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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RDfolder



NDB_00014 [ FASTA input ] CCACUAGUGGCCACUAGUGG
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PDB_00973 [ FASTA input ] AUGAGGAUAACCCAUGAGGAUAACCCA
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PDB_00974 [ FASTA input ] AUGAGGAUGACCCAUUGAGGAUGACCCA
[ reference structure ] (((.((....)))))((.((....))))
[ predicted structure ] (((.........))).............
PDB_00986 [ FASTA input ] CGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUG
[ reference structure ] ((((((((..(((((())))))))))))))
[ predicted structure ] (((((((...((((....)))).)))))))
PDB_00987 [ FASTA input ] GCUGAAGUGCACACGGCGCUGAAGUGCACACGGC
[ reference structure ] (((((.((((((((((())))).)))))))))))
[ predicted structure ] ((((..((((((...........)))))).))))
PDB_00989 [ FASTA input ] GGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCC
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PDB_01001 [ FASTA input ] CUCUCGGUAGCCAAGGGAAGGCGCAAGGUAAAUGAGUCGGGCGUUCGACUCGCCCCCGGGAGACCA
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[ predicted structure ] ((((.........)))).....................(((((.......)))))...........
PDB_01002 [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
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[ predicted structure ] ((((((((((((.......))))))))))))....
PDB_01009 [ FASTA input ] GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC
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PDB_01020 [ FASTA input ] GGACAUUUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACAAUGUCCA
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PDB_01025 [ FASTA input ] GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC
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PDB_01040 [ FASTA input ] GGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAACGGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAC
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PDB_01044 [ FASTA input ] AGACAGCAUAUAUGCUGUCUUUAGACAGCAUAUAUGCUGUCUUU
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PDB_01045 [ FASTA input ] AGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCUUUAGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCU
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[ predicted structure ] (((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))
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PDB_01051 [ FASTA input ] GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC
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PDB_01053 [ FASTA input ] GCUUCCAUAGCUCAGCAGGUAGAGCGUCAGCGGUUCGAGCCCGCUUGGAAGCU
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PDB_01056 [ FASTA input ] GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC
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PDB_01059 [ FASTA input ] GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG
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PDB_01060 [ FASTA input ] CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
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PDB_01061 [ FASTA input ] GGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCC
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PDB_01065 [ FASTA input ] CGCAAUUAGCGCGCAAUUAGCG
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PDB_01073 [ FASTA input ] GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGAUGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA
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PDB_01074 [ FASTA input ] GCGACCGACCAUAGCUGCUGCAGCGGUCAAAGGUCGCGCGACCGACCAUAGCUGCAUGCAGCGGUCAAAGGUCGC
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PDB_01077 [ FASTA input ] GGAUGUACUACCAGCUGAUGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCCGGCGUCCUGGUAUCCAAUCC
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PDB_01084 [ FASTA input ] GGCCAGACUCCCGAAUCUGGCC
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PDB_01097 [ FASTA input ] GGCGAUACACUAUUUAUCGCC
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PDB_01099 [ FASTA input ] GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC
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PDB_01100 [ FASTA input ] GGGCCAUACCUCUUGGGCCUGGUUAGUACCUCUUCGGUGGGAAUACCAGGUGCCC
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PDB_01108 [ FASTA input ] GGCGUGAUCAAGUGAUCGCGCC
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PDB_01114 [ FASTA input ] GCGACUCGGGGUGCCCUGCGUGAAGGCUGAGAAAACCCGUAACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGAGGGAAGUCGCA
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PDB_01117 [ FASTA input ] GGCCUCCAGCGACGGCCUUCGGGACUAGCAAACGGAGGCC
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PDB_01118 [ FASTA input ] GGGUCCGCCUUGAUGCCCGGGUGAAAGCAUGAUCCCGGGUAAUAUGGCGGACCCACA
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PDB_01126 [ FASTA input ] GAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAUCCCCUC
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PDB_01128 [ FASTA input ] CUGCCCUCAUCCGUCUCGCUUAUUCGGGGAGCGGACGAUGACCCUAGUAGAGGGGGCUGCGGCUUAGGAGGGCAG
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PDB_01137 [ FASTA input ] UGCGGAUCACCCAUGCGGAUCACCCA
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PDB_01156 [ FASTA input ] CGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGGCGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGG
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PDB_01160 [ FASTA input ] GGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAAAUCCCUCGGCGUGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGUCC
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RFA_00594 [ FASTA input ] AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU
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[ predicted structure ] ((((((((...(((.((((((.(((.............))).........))))))...)))...))))))))..
