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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - Cylofold



ASE_00408 [ FASTA input ] GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGGAAACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCGCGCAAGCGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCAUAAGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGC
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ASE_00429 [ FASTA input ] GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGGAUGCCGGCUAACGGCCGGACGCCGCGAGGCGAGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUCAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCCGGAGCAACACCAAAUAGGCAGGCGAUGAAGCGGCUCGCUGAGUCUGCGGGUAGGUGGCUUGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCCUAGAGGAAUGGUUGCCACCGACAGAACCCGGCUUAC
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CRW_00548 [ FASTA input ] UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC
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CRW_00552 [ FASTA input ] CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
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CRW_00555 [ FASTA input ] ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUUU
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CRW_00567 [ FASTA input ] AAUCCCCCGUGCCCUUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU
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CRW_00570 [ FASTA input ] GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
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CRW_00573 [ FASTA input ] UGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU
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CRW_01484 [ FASTA input ] AUUAGGGCGGCCAGAGCGGUGAGGUUCCACCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCUCGCCUGCGUUCUGGUCAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAAUCCAGUUCGCCGCCCCU
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CRW_01485 [ FASTA input ] UUAAGGCGGCCACAGCGGCGGGGCGACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGCAGAUAAGCCCGCCAGCGUUCCAGCGAGUACUGGAGUGUGCGAACCUCUGGGAAAACUGGUUCGCCGCCUCCC
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CRW_01489 [ FASTA input ] UUAAGGCGGCCAUAGCGGUGGGGUUACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCCGGUCAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCUACU
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CRW_01491 [ FASTA input ] GGAGUUUGGCGCCAUAGCGGCAGUGUAACUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUACUGUACUGAAGUGUGCGAGCCUUCGGGAACUCUGGAUCGCUGCCAUACUCACC
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CRW_01492 [ FASTA input ] GGGUACGGCGACCAUAGCGGGGGGGCCACACCUGAACCCGUUCCGAUCUCAGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUUGGAGGUGGUACUGCAACGUUAGUUGCGGGAAGCCUCCAACGUCGCCGGCCCA
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CRW_01494 [ FASTA input ] UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC
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CRW_01497 [ FASTA input ] UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC
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CRW_01498 [ FASTA input ] GGAGUUUGGCGGCCAUAGCGGCGGGGCAAUUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCUAUACUGUACUAAAGUAUGAGAGUCUUUGGGAAAUAUGGAACGCUGCCAUCUCC
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CRW_01499 [ FASTA input ] GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU
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CRW_01500 [ FASTA input ] UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU
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CRW_01502 [ FASTA input ] UGGCCCGACCCGGCCAUAGCGGCCGGGCAACACCCGGACUCAUGUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCGCGUUGGGGGAUGCUGUGGGGUCCGCGAGGCCCCGCAGCGCCCCCAAGCCGGGAUCGGGCCG
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CRW_01504 [ FASTA input ] GCCCACCCGGUCAGAGUGAGCGGGCAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGCUCACGUUAGUGGGGCCGUGGAUACCGUGAGGAUCCGCAGCCCCACUAAGCUGGGAUGGGUUUU
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CRW_01507 [ FASTA input ] GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU
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CRW_01521 [ FASTA input ] UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA
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CRW_01532 [ FASTA input ] GUCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGCACCGCUUCUCGUCCGAUCAGCAAAGUUAAGCAACGUUGGGUCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCAGAUGCUGUUGACUU
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CRW_01533 [ FASTA input ] GCCUACGACUAUACCACCAUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGUAUGGUAGGGCCGGGUCAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCCGGUGUUGUAGGCCU
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CRW_01535 [ FASTA input ] GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU
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CRW_01536 [ FASTA input ] ACAUACGGCCAUAGAUUGAAGAAUAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUUCUAAUCGCCAAGUUAGUACUGCGGUGGGUGACCACGCGGGAAUCCUUGGUGCUGUAUGU
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CRW_01537 [ FASTA input ] GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU
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CRW_01539 [ FASTA input ] ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU
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CRW_01540 [ FASTA input ] GCUUACAGCCAUACUGUCCUGAGCACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGACAAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACUGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCUU
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CRW_01542 [ FASTA input ] GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU
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CRW_01548 [ FASTA input ] GCUUACGACCAUAUCACGUUGAAUGCACGCCAUCCCGUCCGAUCUGGCAAGUUAAGCAACGUUGAGUCCAGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCUGGAUGUUGUAAGCU
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CRW_01556 [ FASTA input ] GCUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAUGCACCGGAUCCCUUCCGAACUCCGAAGUUAAGCGGUUUAAGGCCUGUUAAGUACUGAGGUGGGGGACCACUCGGGAACUUCAGGUGCUGAUAGCUU
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CRW_01557 [ FASTA input ] GUCUACAACCAUACCACGUUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUAGGGCUCGGUUAGUACUUAGAUGGGUGACCGCUUGGGAAUACCGAGUGUUGUAGGCUU
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CRW_01559 [ FASTA input ] GGCGUACGGCCAUACUACCGGGAAUACACCUGAACCCGUUCGAUUUCAGAAGUUAAGCCUGGUCAGGCCCAGUUAGUACUGAGGUGGGCGACCACUUGGGAACACUGGGUGCUGUACGCUU
