|
ASE_00001
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCCGCCUCCAGAUCAAGGGAAGUCCCGCGAGGGACAAGGGUAGUACCCUUGGCAACUGCACAGAAAACUUACCCCUAAAUAUUCAAUGAGGAUUUGAUUCGACUCUUACCUUGGCGACAAGGUAAGAUAGAUGAAGAGAAUAUUUAGGGGUUGAAACGCAGUCCUUCCCGGAGCAAGUAGGGGGGUCAAUGAGAAUGAUCUGAAGACCUCCCUUGACGCAUAGUCGAAUCCCCCAAAUACAGAAGCGGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[.((((((((((....)))))(((((.....)))))((...((((............(((((((((((................((...((((((((((....))))))))))..))........))))))))))).......)))).)))))))))))...((.((((((((..((((..]]]]]))))))))))))...))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((...........((((((((((....))))(((((((...)))))))...(((((...........((((((((((((((..((((.......))))..((((((((((....))))))))))..........))))))))))))))......))))).))))))(((....[[[((((((((....(((....)))...))))))))(((((.....))))).)))......]]]....)))))....
|
|
ASE_00002
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCCGCCUCCUGGCCUAAAGGAGUCUCUAUAGAGACAAGGGCAACACCCUUGGCAACUAUACAGAAACAAGUACCUUGAAAGCUACAUGUGAAAAUGAUUGUGCCCCUUCCUCUGGUAACGGAGGAAGAAACAUGAGAGUAGCUUUCAAGGAUGAAAAGAUAGACCUCCUAGGAGCAAGUAGAGGGAAAGAUGAGACUAGGCCCGAUUUCCCUCUAGGACGCAUAGCCAAAUCCCCCAACCAUUACAAAAGCGGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[.((((((((((....)))))(((((.....)))))((...((((.............(((((((((((...............((.....(((((((((....)))))))))...)).......)))))))))))........)))).)))))))))))...((.((((((((...(((...]]]]])))))))))))....))..............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.........))))....((((..(((((((.(((((...((((((.....))))))....))))).)))........(((((((((((((.(((....))).(((((...(((((((((....)))))))))...)))))..)))))))))))))..............))))))))......((((((((((........[[[[[[[[.))))))))))(((............))).................]]]]]]]]
|
|
ASE_00004
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCACGGUGGUGGCCAACAGCCACCCACGGCGACGUGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCAGCGGCCCCGCGGCCUUCGGGCCACGGGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCGACGUCGGCGACGGCGUCGGCUCGGUAAACCCCACCGGGAGCAAGACCAAGAGGGCGCUCCGGCGCCUGCGCUGACGGGCUGCUCGUCCGACGUCAGCGGGUAGGUCGCUCGAGGCACGCAGCAAUGCGUGACCCAGAUGGAUGGUCGCCCCCCAGCCCUCGGGCCGGGG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((....))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((....((((((....))))))..((((((((((.]]]])))))...))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..........(((.[[[[......)))..]]]]((((((..((((.....[[[[............)))).....((((((.((((....)))).))))))...]]]].((((.....(((((.....[[[[)))))..((((((((....))))))))]]]].....))))..(((.((((..((((....((((((....)))))).(((((((((((.....))))...)))))))....))))))))....((((((....)))))).......)))...))))))((((.(((....))).))))
|
|
ASE_00005
|
[ FASTA input ]
|
AAAGCAGGCCAGGCAACCGCUGCCUGCACCGCAAGGUGCAGGGGGAGGAAAGUCCGGACUCCACAGGGCAGGGUGUUGGCUAACAGCCAUCCACGGCAACGUGCGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGUCUUGCCGCCGGGUUCGCCCGGCGGGAAGGGUGAAACGCGGUAACCUCCACCUGGAGCAAUCCCAAAUAGGCAGGCGAUGAAGCGGCCCGCUGAGUCUGCGGGUAGGGAGCUGGAGCCGGCUGGUAACAGCCGGCCUAGAGGAAUGGUUGUCACGCACCGUUUGCCGCAAGGCGGGCGGGGCGCACAGAAUCCGGCUUAUCGGCCUGCUUUGCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((....))))))))))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((((((....))))))))))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((............((((((((....)))))))).((((....[[[[...))))...]]]]..(((..[[[[[....)))...((((....))))........]]]]]..((((....)))).((((((((....))))))))..(((.........[[[..)))..]]](((....[[[))).....((((((.....((((...))))..)))))).]]]...((((((((((((((((....))))))))............((((......(((((((((....))))))))).....))))..))))))))...))))))))))....
|
|
ASE_00006
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAACGGUGGUGGCUAACGGCCACCCACGGCGACGUGCGGGACAGUGCCACAGAAAUCAGACCGCCAGCGGCCGCCGCUCCUCGGAGCAGCGGUGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCGCUCCGGGUGACCGGGGCGGCUAGGUAAACCCCACCGGGAGCAAGACCAAGAGAGUCGCGUGGCGCUUCGGCGGUGCACGGCUUGCGCUGACGGGCUGCUCGUCCGAUGUCAGCGGGUAGGUUGCACGAGGCGUCCAGCAAUGGGCGUCCCAGAUGGAUGGUCGCCCACG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[..((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((((((....)))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((....((((..((((.(((....)))...))))))))..((((((((((.]]]])))))...))))).....))))......((((((((....)))))))).....................
|
| [ predicted structure ] |
.....(((...[[[[[[.)))....]]]]]]...((((....[[[[.....))))............]]]].....(((((.((((....)))).)))))...(((..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........)))).)))....((((.(((....((((((.(((.(((....))).))).)))))).(((((((((((.....))))...))))))))))...))))......((((((....[[[[[[.......))))))..]]]]]]..
|
|
ASE_00007
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUGGGCCAGACGACCGCCGCGGAGCAAUCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAAGGCGCCGGCUAACGGCCGGGAGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAAAGCGCGUAAGCGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCAUUUCCGGCGACGGGAAUGGCAGGGAAAACCCCGCCUGGAGCAAGACCAAAUAGGCGUGCGAUACCGUGGCCCGCGGUGCAUGCGGGUAGGUUGCUGGAGCCUGCGCGUAAGUUCAGGCCUAGAGGAAUGGUCGUCCACGACAGAACCCGGCUUAUCGGCCCACUCCAAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((....)))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((....))).))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.((((((((....(((((..(((.....)))..[[[[..)))))...]]]]..(((...(((......(((..((((....)))).))).....)))..........[[[[)))...((((....)))).]]]].((((.....((((((.......)))))).((((((((....)))))))).[[[[....))))..]]]]................(((((....(((...(((((((.....))))))).)))..[[[[.[[[[[))))).....]]]]]]]]].....)))))))).....................))))))))))....
|
|
ASE_00009
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGGUGGGCGGCUGACCGAAAGGAGGAAAGUCCCCCCACCCGCUGUGGCGGAAGGCCCCUGAGAAGGGGCGGAGGAGGAACAGAAACGAGACCGGUGCGGGGAAAUGCGAUGAUUCCGCAAGGAUGAGGUCACCCGCUCCGGAUGAAACGGCCUCCUCCCCGCCGGGUGCAACGCGUAAGCGGCUCAGUCUAAUGCCGCCGGAACAGAAGGGGGCUUACUACCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((....))....[[[.[[[[[(((((.....(((((...((((((....))))))(((((((((............((((((((((((...........(((....))).....)).))))))))))........)))))))))))))))))))...(((....)))............)))))).........]]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.(((....))).........((((((((.(((((.....(((((...((((((....))))))((((((((.............((((.(((((.......(((...(((....)))....))).))))).)))).........))))))))))))))))))..........(((((....[[[...)))))......]]].)))))))).)))))))).
|
|
ASE_00010
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUAGCACACACCUUAUGGGUGUGUAGUGUUUGUGCUAAGGGAAAUCAUAACCUUAGGUAUGUUGUAUAAACAUAACGGCAAACUAGUUAUAGCUAAGGUGUUUCACUACGUUAUAACUUAAAUUAAAGUGCCACAGAGACGAAUCUAUUUAGAAAUAAAUAGAGUGAAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAAUUAGGUAGGGGCACAUGAUGUGUAGCAAUACAACAUCAUGCAAGAUUUGAAUCUUGAGAUUAAUAGUCACAAAAGAAGAAAUUCUUUACAGAACGCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((.......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((.....)))))).)((......((((........((((...)))).......)))).........(((((...........((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((.............)))))))((((((....))))))...............((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((........(((((..((((((((...))))))))...((((((.((((((..........)))))).((((((.....))))))...))))))......)))))...(((((((((..((((...((((......))))........))))..((((((((....)))))))))))))))))........))))...((((...[[[...))))...]]]...(((((((((((....))).))))))))((((((....)))))).(((.....)))...((((((....))))))...............
|
|
ASE_00012
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAAAGGAGGCGAGGCAGUUGCGGCUCAGGCUUCGGUUAUGGGCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCAAAAGACCAGACUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAGAGUGCCACAGAAACAUACCGCCGAUGGCCUGCUUGCAGGCACAGGUAAGGGUGCAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUCGAGAGGUGUUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGUGGAGGGACAACGGUUGGUCUUUUACCUGUUCCGUUUAUGGACCGCUAGAGGUGGCUAGUAAUAGCCAUCCCAGAGAGAUAACAGCCCUCUGUCUUCGACAGAGAACAGAACCCGGCUUAUGUCCUGCUUUCCCUACUUUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((((((.(((((((((.((((((((((....))).)))))))....[[[.[[[[[(((((.{{{{{{{.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((....(((((..(((.}}}}}}}.)))))))).........)))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((...))))))).......]]]]]]]].).))))))))))............
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((.....(((((.....[[[[[[[.))))).....]]]]]]]....(((((....[[[[..........)))))(((((((...)))))))((((....))))..]]]].............(((...[[[.)))(((((....)))))...]]]..((((.....(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]].....))))(((((.((((((.((((((((..(((...)))..))))))))))))))[[[....))))).....((((((((....))))))))..........]]](((((((((((...))))))).[[[......))))..]]]....)))))))).........
|
|
ASE_00014
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGCCGGCCGGCGGCCCACGGCCCCCCAGCCAGGGGGGCUGAGGAAACUCCGCCCUCCCCGCGGCGGCCGGGCCCCGCAAGGGGCACGGGUGAAACCCGUGGCAACGGCACAGAAACGACACGGCCCCGGGGCGUGUCGAGGACGCGGCUAGGCCGCCCUGGCAACAGGGCGGCAGCAAACCGCAGAGGAACCCCGGGGAUGCGGUGAAACGGCCGCCCCCGGCGGAGCAAGGCCCCCGGGCGGUGAGGGCCGCGCGAAGCCCGGGGGGAGACCGCUUAGCCCAAUGCCGCCGAAGUACAGAAGGCGGGUUAUGGCCGGCGCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((...(((((((((.....)))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{.((((((((((....)))))((((((...))))))((...((((............(((((((((((............((((.....((((((((....)))))))).......)))).......)))))))))..))........)))).)))))))))))...(((((((((((..((((.}}}}}})))))))))))))....))............))))))...........]]]]]]]]..)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((....(((.....(((.(((((((.(((....))).)))))))....))).[[[[.(((((....)))))((((((...)))))))))..]]]].......(((((((.[[[[[[[[))))))).....((((....(((((((((....)))))))))......)))).......]]]]]]]]............)))))))..((((((.......(((((((((.(((.......)))...)))))))))....[[[[[[.........)))))).........]]]]]].....)))))))))))))
|
|
ASE_00016
|
[ FASTA input ]
|
AAACGCAGAGGACCAGAACUUUGGGACGGGAGGCGGGGGUUUUGUUCGCAGGCUCCUUCUUCCCGCUCCUGGUUCUACGCGGCGUGCGCUGUACCACCAUCGGUGGUUAUGGCGCUUACCCCGUGAGGGGGGCUUGGGGAACCGAGUCUAGCGUUGUUAUAAGAAAUCAAUCUUUUGGAUCCAGCCAGGGUCCUCUAGCAGAAAAGGGGGAUGGGGCUCUCUUGGGCUCUCCCCUCCACGCCUGCGGGAUUCUGAUGGGAAUGACAACGGUCGGUCCAUUUGACUUUAUCAUUACGAUGGUUCUAGUCGUGUUAUGGUAAAGGUCUGUUGAGUGCAAUUGUAGAGCAAAUUGAUUCAAUUUGAA |
|
[ reference structure ]
|
........((((((........................................................................................................((((....))))(((((((....)))))))...(((((((................................................((((..(((((((....))))))).))))...........................)))))))...))))))...((((((((((((((.(((((....)))))))))))))))).)))....................(((((((...)))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((((..(((((((((((.((((((((.......)))))))).))))))).))))))))))....(((..(((((((((((((...))))).))))))))...((((....))))(((((((....)))))))...(((((((((......((((....)))).((((..(((((((((...((((....(((((..(((((((....)))))))..)))))....))))))))))))).)))).))))))))))))))))).)))).(((((((((((((((.......))))))..)))))))))....(((((((.(((((........)))))))))))).....
|
|
ASE_00017
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGCUACUUGCUGGGUGCUGUUGUUACUCUAUCAACCAGCCUUGGGGAAGGUCUGAGAUAAGAGCCACUUGUUGCCUUCACAAGGCAUUGCUUGGUGUAAGCAAGUGAGUUCCCAUCAAAGAUGGCUCAGUUGCAAGCUUAAUGCAAGAGACAUAGCAAAGAAGCCCAAUAUACUUCUGAUAUGGAUGCAAUGCCCAACAGACUGGAAAUGACUCACGGCUGGCAUGUUCAAGCUCAAUGACUGAGGGGAAGCAAGUGAUGGCUUCCUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........(((((.......)))))..........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((...........(((...........................................................................))).......))))))))))).....................))))(((((((........)))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[...))))....]]](((.[[[[)))...((((.........))))]]]]...(((((.((((((((((..(((((((((((((((((...))))))((((.....))))))))))).))))..))).....(((((((((((..(((((..((((.....((((....(((((.........)))))..))))..))))(((((.......(((...........)))..)))))....)))))...))))))))(((((((........)))))))...)))..)))))))..))))).........
|
|
ASE_00018
|
[ FASTA input ]
|
CCAGUUGGCCGGGCAGCCGCGCCUUACCAAUGUCGAAAGACGGUAAGGUGAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAAAUACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAAACCGCCAUGCCUUGCAUGGUAAGGGUGAAAGGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGCCGCUGGUGACAGUGGUGGCAAGGUAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGGAUGACACGGGGCGGGCGAAAGCCUGUUCACAGCCGGUUUCCGGGCCCGUCAUCCGGGUGGGUUGCGAGAGGCGGCAUGCAAAUGCCGUCCCAGAUGAAUGGCUGCCACGUUCCGGGUCAAACCGGGGCCAUACAGAACCCGGCUUACAGGCCAACUGGCGAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((...(((....))))))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...((((((((....))))))))...(((.}}}}}}})))..))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((......))))))).))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.....(((((((((...(((....))))))))))))......))))..((((...........[[[(((((((...)))))))((((....)))).................))))..]]](((((((...)))))))..((((.....[[[[[[[[....))))(((.((((((((....))))))))....)))..]]]]]]]]....((((..(((.....(((((((..(((((((((....))))))......((((...)))).))))))))))...))).))))....((((((((....)))))))).(((..[[[[[.)))...]]]]]..(((....[[[[[)))........]]]]]......))))))))))....
|
|
ASE_00020
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCGAAAGACCAGACUUGCUGGAUAACUUCCAGUGCGAGCGAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAAAUACCGCCAAAACAAUUCAAAAUUCAAAAUUCAAAAUUCAAAAUGAAUAAUUUUGGAUUUUGAGUCUUAGUUAUGAAUUCAAUUUUGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUACUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGCCGAAGGAACUAUGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCGUUAUCAGAGAGCCGCUAGAGGCGUUUGGUAACAAACGUCCCAGAUAGAUAAUCGCCCUCGUGUAAAGCAAUUUACACAGAGAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))............)))......((((((((....)))))))).................((((((((((....))))))).))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((..[[[[[....))))).........]]]]]((((((.....))))))((((....)))).......(((((.............(((((((.((((((.........((((((((((((((((.....))))))))))))))))........))))))...)))))))...)))))...(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]].......(((....)))...(((((((..[[[[[[..[[[)))))))..]]]]]]]]]((((((...[[[[[[.....((((((((....)))))))).......))))))....((((((((((....))))))).))).........]]]]]]..
|
|
ASE_00021
|
[ FASTA input ]
|
AGGGAGAGAGUAGGCGUUGGCGGUUGCAGACCAGUUAGCUUAACUGAUUUGAGGAAAGUCCGGACUCCCGAAAGACCAGACUUGCUGGAUAACGUCCAGUGCGAGCGAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAAAUACCGCCAAGAUUGGGGACUGGGGACUAGGGGUUGGGGACUGGGGAAGAAACUUCCCAAUCCCUAAUCCCCCAUACCCAAUACCCAACUCUUGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUACUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGCCGAAGAACUAUGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCGCUAUCAGAGAGCCGCUAGAGGCGUUUGGUAACAAACGUCCCAGAUAGAUAAUCGCCCUCGUGUAAAGCAAUUUACACAGAGAACAGAACCCGGCUUACCACCAACUCUCUCCUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((((((..(((((((((.(((((((((((...)))))))))))....{{{.{{{{{(((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((....(((((..(((.]]]]]]].))))))))............)))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((....))))))).))).......}}}}}}}}.).))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((....(((.[[[[[[[[.)))((((((...)))))).........((((((((....)))........)))))(((((((...)))))))....]]]]]]]].......(((((.............((((((((((((...((((.....(((((((((((.((((((......)))))).))))))))))).....))))...))))).)))))))...)))))...(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]].......(((....)))...((((((((.[[[[[....)))))))).....]]]]]..(((((...[[[[[[.....((((((((....))))))))...))))).........((((((((((....))))))).))).........]]]]]].......))))))))))....
|
|
ASE_00022
|
[ FASTA input ]
|
UCAUAACGUUUGGGUAAUCGCUGCAACGCCAACGUUGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGCCUGAGAUGGCUGUAGUGUUCGUGCCUAGCCAAUUCAUAAGCUAGGGUAUUCUGGCUGUAAGGCUGGUUUAACGGCAGGGAAAAAACCUAAGUCCUUUCGGAUAUGGUUUGACUACCUUUAAAGUGCCACAGUGACGAAGUCCUUGAAGAAAUGAUAGGAGUGGAACGAGGUAAACCCCACGAGCGAGAAACCCAAAUAAUGGUAGGGGAAUCUUUUCCAAGGAAAUGAACGAUGGGAAAGGACAGGUUGUAUAACCUGUAGAUAGAUGAUUGCCACCGGAGUACGAGGCGUGGGCCGUUUGCAGUACAAAGGAACAGAACAUGGCUUACAGAACGUUAUGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((((((....)))))))))).)((.(((.....((((...((((....))))..))))......))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))(((((((....)))))))........))))))).((((((((((((((....))))).....))))))))).......]]]]]]]].).)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((......((((((((....)))))))).......)))...((((.[[[[[[))))..]]]]]].((((((...((((((..........))))))...((((.(((.....((((......)))).(((...(((((...((((....))))..)))))...((((((.......((((..........((((............))))))))...))))))...)))...))).)))).(((......[[[[[[)))..(((((((((.............)))))))))(((((((....)))))))..........]]]]]].....((((..(((....)))[[[[...))))....]]]].))))))........)))))))))))....
|
|
ASE_00023
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAGGAAAUGCGGGUAGCCGCUGCCGCAAUCGUCUCGGCGAUUGGCGGUAGAGGAAAGUCCAGGCUCGCCCAAGCUGAGAUGCUUGGAGUGUUCGUACCUGGCGCAAGCCAGGGCAAGUGAGGCGCAAGCCUCGCUGACGGCGUGGAAAGGGCUCUCUCUGAGGCCCGAGUACGCUGAAAGUGCCACAGAAACGUAGCUUUUCUGGCGACAGAAAAGAUGGAACGCGGUAAACCCUGCGAGCGAGAAACCCAAAUUUGGUAGGGGAACCGUCCUGAAGGAAUCAAACGGAAGGGACGGAUGGUAUCUUCGGAUGCCAUAGAUAGAUGGCUACCGCUCUUGGUGCGAGGGAUACGUCCCGCUUGCAGCACGGGAGAGACAGAACCUGGCUUAUAGCAUUUCCUGCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((((((((....)))))).)))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((....))))))(((.(((((((....))))))))).)((.(((.....(((..((...)).)))......))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((.................)))))))((((((((....))))))))........))))))).((((((.(((((((((....)))))).....)))))))))........]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((.(((((((((((((((((((((....)))))).))))))).(((...)))..((((((((((((......)))))).((((((....(((((....)))))((((((((((((....))))))))..(((((((....((((.(((...)))))))...)))))))....)))).......(((..((((((((....)))))))))))))))))..........))))))..(((.[[[...)))....]]]...(((((((......[[[........)))))))((((((((....)))))))).]]]...)))))))).((((...(((((((((....)))..))))))...[[[[))))......]]]].......))))))))))).....
|
|
ASE_00024
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCAGAUCGGGCAAUCGCGGGGGAUGCAAAUCCUUCGAGGAAGGUCCGGACUCCACAGGGCGGGAUAGCGGCUAACGGCCGUCCGGCGACGCUGGCGGGCUUGCCCGCCGGAAAAGCCGAGGAACAGGGCCACAGAGACGAGUCUGUCAUGAGGGCGCGCCUGGCGCGCACCGGCACGGCCAUCUCCGUGCCGCGCCGUCCGGAAACGGGCGGCGGCAUGACAGGGUGAAACGCGGCAACC |
|
[ reference structure ]
|
...................((((((((....))))))))..............................(((((.....)))))(((((((((((((((((....)))))))))))))))).).....(((((...........((((((((((((((((((...))))))))((((((((......))))))))(((((((((....))))))))))))))))))).........)))..))
|
| [ predicted structure ] |
........((((((.....((((((((....))))))))......))))))..(((....[[[.))).....]]]....(((((.((((....((((((((....))))))))....))))...........(((.........(((((((((...((((((...))))))...(((((((......))))))).(((((((((....))))))))).))))))))))))....)))))....
|
|
ASE_00025
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGUCACGUGCUGAGUGCGUCACGCUUGUGAUGUCAUCUCUAUCCCACCUCCGGGAAGGUCUGAGACAGGAGCCCCUCGCCGCCCUCACAGGGCGUCACCUGAUAUUCGGGUGAGUGAGCCCCCAGCAACCCACGUUGGAGUGGACCGGUCCGUUAUGUGGGAGAGGCUAUGCAAAAGACGCCGAGCAGGGAUGUGGUGAGAUGGGCGGGUCACUGAUUUGAGGCCCGCCUACUCUUCAUCUGCGCCUCUGCCUGGUGGAUGCCGCCUCCUCCCCGGACCUUGGAAGUGACUCACGGCUGGCUUACUGAGUCCAAUGGCUGAGGCGAGGCAGCUGUGCGCCUCGUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........((((((((((......))))).)))))........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((.....)))))))(((((((..........(((................................................................................................................................................))).......)))))))))))....................))))((((((((.(...)))))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((..[[[[[[[[.......)))))(((((((....))))))).]]]]]]]]......(((((...((((((((.((((((((.(((((((((((...))))))((((((((...)))))))))))))...((((....((((......))))...((((((......(((((((((...(((.....(((((.((((((.(((((..(((((((((((((..........)))))))))).)))....))))).)))))).)))))..))).)))).)))))))))))))))..(((...)))....))))).)))((((....))))...(((((((........))))))).......)))))))).....)))))......
|
|
ASE_00026
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGGCAGCUAGCCAUCGCUUAGUUUUAUAAUUAAAGCUAAGAGGAAAGUCCGAGCUCCAAUAAGAACAUAAUGCUAGGUAAUGCCUAGGGGUUUUAAACCUAAGAAAGUGUCGCAGAAAAUUACCGCCGUAAAAGGUAAGGGUGAAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCGCUUAUUUAGCAAUAAAUACAGGCAAGAUAAACCUCAUUAGGAGCAAGAUCAAGUAUGAAAGCACCCUUUGUUCUUGAGGACAUGCUUACGGGUAGAUCGCUCGAUUUUUUUAGCGAUAAAAAAAUAAGAGAGAUGAUGGCAUAGUACAGAACUCGGCUUAUGGGUGUCAGCUUAAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((((....))))))))))....{{{.{{{{{((((....[[[[[.((((((((((.....)))))(((((...))))).((...(((((...........(((((......)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))..))))..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]])))))...)))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((.((((((((((....))))))))))......((((.........((((((((.....((((((...))))))((((......(((((.....((((........((((((((......)))...)))))...((((((.......))))))(((((((((....))))))..)))..)))).......))))).......(((....)))....))))..)))))))).)))).((((....)))).(((.(((.(((((((((....)))))))))..))).))))))))).))))......((((.....))))))))))))....
|
|
ASE_00028
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUAACCGUUCAGGUAACCGCUGCAUCGCAUGCGAUGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACAGGCUGAGAUGCUUGUAGUGUUCGUGCCUAGCGAAGUCAUAAGCUAGGGUAGUCUGGUUCUUAGAACUGGGCUAACGGCAAGGUAAGCACCUACGUUCAUCAUGAAUAUGGUGUGAUGCCUUUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGUCCGUUUGGAAACAGACGGAGUGGAACGAGGUAAACCCCUCGAGCGAGAAACCCAAAAAUUGGUAGGGGAACCUUCUUGAAGGAAAUGAACGGAGAGAAGGACGGAAGUUUUACUUCUGUAGACAGAUGGUUACCACCGGAGUACGAGGUUCAUCACCGUUUGUAGUACGAAGGAACAGAACAUGGCUUAUCGAACGGGAAUGAGA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((((((.....)))))))))).)((.((((....((((...((((.....))))..)))).....)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))((((((((...))))))))........))))))).((((((((((((((.....))))).....))))))))).......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((.........((((((((....)))))))).............(((..[[[[[[.)))..]]]]]]....(((...[[[[[[))).......]]]]]].(((((((((((...)))))))))))(((..((((((.(((((...(((((...)))))..)))))..))))))........[[[[.....)))..((((((((....))))))))]]]]..(((((......)))))..(((....[[[.....)))...]]]...(((((((................))))))).(((..[[[[[.[[[[.[[[.[[[[[[[[[.[[[.)))........]]].....]]]]]]]]]..]]]]]]]....]]]]]..........))))))........
|
|
ASE_00029
|
[ FASTA input ]
|
UGAAAUAACGUUCAGGUAAUCGCUGCAUCAUUUGAUGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGCCUAGUGAAAAAAUAAGCUAGGGCAGCUUGGCUUAUAGCUUAGCUGACGGCGGGAAAAACCACCUAAGUCUUUGGAUAUGGUCGAGUAUCCUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGCUUUGCUGGAAACAGCAAAGGUGGAACGCGGUAAACCCCACGAGCGAGAAACCCAAACAAUGGUAGGGGAACUGUCUCAAAGGAAUCUAACGGAGAGACGGACGGUUACAUGCGUAAUCGUAGAUAGAUGAUUACCGCCUGAGUACGAGAUUAAAAUCGUUUGCAGUACAAAGGUACAAAACAUGGCUUUACGAACGUUGUUGAAACA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((....)))))))....[[[.[[[[[(((((((((.((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((((((...)))))))))).)((.(((.......(((...(((....)))..)))......))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))((((((((....))))))))........))))))).((((((((((((((....))))).....))))))))).......]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((.(((((((.(((((((....))))))).(((...)))...(((..[[[[....)))....]]]]....(((...[[[[[[))).......]]]]]].(((((.((((...)))).)))))..((((((........)))..[[[...((((((......)))))).......))).....]]]....((((((((....))))))))((((..[[[........))))..]]](((..(((...........)))...[[[[[[[.......)))......]]]]]]]((((((((....))))))))........)))))))(((.....((((........)))).....((((....)))).......))).....))))))))))......
|
|
ASE_00030
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCAGAUCGGGCAAUCGCGGGGGAUGCAAAUCCUUCGAGGAAGGUCCGGACUCCACAGGGCGGGAUAGCGGCUAACGGCCGUCCGGCGACGCUGGCGGGCUUGCCCGCCGGAAAAGCCGAGGAACAGGGCCACAGAGACGAGUCUGUCAUGAGGGCGCGCCUGGCGCGCACCGGCACGGCCAUCUCCGUGCCGCGCCGUCCGGAAACGGGCGGCGGCAUGACAGGGUGAAACGCGGCAACCUCUAUCCGGAGCAACAUCAAAUAGGCAUGCGUACGGCCGUAAGGCCGGGAAGGGCGGCUCCGUCCAAGCAUGCGGGUAGGUGGCUGGAGCGGUCCAGCAAUGGUUCGCCAAGAGGAAUGAUUGCCCGCCGGGGAAACCCGGCGUACAGAAUCCGGCCUAUAGAUCUGCUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((((((((((....)))))))))))))))).)((...(((((...........((((((((((((((((((...))))))))((((((((......))))))))(((((((((....))))))))))))))))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((....)))))....((((.]]]].))))..)))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((....))))))).......}}}}}}}}.).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..(((....[[[[[[[)))...]]]]]]].(((..[[[[....)))...]]]]........((((......[[[[((((....((((((((....))))))))....))))........)))).....]]]]..(((((((((...((((((...))))))...(((((((......))))))).(((((((((....))))))))).))))))))).........(((((..(((((((.................((((((...(((((....)))))....(((((....)))))..))))))))))))).[[[[[[[((((.(((....))).))))............)))))(((((((....))))))).......]]]]]]]....))))))))))
|
|
ASE_00031
|
[ FASTA input ]
|
GUUAAUCAUGCUCGGGUAAUCGCUGCGGCCGGUUUCGGCCGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGCCUAGCGAAUCCAUAAGCUAGGGCAGCCUGGCUUCGGCUGGGCUGACGGCGGGGAAAGAACCUACGUCCGGCUGGGAUAUGGUUCGAUUACCCUGAAAGUGCCACAGUGACGGAGCUCUAAGGGAAACCUUAGAGGUGGAACGCGGUAAACCCCACGAGCGAGAAACCCAAAUGAUGGUAGGGGCACCUUCCCGAAGGAAAUGAACGGAGGGAAGGACAGGCGGCGCAUGCAGCCUGUAGAUAGAUGAUUACCGCCGGAGUACGAGGCGCAAAGCCGCUUGCAGUACGAAGGUACAGAACAUGGCUUAUAGAGCAUGAUUAACGUG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((((....)))))))))....[[[.[[[[[(((((((((.((......)))))).....(((((((((((..........))))))((((((((((....))))))))).)((.(((.....((((...((((.....))))..))))......))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))(((((((((....)))))))))........))))))).((((((((((((((.....))))).....))))))))).......]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((....(((((((((....))))))))).(((...)))...((((((...))).))).))))).....((((...[[[[[[))))......]]]]]].(((((((((....)))))))))....(((((...(((((...((((.[[[[))))..))))).....))))).........]]]].......((((((((....))))))))((((..[[[........))))..]]].....(((.......[[[[[)))..(((((((................)))))))((((((..........))))))..........]]]]](((.[[[[....)))((((......)))).((((....))))........]]]]...)))))))))))))...
|
|
ASE_00032
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUAACGUUCGGGUAAUCGCUGCAGAUCUUGAAUCUGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGCCUAGCGAAGUCAUAAGCUAGGGCAGUCUUUAGAGGCUGACGGCAGGAAAAAAGCCUACGUCUUCGGAUAUGGCUGAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGUCUCACUAGAAAUGGUGAGAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGCGAGAAACCCAAAUUUUGGUAGGGGAACCUUCUUAACGGAAUUCAACGGAGAGAAGGACAGAAUGCUUUCUGUAGAUAGAUGAUUGCCGCCUGAGUACGAGGUGAUGAGCCGUUUGCAGUACGAUGGAACAAAACAUGGCUUACAGAACGUUAGACCACUU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((.....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((.((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))((((((....))))))........))))))).((((((((((((((.....))))).....))))))))).......]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((....((((((((.....)))))))).(((...)))...((((((...))).))).)))))......(((...[[[[[[))).......]]]]]].((((((....)))))).............((((......[[[[[[[[[))))..]]]]]]..]]]....((((.[[[......((((((((....))))))))))))..]]]......(((((...[[[....(((........))))))))..(((((((................)))))))((((((....))))))..............]]]....((((.......[[[[[[[[[[[..)))).......]]]...]]]]]]]]..))))))))........
|
|
ASE_00033
|
[ FASTA input ]
|
GCAGUUGGCCGGUCUGUCGCGUGCGCGUUUCGUGCAGGAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCAUCCUACUUCCUAACAGAAAGCUGUCCGCGAGGGUAGAGUAACGUAGAAGAAAAUAACCGCCGCUCCUUUCGGGGAGAGGUAAGGGUGAGAAGGUGGGGUAAGAGCCUACCAGCAGCAUGGUGACAUGUGGGCUGUACGUCUUAGGAGUUGUAAGGUCAUGUAAACCGGCGUUAUGAGAGUUGCUCGCUCCAUGUCGGAGGGUAGACCGCUAAAGUGUCGUGGUGACACGCCACUCAGAUAAAUGACAGGCACCUUAUUAUAUAAGGUACAGAACUCGGCUUAUAGGCUGACUGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((.....)))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).))))))))))))))))...((((.......(((((((....(((((.}}}}))))))))))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((...)))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.((((((((..(((((.[[[[)))))...]]]]....((((((((......((((((...((((.((((....)))).....)))).......................[[[[[.(((((....))))).....))))))....]]]]](((...[[[[[)))....(((((....)))))]]]]].(((((........[[[[[[.[[[)))))....]]].]]]]]]..))))))))((((.[[[[)))).............((((..(((....)))..))))..]]]]..))))))))(((((((...))))))).................))))))))))....
|
|
ASE_00035
|
[ FASTA input ]
|
UGAAGUUGACUAAAAACAGUCGCUGUUUAGUUUUUAAAAAUUAAAAAGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGCCAGAUAACAUCUGGAAAGCGUGAGCUUAUGACUAGUGCAACAGAAAAUAAACCACCUAUUUUGUAAUAUAUAAAAAUAUGGCCAGGGUGAAAAGGCGUGGUAAGAGCACACCGCAUAAUUGGUAACAAUUCAUGGCAUGGUAAACUCCACCCGGAGCAAAGCCAAAUAUAGGAUAAAUUUUUUGUACUGCUCGUACUUCUUAAACCUGGGUAGGCUGCUUGAAUUAGUAAGUGAUUGCUAAUCUAGAUGAAUGACUGUUAAAACAGAACCCGGCUUACACGAGUCAACUUCAAUAAC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((((.....).)))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((...)))))).))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.......(((((.}}}})))))....)))))).....))))......((((((((....))))))))..........))))))).........]]]]]]]].).))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......(((((...((((((((....))))))))..........(((..((((....)))).)))..((((((...)))))).((((....)))).)))))...................(((((.(((((((...))))))).....[[[.)))))....]]](((....[[[[[)))..((((((((....))))).)))...((((...((((....))))....))))..(((((((......))))))).]]]]].................((((((((.....((((((((....))))))))............((((....))))....))))))))...))))))))))).....
|
|
ASE_00036
|
[ FASTA input ]
|
UCGGAAGAGUAAGGCAACCGCUUUUUGUACCUUAACUAAGGUAGAUUAAGAGGAAAGUCUGGACUUCAUAAGAAAAGAUACUGGAGAAACUCCAGGGGCCGUAAGGCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACAUUCCGCUAUAAAAGGGUCUUUUUAUAGACAGGCUGAAAAUUCCUAUUUUAAGAAUAGGAGCUAUUAAGGUGACUUAGUAGACAUGCAAACCCUAUCUGAAGCAAGAGAAAAAGUUUUUGUUUCUGCAUAAUGAGAGGGAGGGUAUCCCUCAUGAACUUUUUCAUAAUCGCUUGAGGGAUAUAGUAAUAUAUCCCCUAGAUGAAUGGUUGCCCUCAAGAUGAGUUUUCUCAUCUUGUAGACAGAAUCCGGCUUACUCGCUC |
|
[ reference structure ]
|
......(((((((((((((.(((((((((((((....)))))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..))........((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((.(((((((.((((.}}}}.)))).(((((((((...)))))))))...))))))).....))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((....))))))))).))......]]]]]]]].).)))))
|
| [ predicted structure ] |
............(((((((.(((((..((((((....))))))....)))))(((..[[[....)))...]]].......((((((...)))))).((((....)))).(((((..[[[[..........)))))(((((((((....)))))))))............(((((((((...)))))))))((((((((....))))))))...]]]].(((((....((((((((((......))))))))))..........[[[[[)))))..]]]]]..........(((..[[[...)))((((((((....))))))))...]]]....)))))))..(((((((((....))))))))).........................
|
|
ASE_00037
|
[ FASTA input ]
|
CGAGUAAGCCAGACAAUCGCUGCUGCAAUUUGCAGGAGAGGAAAGUCCGAGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCGGGUAACUCCCGGUCAAGGCGACUUGAAGGAAAGUGCAACAGAGAUAUACCGCCAUUUUAUAAUGGUAAGGGUGGAAAGGCGAGGUAAGAGCUCACCAGCGCAUUGGCGACUUUGCGGCUAUGUAAACCCCAUCUGGAGCAAGAUCAAAUAGGGAAGCGUUUUGGAGUGGCCCGCUCUGCUUCCGGGUAGCAUCGCUUGAAUCUUAUGGUAACAUAAGGUCUAGAUAGAUGAUUGUCGAAUACAGAACUCGGCUUACAGGUUUAGUCGUCCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((...))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((.....(((((.}}}}))))))))))).....).)))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((.(((((((.((((((((...))).((((.(((...)))...))))....))))).((((..[[[[..(((...(((((....))))).)))..))))..........]]]]((((((....))))))...((((.....[[[[[[[.......))))..(((....)))]]]]]]](((.((((..((((.((((......)))).......((((((.....((((((...)))))))))))))))).)))).)))...((((((((....))))))))..........))))))).............)))))))..................
|
|
ASE_00038
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGUGACCCGCGGGAAAGUGCCACAGAGAACAGACUGCCGGUUUCGAGCCGGUGAGGGUGAAACGGUGGAGUAAGUGCCCACCGCGUCAUCGGUGACGGUGACGGCAUGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGGCCAAGAAGACCGUGAGGUCGCGGACGCGUUUGAGGGUUGCUCGCUUGAGUGUCUGGGUAGGCUGCGCAGCCGAAAGGCUGGAGGACACCAGCAAUGGUGUUCACAGAUGGAUGAUCACCGGCCCGGCGGGGCUACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((....(((((....))))).((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))...(((((....)))))..((((((((....)))))))).................(((((....)))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((....))))..[[[(((((((...)))))))((((....)))))))).....]]].(((.[[[[...)))...]]]].(((((((....(((((..(((((.......[[[[)))))((((((((....))))))))....]]]]....(((.(((.(((...(((.....((((....)))).(((((((...((((.....)))).....))))))))))..)))...(((((....)))))..((((((((....)))))))).))).)))....)))))(((((....))))).......))))))).
|
|
ASE_00040
|
[ FASTA input ]
|
CGGACCAGAUGAUCGGGCGGUCGCGUCGUCUUCGGACGCCGAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGUGACAAGGCGGUGGGUAACGCCCACCGGGAGCGAUCCCAGGGAUAGCGCCACAGAAAGCAAACCUCCUCCCUACGGGGCGGGAAGGGUGAAAGGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGGACCUGGUGACAGGGACGGCAUGGCAAGCCCCGCCUGGAGCAAGACCGAAUAGGGAUCCCGCGUCGGCCUCGCGCCGACUAGGCCGUCACUGGCUGAGAGGAUCCGGGUAGGUCGCGAGAGCCGUCCAGCAAUGGCCGGCCUAGAGGAAUGAUCGUCGCCGUCUCCCUGUCUUCGGAUGGGCGGGGCGGAACAGAACCCGGCUUACAGAUCAUCUGGUCCG |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((((((((((((.(((((((....)))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.....)))))((((((.]]]]]]])))))).)))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((((((....)))))).))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.(((.[[[[[)))......(((.(((..(((...))).))))))...]]]]]...(((((((((....((((((((((....)))).......................((((((((((....))).)))..)))).....))))))......)))))))))...((((....))))...(((..[[[..)))..]]]........((((......((((((...((((((.....))))))..(((((....)))))....)))))).[[[.))))......]]].(((......[[[[[[......)))..........(((((((((((((....)))))).)))))))........]]]]]]....))))))))))))))
|
|
ASE_00041
|
[ FASTA input ]
|
AAUAUUAAGUAAGCCAGAUAAUCGCAUGUAAUCUUACAUGAGGAAAGUCGGAGCUCCAUAGAGCAGGGUGCUAGGUAACGCCUAGUGGGAGCGAUCCUAAGGAUAGUGCAACAGAAAUAAACCGCCACUAUUGUGGUAAGGAUGGAAAGGCGAGGUAAGAGCUCACCAGCAGCUAGGCGACUAGUUGGCUAUGUAAACCCCACCUGGAGCAAGACCAAGAUAGGAAUAAAGAGUGCUGCUCGUACUCUCCGGUAGGUAGGUCGCUUGAGCCUAUUGGUGACAAUAGGCCUAGAAAGAUGAUUAUCUAAUACAGAACUCCGCUUAUAGCCUUGCUUAAUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((....))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.......((((((.((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((...(((.....((((((....))))))......)))...(((((.....[[[....(((((((...))))))).))))).((((...))))..]]]...........(((((..[[[[[)))))...]]]]]........(((...[[[..)))..(((((((....)))))))]]]............((((......[[[[....)))).....(((((((.....)))))))..........]]]].(((..((((((((....)))))))).[[[[))).......]]]]............(((...)))))))))))))..
|
|
ASE_00042
|
[ FASTA input ]
|
UGAGCCGGCUGGGCGAUCGCGACUUUGCGUACCACAUGCGAUGAACAUGGUGGCGCAAGGACGAGGAAAGUCCGGACUCCACAGAGCACGGUGAUUGUUAACAACAACCCGGGGUGACCCGCGGGCAAGUGCAACAGAAAGUAAACCGCCUAGAAUUUUUCUAGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCGAGGUAGGUGACUACCUCGGCUAGGUAAACCCCACUGGGAGCAAGGCAUUAGGGCGUACCGUCGUUUCAGACGGUAUGUCUGCACGAACGCUUGAAGGCUGCUCGCCUGAGUUCGUGGGUAGCUGCUUGAGGCGGCCAGUGAUGGUUUCGUCCAGAUGGAUGAUCGCCGCUGAUCUCCGCUUGUCGGGGGUGAGUACAGAAUCCGGCUUAUAUGCUGGCUCAUUCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.......)))))))).))))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...(((....((((((((.(((......))).))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....)))......((((((((....)))))).))..........)))))))(((((((((((.....)))))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...((((..[[[...))))...(((((((.......))).))))]]]..((((..[[[..))))....]]].....(((((((..(((....)))..)))((((....)))).[[[...))))............(((((((((((...))))))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))..........]]](((((.(((((........((((((((((((......)))))))))))).(((((((......((((.....))))..)))))))......)))))..[[[[[[)))))......((((((....))))))..]]]]]]......((((.[[[[[[)))).........]]]]]]......)))))))))....
|
|
ASE_00044
|
[ FASTA input ]
|
AAAAGCGAGUAAGCCGGAUGACCGCGGGGAGAAAUCCCUGAGGAAAGUCCGAGCUCCAUAGGGCAGGAUGCCGGGUAACGCCCGGUGGAGGCGACUCCAAGGAAAGUGCCACAGAAACAAACCGCCGGUAAGGGUGGAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCGGGCAGGUAACUGUCCGGCUAGGCAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGGACUAUAGAGUGGCCCGCUCUGUCCCCGGGUUGGUCGCUUAAGGCCUCUGGUGACAGAGGUCUCAGAUAGAUGGUCAUCCUCGACAGAACUCGGCUUACAGGCUUACUCGCUUG |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((....))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((()))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((((((((((((((((((((((....)))))).(((..[[[[....)))...]]]].(((((((((((...)))))).((((....))))........((((...........(((((......)))))...((((((.......))))))..(((((((....)))))))....)))).....))))).((((..((((((....((((((...((((((...))))))))))))...)))))))))).(((((((((....)))))))))........)))))))))((((......))))......))))))))))))).
|
|
ASE_00045
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCGCACAUUCUGUGAUGAAUGUAGUGUUUGUGCUGGAUGAAACGAUAAAUCCAGGCAGCGUAAGCUGACGGCUGGAGAAGGCCUGUGGUGAAAGCUAUGGCGGACUCCUUUAAAAGUGCCACAGAAACGAGCUUUUCGGGAAACCGGAAAGAUGGAACGGGUAAACCCCGCAAGCGAGAAACCCAAAUUUGGUAGGGGAAUCUAAUCACGGCAAAACGAAGCCAGUGAUCGGAACGUGGAAACACGUAGAUAAAUGACUGCCACUUUCGCAAGAGAGUACAAAACACGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((....)))).)((..((((...(((...(((....)))..)))......))))....(((((...........((((((((....))))))))........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((...................)))))))(((((....)))))................(((((....))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))...(((((((((((......)))))).....((((.[[[[[[...))))...]]]]]].((((....))))..(((.((((...(((.(((((....))))))))...)))).........)))...........((((((((....))))))))......((((.....))))...)))))...(((......[[[[[)))......((((((((........))).)))))....(((((....)))))..........]]]]]((((((....))))))...............
|
|
ASE_00046
|
[ FASTA input ]
|
AAGCAUAGUAAAUGCUCGCUUCUUUUUAGGAGAGGAAAGUCCGAGCUGCUAAAGACAAACAUUCCAUCUAACAGAUGGCUAGGGUAACCUAAGGGAUAGUGCAACAGAAAGAAAACUACCACGCAAGUGGAAAAGGUGAAACGGCGGGGUAAAAGCCCACCAGCGAUUUUGGUAACAAUUUCGGCUAUGUAAACCCAAUGUGCAGCAAGAAGGGAUGGUUAGCGUCUUUGUUUUAACCCUUCGCUUGAUUUUGUUUGCAAAAACAAAACUAGAUAAAUGAGCAUUCAAGACAGAACUCGGCUUAUCGCUAUGCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.((((.....))).)....{{{.{{{{{((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((((((((.(((.]]]])))..))))))))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((.((((((.....))))))...[[[[)))).................((((((...)))))).((((....))))..]]]].(((((...............((((....))))....(((.....(((.((((....)))).....(((..(((....)))..))))))......)))...))))).....((((((.[[[[[((((....))))....))))))..(((.(((((....))))).)))]]]]](((((.((((..(((......)))))))..))))))))))))))...
|
|
ASE_00047
|
[ FASTA input ]
|
AAACCGCAAGUGUGCAGUCGCUGUAUGGCUUGACGCUGUGCAGAGGAAAGUCCGAACUUCACAGGGCAGGGUGCCGGUCGAGAACCUGGUUCAAGGCCGGGGGCAGCGGUGCAAACCGUCUGUCACAGAGAGUGCAACAGAAAGCAAACCGCCCCGGCUCCGGCCGGAGUAAGGGUGAAAAGGCGGUGUAAGAGACCACCAGGUGCGUCAGCAAUGCCGUACGCUAUGAAAACCUCCCCGAAGCAAGGCCAAAUAUGGAAGCUUUUUCCGCAAGGAAAGAAGGGUUGCCCGCCCAACGUUUCCGGGUAGGCCGCAUCAGAUAAAUGACUGCAGCUUCAUCACUCGAUGAUGAUUCACAGAAUUCGGCUUACAGCUUCGGUUUCAGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((((((((.(((((((((.....)))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.(((.(((((((..((((...))))..))))))((((((((((....)))).))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))))...((((......(((((((((((((....))))))).((((.}}}}))))...)))))).....)))).............)))))))(((((((((.....)))))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((....))).....(((((((((.....)))))))))..(((.[[[[....)))...]]]]..(((.[[[[[[....)))........]]]]]].(((((((((....)))).)))))........(((........)))...(((((..(((((....)))))..))))).....(((((((...........[[[[.[[[.[[[.)))))))..]]]]]]...]]]]....(((((...........((((((((((((((....))))))).((((.....))))...))))))).(((((((((((((......))).)))....((((((.....))))))............))))))).))))).........
|
|
ASE_00051
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUCCCCAUCCCUCUCUGGGUGCUUCUGCAUUCAGAGCGAUAUAAUGCUCUUGAGAGCUUCCUGGGCGUAGAUAGUUACGCCGGGCGUCGCCAUCAGAAAAACAGCAGAGCUACGCUUUGCAUGGGAGGCGGCGCGGAUGGUUGGUCUUUCAAUACGAGGAAAGGCUGUUGAGUGCAAUUUGCGGCCUUUGGCA |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((...................................((((....))))..((..(((((((....))))))))).(((((((............(((((((...)))))))......))))))).))))))...(((((((........)))))))....................(....)..
|
| [ predicted structure ] |
((((((.[[[[[[..((((((((((....))))))))))...............))))))......(((((((....)))))))..((((((((.(((........(((((((...))))))).)))..))))))))]]]]]]..((((((((........))))))))......((((...))))(((...))).
|
|
ASE_00052
|
[ FASTA input ]
|
CGAAUUUAAUUAAUGAUUACAGAUUUAUUCAAUCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCUAUAAAGGUUAGAAUUGCUGGGUAAUUCCCAGUACGAGAUAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAAACACCGCUUAAAAAUAUUUUAAGUAAGGGUGCAAAGGCUUGGUUAAAGCAAACCAGUUAGAUUUCAAAAUCUAUACUUAGUAAACCCCGUUCAGGAGCAAAGUUUAGCGGAAAGUAAUUAACCUUUUUUCUUUCCUUAUAUUUAUUUUUUACUGCUAGAAAAAUUGAGUAAUUAAUUUUGAAGACAGAUAAUCAUUUUAUAAACAAAACCCGGCUUAAAAUUAAGUUCGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((((((((((.((((((.....)))))).....{{.{{{{{(((((.[[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))).))).)))..))))))))))))))...(((.....(((((((((..]]]]]]])))))))))...............)))......((((((((....))))))))..........)))))))((..))......]}}}}}}}..))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((........((((((.....))))))........((((((((((.....(((........(((((((..(((...(((((....))))).)))...)))).)))......)))((((((((...))))))))..((((((.(((..((((((......)))))).((((((....))))))..))).)))...)))....))))))...(((((..((((((...............))))))................(((.....((((((((....)))))))).....))).(((.....)))))))).....)))).....)))))))))))....
|
|
ASE_00053
|
[ FASTA input ]
|
UCGGAAGAGUAAGGCAACCGCUGUUUAUGCUUUUUCACAAUGAAAAAGCAUAAAGAGAGGAAAGUCUGGACUUCAUAAGAAAAGAUACUGGAGAAACUCCAGGGGCCGUGAGGCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACAUUCCGCUAUAAAAUGAAAGUUUUAUAGACAGGCUGAAAAUUCCUACUUUAGGAGUAGGAGCUAUUAAGGUGACUUAAUAGACAUGCAAACCCUAUCUGAAGCAAGAGAAAAAAGCUUUUUUGUUUCUGCAAAAUUGAGAAGUUUUCUUCUCAUAAGUUUUUUCAUAAUCGCUCGAGGGAUUUAGAGAUAGAUCCCCUAGAUGAAUGGUUGCCCUCAGGGAGACGUUUGUCCACCCUGCAGACAGAAUCCGGCUUACUCGCUC |
|
[ reference structure ]
|
......(((((((((((((.(((((((((((((((((...)))))))))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..))........((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((.((((((.....((((.}}}}.))))..(((((((....)))))))....)))))).....))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((....)))).))))).))......]]]]]]]].).)))))
|
| [ predicted structure ] |
............((((((((...((((((((((((((...))))))))))))))..((((....[[[...))))...]]].......((((((...)))))).((((....)))).(((((.......[[[......)))))(((((((((....))))))))).....]]]....((((((((.[[[[))))))))((((((((....))))))))..........]]]]...(((((((((..[[[[[[[[[)))))))))........(((((((....))))))).]]]]]]]]]........(((.[[[[.....))).......]]]].......))))))))..(((((.....[[[[[[..)))))..]]]]]].................
|
|
ASE_00056
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGACUUCGCAGAAAAAGGUGCCAGUGAAAAACUGGGGGCCGUAAGGCUACGGAAAGUGUAACAGAAAACAAACCGCUAAUUCUACCUAGGUAAGAUUAGACAGGAUGAAAAUGUCGAGCUUAUGGCUCGACCUCUUUGUGGAAACACAAGGACGCUGCAAACCCCACCUGAAGCAAGAAAGAGUUCGUUUCAGUUUUUCGCUCAGGAACUCUUAGAGUCGCUCGAGGAUUUUGGUGAC |
|
[ reference structure ]
|
..............((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((....)))))))))))..))........((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((((((((((.....(((.]]]])))...))))))))....)).............(....)
|
| [ predicted structure ] |
((((....[[[[..)))).............(((((.....)))))..(((....)))..]]]]......................(((((..(((....)))..))))).((((........((((((((...)))))))).((((((((....))))))))..............)))).(((....[[[[[[[[.............)))...]]]]]]]]...(((((.((((...)))))))))
|
|
ASE_00057
|
[ FASTA input ]
|
AUCGGAAGAGAAAGGCAACCGCUGUUUAUAUUUCUCAAAAAAUAUAAAGAGAGGAAAGUCUGGACUUCAUAAGAGAAGAUACUGGAGAAAUUCCAGGGGCCGUAAGGCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACACUCCGCUAUAAAAUUUAUUUUAUAGACAGGCUGAAAAUUCCUACUUUAGGAGUAGGAGCCAUUAAGGUGACUUAAUAGGCAUGCAAACCCUAUCUGAAGCAAGAGAAAAAAGCUUUUUGUGUCUGCAAAUGUGAGAGGAAUUCCUCCCAUAGGCUUUUUCGAAAUCGCUUGAGGGAUCUAGUAAUAGCUCCCCUAGAUGAAUGGUUGCCCUUAGGAUAGUUCGCAAGAGCUAUCUUAUAGACAGAAUCCAGCUUACCCUCUCUUCCGAUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((((((((.((((((((((((......))))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((....)))))))))..))........((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((.(((((.....((((.}}}}.)))).((((((((....))))))))....))))).....))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((....))))))))))).))......]]]]]]]].).))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..((((((((...(((((((((......)))))))))........((((((..((((......))))...((((((...)))))).((((....)))).((((..(((..........)))))))((((((((....)))))))).))))))......((((((((...))))))))(((((((((....)))))).)))..........((((((((((......((((((((.(((((....)))))((((.((((....)))).)))))))))))).......))))..((((.(((....))).)))).))))))..))))))))..(((((((((((....))))))))))).....................)))))))))))......
|
|
ASE_00064
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCUGGGUAAUACCCAGUGGAGGCGACUUUAAGGAAAGUGCAACAGAGAUAUACCGCCAGAUUUAUCUGGUAAGGGUGGAAAGGCGAGGUAAGAGCUCACCAGCGUAUAGGUGACUAUACGGCUAUGUGAACCCCAUCUGGAGCAAGAUCGAAUAGGAGAGCAGGAAACUUUGGUUUCCAGGGGUGGCCCGUCCCGCUCUCGGGUAGUAUCGCUGGAGCCUAUUGGUAACAAUAGGCCUAGAUAGAUGAUUGUCUAACACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((......))))).(((((.]]]])))))))))))......))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]((((((((((((...)))))))....[[[)))))........]]]..........((((((((((....))))))...[[[[....[[[..))))...]]]]]]]..(((((((....))))))).........(((((((((......)))).......[[[[[[.((((((....)))))).)))))..........]]]]]]..........((((((((((((((....)))))))).(((((((....)))))))........))))))...
|
|
ASE_00066
|
[ FASTA input ]
|
AAACCGCAAGCGUGCAGUCGCUGUAUGGUAUAACCAUGCAGAGGAAAGUCCGAACUUCACAGGGCAGGGUGCCGGUCGAGAACGUUUGUUCAAGACCGGGGGCAGCGGCGCAAGCUGUCUGUCACAGAGAGUGCAACAGAAAGCAAACCGCUCCGGCUUAAACCGGAGUAAGGGUGAAAAGGGGGUGUAAGAGACCACCAGGCAGGUCAGCAAUGCCCUGCGCUAUGAAAACCUCCCCGAAGCAAGGCCAAAUAAGGAAGCAUUUCCUGCAAGGGAAGAAGGGUUGCCCGCCCAAUGUUUCCGGGUAGGCCGCAUCAGAUAAAUGGCUGCAACAUCACUACUUGAUGGUGAUGGACAGAAUUCGGCUUACAGCUUCGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((((((((.(((((((((...)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.(((.(((((((..((((....))))..))))))((((((((((....)))).))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))))...((((......(((((((((((((....))))))..((((.]]]]))))..))))))).....)))).............)))))))(((((((((.....)))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....(((....))).....(((((((((...)))))))))..(((.[[[[....)))...]]]]..(((.((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))........(((........))).)))(((((((......)))))))...((((....[[[[[[.........))))..(((((..........))))).........]]]]]].....(((...........[[[[[[[[[...)))..(((.....(((...))).)))]]]]]]]]]..(((((((((((((......))).)))..((((((((.....))))))))..........)))))))(((....))).
|
|
ASE_00068
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUGCAUAGGGCGGCGUAGCAGCUAACAGCUGUCCACCGUGAGGUGAGGAUCAGAGCAACAGAGACGAGUCUGGCAGGAGUGCCGCAAGGCAGACCAACCAGGGUGAAACGGGCAAUCUCUACGCGCAGCAAUACCAAGUAGGCACACGUUGACGGGGCCCCCGGAGUGUGCGGGUAGGUAGCACCGAGCCAUCAGGCGACUGAUGGCCAAGAUUAAUGGCGGUCACAUGGCGGGCAACCGUUGUGCACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((....)))))))))))))))........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....)))).......((((((((....)))))))).................(((((((((....)))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..[[[[[...))))...]]]]].(((....[[[[[.((((....))))........)))...(((((...(((((.......((((....)))).(((......)))....)))))..)))))....]]]]]..((((......((((((.....((((...))))..)))))).[[[.))))..]]]..((((((((....))))))))...((((...[[[.....((((((((....)))))))).....))))..]]]..
|
|
ASE_00069
|
[ FASTA input ]
|
UCGGAAGAGUAAGGCAACCGCUGAAACCAGCUUUUUAAAAAAGAUGAGUACCAGAGGAAAGUCCGGACUUUAUAAGAAAAGAUGCUGGAGAAAUUCCAGGGGCCGUAAGGCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACACUCCGCUAUAAAUUGUAUAAUUUAUAGACAGGCUGAAAAAUCUUACUUUAGGAGUAAGAGCUGCUAGGGAAACCUAGCAGACUUGUAAACCCCAUCUGAAGCAAGAGAAAAAGUUAUUUGUUUCUGCAAACAACCUUUCUAACGAAAGGCACAGGCUUUUUCAUAAUCGCUUGAGGAGUACAGUAAUGUGCUCCCUAGAUGAAUGGUUGCCCGCAAGCAAGAACUUCCGUUCGUGCUUGUCGACAGAAUCCGGCUUACUCGCUCUUCCGAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.(((((((((((((((...)))))))).)))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..))........((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((.(((((((..((((.]]]].)))).((((((((....))))))))...))))))).....))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((....))))))))))).))......}}}}}}}}.).)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..(((((((((((....))))................((((.((((.....[[[[[.)))).............]]]]]....((((...((((....))))..)))).))))..(((...........(((((((((....)))))))))[[[[[))).....((((((((...)))))))).((((((((....)))))))).]]]]]........(((.[[[[.)))(((((((((.(((((....)))))...((((((....))))))....)))))))))......]]]]..((((((((....))))))))..........)))))))..((((((.((((....)))).)))))).....................))))))))))....
|
|
ASE_00074
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUCGGCCAGACAGUCGCUUCCGUCCUGGUGACGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGAGAGUCCACGGAAAGUGCCGCAGAAAAGAUACCGCCGACCCCGUCCUCGGACGGGAGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCUGGUGGCAACAUCAGUGGCAGGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACUCGCGGCUUCGACCGCAGCGCGCGGCCCGCGCGUGUUCCCGGGUAGGUCGCUAGAGGCGUGCGGCGACGCACGUCCCAGAUGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAUCGGCCGACUCCCUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((.....))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((....)))))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((....))))).((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((........((((...(((((....)))))..(((..[[[[....)))...]]]]..(((.((((((...)))))).((((....)))).(((......))).........[[[[)))...((((((....)))))).]]]].(((((....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....)))))))).))))............((((((..((((......)))).(((((((...))))))))))))).(((((((((.....((((((((....))))))))............(((((...)))))....)))))))))))))))))))....
|
|
ASE_00075
|
[ FASTA input ]
|
AAGGAGAGAGUAGGCGUAGGCGGUUGCAGAUCAGUCACAAAAACUGAAUUUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCGAAAGACCAAACUUGCUGGAUAACGUCCAGUGCGAGCGAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAGAUACCGCCAAUUAGUCAUUAGUCAUUUGUCAUUAGUCAUUUGGAAAAACACAAAGGACAAAGGACAAAGAACAAAUGACCAAAUUGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAACGUCGAGAGGCGUUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGCGAAAGGAACUAUGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCGCUAAAACAGAGCCGCUAGAGGCGUUUGGUAACAAACGUCCCAGAUAGAUAACCGCCCUCAUGUAGAGAAGUUACUUGUAACAUUUCUACAUUCGAGAACAGAACCCGGCUUACUACCAACUCUUUCCCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((((((..(((((((((.((((((((((.....))))).)))))....[[[.[[[[[(((((.{{{{{{{.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.}}}}}}}.))))))))............)))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((((((....))))))))))))))..))).......]]]]]]]].).)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((........((((((((...(((((.......))))).......((...))(((....))).........[[[.(((((((...)))))))....))))))))......]]]............(((((((((((.((((((.....((((((....(((.((((........)))).)))....)))))).....))))))..)))))))............[[[[))))...]]]](((..(((((((....)))))))[[[[))).(((....)))..]]]]..((((...((((((..(((.........))))))))).........[[[[[[(((..((((((((....)))))))).....))).....))))((((((((((((.((((....)))).)))))))))..))).........]]]]]].......)))))))))......
|
|
ASE_00076
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCACCAUACUUCCUAACGGGAAGGCUUUCUGCUGGUGACGGCAGAAAGACAGACAGGGCCACAGAAACAAACCGCCCUUUGACUUCAAGGCUUGCCAAGAACGUCGAAAGGUAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCGUUCCGAUGGUGACAUCGGAAGCUAGGCAAACCUUAUGGGUUGAAAGGUCAAAUAGGCCCCGGGCAAAGAGCUGCUCGUUCGAUUUCUCCUUCGGGAGGAUUCCGGGGUGGGUAGAUCGAUGGAUCCCGAUUGCAAAGUCGGGACUAGAUAAAUGGCAAGAGCCCAUUUUCCCUCGUGGAAAAUGGGAUACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((.(.....))))))))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.......(((.]]]])).)(((((((((....))))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((.....)))))))))).)......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......(((.....................((((((...)))))).((((((((((....))))))))))...)))(((((....[[[.......))))).....]]]....((((((.......[[[...))))))..]]]...((((((.......)))))).((((((((....))))))))..(((...[[[[)))..]]]]...(((((......((((((((....((((.....))))...((((((....)))))).))))))))((((..(((..(((.((((((((....))))))))))))))............((((((((((.....)))))))))).......)))))))))..
|
|
ASE_00077
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGAGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGGAACAGAGAGCAGACCGCCUAAGCGCUCGCAAGAGUGCCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCAAGUGGCAACAGGCUGCGGCAUGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCAUUGGUGCGGCCCGCAUCGGAUUCGGGUAGGUUGCUUGAGGCUAACGGUGACGUUAGAUACCCAUAUGAAUGACUGUCUACGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((....))))).))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((.(...(((((.]]]])))))).)))).....))))......((((((((....))))))..))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......((((....[[[)))).((((....)))).......]]].............((((((...((((((....)))))).)))............[[[[)))....]]]].((((....))))......(((.(((..(((......))).))).)))..((((......((((((...((((((...))))))))))))[[[[[))))........((((((....)))))).]]]]]..........(((((...)))))...........
|
|
ASE_00078
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGUAGAGCGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAGAGCAGACCGCCUACGUAACCUUCGGGUUGCCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCACCUGGUAACAGUGUGUGGCAUGGUAAACCCCGCUCGGAGCAAGACCAAAUAGGCCCUCGAUGGUGUGACCCGCACUGAGGGCGGGUAGGUUGCUAGAGGUGUCCGGUGACGGGCAUCCCAGACGAAUGAUUGUCCACGACAGAAUCCG |
|
[ reference structure ]
|
..........((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((....)))))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[)))....(((.....))).......]]]]]]]((((....))))........(((........))).((((..[[[((((((....))))))))))....]]]..(((((((.......)))).[[[[[[[)))........]]]]]]]..((((..[[[[.(((...)))...)))).....((((((...((((((...))))))))))))]]]]..((((.....((((((((....))))))))...(((((....)))))..))))........
|
|
ASE_00079
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCAUCGUACUUCCUAACGGGAAGGAUUCCGCUUUAGCGGGAGACAGAAAGUGCCACAGAAAACAAACUACUCGCGCUUAGGUGUGAGAAAAGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCGGUCUUGAAAGUGAUUUCAGAUGCAUGGCAAACCUUACGAGUUGAAAGGCCAAAUAGGUCACGCUCACGAAAGUGAUUAGCUGCUCGCUGAUAGUGCAAGCUGGCGUGAUUGGGUAGGCUGCUUGAUUCUAAUGGCGACAUUAGGGCUAGAUAAAUGAUAGGCACUUCGAAAGAGGAACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((((....))))))).)((...(((((............(((((((.((.....)))))))..)).......((((((.......))))))((((.(((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((....)))((((((.]]]]))))))(((....)))...)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((....)))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((.......((((.(((((((((((...))))))..((((((....)))))).........(((((..........(((.(((((((....)))))))....))).....((((((.......)))))).((((.((((....))))))))...))))).....))))).......((((.....((((((((((((....)))).(((((...((((...))))..))))))))))))).....))))))))...(((((((....))))))).(((.........)))...((((....)))).......))))).....
|
|
ASE_00080
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCGCCGUCGAAACGCGGUGGUGGGUAACACCCACCGGCCGCGAGGCCAGGGAAAGUGCAACAGAAAGCAGACCGCCAUCGGGCCGGGGCAACCCAGCCUGAGGGUAAGGGUGAAACGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCAGGCCGGGUAACCGGUCUGGCUAGGCAAACCCCACCGGGCGCAAGGCCAAGCAGGGAGCAUGGGUGGCGGCAGCGAAUCCGUUCGCCACCGGCCGCCCACGGAUUGUUUCGAGCCGUAACAGACUUCCGGGUAGGCUGCUCGAGACGCCGAGUAAUCGUCGUCCUAGAGAAAUGGCCACCGCCCGUCGUCGCCCUCCGGGGCUUCGACGGGAACAGAAUCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((.....)))).)((...(((((............((((((((((((((((....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((...((((((((((((((((....))))))))).)))))))((((...]]]]]]..))))......))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((((....))))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
........(((.[[[(((((......)))))(((((((...)))))))((((....))))..)))...(((........)))....]]].((((((.(((....))).)))))).(((..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........)))).)))((((....((((..............((((((((..(((....))))))))))))))))))).(((((((((..[[[[[[.)))))...))))(((.((((.(((..((((.(((....))).))))...)))....))))))).(((((((..((((....))))..))))))).........]]]]]]..
|
|
ASE_00081
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGAACGCCGGGUAACACCCGGUGGGGGAAACCCCGAGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCUUCGCCGCGCGAGCGGCGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGCAGACGGUAACGGAUGCGGCACGGCAAACCCCGUUCGGAGCAAGGCCAUGUAUAGGAACGUUCGAGGGCUGCUCGCCCGAGUUCCAGGGUAGGCCGCUCGAGGCGCACGGUAACGGGCGUCCCAGAUGAAUGAUCGCCAAGUGUCCCCGGACACUCACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((....)))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..((((....)))).....(((((((..(((((...((((....))))........[[[[..............((((.((((((....)))))).))))..)))))...(((((((.......)))))))((((............))))....]]]]...(((...........[[[[.......(((((......((((.....))))..))))).)))..]]]]......(((((..[[[.....)))))...(((.....)))]]].((((((....))))))......)))))))....
|
|
ASE_00082
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCACAGGGCAGGAUGCCGCACGAGCUUCACCGCAAGUGCGGGCGUCGCGUUUCAAGGCGCGGCGACGGACAGUGUCACAGAGAAUAUACCGCCCUCCGUGGUUCGGCGAAAGCCGGGCUUCGAAGGGUAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGCCGCCAGCAAUGGCGGCGGCACGAAAAACCCCUUCCGGUGCAAGGCAAAAUAGGUGACUGGGCGGCCCGUCCGAUAGUCACGGGUAUGCCGCAUCCGGCGCCGCUCGCGCAAGUGAGCGGCGCGGGACGAGGCCGCCGCGAGGCGGCCCGAGAGAAAUGACGACUGAAGCGCCGCAAGGCGUGGAACAGAACCCGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.(((((((((((..((......))..))))))((((((((((....))))))))).)((...(((((............(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((((.]]]])))))...))))).....))))...(((((((....................)))))))...(((((((....))))))).................((((((((....))))))))......))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[.....))))....]]]]......((((((((((....)))).((((((.......[[[[[.))))))....]]]]]..............(((((....((((((((....))))))))....)))))..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]............(((((((.[[[[[........)))))))......]]]]].(((.(((((((((((....))))))))))).)))...(((((((....)))))))................))))))(((....)))...................
|
|
ASE_00083
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAUCAACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCAACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAAAAGUAAACCGCCACGGGCGCGUUGCGUUUAGCCUGCGGCAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUUUCCGGCAACGGAAGCGGCAGGGCAAACCCCACCGGGAGCAAAACCGAAUAGGAACGGCGCGCGUUUCCGCGCAAGCGGGAAAGCAGAUCGAUCCGGAUCAGCCGUUCGGGUAGGUCGCUUCAGGCACACAGCAAUCUGUGCCGCAGAGGAAUGGCCGUCACGUGCUGCGUUAUCGCGCAGCGCCAUACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((((((((............)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((((((....)))))))))).((((]]]]]])))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....))))))))).))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((...[[[.))))).......(((((((...)))))))((((....))))..]]]..(((((..............[[[....)))))...]]]....((((.......[[[[....(((((((.......)))))))((((((((....))))))))...))))..]]]]...(((........))).....(((((((.....(((((((....)))))))....((((......)))).)))))))((((.(((((((((.((((((........))))))...))))..))))).....(((((((((....)))))))))........)))).......
|
|
ASE_00084
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAAGGGCAAAGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGACGUGAGUCCACGGAAAGUGCAACAGAAAGCAAACCGCCUAAGUUUUUCGCAAGAAAAGCCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCGGUGGUAACACUCGACGGCACGGUAAACCCCGCUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACAAGUGGUCGUCUCUUCGGAGAUAGUCCGCACGCAUGGCCCAUGCAGGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGUCUGUGGUGACACAGAUCCCAGAGGAAUGAUUGUUCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...(((((((....))))))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((.((((((((((((((....)))))).)))))..((((.]]]]))))))).)))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))..]]]]......((((((...)))))).((((....)))).......((((............((((.....(((((((....)))))))))))..[[[[.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))).....]]]]......((((............((((((..((((..(((((....)))))...))))..(((((...)))))..))))))((((..(((((((..((((((((....))))))))...)))((((....)))).))))...)))).)))).
|
|
ASE_00087
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCAAGCCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCCCCCAAUAGAUUUCAGGUUGCAGCAAGGCAGCAAUCGCUUGAGUCCUCAGGAGCUUAGGUAACUAAGUGACUGGGGUGAAAGCGAGAAGCUAACGCAGCAGCGGCCUGAAAGAUGCAGGGGAUGUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUUCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCACCAGGUACGGUCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((....))))))))))))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))))))))))))....))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..(((.((((((...)))))).((((....))))...))).((((............(((((((((..(((((((......(((((((((((........(((..((((((....((((((..((((((....))))))..))))))...))))))...))).........)))))))))))......))))....)))))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))))))(((...((((.[[[))))....))).....]]]....(((.[[[[[)))..]]]]]........((((((((.....((((((((....))))))))............(((((...)))))....))))))))
|
|
ASE_00089
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUUCAUGAAAACACGGCGCCGGAUAACAUCCGGGGGGCGCAAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACAAACCGCCUUGCUUGGCCUCUGGCGAAGCAGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCGUCCUGGUAACAGGGCGGCUUGGCAAACCCCGCCGGAAGCAAGGCCAAAUAGGGAAGGCAGGAUACUUCGGUAUCAGGGUCCGUUUUCAGACAAGCCGAAUUC |
|
[ reference structure ]
|
..............((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((...)))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))............((((((((..(((((....)))))...(((.]]]]]]])))..)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((.................[[[[)))))....((((..((((....)))).))))..]]]]...............(((((((((.(((...))).)))))))))..((((.....((((((.......))))))...((((((....))))))[[[[[.....))))...........]]]]]......(((.[[[..(((((....)))))....)))(((....)))..]]]......
|
|
ASE_00090
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGGUUGCUAACGGCAACCCGAGGCGACUCGCGGGAAAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGCGGCGACUUCGUCGCUGCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGGGCUGGGCGACCAGCUCGGCUUGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGGUCAAAAGGGCAGGUUCGCCUGUCUGCGCAAGCGUUCGAGGGCGGCCCGCCCGAGCUUGCGGGUAGACCGCUAGAACCGGUCGGCAACGGCCGGUCCAGAUGGAUGGUCGCCACUGCGCGAGAGCGCGGUACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((.........(((....)))...((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].((((.((((....)))).))))..((((.[[[.........))))...]]].....((((((((((((((...)))))))))))..[[[[[....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....)))......]]]]].((((..........(((((((....))))))).[[[[[[[))))..(((((...)))))..]]]]]]](((.((((((((..((((((((....)))))))).....))).))))))))(((((((....)))))))................
|
|
ASE_00092
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGAUGCCGUGGUGGAUAACGUCCACCGACCGCAAGGUUCGGGAAAGUGCAACAGAGAACAGACCGCCGAUCGCUGCGGGGCAACUCGCGGCGAGGUAAGGGUGAAACGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCGGGUCGGGCGACCGACUCGGCUCGGCAAACCCCACGGGGAGCAAGGCCAAGCAGAGAGGAGACUUCGGGCGGCUUCGGUCACUCGGCGUCGCGGGGCGAUUCGUUCCGUUAUCACUCUCGGGUAGGCUGCCAGAGGCGGCGGGCAACCGUCGUCCUAGAGAAAUGAUCGUCGCGACGGCGCAGGCCGUCGGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((((....)))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..(((((((((((((....))))))))))))).((((((.]]]]))))))......))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....(((((((...)))))))....(((..[[[[.......)))......]]]]..((((((..((((((((((....)))))))))))))...........[[[[[)))......]]]]]..((((((((....))))))))(((.[[[...(((....))))))...]]].(((.(((((..(((.(((((.(((....))).))))).)))((((((((...)))))))).....)))))[[[[..)))......((((((((....))))))))..............(((.(((((((....))))))))))...]]]].......
|
|
ASE_00096
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACAUAGAGCAGUGUACUUCCUAACGGGAAGGUAUCCCGCCUUUGGCGGGAUAACAGACAGUGCCACAGAAAACAAACUACCCAUUCCCGAUUUUAUCGGGAGGGGAAAAGGUGAAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCGGUUUGAUGGUGACAUCAGGCGCAUGGUAAACCUUACGCGUUGAAAGGUCAAAUAAGUCACGAUCAUUCACUUGGUUAGCGGCUCGUUAAUUAAGUUGAUUCGUCAGCUUAGUCGUGACGGGUAGACUGAUUGAACCUGAUUGCGAAGUCAGGGCUAGAUAAAUGAUAAGGGCCCUGCCUUUGGCAGGGAACAGAACCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((((((...))))))))).)((...(((((............(((((..((((((((...)))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((((......))))((((.]]]]))))((((((((((....)))))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((...))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...))).(((.((((......)))).((((((...)))))).(((((((((...)))))))))......[[[)))...........]]].(((.((((((((...)))))))))))..(((((.....((((((.......)))))).((((((((....)))))))).........))))).(((..((((.((((...........)))).)))).[[[[[[.)))((((((((((((((((((....))))))))))..)))))))).]]]]]].....((((....(((((.(((((((.........[[[[[))))))).))))).))))............]]]]]
|
|
ASE_00099
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUCGGACGGAUCGUCGCCGCGGGGGCAACUCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAAAGGGCAGAACGCUGGAUAACAUCCAGGGAGGGCAACCUCCGGACAGCGCCACAGAAAGCAAACCGCCCGGCCUCGGCCGGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGAUGCCGUGGUGACACGGCAUGCUCGGCAUACCCCGUUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGGCGGCCGGCCCGGCCGAAGCCUUCCGGGUAGGUUGCUUGAGGGUGUGGGCAACCGCACUCCUAGAGGAAUGACGGUCACACGCGGGCAACCGUGUGGACAGAACCCGGCUUACAGUCCGACUCCCGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......(((((((((((.}}}})))))...)))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((....))))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((........(((.(((((....))))).........[[[[.)))................((((((...))))))(((((....)))))]]]]...(((...........((((((((((....)))))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[)))............]]]]..((((......((((((((((((...)))))...)))))))..[[[[[[[[(((.(((((((((....)))))).))).))).......)))).(((((((....))))))).........]]]]]]]].))))))))))....
|
|
ASE_00100
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGUUACAUACUGAGUGCGUCAAUUCUGUGAUGUCACUUCAUUAUUCCCUCCGGGAAGGUCUGAGACAAGAGCCAAUAGCCGCCCUUACAGGGCGUCACUUGAGCGGGUGAGUGAGUCCCCAGCAACCCCACGGUGGAGUGGACCGGCCCGCUGUGUGGAGGAGGCUCUGCAGGAGAGGCGGGGUGGGCUUGUGGUGAGAGGGAGUGGUCGCAGAUUGAGGCUGCUCCCACCUUACACACGGCUCCACCCGGCUGAUGCUGCCUCCUCCCCGGGCCUUGGAAGUGGCUCUCGGCUGGCUGUAUGAGUCCAAUGGCUGAGGUGGGGCAGCUGCACGGGAUGUGUGCGCGCCCCAUAACCCAAUUCAGACCACUGUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........((((((((((......))))).)))))........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))((((((....))))))(((((((...........(((..............................................................................................................................................))).......)))))))))))....................))))((((((((.(((((((...)))).)))))))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((..[[[[.....)))).(((((.((((...((((......))))....)))).)))))....]]]].((((((..((((((((.....(((((..(((((((((...)))))(((((((....(((..........))).......((((......))))...((((((......(((((((((...(((.....(((.((((((...(((((((((.((((((((((.........))))))))))..))))).))))...)))))).)))..))).))))))))).))))))....)))))))....))))((((.....))))...)))))...(((((((....(((((.....)))))..))))))).......))))))))....))))))......
|
|
ASE_00102
|
[ FASTA input ]
|
GGAACGCGGGGAAACUCCUGGUCGCGCCUGAGCCGCUUUUUUGGUGGACAGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGGGCAAGGAUGCCAGCUAACGGCUGGUCGGCGAGUCGAGCGCCCGCCUGAGCGCCGAGGGCAGGCGGAAAGCGGCGAAGCCGAAGGACAGUGCCACAGAAACCAGACCGCCACCCCACACAGGCCCCGGCGCGGGUGCGGGUGGUCAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGGUUCCCGGGAGACCGGGAGCGUCUGGUCAACCCCAUCCGGUGCAAGACCCGACCGUGCGGCGAGGGCGGCCCGCCCGUUUGAGCCGCCAGGAUGGUCGCUCGAGGCGUCCUGGCAACAGGCGUCCCAGACAGAUGAUCAGGCUGCCCUGGGGGAGACCCCGGAGCAGACAGAACCCGGCUUACCGUUUCCCCGUGCCAGCCACUGCCGCCCCCCGCGCCCGCCGCUGGGGGCGGU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((.((((((.....))))))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[..((((((((((.....)))))((((((((((((.((((((((((...........)))))))))))))))).))))).)((...(((((............((((((((((((((((((....))))))))).)))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....))))))))..)))))..)))))))))))))...((((.......(((((((((((.]]]]))))....)))))))......))))......(((((.(((....))))))))..........)))))))(((((((((((....)))))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))..........(((((((((((((.....)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((((.((((((((((((((..(((((.....))))).))))))......(((.(((..(((((.((((....))))..........(((((((...(((..(((((.......((((((.((((.(((((....((((...))))........................)))))...........))))))))))(((((.(((((((((((.......((((((.......))))))..((((((((....)))))))).))))))).))))))))))))))..)))))))))))))))...(((((...)))))..((((((.((((...)))).)))))).....((((....))))...))).)))...))))))))((((.((((((....)))))).)))).................))))))))))).........(((((((((.(((.....))).)))))))))
|
|
ASE_00104
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUCGGACAGGUCGUCGUCGCGGGUCGCAAGACCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUUCACAGGGCAGGACGCUGGGUAACGCCCAGGGGGAGCGAUCUCCGGAGAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCCGCGUUCGCGCGGGUUAGGGUGAAACAGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGUUGCGGGUGGUGACAUCGCAAGCUAGGAAAACCCCGUCCGAAGCAAGACCAAAUAGGGGAGCGCCAAGGUCGGCCCGACCGAUGCUCCCGGGUAGGUUGCUUGAGGGUGCAGGUAACUGCACUCCUAGAGGAAUGACGACCCCCCGCGAGGGGACAGAACCCGGCUUAUCGUCCGACUCCCACU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((....)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))((((((((.((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((.]]]]))))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((....))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((............((((((....))))))..((((...[[[[...))))...]]]]......((((((...))))))((((.[[[[[))))......((((((.........((((((((((....)))))))...)))..(((.((((((.......)))))).)))....))))))..]]]]]..(((.(((...[[[[.)))..)))...........]]]]...(((..[[[[)))..]]]]((((...((((((.((((((((.(((((((((....)))))).))).)))......)))))((((....)))).....))))))..))))))))))))))....
|
|
ASE_00105
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCGAGAGACCAAACUUGCUGGGUAACGCCCAGUACAGGCGACUGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACAUACCGCCUUUUUUUCAGUCAACAGUAAAAAAAAACUGAUAAUUGGAAAAGGUAAGGGUGCAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCAGUAUCGAGAGGUACUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGUCGAAGGAACAAUGGUUGGUCUUUUUCCAGUUCCGUUUUAGGUGAACCGCUAGAGACGUUUGGUAACAGCCAUCCCAGAUAGAUAACUACCCCCAAUAAGACGUAGUAUACUAUGUCUUUAACUGGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((((((((((((............)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((....(((((..((((.]]]]]]].)))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................(((((((((((((((....)))))))))..)))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....[[[....)))))....]]]...(((((((((((...)))))))).......[[[[[.....)))..]]]]].....(((.((((((((((((((...((((........))))...))))))))....)))))).....[[[[[[)))....]]]]]]..(((((((....)))))))..(((.....[[[)))..]]]............(((((..(((...[[[[[[..))))))))......((((...))))]]]]]]((((((....[[[[...))))))...........((((..(((((((((....)))))))))....))))..........]]]]..
|
|
ASE_00107
|
[ FASTA input ]
|
GAAGCUGACCAGACAGUCGCCGCUUCGUCGUCGUCCUCCUUCGGGGGGAGACGGGCGGAGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGUGUCACGACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCGCGCAAGCGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGCGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCAUAAGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAUCGGUCAGUUUCACCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((....)))))))))).)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((....))))).)((...(((((............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((....[[[.((((((((((.((((((....))))))))).))))))).........)))..]]].......(((.[[[[))).......]]]]..(((..[[[....)))..]]]..((((............((((((..((((((((....))))).))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))))))(((...((((.[[[))))....))).....]]]........((((((...)))))).......(((((((((.....((((((((....))))))))............(((((...)))))....)))))))))))))))))))....
|
|
ASE_00108
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGCUACAUGCAGAGUGCAUAUGUCACUCAAGUACCUUGGGGAAGGUCUGAGACAGGAGCCGGUAAUUGCCCCAGCAGGGCAUCCCCUGAAAAGGGGAGCGAGCUCCCAGAGACCCGGGGCCCAAAGGGGGUGGCAUGAGACGCGUGACCGUGUAUCUGGUACUCGCUGAUGCUUACUCCUUCCGGGCAUUGGAAGUGGCUCGCGGCUGGCACUCCCCUGAGUGCAAUGGCUGAGGUGAGGUAAUGGCGCCUCAUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........(((((.......))))).....))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))((((((....))))))(((((((...........(((....................................................................))).......))))))))))).......................))))(((((((......)))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[...))))....]]]..(((..[[[[[)))....]]]]].......(((((((.((((((((.(((.((((......(((((.....)))))((((((....))))))((((((((((........)))((((..((((((((((((.....(((..((((......))))...)))..)))).))))))))..)))).........))))))))))).((((((....)))))).....)))..(((((((......))))))).......))))))))..))))))).......
|
|
ASE_00111
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGUCAUGUGCCGAGUACAUUUGUUACUCUCUCACCUUGGGGAAGGUCUGAGACAAGAGCCGUUUCUGUCCUUGCAGGACAUCUUCCGAGCCGGGAGAGCGAGCUCCCAGACACUCGGUGCAUGGAGGGGUUUGCACAAGAUGCUAGUUAGUAGUUGGUGGCUUGAUACUGCCUUCCCUGGACUAGUUGAUGCCUAUUCAUCUGGGCAUUGGAAGUGGCUUGUGGCUAGCAUGGCACUGAGUCCAAUGGAUGAGGUGAGGCAACUGUGCCUCAUAACCCAAUUCAGACCACUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((...((((.....((((.........(((((.......))))).....)))).....[[[.[[[[[.....((((.....(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((.............(((....................................................................................)))........))))))))))).......................))))(((((((......))))))).......]]]]]]]]....)))
|
| [ predicted structure ] |
((((......[[[[.))))...(((.....)))(((((.......)))))(((((((((....))))..)))))...]]]]......((((((...))))))(((((((...)))))))(((((((((.....[[[[[[[[[.....))))))))).....((((((((((..((((...(((........)))........(((.....(((((((......)))))))....)))))))..)))))))))).]]]]]]]]]....(((..[[[((((((((....))))))))...)))..........]]]...
|
|
ASE_00112
|
[ FASTA input ]
|
AUUUGUAAUUUUCGGGUGAUCGCGGUUUGCUUUUGCAAGCUGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACAAGCUGAGAUGCUUGUAGUGUUCGUGCUUAGCGAAAUCAUAAGCUAAGGUACUCUUUUAGAGUAACGGCAGGAAAAAUGACUAAGGUUUCGACUAUGUCAAAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGCGAUGUGGGAAACUCCAUCGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGCGAGCAACCCAAACAAUGGUAGGGGCGCUCUUCUAAAGGAAAUGAACGAGUAGAAGAGGCAGAGUUUACUCUGCAGAUAGAUGAUGACCGUCACCAAUUUUUCCUGAAGAAUUGGUGAUACAGAACAUGGCUUAUAGAAAAUUACAAGUAAU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((...)))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((....))))))........))))))).((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.........((((((((....)))))))).(((...)))...(((..[[[[[[.)))..]]]]]]....(((...[[[[[[))).......]]]]]].((((((...)))))).....................(((((((((...((((.......)))).))).[[[[[....))))))..]]]]].....(((...[[[))).........]]].(((....)))...(((.......[[[.)))...((((((((...............))))))))((((((....))))))............]]](((((((((((((....))))))))))))).................)))))))))))))...
|
|
ASE_00114
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGACUCGCACCACCUGAGAUGGUGGUAGUGUUUGUGCUCAGUGAAUCAAUAAGCUGAGGUAUAGAGGCAUCUAUAACGGCAGACCAAAAUCCUAAGGGAAACUAUGGAUGGAGGCUAUAAAAGUGCCACAGUGACGAAGUUCCUAGGGAAACCUAGGAAGUGGAACGAGGUAAACCCCAUAAGCGAGAAACCCAAAAUUGGUAGGGGAACUCACACUACUGAAAUGAAGGUAACGUGAGACGUUUUUAAAACGUAGAUAAAUGAUUAUCGCAAGUCAUAACACGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((.......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((.....(((...((....))..)))......))))....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((................)))))))((((((...))))))..........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))....(((((((((((......))))))(((((((((.((((((..........)))))).((((((....))))))...))))))....[[[[........)))..]]]]..............((((............((((((((....))))))))[[[[.....))))....]]]]..)))))...(((....[[[[[[[)))........]]]]]]].....((((..((((..((((((...))))))......((((((......))))))..))))))))..
|
|
ASE_00115
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGGAUGCUGGGUAAUACCCAGUGGGGGCGACCCUAAGGAUAGUGCAACAGAAAUAUACCGCCUGACACUUAAUAUAUGUAGCUAUAGAUGUUACCAUAUAUUAAGUGCCGGGUAAGGGUGGGAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCAGCUAGGCGACUAGCUGGCUCUGUAAACCCCAUCUGGAGCAAGACCAAGUUAGGGACAUAAAAAGGUGGUGGCCCGUCACCGUCCCGGUUGGUAGGUCGCUAGAGCCUAUUGGCGACAAUAGGCGUAGAUAGAUGGCUGUCUAACACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((.......))))).))))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......(((((.......((((((.]]]])))))))))))........))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....(((((((....(((....)))(((((((((....)))(((..((((........(((((.(((((((((((((((((.......)))).))))))))))))).))))).....((((..((((((.......))))))..(((((((....)))))))...........))))))))..)))..(((((....(((((..........(((((....))))))))))..))))).))))))....((((((((....)))))))).(((((((....))))))).......)))))))...
|
|
ASE_00116
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCAGCCACCACUGGACACACAGACAUUCCCCCAAGGAUGUAGGGCGAGAGCUCUGGCUCUGGCACAGAAACGAGACCGCGCCGCGUAAAGCGAUGAUGCCGCAAGGCUGAGGUCGCGCGGGAGGCGGAUGAAACGGCGAAACCCUGUGGGUGCAAGCCAAAAUAGAGCUGAGAACGCGGACGUCCAGCCGAGCUCGGGUAUGGCGCUAAGCUGAAUGCCGUCAAAGAAACAAAAGCUGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.(((((((((((......))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((...........(((....))).......)))))))..))))........))))..)))))))))))...((((.....(((((.......(((..]]]]]])))))))).....))))..............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..((((.((((((......))))))..[[[....))))........]]](((((......[[[[)))))....]]]]..((((.(((((((((.....)))..((((((....)))....)))))))))..((((((((....(((...((((...))))....))).........(((......))).))))).)))...))))(((((...[[[[.[[[..)))))..............]]]]]]]...
|
|
ASE_00118
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAAAGGGCAGGGCGCCGGGUAAUACCCGGGGUGGGGAAACCCCACACGGUAAGGGCCACAGAAACGAGACCGCCGAAGCGGUAAGCCAGGCAAGGGUGAAAGGGUGGGGUAAGGGCCCACCGGCUCCGCGGUAACGCGGGGUGAGGGGGUAAAAAUCCCCCGGCGGGUUUUCCCGCUCUGGUAACCUCCCGCCCGGAGCAAGGCCAAGUAGCGCCGCACCCCGAAAGGGGAUAAGGUGGCCCGCCGAAAUGCGGUGCGGGUAGGCCGCAAUGGAAGUCGGGGGGCAACUCCCGACUCAAGAUAGAUGACCACCUAGUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((...)))))).)((...(((((............(((((...((.....))..)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)(((.(..(((((((......)))))))..).))).)))...)))))))))))))...((((.....((((((((((((....))))..(((((.]]]])))))..)))))))).....))))........((((((((......))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..((((....)))).))))(((((((.....(((..((((((...)))))).))).....(((...........(((((....)))))..[[[.)))...]]]....(((..(((..(((((((.(((((((((((....))))))))..((((((....))))))))).))))))))))[[[[[[[......)))..]]]]]]]..(((((....[[[[[[[[((((....))))......)))))........]]]]]]]].(((.............(((((((((....))))))))).....[[[...)))..]]].......)))))))...
|
|
ASE_00119
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCAGAGGGUGCGCGUAUCCCGUUAAGGCUGAUGAAGCCGGAGCGGGGGCGUGAGAGCGCCGGAAAGUGCCACAGAAAACAUACCGCCUUAUGUGUCUUCACACAUAAGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCCAGGAAAGGAGAAGGUUUAAGGGAAAAAACGCCCUUGCCGAAUCCUUUCCUGCGGUAAACCCAUACGCGAGCAAGGCCAAGCAGAGGGGAAUUGCGGGAGUUUUCCAAAUCUGACUCCCGCAUGCGGGUUGCACCCUUCCCGCUAACACCCUCGGGUAGGCCGCUUAGAGUAAUGACCCCUUAACACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[[.(((((((((((..((((.....))))..))))))(((((....)))))((...(((((............(((((((((((((....)))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((...(((..(((((........))))))))...)))))))))).)))..)))))))))))))...((((.....(((((....((((((((((..........)))))))))).((((((.]]]]]]])))))).....))))).....)))).............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((....((((((((((((((((((((..((((.....))))..))))))(((((....)))))......((((..........(((((((((((((((....)))))))))))...))))....((((((.......))))))((((((((((...(((..(((((........))))))))...)))))))))).)))).....)))))))(((..............(((((.((((((((((..........))))))))))...((((...))))))))))))..)))))))((((.....(((...)))....))))............)))))....
|
|
ASE_00120
|
[ FASTA input ]
|
AGCCGAAGGGCAGCUACCGGUUUCUAUAGAUUUAAUGUCUGUAGUUAAACUGAGGAAACUCCACCCAUCAUGCAGAGCCGUGGUGCCGUAGCAUCAGCUGAGAGGCUGGACCCUGGAGCAGAAACGACACGUCUCCUGGUGGAUGAUAAUGAAGCUUCACCCUCAAGGAGCAGACUGACAUCAGGAGGACCGGUGAAACGGCCAUUCCACGGGAUGCAAGGACAAAUGCUGCCUGUGAUUACUGUAGGAGGCAGAGGUAGUCCGCCCAGAUGAAUGCUGCCGAACAGAAGGUGGGUUACUCUCGGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((((((((((((((.....))))))))..))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{..(((((((((....))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............(((((........))))).......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....(((((...(((..}}}}})))))))).....))))............))))))........]]]]]]]].)).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((....))).(((((.(((((((((((((.....))))))))..)))))(((....)))....(((((((......)))))))..))))).((((((....)))))).....((((.........[[[..))))..]]]............(((((..[[[[..)))))...(((....)))]]]].(((..[[[.)))...]]]((((((..(((.[[[[...)))..))))))....((((.....)))).....]]]]((((...........[[[[[.........)))).....]]]]].
|
|
ASE_00121
|
[ FASTA input ]
|
AGCCGAAGGGCAGCUACCGGUUUCUAUAGAUUUAAUGUCUGUAGUUAAACUGAGGAAACUCCACCCAUCGUACAGAACCGUGAUGUCUAAGACAUCUGCUGAGAGGCAGGACUCUGGAGCAGAAACGACACGUCUUCUGGUGGAUGAACAUGAAGAUCCGUUCUGAUUGACACCAGGAGGAACGGUGAAACGGCCAAUCCACGGGAUGCAAGGGUAAACACUGCCAGUGAAUCCUGUAUGAGGCAGAGGUAACUCGCAUAGAUGAAUGCUGCCACCAACAGAAGGUGGGUUACUCUCGGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((((((((((((((.....))))))))..))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{..((((((((((...)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............((.....)).......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....(((((...(((..}}}}})))))))).....))))............))))))..........]]]]]]]].)).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((....))).......(((..((((((((.....)))))))).......(((....))).))).......(((((((((..(((...(((..((((((....))))))..)))...)))...))).....[[[[[[[[[[.................)))))).....]]]]]]]]]]...(((......[[[.))).(((((((.....((((.....)))).....)))))))....]]].((((((((..((((......))))..(((((.......)))))))))).)))....
|
|
ASE_00122
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAGUACAGAGCAACCCACCGGUGAACAGCCGGCCACCAAUUGGUGAGAGAAAGUGCCACAGAAAAUAACUGUCUUGCCUAAGGCGAGAUGAGGGUGAAAAUGUGAGGUAAGAGCUCACGGUUGUUAUCGGUAACGGUAGCAACGGGUAAACCUUGGGUGCUGCAAUGCCACAUAUAGAGCCGUUUUGAGAGCUGCUCGUUCAAGGCUCAGGGUAGGCAGCAACAGGUAAACAGUAAUGUUUAUCGCAGAUAAAUGAUAGUGUAGAAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))))).)))..)))))))))))))...((((......((((((.....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....))))))))............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))(((..[[[[.......))).(((((.....))))).((((....)))).......]]]](((...........((((((((...))))))))[[[[)))....((((((.......))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]...((((((..((((.......(((((....((((..[[[)))).....)))))..)))).))))))...((((((((....)))))))).]]].................................
|
|
ASE_00123
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGAUGGCUAACGACCAUCCACGGUGACGUGCGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGUCUUCGCCCCGGCUUCGGUCAGGGCGAAGGGUGAAACGCGGUAACCGCCACCCGGAGCAAUCCCAAAUAGGCAGACGAUGAAGCGGCCCGCCGAGUCUGCGGGUAGGGAGCUGGAGCCGGCCGGUAACGGUCGGCCUAGAGGAAUGGUUGUCACGUUCCGGGCGCGGCAAGCUGCGGGCGCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((....))))))))))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((.......)))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((...((((....)))).[[[[[.(((((..........((((....))))........)))))....)))...(((((((((.(((....))).))))))))).......((((...))))]]]]](((....))).......((((((..........[[[.....)))))).....]]]..((((.((((((((....)))))))))))).((((((.[[[[[.))))))......]]]]].(((.[[[....)))..]]]......
|
|
ASE_00125
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUACGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGUUGGCUAAUAGCCAUCCACGGCAACGUGCGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGUCUUGCCAUCGGGUUCGCCCGAUGGGAAGGGUGAAACGCGGUAACCUCCACCUGGAGCAAUCCCAAAUAGGCAGGCAUUGAGGCGGCCCGCUGAGCCUGCGGGUAGGGAGCUUGAGCCGGUCGGUAACGACCGGCCUAGAGGAAUGAUUGUCACGUGCCGGCAACCGCAAGGAAGCCGGCGCGCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((....))))))))))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((((....))))))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
............(((((.....[[[[[[[...(((((...)))))..((((....)))).......)))))...........]]]]]]]((((..(((((((..[[[[[.)))))))...))))...((((....))))...]]]]](((..[[[[[[)))..((((...))))..]]]]]]((((.(((..(((..((((((((....))))))))...)))......((((..(((((((((............))))))))).))))..))).)))).
|
|
ASE_00126
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUUCACAGGGCAGGAUGCCAGAUAACGUCUGGCGGAGGCGACUCCAGGGAAAGUGCAACAGAAAUAUACCGCCGCUUAAUGCGGUAAGGGUGGAAAGGUGGUGUAAGAGACCACCGCCCUUCUGGUAACAGAAGGGGUCCAUGUAAACCCCAUCCGAAGCAAGACCGAACAGGGAGCAUAAGGCGGCCCGUCUGCUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGCCUGCCGGCGACGGCAGGCCUAGAUAGAUGGCCAUUCAAUGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((.....)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)...)))..)))))))))))))...((((.....((((((...((((.]]]])))))))))).....))))......((((((((....))))))))............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((...[[[[...))))...]]]].(((((((((((...)))))))((((....)))).(((....((((.............(((((.....))))).....((((..((((((.......)))))).((((((((....)))))))).))))))))...))))))).((((..((((.....(((((((...((((...))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))..........((((((((.......))))..))))..
|
|
ASE_00128
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCUACAGAGCAAAGUGGUGGAUAACUUCCACCCGGGGCGACCCGCGGGAAUAGUGCAACAGAGAGUAAACCGCCAAAAGAAAUUUUGGUAAGGAGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCAUUGCAAGUGAUUGCAGUGGCUAUGCAAACCCCACUUUUGAGCAAGAUCAAGAAGUUGCAAGCAAUUGCAAUGGAGUGAAUGUUUGAGAACUGCUCGUUCGAGUUCACAGGUAGAUCGCAUGACAUAUGUAGCAAUGCAUAUGCAAGAUGGAUGAUUGUCCCUCAGCAAUGAGGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((....(((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))).))))...((((....((((((((....))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((....)))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((...((((....)))).....((((((.....))))))[[[)))...]]].(((.....((((..............(((((((....)))))))....(((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))))).))))...))).(((.[[[[[))).(((....(((((((....)))))))....)))........((((.....))))..]]]]]..(((..(((.(((..((((((((....))))))))....))))))..((((((.(((....))))))))).))).......
|
|
ASE_00129
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUCGACAUACGGUGCCGGAUAACACCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAACGAACCGCCUUCACUCCGUGAAGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUUUCUAGCAAUAGAGACGGCAUGGCAAACCCCACCGGGAGCAAAACCGAAUAGGGACGGCACAGUGGAAAGUUCGCUCUCGGGCGAUAACUCCGCGGGGCGAUGUCAGGCCCGCUGUCCGGGUAGGUUGCUUGAGGCGCAAGGUAACUUGCGUCCCAGAGGAAUGGCCGUCACGUCUGCGUGGUGCGAACCAUUCAGGCCCUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...(((((..(((((....)))))......))))).(((((.]]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((((....))))))))))).))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[[[..)))..............]]]]]]....(((((.((((....)))).(((....(((((..........(((((((((((...))))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...)))))...))).)))))...............(((((((...(((((....(((((....)))))....))))).((((........)))))))))))..(((((...(((..((((((((....))))))))...)))....[[[[[....(((((.(((((....))))).))))))))))......]]]]]..
|
|
ASE_00131
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUGCACAGAGCGGGAUGACGGCUAACGGCCGUACGCUGAAAGCUGGCAACAGUAUAAGGCGAGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUAAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCAGCAGCAAUAUCAAAUAGGCUGGCAUUUGUCGCAAGACAUAAGGCGUGGCUCGCGCCUGCCAGCGGGUAGAUAGCUUGAGCGUGUGAGUAAUUGCACGCCUAGAGGAAUGACUGUCAGCUACGCAAGUAGUUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((((((....)))))))))))).)((...(((((...........(((((....))))).........)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((....))))...(((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[[.........))))..]]]]]...((((...((((....((((....))))....)))).[[[....))))...................(((((.(((...))).))))).]]].....................((((((...((((....))))..(((((((...)))))))))))))((((......(((..((((((((....))))))))...)))......((((.((((((....)))))))))).))))......
|
|
ASE_00132
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCAUCCUACUUCUUAACGGGAAGCUAUCUGCGAAGGUAGAGUAAUGUAGAAGAAAACAACCGCCUUUUUCCUCUUUUGGAACAAGGUAAGGGUGAGAAGGUGGAGUAAGAGCCCACCAGUUGCGUGGUGACACGGUUAAGCUGUACGUCUUAGGAGUUGUAAGGUCGAUGUAUACCGGCAUUAUGAGGGCUGCUCGCCCCACGUCGGAGGGUAGACCGCUAAAGUAAUGUGGCAACACAUUACUCAGAUAAAUGACAAACACCUUAAUUUAUUAUUAAGGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........((((((((((((......))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))..))).)).))))))))))))))))...((((.......((((((.......((((.]]]]))))...)))))).....))))......((((((((....))))))))..................(((((((.....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))...........(((.((((.[[[[[....)))).))).(((((....))))).......]]]]]...(((((.(((((.((((......)))).)))))....((((...(((((.........)))))..))))(((....)))........[[[[[[[[......)))))......]]]]]]]](((((.....(((.....)))[[[....))))).((((..........(((((((((....))))))))).................(((((((.....))))))).....))))]]]...
|
|
ASE_00134
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUACAUAGGGCAGCGUGCCAGCUAACGGCUGGGCAGGGUAACUUGACGACCAGUGCAGCAGAGAGUAGACCGCCUUUGGCUUAUAUGAGUAUCGCAAGAUAUUCAUGUCAUCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGGCUGGCAACAGUUCACGGCAUGGUAAACUCCACGCGUAGCAAGACCAAAUAGGCAUCGGCAUGGCGCGGCCCGCGUUCGAUGCGGGUAGGUUGCUUGAGCGUACGAGCGAUUGUGCGCCUAGAGGAAUGAUUGUCCACGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...(((..(((((((((((....))))))))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((......[[[)))..]]].(((....(((((.((((....))))....)))))..)))...((((..((((((((((....(((((((((((....)))))))))))......))))))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....)))..))))..(((((............[[[[[[........)))))((((((((...))))))))....]]]]]].((((((((....)))))))).....(((....[[[)))....]]]...........
|
|
ASE_00135
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGAUGCUGGCUAACGGCCAGGCGUCGCGAGGCGACGGAAAGUGGAACAGAGAGCAGAACCGCCGAUGGCCGGCCGGUGCACCCGCAAGGGUAGCCGGUGGCACAGGCAAGGGUGAAAAGGUGGACUCCUUCGGGAGCCGCCGGGGGGAACCCCGGCGCGGUAAGAGCGCACCGCGGACGCAGUGAUGUGGACGGCAGGCUAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGUACAUUGGCGUGGCCCGCGCUGUACCCGGGUAGGUUGCUUGAGCUUGUCGGUAACGGCAAGACUAGAGGAAUGGCUGUCCAACGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((..(((((.(((((..(((((....)))).))))))))).)))))..)).......(((((.((((....)))))((((((((....))))))))((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((....[[[[[.))))......((((((...)))))).((((((...))))))....]]]]]............((((((....((((.(((((..((((....)))).)))))))))...)))...........(((((.((((....)))))))))((((....)))).[[[[)))....]]]]....((((((((....))))..[[[[[[[[[........))))((((((.(((......(((((((...(((((...)))))))))))).)))...)))))).]]]]]]]]]............(((..[[[.)))(((((....)))))..]]]......
|
|
ASE_00136
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUUCAACGGGCAAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGCGUGAGCCGACGGAAAGUGCAGCAGAGAGUAGACCGCCUUCAAUAUGGUUUCGAGCAAUCGGAAUCGGAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCAUGACUGGUAACAGUUCAUGGCAUGGUAAACCCCACCGGAAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCUUUAGGCAUGGCCCAUGCUGGAUCCGGGUAGGUCGCUGGAGCGUAUGAGUGAUUGUACGCCUAGAGGAAUGAUCGUUCGCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.....((((((((....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((...[[[[[..))))..]]]]]..(((.((((((...)))))).((((....)))).(((....(((........)))....((((((.....((((((((....))))))))))))))..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))..)))........)))......((((((..[[[[[..(((....)))))))))((((..((((((((.((((((((....)))))))))))...((((....)))))))))...)))).]]]]]
|
|
ASE_00137
|
[ FASTA input ]
|
CGAAGAGCACGGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAAAGCAGACCGCCCACCCGCCUCGGCGGCGUGGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGCAAGAGACCACCAGCACCCCCGGUGACGGGGGUGGCUAGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCAAGAAGGCGCCCUCCUGCAGAGGAGGACGCCGCGGGAGCGUUCGAGGGCUGCUCGCCCGAGCUCCCGGGUAGGUCGCACCAGGCCGCUGGCAACAGCGGUCGCAGAUGGAUGAUCGCCCCCUCCGCUCCGGCGGGGGG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((.....))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....(((((((((((....)))))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
......((((...(((((((...)))))))((((....)))).......))))........(((.(((((((((((((....)))).))))))...))).....[[[[[)))......]]]]]..((((((((....))))))))..........(((....)))...........(((((((.((((((....)))))).)))).[[[[[[[.)))..((((.....))))..]]]]]]](((.[[[[[.))).((((((((....)))))))).........]]]]]...((((((((....))))))))
|
|
ASE_00138
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUUCCAAGAGCAAGAGGGCAGCUAACGGCUGCUAAAGGAAACUUUAAGGAAAGCGCCACAGAAAAUAGACCGCCAUUUUGGUAAGGGUGAAAAGGUGGUGUAAGAGACCACCAGUUCUUUAGGAAACUAAAGAAGCUAGGUAAACCCCCUCUGGAGCAAGACUAAAUAGGAAAGGUUAAGGGUUGCUCGUCCAGCUUUCAGGGUAAGUUGCUUGAAAUUAUAAGAGAUUAUAAUUCUAGAUAAAUAAUUAACAUAUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((...))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......(((((.....((((.]]]]))))..)))))......))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((.......((((((...(((((((...)))))))........(((....((((((....((((.........((((...))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........))))..))))((((((.....(((.......))).....)))))).....)))))).....)))))))))..((((((((....))))))))...(((.....))).............)))))....
|
|
ASE_00139
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGACAACACAGAGCAACUCACUUCCUAACGGGAAGGCUCCGUUCAGGCGGAGACAGCAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCUUGUCUUUGAUGAGGUAAGGGUGAAAACGUGAGGUAAGAGCUCACGGUAUUGCAUGGCGACAUGGAUUACGGUAAACCUUGAGUGUUGAAAGACCAAAUAGGUUACGAAACUCGAAGGCUGCUCGUCUUCUUUUACUUCGGUAAGAUUCGUAAUGGGUAGGUUGAUGGAGUCUGUCAGCAAUGGCAGAUCUAGAUAAAUGAUAGAAAACCGAUUUUUCGGUGUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((....)))))).)((...(((((............((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))))))))..)))))))))))))...((((......((((((((....((((((.]]]]))))))((((((....)))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))).)......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))...((((((.(((.......((((((...)))))).[[[[[)))...]]]]]......................(((..((((..(((....)))..)))).......[[[[[[)))....]]]]]](((...((((.[[[))))...)))........]]].)))))).............((((((((....((((((.....))))))((((((....))))))))))))))((((..(((..((((.(((((((....)))))))))))....)))........(((((....))))).......))))......
|
|
ASE_00140
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUUCCGAAAGACCAAACUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGAGCGAUCGCGAGGAUAGUGCCACAGAAAAAUACCGCCUUCUUUCAGUGAACAGUGAACAGUUAUCAGUGAACAGUAAAUAACUGAUAACUGAUAACUGAUAACUGAUAACUGAAAAAGGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGGGCGCACCAGCAACACCGAGAGGUGUUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGAAGCAAGGCGAAUGGAACUAUGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCACAUAUAAGAGCCGCUAGAGGCGUCUGGUAACAGCCGUCCCAGAUAGAUAACCGCCCUCUUAAUUUAAGAGAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................((((((...)))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((.[[[[....))))..............(((((((...)))))))((((....))))..]]]].(((((.............(((((.(((((((...((((...(((((((((((...((((.....))))...)))))))))))...))))...))))))).)))))...)))))...(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]]......))))..........(((((...[[[[[[[..[[[..)))))..]]]]]]]]]].......((((((.....(((((((((...........)))))........))))((((((...)))))).........))))))..
|
|
ASE_00142
|
[ FASTA input ]
|
GAAGCAGAACAGAUGGCCGCCCUUCGCGUGCGGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAUGGUGCUGGAUAACGUCCAGCGGGGGCGACCCCAGGGAUAGUGCCACAGAGAGAAGUCCGCCCGCUCAGGCGGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGUAAGAGCUCACCGGGUUCGGCGGUGACGUCGGAUGCCAGGUAAACCCCACCAGGAGCAAGGCCGAAUAGGGAAGCGUCAAGGAUGGCCCGUCCGUGCUUCCGGGUUGGCUGCUUGAGGCCGUCGGUAACGGCGGUCCCAGAGGAAUGGUCAUCGCCCGCCAAGGGGUAACCCGCGGCGGGAACAGAACCCGGCUUAUGGGCUGCUUCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((....)))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.}}}}))))).)))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((((....))))))))))))......]]]]]]]].))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((((((((((((((....))))))).(((..[[[[....)))...]]]].(((((((((((...)))))))((((....))))..[[[[...)))).........]]]]((((((....))))))...((((....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).............))))..(((((..(((((....(((((((....(((((...))))).)))))))...))))))))))..((((((((....)))))))).........)))))))).((((((..(((....)))..)))))).......((((.....))))))))))).....
|
|
ASE_00144
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCGCACAUCCUGCGAUGGAUGUAGUGUUCGUGCCCGUUCGUAAUGGCGGGGCAGUCAGCUUUUUAGCAGAUUGACGGCGGGGAAAGCAUCCUACAGCCAACUUGGCCAUGGUGCAAGUACCCUGAAAGUGGAUAGAGACGAGUCGUCGGGGAAACUCGACGAGUGGAACGACUAAACCCCACGAGCGAGCAACUCAGUGUGUAGAGGCACCUGGCUGAGAGAAAUGAAUCAAUGCCGGGACGAUCGACAUAUGAUCGUAGAAAAAUGAUUGCCCCUUCUGUGGGAGGCUGGGAAGCCUAGAACCACAUUGGAACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((......))))))((((((((((....))))))))).)((.(((....((((......((((...))))....)))).....))).....((((...........((((((((....)))))))).........))..))))))))))))))...(((........)))...(((((((................)))))))(((((((.....)))))))................(((((((((((((((....))))..)).))))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((......((((.(((((((((......)))))).))).....))))((((........((((((((((........(((((((...(((.((((.....))))...)))..((((((((.(((((...(((.((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........))))...)))...))))))))))))).......))))..)))....(((((((.....))))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...))))....)))......
|
|
ASE_00145
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGGGAGCCCGGCUGCCCGUGCCGUGAGGCAUGAGGAAAGUCCCCCCACCCGUUCGGGCACGCGGCCGGACACACGUCCGGGGCGGGAGACCGCCGGCACUGGAACAGACACGACACGUCCCUCCCACACCGAUGAGGCGCGCGACCCACCCCGAAAGGGACGGCAGUUAACCCGCCGAGGGCGUGGCCGCCACACCGGCGGCCACGGACCGGUGAUCGACACCCCAAUGGGAGGGGAGCGAUGGAACGGCCAACCCCCGCCGGUGCAAGUCCACGCGCGCAUGGUAGCCCGAACCACCCGAAAGGGGCCGCGUGGACGCUCAGCCGAAUGCCGGGCCGAACAGAAGGGGGCUUACUCCCCUCAGCUCGUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((....((((((....))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[[[.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((.........((((.((...((..(((....)))..))..)).....)))).......((((((((.....))))))))......((((.....))))....))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((((((((.........]]]]]]]]..(((....)))..)))))))))............))))))..........}}}}}}}}.)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((...........[[[[)))((((((....)))))).....]]]]..(((..[[[[..)))...]]]]((((((....))))))(((((....))))).....(((.............[[[.[[[[))).......]]]].]]].(((....(((....))).[[[[.))).....]]]]....((((((((...[[[[[[))))))))..]]]]]].(((...[[[[..)))..]]]].(((......[[[[.......)))((((....(((((((((....((((.......))))(((....)))..))))))))).....))))...]]]].(((.......[[[[)))......]]]].........
|
|
ASE_00146
|
[ FASTA input ]
|
CGAGUUGGUUAGACAAUCGCUGGUUUAUUGAAGCCCUUAACCGUAUUUAUACGACCUAGUGGGACAAGUAAACGAGAGGAAAGUCCGAGCUACACAGGGCAGAGUGCCGGAUAACGUCCGGGCGGCGUGAGCCGACGACCAGUGCAACAGAGAGCAGACCGCCGUGUAAACGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGUGCCGUUGGUAACAACGUGCAGCAGGGUAAACUCCACUCGUAGCAAGACCAAAUAGGAACUCAAUGGGUGGCCCGUCCAGAGUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCGGCAGAGUAAUUUGUCGCCUAGAGGAAUGAUUGUCCACGACAGAACUCGGCUUAUCGACCAACUCAAAAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((.((((......))))))))).)))).).)))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((........(((.(((((((....(((.....((((....)))).......)))...))))))).........[[[[.)))......]]]].(((((((((((...)))))).((((....))))...(((..(((............((((((((....)))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))))).)))))).)))......))))).........(((.....[[[[[[..))).(((.....)))]]]]]].((((((((((((..((((((((....))))))))...)))......(((((...)))))....)))))))))))))))))).....
|
|
ASE_00148
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGAGAGCCCGGCCACCGCGGCGUACCGACAGGCACACACGUGCCAGCGGGUACGCACGCGAGGAAAGUCCCCCCACCGCCGGGCAGGUGACCGGGGAAACCCCGGGACGGGAGACCGUCGGCGCUGGAACAGCAACGAGACCCCUCCACCCGACCGAUGAGGCGCGGGCGGUGGCAUCGCCACCGUCUCGGCGCGAGCGGCACGGGGUGCAUCGUGCGCCCCGAAGCGAGCGGGCACCGCCCGCGACGCAGCCGCGAGCGUGCGAACCCGACGCAAAACGGCCACUGGUCGGACAAAGCAACGGGGAGCUAACCCGCCGAGGGAUGAGGGUGGAGAACGGAUGGAACGGCGAAUCCUCACCGGUGCAAGUCCACGCCACGCGGAUCGGCCGCACGGUAGCCCGGCAGGGACGUGGACGCUCAGCCGAAUGCCGGGGCGAACAGAAGGGGGCUUACUCCUCUCAGCCAUGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((...(((((((((((....(((((....)))))....))))))).))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[.(((((((((((...))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((.........((((.((((((((((...))))))))))..(((((((((((.(((((((((...)))))))))..(((.((((((...))))))..))).)))))))))))((...((((..((....(((((...)))))......))..))))..)).....)))).........))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((((((((..(((((...))))).......]]]]]]..)).)))))))............))))))..........}}}}}}}}.)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.((((((((((..(((((((((((((((....(((((....)))))....))))))).))))......(((((......(((((((......((((((...))))))(((((....)))))((((.((((...(((.........((((((((.........((((..(((((((((...)))))))))(((((((..(((((.(((((((((...)))))))))..(((.((((((...))))))..))).)))))..)))).))).((((........(((((...)))))..........)))).........)))).........))))))))..(((..(((........)))...))).)))...))))))))..((((.....))))......))))))).))))))))).(((((............))))).........))))).....))))).)))....
|
|
ASE_00151
|
[ FASTA input ]
|
CGCAUUAGAAGAUGGUCGCUAUUUUAGAAUAGAGGAAAGUCCGGGCUACAUUAGACAAAAUUCCAUCUAACGGAUGGCUAGCGCAAGCUAAGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAAACCGCCUUUUUAAGGUAAGGGUGAAAGGGUGGGGUAAGAGCCCACCAAAGCUAAAGCGAUUUAGCUUGUUUGGGCAAACCCAAUUUGUAGCAAGAAGCGCAUGGUAAGUCUAAAUUAAUACGCGCUUCGCUUGAGGAAUAUUGCAAAAUAUUUCCCAGAUAAAUGGCCAUCCAUUGACAGAACCCGGCUUAUUCUAAUGCUCAAUAACUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.(((((....)))))....{{{.{{{{{((((..[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((...)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)...)))..)))))))))))))...((((.......(((..]]]]]))).......))))......((((((((....))))))))..........)))))))...........}}}}}}}}.)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((........(((((....)))))........(((((.....(((((..........))))).(((((((((...........((((((.(((.(((((........(((((((.......)))))))........((((....(((((...((((((((....))))))))...)))))..))))..))))).))).(((((((....(((.......)))....)))))))..(((..........)))....)))))).......)))))))))..........)))))....)))))))))..........
|
|
ASE_00153
|
[ FASTA input ]
|
AUGGGCGGAGGGAAGCUCAUCAGUGGGGCCACGAGCUGAGUGCGUCCUGUCACUCCACUCCCAUGUCCCUUGGGAAGGUCUGAGACUAGGGCCAGAGGCGGCCCUAACAGGGCUCUCCCUGAGCUUCAGGGAGGUGAGUUCCCAGAGAACGGGGCUCCGCGCGAGGUCAGACUGGGCAGGAGAUGCCGUGGACCCCGCCCUUCGGGGAGGGGCCCGGCGGAUGCCUCCUUUGCCGGAGCUUGGAACAGACUCACGGCCAGCGAAGUGAGUUCAAUGGCUGAGGUGAGGUACCCCGCAGGGGACCUCAUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCUCCGCCCAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((...((((.((..(((((........(((((........))))).........))))).))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((.....)))))))(((((((...........(((...................................................................................))).......)))))))))))....................))))((((((((.(((...))))))))))).......]]]]]]]]....)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..(((((...[[[[[[[[[[[)))))..]]].]]]]...]]]]....(((((.......))))).((((((((..(((((((......)))))))...(((..((((((((...))))))))((((((((((.......)))((((((.((((((.......(((((.....(((((....((((.(((....))).))))..)))))..))))).))))))))))))........)))))))(((((..(((.....)))..)))))...(((((((.((((...)))))))))))..)))..)))))))).....))))))))))).
|
|
ASE_00154
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGAGAGCCCGGCCACCGCGGCGUGCCAGCAGCACGCAGCUGCCAGCGGGCACGCACGCGAGGAAAGUCCCCCCACCGCCGGGCAGGUGACCGGGGAAACCCCGGGACGGGAGACCGUCGGCGCUGGAACAGCAACGAGACCGCUCCCCCGCGAGUGGAUGACGUGGCGCGAACCGACCCGCGAGGGAAGGGAGCUAACCCACAGAACGCAGACCGGGGGAGAACGGAUGGAACGGCGAACCCUCACCGGUGCAAGUCCACGCCACGCGGCGCGAGCCGCACGGUAGCCCGGCAGGGACGUGGACGCUCAGCCGAAUGCCGGGACGAACAGAAGGGGGCUUACUCCUCUCAGCCACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((...(((((((((((....(((......))).....))))))).))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{.(((((((((((...))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((............((((.((...((..(((....)))..))..))....))))...........))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((((((((..(((((....)))))......}}}}}}...)).)))))))............))))))..........]]]]]]]].)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((..((((((...(((((((((((.(((((.....))))).....))))))).))))......((((.(((...(((((((......((((((...))))))(((((....)))))((((.((((...(((......(((((((((((...(((......((((..........(((....)))............))))....)))....))))))))..)))......(((..........))).)))...))))))))..(((((....)))))......))))))).)))....))))............))))))...........(((.....)))))))).)))....
|
|
ASE_00155
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGAGAGCCCAGUUCCCGUGCCCGAGACGGGCAUGAGGAAAGUCCCCCCACCGUCCGAACGGGUGACCGGGCGCAAGCCCGGAGUCGGAGACGGCUGGCGCUGGAACAGAAACGAGACCGCUCGACCCGACCGAUGAUGCGCGCGCGACGGCUCCGCCGUCGCCGGCGCGGCCGUCACGGCCGCGUGCGAACCGACCCGUAAGGGAAGGGAGCUAACCCGCAGAGGGAUGAGGUGGCGUCGCCAUCUCCGACGGUCGAGAACGGAUGGAACGGCGAAUCCUCACCGGUGCAAGUCCGCGCCGCGAAGGGUAGUUCGGACGGCGCGUCGGGUUCGCCCGUCGCGCCCUCGGGGGGCUCGCCCCGAGAAGGCGCGGACGCUGAGCCGAAUGCUGGGACGAACAGAAGGGGGCUUACUCCUCUCAGCCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((...((((((((...))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((.........((((((.((((((((...))))))))))(((((((((...)))))))))((...((..(((....)))..))..)).....)))).......((((((((...))))))))...))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((((((((..........}}}}}}}.(((((((((((....)))))))))))(((((((......)))))))..)))))))))............))))))..........]]]]]]]].)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.((((((((((..((((((((((((...)))))))).)))).(((((....(((((((......(((((((((....))))...((((((((.(((.((((((..........((((....))))(((..............(((((((((((...))))))))..(((((((((...))))))))))))......(((....)))...........(((.....)))....)))))))))))).)))))))))))))....)))))))...(((..........((((....(((((((((.((((......))))...((((((.((((....)))).))))))(((((((......)))))))..))))))))).....))))...))))))))..........))))).....))))).)))....
|
|
ASE_00159
|
[ FASTA input ]
|
GAAUACAGCAGUUCUCUCUUCGUAAGAAGAGAGAUUGUGUUACCCUUCGUAACACAUUACCCGUGAGGGAACUAUUAGGUGGAAACCUAGUUAGCUUUGUCGUCAUAAGUGAUCAACGUCUUUCCCCUCGAUUUAUUUUCGGCGGGCGAAUGACGGAUGGGAACGGCGAUAGUUACAAUGUUUGACGUAUCACGUGAUAUUAUCACAAGGUAUGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACCCCGGUUGUUAUCUACAACCGGUUGAA |
|
[ reference structure ]
|
.................................((((((..................(((((....)))))..(((((((....)))))))......(((((((................(((((((((((.......)))))))))))...............)))))))..))))))....(((((((((((((((...)))))))))))).)))....................((((((((((.....)))))).))))..
|
| [ predicted structure ] |
............(((((((((....))))))))).((((((((.....))))))))...(((....)))....(((((((....)))))))..((((..[[[[[..))))......((((.((((((((((.......)))).))).))).))))]]]]].(((.[[[[[.))).((((......((((((..(((((...)))))..))))))....))))......]]]]]......((((((((.....)))))))).....
|
|
ASE_00160
|
[ FASTA input ]
|
GAACACAGCGAGACAACAAUCGCCAGGGGCUUCGGCCCUGAUUCUCGUGAGAGAAGCCGCUGGAAAGCGGUUGUGGGCGCUGUCAUCAGAAAUACACAUGUUGGCCGGCGCUAUCGCCGCACCAAUGUGAUGGGAAAGGCAGCGGAUGUCUCGUUUGACUUUGCCUUAGGGUAAAGGUCUGUUGAGUGCAAUGGUAGGAGGCCGCUUUAUGGUGGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((..........................(((((....)))))((((((....))))))......(((((((...............(((((((((((....))))))).))))...........)))))))..))))))....((((((((.....)).))).)))....................(((((((....)))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....................(((.(((((....)))))...((((....))))(((((((....)))))))[[[))).(((....)))...]]].((((((((.(((((....)))))..))))))))..........((((((((.......[[[.(((((((....)))))))))))))))....]]]........(((((((....)))))))..
|
|
ASE_00161
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCCCGCGCAAGCUGAGAUGCUUGUAGUGUUCGUGCUAAGCCCAAUAAGCUUAGGGGCCGUGUAAACGGCUACGGCGGCCAAACGCGCUAAGGCGUCAGCUAUGCGCUAGUAGGUCUGAAAAGUGCCACAGUGACGAAACGAUCAGGGAAACCUGAGCGGUGGAACGGGUAAACCCCGCGAGCGAGUAACCCAAACUUUUGGUAGGGGCGUUUUGCCAAGCAAAUUGAAGCGACGGCAAUACAGCGGUAACGCUGAGAUAGAUGAUGACUGAAGGAGCUUGUGCCUGAACAAGUUCUGGAACAACACACGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((.......))))))(((((((....)))))).)((.((((....((((...(((....)))..))))......)))).....(((((............((((((((....))))))))........)))..))))))))))))))...(((............)))...(((((((.................)))))))(((((....)))))..................(((((((((......))))))))).........))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..........((((((.(((((((((((..(((((.((((((.....((((((.......)))))).(((((((((......))).))))))....))))))))))))))))).))))).....)))))).......((((.[[[.........(((((....)))))...))))...(((....)))]]]...((((...[[[.....))))...]]].....(((((..........[[[[...)))))..(((((....)))))..................(((((((((......))))))))).............]]]]..
|
|
ASE_00163
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCAAAGGGCAAGGCGCUGGGUAACUCCCAGUCCCGGUGACGGGAAGGAAAGUGCCACAGAAAAGAUACCGCCCGGAUUCGUUCGGGUAAGGGUGAAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCGCGGACCUGGUGACAGGGACGGCAUGGUAAACCCCGCCUGGUGCAAGACCAAAUAGGGGGGCGUUCCCGCAAGGGAUAAGAUUGGCCCGGUCAAUGCUCCCGGGUAAGGUCGCUUGAAUGCAAGGGUAACCUUGCAUCUAGAGUAAUGGUCACCCUGUCUUUCUUUCGGGAAAGGCAUGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.................((((.]]]]))))...))))))......))))......((((((((....)))))))).................(((((((((.......)))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
......(((((((((.(((........[[[[[))).....(((...(((((....))))).)))..]]]]]..............)))))))))...((((((.(((((((...((((((.......)))))).....((((....))))...(((........[[[[)))((((.....))))....]]]].....((((....))))...((((.((((((....[[[[[))))))..))))......((((((((....))))))))...]]]]]....)))))))((((((((....))))))))........))))))....
|
|
ASE_00165
|
[ FASTA input ]
|
CGCAGAGCAAGGUGGUGGGCAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGAAAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGCUCUCUCCGUUCAUUCGGGAAGAGGGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGUGCCGGGUGACCGGGGCGGCUAGGUAAACCCCACCUGGAGCAAGAUCAAGAAGCCGUUCCUCUUCGGAGGAACGGUGCGCACACGUUCGAGGGCUGCUCGCCCGAGUGUGCGGGUAGAUCGCCCGAGGCUGUCGGCAACGGCAGCCCUAGAUGGAUGGUCGCCAACCGGGGCCACGCAAGAAACCCCGGCGA |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((.(((((((.........))).)))).)))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((((((....))))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((.......[[[[))).....]]]]..((((.[[[[.....))))....]]]]...........((((((.((((..(((......)))..)))).)))..[[[[[....((((((.......))))))..(((.((((....)))).)))....)))......]]]]].((((...........((((((((((....))))))))))[[[[[[..))))..((((.....))))..]]]]]](((..[[[[[)))..((((((((....)))))))).........]]]]](((..[[[[))).............]]]]...
|
|
ASE_00168
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGCCACUAGCUUGGGUGUCUAUCACCCUACUUCCGCCUGUGGGAAGGUCUGAGGGAAGGGCCAAAUUGCCGCCCUAGCAGGGUGCCACCUUCUGAAGGUGGAGUGAGUUCCCACCAAUGUGGGUCUCCGAUGAAGCCCUAGAAUUGAGGCAGGAGAAGCGGAGAGGGGUCGUGGGUCGUGGGUCGUAGGCAUCCUCCCCGCGGAUGCCUCUGUGGCUCCGUUCGGGAUUUGAGAAUGACUUACGGCUGACAGCUUUGAGUACAAUGGGAAGAGGUGAAGCACCGCCAGCUUCAUAUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((..........(((((.....)))))........))))))...[[[.[[[[[.....((((.......(((((.....)))))(((((((...))))))).(((((((...........(((.......................................................................................................))).......)))))))))))......................))))(((((((.......)))))))..........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
..(((((....(((......))).[[[[......(((((.....)))))..)))))....]]]]...(((((.[[[[..))))).........]]]]...(((((.(((((((...)))))))...(((..(((((....))))).)))[[[[...)))))...]]]].....((((...(((((((.((((...(((((((((((((........((((.(((((.(((.....))))))))..)))).......)))))))))))))........(((((....((((.....(((((((.......)))))))....))))))))))))).)))))))...)))).
|
|
ASE_00169
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAGCACAGAGCAAUGCACCGGUGAAUAGCCGGGUUCCGUCUUUGACGGAAACAGACAGUGCCACAGAAAAUAACUGCCUUCCCCUCUCCUUUAGGAGAGGGUUGAGGUAGGGUUGAAAACGUGAGGUAAGAGCUCACGUCCCGAUAUGGUGACAUAUCGGGAGGGUAAACCUUGCAUGCUGAAAUGCCACAUAGGUCAGCGCCUGAGAACUGCUCGUUCAAUGCUGAUGGGUAGGCAGAUUGAUCCCGGUUGGUAACUUCCGGGACAGAUAAAUGAUAGCCACUAAUCCACCUUGCUAAGGCUACGGUGGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((((...))))))).)((...(((((...........((((((((((((((((....)))))))).))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))))).)))..)))))))))))))...((((......(((((((...((((((.]]]]))))))))))))).....))))......(((.(((((....)))))))).......................(((((((((....)).)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((..((((...........(((((.....))))).(((((((...))))))).......))))............(((((((.((((((((....))))))))..)))))))(((.......(((((((....((((...((((((((((....))))))))))))))..)))))))..[[[[[...))).......]]]]]((((.....(((((((((.......))))))))).....(((.((((((..........)))))))))..................[[[[[[......))))...]]]]]].....)))))....
|
|
ASE_00170
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUGGACAAACUGCCAGGUAGCACCUGGGCACAGCGAUGAGCUGUGACGGAAAGUGCCACAGAAAACAAACCGCCAGUACUUCGGUACUGGUAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGUCACCGGUAACGGUGGCGGCACGGUAAACCCCAGUUGGAGCAAGGCCAAAUAGGCGGCGAGAGACAGUCCUUCUCGAUCAAGACGCCGCGGGUUGGCUGCUGGAGCGUGAUGGUGACAUCAUGCCGAGAGGAAUCAUCAUCCGGAUCUUUAAUCCGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[.((((((((((.....)))))(((((((.....)))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((.]]]])))))........)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((.....)))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((..[[[))))))......((((((...)))))).((((((.....))))))..]]]..(((((..............((((((((....))))))))..[[[[.....((((((.......))))))..(((((((....)))))))))))).....]]]]..((((((....((((((....((((((.((((.......))))........))))))...))))))[[[[[[((((((((....)))))))).(((((((.......)))...))))...))))))....]]]]]]...
|
|
ASE_00171
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCCCCACAGAGCAGGAUGCCGGCUAACGGCCGGGCGCAGCAAGCUUCGCAAGAAGCCCAAGGCGACAGACACCAGUGCAACAGAAACAUACCGCCUAAGUCCGCAAGGACCGGCAAGGGUGAAAUCGUGCGGUAAGAGCGCACGGCCGUCCUGGUAACAGUGGCGGCGGGCAACCUCAUCCGGGGCAAGGCCAAAUAGGGGAGCAUUGGCGUGGCUCGCGUCGCUCCCGGGUAGGCUGCUAGAGGCCGUCGGCAACGACGGUCCCAGAGGAAUGGUUGCCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((((((((((....))))))))))))).)((......(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).)))))).))).)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[..........))))...]]]]...((((((((((.....(((((....))))).....))).....((((.(((.........)))...(((...((((....)))).)))...))))....((((((.......))))))(((((((((....))).))))))((((((((...(((..((((..(((......((((((...((((((...)))))))))))).....)))))))...((((((((....)))))))).....)))..)))))))).........)))))))..
|
|
ASE_00172
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGAGUGGUCGGUAACGCCGACCGGCCGAAAGGCUCGGGACAGGGCAACAGAAAGCAAACCGCCGCAUGGGACCGGGCCCCCGUCCAAGUCCAUGCGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCCAAGGUGACUUGACUGGCUAGGCAACCCCCACUCGGAGCAAGACCAAACAGGGAGCAGACGCGUUUUUCGAAACGCGUCGUGGGCUCGUCCGGCCCGCUAUCGACUCCCGGGUAGGUCGCUCGAACCGCCGAGCAAUCGUCGGUCUAGAUGAAUGGCCGUCACCUGAUUCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..(((((((((....)))))))))(((((((.]]]])))))))......))))).....))))......((((((((....))))))))................................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......(((......[[[..((((((....))).))))))..]]]...............((((((((((...((((....))))...))))))))))..(((((....((((((.......))))))..(((.((((....)))).)))[[[..........)))))..]]]..((((.....(((((..(((((((((....)))))))))(((((((.....)))))))......))))).....))))(((((.[[[[.)))))......]]]].....(((..[[[[[))).(((.....)))....]]]]]..
|
|
ASE_00174
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAUCGACGGGCAGGAUGGUCUCUAACGGAGACUGGGGGUAACCCUAAGGAAAGUGCAACAGAAAAUAUACCGCCGCCCGCCUCUGGCGGCACUCAGGCAGAAACGAAAGUUUCUGCCGGUAAGGGUGAAAUGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGUCCCGUGGUGACACGGGAGCUUGGCAAACCCCAUCCGAUGCAAGGCCAAAAAGGGGGCUGCCGGAAAUGGCAGCGAGGAUUGCCCAUCCUUUAACCCGGGUAGGCCGCAAGAGGUCCAGGGCAACCGGGACCCAAAGAGAAAUGGUCACCGUCCCGCCACAGGCGGGAAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((...)))))).....(((((((((....))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((((((....)))))))((((((.]]]]))))))...))).....))))......((((((((....))))))))..................((((((((...))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((..[[[[..)))))..]]]]...............(((((....))))).........................(((..(((((...)))))[[[[[.(((((((((....))))))))))))..]]]]]...(((((((.......))))))).(((((((....)))))))..(((((...[[[[............)))))...]]]](((((((....))))))).....((((((..........[[[[[[.((((......))))..)))))).(((((((...........)))).)))(((((((...)))))))......]]]]]]....
|
|
ASE_00175
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUGAAGCAAGGGUGCCGGGUAAUGCCCGGCCGGGGAAACCCGAGGGAAAGCGCCACAGAGAAGAGUCUGCCCCGAGCUUCGGGGUGAUGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGGACCGGGCAACCGGGACGGCACGGCAAGCCCCACCCGGAGCAAUGCCGAAUAGGGGCCCCGCGCGGGCUGGUCCCGGACUACGGUCCGCGAUACCGCCGCAGGGAUGCUUCAGCCCAGGGGCCCGGGUUGGCAGCUUGAGCCCGUCGGUAACGGCGGGCCUAGAGGAAUGGUCAUCCAGGGGGCGCAAGCCCCCGGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((....(((((((((((((((....))))(((.......))).)))))]]]])))))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((......)))...((((((((((...)))))))((((....)))).[[[.....))).((((......)))).]]]..((((((((......(((...(((((((.......)))))))....((((....)))).....)))..[[[[[....))))))))..((((((....(((((((....(((((((((((((((....))))(((.......))).))))....))))))).)))))))...))))))]]]]].((((((((....)))))))).....(((..[[[[.))).((((((....))))))(((.....)))]]]]..
|
|
ASE_00176
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGGGCAGCGUACUUCCUAACGGGAAGGCCCCGAUUAGUCGGGGACAGAAAGUACCACAGAAAACAAACUACCAUGCCCCGACGAGUCGGGGUAGGAAAAGGUGAAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCGGCCUGGUGGUGACAUCAGGCGCUGGCAAACCUUACGCGUUGAAAAGUCAAAUAGGCCCCGAUCAUGAAUGGCUCGUUCAACUUCCACCCGACUUGUCGGGACGGAAUAUCGGGGUGGGUAGACCGAUUGAUCUCAUCAGCAAUGAUGUGACCAGAUAAAUGAUAAAGGCCCCGACUUGUCGGGGUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((....)))))).)((...(((((............(((((.((((((((....)))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).).)))..)))))))))))))...((((......((((((((..(((((.]]]])))))..((((((((((....)))).)))))).)))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((...((((..........))))...[[[[[[)))..........((((((....)))))).....]]]]]]...................(((((((((((((((((((.......(((((....[[[[[[[......))))).((((((((....))))))))........]]]]]]]..........(((......((((((((..((((((...))))))..((((.(((((....)))))..)))).))))))))[[[[.)))......]]]](((((....)))))....................)))))))))))))))))))..............
|
|
ASE_00179
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAAGAUGGUUGCUAGCGGCAACUGUCCCGCUAGUCGGGAUAAGGAAAGUGCCACAGAAAAGAAAACCCCCGCGUCUUGUGCGCGGGAGAGCUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCUUCGUCGUGAGGCGAAGGCUUGGUAAACCCCAUCUGGAGCAAGGCCGAAUAGGGGAGGGAUAAAGCUGCCCGCCUACCUCCCGGGUGUCGCCGCUAAAGCCCCACGGCAACGUGGGCGCGUAGAUAGAUGAUCACUCUCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((.....)))))).)((...(((((.............(((((((((.....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((......((.]]]]))...))))))......))))......((((((((....)))))).))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....((((..[[[[((((..(((((((.....))))))).......))))...........))))(((((((.....)))))))...]]]]....((((((.......))))))..(((((((....)))))))..(((((...[[[[............)))))...]]]].(((.........)))..(((....[[[[[[.......(((....((((((....))))))....))).)))........(((....)))]]]]]]....
|
|
ASE_00180
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAACAACGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGCUCCUGCCUCGGCCGGAGUUAGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAUACCGCCUGCCUUUGGGCGGGUAAGGGCGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCCGGUAACGGUCGCGGCACGGUAAACCCCACCGGGUGCAAGACCGAAUAGGGGCGGCAUAUGGGCCUGUUCCGGCUCGUCGCCCGGGUUGGUCGCUUGAGGCGAAGGGCAACCUUCGUCCUAGAGGAAUGGUCGCCGAUCCCCUUUUAAGGGGUGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[[.((((((((((.....)))))((((((((((....))))))))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((....(((((.]]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[...))).........]]].(((((((...)))))))...(((((.(((.[[[.))).)))))...((((........))))...(((((((....)))))))...]]]....(((((((((........)))))(((((((....))))))).[[[[.....))))......]]]]..((((((....(((((((....(((((.[[[[[))))))))))))...)))))).....(((((((((....)))))).)))...]]]]](((.[[[[)))((((.....))))...........]]]]...
|
|
ASE_00181
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGACAGGGUGGUCGGUAACGCCGACCGGCCGCAAGGCUCGGGAAAGUGCAACAGAAAGAUACCGCCUCCGCGGCUCGUCCGCGCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCCGGCGGGGUGACCCGUCGGCUCGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCAAACAGAGAGGAGCCGCGCAGCGCAAGCUGCGCGGCGCGGACCGGUCCGGCCCGCCAUUACUCUCGGGUAGGUUGCUGGAGGCGGCGAGCAAUCGUCGUCCUAGAGAAAUGACCAUCGCCGGCCCCAGGGGCCCGGCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((.....))))).)))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))))).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..((((((((((....))))))))))(((((((.]]]]))))))).....))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((...)))).))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..((((....[[[.))))..((((((....))).))).....]]]..........((((((.[[[((((.....)))))))))).(((((...(((((((.......)))))))(((((((((....)))))))))...........)))))]]]...(((((.....(((((..((((((((((....))))))))))((((.(((...))).)))).....)))))((((.((((.((((.((((((((....))))))))))))......))))...((((((((...))).))))).....))))))))).
|
|
ASE_00182
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGAUGCCAGUUAACGGCUGGGUGCUAUACGUCGCAAGACCAAGGCAACGGACAGUGCAACAGAGAACAGACCGCCGAUGGCUUUGGGCUGUGCCGCUGCUUGCAGCGGAAAAGUCCCUUUAGCAGAGCGAUGAUCGUUUCGACGGCCAGCGUUUUGCGGGGGGCGAGGCCCAAAGAUCAGGUAAGGGUGAAACGGCGAGGUAAGAGCUCACCGCGCUGGCGGUAACGUUCAGCGGCACGGUGAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCAUUAGGCGUGGCCCGCGCUGCUUCCGGGUAGGUUGCUUGAGCCUGUCGGUGACGGCAGGCCUAGAGGAAUGAUUGCCGAACCCCGCAAGGGGGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((((.((.....))))).)))).)((...(((((............(((((..((((((((((((((.((((((....))))))....((((((((..(((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[[...))).............(((((.....))))).((((....(((....)))...)))).]]]]].((((......((((..(((((((((..(((((((((...((((((....))))))....((((((...((((((((.....(((....))).....)))))))).))))))..)))))))))))).......((((...(((.(((.......))).)))))))))))))...))))....))))(((..[[[[.............)))......(((((((....(((((...))))))))))))]]]]..(((.(((..((((((((....))))))))...)))........[[[[..((((....))))..)))......]]]]...
|
|
ASE_00183
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGUGUGGUUCCUAACGGGAACCGGGAGUAAUCCCAGGGAAAGUGCCACAGAAAACAUACCGCCGCAAGGAAGGCGACUUCGUUGCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCUUCUCUGGUGACAGGGAAGGCAGGGUAAACCCCACACGGAGCAAGAUCAAAUAAGGAGGCCCCAAAGCGGCCCGCUUUGCUUCCGGAAACGGAAGCGGGCUUCCGGGUAGAUCGCCAGAGGAGCCUGGCGACAGGCUUCCCAGAGGAAUGGCCAUCCGUUCGUUAGCAACCUUACGGCUACUAAUGGAUGUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((....))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...((((.]]]]))))((((((((....))))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((((((....))))))))))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.......[[[))))..]]](((((((...)))))))((((....)))).(((....((((..........(((((((((((.((((....)))).)))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))))))))....))))...)))...........((((......((((((((.((((((...))))))(((((((....))))))))))))))).....))))(((...((((((((....))))))))(((......))).((((((((...((((.........))))..))))))))..........)))...
|
|
ASE_00184
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCCACGGACAGUGCAACAGAAAGCAAACCGCCUAUGUCACGGCUCGUGCAAACGGGUCGCGGCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCCGGUGGCAACAUUCGGCGGCACGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCGCGCGGACCUUCGGGUCCGUUCCUGCUGCCCGCAGGGGCUUCCGGGUAGGUCGCUCGAGGCGCACGGCUGUCGUGCGUCCCAGAUGGAUGGUUGUCCUCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((....))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((((....)))))))((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((.....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..(((.((((((...)))))).((((....))))..((((.((((..............(((((.((((.((((((((....)))))))).)))).....)))))....((((((.......))))))..(((((.........))))).))))....(((((((.(((((((..((((......((((((..(((((((....)))))))((((((.....)))))))))))).....))))))))..(((((((((...))))))))).))).)))..))))))))........))).......
|
|
ASE_00185
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGACAGGGUGGUGGGUAACGCCCACCGGCCGUAAGGUUAGGGAAAGUGCCACAGAAAAUACACCGCCUAAGGGGAGCUGUUAGCGUUUGGCCUUUAGCUCUUAGCCAGACAAUCGUCUGGCUAAUGGCUGACCGCUAAUAGCUAACAGCUUGCCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGGCGAGGUGACUCGCCUGGCUCGGUAAACCCCGCCCGGUGCAAGACCAAGCGGAGAGCAUGAGCCGGUCCGGCUCGCUACGACUCUCGGGUAGGUCGCUAGAGGCCGCGGGCAACCGUGGUCGUAGAGGAAUGAUCGCCAAAUCGCUUCGGCGGAUACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..((((((.]]]]))))))......))))).....))))......((((((((....))))))))..................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[[....))))....((((((((...))))))))(((....)))........]]]]]..........(((((((...((((((((((((((..(((((..((((((.((((((((((....)))))))))).))))))..)))))..))))))))))).))))))...))))....(((((.....[[[[)))))..((((((((....))))))))]]]](((.....[[[[..........)))..]]]].((((.[[[[[[[[....))))....(((...)))(((.((((((((..((((((((....)))))))).))).....))))))))...((((....)))).........]]]]]]]]
|
|
ASE_00186
|
[ FASTA input ]
|
CGGACGAGUUGGCCGGGCGGCCGCGGCUCGUAUCCCGAGUCGAGGAAAGUCCGGACUUCACAGAGCAGGGUGAUUGCUAACGGCAAUCCGAGGUGACUCGCGGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCACCCUCGCGGUGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCACCCCGGGUGACCGGGGUGGCUCGGCAAACCCCACCCGAAGCAAGGCCAAGAAGGCCGUGCCGCCGGCACGGCCGCGCAGGCGUCCGAGGGUUGCUCGCCCGAGCCUGCGGGUAGGCCGCUCGAGGCACCCGGUGACGGUGUGUCCAGAUGGAUGGUCGCCGCCGCGCCGCCGGUUUUCCGGCGGCGCGGAACAGAAUCCGGCUUACAGGCCAACUCGUCCG |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((((((((((((.(((((((.....)))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.....))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((((.....))))))))..((((((....((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((....)))))))))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.(((((((.(((((((.....)))))))......(((((.........((((.(((((((((((...)))))))((((....)))).(((....((((..............((((((.....))))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))))))))))...))))))).......((((.....(((((((((...))))))))).(((((((......((((.....))))..)))))))....))))))))..((((((((....))).)))))....))))))))))))(((((((((((((....))))))))))(((......)))))).....))))))))))))))
|
|
ASE_00187
|
[ FASTA input ]
|
CAUGCGAGAGAGGCUGGACGGCUGACGGGCCUUCGGGUCUGAGGAAAGUCUCCCCACCGCUCCGGAUACACGAACAUCUGUAAAGGAUGUCGGGCGAGAGCCCGGGCCCUGGCACAGAAACGAUAACCAUCCUCUGAAAAUGCGAUGAUGCGGAAGCUGAGAUCUCAGGGUAAAUGGAUGAAACGGCGAACCCUCGUGGGUGCAAGUUGGAAAUCGGGGAGAAGAGAAUUCCGGACUCUCCCGGUUGUUUUUGGAAACGCAUAGCCGAAUGCCGUCACUGCAAGAGUCCUCAGGACCAUUUCCUCCACUGAUGGGUGAUAGGAAAUCUUUGCAGGAACAGAAGGGAGCUUACGUGCCUCACUCGCAUAAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((((((((((((...((((((....))))))....{{{.{{{{{((((..[[[[[[..(((((((((((.....))))))(((((....)))))((...((((.............(((((((((((............((....)).......))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((...(((((((....((((...]]]]]]))))))))))).........)))............))))))((((((((.((((...)))).(((((((.((((....))))..))))))).)))))))).......}}}}}}}}.)).)))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.(((((..((((((...((((((....)))))).......(((((((.((((..............(((((.....)))))((((((....))))))[[[[[[(((((((...(((....))).))))....)))......))))............]]]]]].....(((....((((..((((....))))....))))...)))))))))).(((....[[[[.)))..]]]].(((.[[[[[....)))...]]]]].)))))).(((((((.((((...)))).(((((((.((((....))))..))))))).)))))))......(((....)))....))))).)))))))....
|
|
ASE_00189
|
[ FASTA input ]
|
GAGAUUUUAUUGGUCAAUCGCUGUAUUUGAAAAAGAAUAUAGAGGAAACUCCACGCUUACACAAUCUGUGAUGAUUGUAGUGUUUAUGCUAAAUGAAAAAAUAAAUUUAGGCAGUAAUUAAUUACUGACGGCAUAACUAACCUAAGGCUUUGCUAUGGUGAUGUUAUAAAGUGCCACAGAGACGAAUAAAGAGAAAUCUUGAAAUGGAACGCGGUAAACCCCAUAAGUAAGAAACUCAAAUUUUGGUAGAGGAAUCUGAUUAAGAAAAUAAGAAUCAAAAUCAGAAGUUAUUAUUAACUAGAUAGAUGAUUGACGCUGAAAAGUACAAAACGUGGGUUAUAAAUAAAAUCUCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.((((((((......))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((...(((...(((...)))..)))....))))...(((((...........(((((.....)))))...........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))(((((....)))))........))))))).((....)).......]]]]]]]].).)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.((((((((((((((((......)))))))).(((...))).(((....[[[[[[.)))..]]]]]].....(((((((...............[[[[[[((((((....))))))..)))))))....]]]]]].(((((...((((.............))))))))).........(((...(((((..((((..........[[[))))...)))))..))).......]]].......(((((((.................)))))))(((((....))))).......))))))))(((....))).................)))))))))))....
|
|
ASE_00190
|
[ FASTA input ]
|
AGCAUUGGCUAACAGCUGCUUGAAAGAGUAGAGGAAAGUCCACGCUAGCACAACCUGCGAUGGUUGUAGUGAUCAUGCUAGGCCCAAUAAGCCUAGGCUUAGACGACUAGUGCCACAGAGACGAGAAUUGUGAAACGCGGUAAACUCCAUGAGUUAGAAACCCAAAUAUUGGUAGGGGAACUUUUCAACGGAAAUUGAACCAAAGAAAAGAGUUGAUUAAUCAACUAGAUAAAUUGUUAGCACCUGAGAGGGUACAAAACGUGGCUUAUAAAUGCUAAAACACUUGCGCGAGCAGGCGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.((((((....))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((.......))))))((...).)((...(((((........................)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))((((((....))))))........)))))))((((....))))......]]]]]]]].)).)))))(((((((((((....)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.....((((((....)))))).....))))..(((....[[[[[[.)))..]]]]]].(((.[[[[(((((......(((((....))))).....)))))..))).............]]]].........(((((...))))).....(((.....[[[[[.))).....((((....))))....]]]]].......((((((....)))))).......((((.[[[((((....))))))))......]]]....))))))(((((.(((((....))))).)))))
|
|
ASE_00191
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCAGCCAUCACCCUAAACCCCGGUGCCGCAAGGCAUCGGCCGAGAGGCCGGACCCUGGCGCAGAAACGACACGUCUCCCGAUGGAUGAUAAUGAGGCCCCAAUUAAAGGGGUUGAUUGACAUCGGGAGGAUCGGUGAAACGGCCAAUCCGGGGGAUGCAAGGGUGAAAAUCUGCCAAUGAUAUGAGGCAGAGAUUGCCCGCUUAGAUGAAUGCUGCCUAAACAGAAGGUGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((........((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............(((((.......))))).......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....((((((..(......)))))))....))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[..............((((((....))))))((((....))))))))..]]]]............((((((((....((((.((((..((((((.......)))))).)))).))))....((((.(((......))).))))))))))))...((((((...((((((..........))))))..))))))..(((.......[[[[[[)))......]]]]]]...
|
|
ASE_00192
|
[ FASTA input ]
|
GCACAAGUCAAUCGCAGGUAUAAUCAAAAUAUUAUUUUAUAAAUAUAAAUUAUAUUUUGAUUAAUAUUUGAGGAAAGUCCGCGCUAGCACUACCUGUGAUGGUAGUAGUGUUCAUGUUGGGUCUAAUAAACCCAAGCUUAGACGACAAGUGCCACAGAGACGAGCUUAUUUAUUAAAUUCUUCUUUUUCUAUAUUGAGAAUUACAAUUUUUUUCUUAAUAAAUAAGGUGAAACGCGGUAAACUCCAUGAGCUAGAAACCUAAAUUUUGGUAAGGGAGCCCAAUUUGAAGAAAAAAAACUUCGAUUGGGAAGUUUUUUGAUAAGGUUAUUAUUAAAAGAAAAACUUAGAUAAAUGAUUGACUGAUACAGAACGCGGCUUAUUAGUGCAAAAACAGCGUAAAAACGCUGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.........)))))))))))))))).)))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((.......))))))((...).)((...(((((...........(((((((((((((((((((..((((......))).))))))).......))))))))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((((((((((.....))))....))))))))))........)))))))..........]]]]]]]].).)))))(((((((((((....)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((((((((((((((((...(((((....)))))..))))))))))).))))))).(((....(((((..(((((((((......))))))..........((((((.......)))))))))..............((((((((.(((.(((.....))).))).))))).....(((((((((...........)))))))))......)))...))))).....)))....(((((((.[[[...)))))))..]]]..(((((((.((((........)))))))))))...(((((((((((.....)))))))))))..............)))))))))..........(((.........)))(((((((((((....)))))))))))
|
|
ASE_00194
|
[ FASTA input ]
|
GCUGUCGGUUAGUUGCUGCUUUAAAGAUAUAUUUAAAGUAGAGGAAAGUCCAUGCUUGCACUUGCUGGAAUGCAAGUAGUGUUUGUGUAAAUCAAAGCGAUAAGAUUUAGGAUGUGAUAGCCAUAACGACAUAACUAGUCUAAGGUUAAUACUAUGAUGAUGUUUUGAAAGUGCCACAGAGACGAGGCUUGGUGAAAACCAGGUAUGAAACGCGGUAAACUCCACAAGCAAGAAACCUAAAUUUUGGUAAGGGAAUGUUGCUUUAAGAACAAAUAAUUAAAGUAAUGACAGCAAUUGCUGUAGAUAAAUAACUGACUUUAAAACAGAACAUGGCUUAUUGACAGCAUGCUAUCUAAAAAAAGGAUCAUGAUGAUCCUUUUUUUA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.((((((((((......))))))))))....{{{.{{{{{(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((.[[[[[[)))).)((((((...((((...(((....)))..))))....))))...(((((...........(((((((....))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))(((((....)))))........)))))))............}}}}}}}}.).))))))..]]]]]]((((((((((((((...))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((((((......)))))))))).......((((.......[[[[[[))))..]]]]]]......(((.[[[[[[...)))....]]]]]]...((((.....))))..(((.[[[[[.)))...]]]]].......................((((........[[[(((((((....))))))).........))))..]]]......(((((..[[[...)))))...]]]...(((((((((((..........)))))))))))(((((....)))))..........(((.........)))..........)))))))))........((((((((((((((...))))))))))))))
|
|
ASE_00195
|
[ FASTA input ]
|
UGCACAAGUCAAUUGCAGAUAUAAUUAAAUAUAAUAAUUUUUUUAUAAUUGUUAUAUUUAACAAAUUUAUAUUUGAGGAAAGUCCGCGCUAGCACUACCUGAGAUGGUAGUAGUGUUCAUGUUGGAUCUAAUAAAUCCAAGCUUUAGACGACCAGUGCCACAGAGACGAGUUUAUUUAUUAAUUUGUUUAUAUUAAAAAAUAGUUUAGAAUUUUUAAAUUAAUAAAUAAGGUGAAACGCGGUAAACUCCAUGAGCUAGAAACCUAAAUUUUGGUAAGGGAGCCCAAUUUCGGGAAACAAACUUUAAUUGGGAAGUUCUAUUAUAAUAUUUUUAUAAAGAACUUAGAUAAAUGAUUGAUUAAUACAGAACGCGGCUUAUUAGUGCAAAAAAAACAGCGAAUCUGAACGCUGUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.........))))))))))))))....)).)))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((.......))))))((....).)((...(((((...........(((((((((((((((((((..((((.....)))))))))).......))))))))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))(((((((.((((((.....)))))))))))))........)))))))..........]]]]]]]].).))))))((((((.(((((........)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..........((((((((((((((((((((((((.......))))))))))))))).....))))))))).(((...)))(((((...((((((......))))))...(((....((((((.......))))))......)))....)))))............((((((((((((((((............................))))))))))))))))......((((.............(((((((.[[[...)))))))..]]]..(((((((..(((.......))).)))))))(((((((.((((((.....))))))))))))).........................))))........))))).(((((((((((........)))))))))))
|
|
ASE_00196
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGGCUGGUGACUUUCCCCUCUUUAAGAGGGGAGGAAGUUCCGCCCACCCCAUUUAUGGGCAGCGUCCCCUGAGAAGGGGCGGGAGAUGCAGCAGAAACGACACGGCUCCGGAAGAGAUGACGAUGAUAGUGAAAGUUGAGGACUUCCGGAGAACCGGUGAAACGGGCAUCUCCCCUGCCCGGGGUGCAAGCCGGUUUCGGCGCUUAGCCGAAUGUCACCGAAAUUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...(((((((...)))))))....[[[.[[[[[(((((......(((((((.(.(((((....))))))((((((((((............((((((((((((..............((....))......)))))))))..)))........))))))))))))))))))))))...((((....))))............))))))............]]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.....((((((((((...))))))))))....((((((((((((......((((((...(((((....))))).(((((((((................(((((((((...((((.............))))....)))))))))..(((......)))))))))))))))))))))))).....((((((((((.....))))))....))))...........))))))...)))))))).
|
|
ASE_00197
|
[ FASTA input ]
|
CGGACGAGUUGGCUGGGCGGCCGCGGCUCGUGUCGGUCUGAAAGGCCCGGUAACGAGUCGAGGAAAGUCCGGACUUCACAGAGCAGGGUGAUUGCUAACAGCAAUCCGAGGUGACUCGCGGGAUAGUGCCACAGAAAACAAACCGCCAUCCUCGCGGUGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAUCCCGGGUGACCGGGAUGGCUUGGUAAACCCCACCCGAAGCAAGGUCAAGAAGGCUGCACUACAAGUGCGGCCGCGCAGGCGUUCGAGAGCUGCUCGCCCGAGCCUGCGGGUAGGCCGCUUGAGGCACCCGGCAACGGUGUGUCCAGAUGGAUGGUCGCCGCCGCGCCACCGUAGGCAAUGCCUGCGUUGGCGGGGAACAGAAUCCGGCUUAUAGGCCAACUCGCCCG |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((((((((((((.((((((((((((((((....))))))))).)))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.....))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((((.....))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((((((...)))))))))))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.((((((((((.(((((((.((((((((..(((..........)))...))))))))......(((((.........((((.(((((((((((...)))))))((((....)))).(((....(((((..........((((((........))))))...(((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))))))))))...))))))).......((((.....(((((((((...))))))))).(((((((...((((.....)))).....)))))))....))))))))..((((((((....))).)))))....))))))))))))(((.(((((.(((((((...))))))).))))).(((......)))))).....)))))))))).)))
|
|
ASE_00198
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGAGCAGGAUGGUGGACAACAUCCACCCGGGGCGACCCGCGGGCCAGUGCCACAGAGAGAAGACCGCCUCCGCGCCGCUGCGCGGCGGUAAGGGUGAAAGGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGGCCCCGGUGACGGGGCCGGCUCGGUAAACCCCAUCCGGUGCAAGGCCGAACAGGACGCGUCACGAGGGCGGCUCGCCCCAGCGUCCGGGUUGGCCGCUCGAGCCCGCCAGCGAUGGCGGGCCCAGAUGGAUGGCCGUCACCUCGCGCGGGGCAACGCGCGCGAGGCACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((.....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.....[[[[......))))((((((.....)))))).(((....)))]]]]....(((((.....(((...[[[[[)))..(((......)))]]]]]..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))..[[[[...))))...]]]].....(((......[[[[[[)))....(((((...)))))..]]]]]](((..[[[[[)))..((((((((....)))))))).........]]]]]....(((.[[[[[)))...]]]]]....)))))..............
|
|
ASE_00203
|
[ FASTA input ]
|
CACCGAGCAGGGUGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCGACCCGCGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAAACCGCCCCGAGCCGUACGCGGCACGGGGUAAGGGUGAAACGGCGGUGUAAGAGACCACCAGCAUCCCGGGUGACCGGGAUGGCUAGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGAUCAAGAAGGAUGCCCCCGGGCAUCCGCGGGAGCGUUCGAGGGCUGCUCGUCCGAGGCUCCCGGGUAGAUCGCACCAGGCGGUCGGCAACGGCCGUCGCAGAUGGAUGAUCGCCACUCGGGCUUCGGCCCGAGC |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((....)))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....(((((((....)))))))..((((((...(((((((.]]]]))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((......[[[[[))).....]]]]].((((.[[[[.....))))....]]]]..............((((((.((((....)))).))))))..(((((.......((((........))))..((((((((....))))))))[[[..........)))))..]]]........((((((((((....))))))).[[[[[[[.)))..((((.....))))...]]]]]]](((.[[[[[.))).((((((((....)))))))).........]]]]]....(((((((....))))))).
|
|
ASE_00204
|
[ FASTA input ]
|
CGCUGUCGGUCAGUUGCUGCUCAAUGAGUAGAGGAAAGUCCAUGCUUGCACUUGCUGGAACGCAAGUAGUGUUUGUGUAAAUUGAACAAAUAGAUUUAGGACGCUAAUAGACGUCACGACUGGACUAGUCUAAGGUCUUUGACUAUGAUGAUGUCCGUAAAGUACCACAGAGACGAGCUUAGUGAAAACUAAGUAUGAAACGCGGUAAACUCCACAAGCAAGAAACCUAAAUUUUGGUAAGGGAAUGUUACUUUAAGAAAAAUAAUUAAAGUAAUGACAGGAUUACUGUACAUAAAUAACUGACUUUAAAACAGAACAUGGCUUAUUGGCAGCGUUCUAUUGAAAAAGGAUCUGUUUGGAUCCUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((...))))))....{{{.{{{{{(((((((((((......)))))).....(((((((((((.........))))))(((((.[[[[[[.)))).)((.((((...(((...((((...))))..)))....))))....(((((..........(((((((....))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((.....))))........)))))))............}}}}}}}}.).)))))))..]]]]]](((((((((((....))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((((((((...)))))).(((...)))....((((((((((......))))))..[[[[[[[)))).....]]]]]]].......(((.....[[[[[)))............]]]]]..(((((((..((((........))))...[[[[.)))))))..(((((((....))))))).........]]]]...........(((((..[[[...)))))...]]]...(((((((((((.........)))))))))))((((.....)))).......))))))))).......(((((...(((....)))...)))))...((((((((((((....))))))))))))
|
|
ASE_00205
|
[ FASTA input ]
|
UAGGGGAGCCUAACAGGGGGCCACGGGAAACUGGGGAAACUCCAGCCUCUCGCCCAGGGGGAGUCCCGCGAGGGACGGGGUUAGGUGCUCCGACAACUGCACAGAAACGAGACCUGCGGUGGGCCAGAUGAAAAUGAUCAUUUACCCCAUCUGGCGACGGAUGGGAGGGUGUGAGAGACCUAUCGUGGGUUGAAACGGCAGAUCUCCCCUUGAGCAAGUAGGGGAGGAUAGGGCAAAAUGACUCCCCUGAUACGCAGAGCCUAAUCCCCCAAGUACAGAAGCUGGGUUAUUGUUAGGCUCCCCU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((...(((....)))....[[[.[[[[[((((.{{{{.((.((((((((....)))))(((((.....)))))((...((((............(((((((((((...............((.....((((((((....))))))))....)).......)))))))))))........)))).))))).))))))...((.((((((((...}}}}))....))))))....))............)))))).........]]]]]]]]...)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((((..(((....))).(((...))).)))))..((((.(((((((((((....)))))(((((((..(((((......((((..........(((((((((((((..((((((......))))))..((((((((....)))))))).............)))))))))))))......)))).((((((((.........))))))))...)))))...))))))).(((.....))).......)))))).(((......)))))))..)))))))))))))))
|
|
ASE_00209
|
[ FASTA input ]
|
AACCGAAGGGCAGCUGACGGCCCAUUUUUGGGCUGAGGAAACUCCACCCAUCAUACAGAACCGCGGUGCCGUGAGGCAUCAGCUGAGAGGCUGGACCCUGGAGCAGAAACGACACGUCUUCUGGUGGAUGAUAAUGAAGCUUCACCCUUAAAGGAGCAGACUGACACCAGGAGGACCGGUGAAACGGCCAUUCCGCGGGAUGCAAGGACAAAUACUGCCUGUGAUUACUGUAGGAGGCAGAGGUAGUCCGCCGAGAUGAAUGCUGCCGAAACAGAAGGUGGGUUACUCUCGGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...(((((((....)))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[..((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............(((((.........))))).......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....(((((...(((..]]]]])))))))).....))))............)))))).........}}}}}}}}.)).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..[[[...)))).....((((..(((....)))..)))).....]]]......((((((....))))))........(((((...(((((..(((........(((((......)))))........(((((.........)))))...)))...))))).[[[.........)))))..]]]((((................[[[[[[.......))))...]]]]]].((((((..[[[[[[[.....))))))...................]]]]]]].
|
|
ASE_00210
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGGCUGGUGACUAUCCAAUUGGGAGGAAGCUCCGCCCACCCAUUAUGUGCAACAAUCCCGAGAGGGAUUGAAUGGGGCAUAGAAACGACACGGCCUUAAAACAGAUGACGAUGAUAUCCGAAAAUUGAGGAGUUUUAAGGAAUCGGUGAAACGGCCCCAUUCUGCACGGGUGCAAGCAUUAGCGUUUAGCUGAAUGUCGCCGAAAUUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((.....))....[[[.[[[[[(((((...(((((....((((((....))))))(((((((((............((((((((((((.............((......))......)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...((....))............))))))............]]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((...............((((....))))((((........((((((..................(((((((((.......(((.....(((((((((..............(((.........))))))))))))..)))........)))))))))))))))((((...((((((((.....))).)))))))))...............))))..)))))))).
|
|
ASE_00212
|
[ FASTA input ]
|
CGGAUGAGUUGGCUGGGCGGCCGCGGCUCGCGUAGGGCUUGUGUGGAUUCACGAGGUUCAGCGUCGAGUCGAGGAAAGUCCGGACUUCACAGAGCAGGGUGAUUGCUAACGGCAAUCCGAGGUGACUCGCGGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCAUCCUCGUGGUGGCAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAUUCCGGGUGACCGGGGUGGCUAGGCAAACCCCACCCGAAGCAAGGCCAAGAAGGCCGCACCGAAAGUGCGGCCGCGCAGGCGCUUGAGGGUUGCUCGCCCGAGCCUGCGGGUAGGCCGCUCGAGGCACCCGGUAACGGUGUGUCCAGAUGGAUGGUCGCCGCCGUGCCGCCGUUAGCUUGGCUGGUGGCGGCGCGGAACAGAAUCCGGCUUACAGGCCAACUCGUCCG |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......).)))).))))))).)))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.....))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((((.....))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((((((...)))))))))))))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.(((((((.((((((((((.((((((.((((....)))))))))).))).)))))))......(((((.........((((.(((((((((((...)))))))((((....)))).(((....((((...........(((((((((.....))))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...))))))).......((((.....((((((((.....)))))))).(((((((..(((..(((.....)))))))))))))....))))))))..((((((((....))).)))))....))))))))))))((((((((((((..(((...)))..)))))))))(((......)))))).....))))))))))))))
|
|
ASE_00213
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGGCUGGUGACUAUCCAACUGGGAGGAAGCUCUGCCCACUCAAUUACGUAGAUUUCCUGAGAAGGAAUAAACAAAGUAUAGAAACGACACGGUUCCAAAAAAUAUGACUAUGAUAUUUUAAAAUUGAGGAUUUUUGGAAAAUCGAUGAAACGACUUUGUUUUGCGUGAGUGCAAGCAUUAUGCGCUAAGCUGAAUGUCACCGAAAUUACAGAAGGCAGGCUAUAGCCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((.....))....[[[.[[[[[(((((....(((((.(.(((((....))))))(((((((((............((((((((((((.............(((....)))......)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...((.....))............))))))............]]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.......(((....)))....(((.(((((.......(((((((((.(((((....)))))...(((((((.......(((.....((((((((((((....)))....(((((....))))).)))))))))..)))........))))))))))))))))(((...(((((.............)))))))).............)))))))).)))))))).
|
|
ASE_00214
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAGAGGGCAGGGUGCUGGCUAACGGCCAGUCGAGGCGACUCGCAGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCCGUUCCGAAAGGGGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCCGGGGUGACUCGGACGGCUCGGUAAACCCCGCCUGGAGCAAGAGCCAAUAGGAGCGCGUCCUCGCCGUACGGAGGACAGGGAUGGCCCGUCCCAUGCGUUCGGGUUGCUCGCUGAUGAGGCCCCUGGGCAACCAGGGCCCUUAGAUGAAUGUUCACCGCCCAUCCCGAAAGGGGUGGGAACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((((((..((....))))))).(((((.]]]])))))..)))))).....))))........((((((((......)))))))).................(((((((((....)))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((((((..((((....(((((((...)))))))((((....))))........))))...........((((((((((((....)))))))))..[[[[....(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....)))..]]]]...)))))))..((((.(((..((((((((((((........)))))).((((((...))))))..))))))..)))))))((((.(((((.((((((....)))))).)))))(((...(((((.....(((((((....))))))))))))..)))))))...
|
|
ASE_00215
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCCGGCUGCACAGAGCGGGAUGACGGCUAACGGCCGUACGCUGAAAGCUGGUAACAGUAUAAGGCGAGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGUCGGUUCGACCAGUGAGCAACUUGUUGCGAACUUGCGUCGAAACGGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCUGCAGCAAUAUCAAAUAGGCUGGCAUUUACGCAAGUAAUAAGGCGUGGCUCGCGCCUGCCAGCGGGUAGAUAGCUUGAGCGUGUGAGUAAUUGCACGCCUAGAGGAAUGACUGGUCGCCACGCGAGUGGAUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((((((....)))))))))))).)((...(((((...........((((((((((.(((((((((....)))))))))...)))))))))).........)))..)))))))))))))...((((......(((((((.((((....))))...(((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((.[[[.......)))))).((((((...)))))).((((....((((....))))....)))).............]]]......(((.[[[[)))....]]]].(((((((.(((..[[[[.))).))))))).....((((..........)))).]]]]..........((((((..((((....))))..(((((((...)))))))))))))((((......(((..((((((((....))))))))...)))......(((....((((....))))...))).))))......
|
|
ASE_00216
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGACAGGGUGGUGGCUAACGGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGCUACCCUCCAGGUAGCGGUAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGUCCUCGUGGUGACACGAGGAGCUAGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAGACAGCGUACGACGGUGUUAGUUCACUGGGAGGGCGGUCCGCCCGAGUGCGCGGGUAGGUUGCUAGAGGCCAUCGGCAACGAUGGUCCGAGAUGGAUGGUCGCCGACU |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((.....)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((..(((((......)))))..(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....)))))))).....................
|
| [ predicted structure ] |
..........(((.[[[[[.....))).(((((((...))).)))).....]]]]]............(((((((((.....)))))))))..(((((....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[..........)))))..]]]..(((((....((((((..(((((......)))))...(((((...)))))..)))))).....[[[[[(((..((((((((....)))))))).....))).)))))..]]]]]
|
|
ASE_00217
|
[ FASTA input ]
|
GAAGCCGGUCAGACAGUCGCUGCCUGGUGACAGGGAGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGGAUGCCGGUUAACGGCCGGCCGCCGUGAGGUGAGGAACAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUAAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCCGGAGCAAGAUCAAAUAGGCAGAUGAUGACGCUGCUCGCUGAGUCUGCGGGUAGAUCGCUCGAGCACACGGGUAACUGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAUCGGCCGGCUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((......))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((....))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((............((((....)))).........((((..((((....)))).))))(((((...(((((.[[[[)))))..............]]]].......((((((......(((((.(((...))).)))))((((....))))..........[[[[[[..........((((((((.......))))))))..)))))).....((((....)))).]]]]]]..(((....[[[)))....]]]...))))).....))))))))))
|
|
ASE_00221
|
[ FASTA input ]
|
CGGGACGGGCAGACAGUCGCCGCGUAUCGCGUAAGGCAUACGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGUAGAAUGCCGGUUAACGGCCGGGCGCGGUAACGCGACGGAAAGUGGAACAGAAAGCAAAACCGCCGAUGGCUGCUUUGGCAGCACAGGCAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGGGCGCACCGCGCAUUUGGUAACAAUAUGCGGCAGGCCAAACCCCAUUCGGAGCAAGACCAAACAGAACGCAAUGACGCUGCCCGCCGAGCGUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCAUACCGGCAACGGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCGAGACAGAACCCGGCUUACCGCCUGUCCGGUGUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((.....((((((...(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......(((.....[[[)))((((...))))..]]]...((((..[[[...))))...]]](((.[[[....)))..(((.....(((..((((....)))).))).......)))..........]]](((....(((((....)))))...)))..((((.....(((((......[[[))))).((((((((....))).)))))....]]]..))))...((((..................[[[[[....[[[[[[[)))).....]]]]]]]]]]]]....((((((((....)))))))).....(((....[[[)))....]]].....(((.[[[[))).....]]]]..
|
|
ASE_00222
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAGAGAGCCCGGCUGCCGCGGGCGUCGUGCGACGCGCGCGAGGAAAGUCCCCCCACCUGUUCGGGCAGGUGACCAGACGCAAGUCCGGGGCGGGAGACCGCUGGCUCUGGAACAGAAACGACACGUCUCGGCCCGACCGAUGAUGCGUGCGAACCCGACCGCGAGGAAGGGGAGUUGACCCGCAGAGGGAGUGUGGUCGGUAUCCCGUGGUUCGAAUCCACGGAUUGCGAGCGCGGUUCGACGCGUCUCUGACGCGGGACCCGCGACCGAGUGCGACGGCACGAGCCGUCGAACACGCACGGCGCGAUUGACCACACUGAGACGGCCGAGGAGCGAUGGAACGGCGAACCCUCACCGGUGCAAGUCCGUGCCGUGGUAGCCCGAACAUCUCGCGGCUCCGCCGCGAACGGCGCGGACGCUUAGCCGAAUGCUGGGACGAACAGAAGGGGGCUUACUCCUCUCACCCGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((...((((((((((....))))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{{.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((.........((((.((...(((..((....))..)))..)).....)))).....((((((((((((...((((((.......))))))..((((..((((((((..((((((...))))))))))).))).((((((((((((((....)))))))....)))))))))))))))))))))))....))))))))..)))........))))..)))))))))))...(((((((((......}}}}}}}}...(((((((...)))))))..)))))))))............))))))..........]]]]]]]].)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.((((((((...)))..((((.(((((....))))).))))....((((((((.(((((((....)))))))....(((....)))...(((((....)))))...((((.(((....(((...((((((((.....)))).))))))).....(((............)))..)))..(((((((((((((((((((((((...((((((.......))))))..((((..((((((((..((((((...))))))))).))))).(((.((((((((((....)))))))..)))...)))))))))))))))))))......((((.............))))...)))))..((((....((((((((((((((.........)))(((((((...)))))))))))))))))).....))))..))).))).....)))).))))))))....))))).)))....
|
|
ASE_00227
|
[ FASTA input ]
|
CUCAAGCAAAGCGAUUGCAGAGCAACUAGAAGAUGCUCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCUAACUAUUCCAGCUGCUGGAUAAUUUCCAGUGUGAUAUAAUCACGAGGAAAGUGCCACAGAAAGAAACCAAUCAAAUCUCCAUCGAAUGGCUCACAAGCUCUAGGAGAUCUUGGAUUGGGUGCAAAUGUAUUCUUGACGUGAGUUAAGCGUCUGGUAUACCCCAGUCGGGAGCAAGAUGAGGUUAGUUUAUAGAGAAUAGACCAUAGACUAAUCUAUUCCAUUGCUCGAGAGGGUUCAUACAGAACUCUCCAAUCAGAUAAUCUCCACACCUCUCAGGACCAAGCUAGAAACCAGUUUGAGCCUCUCGAGAUUUGUACCGAACCCGGCUUAUUUCUUGAG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((.(((((((((.((((((((((...)))))))))).....[[.[[[[[(((((...{{{{{{.((((((((((.....)))))((((((...))))).)((...(((((...........((((((((((((((.......((((....))))...)))))).)).))))))........(.(((((((((....)))))))))).)))..))))))))))))))...((((((((((((((((...}}}}}}...))))))))))))....))))......((((((((.....)))))))).........)))))).(((..(((((((..((((((.......))))))..)))...))))..))).......]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[..)))(((((((.........))))))).(((((((..(((...))).))).)))).]]].(((.....(((((..((((((...)))))).)))))[[[[[.)))........(((((..((((((.......((((....))))...))))))....)))))]]]]]...((((..((((((....))))))...[[[[))))..]]]]....((((((....((((((((((((.[[[[.......))))))))))))......))))))..((((((((.....))))))))...........]]]]..........(((..((((((.......))))))..)))(((((((......(((....)))......)))))))
|
|
ASE_00228
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAGGGCGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCUCCCGAAUCCAGCGCCACCGGACGACGGAGGUAAGGGUGAAACGGUGGAGCAAGAGACCACCAGCAUGCCGGGCGACCGGCGUGGCUAGGCAAACCCCGCCCGGAGCAAGAUCAGACAGCACACGCAGGUUCCGACCGGAAGGGCUGCUCGCCCGAGUGUGCGGGUAGAUCGCUGGAGGCCGUCGGCAACGGCGGUCGUAGAUGGAUGGUCGCCCCUCCUCCCGCAAGGGCGGAGG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...................((.....)).)))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((...(((....)))..((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..........((((((((((...)))))))((((....))))[[[[[....))).................]]]]]..(((((((((.(((.....))).)))..(((((....(((((.........)))))..((((((((....))))))))[[[..........)))))..]]]..((((.....((((((.....((((....))))((((.....))))..)))))).....))))))))))((((((((....)))))))).................(((((.(((....))).)))))
|
|
ASE_00229
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAAGGUGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCCCUGCGUGCAGGGGUAAGGGUGAAACGGCGGUGUAAGAGACCACCAGCGACCGGGGCGACCCGGCCGGCUCGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGGUCAAGAAGUCCGGUGCUCUCACCGGACGCGCGCACGACUGAGGGCGGCCCGCCCGAGUGCGCGGGUAGACCGCUGGAGGGCGUCGGCAACGGCGCUCGUAGAUGGAUGGUCGCCACGCUUCGGCGUU |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((((....))))))))..((((((.....(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((....)))).
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[(((((((...)))))))((((....))))........))))...........]]](((((((....)))))))..((((....((((((((........))))......((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]..((((.....((((((((....)))))))).[[[[[[[))))..(((((...)))))..]]]]]]](((.((((((((..((((((((....)))))))).))).....))))))))((((....)))).
|
|
ASE_00231
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAGCGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCAGCGGCCUGGAUGAACCCCGUGGUUCAUCCAGGUGCGGGUGAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCUCCCCAGGUGACUGGGGAGGCUCGGUAAACCCCACGUGGAGCAAGGCCAAGAAGGACGGCGGGCAACCGUCGUCCGCGCGAGCGUUCGAGGGCUGCCCGCCCGAGCUCGCGGGUAGGCUGCUGGAGGCGGCUGGUAACAGCCGCCGUAGAUGGAUGGUCGCCGACA |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((((....))))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....(((((((((....)))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).....................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((....(((((((...)))))))((((....))))........))))............((((.....(((((((((((((....)))))))))))))))))....((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]........((((((((((((....))))))))).[[[[[[[.)))..((((.....))))..]]]]]]](((.[[[[)))...((((((((....))))))))..........]]]].......
|
|
ASE_00232
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAGGGUGGUGGGUAACACCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCUCGCCCCUCGUGGGCGGGGUAAGGGUGAAACGGUGGGGCAAGAGCCCACCAGUGCGCCGGGUGACCGGCGCAGCUCGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAGACAGCACACGUUCGAGGGCGGCUCGUCCGAGUGUGCGGGUAGGUCGCUCGAGGCUGUCGGCAACGGCAGCCCUAGAUGGAUGGUCGCCCCCUCGGAGACGAGGG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((.....)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((...[[[[.)))))...((((....))))........]]]]..............(((((((((.....)))))))))..(((((....(((((.....[[[[)))))..((((((((....))))))))]]]].........))))).((((..[[[[[..........))))..((((((((..((((......))))..))))))))..((((((((....)))))))).........]]]]]...((((((....))))))
|
|
ASE_00234
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCGAAAGACCAAACUUGCUGGAUAACGUCCAGUGCGAGCGAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAGAUACCGCCAAAACAAGUAAAAAGUAAAAAGCAAAAAAGCAAAAGAAACAAAAAUUUCUUUUUACUUUUGCCCUUUAACUUUUGCCUUUUUUUGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCGUCGAGAGGCGUUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGCCAGAGGAACUACGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCGCGUAUGAGAGCCGCUAGAGGCUUUUGGUAACAACCGUCCCAGAUAGAUAACUGCCAUCAUGUAAAAUUUUUACAUAGAUAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((......)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................((((((((((...))))))).))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....[[[....)))))....]]]...(((((.(((.....((((...((((....))))..))))....)))........[[[[[[.....)))))............((((((....((((((((......))))))))...))))))(((((.(((((((((.......)))))))))..))))).]]]]]].((((...[[[[[((((((....)))))).))))...........]]]]]....(((((((..[[[[[[..[[[)))))))..]]]]]]]]](((...[[[[[[))).....]]]]]](((....)))(((.[[[...)))..]]]..((((((((((...))))))).))).................
|
|
ASE_00237
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGGAGGGAAGCUCAUCAGUGGGGUCACAUGUAGGGUGCUUGUCACUCAACCAAUCACCUUGGGGAAGGUCUGAGACAAGAGCCAAUCACUUCCCUAGCAGGGUAUCACCUGAUCUGGGUGAGUGAGUGCACAGAGAAUAUGAGCCAUUGUGAGUUGUCUUUACGGAAGAAACCAGCCAGUACAGCUCUCCAGCACUACUGGUGGAUGUGACCUCACUGGCUUGGAAACACUCAUGGCUGGCAUAUGAGUUUAAUGUGUGAGUUGGAGUACACCUCCAGAACCCAAUUCAGACCACUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
.......(((...((((.....((((.........(((((.....))))).........)))).....[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((..............(((........................................................................))).......)))))))))))...................))))((((((.....)))))).......]]]]]]]]....)))
|
| [ predicted structure ] |
....((((((........((((((((((((((...((((.[[[[[[))))........(((((....)))))....]]]]]]......(((((..(((((((((......))))..)))))..))))).........................(((((((((((...))))).....[[[[[[[))))))........]]]]]]]..))))))))))))))..(((((...(((((((.......)))))))........[[[[[[[[........)))))...]]]]]]]].....))))))
|
|
ASE_00238
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCAAAAGGCCAAGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGAGCGAUCGCGAGGAUAGUGCCACAGAAAUAUACCGCCCUCUAGAUAGAAGAUUUCUCCUGUUUAGUGGGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUGUCGUGAGGCACUGGCUAGGUAAACCCCGGCUGGGAGCAAGGUCGGAGGAAUCAUGGUUGGUCUUUUUCCAGUUCCGUCGCACUAUAGGUAAAUCUAUGGUGUUAGGUGUACCGCAAGAGGUGUCUGGUAACAGGCAUCCCAGAUAGAUAACUGCCCUCUUAACUGGUUUCAGCUAAGGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))....((((((((((....)))))))))).......)))......((((((((....)))))))).................((((((((((....)))))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((.(((...))).[[[[)))....]]]]..(((((((((((...)))))..)))))).(((.....))).(((((.........[[[[(((((((((((((..........)))))))).)))))...)))))...((((((.......))))))..(((((((....)))))))....]]]]......(((((((.........((((((((((....)))..))))))).(((((...((((((((((....))))))))))(((....((((.((((((((((((....))))))...(((........))).))))))...)))).....)))..)))))....)))))))..
|
|
ASE_00240
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGACUUUAUAGGAGAGGAUGCCAGUGAAAGACUGGGGGCCGCAAGGCUACGGAAAGUGCCACAGAAAACAAACCGCUAACAAGCUAUGCUUGUUAGAUAGGGUGAAAUGCCUGCUUUAGGAGCAUGGCCUUAUCUAGAGAAAUUUAGAAAGUGGUAAACCCCAUCCAAAGCAAGACGGAAAUAAAGCGAUACAGUUCUCCGCUGUGCUUUAGAAAAGUCGCUUGAGGGUUUCGGUGACGGCGCCCCUAGAGGAAUGAUUGCUCGUCUGCUUUGCAGACCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((...))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))))..).)))..)))))))))))))...(((.....(((((...((((((.]]]]))))))))))).....)))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))........)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))...............((((((((((.....))))).((((....))))........((((((.........(((.(((((((((...)))))))))....))).....((((((((...))))).)))....((((((....))))))..)))))).....))))).((((..(((.....((((((...(((((..[[[))))))))))).....)))))))..((((.(((....))).)))).....]]]..........(((((.[[[[)))))...]]]]..........
|
|
ASE_00241
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUACAUAGGGCAGAGUGCCGGAUAACGUCCGGGGGGCGCGAGCCUACGACCAGUGCAGCAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCUCAAUUGAGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGCGUGGUAACACGUCAUGGCAGGGUAAACUCCACUCGUAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCAACGAGUUGCCCGCUUGGGAUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCGUAUGUGUAAAUGUACGCCUAGAGGAAUGAUUGUCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((....))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..[[[.....))))..]]].((((....[[[)))).((((....))))]]](((..(((........)))...[[[[..((((((....))).))))))...]]]]....((((((....[[[)))))).((((((((....)))).))))..........]]](((..(((((...(((......((((((..(((((.....))))))))))).)))..)))))....[[[[[[))).....]]]]]].....(((....[[[)))....]]]...........
|
|
ASE_00242
|
[ FASTA input ]
|
AGAGUCGAUUGGACAGUCGCUGUCGCGCAAUAGCGCGGUGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGAGUGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAACCGCCUAAGCGCAACAGCGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGGCUGGCAACAGUGCGUGGCUAGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCAUUGGCGCGGCCCGCGUUGGAUUCGGGUAGGUCGCUUGAGGCGUACAGUGAUGUGCGUCCCAGAGGAAUGGCUGUCCUCGACAGAACCCGGCUUAUAGAUCGACUCUCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((....)))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((............((((((....)))))).(((......[[[[[[[)))....((((...)))).......]]]]]]]((((....)))).(((....[[[[...........))).....((((....)))).]]]].(((((....((((((.......)))))).((((((((....)))).))))[[[..........)))))..]]].......(((..[[[[[[))).(((((...))))).]]]]]].........(((...((((((((....))))))))...[[[[[..)))..]]]]]..................))))))))))....
|
|
ASE_00245
|
[ FASTA input ]
|
UUCCCUCCAAAGUCUGUAUUUUACCUGCCUACAAAAGGAGGAGUCCCCGGCGGACUUCCUCAGUAUUCGCAGGUGGGAAAUUCGGUGAAAUCGCUCUGCCCACCAGGGAAAAGGUAAAACUCUCCCUGGUCCUUGGAAGGACUUGUCCUUCUGAGUCUCGUGAGAGAUGCCAAGCGUGGAGACGCUAGGGUGGUCGCCAUAAGAAACUUCAACAGGUCACACUGUUAUGGGAGGCGCCACGGGCAGUUGGUCCCUUUGCAUCCAGAAGGAAGCUUUGGGGCUGUUGAGUGCAAUAUACAGAGCGCUAGAAGGAGUCCUUCCUUCUACGCGUAA |
|
[ reference structure ]
|
............(((((((...(((((..........(((((((((.....)))))).)))........))))).....................((((((......................................................((((....))))..((((((((....))))))))..(((((((............(((((......)))))......))))))).))))))...((((((((((((((....)))))))))))))).............)))))))(((((((((((((...))))))))).))))..
|
| [ predicted structure ] |
............((((((((((((((((.(((.....(((((((((.....)))).))))).)))...)))))))))).....((((....))))((((((((((((((...(((...))).)))))))).((((((((((....))))))))))((((....)))).....(((((....)))))...((((.((((..(((...))).(((((......)))))......))))))))))))))..((((((.[[[[[[...((((....)))))))))).....]]]]]]..))))))(((((((((((((...))))))))).))))..
|
|
ASE_00246
|
[ FASTA input ]
|
AGAUGUGGAGGGAAGCUCAGUGCUGAGGCUACAACCUGAGUGCAUUUGUCACUCUCAUACAUUCCUCAGGGAAGGUCUGAGAUUAGAGCCAUCUAUUGUCUUAACAAGGCAUUGCUUGGUUUGAGCAAAUGAGUUACCAUCAAACCUUGUUCUGUUGUCGCUAGACUGCACAAGUAAUAGAAGUGGUUUUCCUCUAUGGAUGCUGAGGCAACUGAUUUGGAAAGUGACUCAUGACUAGCAAAUUCAAGUUCAAUUGCUGAGAGGAAGUCAUUACCUUCCUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
(.((((((((((...((((.((..((((.........(((((.......))))).........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((...........(((.................................................................)))........))))))))))).....................))))(((((((.....)))))))........]]]]]]]]....)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((......((((((.....[[[[(((((.......))))).........))))))...]]]].((((((....[[[.......))))))....]]].((((..[[[[[[[))))...........]]]]]]]......(((.(((.[[[))).))).......]]].....))))))))))))...(((....))).....((((((.((((.....(((.((((((............))))))..((((((.......))))))........)))...)))).))))))......
|
|
ASE_00247
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGUCACGCGCUGGGUGUAUCGAUCACCCUCCUUGCUACCUUUGGGAAGGUCUGAGAGAAGGGCCAAGUGUCGCCUUAGCAGGGCGCCAUCUUAGGAAGGUGGGUGAGUUCCCAGCAAUAGGGGUCUCCUGUAAUGCCCCAGUUUGAGGCAGGAGAAGCGGGGCUGGAGGGGCUACUCCCUCCUUCCUGCGGAUGCCUCCGUGGCUUACGCGGGGCUUGGGAAUGACUCACGGCCGGCACGUUGAGUACAAUGGGCAGAGGUGAAGCGGCCGCUUCAUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........(((((.......))))).........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((...........(((..........................................................................................))).......))))))))))).....................))))(((((((....)))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((...........)))).......(((.[[[[[[))).....((((((.((((.(((..........(((((.......)))))..(((.(((((.....))))).)))..))).)))).))))))...]]]]]].....((((((((((....(((((.....((((((......((((((..(((((((....))))))).))))))...)))))).(((.....)))))))).)))))..)))))(((.[[[[..)))(((((....((((.....(((((((....)))))))..))))))))).........]]]].......
|
|
ASE_00248
|
[ FASTA input ]
|
AGAGUCGAUUGGACAGUCGCUGCCCUCUAUGAAAAUUAGGGGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCGAAGUGCCAGGUAAUGCCUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAACCGCCUAAGCACUUCGGUGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGACUGGCAACAGUUCGUGGCUAGGUAAACCCCACUUGGAGCAAGACCAAAUAGGGUUCCAAGGCGUGGCCCGCGCUGGAACCGGGUAGGUUGCUAAAGAUGUCCAGUGAUGGCCAUCGUAGACGAAUGACUGUUCAAGACAGAACCCGGCUUAUAGAUCGACUCUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)).)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((........(((((((.......))))))).........))))..((((((..(((((.....((((((...)))))).((((....))))........[[[[............)))))..((((....)))).]]]].((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))....))))))..((((......(((((((..(((((...))))))))))))[[[[.)))).(((..((((.(((....))).)))).)))........(((((...))))).]]]]........))))))))))....
|
|
ASE_00250
|
[ FASTA input ]
|
CAGCAGAUCGGUCUGUCGCUCACUCUUUCGAGAGUGGGAGGAACGUCCGGGCAACGCAGAGCACCAUCCUUCCUAACAGGAAGUUACUCGUGAGGGUAAAGGAGCGUAGAAGAGAAUGACCGCCAUUUUCCAUGAGUUGUCUGUGCUUCGGUACGGACUACGUGGAGGGUAAGGGUGAGAAGGUGGGGUAAGAGCCUACCGGAUGCAGCGGUGACGCUGCAUGCCGUACGUCUGAUGGGUUGUAAGAUCAUGUAUACCGGCGCAUGUAGGGUGGCUCGCCCGAUGCCGGGGGGUAGAUCGCUGGAGCCAUGCGGUGACGCACGGCCAAGAUAAAUGACAGACGCUCUGGCUACGUGUGGCCGUGAGUACAGAACCCGGCUUACAGAUCUGCUGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........(((((...(((((((..(((((((..........)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).))))))))))))))))...((((.......((((((......((((.}}}}))))..))))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((....)))))).))))......]]]]]]]].).))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((.((((((((....)))))))).(((...))).))))((((...........((((((...))))))((((((....))))))....))))..........))))...((((((((((....((((((((....))))))))..))))))))))..(((((((..((((((.......))))))..((((((((....)))))))).((((..[[[[.))))......]]]](((((.[[[[...)))))...]]]].)))))))...((((((......(((.[[[..(((.((((....)))).)))...)))......]]]..((((((((((....)))))).))))......)))))).....))))))))).....
|
|
ASE_00251
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUCUCCGUCCACGGAGGCAGGUUUCUGCCUUCGCACAAAAUGCUCCUGAGAGCGUCCUGGCGCGAAAGCGCCGGGCAGGGCCAUCAGAAAUCAGUCGAGUUUACUUGGCAUGGGAGGCUCUGCGGACGGUUGGUCAUGUGUAUGAACAUGGCUAUUGAGUGCAAUAUGCGAACCUUGAAAAAGGCA |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((.............................((((((....)))))).(((((((....))))))).(((((((...........((((((....))))))......))))))).))))))...(((((((......)))))))....................((((....))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((.[[[[[[.(((((((((....)))))))))..............))))))...(((((((....)))))))((((((((........(((((((((....)))))).)))..))))))))]]]]]].(((((((((......))))))))).....((((...))))..((((....))))..
|
|
ASE_00252
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAGAAGUAGGCGAGGCGGCUGCGGAUUCGGCGGCGAUGCUGACUGAAUUCGAGGAAAGUCCGGGCUUCCGAAAGACCACACUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGCGUGAGCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAAAUACCGCCCUGGCCCUUCGGGGUUUCGGUGUGGUGGGUCAGGCUCCUGGAGCCGAACCGCUGUCCCUGGAAUCUGUGAGUGAAGGGCUGGGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUGCUGGCUCGGUAAACCCCGGUGGGACGCAAGGUCGGAGGAACUAGGGUUGGUCUUUUUCCCGUUCCGUACAGGGUCAAUCUUCGGGUUGGCGCUGCGGUGUACCGCUAGAGGUGUCUGGUAACAGGCAUUCGAGAUAGAUAGCUGCCCCUAAGUCUGGAGACAGAUGAGGGAACAGAACCCGGCUUAUGUCCAACUUCUUCGUUUUC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.(((((((((.(((((((((((((...)))).)))))))))....{{{.{{{{{(((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((...)))))))))))))).))))))))))).....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((....(((((..((((.]]]]]...)))))))))...(((((((((((....)))))))))))......)))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((....)))))))))).......}}}}}}}}.).))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((..[[[.))).(((((((((((((...)))).)))))))))......]]](((....))).(((..[[[.)))(((((((...)))))))((((....)))).......]]]...............(((((((((((((((((((((....((((((....(((((...)))))...)))))).....))))))).....))))))))))))))..((((.....(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]].....))))...(((((((.....[[[..((((..(((.....)))..)))))))))))..(((.(((((((....))))))).)))(((....)))......(((((((....))))))).]]].......(((((.((((..(((((....))))).)))).[[[.....)))))..]]]...))))))))))....
|
|
ASE_00254
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAGGGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGUGACCCGCGGGCCAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCCCGAUGCGCCGGUUCGCCGACGUGCCGGGGUAAGGGUGAAACGGCGGUGUAAGAGACCACCGGCACCGUGAGCGAUCACGGUGGCCAGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAGACAGCAGGCGGGUUGCUCGCCCUUGCCUGCGGGUAGGUCGCUGGAGGCCGUCAGCAAUGACGGUCCGAGAUGGAUGACCGUCCCACG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((....)))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((((((.]]]]))))..)))))).....))))......((((((((....))))))))......................
|
| [ predicted structure ] |
......(((.((((((((((...)))))))((((....))))...)))..)))............(((((((((..(((.(((....))).)))..))))))..[[[[[....(((((((........))))..((((((((....))))))))))).)))......]]]]].((((((.........[[[[[[...))))))......]]]]]](((..((((((((..((((((((....)))))))).....))).)))))..)))...
|
|
ASE_00255
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCAGGAGAGGUGAUCGCAAUCGAGAUUUAUCGCGUUUCCGCAAUAAACUCUCGGUUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCAGAUGGUCCAACUUGCUGGGUAACUCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACACACCGCCGAUGUCUCAUAGAGCACAGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUACUGGCUUGGUAAACCCCGGUUGGGUGCAAGGCAAAGGUUUUAGGAUGACCAUUUUGCCUAUUUCCUAUUUAAAGCCGCUCGAGGCUGUUGGAGACAACAGUCCCAGAUAGAUGAUCACCCACUAACCAAUUUUGGAUAGUGAACAGAACCCGGCUUACUUCCUGCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((....))))))))).)))))))))....{{{.{{{{{(((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((.((...))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((...(((((..((..]]]]]......))...)))))......)))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((....))))))))).......}}}}}}}}.).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.((((....((((((((((((((.(((....))).))))).))))))))).(((.......[[[)))......((((.....((((((.....))))))((((....))))..))))...]]].........))))(((....(((...)))[[[[.)))....]]]]...(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]].....((((.....))))...(((((((.....[[[[[.......)))))))...]]]]]....((((((.....((((((((....))))))))...(((.....)))...(((((.(((....))).))))).........))))))..)))))))))))
|
|
ASE_00257
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCACGGUGGUGGGUAACGCCCACCGUCCGCGAGGACAGGGAAAGUGCAACAGAAAGUAAACCGCCGGGCCAGUUCGCUGGCCAGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGACCGGGUGACCGGUCUGGCUAGGUAAACCCCACCGGGUGCAAGACCAAGCAGGGAGCAGUUCUGGUUCGCCAGAACACGGAUCGGCCCGAUCCGUUACGACUUCCGGGUCGGUCGCGCGAGGCUGCAGGCAACUGCGGUCCCAGAUAAAUGGCCACUCUCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..(((((((....)))))))(((((((.]]]]))))))).....))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].(((((((((((...)))))))((((....)))).......................[[[))))((((((....)))))).]]]..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........))))..((((((....((((.....(((((..(((((((....)))))))((((((((...)))))))).....))))).)))).((((.....((((((((....))))))))(((......))).......))))...))))))....
|
|
ASE_00258
|
[ FASTA input ]
|
UGGACCUGCCCACAAAAGGAGCUCCGUGCUCAGAAUUACGCAGGUGGGAAAUUCGGUGGUUCACGCUGUCCAACAUUACCCUUUCUCUUGAGAGAUCCUGGCGAGGAAUCGCUGGGUGCGGCCAUAAGAAAUCAGCCCCCUAAAAAGGGCAUGGGAGGCUGCACGGACAGUUGGUCCUUGGAAAGAGGGCUAUUGAGUGCAAUAUACAGACUGGGGGCUUUGGCCCCUGGAA |
|
[ reference structure ]
|
(..(((((..........((((.....)))).........)))))....................((((((............((((....))))..(((((((....))))))).(((((((...........((((((....))))))......))))))).))))))...((((((.....)))))).............)......((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.........((((.....))))........))))))(((.......(((...)))[[[[[[[.......)))..((((....))))..(((((((....)))))))((((((((........(((((((........)))).)))..))))))))]]]]]]]((((((((.....))))))))..................((((((((....))))))))..
|
|
ASE_00259
|
[ FASTA input ]
|
AAGUAAACGUAGAUAGCUGCAGAUUUGAUUUAAUAUAGUCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAAAUACAAUUUGUGCUGGAAAAACCCCAGUGUAGGAAACUAUGAGGAACGUGCCACAGAAAUAAACCGCCAGAACAAAUUAUGUUAGCUGGUAAGGGUGCAAAGGUAAGUUAAAAGCUUACCAAAAAUACUGUAAAGUAUUUGUUAGGUAAACCCCAAAAACGGAGCAAAGCGACUAAAUAAAUUUUUUGUAUUUUUCAGUAGUUUAGUCUAAAAUACUGCAUGAAGUUAUUGGCAACAAUAACUCUAGAGGAAUAGCUAUCCUUCGAAAUACUUGUGCAAUGUAUUCGGAGAACAGAACCCGGCUUAUGUAGUACUUUUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((((((((((.((((((((......)).)))))).....{{.{{{{{((((...[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((....(((...)))..)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))..))))...((((......(((((((((]]]]]]....)))))))))........))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((..(((((((....)).)))))..)))).......}}}}}}}.))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((((((((((((((((............(((((...(((...)))..(((((((((((((....((((((((.......)))))((((....)))).....)))....((((......((((((((((((.....))))..)))))...))).....(((((((.....))))))).......))))...))))))))..................))))).....))))).........)))))(((((((.((((((((...)))...)))))....((((((((....))))))))...))))))))))))))(((((((.(((.........))))))))))..............)))))..)))))....
|
|
ASE_00263
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGGGUGGUCGAUAACGUCGACCGGUCGUGAGAUCAGGGACAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCGCUGCGGGCAUGAGCCCCCGUCAAGGUUUGAUUGUCUGCAUGCGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUCGAGGCGACUCGGCUGGCUAGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAGCAGAGAGCAUGUUGUCGGUGUCACAGCCGACAGCCGGAAUCGGUUCGGUUUCGUAUGACUCUCGGGUAGGUUGCCGGAGCUAGCGAGCAAUUGCUAGCCUAGAGAAAUGGUCGUCAGACGUUUUCGAUCCGUCGAAGAGCCCAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((...(((((((((......)))))))))(((((((.]]]]))))))).....))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....(((((((...)))))))((((....)))).(((....((((...........((((((((((((((((.(((((........)))))...)))))))).)))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...)))..(((((((...(((.....(((((((((((((((((......)))))))))((((((((...)))))))).))).))))).)))..))).)))).((((((((....)))))))).........(((......((((.........))))...[[[[)))..........]]]].
|
|
ASE_00264
|
[ FASTA input ]
|
UUCUCAUCAAAGUCUGUAUUUACCUGCCUACACAAGGGGCCCUCUUCCCCCAGAGGGACCCAGCAGGAGCAGGUGGGAAAUUCGGUGGUACACGCCGCCCAUUAAUUUCUCUCUUGAGAGAGUCCAGGCGAGGAAUCGCUAGGGUGUUGCCAUAAGAAAUUCAGUCCGCCUAGCGGGCAUGGGAGGCUUCACGGGCGGUUGGUCCCUAGUGCAAAACUUUCGCGCUAGGAGGCUUUUGAGUGCAAUAUACAGACCGCCUAGUGGUUCCUUGGGAUCAUCUGGGCGGAACGCGAUACCGAUUAUUUUGGUGAGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((((((..(((((..........(((((((((......)))))).)))........)))))....[[[.[[[[[.......((((((........(((((....))))).((((((((....)))))))).(((((((............((((((...))))))......))))))).))))))...((((((((((((((...))))))))))).))).............)))))))((((((((((((((....)))))).)))))))).......]]]]]]]]..)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.........(((((((.......(((((((((......)))))).))).........)))))))....((((((((((..(((((((.....((((((....)))))).....(((((....)))))...(((..(((.........(((((((((...)))))).)))..)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))))
|
|
ASE_00267
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCCAGAUAACGUCUGGGAGGCGCGAGCCUACGACAAGUGCAGCAGAGAGUAAACCGCCGAUGGCCUGUUUACAGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACAGCUGGUAACAGUUUGUGGCAAGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGUUCUUAUGGUGCGGCCCGCAUUGAACCCGGGUAGGUUGCUGGAGCCAGCGCGCAAGUUCUGGCCUAGAUGAAUGGUUGUCCACGACAGAACACGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....)))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......((((....[[[)))).((((....))))]]]....((((............((((((..(((((((....)))).))))))............[[[[)))....]]]].(((((.(((((....))))))))))...(((...((((.[[[))))....))).....]]]........((((..[[[[[)))).....]]]]].....((((....))))))))..(((((((((.........))).[[[.....))))))..]]]...
|
|
ASE_00270
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGCGCUCGUCGAGACUGGCGGCGGAAGUUCGCCAGUCAAGGCGAGGGAGUUGCUCCGGCGAGAUGCUGGGGCAACUUCGGAAAGUGCCACAGAAACCAUACCGCCGUCGGGCUAAGCGGCACUGUGGCUUCCGCUGCCAGCCGCUGCAGUGUUCGCGUUUCCCGGCGGUAAGGGUGAAAUGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCACGACCGCGAGGUCGUGGCUGGGCAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGGCGCUAUCAGGUUGCCCGCCGAUGCCCCCGGGUCGGUCGCUUAGAGAAAUGGUCGCCAGCGUCAGGGCUAAAACCUGACGCCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.(((((((((((..(((((((((.......)))))))))..)))).))((((((((((((((...))))))))))))).)((...(((((............(((((((((((((((((((((((((((((...(((...))))))))))))).)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((....((.(((.]]]]))))).)))))).....))))...................(((((((((.......)))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((((...((((..((((((((((..(((((((((.......)))))))))..))))).(((((((((((((((...))))))))))))))).....)))))......(((((((((((((((((....(((((((((((((....(((...))).))))))))).))))....)))))))))...)))...)))))(((((....(((((....(((((((....)))))))..)))))..))))))))))))))..(((((....(((((((......(((.....)))..)))))))[[[[[[[.............)))))....((((((((.......))))))))........]]]]]]].
|
|
ASE_00274
|
[ FASTA input ]
|
UUGAGGAAAGUCCGGGCUCCUAUUUGGCCAGGCUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACACACCGCCUAAUGCUUAAUGGGGAAAUCCCAACAAGCGCGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCAUCGAGAGGUGCUGGCUAGGUAAACCCCGGCUAGGAGCAAGGUGAGGGACGCUGGAGGCCAUAGACCGUGUCCCUAAGUAGAGCCGCUUGAGGCUAUCGGCAACGCUAGUCCCAGAUAGAUGAUUACCCAUUCACUUUCUAAAGAAAGAAGAAAGAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.......(((.((((((((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((((((((((...))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((..((((((..(((]]]]]...))).))))))........)))......((((((((....)))))))).................(((((((((.(.....)))))).)))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((...((((((((...(((((.(((((((..(((...(((((....))))).)))...)))).))).....((((......(((((..(((((...)))))..))))).(((..((((.....((((((.......))))))..(((((((....))))))).........))))..)))........))))(((((((((((...)))......)))))))).....)))))(((...[[[....)))...]]]....))))))))...........(((.[[[[[[...)))...]]]]]].......))))).....
|
|
ASE_00277
|
[ FASTA input ]
|
UUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCACAUGGUCAGGCUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGGGCAACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACAUACCGCCUAAUACUUUAUGUAUGGCAAGGGUGCAAGGGUGUGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUUGAGAAGUGUUGGCUAGGUAAACCCCGGCUGGGAGCAAGGCUUAGUAGAUUUAUGACCAUUAAAUAAUCUACUUUUAAGCGCCGCUUGAGACUUUGAAGUAAUUCCAGUCCUAGAUAGAUGAUUGCCCAUCUUAUUAAUUAAGGAGAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.......(((.((((((((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((.....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((..((((((.(((.]]]]]...)))..)))))).......)))......(((((.(((....)))))))).................(((((((.....))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.........((((.[[[.....((((((...((((((((((.....))))..)))))).)))))).))))...]]].......(((((((((..((((.....)))))))...[[[[[...))))))........]]]]]..(((((((....)))))))..........(((.[[[[))).....]]]].((((((((..............)))))))).((((((...))))))......(((....)))...((((.((((((((...[[[)))).)))).....))))...........]]]....
|
|
ASE_00279
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGAAACAACGGUGCCGGAUAAUGCCCGGCGGGGGUGACCCCAGGGAAAGUGCCACACAGAGAGCAGACCGCCCCGGCGCAAGCCAAGGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGGCGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGGGCGGCGUGAGGUUUCGGCCUCAGGGCACGUUUCGGCCCGUCGCCCGGGUUGGUUGCUUGAGCCGUUCCGCAAGGAUCGGCCUAGAGGAAUGGUCGCCUAUCCCCGCUUGGGGUGGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((..............((((((((((....)))).))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.((((((....))))))(((((.]]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[...))).........]]].(((((((....(((((.((((....)))).(((...(((((.............(((((((.(((....)))..))))...))).....((((((.......))))))..(((.(((....))).)))))))).......))).))))).....((((......(((((((.((((((....))))))((((........)))))))))))..........(((..((((.(((....))).))))...)))....))))..(((((((.....))))))).....)))))))...
|
|
ASE_00280
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUGCGGGCUCCACGGAAGCAUGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGACAGCGCCACAGAGAACAGACCGCCCGCCUACGCGCUAACGCGCUUUAAGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUUCUCGGCAACGAGAGCGGCACGGCAAGCCCCGCCAGGAGCAAGACCAAAUAGGGACGGCGCUAUGGGCUGCUUCAGGCUCGCCGUCCGGGUAGGUCGCGCGAGGCGUCCGGCGACGGACGUCCCAGAGGAAUGGUCAUCCAGUCCGCAAGGAUGGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((....)))).)..))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.....(((((.]]]]))))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))......]]]]...(((((((...)))))))((((....)))).(((.....(((..............((((((....((((....)))).....))))))....(((...(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).))))))....)))......(((............[[[[[[[)))..(((((......)))))]]]]]]]...............((((((((....))))))))(((..[[[.)))...]]].((((....[[[[))))...]]]]......
|
|
ASE_00281
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCCCCACAGAGCAGGAUGCCGGCUAACGGCCGGGCGCCGCGAGGCGACAGACAGUGCAACAGAAAACAUACCGCCGAUGGCUCCGCAAGGAGAUCAGGCAAGGGCGAACCGGUGGAGUAAGAGCCCACCGCGGACGUGGCAACACGGACGGCACGGCAAACCUCAUCCGGGGCAAGGCCAAAUAGGGGAGCAUUGACGUGGCUCGCGUCGCUCCCGGGUAGGCUGCUAGAGGCCGUCGGCAACGGCGGUCCCAGAUGAAUGACUGUCCACGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....)))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((.((((......(((.....((((((...)))))).((((....))))........)))...............(((..(((((((....)))).))))))..))))....((((((.........)))))))))))(((....)))....(((.(((......(((((.(((((..((((...(((((((((...((((((...))))))))))))..........)))..))))((((....)))).))))).)))))....(((((...)))))...))))))..
|
|
ASE_00282
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAUAACCACGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGUCGCGCCUCGGGACUGCGCUAUUGCGUGCGAUAGGGGAAGCCAGACAAGCGCGGCAAGGGACAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCUAUGGCCGUCGUCCGUUUACGGAUACGUGGCCAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCGAUGGGUAACCGGAGCGGCAUGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGGACGGCGCGGACUCGCAAGGGUUCAGGGCGUGGUUGUCGCCCAGUCGUCCGGGUUGGUUGCUAGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCGUAGAGGAAUGGUCGCCCAUCUGCUGAAAGGCAGUGGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((....[[[[.((((((((((.....)))))((((((((((((((((((((((.............)))).))))))))..))))))))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((....))))).)))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((....)))))).((((((.]]]])))))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[...))).........]]].(((((((..((((((((((((....(((...((((.....((((((((...................)))).))))....))))......)))....)))))))..((((((..(((((....)))))...)))))).....)))))....((((((.......)))))).(((((((((..((((.((((((......(((((...(((........))).....(((((((..((((((....)))))).(((((.......))))).)))))))))))).))))))...((((((((....)))))))).........))))..))))))((((....)))))))......)))))))...
|
|
ASE_00283
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAAACGACGGUGCCGGAUAAUGUCCGGCGAGGGUGACCUUAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGUCCUUUAAGGGACACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGACCGGUAACGGAAGCGGCAAGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGACCGAAUAGGGACUGCGCGCCCGCAAGGGCAGGCCUGUUUCGGGCCGGCAGUCCGGGUUGGUCGCUUGAGCGCGCCCGGCAACGGGCCGCCUAGAGGAAUGGCUGCCGGUGCGGAUACGGUCGACUUGUGCGAUACCGUCCGCGCCACAGAACCCGGCUAA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((....)))).(((((.]]]]))))).))))))).....))))......(((.(((((....)))))))).................(((((((..(((((((.......)))..)))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[[[..)))...............]]]]]].......(((((((....)))).(((.....((((....((((.....(((....(((((....)))))...)))..(((((....((((((.......)))))).(((..(((....)))..))).............))))).......((((((....(((((((..((((....)))).((((((...)))))).)))))))...))))))))))..(((.(((((....)))))))).........))))....(((((((((...((((.......))))...)))))))))......))).)))..
|
|
ASE_00284
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAACGCGGUGCCGGGUAACACCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGACAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCGAUCGGCGUUUCGACGUCGAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCGACGGGUAACCGAAGCGGCAUGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGGGCGGCACGAGCCUCGUGCGCAAGCAUGGAGUUCCGGGCAGGAACCGGCCCAGCCGCCCGGGUUGGUUGCUUGAGGCGUCCGGUGACGGGCGUCCUAGAGGAAUGAUCGUCGCCGGCUUUCGGGCCGGGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..(((((((((((....))))))))))).((((..]]]]]])))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.(((((((((.(((........(((((((...)))))))((((....)))).(((....(((((..........((((((....)))((((((....))))))...))).....((((((.......))))))......(((....)))........)))))...))).))))))))..(((.......(((((((..((((..(((((....)))))..)))).((((........)))).))))))).(((((....(((.(((((((((....)))))).))).)))...)))))))).)))))))))((((((((......)))))))).
|
|
ASE_00285
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGAAACAAGGGUGGCGGGUAACGCCCGCCGGCGUUCCUUCGGGGGCGCAAGGGAAAGUGCCACAGAGAGUAUACCGCCGAUGAUCCCGGACUUGAUCCGGGAACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGGGCGCACCGGGGGGCUGGCAACAGCCACCGCAUGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCGAAUAGGGGCCGCGUGCCCAUCAGCAAUGGUGGGUAGGGGAGUUUCGCCCCGAGCGGCCCGGGUUGGCUGCUAAAGCGCCGGAGCAAUCCGGCGACCAGAUGAAUGGCUGCCACCGCAGGCCCGUCCCGCAAGGGAUACCGCCUGAGGAGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((....)))))))).)((...(((((............(((((..((((((((((.....)))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((((((....)))))))))((((.]]]]]]))))..))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((((((....)))))).)).))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
........((((((.(((..........[[[(((((((...))))))).(((((((....)))))))...)))....]]]........(((...[[[.))).(((((((.....)))))))...]]]...(((.....((((((.......))))))[[[[(((((....))))))))..........]]]].))))))...(((((......(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..)))))))((((((((.((((...(((((((....)))))))..........)))).)))....(((((..(((((....)))))...))))).........)))))))))).
|
|
ASE_00286
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCACAGGGCAGGAUGCGGCUAACGGCCGGCGCCGUGAGGCGACGGAAAGUGCAACAGAAAGAUACCGCCGAUGGCCCGCGAGGGCUCAGGCAAGGGUGAAAUGGUACGGUAAGAGCGCACCGCUCCAGCGGCAACGUCUGGAGUCGGCAAACCCCAUCCGGUGCAAGACCAAAUAGGGGAGCGUUGGCGUGGCCCGCGUCGCUCCCGGGAUGGUUGCUAGAGGCUGCGGGCAACCGCGGUCCCAGAGGAAUGGCUGUCACGGCGUGAAAGCGCCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.(((((((((.....))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((((....)))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).)))))).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..[[[[....))))......(((((...))))).((((....)))).......]]]]..........(((((((...(((((....)))))..)))...[[[[.........))))......]]]].((((((.........))))))..(((((...(((((((((.....)))......(((((((...(((((...)))))))))))).)))))))))))...((((((((....))))))))(((.[[[..)))(((((..(((((....)))))))))).......]]].
|
|
ASE_00287
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAACGCGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCGAUGGCUCCGAAAGGACCACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCAGCGGGCAACCGAAGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGCACGCGAUGGGCUUAGGCCCGGGGCAGGAACCGGCCCUUUUCGCGUGCGGGUUGGUUGGUUGAGGCCGUCGGCAACGCCGGUGGUAGAGGAAUGAUCGUCACUGUCCUUCGGGGCAGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....)))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((.((((....))))((((((.]]]]]))))))..)))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((((.(((........(((((((...)))))))((((....)))).(((....((((..............(((..(((.(((....))))))..)))....(((....((((((.......)))))).(((..(((....)))..))).)))))))...))).))))))))..((((((....((((((((.((((....))))(((((........)))))..))))))))[[[[[..))))))...(((..((((...))))..)))................((((((....)))))).....]]]]]......
|
|
ASE_00288
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCAGGAUACUUCUUAACGAGAAGCAGUUCGCGAGGGCUGAGUAGUGUAACAGAAAAUAACCGCCACACUUCGGUUUGGUAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCUACCGUAGCGGCCGUAAUUCCGCUAGCCGUACGCCUUAUGGGUUGUAAGAUCAUGUACACCGACGCAUGUAGAGUGACUCGCUCGAUGUCGGGGGGUAGAUCGCUAGAGUUGCGUAGUGAUACGUAAUCGAGAUAAAUGGCAGACGUUGUGCUUGCACAAUACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..))))))))))))))))...((((.......((((((....((((((.]]]]))))))))))))......))))......((((((((....)))))))).................((((((....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.....[[[[......)))).((((((...))))))((((((....))))))....]]]]..............(((..[[[..)))..]]].((((((....((((((.......)))))).((((((........))))))......)))))).(((..........[[[[[...)))..]]]]]..(((...[[[[))).....]]]]((((.....((((..((((((((....)))))))).........))))....((((((....)))))).....))))......
|
|
ASE_00289
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGAGUAAGCGAGCAGUUGCGAAAUUAGUCUUAAAGUAUAAUGAAAAUUUGCUUUAAGUACGGAUUUUGAGGAAAGUCCGGGCUUCCAAGAAGAUCAGGCUGCUGGAUAACGCCCAGUGCGAGCAAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAGAUACCGCCUAACUUCGGUUAGGUAAGGGUGCAAAGGUGUGUUAAGAGCGCACCAGCAGGGUCGUGAGGCUCUGGCUCGGUAAACCCCAGUCGGAAGCAAGGCGAGAGGAAAUAAGCGUUGCGAUCUUCAAUAGACCUUAUUUCCGUGACUUAACUGCGUUUAGUGCGCGAAAGCGUGGCAAGCGUAGUUAAGUGUGUGCCGCAAGAGGUAUUUGGUAACAAAUAUCCCAGAUAGAUAACCGCUAGGGCAGUUGUUAUCAACUCCCAAAACAGAACCCGGCUUAUGUCUUACUCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((....)))))))))))).))))))))))....[[[.[[[[[(((((..{{{{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((....((((((((..((((.}}}}}}}...)))).))))))))...((((((((((((((..(((((....)))))..))))))))))))))....)))......((((((((....))))))))..........)))))))((((.(((((....)))))))))........]]]]]]]].)).)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..(((((((.(((((((...(((((((((.(((....))))))))))))....))))))).(((...)))[[[[..............))))))).......]]]]..(((((....)))))......(((((.........[[[[(((((((....)))))))...)))))...(((((((.....)))))))..(((((((....)))))))....]]]]......((((((.(((..((((...(((((((((.(((.............))))))))))))...((((((((((((((..(((((....)))))..))))))))))))))...))))......((((((((....))))))))..............))).(((.(((((....))))))))..........)))))).....))))))))))).
|
|
ASE_00291
|
[ FASTA input ]
|
AAAGUUUAUUGGAUGUCUGAUUAUAAUAUAUAAUAGGAAAGUCUGGACUCAUUUAAAAAGUGCAGGAUAAAUUCCUGCAGAGAAAACUCUAGGGAAAGUGUUAAAGAAAUAUAAAAACUCUUUUUUAAUAUUAGAGUUUUUUGAAAAAGAUAUAAUCUAAUAAUUUAAAAAAAAAUUAUUAAAGAAACCCCACUUUGAGCAAAACCAUUAGGUUGCUAAAAACAAAUACGUAAGAGAUUGUUUCAGAGAAAUAGACAUACAUAAAAAUUUUUUUAAAUUUUUAGGACAAAAUCCAGCUUAUAAAUAAACUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((...))))))....[[[.[[[[[((((......((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((..............((((((((...........)))))))).......((((...))))((((((((......))))))))......)))))))))))))...((((....))))......(((((............)))))..........)))))))(.(((((((((....))))))))).)......]]]]]]]].).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((.((((((...))))))......(((((..(((..........(((((((.....))))))).((((((((((((......((((((((((............)))))))))))))))))))))).........(((((((((((((((......)))))))).............(((.((((..(((....))))))).))).............)))))))....)))...))))).....(((((((((....)))))))))))))...))))........))))))))))
|
|
ASE_00292
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGACCGGAUGACCGCGGCGGCCCAUAGCUCCGUUUUUCGGAUAGCUGGGCCUCCGAGGAAAGUCCGGACUCCAUGAAGCAACGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCAACCCCAGGGAAAGCGCCACAGAGAACAGACCGCCCCGCUUGCGGGGUGAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCGGGACUGGCAACAGGACCGGCACGGCAAGCCCCACCGGGAGCAACGCCGAAUAGGGAUGCCGCGCCGCAACCGGAAACGGGGGACGGCAGGGGAGCUUCGCCCCGAGGUGUCCGGGUUGGCGGCUUGAGGCUGCGGGUGACCGCAGACCCAGAGGAAUGGUCAUCCAGGGGGCAACCCCGGACAAAAUCCGGCUUACAGGUCUUCCGCGCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))....[[[.[[[[[((((..{{{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((((((....))))).))))).((((.}}}}}}))))..))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((....))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.....(((.((((((..((((((.....)))..))))))))).)))......))))....(((..........[[[(((((((...)))))))((((....))))..)))....]]].............(((((((....))))))).((((....(((((((((....(((.....(((..(((....)))..)))....)))..))))))))).((((..((((((....(((((((..((((...(((....)))....)))).((((.......))))..)))))))...))))))))))....((((((....))))))))))...(((..[[[[.))).((((....))))(((.....)))]]]]....))))))))))....
|
|
ASE_00294
|
[ FASTA input ]
|
UCAGUCGGCCGGACGGCCGCUCCGGCAAGUGCCGAAAGGCCGCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUCGACAUACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAACGAACCGCCCGCCUUCGCAGCUUCGCUGCUUCGGCGCGGCAAGCCCUCGGGCUCGCUGCGCCAUAACCCGCAAGGGUGAAGGCGAGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCGCCGGCAACGGGGACGGCAUGGUAAACCCCACCGGGAGCAAAACCGAAUAGGGACGGCAUCGCGGAUAGUUCGCUGCUCGCAGCGAUAACUCCGCAGGGCGAUGUCAGGCUCGCCGUCCGGGUAGGUUGCUCGAGGCGCUGUGCAAACAGUGUCCCAGAGGAAUGGCCGUCGCGCAUCGCCUCCGCAAGGAAGCGGUGCCCUCACAGAACCCGGCUUACAGGCCGGCUGA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((..(.(((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((...)))))((((((((((((((((....))))))))))))))))((((....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...(((((..((((((((....)))))..)))))))).((((.}}}}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((....)))))))))))..))......]]]]]]]].).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((....(((((((....(((....))).))))))).(((..[[[[[[..)))((((.....)))).]]]]]]..)))))(((((((....)))).[[[.....)))...............]]]........(((.[[[[.)))..((((((((.((((....)))).))))))))...((((....))))....]]]].....((((....((((((.......)))))).((((.(((....))).)))).............))))..(((((..(((......(((((((...(((((....((((((....))))))....))))).((((........))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))...((((...[[[[[....(((((((.(((....))).)))))))))))........]]]]]....))))))))))
|
|
ASE_00295
|
[ FASTA input ]
|
CUAAAUGGUCGUGCAGUUGCGUGAUGAUAAUCACGAGGAAAGUCCGGACUCUAUAGAGGUAUGGUGCCGGUUAACAUCCGGCAGAGUAUUAUUACUUUAGGGCUAGUACCACAGAAAAUAUACCGCCGAGUAUUUCGGUAAGGGUGAAAAGGUGUGGUAAGAGCACACCGGUAAGUUGGCAACAAGUUACGCAUGGUUAACCCCACCAAGAGCAAGAUCAAAUAGGCAUUACAGAAUUUAAAUAUUUAUUUAAGUUCCUGGGUUACCUCUAAUCGGAUUGUAAUGCGGGUAGAUCGCUUGAGGUAAACGGUAACGUUUAUCCUAGAUAAAUAACUGCAAUGAAUUAAUAUUCAUACAGAAUCCGGCUUAUAGACCAGAUGAGCAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((....))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((((....)))))).)((...(((((............((((((((...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((((((((((((....))))))))))(((((.]]]]]]].)))))..)))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((....))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.........((((((....))))))........(((((.....((((((((((((((((((((((...(((.((((((....))))))...(((..(((((((.......((((((((((...))))))...))))......)))))))..)))...)))((((.(((....))).)))).....)))))))......................)))))))..((((((((((....))))))))))......)))))))).......((((.(((((....(((.....(((((((((....)))))).))).)))......))))).(((((....)))))))))...)))))......))))).........
|
|
ASE_00296
|
[ FASTA input ]
|
CCAGUCGGCCGGAUGGCCGCUCUCCGUCAUCGUCCCCGGGCCACCCCCGAUGGACCGUCGGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGGAACACGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCGACCCUAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAAACCGCCGGCCUAUACGGCCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCCUGCCCGGCAACGGGGAGGGCAUGGUAAACCCCACCGGGAGCAAGAUCGAAUAGGGACGGCACGCCCCGGUUUUCCGGGGCAAGCGGCGUUUCCGCGCCGCCGUCCGGGUAGUAUCGCGCGAGGCGUCCGGUAACGGGCGUCCCAGAUGAAUGGCCAUCCCCGUCGUCGCGUCCCUUGCGGGAUACGGCCGGCGUGGACAGAACCCGGCUUACAGGCCGUCUGGCGGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((..((((((((((((.....))))).))))))))))))))....{{{.{{{{{((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((.....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..(((((((....)))))))..((((.]]]]))))...))))))).....).)))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((((((((....))))))))).))))).))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((((((((((.....(((((((((((((.(((((((((...)))))))))..(((...))).)))))...........[[[(((((((...))))))))))))))).............]]]...))))))..((((((((((.....)))))))..[[[[.....((((((.......))))))((((.((((....))))..))))..)))..]]]]..(((((...............(((((((..(((((((....)))))))....(((((....)))))))))))).(((.(((((.(((((((((((((....)))))).....(((((.(((......)))))))).....))))))).))))).))).............)))))......)))))))))))...
|
|
ASE_00297
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCCAGCUAACGGCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAUAGUGCAACAGAGAGCAGACCGCCGCUUCGCUGCUCCGGCAGCGGGCGGUAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGUGCCCCUGGAGACAGGGGGAGCUAGGUAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCUACGUGAGGGCAUGCCCUCGCGCACCCCAGGGAGAGCUUGCCCGGCUCGCUUACCUGGAGGGAUUGGCCGCUCGAGGUCGCUGGCGACAGCGAUCCCAGAUAGAUGACCGUGGAAACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((....(((((............((((((((.(((((.....))))).))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((..((((((((....))))))))...((((((..(((((.]]]]))))).....))))))......))))......((((((((....))))))))..........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....(((.[[[...)))..]]].((((.((((..........(((........)))....((((((.((((((....))))))))))))..)))).....[[[[[[[[....))))((((((.((((((....))))))..))).)))..]]]]]]]]........((((..((((((((....))))))))....(((((..(((((.....))))).....))))).......))))..(((.((((((((....))))))))[[[......)))...]]].................
|
|
ASE_00298
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGGGCAGGAUGCCAGCUAACGGCUGGUCGGCGAGUCGAGCACCCGCACGCGCGCCUUGGCGUGUAGGAAGCGGCGAAGCCGAAGGAAAGUGCCACAGAAACCAGACCGCCAUUCCCGGACAGCCCCGGCGCGGGCGGGAGUGGUCAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGGCUCCCCGGAGACGGCGAGCGCUGGUAAACCCCAUCCGGUGCAAGACCCGACAGUGCGGUAUGGAACGGCCCGUUCCUUUGACCGCCAGGAUGGUCGCUAGAGGCGCGCGGCGACGUGCGUCCCAGAGAGAUGACCGUGACCCCACGCGAGUGGGCCACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((...(((.....((((.(((((((....)))))))....))))))).)))).)((...(((((............((((((((((((......((((...))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)))))..)))))))))))))...((((.......(((((..(((((.]]]])))))....)))))......))))......((((((((....)))))))).................(((((((....))))))).....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...))).(((((.(((.[[[....)))..]]]..(((((..[[[[[.))))).....((((..((((((....)))))).....))))....]]]]]......)))))..........((((((.....(((....[[[[)))...]]]]....)))))).((((.....((((((.......))))))..((((.(((....))).))))[[[[[...))))...]]]]].......(((.[[[..)))...((((((...)))))).]]]...(((.(((((((((.....((((((((....)))))))).........)))))(((..(((((....))))).)))...)))))))...
|
|
ASE_00299
|
[ FASTA input ]
|
UAGGGGAGCCUAACAGGGGGUUACGGGAAUAUCCUGAGGAAACUCCAGCCUCCAAGCCUCAUGGGAGCAGUUAGAUCUGCAGGGUUAGUGCUCUGGCUACUGCACAGAAACGUAACCGGUAUAAUAGGAUAUGAAAAUGAGUUUAUAUGUAGUCUAGGUAACUAGGCUACAUAAAUGAGACCUAUUAUACCGGCUGAAACGGCAGUCCUCCCAGGAGCAAGUAAGGAGGGGAUGAGUUGAGGUUCAACCCUCCUAAGGACGCUUAGUAGAAUCCCCCUAAAUACAAAAGCUGGGUUAUUGUUAGGCUCCCCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((...(((((...)))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[.((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............(((((((((((...............((..((((((((((((....)))))))))))))).......)))))))))))........)))).)))))))))))...((.(((((((...(((..]]]]]]))))))))))....))............))))))..........}}}}}}}}...)))))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((((((((((..((((...))))(((....))).))))))).((((........((((......)))).......[[[[...))))...]]]]............(((((((((((.(((....)))..((((((((((((((((....)))))))))))..))))).))))))))))).((((...)))).((((.[[[[[.........(((((((..((((......)))).)))))))..)))).....(((.............))).....]]]]]....))))))))))))))...
|
|
ASE_00303
|
[ FASTA input ]
|
GUGGAACAGUGGUAAUUCCUACGAUUAAGAAACCUGUUUACAGAAGGAUCCCCACCUAUGGGCGGGUUAUCAGAUAUUAUCAGGUGGGAAAUUCGGUGGAACACAGUGGAGCCUUGUCCUCCGGGUUAAUGUCGCUUUUGGCAUUGACCCCUGCUCCUGAGAGAAGAAAUAUACUGGGGAACCAGUCUUUACCGACCGUUGUUAUCAGAAAUUCACGGAGUUCGGCCUAGGUCGGACUCCGAUGGGAACGGCAACGGUUGUUCCGUUUGACUUGUCGCCCGCUACGGCGUGAGCGUCAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACGUCAUUUGUGGCGAACCCGAUACCGAUUACUGCUGCUGUUCCAGC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((..((((((.........(((((..........((((((((....)))..)))))............))))).............((((.....(((((..........((((((((((((....)))))))))))).............(((......(((((....))))))))........((((((............(((((((((((....)))))))))))........))))))....)))))))))((((((.(((.(((......))).))).))).)))..............))))))(((((....))))).................)))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((..((((((((((....((((((((((..........[[[[[[[.)))))))))).............]]]]]]].........(((.......[[[[[.......)))((((((((((((....))))))))))))..]]]]].....(((((......((((....)))))))))..(((((((((((.[[[[[..(((((((((((((((....))))))))))).))))...))))))))))).....]]]]]((((.(((.(((....)))...))).)))).............))))))))))(((((....))))).................)))))))))))))..
|
|
ASE_00305
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCGGUAGUGUUUGUGCUAGGUGAAUCAAUAAGCCUAGGGACAUCUUUUUGAUGUUACGGCGGGCAAAAAGGCUAAGUCUUUACGGAUAUGUCUGAAUAGCCCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGUUCUUGGGGAAACCUAAGAAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUAGGGGCAUGGGAUAGUUGGAAUCCGAACAAUCUAUCCUGACUGGAAACAGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAGAUAAGACCUAGUUAUCUCUGGAACAAAACACGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((.....)))))).)((.((((.....(((...(((....)))....)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))((((....))))..................(((((((((.....))))))))).........))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..((((((((((((......)))))).....(((..[[[[[[....)))...]]]]]].((((((.....)))))).....((((..((((((...)))))).((((....))))....))))........((((.....[[[..((((((((....))))))))))))...]]].............))))))..(((...[[[[[[[[[)))...((((((((((.........))).))))))).((((....))))..........]]]]]]]]](((((((.......)))))))....................
|
|
ASE_00313
|
[ FASTA input ]
|
AGUUGGAACAGCGACGACUCCUACGACUUAGAGACCUGUUUACACAAGGAGGGUACCCUCCCUCAACCAACAGGUGGGAAAUUCGGUGAAACACAGUGGAAUCAUUCCUUCCAGCCUGGGCUCGCUUCCUUCGGGAAGCUAGGCUCAGGUCUUUCCGUGAGGACAGCCUAGCCGGGGACCGGUCUGCCUGGACGUUGUUAUCAGAAAUUCACACGGGUAACCGUGAUGGGAAAGCAACGAGUGUUUUAUUUGACGGGCUUCUGUUUACACAGUGGUCCAGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACAUGCCCUAGGGCUUGAACCCGAUACCGAUUACCGUCCUUGUCCCAACCCUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((((((..(((((((........(((((.........(((((....))))).........)))))....[[[.[[[[[........((((((............................................(((.((((((....))))))))).(((((...))))).........(((((((............(((((....))))).......)))))))...))))))...(((((((((((((....)))))))))).))).............)))))))((((((....)))))).......]]]]]]]]..)))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.(((((...........(((...[[[....)))(((((((.......(((((....))))).......))))))).......]]](((...)))..(((((.......)))))(((((((((.((((((....))))))..)))))))))...(((....)))...(((.[[[[)))..]]]]....(((..[[[[[[[..)))....((((((((....))))).)))...]]]]]]]............((((((((.((((.[[[)))).))))).)))......]]].(((((.[[[[[..(((....))).............)))))...]]]]]....)))))....
|
|
ASE_00316
|
[ FASTA input ]
|
ACUAAACAGUGAUGAUUCCUACGUUUUAAGAACCUGUUUACAGAAGGAGGAUAACACUUUAGUGCUUUUCUCAUAUAAGUUCAGGUGGGAAAUUCGGUGAAACACAGCGGAACCAACAACAUCUACCAAGGUGUCGUUGCCCUCCCCAAGCCUAGACGGUGUCUUCUUCUAGGAGGAGCUUAAGUCCAGGUCCUUCCCGUGAGGGCAGUUUUCUUUGCAAUUUUAAAUUUUACUGGGGAACCGGUCUGCCUAAAAAUUGCCAUUGAAGAAUUUAUUGGGACGUCGUUAGCAGAAAUUCACAGAGACCUCUUUCAAAGAAAUUGGUCCCUGAUGGGAACAGCGACGGUAGUUCCAUUUGACUUGUGGUGUGAAAUAAUAUCGACCAUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACAGAUUUGAUUUGAAAAUCUGAACCCGAUACCGAUUACCAUUGUUGUUUAGUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((..(((((((........(((((..........(((((((((((....))))))))))).........)))))....[[[.[[[[[........((((((...............................................................................((((((....)))))).......................(((((....)))))...................................(((((((...............(((((((((((...)))))))))))...........)))))))...))))))...((((((((((..............))))))).))).............)))))))(((((((((...))))))))).......]]]]]]]]..)))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.......(((((((..(((((..(((......((((((((((...(((....)))...)))))......(((.((((((((..(((((((...)))..))))..((((.((((((....)))))).))))...))))...)))).))).....)))))......)))..)))))((((........(((....)))((((.((((((((((((((.......(((((....))))).......))))))))....))))))...))))))))....((((((((...((((((.((((..((((...))))..)))).)))...(((((..........)))))...)))((((((((.(((.......))))))))))).)))))))).......)))))))(((((((.......))))))).....(((....))).......))))))))).
|
|
ASE_00318
|
[ FASTA input ]
|
UGAUAUUUCGGGUAAUCGCUAUAGCAAUAUAGAGGAAAGUCCAUGCUCACACAAUCUGAGAUGAUUGUAGUGUUCGUGCUUGAUGAAACAAUAAAUCAAGGCAUUAAUUUGACGGCAAUGAAAUAACCUAAGUCAUUGGAUAUGGUUAGAAUAGUUUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGCUUUUAUAGAAAUAUAAAAGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGUGAGCAAUCCAAAUUGGGUAGGAGCACUUGUUUAGCGGAAUUCAACGUAUAGACGAGACGAUUUUUACGCGAAAGUAAAAAUAUGUAGACAGAUGGUUACCACCGACGUACCAGUGUAACUAGUACACAUUAUGAGUACAACGGAACAGAACAUGGCUUACAGAAAUAUCAUCACUAGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.(((((....)))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((......)).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((.................)))))))((((((((((((....))))))))).)))........))))))).((((((((((((((((.....))))))).....))))))))).......]]]]]]]].).)))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((......(((((....))))).......)))...((((.[[[[[[))))..]]]]]]....(((...[[[[[[))).......]]]]]]...............((((((..[[[[[....)))))).....]]]]]................((((.[[[......((((((((....))))))))))))..]]].......(((............[[[.....)))..]]]...(((((((((((........))).))))))))(((((((((((......)))))))).))).......(((((((..[[[..........)))))))((((.........))))..]]]..................)))))))))........
|
|
ASE_00321
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCGCACAGGCUGUGAUGCCUGUAGUGUUCGUGCUUAGCGAAACAAUAAGCUAAGGUGCUCUAUUAGAGUAACGGCAGGAAAACAAGCUAAGGUUUUUAACUAUGCUUAAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGCGGAUAGGGAAACUUAUUCGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGCGAGCAACCCAAACAAUGGUAGGGGCGCUUUUUGUUGGGAAUUAAGAACGAGACAAAAAGGCAGGUUAACUGCAGAUAGAUGGUUACCACAUUGCUUUUUCUCCCUGGAAAGUAGUGUACAGAACACGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((...)))))).)((.((((.....(((...(((.....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((...................)))))))((((.....))))...............((((((((((((......))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...))).....(((((((((......)))))).)))(((...[[[[[[))).......]]]]]].((((((...))))))..(((..[[[[[[..)))...]]]]]].(((....(((((....))))).....[[[[))).......((((((((....))))))))]]]]..(((......[[[[[...)))....(((........)))]]]]]..(((((((((...[[[[[.......)))))))))((((.....)))).......]]]]]...((((((((((((......))))))))))))................
|
|
ASE_00322
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUCUGUCCUGUUCUGGUAUCCUACGGGAUAGUCCAGGACUAUUGGAUUUAAUUCCAAAUGCUCCUGAGAGCUCCAUAGAGCGGAAGCUCUGGACGAAGCCAUCAGAAAAAUCGCUUACUUGUGAAGUGAUGGGCCACUCUACUUCGGAGUGGCUCAAUGGAAGCGGCUUCGUGGACAGUUGGCUUAGGCCGCCCUCAGGGGCGGUUUGAGCUGUUAAGUGCAAUACACAGACAUUGUGCA |
|
[ reference structure ]
|
..........((((((..............................................((((....)))).....(((((....)))))...(((((((.............................(((((((((((.....)))))))))))........))))))).))))))...(((((((((((((....)))))))))))))....................((...))..
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.(((..........(((....))).....(((((((((((.....))))))))))).)))....))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))).
|
|
ASE_00327
|
[ FASTA input ]
|
UUAGAGCAGUAGCAACUCCUACGAUUUUAACCUGCUUACGAACUAUUAGUCUGAUCUAAUAAUACAUGCAGGUGGGAAAUUCGGUGAAACACAACAAAUGAGGUUUCAGUUAUUUGGGCUCGUGAGAGCAGCCUGGGGAACCUGGUUAUAAUAGCGGCGCUAUCAGAAAUUCAACGCUAUCAAAUUUUGAUGGUGAUGGGAACGGCGCUAGCAACAAACAUAUUUUAUGUACCUCACGUGUUUGACUUAAUCAUUUACUGGUUAAAGUCUGUUCAGUGCAAUCGUAGGACUUCUAAGCAAUUAGUUGCACCCGAUACCGAUCAAUGGUACUGUUCUAAU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((..(((((((......(((((.........((((((......)))))).......)))))....[[[.[[[[[............((((((.............((((....))))(((((((....))))))).......(((((((.............(((((((((...)))))))))........)))))))....................)))))).......((((((((((.....))))))).))).............)))))))(((((((....))))))).......]]]]]]]]..)))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((((((.(((((........((((((......))))))......)))))))).........((((....((((..((((((....((((((...((((....))))((((.(((...)))))))..))))))((((((........((((.(((((((((...))))))))).))))...))))))........(((((...)))))))))))..)))).((((((((((.....))))).)))))..))))....))))))))))....(((....))))))))....(((....))).....))))))))))).
|
|
ASE_00328
|
[ FASTA input ]
|
ACGUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCAUGAAAAGUUAUUUUUUAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCGGUAGUGUUUGUGCUAGGCGAAACAAUAAGCCUAGGGACGGAUUAUUUCGUUACGGCGGAUGAAACAGCUAAGUCUCUUGAUAUGCUGGAGUAGGCCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGUUUUUGUGGAAACACAAAAAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUCGGGGCAUGGAAUGCGUGGAAACGAACAUUGCAUUCUGACUGGAAACAGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAAAUGGUACCUAGUCAUUUCUGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((((...)))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((....))))........)))))))...(((((((((.....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((((((.....(((((((((...)))))))))......)))).(((((((((((((......)))))).....((((.[[[[[[...))))...]]]]]].((((((....))))))..(((........((((...(((....)))..))))......)))........((((.....[[[..((((((((....))))))))))))...]]].............))))))).(((........[[[)))...(((((((((.............)))))))))((((....)))).]]]..(((.........((((((((.......)))))))).........)))........))))))))))).
|
|
ASE_00329
|
[ FASTA input ]
|
CCAUGCUGGACGUACGGGCGAACGCCGCACUUCCUCAAAUUCAAACGCGUUGAAAAGCGCACAGCUCGUUGAGGGGGUAAGGUCGGAGAAACAUCUUCGUUGCGUGCUCGUGAGGAGCGAAGAACGAACGUUCUGCCGAAUGUACCAGAAAUUCAAUCAGUAUGGCCUCGUUUGUCGUACCUGAUUUUGAAACGCAUUCGAGAAGAUUUAUUUUAGUGCAAUGUGUGGCACCUGUUUGUCAGGUAACUCGAUUCCGACUAAUCUUGUCUGUAUGUCUGGUGUGGUU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((((((((((..((((((..(((((..........(((((....)))))..........))))).............((((.(((((......................(((........)))...((((((............(((((((((((.......)))))).)))))........))))))..))))))))).............))))))(((((.....)))))...................)))))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((..(((((((.(((((((........(((((....)))))........)))))))((((...((((((((.....((((((...(((((.....)))))...))))))..)))).))))...)))).....(((((((((((((((.......)))))).))))..)))))..(((((..((((......)))))))))...)))))))(((((.....)))))...(((....)))......)))))))))))))))))))))..
|
|
ASE_00330
|
[ FASTA input ]
|
CCGGAACAGUGGCAUUCCUACUACAAACCUGUUUGCACAAGGAGCGGUCGGCGUCAGUCGCACCCUGCUCAGAAAUACAGGUGGGAAAUUCGGUGAAACGCGGCGGAGCAACUAUUUCCGAGGGCCGUUCUCGGUCCUGAUUUCCGUGAGGAAAGCGUUUGGAAUUUAAACGCUUGGACGUUGUCAUCAGAAAUACACCAGUCUCUUGGCUGGAUGGGAAGGCAGCGGAUGCUCCGUUUGACUGUGUUUAGCUUCGGCGACACAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACACUUCUUAUGAGGUGAACCCGAUACCGAUUAUUGCCGGUGUUUCGUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((..(((((((....(((((...........((((((((((....))))))))))...........)))))....[[[.[[[[[.........((((((..............................(((((....)))))(((((((.....))))))).....(((((((............((((((....)))))).......)))))))..))))))....(((((((((..((....)))))))).))).............)))))))((((((....)))))).......]]]]]]]]...))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.(((((((((((((.((((....))))......((((((.((((....))))....)))))).........))))))))..((((((...((((((((((((......(((((((((((....))))))...(((((....)))))...................)))))(((((((.(((........((((((....)))))).)))...)))))))..)))))))))...(((((((..........))))))).........)))...(((.....((((((....))))))....)))))))))....))))).)))))))..
|
|
ASE_00332
|
[ FASTA input ]
|
CGAGCCGGGCGGGCGGCCGCGUGGAGUCCCUCACGGGACUUCCCGAGGAACGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGAUGGCUAACGGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAAAGCAGACCGCCGGAGGCUUCGGCCCCCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGUGCCCAGGGCGACCUGGGCAGCUAGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGGUCAAGAAGGAAGCGCCCCGGUGCUUCCUGCGCGGACGUUCGAGGGCUGCCCGCCCGAGUCCGCGGGUAGACCGCUGGAGGCCGGUGGCAACGCCGGUCCUAGAUGGAUGGCCGUCGCCGACGGGACCCGCGAGGCCCCGUCGGAACAGAACCCGGCGUACAGCCCGACUCGUCUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((....((((((((......))))))))..((((((....((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((.(((....))))))))))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((....((((((((....)))))))).....(((((((((.(((......((((......(((((...)))))..((((....))))........))))......))).(((((((((.(((....))).)))))..(((((....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).............))))).......))))....(((((((((....)))))))))...)))))))))...)))))))))))))....(((((((...(((((((.((((((((....)))))))))))).)))..[[[[[[[[[[[[[[[[)))))))....]]]]]]]].........]]]]]....]]]...........
|
|
ASE_00335
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUGGUAAAUAUUGCAAUUUUAUCAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCAGUAGUGUUUGUGCUAGACAAAAAAAUAAGUCUAGGGAUGUGCUUUGCGCAUUACGGCGGAUAAAAUGGCUAAGUCUUUGAUAGGCCGGAGUAAUUCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGCUUUUAUGGAAACAUAAAAGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUAGGGGCAUGGAAAAGCUGGAAAAAGAACGGUCUUUUCUGACUGCAUAAGCAGUAGACAGAUGAUUAUCAAAAAAGGUGGUACCUAGUCGCCUUUGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.(((((((((((.....)))))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))((((((((...))))))).)((.((((.....(((...(((...)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))(((((....)))))........)))))))...(((((((((.....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((.....(((((((((.........)))))))))......))))........((((((......))))))....(((...[[[[[[.)))......]]]]]].(((((((...)))))))..(((........[[[[[..))).......]]]]].................((((.....[[[..((((((((....))))))))))))...]]].....(((((....[[[[[.(((........)))))))).........]]]]]....((((..[[[[.)))).(((((....)))))]]]].....((((((......))))))..((((..[[[.))))..........]]].....))))))))))).
|
|
ASE_00337
|
[ FASTA input ]
|
CAUGCCGGACGUACGGACAAACGCCGCACUUCCUCAAAUUCAGACGCACUUUUACAAGUGUUACGCGCAUUGAGGGGGUAAGGUCGGAGGAACUUCUUCGUUGCAUGCUCGUGAGGAGCGGAGGACGAAAGUCCUGCCGGGUGUACCAGAAAUUCGAUCUCUUGGUUCGUCCUUUGAGAUCUUGAAACGCACCCGAGAAGAUGUCUUUUAGUGCAAUGUGCGGCACCUGUGAAAAGUCAGGCAACUCGAUUCCGACUAAUCUUGUCUGUAUGUCUGGUAUG |
|
[ reference structure ]
|
.......(((((((((((((..(((((((.(((((..........(((((.....)).)))..........)))))....[[[.[[[[[.....(((((.....((((((.....))))))(((((....)))))..(((((((............(((((..............)))))........))))))).)))))................)))))))(((((........))))).......]]]]]]]]..))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((..(((..((((((((((........((((((....))))))........))))))))))..)))((((((....))))))......((((.....))))..(((((....))))).........((((.......[[[[[[.)))).........]]]]]].......((((...(((((.[[[))))).))))........]]](((......[[[[)))............]]]]....))))))))))))))))))))
|
|
ASE_00338
|
[ FASTA input ]
|
UUGAACAGUGGUGAUUCCUACGAUUAAGAAACCUGUUUGCAAAAGGGCCUGCCCACGCGGGUCAUCUUAUUUAUCAGGUGGGAAAUUCGGUGGAACACAGUGGAGCCUUGCCUUCCGGGCCAUUGUCUCUGGCAGUGGCCCCUGCUCGUGAGAGAAGAAACUUGCUGGGGAACCAGUCUUUACCGACCGUUGCUAUCAGAAAUUGAACGGGGCCCGGUCCCGCCGGGCCUCGAUGGGAACGGCAACGGUUGUUCCGUUUGACUUGUCGCCCGCCACGGCGCGCUGCAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACGCCAUUCGUGGCGAACCCGAUACCGAUUACCACUGCUGUUAAGGGCGAAUUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((..(((((((........(((((..........(((((((....)))))))...........)))))....[[[.[[[[[........((((((...................................((((((....))))))((..(((((((....)))))))))......(((((((.............(((((((((((...)))))))))))........)))))))...))))))...((((((((((((((....))))))))))).))).............)))))))(((((....))))).......]]]]]]]]..))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((((((((((((.(((.[[[[[)))......(((....)))...]]]]](((((..[[[[[[)))))........]]]]]]...(((.[[[[..)))..]]]](((((((((((...)))))))))))...(((....))).............(((....((((.....(((((((((((.((((...)))).(((((((((((...)))))))))))........)))))))))))........)))).[[[[)))....]]]](((((.(((......))))))))))))))))))(((((....)))))............)))))))))).................
|
|
ASE_00339
|
[ FASTA input ]
|
AUGUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUGAGGAGAAUUGUUUCUCAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACAGGCUGUGAUGCCUGUAGUGUUUGUGCUAGGCGAAACCAUAAGCCUAGGGACGAGAAAUCGUUACGGCAGUUGAAAUGGCUAAGUCCUUGGAUAGGCCAGAGUAGGCUUGAAAGUGCCACAGUGACGGAGUCUUUCUGGAAACAGAGAGAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAAUUUUGGUCGGGGCAUGGAGUACGCGGAAACGAACGUAGUAUUCUGACUGCUAUCAGCUAGAGCUGUUAGUGGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAAGUGGUCCUAGUCACUUCUGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUAUAGG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((((.....)))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))((((((....))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((((((((....))))))))))))........)))))))...(((((((((....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((.....(((((((((.....)))))))))......)))).(((....[[[[[[.)))..]]]]]]...((((...[[[[[[.)))).....]]]]]].(((((....))))).............(((((..(((....))).))))).....(((((((.....((((.[[[......((((((((....))))))))))))..]]]..........))))))).....(((........[[[)))...(((((((((((........))).))))))))(((((((.((((....)))).))))))).]]].(((..........[[[[[[[))).....]]]]]]]....................)))))))))))))...
|
|
ASE_00340
|
[ FASTA input ]
|
CACGGAAACCACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGCUUCGGGAAACCGGAGUCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCAAAGGCUUCGGCCCGGCGAAAGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGACGGCAACGGACGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGGUCGAAUAGGGAUGGCAAGAGGUGACUCAGGGCUGGUUUCCGGCCCCGCCGUCCGGGUUGACUGCUUGAGCGUCCGGGCAACCGGCCGCCUAGAGGAAUGAUCGCCCAUCCCCUGUCAAAAGGGGUGG |
|
[ reference structure ]
|
(.[[[[[.[[.((((((((((.....)))))(((((((((....)))))))).)((...(((((............(((((..............))))...).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..))))))))))......((((......((((((...(((....))).((((.]].]]]]]))))..)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((..(........))))))
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((((((...)))))))((((((((....)))))))).(((....((((.............((((...(((....))).))))....(((....((((((.......)))))).((((............)))).)))))))...))))))).(((((..(((((....(((((((..(((....))).(((((((...))))))).)))))))...))))))))))..(((.((((....)))).))).....(((....[[[[[[.)))...........]]]]]]
|
|
ASE_00342
|
[ FASTA input ]
|
CGAGUUGGCCAGACAGUCGCCGCGUUCGCAAGAACGGGGAGGAAAGUCCGGGCUUCAAAGAGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGUGUGAACCGACGACAAGUGCAACAGAGAGGAGACCGCCAUCAUAGCCUCGGCUAAGGUGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGUGCGGCUAGCAAUAGUCCGUAGCAAGGUAAACUCCACCCGAAGCAAGACCAAAUAGGGUUCCGUAUGGCGUGGCUCGCGUUGGAACCGGGUAGGUCGCUUGAGCCUGUGAGCGAUUGCAGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGACAGGACCCGGCUUAUCGGCCAACUCAACCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((....)))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((.(((....[[[.(((((....))))).........)))..]]]........(((.....((((((...)))))).((((....))))........)))............(((((((((.((((....)))).))))))..[[[[[....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....)))......]]]]].................(((((((....(((((...)))))))))))).(((((((((.....((((((((....))))))))............(((((...)))))....)))))))))))))))))).....
|
|
ASE_00343
|
[ FASTA input ]
|
CUGUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUAGUAUUUUAAUACUAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCAGUAGUGAUUGUGCUAGGCGAACACAUAAGCCUAGGGAUGUGCAUACACAUUACGGCGAAGGAAAUGGCUAAGUCGUUUGAUAUGCCAAAGUACUUCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGUUUUUAUGGAAACGUAAAAAAUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUAGGGGCAUGGGAUAGUUGGAAACGAACAAGCUAUCCUGACUGUCAACAGACGGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAAAUAAUUCCUAGUUAUUUCCGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUAAUAGGUUAAGCUAGCAUUUGCUAG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((....))))))........)))))))...(((((((((.....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))..........................
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((((((.....((((((((....))))))))......))))....(((.[[[[[))).....]]]]].(((......[[[[[[...)))....]]]]]].((((((....))))))(((((........[[[[...))))).......]]]]..((((((....))))))....(((.(((..((((((((....)))))))))))...)))(((...[[[[[...)))....(((........)))]]]]].....(((((((..........[[[[[[[.(((((((((....))))))...)))..)))))))...(((((((((.....)))))))))..........]]]]]]]...))))))))))))..........(((((....)))))
|
|
ASE_00344
|
[ FASTA input ]
|
GAACACAGAGGAUCGAUAAUGACCAGGAACUGUAACAGGUUCUGUUUCCUCGUGAGAGGGGCUUGGGGAACCGAGUCUGGCGUUGCUAUAAGAAAUCUACAGCGUUGUUCGUUACUUGUAACGUGGCAACCCUGAUGGGAAUGGUAACGGAUGAUCCAUUUGACGUACUGCUACCACUUGUGAUAGCGGUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGAGCAAAUGUUCGCAUUUGAA |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((................................((((....))))(((((((....)))))))...(((((((................(((((((((((....))))))).))))............)))))))..))))))....(((((((((((((((....)))))))))))).)))....................((((((....))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((.......(((((((((......))))).....((((....)))).((((((....))))))))))(((((((((......(((((((.(((((((((((....))))).)))))).))).)))).)))))))))..)))))).))))...((((((((..........)))))))).(((...[[[[[[[[.)))...((((....))))]]]]]]]].
|
|
ASE_00346
|
[ FASTA input ]
|
UAUGGGAUCCCUAGCGGGGGUAACGGGGCAAACCCUGAGGAAACUCCGGCCUCCAACCCUUACAAGAACCCCGUAAGGGGUAGGGAUAGAAUCCCUGGCUACUACACAGAAACGAAGCCCUAAUACUAGAUAGAUGAUUGGACCUACUAGCAAGUAAUUGCUAGUAGUACAUGAUAGAUGAAAGUAUUAGGGCUUGAAACGGUAGACCUCUUGGGAGCAAGUUGAAGGGGGAUGAGCAAAGGGUUGACUCCUUAUAGUACGCUUAGUCGAAUCCCCUCAGUACAGAAGCCGGGUUAUGCUAGGGAUCCCUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((...(((((....)))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{.((((((((((....)))))(((((.....)))))((...((((...........(((((((((((...........((...((((((((((....))))))))))..))...........)))))))))))........)))).)))))))))))...((...((((((..(((..}}}}}}))))))))).....))............)))))).........]]]]]]]]..))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((((((((((...(((.....))).(((....)))..))))))(((((........(((((....)))))((((((...))))))((((.((((.........(((((((((((((.(((.....)))....((((((((((....))))))))))..(((.....)))..)))))))))))))......))))....((((....))))((((..((((((.....(((.....(((......)))...)))......))))))))))......)))))))))..))))))))))))..
|
|
ASE_00350
|
[ FASTA input ]
|
GAACACAGAGGAUCAAUUAUCAAAGACCAGGAACUGUAAAGGGUUCUGUUUCCUCGUGAGAGGGGCUUGGGGAACCGAGUUUGGCGUUGUUAUAAGAAAUCAACAGGGUUUGGUUUGGCAUUUUUCGAAGUGGUUGGCCGAACUCUGAUGGGAAUGGCAACGGAUGAUCCAUUUGACGUAUCACUAUUAACAAGUGAUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGAGCAAAUGGUAACACAUUUGAA |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((..................................((((((....))))))(((((....))))).....(((((((.....................(((((((((((....))))))))))).................)))))))..))))))....(((((((((((.......)))))))).)))....................((((((......))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((...........(((((((((......))))))...(((((....)))))((((((....)))))).)))(((((((((......(((.((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).)))..)))))))))..)))))).))))...(((((((.[[[[[[))))))).....]]]]]].(((..........[[[[[[)))...]]]]]]..
|
|
ASE_00353
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGGUUGCUAACAGCAACCCGGGGUGACCCGCGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAGACCGCCCGGCCACCUCGGCCGGGUAAGGGUGAAAGGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCCUCGGGUGACCGGGGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCAGAAGGGAGCCAUUGCGGCUCCUGCGCAGGCGUUUGAGGGCGGCCCGUCCGAUGCCUGCGGGUAGGCCGCUUGAGCCUGUCGGCGACGGCAGGCCCAGAUGGAUGGUCGCCCAGCGCUGCGCCGUAAGGCGGGCGUGGACAGAAUCCGGCGUAG |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((.....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((....(((((((.....)))))))..(((((((...((((((.]]]]))))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((.((((....)))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]...(((((((....))))..(((((((...))).))))....[[[))).....]]]....((((((((.....))))))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]..((((....(((((((.....))))))).((((((((((...(((...)))....))))))))))....))))..(((.((((((((....)))))))).))).(((...[[[..)))(((((.((((....)))))))))(((.....)))]]]....
|
|
ASE_00359
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCACCCACCUGCUGAGCGCGCAGCCGUAUGCAAGUACGGGUGGCGAGAGUCACGGCUAUGGCACAGAAACGACACGGCCUGCCCCCAGCCAUGAUGCGAUCGAGUCCAUUCGUGGGCAAUGCGUCCGCUCCCAACAAGCGCGGAUGUCUCGCUGAUGCAUAAGGGUAGGUAGCGACGAAACGGUGAAUCCUGCGGGUGCAAGCCAAAACAGGGCAACAAGGCUGCUCAGUGCCUGCCCGGGUAUGGCGCGUAGCUGAAUUGCCGCACCGACAGAAGCGGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[[.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............((((((((((...........((((....(((((....)))))...((((((((...........)))))))).))))..........))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....(((((....(((.]]]]]]])))))))).....))))............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...))).....((((((......(((.[[[..))).....]]](((((....)))))...((((((..............[[[[[[[[...))))))..((((....(((((....)))))...((((((((...........)))))))).))))..........]]]]]]]].(((......[[[[[.....))).(((....))).......(((((...((((((...((((((((....))).)))))))))))...))))).]]]]].....))))))....
|
|
ASE_00360
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAACUCCACCCAUCAUACAGAACCGUGAUGCCAGCAGGCAUCUGCUGAGAAGCAGGACACUGGAGCAGAAACGAUAUGUUUUCUAAUGGACGAACAUGAUGCUUAAAUGCUGAUGGACAUUAGAAAAAUACAGUGAAACGGCUAUUCCACGGGAUGCAAGGACAAAUACUGUUUAUGGAUCCUGUAUGAAACAGAGGUAGUCCGCAAAGAUGAAUGCUGCUAAAACAGAAGGUGGGUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[..((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............(((....))).......))))))))))...))........)))).)))))))))))...((((.....(((((...(((..]]]]])))))))).....))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((....))).(((((((.........(((((((((....))))))((((....))))...[[[[[........))).....((((((((((......(((...............)))..))))))))))...]]]]].............(((((((.............[[[[[[....)))))))...]]]]]].....(((.[[[..)))...]]].............)))))))..
|
|
ASE_00361
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGAGCAAUCCUAGGGACAGUGCCACAGAAAUGAGGACCGCCGAUGGUGUCGGCAAUGCCGGCACACAGGCAAGGAUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAACCCGGGAACGGGUUGGCUAGGUAAACCCCACCUGGAGCAAGACCGGAUAGGAGUGCGCACGUGGUGGCCCGCCACGCACUCGGGUAGGUUGCUUGAGCCAAUUGGCAACAGUUGGCCUAGAUAGAUGAUUGCCACUCCAUUCGUGCGAGGCAGACGGGUGAAAUGACCGAGAGCGAGUUGCUUAUCGGAUUUUGCGGACCUGCCGCUUGGAGCACAGGAGCACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((..((((((((((...)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((...(((((((((((((((((((((((..((((((((.....)))).))))))))))))))))))))).....)))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].(((((((((((...)))))))((((....)))).......(((((...............((((((...))))))..[[[[)))))...]]]]..........(((((......[[[)))))..(((((((....)))))))]]]......))))...((((.[[[...)))).......]]]...(((((..[[[[[)))))....]]]]].(((.......((((((((....)))))))).......[[[[...)))....]]]].((((..(((((....(((((((..(((((((((...))))).)))))))))))....)))))[[[[...))))..]]]]...............
|
|
ASE_00362
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCCCCAACGGGCAGAGCGCCAGGUAACACCUGGGAGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCCGCAGAAAAUAUACCGCCUAAGCGCCUUCGGGCGCCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCCGCUGGUAACAGCGGUGGCAGGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCACGCGUUUCGGCGCACGGUGCGGCCCGCGCUGGGAUCCGGGUAGGUCGCUUGAGGUGUGUGGCGACACACAUCCCAGAUAAAUGACUGCUCACGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...(((((....))))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..((((....)))).((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.........((((((((....))))...(((((((((...)))))).[[[)))...]]].(((....[[[[[...........))).....(((((....)))))]]]]].(((((....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....)))))))).......(((.......((((((..((((....)))).(((((((...)))))))))))))[[[[[[)))..(((.((((((((....)))))))).)))........]]]]]]..........)))).....
|
|
ASE_00363
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGAGUGCCAGGUAACACCUGGGGGGCGAGAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAAAGCAUACCGCCCAAAAACGGGGUAACACCCGUUUGAGUGCCUUAGUUGGCUGGGUAAGGUUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGCCGUGGCGAUGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCGUCAGCUGUGGCCCGCAGUGGAUUCGGGUAGGUCGCUACAGGCAGGUGGUGACACCUGUCGCAGAUGAAUGAUCGUCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((......)))))))))).(((......)))..)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)...)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......((((((...)))))).((((....)))).......((((........))))...(((((.(((((((......)))))))[[[[(((......))))))))..((((....(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).........))))..]]]].......(((.......[[[[[[))).((((((...))))))]]]]]]((((..((((.....((((((((....))))))))...(((((....)))))..))))...))))......
|
|
ASE_00364
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGAUGGUCCUUAACGGGGACCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGUAGACCGCCCGCCAAGGCCUGGCCGUGGCGUGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGCAAGAGCUCACCAGUGCCGGCGGUGACGUCGGCAGCUCGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGAGUGAUUGAGGACGGCCCGUUCGAGACUCCCGGGUCAGGCUGCUUGAGGCCAUCGGCAACGGUGGUCCUAGAGGAAUGAUCGUCGCUUCGCAGCGGGCAACUGCUGCGGGGUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((...)))).))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((((.]]]])))))))))))))......))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....((((((.....))))))((((....))))........((((...........(((((((((((.(((...))).))))).)))...)))....[[[[..))))...]]]](((..((((((((....))))))))[[[[)))............]]]]..((((......[[[[[[..[[[[....))))...]]]].]]]]]].(((((..[[[(((..((((((((....))))))))...)))...)))))...((((((((((((....)))))))))))).]]]...........
|
|
ASE_00366
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUCAGGACAGGAUGGUCGAUAACGUCGACCGGCCGCGAGGUCAGGGAAAGUGCAACAGAAAGCAGACCGCCGAACGGUCCUUCGGGACGCGUGGCAAGGGUGAAACGGUGCGGCAAGAGCGCACCAGCGGUCGAGGUGACUCGAUCGGCUUUGUAAACCCCAUCCGGAGCUAGACCAAACAGGUUGCAGUCGUCGAGUUCGCUCGACGCGCGAAGUCGUCCGCUUCGUUAUCGACAUCCGGGUAGGUCGCGAUUGAGGCGACGAGCAAUCGUCGUGCACAGAUAGAUGGUCGUCGACGCCCCAGCGGCGUUACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((.....))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((.........((.........)).(((((((.]]]])))))))......))))).....))))........((((((((....))))))).).................((((((.....))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[....)))))......]]]](((((((...)))))))((((....)))).......((((...........((((((((....((((....))))...))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........)))).(((((((....((((.....))))...(((((((((....))))))..(((((((.....)))))))....))).))))))).)))).........(((((((....))))))))))).......(((.....[[[[[[)))..]]]]]]...............
|
|
ASE_00367
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCUAGGUAAUGUUUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAACAUACCGCCUACGUCCUUCGAGACCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCCGGUGGUAACACCGGUGGCAGGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACUUCGUGCGGCCCGCAUGGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGUGUGUGGUGACACACAUCCCAGAUGAAUGGCUGUCCAUGACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((......))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..((((((.[[[[...((((..((((....)))).)))).))))))..........]]]](((......[[[[......)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....))))))))]]]]((((.........(((((((..(((((...))))))))))))..[[[[[[[[)))).((((((((....))))))))(((......)))(((((...)))))....]]]]]]]]
|
|
ASE_00369
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGGGUGCUGGGUAACUCCCAGUCCUGGCGACAGGAAGGAAAGUGCCACAGAAAGGAGACCGCCUCGUUUGAUGUCUGAGACAUCGGAUGGGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGAUAAGAGCUCACCAGUCCAGCCGGCGACGGUUGGAGCUUGGUAAACCCCGCCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGCGCAUGAGGGUGGUCCGCCCGAGCUUCCGGGUAGGUCGCUUGACCUCGAUGGAGACAUCGAGGCUAGAUGAAUGGUCAUUGUCUUGAAAGUGGGUGACUACUUCGGGAAACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((...)))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((.(((((....))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((...[[[[...))))......(((((((..(((...(((((....))))).)))...)))).)))...]]]]((((((((((((((((((...)))))))))))))))..[[[[[....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....)))......]]]]].......(((((.....((((((......(((((...)))))..))))))..[[[[[[[[.....((((((((....)))))))).........)))))....(((((((.((((....))))))))))).........]]]]]]]]
|
|
ASE_00370
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGAGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCAGCAGAAAAUAAACCGCCUCUUCGGAGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGUUCUGGCAACACGACGCGGCUAGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACAUUAUGUGCGGUCCGCACUGUUCCCGGGUAGGUUGCAAGAGGUGUGUGGCGACACACAUCCCAGAUGAAUGACUGUUCACGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......((((((...)))))).((((....)))).............(((.......((((((((....)))))...)))....(((((((.......)))))))[[[[[[))).......]]]]]]..........((((....[[[[[[..........))))........(((((...)))))]]]]]].((((..((((.....((((((((....)))))))).....(((((....)))))))))...)))).......
|
|
ASE_00372
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUAGGGCAGGAUGCUGGGUAACUCCCAGCGGGACAGGGCAUAAGGCCUGUUCCAGCGCCAGUGCAACAGAAAAUAUACCGCCGGACUUUGUCCGGUAAGGGUGAAAUGGCGGGUUAAGAGCCCACCGGCAGGCUGGUGACAGCCUGGUCUGGUAAACCGCAUCCGGAGCAAAGCCAAAUAGGGAAGGUAUGGAGCUGCCCGCUCUUCUUCCGAGUUGGCCGCUUGAGAUAAGCAGUAAUGAUUAUCCUAGAUGGAUGACUGCCGCUGACUGUGCGAGAGUGCAGUUAGUACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((........)))))))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....)))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[....)))))......]]]]((((((.....))))))(((((((.......[[[)))))))...]]]....................(((((((...)))))))..(((((....(((.[[[[....))).((((((((((((....)))))))..))))).]]]].))))).((((...(((((....((((((...(((((.....)))))))))))...))))).))))....(((((........((((((.....))))))(((..(((((((((((....))))))))))).)))......))))).
|
|
ASE_00374
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCCAGGUAAUCCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAAAAUAUACCGCCAGGAAACUGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCAGGUGGUAACACGCUGCGGCAUGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAAGCGAUGCCGUGGCCCGCGGCGCUUUCGGGUAGGUCGCACGAGGCCGCCGGUGACGGCGGUCCCAGAUGAAUGAUUGCCACAGAUUAACUUCUGGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((......)))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]......((((....[[[)))).((((....))))..]]]...(((...............(((((....)))))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............)))))...))).((((......((((((...((((((...))))))))))))[[[[.))))......((((((((....))))))))(((((....(((((......)))))...))))).....]]]].......
|
|
ASE_00375
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACAAAGAGCGCCAUACUUCCUAACGGGAAGGAGGCUGACUGGAGACGGUCAGUUUACAGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGUUCCGAUAGCUAUCGGGAUAAGGGUGAAAAGGUAGGGUAAGAGCCUACCGCUCCGCCAGUGAUGUCGGGGGCAUGGUAAACCUUAUGGGUUGAAAGAUCAAAUAGGUUCCGCAUUGGAUUAAGUUCCAAGAAGAGUUGCUCGCUCUUACGCGGAAUGGGUAGAUCGAUGGAUCCUGAUUGUGAAGUCAGGGCUAGAUAAAUGGCAAGAAUCCUUUUGGUUUAUAUCAGAUGGAAACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((((....)))))))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((......))))).((((((.]]]]))))))..))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....)))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((.........((((....((((((...)))))).((((((((((....)))))))))).......))))(((........[[[[((((((((....))))))))....)))....]]]](((...[[[)))....]]].((((........[[[[...))))...]]]]...((((....))))......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..)))))))......(((.......(((((((....)))))))[[[[)))...]]]].....(((.((((((....)))))).))).......))))).....
|
|
ASE_00376
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCGGGAUGCCAGGUAAUGCCUGGGAGGUGAAAACCUAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCCCGCCGCGCACGCGCGCUGGGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCUGCUGGUAACAGCAGUGGCAGGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCAUGCGACUGGUUCGCAAUCUGUGGCCCGCAGAUGCUUCCGGGUAGGUUGCUUGAGGCAUUCGGUGACGAAUGACCCAGAUGAAUGACUAUCCGUUGUCUCCAGGCUAAUGGAGAUUCUGACAGAAUCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))).)).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((.....)))))((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((......)))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[)))....((((...)))).......]]]]]]]((((....)))).(((......))).........((((((((((.((((....)))).))))))..[[[[[....((((((.......)))))).((((((((....))))))))....)))).....]]]]].((((((..........((((((((((((.....))))).((((((...)))))))))))))[[[[...))))))....((((((....))))))]]]]........(((..[[[[[[)))........]]]]]].(((((...))))).........
|
|
ASE_00377
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUGGAAGCGCGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCGACCUCAGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAAACCGCCCUCGAGGCCGAAAGGCUUCGCGGAGGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCUUUGGCAACAAAGGCGGCAAGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCAAAUAGGGGCUGCACGGACGAGAGAUCGUCCAGGUCUGUUUCCAGACCCGCGGCCCGGGUUGGUUGCAAGAGGCGUCUCGCAAGAGGCGUCCCAGAUGAAUGGCCAUCACCUCGCAGCAAUGCGAGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((....))))))...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((....)))))).((((.]]]]]]])))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((....((((.[[[[[.))))........(((((((...))))))).]]]]]..)))).(((....((((...........(((((((((((((((....))))))...))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....))))))).....))))...))).(((((.....((((((....(((((((..((((((....)))))).((((((....)))))).)))))))...))))))......((((((((....))))))))...((((......)))).(((((((....))))))).......)))))....
|
|
ASE_00379
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCCAGGUAACUCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAAAAUAUACCGCCCGCUUAUUCACUUGUGAAUGGCGGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCACGUGGUAACACGGGCGGCGAGGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAAACCAUGACGUUGUCCGCGUCGUUUUCGGGUUGGUCGCUUGAGGCCGGAGGGUGACCUUCAGUCCAGAUGAAUGAUUAUCCUAGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((((.....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)...)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....)))).......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..(((((((((.....))))).((((....))))......................))))(((((((.(((((....))))))))))))..(((((....((((((.......)))))).(((.((((....)))).)))....(((....)))))))).((((..((((((....((((((...(((((.....)))))))))))...)))))))))).((((((((((....)))...(((..(((((....)))))...))).....)))))))..
|
|
ASE_00380
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAGCAUAGAGUGCCGUACUUCCUAACGGGAAGGUCCCAAUAAAACGGGAACAGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGUCUCGAUCUAAUCGGGAUAAGGGUGAAAUGGUGAGGUAAGAGCUCACCGCUUCUGCAGUGAUGCAGUUGGCAGGGUAAACCUUACGGGUUGAAAGGCCAAAUAGGUCCUGUUUUCCUUCGUGGAAUUGGGUUGCUCGCUCAAUCGCAAGAGGCAGGAUGGGUAGGCUGAUCGAUCCCGGUAGCGAUACCGGGACCAGAUAAAUGAUAAGAUUCCGUUCAUUUCGGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((........)))).)((...(((((............((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.((((.....))))((((((.]]]]))))))((....)).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((.......)))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((..[[[[((((........))))....)))))...((((...)))).......]]]].........(((...........((((((((((((...))))))))...))))....[[[[[[)))....]]]]]](((.(((((....)))))..)))...(((.[[[[))).((((....))))....]]]]((((...(((.....)))..))))((((..[[[.....))))..]]]....(((.......[[[[..((((((((....)))))))))))............]]]]..(((....[[[[[)))....]]]]]....
|
|
ASE_00382
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACUAUAGGGCGGAGUGCCAGGUAACACCUGGGCGGCGUGAGCCGACGGCAAGUGCAGCAGAGAGAAGACCGCCUGACUCGUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGAGUGGUAACACUUCGUGGCAAGGUAAACCCCACUCAGUGCAAAACCAAAUAGGGGAGAGAUGGUGCGGCCCGCACUUCUCCCGGGUAGGUUGCUUGAGGUAUGUGGUGACACAUAUCCCAGAUGAAUGACUAUCCAAGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((.............((((((...)))))).((((....))))......))))).(((..(((......((((((....))))))..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))..)))..)))..(((.......((((((...((((((...))))))))))))[[[[[[)))..(((.((((((((....)))))))).)))........]]]]]]...................
|
|
ASE_00383
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGAUGGUCCUUAACGGGGACCGGGGGCGACCUUAGGGAUAGUGCCACAGAGAGAAGACCGCCCGCCAUCGUUUUUGCGAUGGCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGUGUCGGCGGUGACGUCGGCAGCUAGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGAGUGCUUGAGGACGGCCCGUCCGAAGCUCCCGGGUCAGGCUGCUUGAGGCCGUCGGCAACGGCGGUCCUAGAGGAAUGAUCGUCACUCUGCAGGGGGUAACCGCUACAGAGGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((....))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((((.]]]])))))))))))))......))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((((..[[[......(((((((.....))))))))))))..]]]..(((...................[[[.)))((((((((....)))))))).]]]..(((((....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[..........)))))..]]]..(((.......[[[[[[)))...(((((...)))))...]]]]]].(((.[[[[[[(((..((((((((....))))))))...))).....)))(((.(((((................))))))))......]]]]]]..
|
|
ASE_00384
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUCGGACAGGGCGCCAGGUAACCCCUGGAGGGCGCGAGCCCAUGGAAAGUGCCACAGAAAACAAACCGCCAGGCCGCAAGGCCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUUCGCGGCACGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGUGCGUGGCCUCACCGCCACACCGCCGGUUCCGAGCGGACUCCCGGGUAGGUUGCUGGAGGCGGCCGGUAACGGCCGUCCUAGAUGAAUGAUUGUCCUCGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((......))))).((((..]].]]]])))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
........((((((((((...)))(((((..[[[......)))))..((((....)))).]]]...(((((..............(((.((((....)))).)))..[[[[.....((((((.......))))))(((.(((((....))))))))))))).....]]]].)))))))(((...........[[[[[)))(((((......))))).((((.........)))).]]]]]((((......((((.((((((((....))))))))))))........(((((...))))).)))).......
|
|
ASE_00385
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUGCAAGUGAGACAGGACUCCAUCUAACGGAUGGCCAGAGUAAUCUGAGGGCAAGUGCAACAGAAAGUAGGUAGCCACUUCGGUGGUGACAGUGAAAGGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGUGCUUAUGGUAACAUAGGCAGCUAGGUAAACCCUGUCCGCAGCAAGAAGUAUAUGGUAUAAGUCUCACAAGCUGUUAGAUCAGCACUCAUACUUCGCUUGAACGUAUUGGCAACAACACGUCUAGAUAAAUAACUACCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((.(.....))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((]]]]]]]......))))))...........))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
......(((((....[[[[.........)))))((((((...)))))).((((....))))........]]]]..............(((((....)))))(((((......((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[.........)))))...]]]..(((((((.........[[[[.....((((......))))....)))))))......((((.(((....))).))))..]]]]..............................
|
|
ASE_00386
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGUGAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCCACGGAAAGUGCAACAGAGAGCAGACCGCCGAUGUCGGCUAUUCGCCGGCAGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCGGUGGCAACAUGCGACGGCUAGGUAAACCCCGCCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGUACGCGAACCCAUGGUUUGCGCCUGCGGCCCGCAGGAACUUCCGGGUAUGUCGCUGGAGAUGAGCGGUGACGCGCAUCCUACAUGGAUGGUUGCCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((.....))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.((((((((...))))))))(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
........(((((((.......(((.[[[[))).......]]]]...((((....)))).(((....(((........))).[[[.))).(((((((.....)))))))]]]..((((....(((((((.......)))))))((((((((....))).))))).........)))).)))))))..............((((((.((((((((...))))))))((((((...)))))).))))))((((.(((((.(((......(((....))).(((((.....))))).....))))))))..))))......
|
|
ASE_00387
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGACAAGGGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCAAGCCCACGGAAAGUGCCGCAGAAAGCAAACCGCCUAAGCCGCCAUCGCUUGCGAUGGCGGACGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCAUCUGGCAACAGAUGUGGCAGGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGAAUCCUUCUGGUGUGGUCCGCAUCGGAUUCGGGUAGGCUGCUCGAGGCGUCCGGCGACGGGCGCCCUAGAUGAAUGACUGUCAGACUUAGAAGACGCUCGCGUUUUUGCGGUCAACAGAACCCGGCCU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.(((((((.(((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((....(((((((((....)))))))))..)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((((....))))))))))))))......))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..(((((((((((...)))))).((((....))))........[[[[[............)))))...(((((((((....))))))))).]]]]].(((((....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....)))))))).(((((..(((......((((((....((((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).....(((.[[[[[[)))......(((((((....))))))).]]]]]]..............
|
|
ASE_00388
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUCGGACAGGGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGUGAGCCCAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCGGCUUGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAACGCACCGCGCGACUGGUAACAGUUCGCGGCACGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGUGCGGGUUAAUAGCCCACCGUCGGUUCCGAACGGACUCCCGGGUAGGUUGCUAGAGGCAACUGGUGACAGUUGUCCCAGAUGAAUGGUUGUCGAUGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((...))))).((((..]].]]]])))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[....)))))......]]]].((((((...)))))).((((....)))).......(((((..............(((((....)))))..[[[[[....((((((.......))))))(((.(((((....))))))))))))).........]]]]].......((((......((((((..((((.....)))).((((.........))))))))))[[[[.))))......((((((((....))))))))(((......)))(((((...))))).]]]].......
|
|
ASE_00390
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUGGGCAGGGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAGAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCGGGUCCGCCCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCAGGUGGUAACACGCUGCGGCAGGGUAAACCCCGCCUGGAGCAAGACCGAAUAGGGGAGUGUCAAGUGUGCCCGCACGAGCUCCCGGGUAGGUCGCUAGAGGUCGUUCGGUGACGGCGAUCCCAGAUGAAUGACUGUCCUCGACAGUUCCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]]))))))))))).....))))......(((((.(((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((..[[[[.)))))......((((((...)))))).((((....))))..]]]]................((((((((((.[[[))))))...))))........]]].....(((.[[[[)))...]]]].....(((..(((.(((....))).)))...)))..(((.......[[[[[[)))..((((....))))..]]]]]](((..(((((((.....[[[[[.......)))))))...]]]]]..(((((((...)))))))))).......
|
|
ASE_00393
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAAAGGGCAAGGUGCCAGGUAACACCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCAGCAGAAAGUAUACCGCCCGGCGAUCCACCUUCGCGGUGGGUCACCAGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGACCGGCAACAGGCACGGCGAUGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCGUCAGCUGCGGCCCGCAGCGGAUUCGGGUAGGUCGCUACAGGCAGGUGGUGACACCUGUCGCAGAUGAAUGAUCGUCCACGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((.....)))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..(((((....(((.[[[[))).......]]]](((((((....))))......................[[[[.)))...((((((((.....))))))))....]]]].(((((....((((((.......)))))).((((............))))..............))))))))))..(((.......[[[[[[))).((((((...))))))]]]]]]((((..((((.....((((((((....))))))))...(((((....)))))..))))...)))).......
|
|
ASE_00394
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGUCAGGCAGGACGCCAGGUAACGCCUGGAGGGUGCGAGCCCAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUUUGCUGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGGUGGUAACACGCCGCGGCAUGGUAAACCCCGUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGCAUGGGGACCUUCGGGUCUCUACCGUACGCCUGAGCGGGCUCCCGGGUAGGUUGCUAGAGGCGACCGGUGACGGUUGUCCCAGAUGAAUGAUUGCCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.((((((((....))))))))((((..]]]]]])))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((....(((.(((((((((((((((...)))))).((((....))))........(((((.........((((((((((...))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...))))).....)))))..(((((.(((......((((((.((((((((....))))))))((((........)))))))))).)))...)))))...((((((((....)))))))).............))))...)))....)))))....
|
|
ASE_00395
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGGCGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUCAGGCUGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCUGCUGGUAACAGCAGUGGCAGGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACAUUGGCGUGGCCCGCGUUGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGCGUCCGGUGACGGGCGUCCCAGAUGAAUGGUUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[[...)))..]]]]].(((((...[[[[.)))))...((((....))))........]]]]..........(((((((.[[[[.))).)))).(((((....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....)))))))).]]]]..((((......(((((((...(((((...))))))))))))[[[[.))))......((((((((....)))))))).((......))((((....))))...]]]].......
|
|
ASE_00396
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUCGGACAGGGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGUGAGCCCAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUUUGGCUGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCAACUGGUAACAGGUGUGGCAUGGUAAACCCCGCUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGGACGUUAUGCGUGGUCCGCGCUGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGUACAUGGUGACAUGUUACCCAGAUGAAUGAUUGCCCACGACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.....(((.]]]]))).))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((....(((((((....))))))).(((..((((((...)))))).((((....)))).......((((((((.......((((((((((....))))))...))))...(((((((.......))))))).....(((....))).)))))))).......))).))).......(((((.....[[[[[[[.......))))).....]]]]]]]((((((.(((.(((.((((((((....)))).))))))).)))....))))))..................
|
|
ASE_00397
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGGAUGGUCCCUAACGGGGACCGGGGGUGACCCUAGGGAUAGUGCCACAGAGAGGAGACCGCCUGUUUUCGCUGCGGCGCUGACAGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGUUCUGGCGGUGACGUCAGAAGCUCGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGGCCGAAUAGGGGAACAUUUGAGGAUGGUCCGUCCAAAGUUCCCGGGUCUGGCUGCUUGAGACCGUCGGCAACGGCGGUCCUAGAGGAAUGAUCAUCGUCCUGCAGCGGGUAACUUCUGCAGGAAACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((....))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((((.]]]])))))))))))))......))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....(((((((...)))))))((((....)))).....(((((((.(((...((((((.....)))))).))).)))))))........((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]..(((((.....((((((.((((.(((...)))...)))))))))).[[[[))))).(((..((((((((....))))))))...)))....]]]]....((((((((.[[[[.....))))))))......]]]].......
|
|
ASE_00398
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUCGGACAGGGCGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGUGAGCCCACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUUCGGUUGGUAAGAAUAAAAUAAUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGACUGGCAACAGUUUGCGGCACGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGUAGGGCAACGCACGAGGCCUCCAACAGGGGCCUUCGGGUGUUGGCCACCGUCGGUUCCGAACGGACUCCCGGGUAGGUUGCUUGAGGUAGCCGGCGACGGCUAUCCCAGAUGAAUGGUUGUCAAUGACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((((((((((((((((.....))))))).)))))))))))).((((..]].]]]])))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((......)))))).((((.((((((...)))))).((((....)))).......(((((........(((...((((((....))))))....))).......(((((........)))))..(((((....)))))...)))))..........)))).((((((.(((......((((((....((((((...(((((((.....)))))))....))))))....((((.........)))))))))).)))...))))))..((((((((....))))))))(((......))).((((...)))).............
|
|
ASE_00400
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCUAGAGGGCGCGGCGGUCGUUAACAACGACUGUCCUGACAUGUACAGGAUAAGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCCUGAGCUUGUCGAAGGGUAAGGGUGAAAUGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGUAUCCCAAGUGAUUGGGAUAGCUUGGCAAACCCCGCUGAGAGCAAAACCAAAUAGGGGAGCACUGAAAUGUACAUCAUUUCAUCAAGUGGCCCGCUUGAAGCUCCCGGGUAGGUUGCUAGAGGUACCUGGCAACAGGUAUCCCAGAUGAAUGACCAUUACCCCAACCAUCUGAUUGGGGGACAGAAUCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((.......)))))).)((...(((((............((((((((((.....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((((.....)))))))((((((.]]]])))))).)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((....)))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..((((....))))..((((((((((...))))))))))[[[....[[[[.)))).......]]]]..]]]......(((((((((..((((......)))).))))))...[[[[[[[)))....]]]]]]].((((((((....)))))))).((((((.......))))))(((((.(((......((((((..(((((((.....)))))))(((((((...))))))).)))))).)))...)))))...((((((((....)))))))).((((((...........[[[[...))))))....]]]]................
|
|
ASE_00401
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUUCUCAGGACAGGAUGGUCGAUAACGUCGACCGGCCGCGAGGCCAGGGAAAGUGCAACAGAGAGUAGACCGCCGAACGGUCCGCUUCGGCGGGCGCGUGGCAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCGAUCGGGGUGACUCGAUCGGCUUGGUAAACCCCAUCCGAAGCUAGACCAAACAGAGCGGAGUUGUUUCAACCGGCGCCCCCGCGGCGUCGGUUGGCACACAAGGCGGUCCGUCUUGUCAACCACGUUCGGGUAGGUCGCGAUUGAGGCGGCGAGCAAUCGUCGUGCACAGAUAAAUGAUCGUCGUCGAUCUUGUGUCAGGCACAGUUCGCUGUGUGGCACAGUUCGUCACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((.....))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((.....(((((((((((((((.....)))))))))))))))(((((((.]]]])))))))......))))).....))))........((((((((....))))))).).................(((((.((((((((..((((((....)))))))))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((....[[[[[.)))).....(((((((...)))))))((((....)))).]]]]]....................((((....((((((....))))))...))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))..[[[[...))))...]]]].....((((.....(((((..((((..((((((((((((.....))))))))))))...((((((((...))))))))))))..))))).....))))(((((((.[[[[[[[[.))))))).................]]]]]]]](((..(((((((..(((((....))))))))))))[[[[)))...]]]].........
|
|
ASE_00402
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGACAGGAUGCCAGGUAACACCUGGGGGGCGAGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCCUGUUUUGGCAGGGUAAGGGUGAAAUGGCGCGGUAAGAGCGCACCGCAUGGCUGGUAACAGGCAUGGCAGGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACACUGGUGUGGUCCGCACUGUUCCCGGGUAGGUUGCACGAGGUGCUUGGUGACGAGCAUCCCAGAUGAAUGACUGCUCAACGACAGAACCCGGCUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))............................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].....((((((((....(((..((((....)))).)))....))))..............(((((((....)))))))..[[[[[...)))).((((........))))((((.(((....))).))))...(((....)))]]]]].......(((((.....[[[[[[[......))))).....]]]]]]]((((..((((.....((((((((....)))))))).(((........))).....))))...)))).......
|
|
ASE_00403
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGACAGGGUGCUGGGUAAUGCCCAGUCCCGGUGACGGGAAGGAAAGUGCCACAGAAAGGAGACCGCCCUGUCAGAUAUGCAAAUAUCCGGCAGGGUAAGGGUGAAAGGGCGAUGUAAGAGCUCACCAGUCUCGCCGGUGACGGCGGGAGCUCGGUAAACCCCACCUGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGAGCGUUUGAGGGCGGUCCGUCCGAGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAUUCCGCUGGCAACAGCGGGGCUAGAUGAAUGGUCAUUGUCCCGACGGCGGGUGACUGCCUCGGGGAAACAGAAUCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((((....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((((....)))))))))))))......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]]..((((((((((...))))..(((((....))))).....))))))(((........(((((((((((.(((((....))))).))))))))...)))....[[[[..)))....]]]](((..((((((((....))))))))[[[[)))............]]]].....(((((..[[[[[[))))).(((((...)))))..]]]]]]..((((((((.....((((((((....))))))))...(((((....))))).((((((.(((((....)))))))))))..........))))))))
|
|
ASE_00404
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAAAGGGCAAGAUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAACCGCCUAAGCAUUUCGGUGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGUCUGGCAACAGUGCGUGGCUAGGUAAACCCCAUCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCAUUGGUGUGGCCCGCACUGGAUCCGGGUAGGUUGCUUGAGGUCAUCAGUGAUGGUGGUCCCAGAGGAAUGGCUGUCCACGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[)))....((((...)))).......]]]]]]].(((((.......[[[...)))))...........]]](((...........[[[[[[..)))(((....((((((.......)))))).)))..]]]]]].(((((((.(((((........(((..((((.............[[[[)))).)))..))))))))))))((((((((((...)))))).))))((((....))))..]]]]...(((....[[[)))....]]]...........
|
|
ASE_00406
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGACGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGAAAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAAUGGCUUUGGCUGUUGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCAUCACUGGUAACAGUGGUGGCAGGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGAGGAACCAAUACCUUAUGGGUAUUUGAAAGUGCGGCCCGCACUGUUCCUGGGUAGGUUGCAAGAGGUGUGCGGGGACGCACAUCUCAGAUGAAUGACUGUCCUUGACAGAACACGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((((...)))))))....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[[...)))..]]]]]......((((((...)))))).((((....)))).((((...((((((........(((((((((((((....)))))))))...(((((..(((((((.......)))))))..)))))))))......))))))(((....)))..))))((((..((((......((((((.(((((((...)))))))....((((((...)))))))))))).....))))....((((((((((....))))))))))..........(((((...)))))......)))).
|
|
ASE_00408
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGGAAACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCGCGCAAGCGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCAUAAGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGC |
|
[ reference structure ]
|
..............((((...[[[[.((((((((((.....)))))((((....))).)((...(((((............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((.(....(((((.]]]])))))).)))).....))))................
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))...]]]].(((((((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............((((((..((((((((....))))).))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).......((((......[[[[[[[........)))).....]]]]]]](((...[[[[)))....]]]]....
|
|
ASE_00409
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAGCACAGAGCAAGGGUGCCUGGUGAAAGCCAGGGAGGCGCUAUCUGGCGUCGACAGUCCAGACCGGCACACUCCUCAGGAGUGUGAGAGCAACAGAGACCAAUCUAUUGUGCCAAGGCGCAAUAGCUGAAAAGGGCAAUCCUCCUCGCUGCAAUCUCCGAUCCGGCCGUUACCAGGUUGCUCGCCAAGGCCGAAAGACGAGAGCCGUCGGUGCUCGCAUCGACCGGUCUAUUCGACCGAGAAAGAUGAUCGCCAGGAACAGAACGCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[..(((.(((((((....))))))((((((((....))))))).)((..........((((((((...)))))))).(((((............(((((((((....)))))))))........)))..))))))))))))...((((....((((((.......(((.]]]])))..)))))).....))))...(((((((....)))))))(((((.....))))).........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((..((((...((((..........(((.((((((....))))))..((((((....))))))..........)))..((((((((...))))))))...................((((((((....))))))))))))....))))..)))))...(((((.......(((.[[[[[)))....(((.....)))..]]]]]...((((.[[[[))))...]]]].((((...(((((..[[[))))).....)))).......]]].......)))))...
|
|
ASE_00411
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUUCCGAAAGACCAAGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAAAGUGCCACAGAAAUAUACCGCCGAUGGAGGGAAACCUCACAGGUAAGGGUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUCGAGAGGUGUUGGCUCGGUAAACCCCGGCUGGAAGCAAGGUGUGCUAGCGCUAAAGAACCAGGGUUGGUCUUUUCCCCAGUUCUUGGCUAGCCAGAGCCGCUAGAGGCACCUGGUAACAGGUGUCCCAGAUAGAUAACCCCCUUUGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...(((((.....))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((........(((((.(((...(((.]]]]]]]..)))...))))))))........)))......((((((((....))))))))............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.........)))).(((((((((.((((((((((...)))))).((((....))))......(((((..........(((((((....((((....))))...)))....((((....))))))))..((((((((..(((((((....)))))))((((((......)))......)))..)))))))).))))).......)))).)))))))))))))).((((.(((....)))[[[[[[(((..((((((((....)))))))).....)))............))))......]]]]]].
|
|
ASE_00412
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCCAAUGGCCAGGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAGAGUGCCACAGAAACACACCGCCGAUGGCUCCGCUUCCGCUGCGGUGGAGACGAGCACAGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCAUCGAGAGGUGCUGGCUCGGUAAACCCCGGCCGGGAGCAAGGCCCAGGGACCAACGGUUGGCCAUGACACCGGUCCCGCCCCAAGUGCGCCGCUCGAGGCCGCCGGAGACGGCGGUCCCAGACAGAUGAUCACCCCGGGCAGGGUCCGCCCCACCCGGAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((.(((((((((....)))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((...((((((...(((.]]]]]]]..)))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................(((((.((((.....))))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((...))).[[[[))))...]]]].(((..(((((((...)))))))((((....)))).........))).............(((.....(((((((........)))))))....[[[[.)))....]]]]...(((((.....[[[[)))))..(((((((....)))))))]]]]......(((.[[[[))).....]]]]..((((((.....[[[[..........))))))...]]]]....((((.....((((((((....)))))))).................(((((..(((....)))..))))).........))))...
|
|
ASE_00413
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCACCACAGGGCUGGUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGCGCGAGCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAUGUAGACCGCCAGGCUCGUCCUGGUAAGGGUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGUCACCAGCAGAGUCGAGAGGCUCUGGCUAGGUAAACCCCGCUGAAGGUGCAAGGCGAAGGUAUAUCUCGAGAAAACGGUGGCCCGCCGCCUCGAGUUGCCGAUGCUGCUAGAGGGUUUGAGUAAUCAGGCUCCCAGAGAGAUGGCGGUAAAAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((.(((((((((...[[[[.((..((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............((((((((.....))))))..)).......((((((.......)).))))(((((((((....))))))).)).)))..))))).))...))))...((((.........((((((....((((.]]]])))).)))))).......))))......((((((((....))))))))..........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((......)))..(((((....(((.[[[[))).((((..(((...(((((....))))).)))...))))(((....))).]]]]((((((.....))))))...)))))...((((.......[[[..))))..(((((((....)))))))]]]......(((.[[[[...)))....]]]]..((((...((((((....(((((...))))).)))))).))))..((((((((..[[[[[[((((......)))).........))))))))......]]]]]]......
|
|
ASE_00414
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGAAAGCGCGAGGGCAGCUGACGCCCUUGAGGUGAGGAAAGUCCCCCCUCCUCGGCGGUAUCCGGCUGGCGCAAGCCAGCAUCCUGAGAGGGAUGGUAAAGGCAAAAGAAAUAAACGGUCUCCGGUAAAGCAUGAUUCCGAAGGGAUGACGUUUCCGGAGGAUCCGAUGGAAAGCCUCCCCGGAUGGAGAAAGUCUAAACGGAUCCUGUGAGGCCGCCGUGAGGAUCGGGUAAGACGAACAGUCGAAUGCUGCCAGCCCAUUGGGUGAACAGAAGGGGGCUUACUCCGCGGAUUCCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((((((((((((...((((.....))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............((((((((((.........(((((...))))).......)))))))..))).......)))).)))))))))))...((((.....(((((..(((..]]]]]])))))))).....))))............))))))(((((...))))).......}}}}}}}}.)).)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((.......)))))))....(((..((((((((.......(((((((((((((((((....))))))(((((....))))).....................(((((((.....((((.....(((....)))....))))....((((((((.((((....((((......))))....))))..))))))))..)))))))..........)))....(((.....)))..)))))))).((((...))))........)))))))).))))))...)))))))).
|
|
ASE_00415
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGGGCAGGGUGGUCGGGAAACCGACCCGGGGAAACCCGCGGGAAAGUGCCACAGAAACGACACCGCCUAAGCGGCGGGACCGCACGUGAGUCUCGCCGCCGGCAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGGCAGCGUGGUGACACGCUGGCCGGGCAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCAAGCAGGGGCGAUGACGCUGCCCGCCGAGCCCCAGGUAGGCCGCAGGGCUCCUCGGAGCCCCGUCCGCGGUGGUCCCCAGGGACUCGGCGCGGGCGAGAUGGAUGGCUGCUCUCGACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((((((((....)).)))))))))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((...(((((.]]]])))))))))).....))))...((((((....))))))(((((((((((((......)))))...)))))))).........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((..((((.(((((((((((((((....))))))((((....)))).........))).............(((((....((((((((.........))))))))(((.(((.(((((....((((((.......))))))..(((((((....)))))))...(((....))))))))..)))..))).......)))))......))))))((((((.(((.....((((((.((((((....))))))........))))))....))).)))))))))).((((((((....))).)))))......)))))....
|
|
ASE_00416
|
[ FASTA input ]
|
UGCCCCAGGAUAGGGGUGCGGUCGCGCCCGGGGGACUUCCCCCCUGGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGGCAGGGUGCCAGCUAACGGCUGGGCGGGGCAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCUUCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCUGGGGCACGGCAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCCGAUAGGCAGGAAGGGCUUGCCCGGCCCGUUAGAACCUGCGGGAUGGGCCGCUUGAGGCCGGUGGCGACACCGGUCCCAGAGAGAUGACCGCGUAAAACAGAACCCGGCUUACGCCCUAUCCUGGGGACCCCGAGCGCAGGCUCGGGG |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((((((......))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((((((...)))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......(((((..(((((.}}}}))))).......)))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((((((.((((((((((......)))))))))).(((...))).((((((.[[[.....))))))..]]]...((((((((((....)))..........)))............[[[[)))).(((((((...)))))))]]]]....(((((...(((((((.......)))))))(((((((((....))))))))).....[[[.....)))))..]]].((((((..[[[[[.....))))))(((((.(((((........))))).))))).]]]]].((((((((....))))))))..........))))))..........))))(((....)))))))))))))).((((((((....))))))))
|
|
ASE_00417
|
[ FASTA input ]
|
UAGGCGAGGGGGCUGGGGGCUGUCGGGCUCGUACCCGAGGAAGUUCCGCCCACCGCACCGGGGCCGCGGUGCCGCAAGGCACCUCCCGAGAGGGAGGGCAACGGCACAGAAACGACACGUCCCUCGGGGGAUGUGGAUGAAAGCGGAGAAGGCUCCUGGCGACAGGAGCCGAGCUAACCCGCAGACAAUCCCGAGGGGAGCGGUGAAACGGCCGUCCCGCGGGGUGCAAGGCCGAGUUAGGGCCAAUGAGUUCCCGGUGUGAGGCCCGUGGUAGGCCGCUUAGUCGAAUGCCCCCGCAGGUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCUCGCCUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((...(((((....)))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((.............((((....((((((((....))))))))........))))......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((......(((((...(((..}}}}}}}))))))))......))))............))))))............]]]]]]]]..))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((.(((((......)))))...))))))......(((((((((.((((.((((((.......((((((....))))))....))))))........((((((((....)))))))).......))))....((((((((....)))))))).............(((.((((((..((((.((((......)))))))).))))))....[[[[..)))..]]]]........)))))))))..(((.((((....)))).............[[[[[.))).......]]]]]...)))))))))))))))
|
|
ASE_00418
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCAGCCACCGCACCGGGGCCGCGGUGCCGCAAGGCACCUCCCGAGAGGGAGGGCAACGGCGCAGAAACGACACGUCCCGGCGGAUAUGGGGAUGAAAGCGGUGAAGGGCCCCGGCGACGGUGCCCGAGAUAACCCGCAGACGACCCGUCGGGGACCGGUGAAACGGCCGUCCCGCGGGGUGCAAGGCCGAGGAAGGGGCGAUGAGUUCCCGGUGGGAGUCCCGUGUUAGGCCGCUCAGUCGAAUGUCCCCUUGAUACAGAAGGGGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[[.((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((.............((((....((((.(((....))).))))........))))......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((......(((((...(((..]]]]]]]))))))))......)))).............................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))...((((((.(((..(((..((((((....))))))((((....)))).)))..)))(((..........[[[[[[.)))......]]]]]]...))))))..((((.(((....))).))))(((....(((((.((((...)))).(((((.(((......)))))))))))))......((((......(((((.......((((...)))))))))......)))).))).(((....[[[[[[[[)))....]]]]]]]]...
|
|
ASE_00419
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGGAGGACGCCGGGUAACACCCGGAGGGAGUAAUCCCUGGAAAGGGCCACAGAAAACAGACCGCCAGCGGCCAGAAAGGAUUUUUUCCUUUCUGGUGCGGGCAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCACCAGGUGGUAACACCUGGUGGCACGGCAACCCCCGUCCGGAGCAAGGCCAAACAGAGCCAUGGGUGCCCCGCCCGCUAAGGCUCAGGUAGGCCGCUUAAGAAGAGGGGUAACCCUCUUCUCAGAGAAAUAAUCACCGCCUGGGGAAAAUUUCCCCAGGUAACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((............((((((((.(((((((((((.....)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......((((..((((.]]]])))).....))))......))))......((((((((....)))))))).................((((((((((...)))))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[....)))........]]]](((((((..(((((..(((((....)))))........................(((....(((((((((((.....)))))))))))...)))..)))))....((((((.......)))))).(((((((((....)))))))))..((((......)))).........((((.....(((((.((((((...))))))....))))).[[[.)))).(((.(((((((((....)))))))))..)))........]]]((((((((((...))))))))))......)))))))...
|
|
ASE_00420
|
[ FASTA input ]
|
UCCUACGAUUUAGAAACCUGUUUGCUAACGGAGUCUCAGGGCUCACACUAAUAGCAGGUGGGAAAUUCGGUGAAUCACUGCGGAACCCGACAGAGCCUAACAAGCUUUGUCGACCGGUUGCCUUGGCGACUUUUCCGUGAGGAGGGCCUGGGGAACCAGGCUCAUAUGGUCAUUGUCACAAGAAAUCAACUCGGUAGUCCUGUACUAUCGAGGAUGGGAAGGCAAUGGACGUUCCGUUUAACUUGAUCUCAUCAAGGUUUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACGGUCUUAGACCUGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((........(((((..........(((((....)))))..........))))).....................((((((.............................................(((((....)))))((((((....)))))).........(((((((............(((((((((.....))))))).)).......)))))))...))))))...((((((((...))))).))).............)))))))(((((...)))).)..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.....(((((((........(((((....)))))........)))))))....................(((((((.(((((((((.......)))))))))...((((((....))))))..(((....)))((((((((....))))))))...(((.[[[[[))).......(((.(((((((((.....)))))))))..))).....]]]]]...)))))))....(((((.[[[[)))))......]]]]...)))))))))).((((...))))....
|
|
ASE_00422
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGGCAGGGUGGUGGCCAACAGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGGCUGCUUGCAGCCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCUCCGGGCGACCGGAGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGUCCAGACAGCGCAUGCACGACGCCUCGGCGUCAGGGAGACCGGCCCGGUCGAGUGCGCGGGUAGGACGCUGGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCCGAGAUGGAUGACCGUCACUGCACCAACGUCGGCAACGACGGUGCGGG |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((....(((((....)))))...((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((...((((....))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[((((((.....)))))).(((....))).........))))...........]]]((((((((....))))))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]..((((.....((((((....(((((....))))).....(((((...)))))..)))))).....))))(((...[[[[[[[)))...]]]]]]]...(((((....))))).(((((((...((((....))))))))))).
|
|
ASE_00423
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGGAGCAGGCGGUCGCGGGGGCGCACACCUGCGCUUCCCGAGGAAAGUCCGGACUCUGGAGCGGGGUGCCGGGUAACGCCCGGGAGGGGUGACCCUCGGACAGGGCCAUAGAGAAGAAGACCGCCCGUUGAGGGCAAGGGUGGAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCGUCGGGGCAACCCGGCGGCUUGGCAACCCCCACCUGGAGCAAGGCCAAGCAGGGGGUUGGGUCGCUCCCCCUAUUCCCCCGGGUUGGCCGCUUGAGGUGUGCGGUAACGCACACCCCAGAUUGAUGACCGCCCACGACAGAAUCCGGCUUAUGCUCCUCUCCCGUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((((((....))))).)))))....{{{.{{{{{((((.[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((.............((((((.....))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((.(((((.]]]].)))))..))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((.((((((((.[[[[[)))))))).........(((((...)))))...]]]]]((((((...))))))(((((....)))))......(((((..............((((.....))))..((((((...((((((.......))))))..(((((((....)))))))[[[[[[[.....))))))........]]]]]]].(((((..(((.......)))....)))))....)))))..(((.((((((((....)))))))).))).....))))))))...................)))))))))))....
|
|
ASE_00426
|
[ FASTA input ]
|
AUACCGGGCAGGGCGGUCGCUGGUGCGGUAAGCACCAGAGGAAAGUCCGAGCUGCACAGAGCGGGGUGCCUGGGGUCAACCCAGGGCAGCGGAGACCGGCGCCGCUGACAGUCCAGAUCGGCGCGCUGGAUAACCCAGCGUGAGAGCAACAGAGACGAUGACCGGGCUCGUCCCGGGGUGAAAAGGGCAAUCCUCCCUGCAGCAAUCUCCGAGCGGGCCGCUAUCAGGUUGCUCGCCGAGGCCCGAGGAUGAGAGCAGUCGCGGAGGUGACGAAGCGACCGUCCGUGCAAGACACGGGCGAGAGAGAUGACCGCCUAGAACAGAACUCGGCUUACUCGCUCGGUAUCGCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((.....)))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.(((.(((((((.....))))))(((((((.........)))))).)((..........((((((((.....)))))))).(((((.............(((((.....))))).........)))..))))))))))))...((((....((((((.......(((.}}}})))..)))))).....))))...(((((((((....)))))))))((((((((.....))))))))........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.(((((((((((.(((((((....)))...(((...)))..[[[))))..]]]..(((.((((((.....)))))).[[[[[[..)))....]]]]]].........((((..(((((((.....)))))))..[[[[........))))......]]]]((((.[[[[......)))).....]]]]...((((((((.....[[[[[[......))))))))......]]]]]]............(((((....)))))..)))))))))))(((.....)))(((((.[[[.......))))).........]]].........)))))))))....
|
|
ASE_00427
|
[ FASTA input ]
|
CCACAAGCUGCAUGCCACAUGUCAUCCCACCCCCAUGUCCCUUGGGAAGGUCUGAGUCAAGGGCCAGAGCACCCUAACAGGACUUUCCCUGAGUUUUGGGGAGGUGAAUUCCCAGAGAACUCAGCUCCCUGCGAGGUCAGACUGGGCUGGACAUGCCACGGACCCACCCUUCUGGGAAGGGCCAGGUGGAUGCCUCCUCAGCCAGAACUUGGAACAGACUCAUGGCCAACCAAGUGAGUUCAAUGAGGUGAGGCACCCCACCCAAGGGGCCUCAUAACCCAAUUCA |
|
[ reference structure ]
|
(........(((((........))))).........)...............((((.....((((....(((((.....)))))(((((((.....)))))))(((((((...........(((..................................................................................))).......)))))))))))....................((((((((.((.......)))))))))).......))))
|
| [ predicted structure ] |
................(((((...[[[[[....)))))....]]]]]...((((.....[[[[.))))...]]]]..(((.[[[[[[[))).......]]]]]]].........(((..[[[..))).....]]]..(((.[[[[[)))..(((.((((...(((.(((....)))..)))....)))))))....]]]]].....(((((.......[[[[[....[[[)))))..]]]..]]]]](((((((.(((.......))))))))))...........
|
|
ASE_00428
|
[ FASTA input ]
|
UGGCCCGGGACGAGGGCGCGGUCGCGCCGAGGGCCGAACCCCUCGGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCUUCCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCCGGGGCACGGCAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCCGGUAGGCAGGGAGGGCUUGCCCGGCCCGAGAGAACCUGCGGGAUGGGCCGCUUGAGGCCGGUGGCGACACCGGUCCCAGAGAGAUGACCGCGGAAAACAGAACCCGGCUUACGCCUCGUCCCGGAGGCGCCCGAGCGUUCGGGCG |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.(((((((((......))))).))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((((((....)))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......(((((..(((((.}}}}))))).......)))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....(((((((....)))))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((((.(((((((((((((((((......)))))(((((......(((((((((((....((((...)))).)))...))))))))(((....))).........((((..............(((....(((((((....)))))))...)))....(((...(((..((((....)))).)))(((((((((....))))))))).))))))).....))))))))))..((((((....(((((..(((((.....))))).......)))))....)))))).(((..((((((((....))))))))...)))....))))))).....................)))))))))))....((((((....)))))).
|
|
ASE_00429
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGGAUGCCGGCUAACGGCCGGACGCCGCGAGGCGAGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUCAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCCGGAGCAACACCAAAUAGGCAGGCGAUGAAGCGGCUCGCUGAGUCUGCGGGUAGGUGGCUUGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCCUAGAGGAAUGGUUGCCACCGACAGAACCCGGCUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((....))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[[.........)))).((((((...)))))).((((....)))).......]]]]].....(((..[[[[.[[[[)))....]]]]]]]](((...((((....))))....)))......((((((....[[[[..........))))))((((.((((((....((((((((....))))))))(((......)))..))))))......)))).]]]]..
|
|
ASE_00430
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAGGGUGGUGGCCAACAGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGGCUGCUCGGCAGCCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCUCCAGGUGACUGGAGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGUCCAGACAGCGUGUGCACGGCGCCUUCGGGCGUCGAGGAGACCGGCCCGGUCGAGCGCGCGGGUAGGACGCUAGAGCCGGCCAGCAAUGGUCGGCCCAGAUGGAUGGCCGUCGCCGCGCCACCGGUAACGGGGGCGCGGA |
|
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((...)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((...(((((((....)))))))..((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[((((((.....))))))((((....))))........))))...........]]](((((((((...)))))))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....))))))))[[[[.....))))......]]]]..((((......(((((((.(((((((....)))))))....(((((...)))))..)))))))....))))......((((((((....))))))))...(((((....))))).(((((((.(((....))).))))))).
|
|
ASE_00431
|
[ FASTA input ]
|
GAUGAGAAAGCACGAGGGCAACUGACGCCGUAAGGUGAGGAAAGUCCCCCCUCCUCGGCAGGGCCCAGUUGGCGCAAGCCAGUGUUCCGAGAGGAAUGGUAAAGGCAAAAGAAAUCAACGGUUCCCAGUAAAGGAUGAACUCGAAGGGGAGACGUUUCUGGGAGAUCCGAUGGGAAGCCUUCCUGGGUGGAGAAAGUCUAAAAUGGCCCUGUGAAGCUGCCGUUAGGGCCGGGUGAGACGACUAGUCGAAUGUUGCCAGCCCGAAAGGGUGAACAGAAGGGGGCUUACUCCGUGGAUUCUCAUCU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((((((((((((...((((....))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{.(((((((((((....))))))(((((....)))))((...((((............((((((((((.........(((((...))))).......)))))))..))).......)))).)))))))))))...((((.....(((((..(((..}}}}}})))))))).....))))............))))))(((((....))))).......]]]]]]]].)).)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..((((...........((((....))))....((((((((.....(((((...(((((((((((....)))))((((((....))))))...(((((........(((.((((((((((....(((((..(((....)))...))))))))))))..))).)))...))))).)))))).......((((....((((((((............))))))))....)))).....))))).((((....((((....)))).))))...))))))))....))))..)))))))).
|
|
ASE_00434
|
[ FASTA input ]
|
GUGUAAAAAGCUAAUUGCUGCAUUUUUUAAAAAAUGUAGAGGAAAGUCCGUGCUCACACUAACUGUGAUGUUAGUAGUGUUUGUGUAUGUAUAAUUAAUAAGGCAUAGCAUAGGCAUAUGACGGCAAAUUUUUAAGCUAAGUGAUUUAAAUUAUAUGUUUAAAAAUUUAUAAAAGUGCCACAGAGACGAUUAAUCAAGAAAUUGAUGAGAUGAAACGUUGGUAAACCCCACAAGUGAGAAACCUAAAUUUCGGUAAGGGAAUCUAAUUUAGUAAAUUAAGAAAUUAAAUUAGGAUAGAAUUGUUUACAAUUCUAUAGAUAAAUAAUUAGCGCUACAUUUUUGUAGAACAGAACACGGCUUAUUUUUACAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((((((((.....).)))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((....)))).)((.((((....((((..((((.....))))....))))....))))......(((((..........((((((((....))))))))..........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))(((((((((....)))))))))........))))))).(((((....))))).......]]]]]]]].)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((....))))))))).(((...)))...(((((.....(((((..((((...((((((((((((((............)))).)))))))))).)))).((((((((((((((...(((((....)))))..)))))))))))........)))))))).(((((((.(((((....)))))..)))....))))..............)))))..(((....[[[[)))..]]]].(((((((((((..........)))))))))))(((((((((....))))))))).......)))))))).(((((....)))))................)))))))))
|
|
ASE_00437
|
[ FASTA input ]
|
AGUUGACUGGGUAGUCGCUGCCUUAUUGACGUCCCUUGGCCUAUCGCCAGGGAGACUGAUAAGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCAAGCCUACGACAAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCUCUCUUCGGGAUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGUGCGACUGGCAACAGUUCGUAGCAGGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGCCUCCACAUAGCGUUGCUCGCGUUAGGAGGCGGGUAGGUUGCUUGAGCCAGUGAGUGAUUGCUGGCCUAGAGGAAUGGCUACUACCGCGCAAGCGGAACAGAACCCGGCUUAUACGUCGACUCCACCU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.....)))))).)))).))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((((...))))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((....)))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((....)))))...((((((((..((((((((((.....))))))).)))))))))))(((.(((...(((..((((....)))).)))..((((((...)))))).((((....)))).((((...(((........)))....((((.(((((..(((((....(((..(((((((((((((....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...(((....))))))))........(((......((((((...((((((.....)))))))))))).)))...))))))))((((((((....))))))))))))))))..)))))...((((....)))).........))))......))))..))).)))
|
|
ASE_00438
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCUCAGGGCAGUGUGCCGUGUGAAAACGCGGGGGCUGGCGGCGUAAGCUUCCGGUCACGGAAAGUGUCACAGAAAACAUACCGCCGCGGGCAACUGCGGUAAGGGUGAAAAGGCGAGGUAAGAGCUCACCGCUCCGACUGAAAGGAAGGAGGCAGGACAAACCCCACACGGUGCAAGACAGAACAGGGGAAACGGCCCGCCCUGGCCGCACUGACUCCGCAAGGAGUUGGGAUAACCCCGGGUAUUAGUCGCACCUCGCGCAAAGCGGGGAGCACGGGGCGCAAGCCCCGGGCUAGAGAAAUGACCGCCACCUUUUGCGGCAACGCGGGAGGCACAGAACCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[.(((((((((((....))))))(((((((((((....)))))))))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...(((......((((....((((.]]]]]]))))..((((((((....)))))))).....))))........)))...((((((.....))))))((((((((((....))))))))))...............((((((((((....))))))))))......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.[[[[[....))))......((((((....)))))).((((((.(((....))).)))))).......]]]]]..........(((((((((((....)))))))...[[[[[........)))).....]]]]].((((............))))(((.......[[[[......)))...........]]]]...(((((.[[[[.)))))..((((((((....)))))))).........]]]]......(((.[[[[)))......]]]](((.((((((....)))))).)))............(((.[[[[[[[[)))...]]]]]]]]................
|
|
ASE_00441
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGGGUGCCGGGUAACUCCCGGUGAAGGUGACUUCAAGGAAAGUGCAACAGAGAUAUACCGCGGGCUAGAGAACAGAGAACAGAAUAUUAAGUUUGCUGCAAAGGCAAUCGUAAUCUGGUCUCUGACAUCUGUUCUCUGUUCUCUGGAACGUAAGGGUGGAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCGGCAUGGCGACUUGCCGGUCUAUGUAAACCCCACUCGGAGCAACACCAUGGAGGGACAUAUGGGCUGCCCGCCCGUCCCAUGGAGGUGGCUUGAGCUGUACAGAAAUGUAUGGCCUAGAUAGAUGAUCGUCAAAUACAGAAUCCGGCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....))))))))))))............)))))))))))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((......))))))..)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((....((((.]]]]))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((...)))..((((((.......((((.....(((..(((...(((((....))))).)))...))).(((.((((.(((((((..(((((((((((((((((((..((((...(((((.....)))))...))))...(((...))).)))))))))))))))))))..)))...))))....((((((.......))))))..(((((........))))))))).)))..))))....))))))......(((..[[[[)))..((((.....)))).]]]]..(((.(((..((((((((((((....))))))))...(((.....))).)))).)))....)))......
|
|
ASE_00443
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUCUCCAUCCAGACUUAUAGAUUGAAACUUUCCUUGAAAGUUUCGGCUUAUGAGUUACAAACUGCUCUUGAGAGCGUCCUUAGCGUGCAAACGCUGGGCGGUGCUAUCAGAAAUUUACCAGUCCUUACUUCGUAUUGGGACUGGAUGGGAAUGGCACUGCGGAUGGUUGGCCCUCUGAAUGAGAGAGAGGGCUUUUGAGUGCAAUAUGCGAACUUGGAUAUUCCAAGAA |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((....................................................(((((....)))))..((((((((....))))))))(((((((............(((((((((((...)))..))))))))........))))))).))))))...(((((((.........)))))))....................((((((...))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((.((((((.(((((((((.(((((((((((...))))))))))).)))))))))......(((((....)))))...(((((((....)))))))((((((((((..........(((((((((((...)))..))))))))......))))))))))))))))..((((((((.........))))))))...)))((((...))))..((((((...))))))..
|
|
ASE_00447
|
[ FASTA input ]
|
UAGGUGGAAUAAGUAGCUGCUGUUGUGUGAUAAACAUAGCAGAGGAAAGUCCGGGCUCCAAGGAAAAAUAGUGACGGGUAAUGCCCGCCGGAGGUAACUCCAGUUAUAGGGCUACAGAAAAUUACCGCCUAAAAUAUUUUUAGGUAAGGGUGAAAAGGUGUGGUAAGAGCACACCAUGGCAAUGGCAACAUUGGUAGUCGAGUAACCAACACUAGGAGCAAGAUUAAAUAGAAGUAGAUUUUAUGUUUUCCUCAUAUCUACUCGGGUAAAUCGCAUGCGGUAAAUGGUAACAUUUACUCCAGAUAAAUAGCUACAUAAACAGAACUCGGCUUAUAUUUCACCUAGGCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((.....)))))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...((((]]]]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........))))))).........}}}}}}}}.)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...((((((((((............((((.((((((((.....(((((.........(((((.(((((...)))))..((((....)))).(((((..((((((......(((((((((((((...))))))))...)))))...((((((.......))))))....(((((....)))))))))))..)))))...))))))))))........((((((.....)))))).)))))))).(((((...(((.....))).....((((((((....))))))))..)))))....))))....)))))....)))))..)))))))))))....
|
|
ASE_00448
|
[ FASTA input ]
|
GCGGUGAAGUCGGCUGGGCAGUCGCGUCAUCCGAGAGGAUGCCGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAAGGUGCCAGGUAACACCUGGGCGGCGUGAGUCGACGGAAAGUGCAACAGAAAGAUACCGCCAAUAUUCCUUUCUAGGAUUCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGAGUUCGGUAACGGACCGGCACGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCUAUGGUGUGGCCCGCGCUGGAUCCGGGUAGGUUGCUUGAGCACCGUGGUGACGCGGUGCCUAGAUGAAUGGCUGUUCAUGACAGAACCCGGCUUAUAGGCCGACUUCACCGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((...((((....)))))).)))..)).......((((((.......))))))(.(((((((....))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((...))).)))))).........(((((((((((((((((((((((((((.((((........(((..(((.....(((((.......((((....))))..))))).((((.....((((((.......))))))....(((((....)))))...........))))...)))..)))..((((..((((...)))))))).)))).)))))))..)))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))..((((...(((((((......))))..))))))).)))))))))))))))...
|
|
ASE_00451
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUGACUAGACAGUCGCCGCUUCACUGCCGUCCCUUUCGGGGGAGACAGGUGGAGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGCAAGCCUACGACAAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCACGCAAGUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGCAACAGUUCGUGGCAUGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCGCAUGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAGGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUACCGGUCAACUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((....))))))))).)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..................(((((.(((((....))))).....((((((....(((...)))...))))))..)))))(((.((((((...)))))).((((....))))........(((........))).[[[)))..((((((((....))))).)))]]]..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...[[[[......)))))........]]]].....((((((....((((((...)))))))))))).((((((((((((..((((((((....))))))))...)))......(((((...)))))....))))))))).)))))))))..
|
|
ASE_00452
|
[ FASTA input ]
|
GAACACUGUGGGACACUAUGCCGACCCGCUGACUUUCUCGGUCAACGGGCCGUUUCCGUGAGGAAAGUCUGGGGAACUAGGCUUGCAGCUGCUGUCACAAGAAAUCAACGCUCACAGUAGCGGAUGGGAAGACAGCAGAGUUCCAUUUAGCUUGAACACAACGUUGAUUGUUUAAGGCUUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACAAGAA |
|
[ reference structure ]
|
........((((((......................................(((((....)))))((((((....)))))).......(((((((...........(((((......))))).......)))))))..))))))...((((((((((..........))))))).)))..........................
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((....(((...((((.(((((.....))))).))))...............((((((((....))))))))))).((((((((.......(((..((((......))))))).....)))))))).)))))))............(((((..[[[[[[........)))))...]]]]]]............
|
|
ASE_00453
|
[ FASTA input ]
|
GAAUUCAGCGGGACGGCAAUGGGUUAGUCGUCAUGACUAAUUCGGCGCAUAACCGGUCGCCUCUGCAGCGUAAGCUACAUUGGGGACUUUUCCGUGAGGAGGGAUCUUGGGGAACCAAGACCAUAUGGUUGUUGUCAUCAGAAAUCAACCAGGUUACGUAAGUUACCUGGUAUGGGAAGGCAACUGUAAGUUCCGUUUGACUUGUGCUAAUUAGUAUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGAAGGACAAGUCUUAUAGAUUUGAA |
|
[ reference structure ]
|
........((((((.........................................................................((((((....)))))).((((((....)))))).........(((((((...........((((((((((....)))))))))).......)))))))....))))))...((((((((((....))))))).)))....................(((((((...)))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[((((((.........))))))......)))))((((..........)))).]]]](((....)))....(((.[[[..((((....))))...((((((....)))))))))..........]]]...........(((((((..........)))))))...((((.....[[[[[[[))))......((((((((....))))))))((((.((((......)))).))))....]]]]]]].......
|
|
ASE_00454
|
[ FASTA input ]
|
UCCUACGCAAUUUUACCUGCCUUCAUAAGGAACUCAAAGGGUUCAGUUAGUACUUAACUUACUAUAUAAGCAGGUGGGAAAUUCGGUGGAACUCUAAGAGACAAUCAGCCGGAUCUUUAGCUUAAUUGUUAAAGAACUGUUUCCGUGAGGAAAGUCUGGGGAACUGGACUUGCAGCUGCUGUCACAAGAAAUCAACGCCCUUUGUUGGUGGAUGGGAAGGCAGUAGAGGUCUCUUUUGGCUUGGAUGCAAAUUUGGACGUCCAAGGCUUGCUGAGUGCAAUCGUGGGACAAAGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.......(((((..........(((((((((((...........)))))))).))).......))))).....................((((((.....................................(((((....)))))((((((....)))))).......(((((((...........(((((.......))))).......)))))))...))))))...((((((((((..........))))))).))).............)))))))(...)..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((((((((.....((((((((((...))))))...[[[[[))))...]]]]].....))))))))))..(((((.....(((...))).....[[[)))))((((((((......)))))))).]]].....(((....((((((((....))))))))....[[[[[[[))).....(((((((.....)))))))..........]]]]]]]........((((.[[[[[[[[))))......]]]]]]]]..((((.....)))).))))))).......
|
|
CRW_00001
|
[ FASTA input ]
|
CACAAUUAUUUAAUGGUGCGACAAUAUUUACAUGGUAAUUCACAAUUAUUUAAUGGUGCGCCUCUCAGUGCGUAUAUUUCGUUGAUGCGUCUAGCAUUAGUAUUAUGAAUCAUCAAUAGAUACUUAAAACAUAUGACUAACUCAGUAGGGGCUAACUUUACGGGGACAAUAGCAUGUCAUAAAACACCUAUGAUUAGUGUAGGUGGAGUUAAGUGUUACAUGGUUAGGUUAACGAACUUCUUACAAGUCUUUAUCAGGAUUACAAUUUCCUCUUAUCAUUUGGAUAUAGUAAAACAAGUUUGAUUAUUUUACGUUGAGGUAAUCAGAUUAUGAUUCAUUGUUUUAGAUAGCACAGGCAGUGUGAAAAAGAUGAAGGACCUAAAUAACACAAAAGGAAAUACGAAAAGUGAGGGAUCAACUGAAAGAGGAAACUCUGGAGUUGACAGAGGUAUAGUAGUACCGAAUACUCAAAUAAAAAUGAGAUUUUUAAAUCAAGUUAGAUACUAUUCAGUAAAUAAUAAUUUAAAAAUAGGGAAGGAUACCAAUAUUGAGUUAUCAAAAGAUACAAGUACUUCGGACUUGUUAGAAUUUGAGAAAUUAGUAAUAGAUAAUAUAAAUGAGGAAAAUAUAAAUAAUAAUUUAUUAAGUAUUAUAAAAAACGUAGAUAUAUUAAUAUUAGCAUAUAAUAGAAUUAAGAGUAAACCUGGUAAUAUAACUCCAGGUACAACAUUAGAAACAUUAGAUGGUAUAAAUAUAAUAUAUUUAAAUAAAUUAUCAAAUGAAUUAGGAACAGGUAAAUUCAAAUUUAAACCCAUGAGAAUAGUUAAUAUUCCUAAACCUAAAGGUGGUAUAAGACCUUUAAGUGUAGGUAAUCCAAGAGAUAAAAUUGUACAAGAAGUUAUAAGAAUAAUUUUAGAUACAAUUUUUGAUAAAAAGAUAUCAACACAUUCACAUGGUUUUAGAAAGAAUAUAAGUUGUCAAACAGCAAUUUGAGAAGUUAGAAAUAUAUUUGGUGGAAGUAAUUGAUUUAUUGAAGUAGACUUAAAAAAAUGUUUUGAUACAAUUUCUCAUGAUUUAAUUAUUAAAGAAUUAAAAAGAUAUAUUUCAGAUAAAGGUUUUAUUGAUUUAGUAUAUAAAUUAUUAAGAGCUGGUUAUAUUGAUGAGAAAGGAACUUAUCAUAAACCUAUAUUAGGUUUACCUCAAGGAUCAUUAAUUAGUCCUAUCUUAUGUAAUAUUGUAAUAACAUUGGUAGAUAAUUGAUUAGAAGAUUAUAUUAAUUUAUAUAAUAAAGGUAAAGUUAAAAAACAACAUCCUACAUAUAAAAAAUUAUCAAGAAUAAUUGCAAAAGCUAAAAUAUUUUCGACAAGAUUAAAAUUACAUAAAGAAAGAGCUAAAGGCCCACUAUUUAUUUAUAAUGAUCCUAAUUUCAAGAGAAUAAAAUACGUUAGAUAUGCAGAUGAUAUUUUAAUUGGGGUAUUAGGUUCAAAAAAUGAUUGUAAAAUAAUCAAAAGAGAUUUAAACAAUUUUUUAAAUUCAUUAGGUUUAACUAUAAAUGAAGAAAAAACUUUAAUUACUUGUGCAACUGAACUACCAGCAAGAUUUUUAGGUUAUAAUAUUUCAAUUACACCUUUAAAAAGAAUACCUACAGUUACUAAACUAAUUAGAGGUAAACUUAUUAGAAGUAGAAAUACAACUAGACCUAUUAUUAAUGCACCAAUUAGAGAUAUUAUCAAUAAAUUAGCUACUAAUGGAUAUUGUAAGCAUAAUAAAAAUGGUAGAAUAGGAGUGCCUACAAGAGUAGGUAGAUGACUAUAUGAAGAACCUAGAACAAUUAUUAAUAAUUAUAAAGCGUUAGGUAGAGGUAUCUUAAAUUAUUAUAAAUUAGCUACUAAUUAUAAAAGAUUAAGAGAAAGAAUCUAUUACGUAUUAUAUUAUUCAUGUGUAUUAACUUUAGCUAGUAAAUAUAGAUUAAAAACAAUAAGUAAAACUAUUAAAAAAUUUGGUUAUAAUUUAAAUAUUAUUGAAAAUGAUAAAUUAAUUGCCAAUUUUCCAAGAAAUACUUUUGAUAAUAUCAAAAAAAUUGAAAAUCAUGGUAUAUUUAUAUAUAUAUCAGAAGCUAAAGUAACUGAUCCUUUUGAAUAUAUCGAUUCAAUUAAAUAUAUAUUACCUACAGCUAAAGCUAAUUUUAAUAAACCUUGUAGUAUUUGUAAUUCAACUAUUGAUGUAGAAAUACAUCAUGUUAAACAAUUACAUAGAGGUAUAUUAAAAGCACUUAAAGAUUAUAUUCUAGGUAGAAUAAUUACCAUAAACAGAAAACAAAUUCCAUUAUGUAAACAAUGUCAUAUUAAAACACAUAAAAAUAAAUUUAAAAAUAUAGGACCUGGUAUAUAAAAUCUAUUAUUAAUGAUACUCAAUAUGGAAAGCCGUAUGAUGGGAAACUAUCACGUACGGUUUGGGAAAGGCUCUUUAACACGUGGCAACAUAGGUUAAUUUGCUAUUUCAUUUUUAGUAGUUGGUCAU |
|
[ reference structure ]
|
...........................................((((..<<<<<(..((.{{{{......{{{{{.{{{{...(((((.....)))))((((((aaaaaaaaa.....))))))...{{{.{{{{{{...(((.((((((.....))))))))).......))..}}}}}}...((((((((.....))))))))..}}}..<<<<<<<..<<<<.(.....)...<<<<......<<<<<<<<<<<<<....))))>>>>..((((.....))))...(((((((((((((((((((...)>>>>>))))))))))))AAAAAAAAA)))))))>>>>>((((.....))))....>>>>>>>>>>>>...>>>>>>>....}}}}}}}}}......}}}}..((((((...((((....))))..)))))).(..(((((.......((.....((((........))))((((((((((...((((..((((....))))..)))).))))))))))..))....))))).((((((((.(((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((...(((((..(((....)))..)))))...))).)))).).................
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((....))).)))............((((((((((...)))))))..)))((((((...[[[..)))))).......((((((.....))))))......]]]........................(((((((((...((((((.....))))))...((((......))))......((((((((.....)))))))).......((((((.....(((((((.....((((.....))))(((((((((((........))))......(((((((.(((((......(((((((((((((((...))))))))))))))).......)))))))))))).((((.....))))......)))))))))))))).))))))..................((((...((((((...((((....))))..))))))....(((((....))))).....))))..((((((((((((((((((((...((((..((((....))))..)))).)))))))))...............(((((((((..(((((....((((((.......)))))).....)))))...(((((((((((((..........................(((((((((..((((.......(((((((((((((((.((((..(((.........((((......((((((..........))))))......)))).........))).....))))))))))))).......(((....)))(((((((((.........((((((((((((.(((((.((((.(((......((((....(((((((........)))))))....))))..(((.....)))(((((((((...((((((((....))))))))...)))))))))...............)))..)))).))))).))))............(((((...)))))))))))))................((((((.......((((((.((((.((((((((((......(((((((((...((((((((..(((((((.......)))))))...........(((((((...(((((.(((((((.....))))))).))))).....)))).)))))))))))......))))).)))).....)))))))))).))))))))))....((((.......(((((((((.(((((((..........(((((((.........(((((((......)))))))..(((....(((....))).....)))..........))))))).......)))))))..........(((((....)))))....)))))))))........))))....))))))..............))))))))).............))))))....)))).(((((((((((......((((....(((((.....(((((((...))))))).(((....(((((...((((((...((((((.(((...)))...)))))).)))))).)))))...))).......))))))))).(((.......((((((.((((......))))....(((((.(((..(((((..(((((......)))))..)))))..))).))))).(((....))).....)))))).......)))........))))))))))))))))))))..........((((((((..(((((((....(((((((.((((...(((((((....))))))).....)))).......((((((((........((((((.((((.((((..((((((....((((((....((((((.((((...))))))))))....)))))).......)))))))))).))))))))))...((((.....((((((((.((((((((((((......(((.(((((..........((((((.(((..(((((((....(((((...))))))))))))...)))))))))........)))))))).....))).....(((((((.....(((((((((((.......(((((............))))).....))))))))))).))))))).....))))))...)))))))))))....((((((((.(((((...(((.((((.....(((...(((((((....))))))).)))..)))).)))...))))).))))))))))))............)))))))).......))))))).....(((......))).)))))))..))))))))(((((........((((......))))..))))).................)))))))))))))...)))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))......(((...(((((..(((....)))..)))))...))).)))))))))))...)))))))))
|
|
CRW_00002
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUGGGACAUUUUCGAGCGGUCUGAAAGUUAUCAUAAAUAAUAUUUACCAUAUAAUAAUGGAUAAAUUAUAUUUUUAUCAAUAUAAGUCUAAUUACAAGUGUAUUAAAAUGGUAACAUAAAUAUGCUAAGCUGUAAUGACAAAAGUAUCCAUAUUCUUGACAGUUAUUUUAUAUUAUAAAAAAAAGAUGAAGGAACUUUGACUGAUCUAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAAAUGUUAUAAAAUUACUUACACCACUAAUUGAAAACCUGUCUGAUAUUCAAUUAUUAUUUAUUAUUAUAUAAUUAUAUAAUAAUAAAUAAAAUGGUUGAUGUUAUGUAUUGGAAAUGAGCAUACGAUAAAUCAUAUAACCAUUAGUAAUAUAAUUUGAGAGCUAAGUUAGAUAUUUACGUAUUUAUGAUAAAACAGAAUAAACCCUAUAAAUUAUUAUUAUUAAUAAUAAAAAAUAAUAAUAAUACCAAUAUAUAUAUUAUUUAAUUUAUUAUUAUUAUAUUAAUAAAAUUUAAUAUAUAUUAUAAAUAAUUAUUGGAUUAAGAAAUAUAAUAUUUUAUAGAAAUUUUCUUUAUAUUUAGAGGGUAAAAGAUUGUAUAAAAAGCUAAUGCCAUAUUGUAAUGAUAUGGAUAAGAAUUAUUAUUCUAAAGAUGAAAAUCUGCUAACUUAUACUAUAGGUGAUAUGCCUAUCUUUAUUUAUAUAUAUAUUAUUAUUAUUAAUAAUAAAAAAAAAUUAAAAAAGAUAGGAGGUUUAUAUAUAACUGAUAAAUAUUUAUUAUAUUAUUUUUUUUAUAAUAAAUAUUAAAAGAUAUUGCGUGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUUACCGGGGGAAAACUUGUAAAGGUCUACCUAUCGGGAUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((...bbbbbb(..((..<<<<....<<<<<<<<<<<<..(((((((((......)))).)))))(((((({{{{{{))))))<<<<..<<<<<<((((((((...(((....))).))))))))..))>>>>>>....(((((.(((....((((aaaaa...((((((...))))))..))))....))))))))>>>>.bbbbbbb..bbbb.((....))...bbbbbb.........bbbbb..))))))((((((((...AAAAA.....))))))))((((((((((((((((....))))))))))))))))(((((((((((.(((((...)BBBBBB.))))).}}}}}}.))).))))))))BBBBB....BBBBBBBBBB...BBBBBBB.......>>>>>>>>>>>>..>>>>....(((((.((((((((((((((((...........)))))))))))((((((.....((((((((.......................................))))))))))))))...(((((((((((....))))).....))))))...))))).)))))...(....((((((..(((.....(((((((.....)))))))...(((((....)))))..((((....)))))))...)))))).....(((((((............................................................................................................................)))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).))))..)..
|
| [ predicted structure ] |
.(((..[[[[....)))....]]]].....((((((((((((.......((((......)))).....(((((((......)))))))(((..((((((((((((((...(((....))).))))))))....))))))))).(((((.(((....((((.....((((........))))....))))....)))))))).....(((((((..((((............((((((..((((...(((((........((((((((....(((...)))))))))))((((((((((((((((....))))))))))))))))(((((((((((.....(((((............)))))...))).)))))))))))))))))))))))))))...))))))).......)))))))))))).............((((((((((((((((((..........))))))))))).....((((.((((((.(((((((((..(((((((((((((......)))))))........))))))...))))))))).)))))))))))))))))..(((((((........)))))))........((((((..(((.....(((((((.....)))))))...(((((....)))))..((((....)))))))...)))))).....(((((((.(((((((((..[[[[[[[[[((((((((....)))))))).............))))))))).....]]]]]]]]]......(((((((((((((..........))))))))))))).....)))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).)))).....
|
|
CRW_00004
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGCAAGUCUGGUUAACAUAUUAUCAGCCAGAUGUUGAUAUCAUACUACACACACAACAGAGUACUACUAGUGCUGCUCUCUUGUUGUUGUGGGUGUGUGAUAUUGGCAGAAAGUUGGAGAUAAGCACCAACUGUACACCGUAAAUUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUAUUCUACCGCGGCUAUGAGGAUGACUCAUAGUGCAGCAGGUGUGGAUAACGCCCACCGGAUGGUAAUAACGAAUAGGAUGACCUUAGUACCUCCAUAAGCAUAAUAAUAACAAAAGGUCGCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCCAUAUGCUGGGAGAAGGUUCAGAGACUAUAAUCGGAUGGGCGCAAGCUUAAGGUAUAGUCCACUCCCACUUCGAAAGAGGUGCUAUAAAACUAUUAAGAAGUUUGCUUACUUCCUAGGGUUUUAUAGAUCCGUUGCUUGUAUAUAUACAACAUACGUGAGUGUGUGGUGUAUACAUCAAUACCCCCAAGGAAAUGCUUGGUUGGAAGAUGGUAGCAAGGGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCC |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((((...........)))))))((((((((((((((....((((.(((((((((((...))))))......)))))..))))...))))))))))))))....(((((.........)))))....((((((....((((((....(((.....((((((((((((((.(((((((.....))))))))))....((((.((......))))))....)))....).))))))).(((((((............................)))))))....)))...))))))(((...((((((.....))))))..)))...[.[[[[[...)))).))(((....))).......]]]]]].((.(.(((((....))))))((((((((((.....(((((......)))))....)))))))))).........................................................................................))......................
|
| [ predicted structure ] |
...((((..((((((((...........))))))))....(((((((((..((((.(((((((((((..........)))))...))))))))))...)))))))))........((((((.........)))))).....(((((...)))))............))))....(((((((((((((((.....))))))((((....((((...........))))(((.((((.........(((....)))...)))))))....)))).................((((((((........((((...((((((.....))))))..))))....(((((((...[[[(((((....)))))...)))))))...]]]((((((....))))))((((((((((.....(((((......)))))....)))))))))).)))))))).(((((((((...((((((....)))))).)))))))))..................((((..[[[[[........))))....]]]]].))))))))).....
|
|
CRW_00005
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCAAGUCUGGUUAACAUAGCAGCCAGAUGUUGAUAUCAUACAAUGCAUGAGAGAGAGUACUAUUAGUGCUCUCUUGUUGUGGUGUGUGAUAUUGGCAGAAAGUUGGAGAUAAGCACCAACUGUACAACCGUAAAUUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUAUUCUACCGCGGCUAUGAGGAUGACUCAUAGUGCAGCAGGUGCGGAUAACGCCCACCGGAUGGUAAUAACGAAUAGGAUGACCUUAGUACCUCCACAUAACAUAAUAACAAAAGGUCACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCCAUAUGUUGGGAGAAGGUUCAGAGACUAUAAUCGGAUGGGCGCAAGCUUAAGGUAUAGUCCACUCCCACUUCGAAAGAGGUGCUAUAAAGCUAUUAAGAAGUUUGCUUACUUCCUAGGGUUUUAUAGAUCCGUUGCUUGUAUACAAUAUACGUGUAUACAUCAAUACCCCAAGAGGAAAUGCUUGGUUGGAAGGAUGGUAGCAAGGGCCAGCAGCCGCGGUAA |
|
[ reference structure ]
|
........(((((((........)))))))((((((((((((((....((((.(((((((((((...)))))))))))..))))..))))))))))))))....(((((.........)))))....(((((((....((((((....(((.....((((((((((((((.(((((((.....))))))))))....((((.((......))))))....)))....).))))))).(((((((..........................)))))))....)))...))))))(((...((((((.....))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((.(.(((((....))))))((((((((((.....(((((......)))))....))))))))))............................................................................))..................
|
| [ predicted structure ] |
.((((..((((((((........))))))))....((((((((((.((((...(((((((((((...)))))))))))..)))).))))))))))........((((((......[[[))))))..............]]](((....)))....))))....(((((((((((((((.....)))))).(((......(((((((...(((((.......................(((((((..........................)))))))...))))).)))))))......((((((.....))))))..(((((...(((((((......(((((....)))))...)))))))......((((((....))))))((((((((((.....(((((......)))))....))))))))))((((((((..((((((((.......)))))))).))))...(((((........)))))......))))........))))).)))))))))))).
|
|
CRW_00007
|
[ FASTA input ]
|
CAAGUCUGGUGAACGCAUGCAUGCUUCAAGCCCUCGUUAAAAUAAAAUCGCGCCAGGUGUCGUUUGUGGCCACAUCAUGCACAAAGAGAGCGAGCACUUGAGCUGUGCUCUGUGUGUGUGUGUGUGUGUCGCGAGCCGGCAAAAUAUGGGAAACAAGAGCCCCCAUCAUACACUUCGAAAUUGUCGGGGAGUGCCCGUUAAGCUUUGACUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGGGCGAGCAAUCGCUCAGGACGCAGCAGUGUUACGUAGUGGUACACGGAUGGUAAAAACGUCAAAGAUAGGGUUGAUCCGCAGGGAAGCGCGAGUGCUCAUGUGUUUGUGUGUGAGCAAAGGCGAACCUUCAGAGACUCUAAUGAAGUGGGCGAAAGCUUAAGGGAGAGUCCAAUCCACGGGGAGACCCGGUCCACAGGAGUAAGGGGGCGCUGCUCACCCCCGAGGACUGUGGAUGAAGACAGACAGACACAGAAGAGUCUAUGUCUUCAGGUAGUCAAUGGCCAGCAGCCGCGGUAUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((.......................................))))))).((.((((((......................)))))))).(((...(((((((.(((.....................................))))))))))...)))..(((((((....((.((((....((((......((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((.((......))))))....)))....).)))))))...))))...))))))(((...(((...((((((((((....))))))))))...)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((.(.((((....)))))(((((((......(((((.........))))).....)))))))((((((((...((((........)))).))))))))........))..........................
