((((........(((...........))).......))))).(..((((....))))).((((.(((...)))))))((.((((.............))))))((((......(((((((((..(.(((((....(((...))).....)))))...).............)))))).))).....((((((((....((.(((..(((.........)))))).(...((((((.(((...)))...)).))))...)(((((...((.(.((((..((..)).)))).).))))))).........(.(((((((..........))))))).)...........))....)))))))).........((((.((.(.((((((....((((.....))))((((...........((((((.((..((((......(((.(((((.....................((((.((((.....(.((.............))...)(((..(((((...)))))..))).((((...........)))))))))))).))))).))).((..((((((........))))))..))........))))..((...........)).....)).))))))....(((((((.........))))))).....))))(..)))))))))).)).))..))))...((((.(((..(((..(..((((...((........))...))))..))))..))))))).(((..)))....))))))..)..))))))...))))))))).......
|
3J7A_7
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA |
[ reference std structure ]
|
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).)).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.((..))))))....((..))(((........)))...((((((...)..)))))))))))).
|
3J7A_7
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAUUGGCGCAGUUGGUUAGCGCGCGGGUCUCAUAAUCCCGAGGUCGUGAGUUCGAUCCUCACAUUACCCA |
[ reference std structure ]
|
.((......((...........))..(............)......(..(.........)..)....)).....
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((.([{{..)..<...<]}}..(.(........).)...>..aa.aa>......AA.AA.))).)).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((.((..))))).....((..))(((........)))...(((((.......)))))))))))).
|
3JB9_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).).................... ()
|
[ predicted structure ] |
...(((((..)))))(((((((((....(((((((((.((........))))))))((((......)))).(......)..)))...))))))))).((...)).
|
3JB9_N
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA |
[ reference std structure ]
|
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
|
[ reference ext structure ]
|
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
|
[ predicted structure ] |
..((((((..(((.((((..)))).)))..)))..(((...................((((......)).)))))(........))))..
|
3JB9_C
|
[ FASTA input ]
|
CGUCAAAGCACUUUGCAAAAGCUAACGUAUCUGUUUCUUGCCUUUUACCAGAAACAGCCGUUUGUAAGGUGUGCUAAUUUGACUGUAUAGUUUUUGUAAUCUUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).).................... ()
|
[ predicted structure ] |
...(((((..)))))(((((((((....(..((((((.((........))))))))(((........))).(......)....)...))))))))).((...)).
|
3JB9_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAA |
[ reference std structure ]
|
.(........)........................................(..((((.....)))..).)...................
|
[ reference ext structure ]
|
((((....))))...........................((.....))(.[[[.[(((.....))).)]]]]..................
|
[ predicted structure ] |
..((((((..((((((((..))))))))..)))..(((...................((((......)).)))))((......)))))..
|
3RKF_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.((..)))))))))).......((((((((...))))))))..)))))))
|
3RKF_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.......)))))))).......((((((.......))))))..)))))))
|
3SD1_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((...(((((((((((((...((((((((((........))).)))))).)...((....)))).)))))))))))......)))).
|
3SD1_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((((((((((((((((((((((((......)))).)))))).))))(((..))))).)))))))))))...)).)))).
|
3SIU_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.....))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(((((..).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((................))))))
|
3SIU_F
|
[ FASTA input ]
|
CUGUCCAAUGAGCGCAUAGUGAGGGCAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.....((.....))..))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...(((((..).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((................))))))
|
3SN2_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.((((((...).)))))))))))
|
3SN2_B
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAUCGGAAGCAGUGCCUUCCAUAAUC |
[ reference std structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.((((((...).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.((((((...).)))))))))))
|
3TRZ_Z
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((.......)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.......)))))(.).
|
[ predicted structure ] |
(((((.......)))))....
|
3TRZ_Z
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGGAUUUUGCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((.......)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((.......)))))(.).
|
[ predicted structure ] |
(((((.......)))))....
|
3TS0_U
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((...))))))))....
|
3TS0_U
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAGUGAUUUUACCCUGGAG |
[ reference std structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.......))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((.(...).))))))....
|
3TS2_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((...))..)).)).(..).
|
3TS2_V
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCUAUGAUACCACCCCGGAG |
[ reference std structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........)))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((...))..)).))......
|
3U4M_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(<.[[){{{{{{{{{{...{{{{{{{{{{....)]}}}}}}}}}}}}}}........>]}}}}}})))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.(((....(.(.((.((((((....(((((((((..))))))))).)))))))).).)...)))))))).....
|
3U4M_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((..(<.[[){{{{{{{{{{...{{{{{{{{{{....)]}}}}}}}}}}}}}}........>]}}}}}})))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.(((........((..((((.....(((((((((..)))))))))..)))).)).......)))))))).....
|
3UZL_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA |
[ reference std structure ]
|
((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
|
[ reference ext structure ]
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(((((((..(((..(<[<..().)))(((((((.....)))))))(((...)))..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((((.........)))))(((((((...)))))))(.......)....((((((...)..))))))))))))....
|
3UZL_B
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA |
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|
((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
|
[ reference ext structure ]
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(((((((..(((..(<[<..().)))(((((((.....)))))))(((...)))..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
3VJR_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUAAGCGGUUCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((...)..)))))))))))).)..
|
3VJR_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUAAGCGGUUCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((((((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.......)))))))))))).)..
|
3W1K_J
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUAGAUAGGCGCUGGUGUGCCUCCUAGACUUCAAAUCUACGGUCUCGCUAUUUAAGCGAGAGGUGGGUUCGAUUCCCACAUACUCCCG |
[ reference std structure ]
|
(((((((....(((((..[.))))).((((((.......)))).))(((((((.....))))))).{{{{{..]....}}}}}.))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((...((((([[{.))))).(((((((.....))))).))((((((((...)))))))).<<<<<<]}.>].>>>>>)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((....)).(((..))).((((((.......)))).))((((((((..)).)))))).((((((...)..))))).))))))).
|
3W1K_J
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUAGAUAGGCGCUGGUGUGCCUCCUAGACUUCAAAUCUACGGUCUCGCUAUUUAAGCGAGAGGUGGGUUCGAUUCCCACAUACUCCCG |
[ reference std structure ]
|
(((((((....(((((..[.))))).((((((.......)))).))(((((((.....))))))).{{{{{..]....}}}}}.))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((...((((([[{.))))).(((((((.....))))).))((((((((...)))))))).<<<<<<]}.>].>>>>>)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..........(((..))).((((((.......)))).))((((((((..)).)))))).(((((.......))))).))))))).
|
3W3S_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC |
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|
(((.((((..((.((([..(.])))))((((((.......))))).)((((.((((....)))).)))).(((((..)....))))))))).)))...
|
[ reference ext structure ]
|
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..)))(((.((..))))).(((((.......)))))..((((.((((....)))).))))((((((.......)))))).))))))...
|
3W3S_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGGUUGGCCGGCUGGUGCCGCCCCGGGACUUCAAAUCCCGUGGGAGGUCCCGCAAGGGAGCUCCGGAGGGUUCGAUUCCCUCCCUCUCCCGCC |
[ reference std structure ]
|
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[ reference ext structure ]
|
(((.((((..((.(((([[()))))))((((((.......))))).)((((((((((..)))))))))).((((((]..)].))))))))).)))... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..)))(((.((..))))).(((((.......)))))..((((.(((((..))))).))))(((((((...)..)))))).))))))...
|
3WC1_P
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC |
[ reference std structure ]
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.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
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[ reference ext structure ]
|
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
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[ predicted structure ] |
(((((((..(((((.((..)).)))))...(((..))).........(((((.......))))))))))))..