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CRW_01562 [ FASTA input ] UGAUGCGGUCAUACCAAGGCUACUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCGCCUUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUGCUGCAUCCAC
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CRW_01563 [ FASTA input ] AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU
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CRW_01566 [ FASTA input ] GGGUGCGAUAAUACCACCGCUAACGUAUCGGAUCCGAUCAGAACUCCGUAAUUAAGCGCGCUUGGGCUAGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCUCGGGAAGUCCUAGUGUUGCACCCAC
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CRW_01568 [ FASTA input ] GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU
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CRW_01569 [ FASTA input ] GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU
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CRW_01570 [ FASTA input ] GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU
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CRW_01572 [ FASTA input ] AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU
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CRW_01573 [ FASTA input ] GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
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CRW_01578 [ FASTA input ] GUUUACGACCAUACCAUGCUGAAUAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCAUAGGGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUGUAGGCAU
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CRW_01583 [ FASTA input ] AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU
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CRW_01584 [ FASTA input ] GUCUACGACCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCGUGGUUAGUACGUGGAUGGGUGACCGCCUCGGAAUACCACGUGUUGUAGGCUU
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CRW_01590 [ FASTA input ] GGGUGCGAUCAUACCAGCGUUAGUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGCGCUUGGGCCGGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUAUUGCACCCUU
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CRW_01593 [ FASTA input ] GUCUACGACCAUACCACAAUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAUUGUCGGGCCAGGAUAGUACCUGGAUGGGGGACCGCCUGGGAACGCCUGGUGUCGUAGACUU
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CRW_01599 [ FASTA input ] GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU
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CRW_01603 [ FASTA input ] AGAUGCGAUCAUACCAGCACUAACGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGCUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUGGAAUGGGUGACCCUCCGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUCCCG
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CRW_01605 [ FASTA input ] GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU
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[ predicted structure ] ((((((((((..........(((((((.[[[)))))))........]]].))))))))))
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[ predicted structure ] ((((((.(((((((.....))))))).......((((((((..(((((.....)))))....))))...))))...))))))
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[ predicted structure ] .((((((.((((.....))))........(((((((....)))))))....)))))).
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[ reference structure ] .((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ] ..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
RFA_00429 [ FASTA input ] GGGUGGUGUGUACCACCCCUGAUGAGUCCGAAAGGACGAA
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[ predicted structure ] (((((((....))))))).......((((....))))...
RFA_00433 [ FASTA input ] GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC
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[ predicted structure ] (((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
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[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
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RFA_00440 [ FASTA input ] GAAGAGUCCUGCGCUUAGCGCACUGACGAGUCUCUGAGAUGAGACGAAACUCUUC
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[ predicted structure ] (((((((..(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00442 [ FASTA input ] CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG
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RFA_00642 [ FASTA input ] UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA
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RFA_00643 [ FASTA input ] AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU
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RFA_00644 [ FASTA input ] GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA
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RFA_00645 [ FASTA input ] AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA
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RFA_00649 [ FASTA input ] UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU
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RFA_00653 [ FASTA input ] GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA
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RFA_00770 [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA
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RFA_00773 [ FASTA input ] CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA
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RFA_00779 [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA
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RFA_00781 [ FASTA input ] GUCUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC
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RFA_00786 [ FASTA input ] GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC
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RFA_00791 [ FASTA input ] GUCUGUACUAGUUGGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUCCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGGCCGCAGCCCCUAGGAGACGUCCCAGCGGCC
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RFA_00792 [ FASTA input ] GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC
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RFA_00801 [ FASTA input ] GUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUAUAUCUGGCGGGUCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGACCGCAGCCCUAGGGAGACGUCCUAGGGUC
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RFA_00809 [ FASTA input ] CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG
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SPR_00007 [ FASTA input ] GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
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[ predicted structure ] (((((....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))))....
