CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - HotKnots
CRW_00548
[ FASTA input ]
UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_00552
[ FASTA input ]
CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_00555
[ FASTA input ]
ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_00567
[ FASTA input ]
AAUCCCCCGUGCCCUUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_00570
[ FASTA input ]
GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_00573
[ FASTA input ]
UGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01482
[ FASTA input ]
ACGGUGCCCGACCCGGCCAUAGUGGCCGGGCAACACCCGGUCUCGUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCACGUCAGAACGGCCGUGAGGUCCGAGAGGCCUCGCAGCCGUUCUGAGCUGGGAUCGGGCACC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01484
[ FASTA input ]
AUUAGGGCGGCCAGAGCGGUGAGGUUCCACCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCUCGCCUGCGUUCUGGUCAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAAUCCAGUUCGCCGCCCCU
[ reference structure ]
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CRW_01485
[ FASTA input ]
UUAAGGCGGCCACAGCGGCGGGGCGACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGCAGAUAAGCCCGCCAGCGUUCCAGCGAGUACUGGAGUGUGCGAACCUCUGGGAAAACUGGUUCGCCGCCUCCC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01487
[ FASTA input ]
GGCAGCGGCCAUAGCGGUGGGGCGACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCCACCAGCGUACCGGGAAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAGCGGGGUUCGCCGCCUGCCC
[ reference structure ]
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CRW_01489
[ FASTA input ]
UUAAGGCGGCCAUAGCGGUGGGGUUACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCCGGUCAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCUACU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01491
[ FASTA input ]
GGAGUUUGGCGCCAUAGCGGCAGUGUAACUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUACUGUACUGAAGUGUGCGAGCCUUCGGGAACUCUGGAUCGCUGCCAUACUCACC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01492
[ FASTA input ]
GGGUACGGCGACCAUAGCGGGGGGGCCACACCUGAACCCGUUCCGAUCUCAGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUUGGAGGUGGUACUGCAACGUUAGUUGCGGGAAGCCUCCAACGUCGCCGGCCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01493
[ FASTA input ]
AGGUUGGCGGCCAUAGCGGAGGGGCCAUACCUGGUCUCGUUUCGAUCCCAGAAGUGAAGUCCUCCUGCGUUUUGUUGUUGUACUGUGGACGAGAGUCUAUGGGAAGCUCAUAACGCUGCCGGCCUC
[ reference structure ]
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CRW_01494
[ FASTA input ]
UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01496
[ FASTA input ]
GGGGCAUGGCGGUCAUGGCGCAGGGGUUAUACCUGAUCUCGUUUCGAUCUCAGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUUGUGGGUGUGUACUGCGGUUUUUUGCUGUGGGAAGCCCACUUCACUGCCAGCCACU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01497
[ FASTA input ]
UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01498
[ FASTA input ]
GGAGUUUGGCGGCCAUAGCGGCGGGGCAAUUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCUAUACUGUACUAAAGUAUGAGAGUCUUUGGGAAAUAUGGAACGCUGCCAUCUCC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01499
[ FASTA input ]
GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01500
[ FASTA input ]
UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01501
[ FASTA input ]
GCCCCUAACCCGGCCAUAGGCGCCGGUGAUACGCCCGGUCUCAUCAGAACCCGGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCGCUCGGGAGUACUGGGCUCCGCGAGGGCCCGGGAAACCGGCGUGCUGGGAGGGGGCUU
[ reference structure ]
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CRW_01502
[ FASTA input ]
UGGCCCGACCCGGCCAUAGCGGCCGGGCAACACCCGGACUCAUGUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCGCGUUGGGGGAUGCUGUGGGGUCCGCGAGGCCCCGCAGCGCCCCCAAGCCGGGAUCGGGCCG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01504
[ FASTA input ]
GCCCACCCGGUCAGAGUGAGCGGGCAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGCUCACGUUAGUGGGGCCGUGGAUACCGUGAGGAUCCGCAGCCCCACUAAGCUGGGAUGGGUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01507
[ FASTA input ]
GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU
[ reference structure ]
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CRW_01508
[ FASTA input ]
GGUACGGCGGUCAUAGCGGCGGGGUCACACCCGGUCUCGUUUCGACCCCGGAAGUUAAGCCCGCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGGGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACU
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CRW_01521
[ FASTA input ]
UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01532
[ FASTA input ]
GUCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGCACCGCUUCUCGUCCGAUCAGCAAAGUUAAGCAACGUUGGGUCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCAGAUGCUGUUGACUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01533
[ FASTA input ]
GCCUACGACUAUACCACCAUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGUAUGGUAGGGCCGGGUCAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCCGGUGUUGUAGGCCU
[ reference structure ]
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CRW_01534
[ FASTA input ]
GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU
[ reference structure ]
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CRW_01535
[ FASTA input ]
GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU
[ reference structure ]
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CRW_01536
[ FASTA input ]
ACAUACGGCCAUAGAUUGAAGAAUAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUUCUAAUCGCCAAGUUAGUACUGCGGUGGGUGACCACGCGGGAAUCCUUGGUGCUGUAUGU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01537
[ FASTA input ]
GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU
[ reference structure ]
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CRW_01539
[ FASTA input ]
ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01540
[ FASTA input ]
GCUUACAGCCAUACUGUCCUGAGCACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGACAAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACUGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01541
[ FASTA input ]
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU
[ reference structure ]
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CRW_01542
[ FASTA input ]
GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU
[ reference structure ]
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CRW_01544
[ FASTA input ]
GUUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCAUGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGCCCAUGUGCUGAUAGCUU
[ reference structure ]
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CRW_01548
[ FASTA input ]
GCUUACGACCAUAUCACGUUGAAUGCACGCCAUCCCGUCCGAUCUGGCAAGUUAAGCAACGUUGAGUCCAGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCUGGAUGUUGUAAGCU
[ reference structure ]
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CRW_01555
[ FASTA input ]
GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUAGAUGAGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCUCGUCCACAACUUUUU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GCUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAUGCACCGGAUCCCUUCCGAACUCCGAAGUUAAGCGGUUUAAGGCCUGUUAAGUACUGAGGUGGGGGACCACUCGGGAACUUCAGGUGCUGAUAGCUU
[ reference structure ]
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CRW_01557
[ FASTA input ]
GUCUACAACCAUACCACGUUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUAGGGCUCGGUUAGUACUUAGAUGGGUGACCGCUUGGGAAUACCGAGUGUUGUAGGCUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01559
[ FASTA input ]
GGCGUACGGCCAUACUACCGGGAAUACACCUGAACCCGUUCGAUUUCAGAAGUUAAGCCUGGUCAGGCCCAGUUAGUACUGAGGUGGGCGACCACUUGGGAACACUGGGUGCUGUACGCUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01562
[ FASTA input ]
UGAUGCGGUCAUACCAAGGCUACUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCGCCUUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUGCUGCAUCCAC
[ reference structure ]
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CRW_01563
[ FASTA input ]
AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01566
[ FASTA input ]
GGGUGCGAUAAUACCACCGCUAACGUAUCGGAUCCGAUCAGAACUCCGUAAUUAAGCGCGCUUGGGCUAGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCUCGGGAAGUCCUAGUGUUGCACCCAC
[ reference structure ]
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CRW_01568
[ FASTA input ]
GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU
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CRW_01569
[ FASTA input ]
GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU
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CRW_01570
[ FASTA input ]
GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU
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CRW_01572
[ FASTA input ]
AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU
[ reference structure ]
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CRW_01573
[ FASTA input ]
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
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CRW_01578
[ FASTA input ]
GUUUACGACCAUACCAUGCUGAAUAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCAUAGGGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUGUAGGCAU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01580
[ FASTA input ]
GCUUACGGCCAUAUCACGCUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGAGCCUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUAGGUGCUGUAAGCAU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01581
[ FASTA input ]
ACACACGGCCACAGUCAGCUGAAAACUGGGCAUCCCGUCCGCUCUGCCAUACAUAAGCAGUUGAACGGCAGAUUAGUACCACGGUGGGUGACCACCUGGGAAUCCCUGCUGCAGAGUGUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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CRW_01583
[ FASTA input ]
AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GUCUACGACCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCGUGGUUAGUACGUGGAUGGGUGACCGCCUCGGAAUACCACGUGUUGUAGGCUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGGUGCGAUCAUACCAGCGUUAGUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGCGCUUGGGCCGGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUAUUGCACCCUU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GUCUACGACCAUACCACAAUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAUUGUCGGGCCAGGAUAGUACCUGGAUGGGGGACCGCCUGGGAACGCCUGGUGUCGUAGACUU
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU
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[ FASTA input ]
GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU
[ reference structure ]
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AGAUGCGAUCAUACCAGCACUAACGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGCUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUGGAAUGGGUGACCCUCCGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUCCCG
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GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU
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GUUGGUGGCCAUACUAAGCCUAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCGAGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGACAACCC
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GGGUACGACCAUACUUGGCUGAAAGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCAGCCACAGGCUUAGUUAGUACUGAGGUCAGUGAUGACUCGGGAACCCUGAGUGCCGUACCCUCCACAACACUC
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
ACAGCCGUUCAUACCACACGGAGAAUACCGGAUCUCGUUCGAACUCCGCAGUCAAGCCGUGUCGGGCGUGCUCAGUACUACCAUAGGGGACUGGGUGGGAAGCGUGCGUGACGGCUGUU
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GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUU
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GCCUACGGCCAUACCACGUAGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCUGCGUCGGGCGUGGUUAGUACUUGCAUGGGAGACCGGCUGGGAAUACCACGUGCUGUAGGCUU
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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CGCGAAUUAGCGCGCGAAUUAGCG
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGGUGACGAUACUGUAGGCGAGAGCCUGCGGAAAAAUAGCCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((.......((((((((....)))))))).......))))
PDB_00159
[ FASTA input ]
UGCUCCUAGUACGUAAGGACCGGAGUG
[ reference structure ]
(((((((..((((..)))).)))))))
[ predicted structure ]
.(((((..((.(....).)).))))).
PDB_00160
[ FASTA input ]
GGCGUAACGUUGAAAAGUUACGCC
[ reference structure ]
(((((((((......)))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_00168
[ FASTA input ]
GAGGGUGGAACCGCGCGCGUCCCUC
[ reference structure ]
((((........((....)).))))
[ predicted structure ]
((((((((.......).)).)))))
PDB_00169
[ FASTA input ]
GGACCUCUCGAAAGAGUUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((..(((....)))..))))
PDB_00170
[ FASTA input ]
GGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGUCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((..)))))))))..)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(((((((....)))))..)).)))))))
PDB_00171
[ FASTA input ]
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCC
[ reference structure ]
((((((((((((.....)))))))))))).
[ predicted structure ]
((((((....((.....))....)))))).
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[ FASTA input ]
CUUGCUGAGGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAGGUGCACACAGCAAG
[ reference structure ]
(((((((.((((((((((((((())))))).)))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).)))))))
PDB_00175
[ FASTA input ]
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ]
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ]
(((.((......)))))(((.((((((.((..((..((((((((.((((((.((......)))))))).)))))).))..))..)))))))).)))
PDB_00178
[ FASTA input ]
GGCGAUACCAGCCGAAAGGCCCUUGGCAGCGUC
[ reference structure ]
(((((..((.((((..))))....))..)))))
