CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home
Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas
Help
FAQ
Contact us
RSS feeds
Twitter
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RDfolder
NDB_00014
[ FASTA input ]
CCACUAGUGGCCACUAGUGG
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
NDB_00015
[ FASTA input ]
ACCGGCGCCACAUGUGGCGCCGGU
[ reference structure ]
((.((((((((.)))).)))))).
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
NDB_00016
[ FASTA input ]
CGCGAAAACGCGCGCGUUUUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
NDB_00047
[ FASTA input ]
CGCGAUAUCGCGCGCGAUAUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
NDB_00048
[ FASTA input ]
GCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGCGCUAUAAAAGGGCAUGCCCUUUUAUAGC
[ reference structure ]
(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))
NDB_00049
[ FASTA input ]
GACUAAGUCAACCGGUUGACUUAGUC
[ reference structure ]
((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((....)))))))))))
NDB_00051
[ FASTA input ]
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
PDB_00001
[ FASTA input ]
CGCGAAUUAGCGCGCGAAUUAGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((........))))........
PDB_00002
[ FASTA input ]
GGCGUAAGGAUUACCUAUGCC
[ reference structure ]
(((((.(((....))))))))
[ predicted structure ]
((((((.........))))))
PDB_00003
[ FASTA input ]
GGCGUCACACCUUCGGGUGAAGUCGCC
[ reference structure ]
((((((((((((..))))).)))))))
[ predicted structure ]
((((...((((....))))....))))
PDB_00004
[ FASTA input ]
GGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((.......((((((((...)))))))).......))))
PDB_00005
[ FASTA input ]
GGGAGCUCAACUCUCCCCCCCUUUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA
[ reference structure ]
(((((.......)))))(((...[[[[[[)))...]]]]]]...
[ predicted structure ]
(((((.......)))))......((((((......))))))...
PDB_00006
[ FASTA input ]
GGGUGACUCCAGAGGUCGAGAGACCGGAGAUAUCACCC
[ reference structure ]
((((((((((...((((....))))))))...))))))
[ predicted structure ]
((((((((((...((((....))))))))...))))))
PDB_00011
[ FASTA input ]
CGCAAAUUUGCGCGCAAAUUUGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
PDB_00012
[ FASTA input ]
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC
[ reference structure ]
..(((....((((......)))).)))..
[ predicted structure ]
((((((...((((......))))))))))
PDB_00013
[ FASTA input ]
GGAGUGCUUCAACAGUGCUUGGACGCUCC
[ reference structure ]
((((((.((.((......)).))))))))
[ predicted structure ]
..((((((.....))))))..........
PDB_00017
[ FASTA input ]
GGUGCAGAAACAGCGCUUCGGCGCGUAUAUUACGCACC
[ reference structure ]
(((((((..((((((((..))))))))....)))))))
[ predicted structure ]
(((((.......((((....)))).........)))))
PDB_00018
[ FASTA input ]
GGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCCGGCAAUGAAGCGCGCACGUUGCC
[ reference structure ]
(((((((.[[..[[[[)))))))(((((((.]]]]..]])))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((((.(((((....)))))..)))))).)))))))
PDB_00019
[ FASTA input ]
GGGAUACUGCUUCGGUAAGUCCC
[ reference structure ]
((((..((((....)).))))))
[ predicted structure ]
((((...............))))
PDB_00020
[ FASTA input ]
GGCAACGGAUGGUUCGUUGCCGCACCGAACCAUCCGGUGC
[ reference structure ]
((((((([[[[[[[)))))))((((((]]]]]]]))))))
[ predicted structure ]
.(((.(((((((((((.........))))))))))).)))
PDB_00021
[ FASTA input ]
GGACUAGCGGAGGCUAGUCC
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
PDB_00022
[ FASTA input ]
GGCGACGGUGUAAAAAUCUCGCC
[ reference structure ]
(((((.((((....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((......))))))))
PDB_00032
[ FASTA input ]
GGCGUUUACCAGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAGGCGCC
[ reference structure ]
((((((....((((...(((((..)))))...)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((((.............................)))))))
PDB_00034
[ FASTA input ]
AACGGGCGCAGAAUCUGACGGUACGUUU
[ reference structure ]
((((((((((((.)))).))).))))).
[ predicted structure ]
..(((.........)))...........
PDB_00035
[ FASTA input ]
GGGAUCACCAUUAGGGAUCUC
[ reference structure ]
((((((.(((..)))))))))
[ predicted structure ]
((((((.........))))))
PDB_00036
[ FASTA input ]
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUAGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACU
[ reference structure ]
((((((((((((((.(((((((((((((.))))))))))))).))))))))))))))...........................
[ predicted structure ]
(((...((((((((((......(((....)))...))))))))))......)))...(((..((((((....))))))..))).
PDB_00040
[ FASTA input ]
GUGCGAAGACGAAAGUCCGAGCGC
[ reference structure ]
((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
..(((..(((....)))....)))
PDB_00041
[ FASTA input ]
GCGGCCAGCUCCAGGCCGCCAAACAAUAUGGAGCAC
[ reference structure ]
((((((.[[[[[[)))))).........]]]]]]..
[ predicted structure ]
((((((.......)))))).................
PDB_00043
[ FASTA input ]
GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGACGGUACACC
[ reference structure ]
(((((((((((((..))))).))).)))))
[ predicted structure ]
((((....((((....))))......))))
PDB_00048
[ FASTA input ]
UUGCCUGGCGGCAACUGCCAGGCAU
[ reference structure ]
..(((((((((...)))))))))..
[ predicted structure ]
.((((((((((...)))))))))).
PDB_00049
[ FASTA input ]
GGCGAAGUCGAAAGAUGGCGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((..............))))
PDB_00053
[ FASTA input ]
ACCGUCAGAGGACACGGUUAAAAAGUCCUC
[ reference structure ]
(((((..[[[[[[)))))......]]]]]]
[ predicted structure ]
(((((........)))))............
PDB_00054
[ FASTA input ]
GCAGGCGUGCGCAGGCGUGC
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
....((((((....))))))
PDB_00056
[ FASTA input ]
GGUGGGAGACGUCCCACCGGUGGGAGACGUCCCACC
[ reference structure ]
(((((((..[[)))))))(((((((..]])))))))
[ predicted structure ]
(((((((....)))))))(((((((....)))))))
PDB_00057
[ FASTA input ]
GGAAGUCCGGUCUUCGGACCGGCUUCC
[ reference structure ]
(((((.(((((......))))))))))
[ predicted structure ]
......((((((....)))))).....
PDB_00065
[ FASTA input ]
GGCCGAGUAGUGUUGGGUCGCGAAAGGCC
[ reference structure ]
.(((((.(((((......)))))))))).
[ predicted structure ]
...............((((......))))
PDB_00070
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((...(((((((.....))).))))......(((......)))...........))))))))))....
PDB_00074
[ FASTA input ]
GGUAUUUCGGUACCGGUAUUUCGGUACC
[ reference structure ]
(((((..((((((()))))..)))))))
[ predicted structure ]
........(((((((......)))))))
PDB_00081
[ FASTA input ]
GGGAUAACUUCGGUUGUCCC
[ reference structure ]
(((((((((..)))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
PDB_00088
[ FASTA input ]
GGUGCGAAGGGCGUCGUCGCCCCGAGCGCC
[ reference structure ]
((((((((((((......))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((...(((((....)))))...)))))
PDB_00096
[ FASTA input ]
UACUAACGUAGUAUACUAACGUAGUA
[ reference structure ]
((((.(((((((()))).))))))))
[ predicted structure ]
.....((((.........))))....
PDB_00098
[ FASTA input ]
GGCCGAAAUCCCGAAGUAGGCC
[ reference structure ]
((((((..........))))))
[ predicted structure ]
((((..............))))
PDB_00102
[ FASTA input ]
GGGGCUCUUCGGAGCUCCACCA
[ reference structure ]
((((((((..))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....)))))))....
PDB_00104
[ FASTA input ]
GUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCACGUGUCGCAC
[ reference structure ]
(((.((((())).)))))(((.((((())).)))))
[ predicted structure ]
(((...((((((............))))))...)))
PDB_00107
[ FASTA input ]
AGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU
[ reference structure ]
(((((((....((((..))))...)))))))
[ predicted structure ]
(((((((...((((....))))..)))))))
PDB_00108
[ FASTA input ]
GGCGGUGCUGAGAUGCCCGUC
[ reference structure ]
(((((.((......)))))))
[ predicted structure ]
(((((...........)))))
PDB_00110
[ FASTA input ]
CUUGCUGAAGCACGCACGGCAAG
[ reference structure ]
(((((((.........)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.........)))))))
PDB_00113
[ FASTA input ]
GGCCUGAGGAGACUCAGAAGCC
[ reference structure ]
(((((((((..))))))..)))
[ predicted structure ]
((((((((....)))))..)))
PDB_00115
[ FASTA input ]
GGCGACUGCAGUACGCCGGCGACUGCAGUACGCC
[ reference structure ]
(((((((()))).))))(((((((()))).))))
[ predicted structure ]
((((((((((((.........)))))))).))))
PDB_00116
[ FASTA input ]
CAGACUUCGGUCGCAGAGAUGG
[ reference structure ]
..(((....))).(((..))).
[ predicted structure ]
..(((....)))..........
PDB_00119
[ FASTA input ]
GGACCCGGGCUCAACCUGGGUCC
[ reference structure ]
((((((((((...))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....)))))))))
PDB_00120
[ FASTA input ]
GGCGUCAUGAGUCCAUGGCGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
PDB_00121
[ FASTA input ]
GGCGUGUUCAGAAGAACGCGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
PDB_00122
[ FASTA input ]
GGCAGAGUGCCGCGCGGCACCUGCC
[ reference structure ]
(((((.((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((((....))))))))))
PDB_00123
[ FASTA input ]
UUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAUUUUGCUGAGGUGCACACAGCAAU
[ reference structure ]
..(((((..{{{{{{.)))))..(((((((..}}}}}}.)))))))..(((((..[[[[[[.)))))..(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ]
.((((((.........))))))..((((((.........))))))..((((((.........))))))..((((((.........)))))).
PDB_00124
[ FASTA input ]
GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGCCCG
[ reference structure ]
((((((..[[[[.))))))........]]]].
[ predicted structure ]
(((((.........))))).............
PDB_00125
[ FASTA input ]
GGUCACAGCCCGGUCACAGCCC
[ reference structure ]
((((((((((.)))))))))).
[ predicted structure ]
((((.......)))).......
PDB_00128
[ FASTA input ]
GAGCCCUGGGAGGCUCGCUGUUCCCAGACAGC
[ reference structure ]
((((([[[[..)))))(((((.]].]])))))
[ predicted structure ]
(((((......)))))(((((......)))))
PDB_00130
[ FASTA input ]
GGAAGGCCCUUUUCAGGGCCACCC
[ reference structure ]
....((((((....))))))....
[ predicted structure ]
....((((((....))))))....
PDB_00132
[ FASTA input ]
GGCGCUCAAUGCUCUUCGGAGACGACCGCC
[ reference structure ]
(((((((...(((((..))))).)))))))
[ predicted structure ]
................(((......)))..
PDB_00134
[ FASTA input ]
UCCGGUCGACUCCGGAGAAACAAAGUCA
[ reference structure ]
(((((..[[[.)))))........]]].
[ predicted structure ]
(((((......)))))............
PDB_00136
[ FASTA input ]
GUCUACCUAUCGGGCUAAGGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUAUGCCCGGGGGAAAAC
[ reference structure ]
...(((((..(((((...((((((((((((((((..))))))..))))))))))..))))))))))....
[ predicted structure ]
..........(((((....((((((((((..............))))))))))...))))).........
PDB_00137
[ FASTA input ]
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCA
[ reference structure ]
(((((((((((((..))))))))))))).
[ predicted structure ]
((((..((((((....))))))..)))).
PDB_00138
[ FASTA input ]
GGCGCGGCACCGUCCGCGGAACAAACGG
[ reference structure ]
..(((((..[[[.))))).......]]]
[ predicted structure ]
..(((((......)))))..........
PDB_00142
[ FASTA input ]
GCGACCGAGCCAGCGAAAGUUGGGAGUCGC
[ reference structure ]
((((((...((((((..)))))).))))))
[ predicted structure ]
............((((..........))))
PDB_00149
[ FASTA input ]
GCGCAGGACUCGGCUUCUUCGGAAGGGACGAGGGGCGC
[ reference structure ]
((((...(((((((((((..)))))..)))))).))))
[ predicted structure ]
((((....((((.(((.......)))..))))..))))
PDB_00150
[ FASTA input ]
GGAAGCAGGCUUCGGCCUUGUUUCC
[ reference structure ]
((((((.((((..))))..))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.......)))))))))
PDB_00152
[ FASTA input ]
GACAGUCUCUACGGAGACUG
[ reference structure ]
..((((((((..))))))))
[ predicted structure ]
..(((((((....)))))))
PDB_00153
[ FASTA input ]
GGCGGUUGCAGGUCUGCACCGCC
[ reference structure ]
((((((.((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((((...........))))))
PDB_00155
[ FASTA input ]
CCAUGCGAACCGCGAUCCUAGUGUGG
[ reference structure ]
((((((((..........))))))))
[ predicted structure ]
.........((((.........))))
PDB_00157
[ FASTA input ]
GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCACGUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC
[ reference structure ]
..((((...((((((()))))))(((((..)))))))))....((((.....((((()))))...((((..)))).))))..
[ predicted structure ]
............((((((((......(((..........)))...........)))))))).....................
PDB_00158
[ FASTA input ]
GGGUGACGAUACUGUAGGCGAGAGCCUGCGGAAAAAUAGCCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
...........((((((((....))))))))...........
PDB_00159
[ FASTA input ]
UGCUCCUAGUACGUAAGGACCGGAGUG
[ reference structure ]
(((((((..((((..)))).)))))))
[ predicted structure ]
...((((........))))........
PDB_00160
[ FASTA input ]
GGCGUAACGUUGAAAAGUUACGCC
[ reference structure ]
(((((((((......)))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_00168
[ FASTA input ]
GAGGGUGGAACCGCGCGCGUCCCUC
[ reference structure ]
((((........((....)).))))
[ predicted structure ]
(((((...............)))))
PDB_00169
[ FASTA input ]
GGACCUCUCGAAAGAGUUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))..))))
PDB_00170
[ FASTA input ]
GGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGUCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((..)))))))))..)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.(((((((....)))))))...)))))))
PDB_00171
[ FASTA input ]
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCC
[ reference structure ]
((((((((((((.....)))))))))))).
[ predicted structure ]
((((((.................)))))).
PDB_00174
[ FASTA input ]
CUUGCUGAGGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAGGUGCACACAGCAAG
[ reference structure ]
(((((((.((((((((((((((())))))).)))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.........)))))))(((((((.........)))))))
PDB_00175
[ FASTA input ]
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ]
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ]
(((...........((((((.((((((...........)))))).)))))).)))..........(((.((((((...........)))))).)))
PDB_00178
[ FASTA input ]
GGCGAUACCAGCCGAAAGGCCCUUGGCAGCGUC
[ reference structure ]
(((((..((.((((..))))....))..)))))
[ predicted structure ]
((((......(((((.......)))))..))))
PDB_00181
[ FASTA input ]
GGAGGCGCUACGGCGAGGCUCC
[ reference structure ]
(((((((((..)))))..))))
[ predicted structure ]
((((.(((....)))...))))
PDB_00182
[ FASTA input ]
GAGCGAAGACGAAAGUCGAGCUC
[ reference structure ]
((((..(((((..))))).))))
[ predicted structure ]
((((...(((....)))..))))
PDB_00183
[ FASTA input ]
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCCUUCGGGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ]
(((((.((((.....((((((((((((((..)))))))))).)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((.(((((((.......))))))))))....((((...........))))....
PDB_00184
[ FASTA input ]
GGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ]
((((...((((((.......))))))....))))
PDB_00185
[ FASTA input ]
GGCUGUGAGGAACUACUGUCUUCACGCAGAAAGCGUCUAGCCAUGGCGUUAGUAUGAGUGUCGUGCAGCCUCCAGCC
[ reference structure ]
(((((.((((.....((((((.((((((((..(((((.......)))))...)))))))).)).)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((..(((........((((.....)))).))).(((((((((......)))))))))...)))))))))
PDB_00190
[ FASTA input ]
GGCCUUCCCACAAGGGAAGGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
PDB_00192
[ FASTA input ]
GGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACCGGUGCUCAGUAGGAGACGAACCGCACC
[ reference structure ]
((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))((((((((.((((..))))))))))))
[ predicted structure ]
......................((((((((((.................))))))))))......................
PDB_00195
[ FASTA input ]
GCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGCGCCAGUUCGCUGGC
[ reference structure ]
(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((....((((((((((....))))))))))....((((((((((....))))))))))....)))))(((((....)))))
PDB_00196
[ FASTA input ]
UAGCGGUGCGCACCGCUACGCACCGUUGGUAGCGGUGCGCACCGCUACCAACGGUGC
[ reference structure ]
((((((((())))))))).((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((....))))))).(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
PDB_00197
[ FASTA input ]
GGCAGUGUGAGUACCUUCACACGUC
[ reference structure ]
....(((((((....)))))))...
[ predicted structure ]
(((.((((((......)))))))))
PDB_00200
[ FASTA input ]
GGAUGCCUCCCGAGUGCAUCC
[ reference structure ]
(((((((((..))).))))))
[ predicted structure ]
((((((.........))))))
PDB_00201
[ FASTA input ]
GGACACGAAAUCCCGAAGUAGUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((.....)).))))))))
[ predicted structure ]
((((((..............))))))