SPR_00016 [ FASTA input ] GGGGGAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUCCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00017 [ FASTA input ] GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUUCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00020 [ FASTA input ] GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.......(((....))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00022 [ FASTA input ] GCGACCGGGGCUGGCUUGGUAAUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAGAAUGUGGGUUCAAAUCCCAUCGGUCGCGCCA
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[ predicted structure ] (((((((....[[[[............(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00023 [ FASTA input ] GCCCGGGUGGUGUAGUGGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCUCGGGCGCCA
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[ predicted structure ] ((((((((((((..[[[[[.)))))(((((((..]]]]])))))))..(((((.......))))))))))))....
SPR_00025 [ FASTA input ] GGCCCCGUGGUGUAGUUGGUUAACACACCCGCCUGUCACGUGGGAGAUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCGGGGCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((...[[[[..)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00026 [ FASTA input ] GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCA
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SPR_00027 [ FASTA input ] GGGAUUGUAGUUCAAUUGGUCAGAGCACCGCCCUGUCAAGGCGGAAGCUGCGGGUUCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA
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SPR_00029 [ FASTA input ] AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA
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[ predicted structure ] .....((((((((.......[[[[[[[[...............))))))))......]]]]]]]]........
SPR_00030 [ FASTA input ] AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
[ predicted structure ] ......(((((((.....................)))))))....(((((.....)))))...........
SPR_00032 [ FASTA input ] AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((..((((.....)))).((((((.....))))))....(((((......))))))))))))....
SPR_00033 [ FASTA input ] AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .....................(((......)))...(((((((([[[[[)))))))).]]]]]..........
SPR_00034 [ FASTA input ] AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA
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[ predicted structure ] (((((((................((((((.....))))))....(((((......))))))))))))....
SPR_00036 [ FASTA input ] UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.......[[[[.......(((((.{{{{..))))).}}}}((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00044 [ FASTA input ] GGCCUGUUGGUGAAGCGGUUAACACACACGGUUUUCAUCCGUGGACACACGGGUUCGAACCCCGUACAGGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00045 [ FASTA input ] GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUGGGGGACGCCA
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SPR_00060 [ FASTA input ] UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
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SPR_00064 [ FASTA input ] GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA
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SPR_00065 [ FASTA input ] GGCUCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACGGACUGAAAAUCCGUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
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SPR_00066 [ FASTA input ] GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
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[ predicted structure ] (((((((..((((...[[[..)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).]]]
SPR_00068 [ FASTA input ] GCCCGGGUAGCUCAGCUGGUAGAGCACGUGACUGAAAAUCACGGUGUCGGUGGUUCGACUCCGCCCCCGGGCACCA
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SPR_00070 [ FASTA input ] GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
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SPR_00074 [ FASTA input ] UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
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SPR_00078 [ FASTA input ] ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA
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SPR_00079 [ FASTA input ] AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA
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SPR_00080 [ FASTA input ] GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA
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SPR_00086 [ FASTA input ] GCCGACUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCUGGUUCGAUCCCGGGAGUCGGCACCA
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SPR_00087 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
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SPR_00088 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
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SPR_00089 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
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SPR_00090 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCACGUGUUCGAUCCACGUUCACCGCACCA
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SPR_00115 [ FASTA input ] GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
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SPR_00116 [ FASTA input ] GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
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SPR_00121 [ FASTA input ] GCAGUACUGGUGUAAUGGUUAGCGCCUUAGAUUUCCAAUCUAAAGGUAGGGGUUCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA
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[ reference structure ] (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
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SPR_00126 [ FASTA input ] GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..)))))))))))....
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SPR_00127 [ FASTA input ] AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA
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SPR_00137 [ FASTA input ] GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA
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SPR_00138 [ FASTA input ] GGCGUAGGUGGUGAAGUGGUUAACACAUCAGGUUGUGGCUCUGACAUACGCGGGUUCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA
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SPR_00139 [ FASTA input ] GGUGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCCCUGGAUUGUGAUUCCAGUUGUCGUGGGUUCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
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SPR_00141 [ FASTA input ] GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
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[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00155 [ FASTA input ] GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGUCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
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SPR_00156 [ FASTA input ] GGGCGAUUAGCUCAGCUGGUUAGAGCGCACGCCUGAUAAGCGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACCAUCGCCCACCA
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SPR_00164 [ FASTA input ] GGGCUUAUAGUUUAAUUGGUUGAAACGUACCGCUCAUAACGGUGAUAUUGUAGGUUCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
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SPR_00166 [ FASTA input ] AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
[ predicted structure ] .........(((.......))).((((((.....))))))...((((((........)))))).........