[ predicted structure ]
((((...((((((....)))...)))...))))
PDB_00181
[ FASTA input ]
GGAGGCGCUACGGCGAGGCUCC
[ reference structure ]
(((((((((..)))))..))))
[ predicted structure ]
((((.(((....)))...))))
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[ FASTA input ]
GAGCGAAGACGAAAGUCGAGCUC
[ reference structure ]
((((..(((((..))))).))))
[ predicted structure ]
((((...(((....)))..))))
PDB_00183
[ FASTA input ]
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCCUUCGGGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ]
(((((.((((.....((((((((((((((..)))))))))).)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((.....((((...(((.((....)).)))....)))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ]
((((...((((((.......))))))....))))
PDB_00185
[ FASTA input ]
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ]
(((((.((((.....((((((.((((((((..(((((.......)))))...)))))))).)).)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((.....((((......))))..((((((.......)))))).(((((.....)))))..)))))))))
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[ FASTA input ]
GGCCUUCCCACAAGGGAAGGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
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[ FASTA input ]
GGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACC
[ reference structure ]
((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((......(....).....((((((((((......(....).....))))))))))......(....).....)))))
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[ FASTA input ]
GCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGC
[ reference structure ]
(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((....)))))((((((..((((((((((((..(((((((((((....)))))))))))..))))))))))))..))))))
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[ FASTA input ]
UAGCGGUGCGCACCGCUACGCACCGUUGGUAGCGGUGCGCACCGCUACCAACGGUGC
[ reference structure ]
((((((((())))))))).((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((....))))))).(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC
[ reference structure ]
....(((((((....)))))))...
[ predicted structure ]
(((.(((((((....))))))))))
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[ FASTA input ]
GGAUGCCUCCCGAGUGCAUCC
[ reference structure ]
(((((((((..))).))))))
[ predicted structure ]
((((((((....)).))))))
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[ FASTA input ]
GGACACGAAAUCCCGAAGUAGUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((.....)).))))))))
[ predicted structure ]
((((((..............))))))
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[ FASTA input ]
GAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUC
[ reference structure ]
((((((((.((((((..))))))...))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))..))))))))
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[ FASTA input ]
GGAGGACAUCCCUCACGGGUGACCGUGGUCCUCC
[ reference structure ]
(((((((......((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((......(((((....))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGCACUCUGGUAUCACGGUACCUUUGUGUC
[ reference structure ]
((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((...(((((....)))))...)))))
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[ FASTA input ]
GGGACUGACGAUCACGCAGUCUAU
[ reference structure ]
.((((((.((....))))))))..
[ predicted structure ]
.((((((.((....))))))))..
PDB_00207
[ FASTA input ]
UUAUAUAUAUAUAAUUAUAUAUAUAUAA
[ reference structure ]
(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGGCCCAU
[ reference structure ]
(((((..[[[[[[.)))))........]]]]]].
[ predicted structure ]
(((((.[[[[[[[.)))))........]]]]]]]
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[ FASTA input ]
GAAGAGAAGCGCUUCUCUUC
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
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[ FASTA input ]
GGCGGUACUAGUUGAGAAACUAGCUCUGUAUCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGUGAAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGAGGUCCCAGGGUU
[ reference structure ]
((((((((((((((..))))))))))))))....((((..(((.((((((((((..))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
.((((..((((((....))))))..)))).....((((..(((.(((((((((....)))))....))))))))))).(((((((((....))))))))).
PDB_00214
[ FASTA input ]
GGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
[ reference structure ]
(((((((...((((..))))..)))))))
[ predicted structure ]
((((((......(....).....))))))
PDB_00215
[ FASTA input ]
UAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUAUAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUA
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGCAGGGCUCAUAACCCUGCC
[ reference structure ]
(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.......)))))))
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[ FASTA input ]
GGCCUAAGACUUCGGUUAUGGCC
[ reference structure ]
(((((..((((..)))).)))))
[ predicted structure ]
((((...(((....)))..))))
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[ FASTA input ]
GGUCAGUGUAACAACUGACC
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
(((((((......)))))))
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[ FASTA input ]
AGCGCCGUGGCGCAGUGGAAGCGCGCAGGGCUCAUAACCCUGAUGUCCUCGGAUCGAAACCGAGCGGCGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((....))))..(((.(((((.(((((.......))))).....(((((.......)))))..))))).)))
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[ FASTA input ]
GGACUUUGGUCCGGACUUUGGUCC
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
(((((..(((....)))..)))))
PDB_00236
[ FASTA input ]
GGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUC
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
(((((..((((((((((..(((....)))..))))))))))..)))))
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[ FASTA input ]
GGCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGCC
[ reference structure ]
.((((...(((((..)))))...)))).
[ predicted structure ]
(((((....(((....)))....)))))
PDB_00239
[ FASTA input ]
GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC
[ reference structure ]
((((((...((((((()))))))(((((..)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.......((....))...((((....)))).)))))
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[ FASTA input ]
GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC
[ reference structure ]
..(((((.[[[[[[[))))).......]]]]]]]..
[ predicted structure ]
........(((((((.(........).)))))))..
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[ FASTA input ]
AUCCCCCGUGCCGGUGCGGGGGAU
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
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[ FASTA input ]
CCGAUGGUAGUGGCGAGAGUAGGC
[ reference structure ]
(((((((((((.))))))))))).
[ predicted structure ]
............((....))....
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[ FASTA input ]
UGCCUGGCGGCCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA
[ reference structure ]
((((((((((((((...(((((((((((..))))))))).))..)))..)))))))))))
[ predicted structure ]
.((((((((((((.((....(((((((....)))))))....)).)))..))))))))).
PDB_00252
[ FASTA input ]
CUGGGCGGGCGACCGCCUGGCUGGGCGGGCGACCGCCUGG
[ reference structure ]
.(((((((....)))))))..((((((((..)))))))).
[ predicted structure ]
(..(((((....)))))..)(..(((((....)))))..)
PDB_00254
[ FASTA input ]
CGUACGCGUACGCGUACGCGUACG
[ reference structure ]
(((((())))))(((((())))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
PDB_00256
[ FASTA input ]
UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU
[ reference structure ]
.((((......))))...........
[ predicted structure ]
.....((((((.........))))))
PDB_00257
[ FASTA input ]
GGCCAGAUCUGAGCGGCUCUCUGGCCC
[ reference structure ]
(((((((...((((.))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((...(((...)))))))))).
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[ FASTA input ]
GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA
[ reference structure ]
((((((((......)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((......)))))))).
PDB_00261
[ FASTA input ]
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((())))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((.(((....))).)))).)))))
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[ FASTA input ]
CCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGG
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
PDB_00264
[ FASTA input ]
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ]
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ]
.(((((.((((.((((.((.........)).)))).)))).))..)))
PDB_00267
[ FASTA input ]
UAGCUCCGGGGCUAUAGCUCCGGGGCUA
[ reference structure ]
((((((()))))))((((((()))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
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[ FASTA input ]
AAAAAAAAAAUUUUUUUUUU
[ reference structure ]
..((((((...))))))...
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
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[ FASTA input ]
CCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGUCCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGU
[ reference structure ]
((((((...........)))))).((((((...........)))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((..........))))))))))))))...))).
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[ FASTA input ]
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCAUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.......((((..(.(..((((((..((....((((....((((......)))).((((((((....)))))))).......))))..).)..))))))..))....))))....((((......)))).))))))))....
PDB_00312
[ FASTA input ]
GGCAGAGUCCUUCGGGACAUUGCACCUGCC
[ reference structure ]
(((((.((((....)))).......)))))
[ predicted structure ]
.((((.((((....)))).)))).......
PDB_00313
[ FASTA input ]
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GGCUCGUGUAGCUCAUUAGCUCCGAGCC
[ reference structure ]
((((((...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
((((((.(.((((....)))))))))))
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[ FASTA input ]
GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
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(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((...((((..))))..)))))))
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PDB_00327
[ FASTA input ]
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCAAA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((.......))))))))))))......
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[ FASTA input ]
GGACCGAUGGUAGUGUCUUCGGAUGCGAGAGUAGGUC
[ reference structure ]
.((((((((((((((((....))))))))))))))))
[ predicted structure ]
.((((.((....(((((....)))))....)).))))
PDB_00341
[ FASTA input ]
CCCAUGCGAGAGUAGGGACUGCCGAUGGUAGUGUGGGG
[ reference structure ]
((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
[ predicted structure ]
(((.(((....)))...((((((...))))))..))).
PDB_00342
[ FASTA input ]
GGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCC
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))....................
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((....))))))))))))))))))
PDB_00343
[ FASTA input ]
GGGCGGCCUUCGGGCUAGACGGUGGGAGAGGCUUCGGCUGGUCCACCCGUGACGCUC
[ reference structure ]
((((.(((....)))...((((((((((.((((..))))))))))).)))...))))
[ predicted structure ]
((((((((....)))...((((..(((..(((....)))..)))..))))..)))))
PDB_00347
[ FASTA input ]
GGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
PDB_00349
[ FASTA input ]
GAGACAUUGCACCCGGAGUCUCGAGACAUUGCACCCGGAGUCUC
[ reference structure ]
(((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
[ predicted structure ]
(((((..[[[(.{{{{.)))))(((((..)]]].}}}}.)))))
PDB_00351
[ FASTA input ]
GCCAAUGAGGCCGAGGCGCCAAUGAGGCCGAGGC
[ reference structure ]
(((...(((()))))))(((.....(())..)))
[ predicted structure ]
(((.....[[[[..)))(((.....]]]]..)))
PDB_00352
[ FASTA input ]
GGGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUC
[ reference structure ]
(((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((((......)))))).....((((........)))))))))
PDB_00357
[ FASTA input ]
GAGGACCUAGAUCACCCCUCGAGGACCUAGAUCACCCCUC
[ reference structure ]
(((((..........)))))(((((..........)))))
[ predicted structure ]
((((.....[[[[...))))((((.....]]]]...))))
PDB_00358
[ FASTA input ]
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCC
[ reference structure ]
(((((((..(((((.......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))
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[ FASTA input ]
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCCGCGGUUCGAUUCCGCGCCUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGACAGCUGUCCCUUCGGGGACAGCUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((....)))))))))))))
PDB_00370
[ FASTA input ]
GGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAACCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAA
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......(((..bb......))).........BB........(((..{{......))).........}}........(((..aa......))).........AA........(((..<<......))).........>>........(((..[[......))).........]]..
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((.....((((((((.....(((...(((..((((((.....((((((((.....(((...(((..(((..((...((((........))))))..)))..)))))).....)))))))).....)))...)))..)))))).....))))))))..))..(((.....)))...
PDB_00371
[ FASTA input ]
GGUCUGGGCGCAGCGCAAGCUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((((..))))).))).)))))))
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PDB_00377
[ FASTA input ]
GGGCGCCGGUACGCAAGUACGACGGUACGCUCC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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PDB_00378
[ FASTA input ]
GGAUCCCGACUGGCGAGAGCCAGGUAACGAAUGGAUCC
[ reference structure ]
((((((((.((((((..))))))....))...))))))