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((...(((....)))....(((....)))............)))))))((((((((((((((((((((((((((...(((((((((......))).)))))).)))))))).))))).)))))))).)))))....(((((.....[[[[[.)))))..(((.((((((.....)))))).)))........]]]]]...((((((((((((((....)))..((((((....)))))).))))............(((.[[[[...)))((((.......))))...............]]]].............((((((...[[[[[[...))))))...]]]]]](((((..[[[[[[..)))))(((((....)))))....]]]]]]...(((.((((....))))[[[[...)))......]]]]((((((.....(((..(((((....((((((((...((((........)))).))))))))..)))))..)))..))))))))))))).........
|
|
CRW_00009
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUUUUUUUUUGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUUAACUACUACGCGCAGUAGAUGCACGUCUGGGCCUGGAAAAGUAGGCUUAGUCCUGCUAGUGCCGACUUUACCUACGUGGAGGAAGCAAUUGCCUCCAACUCAGGGCGUAGGCGAUGGCUUUAAUAAGCCGUCGUGUCGGUGCGACACCAGCUGGUACAGGGGACGCCUAACCGUCUUAUAGGGACCGGCGGCCCGAUCCUGUGGCGAGCCCGAGUAGCGUCGGGCCGUCGCAACGCACGCUAAGCGGUGGGCUCUCAACAGAGGGCUUAAGGUACGUGCUAAUCCACGGGAUAACCGUGGCCGCCUUGACUAGUUCCGAGUUUACGAAGCAAGGCGGGGGUGGACAGGCGCUGCAAGGCCCUUGUCUGCUUGUGGAACAAUUUUCUAGUAAAGUCAUAUGUUAUGAAGCUUUAUUGGAGAGUUGAAAAAAUGCCAGACACAAGUAGGAUUGACAGAUUGAGUUUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.............................................(((((((.............................)))))))...((((((......)))))).((((((((....(((((((.((((.........)))).........)))))))(((((((((....))))))))).))))))))..((((.(((...((((((...(((...((((((.....))).))).)))....))))))((((.((((((......))))))))))...[.[[[[[...)))))))(((((((....))))))).......]]]]]].((((((((.....))))))((((((((....(((............))).....))))))))(((((((..(((((...))))).)))))))....(((((((((((((((((((((...))))..))))))))))))))))).....))...........................................
|
| [ predicted structure ] |
...............((((((((((.........(((....))).(((((((..[[[[[(((.(((.....))).)))...)))))))...]]]]]..(((((((((((.((((((((..........((((((.........)))))).....[[[[....((((((((((....)))))))))))))))))).......((((((....((((((......))))))......)))))).]]]].....(((((((.((((((.[[[[[))))))))))))).....]]]]].....(((((((((....)))))))))..............((((((.....))))))((((((((.[[[.................))))))))...]]]...(((.[[[[[[[)))........]]]]]]]..(((((((((((((((((((((...))))..))))))))))))))))).................)))))))))))))))))))))............
|
|
CRW_00010
|
[ FASTA input ]
|
GUUUAUUUGAUGGUACCUACUACUCGGAUAACCGUAAACGAGAGUUAUUGCGGUAGGGAGACGAGAGUCGUCCCUAGUAGCUCGUCAGAGCUGCGACACUGUCAAAUUGCCUGGACAUCCCGCUACGCUGAGGAGACCGUCUGAUUGGGGAAACCUGAUCGGACACCGACGGUGAAAGCCGUCGGGUAUGGUAACACUUCCUCGGCUAGGGACUAUGGGCAGCCAAGCUCUAAAAGCCUCCUUGGCUCAAGAGUGCAGUUCACAGACUAAAUGGCAGUGGGUGUCCGCCUCCCCAGGCGGAUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCCCCAUCGAGAGGUGGACCGUCGGAGGAAUGGGGCGUUCAGCCCCAGGAGAGCCGAUGGUGUCUGACGACUGGAGUCGCCAGGCGGAGCAAACGAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCGUAAAUCCCGACUCCU |
|
[ reference structure ]
|
.............................(((((((............)))))))...(((((.....)))..)).(((((((....)))))))..(((((((....((((((....((((......((((((((((((((((((((((....))))))))))).((((((((....))))))))....)))....).)))))))...))))...))))))(((..((((...(((((.....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((....))))))))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((.....((((((.....))))))......))))))))((((((((((....)))))))))).......)).........................................
|
| [ predicted structure ] |
..........((((....))))((((.....[[[[[[.)))).....]]]]]](((((((((....))).))))))(((((((....)))))))..((((((((...((((((....((((.....(((((((((((((((((((((((....))))))))))).((((((((....))))))))....))).....)))))))))..))))...)))))).....(((((...((((.....))))..)))))..((((....))))...))))))))(((((((((((....))))))))))).................(((((....)))))((((((((.....((((((.....))))))......))))))))(((((......[[[[[[[.)))))...(((....(((.........)))......)))........]]]]]]].
|
|
CRW_00011
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUUUUUUCUAUGGGUGAAAAGUAUUGCACUUACUGCCCAUGAAAGCAGCCCGUCCCGUCGUCACGGGGCAGAGCGGGCUGCUAGUCACCGCCGCACCGCUAUCUGCGAGGUGCGGCGGCUGGCGAGACCGUCGAAUUGCGGGGACACCCUUAGAGCCUGUGUCACCAACCCGGCGUGGAAACACAGCCGGGGGCCGGGGUAAUUACCUAGGGUAUGGUAAAAGCACACAGGAUUGGGCUAUCCGCAGCCAAGCUCCUAAGGGCCGAGCGAUCGGCCUAGGGAGAAGGUUCAGAGACUAGGUGGCGGUCGGUUCCCAAAGUAUCGCUUGGGGGCUUAAGAUAGAGUCCGACACAGCAGAAAUGCUGCCUCGGGACGAAUGUUUCGAGCAGAAACGGGAGUCCGGGGGAGGGGGAACGCACAGUUGCUCCCCCUUUGAGUAGUCGGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGGUUGCCUUGU |
|
[ reference structure ]
|
..............(((((((.................)))))))...(((((((((((((((....))))).....)))))))))).((((((((((((((...........)))))))))).))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((((((((((((....))).))))))))(((((((....)))))))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...((((...(((((((....)))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((........))))))))).......]]]]]]((..(((((....))))).((((((.....((((((.....))))))....))))))(((((((((............)))))))))......))........................................
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((.(((((...((((.......)))).........(((((((((((((((....))))).....)))))))))).((((((((((((((...........)))))))))).))))....((((......))))...))))).)))))(((((((.((((.(((((((((....))).)))))).(((.((((....))))..))).))))......)))))))...((((.((((((((((...(((((..(((((((....))))))).)))))..))))....(((((((.((((((((((((((((........)))))))))..........((((((.(((((....))))).(((.((((...((((((.....))))))...))))....((((((((..(((....))))))))))).)))..))))))........)))))))))))))).)))))).))))...
|
|
CRW_00012
|
[ FASTA input ]
|
GUAACAAGGUUUUAUCCUAUGGAAGCCUUUGCAGCCCGAUGAAGGGUGGGCGCUCGCGACUAGAUAAAUAAUGACGAAUGCCUGAAAUGCAAGCGGCGGAACAUCUCUUUUAGGGUGUUUGGCCGCGAUCUUCUCAAAUUGCGGGAAAAGUGCUCAAAUUGGCCGUAAAGACACCGCGGCUCUUGUGGACAACACAGAGUGCAGCAGGCGGGGUAGCACCCUGCUGGAUGGUAACAGAUCUUUCGGACACGGGCCUAAUCCGCAGCCAAGCUCCGUAGCGCAUUUUUGUUAGUGCGUCGGAGAAGGUUCACAGACUGUAAGGGAAGGGGUUCGCACUUGUGUGCGGGCUUAAGAGACAGUCGGUCCCUCUGUGAGAGCAGAGUUCCGGGUUUGAGGAAGGUGCGCCGCCGACAAAUGGGCCACCAGAGAGCGCCUGGAGAGUCGUGUGUUUUGCGGGUGUUUGCGGAUAACUCGCGCGCGUGAUUGGCUUUUCUGAACGGAAUCAAAAAAUGUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAGAA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((((..........)))))))((((((((......))))(((((..........................)))))....)))).((((((((((((((......))))))))))))))..(((((((....((((((......(((........(((.((((((((((((.((((.(((.....))))))))))....((((((((...))))))))....)))....).)))))))).....)))....))))))(((...((((...((((..........))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((....))))))))).......]]]]]]((..((((((....))))))((((((((........((((.(((...........))))))).......))))))))(((((.......(((((((...........)))))))........)))))....................))................................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((........))))))))....((((......))))(((((.(((..................))).)))))(((.[[[[[(((((.((((((((......)))))))).)))))....))).....]]]]]......((((((.....((((((.........))))))...(((.....))).))))))....((((((((...))))))))((((........))))...(((...[[[[[[..))).........(((((..(((((((......)))))))))))).]]]]]]...((((((...[[[[.((((((((((....)))))))))).....)))))).....((((((....))))))]]]].(((........[[[[.[[[)))........]]]]]]]...(((((((((.((((.[[[[[[)))).)))))))))..........]]]]]]........((((.[[[[[(((((((........)))))))))))...(((.....))).]]]]].
|
|
CRW_00013
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACGUUCUGAGGGAUGUAUAUUUCACAGCGGGGUUUGGCAACUAAACUUCGAGAGGGUCAAGUAACGUAAAAGGCGUUGCUAGUGGGCAGUGCUGACCUCUGGACCGGCGAUCCGCGACGAGAGACGCCCCCGCGACAUCAUCAAAUUGCGGGGACUCCCUAAAGCUGUGUGCUACUAAGCAGGUGCCGAAACGACCUGUGGCCGGGGUAAUGACCUGGGGUAUAGUAAAAACGCACCAGAUGCCACAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGCAACAGGCCUCUUCCCGCCCGUGGGGGAGAGUGUCCCGCGCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAAACGGUGAUGGGCUAGCGUAAUGAAUGCGUUCUGCACACUCUUACGCCGGCUUAAGAUAUAGUCUACUCCCACUCCGAAAGGAGGGGUACUAAAAGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((......................................................))))))((((((((.....)))))))).(((((..........................................)))))..(((((((....((((((....(((.....(((.((((((((((((((((.((....))))))))))(((((((....)))))))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...(((.......((((((((.......))))))))........)))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((.((((((((...))))))))))))))))))).......]]]]]]((...(.((((....)))))........))...........
|
| [ predicted structure ] |
....(((.[[[[.)))..]]]].................((((((((((...))))))))))((((((((.((((((((.....))))))))....)))..[[[[[.)))))....]]]]]....(((..[[[...)))((((((((..........)))))))).]]].....(((..[[[))).....]]](((((.........[[[[[[(((((.......)))))..............)))))....(((......)))...]]]]]]...........(((....[[[[[[[[[[[)))....]]]]]]]].]]]..(((...[[[[)))..]]]]....(((..[[[[[.)))....(((.((((....)))).))).........]]]]].(((((((..((((.....(((.((((....))))))).)))).....)))))))..
|
|
CRW_00014
|
[ FASTA input ]
|
UAGAAAAGUUACCACAGGGAUAAACUGUAAUAUUGUCCCAGGCCGGGUCUCAUCAGCCCGGGCCUAGUCUGGUCCCCCCCGAAUAGCACUGGGGGAGAAUUCAGGCGACACACUGGAUGCGGGGAACUCUCGUUAGGCGUUUGGUACCACCCAGCAGGAUAACACCCUGCUGGUUCCAAUGAUACGGGCAUCAGGUAAAAAUUCAAACGAUAGAGCCAAUCCGAGCCAGUUGGCUGCCCCAUGGAUUUGGGGGUGCUGGCCGGUUCAACGCUCGCUAAGGUGUGGGUUGCGGGGAGAAAAAAAAAAGAAAAAUACAGAGGGAAUCCCCCGCGGCUUAAGGUACGUACGCCCAUCCGAGAGGAUGACAUCGCUAGCAGUGCCUGCCGAGAAGCGGUGUGACGCCCUGGCUUCAGGCCGGGGCAGGGUAUUACGGAACUGGCUUGUGGCGGCCAAGCG |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((.........)))))))(((((((((.......))))).)))).((((((((((((((...........)))))))).))))))..((((((...(.((((....(((.......((((((((((((((((((((((.....)))))))))))...(((.......)))..)))....).)))))))....)))...)))))(((..(((((..(((((......)))))..)))))..)))...[....[[...).)))))((((((((((...............................)))))))))).......]]].((..(((((....)))))(((((((..((((...))))......)))))))...((((((.((((.....))))))))))....))........................
|
| [ predicted structure ] |
.............((((.[[[[..))))..]]]]...((((.((((((.......))))))[[[[[((((((...((((((........)))))).....))))))......))))..((((((...))))))]]]]]((((((((((..((((((((.......))))))))......((((......)))))))).....))))))(((.[[[[[.)))...((((((......(((((......)))))..)))))).]]]]].(((((......)))))(((((((((((...............................)))))))))))..(((......)))(((((....)))))((((((((...[[[[[[[.......))))))))...(((((((((...))))))))).]]]]]]].......(((((......)))))....
|
|
CRW_00016
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAAAUGGCACGAAUGUUCUGAAAGACAAAUUCGAGAGGGUCAAGUAACGUAAAAGGCGUUGCUAGUGGAGGUUUUGGAACCGAAACCUCUGCUACAUCAUCAAAUUGCGGGGACAUCCUAAAGCUGGUGCUACUAAGCAGGUGCCGAAACGACUUGUGGCCGGGGUAAUGACCUGGGGUAUAGUAAAAACGCGCCAGAUGACACAAUGGACAAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGUGCAGGAGACUUCUCUCCUGCACUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGACGGUGAUGGGCUAGCGUAAUGAAUGCGUUCUGCACACUCUUACGCCGGCUUAAGAUAUAGUCUACUCCCACUCUGAAAGGAGGGGUACUAAAAGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((...................................))))))((((((((.....)))))))).((((((((((........))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((((((((((.((....))))))))))(((((((....)))))))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...(((((((((((....)))))))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((.((((((((...))))))))))))))))))).......]]]]]]((...(.((((....)))))........))...........
|
| [ predicted structure ] |
..((((.......))))......((((.[[[..)))).((((....))))...(((((((.....)))))))((((((((((((((....))))))))))))))..]]].....(((((((....(((.....((((((((((((.((((((.........)))))).(((.((((....))))..))).))))).....)))))))..........)))...)))))))....((((...(((((((((((....)))))))))))..))))(((.....(((.((((.[[[[[.....)))))))......)))................]]]]].(((((((..((((.....(((.((((....))))))).)))).....)))))))..
|
|
CRW_00017
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGAACAAGCAUCAACGGGGUCAAUAGCGGUCACGUGCCGCUAGUCCAGCAGCCGAUCAGUUGUGGGUGGCUGCGGGCGAGACAACCUGGUACGGGGGAGCUACGGGGGAGGGCGGCUGGCGCGUCCUCCUACGGUGAUCCCGUGGCGAGCCUCUCGGGGCCGUCGUAACGCGCGGAAAGGUGUCGGUCGGUGGUCGCGAGGCCGCCGGCUUAAGGGACGUGCUAAACCCGGCGAAAGCCUGCCCUGUGACGGAGCGCCCACAGCGUAAAGUCCCAGGGGGCCGUACUUGUACAACACUCGGGAGGAAAUGCCCGGGCGGAGGCCGGUAUAUUUUAGUGUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.............................................(((((((............)))))))...((((((.....)))))).((((.(((((((............)))))))))))..((((.(((...((((((..(((..((((((..(((.....))).))))))...)))..))))))((((.((((....))))))))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((....))))))))))).......]]]]]]((...((((....))).)((((((((....(((.......)))....)))))))).........................................................))...........................................
|
| [ predicted structure ] |
................(((((((((((...[[[[..)))))))))))..]]]]..........(((((((((......(((.[[[[[[[...((((.(((((((.(((....))).)))))))))))..)))....]]]]]]]....(((.....[[[[[[[[[)))....]]]]]]]]]....)))))))))((((.((((....)))))))).....(((((..........(((((((((((....)))))))))))...[[[.)))))....]]](((....)))..(((((.(((...((((..[[[))))...))).))))).........]]].((((((...[[[[...(((((..(((....))))))))........)))))).......]]]]..........................
|
|
CRW_00018
|
[ FASTA input ]
|
CAAGUCUGGUGAACCACCGCACAAGAGGAACAAAAGCCCCUCUUGCCUGCACUCACAGCCCUCUUUAAACAAAAAUCACGCCAGAUGUCGUUGCCAGGGUCUUCUCAGACUGGACGGGCUCUUGUGCGGGACCACUGUCCCCAUUCACCUAAAUGCUACUCAGUCUGAUAUGGACGUCGCGCACGGCAAAAGAUGGGAUAUUGAGCUCCCAUCAUACACUUCUAAAUUGUCGGGAACGACCUGGAAGGGACUUGCGUUCCUUCCAAAAGGCUUUGGUUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGAGCGAGCAAUCGUUCAGGACGCAGCAGUGUACAUAACGGUGCAUGGAUGGUAAAAACGCCAGAGUAGGGUUAAUCCGCAGGGAAGCGCGAGCAUGUGGGCGGGGACACCUGUUUUGUUGGUGGCUCUGUCACGUGAAGGCGAACCUUCAGAGACUGUAAUGAAGUGGGCGCAAGCUUAAGGGACAGUCCAAUCCACGGGGAGACCCGGUCCACAGGCAUAGAGGGGUUUGCUCACCCUUGAGGACUGUGGAGAGUGACACACAUCACUCGGUAUCAAUGGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((...................................................................)))))))...................................................................................................................................(((((((....((.((((....(((((((((((((....)))))))))......((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((((......))))))....)))....).)))))))..))))...))))))(((...(((...((((((.(((((((((((.........)))))))))))))))))...)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((.(.((((....)))))(((((((......(((((.......)))))......))))))).(((((......)))))........))..........................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((......(((((.((((........(((((((((((((((((((....((((((((.....(((..(((......)))....)))....(((((....)))))))).)))))...)))).(((((((((((((...........(((((.....((((.....))))..(((((.((((((..(((((((........))))))).............))))))(((..((((((((((((((....))))))))).....((((((((((((...(((((((....)))..((((((....)))))).))))...(((.(((.....))).)))......)))).....)))))))).)))))..)))........))))))))))...(((((((.((((.........)))).)))))))(((((((((....)))))).....))).......(((((....))))).)))))))).........(((....))))))))..))))).)))))))))).......))))....((((...((((((......))))))(((.......))).))))..)))))....))))..
|
|
CRW_00019
|
[ FASTA input ]
|
UGACGCAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUAAAUAGCAAUAUUUACCUUUGGAGGGAAAAGUUAUCAGGCAUGCACCUGGUAGCUAGUCUUUAAACCAAUAGAUUGCAUCGGUUUAAAAGGCAAGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCACAGACUAAAUGUCGGUCGGGGAAGAUGUAUUCUUCUCAUAAGAUAUAGUCGGACCUCUCCUUAAUGGGAGCUAGCGGAUGAAGUGAUGCAACACUGGAGCCGCUGGGAACUAAUUUGUAUGCGAAAGUAUAUUGAUUAGUUUUGGAGUACUCGUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCA |
|
[ reference structure ]
|
..............................................(((((((((..............)))))))))...((((((((((......)))))))))).((((((((((((((.......)))))))))).))))..(((((((....((((((....(((......((((.(((((((((((((((((((....)))))))))))(((.....)))....)))....).)))))))).....)))...)).))))(((..((((...((((((((.....))))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((.....)))))))).......]]]]]]((...(((((....)))))(((((((....((((......))))....))))))).(((((((((((((((....))))))))))))))).........))..........................................
|
| [ predicted structure ] |
.................((((.......((((((......(((...[[[[[[[[[)))...........]]]]]]]]]...((((((((((......))))))))))....((((((((......[[[[...))))))))..]]]]..((((......)))).....(((.......((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...[[[[))).........]]]].((((...(((((((((...)))))))))..))))...((((...(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))))))..(((((....)))))...........((((......))))....))))))((((((((((.((((((....)))))).))))))))))............(((((......))))).(((((.......))))))))).
|
|
CRW_00024
|
[ FASTA input ]
|
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGUCAUUGCUAUUGGGGUCCGAUUUAGCCAUGCUAGUUGCACGAGUUCAUACUCGUGGCGAAAAGCUCAGUAACACGUGGCCAAACUACCCUACAGAGAACGAUAACCUCGGGAAACUGAGGCUAAUAGUUCAUACGGGAGUCAUGCUGGAAUGCCGACUCCCCGAAACGCUCAGGCGCUGUAGGAUGUGGCUGCGGCCGAUUAGGUAGACGGUGGGGUAACGGCCCACCGUGCCGAUAAUCGGUACGGGUUGUGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAUCUGAGACAAGAUUCCGGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUUUACACUGCACGCAAGUGCGAUAAGGGGACCCCAAGUGCGAGGGCAUAUAGUCCUCGCUUUUCUCGACCGUAAGGCGGUCGAGGAAUAAGAGCUGGGCAAGACCGGUGCCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCAGCUCAAGUGAUGACCGAUAUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGCCACGAAGGUUCAUCGGGAAAUCCGCCAGCUCAACUGGCGGGCGUCCGGUGAAAACCACGUGGCUUGGGACCGGAAGGCUCGAGGGGUACGUCCGGGGUAGGAGUGAAAUCCCGUAAUCCUGGACGGACCACCGAUGGCGAAAGCACCUCGAGAAGACGGAUCCGACGGUGAGGGACGAAAGCUAGGGUCUCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGCUCGCUAGGUGUGACACAGGCUACGAGCCUGUGUUGUGCCGUAGGGAAGCCGAGAAGCGAGCCGCCUGGGAAGUACGUCCGCAAGGAUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACCGGAGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGACUCAACGCCGGACAUCUCACCAGCUCCGACUACAGUGAUGACGAUCAGGUUGAUGACCUUAUCACGACGCUGUAGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACUUCUAAUUGCCAGCAGCAGUUUCGACUGGCUGGGUACAUUAGAAGGACUGCCGCUGCUAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAUGAGCUGGGCUACACGCGGGCUACAAUGGUCGAGACAAUGGGUUGCUAUCUCGAAAGAGAACGCUAAUCUCCUAAACUCGAUCGUAGUUCGGAUUGAGGGCUGAAACUCGCCCUCAUGAAGCUGGAUUCGGUAGUAAUCGCAUUUCAAUAGAGUGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCAAAGCACCCGAGUGAGGUCCGGAUGAGGCCACCACACGGUGGUCGAAUCUGGGCUUCGCAAGGGGGCUUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCUG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((((((....)))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((..((......)).)))))))......((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)))))))))..((((((((.....)))))))).(..(((((((.......)))))))..)...(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((((.....))))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((((.....(((((((.......)))))))....))))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((((((....)))).)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))............
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......))))))((((((((((.(((((((((......(((.((((..((((((((((....)))))).))))....(((.......((((((((......(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((((((.............))))))).....(((....))))))))))...))))))))(((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).((((((((....)))...)))))))).((((((((......)))))))).((((....))))..)))))))......((((.....(((((....)))))..)))))))))))))..((((((((.....)))))))).((((((((((((...))))))))))))...((((((.......((((((...((((...))))..)))))))))))).))))))))))........(((((......(((((...((((((((((..(((((((((((...((((((((.....))))))))..))))))))..))).))))))(((((.(((.....((((((((((.((((((((((.(((......)))....)))))))))).)))................)))))))....))).)))))))))...)))))..((((((((..[[[..((((.........))))....)))))))).....]]].(((((((.(((((((((((((((...)))))))))))))))........[[[[[..)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..]]]]]..(((((((....(((((..........))))).....((((.....((((((.......(((((((...((((((((.....(((.(((((...))))).)))....))))))))......((((..((((((((((..((((((............((((......))))..))))))....((((..((((((((((((..(((((((....))).)))))))).)))))))).....(((((.....))))).........))))..))))).)))))...))))......)))))))(((.....((((((((...(((((((.....(((((....((((....)))).....)))))......)))))))))))))))...(((((((........)))))))...)))....)))))).((((((((((((.....)))))))))...))))))).)))))))..........)))))...((((.(((..(((((((((((((..(((((((....)))))))..)))))))))))))..))).))))..(((......[[[.(((((((((....))))))))).))).....]]].
|
|
CRW_00034
|
[ FASTA input ]
|
CGUACUCCCUUAAUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGGCGUCCCUUCUGGGACGCCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGCCUGGGGUACUGGAAGGUCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGUAAGGCUCCGCCCGAGGAUGGGCCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGCCUCUGGCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGUGGCCACUAUUAUUGGGCCUAAAGCGGCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUCGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCCGGGGUAGGGGUGAAAUCCUAUAAUCCCGGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGGGCCGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGGUGCCGUAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGGCUGAAGGUCUUGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGGUAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCCUCCCGCUCGGGAGGGAGGCACUCUGGGGGGACUGCCGGCGAUAAGCCGGAGGAAGGGGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAAUGGGUGCCGACCCCGAAAGGGGGAGGUAAUCCCCUAAACCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUGAAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGCGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUCCACCCGAGCGGGGCCUAGGUGAGGCCCGAUCUCCUUCGGGAGGUCGGGUCGAGCCUAGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCCUAUC |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((...{{{.))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..(((((((((((....))))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((((((.((......))))))))))......((((((....)))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)))))))))..((((((((...)))))))).a.((((((((.......)))))))..A)..(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((((.....))))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((((((.......)))))))...)..))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((((((((....))))))))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))..............
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((...((((((.......))))))((((((((((.(((((((((......(((.(((.......(((((((((((....)))))))).(((....(((((((.......((((((...((((.(((((((.(((((((..((((((....))))))...)))))))...(((((((((.(((....)))))))))))).....((((((....)))))).))))))).))))))))))(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...)))))))..))))))).....)))...))).....(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).......(((((...(((((....))))).))))))))))))))..((((((((...)))))))).((((((((((.......)))))))))).......(((((...(((((((...((((...))))..))))))).)))))))))))))))..........(((((....(((((...((((((((((((.(((((((((((..((((((((.....)))))))).)))))))))))..))))))))((((..(((.....((((((((((.((((((((((..(((......)))...)))))))))).)))(((.........))).)))))))....)))..))))))))...))))).))))))))))))................(((((((.(((((........)))))(((((((.(((.(((((((((((...))))))))))).))).(((........)))))))))).)))))))((((..((((....))))...))))........(((((((.........((((((((..(((((((............(((..[[[[.))).(((....)))]]]].(((((((((...[[[[[........)))))))))...(((((.......))))).]]]]]((((((.((((((..(((...))).((((......))))..))))))....(((((.(((((((.((((..((((((((....))))))))))))..))))))).....(((((.....)))))........))))).))))))......(((.((((..........)))))))..))))))).....(((((((.....(((((((..((((....))))..))))..))).....)))))))((((((.[[[[(((((((........)))))))...))))))........(((.(((((((.......)))))))....)))]]]]..)))))))).........)))))))((((.(((..(((((((((((((..((((((((((((....))))))))))))..)))))))))))))..))).))))..((((.....[[[.(((((((((....))))))))))))).....]]]...
|
|
CRW_00048
|
[ FASTA input ]
|
UUUCAACGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCGUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAUGAUCCGGUGCUUGCACCGGGGAUUAGUGGCGAACGGGUGAGUAACACGUGAGUAACCUGCCCUUGACUCUGGGAUAAGCCUGGGAAACUGGGUCUAAUACCGGAUAUGACUCCUCAUCGCAUGGUGGGGGGUGGAAAGCUUUUUGUGGUUUUGGAUGGACUCGCGGCCUAUCAGCUUGUUGGUGAGGUAAUGGCUCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGACCGGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGAAAGCCUGAUGCAGCGACGCCGCGUGAGGGAUGACGGCCUUCGGGUUGUAAACCUCUUUCAGUAGGGAAGAAGCGAAAGUGACGGUACCUGCAGAAGAAGCGCCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGCGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGAGCUCGUAGGCGGUUUGUCGCGUCUGCCGUGAAAGUCCGGGGCUCAACUCCGGAUCUGCGGUGGGUACGGGCAGACUAGAGUGAUGUAGGGGAGACUGGAAUUCCUGGUGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUAUCAGGAGGAACACCGAUGGCGAAGGCAGGUCUCUGGGCAUUAACUGACGCUGAGGAGCGAAAGCAUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCCGUAAACGUUGGGCACUAGGUGUGGGGGACAUUCCACGUUUUCCGCGCCGUAGCUAACGCAUUAAGUGCCCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCAUGCGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAAGGCUUGACAUGGACCGGACCGCCGCAGAAAUGUGGUUUCUCCUUUUGGGGCCGGUUCACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGUUCCAUGUUGCCAGCGCGUAAUGGCGGGGACUCAUGGGAGACUGCCGGGGUCAACUCGGAGGAAGGUGGGGACGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGUCUUGGGCUUCACGCAUGCUACAAUGGCCGGUACAAAGGGUUGCGAUACUGUGAGGUGGAGCUAAUCCCAAAAAGCCGGUCUCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACUCGACCCCAUGAAGUCGGAGUCGCUAGUAAUCGCAGAUCAGCAACGCUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCAAGUCACGAAAGUUGGUAACACCCGAAGCCGGUGGCCUAACCCCUUGUGGGAGGGAGCCGUCGAAGGUGGGACUGGCGAUUGGGACUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((..(((((((....))))))).)).))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((((((....)))))))))).....((.....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(..((....))..)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((.......))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((.....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
......(((...((((.((((((...)))))))))).))).((((.(((......[[[))).))))....]]].(((((((....))))))).....(((.....[[[[[......))).......]]]]](((.....[[[)))....((((((....))))))........]]]....((((((((((....))))))))))..((((((......)))))).(((((..[[[[...)))))......((((((((.......)))))))).]]]]...((((..[[[[[)))).........]]]]]....(((((.(((.....)))))))).((((....))))(((((((((.....))))))....(((((....))))).))).(((....)))..((((....((((((....))))))...))))((((.[[[[[)))).................]]]]].......((((.[[[[......))))....]]]].(((...[[[[[..((((....))))..)))..........]]]]]....((((...(((((((((((...(((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))....))))))).....((((((...(((((((....((((((((((.(((........)))..))))))))))....................)))))))..)))))).....))))...))))....(((((((..[[[..((((.........))))....)))))))......]]].(((((((.(((((((..(((.......)))..)))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))..((((((((...((((....[[[)))).((((.((((....))))))))..]]]....((((.(((((...((((...((((((((...((((((....))))))..(((......))))))))))))))))))))...)))).......(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...[[[[[[[.......(((......))))))...]]]]]]](((..[[[[[)))..]]]]].....(((((.(((...)))...)))))..((((..[[[[[...)))).....]]]]].(((((.((((..........((((((((.((((((.....(((...(((.......((((.......))))..(((((((........))))))).......)))...))).....))))))))).)))))....(((.(((....))))))))))))))).......))))))))..........(((....[[[[)))....]]]]((((...(((((....))))).[[[[[[..))))..]]].]]]((((..(((...))).....[[[[.(((((((((....))))))))).))))....]]]]...
|
|
CRW_00054
|
[ FASTA input ]
|
GAAACGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGUCUCUUCGGAGAUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGAGAAUCUAGCUUCAGGUCGGGGACAACCACUGGAAACGGUGGCUAAUACCGGAUGUGCCGAAAGGUGAAAGAUUUAUUGCCUGAAGAUGAGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGUGGUAAGAGCGCACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAGGGAGGAAGGCUCUUGGGUUGUAAACCUCUUUUCUCAGGGAAUAAAAAAAUGAAGGUACCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCCGCAGGUGGCACUGUAAGUCUGCUGUUAAAGAGCAAGGCUCAACCUUGUAAAGGCAGUGGAAACUACAGAGCUAGAGUACGUUCGGGGCAGAGGGAAUUCCUGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCAGGAAGAACACCGGUGGCGAAAGCGCUCUGCUAGGCCGUAACUGACACUGAGGGACGAAAGCUAGGGGAGCGAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGCGUGGCUUGUAUCGACCCGAGCCGUGCCGGAGCCAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCACGCAAGUGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGUAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAAGACUUGACAUGUCGCGAAUCUUCUUGAAAGGGAAGAGUGCCUUAGGGAGCGCGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGUUUUUAGUUGCCAGCAUUAAGUUGGGCACUCUAGAGAGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGUCUUGGGCUACACACGUACUACAAUGCUACGGACAGAGGGCAGCAAGCUAGCGAUAGCAAGCAAAUCCCGUAAACCGUAGCUCAGUUCAGAUCGCAGGCUGCAACUCGCCUGCGUGAAGGAGGAAUCGCUAGUAAUUGCAGGUCAGCAUACUGCAGUGAAUUCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGCAACGCCCGAAGUCAUUACUCCAACUUUUAGGAGAGGAGGAUGCCUAAGGCAGUGCUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGUGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((....)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).{.(((((((...(..(....)..)....))))))..})..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...a.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........aaaaaa..(((((((((((........)))))))))))...aa..))AA.....AAAAAAA))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
....(((...((((.((((((...)))))))))).)))(((((((((((..(((.(((..........(((((....))))).(((((((((.(((.......(((((((.......(((((((((((......((((((....))))))......)))(((.((((....))))....)))....)))))))).....)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).)))).............))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...)))))).(((....)))....(((((....)))))...)))).))))))).....((((....(((....((((...))))...(((((((((...................)))))))))..)))...[[[...))))..]]](((.(((.((((....((((.((((....)))).)))).....)))))))......(((((.(((.((((.(((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))).))))...((((.....(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))....................)))))))....)))).......)))..)))))...))).((((......[[[[[[[[....))))..]]]]]]]].((((.[[[[))))......(((((((((((........)))))))))))..........]]]].....((((.[[[[))))...(((((....)))))....((((.....))))]]]]...((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].......((((((((...((((...(((((((....)))))))[[[[[.........))))........]]]]]......((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((...(((((.....))))).....))))))).(((.(((((.....))))).....)))))))))))))))))))).....((((..[[[[[...)))).....]]]]].......(((((((.....(((......((((....))))........))).....)))))))......(((..[[[[[[))).......]]]]]].............(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]].......((((.((((............))))[[[[......))))..]]]]...(((...[[[[[[[[((((........))))(((......)))..))).....]]]]]]]](((((((.............((((((((((....))))))))))..)))))))....
|
|
CRW_00059
|
[ FASTA input ]
|
UGAACUGAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGGAUGCUUUACACAUGCAAGUCGGACGGCAGCACGGGCUUCGGCCUGGUGGCGAGUGGCGAACGGGUGAGUAAUGUAUCGGAACGUGCCCAGUAGCGGGGGAUAACUACGCGAAAGCGUGGCUAAUACCGCAUACGCCCUACGGGGGAAAGCGGGGGACCUUCGGGCCUCGCACUAUUGGAGCGGCCGAUAUCGGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAACGGCCUACCAAGGCGACGAUCCGUAGCUGGUUUGAGAGGACGACCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUGGACAAUGGGGGCAACCCUGAUCCAGCCAUCCCGCGUGUGCGAUGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGCACUUUUGGCAGGAAAGAAACGGCACGGGCUAAUAUCCUGUGCAACUGACGGUACCUGCAGAAUAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGUGCGCAGGCGGUUCGGAAAGAAAGAUGUGAAAUCCCAGGGCUUAACCUUGGAACUGCAUUUUUAACUACCGGGCUAGAGUGUGUCAGAGGGAGGUGGAAUUCCGCGUGUAGCAGUGAAAUGCGUAGAUAUGCGGAGGAACACCGAUGGCGAAGGCAGCCUCCUGGGAUAACACUGACGCUCAUGCACGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGUCAACUAGCUGUUGGGGCCUUCGGGCCUUGGUAGCGCAGCUAACGCGUGAAGUUGACCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAUGAUGUGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGAAAAACCUUACCUACCCUUGACAUGUCUGGAAUCCCGAAGAGAUUUGGGAGUGCUCGCAAGAGAACCGGAACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCAUUAGUUGCUACGAAAGGGCACUCUAAUGAGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUAUGGGUAGGGCUUCACACGUCAUACAAUGGUCGGGACAGAGGGUCGCCAACCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCAGAAACCCGAUCGUAGUCCGGAUCGCAGUCUGCAACUCGACUGCGUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGUCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUUUACCAGAAGUAGUUAGCCUAACCGCAAGGGGGGCGAUUACCACGGUAGGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((..(((((((....)))).))))).))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((((((..((....)))))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).{.(((((((...(....((((((((.......)))))))).....)....))))))..})..((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((((....))))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).(((((....)))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((.(....)))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...........(((..(((...[[[[.)))..)))((((.(((..(((.........)))..)))..))))....(((((....))))).....]]]]..(((..[[[[[.........))).....]]]]].(((((((.......((((((....))))))......)))).))).(((....)))(((.[[[[[[....)))...]]]]]]............(((....[[[[[[[[[[[[.((((((((.......))))))))))).........]]]]]]]]]]]]...((((((.(((((..(((((.(((.....)))))))).((((....))))((((((((((((....(((((...(((((....))))).)))))......(((((((((......((((....)))).....))))(((((.((((.........(((((((.......))))))).(((...))).)))))))))...(((...(((..(((((((((.(((...(((......)))....)))..........(((.....))))))......((((((..((((((((((....(((((((((...(((.(((......))).)))..))))))))).....))))))...((((((((..((((.((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...))))...(((.......)))))))..))).)))))..))))..))))))...))))))..)))...((((.........)))).(((((((((((((...(((((((((((.(((((.((((((....)))))).)))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..))).))))..))))..((((....)))).......)))))))))......))).))))).....)))))).....((((.....(((((..(((((((....)))))))...(((....)))..)))))...)))))))))).))))))))))).(((((((((....)))..((((......))))..))))))(((((..[[[[[[[[.)))))........(((((((....)))..))))]]]]]]]](((.[[[[[.)))...............]]]]]...((((....))))..((((((((..(((.....[[[[[[[[)))...(((.......(((....))).........)))......]]]]]]]]..........((((((........))))))))))))))......(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]....(((......((((((((((((....((((((.((((...........))))))))))...))))))))))))....[[[[[[[...........)))(((((((((....)))))))))...]]]]]]]....
|
|
CRW_00061
|
[ FASTA input ]
|
AAAUAACGAAGAGUUUGAUCCUGGCUUAGAACUAACGCUGGCAGUGCGUCUUAAGCAUGCAAGUCAAACGGGAUGUAGCAAUACAUUCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUGGAUGAUCUACCUAUGAGAUGGGGAUAACUAUUAGAAAUAGUAGCUAAUACCGAAUAAGGUCAGUUAAUUUGUUAAUUGAUGAAAGGAAGCCUUUAAAGCUUCGCUUGUAGAUGAGUCUGCGUCUUAUUAGCUAGUUGGUAGGGUAAAUGCCUACCAAGGCAAUGAUAAGUAACCGGCCUGAGAGGGUGAACGGUCACACUGGAACUGAGAUACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGCUAAGAAUCUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCGACACUGCGUGAAUGAAGAAGGUCGAAAGAUUGUAAAAUUCUUUUAUAAAUGAGGAAUAAGCUUUGUAGGAAAUGACAAAGUGAUGACGUUAAUUUAUGAAUAAGCCCCGGCUAAUUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAAGGGGCGAGCGUUGUUCGGGAUUAUUGGGCGUAAAGGGUGAGUAGGCGGAUAUAUAAGUCUAUGCAUAAAAUACCACAGCUCAACUGUGGACCUAUGUUGGAAACUAUAUGUCUAGAGUCUGAUAGAGGAAGUUAGAAUUUCUGGUGUAAGGGUGGAAUCUGUUGAUAUCAGAAAGAAUACCGGAGGCGAAGGCGAACUUCUGGGUCAAGACUGACGCUGAGUCACGAAAGCGUAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCUACGCUGUAAACGAUGCACACUUGGUGUUAACUAAAAGUUAGUACCGAAGCUAACGUGUUAAGUGUGCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAGGAACCUUACCAGGGCUUGACAUAUAUAGGAUAUAGUUAGAGAUAAUUAUUCCCCGUUUGGGGUCUAUAUACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUAUCUGUUACCAGCAUGUAAUGGUGGGGACUCAGAUAAGACUGCCGGUGAUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGGCCCUUAUGUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCCUGUACAAAGCGAAGCGAAACAGUGAUGUGAAGCAAAACGCAUAAAGCAGGUCUCAGUCCGGAUUGAAGUCUGAAACUCGACUUCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAUAUCAGAAUGAUACGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACCCGAGUUGAGGAUACCCGAAGCUAUUAUUCUAACCCGUAAGGGAGGAAGGUAUUUAAGGUAUGUUUAGUGAGGGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAAGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((....)))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((((((((....)))))))))....(.((((.......))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).a.(((((((...(.....(((((((((....))))))))).....)....))))))..A)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.((((((.(((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((...))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
....................((((((((.......((((((((((...((((...(((((..((((....(((((((....)))))))..)))).....((((.....((((((((..........((((((((.((((..((((((....))))))(((............(((((((((....)))))))))..((((((((.......))))).))).)))....)))).))))))))(((((..((((((((.......))))))))..............((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).....))))).......)))))...((((....))))......))).)))))))))....)))).((((....)))).....(((((((.......)))))))..(((((((........))))))).....(((......)))......(((((....(((((((((..........(((((((..(((((((((..((((((..((((((.(((((((((.((((((.((((((..........)))))).)))......((((((.....)))))).))).((((((((((((((((((((.((((((((...(((((((.....(((((((((.....(((.(((....))).)))......))))))))).........)))))))..))).)))))...(((..((((....((((((((.......((((.........))))....)))))))).........((((((((((((((((((...))))))))))..(((......)))))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...))))...)))((((....)))))))).)))))))))...))))))).)))))(((....))).))))((((..(((((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))).....(((.(((((((((....)))).))))).)))..))))..)))).))))))))))))..)))..)))))).....))))))).)))))))))..)))))...........)))))))))).)))))))).......(((.[[[[[..)))..]]]]].((((((...[[[...))))))..........]]]..(((((((....[[[[[.(((..(((....))).........))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))).]]]]]..............((((((....[[[[....))))))(((((............)))))...]]]].......(((.[[[[[[[)))........((((..(((....))).))))]]]]]]]..............(((((((((((..............(((((((((....)))))))))...)))))))))))
|
|
CRW_00068
|
[ FASTA input ]
|
CCAACUUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAGCGAACGCUGGCGGCAGGCUUAACACAUGCAAGUCGAGCGGGCGUAGCAAUACGUCAGCGGCAGACGGGUGAGUAACGCGUGGGAACGUACCUUUUGGUUCGGAACAACACAGGGAAACUUGUGCUAAUACCGGAUAAGCCCUUACGGGGAAAGAUUUAUCGCCGAAAGAUCGGCCCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUAGGGUAACGGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACAUUGGGACUGAGACACGGCCCAAACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGGGCAACCCUGAUCCAGCCAUGCCGCGUGAGUGAUGAAGGCCCUAGGGUUGUAAAGCUCUUUUGUGCGGGAAGAUAAUGACGGUACCGCAAGAAUAAGCCCCGGCUAACUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGAAGGGGGCUAGCGUUGCUCGGAAUCACUGGGCGUAAAGGGUGCGUAGGCGGGUCUUUAAGUCAGGGGUGAAAUCCUGGAGCUCAACUCCAGAACUGCCUUUGAUACUGAAGAUCUUGAGUUCGGGAGAGGUGAGUGGAACUGCGAGUGUAGAGGUGAAAUUCGUAGAUAUUCGCAAGAACACCAGUGGCGAAGGCGGCUCACUGGCCCGAUACUGACGCUGAGGCACGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAAUGCCAGCCGUUAGUGGGUUUACUCACUAGUGGCGCAGCUAACGCUUUAAGCAUUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGACGCAACGCGCAGAACCUUACCAGCCCUUGACAUGUCCAGGACCGGUCGCAGAGAUGUGACCUUCUCUUCGGAGCCUGGAACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGUCCUUAGUUGCUACCAUUUAGUUGAGCACUCUAAGGAGACUGCCGGUGAUAAGCCGCGAGGAAGGUGGGGAUGGCGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUACGGGCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGGUGACAAUGGGAUGCUAAGGGGCGACCCUUCGCAAAUCUCAAAAAGCCGUCUCAGUUCGGAUUGGGCUCUGCAACUCGAGCCCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGCACGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUUGGCUUUACCUGAAGACGGUGCGCUAACCAGCAAUGGAGGCAGCCGGCCACGGUAGGGUCAGCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((....))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).[.(((((((...(.......)....))))))..])..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((....))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((....(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))).)))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.[[[[[.......)))))..]]]]](((...))).(((((......[[[)))))..]]]((((((....)))))).(((((.((((((((.........((((((((((.(((((.((((((.....((((((....))))))......))))))...(((....)))))))).(((((((((((....)))))..((((((((((.(((..((((((((.......))))))))))).(((((...((((..((((....))))..(((((.......((((((((((.((((((...((((....))))...(((((((((.......(((...((((....))))....((((((((((((....)))......(((..(((((((....(((((((((((((((............................((((((((..(((((((((.........)))...))))))..))))..((((((((((.....)))))).....((((((..(((((((((((((.((((((((((.....((((((.....))))))...))))))))))..))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...........))))))))...(((....))).................)))))))..))))).)))...((((.((((.....(((((((.......((((.........))))....)))))))(((.....)))..)))).((((((((((((....)))))))))))).))))...)))))...))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))....))))))))))))))))))....)))))..((((.....(((..(((...)))..)))..))))))))))).......((((((...(((((((....)))))))..(((....))))))))).....)))...)))))))))..))).(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....)))).(((((((.((((............))))..))))))).))))).(((.....)))..((((...((((((((........))))))))...))))..))))))((((...(((.(((((...))))))))....((((((((.(((((....))))).)))..)))))...))))))))))))))....(((((((........)))))))....)))))....))))...))))).)))))).))))...))))))))))))))))..............)))))))).((((.(((..((((((((((((......((((..(((..(((....))).))).)))).....))))))))))))..))).))))..)))))........(((((((((....)))))))))(((.....)))...
|
|
CRW_00096
|
[ FASTA input ]
|
CGAACUAUAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAUGCUUUACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGUCUUCGGAUGCUGACGAGUGGCGAACGGGUGAGUAAUACAUCGGAACGUGCCUAGUAGUGGGGGAUAACUACUCGAAAGAGUAGCUAAUACCGCAUGAGAUCUACGGAUGAAAGCAGGGGACCUUCGGGCCUUGUGCUACUAGAGCGGCUGAUGGCAGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAAAGGCUUACCAAGCCUGCGAUCUGUAGCUGGUCUGAGAGGACGACCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCAAUGCCGCGUGCAGGAUGAAGGCCCUCGGGUUGUAAACUGCUUUUGUACGGAACGAAAAGCCUGGGGCUAAUAUCCCCGGGUCAUGACGGUACCGUAAGAAUAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGUGCGCAGGCGGUUUUGUAAGACAGUGGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCCAUUGUGACUGCAAGGCUAGAGUGCGGCAGAGGGGGAUGGAAUUCCGCGUGUAGCAGUGAAAUGCGUAGAUAUGCGGAGGAACACCGAUGGCGAAGGCAAUCCCCUGGGCCUGCACUGACGCUCAUGCACGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGUCAACUGGUUGUUGGGUCUUAACUGACUCAGUAACGAAGCUAACGCGUGAAGUUGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAUGAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAAAACCUUACCCACCUUUGACAUGGCAGGAACUUACCAGAGAUGGUUUGGUGCUCGAAAGAGAACCUGCACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGCCAUUAGUUGCUACAUUCAGUUGAGCACUCUAAUGGGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUAUAGGUGGGGCUACACACGUCAUACAAUGGCUGGUACAAAGGGUUGCCAACCCGCGAGGGGGAGCUAAUCCCAUAAAGCCAGUCGUAGUCCGGAUCGCAGUCUGCAACUCGACUGCGUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGUCACGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCGGGUCUCGCCAGAAGUAGGUAGCCUAACCGUAAGGAGGGCGCUUACCACGGCGGGGUUCGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...[[[.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((..((((((....))).))))).))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((((((..((....)))))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(....((((((((.......)))))))).....)....))))))..)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.......((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))).)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((......)))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).(((((....)))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((.((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((((((((((.......(((((....(((((((((((........((((........((((((....))).))).....))))..(((((((.......))))....)))((((((((((.........((((((....)))))).......(((......((((((......((((.(((..........))).))))......(((((((.(((((......(((((((((..(((...(((...(((...((((....(((.(((((((.........))))))).)))(((((.(((.....)))))))).((((....))))))))...)))......(((((...(((((....))))).)))))....)))....((((......((((....)))).....))))((((.(((((........((((((((.......))))))))..........))))))))).....))).))))))))).))))).))))))).......))))))......))).........)))))))))))))))))))))(((((((((((((((..(((((((((...((((............))))..)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))....................)))))))..))).)))))..))))..))).....)))))...))))...))))))))))).(((((((..(((...(((........(((((((.(((((((((((......)))))))))))...............))))))).....)))((((.(((((....)))))..))))...)))..(((((((((((((....((((((..((((((((((((..((((........))))))))....(((((((........(((((.(((.((((....))))..))).(((....)))..)))))....(((.((((...((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((.((((...........))))..))))))).(((.(((((.....))))).....))))))).)))))...))))....)))))))...)))))))......))))))))...(((((((((.....(((.......(((....))).........))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).((((((((((.........)))))))...))).....))))))............))))))).)))).))).(((..(((((((....((((((.((((...........))))))))))...)))))))..)))....(((((((..........[[[((((((((((....))))))))))..)))))))...]]]
|
|
CRW_00140
|
[ FASTA input ]
|
AACACGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAACUAACGCUGGCGGCGCGUCUUAAACAUGCAAGUCAAGCGGAGUAGCAAUACUCAGCGGCGAACGGGUGAGUAACACGUGGGUAAUCUUCCUCUGAGUCUGGGAUAACUUUCCGAAAGGGAAGCUAAUACUGGAUGGUCCCGAGAGAUCACAAGAUUUUUCGGGUAAAGAUUUAUUGCUCGGAGAUGAGCCCGCGUCCGAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAAAGGCUCACCAAGGCGACGAUCGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGUUCGGCCACAAUGGAACUGAGACACGGUCCAUACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAAGAAUCUUGCUCAAUGGGGGGAACCUGAAGCAGCGACGCCGCGUGAACGAUGAAGGUCUUCGGAUUGUAAAGUUCAGUAAGCAGGGAAAAAUAAGCAGCAAUGUGAUGAUGGUACCUGCCUAAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAUGGUGCAAGCGUUGUUCGGAAUCAUUGGGCGUAAAGGGUGCGUAGGCGGACAUGUAAGUCAGGUGUGAAAACUGCGGGCUCAACUCGCAGCCUGCACUUGAAACUAUGUGUCUGGAGUUUGGGAGAGGCAAGUGGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUCUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUUGCUGGCCUAAAACUGACGCUGAGGCACGAAAGCGUGGGUAGUGAACGGGAUUAGAUACCCCGGUAAUCCACGCCCUAAACGUUGUCUACCAGUUGUUGGGGGUUUUAACCCUCAGUAACGAACCUAACGGAUUAAGUAGACCGCCUGGGGACUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGUCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAAAAACCUCACCUAGGCUUGACAUGGAGUGGAAUCAUGUAGAGAUACAUGAGCCUUCGGGCCGCUUCACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCACCUUAUGUUGCCAUCAUUCAGUUGGGCACUCGUAAGGAACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGCGGGGAUGACGUCAAAUCCUCAUGGCCUUUAUGUCUAGGGCAACACACGUGCUACAAUGGCCGGUACAAAGGGUAGCCAACUCGCGAGGGGGAGCUAAUCUCAAAAAUCCGGUCCCAGUUCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGACCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACCUGAGUGGGGAGCACCCGAAGUGGUCUUUGCCAACCGCAAGGAAGCAGACUACUAAGGUGAAACUCGUGAAGGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((....)))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((((((((((....)))))))))))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((.((....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.....(((....))).....)....))))))..).((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((((....))))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((..(((((((....))))))).((....))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((..((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
........(((........[[[)))....]]]......((((((..((((((...(((..........(((((....))))).....(((((.(((.......((((((((.......((((((((((((.....((((((....))))))......)))).....(((((((((((....)))))))))))(((....)))..))))))))....))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).((((....)))))))))......(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))).))))))...(((((.....(((....)))..)))))...)))))).(((((......((((....)))).....)))))....(((((.........(((....))).....[[[[.))))).......]]]](((..[[[[[[[[[.(((...(((......)))....))).)))..(((((((.....))))))).....]]]]]]]]].((((((((((..(((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))...))))))))))...........((((..(((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...)))[[[[....(((....)))....))))...]]]].........(((....[[[[[[[[.)))..((((.........))))...]]]]]]]]..........((((((..((((((((((((....))))))))))))...[[[[.........))))))....]]]].....(((((....)))))..............(((((((..(((((.[[[[[.)))))......(((((..((((........)))))))))........]]]]]...(((((((.[[[[[[[[[[..........(((....))))))))))......]]]]]]]]]]...(((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))..........(((((((.((((............))))..))))))).....[[[[[)))..]]]]].....((((...[[[[))))......]]]].(((((..[[[..)))))...]]].(((((....[[[[.)))))........]]]]......((((.[[[.....)))).....]]](((((..((((.((((((((((........)))))))....))).)))).(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]............)))))............)))))))..(((...[[[)))....((((...((((((((...................))))))))..))))...]]]..(((((((((((.............((((((((((....))))))))))..)))))))))))
|
|
CRW_00141
|
[ FASTA input ]
|
UUUAUUUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUUGAGCGCUGAAGGUUGGUACUUGUACCGACUGGAUGAGCAGCGAACGGGUGAGUAACGCGUGGGGAAUCUGCCUUUGAGCGGGGGACAACAUUUGGAAACGAAUGCUAAUACCGCAUAAAAACUUUAAACACAAGUUUUAAGUUUGAAAGAUGCAAUUGCAUCACUCAAAGAUGAUCCCGCGUUGUAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAAAGGCUCACCAAGGCGAUGAUACAUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACAUUGGGACUGAGACACGGCCCAAACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCGGCAAUGGACGAAAGUCUGACCGAGCAACGCCGCGUGAGUGAAGAAGGUUUUCGGAUCGUAAAACUCUGUUGGUAGAGAAGAACGUUGGUGAGAGUGGAAAGCUCAUCAAGUGACGGUAACUACCCAGAAAGGGACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUCCCGAGCGUUGUCCGGAUUUAUUGGGCGUAAAGCGAGCGCAGGUGGUUUAUUAAGUCUGGUGUAAAAGGCAGUGGCUCAACCAUUGUAUGCAUUGGAAACUGGUAGACUUGAGUGCAGGAGAGGAGAGUGGAAUUCCAUGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUAUGGAGGAACACCGGUGGCGAAAGCGGCUCUCUGGCCUGUAACUGACACUGAGGCUCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAGAUGUAGGGAGCUAUAAGUUCUCUGUAUCGCAGCUAACGCAAUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGACCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGUCUUGACAUACUCGUGCUAUUCCUAGAGAUAGGAAGUUCCUUCGGGACACGGGAUACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUAUUGUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUGGGCACUCUAACGAGACUGCCGGUGAUAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGACCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGAUGGUACAACGAGUCGCGAGACAGUGAUGUUUAGCUAAUCUCUUAAAACCAUUCUCAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCACGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGGGAGUUGGGAGUACCCGAAGUAGGUUGCCUAACCGCAAGGAGGGCGCUUCCUAAGGUAAGACCGAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCUA |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((....((((((((....))))))))....)))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((((....)))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).<.(((((((...(.....((((((((.......)))))))).....)....))))))..>)..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))..))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((((.....))))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((...(((((((....))))))).(((....))).))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((.(((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]]........(((((..((((((((....)))))))).......)))))..((((........((((((((.......((((((((((.......((((((....))))))......))))....((((((.((((....)))).))))))....(((((....)))))..))))))....))))))))(((((((.....((((((((.......))))))))[[[..)))))))..]]].((((....))))..((((.....[[[[[.)))).......]]]]].((((....)))).((((((..((((((((((.....(((((....)))))............(((....)))..))))))))))....[[[......))))))..........]]](((.(((((((.....)))).)))[[[..)))..]]].(((.....)))..((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]..)))).(((((((((((.....))))))......(((((.(((..(((((((((...((((((((....(((((((.....))))))).))))))))....)))))))))....((((((...((((((((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...)))................)))))..)))))).......)))..)))))..)))))(((.........[[[[[[....)))...]]]]]].((((((...(((((((((((.(((((((((((((...)))))))))))))...............)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).)))).(((....))).....)))))).((((((((((((..((((........))))))))....(((((((.....(((((((((...((((((....))))))..(((....)))))))))....(((....(((((((...((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((.((((............))))..))))))).(((.(((((.....))))).....))))))).))))).......))))))).)))))))))))))......)))))))).....(((((((..((((.(((....)))[[[..))))..]]]...........)))))))(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]]...(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]........(((..........[[[)))..]]]...(((...[[[)))((((((...))))))..]]]..(((........[[[[[[[.))).........((((((((((....))))))))))..]]]]]]].......
|
|
CRW_00150
|
[ FASTA input ]
|
UUUUCUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUUAACGCUGGCGGCAUGCCUAAUACAUGCAAGUCGAUCGGAUGUAGCAAUACAUUAGAGGCGAACGGGUGAGUAACACGUAUCCAAUCUGCCUUAUAGUGGGGGAUAACUAGUCGAAAGAUUAGCUAAUACCGCAUAACAAGUUAACUAUCGCAUGAGAAUAACUUUAAAGAAGCAACUGCUUCGCUAUAAGAUGAGGGUGCGGCAUAUCAGCUAGUUGGUGAGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGAUGACGUGUAGUUAUGCUGAGAGGUAGAAUAACCACAAUGGGACUGAGACACGGCCCAUACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUUUUUCACAAUGGACGAAAGUCUGAUGGAGCAAUGCCGCGUGAACGAUGAAGGUCUUUUUAGAUUGUAAAGUUCUUUUAUUUGGGAAGAACAGUUAGUAGAGUGGAAAGCUAUUAAUUUGACUGUACCAUUUGAAUAAGUAACGACUAACUAUGUGCCAGCAGUCGCGGUAAUACAUAGGUUGCAAGCGUUAUCCGGAUUUAUUGGGCGUAAAACAAGCGCAGGCGGAUUAGAAAGUCUGGUGUUAAAAGCAAUUGCUUAACGAUUGUAUGCAUUGGAAACUUCUAGUCUAGAGUUUGGUAGAGAGUCCUGGAACUCCAUGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUAUGGAAGAACACCAGAGGCGAAGGCGAGGACUUGGGCCAAUACUGACGCUUAGGCUUGAAAGUGUGGGGAGCAAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCACACUGUAAACGAUGGAUGUUAAGUGUCGGAGCGAAUACUUCGGUGCUGCAGUUAACACAUUAAACAUCCUGCCUGAGUAGUACAUUCGCAAGAAUGAAACUCAAACGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGUGGUGGAGCAUGUUGCUUAAUUCGACGGUACACGAAAAACCUUACCUAGACUUGACAUCUUGGGCGAAGCUAUAGAAAUAUAGUGGAGGUCAACCCAAUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCGUUAGUUACUUUGUCUAACGAGACUGCCAACGUAAGUUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGUCUAGGGCUGCAAACGUGCUACAAUGGCCAAUACAAACAGUUGCAAAUCCGUAAGGUGGAGCUAAUCUGUAAAGUUGGUCUCAGUUCGGAUUGAGGGCUGCAAUUCGCCCUCAUGAAGUCGGAAUCACUAGUAAUCGCGAAUCAGCCAUGUCGCGGUGAAUACGUUCUCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCAAACUAUGAGAGCUGGUAAUAUCUAAAACCGUGUUGCUAACCGCAAGGAAGCGCAUGUCUAGGGUAGGGCCGGUGAUUGGAGUUAAGUCGUAACAAGGUACCCCUACGAGAACGUGGGGGUGGAUUACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((....))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((.(((((....)))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((.((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......(((((....))))).....)))).a.(((((((...(.....((((((((.......)))))))).....)....))))))..A)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....))))))).)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((......))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))....>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((...(((((((....)))))))........))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.........)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
............(((((((((...)))))))))(((((((....(((((...((((((...(((....((((((....)))))).....)))...(((.(((((((((............((((((((.((((((..((((((....))))))....((((((.(((....)))....((((.(((((.((((((((.....((((((((((((((.((((((((((..((((((((((.(((..((((((..(((....))))))))))))))).........((((((((...(((......)))...(((((.(((.....)))))))).((((....)))).)))).)))).......(((....(((((....)))))...)))..)))))))..........(((((................((((((((.....))))))))((((((...(((((....)))))...))))))(((((..((((((((((((((.....(((((((((.........)))...))))))..(((...(((((((((........((((......(((((..(((((((((((((...(((((((.....(((((((.....)))))))..)))))))....))))))))...((((((((...(((((((.....((((((((..(((........)))...)))))))).....................)))))))..))))).)))..)))))..)))))..((((((((.......((((.........))))....)))))))).........(((((((..((((....(((..(((....))).))).....))))....))))))).))))((((....(((((....)))))..))))...))))..))))).....((((....))))....))))))))))).)))))).))))).......))))).)))........)))))))))))))))............(((..(((((.(((...((((......(((((((...((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((.........))))))).(((.(((((....))))).....))))))).))))).......)))))))......))))..)))..(((....))).....)))))..)))....))))))...((((.....)))).........)))))))).)))))((((.((((((((((........)))))))....))).))))...........))))............)))))).....))))))((((............)))).....))))))))...(((......)))....))))))))).)))..........))))))...)))))..)))))))..........((((.....[[[[((((((((((....))))))))))))))....]]]]...
|
|
CRW_00152
|
[ FASTA input ]
|
CGCAAUCAUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUAAACGCUAGCUGUGUGCUUAAUACAUGCAUGUUGAACGGAAUAUUUUAGUUCGCUAAAAUAUUUAGUAGCAAAUGGGUGAGUAACACGUACCUAACCUACCUUUUGGACUGGGAUAACCAUUGGAAACAGUGGCUAAUACCAGAUAUGAUAAAAAUUUGCAUGAAUUUUUAUUCAAAGGAGCCUUCAAGCUUCACCAAGAAAUGGGGGUGCGCAACAUUAGUUAGUUGGUAGGGUAAAAGCCUACCAAGACGAUGAUGUUUAGCGGGGCCAAGAGGUUGUACCGCCACACUGGGAUUGAGAUACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAAGGAAUAUUCCACAAUAAGCGAAAGCUUGAUGGAGCGACACAGCGUGCAGGAUGAAGUCUUUCGGGAUGUAAACUGCUGUUGUAAGGGAAGAAAAAACUAGAUAGGAAAUGCUCUAGUCUUGACGGUACCUUAUUAGAAAGCGACGGCAAACUAUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAUAGGUCGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGUCCGUAGGUUUUUUGUUAAGUUUAAAGUUAAAUGCUAAAGCUCAACUUUAGUCCGCUUUAGAUACUGGCAAAAUAGAAUUAUGAAGAGGUUAGCGGAAUUCCUAGUGGAGUGGUGGAAUACGUAGAUAUUAGGAAGAACACCAAUAGGCGAAGGCAGCUAACUGGUCAUAUAUUGACACUAAGGGACGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAUCAUUAGUUGGUGGCAAAAGUCACUAACACAGCUAACGCGUUAAAUGAUCCGCCUGAGUAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGGAACCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUUGAAGAUACGCGUAGAACCUUACCCACUCUUGACAUUCUCGCAAAACUAUAGAGAUAUAGCCGAGGCUAACGAGAUCACAGAUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUAGGUUAAGUCCUGCAACGAGCGCAACCCUUUUCUUUAGUUGCUAACAUUUAGUUGAGAACCCUAAAGAUACUGCCGGCGCAAGCCGGAGGAAGGUGGGGACGACGUCAAAUCAUCAUGCCUCUUACGAGUGGGGCAACACACGUGCUACAAUGGCUACUACAAAGAGCAGCAAAACAGUGAUGUCAAGCUAAUCUCAAAAAAGUAGUCUCAGUUCGGAUUGAAGUCUGCAACUCGACUUCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCUAUACUGCGGUGAAUACGUUCUCGGGUUUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUUGGUAAUGCCCAAAGUCGGUGAGUUAACUUCGGAGACCAUUGCCUAAGGCAGGACCGAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAUCCCUACGAGAACGUGGGGAUGGAACACCUCCUUUCUA |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((((....)))))))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((((....)))))))))))....(((((......))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).<.(((((((...(.....(((((((((....))))))))).....)....))))))..>)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...a.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(...((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........aaaaaa..(((((((((....)))))))))...aa..))AA.....AAAAAAA))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((...(((((((....)))))))........)))))..)).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(....).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
....((((...[[[[[))))...]]]]].((((((.((((....(((((((((...(((...(((((....(((((((((((....)))))))))))..))))).)))..))))).)))).........(((.....))).((((.....((((((....))))))......))))....(((((((((((....)))))))))))..((((.(((.(((((((((.........(((.(((((..((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))......((((....))))))))).)))..(((((.(((.....)))))))).((((....))))(((((((((....(((((((....(((((....)))))...(((.(((....(((.....)))..))).))))))))))....)))))))))....)))).....((((((..........))))))))))).))).))))........(((((......(((((((((.........)))...))))))))))).))))))))))....(((..[[[[[)))..]]]]].......((((((((.(((((((((.....(((((((.....)))))))..)))))))))..))))))))..............(((((((....(((((((((...[[[[[...........)))))))))...]]]]].............))))))).((((.....))))..............(((((((.......((((.........))))....)))))))..........(((((((.(((((((((....)))))))))..(((......))).)))))))..(((....(((.(((((....)))))..)))...)))..(((........[[[[.)))...]]]]((((((((.................(((.((((..(((....[[[[)))..)))))))........]]]]...((((....))))...........((((((.......(((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((....((((.....))))......))))))).(((.(((((....))))).....)))))))))))))....)))))).((((((........))))))...)))))))).....(((((((....(((..(((...(((....)))...)))..)))......)))))))(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]].....((((.[[[[[[[....))))..]]]]]]]...((((....[[[....))))....]]](((((..[[[[)))))..((((......))))....]]]].(((....[[[[.)))...((((...))))...]]]].....((((((...........[[[.(((((((((....)))))))))....))))))...]]].
|
|
CRW_00166
|
[ FASTA input ]
|
UGAACAUAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAUGCUUUACACAUGCAAGUCGGACGGCAGCACAGGGAAGCUUGCUUCUCGGGUGGCGAGUGGCGAACGGGUGAGUAACAUAUCGGAACGUACCGGGUAGCGGGGGAUAACUGAUCGAAAGAUCAGCUAAUACCGCAUACGUCUUGAGAGGGAAAGCAGGGGACCUUCGGGCCUUGCGCUAUCCGAGCGGCCGAUAUCUGAUUAGCUGGUUGGCGGGGUAAAGGCCCACCAAGGCGACGAUCAGUAGCGGGUCUGAGAGGAUGAUCCGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUGGACAAUGGGCGCAAGCCUGAUCCAGCCAUGCCGCGUGUCUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGGACUUUUGUCAGGGAAGAAAAGGCUGUUGCCAAUAUCGGCGGCCGAUGACGGUACCUGAAGAAUAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGUGCGAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGGGCGCAGACGGUUACUUAAGCAGGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCCGGGAACUGCGUUCUGAACUGGGUGACUCGAGUGUGUCAGAGGGAGGUGGAAUUCCACGUGUAGCAGUGAAAUGCGUAGAGAUGUGGAGGAAUACCGAUGGCGAAGGCAGCCUCCUGGGAUAACACUGACGUUCAUGUCCGAAAGCGUGGGUAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGUCAAUUAGCUGUUGGGCAACUUGAUUGCUUGGUAGCGUAGCUAACGCGUGAAAUUGACCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAUGAUGUGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUUUUGACAUGUGCGGAAUCCUCCGGAGACGGAGGAGUGCCUUCGGGAGCCGUAACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCAUUAGUUGCCAUCAUUCGGUUGGGCACUCUAAUGAGACUGCCGGUGACAAGCCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUAUGACCAGGGCUUCACACGUCAUACAAUGGUCGGUACAGAGGGUAGCCAAGCCGCGAGGCGGAGCCAAUCUCACAAAACCGAUCGUAGUCCGGAUUGCACUCUGCAACUCGAGUGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCAUACUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGGGAUACCAGAAGUAGGUAGGGUAACCGCAAGGAGUCCGCUUACCACGGUAUGCUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...[[[.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((..((((((((((....))))))).))))).))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((((((..((....)))))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(....((((((((.......)))))))).....)....))))))..)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.......((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))).)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((.....))))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
.........((((....[[[[[))))...(((....(((((.(((((.......)))))..)))))....)))..]]]]]..(((((((.[[[[...)))))))......]]]]...........((((.[[[[[))))...((((.......((((((....))))))......)))).]]]]]((((.[[[[[....))))...]]]]](((((((..(((..((((.((((......[[[[[[.)))).))))...))).)))))))...........]]]]]]..((((((((....))))..(((.((((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......)))))))....((((...(((((....))))).))))......))))..((((......((((....)))).....)))).....(((((........((((((((.......)))))))).....[[[[.))))).........]]]](((..[[[[[[[[[)))......]]]...]]]]]](((....(((((.((((((.(((((..((((....((((((..((((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))....................)))))))..))).)))))..))))..))))))...)))).)))))....((((.........)))).(((((((((((((...(((((((((((.(((((.((((((.....)))))).)))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..))).))))..))))..((((....)))).......))))))))).))))))..))))).....)))..(((((....[[[[...(((((..(((((((....))))))).............)))))...)))))(((....)))....]]]](((((((((....)))..((((......))))..))))))(((((.[[[[[[[[[.))))).............(((((((....)))..))))]]]]]]]]]...(((((...(((..[[[[[[)))..)))))..((((((.......)))))).....]]]]]]...(((((((((...((((........(((....)))........)))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....)))))...(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((.[[[[......))))..(((..(((((......))))).))).]]]]((((.[[[[[[)))).(((((...............)))))......]]]]]]((((((..[[[[[)))))).......((((((((((....))))))))))..]]]]]........
|
|
CRW_00173
|
[ FASTA input ]
|
CAAUUGAAGGGUUUGAUUCUGGCUCAGAAUGAACGUUGGCGGCAUGGAUUAGGCAUGCAAGUCCGCGCGAUAACUGAGAGCUCGAGGGGACAGCGGCGAAAGGGAGAGUAACAGGUGGUUUAUCUACCCUCGGGUUUGGGAUAGCGUCGGGAAACUGGCGGUAAUACCAAAUAACAUCUACGGAUCAAAGUUCCGGCGCCCGGGGAUGAGACUGCUCACUAUUAGCUUGUUGGUGGGGUAAUGGCCUACCAAGGCGACGAUGGUUAGCGGGCGUGAGAGCGUGGCCCGUCUCACUGGGACUGAGAUACUGCCCAGACACCUACGGGUGGCUGCAGUCGAGAAUCUUUGGCAAUGGGCGCAACGUGACCAAGCGAUGCCGCGUGCGGAUUAAGGCCUUCGGGUUGUAAACCGCUGUCAGAGGGGAAGAAAUUUUGACUGAUCCUCAGAGGAAGGACGGGCUAAGUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGAACCGUCGGAACGUUAUUCGGAAUUACUGGGCUUAAAGGGUGCGUAGGCGGCCCUACAAGUCAGGUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGAACUGCGCUUGAAACUGAGGGCUUGAGGGAGAUAGGGGUGAGCGGAACUGAUGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUUGAUAUCAUCAGGAACACCGGCGGCGAAGGCGGCUCACUGGGUCUCUACUGACGCUGAGGCACGAAAGCUAGGGGAGCGAACGGGAUUAGAUACCCCGGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGAGCACUGGAUCGAGGGGACUCCCACAUCUUCUCGGUCGUAGCGAAAGUGUUAAGUGCUCCGCCUGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUCAAAGAAAUUGACGGGGGCUCACACAAGCGGUGGAGGAUGUGGCUUAAUUCGAGGCUACGCGAAGAACCUUAUCCUAGUCUUGACAUGUUUAAGAAUCUCCCUGAAAGGGGAGAGUGCUCUUCGGAGAGCUUUUCACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUCGGGUUAAGUCCCUUAACGAGCGAAACCCCUAUCUCUAGUUGCCAGCGGUAAUGUCGGGGACUCUAGAGAGACUGCCGGUGUGAAACCGGAGGAAGGCGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCUUUAUGACUAGGGCUGCACACGUGCUACAAUGAGAGUAAGCAAAUCCCAGAAAACGCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGGUCAGCAUACCGCGGUGAAUAUGUUCCUGAGCCUUGUACACACCGCCCGUCAAGCCACGAAAGUGGGGUGCACGCGAAGUCGCUAAGCUAACUCGCAAGAGAGGCAGGCGCCGAACGUGAACUCCGCGAUUGGGACUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((...(((.(((((..........))))).))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))))..((((.....((((....)))).....)))).a.(((((((...(..(...)..)...))))))..A)..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))..)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..(((((((((((........)))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........)))).........(((((((.....(((.(((((..(((((((....))))))).(((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(.((((................)))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((..(((..(((....))).))).))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
..........((((.((((((...))))))))))....((((((((.......)))))..[[[[.)))...................]]]]...((((..(((((((..(((.[[[[)))..))).))))...((((((.....((((((....))))))......))))))..]]]]...........((((((((.(((((...((((((.(((.((((((.((((..(((((((.......)))))))))))...)))))).)))(((((((....))).))))))))))))))).(((....[[[[[.))).((((....))))...]]]]]......(((((((((.....(((.[[[[[.....)))....]]]]]((((.(((..(((....)))..))).)))))))))))))((((....))))..(((.[[[[)))....]]]]..((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]].))))))))..............(((((((((...(((((((..(((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...((((((((((((((((((...(((((((....(((((((((.((((........))))..)))))))))....................)))))))..)))))...((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.....(((((...........(((((((.(((((((((((........))))))))))).(((((....))))))))))))...)))))((((..((((....))))...))))...........))))).(((.(((.....))))))..((((((((......))))))))..........))).))))))).....))))......(((((((....))))))).))))))))....))))))).....)))))...)))).((((((.(((((((((....)))...(((......)))...))))))....(((...(((((((......(((....)))........))))))).....(((((.....)))))........)))))))))))))...))))).))))))))....)))))))))..)))))))..........)))).....)))))....))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))...(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]..............(((((((.(((.............((((....))))(((((..(((....)))...(((..(((....))).)))..)))))....)))..(((.[[[[[[)))....]]]]]].)))))))(((((((((....)))))))))................
|
|
CRW_00177
|
[ FASTA input ]
|
AGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAUCGCUGGCGGCAGGCUUAACACAUGCAAGUCGAGCGGAACGAUGAUAGCUUGCUAUCAGGCGUCGAGCGGCGGACGGGUGAGUAAUACUUAGGAAUCUACCUAGUAGUGGGGGAUAGCUCGGGGAAACUCGAAUUAAUACCGCAUACGUCCUACGGGAGAAAGCAGGGGAUCAUUAGACCUUGCGCUAUUAGAUGAGCCUAAGUCGGAUUAGCUAGAUGGUGGGGUAAAGGCCUACCAUGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACCGGGACUGAGACACGGCCCGGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGGGGAACCUGAUCCAGCCAUGCCGCGUGUGUGAAGAAGGCCUUUUGGUUGUAAAGCACUUUAAGCAGUGAAGAAGACUCUUCGGUUAAUACCCGGGGACGAUGACAUUAGCUGCAGAAUAAGCACCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGAGCGUAGGUGGCUUGAUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUUAACCUGGGAACUGCAUCUGAAACUGUUAGGCUAGAGUAGGUGAGAGGGAAGUAGAAUUUCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGAAGGAAUACCGAUGGCGAAGGCAGCUUCCUGGCAUCAUACUGACACUGAGGCUCGAAAGCGUGGGUAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCUACUAGUCGUUGGGUCCCUUGAGGACUUAGUGAUGCAGCUAACGCAAUAAGUAGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCCGGUCUUGACAUACACAGAAUCUUGUAGAGAUACGAGAGUGCCUUCGGGAAUUGUGAUACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCCUUAGUUACCAGCGGGUUAAGCCGGGAACUCUAAGGAUACUGCCAGUGACAAACUGGAGGAAGGCGGGGACCACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUAGGUACAGAGGGCAGCUACACAGCGAUGUGAUGCGAAUCUCAAAAAGCCUAUCGUAGUCCAGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUAGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGAAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUUGAUUGCACCAGAAGUGGUUAGCCUAACUUAGUGAGGGCGAUCACCACGGUGUGGUCGAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCCGUAGGGGAAACCUGCGGCGGUUGGAUCACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((.((...((((....))))....)))).))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((((((..((....)))))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).<.(((((((...(..((((((((((.......))))))).)))..)....))))))..>)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((((.....))))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(.....).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).(((((.(((((.....))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
.........(((.[[[......)))..]]]...((((((((.......(((..[[[[.)))...]]]]...))))))))......((((....)))).............((((.(((......)))))))((((..[[[[[[(((((....))))).......)))).....(((....)))....((((((..........))))))]]]]]]......(((....[[[[[[[[[[[[.((((((((.......))))))))))).........]]]]]]]]]]]]............((((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......))))(((....[[[......(((....)))..)))..]]]........((((......((((....)))).....)))).........(((.......[[[[[[[)))....]]]]]]].((((((....(((((.......[[[[[......[[[[[[[[[.)))))...]]]...]]]]]]]]]]]..................(((((((.....(((((...((((((((((((..(((((((((...((((............))))..)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))....................)))))))..)))).))))..))))...)))))...(((((((.......((((.........))))....)))))))..........(((((((.((((((((((((.....))))))))))))...............)))))))))))))).((((..((((....))))...)))).......(((........[[[[.)))...]]]].((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]...(((((..........[[[[[..(((((((....)))))))......)))))..]]]]]..((((....[[[....)))).....(((((((((....)))..((((......))))..))))))]]].(((.(((((((((.......(((......)))......)))))))))...(((((.....))))).....[[[[)))....]]]]..)))))).(((((((.......)))))))......(((....(((((((((...(((((((....((((....)))).)))...)))).....))))))))).........[[[[[[[.)))....]]]]]]]...(((.[[[[..))).((((((((((.........)))))))...))).]]]](((((............)))))...((((.(((..((((((((((((....(((((..((((..........))))....)))))))))))))))))..))).))))..(((((...[[[[.........(((....))))))))(((......))).]]]].
|
|
CRW_00196
|
[ FASTA input ]
|
UUUUAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUCGAGCGAACGGACGAGAAGCUUGCUUCUCUGAUGUUAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGAUAACCUACCUAUAAGACUGGGAUAACUUCGGGAAACCGGAGCUAAUACCGGAUAAUAUUUUGAACCGCAUGGUUCAAAAGUGAAAGACGGUCUUGCUGUCACUUAUAGAUGGAUCCGCGCUGCAUUAGCUAGUUGGUAAGGUAACGGCUUACCAAGGCAACGAUGCAUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAACGCCGCGUGAGUGAUGAAGGUCUUCGGAUCGUAAAACUCUGUUAUUAGGGAAGAACAUAUGUGUAAGUAACUGUGCACAUCUUGACGGUACCUAAUCAGAAAGCCACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUGGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGCGCGUAGGCGGUUUUUUAAGUCUGAUGUGAAAGCCCACGGCUCAACCGUGGAGGGUCAUUGGAAACUGGAAAACUUGAGUGCAGAAGAGGAAAGUGGAAUUCCAUGUGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUUUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAUGUGCGAAAGCGUGGGGAUCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAAGUGUUAGGGGGUUUCCGCCCCUUAGUGCUGCAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGACCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAAAUCUUGACAUCCUUUGACAACUCUAGAGAUAGAGCCUUCCCCUUCGGGGGACAAAGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAAGCUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUGGGCACUCUAAGUUGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACAUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGAUUUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGACAAUACAAAGGGCAGCGAAACCGCGAGGUCAAGCAAAUCCCAUAAAGUUGUUCUCAGUUCGGAUUGUAGUCUGCAACUCGACUACAUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAGAUCAGCAUGCUACGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGCCGGUGGAGUAACCUUUUAGGAGCCAGCCGUCGAAGGUGGGACAAAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((....((((((....))))))....)))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))......(((((((((....)))))))))......((((((...)))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.....((((((((......)))))))).....)....))))))..)...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..(((((((((((((....)))))))))))))...[[..))]].....]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....)))))))..((((....)))).))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((..(((..(((...))).))).))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
...........((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]]..(((.....[[[[)))((((((....))))))...]]]].(((((.((((((((........((((.....)))).(((((((((((((...((((((....))))))(((((((((((((((.(((((((((....)))))))))....((((...))))..((((((((((........(((((((((.........((((((((.......))))))))((((........((((((((((....))))....(((....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).......((((...((((((.....((((....))))(((((((......(((....))).....((((....))))......))))))).....))))))....(((((((........)))))))..........))))........))).))))))......)))).)))).)))))......))))))))))...)))))))))...))))))(((((.......(((((..(((((((((..(((((((.......((((((.....)))))).....)))))))...)))))))))....((((((........(((...((((((((...(((........)))....))))))))...))).(((..........)))......))))))......((((((.(((((....(((((((((......)))......((((....(((((((((((...(((((((((((.(((((((((((((....))))))))..............))))).)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).)))).(((....))).....)))))).((((((((((((..((((........))))))))....(((((((........(((((....(((((....)))))...(((((....))))))))))....(((....((((((((((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((............))))..))))))).(((.(((((.....))))).....))))))))))))).......))))))).)))...)))))))......))))))))....))))).......)))).......(((....)))........))))))..(((.((((.(((((.....(((((((........)))))))...))))))))).))).....))))).))))))...))))).....))))))))).))))))))).....)))))))).((((.(((..((((((..(((((((...((((.......(((...))).....)))))))..))))..))))))..))).))))..)))))....(((((((((((((....))))))))).....)))).......
|
|
CRW_00230
|
[ FASTA input ]
|
AAUUAAAGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUAGAACGCUGAGAACUGGUGCUUGCACCGGUUCAAGGAGUUGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAGGUAACCUACCUCAUAGCGGGGGAUAACUAUUGGAAACGAUAGCUAAUACCGCAUAAGAGAGACUAACGCAUGUUAGUAAUUUAAAAGGGGCAAUUGCUCCACUAUGAGAUGGACCUGCGUUGUAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAAAGGCUCACCAAGGCGACGAUACAUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCGGCAAUGGGGGCAACCCUGACCGAGCAACGCCGCGUGAGUGAAGAAGGUUUUCGGAUCGUAAAGCUCUGUUGUUAGAGAAGAAUGAUGGUGGGAGUGGAAAAUCCACCAAGUGACGGUAACUAACCAGAAAGGGACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUCCCGAGCGUUGUCCGGAUUUAUUGGGCGUAAAGCGAGCGCAGGCGGUUUUUUAAGUCUGAAGUUAAAGGCAUUGGCUCAACCAAUGUACGCUUUGGAAACUGGAGAACUUGAGUGCAGAAGGGGAGAGUGGAAUUCCAUGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUAUGGAGGAACACCGGUGGCGAAAGCGGCUCUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAGGCUCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAGGUGUUAGGCCCUUUCCGGGGCUUAGUGCCGGAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGACCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGUCUUGACAUCCCGAUGCCCGCUCUAGAGAUAGAGUUUUACUUCGGUACAUCGGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUAUUGUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUGGGCACUCUAGCGAGACUGCCGGUAAUAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGACCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUGGUACAACGAGUCGCAAGCCGGUGACGGCAAGCUAAUCUCUUAAAGCCAAUCUCAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCACGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGUCGGUGAGGUAACCUAUUAGGAGCCAGCCGCCUAAGGUGGGAUAGAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((..(((((((((....)))))))))..))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((((....)))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).<.(((((((...(.....((((((((.......)))))))).....)....))))))..>)..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))..))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((((......))))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((...(((((((....))))))).(((....))).))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))............
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((.(((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]].......((((...(((((((((....))))))))).[[[.(((((..........)))))))))......]]].(((....[[[[)))....((((((....))))))......]]]]...........(((((((.(((....((((....(((((....)))))......)))).))).))))))).....(((..[[[[[[[)))......]]]]]]](((..[[[[.....))).((((....)))).]]]](((...(((((.(((.....)))))))).((((....)))).........[[[[[[[[[[)))..(((((....)))))............(((....)))..]]]]]]]]]]..(((((....(((((....)))))........(((((((.........)))))))....))))).((((((((.........((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]...(((.[[[[....))).........]]]]......(((((((...((((((((..((((((((.....(((((((.....)))))))..))))))))...)))))))).....((((((.((((((.(((...((((((((((.(((......)))....))))))))))...)))...............))))))..)))))).))).))))...((((....[[[[[[[))))...((((.........))))....]]]]]]]..........(((((((.....(((((((..[[[[[[)))))))..]]]]]]...........)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((........[[[[.)))...]]]]((((((((((((..((((........))))))))....(((((((........((((((...((((((....))))))..(((....)))))))))....(((....(((((((...((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((.((((............))))..))))))).(((.(((((.....))))).....))))))).))))).......))))))).)))...)))))))......))))))))....)))))))).....(((......((((....))))..[[[...)))....]]].....(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]]...(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]...((((.(((..((((((..((((......((((..(((..(((...))).))).)))).....))))..))))))..))).))))..............((((((((((....))))))))))............
|
|
CRW_00245
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCGUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGGCUCUUCGGAGCUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGAGAAUCUGCCUACAGGACGGGGACAACAGUUGGAAACGACUGCUAAUACCCGAUGUGCCGAGAGGUGAAACAUUUAUGGCCUGUAGAUGAGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAGGGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGCAAGCGACGGAGCAACGCCGCGUGGGGGAGGAAGGUUUUUGGACUGUAAACCCCUUUUCUCAGGGAAGAAGAAAGUGACGGUACCUGAGGAAUAAGCCUCGGCUAAUUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGGAGAGGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGCCUGCAGGCGGUUAAUCAAGUCUGUUGUCAAAGCGUGGGGCUCAACCUCAUACAGGCAAUGGAAACUGAUUGACUAGAGUAUGGUAGGGGUAGCGGGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUCUGGAAGAACACCAGCGGCGAAAGCGCGCUACUGGGCCAUAACUGACGCUCAUGGACGAAAGCUAGGGGAGCGAAAGGGAUUAGAUACCCCUGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGAACACUAGGUGUUGCGUGAAUCGACCCGCGCAGUGCCGUAGCCAACGCGUUAAGUGUUCCGCCUGGGGAGUACGCACGCAAGUUGGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGUAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUCCCCCGAAUCUCUUGGAAACGAGAGAGUGCCUUCGGGAGCGGGGAGACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCACGUUUUUAGUUGCCAUCAUUCAGUUGGGCACUCUAGAGAAACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGUGGACGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUACAUCCUGGGCUACACACGUACUACAAUGCUCCGGACAGCGAGACGCGAAGCCGCGAGGUGAAGCAAAUCUCCCAAACCGGGGCUCAGUUCAGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGGCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCAUACUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGUUGGCCAUGCCCGAAGUCGUUACCCUAACCGUUCGCGGAGGGGGGCGCCGAAGGUAGGGCUGAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGUGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((....)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(..((....))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(..(....)..)....))))))..)...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..(((((((((((........)))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...........((((.((((((...)))))))))).....((((.(((....[[[..))).))))....(((((....))))).]]](((..[[[[[......)))......]]]]].(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....))).............))))))).....(((....((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..[[[[[[[...)))...]]]]]]]....(((((.......[[[..))))).((((....))))......]]]........((((.....[[[[.......))))....]]]]....(((.[[[[[[((((....)))).....)))..]]]]]].(((..............[[[[)))..(((((.(((....))).))))).]]]].....(((.[[[[[[.)))...........]]]]]].....(((..[[[[[)))..]]]]].(((..(((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)))))))))....((((((...((((((.....((((((((((.(((......)))....))))))))))........(((.......)))))))))..)))))).))).(((((..........[[[[[[[)))))..((((.........))))....]]]]]]]......((((.....[[[....[[[[[[[.))))...]]]]]]].....]]](((((((((...(((((((.[[[[.)))))))..))))..)))))....((((.....))))]]]]...((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]..((((.((........))(((((((((((((....))))))).....))))))........[[[[[.))))......]]]]]....(((((((((....)))..[[[[[[..........))))))..]]]]]]..(((((((.((((....[[[.....))))..))))))).....(((((.....)))))..]]].(((((...(((.....))).....((((..........))))..)))))..........(((((((...(((...)))....[[[[(((((.......))))).....)))))))....((((...(((((((........))))))))))).]]]]....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]....(((......(((((((.((((......(((..((((..(((....)))))))..))).....)))).)))))))....[[[[[[[...........)))(((((((((....)))))))))...]]]]]]]....
|
|
CRW_00248
|
[ FASTA input ]
|
UAUAUGGAGGGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAACACAUGCAAGUCGAGCGGGGGAAACUCCCUUCGGGGAGGAGUACCCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGGUAACCUGCCCUCCGGAGGGGGAUAACCAGGGGAAACCCUGGCUAAUACCCCAUACGCUCCAUCAACGCAAGUUGGUGGAGGAAAGGGGCGUUUGCCCCGCCGGAGGAGGGGCCCGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGGUCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGGGAAACCCUGAUCCAGCGACGCCGCGUGCGGGACGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACCGCUGUGGCGGGGGAAGAAUAAGGUAGGGAGGAAAUGCCCUACCGAUGACGGUACCCCGCUAGAAAGCCCCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGGGCAAGCGUUACCCGGAUUUACUGGGCGUAAAGGGGGCGUAGGCGGCCUGGUGUGUCGGAUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUGCAUCCGAAACUACCAGGCUUGGGGGCGGUAGAGGGAGACGGAACUGCCGGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUAUCGGCAGGAACGCCGGUGGGGAAGCCGGUCUCCUGGGCCGACCCCGACGCUGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCCCACUAGGUGUGGGGGGGUAAUCCCUCCGUGCUGAAGCUAACGCGUUAAGUGGGCCGCCUGGGGAGUACGCCCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCGUGUGGUUUAAUUGGAUGCUAAGCCAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGGUGGUACCUCCCCGAAAGGGGUAGGGACCCAGUCCUUCGGGACUGGGAGCCGGCACAGGUGGUGCACGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUGCCCCUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAGGGGGACUGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGAUGACGUCAGGUACUCGUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGCGCUACAAUGGGCGGUACAAUGGGUUGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCCAAAGCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCAGGCUGCAACCCGCCUGCGUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCACCCGAGUCGGGGGCUCCCGAAGACACCUACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGUGUCGAGGGAGAACCUGGCGAGGGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((....(((((....))))).....)))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((((((....))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).a.(((((((...(.....((((((((......)))))))).....)....))))))..A)..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...[.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((((...))))))))))))...[[..))]].....]]]]]]]))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((...(((((((....)))).)))..((((((((....))))))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....(((((((.((((..(((....))).)))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]]..((((...(((.....(((((....))))).....)))..))))....((((........(((((((..(((..(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....((((((((((....))))))))))....(((((....))))).))))))).)))))))))))))).((((((..((((((((.......))))))))[[[[[[..(((....))))))))).......]]]]]]....(((((.[[[........))))).((((....)))).]]].(((((((....(((((...(((((....))))).)))))...(((((((.((((......((((....)))).....)))))))))))[[[[........(((((((........)))))))..........)))))))......]]]](((.........)))....(((((((((((((.(((.(((((..((((.(((((.....)))))........((((...((((((((((((..(((((((((...((((((((.....)))))))).)))))))))...))))))))((((((.((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))......((((......)))))))))))..)))).))))))))))...))))...((((((((.......((((.........))))....))))))))...)))).))))).))).)))).((((((....))))))..(((((......((((....(((((((.((((..((((.(((((....)))))..))))...........)))))))))))...((((((((.(((((((((((..((((........))))))))....(((((((......(((((((....(((((((....)))).)))..((((((((....)))))))).))))))).(((....((((((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((((.(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((.....))))).......))))).)))))...)))...))))).)))...)))))))....))))))).))))...(((((((.....((((((...((((....))))....)))))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))..))))......))))..)))))..)))))))))...((((.....[[[[..))))......]]]]....((((.(((..((((((..(((((...(((((((.((((..(((....))).)))))))))))..)))))..))))))..))).))))............((((((((((((....)))))))))..))).))))).....
|
|
CRW_00250
|
[ FASTA input ]
|
AUGAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAACGAACGCUGGCGGUGCGUUUUAAGCAUGCAAGUCGAACGGCAAGGAAGCGAAUUUUCGUUUCUCUAGAGUGGCGGACUGGUGAGUAACGCGUGGGUAAUCUGCCUUUGAGAUGGGGAUAGCCUCUAGAAAUAGGGGGUAAUACCGAAUACGCUCUUUUGGACGUAGUCUUUGAGAGGAAAGGGGCUGCGGCCUCGCUCAGAGAUGAGCCUGCGACCCAUUAGCUUGUUGGUGGGGUAAUGGCCUACCAAGGCGUCGAUGGGUAUCCGACCUGAGAGGGUGACCGGACACACUGGGACUGAGAUACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGCUAAGAAUAUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCGACACCGCGUGGAUGAGGAAGGUCGAAAGAUUGUAAAGUUCUUUUGCCGACGAAGAAUGAGGACGGGAGGGAAUGCCCGUUUGAUGACGGUAGUCGUGCGAAUAAGCCCCGGCUAAUUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAACACGUAAGGGGCGAGCGUUGUUCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGGGCAUGCAGGCGGACUGGUAAGCCUGGUGUGAAAUCCCCGAGCUCAACUUGGGAACUGCACUGGGUACUGCUGGUCUAGAAUCACGGAGGGGAAACCGGAAUUCCAAGUGUAGGGGUGGAAUCUGUAGAUAUUUGGAAGAACACCGGUGGCGAAGGCGGGUUUCUGGCCGAUGAUUGACGCUGAGGUGCGAAGGUGUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACACAGUAAACGAUGUACACUAGGUGUUGGGGCAUGAGUCUCGGCGCCGACGCGAACGCAUUAAGUGUACCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAGGAACCUUACCCGGGUUUGACAUCAAGAGGAGCGCCGUAGAAAUGCGGUGGCGUAGCGAUACGCCUCUUGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUACUGCCAGUUGCCAGCAAGUGGUGUUGGGGACUCUGGCGGAACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUAUGUCCGGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUGCUACAGAGCGAUGCGAGGUUGUGAAGUGGAGCAAACCGCAAAAAGGCAAUCGUAGUCCGGAUUGAAGUCUGAAACUCGACUUCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCACAUCAGCAUGGUGCGGUGAAUGUGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUCCGAGUUGGAGAUACCCGAAGUCACUAGCCUAACCCGCAAGGGAGGGCGGUGCCGAAGGUAUGUUUGGUAAGGAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((....((((((((....))))))))....))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((((((((((...)))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).{.(((((((...(.....(((((((........))))))).....)....)))).))..})..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...a.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))).)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........aaaaaa..(((((((((((....)))))))))))...aa..))AA.....AAAAAAA))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))..............
|
| [ predicted structure ] |
.....(((...[[[[[)))....]]]]].(((..[[[[...((((.......)))).....)))..]]]]..((((((((....))))))))(((....[[[[[[...(((.....))).)))....]]]]]]...(((.(((......((((((....))))))......)))..[[[[))).......]]]](((((((((......(((((.[[[))))).))))))))).....]]].(((((((.((((..(((((((.......)))))))))))...))))))).((((((((....))))...))))....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).................(((((..(((((....))))).[[[.(((....)))))))).(((((.((((....))))......)))))...]]]...........(((((((.[[[....))))))).(((((....)))))..........]]]((((..[[[[[[[.....)))).......]]]]]]].....((((...))))........(((((((((.((((........(((((((((.((((((((((.....((((((.....))))))...))))))))))..)))))))))....((((..(((((..(((((..((((((((((.(((......)))....)))))))))).....)))))(((((..((((((..(((..((((...........(((((.....(((((((.......((((.........))))....)))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...............))))))))))))...((((..((((....))))...))))......)))).)))..))))))...(((.(((.(((((...(((...((((........))))((((((.....))))))))).((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))...))))).))).))).))))).(((((((((....)))..((((......))))..))))))....))))).(((((((...((((((.....)))))).....))))))).....(((((.....)))))......)))).((((((.....))))))...))))))))))))).(((......[[[)))...]]].((((.....[[[[[[))))((((((...((((......))))......))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))]]]]]]....(((((((.........)))))))...(((((...[[[[[.....)))))..]]]]]...(((..((((...)))).(((((......((((.((((..(((....))).)))))))).....))))).......[[[[[[[)))...............(((((((((....)))))))))......]]]]]]]..
|
|
CRW_00256
|
[ FASTA input ]
|
GUCAAUUUUAAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUUAACGCUGGCGGCAUGCCUAAUACAUGCAAAUCGAACGAAGCCUUUUAGGCUUAGUGGUGAACGGGUGAGUAACACGUAUCCAAUCUACCCUUAAGUUGGGGAUAACUAGUCGAAAGAUUAGCUAAUACCGAAUAAUAACAUCAAUAUCGCAUGAGAAGAUGUAGAAAGUCGCUCUUUGUGGCGACGCUUUUGGAUGAGGGUGCGACGUAUCAGAUAGUUGGUGAGGUAAUGGCUCACCAAGUCAAUGACGCGUAGCUGUACUGAGAGGUAGAACAGCCACAAUGGGACUGAGACACGGCCCAUACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUUUUUCACAAUGGGCGCAAGCCUUAUGAAGCAAUGCCGCGUGAACGAUGAAGGUCUUAUAGAUUGUAAAGUUCUUUUAUAUGGGAAGAAACGCUAAAAUAGGAAAUGAUUUUAGUUUGACUGUACCAUUUGAAUAAGUAUCGGCUAACUAUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAUAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAUUUACUGGGCGUAAAACGAGCGCAGGCGGGUUUGUAAGUUUGGUAUUAAAUCUAGAUGCUUAACGUCUAGCUGUAUCAAAAACUGUAAACCUAGAGUGUAGUAGGGAGUUGGGGAACUCCAUGUGGAGCGGUAAAAUGCGUAGAUAUAUGGAAGAACACCGGUGGCGAAGGCGCCAACUUGGACUAUCACUGACGCUUAGGCUCGAAAGUGUGGGGAGCAAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCACACCGUAAACGAUCAUCAUUAAAUGUCGGCCCGAAUGGGUCGGUGUUGUAGCUAACGCAUUAAAUGAUGUGCCUGGGUAGUACAUUCGCAAGAAUGAAACUCAAACGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGUGGUGGAGCAUGUUGCUUAAUUUGACAAUACACGUAGAACCUUACCUAGGUUUGACAUCUAUUGCGAUGCUAUAGAAAUAUAGUUGAGGUUAACAAUAUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUUUCGUUAGUUACUUUUCUAGCGAUACUGCUACCGCAAGGUAGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUAUCUAGGGCUGCAAACGUGCUACAAUGGCUAAUACAAACUGCUGCAAAAUCGUAAGAUGAAGCGAAACAGAAAAAGUUAGUCUCAGUUCGGAUAGAGGGCUGCAAUUCGUCCUCUUGAAGUUGGAAUCACUAGUAAUCGCGAAUCAGACAUGUCGCGGUGAAUACGUUCUCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCAAACUAUGGGAGCUGGUAAUAUCUAAAACCGCAAAGCUAACCUUUUGGAGGCAUGCGUCUAGGGUAGGAUCGGUGACUGGAGUUAAGUCGUAACAAGGUAUCCCUACGAGAACGUGGGGAUGGAUCACCUCCUUUCUUCGGAGUAAAUUUUUAAUUUAC |
|
[ reference structure ]
|
............(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((...))))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((..((((....)))).))))))....((((((......)))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......(((((...))))).....)))).a.(((((((...(.....(((((((((....))))))))).....)....))))))..A)..((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....))))))).)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..(((((((((((....)))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))....>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((...(((((((....)))))))........))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((........)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).....................................
|
| [ predicted structure ] |
(((..............[[[[[[[)))..]]]]]]].....(((.[[[[)))......]]]].....(((..[[[[[)))..]]]]].(((......[[[[[.....)))..........]]]]].....((((......((((((....))))))......)))).......(((..[[[[[..)))....]]]]].....(((((...[[[[[[[...((((((....))))))))))).......((((((((((((.......))))))..(((...)))....))))))(((....)))......]]]]]]]..((((((((((....(((...((((....))))...[[[...)))....(((((....((((....))))..)))))...]]].....((((......(((((...))))).....)))).((((.((((........((((((((........)))))))).........)))).))))..(((...[[[..)))....]]]....(((.((((((......(((((...[[[[)))))....))))))))).........]]]](((((((((((((..((((((((.....(((((((.....)))))))..))))))))...))))))))...((((((((..((((((....)))))).......(((......)))...................(((.(((((....)))))...))))))).))))..)))))..((((....[[[[[[[))))...((((.........))))....]]]]]]].....((((.[[[[[[[.....(((((((....)))))))..))))...(((....)))]]]]]]](((.[[[[[.)))(((((....)))))..]]]]].......(((........[[[[.)))...]]]]..(((((((.(((((((..(((((......((((((.....))))))......)))))....((((((....))))))..))))))))))))))....(((((((((((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((((((((((((........))))).......(((((....)))))..))))..)))).)))))...))))))..(((((((.......))))..)))...)))))))...............(((.(((...(((....)))...)))...))).........))))))))))....(((((((........)))))))...(((.[[[[[.))).((((((((((..........)))))))...)))]]]]]......(((.....[[[[[[[[[)))...]]]]]...]]]]....(((((((.[[[[.........)))))))....]]]](((((((.((((..(((((.....((((.....))))....((((((((((....))))))))))..))))))))).)))).)))(((((((...)))))))
|
|
CRW_00270
|
[ FASTA input ]
|
UAUAAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUUAACGCUGGCGGUAUGCCUAACACAUGCAAGUCGUACGAGAAUUUUAUUCUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGAGAAUCUACCUCUAGGAGGGGGAUAACAGUUGGAAACGAUUGCUAAAACCCCAUAUGCCAUUAUUGGUGAAAAAGAUUUAUCUGCCUGGAGAUGAGCUCGCGGCUGAUUAGCUAGUUGGUAGGGUAAUGGCUUACCAAGGCAACGAUCAGUAGCUGGUCUUAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGAACUGAGAUACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCACAAUGGGCGAAAGCCUGAUGGAGCAAUACCGUGUGAGGGAUGAAGGCCUGUGGGUUGUAAACCUCUUUUUUCAGGAAAGAAACUUUGACGGUACCUGAAGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUCACUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGUUUAUCAAGUCUGCUGUUAAAGCUUGAGGCUUAACCUCAAAAAAGCAGUGGAAACUGAUAGACUAGAGAAUGGUAGGGGCAGAGAGAAUUCUCAGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUUGAGAAGAAUACCGAUAGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCAUUACUGACACUCAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACUAUGGAUACUAGAUGUUGUGUGAGUAAAAUUGUGCAGUAUCGAAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGAAGUACGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGACUUGACAUGUUACUAAUUUCCUUGAAAGAGGAAAGUGCCUUUGGGAAAGUAAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCUUUAGUUACCAUCAUUAAGUUGGGGACUCUAAAGAGACUGCCGGUGAUAAACCGGAGGAAGGUAAGGAUGAGGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUAGGACAAUAAGUCGCAAAUUCGUGAGAACUAGCUAAUCUUAUAAACCUAAUCUCAGUACGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGACGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUACACAGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCUGGCCAUGUCCGAAAUCAUUACUCUAACCUUAAUGGAGGAGGAUGCUUAAGGCAGGGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUUACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((...)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((....)))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((((......))))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....).))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
..........((((((((((((...))))))))).)))(((.[[[[)))......]]]]...((((...(((((...)))))....))))(((.[[[[[[....)))..........(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))....(((....))).)))))))....]]]]]]((((((((((((..((((((((.......)))))))))))...((((((...))))))........)))))))))...(((((.(((.....)))))))).(((.[[[[[)))......((((((....))))))..(((((....)))))...........]]]]].((((......((((....)))).....)))).((((((((.((((...))))...[[[[[))))))))..(((....)))......]]]]](((.(((.((((....((((.((((....)))).)))).....)))))))......(((((.....((((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...))))))))))...((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))....................)))))))..)))))).((((...)))))))))...))).((((......[[[[[[[[....))))..]]]]]]]]............(((((((.((((((((((((......)))))))))))).......[[[[....)))))))..(((....(((.(((((....)))))..)))...)))..(((.(((....)))..)))]]]]...((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]......(((((((((..........(((((((....)))))))(((((.....................))))).((((....))))[[[[[[(((....))).....)))))))))....]]]]]]....((((..[[[[[[[................))))...]]]]]]].....(((((.....)))))......((((((((((.......)))))..[[[[))))).....]]]]......((((((.....(((((((...(((((.......(((....))).........)))))...)))))))..))))))...(((((((........))))))).............(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]...((((.(((..(((((((.((((......((((.(((((.......)))))...)))).....)))).)))))))..))).)))).((((.....[[[[((((((((((....))))))))))))))....]]]].
|
|
CRW_00271
|
[ FASTA input ]
|
UUGAAAUGGAGAGGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAAUAUUAAGUUUUCUUAAAUUUGUAGAAAUUUAAUAUUAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAAUCUGCUUUUGGGUAAAGAAUAACAAUUGGAAACGAUUGCUAAUACUUUAUAGGCUGAGGAGUUAAAGGUUUUAUUUCCGCCCAGAAAUGAGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUAAGAUAAAAGCUUACCAAGGCAAUGAUCAGUAGUUGGUCUGAGAGGAUGAUCAACCACACUGGGACUGAGAUACGGCCCAGACCUUUACGGAGGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUAUCGCGUGAAGGAUGACGGCCUGUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUUAAGAAAGAAUUCUGACGGUACUUAAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGAAAUUAUUGGGCGUAAAGAGUUUGUAGGUGGUUUUUUAAGUCUACUGUUAAAUAUCAGAGCUUAACUUUGAACAAGCAGUAUGAAACUAAUUAACUUGAGUUUGGUAGAGGCAGAGGGAACUCUCGAUGUAGUGGUGAAAUACGUAGAUAUCGGGGGGAACACCAGUAGCGAAAGCGCUCUGCUGGGCCAUAACUGACACUGAGAAACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGGAUACUAAGUAUUGGGCUUUUUGAAGUUCAGUGUUGAAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGAAUUGACAUACUCGUUGGUUUUUUAGAAAUAAAAAACUGUUAAAGAGAUACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCUUUAGUUGUUAUCUAGAGAGACUGCCGGUGAUAAACCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUAAGUCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGUAUAGACAAAGGGAAGCAAAUCUGCGAAGAGUAGCAAAUCUCAAAAACUAUAUCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCCAUACAGCGGUGAAUAUGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCAUCACGCUCGAGAAAUUGGAAAUACCCAAAGUCAUCAUUCUAACCAUAUUUUUUGGAAGAUAAUGCCAAAGGUAGAGCUAGUGACUCAAGCGAAGUUGUAACAAGGUAACCGUACUGGAAGGUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
..........(((.((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....((........)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..))))))).))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((....))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..((((((.((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((((((((((((....))))))))))...))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.......)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((((.((..(((.......))).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.............((((.((((((...))))))))))(((((((((.(((.........))).((((....(((((((((((((............)))))))))))))..))))...............(((........)))((((((((((((.....((((((....))))))......))))..[[[[[..((((.((((...)))).))))))))))))...]]]]]....((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))((((((((.(((........))))))).))))(((((((((((..((((....[[[[[[...))))....]]]]]]....(((((...(((((....))))).)))))...((((....[[[[))))((((((....))))))...]]]]..(((((....)))))...(((.[[[[[))).(((...(((....)))...)))]]]]]....(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..)))))))))).....(((((......(((((((.......(((((((.....((((((.....))))))...))))))).)))))))...))))).((((((((...(((((((....((((((((((.(((......)))....))))))))))....................)))))))..)))).)))).................(((.[[[[)))...............]]]]........(((((.........[[[[[[[...((((((((((....))))))))))....)))))........]]]]]]]..(((((.((((.(((((....)))))..)))).......(((........[[[[.)))...]]]].((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]...)))))..........(((..((((((((((....)))))))))).....)))..((((....[[[....)))).....(((((((((....)))..((((......))))..))))))]]]..((((.(((((((.......))))))).....(((((.....)))))...))))((((..((((.....))))....[[[[))))......]]]]........((((((...............[[[[.(((....))).....))))))..]]]]........))))))))))).((((((((((........)))))))....)))...))))))))).(((((((..........))))))).....(((....[[[[.....)))....]]]]....((((.(((..(((((...((((......(((...(((..(((.......))).)))..))).....))))...)))))..))).))))...........(((((((((((((....))))))))).....)))).....
|
|
CRW_00273
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGCAAAGCAAUUUGUGUAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUAAGAACCUACCUAUCGGAGGGGGAUAACAUUGGGAAACUGUUGCUAAUACCCCAUACAGCUGAGGAGUGAAAGGUGAAAAACCGCCGAUAGAGGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGGUAACGGCCUCCCAAGGCCACGAGCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUUCGCAAUGGGCGCAAGCGACGGAGCAAUGCCGCGUGCAGGAAGAAGGCCUGUGGGUCGUAAACUGCUUUUCUCAGAGAAGAAGUUCUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCACCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGGUGCAAGCGUUGUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUCGUAAAGUCUAAUGUCAAAUACCAGGGCUCAACCUUGGACCGGCAUUGGAGUACUCACGAGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCAUGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCGAAACUGACACUGAGAGACGAAAGCUGGGGGAGCGAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCCAGCCGUAAACUAUGGAGACUAAGUGCUGCCGCAAGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUCUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGACCGCACAAGCGGUGGAUUAUGUGGAUUAAUUCGAUACAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUGUCAAGAACCUCUCAGAAAUGGGAGGGUGCCCUAACGGACUUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAAGUGUAUAGUUAAGUCUCAUAACGAGCGCAACCCUCGUCUUUAGUUGCCAUUUGGUUCUCUAAAGAGACUGCCAGUGUAAGCUGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACAUCCUGGGCUUCACACGUAAUACAAUGGUUGGGACAAUCAGAAGCGACUCGUGAGAGCUAGCGGCUCUGUUAAACCCAACCUCAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCAGUCAGCUAUAUGGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGUUCUGCUCCAAGUCGUUACCCUAACCUUCGGGAGGGGGGCGCCUAAAGCAGGGCUAGUGACUAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGGGCUACUGGAAGGUGGCCCUGGCUCACCUCCUUC |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((....)))))).))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....(((.....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((.((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(..((....))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))...)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((.....))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....)))))))..(((.....)))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((....))....)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((..(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...).)))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((...(((((.(((((...))))))))))(((..((((.(((...[[[[[.))).))))....))).........]]]]]....(((...[[[[......)))......]]]]..(((((((.((((........(((....))).........)))).....(((....)))....(((.....))).)))))))....(((((((((((....(((...((((((((((....))))))....)))).........(((((((.........)))))))....(((((.(((.....)))))))).((((....))))..))).((((((....))))))..)))))))))))..(((.[[[...)))..]]]........(((..[[[[))).....]]]].(((((((((..(((...)))..[[[[.))))))))).....]]]].....(((((((((...[[[[[[)))...))))))..((((.(((((((((((.....))))))....))))).)))).]]]]]].......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))(((((((......))))))).................((((((((.....[[[[............))))))))...]]]]...(((...[[[))).......]]]..........((((.........[[[[[[[............))))...]]]]]]].(((((((((((.......(((((((.((((((((.....)))))))).((((......)))))))))))..((((..((((.(((((.[[[)))))..)))).......]]].)))).(((((...[[[..[[[[[[)))))..]]]]]].......]]].............(((((........[[[[[..(((((((....)))))))..)))))......]]]]].((((...[[[(((((((((....)))).)))))))))..((((...((((.......))))..)))).]]]....(((((((((.....(((((((((....))))..)))))....)))))))))...(((((..((((.....))))....[[[[))))).....]]]]...............))))))))))).......(((((((.((((..(((((((..((((........(((....))).....(((((((........)))))))......))))..)))))))..)))).)))).)))....(((((((..((((...........))))..))))))).......))))))).((((((((((((......(((..((((..........))))..))).....))))))))))))((((.[[[[[[)))).........((((((((((....))))))))))..]]]]]].....
|
|
CRW_00275
|
[ FASTA input ]
|
UGCCUGCAGAGAGUUGGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGUACGCAUGCAAUUUGGCUUGCCAGAUUGCGAUGAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUAAGAACCUACCUUUUGGAGAGGGAUAACCAUUGGAAACGAUGGCUAAUACCUCGUAUUGCUGAGAAGUGAAAGAUGAAAAUCGCCAAUAGAUGGGCUUGCGGCUGAUUAGCUUGUUGGUGAGGUAAUGGCUUACCAAGGCAAUGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGACAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGAAGGAUGAAGGCCUAUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUCAGAGAAGAAGCAUUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUAAAAAGUCUCCUGUCAAAGAUCAGGGCUUAACCCUGGGCCGGCAGGAGAAACUCUUAGGCUAGAGUUUGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCGGGAGGAACACCAAAGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCAUAACUGACACUGAGAGACGAAAGCGAGGGGAGCAAAAGGGAUUAGAUACCCCUGUAGUCCUCGCCGUAAACGAUGGAUACUAGAUGUUGGGUAGGUUAAAUCACUCAGUAUCGUAGCUAACGCGUGAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGACUUGACAUGCCACUUUUUCCCUGAAAGGGGAAGUUCCAGAGUGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUUUGAAUUGCCAGUAAUGGGAAAUUCAAAAGACUGCCGGUGACAAGCCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGUCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGCCGGGACAAAGAGAUGCAAACCCGCGAGGGCUAGCCAACCUCAAAAACCCGGUCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCCAUACUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCUGGCUAUGCCCAAAGUCGUUACCCCAACCUUUUAGGAGGGGGACGCCUAAGGCAGAGCUAGUGACUAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGGGGGUGGAUCACCUCCUUG |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((((((((....))))))))).)))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..((((((((((.((((((((...(((......)))......)))))))).)))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((((......))))))))))))...[[..))]].....]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((.(((((((....)))))))......))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((....)))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((...))).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.(((..(((....))).[[[[[)))..]]]]].......(((.[[[[)))......]]]]...((((.[[[.((((((((((....))))))))))))))...]]]((((((((.......((((((..((((....((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))..(((....))).))))....))))))))))((((((((((((..(((((((.......)))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))(((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......))).......(((((...(((((....))))).)))))((((((.....((((......((((....)))).....)))).[[[[[[[[[......))))))......]]]]]]]]]...(((((......(((((((((...[[[[[[)))...)))))))))))...((((......))))...((((((...))))))....]]]]]].......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..(((((((.....((((((((...(((((((....((((((((...(((......)))......))))))))....................)))))))..)))).))))....)))))))(((...(((((((..(((...(((........))).)))..)))))))))).......(((((((.((((((((((.(((...)))))))))))))........[[[....)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((.(((....)))..)))]]].....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]......(((((((((..(((((((.((((((....))))))..((((...))))...)))))))...((((....))))[[[[[[(((....))).....)))))))))....]]]]]].....(((..(((((((((.(((....)))..))))))))).[[[.(((((.....))))))))..]]].....((((.....))))....(((......[[[[[[))).........((((...))))]]]]]]...(((.......(((....))).........)))......((((..[[[..))))..(((((((........)))))))]]]..............((((((((((....[[[...)))))))...))).......]]]...........)))))))).((((.(((..(((((((.((((......((((..(((..(((...)))..))))))).....)))).)))))))..))).)))).....(((.[[[[[......)))....((((((.......))))))]]]]]
|
|
CRW_00277
|
[ FASTA input ]
|
UGGAAAUGACGAGUUUGAUCCUUGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUUGAACGAAAUUACUAGCAAUAGUAAUUUAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUAUGUAAGAAUCUGCGCUUGGGCGAGGAAUAACAGAUGGAAACGUUUGCUAAUGCCUCAUAAUUUACUAGAUCUAUGUGAGUAGCUAGUUAAAGAGAAUUUCGCCUAGGCAUGAGCUUGCAUCUGAUUAGCUUGUUGGUGAGGUAAAGGCUUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGAUUUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGAUUGAGAACGGAACAGACUUCUACGGAAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAAGGAAGACGGCCUUUGGGUUGAAAACCUCUUUUCUCAAAGAAGAAGAAAUGACGGUAUUUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAAUUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGGAGAUGCGAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGAGUUUGUAGGCGGUCAAGUGUGUUUAAUGUUAAAAGUCAAAGCUUAACUUUGGAAGGGCAUUAAAAACUGCUAGACUUGAGUAUGGUAGGGGUGAAGGGAAUUUCCAGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUUGGAAAGAACACCAAUGGCGAAGGCACUUUUCUAGGCCAAUACUGACGCUGAGAAACGAAAGCUGAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGUAGUCUUGGCCGUAAACUAUGGAUACUAAGUGGUGCUGAAAGUGCACUGCUGUAGUUAACACGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCUUGCACAAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACACGAAGAACCUUACCAGGAUUUGACAGGAUCUAGGAAGUUUGAAAGAACGCAGUACCUUCGGGUAUCUAGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUUUUUUUAAUUAACGCUUGUCAUUUAGAAAUACUGCUGGUUAUUACCGGAGGAAGGUGAGGACGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUAUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUUAAGACAAUAAGUUGCAAUUUUGUGAAAAUGAGCUAAUCUUAAAACUUAGCCUAAGUUCGGAUUGUAGGCUGAAACUCGCCUACAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCUAUACGGCGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGUCGGCUGUGCCCGAAGUUAUUAUCUUGCCUGAAAAGAGGGAAAUACCUAAGGCCUGGCUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGUGGCUGGAACAACUCC |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((....)))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((...)))......(((((..((........)).))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((.........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))..))))))))..........<<<<<<..((((((((.......))))))))...<<..))>>.....>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((.((((((..((((....))))....((((....))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((....))...)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
.(((......[[[[....)))..]]]]........((((....(((((.[[[[[.)))))..]]]]]...(((((((((....)))))))))...))))((((((((........(((......)))((((((((((((.....((((((....))))))......))))...((((((.........))))))....[[[[...(((...)))))))))))...]]]](((..[[[[[[.[[[[..[[[[[[[)))....]]]]]]]]]]]...]]]]]]..(((((((.........)))))))..(((((...........[[[[....((((....))))....))))).......]]]]....(((((....)))))(((....[[[[[[[)))..(((....(((((....)))))....))).((((((......)))))).....]]]]]]]...(((((.......[[[..)))))..]]]....(((.(((((((.((((.((((....)))).))))..))))))))))...............(((((((((....(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..((((((..[[[.....))))))......]]].......((((((.(((......))).........((((((........[[[[.......))))))...]]]]......))))))..........(((.[[[[)))...............]]]].....))))))))).......((((((..((((((((.......))))))))..........[[[[[[))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..]]]]]]((((((((....((((((..((((((((((((..((((........))))))))....(((((((.....(((.((((((..((((....))))....((((....)))))))))).....((((((..((((.((((((.(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((..............))))))).....(((((....)))))..)))))....))))))))))...))))))...)))...)))))))......)))))))).....(((((((....((((.....(((((...)))))........))))...)))))))....(((((..(((((((........))))))).....))))))))))).(((.((((((.............)))))).))).....))))))))........)))))))).......(((...(((((.(((((..((((((((....((((......(((......))).)))).....)))))))).))))).)))))........((((((((((....)))))))))).......)))
|
|
CRW_00278
|
[ FASTA input ]
|
UCUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGAACGAGAAAUAGAACAACUAUUUCUAGUAGCGAACGGGUGCGUAAUUACAUAAGAACUUAUCCUUUUAAGAAGGAAAUAACAAAUAACAAAUGGAAACAUUUGCUAAUGUCCUAUAAGCUGAAAAGUAAAAGGAUUAAAUCCACUAAAGGUAAGGCUUAUGUCUAGUUAGUUGGUAAGGUAACAGCUUAACAAGACAAUGAUCAGUAAUUGGUCUGAGAGGAUGAUCAAUCACACUGGAACUGAGAUAAGGUCCAGACUCCUACGGGUGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCUGACGGGGCAAUGUUGCGUGAAGGCAGAAGGCCGAUAGGUUGUAAACUUCUUUUGUGAGAAAAUAAGGAAAAUGACAGUAUCUCAAGAAUAAGCAUCGGCUAACUUUGUGCCAGCAGCCGCGGUGAUACAGAGGAUGCGAGCAUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGUGUUUUAAGGUGGCUUUAUAAGUCUAUCGUUAAAUCUCAGAGCUUAACUCUGAUUAGGCGAUUGACUAUUAAGCUAGAGCUUUGAAUAAAGCAAGGGGAAUUUCUAAUGAAGCGGUUAAAUGCGUUGAGAUUGGAAAGAACACCAAGGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCAAAAUUGACACUGAUAAACGAAAGCUAGGGUAGCGAGAGGGAUUAGACACCCCAAUAGUCCUAGCUGUAAACAAUGGAUACUUAGCAUUACUAUAUGAAAAGAUAGCUAAGCUUAAAGCUAACGCAAUAAGUAUCCCGCCUGGGAAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGGCGGGGGUUCACGCAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAAGCGAAGAACCUUACCAGGGAUUGUAUGUCGUAAUCUUUCUGAAAAAGUAAGAUACGUAUUUAUUUAAUAAAUAAAUACGUAGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCCCGUGCUGUCAAGCGUAGGGUUAACUCCCAUAACGGGCGCAACUCCCAUGUUUAGUUACCAAUUUAUGGUACUCUAAACAAACAGCUAAUGAUAAAUACUAAAUUAGAGGAAGGUGGGGAAGACGUCAAGUCAUCAUGCCCUUUAUACUCUGGGCUACACGCGUGCUACAAUGGCUGGGACAAAAUGUUGCAAUUCUGUAAAGAUAUAGCAAAACAUAAAACCCAGUCUCAGUUCGGAUUCGGGCUGCAACUCGCCCGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCAAUACAGCGGUGAAUAAGUCACCGGACCUUGUACACACCGCCCGUCACACUCAGGAAAUUGGUCAUGCCCUAACUCAUUUUAAUAUAAUGAUAAAGGUGAGGCUGGUAACUAGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((((.....))))))))))))))......(((.......((((((((.((...(((((..((.((((...........(((((((....))))))).....))))....(((....)))....(((.....))).)))))))..))))))))))((.(((..((((((((.......))))))))))).....)..)..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((.......))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(...........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..))))))))))))))))))...((.(((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..(((.(((((((........)))).))))))....{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((....(((((((.....)))))))(((((((((((((...)))))))))))))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.....)))....)))))))..((((((((............)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))....))....)))....)))))))......(...(((((((........))))).))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.......))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
((((...))))(((((.(((((...)))))))))).......(((((.[[[[[.)))))..]]]]]...((((((((.....)))))))).((((...(((....)))..)))).......((((.(((((......(((............((((((....)))))).....(((((....(((....)))...)))))....)))...)))))))))(((..(((((.((((((((.........)))).)))).))))).[[[[[))).....((((....))))]]]]]..(((.(((((............)))))..[[[[[[..)))......]]]]]].((((((((((((.(((....))).....(((....((((......))))...))).....)))))......[[[...[[[[[......))))))).......]]]]].....]]]....(((...[[[[[[)))...............]]]]]]((((....))))............((((((........(((((((((((((....((((.((((((.....((((((.....))))))...)))))).))))...)))))...))))))))....((((((....((((((((..((((........))))...))))))))..........(((...((((...))))..)))..........(((((.......[[[[[[[[...........)))))............]]]]]]]].........(((((((((...............(((.[[[[[...)))..]]]]]......)))))))))..(((........(((((....))))).....[[[)))..]]](((....[[[[)))......]]]]((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].....((((((((..[[[[.))))))))..............(((((((((((((...)))))))))))))]]]]...(((((((((((((..((((.(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((((((((((.(((((.....)))))..))))))...................(((...)))......))))))..))))...))))))...((((..........)))).......)))))))...(((((((.....(((((((...(((....)))....)))..))))....))))))).((((((.[[[[[)))))).....................]]]]](((.......[[[[...)))....]]]](((((.....)))))...))))))......))))))...(((((.......[[[[[.((((....((((((((..(((....)))))))))))...))))....)))))..............((((((((((....))))))))))]]]]]........
|
|
CRW_00279
|
[ FASTA input ]
|
UUUUAGGAUAUAAUUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGAGGUUUUUAAAGAUUUUUCUUAAAAAACUGAAAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGAGAAUCUGCCUUUAGGAAAGGGACAACAUUUGGAAACGAAUGCUAAUACCUUAUAUGCCUAUUAUAACUUGUAUAAUUAAUAGGUGAAAAGUUUUCUGCCUAGAGAGGAGCUCGCGGCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAACUGAUUUGAGAGGAUGAUCAGUCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCUGCAAUGGGCGAAAGCCUGACAGAGCAAUACCGCGUGAGGGAUGACAGUCCUAUGGAUUGUAAACCUCUUUUUUCAGGGAGGAAGUUCUGACGUUACCUGAAGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGUGUUAUCCGGAAUCACUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGUUUAAUGUGUCUGUUGUUAAAUCUUAAGGCUCAACCUUAAACCAGCAAUGGAAACUAUUAUGACUUGAGUGUGGUAGAGGUAGAGGGAAUUUCCAGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUUGGAAAGACCACCAAUGGCGAAGGCACUCUACUGGGCCAUUACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGGAUACUAGAUGUCGCAUGUAUCGACCCAUGCGGUAUUAUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGAAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUAGUACGAAGUUUUUUGAAAAAAAAACCACCUUCGGGAACGUACAUACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGUAACCCUUGUUUUUAGUUGCCUUUCGAGGAUAUUUAGAAAGACUGCCGAUUAUAAAUCGGAGGAAGGUAAGGACGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUACACUCUGGGCUACACACGUGCUACAUUGGGUAGAACAAUAAGUUGCUAAGUUGCGAAACCAAGCGAAUCUUCAAAUCUACUCUAAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUAAAGAUGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUACACAGCGGUGAAUCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGUCACACCCAAAGUCGUUAUUCUAACCGUUUGGAGGAAGGCGCCUAAGGUAGGAUUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUAUAAAGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
.................(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((((((.............))))))))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((.....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((..((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))).))....(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..(((((((((((........)))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....)))))))..((....))..))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((....)))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........)))))))).....))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......................
|
| [ predicted structure ] |
((((((.......))))))((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]].........(((((((((....)))))))))........(((.....[[[[[[)))(((.....))).......]]]]]]..(((..[[[[.....((((((....)))))))))...]]]]...(((((((((.[[[[[.......)))))))))..]]]]].....(((....)))..(((...(((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))).[[[[[[[...)))...]]]]]]]..(((((...(((.(((...)))))).((((....))))[[[[))))).........]]]]..(((((....))))).((((((..........((((....(((((((...)))))))...)))).[[[[[[[[[......))))))......]]]]]]]]]........((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]....(((((........((((((((((((((...))))))...))))))))......(((((((((.....((((((.....))))))...))))))))).[[[[[....)))))...]]]]]...(((((((....(((((((((..(((........)))...))))))))).......[[[[[[.......)))))))..]]]]]].......((((........[[[[[[[[.......[[[[.))))....]]]]....]]]]]]]].....(((((....[[[..[[[[[[[[[)))))...]]]]]]]]]...]]]...............(((..[[[[)))....(((((....)))))....((((.....))))]]]]...((((.......)))).((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].....((((((.......(((((..(((((((....)))))))[[[[........)))))........]]]]..((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..))))))..)))))).((((((..[[[[[[[[[(((....)))..))))))..((((((...)))))).]]]]]]]]].(((..[[[...)))...]]].(((...[[[...)))........]]]((((.[[[[)))).........((((......))))..]]]].(((((......[[[[.......)))))...(((((((........)))))))...]]]]........((((.[[[[[[[....))))..]]]]]]]......(((((((((............)))))....[[[[.))))..]]]]..(((((..(((((....(((.(((......(((......)))..))).)))....))))).)))))..........((((((((((((((....))))))))))....[[[[))))....]]]]..
|
|
CRW_00280
|
[ FASTA input ]
|
UCUCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGUACGGGAAGGAUCCUAGUGGUGUUUCCAGUGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUAAGAACCUGCCCUUGGGAGGGGGACAACAGCUGGAAACGGUUGCUAAUACCCCAUAGGCUGAGGAGCAAAAGGAGGAAUCCGCCUAAGGAGGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAAUAGCUUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCUUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAACGUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGUAGAAGGCUCACGGGUCGUAAACUCCUUUUCUCAGAGAAGAUGCAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUUUAAGUCCGCCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGGACAGGCGGUGGAAACUACCAAGCUGGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCGGAAAGAACACCAAUGGCGAAAGCACUCUUCUGGGCCGACACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAAGCGCUGUGCUAUCGACCCGUGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGUGAAUCUUUUUGAAAGAAAAGAGUGCCUUCGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCUUGUUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUUGGAACCCUAAACAGACUGCCGGUGAUAAGCCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGCCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGCCGGGACAAAGGGUCGCGACCUCGCGAGAGAAAGCUAACCUCAAAAACCCGGCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGUGAAUCCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACUAUGGGAGCUGGCCAUGCCCGAAGUCGUUACUCUAACCGUAAGGAGGGGGGUGCCGAACAGGGGCUAGUGACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((.....)))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((.........))))))))))...[[..))]].....]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((..........)))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((.....((((((.((((..((....)).))))))))))...)))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
((((...))))((((.((((((...))))))))))....(((((((((((....((((....((((.(((((((..(((((....(((((((.(((((((((.(((.......(((((((..(((..(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....)))....(((....))).))))))))))..)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).)))).............))))).(((((.(((.....)))))))).........)))))))....)))))..)))))))......))))..))))...)))).)))))))..((((......((((....)))).....)))).(((((((((...[[[[[..........)))))))))...]]]]]((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]].((((..[[[[[..((((.....))))))))..]]]]]........(((((......(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..[[[[[))))).......]]]]]...(((((((..((((((((.....[[[[............))))))))...]]]]..............)))))))..............((((...[[[...[[[[[[[.......[[[[.))))....]]]]....]]]]]]]]]]...(((((..[[[..[[[[[[[[[[)))))....]]]]]]]]]]]]]................((((.[[[[))))...(((((....)))))....((((.....))))]]]]...((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].....(((((........[[[[[..(((((((....)))))))..)))))......]]]]].(((.[[[[)))..((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..))))))(((((...........)))))]]]].....((((((....))))))......(((((.....)))))......(((((..((((.....))))....[[[[))))).....]]]].................(((((((.....((((......(((....))).......))))......)))))))(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]]...(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]......((((..((((............))))........[[[[))))...]]]]((((....(((.((((((......[[[[[[[)))))).)))....))))...(((((.......)))))......((((((((((((....)))))))))..))).]]]]]]].
|
|
CRW_00281
|
[ FASTA input ]
|
UGCUAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGUGCUUAUGGCAAAGAUUCUUUCGAGGGUCGGCGCCAUCUGCAUAGUGGCGAACGGGUGAGGAACACGUAAGAACCUACCCUUUGGAGGGGGAUAACGUCUGGAAACAGUCGCUAAUACCCCGUAGGCUGAGGAGUGAAACGGGAAACCGGCCAAAGGAUGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAAAGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGAUGAAGGCCCAUGGGUUGUAAACUCCUUUUCUCAGAGACGAAGUUCUGACGGUAUCUGAGGAAGAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUCAUUGGGCGUAAAGCGUUCGUAGGUGGUUCCGAAAGUCCGCUGUCAAAGCCCAGAGCUUAACUCUGGUCCGGCAGUAGAAACUUCGGGGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGUAACGGUGAAAUGUGCAGAUCUCGGGAAGAACCCCUAAGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGUGACUGACACUCAUGAACGAAAGCUAGGGGAGCCAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAAGUGCUGUGCGGUUACCAUCGACCAGUACUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUUUUUCAGAAAUGAAGAAGUGCCUUCGGGAGCGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGUCUUUAGUUACGGAAGCUCUAAAGAGACUGCCGGUGAUAAACCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGCCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCCGGGACAAAGAGUCGCCACCUUGCGAAAGGGAGCUAAUCUCAAAAACCCGGCCUCAGUUCAGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGGCGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUAUACAGCGGUGAAUCCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGCCAUGCCCAAAGUUGUUACUCUAACCCCUUCACCGGGGAGGGGAAUGCCAAAGGCAGGGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((..(((((...((((((....))))))...)))))..))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..(((((((((((((....)))))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...........)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((((......)))).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.((((.(((..[[[[..))))))).......]]]]...(((.[[[[)))......]]]]..((((....((((..(((((...((((((....))))))...)))))..))))..))))..(((....[[[....))).....]]]..(((((((.((((........(((....))).........))))[[[[[[[...........(((....))).)))))))...]]]]]]].........(((..((((((((.......))))))))))).....(((...[[[[[[[)))......]]]]]]]....(((((.(((.....)))))))).((((....))))(((((.(((((..(((((((((..(((((....))))).(((.......))).))))))))).....)))))..))))).......((((((((((.....[[[[.........)))))))))).(((....)))]]]](((.........[[[))).....]]].(((((..[[[[.)))))(((((((((((((((...))))))...))))))))).......]]]]....(((.[[[[[[)))..]]]]]](((((.(((....)))))))).......((((((...(((((((.......(((.[[[[.))).......]]]]......(((......))).............)))))))..))))))........................((((......[[[[[[[[....))))..]]]]]]]]........((((((......[[[[[[[........))))))..]]]]]]].........(((........(((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))......)))).[[[)))......]]]...((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]...(((((((........((((...(((((((....)))))))..............))))....(((..((((.(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((.....(((...(((....))).)))(((((.....)))))..)))))))))).)))))...)))))))))...)))...)))))))...................(((((((...............[[[[[[[..((((.....)))).....)))))))..........]]]]]]].(((...[[[[[[)))...]]]]]].((((((.........[[[[[[[[[....))))))...(((((...(((((............))))).......)))))]]]]]]]]].((((....[[[[[[[.....(((((((.....)))))))..((((...))))))))....((((.......))))]]]]]]]...(((((((((....)))))))))(((.....)))...
|
|
CRW_00283
|
[ FASTA input ]
|
UUAUAUUGCGAGUUUGAUCCUAGCUCAGAAUUAACGCUAGAAAUAUACAUUACACAUGCAAAUUAAUGAUAAUAUCAUAGUGUAUAGGUGAGGAUAUAUAAAUUUUUAAUUUUAAAUAGAUUAUAAAUUUUAUUAAAUAAUAAUCUAUAAGCGCAAAAAUAUAUGUACUAUAUUAAAAAUUAAUAUUAUUUAAAAUAAAAUUUAUAUUUGAUUAACUAGUUGGUAAUUUAAAAGACUACCAAGGUUAUUAUCAAAAAUUGGUUUGAAAGAAUGUACAAUCACAUUAGGAUUGAAAUAAAGCCUAAAUUUUUAUAAAAAAUCAGCAGUGAGGAAUAUUUUACAAUAAGUGUAAGCUUGAUAAAGUAAUAUUUCUUUUAGGAAGACAGUAUUAUUAAAAUAUUGUAAACUUUUUAUUUUAUUUUUAAAUAUUGAUAAAAAUAAAAAAUAGUAUUUGCUAUUUCUGUGCCAGCAGCAGCGGUAAUACAGAAAAUGCAAGCGUUAUUCAUUUUAUUAGGCGUAAAGCGUUUUAAGGUUUUAUAUUAAUUUUAUGUUUAAAUAUUUAAAUUAAAUUUAAAAUAAAUUAAUAAAUAAUAAUAUAAUAGAGUAUUAUAAAAGUAUUAAGAAUUUUUUGAGAAGUAGUGAAAUACAAUGAUACAAAAAAGAAUAUCAAAGGCGGAAGCAUAAUACUAUAUAAUUACUGACACUUAAAAACGAAAGCUAAGGUAGCAAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCUUAGCUGUAAACUAUGAAUAUUUUAUAUUUAUAUUUUAUAAAUAUAAUAACUAACGUGAUAAAUAUUCCGCCUGAGUAGUAUAUUCGCAAGAAUGAAAUUCAAAGGAAUUGACGGGAGCUUAUACAAGUGGUGGAACAUGUGGCUUAAUUCGAUGCAACACGAUAAACCUUACCAAAAUUUAACAAUAUUUUUAAUAUUAAGAAAUUAAUAUUUUAAUAAAAUAUAUAGGUAGUGCAUGGCUGUCGUCAGUUCGUGCUGUGAAGUGUUAAUUUUAGUAUUAUAACGAACGUAACCUUUUAUAAAAAAAAUUUUUAUAAUAAAUAAUAAUAAAGAUUACGUCAAGUCAUUAUGCUCCUUAUAUUUUGGGCUGCUCACGUGUUACAUAAAAUAUUACAAUAUUUUAUUAUAUGUUAAAUAUAAUAAUUAAAAUAUAUUUAUAGUUCAGAUUAUAAAUUGAAACUCAUUUAUAUAAAGAUGGAAUCACUAGUAAUCGCUAAUCAGAAUUAUAGCGGUGAAUAAGUUCUUAAGCUUUGUACACACCGCCCGUCACAUCUAAAAAGUAUCAUAUUAUAUAAAAAUUAUUGUUAAAUAAUAAUAUAUAAUUAUAUAAUUUAGAUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUAAUAAAAUAAAUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((.(((((...))))))))......(((.....((((((((.((...(((((((.((((.....((((....))))....))))....(((((......)))))...(((((((...)))))))..)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((.....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((((.....)))))).....)))).(..((.(((...(........)...)))))..)...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).........(((((.....((((..((((.(((((((.(((((((((((....(((((((......)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..((((((((((...))))))))))...[[..))]].....]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....)))))))......))))))).).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...))))))).((.....))...))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..(((........))).....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((((....((((((....)))))).))))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
............(((((..[[[[[)))))......]]]]]..(((((..((((..(((((..(((.((((...))))))))))))..))))...)))))..........((((((((....(((((((((((((((((((((...((((...(((........)))..))))...........))))))))..)))))))))))))(((((((((((..((((((...........)))))))))))..)))))).....)))))))).(((((.[[[[[)))))..]]]]]..(((((((((..((((((...)))))).....((((((....))))))...........((((((((((((..(((((....(((((((((((((((.....))))))))...))))))).((((((((((........)))))))))))))))...(((((..((((((((((.........)))...)))))))..)))))........)))))))))))).............)))))))))....((((((.((((((.........)))))).))))))...((((((....(((((((......))))))).....))))))....((((((((...((((((.......(((((..........)))))...........(((....)))....))))))...))))))))....((((((((......[[[[.(((((.....)))))..)))))))).....]]]].......(((((((((((...)))))))))))........(((......[[[[))).(((((....(((((....)))))..)))))...]]]]((((((((((.......(((((((((.((((((((((.....(((((..((((.......(((((...........(((((((.((((((((....)))))))).....)))))))...))))).(((((((((....))).))))))))))..)))))....(((......)))...((((((.((((((((((((...))))))))............)))).)))))).)))))).)))).)))(((((.(((((((((...((((((...(((((((((....))))))))).))))))((((((((..........))))))))))))))))).)))))........((((((......)))))).)))))).......)))..............(((((...(((((....)))))......))))))))))))((((((((..((((...((((((((...((((((....))))))..)))))))).))))..))))))))..............((((((((((....))))))))))................
|
|
CRW_00284
|
[ FASTA input ]
|
AAACUAUCGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUUACACAUGCAAGUCGUACGAAAGUGUUAAAACUUUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGAGAAUUUACCUUUAGGAGGGGAAUAACAGUUGGAAAUGACUGCUAAUGCCGCAUAUCGUAAUUAUGAGACAUAUCAUAACUAUGAAAGAAGAAAUUCGCCUAAAGAAAAGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUAAGGGUAAAGGCUACAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUUUGAGAGGACGACCAGUCACACUGGACUGAGACACGGUCCAGACUACUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCUGCAAUGGGCGAAACUGAACAGAGCAAUACCGCGUGAGGGAAGAAAGCCCACAGGGUUGUAAACCUCUUUUGUCAAGGAAGAAGAUUCUGACGUUACUUGACGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGGACGGGGGAUGCAAGUGUUAUCCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGUUUGUAGGUGGUUUAGUAAGUCUAUUGUUAAAGCUUGAAGCUUAACUUCAAAAGUGUAAUAGAAACUACUAGACUUGAGGAUAGUAGGGGUAAAGGGAAUUUCCAGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUUGGAAGGACCACCGAUGGCGAAGGCACUUUACUGGGCUAUUUCUGACACUAAGAGACGAAAGCUAGGGUAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGAAUACUAGAUGUUGCGUGUAUCGAUCCAUGCAGUAUCGUAGCUAACGCGUUAAGUAUUCCGCCUGGGAACUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGUGGCAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUUAUGUAAAUCUAUUUGAAAGAACAGAGUGCCCUCGGGAAUACAUAAACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUUCUAGUUGCUUUACAAAAGGAAUCUUGAAGACUGCCGGUUAUAAACCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUACCCUGGGCUACACACGUGCUACAUUGGAUAAGACAAAAAGUUGCGAAUUUGUGAAAAUAAGCUAAUCUUUAAACUUAUUCCUAAGUUCGGAUUGAAGGCUGCAACUCGCCUUCAUGAAGAUGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUAUACAGCGGUGAAUCCGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGUUAUACCCGAAGUCGUUUUCUUAACCUUUUUGGAGAGAGGCGCCUAAGGUAAGGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACGGGAACGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((......)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....((((((((((......))))))))))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..(((.(.((........))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((...........))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))))..((((......((((.....)))).....)))).(..((((((...(..........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]]........]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..(((((((((((........)))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.....)))....))))))).((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((((.((((((...))))))...[[[[.((((..(((.........)))..))))((....))....)))))))...]]]]...((((((((.....(((...(((..((((...))))..)))..((((((....)))))).......)))...(((((.((((((......)))))).)))))........))))))))..(((..[[[[....)))....]]]].((((...........[[[[[[....)))).....]]]]]].((((....)))).....(((...((((((((.....)))))))).[[[[[......)))...]]]]]((((((((((.......(((...................)))..((((......(((((...))))).....)))).[[[[[[[[[..)))))))))).......]]]]]]]]]........((((..[[[[[[[[[...))))..]]]....]]]]]]..........((((((....((((.((((((...))))))))))..(((((((((..(((((((.......((((((.....)))))).....)))))))...)))))))))...))))))....(((((((....((((((((....[[[[[............))))))))...]]]]]............)))))))..(((((((((.......)))))....[[[[[[[[))))...((((.........))))....]]]]]]]].....(((((..[[[..[[[[[[[[[[[)))))...]]]]]]]]]]]]]](((..[[[[[[.)))(((((...((((.....(((((....)))))...))))..)))))...(((....)))....]]]]]]...((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].....(((((......[[[[[[[..(((.(((....))).)))..)))))......]]]]]]]...(((((((..((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..))))))(((((....[[[[[[.)))))........]]]]]]...........((((((...))))))......(((((((((((.....))))))..[[[[))))).....]]]]..((((..(((....(((.......)))......)))....))))...(((((...[[[[[[[..)))))(((.......))).(((((((........)))))))]]]]]]]........((((.[[[[[[[....))))..]]]]]]]....(((....)))..........))))))).(((((((((.......))))..[[[[[...(((.((((((..........)))))).)))((((......))))..)))))..]]]]]..........((((((((((((((....))))))))))........)))).
|
|
CRW_00285
|
[ FASTA input ]
|
AUUUUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCCUAACACAUGCAAGUCGAACUAGCUCUAGCGCAAGUUAGAGUGGGUGGCGGACGGGUGAGGAACACGUAAGAACCUACCCUUUGGAGGAGGAUAACUGUUGGAAACGGCAGCUAAUACUCCAUAUGCUGAGGAGUAAAAGGUCGAAAGGCCGCCAAGGGAUGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAAAUGCUUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAAGGAUGAAGGCCUGUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUCAGAGACGAAUAAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUCCAAGUCUUUUGUCAAAUCCCAGAGCUUAACUUUGGAUCGGCACGAGAAACUCGAGAGCUUGAGUAUGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCCGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCGGGAAGAACACCGAUGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCAUUACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAAGGGAGCGAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCUUAGCCGUAAACGAUGGAAACUAAGUGCUUGGGCCGCGAGUAAUCGCUGCUUGAGUCCUGUAGCUAACGCGUUAAGUUUCCCGCCUGGGAAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCACUCUUUCGGGAGGUCAUGGUGAAAGCCAGUUUAGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCUCUUGUUGCAACUUUGUUGUUAUCGAGAGAGACUGCCGGUGAUAAGUCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGCCCUGGGCAACACACGUGCUACAAUGGCCAGGACAAAGAGAUGCAACCUCGCAAGAGCAAGCCAACCUCAAAAACCUGGUCUCAGUUCGGAUUAGUCUCUGCAACCCGAGACUAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUAUACAGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGGGAGCUGGCUAUGCCCAAAGUCGUUACCCCAACCGUUUGGAGGGGGAUGCCUAAGGCAGAGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...<<<.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((....)))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((....)))....((((....)))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...{.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..((((((((((((((((....))))))))))))))))...{{..))}}.....}}}}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((.((((....))))....((((....)))).....)).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((((...))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
................((((((...)))))).((((((.(((((((.(((..(((.(((.(((...))).((((((((....))))))))..(((((((((.(((.......(((((((..((((.(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...((((....))))...((((....)))).))))))).)))))))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).)))).............))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))))).....((((...(((((....))))).))))...)))))))....(((..[[[[.)))............]]]].(((((((((..................)))))))))........((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]......))))))(((.[[[[.))).((((((...))))))..........]]]]...((((.((((.....((((((.....))))))...)))).)))).((((((....))))))........(((((((....((((((((...(((......)))......)))))))).......[[[[[[.......)))))))..]]]]]]........................((((.....[[[[[[[[.....))))((((..(((((((((.....))))...)))))))))..(((.((((....)))).)))..]]]]]]]]...............(((((..[[[[)))))..(((((....)))))....((((.....))))]]]]...((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].......(((.[[[[..))).((((....))))]]]]..(((...[[[[........)))...]]]]...(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((..(((((...)))))...))))))).(((.((((.......)))).....))))))).)))))...)))))....(((........[[[[)))......(((......)))..]]]].....(((.......(((....)))...[[[[..))).......]]]].(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]]......(((.[[[[[[[....)))...]]]]]]]...((((.....[[[[..))))......]]]]....((((.(((..(((((((................((((............)))).((((...)))).)))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))).............
|
|
CRW_00289
|
[ FASTA input ]
|
UGUGAAAACGAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUAAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGUACGAAGGUAUUUAUCUUUCGAGCUAAAUAUACUGAGUAGCGGACGGGUGAGUAACACGUAAGAAUCUACCUUUUGGAGAGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCUUAUAUUGCUGAGAAGUGAAAAAUGUAAAUUGCCAGAAGAUGAGCUUGCGCCUGAUUAGCUAGUUGGUGUGGUAACUGCAUACCAAGGCAAUGAUCAGUAGCUGUUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGAAGGAUGACGGCCUAUGGGUUGUAAACUUCUUUUCUCAGAAAAGAUUAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUUGUUUAAAAAGUAUUCUGUCAAAAAUUAGGGCUUAACCCUAUACAGGCAGAAUAAACUUUUAAGCUAGAGUUUGGUAGAGGCAGAGGGAAUUCCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUCGGGAGGAACACCAAAGGCGAAGGCACUCUGCUGGGCCAAUACUGACACUGAGAGACGAAAGCGAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUCGCUGUAAACGAUGGAUACUAGGUGUUGGGUGUAUCAAAAACAUUCAGUAUCGUAGCUAACGCAUUAAGUUUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGAACCCGCACAAUUGGUGGGGUACGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGAUUUGACAUGUCAUUUGUUUCUUCAACUUAAUACUUUAAUUUGUUUUAAGUAGAAACAUAAAAAAAUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUUUUUUGAAUUGCUUGGGGCAUUAUAUGCCUUUUUACAGAGGAAAUUCAAAAGACUGCCGGUGAUAAGCCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUAUAUCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGACGUAACAAAGAGAAGCUACUUCGCGAGAACAAGCUAAUCUCAAAAAUACGUUCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUUGGAAUCAAUAGUAAUCGCAGGUCAGCCACACUGCGGUGAAUACGUUUCCGGGUUUUGCACACACCGCCCGUCACACCACGGAAAUUGGCUACGCCCUAAAUCAUUACCCUAACCAUUCUGUGGAGGGGGAUGCCUAAGGCGGGGCUGGUAACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
............(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((((((((((((....)))))))))).)))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(........)....))))))..)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((.......))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((......(((((((....)))))))....((((((((....)))))))).))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((......(((((((...)))))))(((((...))))))))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(((.....))).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
(((....))).............((((((((((((((.(((.(((((.(((.........))).))))).....))).))))))))..))))))................((((((((..............((((..[[[[[[[....))))..((((((....))))))........((((((((((....)))....)))))))....]]]]]]]......((((((((((((((((..((((((((.......)))))))))))..((((((...[[[[[(((....)))))))))......(((((.(((.....)))))))).((((....))))]]]]].....(((....)))(((.(((((....)))))[[[......)))..]]]((((....((((((....))))))...)))).(((((((((...[[[...........))))))))).....]]]((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]]((((....))))........)))))))))))))..(((((.((((((((((((((..(((((((((......(((((.....)))))....)))))))))...))))))))...((((((((...(((((((....(((((((((..(((........)))...)))))))))....................)))))))..))))).)))))).)))..)))))..((((((((.......((((.........))))....))))))))..........((((((..(((((............)))))..))))))(((((....(((((....(((((((((...((((..((((....))))...))))..)))......))))))(((((.......)))))...[[[[.........)))))..]]]]..........(((((((........((((((((((((...((((((..............)))))))))))))......)))))....(((..((((.(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))...(((..(((((((((((.((((((((((...)))))))......)))..)))))))))))...(((((.....))))).....))).....)))))...)))))))))...)))...)))))))(((.....))))))))...(((((((.....((((((((..(((....)))..))))..)))).....)))))))...........(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].........((((((((((...[[[[...)))))))...))).......]]]]..........))))))))..............((((..(((((....(((..((((..((((...))))))))..)))........)))))........[[[[[[[))))..........(((((((((....)))))))))...]]]]]]]....
|
|
CRW_00292
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUAUUACGAGUUUGAUCCUGGCUCCGGAAGAACGCAAGAGAUGUGCUUAACACAUGCUAAUUGAAUGGUAUUAAUAUAUCAUAGUGUAAUAGUGAGUAAUGUAUGAGAAUUUAUUUUUAGAAUAUAAUAAAAAUUUAAUAAUUUAUAAUAAACGCAAUAGUGUUUUAAAAGAUAAUUAUUGUCUAAAAAAAAGCUCAUAUCUAAUUAGCUAGUUGGUGAAGUAAUAGUUUUACCAAGGCGAAGAUUAGUAGCUGCCUUGAGAGGGGAAACAGCCACAUAGAGAUUGAAAUACAGCUCUAACUCCUAAGGGGGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCUGCCAAUAAGCGCAAGCUUGACAGAGCGUCAUCACAUGAAGGAGGAAGGCCUAUAAAGGUUGUAAACUUCUUUUGCUUAAAAAAAUAAUACUGACGUUUAAGUUUAAAAAGUAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUCAUACGGGGGAUACAAGCGUUUUCCAAAAUUACUGGGCGUAAAGUGUAUGUAGGUGGAUUGGUAUGUUCUUCCUUAAAUACUAUUUGAUAAAUUUAGAAAAAGGAAGAAAACUAUUAAUCUUGAGUUCGAUAAGGGUAAGAGGAAUUUUUUGAGGAGUAGUGAAAUGCGAAGAUACAAAAAAGAAGAUCAACAGCGAAAGCAUCUUACUGGGUCGAUACUGACACUGAGAUACGAAAGUUAAGGUAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCUUAACUGUAAACAAUGGAUACUCGGUACUGGAGACAUUAAAUAUAUAAAUUCAGUACCCUAGCUAACGCGUUAAGUAUUCCGCCUGAGUAGUACGCUCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCUCGUACAAGCGGUGGAGCACGUAAUUUAAUUCGAUGUAACGCGAUAAACCUUACCAGAACUAGACUAAAUUUAUUUUAAAUUAUUAAUAUUAAUUAAUAAAAAAUUUACAGGAGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCUACGAGCGCUACCCUUAUUUAAAGUUUUUUAUAUCUUUAAAAACAGACUAUAUAAAUUUUUGUACUAAAUUAGUAGGAAGGAGAGGAAAACGUCAAGUCUUUAUGCCCUUUAUGUUCUGGGCUACAUACGUGCUACAAUAGAUGGUACAAUAAUUUUUAAAAAUAAAUACAAUAUCAAUUUAUUUUUAAUUUAUUUGUGAAAAUAAAUGUAAUAAUUGAAAACCAUUUUUAGUUCGGAACAUAAACUGCAAUUUGUUUAUGUAAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCAUUACGGCGGUGAAUAAGUCUUCGAGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCACGGAAAUUGAUUAUUUUUUAAAACUUUUGAUAAAAGGAUAAAUAAUAAUAAAUAACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACUGGAAGGUGCUGCUGGAUAAUUU |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...{{{.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((....))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((....)))))....))))...(((...)))......(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((........))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((....(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(..(((((....(..........)...)))))...)...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..(((((((((...((.......))...)))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((.(((...(((((((....)))).)))))))))))))..((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((.(((((((((((....)))))).)))))...))))(((((((((((...))))))))))).))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.((((....((((...(((((((.(((...............)))))))))).....)))).......))))...)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((...((((((((...))))))))..))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
............((((..(((...[[[.))).))))....]]].((((((((......((((((((.(((((((....)))))))..................(((((((......((((((((..(((((..(((((....))))).....((((((....)))))).........)))))..))))))))....))))))).))))))))...(((((((((......)))))))))((((((((((....((((((((....)))......(((...(((((.(((.....)))))))).((((...))))))).)))))....))))))).)))..))))))))....((((.[[[[))))......(((((((...(((((....))))).....))))))).]]]]............(((((.((((....))))......((((...(((((((((.........)))...))))))......((((..((((((.......((((((((((..(((((((..(((((((((..(((((((((.....(((...........)))...)))))))))...))))))))).........((((((((.((((((((((.(((((.(((((.....((((.(((............)))..((((....(((((((.(((.((((....)))).(((............((((((........(((((((((.((((((((.(((..............))))))).(((((((((....(((......))).)))))))))...........(((((...((((...(((((....(((((....)))))..)))))..)))))))))))))((((.(((.....))))))).....)))))))))..(((...)))....)))))).)))...((((.....))))...((((((((((((....))))))....))))))))))))))))...))))))))..(((((((((....)))..((((......))))..))))))))))))))))...)))))))))).))))))))........)))))))..(((((.(((((...))))).))))).................))))))))))((((((((((((((((...............(((((((.((((.....((((((((((((.........))))))))))))..(((((((....))))))).....))))...))))))).))))))))))))))))..(((...)))..........)))))).)))).......)))))))))......(((((((.(((((.........))))).)))..[[[[[....)))).(((......((((((.((((...(((((...)))))..)))).))))))......)))]]]]]........(((.[[[[[[)))..........]]]]]].........
|
|
CRW_00294
|
[ FASTA input ]
|
CGACUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCUUGUUUAUACGGCGAGACUGCGGAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGGUUAUUUGAUGGUCUCUUUUGUCUUUUUUUACCUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCGCAAGGUCCCGAGCGCGGGGGGCGGGGCUUCACGGCCUCGUCCUCGCAUGCGCAGAGGGAUGUAUUUAUUAGGUUAAAAACCAGCAGCCGGCAACGGCUUCAACUCCUGGUGAUUCAUAGUAACUCUUUCGGAUCGCAUUCAUGCCCUCCUUGUGGGGGCGGCGACGAUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUCGUAACGGGUAACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUGGCUACCACUUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACAGGCGCUCGAUAAGAGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAACCCCUUAACGAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUAGGGACGCGCAUUUCAAGCGCCCGUGUCGUCGGGUCAAACCGGCGACUGCGUUGGCGUUGCGGGCUCGGUCCGUCGGUGCCCCACAAAGGGCUACUGGCGUGUCAACCGGCCCGCCCGUCCCCUCCUUCUGGAUUCCCGUUCCUGCUAUUGAGUUAGUGGGGACGUCACAGGGGGCUCAUCGUCGUGCGGCGUCAAAACCGUGGCGGCGGUGGGUCCCUGGGGCCCAGAUCGUUUACCGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCAGAUCCAAUUUUCUGCCACCGAAUACAUUAGCAUGGGAUAAUGGAAUAGGACCCUGUCCUCCUAUUUUCAGUUGGUUUUGGCAGCGCGAGGACUAGGGUAAUGAUUAAUAGGGAUAGUUGGGGGCAUUAAUAUUUAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUGAAAGAUUAACUUCUGCGAAAGCAUCUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACGAUGCCGACCAGCGAUUAGGAGACGUUGAAUACAAAACACCACCAUCGGCGCGGUCGUCCUUGGCGUCGGUCCUUCACGGGGCCGGCGCGAGGGCGGCUUAGCCCGGUGGCACCGGUGAAUGACUCCCCUAGCAGCUUGUGAGAAAUCAUAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCGGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAUGCCGCGCUAGCCCGUCCAUCAAAACCCAUGCGUGGCUCACGCGGUCCGCUGCGGGGUGGUGUCACUUCGCGGCGACGUCAUCCCGCCGGCAGGGCCCGGGUCCGUGUGGGCGGUAGGGUUCGGCGUCCGUGCUUCUUAGAGGGACUGCUGCGCGCCUAGCCAGCGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUUAAUCCAACGAGUCCGCUUCAAUCGAGGCGCGAUGCCGUUGGGGUCAAACCCAACUGCGUCGCUGUCCUCGAUCGCGCCUGGGCCGAUAGGUCCGGGUAAUCUUUGCAAAUUUAAUCGUGCUGGGGAUAGAUCAUUGUAAUUAUUGAUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAAUCCUCGGAGCCGUGGCCUCUACGCAAUCCGGGCAACCGGGUUGUGAGGUCUCCCCUUUUGGCGGCGAAGUCGAUUGAACCUUACCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUCUCCGUAGGUGAACCUGCGAAAGGAUCAGGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((.........)))...)))))......(((......((((..((..((....(((..........................((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((((.((((((((((((....))))))))))))....))))...)))))....((((((........(((((..((((....))))........)))))......))))))..........((((.....(((((((.....)))))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((.((((.....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((................................................................................................................................................................................(((((((((((((((((((((......))))).))))))))))))))))..............................................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.(((...............(((((((...((((((((((.(((((((((((....)))))))))))))))))))))....)))))))...........)))))))))))..)))...<<..))>>....>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((.......((((((((((..((.......((((..((((((((....((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))).)))).))))).))).))))))))).))..))))).))))).........)))))))..((((((.((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.........(((((((.(((((((.((((((......)))))).)))))))...)))))))....((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((.........((((((((((....))))))))))................))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......))))))....((((((..((((...))))...[[[..))))))....(((((((....)))))))]]]..(((((.[[[[[[[[........)))))...]]]]]]]]...........((((((....[[[[[.....))))))....]]]]]........((((((.((((.....(((((..(((((((((((((((((....))))))))))))...)))))...))))))))).))))))(((....[[[[[.(((((....)))))..)))..]]]]]...................((((((......(((((((.....)))))))....))))))............((((((......((((((((((((.......))))))))..[[[[..))))..]]]].....))))))....((((..(((((.((((........))))....)))))..))))((((.(((((......((((((...(((((...))))).))))))............(((((((((.((((.....))))))))).))))((((.......))))....(((((..(((.......))))))))...))))).))))..((((.((((.......((((.(((((((..........))))))).)))).......)))).))))......((((((.........(((((((((((((((((......)))))))).)))..))))))((((((.((((.(((((((((((......)))).))))))).....)))))))))).)))))).....(((((..((((((((((((((......))))))))))......((((((((((((((((((((........)))).)))))))))))))))))))).)))))((((((((((.............((((((((....((((((........)))))).(((....[[[[[...)))..]]]]]((((((......[[[[[[))))))...((((.......))))..]]]]]].......................(((((.((((((.............(((((((.....((((.[[[[.....))))...))))))).((((((((((.....))))))))))...]]]]...(((....)))....((((.[[[[[)))).............]]]]]..........))))))..)))))............))))))))......(((((...(((..(((((((((((.((((((((((....)))))))))))))))))))))..))).)))))...))))))))))(((((((((..((((((((....))))))))..))))).[[[[))))((((.(((((....)))))..))))...........]]]]..(((.((((.....)))).)))...(((((((((((.........(((....)))....(((((...........)))))..)))))))..))))...(((((((((((((((((((((((((.((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))...........(((............(((...((((((((....((((..(((((...)))))((((((((((((((((..(((..........)))..))))))).)))).))))).))))....))))))))...)))..(((((.(((((..(((((((...((((((..........))))))..((((((((.....(((....))).....)))))))).)))))))..))))).))))).....(((((.......(((.....))).(((((((.(((((((.((((((......)))))).)))))))...)))))))....((((((((....)))))))))))))...)))....(((((.((((((((((((((((..........))))))..........))))))))))(((((((((.....)))))))))))))).......)))...))))).))))))))))..(((((.....(((((((((..(((..((((......(((((((((((...(((((((((....)))))))))))))))..........)))))......))))..)))..)))))))))....)))))...................(((((....)))))...))))))))))
|
|
CRW_00298
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUUAGUAUAAGCUUCAAUUUUGUGAAACUGCAAAUGGCUCAUUAAAACAGUCACAAGGCAUUUGGCGAUCAAUUCUAAAUGGAUAUCUGUGGGAAUUCUAUAGUUAAUACAUGCACUAAAACUUAUCUUUGGGGAAAGGUUGUGGUCGUUAGUUACAGAACCAAUUCAAGCUAUGCUUGGACACUUGAAUGAUUCACAAUGACAAAUGAAUUACAUGGCAACAGCUGGUGAUAAUUCAUUCCAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUCGACGGUAAGGUAUUGGCUUACCGUGGCAAUGACAGGUGACGGAGGAUUAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCUUGAGAAAUGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGGCACAGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUACAAGGCAUCCAUGUCUUGUACUUGGAAUGAAUGGAUUUUAAACCUUUCUAUAAGUAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCGGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUUUCUGCUGAGGAUGGCUGGUCCGCCCUCUGGGUGAGUAUUUGGCACAGCCUGAGCAUUUAUCUUGAAAGUACAACUGCACUUGACUGUGUGGUGUGUUAUUGAGAACAUUUACUUUGAGGAAAUCAGAGUGUUUCAAGCAGGUGUUUGGCCUUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAAUCAAGAUCGUGGUUCUUUUUUGUUGGUUUCUAGAAUUGAGGUAAUGAUUAAUAGGGAUAGUUGGGGGCAUUCGUAUUUGAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUGUUAAAGACGGACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUUAACCAUAAACCAUGCCAACUAGAGAUUGGAGGUUGUUACUUGUAUGACUUUUUCAGCACCCUAUGCGAAAUCAAAGUGUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAAUGAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUUUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGUUACAUGUAAUUUCGAUUAUGUGGGCAACUUCUUAGAGGGACGUUGUGUGUAUAAUGCAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAUGUGUUCAACGAGUUUUCAACCUUGCCUGGAAAGGUUUGGUAAUUCUUGAACAGGCAUCGUGAUGGGGAUUGUUUAUUGCAAUUAUUAACCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCUUGAGUCAUCAGCUUGUGCUGAUUAUGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGAUCCGGUGAAUAAUUUGGACUGUAGCAAUGUUCAGUUCUUGAACAAUGCAAUGGCAAAUUUAAUGAACCUUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCUGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((.........))...)))))......(((......((((..((..((....(((............((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((....))..)))))....((((((.........((...((((((...)))))).......)).......))))))........((((.((((....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....((((((((((((....))))))))).)))......(((((((.......))))))).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.......((((.(((((((((((..((((.....)))).....))))).)))))).))))....((((((.......(((((((......)))))))......)))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.((((((((....))))))))...))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))...)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((((((((((((((((...(((.((((((((((.(((...(((((((..........(((....((((((((..(((..((((...))))....))))))))))).....)))....((((((..((((....)))).))))))...........)))))))......))))))))))))).)))((((((((((((.(((....)))((((((((((...)))))))...)))))))).))))))).....))).))))).))))(((((((.((((....))))(((((((((((((((.((((((....((((((((.......)))))))))))..))).)))).....((((((.(((((((.((((..(((...((((........))))......)))..)))).............)))...)))))))))).....((((((((...............((((((((((((....))))))))).)))...((((.....)))).)))))))).......(((....((((((.........((((((.....(((((..(((((((.(((((((..........)))))))..(((....)))....)))))))....)))))......))))))..))))))....)))(((((((((.......((((((((.(((....((((((.((((((......))))))))))))....))).....((((((((.....))))))))........)))))))).)))..))))))....((((((.....((((((..(((.(((((((...............))))))).)))..))))))...(((((.....(((((....(((((((((((((.((((....((((((((.((((((...))))))....(((....)))....))))))))..)))).((((((...(((....)))....)))))).))))))))))))).))))).))))).........))))))....)))))))))))))))))).((((((((((((((((.....(((((((.........)))..))))((((....(((((..((((....))))..........(((((....((((((((.((((.....)))).))))..(((((((((((.........(((....)))....(((((...........)))))..)))))))..))))..))))..)))))(((((((((((((((.((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))).............((((..((((.((((((((....))))))))...))))..))))((((((((.(((((((.......((((.((((((((.....(((....))).....)))))))).))))....)))))))..(((.(((.(((((((((((.(((((....(((..((((....))))..))))))))))))))..))))))))..(((((((((.....)))))).....((((....))))...))).....))).......((((((....)))))).)))))))))))...))))).)))))))))).)))))......(((((((((..(((....((((((..((((.(((.(((((((...))))))).))).))))))))))......)))..))))))))).))))))))))))))).)))))...((((((((....))))))))))))))))..
|
|
CRW_00301
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUAAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAACUGUUUAUACAAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAAUUUAUUUGAUAGUACCCUUUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCACAAAAGUCCUGACCUUUACGGAAGGGAUGCAGUUAUUAGAUACAAAACCAACCCGGGCAACCGGUUUUUUGGUGAUUCAUGAUAACUUUGCGGACCGCAUGGCCCUGCCGGCGGCGGGUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUGUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUGAUAACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGAUACAGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACGAUGCAGGACCUUUUGGUCUUUGCAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAAUUUCAAGGGUUUUUUUCGUAGCUAGCCAUUGUUCCCUUUGCGGUCAAUGUGCAUUUGGCUACAGGCCCUUUUUUUCUGCUAGGAGAUGCGGCUCUUCUGCUUGUCAGCGGGGCUGCAGUUUUCCUAGCACUUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCUUUUUCUUUGCCUGAAUAUCUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUUUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACUAGAGUAAUGAUUAAUAGGGAUAGUUGGGGGCAUUAGUAUUUAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAGGAAAGACUAACUUCUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAUCGAAGAUGAUUAGAUACCAUCGUAGUCUUAACCAUAAACGAUGCCGACCAGGGAUCGGGCGCUUGUAGUUUUUCCAAAAAGACACGCCCGGCACCUUUUGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUGGUAAGGAUUGACAGAUUGAAAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAUUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUUUCCUACUCGUUACUUGCUCAUGGGUUUUAUCUCAUGGCACGCAAGUUCUUAGCGGGACUGCUGGCGUUUAGCCAGAGGAAGUUCGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCGCACGCGCGCUACACUGAUGCAGUCAGCAAGUUUUUUAACUGGCUGUAGUUCUUUCGGGAGCUAUGGUCGAUUUCCUUGCCCGAAAGGGUUGGGUAAUCUUUUGAAACUGCAUCGUGAUGGGGAUCGACCUUUGUAAUUAUCGGUCGUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAGUGUGGGUCAUCAGCCCACGCUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGCUUAGUGAGAUUUUUGGAUUGUUGAGCGAUUGCAGCAAUGUGAACGCCCGACGAGAAAUUGAUCAAACUUGGUCAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((.........)))...)))))......(((......((((..((..((....(((................((((....(((((((.....))))))).....)))).......(((((..((.....))..)))))....((((((........((((..((((....)))).....))))......)))))).........((((.((((...))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....((((((((((((....)))).))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......((((((((.....((((((((((((((...((.....)).))))).))...)))))))))))))))......((((((.....((((((((((((.....)))))))))))).......))))))................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((..(((...............))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((((((((((......)))))))...))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))..)).))))))))))...(((((((.....(((.........(((((((((((((....)))))))))))))....((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((....((((((((((((......))).(((((...((((((((((.....((((...(((((((...))))))).(((...)))...((((...))))..(((((...........)))))....(((..(((((((..........)))))))..(((((((......(((((((...(((((....(((...))))))))..((((((((........(((((.((((....))))....)))))......)))))))).....(((((((((((((.(((...)))))))))..........((((((((((.......((((((((.......))))))))..)))))..)))))..(((((((...((((...(((((((.....((((........))))......)))..))))((((.(((((...........((((((((.....(((((..................((((((((((((....)))).)))).))))((((.......))))...))))).....))))....)))).......))))).))))...(((.((((.......((((.(((((((..........))))))).))))(((((((((....((((...))))))))))))))))).)))))))...))))))).)))))))..)))))))..((((((..((((((..(((((((((((((((((((((((.(((.....))).)))))))))..))))))))).....((((((((.....)))))))).(((...(((((.........)))))......((((..(((((((((((((((((((....))))))))))))))..)))))...)))).....))).....))))).....))))))....(((((((((((((...((((((((((((((..((((......))))....(((....)))....)))))))...))))))).(((...(((....)))....)))....)))))))))))))....))))))....(((.((((..........(((..(((((((..(((..((((...))))..))))))))))..)))(((((....))))))))).)))))))))))))((((.(((((....)))))..)))).........))))...((((.((((.....)))).))))..))))))))))((((......(((....)))....)))).))))))))).)))))...)))...((((....)))).((((((((((((((((((((((.((((((((.....(((.(((((((((.....))))))))))))....)))))((((((((((((.(((((((((((((((((((......)))))))...)))))....)))))))....(((((.....)))))))))))..............))))))(((.(((((...........))))))))........(((.((((((((...((((..........((((((((((((....))))))))))))((((.(((.((((....)))).))).)))).))))..)))))))))))..((((((.((((............))))((((...(((....)))....(((((((((.....)))))))))..)))))))))))))...))))).))))))))))...((((.....((((((((((.(((..(((((((...((((((.(((.(((((....))))).))).)))))))))...))))..))).))))))))))....)))).................((((((((....)))))))))))))))...
|
|
CRW_00306
|
[ FASTA input ]
|
UGAAUAGCAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACAAGCUUUUUACGGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUACAACAGUUAUAGUUUCUUUGGAGUUCGUUUUCCAUGGAUAACCGUGCUAAUUGUAGGGCUAAUACAAGUUCGAGGCCUUUUGGCGGCGUUUAUUAGUUCGUUAACCACUUUUUCUGGUGAUUCAUAAUAAACUUGCGAAUCGCUUUUGCGAUGUUCCAUUCAAGUUUCUGCCCCAUCAGCUUGACGGUAGGGUAUUGGCCUACCGAGGCAGCAACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACAGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUACAGGGCUUUCGUCUUGUAAUUGGAAUGAUGGUGAUGUACAACCUCACCAGAGUACCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAACUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGUAUUUCAGCCUCGCGUUUUUUCCCUUUUGUUGGGUCUUUUCGCUGGCUUUUUUUUUACUUUGAGAAAAUUAGAGUGUUUCAAGCAGACUUUUGUCUUGAAUACUUCAGCAUGGAAUAAUAGAGUAGGACCUUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUUGAGCCUUGGUAAUGGUUAAUAGGAACGGUUGGGGGCAUUCGUAUUUAACUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUGUUAAAGACGAACCACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGACGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCCUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGGAUUGGAGGUCGUCAUUUUCCGACUCCUUCAGCACCUUGAGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGUCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAACCUCACCAGGUCCAGACAGAGUAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUUUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAACUAGCUGCUUGGAUGUUGUCCUCGUUUGCUUCUUAGAGGGACUCCUGUGCUUCAAGCGUGGGGGAAGUUUAAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAUGCAUCCAUCGAGUUUGUCCUGUCCCGAAAGGGUUGGGUAAUCUUUAGUGUGCAUCGUGUCGGGGAUUGAUUUUUGCAAUUCUAAAUCAUGAACGAGGAAUGCCUAGUAUGCGCAAGUCAUCAGCUUGUGCAGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUCGAGUGAUCCGGUGAAUUAUUCGGACCGUGGCUUUUCCGAUUCGUCGGUUUUGCCUAGGGAAGUUUUGUGAACCUUAUCACUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUC |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((......)))...)))))......(((......((((..((..((....((((..........((((....(((((((.....))))))).....))))......(((....))).....((((((........((((.......))))......)))))).........((((....))))...))))...))))..))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((....)))))))).)))......(((((((.......))))))).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......((((..(((......(((.......)))......))).)))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.(((.......)))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.(((((((...)))))))..))))..)))))))..(((((((((.....))))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.....((..((((....))))..))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.............(((..((((((((..(((..((((((....(((((...)))))....)))))))))....((((((......(((((((((..((((((..........(((........(((.(((((......))))).)))((((..(((.....)))(((((((((...(((....(((....))))))...)))))))))))))..........)))(((((((.(((.....))).)))))))............)))))).)))))).))).....))))))..))))))))....)))(((((((((.(((((((((.....(((((((........((((..(((...((((........))))......)))..))))(((....(((((....((((((...(((((...))))).))))))...................((((((..(((((.(((((((.....((((((.........)))))).....))))))).))))))))))).)))))....)))....))))))).(((.....))).........)))))))))....(((((((.....((((.....)))).....)))))))(((.......))).......(((((..(((((((......)))))))....((((((.(((((((....))).)))))))))))))))..((((((((((((((((((....))))))))))))).)))))..))))))))).((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....))).....(((...[[[[....)))..]]]].(((((((...........[[[.[[[[[.)))))))..]]]]].]]].((((.((((((((...((((.((((..........)))).))))....))))))))..[[[[[[((((.....))))...)))).........((((.((((.....)))).))))]]]]]].......((((.....(((....)))....[[[[[.....))))..]]]]].............(((((((((........(((((((((((((.(((.....(((((((((((........((((.(((.............))).))))......)))))))))))......((((((..(((((((.(((..(((((...((((((..((((...))))..)))...((((((((.....(((....))).....))))))))))))))))..))).((((((((....((((....))))(((.....((((.(((....))).))))....))))))))))).(((((...(((((((.......)))))))....))))))))))))......(((.(((((((((.....))))))))).)))))))))..)))...))))).))))))))(((((((...[[[[..)))))))............]]]].....(((....((((....))))....))).(((........[[[[.)))..]]]]....)))))))))............((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00310
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUAAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAACUGCUUUAUACAAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAAUUUAUUUGAUAGUACCCCAUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCACUCAAGUCCUGACCGCUUGUCGGAAGGGAUGCAGUUAUUAGAUACAAAACCAGCCCCGGGCAACCGGGUUUUCUGUUGGUGAUUCAUGCUAACUUUGCGGAUCGCAUAGCCUUUGUGCUGGCGACGGGUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGACGGUAGGAUAGAGGCCUACCGUGGUGAUAACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGAUACAGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACGAUGCGGGGCCUUUUGGCCAUCGCAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAAUUUCAGGGCUGUCUUUGUCACCUGGCCACUGAGCCUUUGCGGCCAGUGUUGCUUUCGGGUGCGGGCCCUUUAUUUCUGCUGGGUGCUCCUUUGGGUUGGCUUUUGCUAGCUCGGGGGAUGUCUGCCCAGCACGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCUUUUUUUAAGCUUGAAUAUCUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUCUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUGGGACUGGAGUAAAUGAUUAAUAGGGAUAGUUGGGGGCAUUAGUAUUUAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAGGAAAGACUAACUUCUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAUCGAAGAUGAUUAGAUACCAUCGUAGUCUUAACCAUAAACGAUGCCGACCAGGGAUCGGGCGUCAUGUAGUUAUUCACAUAAAAGACGCGCCCGGCACCUUUUGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUGGUAAGGAUUGACAGAUUGAAAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAUUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUGAUCUGCUAAUUAGUUGGGCUUGCAUUUAUGCAAGUAAUCCAACUUCUUAGAGAGACUGCUGGCGUUUAGCCAGAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUAAGGUCAGCGAGUUUCAACUUGCUGGCUUAAGUUGAGUUUCGGCUCGGCUUAAGCUGGGAUUCCUUGGCCGUGAGGUCUGGGUAAUCUUUUGAAACCUUAUCGUGAUGGGGAUUGACCUUUGUAAUUAUCGGUCAUGAACGAGGAAUACCUAGUAAGUGUGGGUCAUCAACCCACGCUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGCUUAGUGAGAUUUUUGGAUUGCCGGGUGAUUGCAGCAAUGCGAACACUUGGCGAGAAAUUGCUCAAACUUGGUCAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((..........)))...)))))......(((......((((..((..((....(((................((((....(((((((.....))))))).....)))).......(((((..(((.....)))..)))))....((((((........((((..(((((....)))))........))))......)))))).........((((.((((......))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....((((((((((((....)))).))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......((((((((((.((((((((((((.............)))))).)).))...)))).)).)))))).......((((((......((.(((((((((....)))))))))))..........)))))).................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((...(((.................))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((((((((((....)))))))...))))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..........((((((((((((((((....))))))))))))))))....((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).........((((((((...))).)))))...(((((((((((((((((....)))))))......((((((...(((((((((((((.(((....))).)))))))........((((((((..........))))))))....))))))..............(((((..(((.....)))..))))))))))).)))))......(((((((((((....)))))......))))))....)))))......(((.[[[[)))..(((........)))....]]]].........((((.((((((..........)))))).)))).(((..[[[[)))....]]]]......(((((((((((((((..((((((.....((((........))))......)))...(((((((((((((.((((((....((((((((.....(((((..................((((((((((((....)))).)))).))))((((.......))))...))))).....))))....))))..(((..(((.((((...((((((((((.......((((.(((((((..........))))))).)))).......))))..((((...))))))))))......)))).)))......))))))))))))..)))))))))))))..))))))).))))))))(((((((..((((((((((((((....)))))))))))))).....))))))).....((((((((.....)))))))).......(((((((.....)))))))....(((.[[[..))).((((((((((((((....))))))))))))))]]].................((((((((...((((((((((..........)))))))))).((((....((((((((..((((......))))....(((....)))....))))))))..))))))))))))..(((....))).....(((...[[[[....)))..]]]]...............(((....((((.......))))[[[[[[[[[.)))....]]]]....]]]]].(((((.(((((((((....)))))......)))).)))))..((((..((((.[[[))))...)))).......]]].....((((((((....))))).[[[)))....]]].....((((......(((....)))[[[[))))......]]]].((((((((......((((....))))))))))))(((((((((((((((.(((.((((((.(((((((.((((((......((((((((((...........((((((...(((.((((..(((((((((((((....)))))))...))))))..))))))).....(((((.....))))).....(((.........)))))))))(((..((((..(((...)))))))..)))........(((.((((((((((((((((....))))))))(((((((((((((....))))))))))))).(((((((((.((((....)))).))).)))))).....)))))))))))...)))))))))).........))))))))))))).))))))...((((.(((((((((.....))))))))).)))).......)))...))))).))))))))))...((((.....((((((((((...((((..((((...((((((((((.(((((....))))).))))))))))))))...)))).....))))))))))....)))).............((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00326
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUUCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAACGAAUUCAUACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUAUUUGAUGGUAUCUUGCUACAUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCUGAAAAGCCCCGACUUCUGGAAGGGGUGUAUUUAUUAGAUAAAAAACCAAUGGGUUUCGGCCCUCUAUGGUGAAUCAUAAUAACUUCUCGAAUCGCAUGGCCUUGUGCCGGCGAUGCUUCAUUCAAAUAUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUAUCAACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACAGGGCUCUUUUGGGCCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACAACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUCGAACUUCAGGUCUGGCGAGGCGGUCCUCCUCACGGAGUGCACUGUCUUGCUGGACCUUACCUCCUGGUGGUCCUGUAUGCUCUUUACUGGGUGUGCAGGGGAACCAGGAAUUUUACCUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCAAUCGCCCGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACGUGCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGAUCGCCGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUCGGGGGCAUUGGUAUUCCGUUGCUAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUGACGGAAGACCAACAACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAGGUUAGGGGAUCAAAAACGAUUAGAUACCGUUGUAGUCUUAACAGUAAACGAUGCCGACUAGGGAUCGGCCCACGUCAAUCUCUGACUGGGUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGUCAGGCCGGCUUUGGCUGGUCGUUUGACUUCUUAGAGGGACUGUCGGCGUCUAGUCGACGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACUGAGCCAGCGAGUCUUACCGCCUUGGCCGAGAGGCCUGGGUAAUCUUGUGAAACUCAGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGCAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUACCUAGUAAGCGUGAGUCACCAGCUCGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGAUCUCCGGAUUGGCGUUGGGGAGCCGGCAACGGCACCCCUUGGCUGAGAAGCUGAUCAAACUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAGUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((...........))...)))))......(((......((((..((..((....(((.............((((....(((((((.....))))))).....)))).......(((((..((...))..)))))....((((((........((((..((((....))))....))))......)))))).........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((...[.((((...(((.......(((((((((((((((((.((((....))))...)))))))))))))))))....((((((....(((((((((((......)))))))))))....))))))............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.(((..((((((((.((.........))))))))))..)))...[[..))]]...]]]....]]]]))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((((((((((....)))))))...)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((........((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.[[[...))))).(((.....))).]]]..........(((((((((......(((((..........))))).......)))..))))))......(((((...........))))).((((.((((((((........))))))))......[[[..))))..]]].....(((((...........)))))....(((((((((.....((((..((((.[[[))))....))))..))).)))))).....]]](((((.((((.[[[.)))))))))........]]].....(((((......[[[[[.((((((((.......)))))))).........)))))....((((((.......))))))(((.....((((........))))......)))..]]]]](((((((((((.............((((..[[[.))))....]]]....(((((..(((((((((((((....))))))))).))))...[[[[....))))).....]]]]....((((..[[[[[[[(((....(((....)))..))).......))))..]]]]]]].)))).........))))))).......(((.(((....))).))).(((((((((((((((((.((((....))))...)))))))))))))))))....(((((((..((((((((((((......))))))))))))..))))))).......(((............[[[[[[.)))..(((....))).]]]]]]....(((((...[[[[[[[[[[[[[)))))..]]]]]]]]]]]]]((((....((((.......((((((((..(((((......(((((((((.(((((((.(((.............)))...))))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....)))....))))..))))..........((((.[[[[[.........)))).....]]]]]....((((((((.((((.....))))))))))))..((((...((((.(((((...))))).)))).))))((((..((((.[[[))))...)))).......]]].(((....(((((....))))).[[[[)))..]]]].....((((...[[[(((....)))....))))........]]]...........((((((.......(((((.....(((((((((((((((.((((((((...((((.((((((((((.....)))).)))))).)))))))))((((((...(((.((((..((((((((((((....)))))))...)))))..)))).))).((((((((.....))))))))..(((.........)))))))))(((..((((..(((...)))))))..)))........(((.(((((((...(((((.......((((.((((....)))).))))...)))))....))))))))))..((((((((((((..........))))))......(((....))).((((((((((((.....))))))))...)))))))))))))...))))).))))))))))...((((.....((((((((((.(((..((((......(((((...((((.((((....)))).))))...)))))......))))..))).))))))))))....))))..........))))).(((((((((....)))))))))..)))))).
|
|
CRW_00330
|
[ FASTA input ]
|
AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUUAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACACACGAAUUAAAAGUGAAACCGCAAAAGGCUCAUUAUAUCAGUUAUGGUUCCUUAGAUCGUUAACAGUUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAUUAAAACAUGAACCUUAUGGGACGUGUGCUUUUAUUAGGCUAAAACCAAGCGAUCGCAAGAUCGUUAUAUUGGUUGAACUCUAGAUAACAUGCAGAUCGUAUGGUCUUGUACCGACGACAGAUCUUUCAAAUGUCUGCCCUAUCAACUUUUGAUGGUAGUAUCUAGGACUACCAUGGUUGCAACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCACUCCCAGCUCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCAUAUCCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUACACUUUAAAUCCUUUAACAAGGACCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCGGUUAAAACGUUCGUAGUUGAACUUGUGCUUCAUACGGGUAGUACAACUUACAAUUGUGGUUAGUACUAUACCUUUAUGUAUGUAAGCGUAUUACCGGUGGAGUUCUUAUAUGUGAUUAAAUACUUGUAUUUUUUCAUAUGUUCCUCCUAUUUAAAAACCUGCAUUAGUGCUCUUAAACGAGUGUUAUUGUGGGCCGGUACUAUUACUUUGAACAAAUUAGAGUGCUUAAAGCAGGCUUCAAAUGCCUGAAUAUUCUGUGCAUGGGAUAAUGAAAUAAGACCUCUGUUCUGCUUUCAUUGGUUUUCAGAUCAAGAGGUAAUGAUUAAUAGAAGCAGUUUGGGGGCAUUAGUAUUACGACGCGAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGUCGUAAGACUAACUUAAGCGAAAGCAUUUGCCAAAGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGAGGUUCGAAGGCGAUCAGAUACCGCCCUAGUUCUAACCAUAAACGAUGCCAGCUAGCAAUUGGGUGUAGCUACUUUUAUGGCUCUCUCAGUCGCUUCCGGGAAACCAAAGCUUUUUGGGCUCCGGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCGAACAUAAGUGUGUAAGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAAUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCAAAUAUAUUAAAUAGAUAUCUUCAGGAUUAUGGUGCUGAAGCUUAUGUAGCCUUCAUUCAUGUUGGCAGUAAAAUGCUUAUUGUGUUUGAAUGUGUUUAUGUAAGUGGAGCCGUACCUGUUGGUUUGUCCCAUUAUAAGGACACUAGCUUCUUAAAUGGACAAAUUGCGUCUAGCAAUAAUGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCUGCACGCGCGCUACAAUGAAAGUAUCAACGUGUAUUUCCUAGACCGAGAGGUCCGGGUAAACCGCUGAACCACUUUCAUGCUUGGGAUUGUGAACUGAAACUGUUCACGAUGAACUUGGAAUUCCCAGUAAGUGUGAGUCAUUAACUCGCAUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUUAUUUAGUGAGGUCUCCGGACGUGAUCACUGUGACGCCUUGCGUGUUACGGUUGUUUCGCAAAAGUUGACCGAACUUGAUUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((..((((((((.....(((.(((..((...(((....(((.......)))...)))))......(((......((((..((..((....((((............((((....(((((((.....))))))).....))))........(((((..((....))..)))))....((((((.......(((((.(((((....))))).....)))))........))))))........((((.((((.....))))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))).....(((((((((.(((......)))..)))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......((((((((..(((((((((((((.........)))).))))..)))))..))).)))))..............((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))..........((((((.((((((((......)))))))).)))))).......................................................................................................................................((((((.(((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((.(((((......))))))))))))..)))...<<..))>>...>>>.....>>>>))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((.((((..(((((.(((((((((.......................................................................................................)))))))))....)))))..))))))).....(((((.....)))))........))))...)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.....((..((((....))))..)).....))).....)))))))......(...(((((((.........))))).))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.(((((..(..((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((.....))))))))).)))).))))))))))))))..))))))))))))))..).)))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))....((((((((...............(((((((.((((((((((..(((.........))).........................(((((((((.....))))).))))...)))))))))).(((((.....(((((((((((((............(((((..(((...))).))))).....)))))).....((((((((((((....))))))....))))))...))))))).....)))))...)))))))(((...(((..((((...........))))(((((...(((((....((((((((.......)))))))))))))....))))).)))[[[[[[)))....]]]]]]((((....((((........))))...........(((((((....(((((....((((((...((((......)))))))))).................((((.(((......)))(((((.(((((((...(((....)))....(((((....)))))))))))).)))))...)))))))))....))).......))))..))))...)))))))).....(((.[[[[[[....)))..]]]]]]((((((((..(((((((((..(((((((((((.........)))).)))))))........))))).))))....(((((((((((.....((((((((..(((((....)))))..))))))))..))))...........(((((......(((......)))......))))))))))))..((((((((........(((((..((((...(((((.......)))))..((((((......))))))......))))..)))))..[[[[[[[..((((((....))))))))))))))........]]]]]]]......(((.(((((.((((((((((((((......))))))...)))))))).))))).......[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]..........(((....)))..)))))))).((((...[[[...)))).....]]]..(((((((...(((.[[[[[)))........]]]]]...)))))))(((((.......[[[[[[(((..(((((....)))))..))))))))((((.(((((....)))))..))))...........]]]]]].(((((((((.((((.(((((...)))))......))))....(((((((......((((((..((((....))))..)))...))).......))))))).[[[[[[...)))))))))........((((.(((((((((((((((.....)))).)))))....))))))))))..............]]]]]].....((((..((((((......((((((((((..((((..((((..((((......))))...))))..)))).....))))))))))...)))))))))).(((..[[[[))).......]]]].............(((((...[[[[))))).((((......)))).]]]]..........(((..((((...........))))[[[[[[))).......(((.....))).]]]]]].......(((.[[[[[)))(((.....)))........]]]]].((((.((((((((((((.......))))))))............))))))))(((((((((.....)))))))))((((((((((.(((.....))).........[[[[[[....(((.((((((...))))))..)))....))))))))))...]]]]]]..(((((.....[[[[[[...)))))....]]]]]].......((((((.....))))))...............(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_00332
|
[ FASTA input ]
|
AAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUACGCUUGUCUCAAGGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAAGGAUUUAUAAUGAAACUGCAAAUGGCUCAUUCAAACAGUUAUAGUUUAUUUGAUAUUCAAGCUAAUAUUCUUAUUAGUUAAAUGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCGUUACGGGGAACUUUACGGGACCCCAGCGUUUAUUAGAUUUAAACCAAUAUUCCGCAAGGUCUACUGAGAUGAUUCAUGAUAACUGAUCGAAUUGCUGGAACUCUAGCAAUAAAUCAUGUAGGUUUCUGCUUCCCAUCAGCUUGAUGGUAGUGUAUUGGACAACCAUGGCAUUCACGGGCUAUCGGGGGAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAUAAACGGCUACCACUUCUACGGAAGGCAGCAGGCGCGAAAAUUAUCCAAUCCUGAUUCAGGGAGGUAGUGAAAGAAAUAAUGAACUAGGAUUUAUCCUGGGAUCACAAUGGGCUUGAUUUGCAAACACUUAGCGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGAGUAUAUAAACGUUCCUGCAGUUAUUCGAUGCUCGUAGUUGGAUUUCUGAGGUUGAGACGGGAGGGUGGCUAUGGCCAUCGCCCGACUCUUUCCUCAUCCACCUGUUUGCGAAGUCCGGGAUUGAUUUCUCGGCUUCGGGCGCAGUAUCUUACCAUUUCAAUAUUCGUAGUCUUCAUCGAUUAUGUUGUUUCUUUGAGCAAAUUAUAGUGUUUCAGGCAGGCGUGCGCCGGAAUACAUUAGCAUGGUAUAAACGAAUUGGACCGUGUGCCCGUAACUGGGCUUCUCCUUAUUGUUGGUUUGAAGGACACGGAGAUGGUUAAUAGGGACAGCGUUUAUUUCACAAGGAGGCAUUAGUAUUUAAUUUCCAGAGGUGAAAUUCUUUGAAAUAUUAAAGACUAACUUAUGCGAAAGCAUCGUUUGCCAAUGAUGUUUUCAUUAAUCAUUGAACGAAAGUUAGGGGAUCAAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUUAACCAUAAACGUUGCCGACUAGGGAUCGGAGGGCGUGCACAAUCCGCCUUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUUGGGUUCUGUGGGUAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCUUGCGGCUCAAUUUGACUCAACACGGGAAAUCUUACCAGGUCCAGACAUAGCGAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUAUUUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUCGUCUGGUUAAUUCCGUUAAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAAAUAGUUGCUCGCCUUUUCUAUAAGACUUGACAACUUCUUAGAGGGACUUUGUGUGCAACCACAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAUACGUACAACGAGGUAUAUGUACUUGUACAUCAAUGCUGCUCCGAAAUAGACGAGCUUAAUCUUAUAAAUACGUAUCGUGCUGCGGAUAGAUCGUUGAAAUUAUGAAUCUUGAAGGUGGAAUUCCUAGUAAGCGCACGUCACUAACGUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCAAUUUCGAGUGAUCUGGUGAACCUCUUUGGACUGUCGAGCAAUCGCGAAAUUAGAGUGAACCUGACUACUUAGCAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAAUCUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).(((.(((((((.(((((.(((.....(((.(((..((...(((....(..........)...)))))......(((......((((..((..((....((((..........................((((....(((((((.....))))))).....)))).....(((((..((....))..)))))....((((((.........(((((..((....))..)))))..........)))))).........(((((((....)))))))...))))...))))..))))..(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))....((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).)))))....(((.((((((....))))))..)))......(((.(((........)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.......((((...(((.......(((((..((((((((..((((((....)))))).))))))))...)))))......((((..(((((.((((((......))))))))))))))).....................................................................................................................................................................................((((((((............(..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))...))))))).))))).))))...)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..(((((((.((.........)))))))))..)))...{{..))}}...}}}.....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))........((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))...)))))).....((((.(((.((((..(((((.(((..((((....))))..))))))))..)))))))..(((((((......))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((((((....))))).)..(((..(((.....)))..))).....)))......)))))))......(...(((((..............)))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(...((((((((((((..((.(((((((((...(((....))).)))))))))))..)))))))))))))...))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
.................((((((......((((((((...))).))))).((((..[[[[..))))...]]]]........((((((....(((((.........)))))))))))......((((((((((((((....))))))))...)))))).((((((......[[[[.[[[[[[.[[[[.....[[[[....))))))..]]]].]]]].]]]]]].]]]].(((............))))))))).(((....[[[[[[.....)))..((((((((....))))))))..]]]]]].......(((((((((.....((((((((((((((..(((....)))..))))).....)))))))))(((((((((((...(((((.(((((.((((.[[[[[..))))....))))).))))).................]]]]].))))))))))).)))))))))................((((((....)))))).........((((.....((((.........))))((((..[[[[[[[(((....(((....)))..))).......))))..]]]]]]].(((((.............[[[..)))))..]]].......((((....(((((..(((.((((..((((((....)))))).)))).)))...)))))))))(((...[[[((((.((((((......)))))))))))))....]]]..................(((((((......)))))))((((((....)))))).....(((((....((((.(((((((..(((........(((((((.(((.....))).)))))))(((((....)))))...))).........((((..(((((.....((((((((((..(((((.((((...(((....)))(((((((((.(((((((((.(((((......))))))))..)))))).)))))...((((....))))....)))))))).)))))..)))))))))).(((....)))....((((......))))........((((((((.((((.......))))..))))))))....((((((((.((((....(((((.....((((..(((((....(((((((.........((((((((..((((....(((((((.......((((....((((....((((((((((((...(((((...)))))......(((((.....(((............)))(((...(((...((((....))))....)))...)))........))))).))))))))))))....)))))))).(((((((((((((((.....)))).))))).....))))))......))))))))))).....)))))))).........)))))))......)))))..)))).(((((((......)))))))......)))))...........))))))))))))....)))))))))))))))).))))))))).....((((.[[[[[)))).....]]]]]...........((((..........)))).............(((.[[[[))).....]]]]........................(((.[[[...))).((((((((((((.....))))))))...)))).]]]..))))........(((((...(((((((...[[[[....))))))).))))).......]]]].....(((....)))........(((((..[[[[..)))))..]]]]...((((.(((.........((((((((((....)))))))))))))...)))).
|
|
CRW_00333
|
[ FASTA input ]
|
UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAUUAUAUGCUGAUGUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGUAUAAAGACCAAGUAGGAUGAAACUGCGGACGGCUCAUUAUAACAGUAAUAGUUUCUUUGGUUAGUAAAAUACAAGGAUAGCUUUGUGAAUGAUAAAGAUAAUACUUGAGACGAUCCAGUUUGUAUUAGUACAAAAUGGCCAAUUCAUUCAAUGAAUUGAGAAAUGACAUUCUAAGUGAGUUAGGAUGCCACGACAAUUGUAGAACACACAGUGUUUAACAAGUAACCAAUGAGAAUUUCUGAUCUAUCAAUCAGUUGGUAGUAUCGAGGACUACCAAGAUUAUAACGGAUAACGAGGAAUUGGGGUUCGACAUCGGAGAGGGAGCUUUACAGAUGGCUACCACUUCUAAGGAAGGCAGCAGGCUCGUAAAUUACCCACUUUCGAAUUGAAGAGGUAGUGACGACACAUAACUCUAGAGUUGAGUAAAAUCAAUUCUUGAAGGAAUGAGUAGGAGGUAAAUUCUCCUACGAAAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGUGUAUAUUAAAGUUGCUGUGAUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUAAAAUGUGGUUUUAUACAUUUUGAAGACUUUAUGUAAGUAAAGUUUCUAGAAAUGUUAAAUUAAAAUCAAAGAAGGAAACAAUUCAAGUAAUUGAGUUGUUAUUACUUUGAAUAAAAUAAGGUGUUUAAAGCAAAACAUUAUGUUAAUGAAUAUUCAAGCAUGGGACAAUGCUGAGGGGAUGUCAAUAAGACAUUUCGAGAGAAGGAUUAAAAGGAACAAUUGGGGUGAUUCAGAAAAUAACGGGAGAGGUGAAAAUCCAUGAUCGCUAUAAGAUGCACGAGAGCGAAAGCAUUUCACUCAACUGUGUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCCUAACUAUAAACGAUGUCAACCAAGGAUUGGAUGAAAUUCAGAUGUACAAAGAUAGAGAAGCAUUGUUUCUAGAUCUGAGUAUAUCAAUAUUACCUUGUUCAGAACUUAAAGAGAAAUCUUGAGUUUAUGGACUUCAGGGGGAGUAUGGUCACAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACACCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAAGACCGAACAGUAGAAGGAAUGACAGAUUAAGAGUUCUUUCAUGAUUUAUUGGGUAGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCAGGUUAAUUCCGGUAACGAACGAGACUGAAACCUAUUAAUUAGUUUUCUGCCUAUAAGACAGAAAUGUUCGCAAGAACAGGUGCGUAAGUACCACUUCUUAAAGGGACACAUUUCAAUUGUCCUAUUUUAAUUGUAGUUAUCUAAUUUCGGUUAGACCUCUUUUAACGUGGGAAAAAGAAAAAGGAAGCAUUCAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACAUCUUGGGCCGCACUCUCGCUACAAUGGAGUUACUAGAGAGUAUUUUAUCAUUUACACCUUAUUUAUUAGGCUUUGUCUAAUAAUUAAGGAUAGUAAGUGGUGUACCGAGAUUGAAAUAGUUAAGGAAAACUCAAAAGAACGUACAUGACAGGGAUAAAUGAUUGGAAUUAUUUGUUUUGAACGAGGAAUUCCUUGUAAUAUCGAGUCAUUAACUCGAGAUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUAAAGAGGUGAAAUUCUAGGAUUCUGUCUUAUAGAUAGAAAAAUGGAUUUAAAUCUCCUUAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(............)...)))))......(((......((((..((..((....(((...........((((....(((((((.....))))))).....))))........(((((((((....)))))))))...(((((((..((((.(((....)))..))))....)))))))................((((((((((...))))))))))......)))...))))..))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....((((((((((((......))))))))).)))......(((((((.......)))))))........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((..........................................................................................................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((((((...(((((((..((((...(((((...)))))...))))..)))))))...)))...))))))))..)))...<<..))>>....>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((((..............((((....(((((((....(((((..(((((....)))))..)))))........)))))))..))))......)))))))).....((((((....))))))((((((((.............)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)..))))))))))...(((((((.....(((.....((((((((((.(((((.(((((((((...))))))))).)))))...))))))))))..((..((((.....))))..))....)))....)))))).)......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((...))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((((..((((((...))))))...............((((((.............(((((((..........(((((((...(((........((((((((..((((.(((((((........((((.....((((((.....))))))......)))).......(((.((((((....)))))).))).((((((((...))))))))........((((((((.....)))))))).........((((.((((((...)))))).)))).))))))).)))).((((((((.....((((..((((((((.......))))))))))))....(((((..(((....)))..)))))..)))))))).((((((((((...(((((.....(((....)))((((.((((((.(((...)))...(((((.((((((((((...(((....)))....))))((((((((......))))))))...........((((((((.....))))))))....)))))).)))))..)))))).))))...)))))..))))....))))))((((.....))))...)))))))).........))))))))))...........))))))).....(((((.(((((((((....))))))))).)))))..............((((((.....((((((((((....))))))))))....))))))....((((.(((((((......))))))).))))..(((....))).))))))............((((((((.....))))))))......)))))))).............((((((((...........(((..[[[[[...)))....]]]]]...((((((....[[[.....))))))..]]]...(((((((....(((...(((....)))....(((((....))))).))).((((((...((((..........(((.(((.((((...)))).))).)))..(((((((..((((..((((((...))))))..))))..))))))).......(((.(((((((((((((.........)))))))).)))))...)))..((((..((((....))))...))))..))))..))))))..)))))))....(((((...[[[[)))))..............]]]]......(((((..(((...(((((((....((((.(((........))).))))..))))))))))..)))))......(((((...((((.((((((((((.....)))).)))))).)))))))))..................(((.[[[[[[.))).....]]]]]](((((....)))))(((((....)))))..........((((((.........))))))............((((((((((....)))))).[[[...))))..]]].....(((.[[[[.....))).(((...(((....)))..)))]]]].(((.....((((.....(((((.((((...(((.((((....)))).))).((((((((.(((((.(((((((((...))))))))).)))))...)))))))))))).)))))........(((................)))(((((...(((((((........((((((.((((((...)))))).))))))..(((...((((((.....))))))......)))))))))).....))))).....))))....(((((.....((((((((.((((((((..((((...((((((((...))))))))...)))))))..))))).))))))))....)))))..)))..........(((((((((....))))))))))))))))).
|
|
CRW_00338
|
[ FASTA input ]
|
CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGGCGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...........)))))......(((......((((..(...((...((((..............((....(((((((....))))))).....))..................................................))))..)).)..))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))..((....))..((((((.........)))))).....(((((((((.....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((............(((((.........................................))))).........((((((....)).)))).............(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[..(((.((((((.........)))))).)))...[[..))]]....]]]....]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........)))).......(((((((....(((((.......(((((((.......))))))).....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((...))))))..((((((((....))))))))....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((((.....((((((.((....)).))).)))....))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((.....))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))....((.((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((...[[[[)))))).................]]]].............((((((((...((((...((((((.(((((((((......(((((.......)))))....))))..)))))....))))))....))))((((.....[[[[[))))..(((((((((((....)))......(((......)))...)))))))).......((((......))))....]]]]](((((((((((((......(((.((((((.....((((....))))...((((((..(((((((........)))))))...)))..)))......)))))))))..(((((((....(((.[[[[[[......))).......]]]]]]..(((.[[[((((.....))))....)))...]]]..)))))))..(((..[[[[[)))..((((......(((((((((.((((((....)))))))))).)))))......))))..]]]]]........(((.......[[[[[[.........)))...]]]]]]...(((((.(((((....))))).)))))..)))))))))))))...........))))))))...(((((((....((((((((((((((((.....(((...))))))........((((((..((((....))))......((((.............))))..))))))........................)))..))))))))))....))))))).((((((((((((((.........))))))))))((((((...(((((....))))).))))))))))(((.(((((.[[[)))))..)))........]]](((....(((...)))...))).(((((.[[[.........)))))....]]](((((.......((((((.....(((....)))....)))))).(((....))).......[[[[[[[)))))...]]]]]]]((((((((((((....)))(((.[[[[......)))...]]]].......((((.[[[[[[)))).......]]]]]]........((((....[[[[[[[...(((.........)))))))...]]]]]]]((((...[[[[[[[[..........))))....]]]]]]]].....(((.((((..[[[)))))))....]]]...)))))))))..((((..[[[[[..(((((...)))))..))))............]]]]].....(((((((.....[[[[[[...............[[[[[.....[[[[[[[[[[.[[[..[[[.[[[)))))))....]]].]]]..]]].]]]]]]]]]]....]]]]]........]]]]]]...((((((((....))))))))..........
|
|
CRW_00345
|
[ FASTA input ]
|
CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUAUAGGACUAAGCCAUGCAAGUGCAAGUAUGAGUGUAUUAUACAACGAAACUGCGAAUGGCUCUGUAAAACAGCUAUAAUUUCUUCGGUGCUAAAUACUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCUACACAGCGACGCAAGUCGUGGUACAAAUUAGAUACACAAGCCAGCUUUUUUGGUGAUUCUAGAUUUUUUUUCUGAUCGCACAUUGUUGCGACGCACCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUGGAUGGUAAGGUAAUGGCUUACCAUGGUUGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGACUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAACUUACCCAAUCCGGACACCGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAGCAAUAGAGGGCCCGAUGGGUUUUCUAAUUGGAAUGAGAACAAGAUAAACAGCUUAUCGAGGAGCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGAAUUUUGGCGUGUGAUUUGGGUCGUUCUCGCGGACGCGCUCAGGUUGUGCGCCUUUGUGGAGAGGGGGUGUGGUGGUGCUUGAGUGCGCUGCCAUGCUGCCGCCACCGUUUACUGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGAUUGCCCUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACCCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUGUUUGAAUCAGGUAAUGAUUAACAGGGACGGUUGGGGGCAUUCGUAUUCCGGCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUGUCGGAAGACGAACAGCUGCGAAAGCGUCUGCCAAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUGAGGACUGGAGAUCGGACAAGACUGAUUUAUGGCUUGUUCGGCAUCCUUCGAGAAAUCAAAGUGUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCAGGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUCUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAGCUAGGCGCCGUUACCAAUUGAGUUUGGUAGCGAGGCGGUGCCUUCCUAGACGGACUGUGGGCGUCUAGCCCACGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAACGGCCCAACGAGUGGAGGAUGUGCGAGAGCAUUUCCGAAUCUCCAAAUCCGUUCGUGAUGGGGAUCGACGGUUGCAAUUUUCCGUCGUCAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGCGGGUCAUCAUCCCGCGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCCUUGGGAGGGCUGGAUGCGCUGUUUUUAUGCAGACAUUUUGGCCUGAACCUGGUCAAACCUUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAGAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....((((...........((((....(((((((.....))))))).....)))).......((((((....))))))....((((((.........(((((.....)))))......)))))).........(((((......)))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......(((((((((((((((.(((((....)))))..)))))))))))))))...((((...((((((((((((((((......)))))))))))))))).))))...........................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((((............)))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.(((((((((......)))))))))......)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((....((..((((....))))..))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((......))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
....(((((...[[[[))))).(((....))).......]]]]......(((((.[[[[[[.)))))..]]]]]].................((((((.........))))))..........((((.......(((((((....))).))))..((((((((((((..(((((......(((((....))))))))))..)))))........(((((.....)))))..)))))))..............)))).((((((((((..((((((((((.....[[[[.......))))))))))..(((((....)))))..]]]]......((((..[[[((((.....((((.((((......))))))))....)))).))))...]]]......((((.(((((........((((...(((((...))))).))))..............(((((((((((((...))))))))).))))............(((((.....))))).....(((.......)))..))))).))))..((((((............((((((.......((((...(((((((((((..(((((.(((....))).....(((((((((((((((((((((....))))).))))))))))))))))...((((......(((((((((((((......)))))))))))))....))))))))))))))))..........(((((((..((((....))))..)))))))..))))...(((((((((((((((((...))))))))))))).))))..........)))).......)))))).))))))..(((.(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))).......[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]...(((((...((((..(((....(((((....)))))...)))..))))((((((((..........)))))))).....[[[[[[[[[..))))).....]]]]]]]]]..((((((.(((((.((((...)))).))))).))))))...(((((....)))))...............((((((((((((((((..(((((((....(((((((((.(((..(((.....))).)))............((((((..(((((.......(((((((((....)))))))))(((....)))....((((...(((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))(((((((..(((.((((..(((((((((((((((......)))))).....)))))))))..)))))))..((((((((.....))))))))..(((...))).....)))))))...))))))))).)))))))))))))))......)))))))((((((......(((....(((.((((....)))).)))....))).....)))))))))))((((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......))))))))))))............))))).(((((.....(((((((((..(((..((((..(((.((((...(((..((((......)))).)))....))))...)))))))..)))..)))))))))....)))))..))))))))))...(((.(((((....))))).))).........
|
|
CRW_00346
|
[ FASTA input ]
|
CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAGUCUUGUCUCAAGGACUAAGCCAUGCAAGUGCCAGUAUGAGUGAAUUGUACAACGAAACUGCGAAUGGCUCGGUAAAACAGCUAUAGUUUCUUCGGGGGUAAUACUACCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCCGAAAGCGAGUCUCUCGCGGUACAAAUUGGAGACACAAGCCAAUAUUUUGGUGAUUCACAAUUUUUUUUCUGAUUGCACUUUUUAGUGCGACACCCCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUGGAUGGUAAGGUAUUGUCUUACCAUGGUUGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGAGUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUACUAAUUCAGUGAGGUAGUGACAAAGAGUAUCAAUAGGGGGGCCAUCGGCUCUUCUAGUUGGAAUGAGUACAGAGUAAACAAUUUAACGAGGACCAAUAGGAGGGCAAGCCAAGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACUUACUCCUAGGGUGUUUGUUCACAGUGCUGCAGUUAAAAAGUUCGUAGUCGGACCUAUGAGCUGGGCGGUGGUGUGGGCGCAAGCCUGUGGUGCCGCCCGGCUCUUUUGGGGAAAUGGCCGGAGUAGGGUUUUAAGCGGCUUUGCUCCGGGCGUCCCCCGUUUACUGUGAAAAAAUGAGAGUGUUCAAAGCAGGCGAUGAGCCGUGAAUACCAUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGGCCGCUGAUGCCUAUUUUGUUGGUUUCGAGGUGUCGGGCAAUGAUUAAGAGGGACGGUUGGGGUCAUUUGUAUUAAGUCGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUGACGUAAGACAAACAGCUGCGAAAGCGUCUGACAAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUAAGAACUGGGGAUCGGAAGAGUAUUUAAAUAGGGCUCAUCCGGCACCCUCCGGGAAACCAAAGUGUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAGUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCCGGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGAGCGUGGUAGCUAGGGGACUUGUGCAUUUAUGCACGGGCUUUUUCUCCUUCCUACACGGACUGCUGGCGAAUAGUCAGCGGAAGCCUCAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUUGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUGCACUGAGCGGACCAGCGGGCGAGGAUAGCCGAAAGGUUUUCCGGACCCUUAAAUUCGCUCGUGCUGGGGAUGGAGGCUUGCAAUUGUCCCUCUUGAACGAGGAAUACCUUGUAGGCGUGAGUCAUCAGCUCGCGCCGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGGGUGAGGAGGUGAGAAGUUGGGAGGUGUUGGUUCGGGCCCGCAAGGUGUCUGGGCUAGCGCUAAACUCGUUCAAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAGAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....((((..........(((....(((((((.....))))))).....)).)......((((((...))))))....((((((.........(((((....)))))......)))))).........(((((((....)))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((........(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))....((((...((((((((((((((((......)))))))))))))))).))))...............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..((((((((((...........))))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.((((((((....))))))))......)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((..((((....))))..))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)).)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...............(((..(((((.(((((((......))))))).))))))))...((((((((((.....))))))...[[[[[[[....))))..(((......))).]]]]]]]...((((....((((((.[[[.....))))))..]]]...........(((((.[[[[(((((...))))))))))(((((((((......(((((....)))))..))).))))))..]]]]...(((((((....)))))))..))))......................((((((((((((((((..((((...[[[[[[[[..)))).......]]]]]]]].(((.....((((((.....((((........))))......)))..))).....)))(((((((..((((((...((((.[[[[)))).))))))......]]]].(((.((((((((((...))))))))))[[[....))).(((...)))]]]............(((..[[[[[[((((.......)))).........)))........]]]]]]..(((((..(((((((((.............(((((....)))))....(((((((((((((....((((....))))....)))))))))))))....((((..(((.(((((((((((((......))))))))))))).))).))))...)))))))))...(((...(((((((.....(((.....))).)))))))))))))))....((((((((((((...[[[....))))))))))))....(((....)))]]]...............((((((.[[[[[(((((.....((((...((((......))))....)))).....))))))))))).((((((((((.....))))))))))..]]]]]....((((.[[[[[[[[(((((....)))))........))))..]]]]]]]]...........((((.(((..(((((.((((.(((....))))))).)))))..)))..[[[[[[........))))..]]]]]]....((((.(((((....)))))..))))............((((((((....((((((.(((((((...))))((((((..(((.....)))..))))))))).)))))).[[[[[....((((....))))....))))))))......]]]]]................(((((...(((((((((((((((.....)))).))))))))))))))))(((((((..((((.(((..((((((((((((((....)))))))).....))))))..)))))))..((((((((.....))))))))..(((...))).....)))))))(((..((((...........))))..))))))))))((((.(((((((.....(((...(((.((((....)))).)))...))).....))))))))))).(((((((..(((.[[[[[..)))((((......))))......]]]]](((((((((.....))))))))).....)))))))............((((.[[[[....(((((((.....))).))))))))......]]]].(((((((((((((((.........)))))))))))))))............))))))))))))))))...(((.............[[[[)))(((((....))))).....]]]]....
|
|
CRW_00348
|
[ FASTA input ]
|
CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAACAACUUUAUACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUAUUUGAUAAUACCUACUACUUGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCGAAAAAACCCGACUUCUGGAAGGGUUGUAUUUAUUAGAUACAGAACCACUGCAGGGCAACCUGGUUACUUGGUGAUUCAUAAUAACUUCGCGAAUCGAAUGGCUUGUGCCGUCGAUGAUUCAUUCAAAUCUCUGCCCUAUCAACUUUCGGUGGUAAGGUAUUGGCUUACCAUGGUUCCAACGGGUAACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCCGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACUUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACAGGGAGGUAGUGACAAAAAAUAACAAUACAGGAUCUUUAAAGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAACCCCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUUUUGGAAAUUGCUUACUGGUCGGCCGCAAGGUCUGUACUGGUACGGCAGUUUCUUCUUCUCGAAGGCAGUGGGUGCUCUUAAUUGAGUGUCUACUGAGUUCGGGACUUUUACUGUGAGAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCUUAUGCUUGAAUAUUGCAGCAUGGAAUAAUGGAAUAGGAUCCCGAUCUUAUUUUGUUGGUUUCUAAGAUCGAGAUAAUGAUUAAUAGGGACGGUUGGGGGCAUUAAUAUUUAAUUGUCAGAGGUGGAAUUCUUGGAUUUAUGAAAGAUUAACUUCUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCGUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGAUGAUCAGAUACCAUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGGAUUAGUGGACGUUUAAUAAUGACACCAUUAGCACCUUAUGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCCCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACCAGGUCCGGACAUAGGAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGCCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGUUACAUGAUUUUCGAAUCAUGGGCAACUUCUUAGGGGGACUAUUGGUGUAUAAUCAAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGAGGUCAACGAGUAUCAUCCUUCACCGGAAGGUGCGGGUAAUCUUUUGAAACCUUAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUAUUGAUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGUGAGUCAUCAGCUCGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGUUUAGUGAGGUCCUCGGACUGGUACAGCGCGUGGCAACACAUACUGCGCCGGGAAGUUGAACAAACUUGAUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCUAGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((.........)))...)))))......(((......((((..((..((....((((...........((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((...))..)))))....((((((........((((...((((....))))......))))......)))))).........((((.((((....))))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......(((((((((((((((((.((((....))))...))))))).))))))))))...(((((((..((((((((((((......))))))))))))..)))))))...........................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.(((.......)))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((..((((((....))))))....))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.((((.(((((.(((((((((.((((....((((((((...))).)))))..(((((((...((((((((....)))))))).............((((((((((..((((...........))))))))...((((((..........))))))......))))))..))))))).........)))).)))....(((((((((.....))))))..)))...))))))))))).)))).......(((((........((((.((((((((((((....))).....(((.....)))..(((((((((....((((....((((((((.......)))))))))))).....)))...))))))......))))))))).)))).((((((((.....((((((...((((((......(((.((((..((((........((((((((...)))...(((((((((............((((((((((....))))))))))...(((((..............((((((((((((((..........(((((((.(((((((..(((((......(((((((((.....)))............((((((((........((((((((.(((....((((((((((((((((((((.........))).))))))).)))))))))))))(((((((..(((((((.((((......)))).)))))))..))))))).....))))))))..........(((((((.(((......))))))))))))))))))))))))....(((((((((....))))))))).....(((((((.(((((......)))))..))))))))))))..)))))))........(((.(((((((.....((((..........))))...))))))))))....))))))).......)))))))))......(((....))))))))......((((.........))))..........(((.(((((.........(((..(((((((.((((....))))...)))))))..)))..(((....))).))))).))))))))(((......((((((((((((.(((...)))..((((((((((((......(((((((((((.(((((...))))).))))........(((((......(((((...(((..(((((((............(((((((....))))))))))))))..))))))))....)))))......))))))).........))).)))))))))(((....)))....))))......((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))))))))..((((((((.....((((((((((((.....(((....))).....)))))))).))))(((((((....)))...(((.(((((((((((.(((......(((.((((....)))).)))....))))))..)))))))))))..((((((((((((..........))))))......(((....))).((((((((((((.....))))))))...)))))))))))))).))))))))....))))))))))))...))))).........(((.((((....))))..))).))))(((....)))...)))))))...(((((.....)))))...........))))))...))))))....))))))))(((((....)))))....)))))....
|
|
CRW_00358
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAAUAAAUUUAUAUUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGAUCUACGUGACAUAUUCUUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAACCCAAACUUACGAAUGGGUGCACUUAUUAGAUAAAGCCAACGCUGGGUAAAACCAGUUUCCCUUGGUGAUUCAUAAUAAUUUAGCGGAUCGCAUGGCCUUGUGCUAGCGACAGUCCACUCGAUUUUCUGCCCUAUCAUGGUUGAGAUUGUAAGAUAGAGGCUUACAAUGCCUACAACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUGCAGGGCCUUUAAGGUCUUGCAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGUCCGUAGUCAAAUUUUAGCCUUUAGAUGAGGUGGCCUGGUCUUCAUUGAUCAAGCUCGCUUUUAUCGAGGCUUUUUUUCUGGUUAUGCUAUGAAUAGCUUCGGUUGUUUAUAGUCUCUAGCCAGAUGAUUACCAUGAGCAAAUCAGAGUGUUUAAAGCAGGCUUUCAAGCUUGAAUGUGUUAGCAUGGAAUAAUGAAAUAUGACUUUAGUCCCUAUUUCGUUGGUUCAGGAACUUAAGUAAUGAUGAAUAGAAACGGUUGGGGACAUUUGUAUUUGGUCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUGACCGAAGACAAACUACUGCGAAAGCAUUUGAUCCAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGGUCUAAAGUUAAGGGAUCGAAGACGAUUAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCACAAACUAUGCCGACUAGAGAUUGGGCUUGUUUAUUAUGACUAGCUCAGCAUCUUAGCGAAAGUAAAGUUUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGGACGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAAAGCUCUUUCUAGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUAUUCUGCUAAAUAGGCAGGUCAACUUUUUAGUUGAUUAAUAGAUUUAUCUAUCUGGCUUCUUAGAGAGACUAUCGGCUUCAAGCCGAAGGAAGUUUUAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGAAAUCAGCGAGUUUAUAACCUUAGCCGGAAGGUUUGGGUAAACUUUUGAAAUUUCAUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGUUAUAGUGAGCAUAUGGGAUCAGUAGAAUUAGGUUGGCAACAACCUUUCUCUGCAGAGAACUAUGGCAAACUAGGCUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((...........))...)))))......(((......((((..((..((...(((...............((((....(((((((.....))))))).....)))).......(((((..(....)..)))))....((((((......((((..(((((......)))))......))))......)))))).........((((.((((.....)))))))).....)))..))))..))))(((..(..(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......((((((..((((((((((..(((((......)))))...))))))).))))))))).....((((((...((((((((((((....)))))))))))).....)))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....))))))).))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..(((((((.((........)).)))))))..)))..<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((.((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.(((((((....)))))))..(((((....))))).)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((.((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).........((((((((...))).)))))..(((((((...((((((((....)))))))).............((((((.........((((((.....)))))).......(((((((..........))))))).....))))))..)))))))....................((((((...((((((......(((((.(((((......))))).....)))))......))))))....[[[[[((((.((((.....)))))))).....))))))....]]]]].(((((...[[[[.........)))))((((.......)))).]]]]((((((...((((((.......))))))(((......[[[[[.......[[[......)))......]]]..]]]]].......))))))..((((..[[[.))))....]]]...........(((((((((((((...))))))))).)))).........(((((...((((........)))).)))))...(((.....[[[[)))....]]]]...((((...[[[[.[[[[[[[....))))..]]]]]]].]]]](((((((((..(((((.(((((((((((.....((((((...(((((......)))))....))))))....)))))......((((((((.((((((((((((....))))))))))))...))))))))......(((((((((.....((((....((((....))))...)))).....))))..))))).....)))))).)))))...(((((((..(((((.(((((.....(((.....))))))))...))))).))))))).(((((.(((((((((((.............)))..)))))))).)))))....(((....))).........)))))))))..((((((...[[[[[[........))))))......]]]]]].((((((..((((((.(((.(((((.(((.....(((..(((((((.(((......))).)))))))..)))........))).))))).))).((((....))))..))))))..(((.......)))........))))))..((((.((((.....)))).))))..(((((((((((.........(((....)))....(((((...........)))))..))))))..))))).(((((.(((((((((((((((((((((..(((..((((.(((((((((((((((.....)))).)))))....))))))))))((((.((((.((((.....((((((((((....)))))))..(((((....)))))))).....)))))))).....(((((...)))))))))........))).....((((..((((((((((..(((...)))))))...(((((((((....((((((((((((.(((((((...(((.((((....)))).))))))))))))))..))))))))((((((((((((((((..........))))))..........)))))))))))))))((((.....))))))))..))))))..)))).....))))).)))))))).((((((..((((......))))..))))))....)))))))).(((((...((((((....))))))...))))))))))...(((((.......))))).........................((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00366
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGACUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAAUGUUAUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAACAGUUAUAGUUUAUUUGAUAAUCGAAUUUACAUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCUGGUUAGCCUGACUUUUGUGGAAGGGCUGUAUUUAUUAGAUAACAAACCAAUAUUCCCCGUGUCUAUUGUGACGACUCAUAAUAACUGAUCGAAUCGCAUGGACUUUGUCCGCGAUACAUCAUUCAAGUUUCUGCCCCAUCAGCUUUCGAUGGUAGUGUAUUGGACUACCAUGGCUUUAACGGGUAACGGAGGAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUCCUGACUCAGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAACGGACCGAAGCCUAUGUUUCGGGAUUGCAAUGAGUAGAAUUUAAACCCCUUUACGAGGAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUUUCUGGGAGGGUGCCAAUGUCCGCUCGUUUGCGUGUGCAGCGGCGCCCUUCCAUCCUUCUGUUAACGUUUCUUGGUAUUCAUUUACUGGUUUCGGGCUCAGAUACUUUACCUUGAGAAAAUUAGAGUGUUCCAGGCAGGCUUGCGCCGGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUUUAGUCUCCUUUGUUGGUUCGAGGGACUGAAGUAAUGAUUAAUAGGGAUAGUCGGGGGCAUUAGUAUUUAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUCGGAUUUGUUAAAGACUAACUUAUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCAAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGGAUCGGAGGCGCGCUUUAUCCGCCUUCGGCACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCUUGCGGCUCAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAGCCUACUAACUAGUCGAACCAAUCUCCGAUUGGCUGCGACUUCUUAGAGGGACUUUGUGGGCCAAACACAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGACGCAUACAGCGAGUACGUCCCAGCUCCGCGAGGCAGCUGGUAAUCAGCAAUAUGCGUCGUGAUGGGGAUAGAUCUUUGGAAUUAUAGAUCUUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUUACCUUGCGCUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUUCGAGUGGUCCGGUGAACCUUUUGGACUGCGCGAGGCCCCGAGCCUUGUGCGGAAAAUCAAGUAAACCAUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((........))...)))))......(((......((((..((..((....((((...........((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((.....))..)))))....((((((..........(((((..(.....)..)))))..........)))))).........((((..((((...))))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((.(((((((....)))))))..)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((.......((((((((((((..(((.(((......)))...)))..))))))))))))....((((....((...(.(((((......))))))...))....))))...........................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..(((((((((.........)))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((..((((((...))))))...)))))..)))))))..(((((((.......))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.....((..(((((....)).))).))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(...((((((((((((..(((((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))........(((((((...........(((((.((((((....((((((...))))))..............((((((((((((((.......))))......)))).(((((..(((((....)))))..)))))..))))))..))))))))))).((((..(((((((((...((((((.....((((......((((.....(((((((...((((((((....))))))))..(((....(((((..((((...))))))))).......)))......(((((....((((....((((((((.......)))))))))))).....))))))))).)))....))))...((((.....))))..))))...)))))).)))))...)))).)))).)))))))(((..((((((...(((((...))))).))))))..[[[......)))..(((((((....)))))))..]]].(((((.........(((((...(((((((((((((..(((((((..((((((.(((.........(((((((((.(((.....)))............(((((.(((((((.(((.((((..........((((((((((((..(((.(((........))).)))..))))))))))))((((((((((((..((((((((((......))))((((((((......((((((..((((............(((((((.(((........))))))))))....((((((..........(((((((((((((.((((.........)))))))))))....((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))...((((....)))).)))).....)))))..))))))))..(((....)))....((((......)))).......))))))...(((....))).)))))).(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))..(((....))).))))...........))))))))))..........))))))))..))))))))))))))))))..((((.....))))....)))))))...))))))))))))..))))...))))).)))))))))........((((....))))....))))))).))))))).((((((((((((((((((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..)))))))..........(((.((((..(((((..((((((...))))))...)))))..)))).)))........)))))......((((.((((((((.....(((....))).....)))))))).))))((((.(((....)))..(((.((((((((..(((....))).((((((.........))))))..........)))))))))))..((((((((((((..........))))))......(((....)))....((((((((.......))))))))......))))))))))..))))).))))))))))..(((((.........(((((((..(((......(((((.(((((((((((.....)))))))))))....)))))...)))..)))))))......)))))...))))))...)))))..(((((....))))).......))))).
|
|
CRW_00370
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGCAAGUAUGAACUAAUUCGAACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUGUUUGAUGGUACGUGCUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCAACAAACCCCGACUUCCGGGAGGGGCGCAUUUAUUAGAUAAAAGGCUGACGCGGGCUCCGCCCGCUGAUCCGAUGAUUCAUGAUAACUCGACGGAUCGCACGGCCCUCGUGCCGGCGACGCAUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGGGGCCUACCAUGGUGGUGACGGGUGACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACCGGGCGCUUUAGUGUCUGGUAAUUGGAAUGAGUACAAUCUAAAUCCCUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUUAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGACCUUGGGCGCGGCCGGGCCGGUCCGCCUCACGGCAGGCACCGACCUGCUCGACCCUUCUGCCGGCGAUGCGCUCCUGGCCUUAACUGGCCGGGUUCGUGCCUCCGGCGCCGUUACUUUGAAGAAAUUAGAGUGCUCAAAGCAAGCCAUCGCUCUGGAUACAUUAGCAUGGGAUAACAUCAUAGGAUUCCGGUCCUAUUGUGUUGGCCUUCGGGAUCGGAGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUCGGGGGCAUUCGUAUUUCAUAGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUGAAAGACGAACAACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUGGGGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUCAACCAUAAACGAUGCCGACCAGGGAUCGGCGGAUGUUGCUUAUAGGACUCCGCCGGCACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGGGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGCAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUGCGGAGCCAUCCCUCCGCAGCUAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGUUUAGGCCACGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCGCACGCGCGCUACACUGAUGUAUCCAACGAGUAUAUAGCCUGGUCCGACAGGCCCGGGUAAUCUUGGGAAAUUUCAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUGUUGGUCUUCAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGCGGUUCGCCGCCCCCGACGUCGCGAGAAGUCCAUUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((...........))...)))))......(((......((((..((..((....(((............((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((...))..)))))....((((((........((((..((((((...)))))).....))))......)))))).........((((.((((......))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...((((......(((((((((.((((((((.((((....))))...)))))))))))))))))....(((((...((((..(((((((......)))))))..))))...))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.(((........)))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.((((((((....))))))))...))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))..)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))..((((..(((((((((...((((((((((..((((((((.(((....)))....((((((((((..(((..((((...))))....))))))))))))).......))))))))(((((((....))).))))....(((..((((((.((((......((((...........)))).)))).))))))........)))..(((((((((((..(((((((((.(((...........))).)))))).....(((((.(((((((((...................(((((..(((((((((((((((((.......))))))))((((((...(((((((((......(((((.((((((((((.....((((........))))......)))..))))((((.(((((...........((((((((.....(((((..(((.............(((((((((((((....))))))))).)))).............)))..))))).....))))....)))).......))))).)))).(((((((((........((((.(((((((..........))))))).))))......((((...........)))))))))).....((((..(((....)))....))))...)))))))))))...(((((....((((.(((((((......)))))))...))))..))))).)))))))))..............((((...)))).))))))(((((((...(((....)))...((((((.(((((((....))))))).))))))..........)))))))..((((((((..(((((......(((((((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))....))))))))))))))(((....))).........((((((....((((......((((...........))))......))))....))))))..)))))))))....(((....)))..(((....((((((.....((((.(((((....)))))..))))...)))))))))...))))).......))))))))))))))))))))))))((((......(((....)))....)))).))))).)))).....))))(((..(((((....)))))...)))((((((((((......((((((((...(((..(((((.((((.....))))..)))))..))))))))...[[[[.)))......((((((..((((((......)))))))))))).......]]]].....(((((.....)))))(((((((((((((.....(((.[[[))).....)))))))).)))))(((((....))))).....]]]...(((((....(((...(((((...[[[)))))....)))...)))))........]]]....((((((((((((..........)))))).....[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))).))))))..]]]]......))))))))))..(((((.....(((((((((..(((..(((((((...((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))...))))..)))..)))))))))....)))))............((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00371
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUUCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAUUAUACAGCGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUCGUUUAUUUGAUAUUACCUUACUACAUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAUCCCGACUUCGGAAGGGAUGUGUUUAUUAGAUUAAAAACCAAUGCCCUCCGGGGCUCACUGGUGAUUCAUAAUAACCUCUCGAAUCGCACGGCCUUGCGCCGGCGAUGGUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGACGGCUGGGUCUUGGCCAGCCAUGGUGACAACGGGUAACGGGGAGUUAGGGCUCGACUCCGGAGAAGGAGCCUGAGAAACGGCUACUACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUACUGAUACAGGGCUCUUUUGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGAGGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAACCUUGGGCCCGGCCCUCCGGUCCCCCUCACCGGGUGCACUGGCUCGGCCGGGCCUUUCCUUCUGGAGAACCGCAUGCCCUUCACUGGGCGUGCCGGGGAACCAGGACUUUUACUCUGAACAAAUUAGAUCGCUUAAAGAAGGCCUAUGCUCGAAUAGUCUAGCAUGGAAUAAUGGAAUAGGACGUGUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCGCCGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUCGGGGGCAUCAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUAAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAGGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGAUUAGGGAUCGGACGGUGUUAUUUUUUGACCCGUUCGGCACCUUGCGAUAAAUCAAAAUGUUUGGGCUCCUGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACGAUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUCGUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGCCCGCAUCGCUUUGGCGGUGCGCCGGCUUCUUAGAGGGACUAUCGGCUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACAGAGCCAGCGAGUACUCCCUUGGCCGGAAGGCCCGGGUAAUCUUGUUAAACUCUGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGCAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGCUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUCAGUGAGGCUUCCGGACUGGCCCAGGGAGGUCGGCAACGCCAACCCAGGGCCGGAAAGCUAUCCAAACUCGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUCUCCGUUGGUGAACCAGCGGAGGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((.........))...)))))......(((......((((..((..((....(((.............((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..(....)..)))))....((((((........((((..((((....))))....))))......)))))).........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((...[.((((...(((.......((((((((((..(((((.(((......)))...)))))...))))))))))....((((((....((((((((((......))))))).)))....))))))............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.(((..((((((((.((.........))))))))))..)))...[[..))]]...]]]....]]]]))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.....((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).........((((((((...))).)))))..(((((((....((((((....)))))).(((....)))...((((((........((((((((......))))).......))).(((((....))))).........))))))..)))))))....(((((..[[[[[[[.)))))...((((......))))...........]]]]]]](((((((.(((........[[[[..))).(((((.((((.....)))))))))]]]]............(((((....[[[[[[[...((((((.......))))))...........)))))...]]]]]]]....((((..[[[[[[.....[[[[))))....]]]]......]]]..]]].((((.(((((......((((((...(((((...))))).))))))...........((((((((((((((....))))))))).)))))..(((((...)))))...(((((..(((.......))))))))...))))).))))..((((.((((.......(((..(((((((..........)))))))..))).......)))).))))..((((((((((((((..(((((..(((.....)))...)))))...))))))))).....[[[[[[......((((((((......)))))))))))))..]]]]]].......(((((.....)))))((((((....)))..[[[[[[[))).......]]]]]]](((((.............[[[[[[[[[..)))))......]]]]]]]]].....((((((((..(((((......((((..(((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))......(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....)))....((((.[[[[[)))).............]]]]]..............((((.......((((((((.((((.....))))))))))))..[[[[[[[[[............))))(((((....)))))...]]]]]]]]]...........................((((((((((((((.(((((...)))))......)))).....(((....)))....(((((...[[[[[...)))))......(((((((....)))))))..]]]]].))))))))))..((((((((..((((((((((((((((((((...........))))).((((..........(((.((((..((((((((((((....))))))))..))))..)))).))).((((((((....))))))))..((((((((.....(((....))).....)))))))))))).(((((((....))).......(((((((..((((((....(((..((((....)))).)))....))))))...)))))))((((.((((((((((((..........))))))......(((....))).((((((((((((.....)))))))))...))))))))).......)))).....)))))))))).))))))))))))))))))))))))((((((((((((((((.(((................))).))))))).......)))......[[[[.......))))))................((((((((((....))))))))))]]]]....
|
|
CRW_00372
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAGUUAUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAUAUCAGUUAUAGUUUAUUUGAUAGUAUCUUACUACUUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAAAAAAUCCCGACUUUAUGGAAGGGAUGUAUUUAUUAGAUAAAAAACCAAUGCCUUCGGGCUUUUUGGUGAUUCAUGAUAACUUCGCGGAUCGCAUGGCCUUGUGCUGGCGAUGAUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUUUCGACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCUAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACAGGGCUCUUUUGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAGAUACCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAAUUUAGGGAUUGGUUGCCUGGUCCUCCGAAGUUGUGUGCACUGGCGCAACUGAUCCUUCCCUCCUGGAUUACCGGCUGCCCUUCGCUGGGUGUGCCGGAUAGCCAGGGCAUUUUACUUUGAGAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUUUGCUCGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAAAAUAGGACAUGUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCAUUGUAAUGAUUAAUAGGGACAGUUGGGGGCAUUAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGAGAUCGGGCGAUGUUUUUUUCUUGACUCGCUCGGCAUCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUCGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGAAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGCCAGAUUAGCUUUUGCUGAUCGCGGGCUUCUUAGAGGGACUGUUGGCAUGAAGCCAAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGACAGAGCCAGCAAGUUCAUUUUCCUUGGCCGAAAGGUCUGGGUAAUCUUGUGAAACUCUGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGCAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUAUGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUUAAUGAGGUCUUCGGACUGGUGAUGGGUUAUUGGCAACGAUAAGCCUAUUACUGGAAAGUUGAUCAAAUUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((..<<<.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....(((.............((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((..((....))..)))))....((((((........((((..(((....)))....))))......)))))).........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((.......(((((((((((((((((.(((.......)))...))))).))))))))))))....((((((....((((((((((......))))).)))))....)))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..((((((((.((..........))))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((........((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))).)))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.................((((......))))...(((..(((....((((((..((((((((((((((..((((((.((((...))))...)))))).....((((((...........))))))....)))).))))))))))..))))))...))).)))((((((.(((((.....((((............))))))))).)))))).......(((((.(((....)))...))))).....((((.......[[[[[...(((.(((.......))).)))..)))).......]]]]].((((..[[[[[[[[[[[[[[[))))...]]]]]]].....]]]].]]]]............(((.[[[..)))..]]](((.[[[[.................))).....]]]]..((((((..........((((((((..(((...[[[[[[)))...........(((((((((((((....))))))))).))))..................]]]]]].....((((..[[[[[[[(((....(((....)))..))).......))))..]]]]]]]...........((((((((((((((....)))).)))))..))))).)))))))).))))))((((((((.((((((((......))))))))..(((((.(((((((((...((((((((((......))))).)))))...(((.((((((((((.(((....))).))))))))))......)))....(((((((.......((((((...(((((((((((((.....)))))))))))))((((.....(((........((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....)))....(((((....))))).......)))........)))).....)))))).(((((((..((((((((.(((........)))))))))))..)))..(((....))).))))))))))))))))))))(((.(((((....)))))..)))..))))).....))).))))).....(((....[[[[[)))...(((((((((.........(((....)))....(((((...........)))))..))))))))).]]]]].............((((((((..(((..((((........)))).............[[[[[...))).....(((((..........(((.((((..((((.(((((((....)))))))...))))..)))).))).((((((((.....))))))))..)))))]]]]].......(((((....[[[[.))))).....]]]].(((....)))..(((.(((((((...(((((........(((.((((....)))).)))....)))))....))))))))))..((((((((((((..........)))))....[[[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))))))))))...]]]]]]...)))))))).........(((......[[[[[[[.....)))((((...(((((((((((((((((....)))).))))))))))))).((((.(((((....)))))))))....))))...]]]]]]].....((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00374
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCUUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAAGUGAAAGUAUAUAUAUAUUUUAUAUGUAGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAACAGUUAUAGUCUACUUGACAUUUUUAUUAUAAGGAUAACUACGGAAAAGCUGUAGCUAAUACUUGCUUUAUUAUCCUUGAUUUUUAUCUUUGGAUAAGUAUUUGUUAGGCCUUAUAAGAAAAAAGUUAUUAACUUAAGGAAUUAUAACAAAGAAGUAACACGUAAUAAAUUUAUUUUAUUUAGUGUGUAUCAAUCGAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUUGAUGUUAGGGUAUUGGCCUAACAUGGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUUAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUUCUAAAGAAGAGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUGCAAGGCCAAUUUUUGGUUUUGUAAUUGGAAUGGUGGGAAUUUAAAACCUUCCCAGAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAAUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUUCAAAGAAUCGAUAUUUUAUUGUAACUAUUCUAGGGGAACUAUUUUAGCUUUUGGCUUUAAUACGCUUCCUCUAUUAUUAUGUUCUUUAAAUAACAAAGAUUCUUUUUAAAAUCCCCACUUUUGCUUUUGCUUUUUUGGGGAUUUUGUUACUUUGAGUAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAAACAGUUAAAGCAUUUACUGUGUUUGAAUACUAUAGCAUGGAAUAACAAAAUUGAACAAGCUAAAAUUUUUUGUUCUUUUUUCUUAUUUUGGCUUAGUUACGAUUAAUAGGAGUAGCUUGGGGACAUUCGUAUUCAGAUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUUCUGGAGACGAACAACUGCGAAAGCAUUUGUCUAAAAUACUUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAGUGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAAUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGUGUUGGAUGAAAGUGUUAAAAAUAAAAGUCAUCUUUCGAGGUGACUUUUAGAUUGCUUCCUUCAGUACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGCGAGUAUUCGCGCAAGCGAGAAAGUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACUAGUUUAAGACAAGAGUAGGAUUGACAGAUUAAUAGCUCUUUCUUGAUUUCUUGGAUGGUGAUGCAUGGCCGUUUUUAGUUCGUGAAUAUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGAUCUUAACCUGCUAAUUAGCGGCGAGUACACUAUAUUCUUAUUUGAAAUUGAACAUAGGUAACUAUACAUUUAUUCAGUAAUCAAAUUAGGAUAUUUUUAUUAAAAUAUCCUUUUCCCUGUUCUACUAAUAAAUUGUUUUUUACUCUAUUUCUCUCUUCUUUUAAGAAUGUACUUGCUUGAUUGAAAAGCUUCUUAGAGGAACAUUGUGUGUCUAACACAAGGAAGUUUAAGGCAACAACAGGUCUGUGAUGUCCUUAGAUGAACUAGGCUGCACGCGUGCUACACUGAUAUAUAUAACGAGUUUUUAAAAAUAUGCUUAUAUUUGUAUCUUUGAUGCUUAUAUUUUGCAUACUUUUCCUCCGCCGAAAGGCGUAGGUAAUCUUUAUCAAUAUAUAUCGUGAUGGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUGAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCAUGAUUCAUCAGAUUGUGCUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAAGAUAUGAUGAAUUGUUUGGACAAGAAAAAUUGAAUUAUAUUCUUUUUUUUCUGGAAAAACCGUAAAUCCUAUCUUUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((((.....)))))....)))))......(((......((((..((..((...((((...........((((....(((((((.....))))))).....)))).....((((((..(((....)))...))))))....((((((..((((.........(((((...))))))))).....))))))........(((..((((((.....))))))..)))....))))..))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))))....((((((((((((((...))))))))))).)))......(((((((.......))))))).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((..................................................................................................................((((((((......((....))......))))))))..............................................................................................................................................(((((((.((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((.(((((...(((((((((((......(((((((....)))))))))))))..)))))..))))).))))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((.....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((.(((((......(((((((((...(((...(((..(((((((....((..(((((.((((..((....((((((((((....))))))))))......))...)))))))))...))...)))).))).)))....)))...))))))))).)))))...........)))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..........(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).....((..((((....))))..))....))).......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).......(((((((((.(((((((..((((.((((........((((((((.....)))))))).....))))...))))...(((((........(((.....)))..)))))...(((((((((((((((.....)))))).(((........))))))))))))......))))))))))))))))..((((((((((((((.....(((((...)))))......))))))..........(((((.((((((.....))))))...)))))....((((((.......[[[[......))))))..]]]].....))))))))........(((((((...............(((..[[[[)))..]]]]((((((((.............)))..[[[[[[...)))))...((((((.((((.((((.....))))...................((((((((((((((...)))))))))).))))......))))))))))...]]]]]]....(((((((((....(((....(((....)))..)))[[[.((((....(((.....)))....)))).)))))))))........]]]...............((((((((......(((((..(((.....((((((((.((((..((((...))))..))))...)))))))).......))).....)))))....)))))))).(((((((((((.........[[[[[[...))))))))))).......]]]]]].....((((((((((....(((((.(((...)))))))).))))))))))............(((((((...[[[[[[[[[[[[[.)))))))..........]]]]]]]]]].]]]..(((((((.((((((..(((((....(((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))(((.(((....))).))))))))..)))))).)))))))...(((....))).((((((....((((...[[[[..))))...]]]]..........(((..[[[[[)))..]]]]]................((((((((((((....))))))))))))...(((((.((((((.((((...((((........)))).)))).)))))).)))))(((((....)))))...(((((.....)))))....((((.((((.[[[[)))).))))...]]]]..............(((((((..[[[[[[..((((((.((((((...(((((....))))).)))))))))))))))))))..]]]]]]......((((((....((((((...............[[[[[[........))))))......]]]]]]........))))))(((((.....)))))..((((((.((((((.....(((....))).....))))))..)))))).((((((((((....)))))))))).)))))).....................................((((((((((((....[[[((((.......)))))))))))))))).....(((((...)))))]]]..((((((((........[[[[[.......)))))))).....]]]]](((....)))..(((.(((((((((...(((..........(((((..((((..(((((...)))))..))))...))))).....(((.((((....)))).)))....))).....))))))))))))..((((((((((((..........))))))...[[[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))).))))))...]]]]]].......))))))).(((((.....((((((((((.(((.....((((.......(((((..((((...))))..))))).......)))).....))).))))))))))....)))))............((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_00375
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCUUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCACAGAUUAAGCCAUGCAAGUGAAAGUACAUAUGUAAGUAAUAUAUUGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAACAGUUAUAAUCUACUUGAUGUUUUUAAUAUAAGGAUAACUACGGAAAAUCUGUAGCUAAUACUUGUGAAAAUACCUUUUGAUAUAUACAUAUGUAUGUAUCAUUAAGGUAUGUAUUUGUUAGAUAUAAGAAUAAAAUAAAUAUAAUUGAAUUAUAACAAAGAAGAAACACAUAAAAUAUGUGUAUUAUCAAUCGAGUAUCUGACCUAUCAGCUUUUGAUGUUAGGGUAUUGACCUAACAUGGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUUAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUUCUAAAAAAGAGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUACAAUAUCGAAAAAUGAUUUUGUAAUUGGAAUGAUAGGAAUUUACAAGGUUCCUAGAGAAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCAUAUAUUAAAAUUGUUGCAGUUAAAACGUUCGUAGUUGAAUAUUAAAGAAUCCGAUGUUUCAUUUAAACUGGUUUGGGAAAACCAAAUAUAUUAUAUAUUUUGCUUUGUUCAAAAUAAGGUUUUCUAAUAAAUUAUGUUUUUAUCAGAUAUGACAGAAUCUUUUUUAAAAUCUCUUCAAUAUGCUUUUAUUGCUUUUGAGAGGUUUUGUUACUUUGAGUAAAAUUAAGUGUUCAUAACAGACGGGUAGUCAUGAUUGAGUUCAUUGUGUUUGAAUACUACAGCAUGGAAUAACAAAUAUGAAUAAGCUAAUUAUUUUUUUUUUCAUUAUUUUUUUUGAUAUUCUUAUUAGCUUAGUUACGAUUAAUAGGAGUAGCUUUGGGGGCAUUCGUAUUCAGAUGUCAGAGGUGAAAUUCUAAGAUUUUCUGGAGACGGACUACUGCGAAAGCAUUUGCCUAAUCUAUUUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAGUGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAAUCUUAACCAUAAACUAUACCGACUAGGUGUUGGAUGAAUAUAAAAAAUAUAUAAAUAUGUAGCAUUUCUUAGGGAAUGUUGAUUUUAUAUUAGAAUUGCUUCCUUCAGUACCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGCGAGUAUUCGCGCAAGCGAGAAAGUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACUAGUUUAAGACAAGAGUAGGAUUGACAGAUUAAUAGCUCUUUCUUGAUUUCUUGGAUGGUGAUGCAUGGCCGUUUUUAGUUCGUGAAUAUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGAUCUUAACCUGCUAAUUAGCGGUAAGUACACUAUAUUUUUAUUUGAAAUUGAAUAUAGGUUACUAUACGUUUAUUCAGUGUUCAAAUUAGGAUAUUUUUUUUAUUAAAAUAUUCUUUUCCCUGUUUUACUAAUAAUUUGUUUUUUUUUACUCUAUUUCUCUCUUCUUUUAAGAAUGUACUUGCUUGAUUAAAUAAAGCUUCUUAGAGGAACAGUGUGUAUCUAACACAAGGAAGUUUAAGGCAACAACAGGUCUGUGAUGUCCUUAGAUAAACUAGGCUGCACGCGUGCUACAAUGAUAUAUAUAACAAGUUGUUAAAAAUGUACUUAUAAAUAAGUGUGUACAAUUUUUCCUGUACUGAAAAGUAUAGGUAAUCUUUAUCAGUAUAUAUCGUAAUUGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUGAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCAUGAUUCAUUAGAUUGUGCUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAAGAUAUGAUAAAUUGUUUGGAUAUGAAUUAAAAUAAUGAAAUUUUAUAUUUCUGAUUUUUUCUAGAAGAACUGUAAAUCCUAUCUUUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....(((((.....)))))....)))))......(((......(((((.((..((...((((..(........((((.....((((((.....))))))......)))).....(((((..(((((..((((((....)))))).))))))))))....((((((................................))))))........((((((...))))))..)..))))..)))).)))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....((((((((((((((...))))))))))).)))......(((((((.......))))))).........((((((.......((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((.................................................................................................................................((((((((.......................)))))))).................................................................................................................................................................(((((((..((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((.((((.(((((.(((.......((((((((((.((.(((((((((....))))))))))))))))))....)))..))).))))).))))...((....))...)))....))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((.....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((.(((((......(((((((((...(((...(((..((((((((...((..(((((.((((..((....((((((((((.......))))))))))......))...)))))))))...)).....))))).))).)))....)))...))))))))).))))).............)))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..........(((((.(((......))).)))))......((..((((....))))..))....))).......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.((.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((.............)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))).))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).........(((((..[[[[....))))).......]]]]...(((....))).........(((.[[[[[)))..............]]]]]......(((....((((((((...)))))))).(((((((...)))))))..[[[[[..)))...(((((((.((((((((((....))))))))))..)))))))]]]]].(((((((((..............((((((...))))))...........(((((((...)))))))............))))))))).....((((....((((((((.......)))))))))))).((((((((...(((.........(((..[[[[)))..]]]]((((........[[[..............))))....]]]..........)))...........((((((((((................(((((.((((.....)))).)))))...((((...((((((((.....))))))))........[[[[[[[(((....(((....)))..))).......))))..]]]]]]].(((.(((.......)))))).........(((((....))))).((((((((........))).)))))....((((((.....))))))........(((((((.......)))))))..(((.(((.(((((.......))))).)))...)))...........((((((((((.(((..........[[[[[[))))))))))))).......]]]]]].....((((((((.....(((.....)))((((......))))[[[...))))))))...]]]..(((((.((((...((((((....................))))))..)))).)))))...(((((((.(((..(((((((.(((((((......((((((((((.((((((.(((..(((......)))..)))..)))))).)))))....(((....)))..)))))...))))))).)))))))...)))..))))))).........((((...[[[[..))))...]]]]..........(((..[[[[[)))..]]]]]...............(((((((....(((((((((....)))))))))..)))))))......((((((((.(((.((((...((((........)))).)))).)))))).)))))(((((....)))))...(((((.....)))))....((((.((((.[[[[)))).))))...]]]]..............(((((((..[[[[[[..((((((.((((((...(((((....))))).)))))))))))))))))))..]]]]]]....((((((......[[[[[[..........[[[[)))))).....]]]]]]]]]]......(((..[[[[)))...]]]]..((((............((((((((((((((((((....)))......)))))))).))))))).((((((((((.......))))))))))...........)))).....................)))))))))).((((((((((((.......((((.........))))))))))))))))..((((...[[[.))))..]]].(((..[[[[...)))..]]]]....(((.[[[[[)))..]]]]]..(((....)))....(((((((((((...((((............))))........[[[[[[[[[[.....((((((((....))))))))............)))))))))))....(((((((((((..........))))))...............((((.(((((((((.....))))))))).)))).)))))......]]]]]]]]]].))))))))(((((.....((((((((((.(((.....((((......(((..(((((...(((((.....)))))..)))))))).....)))).....))).))))))))))....)))))............((((((((((((....))))))))..))))...
|
|
CRW_00379
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCUUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAAGUGAAAGUAUAUGCAUAUUUUAUAUGUAGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAACAGUUAUAAUCUACUUGACAUUUUUUCUAUAAGGAUAACUACGGAAAAGCUGUAGCUAAUACUUGCCUUAGCACUCUUGAUUCAUUUCUUGAGUGUGUACUUGUUAAGCCUUUUAAGAAAAAAGUUAUUAACUUAAGGAAUUAUAACAAAGAAGCGACACGUAAUGGAUCCGUCCAUUUUUAGUGUGUAUCAAUCGAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUUGAUGUUAGGGUAUUGGCCUAACAUGGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUUAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUUCUAAAGAAGAGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUACAAGGCCAAUCUGGCUUUGUAAUUGGAAUGAUGGGAAUUUAAAACCUUCCCAAAACUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAAUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUUCAAAGAAUCGAUAUUUUAAGCAACGCUUCUAGCUUAAUCCACAUAACUGAUACUUCGUAUCGACUUUGUGCGCAUUUUGCUAUUAUGUGUUCUUUUAAUUAAAAUGAUUCUUUUUAAGGACUUUCUUUGCUUCGGCUUGGAAGUCCUUGUUACUUUGAGUAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAAACAGAUAUAGCAUUGCGCGUUUGAAUACUACAGCAUGGAAUAACAAAUUGAACAAGUCAGAAUUUUUGUUCUUUUUUCUUAUUUUGGCUUAGUUACGAUUAAUAGGAGUAGCUUGGGGGCAUUUGUAUUCAGAUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUUCUGGAGACAAACAACUGCGAAAGCAUUUGCCUAAAAUACUUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAGUGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAAUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGCUUUGGAUGAAAGAUUUUAAAAUAAGAAUUUUCUCUUCGGAGUUUAUUCUUAGAUUGCUUCCUUCAGUGCCUUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGCGAGUAUUCGCGCAAGCGAGAAAGUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACUAGUUUAAGACAAGAGUAGGAUUGACAGAUUAAUAGCUCUUUCUUGAUUUCUUGGAUGGUGAUGCAUGGCCGUUUUUAGUUCGUGAAUAUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGAUCUUAACCUGCUAAUUAGCGGCAAAUACGACAUAUUCUUACGUGGGACUGAAUUCGGUUGAUUUGCUUACUUUGAAGAAAAUAUUGGGAUACGUAACAGUUUCCCUUUCCCUUUUCUACUUAGUUCGCUUUUCAUACUGUUUCUUUUUCGCGUAAGAAUGUAUUUGCUUGAUUGUAAAGCUUCUUAGAGGAACGAUGUGUGUCUAACACAAGGAAGUUUAAGGCAACAACAGGUCUGUGAUGUCCUUAGAUGAACUAGGCUGCACGCGUGCUACACUGAUAUGUAUAACGAGUUAUUAAAAUUACGAUUCAGCUUGCUGUUUCGUAUUUUUCCUCCACUGAAAAGUGUAGGUAAUCUUUAUCAGUACAUAUCGUGAUGGGGAUAGAUUGUUGCAAUUAUUAAUCUUGAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCAUGAUUCAUCAGAUUGUGCUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAAGAUAUGAUGAAUUGUUUGGACAAGAAGAAGGGGGAUUAUAUCUCCUUUUUUCUGGAAAAACCGUAAAUCCUAUCUUUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((..((((((((.....(((.(((..((...(((....(((((.....)))))....)))))......(((......((((..((..((...((((...........((((....(((((((.....))))))).....)))).....((((((..((......))..))))))....((((((..((((.........(((((...))))))))).....))))))........(((..((((((....))))))....)))....))))..))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))).....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((((((.......)))))))........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((..........................................................................................................................(((((.(((...((....))...))))))))..........................................................................................................................................(((((((.((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((.((((((((............(((((((...(((....)))...))))))).......)))))))).))))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((.....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((.(((((......((((((((((((((((..(((..(((((((...((..(((....((((((....(((((((......)))))))......))))))....)))..))...))).)))).)))..)))))))))))))))).)))))...........)))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..........(((((..(((....)))..))))).....((..((((....))))..))....))).......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).(((((((((.....)))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[))).........((((((((...))).)))))...]]]]]..(((((((....))))))).....((((((((.(((................((((((((...............(((....)))...((((((.....))))))..........(((((((((((..............))))))......(((((..(((((.....)))))...))))).))))).)))))))).........((((..((((((....))))))....)))).......)))))))))))(((............[[[[[[[)))......]]]]]]].....((((((((..(((...............[[[[..[[[...[[[))).......]]]......]]]..]]]]((((.(((((...((((((.(((((((((((.............................((((((((((...)))))))))).)))))))..))))))))))...((((((............))))))...))))).)))).(((((.....((((....(((.....)))....)))).....))))).((((....(((.(((((.....((((((...(((((((.((((((..........))))))...................))))))).....((((((...((((((....((((.((((....))))(((.......(((((((((((.............))))))))))).((((((((.....)))))))).))).....))))...)))))).)))))))))))).))))))))......)))).....(((((((..[[[[..)))))))....]]]]...((((((((.(((..(((((((.((((((..(((((....(((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))(((.(((....))).))))))))..)))))).)))))))...)))..))))))))....(((.[[[[.))).....]]]]..((((((...(((...(((.(((.....)))..)))))).))))))......(((((((...(((....)))...)))))))((((.....[[[[[[.[[[[...[[[[))))....]]]].]]]].]]]]]]......(((((....)))))...(((((.....)))))....((((.((((.[[[[)))).))))...]]]]..............(((((((..[[[[[[..((((((.((((((...(((((....))))).)))))))))))))))))))..]]]]]]......((((((....((((((...............[[[[[[........))))))......]]]]]]........)))))).........((((((((((((((((..(((..(((((((.......(((....((((((....((((............))))......))))))....))).......))).)))).)))..))))))))))))))))....((((.[[[[[.))))...........]]]]]((((((.....((((((..((((((((..((((((....)))..)))))))))))......(((.(((....)))..(((.(((((((((...(((.....((((.(((((..(((....)))..))))).))))(((.((((....)))).)))....))).....))))))))))))..((((((((((((..........))))))...............((((.(((((((((.....))))))))).)))).))))))))))))))))))))).))))))))(((((.....((((((((((.(((.....((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....)))).....))).))))))))))....)))))............(((((((((((.....)))))))..))))....
|
|
CRW_00381
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCUUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAAGUGAAAGUACAUGCAUAUUUUUAUAUGCGGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAACAGUUAUAAUCUACUUGACAUUUUUUUCUAUAAGGAUAACUACGGAAAAGCUGUAGCUAAUACUUGCUUUAAUGCUCUCGACGAAUGUCUUGGGCAUGUACUUGUUAAGCCUUUAUAAGAAAAAAGUUAAUAACUUAAGGAAUGAUAACAAAGAAGUGACACAUAGAAGGACCUGCGUCCAUUUAUAGUGUGUAUCAAUCGAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUUGAUGUUAGGGUAUUGGCCUAACAUUGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUUAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUUCUAAAGAAGAGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAAUACAAGACCAAAACUGGUUUUGUAAUUGGAAUGAUGGGAAUUUAAAUCCUUCCCAUAAUACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAAUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUUCAAAGAACCAAUAUUUUAAUAACGCCGUUAGCUAGAUCCACAAGGGGUUGAGCCAAUCACGGUUUCGGCUUCUGUGCGCAUCCUACCUAUCAAGCGUUUUUUUAAUUAAAGUGUUUCUUUUUAAAAUCUUCUUUACCUUAACCAUAUGGAAGAUUUUGUUACUUUGAGUAAAUUAAAGUGUUCAUAGCAAACAGAUACAGCAUUGCGCGUUUUGAAUACUACAGCAUGGAAUAACAAAAUUGAACAAGUCAAAACUAUGUUUCUUUUUUUUUAUUUUUGGCUUAGUUACGAUUAAUAGGAGUAGUUUGGGGACAUUUGUAUUCAGAUGUCAGAGGUGAAAUUCUAAGAUUUUCUGGAGACAAACAACUGCGAAGGCAUUUGUCUAAAAUACUUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAAGGGAGUGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAAUCUUAACCAUAAACUAUACCGACUAGGUUUUGGAUGAAAGUUAAACAAAUAAGGAUAGUCUCUUCGGGGAUAGUCCUUAGAUUUCUUCCUUCAGUACCCUAUGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGCGAGUAUUCGCGCAAGCGAGAAAGUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACUAGUUUAAGACAAGAGUAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUCGAUUUCUUGGAUGGUGAUGCAUGGCCGUUUUUAGUUCGUGAAUAUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGAUCUUAACCUGCUAAUUAGCGGUAAGUACGACAUAUUUUUAUGUCGGAUUGGAUCUGGAUGAUUUGCUUAUAUUGAGGUGCAAUCUAAAUAGGGGAUUGCAAUUAUACUUCGUGUCGGUGUUUCUUAAUCGAAUAGCUGAUGCGUUUGGUAUAUUGCUUUCCUUUUUUUUAUUUCUGCGCUUCUUUACUUGGCUUAUCGUACCGUUUCCUUUUUGUGUAGAAAUGUAUUUGCAUUAUAUUAAAGCUUCUUAGAGGAACGAUGUGUGUCUAACACAAGGAAGUUUAAGGCAACAACAGGUCUGUGAUGUCCUUAGAUGAACUAGGCUGCACGCGUGCUACACUGAUAUGUACAACGAGUUAUUAAAAUUACGAUUCAGCUUGCUGUUACGUAUUUUUCCUCCACUGAAAAGUGUAGGUAAUCUUUAUCAGUACAUAUCGUGAUGGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUGAACGAGGAAUGCCUAGUAAGCACGAUUCAUUAGAUUGUGCUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUCGAAAGAUAUGAUGAAUUGUUUGGACAAGAAGAAAGGGGAUUAUAUCUUCUUUUUUCUGGAAAAACCGUAAAUCCUGUCUUUUAAAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((..((((((((.....(((.(((..((...(((....(((((......)))))....)))))......(((......((((..((..((...((((............((((....(((((((.....))))))).....)))).....((((((..((......))..))))))....((((((..((((..........(((((...))))))))).....))))))........(((..((((((((....))))))))...)))....))))..))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((.....)))).)))).)).))))).....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((((((.......)))))))........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.................................................................................................................................((((((((.................)))))))).............................................................................................................................................(((((((.((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((.((((((((............(((((((.(((((....))))).))))))).......)))))))).))))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((.....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((.(((((......((((((((((((.(((..(((..((((((((..((......(((((........((((((((((..((((.((((((.(((((((((..(((......)))..)))))))))...)))))))))).......))))))))))........)))))....))..))))).))).)))..))).)))))))))))).)))))...........)))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..........((((...(((....)))...)))).....((..((((....))))..))....))).......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((.(((((.....((((((((...))).)))))...(((.(((((((((......))))))))).)))....)))))....)))(((((.....((((((........((((..((((((((((((((.(((((((...(((((.(((.....)))..))))).((((((..(((....)))..)))))))))...))))...)))))).)))))))))))))))))).....))))).....))))....(((((((((.((((....)))).))))).))))...)))))).(((((((.(((..(((......(((((((((.......)))))))))....)))..)))....)))))))....(((..((((.....))))[[[[[.)))...(((...............)))..]]]]]......((((((...((((.....)))).))))))............(((((((((((((....))))))))).))))(((..[[[[[[[)))......]]]]]]]......(((((((((((.......)))).[[[[[..............)))))))................]]]]].............(((((................(((((((((((...((((...(((.(((((.....))))).)))....[[[[[...))))..]]]]]............................)))))))))))......(((((((((((...............))))))))))).((((((((.....))))))))......((((.[[[[.......))))....]]]]...)))))(((..(((((((.((((..((((((((....))).)))))...)))).)))))))..)))..(((((((((..(((((..........((((((((....))))))))..........))))).((((......(((((((....(((....))))))))))....[[[[[[[...))))...(((....)))..]]]]]]]..((((...[[[[..))))...]]]]..............(((.....)))((((...[[[[......))))(((((((.(((((....))))).)))))))..]]]](((((((((.((((...((((........)))).)))).)))))).)))..(((((....)))))...(((((.....)))))....((((.((((..[[[)))).))))...]]]........(((.....))).....((((((.((((((((((........)))...(((((((((....))))))))))))))))))))))....((((((......[[[[[[..........[[[[)))))).....]]]]]]]]]]......(((..[[[[)))...]]]]......(((((((....)))))))....(((..((((((((..(((......((((((((........((((((..(((((.(((((.(((((((((..(((......)))..)))))))))...))))))))))..))))))..........)))))))).......)))..))))).)))..))).....(((((((......))))))).......(((((((((.[[[[[....(((((.....)))))))))))))).((((........))))......]]]]]..............(((....)))..(((.(((((((((...(((.....((((.((((...(((....)))...)))).))))(((.((((....)))).)))....))).....))))))))))))..((((((((((((..........))))))...[[[[[[......((((.(((((((((.....))))))))).)))).))))))...]]]]]]...........((((.[[[[..)))).((((((((.(((.....((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....)))).....))).))))))))..]]]]......)))))))))....((((((((((....))))))))))........
|
|
CRW_00386
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACGCACGGCCGGUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUUGGUCGCUCGCUCCUCUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCCGACGGGCGCUGACCCCCCUUCCCGUGGGGGGGACGCGUGCAUUUAUCAGAUCAAAACCAACCCGGUCAGCCCCCUCCCGGCUCCGGCCGGGGGUCGGGCGCCGGCGGCUUUGGUGACUCUAGAUAACCUCGGGCCGAUCGCACGCCCUCCGUGGCGGCGACGACCCAUUCGAACGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGUCGCCGUGCCUACCAUGGUGACCACGGGUGACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUCCACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUUGGGAGCGGGCGGGCGGUCCGCCGCGAGGCGAGUCACCGCCCGUCCCCGCCCCUUGCCUCUCGGCGCCCCCUCGAUGCUCUUAGCUGAGUGUCCCGCGGGGCCCGAAGCGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCCCGAGCCGCCUGGAUACCGCAGCUAGGAAUAAUGGAAUAGGACCGCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAACUGAGGCCAUGAUUAAGAGGGACGGCCGGGGGCAUUCGUAUUGCGCCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGGCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUCGGAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCCGACCAUAAACGAUGCCGACUGGCGAUGCGGCGGCGUUAUUCCCAUGACCCGCCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACUGGCUCAGCGUGUGCCUACCCUACGCCGGCAGGCGCGGGUAACCCGUUGAACCCCAUUCGUGAUGGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUUGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....(((..................((((....(((((((.....))))))).....)))).......((((...((((((.......))))))...))))....((((((.......(((((.((((...((((.((((((((....))))))))..)))).)))).....)))))......))))))...........((((.((((......))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.......(((.(((((((((((((.((((....))))....))))))))..)))))))).......((((.(((((...(((((((......)))))))....)))))))))................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.(((..((((((((.(((((....)))))))))))))..)))...[[..))]]...]]]....]]].)))..(((.....((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((....(((..((((....)))).)))....))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))...)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..)).....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((........[[[)))..]]].....................(((.(((........[[[[))).)))..]]]].....(((((..((((...))))....))))).....................(((.....[[[[.))).......]]]]..(((((((......((((((....))).[[[[(((((((......)))))))....)))......]]]]......(((((.(((((..((((.((((((((....))))))))..))))))))).....)))))..)))))))....(((((((...((((.((((......))))))))...(((.(((...((((.((((((((.......))))...(((((((((.....)))))))))...)))))))).((((((.......)))))).))).))).))))))).......................(((....(((((....((((((...((((......))))))))))(((.........(((((((((.(((....)))..))))).))))......((((..(((((((((((....))))))...)))))))))..)))..)))))....)))(((((((((.....[[[[[[............)))))))))................]]]]]]....(((...(((((((((((.((((....))))....)))))))))))...)))..((((((.((((...(((((.....(((((((((.((((((.((((((((......(((((((((((.....))))))).....)))).))))....))))..))))))..))))))))).((((((((((((((....))))))))))))))..(((((....)))))..........)))))...))))))))))(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))).......((((((((((.....)))))))))).........((((....[[[[[[[))))...((((.........))))....]]]]]]].........(((((.[[[[[[...)))))..(((((....))))).]]]]]](((((((((.((((.(((((...))))).)))).)))..[[[..))))))...]]]..........((((((((.((((((((.((((.....))))..........((((((((..((((..((((........))))..(((....)))......))))))))))))..)))))))))))))))).(((((((((((((((((((((((...((((.(((((.((((.[[[[))))..))))).)))).....]]]].((((..[[[...))))....]]]......)))))))))..(((((.............)))))..((((.[[[[[[))))......]]]]]].......((((......(((((.........))))).[[[[[[[[........))))......]]]]]]]].(((((..((((....)))).))))).....................(((((((..[[[[[[[........)))))))........]]]]]]].((((((..[[[[.....))))))...............]]]]..))))).)))))))))....((((.....((((((((((.(((..((((......(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))......))))..))).))))))))))....))))................(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_00400
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUUUCAAGGACUUAGCCAUGCAUGCCUCAGAAUCACUGCAUUGCAGGAAUCUGCGCAUGGCUCAUUACAUCAGACGUAAUCUGCCGCAAAAAUCUUGCGGUCUCCGCAAAAUUGGAUAACUUGGCGAAACGCCAAGCUAAUACAUGAACCAACCGGAUGUUCUCUGUUCCGGCGGCAGGGCAACCUGCUGCCAUGGGACGUCCAGCGAAUGAAUGAAAGUAAAACCAAUGCCUUCACCGGGCAGUAACACUCAGAAGUGUUGAUUCAAUUCAUUCCGUGCGAAAGCCGGGUUUUUUAUCCGGCGUCUUUUGACGAACAACUGCCCUAUCAGCCAGCGAUGGCCGUGUAGUGGACUGCCAUGGCGUUGACGGGAGCGGGGGAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUACCACUUCUACGGAGGGCAGCAGGCGCGCAAAUUGCCCAAUGUCAAAAAAAAAAGAUGAGGCAGCGAAAAGAAAUAGAGCCGACAGUGCUUUUGCAUUGUCGUUUUCAAUGGGGGAUAUUUAAACCCAUCCAAAAUCGAGUAACAAUUGGAGGACAAGUCUGGUGCCAGCACCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAAAGCGUAUAUUAAUGCUGUUGCUGUUAAAGGGUUCGUAGUUGAAUUGAGGGCCUCUAAGGCGCAAUGGUUUAGUCCCAUCCACUUCGGAUUGGUGACCCAUGCCCUUGUGGUCCGUGAACAGACAUAUUCAGAAACAAAAAACACGGGAGUGGUACCUUUUCUGAUUAUCGCAUGUCAUGCAUGCCAGAGGGCGCCCGUGAUUUUUUACUGUGACUAAAAAAGUGUGACCAAAGCAGUCAUUCGACUUGAAUUAGAAAGCAUGGGAUAACAAAGGAGCAGCCUCUGGGCCACCGUUUCGGCUUUUGUUGGUUUUAAAAGUCCAUUGGAGAUUAUGGGGCAGUGUGACAAGCGGCUGGGUGGUUAUUCCACACACACGCACACUCCUUUUUUGGAUGUUGUGUCUCUGUGUGUGUGGCACUCGUCGCCUUUGUGGGAAAUCCGUGUGGCACUUGUUUGGUGUUGUUGGCAGACUUCGGUCUUGCCUUCACACACGUUUCACAUGUGUCAUGCCUUCCCUCAACUCACGGCAUCCAGGAAUGAAGGAGGGUAGUUCGGGGGAGAACGUACUGGUGCGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGACCGCACCAAGACGAACUACAGCGAAGGCAUUCUUCAAGGAUACCUUCCUCAAUCAAGAACCAAAGUGUGGGGAUCGAAGAUGAUUAGAGACCAUUGUAGUCCACACUGCAAACGAUGACACCCAUGAAUUGGGGAGUUUUUGGUCGUAGGCGUGGUCGGGCUUGAUUAUAUUAUUUUUCAUCCCGUUCCUCGUCUCGCCAAUGAAUAUAUUAAAUUUACGUGCAUAUUCUUUUUGGUCUUCGUUUUUUUACGGCGAGGACCUUUAACGGGAAUAUCCUCAGCACGUUAUCUGACUUCUUCACGCGAAAGCUUUGAGGUUACAGUCUCAGGGGGGAGUACGUUCGCAAGAGUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAUGGCACCACAAGACGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUUGACUCAACACGGGGAACUUUACCAGAUCCGGACAGGGUGAGGAUUGACAGAUUGAGUGUUCUUUCUCGAUCCCCUGAAUGGUGGUGCAUGGCCGCUUUUGGUCGGUGGAGUGAUUUGUUUGGUUGAUUCCGUCAACGGACGAGAUCCAAGCUGCCCAGUAGGAUUCAGAAUUGCCCAUAGGAUAGCAAUCCCUUCCGCGGGUUUUACCCAAGGGGGGGCGGUAUUCGCUUGUAUCCUUCUCUGCGGGAUUCCUUGUUUUGCGCAAGGUGAGAUUUUGGGCAACAGCAGGUCUGUGAUGCUCCUCAAUGUUCUGGGCGACACGCGCACUACAAUGUCAGUGAGAACAAGAAAAACGACUCUUGUCGGACCUACUUGAUCAAAAGAGUGGGAAAACCCCGGAAUCACGUAGACCCACUUGGGACCGAGUAUUGCAAUUAUUGGUCGCGCAACGAGGAAUGUCUCGUAGGCGCAGCUCAUCAAACUGUGCCGAUUACGUCCCUGCCAUUUGUACACACCGCCCGUCGUUGUUUCCGAUGAUGGUGCAAUACAGGUGAUCGGACAGUCGAGUGCUUCACUUGACCGAAAGUUCACCGAUAUUUCUUCAAUAGAGGAAGCAAAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((((...))))...)))))......(((......((((..((..((...(((((......(((((...)))))..((((....(((((((.....))))))).....))))........(((((.((((......(((((((((....)))))))))..))))))))).....((((((............(((((........((((....)))).....)))))......))))))..........((((((((.....))))))))..)))))..))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((........))))).)))).)).))))))....((((((((((((....))))))))).)))........((((((((.......)))))))).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<...(((.((((((((...................................................................................................................................................))))))))..))).....<<..))>>.....>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((..(((.(((((((....((((((...)))))).....((((((((((((...)))))))))))).............)))))))...))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.....((((....))))....(((..((((....))))..)))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(((((((((((((..((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((...[[[[))))).(((.....))).......]]]]...((((((((......((((....((((...))))...)))).))))))))..........(((((((((.((((((...[[[[))))))............]]]]..(((((((...)))))))..............(((.[[[[[[[[[..)))..(((((((((....)))))))))..]]]]]]]]]...(((((((((((...........(((((.....))))).(((((((....))))))).))).))))))))(((.((((((((((((.....)))))))...)))))))).....(((.....[[[[[))).....(((((((((....))).))))))]]]]].....(((((((.((((.......[[[[[.[[[[[.[[[))))......]]]....]]]]].]]]]].......((((.[[[...))))...]]]................(((...[[[[[........)))((((((((....)))))))).]]]]].(((((...........))))).................((((((.........((((....)))).[[[[[[[[.....)))))).(((((......)))))]]]]]]]].....((((((....))))))....((((...))))....(((.[[[[[[))).........]]]]]].........))))))).(((.[[[[...)))....(((((((.......(((....)))......)))))))...]]]].((((((((..(((....))).((((((((((((..(((((.((((..(((((((((.......)))))...))))...))))....))))).....(((.(((((.(((....)))....)))))[[[[[[[[)))....]]]]]]]]....))))))))))))...)))))))).(((((.(((((......(((((((((((((((.(((......)))...)))))....))))))))))))))))))))......(((((....(((((((((.(((...((((....(((((((....))).))))...)))).......))).))))))))).)))))....(((((............((((((((((((.(((...(((((((((..(((((((...((((......))))....)))))))..)))................))))))..))))))))))))...)))...........))))).((((.....[[[[[[[[[[..(((((((....))))))).))))....((((.....))))..]]]]]]]]]]((((((((((((.((((((................(((((((((.(((((.((((.(((.....))).....((((((((((((((...((((((((((.......))))))))))......)))))))).....))))))..((((((((((((...........((((((......)))))))))))))).(((((....)))))....((((.....)))))))).))))......))))).)))))(((.((((......))))...))).))))((((((((....((((((((((((((((..((((.......))))..))))))...)))))...((((((.....)))))))))))..))))))))..((((((((.(((((...)))))))))))))...))))))((((((.((((.......(((((((.((((((.(((..((((((..((((...))))..))))))((((...)))))))))))))((((.........((((((.....)))))).))))...)))))))..(((.........))))))).......))))))))).))))).))))...(((.((((..((((((........))))))(((.(((((((........)))))))......)))...))))...)))....(((.[[[[[[......)))...]]]]]].....((((((....)))))).(((((((.........))))))))))))))))........(((((..[[[[..(((((((((....))))))))))))))....]]]](((((...((((((((...)))))))).....[[[..))))).(((((((....)))))))..........]]]..(((..(((((((....)))))))[[[.)))...]]]
|
|
CRW_00403
|
[ FASTA input ]
|
AACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCUUUUAUACGGCUAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAACAGUUAUAGUUUAUUUGAUGGUCUUUACUACAUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAUGGCUAAUACAUGCGCACAUGCCUCUUCCCCUGGAAGGCAGUGUUUAUUAGAUACAGAACCAACCCACCUUCCGGUGGUCCUCAGGUGAUUCAUAGUAACCGAACGGAUCGCGUUGACUUCGGUCUGCGACGGAUCAUUCAAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUCGACGGUACUGUAUUGGACUACCGUGGCAGUGACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGAUUCAGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAACACUGGAAAUUUCAUUUCUAGUGAUUGGAAUGAUAGGAAUCCAAACCCCUUUCAGAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUUUCUGCUGGAAGCAGCCAGUCCGCCCUCAGGGGUGUGCACUUGGUGAAUUCUAGCAUCCUUCUGGAUUUCUCCACACUUCAUUGUGUGGAGUUUUUUCCAGGACUUUUACUUUGAGAAAAUUAGAGUGUUUCAAGCAGGCUUGUCGCCUUGAAUACUGCAGCAUGGAAUAAUAAGAUAGGAUUUCGGCCCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACUGAAGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUUGGGGGCAUUCGUAUUUAACUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUGUUAAAGACGAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAAGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGAGAUAGGAAAACGUCAUGCUUGACUUCUCCUGCACCUUAUGAGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGGAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGGAUCAGGAACUUCGUGUUCUUGUAUCACUUCUUAGAGGGACUUUGCGUGUCUAACGCAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAUGCAUCCAACGAGUUUAUAACCUUGGCCGAUAGGUCUAGGUAAUCUUGUGAGUAUGCAUCGUGAUGGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUCAACGAGGAAUGCCUAGUAGGCGCAAGUCAGCACGUUGCGCCGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGUUCCGGUGAAUUAUUCGGACCGUUUUGUGGCGCGUUCGUGCCCGAAAUGGGAAGUUUUGUGAACCUUAACACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((.........))...)))))......(((......((((..((..((....((((...........((((....(((((((.....))))))).....))))......(((((.(((....))))))))....((((((........(((...(((((....)))))......)))......)))))).........((((...(((....))).))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((((((.......))))))).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((........................................................................................................................................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.((((....))))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((((((((((.....))))))).))).))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((.(((((....)))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).....((((((..((((...))))..[[[[..))))))....((((((....))))))]]]].(((((..((((...))))....)))))...................((((((..(((((.(((.((((...(((....((((((.....((((.(((((..(((...)))))))))))).))))))....)))))))..(((((....)))))......))).)))))))))))(((..[[[[(((((..(((....)))))))))))............]]]].((((((......(((((((((((........(((((((((................((((....))))..((((..(((...((((........))))......)))..))))((((.(((((......((((((...(((((...))))).))))))...............((((((((((...)))))))))).(((((..........)))))...((((((((........))))))))...))))).))))....))))))))).....((((((((((.....))))..((((((((((((......(((.......(((....((((((((...((((...(((((....)))))......))))...)))))))))))(((((((...((((((((......)))))))).....)))))))....((((((((.....)))))))).....)))((((.....)))).....)))))))).(((((((((((((((((........))))))))))))..))))).)))).......((((((((..(((((......(((((((((.((((((.(((.((((......)))).)))..)))))).)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....))).))))))..........))).))))))))((((((((....)))........)))))..)))))).............(((((((((((...((((...((((.(((((...))))).))))....(((((..((((....))))..........(((((....((((((((.....(((((.....)))))....((((((((..((((...(((....)))......(((.......)))....))))))))))))..))))))))...)))))(((((((((((((((.((((((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))...(((((((((.((((....((((((((((.....))))))).))).....)))).))).((((((((.....))))))))....))))))............((((((((((..(((...))))))).......((((..(((.(((((((...(((((......((((.((((....)))).))))...)))))....)))))))))).(((((((.(((..........))).)))))))...(((....)))....(((....)))........))))..)))))).....)))...))))).)))))))))).))))).......((((((((..(((......(((...((((((((.(((((....)))))))))))))))).........)))..)))))))))))).))))))))))).........(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_00411
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUUCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUACGCAAAUUAUACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUAUUUGAUGUUUCUUGCUACAUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCGUAAAAAGCCCCGACUUCUGGAAGGGGUGUAUUUAUUAGAUAAAAACCAUCCUCCUCGGAGUUUGGUGAUUCAUAAUAACUUCUCGAAUCGCACGGCCUUGUGCUGGCGAUGCUUCAUUCAAAUAUCUGCCCUAUCAACUGUCGAUGGUAGGAUAGAGGCCUACCAUGGUUGCAACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCCGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUGCAGGGCCCUUUUGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUUUAAAUCCCUUAACGAGGAACGAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAAGUUUGGUCUCGGACGCUGGGUCUGCUUAAUUGCAUGUACUUGACGGUCCGAGACUUCCUUCUUGGUGAACGGCCGCCCUCGGGUGGUCCGGAACCAGGACUAUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCCAUAGGCCCGAAUAUAUUAGCAUGGAAUAACAGAAUAGGACGUGCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGAACUGCCGUAAUGAUUAAAAGGGACAGCCGGGGGCAUUAGUAUUUGCACGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUGUGCAAAGACUUCCUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAGGUUAGGGUAUCGAAAACGAUUAGAUACCGUUGUAGUCUUAACAGUAAACUAUGCCGACUCCGAAUCGGUCGAUGCUCAUUUCACUGGCUCGAUCGGCGCGGUACGAGAAAUCAAAGUUUUUGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACCGGGUCCGGACAUAGUAAGGAUUGACAGAUUGAUGGCGCUUUCAUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACCUUGACCUGCUAAAUAGACGGGUUGACAUUUUGUUGGCCCCUUAUGUCUUCUUAGAGGGACAAUCGACCGUCUAGGUGAUGGAGGCAAAAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCCGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACAGAGACAACGAGUGGAGCCCCUUGUCCGAAAUGACUGGGUAAACUUGUGAAACUUUGUCGUGCUGGGGAUGGAGCUUUGUAAUUUUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGACUUGGGAGAGUACAUCGGGGAGCCAGCAAUGGCACCCUGACGGCUCAAACUCUUACAAACUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUAUCUGUAGGUGAACCUGCAGAUGGAUCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).(((.(((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....(((............((((....(((((((.....))))))).....))))........(((((..((...))..)))))....((((((.......((((..(((....)))..))))......)))))).........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((....)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((.......((((((((((((.((((.(((......)))...)))).)).))))))))))....((((((.....(((((((....))))).))....)))))).............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.(((..((((((((.((...........))))))))))..)))...{{..))}}...}}}...}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((((((((((...))))))))).....))))..)))))))..(((((.(((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((.(((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).........((((((((...))).))))).((((((((.........((((..((((...))))...))))..((((((.....(((((...........))))).....((((((((........)))))))).....))))))..)))))))).....((((........[[[[[))))....((((((.......((((..(((....)))..))))......))))))]]]]]...(((((.((((.....)))))))))................((((((.....(((((.(((((((..((((((((((((.(((((((.............((((....))))..(((((((.....((((........))))......)))..))))((((.(((((......((((((...(((((...))))).))))))............(((((((((((((....))))))))).))))((((.......))))....(((((..(((.......))))))))...))))).)))).))))))).))))(((((((((.(((((((..........))))))).)))......(((.((((((.......((((((((((...((((.(((......)))...))))....))))))))))......(((((...((((((((....))))).)))..)))))))))))((((((((.....)))))))).........((((...))))..........))).))))))(((((((((((((.....)))))))))))))))))))))...))))))).............)))))...))))))......((((((((...........[[[[[[[[..))))))))..........(((....)))....]]]]]]]]((((((..........(((....)))..[[[[[[)))))).....]]]]]]((((......)))).........(((((.[[[[...((((((((................))))))))..)))))((((((.......))))))......]]]]((((..[[[[[[[........)))).................(((.((((.....)))).)))]]]]]]]........(((.....)))...(((.....[[[[[......)))..]]]]]...(((...((((.....))))...)))(((((((((((((((....(((((...((((.((((((((((.[[[.)))).)))))).))))))))).......]]]...((((..((((((((..(((...)))..)))).....))))..)))).((((((.....(((((.....)))))........((((...(((....)))..))))......)))))).(((.....[[[[))).....(((((((...((((((...((((...(((......))).))))..))))))....)))))))]]]].(((((((((((............)))).......(((....))).((((((...[[[[[...))))))..]]]]].)))))))......))))).))))))))))...((((.....((((((((((.(((.((((.......((((...((((((.((((....)))).))))))..))))....))))....))).))))))))))....)))).............((((((((((((....)))))))))..)))....
|
|
CRW_00414
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCACGUGUAAGUACGCACGGCCGGUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUUGAUCGCUCCAUCUGUUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCCGACGAGCGCUGACCCCCAGGGAUGCGUGCAUUUAUCAGAUCAAAACCAACCCGGGGCCCCCGCGCCCCGGCCGCUUUGGUGACUCUAGAUAACCUCGGGCCGAUCGCACGUCCCCGUGACGGCGACGAUACAUUCGGAUGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUACUUUCUGCGCCUACCAUGGUGACCACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACGCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUACACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCUAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUUGGGAUCGAGCUGGCGGUCCGCCGCAAGGCGAGCUACCGCCUGUCCCAGCCCCUGCCUCUCGGCGCCUCCCCGAUGCUCUUGACUGAGUGUCCCGGGGGCCCGAAGCGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCCAAGCAGGCCGCGUCGCCUGGAUACUUCAGCUAGGAAUAAUGGAAUAGGACUCCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAACUGGGGCCAUGAUUAAGAGGGACGGCCGGGGGCAUUCGUAUUGUGCCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGGCGCAAGACGAACCAAAGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUCGGAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCCGACCAUAAACGAUGCCGACUAGCGAUCCGGCGGCGUUAUUCCCAUGACCCGCCGAGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGAAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCCUCCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGGCGGUCGGCGUCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACACGAGAUCGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAACGGAUCAGCGUGUGUCUACCCUGCGCCGACAGGUGCGGGUAACCCGCUGAACCCCGUUCGUGAUAGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUUCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUCGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGUCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCAACGGCCCUGGCGGAGCGCCGAGAAGACGAUCAAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....((..........))...)))))......(((......((((..((..((....(((...............((((....(((((((.....))))))).....)))).......((((...((....))...))))....((((((.......(((((.(((((((......))))))).....)))))......))))))...........((((.((((.....))))))))....)))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.......(((........((((((.((((....))))....)))))).........)))......((((.(((((...(((((((......)))))))...)))))))))...............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((..((((((((.(((((....)))))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>.)))..(((.....((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((....(((..((((...)))).))).))))..)))))))..((((((((.....))))))))....))))...)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((.......((..((((....))))..)).....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.......)))))..((((..((((((((...))).))))).)))).(((((......)))))[[[[)))((((...))))....]]]](((...(((((....)))))....)))....((((...[[[[[[)))).......]]]]]](((((((.......((((......((((...(((...)))..)))))))).............(((((.(((((((......))))))).....)))))..))))))).....(((..[[[[((((.((((.....))))))))))).....]]]].(((((((...............((((.[[[[[[.((((......))))))))..........((((((.......))))))(((.....((((........))))......))).]]]]]]...)))))))..............(((((...))))).((((((((((........(((((((((.(((....)))..))))).)))).................((((((....))))))(((((((((((((.......)))).......[[[[[[[[[....)))))))))..........]]]]]]]]]........((((((..[[[[[..........))))))((((((.((((....))))....))))))....]]]]].(((((...((((.((((((..(((((((......)))))))..)))))))))).[[[[.((((((((.....))))))))......)))))..]]]]..(((((...[[[[[[)))))..((((((((((((((....))))))))))))))..........]]]]]]...(((((((..............(((.(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))).......[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]].)))))))....((((.[[[[[[[.))))..((((.........))))....]]]]]]].........(((......[[[[[[((((((.(((((....))))))))))).))).(((((.((((.(((((...))))).)))).))))).....]]]]]]....(((..........[[[[[[[)))..((((.((((.....)))).)))).....]]]]]]].........((((........)))).((((((((....((((....(((((((....((((..(((((.((((.((((...((((((.....(((..(((((((((((((......((((.(((.............))).))))..))))..)))))))))..)))(((((......)))))))).)))....)))).))))....(((((.....))))).)))))..)))).......))))))).....))))...)))))))).....(((((((((.....[[[[[[...))))))))).(((((.(((((....))))))))))............]]]]]](((..((((..((((((((..(((((.((((.........))))............((((((.....))))))..))))).))))))))))))...)))........)))))))))).....((((((((((.(((..((((......(((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))......))))..))).))))))))))........................(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_00417
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUAUUGACUACUAAUAGACUUACACAUGCAAGCAUCCGCACCCCAGUGAAGACGCCCUUUAAAUCCACCUGAACCAAAAGGAGCUGGUAUCAAGCACACAUUUGUAGCUUAUGACGCCUUGCUCAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCUAUGGACGAAAGUCUGACUAAGUCAUAUUGAUAAGGGUCGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACCCUAGUUAAUAGGAAUACGGCGUAAAGAGUGUUAAAGCAUCACACUAAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCACAGCUGUAAUAAAAAUAGACAACGAAAGUGACUCUACAACCGCUGAUCACACUACAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCAUAAACACAGGUAAUUGUAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUACACCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAACCCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAAGGAACAAGAGUAAGCAUAAUAAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAUUUCAAGAACACUCAACACGAAAGUUAUUAUGAAACUGAUGACUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAACUAAGAAUAGAGCGCUUAGUUGAAUUAGGCUAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAAACACGAUACACCUAAACUUAUUCACACGUAUUAACCGUACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((((...((.....))....))))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))...)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((...(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..(((((((((...(((((((((.....))).......)))))).....(((.....)))....)))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....))))).........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((((..(((((((((((((................(((........)))......(((((.....)))))......(((........))).((((((((..((((((....))).)))..((((.(((((.((((.....(((....))).((((((..((((....)))).))).(((((....))))).....)))...))))))))))))).........))))))))......(((((......))))).)))))))))))))((((((......(((((.........)))))......(((((.....)))))..))))))...................................((((..........[[[[.))))....]]]]...........))))))))))))...............(((....[[[..)))...]]]..........(((((((((.((((......(((....)))....))))....(((((((((((((((((...((((((.(((.((((((((.....((((........))))........(((((((..(((.....)))...((((((...((((..(((....(((.....)))..................................)))))))...))))))......))))))).....)))))))).....((((......))))..)))........((((((((......))))))))..)))))).((((((.....))))))..))))))((((((((......))))...))))........)))))).......((((((..(((.....(((((..................))))).....)))..))))))..))))).......)))(((((((((....)))))))))))))))..
|
|
CRW_00418
|
[ FASTA input ]
|
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUAAUUAGCUGAAAGUAAAAUUACACAUGCAAGACUCCCCACACCAGUGUCAAAUCCCUUAGAACUAGACAGCUAACCUAAGGAGAGGAUAUCAAGCACAUUAAUAUAGCUCAAGACAUCUCGCCAAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCAAUGAACGAAAGUUUGACUUAGUUAUACUUCCAAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUUAUUUUACGGCGUAAAAGGUGUUAUAUCUAAAACAAAUAGAAUUAAAACCUGACUUAUAUGUGAAAAUUCAUUGUCAGACAAAAACACAACCACGAAAGUGAUUCUAAUAAACCAAACACGAAAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUUAAAUAAUUAAUAACAAAAUUAUUUGCCAGAGAACUACUAGCCAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUACUUUAUAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAUACCCCGUUACACCUCACCACCCCUUGCUAAUCCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUCAAAAGGACACACAGUAAGCAAGAGCACAAACAUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGGAAGUAAUGGGCUACAUUUUCUUAAAAAGAACACACGAAACCCUUUAUGAAAUUAAAGGAUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAGAGCAAUGAAGUGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAACUAAUCUUCAAGUAAAAUAAAUAAAAUUAAACUAACUAGAAUACGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((......(((....))).....))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).)))))))))).....(((((.....((((....(((........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....)))))))))..)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.................................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((..(((((...(((((((...(((....)))........(((.............))).......(((....))).)))))))..)))))..))))).(((((((((((....(((((...(((((((((((..(((...(((....)))........(((.....(((((((...(((((....))))).)))))))...........((((((((.......))))))))..)))))).....(((((........))))).......))))....)))))))..............((((((......(((((......((((....)))).))))).............(((....)))))))))................)))))...((((...))))..........(((.((((((((..(((.....(((((((((........)))))))))...(((.......(((....))).....)))....((((((((((((((((((.(((.......)))...((((((((..(((((....((((((((((((.(((....((((((.............(((.................(((....))).......)))))))))......(((........))).)))..))))))))).........)))......((((((.....(((((((................((((((......)))))).((((......))))........))))))).....))))))))))))))))))))))))))))............)))....((((((.......(((...(((..(((.......)))..)))....)))......)))))).))))))......))))))))))).)))..))))))))))).
|
|
CRW_00419
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUCCCGUUAGUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCUACACCCCAGUGAAAAUGCCCUCCAAAUCACUAGUUGAUUAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACUUUACAUAAGUAGCUCACAACACCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUAGAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGCCAUACGAUUAACCCAAACUAACGGGCAUCCGGCGUAAAACGUGUUAAAGAAUCUACUCACAUUAAAGUUAAAACUUAAUCAGGCCGUAAAAAGCUACCGUUAACAUAAAAUACCUUACGAAAGUAACUUUAUUAAUUCUGAUUACACGACAGCUAAGGCCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACAUAAAUAGUUUAGUAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUACACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUUACCACUUCUAGCUACUUCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUCAAAAGGAAGCAAAGUAAGCAUAAUGAUUCCUGCAUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAACCCAUGAAGUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAACAAGAACACUAUACGAAAAUUUUUAUGAAAUUAAAACCUAAAGGUGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAGUUGAAUUGGGCUAUAAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAACGUCAAGAUUUAAACCCAAUAUAUAAUCACAACAGACUAAACGCAAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCGUACUGGAAGGUGUGCUUGGAUAAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....((((.....))))....))).)).(((..(.(((..((((.....)))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((.........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((..[[[.))).......]]]............................(((((((...((((((......(((......((((((.((((........((((((((....(((..((((.....)))).)))......))).))))).......(((....)))...))))))))))........((((.(((((....))))).....(((..((((((((((((((((((.......))))))))...((((((....((((......(((...(((....)))((((...)))))))....))))...........((((....)))).....))))))....(((....))).............((((....))))))))))))))...........)))))))..)))....))))))..)))))))..........(((...[[[[[[.)))...]]]]]]....................(((.....(((....)))[[[....)))..]]]....(((((((.....))))......[[[[.))).........((((........))))...]]]].(((.((((..((((((((.....((((((.....(((........(((....))).....))).........(((..((((...........))))))).)))))).....))))))))..)))).)))(((.....((((.....))))..((((.....(((((((((.(((((...(((....))).))))).)))).)))))....))))..)))...(((....[[[[[.....)))...........]]]]].....((((((.................................................)))))).................(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00421
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUAUUAAUUGUUAGCAAAUUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCUGUGAGAAUACCCUUUAAAUCACCUAUGACUGAAAGGAGUAGGUAUCAAGCACACUUAUUUAUAAGUAGCUAAUCACACCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUCGACUAAGUUAUGCUAAUAUUUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGGUAGCGGCGUAAAGCGUGUUAAAGAACACUAAAUAAAAUAAAGAUAAAACUUGACUAGGCUGUAGAAAGCAACAGUCAAGACUAAAAUAAACUACGAAAGUGACUUUAUUACUUUUGAUCACACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUUAGGUAAUUUAAUUAACAAAACUACUCGCCAGAGGACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCAUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCGCCCCUUGCUAAUACAGCUUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAAGGAAUAACAGUAAGCUUAAAUAUUUCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGGCGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAUAACUAGAAUAUUCACGAAAGUUUCUAUGAAACUAGAAACCAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGUUAAGAAUAGAGCGCUUAACUGAACCAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUUUUAAGUCUACUGAUAUAUAAUCUCAGACUAACUAAUAUUAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGACGAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((....))).....))).)).(((..(.(((..(((((....))))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))......((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))....(((((.....((((...(((.............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((.....................................)))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......)))))).........(((..[[[.....)))..]]]........(((....(((((...((((((((...(((....)))...))))).))).......(((..(((((....))))).)))..)))))...))).....(((.(((....)))....[[[[)))...............(((((....))))).........]]]]........((((((((......((((...(((.[[[[)))..)))))))))))).............]]]](((.....(((((....))))).......(((((((......(((((((..(((......)))...)))))))............(((....))).)))))))............)))...((((((.((((...))))[[[[[[[...........))))))((((....))))..]]]]]]]...........(((....)))((((...(((....)))............(((..(((((((((((((.(((.......)))(((((((((((.((((........))))...((((.(((((((..((((.((((((((((.....................(((....))).......))))))).............(((.....))).......)))))))....)))))))(((...............(((((....)))))..)))......(((((((......))))))).....)))).....)))...(((((((.........)))))))))).))))).)))))))........)))))).)))...((((((.((((((...(((((...(((.....)))..)))))....)))))).))))))...)))).........((((((((((....)))))))))).......
|
|
CRW_00422
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUCUUAAUAAACUUACACAUGCAAGCAUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAGGUUAUUAAAACUAAGAGGAGCUGGCAUCAAGCACACACCCUGUAGCUCACGACGCCUUGCUUAACCACACCCCACGGGAAACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGCACCAUACCAAAUAGGGUUAAAUUCUAACUAAGCUGUAAAAAGCCAUGAUUAAAAUAAAAAUAAAUGACGAAAGUGACCCUACAAUAGCCGACGCACUAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUACAUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAAAAAAAGUAAGCGUAAUUAUGAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUCUCUACACCAAGAGAAUCAAGCACGAAAGUUAUUAUGAAACCAAUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAGAUUCAGUGCAUCUAACCCUAUUUAAACGCACUAGCUACAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..(((...))).))).....))))..((...))))).((((...))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....))))).........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((....(((..((((((((....(((((((((((((((.(((((((((((.(((....))))))....(((((.((((.....)))).)))))....(((....((((((.....))).)))......))).))))).......(((...))).....))))))...............(((((....)))))..)))))).))))))...((((((((......((((...(((.....)))..))))))))))))....))))))))...(((((((....((((....))))..)))....((((((((..(((.......(((......)))(((.(((........)))..)))..)))..)))))))).....))))..........))).....))))))((((.[[[[....))))(((....)))..]]]].....(((((((..........))))))).(((.((((......(((....)))....))))....((((((((((((.......(((((...)))))..(((((((...((((........))))...((((.(((.((((((((.....)))...(((((((((..(((........(((....))).....)))..(((((..(((((...)))))..))))).)))...)))))).(((((...)))))))))).)))(((..(((((((......)))))))..)))......((((((........)))))).....))))...(((.......)))))))))).((((((.(((......)))....)))))).....))))))).(((..((((.(((..(((....(((((...(((......)))...)))))..)))..))))))).)))))))).......)))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00423
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGUUUUCUUUCAGGGAAUUAAAAUUUGAUCAUGGUUUAAGAUGAUUUAAAAUGGUAUUAUCUAAAUUUGAUUUACAGAGUAGGCAAUAAAAAUUUACCUCGGCAAUUUAUCGCUUGUAAAAUACUUGUUCCAGAAUAAUCGGCUAGACUUGUUAAAGCUUGUACUUUAAUUGAUGUUAAUUAUGAAAUUAUUAUAUUUUCUUUUAGAUCUAUGGUAGAAUUUGGAUUUAUAUUAGUGAAUUUUCAUAAUUUUAAGAUUUGUUGAACAAAGCAGAUUAGUACCUGGUUAGACAAAAAUUAAAAGAGCAGGAGUAAAGUUGUAUUUAAACUGAAAAGAUAUUGGCAGACAUUCUAAAUUAUCUUUGGAGGCUGAGUAGUAACUGAGAACCCUCAUUAACUACUUAAUUUUUUGACUCGUGUAUGAUCGUUUAUUUUAUUCUUAAGGAUUAUAAUAAAAAAUUUUUAAUUUAUUAAAAUAGAUAUAUACCCGGUUUAUGAUUUAAGAAACAUUUGGCCUACAAUAUUUUAUAUUAUGGAUUUUAGUUUUAGUUAACUAAAUGAAAUUGUAAAAGACAGUAAAAAAUUCUUAAUGUAUUUUUGAAGAUUAUCUAGAAGUGGUACAAAUCAUCCAUCAAUUGCCCAAAGGGGAGUAAGUUGUAGUAAAGUAGAUUUAGGGGAACCUGAAUCUAGUAAUA |
|
[ reference structure ]
|
.......................(((((...{{{.))))).((((((((((((((((((............................................))))))))...((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))).))...))))))))))...(((([...(.((((..(((..........((((((((((......)))))))))).......((....)).)))))))....(((((....(...((((........))))...))))))..])..)))).(((.....((((...))))...)))...}}}...(((((.((.(((((.((..(((((((((((((((((...((((........)))).....(((((((.....((.((((..(((((((((.(((((.(((...)))......)))))................)))).)))...))))))))....)).)))))..)).))))))))))...((...))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.....)))))))).....))...)))))))))).))..(.((.((...(((((((...)))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((...)))))))).......(((((.((((((.((((((..........)))))))))))))))))..........(((((.........(((.(((((((....(((((((...)))(((((((((..(((((.(((...(((....))).((((...((((((((....(((((((((((((((((((.....((((((((((...))).)))))))...))).))))))..)))))))))))))......)))))))))))).)))))....))))...))))).........)))).(((......(((((((....(((............)))...(((((....(((((...(((((((((..(((.((((....)))))))....(((((......(((....(((((...((((((((((...(((((((((.........))))))))).....)))))))))).)))))...)))......)))))....))))))))).(((.....(((((((.(((((((...(((((....)))))....(((((.....)))))..))))))).)))))))...))))))))....)))))..)))))))....)))...)))))))...))).......))))).......((((((((((....))))))))))......
|
|
CRW_00424
|
[ FASTA input ]
|
AAAUGAAAAAGUAAUGGGUUUGAUAGUGGCUCUGCAAGAACGCUUUAUUAUGGGAAGUAAUACAUGCGAGUGAUAUAGAGUAGCGUACGGGUGAGUAGAUUAUGCGAGUUUAAAUAUACCAAUAGUAACUUAGUAUUAUAAGAAUUAUUGGGAACUCGCAUUGGAUUAGAUAGAUGGGAAUGAUGAAUGUAUAUUAUAGCUUCCCAUGUCUAAAACAUAGUUUAAUUGAUAGAUUAUUAAAUCACAAUGGCACUGAAAAAAGGGCCAUACAAUAAAUAUUGUCAGCAGUAGAGAAUAUUGGACAAUGUAAAAACAUAUGAUCCAGAGCAUAAUAUUAGUCCUGGCAAAUUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAUAGGACAAGUGUAUUGCAUAAUGAUUGGGUAUUGCGUGUGAAAGCAUGACUUAUAAAGAAAAAGAAUAGGAAUUCUCCAUGUAUUGGUAAAAUAAGCAAAUAUGGAUGAGGAACGCCAAAGGCAUAAGCAUAUUUUGAAAAUUUAUAUAAGCUGUAACACGGAAGUCCGAGUAGCAAAAAGGAUUAGAGACCCUCGUAGUUCGGACCGUCAAUUGCCAUUUUAUAUAAUGGUCACCUGAUGACACGGCGGCAACGCUAUUAAGUCAAAGUAUUAGACGGAGAUCAAUAAAUGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUGCGACGAUCCCCGCAAAACCUUACCACUUUUUAACAUUUUAAAAAAGGGCAUUGCAUGGCUGAUCAACUGUUUUUGGAUGUUGAUGACUUUGUCGCGUCGCAUGCAAUUGUAUGCGACGCGACAUUACACAUUACUGAAAAAGUUACACAAGUCCUCAUGGUCCUUAUAGAGUGGGCCACACAUUUGCUACAAUGGAUGCUCGGUCGUCGCCGCUCGCCAGCGAACCUAAAAAUCAUUCGAAGUCCAGAUUAGAUAUCUGAAACCGGUACUAUUAAGUAGGAAUCGCGAGUAAUCGAAAAUCAGACAAGUUUCGGUGAAGUUAAAAGAUAUUGUAGACAUUGACUAUUUCAGAUCCUGAAAUAGUCGUGGCAUACAUAUCUUCAUUAUUUUAGUUGAUCUAGUACUCACUGCCCGUCAAGUACUGAAAGAAAUUUUGAUGUGAAAAUACAUAAUUAUCAUAUAGAUACACAAUGUAUAUAUAACUUUAACGUUUUAAUUGGUAUUAAGUCGUAACAAGGUGACACUAGGGGAACCUGGUGUCGAGAUAGAAAAAAAAACAUUUUAAA |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((...[[[.))))).((((..(((((.(((((((.(......(((.(((..(((((.....)))))......(((........((((((((((.......((((((((..((((......)))).))))))))))))))))))(((..(.(((..(((((((....................))))))))))...))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).))))...)))))))...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))).))))..........(((.....((((.(.((((.....((((((.....((((((((..((((((((...(((......)))......))))).)))..))....(..((....))))))))).....))))))..)))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))........((((((......)))))).))).(((.....((((....)))).....)))...]]]..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.................((.((((..(((((....((((.(((((((.............(((((((((((((((....)))))))))))))))..........))))))))))).....)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((...((((((.((.....))..)))).)).......)))))......((..((((.((((.......))))))))..)).....))))).....((((((((........))))))))......((((((((.(((((.((.((((((((((((...)))))))))))))).).))))))))))..))..))...)))))))))).))....((.((...((((((((..(((((((((((((((..((((((...((((.....))))....))))))...)))))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))........................
|
| [ predicted structure ] |
..............((((((((......((((((......(((..((((((.....))))))...))).......))))))........(((((((.....((((((((((.......((((((((..((((......)))).))))))))))))))))))....(((((((..((((((..((((.......))))...)))))))))))))..((((((((.((((...((((....))))...(((((............))))).))))..((((((((..(((((.....)))))))))))))..)))).)))).......(((..(((((.((((((......((((((((.........)))...))))))))))).)))))..)))...(((((((((((((.(((((...(((......((((((.....((((((....(((((((((((((.....)))......))))))).)))....(((...))).......)))))).....))))))...)))...)))))...(((((((..[[[[.........(((...)))....)))))))......]]]]..............(((...[[[[)))..((((....)))).....]]]]..(((((((((...[[[[.....((((......))))...)))))))))...]]]]...((((..((((......((((((....))))))))))...))))..(((..[[[[[[.))).......]]]]]]((((((((((((((((((((....))))))))))))))).........(((.....))).....)))))....(((((......[[[[[)))))..]]]]].........)))))))))))))....)))))))..))))))))....(((((((((((.(((((.....)))))....(((((((...............(((....))).......(((......((((((......(((((((.(((.....((((((((((((...)))))))))))).....)))))))))).......((((.....))))...))))))...))).)))))))......))))))).))))..((((((...((((.....))))....)))))).....(((((.(((.((((((....)))))).)))...)))))(((((((((....))))))))).........................
|
|
CRW_00426
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUCUUAUUGGUUCUUAGCGAGCUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCGCCAGUGAGAAUGCCCUUUAAAUCACUCCCGAUCAUAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACACUCAUGUAGCUCAUAACGCCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUAGAAAUUUAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGCUACGCUAUAUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAAUUAAUAAGUACCGGCGUAGAGCGUGUUUAGGAGAAGACCCAUAAAUAAAGUUAAAUCAGAUCCAAGCCGUAGAAAGCUAAAGAUCAGACAAAAAUAAUCCACGAAAGUGACUUUAUCAGCUCUGAACACACGAUAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCGAUAGCUUCCAACAAAGCUACCCGCCAGAGAACUACUAGCAAAAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGACGGUGCUUCACAUCCCCCUAGAGGAGCCUGUCCCAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCCCCACUUGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCCAACCCUUAAAAGGUGCAAAAGUAAGCUCAAUGAUAGCCAUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGUGGAGGUCUAAGAUGGGCUACAUUUUCUCUUAGAGAACAAUCAACCAACGGACGUCACUAUGAAACAAGUGACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAACUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUUCAUAACCAUUCCACCAUAUAUGAUCCUAAUAGCAUAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((......))).....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((.............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{....))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))...........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((..................................))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((..(((((((((((((((((.....(((....(((........)))..)))..)))))))))))(((((((((.(((......)))..)))))).))))))...(((((((((....))).((((...(((((.(((((((((...(((....))).......((((.(((...(((((...(((((....))))).))))))))))))......((((((((.......)))))))).....))).....((((......))))..))))))..))))).)))))))))).............(((......)))...)))..))))))).........(((((.[[[[[...........(((....))).))))).....]]]]]..........((((((.........(((..[[[...)))..]]]..))))))............((((((......))))))...(((.(((.......(((....))).....)))....(((((((((((((((((..(((.......)))(((((.......((((........))))................(((((((((..(((..........(((...(((....(((....)))(((....))).)))....)))............(((.(((.((((((((((((((.(((....)))..)))))))))))))).(((...))).......))))))....((((((........))))))...))).))).))))))...(((((((.........)))))))....)))))..))))))))............))))...((((((..(((((((((..............)))))..........))))..))))))..))))).......)))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00427
|
[ FASTA input ]
|
CAGAGGUUUGGUCCUGGCCUUACUGUUAAUUUUUAUUAGACCUACACAUGCAAGUUUCCGCAUCCCAGUGAGUAUGCCCUUUUAGCUUCACUGAAGUAUAAAGGAGCUGGUAUCAGGCACACUUAAUUAAGCAGCCCAUGACACCUUGUUUAACCACACCCCCACGGGUAACAGCAGUGACUAACAUUGAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAAUCAUAAUAAAUAAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAACAGAAAAACGGCGUAAAGGGUGUUUAAGCAUAAACCUCAUAAAUAAAGUUAAAACUCAACUAUGCUGUAAUACGCCCUAGUUGGCAUUAAAAUAUACAACUUACGUGACUUUACUACUGCUGAAGACACUAAAGCUAAGGUACAAACUGGGAUUAGAGACCCCACUAUGCUUAGCCGUAAACCUAGGUAAUUAAAUAACAAAAUUACUCGCCAGAGAACUACUAGCCACUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCCCUAGACCCUCCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUACACCUCACCCCUUCUAGCUUAACAGUCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCUCACCCCAAUAGGGCCCCAAAGUGAGCAAAAUCAUCUAAACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAGGGGGAAGCAAUGGGCUACAUUUUCUAUAUUAGAACAUAACGGAUUGUCUACUGAAAUAGAGGCAUGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAGUAGAGAGCUUAAUUGAAAUAGGCAAUAGGGUGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCGAUAAAGUAACCUUCAAUACCUAAUUAGAAUACGCUAAAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACAAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((.....))).....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<.....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((..........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.........................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.........(((....)))(((((.((((((((((((((((((...(((((..((((((..((((((((..((((..(((((..(((((...)))))..)))))(((((((.((((((...(((....)))..)))..))).))).(((((......((((....))))..((((((((........(((....(((((....)))))......)))...........((((((((.......)))))))).....((((....((((......))))............(((((((((((((...((((((...............(((.......))))))))).....))))))).((((.............))))))))))))))....)))))))).)))))....))))...))))..))))))))......(((...((((((..(((.........(((((((.........))))))).....(((.......(((....))).....)))....(((.((((((((...(((((....(((((((....(((......((((........)))))))........))))))).......)))))..))))))))..))).(((((((((....))).......))))))............(((.(((.....))))))...)))..))))))....)))))))))((((.....))))((((((.((((.(((........)))...)))).)))))))))))....))).)))))))).))))))).)))))...(((((.......))))).....((((......))))..((((....((((((......(((........)))....((((......))))...))))))....[[[.....)))).(((((((((....))))))))).]]]....
|
|
CRW_00428
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGUCUGGUCCUAGCCUUACUAUUAAUUCAUAACAAAAUUACACAUGCAAGUAUCAGCACACCAGUGAGAAUGCCCUCUAACUCUUAUAGAUCAAAAGGAGCAAGCAUCAAGUACACACAGCCCUUACAGUAGCUCAUAACGCUUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCAAUAAGCGAAAGCUUGACUAAGUUAUGUUAUUAUAAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCAACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGUUAUCGGCGUAAAGCGUGUUUAAGACACCUAGACAAUAGAGUUAAACCCUUACUACGCUGUAAAAAGCCUUAGUAGGACCAUAAACCCUUCAACGAAAGUGACUCUAAUUUAUCUGACUACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACUAAAACAGUUCACAAACAAAACUGUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUACAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAUACCUCACCACCCCUUGCUAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAGACCCUAGUAAGGCACCACAGUGAGCACAAUAACAUACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUAAAGAGCAAAUACAAAAAACUUAAUGAAACAAUUUAAGACUAAGGUGGAUUUAGUAGUAAGCUAAAAAUAGAGAGUUUAGCUGAACCAGGCCAUAAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCAAUUAUAAGCGCCACAUAAACUAAAACACAUUAAUUCAGUAGCAACUAUAUAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAACAUACUGGAAAGUGUGUUUGGAUAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..((............)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).))))))))))....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[.....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((.....)))))....(...((((((((.........))))))))..).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.....................................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...(((...(((((((((...((((((((((..........((((..((((.........(((....)))....((((((.....(((...))).....))).))).))))..........(((((((((.((((((..(((((...(((((........(((....))).(((....))).(((...))))))))(((((....))))).....))))))))))).)))))))))))))...(((((((.........)))...))))........))))))))))(((((..(((....(((((...))))).((((...(((((((.....(((((((.(((......)))..)))))))..........(((......))).))))))).....))))..))).))))))))))))))....(((((..(((........)))..))))).))).......(((((((.........))))))).(((.((((......(((....)))....))))....(((((((((((((((((..(((((...)))))((((((((((((.(((........))))))).....(((((((..((((.....((((....................((((.........(((....))).......((((............)))))))).)))).))))....))))))).........(((((.((((((((......(((...(((......(((((.........)))))((((((.....)))))).))).))).....)))))))).)))))))).)))))..))))))))............)))....((((((...((((..............(((......))).............))))...)))))).)))))).......)))(((((((((....))))))))).......
|
|
CRW_00429
|
[ FASTA input ]
|
AUAAAGUUUUAUUUUGGCUUAAAAGUUUGUUAUUAAUUUGAUUUAUAUGUAAAUUUUUGUGUGAAUAUUUAAUAAUUUAAAAAAUUAUUAAAUUUAUUAUAAUCGCAGUAAUUAAUUUUAUUAGUUAAAGAAAUUUAGAAAUAGCAAUAUUAAAGAGUAUAGAUUAAAUUGGUGCCAGCAAUCGCGGUUACACCAAUUAUACAAAUGAAUUUUUUUAGUAAAAGUUAAAUUGGUUUAAUUUAAAUAUAAUUAAAUUUAUUAAGUGAAAUUUUAAAUUUAAAAUUUUUAUUAAGUGAAUAAUUGAAACUUGAAAAUUUUAAAUAAAAACUAGGAUUAGAUACCCUAUUAUUUAAAAUGUAAAUAUAAAUACUUAAGUAGUAAUAGUUAAGUUCUUGAAACUUAAAAAAUUUGGCGGUAUUUUAGUCUAUCCAGAGGAACCUGUUUUGUAAUCGAUAAUCCACGAUGGACCUUACUUAAGUUUGUAAUCAGUUUAUAUACCGUCGUUAUCAGAAUAUUUUAUAAGAAUAUUAAUAUUCAAUAAUUUUUAUUAAAAUUUAUAUCAGAUCAAGGUGUAGCUUAUAUUUAAGUAAUAAUGGGUUACAAUAAAUUUAUUUAAACGGAUAAAAUUAUGAAAAAAUUUUUGAAGGUGGAUUUGGUAGUAAAAUUAUAAAGAUUAAUAAUUUGAUUUUAGCUCUAAAAUAUGUACACAUCGCCCGUCGCUCUUAUUAUUAAGGUAAGAUAAGUCGUAACAUAGUAGAUGUACUGGAAAGUGUAUCUAGAAUGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((..(((.(((..........(((....(((((((((((...))))))))))).....)))....)))))).).....(.(((..(((((....))))).)))).))).)))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))...(((.....((((.((........((((..((..(((((((((..((......)).))))))))).)).((((.....))))...)))))).))))...((((((....(...((((.........))))...))))))).............))).(((......((((.....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((.........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).....)))))).....((((....))))...))))).)))...))))))))....))))))).)).))))))))))...((.....))....(((((((((((.......))))))))))).....))))).....((((((((......))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((.....))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((((........))))).)))))((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((((((...)))))))))))..))).....))))).((((((((...)))))))).)))))))))..((((....)))).....)))))))))))))))))).........(((((..((((..((((....))))....(((((((((((((((...((((.....(((....)))..((((((.(((((((((((((((....)))))))))..((((((...........))))))..(((((((((((....((((.........)))))))))))))))............((((((..........)))))).......)))))).))))))((((((((....((((((((((......)))..((((.....)))).....))))))).((((........)))).........))))))))...))))(((((((.(((....)))..)))))))..)))))))))))))))...........(((((((((((((((((((.....))).))))))))))((((.(((((((....))))))).))))........)))))).))))..(((((.(((.........((((((((....)))))))).))))))))..........))))).......(((((((.....)))))))..........(((..((((((((((....))))))))))..))).
|
|
CRW_00430
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUUAUUAGUUGUCAGUAAGAUUAUACAUGCAAGUAUCCGCCAACCAGUGAAAAUGCCCUCAUACUCGUCCACUACAAACGAUCCCAAAGGAGCCGAUAUCAAGCACACCCACGGUAGCUCAAGACAUCUUGCUCAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUAGUAAAAAUUAAGCAAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUACUGAUUAGGGUUGGUCAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACCCAAAUUAAUGAUUAAACGGCGUAAAGUGUGGUUAAACACUUACCAAUGUAAAUAAAGUUAAACUAGCUCUCAGCUGUAAAAAGCUAAAGAUCUAUGGUAAAUAGACUAUUAAUGUAACUUUACUUAUAGUGAACCCACGAUAGCUAAGAUACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCGUAAACUUUGAUAAUUACUAACAAAAAUAUCCGCCAGAGAACUACAAGCCACUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUACCCCCUAGAGGAGCCUGUUGCAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCCUACCAUCACUUGCUAAAUCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAUAAGGAACAAUAGUAAGCUUAAACGCCCCCGCAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGUGAUGGAAAACAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAACACACGAACUCUUAUAUGAAAUUAUCAGAUAAAGGAGGAUUUAGAAGUAAGCCAGGAAUAGAGAGCCUGACUGAACUUGGCUAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUGUUUAAGACUAACAACCCUAUUACACUAAUACAAACAUAAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAGUAUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....((((.........))))......))).)).(((..(.(((..(((...))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).....(((((.....((((....(((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((................................))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((........(((((((((.(((((....(((((..................((((........))))..((((.........))))(((....)))((((..((((.....((((...((((((((((....))))...)))....(((....))).)))..(((((.....((((......(((((....)))))....)))).)))))....)))).((((((((..(((...(((.....))))))..))))))))........))))....))))...((((((......))))))....)))))..((((((((...(((.(((.((((......))))..)))(((((.....))))))))......))))))))))))).(((....))))))))))))........)))))))))))).........(((......)))..)))))......................(((.(((......((((....))))....)))....(((((((((((((((((((...(((((((.(((((((((....((((........))))........(((((((..(((.....)))...(((((((((......(((....(((....)))...........)))..((((............)))).)))...))))))......)))))))....))))))))).....((((.....))))........))))....(((.....))).....)))...(((....)))..((((((..(((.........)))..))))))))))))))))............)))....((((((..((((((..............(((((...))))).))))))..)))))).)))))).......)))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00433
|
[ FASTA input ]
|
UACAGGUUUGGUCCCAGCCUUUCUGUUAAUUUUUAAUAGAAUUACACAUGCAAGUAUCCACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAAAUCACCCAGAUCAAAAGGAGCGGGUAUCAAGCACACCAUACACCGUAGCUCAAAACGCCCUGCUCAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGACCAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGCCAUAUUAACCAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACUCAAACUAACAGAAAUACGGCGUAAAGCGUGUUAAAGAAUUAAAAGUACAAAUAAAGUUAAAUUCUAACUAAACUGUAAAAAGCCCUAACUAGAAUAAAAAUCUACUACAAAAGUGACUUUAACAAUACUGACCACACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUCCAAAAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCAUACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAACCCUUGCUAAUCCAGUCUAUAUACCGCCAUCUCCAGCAAACCCUAAAAAGGACUAAAAGUAAGCUCAACUAUUACACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGGGCUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAGAACAAGAACACAACCCACCCGAACGAAAACUCCUAUGAAAGCUAGGAACUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUCAAGAGUAGAGUGCUUGAUUGAACAAGGCUAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAACACAAACCCAUAAACAUAAUAGCUAGACAAAACCAAAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGACAAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))...............(...((((((((.......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((......................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((.......(((((((((...)))))))))..........................((((..[[[[[[......))))................]]]]]]....................(((.........[[[[[.)))....(((....)))....]]]]]..............................)))))))))..........(((.[[[[....)))......]]]].(((.((((......)))).............[[[[[[))).....]]]]]]...((((((..((((....((((((((.((((((.......................))))))..................))))))))....))))............((((((.((((...))))..(((........)))..))))))............)))))).....................((((......(((....)))....))))....(((..((((((((((((((..(((....))).((((((((....((((........))))...............((((((((((......((((((.........(((....(((....)))(((...)))..)))......(((....))).(((.....)))..)))))).(((.((((.((((.................((((......)))).....)))))))).........(((((.......))))).....))).))).)))))))..(((((((.........))))))))))).))))))))))))........)))))).)))...((((((..............................................)))))).................(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00434
|
[ FASTA input ]
|
CAAGGGUUUGGUCCUGGCCCUUCCAUUAGUUACUAAUAGGAUUACACAUGCAAGCCUCCGCAUCCCGGUGAAAAUGCCCUCUAAGUCAUAACUGACCUAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACAAAAUGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAGCCACACCCCCACGGGCUACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCCAUGAAUGAAAGUUCGACUAAGCCAUAUUAAAUCAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGCCAUACGAUUAACCCAGACUAAUAGACACACGGCGUAAAGCGUGUUCCAGAAACAACCUACCACUAAAGUUAAACCUUAACUAAGCCGUAAAAAGCCACAGUUAACAUGAAAAUACAACACGAAAGUAACUUUAAUACCCCAACUACACGACAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAAUCUAGAUAGUUAACUUAACAAACCUAUCCGCCAGAGAACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCACCUCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAAGGAAUAACAGUAAGCAAAAGUAUCUUAACAUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAACCCAUGAGGUGGAAAGCAAUGGGCUACAUUUUCUACACAAGAACAUCUUACGAAAGUUUUUAUGAAAUCAAAAACUAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAGCUGAGAAUAGAGCGCUCAGCUGAAUCGGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUACACAAACCCAAACAUAACCUAUUAAAAUCACACUUAAUACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUAAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....((((....))))....))).)).(((..(.(((..(((...))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).....(((((.....((((...((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((.......................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((........((((((((...))))).)))..................((((...[[[....)))).((....((((....))))....))((((((((....((((((.....))).)))......))).))))).]]].......(((.[[[[......)))..........]]]]..((((....)))))))))))))............((((((......[[[[[))))))..]]]]]...(((((((..............(((..((((((((.....((((.....))))...)))......((((((...))))))..)))))..........(((((((.((((..(((.........)))..))))...................((((((.((((...))))..(((........)))..)))))).(((....)))...)))))))...........(((....(((.......(((....))).....)))...)))...((((((((((((...(((.......((((..(((((((.((((........))))....(((.((((((((((((..(((............................(((....))).......))))))))......((((((........))))))....(((...)))...)))))))..(((.....((((.(((((((....((((...)))).....(((((((........)))))))...))))))).)))).....)))))).))))))))))).........)))...))))))........)))))).)))...((((((........................((((((........))))))...))))))...))))))).......(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00435
|
[ FASTA input ]
|
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCCCCUGGCAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGCCCCGGUGAAAUCGCCCUUCAAAUCACCCGUGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACGCAGUAAUGCAGCUCAAAACACCCUGCCUAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGAUAAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUGCCAACCCAGGGUUGGUCAACUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCCAGUUAAUAGAGCCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUUGCUCCCUAAUAAAGCUAAGCUCCAUCCAAGUCGUAAAAAACUCUGGCUGCUAUAAAAUAAACUACGAAAGUGGCUUUAACACCUCUGAAUACACAAUAGCUGAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUCAGCCCUAAACUUCAACAGUCAAAUCAACAAGACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCAACAGCUUAAAAAUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCACACCCCCCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAAUCGAUAAACCCCGUUCAACCUCACCAUCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGACAAAGGCUAUAAAGUAAGCACAAACACCCACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGAUGGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUAUGCCAGAAAACCACGAUAACCCUCAUGAAACUUGAGCGGUCGAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAACAAGGCCCUGAAGCGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUAUUUCAAGGAACCCCUAACUAAAUACUCCACGCAUCUAUGUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACAAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....((((....))))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((.......((.((((..((((((((((..(((((((((.....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).....(..(((((((((.......)))).)))))..).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((...((.......................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..((((......))))(((.((((((((((...(((((......(((.(((.......((((....((((.......((((...((((....))))...)))).(((((.....(((..(((....))).)))........))))).......))))....)))).....)))))).........((((..(((((....))))).....))))))))).....(((((((((....(((((........)))))......)))))))))..))))))))))...)))....(((((...((((...[[[..))))...]]]........................))))).(((((((.....((((((((....)))).)))).....(((((..........[[[[[[.((((...)))).)))))............]]]]]]............(((((..........)))))...(((((........((((....)))).........[[[..)))))((((.....))))..]]]..........(((((...((((......((((((........(((((((..(((..((((.((((..(((....((((......))))....))))))).........................(((.....))).))))..)))....))))))).....)))))).....((((((.....))))))...)))).(((((((.......)))).)))......))))).)))))))..............((((((..........[[[....)))))).........]]].........................(((....))).((((....((((..(((....)))...))))....[[[......))))(((((((((....))))))))).]]]....
|
|
CRW_00437
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCUGGCCCUACUGUUAAUUGUAAUUAGACCUACACAUGCAAGCUUCCACAAUCCGGUGAGAUAUGCCCUACAGAUUACUUACCAUAAUCGUUAAGGAGCGGGCAUCAGGCACACCACAGGUAGCCCAUCACGCCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGACUAAUAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAAUCAUAAUUAAAUCAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCGCCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGUUAACAGAAAACCGGCGUAAAGCGUGUUUAAGCACAAACCUACAAAUAAAGCUAAGACGCAACUAAGCUGUAAUACGCUAUAGUCAACAUUAAAAUACACUACAAAAGUGGCUUUAAUACCGCUGAAGACACGACAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUCAGCUUUAAACCAAGAUAAUUAAACAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCAAUCGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGUCCUAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCACGAUACACCUCACCCCUUCUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCUGGCCCCAACACGGGUAAUAAAGCAGCAAGAUUACUCAACCGUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAGGGGGAAGCAAUGGGCUACAUUUUCUAAAUUAGAACAAACGAAUUAUCUUAUGAAACCUAAGACAUAUGAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAACAGGCAAUAGGACGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCGAUAAAACUGGAUAAAUAACUAAUAACUCCGAGCACAAAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGAACAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((......(((((....(((.........))).....))).)).(((..(.(((..(((...))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((.............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<.....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..((((.((((.....))).......))))).....(((......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((.......))))..))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.........................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[[)))....(((........)))....]]]]...........(((((....(((.[[[[[)))................]]]]]...........)))))((((....[[[..(((...))).)))).((((....((((........(((....)))....))))))))..........]]].(((((....)))))................(((..((((((((.......))))))))[[[[.))).......(((((....)))))........]]]](((.[[[((((....)))).....))).......]]].....(((....[[[))).....]]]...(((...((((((...((((.....))))..))))))...[[[[..)))....]]]].............(((..[[[...)))..]]]((((...((((.......(((((((.........)))))))....)))).......))))..((((..........[[[[[..))))..]]]]].......((((.....(((((((((((.((((........))))........(((((((.(((...((((.(((....(((.....(((..((((((((......)))).......))))....((((......))))..)))...)))..))))))))))...)))))))......))))((((.(((((((.((((..........)))).(((((.......)))))........))))))).))))....(((((((.........)))))))..)))))))..))))..(((.......)))........((((((........((((...............))))..........))))))............(((.((((((((((....))))))))))...)))
|
|
CRW_00438
|
[ FASTA input ]
|
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAACCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACAGAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....((((((..((((.....))))..)))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((...............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((.......((.((((..((((((((((..(((((((((.....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).....(.((((((((((.......)))))))))).).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((((.((((((((...((.......................................))..))))))))..))))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((..((((((.(((.(((((((.....((((((.((((((...(((((((......(((((.(((....))).......(((.....))).....)))))........(((..(((....))).)))......))))............(((....))).....)))))))))......((((..(((((....))))).....)))))))))).....(((((((((......(((...(((.....))))))..))))))))).....)))))))...))).....(((((((((((.....................))))))).....((((((((...........(((((...........((((....)))).((((((...((((....))))...((((((.((((...))))..(((........)))..))))))..............)))))))))))......(((((...........))))).))))))))..))))..)))))).....((((((((....(((....)))..(((((((....((((........))))........((((((.......(((((((.....(((((((((((......))).....(((((((..............(((.((((....))))..))).....)))))))...)))))))).....)))))))...((((((.....))))))........(((((((.......)))))))...))))))(((....))).(((((((.........))))))))))))))....))))))))......)))..((((....((((((..(((((......(((...(((....)))...))).......))))).)))))).....[[[[...))))((((((((((....)))))))))).]]]]..
|
|
CRW_00441
|
[ FASTA input ]
|
UAUAGGUUUGGUCCUGGCCUUACUAUUAGUUUACAGUAAGAUUACACAUGCAAGUAACCGCAUCCCAGUGAGAAUGCCCUCCAAAUCCCCUGAUUAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCAAUAGGUAGCUCACCACACCUUGCUAAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUUGAACUUAAGCAAUAAACGAAAGUUUGACUAAGCUAUACUGACACUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUAUUUCCCGGCGUAAAGUGUGUUUAAGAUUUAUAUAAAUAAAGUUAAUUUUUAUCCAAGCCGUAAAACGCCCCAGCUAAAACAAAACUAACCUACGAAAGUGACUUUAAUACUCUGAAGACACGACAACUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCGUAAACCUAAGUAAUUAACAAACAAAAUUACUCGCCAGAGCACUACAAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCACUUCUUGCUAAUUCAACUUAUAUACCGCCAUCCCCAGCAAACCCUAUUAAGGCCCCAAAGUAAGCAAAAACACAUACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGUCAAUGAAGUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUAUUAGAACAACACCCCAACAGAAGCCUUUAUGAAACUAAAAGCCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAGGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAUCACCAAUUAUUAAUUCACUAAUUCUACUAAACUCUAAACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAAUAUUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((....)))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))......((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((..........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....)))))))))....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.....))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))...........(..(((((((((......)))))))))..).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((............................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
....(((..(((.[[[)))..))).........]]].....((((..[[[[..))))..]]]]......(((.[[[[[))).......(((.......)))....]]]]]..(((..(((....))).))).........(((((........(((....))).......(((......)))..)))))(((((....))))).(((((......[[[[.)))))((((((((.......))))))))......]]]](((((((....................(((((.........((((..(((((....))))).))))..(((((.......))))))))))............................(((.(((((......))))).)))..........(((.....[[[[....)))..]]]]...(((((((........))))))).................(((....)))......((((....))))...........(((..(((((((((((((..((((.......((((((((.....((((........))))........((((((((((((......((((.......................(((....))).....)))).))))).......(((((...(((.....)))...)))))......))))))).....)))))))).....(((((....)))))..............((((((((((....(((((.............))))).............)))))).))))........))))..)))))))........)))))).)))...((((((............................................))))))...))))))).......(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_00442
|
[ FASTA input ]
|
AAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUAGUUAGUUAGAGGUAGAGUUACACAUGCAAAUCUCUAUAAACCAGUGUCAAAUCCCUAGGUUUUACUUUAAACCCUAAGGAGAGGGUAUCAAGCACAUACACAUAUAUAGCUAAAGACACCUUGCCUAGCCACACCCCCACGGGACUCAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUUAGUCAUACCUCAUCAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAACUAUUCUCCGGCGUAAAAUGUGUUUUUAUUACGAACAUAAUAGAAUUAAAACCCAACUAAUAUGUGAAAAUUCAUUGUUGGACUUAAAAUCAAUAACGAAAGUAAUUCUAAUUAUAUUAAUACACGAUAGCUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUAAGUGAUUAAAUAACAAAAUCACUUGCCUGAGAACUACUGGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUACUUUAUAUCCAUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGUUAUACCUUACCACCCCUUGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCUUAAAAAAGAACAAGAGUAAGCAAGAGAAUACCCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUGGGCUGGGAAGUAAUGGGCUACAUUUUCUUCUAAAGAACAGUUACGCUAUCCUCUAUGAAACUUAGAGGACAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAGAGCAAUGAAGUACGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUUAAGCUAACUGUUAACUAUACCUAAUAUUGACUCAUAAACUUAUGAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....))).....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).)))))))))).....(((((.....((((....(((..........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....)))))))))....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[.....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))......(...((((((((.......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..................................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((.....(((..((((((((((.((((((......(((.(((................(((.........((((.((((...)))).))))(((.((((......(((..(((......))).))).......)))).)))...))).(((....))).....))))))......((((((...(((((....))))).))))))..))))))....((((((((......((((...(((.....)))..)))))))))))).)))))))))).....)))(((...(((((((.......))))))).((((((((....(((((......((((....)))).))))).(((..............)))))))))))..........)))..(((.[[[[[[))).....((((.........)))).....]]]]]].))))))))((((((((.........))))))))(((((((.....(((....))).......)))).[[[[[..)))(((.(((((........)))))..))).]]]]].................................((((((.((((............................(((....))).....)))).)))))).................(((((((.((((((((((((((..(((....))).)))))))))))))).........((((((((.(((.(((((((.......)))))))...((((((.((((((.....))))))........((((.((((.......)))).))))(((...........)))...)))))).......)))))))))))......))))))).....(((....[[[[[[..)))...]]]]]]..........((((((((((....))))))))))..
|
|
CRW_00443
|
[ FASTA input ]
|
AAAGGUUUGGUCCUGGCCUUAUAAUUAAUUAGAGGUAAAAUUACACAUGCAAACCUCCAUAGACCGGUGUAAAAUCCCUUAAACAUUUACUUAAAAUUUAAGGAGAGGGUAUCAAGCACAUUAAAAUAGCUUAAGACACCUUGCCUUAGCCACACCCCCACGGGACUCAGCAGUGAUAAAUAUUAAGCAAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUACCUCUUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUUAUCUUCGGCGUAAAACGUGUCAACUAUAAAUAAAUAAAUAGAAUUAAAAUCCAACUUAUAUGUGAAAAUUCAUUGUUAGGACCUAAACUCAAUAACGAAAGUAAUUCUAGUCAUUUAUAAUACACGACAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCAUAAACCUAAAUAAUUAAAUUUAACAAAACUAUUUGCCAGAGAACUACUAGCCAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUACUUUAUAUCCAUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGCUCUACCUCACCAUCUCUUGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGUAUUAAAGUAAGCAAAAGAAUCAAACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCAAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUUAUAAAAGAACAUUACUAUACCCUUUAUGAAACUAAAGGACUAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUUGAGCAAUGAAGUACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUUAAAUUAAACUUAACAUAAUUAAUUUCUAGACAUCCGUUUAUGAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAAUAAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((......(((.....)))....))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((....))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))....(((((.....((((.....(((..........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).......(.((....)))))))))......)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[.......))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....))))).....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((................................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.......))))))...........(((((....[[[[[[......))))).........]]]]]]..............(((((.......(((((.((((.....((((...........))))......)))).)))))......(((....))).......))))).........(((..(((((....))))).[[[[))).......]]]]((((((......[[[[[))))))..]]]]]...(((((((....................((((.....(((((....(((((((.......((((((((...((((((......((((....)))).))).)))....................))))))))...)))))))..)))))...((((((.((((...))))..(((........)))..))))))........(((((......)))))...........)))).(((.......(((....))).....)))....(((..(((((((((((((.(((.......)))....(((.(((.....))))))....(((((.....((((.((((.....((((.....(((((((((.((((........(((....)))(((....))).....))))....(((........))).)))...)))))).....)))).....)))).))))(((((...(((((....)))))...........((((((......))))))..((((.....)))))))))..........))))).(((((((...))))))).)))))))........)))))).)))...(((((((((((((.(((.........)))))))))).(((((....)))))...))))))...)))))))......((((((((((....)))))))))).......
|
|
CRW_00444
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUCCUAUUGAUUAUUAACAGAAUUACACAUGCAAGUCUCUACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCCAAAUCUAUAUGUUGAUUAAAAGGAGCGGGUAUCAAGCACACUAAAUUAGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGCCAUGUUAACAAAGAGCUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAGCCCGAAUCAAUAGGCAAACGGCGUAAAACGUGUUAAGGAUUAUAUUAUAUUAAAGUUAAAAUUUGACAAGGCUGUAAAAAGCUACUGUUAAUAUAAGAUAAACCACGAAAGUGACUUUAUUACUUCCAUCAACACGAUAGCUGAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUCAGCCCUAAACAUAAAUAAUUAUCACAACAAAAUUAUCUGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUACAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUCACCACUUCUAGCUUAAUCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAGGGAAGAAAAGUAAGCACAAUAAUAUUACAUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGAAGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAACCAAGAACACACUCACGAAAGUUUUUAUGAAAACUAAAAACUAAAGGUGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAGGGCCAUAAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAACACACUCAAAUACUACAUAAUAAAAGUAAACCUAAAGCAAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGGUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((........)))....))).)).(((..(.(((..(((.....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[......))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))........(...((((((((.......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((......................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((...(((.....))).(((((........))))).....(((..((((...........)))).)))...))))))))...(((((........((((((((....(((..((((...)))).)))......))).))))).......(((....)))...)))))(((((((.......(((.(((((....))))).....(((.............(((((((.......)))))))......(((..........)))..........)))....)))......((((((..(((.....(((((((((.(((((...)))))..((((......))))....)))))))))((((((.(((....)))..))))))...)))...))))))...((((((.((((...))))..(((........)))..))))))...............)))))))..........(((....(((.......(((....))).....)))...)))...(((((((.....))))......[[[[.)))...((((...(((........)))))))]]]].(((((((..(((((.....(((......................((((...)))).)))....))))).......(((...))).......(((((.........))))).)))))))(((((..[[[......)))))...]]]........(((.....((((((((.......)))))))).......((((((....)))))).......))).((((...[[[...[[[[....))))...........]]]].]]]..((((((..............................................)))))).................(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00445
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUUUUAUUAGUUUAUGAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCCCUACGGUGAAAACGCCCUUUAGCCUUUACAAGUCAAAAGGAGCUGGUAUCAAGCACGCCAAUUUAAGGCAGCUAGUGACACCUUGCUUACGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGAUAAAAAUUAAACCAUUAACGAAAGUUAGAUUUAGUUAUAUCAUUUAUGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCUAAUUAAUAAAAAACCGGCGUAAAAAGUGUCAAAGUGUAUUUAAAUCAAAUAAAAUUAAGCCCUAAUCAAGCUGUAAAAAGCCUCGAUUAUAGUAAAAAUAAACUAUGAAAAUAAUUUUAAUAAAACCCACACACGAUAGCUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCUUAAACCUAAAUAAUUAAUUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAAUAGCUUGAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAAACGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUCCUAGCUAAUGCAGCCUAUAUACCGCCAUCCUCAGCAAACCCUAAUAAAGGAACCAUAGUAAGCAAGAUCAUUGAAACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGAUUGGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUAAAACAGAAUAAGACGAAUACCCUUAUGAAAAUAAGGGUUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGACAAGAAUAGAGAGCUUGACUGAAUUAGGCCCUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCAAAUUUCCAAAAAACAGUAAAUAUAUUAAUGAAUAACAAGAAUGAGAAGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAGGUGUGCUUGGAUAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((...))).....))).)).(((..(.(((..(((.......))).))).....))))..((....))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((.....))).......)))))).....(((......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((.................................))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((.(((((..((((((((.....))))))))............(((......(((.((((....))))...)))....)))............))))).))))))).((((((((((((((((((((((((((.....(((((((...(((....))).(((...(((((((..(((((((...(((((....))))).))))))).)))))))....((((((((.......))))))))......)))....(((((....)))))...........)))))))...))))).....((((((((......((((((((............(((......))).....(((((((........)))))))...))))))))......((((.....(((.......))).....)))).))))))))...)))).)))..))))))))(((.(((((((..........))))))).....((((......(((....)))....))))..)))..))))))((((((((....((((((((((((((((((.(((.....))).................(((((((.(((((............((((.....(((.(((....(((.....)))............(((.....)))............))))))....)))))))))...))))))).....)))))))....))))))...................((((((((....))))))))....)))))....................(((...[[[[[[)))..]]]]]]..))))))))...................((((((..((((...........(((.....)))...........))))..)))))).................(((((((((....))))))))).......
|
|
CRW_00446
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGCUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAGCCCUUAGUAGGAUUACACAUGCAAGUAUCCGCAUUCCAGUGAAAAUGCCCUUGAAAUCAACCAUGAUCAUAAAGGAGCGGGUAUCAAGCACACCACACAGUAGCUCAUGACACCUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCAAUGAACGAAAGUUUGACUAAGCCAUACUACCCCAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGUUAAUAGAUAUACGGCGUAAAACGUGUUAAAGAAUAAACUCCAAAUAAAGUUAAAAUUAGGCUGUGCUGUAAAAAGCUCCAGACAAAAUGAAAAUACACAACGAAAGUGACUUUAAAAUAUCUGACAACACGAUAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUAGAUAGCCACACAACAACGCUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACACCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAACCCUUGCUAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACCAUAGUAAGCAAAACUAUGUAACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGGGUUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUAUAGAACACUUUAACGAAUAUUCCCGUGAAACCAGGAAUGGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUUAGGCCCUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUACCAACACACAAUUAAUUAAACCUAUUAACAAAUGUGCACACAUAUGAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCGUACUGGAAAGUGCGCUUGGACAAAUCAAAGU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....((((....)))).....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((............((((((((..((((((((..(((......)))....))))).))).)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.....))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((..........................................)))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((..(((..[[[[[[[[)))..]]]]]]]]...(((.(((..((((((........(((.......((((...((((....))))....))))...((((.((((((.............)))..))).))))........))).........)))))).))))))................((((....))))))))))))).....(((....((((((((.......))))))))..[[[)))......((((((....)))))).........]]]......(((((........((((........)))).......(((((((((......)))..((((.....((((....(((.......)))..)))).....))))........))))))..)))))....((((.[[[[....))))(((....)))..]]]].(((.((((((...........))))))[[[[[((((......(((....)))....))))..)))...]]]]](((((((....((((...))))....(((((((((((((........))))........(((((((...........(((((......................(((....)))...((((((.......))))))..............))))).[[[[[[[[[[[[[[)))))))......]]]]]]]]]]]]]]....))))))))).....(((..[[[[[[))).......]]]]]].....(((.((((((....(((((((.........)))))))..)))))).))))))))))...................((((((................(((((.......)))))...((((....))))....))))))....(((.......[[[(((((((((....))))))))).)))..]]].....
|
|
CRW_00447
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUUAUUAAUUAUUGCUAGUCCUACACAUGCAAGUUUCCGCUGUCCGGUGAGACAUGCCCUGAGAGCUCUAAAUUUUUUUAAGCCUACAGGAGUUGGUAUCAGGCACGCUUAAUGCGGCCCAUGACACCUUGCUAAGCCACACCCCUACGGGUUGCAGCAGUGACUAACCUUGGGCCAUAAACGAAAGUUCGACCAGGCCAUAGUAAUUACGGGCUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAGCCCAAAUUAAUGAUCAAACGGCGUAAAGCGUGUUUAAGCUCUAUCAACAAUAAAGUUAAUACUAGACUAGACUGUAAAACGUAACAGUCAGGUAUAAGGUACACGACUAAAGUGACUUUAGCACAGCUGAACACACUACAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCAUAAACCUAGAUAGCCUAUAAACAAGACUAUUCGCCAGAGAACUACAAGCGAGCGCUUAAAACUCAAAAGACUUGGCGGUGCCCUAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUUACCUUUUCUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCCUACCCCAGUAGAGAAAAAGAGUAGGCGUAAUAAUUAACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAGAUGAAAAGGCAAGCAAUGGGCUACAUUUUCUAAUUUAGAAGACACGGAUUAUCUUAUGAAAUCUAAGAUAUUAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCCUAAUUGAAACAGGCGAUAGGGCGCGCACACACCGCCCGUCACUCUCCUCAAUAAGCACUCAAAUUUAAAUAAAACAAAUAGACAAUAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGCGUACUGGAAAGUGCGCUUGGAAUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((......(((((....(((.............)))....))).)).(((..(.(((..((.....)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[.....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((.......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((........................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((...((((.........((((((((............(((.(((((.(((....)))))))).)))((((...(((.((((....)))))))...))))(((.(((.((((((.(((.....))))))..))).)))..))).......((((....))))...))))))))........))))....(((....))).)))))))))............((((((((.......)))))))).....((((((.......[[[.......))))))....]]]....(((.[[[[...))).....]]]]....((((.[[[[[.)))).((((((........)))))).]]]]]................(((..[[[[[)))..]]]]].........((((((.......[[[[[..(((........)))..))))))......]]]]]....................(((......)))........(((..[[[....)))..]]].......((((.[[[.....))))...]]].(((((((.....((((........))))........(((((((((((...((((.(((......((((.........((((....))))............))))(((...)))(((.(((.....))))))..)))))))))))..)))))))....(((((((((.....((((((((((............(((((((.......)))))))(((((.....)))))...)))))).)))).....))))).)))).)))))))....(((((.........))))).....(((((((........................................)))))))................(((((((((....))))))))).......
|
|
CRW_00448
|
[ FASTA input ]
|
AUAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGUUGACAGUAAAUUUAUACAUGCAAGUAUCUGCCUCCCAGUGAAAUAUGCCCUCUAAAUCCUUACCGGAUUAAAAGGAGCCGGUAUCAAGCUCACCUAGAGUAGCUCAUGACGCCUUGCUAAACCACGCCCCCACGGGAUACAGCAGUAAUAAAAAUUUAGCAAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUACUAUAACUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGUAAUACGGCGUAAAGCAUGAUUAGGGAAUAAUAUAAAUAAAGUUAAAUGUAAAUCAAAGCUGUAAAAAGCUCCUGAUUAACUUAAAAUAAAACACGAAAGUUACUUUACCACUCCUGAAUUCAUGAUAGCUAGGAUACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCAUAAACUUAAAUAUUUCUCAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACAAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCAUCUAGAGGAGCCUGUUAUGUAAUCGAUAAACCCCGAUAUACCUCACCAUCACUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUACAAGGAAUAAUAGUAAGCCAAAUUAUUACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCAAUGUGAUGGCAAUAAAUGGGCUACAUUUUCUAUUUUAAGAACAUAUCCCUACGAAAACCCAAAUGAAACCAAGGCUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAACUACUAGUAUUACUAAAAAUAUUUCACUACAUAAACGUACUAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAUU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((......(((((....((((.....))))....))).)).(((..(.(((..((.....)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((...((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))..........(...((((((((.....))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((............................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((.......)))))))......(((((..(((......)))......(((((((..(((((((.........(((...(((((.....)))))...))).....(((((..((((.....))))((((....(((((((((((((.....(((....))).(((....))).......)))))))).((((....))))((((.((((((...))))))..((((((((.......)))))))).....)))).(((.(((((......))))).)))....)))))....(((((((((((.............(((((((.......(((.((((......))))..))))))))))....((((.............))))....))))))..)))))..))))..)))))..))))))).))))))).....((((......))))..............)))))..(((((((((((.(((......((((....))))....)))....((((((((((((((((((.(((.......)))((((.....(((((((........)))).)))(((.((((...((((((.((((.....((((((...((((..(((....(((....))).....((((((......))))))..........)))))))...)))))).....)))).))))))...))))(((((...((((......))))(((..................)))..........((((......)))))))))............)))..............)))).)))))))))............)))....((((((.......((((((......))))))....(((......)))...)))))).)))))).......)))(((((((((....)))))))))))))))))
