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UCCCAACUGCAGACCGUACUCAUCACCGCAUCAGGUCCCCAAGCAUCGAAUGCUCUGGUAACAUAGAGAAAGGUACACUCAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUGCGUAAGUUCGCAAGAAGCAUUGGCUCUGAGGGCAAAGUGGGGGUCCACAGGAGGGCCAGUGUCCUUUGAAGGCUACCCUCCCGAGCCGUAUCUACUAACCUCCUUCUGGUGUGUUGUUUUUACGUCUCACUCCCGCGCAGGUGUUUUCGCUUCCUUUUUUUGGUUGCGCACCUACAAAUUGCCAACUCAGAACUGCUUACGGCGGGGAAUCCAACUGUAUAAUUAAAACAUAGGUUUGUGAUGCAUCCAAGUGGUGUAUGUCGCAAACUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAACGUGAGAGAUUCACCGACGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCUUCCAAUUAGAGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUCCCUCUGUCCCGAGUUACUAUCUAGCGAAACGACAGUCAAGGGAACGGACUUGAAGGGCUAAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGUUUGACUCCAGUCUGGCUCUGUGCGGCGACUUUGGAGGUGUAGUAUAGGUGGAAGCGCAAGCUCAAAUGAAAUACCACCACUCGGAACGUUGCUUCACUUAUCGAAUGAAGAGACCAAUGGUUGUUUUGCGCAGUCUUCGGGCUGUGCGCCGUCUAGGCUGGGCAUAAUUGUGGUGUUUCUUUCACCGCCACGGGAGGGGUGUUGGUUUUUUAUCCUCCUCUCCGUUUCUCCUUUUCUCUCUUUCUCCCUUUUUUUGGGCGUUUGAGGGUUGGUGACCCGUGGGCGCCCACGCGUGCGGAACUACUGCGCCAACGGGGUGGGAACUUUUCGUUUCUUCUCCGGAGUCUUGUUUCGAGACAUCUGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCAUAUCUGUUACACGACAACGCAGGUGUCCUAAGGCGAGCUCAGUGGGAACAGAAAUCUCACGUGGAACACAAGCGUAAAUGCUUGCUUGAUUAACGAUUUCCAGUACGAAUCGAGACUGCGAAAGCAAGGCCAGCGAUCCUUUGCGAAGAACAGGAAAUAUGAACAAAUCAUACCAGAGGUGUCAGAAUAAUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUCGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAACCUAGCGCCGCAGAAGACGCUAAGGGUUGGAUUGUUCACCCACUGACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUGGUUUUACCCUACUUGGCUGGAGAUUGCGAGUAAAAGAUUAUCCGCGCAAAGCGGAGGCAGUCCGUUUUUUUCUGGGUCUGCCGUUCGGUGGCAUGUGCUUGGCGCUGCCAUCUC |
| Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
.........................((......))......((((.....)))).........((((....((((..(((.((..(....(.......(((((....(....).....)))))((.(((((((((...((((((........((((....(((.((((..)))).)))))))..(((.((((...(.((.................)).)..)))).)))..))))))...((((....(((..((.......))..)))))).).......)))..)))))).))(.).......((((((((....((.........))...(..((((....((((.....))))......))))..)...(((.(((...((.((.....((....(((.......)))....))..)).)..).)))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))).....).))))))).)..))).))).)))).)))).........(..[[[[[......).]]]]]....(((((..(((.(........(((..((((...(((((.(((((((...((..(((.((.((.((........(...aaaa..((....))..........).AAAA...))).)..)).)))..))....((((.....((......(...((...((((((((....))))))))...).))..((.((((........((((.......))))..((((((..((......((.....))..)).((.((...((((.....(.(((...............))).)...))))...)).))))))))...))))....))...................((((.((((((.....)))))).)))).....))...))))........)))))))..)))))..(((.......)).)((((((...........))))))((.{...{{{{{{{.(.((((((.......))))))...).{{)(..((}}....}}}}}}}....(....(((<....(..>)))...)..((......)).}))..)......((((...............(((.......)))..)))).....)).....)))..).)))........(..(.(.((((((...((.......))...))))))...))...).......((((..((((((...((((((.(......).))))..))..(((.(.....).))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).)))).....)..))).)))))........................(((((.....)))))(((((((((........)))).)))))....((((((..((((...)))).))))))..
