RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - PPfold(20)

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ASE_00134	[ FASTA input ]	GAGGAAAGUCCGGGCUACAUAGGGCAGCGUGCCAGCUAACGGCUGGGCAGGGUAACUUGACGACCAGUGCAGCAGAGAGUAGACCGCCUUUGGCUUAUAUGAGUAUCGCAAGAUAUUCAUGUCAUCGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGGCUGGCAACAGUUCACGGCAUGGUAAACUCCACGCGUAGCAAGACCAAAUAGGCAUCGGCAUGGCGCGGCCCGCGUUCGAUGCGGGUAGGUUGCUUGAGCGUACGAGCGAUUGUGCGCCUAGAGGAAUGAUUGUCCACGACAGAAUCCGGCUUA
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ASE_00136	[ FASTA input ]	GAGGAAAGUCCGGGCUUCAACGGGCAAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGCGUGAGCCGACGGAAAGUGCAGCAGAGAGUAGACCGCCUUCAAUAUGGUUUCGAGCAAUCGGAAUCGGAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCAUGACUGGUAACAGUUCAUGGCAUGGUAAACCCCACCGGAAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCUUUAGGCAUGGCCCAUGCUGGAUCCGGGUAGGUCGCUGGAGCGUAUGAGUGAUUGUACGCCUAGAGGAAUGAUCGUUCGCGACAGAACCCGGCUUA
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ASE_00138	[ FASTA input ]	GAGGAAAGUCCGGGCUUCCAAGAGCAAGAGGGCAGCUAACGGCUGCUAAAGGAAACUUUAAGGAAAGCGCCACAGAAAAUAGACCGCCAUUUUGGUAAGGGUGAAAAGGUGGUGUAAGAGACCACCAGUUCUUUAGGAAACUAAAGAAGCUAGGUAAACCCCCUCUGGAGCAAGACUAAAUAGGAAAGGUUAAGGGUUGCUCGUCCAGCUUUCAGGGUAAGUUGCUUGAAAUUAUAAGAGAUUAUAAUUCUAGAUAAAUAAUUAACAUAUACAGAACCCGGCUUA
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ASE_00142	[ FASTA input ]	GAAGCAGAACAGAUGGCCGCCCUUCGCGUGCGGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAUGGUGCUGGAUAACGUCCAGCGGGGGCGACCCCAGGGAUAGUGCCACAGAGAGAAGUCCGCCCGCUCAGGCGGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGUAAGAGCUCACCGGGUUCGGCGGUGACGUCGGAUGCCAGGUAAACCCCACCAGGAGCAAGGCCGAAUAGGGAAGCGUCAAGGAUGGCCCGUCCGUGCUUCCGGGUUGGCUGCUUGAGGCCGUCGGUAACGGCGGUCCCAGAGGAAUGGUCAUCGCCCGCCAAGGGGUAACCCGCGGCGGGAACAGAACCCGGCUUAUGGGCUGCUUCGACCA
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CRW_00548	[ FASTA input ]	UUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC
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CRW_00555	[ FASTA input ]	ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUUU
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CRW_00567	[ FASTA input ]	AAUCCCCCGUGCCCUUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU
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CRW_00570	[ FASTA input ]	GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
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CRW_00590	[ FASTA input ]	UCUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGUGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUUGAACGUAAAAUGGUCUUUUAAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAAUCUGUCCUUGGGAGGGGAACAACAGUUGGAAACGUCUGCUAAUACCCCAUAGACUGAGGAGUAAAAGGAGGAAAUCCGCCCAAGUAGGAGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGAAAUAGCUUACCAAGGCAAUAAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCUUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCUAAAGCUGACGGAGCAAUGCCACGUGAAGGUAAAAGGCCCCUGGGUCAUGAACUUCUUUUACCAGAGAAUAAAGCAAUGACGGUAUCUGGUGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGAAAUACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGAUGGCUUUUUAAGUCUGCCAUAAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGUACAGGUGGUAGAAACUAUAAAGACUUGAGUUUGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUUCGGUGGAGCGAUAAAAUGCAUAGAGAUCGGAAAGAACACCAAUGGCGAAGGCACUCUGCUGGGCCAAUACUGACAUUGAGAGACUAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGGUACCCCAGUAGUCCUAGCCAUAAACGAUGGAUACCAAGUGCUGUGUGAAUCGAUCCAUGCAGUGCUCUAGCAAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGACGUGGGCCCGCACAAGCGAUGGAGCAUGUCGUUUAAUUCGAUGCAAAGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGUUAUGCCGCGAAUACUCUUGAAAGAGAGGAGUGCCCUAGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCCCAUAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCAAUACUUAGUUUGGAACUCUAAACAUACUGCCGGUGUUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCUACACACAUGCUACAAUGGACAGGACAAAGGAUUGUAAGUCCGCGAGGUUUAGAUAACUCCAAAAACCUGUCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGUGAAUUAGUUCUCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACUAAAAGAGCUGGCUUUGUCCUAAGUCAUUUUUACCUUAACCACAAAGGAGGGGGAUGCCAAAGGCAGGGCUAGUGAUUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU
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CRW_01487	[ FASTA input ]	GGCAGCGGCCAUAGCGGUGGGGCGACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCCACCAGCGUACCGGGAAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAGCGGGGUUCGCCGCCUGCCC
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CRW_01497	[ FASTA input ]	UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC
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SPR_00435	[ FASTA input ]	GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
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	[ predicted structure ]	(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00436	[ FASTA input ]	GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
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SRP_00008	[ FASTA input ]	GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU
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SRP_00011	[ FASTA input ]	GUCGAACUCAGUAACGCGGGCUUGUGAUCCAAGUGGAGACAAUAAGGGGAUGGGACGUUGGGUCGAUCUCAUUGGGCCGGGUUCGGGUUGGGCUAUAUUCUGGCCCGCCCAUUCCAAGUUGGGAGUUGAGGCAUGGGCUUCGAGCGAAGGCUCGGGUCUCAUGUCUUCUAGAGUGGGGGAGACCGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGCGUCCACCUCCCGCUCUUGACGGUGGAAGGAUUACGGGCCAUUGCCUUCCGAGCCCACUAUGACCCAAUAAGCCGCUCCGAUUGGACCAUCACUUU
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SRP_00015	[ FASTA input ]	GUCGAGCUAUGUAACGAGAGCUUGUAACCCAAGUGGGGACUAUAAGAUGGUGGAACACUGGAUCGGCCCACGGGUCGGAUUUGUUGUUGGCAUAGGUCUGGACUGCCCAAUCCAAGCUGUGAGUGAACCGUAUGAACCAAGCGAAGGUUUGAUCCGUACGGUUGCUAAAGGUUGAGGGUAUUGCGUUAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACUACCUCCCGCUCUCAGCAGUGGACGGACAACGGUUCGACGCCACACAAAUCCACUAUGGUCCGCUGGCUCGUAACCCGCUUGAACCACCAUUUU
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SRP_00020	[ FASTA input ]	GGCGGGUCUCCCCGCAUUGCAGCGCGGUGAACCUGGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCCGUUCCCUGCAAGUGCCGGGGGUCAGGCUCGCCACCCCGAACA
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SRP_00024	[ FASTA input ]	UCUACCGUGCUAGACGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCAAUAGCCCAGGUGUGAAUUCCUAUCCUAGGUUUUCUUAUGUGAGGCUGCCGUUGAUGGCGGCGGUGUUGAGGAGCGGGUCCUGUGCAACGCGAACCCAUGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAAGUGGAUCAUCGCGUGUGCCGCAGGGUAGCCUGCUCUGAGCUGCUACCAUAAGUAACGCUCGGAUAAGGAUUAUCGAAGAUAGGUGCACGGUA
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	[ predicted structure ]	.......................................................................................................................((((((((((((((((((((((..(((......(((.....(((....))).....)))....)))....)))))).)).))))))...))))))))........................................................
