1VX6_B
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGUUCAUACUACAGUGGAUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCACUGUAAGGCUUGGCUAGUACUGAGGUGGGAGACCGCUCGGGAACACCAGGUGAUGAGUCAG |
[ reference std structure ]
|
((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
([[[[[[[....[[[[[[[[[.)](((((((...([...).].))))..))...)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).)))))))))]]]]]]]... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))((((((.(....(((((.(((....)))))))).)...))))))))))))))..
|
2KDQ_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((......))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((([..(]((......)).))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((....((((......)))).)))).
|
2L94_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC |
[ reference std structure ]
|
((((((((.((((((((((....))))))))))....))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((.(.(((((((((((......)))))))))))...).)))).
|
2WRQ_Y
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUGAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((...(..(..............)..((((.......)))).......(.............).)...)).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((.(.({<(...}....(..(>.)..((((.......))))...)...[...[.).].....].)..)))..... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
|
2XKV_B
|
[ FASTA input ]
|
CUCUGUUGGUUCUCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAUGUAGCUGGC |
[ reference std structure ]
|
.........(....(....((.......(((......((.....((......)).....))...)))........).)......)....)......
|
[ reference ext structure ]
|
.........(...(((...(((.....((((......((....(((.(.)..)).)...))...))).).....)).).....)))...)...... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.................................................................(((..........(.....)......)))..
|
2XQD_Y
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAACACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA |
[ reference std structure ]
|
((.((((..((((........))))((((((.......))))).)...(((((.......))))))))).))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)(......])}.(((((((.....))))))})..)(((((.......)))))))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
2XXA_G
|
[ FASTA input ]
|
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGC |
[ reference std structure ]
|
(.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))))..)).))))))...)))))))).)
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((.((((((((((((((((((((((...((((...(((((..)))))...))))).))).))).))))))).)).))))))...)))))))))) ( )
|
[ predicted structure ] |
............................((......((((....(((....)))....))))....))..................................
|
3A2K_C
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGCCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(...]))).(((((.......))))).....(((((..)....))))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{)a...[(..A(}}}.(((((.......)))))..).(<<<<<(]).)).>>>>>))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)).
|
3AMU_B
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUUAGCCAGGUCAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGCGGUCGAGGGUUCGAAUCCCUCCGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((..........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{.[)<....(...])}}.((((.........))))....>((((((.).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...........................................(((((.......)))))))))))...).
|
3GX2_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCG |
[ reference std structure ]
|
((((((((......(((...(((...[[)))......))).(((..(((....))).)))...(]]..(((((....)))))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<<.))...).)))))(})..((((..))))...).).(>>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((...........................................(..............)..................)))))).).
|
3IVN_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGUAUAACCUCAAUGAUAUGGUUUGAGGGUGUCUACCAGGAACCGUAAAAUCCUGACUACUGGUC |
[ reference std structure ]
|
(((((((({..((((((......[[.))))))(.....})(((((.]]......)))))..))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([(.(((((((.{{..{{)))))))).(...].(((((.}}().}}.))))).))))))))) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.((((((.........)))))).....)).(((((.........)))))..))))))))
|
3IZ4_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUUGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACCAUCAUCAUCAUCACAUGAGGAUCACCCAUGUAACGAUGAUGAUGCCUCUCUCCCUAGCCUCCGCUCUUAGGACGGGGAUCAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAAGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUUAAUCAGGCUAGUUUGUUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGCUGGCAAGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGACGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACC |
[ reference std structure ]
|
(((((((.............((..((((.......((..(((((((((.((((...aaaa..))))......AAAA.................................((((((((.(.(((.(.((....))).))).).)))))))).(.(((((.((((..(((...[[[[.)))..)))).....)))))..).........]]]]......(....(((..{{{{{.)))....)..............}}}}}..((((((((...(((.<<<.<<<)))...)))))))).........>>>.>>>...))))))...)))..))......))))..))...(((((.......))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
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|
3IZF_C
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((((......((.(((...(....)...)))...)).....))))))).(((((.......((((((((....)))))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((.(((...[(...].).)))...)))...)))))))).((((((((.()((((((((((..)))))))))).)))))))).))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((.(((((.....((.((.((......))...))...))....))))).))((((((.......((((((((....)))))))).....))))))))))))))).
