CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - MCFold



CRW_00552 (ext) [ FASTA input ] CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
[ reference structure ] .((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))).
[ predicted structure ] .((((((((((((((((.(((((((((..))))))))))(((((((((..))))).))))(((((((((((((.((((((...)))))))))))))))))))..))))))))))))))).
CRW_00573 (ext) [ FASTA input ] UGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU
[ reference structure ] ((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((..((((((((((((((((((((((((.....))))))))))).)))))))))).)))(((((((((((((((((...)))))))))))))))))).))))))))))).
CRW_01492 (ext) [ FASTA input ] GGGUACGGCGACCAUAGCGGGGGGGCCACACCUGAACCCGUUCCGAUCUCAGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUUGGAGGUGGUACUGCAACGUUAGUUGCGGGAAGCCUCCAACGUCGCCGGCCCA
[ reference structure ] ((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((((....)))))))))..))))))).))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((....((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))..))))))))))((((((((((.((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))))
CRW_01493 (ext) [ FASTA input ] AGGUUGGCGGCCAUAGCGGAGGGGCCAUACCUGGUCUCGUUUCGAUCCCAGAAGUGAAGUCCUCCUGCGUUUUGUUGUUGUACUGUGGACGAGAGUCUAUGGGAAGCUCAUAACGCUGCCGGCCUC
[ reference structure ] (((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((....))))))))))..))))))).))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((((....((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))..))))))))))((((((.((((.(((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))).
CRW_01494 (ext) [ FASTA input ] UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC
[ reference structure ] ((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
[ predicted structure ] ((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))..)))))))))))))(((((((.((((((((..)))))))))))))))..)))))))))))).
CRW_01496 (ext) [ FASTA input ] GGGGCAUGGCGGUCAUGGCGCAGGGGUUAUACCUGAUCUCGUUUCGAUCUCAGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUUGUGGGUGUGUACUGCGGUUUUUUGCUGUGGGAAGCCCACUUCACUGCCAGCCACU
[ reference structure ] (((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((...))))))))))..))))))).)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))..)))))))))..)))))))((((((((((((((((((..)))))))).))))))))))))))))))))))))).
CRW_01497 (ext) [ FASTA input ] UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC
[ reference structure ] ((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
[ predicted structure ] ((((.(((((((.((((((((((.((((.(((((((((((...)))))))))))...))))))))).)))))(((((((.((((((((..)))))))))))))))...))))))))))).
CRW_01498 (ext) [ FASTA input ] GGAGUUUGGCGGCCAUAGCGGCGGGGCAAUUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCUAUACUGUACUAAAGUAUGAGAGUCUUUGGGAAAUAUGGAACGCUGCCAUCUCC
[ reference structure ] ((((..(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))).))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))((((((((((((.((((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))))))
CRW_01499 (ext) [ FASTA input ] GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU
[ reference structure ] (((((((((.(....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((..(....)))))))))..))))))).))))))))))...
[ predicted structure ] ..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))(((((((((.((((((((((((...)))))))))))))))))))))
CRW_01500 (ext) [ FASTA input ] UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU
[ reference structure ] ....((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))......
[ predicted structure ] ...(((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))).)))))))))).))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))).....
CRW_01504 (ext) [ FASTA input ] GCCCACCCGGUCAGAGUGAGCGGGCAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGCUCACGUUAGUGGGGCCGUGGAUACCGUGAGGAUCCGCAGCCCCACUAAGCUGGGAUGGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((..((((((((.((....))))))))))..))))))))))))).)))))...
[ predicted structure ] (((((((((((...(((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))).)))))))))(((((((((((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))).)))))...
CRW_01507 (ext) [ FASTA input ] GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))))).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).)))))))))...
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))..))))))))).((((((((.((((((((.(((..))))))))))))))))))))))))))))))...
CRW_01521 (ext) [ FASTA input ] UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA
[ reference structure ] ...((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((....))))..)))))))...))))))))))...
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((..))))((((((..))))))....((((((((.(((((....)))))))))))))((((..))))..))).))))))))))))))))))))
CRW_01532 (ext) [ FASTA input ] GUCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGCACCGCUUCUCGUCCGAUCAGCAAAGUUAAGCAACGUUGGGUCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCAGAUGCUGUUGACUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(((((..(((((((((((((....)))))))))))))((((((....)))))).)))(((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01533 (ext) [ FASTA input ] GCCUACGACUAUACCACCAUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGUAUGGUAGGGCCGGGUCAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCCGGUGUUGUAGGCCU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))..))))))))..
CRW_01534 (ext) [ FASTA input ] GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((....(((((((((....(((((((((((..)))))))))..))...))))))).))(((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01535 (ext) [ FASTA input ] GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((...((((...))))((((((((((((....)))))))))).)).))))))(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01537 (ext) [ FASTA input ] GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))((((((....)))))).))))))))))..))))))..(((((((((..))))))))))))).)))))))))..
CRW_01539 (ext) [ FASTA input ] ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))).))))))))))))))((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01540 (ext) [ FASTA input ] GCUUACAGCCAUACUGUCCUGAGCACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGACAAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACUGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((....((((((((((((((((((((((((..)))))))))))).))))))))))).)(((((((((.(((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01542 (ext) [ FASTA input ] GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(.((((((((((....(((((((((((..)))))))))..))...))))))).)))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01548 (ext) [ FASTA input ] GCUUACGACCAUAUCACGUUGAAUGCACGCCAUCCCGUCCGAUCUGGCAAGUUAAGCAACGUUGAGUCCAGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCUGGAUGUUGUAAGCU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((.(((((((..))))))))))..)))))))((((((....))).)))(((((((.((((((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))).
CRW_01555 (ext) [ FASTA input ] GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUAGAUGAGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCUCGUCCACAACUUUUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).................
[ predicted structure ] (((..(((((((.....(((((((..(((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))(((((..((((((((..((((..)))))))))))))))))(((((((((((...)))))))))))...
CRW_01557 (ext) [ FASTA input ] GUCUACAACCAUACCACGUUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUAGGGCUCGGUUAGUACUUAGAUGGGUGACCGCUUGGGAAUACCGAGUGUUGUAGGCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01562 (ext) [ FASTA input ] UGAUGCGGUCAUACCAAGGCUACUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCGCCUUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUGCUGCAUCCAC
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((.((.((((((((((((((((((((((((....))))))))..))))))))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01563 (ext) [ FASTA input ] AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))....((((..)))))))(((.((((((((((.((((..))))))))))))))))))).)))))))))
CRW_01568 (ext) [ FASTA input ] GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))).)))))))(((((..)))))(((((((((((((..))))))))))))))))))).)))))))))..
CRW_01569 (ext) [ FASTA input ] GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((....(((((((((.(..(((((((((((..)))))))))..))..)))))))))).((((((.(((((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01570 (ext) [ FASTA input ] GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((....((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))).)))))).))(((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01572 (ext) [ FASTA input ] AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
[ predicted structure ] .((((((((((((((((...).)))))))(((((((((((((((((..)))))))))))))))))(((((((((.(((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01573 (ext) [ FASTA input ] GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))...
[ predicted structure ] (((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((..))))))))))))))..)))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))...
CRW_01578 (ext) [ FASTA input ] GUUUACGACCAUACCAUGCUGAAUAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCAUAGGGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUGUAGGCAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((...((((((((((.(.((((((((((((..)))))))))..))).)))))))))))(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01580 (ext) [ FASTA input ] GCUUACGGCCAUAUCACGCUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGAGCCUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUAGGUGCUGUAAGCAU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((....))))).((((((((((((((((((((((....)))))))((((((((....))))))))..)))))))))))))))))))))).)))))))))..
CRW_01583 (ext) [ FASTA input ] AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.(((((((((((((..)))))))))..)))))))))))((((((...(.(((((((((...)))))))))))))))).))))))).)))))))))..
CRW_01584 (ext) [ FASTA input ] GUCUACGACCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCGUGGUUAGUACGUGGAUGGGUGACCGCCUCGGAAUACCACGUGUUGUAGGCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(.((((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..))))))).)))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01595 (ext) [ FASTA input ] GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
[ predicted structure ] (((...))).((((((.(((((((((((((((((((...(((((...(((((((((((((((...)))))))))).))))))))))))))))))(((((...))))))))))))))))......)))))).
CRW_01599 (ext) [ FASTA input ] GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..)))))))))))((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01605 (ext) [ FASTA input ] GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((...(((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))).))))))))))(((((((((.((((((((.(((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01606 (ext) [ FASTA input ] GUUGGUGGCCAUACUAAGCCUAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCGAGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGACAACCC
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] .(((((((..)))))))(((((((((((((((((...(((((...))))))))))))))))))))))(.((((..((((((((((((..))))))))))))((((((..)))))))))))
CRW_01613 (ext) [ FASTA input ] ACAGCCGUUCAUACCACACGGAGAAUACCGGAUCUCGUUCGAACUCCGCAGUCAAGCCGUGUCGGGCGUGCUCAGUACUACCAUAGGGGACUGGGUGGGAAGCGUGCGUGACGGCUGUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))).))))))))))))((((((((.(((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))).
CRW_01616 (ext) [ FASTA input ] GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((...((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))..)))))))))))(((((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
CRW_01620 (ext) [ FASTA input ] GUCUACGGCCAUACCUAGGCGAAAACACCAGUUCCCGUCCGAUCACUGCAGUUAAGCGUCUGAGGGCCUCGUUAGUACUAUGGUUGGAGACAACAUGGGAAUCCGGGGUGCUGUAGGCU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((....(((((((((.((((((((((((((..))))))))))))))..)))))).)))((((((.((((((((((.((((..))))))))))))))))))))))))))))).
CRW_01623 (ext) [ FASTA input ] GGGUACGACCAUACUUGGCCGAGUGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGCCGUACCCUU
[ reference structure ] (((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((..))))))))))))).))))))))).)))((((((((.(((((((.((((..)))))))))))))))))))))))))))))..
NDB_00014 (ext) [ FASTA input ] CCACUAGUGGCCACUAGUGG
[ reference structure ] (((((((((())))))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
NDB_00015 (ext) [ FASTA input ] ACCGGCGCCACAUGUGGCGCCGGU
[ reference structure ] ((.((((((((.)))).)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
NDB_00016 (ext) [ FASTA input ] CGCGAAAACGCGCGCGUUUUCGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
NDB_00047 (ext) [ FASTA input ] CGCGAUAUCGCGCGCGAUAUCGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
NDB_00048 (ext) [ FASTA input ] GCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGCGCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGC
[ reference structure ] (((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))
NDB_00049 (ext) [ FASTA input ] GACUAAGUCAACCGGUUGACUUAGUC
[ reference structure ] ((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))))))
NDB_00051 (ext) [ FASTA input ] UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))..))))))))))))))))))....
PDB_00001 (ext) [ FASTA input ] CGCGAAUUAGCGCGCGAAUUAGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00002 (ext) [ FASTA input ] GGCGUAAGGAUUACCUAUGCC
[ reference structure ] (((((.(((....))))))))
[ predicted structure ] (((((.(((....))))))))
PDB_00003 (ext) [ FASTA input ] GGCGUCACACCUUCGGGUGAAGUCGCC
[ reference structure ] ((((((((((((..))))).)))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..)))))).))))))
PDB_00004 (ext) [ FASTA input ] GGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGCC
[ reference structure ] (((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
PDB_00005 (ext) [ FASTA input ] GGGAGCUCAACUCUCCCCCCCUUUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA
[ reference structure ] (((((.......)))))(((...[[[[[[)))...]]]]]]...
[ predicted structure ] (((((((...)))))))....((((((((((..))))))))).)
PDB_00006 (ext) [ FASTA input ] GGGUGACUCCAGAGGUCGAGAGACCGGAGAUAUCACCC
[ reference structure ] ((((((((((...((((....))))))))...))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...(((((..)))))))))...))))))
PDB_00011 (ext) [ FASTA input ] CGCAAAUUUGCGCGCAAAUUUGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00012 (ext) [ FASTA input ] GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC
[ reference structure ] ..(((....((((......)))).)))..
[ predicted structure ] ((((((...(((((...).))))))))))
PDB_00013 (ext) [ FASTA input ] GGAGUGCUUCAACAGUGCUUGGACGCUCC
[ reference structure ] ((((((.((.((......)).))))))))
[ predicted structure ] ((((((.((((((...).)))))))))))
PDB_00017 (ext) [ FASTA input ] GGUGCAGAAACAGCGCUUCGGCGCGUAUAUUACGCACC
[ reference structure ] (((((((..((((((((..))))))))....)))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.(((((..)))))))))))...)))))
PDB_00018 (ext) [ FASTA input ] GGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCCGGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCC
[ reference structure ] (((((((.[[..[[[[)))))))(((((((.]]]]..]])))))))
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((((..))))))).))))))))))))))
PDB_00019 (ext) [ FASTA input ] GGGAUACUGCUUCGGUAAGUCCC
[ reference structure ] ((((..((((....)).))))))
[ predicted structure ] ((((((.((((..))))))))))
PDB_00020 (ext) [ FASTA input ] GGCAACGGAUGGUUCGUUGCCGCACCGAACCAUCCGGUGC
[ reference structure ] ((((((([[[[[[[)))))))((((((]]]]]]]))))))
[ predicted structure ] .((((((((((((((((((...))))))))))))))))))
PDB_00021 (ext) [ FASTA input ] GGACUAGCGGAGGCUAGUCC
[ reference structure ] ((((((((....))))))))
[ predicted structure ] ((((((((....))))))))
PDB_00022 (ext) [ FASTA input ] GGCGACGGUGUAAAAAUCUCGCC
[ reference structure ] (((((.((((....)))))))))
[ predicted structure ] (((((.(((((..))))))))))
PDB_00032 (ext) [ FASTA input ] GGCGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCGCC
[ reference structure ] ((((((....((((...(((((..)))))...)))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))))..)))))).(((..))))))
PDB_00034 (ext) [ FASTA input ] AACGGGCGCAGAAUCUGACGGUACGUUU
[ reference structure ] ((((((((((((.)))).))).))))).
[ predicted structure ] (((((((((((...))).).))))))).
PDB_00035 (ext) [ FASTA input ] GGGAUCACCAUUAGGGAUCUC
[ reference structure ] ((((((.(((..)))))))))
[ predicted structure ] ((((((.((....))))))))
PDB_00036 (ext) [ FASTA input ] GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUAGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACU
[ reference structure ] ((((((((((((((.(((((((((((((.))))))))))))).))))))))))))))...........................
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00039 (ext) [ FASTA input ] GCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGCGCUGGGCGCAGGCCUGACGGUACAGC
[ reference structure ] (((((((((((()))).))).))))).(((.((((((()))).)))..))).(((((((((((()))).))).)))))((((.((((((()))).)))..))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((.(.((((((..))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).).)))))))
PDB_00040 (ext) [ FASTA input ] GUGCGAAGACGAAAGUCCGAGCGC
[ reference structure ] ((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00041 (ext) [ FASTA input ] GCGGCCAGCUCCAGGCCGCCAAACAAUAUGGAGCAC
[ reference structure ] ((((((.[[[[[[)))))).........]]]]]]..
[ predicted structure ] ((((((((...)))))(((((((...))))))))))
PDB_00043 (ext) [ FASTA input ] GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGACGGUACACC
[ reference structure ] (((((((((((((..))))).))).)))))
[ predicted structure ] (((((((((((((..))))).).)))))))
PDB_00048 (ext) [ FASTA input ] UUGCCUGGCGGCAACUGCCAGGCAU
[ reference structure ] ..(((((((((...)))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((...)))))))))))
PDB_00049 (ext) [ FASTA input ] GGCGAAGUCGAAAGAUGGCGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_00053 (ext) [ FASTA input ] ACCGUCAGAGGACACGGUUAAAAAGUCCUC
[ reference structure ] (((((..[[[[[[)))))......]]]]]]
[ predicted structure ] .......((((((((((...))))))))))
PDB_00054 (ext) [ FASTA input ] GCAGGCGUGCGCAGGCGUGC
[ reference structure ] (((((((((())))))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
PDB_00056 (ext) [ FASTA input ] GGUGGGAGACGUCCCACCGGUGGGAGACGUCCCACC
[ reference structure ] (((((((..[[)))))))(((((((..]])))))))
[ predicted structure ] (((((((....)))))))(((((((....)))))))
PDB_00057 (ext) [ FASTA input ] GGAAGUCCGGUCUUCGGACCGGCUUCC
[ reference structure ] (((((.(((((......))))))))))
[ predicted structure ] (((((.(((((((..))))))))))))
PDB_00065 (ext) [ FASTA input ] GGCCGAGUAGUGUUGGGUCGCGAAAGGCC
[ reference structure ] .(((((.(((((......)))))))))).
[ predicted structure ] ((((((.(((((((..)))))))))))))
PDB_00070 (ext) [ FASTA input ] GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((..)))))))))).((((((((...))))))))((((((...)..)))))..)))))....
PDB_00074 (ext) [ FASTA input ] GGUAUUUCGGUACCGGUAUUUCGGUACC
[ reference structure ] (((((..((((((()))))..)))))))
[ predicted structure ] ((((((..))))))((((((..))))))
PDB_00081 (ext) [ FASTA input ] GGGAUAACUUCGGUUGUCCC
[ reference structure ] (((((((((..)))))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
PDB_00088 (ext) [ FASTA input ] GGUGCGAAGGGCGUCGUCGCCCCGAGCGCC
[ reference structure ] ((((((((((((......))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_00096 (ext) [ FASTA input ] UACUAACGUAGUAUACUAACGUAGUA
[ reference structure ] ((((.(((((((()))).))))))))
[ predicted structure ] ((((.(((((((..))).))))))))
PDB_00098 (ext) [ FASTA input ] GGCCGAAAUCCCGAAGUAGGCC
[ reference structure ] ((((((..........))))))
[ predicted structure ] (((((((.((..))).))))))
PDB_00102 (ext) [ FASTA input ] GGGGCUCUUCGGAGCUCCACCA
[ reference structure ] ((((((((..))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((..))))))))....
PDB_00104 (ext) [ FASTA input ] GUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCAC
[ reference structure ] (((.((((())).)))))(((.((((())).)))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((..)))))))))))))))))
PDB_00107 (ext) [ FASTA input ] AGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU
[ reference structure ] (((((((....((((..))))...)))))))
[ predicted structure ] (((((((((.(((((..))))))))))))))
PDB_00108 (ext) [ FASTA input ] GGCGGUGCUGAGAUGCCCGUC
[ reference structure ] (((((.((......)))))))
[ predicted structure ] (((((.((((..)))))))))
PDB_00110 (ext) [ FASTA input ] CUUGCUGAAGCACGCACGGCAAG
[ reference structure ] (((((((.........)))))))
[ predicted structure ] ((((((((.((..))))))))))
PDB_00113 (ext) [ FASTA input ] GGCCUGAGGAGACUCAGAAGCC
[ reference structure ] (((((((((..))))))..)))
[ predicted structure ] (((((((((..))))))..)))
PDB_00115 (ext) [ FASTA input ] GGCGACUGCAGUACGCCGGCGACUGCAGUACGCC
[ reference structure ] (((((((()))).))))(((((((()))).))))
[ predicted structure ] ((((((((((((.(((..))))))))))).))))
PDB_00116 (ext) [ FASTA input ] CAGACUUCGGUCGCAGAGAUGG
[ reference structure ] ..(((....))).(((..))).
[ predicted structure ] .(((((..)))))(((..))).