PDB_00202
[ FASTA input ]
GAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUC
[ reference structure ]
((((((((.((((((..))))))...))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((..............))))))))))
PDB_00203
[ FASTA input ]
GGAGGACAUCCCUCACGGGUGACCGUGGUCCUCC
[ reference structure ]
(((((((......((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((......(((((....))))))))))))
PDB_00205
[ FASTA input ]
GGCACUCUGGUAUCACGGUACCUUUGUGUC
[ reference structure ]
((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((...((((......))))...)))))
PDB_00206
[ FASTA input ]
GGGACUGACGAUCACGCAGUCUAU
[ reference structure ]
.((((((.((....))))))))..
[ predicted structure ]
..(((((.........)))))...
PDB_00207
[ FASTA input ]
UUAUAUAUAUAUAAUUAUAUAUAUAUAA
[ reference structure ]
(((((((((((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
PDB_00209
[ FASTA input ]
GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGGCCCAU
[ reference structure ]
(((((..[[[[[[.)))))........]]]]]].
[ predicted structure ]
(((((.........)))))...............
PDB_00211
[ FASTA input ]
GAAGAGAAGCGCUUCUCUUC
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
PDB_00214
[ FASTA input ]
GGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
[ reference structure ]
(((((((...((((..))))..)))))))
[ predicted structure ]
((((((.................))))))
PDB_00215
[ FASTA input ]
UAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUAUAAGGAGGUGAUAUCACCUCCUUA
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
PDB_00219
[ FASTA input ]
GGCAGGGCUCAUAACCCUGCC
[ reference structure ]
(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
(((((((.......)))))))
PDB_00221
[ FASTA input ]
GGCCUAAGACUUCGGUUAUGGCC
[ reference structure ]
(((((..((((..)))).)))))
[ predicted structure ]
(((((((........))).))))
PDB_00224
[ FASTA input ]
GGUCAGUGUAACAACUGACC
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
(((((((......)))))))
PDB_00229
[ FASTA input ]
AGCGCCGUGGCGCAGUGGAAGCGCGCAGGGCUCAUAACCCUGAUGUCCUCGGAUCGAAACCGAGCGGCGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PDB_00234
[ FASTA input ]
GGACUUUGGUCCGGACUUUGGUCC
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((....))))((((....))))
PDB_00236
[ FASTA input ]
GGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUCGGCGCUUGCGUC
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
(((((..((((((((((..(((....)))..))))))))))..)))))
PDB_00237
[ FASTA input ]
GGCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGCC
[ reference structure ]
.((((...(((((..)))))...)))).
[ predicted structure ]
((((.....(((....))).....))))
PDB_00239
[ FASTA input ]
GUGGUCUGAUGAGGCCGGCCGAAACUCGUAAGAGUCACCAC
[ reference structure ]
((((((...((((((()))))))(((((..)))))))))))
[ predicted structure ]
..(((((....))))).........................
PDB_00243
[ FASTA input ]
GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC
[ reference structure ]
..(((((.[[[[[[[))))).......]]]]]]]..
[ predicted structure ]
........((((((((((.....))).)))))))..
PDB_00248
[ FASTA input ]
AUCCCCCGUGCCGGUGCGGGGGAU
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_00249
[ FASTA input ]
CCGAUGGUAGUGGCGAGAGUAGGC
[ reference structure ]
(((((((((((.))))))))))).
[ predicted structure ]
........................
PDB_00250
[ FASTA input ]
UGCCUGGCGGCCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA
[ reference structure ]
((((((((((((((...(((((((((((..))))))))).))..)))..)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((.......(((((((....))))))).......)))..))))))))))
PDB_00252
[ FASTA input ]
CUGGGCGGGCGACCGCCUGGCUGGGCGGGCGACCGCCUGG
[ reference structure ]
.(((((((....)))))))..((((((((..)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))((((((((....))))))))
PDB_00254
[ FASTA input ]
CGUACGCGUACGCGUACGCGUACG
[ reference structure ]
(((((())))))(((((())))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
PDB_00256
[ FASTA input ]
UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU
[ reference structure ]
.((((......))))...........
[ predicted structure ]
.....((((((.........))))))
PDB_00257
[ FASTA input ]
GGCCAGAUCUGAGCGGCUCUCUGGCCC
[ reference structure ]
(((((((...((((.))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((............))))))).
PDB_00258
[ FASTA input ]
GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA
[ reference structure ]
((((((((......)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((......)))))))).
PDB_00261
[ FASTA input ]
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((())))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((......)))))(((((......)))))
PDB_00262
[ FASTA input ]
CCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGGCCCAUGGG
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
PDB_00264
[ FASTA input ]
CGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCCCGGACCGAGCCAGGCUGGGAGUCC
[ reference structure ]
.(((((...((((.)))).))))).(((((...((((.)))).)))))
[ predicted structure ]
.................(((.((((((...........)))))).)))
PDB_00267
[ FASTA input ]
UAGCUCCGGGGCUAUAGCUCCGGGGCUA
[ reference structure ]
((((((()))))))((((((()))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
PDB_00286
[ FASTA input ]
AAAAAAAAAAUUUUUUUUUU
[ reference structure ]
..((((((...))))))...
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))
PDB_00293
[ FASTA input ]
CCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGUCCUGGUAUUGCAGUACCUCCAGGU
[ reference structure ]
((((((...........)))))).((((((...........)))))).
[ predicted structure ]
...((((((((((((((..........)))))))))))))).......
PDB_00312
[ FASTA input ]
GGCAGAGUCCUUCGGGACAUUGCACCUGCC
[ reference structure ]
(((((.((((....)))).......)))))
[ predicted structure ]
(((((.((((....)))).......)))))
PDB_00313
[ FASTA input ]
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.......(((........((((((............))))))........))).))))))))....
PDB_00317
[ FASTA input ]
GGCUCGUGUAGCUCAUUAGCUCCGAGCC
[ reference structure ]
((((((...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
((((((...((((....)))).))))))
PDB_00326
[ FASTA input ]
GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC
[ reference structure ]
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((...((((..))))..)))))))
[ predicted structure ]
......(((..((((.......))))..)))...........................((((((.................))))))
PDB_00327
[ FASTA input ]
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCAAA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((.........(((.......((((((.................)))))).......))).)))))))......
PDB_00339
[ FASTA input ]
GGACCGAUGGUAGUGUCUUCGGAUGCGAGAGUAGGUC
[ reference structure ]
.((((((((((((((((....))))))))))))))))
[ predicted structure ]
...((((...........))))...............
PDB_00341
[ FASTA input ]
CCCAUGCGAGAGUAGGGACUGCCGAUGGUAGUGUGGGG
[ reference structure ]
((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((....((((...))))........))))))).
PDB_00342
[ FASTA input ]
GGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCCGGCGCGCGCC
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))....................
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((....))))))))))))))))))
PDB_00343
[ FASTA input ]
GGGCGGCCUUCGGGCUAGACGGUGGGAGAGGCUUCGGCUGGUCCACCCGUGACGCUC
[ reference structure ]
((((.(((....)))...((((((((((.((((..))))))))))).)))...))))
[ predicted structure ]
...(((.....(((((((......((((...))))..)))))))..)))........
PDB_00347
[ FASTA input ]
GGCUCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGAGCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.............................))))))))))
PDB_00349
[ FASTA input ]
GAGACAUUGCACCCGGAGUCUCGAGACAUUGCACCCGGAGUCUC
[ reference structure ]
(((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
[ predicted structure ]
(((((............)))))(((((............)))))
PDB_00351
[ FASTA input ]
GCCAAUGAGGCCGAGGCGCCAAUGAGGCCGAGGC
[ reference structure ]
(((...(((()))))))(((.....(())..)))
[ predicted structure ]
.........(((..(((.........)))..)))
PDB_00352
[ FASTA input ]
GGGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUC
[ reference structure ]
(((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))))
[ predicted structure ]
(((.((((((((......))))))))....))).................
PDB_00357
[ FASTA input ]
GAGGACCUAGAUCACCCCUCGAGGACCUAGAUCACCCCUC
[ reference structure ]
(((((..........)))))(((((..........)))))
[ predicted structure ]
((((............))))((((............))))
PDB_00362
[ FASTA input ]
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCCGCGGUUCGAUUCCGCGCCUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PDB_00365
[ FASTA input ]
GGACAGCUGUCCCUUCGGGGACAGCUGUCC
[ reference structure ]
((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((....)))))))))))))
PDB_00371
[ FASTA input ]
GGUCUGGGCGCAGCGCAAGCUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ]
(((((((((((((((..))))).))).)))))))
[ predicted structure ]
((((((....((((....))))......))))))
PDB_00377
[ FASTA input ]
GGGCGCCGGUACGCAAGUACGACGGUACGCUCC
[ reference structure ]
((((((((((((....))))..)))..))))).
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))..)))..))))).
PDB_00378
[ FASTA input ]
GGAUCCCGACUGGCGAGAGCCAGGUAACGAAUGGAUCC
[ reference structure ]
((((((((.((((((..))))))....))...))))))
[ predicted structure ]
((((((...(((((....))))).........))))))
PDB_00392
[ FASTA input ]
UUCCUCGUGGCCCAAUGGUCACGGCGUCUGGCUACGAACCAGAAGAUUCCAGGUUCAAGUCCUGGCGGGGAAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.....(((((((....)))))))...(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
PDB_00400
[ FASTA input ]
GCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAAC
[ reference structure ]
.(((((((((((((((((.))))))))))))))))).....(((((((((((((((((.)))))))))))))))))....
[ predicted structure ]
..........((((((((.((((((((.......................)))))))).)))))))).............
PDB_00402
[ FASTA input ]
GGGCUUGUAGCUCAGGUGGUUAGAGCGCACCCCUGAUAAGGGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACUCAGGCCCAC
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))..
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))............)))))))............
PDB_00411
[ FASTA input ]
GGCGUGUAGGAUAUGCUUCGGCAGAAGGACACGCC
[ reference structure ]
(((((((((..((((((..)))))).)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((........((((....)))).)))))))
PDB_00420
[ FASTA input ]
GGUCUGGGCGCACUUCGGUGACGGUACAGGCC
[ reference structure ]
...((((((((((....))).))).))))...
[ predicted structure ]
((((((..(((......)))......))))))
PDB_00425
[ FASTA input ]
GGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
[ reference structure ]
((((((..(((.........)))((((((((...))))))))....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
PDB_00430
[ FASTA input ]
GGGCAGGUUCCCGAGGGCCAAAGGGGACGGUCUGUAAAACCGUUGGCGUAGCCUUCGCUGGUUCGAAUCCAGCCCUGCCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))(((((((.....)))))))(((...)))...(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((.............((((..(((((.......)))))........)))).(((((.......)))))))))))).
PDB_00431
[ FASTA input ]
GGAGUAGCGCAGCCCGGUAGCGCACCUCGUUCGGGACGAGGGGGGCGCUGGUUCAGAUCCAGUCUCC
[ reference structure ]
((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))
[ predicted structure ]
..................(((((.((((((.....))))))...)))))..................
PDB_00454
[ FASTA input ]
GGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCCGGGCCCGGUAAGUCUCUUCGGAGAUACUGCCGGGCCC
[ reference structure ]
(((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))(((((((((.(((((((..)))))..)))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((..((((....))))...))))))))))((((((((((..((((....))))...))))))))))
PDB_00474
[ FASTA input ]
CCGGCGGUAGUUCAGCCUGGUAGAACGGCGGACUGUAGAUCCGCAUGUCGCUGGUUCAAAUCCGGCCCGCCGGA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))(((((((.....)))))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((.........)))).(((((.......))))).)))))))))......(((((....)))))
PDB_00481
[ FASTA input ]
GCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGCGCGCUCCUCAGUACGAGAGGAACCGGAGCGC
[ reference structure ]
((((((((((.(((....)))))))))))))((((((((((.(((....)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.................)))))))(((((((.................)))))))
PDB_00513
[ FASTA input ]
GGCAACGGUUCGAUCCCGUUGC
[ reference structure ]
.(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.......)))))))
PDB_00522
[ FASTA input ]
GGCGGAACCGUACACCGGAAUCCGAAAGGAUUUGGGCGUGCCCCCGCC
[ reference structure ]
(((((..(((.....)))(((((....))))).((((())))))))))
[ predicted structure ]
..((((.(((.....)))..))))..........((((......))))
PDB_00526
[ FASTA input ]
AGAAGGAGCGUACAGGUAGGUCGCU
[ reference structure ]
.....(((...........)))...
[ predicted structure ]
......((((...........))))
PDB_00527
[ FASTA input ]
AGAAGGAGUGUACGGUUAGGUCGCU
[ reference structure ]
..((....((()))........)).
[ predicted structure ]
......((((...........))))
PDB_00537
[ FASTA input ]
GGAUUGUUACUGCUACGGCAGGCAAAACC
[ reference structure ]
...((((..(((((..)))))))))....
[ predicted structure ]
...(((...((((....)))).)))....
PDB_00553
[ FASTA input ]
GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC
[ reference structure ]
(((((((...((((......)))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((...((((......)))))))))))
PDB_00570
[ FASTA input ]
GGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCCGGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCC
[ reference structure ]
(((((((((....((....)).))))..))))).(((((((((....((....)).))))..))))).
[ predicted structure ]
((((..........)))).........(((...(((((..........))))).)))...........
PDB_00571
[ FASTA input ]
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUUUUUU
[ reference structure ]
.((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......))))))))))).....]]]...
[ predicted structure ]
..((((((.((((........)))).(((((.......))))))))))).(((..(((..........))))))........
PDB_00584
[ FASTA input ]
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCGCAAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC
[ reference structure ]
((((((.........(((((((((((..)))))..........))))))))))))
[ predicted structure ]
..........(((..(((((...(((........))).......)))))..))).
PDB_00599
[ FASTA input ]
GGGAGCUUGAUCCCGGAAACGGUCGAUCGCUCCC
[ reference structure ]
((((((..((((((((..))))..))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((........))))))..))))))
PDB_00603
[ FASTA input ]
GGACUGGGCGAGAAGUUUAGUCC
[ reference structure ]
((((((((((...))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....)))))))))
PDB_00611
[ FASTA input ]
GGAUCGCAUUUGGACUUCUGCCCGGCACCACGGUCGGAUC
[ reference structure ]
.((((.......(((...((((.)))).....))).))))
[ predicted structure ]
.....................(((((......)))))...
PDB_00617
[ FASTA input ]
GGUUCACCUCUAACCGGGUGAGCC
[ reference structure ]
((((((((((....))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_00627
[ FASTA input ]
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC
[ reference structure ]
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.(((((.......))))).))).....(((..........))).)))))
PDB_00629
[ FASTA input ]
CAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUGCAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUG
[ reference structure ]
((((((..((((((..)))))).))))))((((((..(((((....))))).))))))
[ predicted structure ]
.......................(((((((..((((.........))))..)))))))
PDB_00637
[ FASTA input ]
GAUUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCUCGACGGGGACUUCGGUCCUCGGA
[ reference structure ]
......((((((((....))))))))..(((((.......)))))...((((((((....)))))))).
[ predicted structure ]
...(((((((((((....)))))))...(((((.......)))))))))(((((((....)))))))..
PDB_00648
[ FASTA input ]
AGCACGGCUUAAACCGUGCAGCACGGCUUAAACCGUGCUUUU
[ reference structure ]
(((((((......)))))))((((((......))))))....
[ predicted structure ]
.((((((......))))))(((((((......)))))))...
PDB_00663
[ FASTA input ]
GGGGGGGGGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGGGGGGGGGG
[ reference structure ]
...(((.((....)).)))......(((..((..))..)))...
[ predicted structure ]
(((((((((((........)))))))))))..............
PDB_00667
[ FASTA input ]
GCCGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCAGCGCAUUCGUAAUGCGAAGGUCGUAGGUUCGACUCCUAUUAUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))..((((((...)))))).......((((.......)))).)))))))....
PDB_00681
[ FASTA input ]
CUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAGCUGUGUUCGAUCCACAG
[ reference structure ]
(((((.......)))))(((((...((((((((()))))...)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.((((..((((((((((.......)))))))))).))))..)))))
PDB_00682
[ FASTA input ]
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((......)))))))))))))
PDB_00686
[ FASTA input ]
CGUACGCGGAAUACUUCGAUCGAAGUAUUCCGCGUACG
[ reference structure ]
((((((((((((((((((()))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((....)))))))))))))))))
PDB_00687
[ FASTA input ]
GGGAAGGGAAGAAACUGCGGCUUCGGCCGGCUUCCC
[ reference structure ]
((((((..........((((((..))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((.........))))......))))))
PDB_00692
[ FASTA input ]
GCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGCGCUCUGACCGAAAGGCGUGAUGAGC
[ reference structure ]
((((((((((..)))...)))))))((((((((((..)))...)))))))
[ predicted structure ]
..............(((.......))).......................
PDB_00693
[ FASTA input ]
GCGCUCUGAUGAGGCCGCAAGGCCGAAACUGCCGCAAGGCAGUCAGCGC
[ reference structure ]
(((((.......(((((..)))))...(((((((..))))))).)))))
[ predicted structure ]
(((((.......((((....))))...((((((....)))))).)))))
PDB_00698
[ FASTA input ]
CGUACGCGUCACGCGUACGUUCGUACGCGUCACGCGUACGUU
[ reference structure ]
(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
[ predicted structure ]
(((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))..
PDB_00702
[ FASTA input ]
GGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCCGGACGAUGGCGAAACUGCAUGAGGCAAUUCAUGCAAGUCCCUCGUCC
[ reference structure ]
((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))((((((.((.((..((((((((......)))))).))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((.....(((((((......)))))))......(((((........)))))...(((((((......))))))).)))..))))))