|
3J20_0
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUUAGCUGGUGGAGCGCCGGACUGUUAAUCCGGCGGUCCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGCGGCGCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((([.....(..]))).(((((.......))))).....((.((..)....)).)))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.{{{{)<..[(..}}}}.((((((.....))))))....>((((((]).)..)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))...).
|
3J20_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGUAGCUCAGCCUGGGAGAGCACCGGACUGAAGAUCCGGGUGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCCGCCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[[)........]]]].(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..........................................(((((.......)))))))))))...).
|
3J2C_N
|
[ FASTA input ]
|
AAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAAGCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGG |
[ reference std structure ]
|
.......((((..<.<<<..))))..((..(((((..(((((((((....(((.(((...(...((.((..(...(.((.(....).)).)....)))..)).).......(.(.......((((((..(....((((((..(.(......((((((....)))))).......).).....(((....)))....((.((...((....)).)).))..))))))...).)))))).(((....(((..(((((((.........))))))))))......)))..((((((((....))))...))))).).(((((............)))))..(((....)))....)))))).).....(.(((...(((((....)))).))))).)).))))))..(((.......((((....))))......)))...(.(((((...(....((((((..........)).)))).....)....)))))....)..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}})))))..))))).))...........((..(...[.((.(...((..(((((((.((((..((((......((((((.....))))))....))))..))..)))))))))...((.(((((...(((((((.(..((((((((...((........))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).).))....))...).))....(((((....((...(((...........)))...)).)))))...........[[[[[..((((.(((((((.....))))))).))))...[[..).]].....]]]]].].)).(((......((.(....).))....)))...>>>.>........
|
[ reference ext structure ]
|
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|
[ predicted structure ] |
....................((((.((((.((((((.((((((..(((...((.(((..((((...............................(.)....))))...(.((.((((....((((((..((...(((...((.(((.(...((((((....)))))).)....)).).....((......))....(........(....).)...)).....)))..)).)))))).((((((.(((...(((((((.......))))))).)))...))))))(.((((((((....))))...))))...)(((((.(((.....))))))))))))))...)...)))...)).)))....((((((....(((....))).).)))))...))))))..((((.(.((...((...)).)).)...)))).(((.(((((......((..............................)).))))).)))...(((((......((((((.((.((....))))....))))))))))).)))))))))).........))))((.....((((...(((((((((((.(.(((.(((((.....((((((.....))))))...))))).)))...))))))))...((((((((...(((((((.(..((((((((.(.(((......)))....).)))))))).....).....((....)).)))))))..)))).))))..))))...))))....))((((.(......((((.........)))).)...)))).((...........................((.....))....(.(((())))).....((......))..(......).......(((....)))......................))
|
3J2L_3
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC |
[ reference std structure ]
|
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........
|
[ reference ext structure ]
|
.((((((.(..(((.(({(}...(((((((.).[.(...])...)))..))...)).)).).)))((((((((..((((((((.(((..))))))))))).)))))))).)))))).(.)...... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...........((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).))(..(((.......((((((.((....))))))))...)....)).)................
|
3J3D_C
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGCGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGAUGGAUCGAAACCAUCCUCUGCUACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(([.....(...])).(((((.......))))).......(((..)....)))..)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({{..)(<a<..()}}((((((.......)))))).).)(((((A.>..>.)))))))))))).... ( )
|
[ predicted structure ] |
.((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)..
|
3J3E_8
|
[ FASTA input ]
|
AACUCUAAGCGGUGGAUCACUCGGCUCAUGGGUCGAUGAAGAACGCAGCAAACUGUGCGUCAUCGUGUGAACUGCAGGACACAUGAACAUCGACAUUUUGAACGCAUAUCGCAGUCCAUGCUG |
[ reference std structure ]
|
........................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]...........))))..)...)))....((.....))...........
|
[ reference ext structure ]
|
..................................().<((((((((.{{(.).{))).[.}(].(((..(((.}}).)......).).))....).))))>).((.....))........... ( ) ( ) ( ) ( ) () () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.........(((.((.....((((.....(..(((..(.....((((........))))...)....)))....)..............))))..)))))...........(.......)...