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3WC1_P
(ext)
|
[ FASTA input ]
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GCCAUCAUAGUAUAGUGGUCAUUAUAAAUCGUUGUGGCCGAUUAGACCCAAGUUCGAUUCUUGGUGAUGGCAC |
[ reference std structure ]
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.((((((..((............))..(..(.......)..).....(((((.......)))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.([[.(.({{<..)))]]..((.(..()...).)).....aaaaaa}>.A}.AAAAA))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((..))))))))...(((..)))(......).((((((...)..))))))))))))..
|
3WQY_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA |
[ reference std structure ]
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(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
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(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
(((((((..((((..(...)))))(((((((.....)))))))....(((((.((..))))))))))))))....
|
3WQY_C
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUCGUAGCUCAGCGGGAGAGCGCCGCCUUUGCGAGGCGGAGGCCGCGGGUUCAAAUCCCGCCGAGUCCACCA |
[ reference std structure ]
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(((((((..((((....[..)))).((((((.....)))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<.ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
3ZEX_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUGAGAUUGUGAAGGGAUCUCGCAGGCAUCGUGAGGGAAGUAUGGGGUAGUACGAGAGGAACUCCCAUGCCGUGCCUCUGGUUUCUGGAGUUUGUCGAAGGGCAAGUGCUCCGACGCUAUCGCACGGUGGUUCUCGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAACCAGUCCCAAGACCGGGUGCCCG |
[ reference std structure ]
|
...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3ZEX_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGGAAAUGCGAAACACUUGCCAGGUGACCCAUCCAUCCUCCCACGGUGAGCUUUCUUUUCACCAUAAUCCACAUCUCCGGCCUUGCUGGGGCUUGGGCCUCUCGACUUCUCGCGUUACUCGGAGCGGGGGCUCAAGAUUGAAAAAUGCAGCUCACCCUACGUACUGUCCUUUGUUGUGAGUUCGGCGCAUUAAAGCAAAAACCUGGGGUG |
[ reference std structure ]
|
((....))........((....(.(...((...(((........((((((.......)))))....((...((.............))(..((((........(((.......)))........))))...)....)).......((..((.........))..)).).......))).....)).........))..))..........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3ZEX_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAACUGCAGACCGUACUCAUCACCGCAUCAGGUCCCCAAGCAUCGAAUGCUCUGGUAACAUAGAGAAAGGUACACUCAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUGCGUAAGUUCGCAAGAAGCAUUGGCUCUGAGGGCAAAGUGGGGGUCCACAGGAGGGCCAGUGUCCUUUGAAGGCUACCCUCCCGAGCCGUAUCUACUAACCUCCUUCUGGUGUGUUGUUUUUACGUCUCACUCCCGCGCAGGUGUUUUCGCUUCCUUUUUUUGGUUGCGCACCUACAAAUUGCCAACUCAGAACUGCUUACGGCGGGGAAUCCAACUGUAUAAUUAAAACAUAGGUUUGUGAUGCAUCCAAGUGGUGUAUGUCGCAAACUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAACGUGAGAGAUUCACCGACGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCUUCCAAUUAGAGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUCCCUCUGUCCCGAGUUACUAUCUAGCGAAACGACAGUCAAGGGAACGGACUUGAAGGGCUAAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGUUUGACUCCAGUCUGGCUCUGUGCGGCGACUUUGGAGGUGUAGUAUAGGUGGAAGCGCAAGCUCAAAUGAAAUACCACCACUCGGAACGUUGCUUCACUUAUCGAAUGAAGAGACCAAUGGUUGUUUUGCGCAGUCUUCGGGCUGUGCGCCGUCUAGGCUGGGCAUAAUUGUGGUGUUUCUUUCACCGCCACGGGAGGGGUGUUGGUUUUUUAUCCUCCUCUCCGUUUCUCCUUUUCUCUCUUUCUCCCUUUUUUUGGGCGUUUGAGGGUUGGUGACCCGUGGGCGCCCACGCGUGCGGAACUACUGCGCCAACGGGGUGGGAACUUUUCGUUUCUUCUCCGGAGUCUUGUUUCGAGACAUCUGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCAUAUCUGUUACACGACAACGCAGGUGUCCUAAGGCGAGCUCAGUGGGAACAGAAAUCUCACGUGGAACACAAGCGUAAAUGCUUGCUUGAUUAACGAUUUCCAGUACGAAUCGAGACUGCGAAAGCAAGGCCAGCGAUCCUUUGCGAAGAACAGGAAAUAUGAACAAAUCAUACCAGAGGUGUCAGAAUAAUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAACCUAGCGCCGCAGAAGACGCUAAGGGUUGGAUUGUUCACCCACUGACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUGGUUUUACCCUACUUGGCUGGAGAUUGCGAGUAAAAGAUUAUCCGCGCAAAGCGGAGGCAGUCCGUUUUUUUCUGGGUCUGCCGUUCGGUGGCAUGUGCUUGGCGCUGCCAUCUC |
[ reference std structure ]
|
.........................((......))......((((.....)))).........((((....((((..(((.((..(....(.......(((((....(....).....)))))((.(((((((((...((((((........((((....(((.((((..)))).)))))))..(((.((((...(.((.................)).)..)))).)))..))))))...((((....(((..((.......))..)))))).).......)))..)))))).))(.).......((((((((....((.........))...(..((((....((((.....))))......))))..)...(((.(((...((.((.....((....(((.......)))....))..)).)..).)))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))).....).))))))).)..))).))).)))).)))).........(..[[[[[......).]]]]]....(((((..(((.(........(((..((((...(((((.(((((((...((..(((.((.((.((........(...aaaa..((....))..........).AAAA...))).)..)).)))..))....((((.....((......(...((...((((((((....))))))))...).))..((.((((........((((.......))))..((((((..((......((.....))..)).((.((...((((.....(.(((...............))).)...))))...)).))))))))...))))....))...................((((.((((((.....)))))).)))).....))...))))........)))))))..)))))..(((.......)).)((((((...........))))))((.{...{{{{{{{.(.((((((.......))))))...).{{)(..((}}....}}}}}}}....(....(((<....(..>)))...)..((......)).}))..)......((((...............(((.......)))..)))).....)).....)))..).)))........(..(.(.((((((...((.......))...))))))...))...).......((((..((((((...((((((.(......).))))..))..(((.(.....).))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).)))).....)..))).)))))........................(((((.....)))))(((((((((........)))).)))))....((((((..((((...)))).))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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[ predicted structure ] |
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|
3ZEX_C
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
3ZEX_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(..((.(((..((((((.((((((((((((........).).(((..((((...))))...)))..)))).)))..))).))))))(..)).))))..)))))))))).
|
3ZEX_G
|
[ FASTA input ]
|
GUGAGAUUGUGAAGGGAUCUCGCAGGCAUCGUGAGGGAAGUAUGGGGUAGUACGAGAGGAACUCCCAUGCCGUGCCUCUGGUUUCUGGAGUUUGUCGAAGGGCAAGUGCUCCGACGCUAUCGCACGGUGGUUCUCGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAACCAGUCCCAAGACCGGGUGCCCG |
[ reference std structure ]
|
...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
...((((((....).)))))....(((((((..(((((.(.(((((.((.((((..)))))).)))))).((((((...((((...((((((((((....)))))..))))).).))))..))))).((((((.(((((()((.))..)..)))))).)))).))))).....))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........((...((((.(((((.......)))))....(((((((((....(....)..)).))))))).......(((((((((((....(((......)))..........(((.........)))((((......)))).........)))))))))))))))...))((((..))))
|
3ZEX_F
|
[ FASTA input ]
|
CGAAUCGCCACUUCUCUUAUCUGGGUGCUCUGCCCGCCCUUGUCGGCGCCCAGUACCUUCAUUUUCACAAGAU |
[ reference std structure ]
|
..................................((((......)))).........................
|
[ reference ext structure ]
|
..................(..(.........[(((((((.().))))))].)..).)................ ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((.(........)))))..(((((((..(..).))).)..)))...(((.(...)...)))..
|
3ZEX_H
|
[ FASTA input ]
|
UUUUGUCCCUCUCCAAACGAGAGUACAUGCAUGGGCUGGCAUGAGCGGCACGCUCCACGACCGUGGGGCUCGAGGGGCACUUUACGUCCCGAGGCGCUGAACCUUGAUGCUUGGAAUUUCAUGCUCAGGGACUUU |
[ reference std structure ]
|
.....(....(.......)......(.....(..(...(......(((...(((((((....))))))).......(...(...........)...)......))).....)......)...)....).).....
|
[ reference ext structure ]
|
...(((...[(](....))...(..(..((((.((...(.(...((((..((((((((....)))))))).(...((((.(...........).))))...).))))..).)......))..)))).)))).).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((((.....((....))((((((.......).)))))((((............)))).......))))))))......(((((.(((.......)))...(...((((..)))).)....)))))...
|
3ZEX_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((.((.......((.(((((((((((...........).(((..((((...))))...)))..)))).)))..))).))..........))))...))))))))).
|
3ZEX_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(.(((.(((((((((((...(((((((...(((((..)))))(((......)))..))))))...........)....))))).)))))).(((...)))...)))).((((((.(((((((.((((....))).((..........))...).)))))))))))))
|
3ZEX_E
|
[ FASTA input ]
|
UGGAAAUGCGAAACACUUGCCAGGUGACCCAUCCAUCCUCCCACGGUGAGCUUUCUUUUCACCAUAAUCCACAUCUCCGGCCUUGCUGGGGCUUGGGCCUCUCGACUUCUCGCGUUACUCGGAGCGGGGGCUCAAGAUUGAAAAAUGCAGCUCACCCUACGUACUGUCCUUUGUUGUGAGUUCGGCGCAUUAAAGCAAAAACCUGGGGUG |
[ reference std structure ]
|
((....))........((....(.(...((...(((........((((((.......)))))....((...((.............))(..((((........(((.......)))........))))...)....)).......((..((.........))..)).).......))).....)).........))..))..........