|
|
CRW_00449
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUACUGUUAGAUUUGAUUAGAUUUAUACAUGCAAGUAUCCGCAACCCAGUGAGAAUACCCUAAAAACUCUUAACAAGUUAGAAGGAGUAGAUAUCAGGCACACUAAAGUAGCCCACAACAUCUUGCCCUAGCCACACCCCCACGGGACACAGCAGUAAUAGAAAUUAGUCAAUAAACGCAAGUUUGAACAAGUCAUAAUCAAUAAGAGUCGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACUCAACCUAACAAAUAACGGUGUAAAACGUGUUUAAAAACUUAAACUAAUAAGAUUAAAGUAGAACUAAACUGUGAUAAGUCAUAGUUAAUACUAAAGCCAUCUACGAAAGUGAUCUUAGACUAAUUGAAUACACGAUAGCUAAGGUACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUCAAGUCGUUUAAUAACAAAACUACUCACCAGAGAACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUACACCUCACCAUCUUUUGCCACUACUGUCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCCAACCCUAAAAAGGAACAAAAGUAGGCGUAAUCAUUUUUCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUAAGAUGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUUAGAACAUACGAAAAACUCUAUGAAACUAGAGUAUUAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGCCAAGAAUAGAGAGCUUGACUGAACUGGGCAAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAUCAAGCAACACAAACAUUCCUAAAAUCCCAACGCUUUUCAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACCGGAAGGUGUGCUUGGAAUAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.......)))....))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((....))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.....))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....))))))).)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((...........................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((((((......)))))....))))))))))((((.[[[..))))..]]]......((((..[[[[[[...[[[[))))...]]]]...]]].]]].......(((...........)))..........((((.((((....(((....)))................((((((((..(((((....)))))...................((((((((......((((...(((.....)))..)))))))))))).............(((........)))((((((....))))))...((((((((.((((......((((((((....))))))))..)))).................))))))))))))))))............)))).)))).....((((.[[[[....))))(((....)))..]]]]...(((((((((....))).......(((....))).......(((....)))............))))))..(((.[[[[)))......]]]]....(((((((..((((........))))......................................(((((..........(((....)))..........(((.((((..((((....))))..)))).)))[[[[[[[[[[[[[[..))))).....]]]]]]]]]]]]]]......))))))).........((((.....[[[[[[.......))))..]]]]]]...............(((.[[[[[[.......((((...................)))).........)))..]]]]]].........(((((..........((((((.............))).)))........(((((((((....))))))))))))))...
|
|
CRW_00450
|
[ FASTA input ]
|
UAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUGUUAACUUUCAAUAGACUUAUACAUGCAAGCAUCCACGCCCCGGUGAGUAACGCCCUUCGAAUCACACAGGACUAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACACUCUUGUAGCUCACAACGCCUUGCUUAACCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUAACAAAAAUUAAGCCAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUCAUAUUGACCAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACCCAAGCUAACAGGAGUACGGCGUAAAGCGUGUUAAAGCAUCAUACUAAAUAGAGUUAAAUUUUAAUUAAACUGUAAAAAGCCAUAAUUAUAACAAAAAUAAAUGACGAAAGUAACCCUACAAUAGCUGAUACACCAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAAAUAAUUAUAAAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACCGCAACAGCCCGAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUACCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUCCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAAGGGACAAAAGUAAGCUCAAUAAUAACACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGGAGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCAAGAAAAUUUAAUACGAAAGCCAUUAUGAAAUUAAUAGCCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUCAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAAAUAUGAUAUACUUAAACCUAUUUACAUAUAUCAACCACACGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((......(((((....(((......)))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{......))..}}}}}}}.))).(((......(((....)).)....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((.....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((.....((((((((((((....(((((((((((((((.((((((((....(((....)))........((((..................))))...((((....((((((......))).)))......))))))))).......(((....))).....))))))...............(((((....)))))..)))))).))))))....((((((((.......)))))))).....(((((......))))).....)))))))))...)))....(((((((...(((.((((.........((((.(((....))).))))..............((((.......)))))))).....(((....)))....)))...))))....))).....)))))))(((..[[[...)))..]]].....................................(((((((((.((((...................))))....((((((((((((((((((..((((...)))).(((((.......((((........))))...............(((((((....((((.((((((.........(((...((((.....))))..........))).................(((.....)))..)))))).(((.(((..((((...(((((.....)))))....))))......(((......)))...((((......))))..))).))).)))))))))))..(((((((.........)))))))....))))).)))))))))............)))....((((((.........(((((((..((((....))))..))))))).........)))))).)))))).......)))(((((((((....)))))))))))))))..
|
|
CRW_00451
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUUUUAUUGUUUUGUAGCAACCUUACACAUGCAAGACUCCUCACGCCAGUGAGAAUGCCCUUAACAUCAAACUAGAUCAAGAGGAGCGGACAUUAAGCACACUAAUCAGUAGCUCAAGAUGCCUUGCUUAACCACACCCCCAAGGGAUACAGCAGUGAUAAAUAUUUAGCAAUGAACGUAAGUUUGACUAAGUUAUGCUACUUUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAAAUAUCCGGCGUAAAGCGUGAUUAGAAUAAACAACAAAAUAAAAUCAAAUAACAACUAAGCUGUAGAAAGUAAUAGUUGCAAACAAAAAUAAACAACGAAAGUGAUUUUAUACUCUUCGAACUCACGAUAGCUAAGGCCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUUUGAUAAUUUCAUAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACAAGCCAAAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCCGUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCCUACCACUCUUUGCCAACUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCGAACCCUAAAAAGGAGCAAAAGUAAGCUCAAUUACCACCGUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUAGAGUGGAGAGCAAUGGGCUACAUUUUCUACUUCAGAAUAUACGAAAGCCCUUAUGAAACUCUAAGGGCCAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGUGCUUAAUUGAACAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUGACAAAUAUUUACUUAUACCUAAUUACAUAAAUAGACAAGCAUAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGACAUUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((......)))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.....))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))....(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((.......................................)))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.(((....)))........[[[[[[[[..)))))).....]]]]]]]]..(((((....))))).....((((...(((......)))...))))...............................(((...[[[[[)))...........]]]]]...................((((((......(((.(((((((...(((((((((.......((((((((.......))))))))....(((.......(((((......)))))......)))......)))))))))...............((((((((......((((((.(((......)))..))))))........................)))))))).....))))))).)))...))))))........((((.[[[[....))))(((....)))..]]]].....((((((((.......)))))))).....(((........[[[[[..[[[....)))..]]]..]]]]]((((.....[[[.))))....((((....))))]]]((((........))))........(((((((...........(((((.....(((........)))............((((........)))).........(((....))).))))).[[[[[[[[[[[[[[)))))))......]]]]]]]]]]]]]]...((((......[[[....(((((((........)))))))....))))......]]]................((((((..........[[[....)))))).........]]].(((((.[[[[[[..)))))..........................................]]]]]]................((((((((((....)))))))))).......
|
|
CRW_00452
|
[ FASTA input ]
|
CAGAGGUUUGGUCCCAGCCUUCCUAUUAAUCCCUAGCAGACUUACACAUGCAAGUAUCCUCAUCCCAGUGAAAAUGCCCUCCAAGUCAAUAAAACUAAGAGGAGCUGGUAUCAAGCUCACACCCGUAGCUCAUGACGCCUUGCUCAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUCAUGCUAAUUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAGUUAAUAGGCACACGGCGUAAAGCGUGUUUAAGCACUAUGCCAAAUAGAGUUAAACUCCAAUUAAGCUGUAAAAAGCCAUAAUCAAGACGAAAAUAAAUAACGAAAGUAACUUUACAACCGCUGAAACACGAUAGCUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACAUAAAUAGUUAUAUAAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACCGGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUACCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCACCCCUUGCUAAUACAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAAAGUAAGCACAAUCAUUAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGGAGUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUCUAAGAAAACUCUUUACGAAAGUUACUAUGAAAUUAGUAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAAUAGAGUGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCAAAUAGGCACAAUACACUUAAAUUUAAUUAUACGUAUUAAUCAUAUGAGAAGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....))))).........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
..((((.(((....))).)))).............(((....[[[...)))..]]].............................................((((.....(((((((....[[[[[))))..)))......))))............]]]]]....(((.[[[[[.........))).(((((....))))).....]]]]]........((((((((.......[[[[[.(((.....)))......)))))))).........]]]]]..((((((.[[[((((....)))))))))).....((((...)))).......]]]......................................(((....)))..............(((.[[[[[[))).....((((.........)))).....]]]]]]..........(((((((..........))))))).(((.[[[[......)))...........]]]]....((((((((((((........((((((((((.(((((((((((...(((........))))))......((((.....(((.....)))...((((((...((((..(((....(((....))).......(((.............)))........)))))))...)))))).........)))).....))))))))...((((((......))))))))))........(((((((......)))))))...)))))).((((....))))(((....))).((((((.(((......)))....)))))).....))))))).......((((((..(((.....(((((...(((......)))...))))).....)))..))))))..)))))..........(((((((((....)))))))))......
|
|
CRW_00453
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGAUCCUAGCCUUACUGUUAGUUUUAAUUAAACUUACACAUGCAAGUUUCCGCAACCCAGUGAGAAUGCCCCCAAAAUUUAUACACAAUUUAGCAGGAGCAGACAUCAGGUUCACUACAAAGUAGCCCAUAACGUCUUGUCCAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUUAACAUUAAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAAUUAUAAUUAUCUAGGGCCGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGCCAUACGAUUGACCCAAACUAACAGAUGUCGGCGUAAAGCGUGUACAAUCCAACAACCAAAAUAAGGCUAAAACUCAAUCAUGCUGUAAUACGCUAUAGCUAACAUUAAAAAAUGCAACCAAAGUGGCCUUAAUACUGACCAAAACACGACAGCUAAGACUCAAACUGGGAUUAGAUACCCCAUUAUGCUUUAGCGUAAACUUAGAUAGUUUAAUAACGAAACUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCCAGCGCUUAAAACUCAAAGGACUUGACGGUGUCCUAAGCCCAUCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAACCGAUGAACCCCGAUACACCCCACCUCUUCUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCCUACCCCAAUAGGGACCAAAAGUAAGCAAAAUCAUCAACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAGAGGAAAGUGAUGGGCUACAUUUUCUAACAUAGAAAAUUACGGACUAUCUUAUGAAACCUAAGAUAUACGAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAACAGGCAAUAGGACGCGUACACACCGCCCGUCACUCUCUUCAACAUAAACAAACCAAAUAACUAAUAAAAUAAAUAAAUAAAGAAGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACCGGAAGGUGCACUUGGAUCAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.......))).....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).))))))))))....(((((.....((((...(((............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[.....))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).....(...((((((((.......))))..))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.........................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((((.....((((((((((........(((((...(((........))).....)))))...((((...............(((((((..(((..((((....((((.(((....)))))))......))))..))).......(((....)))....(((((((.....))))..))).(((((....))))).)))))))...........)))).(((.....(((((...(((.....)))..)))))...))).)))))))))).(((((((((...))))....................((((((((............((((((......))))))...((((....)))).........))))))))...............))))).............))))))))))))......((((((....)))))).....((((((((.......)))))))).(((((((.......(((....))).....)))....((((((((((.((((((......(((...)))(((((((((....(((......((((...(((....(((((((.(((...((((.(((....(((.............((((((....))).......))).................(((.....))))))..))))))))))...)))))))...))).))))....((((((((...))))))))..)))..(((((((.......))))))).....))))...(((((.......(((((.........)))))))))).)))))..))))))(((.......))))))))..(((((((.........................................))))))).)))))......))))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00454
|
[ FASTA input ]
|
GUUUUAAUAUAAUAAUGAGUUUGAUCCUGGCUCCGAGAGAAUGCUAGCAACUUACUUGAUACAUGCUAGUCGAACGCUUAUAUGAGCGUGGCGUACGAGCGACAAGGGCAAAGAUAGAAAAUACAUCAGUCAAGGGAAAUCCUAGAUUUAAAAGAUUAUAUCGCUGAAUGUAAGGUCUUUGUGAGAUUAGGUUGUUGGUAAGAUAAAAGCCUACCAAGCCGAUGAUCUCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGUACAGCCGCGUCGGAAAUGCAAUAAGGUCCGGACUCCCUCGGGAGGCUGCAGUAGGGAAUCGUGAACAAUGUGCUAACGCUUGAUUCUAUAAUGUUGCGUGGGGGAUACAAAAAACAUUAUUUUAUACUUAUUGUUUUAUAAACAAAUUUAUAUAUAAAAUAGUGAUAAUUCUAGCAACGACUUAAGCGCAAUAAAAGUUUCCGUAAAAAGAGAUUUUUAUCUGUGUCUUCUGUAGCGUGCCUUUCUAGUAGACGGCAAGUUGUCUUAAACCCCUUUUUUUACGAUUAUAAUGACUGUAGUUAGUAUAUAUCUAUUUAUCAAGAUGAGGGUUGGUAAAUUACAUUUUGUUUGUUAGACUAAAAUACUCGAGCAAAAAUGCCUUAUGCUGCUUUGCUUAAAAAUAUCAAACCCCGGCUAACUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAAACGGGGGGGGUUAGUGUUAUUCGUGAUGACUGGGCGUAAAGGGUACGUAGGCAGAUAAUUGAAAAUACAGUAAAAAACUGAGGUAAACCCUCUUCAUUCUGUAUUCACUCAUUAUCUUGAGUUCAGAAGGCGGUUUAUUGAAUUCUCGAAGGAAGGGUGAAAUCUGUUGAUAUCUGGAAGACAUUCGAUAGCGAAAGCAACAUCCGAUUCUGAUCUAACGCUCAGGUACUAAAGUAUGGGGAUCAAAUAGGAUUAGAGACCCUAGUAGUCCAUACCUUAAACAAUGAGUGUUCAACGUCUUUAAUAUAGUCAAUAUAUUUAGGGGGUUUAAAGCUAACGCGUGAAACACUCCGCCUGGGGAAUGUGGCCGCAAGGUCUAAACUCAAAGGAAUUGACGGUGACUUAUACAAGGGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGACAUACCGCGCAAAACCUUACCAAUUUUUGUAUCUGGUUUCUUUUCGUUAGCCAUUUAUUUGGUUAGCCUUCUUCUUUCUGUUGAAGGUCUACUACGAUAUCGAUUGAAGAUGUGGGUGUUUCUAUGCGUAAGCAUGAUCUAGCUAUUUUCAAUUAACGGUAACCAAUGACAAGAGCUGCAUGAUUGUCGUAAGUUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUCAUUCCAUAAACGAACGCAACCCUUUUGAUUAGUUGCAUAAUGGAUGAAAGUUUAAACUGGAUAUCCAUGUUCACUAGUUCAACCAGCCCUUCUACCUUUAGGGAUUAAGGACAGGUCCACGUCAAAUCAUUAUGGCCUUAAUAGAUUGGGCUACACAUGUGCUACAUUGAUGAUCGACAACAAGAAGCAAUGGCGUGAGCCUGAGCAAAUCUUUAAAAGACAUUUCAGUCCGAAUUGUUCUUUGAAACUCAAGAGCAUGAAGCCGGAAUCUCUUGUAAUCGUGGAUCAUUACGCCACGGUGAAUUAGUACAAAAGUCACGUACAGACCGCCCGUCAUGCUAUGGAAACUAUUUGAAGUAGAAGUUACAAGGUUUCAAUUGUUUCGAUAGACCACCUUAUUGAAAGUUUUCAUAAGGCCUUGACAUUCUGUUGGCUUUGUACACGACUCUUUAUUUAGGGACUGGAGUAAAGUCGAAACAGGGUAGUGGUAGAAGAAUCUGCUGCUGGACCAUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...{{{.))))).(((..((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((((((....)))))))))......(((......((((((((......(((((...((((((.....))).(((((...))))).......))))))))..))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))).)))..........(((((...<.((((.(.(((.((((((.((.(((((((((.....((((((.....))))))..)))))))))...))))))))...(((((((((..(((((((.((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..(((((((((((((((.....)))).)))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....((.(((((..........................................................................................................................)))))))....((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....(((((.(.(((((((...(((((.((((.....................))))))))).))))))))..(((((....))))).......)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...((((.((......(((..((...(((....)))...))....))).....))))))......(.(.((((((((........)))))))).).).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...(((((((((..(((((((((((....(((((.(((..((((((((..(((.......((((((.(((....)))))))))..))))))....))))).)))))).))...)))))))))))..)))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
.............................((((.........(((((((..............)))))))...[[[[[.....))))..]]]]]....(((......((((((((......(((((((((...(((....))).(((.(((....))).))))))).)))))..))))))))(((((((((((..(((((...........)))))))))..)))))))..((((((((....))))...))))))).(((((..[[[[......))))).((((....))))..]]]]....(((((((....[[[[[[.........)))))))...]]]]]]...((((((((.......((((((((((((....((((((...)))))).......)))))))))))).....(((((((((((.....((((((((((((((((........))))))))))).)))))....(((((..((((........((((((....))))))..(((((.............((((.((((....)))).))))(((((........))))).)))))))))..)))))..))).))))))))...........(((((((...............))))))).....))))...))))(((......[[[))).......]]].......((((((((((...((((((...))))))...(((((.....)))))..[[[[[............((((.....)))).....))))))))))..]]]]].((((((((......)))))...)))((((((((.(((.[[[[[)))....]]]]]...(((....)))...((((.....((((....)))).......))))......(((.[[[[[[[[)))......(((((((.......((((.........))))....))))))).........]]]]]]]].(((.((((.((((((.....)))))).)))).)))........((((((....((((((...((((......((((.[[[))))....))))......]]]................))))))(((...[[[[[....))).....]]]]]((((((....[[[[..))))))...]]]]........((((((((......))))))))............(((((..(((..[[[[))).))))).......]]]]........)))))).(((.[[[....)))....]]].....((((.....[[[[[[[..)))).....]]]]]]]..(((((((((....)))...[[[[[..........))))))..]]]]]..(((((((((......(((((((..(((....)))...)))))))....))))).))))....((((....[[[[.))))...]]]].((((..(((((((...(((..((((((.........))))))...)))((((...(((...........)))..)))).)))))))..))))...............(((.[[[[[))).....(((((((........)))))))]]]]]..........((((((((((((.....[[[[))))))).......)))))......]]]].))))))))................((((.....)))).........(((........[[[[[[[[[)))...]]]]]]]]]......((((((((.....[[[[[[[[))))))))...(((((..((((((........))))))))))).]]]]]]]](((((((((....)))))))))............
|
|
CRW_00456
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAACUAUUAGUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCACUCCAGUGAGAAUGCCCUCUAAAUCACCCAUAACGAUUAAAAGGAGCAGGUAUCAAGUACACUAAUAACAGUAGCUAACAACACCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGACAAAAAUUAAGCAAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUACUAAGCAGAGCCGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGCCAUACGAUUGACUCAAAUUAAUAGAACCUCGGCGUAAAGCGUGUCAAAGAUAUAACCCCUAAUAAAGUUAAAAACAUAGUUAAGCUGUAAAAAGCUAUAACCAAGAUAAAAUAAACCACGAAAGUGACUUUAAUAUAUCACCCACACUACAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCCAAACUCAAAUAAUUCUUCCCAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCCCCUAGAGGAGCCUGUUCCAUAACCGAUAAACCCCGAUAAACCUUACCAGCCCUUGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCCAACCCUAAAAAGGAACCAAAGUAAGCACAAGUAUAAGACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGAUGGAGAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACUUCAAGAACAACAACUACCCAAACGAAGGCUUUUAUGAAAUUAAAAGCUAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAACCAGGCCAUAAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUUAAAUAUCAUAAACCACAACACAACAUAUUAACGUACGUUGAACAUAUAAAAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCGCUUGGAUAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.........)))....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((....(((...........((((((((...((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....)))))))))....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{{.......))..}}}}}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))...............(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((.....................................))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((.....(((.(((((((((...((((((......(((.(((...........((((.((((((......))).((((.........)))).....((((((((....(((..(((......))).)))......))).)))))...........))).))))...)))))).....((((......(((((....)))))....)))).))))))...(((.((((......((((...(((.....)))..)))))))).)))...)))))))))....)))....(((((((....((((((........((((((..........((((((((......)))).))))...............(((....))))))))).))))))....))))....))).....)))))).(((..[[[...)))..]]]...........................(((..............(((.((((.....(((.......)))..))))....((((((((((((((((((.(((.......)))((((((((...................(((...))).......((((((((((..(((........(((((((........(((....))).......(((((((((.......(((.(((.....))).)))....))).))))))))))))).......((((.......((((......)))).........))))......((((((((......))))))))..))).))).)))))))..(((((((.........)))))))))).))))).)))))))))............)))....((((((..((((..............((((.(((....))).))))...))))..)))))).)))))).......)))(((((((((....))))))))))))....
|
|
CRW_00457
|
[ FASTA input ]
|
UAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUUUAUUAAUUCUUAGUAGACUUACACAUGCAAGUAUCCCCGCCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAUCUCCAUAAGGAUCUAAAGGUGCAGGUAUCAAGUACGCUCUCUCGAGCAGCUCAUGACACCUUGCUACACCACACCCCCACGGGACACAGCAGUGAUUAAAAUUGAGACAUAAACGAAAGUUUGACUGAGUUAUACUAAUAAUUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCUAGUUAAUAAAACACGGCGUAAAGCGUGAUUAAGGAAUAACCCCAAAUAAGAUUAAGCUCUGACUAAGCUGUAAAAAGCCUUAGUUAAAAUAAAAAUUUAUAAACGAAAGUAAUCUUACAACCCCUGAAUUCACGAUAGCUAAGGCCCAAACCGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACAUAAAUACUCAAAUAACAAGAGUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCCACUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGUUAAACCUCACCACUCUUUGCAAUGUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAUAAGGUAUCGCAGUAAGCACAAGAAUUCUGCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUAGAGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUUUCUUUAGAACAUUUCACGAUAGCUGUCAUGAAACAUGAUCAGCCCAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGUUGGGAAUAGAGUGCCCAACUGAAUUGGGCAAUAAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCAAGCAUCCAUGAUAACCCAUAUAAAUAAUACAAAAAUCUCCUAAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAACAUACUGGAAAGUGUGUUUGGAAUAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((....))).....))).)).(((..(.(((..((((....)))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))......((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).))))))))))....(((((.....((((...(((............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(..((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<.....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...((((((.....)))))).......(..(((((((((.......))).))))))..).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.................................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((.....(((.............(((((((((((((((.(((.....((((.......(((.......(((.....(((....))).....)))...((((.((((((..((((....)))).)))..))).))))..........)))......))))....)))))).(((....)))....(((((....)))))..)))))).))))))((((((((((((((......((((...(((.....)))..)))))))))))))))))).........)))......(((((...(((............((((((((.....((((((((...........))))))))..((((....)))).........)))))))).....)))....)))))...........)))))))(((.[[[[....))).(((....)))..]]]].....(((((((.........))))))).(((.(((.......(((....))).....)))....((((((((((((((((((...(((....)))......((((((..(((((.(((...)))...((((.((((((((((......)))....((((((................((((((........((((..............))))........))))))....))))))......))))))).......((((((.(((.((((((.....))))))..(((((.(((....))).))))).)))...))))))..))))(((....)))..)))))..))))))(((((((.....))))))))))))))))............)))....((((((..((((....(((......(((.....))).....))).....))))..)))))).)))))).......)))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00458
|
[ FASTA input ]
|
UAAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAGCUGUCAGUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCAGUGAAAAUGCCCUUGAAGUCAUCAUAGACAUAAAGGAGCCGGCAUCAAGUACACCAUAAUGGUAGCUAACGACGCCUUGCUUAGCCACGCCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCUAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUACUGAUAUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAAUAACCCAAGUUAAUAGAUACACGGCGUAAAGAGUGUUAAAGAACCUGGCAUUGUAAAUAAAGCUAAGACUUAACUAAGACGUAAAAAUCUCCAGUUAAAGUAAAAACAAACUACGAAAGUGGCUUUAUAUUAUUCUGAUCACACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUAAGACAAUCCAACUAACAAGAUUGUUCGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAACCCUUGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAGGGAGCCACAGUAAGCACAAGUAUAUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUAAUGAGUUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAUAUCUAGAACACUUUAACGAAAGUCUUUAUGAAACGAAAGACUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGUGCUUAAUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUACUAAAGCCAGUCAAUAUACAUAAUAUAUAGGCAAUAAAUACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUAAC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((......)))....))).)).(((..(.(((..(((.....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....)))))))))......)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<......))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((....)))))........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((......................................)))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
........(((((((..((((((((((((((((((((((......(((.(((............(((.(((.......((((...(((......)))...))))....(((.........((((...)))).((((((((....))).)))))...)))..)))))).....)))))).(((...)))((((.(((((....)))))....)))).)))))))...((((((......((((((...(((.....)))..)))))))))))).))))))))))...(((((.....(((((((....)))(((((.......(((((((((....((((((.(((........)))..))))))(((........))).......))))))))).........(((....))).((((((.((((...))))..(((........)))..))))))..........(((((((..........))))))).))))).......(((....)))......))))....(((..(((((((.........(((....)))...(((((((...((((........))))........(((...(((.((((((((.....((((((...((((..(((...((((...)))).......(((..........)))..........)))))))...)))))).....)))))))).)))...)))(((((...(((((....)))))..((((......(((((((........)))))))....)))).....)))))......))))))).((((((.................)))))).....))))))).)))...((((((..(((.....(((.....((((.....))))...)))......)))..))))))....)))))...)))))(((((((((....)))))))))))))))).
|
|
CRW_00459
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGUUUGGUCCUGGCCUUUCUAUUAAUUCUUAAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCGGUGAGAAUGCCCUCCAGAUCUUAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACCUAUAACGGUAGCUCAUAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUAUUAAUUAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAUCCACGGCGUAAAGAGUGUUUAAGAAAAAAAAAUCACAAUAGAGUUAAAUUAUAACUAAGCUGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAUAAAAUAACCCACGAAAGUGACUCUAAUAAUCCUGACACACGAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACCCAAAUAGUUACAUAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUCGCAACUGCCUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAGACCUUACCAACCCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGAACAAUAGUAAGCACAAUCAUAGCACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGGUUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUAAGAAUAUCCACCACACGAAAGUUUUUAUGAAACUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAUCAAGAAUAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUGUAGUAAUAAAAAUAACCUAUAUUCAAUUACACAACCAUGCAAGAAGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUUACC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((..............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<.....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))...........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((.........................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..((((......)))).....((((((((((((((((.......(((.(((.....(((.......((((.............(((((...))))).....((((((((....(((..(((......))).)))......))).))))).....))))......)))....))))))......))))))...(((((....))))).((((..........))))....(((.....[[[[[...[[[)))..]]]..]]]]]........)))))))))).....((((......(((((...................((((((....(((((((((.(((......)))..)))))...)))).......(((....)))))))))........)))))......((((((.........(((..[[[...)))..]]]..))))))..........(((((((.........))))))))))).((((..........[[[[[[....)))).........]]]]]](((....((((.(((.....(((((((((((...(((........))))))......(((((((..........(((...((((((...((((.........(((....))).....................(((..........)))))))...)))))))))...))))))).....))))))))....((((...((((((((...............))))))))))))...........))).))))..))).................((((((..........[[[....)))))).........]]].......(((.....(((((..(((((...((((.....))))..))))).....))))).....)))................((((((((((....)))))))))).......
|
|
CRW_00460
|
[ FASTA input ]
|
AAAAGAAAGAAUUUAAUUUUGGUUCCGAUUGAACGUUUUUCAGUAGUUUUAAGACAUGCAAAUCGUUAUUUCUGAAAGUAAAUUUUUAUUUAAAAUUAUAUAAAUAAUAACUAAAUAAAAAUGAUAAUAUGAAAUAAGGUGUAGAGGUGAGGAUAGUAAAUAAGAUACCCUGUAGUCUUCAUAGAUAGAAGAUAUUAUUCUAAGUAAAUUUUUUAAAUUUAUUACUAGUAUUUUUAAAUUAAUUUGCUUGCAUUAUAUAAAAUUAUAAUUGUUUUUCAUUAAUUGCAAAAAUUUAAAUAAAAAUGACUAAAGCAAAAAAAUUAUUUAAAUAACAAUAAUGUAAAAUAAAUGAAUAAAAUAAAAAAGCUAUUUUUAUUAAAAAAAGGAAAUUUUCUGCUAUAGGAUUCUAUUUAUUUUGAUUAGGUAGUUGGUAUGGGUAAAGGCCUACCAAGCCGACAAUCAAUAGCCAUGCUUGACAGAGCAGAUGGCCACAUUGGGAAUGAAAUCUCCCAAGUAGUUUUAUACUACCAGCAGUCAAGAAUAUUAGUCAAUGCUCGUAAGAGUGAACUAGCUAACUGAAAUCGCAAAUGUGUCAUUUGUGAUAAAGUAAGAGAAAAUUAUGAUAUUAUCUUACUACUAGUGCUGUCCAAAACUGGUGCCAGAAGACUCGGUAAGGCCAGAGGCGCAAACGUUAGUCGUCCUAAUCAGGCGUAAAGGGUUUGUAGGCUGCUUUGAAAGUCUUAUUAUUAUAAUAGCUAUUAAAUGAUAAGAUGAAUUGAAGCUAGAAUCUAAUAGAGGGUAAAACAAAUAAUAUUUAAAGUAAGGAUUAAAUCUCAAGAGUUUAGAUGGAAUACUAACGGUUAAAGCUUUUAUCUAUCUACAGAUUGACGCUGAGAAACGAAAGGGAGGUAAGGAAACAGGAUUAGAUACCCAACUACUGCUCCCUGUCAACGAUGAAUGGUGGUUGCUAGUUAUAACUACUUUAAGUAAAUAUUUUAUAUUAUAUAAGAUAAAAUAAGUAGUUAAAAUGACUGGUAGCGAUGCUAACGCGUUAACCAUUCCGCCUUGUGAGUACGACUGCAAAGUUGAAAACAAAAAAAUUAGUCGGUUUCGAAGCAAACGAAGUGAAGCAUGUUAUUUAAUACGAUAAUCCGCGUAAAAUCUUACCAGUUCUUGCAUACAAACUUUUUUUAUAAUAAUUUAAAUUAAAUUUUAAAUAGUUAUUUAAAAAGGAGUGUUUUUACUUUUUUAAAAAUACUUAGAUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGUCCGUGCUGUGAGAAGUUUGGUUAAAUCCGCUAACGGACAAAAUCCCUGUUGUUAAUUUAUACUUAACAAUUAAUGAUACUGAUAGAGCAUCAUUUGGGGCGAAGACAAGUCGUUAUGGCCCUCAUGAACUGGGCUAUAGACGUGCCACAAAGACUUUAACAAAGUGAAGCGAUACUGUUCCCUUAAUAUUUUUCUAAAGAAUUUUAUUAGAUUUAAUUAUAACAAUUAAAUUAUAGGGAAUUUAAGGAGGAGCUAAUCAUUAAAAAAAGUCAAACUAUUAAAUAUAGUCGGAUUGUCAUCUGAAACUCGGGGACAUGAAGAAGGAAUUUCGAGUAAUCGUUGAUCACUACGCAACGGUGAAGCUAGCAUUCGGAAUGAACUAACCGUCUGUCGCUGGGAAGGAGCUUAACUUGGUGGAAACUGGAAUGAAGUUUUAACUUUUACAAAAAUUAAAUUUUUAUUUAGUAUCUUUGAUAUUUUAUUUUUAAUUUAUUAGUUUUUUUUUCGUUAGAUUUUUUUUAAUUUAUUGCUUAAUUAAAAAGUAUUAUUUUUGUUUAAAGAAUAAAUACUUGUCUAACAAUGUUAAAUUUAAAACGAUUUUGUUAAGCAAAUUAGCUCUAGUUAAACCAAUUAAGUAACAUCUCAAAAGUCAUAGCAAGGUAGCCGUACUGGAAAGUGCUGCUGUAAAAUAAAACGA |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...[[[.))))).((((.((((((.(((((((((.....(((.(((..(((.(((((((.........(((((((((((..(((((....)))))...)))))))))))........))))))))))......(((.....((((((((.((...(((((((.((((.......)))).............................................................................................................................................................................................................)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((.((.......))))))))))).....))))..((((.((((....))))...))))))).((((((........)))))).((((.....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((((((...))))))))...((((((((...(.......)....))))))))...(((((.......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.......((((.(.(((.(((((((.(((((((((((...(((....)))..)))))))))..)))))))))...(((((..(((((((((((....((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))).)))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((((((((((.........(((((((((((....))))))))))))))))))...))))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((.......(((((((((......((((....((((((((....))))))))......))))......)))))))))........))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.......)))))))...((((((((.....)))))))).))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...((((((((((((((.......(((.((((((....))))))..)))..........)))).)))))))....)))...))....)))....)))))))..(((((.....)))))(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))..)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((.(((((...(((((((....(((((...(((..((((((......((((.(((((((((....((((....((((...........(((((((...((..((((.((((((((((........))))))))))....)))).))...)))))))))))...)))).....)))))))))..))))...)))))).))).)))))...)))))))..)))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
....((((((.(((((((........)))))))..)))))).((((((....))).)))......(((((((.........(((((((((((..(((((....)))))...)))))))))))........)))))))(((((....[[[[[[[[..........))))).....]]]]]]]]...((((((((.((((((((((((((((.((((((..(((.....)))..))))))..)))))))))).(((.((((....))))..((((((.(((((.(((.....((((((((((....................))))))))))..)))))))).)))))))))))))))((((((((.....))))))))...........))))))))..........................(((.((((((...((((..[[[[))))..)))))).)))........(((((....)))))...]]]]...((((((........))))))(((((.....))))).....((((......(((((...(((((....))))).....))))).....((((((((((...))))))))))..[[[[[[[........))))....]]]]]]]((((((.[[[......))))))..]]]....(((....[[[[[.)))((((....(((((.....)))))...))))....]]]]]...((((((((((...(((((((((((.((((....)))))))))))))))(((((((((..((((((((((............((((...))))..............((((.........))))...(((((((.((((((((((((......(((((........(((..(((((...(((((((((........................)))..)))))).....(((((((((((.((((((((((((((((((((........(((((((((...)))))))))....))))))))...))))))))))))(((((....))))).)))))))....((((.....(((((....)))))...))))........)))))))))..))).....((((.((((.((((....)))).(((((((((...........((((((((((((((((...((((((..(((((.(((((((......))))))).)))))..))))))(((((((((((......)))))))))))........)))..(((((((((....))).))))))))))))))..)))))....((((....))))....(((...((((((((.......))))))))....)))..((((((.......((((.((((...........(((((((((.........)))))))))...)))).))))((((((.....((((((((......((((((((((((...(((....)))...)))))(((((((((.....)))))))))..)))))))..........)))..)))))....))))))...))))))........))))))))).(((....(((((.((((..........(((((((((....(((..(((((.......))))))))....)))))))))............)))).)))))..))))))).)))).))))).........)))))))))))).....((((((...))))))..)))))))...(((((..(((....)))..)))))...........))))))))))))))))))).((((((((((...(((((((((((((.....)))))).)))))))...((((((((((........))))...))))))......(((((....)))))...)))))))))).................))))))))))(((((....)))))..................
|
|
CRW_00462
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUACUGUUAAUUUUAAUUAAGCCUACACAUGCAAGUUUCCGCUGCCCAGUGAGAAUGCCCUCAAAAUUCUACAAUCGAAUCAACAGGAGCAGGUAUCAGGCACACCCAUCCCGGUAGCCCAUAACACCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGACUAACUUUAAGAUAUGAACGAAAGUUUGACUAAAUUAUAAUUAUACAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCGCCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAACAGAACACCGGCGUAAAGCGUGUUUAAGCGCAAAUCUCAAAAUAAAGUUAAUACUUAACUAAACUGUAAUACGCCCUAGUUAACAUUAAAAUAAACAACUAAAGUGACUUUAAUUUCGCUGAAUACACGACAACUAAGACUCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGUCAUAAACCUAGGUAAUCCGAUAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCCACCGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUCUAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUACACCUCACCCCUUCUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCUCACCCCAAUAGGGAACAAAAGUGGGCAAAAUCAUUCACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAGGGGGAAGUAAUGGGCUACAUUUUCUAAAUUAGAAAACCAACGAACUAUCUCAUGAAACCCUGAGUCAUACGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAAUAGGCAAUAGAGCGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAACACAAACCGUCACAUUAACUAAUAAGUUAUCCAAAAAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAGGUGCACUUGGAGUAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((.......))).....))).)).(((..(.(((..(((......))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]]))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((.............((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..))......(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<<.....))..>>>>>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...)))))......(...((((((((........))))..))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((.........................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
....(((..(((....)))..))).........................(((......[[[)))...]]](((((.........)))))................((((((((....(((..(((.[[[[[))).)))......))).)))))..............]]]]].........................((((....))))................(((.[[[[[[)))....(((((...((((...))))..))))).]]]]]]................((((((..((((......))))..........(((.((((((...))))))....)))..)))))).(((((...............))))).(((((........)))))............((((((........((((......[[[)))).....))))))...........]]].((((((((.....))))).....(((.......(((....))).....)))...)))...(((((((.........))))..[[[[.))).........((((........))))...]]]].(((((((.(((...((((.(((.................(((((((((....))).......))))))..........(((.(((.....))))))..))))))))))...)))))))...(((.[[[..))).(((((((...)))))))]]]........((((........(((((((.[[[.......)))))))..]]]...........))))((((.((((.......)))).))))(((.......)))(((.((((.(((...((((..(((((.....(((((....)))))(((.........))).............)))))..))))...))).))))....))).....
|
|
CRW_00463
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUUAUCAACUUUUUCUGAACUUACACAUGCAAGCAUCCGCACUCCCGUGAAAAUGCCCUUAAGCCUCUUAAACAGGGGAUAAGGAGCCGGUAUCAGGCACAACUAAUAGCCCAUGACACCUUGCUCUGCCACACCCACAAGGGAAUUCAGCAGUGAUAAACAUUGAACAUGAGCGACACAAAGCUCGAUUCAGUUACAGUAAAUAGAGUUGGUCAAUCUCGUGCCAGCCGCCGCGGUUAUACGAGAAACUCAAGUUGAUCAUUUUCGGCGUAAAGCGUGAUUAAAGUAACCCAAACUAGAGUCAAACUCCAACCAAGCUGUCGCCGCUUUCGUUGGUUUGAAGAACACUCACGAAAGUAACUCUACCCAUAUUACACUUGAACUCACGACCGCUAGGAAACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCAUAAACUUUGACUACUUACGCAAAAAUCCGCCAGAACUACGAGCCUAAGCUUAAAACCCAAAGGACUUGGCGGUGCUCCAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUACCCCUCGCUAAACCUCACCACUUCUUGCCAAACCCGCCUAUAUACCACCGUCGCCAGCCCACCUCGUGAGAGAUUCUUAGUAGGCUUAAUGAUUUUUCAUCAACACGUCAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAUACCUUAGAAUAAACGCAAGAUCUCUAUGAAACCAGAUCGGAAGGCGGAUUUAGCAGUAAAGAGAAACAAGAGAGUUCUCUUUAAAACGGCCCUGGAGCGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCUACAAAAAUCAACCAAUUUUAUAAACACACAAUUAACACAAAGAAGAGGCAAGUCGUAACAUGGUAAGCACACCGGAAGGUGUGCUUGGAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....((((((...(((((.....)))))..)))).)).(((..(.(((..(.....).))).....))))..((...))))).((((....))))....)))))).).....(.(((..(((((........))))).)))).)).))).)))..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))....(((.......((((...(((..........((((((((..(((((((...(((.....)))....)))))))...)).....(.((....)))))))))...........)))....))))....((((((...((...((((.........))))...)))))))).......(((..............))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((.....)))))....(...(((((((........)))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..........................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((.(((((((.........((((((..(((......(((.(((..((((...(((....)))...)))).......(((((.....)))))....(((((.(((.((((((..........)))..))).)))..)))))......(((....)))......))))))......((((((..(((((........))))).))))))..))).....))))))((((..(((((((..(((((...))))).)))))))...((((((...........((((...(((........(((.......))).((((...)))).......)))..))))((((((((.(((.........))).)))))))).................))))))......)))))))))))..))))))(((..[[[...)))..]]]..............(((((.................[[[[[[[......((((....))))......)))))...]]]]]]].(((((.[[[.........)))))..]]]..................(((........(((((((.(((...(((.((((.........(((....((((...(((....)))..........))))..((((....))))....)))..))))...)))...)))...))))))).........)))................(((......[[[..[[[[[))).......]]]]].....]]].......((((((((((((.........)))))))))..[[[[..)))....(((.......)))]]]]...((((((((........................................))))))))................(((((((((....))))))))).....
|
|
CRW_00464
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCCUUCCGUUAGUUUUUAAUAAAAUUAUACAUGCAAGCUUCCACGCCCCAGUGAGAAUGCCCUUCAGAUCCCUACAGCCGAUCAAAAGGAGCGGGUAUCAAGCACACUCAACGAGUAGCUCACAACGCCUUGCUCAACCACACCCCCACGGGACACAGCAGUAAUAAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUCGACUAAGUUAUAUUAAUCAUAAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAACGGGCUCACGGCGUAAAGCGUGUAAAAGAUCUACCUACACUAAAGUUAAAAUUUAACCAAGCCGUAAAAAGCUGCCGUUAAUACAAAAUAUACUACGAAAGUGACUUUAAUAAUUCUGAUUACACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACAUAAAUAAUUCACUUAACAAAAUUAUCCGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACAUCCCCCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCACCUCUUGCUAAUCCAGUCUAUAUACCGCCAUCCUCAGCAAACCCUUAAAAGGAAAGAAAGUAAGCAUAAUCAUCGCACGUAAAAAAGUUAGGUCAAGGUGUAACCCAUGAGGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAACAAGAACACACCGUACGAAAGUUAUUAUGAAACUAAUAACUAAAGGUGGAUUUAGUAGUAAACUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAACUGGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAAUAACCUCAAAGCACAUACAUAAAUCAAUAUAAAACCAUAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((...(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.........)))....))).)).(((..(.(((..((((...)))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))......((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).)))))))))).....(((((.....((((...(((...........((((((((..((((((((..(((......)))...))))))))..)).....(.((....))))))))).....)))....))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[[......))..]]]]]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((...((..(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).))))))))))...(((((...))))).........(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((......................................))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((.(((....(((.....((((((((((....)))))))...)))...))).))).)))...(((((.(((((((((.((((.........)))).....))).))))))..[[[[.((((...))))..))))).......]]]]........(((....))).....(((((................(((((....)))))...........((((((.....((((((((.......)))))))).[[[.........))))))..........]]](((.[[[[[....)))(((((...........)))))....(((((...)))))...]]]]].....)))))..................(((....)))...........((((((.........[[[[[[.((((...))))))))))............]]]]]].............................(((((((((.(((.......(((....))).....)))....(((((((((((((((((...(((........((((((((.....((((........))))........(((((((..(((.....)))...((((((.....(((.(((....(((....)))..................................))))))....))))))......))))))).....))))))))...(((((((..........((((.......((((((((......))))))))...))))..((((((.....))))))..)))))))............)))...))))))))............))))...((((((.................................(((......))).))))))..))))).......)))(((((((((....)))))))))))))))..
|
|
CRW_00466
|
[ FASTA input ]
|
UACCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAAGAUCGCAAGAUCUUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGAGAAUCUACCCUUAGGAGGGGGACAACAGUUGGAAACGACUGCUAAUACCCCAUAUGCCAUUCGUGGUGAAAAGAGUAAUCUGCCUGAGGAAGAGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAAGGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGAUACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAGGGAAGACGGCCUGUGGGUUGUAAACCUCUUUUCUUAGGGAAGAAUCAAUGACGGUACCUAAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUCAUUGGGCGUAAAGAGUUCGUAGGUGGCUAAGCAAGUCUGUUGUUAAAGGCUGGGGCUUAACCCCAAAAAGGCAAUGGAAACUGUUUGGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCUGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUCAGGAAGAACACCGAUGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGUUACUGACACUGAGGAACGAAAGCUAGGGUAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACUAUGGAUACUAGGUGUUGUGCGUAUCGACCCGUACAGUACCGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCUCGCAAGAGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGUAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUGUCGCGAAUUUUCUUGAAAGAGAAAAGUGCCUUCGGGAACGCGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGUUUUUAGUUGCCAUCAUUCAGUUGGGCACUCUAAAGAGACUGCCGGUGACAAGCCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUAUACCCUGGGCUACACACGUACUACAAUGGUCGGGACAAUAGGUUGCCAACUUGCGAAAGUGAGCUAAUCCGUUAAACCCGGCCUCAGUUCAGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGGUGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCUAUACGGCGGUGAAUUCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGGGAGUCGGCCAUGCCCGAAGUCGUUACCCUAACCAUUUCGGAGGGGGAUGCCUAAGGCAGGGCUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...bbb.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((....))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((....))))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(.(((((((...(.........)....))))))).)...((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..((((((((((.((((((((...(((......)))......)))))))).)))....(..((....)))))))))).))))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........aaaaaa..((((((((((((......))))))))))))...aa..))AA.....AAAAAA.))).(((......((((....))))....)))...BBB..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......((..((((((((........))))))))..)).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((...((((((((..((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))..))))))))....))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...........((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]]..((((....((((((....))))))..))))((((.(((.......(((((((..(((..(((((((.((((.....((((((....))))))......))))...(((((....)))))...(((....))).))))))).))).)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).))))..((((((......((((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......))))...))))))(((...((((....)))).[[[[[[.......))).((((....((((((....))))))...)))).(((((((((.....(((......))).)))))))))..(((....)))..]]]]]](((...[[[[[[)))....((((.((((....)))).)))).......(((((.......)))))...]]]]]].......(((((((((..(((.[[[[[)))..]]]]]....))))))))).........................(((((((....((((((((((.(((......)))....)))))))))).......[[[[[[.......)))))))..]]]]]]...........((((((((.....(((((.....[[[[[[[[..)))))...]]]]]]]].((((.......(((((((.(((((((((((........))))))))))).((((......)))))))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).....))))....((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]...(((((((........(((((..(((((((....))))))).............)))))....(((..((((.(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..))))))....((((..(((((((.((((............))))..))))))).(((.(((((.....))))).....))))))).)))))...)))))))))...)))...)))))))............(((....[[[[[[[....)))........(((((....))))).............]]]]]]]......(((..[[[[[[))).......]]]]]](((.((((....))))....[[[[[[[.)))......]]]]]]]...))))))))...(((((((........(((((......)))))((((((((.((((......(((..((((...........))))..))).....)))).)))...)))))[[[[[[[.......)))))))(((((((((....)))))))))...]]]]]]]....
|
|
CRW_00468
|
[ FASTA input ]
|
GUUGGCUACUAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCUGUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCACAGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUAACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAACGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUUCACGAAGUCUCUUGGAAUAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUGAAGACCAGUACGCUGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUUGACGAAUGACCGAGACGCGAGUCUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGUAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACACCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCUGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGCAGGGGCGAGAGCUCCUGUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUGAGACGAAAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGAGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUGAUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCUCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGUCGUUACAGAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCCAGACAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGUCAUCUCAGCCGGGACAGAGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUGACUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCAUUCAUACG |
|
[ reference structure ]
|
..((((.....((((((((((.....(((..((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))...(((...))).......(((((.....))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((.....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((..((((....))))....))).....((((((((......((((......(((((((...(.((((......)))))(((...).bbb.....))BBB...))))))).......))))...)))))).))......((((((((......))))))))......(((((.ffffff)))))..))))..)..)).)))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((....(((((((((((...(....(((((....))))).....)..)))))))))..)).))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((((.....))))..))))...((....)).....((((...((((...))))...)))).(((((......)))))...)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))....((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((...(((.(((((((((...(((.....((((((((((.((((((((....))))))))))))))))))...)).)...)))))))))))).......)))))).)...((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...(((((....<.<<<<<<..................(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........))......>>>>>>>)))...)))))))(((((((.......)))))..))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.......((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(([[[.((...(((((((((.....))).)))))).....))...(((((........)))))))((((((((.......(((...((((((((((.((((((((((((......)))))))...(((((....((((((((((((.....))).))))))))).....)))))....((....))))))).)))))))))).........)))..)))))))).]]]..)).....((......)).)))).((((.......)))).))))...((((.....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((...))))))))))(...).......(((((((((..(({....(....}))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((....(((((......)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..hhhhh..(((........(((.(((((....)))))..)))..))).......)).).HHHHH))))))))))))))))))...((((....)))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))((cc....cccccc((.((((((.......))))))...))cc)(.(((CC....CCCCCC....(((((((((.........))))))))).(((....))).CC))).).....(((((.(((((.FFFFFF))))))))))....)....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(....eeeeeeee..((((..((((((((...............))))))))(((((...(((....((((((((((....)))))...)))))....))).)))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...EEEEEEEE....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((..(....)..))))))...))).))))).)))...))))...))))...........
|
| [ predicted structure ] |
((((((......))))))........(((((..((((((.((((((((....(((((..............[[[[[[...[[[)))))..]]]......]]]]]]...........(((.[[[[)))....(((((.....)))))]]]]...(((((..(((((.[[[[[))))).)))))....................]]]]].....(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).....))))))))...(((...[[[[[....[[[[)))...]]]]]]]]](((.((((....))))(((((((.....))))))).[[[[..)))..(((......(((((((........)))))))......(((((.......)))))..)))....]]]].))))))........(((....(((((((......)))))))......[[[)))...]]]..........)))))...(((((((((........((((((((((((......((((.(((.........(((((....))))).........))).)))).....)))))))))))).(((((....))))).....(((..((((((..((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...((((...))))...)))))((((((....))))))...))))))..)))))).)))....((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))...)))))))))....((((..[[[[))))..]]]](((((....))))).........(((.[[[..)))(((.((((((.(((.((((....)))).))))))))).)))...]]](((((...[[[[....)))))(((((((((((((((((((((((.....)))))))))).)))(((......)))..............))))))..))))((((((....))))))]]]]..(((.[[[[...)))..]]]].(((((..[[[[..((((((...........))))))..((((......)))).)))))...((((((((...(((.........))).))))))))]]]]...(((..[[[....[[[[[)))....]]]]]......]]].........((((((((..[[[.((((((((....))))))))...)))))))).........]]].((((.........[[[...((((((.......))))))))))....((((...(((.(((((((...........)))))))....))).))))..........]]]..(((....))).....(((((((....[[[[[[.)))))))..((((....))))...]]]]]]((((((((.((((.....((((((....))))))))))....(((...[[[[.))).((((...))))......]]]]......(((......[[[..)))..]]]..)))))))).((((.....[[[..)))).....]]](((.....[[[[[[..)))......((((((....)))...)))]]]]]]......((((((((.((((........((((((((((.....(((....))))))))((((((((((...)))))))))).....)))))..(((((((.....(((((((((.......((((((((....(((....)))......))))))))....((((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....))))))((((.(((((..(((....)))...)))))))))..(((((.......))))))))).....)))))......)))))))....))))))))))))....((((..(((((...[[[[[)))))...]]]]]..)))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((......((((((((((((((.........(((((..(((.[[[[...(((.(((((....)))))..)))..)))....]]]]....))))))))))))))))))).(((((..[[[)))))..]]]...))))))))..)))))(((..[[[[[)))...((((((((.......)))))))).]]]]].((((((((..((((((.......))))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))(((...[[[[))).....((((((.....))))))...(((((((..........................))))))).]]]]..(((((...(((((((((((((....))).))))..))))))..((((.(((((((((((......)))))).))))))))).))))).(((.....))).((((...[[[[[......))))(((....)))....]]]]]............(((((..((((((((((.......(((((((...(((((...(((....((((..(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).(((....))).......))))...)))..))))).....))))))).(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..))).)))))....)))))....))))).
|
|
CRW_00470
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCAGAGAACCUAAGCCGUCUGGUGGAUGGCUCGGCUCGGGGCGCCGACGAAGGGCGUGGCAAGCUGCGAUAAGCCCCGGCGAGGCGCAGGCAGCCGUCGAACCGGGGAUUCCCGAAUGGGACCUCCCGCGGCUUUUGCCGCACUCCCAGUCGGGAGGGGGAACGCGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCGCAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGAUGCCGUUAGUAGGGGCGACCGAAAGCGGCACAGGGCAAACUGAACCCUCCGGGGAAACCCGGAGGGGAUGUGGUGUAGUAGGGCCCUGCACUGGAGCCUCGAGGGUGAAGCCGAAGUCCGCUGGAACGCGGCGCCGUAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGUAAGCCCUCAGGCUCCUGCAGGGUUCCUGAGUACCGUCGGUCGGAUAUCCGGCGGGAAGCUGGGAGGCAUCGGCUCCCAACCCUAAAUACGUCCCGAGACCGAUAGCGAACUAGUACCGUGAGGGAAAGCUGAAAAGCACCCCUGGCAGGGGGUGAAAAGAGCCUGAAACCAGACGGCGAUAGGUGGGUGCGGCCCGAAAGGGUUGACCCUCCCCGAAGGAAACACGGGCGACCGUGGAGUACGAGGGGAGGCGACCGGGGUUGCACCGUCCGUCUUGGAUCACGGGGCAGGGAGUUCACGGCCGUGGCGAGGUUAAGGGGGUUAACCCCGAAGCCACAGGGAAACCGACAGGUCCGCAGCCCGUAAGGGUGAGGGACGGGGUGUGAAAGCGCCCGGAGUCACGGCCGUGAGACCCGAAGCCGGUCGAUCUAGCCCGGGGCAGGGUGAAGUCCCUCAACAGAGGGAUGGAGGCCCGAUAGGGGUGCUGACGUGCAAUUCGCUCCCGUGACCCCGGGCUAGGGGUGAAAGGCCAAUCGAGGCCGGCGAUAGCUGGUUCCCGCCGAAUUAUCCCUCAGGAUAGCCCGGCCGGAGGUAGGUGGUGGGGUAGAGCACUGAUUGGGGGUUUAGGGGGAGAAAUCCCCCGGCUCCCUGUCAAACUCCGAACCCACUGCCGCCGUAGAAGGCCGGAGUAGGGUGACGGUGUAAGCCGUCAACCGAGAGGGGAACAACCCAGACCGGGGUUAAGGCCCCUAAAUGCCGGCUAAGUGUUACUCCAAAGGGCGUCCCUGGCCUUAGACAGCGGGGAGGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCCGUCGAGGUCAGGGGCCCCGAAAAUGGACGGGGCUUAAGCCGGCUGCCGAGACCCCGGCGCACGGACCGAUUGGUCCGUGAUCGGGUAGGCGGGCGUGCCGGUGGGGUGGAAGCCGGGCCGUAAGGUCCGGUGGACCCGUCGGUAUUGUGGAUCCUGCCGGGAGUAGCAGCAUAGCCGGGUGAGAAUCCCGGCCGCCGAAGGGGCCAGGGUUCCACGGCAAUGUUCAUCAGCCGUGGGUUAGUCGGUCCUAAGCCAGUCCGUAACUCGGCGCUGGCGAAAGGGAAACGGGUUUAUAUUCCCGUACCGCGGUGGUAGGUGCGGCAACGCAAGCCCGAGGGGUGACGCCUCGGGGUAGGCGGACCGGCCCACAAGGCCGGCUAAGCGUAUAAGUCCGGGGAGUGCCGUAAUGGCGAGAACCGGAUGAAAGCGCGAAUGGCCUCCCGUAAGGGGGGUUCCGCCGAUCCCUGGGGCCCGUGAAAAGCCCUCGGGAACGAUCCACCGCGACCGUACCGAGAACCGACACAGGUGCCCCUGGGUGAGAAGCCUAAGGCGUGUCGGGGGAAACCCAGCCGAGGGAACUCGGCAAAUUGGCCCCGUAACUUCGGGAUAAGGGGUGCCUGCGGGUGCGUAACCCGCAGGUCGCAGUGACUCGGGGGACCCGACUGUUUAGUAAAAACACAGGUCCCAGCUAGCCCGAAAGGGUUUGUACUGGGGCCGACGCCUGCCCAGUGCCGGUAUGUGAAGCCCGGGUCCAACCGGGUGAAGCACCGGUAAACGGCGGGGGUAACUAUAACCCUCUUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUGCCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGGUCCCCACUGUCCCCGGCUGGGGCCCGGCGAAACCACUGCCAGGCGCAUAUGCCUGGGACCUCCGGUGGGAAGCGAAGACCCCAUGGAGCUUUACUGCAGCCUGCCGUUGCCGUACGGCGGGGGGUGCGCAGCGUAGGCGGGAGGCGUCGAAGCCCGCCUUCCGGGGCGGGUGGAGCCGUCCAUGAGACACCGCCCACCCUCUGCCGUACGGCUAACCCCCGACGGGGGGACAGCGGUAGGUGGGCAGUUUGGCUGGGGCGGCACACCCUCGAAAAGGUAUCGAGGGUGCCCUAAGGUCGGCUCAGGCGGGUCAGGAAUCCGCCGUAGAGUGCAAGGGCAAAAGCCGGCCUGACUGGACCCGUAACAGAGGCGGGUCCAGCCGCGAAAGCGUGGCCUAGCGAACCCCUGUGCCUCCCCGGUGGGGGCCAGGGAUGACAGAAAAGCUACCCUGGGGAUAACAGAGUCGUCUCGGGCGAGAGCCCAUAUCGACCCCGAGGCUUGCUACCUCGCUGUCGGCUCUUCCCAUCCUGGCCCUGCAGCAGGGGCCAAGGGUGGGGGUGUUCACCCAUUAAAGGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGAUGCUAUCUACCGGAGGUGUUGGCCGCCUGAGGGGAAGGCUCCCCCAGUACGAGAGGAACAGGGAGCCGCGGCCUCUGGUCUACCGGUUGUCCUACAGGGCACAGCCGGGCAGCUACGCCGUGUCCGAUAAGGCCUGAAAGCAUCUAAGGCCGAAGCGGUCCCCGAAAAUAGGCGGCCACUCCCAGGCGCAGGGGGUCGGGCGACCGGUCCUUUGCCUGGGACGAGGGCUCGGGAAGAAGACCCGUUUGAUGGGGCGGGGAUGUAAGCGGGAAGGGAAACCGACCCGUUCAGUCUGCCGCUCCCAAUCGCCCGAGGUUUCUGCCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((.......(((((((........))).....((((((...(((.......)))......))))))...))))...(((....)))(((((....))))).(((((....)))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((..(((((((((....)))))))))....))).......((((((((((..(((((((.((((((...(((...(.((((......)))))..(...).(((.......)))...)))....)))))))))))))))))))).)))......(((((((........)))))))......(((((.......)))))..)))).....))))))))).))...............((....))....)).........((((.....))))...........).....)))))))))).......((((((((((....((......(((((((...(....(((((....))))).....)..)))))))...)).))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((((.....))))..))))...((....)).....((((...((((....))))...))))..(((((....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))....((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((...(((.((((((((....(((...((((((((((((..((((((....))))))))))))))))))..)).)....)))))))))))......)))))).)..(((((((((......)))))))))....(((......)))...(((((((...(((......(.((((((................(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...................))))))))))...)))))))((((((((((....))))))))..))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))...............((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((((...(((((((((.....))).))))))....))...(((((........)))))..(((((((((((.((((....))))..(((((.((((...(((((((((..((((((((((((.....)))))))...((((....((((((((((((((.....))))))))))))))....)))).....(((((((....))))))).)))))...))))))))).........)))))))))..))).))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.......)))).))))...((((.....((((((((((((..............(((((...((....))....)))))((((((((((.....))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((....(((((......)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....)))))))))))).))))............(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))))))))))))))))))))...(((((...))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((.........))))))))).(((....))).))..........(((((.(((((.......)))))))))).........)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..((((((((...............))))))))(((((...(((....((((((((((....)))))..)))))....))).)))))..(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((((((..((((((((((....))))))))))))))))))...(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((((((....))))))))))...))).))))).)))...)))).....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((.....(((((.((((((((((....(((((..(((((((((..(((....(((((.......(((......((((((((((((.......))).)))..))))))..((((....))))..(((((((((....))))).(((((....))))).))))..(((((..(((((......))))).)))))...........)))......))))))))..(((((.(((((((.....((((((......)))..(((((((((....)))))))))..)))((((...((((((((((((..(((((((.((((((...((((...(((...)))...))))(((.....((((....))))....)))....)))))))))))))))))))).)))))..)))).)))))))..........((((.(((((......)))))))))..)))))....))))))))).....((((.....................)))).....(((((((....)))))))....)))))....))))))))))..))))).((((((((((.....(((((..(((((((........(((((....)))))........)))))))))))).))))))))))))))(((((((.....(((((.(((..((((((((((((((..((((..((((.....))))..))))................((((...((((....))))...)))).((((((....))))))...)))))))))))))).)))....((((((...(((((((((((.........(((((((....)))))))((((.(((....))).(((......))).....)))).....)))))))))))((((....((((......))))...........((((((.......(((((....)))))..((((((...(((.(((((((((...(((...((((.((((((...((((((....)))))).)))))).))))..)))....))))))))))))......)))))).......(((((((....)))))))........)))))).)))).)))))).......))))).....(((((((((((.....((((..(((.((((((((((((.....(((((((((..((((.......))))..))))....((((........)))).))))).))))))))))))))).....))))....)))).)))))))..)))))))(((((..((((((((....)))))))).)))))..((((((.((((((..(((......((((((((....))))))))...)))..))))))[[[....)))))).......]]].....(((((((......(((((((.((((((((((((((((((((((((...........))))))(((..(((((((((..(((((((((.....))).))))))...)))...(((((........))))))))(((((((....((((....))))..((((((((.....(((((((((..((((((((((((.....))))))....((((....((((((....(((((...)))))....))))))....)))).....(((((((....)))))))))))))...)))))))))..........))))))))......))))))))))...)))..)))))(((((....(((..(((((.....))))).)))))))).(((....))).((((((....))))))...)))))))).....))))).....(((((((((((((((.....))))))))).)))...(((...(((((((....(((((.....)))))..((((((((..(((((....)))))....)))))))).(((((.(((...(((((((.......((((((......)))))).....)))))))...)))((((((.......)))))).....((((...........((((((.....))))))))))......))))).....)))))))...))))))))))))))))))))((((((....((((((......(((((((((((((((((((.((((....(((((...(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))(((.....))).)))))))))))))))))))))))...(((((....)))))..))))))))))..)))))...((((((......(((((((((.......))))))))).....(((((((((..(((((((.....)))))))......(((....)))..)))))))))..((((((((((.......)))))))))).(((....)))...))))))....(((((.((((((.....)))))))))))........))))))....)))))...((((.((((....((((....))))....))))..(((((.......)))))))))((((((((((((((((((((((......)))))).))))))))))(((((.(((......)))))))).))))))..(((.(((((((....))).))))))))))).))))))))))))..((((((((((.(((((.(((((((.................)))))))(((((...((((...(((((((((((...))).))))))))...)))).)))))..(((....(((((...........)))))....)))))))).....))))))))))..)))))))..(((((..(((....)))..))))))))))).....((((.((((.......))))...((((((((((((((...((((((............))))))..)))).)))))))..)))))))..))))))......
|
|
CRW_00471
|
[ FASTA input ]
|
AGUCAAGUAAUUAAGUGCAUGUGGUGGAUGCCUUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAAGACGUAAUAGCCUGCGAUAAGCUCCGGGGAGGCGGCAAAUAUCCUUUGAUCCGGAGAUUUCUGAAUGGGGGAACCCACCUACUUUAAGGUAGGUAUUGCAACAUGAAUACAUAGUGUUGCAAGGCGAACGAGGGGAAGUGAAACAUCUCAGUACCCUUAGGAAAAGAAAUCAAUUGAGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAUCAGCCCCAUUAAGUUAUGUGUGUUUUAGUGGAACGCUCUGGGAAGUGCGAACGUAGAGGGUGAUAUUCCCGUACACGAAAGGGCACACAUAAUGAUGACGAGUAGGGCGAGGCACGUGAAACCUUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCUGUGAGGGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCGCAUGCAUACAAGCAGUGGGAGCCGACUUGUUCGGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCAGUAGCGAGGUUAACCGUAUAGGGGAGCCGUAGAGAAAUCGAGUCUUAAUAGGGCGUUUAGUUGCUGGGUAUAGACCCGAAACCAGGCGAUCUAUCCAUGAGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCCACUGUCGUUGAAAAGCCAGGGGAUGACUUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCUAAUCAAGCCUGGUGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGGACGAAUACCAUAGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCUAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAAACCGAUGCAAACUCCGAAUACCUAUGAGUACUAUCCGGGAGACAGACUGCGGGUGCUAACGUCCGUAGUCAAGAGGAAAACAAUCCAGACCGCCAGCUAAGGCCCCAAAAUCAUAGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCAUAGACAGCUAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAAACUAUGUGCCGAAGCUGCGGAUUUGACUUUUAAGUCAAGUGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCGAUGAAGGUGUAUUGAGAAGUAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACGUGAGUAACGACAAAACGGGUGAAAAACCCGUUCGCCGAAAGACCAAGGGUUCCAGUCCAACGUUAAUCGGGGCUGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACUUCUGUGUAAUGCGAUGAGAGGACGGAGAAGGUUAAGUCAGCCUGGCGUUGGUUGUCCAGGUGAAAGGAAGUAGGCAUGCAUCUUAGGCAAAUCCGGGGUGCUCUAUGCUGAGAUCUGAUAGCAAGCUGUACUUGUACAGCGAAGUGGCUGAUACCAUGCUUCCAGGAAAAGUCUCUAAGCUUCAGUUACACAGGAAUCGUACCCUAAACCGACACAGGUGGUCAGGUCGAGUAGACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCUGCUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUACCGUAACUUCGGGAGAAGGUACGCUGUUGUUGGUGAUGGAACUUGCUUCCUGAGCUGAUGACAGCCACAGAAACCAGGCCGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACAUAGCACUCUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAGUGAUGGGGUUAGCGUAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCAUAAUGAUGGCGGCGCUGUCUCCAGCAGAGGCUCAGUGAAAUCGAAAUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGCAGCUUGACAUUGAACUUUGACCUUACUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUUGGAACGCUAGUUCCAAUGGAGCCGUCCUUGAAAUACCACCCUGGUAAUGUUGAGGUUCUAACUCUGCCCCGUAAUCCGGGGCGAGGACCAUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGUACGAAGGUGCGCUCAGCGUGGUCGGAAAUCACGCGUAGAGUAUAAAGGCAAAAGCGCGCUUAACUGCGAGACCCACAAGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGUCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCUGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCUCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGAGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUACCGUGGGCGCUGGAAAUUUGAGAGGAUCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCAGAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCGGUUGUGACGCCAGUCGCAUCGCCGGGUAGCUAUGUUCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCUACCUAAGAUAAGAUUUCCCUAGGACUUUAUGUCCUCUAAAGAGCCGUUCGAGACUAGGACGUUGAUAGGUUGGAUGUGGAAGCAUAGUGAUAUGUGAAGCUGACCAAUACUAAUUGCUCGUGAGGCUUGACUAUACAACACCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD..DD.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((...(((..(((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).bbb.....))BBB...)))...)))))))))))))...)))......(((((((((.......)))))))))......(((((..aaaa)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((.....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....h.hhhhhh...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......HHHHHHH)))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((gggg.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))...))))...))))...)).((((((((....))))))))..)))))...)))...))))........))))))..))....)))))))))))GGGG..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))(...).......(((((((((..((e....(....E))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ccccc..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).CCCCC))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....(((((((({...(..})))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..AAAA..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...ffffffff..(.((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).)))..)...FFFFFFFF..(((((.....)))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......((((((((((((((((((((..(((((((..(((........)))..((((((.......((((......(((........(((........)))(((((((...((((((..((((((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).........)))....(((......)))...)))))).....)))))))......(((((((...................))))))).))).(((((..(((((((((((((.(((...(((..........)))........(((.......)))...)))...))))))))))))))))))..)))).((((((((.........)))))))).....(((((((....))))))))))))).......))))))).......(((......))).........)))))........(((((...)))))..........))))....)))))))))))....(((((....(((((.....))))).)))))(((((((((((....((((((.......(((((((((((((..((((.............))))......((((...((((.....)))))))).)))))))))))))))))))..(((((((..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((..(((....)))))))))....))))))))))))(((.....)))......)))))))(((((((........[[[..))))))).((((...))))]]].....(((((((((.....(((...(((.((((.....(((((.[[[[)))))......)))).)))..)))......)))))).)))......]]]]....(((((((((((....)))))))))))....(((......)))......((((....((((((....((((......)))).......((((...((((...(((.(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..)))))...))).)))).))))...........)))))).(((((((.((((((((((((((((((((((....))))))))....((((....((((((.(((((.....(((((((((((.....(((((((((.......(((((.........(((.....)))....(((((((.....)))))))((((....((((.(((((((((((((...........)))))))).........(((...(((...(((....)))...)))...)))..(((((........)))))..(((((((((((.......((((..(((((...........((((((..........))))))....((((((((((((((((((............))))))...))))).........((((..((((((....))))))......))))......)))))))........)))))...)))).))))))))))).....)))))..(((......))))))).((((.....))))..))))...(((....)))(((..((((((...(((....((((...(((.((((....)))).)))((((((((((((...((((.....))))...)))))))))))).......)))).)))(((((..(((((((((.....(((.((((((((....(((....)))......))))))))...((((..(((....))).))))...)))..((((((......(((...))).........))))))))))))))).((((((.......)))))).....)))))....))))))((((((.....))))))..))).......(((....)))...))))).)))))))))....)))))))..........((((((......))))))))))..)))))..))))))...))))...........)))))))))(((((.((((((.....(((((.....(((...(((((((((((((...((((((((....)))))))))))))).))))......)))..)))))))).....))))))...(((.((((((.....)))))))))....)))))))))).)))))))..))))......(((((((...........))))))).....(((((((((..(((((((.....)))))))[[[[..............)))))))))..]]]]((((((........[[[[...(((....)))))))))........(((((((((.......)))))))))]]]].....))))))))))).(((((((......((((((((((((.....(((......)))))))))).)))))(((((((((......))))..(((((((((((......)))))).)))))......[[[[[[........)))))..]]]]]]..(((...(((((((....))).)))).[[[[......)))..]]]](((((.............[[[.[[[)))))..]]]]]](((((((....[[[[[)))))))...(((..((((((....))))))....)))........]]]]]...(((....(((((......[[[[.)))))....))).....]]]]......)))))))........((((((....))).[[[[[..)))..]]]]]...(((.[[[[[.)))....(((((....)))))........]]]]]................))))))))...........
|
|
CRW_00474
|
[ FASTA input ]
|
AUCAAGUGUCUUAAGGGCAUUUGGUGGAUGCCUUGGCAUGCACAGGCGAUGAAGGACGUGAUACGCUGCGAUAAGCUACGGGGAGGUGCGAAUACCCUUUGAUCCGUAGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCACCUUUGACUGCUGGAAACGUUAAGCUGUUUUGCAAAAGACAGUUUAGGUUUCUAGUUGUCUUUAAUAAGGUAUCUUCAUCUGAAUAAAAUAGGGUGUAAGAAGCGAACGCAGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCUGUAGGAAAGGACAUCAACCGAGACUCCGUUAGUAGUGGCGAGCGAACGCGGACCAGGCCAGUGGCUUAAAUUUAGAAAAGUAGAAUCGAUUGGAAAGUCGAACCAAAGAGGGUGAUAGUCCCGUAUACGUAAAUCUGAUUUAAGUCCUUGAGUAAGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAACAUGGGUCGACCACGAUCCAAGCCUAAGUACUCGUGCAUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCCCGACGAGGGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGAAUGCCUACAAACAGUCGGAGCCCAAGAUUUGUUCUGGGUGACGGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAGUCUAACGAGCAAGCUUAAGCCGAUAGGUGUAGGCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUCAGUUCGUUGGAUUAGACCCGAAACCGAGUGAUCUAGCCAUGAGCAGGCUGAAGGUAAGGUAACACUUACUGGAGGGCCGAACCCGUAUCUGUUGCAAUAGAUUGGGAUGACUUGUGGCUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCGGAAAUAGCUGGUUCUCCGCGAAAUCUAUUUAGGUAGAGCGUUAGUUGAAUUCUCCAGGGGGUAGAGCACUGGAUGGGCUAGGGGUCCUCACCGGAUUACCAAACCUAACCAAACUCCGAAUACCUGGAAGAACUGACUGGCAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGGAAAGGGCAACAACCCUAACCACCAUCUAAGGUCCCCAAGUUAUGGCUAAGUGGGAAAGGAUGUGAGGAUCCCAAAACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAACAGCUCACUGGUCUAAAUAAGGGUCUUUGCGCCGAAAAUGUAACGGGGCUAAAGCCAUACACCGAAGCUGUGGAUUUACUCUUAUGAGUAAGUGGUAGCGGAGCGUUCCGUAAGCCUGUGAAGGGAGACUCGCGAGAGCUCCUGGAGGUAUCGGAAGUGAGAAUGCUGACAUGAGUAACGAUAAAGGGAGUGAGAGACUCCCUCGCCGAAAGUCCAAGGGUUCCUGCUUAAAGUUAAUCUGAGCAGGGUGAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAACCACGUUAAUAUUCGUGGACCUGUGGGAAGUGACGGAUUAGGAAUAUUGUAAGGUCUUAUUGGAUUGAUCUUGCAGUAGAAUAAUCCCAGGAAAUAGCUCCCACAUAUAGACCGUACCCGAAACCGACACAGGUGGACAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUACGUUGAAGGAACUCGGCAAAUUGCACGCGUAACUUCGGAAGAAGCGUGACCCUUUAGCGGGCAACCGUUAGAGGGUGGCACAGACCAGGGGGUAGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGGCUCUGCGAAGUCGCAAGACGAUGUAUAGGGUCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGAUGUGCAAGCAUUGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGACUUCCCCGCUGUCUCCAACGUAGACUCAGUGAAAUUGAAUUCCCCCGUGAAGAUGCGGGGUUCCUGCGGUUAGACGGAAAGACCCCGUGCACCUUUACUAUAGCUUUACACUGGCAUUUGUGUCGGCAUGUGUAGGAUAGGUGGUAGACUUUGAAGCAGGGGCGCUAGCCCUUGUGGAGUCAUCCUUGAAAUACCACCCUUACCGACAUGGAUGUCUAACUGCAGUCCGUUAUCCGGAUUCAAGACAGUGUAUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCGCGAAGGUAGGCUCAGAACGGUCGGAAAUCGUUUGUUGAGUGCAAUGGCAUAAGCCUGCCUGACUGUGAGACUGACAAGUCGAGCAGAGUCGAAAGACGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACGCCGGGGAUAACAGGCUGAUGACCCCCAAGAGUCCAUAUCGACGGGGUUGUUUGGCACCUCGAUGUCGACUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGUGAGUUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGUGUAGGAAUAUUGACAGGAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUAUCUCUGGUGGACCUGUUGUGGCGCCAGCCGCAUAGCAGGGUAGCUAUAUACGGACGGGAUAACCGCUGAAGGCAUCUAAGCGGGAAACCCACCUGAAAACGAGUAUUCCCUUGAGAACCGUGGUAGACCACCACGUUGAUAGGUCAGGCGUGGAAGUGUGGUAACACAUGAAGCUUACUGAUACUAAUAGUUCGAUUGGCUUGAUCGUUCUCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.gg.gggg)))...G.(((((((..(((GGG.GG.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((.(((.(((((((((.((((((((((((....))))))))))))))))))))).)))......))))).(((((((((..........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((((.(((...(((...(((((......)))))(((...).aaa.....))AAA...))).....)))))))))))))........(((((((((.......)))))))))......(((((..[[[[)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((.((.......))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((......))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....<.<<<<<<...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))........)))))))))))))............))......>>>>>>>)))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.(((((((.(((......(((((.(((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((cccc.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))((((((((..(...((((......(((((.((((((..........)))))).))))).....))))........)..)))))....)))CCCC..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((....))))))))))))(...).......(((((((((..((b....(....B))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....((.(((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).IIIII))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh....hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)(.(((HH....HHHHHH....((((((((f...(..F)))))))).(((....))).HH))).).....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...eeeeeeee..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...EEEEEEEE..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...)))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...)))))))))))..((((....)))).....((((.....[[[.......))))........(((((((..((((....))))......)))))))...]]]....(((....)))(((((.(((.(((((((((.((((((((((((....))))))))))))))))))))).)))......))))).(((((((((..........))))).)))).......(((((..(((......[[[.))).)))))......]]]......(((..(((.[[[[)))..)))..]]]]..(((((...((((....((((((((((.(((...(((...((((((....))))))........(((.......)))...))).....)))))))))))))........((((((((.........)))))))).....(((((((....))))))).))))...((((.((((............)))).))))))))).(((..(((((.......((((.....))))..........)))))....[[[[...)))........]]]].(((((..........)))))..(((((((((((((((....((((((.......(((((((((((((..(((((.(((....))).))))).....(((.....((((.....)))).))).)))))))))))))))))))...((((((..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((((....))))))))))....))))))))))))[[[..............)))))).....]]].(((((.......((((....)))))))))((((((((..(((((((((.....(((...(((.((((.....(((((.....)))))......)))).)))..)))......))))).)))).)))))))).....(((((((((((....)))))))))))...((((......))))....(((.[[[..))).(((((((....)))...))))..]]].(((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..)))))........)))))))))))(((....[[[[.)))(((....))).]]]]((((.((((...((((((((....))))))))..))))..[[[[[[[.....((((.....(((((.(((....))))))))..)))).))))......]]]]]]]........(((((....(((((((.....)))))))((((....((((..(((((((((((((.........)))))))))...(((...(((...(((...(((....)))...)))...)))..(((((........)))))...(((((((......((((((....((((((((((((..........))))))))))))...))))))...........)))))))....)))...))))...(((......))))))).((((.....))))..)))).............)))))..........(((...))).((((...((((....))))))))((((((((((((....))))))))))))....((((((....(((((.......))))).........[[[[..((((..(((....)))..))))...))))))......]]]]..((((((....((((.....(((((....)))))...)))).[[[))))))...]]]((((((.[[[...))))))....]]].(((..((((...((((((.....))))))......))))..)))...(((..[[[[[[.)))....(((.....(((((...))))).......)))......]]]]]].(((.[[[[......)))......]]]].......((((...(((.((((((((((((((((((((......((((...(((((((((((((...((((((((....))))))))))))))..........))))))))))))))))))))))))........((((((.....)))))).....))))))).))).)))).((((((((..(((..(((((((...........))))))))))..[[[[[[[[[.....)))))))).............((((....)))).]]]]]]]]]..(((...((((....))))[[[))).(((....)))(((((...))))).(((((.(((........)))))))).]]].....)))))))))))))))(((..........[[[....)))..(((((.(((((((....(((....)))...))))))).)))))]]]..(((((((((((......)))))).)))))(((.....[[[[))).....]]]].(((......(((....(((((((....))).))))...)))..[[[[[)))....]]]]].............((((((((......[[[[.....))))))))....]]]].(((((.(((((((((((....))))))..)))))(((......)))....[[[[...(((((...........))))).....))))).............]]]].(((((((.......((((.[[[[[[.....))))..]]]]]]..(((((....))))).(((((...(((.(((...))))))...)))))....)))))))...
|
|
CRW_00476
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAAGUAAUAAGAGUCUAUGGUGAAUGCCUAGGAGCUUUAAGGCGAAGAAGGUCGUGGUAAGCUGCGAAAAGCUUGGGGGAGAAGCAAACAUUUAUUGAUCCCAAGAUUACCGAAUGGAGUAAUCCAGCUAGCAAGAUGCUAGCUAUCUAUUAUUUAAAUAAUAGAGGCGAUACCAGGGGGAAGUGAACCAUCUAAGUACCCUGAGGAAAAGAAAUCAAGGAGAUUCCCUUAGUAGUGGCGAGCGAAAAGGGAGUAGCCCAAACUUUAAAUGUGUCAAGCUGCAGAGCGUUGCAUUUAUGGGGUUGUAGGACGUUUAGGCUUAGUCUGUAAUAAGCAAAAAAGUUACAAAAUAUUUAUAUAGAAGAAUAAUCUGGAAAGUUUAACCAAAGAAGGUGAUAGUCCUGUAAUUUAAAUGUAAAUAUCUUUUUAAAAUGUUCCUGAGUAGGACGAGGCACGAGAAACCUUGUUUGAAGCUGGGGAGACCACUCUCCAAGGCUAAAUACUAGAAAGCUACCGAUAGAGAAGAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAACUGAAACCGUAGACUUACAAGCAGUCAAAGCCGUAAUUUAUUGCGGUGAUGGCGUGCCUUUUGCAUAAUGAACCUGCGAGUUAUCAUGUCUAGCAAGAUUAAAGCAUAGAAGUGCUGGAGUCGAAGCGAAAGCGAGUCUUAAAAGGGCGAUUUAGUUAGAUGUGGUAGACCCGAAGCCGAGUGAUCUAUUUAUGGCCAGGCUGAAGCUUGGGUAAAACCAAGUGGAGGGCCGAACUCUAGUCUGUUUAAAAAGGCAGGGAUGAGCUGUGAAUAGGAGUGAAAGGCUAAACAAACUCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGGAUUUAAGUUCAGCCUUAUUUUAGUUUAAUAGAGGUAGAGCACUAAUUGAGCUAGGGCCUGUCAAAGGGUACCAAACUCAGUUAAACUCCGAAUGCUAUUAAAUGAUGAAUAGGAGUGAGACUAUGGGCGAUAAGGUUCAUAGUCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAACAGCUAAGGUCUCAAAAAUGUGUUAAGUGGAAAAGGAGGUUUAGGUACGUAAACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUACCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUACUUAAGCGCCGAUAAUGUAACGGGGCUAAACACAUUACCGAAGCUUUGGAUCUUAACGAAAGUUAAGAUGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCAGAGAAGUUAAACUGGAAAGUUUGAUGGAGGUAUCAGAAGUGAGAAUGCAGGUAUGAGUAACGAAAAAAUGGGUGAGAUUCCCAUUCGCCGAAAACCUAAGGUUUCCUGGGUAAAGGUCGUCUUCCCAGGUUAGUCGGUCCCUAAGGCAAAGCUGAAAAGUGUAGUCGAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUACCUCUUAUAGUUUCGAUGGAGUGACGCAUGAGGUUAACUACUGCUAGGCGAUGGUUGUCCUAGUUUAAGCAUUAAGGUGAUGAUCUUGAUAGGAAAAUCCGUUAAGAGAGCUAAGAUGUGAUGAUGAGUGCUAUUUAGGUAGCAUGAAAUGUAGGUAGUCAAGGUGCCAAGAAAUAGCUUCUAAGGUUAGGCUAUAAGGGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGUGGGAUGAAAAUUCUAAGGCGCGCGAGAGAAUCCACGUUAAGGAACUCUGCAAAAUACGUACGUAACUUCGGGAUAAGUACGACCUAAGCAAUUAGGUAGCAUAAAAAUGGUCCAAACGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCUGCAAAUCUGUAAAGAGAAGUAUAGGGACUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGAUGUUAGUUUAUGCGAACGUUGAAUUUAGCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAUGGUGUAACGAUUUGGACGCUGUCUCAACGUGGAGCUCGGUGAAAUUGAAGUAUCGGUGAAGAUGCCGAUUACUUGUGGUUAGACGGAAAGAUCCGUGAACCUUUUACUAUAGCUUGGUAUUGAGAUUUGAUUAAAUAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGACUUUGAAGCUAUCUCGUCAGGGGUAGUGGAGUCAAUCUUGAAAUACCACCCUUGUUUAAUUAGGUUUCUAACUUAUAGAAAUAUGAGGAGAGUGCCAGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGUGCGCAAAGGUUACCUUAGAGUGGUUGGAAAUCACUCUGUAAGUGUAAAGGCAUAAGGUAGCUUAACUGUAAGACUGACAAGUCGAACAGAUACGAAAGUAGGUCUUAGUGAUCUGGCGGUGGCAAGUGGAAGCGCCGUCACUUAACGAAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUUAUCCUUCCCAAGAGUUCACAUCGACGGAAGGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUAGGGCUGGAGCAGGUCCUAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCCACAAGCGUUGGAUAUUUGAGAGGAGCUAUCUUUAGUACGAGAGGACCGAGAUGGACGAACCUCUAGUGUACCAGUUAUCCUGCCAAGGGUAAGUGCUGGGUAGCUACGUUCGGAAAGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGUGGGAAGCCUUCCUCAAGAUGAGAUAUCCUUUAAGGGUCCUGGAAGAAUACCAGGUUGAUAGGUUAGAAGUGUAAGUAUAGCAAUAUAUUAAGCUGACUAAUACUAAUUACCCGUAUCUUUGGCCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((...)))))))).((((((((....)))))))).))....(((.(((.....((....))......))))).).........((...))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((.((((((((....(((....)))..)))))))).))......((((((((...(((((((....)))))))...........(((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).{{{.....))}}}...)))...)))))))))).)))....)))).)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..hhhh)))))..))))..)..)).))))))).))..............((....))....)).........((((....))))............).....)))))))))).....(.(((((((((((((....)))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((((....)))))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((.(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).)....))))))))))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....bbbbbbb...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))...)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....BBBBBBB)))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))...((ffff.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((...(((((((((((..........))))))((..((((...(((.....(((((((.((.....)))))))))..)))...))))...)).(((((((((....)))))))))..)))))...)))...)))).........))))))..))...)))))))))))FFFF..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((....))))))(...).......(((((((((..((<....(....>))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(.(...((.(((((((..((....))..))))))).))..)))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((.....((((.(((((((..((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ggggg..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).GGGGG))))))))))))))))))...((((((....)))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ee....eeeeee((.((((((.......))))))...))ee)(.(((EE....EEEEEE....(((((((([...(..])))))))).(((....))).EE))).).....(((((((.((..HHHH..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...iiiiiiii..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...IIIIIIII...(.(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....................(((((.....[[[[.)))))..]]]].((((((....))))))...((((..[[[[.)))).............]]]]..((((((........)))))).((((((((...)))))))).((((((((....))))))))..((((......((((((.............(((((..((((((...((((.....)))).((((((.........(((((..((((((.(((((...................(((((((((((.(((((.(((((...((((((((((..(((((........))))).((((((.......((((((((((...(((....)))(((..(((..(((......))))))..)))..........)))))))))))))))).))))).))))).((((...(((((((.........((((((.((((..(((((....)))))..)))).............((((...........................(((........((((....))))(((........)))...))))))).....))))))((((..(((((((....)))))))..))))))))))))))).....(((((......((((((((((((((..((((..(((((....)))))..))))(((..........((((.....))))..))).))))))))))))))........((((((..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))))(((.....)))......))))))........))))).)))))))))).........(((..(((((((..(((((((((.....(((...((((((((.....((((......))))......))))))))..)))......)))))))))...)))))))..)))((((((((((......)))))))))).............(((..((((....(((((((......((((((((.(((..........((((((((((.......(((((((((((((((.......))))).)))))....((((........)))).)))))...)))))))))).(((.........))).))).))))))))......))))))).(((((((....)))))))))))..)))))))))))))).(((......((((((((....))))))))...))).(((....)))...(((........))).........)))))...)))))).))))).......)))))))))))))))))........))))))......)))).((((...(((...(((....)))...)))...)))).(((((........))))).(((((((........(((...[[[[.)))...]]]]......(((((((((...))).))))))....(((((..(((.....(((((((.(((...))))))))))..)))..)))))..((((..(((((((....)))))))........[[[[))))...]]]].(((.[[[[[[))).......]]]]]]..((((((((.......(((..[[[.)))..]]]((((....))))........(((......[[[.)))...]]]....(((......[[[[[)))............]]]]]((((((....)))))).(((...((((((((.....)))))))).........[[[[[[...)))..]]]]]].......(((.[[[[.)))....]]]].....((((((...((((((....((((((......[[[[))))))...)))))))))))).........]]]]......))))))))((((..[[[.....))))((((((.....)))))).]]].(((((.........)))))..(((.[[[[[[[.)))(((((.(((((((...((((((((((......))))).)))))..((((..(((((....))))).)))))))))))..)))))....]]]]]]]...............((((((.[[[[...((((((...((((((((....)))))))))))))).))))))...]]]]((((...........(((((((..((((((....)))))).)))).))).[[[))))......]]]...(((..(((((((...........))))))))))..(((((((((((((((((((...)))))))))....((((....))))))))))))))..((((..((((....))))..)))).(((....)))((((.....))))((((((((......[[[..))))))))...................]]]...........(((.((((((((.............[[[[))))))))..)))........]]]](((..[[[[(((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))....))).....]]]]((((((.(((((..(((....)))..))))).)))......[[[..)))..]]].....))))))).(((.[[[[[)))....]]]]]..(((.....[[[[[)))((((....((((((((((....))))))...))))....)))).]]]]]..((((....(((((.....[[[[[.)))))....)))).....]]]]]...((((......[[[[(((((.......)))))..)))).(((((.(((...((((((....))))))..)))..))))).......]]]]....))))))))..
|
|
CRW_00478
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGCGAACAAGUGCAUGUGGUGGAUGCCUUGGCGAUCACAGGCGAUGAAGGACGCGGUAGCCUGCGAAAAGCUACGGGGAGCUGGCAAACGAGCUUUGAUCCGUAGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCGGCCCUUUUGGGUCAUCCUAGACUGAAUACAUAGGUCUAGUGAGGCGAACGCGGUGAACUGAAACAUCUAAGUAACCGCAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCAAAGUAGUGGCGAGCGAAAUGGGAAGAGCCUGUACUCUUUAUUUGUAUUGUUAGCCGAACGCUCUGGAAAGUGCGGCCAUAGCAGGUGAUAGCCCUGUAGGCGAAAACAGUAUGAAAGAACUAGGUGUACGACAAGUAGGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAAGAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCGUGAUCGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCGCAUGCAUACAAACAGUCGGAGCCUCUUCGGGGGUGACGGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUACGUUCAGUAGCAAGCUUAACCGAAUAGGGCAGGCGUAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGUUCAGUUGCUGGGCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUAUCCAUGGCCAGGAUGAAGGUGCGGUAACACGUACUGGAGGUCCGAACCCACUAACGUUGAAAAGUUAGGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCUAAACAAACCUGGAAAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAACUAUUUAGGUAGUGCCUCGUGUCUCACCUUCGGGGGUAGAGCACUGUCAUGGUUGGGGGGUCUAUUGCAGAUUACCCCGCCAUAGCAAACUCCGAAUACCGAAGAGUGCAAUCACGGGAGACAGACAUCGGGUGCUAACGUCCGGUGUCAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCCAAAUAUGGCUAAGUGGGAAACGAAGUGGGAAGGCUAAAACAGUCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGAUCGAGUCGUCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAGCCAUAUACCGAAGCUGCGGAUGCGAGCUAGUCUCGCAUGGUAGGAGAGCGUUCCGUAAGCCUGCGAAGGUGCGUUGAAAAGCGUGCUGGAGGUAUCGGAAGUGCGAAUGCUGACAUGAGUAGCGAUAAAGGGGGUGAAAGGCCCCCUCGCCGUAAGCCCAAGGUUUCCUACGCAACGUUCAUCGGCGUAGGGUGAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCAGAAAUGCGUAGCUGAUGGGAAGCAGGUCAAUAUUCCUGCACCGUCGUUAGAUGCGAUGGGGGGACGGAUCGCGGAAGGUUGUCCGGGUGUUGGAAGUCCCGGUCGCUGCAUUGGAGAAGGCGCUUAGGCAAAUCCGGGCGCAGGAUUCAAGGGUGUGGCGCGAGCUCCUUCGGGAGCGAAGCAAUUGGAAGUGGUUCCAAGAAAAGCCUCUAAGCUUCAGUCUAACGAUGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGAGAAGGAACUCGGCAAAUUGGUACCGUAACUUCGGGAUAAGGUACGCCCUGGUAGCUUGACUGGCCUGCGCCAGAAGGGUGAAGGGGUUGCAAUAAACUGGUGGCUGCGACUGUUUAAUAAAAACACAGCACUCUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGAUUAAAUGAUGGGGUGCAAGCUCUUGAUUGAAGUCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGAUGGCCACACUGUCUCCUCCCGAGACUCAGCGAAGUUGAAGUGUUUGUGAUGAUGCAAUCUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCAUGAACCUUUACUGUAGCUUUGCAUUGGACUUUGAACCGAUCUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUAUGAAACCGGAAUGCUAGUUUCGGUGGAGCCGUCCUUGAAAUACCACCCUGGUUUGUUUGAGGUUCUAACCUUGGCCCGUGAUCCGGGUCGGGGACAGUGCAUGGUAGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCCAAAGCGUAACGGAGGAGUACGAAGGUACGCUAGGUACGGUCGGAAAUCGUGCUGAUAGUGCAAUGGCAUAAGCGUGCUUAACUGCGAGACCGACAAGUCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCUGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCUCAUCCUGGGGCUGUAGCCGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGAGGUACGUGAGCUGGGUUUAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUUGGAAGUUUGAAGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCGGUUGUGACGCCAGUCGCAUCGCCGGGUAGCUAUGUUCGGAAGAGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAACUCGCCUUAAGAUGAGACUUCCCCGGGGACUUGAUCCCCUUGAAGGGUCGUUCGAGACCAGGACGUUGAUAGGUCGGGUGUGUAAGCGCAGUAAUGCGUUCAGCUAACCGAUACUAAUUGCCCGUACGGCUUGAUCCUA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.hh.hhhh)))...H.(((((((..(((HHH..HH.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((....))))).(((((((((.........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.(((((.(((((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).<<<.....))>>>...)))...)))))))))))))))...)))))..........(((((((((.......)))))))))......(((((..gggg)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...((.(((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).)))..).)))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....ddddddd...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....DDDDDDD)))...)))))))(((((((.....)))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(([[[[.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...(((((((....(((((((((((..........))))))((..((((....((((((((((.((.....)))))))))...)))....))))..)).(((((((....)))))))..)))))....)))))))........))))))..))....)))))))))))]]]]..)).....((......)).)))).(((.......)))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....(((((((((((....)))))))))))...)))))(...).......(((((((((..((a....(....A))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).IIIII))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ff....ffffff((.((((((.......))))))...))ff)(.(((FF....FFFFFF....((((((((e...(..E)))))))).(((....))).FF))).).....(((((((.((..GGGG..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...cccccccc..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...CCCCCCCC..(((((.....)))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......((((((((((((((((((((..(((((((....(((...((((((((....))))......((((((((((((........)))))...)))))))..))))....(((....)))(((((....)))))...(((((((.........)))))))..........(((((..(((..........))).)))))..........)))....(((.((((((..................)))))).((((((((((((((...(((((((((.(((...(((..........)))......(((((.......))))).)))...)))))))))))))).......))))........((((((((.........)))))))).....(((((((....)))))))))))).....)))))))))).......(((......))).........)))))........((((....))))..........))))....)))))))))))....(((((((..(((((....)))))..))))..[[[[..))).....]]]]........(((((((((((((..((((.............)))).....(((.....((((.....)))).))).)))))))))))))((((.....((((((..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))))(((.....)))......))))))...((((((((..(((((....(((((....)))))....((((...(((((((((.....(((...(((.(((((.(((.(((((.....))))).))).))))).)))..)))......)))))).)))....)))))))))..(((((((((((....)))))))))))....(((......))).....)))))))).))))((((......[[[...))))......]]]((((((.(((.........[[[[[.[[[[[)))....]]]]].]]]]].......(((.....((((.......)))).[[[[[[)))...........]]]]]]...........(((.[[[[.))).....]]]]..((((.[[[[....))))((((((((...((((.....((((((((....))))))))..))))..))))).))).........]]]].((((((((..(((((((.....))))))).(((....[[[...))).((((((((...........))))))))......]]](((...(((...(((....)))...)))...)))..((((.[[[[[[[[[)))).(((((((.....)))))))..(((((.(((......))))))))]]]]]]]]]........))))))))..........(((((.......[[[[.))))).........]]]]..(((....(((((....)))))[[[[[..((((((....)))))).....))).....]]]]].(((....)))(((((((((....(((......)))(((((....[[[[.........)))))......]]]]..(((......)))............(((..[[[[)))....]]]].((((((.[[[[[[...(((((....))))).))))))....]]]]]]..........((((((((((((((.............((((((((....(((....)))......)))))))).(((.(((((...((((((..((((.(((...(((((....)))))..)))..))))))))))...))))).)))......)))))))..((((..........))))((((((.....)))))).(((.....[[[[)))......]]]](((.(((((.....)))))(((((...))))).[[[[[.)))..]]]]].........)))))))..........(((((.........(((((.(((.((((((((((((......((((.....(((...(((((((((((.....((((((((....))))))))..)))).))))......)))..)))))))......)))))....((((((((((.....)))))))))).))))))).)))..))))).....))))).....((((((...[[[[[[..)))))).........]]]]]].))))))))).......(((((...[[[[[...)))))....]]]]]...((((..(((.[[[..)))..)))).(((....))).]]]......(((((((((((((.......))))))))).[[[[..))))...........]]]]...........(((((((((...[[[[[.........))))))))).((((......))))]]]]](((((((((((((((((....))))))).)))))......[[[[[[........)))))..]]]]]].(((.(((((..(((....)))..))))).)))......(((.[[[[..)))..]]]]...(((..(((((((...............))))))).[[[[[)))((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).]]]]]..........(((((.....[[[[[.))))).............]]]]]...)))))).(((.....[[[[[)))....]]]]]((((..[[[[.)))).......]]]].(((..[[[((((((....))))))......)))..]]]..............))))))))...
|
|
CRW_00487
|
[ FASTA input ]
|
AGGUAAGCUACUAAGAGCGAAUGGUGGAUGCCUUGACUGGUAAAGGCGAUGAAGGACGUACUAGACUGCGAUAAGCUACGGGGAGCUGUCAAGAAGCUUUGAUCCGUAGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCAAUGUAUAGAGAUAUACAUUACCUAUAUAGGAGCGAACGAGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCUCAGGAAAAGAAAUCAAUAGAGAUUGCGUCAGUAGCGGCGAGCGAAAGCGCAAGAGGGCAAACCCAGUGCUUGCACUGGGGGUUGUAGGACUGCAAUGUGCAAGAGCUGAGUUUAGCAGAACAUUCUGGAAAGUAUAGCCAUAGAGGGUGAUAGUCCCGUAUGCGAAAAACAAAGCUUAGCUAGCAGUAUCCUGAGUAGGGCGGGACACGAGGAAUCCUGUCUGAAUCCGGGUCGACCACGAUCCAACCCUAAAUACUAAUACCAGAUCGAUAGUGCACAAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACUGAGGUGAUCAGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCAUUUGCUUACAAUCAUUCAGAGCACUAUGUAGCAAUACAGUGUGAUGGACUGCCUUUUGCAUAAUGAGCCUGCGAGUUGUGGUGUCUGGCAAGGUUAAGCAAACGCGAAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCUUAGUCAGAUGCUGCAGACCCGAAACGAAGUGAUCUAUCCAUGAGCAAGUUGAAGCUAGUGUAAGAACUAGUGGAGGACUGAACCCAUAGGCGUUGAAAAGCCCCGGGAUGACUUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUUCGUGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAUAUUUAGGUAUAGCGUUGUGUCGUAAUAUAAGGGGGUAGAGCACUGAAUGGGCUAGGGCAUACACCAAUGUACCAAACCCUAUCAAACUCCGAAUACCUUAUAUGUAAUCACAGCAGUCAGGCGGCGAGUGAUAAAAUCCGUCGUCAAGAGGGAAACAACCCAGACUACCAGCUAAGGUCCCUAAAUCUUACUUAAGUGGAAAACGAUGUGAAGUUACUUAAACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCUAGUGAUUUUGCGCGGAAAAUAUAACGGGGCUAAAGUAAGUACCGAAGCUGUAGACUUAGUUUACUAAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAUUUGCGUCGAAGGUAUACCGGUAAGGAGUGCUGGAGCGAAUAGAAGUGAGCAUGCAGGCAUGAGUAGCGAUAAUUAAUGUGAGAAUCAUUAACGCCGUAAACCCAAGGUUUCCUACGCGAUGCUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGUCGAGUCCGAAAGGGGUAGACGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCAACAUUAGUGUGCGAUGGAAGGACGCUUAGGGCUAAGGGGGCUAGCGGAUGGAAGUGCUAGUCUAAGGUCGUAGGAGGUUAUACAGGCAAAUCCGUAUAACAAUACUCCGAGAACUGAAAGGCUUUUUGAAGUCUUCGGAUGGAUAGAAGAACCCCUGAUGCCGUCGAGCCAAGAAAAGUUUCUAAGUUUAGCUAAUGUUGCCCGUACCGUAAACCGACACAGGUGGGUGGGAUGAGUAUUCUAAGGCGCGUGGAAGAACUCUCUUUAAGGAACUCUGCAAAAUAGCACCGUAUCUUCGGUAUAAGGUGUGGUUAGCUUUGUAUUAGGAUUUACUCUGAAAGCAAGGAAACUUACAACAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUCUGCUAACUCGUAAGAGGAUGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCAUUAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGUCUCAAAGAGGGAUCCAGUGAAAUUGUAGUGGAGGUGAAAAUUCCUCCUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGGACCUUUACUACAGCUUGACACUGCUACUUGGAUAAGAAUGUGCAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAGUAUAUGACGCCAGUUGUAUAUGAGCCAUUGUUGAGAUACCACUCUUUCUUAUUUGGGUAGCUAACCAGCUUGAGUUAUCCUCAAGUGGGACAAUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAUAAUAACGGAGGCUUACAAAGGUUGGCUCAGAACGGUUGGAAAUCGUUCGUAGAGUAUAAAGGUAUAAGCCAGCUUAACUGCAAGACAUACAAGUCAAGCAGAGACGAAAGUCGGUCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAAAGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGCUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUAAGAAGAUUGAAGAGAUUUGACCCUAGUACGAGAGGACCGGGUUGAACAAACCACUGGUGUAGCUGUUGUUCUGCCAAGAGCAUCGCAGCGUAGCUAAGUUUGGAAAGGAUAAACGCUGAAAGCAUCUAAGCGUGAAGCCAACUCUAAGAUGAAUCUUCUCUAAGCUCUCUAGAAGACUACUAGUUUGAUAGGCUGGGUGUGUAAUGGAUGAAAGUCCUUUAGCUGACCAGUACUAAUAGAGCGUUUGGCUUAUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((....)))))))).(((....))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((....)))))))......((((((((.....((..(((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).ccc.....))CCC...)))...))))))))))).))..))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..eeee)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((((((....)))))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((....))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...((((((......)))).))...)))).)))..)).)....))))))))))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....f.ffffff...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....FFFFFFF)))...)))))))((((((....))))))....))))))(.((((((((((......((((((((.....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((bbbb.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((.((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...)).(((((....(((....)))....)))))..)))))...)))...))))........))))))..))..)))))))))))BBBB..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((..(((((((((((((.....))))))))))))).))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..<<<<<..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).>>>>>))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....((((((((h...(..H)))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..EEEE..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...aaaaaaaa..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...AAAAAAAA..(.(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
......(((.[[[..)))......]]].((((((..[[[[[.))))))...........]]]]].....(((...[[[[[[[[[[[[)))....]]]]]...]]]]]]].(((((...((((....)))).(((((((.............)))))))...[[[[..(((((..(((((......))))).))))).)))))...............]]]]......................((((((((.....(((((((....)))))))((((((((((((((..(((((...[[[[[[[[[[..((((....))))....)))))..((((..(((.......))).)))).........]]]]]]]]]].))))).(((((..[[[[[))))).....(((............)))((((((....))))))..]]]]]..(((((............)))))(((...[[[[))).......]]]]......(((..[[[..[[[[)))..........]]]].]]].....))))))))).((((..(((((..(((....))))))))..))))...)))))))).......(((((((..((((((((((((((..((((............)))).......(((((..(((.....)))))))).)))))))))))))).......(((((((((((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..)))....))))))))))).(((.....))).)))..)))))))....(((....((((((.(((....))).((((((((((((((.....((((((((.....(((...(((..(((.....((((......))))......)))..)))..)))......)))))))).....))))))((((.(((((((...(((...))))))))))....(((......))).))))....)))..((((((.......(((....)))........((((((((((((......(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..)))))..)))))))))))).............)))))).......)))))...(((....((((((....))))))))).))))))..((((((((((......(((((...........)))))...))))))))))...))).)))))))..............((((((.......)))))).(((....[[[[..))).(((((((.(((....)))..)))))))......]]]](((...(((.[[[)))...)))..]]]..(((...[[[[[))).....]]]]].(((.....[[[[[....)))....]]]]]...((((....(((((((((........)))))))))..))))...(((((((((((.[[[......)))))))....)))).....(((((.(((((....))))))))))((((.(((........)))...))))...]]].((((....)))).(((((.((((((((((((((((((..........((((.((((.((((((((((((((((.(((.((((((((....))).........)))))......((((((((((...)))))..))))).........))).))))))..))))).......(((....)))..........))))).)))).))))..............((((((((....(((....)))......))))))))...........)))))((((.......))))..))).)))))))))).))))).....(((..[[[)))......]]]((((((.[[[...))))))....]]].(((..((((...((((((.....))))))......))))..))).......((((.[[[[[))))....(((...((((...))))....(((((........)))))..)))]]]]]............(((((...((((((......(((((((...((((((..(((((((((((.....)))(((((..(((((...(((((((((....))))))))))))))(((.....))).)))))..))))))))..))))))......(((((((.....)))))))......((((((.((((((((...(((((...)))))((((((...........))))))))))..(((((((((..((((((((...)))))))).....((((....)))).)))))))))..)))).))))))....)))))))...(((....))).(((((..(((..((((((((((.......)))))))))).))).))))).))))))....)))))..........(((((((((...[[[[[.........))))))))).((((......))))]]]]]((((((((((((((((......)))))).)))))......[[[[[[........)))))..]]]]]].(((....(((((((....))).))))[[[))).....]]].((((.......(((((.....)))))...))))....(((((((...((((.....))))..((((...(((((((((((....))))))..)))))...))))...((((.........(((((.....[[[[[.)))))....)))).....]]]]]..)))))))...((((((((..(((((...)))))..)))(((((.....(((.((((....)))).))).....))))).[[[[.)))))..]]]].........
|
|
CRW_00488
|
[ FASTA input ]
|
UACAGACCAAGUUAUUAAGAGCUAUUGGUGGAUGCCUUGGCAUUGACAGGCGAUGAAGGAUGCGUUUACCUGCAGUAAUCUUCGGCGAGCUGGUAUAAAGCUAUGACCCGGAGGUCUCCGAAUGGGGCAACCCGGUAGAUUAAUCAUCUACCAUUAUACGUUGAAUACAUAGGCGUAUAAGGCGACACCUGCUGAACUGAAACAUCUUAGUAAGCAGAGGAAAAUAAAUCAAAGAGAUUCCCUAAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGAGAAGACCAAACCACAUUUUUAAUGUGGGGUUGUAGGGUCGAUAACAUGGGAUCUUAAGUUUUAGUUGAAUACUUCUGGAAAGUAGAACGAUACAGGGUGAUAGUCCCGUAGACGAAAAAACAAGAGACUCUAUUCGAUACCUGAGUAGGGCUAGACACGUGAAACCUAGUCUGAAUCUGGGGAGACCACUCUCCAAGUCUAAAUACUAGUCAAUGACCUAUAGUGAACCAGUACUGUGAAGGAAAGGUGAAAAGAACCCUUGUUAAGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCAGUAGCUUAUAAGCGGUCGAAGACCUAUAACUUCUUAGGAAGUCAUGGUUGACGGCGUGCCUUUUGCAUGAUGAGCCAGGGAGUUAAGUUAAACGGCGAGGUUAAGGGAUUUACAUUCCGGAGCCGAAGCGAAAGCGAGUUUUAAAAGAGCGUUUAGUCGUUUGAUUUAGACACGAAACCAAGUGAGCUAUUUAUGACCAGGUUGAAGCAUGGGUAAGACCUUGUGGAGGACCGAACCAGUACAUGUUGAAAAAUGUUUGGAUGAGUUGUGAAUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUUGGAGAUAUCUUGUUCUCUCCGAAAUAACUUUAGGGUUAGCCUCGGAUAUUAAGCUUUUGGGGGUAGAGCACUGAAUUCUAGCGGGGGCCUACCGGCUUACCAACGGAAAUCAAACUCCGAAUACCAAAAGCGAGUCCGGGAGAUAGACAGCGGGGGCUAAGCUUCGUUGUCGAGAGGGGAACAGCCCAGACCGCCGAUUAAGGUCCCAAAUUUUAUGCUAAGUGAGUAAGGAAGUGAUGAUUCUAAGACAGUUGGAAUGUUGGCUUAGAGGCAGCAAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAAUCGAGAAUCAUUGCGCCAAUAAUAAUCGGGGCUCAAGCAUAAAACCGAAAUCGCGGGUGUAUAUUUAUAUAUACGCGGUAGGAGAGCGUAGUAUUCAGCAGUGAAGGUAUACCGUAAGGAGUGCUGGAGCGGAUACUAGUGAAGAUCCAUGGCAUAAGUAACGAUUAAGGAAGUGAAAAUCUUCCUCGCCGUAAGCACAAGGUUUCCAGGGUCAAGCUCGUCUUCCCUGGGUUAGUCGGCCCCUAAGUCGAGGCACAAAUGCGUAGACGAUGGAGCAACAGGUUAAAUAUUCCUGUACCACCUAAAACUUUAGCAAUGGAAUGACGGAGUACGUUAGCACGCGGACGAUUGGAAAUGUCCGUAUCACAAUGAGACCGGUUAGUAGGCAAAUCCGCUAACAUAAGGUUAGGUUGUGGUUAAGGGAAAUCUUCGGAGGAACUGAUAGUGUGGCGCAAGGCUUUCAAGAAAUAAUUUCUAGCUGUUGAUGGUGACCGUACCUAAACCGACACAGGUGUGCGAGAUGCGUAUUCUAAGGCGGGCGAGAUAACUUUCGUUAAGUAACUCGGCAAAUUAUCCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGAGCCUCUUAGGGUGAUUGCCUUUACGGCAUGAGCUCCGGGGGGCCGCAGAGAAAUGGCCCAGGCGACUGUUUAACAAAAACACAGCACUAUGCAAACCUCUAAGGGGAAGUAUAUGGUGUGACGCCUGCCCAAUGCCAAAAGGUUAAAGGGAUAUGUCAGCCGCAAGGCAAAGCAUUGAACCCAAGCCCUGGUGAAUGGCCGCCGUAACUAUAACGGUGCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGUGUAACGAUCUGGGCACUGUCUCAACGAAAGACUCGGUGAAAUUGUAGUAGCAGUGAAGAUGCUGUUUACCCGCAAAAGGACGAAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUACUUUGGUAUUGAUUCUUGAUUUGUUAUGUGUAGCAUAGCCAGGAGACUGAGAACACUCUUCGUCAGGAGAGUGGGAGUCAUCGUUGAAAUACUGGUCUUAACAAGUUGGGAAUCUAACAUAAUUCCAUGAAUCUGGAAUAUGGACAUUGCCAGACGGGCAGUUUUACUGGGGCGGUAUCCUCCUAAAAAGUAACGGAGGAGCCCAAAGCUUAUUUCAUCGUGGUUGGCAAUCACGAGUAGAGCGUAAAGGUAUAAAAUAGGUUGACUGCAAGACCUACAAGUCAAGCAGAGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGCGGUGGAAAGUGGAAUCGCCGUCGCUUAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUCGCCACCAAGAGUUCAUAUCGACGUGGCGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGAAGGUCCCAAGGGUUUGGCUGUUCGCCAAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCUCUAUCCUUUGUGGGCGCAGGAUACUUGAAAGGAGCUGUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAUGGACGAACCAAUGGUGUGUCGGUUGUUUUGCCAAAAGCAUAGCCGAGUAGCUACGUUCGGAAAGGAUAAGCAUUGAAAGCAUCUAAAUGCCAAGCCUCCCUUAAGAUAAGGUAUCCCUAUGAGACUCCAUAUAGACUAUGUGGUUGAUAGGUUGGGUGUGUACGCACAGUAAUGUGUUUAGCUAACCAAUACUAAUAAGUCCAUUGACUUGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.{{.{{{{)))...}.(((((((..(((}}}..}}))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((.....))))))).(((((((((.........))))))))).))....((((((.....((....))......))))).).........((...))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((...)))))))......((((((((((........(((((((((((.(((...(.((((......)))))(((...).iii.....))III...)))...)))))))))))...)).))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..eeee)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((.((((((((....))))))))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((((....)))))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(..(((((((((....(((...(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).)....))))))))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....<.<<<<<<<..........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........)).....>>>>>>>>)))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.((((((((.((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....)).))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((hhhh.((...(((.(.(((....))).).)))...))....(((((.........)))))))((((((((((...(((..((((((...((((..(((..((((((((((..........))))))...((((...(((((((((((.((.....)))))))).)..))))...))))....((((((((((....))))))))))..))))...)))...)))).........)))))).)))))))))))))HHHH..))....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..fffff..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).FFFFF))))))))))))))))))...(((.((((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((gg....gggggg((.((((((.......))))))...))gg)(.(((GG....GGGGGG....((((((((a...(..A)))))))).(((....))).GG))).).....(((((((.((..EEEE..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...dddddddd..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...DDDDDDDD...(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((......((((..[[[[[[[[[..))))....................]]]]]]]]](((.......[[[[)))((((.......))))..((((....))))..]]]].(((....)))(((((((.....))))))).(((((((((.........)))))))))........(((((..(((((......))))).)))))....................((((((.....[[[[[........)))))).........(((((((...))))))).]]]]]((((((((....((((..((((..(((((..(((..(((.........(((......))).(((.......))))))..))).)))))..))))..))))))))).)))...((((.[[[[[.........)))).......]]]]](((((....)))))..(((....[[[[[......)))...]]]]]......(((((........((((........(((((...)))))...........)))).....)))))(((....)))(((.[[[[))).....]]]].......(((((.....(((((..(((((...........(((......((((((((((((((..((((..(((((....)))))..)))).......(((((..(((.....)))))))).))))))))))))))((((....((((((...(((((((((((..((((...(((.((((...)))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).(((.....)))......))))))...((((..((((.(((((((.....(((((((((...(((((((.....((((((((.(((((....(((........)))....)))))..........((((........))))....))))))))..))))))).....)))(((....)))..(((((((((((...(((((...(((((((.((((.((((..(((.......((((((((...(((((......(((((((((((......(((((..(((((.........)))))..........((((........)))).)))))..)))))))))))................))))))))))))))))..))))))))((((((((....))))))))....(((((((.((((((((.........(((((..........))))).....)))))))).....((((((((((.(((.......)))((((((.......)))))).)))))((((.....))))...)))))..)))....)))))))))))......)))))........(((....)))...))))))))))).(((((.........)))))....)))))).(((((((.......(((((.....)))))....(((((((........)))))))..((((((..((((.((((((..........))))))....))))..)))))))))))))......))))))))))).)))))))))))..))))).....(((((...))))).))))).....)))))(((((....(((......))))))))...(((..........[[[[[((((...((((.....))))..))))))).......]]]]]..((((....)))).(((((.....(((((....)))))...[[[[[..)))))(((((((((........))))))(((((..(((...)))....((((....(((((...((((...))))..)))))...)))).))))).))).]]]]].........((((((..(((..(((....)))...)))(((((((((.....(((((((((((((((((.......))))).........((((........((((((.....)))))).........(((((...(((((((((((((((((((.(((.....)))((((((((((....(((((((((.(((.........))).....(((.........)))....)))))))))..(((((((..((((((..(((((((((((...)))..(((((..((((((...((((((((....))))))))....)))..)))......)))))..))))))))..))))))...((((.(((((......))))))))).....)))))))...))))))))))))))))))).((((((...........))))))))))).((((((((((.((((((((...))))))))...((((.....(((......((((((..((((..(((......)))..)))).(((....))).))))))...))).((((((((.........))))))))))))..((((..........))))))))))...))))))))).))))).(((((.(((((((.(((.........))).))))))).))))).))))(((((((((((......)))))).)))))..))))))))))))......(((...)))....)))))))))...(((....))).(((((((...((((((((.((((((.....((((((.......(((.((((........)))).)))....((((.(((...))).))))....(((.(((.....))).)))))))))....)))))).))))))))...(((...........)))))))))).))))))..............((((..(((..((((..[[[))))..))).))))(((((........(((((....)))))........)))))........]]]...))))))))))).
|
|
CRW_00490
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAACCGAAACGCUUGCGUUUCGGGGUUGUAGGACCAGUUUUUAAGAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUACUGGCACCUGAGUAGGUCGUUGUUCGUGAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAGGGGGCCUACCAGCUUACCAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAGGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAUUCGGGUUUCUCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGCGAAACUGGCCUUUUGGGGUCGGUGGAGGCAACGGUGAAAUACCACCCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUUAUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCACUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..((((((((((((.....(((((((.aa.aaaa)))..A..(((((((..(((AAA.AA.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((....))))).(((....))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.........(((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).hhh.....))HHH...)))...)))))))))))....)))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..[[[[)))))..))))..)..)).)))))).))..............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....).))))))))))..((((........))))((((((....(((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....)).(((((.....)))))......)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...((((((((...(((((((....))))).))...))))))))..)).)....))))))).))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....d.dddddd...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........))......DDDDDDD)))...)))))))(((((((((((...)))))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((gggg.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((.((...(((((...((((..(((..(((((((((((............)))))).(((((.(((((((.(((((((.((.....))).)))))).....))))))))))))..((((((((....)))))))).)))))...)))...))))........)))))...))....)))))))))))GGGG..)).....((......)).)))).((((......))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((.....)))))))(...).......(((((((((..((f....(....F))..(((((((((..((((.....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..eeeee..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).EEEEE))))))))))))))))))...(((((((......))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....(((((((({...(..})))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...bbbbbbbb..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...BBBBBBBB..(((.....))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((...)))..))))).(((.............[[[.))).....]]](((.....[[[[[[.............)))......]]]]]]...(((...((((....))))((((....))))(((((....))))).....[[[[)))(((((......)))))..]]]].((((..(((......)))..))))..........(((((((.........[[[[[[.........)))))))......]]]]]].(((.(((((.........((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))....)))))..)))(((((((((((((((.....))))))))))......((((((....))))))...[[[...)))))..]]].........(((........[[[[[....((((........((((....))))...........))))......)))..]]]]]..(((((((((((((...[[[[)))))))))).)))........]]]]...........((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....)))).......)))))))))))))).........(((((...[[[[[[[[[[[..((((....(((((......)))))(((....)))))))...)))))((((.......))))....]]]]]]]]]]]........(((((.........[[[[[)))))...]]]]]((((..........[[[.[[[[.))))..]]]]]]].((((((((............((((..[[[[))))........................]]]]....((((.[[[.....))))....]]].(((((((.(((.....))))))))))(((.(((......))).((((.........))))......[[[[[[)))..]]]]]]....(((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))...((((........))))....)))..)))))))))))((((......)))).((((.(((..[[[[[[...)))..(((..((((((((...)))))))))))]]]]]].)))).....((((((......(((((..........)))))...[[[[........))))))..]]]].........(((....[[[[.....)))..]]]]........(((.[[[.((((((((...(((...))).))))))))..)))....]]]....(((((((...((((...))))...(((.[[[[))).......]]]]((((((((..((((((((((........))))))....))))..[[[.(((....)))....)))))))).........]]]((((((...(((...))).))))))...)))))))........(((.[[[[)))...]]]]((((((.......[[[[[...........))))))....]]]]]....(((.[[[[.)))...]]]]...(((((..[[[[[...)))))..........]]]]](((.......[[[)))..]]]........................(((....))).((((((((((((...))))))))....[[[[[[[[))))......]]]]]]]].....((((.((((((((....(((.....)))......))))))))...((((..(((....))).))))...))))....(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))......[[[[((((((.....)))))).)))))..]]]].....((((..[[[(((((((((.....)))))..))))..))))....(((((((....)))))))..]]]...))))))))..........((((.[[[...)))).....]]]...((((((((((((((((...(((((...[[[[[...)))))...((((((((....))))))))..................]]]]]..))))))))))))))))...(((((((......)))))))..((((.....))))....((((....[[[[....[[[[[[)))).......]]]]]]]]]]..(((((((((..((((((((...))))))))......[[[[........)))))))))...]]]].(((...[[[)))((((...(((....)))..)))).]]]...(((((((.[[[[........)))))))....]]]]......((((....[[[[.))))...........]]]]....(((.[[[[[)))...(((((.....)))))]]]]].(((((((...(((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))............)))))))..((((.(((((((....))).))))..[[[[[.........))))...]]]]]....(((((.....)))))..(((.......[[[..)))..]]].(((.((((..((((((((((((....))))))...))))))..))))[[[[)))....]]]]...((((.............[[[[[[[))))..........]]].]]]].(((.....)))....(((((((((.......)))))....((((((((.(((..((((((....))))))...)))..))))).)))...))))...)))))))))....
|
|
CRW_00495
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAAAUAUGUAAGGGCGUACGGUGGAUGCCUAGGCACUAAGAGCUGAUGAAGGACGCGACUAACAGCGAAAUGCCUCGGGGAGUGGUACGUACACAACGAUCCGGGGGUAUCCGAAUGGGGAAACCCAAUACUGGUUAUGCAGUAUUACACAUAAAUGAAUACAUAGUUUAUGAUGAGGCAACCUUGCGAACUGAAACAUCUUAGUAGCAAGAGGAAAAGAAAACAAAAGUGAUUCCCUGAGUAGUGGCGAGCGAAACGGGAAAAGCCCAAACCAUCUUCGUGAUGGGGUAGUAGGACCACAACGUGGGAUAUCGAAGCUAGUCGAAUGGCAUUGAAAGGCCAGUCAAAGAAGGUGCAAACCCUGUAGACGAAAGCGUAAGAUACUCUAGUGGUAUCCUGAGUACGGCGAGGCACGUGAAACCUUGUCGGAAUCAACCGGGACCACCCGGUAAGGCUAAAUACUCCUUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCGCGGAAGCGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCGUAUGCUUACAAGAAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACUCAUAAUGUGCGAGGUUAAGUUGAAGAGACGGAGCCGAAGCGAAAGCGAGUCUUAAUAGGGCGAUAUAGUACAUUGUGGUAGACCCGAAACUGAGUGAUCUAGCCAUGACCAGGUUGAAGUUUGGGUGAAACCAAAUGGAGGACCGAACCGACCAUCGUUGAAAAGCUGGCGGAUGAGUUGUGGCUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACUCAGAUAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCGUCAAUGUAAGGCCACUGGAGGUAGAGCACUGAAUGUAUGAUGGCCCCAUCUCGGGGUACUGAAUAUAAUCAAACUCCGAAUGCCAGUGGAUAGUAGUUGGCAGUCAGACUAUGGGUGAUAAGGUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCAUCAGUUAAGGUCCCAAAAUUCAUGCUAAGUGGAAAAGGAUGUGGGGAUGCACAGACAACUAGGAGGUUGGCUCAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACUAGUCGAGUGACCCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAGUAUGAUACCGAAACUAUGGAUUUAUUGUUUCAAUAAAUGGUAGGGGAGCGUUCUAUACUGCGUUGAAGCUGUACCGUAAGGAGCAGUGGAGUGUAUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAGAUGUCAGUGAGAAUCUGACACACCGAUUGCCUAAGGUUUCCAGGGGAAGGCUCGUCCUCCCUGGGUAAGUCGGGACCUAAGAUGAGGCUGAAAAGCGUAGUCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCCGAUACAUAAGUGAAGGAAUGACAGAGAAGGCUAGGUUAAGCCAGCGACUGGAAGUGCUGGUUUAAGCGAAGGAGCUGUAUGGUAGGCAAAUCCGCCAUGCAAAGCAAAGGCGUUAUGAGGAGUGAACCCGUGAGGAAGUAGCGAAGUAACUGAUGCCAGCUCUCAAGAAAAGUUUCUAGCGUUAAUUAUGUAUUGGCCCGUACCAAAACCGACACAGGUAGGCAAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAGCGAGAGAACUGUUGCCAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCGAAAGAGCCGCAGUGAAGAGGCCCAAGCGACUGUUUAACUAAAACACAGCUCUCUGCAAAGUCGCAAGACGAAGUAUAGGGGGUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGGGAAUAUGUUAGAAUUCGUUCGAAGCAUUGAACUGAAGCCCCAGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGUGUAACGAUUUGGGCGCUGUCUCGGCAGCAGACUCGGUGAAAUCUUAGUACCGGUAAAGAUGCCGGUUACCCGCAACUAGACGGAAAGACCCCAUGGAGCUUUACUGUAGCUUGAUAUUGAACUUUGAGCCUACAUGUACAGGAUAGGUGGGAGACUAUGAAGCAUGUACGCUAGUAUAUGUGGAGUCGCCAUUGGGAUACCACUCUUGUAUGAUUGAAAUUCUAACCGCGGUCCGUGAUCCGGAUCCGGGAGAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUACCCUCAGAUUGGUUGGAAAUCAAUCGACGAGCGUAAAGGCAGAAGGGUGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGCGGUUCCGCGUGGAAGGGCCGUCGCUUAACGGAUAAAAGCUACCCUGGGGAUAACAGGCUGAUCUCGCCCAAGAGUUCACAUCGACGGCGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGAGCUGAAUUAGGUUCCAAGGGUUGGGCUGUCCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGUUGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGGAGCGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAAGUAUGGACUGGAUAAGCGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAGCCAACUCCAAGAUGAGAUUUCCCAUACGUAAGUAGUAAGACCCCUGAGAGACGAUCAGGUUGAUAGGUCAGAGGUGGAAGCAUAGUGAUAUGUGGAGCUGACUGAUACUAAUAGGUCCAGGUUUUAAUCACCAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).))))....((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((((.....)))))......((((((((......(((((((...(((.(((...(((((......)))))(((...).ccc.....))CCC...)))...)))....)))).))).))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..<<<<)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((.((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((.(.(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....)))))).)))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....]]]]]]])))...)))))))((((((((...))))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((bbbb.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..(((((.((((((..........))))))((..((((......((((((((.((.....))))))))))........))))...)).((((....((....)).....))))..)))))...)))..))))........)))))).)).....)))))))))))BBBB..))....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((....))))(...).......(((((((((..((e....(....E))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ggggg..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).GGGGG))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh....hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)(.(((HH....HHHHHH....((((((((i...(..I)))))))).(((....))).HH))).).....(((((((.((..>>>>..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...ffffffff..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...FFFFFFFF..(((....))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..)))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((..((((((.[[[[..))))))..)))......]]]]........(((........)))...(((((((....(((.......))).......(((.[[[[[)))..((((....))))]]]]].........(((((...[[[[[[[.)))))...]]]]]]].)))))))..(((((..(((((......))))).))))).....................(((((........[[[.........)))))..]]]....(((((.....))))).....(((((((((....(((..((((...(((.(((...((((........)))).........(((....))).....)))...)))....))))..)))))))..)))))....((((((((....[[[..))))))))...]]](((((...[[[)))))...(((((.......)))))........]]]......((((....[[[[..)))).......((((....))))...........]]]]....((((....[[[[[[[[.......(((((....))))).))))......]]]]]]]]...((((((((...((((.((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....))))......))))))))))))))........((((((((((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((..(((....)))))))))....))))))))))).((((...)))).)))..)))))).....))))))))..(((......[[[...)))..]]]((((((......(((((((.....(((...(((.(((((....(((((.....))))).....))))).)))..)))......)))))))......)))))).....(((((((........[[[[)))))))....(((......))).]]]]........(((((((....(((((.....)))))......(((((((...(((.(((.....(((((.(((((.......))))).)))))....((((..........)))).)))..))).)))))))(((....[[[[[)))......]]]]](((..[[[[[))).........]]]]].....(((((......[[[[[[[.[[[[[[[[[...[[[[[))))).....]]]]]..]]]]].....]]]]]]]]]]](((((((............((((.......)))))))))))...((((......[[[[[[[..)))).......]]]]]]]......)))))))..(((...(((....)))...)))....(((.[[[[))).......]]]]..(((((((((((....................(((((((((((((((((........))))))))))).....(((((((((((((..........)))))))........(((((((.............(((.........))).......)))))))))))))...........)))))).....)))))))))))...........(((......))).((((((((.....))))........[[[[........))))......]]]]..........((((...[[[))))..]]]((((((((....)))).[[[[[......)))).....]]]]]..........(((..((((.(((...(((....)))...))).)))).)))...(((...[[[[[[[.........)))((((........))))......]]]]]]].((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]].(((.....[[[[((((((.....)))))).)))....]]]]...........(((.[[[[)))...]]]].....(((((..[[[[[..)))))...]]]]](((......(((........))).....(((((...((((((.(((((((......(((((((....((((((.(((((((((..(((((..((((.....((((((((....))))))))..)))).)))))..........))))))))).((((.(((((..(((.((((((.....))))))))).))))).)))))))))))))))))....(((((((((((((...........))))))((((..(((((((((..((((((((...))))))))..................)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....))))))).......(((((((....))).))))..))))))))))..))))...))))))....)))))......)))......((((((..(((((....(((((.((((((.....)))))).)))))....((((((((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).....)))))....)))))(((....(((((((....))).))))...))).........))))))..((((((((....((((((((((...((((......(((.....(((((....(((((....))))))))))((((...))))......)))......)))).....)))).)))))).....(((((...................)))))))))))))..(((....))).((((((((((((.......)))))....((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)))...[[[...)))))))...]]]..
|
|
CRW_00496
|
[ FASTA input ]
|
GUUAAGUGACUAAGCGUACAAGGUGGAUGCCUUGGCAAUCAGAGGCGAAGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAAAAGCUUGGAUGAGUCGAUAAGAGGCGUUUAAUCCAAGAUAUCCGAAUGGGGAAACCCAGUAGAUGAAGAAUCUACUAUCAACAAGUGAAUUCAUAGCUUGUUGAGGCAAACCGGGAGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUUCGUCAGUAGCGGCGAGCGAAAGCGAAAGAGCCAGUAAGUGAUAGCAAUAUAGUGAGGAGAAUGUGUUGGGAAGCACAAUCAAAGAGGGUGAUAAUCCCGUAUCUAAAAACCAUAUUGUGGUACUAAGCUAACGAGAAGUAGGGCGGGACACGUGAUAUCCUGUUUGAAGAAGGGGGGCCCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGAUUGACCGAUAGUGAACCAGUACUGUGAAGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGUGAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCUUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCGAGGGCAACCUUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUUUGUAGCGAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGAAUAGUUGCAAGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUCUAUUUAGGUAGAGCCUUGAGGUGACACCUUUGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCUAGGGGGCCAUCCCGGCUUACCAACCCGAUGCAAACUACGAAUACCAAAGAGUGAUACUCAGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGGAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCCAAGUCUAUAUUAAGUGGGAAACGAAGUGGGAAGGCUUAGACAGCUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUGAAAUAUAGCACCGAAGCUGCGGCAUCAGAAUUUAUUCUGUUGGGUAGGGGAGCGUUGUGUAAGCGGAAGAAGGUUCAUCGAGAGGUGGGCUGGACGUAUCACAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAACGGGUGAAAAACCCGUUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGGCUCCUAAGGCGAGGCUGAAAAGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUAAAGCUGCGAUGUGGGGACGGAGUAGGUUAGGUUAUCGCACUGUUGGAUAUGUGCGUUUAAGUUGGUAGGUGGGAAGUUUAGGCAAAUCCGGACUUCCUUAACACAGAGAGAUGAUGACGAGGCUCUACGGAGCUGAAGUAACUGAUACCACACUUCCAGGAAAAGCCACUAAGCGAAAGGCUUUACUAAACCGUACUGAAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACUCAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUAGCACCGUAACUUCGGGAGAAGGUGCGCCGGCGUAGAUUGUAAGGGCUAGCCCCUGAAGGUUGAACCGGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUCUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGAUGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAUUGAUGGUGUCAUCGAAAGAGAAGCACCUGAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCAUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAAAUCGCCGUGAAGAUGCGGUGUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAAUUUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGCCUUUGAAGCAGUGACGCCAGUCAUUGUGGAGGCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAACGUUUGAUGUUCUAACGAAGAUGACGAAACGUGGUCUCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCCAAAGCGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUUGCUAAUCACGGUCGGACAUCGUGAGGUUAGUGCAAUGGUAUAAGCAAGCUUAACUGCGAGACAGACAAGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUAGGAUGAUUGAUUGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCCGGUUGUGUCGCCAGACGCAUUGCCGGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCAAGAGAUGAGUCAUCCCUGACUUUAAGUCAGUAAGGGUUGUUGUAGACUACGACGUAGAUAGGUUGGGUGUGUAAGUGAUGUGAGUCAUUGAGCUAACCAAUACUAAUUGCCCGAGAGGCUUAAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.aa.aaaa)))...A.(((((((..(((AAA.AA.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((.....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.((((((.((((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).bbb.....))BBB...)))...)))))))))))))).....))))))........(((((((((.......)))))))))......(((((..gggg)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((((....))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......]]]]]]])))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((dddd.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((...(((((...((((..(((..(((((.(((((..........))))).((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))....))))...))))...)).(((((((....)))))))..)))))...)))...))))........)))))...))....)))))))))))DDDD..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....((((...((((.....))))...))))...)))))(...).......(((((((((..((h....(....H))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).IIIII))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ff....ffffff((.((((((.......))))))...))ff)(.(((FF....FFFFFF....((((((((<...(..>)))))))).(((....))).FF))).).....(((((((.((..GGGG..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...eeeeeeee..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...EEEEEEEE..((((...))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((((((((....(((((........)))))(((...(((..(((......))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...)))...((((....))))((((((.....))))))..[[[[[[[[[...)))...]]]]]]]]].......((((...[[[[[.............)))).......((((((......)))))).]]]]]...(((................)))......................(((((..((((((....)))))).(((((.((((((....((((((........(((((...))))).(((.............))).)))))).......)))))).)))))....((((((....))))))...........))))).....(((.((((((......))))))...................[[[[)))..]]]]..................)))))))))))....(((((....((((((....)))))).)))))(((((((((((....((((((.......(((((((((((((..((((.............)))).............((((.....)))).....)))))))))))))))))))..((((......(((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))........)))))))))))..(((((.......[[[((((((........)))))).....(((((....))))))))))..]]]..(((((((((..((((.....(((.((((.....(((((.[[[.)))))......)))).)))..)))).....)))))).))).......]]]....(((((((((((....)))))))))))....(((......))).((((...[[[[..))))((((..(((((.....)))))........))))..]]]]....(((((.(((((.(((((.......))))).))))).......(((((...(((.(((.....))).))).)))))....[[[[[..(((.((((.....)))).))).)))))..]]]]].....((((((....))))))....((((((((...(((......((((((((....))))))))...)))..))))).)))...((((......)))).......(((((((.....))))))).(((((...[[[[[[...((((((((...........))))))))....)))))(((((.(((...(((....)))...)))..))))).(((((........))))).]]]]]]....((((..(((....)))..)))).....((((((((((..........))))(((((..[[[......[[[[[[[[))))).......]]]]]]]].....]]]......))))))..(((((....)))))(((((............))))).....((((((.....[[[...)))))).......]]].((((..(((......)))..))))..........(((...[[[[[[[)))...]]]]]]]........(((((.....(((((.....(((....))))))))((((((..........(((..[[[[[)))...]]]]]....(((.......))).))))))(((...(((((.....)))))..[[[[[[[)))..(((....))).......]]]]]]]..)))))(((...((((((..((((..((((((((((.............)))))..)))))))))))))))...)))((((((.[[[...))))))....]]](((..........((((((.....))))))...[[[...((((.........)))).)))(((((.....)))))...]]]..........((((((......))))))....(((((........[[[[...)))))...]]]](((((.(((.((((((((((((...........(((......((((....((((((...((((((((....)))))))))))))).))))........))).............))))).......((((.(((...))).))))....))))))).)))..))))).....(((((...[[[[[))))).........]]]]].((((..[[[[[[[[[..(((((((.....))))))).....)))).........]]]]]]]]]..(((...(((......)))[[[))).(((....)))(((((...))))).(((((((((.......))))))))).]]].....)))))))))))..(((((((.............((((((.(((((.(((((((....(((((...)))))))))))).)))))((((((((((((((((......)))))).)))))......[[[[[[........)))))..]]]]]].(((....(((((((....))).))))[[[))).....]]].))))))............(((...[[[[[[[.....))).......]]]]]]].(((((...((((..((((((((((((....))))))..))))))..)))).)))))...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]]....)))))))...(((((((.....(((((((((((...)))))))....((((((((.......((((((....)))))).......))))).)))...))))....))))))).
|
|
CRW_00497
|
[ FASTA input ]
|
UAAGGCAGUGGUAGCGCUGAAGAAUGUUCGUGCAAUUGUCGUUAUUCAUUAUAAAAGGGCGGGUUUUAAAGGAUAUUUUAAAAUUUAAAACAAGCUUUUAAGAGCAGAUGGCGGAUGCCUUGCCAAAGAGAGGCGAUGAAGGACGUACUAGACUGCGAUAAGCUAUGCGGAGCUGUCAAGGAGCUUUGAUGCGUAGAUGUCCGAAUGGGGCAACCCAACUAAUAGAGAUAUUAGUUACUCUAACAGAGAGCGAACCUAGUGAAGUGAAACAUCUCAGUAACUAGAGGAAAAGAAAUCAACGAGAUUCCCUAAGUAGUGGCGAGCGAACGGGGAAAAGGGCAAACCGAGUGCUUGCAUUCGGGGUUGAGGACUGCAACAUCCAAGAGAACGCUUUAGCAGAGUUACCUGGAAAGGUAAGCCAUAGAAAGUGAUAGCCUUGUAUGCGACAAGGCGUUUUUAGGUAGCAGUAUCCAGAGUAGGCCAGGACACGAGGAAUCCAGGUUGAAGCCGGGGAGACCACUCUCCAACUCUAAAUACUACUCUUUGAGCGAUAGCGAACAAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCGCAGUGAGCGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCAUCUGCUUACAAUCAUUCAGAGCCCUAUGAUUUAUCAGGGUGAUGGACUGCCUUUUGCAUAAUGAUCCUGCGAGUUGUGGUAUCUGGCAAGGUUAAGCGAAUGCGAAGCCGUAGCGAAACGAGUUCUUAAUAGGGCGAACAAGUCAGAUGCUGCAGACCCGAAGCUAAGUGAUCUAUCCAUGGCCAAGUUGAAACGCGUGUAAUAGCGCGUGGAGGACUGAACUCCUACCCAUUGAAACGGGUUGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCAAACAAACUUAGUGAUAGCUGGUUCUCUUCGAAAUAUAUUUAGGUAUAGCCUCAAGUGAUAAUAAAAGGGGGUAGAGCGCUGAUUGGGCUAGGGCUGCUCGCCGCGGUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCUUUUAUCGUAUCUUGGGAGUCAGGCGGUGGGUGAUAAAAUCAAUCGUCAAAAGGGGAACAACCCAGACUACCAAAUAAGGUCCCUAAGUUCUAUUCUGAGUGGAAAAAGAUGUGUGGCUACUAAAACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAAAGCGUAACAGCUCACUGGUCUAGUGGUCAUGCGCUGAAAAUAUAACGGGGCUAAGAUAGACACCGAAUUUGUAGAUUGUGUUAAACACAGUGGUAGAAGAGCGUUCAUACCAGCGUUGAAGGUAUACCGGUAAGGAGUGCUGGAGCGGUAUGAAGUGAGCAUGCAGGAAUGAGUAACGAUAAGAUAUAUGAGAAUUGUAUCCGCCGUAAAUCUAAGGUUUCCUACGCGAUGGUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGUCCGAAAGGGGUAGGUGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCGACUGUGGAGCGUGAUGGGGGGACGCAUAGGGUUAAGCGAGCUAGCUGAUGGAAGCGCUAGUCUAAGGGCGUAGAUUGGAGGGAAGGCAAAUCCACCUCUGUAUUUGAAACCCAAACAGGCUCUUUGAGUCCUUUUAGGACAAAGGGAGAAUCGCUGAUACCGUCGUGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCAUAUCCAUAGUCGUCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGAUGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGCGUGAAAGAACUCUGGUUAAGGAACUCUGCAAACUAGCACCGUAAGUUCGCGAUAAGGUGUGCCACAGCGAUGUGGUCUCAGCAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUUUGCCAACUCGUAAGAGGAAGUAUAAGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAGAGGAUGCGUCAGUCGCAAGAUGAAGCGUUGAAUUGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGUCUCAACCAGAGAUUCAGUGAAAUUGUAGUGGAGGUGAAAAUUCCUCCUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGGACCUUUACUACAACUUAGCACUGCUAAUGGGAAUAUCAUGCGCAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUAAGGGCUUUGGCUCUUAUGGAGUCAUCCUUGAGAUACCACCCUUGAUGUUUCUGUUAGCUAACUGGCCUGUGUUAUCCACAGGCAGGACAAUGCUUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCUCCUAAAAAGUAACGGAGGCUUGCAAAGGUUGGCUCAUUGCGGUUGGAAAUCGCAAGUUGAGUGUAAUGGCACAAGCCAGCCUGACUGUAAGACAUACAAGUCAAGCAGAGACGAAAGUCGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAAAGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGCUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUAGGAAAGUUGAGGAGAGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUGUCACUGGUGCACCAGUUGUCUGCCAAGAGCAUCGCUGGGUAGCACACACGGAUGUGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGCAGGAACCAACUCCAAGAUAAACUUUCCCUGAAGCUCGCACAAAGACUAUGUGCUUGAUAGGGUAGAUGUGUGAGCGCAGUAAUGCGUUUAGCUGACUACUACUAAUAGAGCGUUUGGCUUGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.......................................................................................((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((.......((((((((......)))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((....)))))))).((((...))))......((((((.....((....))......))))).).........((...))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((....)))))))......(((((((.........(((((((((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...))))))))))).....))))..)))......(((((((((.......)))))))))......(((((......)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).......(((((((((((..((....)))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((....))..))))...(.....).(((((......))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((.(.(.(((((((((....(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)).)....)))))))))...)))))))).....((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((......(.(((((.(...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...................))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.((((((((.((......((((((((.....))))))))...))))))))))..).....))))))..............((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((..((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...(((....(((..((.....)).)))....)))....))))....)).(((((((((((((...)))))))))))))..)))))...)))...))))........))))))..))...))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((....))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..((((..((.(((((((..(((....)))...))))))).))..)))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((.....(((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))(((((...........)))).)..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((......))))))))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))).......(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..(((((((((......)))))))..)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...(.(....).)..)))))))((((((...(.(....((((((((((....))).))..)))))....)).))))))..(((....(((((...........)))))....)))))))......)))))))).....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.............((((.(((.[[[[)))))))......]]]].................(((((((((((....))))))))))).......((((....))))...((((....[[[[[))))....]]]]]......((((((..[[[.(((((...((((......))))((((((....)))))).)))))))))))...((((....)))).]]]...(((((....(((.((((...)))))))....[[[[[..........)))))....]]]]]....................((((((........[[[[[[[...))))))..............]]]]]]]....(((((((.......)))).))).......((((((......[[[[[[[[[[[[............))))))...(((((((.....))))))).]]]]]]]]]]]].......(((((((....(((.........))).(((....)))((((((....))))))..[[[......)))))))..]]]...........................((((.............[[[[[[[[[..........)))).......]]]]]]]]]......(((..[[[[[.)))......]]]]].......(((.....)))......(((((((..((((((((((((((..((((.......[[[..))))...]]]......(((((....)))))......)))))))))))))).......(((((((..((((((((((((..((((....(((((((....)))))))...))))....((((((((........))).)))))...))))))))))))(((.....)))......)))))))...............................(((.[[[[[.....))).......]]]]].(((...[[[[.[[[.....[[[[)))....]]]]......]]].]]]]..............((((((.....((((.((((.((((((.(((......))).))))))....(((......))).)))).))))....((((((....((((((.....)))))).....(((((((((((((.....(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..))))).))))))))))))).............))))))..))))))..............(((((((...)))))))...........((((((.((((((.......[[[[[[[........))))))..]]]]]]]..)))))).))))))).......(((((.............))))).(((.((((...((((.....(((((((.(((....)))..))))))).((((((((((....(((...(((....)))...)))...)))..(((((........))))).))))))))))).....)))).))).(((.[[[......)))..]]](((..[[[[))).....]]]].(((..(((((((((((...[[[.......)))))).)))))...))).......((((((..(((((...)))))..))))))....]]]........((((((.(((......))).........(((..(((((..((((.............))))))))).)))..........))))))........((((((((...(((((..........[[[[[...))))).......]]]]]((((((....)))))).........(((...((((((((((((.........((((...((((((...(((....)))...))).))).))))(((.(((((...((((((..((((.....(((((....(((....)))...))))).......))))))))))...))))).)))......)))))))........(((..((((...((((((.....))))))......))))..)))........)))))....))))))))))).(((.......[[[[[[[[[[[[[)))............((((((...............))))))]]]]]]]]]]]]].........((((((((((((((((.....(((((.[[[[[..((((((...((((((((....))))))))))))))))))).......]]]]]..)))))))))))))))).....(((((((....(((.[[[[[[)))...]]]]]]...(((.[[[..)))(((((....)))))........]]]....((((....(((((((((..((((((((...)))))))).....((((....)))).)))))))))[[[[....(((......)))))))...(((....)))]]]]......(((((((((((((.......))))))))).[[[...)))).............]]]...)))))))(((((((((...[[[[[.........))))))))).((((......))))]]]]].....(((((((((((.[[[[[)))))).))))).....]]]]](((......[[[)))......]]].(((...(((((((....))).)))).[[[[......)))..]]]].(((...((((......))))[[[[)))........]]]]..........(((..(((((....)))))...(((((...(((...))).)))))[[[[)))...]]]]....(((((......[[[[.)))))............]]]]..............(((((((((....((((.......))))[[[[[.)))))))))(((....))).............]]]]]....((((.....))))......
|
|
CRW_00499
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGUAAGAAAGGGCGUACGGGGGAUGCCCGGGCAUCAGGACGCGAUGAAGGACGUGGCUUUCUGCGAUAAGCAACGGGGAGUUGUAAGCAAGCAUUGAUCCGUUGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCUCUUGGUGAAUAACCGAGAACGCAAACGCGAGCAAAGUCGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCGGAAUAAAAGAAAAUAAGAAUGAUUCCGUCAGUAGCGGUGAGCGAACGCGGAAGAGCCUAAACCCCUGCCUACGUUACAGAUCUAAUUCGCUGUAGCAGGGGUGUUGUAGGACUGGCAGGAGUAGAUUAGAAUGCUCCACAAAGUUACCAAGCACAAGAUUAGCAGAACGGUAUUGGAAAAGCCGACCAUAGAGGGUGAAAGUCCUGUAAGCGAAAAUUUUGUGCCUUUGGCCAGUAUCCUGAGUACCACGGAACACGUGUAAUUCAGUGGGAAUCUGCGGGGACCACCCCGUAAGGCUAAACAGUACCUGAUGACCGAUAGAGAACAAGUACCGCGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCGGGGGACCGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGUAUGCUUACAAGGUAUCAGAGCCUUUUAAUGGGUGAUGGUGUGCCUUUUGUAGAAUGAGCCGGCGAGUUAUUUUACGUUGCAAGCUUAAGGCAGUGAGAUGCCGUAGGCGAAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUAAAGUAGCGUGGAAUAGACCCGAAGCCUGUCGAGCUAUCCAUGUCCAGGUUGAAGGUGGGGUAAAACUCACUGGAGGACCGAACCCUUUUUCGUUGAAAAGAAUUGGGAUGAGGUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCUAUCAAGGCAGGCGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGGUUUAGGCCUAGCGUCAGUUGUUUAGUUGCGGGGGUAGAGCUCUGAAAGGACUAGGGGGCCCACAAGCUUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCGUAACUCCAAAGACUGGCAGUCAGACUACGGGGGAUAAGCUCCGUGGUCAAAAGGGAAACAGCCCAGACCGUCGUUUAAGGCCCCAAAGUUCAUGCUAAGUGGCAAAGGAUGUGGGGGCGCAUAUACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGCUCCCGCGCCGAAAAUGUAAUCGGGACUAAGCAUGGCGCCGAAGGCACGGAUUCCGUAAGGAGUGGUAGGAGAGCGUUCUUUCUUCCGUUGAAGGCGUACCGUAAGGAGCGCUGGAGGAGUAAGAAAUGAAGAUGCUGGCAUGAGUAGCGUAAAGGGGAGUGAGAUUCUUCCCCACCGAUAGCCUAAGGGUUCCCCGGGAAGGCCAAUCCGCCGGGGGUUAGUCGGCCCCUAAGACGAGGCUAAGAAUGCGUAGUCGAUGGGAAGCAGGUUCAUAUUCCUGCACCGAGUAAAUUGUGCGAUGGAGUGACGCAGGAGGAUAGUUAGUGCGGCUUAUUGGUUGCCGUUGCGAGUAGUAGGCAUUGAGAGUGAUUGGAAAAUCCGUCACUUGAGCUGAGAACUCGCGGGAUCCUAACGAAUGUUAGGCGUAGCUUUCGACUCCAAGCUGCCAAGAAAUAGCUUCUAAGUUUAGGUUUAUUCGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGCAAGUAGAGAAUACUAAGGUGUUCGAGAUAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAUUACUCCUGUAACUUCGGGAUAAGGGAGACCGGAGAUGCUUUAGCCUGCGGCAAAGAGUAUCGAAGGUGGCACAAAAAUGGGGGUAGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGACUCUGCCAAAUCGGAAGAUGAAGUAUAGGGUCUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUCAAGAGGACGGGUUAGCAGCAAUGCGAAAGCUCGGAAUUUAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUGACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGUGUAACGACUUCCCCACUGUCUCAACGAGAGUCUCGGCGAAAUUGUAGUACCCGUGAAGAUGCGGGUUACCUGCGAUAGGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAACCUGGCAUUGAACUUUGGUCCUGUAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUAUGAAAUCUGGACGCCAGUCUGGAUGGAGCCGUCGUUGAAAUACCACCCUUACUUGACCCAAGUUCUAACCGAAUGAAACAACAUUCGAGACAAUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGCGCGGACGGAAAUCGCGCCAAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUAACUGUGAGACAGACAAGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUCGCGUCCAAGAGUCCAUAUCGACGACGCGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCAUCGCAGGCGUUGGAGAUUUGACGGAAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGAACCUCUGGUGUAUCAGUUGUUUCGCCAGAAGCAACGCUGAGUAGCUAUGUUCGGCAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUAUAAGUGGGAAACCCUUCUGAAGAUAAGAUCUCCCUGGGAGCAAUCCCCUAAAGACCCCAAGAAGAUGACUUGGUUGAUAGGUCACAGAUGCAAGUGUGGUAACACAUUCAGUCGAGUGAUACUAAUCGGUCGUGAGGCUUGACCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ee.eeee)))...E.(((((((..(((EEE.EE.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((.....))))))).(((....))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((.(((((.....((......))..)))))))))))......((((((((...(((((........)))))..........((((((((((((((.(((...((((.(......)))))(((...).[[[.....))]]]...)))...)))))))))).)).))))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..hhhh)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....))))))))))......(((((((((((......))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((((....)))))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).)....))))))))))...)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....d.dddddd...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...))))))))))))).............)).....DDDDDDD)))...)))))))(((((....)))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((iiii.((...(((.(.(((....).)).).)))...))...(((((........)))))))((((((((((..((..((((((...((((..(((..(((((((((((.........))))))((.((((...(((.....(((((((.((.....)))))))))..)))...)))).))..(((((((((....)))))))))..)))))...)))...)))).........))))))..))...))))))))))IIII..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((((((...)))))).))))))))))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..fffff..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).FFFFF))))))))))))))))))...(((((((......))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((aa....aaaaaa((.((((((.......))))))...))aa)(.(((AA....AAAAAA....((((((((b...(..B)))))))).(((....))).AA))).).....(((((((.((..HHHH..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...{{{{{{{{..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...}}}}}}}}..((((....)))).....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.............((((.[[[[))))..]]]]...(((....[[[[[.)))..]]]]](((.....(((((..[[[)))))..)))........]]](((..[[[[[[[..(((....)))(((((((.....))))))).(((....))))))....]]]]]]].........(((((......[[[[[.........)))))...]]]]].........(((((((...((((((....((((.((((((((.(((((((......))).....))))))))))))....))))((((((.((((((........)))))).(((((.......((((((((((.......((((.........)))).......(((((....))))).........)))))))))))))))))))))...((((((..((((.....))))..))))))......))))))(((....(((((((..(((((((((...((((((.......((((((((..............(((((.......((((....))))..........)))))...((((((....)))..)))((((..((((......))))..)))).......)))).....((((((((...((((((((((((((..(((((.((((......)))).))))).............((((.....))))......)))))))))))))).......(((((((...((((((((.....((((...((((((......))))))....))))...(((...(((........)))..))).......))))))))((((.....)))).....)))))))....)))))))))))).....(((((....))))).)))))))))))))))))))))).(((...(((....)))))).....)))....)))))))....(((((((...........((((........((((.(((.(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).)))))))..(((........(((((((.(((.........(((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))...)))))))))))((((........)))).))).))))))).)))......)))).((((....)))))))))))..((((((((((.[[[[.......(((...)))))))))))))...]]]]......(((...[[[[[[.)))...]]]]]]...((((((........)))))).(((..((((....))))...)))...(((.[[[[[)))..]]]]].(((.[[[.....)))..]]]...................(((.[[[[[))).....]]]]].(((((...(((.[[[[....)))..]]]]..........(((.[[[[[)))......]]]]].((((((....(((.....(((((((.(((...))))))))))..)))....)))))).(((.((((((....))))))...[[[[[.....)))((((((........))))))..]]]]]..(((((.........[[[[..)))))......]]]]......(((.[[[[[)))...]]]]]......(((((((((...............((((((((((...(((((...........)))))((((((((.(((...)))..))))))))..[[[[[........))))))))))....(((...........)))((((((((....(((....)))......))))))))..]]]]](((...((((((..(((........((((((.(((....)))...))))))........)))))))))...)))((((((.[[[...))))))....]]](((........[[[[[[[[[..)))...]]]]].]]]].(((......[[[....)))..]]]..))))))))))))))....(((((((.((((((......))))))...)))))))(((((((.......))))...)))..(((((..(((((((((((((((.((((..((((((.....)))(((((..((((.....((((((((....))))))))..))))............)))))..)))..)))).))))).....((((((......))))))...))))))))))...)))))..(((((...)))))((((((...........))))))((((..(((((((((..((((((.......)))))).....((((....)))).)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....)))))))..........(((((((((.......)))))))))(((...[[[[.....)))..]]]](((((.....((((((((((((.....(((......)))))))))).))))).........(((((((((((((((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).....)))....))))))))).....(((((((....))).)))).)))))..((((...[[[[...))))..]]]]......((((((((.......[[[[[...))))))))....]]]]]......(((((((((((....))))))..)))))...(((...[[[[[.[[[[....[[[[[...))).....]]]]]....]]]].]]]]]..............((((....)))).........(((((..[[[..)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..))))).)))]]].........))))))))..
|
|
CRW_00500
|
[ FASTA input ]
|
GGCAAAGUUAAUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAAGAGCCGAUGAAGGACGUGACUAACGACGAUAUUCUAGGGGGAGCAGUAAGUACGCAUUGAUCCCUAGGUCUCCGAAUGGGGAAACCCAGCUGCUACUAGCAGUUAUUCAUGAGUGAAUACAUAGCUCAUGUAAAGGUAACGCAGAGAACUGAAACAUCUAAGUACCUGCAGGAAGAGAAAGUAAAAACGAUUUCGUAAGUAGCGGCGAGCGAACGCGAAGAAGGGCAAACCAAGAAGCUUGCUUCUUGGGGUUGUAGGACUGCAACGUGGACUUAAGCAUUAUAGUCGAAUAACCUGGGAAGGUUAAUCAAAGAGGGUAAUAAUCCCGUAGACGAAAUAGCGCUUAUACCUAGCAGUAUCCUGAGUAGGGCUGGACACGCGAAAUCCAGUUUGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAACCCUAAAUACUCCUUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGAGAGGGGAGUGAAAUAGCACCUGAAACCGUGUGCCUACAAGAAGUUCGAGCCCGUUAAUGGGUGAGAGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGUUAUGAUGCGAGGUUAAGUUGAAGAGACGGAGCCGUAGGGAAACCGAGUCUGAAUAGGGCGACUUAGUAUCAUGAUGUAGACCCGAAACCUAGUGACCUAUCCAUGAGCAGGGUGAAGGUGUGGUAAGACGCACUGGAGGCCCGAACCAGGACACGUUGAAAAGUGUUUGGAUGACUUGUGGAUAGCGGAGAAAUUCCAAACGAACUGGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCGUCGAAAUGUAAGUGUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGGUGAGGGGUCCGUCUAGGAUUACCAAUCUCAGAUAAACUCCGAAUGCUAAUACACAUGUUCGGCAGUCAGACUGCGAGUGCUAAGAUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCAACAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGGGUUGCACAGACAACUAGGAUGUUAGCUCAGAAGCAGCUAUCAUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACCCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUUUGGAUUGAUAUUUUAUCAAUGGUAGGAGAGCGUUCUUAACCGCGAUGAAGGUAUACCGUGAGGAGUGCUGGAGCGUUAAGAAGUGAGAAUGCCGGUAUGAGUAGCGCAAGAUAAGUGAGAAUCUUAUCCACCGUAAGACUAAGGUUUCCAGGGGAAGGCUCGUCCGCCCUGGGUUAGUCGGGACCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGACAACUGGUUGAUAUUCCAGUACUAGAUAUGAUCGUGAUGGAGGGACGCAGUAGGCUAAGAGAUGCCAGUUAAUGGAUUCUGGUCUAAGCAGUGAGGUGUGAGAUGUGUCAAAUGCAUUUCUCUCUAACAUUGAGCUGUGAUGGGGAAGCAACUACGGUUGCGAACUCUCUGAUGUCACACUGCCAAGAAAAGCUUCUAGCGUAAAGUCAUAUCUACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCGAGGCGAGUAGCCUCAGGUGAUCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUAGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUGGUGUAAAAGCCAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCAACUGUUUAUCAAAAACACAGCUCUCUGCUAAACCGCAAGGUGAUGUAUAGGGGGUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGCUUAGACGUAAGUCGAAGGUAUGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAAUGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUUUUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCAUGGAGCUUUACUGUAGUUUGAUAUUGAGUACCUGUAAGUCAUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCAUUGAAAUAGGGACGCUAGUUUCUAUUGAGGCGUUGUUGGGAUACUACCCUUGACUUAUGGUUACUCUAACCCGCUGGCAUAAUCGGCCAGGGAGACAGUGUCUGACGGACAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUGGCUCAGAUUGGUUGGAAAUCAAUCGUAGAGUGUAAAGGUAAAAGCCAGCUUGACUGCGAGAGCUACAACUCGAGCAGGUAGGAAACUAGGACUUAGUGAUCCGGUGGUACCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCUGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGCGUAGGUAAUUUGAGAGGAUCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACUUACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCCGCCAGGAGCACGGCUGGAUAGCUAUGUAGGGAAGGGAUAAGCGCUGAAAGCAUCUAAGUGCGAAGCCCACCUCAAGAUGAGAUUACCCAUUCGUAAGAAUUAAGAGCCCAGAGAGAUGAUCUGGUAGAUAGGCUGGAAGUGGAAGAGUUGCGAGACUUGGAGCGGACCAGUACUAAUCGCUCGAGGACUUUACCAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ff.ffff)))..F..(((((((..(((FFF.FF.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((...))))))).(((((((((.........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......((((((((.....((...((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).iii.....))III...)))...))))))))))..))..))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..hhhh)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((.(...(((((((((((....(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)).)....)))))))))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....e.eeeeee...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....EEEEEEE)))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((gggg.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..(((((.(((((..........)))))((..((((...((((.(((((((((.....))))))))).....))))...))))...)).((.(((((....)))))))..)))))...)))...))))........)))))).))....)))))))))))GGGG..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((......))))))(...).......(((((((((..((b....(....B))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).DDDDD))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((cc....cccccc((.((((((.......))))))...))cc)(.(((CC....CCCCCC....((((((((<...(..>)))))))).(((....))).CC))).).....(((((((.((..HHHH..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...aaaaaaaa..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...AAAAAAAA..(((....))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..............((((((((..(((((((...........(((((((((.....(((.....)))...........(((((((..((((((........((((((((...((((..((((....))))(((((((((....(((((((((((((.........)))))))....))))))((((...(((..........)))..)))).....((((............))))...)))))))))((((((..........((((...((((((((....))))))))........((((((...........................((((((....))))))......(((((((...((((((.............((((.((((((.(((((((((((((((((..(((....((((......))))..)))((((((....))))))..))))).......)))))......(((((((.......(((((.(((..(((((.......((((....))))..........)))))....(((((((((((......((((..(((((....)))))..)))).((((((((((.....((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....))))......))))))))))))))........((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).((((...))))......)))))).....))))))))...........(((((((((((.(((((.........((((......((((((....(((((((((..(((((..((((.(((((...))))).))))..)))))...........(((...((((((.(((.(((((((............)))))))....(((......))).))).....(((.(((((((..(((....)))..(((((......(((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))....((((..........)))).)))..)))))))))))(((.........))).((((..((((((.((((....))))(((((((...)))))))((((........((((((((.........(((((..........))))).....)))))))).......))))))))))..))))..(((((........))))).))))).....((((((....(((((((.............))))))))))))))))))))..)))...))))))..(((..(((....)))..((((((......(((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((.(((...(((.....))).)))))))))...((((((((...((((.((((.....)))).)))))))..))))).))))))........(((((....)))))...))))))...)))))..(((..((((....)))).)))....))))))))))(((.........((((((.......)))(((((.....))))).)))...(((((....)))))........((((((......)))(((......))))))..))))))))))......)))))).))).))).....)))))))))....))))))....)))).((((((((....(((....)))......)))))))))))))(((((...((((((..((((.......((((((.(((....)))..)))))).......))))))))))...))))).............))))))))))).(((.........((((((.....)))))).)))))))))))))........)))))))....(((.((((...)))).))).........((((((......)))))).............)))).....))))))))....))))))).....)))))))....((((((.......)))))).)))))).))))......(((((((((....)))))))))..........))))))..)))))))..................(((((((((.......)))))..((((..(((((...)))))))))...))))))))))((((((...........))))))))))......((((((.((((((((...)))))))).....((((...((((...(((.......((((..(((......)))..)))).(((....)))(((........))))))..))))))))....))))))))))))..))))...........)))))))).....))))))))))))).........))))((((..(((((.....)))))..)))))))))(((((((((((((((((....))))))).)))))(((((.....))))).....)))))............(((((((((((....))).)))..((((((.((((((.............((((....))))..((((((.......))))))...))))))(((((...((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).)))))..)))))).....))))).))))))).))))...)))).((((.........(((...((((....)))))))(((((((((.......)))))..(((..(((((........(((((....)))))........)))))....)))))))))))..........
|
|
CRW_00501
|
[ FASTA input ]
|
GGUUAAGUUAGAAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGGAGCCGAAGAAGGACGGGACUAACACCGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUACGUAAGCGUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGGAACCCACUAUCUUUAGUCGGAUAGUAUCCUUACGUGAAUACAUAGCGUGAGGAAGGCAGACCCAGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCUGGAGGAAGAGAAAGAAAAAUCGAUUUCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAACGGAAAGAGCCCAAACCAAGAAGCUUGCUUCUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUACGGAGUUACAAAAGAAAGUUAUAAAUGAAGCGGUCUGGAAAGGCCCGCCAAAGACGGUAACAGCCCGGUAGUUGAAAUGGCUUUCCCUCCAGAGUGGAUCCUGAGUACGGCGGAACACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCCCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAACAGUUCCUGAAACCGUGUGCCUACAAGUAGUUAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUAGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUUGUUGCAAGGUUAAGCGGAAAAAGCGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAUAAGUAACAGGUCGUAGACCGAAACCAGGUGAUCUACCCAUGUCCAGGAUGAAGGUAAGGUAAUACUUACUGGAGGUCCGAACCCACGCACGUUGAAAAGUGCGGGGAUGAGGUGUGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACUUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCGAGGUAAAGAGUCAUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACUAGGGGCCCUUCUCGGGUUACCGAAUUCAGAUAAACUCCGAAUGCCAUGUACUUAUACUCGGGAGUCAGACUGCGAGUGAUAAGAUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGUUAAGGUCCCCAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGGGUUGCUUAGACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCAUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACCCCGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAACUGUGGAUGAACCUCUUUAGAGGUUCGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGGUGAAGUCAGACCGGAAGGACUGGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUAUGAGUAGCGAAAGAAGGGUGAGAAUCCCUUCCACCGAAUAUCUAAGGUUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAUACGUAGGCGAUGGACAACAGGUAGAGAUUCCUGUACCAGUGCUAAUUGUUUAACCGAUGGGGUGACACAGAAGGAUAGGGAAUCGCACGAAUGGAAAUGUGCGUCCAAGCAGUGAGUGUGAGAAGUAGGCAAAUCCGCUUCUCGCGAAGCAUGAGCUGUGAUGGGGAAGGAAAUUAAGUACGGAAGUUCCUGAUUUCACGCUGUCAAGAAAAGCCUCUAGGAAGAGUAGUACUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGAUGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAGCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUAUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCAAAACCGUAAGGUGACGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGCUUAGCUUCGGCGAAGGUACGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAUCUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUUAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAACCUGAUAUGGAAUGUUUGUACCGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCGAAGAGACGUGUGCGCUAGCAUACGAGGAGGCAAUGGUGGGAUACUACCCUGGCUGUAUGACCAUUCUAACCCGCACUUAGCGCGUGGGGAGACAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGAUGGAAAUCAUUCGCAGAGUGUAAAGGCACAAGGGAGCUUGACUGCGAGACUGACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGCGCAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACACACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCCGCCAGGAGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGUGGCAGGGAUAAACGCUGAAAGCAUCUAAGCGUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUUCUUCGGAAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUAGAUAGGUUUGGAGUGGAAGUGUAGCGAUACAUGGAGCGGACAAAUACUAAUCGAUCGAGGACUUAACCAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))))).))....((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(.((((......)))))(((...).hhh.....))HHH...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..iiii)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....))))..............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..(((...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((.(..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....)))))).)))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....]]]]]]])))...)))))))(((((((((....)))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((cccc.((...(((.(.(......).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((......((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...)).((((((.......))))))..)))))...)))...))))........)))))).))..)))))))))))CCCC..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....((((....))))...)))))(...).......(((((((((..((e....(....E))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ggggg..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).GGGGG))))))))))))))))))...(((.(((.......))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ff....ffffff((.((((((.......))))))...))ff)(.(((FF....FFFFFF....((((((((a...(..A)))))))).(((....))).FF))).).....(((((((.((..IIII..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...{{{{{{{{..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...}}}}}}}}..((((....)))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......(((((((((((...(((....))).(((...[[[[[[.....[[[..)))...]]].....]]]]]]((((((.......))).....)))((((((.[[[[[..(((....)))...))))))..]]]]].....(((((((((.........)))))))))...(((..[[[[[...))).............]]]]].....................(((((........[[[.........)))))..]]]....((((((((....))))))))..(((((....(((((....))))))))))..(((((((((.........(((((....))))).........(((...[[[[)))...]]]]..)))))))))....(((...[[[[.)))....((((((((.........))))))))..]]]]((((((....))))))............(((((....................[[[[...)))))..]]]].......((((....))))...................))))))))))).......((((..(((((.[[[)))))..)))).......]]]......((((((((...((((((((((((((..((((...............)))).............((((.....))))......)))))))))))))).......(((((((((((((((((.....((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........)))))))).......)))))))).((((...)))).)))..)))))).....)))))))).....(((.[[[[)))...]]]]..(((.[[[[[..))).(((((.....(((...((((((((.....(((((.....)))))......))))))))..)))......)))))]]]]].((((.........[[[[[[[))))........]]]]]]]....(((......)))...((((.((((..(((........(((((((.(((.........(((((((((((((.....(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).))))).)))))))))))))(((.........))).))).))))))).)))..))))))))(((((((((....)))))))))((((...((((((((((....((((..[[[[..))))....]]]]..))))))))))...........))))(((((...........((((((.......)))))).[[[..)))))...]]].......(((.[[[[[.))).....]]]]].(((((..(((..[[[.)))))))).....]]]........(((((........))))).(((.......((((...(((.....)))...))))........[[[..[[[[[[..)))...]]]]]]]]].(((.(((..((((((((((.......[[[))))))))))...)))..))).......]]]..(((((((.[[[[[[.......)))))))..(((.........)))((((....)))).........]]]]]].....(((..[[[.))).....((((.....))))...]]](((((((....)))))))......(((((.......[[[[[......)))))....]]]]].((((....((((....)))).)))).(((....[[[[[[[.....)))..]]]]]]](((.........[[[..)))...(((....)))]]]......((((........))))...(((((....[[[[.....[[[[[[....)))))..]]]]]]...]]]].((((((((.......((((((.[[[...))))))....]]].(((.....[[[[((((((.....)))))).)))....]]]]...........(((..[[[[[(((.((((...)))).))).........((((((......))))))..)))..]]]]].((((.......))))........(((((.(((((((((((((((.((((((.((((.(((.......))).))))........(((((((....)))))))....(((...(((((....)))))...))))))))).))))))..(((.(((.......)))))).....)))))))))..)))))...))))))))....((((((...........))))))((((..(((((((((..(((((.........))))).....((((....)))).)))))))))..((((..((((....))))..)))).(((....)))))))......((((((((....))).(((..[[[)))...]]]..)))))..(((((.....[[[[[.....)))))...]]]]].....(((.[[[[[)))...(((((.....)))))]]]]]......(((((((((((((((((....))))))).)))))(((((.....))))).....))))).(((.....(((....(((((((....))).))))...)))..[[[[[[)))(((..................)))((((((.......))))))...]]]]]].((((.[[[[))))..]]]](((((..[[[[)))))...]]]]...((((....)))).(((....(((((...........)))))....))).((((..((((...[[[[[)))).....]]]]]....(((((((((.......)))))..(((..(((((........(((((....)))))........)))))....)))))))))))))))))))...
|
|
CRW_00502
|
[ FASTA input ]
|
GGUUAAGUUAGAAAGGGCGCAUGGUGGAUGCCUUGGCACUAGGAGCCUAAGAAGGACGGCACUAACACCGAUAUGCUCCGGGGAGCUGUAAGUAAGCUUUGAUCCGGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCACUGUCCAUAAUGGGACAGUACGUUUACGUGAAUACAUAGCGUAAACGAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUAAGUAUCCGGAGGAAUAGAAAGAAAAAUCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAAGAAGCUUGCUUCUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUACGGAGUUACAAAGGAAUGGAUUAGACGAAGCGACCUGGAAAGGUCCGCCGUAGCGGGUAAAAGCCCCGUAGUCGAAAAUUCAUUCUCUCCAGAGUGUAUCCUGAGUACGGCGGAACACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCCCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCAUGUGCCUACAAGUUGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUCCAUGCAAGGUUAAGCAGAGAAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGAUAGAGUAUGGGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCAUGUCCAGGGUGAAGGUAAGGUAACACUUACUGGAGGCCCGAACCCACGUACGUUGAAAAGUGCGGGGAUGAGGUGUGGGUAGCGGUGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAACUUAAGAAUCUCGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACUAGGGGCCCAUCCCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCGAUGAUUUAUGUUUGGGAGUCAGACUGCGGGUGAUAAGAUCCGUAGUCGAGAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGUUAAGGUCCCCAAGUAUUCGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACGAAUCACCGAAACUGUGGAUUGACAUCUUAGAUGUCAGUGGUAGGAGAGCGUUCCAAGGGCGUCGAAGCUAGACCGUAAGGACUGGUGGAGCGCUUGGAAGUGAGAAUGCCGGUAUGAGUAGCGAAAGAAGGGUGAGAAUCCCUUCCACCGAAUGCCCAAGGUUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCAGGACCUAAGUUGAGGCCGAAAGGCGUAGACGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCCCGCCGUUUGAGCAAUGGGGUGACGCAGUAGGAUAGGGUGAGCGCGCUGUUGGUUAUGCGCGUCUAAGCAGUGAGGUGUGAAAUGAGGCAAAUCCCAUUUCUAUAACAUUGAGCUGUGAUAGCAAGGGGAUUUAUCCCUGAGUCCCUGAUUUCACGCUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGCGGGAGGUGCCUGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGCGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAUCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGGUAGGGUGUUAAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCAAAACCGCAAGGUGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGAGGUCAGCGCAAGCGAAGCUUCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUUAUAAUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAACCUGAUAUUGAAUUCCGGUGCAGCCUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUGGAUUCCGGAGCGCUAGCUUCGGAUGAGGCGUUGGUGGGAUACUACCCUGGCUGUAUUGGACUUCUAACCCAUGCCCCUUAUCGGGGCAGGAGACAGUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUCGGACAUCAUUCGUAGAGUGCAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGCGCAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCUUGCCAAAGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUAUGGACGGGAUAAAUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCGAGAUGAGAUUUCCCAUUACGCAAGUAAGUAAGAUCCCUCAAAGAAGAUGAGGUUGAUAGGUCUGGGGUGGAAGCGCGGCGACGUGUGGAGCUGACGGAUACUAAUCGAUCGAGGACUUAACCAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.cc.cccc)))...C.(((((((..(((CCC.CC.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))))).))....((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(.((((......)))))(((...).eee.....))EEE...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..dddd)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((...(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))).))))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....]]]]]]])))...)))))))(((((((((...)))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((hhhh.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((.((((((......((..((((((...((((..(((..(((.(.((((((..........))))))((..((((...((((.((((((.((.....)))))))).....))))...))))...)).(((((((....)))))))..))))...)))...))))........)))))).))..)))))))))))HHHH..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....((((......))))...)))))(...).......(((((((((..((i....(....I))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..fffff..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).FFFFF))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((gg....gggggg((.((((((.......))))))...))gg)(.(((GG....GGGGGG....((((((((a...(..A)))))))).(((....))).GG))).).....(((((((.((..DDDD..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...bbbbbbbb..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...BBBBBBBB..((((....)))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......(((((((((((...(((....))).(((...(((....))).[[[..)))...]]].....((((((((((((.......)))))...)))))))..........(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........)))))))))........(((((..(((......[[[[))).))))).....]]]]............(((((........[[[.........)))))..]]](((.((((((((....))))))))..)))(((((((((((....((((.......((((((((((.(((.....(((((....))))).......(((((.......))))).)))...))))))))))))))))))))..)))))(((.((((((((.........))))))))......((((((....))))))...)))...((((((((.....(((...(((.(((..........[[[[..)))......)))..)))..)))))))).......]]]]...))))))))))).......((((..(((((....)))))..))))................((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....))))......))))))))))))))........((((((...((((((((.....((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........)))))))).......))))))))((((.........)))).)))))).....)))))))).....(((.[[[[)))...]]]]..(((((((....(((((((((.....(((...((((((((.....(((((.....)))))......))))))))..)))......)))).)))))..))))))).(((.((((((((((......))))))))))....(((......))).))).(((......)))..(((..[[[[[......)))....]]]]](((.[[[[.)))..]]]]...((((.(((((.......))))).))))......((((((..[[[[[[..........(((((...)))))...))))))..]]]]]]......(((((((.((((((.(((((((((...)))))))))....(((((((.((((..((((((....((((..........(((((((...((((....))))....))))))).....))))....((((((.......))))))......)))))).(((...)))..)))).)))).))).(((((((((.[[[..)))))....))))(((....)))...]]]...(((..(((((........)))))..[[[[)))...(((((.....)))))]]]].)))))).......(((..[[[[))).........]]]]((((..[[[[[..[[[[[[[[[[[))))......]]]]]]....]]]]]..]]]]]........(((((((((....)))))))))..((((.[[[[[....))))......]]]]]..((((....[[[[[[[.))))........]]]]]]].(((....(((..((((....(((.(((((....)))))))))))).))).........[[[[)))..((((....))))]]]].((((....((((......)))).)))).(((....[[[[[[[.....)))..]]]]]]](((........[[[[[[)))...(((....)))........]]]]]].(((((((((..((((((...[[[[.......[[[[[)))))).......]]]]].......]]]].........)))((((((.......))))))..((((..[[[.....))))((((((.....)))))).]]].....))))))...............(((((.....)))))))))))).........((((((......))))))...(((((.....[[[[[[[[....)))))..]]]].]]]]..((((((((((...((((((((((((..(((.......)))...(((((....((((((((....)))))))).)))))...(((((....)))))..))))))))))))..(((......((((((.....))))))..))))))))))))).((((............[[[[[[((((((...........))))))))))..(((((((((..(((((((.....))))))).....((((....)))).)))))))))]]]]]]..(((......)))((((.[[[[[[........))))..]]]]]].(((..[[[[)))....((((....))))..]]]]...(((((.....[[[[[.....)))))...]]]]].....(((.[[[[[)))...(((((.....)))))]]]]]..(((..[[[[((((((((((((....))))))).)))))(((((.....)))))....))).....]]]]...(((....(((((((....))).))))...)))..(((......[[[...)))..(((....)))]]]((((((.......)))))).(((......[[[[)))..]]]].(((((((((((.[[[))))))..)))))...........]]]..(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]]...((((...((((....))))........[[[[...))))....(((((((..(((((.(((....(((((....)))))...)))..)))))....)))))))]]]].)))))))..
|
|
CRW_00503
|
[ FASTA input ]
|
ACAAUAAGUUACUAAGGGCUUAUGGUGGAUGCCUUGGCACUAAAAGGCGAUGAAGGACGUGUUAACCUGCGAUAAGCUUCGGGGAGGUGGUAAAAACCUGAGAUCCGGAGGUGUCCGAAUGGAGCAAUCUGGUAGCUUGCAAAAGUUACCAUUAAUUAAUGAAUUCAUAGUUAAUUAAAGCGAUACGUGGUGAAGUGAAACAUCUCAGUAACCACAGGAAAAGAAAACGAAUGUGAUUCCGUGUGUAGUGGCGAGCGAAAGCGGAACAGGCCAAACCUAUCUGAGGAUAGGGGUUGUAGGGCUUGCAUUAUGGAAGUUAAAAGGAUAGAAGAAGCUGUUGGAAAGCAGCGCCAAAGAGGGUGAUAGCCCCGUAUUUGAAAUCUUUUUAAUACCUAGCAAGAAACCUGAGUAGCUCGAAAAACGUUAUUUUGAGUGAAUCUGCCCAGACCAUUGGGUAAGCCUAAAUACUAAUUAGUGACCGAUAGCGAAACAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCAGAGAUGGGAGUGAAAUAGAUUCUGAAACCAUAUGCCUACAACGUGUCAGAGCACAUUAAUGUGUGAUGGCGUGCGUUUUGAAGUAUGAGCCGGCGAGUUAUGAUAGCAAGCGUUAGUUAACCAGGAGAUGGGGAGCUGUAGCGAAAGCGAGUUUUAAGAGAGCGUUUGUUUGUUAUCAUAGACCCGAAACGGGUUGAGCUAGUCAUGAGCAGGUUGAAGGUUGAGUAACAUUAACUGGAGGACCGAACCGACUCUCGUUGAAACGAUAGCGGAUGACUUGUGAUUAGGGGUGAAAUUCCAAUCGAAAUCCGUGAUAGCUGGUUCUCGUCGAAAUAGCUUUAAGGCUAGCGUAAGAUCACAAAUAAGUGGAGGUAAAGCUACUGAAUGUAUGAUGGCGCCACCUAGGCGUACUGAAUACAAUUAAACUCUGAAUGCCAUUUAUUUUAUUCUUGCAGUCAGACAGUGGGGGAUAAGCUUCAUUGUCAAGAGGGGAAGAGCCCAGAUCAUUAAAUAAGGUCCCCAAAAUAUACUAAGUGGAAAAGGAUGUGAAAGUGCUAAAACAGCAAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCGUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACUUGUCGAGUGUUUUUGCGCCGAAGAUGUAACGGGGCUAAGUAUAUUACCGAAUUUAUGGAUAAGAUAUUUUUAUCUUGUGGUAGACGAGCGUUGUAUUGGAGUUGAAGUCAAAGCGUGAGCAUUGGUGGAUCCAAUACAAGUGAGAAUGCCGGCGUGAGUAACGCUUGGGAGUGAGAAUCUCCCAAACCGAUUGACUAAGGUUUCCUGGACCAGGGUCGUCCUUCCAGGGUUAGUCUGGACCUAAGCUGAGGCUGAAGAGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUACAGUUAGACUGAUGGAGUGACAAAGAAGGUUAUCCACCCCCAUUAUUGGAUUUGGGGAUAAACCAUAAGGUGGUACAAUAGGCAAAUCCGUUGUGCAUAACACUGAGUGGUGAUGUCGAGUGAACGAGUGAUCAAGUAGCGAAGGUGGCAAUUAAUCAUGCUUUCAAGAAAAGCUGCUAGGGCUAAUUUAACUGUAACCAGUACCGAGAACGAACACACGUAGUCAAGGAGAGGAUCCUAAGGUUAGCGAGUGAACUAUAGCCAAGGAACUCUGCAAAUUAACCCCGUAAGUUAGCGAGAAGGGGUGCUUAUCUAAAAGUAAGCCGCAGUGAAGAACGAGGGGGGACUGUUUAACUAAAACACAACUCUAUGCCAAACCGUAAGGUGAUGUAUAUGGGGUGACACCUGCCCAGUGCUGGAAGGUUAAAGAAGGAGGUUAGCAAUUUAUUGCAAAGCUUUUAACUGAAGCCCCAGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUAGUCGGGUAAAUUCCGUCCCGCUUGAAUGGUGUAACCAUCUCUUGACUGUCUCGGCUAUAGACUCGGUGAAAUCCAGGUACGGGUGAAGACACCCGUUAGGCGCAACGGGACGGAAAGACCCCGUGAAGCUUUACUGUAGCUUAAUAUUGAUCAAAACACCACCAUGUAGAGAAUAGGUAGGAGCAAUUGAUGCAAGUUCGCAAGGAUUUGUUGAUGUGAAAUGUGGAAUACUACCCUUGGUUAUGUUUUGUUCUAAUUGGUAACUGUGAUCCAGUUUCAAGACAGUGUUAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCACAAAGGUACCUUCAGUACGGUUGGAAAUCGUAUUUAGAGUGUAAUGGUAUAAGGGUGCUUGACUGUGAGACUUACAGGUCGAACAGGUGAGAAAUCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCAGUAUGGAAUGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACUGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCAGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGACUCAUCUCAUCCUCGAGCUGAAGCAGGUUCGAAGGGUUCGGCUGUUCGCCGAUUAAAGAGAUACGUGAGUUGGGUUCAAACCGUCGUGAGACAGGUUGGUCCCUAUCUAUUGUGCCCACAGGAAGAUUGAAGAGCUUUGCUUCUAGUACGAGAGGACCGGAGCGAGGACACCGCUUAUGCUCCAGUUGUAGCGCCAGCUGCACCGCUGGGUAGUAACGUGUCUAUUAGAUAAACGCUGAAAGCAUCUAAGUGUGAAACUAUCUCAAAGAUUAAUCUUCCCAUUUCUGUUAAAGGAAAGUAAGAGCCGUUAUAGACCAUGACGUUGAUAGGUUACAGGUGUAAGCAUAGUGAUAUGUUGAGCUGAGUAAUACUAAUUGCUCGAGGACUUAUUGGU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((......((((((((((.....(((..((((((((.((((.....(((((((.[[.[[[[)))...].(((((((..(((]]].]].))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((....)))))))).(((((((((.........))))))))).))....((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((....))))))......(((.(((((.....((..(((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).<<<.....))>>>...)))...))))))))))).))..)))))...))).....((((((((.......))))))))......(((((..eeee)))))..))))..)..))..)))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((...((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....)))))...)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((...(((((((((((....(((....(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....)))))))))).)))).)))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....{{{{{{{...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....}}}}}}})))...)))))))((((((((....))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((...((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((dddd.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..(((((((((((........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...)).((((....((....)).....))))..)))).)....)))...))))........)))))).)).....)))))))))))DDDD..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((......))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((((....))))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..(((((((..(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...)))........)).).IIIII))))))))))))))))))...(((..(((((.....))))).))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ff....ffffff((.((((((.......))))))...))ff)(.(((FF....FFFFFF....((((((((a...(..A)))))))).(((....))).FF))).).....(((((((.((..EEEE..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..))).)))))))(...hhhhhhhh..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...HHHHHHHH..(((((......))))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((....(((((...[[[[[...)))))..]]]]]....(((....[[[.))).....]]]..((((..(((((((.((((.......))))....))))))).)))).((((.........(((((((((....)))))))))[[[[[[[[[..))))...]]]]]]]]]...(((..[[[[[..........)))......]]]]].....................((((........[[[[..........))))...]]]]..((((((....))))))((((.((((.(((((....(((..(((((((((((.......((((((....))))))..((((..((((....))))....))))..)))))))))))..))))))))...))))....((((((((.......)))))))).....(((((((....)))))))))))...............(((((....((((((..((((....[[[...)))).......]]].....................(((((.....[[[[[[.........))))).(((((....)))))..]]]]]].))))))......((((((((...(((((((((((((((.(((((..(((.....)))..))))).......((((..(((.....)))))))))))))))))))))).......(((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((....((((....))))...)))....)))))))))))(((......)))......)))))))....))))))))..(((....[[[[[[[[.)))..........((((......))))...]]]]]]]].....(((((....(((((.....))))).....)))))......(((((((((..........))))).....[[[.((((((((((......)))))))))).))))(((.....))).]]].........((((((..........((((((.................(((...[[[[)))....]]]].))))))((((...[[[[))))...((((........)))).....(((.((((....))))))).]]]]...(((.[[[..........)))..(((((..((((((((....)))))))).)))))..]]].((((((((((......(((((..........)))))...))))))))))........(((.((((.....))))(((((((.......))))))).......[[[[[[))).(((((((..((((...)))))))))))]]]]]].))))))..(((...[[[....)))...]]]....(((.[[[[))).......]]]].....((((...)))).((((.((((.......)))))))).(((((....[[[...))))).....]]].......(((((((.[[[[.....)))))))....((((....)))).]]]]...........((((..[[[[[[......[[[[))))....]]]]..........]]]]]]..................((((((....(((((((((((.(((.....((((.....)))).......))).)))...(((((((((((..(((((((.........(((......)))......(((((((......)))(((((..((((((((.(((.((((((((((((.........(((..((((((((...(((....)))...))))).))))))....(((((...((((((..((((......(((((((.((((....))))..)))))))......))))))))))...)))))..........)))))))))..(((.(((..((((.....((((..........))))...))))..))).)))...((((..((((((((.(((...(((.(((...)))..)))(((((((....))))))))))......)))))))).))))))))))....))))))))..))))).............))))....))))))).....((((..((((((...((((((((....)))))))).)))......)))......))))))))))))))).)))))))).)))))).(((((..[[[[[[[.....)))))................]]]]]]].)))))((((((...........))))))((((..[[[[[[[[[.(((((((((...)))))))))....)))).........]]]]]]]]]..((((..((((....))))..)))).(((....)))..(((((.(((...[[[[[[))).)))))....]]]]]]......((((..........))))(((....(((.......))))))..(((((.(((((((.....((((...)))).))))))).))))).....(((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))......(((((.[[[....(((....(((((((....))).))))...))))))))........]]].((((((((((...(((...[[[[[)))...]]]]]....(((((..[[[[[))))).(((.(((((((((((....))))))..)))))))).....]]]]]..((((((...[[[.......))))))..]]]...............))))))))))..(((((......)))))........((((((.[[[[))))))......]]]]...(((...((((((....))))))..)))(((((((....)))))))...)))))))))..
|
|
CRW_00504
|
[ FASTA input ]
|
AAGUAAGUGCCUAAGGGCGCAUGGUGGAUGCCUUGGCAUCGAGAGCCGAUGAAGGACGUGGGAGGCUGCGAUAUGCCUCGGGGAGCUGUCAACCGAGCGUGGAUCCGAGGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAACACGAGUCACGUCGUGUUACCCGUAUCUGAAUAUAUAGGGUUCGGGAGGGAACGCGGGGAAGUGAAACAUCUCAGUACCCGUAGGAGAAGAAAACAAUUGUGAUUCCGCAAGUAGUGGCGAGCGAACGUGGAAUAUGGCUAAACCGCACACAUGUCUAACUAGGUAGGGGUUGUGUGUGCGGUGUUGUGGGAUUGGUAUGUCUCAACUCUACCUGGUUGAGGGGUAGUCAGAAAGUGCCGUGGUUAGCGGAAAUGGCCUGGGAUGGCCUGCCGUAGACGGUGAGAGCCCAGUACGCGAAAGCCUGGCACCUGCCUUGUAUCAAUUCCCGAGUAGCAGCGGGCCCGUGGAAUCUGCUGUGAAUCUGCCGGGACCACCCGGUAAGCCUAAAUACUUCUCGAUGACCGAUAGCGGAUCAGUACCGUGAGGGAAUGGUGAAAAGUACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGUGUGCCUACAAUCCGUCAGAGCCUCUUUGUGGGGUGAUGGCGUGCUUUUUGAAGAAUGAGCCUGCGAGUCAGGGACAUGUCGCGAGGUUAACCCGUGUGGGGUAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUAUCACGUGUGAGCGUGUGUAGUGGCGUGUUCUGGACCCGAAGCGGAGUGAUCUACCCAUGGCCAGGGUGAAGCGCGGGUAAGACCGCGUGGAGGCCCGAACCCACUUAAGUUGAAGAUUGAGGGGAUGAGUUGUGGGUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCCGUGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCAUUUAGGUGCAGCGUUGCGUGGUUCACCACGGAGGUAGAGCUACUGGAUGGCCGAUGGGCCCUACUAGGUUACUGACGUCAGCCAAACUCCGAAUGCCGUGGUUUAAAAGCGUGGCAGUGAGACGGCGGGGGAUAAGCUCCGUACGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGAUCGCCGGCUAAGGCCCCUAAGCGUGUGCUAAGUGGAAAAGGAUGUGCAGUCGCAAAGACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCAAGUGAUUGUGCGCCGAUAAUGUAGCGGGGCUCAAGCACACCGCCGAAGCCGCGGCACAUUCACCUUCUAGGGUGGAUGUGGGUAGGGGAGCGUUCCUCAUUCAGCGAAGCCUCCGGGUAACCGGUGGUGGAGGGUGGGGAAGUGAGAAUGCAGGCAUGAGUAGCGAUAAGGCAAGUGAGAACCUUGCCCGCCGUAAGACCAAGGGUUCCUGGGCCAGGCCAGUCCGCCCAGGGUGAGUCGGGACCUAAGGCGAGGCCGACAGGCGUAGUCGAUGGACAACGGGUUGAUAUUCCCGUACCCGUGUGUGUGCGCCCGUGAUGAAUCAGCGGUACUCACCACCCAAAACCGGAUCGACCAUAUCCCCUUCGGGGGCUAUGGAGGUUCGGGGCUGCGUGGGAACUUCGUUGGUAGUAGUCAAGCGAUGGGGUGACGCAGGAAGGUAGCCGUACCAGUCAGUGGUAAUACUGGAGCAAGCCCGUAGGGAGAGCGAUAGGCAAAUCCGUCGUUCGUGAAUCCUGAGAGGUGAUGCAUAGCCGAUUGAGGCGAAUUCGGUAAGCCUCUGCUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGCAUACAUGCGGCCCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGCAUACCAAGGCGUACGAGAUAACUAUGGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGCCUCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGGGCCGGAAUAUCGUGAACACCCUUGCGGUGGGAGCGGGAUCCGGUCGCAGAGACCAGUGAGAAGCGACUGUUUACUAAAAACACAGGUCCGUGCGAAGUCGUAAGACGAUGUAUACGGACUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGACCUGUUAACCCGAAAGGGUGAAGCGGAGAAUUUAAGCCCCAGUAAACGGCGGUGGUAACUAUAACCAUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGACUUCUCAACUGUCUCAACCAUAGACUCGGCGAAAUUGCACUACGAGUAAAGAUGCUCGUUACGUGCGGCAGGACGAAAAGACCCCGGGACCUUCACUACAACUUGGUAUUGAUGUUCGGUGCGGUUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGACUGUGAAACUUCGACGCUAGUUGGGGUGGAGUCGUUGUUGAAAUACCACUCUGAUUGUAUUGAACAUCUAACCUCGAACCGUAUAUCCGGUUUAGGGACAGUGCCUGGCGGGUAGUUUAACUGGGGCGGUUGCCUCCUAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAACCUGGUCGGUAAUCAGGUGGCGAGUGUAAAUGCACAAGGGGGCUUGACUGCGAGACCUACACGUCAAGCAGGGACGAAAGUCGGGAUUAGUGAUCCGGCACCUCUGAGUGGAAGGGGUGUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUUCCCCAAGAGUCCAUAUCGACGGGAUGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCGCGCGCGUCAGAAACUUGAGGAAAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGACGGACGAACCUCUGGUAUACCAGUUGUCUCACCAGGGGCACCGCUGGAUAGCCACGUUCGGACAAGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAACCUUCUCCAAGAUCAGGUUUCUUACCCACUUGGUGGGAUAAGGCCCCCCGCAGAACACGGGAUUGAUAGGUCAGACCUAGAAGCUCAGUAAUGAGUGUAGGGAACUGGCACUAACUGGCCGAAAGCUUACAAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((.......(((((((........))).....(((((((..(((........))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........)))))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..(.(((....(((((((((((.....((......))..)))))))))))......((((((((((((((((((((......))))))))(((((.......((((((.((((.(((...(.((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...))))))))))))))).)))))))).)))).....(((((((((.......)))))))))......((((((....))))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).......(((((((((((.....)))))))))))..((((........))))((((((....(((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....)).(((((.....)))))...((((((....))))))..)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((..(.(((....(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).).)..))))))))).)..)))))))).)...((((((((((......)))))).))))....(((......)))...((((.(((...(((......(.((((((...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))....................))))))))))...)))))))(((((((((((....)))))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))..............((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((......((((....((((........(((((((...(((((((..((((((((((....)))))))))).)))))))...))))))).......))))......)))).((((.(((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...)).(((((......)))))..)))))...)))...))))........)))))))))...)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((...(((((((((((.....)))))))))))..))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((((....))))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((......(((((((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))))))))))))))))))))...(((.((((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((......))))))))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...))))....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
......(((((....))))).((((.(((((....)))))....))))........((((.[[[[[))))....]]]]].............((((((.((((..........))))..((((....))))((((((......))))))..[[[...((((......))))))))))..]]]...(((((...........[[[[....)))))..]]]]..............(((((((......[[[[........)))))))...]]]].((((((((((((((((......))))...)))))))))))).....((((((((((((.(((((((......)))))))((((((.......(((((((((((.((((....((((......))))..)))).)))(((....)))...)))..........)))))))))))))))))))))))....((((((.[[[[.........))))))......(((((((....))))))).]]]].....((((....((((((....))).)))..[[[[[))))..]]]]]........((((....)))).........(((((((((....(((....)))...(((((..(((((.....)))))..)))))....(((((.(((((.(((......(((.((((((((((((..(((((.(((.....))))))))(((..........((((.....))))....(((((....)))))))).)))))))))))).))).....(((((((((((((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))........))))))).(((.....))).)))..)))))))....))).)))))...)))))....)))))))))(((....(((((....)))))...[[[[.))).......((((....))))]]]]...((((((.......(((...((((....((((((((((....(((((((.....((((((((((......)))))).))))....(((......))).....))))(((..((((((..(((....)))...(((.......(((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))...))))))))))))))..........))))))..)))....)))..))))))))))((((((((((....)))))))))).....))))....((((((((((......(((.((((....)))).)))...))))))))))...........)))...)))))).....(((.............[[[[)))..........]]]]((((((((...[[[.....))))))))...(((((..(((......)))))))).]]]...(((((......[[[[[)))))...]]]]]..((((((((((((..((((..[[[....))))...]]]((((......(((((((..(((((.((((....)))).))))).)))))))[[[[[[)))).(((...)))....]]]]]]..(((....[[[..))).........]]].((((...[[[[))))..]]]]......(((..[[[[[.[[[[[[[.)))......]]]]]]].....]]]]]((((((........(((((..[[[[[....)))))..]]]]]..............)))))).....))))))))))))..(((((.....((((((...[[[[))).)))......]]]].....)))))......((((((((..(((.[[[((((...)))))))....((((....))))]]](((((((...((((...((((.....))))...))))..)))))))...(((((.(((((((((....(((((.....)))))..((((((((((..(((....)))..)))..))))))).(((((.(((...((((((..((((........(((((.((((....))))..)))))........))))))))))...)))((((((.......)))))).....((((...........((((((.....))))))))))......))))).....)))))).)))))))))))))))).(((((.......((((.(((((((....)))))))...))))........[[[......)))))...]]].(((((..........[[[[[[[[[[[[[[[[..)))))....(((((...........((((((((....))))))))....(((....)))....)))))..]]]]]]]]]]]]]]]]...(((.((((((......)))))).)))....(((....[[[)))......]]]((((....((((((...........))))))))))..((((.((((..(((((((.....))))))).....((((....))))..))))[[[[[[[......))))....]]]]]]]...(((....))).((((..[[[))))..]]]...(((((((..[[[[[.))))))).............]]]]](((((.....[[[[.....)))))...]]]]......((((....(((.....)))....))))(((((((...(((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).....[[[[[..)))))))(((....(((((((....))).))))...))).....]]]]]...............(((....((((((((...............)))))))).[[[[)))((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).]]]](((........(((((...........)))))[[[[[[[..)))......]]]]]]]...(((((...)))))....((((.((((.......)))).....((((((((.((((...(((((....))))).))))...))))).)))...))))..............
|
|
CRW_00505
|
[ FASTA input ]
|
GUGAAAGUUUCCAAGGGCGCAUGGUGGAUGCCUUGGCAACAGGAGCCGAAGAAGGACGUGGGAAUCUGCGAUAAGCCUGGUGGAGUCGAUAACCGGACGUUGAGACCAGGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCCGCACGACGUGUCGUGUGACCCCCGGUUGAACACAUAGGCCGGGUGGAGGGAACGUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCACAGGAAGAGAAAACAAAAGUGAUUCCGUUAGUAGUGGCGAGCGAACGCGGAUGGGGCUAAACCGUAUGUGUGUGAUACCCGGCAGGGGUUGCAUGUGCGGUGUUGUGGGCCCCUCCUUGUCAUGUCUGCCGGCAUGGCGCAGUGAGGUGCGGGCAUAUAGACGAACCAGUGUGGAUGCUGGACCGUAGAGGGUGAGAGUCCCGUAGUCGAAAUGUGUUCCGCCGCUGUUGGAGGGUUGCCCGAGUAGCACGGGGCCCGAGGAAUCCCGUGUGAAUCUGCCAGGACCACCUGGUAAGCCUGAAUACUACCUGUUGACCGAUAGCGGAUCAGUACCGUGAGGGAAUGGUGAAAAGUACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCAUGUGCCUACAAACCGUUGGAGCCUCCUUGUGGGGUGACAGCGUGCCUUUUGAAGAAUGAGCCUGCGAGUUAGUGAUACGUGGCGAGGUUAACCCGUGUGGGGAAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGAUUGAGUCGCGUGUCCUAGACCCGAAGCGGAGUGAUCUACCCAUGGCCAGGUUGAAGCGCGUGUAAGAACGCGUGGAGGACCGAACCCACUUCAGUUGAAAAUGGAGGGGAUGAGUUGUGGGUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCCGUGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCAUUUAGGUGCAGCGUCACGUGUUUCUUCCCGGAGGUAGAGCUACUGGAUGGACGAUGGGCCCUACAAGGGCUACUGACUUCAGCCAAACUCCGAAUGCCGGGAAGUGAGAGCGUGGCAGUGAGACUGUGGGGGAUAAGCUUCAUAGUCGAGAGGGAAACAGCCCAGACCACCGGUUAAGGCCCCUAAGCGUGUGCUAAGUGGGAAAGGAUGUGGAGUUGCUGAGACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCAAGUGAUUCCGCGCCGACAAUGUAGCGGGGCUCAAGUACACCGCCGAAACCGUGGCAUUCAGUUUUGCUGGAUGGGUAGGGGAGCGUCGUUCACGAGGUGAAGCCAGCGGGUAACUUCUGGUGGAUUGUGGACGAGUGAGAAUGCAGGCAUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAACCCGUCCGCCGGAUGACUAAGGGUUCCAGGGUCAAGCUAAUCUGCCCUGGGUAAGUCGGGACCUAAGGCGAGGCCGACAGGCGUAGUCGAUGGACAACGGGUUGAUAUUCCCGUACCAGUGAAGAACCGCCCAUGCUGAGCCGGUGAUACUAACCGCCCGAACCAUCCCGAACCUCGUCUUUGACGGGGUCGGUGAUGGGGAGCGCGGGACCUGAACCGGGGAGGCAAGCGCAUUAACAGGUGUGACGCAGGAAGGUAGCCGGGCCGGGCAAUGGAAAUGACCUGGUCUAAGGGUGUAGGGCUGCCGGUAGGUAAAUCCGCCGGCUGUAUGCCUGAGACCUGAUGGGCGCCCACAUGGUGGGUGAUCCGGUGAUCCUAUGCUGCCUAGAAAAGCAUCGGCGCGAGGUUCAAACUGCCCGUACCCUAAACCGACACAGGUGGUCAGGUCAGAGAAUACUAAGGCGAUCGAGAGAAUCAUGGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGCCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGGGCCCCAACCUUGAGCACCACGUGCUGGUGUGAGGGGAUCGGGGCCGCAGAGACCAGGGGGAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCCAUGCGAAGUCGUAAGACGAUGUAUAUGGACUGACUCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGGGGACCCGUUAGCUUCGGCGAAGCGGAGAACUUAAGCCCCAGUAAACGGCGGUGGUAACUAUAACCAUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGAGUAACGACUUCCCCGCUGUCUCAACCAUGAACUCGGCGAAAUUGCAUUACGAGUAAAGAUGCUCGUUACGCGCAGAAGGACGGAAAGACCCCGUGACCUUUACUAUAGUUUGGUAUUGGUGUUCGGUGUGGCUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGACUGUGAAGCGGGCACGCCAGUGUUCGUGGAGUCGUCGUUGAAAUACCACUCUGGUCACUCUGGAUAUCUAACUUCGGCCCGUGAUCCGGGUCAGGGACAGUGCCUGAUGGGUAGUUUAACUGGGGCGGUUGCCUCCUAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGCCUGGUUGGUAAUCAGGUGUCGAGUGCAAGUGCACAAGGGAGCUUGACUGUGAGAGUGGCAGCUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGACUAGUGAUCCGGCGGCUCGUUGUGGAACGGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACCUCGGGGAUAACAGGCUGAUCUUGCCCAAGAGUCCAUAUCGACGGCAUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGGAGUAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCUCUGCGCGCGUUGGAAAUUUGAGAAGGUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGACGGACGAACCUCUGGUAUGUCAGUUGUACCGCCAGGUGCAUGGCUGAUUAGCUACGUUCGGGAUGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCGGCUUCGAGAUGAGAUUUCCUUGCCCCUUUGAGGGUGUGAGGCCCCCAGCUAGAACACUGGGUUGAUAGGCUGGAUGUGGAAGCGAGGACUGAAGACUCGUGAAGCUGACCAGUACUAAUAGGCCGAUGACUUACACACA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((.................................................................................................................(..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.....((...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((..((((((((((((.....))))))))))))...)))))(...).......(((((((((..(([....(....]))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..<<<<<<<<.<<<.<<......<<<<<<<<<<<.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..bbbbb..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).BBBBB))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))<(dd....dddddd((.((((((.......))))))...))dd)(.(((DD....DDDDDD....((((((((c...(..C)))))))).(((....))).DD))).).....<<<<<<<.<<..))))..>>>>>>>>>.....>).....>>>>>..>>>>>>........(((.((..((((...((.......))...)))).)..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....>>..>>>>>>>>>>>(...eeeeeeee..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...EEEEEEEE....((((...))))..(..(((((((((........)))))....(((((((((((..(..(((((((.....))))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
.........(((...[[[.......)))...((((....)))).]]]......((((((((.......((((...[[[[[[...))))................]]]]]].(((((....(((....)))(((((((....)))))))...(((((((.........)))))))....))))).(((((..(((((......))))).))))).((((................)))).......(((((((((......(((.((((((..((((((((((((.....(((....)))..))))))))))))......)))))))))..((((((((....))))))))(((((..((((.((((((((.(((...(((((......)))))........(((.......)))...)))...)))))))))))))))))....(((...........[[[[[[[[)))......]]]]]]]].....(((((((....)))))))..............(((((..(((....))).[[[[((((((......)))))).......((((....)))).....)))))...]]]].....((((((((.....(((((..(((((.....)))))..)))))(((.(((((.(((((.(((.......((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....))))......)))))))))))))).......(((((((((((((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))........))))))).(((.....))).)))..)))))))....))).)))))...))))).)))..))))))))..(((((((.(((((((((((.((((....))))((((((......((((((...)))))).(((....))))))...))).....)))))))..))))))))))).....((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((....)))[[[.(((....)))..))))...]]].((((((((((((......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))..))))))))))))(((.........)))(((.......[[[.)))......]]]((((((.(((((.(((......))).))))).((((((((((......(((((.(((...))))))))...))))))))))....)))))).(((.....[[[[....(((((((.....))))))).)))...(((((...........))))).]]]]....(((.(((((..[[[[[.))))).)))....]]]]].((((..(((....))).(((((........)))))..[[[[.......))))...]]]]..(((((........((((.....(((((((((.(((((((...))))))))))).))))).....))))..[[[..)))))..]]]....((((((....))))))((((.....[[[[[[[((((((((............))))))))....))))..]]]]]]]..(((((.....[[[[(((.....)))....)))))..((((((((((...))))))).)))]]]]..((((((((.........))))).[[[[..))).......]]]].....(((..[[[[[[..)))..]]].]]].....((((((((((((((((.(((..((((((((................(((((((.....(((....)))))))((((((..((((..((((((.....))))))..))))...)))))))))(((((...(((((((....(((((.....)))))..((((((((((..(((....)))..)))..))))))).(((((.(((...((((((..((((.(((....(((((...........)))))....))).))))))))))...)))((((((.......)))))).....((((...........((((((.....))))))))))......))))).....)))))))...))))))))))))).)))..)))..))))...(((((((....)))))))........(((((((((.......))))..))))).......)))))))))(((((((((.((((((......(((..((((...(((..(((.((((((((....))))))))....)))..)))....))))..))))))))).))))))))).......((((((.....)))))).(((.[[[[.))).............]]]]((((....((((((...........))))))))))..(((((((((..((((((((...))))))))[[[..((((....)))).)))))))))..((((..((((....))))..)))).(((....)))..]]].....((((((((((.((((....)))))))))).[[[...))))............]]](((....[[[..)))..]]].....(((.[[[[[[[.)))............]]]]]]]..)))))))))(((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))....(((...[[[[[.)))(((....(((((((....))).))))...)))...........]]]]]...............(((((((((.......[[[[[...)))))))))...]]]]].....((((((((((((....))))))..))))))...))))))))((((.......(((((.....[[[[[.)))))((((....)))).]]]]].....)))).((((......))))....(((((((((........)))))....((((((((...(((..(((((.........)))))....))).))))).)))...))))...............
|
|
CRW_00507
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGUGAAUAAGUGCAUCAGGCGGAUGCCUUGGCGAUGAUAGGCGACGAAGGACGUGUAAGCCUGCGAAAAGCGCGGGGGAGCUGGCAAUAAAGCUAUGAUUCCGCGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACUGCAUUCUGUGCAGUAUCCUAAGUUGAAUACAUAGGCUUAGAGAAGCGAACCCGGAGAACUGAACCAUCUAAGUACCCGGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCGCAAGUAGUGGCGAGCGAACGCGGAGGAGCCUGUACGUAAUAACUGUCGAGAUAGAAGAACAAGCUGGGAAGCUUGACCAUAGCGGGUGACAGUCCCGUAUUCGAAAUCUCAACAGCGGUACUAAGCGUACGAAAAGUAGGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCAUCAUCGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGGAGGGAAGUGAAACAGAACCUGAAACCUGAUGCAUACAAACAGUGGGAGCGCCCUAGUGGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAACGACUUACAUUCAGUAGCGAGCUUAACCGGAUAGGGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCUUAAUAGGGCGAUGAGUUGCUGGGUGUAGACCCGAAACCGAGUGAUCUAUCCAUGGUCAGGUUGAAGGUGCCGUAACAGGUACUGGAGGACCGAACCCACGCAUGUUGCAAAAUGCGGGGAUGAGCUGUGGGUAGGGGUGAAAGGCUAAACAAACUCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAACUAUUUAGGUAGUGCCUCGAGCAAGACACUGAUGGGGGUAAAGCACUGUUAUGGCUAGGGGGUUAUUGCAACUUACCAACCCAUGGCAAACUCAGAAUACCAUCAAGUGGUUCCUCGGGAGACAGACAGCGGGUGCUAACGUCCGUUGUCAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCGGCUAAGGUCCCAAAUGAUAGAUUAAGUGGUAAACGAAGUGGGAAGGCACAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGUCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUCAAAUCUAUAACCGAAGCUGCGGAUGCCGGUUUACCGGCAUGGUAGGGGAGCGUUCUGUAGGCUGAUGAAGGUGCAUUGUAAAGUGUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGUUGACAUGAGUAGCGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGAAAGCCCAAGGUUUCCUACGCAACGUUCAUCGGCGUAGGGUAAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCAGAAAUGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGAUUCAAAUGCGAUGUGGGGACGGAGAAGGUUAGGUUGGCAAGCUGUUGGAAUAGCUUGUUUAAGCCGGUAGGUGGAAGACUUAGGCAAAUCCGGGUUUUCUUAACACCGAGAAGUGAUGACGAGUGUCUACGGACACGAAGCAACCGAUACCACGCUUCCAGGAAAAGCCACUAAGCUUCAGUUUGAAUCGAACCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGGUAGGAUGAGAAUUCUAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGAGAAGGAACUCGGCAAAUUGAUACCGUAACUUCGGGAGAAGGUAUGCCCUCUAAGGUUAAGGACUUGCUCCGUAAGCCCCGGAGGGUCGCAGAGAAUAGGUGGCUGCGACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUCUGCCAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAAGAUGUGCAAGCAUCGGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAUGGCGUAACGAUGGCCACACUGUCUCCUCCCGAGACUCAGCGAAGUUGAAGUGGUUGUGAAGAUGCAAUCUACCCGCUGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAGCUUUGCAUUGGACUUUGAAGUCACUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUGGAAGCAGAGACGCCAGUCUCUGUGGAGUCGUCCUUGAAAUACCACCCUGGUGUCUUUGAGGUUCUAACCCAGACCCGUCAUCCGGGUCGGGGACCGUGCAUGGUAGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCCAAAGCGUAACGGAGGAGUUCGAAGGUUACCUAGGUCCGGUCGGAAAUCGGACUGAUAGUGCAAUGGCAAAAGGUAGCUUAACUGCGAGACCGACAAGUCGGGCAGGUGCGAAAGCAGGACAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUUCCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGAGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGUGAGCUGGGUUUAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCAGUGGCGUUGGAAGUUUGACGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCGGUUGUAACGCCAGUUGCAUAGCCGGGUAGCUAAGUUCGGAAGAGAUAAGCGCUGAAAGCAUCUAAGCGCGAAACUCGCCUGAAGAUGAGACUUCCCUUGCGGUUUAACCGCACUAAAGGGUCGUUCGAGACCAGGACGUUGAUAGGUGGGGUGUGGAAGCGCGGUAACGCGUGAAGCUAACCCAUACUAAUUGCCCGUGAGGCUUGACUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ff.ffff)))...F.(((((((..(((FFF..FF.))).....)))))))...))))...(((....)))((((((.....)))))).(((((((((.........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.((((((.....((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).eee.....))EEE...)))...)))))))))).........))))))........(((((((((.......)))))))))......(((((..dddd)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((.....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((....(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).)))..).)))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....g.gggggg...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......GGGGGGG)))...)))))))(((((((....)))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((iiii.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))....))))...))))...)).(((((((....)))))))..)))))...)))...))))........))))))..))....)))))))))))IIII..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((((((.....))))))).)))))))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))...(((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..aaaaa..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).AAAAA))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((bb....bbbbbb((.((((((.......))))))...))bb)(.(((BB....BBBBBB....((((((((<...(..>)))))))).(((....))).BB))).).....(((((((.((..DDDD..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..))))))))))(...hhhhhhhh..((((.(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...HHHHHHHH..((((((...))))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...............(((...((((....))))..))).....((((......[[[[[[....))))........(((((((....((((......))))...)))))))]]]]]](((.(((....)))[[[[[[)))..]]]]]]....................(((((((.........[[[[............)))))))..]]]].....................((((((.......[[[........))))))..]]](((((((.....((((.(((((.(((...((((((....))))))......(((((.......))))).)))...))))).))))...[[[[..)))))))...]]]]((((((((...[[[...)))))))).....(((((((....)))))))........]]]((((.(((....))).))))........(((..[[[....)))........]]]...(((.........[[[..))).....]]]....(((((((..((((..(((((.....)))))..))))......)))))))..((((((.......(((((((((((((..((((.............)))).............((((.....)))).....)))))))))))))))))))...((((((..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))))...[[[.[[[[[.....))))))...]]]]]..]]].(((.....(((((....)))))................[[[[[[))).......(((.....((((((((((...........)))..))).)))).....)))....]]]]]]........((((((((...(((((((((((....)))))))))))....(((......)))..(((((.........[[[[[.............)))))........]]]]].(((...[[[[)))....]]]].........(((((((((...........(((.....((((.......)))).[[[[[[)))...........]]]]]].....(((((.......[[[[[..(((((((....))))))).)))))..(((((((.(((..((((((..((((((((....)))))))).....))))))...)))))))))).......]]]]].....(((((((.....))))))).(((((.....[[[[...((((((((...........))))))))....)))))(((...(((...(((....)))...)))...)))..(((((........))))).]]]]..............(((((.................((((((((((....))))))))))...(((....[[[[[[[[[[[..))).......]]]]]]]....]]]]..((((((.......(((((....)))))[[[[[...........))))))................]]]]].(((((...)))))....)))))..((((..((((((..((((((....))))))...)))))).[[[...)))).........]]]............(((......)))...(((....[[[[[[[..[[[[..[[[)))..]]]...]]]]..]]]]]]]...........)))))))))(((((((.............((((((((....(((....)))......)))))))).(((.(((((...((((((..((((..((((.(((((....)))))...))))))))))))))...))))).)))......)))))))..((((..[[[.....))))((((((.....)))))).]]].....(((......[[[[[)))..]]]]]..))))))))..(((((...)))))...(((......[[[[[[[...))).(((((...((((.......))))...........))))).]]]]]]].((((....))))........(((((.[[[[[..(((((....((((((((....)))))))).)))))))))).......]]]]]..(((........[[[[...)))..((((((.....))))))...]]]].(((....[[[)))......]]]........((((((...........)))))).(((..(((((((((.((((((((.....)))))))).....(((....)))..)))))))))..[[[[))).((((....))))]]]].(((....)))........(((..((((((((((....[[[)))))))))).)))...............]]]((((...[[[.((((((((((((.....(((......)))))))))).))))).))))..]]].(((...[[[[((((((((((((....))))))).)))))...)))....(((((.....)))))..]]]]((((((....(((((((....))).))))...)))..[[[.....)))...]]]........(((.(((((((...............))))))).[[[[[)))((((...(((((((((((....))))))..)))))...)))).]]]]]...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]].(((......((((((...))))))......[[[[)))...]]]]...(((....((((((((...(((..(((((....)))))....))).))))).)))...[[[)))..]]]........
|
|
CRW_00509
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGUGAAGAAGCGCAUACGGUGGAUGCCUUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAAGACGUGGUAGCCUGCGAAAAGCUUCGGGGAGUCGGCAAACAGACUUUGAUCCGGAGAUCUCUGAAUGGGGGAACCCACCUAGGAUAACCUAGGUAUCUUGUACUGAAUCCAUAGGUGCAAGAGGCGAACCACGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCUGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCUUAGUAGUGGCGAGCGAACGGGGAUUAGCCCUUAAGCUUCAUUGAUUUUAGCGGAACGCUCUGGAAAGUGCGGCCAUAGUGGGUGAUAGCCCCGUACGCGAAAGGAUCUUUGAAGUGAAAUCGAGUAGGACGGAGCACGAGAAACUUUGUCUGAACAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUACUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGAGAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUAUGCGUACAAGCAGUGGGAGCCUACUUGUUAGGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCAGUGGCAAGCUUAAUCGUAUAGGGUAGGCGUAGCGAAAAGCGAGUCUUAAUAGGGCGUUUAGUCGCUGGGUAUAGACCCGAAACCGGGCGAUCUAUCCAUGAGCAGGUUGAAGGUUAGGUAACACUGACUGGAGGACCGAACCCACUCCCGUUGAAAAGGUAGGGGAUGACUUGUGGAUCGGAGUGAAAGGCUAAUCAAGCUCGGAGAUAGCUGGUUCUCCUCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCAUGUAUCACUCUGGGGGGUAGAGCAACUGUUUCGGCUAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAAACCGAUGCAAACUCCGAAUACCCAGAAGUGCCGAGCAUGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAAAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUUGUGGUUAAGUGGUAAACGAUGUGGGAAGGCUUAGACAGCUAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUCAAACCACACACCGAAGCUGCGGGUGUCACGUAAGUGACGCGGUAGAGGAGCGUUCUGUAAGCCUGUGAAGGUGAGUUGAGAAGCUUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUGAGUAACGACAAUGGGUGUGAAAAGCACCCACGCCGAAAGACCAAGGGUUCCUGCGCAACGUUAAUCGACGCAGGGUUAGUCGGUUCCUAAGGCGAGGCUGAAAAGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUCUGGUUACUGCGAUGGAGGGGCGGAGGAGGCUAGGGCCGCUUGGCCGUGGGUGGCCAAGUUUAAGGUGGUAGGCUGAAAUCUUAGGUAAAUCCGGGGUUUCAAGGCCGAGAGGUGAUGACGAGUCGUCUUUUAGAUGACGAAGUGCUUGAUGCCAUGCUUCCAAGAAAAGCUUCUAAGCUUCAGGUAACCAGGAACCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCGGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGCACCGUAACUUCGGGAGAAGGUGCGCCGGCUAGGGUGAAGGAUUUACUCCGUAAGCUCUGGCUGGUCGAAGAUACCAGGCCGCUGCGACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUCUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGAUGGCGGCGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAAAUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUAUCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAGCUUUGCACUGGACUUUGAGCCUGCUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGCGUGGACGCCAGUUCGCGUGGAGCCAUCCUUGAAAUACCACCCUGGCAUGCUUGAGGUUCUAACUCUGGUCCGUGAUCCGGAUCGAGGACAGUGUAUGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGUACGAAGGUGCGCUCAGACCGGUCGGAAAUCGGUCGCAGAGUAUAAAGGCAAAAGCGCGCUUGACUGCGAGACAGACACGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGUCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGCCGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGACGUUUGAGAUUUGAGAGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGAACCUCUGGUGUUCCGGUUGUCACGCCAGUGGCAUUGCCGGGUAGCUAUGUUCGGAAAAGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAACUUGCCUCAAGAUGAGAUCUCACUGGGAACUUGAUUCCCUGAAGGGCCGUCGAAGACUACGACGUUGAUAGGCUGGGUGUGUAAGCGUUGUGAGGCGUUGAGCUAACCAGUACUAAUUGCCCGUGAGGCUUGACCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD..DD.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...(((.(((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.((..((((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).ggg.....))GGG...)))...)))))))))))))).))........(((((((((.......)))))))))......(((((..{{{{)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((.....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((.....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((.(((((((((((....(((....(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).)))...)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....e.eeeeee...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......EEEEEEE)))...)))))))(((((((....)))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((<<<<.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((..((((.((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))...))))...)).(((((((((...)))))))))...))))...)))...))))........))))))..))....)))))))))))>>>>..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((...(((.....)))....))))))))))))(...).......(((((((((..((f....(....F))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).IIIII))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh....hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)(.(((HH....HHHHHH....((((((((c...(..C)))))))).(((....))).HH))).).....(((((((.((..}}}}..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...bbbbbbbb..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...BBBBBBBB..(((((.....))))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......(((((((((((...(((....)))(((.[[[[[)))......(((((....)))))....]]]]]..((((((........)))))).....((((((((......(((....)))(((((((....))))))).(((((((((...[[[...))))))))).........(((((.(((..........))).))))).]]].............(((.[[[[)))..((((((..(((....((((.....))))...)))))))))........]]]].....(((...[[[[[.)))....((((....))))]]]]]......))))))))...(((..........[[[[[[[[)))......]]]]]]]].....(((((((....)))))))........(((((...[[[[.....)))))...]]]]..(((.[[[.....))).......((((.....))))............]]]...)))))))))))...((((((((....)))).)))).......((((.[[[[..))))....]]]].......((((((((((((((..(((((.[[[[......)))))...]]]].......((((.....)))).....)))))))))))))).((((....))))...((((((((((((..((((...((((((......))))))....)))).........(((............))).....))))))))).))).....((((......((((.[[[[[.))))...]]]]]......(((((....)))))))))(((((..(((((((((.....(((....(((.((((.....(((((.[[[[)))))......)))).)))..)))......))))).))))....))))).......(((((((((((....)))))))))))....]]]]....(((..((((((.((((....[[[[[.))))))))))....)))........]]]]](((((..(((.....(((((.(((((.......))))).)))))......(((......))).....)))[[[[[)))))..(((.....))).....]]]]]..........(((...[[[)))(((((((....)))))))..]]]...(((((((.....((((.....((((((((....))))))))..)))).[[[.......)))))))....]]].(((((....(((((((.....)))))))[[[[....[[[[......[[[[[[[...))))).....]]]]]]]......]]]].....]]]]..(((....)))........((((..(((((........)))))..(((((((((((....((((((.........(((....)))(((((((((....)))))))))....((((.((((((((((((((..........)))))))))..(((....)))........(((((((...))))))).....))))).))))...))))))....(((((....)))))..))))))))))).......))))..(((((.[[[[[[)))))................]]]]]].(((..(((((((((((............(((....)))..)))).(((((.((((.((((((((((((...(((.....)))....))))))))))))......))))..(((((((.(((((((.............((((((((....(((....)))......)))))))).(((.(((((...((((((..((((..(((((((((((...........))))))..)))))))))))))))...))))).)))......)))))))........(((..((((...((((((.....))))))......))))..))).....)))))))....)))))))))))).)))...............((((((....[[[[[[[....))))))...((((.......)))).......]]]]]]].....(((((((((((..(((.(((....))).....(((((((((((((...((((((((....)))))))))))))).))))......)))..........)))..)))))....(((.((((((.....)))))))))..))))))..(((((.(((((((((((((((...(((((((...........))))))).....(((((((((..(((((((.....)))))))..................)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....))).)))))))).(((((((((((((.......)))))))))......((((..........)))).))))..)))))))...)))))...(((((.(((((((....(((((...)))))))))))).))))).....((((((((((((....))))))).)))))..(((.((((((...............)))))).(((....(((((((....))).))))...))).[[[[)))...........]]]]..........(((((((...[[[.[[[[[...))))))).....]]]]].]]].((((((((((((....))))))..))))))..(((.................[[[[[...))).....]]]]]....(((..[[[)))..]]]..(((((.(((((.....)))))....(((((((((.......)))))....((((((((.......((((((....)))))).......))))).)))...)))))))))))))))))..
|
|
CRW_00511
|
[ FASTA input ]
|
GGUUAAGUGAAUAAGCGUACAUGGUGGAUGCCUAGGCAAUAAGAGGCGAAGAAGGACGUGCUAACCUGCGAAAAGUCAUGAUGAGCUGGUAAGAAGCGCAAAAGUCAUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCAGCAUCAGUUAUGAUGUUAUCAGAGCAAUCUGAGGCGAACCGGGAGAAGUGAAACAUCUCAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUUCCUAAGUAGUGGCGAACGAACGGGAAGCAGCCCAAAAGUUGUAUAAGUCAUAGUUGAAUUAUCUGGAAAGGUAAACGAAAGAGAGUGAUAGUCUCGUAGACGAAGUGGCUUAUAUGAUGAUGAAAGAGUAGGACGGAACACGUGGAAUUCUGUCUGAAGAUAGGGGGACCAUCCUCUAAGGCUAAAUACUACUUAUUGACCGAUAGUGAACAAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCUGUUAGGGGAGUGAAAUAGAAACUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACUACGGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUCGGUCAGCGAGUUACUUUCAGUGGCGAGGUUAACCGCAUAGGGGAGCCGAAGGGAAAACCGAGUUUUAACUGAGCGCGAGUCGCUGGGAGUAGACCCGAAACCUGAUGAUCUAGUCAUGGGCAGGAUGAAGGCAAGGUAACACUUGCUGGAGGGCCGAACCCACUAACGUUGCAAAGUUAGGGGAUGACCUGUGACUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAAUCAGGUGAUAUCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCAAAUGAAAGUUAUGGGAGGUAGAGCACUGUUUCGAUAAGGGGUCCAUCCCGGAUUGCCGAGUCGAUGCAAACUCCGAAUACUCAUAAGGACUAUUUGGGAGACAGACAGCGGGUGCUAAGGUCCGUUGUCGAGAGGGAAAGAGCCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCGAAGUUAAGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCAUAGACAGCUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUAAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAAACCUUACACCGAAGCUGCGGAAUUAAGAAAUUAAUUGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGGCUGUGAAGGGCAACUGGAAGGUUGACUGGAGCUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACGUGAGUAACGAUAAUAUAUGUGAAAAACAUAUACGCCGAAAGACCAAGGGUUUCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGAGUGAGUCGGUACCUAAUGUAAGGCUGAAAAGCGUAGACGAUGGAUAUUCGGUUAAUAUUCCGAAACUAGGCAUUGAUUGUGAGGAAGGACGGAGAAGGCUAGUGCUGCUUACUGUUGGAAUAGUAAGUGGAAGGCGGUAGUUCCGGUGUGUACGAAGAAAAGGCACGCUGAAGGACGAGAGCCGAGAGGAUUACACUACGGUGUAAGAAGAGCAUGAUGCCAGGCUUCCAGGAAAAGUUCCGUACACGUUAAUUAAUGCUGGCCGUACCCGAAACCGACACAGGUGGUCGGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUAGUACCGUAACUUAGGGAGAAGGUAUGCUGAGGAGAUUGAGCAUCCGCGCGAUGUAAGGUUGAAUCAGUGACAGCAAAGAGGUGGCUGGGACUGUUUAACAAAAACACAGCACACUGCGAACACGGAAGUGGAAGUAUAGUGUGUGACACCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAAUGAUGAAGUCAUCGCAAGAGAAGCUUCUGAUUGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGCAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGUGUAACCAUGGCCACGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUCGAAAUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGUCUGUCUGUGUAGGAUAGAUGGGAGACAGAGAAGCGAGUACGCCAGUAUUCGUGGAGUCGGCCGGUGAAAUACCAUUCUGGGAGACUUGGUGUUCUAACCAAAUAUUAACAGAUAAUGGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGGGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCACGGUCGGACAUCGUGAGGUUAGUGUAAUGGUAGAAGCCAGCUUAACUGCGAGACAGACGAGUCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCUGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUUGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUCAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAUGAUUGAAGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGAACCGCUGGUGUAUGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUACGUUCGGAAUCGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCGAGCCUUAAGAUAAGUCAUCCCGAACUAUAAGUUUGUAAGGGACGUUGGAGACUACGACGUUGAUAGGCUGGGAGUGGAAGUGCAGUGAUGCAUGUAGCGGACCAGUACUAAUGACCCGAGAGGCUUAACCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ff.ffff)))...F.(((((((..(((FFF.FF.)))......)))))))...))))...(((....)))(((((((....))))))).(((((....))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.....((((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).eee.....))EEE...)))...))))))))))))))............(((((((((.......)))))))))......(((((..aaaa)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((.....)).(((((.....)))))...)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(.(((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....)))))))...)))))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......]]]]]]])))...)))))))((((((....))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((hhhh.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))((.((((((((((..((((((...((((..(((..(((((((((((..........))))))....((((...((((((((((((.(........)))))))))..))))...)))).....((((((((....))))))))..)))))...)))...))))........))))))..)).....))))))))))HHHH..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(((......((((((((....))))))))...)))........)).).DDDDD))))))))))))))))))...(((.(((((....)))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....((((((((<...(..>)))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..AAAA..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...cccccccc..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...CCCCCCCC..((((...))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...........((((((((((((((..........))))......((((((....(((..........[[[[[[..[[[)))....]]]......]]]]]].))))))...(((((......(((((((....))))))).(((((....))))).......[[[((((.........))))....)))))...............]]]...((((((.......[[[........))))))..]]].....((((((((((((((.(((...((((((....))))))......((((.......))))...)))...)))))))))))))).......((((((.(((.....)))....(((.[[[[)))..(((((((....)))))))]]]]......)))))).(((((((((.........((((............(((.......(((((...)))))(((.........))).....)))[[[[))))..(((((....((((....)))).)))))]]]]..........)))))))))....((((((((((((((..((((.............))))..............((((.....))))....)))))))))))))).......(((((((..((((((((((((.........((((((......))))))....[[[[...(((.(((((........))))))))....)))))))))))).......]]]]......)))))))........(((((...[[[[[(((((....)))))(((((..((((...))))..))))))))))....]]]]]....((((....))))...((((...[[[...))))..((((((((...........)))))))).]]].(((((((((........)))))))))....(((......)))................(((((...(((....))).))))).....((((...((((...(((.(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..)))))...))).)))).))))..........(((........[[[[[[.))).........((((((....)))))).]]]]]].(((.[[[......)))..]]].(((..[[[[...)))..]]]].....((((....[[[....))))(((.....)))....(((((((.....)))))))]]].....(((...[[[[.(((((((...........)))))))....)))...]]]]........(((....))).(((.[[[[[....(((((........))))).)))..]]]]].....................(((((((.(((((((((((....)))))))))))..(((....((((((((((((...........))))))))..))))....)))....(((((((((....))))))...[[[[.............))).......]]]].................))))))).(((((((.(((......)))..))))))).(((((((((((.((((((((....))))))))......(((((.......[[[[[....)))))......]]]]].....(((.[[[[....)))...]]]].....((((((.((((..((((....[[[[[))))..)))))))))).....((((.(((..(((...(((....)))...)))..))))))).]]]]]..((((.[[[[..........(((((....)))))........(((((.....))))).))))....]]]]((((((.[[[...))))))....]]].......(((((.((((((.....))))))......(((((((((.(((..((((...((((((((.....((((((((((........(((........))).((((((......(((((.((((.......))))............)))))..))))))..))))))))))((((((.....)))))).))))))))....((((((((....))))))))......)))))))...))))))))).))))).)))))))))))..(((..[[[[..[[[[[[.))).....]]]]]]...]]]](((((((((.......(((((((...........))))))).....[[[[[[[[[.....)))))))))(((....)))...............]]]]]]]]]..(((...(((......)))[[[))).(((....)))(((((...))))).(((((((((.......))))))))).]]]..((((....[[[[..))))..........((((((((((((.....(((......)))))))))).)))))]]]].(((.[[[[[[[)))..(((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).....(((...)))]]]]]]]...((((..(((....)))..))))......))))))))))......((((((((...(((((...))))).............(((..[[[[[[..))).((((...(((((((((((....))))))..)))))...))))]]]]]]...(((....(((((......[[[[.)))))....)))......]]]].))))))))((((((...))))))...(((((((((.......))))))...((((((((........(((((....)))))........))))).)))....))).....))))))))..
|
|
CRW_00512
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGUAAAUGUAAUAAGGGCAUUUGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGGCGAUGAAGGACGUAAUACGUUGCGAUAAGCUUCGGGGAGUUGCGAAUAAACUUUGAUCCGAAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCACCUAAUUUGUUAGGUAUUAUAUAGUCAAUACAUAGCUAUAUAAGGCGAACCCAGCGAACUGAAAUAUCUAAGUAGCUGGAGGAAAGGACAUCAACCGAGACUCCGUUAGUAGUGACGAGCGAACGCGGACCAGGCCAGUGACUUCAAAAAAAUAACUAAAACAAUAUGGAAAGAUUGACCAUAGAGGGUGAUAGUCCCGUAUAGGUAAAAAGUUUGAAGUUUUUGAGUAAGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUUUGAACAUAGGGGGACCACCCUCUAAGCCUAAGUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACAAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCCCGACAAGGGGAGUGAAAUAGUAUCUGAAACCAAAUGCUUACAAGCAGUCGGAGCAAGCAUAUUUAUAUGUCUUGUGACGGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAGUUUAUCUAGCAAGCUUAAGCCGUUAGGUGUAGGCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUUAGAUGAAUUAGACCCGAAACCGGGUGAUCUAGCCAUGGCCAGGUUGAAAGCGGAGUAAAAUCCGCUGAAGGACCGAACCCACUACUGUUGAAAAAGUAGGGGAUGAGCUGUGGUUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCGGAUAUAGCUGGUUCUCCGCGAAAUCUAUUUAGGUAGAGCGUUAUAGCGAUUACCAUCGAAGGUAGAGCACUGAAUGAGCUAGGGGGUUCUACAGACUUACCAAACUCAAUCAAACUCCGAAUGUCGAUGAGUACAGCAUAGCAGACAGACUAUGGGUGCUAAGGUCCAUAGUCGAGAGGGAAAAAGCCCAGACCGCCAUCUAAGGUCCCUAAAUCAUGACUAAGUGUUAAAGGAUGUGAGAAGACCAAAACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUAGUCUAAAUAAGUUUUCUUGCGCCAACAAUGUAACGGGGCUCAAGUCAUGUACCGAAGAUGCGGAUUUAUGCAUUUAGCAUAAAUGGUAGCGGAGCGUUCCGUAAGCCUGUGAAGGUAAACUGUAAGGUUUGCUGGAGGUAUCGGAAGUGAGAAUGCUGACAUAAGUAGCGAUAAAGAAUGUGAGAAACAUUCUCGCCGAAAGUCCAAGGGUUCUUGCGUAAAGUUAAUCUGCGCAAGGUUAGUCGGCCCCUAAGGUGAGGCUGAAAGGCGUAAUCGAUGGGAAUCAGGUUAAUAUUCCUGAACCUAAAGGAUGUGACGAAAAUAGUAAAUUGUAUAGUCUUAUUGGAUUGAUUGUGCAGUGAAUAUUUUCCAGGAAAUAGCACCUUUAUUAUAGACCGUACCCAAAACCGACACAGGUGGACAGGUAGAGUAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACGAUGCUGAAGGAACUAGGCAAAUUACAUCUGUAACUUCGGAAGAAAGAUGACCUGUGUAUGGGCAACCAUAUGCAGGUGGCACAAGUUAGGGGGUAGCGACUGUUUAUUAAAAACACAGGGCUCUGCAAAGUCAAUAGACGACGUAUAGGGUCUGACGCCUGCCCAGUGCUGGAAGAUUAAAAGGAGGGGUGUAAGCUCUAAAUUGAAGUCCCAGUGAACGGCGGCCGUAACUAUGACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAUGGCGUAACGAUUUCCCCACUGUCUCCAGUAUCGACUCAGCGAAAUUGAAUUCUCCGUGAAGAUGCGGAGUUCCCGCGGUCAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUUGCACUGGUAUUAGAAAUCAAAUGUGCAGGAUAGGUGGGAGACUACGAAGCAGAGGCGUCAGCCUUUGUGGAGUCACUCUUGAGAUACCACCCUUUUGGUUUUUGAUAUCUAACCGAGACUCUUGAAUCAGGGUCCGAGACAAUGCAUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAAGUAACGGAGGCGCGCGAUGGUUAGCUCAGGUUGGUCGGAAAUCAACUUUUAGAGUGCAAUGGCAUAAGCUAGCCUGACUGCGAGUCUGACAAGACGAGCAGAGACGAAAGUCGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCCGAGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGAAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUGAUUUCCAAGCGUCCAUAGCGACGAAAUCGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGGAGAAGGUCCCAAGGGUUCGGCUGUUCGCCGAUUAAAGUGGUACGUGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGUGUAGGAAGUUUGAGAGGAGCUGCCUUUAGUACGAGAGGACCGAGGUGGACGUACCCCUGGUGGACCAGUUGUCGUGCCAACGGCACAGCUGGGUAGCUAAGUACGGAAGGGAUAACUGCUGAAUGCAUCUAAGCAGGAAACCCACCUCAAAACUAGACUUCCCCAUUAGAGCCGUGGAAGACCACCACGUUGAUAGGUCGGGUGUGGAAGCACAGUAAUGUGUGUAGCUAACCGAUACUAAUAGCUCGAUUGAUUUACUUUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ii.iiii)))...I.(((((((..(((III.II.))).....)))))))...))))...(((....)))((((((....)))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((((.......(((...(((((......)))))(((...).aaa.....))AAA...)))........)))))))))........(((((((((.......)))))))))......(((((..<<<<)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((((((....)))).)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((.((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....))))))).))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....e.eeeeee...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))........)))))))))))))............))......EEEEEEE)))...)))))))((((((((.....))))))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((ffff.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((.(((...(((((((....((((.((((((..........)))))).))))...)))))))........).)))))))).....)FFFF..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((....))))))))))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).DDDDD))))))))))))))))))...(((.((((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))(({{....{{{{{{((.((((((.......))))))....)){{)(.(((}}....}}}}}}....(((((((([...(..])))))))).(((....))).}}))).).....(((((((.((..>>>>..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...hhhhhhhh..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...HHHHHHHH...(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
................((((((((.....))))))))...........((((((..[[[.......))))))......((((((((((((.......)))))...)))))))...]]]...((((....))))........((((.(((((.....[[[))))).)))).......]]]....(((((..(((..........))).)))))....................(((.[[[[...)))....]]]]..((((((...(((((((................(((........)))...(((((....(((((((((...(((((((.....((((((........))))))......)))))))........((((((......))))))....))))))))).((((...(((((.....(((((.......................((((((((.......((((.....)))).((((....((((..........)))))))).....((((..(((((((((....)))).)))))..)))).))))))))........))))).....((((((((((((((..(((((.(((....))).))))).......(((((..(((.....)))))))).))))))))))))))(((((....)))))...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))))))))..))))))))).............))))))).))))))...(((((((.(((((..(((....))).))))).....)))))))...(((...(((((.[[[)))))..)))..........]]]......(((.....[[[[.[[[)))....]]]....]]]](((((((((........))))))))).((((((......))).[[[[....)))..]]]].........((((.....)))).....(((((((((((.......(((((((((.(((((.......))))).)))).......(((......)))..)))))........)))))))))))............(((.[[[[..........)))....(((..((((((((.....))))))))....)))]]]].(((((...((((.....((((((((....))))))))..))))..)))))(((....[[[[[.)))...]]]]]....(((((((.....))))))).(((....((((..(((((((((((((.........)))))))))...(((...(((...(((...(((....)))...)))...)))....((((.....((((((.................(((((((....(((((((((((..........)))))))))))...))))))))))))).....))))........)))...))))...(((......))))))).((((.....))))..)))......(((..((((((((....((((..........(((((.....(((....))))))))((((((((((((....))))))))))))......)))).(((((....(((((((.............((((((((....(((....)))......)))))))).(((.(((((...((((((..((((.......(((((....))))).......))))))))))...))))).)))......)))))))........(((..((((.....(((((........)))))...))))..))).......)))))........)))))))).))).........(((..((((((......)))))))))(((.[[[[...)))...]]]]..((((....))))..............((((((((((((((((....(((((..[[[[[..((((.....((((((((....))))))))..))))..))))).....]]]]]..)))))))))))))))).......((((((......))))))......................((((......[[[..[[[[[[[)))).......]]]]]]]]]]...((((((((.((((((((.....)))))))).....((((....)))).))))))))...((((..((((....))))..)))).(((....)))((((.......[[[[[...((((....)))).)))).(((.....)))............]]]]]......(((..(((((((((.....(((......)))))))))))).[[[[)))...]]]].((((((((((((.(((((((......)))))))..)))(((((.....))))).....)))....)))))).(((....(((((((....))).))))[[[))).....]]](((((.....((((((((..........(((((......)))))...(((((((.(((((...((((...((((((((...(((...)))))))))))...)))).)))))..........(((((...........))))).....))))))).....)))))))))))))......(((((..[[[[.)))))......]]]].(((......(((((....)))))..[[[[[)))........]]]]]................
|
|
CRW_00514
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAAGUUUUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACCAGGAACCGAUGAAGGACGUGGGAGGCCACGAUAGUCCCCGGGGAGCCGUCAACCAGGCUUUGAUCCGGGGGUUUCCGAAUGGGGAAACCCGGCAGUCGUCAUGGGCUGUCACCCGCUGCUGAACACAUAGGCAGUGUGGAGGGAACGCGGGGAAGUGAAACAUCUCAGUACCCGCAGGAAGAGAAAACAACCGUGAUUCCGGGAGUAGUGGCGAGCGAAACCGGAUGAGGCCAAACCGUAUACGUGUGAGACCCGGCAGGGGUUGCGUGUGCGGGGUUGUGGGAUCUCUCUUUCACAGUCUGCCGGCUGUGAGGCGAGUCAGAAACCGUUGAUGUAGGCGAAGGACAUGCGAAAGGUCCGGCGUAGAGGGUAAGACCCCCGUAGUCGAAACAUCAGCGGCUCGUUUGAGAGACACCCAAGUAGCACGGGGCCCGAGAAAUCCCGUGUGAAUCUGGCGGGACCACCCGCUAAGCCUAAAUAUUCCCUGGUGACCGAUAGCGGAUAGUACCGUGAGGGAAUGGUGAAAAGUACCGCGGGAGCGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGUGUGCCUACAAGCCGUGGGAGCGUCGGACAUCAAGCUUGCUUGGUGUCUCGUGACUGCGUGCCUUUUGAAGAAUGAGCCUGCGAGUUUGCGGUGUGUUGCGAGGUUAACCCGAGUGGGGAAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGUUUCAGUAGCACGCUCAAGACCCGAAGCGGAGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGCGGAGGUAAGACUUCGUGGAGGACCGAACCCACCAGGGUUGAAAACCUGGGGGAUGACCUGUGGUUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCCGUGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCAUUUAGGUGCAGCGUCGUGUGUUUCUUGCCGGAGGUAGAGCACUGGAUAGGCGAUGGGCCCUACCGGGUUACUGACCUUAGCCAAACUCCGAAUGCCGGUAAGUGAGAGCGCGGCAGUGAGACUGUGGGGGAUAAGCUCCAUGGUCGAGAGGGAAACAGCCCAGAGCAUCGACUAAGGCCCCUAAGCGUACGCUAAGUGGGAAAGGAUGUGGAGUCGCACAGACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCUAGUGAUUCCGCGCCGACAAUGUAGCGGGGCUCAAGCGUACCGCCGAAGUCGUGUCAUUCAUACAUUAGGGCCAACGCCUGUAUGGAUGGGUAGGGGAGCGUCGUGUGCCGGGUGAAGCAGCCGCGGAAGCGAGUUGUGGACGGUUCACGAGUGAGAAUGCAGGCAUGAGUAGCGAUACAAACGUGAGAAACGUUUGCGCCGAUUGACUAAGGGUUCCUGGGUCAAGCUGAUCUGCCCAGGGUAAGUCGGGACCUAAGGCGAGGCCGACAGGCGUAGUCGAUGGAUAACCGGUUGAUAUUCCGGUACCCGCUGUGAAGCGUCAAACAUCGAGCAUCGUGAUGCUAAGGCCGUGAAGCCGCCCUGAUCUCUUCGGAGUUGAGGGGAGUGGUGGAGCCGCCGGACCAAGCGGUUAGUAGGUGAGUGAUGGGGUGACGCAGGAAGGUAGUCCAUCCCGGCGUGGUUGUCCCGGGGUAAGGUGUAGGCCGUGCGGUAGGUAAAUCCGUCGCACACAAGGCUGAGACCUGAUGCCGAGCCGAUUGUGGUGAAGUGGAUGAUCCUAUGCUGUCGAGAAAAGCCUCUAGCGAGUUUCAUGGCGGCCCGUACCCUAAACCGACUCAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCGAGGCGUUCGGGUGAACUAUGGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGCCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGGGCCACACCUGGUGAUGAUCUUUACGGUCUGAGCUGGGGGUGGCCGCAGAGACCAGCGAGAAGCGACUGUUUACUAAAAACACAGGUCCGUGCGAAGCCGUAAGGCGAUGUAUACGGACUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAACGUUAAGGGGACCGGUUAGCUCCAUUUCGGUGGGGCGAAGCUGAGAACUUAAGCGCCAGUAAACGGCGGUGGUAACUAUAACCAUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGACUUCUCGACUGUCUCAACCAUAGGCCCGGUGAAAUUGCACUACGAGUAAAGAUGCUCGUUUCGCGCAGCAGGACGGAAAGACCCCGGGACCUUUACUACAGUUUGAUAUUGGUGUUCGGUUCGGCUUGUGUAGGAUAGCUGGGAGACUUUGAAGCUCGCACGCCAGUGUGGGUGGAGUCGUCGUUGAAAUACCAGUCUGGUCGUGCUGGAUGUCUAACCUGGGUCCGUGAUCCGGAUCAGGGACAGUGUCUGAUGGGUAGUUUAACUGGGGCGGUUGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGCCUGGUUGGCAAUCAGGUGUUGAGUGUAAGUGCACAAGGGAGCUUGACUGUGAGACCGACGGGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGACUAGUGAUCCGGCGGUGGCUUGUGGAAGCGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUUCCCCAAGAGUCCAUAUCGACGGGAUGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGGAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGCUGUGCGCGUAGGAGUCUUGAGAAGGGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGACGGACGAACCUCUGGUGUGCCAGUUGUCCUGCCAAGGGCAUGGCUGGUUGGCUACGUUCGGGAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCUGCUUCGAGAUGAGGACUCCCACCCCCUUGAGGGGUUAAGGCUCCCAGUAGACGACUGGGUUGAUAGGCCGGAUCUGGAAGCACCGCAAGGUGUGGAGGUGACCGGUACUAAUAGGCCGAGGGCUUGUCCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((.......(((((((........))).....(((((((..(((........))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((((((.....(((....)))..)))))))))))......(((.((((((..((((((((....))))))))((((((.......((((((((((.(((...((((.........))))..(...).(((.......)))...)))...)))))))))))))))).))))))..))).....(((((((((.......)))))))))......(((((......)))))..)))).....)).))))))).))..............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).......(((((((((..((((((((((....)))))))))))))))))))..((((........))))((((((....(((.((((((((((..((((..(((....)))..))))...((....)).(((((.....))))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..(((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).)....))))))))).)..)))))))).....((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((......(.((((((...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))....................))))))))))...)))))))(((((((((....((((....)))))))))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))).)))))...))))))))))..).....)))))).............((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((((......((((....(((((........((((((...((((((((((.(((....)))..))))))..))))...)))))).......))))).....)))).((..((((((...((((..(((..(((((.(((((..........)))))((.((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...)).((((((....))))))..)))))...)))...))))........)))))).))..))))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((((((....)))))))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((......(((((((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((......))))))))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...))))....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
................((((((((((........(((...................(((((....))))).....[[[[[[[..)))................]]]]]]]((((((....(((....)))(((((((......)))))))...(((((((.........)))))))....))))))(((((...........[[[[....))))).....]]]]..((((((.....(((((......[[[[........)))))....]]]]..((((((((((....(((((.....))))))))))))))))))))).....(((...(((((((((....)))))))))..))).......((((((((((.......((((.[[[[....))))..]]]]..(((...[[[.)))...]]]...))))))))))(((.[[[[.))).....]]]]..((((((((.........)))))))).....(((((((....))))))).(((....[[[[[[[[)))........((((......)))).]]]]]]]]..........((((....)))).((((.....(((((...((((...(((((((...(((((..(((..((((((((((....)))))))))))))..)))))..((((....(((((.(((......((((..((((((((((..((((..(((....)))..)))).....((((....((((.....)))).)))).))))))))))..)))).....(((((((((((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))).(((.....))).)))..)))))))....))).)))))(((((...(((((....)))))..(((((((.(((((((((((.....(((...(((..(((.....(((((....))))).....)))...)))..)))......)))))))..))))))))))).....((((((((((......))))))))))....(((......))).....((((((((.(((((...(((....)))..(((.....((((((((((((((..((((...((((....(((((.......)))))..))))...((((........))))....)))).))))))))))...((((.....((((............))))........)))))))).)))....)))))..(((((((.....((((((((..(((.(((((.((((......((((((((....))).)))))...)))).)))))...........(((.............(((((((.....))))))).)))..((((((.(((...))).)))))))))..))))))))........(((..(((......)))))))))))))))))))))((((((((((........)))))((((((((....((((((..(((((..((((....(((((..(((((....(((((((...(((....)))....)))).(((((...)))))))).....))))))))))))))..)))))...)))))).(((..........)))))))).))))))))))))).)))))))))))....)))))))))......))))(((((((......(((.((((((((...(((((((((((((.......((((..((((((((((.............(((((((((((.(((((...(((.....((((.....)))).((((.....)))).)))....)))))...((((((((........((((.....((((((....((((....))))))))))(((.((((((...((((.....))))...)))))).)))))))..(((((...(((((((....(((((.....)))))..((((((((((..(((....)))..)))..))))))).(((((.(((...((((((..((((.(((....(((((.(((((((....)))))))..)))))....))).))))))))))...)))((((((.......)))))).....((((...........((((((.....))))))))))......))))).....)))))))...))))))))))))))))..))))))))......((((((....))))))))))).)))))))))(((.......)))....))))))))))))).....)))))))).)))....)))))))..(((.[[[[[..((((((...((((((((....))))))))))))))))).........]]]]]...(((..[[[[)))......(((((.((((.....)))))))))..]]]]((((..[[[[[..........))))....((((((...........))))))]]]]].(((((((((..((((((((...)))))))).....((((....)))).)))))))))..(((...((((....))))[[[))).(((....))).(((.......)))(((((((.(((....)))))))))).]]]...................(((((.....[[[[.....)))))...]]]].(((((((...[[[[[.........)))))))....]]]]]..((((((((((((....))))))).)))))(((...[[[[[[)))............]]]]]].(((....(((((((....))).))))...)))....)))))))))).(((.((((((....))))))[[[[)))........]]]]..(((((.........((((....)))).(((((.[[[[[))))).......]]]]]..)))))(((((......(((((.....[[[[[.)))))((((....)))).]]]]]....)))))(((((.....)))))...((((((((((.....))))))....((((((((((((....(((((....)))))..))))..))))).)))...))))(((((....)))))
|
|
CRW_00516
|
[ FASTA input ]
|
GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCUGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGUAGCUGUAAGUAAGCGUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGGAACCCAGCACAAGUUAUGUUGUGUUAUCGACAUGUGAAUACAUAGCAUGUCUGAAGGCAGACGUGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGCAGGAAGAGAAAGAAAACUCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAAUGAGCUUGCUCAUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUAUGGAGUUACAAAAGAAUCGAUUAGACGAACCGUACUGGAAAGUUGGACCAGAGAAGGUAAAAGUCCUGUAGUCGAAAAUCGAUUCUCUCCUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGGAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGAACUUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUCUGAUGCAAGGUUAAGCAGCGAAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUGAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUGUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCUUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUCAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACGUGGGUGAUAAGGUCCAUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGCAAAGGAUGUGGUAUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGACUGUCCUUCGGACAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUCGAAGCAUGAUCGCAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGAUGGGUGAGAAUCCCAUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCGCCAAGGAUCGUUUUAAGCGAUGGGGGGACACAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCUGUUGGAGUGCACGUCCAAGCAGUGAGACUGAAUAGUAGGCAAAUCCGCUAUUCUCAAGGUCAAGCUGUGAUGGGGAGAGGAAACAUGUUUCCUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGUCGAGAAAAGCCUCUAGCUAGUGAUUUGGCGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUCACGCUCUGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUAGAAACGUGAGCGCCAGCUUACGUGGAGGCGUUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGAUUUCUAACCCGCGCCAUUUAUCAUGGUGGGAGACAGUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGUGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACUUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGUCGUGGGCGCAGGAAGUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUAUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGACUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGGGGUGGAAGCAUAGCGAUAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.gg.gggg)))...G.(((((((..(((GGG.GG.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).)).))....((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(((.((......)))))(((...).ddd.....))DDD...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..ffff)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).)....)))))).)))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....h.hhhhhh...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....HHHHHHH)))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((bbbb.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((.......((..((((((...((((..(((..(((((.((((((.........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...)).(((((((((....))))))))).)))))...)))...))))........)))))).))..)))))))))))BBBB..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((....))))))))))))(...).......(((((((((..((<....(....>))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..eeeee..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).EEEEE))))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....(((((((({...(..})))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..FFFF..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...aaaaaaaa..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...AAAAAAAA.(((....))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.............((((((...[[[[..))))))..]]]]...((((......(((((((......)))).....((((((((.(((.......)))....))))))))...)))...((((....)))).....))))....((((((...[[[[[[[.))))))..]]]]]]]......(((..[[[.....)))...]]](((((...[[[[.(((((((........)))..)))))))))..]]]]...((((...(((.....)))...((((((((....))))))))..))))(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(((.(((....))))))(((......)))............)))...)))))))))))))).)))))..)))).....((((((((.....[[[.))))))))...]]]((((((....))))))...........(((((.....................[[[[..)))))...]]]].......((((....))))(((........))).((((((...(((.[[[[[)))((((..(((((....)))))..)))).......]]]]]....((((((((...((((((((.(((((..((((..(((.....)))..))))..(((........((((.....)))))))..))))).))))))))........((((((((((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))).((((...)))).)))..)))))).....)))))))).....(((.[[[[)))...]]]](((((.[[[[..........)))))....]]]](((((...((((....))))((((....))))[[[[...)))))...]]]]........((((((((((((((((.(((((((((........)))))))))....(((......))).)))............)))))).......)))))))(((((....[[[....)))))...]]]....(((((.(((((.......))))).))))).....((((((..[[[[[[.....(((.(((......))))))..))))))..]]]]]].(((..[[[[[.....)))..(((((((...)))))))]]]]]....(((((((..((((((....(((((..........)))))...)))))).......)))))))(((((..[[[.......((((((.......)))))))))))....]]]..))))))....(((.[[[[[.))).....]]]]].(((((((((...(((...(((....)))...)))...)))).[[[[[)))))...]]]]]..((((....(((((.....)))))........[[[[[[.....)))).....]]]]]]...........(((..(((((..(((((((((((..........)))))))....))))..)))))[[[[[)))(((((((....)))))))(((........)))...]]]]](((...[[[)))..]]].(((.[[[[[[........)))..(((......))).]]]]]].((((..[[[[......(((((((....)))))))......))))..........((((......))))]]]].((((((((((((((((....))))))))))))....[[[[[[[[))))......]]]]]]]]..........((((((((....(((....)))......)))))))).(((((((((...((((((..((((.......((((((...........)))))).......))))))))))...)))((((((.......))))))..((((..[[[.....))))((((((.....)))))).]]].....))))))...(((((...(((((((((.....)))))..))))))))).....((((((......))))))..((((((((((.((((.......))))........(((((.((((((((((((((((((((((((((..(((.......)))...(((((....((((((((....)))))))).)))))...(((((....)))))..)))))))))))))))........((((((.....)))))).....)))))))))))..)))))..(((((...)))))((((((...........))))))......(((((((((..((((((((...)))))))).....((((....)))).)))))))))..((((..((((....))))..)))).(((....)))(((...[[[[.)))(((..((((....))))..)))..]]]]...(((....[[[[[...))).........]]]]]((((((((...[[[[[.........))))))))..((((......))))]]]]](((((((((((((((((....))))))).)))))(((((.....))))).....)))))....(((..[[[))).(((((((....))).))))...]]]...))))))))))....((((((((.........(((((........[[[[[........)))))..]]]]]......(((((((((((.[[[))))))..)))))...........]]]..(((....(((((.......[[[.)))))....)))......]]]..))))))))...(((.((((....))))[[[[[)))....]]]]]....((((((((.(((....(((((.[[[)))))...)))..))))).))).....]]].............
|
|
CRW_00517
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGGUACUAAGGGCACGCGGUGGAUGCCUUGGCGGCGGGAGGCGAUGAAGGGCGUGGCAAGCUGCGAUAAGCCCGGGGGAGCCGCAAGCAGGCGUUGAUCCCGGGAUUCCCGAAUGGGGAAACCUGGGUGGCCGUUGAGGCCACUCGCCGCCGAAAGGCGGUGCGACACCGGGGGAAGUGAAACAUCUCAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCUAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGGAGCCCAAACCAGCGUGGUGUCAAAGCCCGUGGGCGUUGCCACGCUGGGGUUGUGGGACACGGCCGGGCGAGGCCACGGACUCGCCGGGGAGUUACAAAUCCCUCCUCUAGCCGAACCACCUGGGAAGGUGGGCCGGAGAGGGUGACAGCCCCGUAGGCGAAAGGGGAGGGACUCCCUGGGCCGUGCUCCCGAGUACCACGGGACACGUGGAAUCCCGUGGGAAGCUGGGGGGACCACCCUCCAAGGCUAAAUACUACCCGCCGUCCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGGACCUGAAACCGCGUGCCUACAAGAAGUCGGAGCCCCCAUUUGGGGGUGACGGCGUGCCUUUUGAUUAAUGAGCCCGCGAGUUGCCGUCGGUGGCGAGGUUAAGCCGACGAAGGCGUAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCCGAACAGGGCGCUCAGUCACCGGCGGCAGACCCGAAGCCGGGUGAGCUACCCCUGGGCAGGGUGAAGGUGGGUUAAAACCCACUGGAGGCCCGAACCGGUGGACAGUGAAAAGUCCUCGGAUGACCUGGGGGUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCCGGUGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCAUUGAGGUGCAGCCUCGGGCGGUCUGUGCAGGGGGUAGAGCACUGAUGGGGCUAGGGGGGUUUCCUCCGAACCCCGUCAAACUCCGAAUCCCUGCACACAAAGCCCGGGAGUGAGCCCGCGGGGGAUAAGCUCCGCGGACGAGAGGGGAACAACCCAGACCGCCGGCUAAGGGCCCGAAGAGGUGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGAGCGCCUAAGACAGCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGCCGAGGCGCUCUGCACCGAAAAUGUAACGGGGCUCAAGCCACCCCCCGAAGCCGCGGGUCAGUACCUCCGCUGGAGGUACUGGCGGUAGGGGAGCUUUCCGCUGUAGGGUGAAGGCGGACCCGCGAGGGCCGCUGGACGAGGCGGAAGUGAGAAUGCGGGCAUGAGUACGCGAAAGGAGGGUGAGAAUCCCUCCCCCCGUAAGCCCAAGGGUACCUGGGGAAGGUUCGUCCGCCCAGGGUUAGCCGGGACCCUAAGGUGAACCCGAAAGGGGUAGCCGAAGGGAAGCCGGUUAAUAUUCCGGCGCCACCUGCGGUCGAUGGUACGAGGGGUGACGCAGGAGGGUAGGCGCCGGGGGCAAGUGGCAUGCCCCUCCAAGCGGUUAGGGCGAUGACGGGCGUAGGUAAAUCCGCGCCCCGAGCCUGAGCCGUGAUGGGGAGGUCCCUUCGGGGACCAACGGCGCUGACCCCACACUGCCGAGAAAAACCUCGCGUACCGCUUGAGACCGUAGGUGCCCGUUCCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGCUGAGAAGGCUCAGGGGAGCGGGUUAACCCUCGCCAAGGAACUCGGCAAAUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCCGCGUUAGGGUGAACCCAGGGGAAGGGGCAACCCGGAAACUGGGGGAGCCCGAGGCGGUCGCAGUGACAAGGCCCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCUGCUAACUCGAAAAGAGGAAGUAUAGGGACUGACGCCUGCCCAGUGCCGGAAGGUUAAGGGGAGGGGUGAGGCUCCCCUUGUGGGAGCGUAGCUCCGACCCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGACUGGGGCACUGUCUCGGCGGGGGGCCCGGCGAAAUUUCAGUCUGGGUGAAGAUGCCCAGUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUAUUGGGCUCUGGUGCAUCGUGUAUAGCAUAGGUGGGAGGCUGUGAAGCCGCCUCGCCAGGGGCGGUGGAGCCGCCAGUGGAAUACCACCCUCGGUGCACUGGAGUCCUAACCUGACCCUGUGAAGAGCAGGGUGGGGACAGUGCCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCACCUCCUAAAAGGUAACGGAGGUGUGCAAAGGUCGGCUCAGGUGGGUUGGAAAUCCACCGCAGAGUGCAAGGGCAUAAGCCGGCCUGACUGCGAGGCCGACAGGCCGAGCAGGGGGGAAACCCGGCCCUAGUGACCCGGCGGUCCCGUGUGGAAGGGCCGUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGGUCCCGCCCGAGAGUUCACAUCGACGGCGGGGUUCGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCCCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGGGGUACGUGAGCUGGGUUCAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGUCCCUAUCUGCCGCGGGCGUAGGAGGCUUGAGGGGGGUCCUCCCUUGUACGAGAGGACCGGGAGGAGGGGGCCUCUGGUGUACCGGCUGUCGCGCCAGCGGCAUACGCCGGGUAGCUACGCCCCUAAGCGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCGCGCCCCAAGAUUAGGCCUCCCAUCCCGUUAAGGGAGUAAGGCCGGUCCGAGAAGAGGACCUUGAUAGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCAAGGCGUUGAGCCCACCGGUACUAAUCGGCCGAGGCCUUGACCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.gg.gggg)))...G.(((((((..(((GGG.GG.))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((.....)))))))).(((((....))))).))....((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((((((.....(((....)))..)))))))))))......(((((((((((.((((((((....)))))))).............((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).fff.....))FFF...)))...)))))))))).......))))))).)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..bbbb)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((((....))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((......)))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((....(((...(((.((((...(((((....)))))...)))).)))..)).)....))))))))))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[.[[[[[[...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............))......]]]]]]])))...)))))))((((((((((((...))))))))))))....))))))(.(((((((.(((......(((((.(((....))))))))...))))))))))..).....))))))((......((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((hhhh..((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((..(((((((((((((...((((..(((...((((((((((...........)))))((..((((...((((......((((((.((.....))))))))...))))...))))...))...((((((....))))))...)))))...)))....))))........))))))))))))).....)))))))))))HHHH..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....((((...(((((.....(((....))).....)))))...))))...)))))(...).......(((((((((..(({....(....}))..(((((((((..((((.....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((((((.....)))))))..))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..iiiii..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).IIIII))))))))))))))))))...(((.((((((.......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((cc....cccccc((.((((((.......))))))...))cc)(.(((CC....CCCCCC....((((((((d...(..D)))))))).(((....))).CC))).).....(((((((.((..BBBB..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...eeeeeeee..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...EEEEEEEE..((((.....)))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((...(((((((((((.....(((((((((((((..(((((...((((...(((...)))......((((((((((((.......)))((((((.......(((((.....))))).(((..((((((.....)))))).(((((((....)))))))......(((((....(((......)))...)))))))).......))))))......))))).................)))).....))))...(((((((((((.....(((....)))..))))))))))).)))))(((((((((((.((((((........))))))(((((((.......(((((((((.(((...((((((....))))))........((((....))))....)))...)))))))))))))))).))))))).)))).((((((((((((.........))))))))..((((((((((....))))))..))))...)))).)))))))))........((((................)))).......((((....)))).......)))).......))))))))))).......((((..((((((....))))))..))))))))))).....................(((((((((((((..(((((.(((......))).))))).............((((.....)))).....))))))))))))).(((((....)))))...(((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((((........))))))))....)))))))))))(((.....(((((((((....))))..)))))....)))........(((((((((((....(((((((....((((((((((...(((...((((((((...(((((....)))))...))))))))..)))....))))))))))....))))))).......((((((((......))))))))......(((......)))...(((((........[[[......)))))......]]]......((((((((((((......(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))..))))))))))))............(((((((..((((.....(((.((((((((((((((((((((...))))))))))((((.(((....))).))))....((((...(((((.(((....))))))))(((((((.............((((..........))))...((((((.......))))))(((((...(((....)))...)))))....))))))))))).......((((((.((((..(((...(((....)))...)))..))))..(((((........)))))..(((((((((((..(((((((.(((((...((((..((((.(((((((((((((.......))))))((((.((((((.((((......((((((..........))))))...)))).))))))..))))..((((((....))))))..))))))).))))....))))........))))).))))))).....)))))))))))((((((((....(((......)))....(((((.....)))))...))))))))....((((((((........((((.....((((((....((((....))))))).))).((((.((((...(((((.....(((....))).....)))))...))))..))))))))....((((..(((((((....(((((.....)))))..((((((((((..(((.....)))..)))..))))))).(((.(((((...((((((..((((..(((..(((((...((((((.....))))))...)))))..)))..))))))))))...))))).))).....................(((..((((.....(((((........)))))...))))..))).....)))))))..))))..)))))))).))))))...........((((((......)))))).))))))))))...))).....(((((...(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((...)))..((((((.((((....))))..))))))(((((((((...)))))).((((....))))))))))))))))))))))....(((.(((((((.....))))))).))).)))))))))))..)))))(((((((((((...(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((((...)))))))).....((((....)))).)))))))))..((((..((((....))))..)))).(((....))).))))))).....((((((.(((........))))))))).))))......))))))....)))))......)))))))))))((((...........[[[...))))..]]].)))))))))))((((((((((((((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))......)))...))))))))......(((((((....))).))))(((.[[[[[..)))......]]]]].......(((..[[[[[[[))).......]]]]]]]((((((.((((((...((((...(((((((((((....))))))...)))))...)))).))))))..(((....(((((...........)))))....)))..............)))))).(((.[[[[[[)))....(((((((((.......)))))..(((..(((((((((...((((((....))))))..)))).)))))....))))))).....]]]]]]....
|
|
CRW_00518
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGCGAAUAGUGGUUUACGGUGGAUGUCUUGGAGUUGUCAGGCGAUGAAGGUCGUGAUAAGCUGCGAAAAGCCUCGGGGAGGAGCACAUGUCCUGUGAUCCGGGGAUGACCGAAUGGGGUAACCCGACAGGGUAAAGCCUUGUCAUUGCCUUCCUGAAUGAAUAGGGAGGGUAAGGCGAAACUGGGUGAACUGAACCAUCUAAGUAACUUGGGAAAAGAAAUCAAGAGAGAUUCCGAAAGUAGUGGCGAGCGAAAUUGGAGGAGCCUAAACCUGUGUCUAACAGGGGUUGUAGGGCCGCGCGGGCUUGCGUUCGGUGGGUGAAAUAAUCCGGCCUAUAGCAGAAAGGUUUUGGGAAAGCCUGACAGAGAGGGUGAAAUCCCCGUAUGCGGAAUGGGGCGGACCUGCUGGUGCGGUACCUGAGUACGGCGGGACACGAGGAAUCCUGUCGGAAUCUGGGUCGACCACGAUCUAAGGCUAAAUACUCGACAACUACCGAUAGUGGACAAGUACCGUGAGGGAAAGAUGAAAAGAACCCCGGUGAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUAAACCAACAAGAUGUUACAGCCUGUGAGGGUGGUAGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAGCCUGCGAGUUACGGUGUGCAGCAAGGUUAAGGGAUAGGAGUCCUGGAGCCGGAGGGAAACCGAGUCUUAAAAGGGCGUGGUGAGUUGUACGUCGUAGACCCGAAGCCAGGGUGAUCUAGUUAUGAGCAGGUUGAAACAGGGGUGAAGCCUUGUGGAGGACCGAACUAUAAUCUGUUAAAAAAGGUAUGGAUGACUUGUGACUAGGAGUGAAAGGCUAAACAAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCCUUUAGGGACAGCCUUAUACAAAACUGUCGGAGGUAAAGCACUGGAUGGGCUAGGGGGUUUCAUCGCCUACCAAACCCAAUCAAACUCUGAAUGCCGGCAGUCAACGUGUGGGAGUGAGACUGCGUGCGACAAGGUUCGUAGUCGAGAGGGAAACAGCCCAGACCGUCAGCUAAGGUCCCGAAAUACCGCUUGAGUGUGAAAUGAAGUGUGGGUACCUGGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUUCCUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUACGCAUGCGCAGAUAAUGUAUCGGGGCUAAGCGGUAUACCGAAGCUACGGGUCUUGCAUUUUUGGUGCAAGGCGGUAGGGGAGCAUUCCAUGUACUGAUGAAGGAAUAUCCGGGAGGAGUUCUGGAGGGGAUGGAAGAGAGAAUGCAGGUAUAAGUACACGAAAAGGAGGGUGAGAUUCCUUCCCGCCGAAAACCUAAGGUUUCCUGGGUGAAGGUCAUCUGCUCAGGGUAAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGACGAGGGUCGUAGUCGAUGGGAAUCCGGUUUAUAUUCCGGAACCUCUUGCAAUUUCGAUGGCAGGACGCGUGAGGUGAAGCCCGGCCAAAGAUUGGUAGUUUUGGUCUAAGUAUCCGAGCCGUUUUAAGAGCGAUAGGCAAAUCCGUCGUUCGAGGUAAGGUGCGAGUGCGACUGGAGCGAUGAGCGAAGGGAAGCAGGUGUAGUCAUGGCGACGGGAAAUACUGUCUAAGGUUAGGUUGCAAGAGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGUAGGAUGAGUAAUCUAAGGCGCUCGAGAGAACUCGCGUCAAGGAACUCGGCAAAAUACACACGUAACCUCGGGAGAAGUGUGACCCUUGCCUUUGGUGAGGGUGGCAGAAAGCAGGUCCAGGCGACUGUUUAUCAAAAACAUAGCCAUCUGCAAAUCAGUAAUGAGACGUAUAGGUGGUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGAGGUUCGUGGUAACACAACGCUUUGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAUGGUGUAACGACUCUGGACACUGUCUCGACGCGAGACUCGGUGAAAUUUAUGUACCGGUAAAGAAGCCGGUUACCCAUAGUUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUCACCGUAGCUUACUAUUGGAACUUGGUUUACCAUGUGUAGUAUAGGUGGGAGACAGAGAAGCUUGGCCGUCAGGUUAGGCGGAGUCAACAGUGAAAUACCACCCUUGGUACGUCAGGUUUCUAACCUUUGGCCGUGGAUCCGGCAAAGGGACCGUGGUAGGUGGGCGGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGUGCGCGAAGGUCUCCUCACACCGGUUGGAAAUCGGUGCGCGAGUGUAAAGGCACAAGGAGGCUUAACUGCGAGACCGACAGGUCGAGCAGAUACGAAAGUAGGUCUUAGUGAUCUGGCGGUAGCGUGUGGAAGCGCCGUCACUUAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUUUUCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGAAAGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUUUGGCUGUUCGCCAAUUAAAGCGGUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGCGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCUAUGGGCGUUGGAUAUGUGAGAGGAGCUGCUUUUAGUACGAGAGGACCGAAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCAGUUAUCCUGCCAAGGGUACGUGCUGGGUAGCUAUGUUCGGAAGGGAUAACCGCUGAAGGCAUCUAAGUGGGAAGCCCGCCUCAAGAUUACAUAUCCCUGAAGGUUGACCUUCCUGAAGACUCCUUGCACACUACAAGGUCGAUAGGCUGGAGGUCUACGUACCGUAAGGUAUUAAGCCGACCAGUACUAAUAAGUCGUGAGGCUUGACCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.ee.eeee)))...E.(((((((..(((EEE.EE.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((((.....))))))).(((((((((...........))))))))).))....((((((.....((....))......)))))).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((((.....)))))......((((((((((((((....)))))(((((........((((((((((.(((...(((((.......)))))(((...).<<<.....))>>>...)))...)))))))))))))))...)))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..bbbb)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((((....)))))..))))...((....)).(((((.....)))))......)))))))))))))..((.(...((((.((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((.(((((((((((....(((...(((.((((...(((((((....))))).))...)))).)))..)).)....))))))))))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....[[[[[[[............(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))...)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))............)).....]]]]]]])))...)))))))((((((((((...))))))))))....))))))(.(((((((.(((......(((((.(((....))))))))...))))))))))..).....))))))((......((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((iiii.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..((((((...((((..(((...(((((((((((..........)))))).((.((((....(((.......(((((((.((.....)))))))))..)))...))))...)).(((((((((.....)))))))))..)))))...)))...)))).........))))))..))..)).)))))))))IIII..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((...)))))))))(...).......(((((((((..((a....(....A))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...))..)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ggggg..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).GGGGG))))))))))))))))))...(((((.((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh....hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)(.(((HH....HHHHHH....((((((((f...(..F)))))))).(((....))).HH))).).....(((((((.((..BBBB..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...cccccccc..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...CCCCCCCC..(((((....)))))..(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
....((((........))))..............((((((...............(((......[[[.)))..]]].(((((((((..(((.[[[[[[))).....]]]]]](((....(((....)))..[[[)))......(((((.((((((((((.........)))))))))))))))..]]](((..[[[..))).....]]]..(((((.........)))))......(((..........[[[[[[.........)))((((.(((((.(((...))).)))))...)))).......]]]]]].(((.[[[[[[)))........]]]]]].(((...(((((((...)))))))..[[[...[[[[.....[[[[[[.)))...]]]]]]...]]]].]]]((((....[[[[.))))..]]]]....(((.....[[[[[[[....(((((((....)))))))..........)))........]]]]]]]...........(((..[[[....)))........]]](((.(((..............)))...[[[[[[[)))......(((((((.((((....)))).)))))))....(((((((.......)))))))]]]]]]](((((((..((((..(((((....)))))..))))........((((.((((.....)))).))))..))))))).(((...[[[)))......]]]..((((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((((.(((........))))))))....))))))))))))(((...(((.........)))[[[[[..)))...]]]]]((((........(((((.[[[)))))..........))))..........]]]..(((((....[[[[[[....)))))..]]]]]]......(((((........[[[[[[........)))))..]]]]]]....(((....[[[...)))..]]]......(((...[[[[....)))..]]]].....((((((((((.............(((((.((((.......(((((((((.(((((.......)))))..))))....((((........)))).)))))...)))).)))))...((((...)))).....)))))))))).(((...[[[)))(((((((((.....)))))))))..]]].....((((((.[[[[[[......(((((.(((....))))))))....))))))..............]]]]]]....(((.....[[[[[)))......]]]]].(((....[[[[[.)))....]]]]]......((((((((.(((....[[[.[[[)))..]]]...]]]((((......[[[[[......(((((........))))).))))........]]]]](((.[[[(((.....)))..))).((((((((........))))))))......]]]..(((.......[[[[[[[.)))......]]]]]]].......(((.....[[[.)))...]]].............))))))))..(((.....(((((......)))))...(((..((((......))))..)))....[[[)))...]]].....((((.....))))..(((((....[[[.....)))))......]]](((......(((((((.((((((((.....(((.(((((((((...))))))))).)))....((((((...(((...(((((.....)))))..)))))))))...(((....)))......((((((....))))))))))).((((((.......(((((((.(((.(((....)))))).(((((.......((((((((((((....(((....((((.(((((((((((((.(((..((((.....(((((........)))))...))))..)))...((((((.....(((((((..((((((...(((((((...((((.((((((......))))))....))))(((..((((.......)))).))).)))))))...))).((((....((((((....))).....)))))))))).)))))))....((((((((....))))))))))))))(((..(((..(((((....)))))..))).)))....)))))..((((......))))...)))))))).))))...))).)))).))))))))...(((((((...........)))))))..))))).))))))).((((((((...))))))))(((..((((....))))...((((((((.((((..((((....))))..)))).........)))))))).))).))))))))).))))))).....)))...((((..[[[[....))))..]]]].............(((((((((...[[[[[.[[[[[[[.))))))))).......]]]]]]].]]]]].....(((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....)))..((((((((.....(((((..((((((.........[[[[[))).)))..))))).....)))))))).........]]]]]......(((((((((((....))))))...))))).........(((....)))....(((((...[[[.....)))))...]]]...............................))))))))).)))))).......(((...[[[[..)))(((((.(((....(((((....)))))...)))..)))))......(((((....)))))]]]]..
|
|
CRW_00519
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAGCGGGCCGCACGCGGCCCGCAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUGCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUGACCCCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..((((((((((.......(((((((........))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((.....(((((((.....))))))).......(((((((((....(((...((((((((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...))))))))))...))))))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((......)).)))..)))).....)).)))))).))...............((....))....))..........(((....))).............).....)))))))))).......(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....)).(((((.....)))))....(((((((....)))))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(((((((((((..(.(((...((((((((...(((((((....))))).))...))))))))..)).).)..))))))).))).)))))))).)...((((((((((......)))))))))).....(((......)))...((((.(((...(((......(.((((((...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))....................))))))))))...)))))))((((((((.....))))))))....))))))(.((((((.((((......(((((..((....)))))))...))))))))))..).....))))))..............((((((......).)))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((((...(((((...((((..(((..(((((((((((............)))))).....((((((((((((((((.((.....)))))))))).....)))))))).........((((....))))......)))))...)))...))))........)))))...))...)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((......))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((....))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))))))))))))))))))))...(((((....))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((......))))))))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.(((((((....)))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...))))....))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..............(((((((((((....((((((((......)))))...[[[....)))..]]](((.....[[[[[[[...(((....))).)))...]]]]]]]...(((....(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))[[[[[.(((.(((.(((((......))))).)))..)))...))).............]]]]].......(((...........[[[[.)))....((((((((.....))))))))]]]].((((((((((....(((..((((((.((((.(((...((((((....))))))........((((....))))....)))...))))..)))))).))))))))).))))....(((((((((((...)))))))))))..((((((((((....))).......[[[[.....)))))))......]]]].(((...[[[[))).......]]]]........(((....)))..................))))))))))).(((...(((((((((((....)))))))))))[[[[...)))..]]]]((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....))))....((((((((....))))))))...))))))))))))))........((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).(((.....)))......)))))).....))))))))(((((....(((((....)))))..(((((((.....(((((((((...(((...((((((((.....((((......))))......))))))))..)))....))))))))).....))))))).(((.(((((((............)))))))...))).......(((....((((.((((..(((((........)))))...((((......(((((((((((...(((......((((.(((((.......))))).))))....((((........))))....)))..)))))))))))..............((((....))))...)))).))))))))((((((((.....))))))))))).)))))...(((((..((((......(((((..........)))))...)))).)))))((((...[[[..))))..]]](((((......(((((((.....)))))))..............[[[[[[[[....)))))..]]]]]]]]....(((((.(((..(((...(((....)))...)))..)))...(((((........)))))..(((((((((((....(((((((....((((((((...........)))).))))...(((((((((....(((((((((((((((..........))))))).....))))))))))))(((....)))...))))).....)))))))..............(((......))).......)))))))))))))))).((((..(((......)))..))))(((............[[[[)))(((....))).]]]]......((((........[[[[[.........))))..]]]]]((((((((((((.....))))))))))))....((((((((.....[[[[.))))))))..........((((((((....(((....)))......))))))))..]]]]..(((...(((....)))...)))..(((((....)))))..((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]].......((((((((((((...((((((......(((.....)))......)))))).....))))))))))))((((((.((((((....((((((......))))))..(((...((((.....((((...........)))).)))).(((.((((((((((((((((((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))))))))))....(((((.....))))).))))))).)))))))))))).))))))(((..(((((((...........))))))).....[[[[[[[[[..((((((.......))))))......))).........]]]]]]]]]..((((.[[[[[[.........)))).(((....)))]]]]]].......((((((..[[[[.........))))))....]]]]......((((...[[[[[.))))...........]]]]]..((((....[[[[[[[[(((((.....)))))))))....]]]]]]]](((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....))).....(((((((...((((...))))..)))))))...((((((((..((((........)))).....(((..[[[[)))..((((.((((((((((((....)))))...))))))).))))...]]]]...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]].)))))))).((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..)))).))))...))))................
|
|
CRW_00520
|
[ FASTA input ]
|
UCAAAUGAAUUAAGGCGUACGGUGGAGACCUAGGCACUCAGAGACGAAGAAGGGCGCAGAUACCGGCGAUACGCUUCGGGGAGCUGGCAACAAGCUUUGAUCCGAAGAUUCCCGAAUAGGGCAACCUCAUAGAACUACCUAUAUAAUUCAUAGUUAGGUAAGAGGCAACCCAGUGAACUGAAACAUCUAAGUAGCUGGAGGAAAAGAAAGCAAACGCGAUUCCCGUAGUAGCGGCGAGCGAACCGGGAACAGCCUAAACCUAUGUCGCAAGAUGUAGGGGUCGUGGGAGGACAACAUAAAAAUCGCUAUUUUUAAUACGAAGCAGCUGAAUCCUGCACCAUAGAUGGUGAAAGUCCAGUAGUAAAAAGAAAAUUUAGAUUUUUGUCUAAUCCCGAGUAGCAUGGGGCACGUGAAAUCCCGUGUGAAUCAGCGAGGACCACCUCGUAAGGCUAAAUACUCCUGAGUGACCGAUAGCGAAAUAGUACCACGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCUGUUGGGGAGUGAAAUAGAACAUGAAACCGUAUGCUGACAAGCAGUGGGAGCAAGAAUGCUUGUGACCGCGUGCCUGUUGAAGAAUGAGCCGGCGACUUAUAGGGAGUGGCUGGGUUAAGGAGUAAAAUCCGGAGCCCAAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAAAUGGUCACUUCUUAUGGACCCGAACCCGGGUGAUCUAUUCAUGGCCAGGAUGAAGCUUGGGUAACACCAAGUGGAGGUCCGAACCGACCGAUGUUGAAAAAUCGGCGGAUGAGCUGUGAAUAGGGGAGAAAUUCCAAUCGAACUCGGAGCUAGCUGGAUCUCCCCGAAAUGCGUUGAGGCGCAGCGGUAACGAUGAACUGUCUUGGGGUAAAGCUACUGUUUCGAUGCGGGCUGCGAAAGCGGUACCAAGUCGUGGCAAACUCAGAAUACAAGACAUGUCUUCCGUAAACCAGUGAGACAGUGGGGGAUAAGCUUCAUUGUCAAGAGGGAAACAGCCCAGAUCACCAGCUAAGGCCCCUAAAUGGUCACUAAGUGGAAAAGGAUGUGAGAAUGCUGAAACAACCAGGAGGUUUGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUAAAGCGUUCUUGCGCCGAUAAUGGCCGGGACUAAGUGACCUGCCGAAGCUGUGAUAUAAUUUAUUAUAUAAAUUAUAGGUAGGGGAGCGUUCCGCUCUCGGGUGAAGUUUUCACGUAAGUGGGGAUGGACGAAGCGGAAGUGAGAAUGUCGGCUUGAGUAACGAAAACAUUGGUGAGAAUCCAAUGCCCCGAAAACCUAAGGGUUCCUCCACUAGGUUCGUCCAUGGGGGGUUAGUCAGGACCUAAGACUAGGCCAAACGGCGUCGUCGAUGGAAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACGAGUUAAAUUAUGAUCUGAGGGACGAAGGAGGCUAAGCUAGAACUGUUUUUGGAUUGCAGUGGAAGCGUUUAGACGUUGAGAGAUAGAAAAAAAGCUAUCUUGAGUGGAGACGUGAUCCCUAUUUGAUGGUUCGCCGUCGAGUAGCUAGUGAUGUCAUACUUCCAAGAAAAGCUCAUACAUCUUUAUAAUUUAAUGACCUGUACCUGAAACCGACACAGGUAGGUUGGUAGAGAAUACCAAGGGGCGCGAGAGAACUCUCUCUAAGGAACUCGGCAAACUGGCCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGCACCCAUCCGUAACAAGGUGGGUCGCAGUGACCAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCCGCAAAGUCGUAAGACAAUAUAUGGGGGCUGACGCCUGCCCAGUGCCGGAAGGUUAAGGAAGUUGGUUAUUUCGUAAGAAAAAAGCUGACGACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGUCGUAACUAUAACGAUCCUAAGGUAGCGAAAUUCAUUGUCGAGUAAGUUUCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCGGAGAGAGGCUCGGUGAAAUAGACUUGUCCCGUGAAGAUGCGGACUACCUACACCUGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUGACUGUAUCUUGGAAUUGGGUUUGGGCUUUUCUUGCGCAGCCUAGGUGGGAGGCUAUGAAGAUUACCUUCCGGGGUAAUUAGAGCCGUCAUUGAGAGACCACUCUGGAAGAGCUAGAAUCCUAAUGGGGAUCCUUGAAUCAGGACCCUUGACAGUUUCAGGUGGGCAGUUUAUUUGGGGCGAAUGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGUGCAAAGGUUCCCUCAGUCUGGACGGAAAUCAGACAUUGAGUGUAAAGGCAAAAGGGAGCUUGACUGCAAGACCUACAAGUCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGCCUUAGUGAUCCGACGGUGCCGCGUGGAAGGGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUGAUCUUCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGAAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUCGGUCUGUAGUAGGUCCGAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGUGGUACGUGAGCUGGGUUCAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCAUAUCCGGUGUAGGCGUUAGAGCAUUGAGAGUAGCCUUUCAUAGUACGAGAGGACCUGAAAGGACAUGCCAAUUGUGUACCAGUUCUCAUUCCAAUGGGAAACGCUGGGUAGCUACGCAUGGAUAGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGUAGGAAGCUAAACUCAAGAUGAGUGCUCUCUAAGGCCGCGGCUAGACAAGCCGUUAUAUAGGUAUCAGGUGUACAGUCAGCAAUGGCUUUAGCCGAGAUAUACUAAAGGCCGUUUGAUUUUGACCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.gg.gggg)))...G.(((((((..(((GGG.GG.))).....)))))))...))))...(((....)))(...)..(((((((.((........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((....))))))))......((((..((((......................((...((((.......))))(((...).hhh.....))HHH...))...................))))....)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..{{{{)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..(((......)))..))))...((....)).(((((.....)))))......)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((((....(((....((((((((...(((((((....))))).))...))))))))..)).)....)))))))).)))..))))).))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....i.iiiiii...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........)).....IIIIIII)))...)))))))(((((..(((...)))..)))))....))))))(.(((((((.(((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((eeee.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((.(((((((((...((((..(((...(((((.((((...........))))((..((((...(((.((((..(((((........))))))))))))...))))...))(((((((((((....))))))))))))))))...)))...))))........))))))..)))....)))))))))))EEEE..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((........)))))))(...).......(((((((((..((f....(....F))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((((....))))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....((.(((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).DDDDD))))))))))))))))))...(((((.((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((bb....bbbbbb((.((((((.......))))))...))bb)(.(((BB....BBBBBB....((((((((a...(..A)))))))).(((....))).BB))).).....(((((((.((..}}}}..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...[[[[[[[[..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))).(((....(((((...........)))))....))).))))..)...]]]]]]]]..(.(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))..)))).)...)))).))....
|
| [ predicted structure ] |
.............((((((((((........................................(((.......((((((((((((.......)))))...)))))))....)))...(((....)))....(((.[[[[[[.....))).....]]]]]].........(((((..(((......[[[.))).)))))......]]].......(((..[[[[[[.....)))..........]]]]]].(((((...((((((((....))))))))......((((((((((.....(((((...((((((..(((......((((.......(((((....)))))......)))).)))....))))))...)))))))))))..)))).....((((((((.........))))))))......((((((....)))))).)))))......((((..(((................[[[)))..))))...]]].......((((....))))..................))))))))))....((((((((..(((((....)))))..)))).[[[[))))............]]]]..((((((((((((((((((((..(((......)))..)))))............((((.....))))......)))))))))))))))(((((....)))))...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....)))))))))))((((....))))........((((((((((((......((((((..(((((....)))))(((((........))))).))))))...)))))..)))))))((((((((((....))))).........[[[..............((((....)))))))))..]]]((((((((((((((......))))))))))....(((......)))...)))).......((((.[[[...))))......]]].......((((((((((((......(((((((((.(((((....)))))....))))....((((........)))).)))))..))))))))))))(((....[[[.)))..]]].....((((((...[[[....((((((((((...))))))))))))))))..]]].(((((((.(((......(((..(((....)))..)))...)))))))))).........(((................((((((.......))))))[[[)))........]]]..((((((.[[[[[[[.....))))))........]]]]]]].(((...(((....)))...)))((((....(((((........)))))..(((((.........(((...))).((((..(((...(((((.(((((.........)))))(((.((((((.........(((((((........)))))))......))))))..)))(((((((((((....))))))))))))))))...)))...)))).......)))))...))))..............((((((.......[[[[[[))))))..]]]]]].(((........[[[[[..(((((....))))).......))).........]]]]]....((((....))))(((((((((((........)))))))....[[[.....))))((((...(((((.....)))))...)))).]]]...(((....))).........((((.....[[[))))...(((....)))..]]]..(((((((.((((....))))..))))))).((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]]..(((((((.(((.[[[))).))))))).......]]]..((((......[[[[[[))))..]]]]]]..(((....[[[[.......)))(((((((....))).))))......]]]]............(((((........((((((..(((((((((((((((.(((((((((...........(((((..((((.....((((((((....))))))))..))))............)))))..))))))))).))))).....((((.((((......))))))))...))))))))))...))))))....)))))...((((((((...........))))))))....(((((((((..((((((.......))))))..........[[[[[...)))))))))..((((..(((......)))..)))).(((....))).]]]]].(((....[[[[[[..)))........]]]]]]...............((((....[[[..))))..((((((((((((.....(((......)))))))))).))))).]]].(((..[[[[[[)))..((((((((((((...)))).))).))))).]]]]]]...(((((.....[[[[.........)))))(((((..(((....)))..))))).]]]]...((((((.[[[[[....)))))).......((((((.......)))))).(((...)))..]]]]]...(((((((((((((((((....))))))...))))).[[[[)))))).............]]]]............(((..(((...(((((...))))))))..))).((((((((((.....))))))....((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)))..))))................
|
|
CRW_00521
|
[ FASTA input ]
|
UGAACAAGGGCUUAUGCGGGAUUGCUUGGCAUUUAGAGUCGAAGAAGGGCGUAGAAAUUAACGAUAUGCUUUAGGGAGCUAAAGACGAGCUUUAAUCUAAAGAUUCCCGAUGGGGCAACCUAUUACUUUAACAUUACAAUGAAAUGGUAUACAAAUAAUGUAGAGAACUUGGUGAACUGAAACAUCUUAGUAGCCGAAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGAUUUUCUUAUUAGUGGCGAGCUAACGGAAAUCAGCCUAAACCUUUAUGGGUGUUGUGGGUAUAUUAUAAUUACUGAAAAAGAUAGAGAAUUUGUUGAAAACAAAAUCAAAGAGGGUUUUAAAUCCCGUAUUUGUUUUUAAAAAGUAAUUUUUGAUUUUCCCGAGUAGCAUAGAGCACGUGGAAUUCUGUGUGAAUCAGCGAGGACCAUCUCGUAAGGCUAAAUACUCCUAAAUGACCGAUAGUGUACGAGUACCGUGAGGGAAAGCUGAAAUAGAACACUGAGAAGUGAGUGAAAUAGAAUAUGAAAGCAUAAGUUUACAAGCAGUAGGAGAUCUAUUUAAAGAUUGACUGUGUGCCUGUUGAAGAAUGAGCCGGCGACUUAUAGGUGAUGGCAAGGUUAAGGUUUUUCCGGAGCCAUAGCUGAAAUCGAGCUUAAAUAAAGCGAAAAACUUUCUUCUUGAAAGUUUAUGUCAUUGCUUAUAGACCCGAACCCAGGUGAUCUAAUCAUGGUCAGGUUGAAGUUUUGGUAAAACAGAAUGGAGGACUGAACCCACCAAUGUUGAAAAAUUGGGGGAUGAACUGUGAUUAGGGGAGAAAUUCCAUCGAACUUGGAGCUAGCUGGAUCUCUUCGAAAUGCGGUUGGAGGCGCAGCGUUUAAUUAUGGUAAACAUUAGGGGUAAAGCACUGUUUCGAUGCGGGCUAUGAAAAUGGUACCAAGUUGUGGCAAACUCUGAAUACUAAGUUAUAUUUCAAUUAAUCAGUGAGACAGUGGGGGAUAAGCUUCAUUGUCAAGAGGGAAACAGCCCAGAUCACUACUUAAGGCCCCUAAAUAAUUACCUAAGUGGUAAACCAUGUACUAUUACAUAGACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUUCCUUUAAAAAGUGCGUAAUAGCUUACUGGUCAAGUGAUAGUGCGCCGAAAAUGAACGGGACUAAGUAAUUUGCCGAAGGUGUGAGAGAAAUCGGUAGAAGAGCGUUCUGUGUUGAAGAGAAGGAAUAGUGAAAAUAGUUCUGGAUUAAACAGAAGUGAGAAUGUCGGCUUAAGUAACGAAAACAUUGGUGAAAAUCCUAUGCUCCGAAAACCUAAGGUUUCCUUAGCCAGGUUCGUCCUCUAAGGGUUAGUCAGGUCCUAAAAUAAGGUUUAACAACGUAAAUUGAUGGAUGACAGGUUAAUAUUCCUGUACCGAAUGCUCACUUGUAAGGAGUGACGAAAAAGGCUAGAUCGGCCACGUGAUGGUUUGUGGUUUAAGGGUUCAAGAGGUAUCAAAUAUUAAAAAAAAUAUUUUGUCUUAAGGCCUGAAUAGUAUAAAUACUACGGUAUUGAAAGUGAUUGAUGUCAUGUUUCCAAGAAAAACUUUUGUUUAUGUAUAGUGAGCUCGCCUGUACCGUAAACUGACACAGGUAGGUUAGUAGAAUAUACUAAGGAGCGCGAGAUAACUCUUUCUAAGGAACUCGGCAAAAUGACUUCGUAACUUCGGAAGAAGAAGUACCUCUAAUGAGGUGGCAGAAAAGAGGUCCAAGCGACUGCUUACCAAAAGCACAGGUCUCCGCGAAGUUGAAAAACGAUGUAUGGGGGCCGAGGCCUGCUCAGUGCAGGAAGGUUAAAGAAAUUGGUUAGCGUAAGCAAAGCUAGUGACUGAAGCCCCUGUGAACAGCGGCAAUAACUAUAAUUGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCUUAACGAUUUGGACACUGUCUCAGAAAGAGACUCGGUGAAAUAGAAUUGACUGUGAAGAUGCGGUCUACUUGCACUUGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUUACUGUAUCCUGAAAUUGGUUUCGGGCUUUUUUUGCGCAGAAUAGGUGAGAGGCUAUGAUCUUGUCUUUUGGGAUACGGGGAGCCGAAAAAUGAGAUACCACUCUGAGAAAGCUAGAAAUCUAAUCUUAAUCUUAUGUACAAUCAUGAUAAUUGACAGUUUCAGGUGGGCAGUUUUACUGGGGCGGUAGCCUCCUAAAAAGUAACGGAGGCGUACAAAGGUUUUCUCAGGCUAGACGGAAAUUAGUUGUGGAGUGUAAAGGCAUAAGAAAGCUUGACUGUGAGACUUAUAAGUCAAACAGAGACUAAAGUCGGUCUUAGUGACCCGACGGUGCUGUAUGGAAAGGCCGUCGUAAACAGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAACCUGGGGCGGUAGUACGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGAGAGACAGUUCGGUCCAUAUCCGGUGUGAGCGUUAGAGUAUUGAAAGGCGCUUUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAAGGACGCACCACUGAUGUACCAGUUUUUGUGCCAACAGAAUACGCUGGGUAGUCAAGUGCGGAGUGGAUAACUGCUGAAAGCAUAUAAGUAGGAAGCCCACCUUAAGAUAAGUACUCUUCAUAGGUCACGGUAAGACGAACCGUUUGAUAGGUAUUAGGUGUACAAUUGGUAACAAUUUUAGCCGAGAUAUACUAACCGACCGAAAA |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD.DD.))).....)))))))...))))..(((....)))..((((....(((....)))....)))).(((.....))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....(((....)))......(((...((((.(((((((...(((((((((...(((((.....)))))(((...).ggg......))GGG...)))))))))....)))))))..))))...))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..cccc)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....))..........((((....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((......)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((.....)).(((((.....)))))..((((((((.....))))))))..)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....))).....))))))......).))..((((((....(((((......))))).(((((((((..(((((...(((((..(.(((...((((.(((...(((((((....))))).))...))).))))..)).).)..))))).))))....))))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....<.<<<<<.<...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))...)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........)).....>>>>>>>)))...)))))))((....))....))))))(.((((((.((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....)))))).((....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(({{{{.((...(((.(.(((....))).)..)))...))...(((((........)))))))(((..(((((((((((((((((...((((..(((..((((((((((..........)))))....(((((...(((.....(((((((......)))))))...)))..)))))........(((((((....)))))))...)))))...)))...))))........))))))...))))...))))))))))}}}}..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((....)))))(...).......(((((((((..((i....(....I))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((....))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..jjjjj..(((.....((((((((....))))))))...)))........)).).JJJJJ))))))))))))))))))....((((.((((((.....)).))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh...(hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)).(((HH....HHHHHH....(((((((([...(..])))))))).(((....))).HH))).......(((((((.((..CCCC..)))))))))....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...bbbbbbbb..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...BBBBBBBB...(.(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...
|
| [ predicted structure ] |
.............((((..[[[[.....))))....]]]].....((((((((...........)))))))).(((((.[[[[[.....(((((...))))).)))))((((((....)))))).]]]]].((((.......))))...((((.....))))....(((.((((........))))..))).(((..(((((((..............))))))).[[[[[)))..]]]]].(((((((((((((.((((....))))....))))).......(((((((...(((((((((...((((((...))))))........(((........)))...)))))))))....)))))))..))))))))(((....[[[[[[[[....)))..]]]]]]]]...(((((.((((....[[[[[[..[[[[.....))))..........]]]].]]]]]]..............)))))(((((..((((....)))).(((((......((((....))))..)))))..(((((....(((((......))))).)))))....)))))..........(((((...(((((((((((((((.(((((.(((((.....))))).)))))........((((.....))))...((((((((.....)))))))).)))))))))))))))........(((((((((((((((((((((((......((((((......))))))......)))..(((.(((((........))))))))....)))))))))))((((....)))))))..)))))).....))))).(((((((((..(((......[[[[)))..]]]]..............((((((((.......(((..((((....(((((....))))).....))))..))).....((((...[[[[[.....)))).......(((((((((((((((......))))))))))....(((......)))...)))))]]]]]..))))))))....(((((.....)))))..(((((((((((((.......(((((((((.(((((.......)))))..))))....((((........)))).)))))...)))))))))).[[[...)))..]]]..........((((((((.......[[[[...))))))))......]]]]...))))))))).......(((.......(((((.......)))))(((((...((((.(((......(((...............((((.((((((....((((..((((...((((((...((((((((((..((((.........(((......))).....(((......))).(((...(((((........))))).))).......))))....)))).))))))...))))))...))))..(((.(((((((((((....(((((((.........(((((((......))))))).(((....))).......((((((((((....)))))(((((((((....))))).))))......((((....)))).)))))..)))))))......))))))))))).)))))))...((((((.....)))))))))))).(((....)))......))))..))).......((((((....((((....))))...((((((....))))))........)))))).)))))))..)))))......))).((((((((((..(((....)))..)))..)))))))(((.[[[[)))....]]]]..(((((.......[[[[[[.....(((...)))..)))))...(((.(((....))).)))..]]]]]]..........((((..[[[.....))))((((((.....)))))).]]].............((((((...(((((((((.....)))))..)))).....)))))).((((........[[[[[............))))..]]]]].......(((((.(((((((((((((.(((((((..((((.((((....)))).))))..))))))).(((...)))))))))))))))))))))..............((((.((((((....(((....)))...(((((.(((((......)))))..)))))...))))))))))....(((((........[[[[[[[[[)))))......]]]]]].]]]...((((((((((((((.(((........))).....((((....)))).....)))))..((((..((((....))))..)))).(((....)))((((.....))))(((((((.[[[[........)))))))...]]]].........(((((..............[[[[[[[[[..)))))..........]]]]]]]]]..(((((..((((((((((((((((....(((((((......))))))).....(((((.....))))).....)))....))))))))......(((((((....))).)))).....))))).)))))(((((((.[[[........)))))))..]]].....)))))))))(((.....(((((...((((...(((((((((((....))))))...)))))...)))).))))).(((((....))))).............[[[[...)))..]]]].............(((..[[[[(((((.......))))).)))((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)))...]]]].....
|
|
CRW_00522
|
[ FASTA input ]
|
AAUAUAUAAUUAAAUAUAUAUAAUAAAUUUAAAAGGAUGUCUAUAAUUUUUAUUAAAUAAGAAAGACGUUAUAUAUAUUAACGAAAUUUUUAUAAUAAUUAAUAAAAAUAUAUUUAUAUUUAUUAAUAAAUAUUAUUAUAAAAGUAUCUGAUAAAAUAUUUUUAUAUAAAUAUUUUAUUUAAAAACUUAAGGAAUUGAAUCAUCUUAGUACUUAAAGGAAUAAAAAGUAAUAACGAUUUUCAUAGUAGCGGCGAGCGAAUUGAAAAAAAAUAAACAUUUAAAAAAAUAUGUAAAAUUUUAAUAAAGUAAUAUAAUAUAUAAUUUUAUAUAAAUAAUAUAAAAAAUAAUAAGAAUUACCUUAUAAAAUUAAAUAUAAUAAAAGUUUAUAGAGAAAAGUACCGUGAGGAAAGAUGAAAAGAAUUUUGAAAAAAUAGUGAAAAGAAUCUGAAUUUUAAUUUAAAUAAAUUAUAAUAAAAUUUAAUUUUAAUUUUAUUAUAUUCUUGUUGAAGAAAGAAUUAGCAAGUUAUAAUAAAUAGUAUAAUAAUUAGGUUAAAUAUAUUUAAAUAAUGAAGCCAAAGUUAAAUCGAAUUUAUUUUUUUAAUAAAUUUAAAAUAUAUUAUUUAUUAUAGACCCGAAAUCAAAUGAUCUAAUUAUAUUUAAAAUAAAAUUUAAAUAAAAUUAAAUUAUAGUUUGAAUUGAUUACUGUUGCAAAAGUAUCAAAUAAAAUAUAAUUAGUGGUGAAAUGCCAAUCGAAUUUGAAGAUAGCUGGUUCUCUUUGAAAUAUAUGUAAGUAUAGUAUUUAUAUAUAAAUAAAUGUAAAACUCUUUUUUUAUUAGAUUAAUUUAAAUAAUUAAUAUUAAUAUUAAUAAUUUAAUAAUUUUAUUUAAUAAAAUAUAUAUAUUAUUAGAAAAUAAAGGAUAAGCUUUAUUUUCAAAAGGGAAACAGCCCUAAUUAUAAAUUAAGAUUUUUAAAUAUUAAUUAAGUUUUAAAAAGAAUAUAAAAUUAUAUUAAUAAUUAAAAAGUAAAUUUAGAAGCAGUUAUCUUUUAAAGAGUGCGUAAAAGCUCAUUAAUUUAAUAAUUUUAGUUCAAAAAUAAUCGAAAAUAAAUUAAUUAUCGAUAUUAUAAAAUUUAAUAUUAGUACAAUUAAAUUGGUAAAAGAGCGUUUUGAUAAAAUAUUAUUUAUAUGUAAAUUAAAAUAAUAAAAUCAAAAGUGAUAAUGCUAAUUUGAGUAAUGUAAAUAUUGGUAAAAAUCCAAUACUUCUAUAAUUUAAGGUUUCCUAUUUAUAAUUUUUUUUAAUAGGGUUAGUCGAAUCUUAAAAUGAGAUGAAACGUGUAAUUGAUAGAUAAUAAGUUAAUAUUCUUAUACUAUAUUAUAAUUUAUAUUUUAAGACUAAUAUUAAUAAUUUUAAUAUUAUUUAUAUUAUAUAAAAAUUAUUAAUAUAUUUAUUAUAAUAUAUUCGUACCGUAAACUGACACUAGUAAAUAUAUAUAUAUUAUUAAGAAGUUAAGAUAAUUUUUUUUAAGGAACUCGGCAAUUUAAUCUUGUAACUUAGGGAUAAAAGAUACUUUUUAGUUGAAAAUAAAAAAUUUAAGCGACUGUUUAACAAAAACACAAAUCUUUGCUAAAUUGAAAAAUGAUGUAUAAAGAUUGACAUCUGCCCAGUGCUAUUAUGUUAAAAUAAUAUAUGUAAUUAAAUUAUAAUAUAUAUAUAAGCUAUAGUAAACGGCGGCUGUAUCUAUAACGGUCCAAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCAUGAAAGAUGUAACGACUUAAAUGCUGUCUUAAAAAAAAUCUUAAUGAAAUAAAAUUAUCUGUGAAGAUACAGAUUUCUUAUAUUAGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUUACUAUUAAUAAAUAAUGAAAAUAUAUAUAUUUAACAUAGUAUAAAUGGGAAACAAUAAUAUUAUUUUCUUGGAAAUAAUUUAGUUAAAAAUGAAAUACCAUUUUAUUUAUAUAUAAAUUCUUAUAGAAAUUUUAUAACAAAUUUUUAAACAAUAUUUAUGAGAUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAUAUAUAAACGGAGGAGUACAAUGUUAUAUUUAUUAUAUAAAGAUAUAAUAUAUAAUUAACUGUAAAAUUUACAAAUUAAACAGAGAUAAAUGUCGGUCUUAAUGAUCCGAUAAUUAUUUAGUAAUAAAAUUAUCGCUUAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUAAUCUUUUCCGAGAGUCCAUAUUGACGAAAAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUUAUCGCAUCCUAAAGCAGUAGUAUGUUUUAAGGGUAAGUCUGUUCGCCUAUUAAAGCGAUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCAUAUCUAAUAUAAGUGUUAGAAUAUUGAAAUUAUUUUUUUUAGUACGAGAGGAUCAAAAAAAUUAUACCAAUGAUAUAUCAAUUAUAAAAUUUUUUUGUAAAGUUGAGUAGUUAAGUAUAAAAUUUUAAUUGUUGAAGUAAUAUAAAUAAGAAAAUUUAGUUAAAAAUAAUAUUCUAAUCAUAUAAAUGAAUAAAACAAUAAUUAGAAAAAUUAUUUUAUAGGAUUAGUAUGUAUUUAUAGUAAUAUAUUUAGUGUAUAAUUCCUAAUAAGUUGAAUAUUUAAUUA |
|
[ reference structure ]
|
......((((((((.........(((((((((((....(((...(((((((((((.......(((((((...........)))....((((((((((((((.(((((((((....)))))).))).))...))))))))))))...))))...(((....)))....(((((...))))).....((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.............................(............)........(((((((.....))))))).....(((((..[[[[)))))..))))..)..)))))))))))..............((....))...)).........((((....))))............)....))))))))))).....(.(((((((((((.......)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..................................((....)).(((((.....))))).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((((((((((((....(((...(((((((((((((((((((.....))))))).))))))))))))..)).)....)))))))).)).....))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....g.gggggg.............(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........)).....GGGGGGG)))...)))))))((((((((.........))))))))....))))))(.(((((((......((((((((((....))))))))))....)))))))..).....))))))b(.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((<<<<.((...(((.(.(((...))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((.((((((.(((...((((..(((((((......)))))))..))))........)))..))))))...)))))))))))>>>>..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))).((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((....)))(...).......(((((((((..((f....(....F))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((((((((.((((((...)))))))))).))))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....B))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..eeeee..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).EEEEE))))))))))))))))))...(((((((((......))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))(({{....{{{{{{.....{{)(.(((}}.....}}}}}}....((((((((h...(..H)))))))).(((....))).}}))).).....(((((((..((..]]]]..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...dddddddd..((((.(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((.....))))))..)))))....))).)))))).(((....(((((...........)))))....))).))))..)...DDDDDDDD..((((....)))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((.(((...))).))))))...(((((((....(((((((...)))))))))))))).))))))))......(((((((((((((((((((((.(((....))).)))))))......))))))))))))))....((((((((((((......))))))))))))....................(((((((.((((((.......................((((((..................))))))...((((((.(((...))).(((((..((((((((((......)))....(((..((((((((.....)))))))).))).((((......)))))))))))..)))))......))))))......))))))........))))))).((((((.........((((((((((((((.(((((((((...(((.....)))...))))))))))))))..))))))))))))))).(((((((..((((((((...(((((((((((((((((.(((((.((((...(((......)))....))))..)))))....(((((((((.....)))))))))....)))))))))))))))))........(((((((((((((((((((((.((((..(((((((......)))))))...))))...(((((.(((........))))))))...))))))))))))((((.....)))))))..)))))).....)))))))))))))))((((((((((.....(((.(((((((........))))))))))....(((((((((((....((((((.(((((((....))))))).)))))).......)))))))))))))))))))))....((((((((((......))))))))))...((((......)))).....((((((((..(((((((.(((((((..(((((((.........)))))))..))))))).))))))).....((((((((.......))))))))((((........)))).)))))))).((((((...(((..........)))...))))))......(((((((.......)))))))..((((.(((((((((((........(((((((....((((((((............))))))))..))))))).......)))))))))))....))))..((((((.......))))))...............((((((((((((((..........((((((((.......((((((.((((((......((((.....(((((((((.........(((((((((((((((((((((((.....))).....((((((((((((((.((((..........)))).))))))))))))))....)))))))))))...)))......((((....)))).(((((....)))))..))))))((((((((...(((((((((((.(((((((((.......((((.((((..((((..((((....)))).(((..((((.....)))).)))...(((((.....)))))(((.....(((...(((....)))...)))......)))(((.(((((...((((((...(((......(((((((((.(((.....)))))))))))).))).))))))...))))).)))..........))))..)))).))))......)))))))))............((((..(((.........)))..))))..)))))))))))))))))))........)))))))))....)))).....)))))).))))))......)))))))).........((((...(((((((((......))).))))))..))))))))))))))))))..(((.((((((((....)))))))))))(((.[[[[[[.)))..]]]]]].......(((((((.....(((((((((......)))))))))......)))))))........((((....[[[[[(((((((...........)))))))......))))(((.((((((((....)))))))).)))....]]]]]...........(((((....[[[[[[.[[[[[[..)))))...]]]]]].]]]]]]...........(((((((((((........)))......(((..((((((((.........((((((((.(((((((......(((.....)))))))))).))))).))).(((((((((((......)))))).))))).))))))))..)))....)))))))).(((...........(((((((....))).))))[[[[))).(((((((....))))))).((((((((.......))))))))......]]]].......((((((...((((...((((((((((((...)))))))..)))))...)))).))))))..((((((((((((...((((.(((((......)))))))))...............((((....))))......))))))))))))...........((((((((.((((....)))).))).................)))))...((((((....)))))).
|
|
CRW_00524
|
[ FASTA input ]
|
AAAACGACUCUCGGCAACGGAUAUCUCGGCUCUCGCAUCGAUGAAGAACGUAGCGAAAUGCGAUACUUGGUGUGAAUUGCAGAAUCCCGUGAACCAUCGAGUCUUUGAACGCAAGUUGCGCCCCAAGCCUUCUGGCCGAGGGCACGUCUGCCUGGGUGUCACAAGCGACCCCAGGUCAGGCGGGAUUACCCGCUGAGUUUAAGCAUAUCAAUAAGCGGAGGAAAAGAAACUAACAAGGAUUCCCUUAGUAACGGCGAGCGAACCGGGAAGAGCCCAGCUUGAAAAUCGGACGUCUUCGGCGUUCGAAUUGUAGUCUGGAGAAGCGUCCUCAGCGACGGACCGGGCCUAAGUUCCCUGGAAAGGGGCGCCAGAGAGGGUGAGAGCCCGUCGUGCCCGGACCCUGUCGCACCACGAGGCGCUGUCUACGAGUCGGGUUGUUUGGGAAUGCAGCCCCAAUCGGGCGGUAAAUUCCGUCCAAGGCUAAAUACGGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACCGCGAGGUAAAGAUGAAAAGGACUUUGAAAAGAGAGUCAAAGAGUGCUUGAAAUUGUCGGGAGGGAAGCGGAUGGGGGCCGGCGAUGCGUCCUGGUCGGAUGCGGAACGGAGCAAUCCGGUCCGCCGAUCGAUUCGGGGCGUGGACCGACGCGGAUUACGGUGGCGGCCUAAGCCCGGGCUUUUGAUACGCUUGUGGAGACGUCGCUGCCGUGAUCGUGGUCUGCAGCACGCGCCUAACGGCGUGCCUCGGCAUCAGCGUGCUCCGGGCGUCGGCCUGUGGGCUCCCCAUUCGACCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUGACAUGUGUGCGAGUCAACGGGUGAGUAAACCCGUAAGGCGCAAGGAAGCUGAUUGGCGGGAUCCUCGCGGGUGCACCGCCGACCGACCUUGAUCUUCUGAGAAGGGUUCGAGUGUGAGCAUGCCUGUCGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAGCGGGGUAAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAAGCCCGCAGCGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCGUCUGACUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCCUCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCUGGAGCUCGGACGCGAGUUCUAUCGGGUAAAGCCAAUGAUUAGAGGCAUUGGGGGCGCAACGCCUCGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAGGUAGGACGUGUCGGCUGCUUUGUUGAGCCGUCACACGGAAUCGAGAGCUCCAAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGGAAGCCGGGUUACGGUGCCCAACUGCGCGCUAACCUAGAACCCACAAAGGGUGUUGGUCGAUUAAGACAGCAGGACGGUGGUCAUGGAAGUCGAAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUCAACUAGCCCCGAAAAUGGAUGGCGCUUAAGCGCGACCUAUACCCGGCCGUCGGGGCAAGAGCCAGGCCUCGAUGAGUAGGAGGGCGCGGCGGUCGCUGCAAAACCUAGGGCGCGAGGCGCGGAGCGGCCGUCGGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGGCCGAAGAGGGGAAAGGUUCCAUGUGAACGGCACUUGCACAUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGUCGGGGGAAACCCGUCUGAUAGCGCUUAAGCGAACUUCGAAAGGGGAUCCGGUUAAAAUUCCGGAACCGGGACGUGGCGGUUGACGGCAACGUUAGGGAGUCCGGAGACGUCGGCGGGGGCCUCGGGAAGAGUUAUCUUUUCUGUUUAACAGCCUGCCCACCCUGGAAACGGCUCAGCCGGAGGUAGGGUCCAGCGGCUGGAAGAGCACCGCACGUCGCGUGGUGUCCGGUGCGCCCCCGGGCGCCCUUGAAAAUCCGGAGGACCGAGUGCCGCUCACGCCCGGUCGUACUCAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUGGUCGAUGGAACAAUGUAGGCAAGGGAAGUCGGCAAAAUGGAUCCGUAACUUCGGGAAAAGGAUUGGCUCUGAGGGCUGGGCUCGGGGGUCCCAGUUCCGAACCCGUCGGCUGUCAGCGGACUGCUCGAGCUGCUUCCGCGGCGAGAGCGGGUCGCCGGCUGCCGGCCGGGGGACGACUGGGAACGGCUCUCUCGGGAGCUUUCCCCGGGCGUCGAACAGUCAGCUCAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCCGACUGUUUAAUUAAAACAAAGCAUUGCGAUGGUCCCUGCGGAUGCUAACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUGUCUACUAUCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUCCGACUUUGUGAAAUGACUUGAGAGGUGUAGGAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCAAGUGAAAUACCACUACUUUUAACGUUAUUUUACUUACUCCGUGAAUCGGAGGCCGGGGUACAACCCCUGUUUUUGGUCCCAAGGCUCGCUUCGGCGGGUCGAUCCGGGCGGAGGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAAAGAUAACGCAGGUGUCCUAAGAUGAGCUCAACGAGAACAGAAAUCUCGUGUGGAACAAAAGGGUAAAAGCUCGUUUGAUUCUGAUUUUCAGUACGAAUACGAACCGUGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGACUUCGGAAUUUGAAGCUAGAGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUUGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGUGAAGCAGAAUUCACCAAGUGUUGGAUUGUUCACCCACCAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGCCCGCGUCGCGAUAGUAAUUCAACCUAGUACGAGAGGAACCGUUGAUUCGCACAAUUGGUCAUCGCGCUUGGUUGAAAAGCCAGUGGCGCGAAGCUACCGUGCGCUGGAUUAUGACUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCGGGCUAGAAGCGACGCAUGCGCCCGCCGCCCGAUUGCCGACCCUCAGUAGGAGCUUAGGCUCCAAAGGCACGUGUCGUUGGCUAAGUCCGUUCGGCGGAACGGUCGUUCGGACCGCCUUGAAUUAUAAUUACCACCGAGCGGCGGGUAGAAUCCUUUGCAGACGACUUAAAUACGCGACGGGGUAUUGUAAGUGGCAGAGUGGCCUUGCUGCCACGAUCCACUGAGAUUCAGCCCUUUGUCGCUAAGAUUCGA |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((((((.....(((..(((((((((........(((((((........))).......(((......................)))......))))...(((...)))((((((((((....)))))))))).((((((((((((.(((......))))))))).))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((..((((((((((((((((.(....)))))))))))))))))....((((((.((((.(((((((.(((((((...(.((((......)))))..(...)..((.......))....)))))))..)).))))).....)))))))).))........(((((((........))))))).....(((((........)))))..))))........))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....((((((((((((....(..(((((((.......((((((((((....)))))))))).........))))))))...(((((((.(((((((((((((((.......(((((((.....))))))).......)))))))))))))))..........(((((...........((((....))))...))))).....)))))))......)).))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..(((.(((((((....)))))))..)))...((....))....(((((..(((.....)))...))))).((((((((...((....))...))).))).))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..(((((((..........((((((((....(((....((((((((((..((((((.(.....)))))))))))))))))..)).)....)))))))).(((((((((.........)))))))))...........))))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...(((......(.(..(((..................(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...................))))))))...)))))))(((((((((.........)))))))))....))))))(.((((((((((......((....(((....)))))...))))))))))..).....))))))..............((((((.......))))))((((.....((((..((...((((((...((.....)).))))))......(((.((...(((((.(((....))))))......(((....)))....))....))...(((((........)))))..((((.(((((((...((((....))))......((((((...((((.(((((((.(((((((((.........))))))...(((((.....(((((((((((((.....))))))))))))).....)))))......(((((((.....)))))))..)))...))))))).)))).........))))))...........)).))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((.(((((((((((((((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))).))))....))))))))...(((((....)))))..)))))))))......)))))..)))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..((((((((.(.((((....)))).)...))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((....)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))............(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..((....))............))))))))))))).))))))))))...(((((.....((((....(((((...)))))...............(((((((....)))))))..))))..))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((.......))))))))).(((....))).))..........((((((.((((.......)))))))))).........)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))).((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))...)))..))))).(((....(((((...........)))))....))).))))...))))))))....((((((((.....................((((....)))).......................(((((..((((......))))..))))).........................))))))))..((((((((((.......)))))....(((((((((.((..(..((((.((((((((......)))))))))))))...)).....))).))))))...)))))..
|
| [ predicted structure ] |
....(((...)))...(((......((((...[[[[[)))).......))).......]]]]](((.[[[[)))..((((........))))]]]]...........(((....)))..((((...(((....)))...)))).((((((((((((.(((......))))))))).)))))).......(((((.[[[[[.............)))))........]]]]]...(((..[[[[))).....(((........)))]]]].(((((.(((((....(((((((((...))))))))).........((((..((((.((((.(((((((.((((((......(((((....))))).........((((....)))).....))))))...))))))).....)))))))).))))))))).)))))..((((......[[[[))))..((((((......))))))..]]]].....(((........)))...(((..[[[[[[[))).................((((((......)))))).....]]]]]]]......(((((((((...((((((((((((......(((((((((((((..(((((.((((....)))).)))))...)))).)))))))))...(((((((.(((((((((((((((.......(((((.........))))).......))))))))))))))).....(((.((((((((((....)))((((....))))..))))))).))))))))))......))).))))))))).))).))))))....(((((......))))).......(((......((((((......))))))..[[[))).....]]]..(((((((.((((....))))...)))))))(((((((((((((((...)))))..))))).........[[[.)))))............]]]...(((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))(((..[[[...[[[[)))....]]]].]]]...))))))))))).........((((...[[[[[[..))))...]]]]]]..(((.......[[[...)))....(((((((((....)))))))))..]]].....(((((.....[[[[[))))).........]]]]].(((((((...........)))))))..((((....[[[[((((....))))))))....(((.........)))..(((.((((.(((((.....))))).))))..)))((......))...]]]](((....[[[[))).......]]]].(((....((((.....))))[[[))).......]]](((....[[[[[[....(((........))))))...((((........))))..]]]]]].........(((((((..((((...((((....))))...))))....[[[..)))))))....]]]...((((..[[[[[[.))))((((((((((((((.............((((...)))).)))))))))).))))......................]]]]]]........((((...[[[[))))........]]]](((((((..[[[[.....)))))))....]]]].(((.......[[[[)))..]]]].....((((((....)))..((((....)))).[[[[[))).....]]]]]((((((.((((((((((((((....))))).....(((((((((((..((((....(((..((((((....)))))).......(((((.....((((((....((((...))))....)))))).....)))))...)))..)))))))))..............(((((....))))).........)))))).........))))).))))))))))..........(((.[[[[.)))......]]]]....((((...[[[[[[..........)))).......]]]]]]........(((.....[[[.)))...]]]((((((((((((((((.(((((((((((((((((.....(((((((((.(((.(((..((((((..(((((....)))))..))))))..))).))).))))).))))....))))))))..((((((....)))))).)))))))))......)))))..)))))...((((..(((((..(((((((...((((((............((((((((.((((..........)))).)))))))).......((((.(((((.(((...)))...((((....))))....))))))))))))))).((((((.......))))))((((.....(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).))))...)))))))..)))))(((.........)))....)))).))))))((((.((((((...(((..(((((((((........)))))))))..))).....)))))).....(((((((((((((((((((((.....((((....))))..)))).((((......)))).))))))).))))))))))...(((((.....)))))...(((((...))))).........))))..(((((((....)))))))..(((.[[[[[.)))..]]]]].((((((..(((((((((..(((...[[[[[............)))(((...))).]]]]]...(((((((((.[[[[[.)))))).)))..((((.((((....)))).)))).]]]]]........((((..[[[[...))))....]]]].......((((((((((.((((((...))))))))))))).)))..........(((((((.........))))))))))))))))..(((...[[[[[[[[.....))).....]]]]]]]].....(((...(((((((((......)))))..))))..))).......))))))..(((((..........[[[[...(((((((....))).)))).......))))).....]]]].(((((((............(((...[[[..)))...]]]((((.[[[[[.....))))((((((((((((....)))))..))))))).......]]]]](((((((.(((((...[[[.....))))).))))))).......]]]........(((((((((......((((((........(((((....))))).[[[[[.......))))))...(((((..((((......))))..))))).]]]]]...................)))))))))..........................)))))))((((......[[[[[[[[[(((((......))))).)))).((((...))))...]]]]]]]]].........
|
|
CRW_00525
|
[ FASTA input ]
|
AACGCCCCGCCGGCGGAUGCCUCGGCCCGGGCGGCGACGAAGAGCGCGGCGGAGCGCGAGACGCGGUGCGGACCCGCCCGCCCCGAGAAGCACCGACCCUCGAACGCAGCGCGCCCCGGCGCCGCCGCCUCGGCGCCCGCGCGGCCCGAGGCGGCGGGGGCGACGGGCGGAACUUAAGCAUAUCAGUACGCCCCGGAGGAGAAACCAACCGGGAUUCCCCGUAGCGGCGAGCGACGCGGGAGGAGCCCGCCCCGAAGGCGCGCUGUGGGGCGCAGGCGCAGGCCCGCCGCGAGGGGGCCCGAGGGCCCCGCCCGAGAGGGUGCAAGCCCCGUACGGCGGCCGCCGGGCCUGCGCGGCGAGUAGCGCUGCUUGAGCGUGCAGCGCGAAGGGAGGCGCGGCCCUUCCAAGGCUAAAUACGCCCCGGGACCGAUAGCGGACCAAGUAGCGCGAGCUAACGGUGAAAAGGACGCCCUGCGGCCGCUCAAAAGACCUGAACCCGGCCGGCCGCCGGCCCGCCGGCCCCGUCUCGAAACACGGACCGAGGAGCCACGCGCCGCGGCGAGCCCGAGGGAGCCCCCGCGGCGGAGCGAGCGCGAGACGCCCCGGGCCCGCCGCGCCCCUGCGGGCGUGCGCGGGCCGAGCCGCGGCGCGUGGGCCCGAAAGGCGGUGAUCUAUGCCCGGCGAGGGCGAGGCCGGGCGAAAGCCUGGUGGAGGCCCGCCGCGGUGCUGACGCGCAGAUCGCUCGUCGGAGCCGGGCAUGGGGGCGAAAGACUCAUCGAACCGCCUGGUAGCUGGUUGCCUCCGAAAUGUCUCCCAGGACAGCCGCCGCCCCGCAGUUGCGGCCCGUAGAGCGCUGGCCGGCGGGAGCGGGGGGCCUGCCCCUCGCCCGCCCCCCAAACUCCGAAGGGCCGCGCCGCCCCGCCGCUGGCCUGGGCGGGGCGGGCGAAUGCGGGCGGCGCGUGGGCCCCUCCUGGUAAGCAGGACGGGCGAGGCGGGACGAUCCGGACGCCGGGCCAGGGUGCGCCGCCGGGGCCCGCGGAACGGCGUCGGCCGGUCCCGACAGCUGGAAGGUGGCCCCAGAAGUCGGCAUCCUCCAGGGAGUGUGUAACAACCCACCAGCCGAAUCGGCCGGCCCGGAAAAUGGAGCGCGCCGGAGCCCCGGACCCGCGCCCGGCCGCCGCGCGCGGCGGGUAGGAGGCCGCAGAGGCCCCGGGGGCGAAGGCGGCGCGCAGGCCCCGCCGGACCGGCCUCUGGUGCAGAUCUCGGCAGCAGUAGCCGCUACUCCGCGCCCCGGAGGACUGAGGGGGAGACGGGUUCCGCGGCGCCUGCAUCUGGCCGCGGGUGACUCGGGCCUAAGCGGCGGGUGAAGACCGGGAAGGGGCGUGCCCGCCCGUCGAACGGGGAGCCGGCGGAGACUCCGGCAGGCGCGGCCCCCGCGGAGACGCCCGCCCCCCGGCGACGCGCACGGGGACCGCGGCGGGCGGCGCCCCGGCCCGCGAACGCCCCGCAGCCCCCGGACGCCUUGCGCGGAGAGGGGGGCCCGGGGGCGGACCCCGCGCGUCCCCGGCCGCCCCUGAAAAGCCGGGGGGCGCCGGCCGCGCGCCGUACCGACCGCAGCAGGACUCCGGGGUCAGCAGCCUCUAGCGCGGGAGCGAACGCGGCUCAGGGAAGUCGGCAAGCCGGCUCCGUAACCUCGGGAAAAGGAGUGGCUCUGACGGCGCGCCGGGUCAGAACUGGAACGGACGCGGGGAUCCCGACUGUUUACUAGAAACACAGCGUCGCGAGGGCCGCACCCGGCGCUGGCGCGACGUGAUUUCUGCCCAGUGCCACGACCGUCACCGUGAAGCGAUCCGCCGAAGCCCUGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCGGGCAAUUUCCGACGUGCAUGAAUGGACCAACGAGGAUCCCACUGUCCCGAGCCGCGCCUCCGGAGCCUCCAGCCUCGGGAACGGGCGAGGGCCGGCCAGCGGGGCAAGAAGACCCUUUUGAGCUUGACUCCAGCCCGGGCCUGUGGGGCGGGGCGGCCGGCGCAGCGCACAGGGGAGGCCGCGCCCCUGAGACACCCUGACGGCCGCCGCCGCCCCGCUCACCCGGUCGCGCGGGGACCCGCCCGGGCGGGGAGUUCGGCUGGGGCGGCGCGCCUGCUACACCGGACCGCAGGCGUCCCACGGCGGGCUCAGCGAGGACGGAGACCUCCCGCGGAGCAGAAGGGCACAAGCCCGCCCGACCCGCGCCCCCCGUGCCGGCGCGGGCCGCGAAAGCGGGGCCUACCGAUCCUUCGCCGCCCCGGCCGCGGGCGCGGAGGUGGCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCCGCCGAGCGCCCGCAGCGACGCGGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUACCGUCCGCGCGCACCGGCGCGGAAGCGUCGGAUUGUUCACCCGUUCAAGGGAUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGGCCCCGGGGCCAGAGCACGGCGGGCCAGUACGAGAGGAACGCCCGCCGCGGGCGCCCAGCCCCGCGGUUGCCCGCCGGGGCAGGCCCGCGCGCCCGGGCCCGGGGGCCUGGCGCUACCGCCUCUAAAGCGCCACCCCCCCCUCCGGCCCCGCCGGGCCGCCGCCCCAGCCCCGUGCCCCGUCGCCGAGGCGGCCCCCGCCCGGGAGACCACCCCGGGCGGGCGCUCUGUACGGCGCCAGGGCCUGCGAUCGGCCUGGGGACGCGCCUGCAGGAGCGCGGGGCGGGCGCGCGGCCCACUUGCU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((.....(((..((((((((((((.....(((((((........))).....((((((....................))))))...))))...((...))((....)).((((((((((((.(((.....))))))))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((...((.....))....)))))..((((...(((((((.....)))))))((((((((...((((.((((...(.((((......)))))(((...).fff.....))FFF...)))))))).....))))))))........((((((((......))))))))...(((((..eeeeee)))))..)))).....)).)))))).))................((....))....)).........((((....))))...........).....)))))))))).....((....))..((((........))))((((((....(((((((((((((..(((...(((...)))...)))...((....))....((...)).(((((((((((((....))))))).))))))...)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((.......(((((((....(((...(((..(((((..((((((((....)))))))))))))..)))..)).)....)))))))((((((((((.........)))))))))).........))))))).)...((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...(((((....bbbbbbb........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........))......BBBBBBB)))...)))))))(((((....)))))....))))))(.(((((((..(((.......(((((.((....)))).)))...))))))))))..).....))))))((.....((.....(((((.....)))))((((.....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(([[[.((...((....(((....)))......(((((....))))).))....))...(((((........)))))))((((((((...(((....)))....((((((((...((((.((((((.((((.(((((.........)))))....((((((....(((((((((((.....))))).)))))).....)))))).....))))..)))))).)))).........)))))))).....)))))))).]]]..))..((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((..((...)).)))))))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((....)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))...))....(((((........)))))...(((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(....).......)).).DDDDD))))))))).)))))))))...((((......)))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))((aa....aaaaaa((.((((((.......))))))...))aa)(.(((AA....AAAAAA....((((((((c...(...C)))))))).(((....))).AA))).).....(((((.(((((.EEEEEE))))))))))...))....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....)))))....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))).((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((...(((((((((((....))))))..)))))...))).))))).(((....(((((...........)))))....))).))))..))))))...((((((............................)))))).(((((((((.......)))))....((((((..........(((.((.........)))))...............))))))...))))..................