PDB_00705
[ FASTA input ]
GGGGAGUGGUUUGUAUCCUUCCC
[ reference structure ]
((((((.((......))))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((....)))))))))
PDB_00709
[ FASTA input ]
GGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCCGGCGAGCC
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ]
........(((..((((((..........))))))..)))
PDB_00710
[ FASTA input ]
GACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCCGACGAGCC
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))........
[ predicted structure ]
........................................
PDB_00713
[ FASTA input ]
GAGGUGCCCGAGUGGCUGAAGGGGGUAGGGGGGCCUCCCUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCCUCUC
[ reference structure ]
(((((([[[)).........]]]...((((((())))))).(((((.......)))))))))..
[ predicted structure ]
((((.(((.....)))...((((((.........)))))).(((((.......)))))))))..
PDB_00716
[ FASTA input ]
AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC
[ reference structure ]
..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
[ predicted structure ]
........(((...(((((((..............)))))))...((((((((.....)))))))).)))....
PDB_00724
[ FASTA input ]
GGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCCGGUGGUGGAGUCGCUGGCAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ]
((((((((.(((((((.))))))))))))))).(((((((..(((((((.))))))).))))))).
[ predicted structure ]
(((((((....(((((.(((((.....(((((....)))))...))))).)))))...))))))).
PDB_00725
[ FASTA input ]
GGUGGUGAAGUCGCUCGGCGAGCGUCACACCACCC
[ reference structure ]
(((((((..((((((((.)))))))).))))))).
[ predicted structure ]
(((((((....(((((...)))))...))))))).
PDB_00726
[ FASTA input ]
GACCGGAGUGUCGACGCAGAGAUGGUC
[ reference structure ]
((((...((((()))))......))))
[ predicted structure ]
............(((.........)))
PDB_00727
[ FASTA input ]
GGUCAUCGUUGAGAAAACGAAACAGACGGUGGCC
[ reference structure ]
((..(((((................)))))..))
[ predicted structure ]
(((((((((................)))))))))
PDB_00728
[ FASTA input ]
GGGAUACCAUGUUCAGAAGAACGUGGUAUCUC
[ reference structure ]
(((((((((((((((..)))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((....))))))))))))))
PDB_00732
[ FASTA input ]
GCGGAUCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGACCCGCACGCGGAUCCGCACCGCGGAUCCGCACCCGCGGAUCCGCACAA
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))...((((((((((..))))))))))....((((((((((..)))))))))).....
[ predicted structure ]
((((((((((.(((((.......))))).........))))))))))...((((((((((....))))))))))....
PDB_00733
[ FASTA input ]
GCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACGCGGAUAUCCGCGGCGGAUAUCCGCACCGGAUCCGCACCGCGGAUCCCCC
[ reference structure ]
(((((((((((...)))))))))))..(((((((((((...)))))))))))....((((((((.))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((....)))).))))))))))))).((((....))))...((((((((...))))))))...
PDB_00734
[ FASTA input ]
GGUGACGCCGUAAGGCGCAGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))
[ predicted structure ]
.....((((....)))).....
PDB_00737
[ FASTA input ]
GGCACGAGGUUUAGCUACACUCGUGCC
[ reference structure ]
(((((((((((....))).))))))))
[ predicted structure ]
((((((((...........))))))))
PDB_00740
[ FASTA input ]
GAGGAAGGCGAUCGUUAAUCUC
[ reference structure ]
((((((((((()))))))))))
[ predicted structure ]
.........(((.....)))..
PDB_00741
[ FASTA input ]
GGGCUAGCACUCUGGUAUUACGGUACCUUUGUGCGCCC
[ reference structure ]
((((..(((((((((((((..)))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((..((((...((((......))))...))))))))
PDB_00746
[ FASTA input ]
GGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCCGGGAGUGAAGGAGGCUCGCGAACUCGCGAAGCCGAGAAACUUCACUCCC
[ reference structure ]
.(((((((((((((((((((....)))).)))))....))))))))))..(((((((((((((((((((....)))).)))))....)))))))))).
[ predicted structure ]
((((((((((....((((..............))))...))))))))))((((((((((....((((..............))))...))))))))))
PDB_00751
[ FASTA input ]
GGCUGGACUCGUACUUCGGUACUGGAGAAACAGCC
[ reference structure ]
..(((((((((((((..)))))..)))).))))..
[ predicted structure ]
(((((..(((((((....))))..)))...)))))
PDB_00754
[ FASTA input ]
AAUCCAUUGCACGGAUUAAUCCAUUGCACUCCGGAUUUAAUCCAUUGCACGGAUU
[ reference structure ]
.((((.......)))).(((((..........)))))...(((.......)))..
[ predicted structure ]
(((((.......)))))(((((..........))))).(((((.......)))))
PDB_00767
[ FASTA input ]
GGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCGGCCAGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCCUGGCCACCAA
[ reference structure ]
(((((((.(((.........))).)))))))(((((((.(((.........))).))))))).....
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))((((((((((((.......)))))))))))).....
PDB_00800
[ FASTA input ]
GGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUGGCAACGCC
[ reference structure ]
((((((((((..))))))))))((((((((((..))))))))))(((((((((...)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..)))))))))
PDB_00806
[ FASTA input ]
UCCCAGUCCACCGCGGUGAGAAGGGGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ]
.(((..((((((()))))))..)))(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ]
.........((((((((........................))))))))............
PDB_00807
[ FASTA input ]
UCGCAGUCCUAUUAAUAGAGAAGCGAGGCAGAGAAACACACGAUCGUGGUACAUUACCUGCC
[ reference structure ]
.(((....((((()))))....))).(((((((((..(((((())))))...)).)))))))
[ predicted structure ]
((((....(((....)))....)))).....................((((.......))))
PDB_00809
[ FASTA input ]
GAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUC
[ reference structure ]
((((((((((((((...))))).)))))))))
[ predicted structure ]
((((.((((.(((.....)))..)))).))))
PDB_00810
[ FASTA input ]
GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU
[ reference structure ]
..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
[ predicted structure ]
........(((........))).........................
PDB_00815
[ FASTA input ]
AUGCUCAUGCACUGCAUGAAUGCCCCUAAGGGAUGC
[ reference structure ]
....(((((.....)))))....((((.))))....
[ predicted structure ]
....((((((...)))))).................
PDB_00823
[ FASTA input ]
GGUGGAGGCUGCCGAAGCCA
[ reference structure ]
(((((((((.))))))))).
[ predicted structure ]
......((((.....)))).
PDB_00828
[ FASTA input ]
CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG
[ reference structure ]
(((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
PDB_00829
[ FASTA input ]
GGAUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGUC
[ reference structure ]
.(((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.....(((((.......)))))..........((((((.......))))))..)))))))
PDB_00842
[ FASTA input ]
AGUGGCGCCGACCACUUAAAAACACCGG
[ reference structure ]
(((((..[[[.))))).........]]]
[ predicted structure ]
(((((......)))))............
PDB_00851
[ FASTA input ]
GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC
[ reference structure ]
((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
[ predicted structure ]
.(((((((((((((((((.(((.....((((....)))).........)))..)))))))))))))).(((...........))).......)))...
PDB_00855
[ FASTA input ]
GGAUAUAUGAUACAAUUUGAUCAGUAUAUCC
[ reference structure ]
((((((.((((........))))..))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((........)))).)))))))
PDB_00857
[ FASTA input ]
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCCAAACAAAAAAGUCAGCA
[ reference structure ]
((((((........[[[[[[[[[))))))........]]]]]]]]].
[ predicted structure ]
..............(((((((((..............))))))))).
PDB_00863
[ FASTA input ]
UUGCGUCACACCGGUGAAGUCGCUGCGUCACACCGGUGAAGUCGC
[ reference structure ]
..(((((.((((((((..(((((.))))).))))))))..)))))
[ predicted structure ]
..(((...((((((((..............))))))))....)))
PDB_00865
[ FASTA input ]
GGUAACAAUAUGCUAAAUGUUGUUACC
[ reference structure ]
((((((((((((...))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((.....)))))))))))
PDB_00868
[ FASTA input ]
GCUGGUCCGAUUGACUAGCCGCUGGUCCGAUUGACUAGCCUCCGAGGUCCGA
[ reference structure ]
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
[ predicted structure ]
(((((((.....))))))).(((((((.....))))))).............
PDB_00870
[ FASTA input ]
GCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGCGCAGACUUAAAUCUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((())))))))))))))))................
[ predicted structure ]
(((((.((((.((((((((((......)))))))))).)))).)))))
PDB_00871
[ FASTA input ]
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))
PDB_00873
[ FASTA input ]
AAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUUAAAUAUAUAUUU
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_00874
[ FASTA input ]
CGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCGCGAACUUCGCG
[ reference structure ]
((((((((([[)))))))))..(((((((((..)))))))))]]
[ predicted structure ]
.........((((((.(((((((((...))))))))).))))))
PDB_00876
[ FASTA input ]
GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....)))))))))))...))))))))
PDB_00878
[ FASTA input ]
GAGGUCGGCCCGACUUCGGUCACUGCCACCUC
[ reference structure ]
(((((.(((..((((..))))...))))))))
[ predicted structure ]
(((((((...)))))))(((.......)))..
PDB_00883
[ FASTA input ]
GGCUCUUUUCAGAGCCGGCUCUUUUCAGAGCCAAAA
[ reference structure ]
((((((....))))))((((((....))))))....
[ predicted structure ]
((((((....((((....))))....))))))....
PDB_00885
[ FASTA input ]
GGCGAUCUGGCCUUCCUACAAGGGAAGGCCAGGGAAUUGCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((..))))))))))))...))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((......))))))))))...))))))
PDB_00886
[ FASTA input ]
CUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAGCUUGCUGAAGUGCACACAGCAAG
[ reference structure ]
(((((((..{{{{{{.)))))))(((((((..}}}}}}.)))))))(((((((..[[[[[[.)))))))(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ]
(((((((..((((((.((((((((((((((.........))))))))))))))..)))))).)))))))(((((((.........)))))))
PDB_00890
[ FASTA input ]
ACAUGAGGAUCACCCAUGUACAUGAGGAUCACCCAUGU
[ reference structure ]
(((((.((....)))))))(((((.((....)))))))
[ predicted structure ]
(((((..((((...(((....)))..))))...)))))
PDB_00891
[ FASTA input ]
GGCCACGGUUCGAAUCCGUGGCGGCCACGGUUCGAAUCCGUGGC
[ reference structure ]
((((((((.......))))))))(((((((.......)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.......))))))).(((((((.......)))))))
PDB_00892
[ FASTA input ]
CUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUG
[ reference structure ]
((((.((...((............))...)).))))...........((((((()))))))...........
[ predicted structure ]
........................................................................
PDB_00918
[ FASTA input ]
GCGGCACCGUCCGCUCAAACAAACGG
[ reference structure ]
((((..[[[.)))).........]]]
[ predicted structure ]
((((......))))............
PDB_00923
[ FASTA input ]
CCACGGUUCGAAUCCGUGGC
[ reference structure ]
((((((.......)))))).
[ predicted structure ]
((((((.......)))))).
PDB_00924
[ FASTA input ]
GGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCUGGGAUAUGGAAGAACCGGGGAAACUUGGUUCUUCCUAAGUCCU
[ reference structure ]
(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))(((((..(((((((((((((..)))))))))))))...)))))
[ predicted structure ]
.(((...((((((((((((....))))))))))))....)))..(((...((((((((((((....))))))))))))....))).
PDB_00925
[ FASTA input ]
GGAGCGGGGGUGUAAACCUAUCGCUCC
[ reference structure ]
((((((.(((((..)))))..))))))
[ predicted structure ]
((((((..(((....)))...))))))
PDB_00928
[ FASTA input ]
CUCGCGGAUCAGUCACCCAAGCGAG
[ reference structure ]
((((((((.........))))))))
[ predicted structure ]
(((((...............)))))
PDB_00929
[ FASTA input ]
GGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCUGGCGUGCGCU
[ reference structure ]
(((((((((())))))))))(((((((((())))))))))
[ predicted structure ]
.(((((((((((((((((....))))))))))))))))).
PDB_00932
[ FASTA input ]
GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC
[ reference structure ]
((((((.......((.(((((..)))))...))..))))))
[ predicted structure ]
....(((((((......))))))).................
PDB_00937
[ FASTA input ]
GCAUGGACGCGUCCAUGCGCAUGGACGCGUCCAUGC
[ reference structure ]
(((((((((((((((((())))))))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((....))))))))))))))))
PDB_00943
[ FASTA input ]
UUGACUACGGAUCAAUUGACUACGGAUCAAGACUACGGUUUGACUACGGAUCAA
[ reference structure ]
(((((.....)))))(((((.....))))).........(((((.....)))))
[ predicted structure ]
.......((((((..((((.......))))......))))))............
PDB_00945
[ FASTA input ]
CAGCACUGAUUGCGGUCGAGGUAGCUUGAUG
[ reference structure ]
.((((.....))))((((((....)))))).
[ predicted structure ]
...............(((((....)))))..
PDB_00960
[ FASTA input ]
UUCGACGCGUCGAAUUUUCGACGCGUCGA
[ reference structure ]
.(((((..)))))....(((((..)))))
[ predicted structure ]
.((((((((((((....))))))))))))
PDB_00961
[ FASTA input ]
AGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGAC
[ reference structure ]
.............(((((.......))))).............(((((.......)))))
[ predicted structure ]
............((((((.......))))))............(((((.......)))))
PDB_00964
[ FASTA input ]
ACAUGAGGAUUACCCAUGUCAUGAGGAUUACCCAUG
[ reference structure ]
(((((.((....)))))))..((.........))..
[ predicted structure ]
(((((.........)))))((((.........))))
PDB_00966
[ FASTA input ]
UGUCUAAGACAGUGUCUAAGACA
[ reference structure ]
.(((...)))..((((...))))
[ predicted structure ]
(((((.((((...)))).)))))
PDB_00973
[ FASTA input ]
AUGAGGAUAACCCAUGAGGAUAACCCA
[ reference structure ]
.((.((....))))((.((....))))
[ predicted structure ]
(((.........)))............
PDB_00974
[ FASTA input ]
AUGAGGAUGACCCAUUGAGGAUGACCCA
[ reference structure ]
(((.((....)))))((.((....))))
[ predicted structure ]
(((.........))).............
PDB_00986
[ FASTA input ]
CGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUG
[ reference structure ]
((((((((..(((((())))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((...((((....)))).)))))))
PDB_00987
[ FASTA input ]
GCUGAAGUGCACACGGCGCUGAAGUGCACACGGC
[ reference structure ]
(((((.((((((((((())))).)))))))))))
[ predicted structure ]
((((..((((((...........)))))).))))
PDB_00989
[ FASTA input ]
GGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCCGGGUCGGCUUGCUGAAGUGCACACGGCAAGAGGCGACCC
[ reference structure ]
(((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((())))))))))))))).)))))))))))))))..))))))
[ predicted structure ]
((((((.(((((((.........)))))))...))))))((((((.(((((((.........)))))))...))))))
PDB_01001
[ FASTA input ]
CUCUCGGUAGCCAAGGGAAGGCGCAAGGUAAAUGAGUCGGGCGUUCGACUCGCCCCCGGGAGACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.......)))(((.......)))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((.........)))).....................(((((.......)))))...........
PDB_01002
[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((....(((.....)))...((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........(((((.........)))))(((((((..............((((.......))))..)))))))...
PDB_01008
[ FASTA input ]
GGCCCGGGGCGGUUCGAUUCCGCCCUGGGCCACCA
[ reference structure ]
((((((((((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((.......))))))))))))....
PDB_01009
[ FASTA input ]
GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC
[ reference structure ]
((((((((([[[)).......]]]..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((................((((((((((................)))))))...)))..)))))))
PDB_01017
[ FASTA input ]
UAGGGCCCGGGCCCUUAGGGCCCGGGCCCU
[ reference structure ]
.((((((())))))).((((((()))))))
[ predicted structure ]
.(((((((((((((...)))))))))))))
PDB_01019
[ FASTA input ]
AUGGGCCCGGGCCCAAUGGGCCCGGGCCCA
[ reference structure ]
.((((((())))))).((((((()))))))
[ predicted structure ]
.(((((((((((((...)))))))))))))
PDB_01020
[ FASTA input ]
GGACAUUUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACAAUGUCCA
[ reference structure ]
.((((((...(((((((.[[..[[)))))))........((((((]]...]]))))))..))))))..
[ predicted structure ]
(((((((.....(((((.......)))))..........((((((.......))))))..))))))).
PDB_01025
[ FASTA input ]
GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....)))))))))
PDB_01035
[ FASTA input ]
AAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAUAAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUUAU
[ reference structure ]
((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((....)))))))))))(((((((((((((....)))))))))))))
PDB_01040
[ FASTA input ]
GGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAACGGUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAC
[ reference structure ]
.(((((((..[[[[[[.))))))).(((((((..]]]]]].)))))))
[ predicted structure ]
.(((((((..((((((.((((((...))))))..)))))).)))))))
PDB_01044
[ FASTA input ]
AGACAGCAUAUAUGCUGUCUUUAGACAGCAUAUAUGCUGUCUUU
[ reference structure ]
.((((((((((.((((((......)))))).))))))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..
PDB_01045
[ FASTA input ]
AGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCUUUAGACAGCAUGCAUGCAUGCUGUCU
[ reference structure ]
.(((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))
PDB_01050
[ FASTA input ]
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC
[ reference structure ]
((((((..(((((((.......))))))).))))))
[ predicted structure ]
(((((((...((((((.....))))))..)))))))
PDB_01051
[ FASTA input ]
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC
[ reference structure ]
(((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.....((((((.......))))))..))))))))