|
[ reference ext structure ]
|
(((..)))......((((.((.(.((((((...((((.(((.((((((((.......)))))(..((((..((.............))(((((((((.((...(((.[..(.])))..).)).)))))).))...))))....)(((.(((().....()))).)))))).)))))))....)))......)))))))))).)....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
3ZEX_B
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAACUGCAGACCGUACUCAUCACCGCAUCAGGUCCCCAAGCAUCGAAUGCUCUGGUAACAUAGAGAAAGGUACACUCAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUGCGUAAGUUCGCAAGAAGCAUUGGCUCUGAGGGCAAAGUGGGGGUCCACAGGAGGGCCAGUGUCCUUUGAAGGCUACCCUCCCGAGCCGUAUCUACUAACCUCCUUCUGGUGUGUUGUUUUUACGUCUCACUCCCGCGCAGGUGUUUUCGCUUCCUUUUUUUGGUUGCGCACCUACAAAUUGCCAACUCAGAACUGCUUACGGCGGGGAAUCCAACUGUAUAAUUAAAACAUAGGUUUGUGAUGCAUCCAAGUGGUGUAUGUCGCAAACUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAACGUGAGAGAUUCACCGACGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCUUCCAAUUAGAGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUCCCUCUGUCCCGAGUUACUAUCUAGCGAAACGACAGUCAAGGGAACGGACUUGAAGGGCUAAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGUUUGACUCCAGUCUGGCUCUGUGCGGCGACUUUGGAGGUGUAGUAUAGGUGGAAGCGCAAGCUCAAAUGAAAUACCACCACUCGGAACGUUGCUUCACUUAUCGAAUGAAGAGACCAAUGGUUGUUUUGCGCAGUCUUCGGGCUGUGCGCCGUCUAGGCUGGGCAUAAUUGUGGUGUUUCUUUCACCGCCACGGGAGGGGUGUUGGUUUUUUAUCCUCCUCUCCGUUUCUCCUUUUCUCUCUUUCUCCCUUUUUUUGGGCGUUUGAGGGUUGGUGACCCGUGGGCGCCCACGCGUGCGGAACUACUGCGCCAACGGGGUGGGAACUUUUCGUUUCUUCUCCGGAGUCUUGUUUCGAGACAUCUGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCAUAUCUGUUACACGACAACGCAGGUGUCCUAAGGCGAGCUCAGUGGGAACAGAAAUCUCACGUGGAACACAAGCGUAAAUGCUUGCUUGAUUAACGAUUUCCAGUACGAAUCGAGACUGCGAAAGCAAGGCCAGCGAUCCUUUGCGAAGAACAGGAAAUAUGAACAAAUCAUACCAGAGGUGUCAGAAUAAUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAACCUAGCGCCGCAGAAGACGCUAAGGGUUGGAUUGUUCACCCACUGACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUGGUUUUACCCUACUUGGCUGGAGAUUGCGAGUAAAAGAUUAUCCGCGCAAAGCGGAGGCAGUCCGUUUUUUUCUGGGUCUGCCGUUCGGUGGCAUGUGCUUGGCGCUGCCAUCUC |
[ reference std structure ]
|
.........................((......))......((((.....)))).........((((....((((..(((.((..(....(.......(((((....(....).....)))))((.(((((((((...((((((........((((....(((.((((..)))).)))))))..(((.((((...(.((.................)).)..)))).)))..))))))...((((....(((..((.......))..)))))).).......)))..)))))).))(.).......((((((((....((.........))...(..((((....((((.....))))......))))..)...(((.(((...((.((.....((....(((.......)))....))..)).)..).)))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))).....).))))))).)..))).))).)))).)))).........(..[[[[[......).]]]]]....(((((..(((.(........(((..((((...(((((.(((((((...((..(((.((.((.((........(...aaaa..((....))..........).AAAA...))).)..)).)))..))....((((.....((......(...((...((((((((....))))))))...).))..((.((((........((((.......))))..((((((..((......((.....))..)).((.((...((((.....(.(((...............))).)...))))...)).))))))))...))))....))...................((((.((((((.....)))))).)))).....))...))))........)))))))..)))))..(((.......)).)((((((...........))))))((.{...{{{{{{{.(.((((((.......))))))...).{{)(..((}}....}}}}}}}....(....(((<....(..>)))...)..((......)).}))..)......((((...............(((.......)))..)))).....)).....)))..).)))........(..(.(.((((((...((.......))...))))))...))...).......((((..((((((...((((((.(......).))))..))..(((.(.....).))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).)))).....)..))).)))))........................(((((.....)))))(((((((((........)))).)))))....((((((..((((...)))).))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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[ predicted structure ] |
..(((((..(((((((((((..((.......(((((...............)).)))..........))..)))))...(((((((.((.........)).((((((((.(.(((......)))).(((((((((((..(((((((.((((((((((.....(.((((..)))))..))))))....................(((..))))))).........((...(((..........)))....))...((.......))....)).))).))..)))))..))))))...))))))).)(((((((...........(((((..(((.((((((((..(((.............))))))))))).....(((..)))..............((..((((((.(((..(..((.................))..)..))).))))))..))....((...((..((((.((......)))))).)).)).)))..)))))...)))))))(((((......................))))).(..)..((((((((..(((((((((..(((((((.......(((((((((((((((((.(((...(((...).)).)))...)))))...................))))))))))))......((((((.(((((((..((((((.........)))))).(((...))))))))))(((((((....))))))).(((..(......))))......)))))))))))))((((.((......))))))))))))))).........((((((((...((((((((....(((((((......((((((((..(((((...)))))..)))))))).((((.((((.....(..(((((.((((((((((((.....))))))))))))..((((.......))))((((.(((..)))))))..)))).)..).((((...((((...........)))).))))((((..(.(..((((((((((((((((((.((..))...(((........)))(..)..........))))))(((............)))...(((((((.((((..(((((.((........(.......((.(((...(......)...))))).......)....)))))))..))))))))))).((((..((((........)))).((................)).))))....(((((((((((..........)))))..))))))..)))))..)))))))...............))..)))).)))))))))).(((((.(((...)))..)))))...)))))....))).)))))............))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).))(((((.((.(..)..)))))))....
|
3ZEX_H
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UUUUGUCCCUCUCCAAACGAGAGUACAUGCAUGGGCUGGCAUGAGCGGCACGCUCCACGACCGUGGGGCUCGAGGGGCACUUUACGUCCCGAGGCGCUGAACCUUGAUGCUUGGAAUUUCAUGCUCAGGGACUUU |
[ reference std structure ]
|
.....(....(.......)......(.....(..(...(......(((...(((((((....))))))).......(...(...........)...)......))).....)......)...)....).).....
|
[ reference ext structure ]
|
...(((...[(](....))...(..(..((((.((...(.(...((((..((((((((....)))))))).(...((((.(...........).))))...).))))..).)......))..)))).)))).).. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((((((((..(..(((..)))((((((.......).)))))((((..(........)))))......)))))))))......((((((((((....).)))..((..(((((..)))))))..))))))...
|
3ZEX_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGAAUCGCCACUUCUCUUAUCUGGGUGCUCUGCCCGCCCUUGUCGGCGCCCAGUACCUUCAUUUUCACAAGAU |
[ reference std structure ]
|
..................................((((......)))).........................
|
[ reference ext structure ]
|
..................(..(.........[(((((((.().))))))].)..).)................ ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((.(........)))))(.(((((((.((..))))).)..)))...(((((...).).)))).
|
3ZND_W
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...)))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
3ZND_W
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...)))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((((........))))).(((((..(...)))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
4A1C_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((..))))......(((..))).(.(((((......))))).)(((((..((((((((((.(........)))))))..((((((((((.((((....))))).)))))))))..(((........))).(((..)))))))..)))))..
|
4A1C_2
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((..))))......(((..)))...(((..........)))..(((((..((((((((((...........))))))..(((((..((..(((......)))..))..)))))..(((........))).(((..)))))))..)))))..
|
4A1C_3
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........((((((((((((((.(((..(((((((......)))))))..))).).))))))).)))))).((((..)))).....((((((.......).)))))((.(.((..)))))
|
4A1C_3
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
........(((.(((((((((..(((..((((............))))..)))...))))))).)).))).((((..)))).....(((((..........)))))((.(.(....))))
|
4A4U_A
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
4A4U_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGCUGACGCUGGGUCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
4AOB_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((((..((((..))).)..)))))))...........(((((..)))))..((.((((((..))))))...........)))))).
|
4AOB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((..((((((..(.((..))..)..))))))............((((....))))..((.(((((....)))))...........)))))).
|
4ATO_G
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA |
[ reference std structure ]
|
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(((...[[[[[)))....]]]]]..... ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
........((((..))))..(((......))).
|
4ATO_G
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUGGUGUAACCUUACCGUAGUAGGUGCUAA |
[ reference std structure ]
|
.....(((...[[[[.))).....]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.....(((...[[[[[)))....]]]]]..... ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
........((((..))))(.(((......))))