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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(...(((.(((((((...........(((.....((..((((((((...))))).)))..))....(((..((((.((((.((((.((((..........((((......))))..(((((..(..(((((((((((.(((((((......((((((..(((.((....))..))).)))))).(((.((((...((.((((.((....)).).)))))...)))).))).)))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..)))))).)))))).)))).(((((((((...............(((((((((((((((((((.....)))))..)))))))))..(((((((((...(((.(((..((((...(((((...))))).))))..))))))...)))))))))..)))))...............(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).....)).)))))))....)))))))))))).))).)))......(((..(((((((((((((....(((((.(((((((........))))))).)))))..((((((((.((((((.(((((((..((((((((((.((((..(((((..((....))((....))....)))))...((...)).)))).))))).))))).((((((....(((..(((((.((((((((....))))))))(((((((((((..(..((..((((((((.((((..((((...((((((((((.(.(((....))).))))))).))))...((((.((((.................(((((((..(.(((((...))))).)..)))))))((((...(((....(((.(((..(((((.((((((.....)))))).))))).(((((((.((((...((((.....))))..(((((((.((((((((.(.....((((....)))).....).)))))).)).))))))).((((((.......)))))).(((((..((((((....)))))).(((.....))).)))))...)))).)))))))((....))..))))))...)))..)))).)))).))))..(((((.....))))).....))))..))))....))))))))..))..)..))))).)))))).)))))..)))..((((((((.............)))))))).)))))).........)))))))..))).))).(((((..((((....(((((((.((.(....))).)).)))))...(((((((....))).))))))))..)))))....))))))))..................(((((.....)))))...))))))))))))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).) |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..................(((((...........((((.....))))...........(((((((........................((((((((......).............((((.......................(((((((....))))))..............).)))).))))))).............................(((.....(((((((.((((.....((..((.......))..))...................(((((.........(((((.(((((.....(...........)...((((((((((((((.(....)))))..))))))))))))))))))))......)))))..................))))...))))))).....)))((((((.......)))))).............((((..((((((.......)))))).))))................(((((((((((....((((.....)))).....)))))...))))))((((((.((.(((((.(((((((........))))))).)))))...)).))))))......................................(((....))).....((((((((((..........(((.(((((.........))))).))).............((((((((....))))))))......................))))))))))...........(.(((((((.................))))))))...............)))))))........((((((((((.((((.....)))).))))))))))....)))))..............(((((.((((((.....)))))).)))))..((((((...)))))).....(((((.......)))))............(((((((.((((((..........................((((((.......))))))........((((((....)))))).........(((((.........)))))...............((((((..(((((..................(((.......)))...........................)))))..))))))....................((((....))))........................(.(((((((((((.(......).)))))..))))))).........................................)))))).)))))))..........................................(((((.....)))))(((((.((...........)).)))))))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((((((((((..........................((((.....))))...............................................(((......)))......................................(((((((....)))))..............))..................................................(((((((.((((.....((..((.......))..)).).................(((((.........(((((.(((((.....................(((((((((((((((.....)))))..))))))))))))))))))))......)))))...................)))...)))))))........((((((.......)))))).............((((..((((((.......)))))).))))................(((((((((((......................)))))...))))))...........((((.(((((((........))))))).))))....((((((((((.........................................................................((.(((((.........))))).))..............((((((((....)))))))).....)))))))))).........((((.......))))...(((.((((((.................))))))))).............................((((((((((((((((...))))))))))))))))......(.........)......((((((((((((.....))))))))))))..((((((...))))))..................................((((((((((((((.......................(((((((((.......))))))........(((((......))))).........(((((.........)))))...............((((((((((((((........................................................))))))))))))))......................((((((((.............)))))))).......(((((((((((((......)))))))..)))))).............)))..........................))))))))))))))..........................................(((((.....)))))...................))))))))))