RFA_00632 [ FASTA input ] GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC
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RFA_00636 [ FASTA input ] GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA
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RFA_00658 [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
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RFA_00677 [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU
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[ predicted structure ] .(((((((...........)))))))......................
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RFA_00685 [ FASTA input ] AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU
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RFA_00704 [ FASTA input ] AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU
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RFA_00705 [ FASTA input ] AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU
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[ predicted structure ] ((((((..((((.((((.......))))........))))))))))
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RFA_00707 [ FASTA input ] GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC
[ reference structure ] ((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ] ........................(((((.......))))).....
RFA_00708 [ FASTA input ] GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC
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[ predicted structure ] ...................((((.(((...........))))))).
RFA_00709 [ FASTA input ] AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU
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RFA_00710 [ FASTA input ] AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU
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[ predicted structure ] (((.........(((..........)))(((((....))))))))
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RFA_00715 [ FASTA input ] GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
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[ predicted structure ] .....................((((((.......))))))....
RFA_00716 [ FASTA input ] ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU
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[ predicted structure ] ....................(((((((.......)))))))...
RFA_00717 [ FASTA input ] AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU
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[ predicted structure ] .......................(((((......)))))....
RFA_00720 [ FASTA input ] GCCCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUUGACUCUACGGGGC
[ reference structure ] ((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
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RFA_00721 [ FASTA input ] GCGCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUCGACUCUAUGGGGC
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RFA_00731 [ FASTA input ] GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC
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RFA_00733 [ FASTA input ] GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ............................(((((.....)))))
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[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((.(((....)))(((......)))........))))))
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RFA_00745 [ FASTA input ] ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU
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[ predicted structure ] ..(((((..........(((.......))).)))))........
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[ predicted structure ] ((((((.(((....)))(((......)))........))))))
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RFA_00762 [ FASTA input ] CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA
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[ predicted structure ] .....(((((....))))).((((........)))).......
RFA_00763 [ FASTA input ] UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG
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[ predicted structure ] .....(((.........))).......(((..........)))
RFA_00764 [ FASTA input ] CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((...........(((......)))........))))))
RFA_00765 [ FASTA input ] GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC
[ reference structure ] .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ] ((((((...(((...)))..(((..........))).))))))
RFA_00767 [ FASTA input ] GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA
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RFA_00768 [ FASTA input ] ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC
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RFA_00769 [ FASTA input ] UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA
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RFA_00770 [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA
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RFA_00773 [ FASTA input ] CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA
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RFA_00779 [ FASTA input ] CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA
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RFA_00808 [ FASTA input ] CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU
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[ predicted structure ] .....((((......))))......((((((((((..............)))))))))).......
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SPR_00034 [ FASTA input ] AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA
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SPR_00036 [ FASTA input ] UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA
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SPR_00060 [ FASTA input ] UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
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SPR_00064 [ FASTA input ] GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA
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SPR_00066 [ FASTA input ] GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
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SPR_00070 [ FASTA input ] GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
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SPR_00074 [ FASTA input ] UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
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SPR_00078 [ FASTA input ] ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA
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SPR_00079 [ FASTA input ] AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA
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SPR_00080 [ FASTA input ] GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA
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SPR_00089 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
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SPR_00090 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCACGUGUUCGAUCCACGUUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] ................(((..((((((.........((((.(((.........))))))).))))))......)))
SPR_00091 [ FASTA input ] GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ] ((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] ((((.(((...(((((..............)))))..)))(((.....(((((.......))))))))))))....
SPR_00095 [ FASTA input ] GCCGAAAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCCGGUUCAAUCCCGGGUUUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00111 [ FASTA input ] GCAGGUGUAGUUUAAUGGCAGAACUUCAGCCUUCCAAGCUGAUUGUGAGGGUUCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((.........))))..((((((((((.....))).)))))))..........)))))))....
SPR_00112 [ FASTA input ] GCGGGUGUAGUUCAAUGGUAGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGAGCGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
SPR_00113 [ FASTA input ] GCGGGAGUAUUUCAACUUUUAGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAGAUAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((...(((........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00114 [ FASTA input ] GCGGGAGUAGUUCAAUUUUAGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAGGUAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.......)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00115 [ FASTA input ] GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((.....(((...)))(((((.......))))).............))).....)))))))....
SPR_00116 [ FASTA input ] GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
SPR_00117 [ FASTA input ] GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).)))))))....
SPR_00121 [ FASTA input ] GCAGUACUGGUGUAAUGGUUAGCGCCUUAGAUUUCCAAUCUAAAGGUAGGGGUUCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.((((..........))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00124 [ FASTA input ] AUUCUUUUAGUAUUAACUAGUACAGCUGACUUCCAAUCAGCUAGUUUCGGUCUAGUCCGAAAAAGAAUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] .......................((((((.......))))))..((((((......))))))..........