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[))).......]]]].......(((........)))(((((.[[[[[.........(((....)))))))).((((...........)))).......]]]]].........((((((((((.(((.....))))))))))))).............((((................[[[(((((............))))).)))).....]]]......................(((.....)))................(((((((((((..(((..((((((....))))))((((....))))....[[[.)))..]]]......)))))))))))((((....(((((((........)))))))...(((((....[[[[)))))..]]]].....)))).(((((((...((((((((...((((....))))..)))....[[[.(((...))).))))).......]]]......(((((((.((((..((((.(((((((((..........))).......((((((((((((((..(((...(((....)))..)))...(((.........)))....((((((((((((((....))))))).)))))))..))))))))))))))........(((((((......((((((((.....((((((((((....)))))))....(((((((.((((.((((((...........)))))).)))))))....))))......)))((((..(((((((((((....))))).......(((((....)))))..(((((((((((....(((((((...(((...(((..((((((..(((((((....)))))))))))))..)))..)))....))))))).((((((((((.........))))))))))))).....)))))))).....((((.(((((.....))))).)))).))))))..)))).....)))))))).......))))))))))))).))))..))))))))))))))))))....((((.....[[[[))))...(((((.((((...))))(((..........)))..)))))...]]]]................(((.((((....)))).((((((((((.((((.....)))))))...((((((......(((((((((((((...(((((((((((((.((((.((((((((..(((.(((........))).)))..)))....((((...((((((....))).)))))))...))))).)))).))))......((((..(((...))).)))).....(((.(((............((((((((((..(((((...)))))..(((((........))))).))))).))))).(((....)))..((((((((((...(((..((((((((((((...((((.........))))...((((((...((((((...(((.....))).....))))))...))))))....))))).)))))))..))).........))))))))))))).))))))))))))......))).......))))))))))....)))))).))))))).)))..........(((...[[[[[..[[[[[.[[[[....)))........]]]]]]]]]]]]]]..(((((((..(((....)))..))).))))((((((....(((((((((((.......((((((((.(((.....)))[[[[[[[[)))))))).........]]]]]]]].....(((....[[[..)))...]]].......))))))))))).((((((.[[[...))))))....]]]..(((.((((..(((((((.....))))))).))))...))).........))))))...............................(((.........)))..........................((((....((((.((((((.((((((((..((((((((((((((((((((...))).((((((........))))))...........)))))))).)))))))))...((((......)))).....))))))))..)))))).))))))))............................................................................((((....)))).............................((((........(((((....(((....)))..)))))))))((((((((...((((((.....(((((.........)))))........))))))..))))))))(((..[[[[)))..((((....))))...(((.........)))..]]]]....(((((((....))))))).................(((..((((....((((...(((((((....))).))))......))))..((((((....))))))..))))((((((...............)))))).[[[[[[.))).(((((((((....))).))))))..]]]]]]............(((((..(((((((...........)))))))..))))).............((((((((((((..(((((((((((((..(((((...(((((.((((((((.......))))))))((((((......)))))).))))).....))))).))))...............)))))))))))))).))))))).......
|
|
CRW_00526
|
[ FASTA input ]
|
CACACGACUCUCGGCAACGGAUAUCUCGGCUCUCGCAUCGAUGAAGAACGUAGCGAAAUGCGAUACCUGGUGUGAAUUGCAGAAUCCCGUGAACCAUCGAGUCUUUGAACGCAAGUUGCGCCCGAGGCCAUCCGGCCGAGGGCACGCCUGCCUGGGCGUCACGCGCGCGACCCCAGGUCAGGCGGGACUACCCGCUGAGUUUAAGCAUAUAAAUAAGCGGAGGAGAAGAAACUUACGAGGAUUCCCCUAGUAACGGCGAGCGAACCGGGAGAUGCCCAGCUUGAGAAUCGGGCGGCCGCGCCGUCCGAAUUGUAGUCUGGAGAGGCGUCCUCAGCGACGGACCGGGCCCAAGUCCCCUAGAAAGGGGCGCCUGGGAGGGUGAGAGCCCCGUCCGGCCCGGACCCUGUCGCCCCACGAGGCGCCGUCAACGAGUCGGGUUGUUUGGGAAUGCAGCCCAAAUCGGGCGGUAAACUCCGUCCAAGGCUAAAUACAGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACCGCGAGGGAAAGAUGAAAAGGACUUUGAAAAGAGAGUCAAAGAGUGCUUGAAAUUGCCGGGAGGGAAGCGGAUGGGGGCCGGCGAUGCCCCGGCCGUAUGCGGAACGGCUUCGGCUGGUCCGUCGAUCGGCUCGGGGCGUGGACUGUUGUCGGCCGCGCCGGCGGCCAAAGCCCGGGGGCUCCGCGCCCCCGGCAGCCGUCGUCGGACGCAGCCGGUCACCGCGCGCCUCUGGCCGGCCCCUCGGGGCGUCGCGCCGCAACGGCCUGCGGGCUCCCCAUCCGACCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUGACAUGCGUGCGAGUCGACGGGUUCUGAAACCUGGGAUGCGCAAGGAAGCUGACGAGCGGGAGGCCCUCACGCCGCACCGCUGGCCGACCCUGAUCUUCUGUGAAGGGUUCGAGUUGGAGCACGCCUGUCGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAGCGGGGCGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGAAGCGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCGUCUGACUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCCUCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCUGGAGCCCAUUACGAGUUCUAUCGGGUAAAGCCAAUGAUUAGAGGCAUCGGGGGCGCAACGCCCUCGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAGGUAGGACGGCGCGGCUGCUCCGGUGAGCCGCGCCACGGAAUCGGGAGCUCCAAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGGAAGCCUGGUUACGGUGCCGAACUGCGCGCUAACCUAGAACCCACAAAGGGUGUUGGUCGAUUAAGACAGCAGGACGGUGGUCAUGGAAGUCGAAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUCAACUAGCCCCGAAAAUGGAUGGCGCUGAAGCGCGACCCACACAGGCCAUCUGGGCGAGCGCCAUGCCCCGAUGAGUAGGAGGGCGCGGCGGCCGCGCAAAACCCGGGGCGCGAGCCCGGGCGGAGCGGCCGUCGGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGGCCGAAGAGGAGAAAGGUUCCAUGUGAACGGCACUUGCACAUGGGUAAGCCGAUCCUAAGGGACGGGGUAACCCCGGCAGAGAGCGCGACCACGCGCGUGCCCCGAAAGGGAAUCGGGUUAAGAUUUCCCGAGCCGGGACGUGGCGGUUGACGGCGACGUUAGGAAGUCCGGAGACGCCGGCGGGGGCCUCGGGAAGAGUUAUCUUUUCUGCUUAACGGCCCGCCAACCCUGGAAACGGUUCAGCCGGAGGUAGGGUCCAGCGGCCGGAAGAGCACCGCACGUCGCGCGGUGUCCGGUGCGCCCCCGGCGGCCCUUGAAAAUCCGGAGGACCGAGUACCGUCCACGCCCGGUCGUACUCAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUGAACGACCUCUGGCCAAUGGAAGAAUGUAGGCAAGGGAAGUCGGCAAAACGGAUCCGUAACUUCGGGAAAAGGAUUGGCUCUGAGGGCUGGGCUCGGGGGUCCGGCCCCGAACCCGUCGGCUGCCGGCGGACUGCUCGAGCUGCUCGCGCGGCGAAGGCGGGCCGCCGUCGGCCGGCCGGGGGACGGCCGGGAACGCGCCCCUCGGGGGCCUUCCCCGGGCGUCGAACAGCCGACUCAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCCGACUGUUUAAUUAAAACAAAGCAUUGCGAUGGUCCUCGCGGAUGCGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUGUCUACUAUCCAGCGAAACCACAGCCAAGGAACGGGCUUGGCGGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUCCGACUUUGUGAAAUGACUUGAGAGGUGUAGGAUAAGUGGGAGCCCUCGGGCGCAAGUGAAAUACCACUACUUUUAACGUUAUUUUACUUAUUCCGUGAGUCGGAAGCGGGGCCUAGCCCCCUCCUUUUGGCUCUAAGGCCCGAGUCCCUCGGGCCGAUCCGGGCGGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAAAGAUAACGCAGGGUGUCCUAAGAUGAGCUCAACGAGAACAGAAAUCUCGUGUGGAACAAAAGGGUAAAAGCUCGUUUGAUUCUGAUUUCCAGUACGAAUACGAACCGUGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGACCUUCGGAGUUUGAAGCUAGAGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUUGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGUGAAGCAGAAUUCACCAAGUGUUGGAUUGUUCACCCACCAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGACCGUGCCGCGAUAGUAAUUCAACCUAGUACGAGAGGAACCGUUGAUUCACACAAUUGGUCAUCGCGCUUGGUUGAAAAGCCAGUGGCGCGAAGCUACCGUGUGCCGGAUUAUGACUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAAGCUAGCAAGCGGCGCCUGCGCCGACGCCCGCCCCGACCCACGUUAGGGCGCAGACCCCCAAGGGCCCGUGCCACCGGCCAAGCCCGGCCGGCCGACGCGCCGCGGCCGGCCGCCUUCGAAGCUCCCUUCCCAACGGGCGGCGGGCUGAAUCCUUUGCAGACGACUUAAAUACGCGACGGGGCAUUGUAAGUGGCAGAGUGGCCUUGCUGCCACGAUCCACUGAGAUCCAGUCCCCGCGUCGCACGGAUUCGU |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((((((.....(((..(((((((((........(((((((........))).......(((......................)))......))))...(((...)))((((((((((....)))))))))).((((((((((((.((((((())))))))))))).))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((..((((((((((((((((((...))))))))))))))))))....((((((.((((.(((((((.(((((((...(.((((......)))))..(...).(((.......)))....)))))))..)).))))).....)))))))).))........(((((((........))))))).....(((((........)))))..))))........))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....((((((((((((....((((((((.......((((((((((....)))))))))).........))))))))...(((((((.(((((((((((((((.......(((((((.....)))))))......)))))))).))))))).......(((((..........((((....))))..))))).)))))))......)).))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..(((.(((((((....)))))))..)))...((....))....(((((..(((......)))...))))).((((((((...((....))...))).))).))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..(((((((.........((((((((..(.(((....((((((((((..((((((((.....))))))))))))))))))..)).).)..)))))))).(((((((((.........)))))))))...........))))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((.(...(((......(.(..(((..................(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...................))))))))...))))))((((((((((.......))))))))))....))))))(.((((((((((.....((((.((((....))))))))...))))))))))..).....))))))..............((((((.......))))))((((.....((((..((...((((((...((.....)).))))))......(((.((...(((((.(((....)))))).....(((((....))))).....))....))...(((((.........)))))..((((.(((((((...((((....))))......((((((...((((.(((((((.(((((((((.........))))))...(((((.....(((((((((((((.....))))))))))))).....)))))......(((((((.....)))))))..)))...))))))).)))).........))))))...........)).))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((.((((((((((((((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))).))))....)))).)))....(((((...)))))..)))))))))......)))))..)))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..((((((((.(.((((....)))).)..))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((....)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))............(((((.......)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.........(((((..(((....)))............))))))))))))).))))))))))...(((((.....((((...(((((...)))))................((((((((...))))))))..))))..))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........)))).))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....(((((((((.......))))))))).(((....))).))..........((((((..((((.......)))))))))).........)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))).((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))...)))..))))).(((....(((((...........)))))....))).))))....))))))))....(((((((..................((((.....)))).......................(((.(((((((......))..))))))))..........................)))))))...((((((((((.......)))))....(((((((((.((..(..((((.((((((((......)))))))))))))...))......))).))))))...)))))..
|
| [ predicted structure ] |
........(((((((((........((((((((((((((.........((((......))))...((((((.....((((.(((((((((((.......(((((...(((....)))..((((..((((....))))..)))).((((((((((((.(((........))))))))).)))))))))))..(((((..(((((......))))).)))))............))))).))))))...........))))....)))))).)))))...(((((....(((((((((...)))))))))....((((((.....((((.((((.(((((((.(((((((.....(((((....)))))......(((((((....))))..))))))))))...))))))).....))))))))...........(((((((........))))))).....((((((......)))))).))))))....)))))))))).))))..(((..[[[[[[.))).................((((((......))))))......]]]]]]...)))))))))(((...((((((((((((.(((((((((((((((...(((((.((((....)))).)))))....)))).))))))))...(((((((((((.(((((((((((......((((((((.....)))))))).....)))))))).))).))))).....(((((((...)))..((((....))))...))))..))))))..))).))).))))))))).)))((((........))))..........(((.[[[[[....)))..((((((....))))))....]]]]](((..[[[....[[[[[..[[[)))...]]]...]]]]]]]]...(((......((((((..((((((.......(((.(((...((((.(((....(((((((...(((((((((((..((((((((((((((....)))))))............((((............)))))))))))..)))))))))))...(((........))).))))))).((((((((((...((((.....((((..........((((((......(((((((((((...(((((....(((....(((..(((((((((...))))))))))))....)))..)))))....))))))))(((((((((.........)))))))))......)))...)))))).(((.((((.(((((.....))))).))))..))))))).....)))))))).))))))))).))))...))).)))......)))))).....(((.((((((.((((......(((((..(((((...(((...)))....)))))...((((........)))).)))))..)))).))))))))).....(((...((((....))))...)))))))))......)))...((((..(((((............)))))[[[[[[[[[[......[[[[[[))))...]]]]]]....]]]]]]]]]].......((((..((((.....((((..(((......))).))))...))))..))))........((((((((..[[[[.....))))))))...]]]].(((....)))(((((((..[[[[[[.....(((((....))))).)))))))...(((((((.......)))))))...]]]]]]........(((..[[[[)))........(((....)))]]]]....(((((..(((((((....)))))))[[[[....)))))....((((((....((((...))))....))))))..]]]]((((((....((((((.......))))))))))))..(((.[[[[.)))..........]]]].((((.[[[[[[.))))..........]]]]]]...(((.[[[[.)))......]]]]..((((((((.(((.(((......))).))).))))..))))........(((((........[[[....)))))..]]]...((((((((((....))))))))))....(((((((((((..(((((.(((((...(((((....)))))...))))).)))))..))))))).))))....(((.(((......)))[[[[[[[)))..]]]]]]].((((..[[[.))))......]]]....(((((..(((((((....(((((.....)))))..((((((((...((((....))))....))))))))......(((((.(((((.(((...)))...((((....))))....))))))))))......((((((.......))))))((((.....(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).))))...)))))))..)))))...(((((..(((.......[[[.[[[[..)))...]]]]]]].....(((((((((........)))))))))..(((.[[[.[[[[)))...........]]]].]]]....)))))...(((((..(((....)))..[[[[[[[[[[)))))...........]]]]]]]]]].((((((((((((((((.(((((...)))))...))))))))))...((((((((...))))))))..[[[..))))))..((((....)))).]]](((((((((..(((...[[[[[............)))(((....))).]]]]]...(((((((((.[[[[[.)))))).)))..((((.((((....)))).)))).]]]]]........((((..[[[[...))))....]]]].....((((.[[[[[[[....)))).........]]]]]]]..............(((((((.........))))))))))))))))..(((...[[[[[[[[.....))).....]]]]]]]].(((((((...(((((((((......)))))..))))..)))..[[[[[[........))))...]]]]]].((((.......(((....))).[[[[[.....))))......]]]]](((((((.............(((...[[[..)))...]]]((((.[[[[[.....))))((((((((((((....)))))..))))))).......]]]]]..(((((.(((((...........))))).)))))..........))))))).(((......[[[[((((............))))))).........]]]]........((((((.[[[[[)))))).................(((((((..((((....)))).....)))))))]]]]]((((((....................(((((((((.((((...(((((((..........)))))))((((......)))))))).))).))))))..))))))..
|
|
CRW_00527
|
[ FASTA input ]
|
UAGCACAGUCUUAACGAUGGAUGUCUUGGUUCCUACAGCGAUGAAGGCCGCAGCAAAAUGCGAUACGCAAUGAAAAUUGCAGUGACUGUGAAUCAUCAGAAUGCUGAAUGUAAACUACACCAAUUCCUUCGGGGAAUAGUGGUACUCCUACAGAAAAUGUUUGAUUUGAUGUUAGGAGGGCAAAUCCGCCGAAUUUAAGCAUAUAAUUAAGCGGAAGAAAAGAAAAUAACUAUGAUUCCUUUAGUAACGGCGAGUGAACAAGGACCAGCUCAAACGGUUAAUCCUUCGUUUGGUGCAAACCUUUCGACGGAAUUGUCGUUGAAUUAUUCCAUGAAUGCCUUUAAUUUGAGCAAAGUGAGCAGGAAUGCUUCCCCAUAGAGGGUGAAAGGCCCAUAGUUCUUUUUAAUUUAUUCAUUGGAAUUUUUCAUGCCGAGUCGUGUUCUUUGAGAUUGGAGCACUAAUACGUGUGAUACAUUUCACAUAAAGCUAAAUAUGUGUAGGAGACCGAUAGCAAACAAGUACCGUGAGGGAAAGAUGAAAUAGUACUCAGGAAUGAGCAAUUAAAUAGUACCUGAAAUCGUUAAGAUGGAACGGAUUAAGAGAGAAAACAAGUAAAGAGGGGAAUUUUUAAUUUUUUUUGUUAUAAUUCUCUUCUUUAUUAAAAGAAACAUCAGUGAUUAAUUUAAUUUCAAUAAAGCAAUCCCCUGAAAUUCAAAAUUUCUUUUAAUUUUCUUUUCACUUUCUCCCCGCACUAAUGUGGGGAAAACUGGCUUUAUUUCUUCAAUUAUUUUUUUUGCUGAGGAAUUUUAAAAUUAUUUGAAUUUUUCUUCUUAUAAUUUAAGUUGUUUCUAUAUAGUACUUUCUUAACCCACUCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAGCAAAUGUGCAAGUGUAUAUGAUUCUUUAAACAUUUCUCUUUUUAAUAUACGCAUAAUUAAUGUAAUAUGUUUCUUUAUUGUAGAUUUGUGUGGUGUUUAAUUUUUAUUAAAUCCCCACUUUGCAUACAUCCGGUAAGCAAUUAUGCUUUAUUGAGUACGAGCAUAUUUGGUAGGACCCGAGAGGCUUUGAACUAAGCGUGAUGAGAUUGAAGUCAGACGAAAGUCUGAUGGAGGAUCGAGUUGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCAUUUCAAUCACGUUUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAAAAGCCUAUUAGCUGGUUAUUUUCGAAAGAUCUCUCAGGAUCGCUGGAGUUGAAUUAAUAUAAUUUUACCAGGUAGAGAUAAUGAUUAGAGGAAUCAGGGAAAUCGUUUUCCUUGACCUAUUCUCAAACUCCCAAUAGGUAAAAAGGGCGAAAUAACUCAACUUGUAUUUCACUCAUAUUAAAUAAAAUAACUCCAAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGAGGGAUGCUCCUAACGCUUGGAUAAGGUGCCUAAAUAUUCGCUCAUGAGAUCCCAUAAAAGGUGUUGGUUCAUAAUGACAGUAGGACGGUGGUCAUGGAAGUCGAAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUACCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUAAAGCGGAUUACCGAUACCAAGCCAUAAAAAGAACAGAAAAAAUUUAUUUUUUUUUUAGAAUCUUUUUAUGAGUAGAAAAUCGUGGGGUUUGUGUUGAAGCGAAAUACGUGAGUUUUCGUGGAACAUCUCCCUAGUGCAGAUCUUGGUGGAAGUAGCAACUAUUCAAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGUGGAGAAGGGUUUCUUGUCAACUGUGAUUGAACAAGAGUUAGCCGCUCCUAAGGGAUAGCUGAAAAGUGUUUAAAAGGGGGUUCCUUCCCCGUCUCAAAAGGGAAACAGGUUGAUAUUCCUGUGCCAAUAGUAUUAUGAGUUUCUUAGAUGGUAACAUAUAUAUAAAUGAACUCCUUUACAUAGGCUUUACACUCGGGGUGCGUUUUCUUUGCACUUUACCUUUAUAACAAACCUUGGAAUCAAUUUACUUGGAGAAGAGGUUCGUUGAACUCAAUUCAAAAAAUUUCUUGAACGGGGUUUUCGGAUUCAGUUCAUUUUAUUUUUUGUUUUGUAGCAAUAGUAAUUCGUUUUUAUGAAUUAUCCGAAGUGGUAAGGACUAUCCUUGAAAAAAGGAGGGAACGGCUUUGUAAACUUGGUUUCUUCUGAUUCCAUUUUGCUUUGCUAUACUCUUAAUACUUGUAUGAGCGUACCAACAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUUAACAGCCUCUGGUUAAAUAGAAAAAAGUAGGUAAGGGAAGUCGGCAAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAAAAGGAUUGGCUCUGAGGACAUUAGAAAAGAGAAGAAAAAAAGAGGGUCGAAAAUAAAAUUGCAGUCUUAUUUGCUUUUCUUUCGAUUUGCUUGUAAUCUGCUUUUUCUUUUUCUUCUUUCUUUUUUUCUCCCCCUCUUUUCGCCUUCACUUUAUUGUAAUUUUAUUACUUUAAUUUGAUACCUAUAAUGUUAACUCAGAACUGAAACGGACAAGGGGAAUCCGACUGUUUAAUUAAAACAUAGCAUUGUGAAAAGCCACAACUGGUAUUAACACAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUUUGAAUGUCAACUUGAUGAAAUUCAAUCAAGCGCAGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUACUUGCUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAAAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUUACUCUAGUCUGGCUUUGUGAAACGACUUAAGAGGUGUAGCAUAAGUGGGAGUAGAAACUGAAAUAUGUUUUUACGACAGUGAAAUACCACUACUUUUAAAGUUGUUUUACUUAUCCAUUUAUAGGGAAAUAUAUUAUGCUUUAUCCUUCGGGAAGGCAUUCUGAUAUUAUUUGAAUUUUUAAGAAACUUGUUUCUUAUUUUUCUCCCAUUUCUAUGGAGACAUAGCCAGGUGGGGAGUUUGACUGGGGCGGUACAUCUGUUAAAUAUUAACGCAGAUGUCCAAAGACAAGCUCAAAGAGAACAGAAAUCUCUUGUAGACUAAAAGGGGAAAAGCUUGUUUGAUUUCUAUUUUCAGAACAAGUAGAAAACGUGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAUAUUUGCAAAAUGACGUAAAUUACUUACUACUGUGCAUAUAGAGGUGUCUGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCUGCCAAGCGCUCCUAGCGACGUAGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGGGACGCAGAAGUCUCAAAGUGUCGGAUUGUUCACCCGCUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUUUUAUUAUAUUUUUUAUAUAUACAUAUAGUAUUGUGACAGUAAUCCAACUUGGUACGAGAGGAUUAGUUGGUUCAGACAAUUGGUACAGCAAUUGGUUGACAAACCAGUGUUGCGAACGUAAGUCUGUUGGAUAAUGGCUGAACGCCUCUUAAGCCAGAAACCAUGCUGAUUAAACAAUACUAUUUCGUUCUUUUUUGUUUCCUUUUUUACUGCUAAUGUAAAAGAGAAAUUAUAUAUGUACCUUUUUUUGGUACAUAAAUAAUCCUAUCACCUUUUUCGUGAGCUGUGAGCUGUGAGCUAGGCAAUAGUUCUUUAACAACAAAAAAGAAUUGCACAAACUGUAGACGACUUUUUUGCCUCAGGGUGCUGUAAACAUGAAAGUAAACUUUGUUUUACGAUCUGUUGAGGCUUAUCCCUAGUGGUAAAGUGUUU |
|
[ reference structure ]
|
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.....((....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((....((((((((.(((...............(((((...((....))....)))))((((((((((((((.((((((....((((((((((((((..(((((.((((..((((..(((((((((((((....))))))))))))).))))))))...)))))..))))))))))))))..........................(((((...))))).....)))))).......)))))..)))))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((...((((....))))..)..))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((....)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....))....(((((........)))))..aaaaaaa..aaa.aa......aaaa.aaaaaaa.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..((((((((........)))))))).......)).).DDDDD)))))))).))))))))))...(((((.....(((((((((...((((((..(((....)))))))))....)))))...........(((((((....)))))))......))))......))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))a({{....{{{{{{((.((((((.......))))))...)){{)(.(((}}....}}}}}}....((((((((<....(..>)))))))).(((....))).}}))).).....aaaaaa...aaa.))))))....................AAA.AAAAAA....A)...AAAAA..AAAAAA........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....AA..AAA.AAAAAAA.............................((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((...(((((((((((....))))))..)))))...))).))))).(((....(((((............)))))....))).)))).....))))))))......((((((((((((..(((((((((.......)))))))))..((((((((((((((.......))))))))))))))......................................................))))))))))))..((((((((((.......)))))..(((((((((.((..(..(((.(((((((((......)))))))))))))...))....)))).)))))..)))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((........(((.........)))......[[[[[....((((......))))....(((((....)))))...)))))))..]]]]]....(((.....)))......((((.((((....))))....)))).((((((((....(((((((......((((.....))))..[[[[[..[[[[)))))))..]]]]..]]]]].....................(((((..........[[[[....)))))...]]]]...((((...(((.(((...(((....)))...))).)))........((((..((((((((((((...((((...((((.....(((((....))))).........((((.....))))...))))...))))..)))))).))))))..)))).))))(((.(((((((........)))))))......((((((......))))))...))).......))))))))...........................................(((((...................))))).....(((((((((......(((((((((......((((((((((((((((..((((.......)))).))))))))))))))))...((((((((((((((.............((((((((.......(((((...((((((......))))))..))))).....((((((((....))))))))......))))))))................)))))))...((((..(((((((..(((......)))..))))))))))))))))))........))))))))).....))))))))).((((.....[[[[[[[[..(((....)))..))))....]]]]]]]]................((((((.((((.....))))..))))))..................((((.(((((((....)))))))..))))...(((((......[[[..[[[[)))))...]]]]..]]]((((...................((((......((((((((((((.((((((((((((((....)))))))...(((.(((.(((.(((....)))))).))))))..))))))).))))(((((((..........((((((((((........)))..)))))))...((((((((...((((((((((((..(((((((..(((((((.....(((....(((....(((..(((((((((....))))))))))))....)))..)))......))))))).(((.((((((..........)))))).))))))))))......))))))).)))))((((.(((((.....))))).))))..))))))))))))))))))))))).......))))........))))................(((((((((.....(((((.....[[[....)))))....]]]..((((((((...((((..[[[...))))...]]]...........(((............))).....)))))))))))))))))....((((((((((..((((((((......))))))))....))))))))))........(((((((((...(((((...((((((.........))))))..)))))..))))).[[[......)))).......]]]....((((((........)))))).......(((.........((((((((((......))).)))))))[[[[[)))(((....)))..]]]]].............((((.[[[[[[))))........]]]]]](((((.[[[[[[[)))))......]]]]]]].((((((.(((.(((....))).....)))..)))))).....................((((((((.......))))))))............(((((((((..................(((.....[[[[[)))..]]]]]((((((((.[[[[[))))))))........]]]]]...............((((((((..(((((((((....)))))))))....(((..[[[[[)))..]]]]]......((((((((.......[[[[[..[[[))))))))....]]].]]]]].))))))))..................(((.[[[......)))....]]].)))))))))...(((.[[[[)))...]]]]....(((((((((.....(((((((((......((((......)))).((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((.......((((..((((......................)))).)))).......)))))..))))))))))))))....))))))))....(((..(((..(((((...)))))..)))..)))......)))))))..))))))........(((((..(((((((...(((((((...........((((((((....((((....)))).....))))))))....(((((.....(((((((((.(((......))).)))))...)))))))))))))))).((((((.......))))))((((.....(((.((((..((((((.......)))))).))))...))).))))...)))))))..)))))....(((((....)))))..((((.((((((........))))))....(((((((((........)))))))))(((((.((((((((.((((((((((((((((((.(((((((..............((((((((........))))))))....(((......)))))))))).))))))))))))....((((((...(((((((((...((((((..(((....)))))))))....)))))....(((....(((((((....)))))))...)))))))....(((((....)))))..)))))))))))).))))))))....(((((((((((...)))..))))))))....(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))..(((((((((.......))))))))).....)))))))))....))))))))))...)))))....)))).....)))))))))..((((((...........(((...[[[[[...)))...]]]]].(((((.[[[[[[)))))............]]]]]].........((((((...[[[[[.........(((((((......)))))))...)))))).......(((.......))).....]]]]]((((...(((((((....))).))))......))))................(((((.....))))).....((((((((((....(((..[[[[[[...))).........]]]]]]..(((((........[[[[[(((((((....))))))).((((....))))))))).(((....(((((............)))))....)))]]]]].....))))))))))...(((((((((((((..(((((((((.......)))))))))..(((((.((((((((.......)))))))).)))))....(((((((......)))..))))(((..[[[[[[)))..]]]]]]......)))))))))))))))))))..........(((...((((((..((((.(((...((((.....(((((......)))))....))))..)))....))))...))))))..))).
|
|
CRW_00528
|
[ FASTA input ]
|
UAGCCACAAUCUUAACGAUGGAUGUCUUGGUUCCUAUAGCGAUGAAGGCCGCAGCAAAGUGCGAUAUGCAAUGAAAAAUGCAAUUACUGUGAAUCAUCAGAAUGCUGAAUGUAAACUAUACCAUAUUUACCCUUAUGGGCAAAUUAACGUGGUAUUCCUACAGAAAAUAUUUGAUUUGAUGUUAGGAAGGCAAAUCCGCCGAAUUUAAGCAUAUAAUUAAGCGGAAGAAAAGAAAAUAACAAUGAUUUCUUUAGUAACGGCGAGUGAACAAGAAAAAGCUCAAGGAGAUAAUUCUAUAUCGUAGUUGUAAAAAGACUAUGUGUAUAGAAAUUGUUCUGUUAUAAGGAAGAAGUAAUCUGAGAAUAUAUGGGAUUUAUAUAUAUAUUUAGUUAUCGAAAUAAGUAGGAAUACUUUCCCAUAGAGGGUGAAAGGCCCGUAGUUAAUAAAUAUAUAAAGUUCUUUUUUUUUGGAUAAUUUUUUUUUUUAAAGAGUAGUGCUCUUUGAGAUUGGAGUACAAAGAUGUGUGAUACAUUUCACAUAAGGCUAAAUAUAUAUAGGAGACCGAUAGCAAACAAGUACCGUGAGGGAAAGAUGAAAUAGUACUCAGGAAUGAGCAGUUAAAUAGUACCUGAAAUCGUUAAGGUGGAACGGAUUAAGAAAGGAAAAUGUAAGAAGAUAGUAAAUAUUACUCGGCGAGUUUUAUUAAGAUACGAUUUUUUUAUAAAAAGAAACAUGAGUGAACGAGAAUAAAUUAUAAUAUAAUUAUAUUAGAUAGGUAUAGAAUAGAUACACAGGACUAAGGGGGGAGGAGUAGUAAGAAAAAGGGUGCAGUGUAAAAGGGUUAUGCUUGUAUGUUUGAGUAUUCACUGCUUCUUUUUUUUUUUUCUGUAAUUUUAUAUCUAUUUAAUUAAAGUAUCCUUAGCUAAUAAUAAUUUAUGAAGGAAGAACUUAAUUUAUAUGAGUUUUAAAAGGCAUGAUUAUAUUGUAUAUUAUAUGAUAUAUAUAUAAUUAUGUUUUAACCGAAAUGCGUAUAAUUAUUCUGUUUACUGAGGAAAGAGGUAAACAAUAGUGUGAACUAAGAAUGGGAUAUUUCUUUUUUCUGAUUGUAAGUUGUUUUUAAAUAGUACUUUUUUAACCCACUCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAACAAAUGUGCGAGCGUAUGUGAUAUGAAUAAAAACAUAUAUAAAUUUUUAGUUACGCGUAAUUAAUGUGAAUUUUUUGUGGAUGCGCCGGACAAUAGUGCAUUUGGUUUCUGGCUUGCAAACAAUACCGAUAAGCAAUAAGAUAAUUAAGUUUAUUUGAGUAUGAGUACAUUUGUUAGGACCCGAGAGGCUUUGAACUAAGCGUGAUGAGAUUGAAGUCAGACGAAAGUCUGAUGGAGGAUCGAGUUGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCAUUACAAUCACGUUUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAAAAGCCUAUUAGCUGGUUAUUUUCGAAAGAUCUCUCAGGAUCGCUGGAGUUGAGUUGAUUAUAAUUUUAUAAGGUAGAGACAAUGAUUAGAGGGUUUAGGGGAUUAAAUAUUUCUUAACCUAUUCUCAAACUUCCAAUAUGUAAAGAGGGUGCGAUAUCUGAAAAGUAUUUCACUUUGGCGUAAAUAAGAUAACUCCAAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGAGGGAUGCUCCUAACGCCUGGAUAAGGUGCCUAAAUAUUCGCUCAUGAGAUCCCAUAAAAGGUGUUGGUUCAUAAUGACAGUAGGACGAUGGUCAUGGAAGUCGAAAUUCGCUUAGGAGUGUGUAACAACUCACCUACCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGGCUAAAGCGAAUUACCGAUACCGGGCCAUAAGAAGGUAGAAAUUAUAAAUGUUAAUUUAGCUCAGAUCUUUUUAUGAGUAGAAAAUCGUGGGGUUUGUGUUGAAGCGAAAUACGUGAGUUUUCGUGGAACAUCUCCCUAGUGCAGAUCUUGGUGGAAGUAGCAACUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGUGGAGAAGGGUUUCUUGUCAACUAUGUUUCUACAAGAGUUAGCCACUCCUAAGGGAUAGCUGAAAAGUGUUUAAAAGAAGUAAGAUAUUAUAUGGAAAUAUAUAAUUAGAUCUUCGUCUCAAAAGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUGCCAAAUAGAAGUAAGGGUGUGAAUAAAGAAAGAUGGUAACAUACAUACAAAUGAACUCCUUGACAUAGGUUUUACGCUCGGGGUGCGUUAUCUUUGCACUUUAAUUUUAUAGCAAACCUUGGAAUCAAUUUAUUUGGAGAAGAGGUUUGUUGAACUCAAUUCAAAAAAUUUAUGGCUGGGUUUUCGGAUUCAGUUCAUUUUAUUUUUUGUUUUGUAGCAAUAGUAAUUCGUUUUUAUGAAUUAUCCGAAGUGGUAAAAACUAUCCUUGAAAAAAGGAGGGAACGGAGCAUAUACAGAAGGGAAUUUAAUUAUUUUUUUUUUUGAGUUACCUUCUUAUGUGAAAUACUCUUAUAUUCAAUCAAUAAUGAGUGUACCCAAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUUAGUAGCCUCUGGUUAAAUAGAAAAAAGUAAGUAAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAAAAGGGUUGGCUCUGAGGACAUUAGAAAAGAGAAGAAAAAAAAGGGGGUUGAAAAUAAAAUUACAGAUUUAUUUGCUUUAUCUUUUCGAUUUGGUUGUAAAUUUGUUUUUCGUUUUUCUUCUUUGUUUUUAUUCUGUUCCUGUUUUCGCUUUCAUUUUAUUGUAAUUUUAGUUACUUAAAUUUUUUGAUAUAUAUAAUGUUAACUCAGAACUGAAACGGACAAGGGGAAUCCGACUGUUUAAUUAAAACAUAGCAUUGUGAAAAACCAUAACUGGUAUUAACACAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUUUGAAUGUUAAGUUGAUGAAAAAUUCAAUUAAGCGCAGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUACUUGCUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAAAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUUACUCUAGUCUGGCUUUGUGAAACGACUUAGAAGGUGUAGUAUAAGUGGGAGUACAAAGAAGGGAUCGAAAACUAAUUCGAUCUUUAUGUUUUUGUACACAAAUGAAAUACCACUACUUUUACAGUUGUUUUACUUAUCUAUUAAUAGGGAAAUAUAUUAUGCUUUAAUUCUUUGUGAAAAAGGCAUUCUGAUAUUAUUUGAAUUUUUAAGAAACUUGUUUCUUAUAUUUCUCCCAUUUCUAUGGAGACAUAGCCAGGUGGGGAGUUUGACUGGGGCGGUACAUCUGUUAAAAAAUAACGCAGAUGUCCAAAGACAAGCUCAAUGAGAACAGAAAUCUCGUGUAGACUAAAAGGGGAAAAGCUUGUUUGAUUUCUAUUUUCAGAAAGAAUAGAAAACGUGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAUUUUUGCAAAAUGUAUUAAUAACAUUCUGACUGUGCAUAUAAAGGUGUCUGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCUGCCAAGCGCUCUUAGCGACGUAGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGGGACGCAGAAAGUCUCAAAGUGUCGGAUUGUUCACCCGCUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUUUUAUUAUAUAUUUUAUAUAUAUAUAUACAUAUAGUAUUGUGACAGUAAUCCAACUUGGUACGAGAGGAUUAGUUGGUUCAGACAAUUGGUACAGCAAUUGGUUGAUAAGCCAGUGUUGCGAACGUAAGUCUGUUGGAUAAUGACUGAACGCCUCUUAAGUCAGAACCCAUACUGAUUAGACAAUUUUAUAUUGUUCUUUUUGUUUAAAUAUAAAAAUAUUAUUAUUUUUUUUACUGCUAAUGUAAAUGAGAAAUUAUACAUAUAUUAGAAAAAAAAUGUAAUUAAUUGUUUUUUUUUCGCUUUAUAAUAUAUCAAUAAUCCUAUCUUUUUAUAUAUAUGUAUGUGUAUACAUAUAUAUAUAUGUAUAUAUAAAUAGAUUGUAAUUUAACAACAAAAAGUGUUAAGCAUAUUGUAGACGACUUUUCAGUCUCAGAGUGCUGUAAACAUGAGAGUAAACUAAGUUUUACGAUCUGUUGAGGCUUAUCCCUAGUGGUAAAGUGUUU |
|
[ reference structure ]
|
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.....((.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((.(((((((...((((.(((((.((((..(((((.((((..((((((((((((((...(((.....)))..))))))))))))))))))...)))))..)))).))))).))))..........................(((((....))))).......))))))).......)))))..)))))))))(...).......(((((((((..((d....(....D))..(((((((((...((((....))))..)..))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((......)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....))....(((((........)))))..<<<<<<<<.<<<.<<......<<<<.<<<<<<<.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ccccc..((((((((.((((((((((......))))))))))....)))))))).......)).).CCCCC)))))))).))))))))))...(((((.....(((((((((...((((((......(((....)))))))))....)))))...........(((((((....)))))))......))))......))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))<(bb....bbbbbb((.((((((.......))))))...))bb)(.(((BB....BBBBBB....(((((((({....(..})))))))).(((....))).BB))).).....<<<<<<...<<<.))))))....................>>>.>>>>>>....>)...>>>>>..>>>>>>........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((.......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....>>..>>>>>>>>>>>...................................((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((...(((((((((((....))))))..)))))...))).))))).(((....(((((............)))))....))).)))).....))))))))......(((((((((((.......(((((((....))))))).......................((((((((((((((.......................................))))))))))))))......................(((((((((((((....)))))))))))))..................)))))))))))..((((((((((.......)))))..(((((((((.((..(..(((.(((((((((......)))))))))))))...))....)))).)))))..)))))..
|
| [ predicted structure ] |
...............(((.[[[....)))..]]]....(((........))).(((...)))....((((........))))....(((.[[[[[[.))).........((((....(((((((((((.(((....))).))))....)))))))...)))).........]]]]]].(((((...........[[[[[..[[[[..)))))..]]]]..]]]]].(((((((((((((.....((((((((.(((((((.((((............)))).....((((((((((((((((((((.......))))))).)))))).))))))))))))))...)))))))).(((((((((..(((((((......[[[[[[[[[[...........(((((....))))))))))))..((((.....))))........]]]]]]]]]]..........))))))))).........(((((((((((...)))))))))))...((((((.....(((((((......)))))))..((((...................))))..............................))))))....................(((((..[[[[....))))).....]]]]............(((((((((((.(((((((..((((...))))..))))....))).)))))))))))........(((((((((((((((((((................((((((((((((((((((......((((((..(((((((((((((((((..(((.....(((((((((((.....)))))).))))).........)))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))))...(((.[[[[[.))).((((....)))).]]]]]..........(((((((.(((((..(((((((((((((((.(((((((....))))))))))))))))))))))....))))).)))))))(((((((.......[[[[[[[[[[[[[.....((((....)))))))))))..]]]]]]]]]]]]]..........................................((((........)))).......((((((((((((((.......(((.[[[[[.)))....]]]]]...............(((((.....)))))......((((...((((((((((((...[[[..)))...))))))..))).)))).........]]]...((((((......))))))........)))))))))))))).......(((((((...(((((((((((.....(((((((((((....))))))).......(((.(((.(((....)))))).))))))).....))))))))))).[[[..............)))))))....]]]..)))))))))....((((((((...((((((((((((((((((((((..((((((...))))))...)))))))..(((((.(((((((.....)))))))))))))))......(((....(((((....((((((.((((.........)))).)))))).)))))...))).))))))).)))))((((.(((((.....))))).))))..))))))))..(((...[[[[[)))..]]]]]........))))))))))(((((((((....(((((((((.....(((((.....[[[....)))))....]]]..(((((((((..((((..[[[...))))...]]].........((((((...........))))))))))))))))))))))))....(((((((((((........(((((....)))))......)))))))))))...........)))))))))(((.....[[[[[[)))......]]]]]](((.[[[[)))..............]]]]...................(((((..((((((.(((...(((((((..((((.......))))...))))))).....(((((...(((....)))..)))))..))).)))))).((((......((((((((....)))))))).....)))).)))))...(((((...[[[.....)))))..]]]............(((((((((............(((.[[[...)))..]]]....(((......))).)))))))))((((((((.......))))))))............(((((((((.........((((((........((((((....(((..((((((((..(((((((((((....))))))).))))...))))))))..)))...))))))((((((((....))))))))))))))(((((........(((((.....)))))(((...((((((((((.((((((.(((((((............))))))).)))))))))))).....))))((((((((........)))))))))))....)))))........)))))))))..((((.[[[[))))..]]]]....((((((((......((((((........((((......))))......))))))((((((((((((((((((....((((.......((((..(((((.......((((((((((..(((..(((.....)))..))).)))))))))).......)))))..)))).......)))).......)))))....(((.((((..(((((....))))).)))).....)))......)))))))..))))))........(((((..(((((((..(((.(((....))).((((((((((((....((((....)))).....)))))))..(((((((((...(((((....((((.((((((........)))))).)))).)))))...)))))))))..)))))..........)))..(((.((((..((((((.......)))))).))))...)))........)))))))..))))).)))))))).(((............[[[[[[))).....]]]]]]....(((((((((........)))))))))......((((((((.((((((((((((((((((((((((((..((((........(((((((((((((((((((......))))))))))...))))))))).........)))))))..)))))).)))))))))))((((((.......(((((((((...(((((((..(((.....))).)))))))....)))))....(((....(((((((....)))))))...)))))))....(((((....)))))..)))))))))))).))))))))....((((((((...........))))))))....(((((((((..((((((.......)))))).[[[[.............)))))))))....]]]]((((((((....((((...((((....))))...))))....(((((((...((((.(((((.......))))).......)))).)))))))..)))))))).......(((......)))(((((.[[[[[[)))))............]]]]]]............((((...[[[.....)))).(((((((.......)))))))]]]..(((...[[[[[[)))............]]]]]].((((...(((((((....))).))))......))))................(((((((.....)))))))....((((......)))).((((.(((((((....((((.....((((((((.......)))))))).(((((.((((((....)))))))))))....)))).....)))))))....))))...........((((((........)))))).((((((.....)))))).(((((((......))))))).(((((.(((((((((....((((((((.((((....))))...))))))))))))))))))))))...)))))))))))))..((((((((((............((((.(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))).)))).....(((((((........))))))).)))))))))).(((.[[[[[))).(((....)))......]]]]](((((......))))).........(((.[[[[[)))...]]]]].......
|
|
CRW_00529
|
[ FASTA input ]
|
AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUUGUUUGACCUCAAAUCAGGUAGGAGUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAAUAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGAUUGCCUUAGUAACGGCGAGUGAAGCGGCAAAAGCUCAAAUUUGAAAUCUGGUACCUUCGGUGCCCGAGUUGUAAUUUGGAGAGGGCAACUUUGGGGCCGUUCCUUGUCUAUGUUCCUUGGAACAGGACGUCAUAGAGGGUGAGAAUCCCGUGUGGCGAGGAGUGCGGUUCUUUGUAAAGUGCCUUCGAAGAGUCGAGUUGUUUGGGAAUGCAGCUCUAAGUGGGUGGUAAAUUCCAUCUAAAGCUAAAUAUUGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACAGUGAUGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUACGUGAAAUUGUUGAAAGGGAAGGGCAUUUGAUCAGACAUGGUGUUUUGUGCCCUCUGCUCCUUGUGGGUAGGGGAAUCUCGCAUUUCACUGGGCCAGCAUCAGUUUUGGUGGCAGGAUAAAUCCAUAGGAAUGUAGCUUGCCUCGGUAAGUAUUAUAGCCUGUGGGAAUACUGCCAGCUGGGACUGAGGACUGCGACGUAAGUCAAGGAUGCUGGCAUAAUGGUUAUAUGCCGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAACGUCUAUGCGAGUGUUUGGGUGUAAAACCCAUACGCGUAAUGAAAGUGAACGUAGGUUGGGGCCUCGCAAGAGGUGCACAAUCGACCGAUCCUGAUGUCUUCGGAUGGAUUUGAGUAAGAGCAUAGCUGUUGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAAUAGGGUGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGUAGCGGUUCUGACGUGCAAAUCGAUCGUCGAAUUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCAGAAGCUCGUAUCAGUUUUAUGAGGUAAAGCGAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAUGUAAGAAGUCCUUGUUACUUAAUUGAACGUGGACAUUUGAAUGAAGAGCUUUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGAACGUAGAGUUAAGGUGCCGGAAUACACGCUCAUCAGACACCACAAAAGGUGUUAGUUCAUCUAGACAGCCGGACGGUGGCCAUGGAAGUCGGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCGGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUCAAGCGUGUUACCUAUACUCUACCGUCAGGGUUGAUAUGAUGCCCUGACGAGUAGGCAGGCGUGGAGGUCAGUGACGAAGCCUAGACCGUAAGGUCGGGUCGAACGGCCUCUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGUGGGGAAAGGUUCCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGAUGGGGAAGCUCCGUUUCAAAGGCCUGAUUUUAUGCAGGCCACCAUCGAAAGGGAAUCCGGUUAAGAUUCCGGAACCUGGAUAUGGAUUCUUCACGGUAACGUAACUGAAUGUGGAGACGUCGGCGCGAGCCCUGGGAGGAGUUAUCUUUUCUUCUUAACAGCUUAUCACCCCGGAAUUGGUUUAUCCGGAGAUGGGGUCUUAUGGCUGGAAGAGGCCAGCACCUUUGCUGGCUCCGGUGCGCUUGUGACGGCCCGUGAAAAUCCACAGGAAGGAAUAGUUUUCAUGCCAGGUCGUACUGAUAACCGCAGCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUAGUUGAUAGAAUAAUGUAGAUAAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUAAGGGUCGGGUAGUGAGGGCCUUGGUCAGACGCAGCGGGCGUGCUUGUGGACUGCUUGGUGGGGCUUGCUCUGCUAGGCGGACUACUUGCGUGCCUUGUUGUAGACGGCCUUGGUAGGUCUCUUGUAGACCGUCGCUUGCUACAAUUAACGAUCAACUUAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCUGACUGUCUAAUUAAAACAUAGCAUUGCGAUGGUCAGAAAGUGAUGUUGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGAAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCCAGUGAAAUACCACUACCUUUAUAGUUUCUUUACUUAUUCAAUGAAGCGGAGCUGGAAUUCAUUUUCCACGUUCUAGCAUUCAAGGUCCCAUUCGGGGCUGAUCCGGGUUGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAACGAUAACGCAGAUGUCCUAAGGGGGGCUCAUGGAGAACAGAAAUCUCCAGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCCCCCUUGAUUUUGAUUUUCAGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGUCCCUCGGAAUUUGAGGCUAGAGGUGCCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUGUUACCGCAAUAGUAAUUGAACUUAGUACGAGAGGAACAGUUCAUUCGGAUAAUUGGUUUUUGCGGCUGUCUGAUCAGGCAUUGCCGCGAAGCUACCAUCCGCUGGAUUAUGGCUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUAGAACGCGGUGAUUUCUUUGCUCCACACAAUAUAGAUGGAUACGAAUAAGGCGUCCUUGUGGCGUCGCUGAACCAUAGCAGGCUAGCAACGGUGCACUUGGCGGAAAGGCCUUGGGUGCUUGCUGGCGAAUUGCAAUGUCAUUUUGCGUGGGGAUAAAUCAUUUGUAUACGACUUAGAUGUACAACGGGGUAUUGUAAGCAGUAGAGUAGCCUUGUUGUUACGAUCUGCUGAGAUUAAGCCUUUGUUGUCUGAUUUGU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((.....(((..((((((((((.......(((((((........))).......(((......................)))......))))...(((...)))(((((((((....))))))))).((((((((((((.((((......)))))))))).))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((..((((((((((((((((((...))))))))))))))))))....(((((((.((((((((((((((((((((...(.((((......)))))(((...).bbb.....))BBB....))))))))..))))))))....)))))))))))........(((((((........))))))).....(((((..[[[[[[)))))..))))......).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....))))))))))...(.((((((((((((....(((((...((((..((((((((.....))))))))......))))...))))).(((((((((((((((((((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....))))).))))))))))).......(((....))).....)))))))....))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((((.....))))..))))...((....)).......(((((..(((((....)))))...))))).((((((((...((....))...))).))).))....)))))))))))))..((((...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...((((.((.((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......))))..((((((....(((((....))))).(((((((((.......((((((((..(.(((....((((((((((..((((((((.....))))))))))))))))))..)).).)..)))))))).(((((((((.........)))))))))...........)))))))).)...((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...(((((....{.{{{{{{.................(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))...........))......}}}}}}})))...)))))))(((((((((.........)))))))))....))))))(.((((((((.((......((((.((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((.....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((<<<.((...(((((.(((....))))))......(((((........))))).....))....))...(((((........)))))))((((.(((((((.....(((....))).......((((((...((((.(((((((.(((((((((.........))))))...(((((((..(((((((((((((.....)))))))))))))..)).)))))......(((((((....)))))))..)))...))))))).)))).........))))))............))))))))))).>>>..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((((((((((.((((((((.(((((((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))).))))))....))))))))).(((((.....)))))....))))))))......)))))..)))))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((..((((.....))))..)..))))))))..((((.(((..((((((.(..(((....(((((....)))))....))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))...(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ggggg..((....)).......)).).GGGGG)))))))).))))))))))...(((((.....((((..(((((......)))))...............((((((....))))))..))))..))))).....)))))))....))))..((((.....))).)((((((...........))))))((dd....dddddd((.((((((.......))))))...))dd)(.(((DD....DDDDDD.....(((((((a...(...A)))))))..(((....))).DD))).).....((((((..((((.]]]]]]))))))))))...))....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))..((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))...)))..))))).(((....(((((...........)))))....))).))))....)))))))).......(((((((((((((................((((((.....))))))...............((((((((..(((((((((((......))))))))))))))))))).............)))))))))))))..((((((((((.......)))))....(((((((((.((..(..((((.((((((((......)))))))))))))...))....))).))))))..)))))..
|
| [ predicted structure ] |
..............(((((....)))))((((............[[[[))))..]]]]....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....))))))))).((((((((((((.((((......)))))))))).)))))).((((..[[[[[..)))).............]]]]]..............((((((.(((((..........[[[[[..[[[)))))..]]]...]]]]]...))))))..((((.....((((((....)))))).(((((((.(((((((((((((((((((((.(((((....)))))))))((((((..((((....))))..)))))))))))..))))))))....))))))))))))))).((((((((((........)))))))....(((((((......)))))))..[[[[.............)))...]]]]...........(((.....(((((........((((....)))).(((......)))...............(((...(((((.((((((....(((((...((((.(((((((((.....))))))))).....))))...))))).((((((((((((((...((((((......((((((((..((((((((((....))))))..)))).))))))))....))))))....))))).........(((....)))...)))))))))....)))))).))))).))))))))....)))((((......)))).....((((((..((((.(((((.....))))).)))).........(((......[[[[[[.(((((....))))).)))..]]]]]]....(((..[[[[.)))..]]]]..........))))))...(((..[[[))).....]]]...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))....(((((..[[[[....)))))..]]]]..)))))))))))).........((((...[[[[[[..))))...]]]]]]........(((..[[[[[....))).((((((......)))))).]]]]](((((....(((....((((..((((((((...))))))))))))....)))..)))))......((((..[[[[.[[[[.))))....]]]].]]]].............((((..[[[..((((....))))))))...]]].......(((.[[[..)))..]]].((((.......[[[[.......))))....((((((......)))))).(((......)))..]]]]..((((((((((((((((((((((.(((...((((........)))).((((((((((........(((((..............(((((......(((....((((((((((((((.........))))))))).)))))...(((((((((((.........((((.((((....)))))))).....)))))))).)))........(((((.........(((((........((((((.(((((...((((.........((((((((((....))).)))))))((((((...((((....(((((.(((((...)))))...((((((........)))))).)))))....)))).(((((........))))).(((((...((((((.(((((((..((((......))))......((((.(((((((.((((((((((....)))))).((((..(((((....((((((...((((.....))))...)))))).....))))).))))((((((((....))))))))))))...))))))).)))))))))))))))))..(((((......)))))...)))))....))))))..))))....))))).))))))...((((.....))))...)))))..(((((((.((((.(((...........((((......)))).(((...)))..(((((((((((.((((((((.(((..((((....(((((((((((((..((((.(((((((((((((....))))))))))))).))))..))))))).))))))....))))..))).(((((.....)))))....))))))))......)))))..)))))).........)))...((((((((....(((((..........(((((((.......((((((...((((((...))))))..))))))..))))))).......(((...((((....)))).....(((((((((...(((((((((.......))))))........)))...))))).(((((.......))))))))).))).))))).....))))))))....)))))))))))...........))))).....)))......)))))......(((((((((........)))))))))..(((((((....((((....(((((((((((((((((((((.....((((....))))..)))).((((......)))).))))))).))))))))))....))))((((..((((((((((......))))).)))))....)))).((((((....)))))).....)))))))........)))))......)))))))))))))...((((((((...........))))))))....(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))))))))))))))))(((....)))....(((....)))))))).......(((((((..((((((...))))))))))))).)))......((((...(((......)))[[[[[))))...]]]]]..(((...[[[[[[[[.....))).....]]]]]]]](((..[[[.....(((((((......))))))))))...]]]..((((((.......[[[[[...))))))........(((((((....))).)))).......]]]]]((((.....[[[[[[[[.........((((((...............)))))).)))).....((((((((((((((((((....)))))..)))))))))..)))).....((((((.(((((...........))))).)))))).........]]]]]]]].......((((((.........((((..........((((((.....)))))).[[[..))))..]]]((((((((....(((((.(((......)))...))))))))))))).....((((.......))))))))))......((((((.........)))))).(((((((((((((.....[[[[[[))).))))))))))......]]]]]]...........................
|
|
CRW_00530
|
[ FASTA input ]
|
AAAUCUAAAUAUUAACAAUACUGGUGAAGAUCAACAUAAAAAGUAAAACAUACCUUUUGCAUAAUGGUGAUACUAAAUUUAUUCUAAGAUUUUAUAUUUCCCGAAAAUAAAAGAUCUAACUUUUCAUGCGAAAUUAUUAGAACACAAAAUCUAUUGUGGCAUAAAUAGACCUCAAUGAAAAGUUAGUAGUGAAACACUUUCACUUUUAUUGAUAUCUGGAUAUAGAAUAAAUAUAUUUAGUAUAUAAAUACAUUCUUAAAGCGAUAAGGUUUUAAGCGAAGAAUUUUAUAUAACAGUAAAAAUUUCUAAUUAAUAAUAUUAACUGGUAGUUUUAUUGAUAUACAUAUAUUUAUAUAUUAAAUUCCUUGAAAUUCUAUUUAUAUAUUACAACCGGUCAGUAUACUAAUAAUGUAUCAAUUAGUAAAUAGGUAUAAUAAAUAUUAGUAAGGAACUCGACAAAUAAUUGCUUACGACUGUUUAUCAAAAACAUAGCCAAAAGUAGAUAUUUUUGGUGUUAUCUGCCCAGUGAAAAAUUUUAACGGCCGCAGUACCUUGACUGUGCAAAGGUAGCAUAAUAAUUUGACUUUUAAAUGGAGCCUAGAAUGAAAGAAAGAACGUAUGCAACUUGUCUCAUUGAUAUUACUUUAAAUUUAAUGGUUGAGUGAAAAUACUCAUAAUUUUAAUAAUAGACGAGAAGACCCUUAGAAUUUUUAAAAGCAAUAAGUAAUUCUUAUUAGAUUUUUUGUUGGGGCAACAAUAUUUCAAAUAAUAAAUAUAUUAAUGAAAGUAAUAAGUCGAUUAAAUAAUUAUAGAAAAAUUACCUAAGGGAUAACAGCAUAAUUUUAUUAAUAAGCUUGUGACCUCGAUGUUGGACUAGGUACUAUUAAGGCUAAUCGUUUUAAUAUAAUAUGUUCUGUUCGAACUUUGUUACCUACAUGAUCUGAGUUCAGACCGGCGUAAGCCAGGUCAGUUUCUAUCUUUUAUCUGGCCUAUAAUAGUACGAAAGGACCUUAUAGGCACUUAUUCAUAAGUAUA |
|
[ reference structure ]
|
........((.((.......((.....))...)).))...(.((...))..((((........))))((((((.......((..(((....))).))..((.(...((((((...((((((((((((....................((((((((........))))))))..).))))))))))).(((.....))).....))))))......).))..((((((....(((((.....)))))......((((((((((......))))))))))....(((......))).................(((..(((.(((..........))).)))....(..((......)).).)))........))))))(..((((((((.....)).))))))..).....))))))((.....((.....((.....((((((((.(((..............(((((((((..(([....(....]))..((((((((......))))))))..((((.(((..(((((...)))..)))))((((((......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)))))))))....))).))))))))..)))).....)))...(((((........)))).).....(((((.(((.((......(((((((((((..((((((((((((.....))))))))))))..((((.....))))((((((........))))))(.............(((......))).....)......)))))..))))))........(((.((((.......)))..))))..........(((((((((((..((.(((((((....)))))))...))..((((.....)))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..))))))))...((((((((...............))))))))(((((....)))))...
|
| [ predicted structure ] |
............................((((..........((((((......)))))).....(((........((((((((((.(((.....)))(((....((((((((..((((((((((((......(((((....(((((......))))).....)))))......))))))))))))...(((((...))))))))))))).......)))..)))))))))).....(((((((((((((....((((((((......))))))))....((((((((((((.((((((((....(((.(((((...))))).)))...)))))))).)))).....(((((.....)))))....)))))))))))))))))))))..)))))))....(((((((..[[[[[[.)))))))....]]]]]]..........(((((..................)))))..((((((((((((......(((((((((....)))))))))((((((((((...((((....))))..)))((((((......))))))...))))))).......)))))....))))))).......(((((((.........(((((..(((((((((((((.(((......)))))))))..((((((....))))))..(((.....))))))))))....((((((((((((((.......((((.((((((((((((......((((((...))))))..(((((..(((((....))))).))))).)))))))..))))).....))))..)))))))..)))))))......))))).)))))))....((((((..[[[[))).))).....]]]]..(((((((((.....)))))))))...(((((.......[[[[[[........)))))....]]]]]].(((((((....))).))))........((((((.....[[[[[[[[.......))))))..]]]]]]]](((((....)))))...
|
|
CRW_00532
|
[ FASTA input ]
|
AUACUCAUUUACAAUGAGCAAGUUCCUAAUUGGAAGUUUUAUUAUAUUACAAUUGCAUUACAUUGCUGUAUGAGAUUACUAUAUCAAGUAAAUCGUACCUUUUGCAUAAUGGUGAUACUAAACUACUAUAAAUAUUUUAACUCCCGAAAAUAAAAGAUCUAAUUUACCAAUAUGAUAUUAGAAAAUUAAGUGCUAUUGUGGCAUAACUAGCAUUAGAUGGAAAAUUAGUAGUGAAACGCUCUCACUUUUAUUGAUAACUGGAUAUAGAAUAAAUAUAUUAAGUAUAAAAACCAUUCUUGGAAGCGAUAAGGUUACAAGAAAUGAAAUUAUCAUGUUGUAAUAUCCAUCACUAUUUAAUAAUAUUAGUUGGUGAUAUAUUUUAUACACAUAAAUUUAUUAACUAAAUUCAUUUAUAUUCUAUUCUACUAUGUAUUUCAUUAGUGUAUUGAUAAUGUAUCAAUUAGUAAAAUUUAUAUUUAAAAUGUUGAUAAGGAACUCGACAAGAUAAAUGUUUACGACUGUUUAACAAAAACAUAGCCAUUAAGAGAUGUUUAUGUGUUAUCUGCCCAGCUGAAAACUUUAACGGACCGGCAGUACCUUGACUGUGCAAAGGUAGCAUAAUCACUUGACUUUUAAUUGGAGCCUGGAAUGAAUGAAAUAACGUAGACAGCUUGUCUCAUUAAUAGUACUCUUAAAUUGCUAUAGGAGUGAAAAUACUCUUUAAUUUAAAAAUAGACGAGAAGACCCUUAGAAUUUUGAAAAUGUAAAAGGUAUUUCUUUUAUAAAUUUUUGUUGGGGGAACAAUAUUUCAUGUAAUAAAUAUUAUAUAGAAUGAUAGGUCGAUUUAAUAAUUAUAGUUAAAUUACCUAAGGGAUAACAGCAUAAUUUUAUUAGAAGCUUGUGACCUCGAUGUUGGACUAGGUACUAUUAAGGCUAAUCGUUUUAAUAUAAUAUGUUCUGUUCGAACUUUACUACCUACAUGAUCUGAGUUCAGACCGGCGUAACGAGGUCAGUUUCUAUCUUUUUAUUUGCUUACAAUAGUACGAAAGGACCCUGUAAGCACUUUUCUAAAGUAUA |
|
[ reference structure ]
|
.....((...((............((.....))..))..........................))........(((((((......))).))))..((((........))))((((((........((.((....))))...((.(...((((((...((((((((((((...................((((((((........))))))))..).))))))))))).(((.....))).....))))))......).))..((((((....(((((.....))))).....((((((((.((......))))))))))....(((......)))...((((............(((..(((.(((.........)))..)))....(..((......)).).))).....))))....))))))(.((((((.....))))))..).....))))))..............(((.....((((((((.(((...............(((((((((..(((.........)))..((.(((((......)))))))..((((.(((..(..((....))...))).)(.(((((......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)))))))))....))).))))))))..)))............(((((........)))))......(((((.(((.((......(((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..((((.....))))((((((........))))))............((((....))))............)))))..))))))........(((.((((......)))..))))..........(((((((((((..((.(((((((....)))))))...))..((((.....)))).....)))))..)..)))).).....((((((.....)).))))....))..))))))))...((((((((...............))))))))(((((...)))))...
|
| [ predicted structure ] |
...((((((...))))))....(((.[[[[[[)))..............]]]]]]...(((.[[[[[)))...(((......))).]]]]]...(((((((((((((..((((........)))).((((((((((((........))))).......((((((.((((((.((((((((........(((((((((((...)))).))))))).((((((........(((((.......)))))(((((((...(((.((((((.......)))))).))).......(((....)))...)))))))(((((((...((((.....)))).))))))).)))))).........))))))))))))))((((((((..((((((((((((..(((.....)))..)))))).............(((.....)))..))))))....))))))))))))))....)))))))((((((((.....(((((..(((((((((.....((((((((..(((((.....))))).....((((((((....((((((.....(((((...(((..........)))...)))))((((((.........))))))))))))........))))))))........................)))))))).))))))...............((((((((....(((((((....)))))))))))))))........))).....)))))..)))))))).)))))))))))))................(((((.........(((((.(((((((....))))))).))))).(((((.((((((((.......)))))))))))))........))))).........((((((((...((((((((((((((..((((((.(((((((((.....)))))))))(((...((((.....)))).))).)))))).....((((....)))))))))))..)))))))))))))))(((((((...[[[[[[[[.......)))))))...]]]]]]]]...............
|
|
CRW_00533
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUUUUACUUGUUUAAAUAUUGGUAUUGCAUACUAUUACAAUAAAAUUUCAUGUUAAUGAAAAAUAGAAACAAAGGGUAGAGUAAAUAUUAGUUUUAUUGUUUCAUACUAAAAAUUAUAUUUAUUAGAGUUGAUAUGUCGACCUUUGUGAUAACUGUUUUUAUUUUUAUAUUAGAAAAUUAUAUAUUAUAUAAUUAUUUUAGGAAAUUUAAAAUUUGAAGUGUUUUAAAUUUAUGUUUUACAACAUUUUCCUAAUUUUAUUUAAGUUUAAUUUUUAAUUUAAUAAAGUUUUAUUAAAUAAAUAAUUUGUAAAUUAGUAAAUUUUAUAAAUUUAAUUUAUUAUUAAAAUAUAAUUGAAGAACUUGAAGUCUUGAUCAAAUGUUUUUUAAAGACUUAGGCUUUAUAUUAAAGCUGGCUUCUGCCCUAUGAUAUUUAAAUGGCAGUCUUAGCGUGAGGACAUUAAGGUAGCAAAAUAAUUUGUGCUUUUAUUGAGUUCCAGUAUGAAUGAAGUUAUUGGUUAGUUCUAUUUAUGUUUUAUGUUUGAAUUUAAUUUUUAUUUAAGAAAAAAUAAAUAUAUUUAUACAAAGAUAAGUCUUCGGAAAUUCUGUUAUUACACAAUUAAAUAAUUGUGUAAUAAAUUUUCUAGGGCAGAAUAUUAUAUAAUAGUAUUUCACUAUAUUUAAUUUAAAGAAUUACUCCGGAGUUAACAGAAAAUCAUACCUAAUCUAGUACUUAUAGUAAGGUAAGUUUUACAUCGAUGUUGUAUUCAGAUAAUCUAAGAGAGGAGAAGGCUUAGUAGUUUAGACUGUUCUUCUAUUAAUUAAUCUGACGUGAUAUUAGUUUAAUUCAUUGUGAGAUAGAAUUGUUUAUCUUGAUAAAUAUUUAUAUUUAAUACAUUUAGUACGAAAGGAACAUUGUAAAAGUUUUAAACUUUAAAGAUUUUGAAAUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
......................((((.......))))((((((.....((((((....)))))).((.(...((((((...((((((((((((.(((((((.......))))))).))))))))))))..(((.....)))..))))))......).))...........................................(((((.(((..(((.......)))..)))...(.((......)).).))))).......................(.((((((((....))))))))..).....))))))..........................................................(((((((..(((.........)))..((((((.....))))))..((((.(((..((((...))..)))))((((((......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))....)))))))................................(((((........)))))..((((((((.(((.((......(((((((((((.((((((((((((((....))))))))))))))..((((.....))))....................................)))))..))))))........((((.((((((.....((.......))....))))))))))..........(((((((((((..((.((((((.....))))))....)).(((((.....))))).......)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))).........(((((((...............)))))))(((((...))))).(((((((....)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.((((........((((((...))))))..))))))))))))....(((((((((((((((((((((((((..(((((((((.((((((..(((...)))...))))))))))))))).....(((....)))))))))........))))))))))))).))))))..((((((((...))))))))...((((((((....(((((((((....)))))))))(((((....)))))))))))))......(((((((........)))))))....((((((...(((((((((((((((((.........))))))))))..)))))))..))))))....(((((((((.[[[[[[[[.........)))))))))......]]]]]]]].......(((((...(((((...(((...)))...)))))..)))))...(((((...((((((.((((....))))))))))...(((...((((((..........)))))))))))))).....((((((.(((.(((((......(((((((......)))))))...))))).)))))))))...(((((((.......(((((((((((((....)))))))))))))......(((....(((((((((...)))))))))..)))....((((((...)))))).)))))))......................(((.[[[[[.)))..]]]]]..(((((((..(((((.....((((((........(((((((.....((((....))))....)))))))........))))))....))))).((((..(((.....((((((((....))))))))..((((((....)))))).(((.....))).)))..))))..)))))))............(((((((....)))))))
|
|
CRW_00534
|
[ FASTA input ]
|
AAAACAAUAAAGGUAAUAGAUAGUGUAUAUUUAUUUAGUGAUUUUAUUAAAUAAUAGUACUGUGAAGGACACUAUGAAAUUAUAACUAUGCCAAUACAAUAAUAAAUUAUUAUGUACCUUUUGCAUCAUGGGUCAGCUACUUAAUAAACAUAAAAAUAAAUCAAAUUUAAAUGUUUAUUGGACCCGAAACUGCUACGAGCUUGUUAUUAAUAAGUAUGAUAUAACAUGACUGAACCGGUGUCUGUAGUAAAAGACUCGGAAGAUUAAUAACAAGGAGUGAAAGGCUAAUCAAGUGCAGUGAUAGCUGGUUCCCGGCGAAAUCUAUUUAGGUAAAGUGGUAAUCAAAGACAAUUAAAGAUAUAUAAUAAUUGAUCUAUAAAUACUAAUCAGACAUAAAGCGGUAAGGUCUUAUGUCAAAAGGAAAAAAGUCCUAAAGUGAAGUUAAAGUCCCUAAUUGUUUUUUUUUAAAGAAAAUUUUACGUAUUGUAUAAAGAUCUCAUAAAGAUUAGCUUAGAAGCAGUUAUUCUAUAAUGAAAGCGUAGUAGCUCAUAUGUUUAGUACAGUAAGUAAACAAAUGUCCGGGAAUAAGAAAGAACUGAAACUCACUAAAAGAAAGUAAAAAGAAUAUUUCUUUUAGUAGCUGGGCGUUCUAUAAAAAAGAAUUUAUAUUUUAUAAAAAAAUAUAAGUAGUAUAAUGGAUACAUCAUAUAGAAUUGAGAUUGCUGACAUUAGUAACAAUAAGUUUAAUUAAACGGCCGAAAGUCUAAGGUUUUAUCAAGUGAAACGGUAUAUAUCAAAGCCGUACCACAAACCAACGCAGGUAGACUACAACAAUAUUGUAAGGCCAAGAACAAACUAUUUAUAGGGAACUCGGCAAAAUACGUAAUAGACUUCGGUUAAAAGACGCCUCUAAUAGAGGAAAAUAUAAAAGAUUGCUGCAACUGUUUACCAAAAACACAUGGCCAUGCAAACAAAACAAGUAUAUGGCCUGACACCUGCCCAAAGGCUAUCGGCAAACGGCAGCUGUAACUCUAACGGUUCUAAGGUAGCAAAACCCCUUGACGUUUAAUUGGCGUCGCGCAUGAAUGGUGUAAUGAUGGCAAUAGCUGUCCCAUAAAUAGAUUCUGUGAAUUUGAAUUACCCGUGCAGAUGCGGGUAUUUAAGCACUGGACGAAGAGACCCUAUGACACCUUUACAUGAUGAUAUUCCAAAGAUAAAUAGAUCUUUAUGUGGAAAAAGUAAUACAAUAAUAGAAAAAUGUUUGACUUUGUCGCGAAAUGUCCGUCGCAUGCGACGCGACAAAAACCACAAAUGAUACUAGAAAUUAGUAAAGGAAUAUACAUAUGUUUCACUGGGGCGGUGGUUCGUUAAAAAGUAACGCGAGCAAUCAAAGGCUUUGUAAAACCUAAACUAGAAAACAAAGCUUAACUGUAAGGAUCACAAGCCAAGCAGAUGUUCGUCUGGCGUGCGACGCGCUGAAAAGCAGGAAGUAAAGACCCAAUUAAAAUUGUCUUUUAAUUGAUCAACGGAUAAAAGGUACGCUAGGGAUAACAGGCUAGUACGCGCCUAGAGUUCAUAUCGACGCGCGUGUUCGGCACCUCGAUGUUGGAUCAUCGCGUCCUAAAGCUGCACAAGGUUUUAAGGGUUAGGUUGUUCACCUAUUAAAGCGGUACGUGAUCUGAGUUCAGAACGCUGCGAAGCAGUUCGGUUUCUAUCCGUGCUUAGUAAUGUGUGAUAUGUUAAGGAUUAUGAGUACGAAAGGACCAGUAGAUUCUAAACCUCUGGUGAAUUUGUUGUCAAAAAAGGCAUAGCAAAGAAGCUAAGUUUAUAAAAAAGCAUAAAACACAGGUAUAGUAUAUGAUAACAUAUAUGGAUUUGUAAGACUAAAAAGAGAGAUCUUAAAAAAAAGAAGAUA |
|
[ reference structure ]
|
((....)).............((....))..............................((....))...............................(((((.....)))))..((((........))))((((((....((((((((((.....(((((...))))).))))))))))..((.(...((((.((...((((((((((((.((((((......))).)))...((((.((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((.....(((((((((...........)))))).))).....)))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((...........(((((((..........(((((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...))))))))))))).................))))))))))...)))))))((((((((............))))))))....))))))(.(((((((.........((((((((((((......)))))..)))))))...........)))))))..).....))))))..............((((....))))((((....((((..((..((...))......((((..........))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))).((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((...)))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...........)..))))))))..((((.(((...(((((...)))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).))))))).....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.((.(((((.(((((...(((((((..((((((((.........(((((.....(((................................................))).............))))))))))).)).............)))))))...)))))..((((.....))))((((((...........))))))..((..((((((((......((.....))....))))))))..(((((((((......))))))))).(((((((.....))).)))).(((....)))..))..........(((((((((.....)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))..((((((((..((((..(((((((................)))))))((((((...(((....((((((((((....)))))..)))))....))).))))))......((((.......))))..)))).....)))))))).....(((((.......)))))........................
|
| [ predicted structure ] |
...........((((.((((((((((...(((((..((((...((((...))))...)))))))))..)))))))..........)))))))..((((.(((((...))))))))).............(((((........(((((((((..((((.......))))..))))))))).)))))......(((.....((((((((((((...((((......))))......((((.((((........))))))))...))))))))))))...[[[..)))...]]]..(((((((((.((((((((((......((((....)))).....(((((((.....((((((...........)))))).((((((...(((..((((((((((............)))))))...((((......))))....))))))....((((.......((((((((...((((...(((((.((((((((.......((((..(((.(((((.......))))).)))...))))(((((((........))))))).)))))))).)))))....(((((((......................(((((((((((............)))))))))))..)))))))))))..))))))))(((((((((((.....)))))))))))........))))......)))))).....))))))).....((((........((((....))))((((..........(((...)))..(((..(((((..........)))))..)))..(((......)))....(((((.....))))).))))........))))......)))))).))))......(((....(((....))).....)))(((((...)))))............)))))))))..(((((.............[[[[[[[......)))))....]]]]]]].......((((.....[[[[[[))))......((((((.......))))))....]]]]]]......(((((((...........(((((((((..((((......((((((....))))))))))...(((((((...)))))))...(((((((......))))))).((((((((.(((...(((((((.(((((.......(((((...(((((((((((((......)))))).(((((......(((.(((............))))))..((((((((.........((((....))))))))))))..))))).....((((((...))))))..)))))))...)))))....((((((((.((((..((((.....................(((((((((.....(((...)))...)))))))))..((((................)))).......((((((((((.....(((....)))..............(((((((((.....)))))))))(((....))).....))))))))))..))))..))))...))).)))))...)))))..((((((.((((((((((......))))))).)))))))))....((((((.....(((((((....(((((.....)))))))))))).(((.(((.((((....)))).))))))...)))))).))))))).)))))))))))..)))))))))..)))))))...........(((...[[[[[....))).......]]]]]...(((..[[[[.)))..]]]]((((.[[[..))))..]]].................((((((...(((((((....)))))))..)))))).........((((....))))...............
|
|
CRW_00535
|
[ FASTA input ]
|
AUAUGGCUGAAUUACUUGUUAAAAAUUCUAGAUAGAUAUUUGAAACAUCUAUUGUCUUAGUAAAGGCGAAAGAAAGGAAAAUUAAUAUUAAAGUACCGAGAGGGAACAAUAAAAGCUUCUAAAAAACAACUAAAUAGUGUACUUUUCGCAUCACGGCCUAGCAAGAGUAAAAUUUGAAUUAACUUUCUCGAAAGCCGGCGAGCUAUCUUUUUCUGGUUUUUUAGAACAUUUAUGCUAUUAAAAAUGUGGCAAAAUUUUAAUAAAAGGAAAAGAUAGCUGUAAUACGCUUUUCGCGCUGGUGAUAGCUAGUUCUUCCAAAAAGGUAUAUAAGUGCCGAGGCGAGUGAAAUGCCUAAGGCUAAAAAGCUAGCAAAGGUUUCCUCAGCCUAAAAAGACUUAAGGAUAAGCUUAAGUCUAAAACGGAAAAUAGUAGUGUUAUUAACUCAAUGUAGGCUUGAAACUAGCCAGCAUAUAAAGUCUGUUAUAAGAUAGUUCUAUAAGAAAAAAGAUUUAUUUACUCACCUCUCCGUAAAAGAAUGGAAGUAUAGUUUUUAAUAUAAAAACUUAUGCUAAUGCUAGGAUGAGUAUUUUACCAGUUGGUAUCGCGGGCUAAUACAUUAAAUUAUGCCCUAUUUUUCUAUAAAAACUUUUAAAUUAGGAAGAAGGAACUCGGCAACAAUAUGCCUCGCCUGUUUAGCAAAAACAUGGCUCUUUGAAAAAAACUAAUAAAGAGUCGGACCUGCCCAGUGAAGUUUUAACGGCCGCGGUACUCUGACCGUGCAAAGGUAGCAUAAUCACUUGCCUUAUAAUUGAAGGCUGGUAUGAAUGGUUUGACGAGGGCAUAACUGUCUCCUUCCUAAUUAUUAGAAUUUGACCUGUGGGUGAAGAGGCCCAUAUAAAACUGAAGGACGAGAAGACCCUGUCGAGCUUUAGAAGAAAGUAGGCUAAAAUAUAUAAGUAACUAUAAAGCUACUCUUAUUCAUUGGUUGGGGCGACAAGGGAACAAUAGAAGCUUCCCUUAAUAAAUAAACAUAUAUGUAAGGAUCCAGGAUUCCUGAUUACAAAAAUUAGUUACCGCAGGGAUAACAGCAUAAUCUUUUUUGAGAGACCUUAUCGAAAAGGGGGGUUGUGACCUCGAUGUUGGACUAGGAUAUCCCGAAGGUGCAGAAGCCUUCGAUGGUUGUCUGUUCGACCAUUAAAAUCCUACAUGAUCUGAGUUCAGACCGGCGUGAGCCAGGUCAGUUUCUAUCCUCAGUUUUUUACUCAGGCCUAGUACGAAAGGAUCGGGCUGGGGAAAAAAUUUCUAUAGUAGAAAAGAUAUAAUUUUUAACUUAAGAUUAUU |
|
[ reference structure ]
|
....((.......((..........................((....))...(((((.....((.....))....)))))...............((....)).....))........))......(.(((....)))..((((........))))((((((....(((((.......)))))...((.(...((((((...((((((((((((......................(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......)))))).....).))..((((((....(((((....))))).(((((((.(((((......((((....)))).......)))))))).))))...((((((((((......))))))))))..(((......))).........(((...(((..(((.........)))..)))...(...((......)).).)))...........................................))))))(.(((((((((...)))))))))..).....))))))((.....((..(((....)))((((.((((((((.......)))).)))).......))))......((.....((((((((.(((.............(((((((((..(([....(....]))..(((((((((.......)..))))))))..((((.(((..((((...))..)))))((((((......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).))))))))..))))....)))....(((((........))))).....(((((.(((.((......((((.(((((((.((((((((((((..........................))))).)))))))..((((.....))))((((((..........))))))(.(((.((....)).))).........((((...)))).....).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).((((.....)).)).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..))))))))......((((((((...............))))))))((((...))))...(((.(((((.......))))).)))..........
|
| [ predicted structure ] |
...((((.[[[[[....))))..]]]]]..((((...((((......(((.(((((((....))))))).))).....))))...))))...(((((....((((.......(((((((((.......(((....))).......((((....(((((....(((((((.(((....))).(((((((.....(((((((((((((((((((((......((((((..(((.((((((.......)))))))))))))))....))))))))))))))...............)))))))....((((((.((((......(((((....)))))(((((((((((..(((((...((((......))))..(((((((((...(((((..(((((((((......))))))))).....((((((((...(((.((((((((..((((.((((.......)))).))))...((((((......(((....)))..........))))))...(((((((((.(((((......)))))(((((((((((((...))))))).))))))......))).)))))).......)))))))).)))((((((((.......)))).))))))))))))..((((....))))..)))))....)))))...((((......))))..))))(((.....(((((..(((((((((...........))))))))).....(((...)))..))))))))...((((((......))))))...)))))......)))))))))))......))))))))))......((((((((.((((..........((((((((((...)))).........(((((((......))))))).......))))))........)))))))))))).....)))))))..(((....((((........)))).)))))))))).......)))))..))))...........))))))))).(((((....(((....)))...)))))((((...(((((((((((.......)))).....)))))))..((((((...(((((((((.........)))))))))(((((....))))).)))))).....)))).))))...)))))..........((((((((......))))))))...........(((.[[[[[.)))(((((((....))).))))..........]]]]](((((((((....(((((..(((.....)))..)))))((((...))))...)))))))))...((((((((......)))))))).
|
|
CRW_00538
|
[ FASTA input ]
|
ACCUUCCAAUAACAAUUACAAAUUUUUUAAUUCAAAACCCUUAUAUAAAUUAGUAUCCAAAAAAAACUUUAAUUUAAACAACAGUACUGUAAAGGAAUAAAUGAAGUACAGUAAAGUAUAGAUUAACACUAGUACCUUUUGCAUUAUGGUUUAACGAGAUUAUUUUAUAUUAUAAUAUCACUAGAAAAAAAAGGAGCUAUAUAUAAACUUUAUUAAUGUAGCAAAAUUAAAUUAAUGAUUUAUUUAUAGAAGUUAAAUGCAUGCCGUCUUUUUUGAUAGCUAGUUAAAAGAGAAAAGUAUAUAAGUACUAAUUUAAAUUACUAAAAAUUAUUUUUUAAUAUACCGUAAUUUAAAUUACAAUUUUAUUAGGCUAAGCUAAUAAAAUUUAAAAGAAAAUUGUUAACCUUUAAUUAAUGUAAGCUUAAUAGUAGCUAUCAUAUUAAUAGUUCUUUAACAAAUAAAAUCAAAAAUUAUACCUAAUUUCUUUUUAAUAUCUUUUCUUAUUUAAAAUUUAAAAACUUAAAUUAGUUUAUGUUAAAAUGAGUAUUAAAAUCAAAUAUAGUUUAUAAAGCCCAAGAAUAAAAACUUUUAAACAAAAAAAUAUUAUAAAUGUAAAAAAGGAACUCGGCAAAUUCUAGCCCCGCCUGUUUAUCAAAAACAUCGCUCUUUGAAAAUUAUUAAUAAAGAGUCGUGCCUGCCCAGUGAAAUUUUAAACGGCCGCAGUACCCUGACUGUGCUAAGGUAGCAUAAUAACUUGUUUUUUAAUUGAAAGCUUGUAUGAAUGGCUUGACGUGGGCAAGACUGUCUCUAUUACAUUAAAUAAAAAUUAAUUUUUAAGUGAAGAAGCUUAAAUAAUCUCAAAAGACGAAAAGACCCUAUCGAGCUUUAAAUUUAUGUAUAAAUAAAAUCUUUUAGAAAAACAAAAUUUAUAUCCAUUUUUAGUUGGGGCGACAAAAGAACAAAUAAAGCUUCUUUUUAUUAUGUAAAUUUAUAAAUUUAUAGAGCCAUAAUUAUGAUUAAAAGAAAAAGCUACCGUAGGGAUAACAGCAGUUAUUUUUUCAGAGAGUCCUAAUCGAAGAAAAAGUUUGCGACCUCGAUGUUGGAUUAAAGUAACUUUUAAGUGCAGAAGCUUAAAAUAAGUGGGUCUGUUCGACCCUUAAACCUUUACAUGAUCUGAGUUCAGACCGGCGUAAGCCAGGUUGGUUUCUAUCUUUGAGCUAAUUAUUUAUGUUUUAGUACGAAAGGACCAAACAUAACAAAUAAUUUGCCCACUAU |
|
[ reference structure ]
|
...((........................................((((......((....))....))))...............((....))...............)).....(.(((.......)))..((((........))))((((((......((((((.....))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((((((........)))).))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((((((.......................)))))))))).)...((((((((((......))))))))))...(((......))).....((((....(((..(((.........)))..))).....(.((......)).).))))...............................))))))(..((((((...........))))))..).....))))))((.....((......................................................((((...((((((((.(((.............(((((((((..(([....(....]))..(((((((((.......)..))))))))..((((.(((..((((....))..)))))((((((......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))...)))....(((((........))))).....(((((.(((.((......((((.(((((((.(((((.((((((((.......................)))))))).)))))..((((.....))))((((((..........))))))(.(((.((((....))))))).........(((....)))....)......)))))..))))))........(.((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..(((((((((......)))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..))))))))........((((((((...............))))))))((((...))))........
|
| [ predicted structure ] |
.............................................(((((((.....(((((...(((((((((((........(((((((...............))))))).....))))))))....)))...))))).....))))))).....(((((........))))).............((((..[[[[[[[.....))))....]]]]]]].............((((((........))))))...........(((((((((((.....)))))))))))...............(((((((((((((.....((((.....)))).....))))))))))))).(((((((((((......))))))))))).((((((...(((((((......((((((((.((((.......))))...))))))))......))))))).(((((....((((((....))))))..)))))...))))))..((((((...((((((((((......)))))...))))).))))))...............(((((.((((..............))))))))).........................((((...[[[...))))......]]].............(((.((((((((...........)))))))).)))...(((.......[[[[[[...)))((((((......)))))).]]]]]]((((........))))..........(((((.........)))))...(((((((((................................(((((((......)))))))(((((.........(((((((((((((..((((((...(((((......))))).((((((((...........(((((.(((........)))(((...(((((((..........))))))).....((((((((....))))))))..))).....))))))))))))).))))))...)))))).((((....))))))))))).(((.(((.(((.............))).)))))).......)))))..(((..[[[[[[[))).....]]]]]]].....(((((.....)))))..(((((.......[[[.........(((((((....))).)))))))))..]]]((((.(((((....[[[[[[[))))).)))).......]]]]]]].......)))))))))...
|
|
CRW_00542
|
[ FASTA input ]
|
GGUAAAUCAUUUUUUAUUGUCUUAGUAGAGGAGAUAGAAUUAGACGUUUAAGCGGCGAUAGAUAAUAGAUAGUAGCGUGAGUGAAGGUUAAAUAAAUUAAACAGUGAAGUAUCGGUGGUGAGCACUCGCACCUUUUGCAUCAUGGCUUAUACUACUUUUUAUGCUGAGGAAGUAUCCCGAAAGUUUUGUGAUCUACUUUCUUACUUUACAGGUUGGCGUUAUAUUUGCUAUCUGGAGAUGGGGAGAUAGUGGCGAAAUACUUUUCGCACUGGUUGAUAGCUGGUUAUUCCGGAAAUAUAUUUAAGUAUAGUCUUCGGUUGAUGGGGUUUACAGUUUGAUAAUUCUAAUAGUAUUUGGGCUGUUUUUCGAAGGGGUCAGCCCCCUCAGGCUAAGCUGAGGGGGCUAUUUUAAAGGAUGGUUAAUUAAGAAUGGAAAGGCUAAGAAGUGGGCUUGAAGGAGUUAUCUUUAUGGAGUGGGUUAAACCACAAAUGAGCCUUGUAUAAUAAAUUAAAUUUUAUCUAUCUUUGUGUUGUACGGAAUCUCUUUUUGAAACAAUAAUUAUAGAGGUGAUAAUGUAAAGAUGAGUAGUCGAGAAGUUGUAAGUGUUUUAAGGUCGGGGAAAGAAACGUAAGGUUAUGUUCCGUAUUUUUAAAAAAAGCUAAAGGAACUCGGCAAAUAAGGGGACCGCCUGUUUAUCAAAAACAUGGCUCCCUGAGCAAUAUGGGGGGUCGUGCCUUCCCGGUGAGCUUGCGGGCUUAAACGGACGCGGUAAAGCGUGCUAAGGUAGCUAAAUUAUGGCCUAUUAAUUGUAGGUCCUGUGAAUGGUUUGACGAGUUUCCAACUGUCUCUAGUUUUUUUUGGUGAACUUGAAUUGGAUGUGCAAAUGCUUCCAUGGGUAAGAAAGACGAGAAGACCCCGUGAAGUUAGAAAUUUAAGUUAUUGGGAAGUUCCAAGGCUAUUUGUGGCCGAAUCGUUGAGGAGCACUAGAACUUAGUGUUUCAGAAGGGGUGAAUAAUAGCAGUUUUGGCUGGGGCAGCAAAGGAGCAAAGCUAGACUCCUUUAGGGUGUAAAACAGAUGUGUUACGACCCACAAACAUUAAGGUGUGAUUAUCAGAAGAAGUUACUCCGGGGAUAACAGCGUAAUCUGUCUUGAUAGUUCUUAUAGAUGGGCGGGUUUGCGACCUCGAUGUUGGCUCUGGAUAUCCUAAGGCUUGUAGGCGGUCUUGAGGGUUGGUUCGUUCGCCCAUAAAAAUCUGACGUGAGCUGAGUUCAGAUCGGUGAAAGCUAGGUCGGUUUCUAUCUUCUUUCUUUUAAAAUUGGGCUUUAGGGUACGAAAGGACAUUUAGUUCCAGGUGAUGGCCUGUAGUGUGUGAUUUUAGAAUAAUUUUAAUAUAAAAAAGUUUAUCUAUAA |
|
[ reference structure ]
|
......((.......((...((....)).......................((.....))..............((....))....)).................)).....(.(.(((....))))..((((........))))(((.(((....((((........))))...((.(...((((.((...((((((((((((....((((.((((.........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((.............(((((((((...............)))))))))....)))))..)...((((((((((......)))))))))).....(((.......)))...((((.....((((((...(((..(((........)))..)))....(...((......)).).....))))))........................)))).........))))))(.((((((((........))))))))..).....))))))((.....((................................................................((((((((.(((.............(((((((((..(([....(....]))..(((((((((....).))))))))..((((.(((..(((((((....)))))..)))))((((......))))(...).....(........((((((.....)))))))........))))...)).)))))))....))).))))))))....))....)))....(((((........)))))......((((.(((.((......((((.(((((((..(((((..(((((((...................................................................)))))))..)))))..((((.....))))((((((..........))))))(.(((((((((((....))))))).))))......((((.....))))....)....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.(((((((.....)))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))............((((((((...............))))))))(((((....)))))..........(((((..............)))))..............
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.........(((((((((((((...((((......((((.((((((((((((.(((((.((((((....(((..........))).((((.(((..((((.(((....)))))))...))).)))).)))))).))))).)))))(((..((((...((((((.......(((...)))(((((.(((((((.((((..((((...(((((((.((((((((((......((((.(((((....)))))))))..(((.......((((....(((..(((((....)))))...))).....((((((.((((((((......(((((......(((.((((((((((..........(((((((((((......)))))))))))......))))))))))......)))))))).........((((((((......((((((((((((...((((......))))..)))..((((((...(((((......))))).((((((((..((((.....((((((...(((........))).)))))).))))..))))))))....((((((........(((.((((((((.(((((.....(((.....)))...)))))...))))))))...))).......))))))..))))))...((((..(((((((.....(((((((((((.........))))))))))).......)))))))..))))..........((((......))))...))))))))).......)))))))))))))))).))))))........)))).......))))))))))))).......)))))))((((...((((............))))....))))...))))....))))..))))))).))))).........))))))..))))..)))))))))).))))...))))...........(((((((((...(((((..((((((((.....((((....))))((((...(((((((..........))))))).((((((((..........)))).))))...((((((.((((((((((.........)))))).............(((.(((((((((..((((...))))....)))))))))))).)))).)))))).)))).(((((((((((((((.......)))))).)))))..)))))))))))).......))))).....))))))))).(((((((....))).))))...))))))))))))).(((((((((((.(((.((((.(((....((((.....))))...)))....)))).)))...)))))))))))..........))))))))))))))).....
|
|
CRW_00544
|
[ FASTA input ]
|
AUCGAUGACAUAUUGUUUUAACAUCAAAAAAAAAUUUAAUUUAUAAGUAUUUUAAAGGGGUUAUUAAGGAUAACUAGCAAAUUUAUAAAAAAGGAGGCAAAAGCCAAAAGCCAUCAAUACAGAUAAAAUUAUAAUUUUAUAUAUGGAAUCUGUGUGCGAGAAUGUGGCGAUCUAAGGGAAACCUUAUUAUUAUUACUUCCCGAAGUAAAACAUUUCAUUAGGGAAAGGAAAGGAAAUCAACCGAGACUCCGAAAGUAAUGGUGAGUGAAAUCGGAUUAGCCUGAUUUUUUUUAUAUAAAAUAAAAAUUGAUUAAAAAUAUAUUUAAUUUUAUUCUUAUUUAAAGAUGACAAAAUAAGUGAAAGUUAAAAUCUGGUGAAAGUGGAAAUUUCAUUAAGAAUAACUUAACAAAUUAAAUUAGUUUUUAGUAUGAGUAAAUAUAAAUUACGUUAAUGUAAAUAUUUCAUAAUUAAUUUAUUCAUAACUACCUGCGGGUCGGUCAUAUAAAAGGUUUAUAAAAGUCCUGUAUUUUUUAUAUAAACAAAAAGUGAAUUAUAUUAUAUAAUAUCAAAAAUAUAUAUAAUAUUUUUCAAUAAUCAAGUACGAUGAGAGAUAACUUGUCGGAAUAUAGGGGAACCAUCCUCUAAGGCUAAGUAUUAUAAAUUUAGCGAUAGUGAAAAAGUACCGUGAGGGAAAAGUUGAAAAGUGUGAGGGUCAAUAAUUAUUAGAUAUAGCUAGAAAUAAUAUAUUGAGAAUUAUAACCCUUGAAAGUAAAUAACGCAGUGAAAUAGACUUGAAUUAGUAACUCUAUAAGCAGUCGAAAUUUCUUUAAAAUAGAACGAGAGAUGACGGCGUACCUUUUGCAUAAUGGGUCAGCAAGUUAAUAGGAGUAGCAAGGUUAAAAACCUUAGCGAAAGCGACUGGAUCAAAAAAGAUAAUGGGUAAGUUACUUCUAUUAGACCCGAAGCCAGGUGAUCUUUCUAGGACCAGAUUAUAAUGGAUCGAACGGGUGAAUGUUGCAUAAUUCUCCGAAGAGUCCUUGAAAGCGGCGAAAUACCAAUCUGACCUGGUGAUAGCUGGUUUUCUACGAAACAUAUUUAAGUAUGACAUCUACACAAAAUUUAUGGAGGUACAGCACGGCAAUUCCCAACAAGUUUUAGAAUAGUACAUUUUUAUAAAUUUAUUUAUUUUAUUAGGAGUUUAGGUUGCGGGGACCUCGAAAAUCUUACCAAUGGAAGUGAAACUCGGAAUUACAUAAAUUGAUGGUAGAUAUUCAGACUGCUCAUGCUAAGUUGGGUAGUCAAGACGGAAACAGCCGAGAACACAUGAUUAAGGUCCCCAAUGAUUAUUAAGUGAAAUAAAGGAAGUAACAAAUUGAAUGCAGCUGUAAAGUGAGCUUGGUAGUAGCUACUUAUAAUGAUCGUGUAACAACGCAUCAGCCCUUAGAGUGUUGCGCCGAAAAUUCAACGGGUCUUAAAUAAUCAACCGAUAUCGUGUUAAUUUUAAAUAAAAAUUUAUUAUUUGUUUAUAAUUUAUAGACAAAUAUAUCAUAAACUUUUUAUAAAUAAUUAAUUAUACAAAAUAAAAUUUUAUCUUGAACUAUUAAUUAAUUAUUUGUUAUUUAAUUUAAUUAUUUAAAAAUUAAUAUAAAUUAGUUUAAUAUUUCCCAUUUAUAUGAAAUAUGUUAAUAAAAAAAAUAAUACAAAUUUUUAAAUAAUUAAUUUUGUUUUUAAUAGUUUAAAGUAUAAUAUAAAUAUAAUUUAUAAUUAGAUUUUUAUAUUGUUAAUAUAUUAUAUUUAUCUUAAUUUAAUAUAUUAUCUUUAUUUUAUUUAAAAUCUAGGUAGUAGAACAUUCAGAUAUUUUAAAUCCCCAUGAUUAACAGUGUUUCAUUGUUCAUAGGAAUCUGAAGAGAUAAUGCUGACAUGAGUAACGUAAAAAGAAAGAAAAAAUUAGAUCGAGAGGUCUUUGAAGUUUUAAACUUUCUCGCCGAAUACGAAAGGGUUAUUAGCUAAAGAUUAAAUCAACUAAUGUUAUAGCGGUCUCUAAGGUACAAAACCAAUGUUUUGGCUGAUGAGUUAAACUUUGAAAGUCCACAGGGAGAUUAUUAACAAAUAACACAGAAUAGUAAUGAAAAUAUUGAAUAAAAUUAAUUUAAACUAUUGUUUUUAUUAGUUUAGCAGUAUUCUAAUGAAAAGAAGAUUAUUUGAUGAAAAUGUAAGUGAUUUUUAAAAAAUAAUAUUGAAUUGUUCUGAAAAACUUAGUUGAAUAUAAUAGUAAACUUUAGUUGUUAUUUUUAAUAAAAUUGGGACCAGGAAAAAAAUGUUUGAAUAACUCAAUUUGUAGAAGAUAAUUUAGAACUAAACUUUUAGUUUAACUAUCAAAAAAUAAAUAUUCUAAUAAAUUAUAGUUUUCUCUAAUAGUCUAAGAGUAAAUAUUUAUUUUUAUUUUUAUAUUUAGUUUAGUCAAAAGAAUUUAAUUUAGGUGUGAAUUUGAAUUUGUCUUUAUUUAUUUUUUAAUUUAAAGUUCGUAAUUUUAAUUACAAAUUGAGCCUACCGUACCCUAAACCGACACAGGUUCGUAGGUAGAGUAUACUAAGGCGUAGAGCUAAAAGUUGUUAAGGAACUCGGCAAAUUAUCCUCAUAAGUUCGACGACAAGAGGAACCAUUUAUAAGUAGUUAAUAACUCCAUUGAAUUUUAUUAAUCUCUUAUGUGGUGGCACAAAAUCGGAAGCCCCGACUGUUUACUAAAAACACAGCUAUCUGCAACGAUGUAAAUCAUAGUAUAGGUAGUGAGGUUUGCCCGAUGCCAUUAAUAUAAGAGAAGUGAUGGGUAACUGUUAAUUAUCGAAAAUCUGGUUAAUAGCGGUCUUAACUAUGAGGAUCCUAAGGUAGCAAAAUAAAUUGGCCAUUAAAUGUGGUCCGGUAUCAAUAAUUUAACGAUGGCUUCACUGUCUCUACAACUUGCUCAGUGAAAUUGAAUUACCCGUGCAGAUGCGGGUUGCCACCAGGGGGACGGGAAGACCCUAUGCAGCUUCUACUGUAGUUAAUCAUCAUAUUAAUCUAGAACAACCUUAGUCAAUAGCAAAUAGGUAUGUCGAUAGACAAAAAUUGGAAGACCUUAAGUCUAGGGUUGGGUUAAUGUUUACCUUUUUAUUUAACACAAAAUAAAAUGGGAGAGCUGAUUGAUUGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGUCUUUAAUAGAGUAGCAAAGUACAUCCAAAUAUAAAAUUAAUUAUAAAAUAUUUACUAUUAAUAAUAUUAAUGUGUAAAUAUUCUCACAAAUAUCAUAUUGCUGUAAAUUUUUAAUUUACUUUAACAUCAAUUUUUAUUUUUUGUUUUUAUAAGGUAUAGCUAGAAAUUGAAUGGAGAUCAAUUAACCAGUGAUAAGGUUAUGGAGGGCGCAAUGGCGGUAAGCAUGCUUAACUGAUAGACUUAAAAGUCGCACAGAUACGUAAGUAGGGCAUAGUGACCCCUCGCUAUAUUAUGGAUAGACGGGAUCAAUUGAUAAAAGUUACGCUAGGGAUAACAGGCUGAUAGCCGGCGAGAGUACACAUUGUCCCGGCUGUUUGGCACCUCGAUGUCGACUUAUCCUAUCCUCCGGGGGAAGAAGCUUGGAAGGGUUCGGCUGUUCGCCGAUUAAAAGGUUACAUGAGUUGGGUUUAAUACGACGUGAGUCAGUAUGGUCCCUAUCUUCUGGUGGGACAAAUAGUAAAAAGGGGGAGACCUUCCAGUACGAAAGGACCAAUAGGAUGUGUUUCUCUAGUGUACCAAUUGUUGAAAAUGAACUUUAAAAACUUGAAGACAAAAGUAAAGUGGAUAUUGUGAGUGAUUGGCAUAGUUGGGUAGCCACAAACAUAUUAGAUAAGAGCUGAUUGUAUAUAAAGCACGAAACUAUCCCCUAGAUACUAUCAUGGAUUUCUCUUUGUCUCUAUCUUUAGAGGAUUGAUAAGUAUCCCUAUCUUAUCAAAUAUUUCUUGUAAUCUUUGUCAAUUAAGUUUAUACUUUAAUUUUCUAUAAAACAAAUAAUGAAAAUUAUUUCAAUAGUUAAAAAAAUUUUAUGUAUUAUUUAAUUGAAUUUAAGAUAGAAUUGUAUUAUAAAAUAAUAUGUUUAAUCAUAUUAUAAAUAAUAUGGCAAAGAGUUGGGAAAAUCCAAAUAAAUUAAGAAAUAGAACAUUUCUUUAAUAGGAUGCAAAUGAAUUC |
|
[ reference structure ]
|
...............((((((....(((......)))...))))))..........((((((((((.....(((..(((((((((((............................................................................................................((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((.............................................................................................(((((.......))))).(((...)...ddd....))DDD...........................................................................................................................................................................................(((((((......)))))))......(((((..eeee)))))..))))..)...))))))))).))...............((....)).....))..............................................................................................).....)))))))))).....(.(((((((((((((...........)))))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((((.....))))))...((....)).((((((....))))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((......))))...((((.((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).(((((((....(((((((((.....(((........(((.....((((((((((((((...((((....))))....)))))))....)))))))...(((.((((..........))))..)))..)))......)).).....)))))))))....)))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((..(((...(((((....<<<<<<<.............(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........))).)))(...)(...((......)).).)))))....)))))))))))))............))......>>>>>>>)))...)))))))(((((((((((((((.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))))))).))....))))))(.(((((((.(((...............(((((((...)))))))....))))))))))..).....))))))((.....((......((((((..(((((((((((....)))))....))))))...))))))((((....((((..((...((((((..............)))))).......((((.((...(((.((((((....)))))))))...)).............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))).((((....((((((((.(((..............(((((...((.....))....)))))(((((..(((((.(((((((((............))))))).))))))))))))(...).......(((((((((..((c....(....C))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((((((((((((....))))))))))))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((..((((...(((((((..(((((((((.....(((((((((((.((...(..fffff..(((....))).......)).).FFFFF..))))))))))))))))))))...(((((((((((......)))))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........)))).))((aa...............................................................................................................................aaaa.aa.....(((((.......)))))(((((........)))))......aa)(.(((AA.....AAAAAA....(((((((([...(..])))))))).(((....))).AA))).).....(((((((.((..EEEE.)))))))))....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.(((((........)))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((...(((((....................)))))((((((...(((....(((((((((((...................................................))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((............)))))....)))..))))..)))))))).((((((((((((((...............................................................................................................................................................................................................)))))))......)))))))........((((((.......)))))).....................
|
| [ predicted structure ] |
...((((..............))))..................................((((((...)))))).....................(((....[[[[...)))....((((((((.....((((......))))....)))))))).........]]]]....(((((....)))))((((((((((((((((((((.....)))))....)))).......(((.............)))...)))))))))))..((((((((......))))))))............((((((((((((.....................(((((((..........)))))))...((((((...(((.....((((....)))).....))).)))))).........)))))))))))).(((((((((((.....(((((....)))))..(((....)))..))))))))))).(((((((((...............(((..[[[[[[[[.)))....]]]]]]]]...........((((..((((((((((.(((.....)))))))))))))..))))...(((.....[[[[[[[.)))..]]]]]]].....(((((((....)))))))..(((((((.......)))))))....(((((((.((((.....(((((..((((.......(((((((..((((((....((((((...........))))))...)))))).)))))))........))))...(((..(((((.(((......))).))))).....((((..(((((((...........)))))))..))))(((((((...(((((.(((((.......(((((((((((((((((((...))))))..........(((..(((......)))....)))..))))))))))))))))))((((((((.....(((((.(((((..((((......))))...((((.((((........))))))))....))))).)))))........(((((........)))))....))))))))........(((((....)))))...............))))))))))))..))).....))))).....(((....))).)))).)))))))......................(((((((....((((((((.(((.((((.((((.....(((...)))...((((.....))))..)))))))).))).(((((((((........)))))))))....(((......)))..............))))))))........((((((((((((((((((((((((..((((((...(((....)))....(((((.(((((.((((....((((.((((....)))))))).......))))))))))))))..))))))(((...............)))......)))).))))...(((((((((((.((((((((((((...)))))))))))).............((((((((.....(((((((...((((....)))).((((((((((((.((((.....))))......(((((((((((((((((........(((..(((((((....(((....)))....)))))))))).............)))))))))))))))))........)))))))))))).))))))).........)))))))).))))))))))).....((((((((((.(((......))).))))))))))))))))))))))))))......(((((......(((((((((((((...(((..((((...((((((...))))))))))....((((..((((((..(((((((((.(((..((((...((((((..(((((((((((....)))))....))))))...)))))).......))))....(((.....)))...(((...))).))).))))..))))))))))).)))).((((((....))))))......((((...)))).....((((.........(((((((.(((((((.(((((((((......(((((((....((((((((..((((....))))..))))))))..))))))).(((((....((((((((((((.........)))))))))))).........))))).)))))))))...((((.((((...(((....)))))))..)))))))))))))))))).....))))..)))..)))))))))))))..((((((((((((.((((((......((((((((..((((...))))...(((((((((((((.......(((((...........))))).........)))))))))))))............))))))))....(((....(((((((((....)))))))))..)))))))))(((....)))((((((((...)))))))))))))))))))).)))))....)))))))...........)))))))))....(((...[[[)))..]]]....((((((..................[[[[[........))))))..]]]]].................................(((((((.(((((((((((((((((.....(((((((((.....(((((.....)))))..((((((((.....(((.....)))....))))))))..)))))..))))))))))).))))))))))..)))))))...((((((((((.........)))))))))).((((((.[[[...))))))....]]]..........(((((((((.....)))).))))).(((((..........[[[[(((((((...............))))))))))))...((((((......)))))).]]]]((((..(((((((....)))..(((((......)))))(((((((((((.(((((((((.....(((((((............((((...(((((........)))))...)))).....))))))))))))))))((((.(((((((((((......)))))))).))).))))))).)))))))).))))..))))...................(((......)))........................((((((((((((((((...))))))).)))))))))(((((((.((((...((((((((((((...)))))))(((((((((((((......((((((((((((((..((((((...........(((...)))..(((((........)))))..((((((((.............((((((..(((...((((....))))...))).(((....))))))))).)))..)))))))))))))))))..))))))))..)))))).......(((((((((((..(((.((((((((((((....(((....)))...))))))).))))).(((......(((((((((((((((((((((........))))).)))))(((((.....))))).....)))....))))))))(((((.(((((((....))).)))).(((((.(((....)))))))).....(((....((((....))))....)))....)))))...))).)))...))))))))))).....)))))))......((((((....)))))).....)))))....)))))))))))....((((...[[[.....))))..]]].......((((..[[[..))))......]]].................................(((((((((...........(((.[[[[[[[[....)))..]]]]]]]]....((((....(((((..((((((((((..((((...((((((((((.....(((((((....)))))))..)))).....))))))....)))).))))))))))....)))))))))..(((((((...((((((((......))))))))..))))))))))))))))(((((....)))))....((((((((((.....))))).))))).................
|
|
CRW_00545
|
[ FASTA input ]
|
UCCAAAAACCUAGCAUUCCAAUUAUAAUAACAAUAACCUCAUAUUCUCAUAAAUUUCUAAUUAAACCAUUCUAAAAUUUUAGUAUAGGCGAUAGAACAAUCAUAAUAGCUAUAGAAAAAGUACCGUAAGGAAAGAUGAAAUAGAAAUGAAAUAAUUAACUAAGCAACAAAAAGCAGAGAACUUACCUCGUACCUUUUGCAUAAUGGUCUAGCCAGUCAUAAUCAAGCAAAACGAAUUUCAGUUUGACUACCCGAAACUAAGCGAUCUACUCCGAGACAGCUUUUUAGAGCAAACCCGUCUCUGUGGCAAAAGAGUGGGAAGAUCUCCGAGUAGGGGUGUACAGACCAAACGAGCCUAGUGAUAGCUGGUUGCUCAGGAAAUGAAUAUAAGUUCUACCCUAAAUAUAGAUUUUUAACAAUUAAAGUAAAAAGUCUACUUAGGAUUUAUUCAAUCAGGGUACAGCCUGAUUGAAACAGGAUACAACCUAUAAUACUGGGUAAAGAUUAUAAUCUUCAAGGAAAGUUGAGUCAGUGGGCCUAAAAGCAGCCACCUGUAAAGACAGCGUCAAAGCUCACUCAAUCAUUUAACCCUUUAAUUAGUAUAACUAAUUCUAAACCCCCAAACAAUACUGAGCUAUUCUAUAAACUAUAGAAGCACUUAUGCUAGAACUAGUAAUGUGAUACACGAUUCUCCUAAAUGUAAGUGUAAAUCAGAUCGAAUAAAUCACUGAUAAUUAACGUCCUCCCUGAGAUCCUUGCAAUAACAAAACAAGAAAACCAUGCACUUAUUACCGUUAAUCUAACACAAGAACAUUUACAGGAAAGAUUAAAAGACGCAGAAGGAACUCGGCAAACUAUGAACCCCGCCUGUUUACCAAAAACAUUCGCCUCUUGCUUAAAAAACAUUGUAUAAGAGGUCCAGCCUGCCCAAGUGACGUAUAUGUCAACGGCCGCGGUAUCUGACCGUGCAAAGGUAGCGUAAUCACUGUCUUAAUAAGAACUGGUAUGAACGGCCACGAAGGUUCAACUGUCUCCUGCAUCCAAUCCAUUAAACUGACCUCCGUGCAGAGGCGGGGAUAGAACCAUAGAACGAGAAGCCCUAUGGAGCUUUAAACUAAAGAACUGCCAAGUUGAACCUAACCCAUAAGGAAAUAACAAUUAAACAAGCAGAAACUGACCUAAAGUUUUCGGUUGGGGCGACCACGGAGAAUAAAAAAUCCUCCUUGAAGAAUAGGGCCUACCACCCUUUCACCAAGAACCACCAUUCUAAGUAACAAAAUUUAUGACUAUAAUUGAUCCAGUCCUACUGAUCAACGAACCAAGUUACCCUAGGGAUAACAGCGCAAUCCAUUUCAAAAGUUCCUAUCGACAAAUGGGUUUACGACCUCGAUGUUGGAAUCAGGGCAUCCCAGUGGUGCAGCCGCUACUAAAGGUUCGUUUGUUCAACGAUUAAAGCCCUACGUGAUCUGAGUUCAGACCGGAGUAAUCCAGGUCAGUUUCUAUCUAUGAAGUAUUUUUUCUAGUACGAAAGGACCGAAAAAAUGAGGCCAAUGUUUUAAUAAGCCUCUCUCUAUAUCAAUGUAGUCAACUAAAUUGAAAAUAGAACUAAUACUCUGCCCAAGAUUAGGGCUAGCUAGCGUG |
|
[ reference structure ]
|
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((....((((((((.(((..............(((((((((..(((.........)))...(((((((((............)..))))))))..((((.(((...(((((......))).)))))((((((.....))))))(...)..............(((((...)))).)..........)))).)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((........))).........(((.(((.((.....((((.(((((((.(((((.((((((((................................................)))))))).)))))..((((.....))))((((((...........))))))..((...((((.......))))...((...(((......)))...))..((.......)).))..........(((.....)))...........)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((.((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))....((((((((...............))))))))(((((...(((....))).)))))...(((..(((((............)))))...)))............((((.......))))...........
|
| [ predicted structure ] |
......................................((((.((((......((((((...........((((....))))....((((((......)))......))).))))))......(((........)))....)))))))).....................(((..[[[..)))..]]]...((((((((....((((((...............................(((((...[[[[.....)))))...((((((.((((..((((....))))...((((.((((........))))))))....)))).))))))]]]]....))))))...(((((((((....)))))..))))............(((((((((.[[[.....(((((((((.............)))))))))..)))))))))((((((((((......))))))))))..]]].....(((((......))))).(((((....))))).((((.....(((...(((((((......((((....))))...(((...)))...)))))))...)))......))))...(((((((.......................)))))))....(((((((...))))))).(((...(((((....)))))..)))...........((((....((((((((..(((((.............))))).(((((((..(((...)))...((((...........))))......(((....)))...)))))))...........)))))))))))).............)))))))).....(((.................(((((.....)))))...((((((((..(((......)))..))))))))...))).(((....(((((....)))))..))).(((.(((((....[[[...))))).)))...]]]...............((((.[[[[[.)))).....]]]]].((((((.((((((......................)))))).[[[[[))))))..((((((...........))))))..(((((...)))))..]]]]]..((((..(((........)))...))))............((((((((((((.........(((((...)))))..(((..........)))..((((..(((.((((.......)))))))..))))..............(((((.........((((....[[[[[[.)))).....]]]]]]........)))))..(((((((........[[[[[[[[[.....))))))).....]]]]]]]]]....((((.(((......)))[[[[[.....(((((((....)))))))..))))(((((.....))))).....]]]]]......((((....))))..(((....))))))))))))))).(((.....(((((......)))))....)))..........(((((....[[[[[[....)))))........(((((.(((....))).)))))...]]]]]].........((((.......))))...........
|
|
CRW_00546
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUGCAUUGGAUGGAUGCCCGGGCAUUGAGAAGGAAGGACGCUUUCAGAGGCGAAAGGCCAUGGGGAGAGAGAGCGUCUGUGAUCCAUGGAUCUCCGAUCGGGAAACCGUAUCCAAGCUCCGUGGCUAGUCUGCGCUCUUUGGACUUUUCAAACUUAGCGAACUGAAACAUCUGAGUAGCUAAAGGAAGGAAAAUCAACCGAGACCCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAGAGCGGAACAAGGGUUUUCAUCAAAAGAAAUCCGAAGCGGUUUCAUUCGAUUUGUUGUGGAUUGGAUGAUGGAAAAACCAGCAAGCAGCAAGCGUAGGCUGUGUUGCCGUAGCGCGCCUACGGAGUUGUACAAAGUCAGCAUUGGGGCGCAAGCAUAGGCAACACAGGACGGGGUGGGGCGCGCAGUGAACUGGUUUUCUAAAAAGAUUGGAAGAUCCGGCCAAAGAAGGUGAUAGCCCUGUUCAUUCGUUCCCAUGGUUCGAUCCUUCCCAGUAAAACGCGGCGUGUUCGAAUGAUGAUCGCUUUUACGCGAGAAAGGGGGACCACCCUCUAAGCCUAAGUAUUCCUCAAUGACCGAUAGCGUACAAGUACCGUGAGGAAAGGUGAAAAGAACCCCAAUCGGGAGUGCAAUAGAGAACCUGAGAUCCGAUGCGAACAAUCAGUCGAAGGAGCGGACGCGGGCGCACUCACUCUAACGGCGUACCUUUCGCAUGAUGGGUCAGCGAGGAAAUGGGAACAGCGGCUUAAGCCAUUAGGUGUAGGCGCUUUCCAGAGGUGGAAUGGAAGAUUUACGUUCUUCCUAUUUGACCCGAAACCGAUCGAUCUAGCCAUGAGCAGGUUGAAGAGAGCUCUAACAGGCCUUGGAGGACCGAACCCACGUAUGUGGCAAAAUACGGGGAUGACUUGUGGCUAGGGGUGAAAGGCCAACCAAGAUCGGAUAUAGCUGGUUUUCCGCGAAAUCUAUUUCAGUAGAGCGUAUGAUGUCGAUGGCCCGAGGUAGAGCACUCAAUGGGCUAGGGUGGCCCCCAUUUCGCUUUACCAACCCCAGGGAAACUCCGAAUACAGGCCGUCAUCCUUAGUACAGACAGACUGAUUGGGUGCUAAGAUCCAAAGUCGAGAGGGAAACAGCCCAGAUCGUACGCUAAGGUCCCUCAAGCAAUCACUUAGUGGAAAAGGAAGUGAUCGAGCGAUGACAACCAGGAGGUGGGCUUGGAAGCAGCCAUCCUUUGAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCUAGCUCCAUGGCACCGAAAAUGUCUCAGGGCUCAAGUGAUUCACCGAAGCGACGAGACCUUGAAAGCUGCUUUUUCAAGUGUCAGUAGCGGGACGUUCUGUCAAUCGGGGAAGGUUUUUGGUGACAAGACCUGGAGAUAUCAGAAGUGAGAAUGCUGACAUGAGUAACGAGAAAUCCUCUCAAAAACACGAUCGCCUGCCAGUGGAAGGCUUUCUGCGUUCAGUCAAUCUACGCAGAGUGAAUCGGUCCCUAAGGAACUCCCGAAAGGGCUGCCGUCCGAUGGGUACACGAAAGUGACGAAGUUGCUUUGACUACUGAACCAUGCCUGGAUCGUCGGAGCGAAUUGGAUGAUCGGGCCGAGGGCUGCCCCCUCUUCCCCUCGCUCUCCUUUCCUUAAUAUUCACCGUCGAGUCAUCAAAGCCGUCAACUAAUUCGGAGGGGCUCGGCUGGCCCGGUCGCCCUACGCUACUGGCGCUUCCAAAGGCGAACGUCUCGUCUUUGGCGACCAGCAAAGCAAACGGAGGGAGGGCUAAAACCUUUCGUUUUGAAGCAAGGGAUGAGCGCGAAAGCCGUUGCGCUUCCGUACACGCGCAUACUCUUGCUCCGUCGCGCGUUAGGUUAGGUUAGUACUUAGUACUUAACUUAGUACAAUAACGCGCAGCCGUUUUGGGCGGACACGGUUCUCUAAAGGCGAAGACUCUGAAGUGGGCGAACACUCGCCGCAGUGGGCGAACAUGCCGGCUCCCGGCUCCGCGCACCUGCUGACACCUUUCGAAGCACUUUCACGUGUGAACCGAAGUCGUCUUGUCCUUCCUUUCUCAUUUCAGUCCUCGCCUUUUUCAUCUUCCGUAGGGGCCUUUAGUCUUUUGAUUAGAGUAGAGGUCGCGAGAGAGCAGAGCGUACCGCCCUGCCAUAGUCGCGAGGAUCUUAAUAGUCGGUCGCGACUGUUGUCAUAGUCAACGACGGUUUAAACUUCCAGGAAAAAACUUCGUAUUGGGAGGGCGAUCCUCCCGGUGAACUGACCGUACCCCAAACCGACACAGGUGAACAAGUAGAGUAUACUAGGGCGCGUCGAGAGAACCAUGUCGAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUCCUAUCUUUUGAUUAGGAAAGCGGCACAUACCAGGGGGUAGCGACUGUUUAUUAAAAACACAGGACUCUGCUAAGUGGUAACACGAUGUAUAGAGUCUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUCGGAAGGAGAAGUGUGAUAAGCUUUGAAUGGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCAGUAACUCUAACUGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGCAUAAGUAGCGACCUGCACGAAUGGUGUAACGACUGCCCCGCUUGCUCCGACAUGGACCGGGUGAAAUUGAAUUCUCCGUGAAGAUGCGGAGUACCAACGGCUAGACGGUAAGACCCCGUGCACCUUGACUAUAGCUUCGCAGUGACAACCUUGAUCGAAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGUGGUGACACACAACGACCAAUCCUGAAAGACCACUCUUUCGUCUAAGGAUGCCUAACCGCCGCACCGAUCAUUCGGGGGGGGGCGGGACACUGCGAGGUGGGUAGUUUAUCUGGGGCGGAUGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGUGUGCGAAGGUAGGCUCAAGCGUUGAUUCUGCUCGUGAGCGUAAUGGUAUAAGCCUGCCUGACUGUGAGACCGACUGUCGAACAGAGACGAAAGUCGGCCAUAGUGAUCCGGGAGUCCCGUGUGCAAGGGCUCUCGCUCAACGGAUCAAAGGUACGCCGGGGAUAACAGGCUGAUGACUCCCAAGAGCUCUUAUCGACGGAGUCGUUUGGCACCUCGAUGUCGACUCAUCACAUCCUGGGGUUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUCGGUUGUUCGCCGAUGAAAGUGGUACGUGAGUUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUUGGUUCCUAUCUACCGUUGGUGUUAAAGGGAGAACUGCGAGGAGCCAACCCUAGUACGAGAGGACUGGGUUGGGUCAACCUAUGGUGUACCGGUUGUUAUGCCAAUAGCAGCGCCGGGCAGCUAAGUUGGUAUGGAAGAACUGCUGCGCCGCGGGAAAUCCUUCUCUAUACAAGUUCUCGUACGAGGUUUUUGAACAGAACUUCGAUAGGCGAGAGGUGUAAGCACCGCGAGGUGUGAAGCGAUCUCGUACUAAACGAA |
|
[ reference structure ]
|
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((.................................................................................................................(.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.....((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((((((....)).)))))))))(...).......(((((((((..(({....(....}))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((.......))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..[[[[[[[[.[[[.[[......[[[[.[[[[[[[.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ccccc..((((((........)))))).......)).).CCCCC))))))))))))))))))...(((((...((((....)))).....))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))[(<<....<<<<<<((.((((.......))))...))<<)(.(((>>....>>>>>>....(((((((d....(..D))))))).(((....))).>>))).).....[[[[[[[.[[..))))..]]]]]]]]].....]).....]]]]]..]]]]]]........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....]]..]]]]]]]]]]]........((((((((..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).))))))..(((....(((((....)))))....))).))))......))))))))..((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.[[[[))))).....]]]]............(((((....)))))...((((((((((..[[[[[[[[[....((((....))))...((((((....))).)))....)))))))))).....]]]]]]]]].....(((((.[[[[[[.....)))))...]]]]]]....((((((((((.......(((.....[[[[[.....)))........]]]]].....(((((((........))))))).........((((((((..(((((((.(((((.....(((..(((((............(((...((((((((((.....((((((.(((.((((........)))).))))))))).......)))))))))).))).....(((.(((.(((((((.((((((((((.....))))))))))..(((......))).........)))))))))).))).)))))...)))...)))))....)))))))...))))))))...((((...[[[))))...((((((....))))))........]]](((((((....[[[[[...(((....)))..))))))).(((.......)))...]]]]]((((((.....[[[.((((...(((....(((........)))..))).......)))).))))))..]]]....(((.[[[[..))).....]]]]..(((.((((((.((((.((((.((((.(((....))).))))))))))))...(((.((((((((((.......)))))).)))).))).....((((((..((((((((((((..((((...(((.(((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))....))))))))))))(((.........)))..)))))).........)))))))))....(((((....)))))........(((((((((((...((((((((.......((((((...)))))).......)))))))).......(((....))).......)))))))...[[[[[[[[.))))..........]]]]]]]].((((.......((((((...(((...........)))....)))))).....[[[[[[[..)))).....]]]]]]].((((........(((((.[[[[[.)))))......]]]]]...................))))..(((...[[[[))).((((.......))))....]]]]............(((((((((..(((((((((((.....)))))))).)))......(((((.(((......[[[[[)))...(((((....)))))]]]]].....(((..(((......)))....))).....((((.....)))).....(((....[[[[....)))..]]]].((((((((...........)))))))).......)))))...(((...(((....))).[[[[.)))....]]]](((....))).....)))))))))............(((...[[[[[[[...))).....]]]]]]]((((.[[[[[[.))))............]]]]]]..................((((((((.......(((..........)))...))))))))(((((((((((((...((((...)))).....((((((((.....)))))))))))))))........[[[[[[[[[[.))))))...]]]]]]]]]]...((((((((..((((((((......))))))))[[[[...........))))))))..(((((((((((.(((((((((((((...)))).)))))))))....)))))))).(((......))).)))]]]]...(((...[[[[[))).......(((......)))]]]]]...(((.[[[..)))(((((...)))))..]]].........(((...(((((..((((......))))....)))))..)))...)))))))))).........((((((((........(((..(((...((((((((.(((.......))).)))))))))))..)))((((.(((...))).)))).......))))))))..........(((((((((((((((........)))))))))..................((((.(((((((((((...)))))))))))..((((((.....(((.((((...((((((....((((.....))))....(((((((((..................))))))......((((((((.((((....))))..(((((.(((((.........)))))....))))).)))...))))).)))..(((((.....)))))..((((((((....(((....)))......))))))))..))))))..))))..)))..))))))..))))..((((((((((.......(((..[[[)))......]]]((((((.[[[...))))))....]]]..........)))))))))).....))))))(((((.....)))))......(((.((((((.((((...)))).))))))..........((((((......))))))[[[[...))).....]]]]......((((((((((((((((.(((((((((((....(((((..((((.(((((((((.(((.....(((....)))......))).))))))......)))...))))..)))))...(((..........((((....))))........))).)))))))))))..))))))..((((((((....)))))....)))......)))))))))).(((((((((....(((((....((((....))))))))).....)))))))))..((((....[[[[[[.[[[.))))...]]].]]]]]]......(((((((((((.(((........)))))))).[[[...))))))..........]]](((((......[[[[[[[[[.........)))))...]]]]]]]]].........((((.[[[[[))))..(((((((((((......)))))).)))))..]]]]](((((..........((((.......((((....(((((((....))).))))....))))..))))[[[[[[(((........))).)))))..]]]]]]..((((((((((.((((.[[[..)))).(((...)))..]]].((((((((....))))))))..((((((((..((((.[[[[[[[..))))))))).))).(((....)))..]]]]]]]...(((((((.(((((((((.....)))))))))....))))))).(((..(((((....)))))...))).))))))))))......
|
|
CRW_00547
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGUGACCAAGGGCUUACGGUGGAUACCUAGGCAUUCAGAAGCGAUGAAGGGCGCGGUAACCGGCGAAACGCUUCGGAGAGCUGGAAACAAGCUUUGAUCCGGAGAUACCCGAAUGAGGCAACUCCUUGUACUAUCUACUGAAUAGAUAAGUAGAUAAGAGCGAACUCGGUGAACUGAAACAUCUUAGUAACCGAAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGAUUCUCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGACCAGCCUAAACUAUCGAGCUUGUCUUGAUAGGGUUGUGGGACAGCAUAAUGAUAUCGCGCGAAUUAGAAGAAGCAAUUGAAUGUUGCACCUUAGAGGGUGAAAGUCCCGUAUUCGAAAAUUCAAACGAGUUAGCUGUAUCCCGAGUAGCAUGGGGCACGUGAAAUCCCGUGUGAAUCUGCGAGGACCACCUCGUAAGGCUAAAUAUUCCUGAAUGACCGAUAGCGCAACAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGCAGGGGAGUGAAAUAGAAUAUGAAACCGUAAGCCUACAAGCAGUAGAAGGAUGUUGACAUCUGACUGCGUGCCUGUUGAAGAAUGAGCCGGCGACUUAUAGGUAGUGGCAGGUUAAGGUAAAGAAUUACUGGAGCCCUAGCGAAAGCGAGUUUGUAUAGAGCGUUUUGUCACUAUUUAUAGACCCGAACCCGGGUGAUCUAACCAUGGCCAGGGUGAAGCUUGGGUAAAACUAAGUGGAGGCCCGAACUGAUUAAUGUUGAAAAAUUACCGGAUGAGUUGUGGUUAGGGGUGAAAUGCCAAUCGAACCCGGAGCUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGUGUUGAGGCGCAGCGGUUGAGAUUAUAACUUAGGGGUAAAGCACUGUUUCGGUGCGGGCUGCGAGAGCGGUACCAAAUCGAGGCAAACUCUGAAUACUAAGUGAACACUCAGCCAGUUAGACAGUGGGGGAUAAGCUCCAUUGUCAAGAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGUUAAGGCCCCUAAAUAGUAGCUAAGUGGCAAAGGAGGUGGGAGUGCUUAGACAACCAGGAGGUUUGCCUAGAAGCAGCAAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCAAGCGCUCCUGCGCCGAAAAUGAAUGGGACUAAGCUAUUUGCCGAAGCUGUGGGAUGUACUAAAAAAUUAUAUACAUCGGUAGGGGAGCGUUCCGUCAUAGGUUGAAGCAUUUACGUGAGUAAGUGUGGACGAUACGGAAGUGAGAAUGUCGGCUUGAGUAGCGAAAACAUUGGUGAGAAUCCAAUGCCCCGAAAACCUAAGGGUUCCUUUCGGAAGGCUCGUCCACGAAGGGUGAGUCAGGACCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGAUAACGGGUCAAAAUUCCCGUACCGUUUAUUGUUUGUGUAGAGGGACGGAGAAGGCUAUACCAGCCGGUGAUUGGUUGUUACUGGUUUAAGUAUCUGAGGCUUUGAGAGAUGGAGAAAACAUCUUGAGCUGAAGUACAAAUACGAUACGUAGGACAGUUUUUCCUUGUGAAAGAUUCGAAUACGGAAGUGGUUAGAUGUCACGCUUCCAAGAAAAGCUCUAAACACGUUAAGCAAUAAAUGCCUGUACCCAAAACCGACACAGGUGGGUAAGUAGAGAAUACUAAGGGGCGCGAGAUAACUCUCUCUAAGGAACUCGGCAAAAUAGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCCCUUUUUAUAAGGGCCGCAGUGACCAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCCGCAAAUUCGUAAGAAGAAGUAUGGGGGCUGACGCCUGCCCAGUGCCGGAAGGUUAAGGAAGUUGGUUAGCCAUUAGGUGAAGCUAGCGACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCAGGUAAGUUCUGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCGGAGAGAGACUCGGCGAAAUAGACAUGUCUGUGAAGAUGCGGACUACCUGCACCAGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGGGUUCGGGCUUUUCUUGCGCAGUAUAGGUGGGAGGCUAUGAUAGAAUCCUUGUGGGGAUUCUGGAGCCGUCAGUGAGAUACCACUCUGGAAGAGCUAGAAUUCUAACUUUAAGCCGUUAUCCGGCUAAAGAACAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAAGUAACGGAGGCGCGCAAAGGUUCCCUCAGGCUGGACAGAAAUCAGCCGAAGAGUGUAAAGGCAGAAGGGAGCUUGACUGUAAGACCUACAAGUCGAACAGGAACGAAAGUUGGCCUUAGUGAUCCGACGGUACCGAGUGGAAGGGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAACCUGGGGCGGUAGUACGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUUAAAGCGGUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCAUAUCCGGUGCAGGCGUUAGAGCAUUGAGAGGAAGCUCUCCCUUGUACGAGAGGAUCGGGAGGGACACACCGCUGGUGUAUCAGUUAUCGUGCCAACGGUAAACGCUGAGUAGCUAUGUGUGGAGAGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGUGGGAAGCCCACCUCAAGAUGAGUGCUCUCAUCGCCAUCGAGCGAGUAAGAUCACGGCAAGAACAGCCGUUUUAUAGGUGUUAAGUGUAAGUGUAGUAAUACAUUCAGCUAAGACAUACUAAUAGAUCGAGGGCUUGACUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.dd.dddd)))...D.(((((((..(((DDD..DD))).....)))))))...))))...(((....)))......(((((((((.........))))))).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((....((((((((.....))))))))......((((((((......((.(((...(((((.(((...(((((.....)))))(((...).hhh.....))HHH...)))...)))))...)))))..))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..cccc)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.(((((((((((....)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((.((((..(((((....)))))..))))...((....)).(((((.....)))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((....(.(((((((..(.(((...((((((((...(((((((....))))).))...))))))))..)).).)..)))))))....)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....f.ffffff...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))))))..........))......FFFFFFF)))...)))))))((((((.............))))))....))))))(.((((((.((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((.((...((.....)).))))))....(([[[[.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((((((((((...((((..(((..(((((((((((...........))))))....((((....((((....(((((((.....))))))).))))...))))......((..((((....((((((((.....))))))))....))))))..)))))....)))...))))........))))))..))))...)))))))))))]]]]..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))((((((.....))))))(...).......(((((((((..((g....(....G))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..(((....)))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..eeeee..(((......((((((((....))))))))...)))......))..).EEEEE))))))))))))))))))...(((((.((((.....))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((ii....iiiiii((.((((((.......))))))...))ii)(.(((II....IIIIII....(((((((({...(..})))))))).(((....))).II))).).....(((((((.((..CCCC..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....)))))......)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...<<<<<<<<..((((...(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).))))))..(((....(((((...........)))))....))).))))..)...>>>>>>>>..((((......)))).(..(((((((((.......)))))....(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)..)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((....))))....(((((.(((....))))))))........(((.....[[[)))................((((((((((((.......)))))...)))))))...]]]....(((....))).((((..((((((((.........))))))))...))))..(((((..(((((......))))).)))))................................(((((..((((........(((((....((((((((.....))))))))))))).[[[[[............))))...............((((.....))))(((((....)))))...]]]]].........(((((....))))).)))))..((((..[[[[.))))(((((........)))))......((((((....))))))...]]]]......................(((.....[[[[))).......]]]].......(((..[[[[[))).......(((..((((....))))...)))...(((((((..(((((....)))))..)))).)))]]]]].......((((((((...(((((((((((((((((((..(((((....)))))..)))).......(((((..(((.....)))))))))))))))))))))))........((((((..((((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))........))))))))(((.....)))......)))))).....))))))))....(((..[[[[)))...]]]]..(((((((......((((((.(((...((((((...))))))..(((((....)))))))).....(((.....)))......)))))).....))))))).(((.((((((((((......))))))))))...[[[[.))).(((..(((.....)))..)))]]]]......(((((...(((((((....((((((((((((.....(((((((((.((((.........)))).))))....((((........)))).))))).)))))))))))).(((........)))..........))))))).)))))(((.[[[[[)))......]]]]].....(((.((((.((((((((((..........((((((((....)))))))).)))).(((....))).))))))..(((.....))).....((((((.......))))))))))....)))...((((((.....(((.[[[[[.))).........]]]]].))))))..(((...(((....)))...)))..(((...[[[[[))).....]]]]].((((((...............))))))....(((...[[[[)))......]]]]...((((.......[[[[[...(((((...((((((.......)))))))))))..)))).......]]]]]..(((..[[[[[[[)))....]]]]]]].......(((((((.[[[[[.....))))))).........]]]]].........(((.....[[[[))).......(((......))).]]]]..((((((.....[[[[[[[[[(((....)))))))))........(((......)))......((((....))))..]]]]]]]]]......(((((...[[[....)))))((((...(((((.....)))))...)))).]]]...(((....))).........((((.....[[[))))...(((....)))..]]]..(((((((.(((....)))..))))))).((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]].(((.....[[[[((((((.....)))))).)))....]]]]........((((..(((((((((.....)))))..))))...))))...((((((......))))))...(((....[[[.)))......]]]..........(((((.((((((((((((((((.((((((((((((...)))..(((((..((((....(((((((((....))))))))).))))(((.....))).)))))..))))))))).)))))....(((((.((((.....)))))))))..)))))))))))..)))))..(((....[[[)))((((((...........)))))).]]]..(((((((((..((((((.......))))))..........[[[[[...)))))))))..((((..(((......)))..))))............]]]]]..(((..(((((((...[[[[[[....))))))).)))...........]]]]]]..(((.............[[[[)))....(((......)))..]]]](((((.((((..((((((((((((((((....(((((((......))))))).....(((((.....)))))......)))....))))))))......(((((((....))).)))).....))))).)))))))))...........(((......[[[[[[)))...(((.....)))]]]]]]..((((.[[[[)))).(((((((((((....))))))...))))).]]]]...((((...........[[[[[....))))...]]]]].((((((.......(((((.[[[[[)))))......]]]]].....(((((((((.......)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..))))).)))...))))..)))))).....
|
|
CRW_00548
|
[ FASTA input ]
|
UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((....((((((((.....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...((((((......((((((........((((....[[[......))))..]]]...)))))).(((((((((......)))))))))..(((((...(((...))))))))))))))...
|
|
CRW_00552
|
[ FASTA input ]
|
CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((.(((..(((((((......)))))))((((((.......(((((....(((....)))...)))))....((((....))))..))))))..))).))))))))))).
|
|
CRW_00555
|
[ FASTA input ]
|
ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((((((....))))).........((((..[[[......)))).(((...))).]]](((............[[[[)))...]]]](((.....)))....))))))))))..
|
|
CRW_00567
|
[ FASTA input ]
|
AAUCCCCCGUGCCCUUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((......((((((((((.....)))))..(((((....))))).......)))))...(((.......((((((((....)))))))).......))).))))))))))))
|
|
CRW_00570
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))))).(((((.......((((((((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((..(((((.(((............))).)))))...)))))))).....(((((((.((((((((....))))))))...)))).)))))))))))).
|
|
CRW_00573
|
[ FASTA input ]
|
UGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.........((((....)))).((((((((((.....(((....)))...(((((.......))))).))))))))))..(((.(((....))))))..)))))))))).
|
|
CRW_00579
|
[ FASTA input ]
|
GUUGGCUACUAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUAACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUUGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACACCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCUCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGACACUACACAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCGAGUCAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGACAGAGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCAUUCAUACG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((......))))))........((((((........((((((((....(((((..............[[[[[[...[[[)))))..]]]......]]]]]]...........(((.[[[[)))....(((((.....)))))]]]]...(((((..(((((.[[[[[))))).)))))....................]]]]].....(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).....)))))))).(((.[[[[[[[....)))..................(((.((((....)))).))).]]]]]]]..((((....[[[....))))....]]](((((((........)))))))......(((((..[[[[.))))).(((..........))).....]]]]..(((....(((((((......)))))))......[[[)))...]]]..................(((((((((........((((((((((((......((((.(((.........(((((....))))).........))).)))).....)))))))))))).(((((....))))).....(((..((((((((((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...((((...))))...)))))((((((....))))))...)))))))))))))).)))....((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))...)))))))))....((((..[[[[))))..]]]]..((((((...(((.(((((((((...(((.....(((.((((((.(((.((((....)))).))))))))).)))...)))....)))))))))))).......)))))).(((.((((((((((.....))))))))))....[[[)))...]]]...((((((((..(((..........((((((....))))))......(((((......(((.(((((.(((((((((..((((.......))))..))))......((((......)))).)))))....))))).))).(((.........)))........))))))))..))))))))..((((.....[[[[))))....]]]]..........((((((((..[[[.((((((((....))))))))...)))))))).........]]].........((((((.....((((((.......))))))[[[.....[[[[...[[[[[[[[[[[.))))))....]]]]]]]]...]]].]]]]...]]].....(((..[[[[[[.........(((...(((((........))))).)))...)))......]]]]]].((((((((...(((((((((((((....)))))).....(((((....(((((....((((...)))).....))))).....)))))..........)))))))...))))))))..........(((......[[[[[)))..........]]]]].((((((......(((....))).((((....((((.....((((((((.((((........((((((((((.....(((....))))))))((((((((((...)))))))))).....)))))..(((((((.....(((((((((.......((((((((....(((....)))......))))))))....((((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....))))))((((.(((((..(((....)))...)))))))))..(((((.......))))))))).....)))))......)))))))....)))))))))))).)))).....((((((......)))))).))))...)))))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((.(((((((((((((((((((.........(((((....((((.....(((.(((((....)))))..)))........)))).....)))))))))))))))))))..)))))((((....)))).....))))))))..)))))......(((((.[[[[((((((((.......))))))))))))).......(((..((((((.......))))))..)))]]]]..............(((...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))[[[..)))..]]].....((((((.....))))))...(((((((...............[[[[.......)))))))(((....))).....(((((((((((((....))).))))..))))))]]]]..((((((((((((......)))))).))))))(((..[[[[[)))..............]]]]].........((((((....)))..[[[[[.[[[[[[.[[[..)))..]]]]]]]]].]]]]].....((((((((.....[[[[......))))))))(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).]]]]........(((((.((((((((((((((.....))))))..)))...))))))))))..(((((..[[[.....)))))...]]]..))))))............................
|
|
CRW_00583
|
[ FASTA input ]
|
GUUGGCUACUAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUAACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUUGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACACCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCUCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGACACUACACAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCGAGUCAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGACAGAGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCAUUCAUACG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((......))))))........((((((........((((((((....(((((..............[[[[[[...[[[)))))..]]]......]]]]]]...........(((.[[[[)))....(((((.....)))))]]]]...(((((..(((((.[[[[[))))).)))))....................]]]]].....(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).....)))))))).(((.[[[[[[[....)))..................(((.((((....)))).))).]]]]]]]..((((....[[[....))))....]]](((((((........)))))))......(((((..[[[[.))))).(((..........))).....]]]]..(((....(((((((......)))))))......[[[)))...]]]..................(((((((((........((((((((((((......((((.(((.........(((((....))))).........))).)))).....)))))))))))).(((((....))))).....(((..((((((((((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...((((...))))...)))))((((((....))))))...)))))))))))))).)))....((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))...)))))))))....((((..[[[[))))..]]]]..((((((...(((.(((((((((...(((.....(((.((((((.(((.((((....)))).))))))))).)))...)))....)))))))))))).......)))))).(((.((((((((((.....))))))))))....[[[)))...]]]...((((((((..(((..........((((((....))))))......(((((......(((.(((((.(((((((((..((((.......))))..))))......((((......)))).)))))....))))).))).(((.........)))........))))))))..))))))))..((((.....[[[[))))....]]]]..........((((((((..[[[.((((((((....))))))))...)))))))).........]]].........((((((.....((((((.......))))))[[[.....[[[[...[[[[[[[[[[[.))))))....]]]]]]]]...]]].]]]]...]]].....(((..[[[[[[.........(((...(((((........))))).)))...)))......]]]]]].((((((((...(((((((((((((....)))))).....(((((....(((((....((((...)))).....))))).....)))))..........)))))))...))))))))..........(((......[[[[[)))..........]]]]].((((((......(((....))).((((....((((.....((((((((.((((........((((((((((.....(((....))))))))((((((((((...)))))))))).....)))))..(((((((.....(((((((((.......((((((((....(((....)))......))))))))....((((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....))))))((((.(((((..(((....)))...)))))))))..(((((.......))))))))).....)))))......)))))))....)))))))))))).)))).....((((((......)))))).))))...)))))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((.(((((((((((((((((((.........(((((....((((.....(((.(((((....)))))..)))........)))).....)))))))))))))))))))..)))))((((....)))).....))))))))..)))))......(((((.[[[[((((((((.......))))))))))))).......(((..((((((.......))))))..)))]]]]..............(((...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))[[[..)))..]]].....((((((.....))))))...(((((((...............[[[[.......)))))))(((....))).....(((((((((((((....))).))))..))))))]]]]..((((((((((((......)))))).))))))(((..[[[[[)))..............]]]]].........((((((....)))..[[[[[.[[[[[[.[[[..)))..]]]]]]]]].]]]]].....((((((((.....[[[[......))))))))(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).]]]]........(((((.((((((((((((((.....))))))..)))...))))))))))..(((((..[[[.....)))))...]]]..))))))............................
|
|
CRW_00589
|
[ FASTA input ]
|
UCUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGUACUGUAUAUAAUAUAUAGUGGCGCACGGGUGCAUAACACGUAAGAACCUACCCUUGGGAGGGGAACAACGUCUGGAAAUGGCCGAAAAUACCCCGUUAGCUGAGGAGCAAUAGGAGGAAUUCGCCCAAGGAGGGGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGCAAUAGCUUACCAAGGCGAUGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGUAAAAGGCUUAUGGGUCAUGAACUUCUUUUCCCAGCGAAUAAAAAUGACGGUAUCUGGAGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGAGUCUGUAGGUGGCUUUUUAAGUCCGUCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGUAAUACGGUGGAAACUAUCAAGCUUGAGUACGUUAGGGGCAGAGGGAAUUUAUGGUGGAGCGGUUAUAUGUGUAGAGAUCAGAAAGAACACCAACGGCGAAAGCACUCUGCUGGGACGAUACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAUACCCCGGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAAGCGCUGUGUAUCGACCCGUGCAGUACUGUAGCUAACGCAUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUAUGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGGCGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAAGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUCCUAUCGAAAGAUAGGGGUGCCCUCGGGAACGUGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCCCCUAACGAGCGCAACCCUCAUGUUUAGUUGCCAUAUAGGAACUCUGAGCAGACUGCCGGUUAUAAGCCGGAGGAGGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGUCGGGACAAAGGGCCGCAAUACCGCGAGGGCGAGCUAACCCCAAAAACCCUUCCUCAGUUCGGAUUGAAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGUAGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGUGAAUUUGUUCCCGGGCCUUGUACACACUGCCCGUCACACUAUGGGAGCUGGGCAUACCCGAAAUUACCUUAACUACAAUUUUAAGUAGGGGGAUGACGAAGGUAGGACUAGUGACUAGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((...)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((...(((((((....)))))))....)))))....(((....)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((.(....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(........)....))))))..)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((((...)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((........))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((..(((.....)))...))))))).....(((((.....))))).......)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((........))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....(((.((((.(((.........))).)))))))......))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
((((...))))(((((.(((((...)))))))))).......(((((..[[[[.)))))..]]]](((((((((...)))))))))((((....)))).((((..(((......)))[[[[[[[.((((......(((.......)))........))))))))(((....)))....(((....))).]]]]]]].....(((....((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..[[[[[[[.))).....]]]]]]]....(((((.......[[[..))))).((((....))))......]]](((((..(((((.....(((....)))..)))))..[[[[[[...((((((....((((....))))....)))))).)))))...............]]]]]]...............(((((..[[[[[[......))))).......]]]]]]((((((((((((..((((......(((((.(((((((((.......))))))))).)))))..(((.(((((((..((((..((((.......(((((...))))).(((((.((((((((...(((((((........(((((..(((......))).................)))))............)))))))..)))).))))...............)))))))))))))...))))))).)))...))))((((.....((((.....))))..)))))))))).))))))..((((((((....))))................[[[[[[[))))((((..((((....))))...)))).........]]]]]]]..((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]].....(((((........[[[[[..(((((((....)))))))..)))))......]]]]]...........(((((((((....)))).)))))(((...[[[..(((......)))...)))..]]].((((((.(((((((................))))))).....(((((.....)))))..))))))(((((((((.....)))))).[[[[[))).......]]]]].....(((......)))...(((......((((((.........[[[))).)))...)))......]]](((....[[[)))..]]](((((.......(((((.....)))))...........[[[[[[[..)))))...]]]]]]]....(((((((((((...(((........((((........))))......)))..)))....[[[[[[[..((((........))))))))))))..]]]]]]].......((((...[[[[)))).........((((((((((....))))))))))..]]]].......
|
|
CRW_00590
|
[ FASTA input ]
|
UCUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGUGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGAACGUAAAAUGGUCUUUUAAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAAUCUGUCCUUGGGAGGGGAACAACAGUUGGAAACGUCUGCUAAUACCCCAUAGACUGAGGAGUAAAAGGAGGAAAUCCGCCCAAGUAGGAGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGAAAUAGCUUACCAAGGCAAUAAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCUUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCUAAAGCUGACGGAGCAAUGCCACGUGAAGGUAAAAGGCCCCUGGGUCAUGAACUUCUUUUACCAGAGAAUAAAGCAAUGACGGUAUCUGGUGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGAAAUACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGAUGGCUUUUUAAGUCUGCCAUAAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGUACAGGUGGUAGAAACUAUAAAGACUUGAGUUUGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUUCGGUGGAGCGAUAAAAUGCAUAGAGAUCGGAAAGAACACCAAUGGCGAAGGCACUCUGCUGGGCCAAUACUGACAUUGAGAGACUAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGGUACCCCAGUAGUCCUAGCCAUAAACGAUGGAUACCAAGUGCUGUGUGAAUCGAUCCAUGCAGUGCUCUAGCAAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGACGUGGGCCCGCACAAGCGAUGGAGCAUGUCGUUUAAUUCGAUGCAAAGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGUUAUGCCGCGAAUACUCUUGAAAGAGAGGAGUGCCCUAGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCCCAUAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCAAUACUUAGUUUGGAACUCUAAACAUACUGCCGGUGUUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCUACACACAUGCUACAAUGGACAGGACAAAGGAUUGUAAGUCCGCGAGGUUUAGAUAACUCCAAAAACCUGUCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGUGAAUUAGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACUAAAAGAGCUGGCUUUGUCCUAAGUCAUUUUUACCUUAACCACAAAGGAGGGGGAUGCCAAAGGCAGGGCUAGUGAUUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((.....)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((...(((((((....)))))))....)))))....(((....)))....(((.....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((.(....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(..........)....))))))..)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((((...)))))))...)))))))))..)))))))).)...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((..(((((.((...)))))))...))))))).....(((((.....))))).......)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((........))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((((....((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
((((...))))(((((.(((((...)))))))))).......(((((.[[[[[.)))))..]]]]]...................(((((.........(((...(((((((..(((((((((((..((((.....(((..........)))......)))).....)))))))......(((.....))).......))))..)))))))((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))..))).((((....)))).....))))).(((((.(((.....)))))))).((((....)))).((((.((((((....)))))).....[[[...))))....]]]..(((.....[[[[)))...((((....)))).....]]]].(((((((((..........[[[......)))))))))....]]](((((..[[[[[[[.....)))))......]]]]]]]((((....)))).............((((..[[[[[)))).......]]]]].....((((((((.......(((((.....))))).....))))))))..((((..((((....)))).)))).(((((((....((((((((...(((......)))......)))))))).........[[[[.......)))))))..]]]]................(((...[[[[[[[.......[[[[....)))..]]]]....]]]]]]]..........((((((..(((((((((((........)))))))))))........[[[[[[[[))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..]]]]]]]].....(((.((((((((.....))))))))..[[[[.)))....]]]]..........(((((........[[[[[....(((((....)))))....)))))......]]]]].....((((((...((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....[[[[((((((((...((((........))))....))))))))))))))............]]]]...(((((((((((.....))))))..[[[[))))).....]]]].................(((((((((((....))))..(((...[[[.....)))..]]]......)))))))(((.[[[[[..(((((((........))))))))))..]]]]]...(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...(((((...(((((............)))))....)))))....((((((((((........(((((((.((((.......))))..)))))))[[[[...))))))))))..]]]].((((.........[[[[((((((((((....))))))))))..))))..]]]].
|
|
CRW_00591
|
[ FASTA input ]
|
CAAGCUUAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGAGUUUUUAACUCUAGUGGCGAACGGGUGAGUAAUACGUGAGAAUCUGCCCUUAGGAGAAGAAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAGUCUUCAUAUGCCGAGAGGUGAAAUAGUUUCAACUGCCUAAGGAUGAGCUCACGCCUGAUUAGCUUGUUGGUGAGGUAACGGCUUACCAAGGCCACGAUCAGUAGCUGGUUUGAGAGAACGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUCCGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAGGGAUGAAGGAUUUUGGUCUGUAAACCUCUUUUCUCAAGAAAGAAGUUCUGACGGUACUUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGGGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUCAUUGGGCGUAAAGCGCCUGUAGGUUGUUUAGUAAGUCUGUUGUUAAAGACCAGGGCUUAACCCUGGGAAAGCAAUGGAAACUACUAGACUUGAGUAUGGCAGGGGUAGAGGGAAUUUCUAGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUUAGAAAGAACACCGGCGGCGAAAGCGCUCUACUGGACCAUUACUGACACUCAGAGGCGAAAGCUAGGGGAGCAAAAGGGAUUAGAUACCCCUGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGAUGUUGCGCAAUUUGUGCAGUAUCUUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCUCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUACUACAAAUCUUUUCGAAACGAAAGAGUGCCUUCGGGAAUGUAGAUACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCAUUUUUAGUUGCCAAUUUAUUGGGAUUUCUAGAGAGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCCACACACGUGCUACAAUGGCGAAGACAAAGAGUCGCAAACCUGCGAAGGCUAGCUAAUCUCGUAAACUUCGUCUAAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCUGGUCAGCUAUACAGCGGUGAAUUCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGCUGGUCAUACCCAAUAUCGUUAGCCUAACCAUUCGGGAGGGCGGCGCUUAAGGUAGGGCUAGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
........(((......[[[..))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((((((((...))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((...(((((((....)))))))....)))))....(((....))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((.(....)))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((((...)))))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((.....))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((..(((.........)))...))))))).....(((((.....))))).......)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((........))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((((.((((..((.....)).))))))))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...(((....((((.((((((...))))))))))...))).(((((.......)))))..((((....((((((...))))))..))))..(((.[[[[[[....)))..........(((((((.(((((....((((((....)))))).....)))))...((((....))))...((((....)))))))))))....]]]]]]((((.(((((.[[[))))).))))...(((((....))))).]]](((...[[[[[[[)))......]]]]]]](((.(((((.(((.....)))))))).((((....)))).[[[[.)))..........(((.....)))...]]]].((((((..[[[[[[[.((((......((((....)))).....))))(((((....)))))..))))))..(((((..(((.....(((....)))..))).)))))......]]]]]]]......(((((((..((((((((((.((((..(((((((...)))))))..))))((((((((..(((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)))))))).....((((((((((....((((..((((((((((.(((......)))....))))))))))...................(((((............((((...)))).(((....)))...)))))................))))....)))).)))))).....))))....((((((((((((...))))))))))))....)))))).....))))))).(((...((((.(((((....)))))..))))..)))...(((((((...((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]...(((((((........(((((..((((((......)))))).............)))))....(((..((((.(((((..((((((((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((.....((((....))))..((((....))))...(((((.....)))))..)))))))))).)))))...)))))))))...)))...))))))).........(((.(((((((((...(((.....)))....(((.((((..((((((...(((....((((((((((......))))(((((((........))))))).)))))))))...))))))..)))).)))..)))).....(((.(((....))))))....))))))))....)))))))....((((..[[[[[[[.[[[[......[[[[.[[[[..))))......]]]]]]]].....]]]].]]]]]]]((((..[[[[[)))).........((((((((((....))))))))))..]]]]]......
|
|
CRW_00594
|
[ FASTA input ]
|
CAUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCGCCCCAAGGACACAAGCCAUGCACGCCGGCGCGGCACGGCGAAGGGGCGGACGGCUCAGUACACCGGUUGCACCCUGCGCGGCGGUCGGGGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCAGCGACAAGACGAGCGCUCAAGCGCGGCCGGGGAGCCGGCGCGACGCAGCGAAUGGCCGCCUGGGCUUCCGCGGCAUCACCCCGCGGGCACGGUCGCGGCGUGCCCGGGGUCUCACGCCUGGCGGAGGAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGAGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGGGCGCGAGGCAGCGACGGGGCGUGCCGGGACCCGGCGCGGGCGUGGCGUACAGCCCCACGCGUGGAGUCGAGGGAAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCAGGCGUCGCGCGGCGCUGCUGCAGUUAAAACGUCCGGCGUCGGGCCGCCCUGCCGGGAGGAAAGGGGAGCGCUCGAGGCAGGCUCGUUGGACCUACCGCCCGGGACGGCGAGGAGAGUGGGCGGGGGCAUUAGUACCGGACGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCUCCGAGACUCCCCGCGGCGCAGGCGUCUGCCAGGGCCACCUCUGUCGAUCCAGGGCGAAGGCCGGGGGCGAGAAGGCGAUUAGACACCACCGUAUUCCCGGGCGUAAACGGUGCCGCCCCGGCGCCGGCGUCGGUCGGCGCCCCAGGGAAACCGGUCAGGCUCCGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGGAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGAUGUGGAGUCUGCGGCUCAAUUUGACUCAACGCGAACACCUUACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGAUCGACAGCCGGGUGCGCUUUCGUGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGUUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUUCACUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCACACCCGCGUGUGGGACCGCCGCCGGGGAGGCGGAGGAAGGCGGGGCGAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGUACUACACUGGGCCGGGCAGCGCGCGCGCGGCCGCGAGGCCGGGCGACCCGCCAAGCCGGCCCGUGGUUGGGAUCGCGGGCUGGAACGCCCCCGUGAACCCGGAAUAUCUCGUAGGCGCGUGUCCCCAACGCGCGCCGGAUGCGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCCGCGGCGAGUCCCCGGGAGCCCCCGGUGAACGGCGACGAGCCCUGGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUAG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((..(.......(((.(((..((...(((......))).....))......(((......(((((((...((...(((((((...........((.....((((((....))))))......)).........................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).))))))...)))))..(((((...)))))....((((((.........)))))).....((((((........((((((................)))))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((.....((...(((((.........................................)))))...)).....(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((....)))))))))...((....)).....)))...))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((......(((((((.......)))))))....)))))...(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((....))))))......((((.....))))........))))...))))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))))....((((((.........(((.(((((....))))).)))...........))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..............(((..[[[[)))..]]]](((((..............(((.[[[[[))).....]]]]]..)))))..((((((........(((((((.((((((((((((((((((((((((........))))))..))).(((.........((((....)))).(((((....)))))....))).......)))))))(((((((((((......(((((..(((((((.......)))))))))))).....(((((..(((((((....)))...))))(((..(((((((........)))))))...)))...........)))))))))))...)))))..)))))))).)))....(((((((((..(((((((...)))))))..((((((.........))))))(((....((((((...(((..(((.(((((((((.(((.......((((((((((.((((....)))))))))).)))).......)))...((((((..((((............))))...))))))....)))).)))))))).)))....((((((((((((((((...((((((.....(((..((((.((((..................))))))))..)))))))))(((...(((....)))...)))..)))).....(((...........((((((((....(((.......((((((((....((((.(((....(((((((.(((((((((((((....))))))))).(((((...((((.......)))))))))))))((((.(((((....)))))..))))...)))))))(((((((.(((((..(((((.....)))))(((((....(((((((..((((....(((....)))......))))..)))..)))).)))))))))).)))))))...))).))))))))))))....))).((((.(((((..(((....)))(((...........))).....((((...(((((((((...(((((((((.....(((((.....))))).....(((((((((...(((....)))..))))).....)))).....))))))))).........(((((((...(((..(((.(((((....))))).)))...)))....)))))))))))))))).))))))))))))))))))))).......)))...)))))).(((((((((.....))))))))).....))))))...))))))..)))....)))))))))...)))).((((((((((.(((..(((.(((...(((...)))...))).)))..))).))))))))))..........))))))....(((((((((((((....))))))))))....)))..
|
|
CRW_00596
|
[ FASTA input ]
|
CAUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGUACUACGCUACCCCAAGGACAAAAGCCAUGCAAGCGGACACGAGGUAUGAAGUGGCGGACGGCUCGGUACAACGGUACGAGUCUGACCGGGGGUGAAGGCUAGACGGAUACCGCUGGCAACCCAGCGCCAAGACGAGUGCUCAAGAGCGGGGAAGGAAAGCACGCGAUGGAGCGAAUGCCCGGAUGAGGUUCCGAGGUAUUACCUAGUCGGUAGAGUAGUGGUCUACGGAGGGGAUGAUGCCUGGCGGAGGAUCAGGGUUUGACUCCGGAGAACGGGCCUGAGAGACGGCCCGUACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGUGAAGGCGUGAGGCAGCAACGGGGGAUCCCAUGAAAUGGGAAGACUGGGGGGUAGAUGACCCCAGCACAAGUCGAGGGAAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCAGGCGUCGUACGGCGCUGUUGCAGUUAAAACGUCCGGAGUCGAGACGUCCAGCCGGGAGGAAAGAGGAGCGCUUAAGGCGGGAGUGAGUACGAGAAAGCCCGGGACGGACAUGAAGGUGAAUGGGUAAGGGCAUGUGUAUUGGUGGGGGACGGGUGAAAUAGGAUGAUCCGACCAAGACAGACAAAGGCGUAGGCACUUGCCAAGACCAUAUCAGUCGAACCAGGACGAAGCCCGGGGGCGAGAAGGCGAUUAGACACCACCGUAUUCCCGGGCGUAAACGAUGCCACCGAGAGACUGGCCAGGUCGUCAGGAUCGAAGGGAAACCGAUCAGGGUACGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGGAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUUUGACUCAACGCGAACACCUUACCAGGCCCAGACGUACGGAGGAUCGACGGUUGAGAGGACCUUCGUGAUCGUACGAGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCACAGCCCGUGGCUUGAGCCGUCUGCUUGACUGCGACAACGAGCGAGACCCUAACCUGGAUGGGACCGCCAAUGGUGAAUUGGAGGAAGGUGGGGCGAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGCCCUGGGCUGCACGCGUACUACACUGUGGGGAUGAAACCACGUCGAGUUGUGAAGCUUGAUGAGAUCAACCCCCACGUGGUUGGGAUCGUGGACUGGAACGUCCUCGUGAACCUGGAAUGUCUAGUAGGCGUAGGUCAUCAAUCUACGCCGGAUACGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGUCUUCUGGCGAGCUCCUGGGAGGGAUGAACCGAACAGGGACGAACCGCGAGGCUUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCAUCG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((.......(((.(((..((...(((..........)))))......(((......(((((((...((...(((((((...........((.....((((((....))))))......)).........................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((....))))).))))))).)))))..((((((...))))))...((((((.........)))))).....((((((........((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((.....((...(((((.........................................)))))...)).........(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((......)))))))))...((....))......)))...))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((......(((((((.......)))))))....)))))...(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((.....))......((((.....))))........))))...))))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))))....((((((.........(((((((((....)))))))))........))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((.(((((((((((.....((((((((((......)))))).))))....))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......)))))).........((((((............(((((.......[[[...)))))..]]].(((..((((((.(((....)))))))))...)))))))))...(((((.(((...))))))))..(((..............[[[[[....[[[)))..........]]]....]]]]]((((((((((......)))).)))))).(((.[[[[(((((.......)))))..)))...]]]].((((((...((((.....((((((((((((..(((((((........)))))))...)))..((((((((.(((((......(((.(((.((((......))))..(((.....(((....((((((...))))))...))).(((((.....))))).......)))..))).)))))))).)))).(((((((.(((.......))))))).((((((....))))))..))).........)))))))))))))..)))).)))))).......(((((((.....(((((......(((((((..((((((((...........(((.....(((...((((.((((.(((((......(((((...........)))))))))).................)))).))))...)))......[[[..)))..]]]...(((((((((((....................)))..)))))))).....(((((((.......(((......[[[[)))..]]]].........(((.[[[[[...)))(((((....)))))...(((....))).....]]]]].)))))))........(((((((((..(((((((((.............)))))..))))............[[[[....(((((((.....(((.((((.....)))).)))...)))))))..)))))))))..]]]](((((.((((...))))))))).(((.[[[[[.....)))..]]]]]....(((..[[[[....)))....(((((.....)))))....]]]].(((((...(((....)))..)))))........))))))))................(((((((((......(((((((((....)))))))))...((((((.[[[[[.))))))...]]]]]((((((...(((..........)))...)))))).(((((((((.....))))))))).....)))))))))..)))))))...)))))...)))))))..(((((...((((((..((((((((((....[[[[........)))))............)))))..))))))...)))))........((((((((((....)))))))))).]]]]....
|
|
CRW_00597
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAACCUGCCAGAAGGGCAAGCUAAGAUUAAGGAUUAAGCCAUGCAUGCCAGGUAUAAGCUAAUACACAGGUGAAACUGCGAACGGCUCAUUAAAUCAGUUGAAAUGUCUCGUGCUUUAUUCGUAGUCGGCUAAUACGGGCAACUCUCUUACUAAUCGUGCUUCGUUACAUCGGUAGUGAGAGCGAUCUCGGGUUGAUUUAUGUUGUAAAAAUGACUGUUAGGCAGGCACGAUCAGCUUCUGACGCAUCAUUAAGUAGGAGAAGUAAAGGUUAUCCUAUGAGUUCACGCGUACCGGAGAAUUAGGGUUCGACUCCGGAGAAUGAGCAUGAGAGACGGCUCAUAGUUCUAAGGGAGGCAGCAGGCGCGGAAAUUGCCCAAUGUACAAACGUACGAGGCAGUGACGAAAAAUCUUGAGCCGGCUUAGGCCGGUAUUAAGCUGAGCGAGGCGCACACACCCUCGCGAACGCAAUUAGUGGGAGAGCAUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAUCACUGAUAGCUUUCUCUUACGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGCCGUUGUUAGCCCCGCGUGUCACUUUGAGAAAAUCGGAGUGUUCAUUACAGGGAAACCGCUGCACAGUACAGCAAAGAAUGACAUUGCUCCCCGGCGACGGGGGGUACGGAGUAUAUGGCGGCGCGGGACUGAUAGUAUUUGGUGGGGACAGGUGAAAUAGGAUGAUCCACCAAGGACUUUCAACAGCGAAGGCAGUCGGUAAGCGCCGUCCAGUUGGUCAAGAGCGAAAGUGUGAGGAUAGACGAUGAUUAGAAACCGUUUUAUUUCACGCCUUAAACGAUACCAUCUCAGAAGCGGGCUCAGAAGUCCGCAUCUCAAGGGAAACCGCAAGUUUCGGGUUCUGGGGGAAGUAUGAUUGCAAGAUUGAAACUUGAAGGUAUUGACGGAAAGAUACCACAAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUUUGACUCAACACGCAAAUCUUACCAGACCCAGAUGCUUUACGGAGCAACAGAUUAAGAGUUCUUUUGCGAUUGGGCAGUUGGUGGUGCAUGGCCGCUCCUAGUUCGUGGUGUAAACUGUCUGCCUUAUUGCGUUAACGAGCGAGACAACCACCCCCAGCCUGGGGGGAGCGCCUGCGUUGAGCAGGACGAACGUGGUUGCUCUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACACUCUGGGCCGCACGCGUACUACAAUGUCGGCUGCACAGCGUCGCCCGCCUGAAGGCCCGGCCAUUCGUGUGAACCGCCGACGUGGUAGGGAUCGGAGAUUGGAAUUUUUCUCGUGAACGAGGAAUGUCUUGUAGGUCUGCGUUAUUAGCGCGGGGCUGACUAUGUCCCUGUCUUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUUGGAUGUUUUGGUGAGUUGUCCAGAGUGCGCGUCGCGGCAUGCACGAAGUUCUGCGAACCCCAAUGUCUGGAGGAAGGAGAAGUCAUAACAAGGCUGCUGUAGGGGAACCUGCAGCCGGAUCAUUAGUGCC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((..(((((((......(((.(((..((..(((.....................)))))......(((......(((((((...((...(((((((........(((((....((((((....)))))).....)))))................................................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((....))))).))))))).)))))...(((((((((((....)))))).)))))....((((((.........))))))........((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((..((...(((((...................................................................................)))))...))........(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...((....))...))))...))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((......(((((((........)))))))....)))))...(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((......))))......(((((.....)))))........))))...))))).)))...).))))))))....)))))))...)).)))))))))....((((((..((((.....(((.(((....)))..)))......))))....))))))......(...((((((((.......))))))))...).....))))))....((((((((.......))))).)))...........)))))))))).))....((..(.(.(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)...))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
..((((((...)))((((.....)))).[[[.......)))....]]]...........(((.(((((.......(((......)))....(((((((((((.....))))..((((((((((.(((.(((....))).)))...((((((.(((((((((.........(((......)))((((((..(((.....(((((((((..(((...........((((...))))))).)))))))))....))).))))))))))))))).....(((....))).....(((.(((((.(((((((((....)))...)))))).....(((((((((......))))).))))...............)))))))).))))))...........))))))))))..............)))))))))))).)))........(((((((((((.........)))))).[[[[...)))))((((((((((((((((.........))))...))))........))))))))...]]]](((((((((....)))).)))))..........(((..[[[[[(((((((.....)))))))..........))).....((((.......)))).......]]]]](((((((((....))))))))).........(((((((((...(((((((((.(((((((((...................))))))))).)))................))))))..)))))).)))(((((((((((((....((((((((..(((((............)))))..))))))))......(((((((.(((((((.(((((((....))))))).)))...)))).....((((((((((.((((...))))(((....)))....))))))))))..)))))))......((((.((((.....)))).))))...))))...))))).)))).(((((((((....)))......(((((....)))))..(((........)))))))))...((((((..((((((.....))))))....[[[[[[(((....)))..))))))..........]]]]]](((.((((((((((((...)))))......(((((.....)))))......))))))))))......(((((....[[[[.))))).....]]]]...((((...((((.((((((((..((((.....(((.(((....)))..)))......))))....)))))))).)))).......((((((((...(((((((....)))))))..)))....)))))))))..((((.[[[[[[))))......]]]]]]..........(((((...((((.......))))[[[[[[[...)))))...]]]]]]].(((((..[[[[[[..)))))......]]]]]].........((((......................[[[.((((((((....))))))))))))........]]]
|
|
CRW_00598
|
[ FASTA input ]
|
CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACAUACUUUUACAUAGUGAAACCGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUAGAUCGUACAAUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGAAGCACGGCUCUGACCUCGCGGAAAGAGCGCGUUUAUUAGAUCAAAACCAGUCGGGUCCGCAAGGGCCCGUCGGAUUGGUGAGACUGGAUAACUUUGUGCUGAUCGCACGGCCUCGCGCCGGCGACGUAUCUUUCAAAUGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUACGUGAUAUGCCUACCAUGGUUGUAACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCAUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCUGGCACGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACGGGACUCUUUCGAGGCCCCGUAAUUGGAAUGAGUACACUUUAAACCCUUUAACGAGGAUCUAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUCGGGUCCAGGCUGGCGGUCCGACGCCUGUCGGUUACUGCCUGCUCCUGACCUACCUCCCGGUUUUUUCGCCCUUGGUGCUCUUGACUGAGUGUCUCGGGUGGCCGGAACGUUUACUUUGAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCAAUAUCGCCUGAAUAAUGGUGCAUGGAAUAAUGGAAUAGGACCUCGGUUCUAUUUUGCUGGUUUUCGGAGCUCGAGGUAAUGAUUAAGAGGGACUGACGGGGGCAUUCGUAUUACGGUGUUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUCGCCGUAAGACGAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGCAUGUUUUCAUUAGUCAAGAACGAAAGUCAGAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCUGACCAUAAACGAUGCCAACUAGCGAUCCGCCGGAGUUGCUUCAAUGACUCGGCAGGCAGCCCCCGGGAAACCAAAGUUUUUGGGUUCCGGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACCCGGCCCGGACACUGUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCGGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUAGCCUACUAAAUAGUUCGCUGAUCCCCAUUUGCGUCGGCGCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUUAGCCACACGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCGGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAAGGAAUCAGCGUGUCUUUGCCCUUGCCUGGAAAGGUCGGGUAACCCGUUGAACCUCCUUCGUGCUAGGGAUUGGGGCUUGUAAUUCUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGCGCGAGUCAUAAGCUCGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGGCGUUUUAGUGAGCGCCUCGGAUUGGACCCGGAAAUGGUUGGCAACAACCGUACCGGUGUGCCGAAAAGACGCGCAAACUUGAACGCCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((....................)))))......(((......(((((((...((...(((((((..........(((((...(((((((.....)))))))....))))).......(((((((((....)))))))))....((((((.......((((..(((((((....)))))))......))))......))))))...........((((.((((.....)))))))).)))))))..)).)))))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).)))))....)))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))......((.................)).........((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((......((((.((((...((((((((((....)))))..))))).....)))))))).....((((.....(((((...(((((((......)))))))...)))))))))...............................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((..((((((.((((((......))))))))))))..))....((....))..))))....))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((.((((..(((((((((((..........))))))).))))..))))))).....(((((.....)))))......)))))..))))).)))...).))))))).....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((......(((..((((....)))).))).....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((...(((((..(((((((((((((((((..((((((((((((((..((((..(((((((....))))))).))))....))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))....))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
........((((((((.....(((.(((..((((((((...))).))))).....))).))).(((..[[[[..)))..]]]]...((((((.((((((.......(((((((((((.....))))))...((((.....)))))))))(((.....)))))))))...........[[[[[[[[....))))))..]]]]].]]].......(((((..[[[[[[((((((....))))))......)))))..]]]]]].....((((((((..((((.((((.....))))))))....((((((.......(((((...(((((....(((((((((...)))..)))))))))))....)))))....((((((.......)))))).)))))).))))))))................((((((((...((((((...........((((((((((....(((((((((.............(((((((((.(((....)))..))))).))))..((((((...(((....[[[[[[[[.)))......]]]]]]]].....(((.[[[...)))..]]].((((...[[[[.[[[[[[[....))))..]]]]]]].]]]].....))))))..(((((..[[[[[)))))...(((((((((((....)))))..))))))....]]]]].)))))))))(((......)))..(((((((((((((.....)))(((.((((.((((((...((((((((....)))))))).......(((((......)))))....((((((...........((((((((((....)))))))))).((((((((((((.(((.......(((((((..(((((.......(((((((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))....(((....)))..))))......)))))..))))))).............))).)))))))))...))).))))))....)))))).))))...)))((((.....[[[[[[.((((.((((........)))))))).)))).(((((((((..(((((...))))).)))))))))......]]]]]]...........................)))))))))))))))))))).))))))(((.........[[[[[..((((........)))))))......((((........)))).]]]]]....)))))))).......((((((((.........((((((..[[[[[.))))))................]]]]]...........(((...(((.((((..(((((((((((..........))))))).))))..)))).)))....(((((.....)))))...[[[[[)))........]]]]](((..(((((.........)))))..)))(((((((.....[[[[[[...)))))))...(((((..((((....)))).)))))............]]]]]]((((.((((...(((((....((((((((.........))))))))....((((((((((((.....))))))))...)))))))))..))))..)))).)))))))).....((((.....((((((((((.(((..((((......((((..((((..(((((((....))))))).))))....))))......))))..))).))))))))))....))))....................(((((....)))))...))))))))..
|
|
CRW_00599
|
[ FASTA input ]
|
AACCCGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUGUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGCCUAAGUACAAACUAUUCUUAUGGUAAAACUGCGGACGGCUCCAUAGAUCAGUAAUAGUUCGUUCAGUGAUUUGAAAAAGUACUUGGAUAACCCUGUUAAUUGUAGAGCUAAUACAUGCACCGACGGCCUGAUCGGGUGACCGAGAGGGUCGCACUUGUCUUAAUUCACAGUGCCCCGGAACUGAGGCUGUUCGACGUGGUAGGGGAGGACGCUGAAUGGGGCUGGUAGAAACAACUGGGGGUAUAAAACCAAGGAGGAAGCAAAAAAGCCAUAACCCGGCGAUGGCCUUGGUGGAAACCUCUGGGCUCAAGGUUGUUAUUAUGUUGAUUGUGGCCUCUCGGGGUUAUUUUGAAUGUGGUAAUAAACCGAAAGCAACUCUAUCAGUUUGGUUGGGAUGUCCGUUAAUCCUGCGUGGCCAGCGGCUUUGGGACUCCAGGGGACAGGGCGAAACGAGGCAAUUCAAAGCUGAUCGCUUUCUAACGAGGGCGACACACUGUUCGAAUUCCUGACCUAUCAACUCGAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUUAUAACGGGUAACGGGGAAUCAGGGCUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACUUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACUCCCUGCCGACACGGCGAGGUAGUGACGACAAAUACCAAGGAAAACCGCCUUUGGUGGUUUUCCAUUGGAAUGAGCAGAAUUCAAACCCCUCUGCAAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAGAGUGUAUACUAAAGCUGUUGCGGUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUCCAACACCCGGUUUCAAGUUGAAUGGAAAGAAGGGUAUAUUAGUAUUUAGGGGGAGCAAUCCUUUUAAGUAUUGGUGUAUCAGUUCACCGUUUAACUCCGGGGAAGGCUAUCCACUCUAAUGCCUUAUUCCCGCCAGGGCUCUUAAUUGAGUCUUGGAUAUACCACCCGGACCGAUAAGGAAUGGGGGGAAUAAGGACUAAAGGUUUACCUUGAACAAAUUAGAGUGAUUCAGGCAGGCUUUUUUAAGCCCUUGAAUACAUUAGCAUGGGACAAACACAUCCCAAAAACAACCUGGGUCGGGUGGCACCGGGGUUGGAGGUUUGAUAUGAGAGGAGAUUAUGAGUAGGUGGUUAUGAUCAUUUGUGCAAUCAAAACUUAUAGUAGCCUCAAUGGUUCCGUUUGGUUUUCCUGAGGGGGCUCGGACUUGGUCAUCUGUAGGUAUUUCAGGGGUGAUGGGCUCCGGUCUGUUAUUCCUGAGGUAUUCGGAUGAUUGAGGGGUCUAACCAGCAAUGGUUAUAUUAUGAGUUUGUAUGAAUGAUUAUGAUUGCUCUUGUAGUCGAGAAAGACUUCACGUGUCGGGCUUUCAGUCUUAGGACCAUCCAUUAAGACUCAGUCGUUUUGGUUGUAGAAAUGCAAUCGAAACGUUAAACCAAAUAAUAGGGACAGCCGGGGUGGUUAAUACUUCCGUGCUAGGGGUGAAAUCCUAUGAUUACGGAAAGAUUAACUAGUGCGAAAGCAUUCCACAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUGGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUCAACCAUAAACUAUGCCGACCAGAGAUCGGAAGACGCUGUCCUAGAAGGACGCGUGGCUCCUCCGGCACCUUUGAGAGAAAUCAUUGAGUGUCGGGGCUUCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCGCCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAACCUUACCAGGUCCAGACAGUAGAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUAGAUUUGCUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGUUUGAGUUGUCUGUGUCAAUUCCGCUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAAUGUUGGGCAGAGGCUUUGGUUUGAUUAAGUUUCUUUUAUCGGGGCAACUCGGUAGAGGGGAUGGAGUCUUAUCAAACUCUAGUUCAAGCCAUUCUCCUCGACGUUUGAUUGGGGUAUUUGUUAUCGGGGCAACUCGGUUAUAAGUAUUUCAGUCUUAUGCAAAGAAUGGACCAACUUCUUAGAGGGACUAUUUGCUCCCAGCAAAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUCGAUGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUUGGGUGAAUUAGCAUGUGUACACCCCACUUUUUCCUUGUUCUUCUCGAAAGGGAGGGGCAGGGAGGAGGCGGGGAUAAAUGUACCUACCCUGAGUCGAAAGACUUCAGGUAACCUGCUGAAACCUAAUCGUGAUGGGGAUAGGCCUUUGCAAUUAUUGGCCUUAAACGAGGAAUUCCUAGUAGGCGCUAGUCAUCAGCUUGCGCCGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGGAUGAUCCGGUGAAGAUAACGGAUGUGUAAAGUAUAGGACCCUUGGGGGCUUGCUCUCUUGGGUUUUAUAUUUUCCAGAAGUUAUCUAAACCUUAUUAUCUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCGGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((.....................)))))......(((......((((((((...(((..(((((.(((....)))..(((((...(((((((.....)))))))....))))).................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((....)))))))...)))))..)))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).)))))....)))))....((((((((((((((...))))))))))).)))......(((((...........))))).........((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((.((.((((.((((((((.((((((((...)))....)))))))))))))...))))..((....)).....)).....))).)))..........((((....))))..........]]]..(((((.(((((((.....((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((.......))))..)))))).....((((((((.((((..((.(((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))........(((((((......(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))...))))))).))))))).)))))))..((((((((.....))))))))....)))))...))))).)))...).))))))).....)))))))...)..)))))))))....(((((((.....(((...(((((..((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))).....)))))....((((((((....))))).)))....)))......)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((.(((((.((((((((((((..((((((((((((...(((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))).))))))))))))..))))))))))))))))).)))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((.....................(((((..........[[[[.[[[[[[[[[[[[)))))......]]]].]]]]....]]]]...]]]]...............((((((..(((((.((((((......((((.....(((((((.(((((.(((.....(((........((((((..((((....))))..))))))....))).....))))))))..((((((.(((((((((((.......((((((..(((((.......(((((((((((.....((((((((.....(((((((.............(((.......))).....)))))))....))))))))(((.....(((((((((((((....(((((((....)))))))....)))))))))))))......)))...)))))))))))........))))).....))))))......)))))))))))...))).)))))))))).....))))....)))))).....((((((((....))))))))..)))))..))))))..(((((.....[[[[[((((((((.......)))))))))))))...]]]]].....((((((.[[[[[[)))))).......]]]]]].....(((.......((((....))))...[[[[[..))).........]]]]]...(((.....[[[[)))........]]]]..(((((((((((...)))))))))))....((((..[[[[[)))).......]]]]]...........(((.[[[[..)))..]]]]...((((((((......(((((.....(((....)))..)))))))))))))......((((((......(((((((.((((((....((((((((((...(((.((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))).))))))))))(((((....((((..(((((((((.((((((((((.(((((((((......)))))))))........((((.............))))))))))))))....((((....))))......)))))))))(((((((..(((((....))))))))))))....)))).(((((........))))).......)))))(((....))))))))))))))))......))))))....(((((((((......(((((((((((((((((((.....(((((((((((((((...((((((.(((((.....)))))))))))........((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))...))))).((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))))))))(((...[[[)))....]]].((((...((((((((((...)))..))))))).))))((((((((((((....))))))))))))....................)))))))).((((((((..(((((((.(((((......)))))....)))))))..))))))))(((.[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]...........((((..[[[[[[[(((((....)))))........))))..]]]]]]]...........((((.......))))...((((.(((((...))))))))).((((((((....[[[[[[[[..........((((......))))..)))))))).(((((....)))))...]]]]]]]]..(((......[[[[.[[[[)))..]]]].]]]].............(((.....))).....((((..[[[[[.....))))..]]]]]..((((((.((((....)))).)))))).(((((((((.....(((((((((((.(((((((((..((((((.......)))))).))).))))))............(((.....(((((((((.((((....((((((((....(((((((((((((((....)))))))))))))))(((((........)))))...)))))))))))).))))))))).(((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))....))))))))))).))).((((...))))..(((((((((...)))))))))..(((..[[[[...)))..]]]](((..((((.....[[[...))))..)))..]]]...(((.((((((((...((((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))).....)))))....((((((((....))).))))).....)))))).)))))))))))..(((((((((((............)))))...[[[[[[......((((.(((((.(((.....))).))))).)))).))))))...]]]]]]...)))))))))...(((((.....(((((((((..(((..(((((((........((((((((((((((..(((((....)))))..))))))))))))))......)))))))..)))..)))))))))....)))))............(((((..(((((....)))))....)))))......
|
|
CRW_00601
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUAUGUCAAUUGUUAUUAUUCAUAUUAAUUUUUUUUAAAGUUUUUAAUUUUUAUAUUAGUUUAUUGACAAACUUGCUUAAAUCUAUGUUUAGGAAUAGUUAAUAAUAUUUUAUAAUUCUGAUUAGAUUACAUUGUUAGUGCUAUAUAAAGGGGUGUGGAAAUUGUAGUCAAAUAUAAUAAAUAAUUAUAUAAUAAAUUACAUUAUUUACUAACCAGUCAGAAAUGGAUGCCAGCCGUUGCGGUAAUAUCUAUGCUUUUAAAUAUUAUACAUUUAUUUUAUAAUUUUGUUACUUAAUAUAUUUUAGUCAAUUAAAACAUAUGUUUUUGUUAUUUGUUUUUAAACACCGAUUGGUAUAUGCAAAUUUAAAAUGACAUUAAUUAUUAAUUAUAUUAUUUUAUAUUUAUUCAAAUUGUUAAAAAAUAAAAAUUUAUGUAAUUUGACACCAUGAAAAGGACUAUGAAUGAUAUUGUAAAUUUUAUAAUCAAAAUUAACUUAUUAUAUCAAAAAAGCAAUAUUAGAUAAAAAAGUAGAUUUAAAAGGUAUUGUUGCCCACCAAUUUUUAUAAUAAAAAUAACGUGCAGUAAUUAAUGAACUUAUAAAAGUACAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......))))).((((.((((((..........................................................................................................................................................................................(((((.....(((((....................))))))))))..))))))))))................................................................................................................................................................................(((((...(...((((......))))...)))))).(((((.(((((((.....................................)))))))))).))....((.(((..(((((((...)))))))...)))..))....(((((((((....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.................................................(((((((((..((((((((((...((((..((((((((((((((((((((((...(((((((((.....((((((((.(((((((.........((((((......))))))....)))))))..(((((((.....)))))))..(((((......)))))......))))))))(((((((...((((...))))..)))))))......)))))))))....)))))).......(((((...(((......)))(((((.....(((((.(((((((((...........((((((....)))......((((.((((((((...(((((...)))))..)))))))).)))).........)))....))))))))).)))))...)))))..((((........))))..((((((.(((((((((......)))))....)))).))))))....)))))..))))))......)))))))))).))))....((((.(((..(((((((...)))))))...)))..))))))))))))))))))))))).....
|
|
CRW_00602
|
[ FASTA input ]
|
AUUAUACGUAGUCAAUUGUUAUUAUUCAUAUUAAUUUUUUUAAAAGUUUUUUAAUUUUAUAUUAGUUUAUUUGUUUACAAAUUUAAAUUAUAUUUCAUUAUUUAGGAAUAGUUAAUAAUAAUUUAUAAUUCUGAUUAGAUUUAUUUGUUAAUGCUAUUAAAGGGGUGUGGAAAAAGUGUUAAAUUAUUUAUAUAUUUAAAUAAUAAAUAAAAUAUAACUUAUUAGUCAGAAAUGGAUGCCAGCCGUUGCGGUAAUUUCUAUGCUUUUAAAUAUUAUACAUUUAUUUUAUUAAUUUGUUACUAUUUAAUUUUAGUCAAUAAAAAAUAUUAAUAUUUUUAUUUGUUUUUAAACACCGUCCGGUAUAUGCAAAUAAAAAAUGACAUUAAUUAUUAAUUAUAUUAUAUUAUAUUUAUUCACAUAAGUCAACAAUAUCUAUUUACUGUUUUUGACAACAUGAUAAGGAUUAUAAAUGGAAUUAUAAAUUUUAUAAUCAAAACUAAUUUAUUAUAUUAAAUUAGCAUGUUUAGAUAAAACAAUAAAUUUAGAAGGUAUUGUUGCCCACCAUUCUUUGUAAUAAAGACAACGUGCAGUAAUUAAUAUAUUUAUAAAAAUAUAUUUUCUCAUGUUAAACCUUUGUUACUUUUUUUAUUAUUUAGAAAAGAUGUAAGUG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((.......))))).((((.((((((.............................................................................................................................................................................................(((((.....(((((....................))))))))))..))))))))))...............................................................................................................................................................................(((((...(...((((......))))...)))))).(((((.(((((((.....................................)))))))))).))....((.(((..(((((((...)))))))...)))..))....(((((((((....))))))))).....................................................
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((........(((((((...............((((((....))))))((((.((((((((((....))))..))))))))))............)))))))......((((..((((.(((....))).))))..))))..)))))....((((((((((...(((((((.((((((((......))))))))(((((((.(((((......(((.((((((...((((.........))))))))))..)))........)))))..)))))))((((((((((((((((........)))).))))).....)))))))(((((((((((........(((....)))....))))))))))).)))))))......(((.((((......)))).))))))))))....(((((((((((......(((((((((..(((((.....(((((((((.............)))))))))....((((((((......))))))))))))))))...))))))...........))))))))))))))..........(((((((((..((((((........(((((((((....)))))))))....))))))....)))))))))((((((((.....)))))))).........
|
|
CRW_00603
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUUAUGGUCAAUUGUUAGUAUUCAUAUUAAUUUUUUUAAAUGUUUUAUCAUUUUAUAAAGGUUUAUUUUUGAAAGAUUUUUUGUAUAAAAUUUUAGGAAUAGUUAAUAAUAAUUUAUAAUUUUGAUUAGAUUGUUUUGUUAAUGCUAUUAGAUGGGUGUGGAAAAAUAAAAAAAAUAAUUAAUAUAUAUCAAUAAUAAAUUAAAUUAAUCUAUUAGUCAGAAAUGGAUGCCAGCCGUUGCGGUAAUUUCUAUGCUUUUAAAUAUUAUACAAUUAUCAUAUUAAAUUGUUAAGUGCUGAUUUAACCAAUAAAAAUAUAAAUAAUUUUUAUUUGUUUUUAAACACCAUUAGGUAUAUGCAAAUAUAAAAUUAUAGUAAUUAUAAAUUAUAUUAUAUUAUAUUUAUUCAUAUAAUUAAUAGGAUAAUAUUUGUAGUUUUUGAUACCAUGAUAAGGAUUAUAAAUUGAAAGUGUUAAUAUCAUAAUCAAAAUUUAUUAUUUAUAUUAAAUAUGUAUGUGUAGAUAAAAUAAGAAAUUAAAAAGGUAUUGUUGCCCACCAAUUUUUAUAAUAAAAAUAACGUGCAGUAAUUAAUAUAUUUAUAAAAAUAUAUUUUAGCUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((.......))))).((((.((((((........................................................................................................................................................................................(((((.....(((((....................))))))))))..))))))))))..............................................................................................................................................................................(((((...(...((((.......))))...)))))).(((((.(((((((.....................................)))))))))).))....((.(((..(((((((...)))))))...)))..))....(((((((((....)))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((...(((((((((((((.....(((((((..(((((......)))))...))))))).........((((((((......))))))))..))))).))))))))...)))))))))....(((((((.....(((((..(((((....((((((....(((..........)))....))))))..))))).)))))..)))))))...(((...[[[[)))......]]]]..((((((....((((((((.....(((((((.....((((((..((((((((((....)))))).))))...((((((((((((.....((((............(((((.((((((.((((((((...(((((((...........)))))))))))))))...)))))).)))))....((((((((.((((((.((((............)))).)))))).))))))))..........))))....)))))))))))).))))))..)))))))......(((....))).)))))))).))))))(((..(((((((...)))))))...))).(((....(((((((((....)))))))))...)))....
|
|
CRW_00604
|
[ FASTA input ]
|
CGUUUGAGUAGUAAUGAGCCUAAAGAAGUUGGGCACCGCUAUGGUAACAUAGCGUGUUAAACCCAGUGAACCUAUAAAUAUAGGGUGUAUACUCCACGUGCAGGAGUGUCAGGAAAUGGGCACUAGGGAGCGUGCUAACAGGGGAACUGAGUAGGGAUGAGCGCCUACACAGCAAUCCUGUGCCAAGACCCUUUGAGGGUAAGGUGCAACGACUAUCGAAACCACUCAGAAAUGAGGAAGGGAGUAGAGUACCUUACAGGUGAAACUCCUGUAGGGGAAGCGCUGGGCAACCGUUGAGAUAUGUAUAAAACAUAAGGAGGUGAAGAAUAUGGAAUGGAAGGACAUUAAAGGAUAUGAGGGGCACUAUCAAGUAUCAAACACCGGGGAAGUAUACAGCAUAAAGUCGGGAAAGACUUUAAAACAUCAGAUUCCUAAAGAUGGGUAUCACAGGAUUGGACUUUUUAAAGGUGGAAAAGGGAAAACGUUUCAAGUGCAUCGUCUGGUGGCGAUUCACUUUUGUGAAGGAUAUGAGGAAGGUCUAGUAGUUGAUCAUAAAGAUGGUAACAAGGACAACAAUCUCAGUACAAAUUUAAGAUGGGUUACCCAAAAGAUAAACGUAGAGAAUCAAAUGUCUAGAGGGACUUUAAACGUAUCUAAGGCUCAACAAAUCGCCAAGAUAAAAAACCAGAAGCCAAUCAUUGUGAUCUCUCCAGAUGGAAUUGAGAAAGAGUAUCCAUCAACUAAGUGUGCUUGUGAAGAAUUGGGAUUAACAAGAGGUAAAGUAACUGAUGUCCUGAAGGGACAUAGGAUUCACCACAAGGGAUACACUUUUAGGUACAAACUCAACGGUUGAAGAUAUAGUCUAGCAGGUAGUAUAAUCGGGGAAUUUUUAUACUACUUGUAGAACG |
|
[ reference structure ]
|
.................(((((.......)))))(((((((((....))))))).))....((((((......................................................................((((((...(((((((((........)))))))))...))))))((....((((.....))))...))...[.[[[[[((.......((((....))))..........))...(((((((((.......))))))))).....))))))((((((.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))......]]]]]].(((((((((((((...........)))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.................((((((.....))))))..(((((((....))))))).......(((((((..(((((....)))))(((.[[[[[[)))......]]]]]].........(((((..((((...((((..(((.....))).(((((........)))))..)))).)))))))))....((((((....[[[[[[[[[..(((...)))......((((....))))))))))......]]]]]]]]]........((((....))))...)))))))(((((((((((...(((((............((((((...((((.((((......))))..(((((((.......(((....))).....((((..(((((..........(((((((......)))))))..........)))))...((((((((((((((((((((.(((((....((((......((((....)))).....))))((((..(((((((((((....)))).(((((((...(((((((....(((.(((((....))))))))..(((((....((((..(((..((((....((((...))))..))))....)))))))......)))))....)))))))...)))))))............)))))))))))........))))))))))).))))))(((((((....)))...)))).....))))))))......)))).(((((....(((....))).))))).(((......))).))))))).......))))...))))))..((((......))))...)))))..))))))))))).........(((.[[[[[[[[[[[[[....)))....]]]]]]]]]]]]]......
|
|
CRW_00605
|
[ FASTA input ]
|
UGCGUAAAAUGCGCCUUUAAACGGUAACGUUUAUCGAAAACUCCUUUAAUUGCUGGAAAGUCCUUUAUGGAAAACUAGCAGCCAAGGUUUUGCUUGCACCUUUAAUUAGUAUAAUAUAAAUAUGAUUAUACUUUUAAGAGGAUGCACAAUUGAACUAUAGAAAAAUUUGGAUAGAUGCUAACGGACCUAUACCUAAAGAUUCUGAUGGAAGAACAUAAGAAAAGAACAUCAGCAAAAACAUUAGAAAUGGUUAAGAACGGGACCCAUCCUGCACAAAAAGAAAUCACAUGUGAUUUCUGUGGUCACAUUGGUAAAGGUCCUGGAUUUUAUCUAAAACAUAAUGACAGAUGUAAAUUAAAUCCAAAUAGAAUUCAAUUGAAUUGUCCAUAUUGUGAUAAGAAAGAUUUAUCACCAUCAACAUAUAAACGAUGGCACGGCGACAAUUGCAAAACAAGGUUCAACGACUAGUCUUCGGACGUAGGGUCAAGCGACUCGAAAUGGGGAGAAUCCCUCCGGGAUUGUGAUAUAGUCUGGACUGCAUGGUAACAUGCAGCAGUUCAUAAGAGAACGGGUUGAGAAUUAGCGAGCUCAAUCGAACAUACGGUAC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...)))))...((((((....)))))).......((((((....((((((....(((.....)))...))))))((....((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))...)).....[[[[[(((....)))...(((((....))))).....))))))((((((...))))))......]]]]]..(.(((((((....)))))))..((((......)))).(((((((..........))))))).......).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((...))))(((..[[[[[)))...]]]]]........(((.....[[[[[[[............)))...]]]]]]].....(((((((.(((((((((....((((((((.........))))))))....))))).))))((((((((((((.......((((((((((.......((((((.((((......((((.(((......))).))))........................((((........(((((....)))))((((....(((((((....)))))))))))....)))))))).)))))).....))))))))))((((........)))).............))))..))))))))(((((((....(((((...(((....)))....(((((...........)))))))))).))))))))))))))..........((((.(((.[[[)))....))))........]]]...(((...[[[[[)))..]]]]].........(((...(((((((....)))))))..[[[[...))).....(((((((..........)))))))]]]].........
|
|
CRW_00606
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAUUCCAAGCUUAUGAGUUAACGUAAGUCAAGCUCAUGUAAAAUCUGCCUAAAACGGGAAACUCUCACUGAGACAAUCCGUUGCUAAAUCAGCAGUAGCUGUAAAUGCCCAACGACUAUCCCUGAUGAAUGUAAGGGAGUAGGGUCAAGCGACCCGAAACGGCAGACAACUCUAAGAGUUGAAGAUAUAGUCUGAACUGCAUGGUGACAUGCAGCUGUUUAUCCUCGUAUAAAUAUGAAUACGAGGUGAAACGAUGAAAUGGAAAUUAAGAAAAAGCUUAAAAAUUGCCAAUUCUGUAGCAUUUACCUAUAUGGUAAGAUUUCCUGAUAAGUCUUUUUAUAUAGGUUUUAAAAAAUUCAAAACUAUAUAUGGUAAAGAUACAAAUUGGAAAGAAUACAAUUCGUCAUCUAAGCUUGUUAAAGAAAAGCUUAAAGAUUAUAAAGCUAAGUGGAUAAUUCUUCAAGUUUUUGAUUCUUAUGAAUCGGCCCUUAAAGAUGAAGAAAUGCUUAUUAGGAAAUAUUUUAAUAACGAAUUUAUUCUUAAUAAAUCUAUAGGUGGAUAUAAAUUUAACAAAUAUCCGGAUUCAGAAGAACAUAAGCAAAAACUUAGUAAUGCCCAUAAAGGUAAAAUCUUAUCUUUAAAACAUAAAGAUAAGAUACGAGAGAAAUUGAUUGAGCAUUAUAAAAAUAAUAGUAGAAGUGAAGCUCAUGUUAAAAAUAAUAUUGGUAGUAGAACGGCUAAAAAGACUGUUUCUAUAGCUUUAAAAUCCGGAAAUAAAUUUAGAAGUUUUAAAUCAGCUGCAAAAUUUCUUAAAUGCUCUGAAGAACAGGUUAGUAAUCAUCCAAAUGUUAUAGAUAUAAAAAUAACAAUUCAUCCCGUCCCAGAAUAUGUUAAAAUAAAUGACAAUAUCUAUAAAUCAUUUGUGGAUGCUGCUAAAGAUUUAAAACUCCACCCAAGUCGUAUUAAAGAUUUGUGUUUAGAUGACAAUUAUCCAAAUUACAUUGUUUCAUAUAAACGGGUAGAGAAGUAGCGAACUCUACUGAACACAUUGAUGA |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((((...........)))))))......((((((...((((((....((((...))))...))))))((.....((((....)))).....))...[.[[[[[(((((..........)))))...(((((....))))).....))))))((((((...))))))......]]]]]].(((((((((....)))))))(.((((((((((((((........))))))))((((((((((.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))).)))))))(((((((..........))))))).......)).....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.....(((((((......))))))).......)))))....(((.....((((((...(((.....)))....)))))).......[[[)))...]]]....((((....[[[[[(((((..........)))))...(((((....))))).....))))..((((((...))))))......]]]]]....(((((((....)))))))((((((((((((((((........))))))))((((((((((...((((..(((((......)))))......((((((.((((...((((((((((((((..((((((((((((((....))))).)))).......)))))....)))))))).))))))..))))))))))...((((...))))(((((((((((............(((((..........)))))..((((((..(((((((..((((((((((....))))))......)))).)))))))....((((((((((..((((.......))))...)))))))))))))))).((((((..((((((((.......((((((((..(((((((((.(((....((((.(((((((.............((((((((((((.....)))))))))))).(((......))).....)))))))..............))))...))).)))))...(((...)))....(((((((((.........))).))))))..))))..))))))))..))))))))...((((((((((....(((............)))((((.....))))((((((..((((((((((((((((((((..........((((...........)))).(((((.......)))))))))))))))..))))..)))))).)))))).))))))))))))))))((((((........)))))).))))))))))).....)))).....)))))))))).))))))))((((((..........))))))...............
|
|
CRW_00607
|
[ FASTA input ]
|
GAUGUUUUCUUGGGUUAAUUGAGGCCUGAGUAUAAGGUGACUUAUACUUGUAAUCUAUCUAAACGGGGAACCUCUCUAGUAGACAAUCCCGUGCUAAAUUGUAGGACUUGCCCUUUAAUAAAUACUUCUAUAUUUAAAGAGGUAUUUAUGAAAAGCGGAAUUUAUCAGAUUAAAAAUACUUUAAACAAUAAAGUAUAUGUAGGAAGUGCUAAAGAUUUUGAAAAGAGAUGGAAGAGGCAUUUUAAAGAUUUAGAAAAAGGAUGCCAUUCUUCUAUAAAACUUCAGAGGUCUUUUAACAAACAUGGUAAUGUGUUUGAAUGUUCUAUUUUGGAAGAAAUUCCAUAUGCGAAAGAUUUGAUUAUUGAACGAGAAAAUUUUUGGAUUAAAGAGCUUAAUUCUAAAAUUAAUGGAUACAAUAUUGCUGAUGCAACGUUUGGUGAUACAUGUUCUACGCAUCCAUUAAAAGAAGAAAUUAUUAAGAAACGUUCUGAAACUGUUAAAGCUAAGAUGCUUAAACUUGGACCUGAUGGUCGGAAAGCUCUUUACAGUAAACCCGGAAGUAAAAACGGGCGUUGGAAUCCAGAAACCCAUAAGUUUUGUAAGUGCGGUGUUCGCAUACAAACUUCUGCUUAUACUUGUAGUAAAUGCAGAAAUCGUUCAGGUGAAAAUAAUUCAUUCUUUAAUCAUAAGCAUUCAGACAUAACUAAAUCUAAAAUAUCAGAAAAGAUGAAAGGUAAAAAGCCUAGUAAUAUUAAAAAGAUUUCAUGUGAUGGGGUUAUUUUUGAUUGUGCAGCAGAUGCAGCUAGACAUUUUAAAAUUUCGUCUGGAUUAGUUACUUAUCGUGUAAAAUCUGAUAAAUGGAAUUGGUUCUACAUAAAUGCCUAACGACUAUCCCUUUGGGGAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAACGAUAGACAACUUGCUUUAACAAGUUGGAGAUAUAGUCUGCUCUGCAUGGUGACAUGCAGCUGGAUAUAAUUCCGGGGUAAGAUUAACGACCUUAUCUGAACAUAAUGCUAC |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((((......)))))))(((((((....)))))))......((((((...((((((....(((.....)))...))))))((.....((((...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))).....))...[.[[[[[((((....))))...(((((....))))).....))))))(((((((......)))))))......]]]]]].(((((((((....))))))).((((......))))(((((((.........))))))).......)).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((....(((((...........(((((((((....))))))))).((((((........(((((...)))))(((((((...............(((((((((....((((.((((((((((((........))))))))))))..))))....((((((((((((....((((((((.....)))))))).(((.(((((.........(((((((.....((((((((((((((((.....(((...)))))))))))..)))))))).....)))))))..))))).))).(((((((((((((((((((((((......(((((....)))))......(((((........((((((((.....(((((((((((((((((((((((((....(((((((((.(((..((((....))))...)))(((............))))))))))))....)))....))).........(((......(((.((((......)))).)))...((((....)))))))))))))))).(((....((((..........))))..))).)))))))))).........((((((..(((((...))))))))))).((((((...((((...))))...)))))).))))))))(((((.....)))))))))).......))))))))))))))......(((........)))..((((((((..(((((...(((((...(((((((((((..(((...)))..))).))))))))..((((.....)))))))))...)))))...))))))))...........)))))))))..))))))))))))......))))))))).......(((.......((((....))))...(((((....))))).......))).(((((((......)))))))........)))))))(((((((....)))))))(((((......)))))....))))))..))))).....))))))........
|
|
CRW_00608
|
[ FASTA input ]
|
CUCAACAUGCAAGAUUAACUAAGUGCUUAGCAGUUAGUUUUGCUAUGGGCGGUACGUAAAGAAAUUUGCGUGCGUUUACCUGUCAAACUCGGGGAAGCCAUUAGCGCGGUAAUCCCGAACCAAGCUCUCGCAAGAGAGAAGGUGUAGAGACUGGAAGGCAGGCAUCCUAACGUUAAGCCGAGGAUGAAGGGACAGUCCAGACCACAAACUGGUUAACUAAAAGCUAGUUAAUUCAGGCAGUGAAAGCUGUAGAUGAUGGUAAGCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
(((.....((((((((((((...........))))))))))))...)))..(((((((((....))))))))).....((((((....((((((...((........))...))))))((....(((((....)))))...))...[.[[[[[...))))))((((((..((......))))))))......]]]]]].((((((.....(((((((((.....)))))))))...(((((....))))).....)))))).......
|
| [ predicted structure ] |
........((((((((((((...[[[[....))))))))))))....]]]](((((((((....))))))))).....((((((....((((((..(((........)))..))))))(((...(((((....)))))..))).....[[[[[...))))))((((((............))))))......]]]]]...((((....(((((((((((.....))))))).))))(((((....)))))......))))........
|
|
CRW_00610
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAACUGAGCCUUAGUGGAGAAAUCCGCUAAGUGGAAGCUCUCAAACUCAGGGAAACCUAAGUCAGCCUCAAUCAGAUACCCCAGGGUUAUGGUUGAGGAGAUAUGGCAAUCCUGAGCCAAGCCGUUUGAUAGCAAUGGCUAUCUGGUUCUUCAAGCGGAAGGUGCAGAGGCCCGACGGAGCUACCCUAACGUCAAGUCGAGGGUAAAGGGAGGGUCCAAUCCUCAAAGCCCGCUGAGGCUCGGAGCAGCGAAAGUUGUGGGAGGGUG |
|
[ reference structure ]
|
((....))....(((((((((....))))))))).....(((.((....((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...))))))(((...((((((((.(((..(((....))))))..))))))))..)))...[.[[[[[...)))))((((((..((......))))))))......]]]]]].((((((....................(((((....)))))..)))))).
|
| [ predicted structure ] |
........((((..(((((((....))))))).......))))....(((.(((....))).)))...(((((((((...(((....)))..))))))))).(((.[[[[.)))....]]]]..((((((((.......[[[[..........))))))))..........]]]].((((....[[[[[[..))))......]]]]]]..(((.[[[[......)))...]]]].(((..[[[))).(((((....))))).....]]].
|
|
CRW_00611
|
[ FASTA input ]
|
CUCAACGAGUAAGAUUGACUAAACGCUUAAAAGUUAUUCUUACUAUGGGCGGUACGUAAAGAAACUUACGUAUGUUUACCUGUCAAACUCGGGGAAGCCAAUAGCGCGGUAAUCCCGAACCAAGCUCCAGAAAUGGAGAAGGUGUAGAGACUGGAAGGCAGGUACCCUAACAGUAAAGCUGAGGGUAAAGGGACAGUCCAGACCACAAACUGGUUAAUCCAGGCAGUGAAAACUGUAGAUGGUAAGCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
(((....(((((((((((((...........)))))))))))))..)))..(((((((((....))))))))).....((((((....((((((...((........))...))))))((....(((((....)))))...))...[.[[[[[...))))))((((((..((.......))))))))......]]]]]].((((((...((((.....))))(((((....)))))..)))))).......
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((((((.(((((...........))))).))))))).))))..((((((((......))))))))....(((((((....((((((..(((........)))..))))))(((...(((((....)))))..))).....[[[[[...))))))).((((..((((...)))).......)))).]]]]]..(((((.....)))))...(((.(((((....)))))...))).........
|
|
CRW_00612
|
[ FASTA input ]
|
CUGGUGAAUGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUUAAUAGCUAGCCUUAGUAAAACCAAACUAUAUGCGGGAAAACCCUCAAAAGCUUUAAGGUACUCGUUUAGAUAAGUCUAAGCAGUAAAAAUCCUUAAAGAUAUGUGGGCGAUCCGCAGGAAAGACUAAUUGCUUGAAACUCUUAGGUAAAACUUGUCCCUGGUGAGACAAGUUAACUAAGAGCUAAAUUGGAAUCCUCAGAGACCAAACGUUUGGAGUUUGAAAUGCAUUUAGAUGCACAAUGGAUAGUUGGAUUUGUCGAUGGAGAAGGAUGUUUUAAAGUUUCUCUCAAUAAAAUGAAGGAAAUUGAAACUGAAUUCACCGUUGUUCAAAACGAGCAAGAUGUACAAGUACUUUUCGCGUUAAAAAAGCAUUUUGGAUGUGGAGUGGUUCGAAAGAUCCCUUCAAACAGGAUGUGUUAUCGCGUAAAAGAAACUAAACAUCUCUUAACAAAGAUCAUUCCUUUUUUUGAAAAACACUCUCUUAAAACUUUUAAGCGAGUGGAGUUUCAAAAGUUUAGGAAAAUACUCUUGAAAAUCCAAAGAAAUGAGCACAUGAGCGCUGAUGGAAUUGACGAAAUUCAAAACAUCAUCAGACAAGUGGCUUCAAUUCAAACUAAGAUAGAGUCCGACUCUUUUGGAAACAAAAGGGACUAAUCGAGCCAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAU |
|
[ reference structure ]
|
...............................(((((((((.....))))))))).....((((((....((((((....((((((....((((((((((((.(((((((....))))))))))).....))))))))...))))))...))))))(((....((((((((((.......((((......((((((...)))))).....))))....))))..))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))......]]]]]]((((((((((....)))))))).....)).........................................
|
| [ predicted structure ] |
.((((..[[[[.((((((.......))))))(((((((((.....)))))))))....))))..]]]].((((((....(((.......((((((((((((.(((((((....))))))))))).....))))))))......)))...))))))...(((.[[[[[[.)))....(((((((....((((((((........))))))))..)))))))...]]]]]].............(((((..[[[..)))))...(((((....)))))]]](((((..((((((((..((((((.(((....(((((((..(((((.(((......))).))))))))))))....))).)))))).((((...(((..((((((...(((.(((((((((........((((((((....(((((.(((.......))).)))))..)))))))).....)))).)))))..)))..))))))..............(((((.(((((((((..(((((.((((((...)))))).)))))...)))))))))...)))))....))))))))))))))).......(((.(((.....(((((((..((((......))))....)))))))....))))))...)))))......(((..(((((....((((((....))))))))))).)))((((........[[[[[[[[[..))))..]]]]].]]]]..
|
|
CRW_00613
|
[ FASTA input ]
|
ACGCAGCGGACUUAGAAAACUGGGCCUCGAUCGCGAAAGGGAUCGAGUGGCAGCUCUCAAACUCAGGGAAACCUAAAACUUUAAACAUUAAAGUCAUGGCAAUCCUGAGCCAAGCUAAAGCUAAACAACUAACAGCUUUAGAAGGUGCAGAGACUAGACGGGAGCUACCCUAACGGAUUCAGCCGAGGGUAAAGGGAUAGUCCAAUUCUCAACAUCGCGAUUGUUGAUGGCAGCGAAAGUUGCAGAGAGAAUGAAAAUCCGCUGA |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((....))))).(((((((((....))))))))).....((((((....((((((...(((...(((((((...)))))))..)))...))))))(((...((((((((...........))))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((..(((......)))))))))......]]]]]].((((((...(((((....)).))).(((((....)))))...)))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((((....))))).(((((((........)))))))....(((((((......(((....)))...........(((...[[[[)))......(((.(((...((((((((...........))))))))..))).))).]]]]....))))))).((((..(((......))).[[[...))))....]]].((((((..(((((.......)))))(((((....)))))...)))))).....))))))).
|
|
CRW_00614
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGGAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUACUAAGUGAGAACUUCCAAACUCAGAGAAACCCCGGAAUAAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUGUGUUCAGAAAACAAGGUUCAGAAAGCGGGAAUCAAAAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACAAAUAGAGUUGACUGCAUCGGUAAGGGAAUUCUUUCCUUUUAUCCAAACGACAGAAAGGAUGACCUUGUAUACGUACGUAUACAUACUGAAACAUCAAACGAUUAAUCACGACUCGAAUCGGUUUUUUUUUCUGAAAAAUUUCAGAAUAGAAGGAUUGUGAAUUGAUUCCAAGUUGAAGGAAGAAUCGAAUAUUCAGAGAUCAAAUCAUCCAUUCCCGAGUCUAAUAGAUCUUUUGAAGAACCGAUGAAUCGGACGAGAAUAAAGAUAGAGUCCCGUUCUACAUGUCAAUACAGACAACAAUGAAAUUGAUAGUAAGAGG |
|
[ reference structure ]
|
(((...)))....(((((((.(....).)))))))......(((((.....(((((...(((.............)))...))))).(((...((((........................................))))..)))...[.[[[[[...))))).((((((...................................................................................................................................................................................................................................................................))))))......]]]]]]..((((((.((((......)))).((((...))))...))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((((((...(((((..........[[[[...)))))..]]]]..........(((..........[[[..)))...]]].....(((....)))....))))))))))....(((((((........((((((((((((.(((((..(((((....))))).......)))))..)))))))...(((((((....))))))))))))............((((((...(((((((....)))))))..(((((........(((((.....(((((.(((((((((((((.(((((((....))))))).)))........))))))))))..))))).......)))))....)))))........)))))))))))))..........((((((............[[[[.[[[[......))))))...]]]].]]]](((.(((((((...............)))))))))).....
|
|
CRW_00615
|
[ FASTA input ]
|
GAUACAUGGGCUCCUGGAGGUGAAAAUUAGUCACAUUGCCUCCAACUAGUGAAAGCUAGUUUUAAAAAGUCUGCCUAAACGGAGAAUCUCUCAGCUGUAAUCUUAUAACGUUUAGCUUAUCUGAGUUCAGUUUUAGCCUAAAAGGUUUUACAAACACUGAGACAACUCCGUAUCAACUUACCGUUUUUGCUCCGUUUCUGUUGAUUUUUUAUACUAUUCGUAGUAUUUUCCGCCCGCGGCUUUGCCGCGGGCGAUGCCUUAAUUGCAAAAAAUGAUGUAAAUAUUGCUAAAAGUUAUAUAAUUUUCUUAUUCUUUUAAAAACACACAAAUAUCAAAGAAAACGGAGAAAUUAUAACGCCCACGGCUUUGCCGUGGGCGGUGCAUUUGCUUUUUGGGUAACAAUUGUUACUUUUUUUUAGGUUCUCAACAACGUCUUUGUGAGAUUUACUCUAAAGUUAAAAGCAAAAAAUAUAUUUGGUGAAACUGUUUAAAUUUUAGAUCAACUUUCUAAAUAUAGUCGAUUUAGAUUCAUAAACAGUCGAGAAUACGUUUAUCUAUAACUAGAAUAUAACUUUUUGUAAAAUGCUACGCCCGCGGCAAAGCCGCGGGCAACUAUUAAAUACAAAGUCAACGUUCGUAGCUCGGCGUUCUGGAGCUCCGCAUGUUGACGUAAGCUGAACGUCAGGCUUUGUCCGACGUUCAGGUUUACCUUAUUUUACUAAACAGCAUUUUAGAAGAGCCAAAAUAACAGCAAAAAUCAAAUAAACGUAAGUUUAAAACGUAAGAGAUCUAACGACUAUCCCGCAAGGGAGUAGGAGUAAAGUUACUCCGAAACGGCAGAGAUCCUCGUAUAAAACAACAUUGUGUUAUUUCUAAUAGCAUGUCAAUUGUAUAAAUCAGUAACAAAUGUAACAGCUGUUUGGUUGUAUAACCAACUUUCUGUUUUACUUUGUUUUAUAACGGAUCAAGAUAUAGUCUGAUCUUUACAGUGAUGUAAAGCGGGUUUGAAAUAAGCCGGGGCGAAUUAACGAAUCGCUUGAACAUUAAUGGGUG |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((............))))))).(((((((....)))))))........((((((...((((((....((((((................(((((......................)))))..............))))))...))))))((...((((.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))..))...[.[[[[[((((....))))...((((((....)))))).....))))))(((((...................................................................................................................)))))......]]]]]]...(((((((....)))))))((((..........))))(((((((.......)))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((((....((((((((............))))))))(((((((....)))))))...........)))))...((((....((((((.(((........(((.(((((.(((.(((....)))...))).)))))..)))......)))))))))...)))))))))........(((((((((...................((((((....)))))).....((((((((((((((((((((((.........(((((........)))))...((((.(((((((((((........(((((((.......(((.(((((((.......................((((((((((...)))))))))).....(((((((((.(((((((....)))))))..((((((..(((((.(((.....))))))))......))))))..)))))))))....))))))))))..((((((((...((((((((.(((..........))).))))))))....)))))))).)))))))......((((....))))))))))))))).)))).......))))))))))))))))))))))................((((((((....(((((...[[[[[.)))))....))))))))((((((((((((((.(((...))).)))))))).)))))).........(((((......))))).]]]]].........)))))))))....(((((....))))).......(((((((....(((((((((....))))...((((((....))))))...........(((((...((((((((((((((((((((((...))))))))....((((.......))))....)))))(((((....((((((....))))))....)))))......)))))))))..)))))......))))).)))))))....((((((.((((((.((((.(((............)))..))))))))))..)))))).......
|
|
CRW_00616
|
[ FASTA input ]
|
GUUUAAUCUUCCAAUACGCUUCAAAUGGGGCCGUUAGAUAGAAAUAUCUAAAUGAACAUCUGGCUGUAUGCUGGGAACUCCUUAUUAUAAAUUCAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAACGAGAGCUUUUUUGAAUAAGUAAUUUAAAUAUAUAAAACGACUUAUUUAAGUUUUAAGUAAAUAAGUAAAACUGUUUUAUAACGGACAAUCAGCAGGGAAGUCCUAUGACUUUAAAAGUUAUGACCCCUCAACGACUACACGCCGGACACCCAAUAAAAAAUAAGUAUUAUACGUAAACACGCUACGCGUGUUUACUAAUAUAAUAAUUUUAUUUAGGGUGAUGAUAUAGUCUACUACUUAUGUAAACAUAAGGGUUUUGCUUGUUUCUAAACUGAAACAAAGACAAAACUUAAAAUAAAAAAUUAAUUUGGGUAUUUCCUAAAAGGGUAGCAUUGCAGCCCAAGGAAAAAAGAAGUUACUUGUUUUUUAAAAAAUUUAAAAAAUUAUCAAAAAAAAUCUAUAUUGCCUUUGCAAAAAAAACAAAUGACUCCGGCAUACAACCUAUAGACAAAAAUACAAUAAUUGAAAAGAUUGUACAAUCUUUUCAAUUAUGGGUUGUAGAAUAUAGGUUAAGUUUAAAAAAACGUAAGAAAGGCCAGGACGAGGAAUUAAUUCGUAAAGGUACUAAUUUUUUAUAUAAUUUUUUUGAAUAUUCUUAUGAUUUAGGUUGGUUAGAAAAUCAUUUUUCAAUUGAUUCAAAAAAUGAAGUUAUUAUAAAUUGGGAUAUUUUUCCAUUUAUGGAUUUUUACAAUAUUUGCUGCAAAUAUUUAAAAGAAAUUGAAUUAACACGAGAAGAUUAUUCUGCGGACCGUAAUAGUCCGCAGUAUAAUCUUUUUUGUAGUCAUCACAUUAACCCAAAAUUUAAUAAAGGUGGAGACGAACCUGAAAACUUAGUACUAUUGCAUUACUUUGAACACGCAUAUGUUCACUUGUUUAGAUGGUUAAUAACUGACAACCCAAGGGACUUAGGAGGAUUCACAAGUGCUAUGAAUGCAAAAGAAAGACGUGAAUUACAAAUAGAGAAACGUAGAGAAAAUCCACCAAAGCUUACUUUACCUCCUUUACCUCCUCCAGCUGAAGAAAGAAAAAAACCUGCAAAAACAGCUAAAGCAAUACGUGCUGGUAAAGCUGUAGGUAGUAAGUAUCAACUUCAAAGCUUAAAGAGGGCCAAUCCUUUUACAAUGUUUAUGGCAAAUUUAGUUUUAAAAUUCAUUAAUAAUAAUGGUAUUGAAGUAAUUCAUAAACCUUCUGACAAUAUAAAAGACGUUAGUGUUAAUUCCGCAUCAGCUAUUGGUAGAGCAUUAAAUAAUGUUUAUCCUACUGAAACUCUUACAAACAGUCCUGACGGAAUUUCAAAACUACUUAAAGGAACUAAUAAAAUAGUGCAAAACUGGAGAAUCGAUAGUUUAUUUAUUGAUGAUUUUGAAUAUGAAAUCACUCAAGAAGUUUUACUAAAAUAUCAAGACCUUUUUGAAACUUUAACAACAUACUUUUCUGAAAACCAAGAAUUAAGCAUUUUAGAAUUAACUAAAUCUAUGGCGGAUAUACGCAAUAGUAAUCCUAAAGAAAUUGCUUUAAUUCAAAAAAUGUUUACUUUUAUUAAAAAAUGGUCUUUUUUAAUAAAAAGUCUUAGUGAAGGAAAAGCUGAUGACGAAAUUGAUUUACCAACUGACUAAAACAAAGAAAAAAUUAUAAAACCAAGGCCCGGGGGGGGGUGGCAAUACCACCCCCUCCUAAACUUUUUAUUUUUAACUUUUUAUUUUAAUAAAAAGCAUUUAACAACUCUCG |
|
[ reference structure ]
|
.................(((((....)))))..(((((((....))))))).......((((((....((((((....(((.....................................................................................................................)))...))))))((.......((((((((...))))))))...))...[.[[[[[...))))))(((((..(((((((....(((((((.((((((((((...))))))))))...)))))))..))).)))))))))......]]]]]]((..((((((....))))))(((((((.(((((((......)))))))...)))))))((((((((((((((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))))))))).....)).................
|
| [ predicted structure ] |
(((((............(((((....)))))..(((((((....))))))).))))).((((((((((((((((....(((..(((((..((((((((((......................))))))))))..))))).......((((((((((((((((((.........))))))))).....)))))))))..)))...))))))(((..(((..(((((((...)))))))))))))........)))).))))))((((((((((((......(((((((.((((((((((...))))))))))...))))))).)))))))..)))))...........(((..[[[[[)))...]]]]](((((((.(((((((......)))))))...)))))))................(((.....[[[[[[.)))((((.........)))).]]]]]].(((((((((...((((((((((...))))))))))...................(((((((((................((((((.(((((((((((.((((.......(((((((((((((((....)))))))))))))))...))))....))))))))..((((....)))))))......))).))).(((.......)))))))))))).))))))))).((((((((((((...(((....))).(((((((((((....((((((........(((((((((..(((...))).((((((((.((((.....)))))))))))).((((((.((((((((...))))))))))))))...)))))))))...(((((((((((.((((((((.......)))))))).)))))))))))....(((((((........(((((........((((.....................((((((((.........((((((......))))))..........(((((....((((((............((((((((.(((.....(((.......)))...)))....(((((((((.......(((((...........(((.....(((((((..((((.(((((((......(((((........................)))))..((((.....)))))))))))....)))))))))))..........((((...(((((((....))))))).....)))).)))........)))))..(((((((((....)))))).)))...)))))))))...)))))))).............))))))...(((((((..((((...(((((((((((((....))))))....))))))).(((.........))).)))))))))))....))))).................))))))))((((((.(((.((((((((.....))))))))((((((......)))))).)))....))))))..............)))))))))................(((((((.......((((..((((((((((.(((((((......((((.(((......))).))))......(((.....)))..)))))))..)))))))))).(((((((((((((.....)))))))))))))..))))......))))))).))))))).....))))))))))))...))))).....))))))))))))............((((((((((((.....))))))))))))...(((((((((..(((....)))....)))))))))................
|
|
CRW_00617
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUAACGAUCCUAAGGUUAAUUGCUAGCUUUAGUAAAACUGAACUAUAUGCUGGAAAAUCCUCGGGCCUCUUCUUUCCCCAGUUGCUUCGUGCUAAAGCGGGCAGAUGAAACUAUAAAGCAAAAAGAGGCUCAUCACUUUUUUUUACCGGAACUCCGUUCCGGCUUAAAGUGAUGAAAAAGAUGUCUUGUACGCUCGUAUUUUGCCACGAGCCGUGAUAAUCAAGCGUACAUGGGGACAAUCAGCAGGGAAGGAUGUUUGAUACACGCAGAGUAGAACUGGCAGUCUAGAAUCGGUCGGUAUCGCUAAACAUAACCCUCAGAGACUAUACGUUCGGAAGUCUUAAUAAUCAUAAUAAUAGGAGGAAAUUGAAAAUGGACAUUAAUCCUCAAUGGAUUACAGGUUUCGUAGAUGGGGAAGGUUGUUUUAGUGUAAGUAUUCUUAGAAAUAAUUCGUUGCGCUAUGGCCAUCAGCUUCAACCAGAAUUCGUAGUGACCCAACAUAAAUUAGAUGCAAAUGUUUUAUAUGCAUUAAAAGACUACUUUAAAGUUGGAUCAGUCGUUGUGAAUCAUGGGGAACGGCUUUGCUAUAAAGUCAAAAAUAUUGAUCACUUUAUAACCGUCAUUAUACCAUUUUUCGAAAAACAUGAGCUAAAAACAAAAAGAAGAAUUGAAUUUCUUCGAUUUCGAAAAAUCUGCUUGCUGUUAAAAGCAGGUAGACAUUUAGAAUCGCAGGAAGGAUUCGAGAAAGUGUUGGAUUUAGCAAAAAAACUCCGUAUCAAUGAGAAAAACUACCAGGAAUCUAUCAAACGUUUUGAAGAAACUGGCGAGUAAAAAAAAUAAGAUUUAAGAUAGAGUCCAGCCUAUUUUGAAGAAAAAUGGGGUAAAUCUGAGCGAAAUUCAUUGUCAAGUAAGUUUUGACC |
|
[ reference structure ]
|
.............(((((((((.....))))))))).....((((((....((((((....((((((.......................................................................................................................................................................))))))...))))))(((....((((((((((....................................))))...))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))......]]]]]]((((((((((.....))))))))......))................................
|
| [ predicted structure ] |
................(((.......(((((((((((...))))))......))))).....))).(((...[[[[[[[.)))..(((((.(((......)))))))).................]]]]]]].((((((((((......(((((((...)))))))...))))))))))......(((((..(((((((((........))))).))))...[[[[[[[[[......)))))..............]]]]]]]]]..............((((((....[[[.....))))))....]]].........((((((((((..........((((((((....((((.......((((.......(((((((....((((((.....))))))...........(((((..((((((((((((((((((......(((....)))....)))))))..(((.....)))....(((..(((((((((((((((((........((((((.(((...))).)))))).((((....))))...)))))....))))))))))))..))))))))))))))..(((((((((((.....)))...)))))))).)))))......))))))).............((((((..(((.........(((((((((((((((((.......((((((((((......))))))))))......)))))).))))..))))))).......)))..)))))).......))))......)))).....(((.((((...(((.(((((...))))))))..))))..)))........)))))))).......))))...((((((((.....)))))))).....))))))...........((((((.....)))))).
|
|
CRW_00618
|
[ FASTA input ]
|
AAUUGGAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUACUAAGUGAUAAUUUUCAAAUUCAGAGAAACCUUGGAAUUAAUAAAAAGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUAUUUUUUUGAAAAAAUAAAAAAAAAAAUAAAGAUAGGUGCAGAGGUGCAGAGACUCAAUGGAACGCUGUUCUCAAAUGGAGUUGGUGAAGAGGGGUAUAUACAGAGUGUAUCAAACGAUUCACCCACAGCGUGUAGAUUUUUUCACGAACGAAUUAUUAUUCAUCAUCGGAUUAGAAUAAAGAGAGAGUCCCGUUCUGCAUGUCAAUGCCGACAACAAUGAAAUUUAUAGGAAGAGG |
|
[ reference structure ]
|
(((...)))....(((((((.(....).)))))))......(((((....((((((...(((...............)))...))))))(((..((.((((((((......................)))))))))).....)))...[.[[[[[...)))).).((((((.....................................................................................................))))))......]]]]]]..((.(.(.((((......))))(.((......)).).).).))..
|
| [ predicted structure ] |
................(((.[[[..)))..]]]........(((((.[[[[[.)))))......]]]]].........((((...(((.(((..(((...((((((((......))))))))........))).))).)))..(((((((......((((.(((((((.(((.....)))..((((((....(((((((.....)))))))......)))))).)))))))...(((((((((......((((....))))(((....))).........)))))))))))))))))))).....))))...........................
|
|
CRW_00619
|
[ FASTA input ]
|
AAUCGGUAGACGCUACGGACUUAAUUGGAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACUUACUAAGUGAUCACUUUCAAAUUCAGAGAAACCCUGGAAUUAACAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUGUUUUCCGAAAACAAACAAAGGUUCAGAAAAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUAUUCUAACAAAUGGAGUUAAAUGCGUUGGUAGAGGAAUCUUUACAUCGAAACUUCAGAAAGAAAAAGAAUGAAGUGAAGGAUAAACGUAUAUACAUACGUAUUGAAUACUAUAUCAAAAUCAAAUGAUUAAUGAUGACCCGAAUCUGUAUUUUUUCUAUAAAAAAUAGAAGAAUUGGUGUGAAUCGAUUCUACAUUGAAGAAAGAAUCGAAUAUUCAUUGAUCAAACCAUUCACUCCAUAGUCUGAUAGAUCUUUUGAAGAACUGAUUAAUCGGACGAGAAUAAAGAUAGAGUCCCGUUCUACAUGUCAAUACCGGCAACAAUGAAAUUUAUCGUAAGAGGAAAAUCCGUCGACUUUAAAAAUCGUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
...................(((((.....))))).(((((((((....))))))))).....((((((....((((((...(((................)))...))))))(((..(((((.(((((.(((............))).)))))..))))).)))...[.[[[[[...))))))((((((................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))......]]]]]].(((((((.((((......))))(((((....))))).)))))))...................................................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((...))))..............(((..(((((((........)))))))...))).((((.[[[[[.)))).......]]]]].................(((((((....[[[[[[[[...............)))))))......]]]]]]]]((((..(((((..(((((....))))).......)))))...))))..((((((((.(((((((..(((...((((((((.............((((((.(((..((((((....)))))).((((........)))).)))...((((((((((....((((.(((.((((((((....))))))))..))).))))(((...((((((((...........))))))))))).)))))))))).....)))))).....((((...)))).))))))))..((((....)))).)))...))))))).(((.(((........((((......))))...((((..(((((((.....(((...)))..)))...))))..))))..)))))).....))))))))....
|
|
CRW_00620
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGAUAUGGCGGAAUUGGUAGACGCUACGGACUUGAUCGAAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUACCAAGUGAUAGCUUCCAAAUCCAGGGAACCCUGGGAUAUUUUGAAUGGGUAAUCCUGAGCCAAAUCCGGUUCAUGAAGACAAUGUUUCUUCUCCUAAGAUAGGAAGGGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUAUUCUAACGAAUGAAUCUCAUUUGGUCCAAUACUGUAGUUACUGUAGUUAUAGAACGAUCUAUUUACACCUCAAAAAUGGAGAGAGAUGUUAUAUAACAUCAGACAAAACUGGCGAUCAGAACUCGUUCCAAGCAUUUUAUUCAUAAGAUAGAUGCCAGAUUCGAGUUGAAGUACUGAUUUGACAUUAAGUAAUCCAAUUAUGAACUUAUCUACUCUAGAUGAAUAAUUUAAUUAUUUUUUGGAAUAAAUGGUUGGACGAGGAUAAAGAUAGAGUCCAAUUCUACAUGUCAAUGUAAACAACAAUGCAAAUUGCAGUAGGAGGAAAAUCCGUUGGCUUUAUAGACCGUG |
|
[ reference structure ]
|
.................................((((((...)))))).(((((((.(....).))))))).....((((((.....(((((...(((..............)))...))))).(((..((((..(((..............................)))..)))).)))...[.[[[[[...))))))((((((..............................................................................................................................................................................................................................................................))))))......]]]]]]..((((((.(((........))).((((....))))..))))))............................
|
| [ predicted structure ] |
....((((((..((((((((.....(((((((....((((((((.(((.(((((((........))))))).(((((((((((..((((((....))))))..........(((((.....((((((......)))))).........(((.((((((((((...)))).)))))).....)))...))))).))))))))))).............))))))))))).....)))))))...(((((..(((((....))))))))))((((.........(((.((((((....))))))........((((...))))..)))..(((((.(((((......(((((..((((.((((((..(((......))))))))).)))).((((((..((((((....(((((((...)))))))))))))..)))))))))))....))))).))))).)))).............)))))))).))))))..(((((.[[[[........)))))...(((......)))]]]]...............
|
|
CRW_00621
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGUAUUGAGCAUUGGUAUGGGAACCUGCUAAGUGGUAACUUCCAAAUUCAGAGAAACCCUGGAAUCAAAAAUGGGCCCUCCUGAGCCAAAUCCCUUUUUUGAAAAAACAAGUGGUUCUCAAAUGAGAACCCAAAGGAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACGAAUCGAGGUGUAAUUACGUUGUGUUGGUAAUGAAACUCCCUCUAAAUUAUUAAAUUAGAGAAAGAAGGACUUUAUACAUCUAAUACACACGUAUAGAUCCUGACAUAGCAAACGAUUAAUCACAGAACCAGUAUCAUAACAUAGGUUCUUUAUUUAUUUUUUAGAAUGAAAUUAGGAAUGAUUAUGAAAUAGAAAAUUCUGAAUUUUUUUAGAAUUAUUGUGAAUCCAUUCCACUCGAAUAUUGAAUAAAAAAAUCCUUCAAUUCAUUGUUUUUGAGAUUUUUUAUUUUAAAAAGAAGAUUAAUCGGACGAGGAUAAAGAGAGAGUCCCAUUCUACAUGUCAAUACUGACAACAAUGAAAUUUCUAGUAAAAGG |
|
[ reference structure ]
|
(((...))).....((((((.(....).)))))).......(((((....((((.(...(((.............)))...).))))(((..((((.((((((............(((((((....)))))))....)))))))))).)))...[.[[[[[...))))).((((((..((....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))......]]]]]]..((((((.(((((....)))))(.((......)).).))))))..
|
| [ predicted structure ] |
............(((((..((((((...(((((........((((((..(((((.......)))))........((((.....(((.(((..(((((((.(((....))).))).(((((((....)))))))..........)))).))).)))...)))).))))))..((((....))))..(((......(((((((((((((..(((((..(((((((((.........))))))......))).)))))....)))))))).))))).....)))....)))))..(((((((((..((((((..(((......))))))))).......(((((((((((((((...(((((((((....((((....((((((((....))))))))))))...))).)))))).((((((...(((((..............))))).....))))))...)))))))))))))))..)))))))))...................))))))......(((((....))))).))))).................
|
|
CRW_00623
|
[ FASTA input ]
|
GCUACGGACUUGAUUGUAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUGCUAAGUGGUAACUUCCAAAUUCAGAGAAACCCUGGAAUGAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCACUUUUUUCAAAAAAGUGGUUCUCAAACUAGAACCCAAAGGAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACGAAUCGAAGUAAUAACGAUUAAUCACAGAACCCAUAUUAUAAUAUAGGUUCUUUAUUUUAUUUUGAGAAUGAAAUUAGGAAUGAUUAUGAAAUAGAAAAUUCAUAAUUUUUUUAGAAUUAUUGUGAAUCUAUUCCAAUCGAAUAUUGAGUAAUCAAAUCCUUCAAUUCAUUGUUUUCGAGAUCUUUUAAAAAGUGGAUUAAUCGGACGAGGAUAAAGAGAGAGUCCCAUUCUACAUGUCAAUACUGACAACAAUGAAAUUUCUAGUAAAAGGAAAAUCCGUCGACUUUAUAAGUCGUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
........((((((...))))))..((((((.(....).)))))).......(((((....((((.(...(((.............)))...).))))(((..((((..((((((.........(((((........)))))....)))))))))).)))...[.[[[[[...))))).((((((..((.((.(...).))..(((((((((...........................................................................................................................................................................)))))))))..))))))))......]]]]]]..((.(((.(((((....)))))(.((......)).).))).))....................................................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((...((((.(((...(((.[[[[[))).))).)))).....]]]]]...........((((((((......((((((.....(((.(((..(((((((((((...)))))))((((((......))))))..........)))).))).)))..((((.......(((((((....))))...))).....(((((((((..((((((.((((....)))).))))))...(((((((((((((((((....((((.(((((....((((((...(((((((((((....)))..))))))))))))))..)))))....((((....)))).))))........)))))))))))).....)))))....)))))))))................)))))))))).....(((((....))))).........(((((......)))))..)))..((((((...))))))..)))))))))))))...........
|
|
CRW_00626
|
[ FASTA input ]
|
CAGAAAAGUUACCACAGGGAUGUGCUAAGUCUAUUAAGACAAAUUUACAACAUAACGUCCCAGGCAUCGACUCCCAUUGAUGCCUAGUCCGGCUAUAGCUUACUUGUGCUUGCUAUAGUUAGCUCUCUAGAAGAGUGUAAGGGCAACACGUCUGGAUGCGGGGAACUCUCGCUAGGUCUUUGGUACCAAACAUUGGCGGUAACACCCCAAUGUAGAGUCUGUUGGGGCAGACGGGUAAAAAUCCAAAGAAUAGAGACAAUCCGCAGCUGACCUGGCCAAAAGUAUAUUUACAAAGUAGCUAGGCAGUUCAACGCUCGCUAAGAUGUGGGUUGACCAUUAAUGGUCGGCUUAAGGUACGGGCUACGCCACCCGAGAGGGUGCAACUACCUACCGGGCGCACAACCUGAGAAGUAGUUGGUCAUGGUAGUACGGAACUGGCUUGUGGCAGUC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((...............................)))))))(((((((((......))))))))).((((..................................................))))..(((((((...((((((....(((.......(((((((((((..(((((((((......)))))))))..(((((....)))))....)))....).)))))))....)))...))))))(((...((((......(((....))).......))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((....))))))))).......]]]]]].((.(((((....)))))(((((((....((((.......))))....)))))))............))...................
|
| [ predicted structure ] |
........(((.....[[[[[[[..)))((((....))))..............]]]]]]](((((((((......)))))))))(((..[[[[[[[[[..))).......]]]]]]]]].....((((((...((((.......)))).))))))((((((....((((......(((((((((((..(((((((.(((...))))))))))...((((((....)))))).)))).....)))))))...))))...)))))).....((((((.....(((....)))......))))))((((((...(((((........(((((((((((....))))))))))).....)))))(((..(((((....)))))(((((((....((((.......))))....))))))).........)))..))))))(((...)))....
|
|
CRW_00629
|
[ FASTA input ]
|
AAACACUUGCAUGUUUUGCCGCAGCAACUCUGCGCCGAAAAGCAGCCCGAAAGGGUGAUGUGGUGCCCUUGGACAAAAAUAUUAAAUGCUAGUCCGGCCUUCUCACAGGCUGGGCGACACACUCAAACUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUUCACUACCAAGCUUGUGUUUCGAAAGGACAUGGUGGCCAGGUUAAUUGCCUCGGGUACGGUCACAACGUGAAGGAUGUUCCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCCCCUACGUGUAGUGUCUGUAAUACUACAGACAUUUCAUAUGGGGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGGUGUGGGUGCGUUACUCUUGAAGUGACAAGCUUAAGAUAUAGUCCGGCUUCAGUAGAAAUGCUGGAGAUCAGGUUCCACCUGUGAUUAAAACGGGAGCCUGCGGCUUAAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(.....((((.(((......)))))))...).........((((((((....))))(((((.................)))))...)))).(((((((((......)))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((.(((.(((....)))))))))..((((((.....)))).))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((...(((.(((((((((......))))))))).)))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((..((((((.....))))))..))).......]]]]]].(((((((((....))))))))..(((((...))))).........)....................
|
| [ predicted structure ] |
......(((....[[[[[.[[[[[)))..]]]]].]]]]].(((((((....))))..)))..((((((((((..................(((((((((......))))))))).(((............(((....))).....(((((((.........((((((.......))))))((((((((((.....)))).......))))))...))))))).)))))))).)))))(((((((.(((...(((((.(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))..((((....))))...))).)))))))..((((((.....))))))(((((.......(((((...((((((((....))))))))..[[[[[[[[...[[[)))))..]]]]]]]]]]].))))).....
|
|
CRW_00632
|
[ FASTA input ]
|
AUGGGUGAAAGCACUAUUGCCCAUCAUAGCAGCUGUCCACAAAGCAGUCUGCUAGUCGUCGUUGCACCGCUUUGCAAGGCGCAACGCACGGCGAGACCGUCGAAUUGCGGGGACAUCCUUACAGCUCAAGCUACCAACUUGUCGCAGAAAUGCUGGCAAGGGCCGGGGUAAUGACCCAGGGUAUGGUAAAAACGCUUGAGAUUGGAUAAUCCGCAGCCAAGCACCUUACCCGGAUUCAACGUCCGGAAAGGUGAAGGUUCAGAGACUAGGUGGCGGUCGGUCACGAGACGUGGCUUAAGAUAGAGUCCGUUCGCGCUGAAAAGCGUUCGUCGGGAAGAAAGCCUUAGCAAGGCCGGAGCCAGACGAAGGGUAGCCAUUAUUGGCUGCCUCGAGGUACACGGGUGGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........))))))))...(((((((((.......)))).))))).((((((((((((((.........))))))))).)))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((..(((((((((....))).))))))..(((.(((....)))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...((((....((((((.....))))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((...))))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((......(((((...))))).....)))))))).(((((((((....)))))))))........)).........
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((...((((....((((((((((.......)))).)))))).(((((........((((((((((((........(((((((((((((....((((((...((((......((((((((((((.(((((((((....))).)))))).(((.((((....))))..))).))))).....)))))))...))))..))))))(((...((((((..((((((.....)))))).))))))..((((....)))).))))))))))........((((.(((((......))))))))).(((((....)))))))))))........))))).)))))))........))))).(((((((((....)))))))))..........)))))))))
|
|
CRW_00633
|
[ FASTA input ]
|
AAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGAGAACAAAUGAUUCUUUCGCUAAGACAUUUGCUGAAGCCUUGAAGAGCAGUAGUCAUCCUUACUGCUAGUUCAACUUAUUGUUGAGCAACAUUGCCAAAUUGCGGGAAAGUCUUAAUGACUUCGCUACCAAGUUCAAUAGCGUACUCUGAAUGGCCGGCUUAAUACACCGGGUAGGGUUAUAAUGCGAAGUAUGUUACAAUAGGCAACCUGCAGCCAACUUCUACAUUGUAGGAUGCUGUUCACAGAUCAAAUGGCAGUGGGUGCAUCAUGUAAGCUAAUGAUGCGCUUAAGAUAUGAUCGGUCCUUAUUGCGAGAGCUUAAGGUAGAAAACGU |
|
[ reference structure ]
|
..........((((((((.........((((((..((((.....))))))))))..))))))))....((((((((......)))))))).(((((((.....)))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((..((((((........).)))))..(((((.......)))))....)))....).))))))..((...))..)))...))))))(((...((((((...))))))...)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((........)))))))))).......]]]]]](((((((..((....)).)))))......))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((((((.(((((.......(((.....)))........))))).)))))))))...((((((((......)))))))).(((((((.....)))))))............))))))..(((((.....)))))..(((((((((((..(((((((((....((((((.((((........))))..)))))).......)))))))))(((((((..(((.(((((....((((((...)))))).))))).....(((((........((((((((((((........)))))))))))).....)))))))).)))))))...))))))..))))).......
|
|
CRW_00634
|
[ FASTA input ]
|
ACCAGGAGUUAACAAACAGGCUCUGCUCCAAACAGUAGCUCGAAUAGAGUACGGUGGUCGCUGUCGUUUAAAUACUAGUCUGUUUAUAACAGGCAAGAUCUUCAAAUUGCGGGGAAGUACUGGGGCUCUAAUCUACCAAGUCAUUGUCUGAAAAGGCAUGAUGGCCUGAGGUAAUAACUCAGGAUAUGGUUACAACGAUUAGAGAUGUUACAAUGUAUGAUUCGCAGCCCAAUCCCUCAAUAUGGGAUCAGGUUCAGAGACUAAACGGAGAUCGAUCUAGGCAUUGAACUAGGUUUAAGAUAUAGUCCAUUAUUCUGCUUAACAGCAAUUGAAUGUAUUAAUUGGGAGCCUGCGGCUUAA |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.((.....................)))))))....((....(((...)))))(((((.((.(.((......)).).)))).)))..(((((((....((((((....(((.....((((((((((((..((((.(((((....)))))))))..((((((.......))))))....)))....).)))))))).((...))..)))...))))))(((..(((((.......)))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((........))))))).......]]]]]]...((((((.....))).)))...............................
|
| [ predicted structure ] |
....(((((....[[[[[[[[[..)))))((((....((((.....))))(((((....))))).)))).......]]]]]]]]]...........(((((((....((((((...((((.....((((((((.((((.(((((.((((....)))))))))..((((((.......))))))...))))......))))))))..........))))..)))))).....(((((.......)))))..((((....))))....)))))))(((((((..[[[...)))))))...]]].((((.((((....((((....))))....)))).)))).....(((((...)))))..
|
|
CRW_00635
|
[ FASTA input ]
|
GUAACAAGGUUUCCGUAGAAAGUACGAACGAAUUUAAUGAUUCUUCUGCGGUUGAAACUUAUCGAAGCCUUAGUAGCCUGAAAGGUGCUUUGCGCGACUAUAAACAAUGACGAAGCUUAAAUGCUAGUGAAGACAGUGUUCGCACUGAAUAAUCUUUGCAAAACCAUCGAAUUGCGGGGACGCCCUUAGAGCUUCACGUACGGCCAAUCGUUCGAAAGGAUUGAUUUGGCAUCAGGUUAAUGGCCUCGAGUAUCGUAAUAACCGUGAAGAUUGGGUAAUCCGCAGCCAAGUGCUAAACAAGUAUUGGUAAACUCUACUUGCAUGCUAAUGGUUCACAGACUAAGUGAUGGUUGGGGAGAUGUCUAGUCUCUCUUAAGAUAUAGUCGGGCACCUCGGGAAACCUUGGUGGUAAUUCAACUGUGAAUAUGCUCUAGUUUCGGCUAGUUCAUAUCAAUAUGAGAUAACUGU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((......((((.(((.((..................)).)))..))))...))))))))((((((((...))))((((((..................)))))).....)))).(((((((...(((((.....))))).)))))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((.((((((((((....)))).)))).))..(((((.......))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...(((...(((((((...........)))))))..)).)..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((.....)))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))..((((...(((.((((........)))))))..))))((((....))))......))..
|
| [ predicted structure ] |
..........(((.[[[[[[.....))).(((((....)))))]]]]]]((((...[[[......))))..]]]..(((((..((((((.....((((((((...........(((......))).((((((((((((....))))).....)))))))..((((((((...((((((...((((......((((((((((((((((((((((....))).))).)))))...((((.....)))).......)))).....)))))))...))))..)))))).....((((.....(((((...........))))))))).....(((((....)))))..))))))))((((((((.....)))))))).....)))))))))))))))))))..(((..[[[)))......]]]....(((((..(((((....)))))..))))).................
|
|
CRW_00636
|
[ FASTA input ]
|
GGCACCACCAGGUGUAAACUUUUAAGUCGCAGUUACUCUGCACUGAAUAGCAGCCCUAACGGGUGAGGUGGUUGCGCUUAUCAAACAAAUGUAAAUGCUAGUGAGAUUAUAAUCCUAGUCUUGUUAUACGAGACUGCUUUAUGGUCUUGCGAGACCCUCAAACUGCGGGAAAGUCUUAAAAACACGCUACACUAAGCUAUGUUUCGAAAGAUCAUAGUGGCCGGGGUAAUGACCUAGGGUAUAGUAAAAGCGAGCGUGUUUGUGCCAAUAGAUUAUCCGCAUCCAAGUCCCUAAAGUAUGGCAUGCUCCGGCAUGGCAUUACAAUGGGAAAGGUUCAGAGACUAGAUGGGGGUCGGUUCUUUCCGGAUGGGAAGGGUUUAAGGUAUAGUCCGUUACAAACUGCAGUACAUUUUAGAUGUACGUCUGCUUGGUCUGCUUAUAGCUUUAUCUCACUGAGAUAAAGGUAAAGGGAGCCUGCGG |
|
[ reference structure ]
|
..........((((((......................))))))....((..((((....))))((.((((((.(((((((...((....))..)))..)))).))))))..)))).((...((((((.(((....)))))))))...))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((..((((((..((....)).))))))..(((((((....)))))))....)))....).)))))))..((...))..)))...))))))(((...((((....(((((.(((((....))))).)).)))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]]].((.(((.(.(..(((((((...)))))))..).).)))..(((....)))(((((((((...)))))))))...))............
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....))))).............((((.....))))..(((.[[[[[((((....)))).(((((....))))).)))............]]]]]((((((((((((...(((((((((...)))))))))..))))))))))))..((((((((...((((((..(((((...(((((((((..((((.((((((...........)))))).(((.((((....))))..))).)))).......)))))))))........))))).))))))......((((......(((.(((((....))))).)))......))))..((((....))))...))))))))...(((((((.....)))))))......(((.[[[....)))..]]]...(((((((...)))))))....((((...[[[[......(((((((((...))))))))).......))))..]]]]
|
|
CRW_00637
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUCGUUUGAUCCUUCCCGCCCGGUCCCCCAACUCCCCUUCCUCAGAGCACCUUUGAGGAUUUCUUGGGAUGGGGCCCGGUUCGAGACGCAUGGAAGCCUGAGUGGGGGUUGCUCGAUGGAAUGGGGGCAACCACAUGCUAGUGCUGGGCAUCCGUGCCUUGUGCGACGCCGUCAAUCUGCGGGGAAUGUCCUCCUCCGUGGUGCAAGGGUACCAAGCGCGAUGGCUCGUCGUUGAUGCACCGACGCGUGGUGCCGCGACAAGGAGAGCCUAGCGUGGCCGGGCUAGUGAGGCCUAAGGUAAGAACCCCUCACCAUUGGUCCGACCCGCAUCCAAGCCCUGCAAGUUCUGUCCUACAGGAUGUCGCAACUUGCGGGUGGGGUUCACAGACUAGAUGACGGCAGGCUCGUGCGCAUUGCGUGCACGGGGCUCAAGAUAUAGUCGGUCCGCCCAAGGCAAGAUCGCUUCUCUCCAAGGGAACUCGCCCGCAAGUGUAUUCACCGUUCCGUAG |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((((......(((.....(((((((((...(((....(((((((((...)))))))))......)))..)))))))))...)))....)))))))))).((((((((((((((..........)))))))).)))))).((((((((((....))))))))))..(((((((....((((((....(((..........(((..((((((((..((((((.(((((...((((..((((((.....))))))..)))).....)))))))))))..((..(....)..)).....)))....).))))))).....)))...))))))(((..((((...(((((.(((((....)))))....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((.....)))))).))))).......]]]]]]((...(((..((..(((.....)))..))..))).(((((....))))).......)).........
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((......(((.....((((..(((((..((((..(((((((((...)))))))))......))))))))).))))...)))....))))))))))((((((...)))))).(((((((((..........((((...(((.((((.....(((((((.(((..(((((((.((((((((((......))).)))........((((.....((((...(((((...((((..((((((.....))))))..)))).....)))))..))))...(((((((((((((.....(((....)))))))))...)))))))))))....(((...((((((((((.(((((....)))))....))))))))))))).(((....))))))))))))))...(((((((((.....)))))))))......(((...)))....))).))))))).......((((((...))))))...)))))))...))))...)))))))))..
|
|
CRW_00639
|
[ FASTA input ]
|
AAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCAAUUGGUACGCUGACAAAGAUGGUCCUUCCGUCAAGUUCACGUACUGAAGCCUUAGCCGCCUCGCAAGAGGCACUCGCCGCGACUUCCUCUUAUCGAGAGGUAAACAAGGAGCGAGUUUAAAGGCUAGUCAGCUCAGCUGGCAACACCGUCAAAUUGCGGGAACAUCCUAAGAGCUAUCGACCACCAAGCAGGCUGCUGAAAGGCGUCUGUGGCCGGAUUAACGACUCCGGGUAAGGUAACAGCGUCGGUAGAUGAAGCUUCCCUGACCGGAGGCUGAAAUGGAUCAUCCGCAGCCAAGUCCCUCCUCAGACGCUUUCAAGGUGUCUGGCGGGAUGCUGUUCACAGACUAAAUGAUGGUGGGUCCGCUCAUGGCGAGUGGGCUUAAGAUAUAGUCGGGUCGCUCUGGAAACAGGGCAGCGAAUCGCAGUACUUCACCGUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUGAAUCAAUCAA |
|
[ reference structure ]
|
................((((((((.....((((((........(((((.....))))).......))))))))))))))(((((((((....)))))((((((............(((((....))))).......)))))).....)))).(((((.....)))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((((....)))))))....)))....).)))))))).((((((((((......))))))))))..)))...))))))(((..((((....((((((((((...))))))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((.....))))))))).......]]]]]]((..((((((....))))))...................))..........................................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((...((((((((.....((((((.(((....(((((.....)))))....)))))))))))))))))....(((((....))))).......))))))))...(((((....))))).....(((..((((....)))).[[[[[)))..]]]]]..((((((((..(((((((...((((......((((((((.(((..((((((.(((....)))))))))..(((((........)))))....)))......))))))))....(((((((......))))))).....))))..)))))))....(((((...(((((((((.....))))))))).))))).(((....)))......)))))))).....((((((.[[[[))))))....(((........)))((((((....))))))......]]]].....((((...(((((((((....))))))))).[[[...))))...]]]..
|
|
CRW_00641
|
[ FASTA input ]
|
GAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGUUUGCCAAUGCAGCAUUGCCCAGUAUAGCCUUUAGCUAGUCCGCUCCGGCGGGCCACAUCCUCCCUGUGCUGAAAGCCUUCCCCUUACAGGGGCGGUAUCAGCAGCCAAAGAAUGCCAGCGCGGCUUCUUCGGUUCACAGACUAGGCGAGUGAUGGGCUGAGCCCUUAGGGGUCUCAGUUCGAGAUAUAGUCGAGCCCCAGGGUCUAAGACCUGGGUGUUUGCGGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGA |
|
[ reference structure ]
|
...................((((((..(((.......))).))))))...((((.....))))((((((....))))))...((((((....((((((..(((..(((((...))))).))).))))))(((.(((((.(((.....)))))))).)))...[.[[[[[...))).)))(((((((((((....))).))))))))......]]]]]].(((((((((......))))))).....))...................................
|
| [ predicted structure ] |
..(((((............((((((..(((....)))....))))))...((((.....))))((((((....)))))).............((((((..(((..(((((...))))).))).))))))(((.(((((.(((.....))))))))....[[[[......)))..]]]]((((((((((((....))).))))))))).........(((((((((((........)))))).))))).............((((........)))))))))..
|
|
CRW_00642
|
[ FASTA input ]
|
CAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAAGGUUUGCCUACCAAAGCCCUUAGCCAGCGACUCUAAAGAAAUCAGCUAUCAGUCGCCCCUUCGGGGGCUGGCGACGCCAUCAAUCUGUGUCUGGGAGUACGCCCCGCCAAGGGGGCUACCACCAGCAGCUCGUUGCACUUCGAGUUCACAGGUCAAACGAUAGCGGCCACUUCGGUGGUUGAGAUAUGAUCGGCCUCCAGCGCCACCUAGCUGGGGAAUUUUGCGGAACCUGCGGAAGGAUCAUUAAUGAGUUCGGGGGCCUAG |
|
[ reference structure ]
|
...................................((((((((....))))))))...........((((((..(((.((.......................)).))).))))))...((((((......((.((((..(((.(((((......))))))))..))))))(((((........)))))...[.[[[[[...))))))((((((....))))))......]]]]]](((((((((........)))))))......))........................................
|
| [ predicted structure ] |
..........(((....[[[[[[.....(((((..((((((((....))))))))..)))))))).....]]]]]]............((((((.((((((((....))))).))).((((.........))))((((..(((.(((((......))))))))..))))(((....)))..[[[[[[[[[[[..........))))))((((((....)))))).....((((((...(((((((........)))))))..((((((((...)))))))).))))))...]]]]]]]]]]]......
|
|
CRW_00643
|
[ FASTA input ]
|
AUUGAAAGCUCUUUCUUGAUUCUGUGGGUGGUGGUCGAGAAACUUCGGUUGUGUGCCACGCUGCGAGCCUGCGAGAUCUACUGUUAAACUCCGUGCCGCCCAGCACGCGAGGGGUCUCGACAACGGUUGCGCUAGUCCAUCUGCUAUGUGAGCAGGGUGGGCGACACCGUCAAAUUGCGGGGAUCUCCUAUAGCUCAUCGUACCCGCUCAGCGCUCGAAAGGGCGCUGUGCUCAAGGUAACAAUCGGUGAGAUGCGACAAUGGACAAUCCGCAGCCGGGUCCUAAGCUCUUCGCCGGGUAUGGAUCAUCGGUUCACAGACUAGAUGUCGGUGGGUCAUUAUCGAAAAUGGCUUAAGGUAUAGUCGGACCACAUGGGAGACCAUGAUGUGGUGAAUAAGGAGAUACCAUCUCCCCGAGCGCCACGGUGCGCUCAGUCGAGCGGGCACGGGUCGGUCGGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGGUUGCCUUGUCAGGUUGA |
|
[ reference structure ]
|
..........................(((((((...(((......((((.........(((.........)))......)))).....)))..))))))).((((((....................)))))).((((((((............))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((((((....)))))))))).....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...((((......))))..))))....)))...[.[[[[[...)))))))(((((((......))))))).......]]]]]]((...(((((....))))).(((((((.....((((((...)))))).....)))))))((((((((....))))..)))).......))..........................................
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....((((((((((......[[[[[)))))))))).)))))).....]]]]]...(((......[[[[[[[[.........[[[[[[[[)))...]]]]].]]]]]]]]]]]....((((((((...(((((((((((.....)))))((((((((((...))).....[[[[[...........)))))))...]]]]].((((((((....))))))))..((((.(((....)))..))))........))))))....))))))))(((((...((((......))))..))))).(((((.(((.(((.....))).)))[[[[...)))))...(((((........)))))]]]].(((((....)))))..((((((.....((((((...)))))).....)))))).((((((((....))))..)))).(((((...[[[[)))))..........(((.....))).]]]].......
|
|
CRW_00645
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCCCUUAAAAUCUAGGGGUAAAAAGCCGAGUUUGGUUGAAAAGGGCCUUGGCCCUCCAAGCGACAUUUUCAAUCUUUGACGGCAAGUUUCAACCGAACAAGCCGAAGUCUUUGCUUAAAUGCGGAGAUUCAGAGACUAAACGAAGAUGGGGACGCCAAAAUAUAGGCGUCUUUUCUGAUAUAGUCCGACUUAUAGCUGGAAGGCUAUAACGUUUGUGUAGAUGCUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACAGAGACAACGAG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((.....)))))))).........((((((......(((((....)))))))))))...((((((......(..((((..((((.....))))..)))).)((((((((......))))))))...[.[[[[[...))))))(((((((((........)))))))).)......]]]]]].((((((((((....)))))))).....))...............................................
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((.....))))))))....((((.[[[[[[[[[[[[(((((....)))))........................))))...]]]]]]]]]]]](((.....[[[[[[[))).....]]]]]]].....(((((.....(((.(((((((((........))))))))))))....))))).(((((((((((....)))))))).))).((((((...[[[[[...(((....)))))))))...]]]]]........
|
|
CRW_00646
|
[ FASTA input ]
|
CCCUGCCCUUUGUAAGUACAAGGGGCUGACAGCAAUUCUAAGUUGGCGAAGAUAGCCAAUUAAUGCCUUCUAAGUGCGUGGAAGCUCGCUGAGUUACCCGCAGCCAAAUCCUUAAUUUGAAAGGAUGCAGUUCACAGACUAACUGAAGGCGGGUCCUUCUCUUCAAUGGGAAGGCCUAAAUUAUAGUCGAUCUACCCUGUCACCAGGGAUAGAAAAAUGUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGGCUCAGUGAG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((....)))))))))..............(((((((.......)))))))...((((((....((((.((.(((((...))))).))))))((...((((((.......))))))...))...[.[[[[[...))))))(((.(((((((......))))))))))......]]]]]]((...(((((....)))))........))...............................................
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((....)))))))))..((((((......(((((((.......)))))))...((((((.......((((.(((((...)))))..))))(((...((((((.......))))))...)))....[[[[[...))))))(((.(((((((......))))))))))......]]]]]..(((((((((....))))).))))....)))))).......(((..[[[[[..............)))..]]]]].
|
|
CRW_00648
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUCUCGCCUGUACAGCAGCAUGAUCCCUCCGUCGAGUUUUCAUGUACCGAAGGCCUUAGCCGCCCGAAAGGGUGCCCCCGCCGCGACGCGGCCGCCACGGGAGCGGGCCGCACCAAGGAACGCGGGGCUGAAAGCGCUAGUCCGACCGGCCGAGUGCCGAUCGGGCAACACCGUCAAAUUGCGGGGACUCCCUAACAGCUCUCGACCACCAAGCGGGCGCCCGAAAGGGGCCCGUGGCCAGGGUCACGACCUCGGGUACGGUAACAGCGUCGAGAGAUGAGGCCGUUCCCCCCCCCCACCCAUGGGUGGCCGGGGGGCGCGGCGGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUACGGCCGGGCAGCCAGCCCGCGCUACGGAUGCCGUUCACAGACUAAAUGGUGGUGGGUCCGGUGGCGCCAGCAGCGCGCGCCGGGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCCCUGCCGAAAGGUGGGGGGGGACGCAGAGUCACCGCUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((.....(((((......(((...(((....)))...))))))))...)))))))((((((((....)))))((((.............................................))))........))).(((((((((((.....)))))))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((.(((....)))).))....)))....).)))))))).(((((((((((((((...(((((....)))))..)))))).)))))))))..)))...))))))(((..((((...((((((((.....))))).)))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((((.....)))).))))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))..............))..............................
|
| [ predicted structure ] |
......(((...[[[[........((((((...(((....)))...)))))))))..]]]]......(((((....))))).((((((.[[[..((((((............))))))..........)))))).......]]]..((((((.((((.[[[[)))).))))))....((((......))))..]]]]........((((((((.(((....((((.(((....)))))))(((((....))))).[[[...)))..]]]......)))))))).....(((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))(((..(((...[[[[[...)))..)))...((((((((.....))))).))).]]]]]((((((....[[[[[))))))..(((((((((((((((.....)))).))))))))))).....]]]]](((((((((((....)))))))).....[[[[..[[[[[..)))...]]]]]..]]]]...........
|
|
CRW_00649
|
[ FASTA input ]
|
CUUAGAGGGACUAUCGGCUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUUAACAUUCACAGGCCUGUAAAAGUAGACCUCAUUAAAUAUUACUGCUAGUCGAUGCAUCGUUCUCCGCGGGGAAGCCCCCAUUUAUCGGGCGGAGAUAUGCUGAAGCAUCUGAUUACAGUGCUCAGUGUAAGAUGCCGGCGACACCACCUGGUACAGGGGACGCCUCGCGGUUUCCAAACCGAAGGCCAAUCCUGUGGCGAGCUCGGGUCGCGCUGAGCCGUCGCAACGCGCGCUAAGGGGUGGGCUAGUCCUGCGGGGCUGGCUUAAGGUACGUGCUAAUCCACCGCGAAAAGCGGUCUCGUGUGAGAAGACCCGAUAAGUCGAGUCACACGGGGGCUUCUGACAGUGAUUUGUCGUGGGGCUGGUACAGUGGGGAAUGUCAGCAUACAGGGGGAACAGUCAUGGAAGUCGUGGUUACCCUAGAACAUGCUUUAGUGACCCUAGCGCAUGGUCUAGUAGCCCUAGACUGGAGAGUCGUAGUUACUCUAGAAGACUUUUUGUUGACUGUUCUUGUUCCUUCUUGCUUGACAUAACCCACUCAACAUGCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACAC |
|
[ reference structure ]
|
...........................................(.(((((((..........))))))).).(((((................))))).((((..(((((..(((((((((((....)))).........)))))))((((((((.(((.(((....)))))))))))))).)))))))))..((((.(((...((((((...((((..(((((....))))).))))...))))))(((..((((((......)))))).)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((....))))))))).......]]]]]].((..(((((.....)))))(((((((((...(((.......)))...)))))))))((((((((((((....)))))).))))))....................................................................................................................................................................................))...........................................
|
| [ predicted structure ] |
....((((..((((((((....)))))))).....((((......[[[[[[[....))))..]]]]]]].........)))).................((((..(((((..((((((((((....)))...........)))))))((((((((.(((.(((....)))))))))))))).)))))...))))(((....)))((((((...((((..(((((....))))).))))...)))))).((((((((((......))))))..))))...((((((.......(((((((((((....))))))))))).((((.((((((....(((((.....)))))(((((((((...(((.......)))...))))))))).(((((((((((....)))))).)))))))))))((((((..(((((((((...((((((((((((((.(((((((..((((((..((((.(((((.((((.....)))).))))).)))))))))).....((((((...........))))))..)))))))...))))))))))...))))...))).))))))..)))))).....))))(((..((((..(((...)))))))..))))))))).....
|
|
CRW_00650
|
[ FASTA input ]
|
AAGUCGUAACAAGGUUUCCGUUAACACACCUAGCGGAUAAAAGGGGCUGUUAAAAGCAGCUAACCCCUAGUGGCCUCAGUCGAUAGGGCUGAGAGACUGCGACACUGUCAAAUUGCCGGGAACUCCUGCUAAGCUGUUGAUACCGCUGACUCAGGGAAACCUUAGCUCAGCACCGAGGGGAAACUCACGGGUAUGGUAAGAACUCAACAGAUAGGGAUAAUCGGCAGCCAAGCGCUAAGGACUAGCAAUAGUCUAUGCGUGCAGUUCACAGACUAAAUGGCAGUGGGUUCGGCUCAGAGAGUCCGAGCUUAAGAUAUAGUCGGUCCCUACCGAAAGGUAGACUGUGGGAGGAAGCUCGUUCGGUGAGCGGAGAGCCCACAGUGGUCGAGUUAAUACCACUUCUCGCAAGGGAAGCGGCGGUCUUAGUCUGUUAAGGGCUUCAAGACUCGUCUCGCACUGGAGUAAACGAGAGGUGA |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((.......)))))))....(((((((((.....))))....))))).((((((((((((.....))))..))))))))..(((((((....((((((....(((.......(((((((((((.((((((((((....)))))).))))..(((((((....)))))))....)))....).)))))))....)))...))))))(((..((((...((((((....))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((...))).))))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((.....(((((.....)))))......))))))))(((((((((((((((.((((((....))))))....))))))))........................)))).))).......)).........
|
| [ predicted structure ] |
......((((.[[[[....))))....]]]].((((.....(((((((((.....))))....)))))[[[[..(((((((.....)))))))...))))..]]]].......((((((....((((......((((((((((((((((...(((....)))....))))).(((.(((....))).)))....)))).....)))))))...))))...)))))).....((((...((((((....))))))..))))..((((((((((((((..(((.((((((((.(((((..(((..(((((((....(((((((......((((....))))))))))).....))))))))))..)))))...))))))))....((((...........((((((....)))))))))).))))))))))))...))))).....((((.[[[[[.....))))...]]]]].....
|
|
CRW_00651
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUCCGAUGGUCCUUCUCGCCCGAAGGUUCGAGUCGCACGGAAGCCUAAGUGACCAGGGGCGAUUGAAAAAAGACCCUGCGUUGCUAGUGCCGAGCGAGAAAUGCUCGCGACGUUGCCAAAUUGCGGGGAAGACCUCUUUAUUGCGCGGGUUACCAAGCACGGCGGCCGUGCGUCCGUUUUUUAGGAUAAAGCACGCGCCGAGUGUGGCCAGGCCGUAUGAGCCUGGGUGUGGUAAUAACAUCCGACGCUCAUUCCAUUUUCUGGAAAAAAGGUGGACCCGCAGCCAAACCCGUUUCGGCGGGUGCUGUCCACAGACUAAAUGGCAACGGGCCCGUCCCAAUUAAAUGGCGACGGCUCAAGAUAUAGUCGGGCCUGCAGGUGCAUAAUCUGCAGGAAAUUGGAAAAAGCCUUCUCGCAAGUGAAUUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((........(((((......))))).............))))))).(((((((((((...............))))).)))))).(((...((((.....)))))))..(((((((....((((((....(((.........(((((((((((..((((..(((((((((((((........))))...))))).)))).))))..((((((.......))))))....)))....).))))).))....(((((.....)))))....)))...))))))(((..((((((....))))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((.((((((......))).))))))).......]]]]]](((((((((((.....))))))))).................................))..........
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((.......(((((......))))).....[[[[[..)))))))).(((((((((((...............))))).))))))......(((((.....)))))]]]]](((((((..(((((((....((((.......(((((((((((((.((((..(((((((((((((........))))...))))).)))).))))..((((((.......))))))...))))).....))))).)))...(((((.....)))))...))))...)))))))....((((((....))))))...(((....)))....)))))))(((((.((((((......))).))))))))............(((((((((((.....))))))))......[[[[...))).........(((....)))..]]]].....
|
|
CRW_00652
|
[ FASTA input ]
|
AGGGAGCCUGGACAGCUACUAAUAAUACAGAUAGACAGUAGCACAUUUCUUGGGCUCGAGAGCGGGCUGAAAGUGUCCCGCUAGUCCUCCCGCUGUUGGAGGGCAACACCGUCAAAUUGCGGGGAGGCCCUAAAGCUUUGACUACCAAGCCGGCGUGGAAACACAGUCGGUGGCCAGGGUAACGACCUCGGGUAUGGUAAAAACGUCAAAGAUGCACCAAUGGGUUAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGGCAACUCUUUGCCUAUGGAUGCAGUCCACAGACUAGAUGGCGGUGGGUCGGGGGGCGGUGUCCCCCGGCUUGAGAUAUAGUCGGCCCCACCGAGAGGUGGUCUGAGGGAGGAGCGGCGCGCUGUCGCGGUGAGAGCCCUCAGAGUGCUUGGCAUGCGAGUACUUUCGGUCGUGAGGCCGAAAGGGCAGCGUCGUCCCCCGGCGCCGCCUCCGAGCACGGAUUACGCGGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((...((((((................)))))).......))))))))...((((((..........)))))).(((((((.......)))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....))).))))))..(((.(((....)))).))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...((((((....))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((...))))))))))).......]]]]]]((.(((((....)))))((((((((....((((((......)))))).....))))))))((((((((..........................................................)))))))).......))..........................................
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((....((((((................))))))...((((...........[[[[[[..))))....]]]]]].(((((((.......)))))))..((((((((..(((((((..(((((.....((((((((((((.(((((((((....))).)))))).(((.((((....))))..))).))))).....)))))))..........))))).)))))))....((((...((((((....))))))..))))..((((....))))...))))))))(((((((((((...)))))))))))................(((((....)))))((((((((...(((..[[[)))...]]].......))))))))((((((((.......[[[(((((((((....)))))))))(((.((((((.....)))))).))).))))))))....]]]..(((......[[[......)))......]]]..))))).....
|
|
CRW_00653
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUCCGUAUAUACCAUUCACUUGCGGAUGAUAGGGGCAGUGAAAAGCUGCUAACCCCUAGUGAGCUCUCCCUACUCCUUUGUACAUAGAGCUCGCAACACCAUCAAAUUGCCGGGACAUCCUGUUCACAUGCUGCUGGUACCUCCAGGCACAGGGAAACCUUGCACUGGAACCAUGGUGAAAGCCGUGGGUAUGGUAAAAAUCUGGCAGCUAGGGACGAUCGGCAGCCAAGCGCUAAGGGAGUCUCAUUUUAACUGAUGAGGCUCUGAAGCGUGCAGUUCACAGACUAAAUGGUGGUGGGUUCCCUUGGGGAGCUUAAGAUAUAGUCGGUCCCCACCGCAAGGUGGGCUCAUGGGAGAAAAGCCUUGUAAGAAGGCUGGAGAGCCCAUGAGCAGCUUGAGCAGUUGUUCUCAAGCUGGGGUAAACGAGAGGUGA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((.............))))))...((((((((((.....))))....))))))(((((((((...(((......)))...)))))))))..(((((((....((((((....(((..........(((((((((((.(((((((.(((....)))))).))))..(((((((....)))))))....)))....).)))))))....)))...))))))(((..((((....(((((((((((......)))))))))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((...))))))).......]]]]]]((.((((((....))))))((((((((.....((((((.....))))))......))))))))(((((((((........)))))))))........)).......
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[[[...))).......]]]]]]...((((((((((.....))))....))))))(((((((((...(((......)))...)))))))))..((((.......(((((........(((((....((((((((((((((((((((.(((....)))))).))))).(((((((....)))))))....)))).....))))))))...)))))..))))).....(((((...(((((((((((......)))))))))))..))))).....((((.[[[[[....))))(((((((((...))))))))).....]]]]].....(((((....)))))(((((((((.....((((((.....))))))......)))))))))((((((((........)))))))).............)))).
|
|
CRW_00654
|
[ FASTA input ]
|
ACCAGGCGUUAAAAAGCAGACUCAGCGCCUAAGAGUCAGUGGGAAACCAUUGGCUAGUGCUUGGGUUUCAUUACUCAAGUGCAACACUGAUCAAAUUGCGGGAAAGCCCUAAAGCUUUGCUAACCAAGCUAAGUGUGAAAGCACUCAGUGGCCGGGUUAAAGACCUCGGGUAUGGUAAAAUCAGCAAAGAUGCAACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCUGAAGCCUUAUAGGCAAUGGAGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGCAGUGGGCCAACUUGUUGGCUUAAGAUAUAGUCCGUCCCAGCUGAAAGGCUGUCUGCUAGAGGAAGACCUUUCUAGGUCUGAGAGCUAGUAGAGGGUAGGAGAAGUCUCUCCUACCUGGAGGAAACGGGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((.............)))))))...(((((((((....))))))))).((((((((((......))))))))))..(((((.((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((.(((...)))..)))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((....((((...))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((....)))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((....((((((....)))))).....))))))))((((((((((....)))))))))).......)).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.............[[[[)))))...(((((((((....))))))))).((((((((((......))))))))))....]]]]......((((((...((((.....(((((((.((((.(((.(((((....))))).)))..(((((((...)))).)))...))))......)))))))..........))))..)))))).....(((((((..(((...(((....((((.....))))....)))...)))..((((((((....))))))))........(((.((((((((....)))))((((((((....((((((....)))))).....))))))))((((((((((....))))))))))))))))..))))))).
|
|
CRW_00655
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGGGCACCACCAGGCGUUAACUUAGCAGCAAGCUCAGCGCCUCAAAGUCGAAGGGAAACCUUUGGCUAGUAUCUGGGUGUAGAUUUCACCUAAGUGCAACACUGUUCAAAUUGCGGGAAAGCCCUAAAGCUUUGCUAACCAAGCUGUCCUAGAAAUGGGAUGGUGGCCAGGUGAAAGACCUUGGGUACGGUAAAAUCAGCAAAGAUGCAACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCUACGGGCUGUCAAAGCCUAUGGAGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGCAGUGGGCAAGCAUGGCAAUGCUUGCUUAAGAUAUAGUCCGUCCCAGCUGAGAAGCUGCCUAUGAGAGGAAUGCCGUAAGGCAGGAGAGCUAAUAGGAAGUAAGUGUCUUUAAUCAACUUACUUGGAUUCCACGGGAGC |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((((.................)))))))...(((((((((....))))))))).(((((((((((.......)))))))))))..(((((.((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((.((.....))..)))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((...(((((.....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((....))))))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((.....((((....))))......))))))))((((((((...........)))))))).......))......
|
| [ predicted structure ] |
.(((.((((......(((((((.....(((.....))).)))))))...(((((((((....))))))))).((((.((((((.......)))))).))))..((((((......((((((...((((.....(((((((.(((..(((((((((....))))))))).(((((((.....))))..)))..)))......)))))))..........))))..))))))......((((...(((((.....)))))..))))..((((....)))).....))))))(((((((((....))))))))).........)))).)))(((((....)))))(((((........((((....))))[[[[.....)))))((((((((...........))))))))...]]]]........
|
|
CRW_00656
|
[ FASTA input ]
|
AAACUGUUCACAGUUUCUACGAAAGCCGUAGUUAACUCUGCGCCAUAAAGCAGCCCGAUAAGGGUGUGGUGAGUGCGGCCUUAAAUGCUAGUCCGCUGGAGUGGGCUCCCUUCGGGGGGUUUUCCUCUGGCGGGCGACACCCUCAAACUGUUCGGGGAAGCCCUAAAGCUCUGUCUUACCAAGCUACGCGUUGAUAAGACCGUAGUGGCCCGGUUAAUGACCAGGGGUAUGGUAACAACGGAAAGAGAUGUCACAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAACACCCGACUUCGGAAGAAGAGGGUGCAGGUUCAGAGACUAAAUGGGGGUGGGUUUGGAAAACGGACCUUCUAUUUCCCAAGCCUAAGAUAUAGUCCAAUCCCCUAGGGAAACUUAGGGGCUACUACCUCUUCAAGUAGGAUCCUUCAAAUG |
|
[ reference structure ]
|
(....(((.((..((((...))))......)).)))..).........((((((((.....))))(((((.......)))))...)))).(((((((((((.((((((((....))))))))..)))))))))))..(((((((....((..((((....(((.....((((.(((((((..((((((.(((.....)))))))))..((((((.....))).)))....)))....).))).)))).((...))..)))...))))))(((...(((((...(((....)))..)))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((..((((((.(((...))).))))))..))).......]]]]]](..((((((((....))))))))(((((.........)))))...........).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....))))))(((((.....))))).........((((((...[[[((((.....))))))))))..]]](((((....(((..(((((((((((.((((((((....))))))))..)))))))))))..(((((........((((((....)))......(((((.((((((.((((((.(((.....)))))))))..(((((((...)))).)))...))))))..)))))..)))..........)))))....)))......(((((..((((....)))).))))).)))))....(((((..[[[[[[((((((((((((..(((...))).))).))))))))).....)))))....((((((((....))))))))......(((........)))..]]]]]]....
|
|
CRW_00657
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCACCACCAGGCGUAAAACCAAGCCGUUUGGCUCUGCGCCAGUCGGGUGUGAGGAGGGCCUCAAACAAGCUCCUCACACGAGAAACCCGGCUAGUCCUGGUGCGGCUUGCAUCGCGCCGCCGCACCUGGGCAACAUCAUCGAAUUGCUGGAAACCCCUAAAGCUCUUGGUACCAACCUGCAUGGGAAAUCGUGCGGGGGCCCACUCCGGGGAGGUUAUAAUCCAAGAGAUGCAACAAUGGGCAAUCAGCAGCGAAGACCCUGUCGGUUGGGACUUGCGUCCCGGCCCAUGGGUAACGUUCAGAGACUAAGUGGUGAUGGGCCCCGAUGCCACCCGGCCUCGGGGCUUAAGAUAUAGUCCGGCCCCGGCGAAAGCCGAUGUCGAGAUGAGGGGGUGCGACCCCAGAGCUCGGCAGUAGGGAUCAGAGUUCCUGCUCUAAUGUGGGCACGUGCGGCUUAA |
|
[ reference structure ]
|
............((((((...................))))))((((((((((((((((.............)))))))).......)))))))).(((((((((((((............)))))))))))))..(((((((....((((((...(((......(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((.....)))..)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((....(((((((((....)))))))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]].((..((((....)))).(((((((.....(((((...)))))....)))))))((((((((....))))))))......)).................
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......((((((...(((((...)))))...))))))((((((((((((((((.............)))))))).......)))))))).)))))(((((((......)))))))(((((((.(((((..((((((((...((((((...(((......(((((((.(((..(((((((((....)))))))))..(((.....)))..)))......)))))))..........)))...))))))..(((.((((....(((((((((....)))))))))...))))....)))..........))))))))((((((((.(((....))).)))))))).........)))))((((((((....)))).(((((((....((((......))))....)))))))((((((((....))))))))........))))..)))))))....
|
|
CRW_00658
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUGCCUUGAGCAGACGCUUGCGGAAGCCUUAGCAGCCCACAAGGGUUCCCCUCGCGACUAUAUUUAAAGGAAGGGGAUUGAAUGCUAGUGCCUGAGCUGCCAACUUGGGUGCGACAUCGCCAAAUUGCGGAGAACUCCACAUUUGCCUCGAUUACCAAGCGGACCGCCGAAAGGACCCCGUGGCCGGGCUAAUUGCUUUGGGUAUGGUCAAAACAUCGAGGAAAAGGAUGAUCCGCAGCGAAACCCUCUUGUUGUACAAAAGUGGGUGGCGUUCACAGACUAAACGGCGAUGGGUUCCAGAAAUUCGAAACCUGGGCUUAAGAUGUAGUCGGUUUGUCUUCGAAAGUGGCAGAUUGCAGAGUUUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((....................))))))))((((((((....)))))(((((...................))))).......))).(((((((((.......)))))))))..(((((((....((((((....(((.......(((((((((((..((((....((....))...))))..((((((.....)))).))....)))....).)))))))....)))...))))))(((..((((((((.........))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((.((...........))))))).......]]]]]]((..(((((((....))).))))............))..........
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.[[[[)))))..]]]].(((.[[[[.......)))(((((....)))))....]]]]((((((((((.......(((..((((((....(((((((((.......)))))))))..(((((((....((((((....(((.......(((((((.((((.((((...............)))).(((((((.....))))..))).))))......)))))))....)))...)))))).....((((.(((.........))).))))...(((....))).....)))))))..........))))))..))).......))))))))))((((((((...[[[[..))))))))......]]]].............
|
|
CRW_00659
|
[ FASTA input ]
|
UGAUUUCUAUGGGUGGUUUUCCAUCAGCAUUACCCAACACAGCUUUCAAGCUAGUACCGCUAGCGACACACCCUCCCUGUGCUGGAAGCUCCCCACCGCGGGGGGCACCAGCAGCCCAGCGUACCCCUCAAGGCCGCUGCGGUUCACAGACUACGCGUGGUGUGGGCCGGGGCUCAAGGCGACGGCUUCGAGAUAUAGUCGAGAUAUAGUCGAGCCCCGGGUCGAGUGAGUCGUUUCGGUGGUGGUGCAUGGCCG |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((((...........))))))))..((((((....)))).))..............((((.(....((((((...((((((.....))))))..))))))((((((((..((......)).))))).)))...[.[[[[[...).)).))((((((.............))).)))......]]]]]].((..((.((((........)))).)).......))..................
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[[[[[[.....))))..]]]]]]]]....((((....)))).((((((((((((((.(((.....(((((((((..(((((((.....))))))).)))))(((((((((.............))))).)))).)))).((((((...)))))).(((((((((.((((....))))...(((...)))..(((...)))))))))))).....))).))))).....))))))))).......
|
|
CRW_00660
|
[ FASTA input ]
|
UGCGAAUGGCUAAACCUACCAUGGGCCGUCGACGGUGGACUAGCGAGCUGGGGAGCCAGCUCGCGACAGUACCAAAUUGUGGGGCCUGCACCCGCAGCCAGGGCUCUCCUGGUUCAACGACUACAUGGUACGCGGCCGGAGCGUGAGCGUUCCGGUGAAAAUAUAGUCUCUCCUCGGGGACGCGCCCCCGGGACCGUGGCAUUAUAUCAGU |
|
[ reference structure ]
|
.....((((.((....)))))).....((((.((((((.((............)))))..))))))).(((((....((((((.......))))))(((((((...)))))))...[.[[[[[...))))).((.((((((((....))))))))))......]]]]]](..(((((((......))))))).....).............
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((((............))))))..((((((((((((((((((((....)))))))))....((((((...((((((.......))))))....(((((.....)))))..........))))))...(((((((((....))))))))).......))))))...(((((((......)))))))))))).)))..........
|
|
CRW_00661
|
[ FASTA input ]
|
CUGUGAUGCCCUCUAGGAUAGUGUAAAGAGUCUAAAUAGCUCCGCCCAGCGACGUUUGAUUCUCGCCUAGCGAGUUCUUCGAACGAGUCGAUCCCGAAUGAGCGCCUACAUCGGGCUCCUGGGGUGAUCCAGAGACUAGACGGAGGCGACGUCUCGCGGGGCUGGCCUUCAGACAUAGUCCAACGCAACGGCCGGGAUGUAAGUGUUAGAUGUUCUGGGCC |
|
[ reference structure ]
|
......((..((((............))))..)).......((..((.....(((((..(((((.....)))))......))))).((((.(((((...((((.((......)))))).)))))))))...[.[[[[[...)).)).((.(((..........))).))......]]]]]].(((((..........)))..)).................
|
| [ predicted structure ] |
.......((((.......(((......[[[[)))....]]]].((((.(((.(((((((..(((((...)))))....))))))).......[[[[[.....))).....]]]]]((((((((....))))).....[[[[[)))....]]]]]....))))((((...........[[[.[[[[[.[[[))))...]]]..]]]]].]]].....)))).
|
|
CRW_00662
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUCCGUAGGUACGCACGUUUGCCUACCGGAGACCCCGCGCGACUCUAAAGAAGUGCCCCAGUCGGCCCCGAUAAGGGGUUGGCGACGCCGUCAAUCUGCUCCGGGAGCGCCGUCCGCGGCCGUACCAGAAGCCCCUUUGGGGGUCCACAGAUCAAACGACAGCGGCCGCCCCGGGCGGUUGAGAUAUGACCGGCCCGCUUUUAUCGGACGGCGACCUCGCGGAACCUGCGGAAGGAU |
|
[ reference structure ]
|
.......(((((((........)))))))..........((((..((....))..))))....(((((((((.....)))))))))...((.(((......((((((..(.((((....)))))...))))))(((((....)))))...[.[[[[[...))).))(((((((...)))))))......]]]]]]((.(((((((....))))))).....)).................
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.[[[[...)))))).))))))))..................]]]]....(((((((((.....)))))))))(((...)))..(((((((((.(((((((((((((((((((.(((((......))))).((((....))))........))))))))..(((((((((.......)))).)))))........))))))))..))).))))....))))).....
|
|
CRW_00663
|
[ FASTA input ]
|
CUACCAUGGUGGCAACGGGUGAGCACGUUGCCCUGUAGGACGCAAGACCGUCGGGCGCGUCGCGGCGGCACCGGCGACACGCUGGCUCAGAUGAGGUCUCCGGGGCCGACUCUCGGUACGCCACGGGAGCCGCCCGAACGCAUGCAAAGCGGUGGGCCUUCCCAGGGGGCUUUUGGCACAUGCUACCGCCGACUGCGGUGCCGGCAAAGUGAACGGGGAAUUAGGGUUC |
|
[ reference structure ]
|
................((((((.....)))))).((..((((......))))..))..((((((......((((((((.(((((...))).))..))))))))(((...((((((........))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((...))))))))......]]]]]](((((((....)))))........))...................
|
| [ predicted structure ] |
..(((.....[[[[[[[))).....]]]]]]](((...[[[[[........)))..]]]]]..((((...((((((...)))))).......[[[[[[[[[...(((((...))))).))))..(((((..(((((..(((.......))).))))).))))).]]]]]]]]](((........[[[[)))....]]]].(((....[[[...)))...]]].......
|
|
CRW_00664
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCAAGUCUGGUGGACACACGCAUGUUGUCCGGCGCCGAGGCCCCCGGCGUUCGACUGCUGACGCCAGGGAAAACGUCGGCCCCUAAGAUCGGGCGCGACUUAGUGGCGUCGCCGCGAGUAUUCUUGUACGGGGAAGCGCACUUCGCUGUCUCAUCCCGUGUGGCCACAGCCUCCUUAACGCGCGCCAGGUGCCGGUGACUUCCGUGUACCGCUUGAGUACGUGCUAAUACCGCCGGACGGCAUUCCCUCGCCGGGUGCCCAGGGAUAUUGAUCGAGCAGCGCGUAAUCAGCUCAUAGCGUAUAUAAGUGGCCAGCAGCCGCGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((((((((....)).))))...)))))........((((((....(((((((((((.....((.((((((((........)))).))))))..)))))))))))(((((....((((((((((.((((.....))))......)))))))))).....)).)))...[.[[[[[...))))))((((............))))......]]]]]].(((((..(((.(((.......)))))))))..................................................)).................
|
| [ predicted structure ] |
.......(((..[[[)))...]]].....(((.(((((((.[[[...))))))).))).......]]](((..........[[[))).......]]](((((...[[[[[)))))((((.((((....))))((((.((((.....)))).))))....))))..]]]]]............(((((...((((((((..[[[[))).)))))....]]]].)))))........((((.(((...[[[[))))))).......]]]]........((((.[[[[.......))))...]]]]......(((((.....)))))....
|
|
CRW_00665
|
[ FASTA input ]
|
AGUUAGGGGAUCGAAGACGAUUGACCAGGGGUAUUUGUCGUCCACAGGUGCUGCAACCGACCUAGCCGGGAGCCAUCCGUCGCGCACAUCACCACUGCUGGCUCCUUCGGGUACCACAGCCAAGCUCCUCGCCGAGGCCGUCUACAAGACUCAACGUUAGAUGGCGCGCGACGUUUCUAAUAGAGUCGAGUCCCGCUCGUCACGGGUACCGUCGUAGU |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((((((.........)))))))))...((((..........)))).((((((.....))))..))....((((((..((((((...(((..............)))....))))))(((...)))....[[[[[...))).)))((((.....)))).......]]]]]..((..........))...............
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((....(((((...(((...)))..)))))))))...(((......)))..)))))).((((((((..[[[[[[[[.............))))))))...(((......)))...(((......)))((((((((.............))))))))]]]]]]]].............((((.[[[[))))...]]]]............
|
|
CRW_00666
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUGGCUCGAUCGUGGAUCCUUUCGCGGUUGAAACUACCGAAGCCUUAGCUGCCCGAAAGGGUGACCUCCGCGACUCGCAAAACAAGGAGAGGUCUCAAAAGCUAGUGGCUCCUAGCUGCUGCUCGUGCAGUGAGUGCGACAUCACCAAAUUGCGGGAAAUCCCUAAAGCUUUGACUACCAAGUGCGGCGCCGAAAGGCUCGCAUGGCCAGGGUAAUGACCUCGGGUAUGGUAACAACGUCAAAGAUGCAACAAUGGGCUAUCCGCAGCCAAGUCCUCGCCGCUUCGCAGCGGUUGGAUGCUGUUCACAGACUAGAUGGUGGUGGGUUCUCGGAUGCGUCCCGGGGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCUGCUUGGAAACAGCGGGAAAUCGCAGAUGCAUUCACCGUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((...(((((((((((....)))))))))))........)))))))((((((((....)))))(((((....................))))).......))).(((.(((((.((..........)))).))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((.(((....)))).))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...(((((....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]]]((..((.(((....)))))((((((....))))))....))..............................
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((((((((((((....))))))))))..........))))......((((....))))[[[[[[.(((...))).)))).....]]]]]](((..[[[[[[)))...]]]]]](((..[[[[[[)))..]]]]]]((((((((..(((((((....))).....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((.((((....))))..))).))))).....)))))))..))))...(((.......(((((...((((..((((((....)))))).))))))))).......)))..))))))))((((((.(((((((((.(((((((........))))...((((((.......))))))...)))..)))))))))........(((((....)))))...))))))..
|
|
CRW_00668
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUUCGGAGAGACCCGAUGAUCUCUUUCGUGGAGUAUAUAUCCUACCGAAGCCUUAGCCGCCCGAAAGGGUGACCCCCGCGACGUUUACUAAAACAAGGAGGGGUCCGAAAGUGCUAGUGUUCGGACUCGUUGACCGAAUGCGACAUCGUCAAACUGCGGGAGAUCCCUAAAGCUUUGACUACCAAGCACCUGGCCGAAAGGUCGGUGUGGCCAGGGUAAUGACCUCGGGUAUGGUGACAACGUCAAAGAUGCCACAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCCCUGGAGAAGCGACUUCAUGAUUCUUGCCCAUGACAUGUCGGAGCGGACAGUAUUUUGAACCCAGAGCGCCAUUUUUUUGAUGUCAGACAAAAAUACGGUGGCCGCUCGCGUCCCUCCUCAUGUCGAGUCGCUCCUCCGAGGAUGCAGUUCACAGACUAAACGGCGAUGGGCUUGGUGGCCUCCGUCGAGGUAAGCCGAGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCCUCGGGAAACCGAGGGGGUAUUCGCAGAUGCUUUCACCGUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((.................((((.....))))...............))))))((((((((....)))))(((((.......................)))))........))).((((((((.........))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((.((((....)))))))))..(((.(((....)))).))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((..((((...((((((((((((((((((...((((((..........)).))))....................((((...((((((........))))))...)))).................)))))..)))))))))))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((.(((((....)))))..)))))))).......]]]]]](((((((((....)))))))((((((....))))))....))..............................
|
| [ predicted structure ] |
......((((.[[[[[))))......]]]]].((((((........[[[[..............(((((....)))))....)))))).((((....)))).]]]].(((((((((..........))))))))).(((((.....[[[.....)))))..]]](((....))).....((((((((((((.(((((.((((....))))))))).(((.((((....))))..))).))))).....)))))))....(((..[[[)))........]]].((((..(((((.((((((((.(((.........)))((((((..((((.((((...............((((((((((((((((........))))))...))))).)))))..)))))))).)))))))))))))).))))).))))..........(((((....[[[[((((((((((.(((((....)))))..)))))))))).....)))))...(((((((....))))))).....]]]]...(((.((((((........))))))[[[)))..]]].....
|
|
CRW_00669
|
[ FASTA input ]
|
AAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUUUUAUUGGUUCUUCUGCAGUGCGCCAAAGGAAGCCUUAGCAGCCUGAAAGGGUGUAUCUCCGCGACUAUAAAUAAAAAGGGGAUUUUAAAUGCUAGUCUGAUAAAAAAAGGCGACAUUGCCAAAUUGCGGGAAGUCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGUUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGACUCUUAAUUGAGGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGACAUUUUAUUGUCUAUGGAUGCAGUUCACAGGCCAGAUGGCAAUGGGUAUCCUAGUGGGAUAUAUAUAUAUGGAUGCUUAAGAUAUGGUCGAGCUUCUCUCGAAAGAGAGGAGGUAGCACUGUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((....(((((.............)))))...)))))))((((((((....))))((((((...................))))))......)))).((((.........))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).))))))).((((((......))))))..)))...))))))(((..((((...(((((......)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((.......))).)).))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))......))................................
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((...((((((((((.(((((.............)))))))))))))))....((((....))))..[[[[[[))))))...........]]]]]]...........(((...........[[[)))...]]]....((((((....(((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((...............))).))))).....)))))))....(((......))).....)))...))))))((((.((((...(((((......)))))..))))............[[[..))))..]]](((((((...)))))))...........((((......[[[[[[...((((((((....))))))))..))))....((((((((....))))))))..]]]]]]..
|
|
CRW_00670
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCACCUUUUGAGGGUCAUGAAAGCGGCGCGAAAGUGUUAGCUAGUGAUCCGAAAAAUAAAUUCGGGUUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAGUCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGUUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGACUCUUAAUUGAGGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGACAUUUUAUUGUCUAUGGAUGCAGUUCAGCGACUAGACGGCAGUGGGUAUUGUAGAGAUAUGGGGUUAUUUAUGGCCUUAUCUACAAUGCUUAAGGUAUAGUCUAAUCUCUUUCGAAAGAAAGAGUAGUGUGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((.........)))))))...((((((((....))))).))).((((((((((.......))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).))))))).((((((......))))))..)))...))))))(((..((((...(((((......)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((....((((((((....))))))))))))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))....))...........
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((.........))))))))..((((((((....))))).))).((((((((((.......))))))))))...(((((....(((((((....(((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((...............))).))))).....)))))))....(((......))).....)))...)))))))....((((...(((((......)))))..)))))))))..((((..(((((.....(((((((((((((....((((((((....))))))))))))))))))))).......)))))..(((((((....))))))).....))))........
|
|
CRW_00671
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUUAAAGCGGCGUGAAAACGUUCGCUAGUGAUCUGAAGCCUUUUCAGGUUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGCUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGAAUCUUGAUUGAAGAUGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGACGUAUAAUGUCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGAUGGCAGUGGGUGUUGUUAAGACUUAGGUUUUUACAAUGCUUAAGGUAUAGUCUAUUCUCUAUCGAAAGAUAGCGUAUGGUGCUC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).((((((((((.....))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).))))))).((((((((.....))))))))..)))...))))))(((..((((...(((((.....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((((....)))))))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))....))....
|
| [ predicted structure ] |
........(((((....)))))((((.....((((((((....))).))))).(((((((((((...)))))))))))...(((((....(((((((...((((.....((((((((((((.((((((.(((....))))))))).(((...............))).))))).....)))))))....(((((.....))))).....))))..)))))))....((((...((((((...))))))..))))))))).....))))....(((..((((((((((.(((((....))))).)))))))))).[[[[[.)))......(((((....)))))......]]]]].
|
|
CRW_00672
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUGAAAGCAGCGUGAAAACGUUUGCUAGUGGUCAAGUUGGGUAUUCUGAUUUGACUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGCCUUAUUCACCAAGCAAUUGUGGAAACACUCUUGUGGCCAGGUUAAUAGCCUCGGGUAUGGUAACAGUAGUAAGGAUAAAUGUGAAAAAUGGGUUAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGGGAAAAAGAAUUACAAAUCCGUAUUUUCAUCCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGACGGCAGUGGGUACUGCUCUUUUUUACUCUGAGUAGUGCUUAAGGUAUAGUCUGUCCUUUUCUGAAAAGAGAGGGAGGGGAGGUGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).(((((((((((((.....)))))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).)))))))...............)))...))))))(((..((((...((((.((((................))))..))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((...........)))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))........))...........
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((..........))))))))..((((((((....))).))))).((((((((((((((...))))))))))))))..(((((.....(((.(((....))))))..(((((((.((((.((((..(((....)))..)))).(((((((.....))))..))).))))......)))))))......((((((((.(((((((((((.(((..((((..(((((((((.....(((......)))))))).))))..))))..((((....))))....))).)))))))..))))))))))))......)))))((((((((((..(((.(((((((((....))))))))).)))..)))).))))))..
|
|
CRW_00673
|
[ FASTA input ]
|
UCGCAAGGCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGGCACCACAAGGCGUAAACUUUUACCGCUAGCCGCAGUAACUCUGCGCCGAACAGCAGCCCGAAAGGGUGAUGUGGUGACCCUCUAAACAGUAAAUGCUAGUCCAGCACGGCUGGGCGACACGCUCAAAUUGCGGGAAACCCCUUAGAGCCUCUAGCUACCAAGCCGCCGGUCGAAAGACGGCGGUGGCCAGGUUAAUUCCCUCGGGUACGGUGAUAACGCUAGAGGAUUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCCCCUACGUUCCGCAGGGAAUACGGGGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGGUGUGGGUUGGGUCCUCCGGGGGAGGACACCAGCUUAAGAUAUAGUCCGGCGCCAGGGGAAACCAUGGCGGUUCAGGUAUACCUGUCUUAACGGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAA |
|
[ reference structure ]
|
............................................((((((...........................))))))....(((.((((....))))...........................))).(((((((...)))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((((((((((((.(((....)))))))))))(((((.......))).))....)))....).)))))))))..)))...))))))(((...((((...(((((....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((((...))))))).)))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))......................))..........................
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((((............((((.....(((((((((((.((((((.....((((...........))))...))))))........((((....))))..))))))).)))).....))))...((((.....)))))))))..))))((((((((......(((....)))......((((((((((((..((((((((((....)))..))))))).(((.......)))..)))).[[[......))))))))...(((...)))...]]]...((((...(((((....)))))..))))..((((....))))...))))))))(((((((((((((...))))))).))))))........((((...(((((..........)))))...(((((...(((((....))))).)))))...........))))...
|
|
CRW_00674
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUAUUGAUCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGUUUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGGAUGCAAGUCAGCGACGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUUAGAGCUCAGUUCUACCAACCAGUGAGGGAAACCUCCGCUGGGGCCUAUGCUAAAAACAUGGGAGAUGGUAAGAAGGAACUGAGAUUGGAUAAUCCGCAGCCAAGCCCUAAGGUGUGGAAGCACUAUGGGACAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGCAUGCGUUAAGGCGUGUGCUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUUGCUGAGAAAUCAUCAAGAAGUCACUGCACAGAUUGAACGUUCCGUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((......((((..(((((((((((....))))))))))).....))))...))))))))(((((((((....)))))(((..................)))..)))).((((((...))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..(((((((((....))).))))))..((((((.......))))))....)))....).))))))))...)))...))))))(((..((((...(((((....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))...................))........
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....))))).(((.....)))(((.((((....)))).)))((((((((.............(((((......))))).(((((((.(((.(((......(((......))).((((((...))))))...))).)))...((((((...((((......(((((((((((((.(((((((((....))).))))))..((((((.......))))))...)))).....)))))))))...))))..)))))))))))))((((.(((((....))))).)))).....(((((.[[[[[.)))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....]]]]]..(((((.(((....))).))))).))))))))...................
|
|
CRW_00676
|
[ FASTA input ]
|
CUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUUGGACUCCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGGUCUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGAUGCAAGUCAGUUCGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUGAGAGCUCGGUUCUACCAACCAGCAGAGAAAUCUAGCCGGGGCUGAUGUUAACAGCAUCGGAGGGUAAGAAUGAAUCGAGAUUGGAUGAUCCGCAGCCAACCCCUAAGGCUUGCUGCUAUGGGAGAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGUAUGCUCUAGCGUACUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUCUGCUGGAAACAGCGGAGAAGUCACUGCACAUGAAACGUUCCGUAGGUGAACCU |
|
[ reference structure ]
|
................................((((((((......((((..((.(((((((......).)))))).)).....))))...))))))))(((((((((....)))))..((((.............))))...)))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((.(((((....))).)).))..((((((.......))))))..)))....).))))))))...)))...))))))(((...(((...(((.....)))..)))...)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]]]((((((((((....)))))))).................)).................
|
| [ predicted structure ] |
..............(((((....((((....(((......(((((((.....)))))))...)))))))..)))))((((((((..........(((...[[[(((((....)))))..))).(((.(((......(((.....))).(((((....)))))...))).)))...]]]..((((((((......((((((((((((.......(((....)))........(((((((.....)))))))..)))).....))))))))...))))).)))(((((....[[[........)))))...]]].....(((((.[[[[[.)))))..((((((((((((....)))))))))))).....]]]]]..(((((((((....))))))))).))))))))..(((....[[[[)))....]]]]..
|
|
CRW_00677
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAGGGCACCACCAGGAGUAAACGUUUAUGUCGCAGUUAACUCUGCUCCGAAAAGCCGCUCGAAAGAGUCAUGGUGUCCUUGAAGGCUAGUCAGUUCGCUGGCGACAUUUCCAAAUUGCGGGAAACUCCUUAGAGCUCAAGCUACCGCCUCUGUUUAGUGAUAGACAGCUGGCACCGGGUUAACGACCUCGGGUAUGGUAAAAACGUUUGAGAUUGGACAAUCCGCAGCCAGCUUCCUUGAGAGGAAGAAGGUUCAGAGACUAGAUGGAUGUGGGUGAAGUCUUUGGAUAUGAAGAUUUUGCUUAAGAUAUAGUCCAAUCCAAAGCGGAGACGCAUUGGUUACAACAAGUAGAAAAUGGGAGCCUGCGCUUAAUUUGA |
|
[ reference structure ]
|
................((((((.......................))))))....((((((((....))))).(((.....)))...))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((.((.(((((((....)))))))..))..((((((.....)))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((..((((((....))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((((....))))))))))))).......]]]]]].((((((((((....)))))))).(((.....)))....)).....................
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((...((((((...(((............)))..))))))....[[[[((((....))))..))))))))))...]]]].(((((....))))).............((((((....(((......((((((((((((((.(((((((....)))))))..))).(((((((...)))).)))....)))).....)))))))...)))...))))))(((..((((((....))))))..)))(((..[[[[[..)))...(((((((((((((((....))))))))))))))).....]]]]]....(((..(((....))).(((....)))[[[[[......)))((((....)))).]]]]].
|
|
CRW_00678
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAAGUCGUAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUAUUGAUCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGACGGUCUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGGAUGCAAGCCAGCAACGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUUAGAGCUCAGUUCUACCAACCAGUGAGGGAAACUUCUGCUGGGGCCUAUGCUAAUGACAUGGGAGAUGGUAAGAAGGACUGAGAUUGGAUAAUCCGCAGCCAAGCCUAAGGUGUGAAAGCACUAUGGGACAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGCAUGCGCUAAGGCGUGUGCUGCUUAAGGUAUAGUCGGUCUUGGCUGAGAAAUCAUCAAGGAGUCACUGCACAAACUUCAUACCAACAACAACCAUGGCUUCCACAUGUUGGAAAUCUGAAUGCUGCUCAGCUGCUGAGUACAGUCCAACAGAUUCUCAACUAGAAGAGUUUGCUGAUGUCAACGAACAUCUGACUGCCGCCGAAGUACGGAACUUACGAAGCAACCUUCAGUGGCCAGGAAAGCCAGUCUUCAGACCGUACGGCGGCACCAAAGAUGGAGAGUACAGUCAAGUCAGAUUCUGCGGCACCAAGUAUGCUGUUCAUCGAGUAACCUAUGCGCGCUAUAAAGGCGUUGGCUAUCUUGAUGAUACCAUGGAUGUCUCUCAUGUGUCUAUCGGUGGUCGAAAGACUACCCACAACAUCAAUCCCUAUCAUCUACACACUGUGCGCAAUGCUCUCAACAAGACGCGACACGCCUGCCACAGGUUUCUGGAGUAUCGAUGUCGAGAGCGCUAUUUGCGGCGAAGUACUGGCGAGGAAACUACAUCUCUGACGCAAUUCAACACUGGAUGCGAAUGGAUAAUGUUACUUGUGCUAGACGUCAUUCGGAGAAGCGAUGUAAGGUGCAUUGGGGUCUCUGGCAAGGAGACUAUGAGAGGUUUGUUACUGACGGAGGUGAUGGGUCCCUUGCUGCUGUGUGCUUCCGAGCAGAUGACCAGCAUGUUGAGCCAUCCAGUGCUUUUCUCGAAGAGUCUAGCAGUCAGCAUGAUUGAAGUUUGAAUUAGAAGAUUGAACGUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUC |
|
[ reference structure ]
|
..............((((((((......((((..((.((((((((....)))))))).)).....))))...))))))))(((((((((....)).)))..((((.............))))....)))).((((((...))))))..(((((((....((((((....(((......(((((.((((((..(((((((((....))).))))))..((((((.......))))))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...((...(((((....)))))...))...)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]](((((((.(((....))))))))..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))............................
|
| [ predicted structure ] |
.......((((...[[[[[[[[...........))))(((.((((....)))).)))...((((...)))).]]]]]]]]....(((..........[[[.)))..]]].........(((..[[[.))).((((((...))))))......]]]....((((((...((((......(((((((((((((.(((((((((....)))).)))))..((((((.......))))))...))))....)))))))))...))))..))))))(((...((((.(((((....))))).))))...)))...((((((..((((((((.((((((((((((....))))))))))))...(((((((((((((((((.(((....)))))))).....)))).....)))..))))).............))))))))..((((..((((((.....(((((((...)))))))........))))))..))))......)))))).....(((......[[[[[)))((((((((...(((((.......((((....))))..((((.......)))).........)))))))))))))....]]]]].........(((....[[[....[[[))).....]]]..]]].((((((((..........(((((.....)))))[[[....))))))))..]]]..(((((......[[[[[.....(((((((....)))))))....)))))..............]]]]].....(((...[[[[[[........))).......(((..(((....)))..)))........]]]]]](((...[[[)))...]]](((((((((.(((...((((....((((.((((....))))))))...))))...))).))).)))))).(((((.(((((((..(((((((...)))))))...))))))).....(((((......))))).....)))))((((.....[[[[)))).(((((...........)))))..]]]]..((((((((...[[[[..((((...(((...)))...)))).))))))))......((((((.........)))))).(((((((((....)))))))))]]]].
|
|
CRW_00679
|
[ FASTA input ]
|
UUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUAAACGUUUAUGUCGCAGUUAACUCUGCUCCGAAAAGCCACUCGAAAGAGUGUGGUGUCCUUAGAGGCUAGUCAGUCCGCUGGCAACACAAUCAAAUUGCGGGAAACUCCUUAGAGCUCAAGCUACCGCUGCUGCCCAGAGAUGGGCUGUGGCACCAGGUUAACGACCUCGGGUAUGGUAACAACGCCUGAGAUUGGACAAUCCGCAGCCAAGCUCCCUCAUGGGAAGAAGGUUCAGAGACUAGAUGGUUGUGGGUUGAACACGUUUAUCUGAAGUAUUUGAACGGUUCGGCUUAAGAUAUAGUCCAAUCCAAUGUGGAAACGCACUGGUCUGAAAGAUAGAAAAUGGGAGCCUGCGCUUAAUUUGAC |
|
[ reference structure ]
|
....................((((((.......................))))))....((((((((....)))))(((.....)))...))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((.((((((((((....))))))))))..((((((.....)))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...((((((...))))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((.((((((...........)))))))))))))).......]]]]]].((((((((((....)))))))).(((.....)))...))......................
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((((..((((((...(((............)))..))))))........((((....)))))))))))))))........((((.[[[[[))))..............]]]]]...(((....)))....(((..[[[[.)))(((((....))))).]]]].((((......[[[.[[[[[[[.))))......]]]]]]].]]]..(((((((((((((...((((....))))...[[[[[[..........)))))))))))))....((((((...........)))))).....(((........)))(((..(((.((((....)))).)))((((.....))))...)))]]]]]]..............
|
|
CRW_00680
|
[ FASTA input ]
|
UGGCGAAAUCCAACCAAGCUCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUCACCCCCUUAAAUAUGGCGCUCACCAAUGCUCAAAUCUUGGCUGUGAUUGACAGCUGGGAAGAAACAGUCGGUCAGUUUCCAGUGAUAACGCACCAUGUACCAUUAGGUGGCGGUCUGCAAGGAACGCUCCAUUGUUACGAGAUCCCCCUAGCAGCUCCUUAUGGGGUUGGCUUUGCUAAGAAUGGGCCUACCCGCUGGCAAUACAAACGGACAAUCAAUCAAGUCGUCCACAGAUGGGGAUCCCACACAGUCCCUUUUCUAUUAGAACCGGAUAACAUCAACGGCAAAACCUGCACAGCAUCGCACCUAUGUCAUAAUACUCGAUGCCACAAUCCCUUGCACUUGUGCUGGGAGUCACUAGACGACAACAAAGGCAGAAACUGGUGCCCGGGUCCAACGGGGGAUGUGUCCAUGCGGUGGUUUGUUUAAGGCAGGGUCCGUUGUACGCCCGGGGGCGACUGUGGCAGGUCCUCAACAAAGGGGCAGUCACUUUGUGGUAUAAGGUCUGAGGUUACUAGAUCGGGUGGGUCAGCCCACGGGCAAAACGCUGACCGUACCAAGUAGGAGAGAAAAGUCACAGGUAGGCACCUGGUGGCUAGUGGCAUGCACAAUAGCUUGCAUCGUGCAUGUUGCGAGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCACACAGCUGUCUAGUACUAACCCACCGGCGAAAGCGGGGUGGGGGCCUUGCACAGGAUAUAGUAAUAAGCUAGCAGACACGGUCCUAACCACGCAGCCAAGCCCUAACCAAACACACACUGUGUGUUUGUAUGGGUGCAGUUCACAGACUAAAUGUCGGUCGGGGGCUUCGGCCUCAUAAGAUAUAGUCGGCCCUUCCCUUAAUGGGGACCUGGAGAAGAGGUGAUGCAACACCAGAGCUCCGGAGACUCGGGGGUAGCACCCGAGUUUGGAAUCAGCGUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAU |
|
[ reference structure ]
|
..............................................((((((.((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)).))))))...((((((((((....))))).))))).(((((((((((.((.......)).)))))))))))..(((((.(....((((((....(((........(((.((((((((((((((((.((....))..))))))))(((.....)))....)))....).)))))))......)))...)).))))((...((((...(((((((((.....)))))))))..))))...))...[.[[[[[...).)))))((((((....)))))).......]]]]]]((...(((((....))))).((((((....((((......))))....)))))).((((((((.......))))))))........)).........................
|
| [ predicted structure ] |
((((((.......((((((((((((.......((((((.......))))))..((((((.......(((.............)))..(((..(((((.....)))))..)))......((((((((........((((....((((((((.....(((((((((.((((((..(((....))).(((((((...(((((((((((((((((....)))))......)))))....(((((((....(((((((........((((.............))))...(((((((((........)))))..((((...))))........))))............))).))))...((((((((......))).....((((....((((..(((....))).))))(((....))).........))))......)))))..)))))))..)))))))........((((....)))).....(((((((((...(((((((....)))..(((((((..(((((.......))))).....((((.((((((..((((((.......))))))..(((((....))))).(((.....)))....))))))....))))......))))))).((((((.(((((((((.(((((((((((.............)))))))))))....((((......))))......)))))).))).))))))))))....(((((...........))))))))))))))..........)))))))....))))))..(((....))).....))))...))))).(((((((((...)))))))))))).)))))...)))).(((((..((((.....(((((....)))))....)))))))))))))..(((((....))))).((((((....((((......))))....)))))).)))).))))))...))))))))))))...........((((......)))))))))).
|
|
CRW_00681
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCACCACCAGGCGUAAACCUAGCCGUUUGGCUCUGCGCCAGUCGGGUGUGAGAAGGGCCUAGUUCACUAUGGUGGUAAACAAGCUUCUCACGCAUGAGCAACCCGGCUAGUCCGCCACACCAGCAGUCGCACAGUGUGGCAGGGCAACAUCAUCGAAUUGCUGGGAAGCCCUAAAGCUCUUGGUACCAACCUGCAGCGGAAACGCUCGGGGGGCCCCGCUCAGGGGGAGGUGAUAAUCCAAGCAGAUGCAACAAUGGGUGAUCAGCAGCGAAGUCCCUGUAGGCCGCCAGCCCACGGGAAACGUUCAGAGACUAUGUGGUGAUGGGCUUUGACCUCUGCGGUCUGAGCUUAAGAUAUAGUCCGACCCCGGCGAGAGCCGAUGUCGAGAGGAGAGGGGUGCGACCCCGGAGCUCGGCAGUAGGGAGACACACAGUAUGUUCCUGAUCUGAAGUAUACGGGAGCGUGCGGCUUAA |
|
[ reference structure ]
|
............((((((..................))))))((((((((((((((((............................)))))))).........)))))))).(((((((((((.............))))))).))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..((((.....))))..)))....).))))).)).........)))....))))))((....((((....(((.....)))...))))...))...[.[[[[[...))))))).(((((((((.....)))))))))........]]]]]]((...((((....))))..((((..............))))...(((((.........................))))).............)).................
|
| [ predicted structure ] |
(((.........[[[[[[..)))((((....)))).]]]]]]((((((((((((((((.(((..[[[......)))....]]]...)))))))).........)))))))).(((((((((((......[[[....))))))).))))........]]]..((((((...((((.......(((((((((..((((.((((....))))))))...((((.....))))..)))).....))))).............))))..))))))(((.....[[[[[.[[[)))..]]].]]]]]...........((((((((.[[[...(((((.((((.....)))).)))))....))))))))...(((((((....)))).(((((((......(((((...)))))....)))))))...)))...]]]...(((((((((((............))))))))))).......
|
|
CRW_00683
|
[ FASTA input ]
|
AAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGAAAGGGGCAAAGAGGACUAGUGACUCAUCCAAAGACUUACGAGAUGCUUUAUUAGACGCACUGCGUGUAUGAAGACACUUGAACUCCGGGUGGUUACGCAUGAGACGGCAGUAGAUGCGACUUUUGUUCAGGUCGCCGGACUCCAACGUUAAAUGCGCCUUGUUGACACACUUAGCGUUGUGGCACGUGUGGCCCAUGGAGUGCGAAUGCUUCUCUAACUGCUCCAGUACAGCUUGCUGGACGUGAUGGAGCAAGAACUUCUCGUAAGCGUGGGUGGGCGCGACGUCCAUGGUAAUGAGACCUUCUCUGCAUGACAUACCCUACUGAAGCCUUUGCGGCCCGAAAGGGUGCGCGGUCACGACAUUAAAUAAAGAGCCGUGUUCAACGCAAGUGACGGGGGAGAGAGGACUGAAAGUGACGGGGAAAAGUCGCUUUUGUUGGCGACUUUCCCGAGUGGGGGAUGCCAAGGUAUUAUAUCGCGGUAUAUAUAUAUCCUACAAUAGACGACGCAGUCAGUCCGAAAACCCAGUUGCUACCUUUUCAAAUUGCGGGAAUCCCCUAAGAGCCCAUCACUACCGCGGCCGUUGUGGAAAACACUCGGUGCAGCAGGCGAGGUAGUUCCCCGCUGGAUGGUAAUAAGGUGAUGGGAUUGUCUCUAGAGACUUGCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGUCCCUGUCAAAUGGGAAAGGUUCACAGACUGUAAGGAAAGGGGUGCCGCUUCCUAUUACGCGGCGCUUAAGAGACAGUCGGUCCCCUGCGAAAGCAGAGUCCCGAAUUGGAGGAAAAGGCCCAUUAAAAGUGGGCUUUGGAGAGCCUCGGGAGGCCAGAGAGGAAAGGCUCCGCGCCCUCCUCACUCGGCUGGGUUCAAGUCCUUUGACUUUAUGUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((.....((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))....)))))))((((((((....))))(((((((..................)))))))....)))).(((((.....................................................................................................................................)))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((((((.(((..(((.....))).))))))....(((((((.....)))))))....)))....).))))))))..(((............)))..)))...))))))(((...((((........))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((..........)))))))).......]]]]]]((.((((((....))))))((((((..........((((((((((...))))))))))........))))))((((((.(((...(((...........)))..)))..)))).))................))................................
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.[[[.........)))))......]]].....((((..(((.((((((((....(((((((((..((((((...((((...))))..))))))...((((..(((((.(((....))).....(((((((((((.(((((((......)))))))...((((((..((((.(((.(((.((((((.....))))))....))).))).))))...))))))..(((...)))))).)))))(((((((.....))))))))))..)))))))))....)))))))))..)))))))))))...))))..((((..((((...))))....[[[[.)))).............((((((((....)))).))))]]]]..............(((..[[[)))..]]].((((((.(((......(((((((..(((.((((((..(((((((......))))))))))))).((((((.(((((..((((...))))..))))).......)))))).........)))..))))))).....))).))))))...............(((....))).....(((....[[[[[[...((((..(((.....))).))))......)))..]]]]]](((.[[[[))).........]]]]...(((((((((.....[[[[[[....))))))))).....]]]]]].......((((((((.........[[[[[[........[[[[[[[[[))))))))..]]]]]]]]].....]]]]]]..(((.((((....))))..[[[[[[......))).(((((((((.....)))))))))........]]]]]]((((...(((((..(((.....))).)))))....))))(((.....[[[[[[[..........)))(((((....))))).]]]]]]].....
|
|
CRW_00684
|
[ FASTA input ]
|
AAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGAAAGGGGCAAAGAGGACUAGUGACUCAUCCAAAGACUUACGAGAUGCUUUAUUAGACGCACUGCGUGUAUGAAGACACUUGGAACUCCGGGUGGUUACGCAUGAGACGGCAGUAGAUGCGACUUUUGUUCAGGUCGCCGGACUCCAACGUUAAAUGCGCCUUGUUGACACACUUAGCGUUGUGGCACGUGUGGGACGCCUCUUCACCAGGGAGAGGGAGACGCUCAGUCGCUGCCACCGCGACAAUGAUGUGGCAAUAGUACUUCGUGCCUUGAUAGCGCAGUUGGACGUAACCGCCAGAGACCUUAGCAGGGGCGUAGUCCGUCACAAUGCAGCCGUUCUCCAUGGAGUGCGAAUGCUUCUCUAACUGCUCCAGUACAGCUUGCUGGACGUGAUGGAGCAAGAACUUCUCGUAAGCGUGGGUGGGCGCGACGUCCAUGGUAAUGAGACCUUCUCUGCAGGACAUACCCUACUGAAGCCUUUGCGGCCCGAAAGGGUGCGCGGUCACGACAUUAAAUAAAGAGCCGUGUUCAACGCAAGUGACGGGGAGAGAGGACUGAAAGUGACGGGGAAAAGUCGCUUUUGUUGGCGACUUUCCCGAGUGGGGGAUGCCAAGGUAUUAUAUCGCGGUAUAUAUAUAUCCUACAAUAGACGACGCAGUCAGUCCGAAAACCCAGUUGCUACCUUUUCAAAUUGCGGGAAUCCCCUAAGAGCCCAUCACUACCGCGGCCGUUGUGGAAAACACUCGGUGCAGCAGGCGAGGUAGUUCCCCGCUGGAUGGUAAUAAGGUGAUGGGAUUGUCUCUAGAGACUUGCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGUCCCUGUCAAAUGGGAAAGGUUCACAGACUGUAAGGAAAGGGGUGCCGCUUCCUAUUACGCGGCGCUUAAGAGACAGUCGGUCCCCUGCGAAAGCAGAGUCCCGAAUUGGAGGAAAAGGCCCAUUAAAAGUGGGCUUUGGAGAGCCUCGGGAGGCCAGAGAGGAAAGGCUCCGCGCCCUCCUCACUCGGCUGGGUUCAAGUCCUUUGACUUUAUGUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((.....((((............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))....)))))))((((((((....))))(((((((..................)))))))....)))).(((((....................................................................................................................................)))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((((((.(((..(((.....))).))))))....(((((((.....)))))))....)))....).))))))))..(((............)))..)))...))))))(((...((((........))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((..........)))))))).......]]]]]]((.((((((....))))))((((((..........((((((((((...))))))))))........))))))((((((.(((...(((...........)))..)))..)))).))................))................................
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.[[[.........)))))......]]].....((((..(((.((((((((....(((((((((............((((((.((((.(((....(((((((....)))))))......)))((((((((.(((...(((((((......)))))))((((((..........((((.(((((((((........(((((((((((((.(((.(((.(((((((.....)))))))(((...))).)))..((((((............))))))....)))..))))))...)))))))..((((.........)))).....)))))))))))))))))))......))).)))).)))))))).))))))..((((((.........(((((((.....)))))))......))))))......)))))))))..)))))))))))...))))..(((...[[[)))..]]]..(((.....[[[...)))........(((((((....)))).)))]]]................(((..[[[)))..]]].((((((.(((.....(((((((..(((.((((((..(((((((......))))))))))))).((((((.(((((..((((...))))..))))).......)))))).........)))..))))))).....))).))))))...............(((....))).....(((....[[[[[[...((((..(((.....))).))))......)))..]]]]]](((.[[[[))).........]]]]...(((((((((.....[[[[[[....))))))))).....]]]]]].......((((((((.........[[[[[[........[[[[[[[[[))))))))..]]]]]]]]].....]]]]]]..(((.((((....))))..[[[[[[......))).(((((((((.....)))))))))........]]]]]]((((...(((((..(((.....))).)))))....))))(((.....[[[[[[[..........)))(((((....))))).]]]]]]].....
|
|
CRW_00685
|
[ FASTA input ]
|
CCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGAACGUAUGCAUCAAAGCCCUCCGUAAUAAAAAAAAACAGCGCCAGAUGUCUCUCUCUGGAAGCACACCACGCACGGGGUUCGUUCCUCUCUGCAUGGCCGUGUGAAAAAGGCGAGUAGGCAAACGAUGGGAAACCCGGCUUGGAAUAGUAACCAGCCACAGAGGCCCCAUCAUACACUUCUAAAUUGCCGGGGAGUGCCCGCGAGGCCUUGACUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGAGCGAGCAAUCGCUCAGGACGCAGCAGUGUACGUAGUGGUACAUGGAUGGUAAAAACGUCAAGGAUAGGGUUGAUCCGCAGGGAAGCGCGAGGGCCAACCUGCCUUUGGGCAACAGUUGGCAAAGGCGAACCUUCAGAGACUCUAAUGGAGUGGGCGCAAGCUUAAGGGAGAGUCCAAUCCACUGGGAAACCAGGUCCACAGCAGUAACGGGGUGAUGCUCGCCCCAGAGGACUGUGGAAGGCAACCACCAAAGCGGUGUGUGUUGUCGGGUAGCAAUGGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAG |
|
[ reference structure ]
|
...............(((((((.......................................)))))))................................................................................................................................(((((((....((.((((....(((.......((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((((......))))))....)))....).)))))))....)))...))))))(((...(((....((((((.((((....))))...))))))....)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((...((((....)))).(((((((.......(((((((...)))))))......))))))).((((((................))))))........))........................
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((..[[[[[[[[...............))))))).................]]]]]]]]..............((((.(((.(((.((((.[[[[[))))..))).)))..))))......]]]]]..........((((((...[[[[[[.(((........)))(((.....)))))))))...............]]]]]]....((((......(((((((((((...(((((((....)))..((((((....)))))).))))......((((((......))))))....)))).....)))))))...))))...(((....)))..(((....((((((.((((....))))...)))))).[[[)))...]]]....((((((..[[[[.(((((....)))))....))))))...]]]]((((....)))).(((((((.......(((((((...)))))))......))))))).((((((((((.....))))...)))))).(((.......[[[....)))..]]]........
|
|
CRW_00686
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUCCGAUGGUCCUUCUCGCCCACAGGGUUCGAGUCGCACGGAAGCCUGAGCAGACCAAAGGGAGAUGAUUCCUUGGGAUAUGCUAGUGCCCAAGCACUGCUUGAGCGCGACGCCGCCAAACUGCGGGGAAACCACUCUUUGCACCGAGGCUACCAAGCACGGCGGCCGCCAUCCCACCCAAUCUCGAUGUGGGAUAGCGGGCCGAGUGUGGCCAGGCCAGCGAGCCUGGUACGGUAAAAACGCCUCGUGCUGACCAGGUUUGGUCGGGGGUCAACCCGCAGCCAAUCCUGCUCCUACCUGGGAGCCGGUGCUGUUCACAGACUAGAUGGCGACGGGUCGUGCACAUUGCAGCGGCUCAAGAUAUAGUCGGUCCACCUUCGGGUGAGCUAGCCCAAGCCUUCUCGCAUGAGUAUUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((............(((((((...)))..)))).......))))))).((((..(((((((((.....)))))))))...)))).((((((((((...))))))))))..(((((((....((((((...(((........(((..((((((((..((((..(((((...(((((((...........)))))))....))))).))))...(((((......)))))....)))....).)))).))).((((((....))))))..)))...))))))(((..((((((((((....))))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((...))).)))))).......]]]]]]((.((((....))))................................))..........
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((..(((((...(((((((...)))..)))).....(((....)))....)))))..)))))).....)))))((((((((.(((((....)))))((((((((.((((..(((((..(((((((...(((.(((...((((.(((((((((..((((..(((((...(((((((...........)))))))....))))).)))).(((((((......)))))))..)))).....))))))))).(((((....)))))))))))...)))))))........((((((....)))))).(((.(((....))))))...)))))..((((((((((...))).)))))))........))))...((((....)))).)))....)))))......)))))............))).....
|
|
CRW_00687
|
[ FASTA input ]
|
UUAUGUGGGUGGUGGUAGAACUACAUGUGCCACCUACAGCUUAUAUUGCUAGUCUAUCGUAACUGAUGGGCAACAUCCUCAAGGUGCUGGAAGUUACCUGCAAAGGUAAUAUCAGCAGCCACAUCUCCAUGUGGUUCACAGACUAAAUGAGGGUGGACCAAAUCCGCCAGGGUAUAGGUUUCAGAUAUAGUCGGCCUGAUGCGAACAACGUGUACAGACUGCAGCGGCAUGGCCGUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((((..........................))))))))((((((((....))))))))...((((((....((((((...((((((....))))))..))))))(((((((....)))))))...[.[[[[[...))))))(((((..((((....))))...)))))......]]]]]]((((((((((.....))))).)))......))...............
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((.(((....)))....)))))))))).......((((..[[[[[[[))))..]]]]]]]..((((((((.(((.(((...(((((((....)))))))......((((((((....))))))))..))))))...)))))))).(((......[[[..)))...]]].((((...[[[[[...))))((((.......))))..]]]]].((((((...))))))...
|
|
CRW_00688
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGGCUCGGAUUUGAUGGGCCAUUCAACUUAUAACAGGCUCCGAAGUGACCUGUAACAGUGCCAAAAUGCGGGAAUUAGCCACCUUGGUGGUGAAACCCGCAGCUGAUCACCGCGUCAGUUCAACGACUAGAUGGUACUGGCUGGUUCGUUCCAGUUAAGAUAUAGUCUCUCACCGGGGGUAAAUCCCAGUGCUUCACGGCAUUAAAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.........)))))))))........(((((...........)))))...((((((....((((((.....(((((....)))))....))))))((((((......))))))...[.[[[[[...))))))((((((......))))))......]]]]]](.(((.((((.....)))).)))......).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.......)))))))))).((((...[[[[[.....))))..]]]]]..((((((((...((((((.....(((((....)))))....))))))((((((......)))))).....[[[[[..))))))))(((((......))))).......]]]]].......((((.....))))((((((....))))))....
|
|
CRW_00689
|
[ FASTA input ]
|
GGUCUGUGAUGCCCUUGAAUUCAUCUAGGGGUAUCCUAACAGUUUUAGGGCGGUGAUCCAACCGUCCCUGAGGCGACAUCUCCAAGUUCUGGGGAGUGGUGGUUGACCGUUCACACGGUCCGUCGCGACGACCCGGGGCCAGUUCUAGUGGACUGGUCCAGAGACUAAGCGGGGGUGGGCGAUUCCAGUUAAGAGGAACGCUUCAGAUAUAGUCCAACAACGAGCGCUCACGCGUUCGAUCUACGUGUAGAUGUUCUGGG |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((((((........))))))))))......(((((((((((((......)))).)))))))))...((((((....((((((..((((((((((..........))).))))))).....))))))((((((((....))))))))...[.[[[[[...))))))(((((.((((........)))))))))......]]]]]].((..(((((((....)))))))......))..............
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.((((((((((........))))))))))......(((((((((((((......)))).)))))))))..(((((((.((((..(((.....((((..((((((....))))))..)))).....))).((((((((((....))))))))))...))))....)))))))((((.((((........)))))))).)))))....(((((((.(((((((....))))))).((((....)))))))..))))
|
|
CRW_00690
|
[ FASTA input ]
|
AAGUCGUAACAAGGUUUGAUUCUUCGCAGCCCGUUUCCUGCUGAAGCCUUGUACCCCAGUCUACCCGUGCGUCUUCACUGAUGCGGUAGGCAACACUGUCCAUGUGCUGAGAGGUCCCAAGAGACAAUCAGCAGCCGCCUCACCGCGGUCCACAGAUCAAACGACGGUGGCCCAAAGUCCAGCUCGCAGCUGAGUACUACGGGUUAAAAUAUGACCGGUCCUGGUUAGAAAUCUCCAGGAAGACACGUUCCGUAGGUGA |
|
[ reference structure ]
|
........(((((((((..........................)))))))))......((((((((((..((....))..))).)))))))...((((((....((((((...((((...).)))..))))))(((((......)))))...[.[[[[[...))))))(((((...((((((((...)))))))).....)))))......]]]]]](((((((..(....)..))))).....)).............
|
| [ predicted structure ] |
.((((...[[[[[[[[[))))....((((........))))..]]]]]]]]]......(((((((...(((((......))))))))))))..(((((((....((((((...(((......)))..))))))(((((......))))).............)))))))((((...[[[(((((...)))))........))))........]]](((((((((..........))))))...[[[...)))...]]].
|
|
CRW_00691
|
[ FASTA input ]
|
UUUAACGGGUAGAGUUCUACCGUUGCCCGUUAAGUAAGACCGGUUGGAGCGCCGUCUCCAGCAACAUCACUGGUUCAGAGGAUGUUCGCCCCGGCGAGCAGAUUCUGAGGCGAGUUCCAGUUAAGGGACCGUCGCAACGCGUGGCAAGUGAUGGGCCCCUUUGGCUAGGGGCUUCAGGUACAUGCUAGUCCGCUCGAUCGGCUCGAGCUGGAGAUCAACGAACGGGGAAUUAGG |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((..........))))))))))....((((.(((......)))))))........((((((...((((((...((((((....))))))...))))))(((..(((((......))))).)))...[.[[[[[...))))))((((((((......))))))))......]]]]]].((((((((((.....)))))).))......))...............
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.(((....)))))))))((((((.((((..(((.(((((((......)))))))..(((((((..(((((((..(((((((....)))))))..)))))))....(((((......))))).(((((.....))))).)))))))(((((((......)))))))...)))...))))..(((((((((.....)))))).)))........))))))........
|
|
CRW_00692
|
[ FASTA input ]
|
GCGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAAUCAUUAAGGAAUAGACCAAGCUCUAGGUGAUUGAGAAACCCCUUUGGUAUUAGUCCUGGAGACAGGGCGACAUUGUCAAAUUGUUCGGGGACCACCUGUUAAAUUAUAUGCUACUGCAGCAGUGCUGAAAGGCCUGUGAGCACUGAGGGUAACGCCCUCAGGGAUGGUAAUAACGCAUAUAUAGGGUAUAUCCGCAGCGAAGUUCUAAGGCUUCGAGCUAUGAAUCGCGUUCACAGACUAGACGGCAAUGGGCUCCUCGCGGGGCUUAAGAUAUAGUCGAACCCCUCAGAGAUGAGGAUGGAAUCAAUGCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGA |
|
[ reference structure ]
|
.........................(((((((....................)))))))...(((((.....))).)).((((((....))))))..(((((((....((..((((....(((........((((((((((((((((((.(((....)))))))).)).(((((((.....)))))))....)))....).)))))))...)))...))))))(((..((((...(((.....)))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((....)))))).......]]]]]](...(((((....)))))..........)....................................
|
| [ predicted structure ] |
.(((.[[[..))).....]]]........(((((((...........(((..[[[....)))..]]].)))))))....((((((....))))))......(((...[[[..[[[[)))..]]]].]]]..(((((((...(((.((((.(((....)))))))..)))((((((((...))))))))[[[[[........))))))).......]]]]]..(((..[[[[[....)))..]]]]].(((((...)))))..(((((..[[[[[.((((((((....)))))))).....))))).....(((((....)))))..(((((((..(((...))))))))))]]]]].....(((....)))
|
|
CRW_00693
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUCCGUUUAUGAUCCUUCUCGCCCCGUUAUGGGUUCGAGUCGCACGGAAGCCUUAGCACUAUGUGCAUUGUAUUUUAAUACGCUGCACCCGUGCUAGUGCCAAUGAUGAUGUCAUUGGUGCGACGUCAUCAAACUGCGGGAAAGCUCCUAUAUGGCAUGGGAUACCAAGCACGGCAUCACACAUUGUGUGUGAUGAGUGUGGCUGAGUUAAUGCACUCGGGUAAGGUAACAACCCCCAUGUCAAGAGGACCGACCUGCAGCCAAGCCUUUGGUUAUACCAAGGGUGCUGUUCACAGACUAAAUGAUGACGGGUUGCUAAUCACAAAGCGUGAUUGCAGCUCAAGAUAUAGUCGGACUCACUCUAGAGUGAGACAACACGUAAUACCUUCCCGCACGUGAAUUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...............((((.((((...))))..)))).........))))))(((((...((((..................))))..))))).(((((((((((...)))))))))))..(((((((....((((((.....(((......((((((((((((..((((..(((((..((.....))))))).))))..((((((......))))))....)))....).)))))))).....)))....))))))(((..(((((((((...)))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((.((((((.....)))))))))))).......]]]]]]((((((((....))))))....(((((.............)))))......))..........
|
| [ predicted structure ] |
...((((((...............(((((((......)))..))))..[[[[[[.))))))........(((((.(((((....))))).)))))]]]]]]..(((((((((((...)))))))))))...(((((((..(((((((.....((((...(((((((((.((((..((((..(((((((((...))))))))).))))...(((((......))))))))).(((....))))))))))))..))))....)))))))....(((((((((...))))))))).(((....)))......)))))))(((((((.((((((.....)))))))))))))...........(((((((((....))))))....[[[[[.......)))...]]]]]..................
|
|
CRW_00694
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUCCGUUUAUGAUCCUUCUCGCCCCGUUUUGGGUUCGAGUCGCACGGAAGCCUGAGCACCGUGCUGUUGGAACAAAUGCACCCGUGCUAGUGUCAACGACGUUGUCGUUGGCGCGACGUCAUCAAAUUGCGGGAAAUGUCCAGGACGAAAUGGGAUACCAAGCACGGCAGCACACGUCAUUCGUGCUGGAGUGUGGCCGAGUUAAUGCACUCGGGUAAGGUAACAACUCCCAGUUCGAUAGGAUUGACCUGCAGCCAAGCCUUUGGUUACGCCAAGGGUACUGUUCACAGACUAAAUGAUGACGGGUUGUAAAUGCGGACGAGCAUUUGCAGCUCAAGAUAUAGUCGGGCUCGUUCUAGGGCGAGAGAUGAUGAUAUGCCUUUCGCAUGUGAUUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...............((((.((((...))))..)))).........))))).(((((.((((.............))))..))))).(((((((((((...)))))))))))..(((((((....((((((.....(((......((((((((((((..((((..(((((..((.....)))))))..))))..((((((......))))))....)))....).)))))))).....)))....))))))(((..(((((((((...)))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((......)))))))))))).......]]]]]]((((((((....))))))........((((((.....))))))......))..........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((...............((((((((.....((((((((((((((((((.............((((.(((......)))))))))))))..(((((((((((...))))))))))))))(((((((..(((((((....((((....((((.(((((((((..((((..((((((.........))))))..))))..((((((......))))))....)))).....))))).))))...))))...)))))))....(((((((((...))))))))).(((....)))......)))))))(((((((((((((......))))))))))))).........))))))))).....)))))))).......((((((.....)))))).....)))..........
|
|
CRW_00699
|
[ FASTA input ]
|
ACCAGGAGUAAACUUUCACAGCUAGCCGCAGUGUCUCUGCUCCAAAAAGCCGCCUGAAAGGGUCGGUGCGUGUUCCUAUUUGAAAUAAUGGCUAGUCUGAUGCGAAUCAGGCGACACAUCCAAAUUGCGGGAAACUCCUUAGAGCUCUAGCUACCGCGGCCCCAUCGUGAGAUUAGGGUGCAGCACCAGGUUAAUGGCCUCGGGUAUGGUAAAAACGCUAGAGAUUGGACAAUCCGCAGCCAAGCCUCUUCGCAAGAAGUGGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGUUGUGGGUGGCAGACGGUUUCGCGAAUGUAUGAAUCAAUCAUAAACACGUGAAGGAAGUCUGCUGCUUAAGAUAUAGUCCGAGCCACAGGGAAACCUUGGGAAUUUUGGCAACAAACCGAAACAGAUAAAUAACAUCGGGAGCCUGC |
|
[ reference structure ]
|
....((((((......((((((.....))))))....))))))....((((((((....))))(((.............))).......)))).(((((((....)))))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((.((((((((((....)))..))).))))..(((((((...))))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...(((((((....)))))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((..(((((((....(((((.....)))))....)))))))...)))))))))).......]]]]]]((.(((.(((....))))))...((((((.......)))))).............))..........
|
| [ predicted structure ] |
....((((((......(((.......[[[.)))....)))))).....(((((((....))).))))]]].(((((((...........((((.(((((((....))))))).............((((((....(((......((((((((((((((..((((((....)))..))))))...(((((((.....))))..)))..)))).....)))))))...)))...))))))....)))).((((....)))).....(((((...(((((........((((((((((((..(((((((....(((((.....)))))....)))))))...)))))))))))).....))))).)))))..(((....))))))))))((((....))))((((..[[[..........))))....]]].
|
|
CRW_00700
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUGCAAAACAGCCAAAACAUAUCCUUCCGCACGUUCGACACAUGCUGAAGCCUUAGCUGCCCGAAAGUGACCUUCGCGACUUUCUCCCAAAACAACUCCAAAAAAAAGGAAAGGUCUUAAAAGCUAGUGCCACCACUAUGAUGUGGCGCGACACCGCCAAAUUGCGGGAAAUCCCUAAAACUUUGACUACCAAGUACACUUGUCGAAAGACGUGUAUGGCCAGGGCAACGACCUCGGGUAUGGUAAUAACGUCAAAAUAAAAUUGGUUGGUGAAAACGUGGUGUGUGUCGUCGUUCUUGUACUCGAGGACCCCACACUCCUUUUCGAAAGGGCGGGUCUCGAGGCACACACUGCAAUACUCUAUACCACACACUGACCAAAACAUGGGUUAUCCGCAGCCAAGUCCCUACCAUACAUUGCUAUUAACUGCAGUGCUGGGGGGACGCCGUUCACAGACUAGACGGCGGUGGGUCUUUUCAAACGGAAAGGGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCUCUUCGGAGACGAAGAGGGACGUCAUUGCCUUUUACCUUUGGUUCACAAGGAAGAAGGGCAGGCUUUAAUCACCGUUCCGUAGG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((............................................))))))))((((((((....))))((((....................................)))).......)))).(((((((.........)))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((..((((((..(((....)))))))))..(((((.......))).))....)))....).)))))).((...((((((((((.............................((((((.((((......(((((...)))))..))))))))))...........................))))))))))..)).)))...))))))(((..((((((.(((..((((((........)))))).)))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((.....))))))))).......]]]]]]((((((((((....)))))))).......((((((....((((........)))).....))))))..........))..........
|
| [ predicted structure ] |
......((((((.....((((...........((((.(((...........))).)))).....))))...((((((..........))))))...))))))..............((((.(((....((((((.(((((((.........)))))))(((.(((((...(((((((.(((((.......(((((((((((.((((((..(((....))))))))).(((.(((......)))..))).))))).....))))))......((((((((((.....((((((((((((.............(((((.((((.....((((((...)))))).))))))))))))))))))))).(((...)))......)))))))))).....))))).)))))))....((((((.(((..((((((........)))))).)))))))))((((((.........)))))))))))((((((((.....))))))))..........(((...((((((((....))))))))))))))..((((((((..(((((.....)))))..))))))))))))))....))).)))).....
|
|
CRW_00702
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUGAAUAUAAAUCUCAGUAAACGGCGGCUGUAACCAUAACGGUCCUAAGGUGAAUUUGUUGCCUUCUCUUUUGGUAACAAAAGAGCAAACAUUCAACCGUAUGCCGGAAUAUCCUCAAAAGACUUAAGGUGCACCAACUUUUUGUUGUAGCAAAAAUCCUUAGUACACGGGGACAAUCGGCAGGAAACCUUAAAAUUUAUUUUGAAAGGGAUCCUCAGAGACUAUACGUUGAAUAUCCUUAUAGUAGUAAUAAAAGAUGAAAAUCGAUAAGAAUUGAAUCGUAGGGUUUGUUGAUGGAGAAGGUUGCUUUUAUAUCGGUAUAAAUAAAUCAGUUGAUUCAAAAUUAGGUUAUCAAGUACUUCCUGAGUUUAGGGUCGUUCAACAUAAGCGUGACAUAAAGGUUUUAUAUGCUAUAAAAGACUUUUUUGGUCACGGCUCGGUUGUUUGUAACAAGUCUAAUGGCUCAGAAAUUUACGAAUACCGUGUUCGUAAAUUCGAGACUUUACACGACGUUAUACUUCCUUUUUUUGAAUCUAACGGGUUAUUAACGAGUAAGAAGUUUAAUUUUUUAGCAUUUAGAGACGUUAUAUUAAUAAUGAAAAGGCGUGAACAUUUAACCGAGUCUGGCUUGUCUAAAAUAAUUGAUAUAAAAAGUAGAAUGAACCGAUCUUCAAUUCAUUAUUAAAUUUUAUUUUUAAGGAUAAAGAAAUAGUCCGAACUUAGCAGAAAUGUUAAGAGUGCCAAUCAUUAAGCUGUUUCUAUUUAUAACAUAAAUAUAUAGCGCGCUAGAUUGUGCCAACAAAUUGAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAGAAUUGGAACUUGCCC |
|
[ reference structure ]
|
.................................................(((((((.....)))))))((((((((....))))))))......((((((....((((((....(((((.....(((.((((.....((((.....))))..........)))))))....)))))...))))))(((..((((..((......))..))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))......]]]]]].(((((((((....)))))))...................................................................))......................................