PDB_00119 (ext) [ FASTA input ] GGACCCGGGCUCAACCUGGGUCC
[ reference structure ] ((((((((((...))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))))))
PDB_00120 (ext) [ FASTA input ] GGCGUCAUGAGUCCAUGGCGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((....)))))))))
PDB_00121 (ext) [ FASTA input ] GGCGUGUUCAGAAGAACGCGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((....)))))))))
PDB_00122 (ext) [ FASTA input ] GGCAGAGUGCCGCGCGGCACCUGCC
[ reference structure ] (((((.((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((((..)))))))))))
PDB_00123 (ext) [ FASTA input ] UUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAU
[ reference structure ] ..(((((..{{{{{{.)))))..(((((((..}}}}}}.)))))))..(((((..[[[[[[.)))))..(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))).)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))
PDB_00124 (ext) [ FASTA input ] GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGCCCG
[ reference structure ] ((((((..[[[[.))))))........]]]].
[ predicted structure ] ((((((((((((..)).))))))...))))..
PDB_00125 (ext) [ FASTA input ] GGUCACAGCCCGGUCACAGCCC
[ reference structure ] ((((((((((.)))))))))).
[ predicted structure ] ((((...))))((((...))))
PDB_00128 (ext) [ FASTA input ] GAGCCCUGGGAGGCUCGCUGUUCCCAGACAGC
[ reference structure ] ((((([[[[..)))))(((((.]].]])))))
[ predicted structure ] ((((((...).)))))((((((....))))))
PDB_00130 (ext) [ FASTA input ] GGAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC
[ reference structure ] ....((((((....))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((....))))))))))
PDB_00132 (ext) [ FASTA input ] GGCGCUCAAUGCUCUUCGGAGACGACCGCC
[ reference structure ] (((((((...(((((..))))).)))))))
[ predicted structure ] (((((((...(((((..)))).))))))))
PDB_00134 (ext) [ FASTA input ] UCCGGUCGACUCCGGAGAAACAAAGUCA
[ reference structure ] (((((..[[[.)))))........]]].
[ predicted structure ] ((((((....))))))((((...)))).
PDB_00136 (ext) [ FASTA input ] GUCUACCUAUCGGGCUAAGGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUAUGCCCGGGGGAAAAC
[ reference structure ] ...(((((..(((((...((((((((((((((((..))))))..))))))))))..))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((.((((((((((((((((((..)))))))..)))))))))))))))))))))))))
PDB_00137 (ext) [ FASTA input ] GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCA
[ reference structure ] (((((((((((((..))))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((....)))))))))))).
PDB_00138 (ext) [ FASTA input ] GGCGCGGCACCGUCCGCGGAACAAACGG
[ reference structure ] ..(((((..[[[.))))).......]]]
[ predicted structure ] ((.((((..))))))(((((...)))))
PDB_00142 (ext) [ FASTA input ] GCGACCGAGCCAGCGAAAGUUGGGAGUCGC
[ reference structure ] ((((((...((((((..)))))).))))))
[ predicted structure ] ((((((...((((((..))))))).)))))
PDB_00149 (ext) [ FASTA input ] GCGCAGGACUCGGCUUCUUCGGAAGGGACGAGGGGCGC
[ reference structure ] ((((...(((((((((((..)))))..)))))).))))
[ predicted structure ] (((((..(((((((((((..)))))..)))))))))))
PDB_00150 (ext) [ FASTA input ] GGAAGCAGGCUUCGGCCUUGUUUCC
[ reference structure ] ((((((.((((..))))..))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..))))).))))))
PDB_00152 (ext) [ FASTA input ] GACAGUCUCUACGGAGACUG
[ reference structure ] ..((((((((..))))))))
[ predicted structure ] ..((((((((..))))))))
PDB_00153 (ext) [ FASTA input ] GGCGGUUGCAGGUCUGCACCGCC
[ reference structure ] ((((((.((((..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((.((((..))))))))))
PDB_00155 (ext) [ FASTA input ] CCAUGCGAACCGCGAUCCUAGUGUGG
[ reference structure ] ((((((((..........))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))...))))))
PDB_00157 (ext) [ FASTA input ] GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCACGUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC
[ reference structure ] ..((((...((((((()))))))(((((..)))))))))....((((.....((((()))))...((((..)))).))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((...)))))))))))))))))))))).)))))))))....)))))
PDB_00158 (ext) [ FASTA input ] GGGUGACGAUACUGUAGGCGAGAGCCUGCGGAAAAAUAGCCC
[ reference structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
PDB_00159 (ext) [ FASTA input ] UGCUCCUAGUACGUAAGGACCGGAGUG
[ reference structure ] (((((((..((((..)))).)))))))
[ predicted structure ] (((((((.(((((..))))))))))))
PDB_00160 (ext) [ FASTA input ] GGCGUAACGUUGAAAAGUUACGCC
[ reference structure ] (((((((((......)))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00168 (ext) [ FASTA input ] GAGGGUGGAACCGCGCGCGUCCCUC
[ reference structure ] ((((........((....)).))))
[ predicted structure ] (((((((((((...)))))))))))
PDB_00169 (ext) [ FASTA input ] GGACCUCUCGAAAGAGUUGUCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_00170 (ext) [ FASTA input ] GGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGUCC
[ reference structure ] ((((((((((((((((..)))))))))..)))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))..)))))))
PDB_00171 (ext) [ FASTA input ] GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCC
[ reference structure ] ((((((((((((.....)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))))))))).
PDB_00174 (ext) [ FASTA input ] CUUGCUGAGGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAGGUGCACACAGCAAG
[ reference structure ] (((((((.((((((((((((((())))))).)))))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((..)))))).)))))))))))))))
PDB_00175 (ext) [ FASTA input ] CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ] .(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ] .((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((.(((..)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))..))))
PDB_00178 (ext) [ FASTA input ] GGCGAUACCAGCCGAAAGGCCCUUGGCAGCGUC
[ reference structure ] (((((..((.((((..))))....))..)))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))...))))))))))
PDB_00181 (ext) [ FASTA input ] GGAGGCGCUACGGCGAGGCUCC
[ reference structure ] (((((((((..)))))..))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))..))))
PDB_00182 (ext) [ FASTA input ] GAGCGAAGACGAAAGUCGAGCUC
[ reference structure ] ((((..(((((..))))).))))
[ predicted structure ] (((((.(((((..))))))))))
PDB_00183 (ext) [ FASTA input ] GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCCUUCGGGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ] (((((.((((.....((((((((((((((..)))))))))).)))))))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((.....((((((((((((((..)))))))))).)))))))))))))
PDB_00184 (ext) [ FASTA input ] GGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGCC
[ reference structure ] (((((((((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.((((..))))))))).))))))
PDB_00185 (ext) [ FASTA input ] GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ] (((((.((((.....((((((.((((((((..(((((.......)))))...)))))))).)).)))))))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((.....((((((((((((((((((((.((((..))))))))).))))))))))).)))))))))))))
PDB_00190 (ext) [ FASTA input ] GGCCUUCCCACAAGGGAAGGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((....)))))))))
PDB_00192 (ext) [ FASTA input ] GGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACC
[ reference structure ] ((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((..)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))
PDB_00195 (ext) [ FASTA input ] GCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGC
[ reference structure ] (((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((..))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00196 (ext) [ FASTA input ] UAGCGGUGCGCACCGCUACGCACCGUUGGUAGCGGUGCGCACCGCUACCAACGGUGC
[ reference structure ] ((((((((())))))))).((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((..)))))))).((((((((((((((((((..))))))))))))))))))
PDB_00197 (ext) [ FASTA input ] GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC
[ reference structure ] ....(((((((....)))))))...
[ predicted structure ] (((.(((((((....))))))))))
PDB_00200 (ext) [ FASTA input ] GGAUGCCUCCCGAGUGCAUCC
[ reference structure ] (((((((((..))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((..))).))))))
PDB_00201 (ext) [ FASTA input ] GGACACGAAAUCCCGAAGUAGUGUCC
[ reference structure ] ((((((((((.....)).))))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((..))).))))))))
PDB_00202 (ext) [ FASTA input ] GAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUC
[ reference structure ] ((((((((.((((((..))))))...))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))))..))))))))
PDB_00203 (ext) [ FASTA input ] GGAGGACAUCCCUCACGGGUGACCGUGGUCCUCC
[ reference structure ] (((((((......((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))))))))
PDB_00205 (ext) [ FASTA input ] GGCACUCUGGUAUCACGGUACCUUUGUGUC
[ reference structure ] ((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_00206 (ext) [ FASTA input ] GGGACUGACGAUCACGCAGUCUAU
[ reference structure ] .((((((.((....))))))))..
[ predicted structure ] (((((((.((....))))))))).
PDB_00207 (ext) [ FASTA input ] UUAUAUAUAUAUAAUUAUAUAUAUAUAA
[ reference structure ] (((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((..)))))))))))))
PDB_00209 (ext) [ FASTA input ] GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGGCCCAU
[ reference structure ] (((((..[[[[[[.)))))........]]]]]].
[ predicted structure ] ((((.(((((((..)).)))))).....)))...
PDB_00211 (ext) [ FASTA input ] GAAGAGAAGCGCUUCUCUUC
[ reference structure ] (((((((((())))))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
PDB_00214 (ext) [ FASTA input ] GGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
[ reference structure ] (((((((...((((..))))..)))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((((..)))))))))))))
PDB_00215 (ext) [ FASTA input ] UAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUAUAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUA
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))
PDB_00219 (ext) [ FASTA input ] GGCAGGGCUCAUAACCCUGCC
[ reference structure ] (((((((.......)))))))
[ predicted structure ] (((((((((...)))))))))
PDB_00221 (ext) [ FASTA input ] GGCCUAAGACUUCGGUUAUGGCC
[ reference structure ] (((((..((((..)))).)))))
[ predicted structure ] ((((.((((((..))))))))))
PDB_00224 (ext) [ FASTA input ] GGUCAGUGUAACAACUGACC
[ reference structure ] ((((((((....))))))))
[ predicted structure ] ((((((((....))))))))
PDB_00229 (ext) [ FASTA input ] AGCGCCGUGGCGCAGUGGAAGCGCGCAGGGCUCAUAACCCUGAUGUCCUCGGAUCGAAACCGAGCGGCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((..)))))).(((((((((((((((((...))))))))...((((((((...))))))).))))))))))
PDB_00234 (ext) [ FASTA input ] GGACUUUGGUCCGGACUUUGGUCC
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((..)))))(((((..)))))
PDB_00236 (ext) [ FASTA input ] GGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUC
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))
PDB_00237 (ext) [ FASTA input ] GGCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGCC
[ reference structure ] .((((...(((((..)))))...)))).
[ predicted structure ] ((((.((((((((..))))).)))))))
PDB_00239 (ext) [ FASTA input ] GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC
[ reference structure ] ((((((...((((((()))))))(((((..)))))))))))
[ predicted structure ] ((((((...((((((..))))))(((((..)))))))))))
PDB_00243 (ext) [ FASTA input ] GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC
[ reference structure ] ..(((((.[[[[[[[))))).......]]]]]]]..
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))))))))))..)))..
PDB_00248 (ext) [ FASTA input ] AUCCCCCGUGCCGGUGCGGGGGAU
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00249 (ext) [ FASTA input ] CCGAUGGUAGUGGCGAGAGUAGGC
[ reference structure ] (((((((((((.))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((...)))))))))).
PDB_00250 (ext) [ FASTA input ] UGCCUGGCGGCCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA
[ reference structure ] ((((((((((((((...(((((((((((..))))))))).))..)))..)))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))..))))))))))
PDB_00252 (ext) [ FASTA input ] CUGGGCGGGCGACCGCCUGGCUGGGCGGGCGACCGCCUGG
[ reference structure ] .(((((((....)))))))..((((((((..)))))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
PDB_00254 (ext) [ FASTA input ] CGUACGCGUACGCGUACGCGUACG
[ reference structure ] (((((())))))(((((())))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_00256 (ext) [ FASTA input ] UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU
[ reference structure ] .((((......))))...........
[ predicted structure ] .....(((((((((...)))))))))
PDB_00257 (ext) [ FASTA input ] GGCCAGAUCUGAGCGGCUCUCUGGCCC
[ reference structure ] (((((((...((((.))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((...(((...)))))))))).
PDB_00258 (ext) [ FASTA input ] GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA
[ reference structure ] ((((((((......)))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((..)))))))))).
PDB_00261 (ext) [ FASTA input ] GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ] (((((((((((((((())))))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))))))))))))
PDB_00262 (ext) [ FASTA input ] CCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGG
[ reference structure ] (((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))
PDB_00264 (ext) [ FASTA input ] CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ] .(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ] .((((((((((((((((((.(((..))))))))))))))))))..)))
PDB_00267 (ext) [ FASTA input ] UAGCUCCGGGGCUAUAGCUCCGGGGCUA
[ reference structure ] ((((((()))))))((((((()))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((..)))))))))))))
PDB_00286 (ext) [ FASTA input ] AAAAAAAAAAUUUUUUUUUU
[ reference structure ] ..((((((...))))))...
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
PDB_00293 (ext) [ FASTA input ] CCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGUCCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGU
[ reference structure ] ((((((...........)))))).((((((...........)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))...))).
PDB_00307 (ext) [ FASTA input ] UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCAUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((..).))).(((((((.((((((...)..)))))))).)))))))))).)))))))))))))))))((((((((((..(...)))))))))))(((((...)..))))....))))....
PDB_00312 (ext) [ FASTA input ] GGCAGAGUCCUUCGGGACAUUGCACCUGCC
[ reference structure ] (((((.((((....)))).......)))))
[ predicted structure ] (((((((((((..))))))......)))))
PDB_00313 (ext) [ FASTA input ] GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
PDB_00317 (ext) [ FASTA input ] GGCUCGUGUAGCUCAUUAGCUCCGAGCC
[ reference structure ] ((((((...((((....)))).))))))
[ predicted structure ] ((((((.(.((((....)))))))))))
PDB_00326 (ext) [ FASTA input ] GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
[ reference structure ] (((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((...((((..))))..)))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))))))....((((((((....)))))))))))(((((((((.((((..)))))))))))))
PDB_00339 (ext) [ FASTA input ] GGACCGAUGGUAGUGUCUUCGGAUGCGAGAGUAGGUC
[ reference structure ] .((((((((((((((((....))))))))))))))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((((((..)))))))))))))))))
PDB_00341 (ext) [ FASTA input ] CCCAUGCGAGAGUAGGGACUGCCGAUGGUAGUGUGGGG
[ reference structure ] ((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
PDB_00342 (ext) [ FASTA input ] GGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCC
[ reference structure ] (((((((((())))))))))....................
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
PDB_00343 (ext) [ FASTA input ] GGGCGGCCUUCGGGCUAGACGGUGGGAGAGGCUUCGGCUGGUCCACCCGUGACGCUC
[ reference structure ] ((((.(((....)))...((((((((((.((((..))))))))))).)))...))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))).(((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
PDB_00347 (ext) [ FASTA input ] GGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGCC
[ reference structure ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
PDB_00349 (ext) [ FASTA input ] GAGACAUUGCACCCGGAGUCUCGAGACAUUGCACCCGGAGUCUC
[ reference structure ] (((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))
PDB_00351 (ext) [ FASTA input ] GCCAAUGAGGCCGAGGCGCCAAUGAGGCCGAGGC
[ reference structure ] (((...(((()))))))(((.....(())..)))
[ predicted structure ] .(((((((((((..)))))))))).)(((..)))
PDB_00352 (ext) [ FASTA input ] GGGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUC
[ reference structure ] (((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((..)))).))))))))))((((...))))))))
PDB_00357 (ext) [ FASTA input ] GAGGACCUAGAUCACCCCUCGAGGACCUAGAUCACCCCUC
[ reference structure ] (((((..........)))))(((((..........)))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((....))))))))))))....))))
PDB_00358 (ext) [ FASTA input ] GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCC
[ reference structure ] (((((((..(((((.......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((....))))))))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))(((((((((((..)))))))))..)))))))
PDB_00362 (ext) [ FASTA input ] GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCCGCGGUUCGAUUCCGCGCCUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((((..)))))))))))((((((((((((..)))))))))))).))))))))))....
PDB_00365 (ext) [ FASTA input ] GGACAGCUGUCCCUUCGGGGACAGCUGUCC
[ reference structure ] ((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_00371 (ext) [ FASTA input ] GGUCUGGGCGCAGCGCAAGCUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ] (((((((((((((((..))))).))).)))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))).).)))))))))
PDB_00377 (ext) [ FASTA input ] GGGCGCCGGUACGCAAGUACGACGGUACGCUCC
[ reference structure ] ((((((((((((....))))..)))..))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((..)))))..)))..))))).
PDB_00378 (ext) [ FASTA input ] GGAUCCCGACUGGCGAGAGCCAGGUAACGAAUGGAUCC
[ reference structure ] ((((((((.((((((..))))))....))...))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))))...)))...))))))
PDB_00392 (ext) [ FASTA input ] UUCCUCGUGGCCCAAUGGUCACGGCGUCUGGCUACGAACCAGAAGAUUCCAGGUUCAAGUCCUGGCGGGGAAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((....))))))((((((((((...)..)))))))))(((((((...)..))))))))))))....
PDB_00400 (ext) [ FASTA input ] GCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAAC
[ reference structure ] .(((((((((((((((((.))))))))))))))))).....(((((((((((((((((.)))))))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((..).))))))))))))))))))))))))))))))))))))...
PDB_00402 (ext) [ FASTA input ] GGGCUUGUAGCUCAGGUGGUUAGAGCGCACCCCUGAUAAGGGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACUCAGGCCCAC
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))..
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((((..))).))))((((..)))).)))))).((((((...)..))))))))))))..
PDB_00411 (ext) [ FASTA input ] GGCGUGUAGGAUAUGCUUCGGCAGAAGGACACGCC
[ reference structure ] (((((((((..((((((..)))))).)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((.((((((..))))))))))))))))
PDB_00417 (ext) [ FASTA input ] AAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUUAAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUU
[ reference structure ] ..(((.((((..))))...((((((((((.(((((((............(((..))).)))))))))))))).)))...)))..(((((.((((..))))...((((((((((.(((((((.............(((..))).)))))))))))))).)))...)))))
[ predicted structure ] ((((((((...........((((((((((((((((((((..((((...))))....))))))))))))))))))))..((((....))))((((..))))...((((((((((((((((((((...((((...))))....))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00420 (ext) [ FASTA input ] GGUCUGGGCGCACUUCGGUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ] ...((((((((((....))).))).))))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((..)))).).)))))))))
PDB_00425 (ext) [ FASTA input ] GGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
[ reference structure ] ((((((..(((.........)))((((((((...))))))))....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((...)))(((((((.(((((((..))))))))))))))(((((...)..))))))))))).....
PDB_00430 (ext) [ FASTA input ] GGGCAGGUUCCCGAGGGCCAAAGGGGACGGUCUGUAAAACCGUUGGCGUAGCCUUCGCUGGUUCGAAUCCAGCCCUGCCCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))(((((((.....)))))))(((...)))...(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((...(((((((.((((((((((((.((..)))))))))))))))))))))(((((...)..)))))))))))).
PDB_00431 (ext) [ FASTA input ] GGAGUAGCGCAGCCCGGUAGCGCACCUCGUUCGGGACGAGGGGGGCGCUGGUUCAGAUCCAGUCUCC
[ reference structure ] ((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((...)))))))).(((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))
PDB_00433 (ext) [ FASTA input ] GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGU
[ reference structure ] (((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))))(((((((((((((....)))))))(((..)))((((((((((((..))))))))))))))))))(((((((....)))))))))))