SPR_00126 [ FASTA input ] GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..)))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((.(((........))).......)))).))))).......................
SPR_00127 [ FASTA input ] AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA
[ reference structure ] ((((((....(.(..).)..(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ predicted structure ] .............(((((((((((.........)))))))))))..........................
SPR_00137 [ FASTA input ] GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA
[ reference structure ] .(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((..((((((((............)))))))).............)))..(((((((...........))))))).
SPR_00138 [ FASTA input ] GGCGUAGGUGGUGAAGUGGUUAACACAUCAGGUUGUGGCUCUGACAUACGCGGGUUCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA
[ reference structure ] .(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((...(((..........))).((((.........))))......((((.......))))..)))))))...
SPR_00139 [ FASTA input ] GGUGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCCCUGGAUUGUGAUUCCAGUUGUCGUGGGUUCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
[ reference structure ] .(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.....(((((((....................)))))))...((((.......)))).))))))))...
SPR_00141 [ FASTA input ] GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.((((..............((((.......)))).))))(((((.......)))))))))))))...
SPR_00142 [ FASTA input ] GACUAAAGUAGUUUAAAUAAAACCCUAAUUUGUGGUAUUAAAAUUAUCAGUUAAAAUCUGAUCUAUAGUCCCA
[ reference structure ] .((((.((..((((.....))))..((((.......)))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ] .....................(((.........))).........(((((.......)))))...........
SPR_00153 [ FASTA input ] CGGAAUAUAGCUCAGCUGGUUAGAGCAUUCCGCUGAUAACGGAGAGGUCGUUGGUUCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((...((((.........)))))))))).(((.((((.......))))...)))...................
SPR_00155 [ FASTA input ] GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGUCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((...((((.........))))..(((((.............)))))))))))....................
SPR_00156 [ FASTA input ] GGGCGAUUAGCUCAGCUGGUUAGAGCGCACGCCUGAUAAGCGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACCAUCGCCCACCA
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[ predicted structure ] .((((....((((.........))))...))))........(((....(((((((........)))))))..)))..
SPR_00163 [ FASTA input ] GAAACUAUAAUUCAAUUGGUUAGAAUAGUAUUUUGAUAAGGUACAAAUAUAGGUUCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ..(((((.........)))))...........................(((((.......)))))...........
SPR_00164 [ FASTA input ] GGGCUUAUAGUUUAAUUGGUUGAAACGUACCGCUCAUAACGGUGAUAUUGUAGGUUCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ............................((((.......))))......(((((((............)))))))..
SPR_00166 [ FASTA input ] AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
[ predicted structure ] .........(((.......))).............(((((...((((((........))))))...))))).
SPR_00167 [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGACAAAAGAGUUACAUUGAUAGUGUAAAUAAUAGAGGUUCAAACCCUCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ............................................(((((.......)))))...........
SPR_00176 [ FASTA input ] GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ................(((.......(((((.......)))))....((((((.......)))))).......)))
SPR_00177 [ FASTA input ] GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA
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SPR_00178 [ FASTA input ] GAGCCAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUCUGACUUUUAAUCAGAGGGUCGAAGGUUCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((.....))))...((((.((((....((((((.......))))))(((((.......)))))...))))))))
SPR_00183 [ FASTA input ] CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
[ predicted structure ] .((((((..((((........)))))))))).................((((.........))))...........
SPR_00191 [ FASTA input ] GCCUUGUUGGCGCAAUCGGUAGCGCGUAUGACUCUUAAUCAUAAGGUUAGGGGUUCGAGCCCCCUACAGGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((......))))..)))))))....
SPR_00200 [ FASTA input ] GCCCGGCUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUGAGACUCUUAAUCUCAGGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGUUGGGCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00209 [ FASTA input ] GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
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SPR_00213 [ FASTA input ] GCGGGGGUGGCUGAGCCAGGCCAAAAGCGGCGGACUUAAGAUCCGCUCCCGUAGGGGUUCGCGAGUUCGAAUCUCGUCCCCCGCACCA
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SPR_00215 [ FASTA input ] GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA
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SPR_00218 [ FASTA input ] GCGGGUGUGCGGGAAUUGGUAGACCGGCUAGAUUCAGGAUCUAGGGUCUUUAUGGACCUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACCCGCACCA
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SPR_00219 [ FASTA input ] GCCCGGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAUUUAAAAUCCCUCGGCGUUCGCGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA
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SPR_00220 [ FASTA input ] GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
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[ predicted structure ] .........................(((((((.......))))))).............(((((........)))))..........