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((.........)))......)))((((((.[[[...))))))....]]]...(((((((((.........))))))))).........(((((((....((((((....(((((........((((((((..((((.....))))..))).....)))))......)))))...))))))(((..((((.(((.....)))..))))..))).............)))))))..(((................(((....)))........((((((((...((((((((((((.(((((....))))).))))......))))))))...))))))))....)))...............((((((.(((((((((((..(((((((((((..(((((((((.(((...))).)))))))))...)))))((((((((((....((((..(((......(((...((((((((((((...)))))))))))).))).........)))))))(((..(((((((((((((((((.((((((..(((.........))))))))).)))).)))))))..((((((....)))))))))))).)))......))))))))))..)))))).(((.....))).(((.....)))...)))).))))))).))))))....................(((...[[[[[[[[)))...(((((((....)))))))................]]]]]]]]......................((((..[[[[)))).....]]]]...(((..[[[[...))).........]]]].......
|
|
CRW_00703
|
[ FASTA input ]
|
UAGCCGAGGCUAACCUGCUAAUCUGGUUUGGUCUGGUUAUAUGUCACAAAUUGCUAGGAAACCUUUUUAUUUUAAAAACAAAAGACAAUUAGCAGGAAACUUAAUUUAACCUAAUUAAAAAUAUUAGAUAAUUAAACUCUUAUAGACUAAACGUGACAAUUUAAUAUAUAUAUAUAUUUAUUUAUAUAUAUGAUUAAAUAAGAUAUAGUCAAUCAUCGGUGUGAAUCGACUUAAAAAAAAAAGCACAUGGGUUAAACCCAUCCCCCCUUAUUAGGGGAAUCAGAA |
|
[ reference structure ]
|
......(((((((..............))))))).......((((((....((((((....((((((............))))))...))))))((.....(((((.......................)))))...))...[.[[[[[...))))))((((((((((((((((........))))))))).)))))))......]]]]]].(..(((((....))))).................((((((...))))))............)...........
|
| [ predicted structure ] |
.......(((.[[[[.))).....]]]]...(((((((...((((((...(((((((.....(((((............)))))....))))))).....((((((....(((((.......)))))..))))))..(((...)))......))))))(((((((.((((((((((......)))))))))))))))))................(((((....)))))............(((..[[[[)))....]]]]..(((((....)))))))))))).
|
|
CRW_00704
|
[ FASTA input ]
|
ACAUGUUUACGGUAGACUCCAGCCGUCGGAGACAGUAAUGUCUUCGUUUAUUAUCUCGCUAUAUGCUGGAAAGACCCUUUUUAAAAAUAAGUGCUCAUCUAAAGUUAAGAUAGCUAAAAUCUUAUUUUUACGAGGUUUCCCAGCCGGAAAUUAAAACUGGAAUUAAAAUGUUUACUACAACUACUCAAGUUUUAAAAUCCUCAGAGACUGCACGCGGGAAAUCCUGACAAUGGUUAAUUGGGUUAGUUGAAUCUCAAGGCUGCUUAAGCGUAGCUCGAAAAUCUCAUAAUACAGAAGAGCUUUCUCUUUCUGUUUCUCGUCCCCUUAAAGACACUCAAGUUCUUUAUUAUAUAAAAGGCUUAUUCGGGUAUGGUCAUGUUAAACUUUUAACAACUGCAAAAUAUUAUGUUGCAAACAAGAGACUUUUAAUGAAUGUUCUUCCACUUAAAUGCUCGGGCGAUGGGGCUCGACUUGCAGGGCUAGUGGAUGGAGAAGGUGUAUUCAUUGUUUCUUUAAAACAUAAUCCUAAUGGCCCUAAAAAAAAGAACGUGAGUUUUUCUUUAAUCAUAUCACAAGUAGAAGGGGUUGUUUUGAAACCAUUUCUUGAAAAAUUAGGGGGAAGAAUAAGAAAAAAUGAAAAGGGAGGUACUUUUAAAUGAGUAAUACAAGAAAAAGGGGAUUUAAUUCGAAUCGUGCGCCUUUUUAAAAAAUAUUCCUUACGAACUAAGAAAAGGGUUGAUUUUUUGAAGUGGUGCAAAGUAUUAGAGCUAACUAAUUAUAAAUCAGGAUUAAGGUACAGUCCGAACCAUGGUGAAAGCUUUGGUCGGGAAACACUUUAAUAGACAAAGUGUUUUCAAACAUAUUAGUGGAAUGGAUGUUG |
|
[ reference structure ]
|
........(((((((....)))))))((((((((....)))))))).......((((((....((((((...((((.....((((((((((.(((.((((.......)))))))......))))))))))...))))..))))))(((..((((((((.((.......................)).))))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))......]]]]]].(((((.(((....))).))))..(((((((((((.......)))))))))))........)................
|
| [ predicted structure ] |
........(((((........)))))((((((((....)))))))).......((((((.....(((((..(((((.....((((((((((.(((.((((.......)))))))......))))))))))...))))).))))).(((..((((((((..........(((.....)))........))))))))..))).(((...)))...))))))((((((((((((.....))))((((((((.........((((((......)))))).......(((((.....(((((.(((((((.((((..(((((..(((((((((........((((..(((((...)))))..)))).((((((.(((((..((((((....))))))..........((((((((......(((((((....((((((((((((((((((....(((((((((......))))))...))).....))))))...))))....)))))))))))))))...))))))))...(((((((((......((((((....)))))).(((.....(((.....))))))))))))))).....)))))..))))))...)))))))))......)))))....)))).))))))).)))))..)))))((((((...........(((((.....))))).((((((.(((((((((((..(((((............)))))...))))))))))).))))))..)))))).)))))))).........)))))))).........(((..((((.(((....))).))))..(((((((((((.......))))))))))).[[[[[......)))....]]]]].
|
|
CRW_00705
|
[ FASTA input ]
|
CGGAUGCAAUGGAAGGUUGGCGUUGGGCCGUCUUGUCUAAGUAAUUAGCCUUGAUUAUAAAUACACUAUAUGCUGGAAAGACCUUGAGGGUUAAUCAGCCGGUAACAAAGCUGGGAGUUAGAGACACCACUUAAUAGAUUGGUCUAUAGGGUGGUUGGGUUUAUACCCCUCUUCGCUGUUGGUACCUCAGAGACUUUAUGUGAAUCCACUUCGGAUCUCAUGAGAAAAUUUGUUUUCUUGAUGAUCAUUGAAACAAUCCAUAUAAUUUUAAAAAUUUUAAUAAUAGUUAUCCCGUUACUUGUAGCAGUGGCUUAUUUAACUUUAGCUGAACGGAAGGUUUUAGGUUAUAUGCAAGCUAGGAAAGGGCCCAAUGUAGUAGGUGUUUAUGGGCUGUUACAACCUCUUGCUGAUGGUAUAAAACUAUUUACUAAAGAGUUAGUGAUUCCUCACUAUGCUAAUUUGUUUAUUUAUGUGGCGGCCCCCGUCCUUUCAUUCACUUUAGCCUUAAUUGCUUGGGGUGUUAUUCCUUAUGAUAAAGGAGUUGUAAUAAGUGAUUUGAAAAUAGGAAUUUUGUUUACGUUGGCCGUGUCUUCCAUUAGUGUUUAUGCUAUUUUGAUGUCCGGUUGGGCGAGUCAGUCUAAGUAUGCUUUCUUAGGGGCUAUUAGAGCGGCGGCUCAGAUGAUUAGUUAUGAAGUUUCGAUUGGACUAAUAAUAAUCACGGUCAUCUUAUGCGUGGGUUCUUUGAAUAUUACUGAAAUAGUUUUAGCUCAAAGUAGUGGGAUCUGGUUUUUUUUCCCCCUGUUUCCCGUGGCCAUGAUGUUUUUUGCUUCGGCGUUAGCUGAGACUAAUCGAGCUCCUUUUGAUUUAACAGAGGGUGAGUCUGAGUUAGUGUCAGGUUAUAAUGUAGAGUAUGCUUCUAUGUCUUUUGCUUUAUUCUUUCUUGCGGAAUAUGCUCAUAUAAUAUUGAUGAGUUGUUUAACUACAAUUUUAUUUUUGGGAGGAUGGCUCUCUCCUAUUGUAUUUUUUAAAGGCGGGCCAGCUUGGUUUGGUUUAAAAACCUCUUUUAUAAUUUUACUUUUUAUUUGAGUAAGAGCCUCUUUUCCUAGAAUGCGGUACGAUCAAUUAAUGGCCUUAUUAUGGAAAUCUUACUUACCCUUAAGUUUGGCUUUUGUAGUUUUAGUGGCCAGCCUCUUAUUUGGGUUAAAUGGGCUACCCCCCAGCUAAUUGUGGAUGUAUACUGAGUUUUAUGGUAUUUUGGUUUUAUUAAUUUUCAGCGUAGUUCUUUCCGCGAUUAUUUCUGGCGCUUCUUAUAUUUUAGGAGAUAAACAGCCGGAUCGAGAGAAAGUGUCAGCUUAUGAGUGUGGGUUUGAUCCUUUUGGAACCCCAGGGCGACCCUUUUCUAUUCGGUUUUUCUUAAUUGGUAUCCUUUUUCUUAUUUUUGAUUUAGAAAUUUCUUUUCUUUUUCCUUGGUGUGUCGUAUGCAAUCAAGUUUUUCCUUUUGGUUAUUGGACCAUGAUCGUGUUUUUAGCCGUCCUAACUUUGGGUUUGGUCUAUGAAUGGUUAAAAGGUGGCUUAGAAUGAGAAUAGGCCCCUUCAUUGGUCCCUUUGGGUGAGCAAGUUAUAAAGUGGAAGAAAAAGUCCUAUCCGCUAUGAGAGUAGCGGCCCCACCAUUAAUGGUGGCGUAACAACUAUUUAAUACCAACUCCGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..........((((((((.......)))))))).......(((((((....)))))))..((((((....((((((....((((...))))...))))))(((......((((((((........(((((((.(((((....))))).)))))))................))).)))))...)))...[.[[[[[...))))))((((((.....(((((............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))).........))))))......]]]]]]((.(((((((....)))))))..((((((....))))))................))............
|
| [ predicted structure ] |
.((((((...........(((.[[[[))).......]]]](((((((....)))))))............((((((........[[[[[.........)))))).((((((.(((((........(((((((.(((((....))))).))))))).((((....))))))))).))).)))...]]]]]..........((((((((..[[[)))).))))..]]]...(((((((..(((...)))..))))))).....................................((((((......))))))........((((..[[[[[..))))..]]]]]............((((((((((..(((((((((...........(((((((((((..(((((...((((((.....)))))).....))))).((((((....))))))...(((.....)))....)))))))))))...((((((((.((((((..(((((((....)))))))((((((((((......)))))...)))))))))))..))))...)))).......)))))))))..................(((((((......((((.(((.((((((..(((..(((((....(((((....)))))..)))))..))).)))))).((((((.((((..(((((.....))))).))))))))))))).))))....)))))))..((((((.....((((...))))......))))))(((.((((..[[[[[.....)))).)))........]]]]].(((((....(((....)))....((((.((((((...((((((((((......))))))..))))....)))))).))))........[[[[[[[[.......)))))...]]]]]]]]...........(((((.((((((.........))))))))))).................((((((..[[[[[[.)))))).................]]]]]].........(((.[[[[[)))..]]]]]...((((((((.......))))))))....))))))))))....................(((((..(((((((.......(((((....))))).......)))))))......))))).....(((.[[[[[.)))..(((...)))]]]]].((((((((((......(((((..(((.................)))..)))))..........))))))))))..((((((...[[[[.(((((....)))))....))))))..]]]](((((.((((((((((....))))).))))).)))))........(((..[[[[)))........]]]]...........))))))..(((((............)))))....(((((((((..((((((((((...)))).))))))........((((.((((((((((((((((((.....((((((.((((....))))..))).)))...))))))).((((.((((((.........))))))))))...)))))).....))))).)))).........)))))))))(((.....(((((((....)))))))..((((((....)))))).......)))......((((......))))
|
|
CRW_00706
|
[ FASTA input ]
|
GAAACUAAUCGUGCCCCCUUUGAUUUAGCUGAGGCUACUAAUAUGAUUUGGUCUCAUUAAAGAUCACAAAUUGCUGGAAACUCCUUUGAGGCUAGGACAAUCAGCAAGGAAGUUAACAUAUAAUGUUAAAACCUUCAGAGACUAGACGUGAUCAUUUAAUAGACGCCUUGCGGCUCUUAUUAGAUAAGGUAUAGUCCAAAUUUGUAUGUAAAUACAAAAUGAUAAAAAAAAUGAAAUCAUAUAUAAAUAUGAACUCUACCGUUACUACCUUAGGUGCGAACUAUUUAGUUCAUACAGGUUAUUUUAAUACUAUAUCUAGAUUAAAAGUUUGUACAAUAGCUAGUUAUAGAUAUUAUUCUACUUCAAAAUCAGAUUCACAAUCAUCCGAUUUACCUCCUGUUCCUAUUUUUACUAUUAAUAAUCUAAAUAAUAAAGACUCUAUUAAAUCUUCUAGAAUAUUAUUAAAAGACAAAGGAGGUAUUUAUUCUUUUAUUAAUACAGUCAAUAAUAAUCAAUAUAUCGGAAGUGCCAAGGAUUUUUAUUUAAGACUUAAUGAACAUUUGGAAAAUAAGAAGUCUAAUAUUGCUUUACAAAAAGCAUUUACUAAGUAUGGCUUAGAUAAAUUUAUAUUUUGUAUAUAUGAAUAUUUCACAUACGAAAGCAAAAUUAUAAGUCAUAAAGCUUUAACUGAUCUAGAGACUAGUUAUAUUAACAGAUUUAAUUUUGAUAAUCUUUACAAUUUUAAAGCUAUAGCUACAAGCUCUUUAGGUUAUAAACAUACAGAAGAAGCAAGAUUAAAGAUGGUUGAUUAUUAUAAGGAUAAAAAUAAUCAUCCUAUGUUUGGUAAAACUCAUACUGAAGAAGCACUAGGUUUAAUUAGUAAACCAGGUGAAUUAAAUCCUAUGUUUGGUAAAAAACAUAGUGAAGCUACUAAGGCGUCUAUGAGUGAAAAAAAGAAUAAAUAUCCUUUAGGUGUAGGUAUUUAUGAUUUAGAGGACAAUUUAAUUUUAAAGUUUAGUAAUAAUGUAGAGCUAGCUAAAUAUUUAGGUAUUUCUAAGGUUACAGUAGGUAAGUAUUUAAAUUCGGGUCUUGUAUAUAAUAAAACUUAUCGGUUUAAACCUAUACAAGAUUAGAUAUGGUUGUUUUAUUUUUUGGAAUCAGAAUUAGUUAGUGGUUUUAU |
|
[ reference structure ]
|
...............................((((((...........)))))).......((((((....((((((....((((........))))...))))))(((...(((((((...)))))))..)))...[.[[[[[...))))))(((((((((..(((....)))..)))))))))......]]]]]]((.(((((((....))))))).....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))...........................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((...((((((..(((((((((...............((((.((((((((((((...(((((((....((((........))))...))))))).(((((((((((...)))))))...))))...........)))))).))))))))))))))..)))))...))))))...)))))..(((((((((((((....)))))))................((((((((.(((((((.....((((.......((((((((((((((((((((.........))))...((((((.(((....))))))))))))))))))..(((((((((....((((((((...((((.((((((.......((((....)))).....((((.((((.((((((....(((((.((((..(((((.......))))).......)))).))))).))))))....))))(((((((((((((((.............((((((((((((.((((.......(((((....((((((........))))))..))))).........(((((.....((((((....(((((..........(((((((((....(((((...((((((((...((((...)))).))))))))...))))).)))))))))..)))))...(((((((((((.((((((((....((((......)))).....(((((......))))).)))))))).....))))))))))).............)))))))))))...)))))))))))))))).(((((..........)))))............(((((((.........((((.((((((.....)))))).)))).........((((((((......))))))))....(((.....)))...)))))))....)))))))))))))))...))))..(((....))))))))).))))....((((....)))).......))))))))..)))))))))(((((....))))).)))))))....))))....)))))))......(((((((((((.....(((((....))))).....)))))))))))..)))))))).........))))))...............)))))))..
|
|
CRW_00708
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUCGCAGAGGCUGGUUUAAAAUAUCAUAUAAUCUUAGCUUAUUAUUAUAUUACAACCGUAUUUAUUUCAAUUACUAGAUUAAUAAUUAUUAAUUAUAUUUAUAAUAUCACUAUUAUUAGGAAUAUUUACAAUAAUUUUAGUACACUACGUACAUUUUACAAAUUACACUAUGCAUCUGGAAAGGUAAACUUUAAAACAUUCAUAAAAUUAUAUAGUUCCUUAACUCUCAAAGAUAGUUCACUACACCCUGAAUGAAUAACAGGUUUCACAGAUGGGGAAGGUUCCUUUGGUAUUAAGAUUUAUAAAGCUAAGGGCCACAAACUAGGAUGAAGAUUAGAUCCUUUUUUCCAAAUUAAAUUAAAUGCCCGAGAUCUAGAUAUAUUAUAUCGUAUCAAAGAAUAUUUUGGAGGAGUAGGAACUAUAAGUUUUGAGAAAAAUACGGCUAAGUAUAUUAUUAGAAAACUUAGUGAUAUUGUAGAUAUUUUGAUACCGCAUUUUGAAGCUUAUCCUCUAUUAACUAAAAAAUUUGCGGAUUUCGAAUUAUUUAGGCAAAUUAUUUUAAUUAUAAAAAAUGAAUCUUCUUUAAGUGAACAAGGAUUUAUAAAAAUUCUUAACCUUAGAUAUUAUCUGAAUAAAGGAAUAUCAGAGGAAUUAAAAGAAUUAUAUCCUAACUUAGUACCAGUAAUGAGACCUGAAGUUCCAGAAAGAAAAAUCCAACCGGAAUGAUUAGUAGGAUUCAUAGAUGGGGAAGGUAGUUUUAAUAUAAUUACAGUAGAGAAAAAGUCUUCAGAUGCACCAUCAAUACUUAGCACUAGUUACAAAGUAUGAUUACAUUUUCAAAUAACACAACAUAGUCGAGAUACUACUCUCAUGGAAAGAAUAGUUACAUUUUUUGAUUGUGGUAGUGUUAAAAAAAGAAACACCGAUGCUGUUGACUUUAAGUUAAAUAAAUUCGAGUUGUUAGAAAACAUAAUUAUACCUUUUUUUCAAAAAUAUCCACUUCAAAGUGCUAAAGUUUUUGAUUUCUUAUCUUUUAUUGAAGCUGCCAAUGUGAUUAAAAGUAAAAAAACUCGUCAGUGAACUGCAGAAGAAUUUGCUAAAAUUCAAAAUAUUCAAAGUAAUAUGAAUAAAUACAUCAAAGAAAAUCAAAACAAAAAACAGGAUGAUGAAAGUAAUAAAGGUAAAUAACUACCACGGUAAUGGCCAUAUUUAAUGCAGUAUUUCGUAUGUACUUCGCAGGACUGGCAUUUAAUUACUAAUAAUAGUUACAACUAAACUUUAUUUACUCUCGAGGGCUACCAGCCUACCCUCAGCCACCGUUUUUUAUUCUUUAACCUUCUACUAUACUACGUUAGUGGUAUGUAUGGAGAGCUCUAAAUAAUAAAUUUUUUGGUGACGGCCGAGGUAUCUUAAUUUUUUUGUUAGGUUAUAGAUUUUUGAUUAGCGUUAAGAUAGUAUAAAUAUUGAUUUAGCUGAGGCUAUUUAGUAAACAAUACGAUUCGGUCUCGUAAAAAAUUGCUAUAUGCUGGAAAACCCUCGAUCUAAGAUCGAAGACAAUCAGCAGGAAACCAAAGUAAUUUAUUAAUAUUUUAAUAGUUACGAGUAGGAUCCUCAGAGACUAUACGCAAUAAUUAAGUAAAAAAUAUUGUACUUAAUAAGAUAUAGUCCAACCUUGCAUGUGAAUGUAAGAAGUAUGUAUAGGGAUUAGGUUUACUCAGCUAUAAUAAUAGCAAAACAAAUAAUUACCUUCGUAAACAUUUAAUUAAUGCACGAAGAUACUAUUCUACUUAUUCUGAUUCAUCUCCAGAUCCUAUAUCUACUCCUUUACCUAUAAAAAUUUUUAGUAAUUUAGAUAAUAACGAAGUAGUUAUUUCUUAUGCUGAAAUAUUAAGAAAGAAAGCAGGUAUUUAUUGUUUUAUAAAUACAGUAAAUAAUAAAAGGUAUAUAGGUAGUGCUAAAGAUUUGUAUUUAAGACUUAUUGAACAUCUUGCUGGUAAAAAAUCUAAUAUUGCUUUACAAAAUGCCAUAUUAAAAUAUGGUUUAAAUAAAUUUGAUUUUUGCGUAUAUGAGUACUUUACUUAUCACAGUAAAGUAGUAAGUCAUAAAGCUUUAACUGAUUUAGAAACAAGUUAUAUUGAAAAAUAUCCUUUUGACAGCUUGUAUAAUUUUAUGAGAACAGCUACAAGUAUUGAAGGAUAUAAGCAUACAGAUGAAGCUAAGUUAAAAAUGUUAAAUAGGUUUAAAGAUAAAUCUAAUCACCCUAUGUAUGGUAAGAAACAUACAGAGCAAACCUUAAAAUUGAUUAGUAAACUUGGAGAAUUAAAUCCUAUGUACGGUAAGUUACAUAGUGAAGAAACAAAGAAAAAGAUAAGUAAUAGCAUGAGCAAACAUCCUUACGGAGUAGGUAUAUAUGAUUUAGAUGAUAAUUUAAUUGCAAAAUUUCAAAAUAAUAUUGAAUUAUCCUUUGAGUUACUCAAACAAUAUAUCUAAAGUUACAGUAGGGAAAUAUUUAAAUUCAGGCCUUAUUUACAAAAACCAGUAUAGGUUUAAAGUAAAUAAUAAAUAAUAAGAUCAAGUUUUAAUCUUCUUGUUUAUAUACAUUACAUAUGGAAUCAGAACUUGUUAGU |
|
[ reference structure ]
|
.........((((((((.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))).......(((((....((((((....(((((((((...)))))))))...))))))(((.......((((((.(((((....)))))))))))........)))...[.[[[[[...))))).((((((((((.....)).))))))))......]]]]]](..(((((((....)))))))......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)...................
|
| [ predicted structure ] |
.........((((((................................((((((((.((((((((((((((..((((((...((((((((.....(((((....)))))......))))))))((((((((...............((((.......((((((.(((((((...........(((((((((((((((....(((.....)))..((((((((((..(((((..((((((.((((((...(((....((((........)))).....)))...)))...((((((((..((((((..........((((.........(((.((((........))))..)))..(((......))))))).)))))).(((((...))))))))))))))))))))))...)))))))))))))))..((((((((((((....(((((((((((((((((.....)))))))))...........(((((.......(((((((......(((((((..(((((.((((((.......)))))).)))))...........((((((((........(((((((((((((.....(((((..((((...(((((..((((.((((((.(((......))))))))).))))......)))))))))))))).))))))..(((...(((((.((((..(((((..................)))))......)))).)))))...))))))))))........)))))))).))))))).......)))))))......)))))))))))))............(((((((((..(((((...((((((..(((((((((((.((((.(((.......))).))))......)))))))))))...))))))........((((.(((.....((((((...))))))......)))...)))).)))))..))))))))).)))))))))))).....((((....)))).))))))..........)))))))))..............)))))))....)))))).........))))..........((((((....)))))).))))))))..))))))..))))))))))...............(((((((((.((((((.....(((((((((((((......)))...((((((.((((.......((((((((.......)))))..)))....)))).....)))))).....((((....))))..))))).))))).....(((((...)))))..((((.(((((((...((((((.......(((((((.(((((((....)))))))))).))))..........)))))).....))))...))).))))))))))...))))))))).))))......(((((((....))))))))))))))).((((((..((((....)))).))))))........(((((...(((((((.((((((((...((((((.......((((((...))))))......)))))).........)))))))).....(((....))).)))))))..)))))......(((((((.......((((((((..........))))))))....)))))))....(((((((....)))))))...........(((.....[[[[.))).(((((....))))).]]]]......(((.[[[[[))).((((.....))))..]]]]].........((((((((((......(((((((..(((((((.....(((((...........(((((((((.(((((...((((.(((((....))))))))).))))).)))))))))..........((((((((((.........))))))))))...))))).)))))))...((((((((((((((.....(((((((((.((((((((((((...(((((((.....(((.....)))...(((((((....)))))))..(((....)))))))))).............(((((((......))))))))))))))......(((((((.(((.........(((......)))....(((((((((.....(((((((....(((....)))....)))))))...))))))))).......))).))))))).........))))).)))))))))....))))))))..(((.....((((((........))))))(((.....))).....)))))))))...)))))))........(((((((........)))))))...........))).....)))))))................(((((((....(((((((((.(((((((((.(((((((((((......(((....)))...))))))))))).)))))))))........)))))))))........)))))))..............))))))...(((..[[[[[.)))..]]]]]...((((...((((((((.(((((.........))))).)))))))).....)))).......................
|
|
CRW_00709
|
[ FASTA input ]
|
UAGGUCCUAAUUUCGUAGGUCGCACACACAGCGUCUCUAGUUCUUUUAAAAAAUAUUAUCAUACUUCUACAACUGAUAAAUUAAUAAAUGGUUUAUAUUUAAACAGAAAAGCUCCUAUUAAGCCUUUUAAAGACAAUGUAAUUAAAACUUGUGAGGAUUUAUUGUCUCCUUCGGAUCUUAAGACUUUUUUCAGAAGUAUUAAAAGUAAAGGGGGUAUAUAUAUAUUUACUUACAAAGAAAAUCCUGAGAUUUUUUAUAUAGGAAGAGCUAAAAAUUUUAGAAAUAGAUUUAAAGCUCAUCUUAAUAUAAAUUUACAAGAUAAAUUUCAUAUUUUUGCUAAUGCUGUAGGUUGAGAUAAAUUUCAUUUUUCAAUUAUUCAGAUUUGUAGUUUAGAUAUUCAAAAAGAAAGAGAGAAUUAUUAUUUACAAAAAUACUUACCUUUAUUAAAUACAAUAUAUAAAAGUGAGAUGUAUACUAUACAAAAUUACGACUCUUUACAUGAAAUAUUAAAACUUAAACAAUUAGAAUGAAACAAAGAUAAUAAAUAUUCAGGUAUACCUGUCUAUUUAUAUACUUAUAGUGAAGGAUCACUUAAGGAUAACUAUAUCAAAUUCGAGAGUAUUAAUAAAUUAUCUCAAUAUUUAAAUAUAAGCAGAGAAACUAUAAAUAUUUAUUUAAAUACUUAUGUUCCUUAUAAAAGCAAUAUUUUUUUAACUGAUUUAAUAGUAGAUUUUGAAUUAAUAGACAAAUUAGUAAGUGAUACCAUUCAAGGAUUAGAUUUAGAUCGUACUAUAAGUAAAAAAGUCUGAGUUUAUUCUAUAGAUACAAAAAGUAAUAUUGUUAAAAACAUUUAUAAUUCUAUAGGUGAGACAAUUAAAAUUUUAAAUGUGUCACAUAAUUUAGUAAAUAAUCACUUAGAUAAGUGAAUACCUGGUGGUAUUAAAAACAAUUAUUUAUUUAGUAAUGAAUUGGAUAAUUUAAAUAUAGAAAGAUUAAAAGAAGUUCAUUUAUCUAGAAAACAUAAUAACCUUAAUGUUUGAAUAUAUAAUGCUAAUACUUUAGAAUUAAUAGGUAAUUUUAAUAGUAUAAAAAAAGCAGCAGAUUAUUUUAAUGUAGAUUAUAGAUCUUUAAUUAAUCAUUUAGAUACUAAAGAAGCUAUAAAUAAAGGAGGUAAAUUUAUAUAUUUAUUUAAAAAUGAGUUAGAUACAGAAGAUUUAAAUCUUUUAUCUAAUAAAUUUAAUAAAGUUUCUAAUAUGACAACUAGUAUUUGAGUAUAUAAAUAUGUAGAUGAUAAAUUAACUUUAAUCAAUGACAAUAAACCUAGCUAUAUUUCUAAAUUAUCUUUAUCUAAAGAUUUAAAAAUAAGUGUUAAAACAAUAAACAAAUAUUUAGAUUCAAAUGAAUCAUAUAAAGGGUAUUAUUUUUAUAGUAUAUGUAAAUAAUAGUAAAAAUAAAGCGUAGGAAACUUUAUUUGGCCUUUAAACCAUCAAAUUGACGGGGAAGCCUUAAAGCUAUUUAGACUAAGCAAAAUAAGUAAUUAAGUUGUGGCUCGAAAGAGGUAUAGUAACACAUAAAUAGAUGCACGAAAGGAAAUAGGUAAUCCGCAGCCAAGUGCCAUAUAUUUAUUGUAUAAGUAAUGGUGUGCAGUUCAUCGACUAGACGGUGGUUGGUAUUAUUGUUCACAUAAUACUUAAGAUAUAGUCAGACCCUAUCCGAAAGGAUACAGGAAUAUUUAUAUAAUAUUCUGUUAAAUGGAUAAUAUUUUUAUUAUUCAGGGAGAAGGCCCCUGCCUAAAUCUACAGUAUGAUUUUUUUUAUACAUGAUUAAAAGGGGAGAUUCGUAUUAUGGACUACUUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
................((((((..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))...(((((((....((.((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((....)))....)))....).))))))).(((.(....))))..)))...))))))(((..(((((...(((((((...)))))))..)))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((.......)))))))).......]]]]]]((...(((((....)))))..................................................................................................................)).....................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((......)))).(((.......)))(((((..(((((((.........((((......((((((((((...(((....))).(((((....))))).(((((((((((.......(((((((((((((((.((((............)))))))))))).(((........)))(((((.....))))).)))))))....))))).(((....)))..(((((((..((((((..(((((((((((((((((((.((((((((...((((....)))))))..))))).)))).)))))))..........)))))))).))))))........)))))))(((((....)))))))))))......))))..))))))....))))....)))))))..)))))(((((((((((((......(((((.(((((...(((...)))))))).)))))...(((((((((..........((((((((.........................(((((((((....((((.(((((((..((((....))))..))))))).(((((((((((....((((((((.......((((....(((((((((.(((((.(((((((((((..(((......)))....))))(((.((((.(((((....))))).))))))).(((....)))...............))))))).)))))..))))))))).)))).........))))))))..........((((.......)))).))))))))))).....))))...)))))))))....(((.....))).(((((((...(((((((((.......(((((((.(((.((((....)))).)))....(((.....((((((((((..............((((((....)))))).......)))))))))).....)))....(((((((((((((((((...((((((....((((.(((((((......(((((...(((((.(((((.(((((.....((((.((((((((((((((.....))))))))).)))))......))))......))))).)))))...((((((.((((((....(((.....)))..))))))..))))))......)))))...((((((((((((.....((((..((((((((..((((((....))))))))))))))..))))((((.((((...........))))..)))))))))))))))))))))....))))))).)))))))))).................)))))))..)))))))))))))))))...........)))))))))..)))))))............(((((....)))))...))))))))........))))))))))))))))))))))..((((((((.........)))))))).......................(((..[[[)))...]]]......((((.((((..(((....)))..))))..(((....)))...))))..............(((((....(((....[[[..)))...]]]....(((((.(((((((...)))))))))))))))))(((.[[[[[[[[)))..]]]]]]]]...........((((((((....(((...)))...((((((((....)))))..((((((((.....))))))))......(((((((((....)))))))))))).(((..(((((.....((((....((((((......))))))..))))...)))))...))))))))))).............
|
|
CRW_00710
|
[ FASTA input ]
|
AUAGAUUAAUUAACUCUCCUGAUAAAAAUCCAAGAUCAAAUUAUUCUUAUUCACAUUUUAAUUUAUUACCUACAAUUUCACGGCGAAGUCGUAAUUUAAUCCAAUCAAGGAAUUAUUCUAGCCUUUCGCCUAGGACUAGCGCUGUAUGCAGUGUUAGAUCAGAGGGUGAAAGGAAAAUAGUUUUAAAUCCUUCAUUUAUAAGUGGGUUCUCUGAUGCUGAAGGUUCUUUUGUUGUAACUAUUUUAAAUAAUCCUAGAUAUAAAAUAGGAUGAAAUGUACAAGCUAGAUUUCAAAUAAAGUUACAUGAGAAAGAUAGAGCUUUAUUAUUAUUAAUUCAAAAUUAUUUUUAUAAUGUUGGAUAUAUAUCCACCCUAAAGGGUGGAUCUACGGUUGAAUUUAGAGUUAGUGAUAUAACUAGUUUAAAUAAUAUAAUUAUACCUCAUUUUGAAAAGUAUACAUUAAUAACUAAUAAAUAUAAAGAUUUUAUAAUAUUUAAACAAAUUGUAUCGUUAAUGUCAGAAAACAAACAUACUACUUUAGAAGGGUUAAAAGAAAUUUUAGAAUAUAGAGCAUCUCUUAAUUGAGGUUUAUCUAAAAAUUUAAAGGAAUCUUUUCCUUCAAUAGUACCAGUUAAAAGAGUCGAAAUUGAGGAUAAUAUAUUAAGUAAUUUACCUUCUAACUGAGUAGCUGGUUUCUCAGCAGGAGAAUCCAAUUUUUUUAUAACUAUAUCUGGUAAUAAAGUAUGAUUACGUUUUUCUAUAGCUCAAGACUCAAGAGAUAUAUUGUUAUUAAAAAGUUUAGUUGAAUUUUUUAAUUGUGGUUAUAUAGCUCAAUAUAAAAACCGUAAAGUAUGUGAAUUUAUAGUUACAAAAAUUAAUGAUAUAAUUAUAUAUAUAAUUCCUUUUUUUGAAAAAUACAAAAUUGAAGGUUCUAAAUAUAAGGAUUAUGUUAAUUUUAAAGAAGCUGCUAUUCCUAUUAAGAAUAAAGAACAUUUAACUGAAAAAGGUUUAAAUAAAAUAAUAGAAUUAAAAAAUUCUAUGAAUAAAAAUGAUUAAUAUUUUCUUGAUUAAAAGGAAGUUUUCAUCUUGAUCACCAAAGGCGAAGUGAACCUUCGUCUAGUCUUAUACAAGGCGAAACUCUCAAAUUGCGGGAAAUUCUUAAAAACAAAUCUACCAAGUUAAUAUAGUAAUAUAAUUAAUGGAACAAGUAAUGAUUCGUUGUAUGGUAAAAACGAUUUGUAUAUAUAGAAGAUCUGCAGCCAAGCACCAAGUAUUCUUGCUACGCAGGAAUAACGGUGUGCAGUUAAUCGGCUAAAUGUGAGUUGGUUUUUUAUUAAUAUGGGCUGCACAAACUAAAGCUCGGAUAUUAAUAAUUAGCUUAAGAUAUAGUCAGUCUCAAUAUGAGAAUAUUGAGGUAAAACGAAGAGGAAGUAUAGCAAUAGAG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))).....(((((((.......))))))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....))).))))))..(((((((....)))))))....)))....).)))))))......)))...))))))(((..(((((....((((((((...))))))))...)))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((((((((((((...........)))))..)))))))))))))))).......]]]]]]((((((((((....)))))))).....)).......................
|
| [ predicted structure ] |
..(((.(((((...(((...(((....)))..)))...))))).))).......................(((.(((((.....))))).)))....((((((.....(((((((((....((((((((((....(((((((((....)))))))))......))))))))))..)))))))))....[[[[[[........)))))).........]]]]]].((((((..(((((((((((......((((((.........)))))).....................))))..)))))))...))))))..(((((....((((((((((((...(((((....)))))....(((....((((((((....)))))))).....))).......)))))))))))).....)))))........(((((((((.(((...)))...))))).))))........(((((((............))))))).............(((.[[[[.....)))..]]]].........((((((...(((((..(((((((...((((..(((((......)))))...))))....)))))))...))))))))))).....(((((((((.(((.....((((((..((((...))))...))))))..))).)))))).)))(((...[[[[[)))..]]]]]...............(((((((((.(((((........)))))(((((..[[[[.[[[)))))....]]].]]]].....((((((((((((....))))))))))))..........(((((.............((((..((((......)))).)))).....((((((((((((((.(((((......((((((((((.......)))))..)))))......)))))..))))))))))...))))...)))))...(((((((((((((.......(((((((((......))))...........((((((((....))))))))......))))).........))))))))....))))).............(((....[[[[[[[[)))..]]]]]]]].(((((....))))).............((((((...((((.....((((((((((((......((((....))))..(((((((...........)))))))..))))).....)))))))......))))..)))))).....((((....(((((((((...))))))))).[[[[)))).....]]]]......((((....[[[[..[[[[[[[[[[[[[[[.))))......]]]]]..]]]]]]]]]]..]]]]..)))))))))...(((((((((....))))))))).............................
|
|
CRW_00711
|
[ FASTA input ]
|
CUAUAGAUUAGCUUCAAACUAUACUUUUAGUUGUAAGAAUACAACUAAUUCUUCGUACUGUAAAACUCUUAAUAAAGUUUCAGACUUAAAGGCAAAAAAUCGCCUUUUAAGCGUGAGACCUAAAACUUUCGUUAGAAACUAUUCCCAUUUAAUCCAAAAAAGGGUUAGUUUACACCCUUGAUUUAUAACAGGUUUCACAGAUGGGGAGGGUUGUUUUUGAAUAGGUGUUAGACGAGACCCUAGAAAUAAACUAGGCUGAUGUGUACAAGCUUUUUUUCAAAUAGCCCUACAUAAAAAAGAUGAAGCUCUAUUAAAAGCAAUCCAAAAGUACUUUGGAGGUAUUGGGGCGGUAAAAAUUAGAGGUGAUAAAUGUACUUUCAUAGUAAGCUCUUUAUCACAGAUUACAAAAGUAAUUAUCCCACACUUCGAUUCUUACCCUUUAAUUACUAAUAAAUUAGCUGAUUAUUUUUUAUGAAAAGGUAUAAUUGAAAUAAUGAAGGCUAAAAAACAUUUAACUCUAGAAGGAUUAAAUGAAAUAGUACGAAUGAAAGCUCAAUUAAAUUUAGGACUUUCUGAUGAAUUAAAAACCGCUUUUGCAGAAACUUUUUCCACUUCAGCGAUAAUAAAAAGAAUACUAAACAAGGAAUCUAUACCUCAUGGGAUGUGAAUGGCAGGGUUUACAUCUGGAGAAGGUUCUUUCUUCGUCAAUAUCUUUAAAUCCUCGCAUCACAAAGUAGGGUACCAAAUAAGAUUAGAAUUUGAAAUUGCUCAACAUAUUCGCGAUGAACUUUUAAUGCUAAGUUUUACUGAAUUUUUCGGCUGUGGUAUCAUUAGCAGAUAUUCAAGCGAUAUGGUAAAGUUUAGAUGUACUAAAUUUUCAGAUAUAUCUACAAUAAUUGUCCCCUUUUUUAAAGAAUACUUACCAGAAGGUAACAAAAUUAAAGAUUUUCAGGAUUUCUGCAAAGUAUGUGAAUUAAUGGAAAAUAAUGCUCAUUUAACUGAAGAAGGGCUUAAUCAAAUUCGUGAAAUAAAAGCUAGAAUGAACAGCUUUCGUAAGUAGAAAUCUUUUAUUUUUUUUUUACUUUGUGUGUGCUUGUGAUAAAUGUCUAAGACAUAGUAUCGAAUAACUUAGUGGAGAGAUGUAUAAUAUAGGUGAUUGAAGGUUGUAUUACAACAUAUAAAGUGCUCACAUUAAAAAUCUUGAUCUAAAGGGUUAAUAAAAUUAUCCCUAGUCUUAAAUAAAGGCGAAACCUUCAAAUUGCGGGAAGUACCUGAUAAAAUACUGAUUUCGACCAAACCUGCAUGGUAACAUAGCAGGUGGCACAGGUAAUGACUCGUGGUAUGGUAAAACCGAAACAGAUAAUCAGUUAAGCUAUAAUAGUUGACUGUGUAGGGUUAAUCUGCAGCCAACCACCGUAACAUACGAUUUACUAACCAAGCGUAGAUAAAUAGUGACGCUGUAAUCUGAUAAAGAGCAGAUAACACGUUGUUUUUAAUUCUACCUUUACGGGUUUUUACUUUUUAGAGCAAAGAGCGAAGCGCGAAGCUACUCAUGCCUAUUUUAGUAAAAACUAAAAGCCUAGGACCUAAGGACCUAGUCCUAGAUCGAAGAGGUAGAAUAAAUUCUUAUGAAGGUGGGCAGUUCAUCGACUAAAUGUAGGUUGGUGAAAAAUAUUAUUUUCUCUUCUCAUUGUUUUCUUAAUAUAUUAUCUUUACACACGAUUAUUAAAGUCUAUUUGUGCGAAGUUCAUAAUAAUAAGAAAAACAGCUACCUUCGCGCUUCGCAGGGUUAGAGGGAGGGGUGCGUAGCCCAAAAUUAUAUUUUUUGCUUAAGAUAUAGUCAAAUGUUGCUUAAUAUUCUCUCCCUUUUCCGUACCUUCGCUUCGCCCUAGGUACAUGGUUAGGGUUUUUAGUAAAAAAACUAAAAACCGAAAGGUGAAAAUAUAAAAUAGUUUAAUAAUAAUAUAAUAAUUUAACCGAAACCUAUUAUGAAGUGCAGGGCGCAAGCUCCCCUAAUAAAAUAAGGAUUCAAGCUGCUGAUAUAAUAGUAAGGUAUACAUUGUCAAAUUUUGUUAUGUAGCAAAAUAUUGGAUAGUUUAAAUUAUACUAGUUAUUAAAUCUAAUUUAUAAGAGAAAUAACCAACCUAGAAGAGG |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))).(((((((((...))))))))).(((((.....)))))..(((((((....((((((....(((..........(((.((((((((..(((((((((....))).))))))..(((((((....)))))))....)))....).))))))).(((((((((((.(((...)))))))))))))).)))...))))))(((..(((((....(((((((((((.............................................................................................................................................................................................)))).)))))))..)))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((((((((...................................................................................................................................)))))))))))))))))).......]]]]]]((............................................................................................................................................................................................................................................................................................................)).......
|
| [ predicted structure ] |
................((((((....(((((((((....)))))))))...((((((((((..............((((((......((((((........))))))..((((.(((........))).)))).)))))).....((((((((((.....((((((.(((((((((....(((((.(((((.((((.........)))).)))))..))))).)))).)))))..)))))).........(((((..(((((.....(((((((((((((.....(((.(((((((((.....((((.(((((.......((((((.....)))))).(((((((((.(((((......(((((((((((..((((.....)))).....)))))))).((((((....))))))........)))......))))))))))).))))))))....)))).....)))))))))...))).....))))))....))))))).....)))))....)))))..))))))))))..))))))))))....((((.........(((((((((((((...........(((.....((((.....((((((((((.....(((.....(((((.........(((((((((....(((...((((((((((......)))))))))).))).)))))))))...........)))))..)))...((((((((((((((((........((((((.((((((((....((((..(((((.(((...((((((........))))))...(((((......((((.........))))....))))).))))))))....((((((((((((.............))))))))...(((((((..((((((...(((....)))...))))))..)))..))))...(((((((((...)))).)))))..((((((((........))))..))))..))))......))))....))))))))........((((((.........))))))..........)))))).........)))))))))))).))))((((((((.(((((...)))))..))))..))))...)))))))))))))).......)))..((((((((((((((...........)))))....(((((.....)))))....((((.((((...)))).)))).(((((.....)))))..)))))))))....)))))))).))))).......(((.(((((((((.(((((((((....))).))))))..(((.(((....))).)))...)))).....))))))))...........))))...))))))..((((....[[[[.....))))..]]]]..((((...))))............(((((.........[[[)))))...(((((........)))))..]]]..........(((((((((((...((((((((((...(((.(((..(((...(((.....))).))).))))))....))))))))))......(((((((...........))))))).....)))))))))))..........((((((((....((((((((((.[[[[..)))))))))).....))))))))......]]]].((((((((...(((((((((..((((.((((.....))))....))))..)))...)))))).))))))))......(((((.(((...)))))))).(((((((((((...(((((.....((((((((((......)))))))))).....))))).......)))))))))))............((((...((((((...((((((.((((((((((......))))))))))............((((((....(((((((((......(((((((((((.....((((((((.(((...((((....)))).(((.........))).........)))..))))))))...)))....((((((..((((((((....))))))))....)))))).))))))))....))))))))).....)))))).......))))))))))))..))))
|
|
CRW_00712
|
[ FASTA input ]
|
AUUGUAACUGCUUUCCUGGGUUAUGAAUAUAGCCCAAAAUGGUUUAAUAUAAGUAAUAAAGAAAAUAUAAUAAAGCAUAAUAAAAUAAACAAUCAUAGACUGUUUAAUAAAAGCAUAGUUAAAAGAGGAUAUUGUACAGGCCGUCCAAAAGAUAAUAUUGAAAUUUCUGAAAGACUAAAAACAAUUAUUCAAGAAUUAGGUUUAAACCCUGUAUAUGUUUAUGAAAAUUUAAAUUUAGAAGAUACUAGAAAACAAAUUUUAAACGAUACUAGAGGUUUAAGCGGUAUAUAUAUGAUAGUUAAUAAAGUAACUAAAGAUUAUUAUAUAGGUUCUGCGUCGACUAAUAGAUUUUACGCUAGAUUCAGUAAUCAUGUUAUUUAUUUCAGAGGAAGCAAAAUAGUUAAAUUAGCAAUAAAAAAAUAUGAUUUAAUAAAUUUUGCUUUUAUUGUAUUAGAUUUAUAUCCUAAUAUUGUUACUAAGGAAAAUAACAAAGAAUUAUUGGAUUUAGAAGAUAAAUAUUUAAAAUUGUUAGUACCUAAUUAUAAUAUUUUGACAGAAGCAGGUUCUAGUUUUGGUUACAAACACACUGAGAUUGAUCGUCAAAAGAUGAAAGAUAUUUAUAGUGACGCUAGACGUGAAAGAAUCGGUAAUCUAAACAAAGAUAAAAAGCUUUCUCCUGAAACCAUAGAAAAAAUAAGAGAAAAGGCUUUAAAUAGACCUUCUAUGUCUGAUGUAACUAAACAAAAGUGUAUAACUAAUACAAGACCUGUUGUGUUGUAUAAUUUAAAUGGAACUGUUUACGGUGAAUAUUCUACUAUUUUAGAUGCAGCUAAAUCUAUAAACUGUGACGAAAAAACUAUUAGAAGAGCAUUAAAAACAGAAAAAAGAUUAGUAAAAAGACAAUGAAUAGUAAAAGAUUUCAAGUAAAUAGUUAUUUUAUUAUCAAGGCUGCGCUAUCCUUUGGAUAGUGAAACAGCUAAAGCUCUUUAUUAUACUUUAUUUUUAUAUUAAAUUAUAGUUCCAUGAGUAACAAUCUUUUUGUAAUCUUUAUAGAAAAAAAAAGAUUAAAGUGGUAUAUCCCGACAGGGAUAUAGAAUAGUCUUUAUGAUUAUUUGGCAAUGUUAGUGAAAACGAUCAAAGAAGUUUAAACUUCAAGAUCGUCGGUUAUAUAAAUGAUCGCGACAGACUGGGUCACUAAUGGGUGGCUGAAAUGCUGCUUAAUGCACAGGCGAAACUUUUGGUUAGGUGCAAGCUCUUCAUUUAACUAAUAGAAUAUACGAAUUUAAAGUUAUUCUAGCUUAUUAUCUAUAUAUAAUAAGUAAGUUUGUAUGUUCUGCCUUACGGGCAAAUGUCCUUAUGAGGUGCUACGGUUAUUACUAAC |
|
[ reference structure ]
|
................((((((((....))))))))..((((..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))).......(((((((((.................))))))))).......((((((((....))))))))((((((((.....))))))))......(((((((...((((((...(((((....)))))..))))))(((((((....)))))))...[.[[[[[...)))))))(((((((......)))))))......]]]]]](((((((((((((((((.........)))))))))))(((((((..............)))))))(((((((((......))))))))))))))).......................................................
|
| [ predicted structure ] |
........(((((...((((((((....))))))))..(((((((((((((((.(((((((....((((((((((.((((((((((((...........((((((((....(((((((((((((..(((((((((.......(((....(((.(((......))))))....))).....)))).)))))...(((((((((((((((..((((.((((((...((((((...(((((......)))))....))))))))))))))))....)))))))((((....((((((((((((...............))))))))))))....))))....((((((((........((((((((((((((..((((((((..(((...(((((((((((.(((((((((..............)))))))))..)))))))))))...(((((((.........))))))).........)))))))))))....)))))))))))))).((((....))))....))))))))))))))))......)))))))....((((((.......(((((((...((((......(((..(((((....)))))..))).....((((.....((((((((...(((..(((.((((......))))..((((((((((((((......))).........)))..))))))))......)))))))))))))).....)))).......)))).)))))))......)))))))))))).......))))))))..((((((((..((((.....((((((((........(((((.(((.....((((.............((((.......))))..)))).....))))))))...........))))))))......)))).))))))))))))))))))))...(((((((((((((...))))))))...)))))......))))))))))))))))))))))))))))))))........)))))..(((((((((....(((....)))...))))))))).......((((((((....))))))))((((((((.....))))))))......((((((((..((((((...(((((....)))))..))))))(((((((....))))))).(((...[[[.))).....((((((((......)))))))).....]]].........(((((((((((..[[[....))))))))))).(((((((((((((((............(((((((((......))))))))))))))))))))))))((((((.((((....))))...))))))]]].......))))))))
|
|
CRW_00713
|
[ FASTA input ]
|
AAUAAAAGUUACGCUAGGGAUAAUUUACCCCCUUGUCCCAUUAUAUUGAAAAAUAUAAUUAUUCAAUUAAUUAUUUAAUUGAAGUAAAUUGGGUGAAUUGCUUAGAUAUCCAUAUAGAUAAAAAUAAUGGACAAUAAGCAGCGAAGCUUAUAACAACUUUCAUAUAUGUAUAUAUACGGUUAUAAGAACGUUCAACGACUAGAUGAUGAGUGGAGUUAACAAUAAUUCAUCCACGAGCGCCCAAUGUCGAAUAAAUAAAAUAUUAAAUAAAUAUCAAAGGAUAUAUAAAGAUUUUUAAUAAAUCAAAAAAUAAAAUAAAAUGAAAAAUAUUAAAAAAAAUCAAGUAAUAAAUUUAGGACCUAAUUCUAAAUUAUUAAAAGAAUAUAAAUCACAAUUAAUUGAAUUAAAUAUUGAACAAUUUGAAGCAGGUAUUGGUUUAAUUUUAGGAGAUGCUUAUAUUCGUAGUCGUGAUGAAGGUAAACUAUAUUGUAUGCAAUUUGAGUGAAAAAAUAAGGCAUACAUGGAUCAUGUAUGUUUAUUAUAUGAUCAAUGAGUAUUAUCACCUCCUCAUAAAAAAGAAAGAGUUAAUCAUUUAGGUAAUUUAGUAAUUACCUGAGGAGCUCAAACUUUUAAACAUCAAGCUUUUAAUAAAUUAGCUAACUUAUUUAUUGUAAAUAAUAAAAAACUUAUUCCUAAUAAUUUAGUUGAAAAUUAUUUAACACCUAUAAGUUUAGCAUAUUGAUUUAUAGAUGAUGGAGGUAAAUGAGAUUAUAAUAAAAAUUCUCUUAAUAAAAGUAUUGUAUUAAAUACACAAAGUUUUACUUUUGAAGAAGUAGAAUAUUUAGUUAAAGGUUUAAGAAAUAAAUUUCAAUUAAAUUGUUAUGUUAAAAUUAAUAAAAAUAAACCAAUUAUUUAUAUUGAUUCUAUAAGUUAUUUAAUUUUUUAUAAUUUAAUUAAACCUUAUUUAAUUCCUCAAAAUGAUAUAUAAAUUACCUAAUACUAUUUCAUCCGAAACUUUUUUAAAAUAAUAUUCUUAUUUUUAUUUUAUGAUAUAUUUCAUAAAUAUUUAUUUAUAUUAAAUUUUUAUUUGAUAAUGAUAUAGUCUGAACAAUAUAGUAAUAUAUUGAAGUAAUUAUUUAAAUGUAAUUACGAUAACAAAAAAUUUGAACAGGGUAAUAUAGCGAAAGAGUAGAUAUUGUAAGCUAUGUUU |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((.........)))))))((((((((....))))))))..(((((((((....))))))))).....(((((((...((((((....(((((.............)))))...))))))(((...((((((((......(((((((....)))))))))))))))..)))...[.[[[[[(((((...((.......))......)))))......)))))))(((((((((((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))))......]]]]]].(((((((((....)))))))..((((((((......)))))))).............)).............................................
|
| [ predicted structure ] |
..............(((((..[[[[[[[[[)))))....((((((((....))))))))..(((((((((....))))))))).......]]]]]]]]](((((....(((((.............)))))...)))))((((...((((((((............((((....))))))))))))..))))....((((....[[[[[[[..)))).......]]]]]]].......((((..(((((((((((........(((((((((((....((((((((...(((((.....))))).....(((((((((((.........((((((((.......((((((.(((((((.....)))))))))))))...(((((((((((.((((...(((..((((((........))))))..)))..)))).((((....)))).)))..))))))))........(((((((((((......(((((((...((((((.....((((((((....(((.(((((((((.......))))))))).))).........((((((((((..(((((...(((((.....(((((((((((....))))))))))).)))))...)))))................((((((((((((((((((......((((((((....((((.(((......)))..))))....))))))))......))))).)))))....))))))))..)))).))))))....(((((((...)))....))))(((((....(((((......))))).....((((((((((....)))))))))).....)))))........((((....))))(((((((((((...(((((((((((((.((((((.....)))))).)))))))...........)))))).....)))))))))))...)))))))).....))))))....))))))).))))).........))))))......)))))))).((((.....))))))))))))))).)))))))).....))))))))))).........)))))))))))........(((....(((((((....)))))))..((((((((......)))))))))))..((((...))))....))))((((((((...................)))))))).
|
|
CRW_00714
|
[ FASTA input ]
|
AUGGAAUAGACGGGGAUCAAUUGAUAAAAGUUACGCUAGGGAUAAAUUUGUUGUCCUUCUUAAUUGAAAAUUUAAGAUCAAUAAACCAGGUGAAUUGCAAAAAGGACUUAAAUUAAUUUAUAAAGCUAAAUAUUACUAUUAUAAAAAUAAAUAAAAUUGUUUUUUUAUCAAGUAAUGUUUAUGGAAAUAAAGAAGUUAAUUUGCAGCGAAGCUUAUUUAACCAUUUAAUAUAAAUAAGAACGUUCAACGAUUAGAAAGUGAGUUAUGGUAACAAUAAUCUUUCCACGAGUGCCUGGCAUCUACUAUGGUUCAUUUAUUUUUAAUUAAUAUUUAAUAUUUAAUUUUUAAUUUUUAAUUUUUAAUUUUUAAUUUUAUUUAUUUAAAGUACCAUAAGGAAAUCUUCAUAUUAGAAAUCAAUAUUAAAUUAACUUAGGUUAUUUAUAAUUUUUGUUUUUUAUUUUAAUUUCUUUAUUAAAAAUAAACCAUUAAGAUGAUGACAUAAUCUGAACAGUAAUGUAAAUUACUGAAGUAAUGAAUAAAUAAUCAUUACGAUAACAAUUUUUUGAACAGGCUGAUAGCCGGCGAGAGUACACAUUGUCCCGGCUGUUUGG |
|
[ reference structure ]
|
......................................(((((((.....)))))))((((((((....))))))))........(((((((...((((((....((((.......(((((.....((((((((((..(((((((((..............))))))).)))))))))))).....))))).))))...))))))(((...((((((((...........))))))))..)))...[.[[[[[(((((...((.......))......)))))......)))))))(((((...((((((..........................................................................................................................................................................))))))..)))))......]]]]]].(((((((((....)))))))..(((((((........)))))))............))...............................................
|
| [ predicted structure ] |
.(((....(((....(((....)))....)))...))).((((...(((((((....((((((........)))))).)))))))((((((...(((((((...(((((.......(((((.....(((((((((((.....((((((((......))))))))......))))))))))).....))))).)))))..))))))).....((((((((...........))))))))..(((...)))....(((((...(((((.......)))))))))).......))))))(((((...((((((....((((((((((....((((((((((..(((((((((.......((((........((((((......))))))........)))).......))))))))).)))))))))).(((..((((((....))))))..)))..................))))))))))))))))..)))))........))))...(((((((....)))))))..(((((((........))))))).........((((((........[[[[[[[[[))))))...........]]]]]]]]]...
|
|
CRW_00715
|
[ FASTA input ]
|
CGAUAGUUUAAAUGUCGCUUAAAUUAGAAAUAAUUUAUUAUGAAAAAUUGGGUUAAUUUUAAGAAAGUCUCUAAAAUUAUAAUUAUUUAUAAACUAUUUAAAAAAUAUUUUUAUUAUUUAUUUAAUUAUAAUAGAGAAAACUUGAAGCGAAGCUAGUUUAGGCAUAAAAUAAAUUAAACUAGAACGUUCAACGACUAGUAGGUGAGUGCAAAAUGUCCACAAUAAUCCUACCACGAAAGCCCAACAACUACAAAUUAAAAAUAAAAAUAUAAAAUUUAGUUGAUGACAUAGUCUGAUCCUAUUUGUGAAAAUAGGAAGCUUAUAAUAAAGAAUUUAAGCUAAUAACAUAAUGGUCGACUUAUCCUAUCCUCCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))..(((((((....)))))))..........(((((((...((((((....((((((...(((((((((...(((((.((..((((((...)))))).))))))).)))))))))))))))...))))))(((...((((((((..............))))))))..)))...[.[[[[[(((((...((...........))......)))))......)))))))((((((..((((................))))))))))......]]]]]].(((((((((....)))))))..(((((.(((.....))))))))..........))......................
|
| [ predicted structure ] |
...........((((((..(((((((....)))))))..........(((((((..(((((((....((((((...(((((((((...(((((.....((((((...))))))...))))).)))))))))))))))...))))))).(((.(((((((((............)))))))))....)))........(((((...(((.........)))......)))))......)))))))((((((..((((....(((....)))..)))))))))).))))))..(((..((((((((....))))))))[[[[[[......)))...]]]]]].................................
|
|
CRW_00716
|
[ FASTA input ]
|
UUAAAUGUGGUCCGGUAUCAAUAAUAUUUUUGUUGUGUUUUAAUUAGACUGAAUUUAAUUAAAAAUAUCUAAAUAAUAAAAUAUUAGUAAUCUAUAAAAAAAAUGAUAAUAGUUAAAUAAUUUACAUCUUAAUAUAAGUUUGUAAAAUCUAAGAAGAAAAAUAAAGAAAUGUUAAUAAAAUUAUAUUAUUAAUUAAAUUUUUUAUACUUUAACUUACUUAACAAAAUAACUAAUCUAAUAAAUUGAUAGUUUUUACUAUUAUUCUAUUCUUAUUUAAUAAAUUUUUAAUAGUUUGCUGAAUCUAAUUAAAAUAAAUCACGUUAUGUUAUUGUAAAAUAAUCCUAUUUGUUGGAAAUACUUUAUAAAUAUAUAAUACUUAAUAAUAAAAUAAAAAAUAAUAAAUAAACAAAAAAAAUAAAGUAAAAAUUUAUAUAUUUUAGUCAACCAACAGCAAAUAAUAAAAUAAAAAUUUGCUUAGAGACUAUACGGAUUUAACUAAUUAAAGAUUAGUAAGAUAUAGUCCAAUUUAAUCGAAUUCAUUAAUUUAUAUAUAAUUUUUGAAUGAUUAUUAUUGUUAACGAUGGCUUCACUGUCUCUACAACUUGCUCAGUGAAAUUGAAUUA |
|
[ reference structure ]
|
..................(((((((((...((((.(((((((((((((............................................................................................................................................................................................................................................................))))))))))))))).))....)))))))))......(((((....((((((....(((....(((((((((((((((.......................................))))).....))))))).))))))...))))))((((((............))))))...[.[[[[[...)))))..((((((.....))))))......]]]]]]((..(((((..(((((..((((.......))))..))))))))))...))..................................................
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((.......((((((.....))))))(((((((((((((....((((((((...)))...))))).........(((((((.(((((((((((((((...((((((.....((((((.((((...))))..))))))...(((((((....((((((((..((((((((.......))))))))....)))))))).......))).))))......))))))....((((...(((((((....)))))))...)))).))))))......))))).)))).))))))).))))))))))))).))))))))..((((((((.........(((..((((((....(((....(((((((((((((((.......................................))))).....)))))))))).)))...))))))..........((((....))))...))).(((((((....(((.(((((((...))))))).))))))))))((((.((((((..((((..((((.......))))..))))))))))..))))...))))))))(((((((...............))))))).........
|
|
CRW_00717
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAACUGUUAAUUAUCGAAAAUCUGGUUAAUAGCGGUCUUAACUAUGAGGAUCAAAAUUAGGGUCCUCUAUAAACUUAGCUAUAUGCUGGAAACCUUAAAAUUAUAAAUUAUCAUUAUUUUUGUUUUUAUCUAAAUUAAUUUUUAUAAUUUAAUAUUAUUUAAUUAUAACUUUUUUUGUUUAUAAAUAAAUAGAUAAAUAAAUAACUAAAUAAAUAAAUAGAUAAAUAGAUAAAUAAGCCAGUAAUUUAAAUUAAUAAAUAAGUGAUUAAACUUAAUGACUUAAAAUAAUUUAUUAUUAGAAAAUAAAGGUAACCAGCAGGGAAAAUUAAAAGUAAAUUUUUAUUAAAUUAAUUAUCUUUUUAAUAGUUUUUUUUAUUUAUUUAAUAUGCCCUCAGAGAUUGCAAGCUAAGCAAUUUUUAUUUUUAUUUUAAAUAAAAAAUAUUAAUAUUAAUUGAUGAUACAAUCCACAAAUAACUUAAAAUAUAAUCUAAAGUUAUAACUUAAAAUAUAAUCUAAAGUUUUUUUGCCUAAGGUAGCAAAAUAAAUUGGCCA |
|
[ reference structure ]
|
................................................(((((((........)))))))......((((((....((((((...((((...(((.(((((((...((((((.....((((((((..(((...(((((.(((((.(((((((((.(((((((.......)).))))).)))))).)))..)))))......)))))))).)))))))).....)))))).....))))))))))((((((((((((.((((....)))).))))......))))))))..........))))...))))))(((...((((((..(((((..((((((((...........))))))))........)))))))))))...)))...[.[[[[[...))))))(((((..((((..((((((......))))))..))))..)))))......]]]]]](...(((((((.............)))))))(((((.............)))))....)...........................
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((((((((.........)))))))))).(((....)))..(((((((........)))))))......(((((((...((((((..(((((.((((((((((((((..((((((.....((((((((.(((((..........))))).(((((((.((((.......(((((((((......)))))))))...)))).))))))).....)))))))).....))))))....)))))))...........(((((.((((....)))).)))))..)))))))..((((....)))))))))..))))))(((...((((((((((((...((((((((...........)))))))).....))))))..))))))...))).(((...)))..)))))))(((((..((((..((((((......))))))..))))..)))))........))))....(((((((.............)))))))...................(((((((((((........)))))).))))).....
|
|
CRW_00718
|
[ FASTA input ]
|
AACAGGCUGAUAGCCGGCGAGAGUACACAUUGUCCCGGCUGUUUGGCACCUUGACUAAAAUUAAUAAACAAUAUUACAAAAACUAAAUCUGUUAUGUUAAAUUUUUGUUUUAUUUAGUAAAUGUGUUAUAUUUUUUUUAUAUAAUUAAUAUUUAUUAAACUUAAAAUGACAGAACAUAUACACGAUUCAAGGAUUUUUAUAAUAAAUGAAACACUUUAAUUUUUUUAUAGAAUAAAGUGAUUAUAAUAGAUAUUGAUUUAAACAUCGGGGAAUUUUAAUAGAAAUAUUAACUUAGAAAUUGGCUAUUUGCUGAAACUUCCUUAGAGCUUUUGAAAAUAUUUAAGAAAAAUAUAAUAUCAUUUUAAUUAUUUUUAUAAUUAUCUGAAUAGAAUAAGUUAAUUAAUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUUAUUUAAAUUUAAAAUUCAAAAUGAUUGGGAAAUUGGCAGGGAAGUUUUAAUUUAGAUAAUUAGUUAUCUUUAACAGAUUAAAACCCCUCAACGAUCACACGCCAACAUCCAGAACUAAAUUUUAAUUGUACUUUAAAAAUGGAUGAAGAUAUGAGCUAAAUUUAUAUGAAAAUAUAGAUGUAAAUUGCGAU |
|
[ reference structure ]
|
................................................((((((..........((((((((((((...(((((.(((((((((((((......(((((((((((((((((((((((((((.......)))))))..))))))))))))..))))))))...)))))).))).))))..))..)))(((((((........(((((((.((((.....)))))))))))))))))))).)))))).))))....))))))....((((((....))))))........(((((....((((((...(((........(((((((((.((((((..((((((.((((......(((((((....)))))))....(((((((((((((....))))))))))))).)))).))))))..))))))))....))))))).....)))...))))))(((..((((((((((((((((....)))))).....)))))))))))))...[.[.[[[...)))))((((((........((((((.......)))))).))))))......]]].]]((.(((((((....)))))))......)).....
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((((....(((....)))...))))))).))))).((((((.......(((((.....)))))..........((((((((((((......(((((((((((((((((((((((((((.......)))))))..))))))))))))..))))))))...)))))).))).)))))))))..........((((((((((((((((.((((.....))))))))))).........(((((((.((((((....((((((..((((((....))))))........(((((.....)))))...))))))......))))))..(((((.....))))))))))))....(((((((....)))))))...((((((((((((((....)))))))))))))).......))))))))).........(((....[[[[[[.))).(((..((((..((((((((((((((((....)))))).....)))))))))))))))))]]]]]]..(((...((((((........((((((.......)))))).))))))..............((((((((....)))))))).......)))..
|
|
CRW_00719
|
[ FASTA input ]
|
GAGUAUACUAAGGCGUAGAGCUAAAAGUUGUUAAGGAACUCGGCAAAUUAUCCUGCCUUGUGCUUUGGGAAAGUACAUAGAUGGGUCAAACUAUCAAACUCCGGGGACACCCUAAAGCUUAUGAUACCAAACUAUAAUCGAAAGAUUAUAAGUGGCCAGAAUAAUUACCUGGGUAUGGUAAUAAGUCAUAAGAUAGAUGAAAAUCAAAUGGGCUAUCGCGGAUCUAAAUCAAAAUUUAUUACACAAACAAAUUUUGUAAAAGAGCAACGAGUAGACGGUAGUUGGAGCAUAGCUAAAAAUAAACACAUGCUCUUAAGGUGUACUCUAAUGGGUUUCGAAAGAAAUUAUCCAAUCAAAAUCCCUUCUAAACAAUUAAAUAAAUCAUUUUAUUCUACUUCGAAUUGUAAACUUAAAAUUAACCUUUGGUUUGUUAUAAAAUUUACAGAUGCAGAAGGUUGUUUUUCUAUUUCAAUAUAUAGUUAAUAUGUUUAAAAAUAAAUAAUAUUUAACUAGAGAUGUUUAAAUUUUUAAAUGUUAAAAUUGUUAAAAUGUUUUAAUGUUUAAAUCAGAAUACUAGAAAUAAAAUAAAUAAUGAAUAAUAAUAGAUCUUGGUAGAAUAAAUAUUUAUCUAAUUGCAUGAUAAAUUUGAUAGCCAUGCUAAAGUUCGACGACAAGAGGA |
|
[ reference structure ]
|
...................................................((((.((((((((((...)))))))).)).))))...(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....))))))).))..((((.........))))....)))....).))))))).(((((....)))))..)))...)).))))(((....((((((((...........))))))))....)))...[.[[[[[...)))))))(((((((................))))))).......]]]]]].((.((((((....))))))....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)).......................
|
| [ predicted structure ] |
.....(((...[[[)))..]]]....((((...[[[[...))))......]]]].((((..[[[[[[[[..........(((((......))))).......))))....]]]]]]]]........(((...(((((((....)))))))..)))(((.....[[[[[[)))....]]]]]]...((((..[[[..))))..]]].....(((((((...(((....))).((((((((((.(((((.....)))))...((((....((((((((....)))(((((((................))))))).......)))))...((((((((....)))...)))))...........))))...((((((..........(((((((((((...............(((((.(((((((.((((((..........))))))...))))))))))))..(((((((((((.(((((((((((((((....))))).))).)))))))...)))))...((((((((((((((((((.........)))))))))))))....)))))....))))))............................)))))))))))........))))))..))))))))))))))))).........(((........)))..
|
|
CRW_00720
|
[ FASTA input ]
|
CCUAAGGUAGCAAAAUAAAUUGGCCAGCUAAGUGUUCUGGGAAAACACUAUUGUGGGCCCAACUAUCAAACUCCGGGGACAUCCUAAAGUUUAUGAUACCAAGCCAUAGUCGAAAGUCUAUGAGUGGCCAGAAUAAUUACCUGGGUAUGGUAACAAGUCAUAAGAUGAGUGAAAACGAAAUGGAUUAUCGCGGAUCUAAAUCAGAAUUUCAAAGCCCACAGCCAAAAGAAAUUUCUGUAAAAGAGCAACGAGUAGAUGGUAGUUAUUUUGGAUUUUACCCAAAAUUAAGGUGUACUCUAAUGGGCUUCGAAAGAAGUUAUCAACUCAAAAACCCUUCUAACCAAUUUUUUAAAAAAUACUUUUCUAUUUUAAAUACAAAACCUGAAACUUAAAUAAAUCCUUGGUUUUUAAACUGGUUUUGCAGAUGCUGAAAGUUGUUUUUUUAUUAAAAUACAAGCAAAUGCUAAAUUAAAAACUAAAGAAUAUCUAACGAUCCUUCUAAAUCAGUGUACGAUCAAAUAAUAGAAAUAAAAUCAGGUAUGAAUCUAAAUAGAAAAUAGUAGUGUUAAUUAUAUUUAUUACUCAUUUUAUUAAAUUGUAUGAUAAAUUUGAAUAGCCGUGUUAAAUGUGGUCCGGUAUCAAUAAU |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((.((.(((((((.......)))))..)))).)))).(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....))))))).))..((((.........))))....)))....).))))))).(((((....)))))..)))...)).))))(((....(((((((((.................))))).))))....)))...[.[[[[[...)))))))(((((((.......))))))).......]]]]]].((.((((((....))))))............................................................................................................................................................................................................................................................................................................))..........................
|
| [ predicted structure ] |
.......((((..........[[[[.))))((((((.......))))))......]]]]........(((((...(((....)))..))))).(((..[[[...[[[[[))).....]]]]]..]]](((......[[[[[)))....]]]]]......(((((((((((((...(((..[[[[[[.)))..]]]]]]...(((((((((.................)))).))))).....(((....(((((..........(((((((.......))))))).......))))).....((((((....)))))).....)))............................(((((((((((((((..........((((((...............((((((.....((((((((.(((..((((......((((((......))))))..))))..)))....(((.....)))((((.(((....)))..))))))))))))....))))))...............))))))........))))))))).....))))))...........))))))))))))).................((((...((((..(((....)))..)))).))))....
|
|
CRW_00721
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUGACCCUGUACUUUACCAACAUUUAUUCUGGUUCUUUGGUCAACGGAUGGCCCAAAAUAAAGAUUGCAAUGUGCUAUAAGCUGGAAAUCUAUGUAUUCAAUUUUAAAUACUUCCACGUAAAAAUUUUAAAUAUUGGUAGAUAAUCAGCUGGUAACCAAUUAUCCUUUUAAAUAAUAUUAUCCUUUUAAUAUGGAAUAUUUUAUUAUGGAUUUAGUAGGAACCUCAGAGACUAUAUGCACAUCACUUUAUUUUUAAAGUGAAGAGAUAGUCCAAAAAUAUUUACAUUUUUAAAUAUUUGCAUCCAGAGGUCAAUUUUAUAGGCCUCUUAACGUUGCUAUA |
|
[ reference structure ]
|
.........................................(((((.....)))))(((........)))..((((((....((((((..((((((.....(((((((((((((......)))......))))))))))))))))..))))))(((........((((..........................................)))).........)))...[.[[[[[...))))))(((((((....)))))))......]]]]]]..(((((((((......)))))))))..........................................
|
| [ predicted structure ] |
.((((.(((..((((..........((((((.(((...((((.....))))....))).)))))).........))))....((((((..(((((((((((.((((((...(((......)))))))))...)))))..))))))..))))))))).))))...((((...............(((...[[[[[.)))......]]]]].))))...(((...........[[[[[[.)))...((((((((....))))))))....]]]]]]...(((((((((......)))))))))(((...(((((((.........)))))))......)))....
|
|
CRW_00723
|
[ FASTA input ]
|
ACCUCUGGUCAAUGAUAGUCUUAACUAUAAGGAUUCUAAGGUAGCUGAAUGAAAAUAUAAUAUAUUUUCAUUCACUUUAGCUGCCCUUAUAAUAACAAAUAUGAUAAAAUGUUAUCGUUCGAACCUCACUAUAUGCGGGAAAAUCCUAAAGCUUUAACUACUAAUAGUAAUAAUGUUAAAGAUAAUACAAUGGCCAAUCCGCAGGAAACCAAAGCAAAAAAAAAGAAUAUUGGCUGAAAUAUAAGAUUUUUAAAGUAGGUUCCUCAGAGACUACACGUGAGAAAUAAACGAUUAAGGUACUUUUUUUAACAAAAUUAACAAACUACCUAAAGUAUAUGUUUAUUAAGAUAUAGUCCAAAACUAUUGUGAAAAUAAUAGUUAAGUAAGAGCGAAAUUCCUGUCAGGAUGUCUAGGAAACAUUCUAUAUAUGGGUAUUAAACUACCAAACUACGGGGACCCCCUAAAGCUUAUGCUACCAAGCCAUCAUGGAAACAUGGUGUGUGGCUGGAGUAAUUACCCAGGUAAUAUGAUUUUAAUUUUAAUUGUAGUGGUAACAACGCAUGAGAUUUACGAAAGUAGAAUGGGCUAUCGCGUAUCUAAGUCAGACGUGCAGAAGUCUGUAAAAGAGCAACGAGUAGACGGUAGUUGUUGCAAUACUAAUUCUAGUAUGCAAUUAAGGUGUACUCUAACGUCCCAUGAAAAUGGGAAUCUAACCGAAAUCCUUUCUAACCCUGGUAACAACAAUGCAUCAAUUAAUUCAGUUAAACCGUCUUUACCUGUAGACCCUUGGGCUAUUACUGGAUUUACUGAUGCUGAAGGAUCUUUUAUGCUUAAAAUCGCUAAGUUAGUGCGAGUUCAAUUAGAAUUUUGCAUUGGUUUACAUGUUAAAGAUUUAGCUUUACUUAAAGCUAUUCAAAGACAUUUUGGAGUAGGUAACAUUCGUGUGUCUGGUAACACAGCAUACUUUUCUGUUAAAAGACUUGAUGAUAUUCUAAAUGUUGUCAUUCCGUUUUUUGACAAAUAUCCUCUUCAAACCGCUAAAUCAGCAGACUAUCUUUUAUUCAAACAAAGAGCUCUUUUAAUGCAAGAAAAACAUCACCUCAAAAAUAUUUUAAACUUUUGUAGCCAUCAAAAGCUAGUAUUAAUUGGGGGAUUAAGUGGUGCUUUACUUAGAAGAUAUCCUAAUGUUGUAGCAGUUGAUCGACCUAGUGUAACGUUCACUCUGCCAUUAGACCCUAAUUGGGUUGCUGGAUUUACAUCUGGCGAUGGUAGUUUCACUAUCACAAUUAGCGUGGAAAAUGGACGAUCUCGGGUGCGAUUUAAAUUUAAUUUAACUCAACACAUUCGAGACACUAAACUUAUCAAUUAUUUUACUACUUUCUUCAAUUGUGGUUCUGUUUAUAUUAACCGUGAAACAGCUAGUUUUAAUGUGUAUGAUUUCCCUUCAUUAAAUGAAAAUAUUAUUCCUUUCUUCACACAAUAUCCCUUACUUGGAGUUAAACAAUAUAAUUUCAAACUAUGGGUGGAAGCAAUGGAGAUCGUUAAUCGAGGAGAGCAUAAUACUGCAAAAAAAUUAGCUCAGAUUAAAGCGCUUAAAGAACAGAUGAAAUAAUUUAGUACUGCCAGGUAUGAUAAAUUCGGCCGCCGUGUGGCCGUUAAAUGCGGUCCUGCAUGAAUAGAGUAACAAUGCCUCUGCUGUCUCAUAUAGUAUCUCAGUGAAAUUGAAUUAGCCGUGAAGAUGCGGUUUACGUGCGGGUAGACGGGAGGGCGACGAGAAGUG |
|
[ reference structure ]
|
.............................................(((((((((((((...)))))))))))))..............((((((...............)))))).........(((((....((((((.....((.....(((((((................)))))))..........))....))))))(((.(((...............................................)))))).....[[[[[...))))).((((((((..(((((((........................)))))....))..))))))))......]]]]]...(((((((((....)))))))))........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
|
| [ predicted structure ] |
......(((((...(((((....))))).(((.(((((((((((((((((((((((((...)))))))))))).....))))).)))))...........(((((((....)))))))..))))))..........((((...))))....(((((((((((...)))).....))))))).........)))))..(((...))).............(((((..(((((......)))))....)))))...((((....[[[[....))))...]]]].((((((((....(((((......((((.....)))).....)))))........))))))))........((((..(((((((((....)))))))))..............[[[[[[...))))...]]]]]]..............((((......))))..((((((((....)))....((((..[[[[[.))))(((((((....))))))).]]]]]((((((.(((((....)))))...))))))............)))))......((((....(((((....)))))...[[[[[[[[[[[.[[[....[[[[[))))....]]]]]....]]]...]]]......]]]]]]]]((((((.(((((.[[[)))))))))))...(((...........((((((....)))))).....)))]]](((((((........(((((.......[[[[[[...[[[[[[[[......[[[[)))))...]]]]............]]]]]]]]...]]]]]].))))))).......(((((...[[[[)))))....]]]].............(((((..(((((((.(((((.......(((((((....)))))))......)))))(((((((..((((......(((((.(((......)))))))).....(((((((((((.((((((((((...))))))))))....)))))))))))..))))..)))))))....)))))))))))).(((((((((.......((((....))))....(((........(((.((((((.((((((.....((((((.......))))))..))))))..))))))))).......)))......))))))))).............(((((.........((((((..((((((..((((((((.(((((.....)))))(((((((....)))))))))))))))((((((.............))))))..))))))..((((((((....((((((...)))))).......))))))))))))))........((((((((((((((...........)))).(((((((........(((.....((((((((((..(((((((......((((.....(((((........((((...((((.........(((....(((((((((.......))))))))).....)))..))))....)))).)))))....))))........)))).)))..)))))))))).........)))......)))))))))))))))))....)))))..(((.......[[[[.)))..(((((((((((.....))))))..)))))....]]]]......(((....((((((......((((.(((((...)))))...((((((......))))))...))))....))))))...)))...........
|
|
CRW_00724
|
[ FASTA input ]
|
UGUUUAUCUUAGGUGAUGUUCACCCAUUUAUCGGCAAAGUGCGAUUCGUUGGCUAGAAACCAAUCCCAAUAGGGCUUAAGGAGGAUUAGCCGCUUAAGAUUCAUGAGAAUCUUUUGAUAACUGAAUAACAAUGUAGGUGCAAAACCUACCCUCCAAGUGCUGGAGUGAAAGCAUAUCCCCUACUGUAGAGACUAGCCAUCAAUCGGUAAAGCGGGGAUAAAAGGUGGAAAUACUGCAAGCCUAAUGUGGUAAUCACCAAGCAAAGUAUCCAUGAGUAAAGCCAAGGCUUAAAGACACGUCUGAAUCAUCGUGAUAAAACAGUAGCGCAAUCAGGCUGAAUCGCUACAACCAAAAGGUAAAGGAUAAAGGACUGGCAAAUUUUACCUUGACCAGUAUGCACUCCCAAUAAACCCGGUGAAUAGUGUCACUCUAAAGAUACAUAGCAUUGUUAUUCGGAACGAAGUAACCCGUUAUUUACUCUCAGAUGGUCGAGUAUCUGAGUAGGUGCUAACCGGAUGUAAUAACGUGGAGAGAUUGAGUAAGAAGCAAAUGUUUAAUUGUAAUGAUUGAAAUAUGCUGACGUACUCACAAUGAUUUGAAAGGAUUGGUCUGAUUAGGAAGUAUAUAUGUCUAAUACGAGUUUAAAGACUACGGCGGAAUGGAAUACGAUACCCUGGCGAAAGUUAGAACGUAGCGUAUACAAGCUUCAGAAAAGAAUAUACCAAGCUUCUCAACGUGGUGAUACUAAGGCAGUCCGCAAACUCCAAAAAACCCUGAUGAGGUCUUGGUCUGGAAAAGCUCUUGCAGUAAGAAAAGUCACCCAAGAUAACCAAGGAAAGAAGGCAGCAGGUAUUGACGGUGUAAAAUCCCUUAAACCAUCAGCCAGACUCACUUUGGUAAUGAAUAUGAAGCUUAACCAUAAGGUAAAAGCAACUCGUAGAGUAUGGAUUCCAAAACCCGGAAACGUUGAAAAACGACCACUAGGAAUACCCACAAUGCAAGAUAGAGCAACUCAAUCGCUUGUCAAACUGGCAUUAGAACCAGAAUGGGAGGCAAAAUUUGAGCCCAAUAGUUACGGUUUCAGACCCGGACGCAAUGCCCAUGAUGCAAGAGAAGCAAUAUUUAAUAGUAUCAGAUACUCAAACAAAUGGGUAUUAGAUGCUGAUAUUUCAAAAUGCUUCGAUAAAAUAAACCACGAAAAACUAUUGACCAAAAUUAACACAUUCCCGACCAUGAGGAGGCAAAUAAAAGCAUGGUUGAAAGCAGGAGUACUAGACAAUGGUCAUUUCUCAGAAACUACUGAGGGAACGCCACAAGGCGGUGUAAUAUCUCCACUAUUAGCCAAUAUUGCCUUACAUGGGCUAGAAAAGCUAGUAAAGGAGUUUGCAGCCAGCCAGAGAGGAGGAAAGGUGAAGAAUCAGAACAGUAUAUCCCUAAUUAGAUAUGCAGACGAUUUUGUGAUUCUUGCCCCCAAUAAAACUCAAAUAAUAGUACUCAAAGAAAUAGUAAAAACGUGGUUAGCAGAAAUGGGACUGGAAUUAAACCCUAACAAAACCCGUAUAGUUUCGACUUUCAAAAGCUCAGAGAUAUUCGCCUCGCAAGAAGUAGGAUUUAAUUUCCUCGGUUUCAAUGUGAAACAAUACAAAGUGGGAAAGAAUGACUCUGGAAAAUUAUCGAACGGUAAAAAGUUAGGGUAUAAAACACUCAUCAAGCCUAGUGUAAAAUCAGUAAAGAAACACUACGAUGACAUAGCAAGAAUAAUCGAUAAUCACAAAAAUGCUGCACAAGAAACACUAAUAAGUAAACUUAACCCUGUAAUCAGGGGAUGGGUUAACUAUUACUCAACAUCAGUGAGUAAAGAGAUAUUCUCAAAGCUAAGUCAUCUAAUAUAUCAGAAGCUGAAACGCUGGGGAAAACGUCGUCACCCUGACAAGUCUAAUGUAUGGGUAACCAAGAAAUAUUGGCAUACAGUAGGUGGCGAUAACUGGGUAUUCGCAGCAACAAAGAACGGAGAAAUCACAAUGAGGCUAUUCAAACACUCACAAAAAGAAAUUGUGAGACACGUAAAAGUAAAAGGUGAUGCCUCACCGUUCGAUGGGAACUUAAAAUAUUGGAGUUCAAGAAAGGGCGAAAAUCCCUUAGUACCUAAAAGAGUAGCAAUACUACUUAAAAAGCCUUUGGGGAAAUGCUCUCAUUGCGGAUUGUACUUUAGAGAAGAUGACCUAAUCGAGAUUGACCAUAUCAUUCCUAAAUCGCAAGGUGGAAAGGAUGUAUACGACAAUCUGCAAGCAUUACAUAGGCAUUGUCACGACGUUAAAACUGCCACUGACAACUCUUAUAAUCAACCUAAGAGCGAUACAGAAAUAAAUGUGAUGUGGUAGUGAGAAGUACCCACGACUUGGGUCAAGUCAUUGAGGAGCCGUAUGAGGUGAAAGUCUCAAGUACGGUUUUGAAGACCAGCAGGAUUGGUGACAGUCUUGCUGAGUUUAAUAACUCUCCUCAACUAUCGUGGGAUAUUUUGACCAGAGUGAAAAAUCUUUACC |
|
[ reference structure ]
|
............................................((((........................................................................((((((((((((((((((.....)))))).(((((.....))))).....((.((((((((((((..................)))))....)))))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))..))...((((((..((((.((((....))))...(((((.......((((((..........((((((..............)))))).(((....)))...((.......((((((((........))).)))))................))))))))...)))))))))...)))))).....))))))))))))..))))....(((((((.((((.((((((((......))))))))..(((....)))....))))))))).))......((((((...((((....(((((((.....)))))))...))))....))))))(((((((((((............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((((((((((....))))))))))).)))).......................................................
|
| [ predicted structure ] |
....(((....[[[[)))..]]]].(((((((((.....(((((((...(((((((.............(((((.....(((((.((((......(((((((....))))))).......))))........((((((.....)))))))))))..(((((........)))))...))))).........)))))))..)))).))).....((((.....(((((...(((((((.......))))))).)))))..(((...(((((.......((((....)))).....((((..........))))........((((((...(((...)))..)))))).(((....)))...)))))....((((((((........))).))))).)))..)))).......)))))))))....(((((((......(((......))).........(((((((.(((((((((....((((((((......))))))))..(((....)))......))))))..((((((..((((((...((((....(((((((.....)))))))...))))....))))))(((((((((((.........(((......(((((...(((.(((......((((....)))).....))))))..(((((.(((.(((((....)))))...))).)))))....))))).....))).........((((((((((((.(((((.((((((((((((((((............(((......(((((((..(((......(((((...)))))....))).))))))).....)))...((((((...(((((((((...........(((((...(((((.((((((.....))))))......(((((.((((.(((....)))..))))...)))))((((((((...)))...(((((...((((....)))).(((((.....((((((........(((.(((...))).)))((((((((..((((........))))...(((.(((......((((.(((...(((.(((........))))))......(((((..(((....(((((((((((....((((((.((((((((......)))))))).))))))))))).......)))))).........(((((((....(((((((((((...........((((.........)))).............)))))........((((((((.....((((..((((((((......))))))))..))))...(((..(((((...((((..(((((((.......((((.....)))).......)))))))..)))).)))))....)))...(((.......(((.((((((((.....(((((((........)))))))(((....))).)))))))))))..........)))......)))))))).....)))))).....))))))).)))...)))))..)))......((((((((.....(((((((((((...(((....)))..(((((.(((((..(((((.......((((.......))))..((((((...))))))........)))))...))))).)))))..)))))))...))))......))))))))........)))).....((((((((....(((((.............((((((.((((.((((((.......................................(((.((((((.(((((....)))))..)))))).))).(((((((.......))))))).....))))))....)))).)))))).............))))).)))))))).........))).)))))))))))........)))))).........(((((.....))))))))))......))))))))))...........(((((............((((((...(((....(((((((.......)))))))..................))).)))))).))))))))))((((((.........))))))....)))))..........)))))))))..(((((((....)))).))).....)))))).((((.....)))).))))))))))..))))))....((((.((((....((((((...((((...((((..(((....)))....)))).))))....))))))............))))))))))))).)))))...((((((((......((((((.........))))))...((((........))))..))))))))))))))).((((.....))))))))))))))).(((((((((((((((....)))))..))))))))))..(((((((((((((((....))))))))))).)))).....))))))...........))).)))))))...)))))))............
|
|
CRW_00725
|
[ FASTA input ]
|
AGAAACCACUGGCACGUGGAGAAUAAGCUGCACUGGCGUCUGGACGGUGUGCCGCAGGAACACAAGAUAGCUGCAUAAGGAUACGCAGUUAGCUUUUGUAUAAGCUCAUAAAGAGAUGGUGGAAGGCCCACCGGGAUCGGCUGUCGGAAGCAGAUUCCAAACCACUUCAUGCUGCUGUGGUAAAGAGCCAUGGUAGUGAGCGAUGAAGUAAAGCGUGAGUGAAAACUCAGCAGGUAAGAUACUCAUGAGACGAGUGAACCCGAACCCAUGUUGACGCGUCGUAAACCAGAGACUGACAUCAAAACCGAAGGGGCGUCCAGCCUUCGGGAUAAGUCUGCGAGUGAAUUCCGAAUGCUGCGCAGACGGUGUCCGGCGUAAAGUGGGCGUGACGGAGUAUCAGGCUCUUCCUGGGAACUGCGGGAACCUGUCGUUGUGAUGAUAAGGGAGAAAUGCAAGUCACUGAAUUGGCGAGCAUGAAAGUACCGAUGCACAGCACAGGGACGGAGCCGUUCGUAGUAGUGAUGAAGCUUCUGUAAUGGAGGUGGAGCGAAGGGGCGGCAUCAGACAGUCUUUGGACAGUGUUCAACUGAACAUGUUCAGGAGGAGACAAUGACAAAGACAAAAGCGUUUAACAUUGAUAAGUCACUGGUGGUCAGCGCGUACAGGCGAGUGAAGACCAGUGCAGGCGCGGCGGGAAUUGAUAAGCAAUCGCUGGCGGACUUUGAUAAACGGUUAGUUGAUAAUCUGUACAAAAUCUGGAACCGACUUUCUUCAGGAAGUUAUUUCCCACCGGCAGUGAAAGCGGUGGCAAUUCCGAAGAAAUUGGGUGGAGAGAGAAUUCUGGGUAUCCCGACAGUCAGCGAUCGUAUCGCGCAGACGGUGGUAAAACUGGCCUUUGAGCCACAGGUUGAGCCACAUUUUCUGGCAGACUCUUACGGCUACAGACCGAAUAAAUCGGCACUGGAUGCUAUAGGGGUAACGCGUAAGCGUUGCUGGUAUUACGACUGGGUACUGGAAUUUGACAUCAAAGGGCUGUUCGAUAACAUCCCGCACGAACUGAUAAUGAAAGCCGUGGACAAACACAAUCCGGCCCGGUGGGUAAAAUUGUAUAUACAGCGGUGGCUGACAGCGCCGAUGGUGAUGUCAGACGGAGAAGUCAGAGCACGAACAAUGGGAACGCCGCAGGGAGGUGUCAUAAGUCCGUUGCUGGCAAACCUGUUCAUGCAUUAUGUGUUUGAUAAAUGGCUGGCAAAAUAUUAUCCGAAAGUGCCGUGGUAUCGAUAUGCUGAUGAUGGCAUUUUGCAUUGUCACAGCGAAGCAGAAGCGACUGAAAUGCGAGAAGUAUUACGCAAAAGAUUUAGCGAAUGCGGACUGGAAAUGCAUCCGGAGAAAACGCGAGUUAUCUACUGCAAAGAUGGAAGCCGGAAGGGUGAUUAUGAACAUACCAUGUUCGACUUUCUGGGGUACACAUUCAGGCGACGCGUAGUAAAGAACGUUAAGCGAAACAGCCUGUUUGUAAGUUUUACCCCCGCAGCGAGCAAAUCAGCGCUAAAGGCAAUGCGUCGGGAAAUCAAAGCGACAGGGAUAAGGAAAAGAGUGGAUUUAAGCAUUGAGCAGAUAGCGAAAUGGAUAAAUCCAAAACUGAAUGGCUGGAUAAAUUAUUACGGGCGAUAUACCUGUUCGGAAUUAUACAGCGUGUUCAGAUAUAUCAAUAAAGCACUGGUGAGGUGGGGGCGUAAGAAAUAUAAAAUGCUCAGCCGAUACAAGACAAGAGCCUCAAAAUUUCUGGAAGAAAUGGCGAAGCGAAGUCCACAGUUGUUUGCCCACUGGCGUCUGAAGAUGAGAGGCGGACUUGUUUGAUGGGAGCGGUAUGAGCCGAGAGGUUCACGUACCGUUCUGCGAGAGGCUGCGGGGGAGGUUCCUGCGGCCUACUCACCUGGUAAUGAAUGAAGACGACUGCAAAAUAAGAAGAGGAAAUG |
|
[ reference structure ]
|
...................................................((((((....(((((((((((((..........)))))))..)))))).....((((..(((....(((((.....)))))((((((..............))))))..(((.(((((((((((((((((.....))))))))))).....)))))).......(((((....)))))...)))..((((((((....(((.((....))...(((((......((((((.............((((((....((((((...........)))))).....(((((((..................)))))))))))))))))))...))))))))...)))))))).....)))..))))..))))))...(((((.((((((..............((((..((((......))))..)))).............)))))))))))......(((((((......((......((((((.....))))))...))....))))))).((((((........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((((((((((.....))))))))))).))))............................................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[[[))))(((....(((.....))).))).......]]]]]......(((.(((.(((((((..........))))))).))).))).....(((.....)))..(((((.....)))))(((.((((.....((((.....))))..(((((((((((((((((((((.....))))))))))).....)))))))......(((((....)))))...)))....(((((.......)))))...)))).))).....((((((((..........)))...........[[[[[[[.)))))...]]]]]]].....(((((((.....[[[[[[.......)))))))...(((((........)))))....]]]]]]....(((((((((((.......))))).(((((.((((((..............((((..((((......))))..)))).............)))))))))))...)))))).(((((.....[[[[[..((((((.....))))))...))))).......]]]]]....(((((((.......(((..(((((....)))))..)))........)))))))....((((((...(((....)))(((((((..(((.(((......)))..)))..))))))).))))))....(((((((........((((((.(((..(((((((...(((((.....)))))))).))))....((((..(((((((....)))))))..))))..))).)))))).........))))))).......(((((...((((....))))......)))))..(((.(((((...)))))...))).(((((.....[[[[[.....))))).((((..((((.......)))).)))).....]]]]](((.((((.....))))..)))((((((.[[[.((((((((....))))))))))))))....]]]..........((((....))))(((..[[[[[.......)))...]]]]]...........((((((......))).[[[[))).....]]]]....((((....))))(((((.[[[[[[.))))).......]]]]]].............................(((((....[[[)))))......]]].((((((((........(((.((((...)))).)))......)))))))).....(((...[[[[[[[[[[..[[[[[)))...]]]]]]]]]]]]]]]((((((((.........(((..[[[.))).(((((.....))))).]]]......(((((((..(((((............[[[[.(((.(((....))).))).)))))....]]]]....((((((.[[[[[.(((((((...))))))).))))))((((((.(((..(((((..(((....(((......))).))).....)))))..)))......))))))...........]]]]].)))))))))))))))((((...........))))...((((..........((((((((..((((.............))))..))))))))...(((((((((((.((((......(((((.......)))))......)))).)))).)))))))...)))).......((((.....))))..(((................[[[[.)))............]]]].(((..[[[[[)))..]]]]].........((((((.[[[[[[[[[(((....)))((((.........))))))))))........(((((((((((((((....)))))..))))))))))..(((((((((((((((...)))))))))))).)))................]]]]]]]]]....................
|
|
CRW_00726
|
[ FASTA input ]
|
GCGAAUAUGAAUUUGUGAUUGCAACCCACGUCGAUCGUGAACACAUCCAUAACGUGCGCCCAGAUAGGGUGUUAAGUCAAGUAGUUUAAGGUACUACUCUGUAAGAUAACACAGAAAACAGCCAACCUAACCGAAAAGCGAAAGCUGAUACGGGAACAGAGCACGGUUGGAAAGCGAUGAGUUACCUAAAGACAAUCGGGUACGACUGAGUCGCAAUGUUAAUCAGAUAUAAGGUAUAAGUUGUGUUUACUGAACGCAAGUUUCUAAUUUCGGUUAUGUGUCGAUAGAGGAAAGUGUCUGAAACCUCUAGUACAAAGAAAGGUAAGUUAUGGUUGUGGACUUAUCUGUUAUCACCACAUUUGUACAAUCUGUAGGAGAACCUAUGGGAACGAAACGAAAGCGAUGCCGAGAAUCUGAAUUUACCAAGACUUAACACUAACUGGGGAUACCCUAAACAAGAAUGCCUAAUAGAAAGGAGGAAAAAGGCUAUAGCACUAGAGCUUGAAAAUCUUGCAAGGGUACGGAGUACUCGUAGUAGUCUGAGAAGGGUAACGCCCUUUACAUGGCAAAGGGGUACAGUUAUUGUGUACUAAAAUUAAAAAUUGAUUAGGGAGGAAAACCUCAAAAUGAAACCAACAAUGGCAAUUUUAGAAAGAAUCAGUAAAAAUUCACAAGAAAAUAUAGACGAAGUUUUUACAAGACUUUAUCGUUAUCUUUUACGUCCAGAUAUUUAUUACGUGGCGUAUCAAAAUUUAUAUUCCAAUAAAGGAGCUUCCACAAAAGGAAUAUUAGAUGAUACAGCGGAUGGCUUUAGUGAAGAAAAAAUAAAAAAGAUUAUUCAAUCUUUAAAAGACGGAACUUACUAUCCUCAACCUGUACGAAGAAUGUAUAUUGCAAAAAAGAAUUCUAAAAAGAUGAGACCUUUAGGAAUUCCAACUUUCACAGAUAAAUUGAUCCAAGAAGCUGUGAGAAUAAUUCUUGAAUCUAUCUAUGAACCGGUAUUCGAAGAUGUGUCUCACGGUUUUAGACCUCAACGAAGCUGUCACACAGCUUUGAAAACAAUCAAAAGAGAGUUUGGCGGCGCAAGAUGGUUUGUGGAGGGAGAUAUAAAAGGCUGCUUCGAUAAUAUAGACCACGUUACACUCAUUGGACUCAUCAAUCUUAAAAUCAAAGAUAUGAAAAUGAGCCAAUUGAUUUAUAAAUUUCUAAAAGCAGGUUAUCUGGAAAACUGGCAGUAUCACAAAACUUACAGCGGAACACCUCAAGGUGGAAUUCUAUCUCCUCUUUUGGCCAACAUCUAUCUUCAUGAAUUGGAUAAGUUUGUUUUACAACUCAAAAUGAAGUUUGACCGAGAAAGUCCAGAAAGAAUAACACCUGAAUAUCGGGAACUUCACAAUGAGAUAAAAAGAAUUUCUCACCGUCUCAAGAAGUUGGAGGGUGAAGAAAAAGCUAAAGUUCUUUUAGAAUAUCAAGAAAAACGUAAAAGAUUACCCACACUCCCCUGUACCUCACAGACAAAUAAAGUAUUGAAAUACGUCCGGUAUGCGGACGACUUCAUUAUCUCUGUUAAAGGAAGCAAAGAGGACUGUCAAUGGAUAAAAGAACAAUUAAAACUUUUUAUUCAUAACAAGCUAAAAAUGGAAUUGAGUGAAGAAAAAACACUCAUCACACAUAGCAGUCAACCCGCUCGUUUUCUGGGAUAUGAUAUACGAGUAAGGAGAAGUGGAACGAUAAAACGAUCUGGUAAAGUCAAAAAGAGAACACUCAAUGGGAGUGUAGAACUCCUUAUUCCUCUUCAAGACAAAAUUCGUCAAUUUAUUUUUGACAAGAAAAUAGCUAUCCAAAAGAAAGAUAGCUCAUGGUUUCCAGUUCACAGGAAAUAUCUUAUUCGUUCAACAGACUUAGAAAUCAUCACAAUUUAUAAUUCUGAAUUAAGAGGGAUUUGUAAUUACUACGGUCUAGCAAGUAAUUUUAACCAGCUCAAUUAUUUUGCUUAUCUUAUGGAAUACAGCUGUCUAAAAACGAUAGCCUCCAAACAUAAGGGAACACUUUCAAAAACCAUUUCCAUGUUUAAAGAUGGAAGUGGUUCGUGGGGCAUCCCGUAUGAGAUAAAGCAAGGUAAGCAGCGCCGUUAUUUUGCAAAUUUUAGUGAAUGUAAAUCCCCUUAUCAAUUUACGGAUGAGAUAAGUCAAGCUCCUGUAUUGUAUGGCUAUGCCCGGAAUACUCUUGAAAACAGGUUAAAAGCUAAAUGUUGUGAAUUAUGUGGAACAUCUGAUGAAAAUACUUCCUAUGAAAUUCACCAUGUCAAUAAGGUCAAAAAUCUUAAAGGCAAAGAAAAAUGGGAAAUGGCAAUGAUAGCGAAACAACGUAAAACUCUUGUUGUAUGCUUUCAUUGUCAUCGUCACGUGAUUCAUAAACACAAGUGAAUUUUUACGAACGAACAAUAACAGAGCCGUAUACUCCGAGAGGGGUACGUACGGUUCCCGAAGAGGGUGGUGCAAACCAGUCACAGUAAUGUGAACAAGGCGGUACCUCCCUACUUCACCAUAUCAUUUUUAAUUCUACGAAUCUUUAUACUGGCAAACAAUUUGACUGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
..........................................................(((((....(((((((((((..(((((.......)))))(((((........))))).((((.((((((...(((...(((....)))....)))...........))))))...(((((....(((((..........))))).......)))))..))))..((((((....(((((.(((.......)))...(((..(((((..(((((((.......))))((((((.............))))))(((((((...(((((((((.........)))))))))............))))))))))(((((((....)))))))....)))))....))))))))....)))))).........)))))))))))..)))))..((((((...(((((...(((..........)))....(((((..........))))).....)))))..))))))....((((((......(((((.((((((.....)))))).)).)))....))))))..(((((((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((.(((((...((..(((((....)))))....))..))))).)))).)))).........................................................
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((......))).))))....((((.....))))..............((((.(((((....(((((((((((.((((((.......))))))........(((((..........((((((...(((...(((....)))....)))...........))))))...(((((.((((((((..........))))..))))..)))))..))))).((((((....(((((...((((((((...))))))))((((.((((....))))(((.(((.((((((.............))))))(((((((...(((((((((.........)))))))))............)))))))..((((((((....))))))))..))).))).)))).)))))....)))))).........)))))))))))..))))).....(((...........(((.......))).......))).....)))).(((.[[[[....)))..]]]]..(((...[[[[[[)))...(((...(((((((...)))))))....)))....]]]]]].((((((((...((((((((........(((...((((....))))..)))....(((....))).)))))))).........((((((((((((..............(((((.........(((((((....(((((((((((...(((((((....(((...((((((...((((((((((......(((...)))......)))))).)))))))))).)))...(((((((((......(((((((((((((((....))))))).......(((........))).....(((((..........(((((((......(((((((..((((.......)))).))))))).........(((((((.(((...)))((((((((((((.......((((((..(((........))))))))).......))))))))))))...(((...(((((((((...))))))))).....((((((....((((.(((((........(((((((((((((................)))).....)))))))))))))).)))).((((.((((((((((((.......))))).)))...)))))))))))))).................))))))))))........))))))).........))))).(((.((((....))))..........))).............(((((...........)))))...))))))))....((((...((((((((..((((.......(((............)))....))))))))))))...))))..........(((((((((....(((....)))...)))).)))))..)))))))))......))))))).......))))))))))).............((((.....))))....))))))).........((((((.....)))))))))))......((((((......(((......((((((..(((((((((((............)))))))))))............(((....((((((.........)))))).....))).)))))).....)))....(((((((......(((((((...(((((.....((((((.........((((....(((((((((((....)))...((((((.....)))))).............(((.......)))......))))))))...(((..(((((((.........))))))).....))))))).....((((....))))..))))))....((((((....(((((..((((...))))......((((.((((((((((.((((((.......(((((......((((..(((...(((((((((((((((((((((.....((((((.......)))))).)))........((((....((((...((((((((((((........))))))))))))...))))..))))..))))))).)))))))))))..)))...)))).)))))......)))))).))))))))))))))..........)))))..))))))...)))))...)))))))......)))))))..........))))))(((.....)))...(((((((((((((((.........(((......(((((((....(((....((((..((((((.....))))))..))))..)))..))))))).(((((((((.((((..((((((.........)))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))......))))))))))))......)))))))).((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((.(((((.......(((((....)))))........))))).)))).)))).................................((((((((...)))).))))....
|
|
CRW_00727
|
[ FASTA input ]
|
AUAAAUCUAAGUGUAGUGCUUGGUGUAUUGAUUUUUUUUGGAAAGGGAGUGUGUGCGAGUUGUUUAUUUCAAGAAUAGGCUGGACCACCCAGCUGUACCCUUUUCCGUUAUAACUAGGAAAGAGAGGUGCAUGAUCUCGCGAAUUACUUCUGAAUAAAUUCAGAAAUUAUAUGUAAGAACCAUAGCAUUUCGCGAUUCAUUGGUAAAUCAAUUUUGAUUCUCUAUUAACCAAUAAUGUGGAACUAUUAACAUGGUUAAAACAAACUGUUUGAAGUCUAGACGCAGCAUGGUACUCUUUCUACCACUAUGUUAAUAUAGAGGUGGUUUCAAAAUAAAUAUUUUAUCGAUAUAGGAUACUCAUAUUGAUAAAAUGAUUUGAACCGCUUAUUGUAAAUUGUAAAAACGGGGAUUUUACCCCCUUUAUCUAAUGCUGAAUCGACGACCUAUUCUAAGUAAGAAGAGCUUUUUGGAUUUGAAAAAAAAAAAAAGAAACAACUUUGCUGACAAUUACAUAUUUUUUAUUUUGUCAGAAGAGUCCUCCGAAUAUUUUGGUAUUACAUUAGUUUCGAUAUCUUUUUGGAAUAUGAACAAAGAAGAGAAGAUAGGCUCAUUACAUUCAUAAAAAAAGAUAUGAGAAUUUACCUUAAGUAAUUGAGCGUGAGAGCCAAAUGAAUCGAAAGAUUCAUGUUUGGUUCGGGAAGGGAUUAUGGAAUUUUGGAAAGGAAUGGAAAAAUAAUCUACUUUCAUUAAGUGAUUUAUUAGAUAAUCGAAAACAGAGGA |
|
[ reference structure ]
|
.........................................................(((((.....((((((((...(((((.....)))))((((((..........................))))))...((((.((((...((((((((....)))))...........)))...........)))).......(((((.......................)))))......))))...((((...((((.((((.....))))...(((............((((.......))))....................................(((((((((((.........)))))))))))...................................................................)))))))...).)))...........)))))))).....................)))))...(((((....................)))))....((((((......(((.........................................)))....))))))..(((((..........................................)))))....((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((((((..............................)))).)))))...................................
|
| [ predicted structure ] |
..........(((.((((((((((..........((((((((..(((((((..((((((.....(((((...)))))((((((.....))))))(((((.((((((..........))))))...))))).....))))))...))))))).......))))))))(((....)))..)))).)))))).))).....((((((.(((((....))))).[[[[[..))))))...]]]]]....((((.((((((......))))))))))....((((...[[[[[[[[......))))..]]]]]]]]..(((((((((((((.((((.....((((((((((((((.........)))))))))))))).)))))))))))).)))))............((((.......))))......(((((((((((((........((((.....))))(((((((((...(((....)))..)))))).....(((((.(((((((....(((.....))).))))))).))))).))))))....))))))))))......(((((.(((((((((....((((((.......(((........)))......)))))).))))))))))))))..(((((((((....))))).))))((((((((((((((....)))))..))))))))).((((((((((((...(((((.....)))))......))))))).)))))......(((((........)))))...........
|
|
CRW_00728
|
[ FASTA input ]
|
UUCUGGUACAGAAGUUCCUAUAAAAAUGGGAAAUGCCCUACCUUUGAGUGCGGUUUGAACUAUUGAUUUACGUAAUUGGAAAUAACCAAUUAGGUUUACGACGAAACCUAGAAAUCGAUCACUGAUCCAAUUUGAGUACCUCUGCAGGAUAGACCUCAACAGAAAACUGAAGAGUAACGGCAGCAAGUGAUUGAGUUCAGUAGUUCCUCAUAUAAAAUUAUUGACUCUAGAGAUAUAGUAAUAUGGAGAAGACAAAAUUGUUUCAAGCACCGACAGAACCGGAAGCGCCCCUUCUUUCAAAGAGAGGAGGACGGGUUAUUCACAUUUCAUUUGAUGGUCAGAGGCGAAUUGAAAGUUAAGCAGUGGGAAUUCUAAAGAUUCCCCGGGGGAAAAAUAGAGAUGUCUCCUACGUUACCCAUAAUAUGUGGAAGUAUCGACGUAAUUUCAUAGAGUCAUUCGGUCUGAAUGCUACAUGAAGAACAUAAGCCAGAUGACGGAACGGGAAGACCCAGGAUGUAGAAGAUCAUAACAUGAGUGAUUCGGCAGAUUUGGAUUCAUAUAUAUAUCCACCCAUGUGGUACUUCAUUCUACGAUAUAUAUAAGAUCCAUCUGUAUAGAUAUCAUCAUCUACAUCCAGAAAGAAGUAUGCUUUGGAAGAAGCUUGUACAGUUUGGGAAGGGGUUUUGAUUGAUCAAAAGAAGAAUCUACUUCAACCGAUAUGCCCUUAGGCACGGCCAUA |
|
[ reference structure ]
|
....................................................(((....((((.((.((((((.(((((......)))))((((((........))))))...(((((((((................(((....)))...........(((....))).................)))))).......................................)))...(((((..((((.(((((....)))))...(((............((((.........))))..............((((((((....(((((((((...........))))).))))..........))))))))............................)))))))...))))).....................)))))).)).)))))))........(((...(((..............)))))).....((..........))..(((((((..............................................................................................................)))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((((((..............))))))).))))............................
|
| [ predicted structure ] |
....((((..[[[[(((((((....))))))).))))....]]]].....((((.[[[[[[)))).......(((((((......)))))))]]]]]]................(((((((((.((((.....(((...)))....))))....(((..(((....)))..)))...........)))))))))..(((((((((.[[[......))))))))).....]]].((((....)))).............(((........[[[)))....]]]...(((((((((((((...)))))))))..............[[[[[(((((...)))))))))...]]]]]........((((((.(((((....(((((...)))))...)))))[[[[[)))))).....(((((...))))).......]]]]]...........((((((.[[[[[....(((..(((.....))).)))..)))))).........]]]]]..(((((((((...((((...))))(((((...(((((..((((((..(((((((((((((....)))(((........))))))))))))).)))))))))))......)))))..)))))))))........(((((((((....)))))..))))...((((.[[[[[.((((((....))))))((((......))))..))))....]]]]].(((...)))...
|
|
CRW_00729
|
[ FASTA input ]
|
AACCCUAGAUGCUGUCGGAGUAAAGGAUCGUCAACAAGGGCGUUCUAGUGCGUUGUAGAUUCUUAUCCAAGACUUGUAUCAUUUGAUGAUGCCAUGUGAAUCGCUAGAAACAUGUGAAGUGUAUGGCUAACCCAAUAACGAAAGUUUCGUAAGGGGACUGGAGCAGGCUACCAUGAGACAAAAGAUCUUCUUUCUAAAGAGAUUCGAUUCGGAACUCUUAUAUGUCCAAGGUUCAAUAUUGAAAUAAUUUCAGAGGUUUUCCCUGACUUUGUCCGUGUCAACAAACAAUUCGAAAUACCUCGACUUUUUUAGAACAGGUCCGAGUCAAAUAGCAAUGAUUCGAAGCACUUCUUUUUACACUAUUUCGGAAACCCAAGGACUCAAUCGUAUGGAUAUGUAAAAUACAGGAUUUCCAAUCCUAGCAGGAAAGGGAGGGAAACGGAUACUCAAUUUAAAGUGAGUAAACAGAAUUCCAUACUCGAUCUCAUAGAUACAUAUAGAAUUCUGCGGAAAGCCGUAUUCGAUGAAAGUCGUAUGUACGGCUUGGAGGGAGAUCUUUCAUAUCUUUCGAGAUCCACCCUACAAUAUGGGGUAAAAAAGCCAAAAUAAGUGAUUUUAG |
|
[ reference structure ]
|
....................................................(((((......((((((......(((((.......)))))(((((............)))))...(((...((((...(((...(((....)))......)))...........)))).............(((((.(((....)))))))).........))).......((((..(((..((((...............((((........))))(((..((....))..))).((((((..((...(((((.........)))))...)).............))))))................))))......)))...)))).........)))))).......)))))..(((((..((((.........)))).)))))....(((((..........)))))..((((((((..........................))))))))....((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((.((((((...........))))))..))))......................................
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((.((((((...(((((((..((((....(((......)))))))..))))))).)))..)))..))))).((((.....[[[[[[[[..[[[[)))).....]]]]..]]]]]]]]...(((..........[[[[[....)))....]]]]].((((.............(((...[[[[)))...]]]]((((((...((((.(((........)))))))...)))))).........(((((......((((.[[[[....))))....]]]]........)))))(((((.........)))))(((((((........))))))).....(((((((((..............................((((.....[[[...))))((((((...)))))).]]].))))))))).........((((((........))))))..((((((((.......[[[[[[(((......))).))))))))....(((((((((.((((....))))...)))))))))...(((((((.......)))))))]]]]]].((((((.....)))))).....)))).................
|
|
CRW_00730
|
[ FASTA input ]
|
UGCUCCACUUGGCUCGGGGGGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCUCCGCUCUUGCAAUUGGGUCGUUGCGAUUACGGGUUGGAUGUCUAAUUGUCCAGGCGGUAAUGAUAGUAUCUUGUACCUGAACCGGUGGCUCACUUUUUCUAAGUAAUGGGGAAGAGGACCGAAACGUGCCACUGAAAGACUCUACUGAGACAAAGAUGGGCUGUCAAGAACGUAGAGGAGGUAGGAUGGGCAGUUGGUCAGAUCUAGUAUGGAUCGUACAUGGACGGUAGUUGGAGUCGGCGGCUCUCCCAGGGUUCCCUCAUCUGAGAUCUCUGGGGAAGAGGAUCAAGUUGGCCCUUGCGAACAGCUUGAUGCACUAUCUCCCUUCAACCCUUUGAGCGAAAUGCGGCAAAAGAAAAGGAAGGAAAAUCCAUGGACCGACCCCAUCAUCUCCACCCCGUAGGAACUACGAGAUCACCCCAAGGACGCCUUCGGCAUCCAGGGGUCACGGACCGACCAUAGAACCCUGUUCAAUAAGUGGAACGCAUUAGCUGUCCGCUCUCAGGUUGGGCAGUCAGGGUCGGAGAAGGGCAAUGACUCAUUCUUAGUUAGAAUGGGAUUCCAACUCAGCACCUUUUGAGUGAGAUUUUGAGAAGAGUUGCUCUUUGGAGAGCACAGUACGAUGAAAGUUGUAAGCUGUGUUCGGGGGGGAGUUAUUGUCUAUCGUUGGCCUCUAUGGUAGAAUCAGUCGGGGGACCUGAGAGGCGGUGGUUUACCCUGCGGCGGAUGUCAGCGGUUCGAGUCCGCUUAUCUCCAACUCGUGAACUUAGCCGAUACAAAG |
|
[ reference structure ]
|
............................................................((((.....(((((((.((((.((((........))))((((..............))))...(((((((((...((((((((((....))))))))))...........))))))......((((((..........................))))))..)))..((((((.....((((.(((((.....)))))...((((.......(((((((.......))))(((((((................)))))))((((((((((((((((...........)))))))))........))))))))))........................................))))))))...))))))...)))).))))))).....))))..((((((...(((.(((...))).)))..))))))....(((((..........((((((((..............................))))))))......))))).(((((((((................................................................)))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((((((((((........................................)))))))))))).))))..............................................................
|
| [ predicted structure ] |
........((((((............(((((((((..(((((...)))))..)))))))))........((((((((((((.......((((((((..((((..(((...)))...)))).....(((((((...((((((((........))))))))...........)))))))..........))).))))).(((((((......((((.....((((((..((((((..(((((((.((((((...))))))...((((((.((((((..(((((...)))))((((((((....(((....)))..))))))))......(((((((((...........)))))))))..))))))..(((((....((((..(((...)))....)))).....)))))....)))))))))))))))))))))))))...(((((((.......((((((((...(((...((((((((....(((((((((((.((((((........(((((((((.((((((............)))))).....)))))))))....))))))....(((((((((((((((((.....)))))))...(((..(((..........((((..((((((....))))))))))......((((((((((((((....)))))..))))))))))))..))))))))))))).))).)))))))).((((...)))))))))))).))).......))))))))..)))))))............))))......)))))))))))))))))))....)))))).......
|
|
CRW_00731
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAUUAGCUCAGUGGUAGAGCGCGCCCCUGAUAAUUGCGUCGUUGUGCCUGGGCUGUGAGGGCUCUCAGCCACAUGGAUAGUUCAAUGUGCUCAUCGGCGCCUGACCCUGAGAUGUGGAUCAUCCAAGGCACAUUAGCAUGGCGUACUCCUCCUGUUCGAACCGGGGUUUGAAACCAAACUCCUCCUCAGGAGGAUAGAUGGGGCGAUUCGGGUGAGAUCCAAUGUAGAUCCAACUUUCGAUUCACUCGUGGGAUCCGGGCGGUCCGGGGGGGACCACCACGGCUCCUCUCUUCUCGAGAAUCCAUACAUCCCUUAUCAGUGUAUGGACAGCUAUCUCUCGAGCACAGGUUUAGCAAUGGGAAAAUAAAAUGGAGCACCUAACAACGCAUCUUCACAGACCAAGAACUACGAGAUCGCCCCUUUCAUUCUGGGGUGACGGAGGGAUCGUACCAUUCGAGCCGUUUUUUUCUUGACUCGAAAUGGGAGCAGGUUUGAAAAAGGAUCUUAGAGUGUCUAGGGUUGGGCCAGGAGGGUCUCUUAACGCCUUCUUUUUUCUUCUCAUCGGAGUUAUUUCACAAAGACUUGCCAGGGUAAGGAAGAAGGGGGGAACAAGCACACUUGGAGAGCGCAGUACAACGGAGAGUUGUAUGCUGCGUUCGGGAAGGAUGAAUCGCUCCCGAAAAGGAAUCUAUUGAUUCUCUCCCAAUUGGUUGGACCGUAGGUGCGAUGAUUUACUUCACGGGCGAGGUCUCUGGUUCAAGUCCAGGA |
|
[ reference structure ]
|
..........................................((((.((...(((.(((((((.(((...)))(((((..........)))))..((((.(((((...((....((((.....))))...))...........)))))....................................................))))..(((..(((((((.((((.......))))...((((..........(((((((.......))))...........................(((((((.(((((((((.........)))))))))........)))))))))).........................)))))))))))...)))...))))))).)))...)).))))..(((((((.........)))))))....(((((.......(((((..................................))))).....))))).((((((.....................................................................................................))))))...((((((((((((((.....)))))..)))))))))..((((((.................................................................)).))))..............................
|
| [ predicted structure ] |
.........((((.......)))).((((((.......(((((((((((((((.(((((..........)))))...(((((.(((((.(((.((((((((...))))...)))))))))))).)))))))))))).....)))))))).((((((((........((((((((....))))))))....)))))))).....))))))...((((((((..........[[[[[.........))))))))..]]]]].....((((.[[[[[[)))).......]]]]]]....(((((((.(((((((((.........)))))))))..[[[[..)))))))........]]]]..((((................)))).........((((.............[[[[[..(((((((.........)))))))..))))..]]]]]...(((((((((((((((((.......)))..)))))).))))))))....(((((((((...)))))))))((((.[[[[[[)))).......]]]]]].....(((((.....(((....))).......(((((....)))))..)))))(((((..((((....))))....((((((((((((.....)))))..)))))))..[[[[...........))))).....((((((....)))))).]]]].....((((.(((...))).)))).....(((((..[[[[)))))...........]]]]....
|
|
CRW_00732
|
[ FASTA input ]
|
UCGGGUUGCUAACUCAACGGUAGAGUACUCGGCUUUUAAGUGCGGCUAGUCUCUUUUACACAUAUGGAUGAAGUGAGGGAUUCGUCCAUACUCUCGGUAAAGUUUGGAAGACCACGACUGAUCCUGAAAGGGAAUGAAUGGUAAAAAUAGCAUGUCGUAUCAACGGAAAGUUCUGAGAAUAUUUCAUUGUUCCUAGAUGGGUAUAAAACCGUGUUAGAAUUCUUGGAACGGAACAAAAUAAAGUUGGGUCGAAUGAAUAAAUGGAUAGGGCUGCGGCUUCAAUUAAAUUAUAGGGAAAGAAAGAAAAAGCAACGAGCUUUUGUUCUUAAUUUGAAUGAUUCCCGAUCUAAUUAGACGUUAAAAAUUUAUUAGUGCCUGAUGCGGGAAGGGUUUCUUGUCCCAUGAGUGGAUUCUCCAUUUUUUUAAUGAAUCCUAACUAUUACCAUUUUCUAUUACGGAGAUGUGUGUGUAGAAGAAACAGUAUAUUGAUAAAGAAAGUUUUUUCCGAAGUCAAAAGAGCGAUUAGGUUGAAAAAAUAAAGGAUUUCUAACCAUCUUAUUAUCCUAUAACACUAUAACAUAGACCAAUUAAACGAAACGAAAAAAAAAAGAGAUGAUAGAGAAUCCGUUGAGAAGUUUACCUGUAUCCAAGGUAUCUAUUCUUACUAAAAUACUUUGUUUUAACUGUAUCGCACUAUGUAUCAUUUGAUAACCCUCAAAAUCUUCCGUCUUUGGUUCAAAUCGAAUUUCAAAUGGAAGAAAUCCAAAGAUAUUUACAGCCAGAUAGAUCGCAACAACACAACUUCCUAUAUCCACUUAUCUUUCAGGAGUAUAUUUAUGCACUUGCUCAUGAUCAUGGUUUAAAUAGAAAUAGGUCGAUUUUGUUGGAAAAUCCAGGUUAUAACAAUAAAUUAAGUUUCCUAAUUGUGAAACGUUUAAUUACUCGAAUGUAUCAACAGAAUCAUUUUCUUAUUUCUACUAAUGAUUCUAACAAAAAUUCAUUUUUGGGGUGCAACAAGAGUUUGUAUUCUCAAAUGAUAUCAGAGGGAUUUGCGUUUAUUGUGGAAAUUCCGUUUUCUCUACGAUUAAUAUCUUCUUUAUCUUCUUUCGAAGGCAAAAAGAUUUUUAAAUCUUAUAAUUUACGAUCAAUUCAUUCAACAUUUCCUUUUUUAGAGGACAAUUUUUCACAUCUAAAUUAUGUAUUAGAUAUACUAAUACCCUACCCUGUUCAUCUGGAAAUCUUGGUUCAAACUCUUCGCUAUUGGGUAAAAGAUGCCUCUUCUUUACAUUUAUUACGAUUCUUUCUCCAUGAAUUUUGGAAUUUGAAUAGUCUUAUUACUUCAAAGAAGCCCGGUUACUCCUUUUCAAAAAAAAAUCAAAGAUUCUUCUUCUUCUUAUAUAAUUCUUAUGUAUAUGAAUGCGAAUCCACUUUCGUCUUUCUACGGAACCAAUCUUCUCAUUUACGAUCAACAUCUUUUGGAGCCCUUCUUGAACGAAUAUAUUUCUAUGGAAAAAUAGAACGUCUUGUAGAAGUCUUUGCUAAGGAUUUUCAGGUUACCCUAUGGUUAUUCAAGGAUCCUUUCAUGCAUUAUGUUAGGUAUCAAGGAAAAUCCAUUCUGGCUUCAAAAGGGACGUUUCUUUUGAUGAAUAAAUGGAAAUUUUACCUUGUCAAUUUUUGGCAAUGUCAUUGUUCUCUGUGCUUUCACACAGGAAGGAUCCAUAUAAACCAAUUAUCCAAUCAUUCCCGUGACUUUAUGGGCUAUCUUUCAAGUGUGCGACUAAAUCCUUCAAUGGUACGUAGUCAAAUGUUAGAAAAUUCAUUUCUAAUCAAUAAUGCAAUUAAGAAGUUCGAUACCCUUGUUCCAAUUAUUCCUUUGAUUGGAUCAUUAGCUAAAGCAAACUUUUGUACCGUAUUAGGGCAUCCCAUUAGUAAACCGGUUUGGUCCGAUUUAUCAGAUUCUGAUAUUAUUGACCGAUUUGGGCGUAUAUGCAGAAAUCUUUUUCAUUAUUAUAGCGGAUCUUCCAAAAAAAAGACUUUAUAUCGAAUAAAGUAUAUACUUCGACUUUCUUGUGCUAGAACUUUAGCUCGGAAACACAAAAGUACUGUACGCACUUUUUUGAAAAGAUCGGGCUCGGAAUUAUUGGAAGAAUUCUUAACGUCGGAAGAACAAGUUCUUUCUUUGACCUUCCCACGAGCUUCUUCUAGUUUGUGGGGAGUAUAUAGAAGUCGGAUUUGGUAUUUGGAUAUUUUUUGUAUCAAUGAUCUGGCGAAUUAUCAAUGAUUCAUUCUUAGAUUUUCUAAAUGGAAAUUUGUUUCUAAAUGAUGAAGAGAUAAAAAAAUUUCACUAUUCUGAAAUGUUGAUUGUAAUAGUAAUUAAGGGGUAAAUCAACUGAGUAUUCAACUUUUUAAAGUCUUUCUAAUUUCUAUAAGAAAGGAACUGAUGUAUACAUAGGGAAAGCCGUGUGCAAUGAAAAAUGCAAGCACGGCUUGGGGAGGGGUCUUUACUUGUUUAUUUAAUUUAAGAUUAACAUUUAUUUUAUUUAACAAGGAACUUAUCUACUCCAUCCGACUAGUUCCGGGUUCGAAUCCCGGGCAACCCACUAGCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
............................................(((....((((((((((((...(((((..........)))))((.(((........))).))...(((((((((...(((...............)))...........)))))........................................................................................))))....((((((..((((.((((....))))...(((....................((((.......)))).((((.......))))..((((((..(((((................))))).........)))))).......................................)))))))...))))))......................))))))))))))...)))...(((((...................)))))....(((((.......((((...............................................................................................................................................))))......))))).((((((((...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((.......................................................)))).))))..............................................
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((...............(((((.[[[[....)))))....]]]].......(((.[[[[[[[[[[))).....]]]]]]]]]].....(((..[[[[......)))..]]]]..((((....))))..............(((((((((((....))))...[[[[[[[[[[[......((((.(((....))).))))...)))))))..]]]]]]]]]]]............((((((((...........((((((((((..........................(((((...((((((.....)))))).)))))...((((((((((((((.....(((((.((((((.......)))))).))))).))))))(((.[[[....)))..]]].((((((..............)))))).......((((((((((......))))))).)))....((((((((......[[[[[.......))))))))....]]]]]....(((((..((((((((.......(((((((((..((((((.((((...))))..((((...))))...........................)))))).)))).)))))..((((((...(((((.......)))))....)))))).((((....))))))))))))..))))).....(((((((((((.......((((.[[[[[[[[.)))).(((.....)))......]]]]]]]]..(((((...((((((.((((((((.....((((..........(((((((......))).....))))((((....))))..)))).....))).)))))))))))(((((......))))).)))))....................(((((.[[[[[.)))))..]]]]]........((((...((((((...(((((((((..............)))))))))..((((((....)))))).))))))....))))........))))))))))).....(((.........[[[[[[[[...)))......]]]]]]]]....(((........((((....)))).....((((((....)))))).........)))....))))))))....(((...[[[[[[)))............]]]]]]....(((((((.....)))))))....))))))))))..........((((....[[[[...))))..]]]]...........(((((((............((((....((((.......))))....))))(((......)))..)))))))............................((((((((((((((...........(((((((((((((((((((..((((..((((((......)))))).............(((((((((((((((((((((((((((((...(((..(((.((((....)))).)))...))).....)))))..........((((((((.....(((....)))........((((((..((((...))))..))).)))...)))))))).....)))))))))))((((..(((((((((((.....(((((.........(((((((...)))))))........(((.(((((......))))))))...)))))............((((((.(((((...........(((((...(((((((.((((((((((........((((((((((.......((((((((.....))))))))......))).....((((((((((.....))).((((((((......))))))))...............))))))))))))))....(((...))).)))))...((((.((((((.(((.((((((...))))))..))))))))).))))(((....))).((((....)))).(((((((((....((((........))))..))))....)))))..(((((((((....(((((...(((((....)))))..))))).....))))).)))))))))...)))))))......)))))))))).))))))...........)))))))))))...))))((((((((..(((((((((((((......)))))))))))))....(((((((((((((((((((..(((....))).))))))..))))))))((((((....)))))).....(((((((((.....))))))))).))))).....)))))))).........((((......)))))))))))))))))(((...)))..))))...........))))))............(((((((..........))))))).......)))))))))))))((((((((((((........)))..))))))))))))))))))))))).((((((....(((..((((.......))))..)))...))))))...............))))))))....(((((.......))))))))))))..........
|
|
CRW_00733
|
[ FASTA input ]
|
CACAAGCACUAAGGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACUCGUUUACACGCGCGCCAAUGUUUUUCAAGGGAGUUCAUCAUACAAUCAGAAAAAUUGAUCUUGUUGAGAAAUCGAUGUCUUACUCCAUAACUUUGAGGGAACCAUAGCCUGACAAAGAGUUCGGUCCAAUUUGGACGCCCAUUUAGGAGGUGCCAAACAGACCCCAUCAUUGAUUUGAGAUCUUGAUAAGGUGAAUACCCAGUCUAUUCAAUGCUAGGCAUAAUGAGUAUAAGGACCUCAAAAAAAUCUCUUUUCGUCAUAUGAACUUUAAGGUGUAUGAAGUUUCAUAUUUGAUUUUUUCAGCAGAACGAUAGAGACUUCAUUUAACUUAGGUUGAUCUAGGCCAGAGACAGACCUACGUCAAGAUAAUCCCACCUUUGAAACACUUUGGUAAUGCUCCCAAAUAAUGAAUCAGAGCACAUGGAGCCAUUUCCUUAUCUUUUUUUCUGUCAAGAAAAAAAAUGGCAGACUAACUGAUAUUUAUAUCAGUUAAUGAAAGAGCCCAAUGCAAAAAAAAUGCAUGUUGGGUCUUUGAAACAGUUCAGAUCAUUUUAAUAAUAAUAAGUUUGACCUGUUUUACCGAGAAGGUCUACGGUUCGAGUCCGUAUAGCCCUAUAAA |
|
[ reference structure ]
|
......................................................((((....(((((((((.....((((...............))))...........(((..((((...(((((......)).)))...........)))).........................................................)))........(((((..(((.........((((...........................))))...........((((..((((.(((((((((((.........))))).)))))).................)))).)))).....................................)))...)))))..........)))))))))....))))...(((((...............)))))......((((((......((((..........)))).....))))))..(.(((((((........))))))).)....((((((((((((((...)))))..)))))))))..(((((((.(((((...................))))).))))))).........................................
|
| [ predicted structure ] |
....................((((.[[[[[[.))))....(((......))).]]]]]]..........(((((........................(((.[[[[)))...]]]].....)))))...(((((((((....((((...((((((((((...((((...(((((.((((.........)))))))))..))))..........((((((.(((((((..(((....)))..)))((((((((((...))))..))))))..)))).)))))).....))))))..))))))))..)))))))))..((((((((((.(((((((.....))).......))))))))))))))....(((.((((.[[[[.)))).)))...(((....))).]]]]...................(((((...[[[[[)))))..........]]]]]...((((....))))...(((.....[[[[[[[))).......]]]]]]].(((((((((....)))))))))...(((((.(((((((((.......)))..)))))))))))(((((((.((((((....(((....)))...)))))).))))))).....(((.....[[[[)))....]]]].............
|
|
CRW_00734
|
[ FASTA input ]
|
AUUGCUAUGCUUAGUGUGUGACUCCGUUGGUUUUUUAGGGUUAGGAUUAAAAAAGACCAGCCCACAUAGUAUGAACUAAAAACUAUAGAACUAAUAACCAACCCAUCACUUCGCAUUAUCUGGAUCUAAAGAACCAGUCAAGAUAUGAUAUAUAGGUCAUAUCUUUGUAGCAACUGAAAUCUUUUGCAUAAACAAAAAAGGAAAUCUGAUUCUAAGUUGUAAAGCAAAAUAGACAAAAAAGAUGUGGAUAAAUGGAAGGAUGAGAGAAAGAGAGAAAAAGAAUACCAAUGAUAUAAAAUUCCAAUAUGUAAGGUCUAUGAGUAAUCUCAUAAAAGGCAGUGUAAUAAAGCAUCAAUACGCAUUCAUACCAUAAUAAAAUGAAUCUUCUUAUAGAAAUAGAACAAAAAAUCAAGAGCUUCGAGCCAAUAAAGACUGAGAAGAUUGACUCAAGAACCAAUUUCAUUCUGAGCUCCAUUGUAGAAUUCGGACCUAACCAUUAAGUAAGAAGUGAUGGGAACGACGGAACUUGUGAAUGCAAAAGAUUCUAUUGAAAAAGGAAUCUUAAUGAUUCACUGGUCGGGAUGGCGGAACGAACCAGAGAUUAAUUCAUGUAUUCGGAGAUCUGAGAAGUCACGAGUUAACCCUACAAAUGAAAUAGGGAUUGAAAGAGUCAAUAUUCGCCCGCGAAAACUUUUUUUAUUGCAAAAUUUAGGACAAUACAAUAAAGGACAAAAUAAGGAUUUGGUAUAAUAAUACAAUUUUUUUUUAGAUUUCUAUUUAUAAAACUCAAAAGUUUAGUUAUCUAUUCAAACAAGAUAUACAAAUUACUAAUAGAUUGAAUGAAAUCUCAAAGAAUCCCACGUUCAAGGUAUUACUCAGUAAAUACAUAUAUAUCUUAACUUAAGAUUGACUAUUCUAGCUUAAUUCUAAUUAAAUUUUUUGAAUCCUUUUAUUCGCGAGGAGCUGGAUGAGAAGAAACUCUCACGUCCGGUUCUGUAGUAGAGAUGGAAUUCAGAAACAACCAUCAACUAUAACCC |
|
[ reference structure ]
|
......................((.((..........................................................................(((((((((((......................(((((((((((((((......)))))))).))).....)))).................................................................................................................................((((..((((..(((((.............((((((.......................................................................((((((.(((.((((.............)))).)))..................))))))))))))...)))))))))...)))).......)))))))))))....))))...((((((......(((((((...........)))))))......)))).)).......((((((.......................................................................................))))))((((((........................................................................................................................................................................................................................................................................))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))....((((.(((((.............)))))..)))).....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((.[[[[[..........(((((((((((..(((....)))..)))))))))))...)))))))...]]]]]......................(((((((((((......(((........)))..(((..((((((((((......))))))))))....[[[[))).......]]]]................((((...((((..((((...))))..))))......))))..............(((.......................................)))....(((...(((((((((....)))))...)))).[[[[[.....)))....]]]]]((((((...........))))))...............................(((...)))..........((((.[[[[[[.)))).....]]]]]].((((((...[[[....))))))..]]]................)))))))))))..(((....[[[.[[[[[[....[[[[[[[[.))).....]]]]]]]]....]]]]]].]]]......((((((............(((((((.....(((((....))))).......)))))))(((((.........)))))(((((.....))))).))))))((((((....((((((((((....(((......))).))))))))))......(((((((((((((....)))).....((((.(((((....))))).))))...(((((((((((((...........((((((((....(((((((((..(((((((...(((...)))......)))))))..))))....))))).......))))))))...(((((.....(((...))))))))...))))))))))))))))))))))...)))))).((((((((((((((......)))..)))))))))))...((((.(((((.............)))))..)))).....
|
|
CRW_00735
|
[ FASTA input ]
|
UAUCAAUAUCUCUACGUGUGAUUCGGUGAGACCUAAAAUUUCUCCAAAUUCUUUUCUUUCUAGAAACAAAGGUAAAAAGAUUUGAUUGAAUAUAUAUAUUUUCAUUUUUAUUCAGCAUUUGGGUUGAUGAACUAAACCAGAUAGUUAUAUGAGUGAAAGAAAACGGCUUCUAAAUUUGCAGUAAAAAGGUUGAGUCUCAUUUCCUAUGUACAAGAAUCAAAUGGUGAAAAAAGUAAACAUAAGCAAUAGAGAUUGUUUACCCCAAGAUUGGUGAAUUGUCAUGAUAGCUUGAAGCGGGUUCAAAAGAUCAACUGUAUGGAGUUUUUACUGUCUAUUACCAUAGAUGGAUUUCCACAACGGGAGGUUGAAAGCAAAAAUGAGUGGAUGGUUAGGAAGACCAAGAUACACAAAGGAUUAGUAAUUGAGAUUAUGUAAGUUAUCCAAGAGGAUAUUUCUGUACAUAAAAGGAAUUCGAAUUGGGGCUUUACGUUCGUAGAAAUGAUCAAGAAGUACUCCCCAUGAUUCUGAUCCAGAGUAUGUUCCUAUCCACUGAGUAAGUAAAUAACUAUCAAGAACGAAGUAAUCUUUUACUUUGGUUAAAGGCCCUUUUUCUGAGAAAGGAGAAUAGGAAUGAAAUAAAAUAGAAAUAGAAAGAAAAGAAUCUAAUUGCAAAAGCAAAAAGGGGGGAUGUCUUUUUUUUUCUUACUUUUUUCUUUUUUUGUUUUUAUUCUUUCUUUCCUAUAAUUCCAUUUUGAUUUCUAGUUCGAGAGAGAAAUUUUUUGUCAUGAUUCAUGAACUAAUGGACUCUCUAAUUUUUUUCGUAAUUGAGAAUUCGAGGUUGAAAUGUAUAUGUGAUAUUGCUAUAAAGCGCAUUUUAUUUAAUGAUAAGGUUAUUAAUCAACAAAGAAAAAUGAAAAUUCUUAAAAGAUGAGAUCAAUUCAGAAGCCCGUAUUUAUUAGUUUUAAAUAUAGCAGACAGAAUUCCAUUGGUCUAAUUUGGGACCUUAGGAUAGAUUUUUACUCUAUCUGACAAACAUAUCAAGAUAAAGAAUAGGAAAGGGUCCUUAGAUUUAUUUGUGACCUCUGAGGAGCCGUAUGAGAUGAAAAUCUCACGUACGGUUCUGUAAUAGCGAUGGGCACAGUGAUGUUAUCAUCGACUAUGAUUA |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((.(................................................................................................................((((((((((((((..........................................)))))((((..................))))................................((((((((....((((....)))).....))))....))))................................................................................(((((..((...((....))...((((.....(((((((........................................................(((((((((((...(((......)))....))).......))))..)))))))))))...))))...))...)))))..........)))))))))...).))))....(((((((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))).......(((((....((..(((((((.......))))))).)).....))))).....(((........................................................................................))).....(((((((((((((((....)))))..))))))))))...((((((((((..(((....)))..)))))).)))).....
|
| [ predicted structure ] |
........((((...............)))).................((((..[[[[[..))))..]]]]]......(((((..((((((.......(((((((((......(((((((((.(((......))).)))))).)))....)))))))))......(((((....(((((.(((...(((.(((...)))...)))...))).....(((.....))).....)))))...((((......(((.(((((((........))))))).)))......)))))))))..)))))).)))))...........(((((((((((((((....))))))))...[[[[[..........)))))))........]]]]](((((.....)))))...........................((((((((((.((((....)))))))....)))))))..(((((((....(((((...(((.(((........[[[[[.))))))..)))))......]]]]]...........................(((..[[[[)))......((((((((....))))))))]]]].(((.[[[[[[)))..]]]]]]...(((((((.((((...((((((((((((((((.(((((.....((((....)))).(((((((((.......)))))))))...))))).)))))))))))))))).)))).))))))).....(((((..(((((.(((((.(((((((((...))).(((((...))))).........))))))........(((....)))))))).)))))..)))))...........((((((((((((.........((((((((...))))))))..............((((...(((((.....)))))....)))).................))))....))))))))...)))))))...(((((..[[[[)))))...(((((((.......)))))))..]]]]....((((((((((....((((.....))))....))))))).))).......(((((((((((((((....)))))..))))))))))...((((((((((..(((....)))..)))))).)))).....
|
|
CRW_00736
|
[ FASTA input ]
|
GACGUAUACGAAGGAGUGCGGUUCGUUCGAGAAAUUCCUACCUCUCUAUCUAUCUCUGAGAUGUUUGGAUUUUUCAAAACUCCAUGGACAUGCAGAAGAGAAAUGCUAUCCCCACUCGGACCAAGACAGAACUUUUACUUGUUCAAAUAACAAUUAAGGUGAAGCAGGGUCAGGAACGACGAAUCUCUUUAUGAUAAACAGAUCCAUUUUGCAAGUUCGUUAUUACGGGUAGUUCCUACAAAGGAUCGGACUAAUGACGUAUACAAUACUUGAAUUCUCGAUGUAGAUGCUACAUAGUUGGUUCUCAUCCUUCAGAGACUACGAGUGUAAUAAGAGCAUCCGUCGACAAAAGGAUCACCCUAAGAUGAUCAUCUCGUGGCUAUUGAGAACGAAUUAAAUCAGAUGGUUCUAUUUCUCAAUCUUUCUGACUUGCUCCUACGAAACCAAGGUCGAAAAGAUUGAAAAAAUCAGUCAUUCACAACCACUGAUGAAGGAUUCCUCGAAAAGUUAAGGAUUAGUAAUCCUUUUUAGAAAUCGAAUGGAUUCGGUCUUAUACAUACGCGAGGAAGGUAAUCAAAAAAGAAAGAAAAUGGGUUCUUCUUUCUUUUAUCACUUAGGAGCCGUGUGAGAUGAAAGUCUCAUGCACGGUUUUGAAUGAGAGAAAGAAGUGAGGAAUCCUCUUUUCGACUCUGACUC |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((.....((((.(((............................))).)))).....(((.((((.(((..((..........)).((........)).(((((....(((((((((((((.....)))).....))))....)))))....................................))))).......((((((..((((...((((.................(((((..........................((((((.....((.((((.............))))))............))))))))))).....))))..))))...))))))......))).)))).)))..))))....(((((.(((((.......................................................................))))))))))......(((((((...........................................................)))))))(((......(((((((((((.........)))))))))))...)))..(((((((((((((((....)))))..))))))))))....(((((((((....((....))...)))))).)))......
|
| [ predicted structure ] |
..(((.......[[[[[)))........(((((((((.....((((...........)))).....)))))))))...]]]]]..(((...(((...[[[...)))..)))...]]].((((......((((.[[[[[[[))))............]]]]]]]....)))).....(((((.((((.((((...)))).))))...........((((.((((((((.(((((.......((((((.((((((((...(((.....(((((((....)))).))).....)))...))))))))..)))))).....)))))...))))))))))))...))))).....(((.[[[[))).((((....)))).]]]]..((((((((.........[[[[[.........))))))))...]]]]]...................(((((((((((.((((...[[[[[[..)))).....]]]]]]......(((((((.((((...((((((...))))))))))....((((((....))))))............))))))).......................(((((((((((((((((.(((....(((((((((((((((....)))))..))))))))))...)))..)))))))).)))))))))))))))))))).......
|
|
CRW_00737
|
[ FASTA input ]
|
UUCCGGAGUAUGAGUGUGUGACUUGUUAUAAUUGAUCCUAUUGAUAGUACAGAGAAUGGGUCUGUCAUCUUGAUAGAGAUGGUUCUACUUCGUCAGAUAUUUAUUCUAAUAUUUGGAACACGAAAUAGAUUAAGAAAUAUUUGAACUAUGAUUCAUACUUAAUAUUCAGACCUCGUGUCCGGGCUCCAAAAAAUUUUCAAACAAAGAAUUCUAAUUUCUAAAUCGAAAGAUUCUUUUCUUUCAACCCCUAUUUAUAUUUUGACCAAAAGCAAAACCUUUCUUUGAAUUUUUAGUCAUUCUAUUUAUUCAGGGAAUAAGUGAUGAUCCGAGGAUUCUUACUCAGGGAAUCCUUGAUUUGAUUUAGGUUAGGUUUUUUUAUUGAAUCAUCGUGGUUCUAGUAUGAAUCUGAGGUUUUAAUCGAUUCAUAGGGUCUUAACAAGAGAAUUCCUAUCAAUAAUAAAGAAAACAAAUAAUAAAAGCCAUAUUCCACAAAAACAAAUUCUAGAAAGAAAUAGGGAAAAAGAGAAUUCAAGAGGCCCAUAAGUAUCAAAAUAAAGAUAAAGACGACUGCGCCAACUUGAUAUUUUGGUAUUAUCGCCACAAAGAAGAGCUUUCGGAUUUUCCAGAGAAGAUGGGAUCAGAACUUAAUAAAUUUAAAACUUUCUAUUCCAUAUCCGUUGCAACUAGUAUUUGGGUGUUUUUGCUUGAGCUGUACGAGAUGAAAGUCUCAUAUACGGUUCUCAGAGGGGGAGUUCCGCCUAUCUCAAUAA |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((((......((((((((.......(((...........)))((((((....))))))(((....(((((((((((((......))))))))....)))))...)))..........(((((((..((((((((((...........(((((.................................................................................................................................................(((((.(((((((((.........))))))))).............................))))))))))....))))))))))...)))))))........))))))))..))))))....(((((((............................................................)))))))..........((((..(((..................................)))...))))......((((..............................................................................................................)))).((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((.......))).)))).....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((............((((((...(((((((((((((((((((.......((((((((((((((....))))))).((((.(((((((((((((......))))))))....))))).))))......((((((((((......)))).....)))))))))))))...(((.(((((........(((......)))(((((((..((((......((((((......))))))....(((((((...(((((........))))).((((((..((((((.(((.....))).........(((((((((...((((.((((((((((.....))))))))))))))..))).......(((((((((((((((((.(((.(((((......))))))))(((....))))))))((((((((((.....))))..)))))).................))))).))))))).))))))........)))))).)))))))))))))))))...)))))))....))))).....((((........)))).....))).....(((.........)))))))))))..............((((.(((...)))))))..)))))))))))....)))))).............))))))(((((((..[[[[........)))))))..]]]]..((((((((.(((((....)))))...)))))))).....(((.[[[.....)))..]]].....
|
|
CRW_00738
|
[ FASTA input ]
|
AUGGAUUAUGGGAGUGUGUGACUUGAACUAUUGAUUGGUCUGUGUAGAUAUAUGCCUGCCACAUGGGAAUUCACAACCAAAUGUGUCUUUGUUCCAAUCGCCGUGUAAGCCCUAUACAGAGGAUAGGCUGGUUCGCUUAAAGAGAAUCUUUUCUAUGAUCAGGUCCGAAUCAUGUUGUACAUGAGCAGGCUCCGUAAGAUCCAGUAUAAGUGAACUAGAUAAAACGGAAUCAAGAUUCCGUUUUAUCUAGUUCACUUAUAAGAUUAAAUAGUAUGUAAAUGUAUUCAUUUCCUCUGCAGUGACACGAUCAAUACUACUAUCGGAGUGAAACAAGGGAUCUAAAGAAGAAGAGAGGCUAGACUAUAUUAGUAACAAGCAAACCUUGUAUGUGUAUCUCCAAAUAUUUUGGAGAUAAAUACCAAUUAGAAGGUCUGAGACGACCCAGAAAGCACUUGAUCAUAUCAUGAUCUGAUUUGUAAGCCUACUUGGGUCUUGAGUAUUUACUUGUAAGAACGGAAUUCUUUGUUUUGUAAUGGAUAGUUGCAACUCCGUAAAAAAGAAUUCAGUCAAAUUUUUCUUACAUUGAACCAUUCCUAUAUCAUAUAUGUGUAUGUGUAAAUACAGGUACCAUAUAUAUAUUUUAUAUGGAUAUAUGGAGUCAUUUGGUUCUUUUUAUUCUUGCUCGAGCUGGAUGAUUAAAAAUUAUCAUGUCCAGUUCCCUCGGGGGAUGGAUCUAUAAGAAUUCACCUAUCCCAAUAA |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((...(((((((........((((........))))(((((................)))))((((....((((((......................)))....)))..........))))...((((((..((((.............................(((((..........((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))).......((((((......((((...........))))................)))))))))))..........))))...))))))................))))))).))))....((((.((....((((((((((...)))))))))).........)).)))).........(((((....((..(((.....................))))).....)))))...(((((....................................................................................................................................................................................)))))((((((((((((((....)))))..)))))))))....(((((.(((((.(....).))))).)).)))......
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((((..(((((.....((((((((((((..(((((((((((((((((......(((((.((((......)))).....)))))....((((((((.....))))).....(((((..(((((.........)))))...))))).....))).....((((((...)))))))))))).......((((...((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))).)))).....))))).(((((....)))))..))))))..))).))))))))).......((((((((((((((((((......((((....(((((..((((...)))).((((.....((((((((...((((((((((...)))))))))).)))).......))))((((........))))........((((((...))))))....)))).))))).......))))((((....))))...........))))))))))))(((((.....))))).)))))).............))))).....(((.......))).))))))))))..(((((((.((((.(((....))).)))))))))))..(((((((((....))))))))).....(((((((.............((((((((((((........)))..)))))))))......[[[[[[[......)))))))...]]]]]]].....
|
|
CRW_00739
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUAUACUGCGAUGUGUGAUUUGAUCGAAAUUCUGAUUUUACAGACUCGGAAGGAGAAACUGUCAUCCCAGUCAAUCCAAUUGGGAUGCCCUGGACCUGACAUGUGCACUUGGAAAGAGUAACAUGAAGCUCAGAAUUGGGGUGUAGUCAAUACUCCCAAAUAAAAAGGGAAUUGAUCUAUGGUCGAUUUCGUAACAAAUCAAAUAAAGAGGAAUUUCUAUUUGUACCUCGUAAAAAAAGCUUUUUAUUUUGUAGAAUGAAACAUUUCCUUUCUUUUCGUGGAAAGAAAUUAUGUUCAAGUAAGCAAAUAUGUCAUGGUUCUAGGAGUCUAUCUAUCGCGUAUAGACUUUAAGGGCGUGGUGGCCUAACCAUCGAGGUGAAGUCGGGACCUAAAAGAUCGAAUGGAACAAUAUAUAGACAAGUAAAUCCCUUAUGGGUUCCAAGGUAUUCCUUUAAUUAUUAAGAGUUAAGGGAUUUAUCAUUCAAAGGGAAGUAGACUACUCAAGAAUUUUCUAUUUUAUUUGUUGGAAUUGAAUUUGAAUAAAGAAUUAAUAGAAGACGGAAUCACUGAAAUCUUGUUUCGUCUUCACUGGGAACUUGAGUAAGGAGUAGACCUUUUUAUUUUGGGAUUUUCUAGAGUUUGAAAACGAGAACUCCUUUCCUUAUUUGGUGUACCUACUUGAGCCGGAUGAAAGGAAACUUUCACGUCCGAUUUUGAAGGGGGGGAGAUCCUAUAGAAUCCUAUCCCAAUUU |
|
[ reference structure ]
|
....................(((((........(.(..((((((((...............))))((((((.............))))))((((...((((((((((..((((.....)))).)))))....)))))(((.((((((.....)))..))).)))....))))..(((((((..((((.........................(((.............(((((...................................................................................((((((..((.(((((((.........)))))))))................)))))))))))....)))..))))....)))))))..))))..).)......)))))...(((((..((((((((.............................))).......))))).))))).......(((((((...((((...............................................................................))))..)))))))....(((.................................................................)))..((((((((((((((....)))))..)))))))))....(((((((..(((((..)))))))).)))).....
|
| [ predicted structure ] |
....(((((..[[[[))))).....]]]]...((((((((((((.(((.....[[[.......)))((((((((.......))))))))..]]](((((((((((((..(((((((..((((........)))).(((...(((.(((.....))).)))((((((((((((((((((((...)))))))))).................(((((((....)))....))))..........))))))))))(((........))).))).((((((((....)))))))).....)))))))......)))))))).)))))..(((((((((.........)))))))))..(((...[[[[[)))..]]]]]...))))))))))))..............((((((....(((......)))..[[[[[[....)))))).((((.((((((((((......))))))))))..)))).....]]]]]]...((((....(((((.(((((((((...((((((.((((...)))).)))))).....)))))))))(((.....)))...)))))....))))....(((((....((((((((((.....))))))))))(((((((((.(((.(((....))).....(((((((((((....((((....)))).....((((((((((....)))))..)))))......)))))))))))...))).))))))))))))))....
|
|
CRW_00740
|
[ FASTA input ]
|
UUCGUUUGAAACGAUGUGGUAGAAAGCAACGUGCGACUUGAAGGACAGGAUCCGUUGUGGAUUUGUACAUCCACCAUUUUAUGUAGGAAUGAAGGUGCUCUUGGCUCGACAUCAUUGGUUCUGUUUCAUUAGAACCCCUCUUUUUUGUUGUCUUGGAAUGUAAAUAGUCCAUGAUGGAGCUCGAGUAGAAAGUAUUAAUUUAUUUCUCGGGGCAAGAGUCUAGGGUUAAUGCCAAUCAAUAAAAAAAUUGGAACAACUUCGUAAAUAUAUUUUCGGUAUGGAAAUCGAAAGAAUCCAAUUCGAGCAAGUUUCCAAUUCAAAAAUUCCUUGGAAUUGAUUCAAACUUUUCGAUCCAAAGUGUUUCACGCGGGAAUCCAUCGUCUGUAGGAUUCUUUCAUAGAAAUCGCAAAAGGGGUAUGUUGCUGCCAUUUUGAAAGGAUUAAAAAGCACCGAAGUAAUGUCUAAACCCAAUGAUUUAAAAUAAAACAAAGAUAAAGGAUCCCAGAACAAGGAAACACCUUUUUUAUUGUCUUAAUAACUGGAUCGAACUGAAGAAUCCAAAUCCAUUUUAAACGAGACAAACAUAAAAGGAGGAAAGACCGCUCAAUAAAUGAAAUUGCCGAAAGAUUUUCCUUUGAACUGUUUGAAAGUUAUCCAACUUGAGUUAUGAGAGUACGAAUGGUUUCUUUUUCAUUUUCAGGAAGAAAGAAGAAAAAAAAAGACUUACAUCUUUAAUUGAUUUGAUCAUUUUAUGGACCCAGUUGUCAUUUCUUAGAUAGAAUUCCAUACAGAGAUAAAACCUCGAAUCAAUCAUUUUUCUCGAGCCGUACGAGGAGAAAGCUUCCUAUACGUUUCUAGGGGGGGUGUUGUUCAUCUACAUCAAUCCCAAUGAGCCGUCUAUCGAAUCGUUGCAAUUGAUGUUCGAUCCCGAAGAGAAGGAAAAGAUCUUCGGAAAGUGGGUUUUUAUGAUCCGAUAAAGAAUCAAACUUA |
|
[ reference structure ]
|
....................................((((.......((((((...((((((......))))))((((((...........))))))((((...(((((((((..(((..................................................))).))))....))))).......................))))...((((((..((((.((....))............((((....(((((................................................................................................((((((..............................................(((((((........))).))))............))))))))))).....))))))))...))))))...................)))))).....))))....((((......................................................................))))........((((((...((((....................................)))).....))))))...(((...................................................................................................................................................)))((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((((.........)))))).)))).......................................................................................................
|
| [ predicted structure ] |
..........(((.(((........))).)))..........((((.((((((((((((((((..((((((((.((((((.....)))))).....(((...)))..((((.....(((((((......)))))))............)))).))).)))))...)))))))))))))((((((((.((((((((..((((((..(((.((((....)))).)))......(((((..........))))).........))))))))))))))....((((...........)))))))))))).....))).........((((((((((.((((..........))))))))..((((...)))))))))).....))))...(((((((((......((((.(((((..((((...[[[)))).)))))....)))).....]]].......................................(((((((..[[[[[.((((.((((.....)))))))).))))))).......]]]]].....)))))))))....((((((.........((((((..(((((((((.........((((.......))))........)))))))))....)))))).(((((....)))))....(((....))).))))))....((((((.[[[[[.))))))..]]]]].....(((((......))))).((((((((((......((((((.....(((((........)))))...))))))..[[[[.......))))))))))......]]]](((.((((..(((((..[[[))))).)))).)))..........]]].((((((.((((((((..((((((.............))))))..))))))))..))).[[[[[[[)))........]]]]]]].(((.[[[[[)))..]]]]](((.....))).......
|
|
CRW_00741
|
[ FASTA input ]
|
AGUUUAGUGGUAAAAGUGUGAUUCGUUCUAUUAUCCCUUAAAUAGUUAAAGGGUCCUUCGGUUUGAUUCGUAUUCCGAUCAAAAACUUGAUUUCUAAAAAGGAUUUAAUCCUUUUCCUCUCAAUGACAGAUUCGAGAACAAAUACACAUUCUCGUGAUUUGUAUCCAAGGGUCACUUAGACAUUGAAAAAUUGGAUUAUGAAAUUGCGAAACAUAAUUUUGGAAUUGGAUCAAUACUUCCAAUUGAAUAAGUAUGAAUAAAGGAUCCAUGGAUGAAGAUAGAAAGUUGAUUUCUAAUCGUAACUAAAUCUUCAAUUUCUUAUUUGUAAAGAAGAAAUUGAAGCAAAAUAGCUAUUAAACGAUGACUUUGGUUUACUAGAGACAUCAACAUAUUGUUUUAGCUCGGUGGAAACAAAACCCUUUUCCUCAGGAUCCUAUUAAAUAGAAAUAGAGAACGAAAUAACUAGAAAGGUUGUUAGAAUCCCCUCUUCUAGAAGGAUCAUCUACAAAGCUAUUCGUUUUAUCUGUAUUCAGACCAAAAGCUGACAUAGAUGUUAUGGGUAGAAUUCUUUUUUUUUUUCGAAUUUUGUUCACAUCUUAGAUCUAUAAAUUGACUCAUCUCCAUAAAGGAGCCGAAUGAAACCAAAGUUUCAUGUUCGGUUUUGAAUUAGAGACGUUAAAAAUAAUGAAUCGACGUCGACUAUAACCC |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((((..........................................................((((((((....(((((((...)))))))..((((...............................................))))...............(((((((((((....))))........)))))))..(((((((........)))))))................(((((((..(((............(((..(((((.((((.........((((((((((((..........))))))))))))......((((...((((((((.(((..........))).))))........)))).)))))))))))))...))).....)))...))))))).........))))))))))))))....((((((...................))))))......((((((...(((.............................)))....))))))(((...................................................................))).(((((((((((((((....)))))..))))))))))....((((((((((..............))))))).)))......
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.....(((((((((((((((((....(((((.........)))))...((((......((((((.((((((.................((((((((...))))))))....(((((((((((((((((((..........)))))).)))))))....(((.....)))...))))))...)))))).))))))....)))).........))))).)))))).))))))...)))))))............(((((((..(((.((((.((((((.....))))))((((.........((((((((((((..........))))))))))))......(((((......((((.((((((....)))))).))))((((...)))).)))))))))............)))))))...)))))))................(((((((((....(((((((((((.(((((((..(((...))).))))..)))))))..((((((((..(((((((..((((........)))).)))))))..))))))))...))))))).........)))))))))....................................(((((((((((((((....)))))..))))))))))..((((..[[[[[[.....)))).....]]]]]]...........
|
|
CRW_00742
|
[ FASTA input ]
|
CGCGUUGCCUCCAGGGGGACGGGAAACUUAAAUAAACCUGGAUAAAAUUGCGACUAGCUAAGUUUAUAUUAAUAAUGUGGUGAAACCCCACCAAAUAAUCCAUUAUUUGAACUCUAAACAGCAUGCGUUAGAAGUAAUUUUAAAGCAUGAAGCCUGUAAAUUAAAUUAAGAGUUAGAUACUUAUGGAUAAUGUAAUGUGAAUUCACGGUUGAAGUGUAAAUAUUAAGAGUAGGAAAAUUUCCCGCAUUUUCCUUAAUGGGUCCGCAUGUUAAUAUUACAUAUAGUGGAAUCCUAAGAGUAUCAUUAAAGUGUUAAUAUAAAAACUAGGUAACCCCAAUUACAUCCAAUUUUUAUAUUGGAGGUUUCAUUUGUGAAGGUGAAAUAACUGUAAGUGGGUAAAGGAAAUUCAAAAAAGCAAAAGCCCUAUUGUAAUGAUAGGGAUAGGUUAUUUUUAACUAAUCUGAAAGGAUGCCUACUUUGAAUUAGUGUAAGUUUAUAUUAGAAAGAUCAAAAACUCCACCUAGCAGCUUAAAAGCAAGUCCUUGCUUUGCUAGGAUUAAAAAAGCUACAAUGUAUUAGUCAGCAGCUAAUAUUUUAUGUUAUGGAAAAAAAUAAAUUUAAUUUAAAUACAAUAAGGAAUUAUACAACAUUAAAAUCAUCUUAUGAUUUAUUACCUUGGCAAAUUACAGGUUUAACCGAUGGUUGCUUUGUUUUUACCUUAUGGUAAAAACCAUAAGGCUAGGAGGGUUUUAUUGUUCUAUUUUAAAAACUGGAACUGGUGCUACUGGUUUUAGAGUUAAAUUAGAAUUUAAAGUUGUACAAAAAAGCCAUUCUGAAGAAGUAUUAGUAAGUUUACAGAAUUAUUUUUCUUGUGGAAGUGUGGUUAUUGAUAAUAGAAAAACAGAUACUAAAAAAUAUCAUGUUACUUCUAUAUCUGAUAUACUUAAUAUCAUUAUACCACAUUUUGAUACUUAUCCUUGCUUAACUUCAAAAUUUUUAAAUUUUGACGAUUGGAAAAGCAUAGCUUUUUUAUUAAAAAAUAAAGAACAUUUGACAAAAGAAGGAUUGCCCUCUGGUUUGUAACCAUUCGGGUUUAAAACAAAAAAUAAGAGAAAUAAGCUCUAAGAUGAAUUCAAAAAGAAGUUUUUUAGAAAAAUAUGAAUAUUUAAAAAAAGCUUUAAAUGUAGAUUCAGAUGGUAAUGCCAACUAUAAACUACCAGAACACUGGGUACAAACAUUUAUAGAUGGUUGCUUUGUUUGUACCUUAUGGUAAAAACCAUAAGGCUAGGUAUGUUUUAUAAUUACCUAUUUGAUAAUAGUACAACUUUACAAAAUAAAAUAAUUGUUGAUUCUUCAUUAGAAAUUGCUCAAGGAAAUCACGAUGUUUUUAUUUUAUUAGCCUUAAAACAAUUCUUUGACGGAGGUUAUAUUAAACCUAAAUACAAUGUAAAUUCUAUAACUGAAUGUAAAGAAUCUAGAGAUGUUAAUAGGUAUAUACUUAGAGAUAGUAAGAAAAUUAUCGAUUUUGUGAAUAAAUUUCCAAUGCUUACUAGAAAACAGUUAGACUUUUUGGACUGGAAAACUAUUGUUGAAUUAAAAAAUAAUGGUUUACAUAAAACUCCUGAAGGUUUAACUUUAAUCAAGGAAAUUAAAGCUAAAAUGAAUUCUAAAAGAGAUUAAUUGAAUAAUUGACCUUAAAUUUAGGGAUUAAACUAAUAUUGAAACUUAUGCUUGAGCUGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACAGUUCUUAGAGGAUGUUAAUAUAGUAAUAUUUAACGUAGCCUCAACAGACCCUAUGCAGCUUUACUGUAGUUAGUUAUCAUAUGAAUCUAGAACA |
|
[ reference structure ]
|
.....................................................((((.....((((((((((((..((((.......))))(((((((....)))))))((((((..((((((((((((((((....))))))))))))....))))...........)))))).(((((((..((((..(((.(((((....................(((((((....((((((((.......))))))))...............))))))))))))...)))..))))...))))))).......))))))))))))..))))....(((((.(((((((((((......)))))).(((((((((....)))))))))...))))).))))).......(((((((...((.....(((((((.....)))))))...(((((....))))).((((....))))))....))))))).(((((((..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))).((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((((((.(((....))))))))))..))))....................................................
|
| [ predicted structure ] |
..((((...[[[[[[..))))...............]]]]]].........((((((((((((((((((((......(((((......)))))....(((((((((((((.((((..(((((((((.((((((....)))))).)))))....)))).(((...))).)))))))))))...))))))....)))))))))))..((((.(((((......((((((.....((((((.......))))))))))))(((((.(((((((((((((((((...))).((((((.................(((........)))((((((..((((.(((((((((((......)))))).(((((((((....)))))))))...))))).))))....(((((((.......((((((.(((((((.....)))))))...(((((....)))))..(((((....(((((((.......(((((.((((((((((((.....))).......((((((((((((......(((((....)))))))))))))........(((......((((((((.....)))))))).....))).)))).....)))))))))(((.......)))..((((((.....(((((....((((((((....(((..(((((((....))).)))).)))(((((((((((...(((((((((....)))))))))....(((((((.(((((((((..((((((.(((((...(((((((((((...)))))))))))..))))).)))))).)))).((((...................(((((...((((((..(((((((......))).))))((((((((((....((((.(((((.((((((((........)))).))))..)))))))))((((((.....))))))....))))))))))(((....)))))))))..)))))....((((((..((((((....(((((((((...)))))))))))))))..)))))).......))))..........))))))))))))))))))).))))(((...))).........(((.......))))))))))).........((((((((((....(((((....)))))..)))))))))).))))).........((((...)))).(((((((...((((....)))).........))))))).....(((.((((.....(((((((((....))))))))).((((((.(((....)))))))))(((((((...(((......)))(((((((((..(((((.(((((((................))).)))))))))..)))))))))..(((((((....(((....)))...)))))))))))))).......)))).)))))))))...)))))...(((...(((....))).))).)))))))....)))))((((((......))))))..)))))).....)))))))..)))))).........((((((((((((.(((.....(((((((((((.........))))))))))).........))).))))))))))))................................((((.(((.((((((....)))))).)))...))))))))))....)))))))))....)))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((((((.(((....))))))))))..))))....)))))......))))))))))))))))))...................
|
|
CRW_00743
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCUGACACCAGCAGUGAAGUAUGUGUGCGACAAGAAGCGGAUGUUAGUAAUGUGGUGAGAUUCCACCAGGUAUUUUCUCUAUCUGACACUACCUACACAUGCAAAGCAGUAAUGGUUUGUGUGAAGCUGUAGGGACAAUGUAGCCUGCCUUAAAUGGUGAUGCAGAUAAAAAAUCUUCAGGAGCUAGUGUAAGUAAGACAUGGAAAGCGAAAGUUAAAGUAGCAAUGACGCUUCGUAGUACUAGUCAUAUUGGAAGGUAAUAGAUUCUACAUACUAAUCUAUUAGAGAAACCACAUUUCCAGCGAAGUAAAGCUACUUUCCUAAAUCUUAUGUAAUUUGUGCUAAUAUUUGAACUUGGUAACUCCUUUAUUUUCAGUAAUGAGGGCGCAACGUCUUCAUUAAAGAGGUAACAUAUAAGGUUAUAUGCUGAAGUUGUUAUAGCGAAUAAAGGAGAGAGGAGAAGUUAAAAAGCAAAUGCUUAACUUAGAUUUCAAUUGAAGUAAAUCUAGGUUAUAGAUAAAGACGUAAAGUUAACAUUAUUGAUAAAAAGUUUAAAGAGGAUAUAUAUUAAUAGAAAUGCGAUUAGUUAGAUUAACUUAAGCUACGGUAGAUACCUAGGACGAGAUCUAAUAGAGACAAUAAGCUACGAAGGAUACCUGGACGUGAUACUACCUUAAUUAAGGUUUGUCUCUAAGUUUUUUUAAUUAAUGGUUAGGUAUAUAAUUGUGUUGUUUGCUUAAUCUUAAGGUUUAUAAGGAAAAAAUUAUAAAAUAAAGAUGGUAAUUUUUGAAAAAGAAAUUAAAAGUAAAAACUCUAAUCCUGGUAUCAUAACAGUAGCAGAUUAUCCUAAAACAGGCGUCGUUCGCUCCGAAAAAACUAAAGAGAAAAAGUUAAUAUUAAAUCCGUGAUUUAUUACGGGACUUGUAGACGCAGAGGGUAGUUUUGUAGUGAAUAUUGUUAAAGAUUCAAGUAAGAGCUUAGGUUUUUUUGUUUUACCUUAUUUUGAGAUUGCGCUUAAUGAAAAAGAUCGAGAUCUUUUGACAGGGAUACAAGAUUAUUUAGGUAUUGGUAACAUAACUUUUAAUUCAUCUGACAAUACUUUUAAAUUAAAGGUGUCUGGUUUAGAUGGAUUGAGUAAUAUAGUUAUUCGACAUUUCCAGCAAUAUUAUUUACUAAGUAAAAACGUACCGAUUUUGCAAUUGUUUAGCCGUGUUGUAGGAAUAAUGAAAAGUGGAGAUCAUCUUAACCUUAAAGGUUUCCAGGAAAUAGUAAACAUAAGAGCUUCAUUAAACUUAGGUUUAAGUGAUAAACUAAAAGCUUAUUUUCCUGAGACCUUGCCUGUGGUUAGACCGGAAUUUAAUAUAAAAAGCAUUCCAGAUCCUUGAUGAUUAGCAGGAUUUACUGAAGGUGAGUCUUGUUUUUUUAUUCCCCUCCGGAGAGCAGUGCCUCCUCUGAAGGGGGCGCAAGCCAGAGUUUAUAAAUCGGUAAAGUCUAAACAAGGUUUUGCUGUGCAAUUAGCAUUUACAAUAACUCAACAUUCAAGGGAUAAAGAGUUAUUAAAUGUUAUAGCUCAAUUUUUGGAGUGUGGAAGAGUUGCGGAUCGUUCAAAUGGUGGUGCUUGUGAUUUCAUAGUGAAUUCCAUCAAGGACUUAAAAAAUAAAAUUAUACCUUUCUUUAAUAAAUAUCCUCUUUUGGGUACAAAAAGUUUAAACUAUCAAGAUUUUGUAAAAGUUUUUGAGUUAAUGGAUACAAAAAAACAUUUAACUCAAGAUGGUUUAGCUACCAUAAUAAAAAUUAAAUCGGGGAUGAAUACAGGAAGAAUUCAACUUGAUACUUAAUAAUAUUGAUGAGCUUGUGCCCUCAAUAAUAAAAUUUUACGUUUAUUAAGAUUAAAUUAUAGUAUUAAUCUUAAUAUAGCUGACUUAACAUGCGGCAUAAAUUGGCAAAGAAGGGUGAUAAGUAUGUUAGAAUAAACCUUUUUUUGCUUGGGGCGAGGGCUCCUGUAGAAAAUUUAUGUUUGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUUAGAGGGGGAAAGUUCGAGAGGACCUACCUAUCUCAACUGUUUAAUUCGAUGA |
|
[ reference structure ]
|
.................................((((...((((((((((((..((((.......))))((((((.......))))))((((((((((((((((((((.((....)).))))))))....))))))..........((((................((((.....)))).))))...))))))..(((((((..((((.((....))...((((((......(((((((..............((((((.(((((((((.........)))))))))...........)))))))))))))...))))))))))...)))))))........))))))))))))..))))....(((((.((((((((....)))............................................................))))).))))).......(((((((............................................................................................................................))))))).....((.(((((.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).))))..................
|
| [ predicted structure ] |
........(((..[[[))).........]]].........((((((((((((..((((.[[[[..)))).........]]]]......((((((((((((((((((((..........))))))))....)))))).....((((...((((......)))).))))....................))))))..((((((..(((..(((....)))((((((((.((((((((....)))....))))).(((((((.(((((((((.........)))))))))...........))))))).........)))))))).)))..))))))........))))))))))))(((((((...(((((((((((....(((((((((((...))))))))))).....((((((.....(((.....))).....))))))...))))))))))).......((((((...(((....)))))))))..(((((....)))))....)))))))........((((((((((((...((((((((..........(((((((((((.............(((((((.....((((.......(((((....((((((.((((..........(((((((((.....((((.(((...)))...)))).....(((((....)))))))))))))).((((((....((((.(((((((((.(((((...))))).)))))))))))))..(((((((........)))))))..........((((((((.....)))))))).....)))))).....))))))))))......)))))......(((((.....((((((.((((...))))..((((..........))))..(((....(((((((....)))))))....))))))(((((((((((((((.(((((((((.....................((((((((..((((((....((((.....((((((...(((.......))).....)))))).....))))..))))))..))))))))...((((((......((((((((((((((..(((((((((...))))))))).....)))))))))))))).......))))))..................)))))))))....))))).))))..)))))).........)))......)))))...............))))...((((((...((((((((.((((((..((((........((((((((((((....)))).)))).........))))))))))))))))))))))......)))))).......(((......))).(((((((((((((((((.....(((((((((((((...))))))))))))).........((((.(((((...........))))).))))(((....))).(((((.......((((((((((.......))))))))))(((.....)))........))))).....))))))).....(((((((........)))))))....)))))))))).....)))))))....((((...((((((((((.(((....)))))))....)))))).)))).......(((....)))...............))))))))))).((((((((......(((((((((((((((((...))))))))......((((............))))........)))))))))(((....(((((...(((((((((((..(((((.........))))).))))))..)))))..)))))...)))))))))))))))))))..))))))))))))........................................(((((((((..........[[[[[[[[[[[[[.....))))))))).....]]]]]]]]]]]]].(((((....)))))..................((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).))))..................
|
|
CRW_00744
|
[ FASTA input ]
|
UUUAAUGUCUUAGUAGUUGGGCAUGCGGUCUUAAUAAUUUUCUGUGCGCCGUUUCGCUUAAUUUAUCACUGUAUUGAAGUGUUAAUUGAUAAACACAUCUCUGUUUAUUCAAUCAAUGAAAACUUUACCGUAUCAUUUUGGUUCUGAUUCUUAGUAGUAACAUACAUAGAAUUUAGAUACGUAAACCAUAUGGCUUACUCAGUUGGGGCCAACUCAACGGGGACAAUAGCAUGCCAUAAAAGCGCUGGAGUAAAACAGCCAGUGCAAGGUAAGAACUGUCCGAUGGCUAGGUUAACGAACUCCUUACAAGAAUGUUUAGGGUUCUCAUUAACUCCUUCCCACUCGGGGAUUGUGAUUCAUGCUUGUGUAUUGGAAGAAGAGGUACACGAGUUAACCAAAAAUGAAUCAUUAACUUUAAGUAAAAGUUGACAUUCGGAGGGCUGUACGAGUUCAAAUGGUAAAUUAAGAAAUACGGGAUUGUCCGAAAGGGGAAACCCUGGGGAUAACGGAGUCUUCAUAGUACCCAAAUUUAAUUUAAAUAAAGUGAGAUAUUUUAGUACUUUAUCUAGAUUAAAUACAAGGAAGGAAGACAGUUUAACGUAUUUAACAAAGAUAAAUACUACGGAUUUUUCUGAGUUAAAUAAAUUAAUAGAAAAUAAUUAUGAUAAUCCAAAAACCAUUAAUAUUAGAAUUUUAAAAUUAAUGUCAGAUAUUAGAAUGUUAUUAAUUGCUUAUAAUAAAAUUAAAAGUAAUAAAGGUAAUAUAUCUAAAGGUUCUAAUAAUAUUACCUUAGAUGGAAUUAAUAUUUCAUAUUUAAAUAAAUUAUGUAAACAUAUUAAUACUAAUAUGUUUAAAUUUUCUCCUGUUAGAAGAGUUGAAAUUCCUAAAACAUCUGGAGGAUUUAGACCUUUAAGUGUUGGUAAUCCUAGAGAAAAAAUUGUACAAGAAAGUAUGAGAAUAAUUUUAGAAAUUAUUUAUAACAAUAGUUUUUCUAAUUAUUCUCAUGGUUUUAGACCAAACUUAUCUUGUUUAACAGCUAUUGUUCACUGUAAAAAUUAUAUGAAACACUGUAAUUGAUUUAUUAAAGUAGAUUUAAAUAAAUGUUUUGAUACAAUUCCACAUAAUAUGUUAAUUAAUGUAUUAAAUGAAAGAAUCAAAGAUAAAGGUUUCAUUGAUUUAUUAUAUAAAUUAUUAAGAGCUGGAUAUGUUGAUAAACAUAAUAAUUAUCAUCAUACAACUUUAGGAAUUCCUCAAGGUAGUGUUGUCAGUCCUAUUUUAUGUAAUAUUUUCUUAGAUAAAUUAGAUAAAUAUUUAGAAAAUAAGUUUGAGAAUGAAUUCAAUACUGGAUCUAUGUCUAAUAGAAGUAGAAAUCCAAUUUAUAAUGAUUUAUCAUCUAAAAUUAGAAGAUGUAAAUUAUUAUCUAAUAAAUUAAAAUUGAUUAGAUUAAGAGACCAUUACCAAAGAAAUUUGGGAUCUGAUAAAAACUUUAAAAGAGCUUGUUUUGUUAGAUAUGCUGAUGAUAUUAUCAUUGGUGUAAUGGGUUCUCAUGAUGAUUGUAAAAAUAUUUUAAACGAUAUAAAUAAUUUCUUAAAAGAAAAUUUAGGUAUGUCUAUUAAUAUAGAUAAAUCCAUUAUUAAACAUUCUAAAGAAGGAGUUAGUUUUUUAGGGUAUGAUGUAAAAGUUACACCUUGAGAAAUAAGACCUUAUAGAAUGAUUAAAAGAGGUGAUAAAUUUAUUAGGGUUAGACAUCAUACUAGUUUAGUUGUUAAUGCCCCUAUUAGAAGUAUUGUAAUAAAAUUAAAUAAAAAUGGUUAUUGUUCUCAAGGAAUUGUAGGAAAACCCAGAGGGGUUGGAAGAUUAAUUCAUGAAGAAAUGAAAACCAUUUUAAUGCAUUACUUAGCUGUUGGUAGAGGUAUUAUAAACUAUUAUAGAUUAGCUACCAAUUUUACCACAUUAAGAGGUAGAAUUACAUACAUUUUAUUUUAUUCAUGUUGUUUAACAUUAGCAAGAAAAUUUAAAUUAAAUACUGUUAAGAAAGUUAUUUUAAAAUUCGGUAAAGUAUUAAUUGAUCCUAAUUCAAAAGUAAGUUUUGGUAUUGAUGAUUUUAAAAUUAGACAUAAAAUAAAUAUAACUGAUUCUAAUUAUACUCCUGAUGAAAUUUUAGAUAGAUAUAAAUAUAUGUUACCUAGAUCUUUAUCAUUAUUUAGUGGUAUUUGUCAAGUUUGUGGUUCUAAACAAAAUUUAGAAGUACAUCAUGUAAAAAUAUUAAAUAAUGCUGCCAAUAAAAUCAAAAAUGAUUAUUUAUUAGGUAGAAUGAUUAAGAUAAAUAGAAAACAAAUUACUAUCUGUAAAACAUGUCAUUUUAAAAUUCAUCAAGGUAAAUAUAAUGGUCCAGGUUUAUAAUAAUUAUUUUAAACUAUUAAACAUGCGCUAAACGGAGAGCCGUAUGAUAUGAAAGUAUCACGUACGGUUCGGAGAGGGCUCUCUUAUAUGAUUGUUAUUACAAUCAGAUAGGUUUGCUACUCUACUCUUAGUAAUGCCGGCAUUAAUUGGUGGUUUUGGUAACUAUAUGUUACCUUUAUUAAUUGGAGCAUCAGAUAUGUCUUUUGCAAAGAUAAAUA |
|
[ reference structure ]
|
................................................((((....((((((((((((..(((....................................................)))((((((.........................................))))))...(((.((((((...(((.((((((.....)))))))))...........))))))...(((((((..........)))))))..)))..(((((...((..((((.(.....)...((((......(((((((((((((........))))..((((.....))))...(((((((((((((((((((.........))))))))))).........)))))))).)))((((.....))))...))))))))))))))...)))))))...))))))))))))....))))..((((((...((((....))))..))))))....(((((.......((...((((((((((.((((((.(((....)))....)))))).))))))))))....))....))))).(((((((((((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((...(((((.(((((((....))))))).)))))...))).))))...............................................................................................
|
| [ predicted structure ] |
.................(((((..(((((....(((......)))..)))))...)))))..................(((((.[[[[[[.)))))...............]]]]]]...........((((((....[[[[...((((((..(((......)))..))))))..))))))...]]]]..(((((......[[[[[)))))..]]]]]..(((((.[[[[.((((......(((((((..........)))))))..)))).....)))))....]]]].......((((.(((.(((....)))..))))))).......((((....[[[..))))...]]].(((..[[[[[[[[[[[.))).....]]]]]]]]]]]..((((....(((((..((((((((.....)))))))).)))))..(((((.....)))))...))))..............(((.((((((...((((....))))..))))))....[[[[[[......)))..((((((((((.(((((((((((...)))..)))))))).)))))))))).........]]]]]].((((((((((((((.......)))))))..((((....)))).)))))))..............................((((((((((((............................(((((((((((((.(((((((.((((...)))).)))))))...)))))))).)))))(((.....(((((((((((((....((((((...((((((.((((....))))....(((((((((((....)))))))))))..((((((......))))))..))))))......(((((.((((((.......)))))).)))))......(((((((..........((((((((((((((((((((((..((((((((((......))))))))))..)))))))))))).............)))).))))))....(((((.(((.......)))((((((.(((((((.......(((((((.(((((.....))))).....(((......))).(((....(((((((((....)))))))))...))).)))))))........)))))))))))))......(((....)))..)))))..((((.((((((.........)))))).))))...)))))))))))))..)))))))))))))....)))...........((((((((.(((((...........)))))))))))))((((((((......))))).)))((((((((.....))))).[[[[[..)))..]]]]]...((((((((((((....((((((......((((((((((((((.(((....))).))))))....(((((((((((((((....))))).(((((((((((.(((.....)))....)))))))))))........................))))))..)))).)))))))).........))))))..(((((((((..(((((....))))))))))(((.(((((((....))))))).)))...))))...(((((((...((((.....((((((((((((.((((......)))).))))))))))))....)))).)))))))........)))))))))))).(((((((((((........(((...(((((..(((((((.(((((((.(((...(((((...........((((((((((((....(((..((((((......(((((....))))).......)))))).)))...)))...))))))))).....)))))...))).))))))).)))))))..)))))...)))......(((((((((((((.........)))))))))........((((.....(((.(((((........))))).)))....))))(((((.(((........)))...))))).....)))).........))))))))))).(((((.....)))))....................................................((((..(((((((.(((((((..(((((.......((((..(((.(((((.((((((......((((((((........((((.(((((((.....))))))).))))........)))))))).......(((((((((((((((....))))..)))))).))))))))))).)))))...)))..))))..((((.....))))...)))))..)))))))))))))).))))....(((((.....((((((.(((....))).))))))......(((..(((((.....((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((...(((((.(((((((....))))))).)))))...))).))))....))))).)))....)))))))))))))))))((((((.....)))))).............(((..(((....)))..)))...........
|
|
CRW_00745
|
[ FASTA input ]
|
CGGUCGCAAGGCUGAAACUGUGCGCCAUUUCACGAUAUAUUAGGCCCGCGCCCCCAGAUCAAAAUGAUCAGGCAACAGGCGCCGUGCGAGUUGCAAAUCACGCACGUAAUGCUAGCAGCUCAUCCGACGCUAUAACCAAAAGCAAUCCGGCGAAAGCCUAGGGGAGUAUAGCAUGCUGCUAAACGGAGACACGGAUACAAGCACAUAUAUCGAGGCCGUCUUCGGAGCAACCAGUCGUUCAUAGGUUCUAUCUCUGAGUCUACUGCGGGUCUGCCUUCCCGAAGCAGUCAAACUGCUUAAGAGUAGGGGGUCUCCUCAGAGUUUCGGGGGAUCCCAUAAAGCAACCGCUCAUCAGAAACACCAAAGGUGUGCAAUGACUCGAACCUAAAAACGACACUGACCUAAAUAUCGGAACUUGGGGUCCCUGGUAUUCGCCGCCGGGGACGGAUGCCUGAUAGUAGCUUAACGCGCUAAGCAGGCAAGUAUCACUACUCCAUCAAGAACAUUCUGUACCCUCCCGGAGCAUCGUGUCUCUUAUGAUAGAAAUCAAGCCUCCGGAGAUAGGAGGAGUUUAUAAGUUCCAAAAAGAAAAAAAGAAGAGUUAUCAUGACAAAAUGCAAUUACGAGCAACUACUAGACCCCGAGAUAUUUAGGCUAGCUUACGAGCUAAAGAAAUCGAAAUCAGGCAAUAUGAAACCUGGUGCGGAUAAAGAAACUCUCGACGGUUUCUCCCAAGCCUAUGUUGAGAAGGUCGUCCGUCAACUAAAAGACGAAUCAUUUCAAUUCCGUCCGUCACGAAGAGAAUUCAUUCCUAAAGCAGACGGCAAGCUUCGUUCCCUGGGCAUACCAUCACCUAGAGACAAGAUAGUACAAGAGGUCAUGAGGAGGAUCCUUGAACCUGUAUUUGAACCGCGAUUCCUGGAUUCGUCUCACGGAUUUAGACCUCAUCGAUCACCGCACACGGCUCUACGACAAAUCCGUCGAUGGACAGGCACCUCCUGGAUGAUCGAAGGAGACAUCAAAGGAUACUUCGACAACAUCGAUCAUCACCUACUCGCGGGAUUCAUAGCAGAGUUGGUAAAGGACCAACGGCUUCUCGCCUAUCAACACGGUCGCCCGUAAACUGGGGCUUAACACAGCCAAAGUAAUAAAACGCUUCGGCGUGGACCUAAUCUUCCGGGACCACACGAAUGAGAUCAAGCAUAAGCUCAAUUUCCCGCGAUCCCUACCUAAUAAGCGCAUGAACUUCGCCUUGAGUCCGCCUUCGGACCCUAGAGUUCUAUUUGAUACAAGCUGCGCUCGCAUUCAGUGUUGAACGACCUGUGUCAAGUAUGCGGCUCCUACGAACAGGUGGAGAUGCACCACAUAAAAAGACUAAGCCGCGAUAACGCGGUUUCACUAGGUUGAUGGUCUAAUUGAAUCGUAAACAACUCCCGGUCUGCCGUAACUGUCAUAGGAAGAUUCAUAGAGGGGAAUACAACGGAAUGAGGCUGGAACGAUUACUCGCAAGGAACAAAAGACAUCUUGAUUAGUUAGUGACAGGGAGAGCCAUAUGCCGGGAAACUGGCACGUAUGGUUCGGAGGGAGGUAUAUGUCUUCCACAUGGGAGAUGGGUACCGACCCUACCAAAGGAAUUGACG |
|
[ reference structure ]
|
........................(((.....((((((.(((((...(((((.........................)))))((((((............))))))...(((.((((((...(((...(((.........))).....(((....)))..)))...........))))))....((((((...........................))))))...)))....(((((((...((((.......((((((..(((((((........))))..((((.....))))....((((..((((((((((.........))))))))))...........))))..)))..((((.....)))).....))))))))))...))))))).....))))))))))).....)))..((((((((.......))))))))....((((((....((((.......))))..)))))).((.((((((..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))).))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..(((((((((((((((((((....))))))))))))))).))))................
|
| [ predicted structure ] |
(((((....))))).........((((((....)))...........[[[[[....(((((...))))).)))....]]]]]((((((....[[[.....))))))...]]](((((((..[[[[[..((((((...........((((((....)))..)))...))))))..)))))))..........]]]]]...................(((....)))........((((((..(((((((......((((((((((.((((........))))(((((((...)))))))...)))))((((((((((.........))))))))))...........)))))(((...(((((...)))))....)))...)))))))..)))))).....((((((((((.....((((((((..((((((((((((..(((((((((((((((....((((.......))))..))))))((((....)))).............))))).))))..))).((((..((((....(((((((.....((((((((.......))))..)))).....(((......)))...........)))))))))))..)))).....))))....))))))))))))))))))))))).((((...[[[))))......]]]...(((.[[[...))).......]]](((...[[[[[[))).....]]]]]].....((((..[[[[[[[))))....((((........)))).....]]]]]]].(((((....[[[[[[...................)))))....]]]]]]...(((((......[[[.)))))......]]]....((((.((((...[[[..))))))))..]]]...........(((....((((((((((...))))))))))......[[[.....)))...]]].....((((...[[[))))..]]].......(((((.[[[[[[[[[)))))..(((....)))............]]]]]]]]]......((((((((...........((((((.....))))))(((.....))).......(((...[[[))).......]]]........(((.((((........)))).)))((((.(((.[[[[[..))).))))......]]]]]..(((....))).....))))))))..............(((...[[[[[[))).....(((((....)))))....]]]]]](((((((((((...(((....)))......(((....))).)))))))))))((((((...(((((....((((.......))))......(((((((((((((....)))))))............)))))).......)))))......[[[[.....)))))).((((.............)))).]]]].......(((..[[[[.))).........]]]]................(((((....[[[[[[..))))).((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((.(((((.((((((((....)))))))).)))))..)))).........]]]]]].
|
|
CRW_00746
|
[ FASTA input ]
|
GAGUGGUUGAAAGCAUUGGUUUGCUAAAUCAGUGCGACAAGAAACUGUGCAAUGUAAUGUGGUUCAAUUCCACAGGACGUAACCCCCGUCCUACCCAACCUAGACAUGCGUCGGGAGUAAUCUUGAGGUGUGAAGCUCUAGGGACAAUGUAAUGAUGCUUGGGAUUCCGUACUAAGCUAAUGCUAGGGUAAAGAGACCCGGCGGGUCUUCGUGUGCGGAAAUCGUAAAGUCGGCCAGAGGACCUGUAAAGCCAAAGAAGCACGUAGUGCCUGUAAAGGCAAAGAAGUCUCCUUCGGACCCUUCGGGCCCUCAAUAGAUGAACAGUUCAAACGAACUAAUACAGAGACCUCGUAAAAAACAAUUCAAGGCGGAACCAAAAGAUCUUCUGGAUGAAAUAUCGUAGGUUCAAAAUUGGAAUGGUAGGUAUCCCGAGCAGGAAGCCCGCCGUGGAAGGGGUGGUAUCUCUGAUUUUGAUAUCACCGUGGGUUCAGAUUUCCAUCGGGGUUUUUUUAGGUUCUUCCUGUUGAGAGAAAUGGUACAUUGCGCGGAACUUGGUAAACCCGUAUCGCUCCUUUCGGGAGGCUCUGUGGUAAUGCAGAGUAACGCAAUGCGGGUAGAGGACAGCUCAAAAAGCAAAAGCCCGUCUGUAAUUGAUGGGAUAGGAUCUUGUGAUCUACACCGAAAGGUGGCAGACUUGAGCAUGGGUGACUUGUACUAUAUCUUUCUUGAGAUUUUGAUAAAAAGGAUAUAAAAUUCAUUUUUUUUUAUUGGCACAAGGCCCCGGGGACACCAAAAAACCAAAAUACUGUCUGACAAAACAAGGAACAGGGGCUUAGAGUUGCGGGUGAACCCGUAACACUUAACUUGCCAUUUUACACAUGCAACAAGUUCUAGUAGCCAAUGAUUCAAACAUGACUCUUGCGGGUUUACAUUUUGGACAGGUUGCUUGAGCCGUAUGCGGGAAAACUCGCACGUACGGUUCUUAGGGGGGGGAAAGCUUGAGAGGGCCUACCUAUCCCGACAAAUACAACAAUAUUGUAUCAUGGGUUC |
|
[ reference structure ]
|
.....................................((((...((((((((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))..(((..(((((((((((.((((((....)))))).)))))....))))))..............((((((((.....)))))))).......(((((...((((((.....)))))).(((((............................................)))))..(((((....)))))..((((....))))..)))))..)))..((((((((..((((.((....))...((((...((((((((((..........(((((....(((((....(((..............)))...)))))....))))).(((......(((......)))...)))..(((((((.(((((((((.........)))))))))...........)))))))))))))))))))))))))...))))))))........))))))))))))..))))....((((((((..((((.....))))((((((((....))))))))......))))))))........((((((...((.....((((((.......))))))...(((((....))))).((((....))))))....))))))....(((((((((................................................................................................................................................................................................................................)))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((....((((....))))...))).))))...............................
|
| [ predicted structure ] |
.....(((....[[[[[[..[[[[.....[[[[..))).....]]]].]]]]..]]]]]].(((.........((((((.......)))))).[[[[[(((((((((((.((((((....)))))).)))))....)))))))))...(((....)))]]]]].((((((((..(((....))).((((......)))).[[[[[[[[[[..)))))))).(((......)))...]]]]]]]]]]...(((..............(((((....)))))..((((..(((...)))..)))).)))...............(((((....))))).....((((((((((..........(((((....(((((....(((.(((.....)))..)))...)))))....)))))((((..(((.(((......))).)))..))))[[[[[[(((((((((.........)))))))))(((((........)))))))))))))))......]]]]]]....((((((.((((((((...(((....(((.....((((((((..(((((...)))))((((((((....))))))))......)))))))).)))....((((((..........((((((.......))))))...(((((....))))).((((....))))......))))))....)))...)))))))).))))))..........(((((((((((............)))))))))))......(((((((.[[[[[..................(((........))).......)))))))...((((((((....)))))))).......((((............))))...]]]]](((((((.(((.[[[[[[)))(((((....))))).....]]]]]]..))))))).((((((((((((((....)))))..)))))))))........(((...((((....))))..[[[[[[))).....((((((.....)))))).]]]]]]..
|
|
CRW_00747
|
[ FASTA input ]
|
AUAUGUUUAUUAAUUGGUGCUAUGGCUAAAAGUGUGCGCUGAUGAGCUUUAUUUUGAAAUGGAGAUAUAAUCUCUAAACAUUGGUCAAAUAUGUUUCUGACUACGAAAUUAGGUGGCGGGGAAAUCCCAAAGUUGAACAUAGCAUUUUCGCAUAAUGAAGAGAUUAGAUCCAAUCAUGGGGAUCGAUUAGCUCUUCUAGUCAAGUUUUCUAUGAUUAAGACUAUACUGUUUGAAGUUCAUCUACCAGUUGUCUCAAGCCAUGGACUUCAGCGAGCCUGAGAUAGGCUGAAUGCGGCAAACCUUUUUCUUGAACUUUUGGAUAGGGUUAUGGCCUGUCCGCAAACGAAUUGCAUAAACAAUUUCAAGGUAGAGAGUGAACAAUCUAAGGAAAACAAAAUUCAAAAUAUAUGAAGAUCAGGAUUACCUAAGACUAGAAAUAGUUAUGGUAACAGAGGAGUAGUAUUACCCUUUGUAUAUUAUAACAAUAUAUAUUGUCCUUUAAAAAAGGGGAUAAGGGGAAGAACUCUAGAUUUUAAUUUUAGAUUGCUAUCCACUAGUGCUGGGAGUCCAGUACAGAUAAAAUCUAACACUAAUGAUAAGCUUCUAAAGCUAGCUAAGCAUUGUAAAAAGAAUUUUAAUGGUCAAAUCCAAAUGGACAAAUUAUACCGAUUAAUGUAUGAUUCAGCACUGUAUGAAUUGGCAUAUAAAAAGCUAGGCGCUAGUUCUGGGCGCAAAUUCGGCGCAAGCUCUGGAGGGAAUAUAAAUCAGGCGGGUAUUAAUAUUAAACCCCUUGACCAUAACCACUACCCUUUAGUAGGAUCCGCAGAGAUGUUAUCUGAAGUAAUUGAAGGAAUUAUUGCUGAGUUGAAAGAUAGUAGGUUUAGAUUUGAAGGAAAAAAGGUAAAAACCCUAGUAAGUAGACCUCUUACUACUUUUAGAAAUAAACUGGUACAAGAGGUAAUGAGAAUGAUUUUAGAAGUUAUAUUCGAACCAACUUUCUCUGAACACAACCAUGGGUUUAGGCCAGGAAGGGGGUGUCAUUCGGCUUUGAAAGAAAUUAAGGCGCAAGCUAUAAAUUUUGGAGUAUCAACCUGAUAUUUUGAAGGAGAUAUUUCUAAAUACUUAGUUACUUGUGCUGACGAAGUUAUGCAUGCAAGCUCCUCUUUUGUUACUUCGAGACGUGGCGGCGACGGUGGCGGCAAAGCCGCAGCAGCAGCCGCGCUCGUAAGUUCUCAAAUAGAAAGAGUCUUAAUGAAUAUAAUUGAAAAUAAAAUUAAAGACCGUAGGUUUACAGAUUUAAUAUGAAAAGCUUUAAAAGCUGGAUAUUUUGAAUUUAAAAUAUUCAAAGAUUCAAAUACAGGUACUACUCAAGGUGAUAUACUUAGCCCUAUUUUAAGUAACAUUUAUCUAAAUGAAUUAGAUAGAUUUAUUAGUAAGUUAAAAUUAGAGUACGAUAAAGGAAUUAAACCUAAAGUAAAUCCUUAUUAUAACAAACUUUGUAAUAUGAAGAAUAAAACUCUUGAUGUACAAACUAGGAUCCGUAUCCAUAAGUUACACUUGAAGACUCCUUAUUAUAAAACACUAGAUCCUAGUUUCAAGAAAUUAGUAUAUGUAAGAUAUGCUAAUGUUUGGGUUAUAGGUGUUAGAGGAUCCAAAGAGGAUUGUAACAUUCUGUUAGAAAAAAUAGAAAUAUUUUUUAAAGAUAAAUUAAAUAUUGGGGGCGCAAGCUCUCGCGCAAGCUCGAGUUUUGAGCUUGUGCCUAAAACCCUAUCUAGUAUAACUAAUGCUAAAAAGGUCUUAUUCUUGGAUACGGUAAUAUUCAGUAGCUGACACAGAAAACAUCAAUCUUUGACUUCCAGUUCAUCUGGGUUCAUGCUAAGAAAUGGUAGAGAAAUUAGACUUGAAGCACCUAAACAAAUAAUACUACAAAAACUAAAUGAAGCCGGUUUUAUAACUAAUGGGAAACCAUCUCCUAAAUUACUAUGACAACAUUAUAAUAAGGACACAAUAAUAACAUUAUAUAAUUCUGUAUAUAGGUAUAUUAAUUAUUAUAGUUUUGCUGAAAAUAUUUCCAAAAUUUCUUCAUGACUUCACUUUAUAUUAAAAACUUCUUGUGUGAAAUUAUUGGCAUCCAAAUUUAAAUUAGGAACUAUAUGUAAAACUUAUUUUAAAUUUGGAAAAGAUUUAAAAGGAGAUAAUAAAAUCGGUUUUGUGGAUGCGAUGGCUUAUGGAAUAAAUAUUUGAGACUUUAAGAUAUCAACUAAAGGUAUAAUUCAAAUCCUAUAUGCUGGAACAAAAACCUCUAGAGGCGGAGCCGCGAAGCCGCUAAGGAGCAAAGCCGCGAAGCCAGAAAGCCGCCGCACUAAAAUUUAAUAAAAUUAAUGGAUUAAAGGUUAAAAUAGUGCUUUCGAGGAGGCUACGUAUACGAAGUAUGCUUUAUAUAUAGCGCUAUAUAUAGCGCAGCUCCUCCUCGACAUACUUUGUCAGUAUGUAUGUAUGUCAGCACUAAUAUUAUUAUAACCAGACAGUAAUACCACUAUAUAUAUAAUGCAAACGCUUAGUAUAUUAAAAUUGGAGAGCCGUAUGAUGGGAAACUAUCACGUACGGUUCGGGAAAAGGUAUAUAUACUGAUAAGAGGUAUACGUAUCUAGUUCAUUCUCAAGUAGGUUCGGGAAAAGGUAUAUAUACUGAUAAGAGGUAUACGUAUCUAGUUCAUUCUCAAGUAGGUU |
|
[ reference structure ]
|
......................................(((((......(((((((((..((((((...))))))((((((.........)))))).(((((((((((...(((...(((....)))....)))...........))))).......(((((....(((((........)))))......))))).)))))).(((((((..((((.((((......))))...(((((((((((.(((((((........))))((((((.............))))))(((((((((((((.(((..........))).))))))......)).))))))))((((((......))))))...))))))...)))))))))...)))))))....))))))))).......)))))..(((((...(((((....)))))..)))))....(((((.......(((((((((((((.....))))))))..(((((((.....)))))))))))).....))))).(((((((((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((((.((((((.......)))))).)))))).))))...........................................................................
|
| [ predicted structure ] |
............((((((((........[[[[[..))))))))..]]]]].........(((((((...))))))).....((((((..[[[[[[[.))))))...........(((.(((....)))...)))]]]]]]]...((((((.....))))))(((((((...[[[[[[[[[[[............)))))))....]]]]]]]]]]].((((.........[[[[[[[[[[......[[[))))..]]].]]]]]]]]]](((((((((...))))))...)))............(((((((.....(((((((.......)))))))........((((......)))))))))))..((((((((((...............................((((((....(((((...(((((....)))))..)))))....(((((.......(((((((((((((.....))))))))..(((((((.....)))))))))))).....))))).))))))....(((((((..[[[[.....(((((((....)))))))......))))))).......]]]].(((((((....)))..))))...................(((......)))..(((...[[[[[[[))).......]]]]]]].(((.......[[[[[[[[.........)))....]]]]]]]]...((((.......)))).....((((((((........(((((.((((.(((....))))))))))))............)))))))).....(((.((((.......)))).[[[[[[....)))...]]]]]]..(((....))).(((((((((..((((((((......(((....))).(((((((.......)))))))))))))))..))))))..))).....(((((..[[[[[[[.......)))))......(((..((((((((((((..........))))))...))))))..)))]]]]]]]..((((((((....(((.(((....))).))).....[[[[[[[[.........))))))))..]]]]]]]].....((((.((((...[[[[)))).))))...]]]].........(((((((..((((((((.((((((..........(((((...))))).......)))))))))).))))...)))).)))..(((((((..(((((((((((........))))..(((((...)))))..(((((((((((....(((((...)))))..)))..))))))))...))))))))))))))..................(((.....[[[[[[[.)))...]]]]]]]..((((((((((.....))))))))))......(((..(((....)))..)))....(((((.(((.........))).)))))............(((((.[[[[.[[[[)))))..]]]].]]]]..(((((((((((...[[[[[...(((.......(((....))).......)))....)))))))))))......((((((((((.....))))))))))...]]]]]..((((((((...(((......((((((((.....((((((...((((((((....))))))))............((((((((((((....))))))((((((((((((...)))))))))))).....(((.((((((((((.....)))))...((((......))))))))).)))))))))...........)))))).....))))))))....)))...((((((((.(((.(((((.....)))))..))).)))))..)))))))))))........................(((((((((((((((((((((.(((....)))..((((..((((..(((....)))..)))).)))).....(((((...(((((((......)))))))...))))).......)))))..........(((((((..((((((..(((((......((((...))))......))))).)))))).......((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))............)))))))))))))))))))))))......((((.((((.....(((....)))......)))).))))....................(((......(((((.........))))).[[[)))..((((.....(((....))).....))))..]]]....((((...[[[[[[...((((((...........))))))))))....]]]]]]..(((((((((....(((((..(((....)))..))))).((((((....))))))....))))))))).....((((((((((((((((.............(((....)))..((((..(((......)))..((((((..............)))))).....)))).((((((((((((((....)))))..))))))))).........))))))))))))))))(((((....))))).))))))))))................((((((.((((((....[[[)))))).)))))).......]]]..........
|
|
CRW_00749
|
[ FASTA input ]
|
CGGGGUGGCGACUGUUUAUUAAAAAGUGCGACAAGAAGUUCAGGAAGGGAUUGAGGUGAAAGUCCUCCUCCCGAAUCGUUCAUGGGAGAGUCUAUCCAGACUUGCGUAGCGAGUAAUCGCUAGGUGAGAAGCUCUGGAGACAAUGUACCUGCCCUUCAAUUGGAGGUGCCAGGGCUAGGCUUUGUUCCUAUGGCUAGCGAAAGCGAAUACAGGUUAUUAGGCGUCGUGAAAACAAAACUCUUUAUUUAUAGAGAGGCUCGUAGAUGAGUUACCCUCCUUUUUAUGGGGUAACUGAACGAUCAAUAUCUACCGGCGUAGACUGUGAGCCUAAAGGAAACGAAUGAAAGUGUCCCUUCCUGGGAACUUGGUAAGCCCAAUAGACUCCCUUGUGGAGGAGUAAGAGCAAUCUUACUUAUCGUCUAGUGGGUAAAAGACAUAAUAGGAAGCAAAUGCUUGGUUGUAACGAUCGAGAUAGAAUCUGUUGAUUUAAGCUGAAAGGCUGCAGACUUAUUAAAUGGGUGUUCUGGCCUAGGUAUUGAUAAUAAUAAUAUUCCGAGUGAAGAUUUGUGUAAGUUUUCGGCUUAGUCCAUUCUAAGUCAAAAUCAGAAGAACUUGCUCUAAGGAAAUCAUUUUGAAAACAUGAGUAUUCCAUAUAUAAUUCCUUUCAAUUGGCAUGACAUAGAUUGGGCUAACGUCCAGUCGAAAGUCUGUUAUUAUCAAAAUAACCUCGCAGUAGCCGAACUAAAAGGUGAUUCUGGUUUAGUUACCAAACUACAAAGAAAUCUCGUAAAUUCCUUUGCUGGACGAGCCCUUGCAGUACGUGCCAUCACGACUAACAAGGGUAAGAACACACCAGGAAUCAAUGGGGAGAUUUGGGACACAUCUAUUAAGAAAUUGGAUGCAAUCCACAGGUUAGGGAGAGUAUCAAAUUACUCUUGUUCCCCUGUAAAAAGAGUAUACAUACCAAAGUCCGGUGGAAAACUUCGUCCGCUAGGUAUACCUAAUAUGUAUGAUCGAGGAUUGCAGUAUUUAUGGAAAUUGGCUCUGGACCCAAUAGCUGAGUGUCGGGCUGACCGGCAUUCCUAUGGGUUUCGAAAGGGUAGGAGCACGCAGGACGUUCAUACGAUACUGCAUUUGCUUCUUAGCCCCAAAAGUAGAUGUGAUUGGGUUUUGGAAGCUGAUAUCAGGGGCUUCUUUGAUAACAUCAACCAUGACUGGAUCAUACAGAAUAUACCAAUGGACAAAAAUAUUCUUCGGGAAUGGUUAAAAGCAGGUGCUCUAGAAACAACAACUCAGGAGUUUCAUAAGGGUAUUGCUGGAGUACCACAAGGAGGACCAAUUUCACCUUUAAUUGCAAACAUGACGUUGGAUGGUUUAGAAGUUUGGGUGGCUAACUCUGUUAAACAUCUCUAUAAAAAGAGUAAAGAAACUAGUUGGUCCCCGAAAGUAAACGUGGUAAGGUAUGCGGAUGACUUCGUCGUUACCGCUGCAACAAAACGAAUACUCGAGGAUAUAGUGAAACCGUCAAUUCAAGAUUUCCUGGCUUCUCGUGGCCUAGUUCUUAAUCAAGAGAAGACUUGCAUCACUAGCGUAAAGAAAGGCUUCGAUUUUGUUGGGUUUAACUUCCGGGUUUACCCCGAUAAGUCUGGUCCGAAAGGCGCAAAAUCGAUUGUUAAACCGACAAAAGAAGGCAAAAGAAGGCUCCGAUCCAAGAUAAGAAAUGCUGUGAAGACAAAUAAAAGCUCUGGAGAAAUUAUAGUGGAGUUAAACCCAAUCCUUCGAGGUUGGGCUAAUUACUAUAAGGCGACCUCAGCAAAGAAAGUCUUUACAUCGAUUGGUAAAUAUGUAUGGGAUAAAACCUGGACAUGGGCCAAAAGAAAGCAUAGGCAAUUAAAUUUCCGUGACCUUGCGAAGUUAUAUUAUACACGACGCAAGAAAAGGAAAUGGAUCUUCAAAGGAGAAUGGAUGGACAAGGAAUUGACUAUUUUCUUGAUAGAUAGUGUUGCGAUUAGGCGACAUUCUCUGGCAAGGAAUUACAACCCUUAUCUGCUUGACAACGAAGAUUACUUUAUCGAGCGAAACAAAAGACUUUCCUCAUCGAACCUUUGGAACGAGAGACAUAGUAAGUUGUUGCGUAGGGAUAAGUAUAAAUGUAAAGUAUGUAACGAAUACAUUUGUGGUGAGGAUAAAGUUGAAAUUCAUCACAUCAAACCUAAAAGUUUAGGUGGUGAUGAUGCUAUAUCCAAUAACGUGGUUUUACACGCGGAGUGUCAUAAACAGCUGACACACACUAAAUCAAGAAGCCUUUUGGCUCGAUUUGAAAGAGGCAAGAUCUUGAACAUUUAAUUAUGUUUAGUGAAUCUUUUUCUCUAACGAAAAGCAGAAUGCGUGAGCCGUGUGCGAUGAAAGUCGCAAGCACGGUUCUGAUGGGGGGAAAACGAGAGAUCGUCUACCUAUCCAACUCACAGGUCUCU |
|
[ reference structure ]
|
...............................((((...((((((((((((..((((.......))))((((((.........))))))((((((.((((((((((.((((((....)))))).)))))....))))).............(((((...............))))))))))).(((((((..((((.((....))...(((((........((((((...........(((((((....)))))))....((((((((((((((((.........)))))))))..........)))))))))))))...)))))))))...)))).)))..........))))))))))))..))))....(((((.((((((((.....))).((((((((....))))))))...))))).)))))........(((((((..((.....(((((((.....)))))))...(((((....))))).((((....))))))...))))))).....((((((((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).))))..............
|
| [ predicted structure ] |
..((((.((((.((((((((....)))).)))).(((((.(((((((.....(((((((((((((((((((((((...(((((((..((((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))....))))))......((((((.............))))))..(((((..(((..(((((((.((((............((((((((....)))...............(((((((....)))))))(((.((((((((((((((((.........)))))))))..........))))))).))).....)))))))))....(((((((........)))...)))))))))))..))).)))))..)))))))..))))))).((((((((....))))))))...(((((...((((..........((((((((((((((...((((((........(((((..(((((.......((((....))))))))).)))))......(((((((.((((.(((.((((((((((((.....((((.((((...(((((((..((((((((((((......))))))).......)))))...........((((.((((.........))))...)))).))))))).....)))).))))...(((...((((((((....))))))))....)))))))))))))))....)))...(((.((((((........(((....((((......)))).....((((....((((((..(((((((((.....)))(((((((.(((.((((....)))))))..)))))))...........))))))..))))))...))))...))).((((((((....)))..(((((((((((((.....(((((((......))))))).....)))))........((((((((........(((((((....)))).))).((((....)))).)))))))).....))))))))......)))))..)))))))))((((((.(((..(((((((((.....))))))))))))))))))......)))).)))))))............))))))...))))))))))))))..............(((((((.((((.(((....(((((((((((....)))))))...)))).))).)))).))))))).......))))..)))))..........))))))).((((....(((((.((((((.(((((............)))))...))))))))))).....))))...)))))))...)))))))))................((((.(((((((.....((((((.((((((((..(((......((((......))))......))).))))))))))))))((((..(((......(((.((((.((((......)))))))))))......)))..)))).............)))))))))))......)))))))))))))))).))))...............((((...(((.......)))..........))))((((((((..[[[[[[[[...((((.....))))....((((........))))))))))))....]]]]]]]]......................((((((((((.........(((((((((((((........(((...(((...((((((((..((((..(((((((......))))))).))))))))))))......)))))).......)))))))).....(((((...(((((.((((......)))).))))).))))).....)))))...........(((((.....((((((....(((...))).....))))))....)))))))))))......))))..((((((...((((..(((.....(((((((.((((.((((((((......)))))))).)))).)))))))...))).))))...(((((((....((((....)))).)))))))........(((((((((((((...(((....(((((.............)))))....))).......(((((((((..............)))))))))))))))))..))))).....(((((((.....((((((....)))))).))))))).....))))))....((((........))))..((((((........))))))....((((((........[[[[[.[[[))))))...]]].]]]]]..((((((((......)))))))).......(((((......)))))(((...)))..((((((((((((((....)))))..))))))))).((((((.........[[[[[[[.....)))))).........]]]]]]]
|
|
CRW_00750
|
[ FASTA input ]
|
GUACGCCGGGGAUAAGUACGACGUGUAAUGUAUAAAUAAUAGGGUAAGAAUCCCUCACACAUGGUUUGCAAGUGUGAAGUGAAAGCCGGGAGCGUUCGGAGUAAUCCGUAGGUUUUAAGUCGGUUGUAGCUUGAUGGUUCCUAAGAUGAGUGAGAGCGAAUAGAUGGUUGAAGCUUCGUAAGGCGUGACCAUAUUUUUAUGGUACUGCAGUUAGGGGUGGGAAGUUUUGUCCCCGUCCACCCGCAAAUCCAAAUAACUGCCGGAGUAGAGUCUGCAUCUAAGGGAACACGAGAAAGUAUUUAUAAGUUAAGCACGGUAAGCCCCAUGUGCACCUGUUUUCGUUUGGUAAACAGGAGGCUAAAGAGUAAUCCAAGGUAUCGCGCAGGGGGUAAAAGACAGCAUAAAAAGCUAAAGCUCACUCUGUAAUGGAGAGGGAUAGGGUCUUAUGGCCGAUCUGAAAGGAUGCUGACUUAUGCAUGGGUGACGGAAUGCUAAUAAUUAAACCUGGUUUUAUAUUAUAUCUAGGUUAUGUUUGGUACUCACUAGAUUAAGUGUAUGACUAAGUAAGGGAUUAAACAUAUCAAUCGCAGUGUGUGUGUAGUAGGUAGGUUAAUACAUACUACUUGUUUAGGGUACCAGUGGUUGGACUGGUCGUAAAGCUUUUAUUACACAUUAUCAGUAUCUUCGGGUCUAGGUAGACGCAUUUGUAUUAAGUCUUCAAGGGGAUAAAUCGGUUCAGGGCGUUAUCAGUAUCUUCAGGGGUACAAUAUAGAUCUCCUCGGACAACAUGAUGAGGAUCUUACGUUGAUAUAAACUGGCUAAGAGCCCGAAAAGAGCUACUUGUCCAUCAAGAAGAAUUAGUAGAGGCAUAUCGUUCGAAAAACAAUGAGGCUGUUGUUAAAAUGCAAUCGCUUAUAACAUACAGCUUUGCAGCAAGGUGUUUGUUUGUUGGUGGUACAUGGAGUUAUAAAAAUUUGUGUUUGCUGCAUGAAACCUACAACAAACAGGUAACUAAAAAUAAAUUGUUAAACAAAAAGAUUGCCCAUCGGCGAAGUCUUGGGAAGGACUGGAUAACACCUGUACCAACCCAAGAUAAGCACGAUGAUAAGUUGCUUGAGCCGUGUGCGUUGAAAGAUGCAUGCACGGUUCUUAGGGGGGGAAAGCCGGUAACCGUACCUAUCCCAAUCAGGCU |
|
[ reference structure ]
|
.....................(((((....((((((((..((((.......))))(((((...........)))))((((...((((((((((((.((((....)))).)))))))....)))))...))))....((((((..((((.((....))...(((((.......((((((.........((((((....))))))...(((((((.(((((((..............)))))))...........)))))))))))))...)))))))))...)))))).........))))))))......)))))....((((((((((((((...........))).....(((.(((....)))..)))........)))))))))))........((((((..(((.....((((((((.....))))))))....((((....)))).((((....)))))))...))))))....(((((...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....)))).))).)))).........
|
| [ predicted structure ] |
....(((.((((((.(((((((((...))))............((((((...(((((..((((...((((((((((..((((((((((((((((((((((....)))...........((((.......((((...((((((.(((((............(((((.......((((((.........((((((....))))))...(((((((.((((((((.......)))).............))))...)))))))))))))...))))))))))..)))))).))))........(((((((((....((((..(((((.(((((.(((((((.........)))))))..(((..............)))...))))).)))))..((((((((.......)))....(((.((((.....)))).))).....)))))...))))((((....))))..)))))))))......)))).)))))))..........)))))))))...............(((.....)))..((((.((((..((((.(((............))).))))...))))..)))).....((((((.(((......))).))))))...((((....((((((......))))))..))))..........))).(((((...(((....)))...))))).))))))))))....((((...(((((((.....(((..........))).((((((....)))))).......))))))).))))..)))).))))).))))))..........(((((((.....(((.....((((.(((((((....................((((............(((((((((((((((((((...............))))).)))))))).......(((...(((((((((..(((.((((.((((((((....)))))...))).))))..)))..)))))))))....)))........))))))............)))).((((.....((((((((.........................)))))))).....))))))))))).))))((((((((((((((....)))))..)))))))))....))).....)))))))...))))).)))))).....))).
|
|
CRW_00751
|
[ FASTA input ]
|
UCGUUUGGCACCUCGAUGUCGAGUGCGAGCUGUUGGUGUAAAGUAAGAAUUUGAUAUCUUACGUAAAACCGAGUGUACUUCAGGGUAAGAGUCACUUAACUAAUAAUGUAGGCGGGUACCCACUCCCGUGUAUCCAACUCUUAAAGGAUACUGAUCGCACAUCCCCACUUAUCAGGGGAGCGUCUCACGGGAUCUCUGAUGCGUAACCACAGAGAUCUCGGAAGCGAGGGUGAAAGUAGUCAAUACCUUACGUAUUGAAGUAAUUGACUAUGAGAAUGUGCUGGACAAGACUACAGCAAGGAAACUGAUGUAAUAAAACGUCUUCAACAGGAAUUCUGGGACAAUAAAUACGUUAGAUGCAAAUCAACCCAGGCCACAAACAAGUGAUCUUCUCACAUGAAGGAGGUACUCCGUACGACAGGAGGCCUUAAAGAGUCUUUAGAGAAGAGGCGUAGAGUCAGGGUCAGGUCCAGUAUUAUACAUUAUUGGAACAGAUAAGUGAGGGAGAAGCUCCAAUUAAUCUUUAAAACUUAAUUGGUGGGGUCGCUAUAAGCUCUCCCUCAUUACGAUUCCACAAGAAGCUAACGGACACAUGUAAUGUGUGUCAUAUGCCCACGUGUGGAGCCGAAGUAGAUCAUUUAAAGAACUGCAGGGUUAAUAAUACUCUUUGCUUGUAUUGUUGUAUGCGUAAUAUACCUAAGGAAUGGAGUAAAAUUCGAUGGCCGGAAGUUGAACAAAAAGUGUAUUACCUACAGUUCUUUAAAUUGAGUAAAGAAGGUAUAGUUUUAUGGAUCCAAAAUAUGGAAUUCCCAAAAGUCUUUAAUUAAGUGUAUGUAAGCAAGACUGCUUUCGAAAAGGGGCACUGCAUGGUUCAUUCUACCUAAUUUAUAGAUGUGAGUCUCUACUCGGUAGGAGCCGUAUGAAUGGAGACAUUCACGUACGGUUUUGGAGUAGCAGGAUAUAUGGUAACAUGUACUUGACUAUAAGCUC |
|
[ reference structure ]
|
.............................((((..................................................................(((((((((((.(((((........)))))((((((..........))))))......(((((....................((((((((((((((((.(((....)))))))))))))))....))))......(((((((((..................)))))))))....)))))((((((..((((.((....))...(((((........((((((...........((((((...........................))))))...............((((((...((((((((((.((((........))))))))).......)))))))))))))))))...)))))))))..)))))).....))))))))))).))))...(((((((((((....((((((((..........))))))))................)))))))))))....(((((((....((.....(((((((.....)))))))....)).....)))))))(((.((((..............................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))....((((((((.((((((....)))))))))).))))......
|
| [ predicted structure ] |
((((...[[[[((((....)))).))))....(((((.....((((((........)))))).....)))))]]]]......(((((............(((......)))[[[[[)))))...]]]]]((((((..[[[.....))))))(((.(((...(((((........))))))))..)))(((((((((((...........))))))))))).....]]]..(((((((((((.....(((((((((.......................(((((..........))))).....................((((((.....))).[[[[[))).........(((.(((....))))))]]]]]..........((((.[[[[))))..]]]](((((.((((....[[[.))))))))).....]]]...........(((.....)))..((((...(((((((........))))))).......(((((((((((.(((((((((((..........))))))))(((.....)))..))))))))))))))....(((((((...........(((((((.....)))))))...........)))))))........))))............(((....(((((((((..[[[[[[[)))))))))..)))...................]]]]]]].((((((........))))))......(((...[[[[)))..(((((((.......)))))))]]]].........(((((((.....))))..)))...................)))))))))...))))))))))).....((((........))))((((........[[[[[[....))))..((((((....(((((((((((((((....)))))..)))))))))).))))))((((.((((((....)))))))))).]]]]]]....
|
|
CRW_00752
|
[ FASTA input ]
|
CAACGGCAUACCUUUUGUAUAAGUGCGACACGAAGUUAUAUCGUACACUUCCGUGAAAUCCGGAAUCGGCAGUGUUACGCCGAUAUUCUACCUUGGCAUGCGUCUGAAGCAAUUCGGGGGUGUGAAGCCCAAGGGACAAUGUAGCCGAAAGCCUUGCGAUUAGGGUGUAGGAGCUAGAAUGAAUCUUUAUGUCUAAUGUAAUGUGAAUCAAUGUUUGAAGCUUCGUAAAAGGUGUCUCUAGAAUCGCCGGGAUAAUAUACCGUCUACUGGAGAAUUGUGGUUAGGUCUGAGGUUUUAUGCUCCGCAGACAGUAACAUUAAACUUGCCACCGGAGUAAAGUUGGAGACUAAGAAGAUAAUAAGUGUGUACAGUGUGGAACGUGGUAAGCCCUUUAUUCUCUCAUAUAACUGAUGAGUGGGUGGAGAGCGAUCUCUGCUAUCGAAUAGAGGGUAAAAGAAAAGAUAAAAAGCGAAUGCCUGGAUGUAACCUUCAGGAUAAUGGUCCAUACCAUGAGAUGAAAGUCUGCUGACUUAUCUAGGUGUGUUUAACCAACAAUCUGUUGUAUUUUAUUAUUAUUCUUACCAUAAAGGUAAAAUAAUUGCUGGAAUUGACUUGUAUAAUGUAAGAAAUGAAAGCAUUAAAUAAAAAGUGGAAUUCCAUAGAUUGGAAAACAACCAGAACUUUUGUUUCUGAUUUACAACAGAAAAUGGUGGUGGCGUAUAAAAAUAAUAAUUGGUCGGAAGUAUUCCGCUUACAACAGCAACUCAUGCACUCAUUCGAGGGUAGAGCUACUGCCGUAAGGAAAGUGGUGUCCAAUGAAGGUAGUAAAACUAAAGGGCCUGAUGGUAAAACCUGGAAAAAGUCUCAAGACAAGUAUCGGGCAAUAGCAGAUAUCCGUGAUCAUCUACUAACGAAAUCAGGCUCCUAUAAGGCAGGCGCCGUUCGAAGGGUCUGGAUCCCUAAGUCCAGUCCCGGAGAACUACGUCCCCUUGGUAUCCCUAAUAUGAUUGACCGAGCAUUGCAAGCACUUGUCCUAUCCUGUCUCGAUCCCAUCGUGGAAGAAAACAGUGACUCGUGUUCGUACGGAUUUCGGAAGUAUCGUAGUACUAACGACGCAAUACAGCGUAUAAGAUUCAUUCUCGAUAAAGCUGGGGCACCCCGUUAUAUAUGGGAUGCUGACAUCAGUAAAUGCUUUGAUAACAUUUCUCACACAUUUCUUAACAAGGUUGUGAGGGAAAAUCUUUGCAGGAAGGGUUGUGAGCUUGUCGAAGCGUGGUUGAAAGCGCCAAUAAUAGAAAAAGGUUCCAAGAGCUACCCAAGUAGAGGCACUCCACAGGGAGGGGUACUUUCGCCAUUAUUAUGUAAUAUGACUCUAAACGGGUUAGAGAAUGUAAUUCGAGAUGGUUUACCCUCGUCCAGUAGUACGGCAGGGAGGAAACUUAAAGGGAGAUGGGUUGUGAGAUACGCGGAUGAUUUUAUUAUCACCAAUCCGAUUGGUAAAUCUCAAUUUAUAGACAACGAUAUUCCUCUUAUAAACAAAUUUAUGGCCGAUCGAGGUCUAGAGAUAUCUGAAAAGAAAUCUCGAAUCAUAGACCUCGAGAAAGAAAGUUUUAACUUUCUAGGCUGGAAAAUAAGUCAACGUAAGAGAAAUAUUUCUGUCAAUAAGGCGAGCGAUAGCAGACUUGUUCUUGUUGUCGAACCUACCAAGGAAUCUAUUAAACGGCUUAAAUCGCGUAUUAAAUUGGAAUUCCGAUCUAACAAGCCGAUAGGAGCCUUGAUUAAAGAUUUAAACCCAGUCCUUCGAGGCUGGGCAAACUACUAUCGAGGAUCUUAUCACUCCCAGCAAAGUUUCCAAUCGAUUGGGCACUAUGUUUACCAGUUAUUUUGGAAAUGGGCUCAAAAGAAACAUUCGAGUAGGAACAAACAAUGGAUCUACGACAGAUAUAUUGUAAGGACCGAAAAGUCGCUCUUGGCAAUAGGCGUAGAUAAAAAUCUACUUCUGUACGACAUAACCCAAGCAAAGCAGAUAAGGGUUAGUAACCUAAAGAACAAUAUCAAUCCAUAUACUGAUAAUGAUUACUUUGUUAAUCGUGUUAUUCUCAGGGAUGCAGAUAAAUUUCGGAAGGCUAUCUAUAAACUGAAUAAAUUUAGGUGUUUUGUGUGUAGAGGAUCACUGUACGGUGAUGAACCUAUACACCUCCACCACCUAAUCGCUAGAAAAGAUGGUGGAGAGUAUACCCUGAAAAAUAUAGUACCAGUACAUGCAAUUUGCCAUGACAGUAUUACAUAUGCCGUAAAGUAAAAAUAUGAUGGGAGUUUUACCGCCCCUAUCAUGUUAUUUAAUAGAAUAAACAUGCUUCAGCCGUGUGCGGUGAAAGUCGCACGCACGGUUGUGAGGGGGGGAAAAUCUGUGAAGAUCUACCUAUCCCGAUUGGGCAAG |
|
[ reference structure ]
|
............................((((...((((((.(((((((((((.......)))))(((((........)))))(((((((.((((((((((.((((((....)))))).)))))....)))))..........((.....(((((......)))))......))))))))).((((((..((((.((.....))...(((((.......((((((.........(((((((......(((.........)))....)))))))...(((((...((((((((.........))))))))...............)))))))))))...)))))))))...)))))).......)))))).))))))..))))....(((((((((((.(((((.......)))))..((((((((....))))))))...)))))))))))........((((((..(((.....((((((.......))))))...(((((....))))).((((....)))))))...))))))..(((((((((.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).))))...........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((.((((((.....(((((((((((.(((((........(((((((((..(((((....(((((((((((((((........(((((((((((.((((((....)))))).)))))....))))))..((((...(((....((((((....))))))...((((((.((((......((((((...))))))...........))))..))))))......))).(((((((......(((.........)))....)))))))))))))))...(((((.(((.....)))...))))).)))))))......)))).))))).........(((((..........((((((((...((((((...(((((((..(((((((((((.(((((.......)))))..((((((((....))))))))...))))))))))).................(((..(((((.......((((((((((((.((((.((((((...((((((..(((....))))))))).))))))....))))....((((((((((((((((((((((.(((((.....)))))))))))((((...(((..((((.......)))).)))...))))...))))))).((((....))))........((((((.........))))))......)))))))))..(((((((((((.......(((....)))...(((((...))))).((((....(((.....))).(((....))).)))).)))))))))))...........)))))..)))))))...........(((((((((((((...))).(((....(((....)))...((((...........)))))))(((......))).......))))))).)))...)))))..)))..(((...(((.((((((......)))))).))).))).)))))))....((((((((........)))..)))))))))))...))))))))........))))).......)))))))))......)))))))))).))))))......))))))....((((((((....((((......))))...(((.....))).......(((((((((.(((((.....))))).))))...(((((((......((((((...((((((.((((..((((...)))).)))).))))))..((((((.....((((((((.((((....)))).((((.......))))...((((((.......(((((((((((((...........((((....))))))))).(((((..(((((...))))).((((((.....))))))..((((((...((((.........((((.(((.........))))))).((((((((...(((((.....((((..((((((((((((((......))).....(((..((((((...(((........((((..((((((.(((((((......((((((((((..(((((((((((((((.(((....))).)))))......))))))))))...(((((((....))))))).)))).....))))))....))))))).))))))..))))........)))(((((((((........)))))))))....))))))))))))..((((.....))))..))))))))..(((((....)))))...))))...(((((((.((((((((((....)))..(((((((......))))))).........))))))).))))))).)))))....))))))))..))))((((((.((((.....((((.....))))..)))))))))).....))))))..(((((.............))))).((((.....))))......)))))....))))))))........((((((....))))))))))))....))))))))..)))))).......(((((...))))).........))))))......))))))).(((((((......))))))).......(((((((((((((((.............)))))..((((((((....))))...)))).((((((((...((((((....))))))....))))))))((((((((..................)))))))).)))).))))))...........))))).((((........))))..)))))))).))))))))....(((((((((((((((.........[[[))))))))))).))))..............(((((((((((((..((((...)))).)))))))))).)))((((((...((((....))))...)))..))).....]]]...
|
|
CRW_00753
|
[ FASTA input ]
|
AUGAAUUGCGAAAGAAGUUUUUUCGGUUAAAACGCCGUGCGACUCGGAGGACAUAAGACUUCUUGGUCAAGCCAAAAAGAUUGCCGGCAGAAUGCUCCUACCCCACCAUGCCUGGCCCUUUACCUUACCUUAAGAAUAAGGGGGUAUGCAGCGUGGGAAAGAAUUAAAGAAGUGUCUGAUACAACAGGUAACCUUAAGGAGUGGCGGCAAAGCUCUUGAUUGAUCAACGCGAGUGAACUGUGCUUAGACGCUUCGUAAAACCGCACCGAUCUACGAGAGGAGCUGAUGGAUGAGUAGGCUUCCCCUUUCGAUUUACGGAAUGUGAUCUGGGACACGAUGGGGGUUUGCGUGCCUCGGUAGGAAAGAGAUCACCGGAGUAUAGCACAAGAUCGCCUUUUUUUUCUUGCUGCCAUGGGGUCGACCUGUAAACAAGGUAAACCCAAUGGGAACCAAAAACGGGAGGGUACCACAUUGACAUUGGGCAGAAGACGAUCCAAAAAGCGAAGGCUCACCCUGCUGAAGGCGAUCGGCAGUGAGGGAUGCUUACCUUCUUCUUAGAGAAAGGGGAAAGGGGCAACCUAUCUUACUAAUAAUAAGAAAGGGGGUGAGAUAGGCGACAGGUAGCUUGCUUCCAAGCCGGCCGCGAGGAAUCAAGAGAUCUUUGCCGGUGCUGACUUGGAUCUCGGGUGACGGAAAAAGGCGCCCAGAAGUGACGAGCAGUCGCGGUCGAAGCUUGGCUACAGCGAAGCGCUUACCAAGCGCGAAGGAUUCGUUCCUCUCUCCCAGCAAGAGGACCUCCAAGUCAAGCGCGCUAGCGCGCUUUACCAAGGCUUUCUCUGAUAGGGGCUCGAACGCCGUUGCUUGUUUGGGUCGAGCGUCUUCAAACCUUCGCCACUUGAGCCGUAUGCGGGGGAACUCGCACGUGCGGUUCUUAGGGGGGAGAGCUAGUAGGAACCAUCCUAUCCCAAUAGCGUUUAUUUGGAGCUCAAU |
|
[ reference structure ]
|
..........................................((((.....((((((.(((((((((...)))))..(((((........))).))(((..((((((((((((((....))).....(((((....))))).))))))....)))))............................))).........(((..(((((..(((((((..............(((((.....)))))))).)))).......)))))....)))......))))))))))..))))....((((((((.(((.(((.((((......)))))))..))).))))).(((.......))).)))......((((((...................(((((....((((.......((((((..((((.......))))...(((((((...(((...........)))..........))))))).......((..........)).......))))))...))))........(((((((..(((((...((((((((.....))))))))..))))).....)))))))..........)))))))))))...(((((.((((......................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))....((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((..((((....))))..)))..))))........................
|
| [ predicted structure ] |
.....((((..[[[[[[[[[[....[[[......[[[.))))..]]]..]]]..]]]]]]]]]]((((..[[[.....))))...]]].....((((((..(((((..(((....(((((((.((((...))))..)))))))....)))..)))))...........[[[[[[[[[[[(((.....)))......))))))(((......))).((((....)))).(((.........)))]]]]]]]]]]]..............(((..[[[[[[[[[[[))).........]]]]...]]]]]]].....((((.[[[..))))..]]].......(((((((((((..((((....[[[[[[..))))..)))).)))...))))........]]]]]].(((((((.((((..((((.......))))..)))).))))..[[[.....)))...]]]...............(((((.....[[[[.....(((....)))....)))))......]]]]((((..[[[[..))))..]]]].((((((.............[[[[[[[[[[[[[[[[[[.....))))))....]]]]]]]]]]]...........]]]]]]]...((((((.............[[[[[[[..))))))........]]]]]]](((((...........)))))......(((......[[[[.)))...((((((....((((...))))..))))))]]]].(((.....[[[[[[.))).....]]]]]]..........(((((((....)))))))......(((..(((.....)))[[[[[[[[[))).......]]]]]]]]]..(((........[[[.))).....((((((((((((((....)))))..)))))))))..]]](((..[[[[[.((((((....)))))))))(((((...)))))...]]]]]...
|
|
CRW_00756
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGGGAUAACAGGGUGCGACCUGCCAAGCUGCACAAUUCAAUGUGGUUAGAAAACCAACUUGGAAUCCAAUCUCCAUGAGCCUACCAUCACAUGCGUUCUAGGGUUAACCUGAAGGUGUGAAGCUGAUGGGAAAAAGUAACCCAAACUGUAUGUGACAGUGAGGGGGCAGGCUAGAUUCCUAUGGGCAAUGUAAAUGAACACUCAUCUGAGGCAUCGUGACCCUAUCACAUCUAGUUAAUUGUGAGAGAAUCUUAUGUCUCUGUUUCAUAAGAUUGAUUGGACAAUUUCUCACCGGUGUAAAGAGUGGUCCUAAGGGAAUCAUCGAAAGUGAAUUGUGCGGAACAGGGCAAGCCCCAUAGGCUCCUUCGGGAGUGAGCGAAGCAAUUCUCUCUAUCGCCUAGUGGGUAAAAGACAGGGCAAAAAGCGAAUGCCAGUUAGUAAUAGACUGGAUAGGGUGAAUAACCUAACCUGAAAGGGUGCAGACUUGCUCAUGGGCGUGGGAAAUCAGAUUUCGUGAAUACACCAGCAUUCAAGAGUUUCCAUGCUUGAGCCGUGUGCGGUGAAAGUCGCAUGCACGGUUCUACUGGGGGGAAAGCCUGAGAGGGCCUACCUAUCCAACUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....................((((.....((((((((((((...((((......))))...((((........))))..(((((.(((((((((((.(((..(((....)))))).)))))....))))))......((..(((..(((((.....)))))..))).))))))).(((((((..((((.((....))...(((((.......((((((........................((((((((((((((((.........))))))))...........))))))))))))))...)))))))))...)))))))........))))))))))))..))))....((((..((((((((....)))..(((((((....)))))))....)))))..))))........(((((((..((.....((((((.......))))))...((((.....)))).((((....))))))...)))))))....(((((((((.................................)))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).)))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...(((.......((((...((((((((((((...(((((....))))).((((((........)))...(((((.(((((((((((.(((.(((.....)))))).)))))....))))))..........(((..(((((.....)))))..)))...))))).(((((((..((((..(((......)))....(((...(((((((((.....))))............((((((((((((((((.........))))))))...........)))))))).)))))..)))...))))...))))))).....))))))))))))))).....))))...)))....(((((....)))))(((.(((....))).))))))).))))))............((((((..........((((((.......))))))...((((.....)))).((((....))))......))))))..(((((((((((.......(((.(((((...[[[[.))))).))))))))))))))((((((((((((((....)))))..)))))))))..]]]](((....((((....))))...)))..........
|
|
CRW_00757
|
[ FASTA input ]
|
GUAUUAGUAGAUCCAGCCAUUACUAUCAAAGCUAUUGGACAUCAAUGGUAUCGGAGUGCGCCUCUUAACGAGGGUGAUUUAAGUGCAACGAAAUGUACCGGUGGUUCGCGAAGCAUCUGGCUUACCGGUCAUCUCCCAUUCCCGUCGUCGAGAGACUAAAAGAACUAUAGCAUGCCAGAAACGGGGAGUUGAGGUGGUUAGACCUAUACCCCGAAAUGCUCCCAGCAUAGGAGCCUAUGGUUCCAUUCUUGUUAUUGCUGGAGGUACACAUACCUCUUCUCGGUGUGGUGGAGCGAUAUACGAAAAAUAGAUGCUAAGCCCGCAAUGUCCGAUAACGGGGCUUCAGUAGUGAAUCUAUCGGCACCACAGCAGUGGCAUACAACUUUGGACCUAAGGGCCGGCCCCGUUACCUUUCGGAAUGGGGGAUCCCCGUUGGCAACAACCACGGUAGUAGUUGCGGAACUACUGGGCCAAGAGAGGACAACCUGUUGUUCCUGCUCCUCCUUCUUCGCUUCGGGGACGGAGGUCCUACGGUAGGUAAGAGCACGCACAAGCACUUGGCCGAAGGGGACCAGCGCUUCUACUCCUCCACCGAGGAGCCGUUCUUGCGAGAAGCAAGGGAUGUCGUGAACGGUGGGAGGUCAAAGAAAGAGAAUUGACCUCUGAAUACAGUGAUCCUAUGAUCUAGAUAGACUCCGUCCUUUUUUUUUAGAUAAGGGUGACUCAAGAGGGGGGAGAACUACCUAACUAAAGAAGAAUAGCGCUCUUUAAAAAUAAGAGUAGGCGUGGAGAGCUUUUUGCGGGGAAACUUGCAAGUCAAGUUUGGGGGGAGGCGGGCGUCGACCCAACCUUAUGAGUAUUCGGACUAUAACAGUUCCGAUGAACAGUCACUCACUUUUGACAGUUAUACGA |
|
[ reference structure ]
|
............................................................((((....((((((..........(((......)))................((.((((((.........................(((....))).................))))))....((((((............................)))))).))......((((..(((((.....((((.(((((((((((........))))((.(((((((.........)))).))).))(((((....(((((((.............))).))))..........))))))))))((((....)))).))))))....)))))...))))............))))))....))))..((((((..(((.........................................................................))).))))))....((((((.((((.........................))))...)))))).((((((.........................................................................................................................................................................................................))))))...((((((((((((((....)))))..)))))))))..((((((((....)))).)))).................................................................
|
| [ predicted structure ] |
..............................((((((((...))))))))...(((...[[[[))).......]]]]......((((..........[[[[[[[[........)))).....]]]]]]]].((((((((((((......((((((.............(((((....((((.(((((.....((((......))))...)))))..(((((...))))).((((((...)))))).))))......)))))((((((....))))))))))))(((.(((..((((.(((.......)))..))))..)))))).........(((((((((....((((.....))))((((.((((....)))).......(((((....))))))))))))))))))......))))))))))))........(((((.....[[[[[[[.)))))...]]]]]]](((((((...((((((....))))))..((((((((.((((((...)))))).))))..((((...))))...))))...........)))))))..(((((...[[[[))))).((((((....)))))).]]]](((((.....)))))(((((((.......((((((((((((..........)))))))))...)))...((((....))))..))))...))).(((((((((((......[[[.......)))))))))))......]]]..............(((((((((.......)))))).[[[.......)))..(((((((....)))))))]]].......(((.[[[[..........)))..]]]].((((...(((((..........)))))..[[[.[[[[))))....]]]].]]]......
|
|
CRW_00758
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUGGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACAUACCGAAAUAAGGUGAAACCGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUACGGUUCCUUAGACUGUACUUUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCAUCAGAGCUCCGACCUUCGGGGACGAGCGCAUUUAUUAGACCAAGACCAAUCGGACUUAGGUCCGCAAACUGUGGUGACUCUGGAUAACUUUGAGCUGAUCGCACGGUCUAGCACCGGCGACGUAUCUUUCAAGUGUCUGCCUUAUCAACUUUCGAUGGUAGGUUAUGCGCCUACCAUGGUCGUUACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGGCACGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACGGGACUCUAUUGAGGCCCCGUAAUUGGAAUGGGUACAAUCUAAACCCUUUAACGAGUAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGUGGUUAAAAAGCUCGUAGUCGGAUCUCAGAUCCGGAGCUGCGGUCCACCGCCCGGUGGUUACUGUAGCGACCGGACGUUUGGCCGGAUUCCUUUGAUGCUCUUUGCCGAGUGUCUUGGGUGUCCGGCACGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGCUCAAAGCAGGCGUACCGCCUGAAUAAUGGUGCAUGGAAUAAUGGAAUAAGACCUCGUCUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAAAACGAGGAAAUGAUUAAGAGGGACAGACGGGGGCAUUCGUAUUGCGACGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGUCGCAAGACGAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGAGGUUCGAAGGCGAUCAGAUACCGCCCUAGUUCUAACCAUAAACGAUGCCAACCAGCAAUCCGCCUGAGUUCCUCAAAUGACUCGGCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUGUUUGGGUUCCAGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCUUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCCGGCCCGGACACUGGAAGGAUUGACAGAUUAAGAGCUCUUUCUUGAUUCAGUGGAUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUAGCCUACUAAAUAGACGAACGAUCACUGGAGUCGUUCGAUCUUCUUAGAGGGACAAGCGGCUUUUAGCCGCACGAGACAGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAAGGAAUCAGCGUGCGUUUACCCCUGUCCGGCAGGACUGGGUAACCCGAUCAACCUCCUUCGUGAUAGGGAUAGGGGCUUGUAAUUCUUGCCCUUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGCACGAGUCAUAAGCUCGUGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGAUUUAGUGAGGUCUUCGGACUGGCGCUCGGAGCGGCCUUACUGGUCGCGCCGGCGUGCCGGAAAGAUGACCGAACUUGAUUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGGAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((....(((.......)))...)))))......(((......(((((((...((....((((((..........(((((...(((((((.....)))))))....))))).......(((((..((....))..)))))....(((((........((((..(((((....))))).......)))).......)))))...........((((.((((.....)))))))).))))))...)).)))))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((...))))).)))).....)))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))....................................((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((......(((((.....((((((((((((....)))))..))))))).....))))).........(((.(((.(((((((......)))))))..))))))...................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((..((((((.((((((......))))))))))))..))....((....))..))))....))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((((.(((.((((.....((((((((.......))))))))......))))))).....(((((.....)))))......)))))..))))).)))...).))))))).....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((.......(((.((((....)))).))).....))).....)))))))......(((((((((((.........))))).)))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((..(((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((.((((((.....)))))).)))).)))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((...)))))))(((.(((..((((((((...))).))))).....))).))).................((((..(((((((.(((((((......(((((((((((.....))))).....(((.....))))))))).......(((((((((((((.((((.......((((((...))))))......)))).))))))((((........(((((....))))).......))))..)))))))......))))))).))))..)))....))))(((((((........[[[)))).))).......]]]...(((((((((.....)))))))))(((((((((((.......((((((.[[[[[[)))))).......]]]]]]..........................((((.(((((........(((((((((((......))))).................(((((((((.(((....)))..))))).))))...)))))).........((((((((..........))))))))...))))).))))(((.[[[[[[[[......(((..(((((((..........)))))))..))).....))).....(((((((...))))))).]]]]]]]](((((....)))))...)))))))))))..((((...(((((((.(((..(((((((......)))))))..))).)))))))))))...((((((..........[[[[))))))((((((...)))))).........]]]]..............(((.[[[[[[))).(((((....((((((.....))))))......)))))......]]]]]](((.(((((.((((((((...((((......))))....)))))))).))))).......[[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]....(((...(((....)))...[[[[.[[[[[[[....)))..]]]]....]]].]]]]...........((((((....((((((.(((((........)))))))))))..((((((.((((.(((((...))))).))))...)))))).)))))).....................(((......[[[[.[[[[)))..]]]].]]]](((((....(((.........[[[[.)))....]]]].((((((((....((((....(((((((....(((((.(((((.((((((((.....(((.....)))((((....(((((((........((((.(((.............))).))))......)))))))......))))..))))))))(((.(((..........))).)))..((((((...)))))).))))).))))).......))))))).....))))...)))))))))))))(((((((((.....[[[[[[...)))))))))((((((..((((....)))).))))))...........]]]]]](((..((((.(((((((..((((((.....((((....))))...........(((((((((.....))))))))))))))))))))))))))...))).((((..(((....((((.....((((((((((.(((..((((......(((((((((((.((((((.....)))))).)))).)))))))......))))..))).))))))))))....))))........(((...)))..))).))))..(((.....))).......
|
|
CRW_00759
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACAAGCCCCCAGUGGGCGAAACCGCGAAUGGCUCAAUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUAGAUCGUACUAUAUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCACAAUAGCCCCAACUUCACGGAAGGGGUGCUUUUAUUAGAUCAAGACCAAUCGGGGCUUCGGCUCGUCUCUUGGUGACUCUGAAUAACUAUAGCCGAUCGCACGGUCUCGCACCGGCGACGUGUCUUUCAAAUGUCUGCCUUAUCAACUUUCGAUGGUAGGCUAUGCGCCUACCAUGGUUGCAACGGGUAACGGGGAAUCGGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCAGCACGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACGAUGCAGGACUCAUCCGAGGCCCUGUGAUUGGAAUGAGUACACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAACUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCGGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUAUGGGUCUCGGUCGGGUGGUGCCGCCUCACGGUGGUCACUGCCUCGAUCGGACAAUUCAUUGGAUCGUUCGGGGUGCUCUUAACCGAGUGUCCUGGGUGGCCGAUACGUUUACUUUGAACAAAUUAGAGUGCUUAAAGCAGGUGCACCGCGCCUGAAUAUCACAGCAUGGAAUGAUGGAAUAGGACCUCGGUCUUAUUAUGUUGGUUUUCUGGACUUGAGGUAAUGGUUAACAGAGACAGACGGGGGCAUUCGUACUGCGACGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGUCGCAAGACGAACAACUGCGAACAAGUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGAGGUUCGAAGGCGAUCAGAUACCGCCCUAGUUCUAACCAUAAACGAUGCCAACCAGCGAUCCGCGGACGUUACUUGAAUGACUCCGCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUGUUUGGGUUCCGGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCAGGCCCGGACACUGGAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCAGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUAGCCUGCUAAAUAGACGAUGGAUCCUAGUGGUGGAUCGCUCUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUCUAGCCAUAUGAGAGUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGAAGAAUCAGCGCGUCCUCCCUGUCCGAGAGGACCGGGUAACCGCUGAACCUCUUCCGUGGUUGGGAUUGGGGACUGCAAGGAUCCCCAUGAACCAGGAAUCCCUAGUAGGCGCAAGUCAUUAGCUUGCGUCGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUGAUUUAGUGAGAACUUCGGACGACUCGCCAGGGCAGCUCCGGGCCGCUCGUGGUGUGGUUGAAAGGUUGUUCAAACUUGAUCCUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((....(((.......)))...)))))......(((......(((((((...((....((((((............(((((...(((((((.....)))))))....))))).......(((((..((....))..)))))....(((((........(((((...((((....)))).....))))).......)))))..........((((.((((.....)))))))).))))))...)).)))))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((...))))).)))).....)))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))....................................((((((.......((((....................)))))))))).))))))).))..........(((.......((((...((((......(((((.....(((((((((((((....))))).)))))))).....)))))..........((((((.((((((((......)))))))).)))))).....................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((..((((((((.((((......))))))))))))..))....((....))..))))....))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((((.(((.((((.....(((((.(((.....))).)))))......))))))).....(((((.....)))))......)))))..))))).)))...).))))))).....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((....(((.((((....)))).)))....))).....)))))))......(((((((((((........))))).)))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((..(((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((...........)))).))))).)))))))).)))))))..))))))))))))))))).)))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((....(((((.(((((.((((..((((((((...))).))))).))))..((((........((((((((((((((....))).....(((((..........(((((((.....)))))))...(((((.....))))).(((((((.((((.((((((((((...........(((((...(((...)))))))).....))))))(((((((.......((((....))))...)))))))..)))))))).)))))))(((((((((.(((((((((..((((((((.........))))).)))........((((.(((((((((.....))))))))).(((((...((((((...((((((((...))))))))(((.....((((........))))......))).......................)))))).(((((......)))))...)))))))))........))).(((....))))))))).)))))))))..))))).........((((((....))))))))))))).))))..((((((((..((((((((((((((((...(((.....))).........))))))))))))).....)))....(((((((((..(((.((((((((((((((((((....))))).))))))).))))))))).....(((((......(((((.((((......)))).))))).....))))).....((((((((.....)))))))).......(((((((...))))))).))))).)))).......((((.((((((((....)))))))).))))(((((((((...(((((...(((((((...(((.((((((((....))))).))).....((((.((((............((((....)))).......(((((....)))))......(((((((...((((...(((....)))...)))).))))))).........)))))))))))))))))).........((((((....((((((((.((((......))))))))))))....((((.((((.(((((...))))).)))).)))).....))))))..((((((....((((.....)))).....((((.((((.....)))).)))).)))))).......)))))..))))))))).))))))))..))))))))).)))))...)))...((((....))))..........((((((((..(((.(((((((((........))))))....((((.(((.............))).))))....))))))....(((......[[[[)))......]]]]...........((((((....(((((((((.........[[[[[[[...........[[[[..[[[[)))))))))..]]]]..]]]]...]]].]]]]((((((.((((((......(((.((((....)))).)))....))))))...))))))....((((...((((((.....[[[.))))))....)))).....]]]....(((((((((.....)))))))))......))))))............)))))))).((((((...[[[[..........)))))).....]]]]((((((.....(((((((((((.((((....)))).)))......))))))))...[[[[.((((....))))......))))))..]]]].((((((((((....))))))))))........
|
|
CRW_00760
|
[ FASTA input ]
|
UCCCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUUCAAGCGAAAAAUAAAGUGAAACCGCGAAUGGCUCAUUAUAUCAGUUAUGGUUCCUUAGAUCGUACUUACUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCGUUGGGCUCCAACUUUCGGGAAGGAGCGCUUUUAUUAGAUCAAAGCCAAUCGAACUCUCGGGUUCGUUUAAUUGGUGACUCUGAAUAACAUUGCUGAUCGCACGGUCUUGCACCGGCGACGUAUCUUUCAAGUGUCUGCCUUAUCAACUGUCGAUGGUAGGUUAUGCGCCUACCAUGGUUGUAACGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCAGAACGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACGAUACGGAACUCAUACGAGGCUCCGUAAUCGGAAUGAGUACACUUUAAAUCCUUUAACAAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUCAGAAUUGUUGUGGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUCGGUUUCAGGUGAAUGGUGCAUCUUGCGAUGUUUUACUAUUUGCUUGGACGAUUUUGUUGGUUCGUUCAUAGUUCUCUUUACUGAGUGCUUUGAGUGGCCAGCACGUUUACUUUGAAAAAAUUGGAGUGCUCAAAGCAGGCGCUACAGCCUGAACAUUAGUGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGAUCUCGGUUCUAUUUUGUUGGCUUUCGGAGUCGAGGUAAUGAUUAAUAGGGACAGACGGGGGCAUUCGUACUGCGACGUUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUCGUCGCAAGACGAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGAGGUUCGAAGGCGAUCAGAUACCGCCCUAGUUCUAACCAUAAACGAUGUCGACCAGCGAUCCGUCGUCGUUAAUUUUAAUGACUCGACGGGCAGCUUCCGGGAAACCAGAGUGUUUGGAUUCCAGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAAGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAUCUCACCAGGCCCGGACACCGGAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCGGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCCUAUUAACUAGACGUUAUAUCCUAUUAUGGGUUUGACGAUGCUUCUUAGAGGGACGGGCGGCUUUUAGCCGCACGAGAAUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAAGAAAUCAGCGUGUGCUCCCUAUCCGAAAGGAUUGGAAAUCCGUUGAACCUUCUUCGUGAUGGGGAUUGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCAGUAGGCGCGAGUCAUAAGCUUGCGUCGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUCGAGUGAUUUAGUGAGGACUUCGGACUGGUCUUCGAUGUGGCUUUACGGUCGUGUCGUUGUGCCGGAAAGAUGCCCAAACUUGAUUACUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((....(((........)))...)))))......(((......(((((((...((....((((((.........(((((...(((((((.....)))))))....)))))......(((((..((....))..)))))....(((((........(((((.((((((....)))))).....))))).......))))).........((((.((((.....)))))))).))))))...)).)))))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((...))))).)))).....)))))....(((((((((.(((....)))..)))))).)))....................................((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((......((((((((..((((((((((((....)))))...)))))))..))))))))..........((((((.((((((((......)))))))).))))))...................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((..((((((((.((((.......))))))))))))..))....((....))..))))....))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((((.(((.((((........(((((((......)))))))..........))))))).....(((((.....)))))......)))))..))))).)))...).))))))).....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((....(((.((((....))))))).....))).....)))))))......(((((((((((.........))))).)))))).....))))))...((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((..(((((((((((((((((..((((((((((((((.((..(((((((((....)))))))))..))..))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))........((((((......((((..[[[[[[....)))).....)))))).........(((....)))..]]]]]].....((((...(((((((.....))))))).[[[[[[[...))))...]]]]]]]...................(((..[[[[[))).........]]]]].......(((((.....((((((((((((....))))))....))))))...)))))...(((((.....((((.((((.....))))))))....[[[[[..))))).(((((...(((((....(((((((((.....))))))))))))))....)))))..]]]]]........(((((((((((.....((((........))))......)))...((((((.....((((....((((((...((((......))))))))))............(((((((((.(((....)))..))))).))))...(((((((.....(((((.........(((((((.....((((....(((....))).((((((..((((((..(((.....)))........))))))..)))))).....)))).....)))))))....(((((((((((((((((((....)))))...)))))))))))))).)))))(((((((.((((((.(((.(((......))).))).)))))))))))))..((((.(((....))).)))))))))))...(((((......))))).......))))......((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))).....((((((((..(((((......(((((((((..(((((((...((((......))))....)))))))..)))))....(((....)))..)))).....)))))..))))))))..(((....)))...((((.(((((((....[[[[.))))....))).))))........]]]]....(((((.[[[[[[))))).............]]]]]](((((((((.((((.(((((...))))).))))..))).[[[..))))))...]]]....(((....[[[[[[[...)))(((.((((.....)))).)))......]]]]]]]..........(((...........(((((((...)))).......(((((((((((((((....((((((.(((((((((((((((((.(((.....(((((((((((........((((.(((.............))).))))......))))))))))).(((((.((((......)))).)))))...........(((((((.((((((...)))))).(((.............(((((.((((((((((..(((...)))))))....(((((.((((...(((....((((((.....(((..((((....)))).)))....))))))...((((((((.(((((((.(((.........))).)))))))..)))))))))))..))))))))).)))))).)))))..)))....))))))))))...))))).)))))))).........))))))))))........((((((((.......))))))))....)))))).))))).)))).....))).........)))...((((.((((((.....))))))..[[[....))))..(((((((((....))))))))).]]].....
|
|
CRW_00761
|
[ FASTA input ]
|
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUCAGUUCAGGCCUUAAUACGGUGAGACCGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGCUAUGGUUUAUUGGAUCGUGCCCGUUAGAUGGAUAACUGUAAUAACUCUAGAGCUAAUACAUGCCUCGAUGCCCUGACCCUGCUCAUGUUUGCCUUGCUUGCAUGUGGGGGGGAUGGGUGCACUUAUUAGAUCAGAAGCCAACCAACUGUGCGGGUGCAGCUCACUGCGAGGUGGACGUCGCGUGCGUUGAGACACUUACUUCUGGAGACUCUGGAUAAUUGUUACAGAUCGCAGUCGGCGUUGAGUCGGCGACGGGUCUUCAAAUGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGUGACCUGCCUACCAUGGUGGUAACGGGGUAACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACUUCCAAGGGAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCAGCACGGGGAGGUGGUGACGAAAAAUACCGAUGCGGGACUCCUUCAAGAGGCUCCGUAAUCGGAAUGAGUGGACUCUAAACCCCUUCACGAGGAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAACUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUCGGUGGCAUUGUCGCCUGUUGGUGGAUUGAGCGGCCGGUGUGUGGUUAUCGGUGCGCGGUUGCCUCGGCGCCUGCAUGUUGGUGGGCCGGUCAGUAGUUGGGCUGGUAGGUUGGCGUUUGUUGCGUUAGGGUGGUUGGUUGGUUAGUUGACCAGCUGAUGUGCUCUUUCGUCGCGCGCGCGCUCGCUUGCUGGCCGAUUGGUGAGCUGGCUCGCUCGUUCGCCUGCAGCGUUGGGGGGGCUGUGCAGUCGCGGCCAUGAGCAAGCACUGUCGCGUCAAGCCGACGAGGUGGUGGUGUCGCCUUUAAGCCAUGUCUGUGGUGUAGUCGUCGCAGGUGUGGGCGGGUGUUGGGCAGUGCCUGCACACUCUGUGGAGCCUGUCGGCUCGUCCACAUGCCUUUGGAUGCCCUUGAUUGGGUGUCUGCGGGCGGAUGGCACGUUUACUUUGAACAAAUUUGAGUCGUCAAGCCAGGCCGAUGUUGCCUGUAAAGUUUUGCAUGGAAUAAUGGAGGAGGACUUCGGUUCUAUUUCGUUGGUUUUCGGAUCCGAAGUAAUGAUCAAAAGAGACAGGCGGGGGCGUUUGUAUGGCUGCGCUAGAGGUGAAAUUCAUGGACCGCGGCCAGACAAACUAAAGCGAAGGCAUUCGUCAAGCAUGUUUUCAUUGGCCAUGAGGGAAAGUCAGAGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUUCUGACCAUAAACGAUGCCAACUGACGAUCCGUGGUGGUAGCGACGUUGCCUUCCCCACGGGCAGUCGCCGGGAAACCGUUAAGUGUUUGGGUUCCGGGGGAAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUCACCCGGCCCGACACUGUGAGGAUGACAGAUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUGGUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCCAGCCUGCUAAGGAGUGCGUUCGUCGACUGCGCCCGCGUGGGUGAGCUGACGAUCGUCUGUACCGUGUGCAGUUUGCGCUCUUUGCCUCUCUCCUCUCCUCAUGCACUUCUUCGUGAGAGGGGGUGGGUGGGUGGGUGAGGGGGUGAGAGUGCAGGUUGACGCAUACGUGGUUGGUAGUCUGGCGUUGGCUGCGGGUGCGGCGCGAAUGUCCAUCCUCCAGAGGGACAAGCGGGAGAAGCCACACGAGAUAGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCCGCACGCGCGCUACAAUGACGGUGUCAACGAGUGGGACCUUCUGGCCCGAGAGUUGGGCAAACUGGUCAAUCACCGUCGUGACAGGGAUCGGGGCUUGGAAUUGUUCCCCGUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAGUGCAGGUCAUAAGCUUGCGCUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAGUGGUUUAGUAAGAUCCUUGGAUCGGCGUCAUUGUGGCAGUUGCCGGAAGGUCAUUGUCCUGCAGUCGCUGAGAAGACGACCAAACUUGAUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).(((.(((((((.(((((.........(((.(((..((...(((....................)))))......(((......(((((((...((....((((((.........(((((...(((((((.....)))))))....)))))........((((..((((...(((((((((...)))))))))...))))..)))).....(((((((((((((((.......................(((((....)))))........................)))))))....))).)))))..........((((...((((.....)))))))).))))))..)).)))))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))....((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...))))))......((.(((...(((((...))))).)))))....)))))....(((((((((.(((......)))..)))))).)))....................................((((((.......((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((...((((((.(((((.........)))))))))))...))....((....)).....)))....))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........)))).........((((((...(((((.......((((((.......))))))......)))))...((.((((..((((((((((..(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(((.((..((((.(((((((....((((((((((..........................................................................................................................................................))))))))))..))))))).....)))))))))..((((((((....))))))))...))))...))))).)))...).))))))).....))))))....)).)))))))))....(((((((......((.....(((...............)))....)).......)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((...(((((.(((((.((((((((((((..(((((((((((((((((...(((((((((.(((....))).))))..))))))).)))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))....))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((.........((((((.(((..((((((...((((((........((((......))))))))))....)))))).))).))))))......)))))))).))).......(((......[[[[)))...]]]].........(((....((((((..(((((((...((((..(((....(((((...........))))).))))))).)))).)))..))))))...))).(((.(((.........))).[[[[.[[[.[[[[))).....]]]]]]].]]]].((((........[[[[[[[..........)))).....(((..((((((.....))))))..)))]]]]]]]...(((..[[[.....[[[....[[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]...]]]...]]].......((((((.[[[[[[)))))).......]]]]]]...............((((....))))......(((((((...(((((..(((((......)))))..))))).........((((((((((.(((......)))..))))).))))).....((((.((((....(((((...((((((........(((((......(((((.....(((((((....((((..(((((.((((((.........(((((.........((((((...........((((((((..((((((((((((...(((((((((.(((((((((((.....(((((((((.(((((((((.((((....(((((((((((((.(((((((.(((((((((.(((((.....(((..(((((((((((((((((....))))))))))).))))))..))).......))))).)))))))))))))))).))).))))))))))........))))))))))))).))))))))).....))))))......)))))))))).)))))))))).))))))..))))))))......((((.(((((((((....))))))))).)))))))))).....)))))..((((((((...........(((((((((..((((........((((((((......))))))))((((((((((((...(((((...)))))..((((((.(((((.((((.((((((((((((((((....((((((((....((((((((.(((((....))))).))))))))..(((((....)))))..)))..)))))...)))))))).(((((((((.((((((((((((((......))).)))..)))))))).))))))................)))(((....))).)))))))).(((.......)))..))))....))))))))))).))))))(((((.((((((.......((((((((((...(((..(((..((((....(((((((((((.(((((((.((((((....)))....))).)))...))))))))))).......)))).))))..)))....)))...(((((....((((((((((((((.(((((...)))))......))))....((((........))))(((.....((((.......))))..(((((....))))).....)))..))))))))))....))))).))))))))))..(((...))))))))).........(((((((..(((((..........))))).))))))).))))).))))))))))..)))))))))............))))))))(((((((((((.(((((.((((((..(((((.(((((((((....))))))))).))))).))).))))))))))))))))))).......)))))).)))))....)))).....)))))))....)))))...)))))))))))..))))).......))))...))))...((((.............))))(((..(((((.........)))))..))))))))))...(((((((((.......[[[.((((.....((((((...)))))).....))))...)))))))))...((((...(((((..(((((...(((..........))))))))((((.(((((((((.....))))))))).)))).)))))..)))).......]]].(((....((((((........))))))[[[[[..((((....)))))))...(((((((((((.(((....))).))))))..))))).]]]]]....(((((......[[[[[((((.....))))....)))))........(((((((((....))))))))).]]]]]...
|
|
CRW_00763
|
[ FASTA input ]
|
AAUUCCAUUACUUGUAUAAACAAUCGUUGGGUUUUAUUCUGGCUCCGAGUGAACGCUGGUAACAUAUUUUAACACAUGCAAAUCGAACGAAAAGUAAAUUUACUUUAAGUGGUGACCUGGUGAGUAGUAUAGGAGAAUUGAAGUGUGGGUUAGGCUAAAUUCCUAAAAUUAUUAAAAAUAAAAGAUUUAUAUCGCCUACAAUAGAGCUUCUAAAGGAUUAGGUAGUUGUUGUAGUAAUUAUUCAACAAGCCGACGAUGCUUAGCUGGUUUGAGAGAAUGAUCAGCCACAUUGGGACUGAAAACGGCCCAAGUCUUCUAAAAGGGCAGCAGUGGAGAAUAUUUGACAAUGGGCGAAAGCUUGAUCGAGUAAUGUUACGUGGGUGAUCAGAAGGCUUAAUUGCCGUAAAACUCGUUUCGUCAAGGAUUAUAAUGCAAUCGUACUUGAAGGAGAAGCCCUGACUAACUUCGUGCCAGCAGUCGCGGUAAUACGGAGAGGGCGAGUGUUAUUCGCAUUGACUGGGUGUAAAGGGUGCGUAGGUGGUUUGUUAAGUUUCAAAGUAAAUGUUAAACAUAAAGUUUAAAGGCUUUUUAAUACUAACAGACUAGAGUUUAUUAGAAGAUAGCUGAACAUUAAGUGUAAAGGUGAAAUUUUUCGAUAUUUAAAGGACAUGCAAUAGGCGAAGGCUGCUAUCUAUUUUAAUACUGACACUGAGGCACAAAAGCAUAGGGAUCAAACAGGAUUAGAGACCCUGGUAGUCUAUGCCCUGACCGAUGAAUAUUGAUUAUACUGCGAGGUGUAAUUAAGCUAACGCGUAAAUAUUCCACCUGAGUACUACGACCGCAAGGUUAAAACUCAAAGAAACUGACGGAAGAUUGUAUAAGCGGUGGAGUAUGUGGUUUAAUUUGAUAUAACGCAAAGAAUCUUACCAACCCUUGAAUACAAGUUAUUUUAGCUGUGAUAAUGGAAUUUAUUUUCAUUCUCAUAAGCUCAUUAUAAGGAUCACCUGAGGAGGUGUAUCAUAUUGACUUGUACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGGCAGUUCGUGUUGUGAAAUGUUUUGUUAAUUCAUUUAACGGACGUAACCUUCAGCUUUAUUUGUUUUUGAAAAAAUAGAGCAAUAUUAAUUUGAAAAUUAAUUGAGAGGAGAAGAAGUCAAAUCAUUAUGGCCUAUAUAGGUUGGGCUACACACGUACUACAAUGGUAAUUACAAUGUGAAGCGAAAAUGCGAGUUUUAGCUAAUCAUUAAAAAUUAAUCUUAGUUCUGAUUACUCUCUGUAAGUCGAGAGUAUGAAGUAGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGAAUAGAAUGUUGCGGUGAAUAUAUUCUCAAUCUUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAAUUGGUUUGAUUAGAAGUGGUAUAGGCUCAGAUUCUGAUGUCUUUUAAUUUUUUUUAAAGUUAUCGCAUCUUGGUACUAAUUACGACAAUUAGAUUAAGGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCGGUAGGGGAACCUGCUGCUGGACAAAAUUUUUUUAAAGG |
|
[ reference structure ]
|
............................(((((...[[[.))))).((((.((((((.(((((((((.....(((.(((..(((..((((((((((....)))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((..(((.......)))......(((...)))....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((((.......))))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).))))))).))))))..((((........((((....)))).....))))..(...(((((....(........)....)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))..)))))))))..)))))))))...((((((.....(((((((((((((((((((...(((......)))......)))))))))))).....(..((....))))))))))....))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((....))))))))...((....))...))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....((((((((((............................................................................))))))))))(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.((((...))))..))))))).....(((((....))))).......))))...))))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((.((((((((((((((((((((((....(((((.(((((((((((..((((((((((.((......)))))))))))).)))).))))))))))))...))))))))))))))))))))))..))))..))....((((((((((....))))))))))...................
|
| [ predicted structure ] |
...........((((....))))...((((........[[[[[.))))......]]]]].........................................(((((..........[[[[..)))))...]]]]............(((.[[[[[)))....]]]]]..........(((((..(((....)))..(((((((((....(((((....)))))...)))))))))...)))))...(((((((............))))))).(((..((((((.((((.(((((.(((....))))))))(((((.....)))))....((((....(((((((...(((((....))))).)))))))...)))))))).))))))...(((......)))......))).((((.(((((((((.......))))...)))))..)))).(((((......(((((((((..[[[[[..)))...))))))))))).(((((.....)))))]]]]]..........((((.(((.((((((((((......(((((.....((((((.....))))))..))))).......))))))))))..(((((((((((((((((......((((((((.....((((....)))))))))))).............(((....))))))))))..)))))))..))).)))..)))).......(((((......((((.....[[[[))))...]]]]...))))).(((.......(((((((((((....)))))))))))............[[[[[[[[[[(((((.....((((....))))...)))))..........)))..............]]]]]]]]]].((((....((((........)))).......))))..(((((..[[[[[[[[[....((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))).....)))))..(((((....)))))........]]]]]]]]]....(((((...[[[[[.)))))((((((...(((((............)))))...)))))).]]]]]....(((((((((..........)))))))))....((((((........))))))................((((((.(((((((.......)))))))..[[[[[.....)))))).......]]]]].........(((((...(((((((((........)))).(((((.(((....(((((((........))))))).))).)))))...)))))...)))))....(((((((.[[[[[[...))))))).............]]]]]]..((((.((((.......)))).)))).....((((((.....((((...))))[[[[[(((((......)))))..))))))((((((...((((((.....))))))......((((.......))))....))))))(((((((((....)))))))))]]]]]...............
|
|
CRW_00764
|
[ FASTA input ]
|
AAAAGUUUGAUUCUAGCUAGUUUAUUUACUCUUUCUACGAGUCAUAUGCAAGAUAUCAUUAUAGGUUAGAAGUGCAGUGAUUGACAUUAUUGCCUACUUCUUAGGUAUAGCGAACGAAAAGAUAGGGGGACCACUUUGUGCCAGCAUCCGCGGUCAUACAAGGCCCUAGAGCAAAUAUUUUAGGUGAACAGAGGAGCUUUGGGACAAGUUAUUUUAGAUCAAUAAGGGUGAAAUUUGCAUUUAUUCUCCAUUUGUUUGAAUAAAGCACUCUUUAGAUGGCCAAACAACUAGGAUUAGAUACCCUAUUAGUUCAUUUCUAAUUAACCUGGGUAGUAUUAUUUAAACCUAAAGAAUUUGGCGGUUUCUAAACUUACUAGAGGAACCUGCCCCAUAAACGACAAUCCACGAGACAACCGACCCGUUCUUGUAAAACAGCUUAUAUACCGUCGUUUAGGGGAUUAAAUAAAUAACUGCUCUUAAUUGCUUAGGCUAAUAAAUCAGAUCAAGGUGUAGCUUAUGUCCGGGAGAGGGUGGGUUACAAUAAGAACUUAAACGGAACUUUCAUUUUAUCAUGGAGAAGAAGGUGGAUUUAGAAGUAAGGUCUAUCAACCUGAAGGAGGCUCUGAGAAAUGUACACAUACGCCCGUCGCUCUCUUGUCCGAAGAGAUAAGUCGUAACAAAGUAGGUAUACCGGAAGGUGUAUCUUGAAAGA |
|
[ reference structure ]
|
..(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((...(((.(((.....(((......))).......)))))).......(.((..((((.....)))).))).))).)))))...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))...(((.....(((...........((((((....(((((.....(((......)))..))))).........)))))).........)))....((((((....(...((((.........))))...)))))))........))).(((.(((...)))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....(((........))).........(((((((.........(((.((((..(((((((((((((((((.....)))..)))))......(((....)))....)))).)))...)))))))))...))))))).)).)))))))))....((....))...((((((((((((......)))))))))))).....))))))....((((......))))...........)))))))))).)).....((.((((..(((((((...)))))))...))))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((..(((......)))....))).))))))(((((.....(((......)))..(((((((((((((....))))))))..)))))....)))))............((((((.[[[[.))))))............]]]].(((.....[[[[[[[[...........))).........]]]]]]]]....................(((((((.........(((((((.....[[[[[[))))))).))))))).........]]]]]]................((((((((......(((((((...(((((((.((((((((.(((.........((((((((((...........))))))).)))...((((((((.....((((((............)))))).................)))))))))))..))))))))...))))))))))))))....)))))))).............((((((((((.[[[[.......)))))))))).............]]]].((((((.((((((.((((.((((.(((((.((((((.......(((.(((...))).)))...))))))...((((....))))....))))).)))).))))....))))))............(((((((((....))))))))))))))).
|
|
CRW_00765
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUUUUAUUAGUUGGUAGUAAAAUUAUACAUGCAAGUUUCAGCAACCCAGUGAGAAUACCCUUUAAAUCUGCUAGAUUAAUAGGAGUAGGUAUCAAGCACACCAUUAGGUAGCUAAUAACACCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGUUACAGCAGUAACAAAAAUUUAGCAAUUAACGAAAGUUAGACUAAGUUAUACUACUCUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUAAAUACCGGCGUAAAGCGUGUUCAGGGGAAACAAAACAAUAAAGAUGAAAUAUUUCUACACUGUAAAAAGUUAUAGAAGUACUAAAAAUAUACUACGAAAGUGACUUUAUUACACCUUACAACACGAUAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUUUAAUAAUUUAAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCCUAAAACUUAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUAUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCACUUCUUGCUAAUCCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAAGGCAAAACAGUAAGCUUAAUAAUUUCCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUGUAGUGGUAUUCAAUGGGCUACAUUUUCUGAUCCAGAACAUUCUUAACGGAUAUUUUUAUGAAAUUAAAAAUUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAACUAAGAAUAGAGAGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAACUAUAUUCUAUUAAACAUAUUUUAUCCUAAUAAAUACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAAAACU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((....((((...))))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))....(((.......((((...(((............(((((((....(((((((..(((......)))...))))))).....).....(.((....))))))))).....)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....((((.....)))).........(((((((((((........))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((((...........(.....).................)))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((.....(((..(((((((((((((((((......(((.(((..........(((((.(((....((((((...(((((...)))))...))).)))(((...(((((.(((....)))..............))))).))).......))))))))...)))))).....(((((((...(((((....))))).))))))).)))))))...((((((((......((((...(((.....)))..)))))))))))).))))))))))....)))......((((((.((((..........(((((((......((((((((.(((......)))..))))))))............(((....))).)))))))...))))..))))))...((((((........((((.........)))).....)))))).)))))))))((((((((......)))))))).(((.........(((....)))......(((((...(((..(((((((((((((.(((.......)))(((((.......((((........))))...............((((((((((............................((((...((((..........))))..(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((....)))...)))))))))))))..)))...........)))))))....)))))))))))))).......)))).))).)))))))..(((((((.........)))))))....))))).)))))))))........)))).)))...((((((..(((....((((....((((.....))))....))))..)))..)))))).)))))........)))(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00766
|
[ FASTA input ]
|
AGAAUCUUGGUCUUAAAUCUCCUAUUACUUUUCCCCCUAAUUAUACAUGCAAGACUCCCCACAACAGUGAAACAGCCCACCAUAACAGGUUUGGAGCCGGUAUCAGGCAACCGCCCAAGACGCCAAGCAAUUCAGCCACACCCCCACGGGUCCACAGCAGUAGUUAAUAUUAGGCCAUAAGCGAAAGCCUGACCUAGUAAGGGGGACACUAGGGCCGGUUAAUCUCGUGCCAGCGACCGCGGUUAUACGACAGACCCAAAAUAAUAGAUACGGCGUAAAGCACGACUAGUACUGACGUCCCUACACCUAGGGAAGAAUAACCCCAGGCUGUAAAAAGCCAUAGGCAAUAAGAACCAUAUUCCCUAACAACAAACAACUACAACUCGUGAAAGCUAGGACAUAAACUAAGAUUAGAUACCUUACUAUACCUAGCUGUAACACAAUAAUCAAACAACCUAUUAUUCGCCAAAUAACUACGAGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGACGGCACUUUAAACCCCCCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAAUCGACAGUACACGUUACACCCGACCACCUUUAGCCUACUCAGUCUGUAUACCGCCGUCGCAAGCCCGUCCCAUUUGAGGGAAACAAAACGCGCGCAACAGCUCAACCGAGCUAACACGUCAGGUCAAGGUGCAGCCAACAAGGUGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUCAACAUGUAGAAAUAUUCAACGGAGAGCCCUAUGAAAUACAGGACUGUCAAAGCCGAUUUAGCAGUAAACUGGGAAAGAAUACCUAGUUGAAGUCGGUAACGAAGUGCGUACACACCGCCGGUCACCUCCUCGAACCCAACAAAAUGCCCAAACAACAGGCACAAUGUUGGGCAAGAUGGGGAAAGUCGUAACAAGGUAAGCGUACCGGAAGGUGCACUUGGAACAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((...[[[.)))))..(((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((............))).)).(((..(.(((....))).....))))..((......))))).((((....))))....)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))....(((.......((((.(((..................(((((((.......((...(((......)))....))..............)))))))...........)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))........(((((((........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).........)))))).....(((((....)))))...))))).)))...))))))))....))))))).)).)))))))))....(((((......)))))........(((((((((((.........))))))..)))))....))))))....((((((((......))))))))...........)))))))))).))....((.((((..((((((...(((...............................)))...)).))))...))))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
......................................................((((........(((....[[[[))).......]]]].)))).((((....[[[.))))........]]]..........(((...[[[[[...)))..................((((((...........))))))........]]]]].......((((((.[[[[[))).))).........]]]]]((((((.((((...............((((....((((.....((((((...((((((....)))))).((((((.....((((......)))).((((.((((.......)))).))))....................(((..(((((((..(((...((((.........)))).))).)))))))....))).................)))))).............((((....)))).........(((((.....(((.(((((........)))))..))).)))))........)))))).(((((...(((((..(((.((((((((((...((((((...(((..(((.......((((......))))........)))......(((((....))))).........)))....))))))(((......)))..))).)))))))(((.(((((.....(((....)))......)))))....)))......)))(((((.(((.....))).))))).(((((((........)))))))...))))))))))..))))........)))))))).((((......(((((((...((((.........))))...)))))))......))))...))))))......((((.(((((....))))).))))......
|
|
CRW_00768
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCCAGCCUUUCUAUUAGUUCUUAACAAACUUACACAUGCAAGCGUCUACAUCCCGGUGAGAAUGCCCUCUAAAUCACAAAGAUCAAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACGCUAGUACUAGCAGCUCACAACGCCUCGCUUAGCCACACCCCCACGGGACACAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUUAUGUUAAUAAGGGUUGGUAAACUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAGAAACACGGCGUAAAGAGUGUUAAGGAGUCUCAUAGAAUAAAGUCAAACCUUAAUUAAGCUGUAAAAAGCCAUAAUUAAAAUUAAGCCAAACUACGAAAGUGACUUUAAUAUGAUCUGAUCACACGACAGCUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCAUAAACCCCAGUAGUCACAAAACAAGACUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCAUACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAACCGAUAAACCCCGAUUAACCUCACCAACCCUUGCUACUUCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAGGGAACGAAAGUAAGCAUAAUCAUCCUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAACCAAUGGGUUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAACUAAGAAUAUCCCUAUACACACGAAAGUUUUUAUGAAACUUAAAAACCAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUCAAGAGCAGAGUGCUUGAUUGAAUAAGGCCAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUACCCCAGCUAAAGCCACAGUUCAUUAACUCAGGCCAAGCAACUUAUACGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACCGGAAGGUGUGCUUGGACAAAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((.....)))....))).)).(((..(.(((..((((....)))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))).....(((.......((((...(((...........(((((((...((((((((..(((......)))...))))))))....).....(.((....)))))))))......)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....((((...))))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....((((......))))..............((((((((((((.......)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((...((((((..(((.....(((...........................)))......)))..))))))....))))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.......)))))))........................................((((((((((..((((((....(((.....)))....))).)))............((((....))))..)))))........[[[[[[...........)))))(((....))).......]]]]]]..(((((....))))).........(((((((..((((((((......((((...(((..[[[)))..))))))))))))..)))))))........]]]......((((...(((...(((((...(((((((.....(((((((.(((......)))..)))))))...........(((.....)))))))))).))))))))....))))....((((((......[[[[[[..(((........)))..)))))).......]]]]]].(((.................(((.((((......(((....)))....))))....((((((((((((((((((...(((....))).((((((((.....(((.(((.......)))......(((((((..(((.....)))...((((((...............((((...)))).....................((((...........))))....))))))......))))))).......)))(((((...((((......)))).((((..............(((((((.......))))))).......))))...))))).(((((((.........))))))))))).)))).)))))))))............)))....((((((..(((.....(((...(((..((((....))))..)))..)))......)))..)))))).)))))).......)))(((((((((....))))))))).)))....
|
|
CRW_00769
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGCAUGGUCCCGACCUUAUUAUCAGCUCUAACUCAACUUACACAUGCAAGUCUCCGCAACCCAGUGAAUAUGCCCUCAAUCCCCCCACCCGGGACGAGGAGCGGGCAUCAGGCACAAACAUUAGCCAAGACGCCUAGCCAAGCCACACCCCCAAGGAAUUCAGCAGUGAUAAACAUUAAGCCAUAAGUGAAAACUUGACUCAGUUAGUGUUAAGAGGGCCGGUAAAACUCGUGACAGCCACCGCGGUUAGACGAGAGGCCCUAGUUGAUAUUACAACGGCGUAAAGGGUGGUUAAGGAUAAACAAAAAUAAAGUCAAAUGGCCCCUUGGCCGUCAUACGCUUCUAGGAGUCCGAAGCCCUAAUACGAAAGUAACUUUAAUAAACCCACCUGACCCCACGAAAGCUGAGAAACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUCAGCCGUAAACUCAGACAUCCAGCUACAAUUAGAUGUCCGCCAGGGUACUACGAGCAUUAGCUUAAAACCCAAAGGACCUGACGGUGUCUCAGACCCCCCUAGAGGAGCCUGUUCUAGAACCGAUAACCCCCGUUCAACCUCACCACUUCUAGCCACCCCAGCCUAUAUACCGCCGUCGUCAGCUUACCCUGUGAAGGUAAUAAAAGUAAGCAAAAUGGGCACAACCCAAAACGUCAGGUCGAGGUGUAGCGCAUGAAGUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAAUAUAGAAUAUUACGAACAUGCACCAUGAAACAAUGCUUGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAAGGGAAGUAGAGUGUCCCUUUUGAACCCGGCUCUGAGACGCGUACACACCGCCCGUCACUCUCCCCUGUCAAAACGCACCAAAAAUACAUAAUACAACAGCACUGACAAGGGGAGGCAAGUCGUAACACGGUAAGUUACCGGAAGUGCACUUGGAUCAAACC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.)))))...((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....((((((..((((.......)))).)))).)).(((..(.(((..((...)).)))....))))..((...))))).((.(....)))....)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...(((((......(((((....................)))))))))).)))))))).......(((.......((((...(((...........(((((((....((((((...(((......)))....))).)))....).....(.((....))))))))).........)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((..........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....)))........)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((...))))).....((((((.(((...........))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))............)))))))))).))....((.((((..((((((((((((....((.....(......).........))..)))).))))))))...))))..))....((((((((.....))).))))).........
|
| [ predicted structure ] |
....(((..(((....))).............................(((....[[[[))).(((.(((...................)))..)))....]]]]..(((...[[[[..........))).....]]]].)))...........(((((.........((((((.........(((.(((((....))))).......(((((((((.((((((.......(((((...((((.....))))..))))).))))))..)))))))))....))).....(((((((...((((.........((((((...((((((....)))))).....(((((.........))))).....(((....)))))))))..........((((....(((...((((((........((((.........)))).....)))))))))....))))..))))........((((..((((....((((.....((((....))))...))))...))))))))..((((((((((....(((.....((((((((...((((...........)))).......(((((((.............(((((((((.....(((..(((((((((....)))........))))))....((((.....))))..)))...)))....)))))).....))))))).....)))))))).(((.(((((((((...)))))).))).)))...(((......))).....)))............(((((((((.........)))))))))........))))))))))......)))))))))))))(((((((((((................................)))).))))))).......(((...(((((...)))))....))).)))))........
|
|
CRW_00772
|
[ FASTA input ]
|
AUAUAAUAAAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAUGAACGCUAGUGGUUAGCUUAACACAUGCAAGCUAAAAUUUUUUAUUAGUUAUAAAAUUAGUAGCGAACGGGUGAGUAAUGCAUAAAAAUUAACCUUAAAAAAUUGUUAAAUACAUUUAAAAUUAAAUUGUUUUAAGAAAAGUUUAUGUAAGAUUAAGUUGUUGGUAAUUUAAUAGAGUACCAAGCUUACGAUCUUUAGUUGGUCUAUGAGGAUGAACAGCCACAUUGGAACUGAGAUACGGUCCAAACUUAAUUAAAAGGCAGCAGUGAGGAAUAUUGGGCAAUGGGUGAAAGCUUGACCCAGCUAAACCACAAGUGUGAUGAAAGUAAAAUACUUUAAAACACUUUUUUAAAAUAAAUAAUGAUUUUAAUAAAAUAGUCCUGGCUAAUUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAAACGGGAAGGGCAAGCGUUAUUCGGAUUAAUUGGGCGUAAAGAAUACGUAAGUUGAAAAUCCAAUUUUAAGAUAAAUUUUAAAGUUUAUUUUUAAUUAAUUUAAAAAAUUAAUUUUCUAGAGUUUAAAGAGAAGAUUAUAGAAUUUUAAGUGUAACGGUAAAAUGUUUUGAUACUUAAAAGAAUUUCAACAGCGAAAGCAGUAAUCUAAAAUAAAACUGACACUGAGGUAUUAAAGUGUGGGUAGCGAAAGGGAUUAGAUACCCUGUAGUCCACACCCUGACGAUAAGUGUUCAUUUUGGAGAUUCAGAAAUGUAGCUAACGUGUUAAACACUUCGCCUGGGAACUACGAUUGCAAAAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACUUACACAAGCAGUGGAGCAUGUGGUUUAAAUCGACAAUCCGCGCAAAAUCUUACCAAUUUUUGUAUAAUUAUAAUUAAUUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGUCCGUGCUGUGAAGCGUUUGGUUCAUUCCAAUAAACGGACGAAACUCUUAUAUAUUUUUGAAUAUAAACUGCUAAAGAUAUCUUGGAGGAAGGUAAGAAUGACGUCAAGUCCUCAUGACCCUAAUAAAUUGGGCUACUUUCAUGUGCUACAAUAAUUUUUUCAAAAAGUAGCAAAAACGUGAGUUUUAGCAAACCUUUUAAACAAAAUUAUAUUCGGAUUAUUUUCUGAAAUUCGAAAAUAUGAAGUUGGAAUUGCUAGUAAUCGUAAAUUAGAAUGUUACGGUGAAUUUGUUCUUAAGUCUUGUACACACCGCCCGUCACGCUAUGGAAAUUCUUUUUGCUUGAAAAAUGUUUAACAAUUUUAUAGUAAAAGAAAAACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAAAAUAAUUAAAUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((.((((((.....))))))..))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((((((....)))))))))......)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......(((.....))).....)))).(..(((((............)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((((((((.....(((((((((.....(((((.....)))))...))))))))).....))))))...((((((......(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))....)).))))..))))...))))....(((((((...(...((((........))))...)))))))).........((((((..((((((((...))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((((....))))))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))...)))))).....(((((((((((....)))))).....(((((.....))))).......)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...))...)))))))))....(((((((.....(((.....(((((....)))))........)))....))))))).....((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((...((((((((((((((((((.(((..((((((((...))))))))..)))))))))))))))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))..................
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((.(((((..[[[[[)))))......]]]]]...(((((((.........)))))))..))))))))))............((((((.(((((((......(((......((((..(((((....(((.....))))))))..))))..)))((((((((((((((((..............((((((.(((....)))))))))..(((((((..(((((.((((.((((((((..(((((((..(((((.(((.....)))))))).(((......)))((((((((((((............(((((....(((((.((((((((......((((((....((((((...))))))...))))))..(((((((........)))))))...........)))))..(((((((((.........)))...)))))).)))))))).....(((.........((((.....(((((((.(((((.......((((((((((....))))))))))..(((((((.....)))))))......(((((.((((((.......(((((((.(((((((((((((((((......))))...))))))))))....))).............)))))))...........((((((.(((.......(((((((.......((((........))))....)))))))))).......))))))........)))))))))))..))))).)))))))........)))).........))).............))))).....((((.(((((((...((((............))))))))...))).))))..........)))))).....((((((..((((....)))))))))))))))).)))))))((((((((((((((....)))..((((......))))...)))))).....(((((((((((....))))).........(((....)))........)))))).)))))....))))))))))))(((((.............(((((((......((((((((....(((((.....(((((....))))).......)))))....)))))))).((((((......))))))........))))))))))))....)))))..)))))))..............)))))))).))))))))............)))))))..))))))..............((((..[[[[[[[[[[..((((((((((.........)))...))))))).....)))).((((((((((....))))))))))........]]]]]]]]]]
|
|
CRW_00773
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGCUUGGUCCUGACUUUACUAUCAGCCGUAGCACAACUUACACAUGCAAGUCUCCGCAGCCCCGUGAGGAUGCCCUUAAUCCCUGCCCGGGGACGAGGAGCGGGCAUCAGGCUCAAUUAUUUAGCCCAAGACGCCUUGCCACGCCACACCCCCAAGGGAACUCAGCAGUGAUAAAAAUUAAGCCAUGAGCACUAAGCUUGACUUAGUUAGUGUUAAGAGGGCCGGUAAAACUCGUGCCAGCCACCGCGGUUAUACGAGAGGCCCUAGUUGAUAGGUGCGGCGUAAAGGGUGGUUAAGGAGAGCAAGAAUUAAAGCCAAGGGACCUCUUGGCCGUCAUACGCUUCUGAGUAUCCAAAGCCAAAUACGAAAGUAGCUUUAAUAAAACCCACCUGACCCCACGAAAGCUGAGAAACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUCAGCUAUAAACCUAGACGUUUAAUCACAACAAACGUCCGCCAGGGUACUACGAGCGUCAGCUUAAAACCCAAAGGACUUGGCGGUGCCUUAGACCCCCCUAGAGGAGCCUGUUCUAGAACCGAUAACCCCCGUUAAACCUCACCACUUCUAGUCAUCCCCGCCUAUAUACCGCCGUCGUCAGCUUACCCUGUGAAGGCUCAAUAGUAAGCAAAGUGGGCACAACCCAAAACGUCAGGUCGAGGUGUAGCGUACGAAGUGGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUAUAAUAGAAUAAGACGAAUAGCAUCAUGAAAACUUAAUGCUUGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAAAGGAAAUAGAGUGUCCUUUUGAACCCGGCUCUGAGGCGCGUACACACCGCCCGUCACUCUCCCCUGUAAUAGCAAUCAAUGUAAAUAACAACAAAGCACCAACAAGGGGAGGCAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACCGGAAGGUGCACUUGGAUCAAACC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....((((((..((((......)))).)))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((...))))).((((....))))....)))))).......(.(((...(((((.....))))).)))).)).))))))...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))...(((.......((((...(((..........((((((((....((((((...(((......)))....))).)))....)....(.((....)))))))))).........)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((...))))).....(((((((((((..........))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((..((((((((((....((.....((....)).........))....)).))))))))...))))..))....((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((........((((((((..((((((......(((.(((..((((((((((.....(((((....)))))....))))..))))))(((..(((((((..((((....................)))))))).)))....(((....)))..))).)))))).....(((((((...(((((.....))))).))))))).))))))..((((((.......((((((..((((.....)))).)))))).)))))).)))))))).((((((.....((((((((..(((.....((((.....(((((((....)))))))(((...))).)))).....)))..))))...(((....)))...[[[.....))))...]]].((((....[[[[[[[........))))..(((........)))..]]]]]]].....(((.(((((((.........))))))).....((((.....((((....))))...))))..)))....((((((.......)))...[[[[[[..)))..]]]]]]......((((....)))).......(((((((..........(((((....(((.....(((..((((((....(((....)))...))))))....((((.....))))..)))...)))..)))))........))))))).....(((((((......(((((...)))))..........(((((............)))))..........(((((.(((.(((((((......[[[))))))).......)))))))).......]]]...)))))))..((((((((..............(((.....)))..............))))))))...)))))).......(((((((((....))))))))))))))))...
|
|
CRW_00774
|
[ FASTA input ]
|
AAAGACUUAGUCCUGACCUUACGGUUGGUUUUUGCUAAAUACAUACAUGCAAGUAUCCGCGCCCCAGUGUAAACGCCCUCGAUCACCUACCACCCCUAGGCCUUGAGGAGCGGGUAUCAGGCACACCCAAGCAGUAGCCCAAGACGCCUCGCUAAGCCACACCCCCACGGGUAUUCAGCAGUAGUUAACAUUAAGCAAUGAGUGCAAACUUGACUUAGUUAUAGCAACAAUCCCCAUUUUAAGGGUUGGUAAAUCUUGUGCCAGCCACCGCGGUCACACAAGGAACCCAAAUCAACCGUCCUAUUAAGCGGCGUAAAGAGUGGUAAGAUGCCUAUCCUAGCUAACUAAGAUCAAAAUGCAACUAAGCUGUCAUAAGCCCAAGAUGCACCUAAACACACCAUUAAGAUGAUCUUAGGAACUAGCGACUGAUUUAAACCCACGAAAGCCAGGGCCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUGGCCCUAAAUCUUGAUACUUACCCUACCGAAGUAUCCGCCAGAGAACUACGAGCACAAACGCUUAAAACUCUAAGGACUUGGCGGUGCCCCAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUACAAUCGAUGAUCCACGAUUAACCCAACCACCCCUUGCCAACACAGCCUACAUACCGCCGUCGCCAGCCCACCUCGAAUGAGAGCACAACAGUGGGCGCAACAGCACCCCGCUAAUAAGACAGGUCAAGGUAUAGCCUAUGGGGCGGAAGAAAUGGGCUACAUUCCCUAUGCAUAGGGCACACGGAAAGAAGCUUGAAACUGCUUCUGGAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAGCGGGACAAUAGAGCCCACUUUAAGCCGGCCCUGGGGCACGUACAUACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAAGCUACGUCCUACAUAUAACUAAUACCAUUAACACGCUAAAGAUGAGGUAAGUCGUAACAAGGUAAGUGUACCGGAAGGUGUACUUAGAAUAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((((.......)))))....))).)).(((..(.(((..(((.....))).))).....))))..((...))))).((((....))))....)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).(((....)))....(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((...............((((((((....(((.(((..(((......)))...)).)))).....)....(.((....)))))))))).............))).....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.........))))))).))).(((......((((......))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).........)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....))))))).)).)))))))))....(((((....)))))....(((((((((((........))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((..(((((((....((...((......(((.....)))......))..))....)))))))...))))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
..............((((...[[[..))))(((((.............)))))...]]].(((...(((....)))((((((...((((.......))))..))))))...[[[[....)))..]]]].....((((((((.(((.....(((.......((((....))))....)))....)))........(((.[[[[)))........]]]]..........................(((((((...(((((((...(((.[[[[)))..))))))).......)))))))..........]]]]........((((...(((....)))...((((.(((((((((...((((.....(((......)))......))))..(((........)))...)))))))))....)))).............))))....((((((.........(((..[[[...)))..]]]..))))))(((.......(((((((.........)))))))[[[[[[(((.....((((......)))).....))).)))..]]]]]]..((((((...........(((...((((.....(((((........)))))....(((.......))).....)))))))..(((((((((((..........(((....)))........((((((...........)))))).....))).)))...)))))......))))))........))))))))...(((((....)))))....(((..[[[[[[))).....]]]]]]......(((((.((((..(((((.(((.........))).)))))....(((....((((...........))))))).............)))).)))))........................(((...[[[..)))..]]].........((((((((((....))))))))))......
|
|
CRW_00775
|
[ FASTA input ]
|
UAGAAGUUUUAUUCUUGCUUAUUUAUUCAUUUUUUUCUUUGUAUUAUAUGCAAGUUUUUUUAGACUAAAAGUUCUUUUUGCAGUGAUUUAAUUUAAUUAUCAAGUGAUUUUGGAAUUAGCAAUUGAUUUAGUAUUGGCAUAUUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUUAUACGAUUAAUGCAAGUGAAUAUAUUUGGUUAAAACAGUUAUUUUAUGAUUUUAGGAUUAAUUUAUAAAUUUUUAAGGUGGAAUUUUAAUUUUAUUUGUGAUUCUUAUUAUGAUUCUGUGAAACUUAGAUAAUAAACUAGGAUUAGAUACCCUAUUAUUUUAAGUGUUAAUCAUGUUUACCAGGGUAGUAUUAGUUAGGAUCUUAAAACUCAAAGAAUUUGGCGGUAUUUCAUUCCAUUUAGAGGAACCUAUCCCGUAAUUGAUAAUACACGAUUAACUAUACUUAAUUUAUUUGUUUGUAUAUCUCCGUUAUCAGAAAAUCUUUAUUGGAGUUAUAAUUUUCUUGAUUUAUAAUUAUAAAAUAUUUCAGGUCAAGGUGCAGCUUAUAUUAAGAGGAGGUGGGUUACAAUAAAUUUAGUUAUACGUAUUUAAUGGUGAAAGACUAUUAAUAAAGGUGGAUUUAAUAGUAAUUUGAUUUAUUUAAUUCAAUUGAUUUUGGCUCUGAGGUGUGUACACAUCGCCCGUCACUCUCAUUAUUGAUUAAUCUAUUUUAAUUUAAAGUUAGUUUCAGUUUAGAUGAGAUAAGUCGUAACAUAGUAGAUGUACUGGAAAGUGUAUCUAGAAAGUUUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((..((((((((...(((.(((............................)))))).......(.(((..(((((....))))).)))).))).)))))..(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))...(((....((((.................(((((....(((((((((.(((......))))))))))))...............)))))))))....((((((....(...((((.........))))...)))))))..............))).(((......((((.....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((...((((........))))........((((((......((.((((..((((((((((..(((((((((.....))).....)))))).....((((....))))...))))).)))...))))))))....)))))).)).)))))))))....((......))...((((((((((((.......)))))))))))).....))))))....((((((((......))))))))...........)))))))))).))....((.((((..(((((((...((((((...........))..))))............)))))))...))))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((.(((.(((..............)))..))).)))))..........................((((...(((((((....(((....)))....)))))))..))))....(((..[[[[[[)))..]]]]]]......(((....[[[......)))..]]]....(((((((((...((((.....(((((((...(((((((....(((((...(((((((...))))))).)))))...))))))).)))))))..))))..))).))))))......((((....[[[[[)))).........]]]]]..............(((.((((((.((((((.((((........)))).))))))))))))....))).........((((((((...((((((........))))))......((((((....((((...((((.(((((.....(((...)))....))))).))))....(((((((((..(((........)))..))))))))).)))).....))))))....))))))))..((((((((.((((((......((((((((.....))))))))((((......))))...)))))).))))))))................(((..[[[(((((....))))))))..]]].((((((((((((((((......)))).............)))))...)))))))...............((((((((((....))))))))))..........
|
|
CRW_00777
|
[ FASTA input ]
|
AAAUUAGAGUUUGGUGCUGGCUCAGCUUUCAUGCGCCGAGCGGUGGUUUAUACAUGCGAGCUUAAAAGAUUAAGGCCACGAGUGCGUAAUACGCGAGUUUAAAUUUAUUAUACAAAAGUUGCUAGGUGACCCAAUACGGGCAUCGGGCAAAACUCGCGUAGGAUUAGCGAGCUGGGUCGCGACGCCAAUACAGCGGCCCAUGGCUUAUCCUUAGCCUGUCUUAACGGUACUAGGCCACGGUGGCACUGAAAAGGGGCCACGGUUCUUAUGAACCCAGCAGUGUUGAAUUUUGGACAAUCGCUUGAACGGCGGAUCCAGAUGCUGCUUACAAAAUUGUUUGUGAACACCCCCCAAGCACGUGCCAGAAGGGUCGGUAAAACGUGCGGUGUCAGUAUAAAGCGUCUUGACUAGGCAGGCAGCGCGUCUGAGCGUUAAUGGUGAACACUUUAAACGUUGGGUAAUAUUCGGAGGAUCGGUCAAAUGAGAAUAUUCCGGAUGGAAAGCCGAAGGCGAAAGCACCAACAUCAGAGUCACUAAAGCUUCAACGCGUAAGUUUGGGUAGCGAACCGGAUUAGAGACCCGCAGUAGUCCAAACCGUCAACACAUUAUAGUUUUCAAAUCUAUAACGCCUGGUGAUACGGUGGCAACACUAUAAAUCAAAGCAAUUGGCAGCGAUAGAGAUGCGCGGUGGAAUAUGCUGUUUAAAUCGAAUUUACGCGCAAAAUCUUACCACUUUUUAUUAAAAUAGCUCUUGCAUUGCUGAAAAGUUCGAGCGGGACCUCGCCCUUAGUGCCGGUCUUUGCCACGUUUUCUGAACGGUCGAGCAAGUCAUCAUGGGGCUUAUAGAGUGGGCUACAGGCGUAUUACAUUGGACACCCACAAGUUGGAUACCAAAACUGUCCGAAUAUACGGAUUGGAGUAGCAAAACGAGAGAACUAUACAGUUCGUUUGCAUCGUUAUGCCUUGCUGAAACUAGCCUCCAUGAAGAAGGAAUCGCGAGUAAUCGUAGAUCAUUAGCGCUACGGUGAAGGUAACCUCUAUUGUGCACACAUUGCCCGUCACCUCCGAUAAUAGUAUUGUACAGGAAGAACUAUGGCUACACUUAAGUCGCGGCCUAGGAACGUAUGCGUGAUAUUAGAGUUGGAGUAAGUCGUAACAGGUUGGGGUAGGGGAACCUGCUCCAGAGUCAAAUUUAUAUAA |
|
[ reference structure ]
|
......(((((...[[[.))))).((((..(((((..((((((.......(((.(((..((((....................................................))))......(((.....(((((((............)))))))(((..(.(((..((((((((..............)))))))))))...))))..((((((((....))))..))))))).((((((.........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((.....))))).))))....))))))................(((((......(((((....................)))))))))).))))).))))..........(((.......((((..((((.............(((((..(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))).))))).......))))..))))....(((((((...(...((((.........))))....))))))))..........((((((.........)))))).))).(((.....((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((...........((.((((..(((((....((((((((......)))............)))))......(((((.......)))))....)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))..(((((((......................))))))).....((((((((((..............((((((((((.....))))))))))...................)))))))))).....))))))....((((((((........))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((.......(((.((((.............))))))).......))))))))))))))))))))))..).))..))...((((((((((....))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
........(((((((((.[[[[[.........))))))))).(((.......)))..]]]]]...(((((..((((.(((....)))..(((((((((((...(((........)))..((((.((((.(((.....))))))).)))))))))))))))((((.(((....((((((((............))))))))..))).))))...))))))))).(((...(((((((...(((((...........)))))(((((....))))).(((.(((((((..(((((((..(((((.....)))))(((((((((((..(((((((....)))))))(((((......(((((((((.........)))...)))))))))))...........((((.....)))).))).((((((..((((.....((((((...((((....(((((....(((((((((..(((......))).....)))))))))....(((...))).......)))))...))))))))))..))))..))))))..)))))))).(((................)))....)))))))...)))))))..(((((((((................((((((..((((....))))..........(((((.....(((((((((.((((((...((((................)))).)))))).....(((((..((((....))))....((((((...(((....)))....))))))..(((((..((((((.(((....))).(((((...))))).............((((((((((.....(((.(((...(((((((.((((((.(((........))).))).(((.....(((((......)))))))).)))(((((......(((((....))))).))))).....))))))).)))...))))))).)))))).......(((((((....)))).))).....)))))).))))).))))).)))))))))......)))))..))))))(((.(((((...)))))...))))))))))))))).............)))))))...))).((((...((((.[[[[[..))))...)))).....((((((((((....)))))))))).....]]]]]......
|
|
CRW_00778
|
[ FASTA input ]
|
AAGAAAAAAAUGAGUUUGAUUCUGGCUCCGAAUGAAUGCUAUCAGUGGGCUUUAUACAUGCAAGUUGAACGCUAUUGAAAAAUAGAGUAGCAAAAAGGUGAGUAAUGCAUAUGAAUUUUAAUAAUAAUUUUGGGAAUAAAAGAAGAAAUCCAGAAUAAAAAGAAAGAGGAACUUGAAAAACAGUAAGACUCGUUAUUAUAAAAGCGUAUGUCGAAUUAGGCAGUUGGUGGGGUAAAGGCUUACCAAACCUGAGAUUCGUAGGUGGUUCGAGAGAAUGAUCAUCCACAUUGGUAUUGAAAGAACGACCAAACUCUGAAGAGGCUGCAGUAAGGAAUAUUGGACAAUGAGCGCAAGCUUGAUCCAGCUACACUGAGUGAGGGAAGAAGUAAAGCGUAAACCUCUUUUAAUAAGGAAGAUAAUGACAAAAAUUAAAGAAGAAGUCCCGGCUAAUUUCGUGCCAGCCGCCGCGGUAAUACGGAGGGGGCAAGCAUUAUUCGUAAGGAUUGGGCGUAAAGGGUGCGUAGGCUGGUUCUCAAAGGUAUUAUAUGAAAAACACUGAAAAAAGAGGUGUGGGUAUAAAAACAAACAAAGAACCUAGAGUAAAGAUGAUGUAUUUAGAAGAACUAAUCUAGAGGUAAAAUUCAAUUUAGAUUAGUUUGACUGACAGUUGGCGAAGGCAAAAUACAAGCAAUACUGACGCUAAAGCACGAAGGUUCAGGGAGCAAAUCGGAUUAGAGACCCGAGUAGUCUGAACAGUAAACGAUGAGUGUUCAAUAUUCUAAAAAGUAUUUGAGUUAACACGUUAAACACUCCGCCUGAGUAGUACGAUCGCAAGAUUGAAACUCAAGGUAAUUGACGGAACUUUGCGCAAGCAGUGGAUUAUGUUCAUUAAUUUGAUACAACACGAAAAAUCUUACCCUCCAUUGAAUGACAUAUAUAAAACAUGAAACAAAUGUGAAGAAUAGAAGCAGACAAGGUUCUAUUAAAAUAAAUGUCUAACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGUUCGUGCUGUGAGGUGUAACAUUAAGUUGUGAAACGAACGAAAUCCUUAAGUUCAAUUACGAUAUAUAAUCGAGAAAUGGACAGAAGAGUGUGACAUAAAUUAAAUCACAUUGGUAGUUGAGGAAGAUGUCAAGUCAGUAUGGCCCUUAUAGGAGGGGCUUGAAAUGUAAUACAAUGGUUUCUACAAAAGGAAGCGAAAGUGCAAGCUGGAGCAAAACCUAAAAAGAAAUCUUAGUUUGGAUUUAUUUCUGCAACUCGAAAUAAUGAAAGCGGAAUUGCUAGUAAUCGUAGAUCAUAAGGCUUCGGUGAAUAGUUGUCAAAGUUAGUACAUACCGCCCGUCACACCACGGAAAUCAAUCUUUUUCAGAUACAUUAUUAUGUUAAUUAUCUAAAGUUCUUAGGGUAUAACAGUCUCUUUUGAAGAGCAAUUAGAAUGGAGGAGGUUAAUUGUUAAUUAUCGAACAAUAGAGGGGUAACUGGGGUAAAGUCGUAACACGGUAGCUGUUGGGGAACCAGUAGCUGGAAGUA |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((....)))))))))))......(((......(((((((..((...(((((((.((((((..............))))))......................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).(((....)))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((...)).....)))).(....((((...(.......)....))))....)...(((((......(((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((..(((((((((((.....(((((.........)))))..)))))))))))...)))).)))...((((((((...(((((((((((((((((((...(((......))).......)))))))))))).....(..((....)))))))))).))))))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((...((((......)))).....((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((.........................................................))))))...(((.(((..(((((((((((..(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....(((((.(((((....((((.....)))).....))))).....(((((((...........)))))))......)))))...))))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.((((((((..............................................................................................................................))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((..[[[[.))))).....]]]].......(((.[[[[[.)))......((((....(((((....)))))..))))...]]]]].......(((((((..((((((((((.((((((((..............)))))))).........(((...((((........)))).))))))))..))))).)))))))(((((((((...((((((((.......)))))))).)))..))))))..(((.((((....)))).))).......(((((......[[[...)))))..]]]................(((((((((((((.(((((....))))).(((.(((..[[[.)))...)))...]]]............((((((.....))))))....................(((((...[[[..)))))..]]].(((..........[[[[[[...)))........]]]]]].........................(((((((((...........((((....(((((.........)))))...))))...........))))))...)))........(((((((....(((((((((((((............)))))))))))))((((...))))..........))))))).......((((.[[[.............))))..]]]...((((.....[[[[))))...]]]].................)))))))))))))...........((((.....[[[[[[..)))).((((((((....(((((....)))))..)))).))))..]]]]]]((((.((((....)))).[[[[[[.))))..]]]]]].......(((((......((((((((((((....(((((.......((((.......))))....(((((((..........))))))).......))))).....))))..(((((((((....))).))))))...)))).)))).......)))))............((((((((((((....((((.....)))).....))))).....(((((((...........))))))).....))))))).............((((..(((((....)))))[[[[[.......))))....((((((......)))))).......]]]]]...(((((...((((((((....)))..)))))......((((((...(((......)))..)))))))))))............((((..[[[[...))))..]]]]......((((.....((((..((((......)))).....((((((((((((((((((....))))..))).(((((.((((((((((.........))))....))))))..))))).))))))))))).((((((........))))))..............))))......))))....((((((((((....))))))))))......
|
|
CRW_00779
|
[ FASTA input ]
|
AAAAUUUUGAGUUUGAUGAUGGCUCUGAUUGAACGCUGUCCAAGUACUUGACACAUGCUAAUCGAACGACUAAUUAGUUAUUAAACUAAGUAGUAGUGGUGUACAGGUGAGUAAAAGAUAAUUUGGCUACCUUAAAGUAAGGGGAAAAAUCCCUUAUAAAAAGAAAGGAAAAAGAAGGUCCGCUUUAAGAUGUUAAUUAUUAUCACGGUGAGUAGUAGUAAAGGUAAUGACUUUACUAGCUAAAUCCGUAGUCGUGACUGAGAGGUCGAUCGACCACAUUGGGUCUGAAAAAACCCCAAUGCGUUUUAGUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGUCAAUGGCCGAAAGGCGAACCAGUAACUUGGAAGAAUGAAAGUGUAUUAUAAUAAUACAAUAACGAUUAUAUCGUAUAAAAUUCUAAAUAGAAUAAUGAUAAUGACAAUUUUCUAUUUAUAAGUCUUGACCAAACUACCUGCCAGCAGUCGCGGUAAUACGUAGAAGACUAGUGUUAAUCAUCUUUAUUAGGUUUAAAGGGUACCUAGACGGUAAAUUAAACUCUAAAUGAGUACUUAUUUACUAGAGUUUUAUGUAAGAAGGAAGAAGCUCUGGAGUAGUGAUAUAAUACGUAUAUACCAGAGAGACUGGUAACGGCGAAGGCAUCCUUCUAUGUAAAAACUGACGUUGAGGGACGAAGGCUUGGGUAGCAAGAAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCAAGCAGACAAUGAUGAAUGUCAUAGACUAGAAAAAGUCGUUUAGACUAUAAAUUUAGUCUAUAAAUGAAAGUGUAAGCAUUCCACCUCAAGAGUAAUAUGGCAACAUAUAAACUGAAAUCAUUAGACCGUUUCUGAGACCAGUAGUGAAGUAUGUUAUUUAAUUCGAUGAUCCGCGAAAAACCUUACCACAGUUUGAAUAUUUUACAAGCGCUGCACGGCUGUUUUUAGUUAAUGUCGUGAGAUCUGGUUAAGUCCUUUAAUUAACGAAAACCCUCACUUUAUUUGCAUUUAUAAAGUUGAUCGCCUUUAUAUUGGUUAGAUAAUAGGGAUUAAGACAAGUCAUCAUGGCCUUAAUACUGUGGGCUAUAGACGUGCCACAUAUGCCUUUACAAAGGGAUGCGAUUUUGUGAAAUUGAGCUAAUCCCCCAAAAAAGGAUAUAAUAUGGAUUGUAGUCUGUAACUCGACUACAUGAAUAAGGAAUUACUAGUAAUCGUGAAUCACCAUCGUCACGGUGAAUUAAAAAUCAGCUGGGUACUAACCACUCGUCAGGCGCUGAAAGAAGUAUGUGCAAGAAGUUUGAUUUACUUAUAUUUAUAAUAUAUAUAAUCAGUUAUAUAUAUUUAUAAGUUAAAUUUUCGCAUGCAUGACUUUGAUUGGUGUUAAGUCGAAAUAUGGUUCGUGUAAUGGAAAUUGCACGGGAUGAAUUA |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((((((((....)))))))))))))))))......(((.......(((((((..((....((((((.((.((((....))))))...........(((.........))).))))))...)).)))))))..(((..(.(((..((((((((.......)))))))))))...))))..((((.((((....))))...))))))).(((((((.......))))))).((......))...)))))).......(.(((...(.(((....)))).)))).)).))))))..((((......((((.....))))......).))).(...((((((((((.......................))))))))))..)...(((((.......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...((((((((((.((((((.....))))..))))))))...((((((.(((((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))).))))))))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((...((((.....)))).....)))))))))...((....))....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.............(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((......))....)))))).....((((.(((((((((...)).)))))))........((((.......))))....))))...))))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((...)))....))....))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((........))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((((((.((((((....((((((((((........((.(((((((((((....))))))))))))))))))))))).......)))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((((((((((...........)))))).((....))..[[[......))))))).((((.((((((....)))))).)))).]]].......((((((.....(((((((((((...((((((((.((((((....))))))...........(((.........)))))))))))..)))))..))))))((((....(((((((((((.......))))))).))))...)))).(((((((((....)))))..))))..(((((((.[[[.......)))))))..........]]]..........(((((((.....(((....)))..)))))))............(((..(((((((...)))))))...(((((...)))))......)))(((((((((..........[[[....)))))))))...]]].........(((((((....)))......[[[[[[)))).......]]]]]]....((((((.......)))))).((((.....))))..(((.[[[[)))..]]]].(((((...[[[[[[[[[[..)))))......]]]]]]]]]].(((....)))....(((...((((((.....))))))...))).....((((((((..............[[[...[[[[....[[[.[[[[[...))))))))....]]]]].]]].]]]].]]]..........((((((.((((((((((...((((.....)))).....))))))))))...[[[........))))))....]]]......(((((....)))))..((((......(((((.....)))))......))))................((((........))))....))))))...(((((.........)))))......((((((......(((((((((....)))..[[[[..........))))))...]]]]...(((((((........))))))).....(((....[[[[)))..]]]].....(((........[[[)))(((((((.........))))))).]]].(((..(((((.(((((.....(((((.((((((....)))))).....))))).....))))).....)))))...[[[[[[[.)))....]]]]]]]........................(((.[[[[[.)))....]]]]].........))))))(((....))).....(((.[[[[))).........]]]].........((((((((((((.....(((((((((((....))))))))))))))))).))))))..(((.....[[[[[[......)))..]]]]]]........((((((((((....))))))))))........
|
|
CRW_00780
|
[ FASTA input ]
|
AAAAGACUUAGUCCUAACCUUUCUAUUGGUUUUUGCUAGACAUAUACAUGCAAGUAUCCGCAUCCCAGUGAAAAUGCCCCCAAACCUUUCUUCCCAAGCAAAAGGAGCAGGUAUCAGGCACACUCAGCAGUAGCCCAAGACGCCUUGCUUAAGCCACACCCCCACGGGUACUCAGCAGUAAUUAACCUUAAGCAAUAAGUGUAAACUUGACUUAGCCAUAGCAACCCAGGGUUGGUAAAUCUUGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACAAGAAACCCAAAUCAAUAGCUACCCGGCGUAAAGAGUGGCCACAUGUUAUCUGCACCAGCUAAGAUUAAAAUGCAACCAAGCUGUCAUAAGCCUAAGAUCCACCUAAACCCAACCCAAAUCCAUCUUAGCCUCAACGAUUAAUUUUAACCCACGAAAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAAUCUAGAUACCUCCCAUCACACAUGUAUCCGCCUGAGAACUACGAGCACAAACGCUUAAAACUCUAAGGACUUGGCGGUGCCCCAAACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAUCCACGAUUCACCCAACCACCCCUUGCCAGCACAGCCUACAUACCGCCGUCGCCAGCCCACCUCUAAUGAAAGAACAACAGUGAGCUCAAUAGCCCCUCGCUAAUAAGACAGGUCAAGGUAUAGCCUAUGGGGUGGGAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAACAUAGAACAAACGAAAAAGGAUGUGAAACCCGCCCUUAGAAGGAGGAUUUAGCAGUAAAGUGAGAUCAUACCCCCUAAGCUCACUUUAAGACGGCUCUGAGGCACGUACAUACCGCCCGUCACCCUCUUCACAAGCCAUCAACAUCAAUAAAUAUAUACUUCCCCUCCCGGCUAAAGACGAGGCAAGUCGUAACAAGGUAAGUGUACCGGAAGGUGCACUUAGACUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((.....(((.......)))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((....))))).((((....))))....)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))).....(((.......((((...(((..............((((((((....(((.(((..(((......)))...)).))))....)....(.((....))))))))))............))).....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((..............))))).))).(((......((((......))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).........)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....))))))).)).)))))))))....(((((...)))))....((((((((((((.......)))))))))))).....))))))....(((((((((...........)))))))))...........)))))))))).))....((.((((..(((((((...((............((......))..............))...)))))))...))))..))....((((((((((....))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...(((..[[[[...[[[[..)))...]]]]...]]]]...((((..[[[[..))))..]]]].....................(((((...........))))).(((((((...(((.(((((..............((((((((((((((....((((....)))).................)))))))))(((((....)))))...((((.....(((((...))))).....(((((((...(((.....)))..)))))))..............))))...)))))...))))))))......)))))))......(((((((((...........(((......)))(((((((.......................))))))).........)))))))))..........((((((.((((...)))).[[[[[[...........)))))).....]]]]]]...((((..........(((.....[[[.[[[.....[[[[)))...]]]].....]]].]]]..((((.[[[[..))))...]]]]..))))....(((((((((((((........))))).......((((((((((......))).....(((((((((((...(((.(((.(((......)))......))).)))...((((.....))))....))).)))...))))).......)))))))..((((((.....)))))).....)))))))).......((((..(((.....)))))))...(((............[[[[[[[[[.........)))...]]]]]]]]].(((((....[[[[..............)))))..]]]]....................................((((.[[[[[......))))..]]]]]........((((((((((....))))))))))......
|
|
CRW_00781
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUACUCAAAAUAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAGGAACGCUAGCUAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGGGGAGCUGGGCAGAAGGAAAAGAGGCUCCUAGCGUGAAGGUUGCUUGUCUCGCCCAGGAGGUGGGAACAGUUGAAAACAAAGUGGCGAACGGGUGCGUAAUGCGUGGGAAUCUGCCGAACAGUUCGGGCCAAAUCCUGAAGAAAGCUAAAAAGCGCUGUUUGAUGAGCCUGCGUAGUAUUAGGUAGUUGGUCAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAAUGAUGCUUAGCUGGUCUUUUCGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCGGACUCCCACGGGGGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCCGAUCCAGCAAUAUCGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCCGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUGCGCGAUCAUGACAGGACUCGAGGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUCUUCGGAAUGACUGGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCGGGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAAAAACUGGUGGAAUGCUCUCGAAACCAAUUCACUUGAGUGAGACAGAGGAGAGUGGAAUUUCGUGUGUAGGGGUGAAAUCCGCAGAUCUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUCUCUGGGUCCCUACCGACGCUGGAGUGCGAAAGCAUGGGGAGCGAACGGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCCGUAAACGAUGAGUGUUCGCCCUUGGUCUACGUGGAUCAGGGGCCCAGCUAACGCGUGAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGACCGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUACAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAACAACAAAACCAGUCCUUAACGGGAUGGUACUGACUUUCAUACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUUGGUCAAGUCCUAUAACGAGCGAAACCCUCGUUUUGUGUUGCUGAGACAUGCGCCUAAGGAGAAAGUCUUUGCAACCGAAGUGAGCCGAGGAGCCGAGUGACGCGCCAGCGCUACUAAUUGAGCGCCAGCACGUAGCUGUGCUGUCAGUAAGAAGGGAGCCGGCGCCUUUCGAAUUCGAAGCACUUUCUAGUGUGCGCUGUUUUUUGAUUGCAGCUAGCGAGCAAGAAAACGGAUGCGCGAACGCGGCUUUCUUUCGCCUUGCUUGUUGCUUUACUAAAUAGAAAGAAAGGGCUUUUCUCGCUUGUUUAGUAAAGUCCAGUUUUUGGCCUUAUCUUGCAGGUGACGACGACGUCGAGUUGGCGGCGGAGAAAGACUCGGCAUUCAGGUGAGCCGCCCGGUGGUGUGGUACGUAGUGGGUUUAGUACGCCCCGCCAAAACGGCUCCGAAACAAACGAAAAGGUGCAUGCCGCACUCACGAGGGACUGCCAGUGAUAUACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGGCCCUUAUGGGCUGGGCCACACACGUGCUACAAUGGCAAUUACAAUGGGAAGCAAGGCUGUAAGGCGGAGCGAAUCCGGAAAGAUUGCCUCAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGGGAACAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUAUGUACCCGGGCCCUGUACACACCGCCCGUCACACCCUGGGAAUUGGUUUCGCCCGAAGCAUCGGACCAAUGAUCACCCAUGACUUCUGUGUACCACUAGUGCCACAAAGGCUUUUGGUGGUCUUAUUGGCGCAUACCACGGUGGGGUCUUCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGUGGCUGGAUGGAAUCC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((.....................................................................))).))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((((....)))))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(...(((((...(.........)....)))))...)...(((((......(((((.(................).)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((.....)))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((........(((((.....)))))............))))))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((.(((...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))..))))))).....(((((.....))))).......)))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))...))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((....(((((((.((((.....(((.(((((((.....))).)))))))......))))...)))))))...))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((.......)))).))))((((((((.(((((((((..(((.....)))..................)))).)))))...))))))))..............((((...((((...(((((((((((((.(((..............(((...)))...(((((.....(((((......(((((((............(((((((((..((((.(((((.((((((...((((.((((...))))..)))).(((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))))))))..)))))..))))..(((((((...)))..)))).....))))))))))))))))((((..(((..(((((..((((......(((((....))))).(((......((((((((..(((.(((((((..(((.....)))..)))))))..)))..)))))))).......))).......))))..))))))))..)))))))))....)))))........))).)))))))))((((....))))))))..))))...))))........(((((....[[[[...........)))))...]]]]..(((..[[[[[[[....))).(((((....)))))......]]]]]]]...((((...((((((.(((.....)))...))))))..)))).(((.........))).(((((((.[[[[[[..(((....))).((((....)))))))))))....]]]]]].(((....[[[[[)))..]]]]]...(((..[[[[[[[.(((((((((((....)))))))))))..........)))..]]]]]]]..((((..((((.(((((....)))))..))))..[[[......))))..]]].......(((..((((..[[[))))...)))......]]]............((((.((((...((((((.......((((.((((....)))))))).......)))))))))).)))).....((((((((((((((((((((((((((...(((((((......(((((((((....(((((((((.(((((.(((((.................))))).)))))))))))))).((((((((((.....(((((..(((((........)))))((((.....)))).(((..............)))((((((..((((....))))(((((....)))))))))))(((((((.((((.....)))).)))))))......)))))....))))))...))))..)))))))))(((((((((((((...((((((...))))))....)))))))))))))......))))))).))))))))..........)))).)))))))))))))).(((.....[[[[.)))......]]]]((((....((((((((((.((((.......((((((((((....(((.(((..............(((((.....)))))......))))))((((((...)))))).....)))))))....))).....)))).((((((.........))))))...)))))))))).............))))..((((.[[[[.....((((.....))))......))))..]]]]......(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]].....(((((..[[[[...)))))....]]]](((......(((..((((((.....((((....))))))))))..)))[[[[[)))...(((((((((((((.(((.....)))..)))))))).......))))).......]]]]].(((.[[[[[)))....]]]]]........((((((((((....))))))))))..........
|
|
CRW_00783
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUUAUUAGUUCAAAUUAGACCUACACAUGCAAGUAUCCGCUACCCAGUGAGAAUGCCCUUAGAACUUUUUAAAGUAAUAAAGGAGCUGGUAUCAGGCACACACCUUGUAGCCAAUUACACCUUGCUUAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUUAAUAUUAAGCAAUAAACGAAAGUUUGACUAAGUCAUAAUUUACAUUAGGGUUGGUCAAUAUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACCCAAAUUAAUAAUUUGCCGGCGUAAAGUGUGUUUAAGUUAAAUUAAAAAAUAAAGUUAAUAAUUAACUAAACUGUAGCACGUUCUAGUUAAUAUUAAAAUACACAAUAAAAAUGACUUUAAUACUACCGACUACACGACAACUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGUAAUAAACUAAAAUAAUUCAAAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGGACUACUAGCCAUUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCCCUAGACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCCGACCUUAUCUUGCCAAUACAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCUAACCUUUAAAAAGAACUAUAGUAGGCAAAAUCAUCUUACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCGUAUGAUAAGGAAAGUAAUGGGCUACAUUCUCUACUAUUAGAGCAUAACGAAUCACAUUAUGAAAAUAAAGUGCUUGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAGUAGAGAGCUUAAUUGAAUUAGGCAAUAGGGCGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAACAUAAUUACCUAGAUACCUAAUACUAUCAUUCAUCAAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGAAUAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....((((((...((((....))))....)))).)).(((..(.(((..(((...))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).......(..((...(((((....))))).)))..)).))))))......(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))).....(((.......((((...(((............(((((((....(((((((..((........))...))))))).....).....(.((....))))))))).....)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((....))))).....((((((((((((......)))))))..))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((...((((((.....(((....(((((.....)).)))..)))........))))))....))))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((...(((..........)))...)))))))))..........((((.((((....))))...))))((((...((((....))))....)))).(((((((...((((((.....))).)))...)))...[[[[[[[[.....(((....)))...))))...........]]]]]]]](((((....)))))...(((((((...........((((..(((...((((((...[[[..)))))).....)))..))))................]]].....((((((((....................((((...[[[[[[[[[[[..))))..]]].]]]]]]]]....)))))))).......)))))))......................((((((.........(((..[[[...)))..]]]..))))))......................................(((........[[[[..........)))........]]]]((((.[[[.....))))...]]]((((((((.....((((........))))........(((((((.(((...(((((((((((((..................(((....)))...))).))))))......((((..............)))).....)))))))...))))))).....))))))))........((((((((((......(((..(((.((((....)))).))).)))........))))))))))...............(((((((...)))))))....(((((.........)))))......((((((..............((((........))))[[[[.......))))))................((((((((((....))))))))))]]]]...
|
|
CRW_00784
|
[ FASTA input ]
|
UAAAGGUUUGGUCCCAGCCUUCUUAUUAAUUUAUAGCAGGAUUACACAUGCAAGCAUCUACGACCCUGUGAGAAUGCCCUCUAUGUUAAUACAUGUUUAACCUAAAGGAGCAGGUAUCAAGCACACUAUAAUAGUAGCUCAAAACACCUUGCUUAACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGAUUAAAAUUAAGUUAUAAACGAAAGUUUGACUAAGCCAUGUUAUAUUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAAUAAGUCACGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUUUUAACUAUAAUAAAGUUAAACUUUAACUAAGCCGUAAAAAGCCCUAGUUAAAAGUAAAAUAACGAACGAAAGUCACUUUAAUAUUCUCUGAGUACACGAUAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACAUAAACCCUUAUUAACCUAACUGUUCGCCAGAGAACUACAAGCCAAAGCUAAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAUACCUCACCAUUUCUUGUCACCACAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCUUAAUAAGGAGAUAAAGUAAGCUCAAGCACUGACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGAAAUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUACUUCACCAAGUAUAUCCACGUUAACUCUUAUGAAAUCUGAGAGUAGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGCUAGGAAUAGAGAGCCUAACUGAAUAGGGCCAUUAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGCAUUUACUAUUAAUAUUAGUUUAUAUUACCUUACAUACAUGCAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAUGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((((.......)))))....))).)).(((..(.(((..(((.....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))....(((.......((((...(((............(((((((...((((((((..(((......)))...))))))))....).....(.((....)))))))))......)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((....)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....((((......))))......((((((((((((.......)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((.............((.....)).............))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......))))))..............(((((.......(((....))).......)))))(((......)))(((((....)))))....((((....[[[[)))).........((((...)))).]]]]....(((..((((........(((....)))....)))))))..........(((((..(((....))))))))..((((((((((....((((((((......((((...(((..[[[)))..))))))))))))................]]]......(((((((((.......((((..((((((.....((((((((...............))))))))......................)))))).(((((...)))))....)))))))))))))....((((.[[[[....))))(((....)))..]]]]........((((((((((((....((((......))))....(((....)))..........)))...((((((((.........(((....)))...((((..((((.(((........)))))))....................))))......)))))))).............))))))))).......(((((((...((((((((.(((.....))).)))..))))))))))))....((((((((((((.[[[[))))).)))).))).....((((......(((((((.......))))))).......))))....]]]]....((((.........))))....(((.[[[[.)))...............]]]]......((((((..((((.......((((((......))))))..........))))..)))))).......))))))))))(((((((((....)))))))))...
|
|
CRW_00785
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUACUGUUAAUUGUAGUUAGACCUACACAUGCAAGUUUCCGCUGCCCGGUGAAAAUGCCCUGAAAAUUUAAAACUAAAUCAACAGGAGCGGGUAUCAGGCACACUCAUAAGUAGCCCACAACGCCUUGCUUUACCACACCCCCACGGGAUACAGCAGUGACUAAUAUUAAGCUAUAAACGAAAGUUUGACUAAAUCAUAACUAACUAGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAAUUAACAGACGAACGGCGUAAAGGGUGUUUAAGCUAAAACACAUACAAUAAAGCUAAGAGCUAACUAAACUGUAAUACGUUGUAGUUAGCAUCAAAAUACACAACCAAACUAGCUUUAAUCAUGCUGAAGACACUACAGCUAAGAGACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCUUAAACCAAGGUAAUUAGAUAACAAAACUACUCGCCAGAGAACUACUAGCCAAUGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCCUAAACCCACCUAGAGGAGCCCGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCCCACCUUUUCUUGCCAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCUAACCCCAGCAGGGAUAAAAAGUAAGCAAGAUCAUUAACCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCAUAUGAAAAGGAAAGUAAUGGGCUACAUUUUCUAAAUUAGAACACAACGAAUUAUCUCAUGAAACCUGAGCAAUAUGAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAAUAGGCAAUAGGGCGCGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCGACAAACCUUACAAAUAACUAAUAAAAUAAAAUACAAAAGAGGAGAAAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAGGUGCACUUGGAACAUC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....(((((....(((((....)))))....))).)).(((..(.(((..(((....))).))).....))))..((...))))).((((....))))...)))))).......(..((...(((((....))))).)))..)).))))))....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))).....(((.......((((...(((..............(((((((....(((((((..((........))...))))))).....).....(.((....))))))))).....)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....((((...))))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((...))))).....((((((((((((.......))))..)))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))).))))).))....((.((((...((((((..............((.....))................))))))....))))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((((.(((...(((((((((.(((((((.....(((.(((....(((((......((((....(((((((...(((((....)))))...)))).)))((((...(((..(((....))).)))..(((....)))...)))).))))....)))))....))))))...............(((((....)))))............)))))))((((((((......((((...(((.....)))..)))))))))))).)))))))))......)))....)))((((((......)))))).((((............[[[[[[[[[[[))))....]]].]]]]]]]].............))))))))..(((.......[[[[)))......]]]].............(((..[[[...)))..]]]......(((((.....))))).........................(((........[[[[[..[[[....)))..]]]..]]]]](((.[[[..))).......]]]((((((((.....((((........)))).........((((((((........................((((..((((..(((....)))...............((((..((((.........))))))))......))))..)))).)))))))).)))))))).....(((((...)))))............((((......(((...........)))....((((((.....))))))....))))(((((..[[[..)))))....(((((.........))))).]]]..((((((.......................................))))))............(((.((((((((((....))))))))))...))).
|
|
CRW_00786
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUACUCAAAAAAAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAUGAACGCUAGCGAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGUCCUUACGUGUUGAAGGUUGCAUUCGGAGAAGAAAACCUUUUUUCUUCUCUGAGCUGCUCAACUUUUAAUCAGUUGAGCCUGCGGCCUCCAAUCAACCGUGAGAAUCGUUGAAAACAAAGUGGCGAACGGGCGAGUAAUAUGUGGGAAUCUGCCAAACAGUUUGGGACAAAUCCCGAAUAAACGAAAGCUAAAAGGCGCUGUUUGAUGAGCCUACAAAGCAUCAGGUAGUUGGUUAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAACGACGCUUAGCGGGUCUGUUAGGACGAUCCGCCGCACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCCACGGGAGGCUGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCAAUAUGGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCAGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUAUGCGAUUAUGACAAGACUCGAAGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUAUUCGGAAUGACUAGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCCAGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAGCUCAACUGGCGGAAUGCUUUCAAAACCAAUUUACUAGAGUAAGGCAUAGAGGAAAGCGGAAUUUCGUGUGUAGCGAUAAAAUGCAAAAAUAUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUUUCUGGUUCUUUAACUGACGCUAAAGUGCGAAAGCAUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCUGUAAACGAUGAGUGUUCGUUCUUGGUCUACUGAUAUCGCACUCUUUUGGGCUGACUUAAGCUCGGCUUAAUGCUUAAAUUACUGCAAAGGUAGUGUGACUCGAUUGUUUUCUUCAAGUUCCAACAAUCGUGAAAAAUAUGUGAUGAUCAGGGGCUGAGCUAACGCGUUAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGGCUGAAACUCAAAGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUUCAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAAUAAGUGUGCUUGUCCUUAACGGGAUGGUACGAAAAUUCAUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGACGUUGGGUUAAGUCCUAUAACGAGCGCAACCCUUGUUUUGUGUUGCUAAGACAUGCUUUGGUUCAAUCCUUGACCACUGGAGACUGACGAAGACUACGCCGUGAAAAUGGAGGAUACCGACGAGCUAAGUUUUUGCAAACGCCGUGUGGCUCAUUCUGAAAAGAAUAUGACCAUACAAAGUUUUCAUACGGUAUUCUCCGACGAACGAAGCUCUCAGAGCAUUGUACACUUCACACUGAGGAACUCGAUCUUAGUCAAAAUGAUUGACACUCCAAGCCAUGUGCUGCACUCACAAAAAACUGCCAGUGAUAUACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGGCCCUUAUGGGCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCAAUUACAAUUGGAAGCAAUGCUGUAAGGCGGACGGAAUCCAGAAAGAUUGCCUAAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGAGAACAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUAAGUACUCGGGCCCUGUACAAACUGCCCGUCAAACCAUGGGAAUUGGUUUCGCCCGAAGCAGCCUACCAAAGAUCACCCAUUACUCGAGGUGUUCCACGCCGUUGUUGAGUGUGGUCUACUAGAGUCAUUGGUGAUCUUAUGUAGGAGACCAAGGUUGGGCCAUUGACUGAGGUUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGCAGGGGAACCUGUGGCUGGAUUGACUCC |
|
[ reference structure ]
|
.................(((((...[[..))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((...........................................................................................................))).))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((((....))))))..........(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(...(((((...(.........)....)))))...)...(((((......(((((.(................).)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((.......)))))...)))))))))..))))))))).....(((((.(((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))))).....))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((.....................................................................................................................))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((........(((((.....)))))............))))))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((.(((...............................................................................................................................................................................................................................................)))..))))))).....(((((.....))))).......)))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....((((.((...(((....)))...))...))))....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((.((((((((((((((((((((((........(((((..(((((((((....((((.((.....((((((.........))))))....)).))))....)))))))))..))))).......))))))))))))))))))))))..))))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
.(((.((((........)))).)))(((((((..(((.....((((((((..((((((......(((...(((....(((((((((..((((((.(((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))..((((((((.......)))))))).))))))))....)))))))))))......))))))))).....)))....))).......((((((.......((((((((((((((....))))))..........(((....))))))))))).....))))))))))))......(((((((.(((........))).)))))))..))).)))))..))))))))))......(((...(((((.(((.....))))))))..[[[[[[....)))....]]]]]]..(((((.....(((((....))))).............(((((..(((.(((((((..((((...))))..)))))))..)))..)))))........)))))............(((((.(((....[[[[[..)))...]]]]]..........))))).(((.[[[[[[......)))..((((.......))))....(((((((....(((((((((....(((((((.....)))))))..))))))))).....))))))).]]]]]](((.....[[[[[[[....((((((((((.(((......)))....))))))))))....))).............]]]]]]]..........((((.(((...((((....))))....)))...[[[[.))))....]]]]((((.(((.......(((((.[[[[[[)))))..))).)))).......]]]]]]..(((((((((.......)))))))))(((....[[[[[[)))..]]]]]]......((((((((.............)))))))).................((((((((((......((((((..((((((((((....((((.(((((....)))))..))))......(((.(((....)))..)))..)))))))..)))[[[[[..........))))))..]]]]]....))))))))))..(((((((...((((((.(((((....)))))))))))...)))))))........((((((((.......(((((((((....)))...[[[[[..........))))))..]]]]].(((((((......))))))).....(((((...[[[..)))))..]]]......((((((((............[[[[[[[[[[[[........)))))))).((((...((((((.((((............))))))))))...)))).....]]]]]]]]]]]]......((((.[[[[[[...........))))...]]]]]]............(((((.....)))))......))))))))......(((((.........((((((...)))))).[[[..)))))(((...)))...]]]...((((((....)))))).(((..[[[..[[[[.[[[[))).......]]]]..]]]]....]]].(((((((.....))).[[[.....))))...]]]....(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]......((((..[[[[...)))).....]]]]...((((((.......)))))).((((((.....(((((..(((((((((....((((..((((..((((((.........))))))..)))).))))....)))))))))..))))).[[[.....))))))..(((((....)))))]]]....(((...(((((((((....)))))))))[[[)))..]]]
|
|
CRW_00787
|
[ FASTA input ]
|
GUCCUUUGAUUUUGGGGAAUGUAGAAGGCAAGUGGCCCUUUUAAUACAUGCUAGUAUGUCUAUCUGAUGGUCAAAAGAUCUAAGGAUAGCUCGUGCAGACAGGUGAGUAAAUCCGGAAUCCAAAGUGCUGGGCCGGAGUCUUAUUAGGUAGAAGGUGGUGUAAAAGACCACCUUGCUGAAGAUGGGUAGCUUAGUUGGAGCCACACUUUCACUGAAACAAGGGGAAGGCUCACAUAGAGGCAGCAGUAGAGAAUCUUGUGCAAUGCACGAAAGUAUGACACAGAGAGGACACAUUUAAUUGAGCCCGUCAAAUUAAGUGCCAGCCGACGCGGUUAGACUUAAGGGCUGGUCUUUAUAAGUAAAAAGGCGUAAAGGAUGUGUAGGCCAAGAAAUUGUCCAAGAAGGUAAAUGGAAUUUUUCUGGAGCGGUAGAAUGUGAGGAUAGAAAAUAGAACACCUAAGGUUAAAACUAUUUACCACAAAAUAGGCUGAAACAUGAAAGUGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAGACCCUGGUAGUCCCACACUGUGAACUUUGAAGAUGAUGCUUAGCAGACCCGAAAGGUAAAAUCUUCCGCCUGAGUAGUACGAUCGCAAGAUUAAAAUUCAAAAACUUUGGCUGUUCACUAUUUCGAUUAGAGGAGCGUGUAGUUUAAUUCGAUGGUCCGCGUGUUACCUUACCCCAGCUUGAAUCUAUGACCGGUAUUGCAUGGCCGUCGUAAGUCCGUGUGUUAAGCUAGAAGGGACCCAAUCCGGGCGUUUGCCCGAAGGAAGUCAGGUCUUAUGAUCCGAAUGUUGGGGGAUUUUAUGCGCUACAUUUUCUUAUAUAAUGAGAGACUUGAAAGGUAAGCCUCUAAAGUAAGAGUUCGGAAGGUCGCUGUAAAACGACUGGAAGUUGGAUUUAAUAGUAAUCGGAAAGUAGGGCGUUCCGGUGAAUUGGUACAAGUGUUAGCACAAAUUGCCCGUCACCUUUACCUAGGAUGGUUAUUCGGACGCCUUCGGUGGUUACGAAUGCCUACGAGGUAAAGCAAGUCGUAACAUGGUGAGGGAGGGGGAACCCUCCCUUGAAAAUGAAGCAAAAAUCUUGCAUUUUAUUUACACUAAAAAGUUAGUCUAAAAAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...[[[.))))).((((.(((((..((((((((.....(((.(((..(((((.((((((...((((....))))...))))))..)))))......(((....(((((((..((((......)))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((.....))))))).((((((..........)))))).(((.....)))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).........(((((......(((((....................)))))))))).)))))))))........(((.......((((...(((...................(((((((....(((((((..(((......))).....))))))).....).....(.((....)))))))))..........)))...))))....((((((....(...((((.........))))...)))))))............((((((..(((((............)))))..)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((.....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((..............((.((((..((((((((((..((((((((.....))....)))))).....((((((....))))))...))))).)))..))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((((......(((((((((.....)))))))))...)))))))..(((((((((((......))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((.....((.((((((...(((......)))..))))))))....)))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......................................................