PDB_00454 (ext) [ FASTA input ] GGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCCGGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCC
[ reference structure ] (((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))(((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((((((((((((((((((..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))
PDB_00474 (ext) [ FASTA input ] CCGGCGGUAGUUCAGCCUGGUAGAACGGCGGACUGUAGAUCCGCAUGUCGCUGGUUCAAAUCCGGCCCGCCGGA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...)))))))))).((((((((..))))).)))((((((...)..))))).)))))).
PDB_00481 (ext) [ FASTA input ] GCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGCGCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGC
[ reference structure ] ((((((((((.(((....)))))))))))))((((((((((.(((....)))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((..)))(((((..)))))))).)))))))(((..)))))))))
PDB_00513 (ext) [ FASTA input ] GGCAACGGUUCGAUCCCGUUGC
[ reference structure ] .(((((((.......)))))))
[ predicted structure ] .((((((((...)..)))))))
PDB_00522 (ext) [ FASTA input ] GGCGGAACCGUACACCGGAAUCCGAAAGGAUUUGGGCGUGCCCCCGCC
[ reference structure ] (((((..(((.....)))(((((....))))).((((())))))))))
[ predicted structure ] ((((((..((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
PDB_00526 (ext) [ FASTA input ] AGAAGGAGCGUACAGGUAGGUCGCU
[ reference structure ] .....(((...........)))...
[ predicted structure ] (((..(.((((((..))))))))))
PDB_00527 (ext) [ FASTA input ] AGAAGGAGUGUACGGUUAGGUCGCU
[ reference structure ] ..((....((()))........)).
[ predicted structure ] (((((((...)))))))(((..)))
PDB_00537 (ext) [ FASTA input ] GGAUUGUUACUGCUACGGCAGGCAAAACC
[ reference structure ] ...((((..(((((..)))))))))....
[ predicted structure ] ((.(((((((((((..)))))))))))))
PDB_00553 (ext) [ FASTA input ] GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC
[ reference structure ] (((((((...((((......)))))))))))
[ predicted structure ] (((((((...(((((...).)))))))))))
PDB_00570 (ext) [ FASTA input ] GGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCCGGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCC
[ reference structure ] (((((((((....((....)).))))..))))).(((((((((....((....)).))))..))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...((((..((((...))))))))))))))))))...))))..))))).
PDB_00571 (ext) [ FASTA input ] GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUUUUUU
[ reference structure ] .((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......))))))))))).....]]]...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..)))))))))))...((((((..)))))))))))))))))((((((...)..)))))..
PDB_00584 (ext) [ FASTA input ] GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCGCAAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC
[ reference structure ] ((((((.........(((((((((((..)))))..........))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))).)))))))))))))))
PDB_00599 (ext) [ FASTA input ] GGGAGCUUGAUCCCGGAAACGGUCGAUCGCUCCC
[ reference structure ] ((((((..((((((((..))))..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((..((((((((..))))..))))))))))
PDB_00603 (ext) [ FASTA input ] GGACUGGGCGAGAAGUUUAGUCC
[ reference structure ] ((((((((((...))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))))))
PDB_00611 (ext) [ FASTA input ] GGAUCGCAUUUGGACUUCUGCCCGGCACCACGGUCGGAUC
[ reference structure ] .((((.......(((...((((.)))).....))).))))
[ predicted structure ] .(((((((((((..))))))).(((((....)))))))))
PDB_00617 (ext) [ FASTA input ] GGUUCACCUCUAACCGGGUGAGCC
[ reference structure ] ((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((....))))))))))
PDB_00627 (ext) [ FASTA input ] GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC
[ reference structure ] (((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...)..)))))))))))...(((((((....)))))))))))
PDB_00629 (ext) [ FASTA input ] CAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUGCAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUG
[ reference structure ] ((((((..((((((..)))))).))))))((((((..(((((....))))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00637 (ext) [ FASTA input ] GAUUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGA
[ reference structure ] ......((((((((....))))))))..(((((.......)))))...((((((((....)))))))).
[ predicted structure ] ...((((((((((((..))))))))...((((((...)..)))))))))((((((((..))))))))..
PDB_00648 (ext) [ FASTA input ] AGCACGGCUUAAACCGUGCAGCACGGCUUAAACCGUGCUUUU
[ reference structure ] (((((((......)))))))((((((......))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((...))))))))))))))))))...
PDB_00663 (ext) [ FASTA input ] GGGGGGGGGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGG
[ reference structure ] ...(((.((....)).)))......(((..((..))..)))...
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))(((((((((..)))))))))
PDB_00667 (ext) [ FASTA input ] GCCGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCAGCGCAUUCGUAAUGCGAAGGUCGUAGGUUCGACUCCUAUUAUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((..))))))))(.((((((((...)))))))))((((((...)..))))))))))))....
PDB_00681 (ext) [ FASTA input ] CUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAG
[ reference structure ] (((((.......)))))(((((...((((((((()))))...)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((.((((((((((...)..))))))))))))))))).))))
PDB_00682 (ext) [ FASTA input ] CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ] (((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))))))))))))
PDB_00686 (ext) [ FASTA input ] CGUACGCGGAAUACUUCGAUCGAAGUAUUCCGCGUACG
[ reference structure ] ((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((..))))))))))))))))))
PDB_00687 (ext) [ FASTA input ] GGGAAGGGAAGAAACUGCGGCUUCGGCCGGCUUCCC
[ reference structure ] ((((((..........((((((..))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))..))))))
PDB_00692 (ext) [ FASTA input ] GCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGCGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC
[ reference structure ] ((((((((((..)))...)))))))((((((((((..)))...)))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...))))))))).(((..)))))))))))))
PDB_00693 (ext) [ FASTA input ] GCGCUCUGAUGAGGCCGCAAGGCCGAAACUGCCGCAAGGCAGUCAGCGC
[ reference structure ] (((((.......(((((..)))))...(((((((..))))))).)))))
[ predicted structure ] (((..((((((((((((..)))))))).((((((..)))))))))))))
PDB_00698 (ext) [ FASTA input ] CGUACGCGUCACGCGUACGUUCGUACGCGUCACGCGUACGUU
[ reference structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
PDB_00705 (ext) [ FASTA input ] GGGGAGUGGUUUGUAUCCUUCCC
[ reference structure ] ((((((.((......))))))))
[ predicted structure ] ((((((.((((..))))))))))
PDB_00709 (ext) [ FASTA input ] GGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCC
[ reference structure ] (((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
PDB_00710 (ext) [ FASTA input ] GACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCC
[ reference structure ] (((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
PDB_00713 (ext) [ FASTA input ] GAGGUGCCCGAGUGGCUGAAGGGGGUAGGGGGGCCUCCCUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCCUCUC
[ reference structure ] (((((([[[)).........]]]...((((((())))))).(((((.......)))))))))..
[ predicted structure ] (.((..)))((((((..((((((((((....))))))))))((((((...)..)))))))))))
PDB_00716 (ext) [ FASTA input ] AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC
[ reference structure ] ..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
[ predicted structure ] (.(((..)))).((((((((((((((((..)))((((.(((((((.....))))))))))))))))))))))))
PDB_00724 (ext) [ FASTA input ] GGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCCGGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ] ((((((((.(((((((.))))))))))))))).(((((((..(((((((.))))))).))))))).
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((((((...))))))).))))))))))))))))))))))).
PDB_00725 (ext) [ FASTA input ] GGUGGUGAAGUCGCUCGGCGAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ] (((((((..((((((((.)))))))).))))))).
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((...))))))))))))))).
PDB_00726 (ext) [ FASTA input ] GACCGGAGUGUCGACGCAGAGAUGGUC
[ reference structure ] ((((...((((()))))......))))
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))))))))
PDB_00727 (ext) [ FASTA input ] GGUCAUCGUUGAGAAAACGAAACAGACGGUGGCC
[ reference structure ] ((..(((((................)))))..))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))(((....)))))))))))
PDB_00728 (ext) [ FASTA input ] GGGAUACCAUGUUCAGAAGAACGUGGUAUCUC
[ reference structure ] (((((((((((((((..)))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((....))))))))))))))
PDB_00732 (ext) [ FASTA input ] GCGGAUCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGACCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGAUCCGCACCCGCGGAUCCGCACAA
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))...((((((((((..))))))))))....((((((((((..)))))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))(((((((((((((....))))))))))))).
PDB_00733 (ext) [ FASTA input ] GCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACGCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACCGGAUCCGCACCGCGGAUCCCCC
[ reference structure ] (((((((((((...)))))))))))..(((((((((((...)))))))))))....((((((((.))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))..(((((((((...)))))))))..
PDB_00734 (ext) [ FASTA input ] GGUGACGCCGUAAGGCGCAGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_00737 (ext) [ FASTA input ] GGCACGAGGUUUAGCUACACUCGUGCC
[ reference structure ] (((((((((((....))).))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((....))).))))))))
PDB_00740 (ext) [ FASTA input ] GAGGAAGGCGAUCGUUAAUCUC
[ reference structure ] ((((((((((()))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_00741 (ext) [ FASTA input ] GGGCUAGCACUCUGGUAUUACGGUACCUUUGUGCGCCC
[ reference structure ] ((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))
PDB_00750 (ext) [ FASTA input ] GGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCCGGGGCACGGCAAACCCCACC
[ reference structure ] (((((((((.....))))).((((....))))..((...(((((............(((((..((((((((())))))).)))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))))....)))..))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))((((((..))))).)....(.((((.............(((((((((((..)))))))).))))))))(((((...(((.(((((....))))))))((((((((((..))))))))))........)))))))))
PDB_00751 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGACUCGUACUUCGGUACUGGAGAAACAGCC
[ reference structure ] ..(((((((((((((..)))))..)))).))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))..)))).))))))
PDB_00754 (ext) [ FASTA input ] AAUCCAUUGCACGGAUUAAUCCAUUGCACUCCGGAUUUAAUCCAUUGCACGGAUU
[ reference structure ] .((((.......)))).(((((..........)))))...(((.......)))..
[ predicted structure ] (((((.((((((((((((((((((((..))))))))).))))))).)))))))))
PDB_00767 (ext) [ FASTA input ] GGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCGGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCACCAA
[ reference structure ] (((((((.(((.........))).)))))))(((((((.(((.........))).))))))).....
[ predicted structure ] (((((((((((((...)..))))))))))))(((((((((((((...)..)))))))))))).....
PDB_00800 (ext) [ FASTA input ] GGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUGGCAACGCC
[ reference structure ] ((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))(((((((((...)))))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00806 (ext) [ FASTA input ] UCCCAGUCCACCGCGGUGAGAAGGGGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ] .(((..((((((()))))))..)))(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ] .((((.((((((..)))).))))))(((((((((((.((((..))))))...)))))))))
PDB_00807 (ext) [ FASTA input ] UCGCAGUCCUAUUAAUAGAGAAGCGAGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ] .(((....((((()))))....))).(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ] (((((.((((((..)))).)))))))(((((((((((.((((..))))))...)))))))))
PDB_00809 (ext) [ FASTA input ] GAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUC
[ reference structure ] ((((((((((((((...))))).)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((...))))).)))))))))
PDB_00810 (ext) [ FASTA input ] GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU
[ reference structure ] ..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
[ predicted structure ] ..((((((((((((((((((((...)))..)))))))))))))))))
PDB_00815 (ext) [ FASTA input ] AUGCUCAUGCACUGCAUGAAUGCCCCUAAGGGAUGC
[ reference structure ] ....(((((.....)))))....((((.))))....
[ predicted structure ] ((..((((((...))))))))(((((...)))..))
PDB_00823 (ext) [ FASTA input ] GGUGGAGGCUGCCGAAGCCA
[ reference structure ] (((((((((.))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((...)))))))).
PDB_00828 (ext) [ FASTA input ] CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG
[ reference structure ] (((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((..((((((((((((((((((((((((...))))))))..))))))))))))))))))))))))
PDB_00829 (ext) [ FASTA input ] GGAUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGUC
[ reference structure ] .(((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..)))))))
[ predicted structure ] (((.((((((((((((((((...)))))))))))))(((((((..)))))))))))))((((..))))
PDB_00842 (ext) [ FASTA input ] AGUGGCGCCGACCACUUAAAAACACCGG
[ reference structure ] (((((..[[[.))))).........]]]
[ predicted structure ] .((((..))))((((((...)..)))))
PDB_00851 (ext) [ FASTA input ] GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC
[ reference structure ] ((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
[ predicted structure ] ....((((((((((((((((...))).((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))((((((((((((((..)))))).))))))))
PDB_00855 (ext) [ FASTA input ] GGAUAUAUGAUACAAUUUGAUCAGUAUAUCC
[ reference structure ] ((((((.((((........))))..))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.((...)))))).)))))))
PDB_00857 (ext) [ FASTA input ] GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCCAAACAAAAAAGUCAGCA
[ reference structure ] ((((((........[[[[[[[[[))))))........]]]]]]]]].
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...))))))...)))))))))))))...
PDB_00863 (ext) [ FASTA input ] UUGCGUCACACCGGUGAAGUCGCUGCGUCACACCGGUGAAGUCGC
[ reference structure ] ..(((((.((((((((..(((((.))))).))))))))..)))))
[ predicted structure ] ..(((((((((((((((.((((...)))))))))))))).)))))
PDB_00864 (ext) [ FASTA input ] GAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGAUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUG
[ reference structure ] ..((((((((((((..))))))))))))...((((((((.(((.....)))..))))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).))))
[ predicted structure ] ..((((((((((((..))))))))))))...(((((....((((...)))).....)))))..((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((...)))))))))))))))...(((((...)))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00865 (ext) [ FASTA input ] GGUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUACC
[ reference structure ] ((((((((((((...))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))))))))
PDB_00868 (ext) [ FASTA input ] GCUGGUCCGAUUGACUAGCCGCUGGUCCGAUUGACUAGCCUCCGAGGUCCGA
[ reference structure ] (((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((...)))))))))))))))))).(((((..)))))
PDB_00870 (ext) [ FASTA input ] GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ] (((((((((((((((())))))))))))))))................
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))
PDB_00871 (ext) [ FASTA input ] CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))
PDB_00873 (ext) [ FASTA input ] AAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUU
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00874 (ext) [ FASTA input ] CGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCG
[ reference structure ] ((((((((([[)))))))))..(((((((((..)))))))))]]
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))..
PDB_00876 (ext) [ FASTA input ] GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC
[ reference structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
PDB_00878 (ext) [ FASTA input ] GAGGUCGGCCCGACUUCGGUCACUGCCACCUC
[ reference structure ] (((((.(((..((((..))))...))))))))
[ predicted structure ] (((((.(((((((((..)))))).))))))))
PDB_00883 (ext) [ FASTA input ] GGCUCUUUUCAGAGCCGGCUCUUUUCAGAGCCAAAA
[ reference structure ] ((((((....))))))((((((....))))))....
[ predicted structure ] ((((((....))))))((((((....))))))....
PDB_00885 (ext) [ FASTA input ] GGCGAUCUGGCCUUCCUACAAGGGAAGGCCAGGGAAUUGCC
[ reference structure ] ((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((....)))))))))))...))))))
PDB_00886 (ext) [ FASTA input ] CUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAG
[ reference structure ] (((((((..{{{{{{.)))))))(((((((..}}}}}}.)))))))(((((((..[[[[[[.)))))))(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((..))))))).)))))))))))))))))))))).))))))))))))))
PDB_00890 (ext) [ FASTA input ] ACAUGAGGAUCACCCAUGUACAUGAGGAUCACCCAUGU
[ reference structure ] (((((.((....)))))))(((((.((....)))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.((((((..)))))))))).)))))))
PDB_00891 (ext) [ FASTA input ] GGCCACGGUUCGAAUCCGUGGCGGCCACGGUUCGAAUCCGUGGC
[ reference structure ] ((((((((.......))))))))(((((((.......)))))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((.((((((...)))))))))))).)))))))
PDB_00892 (ext) [ FASTA input ] CUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUG
[ reference structure ] ((((.((...((............))...)).))))...........((((((()))))))...........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00906 (ext) [ FASTA input ] GUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACCGUGGUGAAGUCGCGGCGCGUCACACCACC
[ reference structure ] ((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).((((((..((((((.)))))).)))))).
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((...)))))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).
PDB_00918 (ext) [ FASTA input ] GCGGCACCGUCCGCUCAAACAAACGG
[ reference structure ] ((((..[[[.)))).........]]]
[ predicted structure ] ((((..))))((((((....))))))
PDB_00923 (ext) [ FASTA input ] CCACGGUUCGAAUCCGUGGC
[ reference structure ] ((((((.......)))))).
[ predicted structure ] (((((((...)..)))))).
PDB_00924 (ext) [ FASTA input ] GGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCUGGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCU
[ reference structure ] (((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))(((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))
PDB_00925 (ext) [ FASTA input ] GGAGCGGGGGUGUAAACCUAUCGCUCC
[ reference structure ] ((((((.(((((..)))))..))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))).)))))))
PDB_00928 (ext) [ FASTA input ] CUCGCGGAUCAGUCACCCAAGCGAG
[ reference structure ] ((((((((.........))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...)))))..)))))
PDB_00929 (ext) [ FASTA input ] GGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCU
[ reference structure ] (((((((((())))))))))(((((((((())))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
PDB_00932 (ext) [ FASTA input ] GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC
[ reference structure ] ((((((.......((.(((((..)))))...))..))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((..))))))))).(((((..)))))))))
PDB_00937 (ext) [ FASTA input ] GCAUGGACGCGUCCAUGCGCAUGGACGCGUCCAUGC
[ reference structure ] (((((((((((((((((())))))))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((..)))))))))))))))))
PDB_00943 (ext) [ FASTA input ] UUGACUACGGAUCAAUUGACUACGGAUCAAGACUACGGUUUGACUACGGAUCAA
[ reference structure ] (((((.....)))))(((((.....))))).........(((((.....)))))
[ predicted structure ] ((((((..)).))))((((.(((((((((((((...))))))).))))))))))
PDB_00945 (ext) [ FASTA input ] CAGCACUGAUUGCGGUCGAGGUAGCUUGAUG
[ reference structure ] .((((.....))))((((((....)))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((..)))))))))).))))
PDB_00960 (ext) [ FASTA input ] UUCGACGCGUCGAAUUUUCGACGCGUCGA
[ reference structure ] .(((((..)))))....(((((..)))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((..)))))))))))))
PDB_00961 (ext) [ FASTA input ] AGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGAC
[ reference structure ] .............(((((.......))))).............(((((.......)))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))(((((((...)))))))
PDB_00964 (ext) [ FASTA input ] ACAUGAGGAUUACCCAUGUCAUGAGGAUUACCCAUG
[ reference structure ] (((((.((....)))))))..((.........))..
[ predicted structure ] (((((.((....)))))))((((.((....))))))
PDB_00966 (ext) [ FASTA input ] UGUCUAAGACAGUGUCUAAGACA
[ reference structure ] .(((...)))..((((...))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))))))
PDB_00973 (ext) [ FASTA input ] AUGAGGAUAACCCAUGAGGAUAACCCA
[ reference structure ] .((.((....))))((.((....))))
[ predicted structure ] .((.(((((((((..).))))))))))
PDB_00974 (ext) [ FASTA input ] AUGAGGAUGACCCAUUGAGGAUGACCCA
[ reference structure ] (((.((....)))))((.((....))))
[ predicted structure ] (((.((....)))))((.((....))))