SPR_00221 [ FASTA input ] GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA
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[ predicted structure ] .((((((.......(((((......(((((((.......))))))).))))).......(((((.......))))))))))).....
SPR_00223 [ FASTA input ] GCCUUUGUAGCGGAAUGGUAACGCGGCAGACUCAAAAUCUGCUUUGGUAACCCAGGUGGUAGUUCGACUCUCCCCAAAGGCACCA
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SPR_00224 [ FASTA input ] GGGCAAGUGGCGGAAUUGGUAGACGCAGCAGACUCAAAAUCUGCCGCUAGCGAUAGUGUGUGGGUUCGAGUCCCACCUUGCCCACCA
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[ predicted structure ] .....(((((((((.(((................)))..))))))))).......(((.(((((.......)))))......)))..
SPR_00225 [ FASTA input ] GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA
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[ predicted structure ] .........(((((((((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))....(((((.......))))).))))))....
SPR_00226 [ FASTA input ] GCCGAUGUGGCGGAAUUGGCAGACGCGCACGACUCAAAAUCGUGUGGGCUUUGCCCGUGUGGGUUCGACUCCCACCAUCGGCACCA
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SPR_00227 [ FASTA input ] GCCUUGGUGGUGAAAUGGUAGCCACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUACAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA
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SPR_00228 [ FASTA input ] GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
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SPR_00229 [ FASTA input ] GCCGCUAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCUGCUCUUAGGAAGCAGUGCUAGAGCAUCUCGGUUCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
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SPR_00235 [ FASTA input ] AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
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SPR_00246 [ FASTA input ] ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
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SPR_00263 [ FASTA input ] GGAGAGAUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGCUGGUUUAAGGCACCAGUCCCUUCGGGGGCGUGGGUUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA
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SPR_00271 [ FASTA input ] GCCGGGGUGGCUCAGCUGGAGGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCUCGGGUUCGAUCCCCGAUCCCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00273 [ FASTA input ] GGCGGUGUAGCUCAGCGGCUAGAGCGUACGGUUCAUACCCGUGAGGUCGGGGGUUCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA
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SPR_00276 [ FASTA input ] GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
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SPR_00277 [ FASTA input ] GCCUGCUUAGCUCAGUUGGCCAGAGCAUCCGUUUCAUACGCGGAAAGUCACUAGUUCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00279 [ FASTA input ] GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))((((((.......)))))).....((((.......)))).)))))))....
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SPR_00281 [ FASTA input ] AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
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SPR_00289 [ FASTA input ] GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00294 [ FASTA input ] UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00295 [ FASTA input ] UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
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SPR_00297 [ FASTA input ] UGAGUUGUAGCCUAGUGGAAAGGCGUUUGGCCGUUAACUAAAAGAUAGCAAGAUCAAUACUUGCCAGCUCAGCCA
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SPR_00333 [ FASTA input ] UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
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SPR_00356 [ FASTA input ] GUCCUCUUAGUUAAAUGGAUAUAACGAGCCCCUUCUAAGGGCUAAUUGCAGGUUCGAUUCCUGCAGGGGACACCA
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SPR_00359 [ FASTA input ] GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
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[ predicted structure ] .(((((((....(((((.......)))))(((.....)))..))))))).....
SPR_00363 [ FASTA input ] GGACGUUAAAUAGAUAAGCUAUGCCUAGUUACGGGCUGGGAAGAGAGUCGUCUUCCA
[ reference structure ] (((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))......).)))))....
[ predicted structure ] ......................(((........)))..((((((......)))))).
SPR_00364 [ FASTA input ] AAAUAUGAAGCGAUUUAUUGCAAUUAGUUUCGACCUAAUCUUAGGUGAAAUUCACCCAUAUUUUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((....)))).(((((.......)))))....((((.....)))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((...(((................)))(((((....)))))..........)))))))....
SPR_00365 [ FASTA input ] AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ] .(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] .......................((((((.......)))))).((((((((....)))))))).........
SPR_00366 [ FASTA input ] UGGUACUUAGUUUAAAAUAAAAUAAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUUUAAUUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((......)))).(((((.......)))))....(((((......)))))).)))))....
[ predicted structure ] (((((...................(((((.......)))))..(((((((......))))))))))))....
SPR_00367 [ FASTA input ] UGGUGAUUAGUUUAACUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGACAUAUCUCAUAAUCACCAACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((..................((((((.......))))))((((((((......))))))))....))))
SPR_00369 [ FASTA input ] GCUCGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00370 [ FASTA input ] GCUUGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUCCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00373 [ FASTA input ] GACCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUCAGCCUCCGGAGCUGGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGUCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........))))..((((.......))))((((((.........))))))..)))))))....