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.......)))))........(((..[[[))).......]]].((((.(((((.((((((...((((....))))...))))))..)))))[[[[.....))))..(((((..((((......)))))))))]]]]..........((((((((.......))))))))((((........))))(((((..[[[[[....[[[[))))).......]]]]]]]]]...(((((((..............(((((..((((......))))..)))))....(((...........[[[[[)))...((((((...(((((...)))))..))))))]]]]].((((((........)))))).......(((((..(((((.....((((.......(((((((((...(((((((..(((......))).....)))))))......(((...))).....)))))))))))))..((((((...(((((..(((((((((......((((.........))))....)))))))))((((((...((((((..(((...))).(((.....)))...)))))).(((.((((.....((((....))))...........)))).))).))))))..((((.....))))..)))))))))))......)))))))))).(((((((.(((((((.......((((((.(((...[[[[.))))))))).......]]]]..........((((((.....(((((....)))))..[[[.....))))))....]]]....))))))).................((((((((...)))))))).....))))))))))))))...........(((..[[[[[))).....]]]]]...............((((.(((((((....[[[[.)))))))..))))......(((....))).....]]]]....(((..[[[.)))..]]]........(((.[[[[)))....]]]](((.[[[[[......)))..]]]]].(((..((((((((((....))))))))))...)))..((((.....))))......((((.(((((....))))).))))....
|
|
CRW_00788
|
[ FASTA input ]
|
GAUGUAAUAAAAAAAAUUUUUUUUAAUUUUAUAUUACAUCAAUAAAAAUAGAUGAGUUUGGUGAUGGCUCUGAUUGAACACUGUUCAAAUACUUGACACAUGCUAAUCGAACGUUUAAUUUUUGGCCUAAGAAAGGGGUUUCAUCGUGGCUUAAGCUAAGGGGUUUAUUGUGGCUUAAGCUAAGGUUUAAUCUUUGACUUAAGCGGGUGUUUUAGGGGAACUUGUGCCCCUAAAACCUCUUAAUUAAAAGUGGUGUACAGGUGAGUAUAAUAUUUUUUCGCUUAACUUAAAGUGAAGGCAAAUCCUUCAUAUUGCAAAAGGAUAUCUUAGGCACCUGUUGAAAGGGGCCUACUUAUAUUAUAUCCGCUUUAAGAGGAUGAGAAAAGUUUCAGAGAUAGGUAGUUGUUAAGGUCAUGGCUUAACAAGCCAAUAAUUCUCUUAGUCGAAGCUGAAAAGGCUGAUCGACCACAUUGGGAAUGAAAAAAUCCCAAGGCAAAUAGGUACAGCAGUGAGGAAUCUUGGUCAAUGGGCCCACGCCUGAACUGGUAACUUGGAGGAAUGAGGGGUCAACUUUGCAAAUGGAUGAGUGAUCGUUAGAAGAUCCUUAGUCCCCUGGUCUUCUUGACACAUGAGGUAUAUACUUCUAGUCCAUAUUGGGGGGAGACUCCACGUCGAUUUAUCGAGUAAAAUUCUGUAUACAUAUUGGAUAAUGACAAUAUGUACAUUUGUCUUGACUAAUUACGUGCCAGCAGUCGCGGCAAUACGUAAGAGACUAGUGUUAAUCAUCAUAAAUAGGUUUAAAGGGUACUCAGACGGAAAAAUUCGCCCAAAUAUAGGGGACAAUUUUUCUAGAGUUUUAUGUAAGAAGGUCGUACUCUAGAGUGGAGAGAUAAAAUUCUGUGAUACCUAGGGGACGGGUAAAGGCGAAGGCAAUCUUUUAUGUAAAAACUGACGUCGAAGGACGAAGGCAAAGGGAACAAAAAGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCUUUGCAGACAAUUAUGAAUGCCAUAGGUUAGAUUUUUAAUUUAGUCUAUAAAUGAAAGUGUAAGCAUUUCACCUCAAGAGUAAGGCGGCAACGCAGGAACUGAAAUCACUAGACCGUUUCUGACACCAGCAAUGAAGUAUGUUAUUUAAUUCGGUGACCCACGAAAAACCUUACCACAAUUGAAUAUUAAUAAUAAUGAUAUUAUUUUUUAUGCUUGAUAUGGCAAGCACUCAAUUUUCCCCUCCCCGUAGGUUUGCCGCGGGGGGGGAGAAAAAAGAAAAAUAAUGGAUAAUAUAGUAAAUACCAUAUUCCAACUAUAUUUAAUUAUUAAUACAAGUGUUGCACGGCUGUCUUCAGUUGAUGUUGCGAAACUGUGGUUCGUUCCAUGGAAUUAACGUAAACCCUUGCUUUAUUUGUAAAUAUUAUAAAGCAGUUCACCUUUAUAUAGGAAAUGAUAAAAGGGAUCAGACAAGUCAUCAUGGCCUAAAUAUUGUGGGCUAUAGACGCGCCACAUUUUCCUAAACAAAGAGAUGCAAAAAUGUGAAUUUUAGCUAAUCUCAAAAAAUAGGAUAAAAAUAUACAAGGAUUGUAGUCUGAAAUUCGGACUGCAUGAAUAAGAAAUUGCUAGUAAUCGUGAAUCACCAUGACACGGUGAAUAUUCCCUCGGAUUGGUACUAACCACUCGUCACAUGCUGAAAGGAGUGCGUGCAAUAAGUUUGCUUUUCUAUUAUAAGUAAGUAGACAUAUAGGUUUAGAUGUUAUAAUAGGAUCCUUCGUAUGCGCGGCUCUGAUUAGUGUUAAGUCGAAAUACGGUUCGUGUAGUGGAAGUUGCACGGGACUUAUCAAUGUUGAACAAUACGAUUGGAUAUUAC |
|
[ reference structure ]
|
.....................................................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((...((((.........................................................................................................................))))...))))))......(((.......(((((((((......(((((((.((((.......))))..........................................................)))))))..)).))))))).....(((..(.(((..((((((((.......)))))))))))......).)))..((((.((((.....))))...))))))).((((((.........)))))).(((....)))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...........................................................................................................................................(((((..................))))).....(((((.......((((....................)))).))))).))))))))))..........(((.......((((...((((((((((......................))))))...((((((((...(((((((((((((((((.((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))..))).)))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((.........))))))))...((....))....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....((((((((((.................................................................................................................................))))))))))..((.((((..((((((((....(((((((((....))).((((......))))...)))))).....((((((((((((...........)))))))......(((......))).........)))))....))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))...........(((((((((((...........))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((((((.................................................................................)))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))...................................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...((((((......)))))).)))))))))...............((((((((((........((((((...)))))).............(((((...............))))).((((..(((((((..(((.((((((((((((............)))))))))))).)))..)))))))..))))...(((.((((((((((........)))))))))))))..............((((.[[[[[[[)))).......]]]]]]]........(((((((.....))))))).........((((((..(((((.(((......))).)))))[[[[....))))))....]]]]....(((((....)))))..(((......[[[[[[[[)))....]]]]]]]](((.....(((.....[[[[[[[[[)))..]]]]..]]]]]....((((((.........)))))))))...(((((....((((.(((......((((....))))....)))..))))...)))))(((((...[[[[[....((((.......(((((....))))).)))).)))))...]]]]].(((.....)))....(((((....)))))...(((....[[[[[)))..]]]]]..((((....)))).....(((.....[[[[[[[[[))).....]]]]]]]]].....................((((...[[[[..))))..........]]]]...........................(((((((......(((((((((..(((........)))..)))))))))[[[[[[[[[[...........)))))))...........]]]]]]]]]]....(((((.[[[[..)))))...........((((((((.(((.........((((....))))............))).)))))))).....]]]]....(((...[[[))).........]]].((((..((((((...))))))..))))..................(((.[[[...)))....(((....)))]]].......))))))))))((((.(((.[[[))).))))...................]]]....(((.........((((((......((((((((((.....(((((((((((.((((((......)))))).....(((((((((((((((.........)))))))))).)))))..)))))))))))...((((((((.((((...))))...))))))))..))))))))))....(((.(((((((((....)))))).))).)))....))))))..((((....))))...))).......((((((((...........)))))))).(((.[[[[[......)))......]]]]](((.......[[[)))((((((((.......)))))))).]]]...........(((((......(((((...(((((....))))).....)))))......)))))........(((......((((((((((...))))))))))....(((....)))...))).((((...[[[[[))))...]]]]]......(((..(((((((....))))...))).[[[[[....)))...]]]]]......((((((((.[[[[........)))))))).........]]]].................((((((...(((((.((((....)))))))))..))))))........(((.[[[[[.)))..]]]]]...((((((...((((...))))))))))..
|
|
CRW_00789
|
[ FASTA input ]
|
AAACGUAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAUGAACGCUAGCCAUAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGCUUCUGACAAGAAGAGUGGCAAACGGGUGAGUAACACGUAGGAAUCUACCCAACAGCUCGGGGAAAUAGUAUUAUCUAUGAAUCCCGAAUAAAAAAACUAAGUGUUGUUAUUGGAUGAGCCUGCGGAGGAUUAGGUAGUUGGUGAGGUAAAAGCUCACCAAGCCGAUGAUCCUUAGCUGGUCUGAGAGGACGAUCAGCCACACUGGGACUGAGAAGGGCCCAGACUUCUACGGAAGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCUAUAUGGCGUGAGUGAUGAAGGCAAUUUCUGUUGUAAAGCUCUUUCAUUGAGAACGAAUUAUGAUGUAACUCAAAGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGGGGGGGCUAGUGUGGUUCAGCAUGACUGGGCGUAAAGGGCACGUAGGCUGUUAAUUACGUUGGAAGCCAAAGCCUCAGGAAACCCCUGAGAACGUCUUUCAAAACGGAUUAACUCGAGAUAUAAAGAGGAAAGCGGAAUUUCAAAUGGAGAGGUUGAAUUCGUAGAUAUUUGAAGGAAGGCCAAAGGCGAAGGCAGCUUUCUGGUUAUAAUCUGACGCUGAGGUGCGAAAGCAUGGGGAGCAACCAGGAUUAGAUACCCUGUUAGUCCAUGCCCUAAACGAUGAGUGUUCGUGACUUGAUUUUUUAUUGGGUCACCAAGCUAACGCGUGAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGGCUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCAUACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAACAACGCGCAAAACCUUACCAGCUCUUGGUAUUUUUUUAAGUUUCUUGUAAUGAUAGAAACGAUCUUUUGGAAAAAACAGGCGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUUGGUUCAGUCCUAUAACGAGCGAAACCCUUCGACAAUGUUGCUAUGAAUCUUAGAGAAUUCAGCACUCUUUGUUGACUGCCCGUGAUAGACGGGAGGAAGGCGAGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGACCCUAAUGAGCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGAAGACAAAAGGAAGCAAUGACGUAAGUCGGAGCAAAUCCACAAAAAUCGUCGUAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGAGAACAUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGCAUGCCACGGUGAAUUGGUACCUGGGCCUUGUACAUACCGCCCGUCACACCCUGGGAAUUUUUUUGGCCCGAAGGUAACUACACAAAUUUUUUCAUGAUAGAUUCACUUGUGGAUUUAUGGUGCGAAUUUUUAUUAUGUUUCCCACGGUCGAGGAAGUGACUGAGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGUCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAAUAUAUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...{{{.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((....)))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((...(((........)))....))))).......(((.....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((.........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((.....)))).....))))((.(((((((...(........)....))))))).))..(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((.(((((((.(((((((((.......((((((.....)))))).....)))))..)))))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...)....(..((....))))))))))..)))).))))...)))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((.....))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..(((((((.......)))))))........))))).))).((.((((..((((((.((((((((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.((((..((((((...)).))))))))..))))))).....(((((.....)))))........)))).))))).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.....(((...((((([((((((((((....))))))))).]))))))))).......))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((((..(((((.............)))))...[[[............))))))).(((((....)))))...]]]....(((((.......[[[[[[....)))))((((((((((((..((((......))))...))))))...............))))))..........]]]]]](((((((((((..((((((((.......)))))))))))..)))))))).((((((((....))))..((((.....[[[[[.))))......]]]]].((((....)))).))))...((((.(((.((((....((((....))))..))))(((....)))..[[[[)))....(((((....)))))...]]]]((((.(((((.(((........)))..))))).))))...))))((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]].......(((..[[[[[[)))..]]]]]]....((((((....((((.......[[[[[...)))).....((((((.....))))))]]]]].................(((..........)))....(((((.[[[[[[[[[...........)))))...]]]]]]]]]....(((...)))((((.[[[[))))..((((.....))))]]]]..((((....))))(((.........[[[[[[[...)))..]]]]]]].)))))).......(((((((.(((((((((.......)))))))))...............)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..)))...(((((((((((((............((((((((((((......)))).....((((..(((((((((...))))))(((((((((((((((.........))))))......)))))))))..)))..))))..(((((......[[[[[[(((....)))........))))).....]]]]]].....((((((((((...((((..((((........))))))))....)))))))...(((((.....))))))))..((((.[[[[..))))..]]]].(((..[[[..)))....]]].....))))))))...(((((((........(((.....((((....)))).......))).......)))))))....(((..[[[[[[))).......]]]]]]....(((((....[[[[[[.[[[[[[[.)))))...]]]]]]]..]]]]]]...))))))............)))))))((((......((((((((((((.......(((.....((((((...(((.(((((((((....))))))))).))).)))))).......)))......))))))))))))......))))...............(((((((((....)))))))))(((.....)))...
|
|
CRW_00790
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUAGUCAAAAGAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAGGAACGCUAGCUAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGGGGAGCUGGGCAGAAGGAAAAGAGGCUCCUAGCGUUAGUCCGCUUGUCUCGCCCAACAUGUUGGUGGGAACAGUUGAGAACAAAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUGGGAAUCUGCCGAACAGUUCGGGCCAAAUCCUGAAGAAAGCUAAAAAGCGCUGUUUGAUGAGCCUGCGUAGUAUUAGGUAGUUGGUCAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAAUGAUGCUUAGCUGGUCUUUUCGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCGGACUCCCACGGGGGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCCGAUCCAGCAAUAUCGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCCGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUGCGCGAUCAUGACAGGACUCGAGGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUCUUCGGAAUGACUGGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCGGGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAAAAACUGGCGGAAUGCUCUCGAAACCAAUUCACUUGAGUGAGACAGAGGAGAGUGGAAUUUCGUGUGUAGGGGUGAAAUCCGGAGAUCUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUCUCUGGGUCCCUACCGACGCUGGGGUGCGAAAGCAUGGGGAGCGAACGGGAUUAGAUACCCUGUAGUCCAUGCCGUAAACGAUGAGUGUUCGCCCUUGGUCUACGCGGAUCAGGGGCCCAGCUAACGCGUGAAACACUUCGCCUGGGAGUACGGUCGCAAGACCGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUACAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAACAACAAAACCUGUCCUUAACGGGAUGGUACUGACUUUCAUACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUUGGUCAAGUCCUUUAACGAGCGAAACCCUCGUUUUGUGUUGCUGAGACAUGCGCCUAAGGAGAAAGUCUUUGCAACCGAAGUGAGCCGAGGAGCCGAGUGACGUGCCAGCGCUACUAAUUGAGUGCCAGCAAGCACGUAGCUGUGCUGUCAGUAAGAAGGGGGCCGGUGCCUUUCGGCAAACGUGUGCGUAUUGCAGCUAGCGCGCUUUCCCCAGCCUGACAGUUUAGUAAAGUCAAGUUUUUGGCCAACUCUUGCAGGUGAUGACGACGUCGAGUUGGCGGCGGGGAAAGACUCGGCAUGAAGGCGAGCCGCCCGGUGGUGUGGUACGUAGUGGGUUGCCCCGCCAAACGGCUCCGAAACAAACAAAAAGUGCGUACCGCACUCACGAGGGAACUGCCAGUGAUAUACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGCCCUUAUGGGCUGGGCCACACACGUGCUACAAUGGCAAUUACAAUGGGAAGCAAGGCUGUAAGCGGAGCGAAUCCGGAAAGAUUGCCUCAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGGGAACAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUAUGUACCCGGGCCCUGUACACACCGCCCGUCACACCCUGGGAAUUGGUUUCGCCCGAAGCAUCGGACCAAUGAUCACCCAUGACUUCUGUGUACCACUAGUGCCACAAAGGCUUUUGGUGGUCUUAUUGGCGCAUACCACGGUGGGGUCUUCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGUGGCUGGAUUGAAUCC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((........................................................................))).))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((((....)))))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(...(((((...(.........)....)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((.....)))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))..))))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...((....))....))))))).))).(((.....((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((........(((((.....)))))............))))))).((.((.(..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((.(((.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))..)))))))......(((((.....))))).......)))))...))))).)))...)))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(.(....))...))...))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((....(((((((.((((.....(((.(((((((.....))).)))))))......))))...)))))))...))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
................(((((...[[[[)))))...]]]]............(((.........)))........(((((((...(((((((.[[[[[[.........))))))).((((((...(((((((.(((((((((.((((......))))))))..........))))))))))))..)))))).......]]]]]].....(((((((((..((((.(((((.((((((...((((.((((...))))..)))).(((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))))))))..)))))..))))..(((((((...)))..)))).....)))))))))((((((....[[[[...)))))).....((((...(((((....))))).))))......((((....))))..........]]]]..((((.....[[[[[[.[[[[[[..))))..........]]]]]]]]]]]].((((..(((..(((((((((.........)))...))))))..)))..[[[[[[[[..........))))...]]]]]]]]......(((((....[[[[...........)))))...]]]].(((((((..((((....[[[.(((((....)))))...))))....]]].))))))).((((((......[[[[[[[[[)))))).......(((.........)))...]]]]]]]]](((......[[[.)))..]]]...(((((((..(((...(((.[[[....))))))..))))))).........]]](((((.(((((((((((....)))))))))))[[[...)))))(((((....))))).]]]((((.(((((....)))))..))))...........(((((((.(((....[[[.....)))((((...........)))).]]]..............)))))))......)))))))...(((.(((((....)))))))).(((..[[[[[[.))).....(((((((((....)))).))))).]]]]]].(((((......[[[[[...)))))......(((((((((.(((((.(((((.................))))).))))))))))))))..]]]]](((((((.((((((..(((((........)))))[[[[[.)))))).....]]]]].......(((((......[[[[))))).(((((((....))).)))).....]]]].((((((((.(((((.........(((((......)))))[[[[[[[[...)))))...(((...)))]]]]]]]]...)))))))))))))))..............(((.((((((((((((((((((((....)))))..........................)))))))))))).)))..))).....((((((...)))))).....((((.[[[[..))))..]]]]((((((((....))))...[[[[.....)))).....]]]]..(((((..........[[[[))))).((((.....))))........]]]]..........(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]].....(((((..[[[[...)))))....]]]]((((.....((((.((((((.....((((.[[[)))))))))).....)))))))).....]]](((....((((((..((((((......))))))..))))))..[[[..)))..]]]....((((.[[[[..))))....(((..((((((((((....))))))))))..))).]]]]
|
|
CRW_00792
|
[ FASTA input ]
|
UUUACUCACUUUAACCAAAGUUGAGUUUGGUGAUGGCUCUGAUUGAACACUGUCCAAAUACUUGACACAUGCUAAUCGAACGUUUAAUUAAAUUUUACAGUUGCAGUAAAGUUAUUCUUUCCUUUCUGUAAAACUGGUUAUUAAGGAGGUUUAAAUUUAGGGUUUAUUCUCCUCUAUUUAUAAGGUUAAUCUCUCUAAAGGGGUUUUUUUAAUUAAAAGUGGUGUACAGGUGAGUAUUAUGGUUUUUUGUACUACCUAAAAGUAAAGGCAAAUCCUUUAUAGUAAUAAAGAACGGUCAUGUUCGCUUUUAGAUGAAGAUAAAAAAUCUCGGGGAAAGGUAGUUGUUAAGGUAAUUGCUUAACAAGCCUAGUAUUCUCUUAGUCGAAGCUGAGAAAGGUUGAUCGACCACAUUGGGGAUGAAAAAAUCCCAAGGCAAACGAAGUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGUCAAUGGCCUAACGGCUGAACUGGUAACUUGGAAGAAUGGCUCCAUAAAAAUGGAGUUAAUCGAUUUAUCGAAUAAAAUUCUGUAUACAUACCUAUAAUGACGGUAUGUACAUCUUGUCUUGACCAAUUGCGUGCCAGCAGUCGCGGCAAUACGUAAGAGACUAGUGUUAUUCAUCUUAAAUAGGUUUAAAGGGUACUUAGACGGUAGAAUUUGCCUUAACGGGAACAAUUUUACUAGAGUUUUAUAUAAGAAGAUCUUACUCUAGAGUGUAGAGUUGUAAUUCAUUAAUACCUAGGGGACUGGUAAAGGCGAAGGCAAUCUUUUAUAUAAAAACUGACGUUGAAGGACGAAGGCUUAGGUCACAAAAAGGAUUAGAUACCCAAGUAGUCUUAGCAGUCAAUUAUGAAUGCCAUAGGUUAGAUAUAGUUAAAUACAAACAAGGGCGUAAGCUCGUAUUAAAUUUUACCAUCUAGUCUAUAAAUGAAAGUGUAAGCAUUUCACCUCAAGAGUAAUGUGGCAACGCAGGAACUGAAAUCACUAGACCGUUUCUGACACCAGCAGUGAAGUAUGUUAUUUAAUUCGAUGACCCACGAAAAACCUUACCACAACUUGAAUAUAAAAAAAUGCUAUCUACUACCAUCACUUAUUUAAAGGUAGCGGCGCGGGGCGGCGAAAGCUCCUCCUCGCUCUAAAUUUAAGUGUUAGGCGCAAGCUCUAAGAUAUAUAGCUGGCUUAAAUAUUAUUUAGCUAACUAUGCUUUUAGGUUAUAGAUUAAUGCAAGUAUUAUACAAGUGUUGCACGGCUGUCUUCAGUUGAUGUUGUGAAACUGUGGUUCGGUCCAUGGAAUUAACGAAAACCCUUGCUUUAUUUGUAAAUUCUAAAAUAAAGCAGUUCACCUGUAUAUGGGUUAUGAUAAAAGGGAUCAAGACAAGUCCUCAUGGCCUUGAUGUUGUGGGCUAUAGACGUGCCACAUGUACCUAAACAAAGAGAUGCAAAAAUGUGAAUUUUAGCUAAUCUCCCAAAAUAGGAUAAAAUUAGAUAUGGAUUGUAGUCUGAAACUCGGCUAUAUGAAUAAGAAAUUGCUAGUAAUCGUGGAUCACCAUGACACGGUGAAUAUAACUUCGGAUUGGUACUAACCACUCGUCACAUGCUGAAAGGAGUAUGCGCAAUAAGUUUGCUGUUCUGUAUUAAACAAGAAUAGAUGACGGUGCAAGCUAGAUUUUAUUUUUUAAUAUGGGGCUCUUCGUAUGUGUGACUCUGAUUAGUGUAAAGUCGAAAUACGGUUCGUGUAGUGGAAGUUGCACGGGACUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
......................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((((((((((((...................................................................................................................))))))))))))))))......(((.......((((((((...((....((((((.(((((.....)))))...........(((........))).))))))...))))))))))......(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).......))))..((((.((((......))))...))))))).((((((.........)))))).((.......))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..(((...(((((....)))))........)))..................................................(((((.......((((....................)))).))))).))))))))))..........(((.......((((...((((((((((((..(((....)))...))))))))...((((((((...(((((((.((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))..))).)))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((....................((((....)))).................))))))))...((....))....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((....................................................................................................................................................................)))))..((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))...)))))).....((((((((((((((.((.....)))))))))))......((((....)))).........)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....))))).))..........((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))..........)))))))))).))....((.((...(((((((((((((((.............................................................................................)))))))))))))))....))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.............((((.....[[[[[))))...]]]]]...(((.....[[[[)))......]]]]...............((((((((((.....(((((((((.((((.....)))).....))))..))))).......((((((..(((((.....))))).)))))).........(((..[[[[[[)))...]]]]]]..))))))))))....(((((((((((((......((((((((((...(((.....(((((((.....))))))).........[[[[)))...]]]]((((((......((((.....)))).....))))))..((((((((.......))))))))((((.......(((((((....)))))))..((((....))))...[[[(((((......))))).))))...]]].......((((.......[[[[[[[[[(((((....))))).)))).......((((...(((((((((....))))))))).((((....))))......))))...((((((((.........)))))))).........]]]]]]]]](((.[[[[.))).....]]]].........(((((((.........(((((.....((((((.......))))))(((((((((..(((....)))...)))))))))...........)))))...(((.[[[[[)))....]]]]].....(((.....[[[[....)))..]]]]........((((...((((....))))..(((((((((..(((....((((.(((.................))).)))).)))))))).))))........))))...(((........(((.[[[[[.)))..((((....))))]]]]].......)))..)))))))..........(((...[[[[[.))).........]]]]].......(((((((.....[[[[[.....)))))))........]]]]].....((((((......))))))..))))))))))..........................(((((..............((((((((..(((.((((.((((.(((....))).)))).)))))))..))))))))[[[[[[................)))))..]]]]]].........(((...[[[[)))........]]]].....(((((.......[[[....)))))((((((....)))))).]]]...(((.[[[[[[)))...]]]]]]...............(((((((((((..........))))))))))))))))))))))))..(((.((((....[[[)))).))).....]]](((((........[[[[[))))).......]]]]]....((((......(((((...(((((....))))).....)))))......))))...........(((....(((((((........)))))))...)))......(((((((....[[[[.(((((.......)))))............)))))))....]]]]..(((((((..(((((..(((.(((((.....(((..(((((((..........)))))))..))).))))).)))...))))).......(((((((....))))))))))))))...((((.[[[[..))))...]]]]..........(((.[[[[[.)))..]]]]]....
|
|
CRW_00793
|
[ FASTA input ]
|
AAAAUAGAGAGUUUGAUGAUGGCUCUAACUGAACACUGUCCAAGUACUUGACACAUGCUAAUCGAACGACUAAUUAGUUUAAUUAUUAUCUAAUAUUUAAAUUAAGUAGUAGUGGUGUACAGGUGAGUAAAAGAUAAAUUGGCUACCUUAAAGUAAGGGAAAAAAUCCCUUAUAACCAAAGGUUAAUAUUACCGCUUUAAGAUGAUAAUUUAUCUCGGUGAGUAGUAGGAAGGUAAUGACUUUUCUAGCAAUAAACCGUAGUCGUAACUGGAAAGUUGAUCGACCACAUUGGGUCUGAAAAAAACCCAAUGCUUUUAUGUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGUCAAUGGCCGAAACGUGAACCAGUAACUUGGAAGAAUGUCUAUGUAACUUGUAUGGUUACAUUCGCGAUUAACUCGCAUAAAAUUCUAAAUAGAUUGUAUAUAAUGACAUAAUCUAUUUAUAAGUCUUGACCAAACUACGUGCCAGCAGUCGCGUAAUACGUAGGAGGCUAGUGUUAGUUAUCUUUAUUGGGUUUAAAGGGUAAGUAGACGGUAAAUUAAACUCUAAACGAGUACUUUUUUACUAGAGUUAUAUGAGAGAAGGAAGAAUUUCUGGAGUAGAGAUAAAAUUUGAUGAUACCAGGAGGACUGUCAACGGCGAAGGCGUCCUUCUAUGUAAUAACUGACGUUGAGAGACGAAGGCUUGGGUAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUAAUAGUCCAAGCAGACAAUGAUGAAUGUCAUACAUUAGAUAUAAUUUUAAUGUAUAAACGAAAGUGUAAGCAUUCCACCUCAAGAGUACUAUGGCAACAUAUAAACUGAAAUCAUUAGACCGUUUCUAAAACCAGUAGUGAAGUAUGUUAUUUAAUUCGAUGAUCCGCGAAAAACCUUACCACAGCUUGUAUAGCAUAUUAUAAAAAAUUGUUACAAGGCUGCAUGGCUGUCUUUAGUUAAUGUCGUGAGAUUUGGUUAAUUCCUUUAAUUAACGAAAACCCUCACUUUAUUUAUUUAUAUAAAGUGGUUCGCUACUACAUCGGACCAGAUAAUAGGGAUUAAGACAAGUCAUUAUGGCCUUAAUGCUGUGGGCUAUAGACGUGCCACAUACGCCUUUACAACGGGAUGCGAUAUUGUGAAAUGGAGCUAAUCCCCAAAAAAGGAAAUAAUAUGGAUUGUAGUCUGUAACUCGACUACAUGAAAAAGGAAUUACUAGUAAUCGUGAAUCACCAACGUCACGGUGAAUUUUAUCUUAGUUAGGUACUAACCACUCGUCAGGCGCUGAAAAAAGAAGAUGCAGUAAGUUUGAUUUUUUCUGUGUAAAGUUAUAUAUAUUUAUGAUAUAUAAAUAUGCAGGAUAGUUUUCGUAUGCAAAACUUUGAUUGGUGUUAAGUCGAAAUAAGGUUCGUGUAAUGGAAAUUGCACGGGGAGUAUAAAA |
|
[ reference structure ]
|
........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))......(((.......(((((.((.((....((((((.((((.........)))).........(((.......))).))))))...))..))))))).((((((((..((((((((......)))))))))))...)))))..((((.((((....))))...))))))).((((((.........)))))).((......))...)))))).......(.(((...(.(((....)))).)))).)).))))))..(((.......(((((.....)))))........))).....................................................(((((........((((...................)))).))))).))))))))))..........(((.......((((...((((((((((((.((((.....))))..))))))))...((((((((...(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))..))).)))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((........))))))))...((....))....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((.............)))))..((((((..(((((((((...(((((((((....)))..((......))....)))))).....((((((((((((........))))))))...........................))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((........))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((.....................................................................................))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.[[[[[.......)))))..]]]]]........((((((((((...((((.((((....((((.(((((((((.((((....)))).))))))))).))))..))))(((((...(((((..((((((((((.....((((((((((((((.....)))))).(((((...)))))........))))))))....))))))))))((((......(((((((((....))))))))).......))))..(((((((((....)))))..))))....((((((.........)))))))))))...)))))))))(((((...(((((((..(((.......)))..)))))))...........(((..((((((((.....))))))))..))).....))))).........((((((((((((..........))))))))))))...((((........(((((((.....[[[[......)))))))..]]]]........((((((((..........))))))))..))))......(((.[[[[)))..]]]].(((((((.[[[[[[.......))))))).......]]]]]]..(((((((....(((((((((..(((((((..((((.(((..(((((...)))))..))).........((((....))))...((((((............(((((.....)))))...)))))).)))).....((((((.((((((((((......))))))))))..(((....)))..))))))..))))........((((....))))....)))..)))))))))..))))))).........(((..(((((((......((((........))))........(((((((.....(((((.(((......)))))))).((((((..(((((((((((.((((...(((....)))...(((((((.....)))))))......(((.(((((((........)))))))((((((.........)))))).......)))))))))))).))))))...))))))...)))))))......))))))))))...(((.[[[[[[[......)))...]]]]]]].(((......[[[))).....]]]............(((((((........)))))))......................(((...[[[[[.)))....]]]]]...........))))))))))........(((((((((((......[[[[[[.))))..)))))))...(((((((((...((((((((.......)))))))).)))))))))..]]]]]].(((((.....(((((((.......)))))))......((((((((((....))))))))))..)))))...
|
|
CRW_00794
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGUUUGGUCCUGGCCUUAAUGUCAGCUUUAACUAAACUUAUACACUGCCAAGUCCCCGCGCCCCAGUGAAAAUGCCCUCACACGCCAGUAGGUGUAGAGGAGCUGGCAUCAGGCCCACACUAAGUAGCCCAAGACGCCUUGCAACGCCACACCCCAAGGGACACAGCAGUAAUUAAAAUUGGACUAUAAGUGUAAACUUGAUCCAGCCAUGGUUAAAUAAAGUUGGCCAACCUCGUGCCAGCCGCCGCGGUUACACGAGGAACUUAAGUUGAUGCCUCCGGCGUAUAGGAUGAUUAAGAGGAACUUUUACUAAAAUCAAAUAUUGGCCCUGCUGUUAUACGCGCUCGCCAACUAGAAACUCAAAAUUUUUAACUAACAGUACAUCUGAACUCAUGAAAGUCAGGAAACAAACUAGGAUUAGAUACCCUACUAUGCCUGACCCUAAACUAUGACAAGUCUAACUACAUAACUUGCCCGCCAGGAACUACAAGCCCAAGCUUAAAACCCAAAGGACUUGGCGGUGCCUCACACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAGAACCGAUAAUCCACGUUUUACCCAACCUUCCCUAGCAUUUCAGCCUAUAUACCGCCGUCGCCAGCCAACCCCCUGAGGGUAGACUAGUUGGCAGAAUAGAUAACAUCUAGCACGUCAGGUCGAGGUGUAGCACAUGAGAAGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAGUAGAAAACACGGACAAUCCCAUGAAACUGGGAUUCUAAGCUGGAUUUAGUAGUAAGAGAAAAUAAGAAUAUUUUUCUGAAGCCGGCCAUGAGGCGCGCACACACCGCCCGUCACUCUCCUCAACAAUCGUAAACGAUAAAUAAUUAAUUUAGAUAAAAAAGAGGAGGCAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACCGGAAGGUGUACUUGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.)))))...((((((((.((((((((....(((..(((...((....))......(((.....((((((..((((......)))).)))).)).(((..(.(((..((.....)).))).....))))..((...))))).((((...))))...)))))).........(((...(((((....))))).)))..)).))))))....(((((......(((((....................)))))))))).)))))))).....(((.......((((...(((..........((((((((.....(((((...(((......)))....)))))......)......)))))))............)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((...........))))))).))).((......((((....))))....))....]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(.(((((..........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....(((.....)))...))))).)))...))))))))....))))))..)).)))))))))....((((...))))....((((((((((((......)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((..(((((((...................(((.....))).........)))))))...))))..))....((((((((((....))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((.(((((......))))).....)))))))))...(((((((((((((..(((((...((((........))))..[[[[[[.)))))......]]]]]]((((((...(((((..((((.((((......((((.........(((...)))........))))......)))).)))).)))))...)))))).((((..(((((((......))))))).(((((((..(((((...))))).))))))).......)))).........(((((((((((...((((((...)))))).....))).....[[[[[.......))))))))....]]]]].........................(((.....)))...........((((((........((((.[[[[[[..)))).....))))))...............]]]]]]........((((.....))))......((((....))))..........))))))))))))).(((........[[[[[[)))....]]]]]]....................((((..(((((......(((((.....((((((................(((....)))..((((...((((....(((((...)))))....))))))))..)))))).....))))).)))))...))))((((.[[[[[[.))))......(((..(((((((......))))))).....)))............]]]]]]....((((.....))))...(((.[[[[[[.)))(((.......))).......(((((((....((((....))))...(((.....))).........)))))))..........]]]]]](((((((((....))))))))).....
|
|
CRW_00795
|
[ FASTA input ]
|
UAAUAAAAAUGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAGUGAAGGCUAUAAGUCUGCUUGAAUACAUGCGAGUCGAAUGAUUUAGAUCAUGGCGUACGGGUGAGUAAUAGACUCAUAUCUGGCCCCAACUCUUGGAUAAUCCUAUCCCUCCGGGAGAAAAAAAGGGAAAUACAGGAUAAUUAUAAGGUACGCCGGUUGGGGAUGAUUAGGUCGAGUAUUAGGUAGUUGGUAAGUAAGCUUACCAAGCCUUUGAUGCUUAGUUGGUCUGGGAGGACGAUCAAUCACACUGGGACUGAGACAAGGCCCAGGUUUCAUUUGAAGGCAGCAGUAAGGAAUAUUGCACAAUGAGCGAAAGCUUGAUGCAGCAAGACUUGGUGAGGGAUUGAAGGCUUAGGUUGUAAACCUCUUUUUUAACUGAGGAUAAUGACAUUAAGUUAAGAAUAAGUCCCGACUAACUUCGUGCCAGCAGUCGCGGUAAUACGGAGGGGGCAAGCCUUAUUCGUCAUAACUGGGCGUAAAGGGCCCGUAGGUUGCUUUCUGUAAAGUUAUUUGUUAAAUAUUAUAGCUUAACUAUAAAAAGGCAUUUAAAACAUGAAAGCUUGAGUCUGACAGAGGGAAAUGGAAUUUUUUAAUUAGGGUUAAACUCCGGAUAAGUAAAAGAGAACAUCAGCUGCGAAAGAUUUCCUUGUUCAGUACUGACGCUGAGGGGCGAAGGCGUAGGUAGCGAACAGGAUUUGAGACCCUGGUAGUCUACGCUGUAAACGAUGAGUGCUAAUUUUUAGAAAUCUAGAAAAUAUAGCCAAGGCAUUAAGCAUCGCUGAGGAGUACGAGCGCAAGCUUAAAAAUCAACGGAAUUGGCGGGGGUUCAAACAAGUGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUGCGAUAAUACGCGCGUAACCUUACCAGUUCUAGUAAGUCUGUCAUUUUUACGAGACGUAACAAACUUUGGGACUUUCAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUAGGGUUAAUUCCUGUAACUGAGCGCAACCCUCGUCUCUUUUAAGUUUUGUAAUAGUUUAUACUAAGUAAUAAAACAGGAGAGAUACUGCCAACGUUGAGUGGAGGAAGGUGGGAUGAGGUCAAGUCUUCAUGGCCCUUAUAACUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGGAAGGACAACGAGUUGCGAGGGAGUAAUCCAAAGCCAAUCUUAAAACCUUUUCUUAGUUCGGAUUGGGGGCUGCAAUUCGCCCCCAUGAAGUUGGAAUCACUAGUAAUCGCGAAUCAGGAUGUCGCGGUGAAUACGUCACUGGGCCUUGCACACACCGCCCGUCACGUCCUGGGAGUUGACUUGGCCAGAAGAUUUAGGAAUAAACUUUUUAAGUUGAAGUUUGAUAAAAAAAAGCUUUUUUUCUUUUCUAACGAAAAAAGAAAGUCCUUUUGAAGGACAGGUAAGCAACUGGGAGUAAGUCGUAACAAGGUAGUCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAAAAAUUAAUUU |
|
[ reference structure ]
|
..........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((......(((.(((..(((..(((((....))))))))......(((......(((((...(((...((((((((...............................................................))))))))..)))..)))))(((..(.(((..((((((((....))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......................)))).(...(((((................)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((((.........((((.....((((((.....))))))...))))......))).))))))...((((((((..((((((((((((((((((((..(((......))).......))))))))))))....(.((...))))))))))).))))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))............(((((..(((((((....))))))).....((....))....))))).)))(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....((((((....((((((((...))))).))).....))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))...(((......)))....)))))).....(((...............................................................................)))....)))).)))...))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((.........((((.....((((((..((((.........((((((.....))))))......))))..))))))....))))......))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
.........((((((.......))))))..(((.(((((...)))))[[[[[..)))...]]]]]...(((((....)))))(((((((..((((((..[[[))))))..]]].......(((((((...[[[[[.[[[[[)))))))......]]]]].....]]]]].........)))))))................((((((((((((((..((((((((....))))))))))))..))))))).(((((((.........)))))))....[[[[[.....)))....]]]]].......(((...[[[((((((.....)))))).)))(((((....))))).]]]...............((((((..........(((((...((((.[[[[[[[[[))))))))).......]]]]]]]]]..))))))((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]].((((.[[[[[....((((.......))))......))))..]]]]](((((((((.........((((.....((((((.....))))))...))))......))).))))))...(((((((..((((((((((...((((((((((.(((......))).)))...)))))))...))).............)))))))..)))).)))..(((((....(((....)))...)))))..((((.....[[[[))))...]]]]..((((((.......[[[[[[..(((((((....))))))).))))))...]]]]]].....(((((((.[[[...((((....))))..............)))))))...]]]..(((.....[[[[[[.)))((((..(((((........)))))))))......]]]]]](((((...[[[...)))))..]]]((((((...((((((...)))))))))))).(((((.(((.(((((((((((....))).....(((..(((((((.....(((((.......(((((((((..(((((((..((((....))))....))))))))))))))))..............((((((((...(((.......)))..))))).((((((........)))))))))..)))))...))))))).))).))))))))))).(((....)))..))))).............(((...[[[[))).(((((((........)))))))........]]]].....((((((((((.[[[[[[[[)))))))...)))......((((............))))....]]]]]]]]....(((((((.((((....((((....((((((((.......)))))))).)))).....(((((((((.(((((....))))).)))))((((((...))))))....))))..))))...)))))))........((((((((((....)))))))))).............
|
|
CRW_00796
|
[ FASTA input ]
|
ACCGAUUUGGUCCUAGUCCUAACUUUAGCUAAUUUUUAGUUGCCACAUGCAAGCCCAAUGACAAACCAGUGAAGUAAAAAUUUUGGUCUCCCCACCUAAAAAGAGACAGGAGCAAAAAUUCUAGUAUCAGGCCCUAACCAAUGCCCACGACACUAAGCAAUACGCCACAACUGCAGUACUAAACAUUAGACAAUCGGAAAAAUCCGGAUCUAGCAAAAAAAUAAGCAAGGGGGCAAAAUACGUGCCAGCCACCGCGGUUAUACGUACUUCCUAAAGCUAAAUAAAACGGUAUAAAGGGCGGUUAGAAAAAUAGAUUUGACUGUAGCUCCCAGCUAGUGGUAAAAAACUAAUCUGAGAAGAAACAUAAGUCAAAAUAUUUAUUUGAACCCGCGAAAACUAAGACCUAAACCAGGAUUAGAUACCCUACUAUACUUAGACGUAAACAACCUAAGCACCAGAGAACUACAAACUAAAAGUUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUUUUCCAUACCUCCCUGGAGAGCUUGCCAUUGAAUCGAUAAUCCACGAAACACCUCACCAACUUUUGUAAAUCAGCUUGUAUACCAUCGUCGUAAGUCUACUUCUUAAGAAAGUUGGCUCCUAGGGAAAAUUCCCAGACGUCAGAUCAAGGUGCAGCACAUAAGCUGGGAAUGAGUGAGCUACAAUGUUUUUAACGACCAGCGAAAAUAGAAAUGAAACAAUUCUUUAGAAGUUGGAUUCAGCAGUAAGCCCCAAAUAGAAAAUGGGGCUGAAAAGAGCUCUGGAAUGCGUACACAUCGCCCGUCACUCUCGCCUAGCUUAACUUAAGUAAGGGGAGAAAAGUCGUAACACAAUAGGCACACCGGAAGCCUGGAAAAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..(((....)))......(((.......(((((...(((...................)))...))).))..(((..(.(((..........))).....))))..((.....)))))....)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))....(((((......(((((....................))))))))))..))))))))))...(((.......((((...(((........(((((((....((((((...(((......)))....)))))).....)...))))))........)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))................))).(((......(((((...)))))....)))...]]]..(((((.(((((((......(((((((((((((((((...((((........))))........(((((((..........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).)))))).....((((...))))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((...)))......(((((((((((.........))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((.(((((((((.((((.....)))).)))))))))..))))..))....(((((.........)))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.((((.(((...((((((........(((.((((.....))))......)))........)))))).....(((((((......))).))))...))))))).)))).....(((.....[[[.)))......]]].(((......(((.............(((...........(((((...(((((....))))).)))))...........)))((((((.....((((((..((((.....)))).))))))))))))...))).........((((((.((((((((((((.(((((..(((((((........(((.((((........))))..)))............))))))).))))).)))))..)))).....((((..(((.....))).))))....)))..))))))....)))...........(((((.(((......(((((...)))))....)))...(((..(((((((((((((........)))))))).))))).......[[[..)))((((((............))))))..]]]........(((...[[[[)))((((.((((.......)))).))))....((((....)))).]]]].........))))).........(((((....[[[[((((......)))).......)))))....................(((((....((((....))))....(((((((.........)))))))..)))))]]]]......(((.......)))(((....((((.(((.(((((...))))).))).))))................[[[[....)))..]]]].......
|
|
CRW_00797
|
[ FASTA input ]
|
UAAAUUUGGCUCUAGUUUGAAAAUAAAUUUUUUAUACAAAUAACACAUGCAAACACAAUUUAAUUAUUGUGUGUACGGGUGAGUUAAAAAAAUUGAAUUAAUAUUCAAUUUUAGAUAUUAUGGAUAAUUUUGAAUAAAUUUUCGAAGAUAUUAAGGUGUUAACCCACAUCAGAAUUUUCUGAGUUUAUAUUUAUAAUCCAGCAGUGUAAAACAUUAGACAAUAAGUAUAGGCUUGAUCUAGUGAUAUAAAAAAAAGUUUAAGUAUUUAUUUUAAAUUUUUUUAUUAAUUUUAUAAUGAAUGAUUAAUAAAAGUUCAAUCUAAUUAUGUGCCAGCAGAUGCGGUGAAACAUAAUGAGCAAAUUUAUUUUAUUAAAUAGGUUUAAAUUAUACAAAAGUGGUUUUGUUUAUUUUUUUUUAAAUUUUGAAAUUUAAUUUAAUAAAAUAAAACUAGAAAAUAAUUAAUAUCAAAAAUUAAUAAUUUAGGUAAUAGUAAAAUGUUUUAAUCUAAAUUCGAAAACUAAAAGUUAUUCUUUUUUGAUUCUUAUUUUGACACUGUCGUAUGAAAGCUUGGGGAUCAAAAAAGAUUAGACACCUUCGUAGUCCAAGCUGUCAAUAAAGGUUUUUUAUAAAUAUCCUUUUAUUUAUAUCUUGAAAAAAUUAAAACUAACCUGAAGAGUACGAUCACACGAUUGAAAUUCAAAGAGCUUGACGGAAUUUAAGACCAAUUGUGGCACAUGUUGUUUAAUGUGAUACGACACGUUUAUUUUAUCAAAAUUUUUAUUUAUUAAAAAGGUGUUGCGGGGUUGUCCAAAUUUUCUAUAUUAAUUACUAAGAUUAAAUGUUUUAAAGUACAAUAAUGCAAAUUUUCCUGGCCCUUAUAUUUUGAGAUAAGACUUGUGACAUUAAUUCAUAACGAAUUAUAAUUUGGUUAGUAUUGAAAAAUAUUAACUAAAUCGGAAUAAUUAGUAAAAUAAAACAAUUAUUGUUUAUUUGAAAAUUCGGCUUAAAUUUGUACACACUGCUCGUCACAUGUCGAAAUUUAUUUAUAUCUUAAAUAUUAAUUACUAAAUUUUAUAUUUAUUAAAAUUUUUCUAUUAAUCUGAAUUCUAUAAAUAAUGAUUGAGAUGAAGUCGAAACAUGGUGGUUGUAGUGGAAGCUGCAGCUGAGUUUUUUAAAAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((.....(((.(((..(((((((......)))))))......(((......(((((((((((....)))))))))))(((..(..(((.(((((.....)))))))).....))))..(((....)))))).(((((....))))).(((((....)))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).((((.....((((....))))....))))((.(((((((.........))))))).))..(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))........(((.......((((...(((.(((((((((..((...((.((.((...)).)).))...))..)))))))))...(((((((.....((((((((((...(((((((...(((......)))......)))))))...)).....(.(.....))))))))))..)))))))...)))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((......)))))))...((....))...)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........)))).......((((((((((((.....))))).((.((((..(((((((.....((((((..(....)....((((.......))))..)))))).....)).)))...))))))))....))))))).)))..))))))))....(((((.....)))))....(....(((((((......)))))))....).....))))))....((((((((........))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((.((((((((((........((((((....((((((((.......))))))))....))))))........)))))))))).)))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((..(((((((((.....))))....)))))......((((..((((((......)))))))))).....))))))))((((((((((....))))))))))........((((((((((((......(((((((((((((((((((((......)))))...((((((((.((((...(((((((((......((((((((((((((...(((((....))))).)))))))......(((((((((((((.......))))))))))))).....)))))))......)))).))))).(((((......(((((((((.........)))...))))))))))).....(((((((((((((((((((...(((...((((((((......))))))))...)))......)))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))))............(((((((((((......))))...)))))))))))))))...........((((((((((((((((.((((((...)))......)))..))))))))))))))))...(((((((((((....((((((........(((((...((((((((......))))))))..((((.....))))....)))))...((((.(((((....)))))..))))....))))))))).......((((...(((((.(((((........))))).)))))...))))..((((...((((....))))..)))))))))))).))))))))))))................(((((((((.....)))))..))))......(((((((((....(((((((((........)))))..((((((.......)))))).(((((...((((((((((((((....))))))))))))))..((((((.((((((..........)))))).))))))...))))))))).)))))))))........(((...(((.((((...(((((((((........((((((....((((((((.......))))))))....))))))........)))))))))...)))).)))....)))........(((((((((....)))))))))..............
|
|
CRW_00800
|
[ FASTA input ]
|
AAUUAUAUUGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAUGAACGCUAGCCGUAGGCUUAACACAUGCAAGUUGUACGUUUUUUAUAAAUAUAGAAAAAGUAGCGAACGGGUGAGUAACGCGUGAGAAUCUGCCUCUUAAACUGCGGAAUAACAUUACGUUAGAAUCGUGGAUAAGUAUUUUAUGUUAUAUUUAUAUAAAAUAAAGUAUAAAGAAUAAUAUUCGUUAAGAGAUGAGCUUGCGUAAGAUUAGGUAGUUGGUAAGGUAAAGGCUUACCAAGCCAAAGAUCUUUAGCUGGUUUGAGAGAAUGAUCAGCCACAUUGGGACUGAGACACGGCCCAAAUACUUUAGAGUAGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGCGCAAGCCUGAUCCAGCUAUACGGCAUGAGUGUAGAAGACUGUAUUGGUUGUAAAGCUCUUCGGUGAUAUAUUUUUAGAUUAUUUAUAAUUUUAAAGAGCAGAGAUUAUGACAACGUAUCAUCAAAAAGUCCCGGCUAAUCUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGAGAGGGGCGAGCGUUAUUCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUGCGUAGAUUGUUAGAAUGGAUUUCUAUAUAAAAAUCAAGGCAACACCUUGAUAGAUAGAAAAGCAUUAGUUUUAUAAAAAUUAAUAAUUAAUAGAUGUAAUUUAUAAUAAUAAGUUAUAUUUAUGUUUUCCAUCCAAACUUGAGUAUUUAUUAGGAGAGUAGAAUUCCUGGAGUAGAGGUAAAAUUUGUUGAUCUCAGGAGGAAUACCUAAAGCGAAAGCAGCUCUCUAGUAAAACACUGACAUUGAGGCACGAAAGCGUGGGUAGCGAAAAGGAUUAGAUACCCUUGUAGUCCACGCCGUCAACUAUGAUCUUUUUCUAUUUUCCCUUGCAAGGGGGGAAGUGGAGUAGCUAACGCGUUAAAAGAUCCGCCUGAGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUAGACGGGGACCCGCACAAGUGGUGGAAUAUGCGGUUUAAUUCGAAACAACGCGCAAAACCUUACCAGUCCUUGAUAUGACACUUAUAGUUAAAAUGUUAUCGUUUUAUACUUUGUGUUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCGGUUCGUGCCGUAAGGCGUUGGAUUAAUUUCUUUAACGAACGAAACCCCUGUUAUCAAUUGCUAAGAUUACUAAAAACAAUGUUUUUAGAUCAGAACUUUGAUAUUACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGAAGGGAUUACGUCAAGUCUUCAUGACCCUCAUGGGCUGGGCUACACGUGUAUUACAAUGGCGAAUACAAAAAGAUGCAAUGAUGAGAAUCGGAGCAAAUCUAUAAAAUUCGUCUCAGUACAGAUUGUUUUCUGCAAUUCGAAAACAUCAAGAAGGAAUCACUAGUAAUCGUGGAUCAGCACGCCACGGUGAAUCAGUACUCGGGUCUUGUACUCCCCGCCCGUCACACUCUGGGAAUCGAGUAGAUUGUAAGUCUGUAUUUCACUUUUUUUCUAUUCUUUAGAAAUAAUAAUAAGUUCUGAUGAAUUUAUUAAAUAUAGAAAUUUAGAAAAUAUACCCAGAAUUUAUUUGGUAACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUUACUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((((((((((....))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.(((((...((((.....))))....)))))....(((((((((((((((....)))))))))))))))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((.....)))).....)))).(...(((((...............................................)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((........((((..(((.....(((((((...)))))))...)))))))...........................................................................)))...((((((.....(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))....))).)))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((((....)))))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((..((..(((((((....)))))))))...)))))))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((.......(((..((((((((...)))))))))))......))))))).....(((((.....)))))........))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((......(((.((...(((....)))...))...))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((.((((((((((((((((((((((.......(((((((.......(((((((..(((((((((..................)))).))))).)))))))......))))))).....))))))))))))))))))))))..))))..))....((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
..((((.(((((((.......))))))).))))(((..[[[)))..]]]............(((.(((.((((((((....)))))))).)))...)))....(((((((((..(((..[[[[[))).......]]]]].(((..[[[[[)))....]]]]]....(((((((((.(((((....))))).)))))))))...........((((((....)))))).......((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))......((((((.........(((...((((....))))...[[[[[))).....(((((....((((....))))..)))))((((((.......))))))...]]]]]...................(((((((((((....)))...((((((((((........))))))))))....))))))))....))))))(((...[[[[[[)))...............]]]]]].......)))))))))...........((((....(((((......((((((..(((((((((((......(((((((.....)))))))..))))))....(((((((((...))))))))).....(((((((((((((((....))))))))))))))).......)))))..........((((((((.(((((....((((((.....(((......)))........))))))....................)))))))))))))...)))))).....)))))...))))(((((.......[[[[[[..)))))...]]]]]]...(((((...((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))..(((......)))))))))))..(((...((((..((((....))))...))))..))).))))))))....(((((...[[[........)))))...............]]]((((.((((.....(((...))).((((((....((((((((((....))))))).)))..)))))).)))).))))(((((........[[[[[[)))))........(((.....)))....]]]]]].....((((..((((((.......(((..((((((((...)))))))))))......))))))......(((((.....)))))........))))..(((((..(((((((((((...))))))...)))))..)))))...(((...(((((((......((((((..((((....))))..)))..))).....)))))))...)))(((..[[[[[[))).......]]]]]]..........(((.......[[[[[[)))........]]]]]]......((((.[[[[[...)))).....]]]]]...((((((((..((((((((((((.....((((.(((((......((((((.....))))))...((((((((((....))))))))))......))))).))))............))))))))))))..)))))))).((((.....[[[[.(((((((((....))))))))).))))...]]]]..
|
|
CRW_00801
|
[ FASTA input ]
|
CAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUAUUAUCAACUGUUUCUCAACUUACACAUGCAAGUAUCAGCACACCCGUGAGAACGCCCUUUAAAUCUUACCCAGAUAAAGGAGCUGGUAUCAGGCACAAACCCUCCGCCCACAACACCUAGUCUCACCACACCCUCAAGGGUAAUCAGCAGUGAUUAAUUUUGCGUAUGAGCGUCAGCUUGACUCAGUUAGAGAAAAGAGGGCCGGCUAACCCGGUGCCAGCCGCCGCGGCUACACCGUGGGGCUCGAGUUGAUAGUCAUCGGCGUUAAGCGUGAUUAAAGUUAUUACAAAUUAAGGUUAAAUUAAUACUUAGUAGUUUUAUGCUUGUUAUUAAGAAAUCCACAAACGAAAGUUACCCUAAUUAUUAUGCUUGAAUACACGACAGCUAGGAAAACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCGUAAACAAUUAAUUUACACCAAUAAGCGCCAGGGAAUUACGAGCAAUGCUUAAAACCCAAAGGAUUUGACGGUGUCCCACCCCACUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUGAUCCCCGAUAUACCCGACCAUUUCUCGCUUAUCAGUCUGUAUACCUCCGUCGAAAGCUUACCAUGUGAACGCUUGCAGUAGGCUUAAUGACCUAACACGUCAAUACGUCAGGUCAAGGUGCAGCUUAAGAAAUGGGAAGUAAUGGGCUACAAUUUCUAAUCUAGAACAAACGAAAGACUAUAUGAAAUUAUAAUCAUGAAGGUGGAUUUAGUAGUAAAAAGAAAAUAGAGUGUUCUUUUUAACCCGGCUCUGGGACGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCUUCGAUAGUAUCUCACCCCGUUCCUAACCCACUAUUACAUUUUAGAAGAGGCAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGUUUAUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....((((((....(((.....)))..)))).)).(((..(.(((..((....)).))).....))))..((...))))).(((....)))......)))))).......(.(((..(((((....))))).)))).)).))))))...(((((......(((((....................))))).))))).))))))))))....(((.......((((...(((...........(((((((....(.(.((...(((......)))..)))...)....).....(.((....))))))))).........)))....))))....(((((((....(...((((.........))))...))))))))......(((...............))).))).(((......((((...))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((..........((.((((..((((((((((..(((((((((....)))......)))))).....(((.......)))...))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((((...)))))....(((((((((((........)))))).))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((((.((((((((...(((..........((.........))......)))...))))))))..))))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....((((((.(((((((...((((((((((.((((((((((.....(((((((......(((....((((((....((((((..(((.....)))))))))....(((....(((...........)))......)))...))))))...((((....))))........)))......))))))).(((((....)))))....)))).)))))).....(((((.....)))))...((((.((((((.....))))))))))..))))))))))..(((...((((((((((((((.....)))..(((((.(((....((((((...((((......))))...))))))..........(((....)))))).)))))))))))))))).....)))..)))))))...))))))(((..[[[...)))..]]].........(((((.......))))).....((((((...[[[............))))))...]]]....((((((((((.((((((....((((((...((((((((((..((((........))))...((((...((((((((((((...........((((.......((((((((..(((((....)))))))))))))..((((((...((((....)))).))))))))))......))))...))))))))..))))...............)))))).............(((((........))))).))))...))))))..(((((((((.........))))))))).........))))))(((.......))))))))..(((((((((((((..........(((...)))..))))))........))))))).)))))..........(((((((((....)))))))))........
|
|
CRW_00802
|
[ FASTA input ]
|
UGUUAGGUUUGGUCCUGACCUUAGUGUUAAUUGCAACUAAAAUUAUACAUGCAAGUUUCAGCCCCCCUGUGAGAAUGCCCUAAGUAUUCUAUUAAAUAAUUAGGGGCGGGCAUCAGGCACACAUUUUACAUGUGGCCCAAGACGCCUUGCUCAGCCACACCCUAAGGGUUUUCAGCAGUAAUAAACAUUGAUUACAUAAGCGUAAGCUUGAAUCAGUUAAAGUCGACAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUUAUACGAGUGACUCACAUUAACACUUCCCGGCGUAAAGUGUGAUUUAAGGAUGACCUCCAAAUAACUAUAGUUAUGACCUCAUCAAGCUGUUAUACGCAUUCGUGAACGGAAUAAUCAACAACGAAAGUGACUCUAAAUUACCAGGAAUCUUGAUGUCACGACAGUUGGGCCCCAAACUAGGAUUAGAUACCCUACUAUGCCCUACCAUAAACUUAGACAAUACCCUACUAUAUUGUCCGCCAGAGUACUACAAGCGCUAGCUUAAAACCCAAAGGACUUGGCGGUGCCCCACACCCACCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAACCGAUAAUCCCCGUUAAACCUCACCACUUCUUGCCAUUACCGUCUAUAUACCGCCGUCGUCAGCUCACCCCGUGAGGGUUAAAAAGUAAGCAAAAAGAAUUAAACUCCUAAACGUCAGGUCGAGGUGUAGCGAAUGAAGUGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUUUUACCAAAAAAUACGGACAGUAAACUGAAAAAUUACCCAAAGGUGGAUUUAGCAGUAAGAGAAGGUCAGAGUACUUCUCUGAAACUGGCUCUGGGGCGCGCACACACCGCCCGUCACUCUCCUCAAUAAAUACACUUAUUUUUAUAAAAAUUUUACCAAAACAAGAGGAGGCAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGAACCAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...[[[.))))).((((((((((.((((((((....(((.(((..((....))......(((.....((((((((((((......)))))))))).)).(((..(.(((..((((.....)))).))).....))))..((...)))))((((....))))....)))))).......(.(((....(((((....))))).)))).)).))))))...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))....(((.......((((...(((................((((((((((..((((((...(((......)))....)))))).)))......(..((....))))))))))............)))....))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((........))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((......((((((.(((((((((((...((((........))))........(((((((...........((.((((..((((((((((..(((((((((....))).......)))))).....((.......))....))))).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))))....(((.....))).....(...((((((((.....))))))))...).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((........................................))))))))..).))..))....((((((((((....)))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.((((((......))))))(((.(((((((((........))))).))))..)))...(((.[[[[)))..(((((((.....)))))))............]]]].((((...[[[[.(((((.....))))))))).....]]]]((((.......((((...))))....))))(((((.[[[....))))).(((((....))))).....]]]...((((...((((((......((((((..((((.....)))).))))))))))))......[[[[[[..))))...]]]]]]........(((((.......(((((....)))))....))))).(((((((.(((..[[[[)))....]]]]..............(((((..((((((......))).)))..))))))))))))((((.......((((.........))))....))))........((((.(((((((........)))))))[[[..)))).......]]].......................(((((((.....))))....[[[[[..)))..]]]]]...(((........(((((.((((((((.(((.((((..((((............................(((....))).......)))))))).)))..(((......)))......))).))))).))))).......((((((((((((.....))))))))).))).......))).......((((..((((((((....))).)))))..)))).(((((((....[[[..)))))))........]]]..(((((.........))))).....(((((((........................................)))))))............(((((((((((((....)))))))))...)))).
|
|
CRW_00803
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUAGUCAAAAUCUGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAGGAACGCUAGCUAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGGGGAGCUGGGCAGAAGGAAAAGAGGCUCCUAGCUAAAGUUGUCUCGCCCUGCUUCAAAACUACAGGGCGCGCGCUACGGCUUUGACCUAACGGCCUCCGUUUGCUGGAAUCGGAAUAGUUGAGAACAAAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUGGGAAUCUGCCGAACAGUUCGGGCCAAAUCCUGAAGAAAGCUCAAAAGCGCUGUUUGAUGAGCCUGCGUAGUAUUAGGUAGUUGGUCAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAAUGAUGCUUAGCUGGUCUUUUCGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCGGACUCCCACGGGGGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCCGAUCCAGCAAUAUCGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCCGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUGCGCGAUCAUGACAGGACUCGAGGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUCUUCGGAAUGACUGGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCGGGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAAAAAGUGGCGGAAUGCUCUCGAAACCAAUUCACUUGAGUGAGACAGAGGAGAGUGGAAUUUCGUGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUCUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUCUCUGGGUCCCUACCGACGCUGGGGUGCGAAAGCAUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCCGUAAACGAUGAGUGUUCGCCCUUGGUCUACGCGGAUCAGGGGCCCAGCUAACGCGUGAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGACCGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUACAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAACAACAAAACCUGUCCUUAACAGGAUGGUACUGACUUUCAUACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUUGGUCAAGUCCUAUAACGAGCGAAACCCUCGUUUUGUGUUGCUGAGACAUGCGCCUAAGGAGAAAUUGCCACCGAAGUGAGCCGAGGAGCCGAGUGACGUGCCAGCGCUACUACUUGAUUGAGUGCCAGCACGUAGCUGUGCUUUCAGCAAGAAUUUCACCAUUGGGAGCCGGUGCCUUUCGAAGCACUUUCACGUGUGAACCGAAGUCGUCUUGCCCAAGACCCACGGAGACCUACCUAUAGUGACGUCAAAGUACCAGUGAGCAUGGAGGUUUGGUUGAAAUUGGUUACGACGACGUCGAGUUGGCGGCGGAGGAAGACUCGGCAUGAAGGCCAGCCGCCCGGUGGUGUGGAACGUAGUGGUAAUAGUACGCGCCCCGCUCCGAAACAAAGAAAAAGGUGCGUGCCGCACUCACGAGGGACUGCCAGUGAGAUACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGGCCCUUAUGGGCUGGGCCACACACGUGCUACAAUGGCAAUGACAAUGGGAAGCAAGGCUGUAAGGCGGAGCGAAUCCGGAAAGAUUGCCUCAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGGGAACAUGAAGUUGAAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUAUGUACCCGGGCCCUGUACACACCGCCCGUCACACCCUGGGAAUUGGUUUCGCCCGAAGCAUCGGACCAAUGAUCACCCAUGACUUCUGUGUACCACUAGUGCCACAAAGGCCUUUGGUGGUCUUAUUGGCGCAUACCACGGUGGGGUCUUCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGUGGCUGGAUUGAAUCC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((.....................................................................................................................))).))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((((....)))))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(...(((((...(.........)....)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((.....)))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((........(((((.....)))))............))))))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((.(((..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))..))))))).....(((((.....))))).......)))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))...))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((....(((((((.((((.....(((.(((((((.....))).)))))))......))))...)))))))...))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
......((((...[[[[[[[[))))...]]]]]]]]................(((.........)))...............((((((((((.......((((...[[[[[))))..........]]]]]((((((...........)))))).(((.((((((((((..........(((((((((.......((((.....)))).......(((((.....(((((......(((((((............(((((((((..((((.(((((.((((.....((((.((((...))))..))))((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))).))))..)))))..))))..(((((((...)))..)))).....))))))))))))))))((((..(((..(((((..((((......(((((....))))).(((......((((((((..(((.(((((((..(((.....)))..)))))))..)))..)))))))).......))).......))))..))))))))..)))))))))....)))))....))))))))).....(((((((....)))).)))........))))).))))))))..............(((((((..((((((.....))))))...[[[[[[........))))))).............]]]]]]...........((((((.......[[[.....))))))..]]]..(((.........)))))))))))))..(((......[[[[)))((((....))))....]]]]..((((....[[[..))))...]]]..........(((..[[[[[[[.(((((((((((....)))))))))))..........)))..]]]]]]]..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((.[[[[[[[.....)))..(((((....(((((((...........))).)))).....))))).]]]]]]]...((((((........(((((.....)))))..[[[[[[....))))))..]]]]]](((((((((.[[[)))).)))))......]]]((((((...(((...((((..(((((((.[[[)))))))))))....)))...........]]]........))))))......((((..........[[[[[[..[[[[[....))))....]]]]]..]]]]]].(((.....[[[)))..]]]........(((((((..(((((........)))))))).[[[[....))))....(((((....))))).]]]].......((((....[[[[[[[.....[[[[[[.[[[....))))...]]]...]]]]]]......]]]]]]]....((((((.(((.....)))(((......))).))))))....(((((((.....(((((.....[[[[[[[[[)))))................]]]]]]]]]....(((((...[[[[[.((((((...))))))......)))))(((...))).]]]]]...((((((......[[[))))))......(((((...)))))............]]].((((.......((((.....))))[[[.....))))...]]]....(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]].....(((((..[[[[...)))))....]]]].))))))).((((.[[[[[[....)))).........]]]]]].................((((.[[[[[.((((((..((((((......))))))..))))))))))...]]]]]......(((((.[[[[..)))))...(((..((((((((((....))))))))))..))).]]]]
|
|
CRW_00804
|
[ FASTA input ]
|
AGUAAAAAAUUUAUAAGAAUAUGAUGUUGGUUCAGAUUAAGCGCUAAAUAAGGACAUGACGCAUACGAGUCAUACGUUUAUUAUUGAUAAGAUAAUAAAUAUGUGGUGUAAACGUGAGUAAUUUUAUUAGGAAUUAAUGAACUAUAGAAUAAGCUAAAUACUUAAUAUAUUAUUAUAUAAAAAUAAUUUAUAUAAUAAAAAGGAUAUAUAUAUAAUAUAUAUUUAUCUAUAGUCAAGCCAAUAAUGGUUUAGGUAGUAGGUUUAUUAAGAGUUAAACCUAGCCAACGAUCCAUAAUCGAUAAUGAAAGUUAGAACGAUCACGUUGACUCUGAAAUAUAGUCAAUAUCUAUAAGAUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGACAAUGAUCGAAAGAUUGAUCCAGUUACUUAUUAGGAUGAUAUAUAAAAAUAUUUUAUUUUAUUUAGUUCCGGGGCCCGGCCACGGAACCGGACCCGAAAGGAGAAAUAUUAAAUAUUUAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAUAUAUAUAUAAAUUGAUUAAAAAUAAAAUCCAUAAAUAAUUAAAAUAAUGAUAUUAAUUACCAUAUAUAUUUUAUAUGGAUAUAUAUAUUAAUAAUAAUAUUAAUUUAUUAUUAUUAAUAAUAUAUUUUAAUAGUCCUGACUAAUAUUUGUGCCAGCAGUCGCGGUAACACAAAGAGGGCGAGCGUUAAUCAUAAUGGUUUAAAGGAUCCGUAGAAUGAAUUAUAUAUUAUAAUUUAGAGUUAAUAAAAUUAAUUAAAGAAUUAUAAUAGUAAAGAUGAAAUAAUAAUAAUAAUUAUAAGACUAAUAUAUGUGAAAAUAUUAAUUAAAUAUUAACUGACAUUGAGGGAUUAAAACUAGAGUAGCGAAACGGAUUCGAUACCCGUGUAGUUCUAGUAGUAAACUAUGAAUACAAUUAUUUAUAAUAUAUAUUAUAUAUAAAUAAUAAAUGAAAAUGAAAGUAUUCCACCUGAAGAGUACGUUAGCAAUAAUGAAACUCAAAACAAUAGACGGUUACAGACUUAAGCAGUGGAACAUGUUAUUUAAUUCGAUAAUCCACGACUAACUUUACCAUAUUUUGAAUAUUAUAAUAAUUAUUAUAAUUAUUAUAUUACAGGCGUUACAUUGUUGUCUUUAGUUCGUGCUGCAAAGUUUUAGAUUAAAUGUGCAUAAACGACCAAAACUCCAUAUAUAUAAUUUUUUAAUAUAUAUUAAAAAUAUUAUUUAUUAAUAUAAAGAAAGGAAUUAAGACAAAUCAUAAUGAUCCUUAUAAUAUGGGUAAUAGACGUGCUAUAAUAAAAUGAUAAUAAAAUUAUAUAAAAUAUAUUUAAUUAUAUUUAAUUAAUAAUAUAAAACAUUUUAAUUUUUAAUAUAUUUUUUUAUUAUAUAUUAAUAUGAAUUAUAAUCUGAAAUUCGAUUAUAUGAAAAAAGAAUUGCUAGUAAUACGUAAAUUAGUAUGUUACGGUGAAUAUUCUAACUGUUUCGCACUAAUCACUCAUCACGCGUUGAAACAUAUUAUUAUCUUAUUAUUUAUAUAAUAUUUUUUAAUAAAUAUUAAUAAUUAUUAAUUUAUAUUUAUUUAUAUCAGAAAUAAUAUGAAUUAAUGCGAAGUUGAAAUACAGUUACCGUAGGGGAACCUGCGGUGGGCUUAUAAAUAUCUUAAAUAUUCUUACA |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((((((((.....)))))))))..))))))......(((.......(((((.((..((......(((((((.((((.(....))))).....((((((((((((.....))))))))))))...((((((((((...)))))))))).)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((........))))))))))).....))))..((((.((((....))))...))))))).(((((((.......))))))).((((...))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))................................................................................................................................................................................................................................................(((((......(.((((....................)))))))))).)))))))))).....(((.......((((....(((((((((((...)))))))...((((((((...((((((((((((((((((((...(((......))).......))))))))))))....(..((....))))))))))).))))))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((((((.....))).)))))))))...((....))...))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((....(((.(((((.(((((...))))).))))).)))(((.((((..((((((((((..(((((((((....)))....................)))))).....(((...........((((((((....)))))))).....(((((....)))))....)))...))))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((........(((.......................................))).........))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((.((((((.......))))))))..........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((((((((((.(((..............................................................))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))............................
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((((((((((((((((((((....((((((.........(((((........)))))..((((((((((.....))))))))))...)))))).(((((((.((((...))))(((........((((((((.((((.......)))).....((((((((((((.....))))))))))))...((((((((((...)))))))))).)))))))).((((((....)))))).(((..((((((((........))))))))))).....)))....(((.((((....))))...))))))))))...))))))......))))))))..(((((((((((.(((((....((((((...(((((....))))).))))))......((((((((((((((..((((((((((((((.....((((((.(((...))).))))))..............))))))..))))))))....((((((((((((((((((((((((.......((((........))))......(((((((..........)))))))(((((((.....))))))))))))))))))).((((...))))..))))))))))))...)))))))......))))))).........((((.(((((((((.((((((.(((((.((((((((((((((((.((((..........))))...))).)))...(((((((((((..(((((((...)))))))...)))))))))))((((......((((((((((((.(((((((.......((((((((((((....)))......((((((..(((((((.((((...((((((.......((((.........))))....)))))))))).......((((((.((((((((((.((((...))))))))))))))..............))))))..)))...((((.(((((....)))))..))))....))))...))))))............(((((.....(((((......)))))))))).......)))).)))))........))))))).))))))...))))))...)))).)))))....))))).)))))...((((..((((..((((......)))).))))...))))........((((((((((((....))).............((((((.....))))))......((((((((..........))))..))))))).))))))..........((((((((((.....(((((((((..(((((...((((((((((((....))))))..)))))).......((((...)))))))))..))))))))).)))))........(((((((........)))))))...............))))).(((........))))))))).))).........))))))..))))......)))))..((((((((..(((((((((.(((.......((((.(((((...(((((((..........)))))))...)))))....))))..))))))))))))..))))))))..))))........((((((((((....)))))))))).........))))))).)))))))))..
|
|
CRW_00806
|
[ FASTA input ]
|
AUCAUAGUCAAAAUCUGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAGGAACGCUAGCUAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGGGGAGCUGGGCAGAAGGAAAAGAGGCUCCUAGCUAAAGUUGUCUCGCCCUGCUUCAAAACUACAGGGCGCGCGCUACGGCUUUGACCUAACGGCCUCCGUUUGCUGGAAUCGGAAUAGUUGAGAACAAAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUGGGAAUCUGCCGAACAGUUCGGGCCAAAUCCUGAAGAAAGCUCAAAAGCGCUGUUUGAUGAGCCUGCGUAGUAUUAGGUAGUUGGUCAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAAUGAUGCUUAGCUGGUCUUUUCGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCGGACUCCCACGGGGGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCCGAUCCAGCAAUAUCGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCCGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUGCGCGAUCAUGACAGGACUCGAGGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUCUUCGGAAUGACUGGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCGGGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAAAAAGUGGCGGAAUGCUCUCGAAACCAAUUCACUUGAGUGAGACAGAGGAGAGUGGAAUUUCGUGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUCUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUCUCUGGGUCCCUACCGACGCUGGGGUGCGAAAGCAUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCCGUAAACGAUGAGUGUUCGCCCUUGGUCUACGCGGAUCAGGGGCCCAGCUAACGCGUGAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGACCGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUACAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAACAACAAAACCUGUCCUUAACAGGAUGGUACUGACUUUCAUACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUUGGUCAAGUCCUAUAACGAGCGAAACCCUCGUUUUGUGUUGCUGAGACAUGCGCCUAAGGAGAAAUUGCCACCGAGUGACGUGCCAGCGCUACUACUUGAUUGAGUGCCAGCACGUAGCUGUGCUUUCAGCAAGAAUUUCACCAUUGGGAGCCGGUGCCUUUCGAAGCACUUUCACGUGUGAACCGAAGUCGUCUUGCCCAAGACCCACGGAGAGCCUACCUAUAGUGACGUCAAAGUACCAGUGAGCAUGGAGGUUUGGUUGAAAUUGGUUACGACGACGUCGAGUUGGCGGCGGAGGAAGACUCGGCAUGAAGGCCAGAAAAUGGUGUGGAACGUAGUGGUAAUAGUACGCGCCCCGGCUCCGAAACAAAGAAAAAGGUGCGUGCCGCACUCACGAGGGACUGCCAGUGAGAUACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCGCAUGGCCCUUAUGGGCUGGGCCACACACGUGCUACAAUGGCAAUGACAAUGGGAAGCAAGGCUGUAAGGCGGAGCGAAUCCGGAAAGAUUGCCUCAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGGGAACAUGAAGUUGAAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUAUGUACCCGGGCCCUGUACACACCGCCCGUCACACCCUGGGAAUUGGUUUCGCCCGAAGCAUCGGACCAAUGAUCACCCAUGACUUCUGUGUACCACUAGUGCCACAAAGGCCUUUGGUGGUCUUAUUGGCGCAUACCACGGUGGGGUCUUCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGUGGCUGGAUUGAAUCC |
|
[ reference structure ]
|
................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((.....................................................................................................................))).))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((((....)))))).....(((....))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((......)))).....)))).(...(((((...(.........)....)))))...)...(((((......(((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((.(((((((((((.....(((((.....)))))...)))))))))..)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....)))))))))))))))).))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.(((((((((((....)))))))))))...((....))....))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....(((((((........(((((.....)))))............))))))).((.((((..((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((((((((((.(((..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))..))))))).....(((((.....))))).......)))))...))))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))...))).....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((((((((....((((....(((((((.((((.....(((.(((((((.....))).)))))))......))))...)))))))...))))...))))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
.(((.........[[[[[[[[)))....]]]]]]]]................(((.........)))........(((((((((((((((((.......((((...[[[[[))))..........]]]]]((((((...........)))))).(((.((((((((((..........(((((((((.......((((.....)))).......(((((.....(((((......(((((((............(((((((((..((((.(((((.((((.....((((.((((...))))..))))((((((((((..((((((((.......)))))))))))..))))))).))))..)))))..))))..(((((((...)))..)))).....))))))))))))))))((((..(((..(((((..((((......(((((....))))).(((......((((((((..(((.(((((((..(((.....)))..)))))))..)))..)))))))).......))).......))))..))))))))..)))))))))....)))))....))))))))).....(((((((....)))).)))........))))).))))))))..............(((((((..((((((.....))))))...[[[[[[........))))))).............]]]]]]...........((((((.......[[[.....))))))..]]]..(((.........)))))))))))))..(((......[[[[)))((((....))))....]]]]..((((....[[[..))))...]]]..........(((..[[[[[[[.(((((((((((....)))))))))))..........)))..]]]]]]]..(((...((((.(((((....)))))..))))..)))..(((.[[[[[[[.....)))..(((((....(((((((...........))).)))).....))))).]]]]]]]......)))))))....(((((.....)))))..(((((((.((((((....((((.(((.((((...(((((.((((.(((....)))...(((.(((.((((..((((((.......))))))..(((((.....))))).......))))....)))))).))))))))).)))))))......((((.(((((...((((.....))))....))))))))).....))))..)))))).)))))))................((((..[[[[[[....(((((....))))).))))...((((.((((...(((...(((.........))).)))..))))..))))....]]]]]].......((((...[[[[[))))(((.....))).........]]]]]....(((...........[[[[[......[[[[[[[)))...................]]]]]]]]]]]].(((((...[[[[[.((((((...))))))......)))))(((...))).]]]]]...((((((......[[[))))))......(((((...)))))............]]].((((.......((((.....))))[[[.....))))...]]]....(((((((..[[[[[.)))))))...]]]]].....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]].....(((((.[[[[[...)))))....]]]]]........((((.[[[[[[....)))).........]]]]]]...............(((((.[[[....((((((..((((((......))))))..))))))....)))))...]]]...(((((.[[[[..)))))...(((..((((((((((....))))))))))..))).]]]]
|
|
CRW_00807
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAAAUUAGGUUGUAAUCAAAAAAUUUAUUGAGUGUGAUCAUGGCUCGGGAUUAACGCUAAUUAGACGCCUAACACAUGCGAGUUUUAUAUAUAUUAGAUAACAAUUAAAUCUAAAUGUAUAGCGUCAAGGUGAGUAUAAUACAUAAAUAUGCCUUUAAGCCUAUUUAAAUAAUAGUUAAUUUUAAAACAAUAACAAAUGCUAUAAAAAACAAUUAUAAAUUAUAAUAAACAAUCAUAUAAUUCUUUAAAACCAAAAAAAUUAUUAGCAGCUUAAAGAUUAAUUUGUAUAAUAUUAGGUAAUUAUUUCUAAAAUUGUUUAAUAAAUAAAUAUAUUUAUUUUUAGUAAAAUAAGCCUAGAUGUUUAGUUGAAUUUAGAGAUUGUUCAACCACAUACGGGUAUGAAAACUACCCUAUCUAUUUGACAGCAGUGAGGAAUUUUGGACAAUAUGCGAAAGCAUGAUCCAGCGAACUAAUGGAAACGAAGAAGAUAGACAAUAUUGUAAAGUUUAGUGCGAGAAUUAACAAAUGAGUAUAUUCUAGGAGAAGCUCUGGCUAAUACAUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAUGAGGAGCGAGCGUUAUCCAUAUUGACUGAGUGUAUUAAAUACGUAGGAUGUUAUAAUUACUACUUUAAAAAUGUAAUAAAAACUAAAUACUGUAGUUAUUUUAUAAACAAUAAUUAUAAUUAAGAGUAGGAGACUUAUAGAACAACGAUUAAAUGUAGUUACACUAUAUAGCUAGCCAUAAACUAAGGUGCUUCUCUAAUUAUAAUUUUAUCUGAUGUAUGAAAGUACGGGUAUCGAUGAGGACUAGUCUCCCUAGUAGUCCGUACUGUAAAAGAUGAAUACUUUAUGAAUUACGAAUUCAGGAAUAGCUAACGCAAAGUAUUCUGCUUGGGGAGUAUUAUCGCAAGAUUAAAACUUAACUGAAUUGGCGGGAAUUUGUUCGAACGGUGGAACAUGUGGUUUAAUGCGAUAAUCCACGCAAAAUCUUACCAACGUUUUAGGCUUUAUCUAGUAAUAUGGUUAACACUAUAAUUAUGUAGUAAAGUACGGAAUUGCAUGGCUGUCGUCAGUUCGUGCUGUGAAGUUUAGGAUUAAGUUCUUUUUAACGAAUGCAACCCUAUAAAUAAGUCUUUAAUAAGUAUUAAAUGUUUAUAUUUAUUAUUCUUGUUUAAUCUAUAUCCGGGUAUAUCGAAGUAAUAUUUUGUAUACCUGAAUAUAGGGGUUUUAGGCUGAAGUCAAGUCCCUAUGGUCUUUAUACGUUGGGCUACACACGUGUUACAAGGGUAAAAACAAAGAGACGCAAUAGAGUAAUCUGGAGCAAAACUCUAAAAAUUACCUCAGUUCAGAUUGUCUCAUGAAAUUCUGAGGCAUGAAGAUGAAAUCGUUAGUAAUUGUAAAUUAAAAUGUUACAGUGAAAUAUUAGUCAAAUUUUGCACACACCGCCCAUCACGCUCGGAAAGUCAAUAUUAGCGGAAGAUUUGAAAAUCUCUACGGAAUAAUAAAUUUAAUAUUAAUUUAUUAGUCAUUAUGUUUUUUUUUAACGCUGUGGAUGGAAAGUAGUAUCUAAUCUAAUAUUGGUAAUCUGAGUGAAGUUGACACAAGGUACUGGUAGGGGAACCUGUUGGUGGAAUAUAUUAUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.................................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..((((((.((((((.........)))))))))))))))......(((......(((((.((.((...(((((((.(((((.....)))))..............................................................................................)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((((((((((.........................))))))..)))))))))....))))..((((((((....))))...))))))).((.(((((.......))))))).(.....)...)))))).......(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((.....)))).....))))..(...(((((...(......)...)))))...)...(((((......(.((((....................)))))))))).))))))))))..........(((.......((((...(((((((((((..(((((............................)))))....)))).)))...((((((((((.(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))))))))))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((((.((((((((...)))))).))...((....))..))))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((.(((((((((((((....))))).))))).))))))))).(((.(((..(((((((((((..(((((((((....)))..((((......))))....)))))).....((((.........................................................................................................))))...))))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.(((((((((((((((((((((..................................................................................................)))))))))))))))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..............
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((...(((....)))..))))).((((((.........))))))......(((......[[[[[.........))).......((((((((((((.........)))).))))))))]]]]]...(((.[[[[[...)))...]]]]]((((((((.....................(((......)))....(((((.........((((((...))))))..........((((((.(((.......))).)))))))))))))))))))....((((((....(((((..(((((........)))))..))))).)))))).......(((((((........[[[[..[[[[...[[[[[[[)))))))..]]]]]]].]]]]..]]]]...........(((.[[[[[[[..........)))..(((((.....(((((....))))).((((.........))))..))))).]]]]]]].....(((((........)))))..............((((.((((...))))[[[[[[[[..))))....]]]]].]]](((..[[[[[[[[.....)))...((((.......))))...]]]]]]]].((((((.(((((((((((((((((((((......(((............)))((((((((((........))))))))))....)))))))((((....(((........))).(((((((...)))))))(((..(((.........)))))))))))))))))))...))))).))))))...((((((((....(((.[[[....)))..]]].....))))))))...................((((((...))))))............(((.[[[[[[[))).....]]]]]]](((....))).................(((((.....(((((....[[[[)))))...(((((..((((........))))))))).]]]]...(((((((((((((((((((((((((((....))))).))))).)))........[[[[[[(((((((((....))).)))))).))))))))))))))..]]]]]].............(((((..((((((((....((((((((((.........))))))))))..))))))))..((((((.(((((((((.(((((...)))))))))))))).)))))))))))...(((....))).(((((......[[[[.[[[[[[.)))))....]]]]]]...]]]]...........(((((....((((((.............)))))).......[[[[[[........)))))........]]]]]]......((((....)))).(((((.............))))).(((((((.........))))))).....))))).....((((((((...((((((((((....((((.........(((((((..(((((((((.......))))))))).......((((.......)))))))))))...........))))...))))))))))...))))))))..............((((..((((....))))..))))..............
|
|
CRW_00808
|
[ FASTA input ]
|
AAAUAUAAUAAUAAUUAAAUUAUUAUUUUAGAGGAAUUAUAAAAUAUAGAGAAUAUGAUGUUAGUUCAGACUUAAUACUAUAUAGAGACAUAACACAUGCAAAUCAAACGAUUAUUUAAUUGAUAUAUAAUUAUAUAAUAUUAAUAUUAUAUAAUUCAAAUAAUAAUAAUUAAGUGGUGUAUCCGUGAGUAAUAAAUAGAAUUAGAACUAAUAUAUCUUUUAAAUGAGGAAUAAUAAAUAAAGAUAAUUAUUAAUUAAUUAUUGAUAUUAGUCAAGCUAUUAGCAGUAUAGGUAUUAUGUAGGAUAAUAGCCAUACAUAGCCGAUAAUCUGUAGCAAUUAAUUAACGUUAUAAUUGUCACGUCGAUUAUCAAAUACAAUCGAUAUCUAUAUGAUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGGCUUAGAUCGAAAGAUUGACCCAGUUAUCUAUAAUAAUGAAAUUUCAAUUUUCUUAUUUAUUUUUUUUUAAAAUUUAAAUAUAGUAAAGAAAAAAUUGUUAUAAAUUAAAGUUAUAGACUAGCGAGAAUAAUGAUAGUAGCUAUCAUCAGAUUAUGAUGAAUAUAAAAUUUAUUUUUUUAUAUGUCGAUUAGUACCGAUUAAGAUAUGUGCCAGCAUUCGCGGUUAUACAUAGGGUGCAAGUAUUAGUUAUAUUGGUUUAAAGGAUCCGUAGAAUUUAUAUAUAAUAUAUAUAUAUAGAGUUAACAAUAGUAAUAAAUGAAUUAUAAUAGUAAUGAUGAAAUAUUAUGAUAAUUAUAGGACAGUCAAAAUUGAAAAUAUUUAUUAUAUGUUAACUGACAUUGAGGGAUGAAGGCUAAAUUAAUGAAAUGGAUUCGAUACCCAAGUAAUUUUAGCAGUAAACUAUGAGUACUGAAUAUUUAUAAUAAAUAAAUAUUUAAGAGAAAUCAAUAGUAUUCCACCAGGAGAGUAUAAUAACUCAAUGGAAACCCAAUACAAUAGACGGUUAUAAUCAAUAGCAGUGGAGUAUGUUAUUUAAUUUGAUAAUCCCCAAAAAUCUUACCACAUCUUGAAUAUUAUCUUUAAUGAUAUUACAGGCGUUACAUAGUUGUCUUCAGUUCGUGCUGUGAAGUUUAAGGUUAGUUCCGUAAACGAACGCAUUCCUGUAUAAAUAUAUUAAUAUUUAUAAUUCUUUAUUUAAAUGCAUAAAGAGAAUAGGUUUAAGACAAAUCAUUAUGACCCUAAUGUUGUGGGCUAUAGACGUACUAUAAAAUAAUAUAUAAAAUUUAAUUAAAUAGUGAUAUUUAAUGAUAAAUACAACUUAUUAAAAUAUGUUAUAUAUUAAUAUAUAAUUUUAGUAUGAAUUAUAUCCUGUAAUUCGGAUAUAUGAAACAAGAAUUGCUAGUAAUCUGUAAUUAAGUAUAUUACGGUGAAUAUUAUUAAUUGUUUCGCACUAAUUACUCGUCACGCGUAAAUUAAAAUAAAUAACAAAAAUAAAUAUUAUAUUAUUAAUCUUUUAUUAUUUAAUAAUUGUUUUGAUUUUUUAAUUUUAUUUAGUUAUCUGUUUUAUAUUAUUGCGAAGUCGAAAUACAGUUACUGUAGGGGAACCUGCAGUGGGCUAUAACAAUACGAUUGGAUAUUAC |
|
[ reference structure ]
|
..................................................(((((...[[[.))))).((((.((((((.((((((((.....(((.(((..(((..(((..............................................................))))))......(((.....((((((((.((....(((((((.((((.......))))............(((((...........))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((........))))))))))).....))))..((((.((((....))))...))))))).((((((.........)))))).(((.....)))...)))))).........(((...(((((....))))).)))..)).))))))..((((...................)))).................................................................................................................................(((((........((((....................)))).))))).)))))))))).....(((.......((((....(((((((((((.....)))))))...((((((((....(((((((((((((((((((...(((......)))......))))))))))))....(..((....))))))))))..))))))))..))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((.......))))))))...((....))....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((....((((((.(((((((((((....((((........)))).......(((((((.....(((((((......)))))))..((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....(((((...............................................)))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((...........................................................))))).))..............((((((((((((........)))))))))))).....))))))....((.((((((.......))))))))...........)))))))))).))....((.((.(.((((((((((((((((.(((((..(((((((..................................................))))))).))))).)))))))))))).))))..).))..))....((((((((((....))))))))))..........................
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((......)))))))).......((((((.....((((.....))))....))))))...........((((((((........................((((((((...(((((((((((((((((((....))))))))))))....((((....))))....)))))))..)))))))).............((((((((.(((((.....)))))............((((((((.....)))))))).))))))))...(((((((........[[[..[[[[[[...)))))))..]]]]]]]]]((((((((((.(((((((..........))))))).)))..)))))))..............)))))))).......(((((((((.((((((....((((....))))..))))))............(((....)))..)))))))))..((((((((((..............))))))))))(((((((((.......((((.....))))................((((((((((.....))))))((((((((.......))))))))[[[[..))))..]]]]..........(((.[[[[[[..)))........]]]]]].......((((((.((((......((((((((......((((((((...))))))))...((((((((...((((((((((..(((((((....((((((...))))))....)))))))..((((....))))....)))))))))).))))))))..((((((...............))))))..)))))))).....))))))))))....(((.....[[[[[[[[)))..]]]]]]]]............................(((((((((...(((.[[[[.....)))..(((....)))]]]]........(((((.....))))).)))))))))((((((......))))))....................((((((((((((.....)))))))).)))).....((((((((((((......((((......(((((............)))))....)))).(((((((((((((....))))))))..((((((((........)))))))).)))))...))))))....)))))).(((..[[[[[[[))).(((((.....)))))..]]]]]]].....(((((((((((((....))))))))..)))))......(((((((((((((((.....))))))...))))))))).....(((((((.[[[[[[[)))))))........]]]]]]]......................(((((((((.....((((..(((...))).))))......)))).)))))..............................((((((((...........))))))))((((((((((((.((((..(((.(((....)))....)))..)))).))))))))))))...((((((((((....))))))))))..)))))))))...............
|
|
CRW_00813
|
[ FASTA input ]
|
CAAGUCUGGUGAACGCACGCGAGUUCCAAUCUCCUGCACACACAGCCCUCACUAACAAAAAAUCACGCCAGAUGUCGUCAGCCCAUUCUCACACAGGUCGUGCUGCUCACAACAAAAGCAACCGGCACGGCCUUAGUAUCUGCGAGGCAAAUGAUUCGCUCGUGGAGACUUGUUUGGGAGUGGUUGACGCCCGUGCGGUGCAGAUCAUGCGGUACUCCCGCACUGCGUGUCUCAUCCUUGAUACACCCAGUGAUGGUCGAUUUACGCAAAACCAGGUAAAACACUUUUACAUUUACCAGGCGGUGGCAUUUCGCAAAUUCGGGCGCAACCUCAUGGCUACUGUGCUGGCCUCAAAAGCCAACACAGACCUUACGAUUUCUCAUGUUUGUGGUGUCAGGUUUUCUUGAAUGCUUCCCACAUGGUUCUCGAACCCAAGCAAGUGAAUGAUAAACGUGUGCACUGCCAUGUGUUUUUAGCAUAUAUAGCAGAUAACACGAAGAGACUAGCUCUUGCUGAAGAGCACUGUCCUCAUUCACCUAAGUGCUACACUGUCUCAAAACGUGGUUACGGCAAAAGAUGGGCGUUGAGCUCCCAUCAUACACUUCGAAAUUGUCGGGGACGGCCCCACAAAGGACUAUCAUUUUGUCUUUUAGAAGCUCUGGCUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUAAAAGCGAGCAAUCGUUUAGGAUGCAGCAGUGCACGUAACGGUGCAUGGAUGGUAAAAACGUCAGUGUUGGGCUAAUCCGCAGGGAAGCGCGAUCAUGUGAUGGAUGGAGGAAUAGGGGCAUUGGCCAGUCAAUCGUACUUGUGGCGGGUACUCGUCUGGUCGGAUCACAUGAAGGCGAACCUUCAGAGACUGUAAUGGAGUGGGCGCAAGCUUAAGGGACAGUCCAAUCCCCGGGGCAACCCGGUCCACAGGAAUAGAGGGUUUAGCUCGCCCUUGAGGACUGUGGAGAGGAGCACUAAAGAAAGCUCUUUGGUAGAAAUGGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((......................................................))))))).(((..(((.............(((((((((((.................)))))))))))......)))...)))...(((...(((((......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................))))).....)))..(((((((....((.((((....((((......((((.........))))........((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((((......))))))....)))....).)))))))..))))...))))))(((...(((...((((((((..............................................................))))))))...)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((.(.((((....)))))(((((((......(((((.......)))))......))))))).((((((..........))))))........))..........................
|
| [ predicted structure ] |
........(((...[[[)))(((.......))).]]]......(((((..................((((((....(((((((.(((((((...(((((((((((.................))))))))))).(((.((((((((............)))))))).)))....)))))))))))))).....((((.....((((((((((.....))))((((.((((.(((....))).)))).)))).))))))......))))...(((((((((...........))))))..[[[[)))....]]]].......(((.......[[[[))).(((((.((((.......)))).)))))..............]]]]..(((((..(((((....))))).[[[[[.))))).((((....)))).]]]]].((((((((....(((((...((((.((((((.....))))))...))))...)))))..[[[[[..((((((....)))))).......))))))))...((((...))))]]]]].....(((.....[[[[[..((((((.........))))))...))).......]]]]]((((....))))..(((((((.........)))))))......))))))((((.(((....)))...)))).((((((....))))))....(((....((((((......)))))).[[[[)))....]]]]......)))))..(((....)))..(((..[[[[)))....]]]].........(((.[[[[[[[)))....(((((((...))))))).....]]]]]]]......((((((....))))))..((((((...[[[.(((((....)))))....))))))...]]](((((....)))))(((((((.....((((((.......)))))).....)))))))(((((((.[[[......)))))))..]]].....(((...[[[...))).......]]]
|
|
CRW_00815
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUGGUGAACAGGAGCAUCACAAUAAAAAGCCCUCGUUAAAAAAAAAUCAGCGCCAGGUGUCGUUUGUGAUGAUACGCUGACAGAGUGCUGUUGUCUCUGUCCGUGUCUCGUCCCAAAGGGCAAAAGAUGGGAACCUUCCCGCCCUUGUCGCCAUGAUACACACUUGGCGCGCAGGCAGGCGGGAGCGAGCCCCCAUCAUACACUUCGAAAUUGUCGGGGAGUGCCCGUAAAGCUUUGACUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGGGCGAGCAAUCGUCCAGGACGCAGCAGUGUUACGUAGUGGUACACGGAUGGUAAAAACGUCAAAGAUAGGGUUGAUCCGCAGGGAAGCGCCAGUGCUCACGGCAAGAACGUGAGCAAAGGCGAACCUUCAGAGACUCUAAUGAAGUGGGCGCAAGCUUAAGGGAGAGUCCAAUCCACGGGGAGACCCGGUCCACAGGAGUAAGGGGGCGCUGCUCACCCCCAAGGACUGUGGAUGGAGACAGAGUGUUAGCACCUGCCUUCAGGUAGUCAAUGGCCAGCAGUUUUUUUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.......((((............................................))))....(((((((((((((((((((((((((((.........)))))))))))))))))))))))))))....((((((....((((((((((((((((((((.......))))))).)))))..))))))))......))))))...(((((((....((.((((....((((.......(((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((.((......))))))....)))....).))))))....))))...))))))(((...(((...((((((((.......))))))))...)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((.(.((((....)))))(((((((......(((((.........))))).....))))))).((((((((.(((....))))))))))).........))..........................
|
| [ predicted structure ] |
...((((.[[[[...))))..]]]]...........................(((((.....[[[[.[[[[.[[[[[.[[[[.[[[[[[[)))))....]]]]]]].]]]].]]]]].]]]].]]]]...((((((....((((((((((((((((((...........))))).)))))..))))))))......)))))).(((.((((((.....))))))[[[....)))..]]]..(((....[[[))).(((....)))..((((((....))))))..(((((....))))).]]].....(((...[[[[)))....]]]].......((((((......((((...((((..((((((((.......))))))))..))))..))))....((((((.......(((((....)))))....)))))))))))).((((....))))((((((((......(((((.[[[[[[..))))).....)))))))).....(((.(((....))))))......(((........)))]]]]]]................
|
|
CRW_00816
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUGGUGAAGUCUGGUAAACGACGCACGUUGAUGAGGAGCACGACUGCAUUGAAAGCCCUAGGUAAAGAACAAACGGCGCCAGAUGUCCUUGGGGAAAGACAAGGGCAAAAGGUGGGACAGCGGGGGGGGAGUCCCCUGGGAGCCCCGCCCCCUGAGAGCCCCCACCAUACACUUCAAAAUUGUCGGGGAACACCCGUGAGGCCCUUGACUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGGGCGAGCAAUCGCUCAGGACGCAGCAGCGUACGUAGUGGUACGUGGAUGGUAAAAACGUCAAGGGAUAGGGGUCAAUCCGCAGGGAAGCGUCAGUGUCUGCCGCCCUUUGCGCGGGGGGACAAAGGCGAACCUUCAGAAGACUCUAAUGGAGUGGGCGCAAGCUCAAGGAGAGUCCAAUCCACGGGGAGACCCGGUCCACAGGAGUAAAGGGGAAGUAGCUCACCUCUGAGGACUGUGGAUGGGGGGCGCAAGCGCGCCCCUCAGGUAGUCAUGGCCAGCAUUUUUUUUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.......((((......................................................................))))....(((((((........)))))))....((((((....(((((((....(((....)))......)))))))......))))))...(((((((....((.((((....((((......(((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((((......))))))....)))....).))))))))....))))...))))))(((...(((...(((((.((((.......))))..)))))...)))..)))...[..[[[[[...)))))))(((....)))......]]]]]].((.(.((((....)))))(((((((......(((((..........))))).....))))))).(((((((((....)))))))))........))..........................
|
| [ predicted structure ] |
.............(((.[[[....)))(((.((((..........))))))).......]]]................(((((.....((((((((........))))))))...((((((.(((.((((((((..(((....))).)))).)))))))......)))))).......[[[....)))))(((....))).]]]((((..(((((((((((((((....((((((((((((((((....)))).((((((....((((((......)))))).((((.......))))...((((........))))..............))))))))).((((((((......((((.((((....)))).....((((((.......(((((....)))))...)))))).......((((....))))))))......)))))))).......)))))))))..)))))))...((((((((((....)))))))))))))))))).))))......................
|
|
CRW_00820
|
[ FASTA input ]
|
UUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACUCAACACGGGGAAACUCACCGGGUUAACGACCUUCGGACAGUUACGACAUGUCUGGGCCCGGGACAGUGGGAAAGGGACGCCCUUUUCCUGCUAGUACACAACCGAUCCAUGUGAGGAAGUCCUCCUUUUCGGGCAUGGAGCAGCGCCCCCCUUUCUCGGGGGCCUGUAGGUUGGUGCAACACCAGCUGGUACAGGAGACGCCACCUCACAAUUGGCCGAUCCUGUGGUGAGUCGGGAGUAACGUCCUGGCCAUCGCAACGCGCGCAAAGCGGUGGGUAGGGCCCCCUUAGGAUACUAAUGGGGGUCCUGCUUAAGGUACGUGCUAAUCCCAUGGGAUGGUAAACCAUGGCUCAAAGUAUGGGAGGUCCGAAUACUUAACAACUUGGGGCAGCAUACCUAUCGUAGGUGCUGUGUACGCGGGAACUACACCUAACGGUUCCCCCGGCUUAAAUGCCGGACAUGCUUAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.............................................(((((((..............................)))))))...((((((((((((....)))))))))))).((((.(((((..(((((((((((....)))).{{{{{{{)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))..((((.(((...((((((...((((.........))))...))))))((((.(((((((......)))))))))))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((((((....)))).)))))))))))).......]]]]]].((.((((((.........))))))(((((.((.((..(((.}}}}}}})))..)))))))))((((...(((((...))))).))))...((((((((((.........))))))))))......))...........................................
|
| [ predicted structure ] |
..................................(((....))).(((((((...(((..(((........)))...)))..)))))))...((((((((((((....)))))))))))).((((.(((((..(((((((((((....))))........)))))))((((.((((((.......)))))))))).)))))))))...(((....)))....(((..[[[[.))).....]]]]....(((...(((((((((((......)))))))..))))...[[[[[........((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))))))..]]]]]..(((.[[[[[)))......]]]]].(((.[[[[[[)))........]]]]]]...........((((((..((((...))))))))))......(((((((...[[[[[.)))))))(((((......)))))......]]]]]...........................
|
|
CRW_00849
|
[ FASTA input ]
|
AAAUCCGGUUGAUCCUGCCGGACCCGACCGCUAUCGGGGUGGGGCUAAGCCAUGGGAGUCGUACGCUCCCGGGCAAGGGAGCGUGGCGGACGGCUGAGUAACACGUGGCUAACCUACCCUGAGGAGGGAGAUAACCCCGGGAAACUGGGGAUAAUCUCCCAUAGGCGAGGAGUCCUGGAACGGUUCCUCGCUGAAAGGCUCAUGGGCUAUUCCCCGCUCAUGAGCGCCUCAGGAUGGGGCUGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGGGGGGUAAGGGCCCCCCAAGCCUAUAACGGGUAGGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCCCAGUUGGGCACUGAGACAAGGGCCCAGGCCCUACGGGGCGCACCAGGCGCGAAACGUCCCCAAUGCGCGGAAGCGUGAGGGCGCCACCCCGAGUGCUCCCGUAAGGGAGCUUUUCCCCGCUCUACAAAGGCGGGGGAAUAAGCGGGGGGCAAGUCUGGUGUCAGCCGCCGCGGUAAUACCAGCCCCGCGAGUGGUCGGGACUCUUACUGGGCCUAAAGCGCCCGUAGCCGGCCCGACAAGUCACUCCUUAAAGACCCCGGCUCAACCGGGGGAAUGGGGGUGAUACUGUCGGGCUAGGGGGCGGGAGAGGCCAGCGGUACUCCCGGAGUAGGGGCGAAAUCCUCAGAUCUCGGGAGGACCACCAGUGGCGAAAGCGGCUGGCUAGAACGCGCCCGACGGUGAGGGGCGAAAGCCGGGGCAGCAAAAGGGAUUAGAUACCCCUGUAGUCCCGGCUGUAAACAAUGCAGGCUAGGUGUCACAUGGGCUUAGAGCCCAUGUGGUGCCGCAGGGAAGCCGUUAAGCCUGCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGACUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACCACAAGGGGUGGAACCUGCGGCUCAAUUGGAGUCAACGCCUGGAAUCUUACUAGGGGAGACCGCAGGAUGACGGCCAGGCUAACGACCUUGCCUGACUCGCGGAGAGGAGGUGCAUGGCCGUCGCCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCCCACCACUAGUUGGUAUCCUGGUCUCCGGGCCGGGACCACACUAGUGGGACUGCCGGCGUAAGCCGGAGGAGGGAGGGGGCCACGGCAGGUCAGCAUGCCCCGAAACCCCUGGGCCGCACGCGGGUUACAAUGGCAGGGACAGCGGGAUUCCGACCCCGAAAGGGGAAGGUAAUCCCUUAAACCCUGCCGCAGUUGGGAUCGAGGGCUGAAACUCGCCCUCGUGAACGAGGAAUCCCUAGUAACCGCAGAUCAACAAUCUGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCGCUCCACCCGAGUAGGAGAGGGGUGAGGCCCCUUGCCUUUGGGUGGGGGGUCGAGCUUCUCUCCUGCAAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...<<<.))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((((((((......)))))))))))......(((......((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((..((......)).)))))))......((((((((((........)))))))))).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)))))))))..((((((....)))))).[.((((((((.......)))))))..])..(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...a.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........aaaaaa..((((((((((((((.....))))))))))))))...aa..))AA.....AAAAAAA))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((((((.......)))))))...)..))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((((((....)))))))))....)))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((...(((....)))...))....))).....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.......))))))((((((((((..((((((........(((..........(((((((((......)))))))))((((.(((((((......((((((...((((.(((((((.(((((((..((((((....))))))...)))))))...(((((((((..(((...)))))))))))).....((((((((((........)))))))))).))))))).))))))))))((((...((((.....(((((((....)))))))..)))).....((((.((((((((....)))...)))))...((((((............))))))))))....)))).((((((((.......((((.....((((....))))..))))(((.(((((...((((((....)))))).((((((((((.......))))))))))....))))))))..)))))))))))))))))))))).......))))))..))))))))))...((((((((((((......(((((....(((((((((.(((((((((......((((((.....))))))....)))))))))..))))))))).....)))))..)))))...(((.((((((.....((((......))))......)))))).))).(((((.......[[[)))))......]]]......))))))).(((....)))((((........[[[[[[[....))))..]]]]]]](((.........[[[..))).(((.(((((((((((...))))))))))).)))]]].....(((((((..((((((((((...((((.(((((....)))))..))))..)))...)))))))......((((.....))))..((((((((((..(((....)))..(((((.......))))).))).))))))).)))))))(((((.....[[[[[))))).(((.....)))]]]]](((((((....)))).[[[[[..)))....(((((((......))))..))).]]]]].(((((.((((((((((((..(((((((....))))))))))).))))))))[[[[.(((((....)))))........)))))........]]]]....(((((((.[[[[[.))))..)))...]]]]]....((((((((.....((((((....((((....)))).....)))))).....)))))))).....(((((.((((((........)))))).....[[[[[[.......((((((((((((.....)))))))))...))))))))...]]]]]]................((((.(((..(((((((((((((..((((((((((......))))))))))..)))))))))))))..))).))))...........(((((((((((((....))))))))).....)))).
|
|
CRW_00997
|
[ FASTA input ]
|
GACAGAAUCAAACUUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAACGAACGCUAUCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGGACGGACUAAUUGGGGCUUGCUCCAAUUAGUUAGUGGCAGACGGGUGAGUAACACGUGGGAAUCUGCCCAUCAGUACGGAAUAACUUUUAGAAAUAAAAGCUAAUACCGUAUAUUCUCUACAGAGGAAAGAUUUAUCGCUGAUGGAUGAGCCCGCGUCAGAUUAGGUAGUUGGUGAGGUAACGGCUCACCAAGCCGACGAUCUGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCAAUACCGAGUGAGUGAUGAAGGCCCUAGGGUUGUAAAGCUCUUUUAGCAAGGAAGAUAAUGACGUUACUUGCAGAAAAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGAGGGGGCUAGCGUUGUUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGAGUGCGUAGGCGGUUUAGUAAGUUGGAAGUGAAAGCCCGGGGCUUAACCUCGGAAUUGCUUUCAAAACUACUAAUCUAGAGUGUAGUAGGGGAUGAUGGAAUUCCUAGUGUAGAGGUGAAAUUCUUAGAUAUUAGGAGGAACACCGGUGGCGAAGGCGGUCAUCUGGGCUACAACUGACGCUGAUGCACGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAGAUAUCGGAAGAUUCUCUUUCGGUUUCGCAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCUCGCACAAGCGGUGGAGCAUGCGGUUUAAUUCGAUGUUACGCGAAAAACCUUACCAACCCUUGACAUGGUGGUCGCGGAUCGCAGAGAUGCUUUCCUUCAGCUCGGCUGGACCACACACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCAUUCUUAUUUGCCAGCGGGUAAUGCCGGGAACUAUAAGAAAACUGCCGGUGAUAAGCCGGAGGAAGGUGGGGACGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGGGUUGGGCUACACGCGUGCUACAAUGGUGUUUACAGAGGGAAGCAAGACGGCGACGUGGAGCAAAUCCCUAAAAGACAUCUCAGUUCGGAUUGUUCUCUGCAACUCGAGAGCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGUACACACUGCCCGUCACGCCAUGGGAGUUGGUUUUACCUGAAGGUGGUGAGCUAACGCAAGAGGCAGCCAACCACGGUAAAAUUAGCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUUACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
.................(((((...aaa.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..(((((((((((((((....))))))))))))))))))......(((......((((((((.((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((....)))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).[.(((((((...(.......)....))))))..])..((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}}))))).))))))))))..........(((((...<.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..((((((((((((...))))))))))))...<<..))>>.....>>>>>>>))).(((......((((....))))....)))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((.....((((((((...((((((((....)))))))).((((.....))))))))).))).((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((.(.((((((((..((((((((((((....((((((.((((..(....).))))))))))...))))))))))))..))))))))..).))..))..).((((((((((....)))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
..(((.((((((((....)))))))).)))((((.((((((.((((((((((((......(((.(((..........((((((((((((....)))))))))))).(((((((((.(((.......(((((((.......((((((((((((.....((((((....))))))......))))((((((((....)))))......))).)))))))).....)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..))).)))).............))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))...))))))........((((...(((((....))))).))))...)))))))((((((((((..((((....)))).......((((((.....))))))......)))))))))).......(((((......(((((((((.........)))...))))))))))))))))))))))...........((((.....((((((.((((..((((((.(((.....(((((((((((((.....))))))....))))))).))))))))).......((((((...(((((((....((((((((((.((((......))))..))))))))))....................)))))))..)))))).....)))).))))))....))))...))))...((((....[[[..))))...]]]....((((...(((((((((((....(((((((((...)))))))))..................)))))))..(((...((((..((((....))))...))))..))).))))))))..((((.(((..[[[)))))))...(((......)))......]]]...........(((((((........((((((..(((..(((....)))..)))..((((...))))))))))....(((.(((((.((((....))))(((((((((....)))..((((......))))..))))))))))))))..((((((((((((....))))).[[[.......))))))).....(((((.....))))).....]]]...(((...[[[[.)))....]]]]......)))))))........((((((.....(((((((....(((((......(((....)))........)))))...)))))))[[[[((((..((((.....))))..))))))))))...]]]]....(((....[[[[[[[...)))...]]]]]]]...((((.....[[[[..))))......]]]]....((((.(((..((((((((((((.....(((((..(((............)))..)))))))))))))))))..))).)))).((((.....[[[[.(((((((((....))))))))).))))....]]]].
|
|
CRW_01134
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGAUAUGUGUGCUAGCGUCAAAGAUUUAGCCAUGCAUGCUUUUCGAACCCUCGUGGGGAGAGGCGGAUAGCUCAGUAAUACAGUUACAACAUAAGCUGCGUGUGUGGAUAACCUUGUUAAGAUAAGGCUAAGACUUAGCGUGUCGCACUUUUGUGAAGAAAGGCGACUUGAGCAGCAUUGGUUUCUGACCUAUCAGUUAGUAUGUUCUGUAAGGGAGAACAUAGACUAUGACGGGUAACGGGGGAUGCACGUCUGAUACCGGAGAGGAAGCCUUAGAGACAGCUUUCACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUUGUUUUUUGUGACAGAGGUAGUUAUGACGUAUUCUUUAGAGAGAGACCUUGUUAGACAUGGUCCAUAGCGACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGUGCAUAUACAUGCUGUAGUUAGAAAGUUUGUAGCCUAUUUAUGGAUUGUUUUAGACAAAAGGACGACUCAAAUUGACCUUUCAUUUGACUAAUGCAUGAAUGUAGAAGCGAUUGAAGGCGAUUGUAUUCACCAGCCAGAGGUAAAAUUUGAUGACCUGGUGAGGACACACGGAGGCGAAAGCGAUUGCCUAGAGCGUAUUCAGUGGUCAAGAACGUAAGCCGGAGGAUCAAAGAUGAUUAGAUACCGUUGUAGUUCCGGCCGUAAAUUAUGCCAACUUGUGCUUCUGCUUCUGCGGAGGCGCAUAGAGAAAUCAAGAGUUUAUGGGCUCUAGGGAUAGUAAUCCGGCAACGGACAAACUUAAAGAAAUUGGCGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUAUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGACAACUCACCAGAGCCUAUGUGCAGGAGACAGUGAGCUUUGAGAGCGGACUGGAUAGUACUUUGAGUGGUGCAUGGCCGUUUGCAACACGUGAGGUGACUUGUCAGGUUUACUCCGGUAACGUGUGAUGUGCUGUAUGCAAGUAUUUUUGUGAGACUGCAGGCGGUAAGCCUGAUGAAGCGGCGCUAUAACAGGUCAGUGAUGCCCUUGGAUGUUCUGGGCUGCACGCGUAAUACAGUGGGUGCUGUAGAUAUAUAUAGGUGGAAAAGGGCCCGAGACUGGGAUCAUGCUUUGUAAGAAGGAUGUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAUCGCUGCUCACUAAGUAGCGAUGAAUGAGUCCCUGUUCUUUGCACACACCGCCCGUCGCUAUCUGAGAUGGAUGUUUUUAUGAAGAUGCUGCUGUUAGAGGCAUUUGAGUAAGGACGACUAGAUUAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCAGCGGUAGAAGAAUCUGCCGCUAGAUCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((..(((...((.....))...)))))......(((......((((((((..((...(((((...((((....(((((((....))))))).....))))....(((((..((((....))))..)))))....)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((......))))).)))).)).))))))..(((....)))..((((...........))))........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).)))))))))).......(((((.....((((...(((.(((((((.((((((.......(((((.(((......))).))))).....))).))).)))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((((((((((....)))))))))))..<<..))>>....>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((((((((...))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((....)))))))..((((((((.....))))))))...))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.((((((....))))))....)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.......)))))..[[[[)))...]]]]...........((((((((((..((((..(((....)))[[[...))))...]]].(((((...)))))..........)))))))))).......(((((((.....[[[....))))))).(((((.(((((.....))))))))))...]]]......(((..[[[)))...]]].(((((((((((.......)))))))..)))).((((.(((.[[[....))).)))).....]]](((.[[[[[[))).......]]]]]].((((....)))).........(((.....((((...(((((......))))).))))[[[[[[.)))..((((....))))((((.(((...))).))))]]]]]]..((((((.......[[[[((((.........)))).))))))..]]]]...(((((...(((((..((((((((..(((((.(((..(((....))).))).))))).(((((.(((......))).)))))..))))))))..))))).)))))((((((((((....))))))).)))(((.[[[[[.))).............]]]]]...(((.(((..((((((......)))))).(((....))).))))))...((((...[[[[[[[(((((....)))))......))))....]]]]]]].........((((((..(((((((((((....)))))))))))(((((...(((.[[[[[[.))).)))))..........((((....)))).]]]]]].......))))))........((((.....)))).......(((((...(((.(((.....))).)))..[[[..)))))...]]]........(((((((((...((((((.(((....(((((......))))).)))))))))...[[[[[[(((....)))...)))))))))......]]]]]]...(((((((.((((((....))))))..(((.[[[[[)))..]]]]].....)))))))...((((.(((...)))[[[[.....))))..]]]]....(((..........[[[[.(((((......)))))))).......]]]]...(((((((.(((.((((....)))).))).....[[[....))))))).(((((((((.....)))))))))(((((......)))))......]]].....(((((..[[[[[[[))))).(((((((((..(((((((.........)))))))..)))))))))......]]]]]]]...(((.......)))(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_01153
|
[ FASTA input ]
|
CACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUCAAAGACUAAGCCCUGCAAGUGCCUGUAUGAGUGUUUAUAUAACGAAACUGCGAAUGGCUCGGUAAAACAGUAAAAAUUUUUUCGGAGAAAAUACUACUCGGAUAACCGUAGUAAAGCUAGAGCUAAUACGUGCUACAAAAUGAGGCGAGCAAUCGUUCUCGUGGUACAAAAUAGAGAUACAACCCAGUUUUUACUGGUGAUUCAUACUUUUUUCUGAUCACACUUUUAUGUGUGUGACGCUCCGAUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUAUGAUGGUAAGGUAGUGGCUUACCAUAGUUGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCGAACUUCGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAGCAAUAGGGGGACCAAUGGUCUCUCUAAUUGGAAUGAAAACAAUGUAAACUCCUUAUUGAGGAGCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGAACUUUGGCGAUGGUUGCUGAAACUCCGUAAGGAGAUUGAUGUAGCCUCGUCCUUGUGGAUUUUUGGGGGUGUGGUGGUACUUUAUUGUAUUGCUGCAUUUCCGCCACUGUUUACUGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAAGCGAUUGCCCUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACCUGGUUCUGUUUUAUUGGUUUGUCUGUAUCAGGUAAUGAUUAACAGGGACGGUCGGGGGCAUUUGUAUUCCAGCGUUAGAGGUGAAAUUCUUGGAUCGUUGGAAGACAAACAGCUGCCGAAAGCGUCUGCCAAGGACGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUGUAAACUAUGAGGCCUGGGGAUCGGGCGUGGCCUAUUGGUACGUUCGGCACCCUCCGGGAAACCAAAGCUUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGUCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGCAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUCUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAAAUAGAAAAUGCUAUUAAACUGCGGUAGCAUCGAAAAUUUAAUCUUCUUAGACGGACUGUAGGCGUAUAGUCUAUGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAAUGGCUCAACGGGUGAGGUAGUGCGAAAGCAUGACCCAAUCUCUAAAUCCAUUCGUGCUGGGGAUAGAAGCUUGCAAUUAUCCUUCUUGAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGCGAGUCAUCAUCUCGUGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCCUUGGGAGAGCUGGGCGAAUUAGUGUUUAUUCACGAAUUUCCUGGUUUAAACUUGGUCAAACCUUACUACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGCU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((....................)))))......(((......((((..((..((....((((..........((((....(((((((.....))))))).....))))......((((((((((....)))).))))))....((((((.........(((((......)))))......)))))).......((((((........))))))...))))...))))..))))(((..(.(((...((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......(((((.(((((((((((((((....))))))))).)))))))))))...((((......((((((((((((((((......)))))))))))))))).))))...........................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((.....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..(((.(((((((((.((....)))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..((((((((((((......))))))..........)))..)))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((((((((....))))))))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..(.((((((((((((..((((((((((((((((((((((((.(((......)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.................(((.[[[[[..((((((((...)))).)))).)))...]]]]]..(((((((((((.........(((((((..((((((....................((((.......[[[[[[.)))).....]]]]]]......))))))....(((((((.....(((((((....))).)))))))))))....((((((......(((((....)))))[[[[[........)))))).((((((........))))))......]]]]]........(((...[[[[[[[...)))..(((((....)))))]]]]]]].(((.((((....(((((((.(((....(((((((.....((((........))))......)))..))))((((.(((((......((((((...(((((...))))).))))))...............((((((((((...))))))))))..(((.................((((((...)))))))))...........))))).)))).))).))))))).......(((.....)))...))))...)))..))))))).)))))))))))((((........))))((((((.....((((....))))......)))))).(((((((((.(((((((....((((((((((((......))))))))))))......(((........))).)))))))...(((((((..((((....))))..)))))))....(((.....((((((((((((((...))))))))))))))...)))....((((.....))))..))))))))).(((..(((((((((.((((((((...((((......))))....)))))))).)))))....))))((((((((((.....)))))))))).[[[[[[.....))).........]]]]]].((((...[[[[..))))...]]]].................((((((((.(((........(((((((((((((((...((((((........(((((....)))))..)))))).....((((..((((.....))))..((((....((((....((((((((((.(((((((.......(((((((((.(((.....)))...........(((((...........)))))..))))))))).............))))))).))))))))))....)))))))).(((..((((((((((.....)))).))))))..)))......)))))))))))))).)))))...((((((((.......))))))))))).........(((((.....((((((((....))))))))..))))))))))))).....((((((((((.....)))))))....[[[[[[[.............)))..]]]]]]](((((((.(((.((((....)))).)))..[[[[[[[....)))))))..]]]]]]]...((((((.....((((((((.......((((.(((((((.((((((((.......))))))))...((((....(((.....)))..............(((((.....(((((((((..(((..((((......((((((((.(((((.(((......))).)))))))))))))......))))..)))..)))))))))....)))))....)))))))))))))))(((((....)))))))))))))))))))
|
|
CRW_01168
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGACACUUGCCUUGAAGAGUAAGCCAUGCAAGCUUGUGAAUAAAUCCUGAAACAGUGAACGGCUCAGUAGAACACAUUUCAUCUACCCAAGUUAAAAAUAACCAUGGGAAACUAUGGCUAAAUAUAAUUUGGAUGAGAGUGUGACCUAUCAGCUAGUAGGUACGGUAAGAGCGUACCUAGGCUAUGACGGGUAACGGGGAAUCAGAGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUACUACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUGAACAUUGAGGUAGUUACGAGGCGUACCUAUGUAAUAUAAUUAUAUAGGGAUGAGGUAUGAUUUCAAAUCAUGCACGACAUACUGGAGGGCAAGGCUGGUGCCAGCAGCUGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGUGUCUAUGUAAAUUGUUGCGGUUAAAACGUGCGUAGUCUGAUUUGCGAGAUCUAAAGUAAAGAUGCUUUUAUCUAAAAGUAGAAUAUUUUAGAGAUCAAAAAUCUUGAGACAGAGGAGAGGUAACGAAAUUCGAUGGCGAGAGGUGAAAAUUGAUGACCCAUCGAGGAGAAACAGAGGCGAAAGCGGUUACCAGAAGCUGUUCUGACGAUCAAGCACGUGAGCAGGAGUAUCGAAGGCGAUUAGACACCGUCGUAGUUCCUUGCAGUAAACGAUGCCCACACUGAUGUGCUUAACGCAUGUCAGACGCAAAAGUUAAAGUGAGGCUCCGGGGAUAGUACGGUCGCAAGAUUGAAACUUGAAGAAAUUGACGGAAGGACACCACCAGGAGUGGAGUGUGCGGGUUAAUUUGACUCAACGCGGGAAAACUUACCAGUACAGAUUACUAUCGUAUGAAGGAAUACCUGAUGAUGUAAUACGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAACACGUGAAGUGAUUCCUCGUGUCAAAUCAGCUAACGCGUGAGAGGCGAGUCUUAUUUUAUAAAUAAGAGACGGCAUAGGCAACUAUGAGGAAGCAACGCCCAAUAACAGGUCCGUGAUGCCCGUAGAUGUUCUGGGCUCCACGCGCACUACAAUUAUAAAUACUAUUUUGUAAUUUAUAAUCAGUAGGGAUUGUUUGUUGUAAAACUUACAUGAACGUGGAAUUCCUAGUAUAUAGAUGUAAGCAACGUCUAUUGAAUAUUGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCUAAGAUGGUUAUUAGGGGGAAGCUGAUAUAUUAUAUCAGAAGACUUCUGGUAACUAGAUUGGAUGUAAGUCGUAACAUGGUUGCAGUAGGUGAACCUGCCGCAGAUCAGUAG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...((....))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((.......(((((((....))))))).......)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((...))).)))).)).))))))...((.......((((....))))))..((..(((((.........))))).)).....(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.(((((..((..(((((((((....(((((((....)))))))...)))))))))..))..)))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...)))))).))..........<<<<<<.(((((((((.....))))))))).<<..))>>.....>>>.>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((.(((......(((....)))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((((...))))))))..((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((..(((...)))))))))).......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......)))))))).......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((..[[[[.))))).(((((...(((((........)))))))))).........]]]].........................(((((.[[[[[[[..)))))((((((((.......((((((....)))))).......))))))))....]]]]]]]..(((..[[[)))((((((((.......)))))))).]]](((((((((.....((((((....[[[))))))...]]]..(((......[[[[)))....]]]].(((((((((.....((((......((((((((....)))).))))[[[.....)))).((((((((((...))))))))))]]]...((((((((...))))))))..((((((((((((.(((..((((....))))...)))...........))))))).)))))........(((..[[[..)))..]]]........(((((..[[[[[(((((((((....(((((((....)))))))...))))))))))))))....]]]]]............((((((....((((((((.....(((....)))......))))))))....................)))))).....((((((...[[[..........)))))).....]]]..((((....[[[..))))...]]]..((((.(((.....))).[[[.(((((((((.....)))))))))..))))........]]]..(((.[[[[...))).(((((....)))))...]]]]......(((...........[[[[)))..]]]]..(((((((((((...))))))..[[[[.............))))).(((((.(((((....(((....))).)))))))))).]]]].......))))))))).(((((.....[[[[[...)))))..]]]]].....((((((...((((..((((((((...)))))))).....(((((....))))).........)))).............[[[..(((((.........)))))..))))))...]]](((((((((......))))))))).((((((.[[[[[))))))...........]]]]]..(((((.(((.....((((((((((((((.....))))))))...))))))))).)))))............)))))))))(((((((..(((((((((((((....(((((((...)))))))....)))))))))))))..)))))))................(((.(((((....))))).))).........
|
|
CRW_01171
|
[ FASTA input ]
|
CAACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUCAAAGACUAAGCCAUGCAAGUCUAAGUAUGAGGAAUAAUUAAGACGAAACUGCGAAUGGCUCGGUAAAACAGCAAUAAUUUCUUCGGUGAUUUUUACUACUCGGAUAAUCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCACAAUGCUUGGGUUUACUCAGGCAGUGCCGUUUAGAUAACAACACCAACAUAUGGUGAUUCAUAAUCGUCUUUCGGAUCGCUGGCGAAAGCCGGCGACGCACCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUCGAUGGUAAGGUAGUGUCUUACCAUGGUGGCAACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGACUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCAAUCCAGACUCUGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAUCAAUAGGGGACCCAUAAAGUCUUCUAAUUGGAAUGAGAACAAGCUAAACAGCUUAUCGAGAAUCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGGACUUUGGCAAUUCCGGAUGUGUGCGCGUCGUGCGCGCACUUUGCAGGGGUUGCUUUUGUGGGCAUGCGUGGGAUGAUGCGACUUUAUUGUCGAACGUCCCUACGCAACCACCUUUUACUGUGAGAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCAAUUGCCGUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUCGGUCUUAUUUUGUUGGUUUGUUAGGGCUGAGUAAUGAUUAAGAGGGACAGUUGGGGGCAUUUGUAUUCAGGCGCUAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUGCUGGAAGACAAACUGCUGCGAAAGCGUCUGCCAAGGAUGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUGAGGACUGGGGAUCGGGCGAGGAAUAUCGAUGACCCGCCCGGCACCCUCCGGGAAACCAAAGUGUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCAGGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAAAUAGGGGCUACUACCAUUUUGGUAGUACGUUUUCCCCUUCUUAGACGGACUGUGGGCGUCUAGUCCACGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAGUGGAUCAGCGGGUCAGGUUGCACGAAAGUGUUUCCUAAUCUUUAAAUCCGCUCGUGAUGGGGAUUGACGGUUGCAAUUUUCCGUCAUGAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGCGGGUCAUCAUCCCGCGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCUUUGGGAUUGCGAUGGAAAGAGCGUCUCGCUCGUUCUGUCGUGAGAACUCAGUCGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((.....................)))))......(((......((((..((..((....((((...........((((....(((((((.....))))))).....))))......((((((((....))))))))....((((((........(((((.....))))).....)))))).........((((((((....))))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((...{.((((...(((.......((((((((((((.((((((((.....)))))))).)).).)))))))))...((((...(((((((((((.((((((......)))))))))).))))))).))))...........................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{..(((.(((((((.((.(((....))))))))))))..)))...{{..))}}...}}}....}}}}))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.((((((((...))))))))......)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((((((((....))))))))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
........((((((....(((((((......((((((.........(((((((((.((((...(((.....)))....)))).....)))..))))))........(((((((((((((...........(((((((..........)))))))((((((.(((.....(((((....((((((((....)))))))).....(((.....)))..(((((.....))))).....(((((((..(((((.((((((((....))))))))..............(((((((.............(((((((((.....)))))))))....(((((.((((....(((((((.(((.....((((((.....((((........))))......)))..))).((((.(((((......((((((...(((((...))))).)))))).........(((.............)))..(((((((..(((((.(((....(((((....))))).)))....))))).)))))))..))))).)))).))).))))))).......(((.....)))...))))...)))))....(((((....((((((((........(((((((((...(((((((((((...))))))))...))))))))))))...((((...(((((((((((...((((......))))..)))))).))))).)))).....)))))))).........(((((((..((((....))))..))))))).)))))...(((((((((((((((((...))))))))))))).))))))))))))))))..)))))))...............))))).........))).))))))..)))))).....)))))))..))))))))))))).((((((((((.....))))))))))...)))))).......(((((((((((((....)))))......[[[[[[..))))))))....]]]]]].(((..(((..(((((((................)))))))..)))))).(((((((...(((..(((((((....)))))))[[[[)))...]]]]........((((...((((((((((((((((..(((((((....(((((((((.(((..(((.....))).)))............((((((..(((((.......(((((((((....)))))))))((((.....)))).((((...(((((...(((..((((((((((.....)))).))))))..))))))))(((((((..(((.((((..(((((.((((((((...))))))))......)))))..)))))))..((((((((.....))))))))..(((...))).....)))))))...))))))))).)))))))))))))))......)))))))((((((((....((((.(((..((((....))))..))).))))....)))))))))))))((((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......))))))))))))............)))))..))))..(((((((((.....[[[[[[[........(((((((((((.(((((...))))).)))))))))))..)))))))))..]]]]]]]...........................)))))))(((((....))))).............
|
|
CRW_01186
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAGAUGCUAGUCUCUGAGAUUAAGCCAUGCAUGUCAGUGAAGCCUUACGGUGGAACGGCGAACGGCUCAGUAAUGUUGCGGUAAUUUGGUCUCUGUGUGUAAACUAACCACGGUAACCUGUGGCUAAAAGCGGAGAAUAAGGCGCAACCCUAUCAGCUUGUUGGUAGUGUAAAGGACUACCAAGGCCAUGACGGGUAACGGGAAAUCAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAACUUGUCCACUCCUUACGGGGGAGACAGUCAUGAGACGUGAGUAUAAGACCUGAGUGUAAAGACCUUAGGGUGAAGCAAUUGGAGGGCAAGCUUUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAACUCCAACUCCAAGAGUGUCUAUGGUGGAUGCUGCAGUUAAAGGGUCCGUAGUCGUGAAUGCAAUUAAAUGUCGUUGUUCAAUAGCGAUGAGUUUGCUAAUGUUUGCGGAACGGAUAGGGAGUGUAGUAUAGACUGGCGAAGAAUGAAAUCUCAAGACCCAGUUUGGACUAACGGAGGCGAAGGCGACACUCUUAGACGUAUCUUAGGAUCAAGGACGAAGGCAGGAGUAUCGAAAGUGAUUAGACACCGCUGUAGUUCCUGCAGUAAACUAUGCCGACAGCCUGUGUGUGAGAAUACGUGGGCGGGAGAAAUCUUAGUGUUCGGGCUCUGGGGAUAGUACGCUCGCAAGGGUGAAACUUAAAGCGAAAUUGACGGAAGGACACUACCAGGAGUGGAUUGUGCUGCUUAAUUUAACUCAACGCGGGAAAACUUACCAGGGUCAAGUCAUUCGUUGAUUGAAUACGUGAGAAUGGCAGGAGUGGUGCAUGGCCGUUGGAAAUUGAUGGGGCGACCUUUAGCUUAAAUGCUUAAACCAGUGAGACCUCCUUGACAGGUGUUCUGUAACACAGGAGGGUGGAGGCUAUAACAGGUCCGUGAUGCCCUUAGAUAUCCUGGGCAGCAAGCGCAAUACAAUAUCUCUUCAGUAGACAAAGUGAUUUGAGAUGAGUAGGAUCUACGUUUGUAAAUACGUAGUGAAUAAGGAAUUCCUAGUAACGGUGCCUCAUCAAGGCAUGGUGAAUGUGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCACUAUUUCAGAUGGUCAUAGGGAUGAAGAGCUUCGGCUCUGAAUAUCUAUGGCUAGAUAAAGUACAAGUCGUAACAAGGUUUCAGUUGGAGAACCAGCUGAAGGAUCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((..........(((((((....))))))).....)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((....)))).)))).)).))))))............((((((.........)))))).........(((((((((.....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.((((......((((.((((((.......))))))...))))......)))).(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((((((((....))))))))))..<<..))>>...>>>....>>>.))).(((......((((....))))....))).....]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((......(((....)))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((....((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((.(((((......)))))...)))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[)))..]]]]]......((((((..((((((((.....(((((((((....))))........(((....((((.......((((((.........(((((((...........((((((....))))))......)))))))......))))))......))))..((((((((.......)))))))).))).)))))(((........)))..))))))))..))))))(((((((........)))))))..(((....))).......(((((....(((((((.((((...[[[[))))...(((....)))............]]]]..(((....(((....)))...)))......))))))).....))))).......((((((..((((...((((((...))).))))))))))))).........((((((..((((((((((((.....(((((((((...)))))))))...))))....)))))))).)))))).(((((((((((.((((((((...(((......)))......)))))))).)))................))))))))...(((.((((......)))))))...(((((.........((((.........))))[[[[[[)))))....]]]]]](((....(((..(((((....)))))..)))...........[[[[[[[[.)))((((.....(((.(((((....)))))..)))..............)))).]]]]]]]]....((((((.[[[[[))))))............]]]]].......(((((.[[[[[.(((((((.................))))))).....)))))..]]]]].((((........(((....)))..(((......)))....))))(((..[[[[[)))....(((((....))))).]]]]]..(((.[[[........)))....(((((...........)))))...]]]....(((..[[[[[[.[[[))).......]]]...]]]]]]....(((.[[[[[))).......]]]]].((((((((....))).......((((((.....))))))[[[[..[[[[[...))))).....]]]]].]]]]((((.[[[[....))))...]]]](((((.(((((....)))))...)))))...(((.[[[..)))....]]].......((((((((((((....))))))))..))))....
|
|
CRW_01188
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGGAUGCUAUUCUCUGGGGCUAAGCCAUGCAUGCUUGUGAACUCUUUGUGGGGGAUUAGCGGACGGCUCAGUGAUAGCACGAUGAUUUGUUUGCGGGAUGAGCAGUAGCUGCGGGAAACUGCAGAUAGUGGUCUGCCCCUGUGGGGUUGGCAAGUAAGUUGUGGGCCUAUCAGCUGGUAGUUAGGGUAAUGGCCUAACUAGGCGCAGACGGGAUACGGGGGAUCAGGGUUUGGUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUACUACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUGCCUAAUCCUUUGGGGAGGCGGUUAUGAGAAGUGAUGUGUGUGCGAGUGCAAAGGGGUCGCAUGUGAUUGGAGGGCAAGUCGGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCUGCUCCAAUAGUGUCUAUGGUGGAUGCUGCAGUUAAAAUGUCCGUAGUCUGUUGUGUAUGUCUUUGUGUGUGAUGUUUGUGGUUGUGUGUGGAUGUAGUGAUGUGUGUGGCAGAGGACGAGGGGCACUGGAUAGUUGGGCGAGAGGUGAAAUGCGAAGACCCUGACUGGACGAGCGGAAGCGAAGGCUGUGCUCUUGGACUAAUGUUGCGAUGAAGGACGAAGGCUAGAGGAUCGAAAUCGAUUAGAUACCGUUUUAGUUCUAGCAGUAAACGAUGCCGACUGGACGGGACAGUGUGUGUUGUCCAUGAGAAAUCUUGAGUAUGCGGGUUCUGGGGAUAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUUGAAGAGAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCGGCUCUGAAGGAUGCCUGUGAGUGCAUGGCAUGAGGCAUGCGGCGGUGGUGCAUGGCCGUUUUAAAUGGAUGGCGUGAGCUUUGUCUUAAGUUGCGUAAGAUGUGAGACCCUUUGACGGUGUUCUACGGAGCAAGGAGGGGAUGGAAAAGAACAGGUCCGUUAUGCCCUGAGAUGAGGCGGGCUGCACGCGCAUACGAUAGAUGGCGCUUCUGCCUGCUGUGAGGGAUGAAGCUGUGUAAGGGGCUUCUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAUAGCGGCUGACGAAGCUGCUUUGAAUGUGUCCCUGUCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAUCUAAGAUGACGCACUGGACGAAGAUCGGAAGGUCUGAGUCCUGAGUGUUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAUGGCUGCUGUUGGAGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((.....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((....((((....(((((((....))))))).....)))).((((...))))..)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((....))).)))).)).))))))....((....)).....(((...........)))..(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).)))))))..)..........(((((.....((((...(((.(((((.(((((((..(((((((((.......))))))))))))))))))))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((...))))))))))..{{..))}}....}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..((((((((.((((((((....((((........))))........(((((((....((((((......((((...))))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((...((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).)))))))))...((((((((....))))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((..[[[[.)))))..]]]](((.(((((((((((((((((.....(((((((.((((((...((((((....((((((((.((((((....)))..))).)))))))).((((.........((((((....))))))......)))).)))))).)))))).)))))))..(((((.........(((..((((((((.......)))))))))))..........)))))........)))))))))))))))))..)))......(((((.(((((((((((.........(((.(((((.....(((((..(((....)))))))).((((.....))))))))).))).....((((((...((((...(((((..(((((..........(((((.((((.(((((((...........)))).))).)))).))))).........))))).)))))...))))....)))))).......................)))))))))))..(((((((.((((((((.((((((((...(((((.((((.(((((((............((((.((((..(((((..(((....))).)))))((((.......((((.....(((((.(((((.....(((((....))))).......))))).)))))....))))......)))))))).))))...((((((..(((((......((((((((((((((..((((...)))).)))))))).((((.......))))..)))))).......)))))((((.....)))).(((((((((((.......((((...(((((((((((((.((((((...))).))).))))))................(((((.(((...))).)))))....((((((((((....)))(((((((...((((((...))))))..((((((.....(((((....))))).)))))).......))).))))))))))).)))))))...))))..))))))))))))))))).........)))))))))))))))).((((((.......(((..(((...)))..)))....))))))..(((.(((((((.....))))))))))...)))))))))))))))))))))))...)))))..(((((...[[[[[(((((((((..(((((....)))))..))))..)))))......)))))...]]]]]...((((((((((.(((....))).))))))..))))..
|
|
CRW_01189
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGAUGCUAUUCUCUGGGGCUAAGCCAUGCAUGUUUAUGAAGCCUUUAUGGGGGAUUGACGGACGGCUCAGUGAUAGUACGAUGAUUUGAUUGGGUGCCUGGAUGUAACUGUGGGAAACUGCAGGUAAGUUCUGGGUGUGGUAGUUUUUAGCUACUGCGUACCGAGUAAGUUGUAGGCCUAUCAGCUGGUAGUUAGGGUAAUGGCCUAACUAGGCGGAGACGGGAGACGGGGGAUCAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUACUACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUGCCUAAUCCUUAUUGGGGAGGCGGUUAUGAGAAGUAAGAUGUUUAGCAAGUAUAAAUUUGUUGUGAUUUACUGGAGGGCAAGUCGGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCUGCUCCAGUAGUGUCUAUGGUGAAUGCUGCAGUUAAAAUGUCCGUAGUUGUUUGUAUGUCUUUUGUGUGAUGUUUAUAGUUUUUAGUGGAUGUAGUUUGGUUGUAGCAGAGGACGAGGGGCACUGGAUAGUUGGGCGAGGGGUGAAAUACGAAGACCCUGACUGGACGAAGAGAAGCGAAGGCUGUGUUCUUGGACUUUUGUGGUGAUGAAGGACGAAGGCUAGAGGAUCGAAAUCGAUUAGAUACCGUUUUAGUUCUAGCAGUAAACGAUGCCGACUGGACGGGACUGUUUUAGUGUUGUCCGAGAGAAAUCUUAAGUAUGUGGGUUCUGGGGAUAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUUGAAGAGAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCGGUUCUGAAGUGAGUGUGAGAGUGUUUUUACAUGAUGCUUACGGCGGUGGUGCAUGGCCGUUUUAAAUGGAUGGCGUGGGCUUUGGAUUAAGUUACGUAAGAUGUGAGACCCUUUUUGACUGUGCUCUAUGGGGCAAGGAAGGAAUGGAACAGAACAGGUCCGUUAUGCCCUGAGAUGAAGCGGGCGGCACGCGCACUACGAUAGAUGCCUAUGUGGGCUACUGUGAGGGAUGAAGCUGUGUAAUGGGCUUCUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAGAAUGAUUGAACAAGUUAUUUUGAAUGUGUCCCUGUCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAUCUAAGAUGACGCAGUGGACGAAGAUUGAGAGGUCUGAGUCUUUCGUGUUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAUGGCUGCUGUUGGAGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((.....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((....((((....(((((((....))))))).....)))).((((....)))).(((...)))...)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((....)))).)))).)).))))))..(((...))).((((...........))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.....(((((((.......(((.......)))......)))))))...........(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((.....))))))))))..{{..))}}....}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....((((((......((((....))))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.....((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((((((....))))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[)))..]]]]].(((((.((((.(((((..(((.....(((((......((((....))))......)))))..((((((((((....((((((((.((((..(((((((.....((((((....))))))......)))))))((((((((.....))))))))...)))).))))))))....))))).)))))((((((((.......)))))))))))...............((((((((...))))))))........))))).))))))))).((((((((((.....(((....(((((...((((((((..((((.....)))).............((((((.....((((((((....))))))))...))))))...))))))))...)))))....)))((((((....((((....))))...[[[[[[....))))))...........]]]]]]((((....(((((........)))))..)))).......)))))))))).((((....(((((((((.((((((((..............((((((....((((....((((.........(((((.(((....)))...)))))....((((((((((.....((((((..((((((((((((....))))).........(((((((...(((........))).)))))))........))))))).))))))((((....))))...........(((((.....(((.(((((....)))))..)))............)))))...))))))))))((((..((((((.((((..............(((((((....(((.((((((..((((((((....((((....)))).))))))))(((.(((...))).)))((((((........((((((.(((......)))))))))......))))))..(((((.....(((((....)))))....))))).....)))))).)))......))))))).........)))).)))))).))))...((((..((((....))))..)))).))))..((((((........))))))....))))..))))))....(((((((((.....)))))))))....)))))))))))))))))....))))..((((..[[[[[[[))))(((....((((..(((((....)))))..))))..))).]]]]]]].(((....))).........((((((.(((....))).))))))........
|
|
CRW_01214
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGACGCUAGUCUCAUAGGUUAAGCCAUGCAUGUGUAGGCGAAGCAUUUUGUGGAGCGGCGGAAGGCUCAGUAACGGGCGUCUAUUUGAUCUUCUGAGACGGACAACCUCUGUAACCGGAGGCCAAUACGUCAGAGGCACGGUUACCCUGUGUGGUGGUGUGCCGAAAGCAUUGCGCGGAAGAGUAAGGAGCCAUCCCAUCAGUUAGUAAGUAGGGUAAGGGCCUACUUAGACGAAGACGGGUACGGGGAAUUGUGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCAGGUCCAAGGACAGCAGCAGGCGCGAAAAUUACCGAAGCCUCCGGUGAGGGCGGUAGUAAGGAGACGUGGAAACGAUGAGGAGGUAAAGAAUGCUCUGGUAACAGGAGGUCAAGACUGGUGCCAGCAUCCGCGGUAAUACCAGCUCCUGGAGUGUCUAUGAUGAUUGCUGCAGUUAAAGAGUUCGUAGUCGGGCUGCGUGACUGGCGUGAAAGGCCUUCUUUCAAGGGGGGCACAGCGCGGGGAAAGCAGAGGAUAAGGAGCGUUUUGGGGCCAGGUUAUUAAGCGACGAGAGGUGAAAUUUGAUGACUCGCUUAGGAGGAACAGAGGCGAAAGCGCUGGCCAGGGGCGAAUCCGAUGAUAAAGGACGUAGGCUAGAGGAUCGAAGACGAUUAGAGACCGUUGUAGUUCUAGCAGUAAACGAUGCCGAUGCCGUGGUGCGUGCGCGCGACGCGGAGGAGAAAUUGAGUAGGGCCCUGGGGAGAGUACACGCGCAAGCGAGAAAUUUAAAGGAAAUUGACGGAAGAACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGACAGCUUACCAGGCCCGACGACCGCACGAGUGUUGUACACGAUAGGUCGAAGAGUGGUGCAUGGCCGUUAACGACAAGUGGGGUGACCUUUGGGUUAAGUCCGGGAAGUAGUGAGACCCCUGCUGUCCGGCAGACAGGACAGGUGCUCAAAGCACAGGAAGGAAGGGUCAAGAACAGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUGGCGUGGGCUGCACGCGCACUACAGUGGUCACAGAAAGAAUCGCGGAGAGACAAUGGUGAUCGAGAGGGAAUGAGCUUUGCAAGAGGCUCAGGAACGAGGAAUUGCUAGUAAUCGCGGGCUCAUUAAGACGCGAUGAAUACGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCGAAGAUGGAGUCAGGCGCGAACAAGCGAGAGCGAGUGAGUGCAGGGUUCUAGAUGUGAUACAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUAGGAGAACCUGUAGCUGGAUCAGCG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((...(((...)))...)))))......(((.....((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).....(((((.....))))).......((((.....))))....)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...........(((((.........)))))......(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((...((((....(((((((......((((((.....))))))....)))))))....)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((((((((....))))))))))..<<..))>>..>>>.>>>.))).(((......((((....))))....)))....]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((...))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(((((.....)))))..((((((((...)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((......................)))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((.....(((.....[[[[.))).((((((((..(((.(((....))))))..)))...))))).]]]].((((((((((......)))).[[[.......)))))).((((.....((((((....))))))......))))]]].((((((.[[[[))))))...]]]]..(((......[[[[.)))....]]]]...(((.[[[[....(((..((((((((.......))))))))))).......)))...]]]]....((((....((((.....))))[[[[[..........)))).(((....))).....]]]]]......(((((((..[[[[[[........))))))).......(((....)))....]]]]]]...........(((...[[[[[[.)))...((((((((.........)))...)))))]]]]]]......((((((........[[[[[[.......))))))...]]]]]]..((((((((......(((((((.....))))))).....((((.....((((((((((.(((.((((((..(((((((((.((((((((...(((......)))......))))))))....))).............)))))).))))))..))).........(((((((.(((((...........(((((....((((((((...............((((.......(((((.((((....)))).))))).......))))....(((((.(((.(((.((((((............(((((.....)))))............((((.....)))).))))))..)))...(((.(((.....))).)))....))))))))...((((((.(((.(((((....)))))..)))....(((((((.((((((((.....(((..(((....))))))......................(((((...((((((........))))))(((((...))))).........)))))...))).)))))(((..((((...........))))..)))..))))))).))))))....................)))))))))))))........((((((((....))))))))....(((....)))))))).((((((............))))))...))))))).)))))))))).....)))).))))..(((((....((((.....((((....................)))).....))))....)))))..))))..........(((((((((....))))))))))))))))).
|
|
CRW_01222
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGAUGCUAGUCUCUAAAGUUAAGCCAUGGAUGUCUAAGCAAAGCGUAAGUCGAGCGGCACAGGCUCAGUAACGGGCGAAUAUUUAAUCUCCUCGAGUGGAUAUCCUCUGUAACCGGAGGGCAAAACACAGGACGUGCAGUUGUAUAAGGAUUGUUCGUUUAACAUUAGUGGGGGAGAGUAAGACGCCAGUCCAUCAGUUAGUAAGUAGGGUAAGGGCCUACUUAGACGAAUACGGAUACGGGGAAUUAUCGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCGGGUCCAAGGACAACAGCAGGCGCGAAAAUUACCGCAGCCUGCAUUCAGGUCGGUAGUAAGGAGACGUGUAAACGAUGUGCAGGUAAAGAAUGCACUGUAUACAGGAGGACAAGACUGGUGCCAGCACCCGCUGUAAUACCAGCUCCUGGAGUGUCUAUGAUGAUUGCUGCAGUUAAAGCGUUCGUAGUCGAACCGGGUUGAAUUGCGUGACAGUCAGACUCUCAAGGUGUGAUGAGCGCUGUGAUUCUGGGGAAUAAGGAGUGUUUAGGGGCCAGGGUAUUAAACGGCAAGCGGUGAAAUGUGUUGACCCGUUUAUGGAGCGACAGAGGCGAAAGGCUGGCCAGGGGCAAAUCCGAUGAUAAAGGACGUAGGCUAGAGGAUCGAAGACGAUUAGAGACCGUUGUAGUUCUAGCAGUAAACAAUGCCGAUGUUGUGGUGCCGUAACGGACGCAAAAGAGAAAUCUAGUAGGGCCCUGGGGAGAGUACACGCGCAACAGGAAAUUUAAAGGAAAUUGACGGAAGAACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGACACCUUACCGGGCCCACGGCCACACGAGUGUGACACACGAUAGCCGAGGAGUGGUGCAUGGCCCGUUAACGACAAGUGAGUGAUCUUUGGGUUAAGUCCGUAAAUUAGUGAGACCCCAGCAAAGGACAGGUGCGCAAAGCACAGGAAGGAUGGGUCAAGGACAGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUGGUCCGGGCUGCACGCGCACUACAGUGGUCGCCGAAAUUUAGAUAUAGAGCUAAAGGCGAUCGAGAGGGAAUGAGCUUUGGAAGAGGCUCAGGAACGUGGAAUUGCUAGUAAUCGCGGACUCAUUAAGACGCGAUGAAUACGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCGAAUACGGUGCUCGGCGCGAGCAAGGUGAAAUCACUGAGCGAGCGCAAGGUACCGGAUCUGAUACAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUAGGAGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((...((....))...))))).....(((.....((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((....))))......((((.....))))......)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...........(((((.........)))))......(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((..........(((((((........((((((.....)))))).........)))))))..........(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))).)..))....(...(....))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.(((((...(((...))).)))))..[[..))]]..]]].]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((..((((.......((((...))))....))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(...)..(((((((.....))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((....(((((........))))))))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))..((((......((((((........(((.(((....)))...................))).(((((((.......((((..(((((....(((((..(((....(((((((....))))))).....))).(((((.((((((.......)))))).)))))..........))))))))))...)))).((((....(((..((((((((.......)))))))))))......))))....(((((((.....))))))).......))))))))))))).(((((((((((....)))....(((((((((........))).)))))).......)))))))).(((.(((((((......((((((((((.....))).)))))))((((((.......((((((.((((....))))...))))))))))))..((((((....((((((((((((((...((((((((((((((......)))...((((((.(((((.(((((.....((((.....(((((......((((((.....(((........((((((..((((((..((((.....(((...(((((....(((((.((((.((((((..((((....(((((((...)))...(((.........)))......(((((((((((....)))))..............))))))))))......))))..))))))....))))))))))))))..(((....)))....((((((((((..((((...((((((......(((((.....)))))............((((.....))))..)))))))))).......))))....(((...)))....)))))).....((((....)))).)))......)))).....)))))).)))))).(((((..((((.........)))).))))).)))..............)))))).........))))).....)))).........)))))..(((((((..........)))......)))).))))))))))).)))))..((((((((....(((((........)))))))))))))........((((((((....)))))))).))))))..)))))).))))))))...........)))))).....))))))))))..............))))...(((....)))....((((((..((((......((((....))))......))))..)))))).((((((((....))).......(((.[[[[.......)))..]]]].)))))....
|
|
CRW_01224
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGGUGUGGAUGCUAGUCUCAUAGGUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGCAAAGCUAGAAGUGGAGCGGCGCAAGGCUCAGUAACGGGCGGACAUUUGAUCUUCUCGUGUGGACAUCCUCUGUAAGCGGAGGGAAAAACACAGGACGCGCGGACGCAGCCCGUGGGUGUAACGGCGGUGGAGAAGAGUAAGACGCCAUCCCAUCAGUUAGUAAGUAGGGUAAGGGCCUACUUAGACGAAGACGGGUACGGGGAAUGAGUGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCAGGUCCAAGGACAGCAGCAGGCGCGAAAAUUACCGCAGCCUGCCUCAGGGCGGUAGUAAGGAGACGUGAAUGCGAAGUGCUAGCAAAGAAAGCACUGACAACAGGAGGACAAGACUGGUGCCAGCACCCGCGGUAAUACCAGCUCCUGGAGUGUCUAUGAUGAUUGCUGCAGUUAAAGGGUUCGUAGUCUGAGCGGAACGAGGGGUGUGACGGGUCCCAGCUCAAGGGGGACAUAGCACCGCGAUGCCGCGGAACAAGGAGCGUCUAGGGGCCAGGGUAUUAAGCGACGAGGGGUGAAAUCUGGUGACUCGCUUAGGAGCAACAGAGGCGAAAGCGCUGGCCAGGGGCGAGUCCGAUGAUAAAGGACGUAGGCUAGAGGAUCGAAGACGAUUAGAGACCGUUGUAGUUCUAGCAGUAAACGAUGCCGAUGCCGUGGUGCCGCAAGGCGACGCGGAAGAGAAAUUGAGUAGGGCCCUGGGGAGAGUACACGCGCAAGCGAGAAAUUUAAAGGAAAUUGACGGAAGAACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGACAGCUUACCAGUCCCGACGAUCGGAGGAGUGUGUUACACGAUAGGUCGGAGAGUGGUGCAUGGCCGUUAACGACGAGUGGGGUGACCUUUGGGUUAAGUCCGUGAAGUAGUGAGACCCCUGCCGCAAGGGACAGGUGCCGAACGCACAGGAAGGAAGGGUCAAGAACAGGUCAGUGAUGCCCUCAGAUGGGCUGGGCUGCACGCGCACUACAGUGGUCGCAGAAAAGGAAGGAAAGAGAUAAAGGCGAUCGAGAGGGAACGAGCUUUGGAAGAGGCUCGGGAACGAGGAAUUGCUAGUAAUCGCGGGCUCAUUAGGACGCGAUGAAUACGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCGAAGAUGGAGUCAGGCGCGAACAAGCGAGAGCGAGUGAGUGCAGGAUUCUAGAUGUGAUACAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUAGGAGAACCAGCAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((...(((...)))...)))))......(((.....((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))....((((..(((.....)))..))))..........)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))...........(((((.........)))))......(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((...((((.....(((((((......((((((.....))))))....)))))))....)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.((((((((((....))))))))))..[[..))]]..]]].]]].))).(((......((((....))))....)))....}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((...))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).(((.......)))...)))))).....((((.((....))..(((((((.....))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((......................))))))).....(...(((((((......)))))))....).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.......))))))))(((..(((.(((((.........(((.(((........)))..(((........))))))...((((((.....((((((((((((((.(((((...((((....(((((((....))))))).....))))....(((....))).(((((((((......((((................))))..)))....(((..((((((((.......)))))))))))....))))))..))))).))))))))))..))))......))))))..))))))))..))).(((....)))....(((((((((........))).))))))....(((((((................(((..[[[[[[.))).....]]]]]].....((((((.........((((....)))).[[[[[[[[.....))))))...((((...))))]]]]]]]]......(((.[[[[[..)))..]]]]]..(((...........[[[[[..)))....]]]]]......(((((....))))).(((((((((.........(((((((.((((((((............[[[[.....))))))))......]]]](((......[[[.)))...]]]..((((.........))))....((((((((((((....)))))......[[[[....)))))))....]]]].(((((((.(((((.((((....)))).))))).......)))).)))..)))))))...((((...(((.[[[)))....))))........]]]...........((((.....)))).((((((((((((......(((....((((((.........)))))).[[[[[.)))..((((...))))....]]]]].....(((..[[[[[)))(((((..(((..(((....)))))).)))))..]]]]]..((((...[[[[[))))............((((.....)))).........]]]]].................((((......)))))))))))))))).........(((((((........................)))))))........((((((((....))))))))....(((......[[[.....)))..]]](((((.[[[[[.)))))...]]]]]..)))))))))....))))))).....(((((....(((((((..((((....................))))..)))))))....))))).............(((.(((((..........)))))...)))....
|
|
CRW_01239
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGGUGUAGAUGCUAGUUUCUAAGAUUUAGCCAUGCAUGUUUUGUGAAUUCUUACGAAGGAACGGCGAACGGCUCAGUAAUAUUGCGUUAAUCUGGUCUAAAUAUAAAAAUAACUACGGUAACCUGUAGCUAAUAAUUUAGAAUGAGACGCAAAUUUAUCAGUUUGUUGGUAGUGUAAUGGACUACCAAGACUAUGACGAAUAACGGGAAAUUAGGGUUUUAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAAAUUGUCCACUCUUUUAUGAGGAGACAGUUAUGAAACGUGAAUAUAAGUUUGAAUUUUAAAAUAAUUUAUUUUAUGCAAUUGGAGGGCAAGUUUUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCAACUCCAAGAGUGUCUAUGAAGGUUGCUGCAGUUAAAGCGUCCGUAGUUUUUUUAUUGCAAUUUAAAAACUAUGAUUAAAUUAGUUAAGUUUCCAAUACAUUGUGAAACGGAUAGGGAAAAUUGUAUAGCUAGGUGAAGAAUGAAAUCUCAAGACCCUAACUCGACAAACAGAGGCGAAGGCGAUUUUCUUAUACGUAUUCUUAAAUAAAGGACGAUAGUUAGAGGAUCGAAGGUGAUUAGAGACCGCUGUAGUUCUAACUGUAAACUUUGCCGACAUUUCAUAUUGUUUUGAUAAGAAAGGGAGAAAUCUUAGUUUUCGGGCUCUGGGGAUAGUACACUCGCAAGGGAGAAACUUAAAGCGAAAUUGACGGAAGAACACUACCAGGAGUGGAUUGUGCUGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGAAAACUUACCAGAGUCAAAUAUAUUUAUGAUUUUUUUAAAUGAAAUAUAUAAAAGUGGUGCAUGGCCGUUGCAAAUUGAUGGGUUGACUUUUAACUUAAUUGUUGAAACCAGUGAGAUCAUUUAUGACUGGUAUUUUAAAUACAGGAAGGAAAUGGCAAUAACAGGUCCGCACGCCCUUAGACAUUCUGGGCUGCAAGCGCAAUACAAUAUCUUGUUAUUUAUAUUUAUUUAUACAAUUAUAUGUAGGAUUAAUUCUUGUAAAUGAAUUAUGAAUCAGGAAUUCCUAGUAAUAAUAUUUCAUUAAGAUAUUAUGAAUUUGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGUCCGUCACUAUUUCAGAUGGUUAUAAAGAUGAAGAGCUAAGGUUCUGAAUAUUUAUAACUAGAUAAAGUACAAGUCGUAGCAAGGUUGCAGUCGGUGAACCAUCAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((..(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((.........(((((((....))))))).....)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((....)))).)))).)).))))))............((((((.........)))))).........(((((((((....<.<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((...((((......((((.((((((.......))))))...))))......)))).(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((...))))))))))..{{..))}}...}}}....}}}.))).(((......((((....))))....))).....]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((......(((....)))....))))))...((.((((..(.(((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.....((((((((...)))))))).....))))....)))).)))....))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.................))))).))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.......))))))))((((.[[[[[..))))....]]]]]........((((((((....))))))))....(((.[[[[)))...........]]]].......(((((((..........((((((....))))))......)))))))...((((((...............((((((((...[[[[))))))))..]]]].......(((.[[[[......)))...]]]]((((.(((((((........)))))))..(((....)))(((....(((((.((((((((((.((((((...)))))).(((((......((((((.((((((((((...)))....))))))))))))).)))))..)))).)))))).)))))....)))..(((...)))..))))....))))))...........((((((......[[[.[[[[[[[[[..))))))....]]]]]]]]]]]]............((((((((....))).)))))((((((((((((((((.....((((...(((......)))......)))).(((........)))......))))))))))).....)))))..........(((....)))...........(((........)))((((..((((..(((((((.((((((((((.((((.((((.....)))).))))((((....)))).(((..(((...)))..))).((((.(((....))).............((((((((((((((((((.((((((..((((((((((((((((.(((((((((.....(((....)))....)))))))))....(((((((((....))))......)))))))))))))))((((((((.......)))))......(((((((......))))))))))........))))))..)))))).......(((((((((((...............)))(((.((((..(((...))))))))))...............(((((..(((((((((((((((((............(((.....))))))))))))).)))))))))))).))))).)))(((((((((.....)))))))))...........))))))............)))))))..)))))...((((((((((.....(((((....))))).....))))))))))......))))..))))..)))))))))))))....))))...))))..........
|
|
CRW_01250
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAGACGCUAUUCCCUAAUAUUAACCCAUGCAUGUUUUUGACAUUUAUUUGAAAAAUGGACUGCUCAGUAAUACUCACUUUAUUUGAUGUACAUUUGAUGAUAACUACGUUAAAGUGUAGAUAAAAUGUGUACAGUAAGAGUGAGACCUAUCAGCUAGUUGUUAAGGUAAUGGCUUAACAAGGCAGUGACGGGUAACGGUAUUACUUUGUAAUAUUCCGGAGAAGGAGCCUGAGAGACGGCUACUAAGUCUAAGGAUUGCAGCAGGGGCGAAACUUGACCUAUGGAUUUUAUCUGAGGCAGUUAUGGGAAGUAAUAUUAUAUUGUUUCAUAUUGUAAAAGUAUAUGAGGUGAUUAAUUGGAGGGCAAAUCAAGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACUUGUUCCAAGAGUGUGUAUGAUGAUUGAUGCAGUUAAAAAGUCCGUAGUUUAUAUUUAAGAAGCAAUAUGAGGUGUACUGUAUAGUUGGGAGAGAGAUGAAAUGUAACGACCCUGACUGGACGAACAGAAGCGAAAGCUGUACACUUGUAUGUAUUUUUUGAACAAGGACGUAAGCUGGAGGAGCGAAGAUGAUUAGAUACCAUUGUAGUUCCAGCAGUAAACUAUGCCGACGAUGUGAUAUGAUAUUUAUUGUAUUACAUGAUAGAAAUUUGAGUUUUUUGGCUCUGGGGAUAGUAUGAUCGCAAGAUUGAAAAUUAAAGAAAUUGACGGAAGAAUACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGAGGUAACUUACCAAUAUUUUAUUAUUCAGAGAGAAUUUUUAAUUUGAGGAUGAUAAUAGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAAUGGAUGCUGUGAAGUUUUGAUUAAUUUCAACAAGACGUGAGACCCUUUUUUUAUAUAGACAGACACAAUCAGUGUAGGAAGGAAAGGAUUAAAACAGGUCCGUUAUGCCCUCAGACAUUUUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUAGAUAUAUAAUCUUUAUGGGAUAAUAUUUUGUAAGAGAUAUUUGAACUUGGAAUUGCUAGUAAAUUUUAUUAAAUAAGUAGAAUUGAAUGUGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAUCUAAGAUGAUAUGUGUUGUGAAAUUAGUGAAAACUACUUGAACAAUAUGUAUUAGAUCUGAUAUAAGUCGUAACAUGGUUGCUGUUGGAGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(.....)...)))))......(((......((((((((..((...(((((((....(....(((((((....))))))).....))))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...(((..((((...))))....)))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))..((((...))))..(((((((.........)))))))........(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.........((((((.(((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.((((((((((((....))))))))))))..[[..))]]...]]]....]]].))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((......(((((...)))))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(((...)))..(((((((.....))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((.....))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
........(((((((((..........((((.((((............((((((..((((((...(((......))).(((.(((((((((.....(((((((((.....(((((((....)))..(((((......)))))....((((((.((((((........(((..((((((..((((((((.......)))))))))))..)))..)))...((((((((((((((((..(((......)))((((.(((.....(((....(((.(((..((((.......))))..))))))...)))......))).)))).)))))..))))))))))).))))))..))))))......)))))))))))))...))))...((((.......)))))))))))).(((...))).....))))))..))))))...........((((.....((((...(((((..........(((.....(((((((((((.((((((((.....................)))))))).)))......(((....)))))))))))...)))......)))))..))))...)))))))).))))............(((....))).((((((((((((.(((((.((((.((((((((((((....))))))))))))...........(((((....)))))...(((((((.(((((....)))))..((((.....))))(((((...(((.((((.....)))))))((((((((((((((((......(((.(((....(((((.(((((((((.((((((.(((...)))..))))))))))).)))).)))))....)))......(((((((.((((((((((......))))))...............(((((((((..........((((.....))))...)))))))))......))))))))))).)))..)))))....)))))))))))(((...(((((.((((((.......((((.((((...)))).))))...))))))((((..(((..........(((((((((.....))))))))).......)))..)))).))))).....))))))))))))))).((((((((((((((((.....((((....)))).....))))))))))))..)))).......))))...)))))))))))))))))........)))))))))...
|
|
CRW_01260
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGAUGCUAGUGUCUGAGAUUAAGCCAUGCAUGUGAGUGAAUGUAGUAAGCAGGAACUGCGGACGGCUCAGUAAGACUACGAUGAAAUGAUCUGCGAAGAAGAAGUAACGGCGGGAAACUGAAGAAGAGAGUUUUUGAGAAUACUUGAAGGGAUGCGGAGAAGUGAUUUUUGAAGUGAUGUUGAGUAUUUGAGCGGAGUGUGUUGUAGACCUAUCAGCUGGUAGCUAGGGUAAUGGCCUAGGUAGGCGACGACGGGAGACGGGGGAUUAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUACUACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUGCCUAAUCCUGUGGGGAGGCGGUUAUGAGACGUAUGAUAUUGUUAUGAAGCGGACGAUGAAAGAGUCAGUGGAUAUUGGAGGGCAAGUCGGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCUGCUCCGAUGGUGUCUAUGGUGAAUGCUGCGGUUAAAAAGUCUGUAGUCAAGUGAGGAUGUGUAUGAGUAUGAAGGUGAGUGAACUAGAGUUGAAUAAGCUUGUAUGUAUGAGGAGAGCAACGGAGGGGGUGCACUGGAUAGCUGGGCGAGAGGUGAAAUGUGAAGACCCUGGCUGGACGAACGGAGGCGAAGGCUGUGUGCCAUGACGAAUGUGAUGAUCAAGGACGAAGGCCAGAGGAUCGAAAUCGAUUAGAUACCGUUUUAGUUCUGGCAGUAAACGAUGCUGACGGGAUGACAUGUAUGUGUGUUAUGCAAGAGAAAUUGAGUAUGUGAGCUCUGGGGAUAGUAUGUUCGCAAGGGUGAAACUUAAAGAGAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCAGGGCUGAAGAUGUGUGGAGAACUGAGAGGGGAGCACAUUGGCGGUGGUGCAUGGCCGUUUGAAACGGAUGGCGUGAGCUGAGGAUUAAUUUCCGGAAGGCGUGAGACCCACAAGACAGGUUGUUUGGAUGACAGGAGGGAGUGGAACAGAACAGGUCCGUUAUGCCCUGAGAUGUCCUGGGCGGCACGCGCACUACGAUACGUGUAUGAGAUGUGUGAGGGAUGAAUGUGUGGAAUGGCAUUCUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAUGGUGGCUCAACAAGCCGACGUGAAUGUGUCCCUGUCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAUCUGAGAUGGCACAUGGGACGAACACCGAGGGGUGUGAGUCUUCUGUGGUAGAUGAGAUAUAAGUCGUAACAUGGCUGCGGUUGGAGAACCAGCUGCAGGAUCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((.....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((..((((....(((((((....))))))).....)))).....................((((((.....))))))..................)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((....))).)))).)).)))))).....(((....)))...((((((.........)))))).....(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((............(((((((.....((((((((.......))))))))...)))))))...........(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((((((((....))))))))))..<<..))>>..>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....((((((......(((....)))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((....((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((.......))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((..[[[[.)))))....]]]](((...(((...)))..)))..(((((.[[[[[..)))))....((((...)))).....]]]]]......((((((((......((((((((((...........(((....)))..........)))))..(((((((........(((.(((((....)))))...)))......)))))))..)))))...))))))))(((.....[[[))).(((.((((....)))).))).]]]...((((((...(((((((((((...))))))))........[[[))).......]]]....((((....))))......(((((...((((((((..(((.............((((..(((......(((((((.....[[[))))))).....))).)))).....)))))))))))...)))))......]]].....(((((.(((((......(((.........(((((((.........)))))))..............(((((((.....(((......)))............))))))).......)))......))))).)))))((((...[[[[[[[[.....))))............]]]]]]]]..........((((..[[[[...))))...........................]]]]....(((((....)))))........(((((((((((((((((.....)))))(((..[[[[[[))).....]]]]]]............(((..[[[[[[))).............]]]]]]..((((...(((..............)))..)))).....((((.((((..[[[.....)))).))))..]]](((....))).))))))))))))..(((((...........(((((.((((((.((((((((((....(((((...)))))...(((((.(((.(((((..(((((.....(((((((..(((((((......)))).............)))..((((..........)))))))))))..)))))))))).)))..)))))))))))).((((((.......)))))).((((((..((((.((((((...)))))).))))...))))))........(((((.....))))).))).)))))))))))..........)))))..))))))((((((...)))))).....((((..(((((....)))))..)))).(((((...[[[[[(((....)))....)))))((((((((((....))))))))))..]]]]].
|
|
CRW_01266
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAGAUGCUAGCCUCCGAGGCUAAGCCAUGCAUGCCCGUGACGCAAGGAACGGCGAACGGCUCAGUAAUACUGCGAUGAUCUGCUCCGCGCGGACGAUAACUACGGGAAACUGUGGCUAAGAGCGCGGAUUGAGACGCAGCCCUAUCAGCAAGUUGGUAGUGUAACGGACUACCAAGGCGGCGACGGGUGACGGGAAAUCAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAAAUUGCCCACUCUCUUGCGAGGAGGCGGUUACGAGGCGUGACGGAAGGGCGCACUGUAAAGACGUGCGCGAACGCGAUUGGAGGGCAAGUUCGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCGACUCCAAGAGUGUCUAUGGUGGAUGCUGCAGUUAAAAAGUCCGUAGUCGGCACUGCGACGAAAGCGCGCUGCUCGAUGGCGCAGGCGUUGCAGGGGCUUGCGGAGCGGGCGGGGGGCACGGUAUAGGCAGGCGAGAGAUGAAAUGGCCAAGACCCUGCCUGGACCGACGGUGGCGAAGGCGGUGCCCUCGCACGCAUCUGUGGAUCAAGGACGAAGGCCGGAGGAUCGAAAGUGAUUAGAGACCGCUGUAGUUCCGGCAGUAAACGAUGCCGACACCGCGCGGCGGGGCUGCGCGGGGGGAGAAACCUUAGUGUUCGGGCUCUGGGGAUAGUAUGCUCGCAAGUGUGAAAAUUAAACGAAAUUGACGGAGCUACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCACCUUACCAGGGCCACGCGCGCCUGAGACCGCAUGCGCGAGGCGCGCAGGAGUGGUGCAUGGUCGUUGCAAAUUGGUGGGGCGACUUUUGGCUUAAAUGCCGGAACGAGUGAGAUCUCCGAGACGGGUGCGCGCAGCACAGGAGGGUGGAGGCGAUAACAGAUCAGUGAUGCCCUUAGAUGCCCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUCCCCGCGCGCUGCACAGAACGGUCGCGGGGGUGUGGGACCGGCGCCUGUAAGGGCGCCGCGAACGAGGAAUUCCUAGUAACGGCGGCUCACCAAGCCGCGGUGAAUGUGUCCCUGUAGCUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUCAGAUGGCCGUGUCGGUGAAGGGAGCAAUCUCUGUGCCUCCGCGGCUAGAUAAGAUGUAAGUCGUAACAAGGUUGCGGUCGGUGAACCAGCAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((..........)))))......(((......((((((((..((...(((((((........(((((((....))))))).....)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...((((....)))).)))).)).))))))...........((((((.........))))))........(((((((((....<<<<.....<<.)))>>.......>>>>)))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((....(((((((......((((((.....))))))....)))))))........(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......))).......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........[[[[[[.(((((((((...)))))))))..[[...))]].....]]]..]]].))).(((......((((....))))....)))....}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((......(((....)))...))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((....(((((((.....))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.((((.......)))))))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[)))..]]]]]...((((((...))))))((((.(((.[[[[......)))......]]]]...))))..(((....))).....(((..[[[[[[[)))......((((((....))))))......]]]]]]]......(((.[[[[..........((((((((.......)))))))).))).....]]]].......(((((...(((((((((((...(((((((........))))))).(((((..(((((((....((((((((..((((((.(((.........)))(((((((((...))))))......((((((.........))))))...))).......)))))).))).)))))....))))((((...))))..)))......((((((...(((((((((.........((((((....(((.((((((((.....(((((.......)))))...))))))))..)))......)))))).(((((((((((.((((((((......................)))))))).)))................))))))))))).))))))))))))...)))))....)))))..))))))..))))).........(((..[[[[((((........)))).)))(((((((((...))))))))).]]]](((.[[[[[[..))).....]]]]]]...(((.((((.(((.(((.........)))...)))...)))))))........((((.......[[[..........))))..]]]..(((.(((....))))))..((((((((...[[[[[.......))))))))....]]]]](((.[[[[[[)))...........]]]]]].....((((.....[[[[.....))))...]]]]......(((((.(((((.((((((((((.....(((.....))).....)))))).......)))).))))).)))))......(((((((((.((((.......)))))))))))))(((.....(((((((....))))))).......(((....))).......[[[[[[)))..]]]]]]......((((..(((((.(((......(((((........(((((....((((((((..((((.(((((....))))).))))..))))))))....)))))....(((((((...))))))).)))))....))).)))))..)))).
|
|
CRW_01271
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGAUGCUCGCCUUAAAGACUAAGCCAUGCAAGUUUGCGAGCUGAGCAGCGAACGGCUCAGUAAAACAGGGCACUCUAACGCACGGAAGAGAUAACCACGGGAAACUGUGGCUGAGAAGUGCGAUGAGGCUCUGACCUAUUAGUUUGUCGGUACGGUAAGUGCGUACGGAGACGAUGAUGGGUAACGGGGGAUCAAGUCCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUGCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGCAACUUACCCAAUGAGGAUUGAGGUAGUGACGAGGCGUAGAUUGUGAGUUGAGAGUAAAGAACUUAACGAGAGCGACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGGGGCGUAUGUGUGUGUUGCUGCGGUUAAAAAGCGCGUAGUUUGUGGUGUAGCGGGUCGUUGUGGGGCGAGAUCAAUGCGUUCUGUGUGACUUAUGCUCAUUGCUAGGGAGCGCGAGACGCCGGUGGUAUUCGGUAGCGAGGGGUGAAAACUGCAGACCUACCGAGGAGCGACAGAGGCGUAAGCGGCCGGCGAGUGCGGAUCCGACGAUCAAGCGCGUGGGCAGGAGUAUCGAAGACGAUUAGAGACCGUCGUAGUUCCUGCAGUAAACGAUGCCGACAUGGUUGAAUAGAAUUGACCAAAGGGAAACUGAGUGUACGGGCUCCGGGGAGAGUACGGGCGCAAGCCAGAAACUUGAAGAAAUUGACGGAAGGACACCACCAGGCGUGGAGUGUGCGGGUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCCGGGCCGCAGCCUCUUGAGAGGAAACCGAUGGGGCCUCGUGGUGCAUGGCCGUUCUCAACGCGAGGGGUGACCACUGAGUUAGUUCUGGCAAGCCGUGAGGCCCCUGUACUUUUGUAGACGGCGGACGGCAAGUCCGAGGAAGCGAGGGCGUAUAACAGGUCUGUGAUGCCCGCAGAUGUCCGGGGCUCCACGCGCACUACAAUAGCAAAUGGUAGACGAGAGUAAGUUUGUUGUGGUUGGGAUUGACGCUUGUAAAUGCGUCAUGAACGAGGAAUGCCUAGUAGUUGUCUGUCAGCAGCGGACAACGAAUAAGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCUAAGAUGGCGGUGCGGAUGAAGCUGCUACGUGGCAAGAAUCCGUGCUGCUAGAUUGGAUACAAGUCGUAACAUGGUUGCAGUAGGUGAACCUGCCGCAGAUCAAGCU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((.......)))))......(((......((((((((.((...(((((..........(((((((....)))))))......)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((...))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((...))).)))).)).))))))...........((((((.........))))))........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.((((.....((((((.....((((((((.....))))))))....))))))......))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((((.(((...))))))))..<<..))>>..>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((......((...))...)))))..((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(((....)))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((...............)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((...))))).))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[)))..]]]]](((..[[[[[..............))).((((....(((((((........))))))).))))]]]]].((((..[[[[[...))))....((((((....)))))).......]]]]].(((..(((((((((((((..(((((.(((((.......)))))...)))))))))))))..)))))..)))..(((..[[[[)))..]]]]((((........((((((..(((....))))))))).....[[[[[.(((((((((....)))).))))).....)))).....]]]]].((((((.........))))))......((((....[[[[))))...]]]]...((((((((((((....((((...)))).[[[[[[[..)))))))))))).....]]]]]]]......(((((....((((.....[[[[[[.))))....]]]]]]............(((.[[[[..)))...]]]]..(((((((....((((((((.....(((....)))......))))))))............[[[[....)))))))..]]]]((((....))))..(((((((((((((((.......((((.........))))....)))))))...........(((((((((((((......)))))).............)))).)))(((((((((((((((((((.....(((((((.............(((((.....((((((.((((((((.((((..((((((...)))))).))))(((........)))...))))..((((....))))...........)))).)))))).....)))))...(((..................)))..)))))))..(((....))).)))))))))))........(((((.....))))).........((((((...(((....))).)))))).......)))))))).)))))))).((((.[[[[[[[[[.))))..........]]]]]]]]]...((((..((((((........))))))...[[[[[[[[[.))))...(((((((((.....)))))))))............]]]]]]]]]..))))).........(((((((..(((((((((((((...(((((...)))))....)))))))))))))..)))))))...(((.......[[[(((.(((((....))))).))))))...]]]
|
|
CRW_01275
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAUGCGCUUGUCUUGAAGAUUUAGCCAUGCAAGCUAGCGAAGCCUUAUGGUGGAGCGGCGGACAGCUCAGUAAUACAGUUAUUAUUUACUCGUAGUAUGUAUACGGAUAACCAUGGUAAGCUAUGGCUAAUACGUGAACAGGUUAUUGCAUAGAUGAAACAGCGAUAACUGAGAGAGCAAUCGACUACGACUAAGUUUCUGGCCUAUCAGCUAGAUGGUAAGGUAAUGGCUUACCAUGGCUAUAACGGGUAACGGGAAAUCAGUGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAAUAGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUUCCUUAGCGGGAGAGGUAGUGAAGAGACAUGAAGUUCUACUUAGAGACUGUACGGUAAAAUAGUACAGGAUCUACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGCGCAUAUAAUAGUUGCUGCAGUUAAAACGUCCGUAGUUGAUCACAAGGUAUUCUUCUGCAUAGUAUUUGUGGAGUGUAUCUCGAUACUGUGAGAAAAAUAUGGUUCUCAAAGCGGAUUACGUGAGUAAUUUAGCAUGGGACAUGGUGAAUAUAGGAACAGAUGAUGGCAAUAGUAUUCAGCAGUUAGAGGUGAAAAUCGUUGACCUGCUGAGGACUCUCUGAAGCGAAAGCGAUUGUCAAGUAUGUCUCCGUUAAUAAAGGACUUAAGCUGGAGUAUCGAAGAUGAUUAGAUACCGUCGUAGUUCCAGCUGUAAACUAUGCCGACUAGGUGAGGCCGUCAGGCUGCGCCUUAGGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGCUCUGGGGAUAGUAUGGAUGCAAAUCUGAAACUUAAAGAAAUUGACGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGGCAACUUACCAGGGCCGAAUGCAUAGGAGAUCGGCUGUCUGAGAGGGUACCCGAGAUUAUGCAGGAGGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAACACGUGGGGUGGCCUGUCUGGUUAAUUCCGUAAACGCGUGAGGCCUGGGAAGCAAUUCAUUGCUUGACGGAUAGCGGCAAGCUAUAGGAAGACAGGCUAUAACAGGUCAGUGAUGCCCCUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUGGUAUAGUGAGACUAUGUACUGAAAAGUAUGCUUUAAGCUAUAUCGAAUCUGGGAUAAGCUCUUGUAAAUGAGUUUUGAACGAGGAAUUCCUAGUAAUCGCAGGUCAUAAUGCUGCGAUGAAUGCGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUUAGAUGGAUGUAUCGGUGAAAUGGCUGGACGAAAGAAAGGCAGUUGAACCUAUACAAUUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCUGCUAUAGGUGAACCUGUGGCAGGAUCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...<<<.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((((.....((((....(((((((....))))))).....))))....(((((((((............)))))))))....((....)).)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...((((...)))).....((((((.........))))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((.((((......................((((((.............(((.((((..........(((.....)))...)))))))..........))))))...)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((....))))))))))...{{..))}}...}}}....}}}.))).(((......((((....))))....)))...>>>..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((......((((((((((....))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((....))))))..((((((((.....))))))))...))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.........(((((....)))))........)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((...[[[.)))))..(((((.(((.((((...))))..))))))))........]]](((........[[[[))).....]]]](((((((....)))))))(((.[[[[)))....]]]].....((((((((((((((.(((....((((....(((((((((............)))))))))...............))))((((....((((((......))))))))))..))).))))))))))))))......(((....(((((..((((...)))))))))....[[[[[[))).......]]]]]]..(((....)))((((.(((((........((((...((((.....))))..))))(((......)))...(((((...((((..((((((.........))))))..))))....)))))..))))).)))).(((((...((((.((((((((...((((((...........)))))).........((((........((((...(((((.((((.(((((((((...(((.....))).))))))))))))).)))))...(((((....(((((((....)))))))....)))))....)))).....((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((....))).)))).)))))))).)))................)))))))....))).))).........))))...))))))))))))...((((.........)))).........)))))..((((((((....(((((.((((....)))).)))))....((((((....)))))).)))..[[[[.)))))..((((....))))....]]]].............(((....((((.....))))......[[[[[[...(((.(((......)))))))))....]]]]]]..(((((((....((((.((((......)))).))))..)))))))(((..((((.[[[[))))..)))....]]]]..(((((((((((......((((((....))).)))(((....((((((....)))))).....[[[[[)))..]]]]]....))))))))))).....(((.(((.(((.((((((...))))))..)))))).........[[[[[[[[[..)))..((((((....))))))......]]]]]]]]]...((((((.((((((........))))))...[[[[[[[[[))))))..(((((((.........)))))))............]]]]]]]]]...(((((..[[[[.(((((...)))))......))))).........]]]]......(((.[[[[[..)))...]]]]].(((..[[[....))).........((((((((((....)))))))))).]]]....
|
|
CRW_01283
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGGCGUGGAUGCUAGUCUCAUAGGUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGCGAAGCAUUUUGUGGAGCGGCAUAAGGCUCAGUAACGGGCGUCUAUUUGAUCUCCUGAUGUGGACAACCUCUGUAACCGGAGGCCAAUACACAUGAGGCACUGUUUCCGUUUGGUGGGGUGUCAAUAGCUAUUUAAUUUUUAUAGCGCGGGAGAGUAAGGAGCCAUCCCAUCAGUUAGUAAGUAGGGUAAGGGCCUACUUAGACGAAGACGGGUACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUGGCUACCAGGUCCAAGGACAGCAGCAGGCGCGAAAAUUACCGAAGCCUCCGGUGAGGGCGGUAGUAAGGAGACGUGAAUACGAUGUGCAGGUAAAUAAUGCACUAGUAACAGGAGGUCAAGACUGGUGCCAGCAUCCGCGGUAAUACCAGCUCCUGGAGUGUCUAUGAUGAUUGCUGCAGUUAAAGUGUUCGUAGUCGGGCUGCAUGACUGGCGUGAAAGACCUUCCUUUCAAGGGGGUACAGCGCGGGGAAAGCAGAGAAUAAGGAGCGUUUUGGGGUCAGGUUAUUAAGCGACGAGAGGUGAAAUUUAAUGACUCGCUUAGGAGCAACAGAGGCGAAAGCGCUGGCCAGGGGCGAAUCCGAUGAUAAAGGACGUAGGCUAGAGGAUCGAAGACGAUUAGAGACCGUUGUAGUUCUAGCAGUAAACGAUGCCGAUGCCGUGGAGCGAGUUUUAUUCGCUUCGCGGAAGAGAAAUUUAGUAGGGCCCUGGGGAGAGUACACGCGCAAGCGAGAAAUUUAAAGGAAAUUGACGGAAGAACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUCAACUCAACGUGGGACAGCUUACCAGGCCGGACGACCGCACGAGUGUAGUACACGAUAGGUUGAAGAGUGGUGCAUGGCCGUUAACGACAAGUGGGGUGACCUUUGGGUUAAGUCCGGGAAGUAGUGAGACCCCUGCUGUUACGAGUAAUGGUGACAGGACAGGUGCUCAAAGCACAGGAAGGAAGGGUCAAGAACAGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUGGUCUGGGCUGCACGCGCACUACAGUGGUCACAGAAAGAGAUUAUUGAGAGAUAAUGGUGAUCGAGAGGGAAUGAGCUUUGUAAGAGGCUCAGGAACGAGGAAUUGCUAGUAAUCGCGGGCUCAUUAAGACGCGAUGAAUACGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCGAAGAUGGAGUCAGGCGCGAACAAGCGAGAGCGAGUGAGUGCAGGAUUCUAGAUGUGAUACAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUAGGAGAACCAGCAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((...(((...)))...)))))......(((.....((((((((..((...(((((((.((((....(((((((....))))))).....))))......((((........))))........(((((....)).))).........)))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))...........(((((.........)))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((...((((....(((((((......((((((.....))))))....)))))))....)))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((((((((((((...)))))))))))))..<<..))>>..>>>.>>>.))).(((......((((....))))....)))....}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((...))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((.(((((((........)))))))..(((((((.....))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.......................)))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.......))))))((((((((((.........(((...))).(((..[[[[..)))..]]]]..(((.[[[[.)))....]]]].....((((.[[[[[[.......))))..]]]]]]..(((((....(((((((((...........))).((((.((((((((((((((((......(((((.........))))).................))))))))).(((..((((((((.......)))))))))))..))))))).)))).((((....))))..)))))))))))..(((((.....(((...))).(((....))).....)))))......(((((((....[[[[........)))))))..]]]]...(((.(((...(((((.........)))))..))).[[[[[[.)))...((((((((.........)))...)))))]]]]]].))))))))))....(((((((..(((((((((((.((((((..[[[[.))))))((((.....((((.(((....)))))))...)))).......]]]]........))))))))))).(((..[[[[[[[[[.)))...........]]]]]]]]]((((((...[[[.....))))))....]]]..(((((((((..(((.........))))))..((((((((((((....)))))......[[[[....)))))))....]]]].........(((((((((((((...)))))))))))))..................))))))...((((...(((.[[[)))....))))........]]]...........((((...((((.((((...[[[[[[.)))).))))...))))...........]]]]]]..((((((((....))).[[[[......))))).......]]]].(((((.(((((..(((..(((....)))))).))))).(((............[[[[[((((((((((........)))))))..)))(((((...))))).))).....]]]]].......)))))(((..((((...........))))..[[[.)))......]]]((((((.......((((((....))))))(((((.(((..(((..((((((((....))))))))((((((.(((.......(((((((((............))))))...))).))).))))))............))).)))))))).....(((((((..((((....................))))..)))))))..))))))..........(((.[[[...)))......]]].)))))))........
|
|
CRW_01300
|
[ FASTA input ]
|
CACCUGGUUGAUCCUGCCAGUGGUAUAUGCUUGUCUCAAGGACUAAGCCAUGCAAGUCUAAGUAUAAGUGAUUCUGAUGACGAAACUGCGAAUGGCUCGGUAAAACAGCUAUAAUUUCUUCGAUGGUAACUUACUAUUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCCACAAAUGCGGGGUUUCGGCUCCGUGGUGCCAAUUAGAUAACAACACCAACAUUUGGUGAUUCAUAAUUUUCUUUCUGAUCGCUGCAUGCAUUGCGGCGACGCAUCGUUCAAAUUUCUGACCUAUCAACUUUCGAUGGUAAGGUAGUGUCUUACCAUGGUGGUGACGGGUAACGGACCGUGGGUGCGGGACUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCGGACUCCGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAUCAAUAGGGGACCCGAUGGGUGCCCUAAUUGGAAUGAGAACAAGGUAAACAGCUUAUCGAGGAUCCAGCAGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCUGUAAGCGUAUACCAAAGUUGUUGCAGUUAAAACGCUCGUAGUCGGAAGUUGGUGGUCUUGCGGGUGCGCGCGUUGAGCGUACGCCUGUCGAGGCUGCUUUUGUGGAUUGCGCGCACGGGCGGCUUUAGUGUCGAACGUGUUGGGUUUCGCUGCUUUGGCGUUCACGCGGCAGAGCGGCGGAGGCGCAGCCACCGUUUACUGUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUUUGCCGUGAAUACAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACUCGGUUUUCCUAUUUUGUUGGUGUUGUGAGGGGCGAGUAAUGAUUAAGAGGGACAGUUGGGGGCACUUGUAUUCCGGCGCUAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUGCCGGAAGACAAACCGCUGCGAAAGCGUCUGCCAAGGAUGUUUUCAUUGAUCAAGAACGAAAGUAAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUUACUAUAAACGAUGAGGACUGGGGAUCGGGCGUGGAAUUGCGAUGACCCGCCCGGCACCCUCCGGGAAACCAAAGUUUUUGCUUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCAUCACCGGGUGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCAGGACAUAGUGAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGUUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAGCGAGACCUGGGCGUGCUAAAUAGGGGCUAUUACCGCUUUUUUUGGUAGUGAGAGCUUUUUUGACCCCUUCUUAGACGGACUGCGGGCGUCUAGUCCGCGGAAGCUCCAGGCAAUAACAGGUCUGAGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGUGCUACACUGAGCGGAUCAGCGGGCGAGGAUGCGCGAAAGCGUUUCCUAAUCCCCAAAUCCGCUCGUGCUGGGGAUAGAGGGUUGCAAUUCUCCCUCUUGAACGAGGAAUACCUUGUAAGCGUGGGUCAUCAUCCCGCGCUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGGUCCGGUGAGGCCUUGGGAUUGUCGUGAGGGGAGCGUUUGCGCUCGUUUCGUGAAGAAAACUUGGUCGAACCUUAUCACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAAGCU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((.....................)))))......(((......((((..((..((....((((............((((....(((((((.....))))))).....)))).......((((((((....))))))))....((((((........((((((...)))))).....)))))).........((((((((.....))))))))...))))...))))..))))(((..(.(((....((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))....(((((((((((((...)))))))))).)))......(((.(((.......)))).)).........(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).))))))))))..........(((((...<.((((...(((.......(((((((((((((((((((((.....))))))))))).))))))))))...((((.((((((...((.((.(((...(((...(((((..((((.........))))))))))))..)))...))..))...))))))))))...............................................................................................................................(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).))))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<..(((.(((((((.((.((......)))))))))))..)))...<<..))>>...>>>....>>>>))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((....(((((........((((((........))))))......)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((.((((..(((((.((((((((.......)))))))).............)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((.....(((...((((((((....))))))))....)))....)))))))......(...((((((((........))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))..(.((.((...((((((((..(.((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))....))..))..).((((((((((....)))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))(((((((((((((((....(((((.....[[[[.)))))..]]]].............)))...((((((..[[[[[[(((......)))........((((((((((...))))).)))))....)))))).......]]]]]]...((((((..(((.[[[[[[)))...]]]]]](((((..............((((((...)))))).................[[[((((((((.....)))))))).)))))..]]]....(((((((..((((((....(((((((((.....))))))))))))..)))..)))..))))...((((((((((.((((......)))))))).......[[[....)))))).....]]]....))))))...((((((...(((((...))))).))))))...........(((.(((((.((((...)))).))))).[[[[[.)))......(((((.....))))).....]]]]].....(((....[[[[[[[[....)))..]]]]...]]]]......))))))))))))......(((((((..(((((.(((....))).....((((((((((((((((..(((.....)))..)))))).))))))))))...((((.(((((((((((..((((......))))..)))))....(((((((((((((.(((....))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))..........(((((((..((((....))))..)))))))..((((((.....((((((((((((........)))))))))))).))))))....(((((...........((((((.........(((((.....((((((((.....[[[.............)))))))).....]]](((..((((((((((.....)))))))))).[[[[[[.........))).....]]]]]].((((...[[[[..))))...]]]]...(((..........[[[..[[[..[[[[[[[))).............]]]]]]]..]]]]]].........(((((((...[[[[[...........((((....)))))))))))..]]]]]..(((((....((((((((((.(((((((.......(((((((((.(((.....)))....(((((..............)))))......))))))))).............))))))).))))))))))....)))))....(((..((((((((((.[[[[)))).))))))..))).....]]]]....((((((.....(((((.((((((((.......)))))))).[[[[[[......)))))...........((((((((.....))))))))]]]]]].............((((((...[[[[)))))).....]]]].))))))))))).(((.((((((((....(((..((((.((((....)))).))))...)))...)))))))))))..((((((((((((..........))))))...((((((....)))))).((((((((.......))))))))......)))))).))))))........)))))....(((((.....(((((((((..(((..((((..(((....((((((((.(((((....))))).))))))))......)))))))..)))..)))))))))....)))))...............(((.(((((....))))).)))..........
|
|
CRW_01314
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUGGAUGCUAGUCUCAUAGAUUUAGCCAUGCAUGUGUAAGCGAAGCGAUUAGUGAAGCGGCGGAAGGCUCAGUAACGGGCGAGUAUUUUAAUCUCUAGAACCGGACAACCUCAGGAAACAGAGGGGAAAACGGAGUAAGAGCAUGUGUUGUUAGCAUGUGAUGAGAACAACAGUGCAGGAGAGUAAGAAGCCAUCCCAUCAGUUAGUAAGUAGGGUAAGGGCCUAUUUAGACGUAGACGGGUACGGGGGAUUAGGGUUUGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAGACGGCUACCAGGUCCAAGGACAGCAGCAGGCGCGAAAAUUACCGAAGCCUCCAAGAGGGCGGUAGUGAAGAGACGUGAAAACAAGUGUGUGUAAAAACCACAUGAGUAACUGUGGAGGGUCAAGGCUGGUGCCAGCAUCCGCGGUAAUACCAGCUCCAGGAGUGUCUAUGAUGAUUGCUGCGAUUAAAAGGUCCGUAGUCGAAGAACAGUACUUGUUUGUAAUGUGGCUUAUCGAGAGCCGAAUAGAACGAGAAGAGUUCAGAGUAAGGAGGGAAGGAGGGCUAGAUUAUUGAGCAGCGAGAGGUGAAAUUUGAUGACCUGCUUUAGGAGUAACAGAGGCGAAAGCGCUAGUCAAGAACGAAUCCGAUGAUCAAGGACGUAGGCUGGAGGAUCGAAGACGAUUAGAGAGACCGUAGUAGUUCCAGCAGUAAACGAUGCCUACGCUGUUGUGGUUAUGAGCACGGCAGAAGAGAAAUCUAGUAGGGCUUUGGGGAGAGUACGCGCGCAAGCGAUAAAUUUAAAGGAAAUUGACGGAAGAACACCACAAGGAGUGGAGUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGGGACAGCUUACCAUACCCGAUGGCCGUGUGAGCGUAGUACGCGAUAGGUCAGAGAGUGGUGCAUGGCCGUUAACGACGAGUGGGGUGACCUUUGGGUUAAGUCCGCCGAAGUAGUGAGAUCCCUAGGAUACGAAAGUUAUCGACAGGUGUUAAAAACACAGGAAGGAAGGGGCAAGAACAGGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUGGUAUGGGCUGCACGCGCACUACAGUGGUCACAGCAGAAACGGAUAGAAGUAAAUGUGAUCGAGAGGGAAUGAGCACUGUAAUGUGCACAGGAACGAGGAAUUGCUAGUAAUCGUUAUCUCAUUAAGAAGCGAUGAAUGUGUCCCUGUUCUUUGUACACACCGCCCGUCGUUAUCGAAGAUGGAACCAGGUGCGAACAAGUGAAAGCGAGUGAGUGCAGGGUUCGAGAUCUGAUACAAGUCGUAACAAGGCAGCUGUAGGAGAACCAUUAGCAGGAAGCUUG |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((...(((...((.....))...)))))......(((.....((((((((..((....(((((((.((((....(((((((....))))))).....)))).(((((((....))))))).(((.(((((....)))))))))))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)).))))))..........(((((.........)))))......((..((((........((((.....((....)).......)))))))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((...(((.....(((((((......((((((.....))))))....))))))).....))).......(((((((((..(((((((((..((((((((...(((.......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((...........))))...))))))))..........{{{{{{.((((((((((....))))))))))..{{..))}}..}}}.}}}.))).(((......((((....))))....)))...].]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((...))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))...)))))).....((((..((((.......))))..((((((((...)))))))).....))))....))))..)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...(((((((((..............))...)))))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((........))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((..........((((((((...))).)))))..(((...[[[..)))..]]]...........)))))))............(((.....(((((.(((((....(((.....((((........))))......))).......((((.(((((((..(((...)))..))))))))))).))))).))))).)))(((((....(((..((((((((.......))))))))..[[[[)))...]]]].)))))...(((....((((.....))))[[[[[..........)))..(((....))).....]]]]]......(((((((...((((...)))).)))))))..............(((.[[[[[)))......]]]]].....((((((((.[[[....((((....)))).))))))))...]]].(((((.((((((((......))).(((((........(((((.........((((....(((((((......((((((.....))))))....)))))))....))))..................)))))..........)))))..(((......)))........))))).)))))......((((....)))).(((....[[[..[[[)))......]]]]]]..((((((((((((....)))))........[[[.....))))))).....]]]...(((((.((((((((........)))))))).(((....))).)))))(((((((...((((...(((....)))....))))........(((((((.......((((.....)))).((((((.((((..(((((((...((((.....(((((((((.....))).....))))))......))))...))))))))))).))))))..))))))).......((((.(((((....)))))..)))))))))))........((((..((((.......)))).....(((((...)))))........))))..((((((((((...(((..((((...........))))..)))(((((.(((((((.(((..(((..................))).............))).))))))).))))).....(((((...[[[[[[.....))))).(((.....)))]]]]]]........)))))))))).........(((.((((.........))))[[[[[..[[[[............))).....]]]]..]]]]].........(((..[[[)))....]]].((((............))))..........
|
|
CRW_01343
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGUUAUAUGUACUAGUGUCGAAGAUUUAGCCAUGCAUGCUUUACGAAUUCACAAGAAGAAGUGGCGGACAGCUCAGUAAUACAGUUAUAAUAUACUCUCUACUAAAGGAUAACCGCGGUAAGCUGCGGGUAAAACUUCAAGCUAUGUGUUUCAUGAAAGAAUUUAUAGUUCAGAGUGUUAGUUUCUGGCCUAUUAGUUAGUAGGUAAUGUAAGGGAUUACCUAGACUAUUAUGGGUAACGGGAGAUGAAUGUCUGAUACCGGAGAGGAAGCCUUAGAAACCGCUUUCACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUCGUUUUUUAAGACGGAGGUAGUUAUGACACAUGUGAAUUAUUCACGAGGAAGAUCAAUAAAUCAGAUUUUUUUUACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGUGCAUAUACAUGCUGUAGUUAGAAAGUUUGUAGCCGUAUAAGCUUGAAUCAGAGGAAAGGAGGACUCUUAAGGUAAACUUUAACUCUGGUCAAUGCUUAUAUUCGAAGCGGAUGGAGGCACUUGUAUUCAAUAGCGAGAGGUAAAAUUUGAUGACCUAUUGAGGACAAUCAGUAGCGAAAGCGAGUGUCUAGUACGCGUUUGAGGGUCAAGAACGUUAGCCGGAGGAUCGAAGAUGAUUAGAUACCGUUGUAGUUCCGGCCGUAAACCAUGCCUACUUGCCUUGUACAUAGUAUGAAGCAUAGAGAAAUUAAGAGUUUUUGGGCUCUAGGGAUAGUAAUCCGGCAACGGACAAACUUAAAGAAAUUGGCGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUCAACUUGACUCAACACGGGAAAUCUUACCAGGGUCUGUAUAUGUGAGACUGUCCCAUUUAUGGUGGUACACGAUAAUAUACUGAGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAACACGUGGGGUGACCUGUCAGGUUUAUUCCGGUAACGUGUGAGGUCACAGUAUUAAUAAGUAUUUUAAUAGACAGCUAAUGGUAAAUUAGAGGAAGUGUGACGAUAACAGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUACCCUGGGCUGCACGCGCAAUACAUUGAGUAAGUCAUUUACAAUAGUAAUUUUGAAACUUACUCGCUACUGGGAUCAUCCUUUGUAAUUGGGAUGUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAUCGUAGCUCACUAAGUUACGAUGAAUGUGUCCCUGUUCUUUGCACACACCGCCCGUCGCUAUCUAAGAUGGAUGUUGAUAUGAAAUUGCUGCUUGAAUGUGAGGUACUUGAGUAUUAACAACUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCUGCUAUAGAAGAAUCUGUGGCAAGAUCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((..(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((...((((....(((((((....))))))).....))))...((((((((((.......))))))))))...)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).......(((...((((((....)))))).)))..)).))))))..(((((...))))).(((((((((.........)))))))))..(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).)))))))))).......(((((.....((((...(((.(((((((....((((((....(((...(((.....)))...)))....))))))....)))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((((((((...))))))))))..<<..))>>....>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((((((((...))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))...))))))....((((..((((((.((...))))))))..((((((((.....))))))))....))))...)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((((((((.((((....))))...)))..)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......)))))............((((.((((((...((((((((((((.......(((....))).....))).....((((((((((((((.(((...)))((((((......(((((.((((((....)))))).....((((..(((((((...(((......)))..)))))))..)))).....(((((((((((((((((..((((((((.......)))))))))))))..))))))..)))))).....)))))......))))))...(((((.....(((((((...(((....)))(((.((((((....((((.(((...((((((....)))))).)))))))...(((((((((.......(((((((((((((.........)))))))))).......(((....(((....)))..))).....................)))....)))))).))).........)))))).)))((((((((((((.((((((..((((...(((.....)))...))))..)))))))))).))))))))..)))))))...)))))..))))))......((((((((((........(((((((((((......))))).....(((((..(((.....))))))))..))))))...(((...((((((((((((....)))))...(((....))).))))))))))......))))).))))).((((((...))))))...............((((((....)))))).((((((((..((((....))))....((((.(((..((((...((((...((((.....)))).(((((....(((...))).....)))))....)))).))))..))).......))))))))))))..((((.(((...))).))))..)))))))).))))))))).)))))).))))((((.(((((((.....[[[[[[[.............)))))))((((((....))))))..]]]]]]]..(((((.....))))).....(((((.....((((((...(((..((((...........))))..))).....(((((((((((((((...((((....)))).......))))))))..((((((((.((((((........))))))............))))))))(((((((((.....))))))))).))))))).)))))).....))))).))))(((((..[[[[[[.))))).(((((((((.....((((............)))).....)))))))))..]]]]]].(((....)))..........(((((((((....))))))))).........
|
|
CRW_01344
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAGAUGCUAGUCUCUAAGAUUAAGCCAUGCAUGUUUCCUCAAUCAGGGACGAAUAGCUCAGUAAAACUGCGAUGAUUUAGUCUGGCUGUGUAGAUAACACGUGAAAAUGUAGCUAAGGGAAGGCAGAAUAAGACGCAGGACUAUCAGUUAGUUGGUAGUGUAAUGGACUACCAAGACAGUGACGGUUGACGGGAAAUUAGGGUUUUGUACCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUUGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAAAUUGCCCACUCUUUGCAGGAGGCAGUUAUGAGACGUGAAGAUGAGUAUCUUGUAAAGAGGGAUAGGAGAAUUGGAGGGCAAGUUUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCGACUCCAAGAGUGUGUAUGAGAGAUGCUGCAGUUAAAAAGUCCGUAGUCAUAGAAGGGCAAAGAGAGAUGCGAGGUCUCACAGUGCGAUGAUGGAGGAGCCGAUGGGGAACAUAGUAUACCAGGGCGAGAGAUGAAAUGCCAAGACCCCUGGUGGACUGAGCGAGGCGAAGGCGAUGUUCUUGUAGGCAUUCGGUGAUCAAGGACGAAGGCUGGAGUAUCGAAAGUCAUUAGAUACCGCAGUAGUUCCAGCAGUAAAAGAUGCCGACAUGCUCAUUGGACACAGUGGGCAGGGAGAAAUCUUAGAGUUCGGGCUCUGGGGAUAGUAUGCUCGCAAGGGUGAAAAUUAAAGAAAUUGACGGAGCUACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGAGGAAACUUACCAGGGCCAAGUACUUGUGUAGAAACGAGCAAUACAGGAGUGGUGCAUGGUCGUUGGAAAUUGAUGGGAUGACUUUGACCUUAAAUGGUUGAAUGAGUGAGAUCUUUUGGACAUGUUCCGCACGGAACAGGAAGGAAAAGGCUAUAACAGAUCCGAGAUGCCCUCAGAUGCCCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUAGCAGGUAGAGAGAGAGACAGGAAGGUGCUCAGAUGGACUAUGUGCUGUAAGGCACAUACGAAAGAGGAAUUCCUAGUAAGUGUGUAUCAACAAUGGAUAUUGAAUAAGUCCCUGUAGCUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUCAGAUGUUUUUCAGGAUGAAGAGUCCAGGCUCUGAAUAAUGAAAAGUAGAUAAGAUGUAAGUCGUAACAAGGUUGCGGUUGGUGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...{{{.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((.(((.......)))))......(((......((((((((..((...(((((((...((....((((((....)))).)).....)))))))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((....))).)))).)).))))))...........(((((.........)))))......(((((((((....[[[[.....[[.)))]].......]]]])))))).))))))))))..........(((((.....((((...(((..............((((((.....))))))...............(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.(((((((((....)))))))))..<<..))>>...>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...}}}..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((.(((............))))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))..)))))).....((((....((((((((....)))))))).....))))....)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((.......((.....))......))))....(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((......[[[[[)))..]]]]].....((((((.((((((((((........(((((.....))))).................(((((...((((.((((((((...........((((....))))))))......)))).))))....)))))(((..((((((..((((((((.......)))))))))))..)))..))).........(((((((.....))).....[[[[[[))))......]]]]]]..(((....)))(((....(((((..(((((((((.((((((((((((.....(((((...))))).........)))))))))))).(((......)))...)))).))))).)))))....))).(((..[[[)))((((...))))...]]].......(((((.........[[[[))))).......]]]]...((((...[[[...))))....]]].....(((....[[[....[[[[[[[[[[[.[[[[[[[[..............)))....]]]]]]]].]]]................]]]]]]]]...]]].((((...........))))((((...[[[[[...))))....]]]]]....((((((((.(((........))).....(((((((((....)))))))))....(((.[[[[[[[[)))...]]]]]]]].((((.(((((.[[[)))))...))))......]]]..)))))))).((((.....)))).......))))))))))..(((.....(((....))).[[[[[[[[[...[[[[.[[[[.....)))...]]]].]]]]......]]]]].]]]].........((((...(((((((......))))))).........((((((.....((((((....)))))).))))))...[[[........)))).....]]](((((.[[[[))))).(((....)))...........]]]].....))))))(((((........[[[[[..((((((((....))))))))...........))))).....((((((((..(((..((((.........)))).))).....))))))))...]]]]]...((((....(((((((((......(((((....)))))......)))))))))....)))).......(((((...)))))(((..[[[[)))..........]]]]..
|
|
CRW_01456
|
[ FASTA input ]
|
UUCAAACGAGGAAAGGCUUACGGUGGAUACCUAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGUAUUAAUCGACGAAAUGCUUCGGGGAGUUGAAAAUAAGCAGAGAUCCGGAGAUUCCCGAAUAGGUCAACCUUUCGAACUUCUGCUGAAUCCAUGGGCAGGCAAGAGACAACCUGGCGAACUGAAACAUCUUAGUAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGAUUCCCGUAGUAGCGGCGAGCGAAAUGGGAGCAGCCUAAACCGUGAAAACGGGGUUGUGGGAGAGCAAUACAAGCGUCGUGCUGCUAGGCGAAUCAGUGGAGUGCGGAACCCUAGAUGGUGAAAGUCCAGUAGCCGAAAGCAUCACUAGCUUAUGCUCUGACCCGAGUAGCAUGGGGCACGUGGAAUCCCGUGUGAAUCAGCAAGGACCACCUUGCAAGGCUAAAUACUCCUGGGUGACCGAUAGCGAAGUAGUACCGUGAGGGAAGGGUGAAAAGAACCCCCAUCGGGGAGUGAAAUAGAACAUGAAACCGUAAGCUCUCAAGCAGUGGGAGGGGGACCAGACCCUGACCGCGUGCCUGUUGAAGAAUGAGCCGGCGACUCAUAGGCAGUGGCUUGGUUAAGGGAACCCACCGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUUCAUAGGGCAAUUGUCACUGCUUAUGGACCCGAACCUGGGUGAUCUAUCCAUGACCAGGAUGAAGCUUGGGUGAAACUAAGUGGAGGUCCGAACCGACUGAUGUUGAAGAAUCAGCGGAUGAGUUGUGGUUAGGGGUGAAAUGCCACUCGAACCCAGAGCUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGCGUUGAGGCGCAGCAGUUGACUGGACAUCUAGGGGUAAAGCACUGUUUCGGUGCGGGCCGCGAGAGCGGUACCAAAUCGAGGCAAACUCUGAAUACUAGAUAUGACCUCCAAAUAACAGGGGUCAAGGUCGGCCAGUGAGACGAUGGGGGAUAAGCUUCAUCGUCGAGAGGGAAACAGCCCGGAUCACCAGCUAAGGCCCCUAAAUGACCGCUCAGUGAUAAAGGAGGUAGGGGUGCAGAGACAGCCAGGAGGUUUGCCUAGAAGCAGCCACCCUUGAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGAUCGAGCGCUCUUGCGCCGAAGAUGAACGGGGCUAAGCGGUCUGCCGAAGCUGUGGGAUGUAAAAAAACAUCGGUAGGGGAGCGUUCCGUGUUAGGGAGAAACGCGUGCGUGAGCCGCGUUGGACGAAGCGGAAGCGAGAAUGUCGGCUUGAGUAACGCAAACAUUGGUGAGAAUCCAAUGCCCCGAAAACCUAAGGGUUCCUCCGCAAGGUUCGUCCACGGAGGGUGAGUCAGGGCCUAAGAUCAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGACAACAGGUGAAUAUUCCUGUACUACCCCUUGUUGGUCCCGAGGGACGGAGGAGGCUAGGUUAGCCGAAAGAUGGUUAUCGGUUCAAGGACGCAAGGUGACCCUGUUUUUCAGGGUAAGAAGGGGUAGAGAAAAUGCCUCGAGCCAAUGUUCGAGUACCAGGCGCUACGGCGCUGAAGUAACCGAUGCCAUACUCCCAGGAAAAGCUCGAACGACCUUCAACAAAAGGGUACCUGUACCCGAAACCGACACAGGUAGGUAGGUAGAGAAUACCUAGGGGCGCGAGACAACUCUCUCUAAGGAACUCGGCAAAAUAGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCCCCCUCACAAAGGGGGUCGAAGUGACCAGGCCCGGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCCGCAAAGUCGUAAGACCAUGUAUGGGGGCUGACGCCUGCCCAGUGCCGGAAGGUCAAGGAAGUUGGUGACCUGAUGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCACUGUCUCGGAGAGAGGCUCGGUGAAAUAGACAUGUCUGUGAAGAUGCGGACUACCUGCACCUGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUUACUGUUCCCUGGGAUUGGCUUUGGGCUUUUCCUGCGCAGCUUAGGUGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCUUCCGGGGGGGCCCGAGCCAUCAGUGAGAUACCACUCUGGAAGAGCUAGAAUUCUAACCUUGUGUCAGGACCUACGGGCCAAGGGACAUUCUCAGGUAGACAGUUUCUAUGGGGCGUAGGCCUCCCAAAAGGUAACGGAGGCGUGCAAAGGUUUCCUCGGGCCGGACGGAGAUUGGCCCUCGAGUGCAAAGGCAGAAGGGAGCUUGACUGCAAGACCCACCCGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGCCUUAGUGAUCCGACGGUGCCGAGUGGAAGGGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUGAUCUUCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGAAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCUUCGCCACCUGGGGCUGUAGUAUGUUCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCAUAUCCGGUGUGGGCGUUAGAGCAUUGAGAGGACCUUUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAAGGACGCACCUCUGGUGUACCAGUUAUCGUGCCCACGGUAAACGCUGGGUAGCCAAGUGCGGAGCGGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGUAGUAAGCCCACCCCAAGAUGAGUGCUCUCCUAGAAGGUCACGGCGAGACGAGCCGUUUAUCAUUACGAUAGGUGUCAAGUGGAAGUGCAGUGAUGUAUGCAGCUGAGGCAUCCUAACAGACCCACAGACUUGAAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((.....(((((((.<<.<<<<)))...>.(((((((..(((>>>.>>.))).....)))))))...))))...(((....)))......((((((((.........))))).).)).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((....((((....))))......((((((((.....(((((..((((((((.(((...((((.......))))(((...).ggg.....))GGG...)))...))))))))).))))..))))..)))).....(((((((((.......)))))))))......(((((..[[[[)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.((((((((((.......))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((..((.......))..))))...((....)).(((((.....)))))...)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...(((((((....)))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((....(((...((((((((...((.((((....))))..))...))))))))..)).)....)))))))....................)))...))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....a.aaaaaa...........(((.((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))).)..)))))))))))))...........)).....AAAAAAA)))...)))))))(((((......)))))....))))))(.((((((.((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((eeee.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))((((((((((((((.((((((...((((..(((..(((((((((((........))))))((..((((....(((..(((((.....)))))......(((((((.....)))))))..)))...))))...))...(((((....)))))....)))))...)))...))))........))))))...)))...)))))).)))))EEEE..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((...((....))....)))))(((((((.....)))))))(...).......(((((((((..((f....(....F))..(((((((((..((((....))))..)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((.(((((((..((((....))))...))))))).))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).))))))....)))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((((((((((((((((.((...(..ddddd..(((......((((((((....))))))))...))).......)).).DDDDD))))))))))))))))))...(((((.((((.(.....)))))))))).....)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((hh....hhhhhh((.((((((.......))))))...))hh)(.(((HH....HHHHHH....((((((((i...(..I)))))))).(((....))).HH))).).....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).)...).(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...bbbbbbbb..((((..(((((((...............)))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))).(.((....(((((...........)))))....))).))))..)...BBBBBBBB....(..(((((((((.......)))))............(((((((((((..(..(((((....))))))...))).))))).)))...)))).)...))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...............(((((...[[[.....)))))..]]]...(((.[[[[[[.))).....(((..(((...(((((((...(((........)))...))))))).))).))).........]]]]]].....((((((...[[[...))))))...........(((((..(((((......))))).))))).]]].................(((((((......[[[.......)))))))..]]]....((((....)))).(((((......)))))..........((((.(((((((((((..((((((((....(((((((((.......((((((.............(((((((...((((((...(((((.((((....(((.(((..((((((((......((((((....))))))....(((..(((((((.((((.......(((.........))).......((((.......)))).)))).)))))))...))).))))...........((((((.....)))))).)))))))..((((((((((..(((.(((........))).)))((((((((((((((((((((((...........))))).(((.....(((........)))....)))....))))))))))...........((((((((.......)))..))))).....((((((......))))))...........(((.(((((........))))))))))))))))))))))))))))..)))).)))))....)))))).)))))))......(((..(((((....)))))....)))))))))))))))))).....)))))((((((((....(((((....))))).....))))))))...(((((..((((.......((((((..........((((((((..((((.((((((((((((((......))))))))))....(((......)))...)))).......)))))))...))))).............))))))...)))))))))....)))...))))))))))).))))............((((((........(((((((((((.((((....)))))))..........((((......((((((.((((((((...............(((((.((((.(((((..........(((.((((((.........)))))).((((...............))))..)))....)))))...((((((.......))))))))))...((((((....(((((((((((((((((....)))).....(((((((((((........(((....)))...(((....)))...)))).......)))).)))...))))))..((((....)))))))))))..)))))).)))))...(((((.(((((((...(((((...(((.((((((.....)))))).....((((((.......))))))..)))..)))))........(((((....))))).....)))))))))))).....(((((((((((((((..((((.........(((((....)))))...(((......)))....))))........((((((((..((((....((((((((.......(((((......(((((.....(((....))))))))..(((((.....))))))))))......((((((((((....(((((.....)))))..((((((((((..(((....)))..)))..))))))).((((((.....((((.((((..........((((((..((((....))))...)))))).......((((((.....))).((((((.......))))))....))).......))))..((((((.....))))))..))))...)))))).....))))))).)))....)))))))).))))(((((((((.....(((((.....(((((.....))))).....)))))......)))).....)))))...))))))))......))))))))))))))))))))))).))))))..........((((((((....))))))))..)))).))))))))....))))))........(((....))).(((.[[[[[))).(((........)))]]]]].(((..(((((.....))))).))).(((.((((((...........)))))).))).......(((..[[[[[)))........]]]]]((((((...[[[[[........))))))((((..(((......)))..)))).(((....))).]]]]]..(((..(((((((...[[[[[[....))))))).)))...........]]]]]]..((((.....[[[......)))).(((((((.(((((((......(((.....)))))))))).))))))).]]](((((((((........)))))).....(((((.....)))))....[[[)))......]]]..((((.(((((((....))).)))).((((((((...))))))))....))))......(((.[[[[[[))).....]]]]]].......(((.[[[[))).((((...(((((((((((....))))))...)))))...))))..]]]].........((((((.....[[[[[.))))))............]]]]]....(((........[[[.[[[[[)))....]]]]]..]]].......((((((((.(((....(((((....)))))...)))..)))).))))....................
|
|
CRW_01482
|
[ FASTA input ]
|
ACGGUGCCCGACCCGGCCAUAGUGGCCGGGCAACACCCGGUCUCGUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCACGUCAGAACGGCCGUGAGGUCCGAGAGGCCUCGCAGCCGUUCUGAGCUGGGAUCGGGCACC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((..((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((((((....((((((((..(((..((((..(((...)))..))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.........)))))).)))))))))))))))).)))))))))
|
|
CRW_01484
|
[ FASTA input ]
|
AUUAGGGCGGCCAGAGCGGUGAGGUUCCACCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCUCGCCUGCGUUCUGGUCAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAAUCCAGUUCGCCGCCCCU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))..
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((......((((.[[[..))))...]]]....(((....))).......(((((........[[[[......[[[[[[)))))....]]]]]].....]]]]...)))))))..
|
|
CRW_01485
|
[ FASTA input ]
|
UUAAGGCGGCCACAGCGGCGGGGCGACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGCAGAUAAGCCCGCCAGCGUUCCAGCGAGUACUGGAGUGUGCGAACCUCUGGGAAAACUGGUUCGCCGCCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((....((((..[[[[.....))))....((((((....)))..)))..]]]].(((.(((....))).[[[[)))...]]]](((((............))))))))))))...
|
|
CRW_01487
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGCGGCCAUAGCGGUGGGGCGACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCCACCAGCGUACCGGGAAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAGCGGGGUUCGCCGCCUGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))).)))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((..(((.....[[[[.)))..]]]]........(((((....)))))......(((......[[[[.)))..]]]].(((..[[[[..))).(((.....))).]]]].....))))).
|
|
CRW_01489
|
[ FASTA input ]
|
UUAAGGCGGCCAUAGCGGUGGGGUUACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCCGGUCAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCUACU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......((((((.......((((....[[[......))))..]]]...)))))).((((((((((....))))))))))..(((((...(((...)))))))))))))))...
|
|
CRW_01491
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUUGGCGCCAUAGCGGCAGUGUAACUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUACUGUACUGAAGUGUGCGAGCCUUCGGGAACUCUGGAUCGCUGCCAUACUCACC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)).)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((.....))).[[[[))))))..............]]]].((((......))))....((((((((((.......)))).[[[[......))))))......]]]].............
|
|
CRW_01492
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGGCGACCAUAGCGGGGGGGCCACACCUGAACCCGUUCCGAUCUCAGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUUGGAGGUGGUACUGCAACGUUAGUUGCGGGAAGCCUCCAACGUCGCCGGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((((....)))))))))..))))))).))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((((....((((((((((.....((((.............)))).......))))))))))(((((((((....(((((((....)))))))...)))))))))))))))))))).
|
|
CRW_01493
|
[ FASTA input ]
|
AGGUUGGCGGCCAUAGCGGAGGGGCCAUACCUGGUCUCGUUUCGAUCCCAGAAGUGAAGUCCUCCUGCGUUUUGUUGUUGUACUGUGGACGAGAGUCUAUGGGAAGCUCAUAACGCUGCCGGCCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((....))))))))))..))))))).))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....((((..(((((((..((((..(((...)))..))))..)))..))))..))))(((.....(((...((((((((....))))))))..)))....)))))))))))))).
|
|
CRW_01494
|
[ FASTA input ]
|
UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))).
|
|
CRW_01496
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCAUGGCGGUCAUGGCGCAGGGGUUAUACCUGAUCUCGUUUCGAUCUCAGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUUGUGGGUGUGUACUGCGGUUUUUUGCUGUGGGAAGCCCACUUCACUGCCAGCCACU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((...))))))))))..))))))).)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((.(((((((......((((((.(((...((((..(((...)))..))))....))).))))))......((((((.....(((((((.....)))))))...))))))...))))))))))...
|
|
CRW_01497
|
[ FASTA input ]
|
UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((......))))....(((((.......(((((.........[[[[)))))........)))))((((.((((((.....(((((....)))))....)))))).))))...]]]]..
|
|
CRW_01498
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUUGGCGGCCAUAGCGGCGGGGCAAUUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCUAUACUGUACUAAAGUAUGAGAGUCUUUGGGAAAUAUGGAACGCUGCCAUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((((((......((((((.......((((.............))))........))))))...((((((((.....((((((.........))))))....))))))))))))))).))))
|
|
CRW_01499
|
[ FASTA input ]
|
GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((..(....)))))))))..))))))).))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((.(((....(((((((...(((((((.............))))..)))..)))))))...((((((....(((((......)))))......))))))..)))....))))).)))...
|
|
CRW_01500
|
[ FASTA input ]
|
UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU |
|
[ reference structure ]
|
....((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))......
|
| [ predicted structure ] |
....((((((...(((((((((.......((((.............))))........)))))).))).((((((.....((((((.........))))))....))))))..))))))......
|
|
CRW_01501
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUAACCCGGCCAUAGGCGCCGGUGAUACGCCCGGUCUCAUCAGAACCCGGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCGCUCGGGAGUACUGGGCUCCGCGAGGGCCCGGGAAACCGGCGUGCUGGGAGGGGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((..((((((....(((((((((....(((((((............))))..)))...))))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((..((((((....(((((((((.......(((((((....)))..))))........)))))))))((((.(((.....((((((.........))))))....))))))))))))).))))))..
|
|
CRW_01502
|
[ FASTA input ]
|
UGGCCCGACCCGGCCAUAGCGGCCGGGCAACACCCGGACUCAUGUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCGCGUUGGGGGAUGCUGUGGGGUCCGCGAGGCCCCGCAGCGCCCCCAAGCCGGGAUCGGGCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((....((((((((..(((..((((.............))))..)))...)))))))).(((((((.((((((((((.........))))))))))))))))))))))).))))))).
|
|
CRW_01504
|
[ FASTA input ]
|
GCCCACCCGGUCAGAGUGAGCGGGCAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGCUCACGUUAGUGGGGCCGUGGAUACCGUGAGGAUCCGCAGCCCCACUAAGCUGGGAUGGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((..((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).)))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....((((((((..(((..((((.............))))..)))...)))))))).((((((((((.((((((.........)))))).)))))))))))))))).)))))...
|
|
CRW_01507
|
[ FASTA input ]
|
GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
.......(((...[[[[[[[[..........................))).......]]]]]]]]((((((((((...((((((.........))))))..))))))))))............
|
|
CRW_01508
|
[ FASTA input ]
|
GGUACGGCGGUCAUAGCGGCGGGGUCACACCCGGUCUCGUUUCGACCCCGGAAGUUAAGCCCGCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGGGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACU |
|
[ reference structure ]
|
(((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((((......((((((.......((((..(((...)))..))))........)))))).....((((((((...((((((.........))))))..))))))))..))))))))))...
|
|
CRW_01521
|
[ FASTA input ]
|
UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((....))))..)))))))...))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((....(((..(((....)))[[[[........)))..]]]]......(((.[[[[[..)))...............]]]]]..........))))))))))))))
|
|
CRW_01532
|
[ FASTA input ]
|
GUCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGCACCGCUUCUCGUCCGAUCAGCAAAGUUAAGCAACGUUGGGUCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCAGAUGCUGUUGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((...(((............)))...)))...))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01533
|
[ FASTA input ]
|
GCCUACGACUAUACCACCAUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGUAUGGUAGGGCCGGGUCAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCCGGUGUUGUAGGCCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))..
|
|
CRW_01534
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((.......((((.(((....))).)))).....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01535
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01536
|
[ FASTA input ]
|
ACAUACGGCCAUAGAUUGAAGAAUAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUUCUAAUCGCCAAGUUAGUACUGCGGUGGGUGACCACGCGGGAAUCCUUGGUGCUGUAUGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((.....((((....))))..(((.......)))....)))).))))((((((......(((((.(((....)))))))).....)))))))))))))))
|
|
CRW_01537
|
[ FASTA input ]
|
GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((((........((((((.......((((............))))........))))))...(((((((...........(((....))).........)))))))..)))))....
|
|
CRW_01539
|
[ FASTA input ]
|
ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((......((((((.......(((((((....)))..))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....)))))))))))))))...
|
|
CRW_01540
|
[ FASTA input ]
|
GCUUACAGCCAUACUGUCCUGAGCACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGACAAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACUGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((.(((.....[[[[.)))........]]]]..(((((.((((......)))).)))))....))))))......((((((.....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01541
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..))))...)))))...(((((.......((((((.........))))))......))))))))))))))..
|
|
CRW_01542
|
[ FASTA input ]
|
GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.........[[[[[[[[[[[[..[[[[[..[[[..))))))......]]]]]]]]..]]]]]]]]].]]].((((((.....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01544
|
[ FASTA input ]
|
GUUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCAUGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGCCCAUGUGCUGAUAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....((((((...(((..((((............))))..)))....))))))..((((((.........((((((....)))))).......)))))))))))))))..
|
|
CRW_01548
|
[ FASTA input ]
|
GCUUACGACCAUAUCACGUUGAAUGCACGCCAUCCCGUCCGAUCUGGCAAGUUAAGCAACGUUGAGUCCAGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCUGGAUGUUGUAAGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...((((((.......((((............)))).....))))))))))))))).
|
|
CRW_01555
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUAGAUGAGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCUCGUCCACAACUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((......(((((............))))).......))))))(((..((((((....(((....))).)))))).........)))...))))))))).................
|
|
CRW_01556
|
[ FASTA input ]
|
GCUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAUGCACCGGAUCCCUUCCGAACUCCGAAGUUAAGCGGUUUAAGGCCUGUUAAGUACUGAGGUGGGGGACCACUCGGGAACUUCAGGUGCUGAUAGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....((((((........((((.....))))((((....))))....))))))..(((((..((((.(((((.(((....))))))))..))))))))))))))))))..
|
|
CRW_01557
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACAACCAUACCACGUUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUAGGGCUCGGUUAGUACUUAGAUGGGUGACCGCUUGGGAAUACCGAGUGUUGUAGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((.(((....))).)))))...))))))))))))))))..
|
|
CRW_01559
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUACGGCCAUACUACCGGGAAUACACCUGAACCCGUUCGAUUUCAGAAGUUAAGCCUGGUCAGGCCCAGUUAGUACUGAGGUGGGCGACCACUUGGGAACACUGGGUGCUGUACGCUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......((((((.......(((((..........)))))........))))))...(((((((........((((((....))))))......))))))))))))))))).
|
|
CRW_01562
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCGGUCAUACCAAGGCUACUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCGCCUUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUGCUGCAUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((......(((((.(((.............((((....))))))).....)))))...(((((.......((((((.........))))))......)))))))))))))...
|
|
CRW_01563
|
[ FASTA input ]
|
AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((.............((((.......[[[[(((......)))......(((....)))))))((((....(((((.(((....)))))))).)))).]]]].)))))))..
|
|
CRW_01566
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUAAUACCACCGCUAACGUAUCGGAUCCGAUCAGAACUCCGUAAUUAAGCGCGCUUGGGCUAGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCUCGGGAAGUCCUAGUGUUGCACCCAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((........((((.......((((............))))......)))).(((.[[[[[.....))).((((((.........))))))..]]]]]....)))))))))..
|
|
CRW_01568
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((.......((((.(((....))).)))).....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01569
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....))).)))))....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01570
|
[ FASTA input ]
|
GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((......((((............)))).......)))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01572
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((..........))))).......((((..[[[[[...(((((.((((......)))).)))))...))))(((....)))..]]]]].........))))))))..
|
|
CRW_01573
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))...
|
|
CRW_01578
|
[ FASTA input ]
|
GUUUACGACCAUACCAUGCUGAAUAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCAUAGGGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUGUAGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01580
|
[ FASTA input ]
|
GCUUACGGCCAUAUCACGCUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGAGCCUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUAGGUGCUGUAAGCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((........(((........(((...[[[.))).....]]].....)))...(((..[[[[[.....))).....]]]]]....((((((.....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01581
|
[ FASTA input ]
|
ACACACGGCCACAGUCAGCUGAAAACUGGGCAUCCCGUCCGCUCUGCCAUACAUAAGCAGUUGAACGGCAGAUUAGUACCACGGUGGGUGACCACCUGGGAAUCCCUGCUGCAGAGUGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))...)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..............(((((((......(((...)))...[[[[[[[[..........)))))))..((((((((....(((.(((((....)))))))).)))..)))))]]]]]]]]..
|
|
CRW_01583
|
[ FASTA input ]
|
AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
....((((.......[[[[[[....[[[[[[[..))))......]]]]..]]]...]]]]]].((((.....[[[[[[[...((((....))))))))........]]]]]]].......
|
|
CRW_01584
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGACCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCGUGGUUAGUACGUGGAUGGGUGACCGCCUCGGAAUACCACGUGUUGUAGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...(((((((...........(((....))).........))))))))))))))))..
|
|
CRW_01590
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCGUUAGUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGCGCUUGGGCCGGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUAUUGCACCCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((...[[[[[........))))))..((((((.....((((((...(((((....)))))..)))))).....))))))(((......)))(((....)))]]]]].........
|
|
CRW_01593
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGACCAUACCACAAUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAUUGUCGGGCCAGGAUAGUACCUGGAUGGGGGACCGCCUGGGAACGCCUGGUGUCGUAGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....))).)))))....)))))))))))))))..
|
|
CRW_01595
|
[ FASTA input ]
|
GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
......(((((....((((((..(((..((((.....[[[[[[[))))..)))...))))))......)))))........]]]]]]]....(((((((...)))))))......................
|
|
CRW_01599
|
[ FASTA input ]
|
GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01603
|
[ FASTA input ]
|
AGAUGCGAUCAUACCAGCACUAACGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGCUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUGGAAUGGGUGACCCUCCGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUCCCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((....((((.((((.(((..((((............))))...(((((....))))))))....)))).))))...(((.[[[..))).....]]].....))))))))...
|
|
CRW_01605
|
[ FASTA input ]
|
GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((.(((..[[[[........)))....((((((.(((............))))))))).]]]].......))))))((((((.((((((.....)))))))))))).....
|
|
CRW_01606
|
[ FASTA input ]
|
GUUGGUGGCCAUACUAAGCCUAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCGAGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGACAACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...((((.......[[[[[[.....))))........((((.....)))).......]]]]]]..(((((..........((((((....))))))[[[..[[[)))))...]]]..]]]
|
|
CRW_01608
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCUGAAAGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCAGCCACAGGCUUAGUUAGUACUGAGGUCAGUGAUGACUCGGGAACCCUGAGUGCCGUACCCUCCACAACACUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))............
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........((((((..(((..((((.....[[[[[..))))..)))...))))))....((((((....))))))((((....))))]]]]]............)))))))............
|
|
CRW_01613
|
[ FASTA input ]
|
ACAGCCGUUCAUACCACACGGAGAAUACCGGAUCUCGUUCGAACUCCGCAGUCAAGCCGUGUCGGGCGUGCUCAGUACUACCAUAGGGGACUGGGUGGGAAGCGUGCGUGACGGCUGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((...((((((.......((((............))))........))))))...(((((((.....(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))))).
|
|
CRW_01616
|
[ FASTA input ]
|
GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((.......((((............))))........))))))...(((((((......((((.(((....))).))))....))))))))))))))))..
|
|
CRW_01617
|
[ FASTA input ]
|
GCCUACGGCCAUACCACGUAGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCUGCGUCGGGCGUGGUUAGUACUUGCAUGGGAGACCGGCUGGGAAUACCACGUGCUGUAGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((((((....((((............))))..)))...))))))...(((((((.....(((...(((....)))...)))...))))))))))))))))..
|
|
CRW_01620
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCUAGGCGAAAACACCAGUUCCCGUCCGAUCACUGCAGUUAAGCGUCUGAGGGCCUCGUUAGUACUAUGGUUGGAGACAACAUGGGAAUCCGGGGUGCUGUAGGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......((((((..(((..((((............))))..)))...))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))))))))))).
|
|
CRW_01621
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGCGAUCAUACCAGCACUAAGGCAUCGGAUCCCGUCAGAACUCCGAAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACAAGGAUGGGUGACCUCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((((...(((.[[[[[....))).....]]]]]........)))))....((((((.......[[[[[.......))))))....]]]]]...)))))))))..
|
|
CRW_01623
|
[ FASTA input ]
|
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAGUGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGCCGUACCCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........((((((.......((((............))))........))))))...((((((......(((((.(((....)))))))).....))))))..)))))))..
|
|
CRW_01625
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((((..(((..((((............))))..)))...)))))))..((((((.....(((.((((((....))))))....))))))))))))))))))..
|
|
NDB_00014
|
[ FASTA input ]
|
CCACUAGUGGCCACUAGUGG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))
|
|
NDB_00015
|
[ FASTA input ]
|
ACCGGCGCCACAUGUGGCGCCGGU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((.)))).)))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
NDB_00016
|
[ FASTA input ]
|
CGCGAAAACGCGCGCGUUUUCGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
NDB_00047
|
[ FASTA input ]
|
CGCGAUAUCGCGCGCGAUAUCGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
NDB_00048
|
[ FASTA input ]
|
GCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGCGCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
|
|
NDB_00049
|
[ FASTA input ]
|
GACUAAGUCAACCGGUUGACUUAGUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((()))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....)))))))))))
|
|
NDB_00051
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00001
|
[ FASTA input ]
|
CGCGAAUUAGCGCGCGAAUUAGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[.)))....]]]]....
|
|
PDB_00002
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUAAGGAUUACCUAUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.........))))))
|
|
PDB_00003
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUCACACCUUCGGGUGAAGUCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..))))).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...((((....))))....))))
|
|
PDB_00004
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.......((((((((...)))))))).......))))
|
|
PDB_00005
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCUCAACUCUCCCCCCCUUUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))(((...[[[[[[)))...]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......))))).(((..[[[[[[)))...]]]]]]...
|
|
PDB_00006
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGACUCCAGAGGUCGAGAGACCGGAGAUAUCACCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((...((((....))))))))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...((((....))))))))...))))))
|
|
PDB_00011
|
[ FASTA input ]
|
CGCAAAUUUGCGCGCAAAUUUGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
PDB_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(((....((((......)))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((......))))))))))
|
|
PDB_00013
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUGCUUCAACAGUGCUUGGACGCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((.((......)).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((((......)))))))))))
|
|
PDB_00017
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCAGAAACAGCGCUUCGGCGCGUAUAUUACGCACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((((((..))))))))....)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......((((....))))(((...))))))))
|
|
PDB_00018
|
[ FASTA input ]
|
GGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCCGGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.[[..[[[[)))))))(((((((.]]]]..]])))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).)))))))
|
|
PDB_00019
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACUGCUUCGGUAAGUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..((((....)).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..(((....))).)))))
|
|
PDB_00020
|
[ FASTA input ]
|
GGCAACGGAUGGUUCGUUGCCGCACCGAACCAUCCGGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((([[[[[[[)))))))((((((]]]]]]]))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...)))))))))((((((.......))))))
|
|
PDB_00021
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGCGGAGGCUAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))
|
|
PDB_00022
|
[ FASTA input ]
|
GGCGACGGUGUAAAAAUCUCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((......))))))))
|
|
PDB_00032
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((....((((...(((((..)))))...)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((....(((....)))....))).)))))))
|
|
PDB_00034
|
[ FASTA input ]
|
AACGGGCGCAGAAUCUGACGGUACGUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.)))).))).))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((....(((...)))......)))).
|
|
PDB_00035
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUCACCAUUAGGGAUCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((..)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.........))))))
|
|
PDB_00036
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUAGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.(((((((((((((.))))))))))))).))))))))))))))...........................
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((((....))))))..)))).((((..((((((....))))))..))))(((..((((((....))))))..))).
|
|
PDB_00039
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((()))).))).))))).(((.((((((()))).)))..))).(((((((((((()))).))).)))))((((.((((((()))).)))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((....((((((((......((((((((....((((((((.((((.....))))....))))))))......))))))))....))))))))......))))
|
|
PDB_00040
|
[ FASTA input ]
|
GUGCGAAGACGAAAGUCCGAGCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((....)))...))))
|
|
PDB_00041
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCCAGCUCCAGGCCGCCAAACAAUAUGGAGCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.[[[[[[)))))).........]]]]]]..
|
| [ predicted structure ] |
((((((.[[[[[[)))))).........]]]]]]..
|
|
PDB_00043
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGACGGUACACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((..))))).))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((....((((....))))......))))
|
|
PDB_00048
|
[ FASTA input ]
|
UUGCCUGGCGGCAACUGCCAGGCAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((((...)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((...)))))))))).
|
|
PDB_00049
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAAGUCGAAAGAUGGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((....)))..))))
|
|
PDB_00053
|
[ FASTA input ]
|
ACCGUCAGAGGACACGGUUAAAAAGUCCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..[[[[[[)))))......]]]]]]
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[[[)))))......]]]]]]
|
|
PDB_00054
|
[ FASTA input ]
|
GCAGGCGUGCGCAGGCGUGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((((....))))))
|
|
PDB_00056
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGAGACGUCCCACCGGUGGGAGACGUCCCACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..[[)))))))(((((((..]])))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....)))))))(((((((....)))))))
|
|
PDB_00057
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUCCGGUCUUCGGACCGGCUUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((((......))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((((....)))))))))))
|
|
PDB_00065
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGAGUAGUGUUGGGUCGCGAAAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((.(((((......)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.....(((......)))....))))
|
|
PDB_00070
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))....((((((((...))))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00072
|
[ FASTA input ]
|
UCAAGGUACGGUACUUUUGUCAUGUGUAUGUGGGGAUUAAACCCUGAUUAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUUGGUUGUCAAUCAUGGCAAAAGUGCCGUACUUUGAUCAAGGUACGGUACUUUUGUCAUGUGUAUGUGGGGAUUAAACCCUGAUUAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUUGGUUGUCAAUCAUGGCAAAAGUGCCGUACUUUGAUCAAGGUACGGUACUUUUGUCAUGUGUAUGUGGGGAUUAAACCCUGAUUAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUUGGUUGUCAAUCAUGGCAAAAGUGCCGUACUUUGAUCAAGGUACGGUACUUUUGUCAUGUGUAUGUGGGGAUUAAACCCUGAUUAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUUGGUUGUCAAUCAUGGCAAAAGUGCCGUACUUUGAUCAAGGUACGGUACUUUUGUCAUGUGUAUGUGGGGAUUAAACCCUGAUUAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUUGGUUGUCAAUCAUGGCAAAAGUGCCGUACUUUGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((.(((..(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))).))).)))))))))))))))))))(((((((((((((((((((.(((..(((((((((.....[[..((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))).))).)))))))))))))))))))(((((((((((((((((((.(((..(((((((((......{{{((((.....)))))))))))))...((((((...]])))))).))).)))))))))))))))))))(((((((((((((((((((.(((..(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.}}}.)))))).))).)))))))))))))))))))(((((((((((((((((((.(((..(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))).))).)))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....))))(((((((((...((((((.....))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).........((((.....)))))))))))))...((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00074
|
[ FASTA input ]
|
GGUAUUUCGGUACCGGUAUUUCGGUACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..((((((()))))..)))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((((((....))))))))
|
|
PDB_00078
|
[ FASTA input ]
|
GAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCGAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUC |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((((((.((((((....((((.((((.((((((((((((((....)))))))))))(((.{{..)))....)))......))))))))...)))))))))).)))))))..((((...(((((((((...)))))))))..))))((.....[[[.[[[[[[[[.[[[[[[.[[.[[[[.[[[[.[[[(((((((((((....)))))))))))[[..))...]]....]]]......]]]]]]]]]].]]]]]]]]]].]]]]]]]..((((...(((((((((...)))))))))..))))}}.....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..............((((...(((((((((...)))))))))..)))))))))))(((((((......(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..............((((...(((((((((...)))))))))..)))))))))))
|
|
PDB_00079
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCACAGACUAAAUGUCGGUCGGGGAAGAUGUAUUCUUCUCAUAAGAUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGAGUACUCGGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCACAGACUAAAUGUCGGUCGGGGAAGAUGUAUUCUUCUCAUAAGAUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGAGUACUCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((....((((((((.((((((....((((.........((((((((((((..))))))))))))((.......)).................))))...)))))))))).))))...((((((...((((((........))))))..))))))..........{{{{..)))))))..((((((.....))))))........}}}}...((.((((((((..)))))).))......)).(((((((((......((((.(((((.....((((.((...(((..(((.((((((..)))))).)))..(((.....)))....)))........))))))....))))))))).......(((((((...((((((.((..)).))))))..)))))))....[[[..[[[[)))))))))..((..((.....))..))........]]]].]]]....((((((..))))))............
|
| [ predicted structure ] |
((((........[[[[......)))).....]]]](((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))).(((..[[[)))...]]].(((.....[[[[...((((((((....)))))))).....)))........(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))]]]]..(((((....)))))...((((((((.((((........[[[[......)))).....]]]](((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))).(((..[[[)))...]]].(((.....[[[[...((((((((....)))))))).....)))........(((((..((((.....(((((((.....)))))))....)))))))))]]]]..(((((....)))))...)))))))).
|
|
PDB_00081
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUAACUUCGGUUGUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))
|
|
PDB_00088
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCGAAGGGCGUCGUCGCCCCGAGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((......))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...(((((....)))))...)))))
|
|
PDB_00096
|
[ FASTA input ]
|
UACUAACGUAGUAUACUAACGUAGUA |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((()))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...(((....)))...)))))
|
|
PDB_00098
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGAAAUCCCGAAGUAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..........))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..............))))
|
|
PDB_00102
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUCUUCGGAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....)))))))....
|
|
PDB_00104
|
[ FASTA input ]
|
GUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCAC |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((())).)))))(((.((((())).)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((((((..........)))))))).))))
|
|
PDB_00107
|
[ FASTA input ]
|
AGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((....((((..))))...)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((....))))..)))))))
|
|
PDB_00108
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUGCUGAGAUGCCCGUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...........)))))
|
|
PDB_00110
|
[ FASTA input ]
|
CUUGCUGAAGCACGCACGGCAAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.........)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.........)))))))
|
|
PDB_00113
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUGAGGAGACUCAGAAGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..))))))..)))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....)))))..)))
|
|
PDB_00115
|
[ FASTA input ]
|
GGCGACUGCAGUACGCCGGCGACUGCAGUACGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((()))).))))(((((((()))).))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.........)))))))).))))
|
|
PDB_00116
|
[ FASTA input ]
|
CAGACUUCGGUCGCAGAGAUGG |
|
[ reference structure ]
|
..(((....))).(((..))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((....)))..........
|
|
PDB_00119
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGGCUCAACCUGGGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((...))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....)))))))))
|
|
PDB_00120
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUCAUGAGUCCAUGGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
|
PDB_00121
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGUUCAGAAGAACGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
|
PDB_00122
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGUGCCGCGCGGCACCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((((....))))))))))
|
|
PDB_00123
|
[ FASTA input ]
|
UUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((..{{{{{{.)))))..(((((((..}}}}}}.)))))))..(((((..[[[[[[.)))))..(((((((..]]]]]].)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..((((((.((((((..((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).))))))..))))))..)))))).)))))).
|
|
PDB_00124
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGCCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((..[[[[.))))))........]]]].
|
| [ predicted structure ] |
(((((...[[[[[.))))).......]]]]].
|
|
PDB_00125
|
[ FASTA input ]
|
GGUCACAGCCCGGUCACAGCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((....))).(((....))).
|
|
PDB_00128
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCCUGGGAGGCUCGCUGUUCCCAGACAGC |
|
[ reference structure ]
|
((((([[[[..)))))(((((.]].]])))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[[[[))))....]]]]]]].....
|
|
PDB_00130
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC |
|
[ reference structure ]
|
....((((((....))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((....))))))....
|
|
PDB_00132
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCUCAAUGCUCUUCGGAGACGACCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...(((((..))))).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.......(((....))).....))))
|
|
PDB_00134
|
[ FASTA input ]
|
UCCGGUCGACUCCGGAGAAACAAAGUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((..[[[.)))))........]]].
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[))))).......]]]].
|
|
PDB_00136
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACCUAUCGGGCUAAGGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUAUGCCCGGGGGAAAAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((..(((((...((((((((((((((((..))))))..))))))))))..))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((.((((((...(((((((((((((((....)))))..))))))))))..))))))))).....
|
|
PDB_00137
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((..))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((((....))))))..)))).
|
|
PDB_00138
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGGCACCGUCCGCGGAACAAACGG |
|
[ reference structure ]
|
..(((((..[[[.))))).......]]]
|
| [ predicted structure ] |
..(((((..[[[[)))))......]]]]
|
|
PDB_00142
|
[ FASTA input ]
|
GCGACCGAGCCAGCGAAAGUUGGGAGUCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((((..)))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((....(((((....)))))..)))))
|
|
PDB_00149
|
[ FASTA input ]
|
GCGCAGGACUCGGCUUCUUCGGAAGGGACGAGGGGCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((...(((((((((((..)))))..)))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
((((....((((.((((....))))...))))..))))
|
|
PDB_00150
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGCAGGCUUCGGCCUUGUUUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((..))))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))).)))))))
|
|
PDB_00152
|
[ FASTA input ]
|
GACAGUCUCUACGGAGACUG |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((....)))))))
|
|
PDB_00153
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUUGCAGGUCUGCACCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((....)))))))))
|
|
PDB_00155
|
[ FASTA input ]
|
CCAUGCGAACCGCGAUCCUAGUGUGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..........))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..............))))))
|
|
PDB_00157
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCACGUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC |
|
[ reference structure ]
|
..((((...((((((()))))))(((((..)))))))))....((((.....((((()))))...((((..)))).))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......((((((((...((((....)))).(((....))).......))))))))...((((....)))).)))))
|
|
PDB_00158
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGACGAUACUGUAGGCGAGAGCCUGCGGAAAAAUAGCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.......((((((((....)))))))).......))))
|
|
PDB_00159
|
[ FASTA input ]
|
UGCUCCUAGUACGUAAGGACCGGAGUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..)))).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((...............))))).
|
|
PDB_00160
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUAACGUUGAAAAGUUACGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((......)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((........))))))))
|
|
PDB_00168
|
[ FASTA input ]
|
GAGGGUGGAACCGCGCGCGUCCCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((........((....)).))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...............)))))
|
|
PDB_00169
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUCUCGAAAGAGUUGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((....)))..))))
|
|
PDB_00170
|
[ FASTA input ]
|
GGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((..)))))))))..)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((((....)))))))...)))))))
|
|
PDB_00171
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.....)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((.................)))))).
|
|
PDB_00174
|
[ FASTA input ]
|
CUUGCUGAGGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAGGUGCACACAGCAAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((((((((((((((())))))).)))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).)))))))
|
|
PDB_00175
|
[ FASTA input ]
|
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((....[[[[...((((((.((((((...........)))))).)))))).))).....]]]].(((.((((((...........)))))).)))
|
|
PDB_00178
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUACCAGCCGAAAGGCCCUUGGCAGCGUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..((.((((..))))....))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...((((((....)))...)))...))))
|
|
PDB_00181
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGCGCUACGGCGAGGCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..)))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((....)))...))))
|
|
PDB_00182
|
[ FASTA input ]
|
GAGCGAAGACGAAAGUCGAGCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((..))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((....)))..))))
|
|
PDB_00183
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCCUUCGGGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((.....((((((((((((((..)))))))))).)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((.....((((...(((..........)))....)))))))))))))
|
|
PDB_00184
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.......))))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((....[[[[[[..)))..]]]]]]........
|
|
PDB_00185
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((.....((((((.((((((((..(((((.......)))))...)))))))).)).)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((.....((((......))))..((((((.......)))))).((((((...))))))..)))))))))
|
|
PDB_00187
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUAAGGUCGUUGUUCGUGAACGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAUUCGGGUUUCUCUGCGUAGGUGGGAGAAACUGGCCGGUCGGUGGCCACCCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.......((((((((((((...((..((((((((((((.....((((((..aa..aa..)).....((((((...((.AA..AA..))......))))))...))))...(((....)))(((((....))))).(((....))).))..(((((((.....((....))......))))).))........((....))...((((.((...(((...)))..)).)))).........((.(((((......((((..(((((......)))))((......<<<.....))>>>..))))........))))))).....................................)).)))))).))............((((....))))..))........((((((..))))))...............))))))))))))........((((((((((.......))))))))))..((((........))))((((((....(((.((((((((((..(((.(((((...))))).)))...((((..))))....((...))..........)))))))))))))..((((...((((((.....(((((((((..(((((...(((((......)))))...)).)))...(((.(((((........))))))))....)))))))))...((.......))......))))))......))))..(((((((...(((........)))((((((((.....(((((((((...((((...((((((((......))))))))..)).))...))))))).))....)))))).))..(((((((.((......)).)))))))....(((......))).....((.(((..((((........(((((..........(((((.((((((((..........((((.(((..(((.........)))..)))......................))))......)))))))))))))..................))))).))))..))))).....((((.(((...))).))))......)))))))(((((((((.((....(((((((.((....)).))))))).)).))))))).)).....))))))((....((.....((((((.......))))))(((((...((((..((...((((((...((.....)).))))))....(([[[[.((..(((((..(((....)))..)))))..))...(((((........)))))))((((((((((..((....(((....(((((.(((..(((((.((((.((...bb....))))))...(((......((..(((((((...........))))))).....))......)))..((.((((((...))).))).)))))))...)))..))))).........)))....)).....))))))))))]]]]..)).....((......)).)))).(((((....))))).)))))..((((...((((((((.(((...............(((.((..((....))...)).))).(((((((...)))))))............((((((.((...((.........))...(((((((....((.........))......)))))))..((((.(((......................((..........))....................)))((((...........)))).......((...........(((((.......))))).....))...))))...))..)))))).....))).))))))))))))))...))......(((((........)))))..(((((.((.(((.........((((.((((((..(((((((((.((((..(((.((((....(((..((...((........((((((())))))).....)))).)))....)))).)))....((((..........))))......)))).)))).)))))..((.........))((((((...........))))))..((...(((((((..(((.((.........)).))).........{{{......)))))))...((((...((((..))))...))))..(((..)))..))}}}.......((((((..(((......))).)))))).............))))..))))))........(((..(((((((((.(((.....))).)))))))))...))).........((.(((((((((..(((..(((........)))....)))...((((...)))).......)))))..))..))..))....((((((((..)))).))))........))))).))))).....((((((..(((((..(((((((....((....))...)))))))..((((...(((((..((.((((((((.BB.))))))...)).))..))))).)))).....(((..((((...............))))..)))..)))))......))))))...............((..(((((.......)))))....((.(((((.(((....(((((....)))))...)))..)))))..))......))...)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....(((((...[[[[[...)))))..]]]]]...........((((.......[[[........((((((.((((.........))))....))))))..))))....(((....)))(((((....)))))((((....))))]]]..(((.(((.(((((......))))).)))...[[[[..[[[.)))..]]]..]]]].........(((..........[[[[..)))...]]]]...((((((.(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))..((((((...(((((....)))))..)))))).[[[[[[[[..((((..................))))...........)))))).((((((.......((((....)))).....................(((....)))............)))))).]]]]]]]]...(((((((.........(((((((((((..((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....)))).......)))))))))))))).(((.....[[[[[))).........(((.((((....(((((......)))))(((....))))))))))]]]]].....((((.(((....))))))).((((((.......[[[[[......))))))..]]]]].......(((((......((((((((..(((((((((........((((((...(((...(((.((((......)))).)))..)))....))))))........))))).(((((.(((((((.(((.....))))))))))....(((......)))..(((((((((....((((((.....(((((((..((((.......((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))...((((........))))....)))..))))))))))))))...((((((((.((((......((((((........(((..((((((((...))))))))))))))))).))))(((((((((((......(((((..........)))))...............))))))..((((((...........((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...(((...))).))))))))..)))....(((......)))....)))))))))))).))))).(((((........))))).))))))))...)))))))..)))))).................((((.....))))...))))).)))).)))))..))))((((((...(((...))).))))))...)))))))).....))))).(((((....)))))((((((.......[[[[[...........))))))....]]]]]...................(((....((((....))))...[[[[[..))).....]]]]](((.......[[[)))..]]]....((((......[[[[[)))).(((....)))]]]]].....((((((((.(((((...[[[[[[[[))))).....]]]]]]]]..........((((((((....(((.....)))......))))))))...((((..(((....))).))))...))))))))(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))......[[[[((((((.....)))))).)))))..]]]].....((((..[[[(((((((((.....)))))..))))..))))....(((((((....)))))))..]]]..............((((...((((.......)))).)))).(((..[[[[[[[[[[[[[[[[)))...(((((.....(((((....)))))..)))))..]]]]]]]]]]]]]]]]...(((((((......)))))))....((((((..(((.........)))((((....((((((...........))))))))))..[[[[[[[[[..((((((((...))))))))...)))))).........]]]]]]]]]..((((..(((...[[[)))..)))).(((....))).......]]]...(((((((.[[[[........)))))))....]]]]................((((........[[[[[[[[[[[[..))))...]]]..]]]]]]]]]...........)))))))))))...(((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).......))))))).....((((...(((((((....))).))))..[[[[[))))............]]]]]....(((((..[[[)))))....]]].....(((.[[[[..)))..]]]].....((((((((((((....))))))...))))))..(((.((((((...)))))).[[[[[...))).....]]]]].......(((....[[[[[[[..............)))......(((((.......))))).......(((((.(((....(((((....)))))...)))..)))))]]]]]]].......))))))))).
|
|
PDB_00190
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUCCCACAAGGGAAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
|
PDB_00192
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......(((.......[[[[[[[[[)))................]]]]]]]]].................)))))
|
|
PDB_00195
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..(((((((((((....)))))))))))..))))))((((((..(((((((((((....)))))))))))..))))))
|
|
PDB_00196
|
[ FASTA input ]
|
UAGCGGUGCGCACCGCUACGCACCGUUGGUAGCGGUGCGCACCGCUACCAACGGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((())))))))).((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....))))))).(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
|
|
PDB_00197
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((....)))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((((....))))))))))
|
|
PDB_00200
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGCCUCCCGAGUGCAUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.........))))))
|
|
PDB_00201
|
[ FASTA input ]
|
GGACACGAAAUCCCGAAGUAGUGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.....)).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..............))))))
|
|
PDB_00202
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((..))))))...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((....)))))..)))))))))
|
|
PDB_00203
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGACAUCCCUCACGGGUGACCGUGGUCCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......((((((..)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((((....))))))))))))
|
|
PDB_00205
|
[ FASTA input ]
|
GGCACUCUGGUAUCACGGUACCUUUGUGUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...(((((....)))))...)))))
|
|
PDB_00206
|
[ FASTA input ]
|
GGGACUGACGAUCACGCAGUCUAU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.........))))))..
|
|
PDB_00207
|
[ FASTA input ]
|
UUAUAUAUAUAUAAUUAUAUAUAUAUAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((())))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....))))))))))))
|
|
PDB_00209
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGGCCCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((..[[[[[[.)))))........]]]]]].
|
| [ predicted structure ] |
(((((.[[[[[[[.)))))........]]]]]]]
|
|
PDB_00211
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAGAAGCGCUUCUCUUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))
|
|
PDB_00213
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUACUAGUUGAGAAACUAGCUCUGUAUCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGUGAAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGAGGUCCCAGGGUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))))))....((((..(((.((((((((((..))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
|
|
PDB_00214
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((((..))))..)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.................))))))
|
|
PDB_00215
|
[ FASTA input ]
|
UAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUAUAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00219
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGGGCUCAUAACCCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......)))))))
|
|
PDB_00221
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAGACUUCGGUUAUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..((((..)))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((....)))..))))
|
|
PDB_00224
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAGUGUAACAACUGACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......)))))))
|
|
PDB_00229
|
[ FASTA input ]
|
AGCGCCGUGGCGCAGUGGAAGCGCGCAGGGCUCAUAACCCUGAUGUCCUCGGAUCGAAACCGAGCGGCGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.((((....))))..(((.(((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))..))))).)))
|
|
PDB_00234
|
[ FASTA input ]
|
GGACUUUGGUCCGGACUUUGGUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((....))))((((....))))
|
|
PDB_00236
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..((((((((((..(((....)))..))))))))))..)))))
|
|
PDB_00237
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
.((((...(((((..)))))...)))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((....(((....)))....)))))
|
|
PDB_00239
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((((()))))))(((((..)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((..[[[[[...)))))...]]]]]............
|
|
PDB_00243
|
[ FASTA input ]
|
GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((.[[[[[[[))))).......]]]]]]]..
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.[[[[[[[))))).......]]]]]]]..
|
|
PDB_00248
|
[ FASTA input ]
|
AUCCCCCGUGCCGGUGCGGGGGAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
PDB_00249
|
[ FASTA input ]
|
CCGAUGGUAGUGGCGAGAGUAGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
........................
|
|
PDB_00250
|
[ FASTA input ]
|
UGCCUGGCGGCCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...(((((((((((..))))))))).))..)))..)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.......(((((((....))))))).......)))..))))))))))
|
|
PDB_00252
|
[ FASTA input ]
|
CUGGGCGGGCGACCGCCUGGCUGGGCGGGCGACCGCCUGG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((....)))))))..((((((((..)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))((((((((....))))))))
|
|
PDB_00254
|
[ FASTA input ]
|
CGUACGCGUACGCGUACGCGUACG |
|
[ reference structure ]
|
(((((())))))(((((())))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
PDB_00256
|
[ FASTA input ]
|
UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU |
|
[ reference structure ]
|
.((((......))))...........
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[[[.))))....]]]]]]
|
|
PDB_00257
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGAUCUGAGCGGCUCUCUGGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((((.))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((...)))))))))).
|
|
PDB_00258
|
[ FASTA input ]
|
GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......)))))))).
|
|
PDB_00261
|
[ FASTA input ]
|
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((())))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((......)))))(((((......)))))
|
|
PDB_00262
|
[ FASTA input ]
|
CCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00264
|
[ FASTA input ]
|
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
............((((.....[[[[[[....))))...]]]]]]....
|
|
PDB_00267
|
[ FASTA input ]
|
UAGCUCCGGGGCUAUAGCUCCGGGGCUA |
|
[ reference structure ]
|
((((((()))))))((((((()))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....))))))))))))
|
|
PDB_00278
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGCCAGACUGAAGAUCUGGAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCUUUGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCCGCUUGUCGCGUGGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCGUCUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((......)))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))......(((((((..((((........))))((((((..[[[..))))))....(((((.......))))))))))))]]](((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..........((((....[[[[[))))...]]]]].....((((.......))))(((((((((....(((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))).)))))))))..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......)))))))))))).
|
|
PDB_00286
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAAAAAUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((...))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))
|
|
PDB_00293
|
[ FASTA input ]
|
CCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGUCCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((...........)))))).((((((...........)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((..........))))))))))))...))))).
|
|
PDB_00307
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCAUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......))))((((((((....))))))))..(((...[[[[))).(((((((.....)))).)))]]]]((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00312
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGUCCUUCGGGACAUUGCACCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((....)))).......)))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((.((((....)))).)))).......
|
|
PDB_00313
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[[[[.)))....]]]]]]....(((...[[[[)))...]]]]....))))))))....
|
|
PDB_00317
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGUGUAGCUCAUUAGCUCCGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((....)))).))))))
|
|
PDB_00326
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((...((((..))))..)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..[[[[..)))...........]]]]..........(((......)))....(((((((.(((.....)))....))).)))).
|
|
PDB_00327
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((....[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))))......
|
|
PDB_00339
|
[ FASTA input ]
|
GGACCGAUGGUAGUGUCUUCGGAUGCGAGAGUAGGUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((....))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((.......(((((....))))).......))))
|
|
PDB_00341
|
[ FASTA input ]
|
CCCAUGCGAGAGUAGGGACUGCCGAUGGUAGUGUGGGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((....))))))((((((...))))))......
|
|
PDB_00342
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((())))))))))....................
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((....))))))))))))))))))
|
|
PDB_00343
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGGCCUUCGGGCUAGACGGUGGGAGAGGCUUCGGCUGGUCCACCCGUGACGCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((....)))...((((((((((.((((..))))))))))).)))...))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....)))...((((..(((..(((....)))..)))..))))..)))))
|
|
PDB_00347
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
|
|
PDB_00349
|
[ FASTA input ]
|
GAGACAUUGCACCCGGAGUCUCGAGACAUUGCACCCGGAGUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......[[[[.)))))............]]]]......
|
|
PDB_00351
|
[ FASTA input ]
|
GCCAAUGAGGCCGAGGCGCCAAUGAGGCCGAGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((...(((()))))))(((.....(())..)))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.....[[[.....))))..]]]
|
|
PDB_00352
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((......)))))))....((((........)))))))))
|
|
PDB_00357
|
[ FASTA input ]
|
GAGGACCUAGAUCACCCCUCGAGGACCUAGAUCACCCCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..........)))))(((((..........)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..[[[[......))))......]]]]..........
|
|
PDB_00358
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((.......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((............[[[[[)))....]]]]].....(((((((((((.((((((((.....((((....))))...))).......((((.(((((...))))))))).))))))))))).))))))))))))
|
|
PDB_00362
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCCGCGGUUCGAUUCCGCGCCUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00365
|
[ FASTA input ]
|
GGACAGCUGUCCCUUCGGGGACAGCUGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((....)))))))))))))
|
|
PDB_00370
|
[ FASTA input ]
|
GGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAA |
|
[ reference structure ]
|
......(((..bb......))).........BB........(((..{{......))).........}}........(((..aa......))).........AA........(((..<<......))).........>>........(((..[[......))).........]]..
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.(((((.....[[[..)))))....]]].)))))).(((((.....[[[..)))))....]]].((((((.(((((.....[[[..)))))....]]].)))))).(((((.....[[[..)))))....]]]....(((.[[[[[.)))......]]]]].....
|
|
PDB_00371
|
[ FASTA input ]
|
GGUCUGGGCGCAGCGCAAGCUGACGGUACAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((..))))).))).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((....((((....))))......))))))
|
|
PDB_00377
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGCCGGUACGCAAGUACGACGGUACGCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((....))))..)))..))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....))))..)))..))))).
|
|
PDB_00378
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCCCGACUGGCGAGAGCCAGGUAACGAAUGGAUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((..))))))....))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((((....))))).........))))))
|
|
PDB_00392
|
[ FASTA input ]
|
UUCCUCGUGGCCCAAUGGUCACGGCGUCUGGCUACGAACCAGAAGAUUCCAGGUUCAAGUCCUGGCGGGGAAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((....))))))).(((.[[[[[)))............(((((.......)))))......]]]]]
|
|
PDB_00398
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))((...............))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((.............)))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((........[[[[.[[[[[[..[[[[..)))))))..]]]]..]]]]]]..]]]]..((((((...[[[[[))))))......]]]]]..((((((..((((.....[[[[..))))..))))))......]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]]..........
|
|
PDB_00400
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAAC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((.))))))))))))))))).....(((((((((((((((((.)))))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((...))).((((((((.((((((((.............(((...))).)))))))).)))))))).............
|
|
PDB_00401
|
[ FASTA input ]
|
UAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUCGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUCCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAUUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((((((((..(((((((((.((.....(((((((.ee.eee.)))....(((((((((((((EEE.EE.)))...))))))))))..))))...(((...)))....(((((.....))))).))..(((((((((((((......)))).))))))).))....((..((.....))...(((((((.(((((...))))))))))))...(((.((.((...(((((..))))).....)).))..(((((((((....((((((((.((((((((((....((((......)))).((......ddd.....))DDD..))))))))))..)))))))).))))))).)).....(((((((((......))))))))).....(((((.bbbbbb)))))..)))))......))))))).)).............(((((..)))))..)).........(((((...))))).............)))))))))))))))).......((((((((((......(((((((((..((((.((((((....))))))..)))).))))))))).....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((.(((((.....))))).))))...(((..))).....(((((((((((..))))))))))).((((((....))))))...)))))))))))))..(((((((((((((.....(((((((((.((((((((((((((((..)))))))))))).))))..((((.(((.((........)))))))))...)))))))))...(((.....)))......))))))).))..))))..(((((((((((((((....)))))((((((((((((((.(((((((((.(((((....((((((...))))))..)).))).))))))))))))....)))))))))))...((((((((((.....)))))))))))).((((......))))..(((((((..(((((((.....[[[[[[.....[[...........(((.((((((((((...((..(((((()))))).)))))))))))))))..........)))]]....]]]]]].))))..)))))))(((((((((...)))))))..))..))))))))((((((((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)).....))))))(((...(((.......((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(({{{(((..((((((((((.....)).))))))))....)))..(((((........)))))))((((((((.....((((((((((((((((((.((((((((((((..cc.))))))(((((((((..((((((((((.(((.....)))..))))))))))...))))))).))((..)))))))).))))))))))......)))))))))))))))).}}}..)).....((......)).))))..(((((...)))))..))))...((((....((((((((((((...............((((((.((((..))))..))))))(((((((((.....)))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((((.((((((..)))))).))..)))))))).((((.(((..(((((((..((((...((((((....))))))...)))))))))..)))))((...))....................(((((.......)))))..........))))...)).))))))).....)))))))))))))))))))..))).((..<<<<<......))>>>>>..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((((((((((((((((..)))..((((((..))))))..))))))))))).)))))...((.......))..((((((.((....))..))))))..((...(((((((..(((((((..)))))))....((...aaa))....)))))))...((((((((((.......)))))))))).((((..)))).))AAA....((.(((((.(((((.BBBBBB))))))))))))........))))..))))))......(((((.(((((((((..(((.....)))..)))))))..))))).))......((((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).))....((((((((..)))).))))....))..)))))))))))...((((((..(((((..((((((((((.(((....)))))))))))))(((((...(((((..((((((((((CC..)))))...)))))..))))).))))).(((((..(((((..(((.)))....)))))..))))))))))......))))))...(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))...((((((....((((((((.....(((((((....((....)).))))..)))...)))))).)).(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))).))))))...
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((....(((((..((((((.((((((((((((((........((((.....((((((...(((.......)))......))))))..((((...........(((...(((((.....)))))..)))..(((((..(((((......))))).))))).)))).......)))).........)))..(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).))).))))))))..((((((((((......((((......)))).....(((.((((....)))).))).)))))))..((((...)))))))...(((......(((((((........)))))))......(((((.......)))))..))).........))))))...............(((((((......)))))))......((((....))))..........)))))....))))))))))).....((((((((((((....((((.[[[[......))))(((((....)))))............]]]]......))))))))))))..((((....))))(((((((....((((((((((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...(((....)))...)))))((((((....))))))...))))))))))))))........((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))......)))))))...((((..[[[[))))..]]]](((((....))))).(((((((((.......((((....)))).[[[[[[[[......)))))))))...]]]]]]]].(((((((((((((((((((.....)))))))))).)))(((......)))..[[[.........))))))......((((((....))))))]]]...(((.[[[[...)))..]]]].(((.[[[[[)))...]]]]]..((((((.....(((..[[[..)))..]]]......(((..[[[....[[[[[)))....]]]]]......]]]...))))))((((((((......((((((((....))))))))...))))))))........(((..[[[[...........))).((((((.......))))))]]]]...........(((.[[[[[[[)))........]]]]]]].........(((((.((((((.......[[[[[))))))....))))).(((((........)))))..((((....))))...]]]]].((((((((...(((((((((((((...)))))).....(((((....(((((....((((...)))).....))))).....)))))..........)))))))...))))))))..........(((......[[[[[)))..........]]]]].((((((......(((....))).((((....((((.....((((((((.((((........((((((((((.....(((....))))))))((((((((((...)))))))))).....)))))..(((((((.....(((((((((.......((((((((....(((....)))......))))))))...(((((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....))))))).....((((((......))))))(((((.......))))))))).....)))))......)))))))....)))))))))))).)))).....((((((......)))))).))))...)))))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((.((((....))))((((....)))).....))))))))..)))))......(((((.[[[[((((((((.......))))))))))))).......(((..(((((....)))))..)))]]]]..((((........))))..(((((((((((.....)))))))))))((((....))))(((...[[[[))).....((((((.....))))))...(((((((..........................))))))).]]]]..(((((...(((((((((((((....))).))))..))))))..((((.(((((((((((......)))))).))))))))).)))))((((........)))).....((((......(((((((....))).))))(((((((((((...))))..(((((((((..((((..((((((((...............))))))))(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).))))......)))))))))...((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...)))).....))))))).))))((((((........[[[[.))))))......]]]]........((((...(((((((((......)))))))))[[[[[[[..))))......]]]]]]].......
|
|
PDB_00402
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUGUAGCUCAGGUGGUUAGAGCGCACCCCUGAUAAGGGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACUCAGGCCCAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).(((((..[[[..)))))..]]](((((.......))))))))))))..
|
|
PDB_00403
|
[ FASTA input ]
|
UUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((........)))))..((((((((.(((.........((...((((((..(((((((((((((((.(((..)))....((((..)))).....)))))))))).)))))...((..{{...))..((((((.((....))..))))))..((...(((((((..(((((((..)))))))....((...[[[))....)))))))...((((((((((.......)))))))))).((((..)))).))]]]....((.(((((.(((((.......))))))))))))........))))..))..))......(((((...(((((((..(((.....)))..)))))))....))).))......((((((((((((..(((((((((......))))))..))).((((((...)))))).....)))))..))..))).))....((..((((..))))...))........)))))))))))...}}..
|
| [ predicted structure ] |
((((.....))))..((((.((((((((.....(((.....(((((...((((((.(((..((((((((.((((....))))((((....)))).....)))))))).....(((((((((((((.....((((((((.......)))))))))))))..((((((((..(((((....)))))......(((....)))..))))))))...(((((((((((.....)))))))))))((((....)))))))....)))))(((((.((((((.....)))))))))))....))).))))))....))))).......((((....(((((..(((((...(((((((((((((....))).))))..))))))..((((.(((((((((((......)))))).))))))))).)))))((((........)))).))))).........(((((((....))).))))))))))).....)))))))).)))).
|
|
PDB_00409
|
[ FASTA input ]
|
GAGUUGAUCCUGGCUCAGGGUAACGCUGGCGGCGUGCGACAUGCAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUACUCCGUGGUCAGCGGCGGUGAGCGUGGGUCCCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCCCCCCAUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCGCUUUGGUGGGGUGGCCCACCAAGGCGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGCCGGCCACGGGGCACUGAGACCGGGCCCCACUCCUGGAGAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCCUGCGGAGCGACGCCGCUGGAGGAAGCCCUUCGGGGAAACUCCUGAACCCGGGCGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACACCGGGGUGCGCCGGCCUCCGUCCAGCGCCGCGGCGGAGGGCGCAGCGUUACCCGCGUAGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCCCGGGAGGAACGCCGAGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGGCUGAGGCGCAGCGUGGGGCAAACCGGAUUCCGGGUAGUCCACGCCCUAACGCGCUGUCUCUGGGUCCUGGGGGCCGAAGCCAGCGCGCCUGGGGCGGCUGAAACUCAAGGAAUUGACGGGGCCCGAGCGGUGAGCAUGUGGUUUUCGCGAAGACCAGGCCUGCUAGGACCCGGGUGGCCUGGGUGCCCGCGAGGGAGCCCUAGCCAGGGCUCCGUCGGCUCGUGCCGGUUGGGUUCCCGACGAGCCCCCGCCGUUACCAGCGGCCGGGCUCUAACGGGGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGGGGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCGCCUGGCACGUGCUAUGCCCUAAGCGAGCCACCCGGCAACGGGGAGCCAAUGGGCCGGAUUGGGGUCUGAAGACCCCAUCCGAUCGCUUAAUCGCGGGCCGCGGUGAAUACGGGCCUUGUACACGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCAAGUCGCCGCUGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAAAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGA |
|
[ reference structure ]
|
..((.....[[.))...((...((.....(((((........((..........((((.((((..)))).))))........(((.(((.((((((........(((((....(((((((..))))))).)))))...(((.((.((....)).)).)))..((...))............)))))).)))....(((..((((......))))..)))......((((..............)))))))((((.............))))..((...))..))..............((.............))......)))))..(((((...............)))))................((((......))))...............((.(((..{{.......))).....}}...)).....))...))((......(((...((.(((.....((..(((((........(((((.....)))))......)))))....))....)))....((.....((.(((.(((((((.(((.........((....)).....))).)))).......((..))..))).)))))......))..))...)))....((....((..(((((...))).)).))...)).......(((..(((((((((.))))))))).........)))))....((...))........]]....((((...((....((.....(((((((................(((.....(((.(((((.....)))))((..........)).)))...........((...((....((())).(((..))).....))((((.((((((((........))...)))))).....((....))........)))).......))............)))...)))))))...(((...........((((.......)))).......)))......((.((((..)))).))........)).......(((.)))............))...)).))....................(((.(((((((....((...........)).....))))))).)))....................((.((((((....)))))).))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((......))))).(((((((((((((((((((((((.....)))))))..)))))(((((.((((((((((...(((.....(((((((((((((((((.(((((....((((((....)))))).)))))...(((.(((((....))))).)))((((...)))).)))))))..))))))))))((((((((((((((....))))))))))))))..))).((((....))))...))))))))))..(((....))))))))..((((((.......))))))...(((((((...[[[[..)))))))...]]]]...((((....(((....)))...))))......(((......[[[))).....]]].(((...((((......))))[[[[[[[[)))......]]]]]]]]...)))))))))))..............(((((((((((((((((((((......((((((.....))))))....)))))))))..(((((((((((((((((....((((((.((((...((((((((..((((....(((((.......((((....(((....(((((((...........)))))))...))).)))).))))).)))).))))))))...))))))))))....)))))))(((((((((((((((((........(((.....((((..(((....((((....))))))).))))..))).........(((((((....)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))....((((((((......[[[[[[[[[((((....))))...))))))))...((((((..(((((.....))))).))))))..]]]]]]]]]......(((........[[[[.[[[......[[[[[[[[[)))..]]].]]]]]]]]]]]]]......(((.((((....))))[[[[.....)))(((((.((((((....)))))))))))...]]]].....))))))))(((....[[[[)))..........]]]]..((((.(((..((((((((((((...(((.((((....)))).))).))))))))))))..))).)))).........(((((((((....)))))))))...
|
|
PDB_00411
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGUAGGAUAUGCUUCGGCAGAAGGACACGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((((..)))))).)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((....))).....)))))))
|
|
PDB_00417
|
[ FASTA input ]
|
AAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUUAAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
..(((.((((..))))...((((((((((.(((((((............(((..))).)))))))))))))).)))...)))..(((((.((((..))))...((((((((((.(((((((.............(((..))).)))))))))))))).)))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....)))...((((..(((..(((((((....(((((.(((((......(((((((..(((..((((..((((....))))(((....)))...))))..)))..))))))).....))))).)))))......)))))))..)))..))))..))))))
|
|
PDB_00420
|
[ FASTA input ]
|
GGUCUGGGCGCACUUCGGUGACGGUACAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((....))).))).))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....)))......))))))
|
|
PDB_00421
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGGCUAGCUCAGCGGAAGAGCGCUCGCCUCACACGCGAGAGGUCGUAGGUUCAAGUCCUACGCCGCCCACCAGGGCGGCUAGCUCAGCGGAAGAGCGCUCGCCUCACACGCGAGAGGUCGUAGGUUCAAGUCCUACGCCGCCCACCAAA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))).....(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[..))))..]]]](((...[[[))).....(((((.......)))))(((((((....))))))).......]]]...(((..[[[[.))).....]]]].....(((((.......))))))))))))......
|
|
PDB_00423
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUCCGUGAUAACAAAGCGGUUAUGUACCGGAUUUUUAUUCCGGCUAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCAUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......)))))))))))).....((((((..((((........))))(((((((.{{{.)))))))....(((((.......))))))))))).....(((((((..(((.........)))((((((((...))))))))...(((((.......))))))))))))....}}}]]]
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.((((........))))....[[[[..)))))))..]]]](((((.......)))))........(((((.......[[[[.)))))..]]]].((((......[[[))))..]]](((((..[[[..)))))...]]].....((((((((.(((....[[[..))).(((((.......)))))..]]]((((......)))).))))))))..........
|
|
PDB_00425
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((.........)))((((((((...))))))))....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))).....
|
|
PDB_00430
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGUUCCCGAGGGCCAAAGGGGACGGUCUGUAAAACCGUUGGCGUAGCCUUCGCUGGUUCGAAUCCAGCCCUGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))(((((((.....)))))))(((...)))...(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((((...(((.[[[[[)))......]]]]]......))))))(((((.......)))))))))))).
|
|
PDB_00431
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUAGCGCAGCCCGGUAGCGCACCUCGUUCGGGACGAGGGGGGCGCUGGUUCAGAUCCAGUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((.[[[[....)))).(((((((...))))))).]]]](((((.......)))))))))
|
|
PDB_00433
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...(((....)))...)))).[[[[[[...(((......)))..))))).....((((...(((....)))...)))).]]]]]]...(((......))).......
|
|
PDB_00447
|
[ FASTA input ]
|
AGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((..[[[[[[)))))...]]]]]]...(((((..<<<<<<)))))...>>>>>>...(((((..{{{{{{)))))...}}}}}}...(((((..aaaaaa)))))...AAAAAA
|
| [ predicted structure ] |
...(((((........)))))...((((((((.[[[[.))))))))..]]]]...(((..........[[[[[[[[))).....]]]]]]]].(((((..[[[[[[)))))...]]]]]]
|
|
PDB_00454
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCCGGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))(((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((((....)))))..))))))))))((((((((((.(((((....)))))..))))))))))
|
|
PDB_00474
|
[ FASTA input ]
|
CCGGCGGUAGUUCAGCCUGGUAGAACGGCGGACUGUAGAUCCGCAUGUCGCUGGUUCAAAUCCGGCCCGCCGGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((....[[[[.))).....]]]].((((......[[[))))..]]]...(((.....[[[[)))...]]]]
|
|
PDB_00475
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUGGUCUAGUUGGUCAUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCAGGGCCCGUGGUCUAGUUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((................(((..(((((.....)))))...)))(((((.......))))))))))))....(((((((...............(((((.....))))).......................)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.........(((.....[[[[))).......]]]](((....((((.......))))((((((((....)))))))).(((.....))).[[[[[)))....]]]]]......((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00481
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGCGCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.(((....)))))))))))))((((((((((.(((....)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.................)))))))(((((((.................)))))))
|
|
PDB_00513
|
[ FASTA input ]
|
GGCAACGGUUCGAUCCCGUUGC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.......)))))))
|
|
PDB_00522
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGAACCGUACACCGGAAUCCGAAAGGAUUUGGGCGUGCCCCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((..(((.....)))(((((....))))).((((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((....((((((....))))))....))))..)))))
|
|
PDB_00526
|
[ FASTA input ]
|
AGAAGGAGCGUACAGGUAGGUCGCU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((...........)))...
|
| [ predicted structure ] |
......((((...........))))
|
|
PDB_00527
|
[ FASTA input ]
|
AGAAGGAGUGUACGGUUAGGUCGCU |
|
[ reference structure ]
|
..((....((()))........)).
|
| [ predicted structure ] |
......((((...........))))
|
|
PDB_00528
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCGGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCCAAAAAAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((((.......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...)))))).(((((.(((((((.......)))))))...))))).((((((.(((((((.......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((((((.......(((((((...((((((((((((.(((((((.......(((((((...((((((((((((.(((((((.......(((((((...((((((((((((.(((((((.......)))))))...)))))))))))).))))))).......)))))))...)))))))))))).))))))).......)))))))...)))))))))))).))))))).......)))))))...))))))((((((.(((((((.......)))))))...))))))........
|
|
PDB_00537
|
[ FASTA input ]
|
GGAUUGUUACUGCUACGGCAGGCAAAACC |
|
[ reference structure ]
|
...((((..(((((..)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((..((((....))))))))....
|
|
PDB_00553
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((((......)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((......)))))))))))
|
|
PDB_00555
|
[ FASTA input ]
|
GGCCACCUGACAGUCCUCUCCGGAGAGAGAAGUCAACCAGAGAAACACACCAACCCAUUGCACUCCGGGUUGGUGGUAUAUUACCUGGUACGGGGGAAACUUCGUGGUGGCCGGGCCACCUGACAGUCCUCUCCGGAGAGAGAAGUCAACCAGAGAAACACACCAACCCAUUGCACUCCGGGUUGGUGGUAUAUUACCUGGUACGGGGGAAACUUCGUGGUGGCCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..(((((((())))))))..))))(((.(((((..((((((((((..........))))))))))...)).))).)))(((((((..)))))))))))))).(((((((.(((..(((((((())))))))..))).(((((((((..((((((((((..........))))))))))...)).)))))))(((((((..)))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....((((((((((((....(((((((((.......(((((((((..........)))))))))(((...))))))))((((((....))))))((((((...))))))))))....))))))))))))....))))(((((.......(((((((((..........)))))))))(((...))))))))((((((....))))))))))))).
|
|
PDB_00565
|
[ FASTA input ]
|
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))
|
|
PDB_00569
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).....((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...))).(((((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((...((((((((....))))))))(((...))).)))))))))..))))..))))))...))))..))))))..)))...))))))))....
|
|
PDB_00570
|
[ FASTA input ]
|
GGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCCGGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((....)).))))..))))).(((((((((....((....)).))))..))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[.....))))....]]]].......(((((.[[[[.....)))))...]]]]........
|
|
PDB_00571
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......))))))))))).....]]]...
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.((((........))))....[[[[..)))))))..]]]](((((..[[[..)))))...]]]...........
|
|
PDB_00573
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGCGCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
|
|
PDB_00584
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCGCAAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.........(((((((((((..)))))..........))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[...((((...))))...)))).((((......))))..]]].
|
|
PDB_00593
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAGGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((.......)))))(((((((....))))))).)))))))).))).)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))......
|
|
PDB_00599
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCUUGAUCCCGGAAACGGUCGAUCGCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..((((((((..))))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..(((((((....)))..))))))))))
|
|
PDB_00601
|
[ FASTA input ]
|
GCGAGCCUAGCGAAGUCAUAAGCUAGGGCAGUCUUUAGAGGCUGACGGCAGGAAAAAGAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGUCUCGAGAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGCAGCGAGCCUAGCGAAGUCAUAAGCUAGGGCAGUCUUGGCUGACGGCAGGAAAAAAGCCUACGUCUUCGGAUAUGGCUGAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGUCUCACUAGAAAUGGUGAGAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..........)))))).((((((....))))))..((.(((((.......))))).....(((((............(((()))).........)))..))))))))).(((((((((((..........)))))).(((((..)))))..((.((((((((((((...(((....)))..)))))).)))))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..........))))))...(((....[[[[[[)))(((((((.........))).......))))..........]]]]]]..(((.....[[[.........)))...]]]..((((((...[[[....)))))).((((....))))..]]]((((....((((...(((....)))..)))).....))))........((((.[[[......((((((((....))))))))))))..]]].........)))))
|
|
PDB_00603
|
[ FASTA input ]
|
GGACUGGGCGAGAAGUUUAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((...))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....)))))))))
|
|
PDB_00609
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUAAGGUCGUUGUUCGUGAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAUUCGGGUUUCUCUGCGUAGGUGGGAGAAACUGGCCGGUCGGUGGCCACCCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........(((((((((((...((..((((((((((((.....((((((..{{.{{{..)).....((((((...((.}}}.}}..))......))))))...))))...(((....)))(((((....))))).(((....))).))..((((((((....((....)).....)))))).))...................((((....((((.....))))...))))...(((.....((((((..((..(((...((.((......)).))((......ddd.....))DDD...)))....))..))))))......(((((((((.......)))))))))......(((((.[[[[[)))))..)))......)).)))))).)).............(((....)))...))........(((((....)))))...............)))))))))))........(((((((((((.......))))))))))).((((........))))((((((....(((.((((((((..........(((....))).........((....))....((....))............)))))))))))..((((((.((((((.....(((((((((..(((((....((((......))))....)).)))...(((.((((((......)))))))))....)))))))))...((.......))......))))))..))..))))..((((((....(((........)))((..(((((...((((((((((..........(((.((((......)))).)))..........))))))).)))..)))))...))..((((((((..........))))))))....(((......)))...((((.(((...((((((.....cccc............((((.((((((((..........((((((((..(((.........)))..)))..........((....))...)))))......)))))))))))).........)))........CCCC.)))...)))))))((.((((((((...)))))))))).....))))))(((((.(((.((....((((((..(((..)))..)))))).)).))).))).)).....))))))((...((((.....((((((.......))))))(((((...((((.((....((((((...((.....)).))))))....((aaaa.....(((((..(((....)))..))))).......(((((........)))))))..((((((((..(((..........(((((((((..(((((.((((.((...<<....))))))...((((......((.((((((.............))))))....))......))))..((.((((((....)))))))).)))))...)))).)))))...............))).....))))))))..AAAA...))....((......)).)))).(((((....))))).)))))..(((((...(((((((((((...............(((((...(((..)))....)))))((((((((...))))))))............((((((.((...((.........))...((((.((....((((.....))))......)).))))..((((.(((..((.((((..(((....((..(((((....)))))..))....)))))))...)))))..(((.........))).........((...........((((((.....)))))).....))...))))...))..)))))).....))))))))))))))))))))..)).....(((((........)))))..((((((((.(((.........((((.((((((..(((((((((.((((..((.((((.((((((((......(((((.....((((.(()).))))..)))))..)))).)))))))).))...(((((((......))))))).....)))).)))).)))))..(((.......)))((((((...........))))))..((....((((((...(((((.........)))))..........bbb......))))))....(((...((((....))))...))).(((....))).))BBB......((((((((.((..]]]]].))))))))))............))))..))))))........(((...((((((...(((.....)))...))))))....)))...........(((((..(((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))....))..))).......((((((((..)))).))))........)))))))))))....((((((....((((..(((((((....((....))...)))))))((((((...((((...(((((((((((.>>.))))))...)))))...)))).)))))).(((((..(((((.............)))))..)))))))))........))))))..(((..)))...((((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))))...))))))))..(((((.(((....((.((((((....(((((...............)))..))...))))))..)).((.....((((.(((((....))))).)))).....))..))).))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((........(((.[[[[)))(((....))).....]]]].....((((.......[[[........((((((.((((.........))))....))))))..))))....(((....)))(((((....)))))((((....))))]]]..(((.(((.(((((......))))).)))...[[[[..[[[.)))..]]]..]]]].......(((((((((...........((((.....((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))......((((((((((.....))))))))))......((((((....))))))..))))......((((.(((........)))....[[[[....))))..]]]].......((((....))))..............................(((...((((((((((.......))))))))))[[[[...)))..]]]]..(((......((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....)))).......))))))))))))))......[[[[.)))................]]]]....(((((..[[[.)))))((((((((((...)))).))).))).....]]]..((((.((((((.(((((((((.....))).......)))))).)))))).))))..(((((......((((((((..(((((((((........((((((...(((...(((.((((......)))).)))..)))....))))))........))))).(((((.(((((((.(((.....))))))))))....(((......)))..(((((((((....((((((.....(((((((..((((.......((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))...((((........))))....)))..))))))))))))))...((((((((.((((......((((((........(((..((((((((...))))))))))))))))).))))(((((((((((......(((((..........)))))...............))))))..((((..............((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...(((...))).))))))))..)))....(((......)))....))))))..)))).))))).(((((........))))).))))))))...)))))))..)))))).................((((.....))))...))))).)))).)))))..))))((((((...(((...))).))))))...)))))))).....))))).(((((....)))))((((((.......[[[[[...........))))))....]]]]]......((((((((((...(((((.........(((((..(((((....)))))..)))))..[[[[....(((.....)))...)))))..]]]](((((.....(((....))))))))((((((((...))))))))....((((((((....[[[[[.))))))))..........((((((((....(((.....)))......))))))))..]]]]].((((((((((((......((((((((.(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))......[[[[((((((.....)))))).)))))..]]]].....((((..[[[(((((((((.....)))))..))))..))))....(((((((....)))))))..]]]........(((.........)))...))))))))....)))))))))))).((((((((((((.........))))))...((((((.....))))))[[[[[[[[...((((....)))))))))).......]]]]]]]]..........))))))))))....(((.......[[[[[)))..........]]]]]......(((((((((..((((((((...))))))))......[[[[........)))))))))...]]]].(((...[[[)))((((...(((....)))..)))).]]]...(((((((.[[[[........)))))))....]]]]......((((...[[[[[.))))..(((((((((((((((.........)))..))))))).))))).]]]]]......)))))))))(((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....)))..((((((((((...((((...)))).(((((((((......)))).)))))......))).))))))).(((((((.(((.((((..((((((((((((....))))))...))))))..))))[[[[)))....]]]]...((((.............[[[[[[[))))..........]]].]]]].))))))).....(((((((((.......)))))....((((((((.(((..((((((....))))))...)))..))))).)))...))))...))))))))).((((((((((((((....))))).........((((..[[[......)))).(((...))).]]](((............[[[[)))...]]]](((.....)))....)))))))))
|
|
PDB_00611
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCGCAUUUGGACUUCUGCCCGGCACCACGGUCGGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((.......(((...((((.)))).....))).))))
|
| [ predicted structure ] |
..........(((........[[[[[.)))..]]]]]...
|
|
PDB_00617
|
[ FASTA input ]
|
GGUUCACCUCUAACCGGGUGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......)))))))))
|
|
PDB_00627
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.(((((.......))))).))))....((((........)))).)))))
|
|
PDB_00629
|
[ FASTA input ]
|
CAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUGCAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((..((((((..)))))).))))))((((((..(((((....))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((........)))((((...[[[[[[[..))))..((((....)))).]]]]]]]
|
|
PDB_00637
|
[ FASTA input ]
|
GAUUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGA |
|
[ reference structure ]
|
......((((((((....))))))))..(((((.......)))))...((((((((....)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((....)))))))...(((((.......)))))))))(((((((....)))))))..
|
|
PDB_00644
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUAAGGUCGUUGUUCGUGAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAAGGGCACGUAAUGUGUUCUAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUAAGUGCAAGCAAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUCAACGUUGGGACGUGGUGCGUAGGAUAGGUGGGAGGCGAAGAACCCUGGCUACGGCUGGGGGGAGCCGCCGGUGAAAUACCACCCUCUACUCUUUGACGUUGUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........(((((((((((.((((..((((((((((((.....((((((..<<..<<..)).....((((((...((.>>..>>..))......))))))...))))...(((....)))(((((....)))))(((((..)))))))....(((((((...((....))....)))))))...........((....))...((((.((..((((...))))..))))))...(((.....((((((..((..((((..(((((......)))))((.....dddd.....))DDDD.))))....))..))))))......((((.((((.......)))).))))......(((((.[[[[[)))))..)))......)).)))))).)).............(((....)))...))........((((((..))))))............)).))))))))))).........((((((.(((.......))).))))))..................((((((....(((.((((((((....((....(((....)))....))...(((..)))...((.......))..........)))))))))))..((..((.((((((.....(((((((((.((((...(((((((......)))))))....))))..(((....((........))...)))....)))))))))...((.......))......))))))..))....))..(((((((...((..........))..(((((((....((..((.((...((.....(((.((((...(((((((.....)))))))...)))).))).....))...)).))...))...))))))).....(((((((............)))))))....(((......)))...((((.(((..(((((((.....cccccc...........(((...((((((............((((((..(((.........)))..))).........(((....)))..)))........))))))..)))..........)))......CCCCCC.))))..)))))))...((((((((...))))))))......)))))))..(((.((((((....((.(((..(((..)))..))).)).)))))).)))........)))))).....((((.....((((((.......)))))).((((...((((.(((...((((((...((.....)).))))))....((bbbb.((..(((....(((....)))....)))..))...(((((........)))))))..((((((((..(((...(((((..(((((.((((((((((..(((.((...aa....)))))...(((((.((((.((.((((((.............))))))....))))..))))))).((.((((((....)))))).))))))))).)))..))))).......)))))...))).....))))))))..BBBB..)))....((......)).)))).((((......)))).))))...(((((...((((((((.((...............((((((..(((..)))...))))))((((((((...))))))))............((((((.((((.((.........)).))(((((((....((((.....))))......)))))))..((((.(((..((.((((..((((...((.((((((((((....)))).)))))).))...))))))))...)))))..(((.........))).........((............(((((.....)))))......))...))))...))..)))))).....)).))))))))))))))))).........(((((........)))))..((((((((..((.........((((.((((((..(((((.....(((((.((((((((((((((((((.........((((((((((...(((((((((((..)))))))))))))))..........))))))))))))))))))))))))...(((((((......)))))))....)))))......)))))..(((.......)))((((((...........))))))..((....((((((...(((((.........))))).....((...{{{))....))))))....((((..((((....))))..)))).((((..)))).))}}}.......((((((..((..]]]]].)).)))))).............))))..))))))........((...(((((((...(((.....)))...)))))))....))...........((((((((((..((((((............)))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).......((((((((..)))).))))........)).))))))))....(((((((...((((..(((((((...............)))))))((((((.....(((..(((((((((((.AA.))))))...)))))..)))...))))))...(((..(((((.............)))))..)))..)))).......)))))))..(((..)))....(((((((((.......)))))....((((((((.((((...((((((..))))))..))))..))))).)))...))))....)))))))).((((((((((....((.((((((....(((((...............)))..))...))))))..)).(((..((.(((.((((((..)))))).)))..)).)))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((....[[[[[.[[[[[[[[[)))...]]].....]]]..]]].]]]]].(((.....[[[[[[.............)))......]]]]]]...(((...((((....))))((((....))))(((((....))))).....[[[[)))(((((......)))))..]]]].((((..(((......)))..))))....(((((((.....((((((((...((((.....((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))......((((((((((.....))))))))))......((((((....))))))..))))...........(((((.....(((((((..............(((((.......((((....))))...................((((((............))))))))))))))))))))))).(((((((.........(((((((((((..((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....)))).......))))))))))))))........((((..((((((.......(((((((....(((((......)))))((((((((((...)))).)))(((.......(((..((((.....))))..)))......)))...)))))))))).......))))))..(((((......((((((((..(((((((((........((((((...(((...(((.((((...((((((((...))))))))...)))).)))..)))....))))))........))))).(((((.(((((((.(((.....))))))))))....(((......)))..(((((((((....((((((.....(((((((..((((.......((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))...((((........))))....)))..))))))))))))))...((((((((.((((......((((((........(((..((((((((...))))))))))))))))).))))(((((((((((......(((((..........)))))...............))))))..((((..............((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...(((...))).))))))))..)))....(((......)))....))))))..)))).))))).(((((........))))).))))))))...)))))))..)))))).................((((.....))))...))))).)))).)))))..))))((((((...(((...))).))))))...)))))))).....))))).(((((....)))))....)))).........(((((((((...(((((.....((((((.........((((...(((((..(((((....(((((..(((((....)))))..)))))(((((......))))).((((((.(((((....(((((.......(((....)))(((((((((((((...))))))))((((((.........(((....)))(((...)))......(((((.((((..(((.....)))........(((((...)))))..(((................)))...))))))))).......)))))).......)))))))))).....((((((.......))))))........))))).))))))))))).....((((.(((((.(((.....))).....((((.((((((((((((((.(((..(((((...)))))...(((((((....)))))))..)))......((((..((((...........))))......)))).........)))))))))..))))).)))).))))).))))........(((((((....)))))))...(((((((((.......((((.(((((.(((((.((((....(((((((......)))))))((((((.(((((..(((.....((((.((((....((((((...........))))))))))...))))))))))))))))))(((.....)))....)))))))))))))).))))((((..((((..(((......)))..)))).(((....))))))).......)))))))))....)))))..))))......)))))).......((((.........)))))))))..((((((((((.........)))..))))))))))))))))....)))))))))))...(((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).......)))))))...)))))))).(((((((....))).)))).........))))))).......((((((((.(((((.....)))))..(((.......[[[..)))..]]]...((((((..((((((((((((....))))))...))))))..(((.((((((...)))))).[[[[[...))).....]]]]]...)))))).........))))))))..............(((((((((.......)))))....((((((((.(((..((((((....))))))...)))..))))).)))...))))...))))))))).((((((((((((((....))))).........((((..[[[......)))).(((...))).]]](((............[[[[)))...]]]](((.....)))....)))))))))
|
|
PDB_00648
|
[ FASTA input ]
|
AGCACGGCUUAAACCGUGCAGCACGGCUUAAACCGUGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......)))))))((((((......))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((......))))))(((((((......)))))))...
|
|
PDB_00663
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGGGGGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGG |
|
[ reference structure ]
|
...(((.((....)).)))......(((..((..))..)))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))((((((((....))))))))
|
|
PDB_00667
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCAGCGCAUUCGUAAUGCGAAGGUCGUAGGUUCGACUCCUAUUAUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))..((((((...))))))..(((((......))))).....)))))))....
|
|
PDB_00675
|
[ FASTA input ]
|
UAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUAACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUCGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUCCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAUUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACCGCGGUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((((((((..(((((((((.((.....(((((((.ee.eee.)))....(((((((((((((EEE.EE.)))...))))))))))..))))...(((...)))....((((((.....))))))))..(((((((((((((......)))).))))))).))....((..((.....))...(((((((.(((((...))))))))))))...(((.((.((...(((((..))))).....)).))..(((((((((....((((((((.((((((((((....((((.dd...)))).((......<<<.DD..))>>>..))))))))))..)))))))).))))))).)).....(((((((((......))))))))).....(((((.{{{{{{)))))..)))))......))))))).)).............(((((..)))))..)).........(((((...))))).............)))))))))))))))).......((((((((((......(((((((((..((((.((((((....))))))..)))).))))))))).....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((.(((((.....))))).))))...(((..))).....(((((((((((..))))))))))).((((((....))))))...)))))))))))))..(((((((((((((.....(((((((((..(((((((((((((((..)))))))))))).)))...((((.(((.((........)))))))))...)))))))))...(((.....)))......))))))).))..))))..(((((((((((((((....)))))((((((((((((((.(((((((((.(((((....(((((((.)))))))..)).))).))))))))))))....)))))))))))...((((((((((.....)))))))))))).((((......))))..(((((((..(((((((.....ffffff.....ff.........(((((.((((((((((...((..(((((.(((..(((.........)))..)))........((((....))))..))))).)))))))))))))))))........)))FF....FFFFFF.))))..)))))))(((((((((...)))))))..))..))))))))((((((((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)).....))))))(((...(((.......((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((aaa(((..((((((((((.....)).))))))))....)))..(((((........)))))))((((((((.....((((((((((((((((((.((((((((((((..cc.))))))(((((((((..((((((((((.(((.....)))..))))))))))...))))))).))((..)))))))).))))))))))......)))))))))))))))).AAA..)).....((......)).))))..(((((...)))))..))))...((((....((((((((((((...............((((((.((((..))))..))))))(((((((((.....)))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((((.((((((..)))))).))..)))))))).((((.(((..(((((((..((((...((((((....))))))...)))))))))..)))))((...))....................(((((.......)))))..........))))...)).))))))).....)))))))))))))))))))..))).((..[[[[[......))]]]]]..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((((((((((((((((..)))..((((((..))))))..))))))))))).)))))...((.......))..((((((.((....))..))))))..((...(((((((..(((((((..)))))))....((...bbb))....)))))))...((((((((((.......)))))))))).((((..)))).))BBB....((.(((((.(((((.}}}}}}))))))))))))........))))..))))))......(((((.((((((((((((((.....))))))))))))..))))).))......((((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).))....((((((((..)))).))))....))..)))))))))))....((((((..(((((..((((((((((.(((....)))))))))))))(((((...(((((.(((((((((((CC..)))))...)))))).))))).))))).(((((..(((((..(((.)))....)))))..))))))))))......))))))...(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))...((((((....((((((((.....(((((((....((....)).))))..)))...)))))).)).(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))).))))))...(((())))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((....(((((..((((((.((((((((((((((........((((.....((((((...(((.......)))......))))))..((((.........((((.....(((((.....)))))))))...(((((..(((((......))))).))))).)))).......)))).........)))..(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).))).))))))))..((((((((((......((((......)))).....(((.((((....)))).))).)))))))..((((...)))))))...(((......(((((((........)))))))......(((((.......)))))..))).........))))))...............(((((((......)))))))......((((....))))..........)))))....))))))))))).....((((((((((((....((((.[[[[......))))(((((....)))))............]]]]......))))))))))))..............(((((((....((((((((((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...(((....)))...)))))((((((....))))))...))))))))))))))........((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))......)))))))...((((..[[[[))))..]]]](((((....))))).(((((((((.......((((....))))..[[[[[[[......)))))))))...]]]]]]]..(((...(((((((((((((.....)))))))))).)))[[[[[....)))...............]]]]]......((((((....))))))......(((.[[[[...)))..]]]].(((((..[[[[..((((((...........))))))..((((......)))).)))))...((((((((...(((.........))).))))))))]]]]...(((..[[[....[[[[[)))....]]]]]......]]].....((((((((((((......((((((((....))))))))...)))))))).............[[[[........))))...((((((.......))))))]]]]...........(((.[[[[[[[)))........]]]]]]].........(((((.((((((.......[[[[[))))))....))))).(((((........)))))..((((....))))...]]]]].((((((((...(((((((((((((...)))))).....(((((....(((((....((((...)))).....))))).....)))))..........)))))))...))))))))..........(((......[[[[[)))..........]]]]].((((((......(((....))).((((....((((.....((((((((.((((........((((((((((.....(((....))))))))((((((((((...)))))))))).....)))))..(((((((.....(((((((((.......((((((((....(((....)))......))))))))...(((((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....))))))).....((((((......))))))(((((.......))))))))).....)))))......)))))))....)))))))))))).)))).....((((((......)))))).))))...)))))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((.((((....))))((((....)))).....))))))))..)))))......(((((.[[[[((((((((.......))))))))))))).......(((..(((((....)))))..)))]]]]..............(((...(((((((((((.....)))))))))))((((....))))[[[..)))..]]].....((((((.....))))))...(((((((...............[[[[.......)))))))(((....))).....(((((((((((((....))).))))..))))))]]]]..((((((((((((......)))))).))))))(((..[[[[[)))..............]]]]]..(((...(((((((....))).))))....)))........((((((..(((((((........((((((((.....[[[[......))))))))(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).]]]]......))))))).....((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))....(((((((......[[[[[[)))))))......]]]]]](((....)))........((((...(((((((((......)))))))))..[[[[[..))))......]]]]](((((....))))))))))).
|
|
PDB_00679
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGUCGGCCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGUCGGCCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGUCGGCCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((......(((..((((((..))))))..)))...)))))....(((((......(((..((((((..))))))..)))...)))))....(((((......(((..((((((..))))))..)))...)))))....(((((......(((..((((((..))))))..)))...)))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....)))))).....(((..[[[.....)))..]]]((((((((((.....)))))).))))(((..[[[.....)))..]]]((((((((((.....)))))).))))(((..[[[.....)))..]]]((((((((((.....)))))).))))(((..[[[.....)))..]]]....
|
|
PDB_00681
|
[ FASTA input ]
|
CUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))(((((...((((((((()))))...)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((..((((((((((.......)))))))))).))))..)))))
|
|
PDB_00682
|
[ FASTA input ]
|
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((())))))))(((((((())))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((....))))))))))))))
|
|
PDB_00686
|
[ FASTA input ]
|
CGUACGCGGAAUACUUCGAUCGAAGUAUUCCGCGUACG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
|
|
PDB_00687
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGGGAAGAAACUGCGGCUUCGGCCGGCUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..........((((((..))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((......((((....)))).))))))
|
|
PDB_00692
|
[ FASTA input ]
|
GCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGCGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..)))...)))))))((((((((((..)))...)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.................))))((((.................))))
|
|
PDB_00693
|
[ FASTA input ]
|
GCGCUCUGAUGAGGCCGCAAGGCCGAAACUGCCGCAAGGCAGUCAGCGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......(((((..)))))...(((((((..))))))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......((((....))))...((((((....)))))).)))))
|
|
PDB_00698
|
[ FASTA input ]
|
CGUACGCGUCACGCGUACGUUCGUACGCGUCACGCGUACGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))..
|
|
PDB_00701
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUCGACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUCAGGCUGGAGGAUCGCUUGAGUCCAGGACCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUUGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCAAUAGCCACUGCACUCCAGCGAUCGGGUGUCAUCGCGCCUGUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))).((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))((((.((....(((((...((.((((.)))).)).....)))))...)).)))).......(((((.(((((((.(((((...)))))))))))).)))))..((.(((((......))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((((((..((((....((((........)))).....(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....))))))))))).....(((((((.((((.......(((((...))))).(((((...))))).............((((((.(((((...))))))))))))))).)))))))..)))))))))))))))..
|
|
PDB_00702
|
[ FASTA input ]
|
GGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCCGGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((.....((((((((....)))))))).)))..))))))((((((.(((.....((((((((....)))))))).)))..))))))
|
|
PDB_00703
|
[ FASTA input ]
|
UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((..{{.....)))).((((.(((((..((((((((.....(((.(((.((((...((.((((((.)))))).)).))))....((((......((((((((..(((..(((((((.(((((((.((((((((..)))))))).)).)))))((..((((((((((....)))))))))))).((((...)))).))))))).)))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..(((((((((..)))))...))))))))((((((..........))))))((((((..))))))..))))))......((.(((....(((((..)))))..))))))).))))))..(((((....(((((....)))))...)))))....((.((((((((...))))))))..))......((((((((...[[[[[.....[[.)))]].......]]]]])))))..)))))))))..........(((((.....((((.(((((.(((((((.(((((((((((....((((((((...))))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).)))...))))).))))...(((((((...(((.(((((.........))))).)))))))))).........<<<<<<.(((((((((((...)))))))))))..<<..))>>.....>>>>>>.))).(((((.((.(((((..)))))))))))).....}}.(((((.(((((((.(((.(((((((((((((((((......((........))..........(((((((......((((((......((((((..)))))).....))))))..((.(((...(((((((((...((((((((((..))))..(((((....)))))..)))))).....((((.(((((((.((...((((.....))))...)))))))))....(((((((..))))))).......))))....)))).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((((..(((.......((((....)))).........)))..)))))))))......((.(((((((((........))))))))).))....))))))((.((((((((((........)))))))))))).)))...)))))))))).))....((((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((...(((....)))))))))))))))))))))))))).)))))))).))))).))).....(((((((((....)))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
......((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]].....(((((((((.((((((.....))))))...(((........(((((((...((((.(((((((.((((((...((((((....))))))....))))))...(((((.(((((....))))).)))))..((((...)))).))))))).))))))))))))))....(((..((((((((.......))))))))))).....((((((((..((((....))))(((((((....(((((.(((.....)))))))).((((....))))....(((((((((.((((((....(((((....)))))...(((((....)))))...)))))).((((....))))......)))))........((((.....))))))))...........)))))))..((((((.........[[[[.....))))))..]]]]...))))))))..((((((((((((..(((.(((....))).)))...))).)))).)))))...((((((.....))))))(((.(((((((.(((((((.(((.....((((((...(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..))))))......)))...(((......)))...))))...((((.........))))))).))))))))))...(((((((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).)))).....)))))))))....(((((..[[[[[(((((..((((........)))))))))))))).(((((((...((((((((..(((((((....))))))).)))))))))))).)))]]]]]...((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((....)))))........)))))))))....(((.[[[[[[)))....................]]]]]].....(((((((.....(((((....((((....))))......))))).....)))))))......(((..(((((((........))))))).....))).....(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]...((((.(((..(((((((((((((.....((((....(((....))).))))....)))))))))))))..))).))))..............((((((((((....)))))))))).....
|
|
PDB_00704
|
[ FASTA input ]
|
UAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUCGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUGCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUCCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGGGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCGCAAGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCCGACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGGACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUGGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAUUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((((((((..(((((((((.((.....(((((((.cc.ccc.)))....(((((((((((((CCC.CC.)))...))))))))))..))))...(((...)))...((((((.....))))))))..(((((((((((((......)))).))))))).))....((..((.....))...(((((((.(((((...))))))))))))...(((.(((((...(((((..))))).....)))))..(((((((((....((((((((.((((((((((....((((......)))).((......bbb.....))BBB..))))))))))..)))))))).))))))).)).....(((((((((......))))))))).....(((((.aaaaaa)))))..)))))......))))))).))...............(((..)))....)).........(((((...))))).............)))))))))))))))).......((((((((((......(((((((((..((...(((((((..)))))))....)).))))))))).....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..((((.(((((.....))))).))))...(((..))).....(((((((((((..))))))))))).((((((....))))))...)))))))))))))..(((((((((((((.....(((((((((.((((((((((((((((..)))))))))))).))))..((((.(((.((........)))))))))...)))))))))...(((.....)))......))))))).))..))))..(((((((((((((((....)))))((((((((((((((.(((((((((.(((((....((((((...))))))..)).))).))))))))))))....)))))))))))...((((((((((.....)))))))))))).((((......))))..(((((((..(((((((.....[[[[[[.....[[...........(((.((((((((((...((.((((((((((..((((.......))))..))).........(((....)))..))))))))))))))))))))))..........)))]]....]]]]]].))))..)))))))(((((((((...)))))))..))..))))))))((((((((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)).....))))))(((...(((.......((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((ddd(((..((((((((((.....)).))))))))....)))..(((((........)))))))((((((((.....((((((((((((((((((.((((((((((((.....))))))(((((((((..((((((((((.(((.....)))..))))))))))...))))))).))((..)))))))).))))))))))......)))))))))))))))).DDD..)).....((......)).))))..(((((...)))))..))))...((((....((((((((((((...............((((((.((((..))))..))))))(((((((((.....)))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((((.((((((..)))))).))..)))))))).((((.(((..(((((((..((((...((((((....))))))...)))))))))..)))))................(((((.......)))))..........))))...)).))))))).....)))))))))))))))))))..))).((..{{{{{......))}}}}}..((((((((.(((.((......((((.((((((..((((((((((((((((...((((((.........((((((((((..))))..........)))))))))))).......((((((..))))))..))))))))))).)))))...((.......))..((((((.((....))..))))))..((...(((((((..(((((((..)))))))....((...<<<))....)))))))...((((((((((.......)))))))))).((((..)))).))>>>....((.(((((.(((((.AAAAAA))))))))))))........))))..))))))......(((((.(((((((((..(((.....)))..)))))))..))))).))......((((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).))....((((((((..)))).))))....))..)))))))))))...((((((..(((((..((((((((((.((((..))))))))))))))(((((...(((((..((((((((((....)))))...)))))..))))).))))).(((((..(((((..(((.)))....)))))..))))))))))......))))))...(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))...((((((....((((((((.....(((((((....((....)).))))..)))...)))))).)).(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))).))))))...
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((....(((((..((((((.((((((((((((((........((((.....((((((...(((.......)))......))))))..((((...........(((...(((((.....)))))..)))..(((((..(((((......))))).))))).)))).......)))).........)))..(((..((((......)))).)))(((((..((((..((((....))))....))))....))))).))).))))))))..((((((((((......((((......)))).....(((.((((....)))).))).)))))))..((((...)))))))...(((......(((((((........)))))))......(((((.......)))))..))).........))))))...............(((((((......)))))))......((((....))))..........)))))....))))))))))).....((((((((((((....((((.[[[[......))))(((((....)))))............]]]]......))))))))))))..((((....))))(((((((....((((((((((((((..((((..(((((...)))))..))))...............(((((...(((....)))...)))))((((((....))))))...))))))))))))))........((((((((((((((((((((..((((...(((((((....)))))))....))))....(((..(((((......)))))..)))....)))))))))))((((.....)))))))..))))))......)))))))...((((..[[[[))))..]]]](((((....))))).(((((((((.......((((....))))..[[[[[[[......)))))))))...]]]]]]]..((((((...((((((((((.....)))))))))).[[[(((......)))..............))))))......((((((....))))))]]]...(((.[[[[...)))..]]]]((((((....))))))....(((((((....................(((((((((((....((((((((...(((.........))).)))))))).....)))..(((........[[[....[[[[))).....]]]]...]]]((((((((((((......((((((((....))))))))...)))))))).............[[[[........))))...((((((.......))))))]]]]...........(((.[[[[[[[)))........]]]]]]].........(((((.((((((.......[[[[[))))))....))))).(((((........)))))..((((....))))...]]]]]..(((((((((.......(((((((...))))))).......(((...[[[[[))).((((...)))).....]]]]]......(((...[[[[....))).......]]]](((((((.......(((.(((...))).)))........((((((..[[[......((((((....)))...))))))))).....]]]...(((.[[[[....))).......]]]]...(((((....)))))...((((((((((...))))))))))......(((...(((((((.....(((((...........((((((((....(((....)))......)))))))).....(((((....((((((.(((.....((((......))))....)))))))))....)))))...(((.(((....(((((.......))))).))))))..)))))......)))))))...))).......)))))))((((..(((((...[[[[[)))))...]]]]]..)))).((((.[[[[[.....)))).....]]]]](((((.((((((((.((((((........(((..(((....(((....))).((((...)))))))..)))...))))))((((....)))).....))))))))..))))).....((((((.[[[[((((((((.......))))))))))))))......(((..(((((....)))))..)))]]]]..............(((...(((((((((((.....)))))))))))((((....)))).[[[.)))....(((((.((((((.....)))))))))))..]]].........)))))))))......((((....))))(((((..(((.....[[[[[[))).)))))..........]]]]]].((((((((((((((((......)))))).))))).((((.....))))......)))))..))))))))......(((((((....))).))))))))))).............(((((((((..((((..((((((((...............))))))))(((((...((((...((((((((((....)))))...)))))...)))).)))))...((((..(((((...........)))))...)))).))))......))))))))).........((((.....))))((((..(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...)))).....((((((......((((((........((((....[[[......))))..]]]...)))))).(((((((((......)))))))))..(((((...(((...))))))))))))))...
|
|
PDB_00705
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGUGGUUUGUAUCCUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((......))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((....)))))))))
|
|
PDB_00709
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((())))))))(((((((())))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
|
|
PDB_00710
|
[ FASTA input ]
|
GACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((())))))))(((((((())))))))........
|
| [ predicted structure ] |
........................................
|
|
PDB_00713
|
[ FASTA input ]
|
GAGGUGCCCGAGUGGCUGAAGGGGGUAGGGGGGCCUCCCUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCCUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((([[[)).........]]]...((((((())))))).(((((.......)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((...........[[[[[.....))))..]]]]](((((.......)))))))))..
|
|
PDB_00716
|
[ FASTA input ]
|
AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((...[[[[[[(((........))))))))))).....((((((((.....))))))))..]]]]]]
|
|
PDB_00724
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCCGGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.(((((((.))))))))))))))).(((((((..(((((((.))))))).))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((((.(((((...((((((...))))))....))))).)))))...))))))).
|
|
PDB_00725
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGUGAAGUCGCUCGGCGAGCGUCACACCACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((((((.)))))))).))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((((...)))))...))))))).
|
|
PDB_00726
|
[ FASTA input ]
|
GACCGGAGUGUCGACGCAGAGAUGGUC |
|
[ reference structure ]
|
((((...((((()))))......))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..(((....))).....)))))
|
|
PDB_00727
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAUCGUUGAGAAAACGAAACAGACGGUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((..(((((................)))))..))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..............))))))))))
|
|
PDB_00728
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUACCAUGUUCAGAAGAACGUGGUAUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((..)))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((....))))))))))))))
|
|
PDB_00732
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGACCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGAUCCGCACCCGCGGAUCCGCACAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))...((((((((((..))))))))))....((((((((((..)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..[[[[[[[[[[...(((((.(((....))).)))))...))))))))))....]]]]]]]]]]....
|
|
PDB_00733
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACGCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACCGGAUCCGCACCGCGGAUCCCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((...)))))))))))..(((((((((((...)))))))))))....((((((((.))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))))...((((((((...))))))))...
|
|
PDB_00734
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACGCCGUAAGGCGCAGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((....))))..)))
|
|
PDB_00737
|
[ FASTA input ]
|
GGCACGAGGUUUAGCUACACUCGUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...........))))))))
|
|
PDB_00739
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((...(((........))).((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((........[[[[.[[[[[[..[[[[..)))))))..]]]]..]]]]]]..]]]]..((((((...[[[[[))))))......]]]]]..((((((..((((.....[[[[..))))..))))))......]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]].((((......[[[))))..]]](((((..[[[..)))))...]]].....
|
|
PDB_00740
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAGGCGAUCGUUAAUCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((()))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((....)))..))))
|
|
PDB_00741
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAGCACUCUGGUAUUACGGUACCUUUGUGCGCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((...(((((....)))))...))))))))
|
|
PDB_00746
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((....)))).)))))....))))))))))..(((((((((((((((((((....)))).)))))....)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))((((((((((..((((((((....)))).))))......))))))))))
|
|
PDB_00747
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGUGUGCCUUGCGCCGGGAAACCACGCAAGGGAUGGUGUCAAAUUCGGCGAAACCUAAGCGCCCGCCCGGGCGUAUGGCAACGCCGAGCCAAGCUUCGCAGCCAUUGCACUCCGGCUGCGAUGAAGGUGUAGAGACUAGACGGCACCCACCUAAGGCAAACGCUAUGGUGAAGGCAUAGUCCAGGGAGUGGCGAAAGCCACACAAACCAGACGGCCCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((({{{(((((((..(((..))).)))))))...((((((....(((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))(((.((((((((((((..........))))))))))))))).....[[[[[...))))))((((...(((....)))..))))......]]]]].(((((((((((..))))))...))))).))))))}}}
|
| [ predicted structure ] |
((((((....((((((...........))))))((((.(((((....((((((....(((.((((((....)))))).)))...))))))(((..(((((((((((..........))))))))....))).(((...)))...)))...((((...(((....)))..))))..))))).)))).....(((((....))))).........))))))...
|
|
PDB_00750
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCCGGGGCACGGCAAACCCCACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.....))))).((((....))))..((...(((((............(((((..((((((((())))))).)))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))))....)))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...[[[[.))))....((((....))))........]]]]............((((.....(((((.[[[))))))))).....]]]....(((.[[[[[.........)))(((((((((....))))))))).........]]]]]...
|
|
PDB_00751
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGACUCGUACUUCGGUACUGGAGAAACAGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((((((((..)))))..)))).))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((..(((((((....))))..)))...)))))
|
|
PDB_00752
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGCGCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((....((....))(((((((((......((....)).....)))))))))))))))((((((....((....))(((((((((.((((((((..)))))))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((............(((((((.....(((.........)))...)))))))))))))((((((............(((((((.....(((.........)))...)))))))))))))
|
|
PDB_00754
|
[ FASTA input ]
|
AAUCCAUUGCACGGAUUAAUCCAUUGCACUCCGGAUUUAAUCCAUUGCACGGAUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((.......)))).(((((..........)))))...(((.......)))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((..((((.((((((((((..........))).)))))))..)))).)))))
|
|
PDB_00767
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCGGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCACCAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(((.........))).)))))))(((((((.(((.........))).))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.((((..((((((((((....)))))))))).))))..)))))))))))).....
|
|
PDB_00800
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUGGCAACGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))(((((((((...)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00804
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGGUUGCCGAGCCUGGUCAAAGGCGGGGGACUCAAGAUCCCCUCCCGUAGGGGUUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCCCCGCACCAGCGGGGGUUGCCGAGCCUGGUCAAAGGCGGGGGACUCAAGAUCCCCUCCCGUAGGGGUUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCCCCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((([[[))...........]]]((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....(((((((..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[[)))...]]]]((((((.......))))))((((..[[[[[[[))))....]]]]]]].((((((((....)))))))).(((..[[[[)))...]]]]((((((.......))))))((((..[[[[[[[))))....]]]]]]].))))))))....
|
|
PDB_00805
|
[ FASTA input ]
|
GACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCGCGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUACACAGACUAGAUGUCGGCCGGGGAAGAUCUUCUCAUAAGGUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGAGUACUCGGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCGCGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUACACAGACUAGAUGUCGGCCGGGGAAGAUGUAUUCUUCUCAUAAGGUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGAGUACUCGGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCGCGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUACACAGACUAGAUGUCGGCCGGGGAAGAUCUUCUCAUAAGGUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGUCGGACCGUCAAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCGCGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGGAGACUGUUGAUAUGGAUGCAGUACACAGACUAGAUGUCGGCCGGGGAAGAUCUUCUCAUAAGGUAUAGUCGGACCUCUCCCGAAAGGGAGUUGGAGUACUCG |
|
[ reference structure ]
|
..(((((....(((((((.(((((((.....(((.((((.(((.((((((((((....)))))))))).((.......))....)))......)))))))....)))))))))).))))((..(((((...((((((((....))))))))..)))))..))....aaaaaa...)))))..(((((((..))))))).......AAAAAA..(((((((((..))))))).))..........(((((....((((((...(((((.....((((.((((.(((.((((((((((....)))))))))).((.......))....)))......))))))))....)))))..)).))))((...((((...((((((((....))))))))..))))...)).....[[[[[...)))))..(((((((.......))))))).......]]]]]...(((((((((..)))))).)))..........(((......(((((((...(((((.....(((.((((.(((...((((((((....))))))))...((.......))....)))......)))))))....)))))..))).))))((..(((((...(((((((((..)))))))))..)))))..)).....{{{{{.....)))...((((((..))))))........}}}}}.(((((((((((..)))))).)))))...(((((....(((((((..((((((....((((.((((.(((..(((((((((....)))))))))..(((.....)))....)))......))))))))...)))))).))).))))((..(((((...(((((((((..)))))))))..)))))..)).....<<<<....)))))..(((((((..)))))))........>>>>...(((((((((..)))))).)))........
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((....(((((....(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..))))).......((((...((((((((....))))))))..))))..(((((...(((((.......(((.(((((....)))))....))).)))))......(((((....))))).....)))))..))).))).....((((....(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..))))(((....[[[[(((.((((((((....)))))))).))).)))........]]]].(((....(((.(((((((.....)))))))....)))...)))......(((((....)))))...((((((((.....(((.....((((....(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..))))........((((...((((((((....))))))))..))))..........)))..(((....(((.((((((((((((((....(((...(((.((((.(((((....)))))..)))).))).(((.....((((....(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......)))..))))........((((...((((((((....))))))))..))))..........))).........))).))))))))))))))....)))...)))......(((((....)))))...)))))))).
|
|
PDB_00806
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAGUCCACCGCGGUGAGAAGGGGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((..((((((()))))))..)))(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((....(((....)))....)))(((((.......(((....)))(((...))))))))
|
|
PDB_00807
|
[ FASTA input ]
|
UCGCAGUCCUAUUAAUAGAGAAGCGAGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((....((((()))))....))).(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((....(((....)))....))))(((((.......(((....)))(((...))))))))
|
|
PDB_00809
|
[ FASTA input ]
|
GAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...))))).)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((.(((.....)))..)))).))))
|
|
PDB_00810
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
........(((....[[[.))).((((........)))).]]]....
|
|
PDB_00815
|
[ FASTA input ]
|
AUGCUCAUGCACUGCAUGAAUGCCCCUAAGGGAUGC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((.....)))))....((((.))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[.....))))..]]](((....)))....
|
|
PDB_00823
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGAGGCUGCCGAAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((...[[[[)))..]]]].
|
|
PDB_00827
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUUAGUAAUAAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))....((((((....((((((((..(((.))).))))))))(((..((((((((..)))))))).))).....{{{{{(((((..)))))...(((((.[[[))))).....))))))((.((.....)).))......}}}}}..((..(((((((..)))))))...((((((((...]]].)))))))).........)).))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((((....))))))....................[[[[......)))))..]]]](((((((.((((((....))))))....(((...(((((((((....))))...(((((....))))).........((((((((...))))))))....)))))......((((((....))))))...(((((((.........))))))))))......)))))))
|
|
PDB_00828
|
[ FASTA input ]
|
CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...............(((((.[[[[[[[.......)))))..]]]]]]]....)))))))))
|
|
PDB_00829
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.....(((((.......)))))..........((((((.......))))))..)))))))
|
|
PDB_00842
|
[ FASTA input ]
|
AGUGGCGCCGACCACUUAAAAACACCGG |
|
[ reference structure ]
|
(((((..[[[.))))).........]]]
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[.))))).........]]]
|
|
PDB_00851
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC |
|
[ reference structure ]
|
((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((((((((.....((((....))))......))))....))))))))))))))((((.....((((....))))......))))
|
|
PDB_00854
|
[ FASTA input ]
|
UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUAACUUUGUAUGUGAUCUAUCGUGUGGGUCACCACUGCAAAUAAGGAGGUAAAAAUGCCUGUUAUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((.{{{{{.))))).((((.(((((..(((((........(((..((..(((..(((((((((((((.....)))))))))))))))).....((((......(((.((((.......(((((((((((((....(((((((..))))))).....)))))....((((.(((((....))))).))))...((((...))))))))))))....)))).)))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((..[[))))...))))))))((((((..........))))))((((((..))))))..)).)))......((.(((....(((((..)))))..)))))....)))))..((((.....((((((..))))))....))))....((((((.((..(((((((...))))).))..))..))))))......(((((......(((((....(((....)))......))))))))))..)))))))))........]](((.......((((((((((.(((((((.(((((((((((....((((((((...))))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((((.(((((((((..(((((((..(((((......)))...))..)))))))..)).......(((..))).)))))))))))))).)))...))))))))))...(((((((...((.((((((.........)))))).))))))))).........((((((..((((((((((...))))))))))..(((....)))....)))))).))).(((((....((((....))))..)))))...}}}}}(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((.....(((........))).........(((((((......((((((((....((((((..)))))).....((((....))))..))))))))..((......((((((((((...(((((((((....)))...((((....))))...)))))).....((((.(((((((.......(((.....)))......))))))).....((((((..))))))........))))....)))).)))...)))...))....)))))))...)).)))))))))....(((((((....(((.......((((....)))).........)))....)))))))......((.(((((((((........))))))))).))....)))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))....(((((((.((((((((...((((((((((((.....(((((...((((..)))))))))....))))))))))))...))))))))..)))).))).....(((((((((....)))))))))......(((((((.(((((((...(((........))).((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((..<<<..))))))....(((((.......))))))))))))........(((((..(((((((.......)))))))....))))).))))))).....>>>.........
|
| [ predicted structure ] |
.(((..[[[[..))).......((((..(((((...))))))))).]]]].(((..[[[[[)))(((((((((((...))))))))))).]]]]].((((((((......(((((((...((((.(((((((.((((((...((((((....))))))....))))))...(((((.(((((....))))).)))))..((((...)))).))))))).)))))))))))((((((((....)))))))).....(((((.....(((.....((((((((..((((....))))(((((((....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).......((((((.((((((....(((((....)))))...(((((....)))))...)))))).((((....))))......)))))).(((((........((((.....))))(((...))).)))))........)))))))..(((((((((.........)))...)))))).........)))))))).....(((((((.....(((((((((((((.....(((((((((((((......((((((.....))))))....)))))))..)))))).........((((((...(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..)))))).(((.((((.((((........((((((.........((((((((.(((((((.......))).....(((((((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))..(((...((((.(((((....)))))..))))..))).)))).))))(((((((....)))(((.(((((..(((((..((((........)))))))))..........(((...((((((((..(((((((....)))))))...((((....))))..)))))))))))))))).)))))))((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((....)))))........)))))))))))))))))........)))))).)))).)))).))).))).)))).)))))).((((...(((((....((((....))))......)))))......)))))))))))......(((((((........)))))))....)))((((......((((((((((..........)))))))...))).)))).)))))..........)))))))).((((......(((((((((((((.....((((....(((....))).))))....)))))))))))))......)))).....((((((.((((((((((((....))))))))......(((((((((((((...((((...))))...((((((..((((..((((((...((((..((((((..(((...((((((((....))))))))(((...))).)))))))))..))))..))))))...))))..))))))((((((((....(((((..(((....))).))))).......))))))))....)))))...)))))))).....)))))))))).
|
|
PDB_00855
|
[ FASTA input ]
|
GGAUAUAUGAUACAAUUUGAUCAGUAUAUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((........))))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((........))).))))))))
|
|
PDB_00857
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCCAAACAAAAAAGUCAGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((........[[[[[[[[[))))))........]]]]]]]]].
|
| [ predicted structure ] |
((((((........[[[[[[[[[))))))........]]]]]]]]].
|
|
PDB_00863
|
[ FASTA input ]
|
UUGCGUCACACCGGUGAAGUCGCUGCGUCACACCGGUGAAGUCGC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((.((((((((..(((((.))))).))))))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[[....))).......]]]]]]]].......
|
|
PDB_00864
|
[ FASTA input ]
|
GAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGAUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUG |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((((..))))))))))))...((((((((.(((.....)))..))))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
......(((((((....))))))).......(((((....((((...)))).....)))))...((((..(((..(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..)))..)))).
|
|
PDB_00865
|
[ FASTA input ]
|
GGUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((...))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.....)))))))))))
|
|
PDB_00868
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGUCCGAUUGACUAGCCGCUGGUCCGAUUGACUAGCCUCCGAGGUCCGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
|
|
PDB_00870
|
[ FASTA input ]
|
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((())))))))))))))))................
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((.((((((((((......)))))))))).)))).)))))
|
|
PDB_00871
|
[ FASTA input ]
|
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00873
|
[ FASTA input ]
|
AAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_00874
|
[ FASTA input ]
|
CGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((([[)))))))))..(((((((((..)))))))))]]
|
| [ predicted structure ] |
.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
|
|
PDB_00876
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
|
|
PDB_00878
|
[ FASTA input ]
|
GAGGUCGGCCCGACUUCGGUCACUGCCACCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((..((((..))))...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((..(((....)))...))))))))
|
|
PDB_00879
|
[ FASTA input ]
|
GCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGG |
|
[ reference structure ]
|
..(((.(((((((((.(((((((((....)))))))))..))))))...((((((((....((((((((((....)))))))))).))))))))))).)))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).))))))
|
|
PDB_00883
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCUUUUCAGAGCCGGCUCUUUUCAGAGCCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((....))))))((((((....))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((....))))))((((((....))))))....
|
|
PDB_00885
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUCUGGCCUUCCUACAAGGGAAGGCCAGGGAAUUGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((....)))))))))))...))))))
|
|
PDB_00886
|
[ FASTA input ]
|
CUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..{{{{{{.)))))))(((((((..}}}}}}.)))))))(((((((..[[[[[[.)))))))(((((((..]]]]]].)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((.((((((((((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).))))))))))))))..)))))).)))))))
|
|
PDB_00890
|
[ FASTA input ]
|
ACAUGAGGAUCACCCAUGUACAUGAGGAUCACCCAUGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((....)))))))(((((.((....)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..((((...(((....)))..))))...)))))
|
|
PDB_00891
|
[ FASTA input ]
|
GGCCACGGUUCGAAUCCGUGGCGGCCACGGUUCGAAUCCGUGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.......))))))))(((((((.......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((.((((((...)))))))))))).)))))))
|
|
PDB_00892
|
[ FASTA input ]
|
CUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUG |
|
[ reference structure ]
|
((((.((...((............))...)).))))...........((((((()))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
........................................................................
|
|
PDB_00897
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.((((..)))).....)))))))))))(((((((((((.((((..)))).....)))))))))))((((((((((((((((..)))))....)))))))))))(((((((((((.((((..)))).....)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..(((....)))......((((((((((((((((((((..(((....)))......))))))))))))))))))))..(((....)))......))))))))))((((((((((..(((....)))......))))))))))
|
|
PDB_00906
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....((((.((((...((((((.((((((....((((.((((...(((((...)))))....)))).))))...)))))).))))))....)))).))))...)))))).
|
|
PDB_00917
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGGAGCAGGCGGUCCGGGGGCGCGCGCUCCCGAAGCCGGACUCUGAGCGGGUGCCGGGUAACGCCCGGGAGGGGUGACCCUCGGACAGGGCCAUAGAGAAGACCGCCGGCAAGGGUGGAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCGUCGGGGCAACCCGGCGGCUUGGCAACCCCCACCGGAGGGCCAAGGGGGUGGGCGCUCCUACCCCCUUGGCCGGUGUGCGGUAACGCACACCGACCGCCUCCGGCUUAUGCUCCUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.(((((((((((((((()))))))))[[[[.[[[((((.{{{{.((.(((((.....)))))((((((..))))))((...(((((..........((.(())...)).......((((...........)))).((..((((....))))..))...)))..)))).)).))))(((((.(((((.(((}}}}))).))))).))))).(((((.((..)).))))).)))))))]]].]]]]..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((....)))))))...(((..[[[[[..)))...((((((...))))))(((((....)))))...]]]]]..........)))))))(((..((((((..((((((((.....(((......(((((((....)))))))....)))...))))))))...(((((((((((((((....)))))))))))))))((((((((....))))))))..))))))...)))..)))))))))))
|
|
PDB_00918
|
[ FASTA input ]
|
GCGGCACCGUCCGCUCAAACAAACGG |
|
[ reference structure ]
|
((((..[[[.)))).........]]]
|
| [ predicted structure ] |
((((..[[[[))))........]]]]
|
|
PDB_00919
|
[ FASTA input ]
|
GUUAAUCAUGCUCGGGUAAUCGCUGCGGCCGGUUUCGGCCGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGCCUAGCGAAUCCAUAAGCUAGGGCAGCCGGCUGACGGCGGGCCCUGAAAGUGCCGGUAAACCCCACGAGCGAGAAACCCAAAUAGGGGCACCUUCCCGAAGGAAAUGAACGGAGGGAAGGACAGGCGGCGCAUGCAGCCUGUAGAUAGAUGAUUACCGCCGGAGUACGUACGAAGGUACAGAACAUGGCUUAUAGAGCAUGAUUAAC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((((((.(((((((.(((((((((....))))))))).{(..{{.{{{{{(((((((((.((......)))))).....(((((((((((..........)))))).((((()))))..((.((())).....((.(())...))))))))))))))..((((.....))))..((((((((.(((......))).))))))))(((((((........)))))))........)))))))(((((.(((()))).))))))}....}}}}}}}....)))))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((((((((((((((....))))))))).(((...)))...(((..[[[[....)))....]]]](((((((((.....))))))........[[[[[[.[[[[)))..]]]]..]]]]]]...(((((......((((....................))))..(((((((................)))))))[[[[[[))))).....]]]]]].......))))))))((((......((((....))))......)))).....)))))))))))))
|
|
PDB_00923
|
[ FASTA input ]
|
CCACGGUUCGAAUCCGUGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......)))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((.......)))))).
|
|
PDB_00924
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCUGGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..((((((((((((....))))))))))))...)))))(((((..((((((((((((....))))))))))))...)))))
|
|
PDB_00925
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCGGGGGUGUAAACCUAUCGCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((..)))))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....)))).)))))))
|
|
PDB_00928
|
[ FASTA input ]
|
CUCGCGGAUCAGUCACCCAAGCGAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.........))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...............)))))
|
|
PDB_00929
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((())))))))))(((((((((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((....))))))))))))))))))
|
|
PDB_00932
|
[ FASTA input ]
|
GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((.(((((..)))))...))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..........((((....)))).......))))))
|
|
PDB_00937
|
[ FASTA input ]
|
GCAUGGACGCGUCCAUGCGCAUGGACGCGUCCAUGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((())))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((....))))))))))))))))
|
|
PDB_00939
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCAGACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))...(((((..(((((.....)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((..[[[..))))........]]]((((....))))(((((((((((.(((((.((((((((((......((((.......)))))))))))))).((((....))))))))))))))).)))))))))))).
|
|
PDB_00943
|
[ FASTA input ]
|
UUGACUACGGAUCAAUUGACUACGGAUCAAGACUACGGUUUGACUACGGAUCAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.....)))))(((((.....))))).........(((((.....)))))
|
| [ predicted structure ] |
........................((((.((((....)))).......))))..
|
|
PDB_00945
|
[ FASTA input ]
|
CAGCACUGAUUGCGGUCGAGGUAGCUUGAUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((.....))))((((((....)))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((.....))).((((((....)))))).
|
|
PDB_00947
|
[ FASTA input ]
|
AAUCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAUGGUCAAGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUGCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUGACC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((.....((..((((....(((((((.............))))..)))...))))...))((((.((...((((((((....))))))))....))))))..)))))))))..((((.(((......((((((((((((..((((..((((((((((((.....((((((..<<......)).....((((((((.(((....>>.)))....))))))))...))))...(((....)))(((((..........)))))....((......))....))..((((((((.................)))))).))........((....))...(((((((...((.....))..)))))))...(((.....(((..((.....))..))).......(((.......................((........(((..........)))((......ddd.....))DDD..........))....................))).....((((((((.........))))))))......(((((.ccccc)))))..)))......)).)))))).))...............((....))....))....((....((((..)))).........))...))..)))))))))))).......((((((((((......))))))))))..((............))((((((....(((((((((((((............................(((..)))....((....))........)))))))))))))......((.((((((....((((((((((.((((((..((((((......))))))..)).))))..(((..((((........)))).)))....))))))))))..(((.....)))......))))))..))........((((((((...((((....))))...(((((((.....(((((((((..((((...((((((((((.((((((......)))).)).))))))))))..)).))..))))))))).....))))))).....((((((((((......))))))))))....................((...(((..(((.((......[[[[[[....[[...(((((.((((((.(((.......((.((.(((....((.......))....)))......................)).))...))).))))))))))).........))]].....]]]]]]..)))..)))..))((((((((.....))))))))..))))))))((((((............((((((.((....)).))))))........)))).)).....))))))......(((.....((((((.......))))))(((((...((((..((...((((((...((.....)).))))))....((aaaa.((...((((..(((....)))..))))...))...(((((........)))))))(((((((((((((.....(((...((((((((..((((((.((((.((.........))))))......((.......(((((((..........)))))))..........)).............................))))))...))).)))))........))).....))...)))))))))))AAAA..)).....((......)).)))).(((((....))))).)))))..((((...(((((((((..................((((((.((((..))))..))))))..(((((((...........)))))))..............(((((((((...((.........))..((((((((....((........))......))))))))(((((.(((..(((((((..((((..((..((((((....))))))..))..)))))))))..)))))((((((.......)))))).......((...........((((.........)))).....))...)))))..)).)))))))........))))))))))))))))......((..bbbbb......))BBBBB...(((((((.(((.........((((.((((((..(((((((((.......(((((((((.(((...))).))))))))).(((((((....)))))))........)))).)))))...............((((((...........))))))..((....((((((...((((((.......)))))).....((...{{.))....))))))....((((..((((....))))..)))).(((....))).)).}}.......((((((..(((.CCCCC))).)))))).............))))..))))))........(((...(((((((.(((.......))).)))))))....)))............(((((((((.....(((.((......)).))).......((((.....))))......)))))..))..))........(((((((....))).))))........)))))))))).....(((((((...((((..(((((((...............)))))))...(((....((.....(((((((.((....)).)))...)))).....))..)))....(((((...((((.............))))...))))))))).......)))))))...................(((.(((((.......)))))....((((((((..........((......))..........))))).)))....)))....))).))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((......((((((((((.....)))))..(((((....))))).......)))))...(((.......((((((((....)))))))).......))).))))))))))))..............((((((..(((.......[[[[[)))...]]]]]...(((....[[[[.)))......]]]]..(((((........[[[[[[[...)))))..]]]]]]]...(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))......(((.(((.(((((......))))).)))...[[[[))).............]]]].........(((...........[[[[.)))....((((((((.....))))))))]]]]...)))))).(((..(((..((((((.((((.(((...((((((....))))))........((((....))))....)))...))))..)))))).)))..[[[[[[)))(((.(((((((((((...))))))))))).....(((((((....)))))))..)))..]]]]]](((....)))......((((..[[[...........)))).......((((....)))).]]].......((((((.....(((((((((..((((((((((((((....))))))))))).)))..............(((((((..((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....)))).....)))))))))))))).(((....((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).(((.....)))......))))))........((((.((((.....(((((....)))))..(((((((.....(((((((((...(((...((((((((.....((((......))))......))))))))..)))....))))))))).....))))))).(((.(((((((............)))))))...)))))))..))))....((((.((((..(((((........)))))...((((......(((((((((((...(((......((((.(((((.......))))).))))....((((........))))....)))..)))))))))))..............((((....))))...)))).))))))))((((((((.....))))))))....)))..((((((((..((((......(((((..........)))))...)))).))))).)))...)))))))..................(((((((.....)))))))))))))))).....((((((((..(((...)))))))))))....(((((.(((..(((...(((....)))...)))..)))...(((((........)))))..(((((((((((....(((((((....((((((((...........)))).))))...(((((((((....(((((((((((((((..........))))))).....))))))))))))(((....)))...))))).....))))))).....((((.............)))).......)))))))))))))))).((((..(((......)))..))))((((....))))))))))..(((.(((....)))[[[[[.......)))...]]]]](((...[[[[[)))....]]]]]((((((((((((.....))))))))))))....((((((((.....[[[[.))))))))..........((((((((....(((....)))......))))))))..]]]]..(((...(((....)))...)))..(((((....)))))..((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]].......((((((((((((...((((((......(((.....)))......)))))).....))))))))))))((((((.((((((....((((((......))))))..(((...((((.....((((...........)))).)))).(((.(((((((((((((((((((...))))))))))))....(((((.....))))).))))))).)))))))))))).)))))).....(((((((...........))))))).....(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))..((((.[[[[[[.........)))).(((....)))]]]]]].......((((((..[[[[.........))))))....]]]]......((((...[[[[[.))))...........]]]]]..((((....[[[[[[[[(((((.....)))))))))....]]]]]]]](((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....))).....(((((((...((((...))))..)))))))...((((((((..((((........)))).....(((..[[[[)))..((((.((((((((((((....)))))...))))))).))))...]]]]...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]].)))))))).((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..)))).))))...))))............
|
|
PDB_00960
|
[ FASTA input ]
|
UUCGACGCGUCGAAUUUUCGACGCGUCGA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((..)))))....(((((..)))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((....))))))))))))
|
|
PDB_00961
|
[ FASTA input ]
|
AGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGAC |
|
[ reference structure ]
|
.............(((((.......))))).............(((((.......)))))
|
| [ predicted structure ] |
...(((.(((.((((((((.....)))))))).))).)))...((((((.....))))))
|
|
PDB_00964
|
[ FASTA input ]
|
ACAUGAGGAUUACCCAUGUCAUGAGGAUUACCCAUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((....)))))))..((.........))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((............))))).............
|
|
PDB_00966
|
[ FASTA input ]
|
UGUCUAAGACAGUGUCUAAGACA |
|
[ reference structure ]
|
.(((...)))..((((...))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((...)))).)))))
|
|
PDB_00967
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCAGCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((..))))))((....))..(((((.......))))))))))))....(((((((..((((.........))))((((((()))))))((....))..(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((.....[[[(((((((....)))))))(((....)))..))))..]]](((((((((((....))))))..)))))...........(((((((....)))))))........(((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_00973
|
[ FASTA input ]
|
AUGAGGAUAACCCAUGAGGAUAACCCA |
|
[ reference structure ]
|
.((.((....))))((.((....))))
|
| [ predicted structure ] |
...........................
|
|
PDB_00974
|
[ FASTA input ]
|
AUGAGGAUGACCCAUUGAGGAUGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((.((....)))))((.((....))))
|
| [ predicted structure ] |
............................
|
|
PDB_00979
|
[ FASTA input ]
|
GGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUCGGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUC |
|
[ reference structure ]
|
..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((..[[[[[[[[..((((.....))))))))))....]]]]]]]]......((((((((((.....(((((..((((((..(((.((((.....)))).)))..))))))..)))))...........)))))))))).......
|
|
PDB_00980
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCACGGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))..((.((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[.....)))).(((((.......))))).]]].(((((((((((.(((((((((((....))))))..((((.........)))).(((((.......))))).....))))))))))).))))))))))))..
|
|
PDB_00985
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUUCGCCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCACCUCCGGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUUCGCCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCACCUCCGGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUUCGCCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCACCUCCGGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUUCGCCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCACCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((.((..)).))))).....((.......))...)))))))(((((.............(((((((....)))))))..((((.........))))..)))))(((((((...........(((((.((..)).))))).....((.......))...)))))))(((((.............(((((((....)))))))..((((.........))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((....((((((....)))))))))(((((.((((..(((((((((((((((((((.....(((....((((((....)))))))))(((((.((((..(((((....((((((((((((....((((....)))))))))))))))).))))).))))..))))))))))))))))))).....(((....((((((....)))))))))))))).))))..))))))))))))
|
|
PDB_00986
|
[ FASTA input ]
|
CGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..(((((())))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((....)))).)))))))
|
|
PDB_00987
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAAGUGCACACGGCGCUGAAGUGCACACGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((((((((())))).)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..[[[[[[.))))......]]]]]].....
|
|
PDB_00989
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((())))))))))))))).)))))))))))))))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((((((..((((((.(((((((...((((....)))).)))))))..)))))).)))))))...))))))
|
|
PDB_00993
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGACGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAACUCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAUCAGCCCAAAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGAAAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUAAGGUCGUUGUUCGUGAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAACCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCACUCACAAGGCUAAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCUGCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAAGGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUGGUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGGGACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGGACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUUAAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUUGAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAUUCGGGUUUCUCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGCGAAACUGGCCUUUUGGGGUCGGUGGAGGCAACGGUGAAAUACCACCCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGGCUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUUAUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACCACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........((((((((.((.((((..((((((((((((.....((((((..{{..{{..)).....(((((((..(((}}..}}.))).....)))))))...))))...(((....)))(((((....)))))(((((..)))))))..((((((((....((....)).....)))))).))........((....))...((((......(((...))).....))))...(((......(((((.(((..(((...(((((......)))))((......ddd.....))DDD...)))....))).))))).......(((((((((.......)))))))))......(((((.[[[[[)))))..)))......)).)))))).))............(((((..)))))..))........(((((....)))))............)).)).))))))))........(((((((((((.......))))))))))).((((........))))((((((....(((.((.(((((((.(((..((((.....))))..)))...((....))....((....))..........))))))).)))))..((..((.((((((.....(((((((((.(((((((.((((((......)))))).))).))))..((...((((........))))..))....)))))))))...(((.....)))......))))))..))....))..(((((((....((((....)))).(((((((((...(((((((((((..((((...((((((((......))))))))..)).))..))))))))).))..))))))).))..((((((((((......))))))))))....(((......)))...((...(((..(((((((.....cccccc..........((((.((((((((((........((((.(((...................)))........((((....))))..))))....)))))))))))))).........)))......CCCCCC.))))..)))..))(((..((.((.....)).)).)))....)))))))..((((((((((....(((((((.(((..))).))))))).))))))))))........))))))(((...(((.....((((((.......))))))((((....((((.(((...((((((...((.....)).))))))....((aaaa.((..((((...(((....)))...))))..))...(((((........)))))))((((((((((..(((...((.....((((.((((...((((.((((.((...<<<...)))))).....((......((.((.((((...........)))).))....))......))....((...((((....))))...))))))....))))..))))..........))...))).....))))))))))AAAA..)))....((......)).)))).(((((....)))))..))))..((((...(((((((((.((................((((...((....))....)))).((((((((...))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((....(((((...)))))......))))))))(((((.(((..(((((((..((((..((...((((......))))...))..)))))))))..))))).(((...........)))........((...........((((((.....)))))).....))...)))))..)).))))))).....)).))))))))))))))))..))).....(((((........)))))..((((((((.(((.........((((.((((((..(((((.(((.((((..(((((((..(((((((...........((((...(((........(((((......))))).....))).............))))..)))))))..)))))))..(((((((((....)))))))))....)))).)))..)))))..(((.......)))((((((...........))))))..((...(((((((..((((((.........)))))).........bbb......)))))))...(((((((((((..))))))))))).((((..)))).))BBB......(((((((..(((.]]]]]))).)))))))............))))..))))))........((..((((((((...((.......))...))))))..)).))...........((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..)))......((((((((....))).))))).......)))))))))))....(((((((...((((..((((((((..(((....))).))))))))((((((...(((((..(((((((((((>>>.))))))...)))))..))))).)))))).(((((..(((((.............)))))..))))))))).......)))))))..(((.....)))...((((((((((.......)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..))))).)))...)))))...)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((......(((....[[[[[.[[[[[[[[[)))...]]].....]]]..]]].]]]]].(((.....[[[[[[.............)))......]]]]]]...(((...((((....))))((((....))))(((((....))))).....[[[[)))(((((......)))))..]]]].((((..(((......)))..)))).......(((((((((...........((((.....((((((.(((..(((...((((((....))))))..((((.....)))).........)))....))).))))))......((((((((((.....))))))))))......((((((....))))))..))))......((((.(((........)))....[[[[....))))..]]]].......((((....))))..............................(((...((((((((((.......))))))))))[[[[...)))..]]]]..(((......((((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).............((((.....)))).......))))))))))))))......[[[[.)))................]]]]....(((((..[[[.)))))((((((((((...)))).))).))).....]]]..((((.((((((.(((((((((.....))).......)))))).)))))).))))..(((((......((((((((..(((((((((........((((((...(((...(((.((((......)))).)))..)))....))))))........))))).(((((.(((((((.(((.....))))))))))....(((......)))..(((((((((....((((((.....(((((((..((((.......((((((((((...(((.....(((((.(((((.......))))).)))))...((((........))))....)))..))))))))))))))...((((((((.((((......((((((........(((..((((((((...))))))))))))))))).))))(((((((((((......(((((..........)))))...............))))))..((((..............((((((.......))))))((((((...(((.....((((((((...(((...))).))))))))..)))....(((......)))....))))))..)))).))))).(((((........))))).))))))))...)))))))..)))))).................((((.....))))...))))).)))).)))))..))))((((((...(((...))).))))))...)))))))).....))))).(((((....)))))((((((.......[[[[[...........))))))....]]]]]......((((((((((...(((((.........(((((..(((((....)))))..)))))..[[[[....(((.....)))...)))))..]]]]..........(((....))).((((((((((((...))))))))....[[[[[[[[))))......]]]]]]]].....((((.((((((((....(((.....)))......))))))))...((((..(((....))).))))...))))....(((((.(((((...........(((.....))).((((((.......)))))).....)))))......[[[[((((((.....)))))).)))))..]]]].....((((..[[[(((((((((.....)))))..))))..))))....(((((((....)))))))..]]].....................((((.[[[...)))).....]]]...((((((((((((((((...(((((...........)))))...((((((((....))))))))..[[[[[..((((......))))..))))))))))))))))...(((((((......))))))).....]]]]].))))))))))...((((((.....((((((...........))))))......(((((((((..((((((((...))))))))......[[[[........)))))))))...]]]].(((...[[[)))((((...(((....)))..)))).]]]...(((((((.[[[[........)))))))....]]]]..........))))))((((.............[[[[[[[..))))...]]]].]]]((((...[[[[))))..]]]].)))))))))(((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....)))........(((..((((...))))...[[[[[[[[[)))...]]]].]]]]]..(((.......[[[..)))..]]].(((.((((..((((((((((((....))))))...))))))..))))[[[[)))....]]]]...((((.............[[[[[[[))))..........]]].]]]].(((.....)))....(((((((((.......)))))....((((((((.(((..((((((....))))))...)))..))))).)))...))))...))))))))).
|
|
PDB_00994
|
[ FASTA input ]
|
AGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUAAGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((............)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((.......)))))((((((.......))))))...(((((.((((..(((((((((.((((..((((((((((.......))))))).)))..)))).)))).....))))).))))..))))))))))))...
|
|
PDB_01000
|
[ FASTA input ]
|
GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUAGGGGACGCGUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUAGGGGACGC |
|
[ reference structure ]
|
.........(((((.......)))))(((((((.....))))))).....(((.......)))....................(((((.......)))))(((((((.....))))))).....(((.......)))...........
|
| [ predicted structure ] |
....((((.[[[[.))))....]]]]((((((.......))))))....((((((((((((((.........[[[[[[[[[..((((.........))))((((((.......))))))....))))))))))))))..]]]]]]]]]
|
|
PDB_01001
|
[ FASTA input ]
|
CUCUCGGUAGCCAAGGGAAGGCGCAAGGUAAAUGAGUCGGGCGUUCGACUCGCCCCCGGGAGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.......)))(((.......)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.......[[[....)))....(((((((....)))))))]]].)))))))....
|
|
PDB_01002
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((....(((.....)))...((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((.......))))...[[[[[[[........)))))(((((.......))))).]]]]]]]...
|
|
PDB_01008
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCUGGGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))))))))))....
|
|
PDB_01009
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((([[[)).......]]]..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((((((.(((((((....)))))))))).))))...((((.......))))))))))))
|
|
PDB_01017
|
[ FASTA input ]
|
UAGGGCCCGGGCCCUUAGGGCCCGGGCCCU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((())))))).((((((()))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((...)))))))))))))
|
|
PDB_01019
|
[ FASTA input ]
|
AUGGGCCCGGGCCCAAUGGGCCCGGGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((())))))).((((((()))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((...)))))))))))))
|
|
PDB_01020
|
[ FASTA input ]
|
GGACAUUUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACAAUGUCCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((.......)))))..........((((((.......))))))..))))))).
|
|
PDB_01025
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.....)))))))))
|
|
PDB_01035
|
[ FASTA input ]
|
AAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAUAAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....)))))))))))(((((((((((((....)))))))))))))
|
|
PDB_01040
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAACGGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..[[[[[[.))))))).(((((((..]]]]]].)))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((..((((((.((((((...))))))..)))))).)))))))
|
|
PDB_01044
|
[ FASTA input ]
|
AGACAGCAUAUAUGCUGUCUUUAGACAGCAUAUAUGCUGUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((.((((((......)))))).))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..
|
|
PDB_01045
|
[ FASTA input ]
|
AGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCUUUAGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_01050
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.......))))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((((.....))))))..)))))))
|
|
PDB_01051
|
[ FASTA input ]
|
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.(((.....((((((.......))))))..))))))))
|
|
PDB_01053
|
[ FASTA input ]
|
GCUUCCAUAGCUCAGCAGGUAGAGCGUCAGCGGUUCGAGCCCGCUUGGAAGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
|
|
PDB_01054
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCACGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))......((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..((((.(((.(((.((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))((((((......))))))..)))).))).))).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
|
PDB_01056
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((...)))).)))))
|
|
PDB_01057
|
[ FASTA input ]
|
GGACUGUCCACAAGACAGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.....))))))))
|
|
PDB_01059
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG |
|
[ reference structure ]
|
((((.[[[.)))).....]]].
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[))))....]]]].
|
|
PDB_01060
|
[ FASTA input ]
|
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG |
|
[ reference structure ]
|
................(((((((..)))))))((..(((())))..))(((((((())))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_01061
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
|
|
PDB_01062
|
[ FASTA input ]
|
UGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGCUGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((..((((((...(((((.)))))..))))))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((.(((..(((.....)))..))).)))..............
|
|
PDB_01065
|
[ FASTA input ]
|
CGCAAUUAGCGCGCAAUUAGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((())))))).)))
|
| [ predicted structure ] |
(((.....)))(((.....)))
|
|
PDB_01070
|
[ FASTA input ]
|
GGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUCGGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.(((.(((.[[..))))))........)))))....((((((.((((......)))))).)))).)))))((((((((((.(((.(((.]]..))))))........)))))....((((((.((((......)))))).)))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((....(((((.....))))).[[[......))))..]]](((..[[[[[[[.(((....))).)))..]]]]]]]..((((....(((((.....))))).[[[......))))..]]]((((..((((......))))..)))).......
|
|
PDB_01071
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAUCUUGCUCUUCGGAGGAUUUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((((((..)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....(((....)))....)))))
|
|
PDB_01073
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGAUGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((......(((((((((.[[[[)))...)))))).(((..((((..)))).)))....]]]]((((((..))))))...)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((........(((.[[[......)))......]]]((((.(((....)))))))...(((..[[[[)))...]]]]...)))))))).
|
|
PDB_01074
|
[ FASTA input ]
|
GCGACCGACCAUAGCUGCUGCAGCGGUCAAAGGUCGCGCGACCGACCAUAGCUGCAUGCAGCGGUCAAAGGUCGC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((...((((...))))))))...))))).((((((((((...((........))))))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...(((((((((((((((...((((....))))))))...)))))).)))))))))...))))))
|
|
PDB_01075
|
[ FASTA input ]
|
GACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUCGACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.((((((((((((((((..(((()))))))))))).))))))))))))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((((..((((((.(((((((............)))))))..)))))).)))))))...))))
|
|
PDB_01076
|
[ FASTA input ]
|
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((....(((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).....)))))).)))))).(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....((((.........((((....(((....)))....))))....)))).)))))))....)))))))..((((((((((.....))))))....(((.((((((((..(((..(((......)))..)))...)))).))))..)))...))))..
|
|
PDB_01077
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGUACUACCAGCUGAUGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCCGGCGUCCUGGUAUCCAAUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((...((((((.......(((........)))...((((())))).)))))).))..)))
|
| [ predicted structure ] |
((((....(((((((((....((((......)))).......)))....))))))....))))
|
|
PDB_01084
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGACUCCCGAAUCUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((........)))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........)))))))
|
|
PDB_01088
|
[ FASTA input ]
|
UGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUCCGGAAGAAGCUUUCUUUUGGACAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGUUUUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCGCGGGGAGGAAGGGAGCGACGAGCUCAUUGACGUUACCCGCGAAGUAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGUCUCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGACUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCAACCUUCGGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((..{{{{...)))).((((.(((((..((((((((.....(((.(((..(((..(((((((((((((.....)))))))))))))))).....((((......((((((((.((...(((((((((((((((((((((((....)))))))))).))))).....(((....)))....((((...))))))))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..(((((((((..)))))...))))))))((((((..........))))))((((((..))))))..))))))......((.(((....(((((..)))))..))))))).))))))..(((((....(((((....)))))...)))))....(((((((...((.(((((...))))).)).....)))))))......(((((......(((((....(((....)))......))))))))))..)))))))))..........(((((.....(((((.((((.(((((((.(((((((((((.....(((((((...)))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((((.((((((((((((((((((....((((....)))).......))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).)))...)))).)))))...(((((((...(((.((((((.......)))))).))))))))))..........[[[[[.(((((((((((...))))))))))).[[[[))]]]]....]]]]]..))).(((((.((.((((....)))))))))))....}}}}(((((.(((((((.....(((((..((((((((((.....(((........))).........(((((((......((..........(((((..)))))......(((..)))........)).(((.(((..(((((((((....(((((((((....)))..(((((....)))))..)))))).....((((.(((((((.((....(((.....))).))...)))))))....(((((((..))))))).......)))).....))).)))...)))))))))...)))))))...)).)))))))).....(((((.(((..((((...(((.((((..)))).))).....))))..))).)))))......(((.((((((((........)))))))).))).....)))))...((((((((((.......)))))))))).........)))))))))).))....(((.....((((((((.((((((((((((((((.(((((((...((((..))))))))))))))))))))))))))).)))))))).......))).....((((((((((..))))))))))......(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......(((..(((........)))..)))....(((((((((........(((..((((....(((((((((((...)))))))))))..))))......))).....((((((((.......(((((((..(((((...((((((....)))))).....(((.......(((....)))......))))))))..))))))).....))))))))......(((..((((((((.......))))))))))).....((((..(((((((.........)))))))(((.(((((.(((.....)))))))).((((....))))......)))))))....((((....((((....))))..))))))).))))))((((........((((....))))......(((((.((((((........((((.....))))..........))))))))))))))).((((..[[[[[[[[[...))))..]]]...]]]]]](((....[[[[..)))...........((((...))))]]]].((((((((((((.((((((((((...((((............))))..))))))))))..))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...))))(((..........)))))))..))).)))))..))))..((((((((.(((((((.......((((.........))))....)))))))..........((((((((.(((..[[[[[))).((((((...))))))]]]]]..))))))))........((((..((((.[[[))))...)))).......]]].(((((((((((....))))....((((..[[[[[..[[[[))))....]]]]]]]]]..............(((.[[[[[..(((((((....))))))))))..........]]]]].(((((..[[[[.....)))))..]]]](((.[[[[))).....((((......))))]]]](((.[[[[[.))).......]]]]]..((((((...[[[[............)))))).........]]]]......((((.((((((.....)))))).(((((((.......)))))))....[[[((((...))))..))))........]]]...((((..[[[...))))..]]].......(((......(((((..(((((((........))))))).....)))))..)))..((((((((((.........)))))))...)))))))))).(((((((........(((((......)))))...(((((((....[[[[[.[[[[)))))))..........]]]]]]]]].........((((.......))))...)))))))(((((((((....)))))))))....((((.......[[[[.))))...]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]].......(((((.......[[[[.)))))..]]]]..(((........[[[[..[[[[))).....]]]]..]]]].)))))))).
|
|
PDB_01089
|
[ FASTA input ]
|
CGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAACCCCGAUCAUUAUCCAAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCGAGCCUAAUCAGUGUGUGUGUUGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAUGCACAUGCUGUAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGCCGUGGUACCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGGCACCUUAUGCGUGUUAUGGCGUGCCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCGACUUCCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUGUGGGUGAUGGAGGGACGGAGAAGGCUAUGUUAUGCCAAGCUAUGGCUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGGUCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUAACAAAGCCCUCUUCCAGGAAAAGCUUCUAAACGUUGAAACAUGUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUUAGCUCGCCUGAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUGGGGUUGCAAAGCUCUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGGCCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACCCGAAUCCGGGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGCAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGUCAACGGAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAGCCAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCAAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGAGGUCUUGACCAGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGAACUGCC |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((.((((..(((((((((.((.........(((.....bb.)))......((((((..(((BB.....))).....))))))............((...))....(((((.....)))))..)).((..((((..(((......)))...))))...))....((..((....))..((((((((.(((((...)))))))))))))..(((.(((.....(((((((.......(((.....(((......)))..((.....<<<<.....))>>>>..))).......)))))))..)))......((((((((((......))))))))))....(((((..[[..)))))..)))))......))))))).)).............(((((..)))))..)).........(((((...))))).............)).))))))))))...........((..((.(((.......))).)).))...................((((((....(((((((((((((..((((........))))...(((..))).(((((....)))))....)))))))))))))....((......((.......((((((((.((((...(((((((((..)))))))))....))))..(((..((((........)))).)))....))))))))....(((.....)))......))..........))....(((((((...(((((....)))))..(((((((..((.((((((((.(((((...(((.((((.((((((......)))))).)))).)))..)).))).)))))))).))...))))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((..(((((((.....{{{{{{.........(((((.((((.((.((......((((.((.((..((((.......))))..)).........((((....)))).)).))))..)).)).)))))))))........))).....}}}}}}.))))..)))))))((((((((.....))))))))...)))))))(((((...((((.....((((((((((..))))))))))..))))...))).)).....))))))......(((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((ddd.((..(((((((.((....)).)))))))..))...(((((........)))))))((((..((((.........((...((((.......(((((..(((.((.......)))))...(((((......((.((((.................))))....))......))))).((..(((((....)))))..))))))).......))))........)).............))))..)))).DDD..)).....((......)).))))..((((...))))..)))).........(((((((((.(((..............((((((.((((..))))..))))))(((((((((.....)))))))))............(((((((((...((.........))...(((((((....(((((..)))))......))))))).(((((.....((...((..........((((((....))))))........))....))...((((((.......))))))((.))...............((((((.....))))))..........)))))..)).))))))).....))))))))))))....)))......((..aaaaa......))AAAAA..((.......(((.........((((.((((((..((.((((((.(((((((((((((((((.(((..........................................................................))).)))))))))))..(((((....)))))..)))))).)))).)).))..(((.......)))(((....((....)).....)))..((...(((((((..((((........))))....((...ccc))....)))))))...((((((((........))))))))...((..))...))CCC.......((((((((((..]]..))))))))))..........))))..))))))......(((((.((((((((..((((.....))))..))))))..))))).))......((((((((((((...((((((((......))))))..))....((.......)).......)))))..))..))).))....((((((((..)))).))))........)))......))...(((((..(((((..((((((((..(((....))).))))))))...(((...(((((..(((((.((((....))))...)))))..))))).)))....((((..(((((..((...))....)))))..)))).)))))......))))).......((((((((.......)))))....(((.((((..((....((..........))...))...))))..)))...)))..............(((((.....(((((((.......((((.....((....))..))..))......))))).)).....(((((((((((((...)))))))))))))......)))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....((((((((((....(((.(((.....))))))...))))......(((((((..(((.......))).....))))))).(((((...((((....)))).(((((.....))))).........((((.(((..........))).))))..)))))...............((((((.......[[[........))))))..]]](((((.....((((((((((((((((...((((((....))))))....(((.((((....)))).)))))))))))))))))))..))))).....))))))..(((..(((((..((((.....(((((((....)))))))))))......[[[..((((.....))))......)))))..]]].....)))........((((.....))))..................)))))))))).....((((((((((((..(((((((((((((((((((..((((((......(((((((.(((((((((((((((((....((((((((....)))............((((....))))))))))))))))))))).((((.....((((((((((((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))........))))))).(((.....))).)))..))))))...((((((((((((((.....(((((....))))).....((((..(((((((((.......(((.(((.((((...(((((....)))))...)))).)))...))).....)))))))))...)))))))))...(((((((((((...)))))))))))....(((......))).)))..)))))).))))...)))))........((((((.....(((((...(((((..(((....(((((.(((((.......))))).))))).......(((((...(((.(((.....))).))).)))))......)))...)))))...)))))(((((..((((((((.....((((((....((((((........((((((((..((((.....((((((((....))))))))..))))..))))).))).....))))))...))))))....(((((((.....)))))))((((..((((((...((((((((((.((((((..((((((((((((((((...(((...(((...(((....)))...)))...)))..(((((........)))))..........((((((.....(((((((....((((((((((((((((((....)))...((((((...(((..(((((((((((...(((...))).))))))(((((.....(((((...(((((((((((.(((((.................)))))))))..)))))))..)))))....)))))........((((((.((((...(((((((((((((.(((.....(((.((((((((....)))))))).........((((......))))....((((....)))).....))).....))))))))))).((((....((((.....((((....(((((.....)))))))))..(((((...(((....)))...))))).)))))))))))))..))))(((....)))...))))))......)))))...)))(((((........((((((.......)))))).(((((..........))))))))))......))))))........))))))))).))))))...)))))))))))))....(((((...)))))))))))((((.((((((...(((((((((.....((((.......))))..(((...(((((.(((.((((((((((((...........(((..........(((.((((((...((((((((....))))))))))))))..)))........))).............)))))....((((....))))..))))))).)))..))))).......((((((((((((((...........)))))))......(((((((.(((((.(((((((((((((..((((....))))..(((((((((.((((..((((....))))..)))).(((....)))(((((...))))).((((((((........))))))))(((..((((........))))..)))..))))).(((((((((.....(((......)))))))))))))))))))))(((((((((((((((((((((((((((......)))))).)))))(((((.....))))).....)))))....)))))).(((((....(((....)))..((((((((...((((((...))))))..((((.((((.....))))))))......)))))))).)))))))))).)))))))).)))))))))))).....)))))))))).......)))))........)))).....))))))...))))...)))))))))).....(((((......)))))((((....)))))))))))))))(((((.......((((((....)))))).......)))))......)))))..)))))).....)))))))))))).))))).)))))))))))))...........))))))....))))))))))))........))))))))))))))..(((....)))...))))).
|
|
PDB_01092
|
[ FASTA input ]
|
AAGCGCCGGACUUAAAGCCAUGGCUUUAAGUUGACGAGGGCAGGGUUUAUCGAGACAUCGGCGGGUGCCCUGCGGUCUUCCUGCGACCGUUAGAGGACUGGAAAACCACAGGCGACUGUGGCAUAGAGCAGUCCGGGCAGGAA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((..)))))))))))..(((...[[[[[[...)))......)))))...]]]]]](((((.{{{{{{)))))....(((.(((..((((((((((..))))))))))....))).))).}}}}}}.