PDB_01053
[ FASTA input ]
GCUUCCAUAGCUCAGCAGGUAGAGCGUCAGCGGUUCGAGCCCGCUUGGAAGCU
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))...(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(((((((................))).)))).....))))))).
PDB_01056
[ FASTA input ]
GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((.(((.....))).)))))
PDB_01057
[ FASTA input ]
GGACUGUCCACAAGACAGUCC
[ reference structure ]
((((((((.....))))))))
[ predicted structure ]
((((((((.....))))))))
PDB_01059
[ FASTA input ]
GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG
[ reference structure ]
((((.[[[.)))).....]]].
[ predicted structure ]
((((.....)))).........
PDB_01060
[ FASTA input ]
CUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGGCUGGGCGGCCGCCUGG
[ reference structure ]
................(((((((..)))))))((..(((())))..))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01061
[ FASTA input ]
GGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCCGGCGUGCC
[ reference structure ]
(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))(((((((())))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
PDB_01062
[ FASTA input ]
UGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGCUGCGUCGCUCCGGAAAAGUCGC
[ reference structure ]
.(((((..((((((...(((((.)))))..))))))...)))))
[ predicted structure ]
.(((....((((((................)))))).....)))
PDB_01065
[ FASTA input ]
CGCAAUUAGCGCGCAAUUAGCG
[ reference structure ]
(((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ]
(((.......))).........
PDB_01071
[ FASTA input ]
GGCCAUCUUGCUCUUCGGAGGAUUUGGCC
[ reference structure ]
(((((((.((((((..)))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((.....(((....)))....)))))
PDB_01073
[ FASTA input ]
GGCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGAUGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCA
[ reference structure ]
((((((((......(((((((((.[[[[)))...)))))).(((..((((..)))).)))....]]]]((((((..))))))...)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((.....((((((.....((((.(((........)))...))))........)))...))).(((((....)))))...)))))))).
PDB_01074
[ FASTA input ]
GCGACCGACCAUAGCUGCUGCAGCGGUCAAAGGUCGCGCGACCGACCAUAGCUGCAUGCAGCGGUCAAAGGUCGC
[ reference structure ]
.(((((((((...((((...))))))))...))))).((((((((((...((........))))))...))))))
[ predicted structure ]
((((((........((((((((.(((((...........)))))............)))))))).....))))))
PDB_01075
[ FASTA input ]
GACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUCGACGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGUC
[ reference structure ]
((((((((((((.((((((((((((((((..(((()))))))))))).))))))))))))))))..))))
[ predicted structure ]
((((.(((((((..((((((.(((((((............)))))))..)))))).)))))))...))))
PDB_01077
[ FASTA input ]
GGAUGUACUACCAGCUGAUGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCCGGCGUCCUGGUAUCCAAUCC
[ reference structure ]
(((((...((((((.......(((........)))...((((())))).)))))).))..)))
[ predicted structure ]
..............................((((((.........))))))............
PDB_01084
[ FASTA input ]
GGCCAGACUCCCGAAUCUGGCC
[ reference structure ]
(((((((........)))))))
[ predicted structure ]
(((((((........)))))))
PDB_01097
[ FASTA input ]
GGCGAUACACUAUUUAUCGCC
[ reference structure ]
((((((((.....))))))))
[ predicted structure ]
(((((((.......)))))))
PDB_01099
[ FASTA input ]
GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC
[ reference structure ]
(((((((((((..)))))))))))
[ predicted structure ]
(((..(((((....)))))..)))
PDB_01100
[ FASTA input ]
GGGCCAUACCUCUUGGGCCUGGUUAGUACCUCUUCGGUGGGAAUACCAGGUGCCC
[ reference structure ]
((((....((....))(((((((((.(((((((..))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
.((((..........))))......((((((....(((......)))))))))..
PDB_01108
[ FASTA input ]
GGCGUGAUCAAGUGAUCGCGCC
[ reference structure ]
(((((((((....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((....)))))))))
PDB_01114
[ FASTA input ]
GCGACUCGGGGUGCCCUGCGUGAAGGCUGAGAAAACCCGUAACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGAGGGAAGUCGCA
[ reference structure ]
((((((((((((((((.......))))......)))))).(((((((.((((......))))))))))))))))).
[ predicted structure ]
((((((.......((((........((((........(((...............))).)))).)))).)))))).
PDB_01117
[ FASTA input ]
GGCCUCCAGCGACGGCCUUCGGGACUAGCAAACGGAGGCC
[ reference structure ]
((((((((((((.(((((..)))))))))...))))))))
[ predicted structure ]
.............((((((((...........))))))))
PDB_01118
[ FASTA input ]
GGGUCCGCCUUGAUGCCCGGGUGAAAGCAUGAUCCCGGGUAAUAUGGCGGACCCACA
[ reference structure ]
(((((((((.....((((((((((......)))))))))).....)))))))))...
[ predicted structure ]
(((((((((....((((((((............))))))))....)))))))))...
PDB_01119
[ FASTA input ]
GGGGUGAAGGAGGCUUCGGCCGCGAAACUUCACCCC
[ reference structure ]
((((((((((.((((..)))).....))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((.....((((....)))).)))))))))
PDB_01126
[ FASTA input ]
GAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAAUCCCCUCGAGGGGAUGAAAUCCCCUC
[ reference structure ]
(((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((......)))))))(((((((.....)))))))
[ predicted structure ]
((((((((....((((((((((((((((....((((((....))))))....))))))))))))))))...))))))))
PDB_01127
[ FASTA input ]
GCCUACCCGGUAGGCUUUUCAAGCCUACCCCGGUAGGCUUUUCAA
[ reference structure ]
(((((((.))))))).......(((((((..))))))).......
[ predicted structure ]
((((((...)))))).....((((((((....)))))))).....
PDB_01128
[ FASTA input ]
CUGCCCUCAUCCGUCUCGCUUAUUCGGGGAGCGGACGAUGACCCUAGUAGAGGGGGCUGCGGCUUAGGAGGGCAG
[ reference structure ]
((((((((...((((.((((((.....))))))))))....(((((...)))))((((..))))...))))))))
[ predicted structure ]
((((((((...((((.((((.........))))))))....((((.....)))).............))))))))
PDB_01130
[ FASTA input ]
GUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAACGUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAAC
[ reference structure ]
(((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
[ predicted structure ]
((((....(((((......)))))..))))((((....(((((......)))))..))))
PDB_01133
[ FASTA input ]
GGCCUCCAAGCUGUGCCUUGGGUGGCC
[ reference structure ]
((((((((((......)))))).))))
[ predicted structure ]
((((.(((((......)))))..))))
PDB_01135
[ FASTA input ]
AUGAGGCUCACCCAUGUGAGGCUCACCCA
[ reference structure ]
(((.((....))))).((.((....))))
[ predicted structure ]
.((((.(((((....))))).))))....
PDB_01137
[ FASTA input ]
UGCGGAUCACCCAUGCGGAUCACCCA
[ reference structure ]
((.((....))))((.((....))))
[ predicted structure ]
....((((.........)))).....
PDB_01138
[ FASTA input ]
AUCGCGAUUACGGAUCGCGAUUACGG
[ reference structure ]
(((.((....)))))..((....)).
[ predicted structure ]
((((((((.....)))))))).....
PDB_01145
[ FASTA input ]
GGGCUUCACGGAUGAAGCCCGGGCUUCACGGAUGAAGCCC
[ reference structure ]
(((((((......)))))))(((((((......)))))))
[ predicted structure ]
((((((((....))))))))((((((((....))))))))
PDB_01150
[ FASTA input ]
GGAGUGGCCGAAAGGCAUCUCC
[ reference structure ]
((((..((((..))))..))))
[ predicted structure ]
((((..(((....)))..))))
PDB_01152
[ FASTA input ]
GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC
[ reference structure ]
((((((((((((..((...)).))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((............)))))))))))
PDB_01154
[ FASTA input ]
GAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUC
[ reference structure ]
(((((...((((((..))))))..)))))
[ predicted structure ]
...((((.........)))).........
PDB_01156
[ FASTA input ]
CGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGGCGGAGGAACUACUGUCUUCACGCCGCGUGUCGUGCAGCCUCCGG
[ reference structure ]
((((((.....((((((((.(((.))).)))).)))))))))).((((((.....((((((((((((.)))))))).)))))))))).
[ predicted structure ]
((((((.....(((....((((.((((((.((((........(((((........)))))..)))).)))))).))))))))))))).
PDB_01160
[ FASTA input ]
GGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAAAUCCCUCGGCGUGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGUCC
[ reference structure ]
(((..((((.........))))((((((..))))))(((..)))...((((.......)))))))
[ predicted structure ]
((((((..(((((......((((.(((......))).......))))..))))).....))))))
PDB_01162
[ FASTA input ]
AGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCGGUAGUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUC
[ reference structure ]
........................(((())))...(((((.......)))))....
[ predicted structure ]
(((.......((((((((.....))))))))....(((((.......)))))))).
PDB_01163
[ FASTA input ]
GGGACAAGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCUUGUCCC
[ reference structure ]
((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))
PDB_01164
[ FASTA input ]
CAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCGCAAGGUCAUUCGCAAGAGUGGCCUUGCG
[ reference structure ]
((((((((((((..))))))))))))((((((((((((((..))))))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((....)))))))))))(((((((((((((....)))))))))))))
PDB_01167
[ FASTA input ]
UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
(((..(((....)))..)))
PDB_01168
[ FASTA input ]
GGUUUGCCUUUUGGCUUACC
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
(((..(((....)))..)))
PDB_01178
[ FASTA input ]
GGCGUCGCUAGUACCGGGUACUAAAAGUCGCCC
[ reference structure ]
(((((((.(((((((.)))))))..))))))).
[ predicted structure ]
((((....((((((...)))))).....)))).
PDB_01194
[ FASTA input ]
GGAGCCUGGGAGCUCCCACGGUCCCAGACGUG
[ reference structure ]
((((([[[[[.)))))(((((.]]]]])))))
[ predicted structure ]
.....((((((..........)))))).....
PDB_01199
[ FASTA input ]
AUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAUAUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAU
[ reference structure ]
(((((.(((...((((.....))))))))))))(((((.(((...((((.....))))))))))))
[ predicted structure ]
.(((.((((.....))))....)))..((((...(((.((((.....))))....)))..))))..
PDB_01201
[ FASTA input ]
GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUCUUCGGCUCUUCCUA
[ reference structure ]
((((([[[[[[(((((..)))))[[[[[[)))))]]]]]]..]]]]]]
[ predicted structure ]
.....((((((((((....))))((((((.....))))))..))))))
PDB_01203
[ FASTA input ]
GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCCACUGGCUUGUGGCG
[ reference structure ]
(((((.[[[[[(((((..)))))..[[[[.))))).]]]]...]]]]].
[ predicted structure ]
.......((((((.............)))))).((((......))))..
PDB_01205
[ FASTA input ]
GGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCCGGCGUUGCCGGUCUGGCAACGCC
[ reference structure ]
(((((((((.....)))))))))(((((((((.....)))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))
PDB_01208
[ FASTA input ]
GGUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUGCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.............................))))))))))
PDB_01209
[ FASTA input ]
GGGGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGUUCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
..((((((((....................))))))))...........
PDB_01212
[ FASTA input ]
GGGUGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACGUCC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.............................))))))))))
PDB_01213
[ FASTA input ]
GCGGGUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCACUU
[ reference structure ]
..((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))
[ predicted structure ]
.(((......(((......))))))......................
PDB_01216
[ FASTA input ]
GCUGCUGUUUACCAGGUCAGGUCCGAAAGGAAGCAGCCAAGGCAGCGGC
[ reference structure ]
((((((((((....((((.((((((..)))))).)))).))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.............................))))))))))
PDB_01219
[ FASTA input ]
CGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCGCGCAAUUGGCG
[ reference structure ]
(((((((.((())))))).)))(((((((.((())))))).)))
[ predicted structure ]
(((.....((((((.....)))))).....)))(((.....)))
PDB_01237
[ FASTA input ]
GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC
[ reference structure ]
((((((((........))))))))
[ predicted structure ]
((((((((........))))))))
PDB_01251
[ FASTA input ]
GCGUUUGAAACGCGCGUUUGAAACGC
[ reference structure ]
((((((((((((()))))))))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((....)))).))))))
PDB_01260
[ FASTA input ]
GGGCUCCGGAAACCGCGGCGCGCGCUUCGCUCCCGGAGCCCACACUAGGAGCGUGCGGUUU
[ reference structure ]
(((((((((.[[[[[[((((())))).[[[[[))))))))).......]]]]].]]]]]].
[ predicted structure ]
.....(((.......)))((((((((((...................))))))))))....
PDB_01262
[ FASTA input ]
ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU
[ reference structure ]
((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
((((.....)))).......
PDB_01281
[ FASTA input ]
GCGGGAAGCGGGAAUUCCCGCUUCCCGC
[ reference structure ]
((((((([[[[[[[)))))))]]]]]]]
[ predicted structure ]
((((((((((((....))))))))))))
PDB_01299
[ FASTA input ]
GGUUAUUCAGAUUAGGUAGUCGAAUGACCUAAGAAAUUUACCU
[ reference structure ]
((((((((.((..[[[[[.)))))))))).........]]]]]
[ predicted structure ]
...........((((((.........))))))...........
PDB_01313
[ FASTA input ]
GAUCACUUCGGUGAUCACUUCGGU
[ reference structure ]
....((((((((....))))))))
[ predicted structure ]
((((((....))))))........
PDB_01325
[ FASTA input ]
CGCGAAUUCGCGCGCGAAUUCGCG
[ reference structure ]
(((((((((((())))))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((....))))))))))
PDB_01332
[ FASTA input ]
GGUGUCUUGGAGUGCUGAUCGGACACC
[ reference structure ]
(((((((..((.......)))))))))
[ predicted structure ]
((((((...............))))))
PDB_01337
[ FASTA input ]
CCGGAGGAUCACCACGGGCGGAGGAUCACCACGG
[ reference structure ]
((((.((....)))))).(((.((....))))).
[ predicted structure ]
(((...........))).................
PDB_01338
[ FASTA input ]
CCACAGUCACUGGGCAGUCACUGG
[ reference structure ]
((.(((...)))))(((...))).
[ predicted structure ]
...((((.(((....))).)))).
PDB_01340
[ FASTA input ]
UCGCCAACAGGCGGGCCAACAGGCG
[ reference structure ]
(((((....)))))(((....))).
[ predicted structure ]
.((((....))))............
RFA_00389
[ FASTA input ]
GAAAGGUCUGUGCUUAGCACACUGACGAGUUCCUGAAAUGGAACGAAACCUUUU
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))).
RFA_00390
[ FASTA input ]
GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
........(((((...)))))..(((((((.(((......)))....)))))))
RFA_00391
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUAGGCUUAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAGAUACGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
............................(((((......)))))..........
RFA_00396
[ FASTA input ]
UAAGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAAUCUCUGAAAUGAGACGAAACUCUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((........................................)))))).
RFA_00402
[ FASTA input ]
GAUGAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUAUGAAAUGAGACGAAACUCAUA
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
........(((((...)))))................(((((......))))).
RFA_00409
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCGUUGAAAUACGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
........(((((...))))).......(((((......)))))..........
RFA_00416
[ FASTA input ]
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
........(((((....))))).......(((((......)))))..........
RFA_00420
[ FASTA input ]
UCCAGUCGAGACCUGAAGUGGGUUUCCUGACGAGGCUGUGGAGAGAGCAAAUUGCUUUACUCCCGCACAAGCCGAAACUGGA
[ reference structure ]
((((((.(((((.........))))).......((((................................))))...))))))
[ predicted structure ]
((((((.((((((.......)))))).......((((..((((((((((...)))))).))))......))))...))))))
RFA_00425
[ FASTA input ]
ACAGAGUCUGACAAACCGUCACUGAAGACGUUCAACUUGCGUUGAACAGAAACUCUGC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((............))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.((((.....))))(((...(((.........)))....)))..)))))).
RFA_00427
[ FASTA input ]
UCACCGUCGGAAAGUGUGCGCUUUCCCUGAUGAGCCCGAAAGGGCGAAACGGUAC
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
..(((((...........((((((................))))))..)))))..
RFA_00429
[ FASTA input ]
GGGUGGUGUGUACCACCCCUGAUGAGUCCGAAAGGACGAA
[ reference structure ]
(((((........))))).......((((....))))...
[ predicted structure ]
(((((((....))))))).......((((....))))...
RFA_00433
[ FASTA input ]
GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00434
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCUUUGCGAUAAGGCGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((...((((.............))))(((((......))))))))))))
RFA_00436
[ FASTA input ]
CAUAAGUCUGGGCUUAGCCCACUGAUGAGUCGCUGCGAUGCGACGAAACUUAUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00440
[ FASTA input ]
GAAGAGUCCUGCGCUUAGCGCACUGACGAGUCUCUGAGAUGAGACGAAACUCUUC
[ reference structure ]
.((((((..(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((..(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00442
[ FASTA input ]
CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG
[ reference structure ]
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
RFA_00444
[ FASTA input ]
ACGCUGUCUGUACUUGUAUCAGUACACUGACGAGUCCCUAAAGGACGAAACAGCGC
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((.....))))...)))))).
[ predicted structure ]
.((((((.((((((......)))))).......((((.....))))...)))))).
RFA_00446
[ FASTA input ]
CCGGUGUCUCAAGGUGCGUACCUUGACUGAUGAGUCCGAAAGGACGAAACACCAG
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
..(((((.(((((((....))))))).......((((....))))...)))))..