SPR_00374 [ FASTA input ] GCCCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUUGGCCUCCUAAGCCAGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGGUCCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .(((((((((.((((((.......))))))(((........))).................))).)))))).....
SPR_00385 [ FASTA input ] GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGAGAGUCGGGGAAACCCGAGCGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA
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[ predicted structure ] ................((((((.......(((((.......))))).))))))..........(((((((..............)))))))..
SPR_00386 [ FASTA input ] GGAGGAAUACCCAAGUCUGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGACAGGGUGUCAAAGCCCGCGGGGGUUCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA
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[ predicted structure ] .............................(((((.......)))))..(((........)))(((((((..............)))))))..
SPR_00388 [ FASTA input ] GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA
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[ predicted structure ] (((......)))(((((((((......(((((((...)))))))....)))))).........((((((.......))))))))).......
SPR_00389 [ FASTA input ] GGAGAGAUGCCGGAGCGGCUGAACGGACCGGUCUCGAAAACCGGAGUAGGGGCAACUCUACCGGGGGUUCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA
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SPR_00390 [ FASTA input ] GGUGAGGUGGCCGAGAGGCUGAAGGCGCUCCCCUGCUAAGGGAGUAUGCGGUCAAAAGCUGCAUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA
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[ predicted structure ] .......((((((.(((..........)))((((....))))......))))))...........(((((.......)))))...........
SPR_00391 [ FASTA input ] GGUGAGGUGUCCGAGUGGCUGAAGGAGCACGCCUGGAAAGUGUGUAUACGGCAACGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ...............((((...(((..(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......))))))))....))))
SPR_00393 [ FASTA input ] GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
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SPR_00394 [ FASTA input ] GGAAAAUUAACUAUAGGUAAAGUGGAUUAUUUGCUAAGUAAUUGAAUUGUAAAUUCUUAUGAGUUCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA
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[ predicted structure ] .........................................................((((((.......))))))..........
SPR_00395 [ FASTA input ] GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
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SPR_00398 [ FASTA input ] GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA
[ reference structure ] (.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
[ predicted structure ] ..............(((((((..........)))))))((((((.......))))))..........
SPR_00399 [ FASTA input ] AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
[ reference structure ] (((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((...)))(((((((((.......)))))))))(((((.........))))))))))))....
SPR_00402 [ FASTA input ] GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA
[ reference structure ] (((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).....
SPR_00412 [ FASTA input ] GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
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[ predicted structure ] (((((((.(((..(((.........(((((((.......)))))))..))).)))....((((.......)))).)))))))....
SPR_00414 [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA
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[ predicted structure ] .(((.......)))............(((((.......)))))..(((.(((.....(((((.......)))))...))).))).
SPR_00415 [ FASTA input ] GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA
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SPR_00416 [ FASTA input ] GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
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SPR_00417 [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
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SPR_00418 [ FASTA input ] GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
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SPR_00426 [ FASTA input ] AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA
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SPR_00434 [ FASTA input ] GCUGACUUAGCUCAGCAGGCAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
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SPR_00435 [ FASTA input ] GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
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SPR_00436 [ FASTA input ] GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
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SPR_00438 [ FASTA input ] GCCCCUUUAACUCAGUGGUAGAGUAACGCCAUGGUAAGGCGUAAGUCAUCGGUUCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA
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SPR_00439 [ FASTA input ] GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA
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SPR_00445 [ FASTA input ] GGGUCGGUGGUCUAGUCCGGUUAUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAGGUCGGCGGUUGAACUCCGCCCCGACCCACCA
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SPR_00452 [ FASTA input ] GGAGGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCAUCUGCCUUACAAGCAGAGGGUCGGCGGUUCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA
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SPR_00455 [ FASTA input ] GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
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[ predicted structure ] (((((((..((((........))))((((((..........)))))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00456 [ FASTA input ] GAUUCCGUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCACCUUGACAGGGUGGAGGUCGCUGGUUCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA
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[ predicted structure ] (((((((........(((((.((((.(((((((...))))))).........))))...))))).)))))))....
SPR_00458 [ FASTA input ] GAGAGAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACCGUUUUACACACGGAAGGUUGGGUGUUCGAAUCACCCAUUUCUCACCA
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[ predicted structure ] .........((((........))))..((((.......)))).....((((((.......))))))..........
SPR_00459 [ FASTA input ] CAAUUUAAAGCUUAAUUAGUAAAGUAUUUCAUUUACAUUGAAAAGAAAUUUGUGCAAAUCAAUUUAAAUUGACCA
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[ predicted structure ] ..........................(((((.......)))))................................