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((.......(((((...............).)))).(((.(((.....)))..))).......................))).............(((((.((.(((......((((((((((((((....(..((((((((.......((((((.....((((......((((((((((((..(((((...................(((.(............).))).(((((((((((((.......................))))))............................((((.(((((.....................((((((((((.((((.....))))...))))))))))...............(((.............))).))))).))).))))))))...)))))))))).......((...))....)))))))......(.((((((.......)))))).).......))))..........))))))((.((((((((((((...............(((((........)))).)(((((.(((((((........))))))).)))))..((((((..(.(((......))).)..))))))..))))))..(((((..((....))............))))))))))).))....))))))))..)......)))).))))))....))))((((((((....)))))..))).......(((((((((......((((.......))))(((((((((((((.(............)))))))))...(....((((((((.(..(((((.......((((((((((.(((.......))).))))))))))((((...........(.((((..(((((.((((((.....)))))).)))))..((((.......)))).((.(((((((.....))))))).))...((((..(((((...........)))))))))....)))).).((((((((............((((.........)))).((((((((............((((.(((..........)))..))))(((((.((((..(((((..................((((.....)))).......(((.............))).)))))..))))))))...)...))))))))...((((((((((.............)))))))).))....((((((.((((..........))))...))))))........)))))))).......))))((((((((...(((((((....))).))))((......)).)))))))))))))..).))).)))))...)(((((.....)))))(((((.((..(.......))).))))).....)))))..))))))))))))))))))). |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((....((((..................)))).((((((((...))))).))).......(((((((((((((....(((((..((.....((((((((......)............(((((.((((((.........)))(...(((((((....)))))))...)(....))))..))))))))))))....))..))))).)))))..(......)(((.....(((((((.((((.((((((..((.......))..))(((.........)))((..(((((((((.....(((((.(((((....(((.........)))..(((((((((((((((.....)))))..))))))))))))))))))))))))..))))).)).........))))..))))...))))))).....)))((((((.......)))))).........((..((((..((((((.......)))))).))))....))..........(((((((((((....((((.....)))).....)))))...))))))((((((.((.(((((.(((((((........))))))).)))))...)).))))))................................((((..(((....))).....((((((((((..........(((.(((((.........))))).))).........((.(((((((((....))))))))(((.....))).....).))..))))))))))...))))...((.(((((((....((........)).))))))))).............))))))))........((((((((((.(((((...))))).))))))))))...((((((.....))))))...(((((.((((((.....)))))).)))))((((((((...)))))).)).(((((((.....)))))))..(((......(((((((.((((((......((...(..............((((((.......))))))........((((((....)))))).........((((((.......))))))(...(((....)))(((((((..((((((................(((((.....))))).....((..............))..))))))..)))))))...................(((((())))))..........)......((((((.(.(((((((((((.(......).)))))..)))))))..(((..(((.......))))))..)))))).)......)))))))).)))))))........)))...............................(((((.....)))))(((((.(((.......)..)).)))))))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((((((((..(((((......)))..((((((((...))))).))).........))..)))))...((((((.(((((..........(((......))).(((.(((((((.(((((((((((.((((((((.....((((((..(((.((....))..))).)))))).(((.((((...((..(((.......)))..))......)))).)))))))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..))))))......(((((..((....))..))))).............(((((((((((((((.....)))))..)))))))))).........))))))))))((((.((.......)).)))).)))))((((((((((..(((((((((.......))))(((((...((((((.((((..((((((.......)))))).))))...))).))).))))).((((((((((....((((.....)))).....)))))...))))).((((((.((.(((((.(((((((........))))))).)))))...)).)))))).....(((.(((((((((.(((..((.((((..((...(((....)))...))...)))).))..))).))).)))))).))).....(((.((.((.((((.((((((...(((.((((((...(((.....)))....)))))).))))))))))))).)))).))).)))))((((((((((.((.........)).)))))).)))).....((((((((....(((((.......((((((((((.(((((...))))).))))))))))...((((((.....))))))...(((((.((((((.....)))))).)))))((((((((...)))))).)).(((((.(((((((((((.(((((((.....((((((...........))))))))))).)).))))))).((((((.......))))))(((((((.(((((......)))))(((((((.((........))...)))))))..(((....))).((((((..((((((.(.........((...(((((.....)))))))...((((..........)))).)))))))..))))))(((((((......)).))))).((((((((.............)))))))).......(((((((((((..........))))..))))))).......(((((((.((.......)).)).)))))...(((((((....))).)))).))))))))))).))))).)))))....))).))))).)))))))))).(((((((.....))))))).))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((............................((((.....))))