CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - MCFold
CRW_00552 (ext)
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CRW_00573 (ext)
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CRW_01492 (ext)
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CRW_01493 (ext)
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CRW_01494 (ext)
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CRW_01496 (ext)
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UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA
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CRW_01569 (ext)
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GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU
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CRW_01572 (ext)
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AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU
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GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
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GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU
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CRW_01623 (ext)
[ FASTA input ]
GGGUACGACCAUACUUGGCCGAGUGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGCCGUACCCUU
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NDB_00014 (ext)
[ FASTA input ]
CCACUAGUGGCCACUAGUGG
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[ FASTA input ]
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((.((((((((.)))).)))))).
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(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
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(((((((((((())))))))))))
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(((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))
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((((((((((((()))))))))))))
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((((((((((((..))))))))))))
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((((((((((...(((((..)))))))))...))))))
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(((((((((((..)))))))))))
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..(((....((((......)))).)))..
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GGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCCGGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCC
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(((((.((((....)))).......)))))
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(((((((((((..))))))......)))))
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GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
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(((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.((((((((((((((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
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GGCUCGUGUAGCUCAUUAGCUCCGAGCC
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((((((.(.((((....)))))))))))
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GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
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(((((((((((((((((((...))))))...)))))))))))))...
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UUGCGUCACACCGGUGAAGUCGCUGCGUCACACCGGUGAAGUCGC
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..(((((.((((((((..(((((.))))).))))))))..)))))
[ predicted structure ]
..(((((((((((((((.((((...)))))))))))))).)))))
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[ reference structure ]
..((((((((((((..))))))))))))...((((((((.(((.....)))..))))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((....))))...))))))))))))))).......(((..))).)))))))))))))).))))
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..((((((((((((..))))))))))))...(((((....((((...)))).....)))))..((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((...)))))))))))))))...(((((...)))))))))))))))))))))))))))))
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GGUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUACC
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AAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUU
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(((((((((((((((((....)))))))))))...))))))
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GGAGCCUGGGAGCUCCCACGGUCCCAGACGUG
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((((([[[[[.)))))(((((.]]]]])))))
[ predicted structure ]
((((((...).)))))((((.((...))))))
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(((((.(((...((((.....))))))))))))(((((.(((...((((.....))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((((((((((((((((((((((((..)))).)))))))))))))))))))))))))))
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GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUCUUCGGCUCUUCCUA
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.....(((((((((((..)))))((((.(((..)))))))..))))))
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GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCCACUGGCUUGUGGCG
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[ predicted structure ]
.....(((((((((((..)))))((((((((...)))))))).))))))
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((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
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((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
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(((((((((((((((..)))))(((..))))))).(((..)))))))))
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..((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))
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..(((((((((((((..)))))(((..)))))))))))(((...)))
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(((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))
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((((((((........))))))))
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(((((((((((..)))))))))))
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(((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((..)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))(((((.((((((..)))))))))))
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.((((((.......<<<.<<<<<.))))))...........>>.>>>.>>>..((((((.......{{..{{{{{.))))))...........}}.}}}..}}..((((((.......[[[.[[[[[.))))))...........]].]]].]]].
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........((((((((((((((((((.(((.((((((((..(((.......))).....))))))))))))))))))).))).)))))))(((((((((....(((((((((((((....))))))))).))).)......)))))))))......
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((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((..))))))))))))
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ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU
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....((((((((....))))))))
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((((((((((((..))))))))((((((((...))))))))))))
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AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU
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((((((.......((((......))))...((())).))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((..))))))...)))))))))))))
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AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU
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((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
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(((((.(((((((((((((..)))))))))))).)(((..))))))))
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AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU
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((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
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(((((((((.(..((((((..)))))))))).((((..))))))))))
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AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU
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((((((..(((((((.(((..)))(((..))))))))))))))))
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AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU
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GCAAUACUGAAGAGUUCCACAAUAGGACGAAACGGCGAUCCAGUGU
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AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU
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AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU
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[ predicted structure ]
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ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
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(((((((((((((((((((((((...)))))))).))))))))))))))).(.(((..))))
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[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
.(((((((((((((....)))))))))(((((((((((.(((..)))))))))))))).))))
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[ reference structure ]
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[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
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[ reference structure ]
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
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[ predicted structure ]
....(((((.((((((((((((((((.((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))..)))..(((((....))))))))))