SPR_00461 [ FASTA input ] ACAGAUUGUAGCUUAAUCACAAAGCAUCUGGCCUACACCCAGAAGAAUUCAUAAAAAUGAACACUUUGACCA
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[ predicted structure ] ..........((((.......)))).(((((.......))))).............................
SPR_00462 [ FASTA input ] CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA
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[ predicted structure ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).............))))))))....
SPR_00467 [ FASTA input ] GGUUUCGUGGUGUAGUGGUUAUCACGUCAGUCUAACACACUGAAGGUCUCCGGUUCGAGUCCGGGCGAAGCCACCA
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SPR_00478 [ FASTA input ] AGGAGAGUAGUUCAAUGGUAGAACGUCGGUCUCCAAAACCGAGCGUUGAGGGUUCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA
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SPR_00479 [ FASTA input ] AGGGGCAUAGUUCAGUAGGUAGAACAUCGGUCUUCAAAACCGAGUGUCACGAGUUCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA
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SPR_00482 [ FASTA input ] AGGGGCAUAGUUUAACGGUAGAACAGAGGUCUCCAAAACCUCCGGUGUGGGUUCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA
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SPR_00487 [ FASTA input ] GGGGGAAUAGUUUAAUGGUAGAACAACGGUCUUCAAAAUCGUUAGCGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA
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SPR_00489 [ FASTA input ] AAGGAUAUAGUUUAAUGGUAAAACAGUUGAUUUCAAAUCAAUCAUUAGGAGUUCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA
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SPR_00493 [ FASTA input ] GAAGCGGUGGCUCAAUGGUAGAGCUUUCGACUCCAAAUCGAAGGGUUGCAGGUUCAAUUCCUGUCCGUUUCACCA
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SPR_00496 [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
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SPR_00497 [ FASTA input ] GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
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SPR_00498 [ FASTA input ] AGCGGGAUGGGAUAGCUAGGAGAUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGAUCGGUAGUUCAAAUCUACCUCCCGCUACCA
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SPR_00629 [ FASTA input ] GAGAUAUUAGUAUAAAUUUUUUGUAUAUUUCUUUUUCGAAGAAAAGGUUUAUUAUCUUACCA
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SPR_00632 [ FASTA input ] UCCGAUGUAGUAUAACGGUUAGAACACCUGGCUUUCACCCAGGAGAUCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUCGGAG
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
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SPR_00633 [ FASTA input ] UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA
[ reference structure ] (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
SPR_00721 [ FASTA input ] GCCGGCUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCUAGAUUGUGGAUCUAGAGGUCCUCGGUUCGAGCCCGAGAGCUGGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] .((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00722 [ FASTA input ] GCGGUUGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGGUUUGUGGCACCUGAGGUCGGAGGUUCGAUCCCCCCCAACCGUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).(((((......))))).....)))))).....
SPR_00750 [ FASTA input ] AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ] ............................................(((...........)))...........
SPR_00758 [ FASTA input ] GGGCCGGUGGCUCAGCCUGGUUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCAGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCGGCCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((.....(((((........(((((.......)))))....)))))..........))))))))))....
SPR_00760 [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCUGGUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCGAGGGAGGAAGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((.........))))..))))))).......................(((((((..........)))))))...
SPR_00768 [ FASTA input ] GGGGUGUUAACUUAAGUUUAAAGUGUUAGAUUUUUAAUCUGGAAAUGGGUUGUCACAUCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((....)))))))))....
[ predicted structure ] .........((((.......))))...............(((....((((......))))..)))
SPR_00777 [ FASTA input ] GCACUUCUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCGUGGCUUUUAACCUCGUGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGGAGUGCG
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).((.((.......)).)).....(((((.......)))))))))))).
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SPR_00810 [ FASTA input ] GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
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SPR_00816 [ FASTA input ] GCCUUCGUGAUCGGAAUGGUAGAGAUCCUGGUCUUAGGAACCAGCUGCUGAAAGGCGGCGGUUCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((....((((..........((((......))))...((((((((.....))))))))....))))..)))))))....
SPR_00832 [ FASTA input ] GUUGUUAUAGCAUAAGAAGUGCAUUUGUUUUAAGCGUAAAAGAUAUGGGACAACUCCA
[ reference structure ] ((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] ........................((((((((.............)))))))).....
SPR_00867 [ FASTA input ] GCCGCCGUAGCUCAGCCUGGCAGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCGGCGGCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00868 [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGUAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGUGGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGGCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00882 [ FASTA input ] GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
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SPR_00912 [ FASTA input ] GGGCCCGUCGUCUAGCCUGGCUAAGAUGCGGGGUACGGGACCCCGUGGUCCGGGGUUCAAAUCCCCGCGGGCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_00913 [ FASTA input ] GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((((.(((((...)))))......((((((((((.......)))))))))).......))))))))))....