SPR_00167 [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGACAAAAGAGUUACAUUGAUAGUGUAAAUAAUAGAGGUUCAAACCCUCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00176 [ FASTA input ] GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
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SPR_00177 [ FASTA input ] GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA
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SPR_00178 [ FASTA input ] GAGCCAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUCUGACUUUUAAUCAGAGGGUCGAAGGUUCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA
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SPR_00183 [ FASTA input ] CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
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SPR_00221 [ FASTA input ] GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA
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SPR_00235 [ FASTA input ] AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
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[ predicted structure ] .........(((([[[[[[..)))).(((((.......))))).....(((((......)))))..]]]]]]....
SPR_00276 [ FASTA input ] GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00279 [ FASTA input ] GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))((((((.......)))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] (((((((.........[[[[....(((((................)))))((((.......)))).)))))))]]]]
SPR_00281 [ FASTA input ] AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
[ predicted structure ] .....(((((((..............((((.......)))).[[[[.......)))))))]]]]
SPR_00289 [ FASTA input ] GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((...((((((.....))))))....(((((......)))))..((((((.......))))))))))))....
SPR_00294 [ FASTA input ] UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.....(((((......[[[[..))))).....]]]].....(((((.......))))))))))))....
SPR_00295 [ FASTA input ] UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..{{{..)))))).(((.......))).((((..[[[[[.))))..]]]]]))))))).}}}
SPR_00297 [ FASTA input ] UGAGUUGUAGCCUAGUGGAAAGGCGUUUGGCCGUUAACUAAAAGAUAGCAAGAUCAAUACUUGCCAGCUCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.......))))...[[[[................(((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00298 [ FASTA input ] UGGGUUGUAGCCUAAUGGAAAGGCAAUUGGCCGUUAACCAGGAGAUAACAAGAUCAAUACUUGUCAACUCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((([[[[[..))))..((((]]]]]..))))..(((.{{{{{)))....}}}}})))))))....
SPR_00309 [ FASTA input ] CUCCGAUUAGCUCAAUUGGCUAGAGUACACCGUUUGGGGCGGUGGGGUUGAAGGUUCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((.....))))))....((((((.[[[.))))))....((((((.......)))))))))))).]]]
SPR_00314 [ FASTA input ] CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((....[[[[.))))...........((((....))))(((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00315 [ FASTA input ] CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGUAGAGCACAUGGUUUGGGACCAUGGGGUCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA
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[ predicted structure ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00316 [ FASTA input ] CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((..[[[[...)))).((((((.]]]])))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00317 [ FASTA input ] CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCCUGGGGUUGCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((...(((((((((((.....))).[[[[.))))))))]]]]..(((((.......))))))))))))....
SPR_00318 [ FASTA input ] CGGCGAGUAGCGCAGCUUGGUAGCGCAACUGGUUUGGGACCAGUGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUCUCGCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00320 [ FASTA input ] CAGAUAGAAGCCAAAAGGUCAGGCGCUUUCUUUGGGAGAAAGACCUAGUUAGUUCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ] ..((((((........[[[[[[[..((((((.{{{{)))))).}}}}...........))))))...]]]]]]].
SPR_00327 [ FASTA input ] UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGUCGAGAUCAUUGGUUCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA
[ reference structure ] .((((((..((((...........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((......((((([[[[..)))))..]]]]...............(((((.......))))))))))).....
SPR_00329 [ FASTA input ] AGUCCCAUGGGGUAGUGGCCAAUCCUGUUGCCUUCUGGGGGCAACGACCCAGGUUCGAAUCCUGGUGGGACUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
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SPR_00331 [ FASTA input ] UGGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
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SPR_00333 [ FASTA input ] UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((....))).....((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00339 [ FASTA input ] GGUUCUAUGGUGUAGUGGUUAGCACUCUGGACUUUGAAUCCAGCGACCUGGGUUCGACUCCCGGUAGGACCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((........))))).......((((((((((....))))))))))......))))))))....