|
3J3E_7
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCGGUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((.....(((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).).(.(((((.....((.((..((....)).)).))....))))).))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(([[[[[[(...)[[[[[[[[.)..(<(((((...{(...}..)))))...>.).)]]]]]].]](((((((((()(((((((.(((..)))))))))).))))))))).]]]]]].).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...(...((((((......))..))))...)....)))))).).)(..((......((.((.(((....))))).)).....))...))))))))).).
|
3J3F_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....(.((((...(....)...))))...)....)))))).))(((((((.....((.((..((....)).)).))....))))))))))))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((((..)((((((((....(((((((...(....)...))))..))...))))))).))(((((((.(()(((.(((.(((..)))))).))).).))))))))))))))))... ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((.(((....))))).))....))))))))))))))))...
|
3J3F_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................((.((.[[.....))......(.(((......]].............)))..)...)).....((....))(((((.((.......)).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{(((((.((.[[....[))).(.].(((((.(((..]].)........)).)))).))...)))}))((....))(((((((((.....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
...((.........))........((((..((((((.((.....((((......)))).....))...)))...(((.......(......((((....))))..)....)))(((((((((.....))))))))).)))......)))).......
|
3J46_p
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((...((..........)).....(.........)........((((.........)))))))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.[[[..{.<...)<]]](((.((.......)).))).>.}aaaaaa..>A..AAAAA))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(.((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))....)).).
|
3J5B_1
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((.(..((((........))))...(((.......))).......(((((.......)))))).)))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<..ab..}]}}((((((.......))))))...>ccccccAB.C..CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
3J5N_W
|
[ FASTA input ]
|
GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(.((.......)).).)))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{..)<..ab...b]}}((((((.......)))))).B.>cc.cccAB.C..CC.CC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((.((((..........................................((.((.......)).))))))....)).
|
3JYV_7
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
.((((((..((([.....(..]))).((((.........)))).....(((((..)....))))))))))).....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((aa.{)(<.[<..})A.(((((((.....)))))))A..)((((((]>.)>.)))))))))))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
|
3JYX_4
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUAGGUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
..........................................(.(((........))).......(..........................)......)................(((((((....))))))).......................
|
[ reference ext structure ]
|
.(..)..............................().<((((({(([.....[.).}..)..(.(((.((..]].......))......))).)...))))>)...(....)...((((((((..))))))))....................... ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((.(((...(((((.(......((.(.((..(((((((....((((......))))...(((..((((...)))).......)))..)))))))....))...)......))(((((.(((....))).)))))..).))))).))).)).....
|
3JYX_3
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGUAGAGCCGACAGUAGUGUAGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((......((..........(.........(....).........)..........)).(.........(..(..(...)..)..).........)....))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((.....([.....((..)(((.......{(...})......)))...)....(.])((.......(((.((..(...)..)).))).......))).)))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((...(((...((..(...(............)..).))....)))..))(((.......(((((((....)).)))))........)))))))))))).
|
3LA5_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((((([..((((((......{{.))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]..]]]))))))..))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((((((((..((((((.........))))))......).((((((.......))))))..)))))))..
|
3NPB_A
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUAUCAAGAGAAGCAGAGGGACUGGCCCGACGAAGCUUCAGCAACCGGUGUAAUGGCGAAAGCCAUGACCAAGGUGCUAAAUCCAGCAAGCUCGAACAGCUUGGAAGAUAAGAAC |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....(((((...(((.[[[[)))......))))).((..(((((...((((......)))).)))..)).))....(]]]]((.((.......)).))..))))))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..(((((((.()(((.[[[[)))......))))).)).()(((((..((((((..))))))))))..)........(]]]]((.((.......)).))..)))))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
....................................................................((......(((.....))).............(.....)....))......
|
3O58_3
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((([..(.....]))....((..((.........)............))...).).)))....(((...))).((((((((....))))))))......................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(.{((((([((.<<....<).]..)>((.(.(.........>.>..........))...))..))))}))(((...)))(((((((((....)))))))))..................... () ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.((.((.....(...(((....(((.((...((.((.((.(...((((......)))).)...))...))...))..))...)))...))).).))...)).((..(((....(((((((((((....)))))))))..)).))).......))....