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[ FASTA input ]
UUCCUCGUGGCCCAAUGGUCACGGCGUCUGGCUACGAACCAGAAGAUUCCAGGUUCAAGUCCUGGCGGGGAAGCCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAAC
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GGGCUUGUAGCUCAGGUGGUUAGAGCGCACCCCUGAUAAGGGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACUCAGGCCCAC
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGUCUGGGCGCACUUCGGUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ]
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PDB_00421
[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GGGCAGGUUCCCGAGGGCCAAAGGGGACGGUCUGUAAAACCGUUGGCGUAGCCUUCGCUGGUUCGAAUCCAGCCCUGCCCA
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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PDB_00447
[ FASTA input ]
AGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAAAGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAA
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...(((((..[[[[[[)))))...]]]]]]...(((((..<<<<<<)))))...>>>>>>...(((((..{{{{{{)))))...}}}}}}...(((((..aaaaaa)))))...AAAAAA
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...((((([[[[[[[[)))))...((((((((.(((((..<<<<<<)))))...{{{{{{{{......))))))))........]]]]]]]]......}}}}}}}}........>>>>>>
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[ FASTA input ]
GGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCCGGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCC
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CCGGCGGUAGUUCAGCCUGGUAGAACGGCGGACUGUAGAUCCGCAUGUCGCUGGUUCAAAUCCGGCCCGCCGGA
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[ FASTA input ]
GGGCCCGUGGUCUAGUUGGUCAUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCAGGGCCCGUGGUCUAGUUGACGCCGCCCUUACGAGGCGGAGGUCCGGGGUUCAAGUCCCCGCGGGCCCACCA
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PDB_00481
[ FASTA input ]
GCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGCGCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGC
[ reference structure ]
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(((((((......(....).....)))))))(((((((......(....).....)))))))
PDB_00513
[ FASTA input ]
GGCAACGGUUCGAUCCCGUUGC
[ reference structure ]
.(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.......)))))))
PDB_00522
[ FASTA input ]
GGCGGAACCGUACACCGGAAUCCGAAAGGAUUUGGGCGUGCCCCCGCC
[ reference structure ]
(((((..(((.....)))(((((....))))).((((())))))))))
[ predicted structure ]
(((((....((((.((.((((((....)))))).)).))))..)))))
PDB_00526
[ FASTA input ]
AGAAGGAGCGUACAGGUAGGUCGCU
[ reference structure ]
.....(((...........)))...
[ predicted structure ]
......((((.((......))))))
PDB_00527
[ FASTA input ]
AGAAGGAGUGUACGGUUAGGUCGCU
[ reference structure ]
..((....((()))........)).
[ predicted structure ]
......((((.((......))))))
PDB_00537
[ FASTA input ]
GGAUUGUUACUGCUACGGCAGGCAAAACC
[ reference structure ]
...((((..(((((..)))))))))....
[ predicted structure ]
(..((((..((((....))))))))..).
PDB_00553
[ FASTA input ]
GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC
[ reference structure ]
(((((((...((((......)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((...((((......)))))))))))
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[ FASTA input ]
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).....((((((..((((........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
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PDB_00570
[ FASTA input ]
GGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCCGGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCC
[ reference structure ]
(((((((((....((....)).))))..))))).(((((((((....((....)).))))..))))).
[ predicted structure ]
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PDB_00571
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUUUUUU
[ reference structure ]
.((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......))))))))))).....]]]...
[ predicted structure ]
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PDB_00573
[ FASTA input ]
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGCGCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC
[ reference structure ]
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
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PDB_00584
[ FASTA input ]
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCGCAAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC
[ reference structure ]
((((((.........(((((((((((..)))))..........))))))))))))
[ predicted structure ]
(((.((.(((.....(.(((..(((....))).))).)....)))))))).....
PDB_00593
[ FASTA input ]
GGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAGGCCCCAUCGUCUAGCGGUUAGGACGCGGCCCUCUCAAGGCCGAAACGGGGGUUCGAUUCCCCCUGGGGUCACCAAA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((.((((((((.(((((.((((((((.......)))))....(((((......))))).(((((((....))))))).)))))))).)))).))))(((((.......)))))....(((((......))))).)))))))......
PDB_00599
[ FASTA input ]
GGGAGCUUGAUCCCGGAAACGGUCGAUCGCUCCC
[ reference structure ]
((((((..((((((((..))))..))))))))))
[ predicted structure ]
((((((..(((((((....)))..))))))))))
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[ FASTA input ]
GGACUGGGCGAGAAGUUUAGUCC
[ reference structure ]
((((((((((...))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....)))))))))
PDB_00611
[ FASTA input ]
GGAUCGCAUUUGGACUUCUGCCCGGCACCACGGUCGGAUC
[ reference structure ]
.((((.......(((...((((.)))).....))).))))
[ predicted structure ]
................((((.(((......))).))))..
PDB_00617
[ FASTA input ]
GGUUCACCUCUAACCGGGUGAGCC
[ reference structure ]
((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((......)))))))))
PDB_00627
[ FASTA input ]
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC
[ reference structure ]
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.(((((.......))))).))).....((((........)))).)))))
PDB_00629
[ FASTA input ]
CAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUGCAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUG
[ reference structure ]
((((((..((((((..)))))).))))))((((((..(((((....))))).))))))
[ predicted structure ]
((..((((......))))..)).(((((((...((((......))))....)))))))
PDB_00637
[ FASTA input ]
GAUUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGA
[ reference structure ]
......((((((((....))))))))..(((((.......)))))...((((((((....)))))))).
[ predicted structure ]
.......(((((((....)))))))...(((((.......)))))....(((((((....)))))))..
PDB_00648
[ FASTA input ]
AGCACGGCUUAAACCGUGCAGCACGGCUUAAACCGUGCUUUU
[ reference structure ]
(((((((......)))))))((((((......))))))....
[ predicted structure ]
.((((((......)))))).((((((......))))))....
PDB_00663
[ FASTA input ]
GGGGGGGGGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGG
[ reference structure ]
...(((.((....)).)))......(((..((..))..)))...
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))((((((((....))))))))
PDB_00667
[ FASTA input ]
GCCGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCAGCGCAUUCGUAAUGCGAAGGUCGUAGGUUCGACUCCUAUUAUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))..(((((.....)))))..(((((......))))).....)))))))....
PDB_00681
[ FASTA input ]
CUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAG
[ reference structure ]
(((((.......)))))(((((...((((((((()))))...)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((..((((((((((.......)))))))))).))))..)))))
PDB_00682
[ FASTA input ]
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
(..(((((((((((....)))))))))))..)
PDB_00686
[ FASTA input ]
CGUACGCGGAAUACUUCGAUCGAAGUAUUCCGCGUACG
[ reference structure ]
((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
PDB_00687
[ FASTA input ]
GGGAAGGGAAGAAACUGCGGCUUCGGCCGGCUUCCC
[ reference structure ]
((((((..........((((((..))))))))))))
[ predicted structure ]
.....((((((......((((....)))).))))))
PDB_00692
[ FASTA input ]
GCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGCGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC
[ reference structure ]
((((((((((..)))...)))))))((((((((((..)))...)))))))
[ predicted structure ]
((((((.((....))))....))))((((((.((....))))....))))
PDB_00693
[ FASTA input ]
GCGCUCUGAUGAGGCCGCAAGGCCGAAACUGCCGCAAGGCAGUCAGCGC
[ reference structure ]
(((((.......(((((..)))))...(((((((..))))))).)))))
[ predicted structure ]
(((((.......((((....))))...((((((....)))))).)))))
PDB_00698
[ FASTA input ]
CGUACGCGUCACGCGUACGUUCGUACGCGUCACGCGUACGUU
[ reference structure ]
(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
[ predicted structure ]
(((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))..
PDB_00702
[ FASTA input ]
GGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCCGGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCC
[ reference structure ]
((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))
[ predicted structure ]
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PDB_00705
[ FASTA input ]
GGGGAGUGGUUUGUAUCCUUCCC
[ reference structure ]
((((((.((......))))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((....)))))))))
PDB_00709
[ FASTA input ]
GGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCC
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ]
(((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))
PDB_00710
[ FASTA input ]
GACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCC
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ]
..((.((((.((.((......)))).)).)))).......
PDB_00713
[ FASTA input ]
GAGGUGCCCGAGUGGCUGAAGGGGGUAGGGGGGCCUCCCUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCCUCUC
[ reference structure ]
(((((([[[)).........]]]...((((((())))))).(((((.......)))))))))..
[ predicted structure ]
((((.(((.....)))....(((((.(((....))))))))(((((.......)))))))))..
PDB_00716
[ FASTA input ]
AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC
[ reference structure ]
..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
[ predicted structure ]
.((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).((((((((.....))))))))........
PDB_00724
[ FASTA input ]
GGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCCGGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ]
((((((((.(((((((.))))))))))))))).(((((((..(((((((.))))))).))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(.(((((.(((((.(.((((((...))))))..).))))).))))).).))))))).
PDB_00725
[ FASTA input ]
GGUGGUGAAGUCGCUCGGCGAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ]
(((((((..((((((((.)))))))).))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(.(((((...))))).).))))))).
PDB_00726
[ FASTA input ]
GACCGGAGUGUCGACGCAGAGAUGGUC
[ reference structure ]
((((...((((()))))......))))
[ predicted structure ]
(((((..(((....))).....)))))
PDB_00727
[ FASTA input ]
GGUCAUCGUUGAGAAAACGAAACAGACGGUGGCC
[ reference structure ]
((..(((((................)))))..))
[ predicted structure ]
((((((((((..............))))))))))
PDB_00728
[ FASTA input ]
GGGAUACCAUGUUCAGAAGAACGUGGUAUCUC
[ reference structure ]
(((((((((((((((..)))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GCGGAUCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGACCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGAUCCGCACCCGCGGAUCCGCACAA
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))...((((((((((..))))))))))....((((((((((..)))))))))).....
[ predicted structure ]
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PDB_00733
[ FASTA input ]
GCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACGCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACCGGAUCCGCACCGCGGAUCCCCC
[ reference structure ]
(((((((((((...)))))))))))..(((((((((((...)))))))))))....((((((((.))))))))....
[ predicted structure ]
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PDB_00734
[ FASTA input ]
GGUGACGCCGUAAGGCGCAGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((..((((....))))..)))
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[ FASTA input ]
GGCACGAGGUUUAGCUACACUCGUGCC
[ reference structure ]
(((((((((((....))).))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((......)).))))))))
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[ FASTA input ]
GAGGAAGGCGAUCGUUAAUCUC
[ reference structure ]
((((((((((()))))))))))
[ predicted structure ]
((((..(((....)))..))))
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[ FASTA input ]
GGGCUAGCACUCUGGUAUUACGGUACCUUUGUGCGCCC
[ reference structure ]
((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((..((((...(((((....)))))...))))))))
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[ FASTA input ]
GGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCC
[ reference structure ]
.(((((((((((((((((((....)))).)))))....))))))))))..(((((((((((((((((((....)))).)))))....)))))))))).
[ predicted structure ]
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PDB_00750
[ FASTA input ]
GGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCCGGGGCACGGCAAACCCCACC
[ reference structure ]
(((((((((.....))))).((((....))))..((...(((((............(((((..((((((((())))))).)))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))))....)))..))))))))
[ predicted structure ]
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PDB_00751
[ FASTA input ]
GGCUGGACUCGUACUUCGGUACUGGAGAAACAGCC
[ reference structure ]
..(((((((((((((..)))))..)))).))))..