SRP_00027	[ FASTA input ]	UUUCCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUCACUCGCAAUCCGCUAUAGCGAGGCUGAAUCCCUUCUAGAGGUUUUGUCACCGUAGGGUCUGCCCUAAGUAAGUGGUGUUGACGCUUGGGUUCUACGCAACGAAAACCCACGAACCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGUGGCCCCUUUCGUGUGCCGUAGAGUCGCCUGGGCCGAGCUAACUGCUCAGGUAACGCCUAGGGUGGCAUGAUCGAAGGAAGGUGCACGGUUU
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SRP_00030	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCAGGCGAGGUAGCGGUGCCCCAUACCCGCAAUCCGCUCUAGGAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGCGUUGACGUCUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCUGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGAGCACGGUA
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SRP_00031	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUUCCUUCUUGAGGUUAGCUCAUCUUAGGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUACGCAAUGGGAAUCUGUGAACCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGCAGAACCUCUCAUGUGCCAUGGGGUCGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCCUGGGGUGGCUAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA
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SRP_00037	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUAUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUCCCCUCUCGAGGUUAUGUUGCUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAACGGGACCCCGUGAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUAAGCGGGUCUUCUCGUGUGCCGCAGGAGUGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGCUACGCAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA
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SRP_00038	[ FASTA input ]	GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU
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SRP_00042	[ FASTA input ]	AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
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SRP_00072	[ FASTA input ]	GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU
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SRP_00086	[ FASTA input ]	GCCGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAGGCUUGGGUUGGAGGACGGCGUGAGAUUGGGAGCCCUGUGGCGCUCUGCCCUAUGUCGAUCGGGCGUCCGCGCUAAGCUCGGCGUCAAUAUGGACAUCCCGGGGGAGCUUGGGGUGGCCAGGUUGUCUAAGGAGGAACGAACCGGGCGAGGCCCGAAAGGGAGCAGUCAAAAGUUCCCACGUUGAUCAGUAGCGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGAGUGUCACAGCCCAGUCAAUAUCGCAGGACCCGAUCCUUU
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SRP_00090	[ FASTA input ]	CCGUGCUAGACGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUAUAGCAGGGUUGAAUUCCUCGAUUUGAGGCUAUACUAUGUGGGGUCUGACCUAUAUAAGUGGCGUUGAGAAUUGGGUCCCACGCAACGGAAACUCAUGAAACCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGUGAUAAUUUUCGUGUGCCGUGGAUAAACCUGGUUUGAGUUAACUGUAUAGGUAACGUUCAUAUGCUAUAAGUCGAAACGGGGUGCACGG
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SRP_00174	[ FASTA input ]	UGGGUUGAUGAGCGUGAAGCCUUCGCUCGGUUGGAUUUUUCUUCAUUGCUACUCUUGGCUUGCAGGAAUUCCUCAUUUGAGGCAUCGUAAUUGUUUGGUCUGCCCUUGACAAGUUGGUGUGAAGGUUGGGUCUUGCGCAAUGGGAACCUUGUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGCAGUGUUCUCAUGUGCCGCGAGUCGCCUGGCCCGAGCUAACUAUCAGGGUAACGCAGAUGAUUGCAUGUCGAUGUGAGGUGCGCGACACUAA
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SRP_00179	[ FASTA input ]	GCCGAGCUCAGUAGCGUGGGCUUGUAACUCAAGUGAGGGCAUCAGUGUGGUGGAAUGUUGAACAUGCCCAGAAGGUAGGGCUUGUGUGACAAUUCUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCAAAGAGUUGGGUCUUGUGGGCCAAGCGAAGGCUUGGGCUGCUGGGCUCCUAAAGUGGGGUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAUAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAACGAGCCAGUGUCAUAUAAGUUCAACGAAUGUCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUU
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SRP_00181	[ FASTA input ]	GUCGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAACCCAAGUGGGGAUGUUAAGGUGGUGGAAUAUUGGGCUGUCCCAGAUGGCUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGGCCUGCCCUAUCCAAGUACAGAGUUGGAUCAUGUGGUCCAAUUGAAAGAAUGGGCUACUAGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACCCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAAAACUUCCGCUUUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGACCGGUGCCUUCCAAGUUCCAUUAAUGCCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUUU
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SRP_00182	[ FASTA input ]	GCCGAGCUUUGUAACGUGGGCUUGUAACCCGAGUGGGGGCAACAAUGUGGUGGAAUGUUGGGUCCAUCUUGAUGGAUGGGCUUGAAGGGCUAAUGUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUUGGGUCAAGUGGUCUAUACGAAAGUAUAGCCACUUGGCCUUUAGAGUGGGAUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGACUAGUCCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUCACGGGCUAGUGCUCUUUGAGUCCUAACAAAAACCUGAUAGGUUGCCUAAUUAAACCAUCACUUUU
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SRP_00184	[ FASTA input ]	GUUGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAAUCCAAGUGGAGACAUCAAAGUGGUUGAAUAUUGGGCUGUACCAGAUGGUUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGACUUGCCCUAUCCAAGCUUAGAGUUGGAUCAUGUGGCCCAAUUGAAGAAAUGGACUACUUGAUUCGUAAAGUGGGGCGGAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAGUGAACAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAAUGGGUCGGUGUCUUAUCAAGUUCAGUAACGCCUAAUGGGUUGCUCCAAUAAACAACCACCUUUU
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SRP_00188	[ FASTA input ]	GUUGGGUUGACCCAGAUGGUUGGGUUCGGUAGGCUUAUAGUCUGGCCUGCCCUCUCCAAGCAUGGAGUUGGAUCACGUGGCUUAGUCGAAAGACCUGGGUUGCUUGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAACAGCUUCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGGUCAGUGCUCAGCGAGUCCAGUUAACGCCCUGAUGGGCUGCUCCAACUAAACCACCACUUU
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SRP_00194	[ FASTA input ]	GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
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SRP_00200	[ FASTA input ]	GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
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SRP_00209	[ FASTA input ]	GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
	[ reference structure ]	(((((.(((((..(((((.((((((......(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..)))).))).)).........