|
4BW0_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA |
[ reference std structure ]
|
(((...(((....)))......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)))))...))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((...(((....)))......))).
|
4BW0_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAGCCGAAAGGCGAAGAACCCA |
[ reference std structure ]
|
(((...(((....)))......))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)))))...))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((..)))))...).))).
|
4BY9_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((........)).((......))..((((((..)))((........)).((......))..)))))))
|
4BY9_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGAGUGAUGGGCGAACUGAGCUCGC |
[ reference std structure ]
|
((((((....................(...((((....))))......).................))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((.............(((((((((..)))))...)))).............)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((........))................((....))((........))................))))
|
4BYQ_N
|
[ FASTA input ]
|
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG |
[ reference std structure ]
|
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(..(((((.........)))))..).(((.....(((((((((..)))))))))..)))(((((((((....)))))..))))...
|
4BYQ_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG |
[ reference std structure ]
|
.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(..(((((((.....)))))))..).((((....(((((((((..))))))))).))))((((((((((..))))))..))))...
|
4C4Q_N
|
[ FASTA input ]
|
GACUAGCCGUAGUGGCGAGCUCCCUGGGUGGUCUAAGUCCUGAGUACAGGACAGUCGUCAGUAGUUCGACGUGAGCACUAGCCCACCUCGAGAUGCUACGUGGACGAGGGCAUGCCCAAGACACACCUUAACCCUGGCGGGGGUCGCUAGGGUGAAAUCACAUUAUGUGAUGGGGGUACGACCUGAUAGGGUGCUGCAGAGGCCCACUAGCAGGCUAGUAUAAAAAUCUCUGC |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((..((((((((.(((.((....)).))).))))...))))....)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).)).(((....))).((..[[[[.))))))))...))))))).........]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((((((..))))))).))))...)))))...)))))(((....))).))))).))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).))(((((..)))))((..[[[[[))))))))...)))))))........]]]]]. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
4C4Q_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUAGCCGUAGUGGCGAGCUCCCUGGGUGGUCUAAGUCCUGAGUACAGGACAGUCGUCAGUAGUUCGACGUGAGCACUAGCCCACCUCGAGAUGCUACGUGGACGAGGGCAUGCCCAAGACACACCUUAACCCUGGCGGGGGUCGCUAGGGUGAAAUCACAUUAUGUGAUGGGGGUACGACCUGAUAGGGUGCUGCAGAGGCCCACUAGCAGGCUAGUAUAAAAAUCUCUGC |
[ reference std structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((..((((((((.(((.((....)).))).))))...))))....)))))(((....))).)))).)))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).)).(((....))).((..[[[[.))))))))...))))))).........]]]].
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((.((((((((.((((((.(((((((((..((((((....))))))..(((((.(((((((((.(((((((..))))))).))))...)))))...)))))(((....))).))))).))))..((((((((((...))))))))))....(((((...))))).)))))).))(((((..)))))((..[[[[[))))))))...)))))))........]]]]]. ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
4C4W_H
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC |
[ reference std structure ]
|
(((...(((((..........)))))......)))
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((..........))))))...).))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((......)))..))).(((......)))..
|
4C4W_H
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAAGAGCCAUUGCACUCCGGUUUGAUGACCUC |
[ reference std structure ]
|
(((...(((((..........)))))......)))
|
[ reference ext structure ]
|
(((.(((((((..........))))))...).))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((......)))..))).(((......)))..
|
4C7O_E
|
[ FASTA input ]
|
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((......))).)).))))).).))))))))
|
4C7O_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((..)..))).)).))))).).))))))))
|
4CXG_1
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAA |
[ reference std structure ]
|
.(..((.(..(.((.((..(.(.(.((((.(((..(.((..(.....(...((((((((.(.........).)))))))).....).....)..)).)..))).)))).).))..)).)).)...).))...).. ( )
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.(..(.((.(((((.(.(.((((.(((..(.((((((((..(...((((((((.(.........).)))))))).....)..)))))))).)..))).)))).).)))))).)).)().).)).))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..(((.(((((((((((......).)))))))))))).((((((..((((((((((((((((.......))))))))))).).))))..)))).)).((.(((((.((.(((...))))).).))))))..)...
|
4CXG_a
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG |
[ reference std structure ]
|
.(.((....)).)...........................(.....).
|
[ reference ext structure ]
|
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
|
[ predicted structure ] |
(..(((..)))..).....(((....................).))..
|
4CXG_2
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG |
[ reference std structure ]
|
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.((((((((..(((.......)))..))))))..))))).).... () ( )
|
[ predicted structure ] |
((((........)))).((((........)))).................
|
4CXG_1
|
[ FASTA input ]
|
CGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAA |
[ reference std structure ]
|
.(..((.(..(.((.((..(.(.(.((((.(((..(.((..(.....(...((((((((.(.........).)))))))).....).....)..)).)..))).)))).).))..)).)).)...).))...).. ( )
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((.(..(.((.(((((.(.(.((((.(((..(.((((((((..(...((((((((.(.........).)))))))).....)..)))))))).)..))).)))).).)))))).)).)().).)).))).. ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((.((((((..((.........))..)))))))).((((....((((((((((((((((.......))))))))))).).))))....)).)).((.((((..((.(((...)))))...))))))......
|
4CXG_Y
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))((..))((((......))))...(((((.......))))))))))))....
|
4CXG_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCG |
[ reference std structure ]
|
.((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).)....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((.((((((((..(((.......)))..))))))..))))).).... () ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((......))))).((((........))))(........).......
|
4CXG_Y
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))((..))((((......))))...((((((...)..))))))))))))....
|
4CXG_a
|
[ FASTA input ]
|
ACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGG |
[ reference std structure ]
|
.(.((....)).)...........................(.....).
|
[ reference ext structure ]
|
((.(((..))).))..........(..)............(.....).
|
[ predicted structure ] |
...(((..)))........((.......................))..
|
4ENB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
......((((((.((((...(......)....))))....)))))).....
|
4ENB_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
......(((((((((((((((......)))).))))..).)))))).....
|
4ENC_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((...)).)))(.(((....((((((..))))))...))))(......)
|
4ENC_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.....).)))(.(((....(((((....)))))...))))(......)
|
4FNJ_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG |
[ reference std structure ]
|
(.((.(((..((((((....))))).)))).)).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((.((((()((((((..))))))).))).)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((...))..((((((...........))))))...
|
4FNJ_A
|
[ FASTA input ]
|
CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG |
[ reference std structure ]
|
(.((.(((..((((((....))))).)))).)).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((.((((()((((((..))))))).))).)))) ( )
|
[ predicted structure ] |
((...))...(((((...........)))))....
|
4FRG_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...{(.}.((((...<(.(((([(..]..)))))(>(((((..)))))(((((.).).)))))..))))).)))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((..((((....(........)...).))).(((((..)))))(((((.....)))))))).)..))))))).
|
4FRG_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...{(.}.((((...<(.(((([(..]..)))))(>(((((..)))))(((((.).).)))))..))))).)))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...((((..(((....................)))..(((....)))..((((.....)))).))).)...)))))).
|
4FRN_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((...{(.}(((((....(.(((([(..]..)))))(.(.<.<<<<).aaaa(.).).)AAAA..))))))))))).......(((>>>>...>))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((.....(((.(((.(((....................))))))..))).............(((...(((...(((........))).))).)))..))..
|
4FRN_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))).
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((...{(.}(((((....(.(((([(..]..)))))(.(.<.<<<<).aaaa(.).).)AAAA..))))))))))).......(((>>>>...>))). ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((.(...(((((((.((((....(........)...).))))))).))).(((......)))((((..((((..((((((..)))))))))))))).)))..
|
4HXH_A
|
[ FASTA input ]
|
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA |
[ reference std structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ predicted structure ] |
.....((((((....)))))).....
|
4HXH_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA |
[ reference std structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
.....((((((....)))))).....
|
[ predicted structure ] |
.((..((((((....))))))..).)
|
4JF2_A
|
[ FASTA input ]
|
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))))))).(((((((((.((...<<<...)))))))))....(.(((((..)))))).))>>>.. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((....)))))))..............(((((((((..............((((....)))))))))))))
|
4JF2_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA |
[ reference std structure ]
|
(((((((....))))))).((((((((.......[[[[[..))))))))......((((....))))..]]]]]..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..)))))))).(((((((((.((...<<<...)))))))))....(.(((((..)))))).))>>>.. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((..))))))))..(....)......(((((((((..............(((((..))))))))))))))
|
4JRC_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC |
[ reference std structure ]
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(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
|
[ reference ext structure ]
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((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))). ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((......)).))((((((.((......))))))))....).))))).
|
4JRC_A
|
[ FASTA input ]
|
GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC |
[ reference std structure ]
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(((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))). ( ) ( ) ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
(((((.(((........).))((((((...........))))))......))))).