|
3O58_2
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.......................))....)))))).)).(((((.......(((((..((....)).))))).....))))).))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((....((((((((....({((........[...(.]..)....)}.).))))))).)).(((((......(((((((.((....)))))))))....))))).))))))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...((..((((((......))..))).)..))....)))))).))((((((.......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).
|
3PDR_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGAUGCUUGUCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA |
[ reference std structure ]
|
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[ reference ext structure ]
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|
[ predicted structure ] |
........((.(((..(((...(((((.(......(((((.(((((....((((....))))....)))))....(((((..(((.......)))..)))))...))))).((((....))))....).)))))..)))...)))....))..........
|
3RKF_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUAUAACUGCGUGGAUAUAGCACGCAGGUUUCUACCGGGCACUGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
[ reference std structure ]
|
((((((([..(((((((.....{{)))))))(.....])((((((}}.....))))))..)))))))
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((.(((((((.[[[.[[)))))))).....).((((((]]()]]]))))))..))))))) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(((((((.......))))))).....)).((((((.......))))))..)))))))
|
3SD1_A
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGUGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA |
[ reference std structure ]
|
((((....((((((((((((......(((((((...[[[[....))))))).....((....))))).)))))))))..]]]].)))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((.({{{{{{{{{{{{..{{.{{{{{{{{.[.)((((].)}}}}}}}}.}}.(((..)))}}}.}}}}}}}}}.)))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((.(..(((((((((((((...(((((((((.(((....)))))))))).)).)((....))))).)))))))))....)..)))).
|
3ZEX_D
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAAUGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGUUGUACUCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((.(((...(....)...)))...))....)))))).))((((((......((....(((....)))...)).....))))))))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((((..[.((((((((.....((((((...{.(..})..)))..)))....)))))).))(.(((((.(.(((((((.((((..)))))))))))).)))))])))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((..((((...((..((((............))))..))....))))...))((((((...(..(((((.(((....))))))))...).))))))))))))))).
|
3ZEX_C
|
[ FASTA input ]
|
AACGUGUCGCGAUGGAUGACUUGGCUUCCUAUUUCGUUGAAGAACGCAGCAAAGUGCGAUAAGUGGUAUCAAUUGCAGAAUCAUUUCAUUGCCCAAUCUUUGAACGCAAACGGCGCAUGGGAGAAGCUCUCUCGAGCCAUCCCCGUGCAUGCCACAUUUCUCAGUGUCG |
[ reference std structure ]
|
.........................................((((((.[[.....)))....(((((((...(.]].).........).)))).).).)))....((.....))(((((.(.(..((((....))))..).).))))).....................
|
[ reference ext structure ]
|
...................................[(..(.(((.((.{.(.){.)))(..}((((((..((..}..).......).)..))).))..))))].)(((..).))(((((((((.(((((....))))).)))))))))..................... ( ) () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
......(.(....((......(.((............((.(...((((......)))).)...)).........))...)...........))......).).((((.....(((((((((.(.................))))))))..))...........))))..
|
3ZND_W
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCUUAGCUUAGUCUGGUUAAAGCGAUCGGCUCAUAACCGAUUGGGCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGGCCCACCA |
[ reference std structure ]
|
..(........(.............)..(((...........))).......(((.......))).......).....
|
[ reference ext structure ]
|
.((((..(..{.{<(.......>)}}..(((([(.....])))))....)(((((.......)))))...)))).... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((...........................................(((((.......)))))))))))...).
|
4A1C_2
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAAUUUUCAACGGUGGAUAUCUAGGUUCCCGUGACGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGCAAUGCGAAUUGCAGAACCGCGAGUCAUCAGAUCUUUGAACGCAAGUGGUGGAGGUGUAAAAACCUUCAUGUUUGUUUCAGUGUGGAA |
[ reference std structure ]
|
............................................((((((.[[.....))).....(.((((.....]]..........).)))..)...)))....((.....))(((((........)))))....................