PDB_00979 (ext) [ FASTA input ] GGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUCGGGACCAGGGGUGCUUGUUCACAGGCUGAGAAAGUCCCUUUGAACCUGAACAGGGUAAUGCCUGCGCAGGGAGUGUC
[ reference structure ] ..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))..(((.(((((((((((....)))))......)).))))....((((((.((((......)))))).))))...)))
[ predicted structure ] ..(((((((((.((((((((((..).))))))))))))))..((((((..))))))..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..).)))))))))))))))))))))))......)))))))))))))))))).)))
PDB_00986 (ext) [ FASTA input ] CGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUG
[ reference structure ] ((((((((..(((((())))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((..(((((..)))))))))))))
PDB_00987 (ext) [ FASTA input ] GCUGAAGUGCACACGGCGCUGAAGUGCACACGGC
[ reference structure ] (((((.((((((((((())))).)))))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((((((((..)))).)))))))))))
PDB_01001 (ext) [ FASTA input ] CUCUCGGUAGCCAAGGGAAGGCGCAAGGUAAAUGAGUCGGGCGUUCGACUCGCCCCCGGGAGACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.......)))(((.......)))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))....
PDB_01002 (ext) [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ] (((((((....(((.....)))...((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((...))))))(((((....))))))))))))))((((((...)..))))).((((..))))
PDB_01008 (ext) [ FASTA input ] GGCCCGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCUGGGCCACCA
[ reference structure ] ((((((((((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((...)..))))))))))))....
PDB_01009 (ext) [ FASTA input ] GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC
[ reference structure ] ((((((((([[[)).......]]]..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))
PDB_01017 (ext) [ FASTA input ] UAGGGCCCGGGCCCUUAGGGCCCGGGCCCU
[ reference structure ] .((((((())))))).((((((()))))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((...)))))))))))))
PDB_01019 (ext) [ FASTA input ] AUGGGCCCGGGCCCAAUGGGCCCGGGCCCA
[ reference structure ] .((((((())))))).((((((()))))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((...)))))))))))))
PDB_01020 (ext) [ FASTA input ] GGACAUUUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACAAUGUCCA
[ reference structure ] .((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..))))))..
[ predicted structure ] (((((((((.(((((((((...)))))))))(((..)))(((...))))))))))))(((...)))..
PDB_01025 (ext) [ FASTA input ] GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC
[ reference structure ] (((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))))))
PDB_01035 (ext) [ FASTA input ] AAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAUAAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAU
[ reference structure ] ((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_01040 (ext) [ FASTA input ] GGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAACGGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAC
[ reference structure ] .(((((((..[[[[[[.))))))).(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ] .((((((((.(((((((((((((...))))))).))))))))))))))
PDB_01044 (ext) [ FASTA input ] AGACAGCAUAUAUGCUGUCUUUAGACAGCAUAUAUGCUGUCUUU
[ reference structure ] .((((((((((.((((((......)))))).))))))))))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))..
PDB_01045 (ext) [ FASTA input ] AGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCUUUAGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCU
[ reference structure ] .(((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))
PDB_01050 (ext) [ FASTA input ] GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC
[ reference structure ] ((((((..(((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((...))))))))))))))))
PDB_01051 (ext) [ FASTA input ] GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC
[ reference structure ] (((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
[ predicted structure ] (((((.(((..((((.((((((...))))))))))))))))))
PDB_01053 (ext) [ FASTA input ] GCUUCCAUAGCUCAGCAGGUAGAGCGUCAGCGGUUCGAGCCCGCUUGGAAGCU
[ reference structure ] (((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))).((((((...)..)))))))))))).
PDB_01056 (ext) [ FASTA input ] GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC
[ reference structure ] (((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((...))))))))))
PDB_01057 (ext) [ FASTA input ] GGACUGUCCACAAGACAGUCC
[ reference structure ] ((((((((.....))))))))
[ predicted structure ] (((((((((...)))))))))
PDB_01059 (ext) [ FASTA input ] GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG
[ reference structure ] ((((.[[[.)))).....]]].
[ predicted structure ] (((((((.(.....))))))))
PDB_01060 (ext) [ FASTA input ] CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ] ................(((((((..)))))))((..(((())))..))(((((((())))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01061 (ext) [ FASTA input ] GGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCC
[ reference structure ] (((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01062 (ext) [ FASTA input ] UGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGCUGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGC
[ reference structure ] .(((((..((((((...(((((.)))))..))))))...)))))
[ predicted structure ] .(((((((((((((((.((((...)))))))))))))).)))))
PDB_01065 (ext) [ FASTA input ] CGCAAUUAGCGCGCAAUUAGCG
[ reference structure ] (((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_01070 (ext) [ FASTA input ] GGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUCGGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUUC
[ reference structure ] ((((((((((.(((.(((.[[..))))))........)))))....((((((.((((......)))))).)))).)))))((((((((((.(((.(((.]]..))))))........)))))....((((((.((((......)))))).)))).)))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((.....))))...).))))..))))...(.(((((((((((....)))))))))))).)))))((((((((((((((((((.....))))...).))))..))))...(.(((((((((((....)))))))))))).)))))
PDB_01071 (ext) [ FASTA input ] GGCCAUCUUGCUCUUCGGAGGAUUUGGCC
[ reference structure ] (((((((.((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((.(((((((..)))))))))))))
PDB_01073 (ext) [ FASTA input ] GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGAUGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA
[ reference structure ] ((((((((......(((((((((.[[[[)))...)))))).(((..((((..)))).)))....]]]]((((((..))))))...)))))))).
[ predicted structure ] (((((((((.(.(((((((((((((((((..))).))))))).(.(((((..))))))))))))))((((((((..))))))))))))))))).
PDB_01074 (ext) [ FASTA input ] GCGACCGACCAUAGCUGCUGCAGCGGUCAAAGGUCGCGCGACCGACCAUAGCUGCAUGCAGCGGUCAAAGGUCGC
[ reference structure ] .(((((((((...((((...))))))))...))))).((((((((((...((........))))))...))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))).))))))))))))))))))
PDB_01075 (ext) [ FASTA input ] GACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUCGACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUC
[ reference structure ] ((((((((((((.((((((((((((((((..(((()))))))))))).))))))))))))))))..))))
[ predicted structure ] (((((((((((((.(((((((((((((((..(((..)))))))))))).)))))))))))))))..))))
PDB_01077 (ext) [ FASTA input ] GGAUGUACUACCAGCUGAUGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCCGGCGUCCUGGUAUCCAAUCC
[ reference structure ] (((((...((((((.......(((........)))...((((())))).)))))).))..)))
[ predicted structure ] (((((((((.(((((.(((((((((((..)))))))))))))))))))))(((...)))))))
PDB_01084 (ext) [ FASTA input ] GGCCAGACUCCCGAAUCUGGCC
[ reference structure ] (((((((........)))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_01097 (ext) [ FASTA input ] GGCGAUACACUAUUUAUCGCC
[ reference structure ] ((((((((.....))))))))
[ predicted structure ] (((((((((...)))))))))
PDB_01099 (ext) [ FASTA input ] GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC
[ reference structure ] (((((((((((..)))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_01100 (ext) [ FASTA input ] GGGCCAUACCUCUUGGGCCUGGUUAGUACCUCUUCGGUGGGAAUACCAGGUGCCC
[ reference structure ] ((((....((....))(((((((((.(((((((..))))))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((....(((..)))(((((((((.(((((((..))))))))))))))))))))
PDB_01108 (ext) [ FASTA input ] GGCGUGAUCAAGUGAUCGCGCC
[ reference structure ] (((((((((....)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_01114 (ext) [ FASTA input ] GCGACUCGGGGUGCCCUGCGUGAAGGCUGAGAAAACCCGUAACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGAGGGAAGUCGCA
[ reference structure ] ((((((((((((((((.......))))......)))))).(((((((.((((......))))))))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..)))))).)))))))))..(((((((((((((..))))))))))))))))))).
PDB_01117 (ext) [ FASTA input ] GGCCUCCAGCGACGGCCUUCGGGACUAGCAAACGGAGGCC
[ reference structure ] ((((((((((((.(((((..)))))))))...))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((.(((((..))))))))))...)))))))
PDB_01118 (ext) [ FASTA input ] GGGUCCGCCUUGAUGCCCGGGUGAAAGCAUGAUCCCGGGUAAUAUGGCGGACCCACA
[ reference structure ] (((((((((.....((((((((((......)))))))))).....)))))))))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))...
PDB_01119 (ext) [ FASTA input ] GGGGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACCCC
[ reference structure ] ((((((((((.((((..)))).....))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))))....)))))))))
PDB_01126 (ext) [ FASTA input ] GAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAUCCCCUC
[ reference structure ] (((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((.....)))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))((((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01127 (ext) [ FASTA input ] GCCUACCCGGUAGGCUUUUCAAGCCUACCCCGGUAGGCUUUUCAA
[ reference structure ] (((((((.))))))).......(((((((..))))))).......
[ predicted structure ] ((((((...))))))((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_01128 (ext) [ FASTA input ] CUGCCCUCAUCCGUCUCGCUUAUUCGGGGAGCGGACGAUGACCCUAGUAGAGGGGGCUGCGGCUUAGGAGGGCAG
[ reference structure ] ((((((((...((((.((((((.....))))))))))....(((((...)))))((((..))))...))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((.((((...)))))))))))))))))).)))))))))))))))))
PDB_01130 (ext) [ FASTA input ] GUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAACGUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAAC
[ reference structure ] (((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
[ predicted structure ] (((((.(.(((((((((((((((((((((..)))).)))))))))))))).)))))))))
PDB_01133 (ext) [ FASTA input ] GGCCUCCAAGCUGUGCCUUGGGUGGCC
[ reference structure ] ((((((((((......)))))).))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..)))))))).))))
PDB_01135 (ext) [ FASTA input ] AUGAGGCUCACCCAUGUGAGGCUCACCCA
[ reference structure ] (((.((....))))).((.((....))))
[ predicted structure ] (((((((((((....)))))))))))...
PDB_01137 (ext) [ FASTA input ] UGCGGAUCACCCAUGCGGAUCACCCA
[ reference structure ] ((.((....))))((.((....))))
[ predicted structure ] (((((((((((...))))))).))))
PDB_01138 (ext) [ FASTA input ] AUCGCGAUUACGGAUCGCGAUUACGG
[ reference structure ] (((.((....)))))..((....)).
[ predicted structure ] (((((((((...))))))))).....
PDB_01145 (ext) [ FASTA input ] GGGCUUCACGGAUGAAGCCCGGGCUUCACGGAUGAAGCCC
[ reference structure ] (((((((......)))))))(((((((......)))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))(((((((((..)))))))))
PDB_01150 (ext) [ FASTA input ] GGAGUGGCCGAAAGGCAUCUCC
[ reference structure ] ((((..((((..))))..))))
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))
PDB_01152 (ext) [ FASTA input ] GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC
[ reference structure ] ((((((((((((..((...)).))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((.(((...)))))))))))))))
PDB_01154 (ext) [ FASTA input ] GAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUC
[ reference structure ] (((((...((((((..))))))..)))))
[ predicted structure ] (((((((((((((...)))))))))))))
PDB_01156 (ext) [ FASTA input ] CGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGGCGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGG
[ reference structure ] ((((((.....((((((((.(((.))).)))).)))))))))).((((((.....((((((((((((.)))))))).)))))))))).
[ predicted structure ] ((((((.....(((((((((((((((((((((.(((((((((...))))).....))))))))))))))))))))).)))))))))).
PDB_01160 (ext) [ FASTA input ] GGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAAAUCCCUCGGCGUGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGUCC
[ reference structure ] (((..((((.........))))((((((..))))))(((..)))...((((.......)))))))
[ predicted structure ] ((((((.(((((((..))))))(((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))
PDB_01162 (ext) [ FASTA input ] AGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCGGUAGUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUC
[ reference structure ] ........................(((())))...(((((.......)))))....
[ predicted structure ] ((((((.((((((((((((...))))((((((..)))))).)))))))))))))).
PDB_01163 (ext) [ FASTA input ] GGGACAAGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCUUGUCCC
[ reference structure ] ((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
PDB_01164 (ext) [ FASTA input ] CAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCG
[ reference structure ] ((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
PDB_01167 (ext) [ FASTA input ] UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA
[ reference structure ] ((((((((....))))))))
[ predicted structure ] ((((((((....))))))))
PDB_01168 (ext) [ FASTA input ] GGUUUGCCUUUUGGCUUACC
[ reference structure ] ((((((((....))))))))
[ predicted structure ] ((((((((....))))))))
PDB_01178 (ext) [ FASTA input ] GGCGUCGCUAGUACCGGGUACUAAAAGUCGCCC
[ reference structure ] (((((((.(((((((.)))))))..))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((...))))).))))))))).
PDB_01194 (ext) [ FASTA input ] GGAGCCUGGGAGCUCCCACGGUCCCAGACGUG
[ reference structure ] ((((([[[[[.)))))(((((.]]]]])))))
[ predicted structure ] ((((((...).)))))((((.((...))))))
PDB_01199 (ext) [ FASTA input ] AUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAUAUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAU
[ reference structure ] (((((.(((...((((.....))))))))))))(((((.(((...((((.....))))))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((((((((((((((((((((((((..)))).)))))))))))))))))))))))))))
PDB_01201 (ext) [ FASTA input ] GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUCUUCGGCUCUUCCUA
[ reference structure ] ((((([[[[[[(((((..)))))[[[[[[)))))]]]]]]..]]]]]]
[ predicted structure ] .....(((((((((((..)))))((((.(((..)))))))..))))))
PDB_01203 (ext) [ FASTA input ] GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCCACUGGCUUGUGGCG
[ reference structure ] (((((.[[[[[(((((..)))))..[[[[.))))).]]]]...]]]]].
[ predicted structure ] .....(((((((((((..)))))((((((((...)))))))).))))))
PDB_01205 (ext) [ FASTA input ] GGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCC
[ reference structure ] (((((((((.....)))))))))(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
PDB_01208 (ext) [ FASTA input ] GGUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUGCC
[ reference structure ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ] ((.((((((((((((..)))))(((..)))))))))))).(((...)))
PDB_01209 (ext) [ FASTA input ] GGGGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUUCC
[ reference structure ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
PDB_01212 (ext) [ FASTA input ] GGGUGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACGUCC
[ reference structure ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
PDB_01213 (ext) [ FASTA input ] GCGGGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACUU
[ reference structure ] ..((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))
[ predicted structure ] ..(((((((((((((..)))))(((..)))))))))))(((...)))
PDB_01216 (ext) [ FASTA input ] GCUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGCGGC
[ reference structure ] ((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
PDB_01219 (ext) [ FASTA input ] CGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCG
[ reference structure ] (((((((.((())))))).)))(((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))
PDB_01237 (ext) [ FASTA input ] GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC
[ reference structure ] ((((((((........))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_01249 (ext) [ FASTA input ] GGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCCGGCACAGAAGAUAUGGCUUCGUGCC
[ reference structure ] (((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))(((((.((((......)))))))))
[ predicted structure ] (((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((..)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))(((((.((((((..)))))))))))
PDB_01250 (ext) [ FASTA input ] GCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGAGCGCGGCGAUUUAACCGUAUUGCAGUCGCGUGAUAAAUGUAGCUAAAAAGGA
[ reference structure ] .((((((.......<<<.<<<<<.))))))...........>>.>>>.>>>..((((((.......{{..{{{{{.))))))...........}}.}}}..}}..((((((.......[[[.[[[[[.))))))...........]].]]].]]].
[ predicted structure ] ........((((((((((((((((((.(((.((((((((..(((.......))).....))))))))))))))))))).))).)))))))(((((((((....(((((((((((((....))))))))).))).)......)))))))))......
PDB_01251 (ext) [ FASTA input ] GCGUUUGAAACGCGCGUUUGAAACGC
[ reference structure ] ((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))))))
PDB_01255 (ext) [ FASTA input ] GGAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCA
[ reference structure ] .....((((((((.((((((.((.((((.((((.(((.((((((((((....)))))))))).(((.....)))....)))......)))))))))).))))))))))))))(((.(((((...((((((((.....))))))))..))))).)))...
[ predicted structure ] ((((((((..((((((.........))))))(.((((((((((((((((..)))))))))))(((((....))))).))))))...((((.(((((...))))......)))))...((((.(((((((((((...)))))))))))))))))))))))
PDB_01260 (ext) [ FASTA input ] GGGCUCCGGAAACCGCGGCGCGCGCUUCGCUCCCGGAGCCCACACUAGGAGCGUGCGGUUU
[ reference structure ] (((((((((.[[[[[[((((())))).[[[[[))))))))).......]]]]].]]]]]].
[ predicted structure ] .((((..))))(((((((((..))))((((((((((((....)))))))))))))))))..
PDB_01262 (ext) [ FASTA input ] ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU
[ reference structure ] ((((((((....))))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))
PDB_01281 (ext) [ FASTA input ] GCGGGAAGCGGGAAUUCCCGCUUCCCGC
[ reference structure ] ((((((([[[[[[[)))))))]]]]]]]
[ predicted structure ] (((((((((((((..)))))))))))))
PDB_01299 (ext) [ FASTA input ] GGUUAUUCAGAUUAGGUAGUCGAAUGACCUAAGAAAUUUACCU
[ reference structure ] ((((((((.((..[[[[[.)))))))))).........]]]]]
[ predicted structure ] ((((((((.(((((..)))))))))))))((((...))))...
PDB_01309 (ext) [ FASTA input ] CACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUGCACCGGAUGGUUCGGUG
[ reference structure ] .((...((((..((((.[[[[........[[[[({{{{{{{{..{{{{(..<<<<....<<<.......))))..))))...)).)]]]]........]]]]..)}}}}..}}}}}}}}......>>>....>>>>
[ predicted structure ] .........((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).........
PDB_01313 (ext) [ FASTA input ] GAUCACUUCGGUGAUCACUUCGGU
[ reference structure ] ....((((((((....))))))))
[ predicted structure ] (((((((..)))))))(((..)))
PDB_01325 (ext) [ FASTA input ] CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ] (((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((..)))))))))))
PDB_01332 (ext) [ FASTA input ] GGUGUCUUGGAGUGCUGAUCGGACACC
[ reference structure ] (((((((..((.......)))))))))
[ predicted structure ] (((((((..((((...)))))))))))
PDB_01337 (ext) [ FASTA input ] CCGGAGGAUCACCACGGGCGGAGGAUCACCACGG
[ reference structure ] ((((.((....)))))).(((.((....))))).
[ predicted structure ] (((((((....)))))))((((((....))))))
PDB_01338 (ext) [ FASTA input ] CCACAGUCACUGGGCAGUCACUGG
[ reference structure ] ((.(((...)))))(((...))).
[ predicted structure ] .(.(((((((((..))))))))))
PDB_01340 (ext) [ FASTA input ] UCGCCAACAGGCGGGCCAACAGGCG
[ reference structure ] (((((....)))))(((....))).
[ predicted structure ] (((((....)))))(((....))).
RFA_00389 (ext) [ FASTA input ] GAAAGGUCUGUGCUUAGCACACUGACGAGUUCCUGAAAUGGAACGAAACCUUUU
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...)))))..)))(((((((((..)))))))))...)))))