|
4K27_U
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC |
[ reference std structure ]
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|
[ reference ext structure ]
|
((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
|
[ predicted structure ] |
...(((..((((..))))...))).....((.(...)))((((........))))
|
4K27_U
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC |
[ reference std structure ]
|
((((..((..((..(((((...((((....))))..)))))..))..))..))))
|
[ reference ext structure ]
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((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))
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[ predicted structure ] |
.(.(((.(((((..))))..)))))(..)((.(...)))((((........))))
|
4KR2_C
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG |
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|
((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
|
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|
(((((((.[[[[){.<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B..BBBBB)))))) ( ) ( )
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4KR2_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCG |
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[ reference ext structure ]
|
(((((((.[[[[){.<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B..BBBBB)))))) ( ) ( )
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(((((....(((((..))).))..(((((.......)))))...(((((((...)..)))))))))))
|
4KR3_C
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC |
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((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))). ( )
|
[ reference ext structure ]
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4KR3_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGCCGCUGGUGUAGUGGUAUCAUGCAAGAUUCCCAUUCUUGCGACCCGGGUUCGAUUCCCGGGCGGCGC |
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((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))). ( )
|
[ reference ext structure ]
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(((((((.[[[[){<<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B>.BBBBB)))))). ( ) ( )
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(((((....(((((..))).))..(((((.......)))))...(((((((...)..))))))))))).
|
4KR7_X
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.......((((....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
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(((((((.......(((((....))))))))))))....
|
4KR7_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCAAGUCCGGGCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((.......((((....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((().(..)(((((..)))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(..)..((((((..)))))))))))))....
|
4KZE_R
|
[ FASTA input ]
|
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC |
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|
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).))))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((......................((((((((....((((((.........))))))...)).)).)))).)))))))
|
4KZE_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
|
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|
(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).))))))))) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.............)......(((((((((((.(((((((.......)))))))))))).)).))))))))))))
|
4L81_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU |
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|
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|
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|
(((((..(((((((..)))))[)).()(((((.{{{{..))).))....]..((((((..)))))))))))((((((..))))))......}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
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|
4L81_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGUCCGU |
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|
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|
[ reference ext structure ]
|
(((((..(((((((..)))))[)).()(((((.{{{{..))).))....]..((((((..)))))))))))((((((..))))))......}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
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|
4LCK_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUGAGAAGAAGAGUAUUAAGGAUUUACUAUGAUUAGCGACUCUAGGAUAGUGAAAGCUAGAGGAUAGUAACCUUAAGAAGGCACUUCGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((.....(((((.((.(((((((..(((((((((((...)))((((((........).))))).))))))))))))))).)).)))))..)))))))
|
4LCK_F
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUGAGAAGAAGAGUAUUAAGGAUUUACUAUGAUUAGCGACUCUAGGAUAGUGAAAGCUAGAGGAUAGUAACCUUAAGAAGGCACUUCGAGCACCC |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((((......(((....(..((((((..(((((((..........(((((...........)))))..)))))))))))))..)....)))...))))))
|
4M4O_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC |
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|
((((((.(((((.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).))))).))))))
|
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|
(((((((((((((((..(...)((((.(.(.[..)]..).))))))))))))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((.(.((..))((((((((........)))))))).)))))).))))))
|
4M4O_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUCAUCAGGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACUUGACGAACCC |
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|
((((((.(((((.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).))))).))))))
|
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|
(((((((((((((((..(...)((((.(.(.[..)]..).))))))))))))))))))) ( ) ( )
|
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((((((.(((((.........(((((.((........)).)))))..))))).))))))
|
4M6D_F
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
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|
..(.((.......((((.(.(.[..)]..).)))))).)..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
............(((((.((........)).))))).....
|
4M6D_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
..(........).((((((((........)))))))).....
|
4M6D_D
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
.(((.((.......((((...(.[..)]....)))))).)))
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((...(..)((((.(.(.[..)]..).)))))))))) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
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|
4M6D_L
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC |
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|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((.........(((((.((........)).)))))..))))
|
4M6D_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGCC |
[ reference std structure ]
|
.(((..(.......((...(.(.[..)]..)...)))..))).
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((.(.((..))((((((((........)))))))).)))))
|
4M6D_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCUAAAGAGUGCAGAGUUACUUAGUUCACUGCAGACGC |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
.(((((..(...)((((.(.(.[..)]..).)))))))).) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(........).((((((((........)))))))).....
|
4MGN_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU |
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|
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|
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|
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|
[ predicted structure ] |
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|
4MGN_B
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU |
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|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
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|
4MGN_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAUCAAUAGUAGUUAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUAAUGAAACGGCAGUUCC |
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|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(.(((((((((((......)).))((((((.((......))))))))....).)))))).)..)))).))))).
|
4MGN_C
|
[ FASTA input ]
|
GAAUCAAUAGUAGUUAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUAAUGAAACGGCAGUUCC |
[ reference std structure ]
|
(((.........(((((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).)))))))..........))).
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
(((..((.......(((((.(((........).))((((((...........))))))......))))).......))...))).
|
4MGN_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC |
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|
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|
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|
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|
[ predicted structure ] |
((((((..((((.......))))...((((((((..))))))))..((((((...)..)))))))))))...
|
4MGN_D
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC |
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|
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|
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|
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|
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|
4OOG_D
|
[ FASTA input ]
|
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC |
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|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
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|
4OOG_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CAUGUCAUGUCAUGAGUCCAUGGCAUGGCAUGGC |
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|
((((((((((((((....))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((....))))))))))))))..
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|
4OQU_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA |
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|
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|
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|
(((((..((((((....))))[))..((((((.{{{{{.))).)))...]..(((((....))))))))))((((((..))))))......}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
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|
4OQU_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA |
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|
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|
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(((((..((((((....))))[))..((((((.{{{{{.))).)))...]..(((((....))))))))))((((((..))))))......}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
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|
4P5J_A
|
[ FASTA input ]
|
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC |
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|
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|
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|
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|
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..(((((......))))).((((((.......))))))....((((.......)))).(((((....)))))...........
|
4P5J_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACC |
[ reference std structure ]
|
.((((((..[...)))))(((((((.......)))))))...{{{{..]....}}}}(((...{{{{{{))).).}}}}}}..
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((([[()..)))))(((((((.......)))))))...{{{{{]..}].}}}}(((..{{{{{{{))).).}}}}}}.} () ( ) ( )
|
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|
4P8Z_A
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC |
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|
(((((..(((((..(((((((((...[[[.)))))))))..{{{{.{{{.{{{{......{{{{{...{{{{..{{{...]]]}}}.......}}}}((....)).....<<<<<...}}}}}.(((.....)))}}}}.}}}....>>>>>.((((....))))....}}}}...)))))..)))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((..(((((((((...[.[.))))))))).{<<<<<<<<<<<<<(..<)<<<<<<.<.<<<<a.aaa...]].AAA...>.A..>>>aa...>AA....aaaaaa.()>>>>>>a.(.....)>A>>>>>>>>>.}.AAAAA.(((((..)))))..A.>>>>...)))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((..((((((((((((((((.......)))))))))...(((..(((.(((.................))).((((...))))((....)).(((((..(((.(((.((((((((.(((..........))))))..(...)..)))))))))))..)))))))).)))..)))))))..))).)
|
4P8Z_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAACAGUCGUUCCGAAAGGAAGCAUCCGGUAUCCCAAGACAAUC |
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|
(((((..(((((..(((((((((...[[[.)))))))))..{{{{.{{{.{{{{......{{{{{...{{{{..{{{...]]]}}}.......}}}}((....)).....<<<<<...}}}}}.(((.....)))}}}}.}}}....>>>>>.((((....))))....}}}}...)))))..)))))
|
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|
((((((((((((..(((((((((...[.[.))))))))).{<<<<<<<<<<<<<(..<)<<<<<<.<.<<<<a.aaa...]].AAA...>.A..>>>aa...>AA....aaaaaa.()>>>>>>a.(.....)>A>>>>>>>>>.}.AAAAA.(((((..)))))..A.>>>>...)))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
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.((((..(((((((((((((((((..)...)))))))))...(((.((((.((((...............)))).((((...))))(((..))).(((((.((((.(((.((((((((.(((..........))))))..(...)..)))))))))))).))))))))))))..)))))))..))).)
|
4PDB_I
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.([)((((..))))...])))))))))) ( ) ( )
|
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(((((((((.(((..(((..)))..))).)))))))))
|
4PDB_I
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((...(((((....)))..)).)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.([)((((..))))...])))))))))) ( ) ( )
|
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(((((((((.((...((....))...)).)))))))))
|
4PJO_2
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........))))))................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......)))))))................
|
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.((((((......))))))..((((((((........)))))..)))
|
4PJO_4
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........)))))).................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......))))))).................
|
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.((((((......))))))..((((((((........)))))..))).
|
4PJO_4
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........)))))).................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......))))))).................
|
[ predicted structure ] |
.((((((......))))))..((((((((........)))))..))).