SPR_00353 [ FASTA input ] GCGCCCGUAGCUCAAUGGAUAGAGCGUUUGACUACGGAUCAAAAGGUUAGGGGUUCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA
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SPR_00356 [ FASTA input ] GUCCUCUUAGUUAAAUGGAUAUAACGAGCCCCUUCUAAGGGCUAAUUGCAGGUUCGAUUCCUGCAGGGGACACCA
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SPR_00357 [ FASTA input ] GCGCCCUUAGCUCAGUUGGAUAGAGCAACGACCUUCUAAGUCGUGGGCCGCAGGUUCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA
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SPR_00358 [ FASTA input ] GCGCCCGUAGCUCAGCUGGAUAGAGCGCUGCCCUCCGGAGGCAGAGGUCUCAGGUUCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA
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SPR_00359 [ FASTA input ] GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
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SPR_00360 [ FASTA input ] AUAUCUUUAAUUUAAUGGUAAAAUAUUAGAAUACGAAUCUAAUUAUAUAGGUUCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
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SPR_00362 [ FASTA input ] GACAAAUGUUUUCAGGUCUUCUAAAUCUGUUUUGGAGAAAUCCGUUUGUUUCCA
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SPR_00363 [ FASTA input ] GGACGUUAAAUAGAUAAGCUAUGCCUAGUUACGGGCUGGGAAGAGAGUCGUCUUCCA
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[ predicted structure ] ................((((..[[[[))))..]]]]..((((((......)))))).
SPR_00364 [ FASTA input ] AAAUAUGAAGCGAUUUAUUGCAAUUAGUUUCGACCUAAUCUUAGGUGAAAUUCACCCAUAUUUUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((....)))).(((((.......)))))....((((.....)))))))))))....
[ predicted structure ] .....((((((...............))))))...........((((.....))))...........
SPR_00365 [ FASTA input ] AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).)))))))))....
SPR_00366 [ FASTA input ] UGGUACUUAGUUUAAAAUAAAAUAAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUUUAAUUCAUAAUUACCAACCA
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SPR_00367 [ FASTA input ] UGGUGAUUAGUUUAACUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGACAUAUCUCAUAAUCACCAACCA
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SPR_00369 [ FASTA input ] GCUCGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUGCCA
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[ predicted structure ] (((((((.(((((..[[[[...)))))...(((((....)))))...(((((.......))))))))))))]]]]
SPR_00370 [ FASTA input ] GCUUGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUCCCA
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SPR_00373 [ FASTA input ] GACCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUCAGCCUCCGGAGCUGGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGUCGCCA
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SPR_00374 [ FASTA input ] GCCCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUUGGCCUCCUAAGCCAGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGGUCCCA
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SPR_00385 [ FASTA input ] GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGAGAGUCGGGGAAACCCGAGCGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA
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SPR_00386 [ FASTA input ] GGAGGAAUACCCAAGUCUGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGACAGGGUGUCAAAGCCCGCGGGGGUUCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA
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[ predicted structure ] ......((((((......(((((.[[[[[[))))).............]]]]]]........{{{{{{{.....))))))...}}}}}}}..
SPR_00388 [ FASTA input ] GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA
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SPR_00389 [ FASTA input ] GGAGAGAUGCCGGAGCGGCUGAACGGACCGGUCUCGAAAACCGGAGUAGGGGCAACUCUACCGGGGGUUCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA
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SPR_00390 [ FASTA input ] GGUGAGGUGGCCGAGAGGCUGAAGGCGCUCCCCUGCUAAGGGAGUAUGCGGUCAAAAGCUGCAUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA
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SPR_00395 [ FASTA input ] GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
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[ predicted structure ] ..............((((((((........))))))))((((((.......))))))..........
SPR_00399 [ FASTA input ] AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
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SPR_00402 [ FASTA input ] GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA
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SPR_00412 [ FASTA input ] GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
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SPR_00414 [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA
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[ predicted structure ] (((((((...........(((((..[[[[[[)))))..]]]]]]((((...))))..(((((.......))))))))))))....
SPR_00415 [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA
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SPR_00416 [ FASTA input ] GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
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SPR_00417 [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
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SPR_00418 [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
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SPR_00426 [ FASTA input ] AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA
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SPR_00436 [ FASTA input ] GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
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SPR_00497 [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.......))))(((((....))))).........(((((.......))))))))))))....
SPR_00498 [ FASTA input ] AGCGGGAUGGGAUAGCUAGGAGAUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGAUCGGUAGUUCAAAUCUACCUCCCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((.........))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00502 [ FASTA input ] AGCGGGGUGGGGUAGUCAGGAAAUCCGAUGGGCUCAUAACCCGUAGAUCGAUGGUUCAAAUCCAUCCCCCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00504 [ FASTA input ] CGCGGGGUAGAGCAGUUGGUAGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGGCCGCAGGUUCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((..((((...[[[[.)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).]]]]
SPR_00505 [ FASTA input ] CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGUAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCCCCGCUACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((..(((([[[[[[[..)))).]]]]]]]....(((....))).(((((.......))))))))))).....