RFA_00390 (ext) [ FASTA input ] GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00391 (ext) [ FASTA input ] CAUAAGUCUAGGCUUAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAGAUACGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00396 (ext) [ FASTA input ] UAAGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAAUCUCUGAAAUGAGACGAAACUCUUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00402 (ext) [ FASTA input ] GAUGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUAUGAAAUGAGACGAAACUCAUA
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00409 (ext) [ FASTA input ] CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAAAUACGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00416 (ext) [ FASTA input ] CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ] .((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((..)))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00420 (ext) [ FASTA input ] UCCAGUCGAGACCUGAAGUGGGUUUCCUGACGAGGCUGUGGAGAGAGCAAAUUGCUUUACUCCCGCACAAGCCGAAACUGGA
[ reference structure ] ((((((.(((((.........))))).......((((................................))))...))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((.((((((((((((((..))))).)))(((((((...)))))).)))))))))))))))))))))))
RFA_00425 (ext) [ FASTA input ] ACAGAGUCUGACAAACCGUCACUGAAGACGUUCAACUUGCGUUGAACAGAAACUCUGC
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((............))))...)))))).
[ predicted structure ] ((((((((((......((((((..))))))((((((....)))))))))..)))))))
RFA_00427 (ext) [ FASTA input ] UCACCGUCGGAAAGUGUGCGCUUUCCCUGAUGAGCCCGAAAGGGCGAAACGGUAC
[ reference structure ] .((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ] (.((((((((((((((..)))))))))...((((((((..)))))))))))))).
RFA_00429 (ext) [ FASTA input ] GGGUGGUGUGUACCACCCCUGAUGAGUCCGAAAGGACGAA
[ reference structure ] (((((........))))).......((((....))))...
[ predicted structure ] ((((((((..))))))))....((((((((..))))))))
RFA_00433 (ext) [ FASTA input ] GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00434 (ext) [ FASTA input ] CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCUUUGCGAUAAGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00436 (ext) [ FASTA input ] CAUAAGUCUGGGCUUAGCCCACUGAUGAGUCGCUGCGAUGCGACGAAACUUAUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00440 (ext) [ FASTA input ] GAAGAGUCCUGCGCUUAGCGCACUGACGAGUCUCUGAGAUGAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ] .((((((..(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((..((((((((((((((((((..)))))))))))))).)))))))))))
RFA_00442 (ext) [ FASTA input ] CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG
[ reference structure ] .((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((...))))))...((((((((((..)))))))))))))))))
RFA_00444 (ext) [ FASTA input ] ACGCUGUCUGUACUUGUAUCAGUACACUGACGAGUCCCUAAAGGACGAAACAGCGC
[ reference structure ] .((((((.(((((........))))).......((((.....))))...)))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..(((((..)))))))))).(((..))))).)))))))))
RFA_00446 (ext) [ FASTA input ] CCGGUGUCUCAAGGUGCGUACCUUGACUGAUGAGUCCGAAAGGACGAAACACCAG
[ reference structure ] .((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))...((((((((..)))))))))))))))
RFA_00449 (ext) [ FASTA input ] CCGCUAUAUGGGGAUGUGUGUCCCUACUGACGAGUUCAAAAGAACGAAAUAGUUA
[ reference structure ] .((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ] ..((((((((((((((..))))))(((((((((..)))))))))).)))))))..
RFA_00582 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUGUUCACAGUCAGUUACAGAUCGAACUCCUUGUUCUACUCUUUCCCCCCUUCUCACUACUGCACUUGACUAGUCUU
[ reference structure ] ((((((((....(((((((...................................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))).))))).(((((...)))))..............))))))))))))...))))))))))..
RFA_00583 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCCGAGUGCAGUGGUGUUUACAACUAAUUGAUCACAACCAGUUACAGAUUUCUUUGUUCCUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGCCUU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((........................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))(((((....))))).....))))))))).)))))...))))))))))))..
RFA_00584 (ext) [ FASTA input ] AGUUGGUCCGAGUGUUGUGGGUUAUUGUUAAGUUGAUUUAACAUUGUCUCCCCCCACAACCGCGCUUGACUAGCUUG
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((.................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((((((.((((((((((((((((((((..)))))))))))).....))))))))))))...))))))))..
RFA_00585 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..))))))))).((((((..))).))))))))))))))))))))))))..))))))))..
RFA_00586 (ext) [ FASTA input ] GGUUGGUCCGAAAGUUGUGGGUUAUCCAAAUCAUUCAGUUAGUAUCACUAACCUUCUAUUUCACCCCACUGCUGACCUUGACUGGCCAA
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((.............................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((...((((.(((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))..
RFA_00587 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))).(((((....))))))))))))).))))))))))))..)))))))))))).
RFA_00588 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCCGAAAGUAGUGGGUUAUCACAGAAAUUAUUACAGUUAGUUUCACUAACCUUUCUAAGUUCCACCCCACUGCUAACCUUGACUGGUCUU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((....................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.....(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))..
RFA_00589 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUCCGAUGGUAGUGGGUUAUCAGAACUUAUUAACAUUAGUGUCACUAAAGUUGGUAUACAACCCCCCACUGCUAAAUUUGACUGGCUUU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((..................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((...))))((((((((((..))))))))))((((((...))))))..))))))))..))))))))))))..
RFA_00590 (ext) [ FASTA input ] GCUCGGUCCGAGUUUCAUGGUCUCCAAUGUGUGUGUGUGUGUGUUUUCUUUAGGAACCUCGGUUCCAACCUCAUCUUGACCUUGAAACUACUUUGACCGCUCCU
[ reference structure ] ((((((((..(((((((.................................................................))))))).....))))))))..
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))).))))))))))))).)...))))))))..
RFA_00594 (ext) [ FASTA input ] AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((...............................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))).).)))))))))))).))).))))))))..
RFA_00596 (ext) [ FASTA input ] GGCUGGUUGGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUAUUCACAGUCCGCUACAGAUUGAACUCCUGUUCUAUACUUUUUCCACUUCUCACUUCUGCACAUGACUAAGGAU
[ reference structure ] ((((((((.....(((((((..................................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ] (((((..((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))(((((....)))))(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))
RFA_00603 (ext) [ FASTA input ] UUAUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUUUU
[ reference structure ] .....(((((..........(((.(((.....))).)))......................................((((((((........))))))))...)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
[ predicted structure ] .....((((((((.......((((((((...))))))))...............................(((((.........)))))...........))).)))))....(((((.........((((((.......)))))).....))))).........
RFA_00604 (ext) [ FASTA input ] AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU
[ reference structure ] .....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
[ predicted structure ] .((.(((((((((((......((((((((.....))))))))....................................((((((((((....)))))))))))))))))))))))((((((((..(((((((((.(....)))))))))))))))))).......
RFA_00610 (ext) [ FASTA input ] AGUCGGCGGAAAUCAGUCAGUCAUAGCGCUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAAAUUAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGCUCCGCCGACUCAGAGGGCACUGUGGGCUGAGCAAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUUGCUUAGCCCUACCUCUAUCUUUU
[ reference structure ] .....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...))))).......(((((.(((....(((.(((((...........((((.....))))..))))).)))))))))))........
[ predicted structure ] ((((((((((...........................................................(((((((..............)))))))....)))))))))).............(((((((((((..........................)))))))))))..............
RFA_00611 (ext) [ FASTA input ] UUAUACCCGCAUAUCAUUCAGACCCUUUAUGGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUGUCUUAAUUACUUAGGCUAAAAGAAAUAAGUAUUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUU
[ reference structure ] .....(((((........(((.(((.....))).)))......................................((((((((............))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........))))))))))))))))......
[ predicted structure ] ...(.(((((((.......((((..(((((((...............)))))))...............))))...............................)))))))).((((((((((...(((((.(((...))))))))))))))))))......
RFA_00613 (ext) [ FASTA input ] UUAUACCCGCAUUUUCAUUCAGAUCUUUAAUGGAGCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAACUACUGCCUUAACUACUUAGGCAAAAUAAGUCGUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUAUCUUAUUUUUUAU
[ reference structure ] .....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........)))))))))))))))).........
[ predicted structure ] .............((((((..((((.........((((((...............................(((((((((((((.......)))))))))))).).)))..)))......(((((...)))))...))))))))))...............
RFA_00615 (ext) [ FASTA input ] UUAUACCCGCACAUUCACUCAAAUCUGUAAUAGACUUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUACCUUCGCCAAUUAGGUACAAUUAAUGGUUCUCGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACAUUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUCUU
[ reference structure ] .....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))....)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
[ predicted structure ] .............................(((((((((((.............................(((((.........)))))...................)))..)))))))).(((((((((((.......))))))...)))))...........
RFA_00636 (ext) [ FASTA input ] GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA
[ reference structure ] ...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
[ predicted structure ] ((((((((((.(((((((((((..)))))))))))))))(((((((((((((((((((...))).)))))).)))))))))).)))))).
RFA_00642 (ext) [ FASTA input ] UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA
[ reference structure ] ....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))))((((((((..))))))))((((((((((((((....)))))))..)))))))...
RFA_00643 (ext) [ FASTA input ] AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU
[ reference structure ] ....(((((((((..........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ] ......((((((...))))))((((((((.(((((((((.((((..)))))))))))))))))))))
RFA_00644 (ext) [ FASTA input ] GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA
[ reference structure ] ....(((((((((.................)))...((((.(((((........)).)))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))))))((.(((((.(.(((((((((((((..))))))))))))))))))))).
RFA_00645 (ext) [ FASTA input ] AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA
[ reference structure ] ....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
[ predicted structure ] .....((((((((((....((((((((((((((((((...)..)))))))))))))))))))))))))))
RFA_00649 (ext) [ FASTA input ] UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU
[ reference structure ] ....(((((((((........)))...((((.(((..((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ] (((.((((((.(((((((.(((((..))))))))))))((.(((((...)))))))))))))))).
RFA_00651 (ext) [ FASTA input ] UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA
[ reference structure ] ....(((((((((........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((.(((((((((....))))).))))((((((((((((..))))))))))))))))).....
RFA_00653 (ext) [ FASTA input ] GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA
[ reference structure ] ....(((((((((.....)))...((((.(((...((........))..)))))))))))))....
[ predicted structure ] ....((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))
RFA_00654 (ext) [ FASTA input ] UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA
[ reference structure ] ....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((((((((((((((.(((((..))))))))))))))))))))))))))(((..)))......
RFA_00658 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..((((....))))(((...))))))).))))))))
RFA_00659 (ext) [ FASTA input ] AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))).(((((..)))))))))))).)))))
RFA_00664 (ext) [ FASTA input ] CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ...(((..(((..))))))((((((((((.....))))))))).)
RFA_00667 (ext) [ FASTA input ] AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))
RFA_00668 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..))))))))((((((((...))))))))))))
RFA_00672 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...((())).))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..))))))...)))))))))))))
RFA_00673 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ] (((((.(((((((((((((..)))))))))))).)(((..))))))))
RFA_00674 (ext) [ FASTA input ] AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((.(..((((((..)))))))))).((((..))))))))))
RFA_00675 (ext) [ FASTA input ] AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((..)))))))))(((((((((.....))))))..)))
RFA_00677 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((..(((((((.(((..)))(((..))))))))))))))))
RFA_00678 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((.(((((((((..))))))..)))))...)))))))
RFA_00680 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..(((((..)))))(((...))))))).))))))))
RFA_00683 (ext) [ FASTA input ] GCAAUACUGAAGAGUUCCACAAUAGGACGAAACGGCGAUCCAGUGU
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((..))))))))((((((((((((....))))))))))))
RFA_00684 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((....))))))))))).)))....))))
RFA_00685 (ext) [ FASTA input ] AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))))))))..).))..)))))
RFA_00704 (ext) [ FASTA input ] AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((..(((((((((((((...)))))))))..))))))))))
RFA_00705 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((..)))))).((((((((...))))))))))))))
RFA_00706 (ext) [ FASTA input ] CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((....))))))))(((((((...))))))))))).
RFA_00707 (ext) [ FASTA input ] GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((....))))))(((((((...))))))).))))))
RFA_00708 (ext) [ FASTA input ] GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((..)))((((((...))))))(((((..))))).)))))
RFA_00709 (ext) [ FASTA input ] AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((..((((((((((((....))))..).)))))))))))))
RFA_00710 (ext) [ FASTA input ] AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ((((((((((.((.((((..).)))))))))(((..)))))))))
RFA_00711 (ext) [ FASTA input ] CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ..((((((((((....))))))))))(((((..(((..))))))))
RFA_00715 (ext) [ FASTA input ] GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] (((..)))(.((..)))(((((((((((.....)))))))))))
RFA_00716 (ext) [ FASTA input ] ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU
[ reference structure ] ((((((......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] (.((((((((..))))))..(((((((((...))))))))))))
RFA_00717 (ext) [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))..(((())))))))))
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((....)))))))))))))))))))
RFA_00720 (ext) [ FASTA input ] GCCCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUUGACUCUACGGGGC
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ] ((((((.((((...)))(((((((((((..)).))))))))))))))))
RFA_00721 (ext) [ FASTA input ] GCGCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUCGACUCUAUGGGGC
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ] ..(((((((((((..)))((((((((((..)).))))))))))))))))
RFA_00730 (ext) [ FASTA input ] CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...))))))))))(((..)))))))))
RFA_00731 (ext) [ FASTA input ] GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))(.(((((...))))))))))))
RFA_00733 (ext) [ FASTA input ] GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...)))..))))))))))))))))
RFA_00734 (ext) [ FASTA input ] CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] .(((((((((((((((.((((..))))))))))))))))))).
RFA_00736 (ext) [ FASTA input ] GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))(.(((((...))))))))))))
RFA_00737 (ext) [ FASTA input ] ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))(.(((((...))))))))))))
RFA_00745 (ext) [ FASTA input ] ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU
[ reference structure ] .(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..))))..))))))))))))))))
RFA_00749 (ext) [ FASTA input ] GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((...))))))(.(((((...))))))))))))
RFA_00758 (ext) [ FASTA input ] CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] .(((((.((((((.(((.((((..)))))))))))))))))).
RFA_00762 (ext) [ FASTA input ] CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] .((((((((((..))))).((((((((..))))))))))))).
RFA_00763 (ext) [ FASTA input ] UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...)))..))))))))))))))))
RFA_00764 (ext) [ FASTA input ] CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...)))..))))))))))))))))
RFA_00765 (ext) [ FASTA input ] GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...)))..))))))))))))))))
RFA_00767 (ext) [ FASTA input ] GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA
[ reference structure ] ....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((...))))))).))))))))))))))))..((((..))))
RFA_00768 (ext) [ FASTA input ] ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC
[ reference structure ] ....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((...)))))))).))))))))))))))).(.(((..))))
RFA_00769 (ext) [ FASTA input ] UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA
[ reference structure ] ....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ] .(((((((((((((....)))))))))(((((((((((.(((..)))))))))))))).))))
RFA_00770 (ext) [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA
[ reference structure ] ....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ] (((((((((.((((.(((((..))))))))))))))))))(((((((((((..)))))))))))
RFA_00773 (ext) [ FASTA input ] CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA
[ reference structure ] ....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ] ((.(((((((.((...)))))))))))((((((((((((((...)))))))))))))).....
RFA_00779 (ext) [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA
[ reference structure ] ....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ] ((((((((((..))))))))).).((((((((((((.(((((..)))))))))))))))))..
RFA_00786 (ext) [ FASTA input ] GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC
[ reference structure ] ..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
[ predicted structure ] ....(((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))..)))..(((((....))))))))))
RFA_00808 (ext) [ FASTA input ] CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU
[ reference structure ] ...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
[ predicted structure ] ......(((((((((((((...))))(((((((((.((((..))))))))))))))))))))))
RFA_00809 (ext) [ FASTA input ] CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG
[ reference structure ] ...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
[ predicted structure ] .....(((((((((..)))))))))(((((((((((((((..)))))..)))))))))).......
SPR_00007 (ext) [ FASTA input ] GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((....)))))..(((((((((((((((((((..))))))))))(((((((...)..))))).))))))))))
SPR_00012 (ext) [ FASTA input ] GGGCGUGUGGCGUAGUCGGUAGCGCGCUCCCUUAGCAUGGGAGAGGUCUCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ] (((.(.((((((.((((((.((((((((((((....).))))))))))))))))))))))))((((..))))))).
SPR_00013 (ext) [ FASTA input ] GGGCGUGUGGCGUAGUUGGUAGCGCGUUCGCUUAGCAUGCGAAAGGUCUCCGGUUCGACUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ] (((.(.((((((.((((((.((((((((((((....).))))))))))))))))))))))))((((..))))))).
SPR_00017 (ext) [ FASTA input ] GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUUCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((.((((..))))))))))))))).((((((((..))))))))))))))))))....
SPR_00020 (ext) [ FASTA input ] GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00022 (ext) [ FASTA input ] GCGACCGGGGCUGGCUUGGUAAUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAGAAUGUGGGUUCAAAUCCCAUCGGUCGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((..)))((((((((((((.(((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00023 (ext) [ FASTA input ] GCCCGGGUGGUGUAGUGGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCUCGGGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((.((((((((....)))))))))))((((((..))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00029 (ext) [ FASTA input ] AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...)))))).(((((.(((((((.((((((.(..))))))))))))))))))))))))....
SPR_00030 (ext) [ FASTA input ] AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..))).))))))))))))))(((((((((...))))))))))))))...
SPR_00032 (ext) [ FASTA input ] AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((..)))))..((((((((((...))))))))))((((((((..)))))))))))))))...
SPR_00033 (ext) [ FASTA input ] AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..((((((((..)))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00034 (ext) [ FASTA input ] AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))(((((((..))))))))))))))....
SPR_00036 (ext) [ FASTA input ] UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((.((((((((((((((((((((((...)).)))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00044 (ext) [ FASTA input ] GGCCUGUUGGUGAAGCGGUUAACACACACGGUUUUCAUCCGUGGACACACGGGUUCGAACCCCGUACAGGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))).)).(((((((((((((((((..))))))))..))))))))))))))))....
SPR_00045 (ext) [ FASTA input ] GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUGGGGGACGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((.(((...)))((((..))))((((((((...))))))))..(((((((...)..))))))))))))....
SPR_00060 (ext) [ FASTA input ] UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00064 (ext) [ FASTA input ] GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((..))))))))))).))))..((((..((((((...)..))))))))))))))).
SPR_00065 (ext) [ FASTA input ] GGCUCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACGGACUGAAAAUCCGUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))((((((((((((((((...).))))))..)))))))))))))))....
SPR_00066 (ext) [ FASTA input ] GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((..)))))))))))((((((((((((..)))))))))))).))))))))))....
SPR_00068 (ext) [ FASTA input ] GCCCGGGUAGCUCAGCUGGUAGAGCACGUGACUGAAAAUCACGGUGUCGGUGGUUCGACUCCGCCCCCGGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((((((..)))))))((((((.((..)))))))).(((((((((..))))))))))))))))....
SPR_00070 (ext) [ FASTA input ] GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))((((((((((((((((...))))))))...))))))))))))))....
SPR_00074 (ext) [ FASTA input ] UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...))))))((((((((((((((((..))))))))))))))))....))))))))))...
SPR_00078 (ext) [ FASTA input ] ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA
[ reference structure ] (((((....((((........)))).(((((.......)))))....(..)..)))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))(((((((((..)))).)))))
SPR_00079 (ext) [ FASTA input ] AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA
[ reference structure ] .(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((.((..)))))))))))))))).))))))))))))))))...
SPR_00080 (ext) [ FASTA input ] GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA
[ reference structure ] (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
[ predicted structure ] (((((((((((((......))))))((((.((..))))))((((((((...)))))))))))))))....