|
4PJO_2
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUG |
[ reference std structure ]
|
..........((((((.........))))))................
|
[ reference ext structure ]
|
..........(((((((.......)))))))................
|
[ predicted structure ] |
.((((((......))))))..((((((((........)))))..)))
|
4PKD_V
|
[ FASTA input ]
|
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
|
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|
4PKD_V
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..........))))).(((((...(((...((..))...)))..)))))
|
4PLX_A
|
[ FASTA input ]
|
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA |
[ reference std structure ]
|
(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...))))))((((((((....)))))))).((((((((((....(((.....)))...))))))))))
|
4PLX_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA |
[ reference std structure ]
|
(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
|
[ reference ext structure ]
|
((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((...))))))(((((((((..))))))))).((((((((((.((.((((...)))))).))))))))))
|
4QJD_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.......(((((((((..((((.(((..)))))))..)))))))))
|
4QJD_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.......(((((((((..((((.(((..)))))))..)))))))))
|
4QJD_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
.............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
........(((((((((..((((.(((..)))))))..)))))))))
|
4QJD_D
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.......((((.((....((.............))....)).))))
|
4QJD_F
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.......((((.((....((.............))....)).))))
|
4QJD_B
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAUGAUAUAGCCGGUCCCAAGCCCGGAAAAAGGAGGAGGGUAUA |
[ reference std structure ]
|
.............((((.[[[....))))...........]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
.............((((([[[[)[.))))....].....]]]]....
|
[ predicted structure ] |
........((((.((....((.............))....)).))))
|
4QJH_F
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
.........(((.[[[....))).............]]]........
|
[ reference ext structure ]
|
........((((([[[[)[.)))).(.)]......]]]]........ ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.(((.((((((..........))))))))).)).)))....
|
4QJH_B
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
.........(((..[[....))).............]].........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........ ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((.((.....(((((............)))))....)).)))....
|
4QJH_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
........(((..[[......))).............]]........
|
[ reference ext structure ]
|
........(((((()[[)..))))...........]]........() ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.(((.((((((..........))))))))).)).)))....
|
4QJH_F
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
.........(((.[[[....))).............]]]........
|
[ reference ext structure ]
|
........((((([[[[)[.)))).(.)]......]]]]........ ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.....(((((............)))))....)).)))....
|
4QJH_D
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
........(((..[[......))).............]]........
|
[ reference ext structure ]
|
........(((((()[[)..))))...........]]........() ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((.((.....(((((............)))))....)).)))....
|
4QJH_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUAAAGCGGUUACAAGCCCGCAAAAAUAGCAGAGUAAUGUCGCG |
[ reference std structure ]
|
.........(((..[[....))).............]].........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(((.[[[[)[..)).....]......]]]]........ ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
(((.((.(((.((((((..........))))))))).)).)))....
|
4QK8_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GUUGCCGAAUCCGAAAGGUACGGAGGAACCGCUUUUUGGGGUUAAUCUGCAGUGAAGCUGCAGUAGGGAUACCUUCUGUCCCGCACCCGACAGCUAACUCCGGAGGCAAUAAAGGAAGGA |
[ reference std structure ]
|
..((((....((....))..(((((....(.....(.[((((....((((((.....))))))..(((((.{{{{{{)))))..)))).)].)....)))))..)))).....}}}}}}.
|
[ reference ext structure ]
|
..((((((.((((..))))[.(((((..((.....(.[((((.(.(((((((.....)))))))[)((((.{{{{{{)))).].)))).)].))..))))))]))))).....}}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((..)(.((((((((..((((...)))))))))))).).....(((((((...)))))))..((((........))))(.......)))))..((((((((......)))))).)).
|
4QK8_A
|
[ FASTA input ]
|
GUUGCCGAAUCCGAAAGGUACGGAGGAACCGCUUUUUGGGGUUAAUCUGCAGUGAAGCUGCAGUAGGGAUACCUUCUGUCCCGCACCCGACAGCUAACUCCGGAGGCAAUAAAGGAAGGA |
[ reference std structure ]
|
..((((....((....))..(((((....(.....(.[((((....((((((.....))))))..(((((.{{{{{{)))))..)))).)].)....)))))..)))).....}}}}}}.
|
[ reference ext structure ]
|
..((((((.((((..))))[.(((((..((.....(.[((((.(.(((((((.....)))))))[)((((.{{{{{{)))).].)))).)].))..))))))]))))).....}}}}}}. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((....(.((((((((..(((.....))))))))))).).....(((((((...)))))))..(((..........))).........))))..(((((............))).)).
|
4R4P_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......))).)))(((..(((.(((..((((......))))..)))...)))))).....)))))))))..))...)))).)
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))((((((([[[[.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))[[[).(((((((..((((......))))..)))..))))]]]....]]]]))))))..))..))))).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((((.((((((((..(..((((......)))))..))))))))..((((..((((.((..((.((((((...((((((..)).))))...)))))).))..))))))...)))..(((((((((((..)))))))))))((((........)..))))))))).....)))))))
|
4R4P_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....)))))..(((((((.......)))))))......))).)))(((..(((.(((..((((......))))..)))...)))))).....)))))))))..))...)))).)
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))((((((([[[[.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))[[[).(((((((..((((......))))..)))..))))]]]....]]]]))))))..))..))))).) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((((.((((......(..(((........))))......))))...(((..((((........(((((....((((((..)).))))....))))).......))))...)))..((((((((((....))))))))))(((............))).))))).....)))))))
|
4RMO_P
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG |
[ reference std structure ]
|
......(((((...[[[[[..))))).........]]]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]... ( )
|
[ predicted structure ] |
(..((((((((((((..))))))))))))..).(........).
|
4RMO_P
|
[ FASTA input ]
|
AAGUUUACCACUGACCGAUAUGUGGUAUAUAAAUGGUCGGGUUG |
[ reference std structure ]
|
......(((((...[[[[[..))))).........]]]]]....
|
[ reference ext structure ]
|
......((((((.[[[[[[).))))).........]]]]]]... ( )
|
[ predicted structure ] |
.....(((((((........)))))))......(........).
|
4TUW_C
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ predicted structure ] |
....(..((((((....))))))..).
|
4TUW_C
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))....
|
[ predicted structure ] |
.......((((((....))))))....
|
4TUX_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ predicted structure ] |
....(..((((((....))))))..)
|
4TUX_D
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAAGGCCCUUUUCAGGGCCACC |
[ reference std structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
.......((((((....))))))...
|
[ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...
|
4TVX_L
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG |
[ reference std structure ]
|
..............................................(((((....)))))
|
[ reference ext structure ]
|
..............................................((((((..))))))
|
[ predicted structure ] |
......(...............)(((((.(......))))))....(((((....)))))
|
4TVX_L
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGACGGUAUUGUUCAGAUCCUGGCUUGCCAACAGGAGUUCCCCGCGCCAGCGGG |
[ reference std structure ]
|
..............................................(((((....)))))
|
[ reference ext structure ]
|
..............................................((((((..))))))
|
[ predicted structure ] |
.......................(((((.........)))))....(((((....)))))
|
4TZY_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[..[[)))))))).....).{{{{{{]]...]]}}}}}}..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..((((((((.(...).)))))))).......((((((.(...).))))))..)))))))))
|
4TZY_X
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[..[[)))))))).....).{{{{{{]]...]]}}}}}}..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..((((((((.......)))))))).......((((((.......))))))..)))))))))
|
4U7U_X
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG |
[ reference std structure ]
|
.............................................((((((....))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.............................................(((((((..)))))))
|
[ predicted structure ] |
.......(((((..((.....................))..)))))(((.(((..))))))
|
4U7U_X
|
[ FASTA input ]
|
AUAAACCGGGCUCCCUGUCGGUUGUAAUUGAUAAUGUUGAGAGUUCCCCGCGCCAGCGGGG |
[ reference std structure ]
|
.............................................((((((....))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.............................................(((((((..)))))))
|
[ predicted structure ] |
.......(((((..((.....................))..)))))(((.(((..))))))
|
4UE4_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUUUAAGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((((((.......[[..))))...{{{{{...]]......}}}}}))......((((((...((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((.(((..(((((((.((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..))))...)).))))))....)))))))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))...)))))).))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((..([[)[[[)))))(.){{{{{.].]].]]...}}}}})))))(..(((((((((((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((({)(..(((((((.((((((((..(((((((((((....(((((.(((((....)))).))))))..))))).).)))))...)).))))))....)))))))).})))).)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((.(((((((..((((((((((...........))))).(..)...(((((((..)...((((((((.((((((..)))))))))))))).(........)..((.((((.(((..((...(((..))))).))))))).))))))))).))))))..)))))...))))))).)))((.((((....)))))).((..(((.((((.(((..)))))..)).)))))(((((..)))))).)))))))