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((((((((....))))))))))....[[[[[[..((((....))))..)))))..]]]]]]((((((..[[[..))))))....((((((.....((((((....)))))).......))))))]]]......
|
|
PDB_01097
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUACACUAUUUAUCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......)))))))
|
|
PDB_01099
|
[ FASTA input ]
|
GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..(((((....)))))..)))
|
|
PDB_01100
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCAUACCUCUUGGGCCUGGUUAGUACCUCUUCGGUGGGAAUACCAGGUGCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((....((....))(((((((((.(((((((..))))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..[[[[....)))))(((....))).....((((....))))]]]]....
|
|
PDB_01102
|
[ FASTA input ]
|
GGUCAAGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUGCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUGACCAAUCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.......((((((((((((....((..((((((((((.......((((((((cc..cc))))....((((((((..(((CC..CC.))).....))))))))..))))...(((....)))((((((((....))))))))..((.((.....))))........(((((((...............)))))))...........((....))...((((((....((.....))...))))))..((((....((((((((.....))))))))......(((..(((..........((((((..((..(((...(((((......)))))((.......bb.....))BB....)))....))...)))))).....)))...))).....((((((((.........))))))))......((((((<<<.))))))..)))).....)).)))))).))..............(((....)))...))((.))...((((((..))))))................)))))))))))).........(((((((((....)))))))))....(((..........)))((((((....(((((((((((((..((....((........))...))...((....))....((.....)).......)))))))))))))..((.....((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))....))))))))))).(((.....)))......))))))........))..((((((....(((((....)))))..(((((((.....(((((.(((.(((((...((((((((((.((((((......)))).)).))))))))))..)).))).))).))))).....))))))).....((((((((((......)))))))))).....(((......)))...((((.(((..((((.((.....aaaaaaa.........((((.((((((((((.......((....(((...................))).........(((....)))......))...)))))))))))))).........)).......AAAAAAA.))))..)))))))((((((((.....))))))))....))))))..(((((...(((....(((((((..........))))))).)))..)))))........))))))......(((.....((((((.......))))))((((....((((.((...(((((((...((.....)).)))))))...(([[[..((..(((((..((((..))))..)))))..))...(((((........)))))))(((((((((((((...((((((..((((.((((.((((((.((((.((.........))))))(((...((......((((((((.((.....)))))))))).........))....))).....((((..)))).......))))))..))))..)))).......))))))...))...))))))))))).]]]...))....((......)).)))).((((......))))..))))..((((...(((((((((.(((...............(((((..(((..)))...))))).((((((((.............))))))))............(((((((((...((((.....))))...(((((((....((((....))))......))))))).(((((.(((..(((((((..((....((...(((((....)))))...))....)))))))..)))))((((((.......))))))....................((((((.....))))))..........)))))..)).)))))))....))).))))))))))))))))..........(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((((((((((((.((((((((((((((((((.........((((((.((((.....((((((((....))))))))..))))...........))))))))))))))))))))))))..((((((....))))))...)))))))))).)))))..(((.......)))((((((...........))))))..((...(((((((..(((((((.......)))))))....((...{{{))....)))))))...(((((.((((....)))).))))).(((....))).))}}}......((((((((.(((...>>>)))))))))))............))))..))))))........(((...(((((((((((.......)))))))))))....)))...........((((((((((..(((((((((......)))))))..)).((((((...)))))).....)))))..))..))).......(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((((((((..((((((((..(((....))).))))))))((((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))).(((((..((((((...........))))))..)))))))))))....))))))))....((.....)).....((((((((((.......)))))....((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)))...)))))....)))))))..(((((((((((....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((....((.((((((((....))))))))...))..))..))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
..............((((((..(((.......[[[[[)))...]]]]]...(((....[[[[.)))......]]]]..(((((........[[[[[[[...)))))..]]]]]]]...(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))......(((.(((.(((((......))))).)))...[[[[))).............]]]].........(((...........[[[[.)))....((((((((.....))))))))]]]]...)))))).(((.((((..((((((.((((.(((...((((((....))))))........((((....))))....)))...))))..)))))).)))).[[[[[[)))(((.(((((((((((...))))))))))).....(((((((....)))))))..)))..]]]]]](((....)))......((((..[[[...........)))).......((((....)))).]]].....((((((........)))))).(((...(((((((((((....)))))))))))[[[[...)))..]]]]((((((((...((((((((((((((..((((..(((.....)))..)))).............((((.....)))).....))))))))))))))........((((((...(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).(((.....)))......)))))).....))))))))..((((...(((((....)))))..(((((((.....(((((((((...(((...((((((((.....((((......))))......))))))))..)))....))))))))).....))))))).....(((((((............))))))).....))))...........((((.((((..(((((........)))))...((((......(((((((((((...(((......((((.(((((.......))))).))))....((((........))))....)))..)))))))))))..............((((....))))...)))).))))))))((((((((.....))))))))((((.....((((((((..((((......(((((.[[[[[....)))))...)))).))))).)))...))))(((..............((((((.......)))))).)))....(((....)))((((((((...........))))))))....]]]]].(((..(((...(((....)))...)))..)))...(((((........)))))..(((((((((((....(((((((....((((((((...........)))).))))...(((((((((....(((((((((((((((..........))))))).....))))))))))))(((....)))...))))).....))))))).....((((.............)))).......)))))))))))(((((.((((..(((......)))..))))((((....))))...[[[[.)))))........]]]]......((((........[[[[[.........))))..]]]]]((((((((((((.....))))))))))))....((((((((.....[[[[.))))))))..........((((((((....(((....)))......))))))))..]]]]..(((...(((....)))...)))..(((((....)))))..((((..[[[.))))....]]]((((((.[[[...))))))....]]].......((((((((((((...((((((......(((.....)))......)))))).....))))))))))))((((((.((((((....((((((......))))))..(((...((((.....((((...........)))).)))).(((.((((((((((((((((((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))))))))))....(((((.....))))).))))))).)))))))))))).))))))(((..(((((((...........))))))).....[[[[[[[[[..((((((.......))))))......))).........]]]]]]]]]..((((.[[[[[[.........)))).(((....)))]]]]]].......((((((..[[[[.........))))))....]]]]......((((...[[[[[.))))...........]]]]]..(((.....[[[[[[[[(((((.....))))).)))....]]]]]]]](((((((((((......)))))).)))))(((((.[[[[)))))......((((......))))......]]]](((....))).....(((((((...((((...))))..)))))))...((((((((..((((........)))).....(((..[[[[)))..((((.((((((((((((....)))))...))))))).))))...]]]]...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]].)))))))).((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..)))).))))...)))).............((((((((((((......((((((((((.....)))))..(((((....))))).......)))))...(((.......((((((((....)))))))).......))).))))))))))))
|
|
PDB_01103
|
[ FASTA input ]
|
UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGCAAGGAGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCAGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCAGCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((...aaa.))))).((((.(((((..((((((((.....(((..((.((((..(((((((((((((.....)))))))))))))))))....((((......(((.((((..(((..(((((((((((((((..((((((....)))))).))..)))))....((((((((((....))))))))))...((((...)))))))))))).))))))).)))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))))((((((..........))))))((((((..))))))..)).)))......((.(((.....(((....)))...))))))).))))))..((((.....(((((....)))))....))))...(((((((.((....(((((...))))).....))..))))))).....((((((((...<<<<<....<<<.)))>>>......>>>>>)))))..)))))))))..........(((((.....((((((((((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((......)))...)).)))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).)))...))))))))))....((((((...((.((((((.........)))))).))))))))..........bbbbbb..((((((((((...))))))))))...bb..))BB.....BBBBBB.))).(((((....((((....))))..)))))...AAA..(((((.(((((((.((..(((((((((((((((((......((........))..........(((((((......((((((((..(((((((....)))))))...((((....))))..))))))))..((.(((...(((((((((...(((((((((....)))..(((((....)))))..)))))).....((((.(((((((.......(((.....)))......)))))))....((((((....)))))).......))))....)))).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......((...(((((((........)))))))...))....))))))...(((((((((..........)))))))))....))...)))))))))).))....((.((...(((((((((.(((((((((((((.....(((((...((((..)))))))))....))))))))))))).)))))))))....))..)).....(((((((((....))))))))).....((((((((.....................))))))))......((.((({{{.......{{{{{{{..((((........)))).{{{{{..)))..}}}}}.....(((((.......)))))}}}}}}}....[[[[[[[..((((........)))).[[[[[[..)).]]]]]].....(((((.......)))))]]]]]]]....(((((((..((((........))))(((((((.}}}.)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((.((((((...))))))))))...(((.[[[[)))......]]]]..(((((...(((((((((((...))))))))))).))))).((((((((......(((((((...((((.(((((((.((((((...((((((....))))))....))))))...(((((.(((((....))))).)))))..((((...)))).))))))).)))))))))))(((.........((((((((.......))))))))[[[......)))..]]].((((....))))(((((((....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).......((((((.((((((....(((((....)))))...(((((....)))))...)))))).((((....))))......)))))).(((((........((((.....))))(((...))).)))))........)))))))..((((((.........[[[[.....))))))..]]]].......(((((((((.(((((((...((((((((..(((((((((((...((((((((......((((((.....))))))....))))))))....))))))))....((((((...(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..))))))......(((...(((......)))....)))...((((.........))))...))))))))))).......(((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))))))))).((((.(((((....)))))..))))....)))))..))))((((((.......(((((..[[[[[(((((..((((........)))))))))))))).(((((((...((((((((..(((((((....)))))))...((((....))))..)))))))))))).)))]]]]]...((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((....)))))........)))))))))....(((.[[[[[[)))....................]]]]]].....(((((((.....(((((....((((....))))......))))).....)))))))......(((..(((((((........))))))).....))).....(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...........))))))..........)))))))).((((.(((..(((((((((((((.....((((....(((....))).))))....)))))))))))))..))).))))............((((((((((((....)))))))))..)))((((((((.....................)))))))).....................((((((((..((((..((((..((((.(((((((...))))))).....(((((.((((..((((((((((((....)))))))..((((........)))).(((((((...))))))).....))))).))))..)))))(((((((....)))))))..))))..))))..)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))))...
|
|
PDB_01105
|
[ FASTA input ]
|
UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCGCGGGGUGGAGCAGCCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCAGCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCAGGCAAGGAGGUAAAAAUGAAAAAAAAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((.{{{{{.))))).((((.(((((..((((((((.....(((.(((.((((..(((((((((((((.....)))))))))))))))))....((((......(((.((((..(((..(((((((((((((((..((((((....)))))).))..)))))((..((((.(((((....))))).)))))).((((...)))))))))))).))))))).)))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((..[[))))...))))))))((((((..........)))))).(((((..)))))...))))))......((.(((....(((((..)))))..))))))).))))))..((((.......(((....)))......))))...(((((((.((..(((((((...))))).))..))..))))))).....(((((......(((((....(((....)))......))))))))))..)))))))))........]](((.......(((((..(((.(((((((.(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)))))))))...((((((((((.(((((((((.(((((((((..((((......)))).....))))))))).)).......((....)).)))))))))))))).)))...)))..)))))...(((((((...((((.((((.........)))).))))))))))).........((((((..((((((((((...))))))))))...((....)).....)))))).))).((((.....((((....))))...))))...}}}}}(((((.(((((((.(((.(((((((((((((((((......((........)).........((((((((......((((((((..(((((((....)))))))...((((....))))..))))))))..((.(((..((((((((((...(((((((((....)))..(((((....)))))..)))))).....((((.(((((((.......(((.....)))......)))))))....((((((....)))))).......))))....)))).)))...))))))))....))))))))..)).)))))))))....(((((((....((((..((((((((....))))))))....))))....)))))))......((...(((((((........)))))))...))....))))))...(((((((((..........)))))))))...)))...)))))))))).))....(((((...((((((((.((((((((((((((.....(((((...((((..)))))))))....)))))))))))))).))))))))....)).))).....(((((((((....))))))))).....((((((((.(((((((..(((((......)))))((((((..<<<..))))))....(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).......))))))))....>>>.........
|
| [ predicted structure ] |
.(((..[[[[..))).......((((..(((((...))))))))).]]]].(((..[[[[[)))(((((((((((...))))))))))).]]]]]....(((........(((((((...((((.(((((((.((((((...((((((....))))))....))))))...(((((.(((((....))))).)))))..((((...)))).))))))).))))))))))))))....(((..((((((((.......))))))))))).....(((...[[[[[[)))........]]]]]]....(((((.(((.....)))))))).((((....)))).......((((((.((((((....(((((....)))))...(((((....)))))...)))))).((((....))))......))))))...(((.......[[[))).....]]].(((......[[[[[....[[[[[[..[[[..[[[[[[[[[..)))....]]]...]]]]]]]]]....]]]]]]]]]]].....(((((((...((((((((..(((((((((((...((((((((......((((((.....))))))....))))))))....))))))))....((((((...(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..))))))......(((...(((......)))....)))...((((.........))))...))))))))))).......(((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))))))))).((((.(((((....)))))..))))...........(((....))).......(((((..[[[[[(((((..((((........)))))))))))))).(((((((...((((((((..(((((((....)))))))...((((....))))..)))))))))))).)))]]]]]...((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((....)))))........)))))))))....(((.[[[[[[)))....................]]]]]].....(((((((.....(((((....((((....))))......))))).....)))))))......(((..(((((((........))))))).....))).....(((....[[[[[[[...)))....]]]]]]]...((((....[[[[[..))))......]]]]]...((((.(((..(((((((((((((.....((((....(((....))).))))....)))))))))))))..))).))))...((((.......((((((((((....))))))))))....((((((((..((((((((((..((((((..(((..(((((.......))))).)))..))))))....))))..)))))).....(((((((.((((((((((..........))))))).((((((.......)))))).......)))))))))).......))))))))....))))........
|
|
PDB_01108
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUGAUCAAGUGAUCGCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....)))))))))
|
|
PDB_01114
|
[ FASTA input ]
|
GCGACUCGGGGUGCCCUGCGUGAAGGCUGAGAAAACCCGUAACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGAGGGAAGUCGCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.......))))......)))))).(((((((.((((......))))))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((......))).........))))...(((...((((......))))...))).)))))).
|
|
PDB_01117
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUCCAGCGACGGCCUUCGGGACUAGCAAACGGAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.(((((..)))))))))...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..........................)))))))
|
|
PDB_01118
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCCGCCUUGAUGCCCGGGUGAAAGCAUGAUCCCGGGUAAUAUGGCGGACCCACA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.....((((((((((......)))))))))).....)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
|
|
PDB_01119
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.((((..)))).....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..(((....)))......)))))))))
|
|
PDB_01120
|
[ FASTA input ]
|
UGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAAGCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCAUCGGGCUCAUAACCCGAAUGUUU |
|
[ reference structure ]
|
....((((..aaaaa..)))).((((.(((((..((((((((.....(((.....((((..(((((..(((((((((......)))))).))))).)))))))....((((......((((((((.(((..((((((((((((((((((((((((..))))))))))).)))))((...((((..)))).)).((((((..((....)))))))))))))))).)))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))))((((((..........))))))((((((..)))))).....)))......((.(((....((((....))))..))))))).))))))..(((((.....((((....))))....))))).....(((((((((....((((((..........)).)))).....)).))))))).......((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>)))))..)))))))))..........(((((.....((((((((((.(((((((.((((((((((.....((((((((...))))))))...))))))))..)))))))))...((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).))))))))))))).))))...))))))))))...(((((((...(((.(((((((.....))))))).)))))))))).........{{{{{{..((((((((((((.....)))))))))))).{{{{..))}}}}...}}}}}}.))).(((((.((.(((((..))))))))))))...AAAAA(((((.(((((((.(((.(((((((((((((((((.....(((........))).........(((((((......(((((((.(((((((((..))))))))).((((..)))).))))).))..((.(((...((((((((....(((((((((....)))..(((((....)))))..)))))).....((((.(((((((..(((..(((.....))))))...))))))).....((((((...))))))........)))).....))).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((....((((..((((((((....))))))))....))))....)))))))......((.(((((((((........))))))))).))....))))))((.((((((((((.......)))))))))))).)))...)))))))))).))....((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((..((....)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))..)).....(((.(((((....))))).)))......((((((.[[[.))))))]]]...
|
| [ predicted structure ] |
......(((..(((........)))..)))(((((((((((((((....((((((..(((........((((((((((....))))))).))).)))((((((.....(((......(((((((.......(((((((((((((....((((((....))))))......(((......(((....)))....((((....))))))).)))))).))))))).....)))))))((((((.(((..((((((((.......)))))))))))...))))))..(((((((.........)))))))))).(((((.(((.....)))))))).((((....))))(((((((((.....))))))....(((((....))))).))).....)))))).))))))....)))))...(((((((...((((((((.(((((........((((((((.......))))))))..........))))).......(((((......(((((((((.........)))...)))))))))))..(((...((((......((((((((....(((......)))((((((((.((((((((((...((((............))))..))))))))))..))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...))))(((..........)))))))..))).))))).)))))))).((((...(((((((.......((((.........))))....)))))))))))..))))((((((((((((((..((((.....))))..))))))..(((......))))))))))))))...))))))))((((....))))....(((..((((.(((((((.(((((((....)))(((.(((((..(((((..((((........)))))))))....(((.(((.......(((((..(((((((....))))))).............)))))))))))))))).))))))).))))))).))))(((((........(((......))))))))))).)))))))........))))))))))(((((..((((((((.............(((((.....)))))......(((..((((((.....)))))).(((((((.......))))))))))...(((((..(((((((((.....(((.......(((....))).........))).....)))))))))..(((((..(((((((........))))))).....))))).....)))))(((((((.........)))))))......))))))))(((((((......((((((((...........((((((((((((....((((((.((((...........))))))))))...)))))))))))))))..)))))........)))))))(((((((((....)))))))))))))).(((((.......)))))......
|
|
PDB_01126
|
[ FASTA input ]
|
GAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAUCCCCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((.....)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))((((((((....((((((((((((((((....))))))))))))))))...))))))))
|
|
PDB_01127
|
[ FASTA input ]
|
GCCUACCCGGUAGGCUUUUCAAGCCUACCCCGGUAGGCUUUUCAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.))))))).......(((((((..))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((((((...)))))))))..))))))).......
|
|
PDB_01128
|
[ FASTA input ]
|
CUGCCCUCAUCCGUCUCGCUUAUUCGGGGAGCGGACGAUGACCCUAGUAGAGGGGGCUGCGGCUUAGGAGGGCAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((((((.....))))))))))....(((((...)))))((((..))))...))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((........(((((..[[[..)))))..]]]...((((.[[[[))))..]]]].......))))))))
|
|
PDB_01129
|
[ FASTA input ]
|
CUGACUAUGUGAUCUUAUUAAAAUUAGGUUAAACGAGGUUAAAAAUAGUUUUAAUAUUGCUAUAGUAGAGGUCUUGCGAAAGCUUACCACACAAGAUGGACCGGAGCGAAAGCUCCAAUAUCUAGUGUACCCUCGCUGACUAUGUGAUCUUAUUAAAAUUAGGUUAAAUCGAGGUUAAAAAUAGUUUUAAUAUUGCUAAGAGGUCUUGCGAAAGCUUACCACACAAGAUGGACCGGAGCGAAAGCUCCAAUAUCUAGUGUACCCUCG |
|
[ reference structure ]
|
..((.((......(((((....((............[[[[.......))....))).))....)).)).((.((..((..))......aaa..aaaa)).))....((..)).......AAAA..AAA(((.(((<<..........<<<<<.<<<<<<<<<.......))).)))....>>>>>>>>>.>>>>>....>>(((((((((..)))).........{{{{)))))((((((..))))))...}}}}.....]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((...((((((((((..((((......))))...))))))))))))))).)))))...(((((..............[[[[.....)))))(((((....)))))........]]]]..(((((..[[[[[[.((((((..........))))))...)))))......]]]]]]......((((...[[[[....)))).........((((.(((((....(((((....)))))..))))).))))..]]]].
|
|
PDB_01130
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAACGUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((.[[[[[)))...]]]]].(((.[[[[[....)))..........]]]]]....
|
|
PDB_01133
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUCCAAGCUGUGCCUUGGGUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......)))))).))))
|
|
PDB_01135
|
[ FASTA input ]
|
AUGAGGCUCACCCAUGUGAGGCUCACCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((.((....))))).((.((....))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((.(((((....))))).))))....
|
|
PDB_01137
|
[ FASTA input ]
|
UGCGGAUCACCCAUGCGGAUCACCCA |
|
[ reference structure ]
|
((.((....))))((.((....))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((.........)))).....
|
|
PDB_01138
|
[ FASTA input ]
|
AUCGCGAUUACGGAUCGCGAUUACGG |
|
[ reference structure ]
|
(((.((....)))))..((....)).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...))))))))).....
|
|
PDB_01140
|
[ FASTA input ]
|
AGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGGGGGCCCUCGGCCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGCAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGGCGCCGGUGAAAUCCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGG |
|
[ reference structure ]
|
((.......((((((((((((((((((..((((((((((((.....(((((((.bb..bb.)))....(((((((((((((BB..BB.))))...)))))))))..))))...(((....)))((((((((....))))))))(((((......)))))))..(((((((((((((......)))).))))))).))........((....))...(((((((.((((.....)))))))))))...(((.((.(((((...........))))).))..(((((((((..(((...((((((((((((((..(((((......)))))((......ccc.....))CCC..)))))..))))).))))..))).)))))).)))...(((((((((((.......)))))))))))....(((((.{{{{{)))))..)))......)).)))))).)).............((((....))))..)).........(((((..))))).............)))))))))))))))).......((((((((((....))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((..(((..((((.....))))..)))...(((..)))..(((((...)))))..)))))))))))))..(((((((((((((.....(((((((((..((((((((((((((....))))))))))).)))..((((.(((((........)))))))))...)))))))))...(((.....)))......))))))).))..))))..(((((((((((((((....)))))(((((((((....((((((((((....((...(((((((((.................)))))))))..)).....))))))))))....))))))).))..((((((((((......))))))))))))...(((......)))...((((.(((..(((((((.....<<<<<<.....<<..(((((.(((((((((..................))))))))))))))........)))>>....>>>>>>.))))..)))))))((((((((.....))))))))..))))))))(((((((((.(((...((((((((.((((..)))))))))))))))))))))).)).....))))))(((...(((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((eeee.((..(((((.(((((..))))).)))))..))...(((((........)))))))((((((((((((((..(((((((.((((((((((((((((.((((.((...dd....))))))((((.(((((((((((((((((.((.....))))))))).....))))))))))))))((.........))))))))).)))).)))))......)))))))..)))...)))))))))))EEEE..)).....((......)).)))).(((((....)))))..))))..((((...((((((((((((...............((((((.((((..))))..))))))((((((((((.........))))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((((.((((((..)))))).))..)))))))).((((.(((..(((((((..((((..(((((((((((..)))))))))))..)))))))))..)))))(((((.........)))))....................((((((.....))))))..........))))...)).))))))).....)))))))))))))))))))..))).((..aaaaa......))AAAAA..((((((((.(((.........((((.((((((..(((((((((((((((.(((((((((.((((((((.........(((((....................))))))))))))).)))))))))..((((((....))))))...)))))))))).)))))..(((.......)))((((((.((....))..))))))..((...(((((((..(((((((.......)))))))....((...[[[))....)))))))...((((((((((....)))))))))).((((..)))).))]]].......(((((((.(((.}}}}})))))))))).............))))..))))))........(((.(((((((((.((((.....)))).)))))))..)))))...........((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).......((((((((..)))).))))........)))))))))))....(((((((..(((((..((((((((..(((....))).))))))))((((((...((((...(((((((((((.DD.))))))...)))))...)))).)))))).(((((....(((..((...))....)))....))))))))))......)))))))..............((..((((((((((.......)))))....((((((((.(((....(((((....)))))...)))..))))).)))...)))))))..))..(((((((((....(((((((((...(((((((....((....)).)))..))))..))))))).))((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((((((((.......(((((......)))))....((((((((((.((((........))))...))))....[[[[[[[[[[........))))))....(((....)))((((((((....)))))))).]]]]]]]]]].(((((((..(((.(((.(((((......))))).)))..)))..............[[[.)))))))............]]].(((.[[[[..)))...((((((((.....))))))))]]]](((.(((((((.....((((((.((((.(((...((((((....))))))........((((....))))....)))...))))..))))))...))))))).))).....(((((((((((...))))))))))).....(((((((....)))))))(((((...((((((((....)))......((((................))))........(((....))))))))......)))))...))))))))))).(((...((((((((((....))))))))))[[[[...)))..]]]]((((((((...(((((((((((((((.((((..(((.....)))..)))).............((((.....)))).))))))))))))))).((((....))))....(((((((((((..((((...((((((......))))))....))))...((((.((((........))))))))....))))))))))).(((.....)))..(((....))).....))))))))..................(((((((..[[[[[)))))))...]]]]]...(((..[[[[[[[))).(((....))).......]]]]]]]...(((......((((((((...))))))))....(((((((............)))))))....[[[)))...........]]]......(((((((((...(((((((((((.........(((((((((((...(((.....)))..)))))))))))((((......)))).)))).)))))))(((....[[[))).((((((((.....))))))))]]].........(((((..((((......(((((.(((....))))))))...)))).)))))((((...[[[..))))..]]](((((......(((((((.....)))))))...((((....))))[[[[[[[....)))))..]]]]]]]....(((.........(((...(((....)))...)))[[[[[[[.))).............]]]]]]].((((((((((((((((((....((((((((...........)))).))))....(((.((((....(((((((((((((((..........))))))).....)))))))))))).)))..........)))))))...(((((.((((((.......((((..((((....(((((....)))))((((..(((......)))..)))))))).))))(((.(((((.((((((....((((((((........((((......(((((.....(((....))))))))((((((((((((.....)))))))))))).))))...(((((((((((....(((((.....)))))..((((((((....(((....)))......)))))))).((((((.(((...(((....)))...)))..(((((....)))))........((((((.....))).((((((.......))))))....))).......(((...((((((.....))))))......))))))))).....))))))).))))...))))))))...((((...))))....((((((......))))))..))))))((((.....((((...........)))).)))).)))))))))))))))))))))))))))))).......((((((......[[[[[.......))))))..]]]]]...)))))))))..(((((.....)))))............((((............[[[[[[((((((...........))))))))))..(((((((((..((((((.......))))))..................)))))))))]]]]]].((((((.....[[[......(((....)))))))))..(((..((((((.(((........))))))))).))).]]]......(((.....[[[[[[)))......]]]]]]((((..(((.....))).))))(((((.....)))))....(((((((((...(((((((((((......)))))).)))))(((((.....)))))............))))))))).....(((((((....))).))))(((.(((((((((...((((((.((((((((..(((((((((((((..((((((((((...............)))))((((.((((((((((((....)))))...))))))).)))).))))))))))......(((((...........)))))..))))).))).......))))))))..((((.....))))..........(((((((((...(((....((((((((.(((...((((((....))))))..)))..)))).)))).....))).)))))))))..))))))...)))).))))))))....((((...[[[[))))..]]]](((...)))(((.[[[[[[[[))).((((((((....))))))))........]]]]]]]].....
|
|
PDB_01143
|
[ FASTA input ]
|
UCUGUGCUCUGUGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGACGCAGAGCAGGCAGAGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCGGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAACAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).)))))))).))))))))..)))))((((((((((....(((((((((....((((((.............))))..))...))))))).))(((((..(((((((((((...)))))))))))..))))).))))))))))((((((((......((((((((((.(((((((..(((((((((((((.....(((((((....<<<.))).....(((((((.((((>>>....)))).....)))))))...))))...(((....)))((((((((..))))))))(((((((((((((...)))))))))))))))..(((((((((..((......))...))))))).))....((..((....))...(((((((.(((((...))))))))))))...(((..(((((.....(((((((((((((.(((((((((((.bb...)))))((......ccc.BB..))CCC))))))...)))))))))))))..)))))......(((((((((((.......)))))))))))....(((((.aaaaa)))))..)))))....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............))))).)))))))))).......(((((((((((......)))))))))))..((((........))))((((((....(((((((((((((.(((((.((((...)))).)))))..(((..))).(((((.....)))))....)))))))))))))..(((((((((((((.....(((((((((..(((((((((((((......)))))))))).)))..((((.(((((........)))))))))...)))))))))...(((.....)))......))))))).))..))))..(((((((((((((((....)))))..(((((((...(((((((((((.(((((...(((.((((((...)))))).)))..)).))).)))))))).)))...))))))).....((((((((((......)))))))))))).((((......))))..((((.(((..(((((((.....eeeeee.....ee..(((((.((((((((((...((..(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).)))))).))))))))))))))))).........)))EE...EEEEEE.))))..)))))))(((((((((....)))))))))..))))))))..(((((((.(((.....(((((((((....)))))))))..))))))))))........))))))(((...(((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(({{{{(((..((((((.((((..)))).))))))..)))..(((((........)))))))((((((((((.(((..(((((((((((((.(((..((((((((((.....[[[....)))))((((((((.((((((((((((((.((.....))))))))))..)))))).)))))).))(((((((((..))))))).)))))))...)))..))))).....))))))))..))).....))))))))))}}}}..)).....((......)).)))).(((((...)))))..))))..((((...((((((((((((...............((((((.((((..))))..))))))(((((((..((((((((((((.....)))))))))))))))))))............(((((((((...((.........))..((((((((((.((((((..)))))).))..)))))))).((((.(((..(((((((..((((..(((((((((((((((..))))).))))))))))..)))))))))..)))))((((((.......))))))....................((((((.....))))))..........))))...)).))))))).....)))))))))))))))))))..))).((..ddddd......))DDDDD..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((((((((((((.(((((((((((.((((....((((((((......))))))))...)))).)))))))))))..((((.((((((.....))))))))))...)))))))))).)))))..(((.......)))(((((((((....))).))))))..((...(((((((..(((((((.......)))))))....((...fff))....)))))))...(((((((((((..))))))))))).((((..)))).))FFF.......(((((((.(((.AAAAA)))))))))).............))))..))))))........(((.((((((((((.(((.....))).))))))))..))))).........((((((((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..))..))).))....((((((((..)))).))))....))..)))))))))))....(((((((..(((((..((((((((..(((....))).))))))))((((((...(((((..(((((((((((]]].))))))..)))))..))))).))))))..((((..(((((..(((.)))....)))))..)))).)))))......)))))))..((((((...))))))((..(((..(((((.......)))))....((((((((.((((..(((((((..))))))).))))..))))).))).....)))))..)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((....(((....(((....)))....))).)))))))).))))))))..)))))(((((((((.........((((....)))).((((((((((.....(((....)))...(((((.......))))).))))))))))..(((.(((....))))))..)))))))))((((....))))..(((((((((((...(((....)))..((((.(((........)))[[[..)))).....]]]((((((..(((.[[[...)))..]]].))))))((((((....((((....))))((((..[[[[))))....(((((((((.........)))))))))..]]]]...((((.(((......[[[.))).))))..]]]...))))))..(((..(((.[[[[)))..))).........]]]]...((((..((((......(((((((((((((.(((...((((((....))))))....(((.((((....)))).))))))...)))))))))))))...))))........((((((((.........)))))))).....(((((((....))))))).))))...........((((.............))))........................((((.....))))..................)))))))))))....(((((....((((((....)))))).)))))((((.....))))..((((((.......(((((((((((((..((((.............)))).............((((.....)))).....)))))))))))))))))))...((((((((((((((((......((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))........))))))).(((.....))).)))..))))))...((((((((...........(((((....)))))..(((((((.....(((((((.......(((.(((.((((.......)))).)))...))).....)))))))......))))))).....(((((((((((....)))))))))))....(((......))).....))))))))...(((((..[[[.........)))))...]]].(((...[[[)))....]]].(((((.(((((.......))))).))))).......(((((.[[[[[[...(((((...)))))))))).............]]]]]].....(((......[[[))).(((((((((....)))))))))]]].((((.((((((((...((((.....((((((((....))))))))..))))..))))).)))...((((......))))........((((((.....))))))..(((....[[[....)))((((((((...........))))))))...]]]((((((...(((...(((....)))...)))...)))..[[[[))).......]]]]..(((((((((((........(((((((....(((...[[[[)))...]]]]..))))))).(((...((((.(((..(((((((((.[[[[.....)))))))))...)))..))))...)))..(((((....)))))...........]]]].(((((..(((.....)))..)))))...)))))))))))......)))).....(((.[[[[[[))).((((.....))))....]]]]]]......(((((((..........(((.[[[[[[[)))....((((....))))...........((((((((((....)))))......(((((..(((.......)))..)))))..)))))]]]]]]]............((((((((....(((....)))......))))))))..(((..[[[...[[[[[[..[[[[..[[[[[[[[[[[.))).......]]]]]]..]]]]]]]]]]]]]]]...]]]((((((.[[[...))))))....]]](((........[[[[[[[[[..)))...]]]]].]]]].(((......[[[[[)))..]]]]]...)))))))..(((((...)))))(((((((((((((.(((.(((....))).)))..((((.......))))....))))))........((((((((((((((((((.........((((((((....))))))))))).))))))))..........(((.[[[[[)))......]]]]]....))))))).))))))).((((((((((((....(((((((...........))))))).....[[[[[[[[[..))))))))))))............((((....)))).]]]]]]]]]..((((..((((....))))..)))).(((....)))(((((...))))).(((((((((.......)))))))))(((...[[[[.....)))..]]]].............(((((((((...[[[[[.........))))))))).((((......))))]]]]]((((((((((((((((......)))))).)))))......[[[[[[........)))))..]]]]]]..(((((.(((((((....))).))))[[[[[[[....(((...)))......)))))...]]]]]]]..((((..[[[...)))).....]]]..(((((...((((..((((((((((((....))))))..))))))..)))).)))))...(((....(((((.....[[[[[.)))))....)))......]]]]]......((((...[[[[[[))))...]]]]]](((((((.......))))))).....(((((((((....))))........[[[[[[[[..)))))....(((...)))..]]]]]]]]..
|
|
PDB_01144
|
[ FASTA input ]
|
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUCCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCACAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))..........(((((...))))).....................(((((((.......)))))))..................((((((...((.....)).))))))....((...(((..((((((((((.....)).))))))))....)))..(((((........)))))))........(((((((((((((.....))))))(((((((((..((((((((((.(((.....)))..))))))))))...))))))).))((..)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
......................(((((..((((((....))))))..)))))((((((((..[[[[)))).))))((((....(((....)))....))))....]]]]...(((((((((((((((..(((......((((....))))..)))........(((.......[[[[[)))......]]]]]..(((...[[[..)))..]]]...)))))))))))))))...(((((......[[[[[.[[[[[[....)))))...]]]]]]....]]]]].(((((........))))).(((((((((.[[[[[[[((((((...))))))............)))))))))..(((((......................))))).........]]]]]]].
|
|
PDB_01145
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCACGGAUGAAGCCCGGGCUUCACGGAUGAAGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((......)))))))(((((((......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....))))))))((((((((....))))))))
|
|
PDB_01150
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUGGCCGAAAGGCAUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..((((..))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((....)))..))))
|
|
PDB_01152
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..((...)).))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((............)))))))))))
|
|
PDB_01154
|
[ FASTA input ]
|
GAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((...((((((..))))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((....))))...)))))
|
|
PDB_01156
|
[ FASTA input ]
|
CGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGGCGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.....((((((((.(((.))).)))).)))))))))).((((((.....((((((((((((.)))))))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....((((...(((((.(((((....(((((((((...))))).....))))...))))).)))))....)))))))))).
|
|
PDB_01157
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAUGUGAUCUUGCUUGUAAAUACAAUUUUGAGAGGUUAAUAAAUUACAAGUAGUGCUAUUUUUGUAUUUAGGUUAGCUAUUUAGCUUUACGUUCCAGGAUGCCUAGUGGCAGCCCCACAAUAUCCAGGAAGCCCUCUCUGCGGUUUUUCAGAUUAGGUAGUCGAAAAACCUAAGAAAUUUACCUGCUGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGCUGCAUGGCCGUUCUGGUCAGCAUGGCGGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCGCAAGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((........(((((((((((........{{{{{.......)))))))))))......))))).....(((((.((((....))))....aaaaaaaaaa)))))((((.....))))...AAAAAAAAAA..}}}}}...(((.((((.....[[[[[[..)))).)))........]]]]]]...((((((((...<<<<<.....<<.)))>>.......>>>>>)))))(((...((((((()).)))...)).)))((((((.........((((((((((..))))..........))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
............((((((((((..........[[[[[[........)))))))))).((((..((((....)))).))))..............((((.(((((....((((.....))))..))))).))))..]]]]]]...((((((((.....[[[[[[..))))))))........]]]]]](((((....[[[..[[[[[[[[[.)))))...]]]...]]]]]]]]](((((((.((((((...)))))))))....[[[[.)))).........(((.(((....))).((((...)))).))).]]]]
|
|
PDB_01160
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAAAUCCCUCGGCGUGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((..((((.........))))((((((..))))))(((..)))...((((.......)))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..(((((.(((..(((.((((....))))....)))...))).))))).....))))))
|
|
PDB_01161
|
[ FASTA input ]
|
AGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUGGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUGAGGUGGUAGUGCGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUGGAGCCGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUC |
|
[ reference structure ]
|
.((..((((.........))))(((.((.....)).)))(((......)))..(((((.......))))))).....((((..(((...........)))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))(((..(((...........)))(((((((....)))))))(())..(((((.......))))))))((((..((((.........))))....((.)).((()))..(((((.......)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((.[[[..)))......]]]((((((.....))))))((((....))))..(((((.......(((((..((((((((((((((.............))))))))).(((((((.(((.((((.(((((.....(((.((((((((((..(((((.((((...(((((((......)))))))...)))).))))).....))).))))))))))..))))).)))).))))))))))...)))))...))))).......)))))....
|
|
PDB_01162
|
[ FASTA input ]
|
AGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCGGUAGUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUC |
|
[ reference structure ]
|
........................(((())))...(((((.......)))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.[[[[........)))))))...]]]](((((.......)))))....
|
|
PDB_01163
|
[ FASTA input ]
|
GGGACAAGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCUUGUCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))
|
|
PDB_01164
|
[ FASTA input ]
|
CAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....)))))))))))(((((((((((((....)))))))))))))
|
|
PDB_01166
|
[ FASTA input ]
|
AAGCGCCGAACUGGCACCAUUGCACCGGUGCCAGUUGACGAGGUGGGGUUUAUCGAGAUUUCGGCGGAUGACUCCCGGUUGUUCAUCACAACCGAAGCUUUACUUAAAUCAUUAAGGUGACUUAGUGGACAAAGGUGAAAGGUGAUGAAAGCGCCAGAACUGGCACCAUUGCACUCCGGUGCCAGUUGACGAGGUGGGGUUUAUCGAGAUUCGGCGGAUGACUCCCGGUUGUUCAUCACAACCGAAGCUUUUACUUAAAUCAUUAAGGUGACUUAGUGGACAAAGGUGAAAGUGUGAUGAAAGCGCCAGAACUGGCACCAUUGCACUCCGGUGCCAGUUGACGAGGUGGGGUUUAUCGAGAUUUCGGCGGAUGACUCCCGGUUGUUCAUCACAACCGAAGCUUUUACUUAAAUCAUUAAGGUGACUUAGUGGACAAAGGUGAAAGUGUGAUGAAAGCGCCGAACUGGCACCAUUGCACCCGGUGCCAGUUGACGAGGUGGGGUUUAUCGAGAUUCGGCGGAUGACUCCCGGUUGUUCAUCACAACCGCAAGCUUUUACUUAAAUCAUUAAGGUGACUUAGUGGACAAAGGUGAAAGUGUGAUGA |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((((((((........))))))))))..(((...bbbbbb..)))......)))))...BBBBBB((((...[[[[....))))...((.((((..(((((((((((..)))))))))))...))))..))...]]]]...((((..((((((((((..........))))))))))..(((...dddddd..)))......))))...DDDDDD((((((.<<.<<<))))))..(((((((((..(((((((((((..)))))))))))...))))))))).>>>.>>...((((..((((((((((..........))))))))))..(((...cccccc..))).......))))...CCCCCC((((((.{{{{{{))))))..(((((((((..(((((((((((..)))))))))))...))))))))).}}}}}}...(((((((((((((((.........))))))))))..(((...aaaaaa..))).....)))))...AAAAAA((((((..eeeee))))))...(((.(((((..(((((((((((..)))))))))))...))))).))).EEEEE.
|
| [ predicted structure ] |
...((((.((((((((((........))))))))))[[[..))))..]]]....(((.....[[[......))).(((((((.....)))))))..]]]((((((...((((((((....)))))))).....[[[[..))))))......]]]]..((((((((((..((((....((((((((((........((((.(((((...........))))).))))(((..(((((((((.......(((((((((...((((((((....))))))))....))))))))))))))))))...)))..))))))))))..))))....))))))))))..(((...[[[[[[..)))..............]]]]]]((((..(((((((((.......(((((((((...((((((((....))))))))....))))))))))))))))))...))))((((((((((.........))))))))))..(((...[[[[[[..)))..((((...))))]]]]]](((((((.....)))))))...((((((((((...((((((((....))))))))....)))))))))).......
|
|
PDB_01167
|
[ FASTA input ]
|
UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..(((....)))..)))
|
|
PDB_01168
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUGCCUUUUGGCUUACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..(((....)))..)))
|
|
PDB_01178
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUCGCUAGUACCGGGUACUAAAAGUCGCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(((((((.)))))))..))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((....((((((...)))))).....)))).
|
|
PDB_01187
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUCGGCGAAAGCCGUUCGACCAGCGAAAGCUCUUAGACAGGAGGUUAGGUGCUCCGAAAGGAGCACUGGACCUCGGCGAAAGCCGUUCGACCAGCGAAAGCUCUUAGACAGGAGGUUAGGUGCUCCGAAAGGAGCACU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..))))..(((..(((((..)))))..)))...)))))))((((((((....)))))))).((((((((((..))))..(((..((((....))))..)))...))))))..((((((((..)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((....)))))))....(((....))).........((((((.((((((((....)))))))).))))))(((....)))(((.[[[[(((....)))....)))....]]]].((((((((....))))))))
|
|
PDB_01193
|
[ FASTA input ]
|
CUCCUACGGGAGUUCCGCGGAGGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACGACAUGCGCAGUUCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGGCGCCGGUGAAAUCCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCUCCGUGAUAACAAAGCGGUUAUGUACCGGAUUUUUAUUCCGGCUAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((..)))))..((()))..((.((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((.....((((..))))..))))))))))))))))))))))))))))))..))))..))(((.......)))((((((((..(((....))).))))))))(((((((..((((..(((((((((((..)))))))))))..)))))))))..))(((.(((((((((.((((.....)))).)))))))..)))))((.((.(((...................)))......................)).))((((((((.((((((((.........(((((....................))))))))))))).))))))))(((((((..(((.........)))((((((((...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((....)))(((((((((.((((.....((((.(((..(((((((((((((.....((((....(((....))).))))....)))))))))))))..))).))))..((((...))))..((((.((((((((........))))))))........)))).....))))..((((((((((....))))).......((((((((((...(((((....(((((..(((.....))).)))))....)))))(((.(((((.(((((.......))))).))))).....(((((((((...((((....(((((((((((((((.((((....(((((....))))))))).((((.....))))..)))))))))))))))...))))..........))))))))).(((.......))))))))))))))))....))))).)))))))))..
|
|
PDB_01194
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCCUGGGAGCUCCCACGGUCCCAGACGUG |
|
[ reference structure ]
|
((((([[[[[.)))))(((((.]]]]])))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((......)))))((((........))))
|
|
PDB_01199
|
[ FASTA input ]
|
AUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAUAUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((...((((.....))))))))))))(((((.(((...((((.....))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((.....))))........[[[[))).(((.((((.....))))....))).]]]]...
|
|
PDB_01201
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUCUUCGGCUCUUCCUA |
|
[ reference structure ]
|
((((([[[[[[(((((..)))))[[[[[[)))))]]]]]]..]]]]]]
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((....))))((((((.....))))))..))))))
|
|
PDB_01203
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCCACUGGCUUGUGGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((.[[[[[(((((..)))))..[[[[.))))).]]]]...]]]]].
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((((....))))..((((((...))))))...))))))
|
|
PDB_01205
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.....)))))))))(((((((((.....)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))
|
|
PDB_01208
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
|
|
PDB_01209
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
|
|
PDB_01212
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACGUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))).
|
|
PDB_01213
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))
|
|
PDB_01216
|
[ FASTA input ]
|
GCUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGCGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
|
|
PDB_01219
|
[ FASTA input ]
|
CGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((())))))).)))(((((((.((())))))).)))
|
| [ predicted structure ] |
(((.....(((((((((((.....))))).)))))).....)))
|
|
PDB_01236
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((((((((.((((((((((....(((((.((((((..(((((....)))))..)))))).....(((((((((.......)))))))))....))))).......))))))))))))))).))))).))....))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((..(((..((((((((......(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).....)))))))).)))...))).......)))))))).
|
|
PDB_01237
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((........))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((........))))))))
|
|
PDB_01249
|
[ FASTA input ]
|
GGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
|
|
PDB_01250
|
[ FASTA input ]
|
GCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.......<<<.<<<<<.))))))...........>>.>>>.>>>..((((((.......{{..{{{{{.))))))...........}}.}}}..}}..((((((.......[[[.[[[[[.))))))...........]].]]].]]].
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((........))))).[[[[[[[[[[..................)))).(((((........))))).]]]]]]]]]].....((((((.......(((((((.[[[[[...........)))))))..]]]]].)))))).......
|
|
PDB_01251
|
[ FASTA input ]
|
GCGUUUGAAACGCGCGUUUGAAACGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((()))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.((((....)))).))))))
|
|
PDB_01255
|
[ FASTA input ]
|
GGAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCA |
|
[ reference structure ]
|
.....((((((((.((((((.((.((((.((((.(((.((((((((((....)))))))))).(((.....)))....)))......)))))))))).))))))))))))))(((.(((((...((((((((.....))))))))..))))).)))...
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((......(((........((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....)))))))).......))).............((((...(((((((((...)))))))))..))))))))))).
|
|
PDB_01260
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUCCGGAAACCGCGGCGCGCGCUUCGCUCCCGGAGCCCACACUAGGAGCGUGCGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.[[[[[[((((())))).[[[[[))))))))).......]]]]].]]]]]].
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..........[[[[[[[[[....)))))))))......]]]]]]]]].....
|
|
PDB_01261
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAACAUGUAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUGCGGAAACGCAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUUGAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAACAUGUAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUGCGGAAACGCAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUUGAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAACAUGUAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUGCGGAAACGCAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUUGAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAACAUGUAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUGCGGAAACGCAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))....((((((....(((((((((.(((...(()).))))))))))))(((.(((((((((....)))))))))))).....bbbb.((((..<<))))..((((((....))))))....))))))((((((...)))))).......BBBB..((..(((((((..)))))))...((((((((.......)))))))).........)).))))((((((((((((((..))))))))))....((((((....(((((((((.(((...(()).))))))))))))(((.(((((((((....)))))))))))).....aaaa.((((..>>))))..((((((....))))))....))))))((((((...)))))).......AAAA..((..(((((((..)))))))...((((((((.......)))))))).........)).))))((((((((((((((..))))))))))....((((((....(((((((((.(((...(()).))))))))))))(((.(((((((((....)))))))))))).....[[[[.(((((..)))))..((((((....))))))....))))))((((((...)))))).......]]]]..((..(((((((..)))))))...((((((((.......)))))))).........)).))))((((((((((((((..))))))))))....((((((....(((((((((.(((...(()).))))))))))))(((.(((((((((....)))))))))))).....{{{{.(((((..)))))..((((((....))))))....))))))((((((...)))))).......}}}}..((..(((((((..)))))))...((((((((.......)))))))).........)).))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((.((((((....)))))).................[[[[[[.(((........)))))))..]]]]]](((...(((((((....)))))))..))).....(((((((((....))))...(((((....)))))(((......[[[[[[[)))..]]]]]]]....)))))......((((((....))))))...(((((((.........)))))))...........((((..((((......(((.....(((((((.......(((((..((((((....((((......))))...))))))(((...(((((((....)))))))..)))..........((((....))))...(((((....)))))....))))).(((((((...))))))))))))))..)))....((((((....))))))...(((((((.........)))))))...........))))..))))..((((((....))))))(((..............((((((....((((......))))...))))))(((...(((((((....)))))))..)))....)))...((((....))))...(((((....)))))(((......[[[[[[[)))..]]]]]]]....(((((......((((((....))))))...(((((((.........)))))))...........(((....)))..((((((....)))))).................((((((....((((......))))...))))))(((...(((((((....)))))))..))).....)))))((((....))))...(((((....)))))(((......[[[[[[[)))..]]]]]]]...............((((((....))))))...(((((((.........)))))))................
|
|
PDB_01262
|
[ FASTA input ]
|
ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
....................
|
|
PDB_01273
|
[ FASTA input ]
|
UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGGGGUUUUACUCCGGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGACCCGGGACGAAACCCCCACGGGGCUGACGGUACCGGGGUAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACUUUCUCGGGUCCCGAAU |
|
[ reference structure ]
|
....((((..aaaaa..)))).((((.(((((..((((((((.....(((..((.((((..(((((.(((((.....)))))..)))))))))....((((......((((((((.(((..((((((((((((((((((((((((..))))))))))).)))))....((((....))))...((((...)))))))))))).)))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((..[[))))...))))))))((((((..........))))))((((((..))))))..)).)))......((.(((....(((((..)))))..))))))).))))))..((.((......(((....)))......))))....((((((((.((.(((....)))))..)).))))))......((((((((...{{{{{.....{{.)))}}.......}}}}})))))..)))))))))........]](((((.....((((((((((.(((((((.((((((((((.....((((((((...))))))))...))))))))..)))))))))...((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).)))...))))))))))...(((((((...(((.(((((.........))))).)))))))))).........<<<<<<.(((((((((((...))))))))))).<<<..))>>>....>>>>>>.))).(((((.((.(((((..))))))))))))...AAAAA(((((.(((((((.(((.(((((((((((((((((......((........))..........(((((((......((((((((...((((((((..))))))))..((((((..)))))).))))))))..((.(((...(((((.((....((((((((((..))))..(((((....)))))..)))))).....((((..((((..........((.....)).........))))......(((((...)))))........)))).....))..)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))))....(((((((....((((..(((((((((..)))))))))....))))....)))))))......((((((((((((........))))))))))))....))))))((.((((((((((........)))))))))))).)))...)))))))))).))....(((((...((((((((((((((((((((((...((.(((((......))))).))..))))))))))))))))))))))....)).))).....(((((((((....)))))))))........................
|
| [ predicted structure ] |
.(((..[[[[..)))..(((...)))]]]]...(((.[[[[)))......]]]].....(((((((((((((((((..(((((((((((((((.............(((..((((....))))((((((((((((...((((((....))))))....)))))).((((((((((((((....((((...))))((((.....((((((....(((((((((....)))))))))....))))))...)))))))).)))))..((((((.........)))))))))))(((((.(((.....)))))))).((((....))))..............))))))....(((((....))))).....))).))))))..((((......((((....)))).....)))))))))))))..)))))))).....(((((..(((((.(((((...[[[[[.....))))))))))..)))))..............]]]]]........(((((((((.(((((((...((((((((..(((((((((((..(((((((((......((((((.....))))))....)))))))))...))))))))..((((..(((..(((((((....(((((((....(((........))).....)))))))...((((...))))......)))))))..)))..))))...(((...((((....))))....)))...((((.........))))...))))))))))).......(((((((.((((((((((...))))))))))..(((......))).)))))))))))))).((((.(((((....)))))..))))....)))))..))))))))))))).((((((..((((((((((((..((((........))))))))....(((((((......((((((((...(((((((....)))))))...((((....))))..)))))))).(((...(((.(((((((((((.(((((((((....)))..((((......))))..))))))....(((...(((((((.((((..((((...))))))))..))))))).....(((((...)))))........)))))))))....))))))))....)))...)))))))......)))))))).....(((((((.....(((((....((((....))))......))))).....)))))))....(((((..(((((((........))))))).....)))))))))))....(((((((..........)))))))...((((....[[[[[..))))......]]]]]....(((......(((((((((((((.....((((........))))....)))))))))))))[[[[..)))..]]]].....(((..(((((((((....)))))))))[[[[[.))).....]]]]].....
|
|
PDB_01275
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((.(((((....))))).)))..))))))....(((((.....(((((.((((((..)))))).)))))..))))).))))).(((((((((...((((((((((..))))))))))....))))...(((((((....(((((.(((((....))))).))))).)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))).((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))).
|
|
PDB_01281
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAGCGGGAAUUCCCGCUUCCCGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((([[[[[[[)))))))]]]]]]]
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....))))))))))))
|
|
PDB_01299
|
[ FASTA input ]
|
GGUUAUUCAGAUUAGGUAGUCGAAUGACCUAAGAAAUUUACCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((..[[[[[.)))))))))).........]]]]]
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.....[[[[[...)))))))).........]]]]]
|
|
PDB_01309
|
[ FASTA input ]
|
CACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUG |
|
[ reference structure ]
|
.((...((((..((((.[[[[........[[[[({{{{{{{{..{{{{(..<<<<....<<<.......))))..))))...)).)]]]]........]]]]..)}}}}..}}}}}}}}......>>>....>>>>
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))
|
|
PDB_01313
|
[ FASTA input ]
|
GAUCACUUCGGUGAUCACUUCGGU |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((....))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((....))))))........
|
|
PDB_01325
|
[ FASTA input ]
|
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....))))))))))
|
|
PDB_01332
|
[ FASTA input ]
|
GGUGUCUUGGAGUGCUGAUCGGACACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((.......)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............)))))))
|
|
PDB_01337
|
[ FASTA input ]
|
CCGGAGGAUCACCACGGGCGGAGGAUCACCACGG |
|
[ reference structure ]
|
((((.((....)))))).(((.((....))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((...[[[[....)))......]]]].......
|
|
PDB_01338
|
[ FASTA input ]
|
CCACAGUCACUGGGCAGUCACUGG |
|
[ reference structure ]
|
((.(((...)))))(((...))).
|
| [ predicted structure ] |
...((((.(((....))).)))).
|
|
PDB_01340
|
[ FASTA input ]
|
UCGCCAACAGGCGGGCCAACAGGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((....)))))(((....))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((....)))))(((....))).
|
|
RFA_00389
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGGUCUGUGCUUAGCACACUGACGAGUUCCUGAAAUGGAACGAAACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00390
|
[ FASTA input ]
|
GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00391
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUAGGCUUAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAGAUACGGCGAAACUUAUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00396
|
[ FASTA input ]
|
UAAGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAAUCUCUGAAAUGAGACGAAACUCUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...)))))........((((......))))....)))))))
|
|
RFA_00402
|
[ FASTA input ]
|
GAUGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUAUGAAAUGAGACGAAACUCAUA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
|
RFA_00409
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAAAUACGGCGAAACUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((...)))))..)))..(((((......)))))..........
|
|
RFA_00416
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((....))))........(((((......))))).)))))))))
|
|
RFA_00420
|
[ FASTA input ]
|
UCCAGUCGAGACCUGAAGUGGGUUUCCUGACGAGGCUGUGGAGAGAGCAAAUUGCUUUACUCCCGCACAAGCCGAAACUGGA |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((.........))))).......((((................................))))...))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((((((.....))))))).......((((..((((((((((...)))))).))))......))))...))))))
|
|
RFA_00425
|
[ FASTA input ]
|
ACAGAGUCUGACAAACCGUCACUGAAGACGUUCAACUUGCGUUGAACAGAAACUCUGC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((............))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.((((.....)))).(((.[[[[[)))....]]]]]........)))))).
|
|
RFA_00427
|
[ FASTA input ]
|
UCACCGUCGGAAAGUGUGCGCUUUCCCUGAUGAGCCCGAAAGGGCGAAACGGUAC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
|
|
RFA_00429
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGGUGUGUACCACCCCUGAUGAGUCCGAAAGGACGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((........))))).......((((....))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....))))))).......((((....))))...
|
|
RFA_00433
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00434
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCUUUGCGAUAAGGCGAAACUUAUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00436
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUGGGCUUAGCCCACUGAUGAGUCGCUGCGAUGCGACGAAACUUAUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00440
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAGUCCUGCGCUUAGCGCACUGACGAGUCUCUGAGAUGAGACGAAACUCUUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00442
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00444
|
[ FASTA input ]
|
ACGCUGUCUGUACUUGUAUCAGUACACUGACGAGUCCCUAAAGGACGAAACAGCGC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((........))))).......((((.....))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.((((((......)))))).......((((.....))))...)))))).
|
|
RFA_00446
|
[ FASTA input ]
|
CCGGUGUCUCAAGGUGCGUACCUUGACUGAUGAGUCCGAAAGGACGAAACACCAG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
|
|
RFA_00449
|
[ FASTA input ]
|
CCGCUAUAUGGGGAUGUGUGUCCCUACUGACGAGUUCAAAAGAACGAAAUAGUUA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
|
|
RFA_00582
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUGUUCACAGUCAGUUACAGAUCGAACUCCUUGUUCUACUCUUUCCCCCCUUCUCACUACUGCACUUGACUAGUCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....(((((((...................................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((((((((..((((.(((((((((....)))))))))..)))).((((.....))))................)))))))))....))))))))))..
|
|
RFA_00583
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAGUGCAGUGGUGUUUACAACUAAUUGAUCACAACCAGUUACAGAUUUCUUUGUUCCUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGCCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((((((((((.......((((..(((....)))..))))(((((....))))).............))))))...)))))))))))))..
|
|
RFA_00584
|
[ FASTA input ]
|
AGUUGGUCCGAGUGUUGUGGGUUAUUGUUAAGUUGAUUUAACAUUGUCUCCCCCCACAACCGCGCUUGACUAGCUUG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((.................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((((....(((((((....))))))).........))))))...))))))))))))))..
|
|
RFA_00585
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((((((((..........((((((........))))))..(((......)))...........))))))))).....))))))))..
|
|
RFA_00586
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGGUCCGAAAGUUGUGGGUUAUCCAAAUCAUUCAGUUAGUAUCACUAACCUUCUAUUUCACCCCACUGCUGACCUUGACUGGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((.............................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((..(((....(((.(((((................((((((...))))))............))))).)))......)))..)))..
|
|
RFA_00587
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.....(((((((.((((.....((((((((....)))))))).)))).....................))))))).......)))))))).
|
|
RFA_00588
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAAAGUAGUGGGUUAUCACAGAAAUUAUUACAGUUAGUUUCACUAACCUUUCUAAGUUCCACCCCACUGCUAACCUUGACUGGUCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((....................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....(((((((((........(((.........((((((...))))))(((...))))))...)))))))))......))))))))..
|
|
RFA_00589
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAUGGUAGUGGGUUAUCAGAACUUAUUAACAUUAGUGUCACUAAAGUUGGUAUACAACCCCCCACUGCUAAAUUUGACUGGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((..................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...((((((((((...........(((((((.(((((...))))).)))))))........)))))))))).....))))))))..
|
|
RFA_00590
|
[ FASTA input ]
|
GCUCGGUCCGAGUUUCAUGGUCUCCAAUGUGUGUGUGUGUGUGUUUUCUUUAGGAACCUCGGUUCCAACCUCAUCUUGACCUUGAAACUACUUUGACCGCUCCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..(((((((.................................................................))))))).....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((..(((((((.((((....(((.............(((.......(((((....))))))))..)))...)))).))))))).....))))).....
|
|
RFA_00594
|
[ FASTA input ]
|
AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((...............................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((.((((((.......(((((...))))).........))))))...)))...))))))))..
|
|
RFA_00596
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUUGGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUAUUCACAGUCCGCUACAGAUUGAACUCCUGUUCUAUACUUUUUCCACUUCUCACUUCUGCACAUGACUAAGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((..................................................................))))))).......))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[[((((((.(((......))).)))))).........)))...((((....))))..]]]]]]]]...............................
|
|
RFA_00597
|
[ FASTA input ]
|
UGUCAUUCCGGAGAGGGGCGUUUUCUUCUUUCUCUAACCCUAAUGUAUUGCUUGGGCAGCAGCUCUCUCGGUAUGCUCGCUGUUUUGCUGGCUAACUUUCAGCGAGCAGAGGGCGAAGUCGAAUUUCGGACAAGGGAGAAAAAAUGUUAGCCGGGGAACGCCCCUUUCCCGAAUGCCCGUGCCGUCCUUCCUCUCCUCUGGGCCCGUUGGCGAUAGCCCCCGGCCUCCCUCGCUCCUUAGGCCGCGGUCAGUCCGGGCCCUUGCUCUGGCAUGAGGUCCAUUGCUGCCGCGAAGAGUUCGUCUCUGUCAGCCUUGAGGUGGCCAGCAUGGAAUUGGCGGGCUUGUGGCGGCGCGCGGGAAAAAGCAAAUGGUGAACUAGGUGCGUGUUGUGGUCGUGUUCCUGAAGCGUGGAAUGUGCGAUCUGUGCGCUAGUUCAUACACAC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((((((....................................(((((.......(((((((((........[[[[[[[[[))))))))).)))))...........................]]].]]]]]]..)))))))))))))))).)))))(((((((................((((((((((((...........((((..(((((..........(((((.((((..(((...................)))...))))))))).((((.....))))........))))).)))).........)))))))))))).......)))))))..............(((((((((((.........(((((((((........))))..)))))...))))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((((((((((((((...........(((...[[[.......)))..]]](((.[[[[))).(((((((((.................)))))))))]]]].....(((...[[[[.)))......]]]]...........)))))))))))))))))........(((((((((...............((((((((((....)))...((((..(((((......(((((((((.((((..(((((..(((....)))...)))))...))))))))).((((.....))))....))))))))).))))...........)))))))....))))))))).........(((....[[[[[[[[[.))).......(((((((((((........)))))..))))))......]]]]]]]]]......
|
|
RFA_00598
|
[ FASTA input ]
|
UUAAUUAGAGGGAUUGGAAGGUUCCGCUUAUGCUAACCCUAAUAUUGGGGGUCUGUUGAAAACCUCUUUAAGAUAUGCGUGUUGUUUUAUUGGCUGACUUUCAGCGCGCAUUGAGAGGAGUUGCUGCCCAGGACUAAAAAAUGUCAGCUGGGAGUCCUUCCUCUCCCUUAUUUCUGCCUCACAACCUGGACUCUUUAUUUAGCGGUGCCCCAUUUGUCGAGGCCGCAGUCAGUCUUGUUCUUAUACGCUGCUGUUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUCAGCCUCCGGGGCAACGCCUUGAAUUUGGAGAGCCUGGGAAUGUAACAAGGGGUAGGGAAAAUAACGAGAGCUGAGUUGGCUUCUCCUGUGCUGUUCCUGAGCUGUGGAACUUGCAAUCGCAGUCGGCUCUGACACUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((..(((((((((((.....................................(((((........(((((((((........[[[[[[[[[)))))))))...)))))....................]]].]]]]]]..))))).))))))))))))))))(((((((...........(((((((....((((((((((............(((((.((((..(((....)))....))))))))).((((.....))))..........))))))))))........))))))).................)))))))...........((((((.((((..........(((..((((........))))...)))....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((..((((((..........(((..(((((....)))))............((((((......((((((((((..(((.....)))....)))))))))).))))))))).(((.((((((((........)))..))))))))))))))..)))))).((((((((((....(((((.(((((((....(((.((((((.......((((((((((.((((..(((......)))..))))))))).((((.....))))....))))).)))))).)))........))))))).)))))..........)))))))))).......(((((((.[[[.))).))))....]]](((((.[[[[[[.)))))((((....)))).]]]]]]........
|
|
RFA_00599
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGUUGCGGGAGCUGCGAGCGGCCGUCUCGUCUAACCCUAAAGAGAAAGGCGUAGGUGCUUGGCCUUGGCGACUCGCCCGCUGUUUUUUGGCUGGCUUUCAGCGGGUGAAGAGGCCCAAGACCUACCGCCACCCACCGUCUAGUGUCUUAAGGGCACAAAGUCCUGCCCGCCACCCUUCGAGGAGCGAAACCCAAAAAAGUCAGCCCCUGGCCGCCUCUCGCCCUCUCGCAACCCGCCUCCGUCCCAGCCUCCAUCCCCGCCCCAGGCCGCGGUCGGUCCGGGCUUCUUCGGAAGUCCCGUUGCCGUCGCGAAGAGUUCGCCUCUGUCAGCCGCGGGGCUUGGGGCCAGGGACGGGACCCUGUCCGCAGGGAGAGAAACUGGAGCCGGGCCCUCCACGGUGCCUCCCCGAGCUGUGGGAUCUGCACCCGGGACUCGAACCCUACACUU |
|
[ reference structure ]
|
......(((((((((.((((((((((((.......................(((((((((.....(((((.......(((((((((.......[[[[[[[[[)))))))))..))))).....))))).)))).................................................................]]].]]]]]]...))))))...)))))))))))))))(((((..(((((((.(((((....(((((.......(((((.((((..(((.............)))...))))))))).((((.....)))).......)))))....)))))..)))))))..........)))))..........((((((.(((((......(((((((((........))))..)))))..)))))).)))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((..(((((.(((...(((.............((((..(((((((((.(((((((((......((((((((((................)))))))))).)))).)))))))))).))))...(((......)))))))..(((((........))))).............)))..............(((((...))))).))).))))).)))))))))))))))((((((((.(((.(((.((((((....((((((((.((((.((((((((....)))).))))..))))))))).((((.....))))....)))))))))..))))))..)))))))).(((((....))))).(((....(((((.......))))).(((((.((((........))))...))))).[[[.)))...]]].......
|
|
RFA_00600
|
[ FASTA input ]
|
GUCCAGCUGCGGGGAGAAAGUGUCGUUCUCUAACCCUAAUGCGAGGGCAAUGCGGGCCCUUUGUUUAAAGUCCCGUUGUCGCGCGAAGCGGGAGCCCUCGCUGUUUUCUUGGCUAACUUUCAGCGAUGGUGAAAGGGCCUAGCAAAGGUUGGGAAGCGUGAUUUAUUGUUGGUGGGCAGAGAGAAAAAAGUUUCAGCCGCGGCCUCCUCCCCGGCGGCCCAGGACCCCCUGUUGCAACGUGCGAAAUGGCGGCCUCGGCCCCCACCUUUGCUCGCAUGCCCAGCCGAGUAGGCCGCGGUCAGCGCCGGCUUCCACGCCAGUGUGGGGCUUGAUGCUGUCGCGAAGAGUUCGUCUCUGUCAGCCUGGCAGGGGGUGCUACGCAGGGUCGGGGUACGGGGGACAGGGAGAUUAAAUAGCUUGACCAGACGCUAUAACCUGUACUGCAUCUCCCAGAGCUGUGGGACCUGCAAAUCUGCGCUGGUCAUACAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((........................................(((((.................................(((((((((........[[[[[[[[[)))))))))...)))))................................................]]].]]]..]]].........))))))))))))...))))..((((((..................((((((((((............((((((((.((((.......(((((.((((..(((....................)))..))))))))).((((.....)))).......)))).))))))))......))))))))))......))))))...............((((((.(((............((((..((((........))))..)))).....)))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((((((((.....((((((((((....(((((((((((((...(((((..((((....)))).)))))..((((.....))))..))))))))((((((((.((((..((((((.......)))))))))).(((....))))))))))).........))))).....)))))((((....))))....)))))...)))))).)))))...))))......((((..[[[))))....]]].(((((..(((((((((.....((((.(((.((((....((((((((.(((((..(((((((((....))).))))))...)))))))))).((((.....)))))))....)))).))).)))).....))))).))))..))))).(((((........(((((.[[[[[[[..)))))..)))))..((((..(((((......)))))..))))........]]]]]]].......
|
|
RFA_00601
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUGUGGAGGGUGGGCCUGGGAGGGGAAGCGGUCAGUUUUUGUCUAACCCUAACUGAGAAGGGCGUAGGCGCCGCGCUUUUGUUUCCCGCACGCUGUUUUUUUCGCUGACUUUCAGCGGGCGGAAAAGCCUCGGCCUACCGCCGUCCACCGUACAGUUUGGAGCAAACAAAAAAUGUCAGCUGCUGACUUGCUCGCCCCUCCCAGGACCCUGCGGUGGCUCGCCUCCUUAGCCCCCGCGUCCCGCCUAGAGGCCGCGGUCGGCCCGGGGCUUCUCCGGAGGCACCCAUUGCCGUCGCGAAGAGUUGGGCUCUGUCAGCCGCGGGUCCCUUGGGGGGGCCGAGGGCGAGGCUCUGACCGCAGGGAGAGAAACGGGAGCAGGUCCCCGCGCGCGGUGCGCUUCCCUGAGCUGUGGGACUUGCACCCGGGACUGGGCUCAGACACAU |
|
[ reference structure ]
|
.................((((((((((((((.(((((..........................(((((((((.....(((((.......(((((((((........[[[[[[[[[)))))))))..)))))....))))).))))............................]]].]]]]]]...)))))...))))))))))))))..(((((((......((((((((..((((((...(((((........(((((.((((..(((...............)))...))))))))).(((((...))))).......))))).....))))))......))).))))).....)))))))...........((((.((((((........((((((.((((........)))).))))))..))))))..))))........
|
| [ predicted structure ] |
.(((..(((..((((((((((((((((((((((.((((((.............))))))....((((....)))).))))))).)))))))...(((.(((((((((((((...)))))))).))))))))...)))))))).)))...)))...((((...[[[[[[................))))..]]]]]]((((.((((....((((((((((((......(((..((((((....(((((.....((((((((.((((..((((((((....))))).)))...))))))))).(((((...)))))....))))))))........))))))..))).....)))...)))))))))........(((.(((((((((.((((...))))((((....))))...))))))))).)))))))..))))..........
|
|
RFA_00602
|
[ FASTA input ]
|
GGGUUGCGGAGGGUGGGCCUGGGAGGGGUGGUGGCCAUUUUUUGUCUAACCCUAACUGAGAAGGGCGUAGGCGCCGUGCUUUUGCUCCCCGCGCGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCGGGCGGAAAAGCCUCGGCCUGCCGCCUUCCACCGUUCAUUCUAGAGCAAACAAAAAAUGUCAGCUGCUGGCCCGUUCGCCCCUCCCGGGGACCUGCGGCGGGUCGCCUGCCCAGCCCCCGAACCCCGCCUGGAGGCCGCGGUCGGCCCGGGGCUUCUCCGGAGGCACCCACUGCCACCGCGAAGAGUUGGGCUCUGUCAGCCGCGGGUCUCUCGGGGGCGAGGGCGAGGUUCAGGCCUUUCAGGCCGCAGGAAGAGGAACGGAGCGAGUCCCCGCGCGCGGCGCGAUUCCCUGAGCUGUGGGACGUGCACCCAGGACUCGGCUCACACAUGC |
|
[ reference structure ]
|
.................((((((((((((((.(((((..........................(((((((((.....(((((.......(((((((((........[[[[[[[[[)))))))))..)))))....))))).))))............................]]].]]]]]]...)))))...))))))))))))))..(((((((......((((((((.((((((((..(((((........(((((.((((..(((...............)))...))))))))).(((((...))))).......)))))....))))))))..)))).))))..............)))))))..........(((((((((((........(((((..((((........)))))))))....))))))).))))........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((.......[[[[.......)))))))))))....]]]]....(((...((((....))))[[[[.....)))...]]]](((......((((((((...)))))))).[[[[.)))...(((.....)))]]]]..............(((...........[[[[)))..]]]]((((((.((((....)))).(((((((((((((((((((((.((((((((..(((((((((....((((((.(((..((((((((....))))).)))...))))))))).(((((...))))).))))..)))))....))))))))..)))).))))...))))).....)))))))).....)))))).(((......[[[[)))..]]]].((((.[[[[[[[.))))...............]]]]]]].......
|
|
RFA_00603
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((.(((.....))).)))......................................((((((((........))))))))...)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.............(((.(((.((((.....................)))).))).)))..((((...[[[[.[[[))))....]]].]]]]...)))))....(((((.(((.....((((((.......))))))..)))))))).........
|
|
RFA_00604
|
[ FASTA input ]
|
AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((........((((((...[[[[))))))...]]]]........................((((....[[[[[[))))....]]]]]]...))))))))))..((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))).......
|
|
RFA_00605
|
[ FASTA input ]
|
GACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGAGAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUCCUUAUACCUUGAGUAUUGCUGAAUUCAGUUUAGCGUGCAUGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGUCAAAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUAUUUAUGACG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((..........(((...(((......)))...))).....................................((((((((.......))))))))..........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.......((((..((((....))))..))))..........((((((....)))..........((((((((((((((...))))))))...)))))).)))........)))))))))))).......((((.....))))((((............)))).
|
|
RFA_00606
|
[ FASTA input ]
|
GGAUAUAGGGUAGUUCUCCAUUGACUAAUCCGUCAAAUCUGUCAAACAAAACCCCAAAACCGAUCAAUAGGUGCGUUUAGCUUGAUUACACCUCUUAAAUGAAAUCUUGCAAUUCUGGAGAGCUUGAGAGGUGAAACCCCCACAGUUAGGUCAAACAUAGUUUGAGAUUUGUAUCUCAUAUGCUCUAGCUGUCCUCUCAUCUUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........((((((........)))...))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((..........((((......))))...))))).)))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
....................(((((......)))))....(((((...((((......(((........)))..))))...)))))..((((((((((..(((.[[[[....)))..]]]]..))))))))))..(((...[[[[[[[))).......(((.((((((....))))))...))).]]]]]]]...............
|
|
RFA_00607
|
[ FASTA input ]
|
AGUUUCUCGAUAAUUGAUCUGUAGAAUCUGUCAAGCAAAACCCCAAAACCUUACACUGAGAGCAUUUAGCCUGAUUACUCUUUAAAUCAAAUCAGGCAAUAGAGAGAAACUCGAGAGGUGAAAACCCCACAGCAUUCUGAAAUGUAUUUGGGAGUAAUCUCAUAUUAGUUUGCUGUCCUCUCAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........(((......)))......................................((((((((.............))))))))....))))).......(((((..........((((((.(((((.........((((....))))...))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((...(((.......))))))).........................(((((......[[[[[[[[.))))).......]]]]]]]]......)))))))).((((((..........((((((..((((........(((((....)))))..))))..)))))))))))).......
|
|
RFA_00609
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGGUGGAAGUGCGUCAGUCAUAGCACUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAACUCAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGUUCCGCCAGCUACCAGAGGACGAAGUGGGCUAAGUGAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUCACUUAGCCCCGCCUCUCAUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((...........((((.....))))..))))).))).)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((..........)))))............................((((.......[[[[[[[.)))).........]]]]]]]....))))))))))...(((((.......((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))..))))).........
|
|
RFA_00610
|
[ FASTA input ]
|
AGUCGGCGGAAAUCAGUCAGUCAUAGCGCUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAAAUUAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGCUCCGCCGACUCAGAGGGCACUGUGGGCUGAGCAAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUUGCUUAGCCCUACCUCUAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...))))).......(((((.(((....(((.(((((...........((((.....))))..))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.......((((......))))...........................((((.......[[[[[[[.)))).........]]]]]]]....)))))))))).(((((.......((((((((((((((....))).(((((...)))))..)))))))))))..))))).......
|
|
RFA_00611
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCAUAUCAUUCAGACCCUUUAUGGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUGUCUUAAUUACUUAGGCUAAAAGAAAUAAGUAUUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........(((.(((.....))).)))......................................((((((((............))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........))))))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((....((((.(((.......(((...............)))....)))))))........(((.....[[[[[[))).........]]]]]].....)))))..((((((((.....(((((.(((...))))))))..))))))))......
|
|
RFA_00613
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCAUUUUCAUUCAGAUCUUUAAUGGAGCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAACUACUGCCUUAACUACUUAGGCAAAAUAAGUCGUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUAUCUUAUUUUUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.........(((.(((.....))).)))...................((((........[[[[[..))))...]]]]]..............)))))..(((..(((.....(((((.(((...))))))))..)))..))).........
|
|
RFA_00615
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCACAUUCACUCAAAUCUGUAAUAGACUUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUACCUUCGCCAAUUAGGUACAAUUAAUGGUUCUCGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACAUUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))....)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((...............((((.((((.(((...........)))...)))).)))).....(((((..[[[[...))))).......]]]]....)))))....(((((.(((.....((((((.......))))))..)))))))).........
|
|
RFA_00616
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUCAUUAUGUUCAUUCUUCUUCUCCAAUAGGAAAGGAAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUACAAACACCCUGAGUAUUGCUACAUUCAGUGUAGCGUUAAUCCUCUUGGCUAUUCUCGUAACGAUUGUCAAAUUUAGAGUGCUUAUCGUCAAAAAUCAGCAAAUCAUGACGAGUCAUAAGUGCUCUAAAUAGUUAUUUUUAUAUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((..(((......)))....))).....................................((((((((.......)))))))).......)))))........((((((((.....(((.(((((.......((((...............))))...........))))).))))))...)))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((((......((((((.(((....))).))))))............((((.(((.............(((...((((((((...))))))))......))).)))...))))))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))...................
|
|
RFA_00618
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUUAUUAUGUUCAUUCUUCUUUUCAAAUAGGAAAGGAAAUCAUACAACCCCAGAAACCAUCACAAACACUAGAGUAUUGUUACAUAUAGUGUAACGUUAAUUCUCUUAGUUAUUCCCGUAACGAUUGUCAAAUUUAGAAUGCUUAUCGUCAAAAAUCAGCAAAUCAUAACGAACUAAAAGUACUCUAAAUAGUUAUUUUUUGUAUAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((..(((.......)))...)))....................................((((((((.......)))))))).......)))))........((((((((.....(((.(((((.......((((...............))))...........))))).))))))...))))).........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((((....(((((((((((......)))))))..............))))............(((((((...((((((((...))))))))......))).))))......)))))..))))))).(((((((.(((((.((((...................)))).....))))).)))))))....................
|
|
RFA_00619
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUCUUUAUGCUCAUUCUUCCUUCUGAUAGGAGGGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUUCCACAACCCUGAGUAUUGUUGCAUACUGUGCAAUGUAAAUAUUCUUGGUACUCUCAUUUAGAUUGUCAAAUUUAGAGCAUGUUCCAUCAUUUCAAUAUUAUUCAUGAUGGAAUGAUAAUGCUCUAAAUGUUAUUUUUAAUAUAUUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((...(((......))).))).....................................((((((((.......)))))))).......))))).......((((((((.....(((.(((((........((((.....................))))....))))).))))))...)))))..........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.(((((((..(((((((......)))))))))).))))........((((...))))....(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..)))..........))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
|
|
RFA_00620
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((...(((.....)))....)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((((((....(((.(((((.........((((................))))............))))).))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((.(((....((((........))))..(((............)))))).(((............(((((((((((......))))))).)))).)))........))))))))))..((((((((((.((((.(((((((....(((....)))..))))))).....))))))))))))))................
|
|
RFA_00621
|
[ FASTA input ]
|
AUCGUCACUAAUCGAAGCUUACAAAAAUGGAGUAAAGGAAUUUUUCUUCUUACUCAAUAUUAAUGCUUUGGGUUGAAAGUCUCCCACCAAUUCAUAUGCGGAAAACGUAAUGAGAUUUAAAAAAUUUAAAUUCUUUAAAUCAACUCAUUAAGAGAAAUAUCUUUAGAUAUUUCUCUUCUUGACCCAGUACUCUGUUACAGGAGCGCUGGUGUUUUCUUCGGUACUGGAUUCCUUAUAUAUGGAAUCUAAACCAUAGUUAUGACGAUUGCUCUUUCCCAUGCUGGAUCGAGUAACCCAAUGGAGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((....(((((((...........((((((..............)))))).........)))))))...................((((....)))).....((((((((((((((((((...)))).)))))))...))))))).((((((((((....(((((........(((....((((....)))..)))))))))))))))))))...........((((........))))...............)))))))..((((((((......))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
.(((........)))..............(((((((((((...))))).)))))).........(((((.[[[..))))).....]]]..(((...[[[[)))..]]]]....((((((((.(((....))).))))))))...(((..((((((((((((....))))))))))))..))).((((..((((......))))..))))..........(((..((((((((........)))))))).))).....((((....[[[[[[..[[[))))..]]]..]]]]]]............
|
|
RFA_00623
|
[ FASTA input ]
|
AUCGUCACAAAUCGAAGCUUACAAAAUGGAGUAAAAUUUUUUUUACUCAGUAAUAUGCUUUGGGUUGAAAGUCUCCCACCAAUUCGUAUGCGGAAAACGUAAUGAGAUUUAAAAAUUCUAAAUUGUUUAAAUCAACUCAUUAAGGAGGAUGCCCUUGGGUAUUCUGCUUCUUGACCUGGUACCUCUAUUGCAGGGUACUGGUGUUUUCUUCGGUACUGGAUUCCGUUUGUAUGGAAUCUAAACCAUAGUUAUGACGAUUGCUCUUUCCCGUGCUGGAUCGAGUAACCCAAUGGAGCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((....(((((((..........((((((........))))))........)))))))...................((((....)))).....((((((((((((((((((...)))).)))))))...))))))).((((((((((....(((((........(((....((((....))))..))))))))))))))))))...........((((((....))))))...............)))))))..((((((((......))))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
.......(((.(((((((((((......((((((((....)))))))).))))...))))))).)))...............(((...[[[[)))..]]]]....((((((((((((...)))).))))))))...(((..(((.((((((((....)))))))).)))..)))((((....[[[[[[[[))))(((((((........)))))))((((((((((....)))))))))).................((((((..(((......)))..))))))..]]]]]]]]..
|
|
RFA_00624
|
[ FASTA input ]
|
ACCUGAAGUCUAGGCAACGUACGGGAGACGUAGUUCUUCAAUCACAUGACGCCUAGGGGAAAGUCCCCGGAUCUCGGGUAGAAAGUGCCGUGCGCUACUAUGGCGUGCAAUAAUCCCGCCCUGCUGUCCAUAUCAACCCGCCAAGAAGCUCCCAGAGCCGAGCGGCUUGGAUUAGGGCGGGAUCUCUCAUCAGUCACCAUAGUAACUCAGGUAGCGCGGCAACGUCCACGCUAACUAAACGGGGCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.......((((((....))))))............)))))))...................((((.....))))((((((((....)))))))....(((((((((((..(((((.......((((......((((...))))...))))..))))))))))))))))......................))))))).((((((......))))))...............
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((((.(((....[[[[[)))...]]]]]...........)))))(((((...))))).....))))))..........((((((((...))))))))....(((((((((((..(((((.......((((......((((...))))...))))..))))))))))))))))........(((.[[[......)))..]]]...(((.....[[[[.)))..........]]]].
|
|
RFA_00626
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGUGUCCAUCCUUGUUAAAACAAGAAAUUUUACGGAAUAACCCAUUUUGCCCGACCGAUCAUCCACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUCUUUCAGGCAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUGGAAAUAUUUCUGGAGAGUAAUACCCAGUCUGUUUCUCUGAUAAUUGCGCUGUUUUUCCGCAUGAAAAACGGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGACUAGACACGAGGCCAUCGGUUCACACCCGGAAAGGCGUUACUUUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........))))).....)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))..............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((......(((((....)))))......))))))).........((((..............[[[[.))))..]]]]..(((...((((....))))...)))...(((((((((((.....(((...[[[[.....))).......]]]]((((.((((....[[[)))).)))).....((((.(((((((((.....)))))))))))))..]]].......(((((..[[[[[[[[...(((((....))))).................)))))..]]]]]]]].......((((......))))))))))))))).........
|
|
RFA_00627
|
[ FASTA input ]
|
AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUACCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))..........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))....)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((...[[[[[.....[[[[)))))..]]]].........]]]]]...............(((((((((((...(((((((((((.....(((((..(((((((((...)))...))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((........(((((.....((((..(((((....)))))...)))).............)))))..)))))....)))))))...)))).....))))))))))).........
|
|
RFA_00628
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCGCGUUGAUUCUCGUUAAACAGGGAAAACGGUGGAAUUAUAAAAUUUGUCUGAUCGCGCAAAAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGCGAAAUCAAACAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAAUGGAAUCAGAUCUGUCGACGUAAAUCAGAGGCUAUUCCCCUAGUAAAAGUGCUGUCUUUCACAAAGAAAAGCAGGCUUACCGAGAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGACUUUGCGAGAAGACACGGGGCUUUCGGUUUAACUCCGGCCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGCUUUGUCGAUAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....((((...........))))....))))).........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))......)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((..(((((........)))))))).))))))..........(((((..[[[[......((((.......)))).)))))....]]]]...............(((((((((((...(((((((((((.....(((((....((((...........))))....)))))........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((((......(((((...((((....(((((....)))))......))))..........))))))))))))......)))))))...)))).....))))))))))).........
|
|
RFA_00630
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGCACCGAAACUUGUUAAAACAAAAAGUUUAGCGGAAUAACCCAUUUUGUCUGACCGAUCAUCAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUUUUUCAGACAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUAGGAUCUUCUCUGGAGAGUAAUGCCCAGGCUGCUUCCCUGAUAAUUGCGCUGUGUUUCCGUAUGAAAUACAGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGAAAUAGUCACGAGGCCAUCGGUUCAUGCCCGGUAAGGCGUCACCAUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.......(((((....))))).......)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))...............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..((((((....((((((...........)))))).)))))).........((((((((..(((((...((((.......)))).........)))))..)))))))).....(((((((((((.....((((..[[[[.....))))......]]]]..((((.....[[[[.))))..]]]]....((((.(((((((((.....)))))))))))))......(((...[[[[[...))).......(((((....)))))..(((........)))..]]]]].((((....[[[[[))))..]]]]]......))))))))))).........
|
|
RFA_00632
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))).)).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((..[[[[[[[(((........))))))))))......((((.(((((((......)))))))...)))).....]]]]]]]..
|
|
RFA_00636
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((..[[[[[[[(((........))))))))))......((((((((((((......)))))))).)))).....]]]]]]]..
|
|
RFA_00639
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGUGAGGGCGAUCUGGCUGCGACAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCAGGGUUGAUUCGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUGUCCCCUUCCUCCCUCACCGCUCCAUGUGCGUCCCUCCCGAAGCUGCGCGCUCGGUCGAAGAGGACGACCAUCCCCGAUAGAGGAGGACCGGUCUUCGGUCAAGGGUAUACGAGUAGCUGCGCUCCCCUGCUAGAACCUCCAAACAAGCUCUCAAGGUCCAUUUGUAGGAGAACGUAGGGUAGUCAAGCUUCCAAGACUCCAGACACAUCCAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.(((((((.((...((....((((((((((.(((((..(((((((...........))).)))))))..))...)))))))))).)).))..)))))))...))).......((((((((((.((.....))))))(((....(((......))).)))..)))).)).............................(((...((.((((((......((((..(((((.............))))).))))...)))))).))...)))......................(((.((((((((((.....)))))..)))))..)))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((((....(((....)))...)))..)))))))((((.....((((((.....))))))...[[[[[.............))))..]]]]]....((((((.[[[[........)))))).........]]]]..((((...[[[.......(((((....)))))))))..]]].....((((((((..(((.((((((.....(((.((((...(((.....)))...)))).))).....)))))).)))..))))......))))....)))))))....((((((((((.....)))))..))))).....
|
|
RFA_00642
|
[ FASTA input ]
|
UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((...........))).)))))))).................(((...[[[...)))..]]].
|
|
RFA_00643
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....................(((((....(((......))).[[[[[[[)))))..]]]]]]]...
|
|
RFA_00644
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.................)))...((((.(((((........)).)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((...((((((...))))))..)))..((((((.....[[[[.............)))))).......]]]].
|
|
RFA_00645
|
[ FASTA input ]
|
AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..........((((((.....[[[[[[[.[[[..)))))).......]]].]]]]]]]............
|
|
RFA_00649
|
[ FASTA input ]
|
UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((..((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((((....))))..[[[[)))..(((........)))..]]]]..........
|
|
RFA_00651
|
[ FASTA input ]
|
UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.............((((....))))...(((.[[[[[)))((((.....))))...]]]]]....
|
|
RFA_00653
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.....)))...((((.(((...((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((..........[[[[[[[.[[[.....)))))).....]]].]]]]]]].(((....))).
|
|
RFA_00654
|
[ FASTA input ]
|
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((((...........[[[[..........)))))))....]]]]..........
|
|
RFA_00658
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((.((((......)))).....[[[)))))...]]]..
|
|
RFA_00659
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((...[[[[[.[[[.......))).....]]].]]]]]........
|
|
RFA_00664
|
[ FASTA input ]
|
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
...(((.......[[[)))..(((((((.......)))))))]]]
|
|
RFA_00667
|
[ FASTA input ]
|
AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((((.(((((.........)))))...))))).))))
|
|
RFA_00668
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.................................))))))
|
|
RFA_00672
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...((())).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....(((....))).......((((((.....))))))....
|
|
RFA_00673
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
.........................(((...[[[.)))....]]]...
|
|
RFA_00674
|
[ FASTA input ]
|
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............(((.....[[[[[[[....)))...]]]]]]]...
|
|
RFA_00675
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((....)))).....(((((.......))))).))))
|
|
RFA_00677
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..((((...(((....)))(((...))).))))))))))
|
|
RFA_00678
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............((((......)))).................
|
|
RFA_00680
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.((((......))))........)))).))))))))
|
|
RFA_00683
|
[ FASTA input ]
|
GCAAUACUGAAGAGUUCCACAAUAGGACGAAACGGCGAUCCAGUGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
...((((((......(((......))).............))))))
|
|
RFA_00684
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((.....(((((......)))))......)))........
|
|
RFA_00685
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((...((((.........(((........))))))).)))))
|
|
RFA_00695
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUCGAAGACGAGUGAACUAAUUUUUUUUUAAUAAAAAGUUCACCACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAACAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((..............................................................................))))...((((.)))).)))).))
|
| [ predicted structure ] |
....................(((((....)))))..(((..(((((((..((((........)))))))))))..[[[[[[...............)))........]]]]]]......
|
|
RFA_00703
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...(((...((((....((((........((((.........)))).....))))))))..))).....))))....))))))
|
|
RFA_00704
|
[ FASTA input ]
|
AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.........((((.....)))).))))......
|
|
RFA_00705
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..((((.((((.......))))........))))))))))
|
|
RFA_00706
|
[ FASTA input ]
|
CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....((((.[[[((((.......))))....))))..]]].....
|
|
RFA_00707
|
[ FASTA input ]
|
GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........................(((((.......))))).....
|
|
RFA_00708
|
[ FASTA input ]
|
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((...[[[....[[[[..)))..]]]]....]]]...........
|
|
RFA_00709
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((...[[[[[[[......)))........]]]]]]]......
|
|
RFA_00710
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............(((.....)))..((((((....))))))..
|
|
RFA_00711
|
[ FASTA input ]
|
CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((..[[[[[[[........))))....]]]].]]].....
|
|
RFA_00715
|
[ FASTA input ]
|
GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((....(((((.......))))))))))
|
|
RFA_00716
|
[ FASTA input ]
|
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
....................(((((((.......)))))))...
|
|
RFA_00717
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((.(((........))).......)))))))))
|
|
RFA_00720
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUUGACUCUACGGGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.......((((......))))...(((....)))...))))))
|
|
RFA_00721
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUCGACUCUAUGGGGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((.....((((..[[[.))))...)))).....]]].......
|
|
RFA_00730
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00731
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00733
|
[ FASTA input ]
|
GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00734
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
....((((...[[[[[)))).......]]]]]...........
|
|
RFA_00736
|
[ FASTA input ]
|
GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00737
|
[ FASTA input ]
|
ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((....(((...)))..[[[....))))..]]].......
|
|
RFA_00745
|
[ FASTA input ]
|
ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((.......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00749
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00758
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
..((((....[[[...[[[.))))..]]]..]]].........
|
|
RFA_00762
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.(((((.......))))))))...))))).
|
|
RFA_00763
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((..[[[.))).........]]]...))))).
|
|
RFA_00764
|
[ FASTA input ]
|
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
|
|
RFA_00765
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.........(((...)))..(((.....[[[[[)))..]]]]]
|
|
RFA_00767
|
[ FASTA input ]
|
GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((.....))))..[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
|
RFA_00768
|
[ FASTA input ]
|
ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((((((.......)))..[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
|
RFA_00769
|
[ FASTA input ]
|
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((..............[[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]]....
|
|
RFA_00770
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((....(((....))).[[[.[[[[[[[..))))))....]]]]]]]]]]....
|
|
RFA_00773
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((.........[[[..[[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]]]]].
|
|
RFA_00779
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((.....))).))).......((((((((((.............))))))))))....
|
|
RFA_00781
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
....((((.((((((....))))))..))))...((((..(((.((((...((((.....))))..)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
|
RFA_00786
|
[ FASTA input ]
|
GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
....((((.((((((....))))))..)))).(((((((((((((((...))).))))))))).....(((((........)))))....[[[)))..]]]
|
|
RFA_00791
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUCCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGGCCGCAGCCCCUAGGAGACGUCCCAGCGGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..((.((((((....)))))).))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))........((((((....)))(((((((((....)))))...)))).[[[[[)))......(((....)))...]]]]]
|
|
RFA_00792
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[.....)))...........]]]]...((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
|
RFA_00801
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUAUAUCUGGCGGGUCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGACCGCAGCCCUAGGGAGACGUCCUAGGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..(((((.(((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((..[[[[))))).........]]]](((...[[[[..(((((....)))))....)))...]]]].(((((((((.....))))))))).
|
|
RFA_00805
|
[ FASTA input ]
|
UAACUAGAUUACAGAGAUGUGAUGGAAAAUAGUUGAUGAGUUGUUUAAUUUUAAGAAUUUUUUAUCUUAAUUAAGGAAGGAGUGAUUUCAAUGGCACAAGAUAUCAUUUCAACAAUCAGUGACUUAGUAAAAUGGAUUAUCGACACAGUGAACAAAUUCACUAAAAAAUAAGAUGAAUAAUUAAUUACUUUCAUUGUAAAUUUGUUAUCUUCGUAUAGUACUAAAAGUAUGAGUUAUUAAGCCAUCCCAACUUAAUAACCAUGUAAAAUUAGCAAGUGAGUAACAUUUGCUAGUAGAGUUAGUUUCCUUGGACUCAGUGCUAUGUAUUUUUCUUAAUUAUCAUUACAGAUAAUUAUUUCUAGCAUGUAAGCUAUCGUAAACAACAUCGAUUUAUCAUUAUUUGAUAAAUAAAAUUUUUUUCAUAAUUAAUAACAUCCCCAAAAAUAGAUUGAAAAAAUAACUGUAAAACAUUCCCUUAAUAAUAAGUAUGGUCGUGAGCCCCUCCCAAGCUCGCGGC |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((....)))))).....(((((((.(((((((((((...((((((........))))))........((((((((.((..........)).)))))))).....((((((((...........).)))))))...((((((....))))))........((((.(((((....((((.......))))..)))))))))..((((((((((....(((((.(((((((((.........))))))))))))))...(((((((((((.....))))))))))).(((((..........)))))))))))))))........((((((((......))))))))....((((......))))...)))))))).)))((((((((.....)))))))).....((((((((..((((((.............)))))))))))))))))))))..........................(((((((((.........)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((((.(((((.((((((((..........((((((((..............(((((((((((((((((((((((((................))))))))(((((.((((((...(((((......(((((.....((((((....)))))).........)))))........))))).)))))).....))))).......(((((((((.....((((.(((((((((.........)))))))))))))....(((((((((((.....))))))))))).(((((..........))))))))))))))....))))))))))).......)))))).......((((......))))...))))))))....((((((((.....))))))))......))))))))........)))))..(((.......))).........))))))..(((...((((....)))).)))(((((((((.........)))))))))
|
|
RFA_00808
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
|
RFA_00809
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((.......[[[[[[[[[[))))))).......]]]]]]]]]].......
|
|
RFA_00814
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUUAAAACGUUUGGUUCACAUACAUCUGCCUGCUGCCUUGGCACAAUAUCAAAAAGGCAUAAACAUCGCACAUAAUGGUUAUUUACGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCGGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAACUGACCAAAUAACGCAGCCCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUUUGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((..............)))))).....(((((......................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((......................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((........................((((...[[[[[[))))..........]]]]]]...........................))))))).(((........(((((....((((((.((((....)))).......))))))...)))))((((((((..(((...........))).))))))))....[[[[[...)))....]]]]].....
|
|
RFA_00815
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUGAGCGCGUUUGAUAUAGUGAUAAAUGCCUGCUGCCUGGGCUCAACAUCAAAUGCAGGCAUAAACAUCGCAACUAGCAACAAGGAGGAUGGUUUUUAGUACGUAGGCAUUGCGGAACCCUCAACGUGAAGAAGUUCAGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGAGUCAUUGGUUCGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUUCCUUCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((................)))))).....(((((............(((((.(((......(((((....(((((((((((...............)))))......))))))...))))).((((((...............))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[...))))........(((((..((((((((....(((........)))...))))))))....)))))...]]]].....(((((((((......(((((....((((((.((((..(((...)))....)))).......))))))...)))))(((((((.(((........)))))))))).............))).))))))......
|
|
RFA_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGAUCUCUGUAUUUGUUUCUAUUUUGAACAUUUGCCUGCUACCUUGGCAUAACAUCAAUAAGGUACAAACAUCGCAAAAAGUCAUCAUAAGGUGGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUAGAACUUAAUUGUUCUGAUAGAGCAGCGAGUCGUGCAUGCUAGUCUAACAUUUCUUGCUACCUAGUAUCUUUAGAAGAUUUCCCUCCCUUAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..........................................((((((..............)))))).....(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
................(((((.......)))))..(((....[[[[[[[))).........]]]]]]].....(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...)))))(((((((..(((......)))....))))))).............)))..)))))))))).
|
|
RFA_00817
|
[ FASTA input ]
|
AUGUACUAACCUCUAGCUUUUCUUAUACCUUUUGCCUGCUACCUUGGCAUUACAUCUAAAAAGGUACAAACAUCGCAUUGUCAUAAAGAGGUGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUGGGACUUCAUUGUCCCGGUGAUGCAGUGAAUCGUGACUACGAGAUUGUCCAGUAGUUGGUGCUCGUAUCUUUAGAAGAUUUCCUUCCUCGGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((...............)))))).....(((((..........((((((((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((................(((((((((((.[[[[[[[[)))..........)))))))).....................]]]]]]]].)))))))))........((((((......))))))..((((((((..((((..(((((..[[[[[[[..)))))))))))).)))))....((((.....))))...]]]]]]]
|
|
RFA_00818
|
[ FASTA input ]
|
ACCUAGCCGAAACACUAUGUUGGAAAGAAGACGCUUGCUACCUAGGCAUAAUGUAAAAUUAGGUAUAAACAUCGCAGUUGUAAACUUGAGGUGGUUUAGUACGUAGGCGUGAUGAUGACUUGUUGAAGUGAAACCACGAAUCGUGCUCGCUAUUACGUUGGCCCUUAAUAGUAUCUAUGAAGAUUUCCCAUCCUCAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
......................................((((((...............)))))).....(((((...........((((((((....(((((....(((((((((((....))))).....))))))...))))).((((((..............))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....(((.((((((...(((......)))........)))))).)))....))))))......(((((...............(((((((..((((....))))[[[[[.((((....)))).)))))))..]]]]](((.[[[[[[[....)))...]]]]]]].....(((.(((.....))).)))))))).
|
|
RFA_00819
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAGCUAAAUCGUUUGGUUCAAAACAUUUGCUUGCUGUCUUGGCAUAACAUCAAUAAAGGCAUAAACAUCGCAAAAUAAUGGUUAUAAUUAAAUGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCAUAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAAAACUGACCACACACAGUGUUGGCAGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUCCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.....................................((((((...............)))))).....(((((...........................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((..............................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.............((((......))))...((((...[[[[[[))))...........]]]]]].....(((((......((((((((......))))))))((((((((.....(((((....((((((.((((....)))).......))))))...)))))((((((((....(((.(((.(((...))))))))).)))))))).............)))).)))).))))).
|
|
RFA_00820
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCACGGAUUCCAGUGCAUAUCUUAGUGAUACUCCAGUUAACUCUAUACUUUCCCUGCAAUACGCUAUUCGCCUUAGAUGUAUCUGGGUGGCUGCUCCACUAAAGCCCGGGAAUAUGCAACCAGUUACAUUUGAGGCCAUUUGGGCUUAAGCGUAUUCCAUGGAAAGUUAUCGUCCCACAUUUCGGAAAUUAUAUUCCGAGCCAGCAAGAAAAUCUUCUCUGUUACAAUUUGACAUAGCUAAAAACUGUACUAAUCAAAAUGAAAAAUGUUUCUCUUGGGCGUAAUCUCAUACAAUGAUUACCCUUAAAGAUCGAACAUUUAAACAAUAAUAUUUGAUAUGAUAUUUUCAAUUUCUAUGCUAUGCCAAAGUGUCUGACAUAAUCAAACAUUUGCGCAUUCUUUGACCAAGAAUAGUCAGCAAAUUGUAUUUUCAAUCAAUGCAGACCAUUUGUUUCAGAUUCGGAGAUUUUUUGCUGCCAAACGGAAUAACUAUCAUAGCUCACAUUCUAUUUACAUCACUAAGAAGAGCAUUGCAAUCUGUUAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((.((((((...((((((((((.................(((((((.((.((((((((....((((((((((((.((((...((((.(((...........))).)).))..)))).))))))))))))............)))))))).)).)))))))........................(((((((...((((((((((.((((.((((..((((((((.((((((((.(((.((.....((((((.....((((((((.(((((((.(((((...........))))))))..))))..))))))))...........))))))..........)).))).)).)))))).))))(.(((((.(((.........((((((((((((.......))))).))..)))))...............)))))))))..))))..))))....)))))))))))))).....)))))))..........................))))))))))...)))))).)))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((((((.((((((...((((((((((.....(((((.......(((((((....((((((((....((((((((((((.((((.....((((((...........)))....))).)))).))))))))))))............))))))))....))))))).....(((.....(((((((......)))))))......(((((((((((((((..((((((((.((((((..............((((.......((((((((.(((((((.((((((.........)))))))))..))))..))))))))...(((......)))...))))...............)))))).))))..(((((.(((........((((((..((((((.....)))))).....))))))..............))))))))...))))..))))...)))))))))))..........))).)))))...((((........))))....))))))))))...)))))).)))))))..))))
|
|
RFA_00830
|
[ FASTA input ]
|
GCUGCCGAGUUUUUUAAUGCAUUUUCUACUGACAUAAACUGAAGUGCCAUUAUUUGGAAACUUUAUUUGUAAAGCGUUCUUUGAUCUCAACGCUGUCUGGCUGGACAUUUGCCAAAGCCCAUGAAUGCCCAACCAGACACUGUUGAGACGAAUAUGGGCUUUAAUUGAACGCUUUACAGAAGAAGUUUAUAAAUACACAUAAAAUGCAUUUCUUUCUUAUAACUCAGGCCAACUGGCAUAGCAAGUAAAACUGUACUGAUCUAAAUGAAAAAUGUUUCUCUUCCUGAUAAUCGCACGUCCUUCUAUGGACAUUAUAUGCCAUUAUCAGUCGAAGAUCGAACGUUUAACCAAUAAUGUUCUUCAGAAUAUUUUUAAGCUUUGUUAUGCCACAGUUUGCAUGUUGCAAUUAAACAUUCUUCACGUGAGAAUUGUUUACAAAUUGUCUCUAAACACAUGUGAACCACAGGCCUCACUUAUCUAAACGAAAUCUGUACUUACUUUCAGAAUGUAAGAUAGUUUUAUCAAUUGAAAAUGCAUUCCAAAUAUGUAUCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((..((((((...((((((((((..........................(((((((.((.((((((((....(((.(((((((((.((((...((((.(((..........))).)).))..)))).))))))))))))..................)))))))).)).)))))))...............((((((((((((((.((((.((((..((((((((.((((((((...(((.((.....((((((.....((((((((.(((((((.(((((.............................))))).)))..))))..))))))))...........))))))..........)).).)).)))))).))))(.((.(((......((((((((((((.......))))).))..)))))..............))).)))))..))))..))))..))))))))))))..))))))........................))))))))))...)))))).)))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
...............(((((((((((..............(((((((...((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((((((((.(((((((.(((.(((((............))))).))).))))))).))))))))))))..............)))))))))))))).))))))).))))))..........)))))))..(((((((....(((((...((((((((((((..........((((.......((((....))))(((((((((((((.(((.((((......))))......))).))))))))..)))))..(((((((........))))))).)))).............))))))))))))..((((((((((.((((((((((((((((.....))))).)))))...))))))........))))))))))....))))).................((((..........)))).)))))))..............)))))))))))...............
|
|
SPR_00007
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[....)))).(((((.......))))).]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00009
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCGCGCUCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((...[[[[.)))....]]]].(((((.......))))).((((.[[[....))))...]]]..........
|
|
SPR_00010
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((.[[[....)))).(((((.......))))).]]]..((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGUGUGGCGUAGUCGGUAGCGCGCUCCCUUAGCAUGGGAGAGGUCUCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((.....[[[[.)))....]]]].(((((.......))))).((((...[[[..))))..(((....)))]]].
|
|
SPR_00013
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGUGUGGCGUAGUUGGUAGCGCGUUCGCUUAGCAUGCGAAAGGUCUCCGGUUCGACUCCGGACUCGUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..[[[[.......))))))))........]]]]...((((...[[[..))))..(((....)))]]].
|
|
SPR_00016
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00017
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00020
|
[ FASTA input ]
|
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[[[[.)))....]]]]]]....(((...[[[[)))...]]]]....))))))))....
|
|
SPR_00022
|
[ FASTA input ]
|
GCGACCGGGGCUGGCUUGGUAAUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAGAAUGUGGGUUCAAAUCCCAUCGGUCGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((.....))).......((((((..[[[[))).)))...]]]]............))))))))....
|
|
SPR_00023
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGGUGGUGUAGUGGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCUCGGGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((...))).))).(((((((((((....)))))).)))))......))))).)))))....
|
|
SPR_00025
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCCGUGGUGUAGUUGGUUAACACACCCGCCUGUCACGUGGGAGAUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCGGGGCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.........))))((((((..(((...[[[[[))).)))))).....]]]]].)))))))....
|
|
SPR_00026
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((....[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00027
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUUGUAGUUCAAUUGGUCAGAGCACCGCCCUGUCAAGGCGGAAGCUGCGGGUUCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((....[[[..)))).(((((.......)))))..]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00029
|
[ FASTA input ]
|
AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...)))))))....
|
|
SPR_00030
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.........((((......))))...............(((((((((((((...)))))).)))))))...
|
|
SPR_00032
|
[ FASTA input ]
|
AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......))))))))))))....
|
|
SPR_00033
|
[ FASTA input ]
|
AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00034
|
[ FASTA input ]
|
AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......))))))))))))....
|
|
SPR_00036
|
[ FASTA input ]
|
UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((.[[[[...))))..]]]].((((........))))((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00044
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUGUUGGUGAAGCGGUUAACACACACGGUUUUCAUCCGUGGACACACGGGUUCGAACCCCGUACAGGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.....[[[..))).(((((.......)))))]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00045
|
[ FASTA input ]
|
GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUGGGGGACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((....)))..(((..[[[[[)))......]]]]]..((((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00060
|
[ FASTA input ]
|
UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((....)))))(((.(((((((((((.[[[[))))).)))))).....))).....]]]].....
|
|
SPR_00064
|
[ FASTA input ]
|
GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........(((((((....[[[....)))))))..]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00065
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACGGACUGAAAAUCCGUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.((((...(((.....)))...))))..))))).)))))))....
|
|
SPR_00066
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((..........))))))).((((((.......)))))).......))))))))))....
|
|
SPR_00068
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGGUAGCUCAGCUGGUAGAGCACGUGACUGAAAAUCACGGUGUCGGUGGUUCGACUCCGCCCCCGGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((........[[[[[[[[))))...]]]].]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00070
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((..[[[[[.)))).....]]]]].............(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00074
|
[ FASTA input ]
|
UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..((((.......))))(((.((((((..(((....)))..)))))).)))......))))))))...
|
|
SPR_00078
|
[ FASTA input ]
|
ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((....((((........)))).(((((.......)))))....(..)..)))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((......(((((((....)))))))...(((....(((....))).))))))))....
|
|
SPR_00079
|
[ FASTA input ]
|
AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
|
| [ predicted structure ] |
..........((((......[[[[[))))........]]]]]....(((((....)))))...........
|
|
SPR_00080
|
[ FASTA input ]
|
GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
|
|
SPR_00086
|
[ FASTA input ]
|
GCCGACUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCUGGUUCGAUCCCGGGAGUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((....[[[[)))).(((((.......)))))...]]]]....(((....)))))))))))....
|
|
SPR_00087
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((.[[[[.)))....]]]](((.[[[[...))).....]]]](((((.......)))))...))))....
|
|
SPR_00088
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((.[[[[.)))....]]]](((.[[[[...))).....]]]](((((.......)))))...))))....
|
|
SPR_00089
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((.[[[[.)))....]]]](((.[[[[...))).....]]]](((((.......)))))...))))....
|
|
SPR_00090
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCACGUGUUCGAUCCACGUUCACCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((.[[[[.)))....]]]](((.[[[[...))).....]]]](((((.......)))))...))))....
|
|
SPR_00091
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((.[[[[.)))....]]]](((.[[[[...))).....]]]](((((.......)))))...))))....
|
|
SPR_00095
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAAAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCCGGUUCAAUCCCGGGUUUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((........))))...........((((....)))).((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00111
|
[ FASTA input ]
|
GCAGGUGUAGUUUAAUGGCAGAACUUCAGCCUUCCAAGCUGAUUGUGAGGGUUCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((....))).(((..[[[[[.)))...]]]]]....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00112
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGUGUAGUUCAAUGGUAGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGAGCGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))((((....)))).........)))))))....
|
|
SPR_00113
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAGUAUUUCAACUUUUAGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAGAUAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...(((........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..............(((..[[[[[[)))..]]]]]]....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00114
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAGUAGUUCAAUUUUAGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAGGUAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[..)))).((((((.....))))))]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00115
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.........(((...)))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00116
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((....[[[)))).(((((((...))))))).]]](((((........)))))))))))....
|
|
SPR_00117
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00121
|
[ FASTA input ]
|
GCAGUACUGGUGUAAUGGUUAGCGCCUUAGAUUUCCAAUCUAAAGGUAGGGGUUCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((........)))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00124
|
[ FASTA input ]
|
AUUCUUUUAGUAUUAACUAGUACAGCUGACUUCCAAUCAGCUAGUUUCGGUCUAGUCCGAAAAAGAAUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((...[[[[[)))((((((.......)))))).........]]]]]....))))))))....
|
|
SPR_00126
|
[ FASTA input ]
|
GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....(((((.......(((((((...))))))).....)))))..))))))))....
|
|
SPR_00127
|
[ FASTA input ]
|
AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((....(.(..).)..(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.....((((((((((((.......))))))))))))((((((((...)))).))))))))).
|
|
SPR_00137
|
[ FASTA input ]
|
GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.((((...(((...)))(((((((((...)))))))))..(((((.......))))))))).))))).
|
|
SPR_00138
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUAGGUGGUGAAGUGGUUAACACAUCAGGUUGUGGCUCUGACAUACGCGGGUUCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.......(((.....))).((((...[[[...))))..]]](((((.......)))))))))))))...
|
|
SPR_00139
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCCCUGGAUUGUGAUUCCAGUUGUCGUGGGUUCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))))...
|
|
SPR_00141
|
[ FASTA input ]
|
GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....(((...[[[[....[[[[)))....]]]]....]]]].............)))))))))...
|
|
SPR_00142
|
[ FASTA input ]
|
GACUAAAGUAGUUUAAAUAAAACCCUAAUUUGUGGUAUUAAAAUUAUCAGUUAAAAUCUGAUCUAUAGUCCCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((.((..((((.....))))..((((.......)))).....(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((...((((((.((((.....(((.....))))))).))))))((((.......))))....)))))...
|
|
SPR_00153
|
[ FASTA input ]
|
CGGAAUAUAGCUCAGCUGGUUAGAGCAUUCCGCUGAUAACGGAGAGGUCGUUGGUUCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..............(((.[[[[[)))......]]]]]...(((..[[[[[[[[[)))....]]]]......]]]]].
|
|
SPR_00155
|
[ FASTA input ]
|
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGUCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.....)))))(((..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00156
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGAUUAGCUCAGCUGGUUAGAGCGCACGCCUGAUAAGCGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACCAUCGCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[.[[[[[)))......]]]]].]]]........(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00163
|
[ FASTA input ]
|
GAAACUAUAAUUCAAUUGGUUAGAAUAGUAUUUUGAUAAGGUACAAAUAUAGGUUCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00164
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUAUAGUUUAAUUGGUUGAAACGUACCGCUCAUAACGGUGAUAUUGUAGGUUCGAGCCCUACUAAGCCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.......((((..(((.(((...((((....))))....))).)))..))))))).)))))))....
|
|
SPR_00166
|
[ FASTA input ]
|
AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((......((((....))))....))))))....(((((........)))))))))))....
|
|
SPR_00167
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAUAUGUCUGACAAAAGAGUUACAUUGAUAGUGUAAAUAAUAGAGGUUCAAACCCUCUUAUUUCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00176
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((.(........).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((..[[[[[))))...]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00177
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((.[[[....)))).(((((.......))))).]]]..(((((....))))).))))))))....
|
|
SPR_00178
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUCUGACUUUUAAUCAGAGGGUCGAAGGUUCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((..[[[[[)))..]]]]]((((..[[[[[))))...]]]]].....((((....[[[[[))))..]]]]]....
|
|
SPR_00183
|
[ FASTA input ]
|
CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[[)))....]]]]....................(((....))).....))))))))....
|
|
SPR_00191
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUGUUGGCGCAAUCGGUAGCGCGUAUGACUCUUAAUCAUAAGGUUAGGGGUUCGAGCCCCCUACAGGGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((.[[[[))).....]]]]...((((.((((....))))))))(((....[[[[[[)))...]]]]]]..
|
|
SPR_00200
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGCUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUGAGACUCUUAAUCUCAGGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGUUGGGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.[[[[))))))..]]]]....((((((.......))))))(((.......[[[[)))...]]]]....
|
|
SPR_00209
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..........(((......[[[[)))........]]]]............(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00213
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGGGUGGCUGAGCCAGGCCAAAAGCGGCGGACUUAAGAUCCGCUCCCGUAGGGGUUCGCGAGUUCGAAUCUCGUCCCCCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.............)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((......))))).....((((((.......))))))......((((((((......))))))))..)))))))....
|
|
SPR_00215
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((......[[[.....)))...]]].(((((.......)))))(((.........[[[[[[.)))...]]]]]]..........
|
|
SPR_00218
|
[ FASTA input ]
|
GCGGGUGUGCGGGAAUUGGUAGACCGGCUAGAUUCAGGAUCUAGGGUCUUUAUGGACCUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACCCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((......(((((..(((((((...))))))))))))...((((((....))))))..))))..)))))))....
|
|
SPR_00219
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAUUUAAAAUCCCUCGGCGUUCGCGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..(((((.(((......(((((((...)))))))(((((....)))))))).))))).....))).)))))))....
|
|
SPR_00220
|
[ FASTA input ]
|
GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((.(((((.........[[[[))))).)))).........]]]].....(((.[[[[[[[))).........]]]]]]]....
|
|
SPR_00221
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((.............)))))))))((((.[[[[..((((....))))..(((((.......)))))))))..]]]].
|
|
SPR_00223
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUUGUAGCGGAAUGGUAACGCGGCAGACUCAAAAUCUGCUUUGGUAACCCAGGUGGUAGUUCGACUCUCCCCAAAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))..............((.((.......)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))(((...[[[)))..]]]..............)))))))....
|
|
SPR_00224
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAAGUGGCGGAAUUGGUAGACGCAGCAGACUCAAAAUCUGCCGCUAGCGAUAGUGUGUGGGUUCGAGUCCCACCUUGCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...........)))....(((((..((((((((((((....))))).))))))).)))))....)))))))....
|
|
SPR_00225
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..))))))))((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00226
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAUGUGGCGGAAUUGGCAGACGCGCACGACUCAAAAUCGUGUGGGCUUUGCCCGUGUGGGUUCGACUCCCACCAUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.....[[[[[[)))((((((.......))))))....]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00227
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUGGUGGUGAAAUGGUAGCCACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUACAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...........(((((...((((((.......))))))))))).(((...[[[[[)))....]]]]].))))))....
|
|
SPR_00228
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((...........)))))(((.[[[[[......)))..]]]]].......(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00229
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCUAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCUGCUCUUAGGAAGCAGUGCUAGAGCAUCUCGGUUCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..........(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...........(((...(((((((....[[[))))))))))((((......))))...]]]..))))))))....
|
|
SPR_00230
|
[ FASTA input ]
|
GGCUUGAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUAAAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.......[[[.)))((((((.......)))))).]]]..(((....[[[[)))....]]]].)))))))....
|
|
SPR_00235
|
[ FASTA input ]
|
AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.(((((......[[[[[[)))))(((((((((...)))))))))((((.....)))).....]]]]]]...)))))).
|
|
SPR_00236
|
[ FASTA input ]
|
GCUAUUUUGGUGGAAUUGGUAGACACGAUACUCUUAAGAUGUAUUACUUUACAGUAUGAAGGUUCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((.((((.......(((((.........))))).(((((.....)))))..)))).)))...)))))))....
|
|
SPR_00246
|
[ FASTA input ]
|
ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).)))))))....
|
|
SPR_00263
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGAUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGCUGGUUUAAGGCACCAGUCCCUUCGGGGGCGUGGGUUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).)))))))....
|
|
SPR_00271
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGUGGCUCAGCUGGAGGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCUCGGGUUCGAUCCCCGAUCCCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..(((.....)))(((..[[[[[)))....]]]]].......(((......)))..))))))))....
|
|
SPR_00273
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUGUAGCUCAGCGGCUAGAGCGUACGGUUCAUACCCGUGAGGUCGGGGGUUCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((.(((...((((.....))))....)))))))...((((((...))))))..)))))))....
|
|
SPR_00276
|
[ FASTA input ]
|
GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((...[[[...))))..]]]((((......))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00277
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGCUUAGCUCAGUUGGCCAGAGCAUCCGUUUCAUACGCGGAAAGUCACUAGUUCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((....[[[..)))).(((((.......)))))..]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00279
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))((((((.......)))))).....((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......((((((.....(((((................))))).....)))))).....)))))))....
|
|
SPR_00281
|
[ FASTA input ]
|
AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..)))))))....
|
|
SPR_00289
|
[ FASTA input ]
|
GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((((((...)))))))....(((((......)))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00294
|
[ FASTA input ]
|
UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.((((......))))))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00295
|
[ FASTA input ]
|
UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((..[[[[.))))))..........]]]].((((..[[[[[.))))..]]]]]...........
|
|
SPR_00297
|
[ FASTA input ]
|
UGAGUUGUAGCCUAGUGGAAAGGCGUUUGGCCGUUAACUAAAAGAUAGCAAGAUCAAUACUUGCCAGCUCAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((.....(((.....)))....)))).......(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00298
|
[ FASTA input ]
|
UGGGUUGUAGCCUAAUGGAAAGGCAAUUGGCCGUUAACCAGGAGAUAACAAGAUCAAUACUUGUCAACUCAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((..((((..[[[..)))).............]]]...(((.[[[[[)))....]]]]].....))))).
|
|
SPR_00309
|
[ FASTA input ]
|
CUCCGAUUAGCUCAAUUGGCUAGAGUACACCGUUUGGGGCGGUGGGGUUGAAGGUUCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.[[[[))))))...]]]].((((((.....))))))...(((..[[[[))).(((......)))]]]].
|
|
SPR_00314
|
[ FASTA input ]
|
CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((...[[[[..))))..]]]].....((((....))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00315
|
[ FASTA input ]
|
CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGUAGAGCACAUGGUUUGGGACCAUGGGGUCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.((((....)))).(((((((...))))))))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00316
|
[ FASTA input ]
|
CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[....)))).(((((((...)))))))]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00317
|
[ FASTA input ]
|
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCCUGGGGUUGCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[....)))).((((.........))))]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00318
|
[ FASTA input ]
|
CGGCGAGUAGCGCAGCUUGGUAGCGCAACUGGUUUGGGACCAGUGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUCUCGCCGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[....)))).(((((((...)))))))]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00320
|
[ FASTA input ]
|
CAGAUAGAAGCCAAAAGGUCAGGCGCUUUCUUUGGGAGAAAGACCUAGUUAGUUCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...[[[[[.))).(((((...)))))...]]]]]..................)))))))....
|
|
SPR_00321
|
[ FASTA input ]
|
CGAGGUGUAGCGCAGUCUGGUCAGCGCAUCUGUUUUGGGUACAGAGGGCCAUAGGUUCGAAUCCUGUCACCUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[.....)))).(((((.......)))))]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00327
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGUCGAGAUCAUUGGUUCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((...........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.(((((.....[[[[..)))))..]]]]((((((.((((.....))))))))))......)))))).....
|
|
SPR_00329
|
[ FASTA input ]
|
AGUCCCAUGGGGUAGUGGCCAAUCCUGUUGCCUUCUGGGGGCAACGACCCAGGUUCGAAUCCUGGUGGGACUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((.....(((.....((((((((.....)))))))).....)))......))).))))))))....
|
|
SPR_00331
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((.........)))...((((((.(((..(((....)))..))).))))))..))))))))....
|
|
SPR_00333
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.........)))...((((((.(((((((.....))).)))).))))))...)))))))....
|
|
SPR_00339
|
[ FASTA input ]
|
GGUUCUAUGGUGUAGUGGUUAGCACUCUGGACUUUGAAUCCAGCGACCUGGGUUCGACUCCCGGUAGGACCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((........)))))..(((..((((((((((....)))))))))).)))..))))))))....
|
|
SPR_00352
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAUGUAGCUCAGUAGGAUAGAGCACGCGCCUUCUAAGCGUGAGGUCGGAAGUUCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.........(((......[[[[[.))).....]]]]](((((((....)))).)))...)))))))....
|
|
SPR_00353
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCCGUAGCUCAAUGGAUAGAGCGUUUGACUACGGAUCAAAAGGUUAGGGGUUCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))...(((((.[[[[[[....)))))..]]]]]]........)))))))....
|
|
SPR_00356
|
[ FASTA input ]
|
GUCCUCUUAGUUAAAUGGAUAUAACGAGCCCCUUCUAAGGGCUAAUUGCAGGUUCGAUUCCUGCAGGGGACACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00357
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCCUUAGCUCAGUUGGAUAGAGCAACGACCUUCUAAGUCGUGGGCCGCAGGUUCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[....))))..]]]].................(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00358
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCCGUAGCUCAGCUGGAUAGAGCGCUGCCCUCCGGAGGCAGAGGUCUCAGGUUCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((..[[[[[..)))).......]]]]].....(((....[[[[)))....]]]].)))))))....
|
|
SPR_00359
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......((((.......[[[[[[[))))...]]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00360
|
[ FASTA input ]
|
AUAUCUUUAAUUUAAUGGUAAAAUAUUAGAAUACGAAUCUAAUUAUAUAGGUUCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
|
|
SPR_00362
|
[ FASTA input ]
|
GACAAAUGUUUUCAGGUCUUCUAAAUCUGUUUUGGAGAAAUCCGUUUGUUUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((.....)))))).......)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....(((((..[[[[[)))))..]]]]]......))))))))....
|
|
SPR_00363
|
[ FASTA input ]
|
GGACGUUAAAUAGAUAAGCUAUGCCUAGUUACGGGCUGGGAAGAGAGUCGUCUUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))......).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((.....((((.....))))[[[[.)))..]]]]..((((((......)))))).
|
|
SPR_00364
|
[ FASTA input ]
|
AAAUAUGAAGCGAUUUAUUGCAAUUAGUUUCGACCUAAUCUUAGGUGAAAUUCACCCAUAUUUUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((....)))).(((((.......)))))....((((.....)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((....))))....(((((((.((((....)))))))))))....)))))))....
|
|
SPR_00365
|
[ FASTA input ]
|
AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((.(((....)))..((((((.......))))))((((((....)))))).)))))))))....
|
|
SPR_00366
|
[ FASTA input ]
|
UGGUACUUAGUUUAAAAUAAAAUAAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUUUAAUUCAUAAUUACCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(..((((......)))).(((((.......)))))....(((((......)))))).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((......)))).(((((.......)))))..(((((((......))))))))))))....
|
|
SPR_00367
|
[ FASTA input ]
|
UGGUGAUUAGUUUAACUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGACAUAUCUCAUAAUCACCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((((.....))))))))...............((((((((......))))))))........
|
|
SPR_00369
|
[ FASTA input ]
|
GCUCGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.......))))(((.((((..(((((....)))))..)))).)))......)))))))....
|
|
SPR_00370
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[))).........]]]]......(((((....))))).....(((..[[[)))...]]].........
|
|
SPR_00373
|
[ FASTA input ]
|
GACCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUCAGCCUCCGGAGCUGGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGUCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((....((((...(((....)))))))..))).((((((.........))))))..)))))))....
|
|
SPR_00374
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUUGGCCUCCUAAGCCAGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGGUCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((..........[[[...))))......]]].((((((.........))))))..)))))))....
|
|
SPR_00385
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGAGAGUCGGGGAAACCCGAGCGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))...................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((......[[[...))).......]]].(((((((((.....))))).(((((....)))))[[[[[[[.)))).........]]]]]]]..
|
|
SPR_00386
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGAAUACCCAAGUCUGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGACAGGGUGUCAAAGCCCGCGGGGGUUCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........(((((.[[[[[[))))).......(((...((((......)))).)))........]]]]]].)))))))....
|
|
SPR_00388
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((......[[[[[)))((((((((...))))))))((((((......))))))......]]]]].......)))))))....
|
|
SPR_00389
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGAUGCCGGAGCGGCUGAACGGACCGGUCUCGAAAACCGGAGUAGGGGCAACUCUACCGGGGGUUCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((...))))(((.....[[[[[.)))...]]]]].((((((....)))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00390
|
[ FASTA input ]
|
GGUGAGGUGGCCGAGAGGCUGAAGGCGCUCCCCUGCUAAGGGAGUAUGCGGUCAAAAGCUGCAUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))....................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00391
|
[ FASTA input ]
|
GGUGAGGUGUCCGAGUGGCUGAAGGAGCACGCCUGGAAAGUGUGUAUACGGCAACGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00393
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((((((((.(((((....)))))...))))...(((((....))))).....))))).....))))))))))....
|
|
SPR_00394
|
[ FASTA input ]
|
GGAAAAUUAACUAUAGGUAAAGUGGAUUAUUUGCUAAGUAAUUGAAUUGUAAAUUCUUAUGAGUUCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((........))).((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((.[[[[[[))))....]]]]]]......(((((((((((....)))).))))))).......)))))))....
|
|
SPR_00395
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).................(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((((((((........))))))))))..))))))............(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00398
|
[ FASTA input ]
|
GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00399
|
[ FASTA input ]
|
AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((....[[[[[[[[[)))....]]]]]]]]](((((.........))))))))))))....
|
|
SPR_00402
|
[ FASTA input ]
|
GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((.......[[[[[[)))....]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00412
|
[ FASTA input ]
|
GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.....)))))(((.[[[[[)))......]]]]](((..[[[)))...]]].............)))))))....
|
|
SPR_00414
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[[....)))((((((.......)))))).........]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00415
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((....[[[[[.[[[[[[))))...]]]]]]...]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00416
|
[ FASTA input ]
|
GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((((....)))))))))(((.[[[[......))).(((((...))))).(((((.......)))))]]]].......
|
|
SPR_00417
|
[ FASTA input ]
|
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...[[[[[[[)))..]]]]]]]........((((((...))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00418
|
[ FASTA input ]
|
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...[[[[[[[)))..]]]]]]]........((((((...))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00426
|
[ FASTA input ]
|
AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((...)))))))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00434
|
[ FASTA input ]
|
GCUGACUUAGCUCAGCAGGCAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[[[[[[)))..]]].]]]]].....((((((((......)))..))))))))))))....
|
|
SPR_00435
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.((((.[[[[[[.))))............]]]]]].(((.(((((.......))))).))).))))).
|
|
SPR_00436
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00437
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUAUGGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCCCAGUUCGACUCUGGGUAUCAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.........((((.[[[[[[[)))).(((((((...)))))))....(((((.......)))))]]]]]]]....
|
|
SPR_00438
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUUUAACUCAGUGGUAGAGUAACGCCAUGGUAAGGCGUAAGUCAUCGGUUCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[[.))))...]]]]].....(((....)))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00439
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).))))))))))))))....
|
|
SPR_00445
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCGGUGGUCUAGUCCGGUUAUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAGGUCGGCGGUUGAACUCCGCCCCGACCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......)))....(((..[[[[[.)))...]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00452
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCAUCUGCCUUACAAGCAGAGGGUCGGCGGUUCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[[..)))).(((((.......)))))...]]]]](((....)))....)))))))....
|
|
SPR_00455
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.....[[[[[)))..]]]]]..........((((((((....))))))))...)))))))....
|
|
SPR_00456
|
[ FASTA input ]
|
GAUUCCGUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCACCUUGACAGGGUGGAGGUCGCUGGUUCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((((.......((((((.....))))))......)))))).)))).....)))))))....
|
|
SPR_00458
|
[ FASTA input ]
|
GAGAGAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACCGUUUUACACACGGAAGGUUGGGUGUUCGAAUCACCCAUUUCUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.........((((...[[[[.))))..((((.......)))).(((.((((((.......))))))..))).]]]]
|
|
SPR_00459
|
[ FASTA input ]
|
CAAUUUAAAGCUUAAUUAGUAAAGUAUUUCAUUUACAUUGAAAAGAAAUUUGUGCAAAUCAAUUUAAAUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(.(((.......))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
|
|
SPR_00461
|
[ FASTA input ]
|
ACAGAUUGUAGCUUAAUCACAAAGCAUCUGGCCUACACCCAGAAGAAUUCAUAAAAAUGAACACUUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((.((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((......)))))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.....))))).(((((..(((((.......)))))....(((((....)))))..)))))....
|
|
SPR_00462
|
[ FASTA input ]
|
CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.....)))).((.((.......)).))....((((.......)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((.....))))....(((((.........)))))((((.....))))))))))))....
|
|
SPR_00467
|
[ FASTA input ]
|
GGUUUCGUGGUGUAGUGGUUAUCACGUCAGUCUAACACACUGAAGGUCUCCGGUUCGAGUCCGGGCGAAGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[.....)))..........]]]...........((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00476
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[...))))(((((....)))))(((....)))]]].............)))))))....
|
|
SPR_00478
|
[ FASTA input ]
|
AGGAGAGUAGUUCAAUGGUAGAACGUCGGUCUCCAAAACCGAGCGUUGAGGGUUCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........(((...[[[[[[[[[..)))..]]]]].]]]](((((......))))).)))))))....
|
|
SPR_00479
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCAUAGUUCAGUAGGUAGAACAUCGGUCUUCAAAACCGAGUGUCACGAGUUCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00481
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGUGUAGUUUAAUGGUAGAACAGCGGUCUCCAACACCGUACGUUGUGGGUUCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........(((.(((...[[[[))))))...]]]]...(((.[[[..)))..]]]..)))))))....
|
|
SPR_00482
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCAUAGUUUAACGGUAGAACAGAGGUCUCCAAAACCUCCGGUGUGGGUUCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((....[[[[[))).(((((.......))))).((((((((.......))))).))).]]]]].
|
|
SPR_00483
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAGCACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..............(((..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00487
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGAAUAGUUUAAUGGUAGAACAACGGUCUUCAAAAUCGUUAGCGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((.[[[[[[.)))...]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00489
|
[ FASTA input ]
|
AAGGAUAUAGUUUAAUGGUAAAACAGUUGAUUUCAAAUCAAUCAUUAGGAGUUCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00493
|
[ FASTA input ]
|
GAAGCGGUGGCUCAAUGGUAGAGCUUUCGACUCCAAAUCGAAGGGUUGCAGGUUCAAUUCCUGUCCGUUUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((..[[[..))))).......]]]((((....))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00496
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((.......))))...[[[[[[[........)))))(((((.......))))).]]]]]]]...
|
|
SPR_00497
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[...))))(((((....)))))(((....)))]]].............)))))))....
|
|
SPR_00498
|
[ FASTA input ]
|
AGCGGGAUGGGAUAGCUAGGAGAUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGAUCGGUAGUUCAAAUCUACCUCCCGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((......[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00502
|
[ FASTA input ]
|
AGCGGGGUGGGGUAGUCAGGAAAUCCGAUGGGCUCAUAACCCGUAGAUCGAUGGUUCAAAUCCAUCCCCCGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..........[[[..[[[[[)))....]]]]].]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00504
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUAGAGCAGUUGGUAGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGGCCGCAGGUUCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..(((.....[[[......[[[[[)))....]]]]]..]]](((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00505
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGUAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCCCCGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..(((.((((....))))..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00506
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..(((..........[[[..[[[[[)))....]]]]].]]].(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00509
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..(((.(((......)))..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00512
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..((((.[[[[....)))).(((((.......)))))]]]].(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00513
|
[ FASTA input ]
|
CGCAGGAUAGAGCAGUCUGGUAGCUCGUGGGGCUCAUAAUCCCAAUGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00517
|
[ FASTA input ]
|
UGCAAUAUGAUGUAAUUGGUUAACAUUUUAGGGUCAUGACCUAAUUAUAUACGUUCAAAUCGUAUUAUUGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..........(((((..(((....)))..)))))........((((.......)))).)))))).....
|
|
SPR_00518
|
[ FASTA input ]
|
AGCGGGGUAGAGUAGUUGGUUAACUCAUCAGGCUCAUAAUCUGAAGAUUGCAGGUUCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..(((.((((....))))..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......))))))))))).....
|
|
SPR_00519
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAGAUAAGCUAAUUAAGCUAUUGGGUUCAUACCCCACUUAUAAAGGUAAUAAUCCUUUUCUUUUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.....))))(.((((.......)))).)...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.....))))..(((.....[[[[)))........]]]]..........)))))))....
|
|
SPR_00520
|
[ FASTA input ]
|
AGUAAGGUCAGCUAAUUAAGCUAUCGGGCCCAUACCCCGAAAAUGUUGGUUUAUAUCCUUCCCGUACUACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((.((..((((.....)))).(((((.......)))))....(..((.......))..))).))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((.((((.....)))).[[[[)))......]]]]......((((...(((.......)))..))))
|
|
SPR_00533
|
[ FASTA input ]
|
AGCAGAGUGGCGCAGUGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGGUAGAUCGAAACUACUCUCUGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((..((((.......[[[[[.))))..]]]]].(((.[[[[[)))....]]]]]...))))))..
|
|
SPR_00541
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGGUGGCUGUAACCCACUUCCUUACGGUUCGGGGGUUCGAAUCCCUCCCCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.(((.[[[[[[[)))...((((....))))...]]]]]]]....(((...[[[[[.)))...]]]]].))))))....
|
|
SPR_00542
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGCGGACUGUAAAUCCGCUCCCUCAGGGUUCGGCAGUUCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......))))...((((((((((((.........(((...)))....))))))))...)))).)))))))....
|
|
SPR_00544
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((((..[[[[[....)))))).............]]]]]..((((....[[[[[.))))..]]]]].....))))).
|
|
SPR_00548
|
[ FASTA input ]
|
GAGAUGGUGGCUGAGUGGUUAAAGCGGUAGACUGUAAAUCUAUUGGGUAUCCGUCGUCGGUUCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((..(((.(((((.....((((....))))....))))).)))..)))))(((((...[[[.)))))....]]]....
|
|
SPR_00550
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGAUUUUCAAUGUUGGUAGUUGGAGUUGAGCUGUAAACUCAAUGACUUAGGUCUUCAUAGGUUCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((...........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........(((((.....[[[[[[[[[[[......)))))(((....)))......]]]]]]]]]]]...)))))))....
|
|
SPR_00552
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGGGUGGCAGAAAGUUAAUGCACUAAAUUGUAAAUUUAUAAAUAAAGGUUUAAUUCCUUUUCUUGCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........)))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((..(((((..((((......)))))))))......(((((.......)))))...))))))).
|
|
SPR_00557
|
[ FASTA input ]
|
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCACUGGUUCGAAUCCGGUAGGUCGGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))(((.[[[[.....)))...]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00561
|
[ FASTA input ]
|
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGUCGGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))(((.[[[[.....)))...]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00590
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGGCGGGCUGCAGACCCGUUAGUUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCCCCGGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((..[[[[[[[..)))...]]]]]]].((((((........)))))).........))))))))....
|
|
SPR_00593
|
[ FASTA input ]
|
GGCGACAUGGCCGAGUGGUAAGGCAGAGGACUGCAAAUCCUUUUUUCCCCAGUUCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((...[[[...)))...((((((.(((......)))...))))))....]]].))))))))....
|
|
SPR_00595
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCCAUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUUGACUGCAGAUCAAGAGGUCACCGGUUCGAACCCGGUUGGGCCCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[[.)))).....]]]]].((((....))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00598
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCGGUAGUAUAGCCUGGACUAGUAUGCGGGCCUGUCAAGCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCCGCGGCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...((((..[[[[[[....[[[[[[[))))...]]]]]]].....]]]]]].......))))))))....
|
|
SPR_00610
|
[ FASTA input ]
|
UUCUCGGUAGUAUAGUGGUUAGUAUACCCGCCUGUCACGCGGGUGACCCGGGUUCAUUUCCCGGCCGGGAAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...........(((..[[[[[[[)))....]]]]]]]...((((.......)))))))))))).
|
|
SPR_00620
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCCGUGGUGUAGCCAGGUCUAGCAUACGGGGUUCUCGUCCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...))).((((......((((((.......))))))))))((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00629
|
[ FASTA input ]
|
GAGAUAUUAGUAUAAAUUUUUUGUAUAUUUCUUUUUCGAAGAAAAGGUUUAUUAUCUUACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((.........)))).(((((.......)))))........))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((((((...))))))).(((((((...)))))))........))))))....
|
|
SPR_00632
|
[ FASTA input ]
|
UCCGAUGUAGUAUAACGGUUAGAACACCUGGCUUUCACCCAGGAGAUCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUCGGAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..............(((..[[[[[..)))..]]]]]....(((((.......)))))))))))).
|
|
SPR_00633
|
[ FASTA input ]
|
UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))).
|
|
SPR_00721
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGCUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCUAGAUUGUGGAUCUAGAGGUCCUCGGUUCGAGCCCGAGAGCUGGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..[[[[)))))))..]]]](((.......(((((....))))).[[[[[[.)))....]]]]]]......
|
|
SPR_00722
|
[ FASTA input ]
|
GCGGUUGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGGUUUGUGGCACCUGAGGUCGGAGGUUCGAUCCCCCCCAACCGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).((((((....)))))).....)))))))....
|
|
SPR_00750
|
[ FASTA input ]
|
AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((...........))))))))))....
|
|
SPR_00758
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCGGUGGCUCAGCCUGGUUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCAGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCGGCCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((.[[[[.....)))).(((((.......)))))]]]]..((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00760
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUCAGCCUGGUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCGAGGGAGGAAGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[[.))))....]]]](((((((((....(((....)))..(((....[[[[)))....]]]]..))))))))).
|
|
SPR_00768
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUGUUAACUUAAGUUUAAAGUGUUAGAUUUUUAAUCUGGAAAUGGGUUGUCACAUCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((....)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((..(((.....(((((....)))))....))))))))))..)))))))....
|
|
SPR_00777
|
[ FASTA input ]
|
GCACUUCUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCGUGGCUUUUAACCUCGUGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGGAGUGCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).((.((.......)).)).....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........))))(((.[[[[[...(((....))))))......]]]]]....))))))).
|
|
SPR_00810
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...((((((((......(((((((...)))))))((((....)))))))))))).....)))..)))))))....
|
|
SPR_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUCGUGAUCGGAAUGGUAGAGAUCCUGGUCUUAGGAACCAGCUGCUGAAAGGCGGCGGUUCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))............(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((......(((((....)))))..(((((.((((((....)))))))))))...))))..)))))))....
|
|
SPR_00832
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUUAUAGCAUAAGAAGUGCAUUUGUUUUAAGCGUAAAAGAUAUGGGACAACUCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((.....))))...((((((........))))))...))))))....
|
|
SPR_00867
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUCAGCCUGGCAGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCGGCGGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((.[[[[....)))).(((((.......)))))]]]].(((((.......))))).))))))....
|
|
SPR_00868
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGUAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGUGGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGGCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((.........[[[[[[)))......]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_00882
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[[[.......)))).((((.........)))).....(((((.......)))))..]]]]].
|
|
SPR_00912
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUCGUCUAGCCUGGCUAAGAUGCGGGGUACGGGACCCCGUGGUCCGGGGUUCAAAUCCCCGCGGGCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((((((...))).))))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
|
|
SPR_00913
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.............((((...((((((((((.......))))))))))...))))))))))))))....
|
|
SPR_00932
|
[ FASTA input ]
|
AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....(((..[[[[..)))....]]]].(((((((......[[[..)))))))(((((....))))).]]]......
|
|
SPR_00938
|
[ FASTA input ]
|
UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.........(((.....)))......))))))....((((((...)))))).
|
|
SPR_00943
|
[ FASTA input ]
|
GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..................((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
|
|
SPR_00957
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((..................(((((((((.......)))))))))((((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_01040
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((....)))....(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_01051
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCUUAGCACAGUGGCAGUGCACCACUCUCGUAAAGUGGGGGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCAGUGGCCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.[[[[[.)))).(((((.......)))))..]]]]]...............))))))).
|
|
SPR_01088
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUAGCUCAGCCAGGCAGAGCGGCGGGCUCCAGACCCGUAGGUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCGGCCCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......(((.....[[[[)))..]]]]..((((....))))(((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_01095
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGCGGUCUCCAAAACCGCAGGUCGGGGGUUCGAGCCCCUCUGCCCCUGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.((((....((((........)))).[[[[[))))...]]]]](((.[[[[[[[.......)))..]]]]]]]...
|
|
SPR_01103
|
[ FASTA input ]
|
ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(..((((.......)))).(((((.......))))).......).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((...(((((.(((....))).(((((((...))))))).)))))...)))))....
|
|
SPR_01106
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.......))))(((.[[[[[[.)))...]]]]]](((((.......)))))))))))).
|
|
SPR_01117
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((((........)))))(((((........)))))......((((.......))))))))))))....
|
|
SPR_01143
|
[ FASTA input ]
|
AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.(((.[[[[)))..((((((........))))))...]]]]............))))))))).
|
|
SPR_01157
|
[ FASTA input ]
|
CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((....)))....(((((((.......)))))))....((((.......))))))))))))....
|
|
SRP_00001
|
[ FASTA input ]
|
GGUAGCCCUGCUGGUGGCUUCGCAAUUGUACUCUGUGAACCCCGCCAGGACCGGAAGGUAGCAACGGUAGCAGAUCUAUAAUGUGCCGAGGUUUUGCUAGUAGGGUUACCACCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))..)))))))...))))))..)))))))))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((..((((((.(((((..(((........(((....)))......))).)))))..))))))....)))))))..))))))))))))))).......
|
|
SRP_00002
|
[ FASTA input ]
|
GACUGGGAGCGUGGCGUCUCCUGUAACGUGGCUGCUCACGGGUCGGGUUACGGACUGAUUUGAGGUUGGGGUCCACUGUGUGCCGGGUAAGUCCAUGUUGACGGGACGUCCGCACUAAGCUGACCGUCAAUAUGGGUGCAAUGGGGGAGCCCGAUGCAUUCAGGUUGGCUAAAGAGAGAUGAACCGAGCGAGGGGUGAAAACCAGCAGCUAAAAGUCUCCGCGGUAAGCAGUAGUGGGAUCGCGUCCCGGAGUGGACUUCCGGUGCCAGCCUGACCAAUAUAGUCACACUGUAAUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........)))))....(((........)))))))(((((((((..(((((...(((((((.....(((.((((((...((((((((.((..((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...)))))))))))))))))).)))))))))))))))).....)))))..)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((...((((........))))....))))...))))(((((((((..(((((...(((((((.....(((.((((((((..(((((((.....((((((((...(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))))......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))...))).)))..))))).....))))))))..))))))))))))))))))))))))).....)))))..)))))))))....
|
|
SRP_00003
|
[ FASTA input ]
|
CGCCCCCAGCCAUGGGGGCCCCGAAGGCGCCACGCGGGGGCCAGAAGAACCCGCCCCCAGAGCUUGAAGCAGGCCAGCAAGGGCCUGCAGGGUACAAUGAACCCCGUCCCGCGGGGCCGGCGGAGGCGGGCGGCCAGCCGGAGGGCCGGCCGAAGCCGCCGUAGCCGGGGCCACCCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGACCCCGGCCGACCGGCGUUCGCGGGGGGAACGGGGGGAGAAGCCCUGCAGGGUAACCCUCUGGCCUGCUUCAAACUCUGGGAGCGGGGGCUCGGGGGCGGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.((((.............(..(..........)..)..)))).(((.....(((((((((((((((..((((((((((((((....(...((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((.(((....))).)))))...))))).)..((((((.....((((....(((....)))....)))).)))))).)).)))))...))))))....)))))).)....))))))))))....)))))))))))))))))).....).....))))))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.....((((((....(((...))).)))))).......(((((.(((((((.((((((((((((((..((((((((((((((........(((((((((((((((((((....(((((.(((((.(((....))).)))))...)))))...(((((((.....((((....(((....)))....)))).)))))))...))))).))))))))....))))))......))))))))))....)))))))))))))))))).))))))).))))))))).)))))))....
|
|
SRP_00005
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU |
|
[ reference structure ]
|
.((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))).)))...))))..))))))).)))......
|
|
SRP_00006
|
[ FASTA input ]
|
GACCGGGAGCGUGGCGUCUCCUGUAACGCGGCUACUCGUGGGUCGGAUUACGGACUGAUUUGAGGGCGGGAGUCCUGUGUGCUGGACCAGGCCAUGUUGACGGGGCGUCCGCACUAAGCUGGCCGUCAAUAUGGGUGUCACGGAGGAGUCCGAGACAUUCAGGUUGGCUAAGGAGAGACACACCGAGCGAGGGGUGACAACCAGCAGCUAAGAGUCUCCGCGGCAAGCAGUAGUGGGAUCGCGUCCCGGAGUGGACUGCCAGUGCCAGCCCGACCAACACAGUCACACUGUAAUCUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........)))))....(((........)))))))(((((((((..(((((...((.((((....(((.((((((...(((.((((.((..((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...)))))))))))))).))).))))))))))))).)).....)))))..))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.[[[[[..)))))........]]]]].........(((((((((..(((((......((((....(((.(((((((..(((.((((.....((((((((...(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))))...(((((.........(((....(((....)))....))).....)))))..))).)))..))))).....))))))))..)))).)))))))))))))))))........)))))..))))))))).......
|
|
SRP_00007
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAGUCACCGCACCUCUGUGGAUGCCGCCAUGCCAGAAGCAGUGCUGUGUAGGCAGCGCCUGUGGUGGCUUAAAUGGGUGAACGGGCCAGGGCGGUAACGCAGCAACCAUAAGCCCAGUGGCACGCAGUCUGCAGUCCCGUGCGUAGCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(....((.(.(((((.(..((((.(((.(((((((((..(...(((((((....)))))))...)..))))(...)(((((.....((.....(((....))).....))....))))))))))..)))..))))).....)))))).))...).
|
| [ predicted structure ] |
.(((..[[[[[))).....((((......))))((((...((((((((((....)))))).))))..)))).......]]]]]....(((.[[[[)))................]]]].((((.[[[[[..)))).......]]]]]........
|
|
SRP_00008
|
[ FASTA input ]
|
GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
|
|
SRP_00009
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAGCUAAGUAACAAUAGCUUGUAACCCAUGUGGGGACAUUAAGAUGGUGGGACACUGGUUCGGUUCCUCGGAUCGGUUCUGAUGUGGGCAUGUUUCUGAGCUGCCCAGUCCAAGCUGUGAGUAAUUAGUGUUGAGUUGAGCGAAGGCUUGGCUCAUGCAGGUUCUAGAGUCGGAGGGUAAUGCGUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACUACUUCCCGCUUACAGCAGUGGACGGAUCACGGUUUAGCGUCGCUCAGAACCACUAUGGCCUGCUGGUCCGAUCUCAUAUGAACCACCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....((((..)))))))...((((((((((..((.(((((.((.((..(((.((((((((((.(..((.......((((((((.((.(((((.(((((((((((((.(...((((((((((....))))))))))..).))))((..))..(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))))))....))))))))..)).))))))))).....)).)))..)))).)))..))..))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((........))))))....(((....))))))...((((((((((...((((((((((....)))))))))).......((((((.(((....)))))))))(((((.(((((((((......((((((((..(((....)))..))))).))).(((((......[[[[[.......((((((....)))))))))))........]]]]].)))))))))..)))))((((((.((((((((...)))..)))))..[[[[......)))))).....]]]]....))))))))))
|
|
SRP_00011
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAACUCAGUAACGCGGGCUUGUGAUCCAAGUGGAGACAAUAAGGGGAUGGGACGUUGGGUCGAUCUCAUUGGGCCGGGUUCGGGUUGGGCUAUAUUCUGGCCCGCCCAUUCCAAGUUGGGAGUUGAGGCAUGGGCUUCGAGCGAAGGCUCGGGUCUCAUGUCUUCUAGAGUGGGGGAGACCGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGCGUCCACCUCCCGCUCUUGACGGUGGAAGGAUUACGGGCCAUUGCCUUCCGAGCCCACUAUGACCCAAUAAGCCGCUCCGAUUGGACCAUCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((........))).))....((((..)))))))...((((.(((((..((((((((.(..((.((((((.(((.((.((...(((.((.....(((((((.((.(((((.(((((((((.((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))((..)).(((((.....((((....(((......)))....))))...))))).)))))))))..)))))))....))))))).))))))).)).))......).)))))).))).))).))).))..))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
.............(((.[[[..)))..]]]((((((...((((..((((.(((...((((((((..(((....)))..(((((((((..((((.......(((((((....(((((.....(((((.((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))).....((((........((((....(((......)))....)))))))).....)))))......)))))......)))))))..))))))))))))).....))))))))...))))))).)))).....)))))).
|
|
SRP_00012
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAGCUAAGUAACGAGAGCUUGUGACCCGAGUGGGGACAAUAAGGUGGUGGAACAGUGGUUCAAUUCCUCGGGUCGGACCUGAUGCUGACAUAUAUCUGAGCUGCCCAGUCCAAGCUGUGAGUAAUCUGUGUGGGUCAGGCGAAGGCUUGACUCAGGCGGAUUCUAAAGUCGGAGGGUAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGCGACUACUUCCCUCUUACAGCAGUGGAUGGAUCAUAGUUCGAAGUCUCUCAGAUCCACUAUGGCCCGCUGGUUCGAUCUCUCCUGGACCACCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..........)))))....((((..)))))))...((((((((((..(((.((.((.(.((..(((((((((.((((.(..((..(.....(((((((.((.(((((.((((((((.(((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))((..))..(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))..)))))))....))))))).).)).))))).))).....))))))..)).).)).).)..)))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((...[[[[[..)))..]]]]]...(((.....))).....((((((((((..(((.............(((((((...((((....(((........((((((....(((((.((((((((.(((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))............((((...(((....(((......)))....)))..)))).....))))))))..)))))......))))))...)))..))))........)))))))...............)))..))))))))))
|
|
SRP_00015
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAGCUAUGUAACGAGAGCUUGUAACCCAAGUGGGGACUAUAAGAUGGUGGAACACUGGAUCGGCCCACGGGUCGGAUUUGUUGUUGGCAUAGGUCUGGACUGCCCAAUCCAAGCUGUGAGUGAACCGUAUGAACCAAGCGAAGGUUUGAUCCGUACGGUUGCUAAAGGUUGAGGGUAUUGCGUUAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACUACCUCCCGCUCUCAGCAGUGGACGGACAACGGUUCGACGCCACACAAAUCCACUAUGGUCCGCUGGCUCGUAACCCGCUUGAACCACCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.(......).)))))....((((..)))))))...((((((((((..((.((...(((.(((((((((((((((((.(.(((........(((((((.((..((((.((((.((((.(((((((((.(.(((((....))))).).))))))))).((..))...((((......(((....(((......)))....)))....))))..)))).))))..)))).))....)))))))...)))))))))))).....)))))).))).))).....))..))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((......(((((..((((((.(((....)))...))))))..((((...))))(((((((((....))))((((((((...((((....(((.((((((.....((((.((((.((((((((((((((...(((((....)))))...)))))))))(((...))).((((...(((((((...(((......)))))).))))...)))).))))).))))..)))).......))))))))))))).)))))))).....))))).....))))).....))))))...........
|
|
SRP_00016
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCCGAAACCGCCGAUACGCGGGGGCCGAAGCCGAGGGGAGGCCUGUCAAGCGGGCGGCAGCGGUUCCAGGCACCGCAGAGUCCUCGUCCCGGAGGGCCGGCGGUUAUGGCCGGGCUGCCCGGAGGGGCUGUCCGCCAUAUUAGCCGGGGGGAACGGCCCAGGCCCGGAAGGGAGCAGGCUAACCCCGGACGACCGGCGCUUCCGGGGGUGCGGGGAGGAGGUGCCUGGGGCUUCAAGCCGCCCGUAAGGCAGGUCGACCCGAGGCGUGCCCACC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((((((((.....)))))))....((((..............)))))))).(.(((..(((..((((((((..(((((((((.(.(((((((((((((.(....(((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((.((((....)))).)))))))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).)))))...))))))...))))))).).))))))))))))).)..)))))))))..))))))))..)))..))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((...((((((((......))).)))))....((((......)))).))))...(((..(((..((((((((..(((((((((...(((((((((((((......((((((((((((((((((((....((((((.((((.((((....)))).))))))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))))).))))))))...)))))))...)))))))))))))....)))))))))..))))))))..)))..)))..)))))))
|
|
SRP_00018
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAAUCUGUCAUGGAUAACCUAGUGGAAGGCCUGCCGCUAAGUCAGUAACCUUGCUGCGGCAUUUGCCAGCGGGAAAGGUGCCCGGUACGAAUCCUGGGGUCGUCGUUGUACUCGUGCGAGUAAUCCACGAUGCUACAAGGCGCUAAGCAAUGGAAGUGAAUCUUGAGGGAAGCAAUUCUGCAGAGACACUUCCACCCUGGGAUGGCGUCGCCGGAGGACACCUACCCGUUACAGGGAAGUUGGCUGUUUGGCUGGACAACCGCAAUCUUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
..(((.(........).)))..(.((((..(.((.((((.((..(.(.(..(((.((.(......).)).(((((...(((((.(((((....(((((((((.((((..((((.(((((.((....)))))))...)))).))))(...)...(((((((...((((....(((....)))....)))).))))))))))))))))......)))))....)))))..)))))..)))..).).)..))..)))).)).)..)))).)..........
|
| [ predicted structure ] |
.(((.((((.....))))....[[[[[[))).....]]]]]]...(((((....))))).(((....)))((((((..(((((.((((((((.((((((((((((((.(((((.(((((.........)))))...))))))))).........(((((((..(((....((((....))))..)))..)))))))))))))))))..))).)))))....))))).))))))..(((((((.(((.(((((....))))).)))....)))))))..
|
|
SRP_00019
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAUCUGUUAUGGAUAGUCGAGUGGGAGAUCAGCCGCUAGUCGGUGACCUUGCUAAGGUCUUGGCCAGCGCCGACUGGUGCCCGGUACGAAUCCUGGGGUUGUCGAUGUACUCGUGCGAGUAAUCCACGAUCGCUACACGGCAUUAAGCAAUGGAAGUGACCCUUGAGGGAAGCAAUUCUGCAGAGACACUUCCACCCUGGGGUGGCGUCAUCGGAUUACACCGUCGCGUUACAGGGAACCUGGCUGUAUGGUUGGGCAACCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
..(((((.......)))))..((((((..(.(((((((.((((((((..(((.(((((....))))).(((((.(((.((((.(((((....(((((((((.(((((.((((.(((((.((....)))))))....)))))))))(...)...(((((((....(((....(((....)))....)))..))))))))))))))))......)))))....))))))))))))..)))..))).)))))..))))))).)..)))))).
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.....))))))..((((((....(((((((.((((((((..(((((....(((....)))(((((.(((.((((.((((((((.(((((((((((((((.((((.(((((.........)))))....))))))))).........(((((((.(((....)))..(((....))).....)))))))))))))))))..))).)))))....)))))))))))).))))).))).)))))..)))))))....)))))).
|
|
SRP_00020
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGUCUCCCCGCAUUGCAGCGCGGUGAACCUGGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCCGUUCCCUGCAAGUGCCGGGGGUCAGGCUCGCCACCCCGAACA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))))...))))))...))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...)))))))))..........
|
|
SRP_00023
|
[ FASTA input ]
|
CCGGCAAGCGGGGAGGAGCGGGCCCAACCGCAACCGCCAGCGAGGCCGAACCCCCGAGGAGGCGAAGGCCGCCAAGAAGGGGGACGGGGCCGCGCAACGGGACCCCGGAACCGCAGGCCGGAAGGAAGCAGCAAAAGCGGGCCCGGGCCGCAGGAGGCCGAACCGAGCAACGCAAGAACGCAGGACGAACGACAGAAGGGCACGG |
|
[ reference structure ]
|
..(....((.(((.........)))..(.((........))..))).......((..(....(...(.............((..(..(((((((...((((..((((.....(....((....))......).....))))))))...))).))...)))..))......)....)....)................)).)....
|
| [ predicted structure ] |
..(((..[[[[......[[[[)))...]]]]..]]]]..(((.((((...(((((.....(((....)))........)))))....)))).)))..(((....[[[[..)))....]]]]...............(((.[[[[.((((......))))...........)))........................]]]]....
|
|
SRP_00024
|
[ FASTA input ]
|
UCUACCGUGCUAGACGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCAAUAGCCCAGGUGUGAAUUCCUAUCCUAGGUUUUCUUAUGUGAGGCUGCCGUUGAUGGCGGCGGUGUUGAGGAGCGGGUCCUGUGCAACGCGAACCCAUGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAAGUGGAUCAUCGCGUGUGCCGCAGGGUAGCCUGCUCUGAGCUGCUACCAUAAGUAACGCUCGGAUAAGGAUUAUCGAAGAUAGGUGCACGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((.(.((((((.(.(...).).))))....(..(..............)..))).).....((((((...(((..((((((.((((..(((..((.((((.((((((.....(((((((((((((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..)))))))...))))))...)))))))))..)))))).)))))))))...)))).))))).)..)))...)))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((...(((((......[[[[[[[))))).....]]]..]]]]...................((((((...(((.(((((((.(((((((((((....)))))))(((.....(((((((((((((((..((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....))))))....))))))...)))))))))........)))..........)))).)))))))..)))...)))))).))))))))
|
|
SRP_00026
|
[ FASTA input ]
|
UUUGCCGUGCUAAGCGGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUCUAGCGAGGCUGAAUUCCUUUCUGAGGCUGGUAUCCUGUAGGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUCCGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUCCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGGACACCCCCAUGUGCCGCAGGGUUACCUGGACUGAGCUAACUACUUAAGUAACGCUUAUGGGUGCCAGUCGACAGAAGGUGCACGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((..(((.((((.(.(...).).))))...(((((...........)))))))).....(((((....((((((...((((((((...(((.((((((.((((((......((((((((((((((((.((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))))...))))))...))))))))...))).))))))))))))...))))))))..))))))....))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((...((((((....[[[[....)))))).(((((...........)))))]]]].....(((((((.(((((((((((....((((....((((((((..((((......((((((((((((((..(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....)))))....))))))...))))))))...))))..))))))))....))))..)))))))))))..))))))).))))))))
|
|
SRP_00027
|
[ FASTA input ]
|
UUUCCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUCACUCGCAAUCCGCUAUAGCGAGGCUGAAUCCCUUCUAGAGGUUUUGUCACCGUAGGGUCUGCCCUAAGUAAGUGGUGUUGACGCUUGGGUUCUACGCAACGAAAACCCACGAACCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGUGGCCCCUUUCGUGUGCCGUAGAGUCGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUCAGGUAACGCCUAGGGUGGCAUGAUCGAAGGAAGGUGCACGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
...((((((..(((((((.(.(...).).))))....(((((...........)))))))).....((((((...((((.(((((((.((((...(((.((.(((.((((((......((((((((((((((((.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....)))))))...))))))...))))))))...))).)))))).)))))...)))).))))))).))))...)))))).))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.....((((.....[[[[[[))))..]]].]]]....(((....)))..........((((((...((((.(((((((.(((((....))))).......(((((((..(((..(((((((((..((((((..((((.....((((....(((....))).))))......))))....))))))....))))))...)))..))).((((.....))))...)))))))...))))))).))))...)))))).))))))...
|
|
SRP_00030
|
[ FASTA input ]
|
UUUGCCGUGCUAAGCAGGCGAGGUAGCGGUGCCCCAUACCCGCAAUCCGCUCUAGGAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGCGUUGACGUCUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCUGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGAGCACGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((((..((.((.(.(.(...).).).))...((..(...........)..))))......((((((...((((((.(((((.((((...(((.((((((.((((((......((((((((((((((((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...))))))...))))))))...))).))))))))))))...)))).)))))))))))...)))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((((......(((.((((.....[[[[..)))))))..(((......)))]]]]......((((((...((((((((.(((.((((......((((((((..((((......((((((((((((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))))....))))))...))))))))...))))..)))))))).....)))).)))))))))))...)))))))))))))))
|
|
SRP_00031
|
[ FASTA input ]
|
UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUUCCUUCUUGAGGUUAGCUCAUCUUAGGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUACGCAAUGGGAAUCUGUGAACCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGCAGAACCUCUCAUGUGCCAUGGGGUCGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCCUGGGGUGGCUAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((...((((((.(.(...).).))))...((.((...........))))))......((((((...((((((.((((((((((...(((.((((((.((((((......((((((((((((.(((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...).))))...))))))))...))).))))))))))))...))))))))))))))))...)))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((..((((((..[[[.(((((((...)))).)))..)))))).......]]].....((((((...(((((((.(((((((((......((((((((..((((......((((((((((((.(((((((((.(((((.....((((....(((....))).))))......)))))...)))))).)))..))))...))))))))...))))..)))))))).....))))))))))))))))...)))))).))))))))
|
|
SRP_00037
|
[ FASTA input ]
|
UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUAUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUCCCCUCUCGAGGUUAUGUUGCUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAACGGGACCCCGUGAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUAAGCGGGUCUUCUCGUGUGCCGCAGGAGUGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGCUACGCAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((...((((((.(.(...).).))))...((.((...........))))))......((.(((...((((.(((.((((((((...(((..(((((.((((((......((((((((((((((((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...))))))...))))))))...))).)))))))).)))...)))))))).))).))))...))).)).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((...(((((.....[[[[[.........)))))...]]]]]...(((((((......(((....))).....[[[[[....)))))))....]]]]]...(((...[[[...[[[[[[[[)))..]]]]]]]]]]]...(((....)))(((....)))(((.(((....(((((....))))).))).[[[[...............)))..]]]](((((((..(((...))))))))))............))))))))
|
|
SRP_00038
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))....(((..(((((((((....))))))))).)))......
|
|
SRP_00040
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCCGGGUCCCAUACAAUAGCUCUCUUGACGAAUCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGCACUCGAGGGACUAUGUGAUAUGGGGUGCUCGGCCACUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.((.(((.(..(.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...))))).)).).)).....)).)).))))))))).))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((..((((.((((((((......(((.....(((....))).....)))...))))))))))))....))))))..)))))))))))....
|
|
SRP_00042
|
[ FASTA input ]
|
AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((..((.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))...)).)).)..))))))).))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((...)))).(((......[[[.)))........(((...((((.....)))))))..]]].)))))))))))....
|
|
SRP_00043
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACAUCGUAACUGUAGUUAACAGUUUUGUUGAUUUAGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCUAUAACAAAAUUGUAUACAGUUACGAUGAUGUGUGUUAUU |
|
[ reference structure ]
|
....(.(.(((((.(((((.((...((((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)...))...)))))....).)))).).).
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............
|
|
SRP_00044
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGCGGGCCCCUUCGCAUGGUUCGGCGGUGAAUCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCAUAGUCGUUCAGAACCAGUGCCGGAGUAAGGCUCGCCUACCGGUAUCCCU |
|
[ reference structure ]
|
...(((((((((..((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))).)...)))))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).)))))...)))))))).............
|
|
SRP_00045
|
[ FASTA input ]
|
UGGGUUCGAAUCCCAUUCUCUCCGAUUCCUAGGACCCGUACUAUCAAGUAUUGCUGAAUCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGAUGAGUACGUAAGUCUUAGGUUUAAUUUUGAACCCAAAUGCAAUGUUUUGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.(....(.......(.(..((((((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))...))))..).).......)....).))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....(((......))).((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
|
|
SRP_00046
|
[ FASTA input ]
|
CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))....
|
|
SRP_00050
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGCGUGGUGGCGCGCGCCUGUAAUCCAGCUACCUGGAGGCUGGGGUUGGUGGACCGCUUGAGGCCGGGAGUUCUGCGGCGUGCUGUCCUAUGGCGAUCGGGCGUCCACGCUAAGUUCGGCAUCGAUAUGGUUACCCCGGGGGAGCCCAGGGCAACCAGGUCGUCUAAGGAGGGACGCACCGGCCCAGGUUGGAAACAAAGCAGGCAAAAGUCCCCGUGUCGAUCAGUAGCGGGAUCGCGCCCGUGAAUAGGCACUGCGUUUCAGCCCGGCCAAUAUAGUGGGACCCAACUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((.((((((.((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).))))((...)).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).)..)))))))...)))))))...))))))).)))))).)))))))))).....)))))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......)))))))....(((((....)))))))).((((((((....(((((...(((((((.........(((((....(((((......(((((((...(((((...(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))....))))).....)))))))...)))))...))))).....))))))).....)))))...))))))))....
|
|
SRP_00051
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..(((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))))...))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((...((((...))))...)))((((..[[[[[[[[........))))........]]]]]]]].........))))))))))).........
|
|
SRP_00053
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGUUGUGGCGAGCGCUUGUAAUCCAAGUGACUGGGAGGCAUGUGGUGGCGGAUGGAGUGAGAGGAGGAGUCCUGGCUGAUGCUUGGCGGUGGCGACCGAGCGUCCAGGCCAAGCGUGGCGUCGACAAGGUGUCGAGAUAGGAGUGUCAUCGGUACCUGGUCGCAUAAUGAGGGGCGUACGGCUCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGUCCCCGCGUCAUGACAGUGGCCGGAUAGCGCUUGCGAGUCGUCGGUAUUAGUCAGCCUUGUCAAUACCUCCAGACCCAUCGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((.........))))))...((((((....(((((...((.((((....(((((((((..(((...(.......(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((((((.(((....)))..))))))))).))))((...)).(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))..)..)))))))...))))))).....)..))).))))))))))))).)).....)))))...)))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[...)))).......]]]..(((..[[[....)))..]]](((((((....(((((......((((....((((((((((((.(((((.......(((((((...(((((..((((((((((((.((((..(((((((....)))).)))..)))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).))))))))....))))).....)))))))....)))))))))))))))))))))........)))))...)))))))....
|
|
SRP_00054
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))))..))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))......(((..[[[[[[)))...]]]]]].................
|
|
SRP_00056
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAUUUCUGUUAGUCCUAAACACUGUUAAAUUGAAUAAUUGGUCAGAUCUGGAAAGAAGCAGCCAAAUCAAUCGAUACAGGUGUUUUGAUAUAGCUAACAGAAUCUCCUAUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.((((((((..(((((.((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))))...)))).....)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......))))))).......)))))))))))))))....
|
|
SRP_00057
|
[ FASTA input ]
|
GAGUUAUCUGUUAGCUCCAAACACUGCAAUAUUGAAUAGUUGGUCAGAUUCGGAAGGAAGCAGCCAAAUCAAUUGAUACAGGUGUUCUGAUAAAGCUAACAGAAACUCCUAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((..(((((((((.((.((.(((.(..(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))...).))))...).))....))))))))).))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((((((((...((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).......))))))))))))))).....
|
|
SRP_00058
|
[ FASTA input ]
|
GACGUGACGGGCCUCCUCGCAUGGUGGGGCGGUCAACCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCACAGCCGUUUUCCGCCAGUGCCGAGGGUCGGGCUCGUCACCUCCG |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
...((((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).))).)))))...))))))))))).....
|
|
SRP_00060
|
[ FASTA input ]
|
ACCGGGUGUCGUGGCGGGCGCCUGUGAGUCAGCUUCUUGACGGUAGACAAGUGUGGAUGGAGUGAAGGGAGGAGUCCUGUGGGUGUUGUCGGCAACGGCGACCGAGCGUCCGUGCCAAGCGCUGCGUCGCCAGGGGUCUCCGGUCGGAAGGCUGGCGGUCCCGGGCGCAUAAGGAGUGGUGCACGGCUCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGUGCAGUGGCCGGAUAGCGCUUGUGAGUUGUCGCUCGCCCACAGCCUCUCUGAUACCUUCAGACCACUUGUCAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((((((((..((..(((((..(...(((((((((..((((.(((((((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))(.....).(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))).))...))))))).).))))).)).)))))))))))))))).....)))))...))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......)))))))....(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((((((((....)))))))((((((((((.((((.(((((((((((((.(((....((((((....))))))....))).))))..........((((....(((....(((....)))....)))......)))))))))))))..)))))))...))))))).((((....))))))))))))))))))).....)))))...))))))))...
|
|
SRP_00061
|
[ FASTA input ]
|
ACCGAGCGUCGUGGCGGGCGCUUGUGAGUCAGCUUCUUGACGGUAGAUAAGUGUGGAUGGAGUGAGAGGAGGAGUCCUGUGUAUGUCGUUGUCUACGUCGACCGAGCGUCCGUGCCAAGCGCUACGUCACCAGGGGAUAACUGUCGGAAGGCGGUUAGUCCCGGGUGCAUAAGGAGUCGUGGAUGGUUCAGGACCGAAAGGUAGCAGACAAAAGCGACCGCGUGGUGCAGUGGCCGGACCGCGCUUGUGAGUUGACACACAUACGCAGCCUUCUCGAUACCUUCAGACCACUUAUCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((((((((..((..((.((.((...(((((((((..((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))(.....).(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))).))...))))))).)))).)).)).)))))))))))))))).....)))))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......)))))))....(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....((((((((((...((((.........((((((((((.((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))))))......)))).))))))))))))))))).....)))))...))))))))....
|
|
SRP_00066
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGACGCGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCGGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCGGAUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCAGAAAAAGAGCAGGUCAAAACUCCCAUGCUGAUCAGUAGUGGGAUUGCGCCUGUGAAUAGCCACAGCACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCAGGCUCUCUCUUUAAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((......)))).))....((((........)))))))(((((.(((((..(.(((...(((((((....(((((.(((.(((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(........)....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))).))).)))))))))))).....))).).))))).)))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((......[[[)))....]]].....((((((((........))))).[[[[)))....((((..((((((((...))))))))..))))]]]](((((((...((((....))))....))))))).....(((((..((((((....))))))..)))))..(((((......((((((....(((....))).........(((((((((...(((((((((....)))).)))))))).))))))............))))))[[[[[[))))).....]]]]]]............
|
|
SRP_00067
|
[ FASTA input ]
|
AGCCUUUUCUUAGACCUGUGCAAUGCUAUUUUUAAGCACCGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCACUUGAUUUUAGUGUGUGCCGCAGUUAUCUGGGGAAGGGUUA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.((((((.((((((...(((((....((((....(((....)))....)))).)))))...)))))))...)))))...)))))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((.....((((.......))))......))))(((....))).(((..(((((.......))))).)))........)))))))))))))).
|
|
SRP_00069
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGUGAUGGCUUUUAGCGGAAGUGCGCUGUUCGUGUACCUGCUGUUUGUUAAAAUUUUAAGAGCAAAGUGUCCGGCUCGAUCCCUGCGAAUUGAAUUUUGAACGCUAGAGUAAUCAGUGUCUUCAAGUUCUGGUAAUGUAUAGCAUAACCACUGGAGGGAAGCAAUUCAGCACAGUAAUGCUAAUCGUGGUGGAGGCGAAUCCGGACGGCACUUUGUUUGUUGAUAGAUAGUGCGGUAUCUAGUGUUACAACUCUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.......)))..(((.((......(..(((.(.((((((((((((((((((........(((((((((((((((.(...(((((((((.(.(((((.((.(((((.((....))))))).)..)))))).)(...)...((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))))).))).....).))))...))))))))))).))))))))))))).)))))).)..))..)..))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((.[[[[[[...))))........]]]]]]...((((((((((((((((((........(((((((((((((((.(((.(((((((((...((((((...(((((.........)))))....))))))(((((((((...))))....((((....(((....)))....))))..))))).)))))).)))..)))..))))...))))))))))).))))))))))))).)))))..(((......)))........
|
|
SRP_00070
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUGUAAUGGCUAUUUAGUGGAAUUGUUCUCCUUGGGAAUUUUGGUCUGGGUUCGAACCCUACGGCCAGACGCGGAGGCACGCCUUUAAUUAUUACACCGUUUCGGUGGGGGCAAAGGAGCAAGCUGGGCUCGCCCAGCCUGUUCCUGCACCGUGACUUCCCGUGAACUGCAGUCGUCUCCCCCCUGUGGGGAAGGCGAGCCACCCAGGGACGUGUCUCGGUUCAUCCAACCAAUCGAUCCUUGCGGGCGUUCGUGGCCCCUGCUGGCGCUGUGAGUAAUCCAGUGUCCUCUAGGGCCGGCAACGUAGCUACGGUCUACCCUCCCUAGGAGGGGGGCCCACCUUCACCGCCGUUAGGGGAGUUUCAUCCAGCGAUGGCAAAGGUGACCCGUGAUGGAGGCGGUCGGGAUGGCACUGGUCCCGUGGUUACCUACCUGCAGUCGCGGUGGCAUUAUCCUGCCCUUCAAUGGGCUUUGGGAUUAUCAAGACCACAAUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((.......)))...(.((((..(((.(...((......(((.(.(.((((.(...).)))).).).))).(((..((.(.((..((.......).)..)).)...((((..(.............)..))))))).))..(.....(.(..((.(.....(.(.........(..((((.(....).))))..)..).)..(.(((.(((.(((((((((((...............((((((((((......(.(((((((..(((((((.((....)))))))))...)).))..))).).........(.(((.(.((.....)).).))).).((((((....(((((....(((......)))....))))).)))))).))))))).)))...)))))))...))))...)))..))).)......(.(...).)...).))..)...)......)............))...).)))..)))).).........
|
| [ predicted structure ] |
.((((.....)))).....((((........((((.((((..(((((((.((((....))))...)))))))(((((......((((((((...)))(((((...))))))))))..(((((((.((((((....)))))).)))))))...))))).....((((((.((((((((((((((((.....)))).)))))).....(((((((((((((..((((.....)))).((((.((((((((((.....((((((((((..(((((((.........)))))))...)))))...........)))))(((((.((((((...)))))))))))((((((..(((.((((...(((......))))))).)))..)))))).))))))).)))..))))......)))))..))))).)))........))))))))))))........))))((((......))))...)))).........))))...........
|
|
SRP_00072
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))...)))))))))....................
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..((((((...(((.((((...)))).)))(((....))).....(((....(((.....)))))).))))))))))))))))....................
|
|
SRP_00073
|
[ FASTA input ]
|
GACUGUAAUGGUCAGUUUGGUUUCGGAGGCACUUGAUUUUCUCGCUGUUUCUACUCCAUCCCCAUAAGAACCCCCCAGCGGCGCCCAGCACGAAUCUCGCGGUGGCCACCCACUCGCACGGGUAACCUGCGAUCGCUGCGUGUGGCCCUAAGCAAUGAAGAUGACACUUGAGGGAGGUCUCACUCUGCAGAGGCAUCUUCACCGUCAGAUGGCGCGCUGGAUCACGAUCGCUGGGGGCUUGGGGUAGAGCGGCGAGAUGGAGAUGUCGACUCCAAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.......))).....((((...........(.((.((.(.(((((((....(..((....))..).....((((((((.(.(((((.((.((((.((((....(.(..(.(((((.((....))))))))....).).......(...)...(((((((....(((....(((......)))....)))..))))))))))).))))..)).)))))....)..))))))))...........)))))))).......)).))..)....))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((.....)))).((((........)))).........((((((((((.((((((((.............((((((((((...(((((....((((.(((((((((((....(((((.........))))).........)))))).........(((((((...(((...((((......))))...))).)))))))))))).)))).....))))).......))))))))))..))))))))))))))))))(((((.......)))))......
|
|
SRP_00074
|
[ FASTA input ]
|
GUAAGUUGGGGACCUUUUAAGAGAAGAGACCUACGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGAAGUGUUUUCUUUUGCUAGAAGUGUUCUCCAACUUACUCUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(..(((.((....(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..))))))..........)).)))..).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))........))))))))...))))))...)))))))))))).........
|
|
SRP_00075
|
[ FASTA input ]
|
GUAAGUCGGGGACCUCUUAAGAUGAGAGACUUCUGAACCGGGUCAGGAUCGGAAGAUAGCAGCCCUAAGGAAAGGCCUUUUGUGCUAAGAGUCUUCUCUGACUUAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.((((((((.(((((.(((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....))))))).)))))))...)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.((((((...)))))).(((((((...[[[[.....)))))))......]]]].(((....[[[)))....]]]........))))))))))))
|
|
SRP_00076
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAGUUGGGGGCCUUUUAAGAGAAGGAACCUGCGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGGAGAGUUUUCUUUUGCUAAAAGAAUGUUCUCCAACUUACUCUUUUGUAAGUUGGGGGCCUUUUAAGAGAAGGAACCUGCGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGGAGAGUUUUCUUUUGCUAAAAGAAUGUUCUCCAACUUACUC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..)))))).....))))))))))))))..........................(...(................................)...)..............................................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((.....)))))...((((..(((.((((..((((....(((.((((((((((((((((..(((((((...)))))))..))))))..(((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))..))).))))..))))....))).))))))))..((((((..(((((((...)))))))..)))))))))))))))
|
|
SRP_00077
|
[ FASTA input ]
|
GGGUAAGUUGGGGGCCUUUUAAGAGAAGGAACCUGCGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGGAGAGUUUUCUUUUGCUAAAAGAAUGUUCUCCAACUUACUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..)))))).....))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((..(((((.....)))))..))).......((((....(((....)))....))))...((((((..(((((((...)))))))..)))))))))))))))....
|
|
SRP_00079
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCGGCUGGAGUCACGUCCAGUUGUCACCCAUGUGGGGGCCAAGCGGAUGAAGGAACAUAUGGCUCUCCGGUCGUGAACGCUUCCGUCGAUAGCGUGUCCUCUUCGAGUCCACAGUCGGCAAGGUCGCUGCCCUGAUGGGUGGCUGACCUGGUUGAUGAUUAGUCCCGCACCGCGUGAGGCAGGAAACUGAGCAGCGAAAAGGGACAGCUGCGGACGGCGAAAGGAUCGCAUGCUUGAGGAGGUGCCACGACCACCCGGGGGGUCCUCUGUGGGACCAACUACCGUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((......)))))))....((((..))))))).((((((..(..((..((((.(.......(((((((..(((((((......(((((((((..((((.((((.((((((((.((((((.(...((....))..).)))))).))))(....).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))).))...)))))))...))))))).))))))).............).))))...))..)..))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((......))))))))..........[[[[[[[[.))).(((......))).]]]]]]]].(((((((..(((((((.((((..(((((((((.((((.((((.((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))))))...))))))))))))))))).)))))))...((((.[[[[[))))..]]]]]...........
|
|
SRP_00081
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGUAAGUCCUAUACAGCAUUCUCUUGCCCAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUCCGGUAAUGUGAGUGCGUGAUAUAGUCAGCUUGCUCUCCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((.((((...(.((.(.((((((.....((((....(((....)))....))))..)))).....)).).))..)))))...)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((..((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))....)))))...)))))))))))....
|
|
SRP_00083
|
[ FASTA input ]
|
GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.((((..(((.(((((((......((((.....((....)).....))))....)))))..)).)))...)))).))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..((((...(((((.....(((....)))....))))).......((((.......))))...........))))..)))))))))....
|
|
SRP_00084
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGCACGGUAGCGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGUUAUUCAGUGCAAGUGCCGGGGGUCGGGCUCGCCACCCCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...))))))))).........
|
|
SRP_00085
|
[ FASTA input ]
|
ACCGGGCUUGGUAACGCUAGUCUAUAACUCAAGUGAGGGUAUCAAAGUGGUUGAACUUUGAGCUUGGCUUAGCUAGUUGGGUCUGUAGACACCGCACCUGGCUUGCCCGUUCCAAGUCGAGAGUGGGUUCAUGUUUCCUGAGCGAAGGCUCGGGUGAUGUGAGCUUUAGAAUCGGGGGGCAAUGCGUUAGGCUGGUUUCACAGAGCUGCGAAAACCUCUACCUCUCGACUGUGGAAGGAUUACAAGCCGGAGUGUCUUAGGCUCAUAUAACCAGCCUGGCUAGCCCAACAGGACACCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.(......).)))))....((((..)))))))....((((((.((..(((((.(((.(..((((......(((((((..(((((.....((((((((.((.((((((((((((((..((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))((..))..(((((....(.(((....(((......)))....))).)..)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))).)))))))...........))))).))).))).))..)).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((.(((...(((((((.....(((....)))(((.(((((((......)))))))))).))).))))....((((((((.((((((.....((((((((....((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))).......(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))).)))))......)))))))).))))))))))))))....)))))))))).......................
|
|
SRP_00086
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAGGCUUGGGUUGGAGGACGGCGUGAGAUUGGGAGCCCUGUGGCGCUCUGCCCUAUGUCGAUCGGGCGUCCGCGCUAAGCUCGGCGUCAAUAUGGACAUCCCGGGGGAGCUUGGGGUGGCCAGGUUGUCUAAGGAGGAACGAACCGGGCGAGGCCCGAAAGGGAGCAGUCAAAAGUUCCCACGUUGAUCAGUAGCGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGAGUGUCACAGCCCAGUCAAUAUCGCAGGACCCGAUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....(((........))))))..(((((((....(.(((...(((((((....(((((((((((((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).))))((...)).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).)..)))))))...))))))).).))))))))))))))))))))))))).....))).)...)))))))...
|
| [ predicted structure ] |
..((((..(((((((((...(((.((((((((((.......))).))))))).)))...))))..(((((((....(((((((((((((((.(((......(((((((...(((((...(((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).))))(((.....)))......(((((...)))))...((((((........)))))))))))))....))))).....)))))))...))))))))))))))))))))))))).....)))))..)))).......
|
|
SRP_00087
|
[ FASTA input ]
|
UUGCUGUGAUGGCAUUUGGCAGAAGCGCGCUAACCGCGCCCUUUGCGAUGCUUGUUACAGGAGAAGUGUCCGGUUCGAUCCCUGCGUGGGUUAUCCACGGCGGAAGCGGCUUGAGUAAUCAGCCUUCGACCGCCAGCUAACAAGCAGGCUUAAACCCGGAGGGAAGCAAUUCAGCACGGGGACCUGUCCGUGGGGAGGCGAAACGGAUGGCACAUCUUCUGGCUUUGGCAAGUAUUGUAUGGGGCCUAGUGAUGCGACUCCACAGGAUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((.......)))...((.....(..(((....(((.......(((.(.....((......))).)))(.(..(...(.((((..(.(.((.(((((((.((..(.((((.((....)))))).....)..)).........(((((......((((....(((....)))....))))..)))))))))))).)).).)..)))...).)...................)..).)...........)))..)))..)........)).....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((...(((((.(((....(((((.....)))))(((.(((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((((((((((((...)))).(((((....((((.........)))).....))))).(((....))).(((.....((((....(((....)))....)))).....)))))))))))..)))).)))...)))).)))))))....)))))))))))))).))))))....))))).....))))).........
|
|
SRP_00088
|
[ FASTA input ]
|
GUGCUAGACGGGGAGUUAGCGGUGCCUUGUACCUGCAAUCCGCUGUAGCAGGGUUGAAUUCCUUGUUUGAGGCUAUAAUUUGUGGGGUUUGCCUCAUCUUGGUCAAUGUUGAGAAUUGGGUCCCACGCAACGGAAAUUCAUGAACUCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGUGAAAUCUUCCGUGUGCCGUGGAUAAAUCUGAUUUGAGUUGACCAGGUGAGUAACACUCAUAGAUUAUUGUCGAUUCAAGGUGCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((.(((...))).))))...(((((...........)))))))).....(((((..(..(((.((((((((((((...((.(((((((.(((((((.....(((((((((.(((((((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...)))))....)))))))))..))))))))))))))...)))))))))))))).))).)..))))).))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((...(((((...)))))..((((((.........))))))))))))))))))).(((.((((((((((((..((((.....((((((((((.....(((((((((.(((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))))....)))))....)))))))))..))))))))))...))))..)))))))))))).)))..........))))
|
|
SRP_00089
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGCUAGAUGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCUACAGCAGGAUCGAAGUCCUCAUAGAGGCUCUAACUUGUGGAGUCUGCCCUAUGUAAGUGGUGUUGAGAGUUGGGCCCCACGCAAUGGAAACCUGUGAACCUCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGAUAAGCAGUCAUUUUCAUGUGCCGUGGAUACGUCUGGCUUGAGCUAACUGCAUAGGUAACGUUCAUAAGUUAUUGUCGAAGUGAGGUGCACGGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((((.(((...))).))))....(((((...........)))))))).....((((((...(((..(((((((((((...((.(((((((.((((((.....(((((((((.(((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))))...)))))....)))))))))..))).))))))))))...)))))))))))))..)))...)))))).))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((..........[[[[[...))))))..]]]]]........((((((...(((..(((((((((((......((((((((..((((.....((((..(((.(((((..(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...)))))))....)))))....)))..))))..))))..)))))))).....)))))))))))..)))...)))))).))))))).
|
|
SRP_00090
|
[ FASTA input ]
|
CCGUGCUAGACGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUAUAGCAGGGUUGAAUUCCUCGAUUUGAGGCUAUACUAUGUGGGGUCUGACCUAUAUAAGUGGCGUUGAGAAUUGGGUCCCACGCAACGGAAACUCAUGAAACCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGUGAUAAUUUUCGUGUGCCGUGGAUAAACCUGGUUUGAGUUAACUGUAUAGGUAACGUUCAUAUGCUAUAAGUCGAAACGGGGUGCACGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.(((...))).))))...(((((...........)))))))).....(((((.((...((((..(.((((((((...((((((((((.((((((.....(((((((((.(((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))))...)))))....)))))))))..))).)))))))))))..)))))))))).)...)))).)).))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((..((((((....((((((.[[[[[[[.........))))))..]]]]]]].......((((((.[[[[(((((..((((((((......)))))))).))))))))))).......(((........)))..]]]].....))))))...(((....)))....((((((..(((......)))..)))))).......((((.(((((.......(((((...........)))))......))))).))))..))))))
|
|
SRP_00091
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGUGAUGGCCUAAAUGGAAGACUGUCUGCUCAACACCCGCAGCCAACCCAUGAAUUCUGCUUAGUCAGAAAGGACGAGACGGUGCCUGGUUCGAAUCCCGGAGUCGCGACCCGGGCGUGGUCUUAUUUAAUGGACCGCGUCUCUUCUGGUUCUCCCACACUCGUGCGAGCAAUCCACGAACGGCUGUGGCGCGCUAGGCAAUGGAGGCGACACUUGAGGGAAGCAAUUCUGCAGAGACACCUCCACUCCGGGAUGGCGGCACCAGAUCACACCGGCUGUUCACUGUGGGUUGGCCGUGGAUUCUGGACGGUCAACUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((.......))..(((.(...(.(((............((((.((((((((((...(((((......))))).((((.((.(((((.(((((.(..(((((((((.....(((.(((((((((((........))))))))))).....))).(.((.(((.(((((.((....))))))).....))))).)..(...)...((((((.....(((....(((....)))....)))...)))))))))))))))....).)))))....))))).))))))...)))))))))).))))....))).)......).)))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((.....)))..........((((((((.........((((.(((((((((((..(((((......))))).(((((...(((((.(((((....((((((((((........(((((((((((........)))))))))))...(((((....(((((.(((((.........))))).....)))))...))))).....(((((.....(((...((((....))))...)))...)))))))))))))))......)))))....)))))..)))))..))))))))))).)))).....))))))))...........
|
|
SRP_00093
|
[ FASTA input ]
|
CCGAACCUCAUUACCUUGGCCUGUUACCCCAAGUUGGGGGUCUUUAAGGUUAUUUGAUGUUGGGCCUAUGCUACCGGCCGGGCUCUGGUCCUGCUUAUUCUGGCCCGCCCGUUCCAAGCCGGGAGUUGGCCCAUGUGGUUUAUGCGAAGGUAUAGGCUUCGGUGGUUCC |
|
[ reference structure ]
|
.((..((..........))..)....(((((...)))))).......................................................................................((.(((((.(((((((((....))))))))).).)))).)).
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).))).))))))...(((((((((....))))))))).....))))).
|
|
SRP_00094
|
[ FASTA input ]
|
GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....)))..)))))))))))).....
|
|
SRP_00095
|
[ FASTA input ]
|
GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((..((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....)))).)..))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...((((((...))))))(((..[[[[[[.))).(((...........))).]]]]]]......)))))))))))....
|
|
SRP_00098
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGCCGCAGGGGUCCCCUCGCGACGAAUUGCCGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGCGGUGGAUUUGGGUGCCGAGGUGCGGCUUUUGUGGCUGUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..((((.((((((((..(((((((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))).)...)))))...)).)))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((.(((((...(((((((((((..(((........(((....)))......))).))))).)))))).....)))))...))))))))))))))))....
|
|
SRP_00099
|
[ FASTA input ]
|
GACUGGCUGGGAUAACGCCCAGCUGUAACCAAGUGGAGUCGUUAAAGGUUUAGGAUGGGAUACUGUGUCACUACAUCCUGGAAGUAACAUUGCACGAUGGCUGCCCAUUACAAGGCUGCAGUCUCUAGAGUUGCCUUGGUGGAGACCGAGGUGACUUGUGAGAUAGUGAAACCCGUACCGCCGGAGGCUGGAAACAGAGCACGGAAAAGGGUUCGCUGUAGUACGGUGUAAGGAUAACAGUAGUUGUGUAACUUCCUGGCAUCUCAGUGAUUCGCGAGAUUCAUCUCGGACUAAAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((......)))))))....(((..)))))))(.....(((((.(((((((.(..((....(.(((....((..((.(...(((((((((.((((.((.(.(((.((((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..)))(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).)..)))).))....)))).))))))))).).).)..)).....))).).))..)..))))))).))))).....)..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......)))))))............))))...((((((((((..((((((..(((((((((.......((((((.....((((((((.((((....(((((..(((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..))))).(((((.(((......(((....(((....)))....)))....))))))))))))))....)))))......)))).)))))))))))))).........)))))..))))......))))))..))))))))))
|
|
SRP_00101
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.(((..(.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)..)))....))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..(((((..((((((...((((...((((....))))...)))).))))))......)))))...))))))))....
|
|
SRP_00102
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCAGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAAGCUACUGGGAGGCUGAGGCUGGCGGACCGCUUGAGCUCAGGGGUUCUGGGCUGCAGUGGACUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGUAUCGAUAUGGUGCUCCUGGGGGAGCCUUGGACUACCAGGUCGUCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAGACGGAGCAGGUCAAAGCCCCCGUGCCGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGACACUGCAGUGCAGCCUGAGUAAUACAGCGGGACUCAGUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((.........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((.(((((((((..((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).))))((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))).))))))))).)))))))))).....)))))...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......)))))))(((.[[[....)))..]]]....((((((((....(((((...(((((((....(((.(((((((((..((((.........((((((.(((((...(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).))))........(((((...(((((....))))).(((.......)))...))))).)))))))....)))))))).)))........)))).))))))))).)))))))))).....)))))...))))))))..
|
|
SRP_00103
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGAGGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCUCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGUACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((........))))))).(((((.(.(...(((((...(((((((....(((((.(((((((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))))))).)))))))))))).....)))))..).).)))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((..(((((....)))))[[[[....((((........)))))))..]]]]...(((.(((((...(((((((....(((((.(((((((.(((((.........((((((.(((((...(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))......(((((.......((((....(((....)))....))))....))))))))))))....)))))))).)))........)))))))))))).)))))))))))).....)))))...))).........
|
|
SRP_00104
|
[ FASTA input ]
|
AUGCUGUGAUGGCGUAUGGCAGAAGCGCGCAGAUUGUGUACUUUUGAUUCUUUAUUACAGUUUAAGUGUCCGGUUCGAUCUCUGCGGUCGCAAACUUGUGAAUUUGAGUAAUCAAUUCUUCAAGUUUCAGCAAUGAGUGGCAAUAUCGCUGGAGGGAAGCAAUUCAGCACAGCACGCUACCCGUAGAGAGGCGAAGCGGAUGGCACUUGGCUGGCUUUGGUAAGGAGUUAUAAGUAUCUUGUGUGUCGACUCCAAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......))))..((.......(((((.(..((((....(((...((((.(..(.........((((.(((((.(((((((((....(((((.(.((((.(((....))))))).)..)))))..(...)..(((((......((((....(((....)))....))))..)))))))))))))).......))))).).....))).......)..).))))...)))))))..).)))))....))...........
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....))))).(((.....((((((((.....((((((.((((((((((((((((((.(((((((((.((((.(((((((((....(((((((.(((((.........)))))..))))))).........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))))))..)))).)))...)))))))))))....))))))))))))).)))))).)))))))).....))).........
|
|
SRP_00105
|
[ FASTA input ]
|
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.((((((((.((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))..)).))))))...))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((.[[[[))))....]]]].....((((((............[[[[[[[[[[[.......(((((....)))))))))))....]]]]]]]]]]].........
|
|
SRP_00106
|
[ FASTA input ]
|
GGUAGCUAGGUCUAUGCAACAGAGAAUCACGAACUCCGCCAGGCCUGGAAGGGAGCAACGGUAGUGACACUCUCUGUGUGCGUAGGUUGCCUAGCUACCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
.(.(.(((((.(.((..(...((((.((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))))..........)).))))))......).)
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((.((((...((((.(((....)))...))))........))))...))))))).)))))))...)))))))))))....
|
|
SRP_00107
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((..((..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))).......)...))))).)))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((...)))))).((((.......(((....)))......((((((....))))))))))))))))))))).
|
|
SRP_00108
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAGGAUUGGGUAGCGGCAACCUGUAAUCAAGCGAUGCAUUCGAGGCGAGGACGAGAGCAUUGUUAGGACCUUUGGGACAAGCGACGCAUACAGUUGAUCCACACUAACGUUGGUGUCGACAUACUAUCAGUCUCUAAGGAUUGAAAGUAAGUUGAUAAUGACCAAGUCAAGGUCCAGGCUGGCAACAGAGCAGACAGAGCGAGGCACAUCGAUGGGUAGCGAGGAAAGUCGACUUAAAGUCGUCCAAAGGAAAUAACAAUGUAAACUCGAACAAA |
|
[ reference structure ]
|
..((.((.(((........))).))....((.............)).))........(((..((((........(((((.....(...(.....(((((((((.(.(((.(((((((((((((.((((.(((((..(....)))))).)))).)))).(...).((..((....(((....(((....)))....)))...))..)).)))))))))..))).).))...))))))))...)...))))).............)))).))).......
|
| [ predicted structure ] |
.((((((.(((....[[[.))))))))).........]]].((((...))))..((((.(((((((((...(((((((.....(((((......(((((((((..(((..(((((((((((((.((((.(((((((....))))))).)))).)))))...((((...))))..(((....(((....)))....)))...........))))))))))).....)))...))))))....))))))))))))...)))))))))...))))......
|
|
SRP_00117
|
[ FASTA input ]
|
GACUGGAAGGUUGGCAGCUUCUGUAAUCACGCUUCUGUGAGGUCCGAUUGUGGGAUGGCCUGAGGCUGGGAUUUACUGCGUAGCGGACCAGCUCAUGUUGACGGAACGUCCGCACUAAGCUUGCCAUCAAUAUGGGUGCCAUGGAGGAGUCCGUGGCAUUCAGGUUGGCUAAGGAGGGAUGAACCGGGCCAGGGGUGAAAACCAGCAGCCAAGAGUUCCCGUGGUAGGCAGUAGUGGGAUAGCGUACCGGAGUGGACUGCCGUUAUCAGCCCAACCAAUAUGGUUGGACCACAAUCUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(....).)))))....(((........))))))).((((((((..(((((...((.((((.....(((.((((((...(((.((((.((..(((.((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))).))))))))).))).))))))))))))).)).....)))))..))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[[))).....]]]]].(((((.(((....)))[[[[[.)))))......]]]]]..((((((......((((...)))).))))))...(((..[[[)))..]]](((((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).))))........((((.......(((....(((....)))....)))......)))))))))))))..))))).(((((((.......[[[[.....)))))))...(((((((...))))))).]]]]..........
|
|
SRP_00118
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGCGUAGCGAGCCGCUGUUACCCGUGCGGGGGUCGGCUCGGUGGAGGCAUCAGUGGUGCCGCUGUAGUGUGGGGUGUUAGCGGCCAAACGCCCCACUGGGAUCGCAGCCCCCGGCGAUCCCCGCGCGGAGGCGGGAGGAUCGCUGGAGAUGCUGCGGCGCGCAACGCCCCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGAAAAGUGCCCGCUGCGUUCCGCGGUGGGACAACGGGGGGCCGCGCCCGGGCUGCGGCGGCCCGCGGCGGCCAACGCCGAGCUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((........))))....((((())))).)))(((((((((..(((..(.((((.(((((((((((.((((......((((((...((.((((((((((.(((((((.((((((((((.(.(((....))).).)))))))))).)(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))).))).)))))))....))...)))))).)))).))))))))))))))).)..)))..))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
....(((....[[[[[[)))...((((......)))).]]]]]].....((((((...))))))((((((((((((((((((........))))))))))......[[[[[[[[((((((((((...(((....)))...))))))))))....))))))))((((...(((((...(((....)))..............(((((((((...))))))))).......))))).))))..]]]]]]]]..(((...[[[[[)))..]]]]].........
|
|
SRP_00119
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGUAAGCAUGGGCCUGGAUGAUCUCCUUGUGGGCAGUUGGGGAGCCUGUAGGGGUGCUCCACCUGCCAUUAAAGCGGAGGGGAACGCAUGAGGGCGGAAACGCAGCAAUGAGUACCUCCUGCAGGGUAGAGUCGCCAGCAGACCAUGCCAGUCCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((..((..((((((.(...(.((.(((((((((.(((((.(((((.((((....)))).))))).))))).(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))).)))..)).).)....))))))..))..))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.....((((((..((((....(((((((((((((((.(((((.((((....)))).))))).)))))........(((((......(((....(((....)))....)))....)))))))))))).)))....))))....))))))..))))....
|
|
SRP_00120
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGGAUGAGUAACGCCCAUCUGUAACCAAAUUGUUUGGAAUCAUUAUAAAAAAAUAGAAUUGAUCCUAUCAUAAUUAUGAACAUUUGAGACUACCCCAUCCCAUAUCUUCGUACUUCAUUACUUAAUUUACGUAGGUAGAUUUAGUGCGGAAGGUAACGAACAGGGUACAGCGUGAGGCCGGUUAACGGAGCAACGAAAACCUGUCUACGAAUGAUAGACCUGGGUUGAAAAGGAUGUCAAGUUGAUAUGAUUGAUAGUAUUGGAACUAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((...)).)))))....((((((.)))))))))).........((((((..(((((.((((((....(((.((..(((((........(.((((((((.((((((((((..((((.(((((((....))))))).))))..)))).(...).(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).))))))..)))....))))...)...)....))))))).)))....)))))).)))))..))))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.........)))))....(((((...))))).............((((((........((((((...........((((((...........((((((((((((((((((..((((.(((((((....))))))).))))..)))).......(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))).))))....))))............)))))).........))))))........))))))
|
|
SRP_00121
|
[ FASTA input ]
|
CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA |
|
[ reference structure ]
|
......((.(.(((((.((((((.((.((.....((((....(((....)))....))))...)).))..))))))))..))).).)...)..
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((((((((((........((((....(((....)))....))))......))).))))))).)))))..........
|
|
SRP_00123
|
[ FASTA input ]
|
GCUCGGAUAUUUUACGAAUAUCUGUGACCAUAAGGUUUGGGAGCUUAAAAAUUGGAAUUGGUGUUUUGAGAAGUAGAUGUGUUUGAGACUACCUCGAUCCAUAUCUUCGUUCAUCACUGCGAGUUUUUCGGAAGAGAGGCUUUUGGGGAUGGUAAGGAACAGGGUAAUGCGUCAGGCCGGCAACGGAGCAGCGAAAACCUGUCGACGAAUGAUAGACCUGGAACGAAAUGGAUGUCAAGUGUUUACCAAUCAAAAUGCUGGGACUGAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((...))))))))....(((.(...).)))))))...((((((((..((((((((((((...(((((((..(((((........(..(((((((.((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).(...).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).))))))..)))....)))).......)....))))))))))))...))))))))))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((...))))))))..((((....))))...))))...((((((((.....(((((((((...(((((((..(((((.......(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))))).))))....)))).)))........))))))))))))...))))))))).....))))))))
|
|
SRP_00124
|
[ FASTA input ]
|
GUUCGGAUGACUAACGACCAUCUGUUACCUCAAGGUGAGGGAACUUAAGAAUUGGAAUUGGCUACUCGGAAUGUUUGAUCGUCUGAGACUACCCCAACCCAUAUCUUCGUGCAUCACUGUGUGUCUUUCGGAUGGAGGGCAACUGGGGAUGGUAAGGAACAGGGUACUGCGUGAGGCCGGCAACGGAGCAACGAAAACCUGUCCACGGAUGAUAGACCUGGGUUGAAAAGGAUGUCGAGAUCUUGCGGACCUUGUGGGUGGAACUGAUUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..(...)..)))))....(((((...)))))))))..(((((((((..(((.((((..((..(((..(((..(.(((........(..(((((((.((((((((((.(((..((((((((....))))))))..))).)))).(...).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).))))))..)))....)))).......)....))).))))..)))..))..)))).)))..))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[[...)))...]]]]]....((((.[[[[))))..]]]](((((((((.........((((((...........)))))).((((((((((((((((((((((.((((.(((..((((((((....))))))))..))).))))....(((...((((....(((....(((....)))....)))...)))).)))))))).))))....)))))))..((((....(((....)))....))))..))))))..))))))))).
|
|
SRP_00125
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGGAGGGUGUCACGCCCCUCUGUCACCUGAGUUGGGAGGCACUGUGUGCCUGGGACUGCCCCACACACCCUAGGCCUCCCUUGGCCUGGUUGCACCAUGGUGCCAUGCAGAGACUGCGCCCACUGAAAGACAGCUGCCCUCACUGGCACCGCCUGGCAACAUUGGCGGUGUCUUGGAGGCUAUGAUGCGGAGGGGACUGGGCAAGGCUGGCAACAGAGCAGCCAAAACCUCCCACAGCUGUCAGUUCAGGGAACACGCAGUUGAGUGGUGCUGCAGCAGGUUGGGCUGAGGGUGCAAGGUAGGACUGGGCAUACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((........))))))....(((((.)))))))))...((((((((((..((..((....((((((.((....(((.((((((.(((.......(((((((.(...(((((((.((.((((..((((((((.(.(((..(((((((((((....))..))))))))).))).)..((...)).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..)))))..))))))))...))))))....)))))))).))))))))).).))))))))))).))))))...))..)).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((...)))))(((.[[[.[[[)))..]]].]]]...((((((((((..(((((.....((((((.(((((.....((((((.(((((.....(((((((.....(((((((....(((((.((((((((.((((...(((((((((..........)))))))))...)))).........(((((......(((....(((....)))....)))....)))))..))))))))..)))))......)))))))..))))))))))))))))))))))).))))))...)))))..)))))))))).
|
|
SRP_00127
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGUGACGGCCUUUGGCCGGAAGGGACAUUAGCAAUCCCGGCUUGGUGAGGCGCUCCCGCGUUCGAACCUGCGGCCGGGCAUGGUUGCGGAAAAGCGAGGUUGCCUAGCUCCUCGUGCGCCAUGAUACCACACUGGUCUUUCUGACGCGUGUCCUGCUACUUAUCGAUUUCUGCGGGUUUGCCGUCGAUGCUGACAUGGGAAACCUGUCGGUGGGGCGUGCAGUAAUGGCAGGGCGAAUGCCCGUCCGCUCAUACGCUGGAGGGGAGUUUCAUCCAGCACAGCGCGAGCGGCCCGUGGGGAGGCGAGCAGGAUGGCACGUGUUAGGCGCUUGCGCGGACCUAUCGUGGUAUUGGAGCAUUAUGUUCCGACCGACUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((.......))....((.(((..(((((((...(((((((((((..(.(....(.........)....).)..)))))))((((((.........((((((..........))))))..))))))..(((((...(((((..(((((((((((((((((.........((((((((((.((((((((..((((((((.((....)))))))))).)))).))))..((((((.......))).)))((((((...(((((....(((......)))....))))).))))))))))))))))....))))))...)))))))))))((((..)))))))))....))))))))).......)))))))..))).))....
|
| [ predicted structure ] |
.((((....((((...))))....[[[[...))))..]]]]......(((.[[[[[...)))........(((((((((....)))))))))....((((((..........))))))]]]]]..((((((((...(((((..(((((((((((((((((.........(((((((((((((((((((..((((((((.........)))))))).)))).))))....(((.((((....)))))))(((((...(((((....(((......)))....))))).))))))))))))))))....))))))...)))))))))))(((....))))))))....))))))))((((((...))))))............
|
|
SRP_00128
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGCCCUGUCGGUUCUCCCGCAACACUAUCCUGUGGACUCGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCAGGAGACGUGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCGGGGCCUCCACCAAUU |
|
[ reference structure ]
|
.(.((.((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...))))))).))).)).).......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((.(((((..((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...))))....)))))...)))))))))))))))).......
|
|
SRP_00130
|
[ FASTA input ]
|
GAGUAUUACUGGACUAGACCGGGGAGCUAGGCACUCCCUGUGACCCGUGCCGAAAUGCGGGGGCGACUGUCUGGUGAGGGCAACCAGGCCUUUGGCAGUCUUCAUGAAAUCGUAGAGUCUCUGUCCUUUUGGAUCGGGGGUUUGCAUAUGCAACUUCAAAGGAUGAUGCAUAUACAAUCUGUCGGGAAAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAACACCGGUAUUCCGAACCAUCGAUGCUGAGAGGGUGCGGGGAGGAGAGGAAGUGGAGGACGCUACCAAAACACCUGGUCUGAACCAGAUGUGUCCAGUAUUAUGG |
|
[ reference structure ]
|
..(((.((((((((....((((((((.......))))))....((((..........))))))....((((((((...((....(.((..(((((.(((.(((.(.(..((.(....(((((((((((((.(.(((.(((.(((.(((((((.(.((....)).).))))))).))).)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))..))))...))))))..))))))).).)).....).).))).))).)))))....)).).))..)))))))).)))))))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
......(((((((((((((((((..........((((((....((((((((.....(((((((((((((((.(((............)))...)))))))...(((....)))...)))))))).((((((((((((.((((((.(((((((...(((.....))))))))))....((((.((((.....)))).))))(((....))).............)))))).))))).))))))))))))))).))).)))..((((.....)))).........)))))))))..........))))))))......
|
|
SRP_00132
|
[ FASTA input ]
|
GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU |
|
[ reference structure ]
|
(..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).)))))).))))))))))....
|
|
SRP_00134
|
[ FASTA input ]
|
CUGAUAGCUGGGUCCCGCGCAACGGUAGGUUAUGAACCCCGCCAGAUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGUAGCUGAUUCCGUGUGCCGCGGGGGAGCCCAGCUAUCAGUUGU |
|
[ reference structure ]
|
...(...(((((((((.((((.(((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))).....)).)))).)))))........)..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((....(((.[[[.....)))..]]]...(((....)))(((.[[[[.....)))....]]]]....))))))...)))))))))))))....
|
|
SRP_00135
|
[ FASTA input ]
|
GGACGCCGAAGCAGCCGCGGCCUCUGGCUUGGACCCCGUGGCGUCGCCGGCCUCCGCGGAGGCAGGGGCCGGCCCGCCUUCAACUCAGCCGGACAGCCGGAGGCCGGAGACGGAGCACGGUCAGGCGGGCGGGGUGCAGUGCCAGCCCCAGCCGCAGAGCGGCUUCCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((......(.((((...((((.(((.((((((.((((..(((((((((.((....)).))))))))).)))).......(.(((.....((((....(((....)))....))))..))).).)))))).)))..))))......)))).)..)))).)))...
|
| [ predicted structure ] |
...((((......(((((((..(((.....)))..)))))))...(((((((((...[[[[[[.)))))))))..]]]]]]..(((..((((....)))).[[[[[)))........]]]]].))))...(((((.........)))))((((((...))))))......
|
|
SRP_00136
|
[ FASTA input ]
|
GACUGUAAUGGUCCAACGGGGAAGGCGUUCAAACCCGCUUAACCGUCCAUCCCAAUUCUGGUCGUGCUUGCGCUUCCAGCCCUCCGCCGCGCCCCGCCCGAACGCUGCGGUGGCCGCCCACUCGUGCAGGUAACUCACGAUGCUGGAACUUCUGCGGCCCUAAGCACUGGAGAUGACCCUUGAGGGAGGUUUCACUCUGCAGAGAUCUCUCCCCCGUCGCGUGGCGGGUGGGAACACGUUAGUGCGGGGGGAUUUGGGAUGGCAAAUGGAUAAGAUGGAACAGCCAACUGUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.......)))....((((((.............(.((.......(.(((...(.((((..(((....)))..)........(((.(.(.((((((((.((((.((((.((...((((.(((((.((....)))))))))..))..))......(..(...)..).(((((.....(((....(((......)))....)))...))))).)))).))))..))))))))....)..).)))...............))).)...))..).)...........)).).))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...........(((.[[[[)))(((((........)))))..]]]](((((((((..((((..(((....)))..))))((((((((.(((.((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((.........)))))...))).......)))))).........(((((...(((....))).((((((........))))))))))).)))).))))..))))))))....)))....))))))))..)))))))))..............(((((((....)))))))....
|
|
SRP_00137
|
[ FASTA input ]
|
ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.........((((.....((((....(((....)))....))))...))))............)))))))))))))...
|
|
SRP_00138
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((...(((((((.(((((((...((((....(((....)))....)))).)))))))))))))).....))))))))).....
|
|
SRP_00139
|
[ FASTA input ]
|
ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...))).)))).[[[[[[.......)))........]]]]]]............
|
|
SRP_00140
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAUUAUUGGUUUCUCGCAGCAGAAUUCAGCUUACUUAGUCAGGGCCGGAAGGAAGCAGCUUGGGUUGAAUUUCUGGGUGCCGGGAGUCGCUGGUAAUACCCCACCUUUUUGGUAAAAGGUAAUACCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((((..((((((((((((...(.(((.....((....)).....))).)))))))).))))).)...))))))..)))))))))))))).........................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.((((((...((((((((((((((...(((..................)))))))))))).))))).....))))))...)))))))))))))((((((..[[[[))))))..]]]].
|
|
SRP_00141
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACCUUCUCGGUCUCUCGCAACGGUGUCUGGUUUACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAAGUCGGAAUUACUGUGUGCCGAGAAGAAGCUGGGAAGGUUUCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..)))))))...)))))....)))))))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((((..((((((((((....(((.(((....(((....)))....)))..)))))))..))))))....)))))....)))))))))))))))...
|
|
SRP_00142
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGGCCGGGCGGUUUGGCUCCGCCCGACACCCGUGAGACAGUCAUCAGCGGGGGCCGAACACCGGGCGCGUCCGACCGCCGCGGUCGGCCCCGGAAGCCAACGUGGAAGCCUCGUCCGUCGGGGACGGCGGUCCGCGGCGUGCGCCCGCAGGGGCGUUCCGUCGUGGUUCGACGGUGGCAACCCGCCAGGCACGGAAGUGAGCAGCGGACCACCGAACGCCCGUCGCUCGACGGGUCGCGGGGUGGAGAAGGCGACCGGGACUACCCGGCCGGGAACGCCGGGCUACCCCGACUGUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((..((((((((((.......))))))....(((((.............)))))))))......((((...(((((.(...(.(((((((.(((((..(((..(.(....(((((((((((((.(.(((((((.(((((..(.((((((....)))))).)..).))))..)..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)).)))))...))))))...))))))).).)..)))..))))).....))))))).)...).)))))...))))...))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((((((((.......)))))))...[[[[[......)))....]]]]].........(((((.(((.[[[[[)))....]]]]].)))))..(((.........(((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((....))))))..)))))))).))).((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).....))))).))))))))...)))))))......)))..(((......[[[[[[)))....]]]]]]...........))))..
|
|
SRP_00143
|
[ FASTA input ]
|
GAUGGACUAGGUCGGGGGGCUAGGCCCCCCUCCUUGCCCGCACUGUGGUCUUGAGCGGGGACCGAACACCGGGGGCGUCCGGUCUGACGGACGUGGACCCCGUGAGCUAACGUGGAAGCCUCGUCCCACGGGGACGGCGGUCCGCGUGGUCGCACCUGCAGGGGUGCGCCCACGUGGUUAAACGAUGGCACUCCGCCAGGCACGGAAGUGAGCAGCGGACCAUCGAACACCCGUCGCUCGUGGGGUCGCGGGGUGGAGGAGGCAAACGGGAUUACCCGCGUCCGAACGCCGGGCCAUCCUGGCUGUCCGUUCCAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((((((((.......))))))....(((((.............))))))))).....((((((..(((((((.(...((...((((.(((((..(((..(.(....(((((((((((((.(.((((.((.((((((((.(((((((....))))))).)))))))).)...((((((...(((((....(((....)))....)))))))))))..).).))))...))))))...))))))).).)..)))..))))).)...)))..))...).)))))))..))))))..))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
...(((...[[[[(((((((...))))))))))...(((((.............)))))]]]]...(((.(((.(((((((......)))))))...))).))).(((.[[[....)))..]]](((((((((((((....((((((((.(((((((....))))))).)))))))).....((((((...(((((....(((....)))....))))))))))).....))))).))))))))........((((((..((((..((((((..(((((((....))).))))..))))))..))))..)))))).
|
|
SRP_00144
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGGUCGGGCAGUUAGGCCCUGCUCUUCACCCGCGAAAUAGGUCUUUAGCGGGGACCGAACACGGGCGCGUCCGGUCAGACCGGCGCGGGCCCCGGAAGCCAACGUAGAAACCUCGUCCUUCGGGGACAGCGGUUCCGCGUACCCCUUCCGCAGGGAAGGGUUCGCGCGGUUUAUCGGUGGUACCCCGCCAGGCGCGGAAGCGAGCAGCGGACCAUCGGACGUGCGUCGCUCGAGGGAUCGCGGGGUGGAGGAGGCAACCGGGAUUCCCCACGUCGGAACGCCGGGCAACCUCGCUGUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
((((..((((((((((.......))))))....(((((..............))))))))).....((((...(((((((....((((((..((.(((((..(((..(.(....(((((((((((((.(.((.((((..((((..(.(((((((....))))))).)...))))..).(((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)))..)))...))))))...))))))).).)..)))..))))).....)).))))))...)))))))...))))..))))..
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((.((((......)))).))).(((.[[[[[)))...........]]]]]..(((........((((.(((((...)))))))))[[[..)))..]]]..........(((..((((((((((((.(((...((((((..(((((((....)))))))...))))))....((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))).)))..))).)))))))))....)))((((..[[[[...[[[[..[[[[))))...]]]]..]]]]....]]]]...))))..
|
|
SRP_00145
|
[ FASTA input ]
|
UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((((((.(((((((.((((((((((((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))))))...))))))...)))))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((((.((((((..((((((((((((((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))))....))))))...)))))))))))).......
|
|
SRP_00146
|
[ FASTA input ]
|
CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...))))))))))))
|
|
SRP_00148
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGUCAUGGCCGAAGGGAGACCUCCCGCAUCCGCGAGGUGUGUGUGGCUUGGGGGUCACCUGAUCCCCCAAACAGCGGACUUGGUGCCUGGUUCGAAUCGCCGGGUCGCGAGAUUUUGUCCUUCACGGGGCAACUUCUUCUCCCGCACUCGUGCGAGUAGUCCACGACCGGCUGUCGGUGCGCUAAGCCCUGGCCCGUACCCUCGAGGGAAGCGAUUCUGCAGAGACCGGGCCCCCCGGCGAUGGCGGCACCAGAUCACACCGCCGCUGCACACCCACCGCGCUGAAUGGGAUGGUCGACUUUCUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((.......))..((((((((((..((.................((((.(.(((((((....))))))).)..(((((...(.((((.(((((.(..(((((((((..(.(((.((((((.....))))))...))).).(.((.(((.(((((.((....))))))).....))).)).)..(...)....((((((....(((....(((....)))....)))..)))))).)))))))))....).)))))....))))).))))).....))))...........))..))))....))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.(((.....))).(((((..(((((((((.....(((.((((.(((((..(((((((.........))))))).((((((...(((((.(((((....(((((((((....((((..(((((((....)))))))..))))....((((((((((.........)))))..........))))).........((((((..(((....)))..(((....)))......)))))).)))))))))......)))))....)))))))))))))))).)))).)))....))))).))))..)))))...........
|
|
SRP_00152
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAGCAACGUGGGCCUGUAACCCAAGUGGGGGCAUGUGGGAAAUGGGACUUUAGUUCGGCCCAUUGGAUCGGAUCCAGUGUUAGCUGCUUGCUGGGCUGCCCAUUCCAAGCCGAGAGUUGAGCUGUGUGAGCCGGACGAAGGUCUGGCUUGGUCAGCUCCUAAAGCGGAGGGCAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGCGACAACCUCCCGCUCUCGGCAGUGGAAGGAUAACGGGCCGGUGCUGCUUGGACCCACCAUGGUUCACUGAGCUGACUCUUAAUAGGACCAUUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((......)))))).....((((..)))).....(.(((((((((..((((((.((((..((.((((((((.(((((.(.(((.((....((((.(((.((.(((((.(((((((((.((((((..((((((((((....))))))))))..))))))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))))))....))).))))))))))))))).)).....)))))).))..)))).)..))).))..))))))))).)
|
| [ predicted structure ] |
((((.....[[[[[)))).....(((....)))..]]]]]....((((((......[[[[[.))))))....]]]]].(((..[[[[)))....]]]]...((((.(((((.(((((((((.((((((..((((((((((....))))))))))..)))))).......(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..))))).......)))).((((..[[[[[[[[[))))..]]]]]...]]]]..........................
|
|
SRP_00153
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGUCUUAGCAACGUGGGCCUGUAACCCAAGUGGGGGCAUGUGGGAAAUGGGACUUUGGGUCAACCUAGUGGAUCGGGUCCAGUGUUAGCUGCUUACUGGUCUGCCCAUUCCAAGCCGGGAGUUGGGCUGAGUGACCUGGGCGAAGGGCUGGGUUGCGCACGUCCUAGAGUGGAGGGCAAUGCGUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACUACCUCCCGCUCUCGGCAGUGGAAGGAUAACGGGCCGGUGCUACCUGGGUCCACCAUGCUUCACUAGGCUGACUCUUAAUAGGACCAUUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((......)))).))....((((..)))))))..(.(((((((((..((((((((((..((((((((.(((((((((.(.(((.((....((((((((.((.(((((.(((((((((.((..((.(((((((((.(....).))))))))).))..))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))))))....)))))))))))))))))))))).....).))))))))..)))))..))).))..))))))))).)
|
| [ predicted structure ] |
...((((......[[[[[)))).....(((....)))..]]]]](((((((((......((((((.(((((((((...(((((((...((((.....(((((((((....(((((.(((((((((...(((..........)))..(((....(((((((((.(((((.......)))))..)))((((((....))))))......)))))).)))...)))))))))..)))))......))))))))))))).))))....)))....))))))))).)))))).........)))))))))..
|
|
SRP_00157
|
[ FASTA input ]
|
ACGGCUGUAAUGGUCAAACGGUGAAGGCUCUCGCACAAAGGCCCGCCACUCCCCAAUCCCACCCCCGUCAGAUCCCCUCCGUUCGACGCCCAGCCCGAACGCCGCGGUGGCCGCCCGCUCGUACAGGUAACUUACGAUGUCGGAAACACUUUACCGUGGCCCUAAGCAAUGGAGAUGACACUUCAGGGAGGCUUCACUCUGCAGAGAACUCUCCCCCGUCGCGUGGCGGGCUGGAUUACGAUCGCGGAGGGCGUGGGUUGGGGUGGUGGGACGGAGAAUGCCAACACCUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
..(((.......))).((.((.........(.(((......(..((((((((..((((..((....))..))).....(..(.(((.(.((((((((.((((.((((...(((.(.(.(((((.((....))))))))).)))..................(...)....(((((.....(((....(((......)))....)))...))))).)))).))))..))))))))....)..))).)..)........).)))))))))..........)).).)...)).))......
|
| [ predicted structure ] |
..((((.....))))....((((..(((((((.........((((((((..(((((.(((((............(((((((((((....((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((.........)))))...)))(((...)))...))))))........(((((......)))))((((((.(((..........))).)))))))))).))))..))))))))....)))..)))))))).))))))))))))))))))...))))..)))..))))..........
|
|
SRP_00158
|
[ FASTA input ]
|
ACCCUGUCGAAGGAGUGUGAUGCUUGGAUAUGUGGCUCCGGUUCGAAACCGCACAGUCACACCGGGUCUCUUUCAAAUGGAAGAGGUUUCACAAUGGUAUCCCAAACAGGCGUGAAAUGUCUCGUAGUGGUUAUAUGCCAUUACCCGCUUUUCGUGUCUGGCCGCCCGGUCUACGCGUUCAUUUAUUUGUGUAACUGCUUUGGACAGCUGGAUCUCGGUUCGGUUGUCACGUGGUCGACGUGUCCCACCGUUACAAAAUUGUUGCGGGUUAUCCUUUGUGGUGGCUCGGUCGCAUGAGAAGUCUGCGGUUCGAAGCCCAACUGGUAACGAUUUAGCAUUUCAACUAAUACUUGAAGCUAGUUUAGUGUUUAACGUUGUAGGGGAGUCUCAUCCAGCACAACGAACACUGCCCGUGACGAGGUGGUGUGGAUUGCACGUCCCGUGGUUAAGCAGUGCGUGUGGGUUCAGAGGCAGACAUACACUGUCCUUCAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((.......))...((((.(..(.(.(.((((.(.....((.((((..(.((...........)))..)))).))(((..(..((.....(......).....(.((.((...............)).)).))).)..))).................(...(..............((.((((....)))).))............)...).........(((.(.(((((...((((((.((((..(.......((((((((((.......(((....((((.(((((((.((....)))))))))...))))....))).............((((((.(...).))))))......((((((....(((((....(((......)))....))))).))))))))))))))))...)..))))...)))))).)))))).)))..(((...(...))))........).)))).).))..).)))).......
|
| [ predicted structure ] |
........((((((.(((((.((((((...(((((((.(((((...)))))...)))))))))))))(((((((....)))))))...))))).(((....)))..(((((((((((......((((((((.....)))))))).....)))))))))))(((.......((((((((.(((......)))..(((((((..(((((((((((....))))))))))).(((((..(((((((..((((.........(((((((((((((((..(((....((((((((((((.........))))).))).)))))))..)))).....(((((..(((((.......))))))))))...((((((...((((((...(((......)))...)))))))))))))))))))))))...))))......))))))))))))...))))))))))))))).......)))............)))))).........
|
|
SRP_00160
|
[ FASTA input ]
|
AUCACUGUAACGGUCGACAGUGGAACUGUAUUUUCCGAGAUUUCUGCCCUGGGUUCAACCCCUGCGGUCGGACGUGUUACGCUUUAAGCCUCUUUCGGGAGGUUGCUACACGCUCAGUCUAACAAUCGAGUCGACGUGCCCUGGUAACAAAUCGAUCCUUGCGGGCAGUCCAGGGCGAGAUGUGAGAAGUCCGUCUUGUACCUGGUACGGCAAUGGUAGGCGAGGGUGCUUAACGCUAACCCGUCUCUUGUGCUCCUAUCGCUGAAGGGGAGUUUCAUCCAGCACAGCAAGAGCAACCCGUGAUGGAGGCGACUGGGAUUACACUUGUCCUCGUAUAAGGGAUUUAUCCCUUCGUUGUGGGCGUGAAUCUCAUCCUAUGGAAUGUGAAGAUACUAGAACCCUGUCAUAUUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.(.((.......)).)((((.((..((((((((((.((((((((((.((..((........))..)).))))(((((.(.......(((((((....)))))))..))))))((((...((((...((((.(((.(((.((((((..........(((((((((((.(((((((((((((((.((....)))))))))).))))).)).)....(((.((((.(((..)))..)))).))).........(((((.....((((....(((......)))....))))..))))).))))))).)))....))))))....))))))..))))...(((((((..))))))).))))))))....)))))).(((...)))....)))))))).))..))))))............
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((........)))))))....((((((((.(((((((.(((((.(((......))).(((.......[[[[..)))....(((((((....)))))))...]]]].(((.[[[........)))..]]].(((((((((.....))))....[[[[)))))..(((((((((((((.........)))))))).)))))....]]]]...(((((..[[[[)))))......]]]]..(((((((....[[[[[[[......(((......)))......)))))))......]]]]]]]..(((...[[[[[.......[[[[[)))....]]]]]..]]]]]........))))).))))))).(((...)))....)))))))).......................
|
|
SRP_00161
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((............)))(((....))).(((((......))))))))))))).)))))....
|
|
SRP_00162
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...))).).))))))))..))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...))).))))))))).))))))....
|
|
SRP_00163
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((....(((((.((((....(((....)))....))))...))))).)))))))).)))))))))....
|
|
SRP_00164
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACUCUAUUGGUCCCCUCGCGACGAUAGAUUGUGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGCAGUUGAUGCGGGCGCCGGGGUGUGGCUCUUAGAGUCGCCGCCCAACU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..((((.((((((..((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....)).)...)))))...))))..))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..((((((((.(((......((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))........))).))))...))))..))))))))))........
|
|
SRP_00167
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCGUUGCUCUGUAACCUUCGGGGGCUUCCUAGGUGGAGCGGGGGUGUCGUGGACCAGCGAGGGUGGCGCGCUGCGUUGACGCGGUGCUCUGCUUGGCUGUGUGUCGGUGUGGCCUGCCCCCCUGUAGAGGGGUGUCGUAGGCUACCCGUUGAAGCGAGGGAAACCGGGUCAGGCCGGAAACGGAACAGCCCAUCCUGCGCACGUCCGCCGUUGCAGAAUCACGCCGCGGAGCAUGACCGCACUUGAGCCCCACGCGCCGUCGCAAAACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...)))))....(((..)))))).....((((...((((.(....(((((....((..(((((..(..((((.((..(((((((.(((((..(((.((((((..(..(...(.((.(((((....))))).)).)..)..).....(...)(((.(((.....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..)))...)))))....)))))))))))).).)..)))))..)).)))))...).))))...))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...))))).........[[[)))..]]]((((...((((.((((.(((((.....((((...(((((((((((....))))))))(((((.((((((((((((((.(((((((((.(((((....)))))....))))))))))))(((...)))((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))...))))..))))).....)))((((.......)))).))))....))))))))).))))...))))...
|
|
SRP_00168
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCUCAGCUCUGUAACCGUCGGGGGCUAAUCAGGCUUAGCGGGGAGGACGUGGACCAGCGAGGGUGACGCGCUGCGUUGACGUGGUGCUCUGCUUGGCUGUGUGUCGGUGUGACCCGCACCCCUGCAGAGGGGUGGCGCGGGCCCGCCGUUGAAGCGAGGGAACCGGGUCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCGCGCACGUCCGCCGUUGCAGAAUCACACCGCGGAGCAUGUCCGCACUUGAGCCCCACGCCUCGUCGCAAAGCCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...)))))....((....))))).((..((((((.((((.(.((.(((((....((..(((((..(..((((.((..(((((((.(((((..(((.(((((((((..(...(..(((((((....)))))))..)..)..)))...(...)(((.(((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..)))...)))))....)))))))))))).).)..)))))..)).))))).))).)))).))))))..))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...)))))............))).....((((((.((((.((((.(((((.....((((((((..((((((((....))))))))(((((..(((.....)))((((.(((...(((((((....)))))))((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..)))))))..)))))))...)))))....))))(((((.....))))).))))....))))))))).)))).))))))....
|
|
SRP_00170
|
[ FASTA input ]
|
GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((...(((.....))).....(((((((((((....))).................))))).))).))))))))))).....
|
|
SRP_00171
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGAGGCGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUAGGAGGCUGAGGCGGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGUCUGUAGUGCACCAUGCCCGUUGGGUGCCUGCACAAAGUUCAGCAUCAAUAUGGUGACCUUCCGGGAGCAGGGGACCAGCAGGUUUCCUAAGAAGGGGUGAACCGGCGCAGGUUGGAAAAGGAGCAGGUCAAAACUUCCAUGCUGAUCAGUGGUGGGAUCACAUCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACUUAUUGAGACCCCGUCUCUAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((..(((......)))..))....(((..........)))))).((((((((....(((.(...(((((((....((((..(((((((..(.((.(....((((((.((.(((.(.(.(((((((.(((.((.((..((((.(....).))))..)).)).)))..(...)..(((((.....(((.....((......)).....)))...))))).))))))).)..).)))))....)))))).).)).).)))))))..))))))))))).....).)))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((........((((..[[[[))))......((((.((((((.....)))))).))))........]]]]..(((((.(((((......[[[[)))))))))).......]]]].......(((...[[[[))).....((((((((....))))))))...]]]].(((..[[[[)))...]]]]....(((...[[[[[.....)))....]]]]]...((((...[[[))))..]]]...)))))))).)))))))..(((.........[[[[)))..]]]]....
|
|
SRP_00172
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCCUUGCUCUGUAACCUUCGGGGGCUUUCACCAGCUGAACAGGGAGCUGUCUGGACCAGCAUAGGGUGCUUGCGGCGUUGACGUGGUGCUCUGCUUGGCUGUGUGUCGGAGGCCUCCGGGUGCCCCCUUGCAGAAGGGGCGCGCCCCCUCCGUUAAAGUAGAGGAACUGGGUCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCUCGCGCACGUCUGCCGUUGCAGAACCACACCGCGGAGCCUGUCAUCACCUGCGCCCCAGGCGAUCCUGUGAAGCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...)))))....(((..)))))).......((((..((((((.(((..........((.((((..(.(.(((((.((..(((((((.(((((..(((.((((((((((((.....((((((.(((((....))).)).))))))))))))(...)((..(((...(((((....(((....)))....)))))))).))))))))..)))...)))))....)))))))))))).)).).).)))).))....)))..))))))..))))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((..((((...)))).)))))).(((((((.[[[[.......)))))))..]]]](((.[[[...)))...]]](((.....(((((((.(((((.(((((((((((((((((.....((((((((((((....)))))).))))))))))))........((((...(((((....(((....)))....))))))))))))))))...))))..)))))....)))))))..)))............((((...))))...............
|
|
SRP_00173
|
[ FASTA input ]
|
UUUGUCGUGCUAGACGGGGAGGUAGCGGCGCCCUGUAACCCGCAAUCCGCUCUAGCGGGGUUGAAUUCCUCAUUUGAGGCAUCGUAAUUGUUUGGUCUGCCCUUGACAAGUGGUGUUGAAGGUUGGGUCUUGCGCAAUGGGAACCUGUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAUCAGUGCUUCUCAUGUGCCGCGAGGUUGCCUGGCCCGAGCUAACUAUCAAGGUAACGCAGGUGAUUGCAUGUCGAGGUGAGGUGCGCGACACUAA |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((..(((((((.(.(...).).))))....(((((...........)))))))).....(((((((...(((((..((((((((((...(((.(((((..((((((......((((((((((((((((.((((((.(((......((((....(((....)))....))))....)))...))))))))...))))))...))))))))...))).))).))))))).)..)))))))))).)))))..))))))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((...((((((.....[[[[..))))))...]]]]..(((((....)))))........((((((((..(((((.(((((.......(((((((((((....((((......(((..(((((((((..(((((((((((..........))))(((....)))....(((((....))))))))))))....))))))...)))..)))...))))....))))))....)))))..)))))))))).)))))))).))))))))....
|
|
SRP_00174
|
[ FASTA input ]
|
UGGGUUGAUGAGCGUGAAGCCUUCGCUCGGUUGGAUUUUUCUUCAUUGCUACUCUUGGCUUGCAGGAAUUCCUCAUUUGAGGCAUCGUAAUUGUUUGGUCUGCCCUUGACAAGUUGGUGUGAAGGUUGGGUCUUGCGCAAUGGGAACCUUGUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGCAGUGUUCUCAUGUGCCGCGAGUCGCCUGGCCCGAGCUAACUAUCAGGGUAACGCAGAUGAUUGCAUGUCGAUGUGAGGUGCGCGACACUAA |
|
[ reference structure ]
|
.(.((((...(.(.((.(.((..(.....)..)).)...(...(.............)...))).)....((((((....(((((.(((((((((((...(((.(((((..(((((((.....((((((((((((((((.(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)))))))))...))))))..))))))))...))))))).))))))).)..))))))))))))))))...)))))))...)))).)...
|
| [ predicted structure ] |
........((((((....[[[[[))))))...(((..(((((.....((((....))))....))))).)))......]]]]]...(((((((((((...((((((.....(((((((.....(((..(((((((((..((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).))))))))....))))))..)))..)))...)))))))...))))))...)))))))))))........(((.[[[[)))..]]]]..
|
|
SRP_00175
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGUGAUGGCUUUUAGUGGAAGUGUACUUCUUGCGCACUCUCAGAUUUGUUAAAUUGUGUAAAAGAUUCUCUUGAGUUUUUUCGCUGUGUUCAAAGUGUCCAGUUCGAUCCUCGCGGUUUGAAUUUUCUUGACUACUUGAGGAAUCAGUACUGUCAGAUUCUGCUAAUUAAUAGCACCACCACUGGAGGGAAGCAAUUCAGCACAGUAAUGCUAUCCGUGACGGAGGCGAUACUGGAUGGCACAUUGUUCCGUUAGUUAAUAGUCUGGGAAAGCCUUAGUGUGACGACUCUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.......)))..(((.((..((.(((...(.(....((.....(((.(((((...(((.(((((((((....))))))))))))......(((.(((((((((....((.((((((...(((.(((..(.(.((((.((....)))))).))..)))))).(.....)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).)))))).)).......)))))...)))).))).....))))).))).....)).......).)..)))))..))))).....
|
| [ predicted structure ] |
.((((....((((((..(((.(((.......))).)))...((((((((.(((((...(((.(((((((((....))))))))))))((((((......((((((((((.(((((((((...(((((....((((....(((....))).....)))))))))(((((.....)))))(((....)))...(((....)))((((......))))..)))))).)))..))).)))))))))))))(((......)))))))))))))))))))))).)))).................
|
|
SRP_00178
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAGCUUAGUAAUGUGGGCUUGUAACCCAAAUGGGGGCAUUAAUGUGGUGGAAUGUUGGGCUGUACCAGAUGGUUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGACUUGCCCUAUCCAAGCUUAGAGUUGGAUCAUGUGGCCCAAUUGAAGAAAUGGACUACUUGAUUCGUAAAGUGGGGCGGAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAUAAGUUUCCGCUCUAAGCGGUGGAAGGAUAACGAGUCGGUGUUCUCUGAGUCCAGUAAUGCCUGAUGGGCUGCUCUAAUUAAACCACCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((..)))))))...((.(((((((..((((((((.((.(((...(((.((((((((.(((.((....((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.((((.(((.((....)).))).)))).)))))).(..)..(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....))))))))))))).))))))))......)))...))))).))).))).))..))))))).)).
|
| [ predicted structure ] |
...((((((..[[[[[[))))))....(((....))).]]]]]]..(((((((...(((((......(((...((((((((((((.((((......((((((((.(((.((((.((((((((((((((((.((((.(((..........))).)))).)))))))......((((.......(((....(((......)))....)))......)))))))))))))..)))))))....)))))))).)))).))))))))).....)))...)))......)))))....)))))))....
|
|
SRP_00179
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGCUCAGUAGCGUGGGCUUGUAACUCAAGUGAGGGCAUCAGUGUGGUGGAAUGUUGAACAUGCCCAGAAGGUAGGGCUUGUGUGACAAUUCUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCAAAGAGUUGGGUCUUGUGGGCCAAGCGAAGGCUUGGGCUGCUGGGCUCCUAAAGUGGGGUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAUAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAACGAGCCAGUGUCAUAUAAGUUCAACGAAUGUCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((..)))))))...((((((((((..(((((((((...(((..(((((((((((((((((..(....(((((.((.((..((((.(((.(((((.((((((.((((.((((((....)))))).)))).))))))((..)).(((((....(.(((....(((......)))....))).)..))))).))))).)))..)))).))....)).)))))).))))))))))))......)))))..)))..)))).))).))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((.[[[[.......)))(((((.....)))))..]]]]...((((((((((......(((((.(((((.......((((((((((((((.....(((((....(((.((((.(((.(((((.((((((.((((.((((((....)))))).)))).)))))).......(((.........((((((....))))))..(((........))))))))))).)))..))))))).......))))))))))))))))))).............))))))))))........)))))))))).
|
|
SRP_00180
|
[ FASTA input ]
|
UAGUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUAGGAUCACGAGGCCCAAAUGAAAAUAUGGGCUUCUUGAUUCCUAAAGCGGGGCGGACCGCAUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGUGAACAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAAUGGGUCGGUGUCUUAUCAAGUUCAGUAACGCCUAAUGGGUUGCUCCAACUAAACCACCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((...((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....))))))))))......................................................
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((.(((.((((.(((((((.((((((((.((((((((..........)))))))).))).)))))..((((((((...)))....(((((..(((((......))))))))))))))))))))))..)))))))....))))))((((........((((.((((((.........))))))..))))....))))......
|
|
SRP_00181
|
[ FASTA input ]
|
GUCGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAACCCAAGUGGGGAUGUUAAGGUGGUGGAAUAUUGGGCUGUCCCAGAUGGCUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGGCCUGCCCUAUCCAAGUACAGAGUUGGAUCAUGUGGUCCAAUUGAAAGAAUGGGCUACUAGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACCCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAAAACUUCCGCUUUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGACCGGUGCCUUCCAAGUUCCAUUAAUGCCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((..)))))))...((.(((((((..((((((((.((.(((...(((.((((((((.(((.((....((((.(((.((..((((.(((((((((.(((((..((((((((.((....)).))))))))..)))))((..)).(((((.....(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....))).)))))).))))))))))).......)))...))))).))).))).))..))))))).))..
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((..[[[[[[)))))))...(((....))).]]]]]]..(((((((.....(((.[[[[(((((....)))))...(((((((((.....)))))))))))).......]]]](((((((((....)))))))))...........(((((....[[[...)))))...]]](((((.(((((((...((((((((...(((....))).))))))))...(((((((..............)))))))....))).....)))).)))))..............))))))).....
|
|
SRP_00182
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGCUUUGUAACGUGGGCUUGUAACCCGAGUGGGGGCAACAAUGUGGUGGAAUGUUGGGUCCAUCUUGAUGGAUGGGCUUGAAGGGCUAAUGUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUUGGGUCAAGUGGUCUAUACGAAAGUAUAGCCACUUGGCCUUUAGAGUGGGAUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGACUAGUCCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUCACGGGCUAGUGCUCUUUGAGUCCUAACAAAAACCUGAUAGGUUGCCUAAUUAAACCAUCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....((((..)))))))...((.(((((((..((((((((....((....((.(((((((((.(((.((.....((((((((.((..((((.(((((((((.(((((((((((.((((((....)))))))))))))))))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....)))))))))).))))))))))).......).))....))...)))))).))..))))))).)).
|
| [ predicted structure ] |
(((.....[[[[......)))......(((.....)))]]]]....(((((((..((((((((((((....)))))...(((..((((((.......((((((((.(((.((((.(((((((((.(((((((((((.((((((....)))))))))))))))))............(((((((((....(((......)))....)))..))))))..)))))))))..)))))))....)))))))).))))))..))))))))))..(((((...)))))...........)))))))....
|
|
SRP_00184
|
[ FASTA input ]
|
GUUGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAAUCCAAGUGGAGACAUCAAAGUGGUUGAAUAUUGGGCUGUACCAGAUGGUUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGACUUGCCCUAUCCAAGCUUAGAGUUGGAUCAUGUGGCCCAAUUGAAGAAAUGGACUACUUGAUUCGUAAAGUGGGGCGGAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGUGAACAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAAUGGGUCGGUGUCUUAUCAAGUUCAGUAACGCCUAAUGGGUUGCUCCAAUAAACAACCACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((..)))))))...((((..(.(...((((((((.((.(((...(((.((((((((((((.((....((((((((.((..((((.((.((((((.((((((.((((.(((.((....)).))).)))).)))))).(..)..(((((....(.(((....(((......)))....))).)..))))).)))))).))..)))).))....)))))))))).))))))))))))......)))...))))).))).)))).)...).)..)))).
|
| [ predicted structure ] |
((((.......)))).((((.[[[...)))).(((....)))]]].(((((((..((((((......(((...((((((((((((((((.......((((((((.(((.((((....(((((((((((((.((((.(((..........))).)))).)))))))......((((((.....)))..(((((..(((((......))))))))))))))))))).....)))))))....))))))))...))))))))))))).....)))...)))......))))))..))))))).....
|
|
SRP_00188
|
[ FASTA input ]
|
GUUGGGUUGACCCAGAUGGUUGGGUUCGGUAGGCUUAUAGUCUGGCCUGCCCUCUCCAAGCAUGGAGUUGGAUCACGUGGCUUAGUCGAAAGACCUGGGUUGCUUGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAACAGCUUCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGGUCAGUGCUCAGCGAGUCCAGUUAACGCCCUGAUGGGCUGCUCCAACUAAACCACCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(..(((...(((.(((((((.(.((.(......((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.(((((((((((....))).)))))))).))))))((..)).(((((....(.(((....(((......)))....))).)..))))).)))))))))..)))).))....)))))))).))).).))))))).......)))....))).).))).))))..............
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((((.(((((...((((((((........))))))))...))))).)))......[[[[[[.........(((....)))))))))))..]]]]]]..(((((((((((((((..((((((....)))))).(((((........((((((((......))))))))(((.....)))..)))))....)))))((((...((((....))))......))))..))).)))))))
|
|
SRP_00193
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGCCCUCUUGGUUCCUCGCAAUGAUGUUCGGUUUAUUAGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCGGAGUCGAGAUUUUCGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAGGGUCUCCACCCAACU |
|
[ reference structure ]
|
((.(.((.(((((((..(((((.((((.((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..).)))))...)))).....))))))))).).)).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((...((((..((((..((((........(((....(((....)))....))).....))))....))))....))))......))))))))))))))........
|
|
SRP_00194
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((.((((((.....(((....(((....)))....)))....)))..)))))))).)))))))))....
|
|
SRP_00196
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.(((.((.((.(((....((((....(((....)))....))))..))).)))).))).......))))...))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))).))))))).....
|
|
SRP_00197
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAAAUCGCCGAUAUGCGGGGGACGAAGCCAAUGGAAGAUGCGUCAAAGGGAUUCCAGCCUGUGAUCUCAACUGAGAAACCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGCAGGUAUGUGGACUUGCUGGAAAACAGGUCCUCAUACCCUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUCACUGUGGGCAACCGUCGCUUGCGGGGUCGCGGGGUGGAGAAGAGAUUCCAGUCUACUGAAAUCUCCCAGAUACAACGACCUGCGGUGUGCUCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((...((..(.((.(((...((((((.(((.(((.((((((..((.....((((((((((((.((.(((.((..((((((.(((((((.(....).))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))..)))))...)))))...)))))))..))..)))))).)))....))).))))))...))).)).)..))...)))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.....(((((.....[[[[.........)))))....]]]].....((((((..................[[[[[[..(((........)))....((((....))))..))))))...........]]]]]]((((((.(((((((........))))))).))))))....((((((....[[[[.(((.(((....)))......))).))))))...]]]]...((((..[[[[[[))))(((.....((((((.(((....))).)))))).....)))..]]]]]].......))))))))
|
|
SRP_00198
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAGAUCGCCGAUACGCGGGGGACGAAGCCAAGGGAAGAUGCGUCGAAGGGACUCCAGCCUGGAAUCUCAACGGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGGUGCAGGUAUGCGGGUUUGCUGGAGAGCAGGUCUUCAUACCAUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUUACUGUGGGCAACUAUCGCUUGCGGGGCUGCGGGGUGGAGAAGAGGUCCCAGUCUCCUGGUAUCUCCAAGAUUCAACGACCCGAGGCGUGCUCAUCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(.((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((..(((..(.((.(((...((((..((((.((((.(((((..(......((((((((((((.((.((((((..((((((.(((((((((....))))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).))))))...)))))...)))))))...)..))))).))))....))))..))))...))).)).)..)))..)))..)))))))).).
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((..(((((((((((.....)))))))....((((..(((...)))...))))))))...(((..(((......(((.(((....(((((.((((...((((....))))((((((((........((((((...((((((.(((.(((((....))))).))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...))))))....)))))))).)))).)))))..(((((.((((....)))).))))).....))).))).)))..)))..)))))))....
|
|
SRP_00199
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCGGGCUAGUCUGGGUAGGCCGGCGUUACCUAUAACCCGAAAUCGUCGAUAUGCGGGAGACGAAGCCAAAAGAAGUUGUUUUGAUCAUAUCUAAACCUGUGAUCUCAACUGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGUUGGUAGAAGAACUAAUUGGAGAAUUGGUUUUCCUAUCUUUACAGUGGGAACCAGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACCUACCAUUGACAUUUGUCGCUUGUAGGGCUGCGGGGUGGAGGAGAGGUUGCAGAUCAUUUGGAUUUGUGACAAGCGGCAACUCGCGGUAUGCCCGCCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((((((((.......))))))....((((.(..........).))))))))...(((...((..(((((.(((..((.(((((((.((((((((((..((.....((((((((((((.((.((((((..(((((.((((((((((....)))))))))).)))))....((((((......(((....(((....)))....)))...)))))).))).)))))...)))))...)))))))..))..))))))))))....))))))).))...))))))))..))...)))..)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..(((.[[[[[)))......]]]]]....((((......[[[.....))))...]]].....((((.[[[[[))))(((((((........))))))).]]]]]......((((((((.....))))).(((.(((((.((((((((((....)))))))))).)))))...)))..)))..((((((....(((....)))....)))((((...((((....))))...)))).[[[[[[[[.))).......((((((((((.....)))))))))).........]]]]]]]]..)))))))))...
|
|
SRP_00200
|
[ FASTA input ]
|
GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU |
|
[ reference structure ]
|
((..((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))))..))........
|
| [ predicted structure ] |
....((((((((((((((((.(((((((..((((((..(((........(((....)))......))).))))))...)))).))).))))...))))))))))))............
|
|
SRP_00201
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUAGGCCGGGGGGUUAGGGGUCCCCUGUAAGCGCAAAUCCCCUAUAUGGCGCGGCCGAAGCCCAGGAGGCGGCAAGACCGCCAGACAUCGGCCUGAGGGUUAAACAAUGAAGCCUCGUCCCACAGGGCCACCGGUGGCGAGGGUCCAGCUGGAGGGCUGGACCUAAUCGCCUUUGCUGCGGGAACGGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCCUACCGCAGACGGAUGGUGCUUGUGGGUCAACGGGGUGGAGUCUAUAACCCUCAGAUCACCGGUGUCUGGUGGUCUUGUCCACUCCUGGGCGUGCCU |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((((((((..(((((((((.(((((((((((.((((((((((.((..(...(((((((((((((.(.(((((((.(((((((((((((((....))))))))))..))))).)..((((((....((((....(((....)))....))))..)))))).))).))))...))))))...))))))).).)).)..)))))))))....))))))))))).)))))))))..)))))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
((((..((((.(((((.[[[[[[.)))))............]]]]]]........))))...(((((((((..(((((((((((((((((((((.((((((((((.........((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((....))))))))))..)))))....((((((....((((....(((....)))....))))..)))))).))).)))).))))))))...)))))))........))))))))))....)))))))))))))))))))))..)))))))))..))))
|
|
SRP_00202
|
[ FASTA input ]
|
GGUGUGCAUGGCUAGGCCGGGGGGUUGGGCGUCCCCUGUAACCCGAAAUCGCCCUUAUGCGGGGGCCGAAAACUUGGGGGCGGCAUGUCCUCCAGUCCUUCCUUCCCAGACUCCUCGAUGAGGUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGACGGAGAAGGAAUCUGGGGGCGAGGGAGGACUGGAGGACAUGCCCACCCCAAGGAAGCCAUGCACACCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).)))))))).....(((((((..(((((((((((((((((((((((((((((.((((...(...(((((((((((((.(.(.((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))))))...))))))...))))))).)...)))).))))))...)))))))))))))))))))))))..)))))))..)))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((((.....(((....))).....))).......(((......))))))).....(((((((..(((((((((((((((((((((((((((((.((((.......(((((((((((((((...(((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((..(((........(((....)))......))).)))))).)))))...))))))))...))))))).....)))).))))))...)))))))))))))))))))))))..)))))))..)))))))))))))......
|
|
SRP_00203
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAGGCCGGCGGGCUGGCGGUCCGCUGUAACCCGAAAUCCGCCUCAUGCGGGGGCCGAAGCCGAGGGGGCGGCCCGGUCCCCCGGAGUACCGGCCCCCCGGACCCGACCGAUGACCCUCCGGCCCCCCGGGGGCCCGGGGUGGCGGGGCCGCCGCCGGAGGGCGGCGCGCCACCGCCUUUGCCGGGGCACCGGGUCAGGCCCGAGAGGGAGCAGCCCACCCCGGACCCGCGGCCGCUCGGGGGUCGCCGGAGGCAGGUCGGCCGGGGGAGUACCGGGCUCCGGGGGCCGGGUCCACCCCUCGGCGCGCCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((((((((..(((((((((..(((((((.((((.(.(((....((((((......((((((((((.(((.(.(((..(((.((((((..(((((((....)))))))..)..))))).)..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..))..))))...))))))...)))))))..))))))....))).)..))))))))))).)))))))))..)))))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
(((...[[[[((((((((...))))))))....)))....(((((.....)))))]]]]...(((((((((..(((((((.((((((((((.((((.(((((((..((((((......((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((....))))))).))).)))))....((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))).)))).))))))))..))))))))..)))))))))))))....)))))))))))))))))))))..)))))))))......
|
|
SRP_00204
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCUAGGCUGGGAAGUUAGGCGUUUCCUGUAACUCGAAAUCGCCUUUGCGAGAGCCGAAAACUUGAGGGCGGUUUUAAAUUCUGUCGCCCAUUCUCAAGUUUUGUGUAGACAUUUCGUCCUUUGGGGUAAGAUGGAGGAGGAACCUUUUUUGUAAGAAAAAGACAAACCUCCCUUAUCUUUCGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGAAAGAACUUCAACGCUCAGAGGGUUGCGGAAUCGAGCAGAACUUGAGGUACAAUGGGUUUCAGGAUUUUUCACCCACCUCAAGGAAGCCACUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((((((((.....)))))))....((((............)))))))).....(((((((..(((...(((.((((..(((((((((((((((((((.(....(((((((((((((.(.(..((.((.(((((...(((((((....))))))).....))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).).)).))...))))))...))))))).).))))))))))))....)))))))..))).).)))..)))..)))))))..)))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.((((........(((((((((.........)))).))))).......)))).....(((((((..(((...((((((((..(((((((((((((((((((.......(((((((((((((((((((((((.(((((...(((((((....))))))).....))))).)))))))....)))))......(((....)))...((((...(((.....)))..))))..)))))..))))))....))))))))))))....)))))))..))))))))...)))..)))))))..)))))).....
|
|
SRP_00206
|
[ FASTA input ]
|
UGGGCUAGACCGGAGGGUUAGGGGUCCUCUGUAAGCGCAAAUCCCCUAUACGGCGCGGUCGAAGUUCAGGGGACGGCUGAUCGACUGUUUAUCGGCCCUGCUGAUUGGUGUCGAAGCCUCGUCCCGCAGGAUCAGUGGUGAUGGGGCCCUGACUGGAGGGUCAGGGUAAACCAUCUUAGUCAUGGGAACGGGUCAGGCCUGGAAAGGAGCAGCCCUACCAUGGACAGCUGAUGCUUGCGGAUUAACGGGGUGGAGCCAGUCAGCGGGAUCACCGGUAAAUGGAAGGUCUGUCAACCCCUGAACGUGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((..(((((((((((.....)))))))....((((..............))))))))...(((((((((..(((.((((..(((((((((((.(((((((((((((.(....(((((((.(((((.(.(((((((.(((((.(((((((((....)))))))))...))))).)..((((((....((((....(((....)))....))))..)))))).)).)))))...)))))....))))))).).)))))))))))))....)))))))))))..)))).)))..)))))))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((..(((.[[[[[)))......]]]]]....(((.............[[[)))..]]]..(((((((((..(((.((((..(((((((((((.(((((((((((((......(((((((.(((((((((((((...(((((.(((((((((....)))))))))...)))))....((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).)))))))....)))))))...)))))))))))))....)))))))))))..)))).)))..)))))))))..)))))
|
|
SRP_00208
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUAGGCUGGGAGGUUAGGCGUCUCCUGUAACUUGAAAUCGCCUUUGCGAGAGCCGAAAACUUGGGGGCGGCAUAAGUUCCCAAAUUUCAUUCUUAAUUAGUAUGUCGACGUUUCGUCCUUUGGGGUAAGAUGGUAAGAGACUCUCUUUCUUAAGAAAGAGUCAAACUCUUUUCGUAUUUCGAAACCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGAAUUUACUUCGACGCUCAAGGGGUAGCGGGGCUGAGUACUAAUUAAGGCAAAAUGAGAUUUGGUGCUUUUGUCCACCCCAAGGAAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((((((((((.....)))))))....((((............)))))))).....(((((((..((((.((((..((((((((((((((((((((((((.(....(((((((((((((.(.(..((.((.(((((...(((((((....))))))).....))))).)...(.(((.....(((.....(((....))).....)))..))).)..).)).))...))))))...))))))).).))))))))))))....)))))))))))).)))).))))..)))))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((.((((((((((.......))))))...........((((....)))).)))).....(((((((..((((.((((..(((((((((((((((((((((((((((.......((((((((.((((....(((((((((...(((((((....))))))).....))))).................)))).)))).)))))((((..(((...........)))..))))........))).)))...))))))))))))....)))))))))))).)))).))))..)))))))..)))))
|
|
SRP_00209
|
[ FASTA input ]
|
GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.(((((..(((((.((((((......(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..)))).))).)).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((((....(((..(((((((.....(((....))).....))).)))).)))..)))))..))))).))))))).........
|
|
SRP_00213
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..((.(...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....).)).)..))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((....(((((((((.......[[[))))).)))).(((((....((((....)))))))))]]].)))))))))))......
|
|
SRP_00214
|
[ FASTA input ]
|
AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((...(((.....((((...(((....)))...))))....)))....)))))).))))))))))
|
|
SRP_00215
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).)))))))))....
|
|
SRP_00216
|
[ FASTA input ]
|
AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))).))))))))))))
|
|
SRP_00217
|
[ FASTA input ]
|
GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))...)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...)))))).)))))))))....
|
|
SRP_00219
|
[ FASTA input ]
|
GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((..((((.....((((..................))))...))))...)))))).)))))))))....
|
|
SRP_00221
|
[ FASTA input ]
|
GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((..(.(..(.....((((....(((....)))....))))...)...)...)..))))..))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((..(((........((((....(((....)))....)))).........)))..))).))))))))).....
|
|
SRP_00222
|
[ FASTA input ]
|
AGCCGUCACAUCAUUACGGUCGAAUCGUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUAUUUAAUGAGUGUGAUGGUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..(((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))).)..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...)))))).))))))))))
|
|
SRP_00223
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((..(.(.(((((..((((.....(((......((....))......)))...))))...))))))...)..)))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((..(((((((((..((((.....(((....................)))...))))...)))))).)))..)))).....
|
|
SRP_00227
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGUCUCCCCGCAUGGCAAAUCGGAACACCGGGUCAGGGGCGGAAGCCAGCAGCCCACUCCAAUGCGCCAGUGCCGGGGGUUUGGCCCGCCGCCCUAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))))...))))))...))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..))).....))).))).))))))...))))))))........
|
|
SRP_00228
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCAUUGUGGCGCAUGCCUGUAAUCCAGCUGCUUGGAGGCUAGAGAUGUUGAAUGGCUUGAGGUGUGGAUUCCUGAUGGCGGUCGUGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCGCUAAGUCGGGCGUCAAUAUGGUGCCUUAAGAGGAGUCUCGAGUCACCAGGUUGGUUAAAGAGGAGCGUACCGGCCCAGGGUGGAAACACAGCAGGCAAAAGCUCCCGCGUUCGACAGUAGUGGGAUAGCACCUGUGAAUAGACGGCCGUCAACAGCCAUGCCAAGAUAGUCGAACUCAUCUCUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....(((........)))))).(((((((.....(((((...(((((((....(((.((((((((((......(....(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))).).....)))))))))).)))))))))).....)))))....)))))))......
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((....(((....)))........[[[)))))))..]]](((((((.....(((((...(((((((....(((.((((((((((.((((......(((((((...(((((.(((((((((((((.(((((.....(((....))).....))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..))))).....)))))))...)))))))))))))).)))))))))).....)))))....)))))))......
|
|
SRP_00229
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAUAGAGGAGGAUCUUCAACGUUUUGAAGAUGUGUCAGGACUGAAAAGAAGCAGCACGCAAAACGCUUCGAAGUCGCCCCCAUUCUAUGGGUGCCGUACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..((...((.((.((.((.....(((((.....((....)).....)))))...)).)))).)).......))..))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((....((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........
|
|
SRP_00230
|
[ FASTA input ]
|
CGACUGUAAUGGUCAAGGUGGGUUUGAAGGCACUUGAUUUUCUCAAUGUCUCUAUUCCAUGUCCAAAUCUGGAAGCCCAGCGGCGCCCAGCACGAACCUUGCGGUGGUCACCCACUCGCACGGGUAGCCUGCGACUUGCUGCGCGUGGCCCUAAGCAAUGAAGAUGACACUUGAGAGAGGUUCCACUCUGCAGAGACAUCUUCACCGUCAGGUGGCGCGCUGGAUUACGAUCGCUGGGGGGUUGGGAUAGAGCGUUGAGAUGGAGAUGUCGACUCCUAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((.......))).(((((((......(((((((.(...((((((((.(((((((.((..((((....))))..((((((((((.(((((.((.((((.((((.(..((.(.(.(((((.((....))))))).).).))..)......(...)...(((((((....(((....(((......)))....)))..))))))))))).))))..)).)))))....)).))))))))....)))).)))))))))))))).))).))))....))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.((((.....))))((((((((......((((........((((((((.((((((((((..((((....))))..((((((((...(((((....((((.(((((......((((.(((((((((........))))).)))).))))...........(((((((...(((....)))......(((....))).)))))))))))).)))).....))))).......))))))))....))))))))))))))))))......))))....))))))))
|
|
SRP_00231
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...)))))))).........
|
|
SRP_00233
|
[ FASTA input ]
|
GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.........((((.[[[[[[[..(((....)))(((....))).))))...((((((...)))))).]]]]]]]....))))))))........
|
|
SRP_00234
|
[ FASTA input ]
|
AUACGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUAUAGCGGGGCCGAAUUCCCACUCGAGGUGGGACGACUUUAUGGUCUGACUUAAGGGAUUGGUGUUGACGCCCGGGUCCUGCGCAACAGGAACCCACGAAUCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGUGGUUAUUCUUGUGUGCCGCAGGGAAGCCUAGGCCGAGCCAUGAACUUAUGUAGCGCAUAGGGUCGUUUCAUCGACAGUGGGUGCACGUAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((...((((((.(.(...).).))))...(((((...........)))))))......((((((...((((((.((((((((((..(((...((((...(.(((......(((.((((((((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..)))))))...))))))...)))).)))...)))..)..))))..)))..)))))))))).))))))...)))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((((..[[[.((((....)))).)))))..(((((....)))))]]].....((((((...(((((((((((((((((.((((((....((((((((((....)))).((((((((.....)))).))))...))))))))))))(((....))).......((((((((((.((((((((...))))))))))))..(((...)))....))))))......)))))))))))))))))...)))))).))))))))
|
|
SRP_00235
|
[ FASTA input ]
|
GGUAUAGUUUUAUUAAAACUUAAGAUAGACUUACUAUGUCAGAAUCGUAAGAUAGCAGCAUAAAGAUCUCAUUUUUAGUUAGUAUUAAAGCUAUACCUAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((....((((.((((.(((((...(((((....(((....)))....))))).)).)))..)))).)))).....))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....((((.((((.((((((..(((((....(((....)))....)))))))).)))...)))))))).....))))))))))))....
|
|
SRP_00239
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGCUCAGUAGCGAGAGCCUGUAACCCAAGCGGGGGCACUAAAGGUGGCUGCGGAUGUUUGGUGUGGAUUCUGAUCCUGGGCCCCAUGUUGUUGUAAUCUUGCUGGCUUGCCCGUUCCAAGUUGCGUAGUGGGCCGGAGGGGCUUUGGCGAAGGCCUUUGCUUUGCUUCUCCGGCCCUAAAGUGGCAGGCACAGCGUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGAUCACUGCCCGCUUCCAUCGGUGGAAGGAUAACAGGCUGCUGCACCUUGGGCCCGCUUCUGGCCCAGAGUCCCUCUACAACAGACCACCAUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.((((........)))).)....(((....))))))...((((((((..(....((.(((...((((....(((.(((((((.....(((..((..(.....(((((((.((.(((((.(.((.(.((((((..((.(((((...(((....)))...))))).))..)))....((..)).(((((....(.(((....(((......)))....))).)..))))).))).))).)..)))))))....)))))))..).))..)))..........))))))).)))..)))))))))..)..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
......(((.[[[[[))).((((....(((....)))........)))).]]]]]........(((((((..(((((((((((((.....((((((((..(((.((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))((((((....)))))))))))))))))....))))...((((....)))))))))..))))...)))))))((((((.....[[[[)))))).............]]]]...........
|
|
SRP_00240
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGCCAGGUAGCGUUGGCUUGUCACCCGAGCGGGGGCAAUAAGGUGGUGUUGGAUGCCUGGUCGUUUGCGCUUGGGGUCUGCGCCUGUGGUUUGCACUAUGCGGCCCGCCCGUUCCAAGUUGCGUAGCGUGUGUGGGGCGCCUGGGCGAAGGCUCGAGCGUCCCUGCACCUAGAGUGGCGGGUAUUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGCGAGUACCGCCCGCUUCCAACGGUGGAAGGAUAACGGGCCGCUGCAGCCCUGGCCCGCUUCCGGCCCAAGUGCCUUCCAUGGCAGACCACCACCUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((..)))))))...(((((((((.(...((((..(..(...((.((((.((((.(.(((.(..(.(((......((((((((.((.(((((.((((.(.(((..(((((((((((.(((((....))))).)))))).)))))((..)).(((((....(.(((....(((......)))....))).)..))))).))).)))))..)))))))....))))))))..)))).).))).)......)))))))).))...))..)))).).))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((..[[[.)))(((....))).....(((....)))]]]...(((((((((.....(((((((......(((((((((......(((......(((((....((((((((....(((((.((((..(((.(((((.(((((((.(((((....))))).)))))))))))))))(((((((((...((((......(((......)))....))))...))).)))))).))))..)))))......)))))))))))))....)))(((....))))))))))))...))).))))...))))))))).
|
|
SRP_00241
|
[ FASTA input ]
|
GCUCAGGAGGAUUUAUUCUCUGUAACAUCGUGGGUUCGGUUCUGCGUGUGCUUGUAGGACUAAGAGUGAACCUGUUAUGACGCUGUGCUUUGGCUUGUCCAUUUCAAAUUAGGUGUCAACAAUGUGGGCUUAGAGUAGUCUUCGCUUUCAUGGUUGUCAAAGAAGUCGGGAAUGCCUCAGGCUGGCAACAGAGCAGGGAAAACGACUCGCACUUAAUAGUGAAAGGAUAGCAAGCCUUUAUAGCGUCGAAGGUUAUCGCUUGGCUCCUAACUGGUAUUCGCAUGGCUGUGGCAUCAAUACCUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((.(((((((..))))))).....(((...)))..)).......(((((((..((.(((..(..((..........(...(.(((((..(((((((((.(((...(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).))))(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))))))...))).))...))))))).....))))).)....)..............))..)))).)).........).)))).))........
|
| [ predicted structure ] |
.....((((((....))))))..........((((.((((..((((.(((((..((((((((((....(((((....((((((((((....(((((((...(((((.(((((((((((((.(((..(((..(((....)))..)))..))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..))))).....)))))))..)))))))))).)))))....))))).)))))...))))).))))..))))..........))))..
|
|
SRP_00243
|
[ FASTA input ]
|
AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((..(.((((.((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).).).)))).)..))))....)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((.((((....((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....))))....))))....)))))))))....
|
|
SRP_00244
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.(((((.((((.((((((((.....(((....(((....)))....)))..)))))))..).)))))...))))....))))))))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((.((((..((((..((((........(((....(((....)))....))).....))))....))))....))))....))))))))))))))))........
|
|
SRP_00245
|
[ FASTA input ]
|
GAUCCGUAACGCGAGCUUAUAACUCGAGCGGGGGCUAUAAAGGUGGUGUGGAACGAGCUGACUCGACCUGCCGGGUUGGGCCAGGGACUGCGGUGCUGGCUCGCCCGUUCCAAGUCGGGUAGUGGGCCAUGUGGCUUGGGCGAAGGCCUGGGUUUCUUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((.(..........).))....((((..))))............................................................................................(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
|
| [ predicted structure ] |
..((((((...((((.......)))).[[[[[.(((.....)))..)))))).((((....)))).]]]]](((((.(((((((.[[[[......)))))))))))).....]]]]........(((((...((((..(((....)))..))))...)))))
|
|
SRP_00246
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGUGAGUAGCGAUCGCCUGUAACCCAUGCGGGAGCUGGAUCUGUGUGAAUGGUCGGUCGUGCCUAGGGCUGAUCAGAGAUCGGCCGCCCGUCCCAAGGGGCCACCAGGUCUGGGUGGGAUGAUGGAAGUCGUCGCAUCCGGACAUCUGAAGAAGCGGGUACAGGCUAAGGCUGGGAACAGAGCAGGCAAUACCGCGCGGUGGAAUCAGUGAGGAUGGAAAGUGGUCGAGAGACUGGUAGCCUGGGCAAUAACAUCGACAUGCCAAACACAAAGAUCGUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((.(...).))))))....(.(()).))).(.(((.(.(((((.(........(..((((..(...(.(.....(((((....(((.(.....((..((((((.(((((((((.((((((....)))))).))))))))).).(...)..((((......(((....(((....)))....)))....))))..)))))..))...).))...)....))))).......).)...)..))....))..)......)....).))))..).))).)....
|
| [ predicted structure ] |
...((((((.[[[[..))))))....(((....))).]]]](((((.((((..((((..((((((((((((....(((((...((((((((((((((.......(((((..(((((((((.((((((....)))))).)))))))))..........(((((((...(((....(((....)))....)))..)))).)))))))).........))))))...))))))))....)))))..)))))))).......))))..))))..)))).))))).......
|
|
SRP_00247
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGAGUCGUGGCGUACUCCUGUCAUCCGGCGACUCGGAGGCUGAUGUGUGAGGAUGGCUGCGACCGGGAGCCAACCGGCACCUCUGCGCUCAUGGCGAUCGGGCGUCCGCACCGGGCUUGCCAUCAACAUGCGCCCUCUGGAGGAGUCCGGGCGGGUGCAGGUUGGCUAAGGAGGGGCGCACCGGGUCAGGGAGGCAACUCAGCAGCCAAAAGCUCCCGUGGCGAGCGGUGGUGGGAUCGCGCCCGAGAGUGAGGGCACGGUGCCGGCCCGGGUCGUCCAGCCAGACCGCCCAUCAAAACAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........)))))).......)))...(.((.(((.(.((.((((((.((.........(((.(((....))).)))......((.(.((..((((((((((.(((((.(((((((((((((.((..((.((((((....)))))).))...)).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))..)).).))........)).))....)))).)).)......)))..)).)........
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((..[[[[)))))..)))).....]]]]..(((((.(((....((((((((((((((......((((((((..(((.(((((.....((((((((...(((((.(((((((((((((.(((((((((((((....)))))).))))))).)))).....((((.(((.............(((....)))....))).....)))).)))))))))..))))).....))))))))..))))).))).))))))))))).)))))..))))))...))).))))).........
|
|
SRP_00250
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUAACUUGUUAACUUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAGCAGGGGAUGUGUGUGCCGGGAUGUCGCUGGCAGAGCCCUCGCCAAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((..(.((((((((.((((((.((((...((((((....((((....(((....)))....)))).))))))....)))))...))))).)..))))))))..))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......(((((..((((...(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))....))))....)))))........))))))))))).......
|
|
SRP_00251
|
[ FASTA input ]
|
GAGGCCCCCAUUGGUCCUCCCGCAACACUAACCUGUGAACUCGGCCAGACCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAGGUGACGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGUGGGGGCUUCCACCCAUCU |
|
[ reference structure ]
|
(((.(((.((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))).)))..........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..(((.(((((..((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))))....)))))...)))..))))))))))).........
|
|
SRP_00252
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGUUGGGUGGCGCCAACUUGUAACGGGUAUGCUUCUGCUCGGGUAGUAAGGUGUGAGGGUUGUGGCAUGCGUUGUGUUGUCACUAUCCCCAGGAUGUGGAAGGCGCGUCCAUCUCAAACCAGGAGUCGACAUUGGGACAUUGUCGUAAGACACUGUACCGAGGUCACUAAGGAAUGGUGAACUGCCCCAGGCUGGAUAACAGAGCAGGGAAAAGCCCUCGCUCUUGGUAGUGGGAGGAUCUCGUGCCAGAAUUCUGACGUGCUAACGCAUCGCUGCAAGCCGCAAUUCGAUCACCUUGCGAUUACAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((((.(..).)))))))))......(..((.((((.((.(..((..(((((.((.......(....(((..(....((((((.((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((.((((....)))).))).)))).)))..(...).(.(((....(.(((....(((.....)))....))).)..))).).)))))))))..)))))))....))))))..)..)))...)...........)).)))))..)).....).)).))))..))..).......
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......)))))))(((.[[[[[[)))...]]]]]]....((((((((...((((((((((.((((.(((((((.((((((((...))))).(((((((((((((.(((((.(((((((((..........(((.((((....)))).)))...((((((((((.....))))))....(((....(((.....)))....)))......)))))))))))))..))))))))...))))))....))))...))).)))))))....)))).))))))))))...))))))))...........
|
|
SRP_00253
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGUUGGGUGGCGCCAACUUGUCACGGAUACGCUUCUGUCCGGGUAGUAAGGUGUGAGGGCUGUGGCAUGCGUGGUGGUGUCACUAUCCCCAGGAUGUGGAUGGCGCGUCCAUCUCAAACCAGGAGUCGACAUUGGGACAUUGUCGUAAGGGACUGUACCGAGGUCACUAAGGAAGGGUGUACCGCCCCAGGCUGGUUAACAGAGCAGGGAAAAACCCUCGCUCUUGGUAGUGGGAGGAUCUCGUGCCAGAAUUCUGAUGUGCCGCUACUACGCUGUAAGCCACAGUUCGAUCACCUUGCGUAACACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((((.(..).))))))))).....(.((((.(((..((.(..((..(.((((((.......(....(((..(...(((((((.((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((.(.((....)).).))).)))).)))..(...).(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))....))))))).)..)))...)...........)))))).)..)).....).))..)))..)))).).......
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((......))))))))...((((((......))))))(((.((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...)))))))).....)))....
|
|
SRP_00254
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCUGUGAUGGCAUUUGGCAGAAGCGUACCGAGCGCGCACUAUUUCGGCUUACCUAUCUUCGUGGGUCCGGUUCGAUCCGCGCGGUCAGAAUGUCUCAAUUCGAGUAAUCAAUUGUGCAGUUCUAGCAGCGAGCGGCAGUACCACUGGAGGGAAGCAAUUCAGCACAGUAAGCCGCCCGUGCAGAGGCGAAGCGGAAGACCCAGCUGUUUAAGGAGGACGGAAUAGUGACUGGUAUGUCGACUCCACUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.((((.......))))..((.....(.(....((.....(..(((((((.(((.....(.(..((((.(.(..(.((..((.((((...(((((..(.(((((.((....))))))).)..)))))...........((.(....((((....(((....)))....))))...).))...))).).)).....)))..)....).))))..).).))).)))))))......).....))...).)..))....
|
| [ predicted structure ] |
((((......((((((....(((..((((.....)))).((((((((((.....(((...........((((.((((....((((((..(((((....(((((.........)))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).....)))).))))...............)))....)))))))))).)))..))))))....)))).....
|
|
SRP_00255
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGACUUGGCCGGGAAGCCAGGCACUUCCUGUUACCCGAAGCCUAAAUGCGGGGGCGACAGCCGGUUGAGGGCAACCAGGCCUCCAUAGGGUCCCUGUGGAAGCAAUGAAUCUCUGUCCUCCUUGGUCCUGGGUUUAUGCGUGCAUUUCCAAAGGGAGAUGCAUGCAUAAUCUGUCCGGUGAACCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUGGCUGGAACCAAGGAUGCUAGGAGGGUGCGGGGACGAGUGGAAGCAGGGGGCAGCCCUAUGGGCGCCUGGUCCGAUUCCGGCGUGUCCAGCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(.(((((((((.......))))))....((((...........))))))).)..(((((.....((....(.((..((((((((((.(((.(.(..((......(((((((((((((..(..((.((.((((((((((((((((....))))))))))))))))....((((((....(((.....(((....))).....)))..)))))).))..)).)...))))))..)))))))...)).....).).)))..))))))))))...)).).))....)))))..))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((.(((((((...........((((..[[[[.....))))(((....)))(((((....)))))]]]].((((((((((((((((............(((((((((((((..(((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))....((((((..(((.......(((....)))......))).))))))))).)))))...))))))..))))))).........))))))....)))))))))).)))))))....)))))))..))))))).....
|
|
SRP_00256
|
[ FASTA input ]
|
GGCGACCCUUGCGACUGUGAGUCGUGAACCUGGUCAGGCCUUAACUGGAGCAGCCAUAAGCGGUGUAACUUUGUGUGAGGGUUGCCGCCACCG |
|
[ reference structure ]
|
((((..(.((...((.(.(.(((((.....((((....((......))....))))...)))))....).).)..)..)))....))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((..........(((...(((.((((.......))))..))).)))...[[[[[........)))))))))))))..]]]]]
|
|
SRP_00257
|
[ FASTA input ]
|
AUCCGGCUGUAUGCUCCUCGGGGUAUGCAGCUGUAACCGUAAGGGGAAAGCAAAGUAAUUUGCGCAGCCUUUAAGGGAUGUUACUCAUGCCACGAGAAAUUCAAUAUAUAAGAGCUCUCGUCUAUUGCAAGAUAUAAGUUACUGAGCAUGUUAUGUUGGAAAGAUAACAUGCUGUAGUAAUAAUGAAUUGCGGAACGCCUUAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUUAGCAAUCGCUUGUAUACGGUGCAAAGUUUGCGAUGAGCGAUUAGUAUAUCUCGAAUCUCGUCAAGCAUGGUAAGCACACCAAUUGGUUGUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((..))))))))))))).....(.((((((....(((((....)))))....)))))).)))))(((((.(((((.((((((..(((.((((((.((.((((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...)))).))))..)).))))))...)))))))))...)))))))).))......................
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((((....)))))))))))).......[[[[[)))..(((((....))))).....]]]]].......((((.(((((.((((((......((((((....((((((((...(((((..(((((((((((((((((((((((.........)))))))))).))))).......(((((..(((.(((....(((....)))...)))))).))))).))))))))....))))).....)))).)))).....))))))......))))))...)))))))))....(((....)))..........
|
|
SRP_00260
|
[ FASTA input ]
|
GUCCGGCUAUGUCCGUGCAAGUGCGGAUUUAGCUGUAACUUUCGAGGGGCAGCACUCUUGUGCAGAUAAAUGGGAUACUAUUAAGUUUAUGAGAAUUUCAAUAUUAUAUAUGUUCCCGUCUAUCACAAGACAUCAGUUACUGAGCAUAUUUUGCUGGAAAGGGAAUAUGCUGAAGUAAUGAUGAAUCAUGAACCGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUAAGUGGUCGCUGAUGUACGGUGUGAAGAUUACGGUUGAACAUUAAGAUAUUUCAGAAUUCUCGUAAACGUAAUAUGUACACCAUUUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((....))))))).)))))....(.((.(.....(.((((....)))).).).)).)))))(((((((.(((..((((((.(((.(.((..(...((.((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...))))..))....)).)..)).)..))))))))).)).).))))).)).............
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.(((((((....))))))).))))).........(((.....[[[)))...]]]....((((((...........((((((((((((((.((((((....((((((((((...(((((..((((((((((((.((((((((((.........))))))))))..))))((((....))))..((((((((...(((....)))....)))...))))).))))))))....))))).....))))..))))))...))))))...))))))))))))))............))))))....
|
|
SRP_00261
|
[ FASTA input ]
|
AUCCGGAUGCAUGCUUUCGGGUAUGCAGCUGUAACUUAUGAGACGCGCAAAUUUAUUUGCAAAAAUCAUGGGAUGCUACAAUGUGGAGAGGAUAUUCCAAUGCCUAACGUCCGUUCCCGUCUAUUGCAAGACACCAGUUACUGAAUGUGUUCUGUUGGAAAGAGAACAUAUUGAAGUAAUAAUGAACUGCAAACCGCGUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUCAGUGGUCGCUGGUGUACGGUGCGAAGAUUACGGUUGAGCGGGCCAGGUGUAUGAAUCUCUCUUGCAGGGUAUGUGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((((((..))))))))).))......(((((.....((((((..)))))).....)))))))))(((((..((.((((.(((..(((..((((((...((((((((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((.(....(((....)))....).))..))))).))))))))....)))))))...))))..)))))))).))))))..))))))))))..))..))).))......
|
| [ predicted structure ] |
...(((.((((((((....)))))))).)))...(((((((..[[[(((((....))))).....)))))))..........]]]....(((...))).((((((...((((((((((((...(((((..((((((((((((.((((((((((.........))))))))))..))))....(((.((((.............(((....))).))))..)))......))))))))....))))).....))))..)))))))).))))))........(((.[[[[)))....]]]]...
|
|
SRP_00262
|
[ FASTA input ]
|
GUCCGGCUACUGUUCUUUUUAAGUUCAGUAGCUGUUACAUUCUUGGGACUGCAUUUCGAUGCGAAGGAAUGGGAUGCUAUAAUAUUUCUGAGAAUUUUCAAUAUCUAAAAAUUCCCGCCUAUCACAAGACGUCAGUUACUGAACAUAUUCUUCUGGAGAGAGAAUAUGUUGAAGUAAUGAUGAAUCAUGAACCGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUUAGUGAUCGCUGACGUAUGGUGUGAAGAUUACGGUUGAAUAAAAGGAUAUUUCAGAAUCUCAUAAGUAUAAUAUGUACACCAUUUUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..(((...)))..))))))))....(((((((.....((((((..)))))).)))))))))))(((((.(((((..(((((...(((.(.((.(.....((((((.((.((((((.((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).)))))))).)..)))))))....)))..)....))...).)).)..)))))))).)).))).))).)).................
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((..(((...)))..))))))))....[[[[[[[.)))).((((....))))..]]]]]]]..........((((((.(((((......(((((((....(((((((....(((((..((((((((((((.(((((((((((.......)))))))))))..)))).......(((((.((((........(((....))).....)))).))))).))))))))....)))))......)))..))))....)))))))......))))).))))))........................
|
|
SRP_00263
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGGCUGUAUGCCCUCGGGUAUGCAGCUGUAACUUUUAGAGACACGCAAAUUCGUUUGCAAAGAUCAUGGGAUGCUACAAUGUGGAGAGGAUAUUCAACGCCUAAAGUUCGUUCCCGUCUAUCGCAAGACACCAGUUACUGAACAUGUCCUGUUGGAAAGAGAACAUGUUGAAGUAAUGAUGAACUGCAAACCGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUCAGUGGUCGCUGGUGUACGGUGCGAAGAUUACGGUUGAGCGGGCAAGGUGUCCGAAUCUCUCUGACAGGGUAUGUGCACCAUUGUUUUUGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((..)))))))))))).......(..((.....((((((..)))))).....))..)))))(((((..(((((((.(((..(((.((((((...((((((((((((((.(((((..((((((((((((.(((((((.((.((....)))).)))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...))))..)))))))).))))))..))))))))))).))..))).))................
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((....)))))))))))..[[[......))))..........]]].((((((((.((((..(((........(((((((...(((.((((((...((((((((((((...(((((..((((((((((((.(((((((...............)))))))..)))).((((...((((.............(((....))).)))).))))......))))))))....))))).....))))..)))))))).))))))..))))))))))............))))))).))))))))
|
|
SRP_00265
|
[ FASTA input ]
|
AUCGGCUGUAAUGGUCAUAUUGGUUAAGGAGACGCCUGAAAAUCUUCUCCCGACUCCAGUCUCAUAUCCAUGAGAACUUCCCCCGUGGCGCCCAGCGUGAAUCUUGCGGUGGCCACCCACUCGCACGGGUAACCUGCGAUGCUGCGCCGUGGCCCUAAGCAAUGAAGAUGAUACUUGAGGGAGGCUUCACUCUGCAGAGGCAUCUUCACCGUCCGAUGGCAGGCUGGAUCACGAUCGUGGGGGGAAUGUGAGAUGGAGCGGAGAGGUGGGGAUGUCGACUCCGAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
...(((.......))).....((((...........(.(.(.(.((.(((...((....((((((....)))))).....((((((((.(.(((((.((.(((..((((.((....(((.(((((.((....)))))))))..)..))......(...)...(((((((....(((....(((......)))....)))..)))))))))))..)))..)).)))))....)..))))))))............))...)).).))....).).)..)....))))..
|
| [ predicted structure ] |
...((((.....))))..(((((.......(((((((....((((....(((.(((((.((((((((...........((((((.......(((((....(((..(((((((((((....(((((.........))))).........)))))).........(((((((...(((...((((......))))...))).))))))))))))..))).....)))))..(((....)))))))))))))))))))))))))..)))).))).))))....)))))...
|
|
SRP_00266
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((..(((((.((((......((((....(((....)))....))))....))))...)))))...)))).)))))))))).....
|
|
SRP_00267
|
[ FASTA input ]
|
ACGGAGUGUCGUGGCGGGCACUUGUGAGCCAGCUUCUAGGCCGUAGAUUAUGGUGGAGAGAGUGAGGGAGGGAUCCCUGGUCGGAAUUCGGUCUACGACGACCGGGCGUCCGUGCCAAGCGAUGCGUCACUAGGGGGUAAGACUCGGAAGGGUCUCUCUCCCGGGUGGAAAAGGACAACCGUAUGGCUCAGGCCCGAAAGGGAGCAGGCAAAAGGUUGCGCGCGUUGACAGUGGCCGGAUAGCGUCUGCGAGUAGAUCGACCUGAACAGCCCUUCUAAUACCUCUCGACCCAUAAUCGU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((.((((..((.(.(((((..(...(((((((((..((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))..)..)))).))...))))))).).)))))).)).)))).)))))))))).....)))))...))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((.[[[[.)))))))....]]]](((....)))....((((((((..(((((.....(((((((....(((.((((...(((((((((......((((((((((.((((..((((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).))))))))....)))))))...)))))))...))))))))).)))).)))))))))).....)))))...))))))))..
|
|
SRP_00268
|
[ FASTA input ]
|
GUUCCCCGUGCGGCGGCACCUGACUGAACUCCCCCAGGACCGAGAGGUAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUACCGGGUGCGCGGGGAGCCCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((..[[[[.)))........]]]](((....)))..(((.[[[[[[)))..]]]]]]...))))))))))))......
|
|
SRP_00269
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGGGCCCAUGCGGCUUCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAAUCUGGCGUGGAUUCCGGGUCACCUAAA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((((.((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))).)).))))))..)))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((...(((((.((((...((((((....)))))))))).(((...........))))))))....))))))..)))))))).......
|
|
SRP_00270
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGGACCCAUGCGGCCGCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCGUGACAGGCGUGGACUCCGGGUCACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((.(.((((((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).))))).)..))))))..))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.(((((((((.......(((...((((((....)))))).)))....))).((((((...))))))....))))))..))))))))...
|
|
SRP_00271
|
[ FASTA input ]
|
CUCGGCCUUUCGCGGUUUUAACGCCCAAACCUGGUCAGGAUCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAGGCAGGCGAG |
|
[ reference structure ]
|
........(((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..)))))
|
| [ predicted structure ] |
...((((.[[[[[(((((........))))).))))...(((....)))....(((.((((.....)))).)))..]]]]]
|
|
SRP_00273
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((((((.(((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))...))))))...)))))...)))))))))))))))).......
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((.((((((((..(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))...))).))))).))))...)))))))))))))))).......
|
|
SRP_00274
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGGCACCACCUAUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((((((.((((((.(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))...)))))...))))))))))).))))........
|
| [ predicted structure ] |
((((.(((((((((((((((.((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).))))...))))))))))).))))........
|
|
SRP_00276
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCAAAGCCGCUCCCAGAAGCCGAGGUCGAACGAUGAGUCCUCGUCCCGCGGGGUGCCCGGUGGGGGAGGCACGGCUGAAGGGCCGUGCUAACCCCCUUUGGGCCCCGAACCCCGCAAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGGGCCACGGAGCACGCUCGCGGGGGUGCGGGGAUGAGAUAGGCCUCGGUGGAUGGGAGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCCGCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((((((((..((..(((...((((((((((...(((((((((.(.(.....((((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))).))))...))))))...))))))))..).).)))))))))...))))))))))...)))..))..)))))))))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..((((.(((((.[[[[[[.)))))............]]]]]]........))))...(((((((((......(((...((((((((((...(((((((((.........(((((((((((((((((((((((..(((((.(((((((((....)))))))))..)))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))).)))).))))))))...))))))))......)))))))))...))))))))))...)))......)))))))))..))))))))))
|
|
SRP_00278
|
[ FASTA input ]
|
CGGGUAGGGCCGGGGGCUCGCCCUCCCCCGAGCCCCGAAAUGGGCGUAAUGCGGGGGCCAGUAACCCGCACGUCGGCCGUAGUGGUCCAGGGCAGACCCGGCCGACCCAUGACCCCCGUCCCGCGGGGCCGGCGGCGCGGAGCCCCCUCCGGAGGGAGGGAGGCUACCGCCCUUACCGGGGGAACCAGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCUAACCCCGGACGCCCGGCGUUCGCGGGGCCACGGGGUGAGGCAACGGCCGGGCCCCCUGCCCUGGGCCCCUACGGCUGGCGUGCGGGGGCCGC |
|
[ reference structure ]
|
(((.(..(((((((((.......))))).....((((.(..........).)))))))).....((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((..((.(...((((((((((((.(.(((((((.((((((((((((((....)))))).)))).))))..)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)).)))))...))))))...)))))).).))...))))))))....)))))))))))).))))))))))))))))))).))).
|
| [ predicted structure ] |
(((..[[[[)))........]]]](((((..((((......))))....[[[)))))...]]].((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.......(((((.(((((((((((((((....((((((((((((((....)))))).)))).)))).....((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....))))).))))))))))...))))).......))))))))....)))))))))))).))))))))))))))))))......
|
|
SRP_00282
|
[ FASTA input ]
|
ACUGGAAAGUGUAACGUCUUUCUGUAAGCAGAGUUGCAGUCUAUAAAAGGAUGAAUUCAUCUGUUGAUGGAAUCACGGUAUAUUCAACGCUUUGUCGAAAUUAGUGUCUUCCAGAGUCUAGUGUCAACAUUCUAGUUCGGGCGUAGGCCUGAGUUAGGAGGUUGUUCAAUACUGGGGAACCGCCCGAGGGUAGCAAUACAGCAGGGAAAACUCAGAGCACUGGCACGGCUGUAAGAUAGCACAAUGGAGAAGUGAUUGGAUAUACUACCAUUGCGGGUGGGAACUCCCUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((.(.....).............))(((...........((((.....((.(.((((.......((.((......)).)).....................(.(((((((.(((.(.(((((((.(..(((....(((.(((.((....)).))).))))))..)......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).)...)).)))...)))).).........)))).).....)).....)).))...........))).....
|
| [ predicted structure ] |
..((((...((((((.....((((....)))))))))).))))........(((.((((((....)))))).))).(((((((((((((((((...........((((((.(((...(((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).....))).))))))..........)))))).))))))))))).(((....[[[))).....]]].......
|
|
SRP_00284
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGUAGUGGGCAUUGUACCUGUUUAGUCGGUCAGGUCUGAAAGGAAGCAGCCAGAGUGGGAUUCGAUGGGUCAUUACUAGCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((((..((((((...(.(((....(((....)))....))).)))))))...)))))..)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((........((((....[[[[[.))))(((....))).....(((...)))...]]]]]...)))))))))))....
|
|
SRP_00285
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGUAGUGGGCAUUGCUCUUGCUUAGUUGGUCAGGUCUGAAAAGAAGCAGCCAGGGUAAGAUUCUGUGGGUCAUUACUAGUAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((.(.(((((((...(((((....(((....)))....))))))))))))..).)))..)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.(((...((((((((...((((....(((....)))....))))))))))))....)))..)))))))))))....
|
|
SRP_00286
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUGUAAUGGCUUUCUGGUGGGAUGGGAUACGUUGGGAAUUUUGGCCGAGGAACAAAUCCUUCCUCGCGGCCAGACACGGACUGCACGCCCUUUGGGCAAGGGAUGGUUCUCCAUCUCGCACCGUGCCCUGUUGUGGCAACCGUCUUUUCUCCGUCGCUAAUUUGUCCUGGGCAGAAAUGUCUGCUCGGAGGCGGGGGAGUCCGGUCUGAAGUGUCCCGGCUAUAAUAAAUCGAUCUUUGCGGGCAGCCCGUUGGCAGGAGGCGCGAGGAAUCCGUCUCUCUGUCUGGUGCGGCAAGGUAGUCCUGGGUCCCUUUGGGGCUCCACCUUCACCGCUGUUAGGGGAGUUUUAUCCAGCGGCAGCAAAGGUGACCCGUGAUGGAGGCGGCCGGGAUAGCACAUAUCAGUCGGAUAAUCGUGCAAGUUGAUCGUUUCGGCGGUCUAAUUUGGCGGUGCCAUCAGGAUUUACUCGCACAUUGUGUUCGUUCCCUCGGGGACGAGUGUGUAUCCUGAACCACAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......))))....((((...((.(((((((((((((((((((((.((...(.....)...)).))))))))(((((.......((((...))))..(((((((....)))))))...))))).((((..(((((.((((((....(((((((.........(((.(((((((....))))))))))))))).)).(((((((.(((.(((((((((((............((((((((((..((((((((((.(((((((.((....)))))))))..))).)))).))).....(((((((((...))).)))))).((((((....(((((....(((......)))....))))).)))))).))))))).)))...)))))))...))))...)))))))))).....((...((((.(((...))))))).))....)))))))))))))))))))..)))(((...))).(((((((....))))))))))))).)).....))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....)))))......(((((((..((((..(((...(((((((((((((.......)))))..))))))))(((((..(((..((((...))))..(((((((....))))))))))))))))))...))))....)))))))(((((((((.....[[[[[.(((((((((....))))))))).)))))))))..((((...........)))).....]]]]]....((((((........[[[[.[[[[[[[[[[[))))))...]]]]]].]]]]]....]]]]...(((......(((((((...)))))))[[[[[[.)))((((((...(((......)))...)))))).]]]]]].((((..........[[[)))).............]]].....(((((.((((((((((((....)))))).)))))))))))....(((((((.(((.((((...))))((((((((....)))))))).))).)))))))...........
|
|
SRP_00287
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUGUAAUGGCUUUUAGUGGAACCAAGUAUUUUGGGAUAUUUGGCCUGGGAACGAAACUUCCUUACGGUCAGACAUGGAUUGCACGUUUCGUCUUUGGCGGAACAAGGGGUUUUGCCAAGUUUUGGUAGGGUUCUGCGCCAUGCCCUGUUGCUUCAACCGUCUUCCUGAACCCGCCUGUUAGGGCUUGUCUCGGCUGGUGUAGUUUUCUGUGCCAGUUGGAGGGUUUAGGGCUCUGAGUUAACGUGUCCCGGUUUAACAAUCAAUCGAUCUUCGCGGGUUGCUCGUUGGCAGACAGCGCGAGAAAUCCGUUGUUUCUGUCCGAUGCGGCAAUGUAAUCUGGUCAUGUGACCUCGCCUUGACCGCCAUUAGGGGAGAUUCAUCCAGCGAUGGCAAAGGCGACCCGUGAGAGAGGCGACUGGGAUGGCACUGUUCUUAGGGUUAACAAGUACAAGUUCGGUUUAUUAUGGACGGUGGAGUCUGGUAUUUCCUACCACAUGUUGGGUGUAAACUACUCUUAGGAACCACUAACU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......)))).((((((.....(((((((..((((((((((((..((...(....)...))..)))))))(((((.(.....(((((((.....)))))))..(((((((...............)))))))..)))))).............((((..(..((((((((.((................(((((((((((....))))))))))))).))))))))(((((((((..(..(((((((((((..............((((((((((((((((((((((((((((((.((....))))))))))..))).)))).)))))........(((((..)))))(((((((....(((((....(((......)))....))))).)))))))))))))).)))...)))))))...))))..).)))))))))...........)..)))).)))).)...(...)..(((((((((.(......).)))))))))..))).))))........))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....)))))(((((((.((((........(((...(((((((.(((((......)))))...)))))))(((((..(((..((((((((...))))))))...((((((((((((...)))))))))))).)))))))))))....((((((.((((((.(((((((((((((....))))......(((((((..(((....)))..)))))))..)))))))))((((((((.....((((...((((....))))..(((...((((((((((((((((((((((((((((.........)))))..)))).)))))).)))))........((((....))))(((((((....((((((...(((......)))...)))))).))))))))))))))).....)))........))))....)))))))).(((........)))...........)))))))))))).))))..(((((((((.....)))..(((...)))...)))))))))))))..
|
|
SRP_00290
|
[ FASTA input ]
|
AGAGCUGUAAUGGCUUUUGGUGGAACCAGGUGUCUCGAGAGUUCUGGUCUGGGUUCGAAUCCUACGGCCGGACGUGGUUGCAAUUAUACAACUCUUUGUGGGUUGGCGCCGCGCCCAAGCUCAACUGCACUUCCUCGUAAGAGGAGCCGAGUUUUAGACGUGUCCCGGAUUAUAUCGAUCUUUGCGGGGAGUCCUGGGCGAGACAUGAGAAGUCUGUCUUCGCUUAGGUACGGCAAUGGUACCACACGACGCACCUUGUGUCGUUGUGUGGUUUUCGCAUGCUCCUUCCGCUGAAGGGGAGUUUCAUCCAGCACAGCAGGAGUCACCCGUGAGGAGGCGGCCGGGAUGGCACUCGUCCUCGGUAUCAUUAAGCACGGCGGUGGGUUGGGAUUUCCUCGGGGCAUUUAGCCUCUGUUGGACACCUUAGGAACUACCAAAGUAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))((((((..(.((((((((.(..((((((((((..((........))..)))))))((((((..........((((((.....))))))..))))))...................((((....)))).((((((...(.((.(((((((((.(........((((((((((....(((((((((((((.((....)))))))).))))))).............(((((((((((((...))).)))))))))).........(((((....((((....(((......)))....)))).)))))..))))))))))...).)))))...)))))))..))))))...)))...)..(((((.((((((((..((((..))))..)))))))))))))))))))))..)...)))))).............
|
| [ predicted structure ] |
...............((((((((....((((((((.(((...(((((((((((.......)))).)))))))((((((..........((((((.....))))))..))))))(((((.((((.((((...(((((....)))))((((((.....((((((((((((......(((.((((((((((....(((((((((((((.........)))).)))))))))...((((.(((.((((((((((((((...))).)))))))))))..)))..))))..((((((((....(((......)))....)))).))))...))))))))))..))))))))))).....)))))))))).............))))))))))))).....)))(((((.....)))))....))))))))......))))))))...........
|
|
SRP_00292
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUGUAAUGGCUUUCUGGUGGAAUGGGAUACGUUGAGAAUUUUGGCCGAGGAACAAAUCCUUCCUCACGGCCGGACACGGAUUGCACGCCCUUUGGGCAAGGAGUAGAAUUUCUAUUUCGCGCCGUGCCCUGUUGUGGCAACCGUCUUUCCCCCGUCGUUGGUUUGUCCUGGGCAGAGCUGUCUGCCCGGAGGCGGGGGAGUCCUAUCUAAAGUGUCCCGGCUUAAAUAAAUCGAUCUUUGCGGGCAGCCCAUUGGCAGGAGGCGUGAGGAAUCCGUCUCUCUGUCUGGUGCGGCAAUGUAGUUCUGGGUCCCUUAGGGGCUCCACCUUCACCGCUGUUAGGGGAGUUUUAUCCAGCAUCAGCAAAGGUGACCCGUGAUGGAGGCGGCCGGGAUAGCACAUAUUAGUGGGAUAAUCGUGCAAAUUUAUCGCUUCGGUGGUUUAAAUUGGCGGUACCAUCAGGAUUUACUCUCACAUUGUGGUCAUACCUUCUGGUGUGAGUGUGUAUUCCAAACCAUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......))))...(((((...((.((((((.((((((((((((((.((...(.....)...)).))))))))(((((.(.....((((...))))..(((((((.....)))))))..)))))).((((..((((..((((((....(((((((.........(((.(((((((....))))))))))))))).)).(((((((.(((.(((((((((((............((((((((((..((((((((((.(((((((.((....)))))))))..))).)))).))).....(((((((((...))).)))))).((((((....((((.....(((......))).....)))).)))))).))))))).)))...)))))))...))))...)))))))))).....((..((((..(((...))).))))))....)))))).))))))))))))..)).(((...))).(((((((....))))))))))))).)).....))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....)))))...(((((..((((((((..(((((..(((((((((((((.......))))))..)))))))(((((..(((..((((...))))..((((((((...)))))))))))))))).((((..((((..((((((..(((((((((...........(((((((((....))))))))).)))))))))((((((.......((((((((((...........(((...(((((..((((((...(((((((((.........)))))).)))....))).)))...........(((((((...))))))).....(((((((((.....(((......))).....))))...)))))))))))))......))))))))))...........)))))).........((((((((((....))))..)))))))))))).))))))))......)))))........(((((((....)))))))....))))))))..))))).....
|
|
SRP_00294
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUGUAGUGGCUUUCUGGUGGGAUGGGAUACAUUGGGAAUUCUGGCCGAGGAACAAAUCCUUCCUCGCGGCUGGAUUGCACGCCCUUUGGGCAAGGGGUGGUUUUCUACUCCGCACCGUGCCCUGUUGUGGCAACCGCCUUUUCCCUGUCGUAAAUUUGUCCUGGGCAGAGCUGUCUGCCUGGAGGCAGGGGAGUCCGGUCUGAAGUGUCCCAGCUAAAAUAAAUCGAUCUUGCGGGCAGCCCGUUGGCAGGAGGCGUGAGGAAUCCGUCUCUCUGUCUGGUGCGGCAAGGUAGUUCUGGGUCCCUUAGGGGCUCCACCUUCACCGCUGUUAGGGGAGUUUUAUCCAGCGUCAGCAAAGGUGACCCGUGAUGGAGGCGGCCGGGAUAGCACAUAUCAGUCGGAUAAUCGUGCAAGUUGAUCGUUUCGGCGGUUUAAUUUGGCGGUGCCAUCAGGAUUUACUCGCACAGCCAUUCCCUUGGGAAUGAGUGUAUUCUGAACCAUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......))))...(((((..(((((((((((((((((((((((((.((...(.....)...)).))))))))(.....((((...))))..(((((((....)))))))..)......((((..(((((.((((((....(((((((.........(((.(((((((....))))))))))))))).)).(((((((.(((.(((((((.(((............(((((((((..((((((((((.(((((((.((....)))))))))..))).)))).))).....(((((((((...))).)))))).((((((....((((.....(((......))).....)))).)))))).)))))))..))...))).)))...))))...)))))))))).....((..(((((.(((...))))))))))....)))))))))))))))))))..)))......((((((....)))))).))))))))))..)))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.....)))))...(((((..(((((((((((......(((((((((((((.......)))))..)))))))).(((..((((...))))..(((((((....))))))))))..((((((((..((((((.(((((..(((((((((.........(((.(((((((....)))))))))))))))))))((((((.((((.(((((((.(((.......(((((((((((..(((..(((..(((((((((((.........)))))).))))))))))).))))))).....((((((((((.((((((((.(((...........)))))))))))..............)))).))))))))))......))).))).....)))).))))))))))........(((((((((((....)))).))))))))))))))))))))))........))))...((((((....)))))))))))))))))..)))))....
|
|
SRP_00295
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUACUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAUGACGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCAGGGCCCCCACCCAAUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((((((.((((...((((((.....(((....(((....)))....)))..))))))....)))))...)))))...))))))))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......(((((..((((...(((((((....(((....(((....)))....))).)))))))....))))....)))))........)))))))))))........
|
|
SRP_00299
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGCGUGGUGGCGUGCGCCUGUAAUCUAGCUACUUGGAGGCCAGGGUGCGGGAUUUCGUGGGACCGGGAGUUCUGGCAUAUGGGUGCUCAUGUUGAUCGGGCGUCCACGCUAAGCACGGCGCCGAUAUGGAUGAGCUGUCGGAGGACGGGUUGUCCAGGUCGUCUAAGGAGGGGCGGACCGGCCCAGGGGGGAAACCCAGCAGGCAAAAGUCCCCGCGUGGUGCGGUAGCGGGAUAGCGCCUGUGAAUGGUGUCCAUGUGACAGCCCGGUUGGCGCGUGAAGACCGCCUCCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((.((((..(((.....(((((((....(((.((((.((((..((((.((...(((((((((.(((((.((((.((((((((.(((((((.(((((....))))).))))))).))))((...)).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))))))...))))))).)))))).)))).)))).)))))))))).......)))..)))).))))...
|
| [ predicted structure ] |
.........((((((....[[[[........))))))...]]]].((((.((((.....((((.(((((((....(((.((((((((....(((......(((((((...(((((.((((.((((((((.(((((((.(((((....))))).))))))).))))(((....)))...((((..(((....(((....)))....)))....))))..)))).))))..))))).....)))))))...)))...)))))))).))))))))))..))))......)))).))))...
|
|
SRP_00300
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGACGUAGCGGUGUGCGUCUGUAAUCCAACUACUAGGAGGCCGGGUAUAUGAAUGGUUUGAGAUGAGGAGUUCUGUGAGCAUUGCGCCUAUGUAGAUCGGAUGUCCACAGUAAGCUUGGCGUCAACAUGGUUAUAUUGUCGGAGGAUAGAAUACCCAGGUUGUUUAAUGAGAGAGGUAACGGCUCAGGGGAGAAAUCCUGCAGGCAAAACUCUCCACGUCAUUCGGUAUUGGGAUAGCAUCUGUGAAUAGAGCAGUGUUGGCAGCCUCAUCAAUAUGACCAGACUCGUACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((..(..(((((...(((((((....((((.((((((((.(.....(....(((((((((.(((((.(..((((((((((.(((.(((.(((((....))))).))).))).))))(.....).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))..)..)))))))...))))))).)....).)))))))).))))))))))).....)))))..)..))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((......)))))))(((.[[[...)))..]]]....((((((.....(((((...(((((((....((((.((((((((..((((.(((((....(((((.(((((....((((((((((.(((.(((.(((((....))))).))).))).))))........(((((......(((...((((....))))...)))....))))).)))))).....))))))))))..)))))...)))).)))))))).))))))))))).....))))).....))))))...
|
|
SRP_00301
|
[ FASTA input ]
|
CGCUGUAAUGGCUUGGUCGAAGUGUUUAGUACUCCCAAUAGUGCAUGUUCGGUGGUCUCGGGUUCGAGUCUCGCUUUCGAUCCCUCGAUCUGCCACGUCUGUUCGAAGAGUAGUCUUCGUGGCAACUGGCAGUUAAACCGUGUAGUACCGAUGGAGGUUGGAAACAAUGCACAUCACUACCGGGUCUUGGGCAGUGCGAUAGCGAUGGGAUUCACCUUCGCAGGAUGUGCAUGGAAGUAUAAACACAACGGUCGUU |
|
[ reference structure ]
|
.((.......)).((((((..((((((.(((((.((....((((((((((.((((....((((..((((((((((.(((..(((..(((.(((((..(.(.(.((((((....)))))).)).)..)))))((...))(..((((....((((....(((....)))....)))).))))..))))..))).....))).)))...))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))))..))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((..((((...))))..(((((((.((((.......((((((((((.((((....((((..((((((((((.(((..(((..(((((((((....((((((((((....)))))).))))..)))))).....(((.(((((...((((...((((....))))...)))))))))))))))..))).....))).)))...))))))))))))))).))))))))))...))))))))))).)))))....
|
|
SRP_00302
|
[ FASTA input ]
|
UGACUGUAACGGUCAUAAGCCCAAGACGAGCCCACACUCCCAAUUCUUCCACUCAAAAAUCUCAAUCUAACGAUUGAAGCUACCAACAGUGCCCAGUCCGAACACCGCGGUGACAGUCCACUCGUGCGGGAAACCCACGAUGCUGGUGUUGUCUUGAGCAAUGAAGAUGAUUUCUUGAGGGAGGUUUCACUCUGCAGAGAGCUCUUCACCUUAGUGUGGCGGUAUUGAAUUACAUUUGUUGUGUGGUUUGGAGAGGGGAUUUGGGUUGGGUCUCUACUUUUGCAGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((.......)))).((...(.(((.(((..(.((.(((.((((.(((..((.((...(.((((((....)))))).)...(..(..(.(..((((.(..((((.(.((..(..(((((.(((((.((....)))))))))..)))..)...(...)...((((((....(((((....(((......)))....))))).)))))))).).))))....).)))).....)...)..)..)....))))...))))))).))).)).)...)).).))))...))..
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((.(((.....)))......(((((((....(((((....(((.(((..(((((((((((....))))))......(((((((((.(((....((((((((((((......)))(((((.........)))))))).))))))...))).))).((((((...(((((....((((......))))..)))))..)))))).............(((......)))..))))))...))))).))).)))...))))).)))).))).....))))))))..
|
|
SRP_00303
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCCUAGGGUCCCCCCGCAAUGAUAACUUGUGAACUCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAAGCGACUCGUGUGCCGGGGUGUCGGCUCUAGGGGAACCUCCAAAU |
|
[ reference structure ]
|
(((..(((((((.(..((((((.((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))))...)))))....).)).)))))..))).......
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((((((((((((.(((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..))).......
|
|
SRP_00307
|
[ FASTA input ]
|
AGAGAUAUGGUUGUGCCAAGUUUAGUCAUGUGCAAUAGCGAAUAUGGUGUAGAUCAUUGAGGCAUCUGCUUAAUGUGAUGGGGAAUGCGUCAGGACGGCAACGUAGCAGCGAGUAACCGUCAGCAUGAUUAGUACCGUGGAAUAACAUAACCUAGUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(..(.(...(((((.(...((((((((((((...((.((....(((((....)))))....))))..........((((((....(.(((....(((....)))....))).)...)))))))))))))))).)).)....)))))...).)...).....
|
| [ predicted structure ] |
........((((((((((...((((((((((............(((((....)))))..((((....))))....((((((......(((....(((....)))....))).....)))))))))))))))).....))).....))))))).........
|
|
SRP_00308
|
[ FASTA input ]
|
CCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUUCCCUGUACUCGAAAUCCGCUUUAUGCGAGGCUUAAUUCCUUUGUUGAGGCCGUAUUUUUGCGAAGUCUGCCCAAAGCACGUAGUGUUUGAAGAUUUCGGUCCUAUGCAAUAUGAACCCAUGAACCAUGUCAGGUCCUGACGGAAGCAGCAUUAAGUGGAUCAUCAUAUGUGCCGUAGGGUAGCCGAGAUUUAGCUAACGACUUUGGUUACGUUCGUGAAUUACGUUCGAUGCUUAGGUGCACGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((((((.(...).))))))...((((.(..........).))))))))....(((..((...((.(((...((((((((....((.(((((..((((((......((((((((((((((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..)))))))...))))))...)))))))))).))).))).)))))))....))))))))..))).))...))..))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....((((((..[[[[[))))))...........]]]]]......(((.[[[[[))).....]]]]]...(((....)))(((((((.....((((((...))))))..)))))))(((((..(((..((((....))))......(((((...)))))....)))[[[[.....))))).......]]]](((((.(((((((((..............)))))))))..[[[....)))))..]]].........))))))
|
|
SRP_00310
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCAACAUUUACUCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUGCUAAAUGUGUGCUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..).))))))))..))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))).))))))....
|
|
SRP_00312
|
[ FASTA input ]
|
GCCCCUCACGUGGCGCUAUCUGACUGAACUCCCCCAGGGCCGGAAGUCAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGCGCUUGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(.(....).).....)))..))))))...))))).)..))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((............(((.....[[[))).((((((.((((((........))))))))))))]]].)))))))))))......
|
|
SRP_00315
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCAACAGUUCUGCGUGAAGCGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUGAAUUGUGUGCUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)..))))))))..))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))).))))))....
|
|
SRP_00317
|
[ FASTA input ]
|
ACUGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAAGUCGGGGUUGGUGGAUCGUUUGAGAGCGGGAGUUCUGUAUGUCGUCGCUCUAUGGCGAUCGGGCGUCCAUGCUAAGCUCGGCAUCGAUAUGGUUGAUUGGUCGGAGGACUGGCCAACCAGGUCGUCUAAGGAGGGACGUACUGGCCCAGGGCGGAAACGCAGCAGGCAAAAGUCCCCGUGUGGAGCAGUAGUGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGCGGCUUGCAGCCCGUUCAACAUAGUGAGACCCAAUCCUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((((.(((((((((..........(((((((((.(((((.((((.((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))((...)).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))).))))..)))))))...)))))))......))))))))).)))))))))))).....)))))...)))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
...((((((...[[[..))))))....(((((....))))).]]]((((((((......((((..(((((((....(((((.((((((((.((((......((((((((((((((..((((.((((((((.((((((....(((....)))....)))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).)))))))).)))....)))))))...)))))))))))).)))))))))))).........)))))))))))).....
|
|
SRP_00318
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCAACACUUGUGCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUUCGGGUGUGUGCUCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)...))))))))..))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...))).....))))))).))))))....
|
|
SRP_00321
|
[ FASTA input ]
|
AUGGUCAGGUAGGGUGGAGGGUCUCGCCAGCCCUUAUACCCACAUGGCGCAACGUGGGCACCAGUAACUCCUAUGCUAUAAUACCUGCUCUUCGAGAUCCCAGUCUAACUAUGAUCAUCGCCCGACGGGGCGAGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUCCGCGUUCGUCGGUCUCCGAUAGGAGGAAGACUGGGGGUAAAUCUCGGGGAGUAAGGGUUAUGGCAUAGGGGAGCUGACCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.(..((((((((((.......))))))...(((((..........))))))))).....(((((((((((((((.(.(((((((((((.(((((((((..((....(.((((.((((((.(.((.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).))))).)..(((.((....(((.....(((....))).....)))..))))).)))))))...))))))....)))))...)).)))))))))......))))))))))).).)))))))))))))))).))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((((((((((.......)))))).)))))...(((.............)))....(((((((((((((((...(((((((((((((((((((((.....(((...))).(((((((((((.((((((((((((((((((((((....)))))))))).))))).....((((.....)))).....(((....))).(((....)))..)))))))))).))))))))(((((....))))).)))))))).....)))))))))))))...)))))))))))))))..))))))))
|
|
SRP_00322
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCAGGGAGGGUGGGGGAUCUCGCCAAUCCCUAUUACCCGCAAGGCGUAAUGCGGGCACCAGUAACUCCUACCCUAUGGUGUCUCCUAUCUGUAGGUCCCAGUGGAGCGAUGAAGCCUGCCCAGCGGGGCUUGGCGGUCAUGGGCUUUCUCUCCGGAGGGAGAGAAAGUACCAUGAUAGCUGGGGGAAUCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGUGCCUGGACGCCAGCGUUCGCUGGUCAACAGCCAGAGUGAAACUGGGGUAAACCUAUAGAUAGGUAGGCCAUGGGGUAGGGGGUCUGGCCCCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((...((((((((((.......))))))....((((((........)))))))))).....(((((((((((((((.(..(((((((((((((((((((...((......(.(((.((((((.(.((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..(((.((....((((....(((....)))....))))..))))).)))))))...))))))....))).)...))...))))))))....))))))))))).).))))))))))))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..(((..[[[[[[)))....]]]]]]....((((((........)))))).........(((((((((((((((....(((((((((((((((((((...........(((.((((....))))..))).((((((((((((((((((....))))))))))).))))))).((((.(((...((((....(((....)))....))))..)))....((((((....))))))...)))).........))))))....)))))))))))))...))))))))))))))).)))))))))..
|
|
SRP_00323
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCGGGUAGGGUGGGGAGUCUCGCCAGCUCCUGUAACCCCGUGGCGUAAUGGGGCACCAGUAACCCUUAUGCCAUGAUACCUACCUCUCUAGAUCCCAGCUGAACGAUGAGCACCGCCCGGUGGGGCGAGACGGACGCGAAUCUCCUCUCUGGAGGGAGAGGGGAUAUCGCGUCAACCGGAGGAAUCGGCCAGGUCCGGAAGGGAGCAACCGUGUCCGGCCGUCCGCGUUCACCGGUCACCGGUGUGAGAAAGGCUGGGGGUAAAUCUAGAGAGGAAAGGAUCAUGGCAUAAGGGGGCCGACCCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(..((((((((((.......))))))....(((((........))))))))).....(((((((((((((((.(.(.(((((((((.((((((((...(..(..((((((.((((((.(.((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..((((.(....(((.....(((....))).....)))..))))).)))))))...))))))....))))))).)...))))))))......))))))))).).).)))))))))))))))).)))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((((((((.......))))))....((((((......)))))))))).....(((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((.........((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))).))))))).))))))))....))))))......))))))).....)))))))))))..))))))))))))))))))..)))))))..
|
|
SRP_00324
|
[ FASTA input ]
|
CUCCACCAGUCCGCUAGCGACCCUGCGGAAACGCGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCGCACCGCCGGGUCGCUAGGUGGACAGCCUGCAGAUGUGGCGGAAUUGG |
|
[ reference structure ]
|
((.((.(.((((..((((((.(((((((....((((....(((....)))....)))).))).))))))))))))...)).)..)).))...............
|
| [ predicted structure ] |
.(((....(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).)))))))).))))))).(((.........)))))).....
|
|
SRP_00325
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGGACUCAUGCGAUUACAACGCCCAAAUCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAGGGAUGCUUGUGGUAGGCGUGAACUCCGGGCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.((((((.(((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....)))))))..))))))..))))))))
|
|
SRP_00326
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGGGCCAUGCGGCUCGGACGCCCAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCAGAGCAGGCGUGGACUCCGGGUCACCCAACU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.((((.(((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).)).))))..))))))..))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((.((((...........((((((....))))))...(((((...........))))).))))..))))))...)))))))........
|
|
SRP_00328
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUAGCAAUGCCUGUGACCUCGUGUGGCAUAAACAAUGUAGUUAGAAUAGUCAGAGUAUGAGAGUUUGAUGAGACAGUUUGCUAAGAGUGUGCCCGUUCCAAACAGUGAGUUGCUAUGGUGGAAACCUAGUAAUAGGACUUCACCAGGGCAUUAAAGAGCUGAGGAACCGCCUCAGGCUGGCAACAGAACAGGGAAAACUUGCCGCUUAUUGUGGUGGAAGGAUAACAUACUCAUUAACUGUCAAGCUAAUCGGUUCUGCUAUUCUGAUCAGACACU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....)))))....(.(.).)))))..........(.((((.....(..((.(.(.....(((.(.(..(((((((.(....(((((((.((.(((((.(((((((((((((.(((((((..((((....))))..))))))).))))((...))(.((((......(((....(((....)))....)))....)))).))))))))))..)))))))....))))))).).))))))).).).)))....).).))..).))))..).....
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((....))))).........[[[)))....]]].....((((((((((.((((((.....((((((((.(((...))).....(((((((....(((((.(((((((((((((.(((((((..((((....))))..))))))).))))........((((((.....)))))).(((....)))..((((.....))))..)))))))))..)))))......))))))).......)))))))).....))))))))))))))))........
|
|
SRP_00329
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUAGCAAUACCUGUGUCUAUAUGUGGCAUAAACAAUGUAGGUUGUGAUAGAUAGGAUAUGAGAGUUUGAUGAGACAGUUUGCUAAGAGUGUGCCCGCUCCAAACAAUGAGUUGCUAUGGUGGUAACCUAGUAAUAGGACUCCACCAGGGCAUUAAAGAGCUAAGGAAACGCCUCAGGCUGGCAACAGAACAGGGAAAACUUGCCGCUUGUUGUGGUGGAAGGAUAACAUACUCAUUAACUGUCAAACUAAUCGGUUCUACUAUCAAAGCCAGACAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....)))))....(.....)))))......(...(.((((......(((((.(.(.....(((.(.(..(((((((.(....(((((((.((..((((.(((((((((((((.((((((...((((....))))...)))))).))))((...))(.((((......(((....(((....)))....)))....)))).))))))))))..)))).))....))))))).).))))))).).).)))....).).)))))..)))).)...).
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((....))))).........[[[)))....]]].....((((.((((((.((((((.....((((((((.(((...))).....(((((((.....((((.(((((((((((((.((((((...((((....))))...)))))).))))..........(((......(((....(((....)))....)))....)))...)))))))))..)))).......))))))).......)))))))).....)))))))))))).)))).......
|
|
SRP_00330
|
[ FASTA input ]
|
UAUUGCCAGACUUGGCCGGGGGGUUAGGCGUCCCCUGUACCCGAAGUCUAGAUGCGGGGGCGACAGCCCGGUGAGACCACCUGGGUUUCUGCCAGGCCCUGCGGAAUCAAUGAUCUCCUGUCCCUCUGGAUCGGAGGCCCAUGGACACGAUCUCAAAGGAGAACGCGCCCAUGGCUUGCCAGGGGAACGCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGACACCCUGGACUCUCGAUGCUGGAGGGGUGCGGGGGUGAGAGGAAACAGGGGGUACCUGACAGGACGCCCAGACCGAACCGGGUGUGUCUGGCUUCUGAUCGGC |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((.(.((((((((((.....)))))))...((((...........))))))).)..(((((((..(..(...(((..(((((.((((.(((.(.(..((......(((((((((((((.(.(((((((.((((((.(.((.((((....)))).)).).)))))).)..((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).))).))))...))))))..)))))))...)).....).).)))..)))).)))))...))))..)..)))))))..)))))))...........
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((....((((..((((.((((((((((.(((((..........((((((((((..(((((((((....)))).)))))..)))....)))))))..(((...))).......(((((((((((((((..((((((......((((....))))......))))))....((((((............(((....)))..........)))))).))).)))).))))))))......)))))..)))...((((.....))))...)))))))..))))...))))....)))))))...........
|
|
SRP_00331
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGGCUUAUUGCUGUAACUCCGGAGGCACGAGUGUGAACAUGAGGGGGUGUAUUAGUUCGCGGGUUAGCCGCGCCUGUCUGCUGGACGUCUGAGUCGAUUGCGGGCUCUAGUGUAAGCUUGAGCUCGCGGCCGGUGCGGUUCGGCGGAACGCUCCAGGCUGGUAACAGAGCAGAGAAAAGCCGACGCUUUGACUGGCCAGCAGACCGCAGGUGUAUCUCAACCCGUCCAGACUUCAAAUGCAUUGUACCCACCAGGACAUGCUCGUAUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.....)))....((..))))))(.((((((((.((((...(((((((.(.(...(((((((.(..(((((((((((((((..(((.((((((.((((((((((.(((....))).)))))))))).)).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).)))...)))))))...))))))))...).))))))).......).......).))))))).......)))).)))))))).).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....)))...[[[[...))))..]]]]..........(((.(((((((((((.(((((((....(((((((((((((((..(((....(((..(((((((((.(((....))).)))))))))..))).(((..(((((......(((....(((....)))....)))....))))))))...)))...)))))))...)))))))).....)))))))...))))...)))))))....))).......................
|
|
SRP_00332
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGUCGAUACGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCGAAGCCGUUCCCGGAAGCCGGGGCACAACGGUGAUCCCUCGUCCCACGGGGCCGGCGGUGGGCGGGGUCCGGCUGGAGGGCCGGGCUAACGCCCUUUGCCCGCCGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGCGGGACGUUCGGCGCUCGUGGGGUAGCGGGGGUGAGCGAGCCCCGGUGGAAGGGGACGGUGGAGGGUCCCCACCCCCGGGCGCGCCCGCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((..............))))))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....((((((((.(..(......(((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))).))))...))))))...)))))))...).).))))))))....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((..((((.(((((.[[[[[[.)))))............]]]]]]........))))...(((((((((......(((...(((((((((....((((((((...........(((((((((((((((...(((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)))))((((((((((((((...(((....)))..........))))))..))))))))))))))))...))))))).......))))))))....)))))))))...)))......)))))))))..))))))))))
|
|
SRP_00333
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGGAAUCAUGCGAUCGCAACGCCUCAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUACGGGAUGCUUGCGAUAGGCGUGAUCUCCGGGUCACCCUCUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))).))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((.(((((((...(((....((((....(((....)))....))))...)))....)))))))..))))))).))))))))........
|
|
SRP_00335
|
[ FASTA input ]
|
CCACGCUAGGCGGGGGGCUGGCGGUCCCCUGUACCCGAAAUCCGCCGUACGCGGGGCCGAAUUCCCACCCGAGGCUCUUCGGGUCGGGAAACGGCGUGACUCGGGGGCGAUGAAGACCGGGUCCCACGCAACGGAACCCUGUGAACCUGGUCAGGCCCGGGAGGGAGCAGCCAUAAGCAGGUGUUUCCGUGUGCCGUGGGGGAGCCCGGUUGGAGCCUUCCGAUCAUGCACGCCCCGGUCCGGAGAAGUCGACGGUGGGUGCGUGG |
|
[ reference structure ]
|
.............(((..(.(.(..(....)..).).)..))).............................((.(.(.((.(...((((......((..(......................(......(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))).....).......)..)).........))))...).)).).).))...............................
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((((((((...)))))))))).......(((((((((...((((............)))).((((((((((..((((.....((((((.((((((((......((((((((((((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))))....))))))...))))))))...))).)))))))))))....))))..)))))).)))).)))))))))))))))
|
|
SRP_00336
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGGCUUAUUGCUGUAACUCUUGAGGCACGAGUGUGAACAUGAGGGUUUGUAUUGGGUCGGCGGUGCUCGGCGGCGCCUGUCUGCUAAAAUUCUGAGUCGGUUGCGCGCUUUUGUGUAAGCUUUAGAUCGCGACUGCUACGGCUAGGCGGACCGCUCCAGGCUGGCAACAGAGCAGGGAAUAGCUGACGCUCAGACUGACUAGCAAGACUGCAGAUGUAGCUUGAACCCGCUUCGACUUGAACUACAUUGUACCCACCAGGACAUGCUCGUAUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.....)))....(....)))))(.((((((((.((((...(..((((.(.((.(((...((..(....(((.((((((((((....(((((((((((((((..((...((....))...))..)))))))).......(.(((......(((....(((....)))....)))....))).).))))))).....)))).))...)))).))).)..))...))).......)).......).))))..).......)))).)))))))).).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....)))...[[[[...))))..]]]]....(((..[[[[[[)))....(((.(((((((((....)))))).))).)))..]]]]]].((((((((....((((......))))........(((.(((((.[[[[[[)))))..)))(((...(((....))).....))).]]]]]].......))))))))..((((.((((....))))))))............((((.................)))).................
|
|
SRP_00337
|
[ FASTA input ]
|
CCGUACUAGAUGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAGCCUGCAACCCGCUAUAGCAGGGUCGAAUUCCCAGGCUGAGGCCUGAUUUCUGUAAGGCCUGGCGCAAGUAAGUGGCGUUGAUACUUGAGUCCUGCGCAACGGAGAUUUGCGAACCCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGCAAACACCUCCGUGUGCCGCAGGGGUGCUUGAGUGGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGGGACAGGUCGAAGCUGGGUGUACGG |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.(.(...).).))))....(((((...........)))))))).....(((((..(..((((((.((((((((((...((((((((((.((((((.....(((((((((((((((((.((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))))...))))))...)))))))))..))).)))))))))))..)))))))))))))))))).)..))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((....((((((.((((....[[[[[[[[[[)))).....]]]...]]]]]]]....))))))((((..((((((.((((((((((.....(((((((((..((((.....((((.....((((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))))....))))))........))))..))))..)))))))))....))))))))))))))))..))))....))))))
|
|
SRP_00338
|
[ FASTA input ]
|
AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).)))))))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).....))))))...)))))))))....
|
|
SRP_00339
|
[ FASTA input ]
|
UGUGCCAGACUUGGCCGGGGGGUUAGGCGUCCCCUGUACCCGAAGUCUAGAUGCGGGGGCGACAGCCCGGUGAGACCACCUGGGUUUCUGUCAGGCCCCGUGGAAUCAUUGAUCCUCUGUCCCUCUGGAUCGGAGGCCUGCAUGUACAUCCUCAAAGGAGGGUGUAUGUGCAGCCUACCAGGGGAACGCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGACACCCUGGACUCUCGAUGCUGGAGGGGUGCGGGGGUGAGAGGAAGCGGGGGGUACCUGGCAGGACGCCCAGACCGAACCGGGUGUG |
|
[ reference structure ]
|
.........(.(.((((((((((.....)))))))...((((...........))))))).)..(((((((..(..(...(((..((((((((((.(((.(.(..((.(....(((((((((((((.(.(((((((.((((((((((((((((....)))))))))))))))).)..((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).))).))))...))))))..))))))).).)).....).).)))..))))))))))...))))..)..)))))))..)
|
| [ predicted structure ] |
...((((....))))((((........[[[[[[[....))))............]]]]]]]...(((((((........((((((((((((((((((((((..........((((((...(((((((((((((((((.(((((((((((((((....))))))))))))))))))).((((((............(((....)))..........))))))....))))).))))))))....))))))........))))))....)))))))))).)))))).....)))))))...
|
|
SRP_00340
|
[ FASTA input ]
|
GGUGAGCGUAACGUCUCGCUGUCACCUGAGUGGGGGUCGUCCGUUGGUGGCAGGAGAAUCGCGCUUCCCUGCCUGGCACCGGGUACAAGUGACAAUCUGCCCCUUGCAAGGCCGCAGUCUCCGGUGGGAUGGGGACGGAGGUCCCCAUCUCUCGGGUGAUGAUGAGACGCGCAACGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGAAAAGUGUCCGCUGUGGCGCAGAGCAGGGAUCACAGAGUGUCACCCCGGCUGAACAGGGCAGGUGGAGGAGCUCCUCACACCGCGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((..(..)..))))....((((..)))).)))..(.((..(.((........((((.......(.(.(....(((((.....((((((.((((.((((.((..((((((((((.((.(.(((((((((((....))))))))))).).)).)(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).)...))))))....)))).)))))))))))....)..).)...)))).......)).)..)).).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((.((((((((....((((.....))))..))))))))))))...)))))..(((((((....(((((.....((((((.((((..((((((...((((((((.(((((.(((((((((((....)))))))))))))))).........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).....))))))....)))).))))))))))).......)))))))..((((....)))).))))......
|
|
SRP_00341
|
[ FASTA input ]
|
CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((.((((((((((((((((.((((..((.....((((....(((....)))....))))..))..)))).))))))))...))).))))).)).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((..((((((((((...)))..((((....(((....)))....)))).........)))))))....)))))...)))))))....
|
|
SRP_00342
|
[ FASTA input ]
|
CCGGGGCCGCCCACGAAAUAUCCCCCAAACCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGGGGGACGCUUCGGUGCGCGAUCCGCCCCGG |
|
[ reference structure ]
|
(.((((.((.(..((((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).))))..)..)).))...)).).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...((((...((((((..(((..(((...(((....))))))...))).))))))...))))....)))....)))))))
|
|
SRP_00345
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGUCUGCCCGUUCCAAGUUGAGUAGUGGACCGCUUGGGGCCUAUGCGAAAGUUGGGCCUCACGGUCCAUAAUGUGGCAGGCACCGCGUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACAACUGCCCGCUUCCAACGGUGGAAGGAUAACGGGCCGCUGCACUCCUAGGCCGCUUGGGCCUCGUAGCCUACUCCAGCGACCACCAUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((((.((.(((((.((((.(.(((.(((((..(((((((((.((....))))))))))))))))((...)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).))).)))))..)))))))....))))))))..................................................
|
| [ predicted structure ] |
(((.(((((((((((............((((((((..(((((((((.........))))))))))))))))))))).)))))))..(((..(((...((((.......((((((......(((((((((((....)))))).....)))))))))))......(((((.....)))))...))))..)))..))))))......
|
|
SRP_00347
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGUUGUGGCGAGCGCUUGUAAUCCAGCUACUUGGAGGCUUGGACCAGUGGAUGUCUUGAGAGCGGGAGUUCUGUGCCUGGUUGUGCUCAUGUUGACCGAGCGUCCGCAUCAAGCAUGGCGUCAACAUGGUUGAUUCUGAGGAGUCAGAGCCGACCAGGUUCGUCAAAGAGGGUCGGACCGGCCGAGGGCGGAAACGCAGCAGGCAAAAGUCCCCGCGUCAGCGCAGUGAUGGGAUAGCGCUCGCGAAUAAGCCGCCGGGUACAGCCCGCUCAAGAAACUCAGACCUGGUCCUUACCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........))))))..(((((((....((..((..(((((((....(((((((((..((..((.((.((...(((((((((.(((((.((.((((((.(((.((((((.((((((....)))))).)))))).)))..(...)..(((.(......(((....(((....)))....)))....).))).))))))..))..)))))))...))))))).)))).)).)).))))))))))))))))....))..))...))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......)))))))....(((((....))))))))..(((((((......((((((..(((((....(((((((((((...(((.........(((((((...(((((....((((((.(((.((((((.((((((....)))))).)))))).)))..............((((..(((....(((....)))....)))....))))..))))))......))))).....)))))))......))).)))))))))))))))))))))).........))))))).........
|
|
SRP_00348
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGGGUUGGUGUGACUCCAGCCUGUAAAGCGUAUGCUACCCUUAAAAAAUAGGCAGUCGCGUAGAUCAAGGUAAACUGCGGUUGUCAUGUGUUGAGUGCCCUCCUACCAGGUACUGCUGCGGGGUCGUGGGUCCGACGAAGGUUGGAAUUUCGAUCUUGAUAAUGCAAUCUGCACUGCGUGAGGCCGGUAAACGGAACAGCGAAAAGGAUUCCAGCGGUAUGGUGCGUAGAUUCUGGGCGCGAGCAUGCGCUUCAGCCUCUGACUUGGUUCAAACGGUCCACUAUUUUUUUCCUCGAUCCUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(...).)))))))....((((()))))))))....((((.((..(((.(..(.((((((((....(((.(((...(((((.(...((((((..((((((.(((((((((((((((((.((.((((((....)))))).)).))))))))(...)..(((((....(.(((....(((.....)))....))).)..))))).)))))))))..)).)))).....))))))).))))).))).)))...)...))))))).....)..).))).)).))))..............
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((.......)))))))...(((((((((((...........(((((((..(((.................)))..)))).))).....((((((..((((...(((((((((((((((((....((((((....))))))....)))))))).......(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).))))))))).....)))).....)))))).))))))))))).((((...[[[[.)))).....]]]]..........................
|
|
SRP_00350
|
[ FASTA input ]
|
GCCUCCGCGCGGCGUUACCCGGGUGAACUCCCCCAGGUUAGGAAUAAAGCAAGGGUAGCUCGGCUCUGGCGGGUGUGCGGGGGUCUUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..))))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((..((((((((((........)))..[[[[[[..........))))))).....]]]]]]...))))))))))).....
|
|
SRP_00353
|
[ FASTA input ]
|
AGCCGGAGCGCAUUGCUCUGUAACCUUCGGGGGCUGAUCCCGCUUAGCGGGGACGUCUUGGACAAGCGGGGGUUCUGUUGCGUUGACUUGGUGUUCUGCUUGGUUGCGUGUCGGUGUUGAGGUCGCCACUGUAGAGAGGCGUUCUCGCGCCGUUAAAGUGGGGGGAACGGGUCAGGCCGGUGACGGAGCAGCCCACCUUGCGCACGUUCCCGUUGCAGAAGCACACCGAGGAGCAUCUCAGGACUUUGCGCCCCAAGUGUCGUCGCGAGGCGGUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((...))))))....(((..))))))).(..((((((.((((.((((.(((((....(((.((((((((.(((.((..(((((((((((((..((..((((((((((((.((((.((((.((....)).)))).))))))))))(...)(((.(((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..))...)))))...)))))))))))))...)))))).)).))).))))))))).)))).))))))..)
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...))))))............))))....((((((.((((.((((.(((((....((((((((((((.(((.....(((((((((((((.(((..((((((((((((.((((.((((..........)))).))))))))))........(((.....((((....(((....)))....)))).)))...))))))..)))..)))))...))))))))..)))...))))))))).))).))))))))).)))).))))))...
|
|
SRP_00354
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCGACUGCUCUGUUACCCUUUCGGGGGCCGGGUCCGCUUAGCGGGGACUUCUUGGACAAGCGAGGGUUCUGACGCGUUGACUUGGUGUUCUGCUUGGUUGCGUGUCGGCUGCGGCGACGUCCCUGCAGAGGGACGUGGCCGGGCCGUUGAUGCGGAGGGAACGGGUCAGGCCGGCGACGGAGCAUCCCACCUUGCGCACGUUCCCGUUGCAGAAGCACACCGAGGAGCAUCUCAGGGCUUGAGCCCCAAGUGUCGUCGCGAGGCGGUCCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((....)))))....(((....)))))).(((.((((((.((((.(..(..((.(....((..(((((((((.((.((..(((((((((((((..((..(((((((((((..(((.((((((((....)))))))).))).))))).....(((.(((....(((.....(((....))).....))).))))))))))))..))...)))))...))))))))))))...)))))))))..))..).)).).).)))).)))))).)))...