RFA_00449
[ FASTA input ]
CCGCUAUAUGGGGAUGUGUGUCCCUACUGACGAGUUCAAAAGAACGAAAUAGUUA
[ reference structure ]
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
[ predicted structure ]
........((((((......)))))).............................
RFA_00583
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAGUGCAGUGGUGUUUACAACUAAUUGAUCACAACCAGUUACAGAUUUCUUUGUUCCUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGCCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.....(((((((.....((((.((((((........)))))).........)))).............))))))).......))))))))..
RFA_00584
[ FASTA input ]
AGUUGGUCCGAGUGUUGUGGGUUAUUGUUAAGUUGAUUUAACAUUGUCUCCCCCCACAACCGCGCUUGACUAGCUUG
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((.....((((((((....((((((......)))))).........)))))))).......))))))))..
RFA_00585
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.......................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((...(((((((((..........((((((........)))))).(((............)))......))))))))).....))))))))..
RFA_00586
[ FASTA input ]
GGUUGGUCCGAAAGUUGUGGGUUAUCCAAAUCAUUCAGUUAGUAUCACUAACCUUCUAUUUCACCCCACUGCUGACCUUGACUGGCCAA
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((.............................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
...((((((.........)))))).................................................................
RFA_00587
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
[ predicted structure ]
((((((((.....(((((((.((((.....(((((((......))))))).)))).....................))))))).......)))))))).
RFA_00588
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAAAGUAGUGGGUUAUCACAGAAAUUAUUACAGUUAGUUUCACUAACCUUUCUAAGUUCCACCCCACUGCUAACCUUGACUGGUCUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((....................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((....(((((((((.......(((((........((((((...)))))).))))).........)))))))))......))))))))..
RFA_00589
[ FASTA input ]
GGCUGGUCCGAUGGUAGUGGGUUAUCAGAACUUAUUAACAUUAGUGUCACUAAAGUUGGUAUACAACCCCCCACUGCUAAAUUUGACUGGCUUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((..................................................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
.(((((((...((((((((((.......(((((....(((....))).....)))))(((.....))).)))))))))).....)))))))...
RFA_00594
[ FASTA input ]
AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU
[ reference structure ]
((((((((.....(((((((...............................))))))).......))))))))..
[ predicted structure ]
((((((((...(((.((((((.(((.............))).........))))))...)))...))))))))..
RFA_00632
[ FASTA input ]
GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC
[ reference structure ]
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))).)).)))).....]]]]]]...
[ predicted structure ]
...........((((((((((........)))((((..............(((((((......))))))).....))))...)))))))..
RFA_00636
[ FASTA input ]
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA
[ reference structure ]
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
[ predicted structure ]
...((((((......(((((......))))).))))))((((...((((((((((((......)))))))).))))..........))))
RFA_00642
[ FASTA input ]
UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA
[ reference structure ]
....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
[ predicted structure ]
......................(((((........))))).................((((.........))))...
RFA_00643
[ FASTA input ]
AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU
[ reference structure ]
....(((((((((..........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ]
............................................((((((.......))))))....
RFA_00644
[ FASTA input ]
GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA
[ reference structure ]
....(((((((((.................)))...((((.(((((........)).)))))))))))))....
[ predicted structure ]
.............(((((((...........)))))))....................................
RFA_00645
[ FASTA input ]
AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA
[ reference structure ]
....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
[ predicted structure ]
............................(((((.......))))).........................
RFA_00649
[ FASTA input ]
UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU
[ reference structure ]
....(((((((((........)))...((((.(((..((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ]
...........................((((.....(((........)))..))))..........
RFA_00651
[ FASTA input ]
UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA
[ reference structure ]
....(((((((((........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
[ predicted structure ]
.....................((((..((((..(((((........)))))))))..))))....
RFA_00653
[ FASTA input ]
GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA
[ reference structure ]
....(((((((((.....)))...((((.(((...((........))..)))))))))))))....
[ predicted structure ]
....((((((......(((((((.(((................))).)))))))..))))))....
RFA_00654
[ FASTA input ]
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA
[ reference structure ]
....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((((......((((((.................))))))..........)))))..............
RFA_00658
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
...(((.(((((.((((......))))........)))))..)))...
RFA_00659
[ FASTA input ]
AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
.......(((((.(((...............))).)))))........
RFA_00664
[ FASTA input ]
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
...(((..........)))..(((((((.......)))))))...
RFA_00667
[ FASTA input ]
AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.........(((.(((((.........))))).))).........
RFA_00668
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((.......((((...............))))...))))))
RFA_00672
[ FASTA input ]
AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((())).))))))
[ predicted structure ]
......................((((((.....))))))....
RFA_00673
[ FASTA input ]
AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
.........................(((.......)))..........
RFA_00674
[ FASTA input ]
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
[ predicted structure ]
......................((((((..........))))))....
RFA_00675
[ FASTA input ]
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.......................(((((.......))))).....
RFA_00677
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
......................((((((.......))))))....
RFA_00678
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.....................(((((..........)))))...
RFA_00680
[ FASTA input ]
AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
[ predicted structure ]
.(((((((...........)))))))......................
RFA_00683
[ FASTA input ]
GCAAUACUGAAGAGUUCCACAAUAGGACGAAACGGCGAUCCAGUGU
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
...((((((....((((.......))))............))))))
RFA_00684
[ FASTA input ]
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
............(((((......))))).................
RFA_00685
[ FASTA input ]
AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
(((((...((((.......................)))).)))))
RFA_00703
[ FASTA input ]
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG
[ reference structure ]
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
[ predicted structure ]
..................................................((((((....(((...........))).....)))))).....
RFA_00704
[ FASTA input ]
AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
..........((((..(((.............)))....))))..
RFA_00705
[ FASTA input ]
AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
((((((..((((.((((.......))))........))))))))))
RFA_00706
[ FASTA input ]
CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
..(((.......))).........(((((.......))))).....
RFA_00707
[ FASTA input ]
GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
........................(((((.......))))).....
RFA_00708
[ FASTA input ]
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
...................((((.(((...........))))))).
RFA_00709
[ FASTA input ]
AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.........((((((((.........)))....))))).......
RFA_00710
[ FASTA input ]
AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
(((.........(((..........)))(((((....))))))))
RFA_00711
[ FASTA input ]
CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC
[ reference structure ]
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.((((.......)))).(((....(((((.......))))).))).
RFA_00715
[ FASTA input ]
GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
.....................((((((.......))))))....
RFA_00716
[ FASTA input ]
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU
[ reference structure ]
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
[ predicted structure ]
....................(((((((.......)))))))...
RFA_00717
[ FASTA input ]
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
[ predicted structure ]
.......................(((((......)))))....
RFA_00720
[ FASTA input ]
GCCCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUUGACUCUACGGGGC
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
((((((((((.....))))...(((.(((.....)))..))).))))))
RFA_00721
[ FASTA input ]
GCGCCGCUGAUGAGGUCAGGGAAGACCGAAAGUGUCGACUCUAUGGGGC
[ reference structure ]
((((((.......((((......))))...((((....)))).))))))
[ predicted structure ]
....((((.....((((......))))...))))...............
RFA_00730
[ FASTA input ]
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.....(((......)))(((......)))..............
RFA_00731
[ FASTA input ]
GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((..((((...)))).(((..........))).))))))
RFA_00733
[ FASTA input ]
GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
............................(((((.....)))))
RFA_00734
[ FASTA input ]
CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.(((((.....(((((...........))))).....))))).
RFA_00736
[ FASTA input ]
GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((.(((....)))(((......)))........))))))
RFA_00737
[ FASTA input ]
ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((...(((...)))..(((..........))).))))))
RFA_00745
[ FASTA input ]
ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
..(((((..........(((.......))).)))))........
RFA_00749
[ FASTA input ]
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((.(((....)))(((......)))........))))))
RFA_00758
[ FASTA input ]
CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
...............................(((.....))).
RFA_00762
[ FASTA input ]
CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.....(((((....))))).((((........)))).......
RFA_00763
[ FASTA input ]
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
.....(((.........))).......(((..........)))
RFA_00764
[ FASTA input ]
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((...........(((......)))........))))))
RFA_00765
[ FASTA input ]
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC
[ reference structure ]
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
[ predicted structure ]
((((((...(((...)))..(((..........))).))))))
RFA_00767
[ FASTA input ]
GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
...........................(((((((((.............)))))))))....
RFA_00768
[ FASTA input ]
ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
...........................((((((((((...........))))))))))....
RFA_00769
[ FASTA input ]
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
.(((.(((((........)))))))).((((((((((...........)))))))))).....
RFA_00770
[ FASTA input ]
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA
[ reference structure ]
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
..........................((((((((((((............))))))).))))).
RFA_00773
[ FASTA input ]
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
[ predicted structure ]
...........................((((((((((...........)))))))))).....
RFA_00779
[ FASTA input ]
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA
[ reference structure ]
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
[ predicted structure ]
...........................(((((((((.............))))))))).....
RFA_00808
[ FASTA input ]
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU
[ reference structure ]
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
[ predicted structure ]
(((.......)))...........(((((((((...............))))))))).......
RFA_00809
[ FASTA input ]
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG
[ reference structure ]
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
[ predicted structure ]
.....((((......))))......((((((((((..............)))))))))).......
SPR_00007
[ FASTA input ]
GGAGCCUUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00009
[ FASTA input ]
GGGGGCAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCGCGCUCCCACCA
[ reference structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))..))))))....
SPR_00010
[ FASTA input ]
GGGGCUAUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCUGCUUUGCACGCAGGAGGUCUGCGGUUCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
................(((....(((...........))).((((...(((((.......)))))...)))).)))
SPR_00012
[ FASTA input ]
GGGCGUGUGGCGUAGUCGGUAGCGCGCUCCCUUAGCAUGGGAGAGGUCUCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ]
(((((....(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))))....
SPR_00013
[ FASTA input ]
GGGCGUGUGGCGUAGUUGGUAGCGCGUUCGCUUAGCAUGCGAAAGGUCUCCGGUUCGACUCCGGACUCGUCCACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
[ predicted structure ]
(((((....(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))))....
SPR_00016
[ FASTA input ]
GGGGGAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUCCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00017
[ FASTA input ]
GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUCGAUGCCCGCAUUCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00020
[ FASTA input ]
GGCGCGUUAACAAAGCGGUUAUGUAGCGGAUUGCAAAUCCGUCUAGUCCGGUUCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..............(((......(((((((((...)))))).))).(((((.......))))).))).......
SPR_00022
[ FASTA input ]
GCGACCGGGGCUGGCUUGGUAAUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAGAAUGUGGGUUCAAAUCCCAUCGGUCGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....................(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
SPR_00023
[ FASTA input ]
GCCCGGGUGGUGUAGUGGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCUCGGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((........))))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
SPR_00025
[ FASTA input ]
GGCCCCGUGGUGUAGUUGGUUAACACACCCGCCUGUCACGUGGGAGAUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCGGGGCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.(((....))))))))............((((..(((......))).))))..)))))))....
SPR_00026
[ FASTA input ]
GGAGCGGUAGUUCAGUCGGUUAGAAUACCUGCCUGUCACGCAGGGGGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCCGUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.........(((........(((((.......)))))...(((......)))...))).)))))))....
SPR_00027
[ FASTA input ]
GGGAUUGUAGUUCAAUUGGUCAGAGCACCGCCCUGUCAAGGCGGAAGCUGCGGGUUCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.............(((....(((((.......)))))...)))((((.......)))).)))))))....
SPR_00029
[ FASTA input ]
AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
....................(((((((..(((((((..........))))))).....)))))))........
SPR_00030
[ FASTA input ]
AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
[ predicted structure ]
........................(((((.......)))))..............................
SPR_00032
[ FASTA input ]
AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........................(((((((...)))))))...((((((......))))))..........
SPR_00033
[ FASTA input ]
AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........................(((((.......)))))...((((((.......))))))..........
SPR_00034
[ FASTA input ]
AAGAUAUUAGUAAAAUCAUUACAUAACUUUGUCAGAGUUAAAUUAUAGACUAAUCUCUAUAUAUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
....................(((......)))...........((((((......))))))..........
SPR_00036
[ FASTA input ]
UCUUCGGUAGUAUAGUGGUAAGUAUGUCCGCCUGUCACGCGGAAGACACGGGUUCAAUUCCCGGCCGGAGAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....(((........))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
SPR_00044
[ FASTA input ]
GGCCUGUUGGUGAAGCGGUUAACACACACGGUUUUCAUCCGUGGACACACGGGUUCGAACCCCGUACAGGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..(((..............(((((.......)))))..)))(((((.......))))))))))).....
SPR_00045
[ FASTA input ]
GUCCCCUUCGUCUAGAGGCCCAGGACACCGCCCUUUCACGGCGGUAACAGGGGUUCGAAUCCCCUGGGGGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...(((...........)))((((((.......))))))..((((((.......))))))))))))....
SPR_00060
[ FASTA input ]
UCCCAUAUGGUCUAGUGGCUAGGAUAUCUGGCUUUCACCCAGAAGGCCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((....((((((((.....)))))...))))))......(((((.......))))))))))))....
SPR_00064
[ FASTA input ]
GGUCGUGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGCAGACUGAAGCUCUGCGUGUCGGCGGUUCAAUUCCGUCCACGACCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...........(((((((...........))))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00065
[ FASTA input ]
GGCUCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACGGACUGAAAAUCCGUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.....(((.((((.............(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))).))).
SPR_00066
[ FASTA input ]
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
SPR_00068
[ FASTA input ]
GCCCGGGUAGCUCAGCUGGUAGAGCACGUGACUGAAAAUCACGGUGUCGGUGGUUCGACUCCGCCCCCGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00070
[ FASTA input ]
GGCUCGGUAGCUCAGUCGGUAGAGCAAAGGACUGAAAAUCCUUGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
....(((((((((........)))).(((((.......))))).)))))..((((((.........))))))....
SPR_00074
[ FASTA input ]
UGCUUAAGUAGCUCAGUGGUAGAGCGUCAGGCUGAAAACCUGAAGGUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((..((((.......)))).(((((.......))))).......(((.......)))..))))))))...
SPR_00078
[ FASTA input ]
ACUCUGUUAGUUUAUGUUUUAAAAUAUGACUUUGAAGAAGUUGGAAAAUGUUAGGAGUGCCA
[ reference structure ]
(((((....((((........)))).(((((.......)))))....(..)..)))))....
[ predicted structure ]
............................((((.....)))).....................
SPR_00079
[ FASTA input ]
AGUUAAUGUAGCUUAUAAUAAAGCAAAGCACUGAAAAUGCUUAGAUGGAUUCAAAAAUCCCAUAAACACCA
[ reference structure ]
.(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
[ predicted structure ]
......(((...........(((((............)))))..((((...........))))..)))...
SPR_00080
[ FASTA input ]
GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA
[ reference structure ]
(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
[ predicted structure ]
(((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).)))....
SPR_00086
[ FASTA input ]
GCCGACUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCUGGUUCGAUCCCGGGAGUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....(((((..............))))).((((....))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00087
[ FASTA input ]
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
.........((((........)))).(((((.......))))).(((.(((((.......)))))..)))......
SPR_00088
[ FASTA input ]
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
................(((....((((((((.......))))).....(((((.......)))))....))).)))
SPR_00089
[ FASTA input ]
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
.........((((........)))).(((((.......))))).(((.(((((.......)))))..)))......
SPR_00090
[ FASTA input ]
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCACGUGUUCGAUCCACGUUCACCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
................(((..((((((.........((((.(((.........))))))).))))))......)))
SPR_00091
[ FASTA input ]
GCGGGGAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUCAGACUGAAGAUCUGAAGGUCGCGUGUUCGAUCCACGCUCACCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
((((.(((...(((((..............)))))..)))(((.....(((((.......))))))))))))....
SPR_00095
[ FASTA input ]
GCCGAAAUAGCUCAGUUGGGAGAGCGUUAGACUGAAGAUCUAAAGGUCCCCGGUUCAAUCCCGGGUUUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00111
[ FASTA input ]
GCAGGUGUAGUUUAAUGGCAGAACUUCAGCCUUCCAAGCUGAUUGUGAGGGUUCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.((((.........))))..((((((((((.....))).)))))))..........)))))))....
SPR_00112
[ FASTA input ]
GCGGGUGUAGUUCAAUGGUAGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGAGCGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
SPR_00113
[ FASTA input ]
GCGGGAGUAUUUCAACUUUUAGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAGAUAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((...(((........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00114
[ FASTA input ]
GCGGGAGUAGUUCAAUUUUAGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAGGUAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00115
[ FASTA input ]
GCGGGUGUAGUUUAGUGGUAAAACCUCAGCCUUCCAAGCUGAUGUCGUGAGUUCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((.....(((...)))(((((.......))))).............))).....)))))))....
SPR_00116
[ FASTA input ]
GCGGGCGUAGUUCAAUGGUAGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAUACGAGGGUUCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
SPR_00117
[ FASTA input ]
GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).)))))))....
SPR_00121
[ FASTA input ]
GCAGUACUGGUGUAAUGGUUAGCGCCUUAGAUUUCCAAUCUAAAGGUAGGGGUUCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.((((..........))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00124
[ FASTA input ]
AUUCUUUUAGUAUUAACUAGUACAGCUGACUUCCAAUCAGCUAGUUUCGGUCUAGUCCGAAAAAGAAUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......................((((((.......))))))..((((((......))))))..........
SPR_00126
[ FASTA input ]
GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..)))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((((((((.(((........))).......)))).))))).......................
SPR_00127
[ FASTA input ]
AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA
[ reference structure ]
((((((....(.(..).)..(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
[ predicted structure ]
.............(((((((((((.........)))))))))))..........................