...............................................(((....aa)))...AA..((((...........................[[[[[[[))))]]]]]]]...(((((((......................................................(((((((.((((....(((..((.......)){{)))...........((..}}.(((((.........((((((.((((.....((.........))...(((((((((((((((.....)))))..))))))))))))))))))))......)))))....))............))))...)))))))...............................)))))))..((((..((((((.......)))))).))))................(((((((((((....(((.......))).....)))))...)))))).(((((....(((((.(((((((........))))))).)))))......))))).......................................(((....))).............................(((((.........))))).................((((((((....)))))))).......................(((((.......))))).....(((((((....((........)).)))))))...............................((((((((((.((((.....)))).)))))))))).....(((.......))).....(((((.((((((.....)))))).)))))..(((((.....)))))..................................((((((...........)))))).................((((((.......))))))........(((((......))))).................................((....))..........................................................................................((.................<<<<<<)).............>>>>>>.......((.((((.((((..........))))...))))))...............................((((...(((((((....))).))))......))))...............................(((((.....)))))bbbb..((...........))))BBBB....(((((((.((((...))))))))))).. |
|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((((((((....(((......)))..((((((((...))))).))).............)))))...((((((.(((((.........((((......)))).(.((((((((((((((((((((.((((((((.....((((((..((...(........))).)))))).(((.((((...((..(((.......))).....))...)))).)))))))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..))))))......(((((..((....))..))))).............(((((((((((((((.....)))))..)))))))))).......).))))))))).((((.((.......)).)))).)))))((((((((((.....((((((.......))))))....((((......)))).((((((.......)))))).(((((((.((((((..((((((...((((((((......((((((.((.............(((((.((((((.((.(((((.(((((((........))))))).)))))...)).)))))).....(((.(((((((((.(((..((.((((...(...(((....)))...)....)))).))..))).))).)))))).)))...............(((...))).....(((.((((((...(((.....)))....)))))).))).....((((((.......)))))).((((((((((...............)))))).))))...................))))).....((((((((((.(((((...))))).))))))))))...((((((.....))))))...(((((.((((((.....)))))).)))))..((((((...))))))....)).)))))).(((((((.(((((((.....((((((...........))))))))))).)).)))))))...)))).))))))))))..........(((((......)))))(((((((.((........))...)))))))..(((....))).((((((..((((((...........((...(((((.....)))))))...((((..........))))..))))))..))))))...((((((...((.......))...))))))...))))))))).)))).(((((.(((.(((((((((..........))))..)))))))).(((((.((........))))))).)))))((((...(((((((....))).))))......))))(((((..(........).))))).....)))))))))).(((((((.....))))))).))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((..........((((((..(((((((.....((((((((((.........(((((((((((((((....((((((((((.......))).((((((((.......((((((((((.........(((((..)))))...))))))))))((((((((.(((((((((((((..((((..................((((((.......)))))).....(((((((.(((((((((((.........(((({{{{{{............)))).(((((((((.....((((((((........................(((((((((((((((.....)))))))..))))))))..))))))))))))..)))))........)))))))...))))...)))))))...))))))))))..................)))))))..((((..((((((.......)))))).))))....(((..........)))..(((((......................))))))))))))).)))))))).((((((((((((((........)))))))......((((..)))))))))))......)))))))...)))))).....(((((((}}}}}}........((((((((((..(((((..((((((((((.........)))))....))))).......((((((((((..)))))))))).........))))).......))))))))))))))))).....((((((((...............))))))))........)))))))))................))))))))))))).....))))((((((..)))))).))))))..((((((((((..(((((.((((((.....)))))).)))))..............(((((((((((((((.........((((...)))).))))))............)))))))))....))))....))))))...((((((.....((((((...(((((((..)))))))((((.....((((((((((......(((((.........((((((.........))))))(((((........(((((((.....(((((...)))))...........(((((((.........)))))))..[[[[[[[))))))).((((((((.............))))))))..)))))(((((((((((..........)))))..))))))...((((((...............)))))).((((..((((((.............)))))).))))..)))))))))))))))))))..........)))))).((((((((.....))))))))))))))))))))).....(((((((...]]]]]]]..))))))).. |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.(((((((...........(((.....((..((((((((...))))).)))..)).((((....((((.((((.((((.((((..........((((......))))..((((...((.(((((((((((.(((((((......