|
[ reference ext structure ]
|
.......................................(.<((((({((.[[....[).}..)](((((((.((..]]...)....).).)))).))..))))>))((.....))(((((........))))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.....((.((.(((((..(((.((...(.((...((.(..((.(...((((......)))).)...))....)...))..)).)...))...)))......)))...(((....(((((.(.........))))..)).))))).)).))....
|
4A1C_3
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference std structure ]
|
(((((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))).))((((((......(((((..((....)).))))).....)))))))))))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((({(.}((((((((....(<(((((...([[..)]].))))...>.).))))))).)))(((((..(.((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))))))).. ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(.(...(((....((((...........((((((......))..))))............)).))..(.((......(((((.(((....))))))))......)).).)))....).).
|
4AOB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGGCAAGAGACUGGCUUGAUGACCCCCGGCAACCAAAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGAGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((((....(.(((...(((.[.[[)))......))))(((..(((....))).)))...(]].](((.(....).)))..))))))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((((..({(.((((.((((.<<<..))...).)))))(})..((((..))))...)...()>>>((((((..))))))..))))))))). ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
.(((((((......................................................((......))..((...))....)))))).).
|
4CXG_Y
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCGGUCUCCAAAACCGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
[ reference std structure ]
|
(((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
|
[ reference ext structure ]
|
(((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC))))))).... ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
|
4ENB_A
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
((....((((((............................))))))..)).
|
4ENC_A
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUGAGGCCCGCCCAAACUGCCCUGAAAAGGGCUGAUGGCCUCUACUG |
[ reference std structure ]
|
.((((..[[[[[[))))......(((((....)))))....]]]]]].....
|
[ reference ext structure ]
|
.{((((.<<<<<<)).}...)..((((((..))))))).(.>>>>>>).... ( )
|
[ predicted structure ] |
.((....((((((..............(.....).......))))))..)).
|
4FRG_B
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCAGAUGCGAAAGCAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGGCCA |
[ reference std structure ]
|
((((((........((((....(.((((.......)))))((((((....)))).[[[.....))]]]....)))).)))))).
|
[ reference ext structure ]
|
((((((...{(.}.((((...<(.(((([(..]..)))))(>(((((..)))))(((((.).).)))))..))))).)))))). ( )
|
[ predicted structure ] |
............(.(..(((....((((.......)))....................).....)))..............).)
|
4MGN_B
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCU |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB)))))).. ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..((((.......)))).......................(((((.......)))))))))))..
|
4MGN_D
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGUAGUUCAGUGGUAGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCUUCCGCUC |
[ reference std structure ]
|
((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))...
|
[ reference ext structure ]
|
((((((([{{.{)<.a().}]}}((((((.......))))))...>bbbbbbA..B..BBBBB))))))... ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
|
4W24_8
|
[ FASTA input ]
|
CGACUCUUAGCGGUGGAUCACUCGGCUCGUGCGUCGAUGAAGAACGCAGCUAGCUGCGAGAAUUAAUGUGAAUUGCAGGACACAUUGAUCAUCGACACUUCGAACGCACUUGCGGCCCCGGGUUCCUCCCGGGGCUACGCCUGUCUGAGCGUCGCU |
[ reference std structure ]
|
............................................(((.[[....[)))...]...{{{......]].............}}}.............((....))(.....((.......)).....)....................
|
[ reference ext structure ]
|
....................................(..(.(.(.((.[[....[))).{.]...{{{{{{{..]]..}.......}}}}}}...}....))..)((....))(((...((((.)..)))...))).................... () ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
..((.((((((((..(((........((...((.((.((.....((((......)))).....))...))...))..))...........)))......)))...(((...(((((((((((.....)))))))))..)).)))))))).))....
|
4W24_7
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU |
[ reference std structure ]
|
((((((.......((...((......((((((...(....)...))))..)).....))....))((((((......((.((..((....)).)).)).....))))))...))))))..
|
[ reference ext structure ]
|
(((((...(...)(((.((((.....((((((...(....)...))))..))....)))))..))((((((..(()(((((((.(((..)))))))))).)..))))))...).)))).. () ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( ) ( )
|
[ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...((..((((............))))..))....)))))).))(((((((.....((.((...((...)).)).))....))))))))))))))))..
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