SPR_00137
[ FASTA input ]
GUCCGGGUUGGGGUAGUGGACUAUCCUUCAGCCUUGUGGAGGCUGAGACGCGGGUUCAAUUCUCGCACCUGGACCCA
[ reference structure ]
.(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((..((((((((............)))))))).............)))..(((((((...........))))))).
SPR_00138
[ FASTA input ]
GGCGUAGGUGGUGAAGUGGUUAACACAUCAGGUUGUGGCUCUGACAUACGCGGGUUCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA
[ reference structure ]
.(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...(((..........))).((((.........))))......((((.......))))..)))))))...
SPR_00139
[ FASTA input ]
GGUGGCUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCCCUGGAUUGUGAUUCCAGUUGUCGUGGGUUCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.....(((((((....................)))))))...((((.......)))).))))))))...
SPR_00141
[ FASTA input ]
GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.((((..............((((.......)))).))))(((((.......)))))))))))))...
SPR_00142
[ FASTA input ]
GACUAAAGUAGUUUAAAUAAAACCCUAAUUUGUGGUAUUAAAAUUAUCAGUUAAAAUCUGAUCUAUAGUCCCA
[ reference structure ]
.((((.((..((((.....))))..((((.......)))).....(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
.....................(((.........))).........(((((.......)))))...........
SPR_00153
[ FASTA input ]
CGGAAUAUAGCUCAGCUGGUUAGAGCAUUCCGCUGAUAACGGAGAGGUCGUUGGUUCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((.........)))))))))).(((.((((.......))))...)))...................
SPR_00155
[ FASTA input ]
GGACCUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAGACGGCUCAUAACCGUCCGGUCGUAGGUUCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((...((((.........))))..(((((.............)))))))))))....................
SPR_00156
[ FASTA input ]
GGGCGAUUAGCUCAGCUGGUUAGAGCGCACGCCUGAUAAGCGUGAGGUCGGUGGUUCAAGUCCACCAUCGCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((....((((.........))))...))))........(((....(((((((........)))))))..)))..
SPR_00163
[ FASTA input ]
GAAACUAUAAUUCAAUUGGUUAGAAUAGUAUUUUGAUAAGGUACAAAUAUAGGUUCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..(((((.........)))))...........................(((((.......)))))...........
SPR_00164
[ FASTA input ]
GGGCUUAUAGUUUAAUUGGUUGAAACGUACCGCUCAUAACGGUGAUAUUGUAGGUUCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
............................((((.......))))......(((((((............)))))))..
SPR_00166
[ FASTA input ]
AAUGAAUUGCCUGAUAAAAAGGAUUACCUUGAUAGGGUAAAUUAUAAAGAUUUAAUACUUUAUUCAUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
[ predicted structure ]
.........(((.......))).............(((((...((((((........))))))...))))).
SPR_00167
[ FASTA input ]
AGAAAUAUGUCUGACAAAAGAGUUACAUUGAUAGUGUAAAUAAUAGAGGUUCAAACCCUCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
............................................(((((.......)))))...........
SPR_00176
[ FASTA input ]
GUCUGAUUAGCGCAACUGGCAGAGCAACUGACUCUUAAUCAGUGGGUUGUGGGUUCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((.(........).)).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
................(((.......(((((.......)))))....((((((.......)))))).......)))
SPR_00177
[ FASTA input ]
GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((......(((((((......)))))))...............(((((.......))))))))))))....
SPR_00178
[ FASTA input ]
GAGCCAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUCUGACUUUUAAUCAGAGGGUCGAAGGUUCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((.....))))...((((.((((....((((((.......))))))(((((.......)))))...))))))))
SPR_00183
[ FASTA input ]
CUUUGAUAAGCUUAUAAUGGCAAGCAUUAAACUCUUAAUUUAAAUCAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((........)))))))))).................((((.........))))...........
SPR_00191
[ FASTA input ]
GCCUUGUUGGCGCAAUCGGUAGCGCGUAUGACUCUUAAUCAUAAGGUUAGGGGUUCGAGCCCCCUACAGGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((......))))..)))))))....
SPR_00200
[ FASTA input ]
GCCCGGCUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUGAGACUCUUAAUCUCAGGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGUUGGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..((((((.....)))))).......(((((.......)))))....((((((.......))))))..........
SPR_00209
[ FASTA input ]
GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((........))).....(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
SPR_00213
[ FASTA input ]
GCGGGGGUGGCUGAGCCAGGCCAAAAGCGGCGGACUUAAGAUCCGCUCCCGUAGGGGUUCGCGAGUUCGAAUCUCGUCCCCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.............)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((........))))..(((((............)))))......((((((((......))))))))..)))))))....
SPR_00215
[ FASTA input ]
GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((.....)))................(((((.......)))))............((((((.......))))))..........
SPR_00218
[ FASTA input ]
GCGGGUGUGCGGGAAUUGGUAGACCGGCUAGAUUCAGGAUCUAGGGUCUUUAUGGACCUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
......(((((((....((((((((..((((((.....)))))))))))......)))((((((........)))))))))))))..
SPR_00219
[ FASTA input ]
GCCCGGAUGGUGGAAUCGGUAGACACAAGGGAUUUAAAAUCCCUCGGCGUUCGCGCUGUGCGGGUUCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..(((...........)))..(((((((.......((((..............))))...)))))))..)))))).....
SPR_00220
[ FASTA input ]
GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
[ reference structure ]
((((.((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))).))))....
[ predicted structure ]
.........................(((((((.......))))))).............(((((........)))))..........
SPR_00221
[ FASTA input ]
GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((.......(((((......(((((((.......))))))).))))).......(((((.......))))))))))).....
SPR_00223
[ FASTA input ]
GCCUUUGUAGCGGAAUGGUAACGCGGCAGACUCAAAAUCUGCUUUGGUAACCCAGGUGGUAGUUCGACUCUCCCCAAAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))..............((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...((((.(((.......(((((.......))))).........)))........))))........)))))))....
SPR_00224
[ FASTA input ]
GGGCAAGUGGCGGAAUUGGUAGACGCAGCAGACUCAAAAUCUGCCGCUAGCGAUAGUGUGUGGGUUCGAGUCCCACCUUGCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.....(((((((((.(((................)))..))))))))).......(((.(((((.......)))))......)))..
SPR_00225
[ FASTA input ]
GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........(((((((((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))....(((((.......))))).))))))....
SPR_00226
[ FASTA input ]
GCCGAUGUGGCGGAAUUGGCAGACGCGCACGACUCAAAAUCGUGUGGGCUUUGCCCGUGUGGGUUCGACUCCCACCAUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..........((((((..(((((((.......)))))))...))))))...(((((.......))))))))))))....
SPR_00227
[ FASTA input ]
GCCUUGGUGGUGAAAUGGUAGCCACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUACAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((.............((((.(((((((.......)))))))((((.....)))).))))...........))))))....
SPR_00228
[ FASTA input ]
GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((...........))))).((((((..(((((....................))))).))))))...)))))))....
SPR_00229
[ FASTA input ]
GCCGCUAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCUGCUCUUAGGAAGCAGUGCUAGAGCAUCUCGGUUCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
SPR_00230
[ FASTA input ]
GGCUUGAUGGUGAAAUUGGUAGACACGCGAGACUCAAAAUCUCGUGCUAAAGAGCGUGGAGGUUCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......((((((..(((..(((.......(((((..((((((...............)))))).))))).))).))).))))))
SPR_00235
[ FASTA input ]
AUAGGUGUGCUGGAAUUGGUAGACAGGUUCCGUUUAGGCCGGAAUGGUUUAAAAACUGUACAAGUUCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((........))).((((......((((((((.....))))))))..))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00236
[ FASTA input ]
GCUAUUUUGGUGGAAUUGGUAGACACGAUACUCUUAAGAUGUAUUACUUUACAGUAUGAAGGUUCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......(((((..(((...........................((((....))))((((((.......)))))))))..)))))
SPR_00246
[ FASTA input ]
ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
..((((...(((((......))))).(((((.......))))))))).((((((..............))))))
SPR_00263
[ FASTA input ]
GGAGAGAUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGCUGGUUUAAGGCACCAGUCCCUUCGGGGGCGUGGGUUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((.........((((..(((((.......)))))..))))....)))(((((.......))))))))))))....
SPR_00271
[ FASTA input ]
GCCGGGGUGGCUCAGCUGGAGGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCUCGGGUUCGAUCCCCGAUCCCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((...(((.....))))))............(((.((((........)))).)))))))))))....
SPR_00273
[ FASTA input ]
GGCGGUGUAGCUCAGCGGCUAGAGCGUACGGUUCAUACCCGUGAGGUCGGGGGUUCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))).....
SPR_00276
[ FASTA input ]
GCCUAUUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCAUCCGUCUCAUACGCGGGAAGUGACUAGUUCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))..(((.........)))......(((((.......))))))))))))....
SPR_00277
[ FASTA input ]
GCCUGCUUAGCUCAGUUGGCCAGAGCAUCCGUUUCAUACGCGGAAAGUCACUAGUUCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00279
[ FASTA input ]
GCUUGUAUAGUUUAAUUGGUUAAAACAUUUGUCUCAUAAAUAAAUAAUGUAAGGUUCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))((((((.......)))))).....((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
..................................................((((.......))))............
SPR_00281
[ FASTA input ]
AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....))))))))....
[ predicted structure ]
..........................((((.......)))).......................
SPR_00289
[ FASTA input ]
GGUUCCUUAGCUCUAAUGGUUAGAGCCGCAUCUUGUUAAGUUGAGGGUUGCUGGUUCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.................((((........(((((.........)))))((((((.......))))))..))))....
SPR_00294
[ FASTA input ]
UCCUCUGUAGUUCAGUCGGUAGAACGGCGGACUGUUAAUCCGUAUGUCACUGGUUCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..........((((..((((............)))).))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00295
[ FASTA input ]
UUCACAGUAGCUCAGUGGUAGAGCUAUCGGCUGUUAACCGAUCGAUCGUAGGUUCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........................(((((.......)))))...((((((((.........)))))))).....
SPR_00297
[ FASTA input ]
UGAGUUGUAGCCUAGUGGAAAGGCGUUUGGCCGUUAACUAAAAGAUAGCAAGAUCAAUACUUGCCAGCUCAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00298
[ FASTA input ]
UGGGUUGUAGCCUAAUGGAAAGGCAAUUGGCCGUUAACCAGGAGAUAACAAGAUCAAUACUUGUCAACUCAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......))))...(((.......))).......(((((.......))))))))))))....
SPR_00309
[ FASTA input ]
CUCCGAUUAGCUCAAUUGGCUAGAGUACACCGUUUGGGGCGGUGGGGUUGAAGGUUCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..((((((.....))))))........(((((.......)))))....((((((.......))))))..........
SPR_00314
[ FASTA input ]
CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).((((((.....))))))......((((.......)))).)))))))....
SPR_00315
[ FASTA input ]
CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGUAGAGCACAUGGUUUGGGACCAUGGGGUCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))..((((....(((((...........))))).....)))))))))))....
SPR_00316
[ FASTA input ]
CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGUAGCGCACUUCGUUCGGGACGAAGGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUAUCACCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))................((((((((......)))..))))))))))))....
SPR_00317
[ FASTA input ]
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCCUGGGGUUGCGGGGGUCGGAGGUUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...(((((((.(((.....))).......))))))).......((((.......)))).)))))))....
SPR_00318
[ FASTA input ]
CGGCGAGUAGCGCAGCUUGGUAGCGCAACUGGUUUGGGACCAGUGGGUCGGAGGUUCGAAUCCUCUCUCGCCGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).((((((.....))))))((((...........))))...)))))))....
SPR_00320
[ FASTA input ]
CAGAUAGAAGCCAAAAGGUCAGGCGCUUUCUUUGGGAGAAAGACCUAGUUAGUUCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((.............))))(((((.....)))))..(((...........)))..)))))))....
SPR_00321
[ FASTA input ]
CGAGGUGUAGCGCAGUCUGGUCAGCGCAUCUGUUUUGGGUACAGAGGGCCAUAGGUUCGAAUCCUGUCACCUUGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.................((((((.....(((((.......))))).......((((............))))))))))
SPR_00327
[ FASTA input ]
UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGUCGAGAUCAUUGGUUCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA
[ reference structure ]
.((((((..((((...........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((.(((((...........)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
SPR_00329
[ FASTA input ]
AGUCCCAUGGGGUAGUGGCCAAUCCUGUUGCCUUCUGGGGGCAACGACCCAGGUUCGAAUCCUGGUGGGACUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((........))).....((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
SPR_00331
[ FASTA input ]
UGGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00333
[ FASTA input ]
UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00339
[ FASTA input ]
GGUUCUAUGGUGUAGUGGUUAGCACUCUGGACUUUGAAUCCAGCGACCUGGGUUCGACUCCCGGUAGGACCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((......((((.....))))((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
SPR_00352
[ FASTA input ]
GCCCAUGUAGCUCAGUAGGAUAGAGCACGCGCCUUCUAAGCGUGAGGUCGGAAGUUCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........(((((........((((((((.........)))))((((((......))).))).))).)))))....
SPR_00353
[ FASTA input ]
GCGCCCGUAGCUCAAUGGAUAGAGCGUUUGACUACGGAUCAAAAGGUUAGGGGUUCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.((((............))))))))))...........(((((.......))))).....))))..
SPR_00356
[ FASTA input ]
GUCCUCUUAGUUAAAUGGAUAUAACGAGCCCCUUCUAAGGGCUAAUUGCAGGUUCGAUUCCUGCAGGGGACACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..........................(((((.......)))))...((((((.......))))))..........
SPR_00357
[ FASTA input ]
GCGCCCUUAGCUCAGUUGGAUAGAGCAACGACCUUCUAAGUCGUGGGCCGCAGGUUCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00358
[ FASTA input ]
GCGCCCGUAGCUCAGCUGGAUAGAGCGCUGCCCUCCGGAGGCAGAGGUCUCAGGUUCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..............(((...(((((.......)))))...)))((((.......)))).)))))))....
SPR_00359
[ FASTA input ]
GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.........)))))........((((((...........))))))........)))))))....
SPR_00360
[ FASTA input ]
AUAUCUUUAAUUUAAUGGUAAAAUAUUAGAAUACGAAUCUAAUUAUAUAGGUUCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........................((((((.......))))))..((((((.......))))))..........
SPR_00362
[ FASTA input ]
GACAAAUGUUUUCAGGUCUUCUAAAUCUGUUUUGGAGAAAUCCGUUUGUUUCCA
[ reference structure ]
(((((((............((((((.....)))))).......)))))))....
[ predicted structure ]
.(((((((....(((((.......)))))(((.....)))..))))))).....
SPR_00363
[ FASTA input ]
GGACGUUAAAUAGAUAAGCUAUGCCUAGUUACGGGCUGGGAAGAGAGUCGUCUUCCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((.....)))).(((((.......)))))......).)))))....
[ predicted structure ]
......................(((........)))..((((((......)))))).
SPR_00364
[ FASTA input ]
AAAUAUGAAGCGAUUUAUUGCAAUUAGUUUCGACCUAAUCUUAGGUGAAAUUCACCCAUAUUUUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((....)))).(((((.......)))))....((((.....)))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...(((................)))(((((....)))))..........)))))))....
SPR_00365
[ FASTA input ]
AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ]
.(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......................((((((.......)))))).((((((((....)))))))).........
SPR_00366
[ FASTA input ]
UGGUACUUAGUUUAAAAUAAAAUAAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUUUAAUUCAUAAUUACCAACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((......)))).(((((.......)))))....(((((......)))))).)))))....
[ predicted structure ]
(((((...................(((((.......)))))..(((((((......))))))))))))....
SPR_00367
[ FASTA input ]
UGGUGAUUAGUUUAACUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGACAUAUCUCAUAAUCACCAACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((..................((((((.......))))))((((((((......))))))))....))))
SPR_00369
[ FASTA input ]
GCUCGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00370
[ FASTA input ]
GCUUGCGUGGCGUAAUGGCAACGCGUCUGACUUCUAAUCAGAAGAUUAUGGGUUCGACCCCCAUCGUGAGUCCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00373
[ FASTA input ]
GACCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUCAGCCUCCGGAGCUGGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGUCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))..((((.......))))((((((.........))))))..)))))))....
SPR_00374
[ FASTA input ]
GCCCCAGUGGCCUAAUGGAUAAGGCAUUGGCCUCCUAAGCCAGGGAUUGUGGGUUCGAGUCCCAUCUGGGGUCCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((((((((.((((((.......))))))(((........))).................))).)))))).....
SPR_00385
[ FASTA input ]
GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGAGAGUCGGGGAAACCCGAGCGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))...................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
................((((((.......(((((.......))))).))))))..........(((((((..............)))))))..
SPR_00386
[ FASTA input ]
GGAGGAAUACCCAAGUCUGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGACAGGGUGUCAAAGCCCGCGGGGGUUCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.............))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.............................(((((.......)))))..(((........)))(((((((..............)))))))..
SPR_00388
[ FASTA input ]
GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((......)))(((((((((......(((((((...)))))))....)))))).........((((((.......))))))))).......
SPR_00389
[ FASTA input ]
GGAGAGAUGCCGGAGCGGCUGAACGGACCGGUCUCGAAAACCGGAGUAGGGGCAACUCUACCGGGGGUUCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((................(((((.......)))))......))))........(((((.......))))))))))))....
SPR_00390
[ FASTA input ]
GGUGAGGUGGCCGAGAGGCUGAAGGCGCUCCCCUGCUAAGGGAGUAUGCGGUCAAAAGCUGCAUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))....................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.......((((((.(((..........)))((((....))))......))))))...........(((((.......)))))...........