SPR_00087 (ext) [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] (((((((...((((((((((((..))))))))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00088 (ext) [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] (((((((...((((((((((((..))))))))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00089 (ext) [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] (((((((...((((((((((((..))))))))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00090 (ext) [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCACGUGUUCGAUCCACGUUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] (((((((...((((((((((((..))))))))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00091 (ext) [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] (((((((...((((((((((((..))))))))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00095 (ext) [ FASTA input ] GCCGAAAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCCGGUUCAAUCCCGGGUUUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((((..)))))((((((((((((..)).))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00111 (ext) [ FASTA input ] GCAGGUGUAGUUUAAUGGCAGAACUUCAGCCUUCCAAGCUGAUUGUGAGGGUUCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((...))))))))).)))))))..(.((((((...)..))))))))))))....
SPR_00112 (ext) [ FASTA input ] GCGGGUGUAGUUCAAUGGUAGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGAGCGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..)))))((((((...))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00113 (ext) [ FASTA input ] GCGGGAGUAUUUCAACUUUUAGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAGAUAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((...(((........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.(.(((((((...)))))))))))))))))))))))....))))))))....
SPR_00114 (ext) [ FASTA input ] GCGGGAGUAGUUCAAUUUUAGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAGGUAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...)..))).(((((((((((...)))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00115 (ext) [ FASTA input ] GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((.((..))))))))))).)))))))))))))..))))))))....
SPR_00116 (ext) [ FASTA input ] GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((...))))))((((((((...)))))))))))((((((...)..))))).))))))....
SPR_00117 (ext) [ FASTA input ] GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))(((((((...)))))))(((((((((..))))))))).))))))))....
SPR_00121 (ext) [ FASTA input ] GCAGUACUGGUGUAAUGGUUAGCGCCUUAGAUUUCCAAUCUAAAGGUAGGGGUUCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((.(((....))))((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00124 (ext) [ FASTA input ] AUUCUUUUAGUAUUAACUAGUACAGCUGACUUCCAAUCAGCUAGUUUCGGUCUAGUCCGAAAAAGAAUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((..))))))(((((((((...)..))))))))((((((..))))))))))))))....
SPR_00126 (ext) [ FASTA input ] GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((...)))).((((((((((((((.((((..))))))))))))))))))(((((...))))).
SPR_00127 (ext) [ FASTA input ] AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA
[ reference structure ] ((((((....(.(..).)..(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..))))))))))))).(((((((((((..)).)))))))))))))))....
SPR_00137 (ext) [ FASTA input ] GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA
[ reference structure ] .(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))).)))))))))))))))))))))))))))...
SPR_00139 (ext) [ FASTA input ] GGUGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCCCUGGAUUGUGAUUCCAGUUGUCGUGGGUUCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
[ reference structure ] .(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((..)))))))).(((((((((((((((((..)).))))))))))))))))))))))))...
SPR_00141 (ext) [ FASTA input ] GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((....))))))))))))))(((((((....((((((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00142 (ext) [ FASTA input ] GACUAAAGUAGUUUAAAUAAAACCCUAAUUUGUGGUAUUAAAAUUAUCAGUUAAAAUCUGAUCUAUAGUCCCA
[ reference structure ] .((((.((..((((.....))))..((((.......)))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((...((((((..))).))))))))))))((((((...)..)))))))))))))...
SPR_00153 (ext) [ FASTA input ] CGGAAUAUAGCUCAGCUGGUUAGAGCAUUCCGCUGAUAACGGAGAGGUCGUUGGUUCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((.((..))))))((((((((((.((..))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00155 (ext) [ FASTA input ] GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGUCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((((((((((((((((...))))).)))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00156 (ext) [ FASTA input ] GGGCGAUUAGCUCAGCUGGUUAGAGCGCACGCCUGAUAAGCGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACCAUCGCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.(((..)))))))))))).)))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00163 (ext) [ FASTA input ] GAAACUAUAAUUCAAUUGGUUAGAAUAGUAUUUUGAUAAGGUACAAAUAUAGGUUCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((.((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))..))))))))))))))))))....
SPR_00164 (ext) [ FASTA input ] GGGCUUAUAGUUUAAUUGGUUGAAACGUACCGCUCAUAACGGUGAUAUUGUAGGUUCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00166 (ext) [ FASTA input ] AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..((((....))))))))))))))))((((((((((..))))))))))))))....
SPR_00167 (ext) [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGACAAAAGAGUUACAUUGAUAGUGUAAAUAAUAGAGGUUCAAACCCUCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((((..(....))))))))))))(((((((((((((((.((((..)))))))))))))))))))
SPR_00176 (ext) [ FASTA input ] GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((.((((((((((((((..)).))))..)))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00177 (ext) [ FASTA input ] GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((..((((((((((..)))))))))))))))))))((((..(((((...)..))))(((..)))))))
SPR_00178 (ext) [ FASTA input ] GAGCCAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUCUGACUUUUAAUCAGAGGGUCGAAGGUUCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))(((((((..)))))..))))))))))))....
SPR_00183 (ext) [ FASTA input ] CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..).)))))))..(((((((..)))))))((((..)))).))))))))))))....
SPR_00191 (ext) [ FASTA input ] GCCUUGUUGGCGCAAUCGGUAGCGCGUAUGACUCUUAAUCAUAAGGUUAGGGGUUCGAGCCCCCUACAGGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))...((((.((((....))))))))((((((..)))))))))))))))....
SPR_00209 (ext) [ FASTA input ] GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
[ reference structure ] (((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((..)))))))..))))))))))((((..))))..((((((...)..))))))))))))....
SPR_00215 (ext) [ FASTA input ] GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((...))))))))((((..))))))))))).))))))))))))))))))....
SPR_00218 (ext) [ FASTA input ] GCGGGUGUGCGGGAAUUGGUAGACCGGCUAGAUUCAGGAUCUAGGGUCUUUAUGGACCUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACCCGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((.((((((.((((((((..(((((((...)))))))))))))))(((((((..))))))))))))))))))))))....
SPR_00219 (ext) [ FASTA input ] GCCCGGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAUUUAAAAUCCCUCGGCGUUCGCGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)).)))))))((((((...))))))(((((((..)))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00220 (ext) [ FASTA input ] GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] ..(((((((((((((((..))))).))))))))))(((((((((.((((....))))((((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00223 (ext) [ FASTA input ] GCCUUUGUAGCGGAAUGGUAACGCGGCAGACUCAAAAUCUGCUUUGGUAACCCAGGUGGUAGUUCGACUCUCCCCAAAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........)))((((((.......))))))..............((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((((...))))))(((((((((((((((((((((((...))))))))).)))))))))))))))))))))....
SPR_00224 (ext) [ FASTA input ] GGGCAAGUGGCGGAAUUGGUAGACGCAGCAGACUCAAAAUCUGCCGCUAGCGAUAGUGUGUGGGUUCGAGUCCCACCUUGCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((.(((((....))))))))))))))))(((((..)))))..((((((...)..))))))))))))....
SPR_00225 (ext) [ FASTA input ] GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..(((((((((.(((((((((...)))))))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00227 (ext) [ FASTA input ] GCCUUGGUGGUGAAAUGGUAGCCACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUACAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..(((...)))(((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00228 (ext) [ FASTA input ] GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((.((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))((((((..)))))))))))))))))))....
SPR_00229 (ext) [ FASTA input ] GCCGCUAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCUGCUCUUAGGAAGCAGUGCUAGAGCAUCUCGGUUCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((..)).))))))(((((((..))).))))((((..)))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00230 (ext) [ FASTA input ] GGCUUGAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUAAAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((...(((...)))(((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00235 (ext) [ FASTA input ] AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))).(((((...))))))))))))))))))))))....
SPR_00236 (ext) [ FASTA input ] GCUAUUUUGGUGGAAUUGGUAGACACGAUACUCUUAAGAUGUAUUACUUUACAGUAUGAAGGUUCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((.(((((((..(((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00246 (ext) [ FASTA input ] ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))((((((((..((((((((..))))))))))))))))))))))))....
SPR_00271 (ext) [ FASTA input ] GCCGGGGUGGCUCAGCUGGAGGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCUCGGGUUCGAUCCCCGAUCCCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((....))))))(((((((((((((((((...))))))))))))((((((((((...)))))))))))))))
SPR_00273 (ext) [ FASTA input ] GGCGGUGUAGCUCAGCGGCUAGAGCGUACGGUUCAUACCCGUGAGGUCGGGGGUUCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((....)))))((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00276 (ext) [ FASTA input ] GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))).))))))(((((((((..)))))))).)((((((...)..))))))))))))....
SPR_00279 (ext) [ FASTA input ] GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))((((((.......)))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00281 (ext) [ FASTA input ] AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))).)))))))....
SPR_00289 (ext) [ FASTA input ] GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((...(((((((...)))))))((((((((...))))))))...(((((((...)..))))))))))))....
SPR_00294 (ext) [ FASTA input ] UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(.(((((((((((((((((..))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00295 (ext) [ FASTA input ] UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((((...)))))))(((((((((..)))).))))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00297 (ext) [ FASTA input ] UGAGUUGUAGCCUAGUGGAAAGGCGUUUGGCCGUUAACUAAAAGAUAGCAAGAUCAAUACUUGCCAGCUCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((.((((((((.(((((((((((..)))))))))))))))..((((((((((((..)).))))))))))))))))
SPR_00298 (ext) [ FASTA input ] UGGGUUGUAGCCUAAUGGAAAGGCAAUUGGCCGUUAACCAGGAGAUAACAAGAUCAAUACUUGUCAACUCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...))))))))))))))))(.((((((((((((((..)).))))))))))))))))
SPR_00309 (ext) [ FASTA input ] CUCCGAUUAGCUCAAUUGGCUAGAGUACACCGUUUGGGGCGGUGGGGUUGAAGGUUCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((.((..))))))((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00314 (ext) [ FASTA input ] CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((.(((((..))))).(((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00315 (ext) [ FASTA input ] CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGUAGAGCACAUGGUUUGGGACCAUGGGGUCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((((((...)))))))(((.(((((((((((.((((..)))))))))))))))))))))))))....
SPR_00316 (ext) [ FASTA input ] CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...))))))).(((((((...)))))))((((((((..)))))..))))))))))))....
SPR_00320 (ext) [ FASTA input ] CAGAUAGAAGCCAAAAGGUCAGGCGCUUUCUUUGGGAGAAAGACCUAGUUAGUUCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((....))).((((((((((((...))))))((((((..)))))))))))).)))))))))....
SPR_00321 (ext) [ FASTA input ] CGAGGUGUAGCGCAGUCUGGUCAGCGCAUCUGUUUUGGGUACAGAGGGCCAUAGGUUCGAAUCCUGUCACCUUGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((..))))))))))).))))))(((.(((((((..((((((...)..))))))))))))))).
SPR_00329 (ext) [ FASTA input ] AGUCCCAUGGGGUAGUGGCCAAUCCUGUUGCCUUCUGGGGGCAACGACCCAGGUUCGAAUCCUGGUGGGACUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..((((((...))))))))))))))))))((((...)..))))))))))))....
SPR_00331 (ext) [ FASTA input ] UGGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...)))(((((((.(((((((..))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
SPR_00333 (ext) [ FASTA input ] UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((..))))((((.((((((((...))))))))(((((((..)))))))))))))))))))....
SPR_00339 (ext) [ FASTA input ] GGUUCUAUGGUGUAGUGGUUAGCACUCUGGACUUUGAAUCCAGCGACCUGGGUUCGACUCCCGGUAGGACCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))..))))))))....
SPR_00352 (ext) [ FASTA input ] GCCCAUGUAGCUCAGUAGGAUAGAGCACGCGCCUUCUAAGCGUGAGGUCGGAAGUUCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((....))))))))))))))(.(((((((((..))))).)))))))))))))....
SPR_00353 (ext) [ FASTA input ] GCGCCCGUAGCUCAAUGGAUAGAGCGUUUGACUACGGAUCAAAAGGUUAGGGGUUCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((....)))))((((((((((((..)).))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00356 (ext) [ FASTA input ] GUCCUCUUAGUUAAAUGGAUAUAACGAGCCCCUUCUAAGGGCUAAUUGCAGGUUCGAUUCCUGCAGGGGACACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))))((((((..))))))....(((((((...)..))))))))))))....
SPR_00358 (ext) [ FASTA input ] GCGCCCGUAGCUCAGCUGGAUAGAGCGCUGCCCUCCGGAGGCAGAGGUCUCAGGUUCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...))))...(((((((((((((..)).)))))))))))(((((...)..)))).)))))))....
SPR_00359 (ext) [ FASTA input ] GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((...)))))((((((((((((((((((((...)..)))))))...(((((((..)))))))))))))))))))
SPR_00360 (ext) [ FASTA input ] AUAUCUUUAAUUUAAUGGUAAAAUAUUAGAAUACGAAUCUAAUUAUAUAGGUUCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((....)))))))((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))....
SPR_00362 (ext) [ FASTA input ] GACAAAUGUUUUCAGGUCUUCUAAAUCUGUUUUGGAGAAAUCCGUUUGUUUCCA
[ reference structure ] (((((((............((((((.....)))))).......)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((....((((((((((..))))))))))))))))))))))....
SPR_00363 (ext) [ FASTA input ] GGACGUUAAAUAGAUAAGCUAUGCCUAGUUACGGGCUGGGAAGAGAGUCGUCUUCCA
[ reference structure ] (((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))......).)))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...)))..)))))))))))))((((((((...).)))))))
SPR_00364 (ext) [ FASTA input ] AAAUAUGAAGCGAUUUAUUGCAAUUAGUUUCGACCUAAUCUUAGGUGAAAUUCACCCAUAUUUUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((....)))).(((((.......)))))....((((.....)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))))(((((((((.((((((..)))))))))))))))))))))))....
SPR_00365 (ext) [ FASTA input ] AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((..))))).((((((((...))))))))(((((((..))))))).))))))))))...
SPR_00366 (ext) [ FASTA input ] UGGUACUUAGUUUAAAAUAAAAUAAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUUUAAUUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((......)))).(((((.......)))))....(((((......)))))).)))))....
[ predicted structure ] (((((.((((((((...))))))))((((((...))))))(.((((((((((..)))))))))))..)))))
SPR_00367 (ext) [ FASTA input ] UGGUGAUUAGUUUAACUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGACAUAUCUCAUAAUCACCAACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((..))))))((((((((...))))))))((((((((((..))))))))))))))))))
SPR_00373 (ext) [ FASTA input ] GACCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUCAGCCUCCGGAGCUGGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGUCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))((((((((((..))))))))))(((((...)..)))).)))))))....
SPR_00388 (ext) [ FASTA input ] GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..))))))((((.....((((((((((((((.(((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00393 (ext) [ FASTA input ] GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.(.((((((((((....)))))))))))))))((((((..)))))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00394 (ext) [ FASTA input ] GGAAAAUUAACUAUAGGUAAAGUGGAUUAUUUGCUAAGUAAUUGAAUUGUAAAUUCUUAUGAGUUCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((........))).((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((..)))))))))).((((((...))))))(((((...)))))((((((((...)..))))))))))))....
SPR_00395 (ext) [ FASTA input ] GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......)))))).................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((.((((((((((((..)))))))))))))))((((((((..))))))))((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00398 (ext) [ FASTA input ] GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA
[ reference structure ] (.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
[ predicted structure ] ((((((((((((..(((((((((((..))))))))))).(((((..)))))))))))))))))....
SPR_00399 (ext) [ FASTA input ] AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
[ reference structure ] (((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
[ predicted structure ] ..((((((..(((((((((((((((.((..)))))))(((((((...))))))).))))))))))))))))
SPR_00402 (ext) [ FASTA input ] GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA
[ reference structure ] (((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((.((((((((((((.((..))))))))))))))(((((((((..))))))))))))))))))..
SPR_00412 (ext) [ FASTA input ] GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))(((((...))))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00414 (ext) [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(..(.((.((((((((((..))))))(.((((((((((((...))))).)))))))).)))))))))))))))....
SPR_00415 (ext) [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..)))))).((((((((((((((((..))))))).)))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00416 (ext) [ FASTA input ] GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ..(((((((((((..)))))))))))(((((.((..)))))))((((((..(((((.((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00417 (ext) [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((.((((((.(((((((...))))))((((((...))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00418 (ext) [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((.((((((.(((((((...))))))((((((...))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00426 (ext) [ FASTA input ] AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((...))))))))((((((.((..))))))))((.((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00434 (ext) [ FASTA input ] GCUGACUUAGCUCAGCAGGCAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))((((.((..))))))(((((((((..)))))..)))).)))))))....
SPR_00435 (ext) [ FASTA input ] GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((.((((((((((..))))))))))((((..)))).((((((((((((..)))))..))))))))))))....
SPR_00436 (ext) [ FASTA input ] GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...))))...((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00437 (ext) [ FASTA input ] GCUGAUAUGGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCCCAGUUCGACUCUGGGUAUCAGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((..((((((((((((...)))))))))))))))))).)))))...))))))))....
SPR_00438 (ext) [ FASTA input ] GCCCCUUUAACUCAGUGGUAGAGUAACGCCAUGGUAAGGCGUAAGUCAUCGGUUCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((...))))))))))))).((((..))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00439 (ext) [ FASTA input ] GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((...))))))))(((((((((..)))))))))(((((((...))))))))))))))....
SPR_00445 (ext) [ FASTA input ] GGGUCGGUGGUCUAGUCCGGUUAUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAGGUCGGCGGUUGAACUCCGCCCCGACCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((..((((((((..)))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00452 (ext) [ FASTA input ] GGAGGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCAUCUGCCUUACAAGCAGAGGGUCGGCGGUUCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((....((((((((((((((((..))))))))))))))))((((((((((...)..))))))))))))))).
SPR_00456 (ext) [ FASTA input ] GAUUCCGUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCACCUUGACAGGGUGGAGGUCGCUGGUUCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((.(((((((((((((((...))))))))))))))))))).))))...)))))))))....
SPR_00458 (ext) [ FASTA input ] GAGAGAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACCGUUUUACACACGGAAGGUUGGGUGUUCGAAUCACCCAUUUCUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))).)))(((((((...)..))))))))))))))..
SPR_00459 (ext) [ FASTA input ] CAAUUUAAAGCUUAAUUAGUAAAGUAUUUCAUUUACAUUGAAAAGAAAUUUGUGCAAAUCAAUUUAAAUUGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((..(((((((((((((.(((((((((.(...))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00461 (ext) [ FASTA input ] ACAGAUUGUAGCUUAAUCACAAAGCAUCUGGCCUACACCCAGAAGAAUUCAUAAAAAUGAACACUUUGACCA
[ reference structure ] .((((.((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((......)))))).))))....
[ predicted structure ] ...((((((...))))))(((((((((((((((...)))))))))((((((((..))))))))))))))...
SPR_00462 (ext) [ FASTA input ] CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.....)))).((.((.......)).))....((((.......)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((.(((((..)))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00467 (ext) [ FASTA input ] GGUUUCGUGGUGUAGUGGUUAUCACGUCAGUCUAACACACUGAAGGUCUCCGGUUCGAGUCCGGGCGAAGCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))))((((((((..)))))))).(((...)))))).
SPR_00476 (ext) [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((..(((((..)))))(((((.(((((((((..)).))))))))))))((((...)..))))))((((..))))
SPR_00478 (ext) [ FASTA input ] AGGAGAGUAGUUCAAUGGUAGAACGUCGGUCUCCAAAACCGAGCGUUGAGGGUUCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))(((...)..))))))))))))....
SPR_00479 (ext) [ FASTA input ] AGGGGCAUAGUUCAGUAGGUAGAACAUCGGUCUUCAAAACCGAGUGUCACGAGUUCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))))(((((((...)))))))(((((((((..))))))))).))))))))....