[ predicted structure ]
(((((..(((((((....))))..)))...)))))
PDB_00752
[ FASTA input ]
GCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGCGCCGGCCACACCUACGGGGCCUGGUUAGUACCUGGGAAACCUGGGAAUACCAGGUGCCGGC
[ reference structure ]
((((((....((....))(((((((((......((....)).....)))))))))))))))((((((....((....))(((((((((.((((((((..)))))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))((((((....((....))(((((((.....((.((....)).))....)))))))))))))
PDB_00754
[ FASTA input ]
AAUCCAUUGCACGGAUUAAUCCAUUGCACUCCGGAUUUAAUCCAUUGCACGGAUU
[ reference structure ]
.((((.......)))).(((((..........)))))...(((.......)))..
[ predicted structure ]
(((((..((((.((((((((((..........))).)))))))..)))).)))))
PDB_00767
[ FASTA input ]
GGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCGGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCACCAA
[ reference structure ]
(((((((.(((.........))).)))))))(((((((.(((.........))).))))))).....
[ predicted structure ]
((((((((((((.((((..((((((((((....)))))))))).))))..)))))))))))).....
PDB_00800
[ FASTA input ]
GGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUGGCAACGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))(((((((((...)))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00804
[ FASTA input ]
GCGGGGGUUGCCGAGCCUGGUCAAAGGCGGGGGACUCAAGAUCCCCUCCCGUAGGGGUUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCCCCGCACCAGCGGGGGUUGCCGAGCCUGGUCAAAGGCGGGGGACUCAAGAUCCCCUCCCGUAGGGGUUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCCCCGCACCA
[ reference structure ]
((((((((([[[))...........]]]((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....(((((((..(((.............)))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).((((((((((((((.((((((((....))))))))....((((((.......((.(((((((....).)))))).))....)))))).)))))))))))))).))))))))....
PDB_00806
[ FASTA input ]
UCCCAGUCCACCGCGGUGAGAAGGGGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ]
.(((..((((((()))))))..)))(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ]
.(((..(((((....))).))..)))((((..((((.(((....)))))...))..)))).
PDB_00807
[ FASTA input ]
UCGCAGUCCUAUUAAUAGAGAAGCGAGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ]
.(((....((((()))))....))).(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ]
((((..(((((....))).)).))))(((((..((((.(((....)))))...))..)))))
PDB_00809
[ FASTA input ]
GAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUC
[ reference structure ]
((((((((((((((...))))).)))))))))
[ predicted structure ]
((((.((((.(((.....)))..)))).))))
PDB_00810
[ FASTA input ]
GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU
[ reference structure ]
..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
[ predicted structure ]
..(((((((.(.(.((.((((.....))..)).)).).).)))))))
PDB_00815
[ FASTA input ]
AUGCUCAUGCACUGCAUGAAUGCCCCUAAGGGAUGC
[ reference structure ]
....(((((.....)))))....((((.))))....
[ predicted structure ]
....((((((...))))))...(((....)))....
PDB_00823
[ FASTA input ]
GGUGGAGGCUGCCGAAGCCA
[ reference structure ]
(((((((((.))))))))).
[ predicted structure ]
......((((.....)))).
PDB_00828
[ FASTA input ]
CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG
[ reference structure ]
(((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
PDB_00829
[ FASTA input ]
GGAUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGUC
[ reference structure ]
.(((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.....(((((.......)))))..........((((((.......))))))..)))))))
PDB_00842
[ FASTA input ]
AGUGGCGCCGACCACUUAAAAACACCGG
[ reference structure ]
(((((..[[[.))))).........]]]
[ predicted structure ]
(((((......)))))............
PDB_00851
[ FASTA input ]
GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC
[ reference structure ]
((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
[ predicted structure ]
....((((((((((((((((((.(...((((....))))....).))))....))))))))))))))((((.(...((((....))))....).))))
PDB_00855
[ FASTA input ]
GGAUAUAUGAUACAAUUUGAUCAGUAUAUCC
[ reference structure ]
((((((.((((........))))..))))))
[ predicted structure ]
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PDB_00857
[ FASTA input ]
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCCAAACAAAAAAGUCAGCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
((((((........[[[[[[[[[))))))........]]]]]]]]].
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[ FASTA input ]
UUGCGUCACACCGGUGAAGUCGCUGCGUCACACCGGUGAAGUCGC
[ reference structure ]
..(((((.((((((((..(((((.))))).))))))))..)))))
[ predicted structure ]
..(((.(.((((((((..(.((...)).).))))))))..).)))
PDB_00864
[ FASTA input ]
GAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGAUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUG
[ reference structure ]
..((((((((((((..))))))))))))...((((((((.(((.....)))..))))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).))))
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......(((((((....))))))).......(((((....(((.....))).....)))))...((((..(((..(((((((....(((((((.((.(((........)))..)).)))))))...((((...))))......)))))))..)))..)))).
PDB_00865
[ FASTA input ]
GGUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUACC
[ reference structure ]
((((((((((((...))))))))))))
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[ FASTA input ]
GCUGGUCCGAUUGACUAGCCGCUGGUCCGAUUGACUAGCCUCCGAGGUCCGA
[ reference structure ]
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
[ predicted structure ]
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
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[ FASTA input ]
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((())))))))))))))))................
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(((((.((((.((((((((((......)))))))))).)))).)))))
PDB_00871
[ FASTA input ]
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
PDB_00873
[ FASTA input ]
AAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUU
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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PDB_00878
[ FASTA input ]
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PDB_00879
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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PDB_00883
[ FASTA input ]
GGCUCUUUUCAGAGCCGGCUCUUUUCAGAGCCAAAA
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
CUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAG
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[ FASTA input ]
ACAUGAGGAUCACCCAUGUACAUGAGGAUCACCCAUGU
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[ FASTA input ]
GGCCACGGUUCGAAUCCGUGGCGGCCACGGUUCGAAUCCGUGGC
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
CUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUG
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[ FASTA input ]
GGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACUCCC
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GUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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PDB_00918
[ FASTA input ]
GCGGCACCGUCCGCUCAAACAAACGG
[ reference structure ]
((((..[[[.)))).........]]]
[ predicted structure ]
((((......))))............
PDB_00923
[ FASTA input ]
CCACGGUUCGAAUCCGUGGC
[ reference structure ]
((((((.......)))))).
[ predicted structure ]
((((((.......)))))).
PDB_00924
[ FASTA input ]
GGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCUGGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCU
[ reference structure ]
(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))
[ predicted structure ]
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PDB_00925
[ FASTA input ]
GGAGCGGGGGUGUAAACCUAUCGCUCC
[ reference structure ]
((((((.(((((..)))))..))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((....)))).)))))))
PDB_00928
[ FASTA input ]
CUCGCGGAUCAGUCACCCAAGCGAG
[ reference structure ]
((((((((.........))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.........))..)))))
PDB_00929
[ FASTA input ]
GGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCU
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
((((..(((..(((..((....))..)))..)))..))))
PDB_00932
[ FASTA input ]
GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC
[ reference structure ]
((((((.......((.(((((..)))))...))..))))))
[ predicted structure ]
((((((......(((.((((....)))).)))...))))))
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[ FASTA input ]
GCAUGGACGCGUCCAUGCGCAUGGACGCGUCCAUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((((())))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((....))))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCAGACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))...(((((..(((((.....)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))...
[ predicted structure ]
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PDB_00943
[ FASTA input ]
UUGACUACGGAUCAAUUGACUACGGAUCAAGACUACGGUUUGACUACGGAUCAA
[ reference structure ]
(((((.....)))))(((((.....))))).........(((((.....)))))
[ predicted structure ]
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PDB_00945
[ FASTA input ]
CAGCACUGAUUGCGGUCGAGGUAGCUUGAUG
[ reference structure ]
.((((.....))))((((((....)))))).
[ predicted structure ]
..(((.....))).((((((....)))))).
PDB_00960
[ FASTA input ]
UUCGACGCGUCGAAUUUUCGACGCGUCGA
[ reference structure ]
.(((((..)))))....(((((..)))))
[ predicted structure ]
.((((((((((((....))))))))))))
PDB_00961
[ FASTA input ]
AGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGAC
[ reference structure ]
.............(((((.......))))).............(((((.......)))))
[ predicted structure ]
((.(((.(((.((((((((.....)))))))).))).))))).((((((.....))))))
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[ FASTA input ]
ACAUGAGGAUUACCCAUGUCAUGAGGAUUACCCAUG
[ reference structure ]
(((((.((....)))))))..((.........))..
[ predicted structure ]
(((((.((....)))))))((((.((....))))))
PDB_00966
[ FASTA input ]
UGUCUAAGACAGUGUCUAAGACA
[ reference structure ]
.(((...)))..((((...))))
[ predicted structure ]
.((((.((((...)))).)))).
PDB_00967
[ FASTA input ]
GCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCAGCCGGGGUGGCGGAAUGGGUAGACGCGCAUGACAUCAUGUGCGCAAGCGUGCGGGUUCAAGUCCCGCCCCCGGCACCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
AUGAGGAUAACCCAUGAGGAUAACCCA
[ reference structure ]
.((.((....))))((.((....))))
[ predicted structure ]
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PDB_00974
[ FASTA input ]
AUGAGGAUGACCCAUUGAGGAUGACCCA
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(((.((....)))))((.((....))))
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUCGGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCACGGCGGCGUAGCUCAGCUGGUCAGAGCGGGGAUCUCAUAAGUCCCAGGUCGGAGGUUCGAGUCCUCCCGCCGCCAC
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
CGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUG
[ reference structure ]
((((((((..(((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((..((.((((....)))).)))))))
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[ FASTA input ]
GCUGAAGUGCACACGGCGCUGAAGUGCACACGGC
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(((((.((((((((((())))).)))))))))))
[ predicted structure ]
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PDB_00989
[ FASTA input ]
GGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCC
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(((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((())))))))))))))).)))))))))))))))..))))))
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[ FASTA input ]
AGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUAAGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUACC
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PDB_01000
[ FASTA input ]
GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUAGGGGACGCGUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUAGGGGACGC
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PDB_01001
[ FASTA input ]
CUCUCGGUAGCCAAGGGAAGGCGCAAGGUAAAUGAGUCGGGCGUUCGACUCGCCCCCGGGAGACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.......)))(((.......)))...(((((.......))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
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[ FASTA input ]
GGCCCGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCUGGGCCACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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PDB_01009
[ FASTA input ]
GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC
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[ FASTA input ]
UAGGGCCCGGGCCCUUAGGGCCCGGGCCCU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
AUGGGCCCGGGCCCAAUGGGCCCGGGCCCA
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[ predicted structure ]
.(((((((((((((...)))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGACAUUUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACAAUGUCCA
[ reference structure ]
.((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..))))))..
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....)))))))))
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[ FASTA input ]
AAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAUAAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAU
[ reference structure ]
((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((....))))))))))).((((((((((((....)))))))))))).
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[ FASTA input ]
GGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAACGGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAC
[ reference structure ]
.(((((((..[[[[[[.))))))).(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
AGACAGCAUAUAUGCUGUCUUUAGACAGCAUAUAUGCUGUCUUU
[ reference structure ]
.((((((((((.((((((......)))))).))))))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..
PDB_01045
[ FASTA input ]
AGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCUUUAGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCU
[ reference structure ]
.(((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC
[ reference structure ]
((((((..(((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(.((((((.....)))))).))))))))