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
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.....(((((((((..)))))))))(((((((((((((((..)))))..)))))))))).......
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GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
((((((((((((((.((((((((((((..)))))))))))))))((((((((..))))))))((((((...)..))))))))))))))))
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GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA
[ reference structure ]
(.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
[ predicted structure ]
((((((((((((..(((((((((((..))))))))))).(((((..)))))))))))))))))....
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AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
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(((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
[ predicted structure ]
..((((((..(((((((((((((((.((..)))))))(((((((...))))))).))))))))))))))))
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GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
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GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
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[ predicted structure ]
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GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA
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GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA
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GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
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GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
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(((((((..(.(((((((((((((((((...))))))))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
SPR_00882 (ext)
[ FASTA input ]
GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))((((((((((((...)..))))).).)))))
SPR_00913 (ext)
[ FASTA input ]
GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((...)))))((((((((((((((((((..)).)))))))))))))))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((..)))))))))))))))).(((((((((....((((((...)..))))))))))..))))
SPR_00938 (ext)
[ FASTA input ]
UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA
[ reference structure ]
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ]
((((((..))))))((((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))).
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[ FASTA input ]
GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(((((((((...)))))(((((((...)))))))))))((((((...)..)))))))))))).
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GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.((((((((..))))))))))))))))....(((((((((((((((((...)..))))))))))))))))
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[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((...)))...((((((((((((...))))))))))))((((((...)..))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GGCCGCUUAGCACAGUGGCAGUGCACCACUCUCGUAAAGUGGGGGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCAGUGGCCU
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..((((((...))))))(((.((((((...))))))))).((((((...)..)))))))))))).
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[ FASTA input ]
AGGGGUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGCGGUCUCCAAAACCGCAGGUCGGGGGUUCGAGCCCCUCUGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((..))))))).(.(((((((..((((((((..)))))))))))))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((.......)))).(((((.......))))).......).)))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((..)))).(((((((...)))))))))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..((..((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))).
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[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((....)))))((((((....)))))))))))))((((...)..))).))))))))....
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[ FASTA input ]
AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..((((((.(((((((((((...)))))))))))))))))(((((((...)))))))))))))).
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[ FASTA input ]
CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((...))))).((((((((((.((..))))))))))))((((((...)..))))).))))))....
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[ FASTA input ]
GGUAGCCCUGCUGGUGGCUUCGCAAUUGUACUCUGUGAACCCCGCCAGGACCGGAAGGUAGCAACGGUAGCAGAUCUAUAAUGUGCCGAGGUUUUGCUAGUAGGGUUACCACCAUUU
[ reference structure ]
(((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))..)))))))...))))))..)))))))))))))))).......
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))..)))))).)).)))))))..))))))))))))))).......
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[ FASTA input ]
GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU
[ reference structure ]
.((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
AUGCAGUCACCGCACCUCUGUGGAUGCCGCCAUGCCAGAAGCAGUGCUGUGUAGGCAGCGCCUGUGGUGGCUUAAAUGGGUGAACGGGCCAGGGCGGUAACGCAGCAACCAUAAGCCCAGUGGCACGCAGUCUGCAGUCCCGUGCGUAGCAUUUU
[ reference structure ]
(....((.(.(((((.(..((((.(((.(((((((((..(...(((((((....)))))))...)..))))(...)(((((.....((.....(((....))).....))....))))))))))..)))..))))).....)))))).))...).
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU
[ reference structure ]
((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((.((((((.((((((((...))))).)))(((((..))))))))))))))))))...((((((((((..))))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GGUGGCCGGGUCCCAUACAAUAGCUCUCUUGACGAAUCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGCACUCGAGGGACUAUGUGAUAUGGGGUGCUCGGCCACUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((((.((.(((.(..(.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...))))).)).).)).....)).)).))))))))).))...
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
[ reference structure ]
((.((((((((..((.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))...)).)).)..))))))).))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((...))))((((.(((((((((((((((..))))).)))))).))))(((....))))))))))))))))))....
SRP_00043 (ext)
[ FASTA input ]
UUAUACAUCGUAACUGUAGUUAACAGUUUUGUUGAUUUAGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCUAUAACAAAAUUGUAUACAGUUACGAUGAUGUGUGUUAUU
[ reference structure ]
....(.(.(((((.(((((.((...((((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)...))...)))))....).)))).).).