SPR_00391
[ FASTA input ]
GGUGAGGUGUCCGAGUGGCUGAAGGAGCACGCCUGGAAAGUGUGUAUACGGCAACGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
...............((((...(((..(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......))))))))....))))
SPR_00393
[ FASTA input ]
GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((......((((.......(((((.......))))).....((((............)))))))).))))))))))....
SPR_00394
[ FASTA input ]
GGAAAAUUAACUAUAGGUAAAGUGGAUUAUUUGCUAAGUAAUUGAAUUGUAAAUUCUUAUGAGUUCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((........))).((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........................................................((((((.......))))))..........
SPR_00395
[ FASTA input ]
GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).................(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....(((.(((((((((........)))))))))))).(((((......))))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00398
[ FASTA input ]
GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA
[ reference structure ]
(.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
[ predicted structure ]
..............(((((((..........)))))))((((((.......))))))..........
SPR_00399
[ FASTA input ]
AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((...)))(((((((((.......)))))))))(((((.........))))))))))))....
SPR_00402
[ FASTA input ]
GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA
[ reference structure ]
(((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).....
SPR_00412
[ FASTA input ]
GUUAAUGUGGCCCGAGUGGUUAAGGCGCUUCCCUGCUAAGGAAGUGGGCUCUGCCCGAGCAGGUUCGAAUCCUGUCAUUAACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((..(((.........(((((((.......)))))))..))).)))....((((.......)))).)))))))....
SPR_00414
[ FASTA input ]
GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUUGAAAUCUGUUGGGCUUCGCCCGCGCAGGUUCGAACCCUGCUGUCGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((.......)))............(((((.......)))))..(((.(((.....(((((.......)))))...))).))).
SPR_00415
[ FASTA input ]
GUCGAUAUGUCCGAGUGGUUAAGGAGACAGACUCGAAAUCUGUUGGGCUUUGCCUGCGCAGGUUCGAAUCCUGCUGUCGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..............(((..(((((.......))))).........)))..(((((.......))))))))))))....
SPR_00416
[ FASTA input ]
GUCGCCUUGGCCGAGUGGUUAAGGCGUGUGCCUGCUAAGUACAUGGGGUUUCCCCGCGAGAGUUCGAAUCUCUCAGGCGACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..((((((((((....)))))))))).................(((........((((((((.......)))))..)))...)))
SPR_00417
[ FASTA input ]
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUUUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((.((((((.............)))))).)))........((((((.........(((((.......))))).))))))....
SPR_00418
[ FASTA input ]
GUGGACGUGCCGGAGUGGUUAUCGGGCAUGACUAGAAAUCAUGUGGGCUCUGCCCGCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGUCCACGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...............((((((...(((.........)))....)))))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00426
[ FASTA input ]
AAGAAAGAAGCAUUAAGUGGUUUGAUGCGGUUGGCUUGAAACCAACAUGUGAGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((((((.....))))))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00434
[ FASTA input ]
GCUGACUUAGCUCAGCAGGCAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
SPR_00435
[ FASTA input ]
GCCGGUGUAGCUCAAUUGGUAGAGCAACUGACUUGUAAUCAGUAGGUUGGGGGUUCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((....((((........)))).(((((.......)))))((((((......)))..)))....)))))....
SPR_00436
[ FASTA input ]
GCUGAUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCGGCAGUUCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00437
[ FASTA input ]
GCUGAUAUGGCUCAGUUGGUAGAGCGCACCCUUGGUAAGGGUGAGGUCCCAGUUCGACUCUGGGUAUCAGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00438
[ FASTA input ]
GCCCCUUUAACUCAGUGGUAGAGUAACGCCAUGGUAAGGCGUAAGUCAUCGGUUCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00439
[ FASTA input ]
GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).((((.........))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......)))).....((((((.....))))))((((((.....)))))))))))))....
SPR_00445
[ FASTA input ]
GGGUCGGUGGUCUAGUCCGGUUAUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAGGUCGGCGGUUGAACUCCGCCCCGACCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((......))))).(((.(((((.......)))))..)))(((((.......))))))))))))....
SPR_00452
[ FASTA input ]
GGAGGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCAUCUGCCUUACAAGCAGAGGGUCGGCGGUUCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..(((....((((........)))).....)))........((((((.(((((.......))))))))))).....
SPR_00455
[ FASTA input ]
GGGUGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCACCUCCCUUACAAGGAGGGGGUCGGCGGUUCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........))))((((((..........)))))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00456
[ FASTA input ]
GAUUCCGUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCACCUUGACAGGGUGGAGGUCGCUGGUUCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((........(((((.((((.(((((((...))))))).........))))...))))).)))))))....
SPR_00458
[ FASTA input ]
GAGAGAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACCGUUUUACACACGGAAGGUUGGGUGUUCGAAUCACCCAUUUCUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.........((((........))))..((((.......)))).....((((((.......))))))..........
SPR_00459
[ FASTA input ]
CAAUUUAAAGCUUAAUUAGUAAAGUAUUUCAUUUACAUUGAAAAGAAAUUUGUGCAAAUCAAUUUAAAUUGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(.(((.......))).))))))))....
[ predicted structure ]
..........................(((((.......)))))................................
SPR_00461
[ FASTA input ]
ACAGAUUGUAGCUUAAUCACAAAGCAUCUGGCCUACACCCAGAAGAAUUCAUAAAAAUGAACACUUUGACCA
[ reference structure ]
.((((.((..((((.......)))).(((((.......)))))....((((......)))))).))))....
[ predicted structure ]
..........((((.......)))).(((((.......))))).............................
SPR_00462
[ FASTA input ]
CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.....)))).((.((.......)).))....((((.......)))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).............))))))))....
SPR_00467
[ FASTA input ]
GGUUUCGUGGUGUAGUGGUUAUCACGUCAGUCUAACACACUGAAGGUCUCCGGUUCGAGUCCGGGCGAAGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((..((((((..........))))))..............))))).((((.......))))............
SPR_00476
[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........(((((.........)))))(((((((....(((....)))((((.......))))..)))))))...
SPR_00478
[ FASTA input ]
AGGAGAGUAGUUCAAUGGUAGAACGUCGGUCUCCAAAACCGAGCGUUGAGGGUUCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
...............(((((((((((((((.......))))).))))(((((............)))))))))))
SPR_00479
[ FASTA input ]
AGGGGCAUAGUUCAGUAGGUAGAACAUCGGUCUUCAAAACCGAGUGUCACGAGUUCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((................((((((((.......))))).))).(((((.......))))))))))))....
SPR_00481
[ FASTA input ]
AGGGGUGUAGUUUAAUGGUAGAACAGCGGUCUCCAACACCGUACGUUGUGGGUUCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.............((((..((((.......))))..........)))).........)))))))....
SPR_00482
[ FASTA input ]
AGGGGCAUAGUUUAACGGUAGAACAGAGGUCUCCAAAACCUCCGGUGUGGGUUCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00483
[ FASTA input ]
AGGGGCGUAGUUCAAUUGGUAGAGCACCGGUCUCCAAAACCGGGUGUUGGGAGUUCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00487
[ FASTA input ]
GGGGGAAUAGUUUAAUGGUAGAACAACGGUCUUCAAAAUCGUUAGCGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
...............(((.((((...(((.......(((((............))))).))).))))....)))
SPR_00489
[ FASTA input ]
AAGGAUAUAGUUUAAUGGUAAAACAGUUGAUUUCAAAUCAAUCAUUAGGAGUUCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......))))...(((((.......)))))..(((((.......))))))))))))....
SPR_00493
[ FASTA input ]
GAAGCGGUGGCUCAAUGGUAGAGCUUUCGACUCCAAAUCGAAGGGUUGCAGGUUCAAUUCCUGUCCGUUUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.....(((........(((((((.......))))))).)))((((.......)))).)))))))....
SPR_00496
[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........(((((.........)))))(((((((..............((((.......))))..)))))))...
SPR_00497
[ FASTA input ]
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
........(((((.........)))))(((((((....(((....)))((((.......))))..)))))))...
SPR_00498
[ FASTA input ]
AGCGGGAUGGGAUAGCUAGGAGAUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGAUCGGUAGUUCAAAUCUACCUCCCGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((............))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..............(((....(((((.......)))))..)))(((((.......))))))))))))....
SPR_00502
[ FASTA input ]
AGCGGGGUGGGGUAGUCAGGAAAUCCGAUGGGCUCAUAACCCGUAGAUCGAUGGUUCAAAUCCAUCCCCCGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))(((((.........((((......)))).......))))))))))))....
SPR_00504
[ FASTA input ]
CGCGGGGUAGAGCAGUUGGUAGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAGGCCGCAGGUUCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
...(((((((................(((((.......))))).(((...........))))))))))........
SPR_00505
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGUAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCCCCGCUACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))).....
SPR_00506
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00509
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........))))(((((.........((((......)))).......))))))))))).....
SPR_00512
[ FASTA input ]
CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((.((((.((((((.........))))))...((((...........))))......)))))))))).....
SPR_00513
[ FASTA input ]
CGCAGGAUAGAGCAGUCUGGUAGCUCGUGGGGCUCAUAAUCCCAAUGUCGCAGGUUCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.(((((((.....((((((........((((.........))))......))))))...)))))))...........
SPR_00517
[ FASTA input ]
UGCAAUAUGAUGUAAUUGGUUAACAUUUUAGGGUCAUGACCUAAUUAUAUACGUUCAAAUCGUAUUAUUGCUACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
SPR_00518
[ FASTA input ]
AGCGGGGUAGAGUAGUUGGUUAACUCAUCAGGCUCAUAAUCUGAAGAUUGCAGGUUCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA
[ reference structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00519
[ FASTA input ]
AAAAAGAUAAGCUAAUUAAGCUAUUGGGUUCAUACCCCACUUAUAAAGGUAAUAAUCCUUUUCUUUUUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.....))))(.((((.......)))).)...(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.....))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00520
[ FASTA input ]
AGUAAGGUCAGCUAAUUAAGCUAUCGGGCCCAUACCCCGAAAAUGUUGGUUUAUAUCCUUCCCGUACUACCA
[ reference structure ]
((((.((..((((.....)))).(((((.......)))))....(..((.......))..))).))))....
[ predicted structure ]
((((.(((.((((.....)))).(((((.......)))))(((......)))..))).......))))....
SPR_00533
[ FASTA input ]
AGCAGAGUGGCGCAGUGGAAGCGUGCUGGGCCCAUAACCCAGAGGUCGGUAGAUCGAAACUACUCUCUGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
...((((((((((.......)))..(((((.......)))))...(((......)))..))))))).........
SPR_00541
[ FASTA input ]
GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGGUGGCUGUAACCCACUUCCUUACGGUUCGGGGGUUCGAAUCCCUCCCCCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((....(((...........)))((((.......)))).)))))....(((..(((((...........)))))...))).
SPR_00542
[ FASTA input ]
GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGCGGACUGUAAAUCCGCUCCCUCAGGGUUCGGCAGUUCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((((...(((...........))).(((((.......))))).)))))((((...(((((.......))))).))))......
SPR_00544
[ FASTA input ]
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAAAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....(((.((((.......................))))...))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00548
[ FASTA input ]
GAGAUGGUGGCUGAGUGGUUAAAGCGGUAGACUGUAAAUCUAUUGGGUAUCCGUCGUCGGUUCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........)))((((((.......))))))...........(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((......))))...(((((((.......)))))))...........((((.......)))).)))))))....
SPR_00550
[ FASTA input ]
GGAGGGAUUUUCAAUGUUGGUAGUUGGAGUUGAGCUGUAAACUCAAUGACUUAGGUCUUCAUAGGUUCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((...........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((......................(((((.......)))))..............(((((.......))))))))))))....
SPR_00552
[ FASTA input ]
GGCAGGGUGGCAGAAAGUUAAUGCACUAAAUUGUAAAUUUAUAAAUAAAGGUUUAAUUCCUUUUCUUGCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........)))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.....(((((((.(((((((......)))....(((((((........)))))))....))))...))))))).
SPR_00557
[ FASTA input ]
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCACUGGUUCGAAUCCGGUAGGUCGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((.........)))))........((((.......))))........((((((((..........))))))))
SPR_00561
[ FASTA input ]
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCGCUGGUUCGAAUCCGGCAGGUCGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((........))))..((((.......)))).)))))).((((((((..........))))))))
SPR_00590
[ FASTA input ]
GCCGGGGUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGGCGGGCUGCAGACCCGUUAGUUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCCCCGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))......(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.....((((............((((.......))))...))))(((((.......))))))))))))....
SPR_00593
[ FASTA input ]
GGCGACAUGGCCGAGUGGUAAGGCAGAGGACUGCAAAUCCUUUUUUCCCCAGUUCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((...(((...(((........((((((.(((......)))...))))))..)))))).)))))))....
SPR_00595
[ FASTA input ]
GGGUCCAUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUUGACUGCAGAUCAAGAGGUCACCGGUUCGAACCCGGUUGGGCCCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
SPR_00598
[ FASTA input ]
GCCGCGGUAGUAUAGCCUGGACUAGUAUGCGGGCCUGUCAAGCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCCGCGGCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.......(((((..........)))))(((...((((((.....)))))).......))))))))))....
SPR_00610
[ FASTA input ]
UUCUCGGUAGUAUAGUGGUUAGUAUACCCGCCUGUCACGCGGGUGACCCGGGUUCAUUUCCCGGCCGGGAAG
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..................((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
SPR_00620
[ FASTA input ]
GCCCCCGUGGUGUAGCCAGGUCUAGCAUACGGGGUUCUCGUCCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..((((((....(((......)))....)))))).....(((((((....(((((.......))))))))))))....
SPR_00629
[ FASTA input ]
GAGAUAUUAGUAUAAAUUUUUUGUAUAUUUCUUUUUCGAAGAAAAGGUUUAUUAUCUUACCA
[ reference structure ]
((((((...((((.........)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ]
...........................((((((.....)))))).(((..........))).
SPR_00632
[ FASTA input ]
UCCGAUGUAGUAUAACGGUUAGAACACCUGGCUUUCACCCAGGAGAUCCGGGUUCGAUUCCCGGUAUCGGAG
[ reference structure ]
(((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
((((((....................(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).
SPR_00633
[ FASTA input ]
UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA
[ reference structure ]
(((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
SPR_00721
[ FASTA input ]
GCCGGCUUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCUAGAUUGUGGAUCUAGAGGUCCUCGGUUCGAGCCCGAGAGCUGGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))).....
SPR_00722
[ FASTA input ]
GCGGUUGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGGUUUGUGGCACCUGAGGUCGGAGGUUCGAUCCCCCCCAACCGUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).(((((......))))).....)))))).....
SPR_00750
[ FASTA input ]
AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).))))))))))....
[ predicted structure ]
............................................(((...........)))...........
SPR_00758
[ FASTA input ]
GGGCCGGUGGCUCAGCCUGGUUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCAGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCGGCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.....(((((........(((((.......)))))....)))))..........))))))))))....
SPR_00760
[ FASTA input ]
GGGCCCGUAGCUCAGCCUGGUAGAGCGGCGGGCUCUUAACCCGCGAGGGAGGAAGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((.........))))..))))))).......................(((((((..........)))))))...
SPR_00768
[ FASTA input ]
GGGGUGUUAACUUAAGUUUAAAGUGUUAGAUUUUUAAUCUGGAAAUGGGUUGUCACAUCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....((....)))))))))....
[ predicted structure ]
.........((((.......))))...............(((....((((......))))..)))
SPR_00777
[ FASTA input ]
GCACUUCUAGCUCAGUUGGUAGAGCGCGUGGCUUUUAACCUCGUGGUCGUGGGUUCGAGCCCCACGGAGUGCG
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).((.((.......)).)).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
..........(((.(((.....))).(((((........((((............))))..))))))))....
SPR_00810
[ FASTA input ]
GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((..........))))........................(((...........(((((.......)))))...))).....
SPR_00816
[ FASTA input ]
GCCUUCGUGAUCGGAAUGGUAGAGAUCCUGGUCUUAGGAACCAGCUGCUGAAAGGCGGCGGUUCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))............(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....((((..........((((......))))...((((((((.....))))))))....))))..)))))))....
SPR_00832
[ FASTA input ]
GUUGUUAUAGCAUAAGAAGUGCAUUUGUUUUAAGCGUAAAAGAUAUGGGACAACUCCA
[ reference structure ]
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ]
........................((((((((.............)))))))).....
SPR_00867
[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUCAGCCUGGCAGAGCGCCGGACUCAUAAUCCGGAGGUCCCGGGUUCGAAUCCCGGCGGCGGCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((......(((((((.......(((((.......))))).....))))))).......))))))).......
SPR_00868
[ FASTA input ]
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGUAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGUGGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGGCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
..............(((........(((((((.......)))))))..((((((........)))))))))......
SPR_00882
[ FASTA input ]
GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((((((...(((....)))...)))))).............(((((.......)))))))))))).
SPR_00912
[ FASTA input ]
GGGCCCGUCGUCUAGCCUGGCUAAGAUGCGGGGUACGGGACCCCGUGGUCCGGGGUUCAAAUCCCCGCGGGCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((..........)))))((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_00913
[ FASTA input ]
GGGGCCGUCGUCUAGCCUGGCUAGGAUGCCAGCCUGGGGCGCUGGUGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((.(((((...)))))......((((((((((.......)))))))))).......))))))))))....
SPR_00932
[ FASTA input ]
AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((....................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
SPR_00938
[ FASTA input ]
UAUACUUUAGUUUAGGAAGAAUAUUUAUUUUUGGUGUAAAAGGGUUGUAGUAUAGCCA
[ reference structure ]
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
[ predicted structure ]
..........................((((((.......)))))).............