SPR_00506 [ FASTA input ] CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00509 [ FASTA input ] CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
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SPR_00512 [ FASTA input ] CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
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SPR_00517 [ FASTA input ] UGCAAUAUGAUGUAAUUGGUUAACAUUUUAGGGUCAUGACCUAAUUAUAUACGUUCAAAUCGUAUUAUUGCUACCA
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SPR_00518 [ FASTA input ] AGCGGGGUAGAGUAGUUGGUUAACUCAUCAGGCUCAUAAUCUGAAGAUUGCAGGUUCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA
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[ predicted structure ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
SPR_00557 [ FASTA input ] CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCACUGGUUCGAAUCCGGUAGGUCGGACCA
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SPR_00561 [ FASTA input ] CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGUCGGACCA
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[ predicted structure ] (((((((..((((.[[[[[[[....))))]]]]]]]..............(((((.......))))))))))))....
SPR_00593 [ FASTA input ] GGCGACAUGGCCGAGUGGUAAGGCAGAGGACUGCAAAUCCUUUUUUCCCCAGUUCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((..[[[[...)))((((((]]]]...))))))....................))))))))....
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[ predicted structure ] (((((((..((((.[[[[[.)))).....]]]]].((((....))))(((((.......))))))))))))....
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[ reference structure ] (((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.....(((((((........((((((..[[[..))))))]]]))))))).........))))))))....
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[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((.................(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))).
SPR_00620 [ FASTA input ] GCCCCCGUGGUGUAGCCAGGUCUAGCAUACGGGGUUCUCGUCCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGGGCACCA
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[ predicted structure ] ((((((((((..[[[)))...]]]...(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))))....
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[ reference structure ] ((((((...((((.........)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] (((((((....[[[[[[[[[[[..)))))))..........]]]]]]]]]]]..........
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[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
SPR_00633 [ FASTA input ] UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((.......((((........[[[[[...))))]]]]]....(((((.......)))))))))))).
SPR_00721 [ FASTA input ] GCCGGCUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCUAGAUUGUGGAUCUAGAGGUCCUCGGUUCGAGCCCGAGAGCUGGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((...[[[[.))))))..]]]]..........(((((....))))).((((((........))))))......
SPR_00722 [ FASTA input ] GCGGUUGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGGUUUGUGGCACCUGAGGUCGGAGGUUCGAUCCCCCCCAACCGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).((((((....)))))).....)))))))....
SPR_00750 [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((...............((((((.....))))))......................)))))))....
SPR_00758 [ FASTA input ] GGGCCGGUGGCUCAGCCUGGUUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCAGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCGGCCCGCCA
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SPR_00768 [ FASTA input ] GGGGUGUUAACUUAAGUUUAAAGUGUUAGAUUUUUAAUCUGGAAAUGGGUUGUCACAUCCUGCCA
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[ reference structure ] (((((((..((((........)))).((.((.......)).)).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((....((((........))))..............((((...[[[[[[[..)))).]]]]]]]))))).
SPR_00810 [ FASTA input ] GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
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SPR_00816 [ FASTA input ] GCCUUCGUGAUCGGAAUGGUAGAGAUCCUGGUCUUAGGAACCAGCUGCUGAAAGGCGGCGGUUCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA
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[ predicted structure ] .........((((.....))))..((((((((.............)))))))).....
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SPR_00912 [ FASTA input ] GGGCCCGUCGUCUAGCCUGGCUAAGAUGCGGGGUACGGGACCCCGUGGUCCGGGGUUCAAAUCCCCGCGGGCCCACCA
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SPR_00932 [ FASTA input ] AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA
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SPR_00938 [ FASTA input ] UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA
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SPR_00943 [ FASTA input ] GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
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SPR_01088 [ FASTA input ] GGGGCCGUAGCUCAGCCAGGCAGAGCGGCGGGCUCCAGACCCGUAGGUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCGGCCCCACCA
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SPR_01103 [ FASTA input ] ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
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SPR_01106 [ FASTA input ] GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
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SPR_01117 [ FASTA input ] CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
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SPR_01143 [ FASTA input ] AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
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SPR_01157 [ FASTA input ] CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
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SRP_00008 [ FASTA input ] GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU
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SRP_00084 [ FASTA input ] GGCGGGCCUCCCCGCAUUGCACGGUAGCGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGUUAUUCAGUGCAAGUGCCGGGGGUCGGGCUCGCCACCCCUCCC
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SRP_00094 [ FASTA input ] GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
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SRP_00095 [ FASTA input ] GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
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SRP_00101 [ FASTA input ] GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU
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SRP_00105 [ FASTA input ] GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGCUUUU
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SRP_00106 [ FASTA input ] GGUAGCUAGGUCUAUGCAACAGAGAAUCACGAACUCCGCCAGGCCUGGAAGGGAGCAACGGUAGUGACACUCUCUGUGUGCGUAGGUUGCCUAGCUACCAUUU
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SRP_00107 [ FASTA input ] GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU
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SRP_00121 [ FASTA input ] CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA
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SRP_00128 [ FASTA input ] GGAGGCCCUGUCGGUUCUCCCGCAACACUAUCCUGUGGACUCGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCAGGAGACGUGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCGGGGCCUCCACCAAUU
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SRP_00132 [ FASTA input ] GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ] (..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
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SRP_00134 [ FASTA input ] CUGAUAGCUGGGUCCCGCGCAACGGUAGGUUAUGAACCCCGCCAGAUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGUAGCUGAUUCCGUGUGCCGCGGGGGAGCCCAGCUAUCAGUUGU
[ reference structure ] ...(...(((((((((.((((.(((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))).....)).)))).)))))........)..