SPR_00932 [ FASTA input ] AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((....................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00938 [ FASTA input ] UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA
[ reference structure ] ((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ] ..........................((((((.......)))))).............
SPR_00943 [ FASTA input ] GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
[ reference structure ] (((((((..(((..........))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..................((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
SPR_00957 [ FASTA input ] GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((...........(((((((((.......)))))))))...)))))..........)))))))....
SPR_01040 [ FASTA input ] GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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SPR_01051 [ FASTA input ] GGCCGCUUAGCACAGUGGCAGUGCACCACUCUCGUAAAGUGGGGGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCAGUGGCCU
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((..((((.......))))..............((((((((((......))))))))))))))))).
SPR_01088 [ FASTA input ] GGGGCCGUAGCUCAGCCAGGCAGAGCGGCGGGCUCCAGACCCGUAGGUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCGGCCCCACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.(((((.(((.........))))))))...((((....))))(((((.......))))))))))))....
SPR_01095 [ FASTA input ] AGGGGUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGCGGUCUCCAAAACCGCAGGUCGGGGGUUCGAGCCCCUCUGCCCCUGCCA
[ reference structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_01103 [ FASTA input ] ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
[ reference structure ] (((((.(..((((.......)))).(((((.......))))).......).)))))....
[ predicted structure ] (((((...((((((((........))))))))..((((.......))))..)))))....
SPR_01106 [ FASTA input ] GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] ........(((((((((......)))))...........(((((((..........))))))).))))....
SPR_01117 [ FASTA input ] CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
[ reference structure ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((..(((((........)))))(((((........))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_01143 [ FASTA input ] AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ] (((((((((.......(((.(((.......)))....)))(((......)))..........))))))))).
SPR_01157 [ FASTA input ] CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
[ reference structure ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ] (((((((.........(((....(((((((.......))))))))))(((((.......))))))))))))....
SRP_00005 [ FASTA input ] GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU
[ reference structure ] .((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
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SRP_00008 [ FASTA input ] GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU
[ reference structure ] (((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
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SRP_00042 [ FASTA input ] AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
[ reference structure ] ((.((((((((..((.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))...)).)).)..))))))).))....
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SRP_00046 [ FASTA input ] CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
[ reference structure ] ((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
[ predicted structure ] ((((((((.(((((((((((..(((((((.....................)))))))..............))))).))))))...))))))))....
SRP_00083 [ FASTA input ] GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG
[ reference structure ] ((((((((((.((((..(((.(((((((......((((.....((....)).....))))....)))))..)).)))...)))).))))))))))....
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SRP_00094 [ FASTA input ] GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
[ reference structure ] ((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
[ predicted structure ] (((.....(((((........)))))...)))...................(((((.....((((((.............)))))))))))
SRP_00095 [ FASTA input ] GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
[ reference structure ] ((.((((((((..((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....)))).)..))))))))).....
[ predicted structure ] (((((((((((...(((((.....)))))(((.........)))...........(((((......)))))....)))))))))))....
SRP_00101 [ FASTA input ] GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU
[ reference structure ] ((((((((.(((..(.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)..)))....))))))))....
[ predicted structure ] .((((((.(((((.........)))))(((((...........)))))..........................)))))).....
SRP_00107 [ FASTA input ] GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU
[ reference structure ] .......((((((..((..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))).......)...))))).)))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((..............)))))....(((......((((((.......))))))..)))..))))))))))).
SRP_00121 [ FASTA input ] CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA
[ reference structure ] ......((.(.(((((.((((((.((.((.....((((....(((....)))....))))...)).))..))))))))..))).).)...)..
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SRP_00132 [ FASTA input ] GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ] (..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
[ predicted structure ] .((((((((......(((((.............(((((.....(((........))).((((.......))))))))).)))))..)))))))).....
SRP_00137 [ FASTA input ] ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
[ predicted structure ] ((((((((((((((((............))).(((.(((.(((((............))))))))....)))....)))))))))))))...
SRP_00138 [ FASTA input ] GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU
[ reference structure ] (((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
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SRP_00139 [ FASTA input ] ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG
[ reference structure ] (((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
[ predicted structure ] ..............((((((.........))))))...............................
SRP_00161 [ FASTA input ] GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ] (((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
[ predicted structure ] .((((((((((((.............................................)))))))).)))).....
SRP_00162 [ FASTA input ] GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ] ((((((.((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...))).).))))))))..))))....