((((((..(((.((....))..))).)))))).(((.((((...((..((..((....)).))...))...)))).))).)))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..)))))).)))))).)))).(((((((((...............(((((((((((((((((((.....)))))..)))))))))..(((((((((...(((.(((..((((...(((((...))))).))))..))))))...)))))))))..)))))...............(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).....)).)))))))....)))))))))))).)))))))......(((..(((((((((((((....(((((.(((((((........))))))).)))))..((((((((.((((((.(((((((..((((((((((.((((..(((((..((....))((....))....)))))...((...)).)))).))))).))))).((((((....(((..(((((.((((((((....))))))))((((((((((((((..((..((((((((.((((..((((......(((((((....((........)).))))))).....((((.((((.................(((((((((..(((((...)))))..)))))))))((((...(((....(((.(((..(((((..(((((.....)))))..))))).(((((((.((((...((((.....))))..(((((((.(((((((.....((((((...........))))))))))).)).))))))).((((((.......)))))).(((((..((((((....)))))).(((.....))).)))))...)))).)))))))((....))..))))))...)))..)))).)))).))))..(((((.....))))).....))))..))))....))))))))..))..)))))))).)))))).)))))..)))..((((((((.............)))))))).)))))).........)))))))..))).))).(((((..((((....(((((((.((.......)).)).)))))...(((((((....))).))))))))..)))))....))))))))..................(((((.....)))))...))))))))))))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((((((((....(((......)))..((((((((...))))).))).............)))))...((((((((((((.........((((......)))).(.((((((((((((((((((((.((((((((.....((((((.......(((....)))...)))))).(((.((((...((.((((.......)))....)))...)))).)))))))))))..(((((....(((...............)))))))).....)))))..))))))......(((((....aaaa....))))).............(((((((((((((((.....)))))..)))))))))).AAAA..).)))))))))(((((.............))))))))))((((((((((.....((((((.......))))))...(((((......)))))((((((.......)))))).(((((((.(((((((.((((((...((((.(((......((((((.(((...........((((((.((((((....(((((.(((((((........))))))).)))))......)))))).....(((.(((((((((.(((.....((((.....(.(((....)))).......)))).....))).))).)))))).)))..........((((((((...))))(((.(((.((((((..................)))))).))).))).((((((..bbb..)))))).((((((((((...............)))))).))))......<<<....))))..))))))....((((((((((.(((((...))))).))))))))))...((((((.....))))))...(((((.((((((.....)))))).)))))((((((((...)))))).))))).)))))).(((((((.(((((((.....((((((..{{{......))))))))))).)).)))))))...)))..))))))))))..........((((((....))))))(((((((......[[[.......)))))))..(((]]].)))(((((((..((((((.(..............(((((.....))))).....((((..BBB.....)))).)))))))..)))))))..((((((.................))))))..)))))))))).)))).(((((.(((.(((((((((..........))))..)))))))).(((((.((........))))))).)))))((((...(((((((}}}.))).))))......))))(((((.((........)))))))>>>..)))))))))).(((((((.....))))))))))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.(((((((...........(((.....((..((((((((...))))).)))..)).((((....((((.((((.((((.((((..........((((......))))..(((((..(..(((((((((((.(((((((......((((((..(((.((....))..))).)))))).(((.((((...((.((((.((....)).).)))))...)))).))).)))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..)))))).)))))).)))).(((((((((...............(((((((((((((((((((.....)))))..)))))))))..(((((((((...(((.(((..((((...(((((...))))).))))..))))))...)))))))))..)))))...............(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).....)).)))))))....)))))))))))).)))))))......(((..(((((((((((((....(((((.(((((((........))))))).)))))..((((((((.((((((.(((((((..((((((((((.((((..(((((..((....))((....))....)))))...((...)).)))).))))).))))).((((((....(((..(((((.((((((((....))))))))(((((((((((..(..((..((((((((.((((..((((...((((((((((.(.(((....))).))))))).))))...((((.((((.................(((((((..(.(((((...))))).)..)))))))((((...(((....(((.(((..(((((.((((((.....)))))).))))).(((((((.((((...((((.....))))..(((((((.((((((((.(.....((((....)))).....).)))))).)).))))))).((((((.......)))))).(((((..((((((....)))))).(((.....))).)))))...)))).)))))))((....))..))))))...)))..)))).)))).))))..(((((.....))))).....))))..))))....))))))))..))..)..))))).)))))).)))))..)))..((((((((.............)))))))).)))))).........)))))))..))).))).(((((..((((....(((((((.((.(....))).)).)))))...(((((((....))).))))))))..)))))....))))))))..................(((((.....)))))...))))))))))))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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RNAwolf