PDB_01051
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
(((((.(((.(...((((((.......))))))).))))))))
PDB_01053
[ FASTA input ]
GCUUCCAUAGCUCAGCAGGUAGAGCGUCAGCGGUUCGAGCCCGCUUGGAAGCU
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
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[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCACGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
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[ FASTA input ]
GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((...)))).)))))
PDB_01057
[ FASTA input ]
GGACUGUCCACAAGACAGUCC
[ reference structure ]
((((((((.....))))))))
[ predicted structure ]
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PDB_01059
[ FASTA input ]
GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG
[ reference structure ]
((((.[[[.)))).....]]].
[ predicted structure ]
((((.....)))).........
PDB_01060
[ FASTA input ]
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
(..((((((((((..((..(((((((((((....)))))))))))..))..))))))))))..)
PDB_01061
[ FASTA input ]
GGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01062
[ FASTA input ]
UGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGCUGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGC
[ reference structure ]
.(((((..((((((...(((((.)))))..))))))...)))))
[ predicted structure ]
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PDB_01065
[ FASTA input ]
CGCAAUUAGCGCGCAAUUAGCG
[ reference structure ]
(((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ]
(((.....)))(((.....)))
PDB_01070
[ FASTA input ]
GGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUCGGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUC
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PDB_01071
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((.((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ]
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PDB_01073
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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PDB_01074
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((........)))))))
[ predicted structure ]
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PDB_01092
[ FASTA input ]
AAGCGCCGGACUUAAAGCCAUGGCUUUAAGUUGACGAGGGCAGGGUUUAUCGAGACAUCGGCGGGUGCCCUGCGGUCUUCCUGCGACCGUUAGAGGACUGGAAAACCACAGGCGACUGUGGCAUAGAGCAGUCCGGGCAGGAA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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PDB_01097
[ FASTA input ]
GGCGAUACACUAUUUAUCGCC
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PDB_01099
[ FASTA input ]
GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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PDB_01117
[ FASTA input ]
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PDB_01118
[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GCCUACCCGGUAGGCUUUUCAAGCCUACCCCGGUAGGCUUUUCAA
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGCCUCCAAGCUGUGCCUUGGGUGGCC
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[ FASTA input ]
AUGAGGCUCACCCAUGUGAGGCUCACCCA
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PDB_01137
[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGGCUUCACGGAUGAAGCCCGGGCUUCACGGAUGAAGCCC
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PDB_01150
[ FASTA input ]
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PDB_01152
[ FASTA input ]
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PDB_01154
[ FASTA input ]
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PDB_01156
[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAAAUCCCUCGGCGUGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGUCC
[ reference structure ]
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PDB_01162
[ FASTA input ]
AGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCGGUAGUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUC
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PDB_01163
[ FASTA input ]
GGGACAAGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCUUGUCCC
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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PDB_01187
[ FASTA input ]
GGACCUCGGCGAAAGCCGUUCGACCAGCGAAAGCUCUUAGACAGGAGGUUAGGUGCUCCGAAAGGAGCACUGGACCUCGGCGAAAGCCGUUCGACCAGCGAAAGCUCUUAGACAGGAGGUUAGGUGCUCCGAAAGGAGCACU
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[ FASTA input ]
GGAGCCUGGGAGCUCCCACGGUCCCAGACGUG
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUCUUCGGCUCUUCCUA
[ reference structure ]
((((([[[[[[(((((..)))))[[[[[[)))))]]]]]]..]]]]]]
[ predicted structure ]
.....((((((((((....))))((((((.....))))))..))))))
PDB_01203
[ FASTA input ]
GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCCACUGGCUUGUGGCG
[ reference structure ]
(((((.[[[[[(((((..)))))..[[[[.))))).]]]]...]]]]].
[ predicted structure ]
.....((((((.(((....)))...((((((...))))))...))))))
PDB_01205
[ FASTA input ]
GGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))
PDB_01208
[ FASTA input ]
GGUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUGCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((..((((((....(((....(((....)))....))).))))))..))
PDB_01209
[ FASTA input ]
GGGGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUUCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
PDB_01212
[ FASTA input ]
GGGUGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACGUCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((..((((((....(((....(((....)))....))).))))))..))
PDB_01213
[ FASTA input ]
GCGGGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACUU
[ reference structure ]
..((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))
[ predicted structure ]
..((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))
PDB_01216
[ FASTA input ]
GCUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGCGGC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))))
PDB_01219
[ FASTA input ]
CGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCG
[ reference structure ]
(((((((.((())))))).)))(((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ]
((((((((((((.((((((.....)))))))))).))))).)))
PDB_01236
[ FASTA input ]
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA
[ reference structure ]
(((((((((.((((((((((.((((((((((....(((((.((((((..(((((....)))))..)))))).....(((((((((.......)))))))))....))))).......))))))))))))))).))))).))....))))))).
[ predicted structure ]
((((((((....(((..((((((((((((..(((.(((((((((((....((((....))))....)))......((((((((((.......))))))))))...))))).))).))).)))))))).)....)))..)))...)))))))).
PDB_01237
[ FASTA input ]
GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC
[ reference structure ]
((((((((........))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_01249
[ FASTA input ]
GGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCC
[ reference structure ]
(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((......)))))))))(((((.((((.((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((((((((((.((((......)))))))))))))).)))).)))).)))))))))))))).)))).)))).)))))))))
PDB_01250
[ FASTA input ]
GCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGA
[ reference structure ]
.((((((.......<<<.<<<<<.))))))...........>>.>>>.>>>..((((((.......{{..{{{{{.))))))...........}}.}}}..}}..((((((.......[[[.[[[[[.))))))...........]].]]].]]].
[ predicted structure ]
(((((((......((.((......(((((((........((((((.......((((((((((........)))))...)))))........)))))).......)))))))......)).))......))))))).....................
PDB_01251
[ FASTA input ]
GCGUUUGAAACGCGCGUUUGAAACGC
[ reference structure ]
((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((....)))).))))))
PDB_01255
[ FASTA input ]
GGAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCA
[ reference structure ]
.....((((((((.((((((.((.((((.((((.(((.((((((((((....)))))))))).(((.....)))....)))......)))))))))).))))))))))))))(((.(((((...((((((((.....))))))))..))))).)))...
[ predicted structure ]
.(((((((......(((..((....((((.((((((((.(((((((((....))))))))).(((((....))))).)))).....))))))))...))..))).............((((...((((((((.....))))))))..))))))))))).
PDB_01260
[ FASTA input ]
GGGCUCCGGAAACCGCGGCGCGCGCUUCGCUCCCGGAGCCCACACUAGGAGCGUGCGGUUU
[ reference structure ]
(((((((((.[[[[[[((((())))).[[[[[))))))))).......]]]]].]]]]]].
[ predicted structure ]
(((((((((.........[[[[[[[[[[....)))))))))......]]]]]]]]]]....
PDB_01262
[ FASTA input ]
ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
....................
PDB_01281
[ FASTA input ]
GCGGGAAGCGGGAAUUCCCGCUUCCCGC
[ reference structure ]
((((((([[[[[[[)))))))]]]]]]]
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
PDB_01299
[ FASTA input ]
GGUUAUUCAGAUUAGGUAGUCGAAUGACCUAAGAAAUUUACCU
[ reference structure ]
((((((((.((..[[[[[.)))))))))).........]]]]]
[ predicted structure ]
((((((((.((((....))))))))))))..............
PDB_01309
[ FASTA input ]
CACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUG
[ reference structure ]
.((...((((..((((.[[[[........[[[[({{{{{{{{..{{{{(..<<<<....<<<.......))))..))))...)).)]]]]........]]]]..)}}}}..}}}}}}}}......>>>....>>>>
[ predicted structure ]
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PDB_01313
[ FASTA input ]
GAUCACUUCGGUGAUCACUUCGGU
[ reference structure ]
....((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
((((((....))))))........
PDB_01325
[ FASTA input ]
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
PDB_01332
[ FASTA input ]
GGUGUCUUGGAGUGCUGAUCGGACACC
[ reference structure ]
(((((((..((.......)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((.......)))))))))
PDB_01337
[ FASTA input ]
CCGGAGGAUCACCACGGGCGGAGGAUCACCACGG
[ reference structure ]
((((.((....)))))).(((.((....))))).
[ predicted structure ]
(((..(((((.((......))..)))).)..)))
PDB_01338
[ FASTA input ]
CCACAGUCACUGGGCAGUCACUGG
[ reference structure ]
((.(((...)))))(((...))).
[ predicted structure ]
...((((.(((....))).)))).
PDB_01340
[ FASTA input ]
UCGCCAACAGGCGGGCCAACAGGCG
[ reference structure ]
(((((....)))))(((....))).
[ predicted structure ]
.((((....)))).(((....))).
RFA_00389
[ FASTA input ]
GAAAGGUCUGUGCUUAGCACACUGACGAGUUCCUGAAAUGGAACGAAACCUUUU
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00390
[ FASTA input ]
GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00391
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUAGGCUUAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAGAUACGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((...(((...))).........(((((......)))))...)))))))
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[ FASTA input ]
UAAGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAAUCUCUGAAAUGAGACGAAACUCUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...)))))........((((......))))....)))))))
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[ FASTA input ]
GAUGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUAUGAAAUGAGACGAAACUCAUA
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
RFA_00409
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAAAUACGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((.(((..((((...))))))).))).(((((......)))))..........
RFA_00416
[ FASTA input ]
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((....))))........(((((......))))).)))))))))
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[ FASTA input ]
UCCAGUCGAGACCUGAAGUGGGUUUCCUGACGAGGCUGUGGAGAGAGCAAAUUGCUUUACUCCCGCACAAGCCGAAACUGGA
[ reference structure ]
((((((.(((((.........))))).......((((................................))))...))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((((.....))))))).......(((((((((((((((.....))))).))))...)).))))...))))))
RFA_00425
[ FASTA input ]
ACAGAGUCUGACAAACCGUCACUGAAGACGUUCAACUUGCGUUGAACAGAAACUCUGC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((............))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.((((.....))))........(((((((....)))))))....)))))).
RFA_00427
[ FASTA input ]
UCACCGUCGGAAAGUGUGCGCUUUCCCUGAUGAGCCCGAAAGGGCGAAACGGUAC
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
RFA_00429
[ FASTA input ]
GGGUGGUGUGUACCACCCCUGAUGAGUCCGAAAGGACGAA
[ reference structure ]
(((((........))))).......((((....))))...
[ predicted structure ]
(((((((....))))))).......((((....))))...
RFA_00433
[ FASTA input ]
GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
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[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCUUUGCGAUAAGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
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[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUUAGCCCACUGAUGAGUCGCUGCGAUGCGACGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
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[ FASTA input ]
GAAGAGUCCUGCGCUUAGCGCACUGACGAGUCUCUGAGAUGAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ]
.((((((..(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
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[ FASTA input ]
CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00444
[ FASTA input ]
ACGCUGUCUGUACUUGUAUCAGUACACUGACGAGUCCCUAAAGGACGAAACAGCGC
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((.....))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.((((((......)))))).......((((.....))))...)))))).