|
4UE4_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUUUAAGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((((((.......[[..))))...{{{{{...]]......}}}}}))......((((((...((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((.(((..(((((((.((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..))))...)).))))))....)))))))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))...)))))).))))))) ( )
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((((((..([[)[[[)))))(.){{{{{.].]].]]...}}}}})))))(..(((((((((((((((.((((((((.(..((((.(((((((.(((((({)(..(((((((.((((((((..(((((((((((....(((((.(((((....)))).))))))..))))).).)))))...)).))))))....)))))))).})))).)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((((..((..((..((((.(((((...........)))))........(((((((..)...((((((((.((((((..)))))))))))))).(........)..((.((((.(((..((...(((..))))).))))))).))))))))..))))))....))....))))))).)))((.((((....)))))).((..(((.((((.(......)))..)).)))))..((....))....)))))))
|
4UE5_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCU |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..[...)))))))....{{{{.....]..}}}}))).(((((.((....(((((...((.((((.....((((..((((((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((.(((.(..((.(..((((((....))))))..).))..).))......(.(((((.....((((....(((....)))....))))...))))))).))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))..)))).)))).)).....)))))...)).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.[{).)))))))....<<<<.....]}.>>>>))).((((((((.(.)(((((..((..((((...(<)(((.(((((((.(((((......(((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((..<a)))))))))).)).))))......b.bbbbbb....bbbbbbbbbb....>ABBBBBBBBBB..BBBBBBB)))))))))).)))))))...)))))))...)))))))))))).))).>)))).).)....)))))...)))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((..)..)))))))).).((((........))))....(((((.((.(((((((((((...(((..(..(((((.(((((((.(((((.(((..(((((((..)))).)))..))).......((((((..(((((......)))))..))))).)..((((((..))))))...((((((..))))))...(..)(((((((..).(.(((((((((..)))).)))))...).))))))..))))))))))))).))))))))....))).)))))).))))))))).
|
4UE5_A
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCU |
[ reference std structure ]
|
((((((((((..[...)))))))....{{{{.....]..}}}}))).(((((.((....(((((...((.((((.....((((..((((((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((.(((.(..((.(..((((((....))))))..).))..).))......(.(((((.....((((....(((....)))....))))...))))))).))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))..)))).)))).)).....)))))...)).))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.[{).)))))))....<<<<.....]}.>>>>))).((((((((.(.)(((((..((..((((...(<)(((.(((((((.(((((......(((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((..<a)))))))))).)).))))......b.bbbbbb....bbbbbbbbbb....>ABBBBBBBBBB..BBBBBBB)))))))))).)))))))...)))))))...)))))))))))).))).>)))).).)....)))))...)))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((((......))))))))...((((........))))....(((((.((.((((((((((....(((..(..(((((.(((((((.(((((.(((..(..((((..))))...)..)))........(((((..(((((......)))))..)))))....((((......))))...((((((..)))))).......((((((.....(.(((((((((..)))).)))))...).))))))..))))))))))))).)))))))).....)).)))))).))))))))).
|
4UN5_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG |
[ reference std structure ]
|
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
|
[ predicted structure ] |
(..((((((((((((((((...)))(((((((((..((((..)))).....)..))))))))))).)))))))).))..).
|
4UN5_A
|
[ FASTA input ]
|
AUAACUCAAUUUGUAAAAAAGUUUUAGAGCUAGAAAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUG |
[ reference std structure ]
|
....................((((((..((((....))))....))))))..(((..).)).......((((....)))).
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((..((((....))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).
|
[ predicted structure ] |
.....((((.(((((((((...)))...(((((...((((..))))........)))))...))).))).)))).......
|
4UYJ_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGUAAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((.[.{{{{{.)))))....<<<<<}]..}}}}....>>>>>)))))).((((((((((.((((((((..))))))))).)))))))))..)))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((.(((..((((..))))..)).))))))))))).))))
|
4UYJ_R
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGUAAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((.[.{{{{{.)))))....<<<<<}]..}}}}....>>>>>)))))).((((((((((.((((((((..))))))))).)))))))))..)))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))).))))
|
4UYK_R
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGAAGCCGCCUCUGUAAGGAGGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...[[[[[{)))))....<<<<<]}..]]]]....>>>>>)))))).(((((((((((((((((((((((((((((((.).))))))))))))))))))))))))))))))..)))) ( ) () ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
.(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((..((..(((...((((((((......))))))))...)))..))..)))))))))).))))
|
4UYK_R
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGAGGGGCGGUUCCCGAAGCCGCCUCUGUAAGGAGGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCU |
[ reference std structure ]
|
.((((..(((((((((...[[[[[.)))))....{{{{....]]]]].....}}}}))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...[[[[[{)))))....<<<<<]}..]]]]....>>>>>)))))).(((((((((((((((((((((((((((((((.).))))))))))))))))))))))))))))))..)))) ( ) () ( ) ( ) ( ) ()
|
[ predicted structure ] |
.(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((.(((..(((((((((((((((...).))))))))))))))..)).))))))))))).))))
|
4W24_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
............................................(((.[[....[)))...]...{{{......]].............}}}.............((....))(.....((.......)).....)....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(..(.(.(.((.[[....[))).{.]...{{{{{{{..]]..}.......}}}}}}...}....))..)((....))(((...((((.)..)))...))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.............(((..((((......)))).))).....((((((((.(((((..(((((((((..........)))))))))..))).))......(((((..)))))((((((((...))))))))))).).))))......))))..
|
4W24_8
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
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|
[ predicted structure ] |
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|
4W24_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU |
[ reference std structure ]
|
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|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
((((((((.(...(((.(((........((((((......))))..))..(((((.((((......)))).)))))...))).)))..)..(((((.((....)))))))))))))))..
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4W24_7
(ext)
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[ FASTA input ]
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GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU |
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[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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4W28_6
(ext)
|
[ FASTA input ]
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UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA |
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.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).).... ( )
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[ predicted structure ] |
(((((((.....((.((((..((((.(((((.......)))))))))))))))..((......)).)))))))...
|
4W28_6
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[ FASTA input ]
|
UGCCCGGUAGCCCCGAAGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA |
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.(.((((....(.(.[{....).)..((((.........)))).......<<.(...)]}.>.>..)))).).... ( )
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.(.((((....(.([{(.{).).).(((((.........)))))...]<.<<<<.}.>}.>>.>.>)))))..... ( ) ( ) ( ) ( ) ()
|
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(((((((.....((.((((..((((.(((((.......)))))))))))))))..(........).)))))))...
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4WFL_A
(ext)
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[ FASTA input ]
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GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
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|
4WFL_A
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[ FASTA input ]
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GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU |
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(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.){{{{{]...]]]]...}}}}})))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))) ( ) ( ) ( )
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4WJ4_B
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4WJ4_B
(ext)
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4X4P_B
(ext)
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4X4P_B
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4XW7_A
(ext)
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4XW7_A
|
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4Y1J_A
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AAAGGGGAGUAGCGUCGGGAAACCGAAACAAAGUCGUCUAUUCGUGAGGAAACUCACCGGCUUUGUUGACAUACGAAAGUAUGUUUAGCAAGACCUUUCC |
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4Y1J_A
(ext)
|
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AAAGGGGAGUAGCGUCGGGAAACCGAAACAAAGUCGUCUAUUCGUGAGGAAACUCACCGGCUUUGUUGACAUACGAAAGUAUGUUUAGCAAGACCUUUCC |
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|
4Y1M_B
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[ FASTA input ]
|
GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC |
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(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((...(((......)))....)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
|
4Y1M_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC |
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4ZNP_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACAGGACUGGCGGAUUAGUGGGAAACCACGUGGACUGUAUCCGAAAAAAAGCCGACCGCCUGGGCAUC |
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|
4ZNP_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACAGGACUGGCGGAUUAGUGGGAAACCACGUGGACUGUAUCCGAAAAAAAGCCGACCGCCUGGGCAUC |
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.((((((((..(.[[[[[....((((....))))..)..))))))))........{{{..]]]]]..}}}...
|
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|
5A17_A
|
[ FASTA input ]
|
GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC |
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|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((.....))))).))))))))
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5A17_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC |
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|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((((.....))))).))))))))
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(((((((((.(((.((..))))))))))))))