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SRP_00137 [ FASTA input ] ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
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SRP_00138 [ FASTA input ] GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU
[ reference structure ] (((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
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SRP_00139 [ FASTA input ] ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG
[ reference structure ] (((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
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SRP_00141 [ FASTA input ] GGAAACCUUCUCGGUCUCUCGCAACGGUGUCUGGUUUACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAAGUCGGAAUUACUGUGUGCCGAGAAGAAGCUGGGAAGGUUUCCGCC
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SRP_00145 [ FASTA input ] UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU
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SRP_00146 [ FASTA input ] CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG
[ reference structure ] ((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
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SRP_00161 [ FASTA input ] GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ] (((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
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SRP_00162 [ FASTA input ] GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
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SRP_00163 [ FASTA input ] CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))))))....
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SRP_00164 [ FASTA input ] GGUGACUCUAUUGGUCCCCUCGCGACGAUAGAUUGUGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGCAGUUGAUGCGGGCGCCGGGGUGUGGCUCUUAGAGUCGCCGCCCAACU
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SRP_00170 [ FASTA input ] GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
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SRP_00193 [ FASTA input ] GGAGGCCCUCUUGGUUCCUCGCAAUGAUGUUCGGUUUAUUAGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCGGAGUCGAGAUUUUCGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAGGGUCUCCACCCAACU
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SRP_00194 [ FASTA input ] GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
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SRP_00196 [ FASTA input ] GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA
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SRP_00200 [ FASTA input ] GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
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SRP_00209 [ FASTA input ] GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
[ reference structure ] (((((.(((((..(((((.((((((......(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..)))).))).)).........
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SRP_00213 [ FASTA input ] GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
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SRP_00214 [ FASTA input ] AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ] ((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((........................(((....))).........................))))))))))
SRP_00215 [ FASTA input ] GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
[ reference structure ] (((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((................(((....)))................)))))))).)))))))))....
SRP_00216 [ FASTA input ] AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
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SRP_00217 [ FASTA input ] GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))...)))))))....
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SRP_00219 [ FASTA input ] GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((........((((...[[[[[[))))................(((]]]]]]..))).....)))))))))....
SRP_00221 [ FASTA input ] GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((..(.(..(.....((((....(((....)))....))))...)...)...)..))))..))))))).....
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SRP_00222 [ FASTA input ] AGCCGUCACAUCAUUACGGUCGAAUCGUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUAUUUAAUGAGUGUGAUGGUU
[ reference structure ] (((((((((..(((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))).)..))))))))
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SRP_00223 [ FASTA input ] GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU
[ reference structure ] ((((..(.(.(((((..((((.....(((......((....))......)))...))))...))))))...)..)))).....
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SRP_00227 [ FASTA input ] GGCGGGUCUCCCCGCAUGGCAAAUCGGAACACCGGGUCAGGGGCGGAAGCCAGCAGCCCACUCCAAUGCGCCAGUGCCGGGGGUUUGGCCCGCCGCCCUAUU
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))))...))))))...))))))))........
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SRP_00229 [ FASTA input ] GCCCAUAGAGGAGGAUCUUCAACGUUUUGAAGAUGUGUCAGGACUGAAAAGAAGCAGCACGCAAAACGCUUCGAAGUCGCCCCCAUUCUAUGGGUGCCGUACC
[ reference structure ] ((((((((((..((...((.((.((.((.....(((((.....((....)).....)))))...)).)))).)).......))..))))))))))........
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SRP_00231 [ FASTA input ] GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
[ predicted structure ] ((((((((((((((..((((((((.......(((((......)))))....(((.......)))...))))))))....))))))...)))))))).........