RFA_00446
[ FASTA input ]
CCGGUGUCUCAAGGUGCGUACCUUGACUGAUGAGUCCGAAAGGACGAAACACCAG
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
RFA_00449
[ FASTA input ]
CCGCUAUAUGGGGAUGUGUGUCCCUACUGACGAGUUCAAAAGAACGAAAUAGUUA
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
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[ FASTA input ]
GGCUGGUCGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUGUUCACAGUCAGUUACAGAUCGAACUCCUUGUUCUACUCUUUCCCCCCUUCUCACUACUGCACUUGACUAGUCUU
[ reference structure ]
((((((((....(((((((...................................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((((.(((((((((..((((.(((((((((....)))))))))..)))).((((.....))))................)))))))))....))))))))))..
RFA_00583
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAGUGCAGUGGUGUUUACAACUAAUUGAUCACAACCAGUUACAGAUUUCUUUGUUCCUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGCCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.(((((.((..(((....(((....))).........((..(((((....)))))..))..........)))..)).)))))))))))))..
RFA_00584
[ FASTA input ]
AGUUGGUCCGAGUGUUGUGGGUUAUUGUUAAGUUGAUUUAACAUUGUCUCCCCCCACAACCGCGCUUGACUAGCUUG
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.((((((((((((....(((((((....))))))).........))))))...))))))))))))))..
RFA_00585
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.(.(((((((((..(.......((((((........))))))..(((......)))........)..))))))))).)...))))))))..
RFA_00586
[ FASTA input ]
GGUUGGUCCGAAAGUUGUGGGUUAUCCAAAUCAUUCAGUUAGUAUCACUAACCUUCUAUUUCACCCCACUGCUGACCUUGACUGGCCAA
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.............................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
(((..(((....(((.(((((......((((......(((((.....))))).....))))...))))).)))......)))..)))..
RFA_00587
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((.((..(((((((..........((((((((....))))))))..((................))....))))))).))....)))))))).
RFA_00588
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAAAGUAGUGGGUUAUCACAGAAAUUAUUACAGUUAGUUUCACUAACCUUUCUAAGUUCCACCCCACUGCUAACCUUGACUGGUCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((....................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
(((..(((....(((((((((........(((((((.......)))))))...(((........)))....)))))))))......)))..)))..
RFA_00589
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAUGGUAGUGGGUUAUCAGAACUUAUUAACAUUAGUGUCACUAAAGUUGGUAUACAACCCCCCACUGCUAAAUUUGACUGGCUUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((..................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
(((..(((.((((((((((((...........(((((((.((((.....)))).)))))))........)))))))))..))).)))..)))..
RFA_00590
[ FASTA input ]
GCUCGGUCCGAGUUUCAUGGUCUCCAAUGUGUGUGUGUGUGUGUUUUCUUUAGGAACCUCGGUUCCAACCUCAUCUUGACCUUGAAACUACUUUGACCGCUCCU
[ reference structure ]
((((((((..(((((((.................................................................))))))).....))))))))..
[ predicted structure ]
...(((((..(((((((.((((...((((..(......)..)))).......(((((....)))))...........)))).))))))).....))))).....
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[ FASTA input ]
AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((...............................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.((.((.((((((....((.(((((...))))).))......)))))).))..))..))))))))..
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[ FASTA input ]
GGCUGGUUGGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUAUUCACAGUCCGCUACAGAUUGAACUCCUGUUCUAUACUUUUUCCACUUCUCACUUCUGCACAUGACUAAGGAU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((..................................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
.((.(((.(((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))).)))...))..............
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[ FASTA input ]
UUAUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUUUU
[ reference structure ]
.....(((((..........(((.(((.....))).)))......................................((((((((........))))))))...)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
[ predicted structure ]
.....(((((.....((((((((.((((...)))).)))...............((((((((..(((........)))...))))))))......)))))....)))))....(((((.(((.(...((((((.......))))))).)))))))).........
RFA_00604
[ FASTA input ]
AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU
[ reference structure ]
.....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
[ predicted structure ]
....(((((((((((((.....(((((((.....))))))).........(((((((..(..(.(((....))).)..)..)))))))...........))).))))))))))..((((.(((..(((((((((.......)))))))))))).)))).......
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[ FASTA input ]
GACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGAGAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUCCUUAUACCUUGAGUAUUGCUGAAUUCAGUUUAGCGUGCAUGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGUCAAAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUAUUUAUGACG
[ reference structure ]
....(((((..........(((...(((......)))...))).....................................((((((((.......))))))))..........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))......
[ predicted structure ]
((((((..((((.......((((..((((....))))..)))).............................((..((((((((((((((...))))))))...))))))..))........))))..))))))...................(((((............)))))
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[ FASTA input ]
UUAUACCCGCAUAUCAUUCAGACCCUUUAUGGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUGUCUUAAUUACUUAGGCUAAAAGAAAUAAGUAUUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUU
[ reference structure ]
.....(((((........(((.(((.....))).)))......................................((((((((............))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........))))))))))))))))......
[ predicted structure ]
.....(((((........(((..((.....))..)))...................((((((.......((((.........))))....(....)..))))))..)))))..((((((((.(...(((((.((.....)))))))).))))))))......
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
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.....(((((...............((((.((((.((...............)).)))).)))).....(((((.........)))))...............)))))....(((((.(((.(...((((((.......))))))).)))))))).........
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[ FASTA input ]
UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU
[ reference structure ]
.....(((((..........(((...(((.....)))....)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((((((....(((.(((((.........((((................))))............))))).))))))))))).........
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[ FASTA input ]
GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC
[ reference structure ]
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.((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).((((((((((((......))))))).).))))......((....))
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[ FASTA input ]
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA
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[ FASTA input ]
UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA
[ reference structure ]
....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA
[ reference structure ]
....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
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[ FASTA input ]
UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA
[ reference structure ]
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(((..........((((....))))..((((..(((((........)))))))))..))).....
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[ FASTA input ]
GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA
[ reference structure ]
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....((((((......(((((((.(((.(............).))).)))))))..))))))....
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[ FASTA input ]
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA
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[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
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[ FASTA input ]
AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
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((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
.......(((((.(((.((.......))...))).)))))........
RFA_00664
[ FASTA input ]
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
....((((....)))).....(((((((.......)))))))...
RFA_00667
[ FASTA input ]
AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((.....(((.(((((.........))))).))).....))))
RFA_00668
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((..((((.....)).))...))).))..))))))
RFA_00672
[ FASTA input ]
AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((())).))))))
[ predicted structure ]
.....(((....))).......((((((.....))))))....
RFA_00673
[ FASTA input ]
AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
(((((...((((.((.................)).))))....)))))
RFA_00674
[ FASTA input ]
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((..((((.((((......))))...(.....).))))))))))
RFA_00675
[ FASTA input ]
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((..((((....)))).....(((((.......))))).))))
RFA_00677
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((..((((.(((((.....)))......)).))))))))))
RFA_00678
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.....((......((((......))))....))...........
RFA_00680
[ FASTA input ]
AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((.((((......))))........)))).))))))))
RFA_00683
[ FASTA input ]
GCAAUACUGAAGAGUUCCACAAUAGGACGAAACGGCGAUCCAGUGU
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
...((((((.(..(((((......))).......))..).))))))
RFA_00684
[ FASTA input ]
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((......)))))...)).))....)))))
RFA_00685
[ FASTA input ]
AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
(((((...((((((..................)).)))).)))))
RFA_00695
[ FASTA input ]
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUCGAAGACGAGUGAACUAAUUUUUUUUUAAUAAAAAGUUCACCACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAACAG
[ reference structure ]
((((((.......((((..............................................................................))))...((((.)))).)))).))
[ predicted structure ]
..((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....))))...
RFA_00703
[ FASTA input ]
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG
[ reference structure ]
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
[ predicted structure ]
((((((((((...(((...((((....((((..((.((...((......))...)).))..))))))))..))).....))))....))))))
RFA_00704
[ FASTA input ]
AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.....((((.[[[[..[[[..))))(((....]]]))).]]]]..
RFA_00705
[ FASTA input ]
AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((.((((.......))))....))).))..))))))
RFA_00706
[ FASTA input ]
CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.....((((.[[[(((({{{....))))....))))..]]].}}}.
RFA_00707
[ FASTA input ]
GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.......((.((....)).))...(((((.......))))).....
RFA_00708
[ FASTA input ]
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
(((.{{(.{{{{.{{{{..)))..}}}})}}.....}}}}......
RFA_00709
[ FASTA input ]
AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.......((((((((.((........))....))))).)))....
RFA_00710
[ FASTA input ]
AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
..............(((.....)))..((((((....))))))..
RFA_00711
[ FASTA input ]
CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.((((.(...).))))........(((((.......))))).....
RFA_00715
[ FASTA input ]
GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.............(((((....(((((.......))))))))))
RFA_00716
[ FASTA input ]
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU
[ reference structure ]
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
....((.((....)).))..(((((((.......)))))))...
RFA_00717
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.((.(((........)))...)))).).))))))
RFA_00720
[ FASTA input ]
GCCCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUUGACUCUACGGGGC
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((...)))))....((((....).))).......))))))
RFA_00721
[ FASTA input ]
GCGCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUCGACUCUAUGGGGC
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
((.((.(((((...)))))....((((....).)))........)).))
RFA_00730
[ FASTA input ]
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((....(((......)))..)))...))))))
RFA_00731
[ FASTA input ]
GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((......))).))))...))))))
RFA_00733
[ FASTA input ]
GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((......))).))))...))))))
RFA_00734
[ FASTA input ]
CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.(((((.(..(((.((((((....).)))))))).).))))).
RFA_00736
[ FASTA input ]
GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((......))).))))...))))))
RFA_00737
[ FASTA input ]
ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((.(.(.((.((((.....))..)).)).).).))))))
RFA_00745
[ FASTA input ]
ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((.......))).))))...))))))
RFA_00749
[ FASTA input ]
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((......))).))))...))))))
RFA_00758
[ FASTA input ]
CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
..((((....(((...(((.......)))..)))...))))..
RFA_00762
[ FASTA input ]
CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.(((((....(((.(((((.......))))))))...))))).
RFA_00763
[ FASTA input ]
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.(((((.(.(.((.((((.....))..)).)).).).))))).
RFA_00764
[ FASTA input ]
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((....(((.(..(((......))).))))...))))))
RFA_00765
[ FASTA input ]
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((.(.(.((.((((.....))..)).)).).).))))))
RFA_00767
[ FASTA input ]
GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
(((.[[[[[[[[........)))....((((((((((.]]]]]]]]..))))))))))....
RFA_00768
[ FASTA input ]
ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
RFA_00769
[ FASTA input ]
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
....((((((((.....((....)).(((((((((((.))))))))..)))))))))))....
RFA_00770
[ FASTA input ]
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
.....(((((((....(((....))).(((.(((((((..)))))))...))))))))))....
RFA_00773
[ FASTA input ]
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
....((((((((....(((....)))(((((((((((.))))))))..)))))))))))....
RFA_00779
[ FASTA input ]
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
.(((([[[[[[[.....)))).....((((((((((..]]]]]]]....))))))))))....
RFA_00781
[ FASTA input ]
GUCUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC
[ reference structure ]
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
[ predicted structure ]
....((((.((((((....))))))..))))...((((..(((.((((...((((.....))))..)))))))))))..((((((((....))))))))..