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5AJ3_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..[[[[[..)))))(((((((((..((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((...(((((...)))))...))).)).(((....((..((((......))).)))......)))..(.....)))).(((....))).....)))))).......(..((...(((((....)))).))).).)).))))))...(.((((((.....[[[.....[[.)))]].......]]]..))).)..))))))))).....((((......((((...((..............(((((((......((((((.((........))..))))))......).....(.((....)))))))))......))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{{......)..}}}}}}}.))).(((........((....))......)))...]]]]](((((.(((((.(...((..(((((..((((((((((.....((........))..........(((((((..(......).((.(((...((((((.(....((..(((((....))).......))..))......((.....))......).).)))...)).)))))....)))))))..)).)))))))).(...((((.....))))..(.....)..(....(((((((......)))))))....)..)..))))).....(((((((.........)))))))......))...).)))))))).))..(.(..((.(...(((.((..((((((.(((((...((((.....))))..)))))...).)))))..)).)))....).))...)..)..(((((((((....)))))))))}.......
|
[ reference ext structure ]
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|
[ predicted structure ] |
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|
5AJ3_A
|
[ FASTA input ]
|
ACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC |
[ reference std structure ]
|
(.((((..[[[[[..)))))(((((((((..((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((...(((((...)))))...))).)).(((....((..((((......))).)))......)))..(.....)))).(((....))).....)))))).......(..((...(((((....)))).))).).)).))))))...(.((((((.....[[[.....[[.)))]].......]]]..))).)..))))))))).....((((......((((...((..............(((((((......((((((.((........))..))))))......).....(.((....)))))))))......))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...{{{{{{{......)..}}}}}}}.))).(((........((....))......)))...]]]]](((((.(((((.(...((..(((((..((((((((((.....((........))..........(((((((..(......).((.(((...((((((.(....((..(((((....))).......))..))......((.....))......).).)))...)).)))))....)))))))..)).)))))))).(...((((.....))))..(.....)..(....(((((((......)))))))....)..)..))))).....(((((((.........)))))))......))...).)))))))).))..(.(..((.(...(((.((..((((((.(((((...((((.....))))..)))))...).)))))..)).)))....).))...)..)..(((((((((....)))))))))}.......
|
[ reference ext structure ]
|
(.(((((.[[[[[)[)))))((((((((((.[[[[[[((.((([[[{{{{.(((....))).(..){)(...({(((((.((((((((.)))))))).))).)).((((<<(((..(((((...).))).)))...))>))))}((...))).}.(((....)))(.)..}}}]]]))(..)<<}((((...(((((..))))).))))>>)))]]]]]]...((((((((().<<<<<(..)<<<.)))>>>......>>>>>)))))..))))))))).....(((((...<.(<<<<.<<<......<......<<<<<<<(((...(((((((.((.(....).))..)))))))...))).....<.<<<.)>>>>>>>>>>>...>.>>>>.>>>..(..((((((...((.((((((.........)))))).))))))))..)...a...aaaaaaa.....))..AAAAAAA>))).aaaaa.aa>(.((....)).)AAAAAAA.].]]]]](((((.(((((.(...((..(((((((((((((aaaa...aaaa......).AA....b......bbbbbbb.(......).bb.bbb(.bc)((((((..(.((.((((((....))).......))).))......((.....))....).))).)))BA..C.BBBBB..B.BBBBBBA..AA.AA.))))))(((.((((.....))))).((..).).)((..(((((((((...).))))))))..))..).))))))cc()ccccccccc..B....CCCCCCCCC.CC..)))....)))))))).))..(.(((((.(..(((((((((((((((((((((...((((.....))))..))))).).).))))))))))))))...).)).)))c.)C.(((((((((....)))))))))A....... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((......))))).((........(((((.........(((........)))..((((...).))))))))..(((...(((((...)))))...)))))..((((.(((((((((.((((((..(((.(((.......(((..))).(((...(((..)))........))).............(..)(((....))))))))).))))))....(((((((.......(((.(((..........(.......(..((((......))))..)...(((..........))).....).........)))...)))((((.(((.(((((...((......))....))))).)))....)))).(((....)))))))))).....(((.(...(....)(((((...((.(.((((..((..)).)))).).)))))))...........(((((((.........))))))).).)))....((....(.............)....))((((((...((((((((........(((.(((((..)))))....((..............)).(((.((((((((((......))..((((......((.....................))....))))((((((((..(.((((..........)))))..(..).))).))))))))))))).)))(((((.....))))).)))((((((((.................))))))))...(((((..(.......)..))))).....(((((((.........)))))))...........))))))))((...........))....(((.((..((((((.((..(((.................))).)).).)))))..)).))).))))))....(.......)...........)))))))))...))))
|
5AXW_B
|
[ FASTA input ]
|
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU |
[ reference std structure ]
|
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).))))....
|
[ predicted structure ] |
((..(((..((((.((((....(((((((..(((....)))....))))))).))))))))))).)).....
|
5AXW_B
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGAAAUUAGGUGCGCUUGGCGUUUUAGUACUCUGGAAACAGAAUCUACUAAAACAAGGCAAAAUGCCGUGUU |
[ reference std structure ]
|
....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))).....
|
[ reference ext structure ]
|
....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).))))....
|
[ predicted structure ] |
((.((((..((((.((((.(..(((((((..((((..))))....)))))))))))))))))))))).....
|
5CCB_N
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((([{{.{).......}]}}((((((((...))))))))....(((((.......)))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((...(((((((....))................)))))....(((((..(..).)))))))))))..)).
|
5CCB_N
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
.(((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((([{{.{).......}]}}((((((((...))))))))....(((((.......)))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((..)))................)))))))..(((((.((..)))))))))))))..)).
|
5D3G_E
|
[ FASTA input ]
|
ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5D3G_E
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5DDR_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((....)))))..[.....((((((..........))))))....)))))].
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[(((((((..)))))))){.(()(((((((..........))))))).).]]].)}. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((..))))))(..)....((((((..........)))))).)..)))))..
|
5DDR_A
|
[ FASTA input ]
|
CGUUGACCCAGGAAACUGGGCGGAAGUAAGGUCCAUUGCACUCCGGGCCUGAAGCAACGCG |
[ reference std structure ]
|
(((((.(((((....)))))..[.....((((((..........))))))....)))))].
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[(((((((..)))))))){.(()(((((((..........))))))).).]]].)}. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((((....)))))........((((((..........))))))....)))))..
|
5DI4_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA |
[ reference std structure ]
|
...............(....).(((((......)))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.........(.....(....)[[[[[[[)..].]]]]]].........
|
[ predicted structure ] |
((((......))))(((....)))...((((.............))))
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5DI4_A
(ext)
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[ FASTA input ]
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GGGUACUUAAGCCCACUGAUGAGUCGCUGGGAUGCGACGAAACGCCCA |
[ reference std structure ]
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...............(....).(((((......)))))..........
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[ reference ext structure ]
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.........(.....(....)[[[[[[[)..].]]]]]].........
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[ predicted structure ] |
((((......))))((((..))))...((((((........)).))))
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5F9F_D
(ext)
|
[ FASTA input ]
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GAAUAUAAUAGUGAUAUUAUAUUC |
[ reference std structure ]
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((((((((((....))))))))))
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[ reference ext structure ]
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((((((((((....))))))))))
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[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
5F9F_D
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[ FASTA input ]
|
GAAUAUAAUAGUGAUAUUAUAUUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((....))))))))))
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[ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
5F9R_A
(ext)
|
[ FASTA input ]
|
GCGCAUAAAGAUGAGACGCGUUUUAGAGCUAUGCUGUUUUGAAAAAAACAGCAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCUU |
[ reference std structure ]
|
...................((((((..((((((((.(..(....)..).))))))))....))))))..(((..).)).......(.((....)).).((.(((...))).))..
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[ reference ext structure ]
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[ predicted structure ] |
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|
5F9R_A
|
[ FASTA input ]
|
GCGCAUAAAGAUGAGACGCGUUUUAGAGCUAUGCUGUUUUGAAAAAAACAGCAUAGCAAGUUAAAAUAAGGCUAGUCCGUUAUCAACUUGAAAAAGUGGCACCGAGUCGGUGCUU |
[ reference std structure ]
|
...................((((((..((((((((.(..(....)..).))))))))....))))))..(((..).)).......(.((....)).).((.(((...))).))..
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[ reference ext structure ]
|
...................((((((..((((((((.((.(....).)).))))))))....)))))).((((..).)))......((((....)))).((((((.())))))).. ( ) ( )
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[ predicted structure ] |
..............(((..((((((...((((((((((((....))))))))))))..........))))))..)))..((.(((...))).))...(((((((...))))))).
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5GAP_U
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[ FASTA input ]
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UUCUUGCCUUUUACCAGAAC |
[ reference std structure ]
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.(((...........)))..
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[ reference ext structure ]
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(((((.........))))).
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[ predicted structure ] |
(((.((........))))).
|
5GAP_U
(ext)
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[ FASTA input ]
|
UUCUUGCCUUUUACCAGAAC |
[ reference std structure ]
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.(((...........)))..
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[ reference ext structure ]
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(((((.........))))).
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[ predicted structure ] |
(((.((........))))).
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5HLF_E
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[ FASTA input ]
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UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
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..(((((((((((((((...)))))))))))))))
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[ reference ext structure ]
|
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
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[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
|
5HLF_E
(ext)
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[ FASTA input ]
|
UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG |
[ reference std structure ]
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..(((((((((((((((...)))))))))))))))
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[ reference ext structure ]
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..(((((((((((((((...)))))))))))))))
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[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((...)))))))))))))))
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