SRP_00233 [ FASTA input ] GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU
[ reference structure ] ((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........
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SRP_00235 [ FASTA input ] GGUAUAGUUUUAUUAAAACUUAAGAUAGACUUACUAUGUCAGAAUCGUAAGAUAGCAGCAUAAAGAUCUCAUUUUUAGUUAGUAUUAAAGCUAUACCUAAA
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SRP_00243 [ FASTA input ] AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((..(.((((.((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).).).)))).)..))))....)))))))))....
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SRP_00244 [ FASTA input ] GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG
[ reference structure ] ((((((((((((((((.(((((.((((.((((((((.....(((....(((....)))....)))..)))))))..).)))))...))))....))))))))))))))))........
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SRP_00250 [ FASTA input ] GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUAACUUGUUAACUUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAGCAGGGGAUGUGUGUGCCGGGAUGUCGCUGGCAGAGCCCUCGCCAAUU
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SRP_00251 [ FASTA input ] GAGGCCCCCAUUGGUCCUCCCGCAACACUAACCUGUGAACUCGGCCAGACCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAGGUGACGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGUGGGGGCUUCCACCCAUCU
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SRP_00256 [ FASTA input ] GGCGACCCUUGCGACUGUGAGUCGUGAACCUGGUCAGGCCUUAACUGGAGCAGCCAUAAGCGGUGUAACUUUGUGUGAGGGUUGCCGCCACCG
[ reference structure ] ((((..(.((...((.(.(.(((((.....((((....((......))....))))...)))))....).).)..)..)))....))))....
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SRP_00266 [ FASTA input ] GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU
[ reference structure ] ((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
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SRP_00268 [ FASTA input ] GUUCCCCGUGCGGCGGCACCUGACUGAACUCCCCCAGGACCGAGAGGUAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUACCGGGUGCGCGGGGAGCCCUUUU
[ reference structure ] (((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
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SRP_00269 [ FASTA input ] GACUCGGGCCCAUGCGGCUUCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAAUCUGGCGUGGAUUCCGGGUCACCUAAA
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[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((......)))....((((((....)))))).(((....))).....((((......)))).))))))..)))))))).......
SRP_00270 [ FASTA input ] GACUCGGACCCAUGCGGCCGCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCGUGACAGGCGUGGACUCCGGGUCACC
[ reference structure ] ((((((((.((((((.(.((((((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).))))).)..))))))..))))))))...
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SRP_00271 [ FASTA input ] CUCGGCCUUUCGCGGUUUUAACGCCCAAACCUGGUCAGGAUCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAGGCAGGCGAG
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SRP_00273 [ FASTA input ] GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU
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SRP_00274 [ FASTA input ] GGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGGCACCACCUAUCU
[ reference structure ] ((((.(((((((((((.((((((.(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))...)))))...))))))))))).))))........
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SRP_00295 [ FASTA input ] GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUACUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAUGACGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCAGGGCCCCCACCCAAUU
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SRP_00312 [ FASTA input ] GCCCCUCACGUGGCGCUAUCUGACUGAACUCCCCCAGGGCCGGAAGUCAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGCGCUUGC
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SRP_00318 [ FASTA input ] GGAGCAACACUUGUGCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUUCGGGUGUGUGCUCUUUUU
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SRP_00324 [ FASTA input ] CUCCACCAGUCCGCUAGCGACCCUGCGGAAACGCGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCGCACCGCCGGGUCGCUAGGUGGACAGCCUGCAGAUGUGGCGGAAUUGG
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SRP_00326 [ FASTA input ] GACUCGGGCCAUGCGGCUCGGACGCCCAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCAGAGCAGGCGUGGACUCCGGGUCACCCAACU
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SRP_00333 [ FASTA input ] GGCUCGGAAUCAUGCGAUCGCAACGCCUCAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUACGGGAUGCUUGCGAUAGGCGUGAUCUCCGGGUCACCCUCUG
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SRP_00338 [ FASTA input ] AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU
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SRP_00367 [ FASTA input ] GGUGGCCCCGUCGGUCCCUCGCGACGCUAGAUCGAAAAUCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUCGAUUGAUGCGGGCGCCGAGGUCAACCGGCGGGGACACCACCCCACUC
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SRP_00369 [ FASTA input ] GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC
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SRP_00383 [ FASTA input ] GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
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TMR_00272 [ FASTA input ] GGGGAUGAAUUAGUUUAGAUAUUUAAGUAAUCCAUGAAAAUUCAUCAGAAUUUUGUAAUAUUGCUUAGAUAAAACCAUGGGCAGUACAUGGCAUCUCCACCA
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  • N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.

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