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SRP_00213	[ FASTA input ]	GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
	[ reference structure ]	(((((((((((..((.(...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....).)).)..))))))))))......
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SRP_00215	[ FASTA input ]	GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
	[ reference structure ]	(((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
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SRP_00228	[ FASTA input ]	GCCGGGCAUUGUGGCGCAUGCCUGUAAUCCAGCUGCUUGGAGGCUAGAGAUGUUGAAUGGCUUGAGGUGUGGAUUCCUGAUGGCGGUCGUGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCGCUAAGUCGGGCGUCAAUAUGGUGCCUUAAGAGGAGUCUCGAGUCACCAGGUUGGUUAAAGAGGAGCGUACCGGCCCAGGGUGGAAACACAGCAGGCAAAAGCUCCCGCGUUCGACAGUAGUGGGAUAGCACCUGUGAAUAGACGGCCGUCAACAGCCAUGCCAAGAUAGUCGAACUCAUCUCUCUUUUU
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SRP_00231	[ FASTA input ]	GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU
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SRP_00233	[ FASTA input ]	GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU
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SRP_00234	[ FASTA input ]	AUACGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUAUAGCGGGGCCGAAUUCCCACUCGAGGUGGGACGACUUUAUGGUCUGACUUAAGGGAUUGGUGUUGACGCCCGGGUCCUGCGCAACAGGAACCCACGAAUCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGUGGUUAUUCUUGUGUGCCGCAGGGAAGCCUAGGCCGAGCCAUGAACUUAUGUAGCGCAUAGGGUCGUUUCAUCGACAGUGGGUGCACGUAU
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SRP_00243	[ FASTA input ]	AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU
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SRP_00244	[ FASTA input ]	GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG
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SRP_00250	[ FASTA input ]	GGGGGCUCUGUUGGUUCUCCCGCAACGCUAACUUGUUAACUUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAGCAGGGGAUGUGUGUGCCGGGAUGUCGCUGGCAGAGCCCUCGCCAAUU
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SRP_00251	[ FASTA input ]	GAGGCCCCCAUUGGUCCUCCCGCAACACUAACCUGUGAACUCGGCCAGACCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAGGUGACGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGUGGGGGCUUCCACCCAUCU
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SRP_00266	[ FASTA input ]	GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU
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SRP_00268	[ FASTA input ]	GUUCCCCGUGCGGCGGCACCUGACUGAACUCCCCCAGGACCGAGAGGUAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUACCGGGUGCGCGGGGAGCCCUUUU
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SRP_00269	[ FASTA input ]	GACUCGGGCCCAUGCGGCUUCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAAUCUGGCGUGGAUUCCGGGUCACCUAAA
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SRP_00270	[ FASTA input ]	GACUCGGACCCAUGCGGCCGCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCGUGACAGGCGUGGACUCCGGGUCACC
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SRP_00273	[ FASTA input ]	GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU
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SRP_00274	[ FASTA input ]	GGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGGCACCACCUAUCU
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SRP_00303	[ FASTA input ]	GGUGACCCUAGGGUCCCCCCGCAAUGAUAACUUGUGAACUCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAAGCGACUCGUGUGCCGGGGUGUCGGCUCUAGGGGAACCUCCAAAU
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SRP_00308	[ FASTA input ]	CCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUUCCCUGUACUCGAAAUCCGCUUUAUGCGAGGCUUAAUUCCUUUGUUGAGGCCGUAUUUUUGCGAAGUCUGCCCAAAGCACGUAGUGUUUGAAGAUUUCGGUCCUAUGCAAUAUGAACCCAUGAACCAUGUCAGGUCCUGACGGAAGCAGCAUUAAGUGGAUCAUCAUAUGUGCCGUAGGGUAGCCGAGAUUUAGCUAACGACUUUGGUUACGUUCGUGAAUUACGUUCGAUGCUUAGGUGCACGG
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SRP_00310	[ FASTA input ]	GGAGCAACAUUUACUCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUGCUAAAUGUGUGCUCUUUUU
	[ reference structure ]	((((((.(((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..).))))))))..))))....