SPR_00481 (ext) [ FASTA input ] AGGGGUGUAGUUUAAUGGUAGAACAGCGGUCUCCAACACCGUACGUUGUGGGUUCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((.(((((((((...)))))(((((((((..)))))))))))))))))))).)))))))....
SPR_00482 (ext) [ FASTA input ] AGGGGCAUAGUUUAACGGUAGAACAGAGGUCUCCAAAACCUCCGGUGUGGGUUCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((.(((((((((((((...)))))((((((((...))))))))))))))))))).)))))))....
SPR_00483 (ext) [ FASTA input ] AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAGCACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))(((((((((((((((...)))))).))))))).))...)))))))))....
SPR_00489 (ext) [ FASTA input ] AAGGAUAUAGUUUAAUGGUAAAACAGUUGAUUUCAAAUCAAUCAUUAGGAGUUCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((..(.((((..)))))))))))))))))(((...)..))))))))))))....
SPR_00493 (ext) [ FASTA input ] GAAGCGGUGGCUCAAUGGUAGAGCUUUCGACUCCAAAUCGAAGGGUUGCAGGUUCAAUUCCUGUCCGUUUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (.(((....))))..(((((((((((((((((...))))))))((..((((((...)..))))))))))))))))
SPR_00496 (ext) [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((...))))))(((((....))))))))))))))((((((...)..))))).((((..))))
SPR_00497 (ext) [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((..(((((..)))))(((((.(((((((((..)).))))))))))))((((...)..))))))((((..))))
SPR_00498 (ext) [ FASTA input ] AGCGGGAUGGGAUAGCUAGGAGAUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGAUCGGUAGUUCAAAUCUACCUCCCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((...))))))))((((((((...))))))))....((((((...)..))))))))))))....
SPR_00502 (ext) [ FASTA input ] AGCGGGGUGGGGUAGUCAGGAAAUCCGAUGGGCUCAUAACCCGUAGAUCGAUGGUUCAAAUCCAUCCCCCGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((((.((..)))))))(((((((((.(((((.((((..)))))))))))))))))))))))))....
SPR_00504 (ext) [ FASTA input ] CGCGGGGUAGAGCAGUUGGUAGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGGCCGCAGGUUCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((..(((((((..)))))))(((((((((.((((((((...)))..)))))))))))))))))))).....
SPR_00506 (ext) [ FASTA input ] CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] ...(((((((((((((...)))))))((((((((...))))))))((((((((((...)..))))))))).))))))
SPR_00509 (ext) [ FASTA input ] CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .(.(((((((((..(((.((((((((((((((((...)))))))))))))))((((..)))))))))))))))))).
SPR_00512 (ext) [ FASTA input ] CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .(.(((((.(((((((...)))))))((((((((...))))))))((((((((((...)..))))))))))))))).
SPR_00513 (ext) [ FASTA input ] CGCAGGAUAGAGCAGUCUGGUAGCUCGUGGGGCUCAUAAUCCCAAUGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] .((((((..(((((((...)))))))((((((((....))))))))...((((((...)..))))))))))).....
SPR_00517 (ext) [ FASTA input ] UGCAAUAUGAUGUAAUUGGUUAACAUUUUAGGGUCAUGACCUAAUUAUAUACGUUCAAAUCGUAUUAUUGCUACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))).))))))))((((...)..))))))))))))....
SPR_00518 (ext) [ FASTA input ] AGCGGGGUAGAGUAGUUGGUUAACUCAUCAGGCUCAUAAUCUGAAGAUUGCAGGUUCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA
[ reference structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((...)))))).)))))))(((((..)))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00519 (ext) [ FASTA input ] AAAAAGAUAAGCUAAUUAAGCUAUUGGGUUCAUACCCCACUUAUAAAGGUAAUAAUCCUUUUCUUUUUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.....))))(.((((.......)))).)...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((.(((((....))))(((((..))))).))))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00520 (ext) [ FASTA input ] AGUAAGGUCAGCUAAUUAAGCUAUCGGGCCCAUACCCCGAAAAUGUUGGUUUAUAUCCUUCCCGUACUACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((.....)))).(((((.......)))))....(..((.......))..))).))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((.((..)))))))(((((...))))))))))))))))))))))))....
SPR_00533 (ext) [ FASTA input ] AGCAGAGUGGCGCAGUGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGGUAGAUCGAAACUACUCUCUGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((.(((..)))))))((((((...))))))(((((((((..))))).)))))))))))))....
SPR_00541 (ext) [ FASTA input ] GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGGUGGCUGUAACCCACUUCCUUACGGUUCGGGGGUUCGAAUCCCUCCCCCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))((((((((((((..)))))))))))))))))).
SPR_00542 (ext) [ FASTA input ] GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGCGGACUGUAAAUCCGCUCCCUCAGGGUUCGGCAGUUCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((..))))))((((((((((((((((..))))))))))).))))).((((((...)..))))))))))))....
SPR_00548 (ext) [ FASTA input ] GAGAUGGUGGCUGAGUGGUUAAAGCGGUAGACUGUAAAUCUAUUGGGUAUCCGUCGUCGGUUCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((.((((((((((..((((..))))))))))))))(((..))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00550 (ext) [ FASTA input ] GGAGGGAUUUUCAAUGUUGGUAGUUGGAGUUGAGCUGUAAACUCAAUGACUUAGGUCUUCAUAGGUUCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((...........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((....(((((((((((((((((((((.((..)))))))))))))))))))))))((((...)..))))))))))))....
SPR_00552 (ext) [ FASTA input ] GGCAGGGUGGCAGAAAGUUAAUGCACUAAAUUGUAAAUUUAUAAAUAAAGGUUUAAUUCCUUUUCUUGCCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........)))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ....((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))...))))))))))).)))))))
SPR_00557 (ext) [ FASTA input ] CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCACUGGUUCGAAUCCGGUAGGUCGGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ..((((((((((((((..)))))))))))))).((.((((....))))))((((((((..(((..)))))))))))
SPR_00561 (ext) [ FASTA input ] CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGUCGGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((..))))))))(((((((..)).))))))))))))((((((((..(((..)))))))))))
SPR_00590 (ext) [ FASTA input ] GCCGGGGUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGGCGGGCUGCAGACCCGUUAGUUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCCCCGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((((((...(((((..)))))))))).))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00593 (ext) [ FASTA input ] GGCGACAUGGCCGAGUGGUAAGGCAGAGGACUGCAAAUCCUUUUUUCCCCAGUUCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00595 (ext) [ FASTA input ] GGGUCCAUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUUGACUGCAGAUCAAGAGGUCACCGGUUCGAACCCGGUUGGGCCCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((.((((((.(((((..))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00598 (ext) [ FASTA input ] GCCGCGGUAGUAUAGCCUGGACUAGUAUGCGGGCCUGUCAAGCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCCGCGGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((...)))))))(((.((((((.((..)))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00610 (ext) [ FASTA input ] UUCUCGGUAGUAUAGUGGUUAGUAUACCCGCCUGUCACGCGGGUGACCCGGGUUCAUUUCCCGGCCGGGAAG
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((.(((((((((..)))))))))(((((((...)))))))..(((((((...)))))))))))))).
SPR_00620 (ext) [ FASTA input ] GCCCCCGUGGUGUAGCCAGGUCUAGCAUACGGGGUUCUCGUCCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...))))(((((((((((((((...)))))))))))))))(((((...)..)))).)))))))....
SPR_00629 (ext) [ FASTA input ] GAGAUAUUAGUAUAAAUUUUUUGUAUAUUUCUUUUUCGAAGAAAAGGUUUAUUAUCUUACCA
[ reference structure ] ((((((...((((.........)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((...))))))))(((((((((...))))))))))))))))))....
SPR_00632 (ext) [ FASTA input ] UCCGAUGUAGUAUAACGGUUAGAACACCUGGCUUUCACCCAGGAGAUCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUCGGAG
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..)))((((((((((((....)))))))))))).))))))))))))))))).
SPR_00633 (ext) [ FASTA input ] UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((...)))))).))))))))))))(((((...)..)))))))))))).
SPR_00721 (ext) [ FASTA input ] GCCGGCUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCUAGAUUGUGGAUCUAGAGGUCCUCGGUUCGAGCCCGAGAGCUGGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((..))))))))).(((((((((((((...)))))))))))))(.(((((((((((..))))))))))))
SPR_00722 (ext) [ FASTA input ] GCGGUUGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGGUUUGUGGCACCUGAGGUCGGAGGUUCGAUCCCCCCCAACCGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00750 (ext) [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ] .((((..))))((((((((((((((((((...))))))))))((((((((((..))))))))))))))))))
SPR_00760 (ext) [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCUGGUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCGAGGGAGGAAGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...))))))))))))).((((((((((..)))).)))))))))((((...)..)))(((((..))))).
SPR_00768 (ext) [ FASTA input ] GGGGUGUUAACUUAAGUUUAAAGUGUUAGAUUUUUAAUCUGGAAAUGGGUUGUCACAUCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((....)))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((((..)))))))(((((((((((...)))))))))))((((((...))))))))))
SPR_00777 (ext) [ FASTA input ] GCACUUCUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCGUGGCUUUUAACCUCGUGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGGAGUGCG
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).((.((.......)).)).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..(((((((..)))))))(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))).
SPR_00810 (ext) [ FASTA input ] GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((...))))))))((((..)))))))))))).)))))))))))))))))....
SPR_00816 (ext) [ FASTA input ] GCCUUCGUGAUCGGAAUGGUAGAGAUCCUGGUCUUAGGAACCAGCUGCUGAAAGGCGGCGGUUCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((..((((((((((..((((((((..))))))))(((((((((..))))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00832 (ext) [ FASTA input ] GUUGUUAUAGCAUAAGAAGUGCAUUUGUUUUAAGCGUAAAAGAUAUGGGACAACUCCA
[ reference structure ] ((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))..(((((..)))))
SPR_00867 (ext) [ FASTA input ] GCCGCCGUAGCUCAGCCUGGCAGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCGGCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...))))))))((((((((.((((((((.(..)))))))))))))))))))))))))....
SPR_00868 (ext) [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGUAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGUGGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGGCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(.(((((((((((((((((...))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00882 (ext) [ FASTA input ] GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))((((((((((((...)..))))).).)))))
SPR_00913 (ext) [ FASTA input ] GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((...)))))((((((((((((((((((..)).)))))))))))))))))))))))))))....
SPR_00932 (ext) [ FASTA input ] AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))))))))))).(((((((((....((((((...)..))))))))))..))))
SPR_00938 (ext) [ FASTA input ] UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA
[ reference structure ] ((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] ((((((..))))))((((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))).
SPR_00943 (ext) [ FASTA input ] GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..(((((((((...)))))(((((((...)))))))))))((((((...)..)))))))))))).
SPR_00957 (ext) [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((((((..))))))))))))))))....(((((((((((((((((...)..))))))))))))))))
SPR_01040 (ext) [ FASTA input ] GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((...)))...((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_01051 (ext) [ FASTA input ] GGCCGCUUAGCACAGUGGCAGUGCACCACUCUCGUAAAGUGGGGGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCAGUGGCCU
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..((((((...))))))(((.((((((...))))))))).((((((...)..)))))))))))).
SPR_01095 (ext) [ FASTA input ] AGGGGUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGCGGUCUCCAAAACCGCAGGUCGGGGGUUCGAGCCCCUCUGCCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..))))))).(.(((((((..((((((((..)))))))))))))))))))))))))....
SPR_01103 (ext) [ FASTA input ] ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((.......)))).(((((.......))))).......).)))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((..)))).(((((((...)))))))))))))))))))))....
SPR_01106 (ext) [ FASTA input ] GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..((..((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))).
SPR_01117 (ext) [ FASTA input ] CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((....)))))((((((....)))))))))))))((((...)..))).))))))))....
SPR_01143 (ext) [ FASTA input ] AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..((((((.(((((((((((...)))))))))))))))))(((((((...)))))))))))))).
SPR_01157 (ext) [ FASTA input ] CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((...))))).((((((((((.((..))))))))))))((((((...)..))))).))))))....
SRP_00001 (ext) [ FASTA input ] GGUAGCCCUGCUGGUGGCUUCGCAAUUGUACUCUGUGAACCCCGCCAGGACCGGAAGGUAGCAACGGUAGCAGAUCUAUAAUGUGCCGAGGUUUUGCUAGUAGGGUUACCACCAUUU
[ reference structure ] (((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))..)))))))...))))))..)))))))))))))))).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))..)))))).)).)))))))..))))))))))))))).......
SRP_00005 (ext) [ FASTA input ] GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU
[ reference structure ] .((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
[ predicted structure ] .((((((((((.(.(((((((((((((....))))))((((..)))))))))))).(((((((((((..)))))))))))))))))))))
SRP_00007 (ext) [ FASTA input ] AUGCAGUCACCGCACCUCUGUGGAUGCCGCCAUGCCAGAAGCAGUGCUGUGUAGGCAGCGCCUGUGGUGGCUUAAAUGGGUGAACGGGCCAGGGCGGUAACGCAGCAACCAUAAGCCCAGUGGCACGCAGUCUGCAGUCCCGUGCGUAGCAUUUU
[ reference structure ] (....((.(.(((((.(..((((.(((.(((((((((..(...(((((((....)))))))...)..))))(...)(((((.....((.....(((....))).....))....))))))))))..)))..))))).....)))))).))...).
[ predicted structure ] ((((......(((((.((((.((((((..))))))))))(((...)))(((((((((((((((((((..((((..((((((((.........(((((..)))))))))))))))))))))))))..)))))))))))....)))))..))))...
SRP_00038 (ext) [ FASTA input ] GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU
[ reference structure ] ((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((.((((((.((((((((...))))).)))(((((..))))))))))))))))))...((((((((((..))))))))))))))))....
SRP_00040 (ext) [ FASTA input ] GGUGGCCGGGUCCCAUACAAUAGCUCUCUUGACGAAUCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGCACUCGAGGGACUAUGUGAUAUGGGGUGCUCGGCCACUUUUU
[ reference structure ] (((((((((((.((.(((.(..(.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...))))).)).).)).....)).)).))))))))).))...
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.(((((...((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))).)).))))))..)))))))))))....
SRP_00042 (ext) [ FASTA input ] AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
[ reference structure ] ((.((((((((..((.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))...)).)).)..))))))).))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((...))))((((.(((((((((((((((..))))).)))))).))))(((....))))))))))))))))))....
SRP_00043 (ext) [ FASTA input ] UUAUACAUCGUAACUGUAGUUAACAGUUUUGUUGAUUUAGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCUAUAACAAAAUUGUAUACAGUUACGAUGAUGUGUGUUAUU
[ reference structure ] ....(.(.(((((.(((((.((...((((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)...))...)))))....).)))).).).
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((...((((((...(((((((((.((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))......
SRP_00044 (ext) [ FASTA input ] GCUGGCGGGCCCCUUCGCAUGGUUCGGCGGUGAAUCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCAUAGUCGUUCAGAACCAGUGCCGGAGUAAGGCUCGCCUACCGGUAUCCCU
[ reference structure ] ...(((((((((..((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))).)...)))))))).............
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))).).))))))..)))))))))))..........
SRP_00045 (ext) [ FASTA input ] UGGGUUCGAAUCCCAUUCUCUCCGAUUCCUAGGACCCGUACUAUCAAGUAUUGCUGAAUCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGAUGAGUACGUAAGUCUUAGGUUUAAUUUUGAACCCAAAUGCAAUGUUUUGCUUU
[ reference structure ] ((((.(....(.......(.(..((((((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))...))))..).).......)....).))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((...........((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((..))))))).....))))))))).........)))))).)))))))..))))))))))))))))))))))))(((((((....)))))))
SRP_00046 (ext) [ FASTA input ] CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
[ reference structure ] ((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((.((((..)))))(((((..))).))((((((((.(((...)))))))))))))))))))))))..))))))))....
SRP_00051 (ext) [ FASTA input ] GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU
[ reference structure ] (((((((((..(((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))))...))))))))).........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..
SRP_00054 (ext) [ FASTA input ] GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU
[ reference structure ] ((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))))..))))))))).........
[ predicted structure ] ((((((((((.((((((((((...))))))))))((((((((((((..))))).)))))))...((((((.((((((((..)))))))))))))))))))))))).
SRP_00057 (ext) [ FASTA input ] GAGUUAUCUGUUAGCUCCAAACACUGCAAUAUUGAAUAGUUGGUCAGAUUCGGAAGGAAGCAGCCAAAUCAAUUGAUACAGGUGUUCUGAUAAAGCUAACAGAAACUCCUAAA
[ reference structure ] (((((..(((((((((.((.((.(((.(..(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))...).))))...).))....))))))))).))))).....
[ predicted structure ] (((((.((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((..).))))))))))))))))))))))))).)))).))...)))))))))))))))).....
SRP_00072 (ext) [ FASTA input ] GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU
[ reference structure ] (((((((((.((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))...)))))))))....................
[ predicted structure ] ((((((((((((((.(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))....(((((((((..))))))))))))))))))).......((((...))))..
SRP_00074 (ext) [ FASTA input ] GUAAGUUGGGGACCUUUUAAGAGAAGAGACCUACGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGAAGUGUUUUCUUUUGCUAGAAGUGUUCUCCAACUUACUCUUCUUUU
[ reference structure ] (..(((.((....(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..))))))..........)).)))..).....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))).........
SRP_00083 (ext) [ FASTA input ] GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG
[ reference structure ] ((((((((((.((((..(((.(((((((......((((.....((....)).....))))....)))))..)).)))...)))).))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((((((..)))))))))))))..)))))))))((((....))))))))))))))))))))....
SRP_00094 (ext) [ FASTA input ] GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
[ reference structure ] ((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
[ predicted structure ] (((((((((((((.(.....))))))(((((((....(((((..)))))(((((((((....)))))))))))))))))))))))).....
SRP_00095 (ext) [ FASTA input ] GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
[ reference structure ] ((.((((((((..((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....)))).)..))))))))).....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((....)))))))..))))))))))))))))(((((((((((....)))))))))))))))....
SRP_00098 (ext) [ FASTA input ] GGCAGCCGCAGGGGUCCCCUCGCGACGAAUUGCCGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGCGGUGGAUUUGGGUGCCGAGGUGCGGCUUUUGUGGCUGUCUUUU
[ reference structure ] ((((((((..((((.((((((((..(((((((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))).)...)))))...)).)))).))))))))....
[ predicted structure ] ((..(((((((((((....((((((((...)))))))))))))))).)))))((((((((((((((((((((((..(((((((..)))))))))))))))))))))))))))))
SRP_00101 (ext) [ FASTA input ] GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU
[ reference structure ] ((((((((.(((..(.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)..)))....))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((((..))))))))))))((((((.((((((((((..)))).)))))))))))))))))))))....
SRP_00105 (ext) [ FASTA input ] GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGCUUUU
[ reference structure ] ((((((((((.((((((((.((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))..)).))))))...))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((..((.((((((.(..(((((((..(((((....)))))((((((((..((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))....
SRP_00106 (ext) [ FASTA input ] GGUAGCUAGGUCUAUGCAACAGAGAAUCACGAACUCCGCCAGGCCUGGAAGGGAGCAACGGUAGUGACACUCUCUGUGUGCGUAGGUUGCCUAGCUACCAUUU
[ reference structure ] .(.(.(((((.(.((..(...((((.((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))))..........)).))))))......).)
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))..))))))))..)))))))).)))))))...)))))))))))....
SRP_00107 (ext) [ FASTA input ] GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU
[ reference structure ] .......((((((..((..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))).......)...))))).)))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..)))))))..(((((((((.(((((..)))))(((((((...)))))))))))))).))))))))))).