[ predicted structure ] ....................((((((...........))).....(((((((((.......)))).))))))))...
SRP_00163 [ FASTA input ] CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))))))....
[ predicted structure ] .....................................((((((((((.((((.......))))....)))...)))))))....
SRP_00170 [ FASTA input ] GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
[ reference structure ] ((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
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SRP_00194 [ FASTA input ] GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
[ predicted structure ] .((((((((((((.....(((.................................)))......)))).)))))))).....
SRP_00196 [ FASTA input ] GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA
[ reference structure ] (((((((..((((.(((.((.((.(((....((((....(((....)))....))))..))).)))).))).......))))...))))))).....
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SRP_00209 [ FASTA input ] GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
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SRP_00213 [ FASTA input ] GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
[ reference structure ] (((((((((((..((.(...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....).)).)..))))))))))......
[ predicted structure ] (((((((((((...................(((.((((((.....(((.......))).....))))))..))).)))))))))))......
SRP_00214 [ FASTA input ] AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ] ((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
[ predicted structure ] ..........(((......))).........................................................
SRP_00215 [ FASTA input ] GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
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[ predicted structure ] (((((((((((((((((..........................................)))))))).)))))))))....
SRP_00216 [ FASTA input ] AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
[ reference structure ] (((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
[ predicted structure ] (((((((((((((((((..((((.....(((.....(((....))).....)))...))))....))))).))))))))))))
SRP_00217 [ FASTA input ] GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))...)))))))....
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SRP_00219 [ FASTA input ] GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU
[ reference structure ] (((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...)))))))....
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SRP_00221 [ FASTA input ] GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU
[ reference structure ] (((((((((.((..(.(..(.....((((....(((....)))....))))...)...)...)..))))..))))))).....
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SRP_00222 [ FASTA input ] AGCCGUCACAUCAUUACGGUCGAAUCGUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUAUUUAAUGAGUGUGAUGGUU
[ reference structure ] (((((((((..(((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))).)..))))))))
[ predicted structure ] ((((((((((((((((.((((...........))))...((((......)))).........)))))).))))))))))
SRP_00223 [ FASTA input ] GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU
[ reference structure ] ((((..(.(.(((((..((((.....(((......((....))......)))...))))...))))))...)..)))).....
[ predicted structure ] ...............(((.........))).(((((.....(((((....((((...........)))).))))).)))))..
SRP_00256 [ FASTA input ] GGCGACCCUUGCGACUGUGAGUCGUGAACCUGGUCAGGCCUUAACUGGAGCAGCCAUAAGCGGUGUAACUUUGUGUGAGGGUUGCCGCCACCG
[ reference structure ] ((((..(.((...((.(.(.(((((.....((((....((......))....))))...)))))....).).)..)..)))....))))....
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[ reference structure ] ((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
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SRP_00268 [ FASTA input ] GUUCCCCGUGCGGCGGCACCUGACUGAACUCCCCCAGGACCGAGAGGUAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUACCGGGUGCGCGGGGAGCCCUUUU
[ reference structure ] (((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
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SRP_00270 [ FASTA input ] GACUCGGACCCAUGCGGCCGCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCGUGACAGGCGUGGACUCCGGGUCACC
[ reference structure ] ((((((((.((((((.(.((((((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).))))).)..))))))..))))))))...
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[ reference structure ] ........(((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..)))))
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SRP_00341 [ FASTA input ] CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU
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SRP_00342 [ FASTA input ] CCGGGGCCGCCCACGAAAUAUCCCCCAAACCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGGGGGACGCUUCGGUGCGCGAUCCGCCCCGG
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SRP_00350 [ FASTA input ] GCCUCCGCGCGGCGUUACCCGGGUGAACUCCCCCAGGUUAGGAAUAAAGCAAGGGUAGCUCGGCUCUGGCGGGUGUGCGGGGGUCUUGC
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SRP_00363 [ FASTA input ] UUCCAGCAUACAGCAAUAUUUUUAUUAGUAAAUUCGAUCAGGUCCGACAGGAAGCAAUCGUAGCUACAAAAAGUAUGUGUAUAGUAUGCUGGAAAAUU
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SRP_00365 [ FASTA input ] GGUAUGCAGGCAAAAACUCUGUAACUUGGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCCACACCAGAAUCUUUUUGGGUUGCAUACCUAUU
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SRP_00383 [ FASTA input ] GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
[ reference structure ] (((((((((.(((((...(((......((((....(((....)))....))))...))).....)))))..)))))).)))
[ predicted structure ] ..((((.....((((....))))..))))....................((((.(((((............))))).))))


  • N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.