[ predicted structure ]
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SRP_00044 (ext)
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GCUGGCGGGCCCCUUCGCAUGGUUCGGCGGUGAAUCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCAUAGUCGUUCAGAACCAGUGCCGGAGUAAGGCUCGCCUACCGGUAUCCCU
[ reference structure ]
...(((((((((..((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))).)...)))))))).............
[ predicted structure ]
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SRP_00045 (ext)
[ FASTA input ]
UGGGUUCGAAUCCCAUUCUCUCCGAUUCCUAGGACCCGUACUAUCAAGUAUUGCUGAAUCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGAUGAGUACGUAAGUCUUAGGUUUAAUUUUGAACCCAAAUGCAAUGUUUUGCUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
[ reference structure ]
((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((.((((..)))))(((((..))).))((((((((.(((...)))))))))))))))))))))))..))))))))....
SRP_00051 (ext)
[ FASTA input ]
GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU
[ reference structure ]
(((((((((..(((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))))...))))))))).........
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..
SRP_00054 (ext)
[ FASTA input ]
GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU
[ reference structure ]
((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))))..))))))))).........
[ predicted structure ]
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SRP_00057 (ext)
[ FASTA input ]
GAGUUAUCUGUUAGCUCCAAACACUGCAAUAUUGAAUAGUUGGUCAGAUUCGGAAGGAAGCAGCCAAAUCAAUUGAUACAGGUGUUCUGAUAAAGCUAACAGAAACUCCUAAA
[ reference structure ]
(((((..(((((((((.((.((.(((.(..(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))...).))))...).))....))))))))).))))).....
[ predicted structure ]
(((((.((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((..).))))))))))))))))))))))))).)))).))...)))))))))))))))).....
SRP_00072 (ext)
[ FASTA input ]
GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))...)))))))))....................
[ predicted structure ]
((((((((((((((.(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))....(((((((((..))))))))))))))))))).......((((...))))..
SRP_00074 (ext)
[ FASTA input ]
GUAAGUUGGGGACCUUUUAAGAGAAGAGACCUACGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGAAGUGUUUUCUUUUGCUAGAAGUGUUCUCCAACUUACUCUUCUUUU
[ reference structure ]
(..(((.((....(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..))))))..........)).)))..).....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))).........
SRP_00083 (ext)
[ FASTA input ]
GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG
[ reference structure ]
((((((((((.((((..(((.(((((((......((((.....((....)).....))))....)))))..)).)))...)))).))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((((((..)))))))))))))..)))))))))((((....))))))))))))))))))))....
SRP_00094 (ext)
[ FASTA input ]
GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
[ reference structure ]
((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((((((((.(.....))))))(((((((....(((((..)))))(((((((((....)))))))))))))))))))))))).....
SRP_00095 (ext)
[ FASTA input ]
GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
[ reference structure ]
((.((((((((..((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....)))).)..))))))))).....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((((((....)))))))..))))))))))))))))(((((((((((....)))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GGCAGCCGCAGGGGUCCCCUCGCGACGAAUUGCCGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGCGGUGGAUUUGGGUGCCGAGGUGCGGCUUUUGUGGCUGUCUUUU
[ reference structure ]
((((((((..((((.((((((((..(((((((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).))))).)...)))))...)).)))).))))))))....
[ predicted structure ]
((..(((((((((((....((((((((...)))))))))))))))).)))))((((((((((((((((((((((..(((((((..)))))))))))))))))))))))))))))
SRP_00101 (ext)
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU
[ reference structure ]
((((((((.(((..(.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)..)))....))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.(((((((((((((..))))))))))))((((((.((((((((((..)))).)))))))))))))))))))))....
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[ FASTA input ]
GCAUUGCUGGUGCAGCGCAGCGCGGACGCCCGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCAUAAGGGAUGCUUUGCGGGUGCCGUUGCCUUCCGGCAAUGCUUUU
[ reference structure ]
((((((((((.((((((((.((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))..)).))))))...))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((..((.((((((.(..(((((((..(((((....)))))((((((((..((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))....
SRP_00106 (ext)
[ FASTA input ]
GGUAGCUAGGUCUAUGCAACAGAGAAUCACGAACUCCGCCAGGCCUGGAAGGGAGCAACGGUAGUGACACUCUCUGUGUGCGUAGGUUGCCUAGCUACCAUUU
[ reference structure ]
.(.(.(((((.(.((..(...((((.((((.....(((.....(((....))).....)))..))))...)))))..........)).))))))......).)