SRP_00119 (ext) [ FASTA input ] GGGCAGUAAGCAUGGGCCUGGAUGAUCUCCUUGUGGGCAGUUGGGGAGCCUGUAGGGGUGCUCCACCUGCCAUUAAAGCGGAGGGGAACGCAUGAGGGCGGAAACGCAGCAAUGAGUACCUCCUGCAGGGUAGAGUCGCCAGCAGACCAUGCCAGUCCUUUU
[ reference structure ] (((..((..((((((.(...(.((.(((((((((.(((((.(((((.((((....)))).))))).))))).(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))).)))..)).).)....))))))..))..))).
[ predicted structure ] ((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))(((((.(((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..))))))))..))))....
SRP_00121 (ext) [ FASTA input ] CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA
[ reference structure ] ......((.(.(((((.((((((.((.((.....((((....(((....)))....))))...)).))..))))))))..))).).)...)..
[ predicted structure ] (((..))).((((((((((((((((((((((((((((((..(((((..))))))))))))))))))))).))))))).)))))))........
SRP_00128 (ext) [ FASTA input ] GGAGGCCCUGUCGGUUCUCCCGCAACACUAUCCUGUGGACUCGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCAGGAGACGUGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCGGGGCCUCCACCAAUU
[ reference structure ] .(.((.((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...))))))).))).)).).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((((..))).)))))))))))))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))))).......
SRP_00132 (ext) [ FASTA input ] GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ] (..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((..))).)))))))))))))).)))))))))).))))))).)))))))))....
SRP_00134 (ext) [ FASTA input ] CUGAUAGCUGGGUCCCGCGCAACGGUAGGUUAUGAACCCCGCCAGAUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGUAGCUGAUUCCGUGUGCCGCGGGGGAGCCCAGCUAUCAGUUGU
[ reference structure ] ...(...(((((((((.((((.(((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))).....)).)))).)))))........)..
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((.(((..((((...)))))))...((((((((((.((((((((..)))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))....
SRP_00137 (ext) [ FASTA input ] ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((..))))).)))))))))))))..)))).))))))))))))))))))...
SRP_00138 (ext) [ FASTA input ] GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU
[ reference structure ] (((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((.(((((((..((((.((((((((..)))).)))))))))))))))))))))).))).))))))))).....
SRP_00139 (ext) [ FASTA input ] ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG
[ reference structure ] (((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))).))))))))))))).))))))))
SRP_00141 (ext) [ FASTA input ] GGAAACCUUCUCGGUCUCUCGCAACGGUGUCUGGUUUACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAAGUCGGAAUUACUGUGUGCCGAGAAGAAGCUGGGAAGGUUUCCGCC
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((((.(((((((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..)))))))...)))))....)))))))))))))))...
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((..)))))..))))))))))))))))(((((((....)))))))))))))))))))))))))))))...
SRP_00145 (ext) [ FASTA input ] UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU
[ reference structure ] .((((((((((((.(((((((.((((((((((((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))))))...))))))...)))))))))))).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))).)).)))))))..)))))))))))))......
SRP_00146 (ext) [ FASTA input ] CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG
[ reference structure ] ((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))).))))))))...))))))))))))
SRP_00161 (ext) [ FASTA input ] GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ] (((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((....(.(((..)))))))))))((((((.(...)))))))))))))).)))))....
SRP_00162 (ext) [ FASTA input ] GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ] ((((((.((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...))).).))))))))..))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((.(((..)))(((.((..)))))))))))))))))))))))).))))))....
SRP_00163 (ext) [ FASTA input ] CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((..)))))(((.((((((((..))))).)))))).((((..)))))))))).)))))))))....
SRP_00170 (ext) [ FASTA input ] GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
[ reference structure ] ((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
[ predicted structure ] (((((((((((((.((((...)))))))(((((((((.((((..))))((((((((..)))))))))))).))))))))))))))).....
SRP_00193 (ext) [ FASTA input ] GGAGGCCCUCUUGGUUCCUCGCAAUGAUGUUCGGUUUAUUAGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCGGAGUCGAGAUUUUCGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAGGGUCUCCACCCAACU
[ reference structure ] ((.(.((.(((((((..(((((.((((.((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..).)))))...)))).....))))))))).).)).........
[ predicted structure ] ((((((((....)).))))).)..(((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))(((((((((..))))))))).))))(((((((((((..)))))))))))
SRP_00194 (ext) [ FASTA input ] GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((.(.((((((((..))))).)))))))))))))))).))))).)))))))))....
SRP_00200 (ext) [ FASTA input ] GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
[ reference structure ] ((..((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))))..))........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)))).))).)))).).))))))))))))))))........
SRP_00209 (ext) [ FASTA input ] GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
[ reference structure ] (((((.(((((..(((((.((((((......(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..)))).))).)).........
[ predicted structure ] ......(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))((((((..)))))))))))))))))))))))).
SRP_00213 (ext) [ FASTA input ] GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
[ reference structure ] (((((((((((..((.(...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....).)).)..))))))))))......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((.(..(((((((((..))))..)))))))))))))))))(((...)))..)))))))))))))......
SRP_00214 (ext) [ FASTA input ] AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ] ((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((..))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))
SRP_00215 (ext) [ FASTA input ] GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
[ reference structure ] (((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((...))))).(((((((((((((....)))))))))))))))))))).)))))))))....
SRP_00216 (ext) [ FASTA input ] AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((..))))))))))))).)))))))..))))).))))))))))))
SRP_00217 (ext) [ FASTA input ] GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))...)))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((..)))))))...((((((...)))))))))))).)))))).)))))))))....
SRP_00219 (ext) [ FASTA input ] GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...)))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((..(.((((((..)))))))((((((...)))))))))))).)))))).)))))))))....
SRP_00221 (ext) [ FASTA input ] GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((..(.(..(.....((((....(((....)))....))))...)...)...)..))))..))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..))))).)))))))))))))).)))))))).))))))))).....
SRP_00223 (ext) [ FASTA input ] GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU
[ reference structure ] ((((..(.(.(((((..((((.....(((......((....))......)))...))))...))))))...)..)))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((.((((((((((((((((((..)))).(((...)))))))))))))))))))))).))))))))).....
SRP_00231 (ext) [ FASTA input ] GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
[ predicted structure ] .(((((....)))))((((((.((((((((.((((..))))(((((((((((((((...)))))))))))))))...((((((..))))))))))))))))))))
SRP_00233 (ext) [ FASTA input ] GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU
[ reference structure ] ((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........
[ predicted structure ] (((((((((((.((((..))))((((((((((((((((..)))...)))))(((((((((....)))))).))))))))))))).)))))))))........
SRP_00235 (ext) [ FASTA input ] GGUAUAGUUUUAUUAAAACUUAAGAUAGACUUACUAUGUCAGAAUCGUAAGAUAGCAGCAUAAAGAUCUCAUUUUUAGUUAGUAUUAAAGCUAUACCUAAA
[ reference structure ] ((((((((((((....((((.((((.(((((...(((((....(((....)))....))))).)).)))..)))).)))).....))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((..((((.((((((((..)))).))))))))))).))).))))))))))).)))))))))))))))....
SRP_00243 (ext) [ FASTA input ] AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((..(.((((.((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).).).)))).)..))))....)))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((..))))).))))))))))))))).))))))))))))))...))))))))))....
SRP_00244 (ext) [ FASTA input ] GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG
[ reference structure ] ((((((((((((((((.(((((.((((.((((((((.....(((....(((....)))....)))..)))))))..).)))))...))))....))))))))))))))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((..))))))..)))))))))))))))((((...))))..)).))))...)))))))))))))))))........
SRP_00250 (ext) [ FASTA input ] GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUAACUUGUUAACUUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAGCAGGGGAUGUGUGUGCCGGGAUGUCGCUGGCAGAGCCCUCGCCAAUU
[ reference structure ] ((((..(.((((((((.((((((.((((...((((((....((((....(((....)))....)))).))))))....)))))...))))).)..))))))))..))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((.((((((((((((((((((((((...(((.((((((((..))))).)))))))))))))))).)))).))).)))).)..))))))))))))))).......
SRP_00251 (ext) [ FASTA input ] GAGGCCCCCAUUGGUCCUCCCGCAACACUAACCUGUGAACUCGGCCAGACCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAGGUGACGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGUGGGGGCUUCCACCCAUCU
[ reference structure ] (((.(((.((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))).)))..........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((.((((((..)))).)))))))).)))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))))).........
SRP_00256 (ext) [ FASTA input ] GGCGACCCUUGCGACUGUGAGUCGUGAACCUGGUCAGGCCUUAACUGGAGCAGCCAUAAGCGGUGUAACUUUGUGUGAGGGUUGCCGCCACCG
[ reference structure ] ((((..(.((...((.(.(.(((((.....((((....((......))....))))...)))))....).).)..)..)))....))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))).))))))))).(((((((.(((..))))))))).)))))))))).......
SRP_00266 (ext) [ FASTA input ] GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU
[ reference structure ] ((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
[ predicted structure ] (((((((((((((((....)))))))).((((((((((((((((..))))).).(((((.((((..)))))))))))))))))))))))))).....
SRP_00269 (ext) [ FASTA input ] GACUCGGGCCCAUGCGGCUUCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAAUCUGGCGUGGAUUCCGGGUCACCUAAA
[ reference structure ] ((((((((.((((((((.((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))).)).))))))..)))))))).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((..((...(((((((..))))))))))))))))))))))))...)))))))))(((.(((((((..))))))))))..
SRP_00271 (ext) [ FASTA input ] CUCGGCCUUUCGCGGUUUUAACGCCCAAACCUGGUCAGGAUCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAGGCAGGCGAG
[ reference structure ] ........(((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..)))))
[ predicted structure ] (((.(((((((((((...(((((((((((((((..)))))))))))))))(((((((...)))))))))))))))))))))
SRP_00273 (ext) [ FASTA input ] GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU
[ reference structure ] ((((((((((((((((.((((((.(((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))...))))))...)))))...)))))))))))))))).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((((..))))).))))))))))))))).))).))))))))))...)))))))))))))))).......
SRP_00274 (ext) [ FASTA input ] GGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGGCACCACCUAUCU
[ reference structure ] ((((.(((((((((((.((((((.(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))...)))))...))))))))))).))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((.((((((((..))).))))))))).))))))).))))).))))))))...))))))))))))))))........
SRP_00284 (ext) [ FASTA input ] GCUAGUAGUGGGCAUUGUACCUGUUUAGUCGGUCAGGUCUGAAAGGAAGCAGCCAGAGUGGGAUUCGAUGGGUCAUUACUAGCAUUA
[ reference structure ] (((((((((((.(((((..((((((...(.(((....(((....)))....))).)))))))...)))))..)))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((..((((((((..))))))))))))))(((...)))).)))))))).)))))))))))....
SRP_00285 (ext) [ FASTA input ] GCUAGUAGUGGGCAUUGCUCUUGCUUAGUUGGUCAGGUCUGAAAAGAAGCAGCCAGGGUAAGAUUCUGUGGGUCAUUACUAGUAUCA
[ reference structure ] (((((((((((.(((.(.(((((((...(((((....(((....)))....))))))))))))..).)))..)))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((.(((((((((((.((((((..)))))))))))))))))((((((...)))))))))))))))))))))....
SRP_00295 (ext) [ FASTA input ] GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUACUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAUGACGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCAGGGCCCCCACCCAAUU
[ reference structure ] ((((((((((((((((.((((((.((((...((((((.....(((....(((....)))....)))..))))))....)))))...)))))...))))))))))))))))........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))..)))))).(((..)))))).))))))).))).)))).).))))))))))))))))........
SRP_00303 (ext) [ FASTA input ] GGUGACCCUAGGGUCCCCCCGCAAUGAUAACUUGUGAACUCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAAGCGACUCGUGUGCCGGGGUGUCGGCUCUAGGGGAACCUCCAAAU
[ reference structure ] (((..(((((((.(..((((((.((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))))...)))))....).)).)))))..))).......
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((....((((((((((((((..)))))))))))).))))))))).)))).))))))))....))))))))))))))).......
SRP_00307 (ext) [ FASTA input ] AGAGAUAUGGUUGUGCCAAGUUUAGUCAUGUGCAAUAGCGAAUAUGGUGUAGAUCAUUGAGGCAUCUGCUUAAUGUGAUGGGGAAUGCGUCAGGACGGCAACGUAGCAGCGAGUAACCGUCAGCAUGAUUAGUACCGUGGAAUAACAUAACCUAGUUUUUU
[ reference structure ] (..(.(...(((((.(...((((((((((((...((.((....(((((....)))))....))))..........((((((....(.(((....(((....)))....))).)...)))))))))))))))).)).)....)))))...).)...).....
[ predicted structure ] .(.((((((.((((((((((.((((((((((............(((((....)))))((((((....))))))..((((((((((.(((((..)))).)............).)))))))))))))))))))...))))))))))))))))).........
SRP_00310 (ext) [ FASTA input ] GGAGCAACAUUUACUCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUGCUAAAUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ] ((((((.(((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..).))))))))..))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((..(.(((((((((((((..))))).))))))))))))).).))))))).))))))....
SRP_00312 (ext) [ FASTA input ] GCCCCUCACGUGGCGCUAUCUGACUGAACUCCCCCAGGGCCGGAAGUCAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGCGCUUGC
[ reference structure ] (((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(.(....).).....)))..))))))...))))).)..))))))))))......
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))(((((((..))))))))))).)))))))))))))......
SRP_00315 (ext) [ FASTA input ] GGAGCAACAGUUCUGCGUGAAGCGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUGAAUUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ] ((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)..))))))))..))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((...)))))((((((((((..))))).)))))(((((..))))))))))).))))))....
SRP_00318 (ext) [ FASTA input ] GGAGCAACACUUGUGCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUUCGGGUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ] ((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)...))))))))..))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))).))))))....
SRP_00324 (ext) [ FASTA input ] CUCCACCAGUCCGCUAGCGACCCUGCGGAAACGCGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCGCACCGCCGGGUCGCUAGGUGGACAGCCUGCAGAUGUGGCGGAAUUGG
[ reference structure ] ((.((.(.((((..((((((.(((((((....((((....(((....)))....)))).))).))))))))))))...)).)..)).))...............
[ predicted structure ] .(((((.......((((((((((((((((...(((.((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))(((((.(((..))))))))......
SRP_00325 (ext) [ FASTA input ] GGCUCGGACUCAUGCGAUUACAACGCCCAAAUCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAGGGAUGCUUGUGGUAGGCGUGAACUCCGGGCU
[ reference structure ] ((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((..))))).)))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SRP_00326 (ext) [ FASTA input ] GACUCGGGCCAUGCGGCUCGGACGCCCAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCAGAGCAGGCGUGGACUCCGGGUCACCCAACU
[ reference structure ] ((((((((((((((.((((.(((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).)).))))..))))))..))))))))........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((.((((..((((((((..))))))))))))(((((((...)))))))))))))))).))))).).)))))))........
SRP_00333 (ext) [ FASTA input ] GGCUCGGAAUCAUGCGAUCGCAACGCCUCAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUACGGGAUGCUUGCGAUAGGCGUGAUCUCCGGGUCACCCUCUG
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))).))))))))........
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((.(((((.((((....))))(((((.(((....))).))))))))))))))))))).)))))).))))))))........
SRP_00341 (ext) [ FASTA input ] CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU
[ reference structure ] ((.((((((((((((((((.((((..((.....((((....(((....)))....))))..))..)))).))))))))...))).))))).)).....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((..))))))))))))))))))))..)))))))))).)))).).)))))))....
SRP_00342 (ext) [ FASTA input ] CCGGGGCCGCCCACGAAAUAUCCCCCAAACCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGGGGGACGCUUCGGUGCGCGAUCCGCCCCGG
[ reference structure ] (.((((.((.(..((((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).))))..)..)).))...)).).
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))).))))))....)))))))
SRP_00350 (ext) [ FASTA input ] GCCUCCGCGCGGCGUUACCCGGGUGAACUCCCCCAGGUUAGGAAUAAAGCAAGGGUAGCUCGGCUCUGGCGGGUGUGCGGGGGUCUUGC
[ reference structure ] ((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..))))))))).....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))..((((((((((((..))))))))))))..)))))))))).....
SRP_00356 (ext) [ FASTA input ] UUAUAAUAUAUAUGUCAUUACAAUAUUAAGUAGCGAACCUUGUCAGGCCAGAGAUGGAGCAGCAAUAGCAAUAUCUUUUUAUGUGUGAUGACAUAUAUUAA
[ reference structure ] .......(((((((((((((((.((..((((.((.....((((....(((....)))....))))..)).))...))..))))..)))))))))))))...
[ predicted structure ] ..(((((((..((((((((((((((((((((((((..(((((((((..))))))))))))))).((((..)))).))))))).))))))))))))))))))
SRP_00357 (ext) [ FASTA input ] GGGGGCCCUGGUCCUCCCGCAACACUAGUUCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGAUGAUGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCUCC
[ reference structure ] (((((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...)))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((.....(((((((((((((..))).))))))).)))))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))
SRP_00358 (ext) [ FASTA input ] UGGGGCUCUGGUCCUCUCGCAACAAUAGCUCGUGAACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCGUGUGACUUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCCCACCCUUUAAA
[ reference structure ] (((((((((((((.((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..)))))))))))).))))))))))))))))))))))).).))))))))))))).........
SRP_00363 (ext) [ FASTA input ] UUCCAGCAUACAGCAAUAUUUUUAUUAGUAAAUUCGAUCAGGUCCGACAGGAAGCAAUCGUAGCUACAAAAAGUAUGUGUAUAGUAUGCUGGAAAAUU
[ reference structure ] (((((((((...(((.(((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..))))))))..)).....)))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))....
SRP_00365 (ext) [ FASTA input ] GGUAUGCAGGCAAAAACUCUGUAACUUGGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCCACACCAGAAUCUUUUUGGGUUGCAUACCUAUU
[ reference structure ] (((((((((.((((((.(((((....((((....(((....)))....)))).)).)))...))))))..)))))))))....
[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((..((((.((((((((..))))).)))))))))))))..)))))))).)))))))))....
SRP_00367 (ext) [ FASTA input ] GGUGGCCCCGUCGGUCCCUCGCGACGCUAGAUCGAAAAUCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUCGAUUGAUGCGGGCGCCGAGGUCAACCGGCGGGGACACCACCCCACUC
[ reference structure ] ((((.((((((((((.((((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...)))))...)))))))))).)))).........
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))..))))))))))))))((((((((((..))).))))))))))(((((.((...)))))))(((..)))...))))).
SRP_00369 (ext) [ FASTA input ] GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC
[ reference structure ] (((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...))))....)))))))))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))
SRP_00383 (ext) [ FASTA input ] GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
[ reference structure ] (((((((((.(((((...(((......((((....(((....)))....))))...))).....)))))..)))))).)))
[ predicted structure ] ((((((((((((((...)))))))))))))).(((((((..))))).))(((((((((((((((..)))))))))))))))
TMR_00272 (ext) [ FASTA input ] GGGGAUGAAUUAGUUUAGAUAUUUAAGUAAUCCAUGAAAAUUCAUCAGAAUUUUGUAAUAUUGCUUAGAUAAAACCAUGGGCAGUACAUGGCAUCUCCACCA
[ reference structure ] (((((((............((((((((((((.....(((((((....))))))).....))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..)))))..))))))))))).)))))))))))))).(((((((...))))))))))))))....


  • N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.