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SRP_00312	[ FASTA input ]	GCCCCUCACGUGGCGCUAUCUGACUGAACUCCCCCAGGGCCGGAAGUCAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGCGCUUGC
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SRP_00315	[ FASTA input ]	GGAGCAACAGUUCUGCGUGAAGCGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUGAAUUGUGUGCUCUUUUU
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SRP_00317	[ FASTA input ]	ACUGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAAGUCGGGGUUGGUGGAUCGUUUGAGAGCGGGAGUUCUGUAUGUCGUCGCUCUAUGGCGAUCGGGCGUCCAUGCUAAGCUCGGCAUCGAUAUGGUUGAUUGGUCGGAGGACUGGCCAACCAGGUCGUCUAAGGAGGGACGUACUGGCCCAGGGCGGAAACGCAGCAGGCAAAAGUCCCCGUGUGGAGCAGUAGUGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGCGGCUUGCAGCCCGUUCAACAUAGUGAGACCCAAUCCUUUUUU
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SRP_00318	[ FASTA input ]	GGAGCAACACUUGUGCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUUCGGGUGUGUGCUCUUUUU
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SRP_00325	[ FASTA input ]	GGCUCGGACUCAUGCGAUUACAACGCCCAAAUCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAGGGAUGCUUGUGGUAGGCGUGAACUCCGGGCU
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SRP_00326	[ FASTA input ]	GACUCGGGCCAUGCGGCUCGGACGCCCAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCAGAGCAGGCGUGGACUCCGGGUCACCCAACU
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SRP_00333	[ FASTA input ]	GGCUCGGAAUCAUGCGAUCGCAACGCCUCAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUACGGGAUGCUUGCGAUAGGCGUGAUCUCCGGGUCACCCUCUG
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SRP_00335	[ FASTA input ]	CCACGCUAGGCGGGGGGCUGGCGGUCCCCUGUACCCGAAAUCCGCCGUACGCGGGGCCGAAUUCCCACCCGAGGCUCUUCGGGUCGGGAAACGGCGUGACUCGGGGGCGAUGAAGACCGGGUCCCACGCAACGGAACCCUGUGAACCUGGUCAGGCCCGGGAGGGAGCAGCCAUAAGCAGGUGUUUCCGUGUGCCGUGGGGGAGCCCGGUUGGAGCCUUCCGAUCAUGCACGCCCCGGUCCGGAGAAGUCGACGGUGGGUGCGUGG
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SRP_00337	[ FASTA input ]	CCGUACUAGAUGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAGCCUGCAACCCGCUAUAGCAGGGUCGAAUUCCCAGGCUGAGGCCUGAUUUCUGUAAGGCCUGGCGCAAGUAAGUGGCGUUGAUACUUGAGUCCUGCGCAACGGAGAUUUGCGAACCCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGCAAACACCUCCGUGUGCCGCAGGGGUGCUUGAGUGGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGGGACAGGUCGAAGCUGGGUGUACGG
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SRP_00341	[ FASTA input ]	CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU
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SRP_00350	[ FASTA input ]	GCCUCCGCGCGGCGUUACCCGGGUGAACUCCCCCAGGUUAGGAAUAAAGCAAGGGUAGCUCGGCUCUGGCGGGUGUGCGGGGGUCUUGC
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SRP_00357	[ FASTA input ]	GGGGGCCCUGGUCCUCCCGCAACACUAGUUCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGAUGAUGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCUCC
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SRP_00368	[ FASTA input ]	GCCGGGCGCUGUGGCGUGUGCCUGUAAUCCAGCUACUUGGAGGCUUGGGCUGUCGGAUCGCUUGAGUCCAGGAGUUCUGGGCUGCACUGAGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGUAUCAAUAUGGUGUUCCUGGGGGAGCCUCGGAUCACCAGGUUGCUCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACCCCCGUGCCGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCGGUGCAGAACAGCCUGAACAACACAGCGAGACACAGUUCU