SPR_00943
[ FASTA input ]
GGUCCUAUAGUGUAGUGGUUAUCACUUCGGACUUUGAAUCCGAAAACCCAGGUUCGAAUCCUGGUAGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..(((..........))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..................((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
SPR_00957
[ FASTA input ]
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((...........(((((((((.......)))))))))...)))))..........)))))))....
SPR_01040
[ FASTA input ]
GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
.((((.........)))).....(((((((.......)))))))...(((((.......)))))...........
SPR_01051
[ FASTA input ]
GGCCGCUUAGCACAGUGGCAGUGCACCACUCUCGUAAAGUGGGGGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCAGUGGCCU
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((..((((.......))))..............((((((((((......))))))))))))))))).
SPR_01088
[ FASTA input ]
GGGGCCGUAGCUCAGCCAGGCAGAGCGGCGGGCUCCAGACCCGUAGGUCGGGGGUUCGAAUCCCCCCGGCCCCACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.(((((.(((.........))))))))...((((....))))(((((.......))))))))))))....
SPR_01095
[ FASTA input ]
AGGGGUAUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGCGGUCUCCAAAACCGCAGGUCGGGGGUUCGAGCCCCUCUGCCCCUGCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_01103
[ FASTA input ]
ACAGAUUUAAGUUAAGUUUAAACUCUUGGUUUUCAAAACCAAAAAUUUUACUCUGUACCA
[ reference structure ]
(((((.(..((((.......)))).(((((.......))))).......).)))))....
[ predicted structure ]
(((((...((((((((........))))))))..((((.......))))..)))))....
SPR_01106
[ FASTA input ]
GGGGGCUUAGCUCAGUGGUAGAGCAUUGGAUUCCAAAUCCAGGGGUCGUAGGUUCAAUCCCUGCAGCUCUCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
........(((((((((......)))))...........(((((((..........))))))).))))....
SPR_01117
[ FASTA input ]
CGCGGGGUGGGGCAGCCUGGAGUGCCCGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCCCGGUUCAAAUCCGGGCCCCGCGUCCA
[ reference structure ]
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((..(((((........)))))(((((........))))).....(((((.......))))))))))))....
SPR_01143
[ FASTA input ]
AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
[ predicted structure ]
(((((((((.......(((.(((.......)))....)))(((......)))..........))))))))).
SPR_01157
[ FASTA input ]
CCCGCCGUAGCUCAGCGGCAGAGCGCCCGGCUGUACACCGGGUGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCGGCGGGACCA
[ reference structure ]
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((.........(((....(((((((.......))))))))))(((((.......))))))))))))....
SRP_00005
[ FASTA input ]
GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU
[ reference structure ]
.((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
[ predicted structure ]
.(((.((((((.....)))))).....))).......................................((((........)))).....
SRP_00008
[ FASTA input ]
GCCCUGCGGCGGGACAGGGUGAACUCCCCCAGGCCCGAAAGGGAGCAAGGGUAAGCCCGCCGUCCCGUGCGCAGGGU
[ reference structure ]
(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
[ predicted structure ]
......(((((((.........((((.(((..........))).....))))...))))))).(((.......))).
SRP_00042
[ FASTA input ]
AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
[ reference structure ]
((.((((((((..((.((.(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))...)).)).)..))))))).))....
[ predicted structure ]
(((((((((((........((((.(((.....(((...(((....))).....)))....)))....))))....)))))))))))....
SRP_00046
[ FASTA input ]
CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
[ reference structure ]
((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((.(((((((((((..(((((((.....................)))))))..............))))).))))))...))))))))....
SRP_00083
[ FASTA input ]
GAGAUUCAUUACUCUAAAUCAGUCAAUUACAAUCAUGUCAGAACUGAAAAGAAGCAGCAUUAACGGUUGAUAUCGAUAAGAGAGGGAUGAAUCUCUUCG
[ reference structure ]
((((((((((.((((..(((.(((((((......((((.....((....)).....))))....)))))..)).)))...)))).))))))))))....
[ predicted structure ]
............(((...(((((.....(((....)))....)))))..))).........................((((((........))))))..
SRP_00094
[ FASTA input ]
GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
[ reference structure ]
((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
[ predicted structure ]
(((.....(((((........)))))...)))...................(((((.....((((((.............)))))))))))
SRP_00095
[ FASTA input ]
GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
[ reference structure ]
((.((((((((..((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....)))).)..))))))))).....
[ predicted structure ]
(((((((((((...(((((.....)))))(((.........)))...........(((((......)))))....)))))))))))....
SRP_00101
[ FASTA input ]
GCCCGGAUAUGUACUAGCUAUUUAUAUUGCGAGGACUGGAAAGUUGCAGCAAGAAAUAGUCUGAAAGUGCUAAGUCCGGGUUUUU
[ reference structure ]
((((((((.(((..(.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))...)..)))....))))))))....
[ predicted structure ]
.((((((.(((((.........)))))(((((...........)))))..........................)))))).....
SRP_00107
[ FASTA input ]
GGGAGCCGGGCGGCGGUAACGCUGCCAACCCCGCCAGGUCCGAAAGGAAGCAACGGUAACAGUUGUUGCCGGGUGUCCGGCUCCCU
[ reference structure ]
.......((((((..((..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))).......)...))))).)))...
[ predicted structure ]
((((((((((((((((..............)))))....(((......((((((.......))))))..)))..))))))))))).
SRP_00121
[ FASTA input ]
CCGAAAGGCUAGGACAAUGGCGGGCUAGUGAAUUGUGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGCAAGUGCCGCCAUGUGUCUGAUUGAAUAA
[ reference structure ]
......((.(.(((((.((((((.((.((.....((((....(((....)))....))))...)).))..))))))))..))).).)...)..
[ predicted structure ]
............(((((((((((..(((((............(((....))).....)))))........))))))).))))...........
SRP_00132
[ FASTA input ]
GCCCUUAGGGGAUAUGAUAUAUUAUUGUCGAACCGUGUCAGAUCUGGAAGGAAGCAGCACUAAGAUUUAUAGUAUAUGCAUGUCUUCCUAGGGGUAUCU
[ reference structure ]
(..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
[ predicted structure ]
.((((((((......(((((.............(((((.....(((........))).((((.......))))))))).)))))..)))))))).....
SRP_00137
[ FASTA input ]
ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU
[ reference structure ]
(((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
[ predicted structure ]
((((((((((((((((............))).(((.(((.(((((............))))))))....)))....)))))))))))))...
SRP_00138
[ FASTA input ]
GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU
[ reference structure ]
(((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
[ predicted structure ]
.((((((((...((((((..(((((((.((((......)))))))))))....(((.....))).)))))).....))))))))......
SRP_00139
[ FASTA input ]
ACCGGGCUUGGCAACGCUUGCCUAUAACUCAAGUGAGGGUAAGAAAAAGGGUUGGAAUUGAAAGGG
[ reference structure ]
(((((((..(......)..))))....((((..)))))))..........................
[ predicted structure ]
..............((((((.........))))))...............................
SRP_00161
[ FASTA input ]
GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
[ reference structure ]
(((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))....
[ predicted structure ]
.((((((((((((.............................................)))))))).)))).....
SRP_00162
[ FASTA input ]
GGAGCAAUAAGUUUCUUACGAAGCGUGUCAGGACCUGACGGUAGCAGCACUAAGUAUGGAGCUUAUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
((((((.((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...))).).))))))))..))))....
[ predicted structure ]
....................((((((...........))).....(((((((((.......)))).))))))))...
SRP_00163
[ FASTA input ]
CAAAAGGCAAGGGUGGAUUUACGAAUCGUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCACUAAGUUUGCUUCAUCUUGUGCCUUUUGUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))..).)))))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
.....................................((((((((((.((((.......))))....)))...)))))))....
SRP_00170
[ FASTA input ]
GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
[ reference structure ]
((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
[ predicted structure ]
.(((((((((((((.........))))((((.....))))....................................)))))))))......
SRP_00194
[ FASTA input ]
GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
.((((((((((((.....(((.................................)))......)))).)))))))).....
SRP_00196
[ FASTA input ]
GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA
[ reference structure ]
(((((((..((((.(((.((.((.(((....((((....(((....)))....))))..))).)))).))).......))))...))))))).....
[ predicted structure ]
(((((((..............................................................................))))))).....
SRP_00209
[ FASTA input ]
GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
[ reference structure ]
(((((.(((((..(((((.((((((......(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..)))).))).)).........
[ predicted structure ]
((((((((((...(((((.(((((....(((((.........))))).............)))))...)))))....))).))))))).........
SRP_00213
[ FASTA input ]
GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
[ reference structure ]
(((((((((((..((.(...(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))....).)).)..))))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((((((...................(((.((((((.....(((.......))).....))))))..))).)))))))))))......
SRP_00214
[ FASTA input ]
AGCCGCGAUAAGAAUAACAUCUGAAUGAGUUAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGAAAAGUGUUCUGUAUUGCGGUU
[ reference structure ]
((((((((((.(((((...(((.....(((....(((....)))....)))....)))....)))))))..))))))))
[ predicted structure ]
..........(((......))).........................................................
SRP_00215
[ FASTA input ]
GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..)))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((..........................................)))))))).)))))))))....
SRP_00216
[ FASTA input ]
AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU
[ reference structure ]
(((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
[ predicted structure ]
(((((((((((((((((..((((.....(((.....(((....))).....)))...))))....))))).))))))))))))
SRP_00217
[ FASTA input ]
GCCACUAAAAUAAUAACCUUGUAACCUGGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCCAUAUCGAGAAGUGUUGUGUUUAGUGGUUUUU
[ reference structure ]
(((((((.(.(((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))...)))))))....
[ predicted structure ]
.((((((((...((((((((.......................................))).))))).)))))))).....
SRP_00219
[ FASTA input ]
GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU
[ reference structure ]
(((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...)))))))....
[ predicted structure ]
.((((((((((((((..((((.....((((((.........))).....)))...))))...)))))).)))))))).....
SRP_00221
[ FASTA input ]
GACGUCAUAACAUUAGAAGUGAAUCGUGUCAGGAUAGAAAUAUAGCAGCACUAAGCAAUAUCUUUUGUGUAUGGCGUCUUUUU
[ reference structure ]
(((((((((.((..(.(..(.....((((....(((....)))....))))...)...)...)..))))..))))))).....
[ predicted structure ]
................................................(((.(((......)))..)))..............
SRP_00222
[ FASTA input ]
AGCCGUCACAUCAUUACGGUCGAAUCGUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUAUUUAAUGAGUGUGAUGGUU
[ reference structure ]
(((((((((..(((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))).)..))))))))
[ predicted structure ]
((((((((((((((((.((((...........))))...((((......)))).........)))))).))))))))))
SRP_00223
[ FASTA input ]
GCCUUUAGAACAAUAACCUCAUAACCCGGUCAGGACAGAAAUGGAGCAUCCGCAUUGAGAAGUGUUGUGUCUUUAGGUCUUUU
[ reference structure ]
((((..(.(.(((((..((((.....(((......((....))......)))...))))...))))))...)..)))).....
[ predicted structure ]
...............(((.........))).(((((.....(((((....((((...........)))).))))).)))))..
SRP_00256
[ FASTA input ]
GGCGACCCUUGCGACUGUGAGUCGUGAACCUGGUCAGGCCUUAACUGGAGCAGCCAUAAGCGGUGUAACUUUGUGUGAGGGUUGCCGCCACCG
[ reference structure ]
((((..(.((...((.(.(.(((((.....((((....((......))....))))...)))))....).).)..)..)))....))))....
[ predicted structure ]
((((((((((((.((((............(((..(((.......)))...))).......))))..........)))))))))))).......
SRP_00266
[ FASTA input ]
GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU
[ reference structure ]
((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
[ predicted structure ]
.(((((((((((((...............................................................)))).)))))))))......
SRP_00268
[ FASTA input ]
GUUCCCCGUGCGGCGGCACCUGACUGAACUCCCCCAGGACCGAGAGGUAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUACCGGGUGCGCGGGGAGCCCUUUU
[ reference structure ]
(((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
[ predicted structure ]
(((((((((((.......((((............))))(((....((((((((.......)))...))))).))))))))))))))......
SRP_00270
[ FASTA input ]
GACUCGGACCCAUGCGGCCGCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCGUGACAGGCGUGGACUCCGGGUCACC
[ reference structure ]
((((((((.((((((.(.((((((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).))))).)..))))))..))))))))...
[ predicted structure ]
((((((((.((((((........(((.....((((((....))))))...(((((...........))))))))....))))))..))))))))...
SRP_00271
[ FASTA input ]
CUCGGCCUUUCGCGGUUUUAACGCCCAAACCUGGUCAGGAUCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAGGCAGGCGAG
[ reference structure ]
........(((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..)))))
[ predicted structure ]
(((((((((((..(((((........)))))......))).................((((.....))))))))...))))
SRP_00284
[ FASTA input ]
GCUAGUAGUGGGCAUUGUACCUGUUUAGUCGGUCAGGUCUGAAAGGAAGCAGCCAGAGUGGGAUUCGAUGGGUCAUUACUAGCAUUA
[ reference structure ]
(((((((((((.(((((..((((((...(.(((....(((....)))....))).)))))))...)))))..)))))))))))....
[ predicted structure ]
((((((((((..(((((.(((((..........)))))(((........))).............)))))...))))))))))....
SRP_00285
[ FASTA input ]
GCUAGUAGUGGGCAUUGCUCUUGCUUAGUUGGUCAGGUCUGAAAAGAAGCAGCCAGGGUAAGAUUCUGUGGGUCAUUACUAGUAUCA
[ reference structure ]
(((((((((((.(((.(.(((((((...(((((....(((....)))....))))))))))))..).)))..)))))))))))....
[ predicted structure ]
.(((((((((....(((((((......((((......(((....)))..)))).)))))))............))))))))).....
SRP_00310
[ FASTA input ]
GGAGCAACAUUUACUCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUGCUAAAUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
((((((.(((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..).))))))))..))))....
[ predicted structure ]
......................(((((..........)))))...................................
SRP_00312
[ FASTA input ]
GCCCCUCACGUGGCGCUAUCUGACUGAACUCCCCCAGGGCCGGAAGUCAGCAAGGGUAGGUUGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGCGCUUGC
[ reference structure ]
(((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(.(....).).....)))..))))))...))))).)..))))))))))......
[ predicted structure ]
((((((((((...(((((.(((((......(((....(((.....))).....)))...)))))...)))))....))))))))))......
SRP_00315
[ FASTA input ]
GGAGCAACAGUUCUGCGUGAAGCGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUGAAUUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)..))))))))..))))....
[ predicted structure ]
...............(((((..((((((..(((.............))).....))))))..)))))..........
SRP_00318
[ FASTA input ]
GGAGCAACACUUGUGCGUGAAGUGGGUCAGGGGAGGAAUCCAGCAGCCCUAAGCGAUUUUCGGGUGUGUGCUCUUUUU
[ reference structure ]
((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))).)...))))))))..))))....
[ predicted structure ]
.(((((.(((((.......)))))....((((..............))))..................))))).....
SRP_00325
[ FASTA input ]
GGCUCGGACUCAUGCGAUUACAACGCCCAAAUCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAGGGAUGCUUGUGGUAGGCGUGAACUCCGGGCU
[ reference structure ]
((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))
[ predicted structure ]
.(((((((.((((((...........(((.(((((...........)))))((((...........))))..)))...))))))..))))))).
SRP_00341
[ FASTA input ]
CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU
[ reference structure ]
((.((((((((((((((((.((((..((.....((((....(((....)))....))))..))..)))).))))))))...))).))))).)).....
[ predicted structure ]
((((((..(((((((((((.((((.....))))(((.......)))........................))))))...)))))....))))))....
SRP_00342
[ FASTA input ]
CCGGGGCCGCCCACGAAAUAUCCCCCAAACCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGGGGGACGCUUCGGUGCGCGAUCCGCCCCGG
[ reference structure ]
(.((((.((.(..((((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).))))..)..)).))...)).).
[ predicted structure ]
(((((((.............((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))(((........)))....)))))))
SRP_00350
[ FASTA input ]
GCCUCCGCGCGGCGUUACCCGGGUGAACUCCCCCAGGUUAGGAAUAAAGCAAGGGUAGCUCGGCUCUGGCGGGUGUGCGGGGGUCUUGC
[ reference structure ]
((((((((((..(((((.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))))).)..))))))))).....
[ predicted structure ]
.(((((((((..(((((.(((((......(((....(((........)))..)))...)))))...)))))...)))))))))......
SRP_00363
[ FASTA input ]
UUCCAGCAUACAGCAAUAUUUUUAUUAGUAAAUUCGAUCAGGUCCGACAGGAAGCAAUCGUAGCUACAAAAAGUAUGUGUAUAGUAUGCUGGAAAAUU
[ reference structure ]
(((((((((...(((.(((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..))))))))..)).....)))))))))....
[ predicted structure ]
(((((((((((......((((........))))(((........)))....................................)))))))))))....
SRP_00365
[ FASTA input ]
GGUAUGCAGGCAAAAACUCUGUAACUUGGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCCACACCAGAAUCUUUUUGGGUUGCAUACCUAUU
[ reference structure ]
(((((((((.((((((.(((((....((((....(((....)))....)))).)).)))...))))))..)))))))))....
[ predicted structure ]
....(((((.........)))))........((((..........((((((.................))))))..))))...
SRP_00383
[ FASTA input ]
GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
[ reference structure ]
(((((((((.(((((...(((......((((....(((....)))....))))...))).....)))))..)))))).)))
[ predicted structure ]
..((((.....((((....))))..))))....................((((.(((((............))))).))))
N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.
Copyright© - Adam Mickiewicz University & IIMCB - All rights reserved