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....)))))....(((....)))))).(((.((((((.((((.(((..(((((........(((((((((...(((..(((((((((((((.(((..(((((((((((.((((.((((((((....)))))))).))))))))).........((((...(((.....(((....))).....))).))))..))))))..)))..)))))...)))))))).)))...))))))))).....))))).))).)))).)))))).)))...
|
|
SRP_00355
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCUCUCUGCUCUGUCACCUUCGGGGGCCGGCGCCUGUGAGCGGGGAAAGCCUGGACCAGCGGGGGUACUGCUGCGUUGACUUGGUGUUCUGCUUGGCGGUGCGUCCGUUCCGGCGGCGUCACUGUAGAGCGACGCUGGCGAGCGGUUAAUGCGUGGGAAACGGGUCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCUCGCGCGCGCCGCCGUUGCAGAAGCACACCGAGGAGCAUCCCAGUGCUCUGCGCCCCAGGCGUCGUCGCGAGCCGGCGCUCAAACUCGAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....)))))....(((..)))))).((((((.((..((((.(...((((((.......(((((((((.(((.((..(((((((((((((..((((((((((((((((.(.(((((((.((....)).))))))).))))))).....(((.(((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))))))...)))))...)))))))))))))...))))))))).....))))))..).))))..)).))))))..............
|
| [ predicted structure ] |
..((((((.....))))))......(((((....((((((.....((((.....((((((....((((((((((((.(((.....(((((((((((((.(((((((((..((((((...(((((((..........)))))))..)))))).....(((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))))))..)))))...))))))))..)))...))))))))).))).))))))....)))).....))))))....))))).....
|
|
SRP_00356
|
[ FASTA input ]
|
UUAUAAUAUAUAUGUCAUUACAAUAUUAAGUAGCGAACCUUGUCAGGCCAGAGAUGGAGCAGCAAUAGCAAUAUCUUUUUAUGUGUGAUGACAUAUAUUAA |
|
[ reference structure ]
|
.......(((((((((((((((.((..((((.((.....((((....(((....)))....))))..)).))...))..))))..)))))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
.......(((((((((((((((.(((.(((.......(((....)))(((....))).......(((....))))))...))))))))))))))))))...
|
|
SRP_00357
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCCCUGGUCCUCCCGCAACACUAGUUCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGAUGAUGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...)))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((..((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...))))....)))))...)))))))))))))
|
|
SRP_00358
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGCUCUGGUCCUCUCGCAACAAUAGCUCGUGAACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCGUGUGACUUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCCCACCCUUUAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((..((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..)))......))))....)))))...))))))))))))).........
|
|
SRP_00361
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGGAAUGUUGCGUCUCCCUGUCACCCGAGCGGGGGCUGAUGGAUGGAAGUUUCGCAUGAUACCGUCGGUCCAGUUCUCCUGCGUCGAUGGCGUGUCCGUUCUGAGCCUACAGUCGACAACGGCAUCUCCCUGACGGGAGGUGGUCGUAGUUGAUGAUUAAUCCGGGACCGCGUGAGGCAGUAACCUGAGCAGCGAAAACGGAUAGCUGCGGGCGGCAGACGGAUCGCAUGCCUGAGUGGGCGGCUGGGCCACCCGACGGGUCCUCUGCGAGGCAACCAACUGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..........)))))....((((..))))))).(((((.(((..((((((((.(.....(..((((((((.(.(((((......(((((((((..((((.((((.((((((((.(((((..((..((....)).))..))))).))))(....).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))).))...)))))))...))))).)))))))))...........).).))))))))..))).)))))..
|
| [ predicted structure ] |
...(((((......[[[[)))))(((.(((....)))))).]]]]..(((..((((((((.....((((((((((((((..(((((......(((((((((((.(((.(((..((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).))))..)))..)))))))...)))))))...))))).)))))))....)))))))......))))))))..)))........
|
|
SRP_00363
|
[ FASTA input ]
|
UUCCAGCAUACAGCAAUAUUUUUAUUAGUAAAUUCGAUCAGGUCCGACAGGAAGCAAUCGUAGCUACAAAAAGUAUGUGUAUAGUAUGCUGGAAAAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((...(((.(((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..))))))))..)).....)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...)))))))))))....
|
|
SRP_00365
|
[ FASTA input ]
|
GGUAUGCAGGCAAAAACUCUGUAACUUGGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCCACACCAGAAUCUUUUUGGGUUGCAUACCUAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((((.(((((....((((....(((....)))....)))).)).)))...))))))..)))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((......((((.........))))(((....)))....)))...((((((...))))))..))))))))....
|
|
SRP_00367
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCCCCGUCGGUCCCUCGCGACGCUAGAUCGAAAAUCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUCGAUUGAUGCGGGCGCCGAGGUCAACCGGCGGGGACACCACCCCACUC |
|
[ reference structure ]
|
((((.((((((((((.((((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...)))))...)))))))))).)))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((.((((((((((.(((((...(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).....)))))...)))))))))).)))).........
|
|
SRP_00368
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCUGUGGCGUGUGCCUGUAAUCCAGCUACUUGGAGGCUUGGGCUGUCGGAUCGCUUGAGUCCAGGAGUUCUGGGCUGCACUGAGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGUAUCAAUAUGGUGUUCCUGGGGGAGCCUCGGAUCACCAGGUUGCUCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACCCCCGUGCCGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCGGUGCAGAACAGCCUGAACAACACAGCGAGACACAGUUCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....(((........))))))..(((((((....(((((...((.((((....(((..((((((((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).)))).((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))))))))..))))))).)).....)))))...))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((..((((.[[[[[))))............]]]]].....)))..(((((((....(((((......((((....(((..((((((((.(((((.........((((((.(((((...(((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).)))).........(((.......((((....(((....)))....))))....)))..)))))))....)))))))).)))........)))))))))))))..)))))))........)))))...))))))).
|
|
SRP_00369
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...))))....)))))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((..((((...(((..((((((..(((........(((....)))......))).))))))...))).....))))....)))))))))))))))
|
|
SRP_00371
|
[ FASTA input ]
|
CUUAGCUGUAAUGGCAUUUUGUCGGAGUGGUAAAUCGUCUUCUUGUUGUGCGUUCGAGUCUUGGGCUCUGCACUUGGCCAUUUGGUUGUCCUUUCCGAAUUCUGCGGUUGAUGGGCGUCUCGGUCUGAGUAAUCGGCUUUGAGAUUUCCGUUCUAAGAUUAACUGGGAAACUUCAGUGGAGCAAUCCAGCAGAGAUCCAGUUGCCGUGGGUAUGGCGGUGGGAUCGCAACCAAGUGGUAUAUGUUAUGGAAGAUAUUUACGAUCACGAUU |
|
[ reference structure ]
|
....((.......)).....((((..((.((((((.(((((((....(((((.....(.........))))))...(.((((((((((((((..((((..(((((((...(((((.(((..((((.((....))))))..))..).)))))((...)).((((((...(.(((....(((....)))....))).).)))))))))))))..)..))).)))...)))))))).......))).)..))))))))))))).))..)))).
|
| [ predicted structure ] |
....(((.....))).....................(((((((....(((((...(((((...))))))))))...(((((((((((((.....(((...[[[[)))..((((((.(((((((.((((....))))..))))))).))))))..........(((((....)))))((((....)))).]]]](((((..(((((((....)))))))..)))))))))))))))))).........)))))))................
|
|
SRP_00382
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGUAAUGGCUCAAUGGUGGAAUUGUACACCUUGGGAUUUCUGACUUUGGUUCAAUCCUCGCAGUCGGACGUAGGUUAGCAUGUCACGUUUCGGCGUGGCAAGGGGUACUCACCUUCCCGUGGGGCUCCGCACUGCGCGUCGGCGACAACCGUCAUCCUUCUCUCGCUUCCAGUUGCCGAGGCCGUCAAUCUUGGCGGUCUCAGAGAGAGGGACUCGGGGUUAACGUGUCCCGGUUAUUAUCGAUCUUCGCGGGGUUUGUUUGCGCGUUCGGGCACGAGAGAAAUCCGUGUUCCUGGGCGUGUGGCAAAGUAGUUACGGGUUCCUUGUGGGCCUCGCCUUGACCGCUGAAGGGGAGUUUCAUCCAGCACAGCGAGGGCGACCCGUGAUGGAGGCGGCCGGGAUAGCACUAGUUCUCCGAGUACAAGUGCAGACUGGGUUGGCCCUGUGCCAAUCUUAACGGGCGGUGUCGCUGAUAAUUACCCACCAGUAAAGGUACGUUGCUUGCAGCGUGGGGUGUACAAAACUAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.......)))..(.(((((...(((((((((((((((((((((((.(((........))).)))))))(((.((.(.....(((((((....)))))))..(((((.(.............).)))))..))))))...(((......(.((....((((((((.............((((((((((....)))))))))).)))))))).((((((((.(...(((((((((((........((((((((((..(((((.(((((((.(((((((.((....)))))))))...))))))))))))....((((((((...))))).))).(((((((...(((((....(((......)))....))))))))))))))))))).)))...)))))))...))))..)..))))))))......)).).)))))))..))...((.......)).((((((((((..((..(.(((.......))).)))..))))))))))......))))))))))...))))).)
|
| [ predicted structure ] |
((((.....)))).((((((....((((((((((((((...(((((((.(((........))).)))))))(((((.......((((((((....)))))))).(((((.(((((......))))))))))...))))).((((((((((.(((((.(((((((((((((...)))....((((((((((....)))))))))).))))))))))..((((((((((.(((((((((.........((((((((((.((((.(((((((((((((((((.........))))..)))))))))))))))))............(((....)))..(((((((...(((((....(((......)))....))))))))))))))))))).)))....)))))))))(((((...............))))).......))))))))))..............))))))))))))))).....)))............((((((....))))))))))))))))).))))))..
|
|
SRP_00383
|
[ FASTA input ]
|
GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((...(((......((((....(((....)))....))))...))).....)))))..)))))).)))
|
| [ predicted structure ] |
(((.[[[[)))........]]]].((((.......(((....)))....[[[[...............)))).....]]]]
|
|
TMR_00007
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUCACGGUUUCGACGGGAUUGACUGCGGCAAAGAGGCAUGCCGGGGGGUGGGCACCCGUAAUCGCUCGCAAAACAAUACUUGCCAACAACAAUCUGGCACUCGCAGCUUAAUUAAAUAAGUUGCCGUCCUCUGAGGCUUCGCCUGUGGGCCGAGGCAGGACGUCAUACAGCAGGCUGGUUCCUUCGGCUGGGUCUGGGCCGCGGGGAUGAGAUCCACGGACUAGCAUUCUGCGUAUCUUGUCGCUUCUAAGCGCAGAGUGCGAAACCUAAAGGAAUGCGACUGAGCAUGGAGUCUCUUUUCUGACACCAAUUUCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((...(((((.((((((((((((((((..aaaaaa.)))).....AAAAAA.................................((((((((......))))))))(((((.((..(((((.<<<<<<)))))..))..))))).......>>>>>>..((((((.((((([[.[[..))))).)))))).........]].]].((((((((((...((({{{{{{{{.)))))))))))))...........}}}.}}}}}...)))))...))))))).))).))..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....((((((...........(((((((..............(((.[[[[[[.)))......]]]]]]...........(((((.........)))))...((((((((......))))))))((((((...((((...))))...[[[[[[[[.)))))).....(((....)))....]]]]]]]]........)))))))((((...))))........(((((((((((................))))))))))))))))).((((((.(((......)))[[[.[[[))))))..]]].]]]...(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00008
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCGGCUUCGACGCAGGUCGCGAAGCCUUCGGUGCAUGCAGAGCUGCGGUUCGCUCUUAAAACUGGUCGCAGAUUCAUAAUUGCCAACGACAGCAAUUACGCCCUCGCUGCUUAAGCAGUGAGCCCUCUGCCCGGAUUUGUCUGUGGAUCCGGAGCCGAAAGGCGCGCGGAGGGUCAUGAAACACGGAAUCGUGCGCAUUCUAGUCUGUGGGAUGCGUGCUAAAUUAAAGCAGAAUCGCCAUGUCGUCAUCCUGUCUGUCGGAGGGCGGUGCGGUUAAAGCCAAAAGACAAACUACGCAUGUAGAUCCGGUGGUCUAGGUACUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((.(..(...(((.((((..((((((((((aaaaaaa.))))).......AAAAAAA................................(((((((((..)))))))))(((((((.(((((((..[[[[[[))))))).(((....)))...)))))))........]]]]]].(.((((((((((((.{{{{)))))))))))).)........}}}}...(((.(..(....(((.<<.<<<<))).....).).)))...........>>>>.>>...))))).....)))).)))...)..))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((..[[[.....))))))).........]]](((((..[[[[[.)))))...]]]]]......(((((.(((((((........)))))))....((((((((....))))))))((((((((((((((((......)))))))).(((....)))..))))))))............)))))((((((((((((.....))))))))))))..............((((((.[[[[....(((........))).))))))..(((....)))....]]]].(((.[[[[..((((((....)))))))))..]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00010
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAACUGGCUUCGACUUUGAAGCGAGCCUCUCAGUAGCGAGCUGAGGGUCCUAGGGCCUCAUUAAAAACGUAGGAAAAAAAAGAUAACUGCCAAACCUAAAUUGGCCGUAGCAGCUUAAUUGUUGCUCGUCGACUAUCGGGGUUCCCACCUCGGAUAGUAUCGGCGUCGAAAUGUGGGAUGCUAAGUUAGUUUACCGGCUAGCUUUCAAGAUUUAAGGUAAAAACUAUUGAGAAUUUGUUUCUGGUGACUCUCUCAAUAGUAUUUCACCAGAUGCGCUCGGAGAAGCUGUUAGGUAGCUUAAAAGGACCGGGGUUCGACUCCCCGCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((.((((...(((..((((..((((((((((.aaaaa...))))).........AAAAA................................(..(..(......)..)..)((((((((((((((<<<.<...))).)))))..))))))..>.>>>.(.(((.(((.((((..[[[[[[))))))).))).).......]]]]]].(((((...(.(...(..{{{{{{{{..)).)..)))))...}}}}}}}}...))))).....))))..)))..)))).))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((....))))))...[[[[.))))........]]]]((((((.((((...........((((..............))))............))))..((((((......))))))((((((((((((((((....))))).)))))..))))))........))))))((((.(((..[[[[[[))))))).............]]]]]].((((((((((.......[[[[[[[[...))))))))))...]]]]]]]]...........((((((.....))))))....(((..[[[[)))....]]]].)))))))....
|
|
TMR_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUAUUGGCUUCGACGCUGGUGAUGAAGCUCAUAGAUGCAUGCCGAGAGCGCAUUUUCUCUCGUAAAUAAAAUUUGCAUUUUAAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCUCUAGCUGCCUAAGGGCAGUUUGUCCGCUUCCUAGAAUACUUGUGGUUUAGGAACCCGACCGUAGCGCACGCACACAAGUCCGUAUAGAGUCAAGCCUCGGGGCUUUAUACCAAACUUAGAGGAUCGCAUCUUGUACCCUGUUCGUCGGGUCACUGGGUGUUAAAACAAUAGACGAUAUCUAAGCAUGUAGUAUUCUCGAGUGUAGUGCUGGCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.(...((((...((((((((((((((..[.[[[[[.))))).....]]]]].]................................(..(.((((((((..)))))))).)..)....((((((.((....)).))))))...(.....((.......))......)...............................................(((((.((...((({.{.{{{)))....)))))))..........}}}...}.}...)))))...))))...))))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((((...[[[....)))))))..]]].(((((((((((((........))))))............)))).......[[[)))...]]]......(((((((.(((((((....))))))).(((...((((((((..[[[[[[[.))))))))...))).............]]]]]]]..((((((((((...[[[[..))))))))))........]]]]...((((((...((((...[[[[[))))....))))))..........]]]]]......................)))))))............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00014
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACGACGGUCGUAGGUUCAGGAGAAGCGGGUCGAGGAUGCGCAGUCAUCUCGUCAACGCUCUGCGCGAACCAAUAGGUGCCGAUAACACUCGCACCGACUUCGCCCUCGCCGCCUGAGCGAGCCUCGAAGUCCGUCAGCCCGGGGAACGCUUCCGCCCCGGUUCCUGGCGUCAUCUAGGAAGCCACUGCUGAGAGCCCGUGUCGGUAGGGCUCUCGGGACUUUUCAUCGACUGAGCCCGUCGGCGUCCUUGCUCGCGUGAGACGCCGGGGCUGAGAAAAACGCUAGCGAGCUGCACCCGGAGAAGUCCUGUUGUGCGGCCGUCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCAUCUCCACGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((((((....(((((....((((((((((.aaaaaaa...)))))........AAAAAAA.............................(((((((..(((((.......)))))...)))))))((((((.((((((...<<<<<<.))))))...)))))).......>>>>>>.....((((((((((..{{{{{{.))))))))))........}}}}}}..(((((..(((((..((.[[[[[[..[)).))))))))))..........]..]]]]]]...)))))......)))))...)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
........(((....[[[)))...]]]..(((((.......(((...[[[[.[[[)))...]]]]]]]....(((...))).)))))....(((((...........)))))(((((((..(((((.......)))))...)))))))((((((.((((((...[[[[[[.))))))...)))))).......]]]]]](((....[[[[[[[[)))......]]]]]]]]((((((((((........(((((..(((((((.((((....)))))))))))))))).................[[[[[[[...))))))))))...]]]]]]].((((((.[[[[[))))))..]]]]]..........
|
|
TMR_00017
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUGGCGAAGCCCAAGGUGCACGUCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUAAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAACAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCAUUUAGCCUUCGCUCCCCAGCUUCCGCUCGUAAGACGGGGAUCAAGCGGAGUCAAACCUAAACGAGAUCGUGUGGACGCUUCGGCUUGGAGAUCGAAACACUAAAUUGAAUCAAGCUAGUUUAUUCUUCGCGUGUCUGUCCGCAGGGGAUAAAUGAAGUUAAAGACCAGACUAAACGUGUAGUGCUGAAGGUAGAGUAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((...(((((((((((((({{{{{{...))))).......}}}}}}.............................(((..(((((.........)))).)..)))(((((((((((..(((...<<<<<)))..))))....)))))))..........>>>>>....(((.....(((.aaaaaa)))......)))...........AAAAAA.((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))))))))).........]]].]]]]...)))))...))))...)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.........[[[[[[[..........)))))........]]]]]]].((((((......[[[[.....))))))........((((....))))......]]]].....((((..[[[....))))..]]]..(((((((((((..(((...[[[[[)))..))))....)))))))..........]]]]]...((((.........[[[[[[[...[[[[.))))....]]]].]]]]]]].(((((((((..(((........)))..)))))))))...(((......[[[[[[[)))...]]]].]]]......(((....)))(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00018
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACAAGAUUCACGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGCUAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUGGCAGCUUAAUAACCUGCGCAGAGCCCUUCUACCCUAGCAUGCCUGUGUCCUAGGGAAUCGGAAGGUCAUCCUUCACAGGAUCGUGUGGAAGUCCUGCUCGGGGCGGAAGCAUUAAAACCAAUCGAGCUAGUCAAUUCGUGGCGUGUCUCUCCGCAGCGGGUUGGCGAAUGUAAAGAGUGACUAAGCAUGUAGUGCCAAGGAUGUAGUAAUUUUGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((......(.((..(((((((((((((({{{{{{...))))).......}}}}}}.............................((.(((((((.........)))).))).))((((((...((........[.[[[.....))....)))))).........]]].]...((((....((((.aaaaa))))....))))..........AAAAA..(((((.((...(((.<<<.<<<)))....))))))).........>>>.>>>...)))))...))))..)).).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...[[[[...)))....]]]](((...)))....(((....[[[[[[.)))...........]]]]]]........((((....)))).....((((((.(((((((.........)))).)))..........((((((....[[[[[[..)))))).(((....))).......]]]]]]...))))))..(((..[[[[[[))).................]]]]]]..((((((((((.(((.....[[[))).)))))))))).........]]]..((((......)))).((((((.........))))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00028
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUACUGGUUUCGACGGGGGUUUAGAGUCAUUAGUGGCGAGCCGUGUUUAGCUUGGGAUCACGUAACAAACUGAGCAAUAAAUACAAACGCAAACGAUAAUUAUUCACUAGCUGCAGCGUAAUAGCACAGCUCGUUUCUCCUAGGCUUCCCACAGUCUAGACAGAAACGUCAUCUUAGUGGGGAACGUCUUAAGGCUGUCGCGACCUUAAGUUGUACAAUUGUGACUAGCUGAUCUUAAAACCCGUUGCUAGGUGUUAGGUAAAGCGAAAUUCUAAAGUAGCAACUACGCUCGUAGAAGCUGAUGGUGAAGGGCCUUCGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((...(((((((((..(((((((.((aaa)).))................AAA...................................(((((.............)))))(((((((.(((((((<<<<<<)))))))..)))))))........>>>>>>..((.(((((((..{{{{{{{))))))).)).....}}}}}}}..(((....((..(.(..[[[[[[[).)....))...)))............]]]]]]]...))))).....)))))))))...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.......))).........(((((((((.((((((.(((((((((((((.....[[[......))))))..)))))))........]]]..............((((.[[[....))))...]]](((((((.......[[[[[[[.........)))))))........]]]]]]]....(((((((..[[[[[[[)))))))........]]]]]]]..(((...(((((.(((.[[[[[[[))).)))))...)))............]]]]]]]...))))))....)))))))))..((((...((((((....))))))...)))))))))))....
|
|
TMR_00030
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCCGUAACGGUUUCGACAGGUUGGCGAACGCUACUCUGUGAUUCAGGUCGAGAGUGAGUCUCCUCUCGCAAAUCAAGGCUCAAAACAAAAGUAAAUGCGAAUAACAUCGUAAAAUUUGCUCGUAAGGACGCUCUAGUAGCUGCCUAAUUAGCCUCUUACAGGUUCGAGCGUCUUCGGUUUGACUCCGUUAAGGACUGAAGACCAACCCCCAACGGAUGCUCUAGCAAGUGUUCUCUGGUUGGCUUGCUAGCUAAGAUUUAAUCAGAGCAUCCUACGUUCGGGAUAAUGAACGAUUCCCGCCUUGAGGGUCAGAAAGGCUAAACCUGUGAAUGAGCGGGGGGUCAAUACCCAAUUUGGACAGCAGUUCGACUCUGCUCGGAUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(..(((.(((..(.(((((((((((((.{{{{{{...)))))........}}}}}}..........................(........(((.((.(((..(((.....)))..))).)).))))................(((((((((((...[[[[[[..)))))))))))........]]]]]]....(((((((((...<<<<<<<..)))))))))..........>>>>>>>.(((((.aaaaa)))))...AAAAA((((..bbbbb..))))....BBBBB...)))))..))).)..))).)))...)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((............(((((.((((....)))).))))).........((((((.[[[[[[.)))))).......]]]]]]..............(((((......)))))......(((((..(((..(((.....)))..)))....(((((.....))))))))))(((((((((((...[[[[[[..)))))))))))........]]]]]].....((((((((...[[[[[[[[[)))))))).........]]]]]]]]].((((..[[[[[[))))..]]]]]]..(((.[[[[[..))).....]]]]]....(((((......)))))((((....))))...(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00034
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGGAAAGGAUUCGACGGGGACAGGCGGUCCCCGAGGAGCAGGCCGGGUGGCUCCCGUAACAGCCGCUAAAACAGCUCCCGAAGCUGAACUCGCUCUCGCUGCCUAAUUAAACGGCAGCGCGUCCCCGGUAGGUUUGCGGGUGGCCUACCGGAGGGCGUCAGAGACACCCGCUCGGGCUACUCGGUCGCACGGGGCUGAGUAGCUGACACCUAACCCGUGCUACCCUCGGGGAGCUUGCCCGUGGGCGACCCGAGGGGAAAUCCUGAACACGGGCUAAGCCUGUAGAGCCUCGGAUGUGGCCGCCGUCCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.((((((((((((((..((((((((({{{{{))))....}}}}}...............................(((((((.........)))))))((((((((((((((..aaaaaaa))))))))).))))).......AAAAAAA...(((((((((((.<<<<<<<))))))))))).........>>>>>>>..((((..(((.(((.[[[[[[[)))..)))..))))..........]]]]]]]...))))).....))))))..).))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((.(((((((((((.(((((((.((((((.(((((((((((((((........)))........(((((.....))))).......((((((((((.........))))))((((((((((((((((.......)))))))))).))))))..))))))))))....((((((((((((......)))))))))))).........((((((...((((((((..(((((....)))))..))))))))...........))))))....))))))....))))))....)))))))))))))).........)))).)))..))))))))....
|
|
TMR_00035
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACGAUGUUAGUCGCGACAGGUGAAGCGGGCCGAGGAUGCAGAAUUAUCUCGUAAACGCUGUCUGCAAAACAAUAAGUGCCAAACAAACGCGCACUGACUUCGCUCUCGCUGCCUAAGCAGUAAGACAGUCCGUCAGCCCGGGAUUGCUAUCGUCCCGGUUCCUGGCGUCAUUAAGAUAGCCACUGCUGUUUACCUUCGUCAUUGGGGUGAACGGGACUCUUAGAUGACUGGGCCCGGAUCAGCUACUUGUUUGCAGGAUAGCUGGGGCCGAGAAAAUCCGACGCAAACUGCGCCCGGAGAAGCCCUGACAACACGACAUCGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((......(.((((.....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA.............................((((....(((.(((((....))))).))).))))((((((.(((((((.<<<<<<)))))))...)))))).......>>>>>>.....(((((((((([.[[[[[[.))))))))))........]]]]]].](((.............(.{{{{{{...)..)))...................}}}}}}...))))).......)))).).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......(((.....[[[[)))....]]]]...........(((((((((((...........)))))....[[[[)))))).........]]]]..........(((....[[[[.)))(((..((((....))))..))).]]]].(((((.(((((((.......)))))))...)))))((((((.............(((((((((((.......)))))))))))..[[[...))))))..(((((....((((((((((....)))).)))))))))))]]]....(((((((((...))))...[[[[[..................))))).(((((........))))).]]]]]....
|
|
TMR_00036
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGAUUUGCCAAGGUCAACGAAAUUUAUAUAGCAUAUCUUGGUUAUGCAAGUAAAAACAUCGAGGUUAUAAUAACCGGAAAUAAAAAACAAACUGCAACAAAUACAAAAGAUUUUACUGGACAAACUCCAGUUUAUCAAAUGAAUUUUGUAAACAGUUUUUCUUCACAAUUAGCUUUUGCUUAAAUAAAUAAGCAGAACCCGCACUUAAAUUAACUUACGAUUUAAGGAAGGAAAUAAGGUAAGUUUUGCUAUUUGAGUUUGUCUUUGCUCUUUUAAGCAAAUAUCAAAAAGACUAGUAAUUUAUGGAUUUUGUUUGUUUUUUCAUAAAUUGCAAAACCACAAAAUAAACUAAAUAUGUAGAAUAUAUAAAUUAAAGUGAUUUUGCACAUGGGUUCGACUCCCAUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....((((((((((.(((((((((.{.{{{))))......}}}.}................................................................................................................(((((((((......))))))))).((...((((((((.aaaaaa))))))))...)).......AAAAAA((((((....(.(.<.<<<<<<..).)....))))))......>>>>>>.>(((((.(..(((....[[[[[[[[[)))...))))))........]]]]]]]]]...))))).....))))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((......((((((((....((((((((((((((((..(((((.(((((.............(((((...)))))......(((((((((((....(((((.......(((...((((((.....))))))..)))........))))).......((((((((.........(((((((((......)))))))))......((((((((.......))))))))))))))))....(((((((..((((......((((..((((((......))))))...)))).....))))))))))).......)))))))))))......))))).))))).............))))))....))))))))))....)))))))).....((((...))))))).)))))))....
|
|
TMR_00038
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGCUUCGACGUGGGUCGCGAAGCAGUGCAGUGCAUACCGAGGACCAGUCACCUCGUAAAUCCAUCUGGGAAACUACAAACGCCAACGACGAGCGUUUCGCUCUCGCCGCUUAAUCCCGGCGGGCGCUGCACCGGCAGGUCUCUGGGCCGGGUGGUUCCAGCGUAAGCUGGGCCGCUGCAGUGUCAUUUACAGAGAAUCGCGAGCAGGGCCGGGUUACUUGGCUCUGUAGCUAAAGGUAAGGUAACUCGCUGAUGACCGGCCUGCCGACCGGCUAAGUCAGAGGCUAAAUCCAAAUAGGUCGGCUAAGUAUGUAGAGCUGUCUGUAGAGGGCUUGCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..((((.((((((((((.[[[[...))))).........]]]].................................(((((((........)))))))((((((((((((...<<<<<<.)))))(((((.(((((....))))))))))))))))).......>>>>>>...((.(.((((((.aaaaaaaaa.))))))).))........AAAAAAAAA(((......(((((.{{{{{{{))))..).....)))............}}}}}}}...)))))....)))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..((((((((((((((((..........)))))).(((((((((....(((((.[[[[...))))).........]]]]...............(((...[[[[)))..]]]]...(((((.......)))))))))))))).....(((((((((((((((((((.(((((....))))))))))..(((((...(((((............(((((((((((...)))))))))))........)))))......)))))....)))))).(((....))).....)))))))).........))))))))))..(((....[[[[[((((.....)))).)))....(((((........)))))]]]]].....
|
|
TMR_00042
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGGAUAGUUCGAGCUUAGGUUGCGAGUCGAGGGGAUCGGCCUCGUUAAAACGUCAAAGCCUAUAAUUGGCAAACAAAACAAUCUUUCUUUAGCUGCUUAAUUGCACUAAAGGUUCCUCCCUCCAUCGUCCAUGUGGUAGGGUAAGGGACUCAAACUAAGUGGACUACGCCGGAGUUCGCCGUCUGAGGACAAAGGAAGAGAACAACCAGACUAGCAACUUGGAAGCCUGUCGAUAGGCCGAAGAGUUCGCGAAAUGCUAAUAUAUCGACUACACUCGUAGAAGCUUAAGUGCCGAUAUUUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(..(.(((((((((.((((((((((.<<<...))))).......>>>.................................(((.(.(((......))).).)))((((((((((((((.aaaaaa)))).))))..)))))).........AAAAAA....((...((((...{{{{{.))))...))...........}}}}}..((((.((....(((.[[[[[[[))).....)))).))............]]]]]]]...)))))....))))))))).).).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((...................(((((((((((((((.....)))).)))))......[[[[[))))))...]]]]]................((((((.(((......)))))))))((((((((((((((.[[[[[[)))).))))..)))))).........]]]]]].....(((.[[[[.)))(((........)))....]]]].....(((.............[[[[)))...]]]]....)))))))(((...[[[......))).((((....)))).]]].......((((.....))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00046
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUUUGGAUUCGACAGGGAUAGGUCGAGCUUGCGUUGCGAGCCGAGGGGUCGGCCUCGUAAAAACGCACAAGCCAAUAACUGGCAAAGAAAACAACAACUUCGCUCUAGCUGCAUAAGCUAAGCGGUCUCUCCUCUCCAUCGCCCAUGUGGAGUGGCUGAGACUCAACUUUAGUGGGAUACGCCUUUCUCCCCCCGCCUGAGGGAGAAGGAAGAGACUAAUCAGGCUAGCUGCACGGAGGCCUGUCUUUGGGCUGAAGUGCUAGCGAAAUACGAAUACAAAGACUACGCUCGUAGAAGCGUAAGUGUCGUUAUCUCUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCGUCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((...(.(((((((((.((((((((((.{{...))))).......}}..................................((((.(((((.....)))))))))...((((((.(((((..aaaaa)))).).))..))))..........AAAAA......((((.(((....<<<<<<))).))))...........>>>>>>..((((......((((.[[[[[[[)))).......))))............]]]]]]]...)))))....))))))))).)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......(((((...((((((........))))))..(((((((((((((((....)))).)))))...))))))...((((.....))))....)))))........((((.(((((.....)))))))))(((((....((((((..[[[[[)))))).....))))).........]]]]]......(((((((((...[[[[[[)))))))))..........]]]]]]..(((((((...((((((....))))))...)))).)))....((((........[[[[[[[[[))))..]]]]]]...]]]........((((.[[[[[))))...]]]]]...........
|
|
TMR_00047
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUUGUUAAGGAUUCGACAGGGGAAAAUAGUAUAAGACAUGAUACUCGUAAAGCAUACGUUACAUGCUAAGUUAAAUAUAACUAACAACGAAUUACAAGUAGCCUAGUUAAUAGGUGCCAAAACAAUAGAGUUGCUCUAACAUCUAUUUGAGGUUCAAAGAUUUGAGCUAUUUCUUACUUUAGAAUAAAGUAAGUGGUGGAGCCUAGAGAAAACGCUGUAGAAACUAACUAUUCAAAUUGUAAAUGGUAUCAAACAAGUGUCUAUAUGAAAGUCUUCUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCAGUUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((......((((.......(((((((((.....)))).................................................................(.(((.(.....((.(...{{{{{{{.............).)).....).))).)...........}}}}}}}...((..(.((.(........[.[.[.[....).)).)..))......].].].]....)))))...))))....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((.....(((((.((((((((((((((..(((((.......))))).(((((....)))))....)))).((((((...(((((.....)))))........(((((((((((((((............(((((((....)))))))....(((((((((...)))))))))...))))))(((............))).))))..)))))....))))))...)))))......)))))))))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00048
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUCUGGAUUCGACAGGAAUAGGUCGAGCUUAAGUGGCGAGCCGAGGUGGCGAACUCGUUAAAACGCCAUCGCCAAUAACUGGCAAAGAAAACAACAACUUCGCAUUAGCUGCCUAAGCUAGCAAAUGCGGUUCCGCCCUCCAUCGCCCAUGUGGUAGGUGUCGGGACUCACUUUUAGUGGGCUACGCCUCUCACCCUCCGUCUGUGGGUGAAGGAAGAGAUUUAUCAGACUAGCCUUACGGAAGCCUGUCGCUGGGCUGAAGUAACGGCGAAAUGCGAAUACAGUGACUACGCUCGUAGAAGCUUAAGUACUCGUUAUUUCUGGACGUGGGUUCGAUUCCCACCGUCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((...(.((((((((..(((((((((..[[[[..))))......]]]]......................................((..(((........)))..))..((((((.(((((((.aaaaaa)))).)))...)))))).........AAAAAA.....((.((((((...<<<<<.)))))).))...........>>>>>..(((.(.....((((.{{{{{{{))))......).)))............}}}}}}}...))))).....)))))))).)...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))).........(((...[[[[[[)))((((........))))......]]]]]].((((.....))))..................(((.[[[[)))....]]]]......(((....)))..(((.((((((((((((..((((..(((.((((((...)))))).....)))..))))..)))..))))))))).)))............(((..[[[[[[[...[[[[[)))...]]]]]...]]]].]]](((((((((.((((((..((((....))))..)))...))).))).)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00049
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGGACGGAUCGAGCUUGAGCUGCGAGCCGAGAGGCGAUCUCGUAAAAACGCACCUAAAUAUAACUGGCAAAUCUAACCAGAACUUAGCACUAGCUGCCUAAUUAGCGCAGCGAGCUCUUGCCCGCAUCGCCUAUGUGCCGGUUAAGAGCCCAUAACGAAGUAGGCUACGCUUGCGCCCCCGUCUGAGGGCGCAGGAAGAGACUCAUCAGACUAGCUCUCCUAGGGCCCGCCCGCAGGCACGAAGAUGAGCGAAACUAAAUAUGCAGGGCUACGCUCGUAGACGCUGAAGCAAUCGACGUUUCUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCAUCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......((((.(((..((((((((((.aaa.)))))......AAA.........................................(((((((....)).)))))..(..((((.((((((.{{{{{{)))).)).)..)))..)........}}}}}}.....((...((...<<<<<<)).....))..........>>>>>>..((((..((...(((.[[[[...)))....))..))))...............]]]]...))))).....))).))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((((..[[[..))))))..(((((.....)))))(((((.....)))))..........]]]........((((.........))))...((((.....[[[[[)))).....]]]]]..(((((((...((((.[[[[[[))))....)))))))..........]]]]]]....(((((((((..[[[[[[)))))))))..........]]]]]]..(((((...)))))..((((............[[[[[[[..............))))..]]]]]]].............................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00051
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGGAUGGAUCGAGCUUGAGCUGCGAGCCGAGAGGCGAUCUCGUAAACACGCACUUAAAUAUAACUGGCAAAACUAACAGUUUUAACCAAAACGUAGCAUUAGCUGCCUAAUAAGCGCAGCGAGCUCUUCCUGACAUUGCCUAUGUGUCUGUGAAGAGCACAUCCAAGUAGGCUACGCUUGCGUUCCCGUCUGAGAACGUAAGAAGAGAUGAACAGACUAGCUCUCGGAAGGCCCGCCCGCAGGCAAGAAGAUGAGUGAAACCAUAAAUAUGCAGGCUACGCUCGUAGACGCUUAAGUAAUCGAUGUUUCUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......((((((((..((((((((((.aaa.)))))......AAA..................................................(((((((....)).)))))..(((((((.((((((.<<<<<<)))).)).)))))))........>>>>>>....(((((((((..{{{{{.)))))))))..........}}}}}..((((.......(((.[[[.[[[)))........)))).............]]].]]]...))))).....))))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((..(((((((((((((((((((((((((((((....))).........(((.........(((.((((((...))))))..)))...((((((....(((((.........)))))..(((((((..(((((.......)))))...)))))))............))))))(((((((((........)))))))))..))).............))))))...((((.(((....)))......(((........))).........))))..)))))))...))))))))..))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00055
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGACUGGUUUUGACAGCGGGCAGAAAUGGUGGGUAAGCAUGCAGUGCGUCGGUGAUUUGCACUUUAAUCUCAGUUAUCAAAAUUUUAUCUGGCGAAACUAAUUACGCUCUUGCUGCUUAAUCGAAUCAUAGUAGAUUAGCUUAAUCCAGGCACCAGGUGCCAGGACGAGACAUCACUCGGAAGCUGUUGCUCCGAAGCAUUCCGGUUCAGUGGUGCAGUUACAUCGGGGAUAGUCAGAAGUGGCCUUGCGCUUCUGAUGAAACUUUAAAGGAUAAGGCAGGAAUUGAUGGCUUUGGUUCUGCUCCUGCACGAAAAACUUAGGCAAAGAUAAGCAUGUAGAAAGCUUAUGAUUUCCUCGUUUGGACGAGGGUUCGAAUCCCUCCAGCUCCACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((..((..(((((.((((((...((((((((((...aaaaaaa.)))))........AAAAAAA.............................(((((..(((.((((.(.(...).).)))))))....(((.(((((...))))).))))))))((((((((((((..(....{{{{{{.)..))))))....))))))........}}}}}}...((((((((((.[[[[.)))))))))).........]]]].....((((((.(.((...<<<<<..)).).))))))..............>>>>>....)))))......)))))).))))).))..)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
........(((.[[[[[.)))....]]]]](((((...((((((.(((..((((.((((.....))))......((((...............))))...........))))...))))))))).....)))))(((((..((((((..(((.(((((...))))).)))((((......)))).)))))))))))(((((((..(((.((((..(((((......))))).)))).((((((((((......))))))))))...........)))....[[[[[[.......)))))))......]]]]]].............(((...[[[[[[.))).....]]]]]](((((((((((.[[[))))))....))))).........]]]...
|
|
TMR_00057
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGCCCUGGUUUCGACGGGUUGCUAGAAGUUUUGUGGGCGUGUCCAGGCUGGUGUCCAAGGUCCUGGUUAAAAGGAGACCAAACCAUAAUUGCAGAAUCUAAUUUUGCUCCAGCUAUGGCCGCUUAAUUUAAUUAACGCCGCCGCUUUAAGUAGCUUGAGGGGUUAGCAUCCAAUAAACAGAAGCUAACAUCCCAGUGGUAACAACUGGCUAACUUGUUACGCAGCAACUGCCAUGCAAUGCUGUUGAAAAAACAAGUGGGGUUUGUCGAGUUCGCGUAAUUCGAACAGUCUUGUCUUCUGACGAUAAAUGAAGACUACGCACGUAGUCCGCACUAUGGAAAUCAACUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.(....((..((((((((((((((((..aaa.aaa.....)))))......AAA.AAA...........................................((((.....)))).......(.(((..((.........[[[[[[.))...........))).)...................]]]]]]......((..(((((({{{.........))))))..))......}}}...(......((..(...<<..<<...)...))......)............>>..>>...)))))...))))))..))....).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((.(((((...((((..(((.(((((((((.......(((..(((((.......))))).)))......(((((((...))))))).)))))).))).)))(((((...)))))..)))).))))).))))))))).(((((((((...............)))))).)))(((..[[[[[[[)))......]]]]]]](((.[[[[.....)))......]]]].........((((((...((((((..(((((...((((..(((.(((((....)))))........((((((....))))))...))).(((...)))..)))))))))..)))))))))))))))))))....
|
|
TMR_00061
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUACUGGCUUCGACGUGGGUGCUGAAGCAUAAGGAGCAUACCGGGGCGGAUGAGGACCUCGUUAAAAACGUCCACUUUGUAAUUGGCAACGAUUACGCACUUGCAGCUUAAUUAAGCAGCACGAUCAACCUUGUGGUGGUUCCGCACUUGGAUUGAUCGUCAUUUAGGGACCUCGGCGUGUUGGGUUUUCUCCAGCAGACAUGCUUAAAUUUACUGGGGGAGAGGUCUUAGGGAUUUUGUCUGUGGAAGCCCGAGGACCAAUCUAAAACACUGACUAAGUAUGUAGCGCCUUAUCGUGGAUCAUUUGCGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(...((..((((.(((((((((((.[[[[[....))))).......]]]]]..........................((((.........))))....(((((((.((..(((..{{{{{{.)))..))..)))))))......}}}}}}(.((((((((.(...aaaaaaaa).)))))))).)......AAAAAAAA..(((((...((.(((.<<<.<<<)))..))..))))).........>>>.>>>...)))))...).))))...))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((......(((((.......[[[[[)))))......]]]]]......((((((((.......(((...))).(((((...(((((((....)))))))...(((...((((....))))...((((((((...(((((.....)))))......)))))))).....)))......(((((((((((.....))))))..(((((((((...........(((..((((((.(((.((((......)))).))).))))))..)))...........))))))))).))))).....)))))))))))))(((.[[[[[)))....]]]]].))))))....
|
|
TMR_00062
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCGGUUUCGACGGUGACCUGUUCGCUGCAGGGAAGCGUGCCGAGAACGCCGGGUCCGCUCGUGGAUGACCCCGGCAAAAGAAUAAGUGCUAAAUCUAACCGCACUGAGUUCGCUCUCGCUGCCUGAUUUUUAGUCAGGAUUAACCAGUGAGCAGCCGCUCCGUUCACUCCUCCUCGUCUUUGGGAGGAUGCUGAGCGUCGUUUAGAAGACUUGCUGAUGCAGUUGAGCCUCAGGGCUGCAUCGGGACUUUAACUGCGGAUAUGCUCGCCAUCAGUUGUCUGCGACAUCGAUGGGGGCAGAAAAAUCGCCAACUUGGCCAGCAGACUACGCACGUAGAAGACUGUGGGUUCGGUCAUCGGACCGGGGUUCAAUUCCCCGCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((((.(....((((((.....(((((((((...[[[[[[....))))........]]]]]]................................(((((((.......(((((((...))))))).......)))))))........((((((.((((((..{{{{{{.))))))...)))))).......}}}}}}....((((((((((.<.<<.<<.))))))))))..........>>.>>.>...(((..((((.((.aaaaaa...)).)))))))........................AAAAAA...))))).......))))))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((....)))......(((((.[[[[)))))..]]]]..........((((((((((....))))....))))))...(((...[[[[[....)))....]]]]]((((..((((((((((((((((.....))))))......))))))).))).)))).(((((.(((((((.[[[[[[)))))))...)))))........]]]]]]...((((((((((.[[[.......))))))))))..]]]...((((.(((.(((((.(((((...((((...))))..)))))))))).....)))((((...))))..)))).((((....))))..(((((......)))))...(((..[[[[)))....]]]].)))))))....
|
|
TMR_00064
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUAGGUUUCGACUGAAUGUCUUUGUGUUUGCAGUGCAUGUCGAGGGGAGAUAGGCCUCGUAAAAAAAUCUCAAAAAAUAAUUGCAAAAAAUAAAUAUAAUGAACCUGUUGCAUUAGCAGCUUAAUUGGGUUAAUAACCUAAAGGUUCCCUCUUAAUUUUUUUGUUACUCUUAACAAGAAAAUCAUUAUCUCAUAAGAGGUCUAUAAAUAAGAGCGCUCAUUAUAAAGUGCCUAACUCUAUAAUGAUAAGAAUAAAAAUUAGAGCUAAUUGAUUAAUUGACAUGAUCUUAAGUCAUUUUUCAAUAAAAUAUUAAAGAUCUAAACAUGUAGUAUCUGGAAAAUAUAAGAAUUCUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAGCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(.((((.(.(.....(((...(((((((((((((.<<<<<...))))).......>>>>>.............................((((((.....((((((...........)))))).......))))))(((((((((((((((((..[[[.[.))))))))))..........)))))))..........]]]]...((((((..(.(.{{{{{{.).).))))))............}}}}.}}..(((((..((..(((..aaaa.a.a)))...))))))).......A.A.AAAA...)))))...)))....)))....).).)))).)...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........(((.[[[[))).....]]]]....(((((((.((((.[[[[[...))))........]]]]].............................(((((((((((....)))))....(((((((...)))))))))))))(((((((((((((((((((....))))))))))))..[[[[....)))))))...]]]]((((..[[[[[..))))..]]]]]....(((((...................)))))...(((((.....((((..[[[[[[..))))....))))).........]]]]]]...)))))))............................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00065
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUUGGAUUCGACGGAGUAUCUUGUUAUUUAAAGUGCAUGCCGAGGUGAGGCAGGCCUCGUAAAAAGCCUCAAAAGAUAAAUGCAAAUAAUACUACAUAUAGAGAAUCUGUUGCUUUAGCAGCUUAAAUCAGACUAAUAUUCUGAAGGUUCCCUCUCGUUUCAAUAUUUACUCUUAGAUAUUAAAAAAUAAAUAGAGAGGCCAUAUAAAUAAGAGUGCGCGUAAAUGCUUGCUUUUGGCUUAACGUUAAGUAUAAAAAGCUAGUUGGUUAGUGAUUGGUCUUGAUAUAUCUACGCCAAUUAAAUGUAAUUCAAGACCUAAGCAUGUAGGUUACUAAAAAUAAAAAGAAUUCUGGACGCGGGUUCGAACCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((.(.(...(((((..(((((((((((((({{{{{{...)))))......}}}}}}...............................(((((((..(..((((..............))))..)..)..))))))((((((.(((.((((((.[[[[.[.)))))).)))........))))))...........]]]]]..((((.(..(((.aaaaaa))).).))))........AAAAAA..(((((.(....((.<<<<.<<<.))......))))))..........>>>.>>>>...))))).....))))..)))))..).).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((((((((......))))).............(((....[[[[[[.)))..........]]]]]]...............................(((((((((((....))))).....(((((.......)))))))))))((((((...........[[[[[[[[..................)))))).........]]]]]]]].(((((...(((.((((((.(((((....)))))...)))))).)))...[[[[[[[[[[[[[[[[[[[[[[.))))).......]]]]]..]]]]]]]]..........]]]]]]]]].........)))))).....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00067
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGAUCCGGAUUCGACGUGGGUCAUGAAACAGUUCAGGGCAUGUCGAGCACCAGUACGCUCGUAAAACCACUGGAAACAAUACAAACGCCAACGACGAGCGUUUCGCUCUCGCCGCUUAAGCGGUGAGCCGCUGCACUGAUCUGUCCUUGGGUCAGGCGGAGGAAGCAACUCCCGUAAGGGAGCCAUCGCCUAAAGGGGCAACCCUUGAACCGCAGCAGUGUUAUUCACAAGGAAUCGGUCUGCGCUGGGGUCACACGGUUCAGGCUUAAAUUACGUGAAUCGCUUCGGUCCGGCCCGUUGAUCGGCUAAGUCCGGGGUUAAAUCCAAAUAGAUCAACUAAGCAUGUAGAACUGACUGCGGAGGGCUUGCGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(....(((.((((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]]..................................((((((((....)))))))).((((((.((((((..<<<<<<))))))((((.........(((((....)))))............((((....))))...)))).)))))).......>>>>>>....(((((.((((.{.{{{{.)))).))))).........}}}}.}..((((((.(.((((.aaaaaaa))))..).)))))).............AAAAAAA...))))).....)))))))...).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((.(((((((((.....((((....))))...))))))))).......[[[[[[[[.......)))))...................]]]]]]]]...(((((((((((....))))))))...((((.((((((((....))))))))))))....)))..(((((....))))).....(((..[[[[)))...]]]]((((((((((.(((.....)))..(((.....)))..))))...[[[[.)))))).............]]]]...(((((((...((((.[[[[[[[))))....)))))))............]]]]]]](((((.(((((......)))))....))))).(((.[[[[[)))...]]]]].)))))))....
|
|
TMR_00073
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGAUUUGACUGAAAAUGCUAAUAUUGUAAGUUGCAGGCAGAGGGAAUCUCUUAAAACUUCUAAAAUAAAUGCAAAAAAUAAUAACUUUACAAGCUCAAACCUUGUAAUGGCUGCUUAAGUUAGCAGAGAGUUUCGUUGAAUUUGGCUUUGAGGUUCACUUAUACUCUUUUCGACAUCGAAGCUUGCUUAAAAAUGUUUUCAAGUUAAUUUUUAGGGACUUUUGUACUUGAGAGCAAUUUGGUGGUUUGCUAGUAUUUCCAAACCAUAUUGCUUAAGUAAAAUGCUAGAUAAGCUUGUAGAAGCUUAUAAUAUUGUUUUUAGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCAUCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((...(((((((((((((.(((((((.(([[[.)).)).....]]]..........................(((((((.(...).)))))))(((((.....)))))..((((((.(..((.((.((.{{{{{{{)).)).))..)..)))))).......}}}}}}}(.(((((((((...<<<<<<<..))))))))).).......>>>>>>>.(((((...((((((((aaaaaaaaa.))))))))))))).......AAAAAAAAA....)))))....)))))))))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((......)))))).....(((((((((((((..(((.[[[[[......)))....]]]]]........................((((((((((....(((((......(((((......))))).(((((((((((((........((((.....)))).......)))))...)))))))).........[[[[[[[[[[[.......)))))........]]]]]]]]]]]...((((......[[[[[[[[[....)))).............]]]]]]]]]...)))))))))))))))))))))))...........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00076
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACGUCGGACACUGCGACGGGAGAAGCGGGCCGAGAAUGUAGAGUCAUCUCGUUAAUGUCCUCUGCAAAACAAUAGGUGCUAAGUCUAAUAACCGCACCGAUUUCGCCCUCGCUGCCUGAUUAGGCCGAGCUGCGAAUCCGUCAGUCUAGAGUUGCUUCCACUCUAGGUCCUGGCGUCGCUUAGGGAGCCACUGCUUCAGAUAUUUGUUGAGGGUAUCUGAGGGACUUUUACUCAACUCCGUUCGUUGGUCCACAUGUUCGUGUGAGGGCCAGAACCUAAGAAACUACUUCACGAACUGCGCCCGGAGAAGUCCUGACAAUCUGCCGACGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCAUCUCCACCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((.......(.(((((....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA................................(((((....((((..((((....))))))))....)))))((((((.(((((((.{{{{{{)))))))...)))))).......}}}}}}.....((((((((((..[[[[[[.))))))))))........]]]]]]...((((............<<<<<<<.<.))))..................>.>>>>>>>...)))))......))))).)......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((....)))((((.....[[[[))))......]]]]..((((..[[[[[[[.[[[))))...]]]..]]]]]]]........(((((..............)))))...(((((....(((((((....))))..))).)))))...(((((.(((((((.[[[[[[)))))))...)))))........]]]]]].....(((((((((((.[[[[[[)))))))))))........]]]]]].........((((((....[[[[[[[...))))))..................]]]]]]]......((((((.[[[[......))).)))..]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00080
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUUUUUGGAUUCGACAAAGUUAUCAAAAAAGUAAAGUGCAUGCCGAGGAACGGUUUGCCUCGAUAAAAAACCGUAAAAAAAUAGCUGCAAAUAAUAAACAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAAAAACUGUAUAAAGCCCUUUCAUCUCUGACUUCUCUCUUGAGAACGAGAAAUUUUUAAGAAAGGCCGACAUUUAAAGAGAAAAAUGUGAGCACUAUGCUUGAUAGUGACACAAAAUUAAUUUUUCAAGCUAUAAGCUUAAAAUGAGUUUUUCCAAAUUAAGCAAUGAAAAAAUAAAGAAAAACUAAGCAUGUAGUAUCUUUAUUUAUAGAAAUUUUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((.(....(((..((.(((((((((((((.{{{{{{..)))))......}}}}}}.................................((((((((((.........)))).))))))((((((.((((...(((.[[[[[[)))...)))).........))))))..........]]]]]]....((((..(((((.aaaaaa))))).))))...........AAAAAA..(.(...(.....<..<.<<<.........)...).).........>>>>..>...)))))...))).))..)))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((.......)))).........................(((((.[[[[[[[.))))).....]]]]]]]........((((((...................[[[[[[))))))............]]]]]]((((((.((((....[[[[[....))))..]]]]]........))))))...((((((........))))))...(((((.[[[[[[)))))................]]]]]]...(((((((...))))))).(((((((((.....)))..(((((((((...((((......)))).)))))))))........)))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00081
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUAUUGGAUUUGACAAAAUUAUUGAAAACUGAUGUGCAUGCCGAGGAUGGUUUGCCUCGUUAAAAAACCAUAAAAAAUAGUAGCAAAACAAAAUCAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAAUCUGAAUAAAGCCCUUCUUUUAAACAUAUUCUCUUAAUGUUUAAUUUAUAUAGAAGGUUAAUCUAAAGAGAUCGCAACUCAAAUCUAUUUUGAAAGAUUUUUUGUUGCUAAAUAAAAACUUCAAAAUAUAUAUCUAUAAUGAGUCUAUACAUCGAUAGAUAAGAAAAGAUAAUAGACUAAGCAUGUAGUAUCUGAAGUCGUAAAAAUUUUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAGCUCCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((.((...(..(.(.((((((((((((([[[[[[..)))))......]]]]]].............................((((((.(((.........)))..))))))((((((.((((((((..aaaaaa.)))))))).......))))))........AAAAAA..(((((..((((((<<<<<<<<))))))...)))))...........>>>>>>>>((.((((.((...(.{{{{.{{))).)))).)).........}}..}}}}...)))))...))).).)..)...)).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((.......)))...((((((.........(((.(((.....(((((((...........)))))))........))))))........)))))).((((((.(((.........)))..))))))((((((.((((((((..[[[[[[.)))))))).......))))))........]]]]]]..............(((((((((....((((((((....)))))))).)))))))))..(((((((....[[[[[[[..[[[.)))))))......]]].]]]]]]]............((((((((.......)))))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00082
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUUUUUGGAUUUGACAAAAUUAUCAACAAAGUAAAGUGCAUGCCGAGGAACGGUUUGCCUCGAUAAAAGCCGUAAAAAAAUAAUUGCAAAUAAUAAACAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAAAAACUGAAUAAAGCCCUUCCUUCUUAUCCUCCUUCUCUUAGGAUGAGAAAACAGGAAGGUCAGAAAAAGAGAAAAACGUGGAUAUCAAGCUUGACGAUAACACGAAGUAGUUUUUUCAAGCUAUAUACCUAAUAUGUGUUUUUCCAAAUUAGGUAAUGAAUUCAAUAAAGAAAAAACUAAGCAUGUAGGGCUUUAUUAGUAGAAAUUUUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAGCUCCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((.(.....((...((((.((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>.................................((((((.(((.........)))..))))))((((((((((((.(....{{.{.{..)..)))))....))))))).......}.}.}}....((((..((((.aaaaaaa.)))).))))...........AAAAAAA.(.((.....(.((.[[[[[[[))....).....)).).........]]].]]]]...)))))....))))..))....).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((.......)))))..........((((((((......(((((.[[[[[[[.)))))....]]]]]]].................................((((((.(((.........)))..))))))((((((((((((((((.........)))))))))....))))))).................((((..((((.[[[[[[[.)))).))))...........]]]]]]]...((((((((..............))))))))..................................))))))))................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00083
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGUUUCGACAGGGGUUGUGAAGCGGCUAGGGCAUGUCGAGGACCCGUCACCUCGUUAAUCAAUGGGAAAAUCGUAACUGCAAACGACGAUACGUUCGCACUGGCAGCCUAAGGGCCGCCGUCCUCUGCCUAGUUCACUGACGGGCUAGUGUCGCAAGACCGGUAGCAAUACCGCCAGAGGUCAUUUACGUCAGUUAAGCCCUGUCGGCGUCGCGACGCCAGGGUCGAAAAUCUAGCGAAUCGCCGUAGUGCAGCGUGUUCGUCCGCGUCGCUGCGGUUAAAUCAAAAGACUGGACUAAACAUGUAGAACUAGUCGUGGAGCGCUUCUGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(...((((((((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]]..................................((((.(((....))).)))).((((((.((((((.{{{{{{{)))))).(((....)))(((((....))))).)))))).......}}}}}}}...((((((.((...<<<<.<)).))))))........>.>>>>....((((.(....(((.aaaaaaa))).....)))))...........AAA.AAAA...))))).....))))))))..)..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((.......)))).(((....)))....(((((....(((((.[[[[[..))))).......]]]]]...(((((...[[[.....)))))......]]]..(((.(((....))).))))))))....((((((.[[[[[[[)))))).(((....))).((((....)))).((...)).......]]]]]]]...(((((...(((((.[[[))))))))))................]]].....((((((((((..[[[[))).)))))))......(((...((((((.(((......)))..)))))).))).........]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00092
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUGUUUUGGAAUUCGACGGGGGCAGUCGGAUUCCAAAUAGCGGGUAGUGGUUUUCUCGGUACCACUAUAAAAAACCGAGAAGAAAAAUAACUGCAGACAAAGCUGAACUCGCUUUAGCUGCAUAAGAUAAGCAGCUAACGUCCGCCGGAGGUGCCCACGGCCUCCGAGUCGGGCGCCAACCCACGUGGGGCACCGAAAGUAAGGUCGCCUGAGCCUUACUUUUGGGUCAAAUCUCAGGCUGGGGAAGAAAAAGCCUGUCAGUGGGCGUUUUCUUCCCGAGAAUUUAAGUACACUGACUGCACCCGGAGAAGUUUGGAGUUCGAUGCCUUCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...............((((((((.(.(((((((((((..((((((((((...aaaaaaa.))))).......AAAAAAA.................................(((((((...........)))))))((((((.((((((...[[[[[.))))))...))))))........]]]]]...(((.((((...{{{{....{........)))).)))....}....}}}}.(((((..(((..(..<<<<<<<)....))).))))).............>>>>>>>...))))).....)))))))))))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((((((((((.......))))))))))))).(((((((.((((((((((((((.............)))))))).......)))))).[[[........)))))))((((((((.........)))))))).]]].((((..[[[[[[[.)))).........]]]]]]]...........(((.(((((((((((((.[[[[[[)))))))))))))))).....]]]]]]..((((((((((.((((......)))).))))))))))..........(((..[[[..)))...]]]....((((((((........))))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00093
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCGACUUGGCUUCGACAGGAGUAAGUCUGCUUAGAUGGCAUGUCGCUUUGGGCAAAGCGUAAAAAGCCCAAAUAAAAUUAAACGCAAACAACGUUAAAUUCGCUCCUGCUUACGCUAAAGCUGCGUAAGUUCAGUUGAGCCUGAAAUUUAAGUCAUACUAUCUAGCUUAAUUUUCGGUCAUUUUUGAUAGUGUAGCCUUGCGUUUGACAAGCGUUGAGGUGAAAUAAGGUCUUAGCCUUGCUUUUGAGUUUUGGAAGAUGAGCGAAGUAGGGUGAAGUAGUCAUCUUUGCUAAGCAUGUAGAGGUCUUUGUGGGAUUAUUUUUGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCUUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((...(((..((((..((((((((((aaaaa.)))))......AAAAA...........................................(((..(((((........))))).)))((((((.(((((.({{{{{{{{..)))))).))))))........}}}}}}}}.((((((((((.[[[.))))).)))))........]]]...(((((..(((....(.(..<<<<<<<<).)))).))))).......>>>>>>>>.....))))).....))))..)))...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....(((((....)))))..(((......[[[)))..]]]..(((((((...[[[[.....))))))).........]]]]................((((..((((((((.......))))))))......))))((((((.((((((.[[[[[[[[..)))))).))))))........]]]]]]]].(((((((((((...))))).))))))........((((..[[[[[[[[[[...........))))....]]]]]]]]]](((((((((((((((((.......))))))))...[[[..)))))))))...]]]((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00096
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACUUGGCUUCGACAGGAGUAGUGGAGUCACGGCGGCAUGCAGCUUUGGGCAAAGCUUAAAAAGCCCAAAAUAAAAUUAAACGCAAACAACGUUAAAUUCGCUCCUGCUUACGCUAAAGCUGCGUAAGUCCAGUUGAGCCCUGCGAAACUUCAAUGCUAUCUAGAAGCUUUAGCGGGUAAUUUUUGAUAGCUUAGAUUAAAGAAUUGACGAAUCUAUAAUUGAAAUUUAGUCUUAGCUUAGCUAAACGCUUUGGGAAGUGAGCGAAGCUAAGUGAAACUCUCACUUCUGCUAAGCAUGUAGAGGCUAUGAAUCUAUUAUUUUUGGACUGCAGUUCGAUCCUGCACACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((((((.(((.(((..((((((((((<<<<<.)))))......>>>>>............................................(((..(((((........))))).)))(((((.(((((..({{{{{{{{..)..))))).)))))........}}}}}}}}.(((((.(((.(.[[[.).))).)))))........]]]...(((((..(......(...aaaaaaaa)....).))))).......AAAAAAAA.....))))).....))).))).)))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((((((............(((...(((((((............))))))).........[[[)))......]]]......((((..((((((((.......))))))))......))))(((((....((((...[[[[[[..)))).....)))))........]]]]]]..((((((((...........[[[[[[.......))))))))..(((((((....(((((........))))).....((((((.....))))))..))))))).]]]]]].........)))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00101
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGACUUGGCUUCGACAGGAGUAGAGUGGCCUUGGUGGCAUGUCGCUUUGAGCAAAGCGUAAAAAGCUCAAAUUAAAAUUAAACGCAAACAACGUUAAAUUCGCUCCUGCUUAUGCUAAAGCUGCGUAAGUUCAGUUGAGCCUGAAUUUUAAGUGAUACUAUCUAGCUUAGAAUUUGGUCAUUUUUGAUAGUGUAGAUUGAAAUUUGACAAAUUUUAAUUGAAAUUAAAGUCUUAGUCUAGCUUGAAAUUUUGGAAGGUGAGUUUGGCUAGAUGAAUUUUUCACCUUUGCUAAGCAUGUAGAUGCCGUGGUUGUUUUAUUUUUGGACAGGGGUUCAAUUCCCCUCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((((..((((.(((((.((((((((((<<<<<.)))))......>>>>>............................................(((..(((((........))))).)))(((((((((((((.[[[[[[[[..)))))))))))))........]]]]]]]].((((((((((.aaa.)))))))))).........AAA...(((((..((.((((....{{{{{{{{)))))).))))).......}}}}}}}}.....)))))....))))).))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.......((((......[[[[......)))).(((.....))).]]]]..(((((((...[[[[.....)))))))..........]]]]..........((((((((((..((((((((.......))))))))......))))..))))))......((((((((....[[[[[[[[[[.........))))))))..............]]]]]]]]]].................((((((((..........[[[[[[[[[...))))))))......]]]]]]]]].(((..[[[[)))....]]]]............(((((..[[[[)))))..]]]]............
|
|
TMR_00102
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGACCUGGCUUCGACAGGAGUAGUUUGACUAGGAUGGCAUACCGCUUUGGGCAAAGCGUAAAAAGCCUAAAUAAAAUUAAACGCAAACAACGCGAAAUUUGCUCCUGCUUACGCUAAAGUUGCGUGAGUUCAGUUGAGCCUAGAGCUUGAGUGAUACUAUCUAGCUUAAGUUUUAGUCAUCUUUGGUAGUGUAGUUUUAAGACUUGACGCACCUUAAAGUGAAGUUUAGUCUAGUCAAAUUUGUAAGUUUUGGAAGAUGAGCGGAAUUUGAUGAAAGAGUCAUCUUUGCUAAGUAUGUAGAGGUCUUUUUUGGGCUAUUUUUGGACAGGGGUUCAAUUCCCCUCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((((...(..(((((..((((((((((aaaaa.)))))......AAAAA...........................................(((..(((((........))))).)))(((((((((((((.[[[[[[[[..)))))))))))))........]]]]]]]].((((((((..{.{{{....))))))))........}}}.}(((((..((.....(.(..<<<<<<<<).).)).))))).......>>>>>>>>.....))))).....)))).)..)..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.......))))(((.[[[[[))).....(((....((((((....))))))......)))]]]]].........(((...[[[[)))............((((((((.......))))))))...]]]]....((((((((((((...........))))))))))))(((..(((((((.((((((((....))))..)))))))..)))).......((((((((((((((((....((((....)))).....))))))))).((((((..((((((((.......)))))))))))))))))))))......))).((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00103
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAAAGGGUUCGACGGGGGAGCGAAGGGCCGAAAGUAGCGAGGCGAGGACCCCAUCUUACCUCGUUAAAAAUGGUGGGAAAAGAUAACUGCCAACGAAAACUACGCUUUAGCUGCUUAAUAACGCAGCUACGUCCUGACGGAAGCUUGCCCGGGGCUUCUGUCGGGGCGUGACCGGACCGGGCUGGCUUAUGAAGGGUGUCCCGGCUCUUCAUAAGCGAGAUUUUACGGGAUAGCCCGAUUGUGGCCUGCCGGUAGGCACCAAUCGGGUGAAAGCAAAAAUACCGGCUGCCCUCGGAGAAGCUUUCGGUUCUUGUCCUCCGGACGGUGGGUUCGAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(..(((((((((((..((((((((((..[[[[[[...)))))........]]]]]]..............................((((((..........))))))((((((((((((((((.aaaaaa))))))))))))))))........AAAAAA..(((((((((((({{{{{{{.)))))))))))).........}}}}}}}(((((..(..(.(..<<<<<<<).)....).)))))...........>>>>>>>...))))).....))))))))))))..)))))))....(.(((.......))).))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((((((..(((((((((((((((((.(((((((..[[[[[[...)))))))......]]]]]].........................)))).................(((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))).[[[......))))(((((((((((((......))))))))))))).........]]]....(((((((((..(((((....)))))..)))))))))...(((.......[[[))).....]]]....))))))))))))).......((((.....))))..))))))))))))))....
|
|
TMR_00104
|
[ FASTA input ]
|
UAGCACAAUAUGUUACAUUAUUUAUGUGAGCAAGUUCGAUAAAAGUUCGUCUCCCUAAAGUGAUAUAAAACACUUGAAGCUAUCUAAAUAUUCAUAAGUUUAAAAAGCUAUUAUAACUUUUUCUUCUGAAAAAUAAUCAAAGGAAAUUUUUACGGCAUCGCCCAUGUGCUCGGGUAAGGGUCCUAUAAUAAGUGGGAUACGCUAAAUUUUUCCGUCUGUAAAGUUUAGAAGAGAUUAUCAGACUAGCGAUGCAUGAUGCCUGUUAGGCGGCUAAUGUUCAGCGAAACCUUAAUAGCAUGACUAUGAACGUAGAUGUCUAAGUGCCGAUAUGCUUGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCGUCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
..(..........(.((....(.....(.((..(..((.(.(.{..{{{{.).......}}}}..}..................................................((((...(..........)...))))...((((((.((((((..aaaaa)))).)).)..)))))..........AAAAA.....(((((((((...<<<<<.)))))))))..........>>>>>..((..........(((.[[[[.[[))).........))............]].]]]].......)....))..)..)).)....)....)).).(((((.......))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
............((((((.....)))))).............(((((..........(((((........)))))..((((...(((((........)))))...)))).....)))))((((((.(((.......))).))))))........((((.[[[[..))))..]]]]....(((((((.....)))))))...(((((((((...[[[[[.)))))))))..........]]]]].......(((...[[[[)))..]]]](((.[[[[[[))).........((((.....))))]]]]]]...(((((((((........)))))))))((((...[[[))))...]]].......
|
|
TMR_00106
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAUAGGUUUCGACUUAGGAAUGAAGUGUUAAUCGCAUGCGGAGGGCGUUGGCUGGCCUCCUAAAAAGCCGACAAAACAAUAAAUGCCGAACCUAAGGCUAAAUGCGAAAUUAUCAGUUUCUCUGAACUCUCUGAGCAAAGAUUAGCUGCUUAAUUAGCAAAAGUUGUUAUUUAGAUAACCUCUAGAUAACCCGGUCUUCAUGGACUCUACCAGAGGUUUGUGAAGUACCGUCAUCUAUCUGGUUGGAAUCUACCUCCUCUAAUUCUCAAGGGGGUUUAUUCGAGAUUAUUGAGAAUCGUUGGUUUCCAUAGAUGUUCUUAGCUGAGGAAAUGCAACGUUAGACUACUAGGGACUAAGCAUGUAGAAGUUAGCAGGGAGUUUACUAAGGACGAGAGUUCGAGUCUCUCCACCUCCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.(((....(((((((..((((((((((..{{{{{{{..))))).....}}}}}}}..................................................(.(.((....(......((.((((.((((.........)))).)))).))......)....)).).)..((((.((((((((((..[[[[[[))))))))))..)))).......]]]]]](.((((..(((((((...aaaaaaa)))))))..)))).)......AAAAAAA(((((((((((.(((..<<<<<<<<))).)))))).)))))........>>>>>>>>...))))).....)))))))....)).).)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......(((.[[[[..)))..]]]].....((((((..(((((..[[[[[[[..))))).....]]]]]]]............(((........)))...)))))).....((((.....))))..(((.[[[[[[.))).....]]]]]].............((((((((((.....)))))))))).((((((((((((.((((...))))..)))))))).))))...............((((..(((((((...[[[[[[[)))))))..))))........]]]]]]](((((((((((.(((..[[[[[[[[))).)))))).)))))........]]]]]]]]............(((.(((.[[[[))).)))..((((....))))...]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00109
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAAAGGUUUCGACUUAGAAAUGAAGCGUUAAUUGCAUGCGGAGGGCGUUGGCUGGCCUCCUAAAAAGCCGACAAAACAAUAAAUGCCGAACCUAAGGCUGAAUGCGAAAUUAUCAGCUUCGCUGAUCUUAAUGAUCUAAGAGUUGCUGCUUAAUUAGCAAAGUUGUUACCUAAGUACUGGUAACCCGGUGUUCGCGAGCUCCACCAGAGGUUUUCGAAACGCCGUCAUUUAUCUGGUUAGAAUUAGGGCCUUUUAACUCUCAAGGGAACUAAUUUGAAUUUUAAUGAGAGUCGUUGGUCUCUAUAGAGGUUUCUAGCUGAGGAGAUAUAACGUAAAAUAUUCUAGAAACUAAGCAUGUAGAGGUUAGCGGGGAGUUUACUAAGGACGAGAGUUCGAAUCUCUCCACCUCCAUAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.(((....((((((((.((((((((((..[[[[[[[..))))).....]]]]]]].......................................................(((.((.(.(..(.((.((.((((........)))).)).)).)..).).)).)))..(((((((((.(((((..{{{{{{))))).)))).))))).......}}}}}}(.(((((((..((((...aaaaaaa))))..))))))).).......AAAAAAA(((((((((((.(((..<<<<<<<<))).)))))).))))).........>>>>>>>>...)))))....))))))))....)).).)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..................(((...[[[[..)))..]]]](((((..[[[[[[[..))))).....]]]]]]]............(((..[[[...)))....(((..(((((.(((((((...((((.....))))...)))..))))..))))).))).....((((((........))))))..]]].((((.(((((..[[[[[[))))).)))).............]]]]]]..(((((((..(((((..[[[[[[)))))..)))))))..........]]]]]](((((((((((.(((.[[[[[[[[[))).)))))).))))).........]]]]]]]]]...............(((.[[[[)))......((((....))))...]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00111
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAUAGGUUUCGACUUGAAAAUGAAGUGUUAAUUGCAUGCGGAGGGCGUUGGCUGGCCUCCUAAAAAGCCAACAAAACAAUAAAUGCCGAACCUAAGGCUGAAUGCGAAAUUAUUAGCUUGUUUGACUCAGUAGAGGAAAGACUAGCUGCUUAAUUAGCAAAAGUUGUUAGCUAGAUAAUCUCUAGGUAACCCGGUAUCUGCGAGCUCCACCAGAGGCUUGCAAAAUACCGUCAUUUAUCUGGUUGGAACUUACUUUCUCUAAUUCUCAAGGAAGUUCGUUCGAGAUUUUUGAGAGUCAUUGGCUGCUAUAGAGGCUUCUAGCUAAGGGAGUCCAAUGUAAACAAUUCUAGAAGAUAAGCAUGUAGAGGUUAGCAGGGAGUUUGUCAAGGACGAGAGUUCGAGUCUCUCCACCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.(((....((((((((.((((((((((..{{{{{{{..))))).....}}}}}}}..................................................(.(((.((..(..(...(.(((((.((((.........)))).))))).)...)..)..)).))).)..((((((.((((((((..[[[[[[)))))))).).))))).......]]]]]](.((((..(((((((...aaaaaaa)))))))..)))).)......AAAAAAA((((((((.((.(((...<<<<<<<))).)).))).))))).........>>>>>>>....)))))....))))))))....)).).)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((((....)))))........((((.....))))..(((((..[[[[[[[..))))).....]]]]]]]............(((.[[[....)))....(((..(((((.(((((.((((..(((....)))...)))).)))))..))))).)))...]]]((((.(((((.....))))).)))).((((((.((((((((..[[[[[[))))))))..)))))).......]]]]]]..((((..(((((((......[[[.)))))))..))))...........]]].........(((.....[[[[[[[)))...]]]]]]]............((((....[[[[[[[.[[[))))....]]]....]]]]]]]..(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00116
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGCUCUGGUUUCGACAGGGAGUGAACGCCGUAGACUGCAGGUCGUGCCGCCCAGUCACGUAAAAGGGGCAAGGCAACAACUGCCAACACCAACACUCGGGCCCAGGCUCGCCUGGCCCUCGCCGCUUAAUAAUAGCGGCGCGCUCGCCGUAGCUCCCCCGAUGGUUACGGGUCGAGCGUCAGCAGUCGGGUGCUCCGGUAACGCCUGCCUGAGCGUUAUCGGCUAAGAGAUCAGGCUGGCCCAACGGUCGCUUUGCCACUCGUGCGACUGCGGGUGAGAUGAAACGAGGGGCUAAACCUGUAGAUGUCUGCGGUCUAGCUUUCUGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(.(((((((((..(((((((((..aaaa...))))......AAAA..................................................(((((((.......)))))))((((((((((((((..<<<<<<))))))))..))))))......>>>>>>....((((((((((..[[[[[[))))))))))........]]]]]]..((((..(((((((...{{{.{{{{.))))))).)))).........}}}}.}}}...))))).....))))))))).).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((.[[[[[...))).....]]]]]..........(((.[[[[))).((((((((.............))))..))))....]]]]..............(((((.(((....))))))))..((((((.......))))))(((((((((((((((..[[[[[[))))))))..))))))).....]]]]]]....((((((((((..[[[[[[))))))))))........]]]]]]..((((..(((((((.......[[[[[))))))).))))........]]]]]((((((.(((.((((....))))))).)))))).......(((((........)))))..........
|
|
TMR_00117
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACAGGCUUUCGACAGGGUAGGUGUAAGGUGGCGUUGCACUCCGAGUUUCAGCAUGGAUGGACUCGUUAAAGAAGUCUAUGCAACCUUUAGAUGCAGACGAUUAUUCGUAUGCAAUGGCUGCCUAAUUAGCAAAAGUUAAUUAACCAGCCAUCGCUCUUCAGCGGAGGCGCUUACUCCAAGGCUGUUAGAGUGGCAUAAUUCGCGCUUGAGCUCUGCUCGCGCAAGUAAGCUCCGUUUUGUAUUGCCUGAUGUGCUUAGCGGGUAUUUAUUCGGGAUAGUAAGUUGAACGUUACAAGUGUCGUACCAACUUAUGAAUCUUAAACACUUGAGAUGAGUGUGGUAGCGUUAUCAAGCAAUAUUCUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(((..((((((((((((((((((((.....{{{{{{{..)))))........}}}}}}}.................................((((((...(.((((((....))))).).)..))))))(((((..((((......aaaaaaa.....))))...))))).........((((..((((...)))))))).AAAAAAA((((((..((((..[[[[[.))))..)))))).......]]]]]...((((((((.(((...<<<<<<.)))..))))))))..........>>>>>>....)))))...))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((.......(((((((((((....((((((...[[[[[[[[.))))))........]]]]]]]]..........((((.((((....)))).))))(((((((..((((((((....))))))))..)))))))((((((.((((((((.......))))...))))..)))))).........((((..((((...))))))))........((((((..((((..[[[[[.))))..)))))).......]]]]]...((((((((.(((...[[[[[[[)))..)))))))).........]]]]]]]...........)))))))))))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00118
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACAGGCUAUCGACAGGAUAGGUGUGAGAUGUCGUUGCACUCCGAGUUUCAGCAUGGACGGACUCGUUAAACAAGUCUAUGUACCAAUAGAUGCAGACGAUUAUUCGUAUGCAAUGGCUGCCUGAUUAGCACAAGUUAAUUCAGAAGCCAUCGUCCUGCGGUGAAUGCGCUUACUCUGAAGCCGCCGGAUGGCAUAACCCGCGCUUGAGCCUACGGGUUCGCGCAAGUAAGCUCCGUACAUUCAUGCCCGAGGGGGUGUGCGGGUAACCAAUCGGGAUAAGGGGACGAACGCUGCUGGCGGUGUAAUCGGACCACGAAAAACCAACCACCAGAGAUGAGUGUGGUAACUGCAUCGAGCAGUGUCCUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(((..(((((.((((((((((((((.....{{{{{{{..)))))........}}}}}}}................................((((((..(((((((((....))))).)))).))))))(((((.(((((......<<<<<<<.....))))).))))).........((((..(((((....))))))))).>>>>>>>(((((((((((...aaaaa..))))))))))).......AAAAA....(.((.(((..((..[[[[.[[[))..)))..)).).........]]].]]]]....)))))...)))).)))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.........(((((........[[[...)))))...]]]..((((((...[[[[[[[[.))))))........]]]]]]]].........((((.((((....)))).))))((((((..(((((((((....))))).)))).)))))).......(((((.[[[[((((......)))))))))....]]]]..(((((((..(((((....))))))))).........((((((((((...[[[[[..))))))))))........]]]]]....)))..(((((((((....))))))..))).((((((............[[[[.......)))))).(((((.....)))))...]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00119
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACAUGGCUUCGACGCCGGUGACAAUCCCUGAGGUGCAUGCCGAGAGCGUAACGUAUCUCGUAAAUCCAACGUUACGAUUAAAUAGUCGCAAACGACGACAACUACGCUCAGGGCGCGCUGGCAGCGUAACAACUGCUAGCUUCUAGUCCGGCCCGGAGGUGAUGUGCCCAUUCAUCACCGAUGGGAUACGAGCUCAGACUGAUGGGAUCGCGGUUGGCCCUGUCCUCGUGUCAGCCGCUAAAACUUAGAGGAAUCGCGUCGCUGGAUCCUGCCCGUCGGAGCCAGGGACGUUAAAUCAGAAGACGGACCUAAGCAUGUAGAGCCGAUGGGUGAGUGCCGGCGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((...(((.((((((((((.{{{{{{{..))))).........}}}}}}}.........................................(((((((........)))))))(((.((......((((...((((((..<<<<<<))))))...)))).)).)))........>>>>>>.(.(((((((((.(..aaaaa).))))))))).).......AAAAA...(((((.((.(.(((.[.[[[[[)))..).)))))))..........]]]]].]....)))))....)))...)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((......))))..............(((....)))..(((((((.((((...(((.......))).))))........((((....))))......))))))).(((((.((((((((........))))))))...........[[[[..[[[[[[[)))))...]]]]]]]..]]]].......((((......))))...(((((((((....[[[[[..))))))))).........]]]]]......(((((((.....(((((((((....(((..((((.........))))..)))............))))))))).....)))))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00123
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUCGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUCAGAGCCCUCUCUCCCUAGCUUCCGCUCUUAAGACGGGGAUCAAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUAAUCAGGCUAGUCUGGUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGGUGCCAGGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGAUGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(.((..(((((((((((((({{{{{{...))))).......}}}}}}.............................(((((.((((.........))))..)))))(((((((((((..(((...<<<<<)))..)))).....)))))))..........>>>>>....(((....((((.aaaaa))))....)))...........AAAAA..((((((((.(.(((.[[[.[[[))).).)))))))).........]]].]]]...)))))...))))..)).)....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((...(((((((.......)))))))[[[....)))...]]]...(((....[[[[[[.)))...........]]]]]]........((((....)))).........((((((((((.........))))).)))))(((((((((((..(((...[[[[[)))..)))).....)))))))..........]]]]].(((((((((((((((....)))).....(((((...((((.(((((....))))))))))))))...))))))).[[[[[...))))((((.............))))...]]]]].................(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00124
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAUUGCCUGAAUGACUGCGAGAAGCGGGUCGAGGAUGCAGGGCUAUCUCGUAAACGCUCUCUGCAAAAUACAACUGCCAAUAACAAGCAGUCGUCCUUUGUUCUCGCUGCCUAAGCGAGCGCACUAACAGGACCGUCGACCCGGUGAUGCUCUCUAUCCGGUAAGUCGGCGUCAGAAAAGGGAGCUCGCUGCGCGGUCGUGCCUCAGGGCCGCGCGGGACUCGAACUGAGGCUGGGCCCGUCGGAUCAGAUGCCAGGAGCAAGUUCCGGGGCCGAGCAGGACGCCUUUCCUGGAUACACCCGUAGAAGGCGCAGGAUUACAGCAGUGGACCGGGGUUCGAUUCCCCGCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((...(....(((((.....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA............................(..((.((.(.(.(.........).).).)).))..)...((((((.((((....{{{{{{{..))))....)))))).......}}}}}}}...((((((((((..<<<<<<.)))))))))).........>>>>>>..(((((..((((.(.....[[[[[[[...).))))))))).............]]]]]]]....))))).......)))))...)...))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((.....[[[[)))..]]]]..(((((((.(((...(((((..[[[[.....)))))....))))))).)))........]]]]...............(((((.(((.((((((.....)))))).))).....)))))(((((((........[[[[[[[.........))))))).......]]]]]]]...((((((((((....[[[[.)))))))))).........]]]](((.((((((((......)))....((((....)))).))))).))).....((((((..(((...[[[)))..))))))..............]]]....((((.......)))).)))))))....
|
|
TMR_00125
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCUUUUGGUUUCGACGGGGAUGAUGUUACGUUUGAGAAGCGAGUCGAGGGAACCUGUGGACCCGCGUUAAAAAACUAUAGGCCUUAAAAAUAAAGGAUAACGAAAAUAAUUUAGCUUUAGCUGCGUAGUCAGCUAACGUCAGCCUGAGAGUCCCGCGACUCAGAGUCUGGCGUCGACAGCGGGGAACCGAGCCUUACAAAGCUUUGAGUAAGGAACGGAAUUUAUGAAGCUACUGAAGUGAAAAGCUUGUUUGUAGGCGUUUCAUGGAGGGAAUGUUAAAAUACAAACUGCACUCGGAGAUGCUUAAAUGAAACCAUUUUCGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCCUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.(..(.((((((((.(.(((((((.((...[[[[[[[..)).))........]]]]]]]...................................(((((((......)))))))((((((.(((((..{{{{{{..)))))...))))))......}}}}}}..(((..((((((..aaaaaaa.))))))..)))......AAAAAAA..(...(...((..(..<<<<<<<)....))..)...)............>>>>>>>...)))))....).)))))))).)).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((....[[[[[..(((((......))))).))))))..]]]]](((..[[[[[[[.)))...........]]]]]]]((((.......))))...(((...........[[[[[[[[[[)))...]]]]]]]....]]](((((..[[[[[[..))))).(((.......))).]]]]]]..(((..((((((..[[[[[[..))))))..))).......]]]]]].((((.(((........(((((((((((((((...[[[))))))))....)))))))..))))))).....]]](((((....)))))(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00127
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCAAUGGUUUCGACGGGGGCAAAUUGCUCCUGGGAAGCGAGUCGAAGGGAUCCUGUACCUGCGUUAAAAAACUGGGAACUUAAAUAUAAUUGCAAACGAUAAUUUUGCAUUAGCUGCCUAAUAGUUGCAGCUCGUCAGCCUAAGAGUCCCACGACUUAGGGUCUGGCGUCGACAGUGGGGAACCGAGUCUUACAAAGCUUUGAGUAAGGAACGGAAUUAAUGAAGCUACUGAAUCUAGGAGCCUGUUUAUCGGCGCUUAGAGGAGGGAAUGUAAAAGGAUAAACUGCACUCGGAGAUGCCCAGGGGUUGCUGCUUUCGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((.(.(((((((.((...[[[[[...)).)).........]]]]]..................................((((((.........))))))((((((((((((..{{{{{{..))))))..))))))......}}}}}}..(((..((((((..aaaaaaa.))))))..)))......AAAAAAA..(...(.(.((..(..<<<<<<<)....)).))...)............>>>>>>>...)))))....).)))))))))...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((..((((((((...)))))))).))))).......(((..[[[[...)))..(((....))).]]]].......(((...[[[[[[..)))..]]]]]]..((((((.........)))))).....(((......[[[[[[((((...)))).))).......]]]]]]..(((..((((((..[[[[[[..))))))..))).......]]]]]]......((((((.(((.[[[[[[[))).))))))................]]]]]]].(((.[[[[[[..(((....))))))...]]]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00128
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAAAGGUUUCGACGUGGGUUUGGAACUUGAGGCUGCAUGUCGUGUUACUCUGGGUCACGUAAAAACUGGGGAACUUUAAAAUAAACGCAGACGAUAAUUUCGCGAUAGCAGCCUAGUUGCUGCUCGUCCCUCUUAGUCCUCCUGCCGACUAAGACUGGACGUCAUUAUGCAGGGAACUACUUUAGGGGUGUCUCGACUUGAAGUAGAUUAAUUGGGACUGGCUAAGCAUAGAGCCUGCCACUUGGCGCUAUGUGAGGUGAGAUAUUAGUGAAGUUGGCUAAGCAUGUAGAUGCAGCAAGGAAAAGAUUUGCGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....((((..((..(((((((((...{{{{{{..))))......}}}}}}...................................((((((......))))))(((((.((((((((.[[[[[[.))))))))..))))).......]]]]]]..((((((((((...aaaaaaa)))))))))).....AAAAAAA...((..(....(..(..<<<<<<<)....)...)..)).............>>>.>>>>...))))).....))..))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....(((...[[[[[[[[[)))....]]]]]]]]].(((((((.(((((((...((((((............)))))).......((((..............))))))))))))))))))..(((((((.(((((.((((((((.[[[[[[.))))))))..))))).......]]]]]]..((((((((((....[[[[[[)))))))))).....]]]]]].((((...[[[[[[.[[[.))))...]]].]]]]]]...........(((((.......)))))..........))))))).............(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00131
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUUUGGCUUCGACGGGGGUAAGAUGGGUUUGAUAAGCGAGUCGAGGGAAGCAUGGUGCCUCGAUAAUAAAGUAUGCAUUAAAGAUAAACGCAGAAGAUAAUUUUGCAUUAGCAGCUUAAUUUAGCGCUGCUCAUCCUUCCUCAAUUGCCCACGGUUGAGAGUAAGGGUGUCAUUUAAAAGUGGGGAACCGAGCCUAGCAAAGCUUUGAGCUAGGAACGGAAUUUAUGAAGCUUACCAAAGAGGAAGUUUGUCUGUGGACGUUCUCUGAGGGAAUUUUAAAACACAAGACUACACUCGUAGAAAGUCUUACUGGUCUGCUUUCGGACACGGGUUCGACACCCGUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.(.(((..(((...((((((((((...[[[[[...))))).........]]]]].................................((((((..........))))))(((((((.(((((((.{{{{{)))))))...)))))))..........}}}}}...(((..((((((.aaaaaaaa.))))))..)))......AAAAAAAA.((..(..(((..(..<<<<<<<)....))).)..))...........>>>.>>>>...)))))......)))..))).)).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((....)))))....................(((((((...[[[[[...))))))).......]]]]]........((((.((((((.....))))))...[[[[[[....))))..]]]]]](((((((.........[[[[[..[[[[[...)))))))...]]]]]..]]]]]...(((..((((((.[[[[[[[..))))))..))).......]]]]]]]......(((.......(((((((...((((((...)))))).......))).))))....)))(((((..[[[[......)))))....]]]]((((((.....)))))))))))))....
|
|
TMR_00135
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAAAUGGUUUCGACGGGGGCAAGUUGCUCCUGAGAAGCGAGUCGAGGGGUCCUGGGCCCGCGUUAAAAAACUGGGAAAAAUUAUAAACGCAGACGAUAAUUUCGUUUUAGCUGCCUAAUUAGUGCAGCUCGUCCUACUUGGGAGUCCCACGACCUAAGAUAGGGCGUCAAUUAGUGGGGAACCGAGCUCUACAAAGCUUUGAGUAGAGAACGGAACUUAUGAAGCUACUGAAUCUAGAAACCUGUUUAUCGGUGUCUAGAGGAGGGAAUGUUAAAAGGUAAACUGCACUCGGAGAUGCUCAGGGGUUACUGCUUUCGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((....(((((((((.(.(((((((.((..[[[[[[..)).))........]]]]]]................................((((((.........))))))(((((((((((((..<<<<<<..)))))).))))))).......>>>>>>..(((..((((((..{{{{{{{.))))))..)))......}}}}}}}..(...(.(.(.(.(..aaaaaaa).)...).))...)............AAAAAAA...)))))....).)))))))))...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((((..((((((((...)))))))).))))).......(((.[[[[[[.)))...........]]]]]]..............((((((.....)))))).((((((.........))))))(((((((((((((..[[[[[[..)))))).))))))).......]]]]]]..(((..((((((..[[[[[[..))))))..))).......]]]]]]......((((((.(((.[[[[[[[))).))))))................]]]]]]].(((........)))..(((((...(((...[[[[[)))...]]]]]..))))))))))))....
|
|
TMR_00136
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAUUGGUUUCGACGGGAUUGUUGAAGCUUGAGUAGCGGGUAGAGGAUUCUCGUUGGCCUCUUUAAAAAACGAGAAACUAAAAUAAACGCUAACGAAGAUAAUUACGCUUUAGCUGCUGCCUAAUAUAGGCAGCCCGUCAGUCCAGGGUUCCUGCGCCUUGGGUAGCUGGCGUCAUUAAGUCAGGCCUUUUGAGUGGGAAGGUUAAACUCUAGAACUGUCACAGUGGUAGCCUUGAGCUGUGAUGGAUUUUAAAGGCUACUGAUAUCCAAAGCCUGCCCAUGGGCGUUGGGUUGAGGGAAUUUUUAAAACAUGGGCUGCACCCGGAGAAGCUCUUGUGGAUACGAUUUCGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....((..((((..((((((((((....a..aaa.)))))........AAA..A....................................(((((............)))))..(((.((((((((({{{{{{))))))))...((.(......).)).).))).......}}}}}}...(((.....)))..((((((((((.[[[[[[[[..))))))))))......]]]]]]]](...(.((.(..(..<<<<<<<)....).)))...).............>>>>>>>...))))).....))))..))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((((((((....))))))))))....(((((....((((.[[[[[[[[..)))).......]]]]]]]]...........))))).......................((((((((...))))))))..(((((((((((((......)))))))...))))))(((.[[[[[...)))..]]]]]...(((.[[[[....)))..]]]]........(((((((((..........[[[[....)))))))))...]]]]...(((.[[[[[[[)))......((((((....))))))..]]]]]]].......((((.((((((((((((......)))..)))))))))...))))...)))))))....
|
|
TMR_00137
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCGGAUCUAGGAUUCGACAAGAUUCAUGAAACUCAAGGUGCAUGCCCAGGGGCGGUUUGCCUGGUAAAAAGCCGCAAAACUAUAAUUGCUAACGACGAUACGUUCGCACUAGCCGCUUAGGCUAGCCAUCGCCUUGAAAUCUCUCCUAUUGGUUAGAGGAUCGAUGGUCACCCCAAAUAGGAUAGCGAGGGAAGCACGCUUGAGGCUGAACCGCGAAAUAGUAUCAAGCUCACCAUGACGAAGCCUGUCGCUUGGCGUCUAAUUGGUUAAAUAAAUGAGCGACUAAGCAUGUAGUACCGAGAACGUAGGCUUUUUGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCCGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(.(.....((..((((((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>...............................(....((.......))..)((((((((((...(.((.[[[[[[.)).).))))..)))))).........]]]]]]..(((.....(((..aaaaa..)))....)))..........AAAAA..((((....(..(((.{{{{{{{)))...)...)))).........}}}}}}}...)))))...))))..))....).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((......))))).......((((((((.....(((((.[[[[[[[.)))))....]]]]]]]...........(((.((((......)))).)))((((((.....))))))....))))))))((((..[[[[...))))..]]]]......(((..[[[......))).....]]].(((..[[[[[[.)))................]]]]]].............(((.[[[[[[[)))....................]]]]]]].....(((.....[[[[[[[)))....]]]]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00139
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAAAGGUCUCGACGGCGAGUCGGAGCCUUGAGCUGCAGGCAGGGUUGGCUGCCACACCUUAAAAAGGGUAGCAAGGCAAAAAUAAAUGCCGAACCAGAAUUUGCACUAGCUGCUUAAUGUAAGCAGCCGCUCUCCAAACUGAGGCUGCAUAAGUUUGGAAGAGCGUCAACCCAUGCAGCGGCUCUUAAGCAGUGGCACCAGCUGUUUAAGGGUGAAAAGAGUGGUGCUGGGCAGUGCGGUUGGGCUUCCUGGGCUGCACUGUCGAGACUUCACAGGAGGGCUAAGCCUGUAGACGCGAAAGGUGGCGGCUCGUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((((..(((((..((..((((((((....[[[[[[...))).......]]]]]]....................................((((((((...))))))))((((((.((((((.(.<<<<<.).))))))..))))))............>>>>>(.(......(.{{{{{{{......)......).).....}}}}}}}.(((((.....(...aaaa.aa).......)))))...........AA.AAAA...))))).....))..)))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((((..((((.....))))..)))))(((((((.(((((......))))).((((((......(((.[[[[((((........))))..))).....]]]]....((((((((...)))))))).((((((((((((...[[[[[[[.))))))).)))))........]]]]]]].(((((((((((((.......)))))))))))))................(((((((((((((((...))).))))))))))))....(((.[[[[[)))......]]]]]........))))))))))))).......(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00140
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUUGGUUUCGACUGCGUGCAUUAAGCUAGGGGAAGCGUGCCGGUGCAGGCUAGAGACCACCGAUUUUAAGCGUCGUAGCAAAUAUAUAAGCGCAGAGAACACUCAGCGCGACUACGCCCUCGCUGCCUAAUUUGCAGCGACCUGCGUGUCUGUCAGCCUAGAUUCGUCUCUGGUUUAGUGUCUGGCAUCGAUUAAGAGACUUGCUGGUUUGUUGUGUCAACGGGGCAAACUGGGACUUUCACCGAUGACUGGGCUCAUCAUCCGGGUGUGUUCGUCCAAGCCGGAGAGCCGAGUAGAGAUCCACGCGCGAACUGCGCACGGAGAAGCCCUAGCGAGGUGACGUAGGACCCGGGUUCAAUUCCCGGCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((...(...(((((((....((((((((((...[[[[.....))))).............]]]]..............................(((.......((((.............)))).......)))((((((.((((((..<<<<<<.))))))...)))))).......>>>>>>...((((((((((..{{{{.{{{))))))))))........}}}.}}}}..(((((....(((((.(..aaaaaa.a.).))))))))))..............A.AAAAAA...)))))......)))))))..)...))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((....)))((((((.......(((((((......((((((...(((((((((((...((((.......))))..(((.........((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))))))............))))))))))).....))))))........((((....((((((((((..........))))))))))...)))).(((...(((.(((((....(((((...............)))))))))).)))..........(((((...))))).))).....)))))))......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00142
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACAUGGUUUCGACUACGUUGAUUUAGCCAGGGGAAGCGUGCCGGUGAAGGCUGGAGACCACCGUAAGCGUCGCAGCAAACCAAUAAGCGCCGAGAAGUCUCAGCGCGACUACGCCCUCGCUGCAUAAGCAAGCGACCGCGUGUCUGUCAGCCUAGGGAAGUCCCUGACCUAGAUCCUGGCAUCGACUAAGGGACUUGCUGUUCAAUCGCGUCAGCGGGGUUGAACAGGACUUUUACCGUUGACUGGGCUCAUCAUCCGGAAGUGUUCGUCCUAGCCGGAGGGCCAAGCAGAGAUCUUUGCGCGAACUGCGCACGGAGAAGCCCUGGCGAGGUGACGUAGGACCCGGGUUCAAUUCCCGGCAGCUCCACCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.(.(((((((....((((((((((...<<<<.....))))).........>>>>..............................(..(...(.((.((.......)).)).)...)..)...((((((.(((((...[[[[[[..)))))...)))))).......]]]]]]...((((((((((..{{{{{{{{))))))))))........}}}}}}}}..(((((....(((((....aaaaaa.a...))))))))))..............A.AAAAAA...)))))......))))))).)).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((..[[[[)))..]]]]....(((((((.........(((((...[[[[..[[[))))).....]]].]]]]..........((((.(((....))).))))(((.((((..(((((.........)))))..)))))))((((((.......[[[[[[[[..........)))))).......]]]]]]]].((((((((((..[[[[[[[[))))))))))........]]]]]]]]..(((((....(((((....[[[[[[.....))))))))))..(((((....)))))]]]]]]..............)))))))...............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00143
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCAGGCUUCGACGUGGAUCCUGAAACCCGAGACGCAUGUCGAGCCGGCAACGAAGGCUCGUAAAUCCAUCAGUUGCAAACAGAUAGUUGCAAACGAUAGUAAUUAUCUCCAAGAAGCUUACGCAUAAAGCUUCUUCCGUUGCUGGGAUUCGCUUAUAGAUCCCUACCAACGGCCAUAGCAUAUAAGCUCGCCCUCAAGCAUGGCUCAUGACUUGAAGGUUAAACAGAAGAGCUCGCAGUCAAUUUCCCCUGCACGUCGGGCGAUUGACUGUUAAAUCAUAGACGAUGCUAAGCAUGUAGUGUCAACGGCGGAUGAUUUACGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.....(((.((((((((((((((..aaaaa....)))))...........AAAAA..................................(((((((((.......)))))))))((((((..((((((.[[[[[[[))))))...))))))........]]]]]]](.(((.(((..(((<<<<<)))...))).))).).......>>>>>..(((((.(.((.(((.{{{.{{{))).)).))))))..........}}}..}}}...)))))...))))..)))...).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((........[[[..))))....]]]...........(((((.[[[[[...)))))............]]]]]....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((.[[[[[[[))))))...))))))........]]]]]]]..(((.(((((((((...)))).))))).)))...........(((.((((((((((.(((.........))).))))))))))[[[[[[[[....(((((((......)))))))...)))..]]]]]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00144
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGCAACGGCUUCGACAGGCUGGCGAAAUCCAAAUUGUGAUUCAGGUCGAGAGUGAGUCUCCUCUCGUAAAUACAAGACUCAAAACAAUAGUAACUGCGAACAACAUCGUAAGCUUCAAGCGCGUAGCAGUAGCUGCGUAGAACUCUCUCAUAGAGUCGCUUACCUCUGACCUGACUCCGUUAAGGACUCGGAGGUACCAACCCCAACGGAUGCCCUUAAUAGCUACCUCUGGUUGGCUGUUGAGCUAAGACUACACCAGAGCAUCCCACCGUUCGGGAGAAUGAGCGGUUCCCGUCUGAGGGUCAGAAAGACUAAGCCUGUGAAUGAGCGGUAGGUCAAUACCCAGUCUGGACAGCAGUUCGACUCUGCUCGGCUCCAUUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(...((.(.(..(.(((((((((((((.{{{{{{...))))).........}}}}}}...........................(.(......((..(...((((...))))...)..))......).)........(((((((..((...[[[[[[..))..).)))))).........]]]]]]....(((((((((((.aaaaaaa)))))))))))..........AAAAAAA..((((..<<<<<))))....>>>>>(.((..bbbb...)).)....BBBB...)))))..))).)..).).))....)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...))))))).((((((((((..((((........))))...)))(((..[[[[[[[.)))...........]]]]]]]................(((.......[[[[[[)))....(((((((....)))))))...(((((.....))))).]]]]]]......(((..[[[[[...)))...]]]]].....................(((((((((((.[[[[[[[)))))))))))..........]]]]]]]..(((.[[[[[[[[)))...]]]]]]]].....(((...[[[[)))..]]]].)))))))....((((((((......))))......(((.[[[[[)))....]]]]]..)))).....
|
|
TMR_00146
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAAAGGAUAUUCGACAUAUUAAUUUCGUGCGCUAUGAUGCAAGCCGAGAAUGCUUAUCUCGUAAAAAAGCAGACAAAGAAAUAAAUGCAAACAAUAUUAUUGAAAUUAGCAAUAUUAGAAAACCAGCUCUAGUAGUCUAGCCUGAUUCAGUUAUUUCUAAAUUAUUUAUGUUAUGUUAUUUAAGCUUGUAGUAACUAUCUAGUGUACAAUUUCUAUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCAGCUCCACAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((..((((...(((((((((.(.((((((((((..[.[..)))))..........].].............................................................................................................))))).).))......))))))).))))..))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((........((((((((...((((((((((((.......)))))......((((((((.(((((((((((.......)))..(((((.((((...(((((((........))))))).......)))))))))))))))))..........)))).))))......))))))).........))))))))......))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00148
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUAAGGUGUUCGACAUAAGUUGUUGUUAUUCAAUAAUUGCAAAUCAAAUUCUACCUUUUUCUAUUCCCGUUAAACAUCUAGCUGUUUAAAUUUAAAGACAAUUUAAAGACAAUCUAAAGACUCAAGAGACAAAAAUUUUAGGUAUUUAGGUAACUUUUAGGUAACUAAGUAAGGAACUAAGUAACGAAAACAACUUAUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCAGCUCCAAUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((.(.......).).......................................................................................................................................................................)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((((...(((((((((((((((......(((.....)))....(((((...(((.......(((((((......)))))))......)))......((((...(((((((.(((.((((........)))).))).)))))))..)))).)))))....(((.....))).))))))...))))))))))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00150
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUUUAGGUUUCGACGUUUUUUUCUAAUUAUGUUUGUUAAGCAAGUCGAGGAUUUGUUCUAUCUCGAAAAUCAAGAACUCUCAAAAUUUAAACGCAACUAAUAUUGUACGUUUUAACCGUAAAGCAGCUUUCGCUGUUUAAUAAUUACUUUUAAUUUAAAAACCUAAUUUUUUUAGGAAUUUAUUUAUUUAUUGUUUAUCCUGCUUAAUGAAUUAAAAAAAGCUAUACUUGUGAAUAAACGCAUAAUUUAAAAAAACGGACGUGGGUUCAAAUCCCACCAGCUCCACUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.......(((((((....(((((((((([.[[.[....)))))........]]].]...................................................................................................................................................)))))...)))))))........)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((..((((((((.......((((((.((((.(((((((......)))...))))...))))......((((((......((((((((((.......)))).((((((....)))))))))...............((((..(((((.....)))))..))))......)))))))))....((((.............))))...))))))........)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00152
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGACAGGAAUUGACAGGUUGAGUGAUUACGUGUGUAAGCAUGCAGGCUCAUGGGAUGAGAGCCUUAAAAGAUAGUUCCGAACAAUAAUUGGCGAAGAAUCUUACGCCAUGGCUGCUUAAUUACGAACUAAGUUUGUAAUAAUGAGCGUUGAGUGGAGCUGUUAAGAACAGCACCCGGCCACAUCUCACACGGCUUCUGUUCUGCGGGCUGUGAACUGAGAUGUCGAACAGCAGGACUAGGGGAGUACAAGUUGCGGGUGCUUCGCGAAAUUAAGUAACUAAGGUUAUAGUUGGGUGCCGGUGACCUGCUACAGCUCGAAAAUGAACAUCCGGCUAAGCAUGUAGAAGAUUCGAUAGUGGCCUUCUCUGGACGAGAGUUCGAAUCUCUCCGACUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((..(.(...(((((((.((...((((((((((..[[[[[[...))))).........]]]]]].............................((((((..(.(((((((((...))))))))).)............((.((((((...)))))).))))))))((((((.((((.((...aaaaaaa)).).)))....)))))).......AAAAAAA..(.(((((((.<<<<<<..))))))).)........>>>>>>..((((.((((.((..{{{{{...)).)))).)))).............}}}}}...)))))......)).)).).))))).)..))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((((.(((.....(((((....)))))((((((.........)))))).....((((((((((..((((...((((((((...))).))))).....((((((((((((((...)))))))))..)))))))))..))))))))))........))).)))))((((((((((((((((..[[[[[[[))))))))...))))))))......]]]]]]]....(((((((.[[[[[[..)))))))..........]]]]]].(((((((..[[[[[[....)))))))......]]]]]]............(((((..........[[[[[[[[...))))).((((.....))))..]]]]]]]]...)))))))....
|
|
TMR_00155
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGCGUGGUUUCGACAGGGAAGGUAGGCUACUGGAUUGCAGGCUGAGGUGCCAUCCACCUCAUUAAACAGGUGGCAAAAAACAACUGGCGAACGUGAACUCGUUCUUGCUGGCUAAAUAAGACAGCACAUCCUGCUUGGCCCCACCUCAACGGGUCAGGUUUGGGUGCCGAUUAGUUGAGGUGCCGUUUCCCCAACGCCGAUGAGGGGGACGAAAGAAAUAUCGGCUGGUUUGGCUAAAUUAGGCCGGCAAAAGCUAGCCAGACAAGAUUAAAUAGACGGAUAAUCCUGUAGUAGAUCCUGGGUCACCUUUUCUGGACGGGGAGUUCGACCCUCCCCCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((((..(((..(.(((((.((((.(((((.{{{{{{..))))).......}}}}}}...............................(((((.((.....)).)))))(((((.(((((((((aaaaaaaa.)))))))))..)))))........AAAAAAAA.((((((((....[[[[[[..))))))))........]]]]]]..(((((((((..((...<<<.<.<))..))))))))).........>.>.>>>.....)))).....))))).).))).)))))))))....(((((.......))))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........((((((((((..((((((......[[[..(((((((.....))))))).......)))))).........]]]..(((((......))))).(((((...........)))))(((((.(((((((((.[[[[[[[[)))))))))..))))).......]]]]]]]].....((((((...[[[[[[[.)))))).........]]]]]]]..(((((((((..................)))))))))........((((..[[[[....)))).....]]]]......))))))))))...((((((.......)))))))))))))....
|
|
TMR_00156
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACCCGGUUUCGACAGGGGAACUGAAGGUGAUGCUGCGUGUCGAGGUGCCGUUGGCCUCGUGAACAAACGGCAAAGCCAUUAACUGGCAACCAGAACUACGCUCUCGCUGCUUAAGUGAGACAGUGACCGCCGAGCCCGGCCUUUGGCGCGGCGCGAACUGAACCAAAAGAAGGCUAGCCCCGGCGAGGUUCCAUAGCCGCAGGCGAAACUCCAUGGAAAUACGGUCUGGGCGAGCCUGCCCGCUGGCGCUCCCCGACCCGACAACAAAAAAGCGGGCUACACACGUAGACGCACGCUGGAAGGACUCUUGGACGGCGGUUCGACUCCGCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((..((...((((.(((..((((((((((.aaaaaa..)))))......AAAAAA..............................(((((((.....)))))))((((...((((..(((..<<<<<<)))..))))...))))........>>>>>>..(((..(((....{{{{{{.)))...)))........}}}}}}...(((..((((.(.(((.[[[[[[[))).)..))))..)))..........]]]]]]]...))))).....)))))))....)).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((........[[[)))..]]]..(((..(((((..(((((((((...[[[.))))))...)))..)))))..))).....((((...))))]]].....(((((((.....)))))))((((...(((((.(((.[[[[[[[))).)))))...))))........]]]]]]]....((((((...((((((.[[[.[[[[[........)))))).....]]]]]]]]..(((.[[[[[[[))).......................]]]]]]]................))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00158
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACCCGGUUUCGACAGGGGAACUGAAGGUGAUGUUGCGUGUCGAGGUGCCGUUGGCCUCGUAAACAAACGGCAAAGCCAUUUAACUGGCAACCAGAACUACGCUCUCGCUGCUUAAGUGAGAUGACGACCGUGCAGCCCGGCCUUUGGCGUCGCGGAAGUCACUAAAAAAGAAGGCUAGCCCAGGCGAUUCUCCAUAGCCGACGGCGAAACUUUAUGGAGCUACGGCCUGCGAGAACCUGCCCACUGGUGAGCGCCGGCCCGACAAUCAAACAGUGGGAUACACACGUAGACGCACGCUGGACGGACCUUUGGACGGCGGUUCGACUCCGCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((..(((..((((.(((..((((((((((.<<<<<<..)))))......>>>>>>...............................(((((((.....)))))))((((..(((((..(((..[[[[[[)))..)))))..))))........]]]]]]..(((..(((....aaaaaaa)))...))).......AAAAAAA...(((.(((((...(((..{{{{{{)))...)).))).)))..........}}}}}}....))))).....)))))))...))).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((........[[[)))..]]].....(((...[[[[)))..(((((((((.............))))))...((((......)))).)))......]]]](((((((.....)))))))((((..(((((..(((.[[[[[[[)))..)))))..))))........]]]]]]].(((..(((....[[[[[[[)))...))).......]]]]]]]....((((.(((...(((..[[[[[[)))...))).))))............]]]]]].................(((((..[[[[........))))).......]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00159
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCCAAGGUUUCGACGGGGAUUGGAAGCUAAGGUUGCAUGUCGGAGUGGGCAGGCUCCGUUAAAAAGCCCAUCUUAUACAAACGCCGAUACUGACGUUUCGUACGCACUGGCAGCUUAAGUCUGCCACGUCUCUAGUCUCUUCGCCUGCGGGUUUCUAGCGACGUCAAUUUAGUAGGCUGGUUGUUGUUCAAGUCCGUGGUUCAACAGCGAGAUCUAAACGGAAUCGCCACAUGUAAGAGCCUGUCUGUGGGGGCUGCAUGCGGUUAAAUUUAAAACACAGACUACACAUGUAGACGCCUUAAGUGAAAGAUUUUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((.((((..((((((((((<<<<..<.)))))..........>..>>>>................................((((((.......))))))((((.((((........[[[[[.[[...)))).)))).....]].]]]]]((.(((((((....{.{{{{{....))))))).))......}}}}}.}.....(.(((..(..((.aaaaaaa))...)..))).).............AAAAAAA...))))).....))))..)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((((((((......((((......((((((.[[[..))))))......))))..............]]]......(((((............(((((.......))))))))))))))))))))..((((((.......[[[[[[[.........))))))..]]]]]]].....(((((.(((((.(((((((..(((....))).))))....)))..))))).(((((((....[[[[[[[...............)))))))....]]]]]]].(((.....))).........)))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00160
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCACUGGUUUCGACGGGGAUAAAGAAGCCGGAGUGGCAGGUCGAGGCGCCGCUGGCCUCGUUAAAAGCGGCACAAAUGUAAUUGCCAACAACGAUUACGAAUACGCAAUGGCAGCCUAAUUAGGCUUGCCGCACUGAUUGGCUGACGUCAGAUACGCCGACCAGUGACAAACUUAUCCGACUGGCACCCAAAGCCGUCUGUCGCAGCGGGUGUAAGAUUUUUUAAGACAGACUUGCCGCCGGUAGCCCGAUCAGGGGCAUCACCGGAUGGCGAGCUUGAAUACCUGAUCUAAACCUGUAGAAGCUUCGAGUGGACUGUUCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((..((((..((((((((((.aaaaaa..))))).....AAAAAA.....................................(((((((((....))))).))))(((((.(((((.....{{.{{{{.))))).))))).......}}}}.}}.(.((((((...((..[...[.))...)))))).)..........]...]...(((((.(.(..(((.<<<<<<<))).....).).)))))..........>>>>>>>...))))).....))))...))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((............)))))))).......(((.[[[[[)))....]]]]].........(((.....[[[[[[[)))......]]]]]]].........(((((((((....)))).)))))(((((.(((((........[[[[.))))).))))).......]]]].(((..[[[[[[..........))).....]]]]]].......((((((.[[[.((((((((((((.((((......))))...))))).)))))))))))))...]]].(((.[[[[[[[)))...((((((.........)))))).]]]]]]]..........)))))))....
|
|
TMR_00164
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAACGGCUUCGACGGGGAUGUAUAAGCUCUACGUUGCAUGUCGAGCAACUGCCAGCUCGUAAAAAAGGCGGAAACUAAUAUAAUCGCAGACGAUUAUAACUACGCAGUAGCAGCUUAAUAACUGUCAUACUGCCGUCUCUCCAGUCCUCCGCUCAUGAGGGUUGGGUCCGAGGCGUCGACCAAAAUGAGCUAGCAAUCGGGUGGUGUUCUGGUCGCCCCGGCGCGAAAAUAUACAGAAUAGCGUUAUAGUAUCCCUGUUCCGACGGAAGCUAAAUCGCGAAAACUAAGUGGGAACUAAACAUGUAGAUACGAGAGGGGAGCAUUUGCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((((((.....((...(((..((((((((((..[[[[[.))))).......]]]]]................................((((((((((........))))..))))))((((((((((((((((.{{{{{{))))))))))...)))))).........}}}}}}..((..(.(((((((aaaaaa))))))).)..)).........AAAAAA.(((.(.((((.(((..<<<<<.<<))).)))).).))).........>>.>>>>>...))))).....)))...))...)))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.........(((((.................))))).....(((((..[[[[[.))))).......]]]]].......((((((((....)))))))).....((((((((((........))))..))))))((((((((((((((((.[[[[[[))))))))))...)))))).........]]]]]].......((((...[[[[[[[.[[[[))))..]]]].......]]]]]]]...........(((....[[[[.[[[[.[[[...[[[......[[[.[[[)))......]]].]]]...]]]......]]].]]]]]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00165
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCACUGGUUUCGACGGGGACGUAGAAGCCGGAGUUGCAGGCCGAGGCGCCGCUGGCCUCGUAAAAAGCGGCACAAAAGUAAUUGCCAACAAUUACGACUACGCUCUGGCUGCUUAAUUGACGGCCACGUCGAACCGGUUCACGCCUGAUAGACCGGUGAGACGUAACUUCAUCAGGCUGGCAUCUGACGGCGCUCGCCGCGAAGGGUGCGAGAAAAACAGGUGAGCUGGUCGAAGGUUGCCUGGUCGGGGGCGAAACCUGAGAUGACGAUUGUACUCGACCUAAGCCUGUAGACGCUUCGUGUGGAACAUUCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((.((....((..((((..((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>..................................((((((.........))))))((((..((((((.....[[[[[[.[))))))..)))).....].]]]]]].(.((((((..((..aaaaaaa.))..)))))).)........AAAAAAA..(((...((.((((.{{{{{{{)))...).))..)))..........}}}}}}}...))))).....))))...))...)).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((.(((....))).))))))))...)))....((((((...[[[[))))))....(((((((......(((((((....)))))))............)))))))......]]]].(((((..(((((((...[[[[[[[.)))))))..)))))......]]]]]]]..((((((......[[[[[[[.....))))))..........]]]]]]].......(((((....(((((((..(((...........[[[[)))..)))))))..))))).........]]]]...........(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00166
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUCUUGGAUUCGACGGGGAUUGCGAGGCUCGAGGUGCAUGUCGAGAAUGAGAGAAUCUCGUUAAAUACUUUCAAAACUUAUAGUUGCAAACGACGACAACUACGCUUUAGCGGCUUAAUUCCCGCUUUCGCUUACCUAGAUUUGUCUGUGGGUUUACCGUAAGCGACAUUAACACAGAAUCGCUGGUUAACGCGUCCGCUGUUAAUCGGUUAAAUUAAGCGGAAUCGCUUGUAAAAUGCCUGAGCGUUGGCUGUUUAUGAGUUAAACCUAAUUAACUGCUCUAAACAUGUAGUACCAAAAGUUAAGGAUUCGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((.(((((.....(((...((((((((((((((.{{{{{{..))))).......}}}}}}..............................(...(.(.((.....)).).)...)(((((((.((((((..[[[[[[))))))..))))))).......]]]]]].(.(((((((((((..aaaaa))))))))))).)......AAAAA...(((((..(((.(((.<<<<<<<)))..))).)))))...........>>>.>>>>...)))))...))))...)))....))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((..........(((.[[[[.....)))..]]]].(((((....(((((.[[[[[[..))))).......]]]]]].......((((((..........))))))......(((((........))))).((((((((.........[[[[[[........))))))))......]]]]]]...((((((((((...[[[[[[)))))))))).......]]]]]]..(((((.......[[[.)))))..]]].(((((.[[[[)))))..........]]]]..........))))).................(((.[[[[[)))....]]]]].))))))....
|
|
TMR_00168
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUGGUUUCGACAGGGAGUACAAGGAUCAAAAGCUGCAAGCCGAGGUGCCGUUACCUCGUAAAACAACGGCAAAAAAGAAGUGCCAACACAAAUUUAGCAUUAGCUGCUUAAUUUAGCAGCUACGCUCUUCUAACCCGGGCUGGCAGGGUUAGAAGGGUGUCAUAAUGAGCCAGCUGCCCCUUCCGACUCCCCUAAGGAAGGGAAAGAUGUAGGGGAUAGGUGCUUACAGAAUCCUGCGGGAGGGAGUCUGUAAGUGCCGAAAAGUUAAAACUCCCGCUAAGCUUGUAGAGGCUUUUGAUUCUUGCUCUCUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((((..(((((((((((((.(((((((((([[[[[[[.)))))......]]]]]]].............................((((((((......))))))))((((((((((((((.aaaaaaa.)))))))))))))).........AAAAAAA...((((.(...<<<<<<<..).)))).......>>>>>>>..((((((((((((.(((.{{{{{{{))).))))))))))))............}}}}}}}...)))))....))))))))))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((....)))(((((((((..((((((((((((((((((((((((((....))))))).........(((...(((...(((....)))...)))..(((((...................(((((((((((((((.........)))))))))))))))..))))).)))(((...(((((((...........)))))))..........((((..((((((((((((.((((......)))).)))))))))))).............)))))))..))))))...))))))))))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00173
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUUUUGGAAUCGACAUUAAAAUUUUUAGGACAUUUUGUUAUAACUUAUAAAGUUAUUUACUUUAGAACAAAUGCAAACAACAUCUUAAACUUUAAUUCAAAGUUAGCUAUCGCUUAAAAUUUUUGAAUUACCAAUGAAAUUGGUCACUUAUUUUAUUGGUUCGAUUUAUAGUGAAUGCUGUAUUACGUAUACAAAGAAAUUUUCAUCUCGAAUAAAACGCCGUAGUUGACAAAGGUUCAAUUUAAAAUUGAAUGGACGUGGGUUCAAAUCCCACCAGCUCCAAAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((..((((((.((...((.((((((((((....[[[)))))....]]]...................................................................................................................................................)))))..(...((.....))...)))....)).)))))).))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((.......(((((...(((((((...(((((.........((((((.....))))))........))))).....))))))).)))))))))))(((((((((............((((...(((((((((((...[[[[[.))))))))))))))).....]]]]]....(((((.....)))))............................)))))))))(((.[[[[[[)))....]]]]]]....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00179
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUACGGAUUCGACAGGCAUAGUUGAGCUUGAAUUGCGUUUCGUAGGUUACGGCUACGUUAAAACGUUACAGUUAAAUAUAACUGCUAAAAACGAAAACAAUUCUUUCGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCUAGCGAAGAUCCUCCCGGCAUCGCCCAUGUGCUCGGGUCAGGGUCCUAAUCGAAGUGGGAUACGCUAAAUUUUUCCGUCUGUAAAAUUUAGAGGAGCUUACCAGACUAGCAAUACAGAAUGCCUGUCACUCGGCACGCUGUAAAGCGAACCUUUAAAUGAGUGUCUAUGAACGUAGAGAUUUAAGUGGCAAUAUGUUUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGUCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((((((((.(((((((((({{.{{{.)))))......}}}.}}.......................................(.(((((((.........))))))).)..((((((((((((((..aaaaa)))).))))..)))))).........AAAAA.....(((((((((...<<<<<.)))))))))..........>>>>>..((..(...(..((((.[.[.[[[))))...)..)..))............]]].].]...)))))....))))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((.[[[[[[.)))))..(((((...)))))....]]]]]]........((((.((((((....)))))).....))))...........((((((..(((((.........)))))))))))((((((((((((((..[[[[[)))).))))..)))))).........]]]]].....(((((((((.........)))))))))....(((..[[[[[[.))).............(((((((.....((((....))))..........(((((.(((((....))))).))))))))))))....]]]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00180
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGCACAGUCGAGCUUGAAUUGCGUUUCGUAGGUUACGUCUACGUAAAAACGUUACAGUUAAAUAUAACUGCUAAAAACGAAAACAACUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACAGUUAGCGUAGAUCCUCUCGGCAUCGCCCAUGUGCUCGAGUAAGGGUCCUAACUUUAGUGGGAUACGUUUCAACUUUCCGUCUGUAAGUUGAAAAAGAGAACAUCAGACUAGCGAUACAGAAUGCCUGUCACUCGGCAAGCUGUAAAGUGAAUCCUUAAAUGAGUUGACUAUGAACGUAGAUUUUUAAGUGGCGAUGUGUUUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGUCUCCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((((((...(((((((((({{.{{{{))))).....}}}}.}}.......................................(.(((((((........))))))).)..((((((((((((((..aaaaa)))).))))..)))))).........AAAAA.....(((((((((...[[[[[.)))))))))..........]]]]]..((..(...(..((((.<<<<<<<))))...)..)..))............>>>.>>>>...)))))......))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((.(((.((((((((((((((.(((((.(((((....)))))...((((.((((((....)))))).....))))....((((((.((((((..(((((........)))))))))))((((((((((((((.......)))).))))..))))))(((....))).(((((...(((((((((.........))))))))).............(((.....(((((..((((........))))..))))).)))..))))).....)))))).))))))))))))...)))))))..)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00182
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACAGGAAUCGACAGUAGAGUGUAUCAUGUCAGUAAGCAUGCCGGGGAAUGGUGGUUUACCCCGUUAUCAAAUGAUUACCGACCAAUAAUUGGCGAAACUCGUUUCGCGUUGGCUGCCUAAUUCAAGGAAUUAGCGUGCCUUCAUGCUAAGGGUUUGAUAUCUGCUAAAACCCGGUGCAUUCAUCAAUGCAGGUUAAGCCAAAGGGAUGUCCCGACCGGAGGCCGACAAUCCAGGGAACCGGAUGUCAUCACGUUGUUGCAGUACCAGAUGGCAUCUUAAAUCCGAUCUGCAAAUAAGCAUGUAGAAAGCUGAUGUGGGCUUUAGCUGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((.(((.((.((((((((((...((((((((((..<<<<<<<...)))))..........>>>>>>>.........................(((((((.(.(((......))).))))))))(((....((...(((..[[[[[.)))..))......)))......]]]]]..(.((((..(.....{{{.{{{)..)))).)......}}}.}}}........((((((((((..((..aaaaaa.))..))))))))))..........AAAAAA....)))))......))))))))))))))).))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((...............[[[[....)))))))..]]]]..(((((..[[[[[[[[..))))).........]]]]]]]]...........((((((....))))))...(((..(((......)))..[[[[[[[)))...]]]]]]]((((((......[[[..))))))...]]]............(((..((((...(((....)))..(((((((((.(((...((((((...((((((((((...(((...))).....))))))))))....)))..((((((........))))))...))).))).)))))...))))..(((((.......))))).))))..))).
|
|
TMR_00183
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCGGUUUCGACGGGGGUCGCGAAAUCGCCUGGAGCAUGCCGAGGGCGUCAUCUUCCUCGUUAAUCCGGUGGCAAAAAACUCAGACGCCAACGACGACGUCUACGCUGUAGCCGCUUAAGGCUUAAGCCCCGAACCCACUUGUGCCUGUGCUCGUGGAUGUAGGGUCACUAUCACGGGAUCGCUGCUGGUUGCCGUCCGUCGGCCAGCGGUUAACCUAAAACGGGCUGGUCCUUCGGUGCGCUUUGCACGCCGUGUUGCCGCGGGACGAGACCAAAACGGCGCGCUAAGCAUGUAGCGCCGGGGAUGUAGCGCCUUCGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((..(.(.(((.(((((.(((((((((((..{{{{{{..))))).......}}}}}}...............................(((..((((......))))..)))(((..((...((...(aaaaaa.)...))..)).))).......AAAAAA...(((((((((((..<<<<<<))))))))))).........>>>>>>..(((((.(((((.((...[[.[[[[[.))))))).)))))..........]]]]].]]...)))))...).)))))))).).).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((((...(((((((....)))).))))))))))((((....((((((((((((((((((((((...((((.((((((.......(((((..........)))))(((....(((((((.((((....(((((....(((....((((((.(((........)))))).)))......)))...(((((((((((........)))))))))))...........)))))...)))).)))).)))........))).)))))))))))))))........(((((............))))))))))))..))))))))))..(((((........)))))..))))....
|
|
TMR_00184
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGCACCGGUUUCGACGGGAUUGAAUCGUUGUGGGAAGGCGUGCCGGGUUCCGAGCUCCCGUAAAACGAUCGGAAAACAACAACUGCCAACAACACGCAGUUUGCAUACGCUGCCUAAUUAAUUAGGUAGCCGCUGCGGUCUCUGGCUCCUGUCUGGAGGCCUGUCGGCGUCUUAAUGCAGGAUGGGCCUAACGCUUCGGUCCGGAGCGGACAGCCGAGAUCAAUCGGGCUAAGCCGACCGGCUCUUGCCGGUUCCUCACCGGUCGGACGAAAACCACCGAAUCGGACACGCACGUAGUCUUUUCAUGGCGGACUUUCUCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((..(..(((((((.(((((((((((((((...<<<.<.))))......>.>>>.....................................(((((((((....)))))))))(((((.(((((((((.aaaaaa)))))))))...))))).......AAAAAA..(((....(((((.[[[[[[)))))....))).........]]]]]]...((((((((......{{{{{{{....))))))))............}}}}}}}....)))))....))))))))))))).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((.....((((..(((((((((((((((((.........)))).....(((((((........((((((.........)))))).(((...(((((((((....)))))))))...)))((((((.((((.........(((((((((.((((....))))..)))))))))..(((((((...)))))))...))))))))))..(((.......(((((((((....)))(((.....))))))))).)))......))).)))).....))))...)))))))))..))))....)))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00193
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAUUAGGCUUUGACGUCUACCACGGAACCCAAAGUGCAUACCGAGCACGAACAUAACUCGUAAAAUAUUGUUUAAAACAAAUAGUUGCAAAUAAUUACAACUAUAGUUUGGCAGCUUAAUGCCAACCUGUUAUCAUUUGUGACCUACAACAUUUGAUAACGGUCAUUUUAGUAGGAUAUACUCUACCAGAGCCCACUUGUAGAGCGAAUUUAAGGGCUUAGCUUAGUGUGUCUUGAUCAUCAGGCUACACCAAAGUGAAUUAAAUUGAUGAAUCUAAGUAUGUAGAGACUAGGGGAAAGUGAUGACGGACGUGGGUUCAAAUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((..(.......(((.(..(.(((((((((...aaaaa...))))........AAAAA................................(((.((((......)))))))(((((((..(..(....{{{{{{...).)))))))).....}}.}}}}....(..(.....((<<.<<.)).)..)............>>.>>.((((.(....(((.[.[[[[[)))......).))))..........]]]]].]....)))))....)..).)))......)..))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((((....(((.....))).........(((.....[[[[)))........]]]].......(((....[[[[..[[[[[[[))).......]]]]]]].]]]]...))))))))))....(((((((((..(((..[[[[[.)))..)))))))))........]]]]].....((((((..[[[[[[....)))))).........]]]]]].((((((...[[[[[..(((((((....(((....))).......)))))))..)))))).....]]]]].................(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00194
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACUUGGCUUCGACAGCAGAUACAAACCCUCAAGUGCAUGUCGAGAAGGUAGUAAUUCUCGUAAAUAAAUUGCUGCAAACUUGUUAGUUGGCGAAAACGCAGACUACGCUUUAGCCGCUUAAUUGGCUAACUGUCCUUGGUAACGUGCUCGUGCGCCUCCAAAGACAGACGACUACACGAGAUGCUGGAAUUGUUCUUCUCAUUGACAAUUUCUUAAGAAUUAAAUUGAGAUCGUUUUUUGAUCCCUGUUUAUCGGGUGUAAAAGAUUAAAUUAAUAGAUAAAACUAAACAUGUAGAUCUUGUGGCAGAGUACUGAUGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.(((.......((..((((..((((((((((.{{{{{{...))))).......}}}}}}....................................(((((((......)))))))(((((.((((....(((aaaaaa)))..)))).))))).......AAAAAA.....(((((((((.<<.<.<..)))))))))............>.>.>>...(((((..(.(((.[[[[[[[))))..)))))............]]].]]]]...))))).....)))).)).......))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[[[[[[[[....))).........]]].]]]]]]]...(((((((((.[[[[.....)))))))))........(((((.(((....))).)))))....(((((((......)))))))(((((.((((....((((....))))..)))).)))))]]]]......((((....[[[[[[[[[..))))...]]]]]]]]]..............((((((..........(((..[[[[[[)))....................]]]]]]............))))))....................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00196
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCGGUUUCGACGAAAUAUGCAUCUUUCUAAAUGGCAUGCCGAGUCCCAGAAUCUCGUAAAUAAUCUGGAAAAACCAUAAAUGCCGAUAACGGCUACAUGGCCGCUGCUUAAGUAAGUGGUCCGUCCUUAGUUUAGUGCGUCUAUGGCUUAGCUAAAGGGCGUCAAAUACAUAGACUGGUUCUGGUUGUGUCUGUGAUAUCAGGAUGAGAAUUAAACAGACUGUGUUUAUAAUAGUUUUGUCAUCAGGACAGUUAUAAGCAAGAUUAAUCUGAUUGACUAAGCGUGUAGAUAUUUUUUUAGGUUCUAUCUCGGACGGGAGUUCGAUUCUCCCCGCCUCCACAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((.(((.(...(((...(((((.(((((((((..aaaaa..)))).......AAAAA..............................(((((((..(...)..)))))))(((((((((((.(....[[[[[[[..).)))).))))))).......]]]]]]]..((((((((...{{{{{{...)))))))).........}}}}}}..(((((...(...((..<<<<<<<)).....)..))))).........>>>.>>>>...)))))....)))))....))).).))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((..[[[[.)))..(((((.............))))).]]]]..(((((.....[[[.....))))).............((((....))))]]]..(((((((.........))))))).((((((((((.(((..[[[[[[[))).)))).))))))........]]]]]]]..((((((((...[[[[[[...)))))))).........]]]]]]..((((((((((.((((((....)))))).))))))))))......(((((..............)))))..........((((......))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00199
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCGGUUUCGACGGGGUAAGAUAAUGAUAAGAUUGCAUGCAGAGGUUCGGGAUCCUCUUUAAUAUCCCCGAAAUAUCAAUAAAUGCCGAUUACGGCUACAUGGCAGCUGCUUAAUUAGCUCUGCCCGCUCUGGAUUAAGUUUGUCUGUGGUUUAAUCUAAGAGCGUCAUAAACGCAGACUGGUCCCUGGAUUUGUUUACUAGAAAGGGAUAAGAUGUUUUGUAAACUGGUUGAUAUAUGGGUUGUUAUUUGUCCGCUAUAUCAAUGAGAAUAAAUCAGAUGACUAUGUAUGUAGACGUUUUGUUAGAAUCUAUCUCGGACGGGAGUUCGAAUCUCCCCGCCUCCACAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((.(....(((((((((..(((((((((([[[[[[..)))))........]]]]]]..............................(.....((..(......)..)).....).(..((...((((......aaaa....))))))..).........AAAA(.((((((...(((<<<<<<.))).)))))).)........>>>>>>..(((((.....((((.{{{{{{{))))......)))))...........}}}}}}}...))))).....)))))))))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((.......)))...........................((((...[[[[[))))......]]]]]................((((....)))).....(((((..(((.....))).)))))((((((((((((((((.[[[[[[)))))))))).))))))........]]]]]]..((((((.......[[[[[.....))))))..........]]]]]...((((((((((((((.[[[[[[[))))).)))))))))...........]]]]]]]...............................((((((....)))))).......)))))))....
|
|
TMR_00200
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAACAGGAUCGACGAGGGUGUAAAGAGCGACUUUUUGUUCGGUAUUGUACCACCGUUAUCGGGCUAAACUUGUAGUUGCAAAUGACAACUAUGCGGAAGCUCGUCUCGCUGCUUAAUUGCGGUGUGACACUUCACAUUAAGCCCUAGAGGGUCGCACUUCUAGGCGGGGUUCGGAGGUACCUGGCAACAGAAACCUCCACUUGCUGCGCAAGCAGCUAUGACAAUAAACGAGCGUUGCAAUAAACCAUUCGGACCCGGGGGCGGUACCCGGCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((.(((.((...((((..(.((((((((((.{.{{.{.)))).....}.}}.}............................(..((.(.(((.((((((......)))))).)))).))..).......(((((((.(...)..)))))))..((((..[[[[[[))))..........]]]]]]....(((((....)))))...)))))...).)..))))....)).)))..)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((.......(((((((((((..((((........)))).....(((((......(((((((.......)))))))...((((...(((.((((((......)))))).))).))))......))))))))))))))))........((((.((((((((((..(((....)))..))))))....(((((....)))))(((....)))...)))).)))).....))).))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00204
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAUAGGGUUCGACGUUUCUACUGGACUCCGAAGCGCAUGCCAAGAUUGUAGUAAUUCUUGUAAAACAUACUACAAAAAAAAUAGUUGCAAAUAACGACAACUACGCUUUAGCAGCUUAAUGCUAACCGAUGCAAGAAUUGACUGUGGUUUGAAGCAUCGGCUAAACACACAGUCUAGCCAAGCUAUAUUGCUUGGAUAUAGUUUGGUAAAAACUUAAUCAAGCUAGCUUUUAUGCCCUGCUCUUCGGGUGAUAAAAGUUAAAAAUAAUAGAAUGAGCUAUGCAUGUAGAAGUUAGGCUGAAGGAUUGACGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((..(.((...(..(.((...((((((((((.<<<<<<<..))))).......>>>>>>>.................................((((((......))))))((((((((((....[[[[[[..))))...))))))........]]]]]](.((((((((((((aa.aaaa)))))))))))).)....AAAA.AA.(((...(.((...(((.{{{{{{{))).)).)..)))...........}}}.}}}}...)))))......))..)..).)).)..))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((((((..........))))))).((((((..........((((((((.....(((...)))))))))))......((((((..........))))))))))))..(((((((((.....(((((((.......[[[[[[[.......))))))).......]]]]]]]..((((((((((((.[[[[[[))))))))))))..........]]]]]]((((((((((((((.[[[[...)))).)))))))))).............]]]].............)))))))))..............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00207
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACAGGAUUUGCAAAGCCCUAGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUUGCCUCGUUAAAAGCCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUUCGCACCUGCUGCUUUAGCAGCUUAAUCAGCUUAAUAAACUGAAGGUGUCCUCUCUCCCUAGCCUCCGCUCUUAGGACGGGGAUCAAGAGAGGUCAAAACUAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAUCCAAUCAGGCUAGUUUGUUAGUAGCGUGUCCGUUCGCAGCUAACCGGCGAAUGUAAUAACUGGACUAAGCAUGUAGUGCCGACGGUGUAGUAAUUCUGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((......(((.(.((.(((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>..............................((...((.(...(((((.(......).)).)))...).))...))..(((((((((((..(((...aaaaa)))..))))....)))))))..........AAAAA....(((....((((.{{{{{))))....)))...........}}}}}..(((.((((((.(((.[[[[[[[))).)))))).))).........]]].]]]]...)))))...).)).).))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.......))))))).....)))))).(((((....(((((.[[[[[[[.)))))....]]]]]]].........((((....)))).........(((((((((((....)))))....((((.........))))))))))(((((((((((..(((........)))..))))....))))))).................(((.[[[[[(((((....)))))....)))....]]]]]....(((..[[[.[[[[[[.[[[.)))....]]].]]]]]].]]]............(((((((.[[[[.)))).)))...]]]]........((((.[[[[[))))...]]]]]..)))))....
|
|
TMR_00223
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACGGGGGUAGUUCGGUCUUCUGUGGCGUGUCGAGGGGUCGGCCUCGUUAAAACGCAUCAGCCAUAACUGGCAAAACUAACACACAACUCGCAGCAGCUUAAUAGCUACUACGGAUCCUAGCAGCCGUCGCCUGGUCGGCUGAUUUCUAGGGUCUCACUUUAAACAGGCUACGCUUGGACCCUUCCGUCUGGAGGGAAAGAGAAGAGAUGGAAUCAGACUGGUCGGACGGACGCCUGUCAAUUGGCAGCCUGACGACGAGAUCCCAAUAAAUUGACUACACACGUAGAAGCUUAAGUAUACGAUGCCUUCGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(..(..(((..((..(((((((((({{{...))))).........}}}..............................((.((.((((....)))).)).))(((((((.((((((..<<<<<.<)))))).)....))))))........>.>>>>>....(((...((((...aaaaaa))))...)))...........AAAAAA..((((....(..(((.[[[[[[[)))....)..))))............]]]]]]]...))))).....))..)))..)..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((...(((.(((....))).))).))))))))(((....(((((((((((((((.....(((((.((((....))))........................(((((..((((.(((((((((........(((((.(((..(((((((((((....(((((.((((...(((((...)))))...((((((....))))))..))))..))))))))))))).)))..))).(((..(((........)))...))).))))).)))).(((....)))........))))).)))))))))....))))).....)))).))).))))))))))).))))))....
|
|
TMR_00224
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGCUCUGGUUUCGACAGGGUUACCGAAGUGUUAGUUGCAAGUCGAGGUCUCAGACGAGGGCAACUCGUUAAAAAGUCUGAAAAAAAAUAAGUGCUGACGAAAACUACGCACUCGCUGCCUAAUUAACGGCAACGCCGGGCCUCAUUCCGCUCCCAUCGGGAUGUACGUCCGGACGCAAUAUGGGAUAGGGAAGUGUCAUGCCUGGGGGCAUCUCCCGAGAUUUACUAGGCUGGUCAAACUCCGCGCCGACCUUCUUGGGCGUGGAUAAGACGAGAUCUUAAAUACGAAGGGAACACUUGUAGGAACGUACAUGGACGUGAUUUUGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCACCUCCAGAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((((...((((..(((.(((((((((...aaaaaa........)))).......AAAAAA................................((.((((........)))).))(((((...(((((((.{{{{{{)))))))....))))).......}}}}}}..((((.(((((..<<<<<<.))))).))))........>>>>>>..(((....((((((((..[[[[.[[[))))))))...))).............]]]]]]]...)))))....)))..))))))...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.......)))))...(((((((.....((((((((.((((((((.((((((.....)))))).....(((............[[[[[.))).........]]]]]...((((........))))...((((((..(((((((.[[[[[.)))))))...))))))........]]]]]..((((........[[[[[[.......))))........]]]]]].((((....[[[[[[[[))))......]]]]]]]]......))))))))...............))))))))..((((......)))).)))))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00226
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACCGGCUUCGACUCCGGACGUCGAGGCAGGGGAAGCGGGCCGAGGAUGAGCGGUUAUCUCGUUAACGAUCCGUUCAGAACAACAGCUGCCAACAAGACGCAGCCCACUACCCCCACUUACGCGCUCGCCGCUUAAGAGGGACUAGGUAGUCGUCAGCCUGGGAGAGCCUCCGGCCCAGAAUCUGACGUCGCUAGGAGGAUCACCGGCUGACCUGGUCGCGGGGUCGGUCGGGACAUCAAACAGCGACUGAGCCUAUGUCGGCUUGCCUGCGUGUCCGACGAGGCUGAGAAACAAGUAGCAGGAUGCGCCCGGAGAAGCCCUGUGUCGGGGCCGGAGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCACCUCCACAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((.(.(.((.((((((....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA..............................(((..(((.((((.(((.....))).)))).)))..))).....((((((.(((((...{.{{.{..)))))...)))))).......}.}}.}..((((((((((<<<<<<<..))))))))))...........>>>>>>>(((((.((((((....[[[[[....)))))))))))............]]]]]....)))))......)))))).))).).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........((((((((.......)))))))).............((((..[[[[[[[....))))........]]]]]]]........(((((......[[[)))))...(((..(((.((((.(((.....))).)))).)))..)))...]]](((((.(((((....[[[[[..)))))...))))).......]]]]]....(((((((((((.......)))))))))))....(((......[[[)))......]]](((..[[[[.[[[)))..]]]]]]].............(((((....[[[[........)))))....]]]].(((((..(((((.......)))))..)))))....
|
|
TMR_00227
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACCGGCUUCGACUCCGGACGUCGAGGCAGGGGAAGCGGGCCGAGGAUGAGCGGUUAUCUCGUUAACGAUCCGUUCAGAACAACAGCUGCCACUAAGACGCAGCCUGCUAGCUCCACUUUCGCCCUCGCGGCCUGAGUAGAGACCAACUAGCCGUCAGCCUGGGAGUUCCUCCGGCCCAGGAUCUGGCGUCGACAGGAGGAUCACCGUCCCACCCGGUCGCGGGGUAGGUCGGGAAAUCUAACAGCGACUGAGCCUGCGCCGGCUUGCCUGCGGGACCGGCGGGGCUGAGAAAAAACAAGCAGGCUGCGCCCGGAGAAGCCCUGUGUCGGGGCCGGAGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((.(.(.((.((((((....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA..................................(((.((((..(((.....)))..)))).)))..........((((((.(((((.....{{.{..)))))...)))))).......}.}}....(((.((.(((<<<<<<<..))).)).)))...........>>>>>>>(((((.((((((...[[[[[[..[.))))))))))).........]..]]]]]]...)))))......)))))).))).).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........((((((..[[[......))))))...]]]..(((((...(((((.[[[[[[...(((....)))..)))))........]]]]]].........((((((((((..(((.((((..(((.....)))..)))).)))..........((((((((((((...[[[[[[..))))))..))))))......]]]]]]...(((.......[[[[[[[....[[[[[)))...]]]]]...]]]]]]](((((.((((((((((....)))).)))))))))))...........)))))))))))))))..(((((((((...)))))).[[[[[..[[[[[)))....]]]]]..]]]]]....
|
|
TMR_00228
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAUAUGGUUUCGACAUGAAUGUCAAAAUCUAAGGUGCAUGCCGAGGAAGUACCGUAACCUCGUUAAUAACAGUACAAAUGCCAAUAAUAACUGGCAACAAAAAAGCAAACCGCGUAGCGGCUAACGACAGCAACUUUGCUGCUGUUGCUAAAGCUGCCUAGUCUAGCUUAAUAAUCUAGAUGCGCACGGAUAUGAUAGUCUUUCUUAUGACACUAUCUAUACAUCCGUUCAUAUUCCGCAUAAGACGGUCUUUGCUUUUUGUCUGGGAGUUAAGGCUGUAUUUAACAGACUCGCUAACUAUUACCCUGGCUAAUUGGGGAAUAGUCAAGCUAAACUCAAAUAGAUUAGCCUAAGCAUGUAGAUCCAAAGAUCUAGAGUUUGUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((.(....((((..((..((((((((((..{{{{.{...))))).......}.}}}}................................................................(...(.(..(.((((((.......)))))).)..).)...)...(.((((..(((.((((.(.[[[[[[[).))))......))))))).)........]]]]]]](((((((.(((((..aaaaa))))).))))))).......AAAAA..((((((((((.((((.<<<<.<<)))))))))).))))...........>>..>>>>....))))).....))..))))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((.((((....)))).)))))...(((((.....[[[[..)))))....]]]].................(((((........))))).......(((..........((((((..((((((((.......))))))))....))))))[[[[....))).......]]]](((((.((((((..((((((............)))))).....))))))........)))))...((((((((.((((((.....)))))).)))))))).....((((((((....((((((.(((.[[[[[[[[.))))))))).................]]]]]]]]........((((((....))))))))))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00234
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGCAAAGGUUUCGACGGGGUUGUGAGGUUAUAGGUAGCAAGUCAGGCUUGUCGCUGUGAGAGACUAAACACAUCUUUUAGAUGGAAACAAAGAUUACGCUUUAGCUGCUUAGUUCAGCUACACCUUGGAUAACUUAUUCUAUACGGGUUUUUCAAAGGUGUUGACUAGUAUAGAUCACCAUAAAUGAUUUCUCUAAGUUUAUGGGACAUUUUAGAGGAUAGUUUUAGUUAGCCCUGUUUACGGGAGUAAUUAUUACGAAAUUUAAUAGUAAACUAAACUUGUAGAAGCUUAUGGUCAUUAUGAUUUCGGACACGAGUUCGACUCUCGUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.((((((((((..(((((((.(..<.<.<.).)).....>.>.>.................................((((((.......))))))(((((((((.(((((..aaaaaaa))))).)))).))))).......AAAAAAA...((((((((...{{{{{{{{))))))))......}}}}}}}}(.((..((((((..(..[[[[[[.[)..))))))..)).).......].]]]]]]...))))).....)))))))))).)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((((....................(((.((((((...)))))).)))(((.....[[[[[)))....]]]]].................(((..((((....)))).))).((((((((((.(((((..[[[[[[[))))).))).)))))))......]]]]]]]...(((((((....[[[[[[[[[))))))).....]]]]]]]]].............(((.[[[[[[))).((((...))))...........]]]]]]..........)))))))...............(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00238
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCUGGUAUCGACCGGGUGUCGGAAGUGUUCGGUGGCGUGUCGUGGUUGAUCAGCUGGCCACGUAAAAAGCCGAUCAAAAUUUAACUGCUGAACCGCAGUACUCCCUCGCGGCUUAAGUGCCGAGAGCCGUUCUGGCAGCUUCGCCUGAGAGGUGCUAGUCCGGACGCAAGUCAGGCUCGCGGGAACUCGAGGAGAGGGGACAACCACCCGAUCCGCCUCGGCGGCCGUUCCUGCUAAAAAAAUCUGGCCGAUAGUUGUGUCGGGGUCCCGCUCGUAGGAACCCGGUAACAACGAACGUGCGGCGGCCCGUUAAACGGUGCGCCGCAGGAAUAUACGAGCUACACACGUAGAUGCCGGCGCGGAAGCGCCUCGGGACCGGGGUUCGAUUCCCCGCGCCUCCACUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.((.....(((.((((((.((((((((((...{{{.{{{..))))).....}}}.}}}.................................(((((((.........))))))).((((((.((((aaaaaa))))))))))............AAAAAA...((((...(.(...........).)...))))....(((((((((...<<<<<<<<.......................))))))))).......>>>>>>>>..............(.(((((((....[[[........))))))).)........]]]...)))))....)))))))))....))..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((..(((.....)))..)))).....(((((.......((((((((.[[[[[))))))))......))))).............]]]]].((((...[[[.....))))....]]].....(((((.....(((.[[[[[)))...]]]]].........(((....))).)))))(((((((.((((((...(((........)))......))))))[[[[[[)))))))..........]]]]]]...(((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))))).))))).....(((((((..((((...))))..)))))))......]]]]]]].............((((((((....)))))..[[[[....))).....]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00239
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGAUCCGGAUUCGACAGGGGUAGGUCGAGCUUAAGCGGCGAGCCGAGGGGGACGUCCUCGUAAAAACGUCACCUAAAGAUAACUGGCAAACAAAACUACGCUUUAGCUGCCUAAUUGCUGCAGCUAGCUCCUCCCGCCAUCGCCCGCGUGGCGUUCGAGGGGCUCAUAUGAAGCGGGCUACGCCCAAAUCCGCCGCCUGAGGAUGAGGGAAGAGACGAACCAGGCUAGCCGCCGGGAGGCCUGUCGGUAGGCGGAACGGACGGCGAAGCGAAAUAUACCGACUACGCUCGUAGAUGCUUAAGUGGCGAUGCCUCUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((...(..(((((((((.(((((((((({.{{{..))))).......}}}.}...............................(((((((.........)))))))(.((((..((((((.aaaaaa)))))).....)))).)........AAAAAA....(((..((((...<<<<<.))))..)))...........>>>>>..((((.(.(...(((.[[[[[[[)))....).).))))...........]]]]]]]...)))))....))))))))).)...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((..(((.(((((((((((((((....((((((((..........))))).))).........(((............((((((((((((.........))))).((((((((.(((((.........)))))...))))))))....))))))).(((.((((....(((((((((((..(((.................(((((...........))))))))..)))))))..)))).)))).)))........))).....))))))...)))))))))..)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00240
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUACAGGUUUCGACGGGGAUAGGAAACUAAAGGUUGCAUGCCGAGGUCCGGGCUGGCCUCGUUAAAAAGCCCGGGGCGAAUUACACGCCGAUAAUUACGACUACGCCGUAGCAGCUUAAUACCCUGCUACCGAUCCGCCGAGCCUCUCCCACGGGUGAAGAUGGAUCGUUAUUUCAGUGGGAUAGUCAAGGGGAGUGCCCGCGGCCCCAAGGCGAAACUUUAGCAGGAUCGCUUCCCGGAAAUCCCUGCCAGGGGAGAGUCGGGCGGCUAAAUCAAAUCCUGGCAUAAGCAUGUAGACGCCUUCUGUGUAUGAUCUUCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.(...((...((((..(((((((((({{{{{{{...))))).......}}}}}}}..............................(.(((((((.........))))))).)..(((.(.............<<<<<<.).)))....>>>>>>........(..(...((...a..aa.aa..))....)..)........AA.AA..A..((.((.((..(((.[[[[.[[)))...)).)).))..........]]..]]]]...))))).....))))...))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.................(((((((.(((....)))..(((.....))).....[[[[[[[..)))))))....]]]]]]]((((.......))))....((((..........[[[[[[[..))))...]]]]]]](((((((....((((.[[[[[[)))).....)))))))........]]]]]].......((((...[[[.....))))..]]].........(((((....[[[[[[.......)))))..]]]]]].....((((((((..........))))....[[[[.....))))....]]]].......(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00246
|
[ FASTA input ]
|
GGGACUGCAAGGUUUCUACAUAUAGUAUACAAUAUACAUUGUCAUUAAUAUAACUUUAUUACUAUUAGUAAAUGCUAAAAAUAAUAUAUUAACUUUAUCUAGAAGAUUAAUUUAUGCUUAAACUUUUUGAAAUAAAAGAUUAAGCAGUUACAGAUUGUUACUAGAACUCAAAUAAUAUAAGCCAUAUAGUUAUUUGAUAUAUUGAAUUUGGUUGCUCUUAAAUUAGUCUUAAUCAAAGAAUUAAUUUUAAGAUAAGUAAGAAAUCAUUACAACAUCAAAUCGUAUUUUUUAGAUUACAUCUAUAAUAUAUUACUUAUAAUAUAUUAUUUCUAAUGUAAUUAGACGAUAUAUAGUAUAUUAUUAUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCAGUUCCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.........(.((((..(.......((((..((((((.(((..[[[.....))).).]]]..................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))..))))......)..)))).).(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........((((((((((((.......((((((((((((((((.....))).)))))))((((((......(((((((.........(((((..(((((((...(((((((.(((((......))))).))))))))))...))))....)))))..((((((((((((.....))).)))))))))))))))).(((((((...(((((((....((((.....))))......)))))))...((((.......))))...))))))).))))))....((((((((..(((((((((((....))))))))))).....)))))))).)))))).....)))))))).))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00248
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUGGAUUCGACAUAUAAAUUUGCGUGUUUCAUUAUGAAGCAAGUCAAGUUUAAUGAUCUUGUAAAAAACAUUAAAGUACAAAUAAAUGCAAGCAAUAUAGUUUCAUUUAGUUCAAAACGUUUAGUCUCUUUUGCAUAAGCAAAAUGUGUUAAUAACUUUCUUAGUAGAAAUUGGAGAAGUUUACUAAGAUUUAUAUUUACUCCAUAAUUAUUUUAAAGAUGGUAAAAAGGUGAUUCAUCAUUUGUAUGUUUCUAAACUUUGUGAAAGAAUAGUGGGCUCCAUUUAUAAUGAACGUGGGUUCAAAUCCCACCAGCUCCAUAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((...((......(.(.(.(((.(.....((((((((.[[[[[[..)))).......]]]]]].....................................................................................................................................................................................))))......).))).).).)......))...)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((((....(((.((((((((..(((((((...)))))))...)))))))))))...(((((.............))))).((((((.((((......)))))))))))))))))..........(((((((((..((((.....)))).((((...((((((((((...[[[[[...)))))))))).)))).....]]]]]............(((..(((...((((((....)))))).)))...)))......)))))))))..(((((...)))))..........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00257
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUUGGAUUCGACGGAAUUAGCGAAGCCCAAGGUGCACGUCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUAAAUAAACCGCAAAACAAUAGUCGCAAACGACGAACAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUCAUAGCCUUCACUCCCUAGCUUUCGCUCGUAAGACGGGGAUAAAGUGGAGUCAAAUCCAAACGAGAUCGUGUUGAAGCCGCCGCUUUAGGAUCGAAGCAUUAAAUUGAAUAAAGCUAGUUUUUUGAUGGCGUGUCUGUCCGCAGUCAAUUUACGAAAUUAAAGAUUAGACUAAACGUGUAGGACUGAAGGUAGAGUAAUUUCGGACGGGGGUUCAACUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((...(((.(((((((((({{{{{{...))))).......}}}}}}.............................(((.(.((((.........))))..).)))(((((((((((..(((...<<<<<)))..))))....)))))))..........>>>>>....((((..(.((...aaaaa.)).)...))))...........AAAAA..((...(((((.(((.[[[[[[[))).)))))...)).........]]].]]]]...)))))....)))...)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.......))))))))))....)))..(((......((((((...[[[.)))))).......)))...........((((....))))......]]](((..(((((.........)))))...)))......(((((..(((...[[[[[)))..))))).....((((......)))).]]]]]...(((((.........[[[[[[...[[[[)))))....]]]].]]]]]].......(((((.(((.[[[[[..))).))))).................]]]]].............((((((...[[[[..))))))..(((((........))))).]]]].....
|
|
TMR_00259
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUGGCUUUCGACAGGAGCAAAGAGACUUAAGUGCAUGUGAGCUGGUAAGCUCUAAAACUACCACAAAUAAAUAAACGCAAACAACGCAAAUUACGCUCCAGCUUACGCAAAAGUCGCGUAAGUUUAUCACACUUUUGGAGUCGGCUUAAGAACUUCUAAUCUAGCUAGAAUCUUUCAAGCUGUAAUCUUUGCUAGAUGCUCUUUUUGUCAUACCUUAGCAAAAAGAAAAGAAUAAGGUUGCUUGUGGGAUUUAUCUUGGGGUGUUGGAUAACCACGAAAAGAAAACAAUACCUACUAAACAUGUAGAUUCUUAAGAAGCUCAAGCUUUUGGACUGGGGUUCAACUCCCCACAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((...(...((((((.((((((((((([[[[)))))......]]]]......................................((((....(((((..................))))).))))((((((.(((..(((((.aaaaaa)))))..))).))))))........AAAAAA...(((((((((...<<<<<<)))))))))......>>>>>>...(((((.(...((((.{{{{.{{{{.)))).)))))).........}}}}}}}}....)))))....).))))))....)...)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((...))))(((((((...(((.((((((((((((((((((....)))))..............((((((...(((((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))))))............)))))).(((((((((..(((((.......)))))))))..)))))))))..))))).......(((((((((.........)))))))))..........)))).)))))..)))))).(((((((((((...................)))))))..)))))))))))....))))))...)))..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00261
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUGGCUUUCGACAGGAAUUGUAUCGCUUGGAUUGCAUGUCGGUAGGCAUACCGUAAUCCUGCCAGCUUAAAUUAAACGCAAACAACAAAAAUUACGCUCCAGCUUACGCAAAAGUAGCGUAGGUUUAUCUCUGUUUUGGAGCCGAUCUUUUUGCCAUAUCUACUAACAAAAAAGGUCGUUAUUUCGUAGGUUGCGCUUUUUUGUGUCAUCAAAAAAGCAAAGAUAAGACUGCUUGCCUGCAAAAGAUUUUGAAAGUUGAAUCUAGCGGGCAAAAAGAUUAUUCAACUUUGCUAAGCAUGUAGAGAUCCUUGUAGAUAUAAUUUUUGGACUGGGGUUCGAUCCCCCACAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((((((((((..(((((.(((((((((({{{{)))))......}}}}......................................((((....(((.(.................).)))..))))((((.((((((..(.<<<<<<)..)..))))))))).......>>>>>>...(((((((((.aaa.a)))))))))......A.AAA...(((((......(((((...[[[[[[[)))))....)))))..........]]]]]]].....)))))....)))))..)).)))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((((((((((((...........(((..[[[[[[)))........]]]]]]..................(((...........[[[[[[((((((((.......)))))))).......)))..]]]]]]((((((((((................))))))))))((((((.[[[[.....(((((((((......)))))))))..))))))..]]]]((((((((...((((((........)))))).)))))))).....(((.....[[[[[[)))....]]]]]].........)))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00262
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACUUGGAUUUCGACAGAUUUCUUGUCGCACAGAUAGCAUGCCAAGCGCUGCUUGUAAAACAGCAACAAAAAUAACUGUAAACAACACAGAUUACGCUCCAGCUUACGCUAAAGCUGCGUGAGUUAAUCUCCUUUUGGAGCUGGACUGAUUAGAAUUUCUAGCGUUUUAAUCGCUCCAUAACCUUAAGCUAGACGCUUUUAAAAGGUGGUUCGCCUUUUAAACUAAGAAACAAGAACUCUUGAAACUAUCUCAAGGUUUUAGAAAGUUGGACCAGAGCUAGUUUUAAGGCUAAAAAACCAACCAAUUUUCUAAGCAUUGUAGAAGUUUGUGUUUAGGGCAAGAUUUUUGGACUGGGGUUCGAUUCCCCACAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((..((((((((.((((((...((((((((([[[)))))......]]].....................................((((.....((((.................))))..))))((((.((((((((((.aaaaaa)))))))))).)))).........AAAAAA....(((((((((({{{{{))))))))))...........}}}}}.(((((..(...(...(((....<<<<<<<<<)))...)...).)))))..............>>>>>>>>>...)))).......))))..)).)..)))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((...[[[[[)))..]]]]]((((((((.......((((.[[[[)))).....]]]]...........((((.......)))).....((((((((((((((.......))))))))...........))))))((((.((((((((((.[[[[[[)))))))))).)))).........]]]]]]....((((((((((.[[[[))))))))))...........]]]].((((((((((.........[[[[[[[[[[[[[........)))))))))).............]]]]]]]]]]]]]..........))))))))....................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00271
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUCUGGAUUCGACGGGAUACACGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGAGGCAGGCCUCGUAAAAAGCCUCAACCUAAUAGUUGCAAACGACGACAACUACGCUCUAGCGGCUUAAUAACCCGCUAAGCCCAUCCCCCGGCGCUUUGUCUGCGAGACCGGACCAGGAUGGCUCAAACUAAUGUAGACUCGCGUGGAGGCUUUGUCCGGAGCUGAAGCGUUAAAACCAAUCGGACUCGUCAGUUGUGAAGCCUGUCAGUCGGCGUCACACUGAUUAACUAAAAGACUGACUAAGCAUGUAGGACCGAGGAUGUAGGUAUUGCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((................((.(((((.....(.((..(((.((((((((((<<<<<<...)))))......>>>>>>................................(((((((.........)))))).).(((((..(((....(((aaaaaa)))..))).....)))))...........AAAAAA..((((....(.((({{{{{))).)...))))..........}}}}}..((((((....(.(((.[[[[[[[))).)...)))))).........]]]]]]]...)))))....)))..)).)....))))).))...(((((.......)))))...))).....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((...[[[....)))...]]]...(((....[[[[[[.)))..........]]]]]]...............(((.(((...(((((((.((((((.........)))))))))((((((.(((((((.......)))...))))....))))))...........))))..))))))...((((..[[[[[[))))................]]]]]]..((((((.((((.(((.[[[[[[[))).)))))))))).........]]]]]]]............(((.....[[[[)))..]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00272
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAAUUAGUUUAGAUAUUUAAGUAAUCCAUGAAAAUUCAUCAGAAUUUUGUAAUAUUGCUUAGAUAAAACCAUGGGCAGUACAUGGCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((((((.....(((((((....))))))).....))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...))).((((((((((((.....(((((((....))))))).....))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00274
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACAGGUUUCGACGUUGGUCGUCGAGCCAGGGGAAGCGGGUCGAGGAUGCAUGGUCAUCUCGUCAACGAUCCAUGCAAACCAAUAGGUGCCGAUUCCAAGCGCACCGAGUUCGCCCUCGCCGCCUGAGCGAGCGCGACUCUGUCAGCCCGGGUGAGCUCCCGCCCCGGGUCCUGGCAUCGACUAGGGGGCUCACCUCUCACCGAGGUCGCGUAGGUGAGAGGGACAAUCAACGCGGCUGGGCCCGGCGAUGACAUGCCUGUAUGAGCAUCGGGGCCGAGCAGACCGCUGAACAGGAUGCACCCGGAGAAGCCCUGGUACCACGCUGACGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCAUCUCCACUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((....(.(((((((....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA.............................(((.((((.(((((.......))))).)))))))((((((.(((((...{{{{{{..)))))...)))))).......}}}}}}...(((((((((..[[[[[[[..))))))))).........]]]]]]].(((((..(((((.....<<<<<.<<..))))))))))...........>>.>>>>>....)))))......))))))).)...)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((.((((....))))...))))........(((.....[[[(((((((.....(((....))).))))))).(((....))).)))..]]]..(((....[[[[.[[[.[[[[[)))....]]]]].]]]]]]]((((((.......[[[[[[[[......[[[[))))))..]]]].]]]]]]]].(((((((((..[[[[[[[[.)))))))))........]]]]]]]].(((((..(((((.((((....))))..)))))))))).(((.....)))...((((......[[[.......))))............]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00278
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGGAUUCGACAGGCGUAGACCCGCAUUGACUGCGAUUCGUAGGUUACGUCUACGUAAAAACGUUACAGUUAAAUAUAACUGCAAAUAACAAAAAUUCUUACGCAUUAGCUGCUUAAUUUAGCGCAUGCGUUGCUCUUGACCAGUUUACUCGUGACUGGUUUUCGAGUAUCAACUUUAGCGAGUUACGUUUAACUACCUCACCUGAAUAGUUAAAAAGAGUCUUAACAGGUUAGCUGGUUCAUACUAGCCCUGUUAUAUGGCGUUUUGAACUAGUGAAGUUUAAGUAAUAUAACUAUGAUCGUAGAGGUUAAUGACGAGAUGCGUUUGGACAGGGGUUCAAUUCCCCUCAUCUCCAUAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((...(..((((((((.((((((((((<<.<<<<))))).....>>>>.>>.......................................((..(((........)))..))...(((((..((((((((.[[[[[[))))))))...))))).........]]]]]]....((((((((....{{{{{..))))))))...........}}}}}..(((((((((.(...(((..aaaaaaa)))..).)))))))))............AAAAAAA...)))))....))))))))..)...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((...))))((((((((......(((((((((((((.(((((.(((((....)))))....(((((((((((((.(((((...(((.......)))...((((((.....(((......)))..))))))(((((..((((((((.......))))))))...)))))............))))).))))))))...((((.....(((((((((...(((.(((((((...((((((....)))))))))))))...))).)))).))))))))).......)))))....))))))))))...))))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00279
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUUCUGGAUUCGACUGGUAUAGGUUGCGCCCCAACUGCACUCCGUAGCGGCAUCUACGUUAAAAGGUCCAGUUUAAUUAUAACUGCAAAAAAUAAUAACAAUUCUUACGCUUUAGCUGCUUAAUAGGCGCUUAACGUAGAUCCUCCUAGGCUUGUCCGUGGUCUAGAUCUGGGUCCUAAAUUUAACGGACUUACGCUAACGACUCCCACCUGAAGUACGUUAGAAGAGAAAAAUCAGGUUAGCUGUUCAUGUGGGCCCUGACAGGCGGCAAGUUGGGCAGUGAAACCUUAAGUAGUCUGAAUAUGAGUGUAGACGUUGGGGUGGCAAUAUGCUAGGACGCGGGUUCGAUCCCCGCCGGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((((((((..((((((((((..[[.[))))).....].].].........................................(.((((.(((.......))).)))).)..(((((..(((((((.aaaaaa)))))))....))))).........AAAAAA.......(...(((...<<<<<<)))...).............>>>>>>..(((((.(..((..(((....{{{{{))).).)..)))))).............}}}}}.....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((.....(((((((((.......(((((.[[[..))))).......]]](((((.......)))))....................((((....(((.(((.....))))))...))))((((...(((((((.[[[[[[))))))).....)))).........]]]]]].....(((((((((...[[[[[[))).))))))..........]]]]]]..((((((((.....(((....[[[[[)))....)))))))).............]]]]]...............)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00280
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAAUGGUCUCGACAUUGCUUUUCGCACAUGCAGUGCACCUCGGAGGCUCGGCUCCGUCAUCAACGGAACAGUUAAUAUAACUGCAAAGAACGAAAAUUCUUACGCUUUAGCUGCUUAAUAACCAGCUAGCGUGAUCCUUCCGACUUCGCUCAAGGGUCGGGUCUGGGUCUCAAAUUAUUGAGCUACGGUUAAUGUUGCCACCUGAGGCAUUAACAAGAGACUAGUAGGUUAGCUGCGUUGUGUUAGCCUUGCUGGCUGGCGCGACAUCGCGGCGAAUUUUAAAUAAGUCAGCUAUAGGUGUAGAGCUGCAUGUAGCAGGGGUGAUGGACAGGAGUUCGAUUCUCCUCACCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....(((((((((.((((((((((<.<<<.))))).......>>.>.>....................................(.(.(..((..........))).).).(((((.((((((((.{{{{{{))))))))...)))))........}}}}}}....(((((((((...aaaaa.)))))))))..........AAAAA..((((((.(((....(((..[[[[[[[)))...))).))))))............]]]]]]]...)))))....)))))))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((....((((((((((...(((((((((((((((.((((..(((..(((((.....))))).((((((...)))))).......)))...)))).......((((((.....(((((.(((((((((((((.((((((((.......))))))))...))))...............)))).....(((((((......))))...))).....))))).)))))(((((((((((((((((.....)))))))))))...))))))...............)))))).))))))...)))))))))...)))))))))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00283
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGGAUUCGACAGGCGCAGACCCGCGCUGGUUGCGAUUCGUAGGUUACGUCUACGUUAAAACGUUAAACAGUUUAAAUUAACUGCAAACGAAAACUCAUACGCUGUAGCUGCUUAGUUCAGCCCAGCUGCCAAUAGACUGCCUGCCCGUGGCGGUCUUGCGGUAUCAACAUUACGGGAUACGCUUGCCUAUCACACCUGAAUAAGCGAGAAGAGACUAACAGGUUAGCCGUGGCUGUUUGGCCCUGUCAUAUGGCGUUUUGCCCCGGUGAAGUUUAAAUAAUAUGACUAUGAUCGUAGAGAUUAGUGACGGGAUGCGUUUGGACAGGGGUUCAAUUCCCCUCAUCUCCAUCU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((...(..((((((((.((((((((((.a.aaaa))))).....AAAA.A.....................................(...((((.......))))...).((((....(((((((..{{{{{)))))))....))))........}}}}}.....(((((.(((...<<<<<.))).)))))..........>>>>>..((((.(((.(....(((..[[[[[[[)))...).))).))))............]]]]]]]...)))))....))))))))..)...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((((((..((((((((((((..(((..[[[[)))....]]]].......((((...(((((......)))))..))))...........((((.....[[[.....))))..]]]((((...((((((((..[[[[[))))))))...))))........]]]]]...((((((........[[[[[..))))))............]]]]]((((....))))....(((..[[[[[[[))).((((((....))))))........]]]]]]]............)))))))).)))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00289
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGGAUUCGACAGGCGUAGAUUCGCGUUGACUGCGAUUCGUAGGUCACGUCUACGUUAAAAACGUCACAGUUAAAUUAUAACUGCAAAUAACGAAAAUUCUUACGCAGUAGCUGCUUAGUCAGCCUGCGUGAUCCAAAGAUGGAUUGCUCGUGUCUAUCUACGGGUCUUACCAUUUAACGAGCUACGUUUAACUACUUACCUUAAUAGUUAGAAAUAAGAUUCUUAGGUUAGUUUUGAUAGUUUAGCCCUGUUAUAUGGCGUUUUAUCAAAGCGAAUUUUAAGUAAUAUAACUAUGAUCGUAGAUGUUAACGACGAAAUACGUUUGGACAGGGGUUCAAUUCCCCUCAUCUCCAUAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((...(..(((((((..((((((((((<<.<<<<)))))......>>>>.>>.......................................((((.(.........).))))..(((((...(((((((.aaaaaa)))))))...)))))..........AAAAAA....(((.(.(....{.{{{{{..).).))).........}}}}}.}.((((((((((....(((..[[[[[[[)))...))))))))))............]]]]]]]...))))).....)))))))..)...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((((((...(((((..[[[))))).......]]](((((((((.......(((..((((((.....))))))......))).........((((((..((((......))))))))))(((((..((((((((.[[[[[[))))))))..)))))..........]]]]]]....((((((((..........))))))))..((((((((...[[[[[((((((((((....(((.........)))...)))))))))))))))))).......]]]]].....)))))))))...........))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00290
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUGUCGCGCAUGAACUGCAACUGCUGAGGGAUCAGGAUAAUCAUCCGCAGAUAAAUAUAACUGCUAAAAAUAAUACACAAACUUACGCAAUGGCAGCCUAAACAGCACCAUGCGUGCCUGAUUUUUGCUCUCUGAUGGCAAUUUGACGGCCUAAACUUUUAGUCAGAUACGUUGUUGUGGAGGCUUGACGCAGCAAAAGAGAUUUAAAGCCCCGCAAAAUGUCGCUGUUUGAGACUGGCUUUGGCAUUUUGUUAAAUUUGAGAAAGUCCUAUGGUUGUAGACGUUGAUGUAGCAAGGUGUUUGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCGCCUCCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.(((..(((((.(((..{{{{))).......}}}}......................................(((((.(((..............))))))))(.(((....(((((.aaaaaa))))).....))).)..........AAAAAA....((((((((<.<<<<<..))))))))..........>>>>>.>((((((((((...(.....[[[[..[.).)))))))))).........]..]]]]....))))).....))).)))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..........(((((...)))))(((((((..((((...(((((((......((((....))))((((..........)))).................)))).)))...))))......[[[...)))))))..]]]................(((.[[[[[[[.)))..........]]]]]]]...((((((((..[[[[[..))))))))..........]]]]]..(((((((((((..(((...[[[[)))..)))))))))))............]]]]((((....))))..........................(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00296
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUCUGGAUUCGACAGGUAUAGUUUGAGUUCGGAUUGCGCUUCGUAGGUUGUGUCUACGUAAAAACGCUCAGUUUAAAUUAUAACUGCAAAAAAUAAUAACAAUUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAUAAGCGCUUAACGUAGAUCCUCCCAGGAUCGUCCAUGUUCUGGAUCUGGGUCCUAAAUUUAGUGGACUUACGCUCAAAGCUUCCACCUGGAGUUGCGAGAAGAGACUAAUCAGGUUAGUCAUUGCUGGGUGCCCUGUCAUACGGCGUUUGCAAUGAUGAAAUUUAAAUAGUAUGAAUAUGAGCGUAGAUAUCCGAGGGGCAAUAUGCUUGGACGCGAGUUCGACUCUCGCCAUCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.......(((((((..((((((((((...<<<<))))).....>>>>...........................................(.((((.(((.......))).)))).)..(((((..(((((((.{{{{{{)))))))....))))).........}}}}}}.....(((..((((...aaaaaa))))..)))..........AAAAAA..(((((...(((.((((...[[[[[[))))).))..)))))............]]]]]]....))))).....)))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((((((((.[[[[.....)))))))))))....]]]].((((...[[[[))))......]]]].(((((........)))))......................((((((((.[[[)))..)))))......]]]((((((...))))))((((((.....((((....))))........))))))(((((((((....(((.[[[[[)))..................]]]]]..((((((((....((((...[[[[[[))))...))))))))............]]]]]]...)))))))))((((..[[[[[...))))..((((((....))))))]]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00298
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUUACGGAUUCGACAUGUGUAGGUGAGCGUGAAUUGCACUUCGUAGGUUACGUCUGCGUUAACAACGUUACAGUUAAUUAUAACUGCAAACAAUAACAAUUCUUACGCUGUAGCUGCCUAAACACCAGCAUAGCGUGAUCCGUCUGACUUCACCCAAGGGUUAGAUCCGGGUCUCAAAUUAAUUGGGUUACGUUAAAUGCCGCCGUUUGAAGUGUUUAAAAGAGAUUUUCAAGCUAGUUAGUCCAUCCGAGCCUCUGUUGAACGGCGUUUUGGGCUAGCGAAUUUCUAAAUAGUUCGACUAUGAGUGUAGAGAUUGACGUGGCAAUGCGCAUGGACGCGGGUUCAACCCCCGCCGGCUCCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((.(((((((((([[.[[[[)))))......]]]].]].....................................(((.(.(((..........)))).))).(..((.((((((((.aaaaaa))))))))....))..)........AAAAAA....((((((((....{{{{{{.)))))))).........}}}}}}..(((((((((.....(((...<<<<<<<)))....))))))))).............>>>>>>>...)))))....)))).)))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((..[[[[))).((((((.((((.....)))).))))))]]]]((((((...[[[[..))))))..]]]]....................(((((((.((((.........)))))))))))((((((((((((((.[[[[[[))))))))..)))))).........]]]]]]............(((.[[[[[[[))).............]]]]]]]..(((((((((.....(((...[[[[[[[)))....))))))))).............]]]]]]]..................((((.....[[[))))..]]]((((...))))....)))))))....
|
|
TMR_00300
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGCACUGGUUUCGACGGGGAUGUGGAAACCAAAGUGGCAGGUCGAGGCGCCGCUGGCCUCGUAAAAAGCGGCAACAAUGUAAUUGCAAACAACAAUUACGACUACGCUCUUGCUGCAUAAGUAAUAGCGUACCUGGCUAUUUAAAUAGCCACGUCAAUCCUGCUGAUGUCUGAUAAGCUGGUGCGGCGACAAUCAUCAGGCUAGCAGCCUAUUGUGUUUACUGGAUAGUCUGCGAAAUUAUUACAGUAAACUUGUUUUGAUCUGCCUGGCUAAGGGCUAGAAUCAAAAUAAGAUGUAAACUUAGCCUAAACCUGUAGAUACUUUGUGUGGAACUUUCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((.((...(..(((((((.((((((((((.aaaaaa..))))).....AAAAAA................................((((.(((((.....))))).))))....(((((((....)))))))((((...((.(((....[[[[[[.))).))...))))......]]]]]].(.((((.(((((..{{{{{{{{))))).)))).)........}}}}}}}}..((((((((.((((.<<<<<<<)))..).))))))))..........>>>>>>>...)))))....)))))))..)...)).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((.((((((.(((....))).)))))).....(((((((((((((((((((............))))))......(((((((.......)))))))(((((((((.(((((.....))))).))))))..(((((((....))))))).))).....(((((..[[[[[[[.........)))))......]]]]]]]..((((.(((((..[[[[[[[[))))).))))..........]]]]]]]]..))))))))))))).(((((((.......(((.......))).....)))))))..................)))))........(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00301
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGCUUCGACGUGGGUUGCAAAACCGGAAGUGCAUGCCGAGAAGGAGAUCUCUCGUAAAUAAGACUCAAUUAAAUAUAAAUGCAAACGAUGAAAACUUUGCUGGUGGGGAAGCUAUCGCUGCCUAAUAAGCACUUUAGUUAAACCAUCACUGUGUACUGGCCAAUAAACCCAGUAUCCCGUUCGACCGAGCCCGCUUAUCGGUAUCGAAUCAACGGUCAUAAGAGAUAAGCUAGCGUCCUAAUCUAUCCCGGGUUAUGGCGCGAAACUCAGGGAAUCGCUGUGUAUCAUCCUGCCCGUCGGAGGAGCCACAGUUAAAUUCAAAAGACAAGGCUAUGCAUGUAGAGCUAAAGGCAGAGGACUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......((...(((.((((((((((..[[[.[.))))).......].]]]...............................................(..(((........)))..)...................(((((((.........))))))).(((((.....(.(((.aaaaaa.))).)......))))).........AAAAAA(.(((((.((((((<<.<<)))))).))))).).......>>.>>.(((((...(..(((.{{{.{{{)))...)..)))))...........}}}..}}}...)))))....)))...)).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..............(((..[[[[...)))....]]]]...((((...[[[.[[[))))......]]]]]]....................((((....(((.[[[...)))..]]]....(((..[[[[..)))...]]]]......)))).....(((((((.........))))))).......(((((.....[[[[[[[(((.....)))..)))))......]]]]]]]..(((((.((((((.[[[[)))))).)))))........]]]]...((((((.....(((.....[[[))).....))))))...........]]]..((((.[[[......))))....]]]..((((((((....)))))))).........)))))))....
|
|
TMR_00302
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAUUGUCUGCGUGAGUAUGAGAAGCGGGUCGAGGACGCAUGGUUAUCUCGUUAACGAUCCAUGCAAAAAAUAAGUGCCAAUUCCAAGAGCACUGUCUCGGCCAAGGCCGACUUCGCCCUCGCGGCGUAAGUUCACCUCAGCCAUCUGAAGAGGCCGUCAGACCGGGAACUGUUCUCUACCCGGAGCCUGGCGUCAGUGAGAGAACUCGCUUCUGCGUUGAGUAUCAGGGCGCAGAGGGACUUCAACUGAUACUAGGCCCGCCGGAACAGGUGCCAGCGACACGUUCCGGGGCCGAGAAAGCGACACACUGGCUACGCCCGUAGAAGGCAUAUGACCACAGCAGUGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((........(((((.....((((((((((..aaaaa....))))).........AAAAA.............................................(..(.((.......................)).)..)........((((((.(((((....{{{{{{{.)))))...))))))......}}}}}}}...((((((((((.<<<<<<<.)))))))))).........>>>>>>>.(((((..((((((....[[[[[.[....)))))))))))............].]]]]]...))))).......))))).......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((.((((((((...)))(((....)))...))))).))))..(((.((((((.....(((....))).))))))........[[[[[....)))....]]]]].((((((((..(((.(((((((((.....)))).)))))..[[[[.))).......]]]](((.[[[..)))...]]].........(((.((((((.((((((....(((....((((((((((((...)))..)))))))))...))).)))))).)))))))))(((((((..(((.......)))))))))))))))))).(((......[[[)))..(((.......))).........]]]....(((.[[[[[))).....]]]]]..........
|
|
TMR_00305
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGAAAUUGGUUUCGACUGUUGUUGCCAGGGGUUAUGUGGCGUGUAGAGGUUGUAGGCUCCUCUAAAAACCUUCAAACAAUAACCGCUAAUAACGAAUUAGCUUUAGCAGCUUAAUCUCUGCUACGGAACUUUAGUUUUUUCUCUCGAAUUCUAAAUGUUCUGACAAUGAUCGGGAGGCGAUUCUUUUGGUUUUUGGUUCCUAAAAGAGUUUGUAUUUGAGCCGAAUAGGAAAGAGAGUCCUGUCUGAGGGUGAACCUCUUUCCGAAAUUUUAUACACAGACUACACACGUAGAGGCUGAUCUGGGGCGCAAUAGGACGCGGGUUCGAACCCCGCCGUCUCCAAAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((..((..((((((..(..((((((((((..a.aaa..))))).....AAA.A..............................((((((........))))))(((((.(((((..((.<<<<<<<))..)))))..)))))........>>>>>>>..((((((((((..{{{{{{{{))))))))))........}}}}}}}}(.((((((((..((..[[[[[.[...))..)))))))).).........].]]]]]...)))))....)..))))))..)).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((..(((...)))..))))..((((((.(((....((((((...[[[[[[)))))).......)))....))))))((((((.....))))))......]]]]]]..((((((..((((((..........[[[[[[[[.........)))))).......]]]]]]]].(((((((((((..[[[[[[[[))))))))))).......]]]]]]]]..((((((((......[[[[[.........)))))))).............]]]]].......))))))(((..[[[[.)))....]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00306
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCGGGUUCGACGGGGAUGAGAAAGCAAGGACAGCAUGCCGAGGUCCCAGGUCCUCGUAAAACCUUUGGGAAAAAGACAACUGCCAACGAAGAGCUGGCUCUCGCUGCUUAAUCUAAACAAUUAAGUGAGCGCGCUUAUCGGAUUUUGCGCCUGCCCGGAUCCGAAGGCGUGGAGAAGGCAGGAUCGCCAAGGGAACAUGCCUGGGUUCCCGAGGUUAAACCCUUACAGGCUCGCUGAUGACGGGUACGCCCCUCUUUCCCGUCGUUGGUCAGACUUAAACAGGGGCUAAGCAUGUAGCGGUUCUUGGCGGACUGUUUCCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((((.....((((((((.(((((((((((.<<<<<<.))))).......>>>>>>...............................(...((((((((.......))))))))...)((((..((((..((((..{{{{{{)))).)))).)))).......}}}}}}...(((..((((((..[[[[[.))))))..)))..........]]]]](.((((((((((((...aaaaaa.a..)))))))))))).).......A.AAAAAA...)))))...).)))))).))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((....((((((((......(((.[[[[....)))....]]]]...)))))))).....(((((..............[[[[.)))))...]]]].((((((..................))))))(((((((.((((((((....[[[[[[.))))))))))))))).....]]]]]]........((((((..[[[[[.))))))((((......)))).]]]]]..((((((((((((...[[[[[[....))))))))))))...........]]]]]].........((((((((.....)))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00310
|
[ FASTA input ]
|
GGGUCUGUUUUUGGAAUUCGACAGGUCGUUUAGAGCAUUGAUUGCGUUUCGCCAUCCGGGCGCAAAACGGGCAGAAAUUUUAACUGCAAAAAACGAAAACUCUUUCGCUAUCGCUGCCUAAAAACCAGUGAUGCGUAGCUUAAUCUUGGUUGCUGGCGUCUGAGGUUAGGCCAUAAAAGGCCAGAUCGUACUGCUUCUUACAUCUGGAAAAGCAGUAUUAAAUCAAUCAGGUUAGUUAUAUUGAAGAGCCUUGAGCUAUGGCAGACAAUAUAAUGAACUACAAAUAAUAGCCCUAUAAACGUAGAUAUUGGUGUAUCGGGCGAUUUGGACAGGGGUUCGACUCCCCUCAGAUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((..............(((((((((..(.((((((((..(((((((((.aaaa)))).....AAAA.....................................((((((((.........))))))))....((((((((((((.(.[[[[[).))))))))))))........]]]]].....(((((((.(...<<<<<<).)))))))..........>>>>>>..(((((..(.....(((..{.{{{{{))).....).)))))............}}}}}.}...))))).....)))))))).)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........................(((.....)))....((((..[[[)))).....]]]((((...[[[[..))))..]]]](((((....))))).((((((((.........))))))))....((((((((((((...[[[[[..))))))))))))........]]]]]...(((((((((.............)))))))))....(((....[[[[.[[[[[[[[[....[[[.))).....]]]...]]]]]]]]].]]]]..........((((..[[[[....(((((....)))))))))..]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00317
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUACGGAUUCGACAGGGAUAGUUCGAGCUUGAGUUGCGAGUCGGGGGGAUCGUCCUCGUUAUCAACGUCAAAGCCAAUAAUAACUGGCAAAGAAAAACAAAACCUAGCUUUCGCUGCCUAAUAAGCAGUAGCAUAGCUGAUCCUCCGUGCAUCGCCCAUGUGCUACGGUAAGGGUCUCACUCUAAGUGGGCUACACUAGUUAAUCUCCGUCUGAGGUUAAAUAGAAGAGCUUAAUCAGACUAGCUGAAUGGAAGCCUGUUACCGGGCUGAUGUUUAUGCGAAAUGCUAAUACGGUGACUACGCUCGUAGAUAUUCAAGUGCCGAUAUUUCUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCAUCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(..(.((((((((..((((((((((<<.<...))))).............>.>>.................................((..(((((..........)))))..))..((((((((((((((.aaaaaa)))).))))..)))))).........AAAAAA....(((.((((((...[[[[[[)))))).)))..........]]]]]]..((((.(..(.((((.{{{{{{{))))..)..))).))............}}}}}}}...))))).....)))))))).).).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((..(((.((((((((((((((....(((((...)))))((((((.........((((........))))................((((((((((.......(((((.(((((......((((((((((((((.......)))).))))..))))))(((((...)))))))))).(((.((((((((.....)))))))).)))....))))).((((.....))))(((((((((((....))))))....))))))))))).))))....))))))....))))))...))))))))..)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00331
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAACUGGCUUCGACGGGGUGUGGAACGGUUAGCAAGGCGACUCGGAAUGGUACCUACGUACAGGACCAAACUUUACAAUUGCCAAUGACGAGCACUACGCUCCGGCUUUUGCAGCUGCAUAAAGUAGUUGUACAAAGCGGGGUCUGAACCCGGGCCCGGCAACAGAAGCUUUUAGCGGGGUUAAGCCGGAACUGUGUAGGCCGGUGUAAAUCCAGGGACACCCAGUUCUCCGAGGUAACGGGGGCUAUGUGGUCAGCCAGCCUGAGACGCCACAAAGCAGUAGGGUUGGCAAAAUGGUCGUGAUUCCUUCUAGCUUAAUACAUAUUUCGGACCGGGGUUCGACUCCCCGCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....((((.(.(((((((((((.(.[[[[.[.).))....].]]]]..............................((((((..((.(((((((((.....))))))))).))..))))))............(.(....).)((....))......................................................((((........))))(((.(...(.(.{{{{{{{{..)....)..).)))....}}}}}}}}.....))))).....)))).))))).....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((.......(((..[[[[[[[[[)))..((((....(((((.......((((.(((......)))))))..........)))))..))))......]]]]]]]]]((((((((((((((.....))))))))).))))).(((((((....)))))))....((((..(((...))).[[[[[..[[[[[..)))).....]]]]]...]]]]]..(((..[[[.....)))........]]]((((.[[[[[[.))))..........]]]]]]((((...((((.((((......))))....))))....))))..........(((((.[[[[[)))))..]]]]]......)))).
|
|
TMR_00332
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUUGGAUUCGACGGGAUUGGCGAAGCCCAAGGUGCAUGUCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUAAACAAACCGCAAAAUAAUAGUCGCAAACGACGAACAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUUUAAAGCCUUAUCUCCUCAGCUUCCGCUCGUAAGACGAGGGCAAAGAUAAGUCACCCAAAACGAGAUCGUGUGGACGCCGCCGCUUUAGGAUCGAAACACUAAAUUAAAUAAAGCUAGUUUAUUCAUUGCGUGUCUGUCCGCUGUGAAUAAGCGAAAUUAAAGACUAGACUAAACAUGUAGUACUGAAGGUAGAGAAAUUUCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((......(((...((((((((((((((<<<<<<...))))).......>>>>>>.............................(((((((..(..........)..).))))))(((((((((((..(((...[[[[[)))..))))....))))))).........]]]]]....(((.....((...aaaaa.))......)))...........AAAAA..((((((((((.(((.{{{{{{{))).)))))))))).........}}}.}}}}...)))))...))))...))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.........[[[[[[[..........)))))........]]]]]]].((((((.......[[[.....))))))........((((....))))......]]](((..[[[)))..........]]].......(((((((.[[[.(((....(((((...))))))))..)))))))...........]]].(((.((((......))))[[[[[...)))....]]]]].............((((((((((.(((.[[[[...))).))))))))))........]]]](((((((......)))).)))................(((.[[[[[))).....]]]]]..........
|
|
TMR_00334
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGACUUGGCUUCGACGCCGGUGACGAACCCUUGGGUGCAUGCCGAGAUGGCAGCGAAUCUCGUAAAUCCAAAGCUGCAACGUAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUGGCGGCGUAAGCCGUUCCAGUCGUCCUGGCUGAGGCGCCUAUAACUCAGUAGCAACAUCCCAGGACGUCAUCGCUUAUAGGCUGCUCCGUUCACCAGAGCUCACUGGUGUUCGGCUAAGAUUAAAGAGCUCGCCUCUCGCACCCUGACCUUCGGGUCGCUUGAGGUUAAAUCAAUAGAAGGACACUAAGCAUGUAGACCUCAAGGCCUAGUGCUGGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......(((((((..((((((((((..{{{{{...)))))..........}}}}}..............................((...((((((....))))))...))(((((((((((((..aaaaaaaa))))))..........))))))).......AAAAAAAA.(((..(..((((((<<<<<.)))))))..)))..........>>>>>.(((((..(..(((.[.[[[[[)))....).)))))..........]]]]].].....))))).....))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((.[[[..))).....]]](((....)))...(((.(((((.[[[[[..))))))))........]]]]]..((((...((((....))))......)))).(((((((((....))))..))))).((((((((((((..[[[[[[[[)))))..........)))))))........]]]]]]]]....(((..((((((......))))))..)))...........(((.[[[[[.)))((((...((((....)))).(((((((((.......(((.......)))........))))))))).....)))).]]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00337
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCCUGGUUUCGACAGGAUACUCUGGUCAUAUAAUAGCAGUGGUGUGGUAGACCAUAAUACUUCUAGGUUUGAUAAAAUGCAAACAAAAACGAAGAAAACACAAACGAAGUUCCAACAUUUAUGUUAAAUGCUGGACAAGCAAAUUACGCUUUCGCUUAAUUUGACUUAAAUACAAAUAUACGUUUGGCAAUUUUUAAUAGUCUUGGAAUCUGUUAAUUAUUGUACAUACCAAUUCCAAUAGAAAUUAUGAUCGUAAUAAAUAAUUUUGAAACUCAAUUACGGAUGUUAUAUUAGUCUUUUGAUAAUUUUAUUUAAUAUAGCAAAUUAGAAAAUUAUCUAAACUGUAGAAUUUAUAUGAUUCGGUAUUUUGGACGUGGGUUCGAUUCCCACCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((..(((((((((((.((((((((((..aaaaaa...)))))....AAAAAA.......................................((((.((((((...)))))).)))).....((((((.((....)).))))))........(((((..................(((((((..<<<<<<<)))))))...))))).......>>>>>>>(.(((((((([.[[[[[[[..)))))))).)......]]]]]]].].(((((.(.(....(.{{{{{{{{{)..).))))))........}}}}}}}}}...)))))...))).)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((...(((((.......)))))..)))).(((......(((.((((.(((((....))))).)))).))).[[[[))).......]]]]................((((((....((((.((((((...)))))).)))).((((((((((..........))))))).)))..(((....))).))))))(((((..(((((((..[[[[[[[)))))))..)))))........]]]]]]]............(((((((..................))))))).(((((((((((......[[[[[[[[[..)))))))))))......]]]]]]]]].........(((((.....))))).......((((.(((((.......)))))....))))...
|
|
TMR_00340
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGAAAUGGUUUCGACGUUUUAGUAUAUAUCUUCUUACAAGCAAGUCGAGAAUGAACCAAUCUCGUAAACUUGAGUUCAAUUGCAAAUAAAUGCUAACAAUAUUUUACCUUUUAAUCGUAAGACAGCCGUAGCUGUUUAAAAGUUUUUUGAUAACUUCGAGCAUUUUUGAUUUGUUAAAUACAAUUGUUAUAAAACAAAUUAAAUAAUAGUUUUUGUUUCUUUACAAAUAAUGUAGAAAUAAUUUUUUUUAGCUUUUCAAGCUCCAGCUUUGUGGAUUAGCAAAGCUAAACUUGUGAAUACAAAGAAGAGAUCAAACUAAAGCGGACGCGGGUUCAAAACCCGCCAGCUCCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.....(.((.((..(..((((((((((.aaaaa...))))).........AAAAA......................................................................................(((((((((((...((.[[[[[[[[)).)))))))))))]]]]]]]]...((((......))))....(((({....(...})))).......).(.((..<<<<<..)).)....>>>>>...)))))....)..)).)).).......)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((.....(((((((.....((((((((((.........)))))...))))).(((((.........(((((((.............(((((((.......(((((....)))))))))))).....(((.....))))))))))((((...((((((...(((((((...(((((((...(((....)))))))))).((((((.....)))))))))))))...))))))...)))).....((((((((......)))))))).......)))))...)))))))......)))))))))...(((((((...))))))))))))))....
|
|
TMR_00341
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACAUGGCUUCGACGUGGAUCGCGAAACCUGAGGUGCAUGCCGAGGUGCAGAUGACCUCGUAAAUCCAUCUGCAAACCAAAUAAACGCCAACGACGACGUUUACGCACUGGCCGCUUAAGCCGGCCGGCCUCUGAUCAGCAGCUCGCUUACAAGCGGCUGGUUGGGGGUAACCCAAUUGUAAGCUCGCGCUGAAGUCUGUCCGGGGCCGAAGCGCUAAAACCCAACGGAAUCGCCGUCCGUCUUCCCUGCCACUCGGGUAGCGUCCGGCUAAAUCAAUAGAGUGGAUACGCAUGUAGAACCGAUGGCAGAGGAUUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.......(((.(((.((((((((((.<<<<<<..))))).......>>>>>>..................................(((((((.......)))))))((((.(.......(.(((({{{{{{)))).)..).)))).........}}}}}}..(.(((((...((((.[[[[))))...))))).)........]]]]...((((.......(((...aaaaaa))).......))))..........AAAAAA....)))))....)))..))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((..((((..[[[[.)))).....]]]]....(((((.........[[[[[[[[[[))))).......]]]]]]]..]]]...((((((..........))))))....(((((.......)))))...(((((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))))))))))))........]]]]]]]..(((((...((((.[[[[))))...)))))..........]]]]......((((((..(((((((((.((((.((((.....)))).....(((..(((....))).)))....)))))))))).)))...))))))(((((.......))))).))))))....
|
|
TMR_00343
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCAGGUUUCGACGUGGGUUGCAAAGCAGCGCAGGGCAUACCGAGGCCUAGUCACCUCGUAAAUAAACUAGAACAAGUAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCUCUAGCCGCUUAAUCCCGGCUGGACGCUGCACCGGAAGGCCUCUCGGCCGGGCGGGUAACCGCAGCAGCGUCAUUUAGAGAGGAUCGUGUUGUAUUGGGUUACUUAAUACAACAUUAAAUCCAAGGUAACUCGCCUGCUGUUCGCUUGCUCGUUGGUGGGCAUCAGGUUAAAUCAAACAACACAGCUAAGUAUGUAGAACUGUCUGUGGAGGGCUUGCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..(((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]].................................((((((((........))))))))((((((.((((....{{{{{{..))))((((....)))).)))))).......}}}}}}...((((((((((aaaaaaaaa))))))))))........AAAAAAAAA(((((....(((((.<<<.<<<)))).)...)))))..........>>>..>>>...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((.[[[[.....)))(((((...)))))...]]]]....(((((.[[[[[..))))).......]]]]]...((((...((((....))))...))))...(((((((((........))))..((((((((.......((((....))))..((((....)))).))))))))...))))).((((.(((((((((((((...)))))))))))))...))))..(((.....(((((.((((((((.[[[[...)))))))).)))))...)))......(((((...(((.......)))..)))))..]]]]...((((.[[[[[))))..]]]]].)))))))....
|
|
TMR_00345
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAAUGGUUUCGACGGGGGUAGCAUUGGCAGUAGUAGCCAGGCGAGAUCCCACCGGCUCGUUAAACGGUGGAACGGCUAUUAAGUGCCGACGAUAAUUUAGCUCUGGCUGCUUAAUUAAAAAGUAGCCCAUCCGUCUGGUCCUGGCCUGCGGGGACCAGUACCGGGUGUCAAAUCUAGCAGGCUACCGGCAAGGCCCCGGCCCGGGGGCCUGAAGGGAAUCUCAAGCGGGCUGGCCCGAGGGUAUCCGGUUUCCGGGAGACCCGACGGCGAGAUUGAAAACGGAAACUAUCCUGGUAGAAGCUACUGUGGAUGUACCUUCGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((...((.((((((((..(((((((((...{{{{{{.)))).....}}}}}}..................................((((((((.......))))))))((((((.(((((((([[[[[[[.))))))))...)))))).........]]]]]]].((..((.((((((aaaaaa))))))))..))..........AAAAAA...(((..((..((..<<<<<<<))....))..)))............>>>>>>>...))))).....)))))))).))..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((......((((((((((((..(((((...[[[[[[.)))))....]]]]]]..((((..[[[[[[))))......]]]]]]....((((((((.......))))))))((((((.((((((((........))))))))...))))))............))))...(((.[[[[[[[.)))..]]]]]]]......((((((.......[[[(((...((((.(((((...)))))..))))...))))))))).....]]]...((((....))))..)))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00346
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUCUGGCUUCGACGCUGGUAGCGAAACCUAAUGAUGCAUGUCAAGAGCGUGUGACUCUUGUAAAUCAACAUACAUUUAAAAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCACUAGCAGCUUAAGGGCUGCUUAGGACGGCACAAAUUGCCUUUGGUUUGGUUGCUCUCCUAGAUGCGAAUGCACAAAGGAUAGCCAAAAUUAGCGUUGCGAUGAUUUUGGCGAAAUUCUUAGCAAAUCGUCCAAUCCAUCCUGACUGUCGGUUCGGUGCGGAUUAAAGCCAUAGACAGAAUCUAAGCAUGUAGAUUCAUAGAUGUAGUACUGGCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((........(.(.(((.((((((((((..[[[[[..)))))..........]]]]]..................................((((((((..))))))))(((((.((((..((.(.aaaaaa).))...)))).)))))............AAAAAA...((((((((((...{{{{..))))))))))..........}}}}...((((..(.(...((<<.<<<<))....).).))))..........>>>..>.>>...)))))...)))..).)......))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((...[[[))))).))).................]]]....((((((((((....(((((........)))))....)))))))..........[[[[)))...(((((((....)))))))]]]]..(((.[[[[[[)))...]]]]]].((((..[[[[....))))........]]]]..((((((((((...[[[[..))))))))))..........]]]]...............(((((((..[[[[)))).))).....]]]].......(((((((.[[[[.)))))))....]]]].........(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00348
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAAUGGCUUCGACAGGCACUGGAUUUAAUAAAUUGCAGUGGUUGGUAACCUAAAACCAUCUAGGCUUUUUUAAACGGAAACUUAGAAACUUCUGAAGACAAGAAACUUGAUCUUCAAUUUGUGAUGAACUCACAAACACAACAAAAUCUACUAUUUGCUUAAUAAAUCGUAGUCAGGCGAAUAUAUUAGUUUCAAAUAUUUGCUUUGUCGCUUAGGAACUAUGCCUUAACUAAAGUAGCUAAGUUAAGUGUUAAAUAAUUGCUACUCAAAUUUAUUGACAUUUGUUAAUUAGAUAAAUAAAUGGGUCUUUCACUUAAUUAACUAAACUUGUAGACAUUUAUUAAUGAAAGUGUGUGGACCGGGGUUCGAUUCCCCGCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.(((((....(((((((((.((((.(((.(..[[.......).))).......]]..............................................................................((((.(((((.....))))).)))).(((((((((((.(<<<<<<<).)))))))).))).......>>>>>>>.(((((((((..{{{{{{.{))))))).)).......}.}}}}}}..(.((..((.(..(.(aaaaaaaaa).)..).)).)).).......AAAAAAAAA.....))))....)))))))))....))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...(((......(((((((((((((...))))).)))))..[[[[..)))...]]]]((((((.(((((.....)))))))))))......((((((((((...)))).)))))).(((((((.....)))))))...........((((.(((((.....))))).))))..((((((((((..[[[[[[[..)))))))))).........]]]]]]].)))........((((((.....[[[[[[[[[[..[[[[))))))..]]]]..]]]]]]]]]]...................(((((..(((((.(((((.((((..........)))))))))..)))))...)))))((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00352
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCUGACAAGGUUUCGACUGGUCGAUGGACAACUGAACAGCGGGCGAGUGUUGGCCGCACUUCUACUCUGAGUGAACGCGGCAACUGAUAAACGCAACCGACACGGAUGCAACGGUGACCGACGCCGAGAUCGAGGCCUUCUUUGCUGAAGAGGCUGCCGCUCUCGUCUGAAGGAACCAGCCUGGCUCAGCGUGCUGCUGUGCAGCGGCCAGGCUUCAUCUCUAACAGCAGCGAACGGACAUGAGGGAGCGCAAACCCUCGUCCCAAACAUCAUGAAUGCGUCGCACGGGCUCCAGCGUCAGGGGCCAGAGGUGGGAAACGGUGUGAAACUCCUGUCCUGGGGAUCACCGACCGAUACGCCAAACCAGGACUACGCCCGUAGAACGCAGUGAGAAAGACACCAGGACAGGGGUUCGAGUCCCCUCAGGUCCACGU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((...(.......((..(..((((((((((...[[[[[.....))))).........]]]]]....................................................(...(..(.((((((..((((((...((.(((..))).))...))))))...)))))).)..)...)....................................................................................................................(.((((((((...(((.{{{{{{{)))))))..)))).)........}}}}}}}...)))))..)..)).........)...)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((....(((((((.[[[))))..)))..]]]....((((..[[[[[....)))).....]]]]].........((((((..((((....(((.(((...))).)))..(((((.....)))))..))))...[[[[[...(((.....)))))))))........]]]]]....(((((((((......[[[[[[[[.....))))))))).........]]]]]]]]....((((..(((((........)))))))))..................(((...[[[[[[.)))...]]]]]]......((((..(((((...[[[[[[[[[[[[[[....)))))....................((((....))))..................]]]]]]]]]]]]]]....)))).))))))))....
|
|
TMR_00353
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCAUGGAUUUGACAGGAUAUCUUUAGUACAUAUAAGCAGUAGUGUUGUAGACUAUAAAUACUACUAGGUUUAAAAAAACGCAAAUAAAAACGAAGAAACUUUUGAAAUGCCAGCAUUUAUGAUGAAUAAUGCAUCAGCUGGAGCAAACUUUAUGUUUGCUUAAUAACUACUAGUUUAGUUAUAGUAUUUCACGAAUUAUAGAUAUUUUAAGCUUUAUUUAUAACCGUAUUACCCAAGCUUAAUAGAAUAUAUGAUUGCAAUAAAUAUAUUUGAAAUCUAAUUGCAAAUGAUAUUUAACCUUUAGUUAAUUUUAGUUAAAUAUUUUAAUUAGAAAAUUAACUAAACUGUAGAAAGUAUGUAUUAAUAUAUCUUGGACGCGAGUUCGAUUCUCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.((((((((((..((((((((((..{{{{{{....)))))....}}}}}}........................................................................(((((....(((........)))....))))).(((((((.............((((.....[[[[[[[)))))))))))...........]]]]]]](.((((((((..aaaaaaa..)))))))).)......AAAAAAA(.(....(((((.....<<<<<<<<<.))).))..).).......>>>>>>>>>...))))).....))))))))))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((......)))((((((((..(((((((((((....(((((((((..........)))))))))..((((....))))...........(((((....)))))((((..[[[[)))).(((((.......)))))]]]]((((((((.....)))))))).(((((((......)))))))........(((..(((((((((..[[[[[[[[))))))))).))).......]]]]]]]]............(((((((.............[[[..)))))))..]]]........(((((((((((((...................))))))))))))).........))))))))))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00357
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCAAGGCUUCGACAUGAUUGAUAAACUUAUUAGUUCAGUAGGGUCUGCCCUUUAUAGCUCAAGGUAAUAAUAACCGACAAAACUUCUAAAGAACUAGCUGACGAAAACUUUGUUUUAAAUCAGUUAGCAUCAAACAACUACGCUUUAAACUUCUAAAUAAAUAAUAAAUAGCGUACUAGGUUUUUUAAAAACCUAGAUUUAUAGGAUAAAACUAGAUUUUGUAACUCGUUUUUAGUUUUACUAUUAAUACUGAUUAAUUAGUUUUUUGACCCAACGAUUACUACGAACCAAGAUGUUGAUACUUAUCACUUGGUUUGAGCUUCAUAAGUAUCUAAACUGUAAAUAAAACUAAUUUGCUGAGUCGAUUGUGGAAACGGGUUCGAUUCCCGUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((..(.(..((((((.(((((((([..[.)))).....]..]..................................................................................(.(....((..............))....).)(((((((((...)))))))))(.(((.(((.aaaaaa....)))..))).)........AAAAAA.((..((.....{.{{{{{...))..)).......}}}}}.}.(((((..((.((..<<<<<<<<.)).)).))))).......>>>>>>>>...))))........))))))..).)...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....(((((........)))))...............((((((....(((....)))............(((.......)))...............))))))((((((.......[[[[[[.......))))))...]]]]]].((((((.........................))))))(((((((((...))))))))).....(((.[[[[[[)))..]]]]]]...(((((....(((..(((((((((....))))).)))).....)))..)))))......(((((((((.....[[[[[[[[[..)))))))))......]]]]]]]]]......((((((.......)))))).(((((((..[[[[[.......)))))))........]]]]]..
|
|
TMR_00358
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGGUUUGACAUAAUGCUGAUAGACAAACAGUAGCAUUGGGGUAUGCCCCUUACAGCGCUAGGUUCAAUAACCGACAAAGAAAAUAACGAAGUGUUGGUAGAUCCAAAUUUGAUCAUUAACCAACAAGCAAGUGUUAACUUUGCUUUUGCAUAAGUAGAUACUAAAGCUACAGCUGGUGAAUAGUCAUAGUUUGCUAGCUGUCAUAGUUUAUGACUCGAGGUUAAAUCGUUCAAUUUAACCUUUAAAAAUAGAACUUGUUGUUUCCAUGAUUGUUUUGUGAUCAAUUGGAAACAAGACAAAAAUCCACAAAACUAAAAUGUAGAAGCUGUUUGUUGUGUCCUUUAUGGAAACGGGUUCGAUUCCCGUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.(...(..((((((((((.(((((((((..aaa.))))...AAA.................................................................................(....(((.........)))....).....(((((((((((((<<<<<<<))))))))))))).......>>>>>>>.((((((((((.{{{{.))))))))))........}}}}...((((((((.((((.[[[[[[[[))))...))))))))..........]]]]]]]]...)))))....)))))))))).)...).)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((((....[[[[[[[.....)))))..]]]]]]]((((....))))..(((((....((((....))))..............((((.[[[[[[[.........)))).......]]]]]]](((.((((((.(((((((....))).)))).))))))...)))((((((((((((.[[[[[[[[))))))))))))......]]]]]]]].((((((((((.[[[[.))))))))))........]]]]...(((((((((.....[[[[[[[[......)))))))))..........]]]]]]]]............)))))........(((.....))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00361
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUUUUGGUUUUGACAAUUAAAAAAAAUUUCUAAGAUGCAGUGGUUUGGUAGACCAUAAUACCGAAAUAAUCAAAACGCAAAAAAUUCAAAAAAAUCUCCAAACGAAGCAAAAAUUGAUUACCCAUUUUUAUCAUAUAACCAAUUAAAUUUUGCAUACGUUUAAUCAAUUUAUUAUAAUAUAUCCUUAAAAAUUUAAAUUUUAUCAUGUAUACGGGCCUCCCAUUUCUGUAACUUGAAAAAUAUUUAAAUUUAGAUAAUCAAACUUAUCAAACUUAUAAGAUUAUCCUCCUUUCAAUUUAUUAUAAUAUAUCCUUAAAAAUUUAAAUUUUAUCAUGUAUACGGGCCUCCCAUUUCUGUAACUUGAAAACUGUCGACUCUAUUAAUUUUUUUUAUUUGGAUCGGGGUUCGAUUCCCCGCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((.((((((.((((..((.(.((((((.(.(({{{.)).)..............}}}............................................................................................(.(((((.(..............).))))).).(((((................((...(<<...<<)...))))))).............>>...>>(.......(...[...[[....).......).......]]...]........(....((......a...a.aaa.))....)...........AAA.A...A...)))))..).).))..)))).)))))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...((((........(((((((((((........(((((..(((((((........)))))))((((((............(((......)))....(((((..((((((.((((((........((((...))))..)))))).))))))...)))))..........((((((...........(((((((((((((.(((....((((((.........))))))...))))))..)))))))))).(((((......)))))....)))))))))))).....((((((.((((....((((((...(((((.......)))))..))))))..(((...)))......)))).)))))))))))..........)))))))))))....))))((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00366
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAAAGGUUUCGACUUCGCGCAUCGAAUCAAGGGAAGCGUGCCGGUGCAGGCAAGAGACCACCGUAAGCGUCGUUGCAGCAAUAUAAGCGCCGAUUCAUAUCAGCGCGACUAUGCUCUCGCUGCCUAAGCGAUGGCUAGUCUGUCAGACCGGGAACGCCCUCGUCCCGGAGCCUGGCAUCAGCUAGAGGGAUCUACCGAUGGGUUCGGUCGCGGGACUCGUCGGGACACCAACCGCGACUGGGAUCGUCAUCCUGGCUAGUUCGCGUGAUCAGGAGAUCCGAGUAGAGGCAUAGCGAACUACGCACGGAGAAGCCUUGAGGGAAAUGCCGUAGGACCCGGGUUCGAUUCCCGGCAGCUCCACCG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((.((.((((....((((((....((((((((((...{{{{.....))))).........}}}}.................................(..(((.((((.......)))).)))..)..((((((.((((((...aaaaa.))))))...)))))).......AAAAA.....((((((((((<<<<<<<<.)))))))))).........>>>>>>>>(((((....((((((...[[[[[[....))))))))))).............]]]]]]...)))))......)))))).....)))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((((....[[[[.))))).........]]]]..(((((...[[[[..[[[))))).....]]].]]]]..........((((.(((....))).))))(((((.(((.(((((.....))))).)))))))).......((((((...[[[[..))))))...(((((....)))))]]]].....(((((((((((.......)))))))))))............(((..[[[[[))).(((((...............)))))]]]]].....(((((...(((.....)))[[[[....)))))..........]]]].....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00372
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUAAUGGAUUUGACAUGCAUAAGGUUUAUUAGACUGCAGUACUAUGGUAGAGUAUAAGACCACUAGGCUUUUUCAAACGGAAAAGAAAAACAAUUAGAAGUUUCUCCUUUAUUAAUGAGUUCUUCACAAUCAAAUCUAGUUUUUGCUUAAUUAAAAAUUAGUCGCUUCUAAGUGGUGUUGCUACAUUUAUAAGUGUUGUUUAGCAAAUAUAGUUUUAUGAUCUAAUUAAAUAAGACCGAAUAAAAAAUUAGUUAAUAUAAAUGUUUUUAGUUAAGUUUCGAUUUUAUAUUAAUAUCAAAAUUUAGCUAAACUGUAGAUGUCUCUUAAAUUUUAUGUGUGGACCCGGGUUCAACUCCCGGCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((...(((..((((.(((((..(.(...[[..[...).)......]..]].................................................................((((((((((......)))))))))).(((((.((((((...<<<<<.)))))).)))))......>>>>>.....(((((((...aaaaaa..))))))).........AAAAAA.(((((..((.(((....{{{{{{{{{.))).)).)))))......}}}}}}}}}...)))))....))))..)))...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...................(((((((((((((((...........((((.[[[[..))))....]]]].....(((((((....)))))))...........((((...(((..........)))..))))..........((((((((((......)))))))))).(((((.((((((...[[[[[[)))))).))))).....]]]]]].....(((((((...........)))))))..............(((((((((((.....[[[[[[[[[[[[....)))))))))))....]]]]]]]]]]]]...............)))))))))))))))...(((((.......)))))...........
|
|
TMR_00374
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCACGGUUUCGACAUGAAUGGUUGAUCUUCAAAUGCAGCAGGGUAAGCCCUUUACAGCUGUCGAGGCUAAUAAAUGCUAAGAACAAUAAAAACGAAGCUGUUGAAGUAGAAUUAAACGACUUUGAAAUCAACGCUUUAAGCCAAAACGCUAAUUUAGCUUUAUACGCUUAAUUACAUUUGGUAAUAAGUUCAUAUCUUUUUCUAGGUAGGUAUGAAUGUUUAAUAACUAGAUAGCUAAUUUAAUUCCUAUAACAAUUAGUGAAGUUCGUUAGGAUUACUUUUAUUUAUGGGUUGUUCUUUGCCUCUAUUUAAAAGGACAUAUUAAAGUUAGAACUAAGCUGUAGAUUUUGUCGCAUUGCUAUUUGUGGAAACGGGUUCGACUCCCGUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((..(..(..((((.(((((.((.(.....[[[...).))....]]]....................................................................................((((.(((.......))).))))(((((((..........(.(((.....{{{{{))).)..))))))).......}}}}}..(((((((....<<<<<....))))))).........>>>>>...((((((..((.((((.aaaaaaa)))).))..))))))..........AA..AAAAA...)))))....))))..)..)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((..(((((((((((((...)))(((((....(((....)))(((((((((...(((((...........((((((((.........(((((((..(((...((((((((...(((....)))........((((((....(((((.(((.......))).)))))..))))))......(((((((((..........))))))))))))))))).))).))))))).........(((((((.....(((((..(((....)))))))).....))))))))))))))).)))))..........(((........))).......))))))))).......))))))))))))))))))))(((.......)))..)))))))....
|
|
TMR_00375
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUAGAGGUUUUGACAUAAUGUUGAAAGGAAAACAGUUGCAGUGGGGUAUGCCCCUUACAGCUCUAGGUAUAAUAACCGACAAAAAUAACGACGAAGUUUUGGUAGAUCCAAUGUUGAUCGCUAACCAACAAGCAAGUAUCAACUACGCUUUCGCUUAGAACAUACUAAAGCUACACGAAUUGAAUCGCCAUAGUUUGGUUCGUGUCACAGUUUAUGGCUCGGGGUUAACUGGUUCAACUUAAUCCUUAAAUUAUGAACUUAUCGUUUACUUGUUUGUCUUAUGAUCUAAAGUAAGCGAGACAUUAAAACAUAAGACUAAACUGUAGAAGCUGUUUUACCAAUCCUUUAUGGAAACGGGUUCGAUUCCCGUCAUCUCCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((.(......(.(((((((((((((((((((.<<..<<.....))))).>>..>>...........................................................................(((((.(...........).))))).(((((((((((((.aaaaaa))))))))))))).......AAAAAA..((((((((..{{{{{{..)))))))).......}}}}}}..(((((...(((..([[[[[[[[)..)..))..)))))..........]]]]]]]]...)))))...))))))))).).....).)))))...(((((.......)))))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((..(((...)))..)))..(((((((((.....(((.[[[[[)))............]]]]]...(((((.......(((......)))))))).(((....[[[[[)))......]]]]](((.(((((...(((..........)))...)))))...)))((((((((..(((.[[[[[[)))..)))))))).......]]]]]]..((((......[[[[[[...[[[[))))..]]]]]]]]]]..(((((((((.....[[[[[[[[...[[[)))))))))....]]]...]]]]]]]]...........))))))))).....(((.....))).(((((.......)))))))))))).
|
|
TMR_00376
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUAAUGGUUUCGACAGGCAUUUAUAACCUUAUAAUGCAGUAGUUUGGCAGACUAUAAUGCUACUAGGCGUUUCAAUAAACGGAACAAAAAAACAAGAAAAUGACUAUCAAGAUUUAAUGAUUAGUCAAAAUCUAAACCAAAAUCUAGCUUUUGCUAGCGUUUAGCAGCUAGUUGCUCCAUUAUAUGUUCUGGAUAAUGGAAGCAUGCCUAAGAACUUAGUGAAGUUGCUCUAGCGUCAAUUUCAUGAAAUUUAGCUAGUUGAUUUAAUAGAAUUUUGUUCAAUUUUUUCUAUUAAAUCAACAAUUAAAAAUUGGAAUAAACUGUAGAUUUAUAAGCAUUGUGAAUGUGUGGACCCGGGUUCGACUCCCGGCAUUUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((((((..(..(((((((.((((((((.(.[..[.[....).)))....].]..]........................................................................((((((.((..........)).)))))).(((((((((((..{{{{{..)))))))).)))......}}}}}.....(((((((..aaaaa..)))))))..........AAAAA.(((((..(.((((.....<<<<<<<<<))))..).))))).......>>>>>>>>>....)))))....)))))))..)...)))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..............((((((((((.........(((...[[[[[[..........)))..]]]]]](((((.......)))))...............(((((((((........))).))))))....((((((........[[[....[[[[[[))))))..]]]]]].]]].........(((((.....(((....))).....)))))...(((((((((...[[[[..)))))))))........]]]](((((((((((((((..............)))))))))))))))....................................)))))))))).......((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00378
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAACGGUUUCGACUUCGAGCAUCGAAUCCAGGGAAGCGUGCCGGUGCAGGCAAGAGACCACCGUAAGCGUCGUUGCAACCAAUUAAGCGCCGAUUCCAAUCAGCGCGACUACGCCCUCGCUGCCUAAGCGACGGCUGGUCUGUCAGACCGGGAGUGCCCUCGGCCCGGAUCCUGGCAUCAGCUAGAGGGACCCACCCACGGGUUCGGUCGCGGGACCUGUGGGGACAUCAAACAGCGACUGGGAUCGUCAUCUCGGCUUGUUCGUGUGACCGGGAGAUCCGAGUAGAGACAUAGCGAACUGCGCACGGAGAAGCCUCGAGGACAUGCCGUAGGACCCGGGUUCAAUUCCCGGCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((.((.((((....((.(((....((((((((((...<<<<.....))))).........>>>>.................................(..(((.((((.......)))).)))..)..((((((.(((((....{{{{{..)))))...)))))).......}}}}}.....((((((((((aaaaaaa..))))))))))...........AAAAAAA(((((....((((((...[[[[[[....))))))))))).............]]]]]]...)))))......))).))....)))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.[[[)))).)))).....]]]...(((((.(((((...[[[[..[[[))))).....]]].]]]].((((.....((((.(((....))).))))[[[...(((.(((((.....))))).)))))))..]]]...(((((....[[[[[..)))))...(((....)))...]]]]].(((((((((((((((.......))))))))))).............[[[))))...]]].(((((((((.((((((((..((((...))))..........(((....))))))))))).)))))..)))).)))))........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00383
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGUUUCGACGGGGGCAUUGAAGUUCGAGACGCGUGCCGAGCUUGUCAGGUAGCUCGUAAAUUCAACCCGGCAAAGACACAAAAGCCAACGACAACGUUGAGCUCGCGCUGGCUGCCUAAAAACAGCCCAUAGUGCGCGGUCCCCCCGCCCUCGGCCUGUGGGGUUGGGACAGACCGUCAUAAUGCAGGCUGGCUGCCGAGGGUGCCUGGACCCGAGGUGGCGAGAUCUUCCCAGGACCGGCUCUGAGUAUCCCGUCCGUGGGAGCCUCAGGGACGUAGCAAAUCGCGGACUACGCACGUAGGGUCGAAGAGCGGACGGCUUUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(...((((..(((.((((((((((.{{{{.{{..))))).........}}.}}}}...............................(((((((((((........)))))...))))))..(((((...(((((..<<<<<<))))).))))).............>>>>>>..((((((..((((.aaaaa))))..)))))).........AAAAA....(.(((..(..(((.[[[[[[[)))...)..))).).........]]]]]]]...)))))....)))...))))..)..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((.......(((((((....[[[[[......)))))))..]]]]](((((.....[[[))))).........]]].......(((.....((((((((....))))).)))(((((((((((........)))))...))))))..)))))))).(((.[[[[[[[[))).....(((.....))).....]]]]]]]]((((((..((((.[[[[[))))..)))))).........]]]]].....(((((((..(((((....)))))..))))))).(((((......[[[..)))))..]]]...(((...........[[[.....)))(((((.......))))).]]].......
|
|
TMR_00384
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUUGGUUUCGACGGGGGUUGCGAAGCAGAUGCGGGCAUACCGGGGUCUCAGAUUCCCGUAAAACACUGAAUUCAAAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCUUUAGCCGCUUAAGGCUAGCCGUUGCAGCAGUCGGUCAAUGGGCUGUGUGGUGAAAGCCACCGCAACGUCAUCUUACAUUGACUGGUUUCCAGCCGGGUUACUUGGCAGGAAAUAAGACUUAAGGUAACUGGUUUCCAAAAGGCCUGUUGGUCGGCAUGAUGGAAAUAAGAUUUUCAAAUAGACACAACUAAGUAUGUAGAACGCUUUGUAGAGGACUUUCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((((.(((..((((((((((..<<<<..))))).......>>>>.................................((((((......)))))).((((((.((((((.[[[[[[[))))))(((((....))))).))))))........]]]]]]]..((((((.(((.{{{{{{{{))).))))))........}}}}}}}}.(((((..(...(((.aaaaaaa)))....).)))))...(((....))).AAA.AAAA...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......(((((((((....[[[[[[[[[.........(((....))))))))))))...]]]]]]]]]...................((((....)))).........(((.(((((......)))))...[[[[[)))...(((((....))))).(((((....))))).]]]]]((((..[[[[..))))..((((((.((((((...)))))).))))))..........]]]]...(((((((....(((.....[[[)))....)))))))..............]]]...................................(((((.[[[[[)))))...]]]]]..........
|
|
TMR_00393
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUCAUGGAAUCGACGUCUCUUCUAAGAACGAAAGGUUAAAGCAGGUCGAGGUCGAAGAUGGACUCGUACUCUCCACUUCAUUGCUUGAUUGCAUGCUAAUCAGAUUCUUCCUUUCUCUCGCCGGGUAGCCGUUGCUGCUUAAGCGAGUUUCUAGUGCCACUUUGUCACUAGUUUGUAUUAUGAGUUUCACACUCACUUCAAUGACGGUGAUAGAUACUACAUAUCACUCCUGCUUAGAGGGUCAUCUAAGCUAAACCAUGUGAAUAUAACCUUUCGGGCCUCGAGAGACGGAAGUGAGUUCAAUUCUCACCAACUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((........(((.(.(..(....(((((((...{{{{.....)))).........}}}}............................................................................................................................(..(([[[[.))..)...]]]]((((..<<<<<..))))....>>>>>...))).......)..).).)))........))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((...[[[[[.)))).....]]]]]....((((((((((........((((...[[[[.[[[[)))).....]]]]]]]]..(((.[[[[[)))....]]]]]..............(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.........)))))).........((((.[[[[[[))))..........(((((((.........)))))))...(((((((......))))))).......]]]]]]..)))))))))).............(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00395
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCCGGUUUCGACGUGGGUUGCAAAGCAGCGCAGGGCAUACCGAGGUUCAGUACCCUCGUAAAACAGCUGAAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUUUAGCCGCUUAAUCCGGCUAAACUCCACACCGGUGGGCCUCAACGCCGGGUCUGGCAACAGACAGUGGAGUCAUUAACGAGGAUCGCGUUUUGCAGGGUUACUUUGCAGAGCGCUAAAAAAUAGGUAACUCGCCUGUCAUCAGCCUGCCGGUUGGCGGAUGCCAGGUCAAAUUAAAUAACAUGGCUAAGUAUGUAGAACUGUCUGUAGAGGACUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..(((..(((((((((([[[[[[..))))).......]]]]]]...............................((((((((.......))))))))((((((.((((((..<<<<..))))))(((((....))))).))))))........>>>>...((((((((((aaaaaaaaa))))))))))........AAAAAAAAA(((((......(((.{{{{{{{)))......)))))...(((.)))}}}.}}}}...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....(((((((........[[[)))))))......]]]..(((.....[[[[[))).....]]]]]......(((............((((....))))............[[[[[[)))......]]]]]](((((((.((((((........))))))(((((....))))).)))))))......((((....(((((((((((((...)))))))))))))........[[[...)))).(((....)))]]].(((.[[[[)))...]]]].............(((((......))))).(((..((((((((.....))))))))[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00398
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACUUGGCUUCGACGUGGGUUGCAAAACAGAGCAGGGCAUACCGAGGACCAGUUACCUCGUAAAUACAUCUGGAAACCAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUCUAGCCGCUUAAAUCCGGCUGGACUCCGCACCGGUGGGCCUCAACGCCGGGUCUGGCAACAGACAGCGGAGCCAUUAACGAGGAUCGCGCCCGGUAGGGUUACUUUACAGGGCGUUAAACAAUAGGUGACUCGCCUGCCAUCAGUCCGCCGGUUGACGGAUGCCAGGUUAAAUUAAAAAACAUGGCUAAGUAUGUAGAACUGCCUGUAGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..(((..((((((((((.[[[[.[.))))).......].]]]]................................((((((((........))))))))((((((.((((((..{{{{..))))))(((((....))))).))))))........}}}}...((((((.(((aaaaaaaaa))).))))))........AAAAAAAAA(((((......(((.<<<<<<<)))......)))))....((.)).>>>.>>>>...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((((((..(((..((((........))))..)))..))))).)))....((((((.........(((...)))...((((....))))...........((((((((........))))))))((((((.((((((........))))))(((((....))))).))))))......))))))...((((((....[[[[[[[[[....))))))........]]]]]]]]](((((.((((.(((.[[[[...))).)))).)))))..............]]]]..(((.[[[[[.))).(((....)))..]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00399
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGCUUCGACGCGGGUAGCAAAACCUAAGGGGCAUGCCGAGGUGCAGUGACCUCGUUAAUCACGCUGCAACAUUAUAGUUGCCAACGACGACAACUACGCACUCGCUGCUUAAAACCCAGUAGGGUGCCGUCUGACUGAAGCCGUGCUUGUGCGUUCAGAUUUCAGGCGUCGAUUCUCACAAGAUCGCGGUGAAGUUCUCCCAGGGCAGACCCGCUAAAACUUUACUGGGAUCGCCGUAUGUUUUCCUUGCCCGUCGGGUAGCAUGCGGUUAAAUUAAUGACUGGGCUAUGCAUGUAGAACCGAAGGCGGAGUACUUGUGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......(((..((..(((((((((([[[[[[[.))))).......]]]]]]]................................((.((((.........)))).))....(((((((.....(.((..aaaaaa)).)......)))))))........AAAAAA.(.((((....(((({{{{{))))....)))).).........}}}}}..(((((....(.(((..<<<<<<<)))..)...))))).........>>>.>>>>...))))).....))..))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((.......[[[[)))...]]]]..((((..........[[[[[[[.))))........]]]]]]]......((((((....[[[[..)))))).((((((((((.........)))).)))))).(((((((((((..((((....)))))))))...))))))]]]]..........((((.((((((((((......(((....))).....)))))))))).))))((((((((((......[[[[.......)))))))))).............]]]].......(((...(((....)))..)))........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00404
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAACGGUUUCGACUGCGUACGUUGAUUCAGGGGAAGCGUGUCGGUGCAGGCAAGAGACCACCGUAAGCGUCGCUGCAACCAAUUAAGCGCCGAUUCUCAUCAGCGCGAGUACGCUCUCGCUGCCUAAGCGAAGCGUCUCUGUCGGCCCGGGAUAUGCCCUCGGUCCCGGUGCCGGCAUCAGCUAGAGGGCUCACCGUCCGCCUCGGUCGCGGAGACGGACGGGACAUCCAACAGCGACUGGGAUCGUCAUCUCGGCUUGUUCGCGUGACCGAGAGAUCCGAGCAGAGACACAGCGAACUGCACACGGAGAAGCCCUGAAGACGCGGCGGAGGACCCGGGUUCGAUUCCCGGCAGCUCCACGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((.(((.......(((((((....((((((((((...<<<......)))))..........>>>................................(.....(.((((.......)))).).....)((((((.(.(((....[[[[[[..))).)...)))))).......]]]]]]...(((((((.(({{{{{{{..)).)))))))...........}}}}}}}(((((....((((((...aaaaaa....))))))))))).............AAAAAA...)))))......)))))))......))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[[)))......]]]](((((((......(((...[[[[[)))...(((..........))).]]]]].........((((.(((....))).))))(((.(((((.(((((.....)))))))))))))((((((((((((((..[[[[[[.))))))).))))))).......]]]]]]...(((((((.[[[[[[[[[.....)))))))...........]]]]]]]]]...(((.((((((.(((......)))))))))..[[[[.[[[[.)))........]]]]...]]]]....)))))))...............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00408
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGGAUAGAUUGAGCUCAGGUUGCACGUCGAGGUUACGGCUCGUAAAACGUUAUGCCUAAAUAUAACUGGCAAAGAAACUAAUCAACCUGUUUUAGCAGCUGCGUAAGUAGCCUAAAACGAUCCUUCCUGGCAUCGCCCGUGUGGCAGAUUGAAGGGUCUCAAAUUAAGCGGGCUAUGCUACGAUCCUCCGCCUGGGGAUUUGUAGAUGAAUCUAAUCAGGCUAGCUCCAUGAAAGCCUGUUGGUAGGCCAACAUGAGAGCGAAUGAUAAUAUACCAACUACGCGUGUAGAAGCCUGAGUGGCGAUAUCCUUGGACGAGGGUUCGACUCCCUCCGUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......(((((((((.(((((((((.[.[[[.)))).....]]].]......................................(((.(..((..........)).).)))..((((((.(((.(((.aaaaaa))).)))....))))))..........AAAAAA.....(...(...(..<<<<<<.)...)...)..........>>>>>>..((.(.......(((.{{{{{{{)))........).))...........}}}}}}}...)))))....))))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((......(((((((((....(((....[[[[)))..]]]]...(((.[[[[..)))......]]]].................(((((((..(((((....))))))))))))(((((((((((.(((.[[[[[[))).)))...)))))))).........]]]]]]..(((...........[[[[[[[[[[[[)))...]]]]]]..]]]]]]..((((((((...(((((....)))))...)))).)))).................((((....)))).))))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00409
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACUUGGUUUCGACAUUUAAAAAUUGUUACAGUAUGAUGCAGGUCGAAGUUUCUAAUCUUCGUAAAAAAAGAGAAAUUUAUAAUAAAUGCUAAUAAUUUAAUUUCUUCUGUGUUUAAAAGUUUAUCAACUAAGCAAAAUAGUUUAAAUUUAAGUUUUGCUGUUUAAGUUUUAUGCACAUUUAAUGAUCUAGUAAAUAACUUUGUUCGCUAUAAUUUAUAUUUAUAACUAGACUUUUGUCUUUUUUAUAGUUUAGAAUAACUUUAUCAUUUCAAACCUCGUUCCAUCUAGUUGAACUAAACCUGUGAACGAAUACUAUAAUAAAAUUUUUAGAUGGACGUGGGUUCGACUCCCAUCAGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((((..(((.(((((....(((((((((([[[[[...))))).........]]]]]..............................................................................................................................................................................................................................))))).......))))).)))....)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((..(((..((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((((........)))).........((((((((......((((.......)))))))))))).(((((.(((((.((((..(((..((((((((...(((....))))))))))))))))))))))).)))))......))))).))).......((((((((((((...))))..(((((..((((....))))...)))))((((((..(((((...........(((...)))......)))))..))))))..))))))))))))).))))..)))))))))))).........))))...)))))))))))....
|
|
TMR_00411
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUAGUUCCGGAAUUCGACAGGUUAUUACAAGCAUGGAUUGCGUUCCCGUUUGUCGGGUUAAAGACUGCAGAUAUAACUGCAAAAAAUAAUGAACCAUCUUACGCAUUAGCUGCCUAAUCGCAGUAGCGUAGCCCUUUGUUGAGUCCACGGCAACAUUCUCGGCCUAAUUAGUGGAUUAGCUGCUGGCAUUUAUGUUCGGAAUAAAAGCAGUGAAACAAGAAUCGAACUAGCUCUCGAUUUGGAAGUUAGCAACCUAAUCUUGAGCGAAAUUACUUGUUAACUAUGAGCGUAGAUAUUUAUGUGAUUGGAUAAUUUGGACAUGGGUUCGACUCCCAUCUACUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((((....((((((((..((((((.((..)).)................................................(.(((.((((......))))))).)..(((...(((((.{{{{{{..))))).....))).......}}}}}}.....(((...(((...[[[[[[)))...))).............]]]]]]..((((..(..(.((..<<<<<<<<))..)..).))))........>>>>>>>>...))))).....)))))))).....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...............((((.......(((.....)))...(((....[[[))).....]]](((((.[[[..)))))....]]]...))))....(((((....(((((......))))).)))))(((........[[[[[[[)))...................]]]]]]].((((((........[[[[.........))))))..]]]].(((((((........)))))))...(((((((((.[[[[[[.(((......))).)))))))))....((((((....))))))]]]]]]...........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00415
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUUUUGGAUUCGACGGGGAUAGUUCGAGCAUGGGUAGCGGGUAGUGGGGACGCGUCCGCUUUAUCAACGCUAACGCCAAAUUUAAACGGCAAACAACAAAACAACUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUUGCGUGCUCCUGCUUUGCAUCGCCCAUGUGCCAAGUUAGGGGCUCAACUUUAGUGGGCUACGCUGUCUAGUCUCCGCCUGAGGCUAGCUGAAGAAGACAAUCAGGCUGACCUGUGAGAAAGCCGGUUACGGGGCGGGCUUACAGGUGACAUUAAAACCGUGACUACACCCGUAGAAGCCUAUGUGGCGUUAUCUUUGGACACGGGUUCGACUCCCGUCGCCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((((....((((((((..((((((((((.{.{{...))))).......}}.}.....................................((.(.(((((.........))))).).))((((((((((.((((.<<<<<<)))).)))).)))))).........>>>>>>....(.((.(((((...aaaaaa))))))).)..........AAAAAA..((((...((....((([[[[[[[..)))..))..))))..........]]]]]]]...))))).....))))))))...))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((..........((((....[[[[..))))........(((((...(((....)))..))))).]]]].....(((.[[[....)))...]]]................((((...(((((.........))))).))))((((((((((.((((.[[[[[[)))).))).))))))).........]]]]]]........((((((...[[[[[[)))))).............]]]]]]..(((((((((...(((..[[[[[[)))...)))))))))......................]]]]]]..(((.....))).......(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00419
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUUACGGUUUCGACUAGGAAGUGAAAAAUUGAUUGCAUGCGGAGGAUAUCGGUUGGCCUCCUAAAAAAACCGGUAAAACAAUAAAUGCUAACAAUAGCAAUAAAAUUGCAAAAGUUGACUUCCAGGAAGGGACUUUUGCUAGAGCUGCGUAAGACCUAACAGUCUUGGUAGCCCGAUAGUCUGAAACUGGACCGAGGGUUUUAGAAUCUAUCGUCAUUUUCUUGGUAUGAAUUCUUUUUCUCGCCGCUUCUAGGGAAAAGUUUUCAAGAUUAAAUGAAGCAAACUAACUUCGAUUGUUGCGUUCUGCAUAGGAGUUAGGGAUUUUACAGAACGAUAAGCAUGUAGUGGUCAAUUCGUAAUUUGCCAAGGACGAGAGUUCAAUUCUCUCCACCUCCAAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((.(((.(..(((((((((((((((((((..[[[[[[[..)))))......]]]]]]].....................................................................(((((.((((((......))))))))))).(((((((((((((((..<<<<<<)))))))))..)))))).......>>>>>>..(((.(.(((((((....aaaaa.))))))).).)))...........AAAAA...((((((((...((...{{{{{{{))..))))))))........}}}}}}}....)))))...)))))))))..).)).).)).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((............(((((((((...................(((((.[[[[[[[[..)))))......]]]]]]]]..........(((((....)))))........(((((((((..((((...)))).)))))))))....(((((.((((((......))))))))))).(((((((((((((((........)))))))))..))))))....))))))))).((((..((((((((....[[[[[..))))))))..)))).........]]]]]...((((((((...(((..[[[[[[)))..)))))))).........]]]]]]............((((.((((...)))).)))).(((.[[[[[)))....]]]]].))))))....
|
|
TMR_00422
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUAUGGAUUCGACAGGUAUGGGUCGAGCCAUGACUGCAUUUCGUAGGUUACGGCUACGUAAAAACGUUCAGUUUAUUAUAACUGCAAAAAAUAAUAACAAUUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAUAGUAGCUUGACGUAGAUCCGCCUAGUCUCGUCCAUGGGCUAGAUACGGGUCCUAAAUGAAGUGGACUUGCGCUUAAGUACUGGCCUGGGUGCUUAAGAAGAGGAUUUACAGACUAGCGUUUUAAUGAAGCCCCGACAUACGGCGUCUUAUUUCGCGAAAUUUAAGUAGUAUGAAUAUGAAUGUAGAUGUCAUGGUGGCGACAUGCUUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGACUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......((((((((..((((((((((...<<<.)))))......>>>.........................................(.((((.(...........).)))).)..((((((.(((((((.aaaaaa)))))))...)))))).........AAAAAA.....(((((((((..{.{{{.)))))))))...........}}}.}..(((.....(.(..(((....[[[[[))).)..)....)))............]]]]].....))))).....)))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((..(((.(((((((((((((((.(((...)))((((.....((((((((.((((((((((...........))))).................((((((......))))))....((((((((..(((((((.......)))))))...(((((((..........)))))))..((((((((((......))))))))))....))))))))))))))))))))).....))))....(((((.(((........)))............))))).....)))))))...))))))))..)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00423
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACACGGUUUCGACGGGGAUUGGAAGCGAAGGUGGCAUGCCGGGGACGCCAGUUGGCCUCGUUAAAAAACUGGCAUACAUACAAACGCCGAUACUGACGUUUCGUACGCACUGGCAGCUUAAUUGCUGCCUCGUCUUGAGUUCCUUCGCCUGCGCGGAGCUUAAAGACGUCAAUUGAGUGGGCUAGUUUCGGUGAGCGUUCGCGGUGCCGAAGCGAAAUUUAAGCGAACUCGCCUGAUACACAUCCUGUCGACGGGAGUUGUAUCCGGUUAAACUCAAAACAUCGACUACGCAUGUAGAAGCCUUAUGUGAAAGAUUUUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((.((((..((((((((((..{{{{{{{..)))))......}}}}}}}.................................(.((.((..(.........)..)).)).)..((.(................).))................(......(((.((..<.....<)).)))......)..........>.....>...(((.......(((.[[[[[.[)))........)))............].]]]]]...))))).....))))..)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.................(((((((.(((....))).(((.....)))......[[[[[[[..)))))))....]]]]]]].....((((((((..........))))).)))......((((((......)))))).(((((((((((((...[[[[[[..))))))).))))))........]]]]]]..(((((((((...[[[[[[..))))))))).........]]]]]]..(((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))....................((((((.........))))))........(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00427
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCAGGAUUCGACAGGAUCAAGAAGGCUUGUGGAGCAUGCCGUGGGGCGGUUGGCCACGUAAAAAGCCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUUCGCACUAGCAGCUUAAUAACCUGCUAGCGCACUUCUACCCUAGCUUCCGCUUGUAAGACGGGGAAUCAUAGAAGUUCAAACCCAAACGAGAUAGCGAGGGAACCUUUGACUAGAGAGGUGAACCGCGAAAUAGAAUUCUGGUAUGUAUUUACAUGGCGUGUCUGUUCGCAGUGUACUUACGAGAAUAAAGAUAGACUAAGCAUGUAGCGCCUAUGGUUGGAUUGCUCUUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((.(((...((((...((.(((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>..............................((.((.((((.........)))).)).))(((((((((((..(((...[[[[[)))..)))).....)))))))..........]]]]]...(((.....(((((..{{{{{{)))))....)))..........}}}}}}..(((........(((.aaaaaaa)))........))).........AAAAAAA...)))))...).))...))))...))).)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((..(((..(((((....)))))..))))))))(((((((....(((((.[[[[[[..))))).....]]]]]].........((((....)))).....((((((.(((((((.........)))))))...(((((((((((..(((...[[[[[)))..)))).....)))))))..........]]]]]...))))))..((((((......))))))..((((.(((......))))))).((((..(((((.(((.[[[[[[[))).)))))..))))........]]]]]]]..((((..((((.......))))...)))).(((((.[[[[[)))))..]]]]]..)))))))..
|
|
TMR_00429
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGCACUGGUUUCGACGCGGGUACGGACGCGCAGUGGGGCAUGCCGAGCUUAGUGUGCUCGUAAAACUGACUAAAACAAACUAACUGCAAACGACGAACGUUUCGCACUCGCUGCUUAAUAACCAGUGAGCCCUACAACAGCAGGCCGAUGGGCUGGGCAAGGGGUCUUUAGCGCAAGUUGAAGGCUCCCGGCUGUAGGGUCAUACACAUCGGCUGGCCUGGUACCGGGCACCUUGGUAUCAGGCGAGACAAUAGGAUGCUGGCAACCUGUAUAGCGUGCUGCUGCGCGAUACGGGAAGUGAGACUCAAAUCAGACGGCUAAGCAUGUAGAACUACGCGAAGAAGGCUUGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.......(((.((((..((((((((((<<<<<..)))))........>>>>>.................................(((((((.........)))))))(((((((.((((..{{{{{{{.)))).((..(((((.((((((....)))))).)))))..))))))))).......}}}}}}}..((((((((((.aaaa.aaa))))))))))........AAA.AAAA..(..((......(((.[[[[[[[)))......))..)............]]].]]]]...))))).....)))))))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.((((((((.....(((........)))((((((((......(((((.......)))))........................((((((((.....))))).))))))))))).....))))))))))))))....((((.[[[[[[[[.))))(((..((((((((((((....))))))))))))..)))(((......))).]]]]]]]].(((((((((((((...)))))))))))))...........((((((((..(((((((..(((((....))))))))))))...(((........)))....))).)))))...(((...(((((.......)))))...[[[[[))).....]]]]]..........
|
|
TMR_00430
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACCGGCUUUGACAGCGUGAUGAAGCGGUAUGUAAGCAUGUAGUGCGUGGGUGGCUUGCACUAUAAUCUCAGACAUCAAAAGUUUAAUUGGCGAAAAUAACUACGCUCUCGCUGCGUAAUCGAAGAAUAGUAGAUUAGACGCUUCAUCGCCGCCAAAGUGGCAGCGACGAGACAUCGCCCGAGCAGCUUUUUCCCGAAGUAGCUCGAUGGUGCGGUGCUGACAAAUCGGGAACCGCUACAGGAUGCUUCCUGCCUGUGGUCAGAUCGAACGGAAGAUAAGGAUCGUGCAUUGGGUCGUUUCAGCCUCCGCUCGCUCACGAAAAUUCCAACUGAAACUAAACAUGUAGAAAGCAUAUUGAUUCCAUGUUUGGACGAGGGUUCAAUUCCCUCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((......(((.((((((((...((((((((((...aaaa.aa.)))))........AA.AAAA.............................(.(((((((.....(((.(((..((.......))..))).)))...........))))))).)...((((((.(((((.(((..<<<<<<<))).))))).....))))))........>>>>>>>..((((((((...{{{{{..))))))))..........}}}}}.(...((.((.((...(((..[[[[[[[)))..)).)).))...).........]]]]]]]...)))))......)))))))).))).....)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((.....)))((((((((((............(((((((((..[[[[...)))))))))........]]]]....((((((((............(((((..[[[..)))))..]]].........)))))))))))))))))).((((...)))).(((......[[[))).(((((.(((((.....))))).)))))]]]..(((((.((((....))))..)))))..(((((....))))).((((.....[[[[..))))........]]]].......(((..[[[[[[[)))....(((....))).........]]]]]]].....((((.....))))......((((....)))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00431
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGCAAGGUUUCUACAUUGUGAAAAAACAAAUAUAUGAAAGUAAAACGAGCUCAUUAUUAGAGCUUUUAGUUAAAUAAAUGCAGAAAAUAAUAUUAUUGCUUUUUCUCGAAAAUUAGCUGUUGCAUAAAUAGUCUCAAUUUUUGUAAUUCGAAGUGAUAGACUCUUAUACACUACGAAUAUUCUGUUAGAGUUGCUCUUAAUAAAAGAAAAGUAAAAAAAUACAAAUUCUUAUGUUUUUUACCUGAAUUGAUUCAAUUUAAGGUUAGUAUUUUUUGAUUUUUACAAUGGACGUGGGUUCAAGUCCCACCAGCUCCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.........(.(((((((((((...((((((........((((((((((..[.[[[[.))))).]]]].]................................................................................................................................................................)))))..((((((((((...)))))).))))..)))))).....))))))))))).).(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........((((((((((((((.....(((....)))....((((((.......))))))...))).........(((((((((......(((((((((..((((((((..(((((.....)))))....))))))))..(((((.((((((((....)))).)))).)))))....((((((((...))).)))))...))))))))).((((.(((........))).))))((((((((((...)))))).))))...))))))))).)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00432
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUGUAUGGAUUUGACGGCAAGACGAAAUGGUAUGUAAGCAUGCGGAGCAUUGGUAGCUGGCUCCUAAAUAUCGGUUAUCAAACAAUUAAUUGGCGAAAACAAUUACGCUCUCGCUGCCUAAUCGAAGUACAGUAGAUUACUGGCUUUAUUCGACUAUUAGAUAGUUGAACGAGACACUGCUCCAAAGAUGUUGUUCCGAAUCGGAGGGUAAAGCGGUGCAGGUUAAAUCGGAAAUAGUUUGGGUAUGCCUCGCUGCCCAAAUGAAAUUUAGAGGAUAAGGCAUUGGUUGGUGGUUCAGGUCUUGCCAAUGCUCGAAAACCAAAGGCUGAAAUAAGCAUGUAGAAAGCGUAUGGUUUCCUUGUGCGGACCGGAGUUCGACUCUCCGCAGGUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((..(((((.((((((...((((((((((...aaaaaaa.)))))........AAAAAAA.............................(.(.((((......((((..(...(((....)))...)..)))).........)))).).).....(((((((((...(((....<<<<<<)))...)))....)))))).........>>>>>>...(((((((((..[[[[..)))))))))........]]]]......(....((((((..{{..{{{...))))))....)..........}}}..}}...)))))......)))))).)))))))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.........................(((((....)))))((((..[[[[[[[[[[[))))......]]]]]]]]]]]..........((((.............[[[[[.)))).....(((((.(((((...)))))))))).(((((((((...)))))))))]]]]](((((((.....(((.....[[[..)))...]]]...))))))).((((...[[[..[[[[.[[[[[[[[[.))))...]]]]]]]]]...]]]]....]]]..(((((((((...[[[[[........)))))))))....]]]]]...(((......))).........(((...[[[[[...)))..]]]]]((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00433
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGACUGGAUUUGACGGCGAGAUGAAAUGGUACGUAAGCACGCGGAGGCUUCUUUGGUUCCCUCCAUAAUCUGAGUCAAGGAAAAUUUAAUUGGCAACAAUGAGUAUGCUCUCGCUGCCUAAUCGAAGUAUAGUAGAUUACUGGCUUUAUUCCUUUACAAGGUAGAGGAACGAGACGUCGCUCCGAGGAUGUUGUUCCGAAUCCAAAGAUCAAGCGGCGCAGGUUAAAUCGGAAAUAGUCGUUGCAGACUCCGAUGUAGCGGUGAAAUUUUAGGAGAUAAGGUUGCGGUUGGUGGCUUGGGUCUUGCCGCAGCUCGAAAAUGAAGGCCAAGAUAAGCGUGUAGAAAGCGUAUGGUUUCCUUGUGCGGACGAGGGUUCGACUCCCUCCAGCUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((..(((((.((((((...(((((((.((...[[[[[[[)).))...........]]]]]]]............................(.((.((((......(((..(...(((....)))...)..))).........)))).)).).....((((((((...((((....<<<<<<))))...))....)))))).........>>>>>>...(((((((((..{{....))))))))).........}}...(..(((((((((.((...aaaaa..)).)))))))))..).........AAAAA....)))))......)))))).)))))))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
........(((.[[[[..)))..]]]]......((((((..(((((((((((............)))))....(((..[[[[[)))........]]]]]........(((...[[[[[.)))......(((((.(((((...)))))))))).(((((((((...)))))))))]]]]](((((((............[[[[[[............))))))).........]]]]]]...(((((((((..[[[[..))))))))).........]]]]....(((((((((...[[[[[[.......))))))))).........]]]]]]......)))))).....))))))............((((.[[[[[))))...]]]]]...........
|
|
TMR_00439
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACUGGUUUCGACUUGGAAUGGUUGUUCCAGGAGAAGCGGGCCGAGGACCCAGGGUCAACUCGUUAACGAUCCUUGGAAACCUAUAAGUGCCGAGAACACUCGCACUGACUUCGCUCUCGCUGCCUGAUCAGUGAUCGAAGGGUCAGCCCGGAUGUAGCCUUCCGUCCGGAUCCUGGCCUCGUUUAGAAGGCUUGCCGUACAGCUGUGGUCACGGGGGCUGUACGGGACGUUUACGUGACUGGGCUUGUCUGCACCAUGUCGGUGUGAGUGCAGGAGCCGAGCAAUAACGACAGCAUCGACUGCGCCCGGAGAAUGUCUGGACGGUCUUUCAAGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCAUCUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((.(.....((((((.(...(((((((((...[[[[[.....)))).........]]]]].................................((..(..((((..........))))..)..))(((((.((((((...{{{{{{.))))))...)))))........}}}}}}....(((((((((.aaaaaaaa..))))))))).........AAAAAAAA(((((..((((((...<<<<<<<<..)))))))))))..............>>>>>>>>...))))).....).))))))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((..((((((((....)))))))).)))))...(((((((....[[[[....(((....))))))))))..]]]]...(((((.(((....))))))))..(((((...((((((......)))))).)))))((((((.(((((((.[[[[[[[)))))))...)))))).......]]]]]]]..((((((((((..[[[[[[[..))))))))))........]]]]]]].(((((..(((((((((......))).)))))))))))..............(((..[[[)))..(((((.....)))))...]]]......(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00441
|
[ FASTA input ]
|
GAGCUGUAGUGCAGCGUUUUCCGGACGGUUGUUCCAGGAGAAGUGGGGUGAGGGCCCAGGGUCAACUUGUUAACGAUCGUUGGGAAUCUAUAAGUGCCGAGAAUACUCGCACUGACUUCGCUCUUGCUGCCUGAUCAGUGAUCGAAGGGUCAGCCCGGAUUCUGGUUUCGUUGCGAUGACUUGCCGCCCAGUUGUUGUCGUGGUGACUGGGCGGAAUUAUUUCUACGAUCGAGUUUGUUUGCACCAUGUCGGUGUGAGUGCAGGAGCCGAGCAAUAACGACAGCAUCGACUGCGCCCGGAAAAUGUCUGGACGGUCUUUCAAGGACGUGGGUUCAAUUCCUGCCUCUCCACUA |
|
[ reference structure ]
|
(.(..(..........((((..(((.(.....((((((.(...((((.((((..[[[[[......))))..........]]]]].................................(..(..((((..........))))..)..)((((((........)))))).................(((((((((({.{{{{{{.))))))))))..........}}}}}}.}.((((..((((((...<<<<<<<<..))))))))))...............>>>>>>>>....)))).....).))))))...).)))..)))).(((((.......))))))..).)....
|
| [ predicted structure ] |
..........(((((((((((((((.......))).))))))..(((((((((.(((((((((...........)))).)))))........(((((.(((....))))))))..)))))))))))))))..((((((.((((...(((....))).)))))))))).....((((((((...[[[[[[[[[.))))))))....]]]]]]]]]..............(((.((((.((((((((..[[[)))))))).....)))))))........]]].(((..[[[)))..(((((.....)))))...]]].....((((.[[[[[......)))).....]]]]]..
|
|
TMR_00443
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUUGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAAAGAUAGUCGCAAACGACAAUCAAUAUAAAGCACUAGCAGCUUAAUAACCUGCCUAGAGCCUUCUCUCCCUAGCUUCCGCUCUUAAGACGGGGAUAAAGAGGAGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCUAGCUUGGGGUUGAAGCGUUAAAUUUAAUCAAGCUAGCUUAUUUGUGGCGUGUCUGUCCGCAGCAAGUAAGUGAAUUUAAAGACUAGACUAAGCAUGUAGUGCCGCGGAUGUAGAAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(.((..((((((((((((((.aaaaaa..))))).....AAAAAA.................................((.(((((((.........)))).))).))(((((((((((..(((...[[[[[)))..))))....)))))))..........]]]]]....(((....((((<<<<<<))))....)))...........>>>>>>.((((((((((.(((.{{{{{{{))).)))))))))).........}}}.}}}}...)))))...))))..)).)....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((....((((((.......)))))).[[[....))).....]]].(((..[[[[[)))..]]]]].......((((((((..(((.((((....)))).)))......(((..[[[[[[[)))......]]].]]]]...(((((((((((..(((...[[[[[)))..))))....)))))))..........]]]]]..(((........[[[[[[[[[..[[[[[))).....]]]]]]]]]]]]]]....))))))))......((((((.(((.....(((..((((.....)))).....)))....))).))))))...........(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00448
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGAUUAGGAUUCGACGCCGGUAACAAAACUUGAGGGGCAUGCCGAGCUGGUAGCAGAACUCGUAAAUUCGCUGCUGCAAACUUAUAGUUGCCAACGACGACAACUACGCUCUAGCUGCUUAAUGCGGCUAGCAGUCGCUAGGGGAUGCCUGUAAACCCGAAACGACUGUCAGAUAGAACAGGAUCGCCGCCAAGUUCGCUGUAGACGUAACGGCUAAAACUCAUACAGCUCGCUCCAAGCACCCUGCCACUCGGGCGGCGCGGAGUUAACUCAGUAGAGCUGGCUAAGCAUGUAGAACCGAUAGCGGAGAGCUGGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((........(((.((..(((((((((...[[[[[[[..))))........]]]]]]].................................((((((((.....))))))))((((((...(((..(.{{{{{)..)))....)))))).........}}}}}...((((..(.(((.<<<<<<))).)..)))).........>>>>>>..(((((......(((aaaaaaa)))......)))))..........AAA.AAAA...))))).....))..)))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((((......))).....))).....(((...[[[[[[[..))).........]]]]]]].......((((((.....[[[..))))))....((((((((.....))))))))..]]]....(((....[[[[[...))).......((((...)))).]]]]]...........(((.[[[[[.)))...]]]]].............(((.[[[[[.)))...(((((.....)))))...]]]]]........(((.[[[[[)))...........(((....)))....]]]]](((.[[[[[)))...]]]]].)))))))....
|
|
TMR_00451
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUUGGAUUCGACAAGAUUCUUGAGGCUUUAGGUGCAUGCAGAGGAGCGGUUUGCCUCUUAAAAAGCCGCAUUUAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUCUAGCCGCUUAAUAACCGGCUAAGCCCUUCCACUCAUACUCUUUCUGCUAGUAGAGGUUCGGAAGGUCAUCCCAGCAGAAUAGCGAGGGAACCUUGUCUAAGGGUGAACCGCGAAAUAGUAUUAGGCCCGCUAUGAGAAAUCCUGUCUGCCGGAGUUCGAAAUAGUUAAAUAAAAGACAGAAUAAGCAUGUAGUACCGACGGUUAACGUUUUUUGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(.(..((((.(.((((((((((((((.{{{{{{..))))).....}}}}}}..............................(..((.((((.........))).).))..)...(..(..((.(..aaaaaa..))))..).................AAAAAA..(((.....((((([[[[[)))))....)))..........]]]]]..(((((....(.(((..<<<<.<)))..)....))))).........>.>>>>....)))))...)))).).)))).).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.......)))))).............(((((....(((((.[[[[[[[.)))))....]]]]]]].........((((....)))).........(((.((((((.........)))))))))((((((.(((.((((..[[[[[[[)))))))....)))))).......]]]]]]]..........((((.[[[[[[))))................]]]]]]..(((((..(((.(((..[[[[..))).)))...)))))...........]]]]...........)))))((((.....))))........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00457
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUUUAGGAUUCGACGCCGGUCGCGAAACUUUAGGUGCAUGCCGAGUUGGUAACAGAACUCGUAAAUCCACUGUUGCAACUUCUUAUAGUUGCCAAUGACGAAAACUACGGCCAGGAAUUCGCUCUCGCUGCGUAAGCAGCCUUAGCCCUGAGCUUCUGGUACCUUCGGGUCCAGCAAUCACCAGGGGAUGUCUGUAAACCCAAAGUGAUUGUCAUAUAGAACAGAAUCGCCGUGCAGUACGUUGUGGACGAAGCGGCUAAAACUUACACAACUCGCCCAAAGCACCCUGCCCUUCGGGUCGCUGAGGGUUAACUUAAUAGAAACGGCUACGCAUGUAGUACCGACAGCGGAGUACUGGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((........((..((((((((((((((..[[[[[[[.)))))........]]]]]]]....................................((......(((...(((((....)))))...)))......)).((((.(((....)))))))(((((((..(((..(.<<<<<)..)))...))))))).........>>>>>...(((((...((..aaaaaa.))...))))).........AAAAAA..((((...(...((({{{.{{{)))....)..))))..........}}}..}}}...)))))...))))...))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.......((((.[[[[.....))))......]]]].....((((((.[[[[[[[))))))........]]]]]]].................................(((((((.((((((...(((((....)))))...)))...))).)))))))(((....)))...((((((((..(((....[[[[[...)))...))))))))........]]]]]...((((........[[[[[[....[[[)))).....]]].]]]]]]..((((..(((((((.[[[....)))).)))..))))...............]]]..(((...[[[[[......)))...]]]]]..(((.[[[[[)))...]]]]].)))))))....
|
|
TMR_00458
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUAGGAUUCGACGGAAUUCAAGAAGCCCAAGGUGCAUGUCGAGGUGCGGUUUGCCUCGUUAAACAGCCGCAACCUAAAGUAAUCGCAAACGACGAUAACUACUCUCUAGCGGCUUAGGCCAGCUAGCGCUCCUUCUAUGUAUUCUUGUGGACUAGAUUUUGGAGUGUCACCCUAACACCUGAUCGCGAUGGAAACCCUGGCCGGGGUUGAAGCGUUAAAACUAAGCGGCCUCGCCUUUAUUUACCGUGUUUGUCCGGGACUUAAAGGUUAAUUAAAUGACAAUACUAAGCAUGUAGUACCGACGGUCGAGGCUUUUCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((..(.....(((...((((((((((((((<<<<<<<..)))))......>>>>>>>..................................((((((((....))).)))))((((((.((((.....(([[[[[)).))))....)))))).........]]..]]]..(((.(....(.(((aaaaa))).)..).)))..........AAAAA..(((((......(((...{{{{{)))......))))).........}}}}}......)))))...))))...)))....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.(((((.....((((((....))))))....))))).....(((.....[[[[[[[[[[)))..........]]]]]].]]]]..(((.((((.......)))).)))....(((((.(((....))).....[[[[[[[.((((((......)))))))))))....]]]]]]].........................(((((.[[[[[))))).................]]]]]..(((((((....(((...[[[[[)))....))))))).........]]]]](((((......)))))((((.(((.[[[)))..))))..(((((........)))))..]]].....
|
|
TMR_00460
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGAUUAGGAUUCGACGCCGGUAGCGAAACUCUAGGUGCAUGCCGAGUUGGUAACAGAACUCGUAAAUCCACUGUUGCAACUUUUAUAGUUGCCAAUGACGAAAACUACGGCGCGGAGUACAAGCUGGCUGCGUAAGCAGUCCUCUUGACCCGUUGCUUCUGGUAGCUUCGGCUCCAGCAAUCACUAGGGGAUGCCUGUAAACCCGAACUGAUUGUCAUACAGAACAGGAUCGUCGCGUAGCACGUUGUGGGCGAAGUGACUAAAACUUACACAACUCAUCCAAAGCACCCUGCCCGUCGGGCGGCUGCGGAUUAAAUCAGUAGACACGGCUAAGCAUGUAGUACCGACAGCGGAGUACUGGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.......(...((((((((((((((..[[[[[[[.)))))........]]]]]]]...............................((...(..(..((((..((((((....))))))..))))..)..)...))((((.(((....)))))))((((((...(((..(.<<<<<)..)))....)))))).........>>>>>...(((((.(.((..aaaaaa.)).).))))).........AAAAAA..((((...(...((({{{.{{{)))....)..))))..........}}}..}}}...)))))...))))....).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((.[[[[)))..............]]]](((((.[[[[[[[))))).........]]]]]]]........(((((.....[[[....))))).(((((((....((((..((((((....))))))..))))..))).)))).((((.(((....)))))))...]]]...(((....[[[[[...)))...(((.........))).]]]]]...(((((.......[[[[[[......))))).........]]]]]]............(((...[[[[[)))..(((((((((((......(((......)))......)))).))).))))........]]]]]..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00465
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUCUGGCUUCGACGCUGGUGAUGAAACUCAAUGAUGCAUGUCGAGAGUAUAUGUCCUCUCGUUAAUCAAACAUAUAUUGUUAUAGUCGCAAACGACGAAAAUUACGCUCUAGCAGCUUAAACCCUGUUUACUUGGUUGCUGAUCAUCUACAGUUGGUCAACUAAGUUGAAGCGUCCGCAUGUAGAAGCGCCACAAGUGAUUGUCUCAAUUGCUUGGGUUUAAAAGUAGAGAAUCAUCCUAUCCAUCCUGACUGUCGGAUCGGUGCGGACUAAAACCAAAGACAGAAACUAAACAUGUAGAUUCAUGAGCGUAAUGCUGGCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(....((((..(((.((((((((((..<<<<<<..)))))........>>>>>>...................................(((((........))))).((((((((((((((..[[[[[[))))).))))))))).............]]]]]]...(((...((((((..{{{{.))))))..))).........}}}}....(((..(.(...((a..aaaa))....).).)))...........AAA..A..A...)))))...)))..))))...).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((((((((((..(((((....((((((((.....((((((........)))))).........))).))))).....((((....)))).............(((((((((((((...)))))...)))))))).)))))..))))(((....))).))))))))((((((..............(((((((((.[[[[)))))))))............]]]]....(((((((.((((...[[[[[)))).)))).)))...........]]]]]...(((..[[[[)))...]]]]((((...)))).))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00469
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGUUUCGACGUGGGUUGCGAAGCAGUGGAGGGCAUACCGAGGACCCGUCACCUCGUUAAUCAAUGGGAAUGCAAUAACUGCUAACGACGAACGUUACGCACUGGCAGCCUAAGGGCCGCCGUCCUCGCACUGGCUCGCUGACGGGCUAGGGUUCGCAAGAACCAGCGAGGUCAUUUACGUCAGAUAAGCCCCGUCGGUGUCACGACUGCGGGGACGAAAACCAAGUGACUCGCCGUCGUAGAGCGUGUUCGUCCGCGAUGCGGCGGUUAAAUCAAAUGACAGAACUAAGUAUGUAGAACUCUCUGUGGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]]..................................((((.(((....))).)))).((((((.((((((..<<<<<<))))))(((((....))))).)))))).......>>>>>>.....((((((.(..aaaaa..).))))))...........AAAAA...((((....(.(((.{{{{{{{)))..)...))))...........}}}.}}}}...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((((.(((((((((((((.((((((.....((((...((((........))))(((....)))....))))....))))))...(((....))).)))).((((.(((....))).)))).((((((.((((((((....))))))))(((((....))))).))))))..))))))))).......(((((.((((......)))))))))....))))))........(((((((((..(((.....[[[)))..)))))))))..........]]]....(((.[[[..)))..(((((....)))))..]]]....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00472
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGUUUCGACGUGGGUUGCGAAGCAGUAGCGGGCAUACCGAGGACCCGUCACCUCGUUAAUCAAUGGGAACGCAAUAACUGCUAACGACAACCGUUACCAGCUGGCCGCUUAAUUGCGCGCCGUCCUCGCACUAGCUUGCCGAUAGGCUAGGGCCGCAAGGCCACGCGAGGUCAUUCAUAUCGGAUCGCUUCGGCCGGUGUCACGACGGCCGGGGUUAACUCCAAGUGACUCGUCGUCGCGCAGCGUGUUCGUCCGCGUCGCGCCGGUUAAAUCAAAUGACUGAACUAAGUAUGUAGAACGCUCUGUAGAGGACUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]]................................((.(((.............)))))((((((.((((((..aaaaaa))))))((((....))))..)))))).......AAAAAA....((((((((...<<<<<...))))))))..........>>>>>..((((.......(((.{{{{{{{))).......))))..........}}}.}}}}...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((((.[[[......))))))....]]].......(((((.[[[[[..))))).......]]]]]..........(((.(((((.....))))).)))..((((((......))).)))..((((((.((((((((....))))))))((((....))))..)))))).....(((...[[[..[[[[[[[[[[)))......]]]]]]]]]]....]]]..(((((.....)))))...(((((...[[[[[[..)))))((((((.......))))))....((((.((((((....))))))....))))]]]]]](((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00478
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACUUGGAAUCGACCGGAUGUCAAGAAGCGUAUGCCUGCGUGUCGUGGUUGAUCAGUUGGCCACGUAAAAAGCUGAUCAAAAACUUUUAGUUGCAGAAGAAAACUUUGCACUGGCCGCCUAAUUACAGGUAGCCCGGACUGAUGGGGAUCGCCGAUGUCGCCUGAAUGUCCGUCACAAUGUCGGAUCGUGGCCCGUCUUACUCAAGACGCGGGUCGCUAAACAAGAUUUGAGUUAGCGGAUUCGGGAGCCUGUCAGGUAGCGCCCGAUGAAGCGAAAAGGAAUCUUCGAGAUUCCACAAAUAGCUUGACUACACAUGUAGACGGCAUCGUGGAUGCAUCGCGGGACGGGAGUUCAAUCCUCCCCGCCUCCACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((...(...(((.(((((..((((((((((...[[[[[[[..))))).....]]]]]]]..............................(..(.(((.((((......)))).))).)..)(((((((.((..........aaaaaa)).)))))))..........AAA.AAA((((...(((((((.({{{{{{..{.......).)))))))..)))).....}..}}}}}}....(...(.....(((((.<..<<<....))))).....)...).....>>>..>...))))).....))))))))...).)))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((.(((.....))).)))))..(((..[[[[[[)))...((((((((((((((............)))))))))............((((((.......))))))...))))).......]]]]]].(((.[[[.....))).........]]]...(((..[[[[[)))......]]]]].(((((((((...[[[[[[...)))))))))..........]]]]]]..((((..(((((.((((...))))....)))))....((((...(((((((...))))))).......(((...((((....))))..))).))))[[[[...)))).((((....)))).]]]]....)))))))....
|
|
TMR_00498
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGUUUCGACGUGGGUGCGGAAUUGGAGUGGUGCAUGCCGAGCAUCAGUGAGCUCGUAAAUCCAGCUGAAACAAACCAACUGCGAACGACGAACGUUUCGCCCUCGCCGCUUAAACACCGGUGAGCGUCUCAACGGCAGGCCGAUGGGCCGGGCCCAAGCCGCAAGGUGGAAGGCUGAGACGUCAUGCACAUCGGCUGGUUGCUCGUCGGGUCACUCGGCGUUCAACGAGACUCAGUGACUGGCGUUGUCCGUAGCGUGCUUCUGCGCGACGGCGGCGUGAGACUCAAAUCAGACAGCUAAGCAUGUAGAUCUACCUGAGGAUGGCUUGCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((......((((.((((..((((((((((.[[[[[..)))))........]]]]].................................(((((((.........)))))))(((((((.((((..aaaaaaa.)))).(((...(((....)))....)))))))))).......AAAAAAA..((((..((((.<<<<<<<.))))..)))).......>>>>>>>.....(...(...(((.{{{.{{{)))....)..)..............}}}..}}}...))))).....)))))))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..(((((.((((((((((.........)))))))...(((((((((((..(((.....(((((((((....((((((((............(((((..........))))).(((((((.........)))))))(((((((......((((....))))..(((...(((....)))....)))))))))).........)))))))).....(((((((...)))))))....))))).))))....(((((((((.((((..(((((....)))))))))))))))...........)))...)))..)))))))...))))...))).)))))..((((.[[[[[))))....]]]]]..........
|
|
TMR_00499
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCCGGCUUCGACGGGAGCGGACAGCGUCCGGUGAGACGAGCCGAGUUCGCCGGAGACUCGUAAAACGCCGGCACCUAAACAUACACGCCAACGACAGAGAGAUGGCGCUGGCUGCCUAAAACCACUGGCAGCCCGUCGGUCCGGGCGGCCCACGGCCCGGUUUCCGGCGUCGGUUAGUGGGCUUACCUCCCGGGCUCCGGCCCGGGGUCCGGGGGGGACACCACAGCAGGGCUAGCCCCUCUGCGGCGCCCCGGUCCGCAGAGGCCGGUGAAGCUAAACCGGGUGCGACGCUCGUACAAUCUCCCGGAUGGCGCGCUCGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.(((((.....(((((((.(.(.((((((((((..<<<<<..))))).......>>>>>.....................................(((((((..........)))))))((((((((.((...aaaaaa..)).))...)))))).......AAAAAA...(((((.((.(((.{{{{{))).)).))))).............}}}}}.(((.((((((([[[[.[[[[..)))))))...))).........]]]]]]]]...))))).....).).)))))))...))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((((.(((((((.((((....((((..((((((((.............((((((.............(((((............)))))..(((((((..........))))))).))))))......(((((.((((((((...)))).))))(((.((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))))).)))))....(((((((((.........)))))))))))))))))......((((((((((...)))))......))))).))))...)))))))))))..))))).)))))).)))))))....
|
|
TMR_00501
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUAAAGGUUUCGACGGGGGUCUUGAAGGGCGAUAAGCGAGUGGAGGAGCGCACUCUCCUUAAACGGCGUACGUUUUAAAUUAGACGACAACGAUAAUUUUGCAAUGGCAGCCUAAGGGCAGCCCGUCUUGCCUGAGAGUACCACGGCUUGGGUAAAGGCGUCGACUAGUGGUGAACGUCGGCAGGCGAUGACUGUGACCUGUCGGUGUAUUGCAGUCUACCAAAGCGAGGGGCGUGUCUGUUUGCCCGUGCGGAGGGAAACGGCGCAAGCCGAAAUAACCGACUAGACUCGUAGAAAUUCGCGUGAAUGGGCUUUCGGACAGGAGUUCGAUUCUCCUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....(.((((....((((((((((<<<<.<<))))).........>>.>>>>..............................((.(........).))...(((((((((((((.....{{{.{)))))))).)))))........}.}}}......(((..((((((((((...[[[[[)))).)))))).))).......]].]]]....(((.(..((.(..aa.aaa.)...))..).)))...........AAAAA...))))).......)))).)....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((....))))))))...((((.....(((....[[[[[[)))...]]]]]]......(((.(((((......)))))...))).......(((....)))(((....))).))))((((((((((((..[[[[[[..))))))).)))))........]]]]]]..(((..[[[[)))....]]]]...(((..[[[[.....)))..]]]]...((((((((((........)))))..[[[[[......((((....))))...............))))).....]]]]].(((.[[[[[[[))).....]]]]]]]........)))))))....
|
|
TMR_00502
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUAGGAUUCGACGCCGGUAACAAAACCCGAAGUGCAUGUCGUGAGGGUAGCCAAUCACGUAAAUCCAAAGCUGCAAAUUAUCAGUUGCCAAUGAUGACAACUACGGUGCUCAACUAGCUGCGUAAGUAGCUUUUUGUUACACCAUCUAGCGGUACGCCGCUAGCGGUUUUUAACAAGGUGCCAGUACCGCGUUAACGACUGUCACUUAGAACUGGAUCGCAGUGAAGCCUGCCUGGGGUGGAUCAGCUAAACUUUUACAGGAUCGCGCUUUUCGUCCCGCCCGCUGGGCUGUAAAGCGUUAAAUCAAUAAGCGGUUCUAAGCAUGUAGAGCUGACGGCGGAGUACUGACGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.(((((......((...(((.((((((((((..<<<<<...)))))..........>>>>>..............................(.....(((..((((((....))))))..))).....)....((((((....))))))(((((.......aaa.aa.....)))))............AAAAA.........(.((.(....((((.{{{{))))....).)).)........}}}}...(((((.((..(((.[.[[[[[)))....)))))))..........]]]]].]....)))))....)))...)).....))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((.......[[[[.))))............]]]]........(((((..[[[[[...)))))..........]]]]]...((((((...[[[..)))))).......((((..(((..((((((....))))))..)))...))))..(((((((....))))))).]]].........(((.[[[[[)))..........(((.....))).]]]]]...((((......))))((((.[[[[[)))).......]]]]]((((((((..............[[[[[[.(((....))).............)))))))).(((.......)))..]]]]]].........(((.[[[[[))).....]]]]]..........
|
|
TMR_00503
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACACGGCUUCGACGUGUAGUAAGCGUGCAGCAGACUGACCUGCCGAGCAGCCUGAUUCGCUUCGUAAAACCUGUCAGGAACUGUAACUGCGGACGAUUAUUCGUACGCGAUGGCGGCGUAACAGCCCCCAUCUGUCUCGCGUCGCUCCUGGCCCUUGGGGAGCGUGAGACAUCGACAAAAAGGGUGUAGCCGCCGCGUUCUCCGACUGCGGAUGCGCCGGUGAAAUCUAAUCAGUCUCAGCGCCGCCCUGGCCUUGUGAAUGGGCAGACGGGCGACGUGAACCGCCAAUGCAUUCACUAUGCAGGUAGAGGUUUGCCUGUGCGGCUACACGGACCCGGGUUCGACUCCCGGCAUCUCCACAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((...(((((((((((((..(((((((((...[[[[[[....))))........]]]]]]..............................(((((.(((......))).)))))((((((((((..((((..{{{{{{)))).))))))))))........}}}}}}...((((.(((((((...aaaaa.))))))).))))..........AAAAA...(((.((((((.(((..<<<<<<<)))..).))))).)))............>>>>>>>...)))))....)))))).)))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((..((((((((((((...(((((((((((((...(((((..((((((((((................))))))..))))....((((((((....))))(((.(((((.(((......))).)))))))).(((((((((((..((((...(((..(((((((((............((((((.((((...(((....))).)))).))))))(((........))).))))).))))..))).))))((((......))))..))))))))))).))))...(((((.....)))))))))).)))))).))))))))))))))).........))))...))).)))))))....
|
|
TMR_00519
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUCGCGAAACUCCGGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAGUUAUAGUUGCAAACGACGAUAACUACGCUCUGGCUGCUUAAUUAGCGCCAGCCAUCUACCACAGGUCUCGCACAUGGGCAGUGGAUUUGAUGGUCACCUUACAUCGUGCUAGCGAGGGAACCUUGUCUGGGGGUGAACCGCGAAACAGUUCCAGGCUCACCGUUAGAAAUCCUGUCUUUCGGAGUUCGAGCGGUUAAAUAAAAGAGAGACUAAGCAUGUAGCGCCUUGAGCGUAGGUUUUUCGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(......(((.(((.(((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>.................................((((((.........).)))))(((((..((((..(.((({{{{{{)))).))))....))))).........}}.}}}}..(((.....((((([[[[[)))))....)))..........]]]]]..(((((....(.(((.aaaaaaa)))..)...))))).........AAAAAAA...)))))...).))).))).....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((((((((.(((...)))))))..)))))))....(((..[[[[[)))..]]]]]..........(((.((((((.((((....)))).))))))......[[[[))).........]]]]((((((..((((..((((.[[[[..)))).))))....))))))...........]]]]..(((..........[[[[[[[[......))).......]]]]]]]]..((((((.(((.(((.[[[[[[[))).))).)))))).........]]]]]]].(((......[[[[)))..]]]]..(((.....)))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00520
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACAGGAUUCACGAAACCCUGGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCACCGUUAUAGUUGCAAACGACUCUAACUACUCUCUAGCAGCUUAGGCUAGCUAGCCAUCUGACACAGGUCUCUCAAAUGGGCAGUGUAUACAGAUGGUCAUCCUACAUUUGAUAGCGAGGGAACUCCGUCCGGGGGUGAACCGCGAAAUAGUACCGGACUCGCCCGAUGAAAUCCUGUCUUUCGGAGUUUAUUCGGGUUAAUUAAAAGAGAGACUAAGCAUGUAGUGCCUUGGAUGUAGGUGUUCUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((.(.....(.((.(((.(((((((((((.{{{{{{..))))).....}}}}}}.................................(((((.(.......).)))))((((((.((((..(.(((<<<<<<)))).))))....)))))).........>>>>>>..(((.....(((((aaaaa)))))....)))..........AAAAA..((((((..((.(((.[[[[[[[)))..))..)))))).........]]]]]]]...)))))...).))).)).)....).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((........((((.[[[[.....))))..]]]]((((((...(((((.[[[[[[..))))).....]]]]]]..((((..[[[[[[.)))).................]]]]]].......((((((((((((((((..((((.......)))).))))...))))))))..[[[[........))))..]]]]((((.[[[[[[))))................]]]]]]..((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))).)))))).........]]]]]]]...((((.(((....))).))))...))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00522
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACAGGAUUCACGAAACCCAAGGAGCAUGUCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCACCGUUAUAGUUGCAAACGACUCUAACUACUCUCUAGCAGCUUAGGCUAGCUAGCCAUCAACCACACGUUUCGCACGUGGACAGUGGAUUCUGAUGGUCAUAUUACAGUGUGCUAGCGAGGGAACUCCGUCCGGGGGUGAACCGCGAAACAGUACCGGACUCACCAAGUAGCAUCCUGUCUUUCGGAGACUGCUUGGUUAAAUAAAAGAGAGACUAAACAUGUAGUGCCGAGGAUGUAGGCUUUCUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(.....(.((..((.(((((((((((.{{{{{{..))))).....}}}}}}.................................((((((((....))).)))))((((((.((((..(.(((aaaaaa)))).))))....))))))..........AAAAAA..(((.....((((([[[[[)))))....)))..........]]]]]..(((((...(..(((.<<<<<<<)))...)..))))).........>>>>>>>...)))))...).))..)).)....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((....))))))).))).(((...((((.(((.(((((((((((............))))))...((((.(((((....))))).))))..)))))..)))))))..((((((..(((((((.((((((((.....)))).....))))....))))))).((((....))))))))))..))).((((.[[[[[[))))................]]]]]]..(((((((((..(((.[[[[[[[)))..))))))))).........]]]]]]]............(((..[[[....)))..]]]....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00528
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACAAGAUUCACGAAACCCUAGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCACAGUUAUAGUUGCAAACGACGAUAACUACGCUCUAGCAGCUUAGGCUAGCUAGCCAUCUUGCUCACGUUUCUCAAAUGGGCAGAGUAUUAAGAUGGUCACCUUUACAUUUGAUAGCGAGGGAACCAUGUUCAGGGGUGAACCGCGAAACAGUACUGAACUCGCCAAUAACAAUCCUGUCUUUCGGAGUGUUGUUGGUUAACCAAUAGAAAGACUAAGCAUGUAGCGCCGAGGAUGUAGGCUUUUUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(.....(.(((.((.(((((((((((.{{{{{{..))))).....}}}}}}.................................((((((((....))).)))))((((((.((((..(.(((aaaaaa)))).))))....))))))..........AAAAAA..(((.....(((.([[[[[).)))....)))..........]]]]]..(((((..(...(((.<<<<<<<)))....).))))).........>>>>>>>...)))))...).)).))).)....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((...[[[[...)))....]]]]...............(((((.[[[[[[..))))).....]]]]]]...(((.[[[[[[.....)))..]]]]]]....((((((((....))).)))))((((..[[[[[...........))))...]]]]]...(((((....[[[[[.)))))......]]]]].(((..[[[[[[.)))................]]]]]]..((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))))))))).........]]]]]]]..........((((((((((....[[[))))))).)))........]]]....)))))))....
|
|
TMR_00540
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUCCUGGACUCGACGGGAUUUGCGAAACCUAAGGUGCAUGCCGAGGUGAGGCUGGCCUCGUAAAAAACCUCAAAAAAAUAAUUGCAAACGACUCGCAAUUCGAAUCUAACGCUGCUUUAGCAGCUUAAUCAGCUUAAUAACCUGAAGAUUCCCUCUCUCCCUAGCCUCCUCUCUUAGGACGGGGAUAAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGUCCUGCCUGGGGCUGAAGCGUUAAAACUAAUCAGGCUAGUUUGUUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGCUGACAGGUGAAUGUAAAGACUGGACUAAGCAUGUAGUGCCGAAGGCGUAGAAAUUCCGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((......(((..(((((((((((((({{{{{.{..))))).....}.}}}}}...................................(.(..((..(((..((..........))..)))..))..).)..(((((((((((..(((..<<<<<<)))..))))....)))))))..........>>>>>>...(((....((((.aaaaa))))....)))...........AAAAA..((((((((((.(((.[[[[[[[))).)))))))))).........]]].]]]]...)))))...))))..))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...(((((.(((..[[[.....)))..]]]........(((.[[[[[((((....)))))))....]]]]].................((((((.......((((((...(((((....)))))....((((.........))))))))))(((((((((((..(((........)))..))))....)))))))............))).))).......(((..[[[[[[))).................]]]]]].....(((((((.(((.....[[[))).)))))))............]]](((((((...[[[)))).)))....]]]......)))))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00541
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAACGGAUUCGACGGGAUUGAAUCGUGGUGGGGAGGCGUGCCGGGUUCCGAGCUCCCGUAAAACGAUCGGAAAACAUAACUGCCAACACGCAGUUUGCAUACGCUGCUUAAUUAAUUAAGUAGCCGUUCCAGCCACUGAGCCUGCGCGGUGGUGAGUGAACGUCAUUUUGCAGGAUAGGCCAAGAGCUUCGGUCCGGAGCUGGCGGCUGAGACUCAAUCGGGCUAAGCUGCCACCGCCCUUGCCGGUUCAGGGGUGGCCGCCGACAACCAUGAGCCGGAUACGCACGUAGUUCUCUCCAGUACGGGCUUUUUCGGACGGGGGUUCAACUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((..(..(((((.(((((((((((((((((...<<<.<.))))......>.>>>.................................(((((((((....)))))))))(((((..(((((((..[[[[[[)))))))....)))))......]]]]]].(.((((...(((((.{{{{{{)))))...)))).)........}}}}}}..((.((((((..(((..aaaaaaa))))))))).))..........AAAAAAA....)))))....)))))))).))))).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....(((((((.....)))))))....(((((((((((((....((((((......[[[......)))))).....((((((......))))))....]]](((((((((....)))))))))(((((..(((((((..[[[[[[)))))))....)))))......]]]]]]..........(((((((...)))))))(((((((....(((....)))...))))))).(((((((..[[[[[[[[))))))).............]]]]]]]]....))))))....)))))))..............(((.[[[[[)))..]]]]]..)))))))....
|
|
TMR_00544
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUCCGGUUUCGACAGGAAUGAUUUACUAAUAUUGGCAGUAGUUUGGCAGACUAUAAUGCUACUAGGUUUGAAGAAACGCAAACAAAAAACAAAAAGAAGACAAAAUUAAAAUUCCAGUUUCGUUGAUGAACAAUCAACUACCAGGUUCAAUGUUAGCAGCUUAAUUCCUCGUUGUUAGAGGAUUGCUAGCCGUAAUAAUAGUUAAUUAUAGAUUAUUAACUAUUAUCGUAUCUCAAGUCUUAAUCUAAUAAAAAUUCUAAUUGAUAAUGUUAGAAUUUUGAAAAUCUUAUUAUCUAGUUAUUUAAUUAGUUGUCUAGUCCUAUUAUUAAAUAAUGAAAGAAAGAUGAUUAGACUAAACUGUAGAAGGUAUUAGAACAUUAUUUGUGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((((((..(.((((((((.((((((((.(..[[[[[[...).)))....]]]]]]..................................................................................((((((((..........)))))))).((.(....).))...(((((((((((...{{{{{{{)))))))))))..............}}}}}}}...((((((((((..aaaaaaa))))))))))........AAAAAAA..(((((.(.(.(((..<<<<<<<<)))....).))))))...........>>>>>>>>...)))))....)))))))).)..)))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((...........((((((((((.(((....(((((((((((.....))))))..))))).)))(((((........)))))...................)))))...)))))......((((((.....))))))....(((......[[[[[[[[)))...(((((.......)))))]]]]]]]]....((((((((((((........))))))))))))................(((.....[[[[[[[[[[[.)))...]]]]]]]]]]]...........................(((..[[[[[[[[)))(((((....))))).........]]]]]]]]...(((......)))....))))))).....((((.[[[[[))))...]]]]]...........
|
|
TMR_00547
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUCAUGGAUUCGACAGGGGUCCCCCGAGCUCAUUAAGCGUGUCGGAGGGUUGGCUUCGUCAUCAACACACACAGUUUAUAAUAACUGGCAAAUCAAACAAUAAUUUCGCAGUAGCUGCCUAAUCGCACUCUGCAUCGCCUAACAGCAUUUCCUAUGUGCUGUUAACGCGAUUCAACCUUAAUAGGAUAUGCUAAACACUGCCGUUUGAAGUCUGUUUAGAAGAAACUUAAUCAAGCUAGCAUCAUGUUGGUUGUUUAUCACUUUUCAUGAUGCGAAACCUUUCGAUAAACUACACACGUAGAAAGAUGUGUAUCAGGACCUCUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCGUCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((((...(.((.((((...((((((((((aaaaa.))))).............AAAAA..................................(.((.(((......))))).)..(((((.(((((((((.<<<<<<)))))))))..))))).........>>>>>>....(((((((.....[[[[[[....)))))))...........]]]]]]..((((((((..(((.{{{{{{{)))...))))))))..........}}}}}}}...)))))......)))).)).)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((((((((.....(((.....))).((((((((((((....................(((((......)))))....................((((....(((......)))..))))(((((.(((((((((.[[[[[[)))))))))..))))).........]]]]]].....((((((.....((((((.....((((.....))))....))))))..[[[[[[[[..[[[))))))..]]]...]]]]]]]]..))))))))))))..(((.[[[[[))).....]]]]]....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00553
|
[ FASTA input ]
|
GGUCCCCGAGCUUAUUAAGCGUGUCGGAGGGUUGGCUCCGUCAUCAACACAUUUCGGUUAAAUAUAACUGACAAAUCAAACAAUAAUUUCGCAGUAGCUGCGUAAUAGCCACUGCAUCGCCUAACAGCAUCUCCUACGUGCUGUUAACGCGAUUCAACCCUAGUAGGAUAUGCUAAACACUGCCGCUUGAAGUCUGUUUAGAUGAAAUAUAAUCAAGCUAGUAUCAUGUUGGUUGUUUAUUGCUUAGCAUGAUGCGAAAAUUAUCAAUAAACUACACACGUAGAAAGAUUUGUAUCAGGACCUCUGGACGC |
|
[ reference structure ]
|
.......(.((..(((...(((((((((({{{{{{))))).............}}}}}}..................................((((..((......))..))))(((((.(((((((((.aaaaaa)))))))).).))))).........AAAAAA....(((((((.....<<<<<<....)))))))...........>>>>>>..(((((((((((((.[[[[[[[))).))))))))))..........]]]]]]]...)))))......)))..)).)................
|
| [ predicted structure ] |
(((((....((((...))))....(((((.[[[[[)))))...]]]]].....(((((((....)))))))...................(((((.((((.....)))).)))))(((((.(((((((((.[[[[[[)))))))))..))))).........]]]]]]....(((((((.....[[[[[[....)))))))...........]]]]]]..(((((((((((...[[[[[[[[..))))))))))).........]]]]]]]]..............(((....))).))))).........
|
|
TMR_00559
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGCAUUGGUUUCGACGGGGGUUGUGAAGUCGCCUGGCGCAUGCCGAGGGGGUAGCUUUCCUCGUAAAUCCAGCUGCAAAACUCUAGUUGCCAACGACGACAACUACGCUCUGGCCGCUUAAGGCCUAAGCCUCGAAACCGCUUGUGUCCAUGCUCGCGGUGUAGAGUCACUAUCAUGGAAUCGCGCUGGGUGGCUGCCUGUCAGUCCGGCACUAGAACACAACAGGCUGGUUCCCGGAUGCGCUUUGCACGCCGUGCUGUUCGGGGACGAGAUCCAACGGUGAGCUAAGCAUGUAGUGCUGGGGAUGGAGUGCCUUCGGACGGCGGUUCAAUUCCGCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((..(...(((.(.(((((((((((((((..aaaaaa..))))).......AAAAAA..............................(((..((((......))))..)))(((.(.(.(((..(..[[[[[[)..))).).).))).......]]]]]].(.(.(((((((.(<.<<<<<<).))))))).).).......>>>>>>.>(((((..((.((((...{{.{{{{))))...)).)))))..........}}}}.}}...)))))...)))))).)))..)..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
................((((....))))...(((((((((((((....(((((..[[[[[[..))))).......]]]]]].......((((((....[[[...)))))).(((..((((......))))..))).]]]..(((((.....[[[[[[...))))).............]]]]]]...)))))))))))))((((((......[[[[[[........))))))..((((((((.(((((((....((((((....((((....)))).....))))))....))))..)))...))))))))..]]]]]]...(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00560
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGUAUAUUUCGCGACUCAUCGGCAGAUGUAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAAUUCUUACGCAUUAGCUGCCUAAAAAACAGCCUGCGUGAUCUUCACAAGAUUGUUUGCGUUUUGCUAGAAGGUCUUAUUUAUCAGCAAACUACGUUUGGCUACUGUCUAGUUAGUUAAAAAGAGAUUUAUAGACUCGCUAUGUGAGGGCUUGAGUUAUGUGUCAUCACCUAGUUAAAUCAAUACAUAACCUAUAGUUGUAGACAAAUAUAUUAGCAGAUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[)))).....]]]]...................................((.(..((((.........))))..).))((((((..((((((.aaaaaa))))))....))))))..........AAAAAA....((((((((..{{{{{..))))))))..........}}}}}..((((.((((.(((....<<<<<<<))).)))).)))).........>>>>>>>....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..............(((((((((((.............)))))..[[[[......))))))............]]]]..........(((..[[[[[[))).((((.........))))..]]]]]]......((((((.[[[[[[))))))....................]]]]]](((((..(((....(((((...((((.......))))..)))))..))))))))(((......[[[[[[[[[.....)))..........]]]]]]]]].....((((....[[[[[[[..))))..]]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00562
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAGGGGAUGUUGAAACAGGGGAAGCGAGCCGAGGAACGCGGCAAUGAUCUCGUUAACCACGUGUCGCAAAAAAAUAAUCGCCAACUCUAAGCGCGAUUCCCAGCAGUUCGCUCUCGCUGCCUAAUAAGCACCGAUAGCGCUUGGGUGUCAGACCGGGGAGUUCCCGACCCGGACCCUGGCAUAAUCUAGGGAACUCAACCGUCCGCCCGGGCUGCGGGGGCGGAUGGGAAAUCAAACAGCAGCUGGGCCUGUUGGCGGCUUGUCCGCGUGACCGCCAGGGCCGAGAAAAGCACAGCGGACUGCGCUCGGAGAAGCCCUGAAUUAACUCCACUGGACCCGGGUUCGAUUCCCGCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((.(((..(.((..(((((....((((((((((...[[[[[.....)))))..........]]]]]....................................(.(..((((.(((.(((.......))).))).))))..).).((((((.(((((..<<<<<<..)))))...)))))).......>>>>>>....((((((((((.{{{{{{..))))))))))...........}}}}}}.(((((..((((((...aaaaaa....)))))))))))............AAAAAA...)))))......)))))..)))..))).)))....((((.......)))).)))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....(((((((((.....)))))))))..(((((.((((((.(((...((((((.......(((.....))))))))).................(((..(((((..((((((....(((((((((((.((((...((((.........))))(((((...(((....((((((((...((((...)))).........))))))))....)))))))))))).)))))))))))))))))...........(((((((((..((((((.(((......))))))))))))))..........)))).....)))))..)))....)))........(((...)))....)))))).)))))..)))))))....
|
|
TMR_00563
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAGCGGCUGUUGAAGCAGGGGAAGCGUGUCGAGGAAGCGGCAAUGAUCUCGUAAACCAUAUGUCGCAAAAAAUAAUCGCCAAUACCAAGAGCGAUUCCCAGUCCUUCGCCCUCGCUGCCUAAUAAGCAGUGAGUGAGGGACCCUUAAUGGGUGUCAGCCCGGGAGUGUUCCCGACCCGGACCCUGGCAUAAUCUAGGGGACUAAACCAUCGAGCCCGGUCACGGGGUUCGAUGGGAAAUCAAACAGUGACUGGGCCCGUCGGCGACUUGUUCGCGUGAUCGCCGGGGCCGAGAAAAUCGCAGCGAACUGCACACGGAGAAGCCCUGAUUCUGCACCGGUGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCAUCUCCACGA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((.(((.....(((.(((((....((((((((((..<<<<<.....)))))..........>>>>>......................................(((.(.((((((((.......)))))))).).)))............((((((.(((((...[[[[[[..)))))...)))))).......]]]]]]....(((((((((({{{{{{{..))))))))))...........}}}}}}}(((((..((((((...aaaaaa....)))))))))))............AAAAAA...)))))......))))).)))....))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((...)))))))).(((((.......((((.(((((((((((((...........))).))))))...........................((((((.(((((((((..(((((((.......)))))))))))))))).......((((....)))))))))).)))))))).....)))))(((.((((.((((.......(((((((((((.......)))))))))))...........(((....(((((..((((((.(((......)))))))))))))).........((((....)))).))).......)))))))).)))))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00566
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCCUAUUUUGCAACUCAUCGGCAGAUGUAAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUAACACAACUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCCGGCGUGACUUCUAUAGGAUUGCUUGUGUCUUAUUAGAGGUCUCAAAACAGCAAGCUACGUUUAGGUGAUUGUCUAGUCACCUAAAAAGAGAACCCUAGACUCGCAGGCUGAUGGCUUGAGUUAUGUGUCCUUGGUCUGUUAAAGUAAGACAUAACCUAUGGUUGUAGACAAAUAGGUUAGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCAGCUCCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[))))......]]]]...................................((.((.((((.........)))).)).))((((((.(((((((.aaaaaa)))))))..))))))........AAAAAA....(((((((((..{{{{{{))))))))).........}}}}}}..(((((.(...((.(...<<<<<<<).))...)))))).........>>>>>>>....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............((((...[[[[[)))).........]]]]].((((.[[[[.....))))......]]]]...........................(((.[[[[....)))..]]]]......((((((((((((((.[[[[[[)))))).))))))))........]]]]]]....(((((((((..[[[[[[))))))))).........]]]]]]..(((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]......((((.(((......))).))))..........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00568
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUAUUUUGCGACUCAUCUAGCGGAUGUAAAACGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUAAUACUUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCGGGCGUGACCCGAUUCGGAUUGCUUGUGUCUGAUGACAGGUCUUAUUAUUAGCAAGCUACGGUAGAAUCUUGUCUAGUGAUUUUACAAGAGAUUGAUAGACUCGCUUGAUUUGGGCUUGAGUUAUGUGUCAAAAUCAAGUUAAAACAAUACAUAGCCUAUGGUUGUAGACAAAUGUGUUGGCAGAUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..(((((((((..{{{)))).....}}}....................................((.((.((((.........)))).)).))((((.((((.((((.<<<<<<)))))))..).)))).........>>>>>>....((((((((..aaaaa..))))))))..........AAAAA..(((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((................(((..[[[[[........)))..]]]]]...((((.((((.(((....)))...)))).)))).....................(((.[[[[....)))..]]]]......((((....((((((.[[[[[[)))))).....)))).........]]]]]]....((((((((..[[[[[..))))))))..........]]]]]....(((((...[[[[[[[.......)))))..]]]]]]]...(((((.....[[[....))))).((((....))))]]]......(((...[[[[[..)))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00570
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUAUUUUGCGACUCGUGUGGCGACGUAAACGCUCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUAACACUUCUUACGCUCUAGCUGCCUAAAAACCAGCAGGCGUGACCCGAUUUGGAUUGCUCGUGUUCAAUGACAGGUCUUAUUAUUAGCGAGAUACGAUCAAGCCUUGUCUAGCGGCUUGAUAAGAGAUUGAUAGACUCGCGGUUUCUAGGCUUGAGUUAUGUGUCGAGGGACUGUUAAACGAAUACAUAACCUAUGGUUGUAGACAAAUAUGUUAGCAGAUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((..<<<.))).....>>>....................................((.((.((((.........)))).)).))((((.((((.((((..aaaaa)))))))..).)))).........AAAAA.....((((((((..{{{{{..))))))))..........}}}}}..(((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...............(((.[[[[[[........)))..]]]]]].((((.[[[[[.))))((((((....))))))................]]]]]........((((..........)))).......((((((.....[[[[[.........)))))).........]]]]].....((((((((..[[[[[..))))))))..........]]]]]..(((((((((........[[[[[[[[[..))))))))).......]]]]]]]]].....((((....[[[[[[[..))))..]]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00571
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGACCUAUUUUGCGACUCAUCUAGCGGAUGUAAAACGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAAUUCUUACGCAGUAGCUGCCUAAAAACCAGCCUGUGUGAUCAAUAACAAAUUGCUUGUGUUUGUUGAUUGGUCUUAUUGUUAACAAGCUACGUUAGAACUGAGUCAGGCUGUUCUAAAAGAGUUCUACUGACUCGCAUCGUUAGAGUUUGAGUUAUGUAUUGUAACGGUGUUAAAUAAACACAUAACCUAUAGUUGUAGACAAAUGGGUUAGCAGAUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..(((((((((..{{{)))).....}}}....................................(((...((((.........))))...)))((((((.(((((((.<<<<<<)))))))..)))))).........>>>>>>....(((((((..[[[[[[...)))))))..........]]]]]].(((((((((.(((....aaaaaaa))).))))))))).........AAAAAAA....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((....(((((((((.......((((..[[[)))).....]]]............(((((.....[[[[[.........))))).((((.........)))).]]]]]((((((((((((((.[[[[[[))))))).))))))).........]]]]]]....(((((((.[[[[[[[...)))))))..........]]]]]]](((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]((((....))))..)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00576
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUGUUUUGCGUCCCAUCGGCAGAUGUAAAUUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAACUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCUAGCGUGACUUCUACAAGAUUGCUUGUGUCCUGUUAGAAGUCUCAAAAUAGCAAGCUACGGUUACGAAAUUGUCUAGUUUCGUGACAAGAGAUUGAUAGACUCGCAAACUAAUGGCUUGAGUUAUGUGUCUUUAGUUUGUUAAAUGAAGACAUAACCUAUGGACGUAGACAAAUAUGUUGGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[)))).....]]]]...................................((.(((((((.........))))))).))((((((.(((.(((.aaaaaa))).)))..))))))........AAAAAA....(((((((((..<<<<<.)))))))))..........>>>>>..(((((((((.(((....{{{{{{{))).))))))))).........}}}}}}}....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((....((((..[[[[[[....((((....)))).....))))..............]]]]]].............(((((..(((((.........))))))))))((((((((...(((.[[[[[[)))....))))))))........]]]]]]....((((((((((.[[[[[))))))))))..........]]]]]..(((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]].....((((((......))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00579
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAGCGGAUGUCGAGGCAGGGGAAGCGUGUCGAGGAAGCGGCCACGAUCUCGUUAACCACAGGCCGAAAAAAAUAAUCGCCAAUUCCAAGAGCGAUUCUCCGCAGCAGCAGUUCUCCCUCGCCGCCUGAUCUCAGGUAGCGACGAGACUGCUCCUGCACUAAGGAGUGUCAGCCCGGGGCUGUUCCCGACCCGGAUCCUGGCAUCAGCUAGGGGACUAAACCUUGAUCCCGGUCACGGGGUGAAGAGGGAAAUCUAACAGUGACUGGGCCCGUCGGCGACUUGUUCGCGUGAUCGCCGGGGCCGAGAAAAUCACAGCGAACUCCCCGGCUGACAGCGCGGGCGAGCACGGCGCGCCGGGUGGCGGGAUGACCGCACUCCCCACGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((...........(.(.(((........(.(.(.(......((.(((((...{{{{.....)))))..........}}}}..............................(((..(.....(......(.(.((((.((((((..)))))).)))).).)......).....)..)))..((((((.(((((...[[[[[[..)))))...)))))).......]]]]]]....(.((...((<<<<<<<..))...)).)............>>>>>>>(((((..((((((...aaaaaa....)))))))))))............AAAAAA....))........).).).)........)))).).(..(.........)..)..)))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((((.....))))))))).(((((.((((((((......((((((((....)))........)))))..........(((((..........(((...((((((((.((((((.(((..((((..((((....))))..)))).))))))))).)))).....))))((((((((.((((..((((....(((...(((((((....)))))))........(((.((((((....)))))).))).)))..........((((...(((((..((((((.(((......)))))))))))))).......))))...)))).)))))))))))).))).)))))...))))))))......((((.....))))..)))))....
|
|
TMR_00580
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCUUGUUUUGCAACCCAUCGGCAGAUGUCAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAAUUCUUACGCAGUAGCUGCCUAAACACCAGCCUGUGUGACUAAUAGCAGAUUGCUUGUGUUUGCCUAUUAGUCUUAAAAUCAGCAAGCUACAUUAGGUUGCAGUCAGGUCAGCCUAAAAGAGAUUUACUGACUCGCAAGAUUUGGGCUUGAGUUAUGUGUCGAGGUCUUGUUAAACCAAUACAUAACCUAUGGUUGUAGACGAAUAAGUUAGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUAG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[))))......]]]]...................................(((...((((.........))))...)))((((((..((((((.<<<<<<))))))...)))))).........>>>>>>....((((((((.aaaaaa..))))))))..........AAAAAA.(((((((((.(((....{{{{{{{))).))))))))).........}}}}}}}....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((............((((((........))))))(((((((((....((((.[[[[.....))))......]]]].(((((...................))))).((((.....[[[[))))..]]]]((((((((((((((....[[[))))).)))))))))................]]](((((((..[[[[[[[[[)))))))....]]]...]]]]]].(((((((((........[[[[[[[[[..))))))))).......]]]]]]]]]....)))))))))...................(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|
|
TMR_00581
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCUUGUUCUGCAACUCAUCGGCAGAUGUAAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAACACUUACGCAUUAGCAGCUUAAUAACCUGCCUGCGUGACCAGUCGCGAAUUGCUUGUGUUUGCUGAUUGGUCUUAAAAUAGCAAGCUACGUUGGGAUUGAGUCAGGCAGUUCCAAAAGAGAUUUACUGACUCGCUUGGUCUAGGUUUGAGUUAUGUAUCGAGUUCAAGUUAAAGUUAAAGCAAGACAUAACCUAUGGUUGUAGACGAAUAAGUUAGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCAGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[))))......]]]]...................................((.(..((((.........))))..).))((((((..((((((.aaaaaa))))))...))))))........AAAAAA....(((((((((<<<<<<.)))))))))..........>>>>>>.(((((...(.(((....{{{{{{{)))..)..)))))...............}}}}}}}....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((((((........(((((......[[[[[..)))))..]]]]]((((.......((((((....)))))).......)))).......(((((...((((.........)))).)))))((((((((((((((.[[[[[[)))))).))))))))........]]]]]]....(((((((((.......)))))))))...(((((...[[[[[[....)))))......]]]]]]....))))))))........(((.(((((....((((((...)))))).(((......)))......))))).)))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00584
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUAUUCUGCGACUCGUGUGGCGACGUUAACGCUCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACUAAUUCUUACGCUGUAGCAGCCUAAACACCUGCUCGCGUGACUUCUAGCAGAUUGCUUAUGUUUGUUUAGAGGUUUUAUUGAUUUAUAAGCUACGUUCGAUCAUUGCCUAGCUGGUCGAAAAGAGAUUUAUAGGCUCGCAUAUAGAAGGCUUGAGUUAUGUGUCGCCUAUCUGUUAAAUGAAAGACAUAACCUAUGGUCGUAGACGAAUAUGUUGGCAGAUGCUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((..<<<<)))....>>>>....................................((...(((((.........)))))...))((((((.(((((((.aaaaaa)))))))..))))))..........AAAAAA....((((((((..{{{{{..))))))))..........}}}}}..(((.((((..(((....[[[[[[[)))..)))).)))..........]]]]]]]....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((....(((((((((((((((......((((((.(((((.....)))))((((((((......(((....))).((((((...(((((.........))))).))))))((((((...(((((...((((..(((((.(((((.....))))).))))).)))).)))))...(((((...((((.......))))..))))).......)))))).....))))))))))))))....((((........)))).........))))))...)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00586
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUUACGGAUUCGACAGGCACUAUGAGGCAUGUUUUGCAACUCAUCGGCAGAUGUAAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAACUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCUAGCGUGACUUCUUCAAGAUUGCUUGUGUCCUGAUAGAAGUCUCAAAAACAGCAAGCUACGACUAAAGCCUUGUCUAGAGCCUUAGUAAGAGAUUUAUAGACUCGCUAAGUAAUGGCUUGAGUUAUGUGUCCUUACUUAGUCAAAACAAGACAUAACCUAUGGUUGUAGACAAAUAUGUUGGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCAGCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[))))......]]]]...................................((.(((((((.........))))))).))((((((.(((.(((.<<<<<<))).)))..)))))).........>>>>>>....(((((.((...{{{{{..)).)))))..........}}}}}..(((((...(.(((....aaaaaaa)))..)..))))).........AAAAAAA....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((((((....(((((.(((((((........[[[[.))))))))))))............]]]].................(((((..(((((.........))))))))))((((((((((.(((.[[[[[[))).))).))))))).........]]]]]]..........((((((((((.((((..((((((.(((.(((((.(((((((.....))))..)))))))).)))))))))..(((.......))).........)))).))))))).......))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00587
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUACGGGUUCGACGGCAAGAGCAGGCAAAGGGAAGCAUGCCGUAGAAGGCCACUACGUAAAAAACCAAAACAAAACAAUUCCCGAACGCGAAAUCGCUCUCGCUGCUUAAUUAACGCAGCGACGUCCUACCCGGUUUGCCUGUAGGCUGGGAUAGGGCGUAAGACAUACAGGAUAGGAGGUUGCCAACCUCCCCUGAGGUAACCUCCGAAACUCUACGGGGAUAGCUUCUCUCCUCCUGCCUGUGGGAAAGAGAGAAGCGAAACUCAAACACAGGCUAAGCAUGUAGAUGCCCUACUGCUUAGGCUCUUGUCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGCCUCCACUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((((((((.((((.(.((((((((((..<<...))))).......>>.................................(((((((.........)))))))(((((..(((((((..aaaaaa)))))))...))))).......AAAAAA...((((((((((....{{{{{...))))))))))..........}}}}}..((((.(.(..(((.[[[[[[[)))..).)..))))..........]]]]]]]...)))))....).))))..)))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((((((((.((((..(((((((((((.......)))))....................(((((((...(((....)))(((((((((.........))))))(((((((((((((((((....))))))))).)))))))).)))......(((..((((((((((............)))))))))).....))).))))))).(((((((((.(((((....)))))..)))))))))....................)))))).....))))..)))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00588
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUAAUGGUUUCGACGUGUUGGUGAAUCCUUCACCGUGAUUCAGGCCGAGAGGGAGUCCACUCUCGUAAAUCCAGGCUCAACCAAAAGUAACUGCGAACAACAUCGUUCCUUUCGCUCGUAAGGCUGCUCCUGUAGCUGCUUAAACGCCACAAACUUUCUGGCUCGAGCGUCUAGUCGUAGACUCCGUUAAUACGCCUAGACUUAAACCCCCAACGGAUGCUCGAGUGGCGGCCUCAGGUCCGUCCUCUCGCUAAGCAAAAACCUGAGCAUCCCGCCAACGGGGAUAAUCGUUGGCUCCCGCACAGUGGGUCAACCGUGCUAAGCCUGUGAACGAGCGGAAAGUUACUAGUCAAUGCGGACAGCGGUUCGAUUCCGCUCAGCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(...(((..(..(..((((((((((((..{{{{{...)))))........}}}}}..........................(....(.(.((...((((................))))...)).).)....)............((((((.((((...[[[[[[..)))).))))))..........]]]]]]....((((.((..(.<<<<<<<.)..)).))))..........>>>>>>>.(((((..aaaaa)))))...AAAAA((((..bbbb...)))).....BBBB...)))))..))..)..)..)))....).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.............(((....[[[[[[...)))...]]]]]]...((((((.[[[[[..))))))........]]]]].......(((((((..((((......)))).((((((((((..((((((....))))))........((((....[[[..))))..]]].((((((........[[[[[[.......))))))..........]]]]]].....(((.(((((.[[[[[[[)))))..)))...........]]]]]]].((((.[[[[[[[[))))..]]]]]]]]....((((...[[[[.....))))...]]]]....))))))))))))))))).(((...[[[))).............]]].)))))))....
|
|
TMR_00594
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGCAAUGGUUUCGACAGGUUGGCGAAAGCUUGCCCGUGAUACAGGUCGAGAGUGAGUCUCCUCUCGCAAAUCAAAGGCUCAAAAAAAAGUAACUGCGAAUAACAUCGUCAGCUUCAAACGGGUAGCCAUAGCAGCCUAGUCUGUAAAAGCUACAUUUUCUUGUCAAAGACCGUUUACUUCUUUUCUGACUCCGUUAAGGAUUAGAGGUUAACCCCAACGGAUGCUUUGUUUGGCUCUUCUCUAGUUAGCUAAACAAUCAAGACUCAGACUAGAGCAUCCCACCAUCAGGGAUAAUCGAUGGUCCCCGUCCUAGGGCUAGAAGGACUAAACCUGUGAAUGAGCGGAAAGUUAAUACCCAGUUUGGACAGCAGUUCAAUUCUGCUCGGCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(..((((.((..(.((.((((((((((.{{{{{{...))))).........}}}}}}.........................(..((..(.......((((.(...........).)))).......)..))..)................((((((..(((...[[[[[[..)))..)))))).......]]]]]]....((((((((((...bbbbbbb.))))))))))...........BBBBBBB.(((((..aaaa.)))))....AAAA(.((..<<<<<..)).)...>>>>>...)))))...)).)..)).))))...)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((...(((.[[[[[[[.(((.(((....))).)))))).......]]]]]]].(((((((....[[[[[......)))))))............]]]]]........(((((....(((((((((((....((((......))))....)))))....((((....))))))))))[[[[[[...)))))(((.....)))..]]]]]].................((((((((((...[[[[[[[[))))))))))..........]]]]]]]]..(((.[[[[[[.)))......]]]]]](((.[[[[[.))).....]]]]].............((((((((..............((((((....))))))))))))))))))))....
|
|
TMR_00596
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGCAACGGUUUCGACAGGUUGGCGAAAGCUUCCACUGUGAUGCAGGUCGAGAGUGGGUCUCCUCUCGCAAAUCAAAGAUCCAAACAAAAUGUAACUGCGAACAACAUCGUUCCUUUCGCUCGCAAAGCUGCUGCUGUAGCUUAAUAAGAACACCUUAACUUAGGUUCGAGCAUUCAUAAUUCGACUCCGUUAAGGAUUAUGACUAAACCCCCAACGGAUGCUCUCUAGGAAUACAUCUGGUUUGCACUAGAGCUAAGACUAGACCAGAGAUUCUUGGCGACUCGGAACAAGCAGUCGUUCCCGUUCUGAGGAUUAGAAGAACUAAACCUGUGAAUGAGCUAGGGGUGAAUACCCAGUUUGGACAGCAGUUCGACUCUGCUCGGCUCCAUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(....((((....(.((.((((((((((.bbbbbb...))))).........BBBBBB...............................(.(...(...((...............))...)...).)...................(.(((((((((...[[[[[[..))))))))).)........]]]]]]....((((((....(..aaaaaa)....))))))..........AAAAAA...(.(((..{{{{))).).....}}}}((((..<<<<<..))))....>>>>>...)))))...)).)....))))....)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((..[[[....)))).((((...(((....)))....))))..]]].....(((..[[[[[[[.)))...........]]]]]]].......(((......[[[[.)))..]]]].....(((((..(((((((....))))))).........((((......)))).)))))..(((((((((...[[[[[[..)))))))))..........]]]]]].....(((((.......[[[[[[[[...)))))....]]]]]]]]...(((.....[[[[..)))(((((........)))))(((((..(((.((((.....)))).)))..))))).]]]].((((....))))...(((((.[[[[[)))))..]]]]]...........
|
|
TMR_00599
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUACGGUUUCGACGGGGAUAGUUGAAGCUGUAGAAGCGUACCGAGGUUCCUACAGGCCUCGUUAAACAGGUAGGAAAACAAUACUCGCAAACGACUACGAGUACGCAUUAGCCGCUUAGUCGGCUAACGUUCUUUCUGAUUUUUCCUGUCGGAUCAGAGGGGGCGUAAUUUCAGGCAGGAUAGUCCUAACCUUUUCCUGUGGGGAACAGGGCGAAAUUCACAUGGGAUAGCAAUCAGUAAAGCCUGCCUUUGGGCGUUACAGAGUGCGAAUGACAAAACAAAGGAUACGUACGUAGAAACUGCAGUGGAAUAUUUUCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(...(..........((((((((((<<<<<<<...)))))........>>>>>>>............................(.(.(....(.........)....).).).(((.............[[[[.[..)))....].]]]].........(..((....(((.a..aa...)))....))..)...........AA..A...((.....(.(((..{{{{{{)))..).....)).............}}}}}}....)))))............)..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((.......)))))))))))))..(((...(((((((......)))))))........[[[[............)))......]]]](((.......[[[[[[)))...]]]]]]((((((((((((((((........))))))))))))))))........((((((..[[[[[.......)))))).......]]]]]..........(((((..(((....((((.((((.[[[[[)))).))))....)))............]]]]]........((((...)))).(((........[[[[[)))...]]]]].))))).)))))))....
|
|
TMR_00600
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACCGGUUUUGACAGCGGGCAGAAGUGGUUUGUAAGCAUGCAGUGCGUCGUUGGCCGGCACUUUAAUCUCGGUUGAUCCAAUUUUAACUGGCGAAAAUAACUACGCUCUCGCUGCUUAAUCGAAGCACAGUAGAUUGAAGCUUAAUCCUUACACAAGGUGUUUGGACGAGACAUCACCCGGAAGCCGUGGCUUCGAGGCAAUCCGAACCGGUGGUGCAGAAAUGUCGGAGAUAGCUUGACGGAUGUCCCGUACGGCAAGUGAAAAUUCAGGGAAUAAGGUUGCGGUGGGUGGCUUCGGUCUUGCCGCAGCACGAAAAUGAAGGCGAAGAUAAGCAUGUAGAAAGCAAAUUAGUUCCUCGUUUGGACGAGAGUUCGAAUCUCUCCAGCUCCACAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((..((..(((.((((((((...((((((((((...aaaaaaa.)))))........AAAAAAA.............................(((((..((((((((.(.......).))))).)))....(((..((((...))))..))))))))((((((.((((.(((....{{{{{{)))..)))).....))))))........}}}}}}...(((((.((.((.[[[[)).)).))))).........]]]].(...(((((((((((...<<<<<..)))))))))))...).........>>>>>....)))))......)))))))).))).))..)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........((((((...[[[[[[........((((...)))).)))))).....]]]]]].(((.[[[[[)))........]]]]]((((......[[[[....))))(((((.....)))))..]]]]............(((........[[[[[[[)))..]]]]]]].(((....(((.....[[[[.)))....]]]](((..[[[(((....)))))).....]]]..((((.[[[[))))..]]]]............)))......((((((((((....[[[[[...)))))))))).......]]]]]..(((..(((...(((.....)))..))).)))...((((((((....)))))))).....)))))))....
|
|
TMR_00601
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUGGUUUCGACAUUUAAACACUAUUUCUAUAUGUCAGGUCAAAGUUUGUAUUCUUUGUAAAAAAUACUAAAUUAUUAAUAAAUGCUAACAAUAUAAUGCCUUUUAUGUUUAACGUAGUAAAAACAAACCGUUCAUUAACUACUUUAAAUUUCGCUGUUUAAUCACUUAACUUAGGUUAUUAAAUAUUUUUUCAUUAUUGCUAGACUUUUAUCUAGUAUAUAGUUUAGAAUAAGUUUAAAUUUUAAAAAUUGUUCAAGUUUUUUGAACUAAACCUGUAAAUGAGUAUAUUAAUAAACUUUAGAUGGACAUGGGUUCAAUUCCCAUCAGCUCCAAUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.......(.(((.((((((((((((([[.[[[..))))).......]]].]]........................................................................................................................................................................................................)))))...))).))).).........))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((....(((((..(((.....)))....)))))...)))))..........(((....)))...((((((((((((((..((((...(((((((......)))))))....(((((...(((.....))).....)))))............((((((((.(((((...))))).))))))))......((((..(((((((......)))))))(((((((((((((........))))))))....(((((((...))))))).....))))))))))))))))))))))..))))).......((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00603
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUGGUUUCGACAUUUAAAACUUCUUUCUAUGUGUCAGGUCAAAGUUUGUAUUCUUUGUAAAAAAAUACUAAAAUACUAAUAAAUGCUAAUAAUAUAAUACCGUUUAUUUUUAAAGCAGUAAAAACAAAAAAAGAAGCAAUGGCUUUAAAUUUUGCUGUAUAGUUCAUUAACUUAGGUUAUUAAAUAUUUUUUCAUUAUAACUGGACUUUUCUCUAGUUUAUAGUUUAGAAUAAAUUUAAAUUUUGCAAAACUCGUUCGAAAAUUUUCGGGCUAAACCUGUAAACGCAAAUACUAAGAAAUUUUAGAUGGACAUGGGUUCAAUUCCCAUCAGUUCCAAUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((......(.(.((((((((((((((([[.[[[..)))))........]]].]]...........................................................................................................................................................................................................)))))...))))).).)........)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((....)))(((((((((.(((((....((((((((((...(((((........(((((((....((((.......((((((((...............))))))))......(((((((((.........(((((....)))))...))))))))).))))....((((....))))(((((((((((...((((((((((((......))))).)))))))..)))))..)))))).)))))))))))).(((((((....)))))))...)))))...)))))......))))).))))))))).....(((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00604
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAAAGGGCUCGACGGGGAUAGGUAGGAUUAAACAGCAGGCCGUGGUCGCACCCAACCACGUUAAAUAGGGUGCAAAAACACAACUGCCAACGAAUACGCCUACGCUUUGGCAGCCUAAGCGUGCUGCCACGCACCUUUAGACCUUGCCUGUGGGUCUAAAGGUGUGUGACCUAACAGGCUUUGGGAGGCUUAAUCGGUGGGGUUAAGCCUCCCGAGAUUACAUCCCACCUGGUAGGGUUGCUUGGUGCCUGUGACAAGCACCCUACGAGAUUUUCCCACAGGCUAAGCCUGUAGCGGUUUAAUCUGAACUAUCUCCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(.(((((((((.(((((((((((..[[[[[[..))))).......]]]]]]..................................(((((((........)))))))((((((((((.((((.{{{{{{)))).)))))))))).......}}}}}}..((((((((((((..aaaaaaa))))))))))))........AAAAAAA..(((.((.((((((..<<<<<<<.)))))).)))))..........>>>>>>>...)))))...).))))))))).).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((...(((((((((.......((((((.[[[[[[.)))))).......]]]]]]..........(((((((....[[[[[.......))))))).....]]]]]....(((((((((((((((((.......))))))))))))))))).....((((((.(((((((((((((((.....)))))))))))))))................[[[[[[[.[[[[[..))))))..]]]]]]]]]]]]...........((((((...))))))....)))))))))...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00605
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAAACGGCUUCGACGUCCUAGUGAAAGUUGGGCUGUGAUGCAGGUCGAGAGUGGACUAUCUCUCGUUAAUCCAGAGUCCAAGCCAAAAGUAACUGCGAACAACAUCGUUCCUUUCGCUCGUAAAGCUGCUGCGGUAGCCUAAGACCUCUAAACAGGUUCGAGCACUCGUUGUCCGACUCCGUUAAGGGCAGCGGGUUAACCCCAACGGAUGCGCUAGACAGUUCUCUCUGGUGGGCUGUUUAGCAAAGACUCGACCAGAGCAUCCUACUGUUCGGGAUAAGGAACAGUCCCCGCCUGAGGGUCAAAAAGGCUAAGCCUGUGAAAGAGCAGUCGAUGAAUAGCUAGGGCGGACACGGGUUCGACUCCCGUCAGCUCCAUUA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(..(((((....(..(.((((((((((.[[[[[[...))))).........]]]]]]...........................((..((..(....(.(.((((......)))).).)....)..))..))........((((((.((((...bbbbbb..)))).)))))).......BBBBBB...((((((((((((.<<<<<<<)))))))))))).........>>>>>>>.(((((..{{{{{)))))...}}}}}(.((..aaaa...)).)....AAAA...)))))...)..)....)))))...).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((...........(((((((((.....(((((((.....[[[[..((((((........)))))).........)))))))...........]]]]((((......)))).....(((((....(((((....)))))....(((((......))))))))))(((((((((((...........)))))))))))....(((...((((((((((((((((((........))))))))))))...............)))))).[[[[[[[))).....]]]]]]].(((..[[[.)))(((...((((...)))).))).....]]]..........)))))))))....((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00606
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAUCGGUUUCGACUUCGAUGGUUGUUGUAGGGGAAGCGGGCCGAGGAGAGCGGACGCAGCCUCGUUAAAAAUGCGACCGCGAAAAAAUAAGUGCCAACUCUAAGCGCACUGAGUUCGCUCUCGCUGCUUGAUCGAGAGUGACUCUGUCGGCCUGGGAGCGUCUCCGACCCAGUGUCCGGCAUCGUUGAGGAGACUUGCCGGUCAGAUCAGGCCACAGGAUCUGACUGGGACAUGCUCUGUGGCUGGGCCUGUCGGCGACUUGUCUGCGUGAGCGCCGGGGCCGAGGAGAACGCUGAGCAGACUGCGCCCGGAGAAGCCCUGCUGCAGCAUCGAAGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCACCUCCACGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((((.(.((.((((((....((((((((((...[[[[......)))))............]]]]..............................(((((.(((((((.........))))))))))))((((((.(((((...{{{{{{..)))))...)))))).......}}}}}}....((((((((((.<<<<<<<.))))))))))..........>>>>>>>.(((((..(((((....aaaaaa.aa..))))))))))...........AA.AAAAAA...)))))......)))))).))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((....)))((((((((......((((((...((((..(((((........[[[[.))))).......]]]].))))....................(((((.....[[[[.[[[[[[[[..)))))..]]]]]]]]]]]]((((((.(((((...[[[[[[..)))))...)))))).......]]]]]]...((((((((((..[[[[[[[[[)))))))))).......]]]]]]]]].((((((((...)))..[[[[[[...[[[[...)))))........]]]]..]]]]]]..............)))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00609
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAACGGGUUCGACGGGGAUGGAGUCCCCUGGGAAGCGAGCCGAGGUCCCCACCUCCUCGUAAAAAAGGUGGGAACACGAAUAAGUGCCAACGAACCUGUUGCUGUUGCCGCCUAAUAGAUAGGCGGCCGUCCUCUCCGGAGUUGGCUGGGCUCCGGAAGAGGGCGUGAGGGAUCCAGCCUACCGAUCUGGGCUCCGCCUUCCGGCCCGGAUCGGGAAGGUUCAGGAAGGCUGUGGGAAGCGACACCCUGCCCGUGGGGGGUCCUUCCCGAGACACGAAACACGGGCUGCGCUCGGAGAAGCCCAGGGGCCUCCAUCUUCGGACGGGGGUUCGAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((((((.((((((((...((((((((((..aaaaaaa)))))......AAAAAAA..................................((((((((.....))))))))((((((.(((((((..<<<<<<<))))))).).))))).......>>>>>>>..((((((((((((..[[[[[[[)))))))))))).........]]]]]]](.(((((((.(.(.(...{{{{{{{.).).).))))))).)........}}}}}}}...)))))......)))))))).)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........(((((((((((.((((((((........(((((..[[[[[[[)))))......]]]]]]]..(((......)))..((((..[[[.....))))((((((((.....))))))))((((((((((((((((.....)))))))).))))))))..]]]..((((((((.((((((((((((.........))))))))))))..)))))..)))..(((..[[[.)))....]]].(((((((.((((....))))[[[........)))))))....]]].......)))))))).)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00610
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACUGGAUUCGACAGGGCCGUAGGUGCGAGGAUUGCAGGUCGAGGUCGCCCACGAACUCGUAAAAAGGGGCAGCCAAGUAACUGGCGAGCGCGAACUCGCUCUGGCUGCGUAAUUCACGCAGCCACGUCUGCCCGGACCCUUCCCUGGUGGGUUCGGAGCGGGCGCCGCAAGACCGGGGUGCCCCUGGCCCAAGCGCCGGUGCGGGCCAGGUCAAGCGUGAUCCGGCUCGGCUGACCGGGAUCCUGUCGGUGGGAGCCUGGCAGCGACAGUAGAACACCGACUAAGCCUGUAGCAUAUCCUCGGCUGAACGCUCUGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........((((((..(.(((.(((((((..(((((((((...[[[[.....)))).......]]]]...............................(((((((((.....)))))))))(((((..((((((((..aaaaaaa))))))))...))))).......AAAAAAA....((((((((..<.<<<<<...))))))))...........>>>>>.>.((((.(((((.(((.{{{{{{{))).)))))))))..........}}}}}}}...)))))......)))))))))).)..))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...........((((((........((((((((((((((...(((((((.(((....)))....(((((((..........(((((((((......)))))(((((((((.....))))))))).((((((((((((((.........)))))))).))))))))))...........)))))))))).........((((((((((.(((((....))))).))))))((((.(((((.((((......)))).)))))))))..........))))))))..)))))))....))))))).......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00611
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUGUUGGUUUCGACGGGGGCGGUCGAGGUAAAAGUAGCGAGCCGAGUUCUCCACCAGCUCGUAAAAAAGGUGGAAAAAAAUAAACGCAGACAGAGAACUCGCUUACGCUGCCUAAUUAAAGGCGGCCGUCCAGCCUGAAAUGCCCACGUUUCAGGACUGGGCGUCAAAAGAGUGGGGAACUGGUUUUGCCUGCGCCUCGGGGCAAAACCGGAAUAAUGAGGCUACCGAAGCGGUUAUCCUGUCGCUGGGAGAACCGCUGAGGGAAAGCUAAAACAGCGACUGCGCUCGGAGAAGCUUUUACCGGGACGCCUUCGGACCGGGGUUCGAAUCCCCGCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(...(((((((((..((((((((((..{{{{{{.))))).......}}}}}}................................(((((((......)))))))(((((((((((((((.[[[[[)))))))).)))))))........]]]]]...(((((((((((...<<<<<<.))))))))))).....>>>>>>..(..(....(.(.(...aaaaaaa).)....)..)..)............AAAAAAA...))))).....)))))))))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((..((((....((((((((.....(((((((((......((((((..((((((.............))))))...........((((........(((((((..(((((((......)))))))((((((((((((((((....))))))))).)))))))......)))))))...((((((((((((........))))))))))))........((((.....(((((((.((((......)))).))))))).......))))..........))))))))))....)))))))))....)))))))))))).(((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00612
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAAACGGUCUCGACGGGGGUCGCCGAGGGCGUGGCUGCGCGCCGAGGUGCGGGUGGCCUCGUAAAAACCCGCAACGGCAUAACUGCCAACACCAACUACGCUCUCGCGGCUUAAUGACCGCGACCUCGCCCGGUAGCCCUGCCGGGGGCUCACCGGAAGCGGGGACACAAACCCGGCUAGCCCGGGGCCACGCCCUCUAACCCCGGGCGAAGCUUGAAGGGGGCUCGCUCCUGGCCGCCCGUCCGCGGGCCAAGCCAGGAGGACACGCGAAACGCGGACUACGCGCGUAGAGGCCCGCCGUAGAGACCUUCGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(.(.((((.((((.((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>...............................((((((........))))))(((((.((((.((((..[[[[[[))))..))))...))))).......]]]]]]..((((((((....aaaaaaa..)))))))).........AAAAAAA...((((((((.(((.{{{{{{{)))...))))))))...........}}}}}}}...)))))....)))))))).).).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((....((((((.((((((((((((((((((((((((..(((......(((((((............)))))))..((((....))))...........)))..((((((........))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..))))))........((((.....))))))))))))))))...((((((((...)))))..))))))...((((((((.(((((....)))))...))))))))...((((.....(((.....)))))))...))))).)))).)))))).......(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00614
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAAAGGACUCGACGGAGGUAGUGAGGGCUAAGCUGCAUGCCGUGGUUCCUGCCACCACGUAAAACAGGUAGGGAAAACACAACUGCCAACAACGAAUUGGCACUCGCUGCUUAAUUAAAAGCAGCCGUCUUCCCAAGUUCUGCUCUGAGGCUUGGGCAAGGCGUCAUAAAUCAGAGCUAUCCUAAGGCACAAACCCGAUGCCUUAGGGAGAGCUAAGGGUUGUAGGAGCUUAGAGAGCCUGUGGAAGGGCGAGCUAACUUCCGAAUCCUAAAACUUCCACUAAGCAUGUAGAUGCUUAGAAGUAGCACCUUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((..(.(...((((((..((((((((((.aaaaaaa.))))).......AAAAAAA................................(((((((......)))))))((((((.((.((.((.<<<<<<<)).)).)).)))))).......>>>>>>>..((((((((((..{{{{{..))))))))))........}}}}}.(.((((.((((...(((.[[[[[[[)))...)))).)))).).........]]]]]]]...))))).....))))))...).).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((......(((....)))(((((...[[[...)))))..]]](((.((((((((.............))))))))...)))...((((((.......))))))...(((((((......)))))))(((((((((((((...[[[[[[[.))))))).)))))).......]]]]]]]..((((((((((..[[[[[..))))))))))........]]]]].(((((..((((...((((......))))...))))..[[[[[[)))))..(((((...(((((((....))))))))))))......]]]]]].(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00615
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGCACUGGUUUCGACGGGGAGUACAAAGUUUAGGAUGCAUGUCGUGCCUGAAUGAUGCACGUAAAUCUUUAUUUCAAUUUGUUAUAGUUGCAAACGACGAUAACUACGCUCUAGCGGCUUAAUCCCGCUAGCGCAGACUGGGACCGUUGUUCGUGGCACCCAGCUCUGUGUCGACUCACACGGAAUCGUCGGGUCUUAUGUGUUUGGAUAAGACUUGACUAAACUUAACAAACUCGCUUAAUGUGAUCCCUGCUGGCCGGGCAGCAUUAAGUUAAAAUAAUAGACCAAAUAAACAUGUAGAGUUUUAAAUGGAGGCUUCUCGGACGGCGGUUCGACUCCGCCCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((((((((.((((((((((..<<<<<..)))))........>>>>>....................................(((((((.......)))))))((((((.((..((..[[[[..))..))......)))))).........]]]]..(.(((((((((((({.{{{{{.)))))))))))).).......}}}}}.}(((((......(((....aaa.a)))......)))))..........A.AAA.....)))))....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((.......)))(((((....((((((((((......(((((.........)))))...)))))...........(((((.((((....)))).)))))......(((((((.......)))))))...))))).(((((((((((((.(((..(((..(((((((......)))))))...((((((((((((........))))))))))))..........(((((((((((((((...(((........)))..)))))))))................(((....))).))))))....)))..)))...))))))))))))).)))))...)))))))....
|
|
TMR_00616
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGCUUCGACGUGGGUCGCAAAGCAGCGUAGGGCAUACCGAGGGUCAGAGCACCUCGUAAAUCCAACUGAAAAACUUUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCCCUGGCCGCUUAAGGUCCAGGACUCACACUAGCCUGUUCAUGGGCUAGGCCGGGUCAAACCGGCAGUGAGUUAAUUCACAUGAAAUCGCGCUUGUCCGGGUCGCUUGGGCAGGUGCUAAAUCCAAGGCGGCUCGGCGAAAUCCAGCCUGUUCGGCGGGCGUGAUGGAGCUUAAAGCUUAAAAACACCGGACUAAGUAUGUAGAACUGCCUGUAGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((.<<<<....))))).........>>>>................................(....(.(.........).))((((((.((((((..aaaaaa)))))).((((.(..).))))..)))))).......AAAAAA...((((((((((.{{{{{{{{))))))))))........}}}}}}}}.(((...(((...((.[[[[[..))....)))...)))...............].]]]]...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((.((((((((....))))..))))((((((((((....(((((.........)))))..................(((.((((....)))))))......))))))..))))..)))))...(((((((.(((((((......)))))))(((((......))))).)))))))..(((....)))...(((((((((((((...))))))))))))).............(((((.((((.[[[......)))).)))))(((...(((((...))))).....))).]]]................((((.....))))...((((.[[[[[))))...]]]]].))))))....
|
|
TMR_00617
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACAGGGAUUCGACACGGGGCAAGGGAUGGGGUGCCAUGCCGAACAGCCCAACGUUAGGGGCACGAAAGGUGCACCAAGUAAUAGGUUCACCAUUGUGGCUAACGAUUGCAUCGACGCGUUAGUCAGAAGAGCAGUGGUAUAGUGCGAAGGUACACUGAGGGACUAGGCUGACGGUCAUAGUGCGACUGUAAACAAAGCAUGUUGUGCACCCCACACCUCCCUGCUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCAUCUCCAGGC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.......((((((((((((((.(((.{{{{...))).)}}}}...............................(.(((.......<<<<<.......))).)............>>>>>....(.(.[.[[[.....).)..............]]].].((..(....)..))...)))))....)))))))).....))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((.......(((((..(((..(((((((((((((....(((((....((((...((((.....))))......)))).(((((((((((((((((((((.(((...)))..))))))))......))))))))...((((....))))......))))).)))))((((((.......)))))).......)))))....))))))))..)))))))).(((((....)))))..))))..)))))))....
|
|
TMR_00623
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUCCGGUUUCGACCGGAAAGACGGAGGCUUAAGCUGCAGGCGGAGUGCCGAUCUCCUGAUUCGGCAAACACUAUAACUGCCGAAAAUAACGACAGUUUCGAUUACGCCUUAGCUGCAUAAUCGCGGAAUCUGCUUUGCACUGCUCCGAGCGGGGCAUGAUUCCGACGCCAAUCGGGGCUUGCUUUUUAGCGGCGUGUAAACGUUAAAAGGGACUUUUUUUACACUAAGGAUUCGACGCUUUCGGUGCUGCUACCGGAUCCCUACAACCACCUCGCACCGAUAAGCCUGUAGACGCUUCUGAUUCCCUUUUCGGGACGGGGGUUCAAUUCCCCCCAUCUCCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..((((.(..(((((.(((((((((.[[[[[.))))....]]]]].................................((((((.((.......)).))))))((((((.((((((((...<<<<<<<)))))))).).))))).......>>>>>>>...((((((((((..{{{{{{{)))))))))).......}}}}}}}((.(((((((..(.(.aaaaaaa.).)..))))))).))..........AAAAAAA...)))))...).))))..).))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((....)))))))...(((((((.....((((((((((((.......))))...(((((((...........)))))))........(((((.[[[[[[......)))))..]]]]]](((((((((((((((...[[[[[[[)))))))).))))))).......]]]]]]]...((((((((((..[[[[[[[)))))))))).......]]]]]]]...((((((.......[[[[[[[.......)))))).............]]]]]]]...))))))))..)))))))..((((.....)))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00624
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACUAGGUUUCGACUAGGGAUGUGGGGUGUUGCGCUGCAGGUGGAGUGUCGAUCUCCUGAUUCGGCGCCUUUAUAACUGCCAAUUCUGACAGUUUCGACUACGCGCUCGCCGCGUAAUCGCGGGCCUGUGUUUGCGCUGCUCUGAGCGAACAUAUCGGCCCGACGCCAAACGGAGCUUGCUCUUACGUUGUGCACGGCGGACGUAGGGGGACUUUUGUCUGUGCUAAGACUCUGGCGCGUGCGGUGCAGGCCUAGCAGAGUCCGACAAACGCAGUACGCACCGCUAAACCUGUAGGCGCGCAGCACUCGCUCUUUAGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCAUCUCCACAA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((....((((((((((((.(((((((((.{{{{{.))))....}}}}}.............................(((.((((((.....)))))).)))(((((((((((((((...aaaaaa.)))))))))..))))))........AAAAAA...((((((((((..<<<<<<..)))))))))).........>>>>>>(..(((((((..(.(.[[[[[[[...).)..)))))))..)............]]]]]]]...)))))...).)))))))))))..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((.......)))).......(((((((((((..((((....[[[[[[[...))))..]]]]]]]......(((((..........))))).....((((((.....))))))....(((((((((((((((...[[[[[[.)))))))))..))))))........]]]]]]...((((((((((..[[[[[[..)))))))))).........]]]]]]...(((((((......[[[[[[[........)))))))...............]]]]]]].............)))))))))))............(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00625
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCAUUAACGGUUUCGACAGGGUGGUGAAAUCUGCUUUGUGAUGCAGGCCGAGAGUGAGUCUUCUCUCGAAAAUCCUGGACUCAAAAAAUAAUAAGUGCAAACAACAUUGUACCUUUUGCUCGUAAGCAAGUAGCUGCUCUAGCUUAAUUGCAAAAACACCUCUUAUAGGUUCGAGCGUCUGUGGUUUGACUCCGUUAAUAAUUGCAGACUUAACCCCAACGGAUGCUCUAGCAAUUUUUCUCUGGUUACCUGCUAGUUAAGAUUUAACCAGAGCAUCCCACUAUCCGGGAUAAUGGAUAGUCCCAGCUCUGAGGGUUAAGAAGGGCUAAACCUGUGAAUGAGUGAAGGGUGAAUAGCCAUUUUGGACAUGGGUUCGACUCCCAUAUGCUCCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(...((..((..(.((.((((.(((((.{{{{{{...))))).........}}}}}}.........................(....(((((.(.((.((...(.(.....).)...)).)).))))))....)................((((((((((....bbbbbb...))))))))))........BBBBBB....((((((..(...[[[[[[[.)..))))))..........]]]]]]].(((((..<<<<<)))))...>>>>>((((..aaaaa..)))).....AAAAA....))))...)).)..))..))....).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............(((((((((...(((.[[[[...)))..]]]].((((.[[[[[[[))))...........]]]]]]]..........................((((((((((((((..((((..(((((...)))))...))))...........(((((((((..(((((((((((.(((((...)))))...)))))))).....(((...(((((((((...((((((...(((((.....)))))..)))))).....))))))))).((((((((......))))))))...........))).........))).)))))))))))))))))))))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00626
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACUGGUUUCGACGCUGUUUGUGUACUCGUGGGAAGCGGGUCGAGGAUGCGAGGUUGUCUCGUUAACGAUCCUCGCAAAAUAUAAGUGCCAACUUAAAGCGCACUGAUCUAAGUCUUGCUGCUUAAGCGCUUAGAUCUGUCGGUAUAGGGCUUGUCUUCGGCCCUGUAUCCGGCAUGGUUUUAGAGGACUUGCCGCGUGUUUGCCGCUUGCGUGAACACCGGGACUUUAUUGCAAGCUGGGCCUGUUGAUUUAGAUUCCGCUGCAAAGAAUCAGGGCUGAGUAUAACGGUUUUAGCGGAUACACCCGUAGAAGUCACGGGCUCCAUGCCGCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCAUCUCCACUG |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((.((.((....(((((((....((((((((((.aaaaaa....))))).........AAAAAA............................((((((((...((((.....))))))))))))((((((.(((((((..{{{{{{.)))))))..))))))........}}}}}}...(((.((((((([.[[[[[[.)))))))))).........]]]]]].](((((..((((((....<<<<<<<.<..)))))))))))............>.>>>>>>>...)))))......)))))))...)).)).)))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((.((((.(((.............))).)))).)))..((((..[[[[[[[[[[[))))...]]]].]]]]]]].....(((((....)))))((((((.......[[[[[[[[.........))))))((((((((((((((((((((.......))))))))).)))))).)))))...]]]]]]]](((.((((((((.[[[[[[))))))))))).........]]]]]]..(((...........[[[[[.))).....]]]]]...((((((....[[[[.))))))........]]]]...(((..[[[))).....]]]((((.[[[[[))))..]]]]].)))))))....
|
|
TMR_00680
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGCUUCGACGGGGAGAGAGAAUUCGAGAGCGCGUGCCGAGGUCCCCGACAACCUCGCUAAUCCUCGGGAAAAAAAUCAAACGCCAACGAUAACUCGUAUGCGUUGGCCGCCUAAAGAGAUUUAGGUAGCCCGUUGGCGUCCGUGGGGCCUACAACGCGGACGCCGACGCCAUCUACAGCAGGCUAGCCGAUCACUCUUGUUCAGGGGCGGCCGGCGAAACUCUCUGAACUGGUCCAAUCCGGAUCCUGUCAGUCGGAGCUGGUGAGGAUGAGAAAGCCGUAGCAUAGACUGACUACGCACGUAGUGGUCUCGUAGGACCUAUUCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((.((....((...(.((.(((((((((({{{{.{....))))).......}.}}}}...................................(((.(((((((....))))))).)))((((((((((((((.<<<<<.<..)))))))))))))).........>.>>>>>...............((((((((.[[[[[[......))))))))]]]]]]..((((..((.((aaaaaaa)).....))..)))).................AAAAAAA...))))).....)).)...))...)).))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((.(((((((((....((((((...........((((.((((((....(((.....))).....))))))............))))..((((....))))...((((((((((((.((((((((....(((((.(((((((((((((..........))))))))))))).............)))))...)))..)))))......))))))))))))...)))))).....(((((.....)))))......))))))))))))(((((((.........(((......)))(((((....)))))(((((....))))))))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00681
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGACCCCGGUUUCGACGUGGGUUACAAAGCAGUGCAGGGGCAUACCGAGGACCAGUCACCUCGUAAAACAACUGGAAAAAGUAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCUCUAGCCGCUUAAUACCGGCUGGACGCUGCACCGAAGGGCCUUCGGUCGGGCAGGGCAACCUGCAGCAGCGUCAUAAAGAGAGGAUCGUGCCGUACCGGGUUACUUGAUACAGCAUUAAAUCCAAGGUAACUCGCCUUGCCUCAGCCUGCCGGUUGACGGUUGCAAGGUCAAAUCAAAUAACCAGGCUAAGUAUGUAGAACUGUCUGUAGAGGGCUUGCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....((((..(((...((((((((((.{{{{{..))))).......}}}}}.................................((((((((........))))))))((((((.((..(...aaaa...)..))((((....))))..)))))).........AAAA...((((.(((.(<<<<<<<<<).))).))))........>>>>>>>>>(.(((..(...(.(.[[[.[[[).)....)..))).).........]]]..]]]...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((....))))........((((((((........((((....))))..(((((.[[[[[..))))).......]]]]]..........((((....))))..))))))))(((((((((........))))).(((((((((((((((...)))))))...(((((....))))).))))))))....)))).((((..[[[[(((.((((...)))).)))........))))..]]]]....(((((((.((((((.[[[)))))).....)))))))...............]]].............((((.....[[[[....))))..(((((........))))).]]]].....
|
|
TMR_00683
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAUUCGGAUUCGACGACGGUAUCGAACCCUUAGGUGCAUGCCGAGGGCGUAGUGGUUCUCGUUAAUCAAAACACUACAAACCUAUUAGUUGCCACAUUGACAACUACUGGAAGUGCAAACGACGAGUUCUUUGACGCUCGUCUUCGUGCUUAAUCGUAGCUAAACCCUACGAGCUUCCCAGUCCGUCCGGCUCGUCUGCUGGCUGGUUUUUCGGACUGUCAUCGUAAGCGGACUCGCCACGUUCAGCAGGUCUCUGGCUGACGGGUUAAAACUUGUGGGAAUCGCGCUGCAGAACCCCGACCACUGGGUCGCUGUGGUGUUAAAUUUAAACGUGGAUCUAAGCAUGUAAAGCCGAAGGCUGAGAGCUGGCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((((.(.....(((..(((.((((((((((..{{{{{{..)))))..........}}}}}}...........................................(.(..((....(...((((((....))).........)))...)....))..).)...(((((((.((((((...aaaaa)))))).....)))))))........AAAAA(((((......(((((...<<.<<<)))))))))).........>>>>>...(((((...(.((((.[[.[[[.))))...)..)))))...........]].].]]...)))))....)))..)))....).)))).))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..(((..[[[[[))).....]]]]](((((.(((....))))))))....((((..........................[[[.[[[[[[)))).....]]]]]].]]]....(((...(((((((........)))))))....)))(((.[[[[[[.)))...]]]]]]......(((((((.((((((.[[[[[[[)))))).....)))))))........]]]]]]]..((((...........[[[[))))..((((((....))))))]]]]((((((((((((.....(((((....)))))))))))))).........[[[[[))).....]]]]]....(((..((((...))))..)))..(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00686
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGUCCUGGUUUCGACGUGGGUUCGGGACCGGUGUGGUGCAUGUCGAGCUUGAGUGACGCUCGUAAAUCUCCAUUCAAAAAACUAACUGCAAACGACGAACGUUUCGCACUCGCCGCUUAAAUCCGGUGAGCCUUGCAACAGCACGCUGAUGGGCUGGGCAAGGGGGUAGCAAUACCUCCCGGCUGCAAGGGAAUUUACAUCAGCUGGCUGCGUGCUGGGCUUCUUAGUACGUGGCAAGAUCCAAGGAAGCUGGCAUCCCGGGUAGCGUGCGCCUGCGCGACUUGGGAGGCGAGACUCAAAACAGAACGCUAAACAUGUAGAUCUGCCCGGCGAAGGCUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..(((((((((({{{{{{{..)))))........}}}}}}}................................(..(.(.......).)..)..(((((((.((((..aaaaaaa.)))).((..(((((((....)))))))..))))))))).......AAAAAAA..((((((((((.<<<<<<<<))))))))))........>>>>>>>>..(.(((..((..(((.[[[.[[[)))...)).))).)............]]]..]]]...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((((((((.......)))))))))).....(((((((..(((((((((..((((.((((((...................((((((((.....))))).)))(((((((........)))))))((((((..((((..........))))(((..(((((((....)))))))..)))))))))..)))))).((((((.(((((((((((((...)))))))))))))............))))))..((((((((.((((......)))).))))))))))))..))))))........)))..)))))))..(((((..(((....))).))))).(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00687
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGCCCUGGUUUCGACGUGGGUUCGGAAUCGGUGUGGUGCAUGUCGAGCUUGAGUGGCGCUCGUAAAUCUGCAUUCAACAAACCAACUGCAAACGACGAACGUUUCGCACUCGCCGCUUAAACACCGGUGAGCCUUGCAACAGCACGCUGACGGGCUGGGCAAGGGGGCCGCAAGGCCUCCCGGCUGCAAGGUUAUUCACGUCAGCUGGCCUCCUGCCGGGUACCUUGGCAUGGGGCGAGAUCCAAGGGUGCUGGCCUUCCUUGCAGCGUGCGACUGCGCGGCGUGGAAGGUGAGAUCCAAAACAGACCGCUAAACAUGUAGAUCUGCCCGAAGAAGGCUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((<<<<<<<..)))))........>>>>>>>...............................(((((((.........)))))))(((((((.((((..{{{{{{{.)))).((..(((((((....)))))))..))))))))).......}}}}}}}..(((((.((((.aaaaaaaa)))).)))))........AAAAAAAA..(((((.(....(((.[[[.[[[))).....))))))............]]]..]]]...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
......((((((((((((((((((((.....((((((((..............((((((((((...(((....)))...............((((((((.....))))).)))..)))))))))))))))))).((((((((..((((..........))))(((..(((((((....)))))))..)))))))))))))))))))).....(((((.(((((((...))))))).)))))))))))..))))).((((((((((.(((.((((......)))).))).))))))).[[[[[.....)))...............]]]]](((.......)))....(((.[[[[[)))....]]]]]...........
|
|
TMR_00696
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCACGGUUUCGACGUGACACAUUAAUUUUUAAUUGCAGUGGGGUUAGCCCCUUAUCGCUUUCGAGGCAUUUUAAAUGCAGAAAAUAAAAAAUCUUCUGAAGUAGAAUUAAACCCAGCGUUUAUGGCUUCAGCUACUAAUGCAAACUACGCUUUUGCGUACUAAUUAGUUAUUAGUAGAAACGUUCAUUAACAUAAUUACUAUUGGUUGGUUUUUGGGCUUAUUUUACAAUAGUUUUAAAUUUAAAAUUCUUAUUUGUUGUUUAAAUUUAAAUAGAUUUAACAAAUAGUUAGUUAAUUUUAAAUUUGUUUUAUUAGUUAUUAACUACACUAUUUUUAAUAAAACUAAACUGUAGAUAUUAUUAAUUAUGUGUUGCGGAAAGGGGUUCGACUCCCCUCAUCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(((((..((((.((((((((((..[...[[....)))))...]]...]..............................................................................(.((((((.((.(((....))).)))))))).)(((((..(((.((((.<<<<<<<)))))))..)))))........>>>>>>>((((((((((((....aaaaaaaaaa))))))))))))......AAAAAAAAAA.(((((.(.(..((.(..{{{{{{{{).))).))))))..........}}}}}}}}...)))))....))))..))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.............((((((((((..........(((((..((((....)))).....(((.....))).[[[[[..)))))....]]]]]..(((.[[[[[[[)))..(((((.....)))))..]]]]]]](((((((((......((((....))))(((....))))))))))))....(((((..(((.((((((....)))))))))..)))))..........(((((((.((((((((((((.....((((((((.((((((....))))))))).)))))......))))))))))))((((((((((..................)))))))))).)))))))..............))))))))))(((.[[[[)))..]]]]....))))))....
|
|
TMR_00698
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUCUGGUUUCGACGGAUUGCUAGAAGUGGAGGCUGCAUGCCGCGGAUGAUUCGUUGGCCGCGUUACCAAUUCGGAUCAAACAAACUAAAUGCGAACUCUAACGAGCUUGCCCUCGCCGCUUAAUUGACGGUGACGUUCCUCCAGUGAAGUCUGUGAAUUGGAGGGGCGACUACUUACAGGCUGGCCAAAAGAGCGGGCGACCGGCUCCGAGGCGAGAUCUACAGGCCGCUGGGUGGACGGUAUCCUGGCAGUAGGAGACUGGACAUCGAGAUCAAAUUAUUGCCUGAGCAUGGAGACGCUUUCAUGGAAGGUGGUUCGGACAGGGGUUCAACUCCCCUCGCCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....(((.(((.((((((((((((..{{{{{{....))))).........}}}}}}.............................(((((.(((.........))).)))))((((((((((((..aaaaaaaa.))))))))))))......AAAAAAAA.(((....((((.[[[[.[[.))))...)))..........]].]]]].((((..((((.((..<<<<<<<<)).))))..)))).........>>>>>>>>...)))))....)).))))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...((((.((((.......)))).))))....(((..[[[)))..]]]((((.[[[[[[[....))))..........]]]]]]]............((((.(((....))).))))..((((((.........))))))((((((((((((..[[[[[[[[[)))))))))))).....]]]]]]]]].(((....[[[[.))).....]]]]...((((.[[[[[......)))).((((..((((.(((((....))))).))))..)))).]]]]]..........((((((.[[[[[.(((((((...)))))))))))))..(((((.......)))))...]]]]]...
|
|
TMR_00699
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCAGGAUUCGACGGGAAUUUUGCAGUCUGAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAACAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUAGCAGCUUAAUACCCUGCUCAGAGCCCUUCCUCCCUAGCUUCCGCUUGUAAGACGGGGAAAUCAGGAAGGUCAAACCAAAUCAAGCUGGCGUGGAUUCCCCCACCUGAGGGAUGAAGCGCGAGAUCUAAUUCAGGUUAGCCAUUCGUUAGCGUGUCGGUUCGCAGGCGGUGGUGAAAUUAAAGAUCGACUAAGCAUGUAGUACCAAAGAUGAAUGGUUUUCGGACGGGGGUUCAACUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.(...((((..((((((((((((((<<<<<<...))))).......>>>>>>.............................((.((.((((.........))))..)).))(((((((((((..(((..aaaaa.)))..)))).....)))))))...........AAAAA..((((....((((..[[[[[[))))....))))..........]]]]]]..((((..(..(.(((.{{{{{{{)))..)..))))).........}}}}}}}...)))))...))))..))))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((...((((((((.....))))))))......(((((...(((((.[[[.))))).)))))........]]]...........((((....))))((((((((......(((((.........)))))......(((((((((((..(((..[[[[[.)))..)))).....)))))))...........]]]]]..((((....((((..[[[[[[))))....))))..........]]]]]]..(((((.((((.(((.[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]........................))))))))....(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00702
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCAGGAUUCGACGGGAAUUUUGAAACCCGAGGAGCAUGUCGUGGGGCGGUUGGCCACGUAAAAAGCCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUAGCAGCUUAAUAACCUGCUGAGAGCUCUCCUGCCCUAGCUUCUGCUUGUAAGACGGGGAAUAACAGGGGAUCAAACCCAAACGAGCUAGAACGGAUUCUCCCGCCUGAGAGAUGAACUUCGAAUUAUAAUUCAGGAUAGCCAUAAGAUAGCGUGUCGGUUCGCAGUUUUACGGUGAAAUCAAAGAUCGACUAAACAUGUAGCGCCAACGGUGAACGAUUUUCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.(...(((...((.(((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>..............................((.((.((((.........))))..)).))(((((((((((..(((..aaaaaa)))..)))).....)))))))..........AAAAAA..(((.....((((...[[[[[)))).....)))..........]]]]]...(((.(.(((..(((.{{{{{{{)))...)))).))).........}}}}}}}...)))))...).))...)))..).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((..[[[))))))))))..]]]..........(((((.[[[[[[..))))).....]]]]]].........((((....)))).........(((.((((((.........)))))).[[[[[....)))...]]]]]..((((((....[[[[........(((.......)))..)))))).((((....))))]]]]((((((..((((........))))..))))))...(((.((((((.(((.[[[[[[[))).)))))).))).........]]]]]]]......(((..((((...)))).)))..........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00703
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUAGGAUUCGACGGGAAUUCAGAAGUCUGAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAACAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUAGCAGCUUAAUACCCUGCUCAGAGCUCUCUCGCCCUAGCUUCCGCACGUAAGACGGGGAAUAACGAGAGAUCAAACCCAAACGCGCUAGCCCGGAUUCUCCCGCCUGAGAGAUGAACGGCGAAUUAUAAUUCAGGAUAGUCAUUCAUUAGCGUGUCGGUUCGCAGGUGGAUGGUGAAUUUAAAGAUCGACUAAGCAUGUAGUACCAAUGAUGAAAGGUUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((...((((((((((((((<<<<<<...))))).......>>>>>>.............................((.((.((((.........))))..)).))(((((((((((..(((..aa.aaa)))..)))).....)))))))..........AAA.AA..(((.....((((...[[[[[)))).....)))..........]]]]]...(((((.(..(.(((.{{{{{{{)))..)..)))))).........}}}}}}}...)))))...))))...)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.....((((((.....))))))....(((((((((((..(((....[[[[[[.)))...........]]]]]]........((((....)))).........)))))(((((.........)))))......(((((((((((..(((.[[[....)))..)))).....)))))))............]]].....(((...((((...[[[[[))))....)))...........]]]]]..............(((.[[[[[[.)))...(((((.....)))))...]]]]]]............(((..........)))..))))))(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00706
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUAUGGAUUCGACGAAAUAAACAAAACUAAAGAUGCAUGUCGAGCAGAGGUGGACUCGUAAAACCUCAAAUUGAUAAUUGCAAAACAUAAGUACAACGAGCCUGCUCUAUUAGCAGCUUAAUUAGAAUAAAAUCUUAGGCUCCUUCUUAGAUAUAUUAUCUCUAGAUGUAUCAAUAGAAGUCAAAAUUAGAGAUCGCGAUAUGAACGGGCUUGUACGUUCCUACGCUAAAAUAAUACAAGAUAAUUUUUAGUUCACACUUCUUUCUGUAGAACUAAAAAUAUUUAAGAAAGAAUAAACAUGUAGUAUCAAUAGAAUUGAAGUUUCGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCAUAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((........(((..(((((((((((((..{{{{{...))))....}}}}}..............................(((((((((.(....).)))......(((.(..).))).))))))(((((..((((((((.aaaaaa))))))))...))))).......AAAAAA..(((....(((((<.<<<<<<)))))...)))........>>>>>>.>.(((((..(.(.(((.[[[[[[.)))...).).)))))......]].]]]]...)))))...))))..))).......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((............((((..................[[[[[[[[[[...[[[[[....))))...]]]]]...]]]]]]..]]]]...............((((((.[[[[[..............(((......))).))))))(((((..((((((((.......))))))))...))))).......]]]]]...(((....(((((..[[[[[[)))))...)))........]]]]]]...((((((((((((((.[[[[[[[))).)))))))))))......]]]]]]].............(((((...)))))..........(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00711
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGACUUGGAUUUCGACGGGAGCUAAAUAGCCUCGGUUGCAUGUCGGCAUGGGCACGCCGUAAAACUACCCGCAAUCAAUAAACGCAAACAACGCAAACUACGCUCCCGCUUACGCCAAAGCUGCGUAAGUCUAACUCUUCGGAGCCGUCAAGCCUCACAAUGCUAACUAGUGGGGAUUUGGCGUAACUUUGUUAGCCGCUCUCUCGUCUCAUCCGAAGCGAGGGAAAAGAUUAGGAUUGCCCAUCACUUCCGCCUUGGGGGCUUGAGCAAAGCGAUGGAAAGAGCUUUCAACCCCAUCUAAGCAUGUAGAGACUGGGGUGGGUUUGGCUUUCGGACUGGGGUUCGAUUCCCCACGACUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((((...(((((((((.(((((((((.[[[[...))))........]]]].........................................(.((.(((................))).)).).(((((((((((((...{{{{{{..)))))).))))))).......}}}}}}...((((((((...<<<<.<<)))))))).....>>.>>>>...(((((..((....(((.aaaa.a.)))...)).)))))...........A.AAAA......)))))....)))))))))....))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((..((((...))))((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((((....(((....)))....((((..........(((((..........(((((.((((((((.......))))))))..........)))))(((((((((((((...........)))))).))))))).....)))))......((((((((..........))))))))...)))).....))))))).......))).(((((((((.....))))....((((....))))..))))).....))))))...)))))))))..))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
|
TMR_00712
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGCACUGGUUUCGACGGGGGUCGCGAAGUCGCUUGGCGCAUGCCGAGGGGGCAGCUUUCCUCGUUAAUCCAGCAGCAAACUUUUAGUUGCCAACGAUGACAACUACGGUUCGGACUUCGCUAUCGCCGCUUAAUUGGCUUUAGUUGUAGUUCUACAGCCGCCUAAGGCGAACCCCCGAACCUACUUGUGCCCGUGCUCGUAGGUGUAGGGUCAUUAUCACGGAACCAUCGGUAGUGGCUGCCUGUCAGCUACCGGUCAGAUAAAGCAGGCUGGUUUCCAGGUGCGCUUUGCCAACCGUGCUGCCUGGGAACGAGAUCUAACGGAGGGCUAAGCAUGUAGUGCUGGGGAUGGAGUGCUUCCGGACGGCGGUUCGAUUCCGCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((......(((.(.(((((((((((((((..aa.aaa..))))).......AAA.AA...................................((...(.((((..((((......))))..)))).)...)).......((((...))))...(((.(....((((((((.{{{{{.{))))))))).))).....}.}}}}}....(((((((((.([.[[[[[[).)))))))))........]]]]]].](((((..((.((((...<<<..<<))))...)).)))))..........>>..>>>...)))))...)))))).))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((....(((((((.((((((((..(((((...(((((((((((....))))))))........)))...((((...))))))))).......(((....)))..))))))))..(((((.......(((((.(((........))).))))).....)))))))))))))))).......((((.(((.....[[[)))))))............]]]((((((((((((..[[[))).)))))))))..........]]]...((((((((((((((...[[[....)))).))))))))))..............]]]..(((((...)))))........)))))...((((.[[[[[))))...]]]]].))))))....
|
|
TMR_00716
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGCACUGGCUUCGACGGGGGUCACAAAAUCACUUGGUGCAUGCCGAGGGGGCCGCUUUCCUCGUAAAUCCAGCAGCAAACUUAUAGUUGCCAACGAAGACAACUUCGCUGUAGCCGCUUAAGGCUUAAGCCUCGAAACUGCUUGUGUCCGUGCUCGCAGCGUAGAGUCAUCAUCACGGAACCGCUGAGACGUGGCCGUCUGCCCAUCCUCGGUUAAAUCUAGCAGACUGGUUUCCGGGUGCGCUUUGCCUGUCGUGCUGCCCGGCGACGAGACCUAACGGCGAGGAUAAGCAUGUAGGGCCGGGGAUGGAGUACUUUCGGACGGCGGUUCGAUUCCGCCCACCUCCACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((......(((.(.((((.((((((((((..aa.aaa..))))).......AAA.AA..............................(((..((((......))))..)))(((.(...((.(((((<<<<<<.<)))))))).))).....>.>>>>>>...((((((..(((([.[[[[[[)))).))))))........]]]]]].](((.(..((.((((....{{{{{{))))...)).).)))..........}}}.}}}....)))))....))))).))).....)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
((((((.....((((((.[[[[[[[...........((((((....))))))))))))....]]]]]]].......(((((...[[[...))))).....]]]........(((..((((......))))..))).......((((.....[[[[[[[[[))))....]]].......]]]]]].((((..[[[[))))..]]]]..(((((((((((........(((((...[[[.[[[[[[[[[[))))).....]]]].]]]]]].]]]....(((.......))).............))))))))))).......(((((.[[[[[)))))..]]]]].))))))....
|