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SRP_00369	[ FASTA input ]	GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC
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SRP_00383	[ FASTA input ]	GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
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TMR_00017	[ FASTA input ]	GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUGGCGAAGCCCAAGGUGCACGUCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUAAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAACAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCAUUUAGCCUUCGCUCCCCAGCUUCCGCUCGUAAGACGGGGAUCAAGCGGAGUCAAACCUAAACGAGAUCGUGUGGACGCUUCGGCUUGGAGAUCGAAACACUAAAUUGAAUCAAGCUAGUUUAUUCUUCGCGUGUCUGUCCGCAGGGGAUAAAUGAAGUUAAAGACCAGACUAAACGUGUAGUGCUGAAGGUAGAGUAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA
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TMR_00018	[ FASTA input ]	GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACAAGAUUCACGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGCUAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUGGCAGCUUAAUAACCUGCGCAGAGCCCUUCUACCCUAGCAUGCCUGUGUCCUAGGGAAUCGGAAGGUCAUCCUUCACAGGAUCGUGUGGAAGUCCUGCUCGGGGCGGAAGCAUUAAAACCAAUCGAGCUAGUCAAUUCGUGGCGUGUCUCUCCGCAGCGGGUUGGCGAAUGUAAAGAGUGACUAAGCAUGUAGUGCCAAGGAUGUAGUAAUUUUGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCAGCUCCACCA
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TMR_00046	[ FASTA input ]	GGGGACGUUUUGGAUUCGACAGGGAUAGGUCGAGCUUGCGUUGCGAGCCGAGGGGUCGGCCUCGUAAAAACGCACAAGCCAAUAACUGGCAAAGAAAACAACAACUUCGCUCUAGCUGCAUAAGCUAAGCGGUCUCUCCUCUCCAUCGCCCAUGUGGAGUGGCUGAGACUCAACUUUAGUGGGAUACGCCUUUCUCCCCCCGCCUGAGGGAGAAGGAAGAGACUAAUCAGGCUAGCUGCACGGAGGCCUGUCUUUGGGCUGAAGUGCUAGCGAAAUACGAAUACAAAGACUACGCUCGUAGAAGCGUAAGUGUCGUUAUCUCUGGACGUGGGUUCAAUUCCCACCGUCUCCAUAU
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TMR_00080	[ FASTA input ]	GGGGCUGUUUUUGGAUUCGACAAAGUUAUCAAAAAAGUAAAGUGCAUGCCGAGGAACGGUUUGCCUCGAUAAAAAACCGUAAAAAAAUAGCUGCAAAUAAUAAACAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAAAAACUGUAUAAAGCCCUUUCAUCUCUGACUUCUCUCUUGAGAACGAGAAAUUUUUAAGAAAGGCCGACAUUUAAAGAGAAAAAUGUGAGCACUAUGCUUGAUAGUGACACAAAAUUAAUUUUUCAAGCUAUAAGCUUAAAAUGAGUUUUUCCAAAUUAAGCAAUGAAAAAAUAAAGAAAAACUAAGCAUGUAGUAUCUUUAUUUAUAGAAAUUUUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCAAAA
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TMR_00082	[ FASTA input ]	GGGGCUGUUUUUGGAUUUGACAAAAUUAUCAACAAAGUAAAGUGCAUGCCGAGGAACGGUUUGCCUCGAUAAAAGCCGUAAAAAAAUAAUUGCAAAUAAUAAACAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAAAAACUGAAUAAAGCCCUUCCUUCUUAUCCUCCUUCUCUUAGGAUGAGAAAACAGGAAGGUCAGAAAAAGAGAAAAACGUGGAUAUCAAGCUUGACGAUAACACGAAGUAGUUUUUUCAAGCUAUAUACCUAAUAUGUGUUUUUCCAAAUUAGGUAAUGAAUUCAAUAAAGAAAAAACUAAGCAUGUAGGGCUUUAUUAGUAGAAAUUUUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAGCUCCAAAA
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TMR_00137	[ FASTA input ]	GGGGCGGAUCUAGGAUUCGACAAGAUUCAUGAAACUCAAGGUGCAUGCCCAGGGGCGGUUUGCCUGGUAAAAAGCCGCAAAACUAUAAUUGCUAACGACGAUACGUUCGCACUAGCCGCUUAGGCUAGCCAUCGCCUUGAAAUCUCUCCUAUUGGUUAGAGGAUCGAUGGUCACCCCAAAUAGGAUAGCGAGGGAAGCACGCUUGAGGCUGAACCGCGAAAUAGUAUCAAGCUCACCAUGACGAAGCCUGUCGCUUGGCGUCUAAUUGGUUAAAUAAAUGAGCGACUAAGCAUGUAGUACCGAGAACGUAGGCUUUUUGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCCGCUCCACCA
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• N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.