RFA_00786
[ FASTA input ]
GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC
[ reference structure ]
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
[ predicted structure ]
....((((.((((((....))))))..))))...((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((.(((((....))))).))..
RFA_00791
[ FASTA input ]
GUCUGUACUAGUUGGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUCCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGGCCGCAGCCCCUAGGAGACGUCCCAGCGGCC
[ reference structure ]
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..((.((((((....)))))).))..
[ predicted structure ]
.......(((((({{{{)))))).......((((.((....)))))).((((([[[[)))))........((((((}}}}.........]]]]...))))))
RFA_00792
[ FASTA input ]
GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC
[ reference structure ]
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
[ predicted structure ]
((..((.((((((....))))))))..)).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
RFA_00801
[ FASTA input ]
GUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUAUAUCUGGCGGGUCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGACCGCAGCCCUAGGGAGACGUCCUAGGGUC
[ reference structure ]
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..(((((.(((....))))))))..
[ predicted structure ]
.......((((((....))))))...........((((...((.(((((((((....)))))...)))))).)))).(((((((((.....))))))))).
RFA_00808
[ FASTA input ]
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU
[ reference structure ]
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
[ predicted structure ]
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
RFA_00809
[ FASTA input ]
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG
[ reference structure ]
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
[ predicted structure ]
...........(((((((.......[[[[[[[[[[))))))).......]]]]]]]]]].......
SPR_00007
[ FASTA input ]
GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
SPR_00009
[ FASTA input ]
GGGGGCAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCGCGCUCCCACCA
[ reference structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))..))))))....
SPR_00010
[ FASTA input ]
GGGGCUAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.(((((((((.(.((.(.(((((.......))))).).))).))))).))....))))))))))....
SPR_00012
[ FASTA input ]
GGGCGUGUGGCGUAGUCGGUAGCGCGCUCCCUUAGCAUGGGAGAGGUCUCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ]
(((((....(((([[[[[[..))))....((((....{{{..))))..(((((.]]]]]])))))..))))).}}}
SPR_00013
[ FASTA input ]
GGGCGUGUGGCGUAGUUGGUAGCGCGUUCGCUUAGCAUGCGAAAGGUCUCCGGUUCGACUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ]
(((((....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))))....
SPR_00016
[ FASTA input ]
GGGGGAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUCCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
SPR_00017
[ FASTA input ]
GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUUCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
SPR_00020
[ FASTA input ]
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00022
[ FASTA input ]
GCGACCGGGGCUGGCUUGGUAAUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAGAAUGUGGGUUCAAAUCCCAUCGGUCGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((.((...((((....))))..)).)))..((((..((((....))))...))))..)))))))....
SPR_00023
[ FASTA input ]
GCCCGGGUGGUGUAGUGGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCUCGGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.(...((((((....(((((((.......)))))))....))).)))...)))))).)))))....
SPR_00025
[ FASTA input ]
GGCCCCGUGGUGUAGUUGGUUAACACACCCGCCUGUCACGUGGGAGAUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCGGGGCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.(.(.((((.......((((((((.((....)).))...)))))))))).))))).)))))))....
SPR_00026
[ FASTA input ]
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...................((((.((((.....)))))))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00027
[ FASTA input ]
GGGAUUGUAGUUCAAUUGGUCAGAGCACCGCCCUGUCAAGGCGGAAGCUGCGGGUUCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((...((.((((.........))))))..)))......(((((..((((((((.......)))).)))).))))).
SPR_00029
[ FASTA input ]
AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...)))))))....
SPR_00030
[ FASTA input ]
AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))...
SPR_00032
[ FASTA input ]
AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......))))))))))))....
SPR_00033
[ FASTA input ]
AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
SPR_00034
[ FASTA input ]
AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......))))))))))))....
SPR_00036
[ FASTA input ]
UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.............((...(((((.......)))))..)).((((.......))))))))))))....
SPR_00044
[ FASTA input ]
GGCCUGUUGGUGAAGCGGUUAACACACACGGUUUUCAUCCGUGGACACACGGGUUCGAACCCCGUACAGGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((..........)))..((((..((((((((((....)))))))..)))..)))))))))))....
SPR_00045
[ FASTA input ]
GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUGGGGGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((.(.....).))))((((((.......))))))..((((((.......))))))))))))....
SPR_00060
[ FASTA input ]
UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((....)))))........(((((((.....)))))))((((.......)))).)))))))....
SPR_00064
[ FASTA input ]
GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((((((.((......)).))))).)))).........(((((.......))))))))))))....
SPR_00065
[ FASTA input ]
GGCUCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACGGACUGAAAAUCCGUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.((((...(((.....)))...))))..))))).)))))))....
SPR_00066
[ FASTA input ]
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.(....)))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00068
[ FASTA input ]
GCCCGGGUAGCUCAGCUGGUAGAGCACGUGACUGAAAAUCACGGUGUCGGUGGUUCGACUCCGCCCCCGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))................(((.(((((....))))).)))..)))))))....
SPR_00070
[ FASTA input ]
GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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(((((((..((((........)))).(((((.(....)))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00074
[ FASTA input ]
UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((..((((.......)))).((.(((..(..(((....)))..)..))).)).......))))))))...
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[ FASTA input ]
ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA
[ reference structure ]
(((((....((((........)))).(((((.......)))))....(..)..)))))....
[ predicted structure ]
(((((.((((.(((((((....)))))))..))))....(((....)))....)))))....
SPR_00079
[ FASTA input ]
AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA
[ reference structure ]
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SPR_00080
[ FASTA input ]
GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00086
[ FASTA input ]
GCCGACUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCUGGUUCGAUCCCGGGAGUCGGCACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00111
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00112
[ FASTA input ]
GCGGGUGUAGUUCAAUGGUAGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGAGCGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA
[ reference structure ]
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SPR_00113
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GCGGGAGUAGUUCAAUUUUAGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAGGUAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ]
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SPR_00115
[ FASTA input ]
GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
[ reference structure ]
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SPR_00116
[ FASTA input ]
GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00121
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00124
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00126
[ FASTA input ]
GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00127
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00137
[ FASTA input ]
GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00138
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
.(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00139
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
.(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00141
[ FASTA input ]
GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00142
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00153
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00155
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00156
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00163
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00164
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00166
[ FASTA input ]
AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00167
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00176
[ FASTA input ]
GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((.(........).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00177
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00178
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00183
[ FASTA input ]
CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00191
[ FASTA input ]
GCCUUGUUGGCGCAAUCGGUAGCGCGUAUGACUCUUAAUCAUAAGGUUAGGGGUUCGAGCCCCCUACAGGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00200
[ FASTA input ]
GCCCGGCUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUGAGACUCUUAAUCUCAGGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGUUGGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00209
[ FASTA input ]
GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00213
[ FASTA input ]
GCGGGGGUGGCUGAGCCAGGCCAAAAGCGGCGGACUUAAGAUCCGCUCCCGUAGGGGUUCGCGAGUUCGAAUCUCGUCCCCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.............)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00215
[ FASTA input ]
GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00218
[ FASTA input ]
GCGGGUGUGCGGGAAUUGGUAGACCGGCUAGAUUCAGGAUCUAGGGUCUUUAUGGACCUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...((((......(((((..(((((((...))))))))))))...((((((....))))))..))))..)))))))....
SPR_00219
[ FASTA input ]
GCCCGGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAUUUAAAAUCCCUCGGCGUUCGCGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00220
[ FASTA input ]
GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00221
[ FASTA input ]
GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.((....(((((.....))))).((((.(.((((.((((....)))))))).).))))..))))).)))))))....
SPR_00223
[ FASTA input ]
GCCUUUGUAGCGGAAUGGUAACGCGGCAGACUCAAAAUCUGCUUUGGUAACCCAGGUGGUAGUUCGACUCUCCCCAAAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))..............((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00224
[ FASTA input ]
GGGCAAGUGGCGGAAUUGGUAGACGCAGCAGACUCAAAAUCUGCCGCUAGCGAUAGUGUGUGGGUUCGAGUCCCACCUUGCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((...........)))....(((((..((((..((((((....))))).)..)))).)))))....)))))))....
SPR_00225
[ FASTA input ]
GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00226
[ FASTA input ]
GCCGAUGUGGCGGAAUUGGCAGACGCGCACGACUCAAAAUCGUGUGGGCUUUGCCCGUGUGGGUUCGACUCCCACCAUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.....((((((.(((((((.......))))))).).)))))))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00227
[ FASTA input ]
GCCUUGGUGGUGAAAUGGUAGCCACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUACAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((.........)))))..(((((((..((((((..(((....)))...)))))).)))).)))..))))))....
SPR_00228
[ FASTA input ]
GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((...........))))).((((((..(((((.(((.............)))))))).))))))...)))))))....
SPR_00229
[ FASTA input ]
GCCGCUAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCUGCUCUUAGGAAGCAGUGCUAGAGCAUCUCGGUUCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((...((............((((((((....).)))))))...((((......))))...))...))))))))....
SPR_00230
[ FASTA input ]
GGCUUGAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUAAAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......((((((....((..(((.(((((((.......))))))).....((((......))))..)))..)).....))))))
SPR_00235
[ FASTA input ]
AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00236
[ FASTA input ]
GCUAUUUUGGUGGAAUUGGUAGACACGAUACUCUUAAGAUGUAUUACUUUACAGUAUGAAGGUUCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....(((.((((.......(((((((....)).))))).(((((.....)))))..)))).)))...)))))))....
SPR_00246
[ FASTA input ]
ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((.......)))).)))))))....
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(((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).)))))))....
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[ FASTA input ]
GGAGAGAUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGCUGGUUUAAGGCACCAGUCCCUUCGGGGGCGUGGGUUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GCCGGGGUGGCUCAGCUGGAGGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCUCGGGUUCGAUCCCCGAUCCCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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GGCGGUGUAGCUCAGCGGCUAGAGCGUACGGUUCAUACCCGUGAGGUCGGGGGUUCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA
[ reference structure ]
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GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
[ reference structure ]
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GCCUGCUUAGCUCAGUUGGCCAGAGCAUCCGUUUCAUACGCGGAAAGUCACUAGUUCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA
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GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
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(((((((..(((({{{{{{...))))..........................[[[}}}}}}.....)))))))]]].
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[ FASTA input ]
AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
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(((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..)))))))....
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[ FASTA input ]
GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
[ reference structure ]
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UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
[ reference structure ]
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UGGGUUGUAGCCUAAUGGAAAGGCAAUUGGCCGUUAACCAGGAGAUAACAAGAUCAAUACUUGUCAACUCAGCCA
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CUCCGAUUAGCUCAAUUGGCUAGAGUACACCGUUUGGGGCGGUGGGGUUGAAGGUUCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA
[ reference structure ]
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CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
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CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGUAGAGCACAUGGUUUGGGACCAUGGGGUCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA
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CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCCUGGGGUUGCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
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CGGCGAGUAGCGCAGCUUGGUAGCGCAACUGGUUUGGGACCAGUGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUCUCGCCGACCA
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[ predicted structure ]
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SPR_00320
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00321
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00327
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00329
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00331
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00333
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00339
[ FASTA input ]
GGUUCUAUGGUGUAGUGGUUAGCACUCUGGACUUUGAAUCCAGCGACCUGGGUUCGACUCCCGGUAGGACCUCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00352
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00353
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00356
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00357
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00358
[ FASTA input ]
GCGCCCGUAGCUCAGCUGGAUAGAGCGCUGCCCUCCGGAGGCAGAGGUCUCAGGUUCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00360
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00362
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00363
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00364
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00365
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00366
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00367
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00369
[ FASTA input ]
GCUCGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00370
[ FASTA input ]
GCUUGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUCCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00373
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00374
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00385
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))...................(((((.......))))))))))))....