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((..(((((((((((..((.......(((((...............)).)))..........))..)))))...(((((((.((.........)).((((((((.(.(((......)))).(((((((((((..(((((((.((((((((((.....(.((((..)))))..))))))....................(((..))))))).........((...(((..........)))....))...((.......))....)).))).))..)))))..))))))...))))))).)(((((((...........(((((..(((.((((((((..(((.............))))))))))).....(((..)))..............((..((((((.(((..(..((.................))..)..))).))))))..))....((...((..((((.((......)))))).)).)).)))..)))))...)))))))(((((......................))))).(..)..((((((((..(((((((((..(((((((.......(((((((((((((((((.(((...(((...).)).)))...)))))...................))))))))))))......((((((.(((((((..((((((.........)))))).(((...))))))))))(((((((....))))))).(((..(......))))......)))))))))))))((((.((......))))))))))))))).........((((((((...((((((((....(((((((......((((((((..(((((...)))))..)))))))).((((.((((.....(..(((((.((((((((((((.....))))))))))))..((((.......))))((((.(((..)))))))..)))).)..).((((...((((...........)))).))))((((..(.(..((((((((((((((((((.((..))...(((........)))(..)..........))))))(((............)))...(((((((.((((..(((((.((........(.......((.(((...(......)...))))).......)....)))))))..))))))))))).((((..((((........)))).((................)).))))....(((((((((((..........)))))..))))))..)))))..)))))))...............))..)))).)))))))))).(((((.(((...)))..)))))...)))))....))).)))))............))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).))(((((.((.(..)..))))))).... |
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RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((..(((((((((((..((.(((((.(((((((..........)).)).))).).))..).)))..)))))...(((((((((((((...))))).((((((((((.(((......)))).(((((((((((..(((((((.((((((((((.(..((.((((..)))))))))))))..(((...........))).(((..))))))).........((...((((........))))....))...((.......))....)).))).))..)))))..)))))))..))))))).)(((((((..........((((((..(((.((((((((..(((.............))))))))))).(...(((..)))..)...........((((((((((((((..(.(((.(..............))).))..))))))))))))))....((...((.(((((.((......))))))))).)).)))..))))))..)))))))(((((((................).).))))).(..)..((((((((..(((((((((..(((((((..((..((((((((((((((((((.(((...(((...).)).)))...)))))...................)))))))))))).)..))((((((((((((((..((((((((.....)))))))).(((...))))))))))((((((((..)))))))).(((..(......))))...)..)))))))))))))((((.((.(...))))))))))))))))......((.(((((((((..((((((((..(((((((((.....((((((((((((((((...))))))))))))))))((((.((((..(..(((((((((((((((((((((.....))))))))))))..((((.......))))((((.(((..))))))).))))).)))).((((...((((.((......)))))).))))(((((((.((((((((((((((((((((((((..)).(.(((((....)))))(..)).......).))))))(((.((......)).)))...(((((((.(((((.(((((.(((....)(((((((..(((.((((..(......)..)))))))..)))))))..)))))))).))))))))))).(((((.((((........)))).(((.............).)))))))....(((((((((((.(.......))))))..))))))..)))))..))))))).))..(((...))).)))))))))))))))))))((((((((((...)))).))))).).)))))))..))).)))))...........)))))))))))))))))))))))))))))))))..))).))(((((.((((..)).))))))).... |
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Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.(((((((...........(((.....((..((((((((...))))).)))..)).........((((.((((.((((.....(((.....(((((.....(((....))))))))...(((((((((((.((((((((.....((((((..(((...........))).)))))).(((.((((...((.((((.((....)).).)))))...)))).)))))))))))..(((((....(((..((.......))..)))))))).....)))))..))))))..))).......((((((((((....................(((((((((((((.......))))..)))))))))...((((((((...(((...(..((((...((((.....)))).))))..)..)))...)))))))).......................(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).....)).))))))))...)))))))))))).....)))......(((..(((((((((((((....(((((.(((((((........))))))).)))))..((((((((.((((((.(((((((.((.....((((.(((...(((((.(((....)))...........)))))............))).))))........((((((....(((..(((((.((((((((....))))))))(((((((((((..(..((..((((((((.((((..((((...((((((((((...............)))))).))))...((((.((((.................(((((((..(.(((((...))))).)..)))))))((((...(((....(((.(((..(((((.((((((.....)))))).))))).(((((((.((((...(((((...)))))..(((((((.(.((((((.......(((......))).......))))))..).))))))).((((((.......))))))..(((...(((((......)))))..............)))....)))).)))))))((....))..))))))...)))..)))).)))).))))..(((((.....))))).....))))..))))....))))))))..))..)..))))).)))))).)))))..)))..((((((((.............)))))))).)))))).......)))))))))..))).))).(((((..((((....(((((((.((.(....))).)).)))))...(((((((....))).))))))))..)))))....))))))))..................(((((.....)))))...))))))))))))))))))))))).))).(((((((.((((...))))))))))).. |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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