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))..))))))))..)))))))).)))))))...)))))))))))....
SRP_00107 (ext)
[ FASTA input ]
GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU
[ reference structure ]
.......((((((..((..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))).......)...))))).)))...
[ predicted structure ]
((((((((((((((((..)))))))..(((((((((.(((((..)))))(((((((...)))))))))))))).))))))))))).
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[ FASTA input ]
GGGCAGUAAGCAUGGGCCUGGAUGAUCUCCUUGUGGGCAGUUGGGGAGCCUGUAGGGGUGCUCCACCUGCCAUUAAAGCGGAGGGGAACGCAUGAGGGCGGAAACGCAGCAAUGAGUACCUCCUGCAGGGUAGAGUCGCCAGCAGACCAUGCCAGUCCUUUU
[ reference structure ]
(((..((..((((((.(...(.((.(((((((((.(((((.(((((.((((....)))).))))).))))).(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))).)))..)).).)....))))))..))..))).
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA
[ reference structure ]
......((.(.(((((.((((((.((.((.....((((....(((....)))....))))...)).))..))))))))..))).).)...)..
[ predicted structure ]
(((..))).((((((((((((((((((((((((((((((..(((((..))))))))))))))))))))).))))))).)))))))........
SRP_00128 (ext)
[ FASTA input ]
GGAGGCCCUGUCGGUUCUCCCGCAACACUAUCCUGUGGACUCGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCAGGAGACGUGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCGGGGCCUCCACCAAUU
[ reference structure ]
.(.((.((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...))))))).))).)).).......
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((((..))).)))))))))))))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))))).......
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[ FASTA input ]
GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ]
(..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((..))).)))))))))))))).)))))))))).))))))).)))))))))....
SRP_00134 (ext)
[ FASTA input ]
CUGAUAGCUGGGUCCCGCGCAACGGUAGGUUAUGAACCCCGCCAGAUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGUAGCUGAUUCCGUGUGCCGCGGGGGAGCCCAGCUAUCAGUUGU
[ reference structure ]
...(...(((((((((.((((.(((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))).....)).)))).)))))........)..
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((.(((..((((...)))))))...((((((((((.((((((((..)))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))....
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[ FASTA input ]
ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU
[ reference structure ]
(((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((..))))).)))))))))))))..)))).))))))))))))))))))...
SRP_00138 (ext)
[ FASTA input ]
GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU
[ reference structure ]
(((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((.(((((((..((((.((((((((..)))).)))))))))))))))))))))).))).))))))))).....
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[ FASTA input ]
ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG
[ reference structure ]
(((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))).))))))))))))).))))))))
SRP_00141 (ext)
[ FASTA input ]
GGAAACCUUCUCGGUCUCUCGCAACGGUGUCUGGUUUACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAAGUCGGAAUUACUGUGUGCCGAGAAGAAGCUGGGAAGGUUUCCGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..)))))))...)))))....)))))))))))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((..)))))..))))))))))))))))(((((((....)))))))))))))))))))))))))))))...
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[ FASTA input ]
UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU
[ reference structure ]
.((((((((((((.(((((((.((((((((((((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))))))...))))))...)))))))))))).......
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))).)).)))))))..)))))))))))))......
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[ FASTA input ]
CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG
[ reference structure ]
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))).))))))))...))))))))))))
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[ FASTA input ]
GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ]
(((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....(.(((..)))))))))))((((((.(...)))))))))))))).)))))....
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[ FASTA input ]
GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
((((((.((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...))).).))))))))..))))....
[ predicted structure ]
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CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
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[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
[ reference structure ]
((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GGAGGCCCUCUUGGUUCCUCGCAAUGAUGUUCGGUUUAUUAGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCGGAGUCGAGAUUUUCGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAGGGUCUCCACCCAACU
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
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[ FASTA input ]
GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
[ reference structure ]
((..((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))))..))........
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((..)))))))))))))))))))))).)))).))).)))).).))))))))))))))))........
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[ FASTA input ]
GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
......(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))((((((..)))))))))))))))))))))))).
SRP_00213 (ext)
[ FASTA input ]
GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ]
((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
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[ FASTA input ]
GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
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AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
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GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
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[ predicted structure ]
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[ predicted structure ]
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[ reference structure ]
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[ predicted structure ]
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[ reference structure ]
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[ FASTA input ]
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[ FASTA input ]
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