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SPR_00386
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00391
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
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SPR_00393
[ FASTA input ]
GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
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SPR_00394
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00395
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00398
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00399
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00402
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00412
[ FASTA input ]
GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00414
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00415
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00416
[ FASTA input ]
GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00417
[ FASTA input ]
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
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SPR_00418
[ FASTA input ]
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00434
[ FASTA input ]
GCUGACUUAGCUCAGCAGGCAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00435
[ FASTA input ]
GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00436
[ FASTA input ]
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00437
[ FASTA input ]
GCUGAUAUGGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCCCAGUUCGACUCUGGGUAUCAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00438
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00439
[ FASTA input ]
GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00445
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00452
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SPR_00455
[ FASTA input ]
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00456
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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CAAUUUAAAGCUUAAUUAGUAAAGUAUUUCAUUUACAUUGAAAAGAAAUUUGUGCAAAUCAAUUUAAAUUGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(.(((.......))).))))))))....
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA
[ reference structure ]
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GGUUUCGUGGUGUAGUGGUUAUCACGUCAGUCUAACACACUGAAGGUCUCCGGUUCGAGUCCGGGCGAAGCCACCA
[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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AGGAGAGUAGUUCAAUGGUAGAACGUCGGUCUCCAAAACCGAGCGUUGAGGGUUCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA
[ reference structure ]
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AGGGGCAUAGUUCAGUAGGUAGAACAUCGGUCUUCAAAACCGAGUGUCACGAGUUCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
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AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAGCACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
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[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
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[ FASTA input ]
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CGCGGGGUAGAGCAGUUGGUAGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGGCCGCAGGUUCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
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SPR_00505
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGUAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCCCCGCUACCA
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[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00512
[ FASTA input ]
CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
[ reference structure ]
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SPR_00513
[ FASTA input ]
CGCAGGAUAGAGCAGUCUGGUAGCUCGUGGGGCUCAUAAUCCCAAUGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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SPR_00519
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00520
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00533
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00541
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00542
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00544
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00548
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00550
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00552
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00557
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00561
[ FASTA input ]
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGUCGGACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00590
[ FASTA input ]
GCCGGGGUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGGCGGGCUGCAGACCCGUUAGUUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCCCCGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(((((.......))))))))))))....
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SPR_00593
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00595
[ FASTA input ]
GGGUCCAUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUUGACUGCAGAUCAAGAGGUCACCGGUUCGAACCCGGUUGGGCCCUCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_00598
[ FASTA input ]
GCCGCGGUAGUAUAGCCUGGACUAGUAUGCGGGCCUGUCAAGCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCCGCGGCGCCA
[ reference structure ]
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SPR_00610
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00620
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00629
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00721
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00722
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00750
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00758
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
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SPR_00810
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00816
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00832
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SPR_00867
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
[ reference structure ]
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SPR_00957
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA
[ reference structure ]
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SPR_01051
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_01088
[ FASTA input ]
GGGGCCGUAGCUCAGCCAGGCAGAGCGGCGGGCUCCAGACCCGUAGGUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCGGCCCCACCA
[ reference structure ]
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SPR_01095
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_01103
[ FASTA input ]
ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_01106
[ FASTA input ]
GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
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SPR_01117
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_01143
[ FASTA input ]
AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SPR_01157
[ FASTA input ]
CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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SRP_00001
[ FASTA input ]
GGUAGCCCUGCUGGUGGCUUCGCAAUUGUACUCUGUGAACCCCGCCAGGACCGGAAGGUAGCAACGGUAGCAGAUCUAUAAUGUGCCGAGGUUUUGCUAGUAGGGUUACCACCAUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00005
[ FASTA input ]
GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU
[ reference structure ]
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SRP_00007
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00008
[ FASTA input ]
GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU
[ reference structure ]
(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGCGGGUCUCCCCGCAUUGCAGCGCGGUGAACCUGGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCCGUUCCCUGCAAGUGCCGGGGGUCAGGCUCGCCACCCCGAACA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU
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[ FASTA input ]
GGUGGCCGGGUCCCAUACAAUAGCUCUCUUGACGAAUCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGCACUCGAGGGACUAUGUGAUAUGGGGUGCUCGGCCACUUUUU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
UUAUACAUCGUAACUGUAGUUAACAGUUUUGUUGAUUUAGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCUAUAACAAAAUUGUAUACAGUUACGAUGAUGUGUGUUAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GCUGGCGGGCCCCUUCGCAUGGUUCGGCGGUGAAUCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCAUAGUCGUUCAGAACCAGUGCCGGAGUAAGGCUCGCCUACCGGUAUCCCU
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[ FASTA input ]
UGGGUUCGAAUCCCAUUCUCUCCGAUUCCUAGGACCCGUACUAUCAAGUAUUGCUGAAUCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGAUGAGUACGUAAGUCUUAGGUUUAAUUUUGAACCCAAAUGCAAUGUUUUGCUUU
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[ FASTA input ]
CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
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[ FASTA input ]
GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU
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[ FASTA input ]
GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU
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[ FASTA input ]
GGAGAUUUCUGUUAGUCCUAAACACUGUUAAAUUGAAUAAUUGGUCAGAUCUGGAAAGAAGCAGCCAAAUCAAUCGAUACAGGUGUUUUGAUAUAGCUAACAGAAUCUCCUAUA
[ reference structure ]
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GAGUUAUCUGUUAGCUCCAAACACUGCAAUAUUGAAUAGUUGGUCAGAUUCGGAAGGAAGCAGCCAAAUCAAUUGAUACAGGUGUUCUGAUAAAGCUAACAGAAACUCCUAAA
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SRP_00058
[ FASTA input ]
GACGUGACGGGCCUCCUCGCAUGGUGGGGCGGUCAACCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCACAGCCGUUUUCCGCCAGUGCCGAGGGUCGGGCUCGUCACCUCCG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00067
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00072
[ FASTA input ]
GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00074
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00075
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00077
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00081
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00083
[ FASTA input ]
GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00084
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00093
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00094
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00095
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00098
[ FASTA input ]
GGCAGCCGCAGGGGUCCCCUCGCGACGAAUUGCCGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGCGGUGGAUUUGGGUGCCGAGGUGCGGCUUUUGUGGCUGUCUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00101
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00105
[ FASTA input ]
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGCUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00106
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00107
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00119
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00121
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00128
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00132
[ FASTA input ]
GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00134
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00135
[ FASTA input ]
GGACGCCGAAGCAGCCGCGGCCUCUGGCUUGGACCCCGUGGCGUCGCCGGCCUCCGCGGAGGCAGGGGCCGGCCCGCCUUCAACUCAGCCGGACAGCCGGAGGCCGGAGACGGAGCACGGUCAGGCGGGCGGGGUGCAGUGCCAGCCCCAGCCGCAGAGCGGCUUCCUUU
[ reference structure ]
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SRP_00137
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00138
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00139
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00140
[ FASTA input ]
GGGGUAUUAUUGGUUUCUCGCAGCAGAAUUCAGCUUACUUAGUCAGGGCCGGAAGGAAGCAGCUUGGGUUGAAUUUCUGGGUGCCGGGAGUCGCUGGUAAUACCCCACCUUUUUGGUAAAAGGUAAUACCG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00141
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00145
[ FASTA input ]
UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00146
[ FASTA input ]
CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00161
[ FASTA input ]
GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00162
[ FASTA input ]
GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
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SRP_00163
[ FASTA input ]
CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00164
[ FASTA input ]
GGUGACUCUAUUGGUCCCCUCGCGACGAUAGAUUGUGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGCAGUUGAUGCGGGCGCCGGGGUGUGGCUCUUAGAGUCGCCGCCCAACU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00170
[ FASTA input ]
GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00193
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00194
[ FASTA input ]
GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
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SRP_00196
[ FASTA input ]
GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00200
[ FASTA input ]
GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00209
[ FASTA input ]
GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00213
[ FASTA input ]
GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00214
[ FASTA input ]
AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ]
((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
[ predicted structure ]
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SRP_00215
[ FASTA input ]
GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
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SRP_00216
[ FASTA input ]
AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00217
[ FASTA input ]
GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00219
[ FASTA input ]
GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU
[ reference structure ]
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SRP_00221
[ FASTA input ]
GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
AGCCGUCACAUCAUUACGGUCGAAUCGUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUAUUUAAUGAGUGUGAUGGUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGCGGGUCUCCCCGCAUGGCAAAUCGGAACACCGGGUCAGGGGCGGAAGCCAGCAGCCCACUCCAAUGCGCCAGUGCCGGGGGUUUGGCCCGCCGCCCUAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00229
[ FASTA input ]
GCCCAUAGAGGAGGAUCUUCAACGUUUUGAAGAUGUGUCAGGACUGAAAAGAAGCAGCACGCAAAACGCUUCGAAGUCGCCCCCAUUCUAUGGGUGCCGUACC
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00231
[ FASTA input ]
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00233
[ FASTA input ]
GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00235
[ FASTA input ]
GGUAUAGUUUUAUUAAAACUUAAGAUAGACUUACUAUGUCAGAAUCGUAAGAUAGCAGCAUAAAGAUCUCAUUUUUAGUUAGUAUUAAAGCUAUACCUAAA
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00243
[ FASTA input ]
AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((..(.((((.((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).).).)))).)..))))....)))))))))....
[ predicted structure ]
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SRP_00244
[ FASTA input ]
GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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SRP_00245
[ FASTA input ]
GAUCCGUAACGCGAGCUUAUAACUCGAGCGGGGGCUAUAAAGGUGGUGUGGAACGAGCUGACUCGACCUGCCGGGUUGGGCCAGGGACUGCGGUGCUGGCUCGCCCGUUCCAAGUCGGGUAGUGGGCCAUGUGGCUUGGGCGAAGGCCUGGGUUUCUUGGCC
[ reference structure ]
((.(..........).))....((((..))))............................................................................................(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
[ predicted structure ]
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SRP_00250
[ FASTA input ]
GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUAACUUGUUAACUUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAGCAGGGGAUGUGUGUGCCGGGAUGUCGCUGGCAGAGCCCUCGCCAAUU
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SRP_00251
[ FASTA input ]
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SRP_00256
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00266
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00268
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00269
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00270
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00271
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00273
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00274
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00284
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00285
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00295
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00303
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00307
[ FASTA input ]
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SRP_00310
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00312
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00315
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00318
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00324
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00333
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00338
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00341
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00342
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00358
[ FASTA input ]
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SRP_00363
[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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SRP_00369
[ FASTA input ]
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SRP_00383
[ FASTA input ]
GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
[ reference structure ]
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TMR_00272
[ FASTA input ]
GGGGAUGAAUUAGUUUAGAUAUUUAAGUAAUCCAUGAAAAUUCAUCAGAAUUUUGUAAUAUUGCUUAGAUAAAACCAUGGGCAGUACAUGGCAUCUCCACCA
[ reference structure ]
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N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.
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